Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score ACTGGTCTATATATATATATATATATGTCGGGATAAGAATATCAGAGGCCT:1 + chr3L 10814541 5' - micropia 5436 2 78.43 GTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAATCATACGTTT:1 + chr2L 8553336 5' + pogo 89 1 80.14 GCTTACGATATAAAAATAAATAAATCGAATTTGTAACTTCTTTTTGAGCTGATTCAATGGAGTATGCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTC:1 + chr3R 17395857 5' - invader1 94 2 53.78 CCTTCTTGATGTAAACGCTATCCGGTAAAATGATACGCCTTGCGCTTTAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr2L 21777782 5' - pogo 2078 1 62.24 AATTATTGTTGATCTTTGTGCGCTGTGAATTCCCTCAATCGAAAGCAAAGTCCCTAATAGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2L 13850633 5' + roo 67 2 62.33 CTCTCTCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGTGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - 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roo 390 2 72.60 TGTGGGCCCTCAAAAGTATGCAACACTTTTCGAATGAGTGCAGACAGGCGAAGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGCCAATGCTGACCATCGGACTAGAGC:1 - chr2R 21229078 5' + jockey 4719 1 54.03 TGCAAAAGCTTGGACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3R 20345583 5' + blood 7030 2 71.23 AATGTTGCGTGCGCACAAATGTATGCTACACTTTTTTATTTTGTTCGTGGTTTCCAAAAGCTATTAAATTTAAATGCTTTAACTTAGTTTCAAGTAAACTAAAGTGTAAACACTTTTATTTTTTTATTTTTTACACATTTGAACAA:1 + chrX 7992512 5' - NOF 3891 1 64.38 GTTGCTCAAAATAAATTATTATGAACACAGTTAAATGCAATAGGCAGCTACACTAAAACAGTATCCAATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chr3R 14800984 5' - pogo 2052 1 54.79 AAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 + chr3R 10433220 5' - 412 412 2 73.29 CTTGATGATACTCAAGAGTCGCGACACTAAAAGAATGATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGC:1 + chr2R 16072858 5' + opus 2 2 80.14 ATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGG:2 - 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roo 8974 2 82.19 GCCGTGTCCAATTTTTGATGGGTTGTGTGAGTGATGGAAATACCCTGATGGCAAACGAAAGACTCAGCTATGTAAATAACTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 - chr3R 30816493 5' + FB 42 1 55.48 ATTCGATGCACTATGATTTATACGTAAGCGATCATCAATCTTCTTTTACTGACATGGTTGTTGTTGGTTCTGTTACTGCCAGTTGAGTGGAGGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chr2R 8199232 5' - blood 353 2 61.64 ATCAGTTTTAATTAAAAACCACTATCAATATTTTCTTGGAACTGCAGGCTAACAATAAATATCTTTAATACATAGATACTGATAAACAAAAAATTATCATATATACGATATACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAC:1 + chr3R 15701880 5' - INE-1 87 1 63.70 TTAGACCAGAAACTTCAATAGCAGATGCCTAGTCTTTAAAACTCATATATCATAACAGTCAGGTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 - chr3R 4197992 5' - 1360 3332 1 58.22 GGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACCTACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1 - chr3R 20345515 5' + blood 7098 2 76.71 TTCCTCTTCGTTATGAACCCAACTTCAATGCAAAATTAACAGAAATATGCAAATTTTCTTTTCGTCCAGTCCTCCCCTTTTCTACATTTTAGGTTATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGG:1 - 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BS 5072 1 46.58 ATTATTTTACAAATAGCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3R 10433314 5' + 412 48 2 54.79 AGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2L 13697608 5' + F-element 86 1 63.70 ATTGCAAACATATTCCAGAGCCGAGCACTTCAATCATCCATGAAATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr3R 5977722 5' + copia 4923 2 53.42 TTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTTTGTTAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2R 19878793 5' - 412 7515 2 63.01 TGTCATATGATTTTTCCAAGAATCTCGTAGTTCAGAAAGTTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAA:1 - chr3L 18010312 5' - diver 6029 2 73.29 CTACTAGGTTTTAATGGAAATTTCCCGGAACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr2R 9091794 5' - 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chr3R 10900892 5' + F-element 85 1 63.64 AATGAGAAAATATTATATTATCTGCAAAATCATCTGTAACATCGAATGATATTCAACACTATCCGGCTGGGAATGCCACAAGCGATTATTATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTA:1 - chr3R 27660666 5' + 297 6569 1 63.01 ATGCTTGTGGATTCGTTGTGGGCGGGCAAAGTGCCACAATTTAATTACTATTATTAGGTATCCTTCCCGCTTGGCCAAATCCAGTGTCGTGCCCTGGTCGATGAGGCTGTACCCAGGGACATAAATGTTGCAGATGTCCTACCG:1 - chr3R 27064648 5' + Copia1_DM 4210 1 69.44 ACTACTATCATCGTTAATCTATTGGTTATATACCTTAACAGAAGTCAATGTAATGACAACTTTTACAAGCTTGAAATCGGCTGCAATTGAAATATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr2R 17059521 5' + pogo 22 1 70.34 AAATGTGAGCGAGCAGCGGGGAAAACAAAGCAAAGCCAAGCGGCAAAAAATGTATTTCATTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTC:1 + chr3L 10023963 5' + transib2 59 1 60.96 ACATCTGTTTTAATGTCTTTGAGGGATTCCGCGTTGAACAAGCTAAGTGAAGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 + chr2L 13697558 5' + F-element 36 1 76.71 ATACATAATAGATATACCTCATATCTCTGTAAGCAACGCGGCATTCCGAAAATGCCTTAGAAATTAATGCGAATGTAATATATATTTAATTTACGACATAAACGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCG:1 - chr2L 14283997 5' + Stalker 7010 6 68.57 CGAACTAATCTATTAGCTCTAAGAAATTATGAAAAAAAAAACTTAAGCGAACGGCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGGATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAAC:1 - chr3R 25592497 5' - Quasimodo 7239 2 94.74 CGAGGGACGGGCGGCGAAGGGGCGTGCCGGGTCTGGGCGCAAGATTTATGGGTCGTCGTCGTCGAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGACATGGAAAAATGCATTTGTATTACTAAGTTTCCCTCGCACTGCTA:1 - chrX 7982112 5' - HB 24 1 56.16 GTACATATTAACAAAAACATTTGGTTTTTAATTGGCTTTAAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCAT:1 - chrX 7847282 5' - hopper 83 1 61.64 GTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr2R 19726928 5' - 1360 3346 1 58.47 CGCAGCAGCCATCATTCAAAGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 8553266 5' + pogo 18 1 73.10 AACCCTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAA:1 - chrX 21227214 5' - Tabor 7270 2 53.42 AGTTTCGACATGGAACCGCAATCTCTGCGGTTCGTCTGCTGTCAATTGTCTTGCGTGCGAACTATTCACAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAG:1 + chr2R 17609742 5' - mdg3 5445 2 52.05 GATATGCCACGTTCTTAATGTACACAGCGTGTTTAGAATTGAATTATACGATTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 - chr2L 21777873 5' + pogo 64 1 63.70 AGCAATTACAACAATAACAATAATCATAACTAAACAAGTGGAGGAAGAAGGGGCCAAAACCAAGGAAGAGGCCGAGGTAACTTCAACCAGGGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1 + chr3R 23184753 5' + GATE 8270 2 61.87 AGATTCCCTTTACTTCGCTTTTAGAGTTCGATTGAAAAAAAAACAATCATATATATATATTAGTTTACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3R 4197885 5' + 1360 56 1 57.53 AGTTCTGCGTTACGTAACGATGTCAACCTAACATACATAAACTAACCACATTTCAGGGCCTTTGGCCATCGCTCAGAGGTTCGGTTGCGCTAACCTGAAAATATTCGAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAG:1 - chr3L 22462882 5' + F-element 107 1 73.29 TCCATCTGCGACGATCGTTTTTGAAAAATGTGTTCAATAAACGCGTTACTTGTAGACTAAACAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 + chr4 407131 5' + jockey 67 1 55.86 GCTGCCTACGGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr3R 15047408 5' + F-element 61 1 58.78 AATTTCTGTTTGCACTTTTCATTGTGGCAGCACAAACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTT:1 - chrX 8208445 5' - roo 397 1 76.15 GCATATACATATATATATAAAGTATATATATATATATATATATGAAGAGGATCAAGGACTGTGTGGGTCTGCGGCCCGAATGCATTTTGGACCGCACAAAAGCCAGTGGCAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:1 + chr2L 2413063 5' + 1360 33 1 71.23 TAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGG:1 - chr2R 4774736 5' - baggins 5325 1 73.29 GATTTGCTAAGGAGATCACTATCACTAAACTATCTTTAGCTAAGCCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2R 2534688 5' + 1360 16 1 51.14 CAAATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 21938136 5' + roo 8700 2 60.27 AGCTAACAAATTTACTTGAATCTCCAGTACTTTTTCGCTTCCCCATTTTTTGTTGCTCTTTGCTCGGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2L 16995427 5' - roo 403 1 77.24 CGGTCTGAGCGAGTTAAGGCGGAAAATTTGTTGGCCCATAAAAGTGCAGCGTCGTCTCTCAAAATGGGTAACAAAAATTATTCATAGTGCAGTTGCCATTTTCCCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATA:1 + chr3L 18119398 5' + 1360 15 1 74.66 TCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAA:1 - chrX 6106827 5' + gypsy 7019 2 63.70 AAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTAT:1 - chr3L 19350058 5' + 1360 3211 1 63.45 ACCCAAGAAATTGGTACAAATGAACTGATTGATTACCACAACCGAGTAAAAATCGAGTAAATGAAATACCGCAAAAGTGCAATCATGCAATGAAAACCCAAAATCATTGAGTATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAA:1 - chr3L 5477787 5' - INE-1 284 1 76.03 ATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACCTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 12125288 5' - roo 335 2 68.49 AGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTA:1 - chr3L 10814600 5' + micropia 5017 4 60.27 AGATAATATATTGCTTCAACTAAAGCACTTCAATTTAATTGCTGTAACCAGCATTATANACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3L 19222563 5' + 412 7086 2 60.96 CATTTTCAACCAGTGAAATATACGCTGTTGGAGATTGGGATAAGCTAAAGCTGCTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCAGACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATT:1 - chr3L 17729279 5' + Tirant 8396 2 60.96 GATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACA:1 - chr3R 7042060 5' + Stalker2 80 2 69.86 GGTTTGCCCGGCCGGAGAACCATTTCTACGCTACTTCTCAGGCTCGGCTAAACAAATCGGTCCACCCTCGCCATTCCAAATATAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:1 + chr3L 13186732 5' - Juan 4163 1 56.16 ATGTTTCCTAAGTGAGCCAAAGGCACTAGAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTCCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr2R 16073063 5' - opus 7486 2 75.34 TCTCTCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGTGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3R 13530034 5' + jockey 27 1 71.23 TCAGTTGGCCAAAACAGTTTAAACGTGGACGTGGTCCGTCGGTGAGATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1 + chr3R 25961992 5' - I-element 5282 1 66.44 TTTTATAAATTACATGATAATTATAAACCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATGT:1 - chr2L 18738062 5' - roo 9037 1 57.36 TAATTTTTATTTGACTAGTTCCATTGCATAAACTTAAATACATGTTCATTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTA:1 + chr2R 21619337 5' - blood 7321 1 64.14 AGTAATTATCGTTAGCTCGAGTGGCTCGCCCTGCAATCCCCTCCCTTGTTTATTTTTTATGTACGTTTTCAACTCTTTTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAA:1 - chr3L 21222507 5' - jockey 4788 1 57.26 ATTACCATGGAAATTGGAACAATTCAAATGTTTTAAGTGCAACGCCAAATACCCAATCCTTTGCGCCTCCCCCCCACAAACTTTGCACAAACATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3R 18204480 5' - hobo 2931 1 73.64 CTGCTCAGGATGAAGGATGCGTAGGCGTGTCTGAAATGTCATGCACAGCGGACTGATTGACCCATTCATTTACTCAGCAAAGTTAAGGAGATCTCCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATATTGGTCCACTTCTTTTT:1 - chr3L 10105823 5' + Q-element 501 2 57.53 ATTTGAAAAGTAAAAAAAAAAAGGAAAAT:1 - chr3L 16240736 5' + Doc2-element 247 1 86.21 AAAACAAATCACTGCACACGGGGTTCGAGCCGAGCTACCAAGGGCAGCTACCTCGAAATCCTAGCCCAACACAGTCCACTGCAATCCCACCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATACAGGCTAAATTTTTATGT:1 - chrX 18523745 5' + transib2 30 1 65.07 TAATTTATATCATGATTAATTTGGAAGGTCTATTAGGCATTACCCTCCTTTAAAAAAAGATACATTTTTGATTGCTGTTGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACT:1 + chr2R 16749731 5' + roo 8964 2 49.32 AACAAAACAAAACGTAAGAATGTGTCTGGTTCTTTTAAAATACAGACAAAACAAGGACAAGAATGCCACACAGCAGACACAGCAATAGCCTTGGGACCAAGTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr2L 3408686 5' - opus 7486 2 72.60 GGTCCTGTCCAAAGATGGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:2 + chr3L 21292507 5' + 412 7117 2 59.59 TAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:2 - chr3R 20345568 5' + blood 7045 2 60.96 ATGTTACTTTTTATCATCGAAGCTTTTAAAGTGTTTCTTAAGTCTAGTAAGTACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:2 + chr2R 7769743 5' + Transpac 66 2 63.01 AAGAACGGCAAAGAAGAAACTAATTTCGCGCAAATTAAATGCAAAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 1232706 5' + roo 8739 2 70.55 CTCCCACTTGGAACCACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 - chr2L 1451264 5' - mdg1 372 2 52.05 AATTCAAATGTTTTAAGTGCAACGCCAAATACCCAATCCTTTGCGCCTCCCCCCCACAAACTTTGCACAAACATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3R 18204460 5' - hobo 2894 1 52.74 CAAGGAACAAGGATTCTCGAAAGGGGTTGTGTGTGGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 + chr3L 8249328 5' - HMS-Beagle 7022 2 71.92 AAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 29384690 5' - roo 8986 2 88.19 GACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3R 8381736 5' + Tirant 8169 2 74.36 TCATAATTTTGAAAAACGCTTACACTGGATACTTCAAATATTTCTAGTAAACTAATATGTGTTTGCTGTTTGTCTTTGATTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATG:1 - chr3L 25883685 5' + 1360 3141 1 52.74 AGCCGTTTTGTCGGCCGGCTTTTGCTTTTGCTTTTGCTTTTGCTTTACCAATAGCTATAGCTATTGATCAAACAAATGTCGGCGAAGTGCCATGAACACTATATATGTGGCATGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGG:1 - chr3R 14786619 5' + hobo 2874 1 71.92 TCATGCTCCAGTGATCGATCATCGCCGAGTTGGACTCCACCTTGATGAGGCCAGGATCCCTGAACGAGTCGAGGTATAATCATATTAGCTAATGTATGGTAATGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATG:1 + chrX 19679272 5' - opus 7236 2 71.92 CACCACCCCCCCCGTGAATATTCACCCCAACCGCAATTTGAAAGTGCGAACTTGATTATAATGCACTCACTGCATTCAAAATTCGAATGTGTTCACACATGAACACGCATATCTTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 12343303 5' + roo 8687 2 67.67 GTGCATAACAACGTGGAAATATTGCAAAGGCAAACTACACACAAACATAACTCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTGCCAACTTGTCCGGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCTACATATTAAACTCATGCCCATCC:1 + chr3L 21221677 5' + I-element 5045 1 75.34 ATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGA:1 - 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chrX 14189233 5' + 412 7122 2 60.96 GAAATAGAAAATAAAAGGAAAAAGCGCAGAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr2L 4269048 5' - hobo 2913 1 62.40 TTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 12125278 5' - roo 9009 2 63.01 CATTTGTTTTGTTTTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCC:1 + chrX 16608275 5' + P-element 190 1 19.18 CACCAAAAACTCCTGATTTGTGGACGCGTTTCAATTAGAAGCTATTCGGAGCTTAATACCTGCTCCGATCGACGATCTGATCGGACGATTCCCAGCGATGTATATCTGCGGATATATATATATATTGACTTCGTATGGACCTAAAT:1 - chrX 20495009 5' - flea 4571 1 67.81 AATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCGTTTTATTTGTTCTTATCTCTT:1 + chr2R 13695653 5' - blood 304 2 76.15 TGTTTAATGAAAATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATA:1 - chr3R 7042103 5' + Stalker2 37 2 60.27 ATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAACCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTT:1 - chr2R 5924408 5' - jockey 4742 1 32.88 ATAGGAAAACCCCCAAAACAAAAAAAAAAACAATAAAACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTCTGTTGCTATGTTTATGTGTATGTTT:1 + chrX 19121918 5' + 412 7125 2 68.89 GATTATATTGTACTATCAAAACCAAAAACAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTNACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr2R 22596037 5' + Doc 17 1 69.86 CCGAAACCATCTGGCCTCTCTATTAGTTTGGGCAAAACATTTTCCTGGTTTGCTAATTTTCACTTCCGTTTATATAGATGTATATAGATATATATATGTATGTGTGTATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 12263654 5' - roo 396 1 78.08 GTGGGGTGGCGGTTGGCATCTGGAAATTTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr2R 17609869 5' + mdg3 43 2 57.24 GAGCACTTTTCGCGAAATGCTGGGTGATCTGAAATCGCTCTTTATCGCATGGCAGAGTATTTGCTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGT:1 + chrX 1127734 5' + FB 59 1 57.53 CAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACA:1 + chr2L 3133688 5' + Doc 58 1 59.59 CATAGCCACAGAGGAGGTGACAACGCAACTGGGAAAAAAAGGTCGAAACCTATTCCTCCTCGGGCTACTCATTTAATTCCTCCCCTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 - 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chr2L 5341589 5' + Burdock 6207 2 65.07 GGAATACTCAGCACACCCGTCACATCCTCCTGGTACTCGCCCAGTCCGTCGTCCACCTCTAGCAAGGCTTCTATGGTTTCCTTTTGGTTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAA:1 + chrX 17420203 5' - hobo 54 1 58.90 GTTGACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 16920289 5' + roo 8714 2 52.74 GTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3L 15035233 5' + pogo 41 1 57.14 GCAAGTGGTAACCGCCAGGATGCGGAGGGTTAAGGGCCCAGAGCTGAGGTGGCAGATGGGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 - chr3R 7600583 5' - hopper 1353 1 58.90 GAATGGCAGGCGCAAAACAGAATCGCAAAAATTGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 13684821 5' + 412 7071 2 70.55 AGGAAAATATATTGATTTCTGAGTACCTATTTCATAGCTAAGCAATTTGGTTTCTTGAATAATCATTACATCAAATGTGTAGCCAGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chr3R 19629059 5' - Transpac 277 2 57.53 ATATTTCCCATGACATCTTCTAGATTCTGGTGCGCAATGTTAAGATATTGCATGGGTTCAATCCAAATGTTATATATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAG:1 + chr3R 20308138 5' - invader4 3037 2 52.05 TAATCAACATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 - chr2L 6154029 5' - copia 5080 2 54.79 AAGTTGCTAAACAAAAGTACATTCGTTTGAATTTTTTCTTTGTTTTTCTGTGCCATACGCTCCTTTTTTTTTTTAATGGTTTTGCAGAGGCAGCCAAAATGTCTGGACTTAACAATGGAGTATAACTAATTTTCTGACAA:1 - chr3R 26933404 5' + transib2 410 1 78.57 GGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGACAGGACAACCAACATGCTGTGGT:1 - chr3L 22435180 5' - opus 433 2 73.98 GCGTGCGTGAGGGAAATAAGGAGCAAAGTTTCTGTGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTTTTTTTTGTTTTACCAATCATTTTTAAAGTATCCATTTAATCTGTTACTAATTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTG:1 - chr2R 16401496 5' + Tc1 1536 1 75.34 AGATAGATTCCACTTATGTATTATTTATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTAACAT:1 + chrX 20266139 5' - BS 5056 1 57.53 TGTATTACATATTAGAGAATGTTTTCTTCTTGTTTCCGAGGGAACATGCATTTTCTTTTTGATCCTTATTTAGTAGGGATTACATTCAGTATTTGCATTCCTATCTTGATTATTTTTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATT:1 + chrX 4415183 5' + Circe 6983 1 57.53 CCCAGAGTTGTGGAACTTTATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chrX 5456558 5' + roo 67 2 65.07 TTTTCTTGTAAAAACGCTTGGGTTTTCCCATGTTTTTTTTTTTGTGTTTACC:1 - chr3R 23167287 5' - Porto1 162 1 88.46 ACTTCATTTCAGTGAGTCAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATGTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGGGCGAGAGAGAGAAGAGCGCGACAGC:1 + chr2R 4262584 5' + 1360 114 1 78.42 CAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3R 20345553 5' + blood 7060 2 52.05 TAGTTTTAGCTTTACTATAACTCAAAACACGACTGTCCTTAATTAGTTACTAGCAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATGATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCG:1 + chr2R 12892055 5' + invader2 453 1 63.70 TCTGCTGCTGAGATTGGAGTTTTGAATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTT:1 - 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412 414 2 73.97 AATTGCATTTAGAATCTATCTGCCTTTGGCAGATGGGGATTGGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACA:1 + chr2R 8689377 5' - hobo 2860 1 71.23 TTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGTTCCGTTCATATCT:1 - chr2R 9871576 5' + roo 39 2 54.33 AATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1 - chr2L 20508389 5' + pogo 68 1 70.55 ATAATCAACCTTGAATCTAGACGTTCGCTTTAATTGCTTAAAACTTTCCTTTGACTTTTAATCAATAAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2L 2317041 5' + roo 53 2 55.48 ACAAATACTCGGCAAAGAATCACAGAACAGAACGCAATGAGAGTGATGGAAACAAAAGGAACTCAAACAAAACCCAGACTTGACCTGAGCATCTTGCTTTGAGCTGCTAGGTGCATGCTCGGCACTCTCACGCTCCGCTATCGGCT:1 - chr3R 16278906 5' - Stalker3T 149 1 67.12 CAGGGATTGTTAGGTGAATTCAAAACCCTTCTTGTTTTCAGTGTATTTATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTT:1 - 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Doc3-element 4492 1 78.57 TGTAATTATATATATGTATGTATATATATGTATGTATGTATATATGTATATATATATATGTCGTGGCGAAAGTAATGAGT:1 + chr2R 7719191 5' + micropia 1 2 58.75 ATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3R 24010978 5' + roo 8728 2 63.45 GCTCGCCTGCATTGGCCCAAAAGCTTTGAGTGCAACGAATGCGCTCTCCAAAGAATTCGCGTAAGGAGAGGCAGTGAGAATCGGAGAGCGTTTGCGCGAGATAGGGAAATCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGACAGCCG:1 + chr3R 20784922 5' + Chouto 130 1 58.90 ACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATTCATA:1 + chr2L 17550624 5' - Transib-N1_DM 430 1 79.45 AGTAGCGGCTGTGAAGCGTGTATTTGGTGAAATATGGGGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr2R 15472176 5' + 412 32 2 66.44 TACTAAGCGCCACTTGACTTGTGACCCGAACCCCTCGCTGACCTCAGACCCAGTAAACGAAAGCTCCCTTGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - 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chr2R 17609853 5' + mdg3 5312 2 57.53 ATTCAACTTTATTGCGGAAACTCAAGCAACTAATTGTGCGCCCTTTATTACGCTGTATTTTCAAAACTTCTAAAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAG:1 + chr3R 12181935 5' + mdg3 20 2 72.60 TAAAAGTAAACTTTAAAAGTGGCCTTAATACTTTTATTTTATATGATGAAAGTTTACATTAATAAAGAGCACTAACACATATAGATTGTTTTACTTAATAGTTCGCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 15728542 5' + roo 8697 2 70.34 GCATGTGTTTCGTCATGTTTCTATGTTAGCAACATTGTAATAGTCGGCAGTTTTATACGGTTTGTGGGTGTTAGAGTGGGCGTGGCAAGATGGGTCAACATNCTTGCACTGTCGCTAAGTCTCAACCTTCTTTCTTTTATAGTTCC:1 - chr2R 5891528 5' - INE-1 157 1 68.49 ATATAAAAAATACAACAGCCTTTTAGGATTTCCCTTAGTCACTTTTTTTTTACGGCTTCTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chr2R 18043973 5' - jockey 4930 1 65.75 GTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3R 15137341 5' - roo 323 2 75.34 CCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTATGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAGAAAC:1 - chrX 21587766 5' + INE-1 140 1 55.48 ACTACGTCTAGGACACTCCATACTGTCCCATGAGCGCGACAATTCCCCAAATCCTAGACGATTGCATCGCCCTCCAATCACATACAATTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTTACTTA:1 - chrX 21084043 5' - HB 290 1 65.12 CCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGGCTGAGTG:1 - chrX 14825328 5' - P-element 2794 1 19.15 AGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 12125295 5' - roo 345 2 71.32 GCGATGTCAACCAAGTTGGCTTTTCGATGCGCAGTGCTGATTTTTTTTAATAAGTATAAATTTTGG:1 + chr3L 9183513 5' - I-element 250 1 90.91 ATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAAT:1 + chr3L 27415241 5' - transib2 2736 1 78.77 CGGTTGAGTTTTCCTCTTGCCTTCTTCTCGTTGGCAAACCCGTTTTGTTTGTGCTCCCCCCCCCCCTCCCCCC:1 + chrX 11686263 5' + accord2 224 1 75.34 TATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGAAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGCTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATACAGTCTAAAAATTGAGCT:1 + chr2L 18112463 5' - transib2 2794 1 60.42 CTATGCAAGTTAACAAACCATCAATTTCACCCTTAGCAACTAAGTAGCCTTGCAT:1 - chr3L 23797516 5' + gypsy 7016 2 76.36 GGAAGCGGCACAGTTTTTCTGGTACTGGAAACTTCAGGCGAAATGGTACTTTGGAGCACTTCATTTGGCTCTAAACTCGTAGTTTCAACGGTCTTGCATTGTTTAATGTTTATGGACACCACGCCAGTAGGTAGCACACGGGGAT:1 + chr3R 22769372 5' + baggins 11 1 77.93 GGGGGGAAAACGGGGAAAATTGCTGAAAAGTCAGGTGAAGAAAAATGTGAGCGAGCAGCGGGGAAAACAAAGCAAAGCCAAGCGGCAAAAAATGTATTTCATTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr3L 10023921 5' + transib2 17 1 73.29 AGCGCCACTTGACTTGTGACCCGAGCCCCTCGCTGACCTCAGACCCAGTAAACGAAAGCTCCCTTGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chrX 7508203 5' + roo 8718 2 55.48 CTTTCCATGCCCTAGACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:2 + chr2R 7622917 5' + P-element 103 1 15.75 CTACGTTCAATGTTTGCGGCACAAACTGCAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 + chr2R 20706801 5' - I-element 5265 1 76.71 TAGCCCGAAAATGCGTCACTGCCCAAACAGAAAACAAGCGGCAACAGAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAACAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 + chr3L 17934885 5' - HMS-Beagle 7018 2 66.44 AAAACTAAAGCACAGTTTTAAACGCTGGGCACTTAACATTGTGCATTTAGCACTGCAGAGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 14332160 5' + jockey 14 1 78.08 TCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTATTTAAACTATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCA:1 + chrX 13401519 5' + flea 4831 1 75.54 AGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 + chrX 15405962 5' + opus 64 4 69.18 GTTGTCCATAATGGGGTTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 - chr3L 13888969 5' - 412 404 2 77.40 CTACCTTTTCAATATTTTAAATATGGCTTTGGGCTAATAAAGTAATAAACAAATCGCAAATTACGTTTTCCTCTTAACGGTGTTGAAAACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTTACAAAC:1 - chr4 1063950 5' - S-element 3 2 60.27 CTTATTACTTCTTAATTATTCAAAGTCGAAATTTTGATCTGATCACCGCCAATTCGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr3L 18075549 5' + pogo 63 1 61.64 GTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGGCCAAAAATTCCACGAACACTCTTTTGAAAATTTGCTAAATATGTTTTCATTATTTCATTTTCATTATTATTTTTATTTTAAACCCCAAAATCTATCGATATCACGGAAAAATTG:1 - chr3L 23702890 5' + INE-1 503 1 37.67 AAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3R 21679671 5' - roo 9004 2 63.89 AATTAAGGAGGCGGTAGGGTGTCGAGTCCTTACATCCCTGCACCTAGGATGTGGTAGCATACGAGTCGGAGTCGGTACAAGTTCAAGTCCGAGTCCTTCATATGCAGATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATT:1 - chr2R 12785539 5' - I-element 404 1 74.31 CGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGTCAGTAGAC:1 + chr3R 5518327 5' + Transpac 5003 2 75.34 GTAAATTTCCTTTAAGCTGGATTTTATTAAATTGTTTGTGTCGCTTTTAGCATTACGAGAATTTTATTTGCGTGACGATTTGCATGATCTATGAGCCGGTTGTGACGTTACTGCGCCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGT:1 - chr2R 8550205 5' - gypsy4 6594 2 69.86 AAAGGTATTTAAATAATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGANGNTATAAAGTCATGGATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGC:1 + chr2L 1729753 5' + Transpac 4983 2 58.90 CAATTAAGTCTGATTCATTTAGCGGCGCGTGTCATCAAGTTGCGAGATCAGCGGGGGATTGTCTTGTCAATTATTATTTAATTAACTAATTAATTAAGTGGGTTTGTTACTACCCCTATATAACTCAAAGATCACCCTGAAGTCTA:1 + chr2L 12463949 5' - baggins 5364 1 60.27 CCACATCACAATGGTGTATCATCAATTCCAAGTTAACTCACCTGCAATGGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCCGGTAACTTAAAAAT:1 + chrX 10284809 5' - pogo 2057 1 56.20 ATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1 - chr2R 4601665 5' + HMS-Beagle2 41 2 60.27 TAGCCCGATGCAACTGCAGCTGAGATGATTAGCGGTACTGAGACTGCATCTGCATTTGGAGTGCGGAGCAGGGTAGGAATGTGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr3R 17495017 5' - hobo 2900 1 58.90 ACCTCCTACTCCCCCGATCAGCAGAAGCACAACCTGCGTCTGATGTACGGAAATGGACTGAGGCCACAGATCTGGTCGCAGTTCGTCCGTCGCTTCGGTATTCCGCACATTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGG:1 + chr2R 24296794 5' - X-element 126 1 75.34 TGGGCATCACAATTTAATTTCAGTTTTCAACCCATTGCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 5398195 5' + roo 17 2 75.17 ATTATGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2R 8258227 5' + jockey 23 1 71.23 GTGTAATGATATAGTATTATAATAGAAATAAAATATTAGTATAATAGTAATGTAGTTCTAACAAAAAATTCGATTTTAGACTCCGCTCATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATAT:1 - chr2R 6094275 5' + roo 8604 1 58.90 CATAGTAAAATAAATTTCTGAGCATTAATAAAGCACAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2R 16749820 5' - roo 8986 2 78.08 AGAGGGTAAACATGATAAGCCGAATGTCAGGGCGAGGTGTTACCACCCACCACCCCGCTCCAGTCCCCAATAGCATACCACCTTTTGCTTGTTTTCCAAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGG:1 + chr2L 789161 5' + blood 7272 2 65.07 AACCTGTTCTTGGCCACACAGAAATCACTGCGAGCGGGTCTGATCGATCAGCTGTTGGTGGGCACCAGAGGTGACGCAGTGACTGCGGAAAGTAGTCACCGTATCTGACTTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 - chr2L 1729893 5' - Transpac 5217 2 73.29 GCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3L 21636403 5' + 297 6615 2 62.33 AGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr2L 13468244 5' + roo 81 2 73.97 AGAAGAAAAAGGCATTAGTTATCAAAATCCCTTTCCCACACAACGCATAAAGCGTAAATGACGACTATGTACCGTTTGATTATCGAAATTCCCCAGAATAGGAGCGAAATAAAAAACAAAAGAGAAGTGTGCAAACAATTTCTTGA:1 + chr3L 23233637 5' - S2 215 1 76.71 GTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 + chr3L 27415230 5' - transib2 2747 1 71.23 TTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTTATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACCGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 - chrX 140071 5' + blood 7055 2 59.81 CCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 + chr3L 9522049 5' - opus 430 2 71.92 TTTGGGGTAATTTGTACGCATTTCTTTTGTCATTCTGAGCGACTTTGGTTTTTTTTTGGCTGGTGCAGCTGATAAAGAGATGTATCTCGTTTAGTATATTCNCGATCCCTAGTACTGCATTTAATATGACCCTAA:1 - chr3L 14392087 5' - Gypsy12A_LTR 85 1 54.07 TAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTA:1 - chrX 19163344 5' - Burdock 177 2 76.03 ATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGCTTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAAT:1 - chr2R 5531212 5' + 1360 77 1 61.24 GCTATATATTTGCATTTATTATTGAACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 7042761 5' - roo 9046 1 68.49 TACCGTGTGAGAAACAGCAGCGGGAATGGCAAAACAAAAAAAATGGGCAACAAAATAACGAGGAAAAACGAAAAGGAAACAAAAAAAAAAAGGAAAA:1 + chr3L 4605185 5' + Doc2-element 246 2 61.86 GTCAGTCTGTCTGTCCTTTCGTATGATTCAGGAACCACAAGAGTGGAAGTTATAAACAAAATCGAAATCGCTTTACTTGCATTGCAGTGCATTTCTTCAACTTCACTGCACTTCCATCTAGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTAG:1 - chr2L 20935323 5' + INE-1 550 1 52.05 GAAATTGGTTTTTATTGGTCCCATNTTCGGGGTGATTGCAGCGCACCTTGCCGTCTGAACGTCTGAAAACGTTTATGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 4469511 5' - roo 9029 1 48.63 GTAATTAATTTAATTCACAAATTATCATTAACTATAATTTATTGTGATTTAAGCTTATTACTTCTTAATTATTCAAAGTCGAAATTTTGATCTGATCACCGCCAATTCGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3L 18075496 5' + pogo 10 1 75.34 GCTAACTCTGCACCGCTATGGCCACCATCCGACCGCCCAATACACACACATCCATATACAAATACAAATACAAGTGCATATACACACACACACACACA:1 - chrX 12166240 5' + accord 7026 4 64.29 GTAAAAGTGTTTTTTTTTCTGTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGAAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr2L 1692846 5' + 412 71 2 63.70 AAATGTTTTAGGTACTTAAAACTGGTCTGTAATTAAATGCATTCGCTTCATATTTACTATTTATTTAATCCGTAAAGTAATTGATAGTTCATATATCGCAAGCAATGAGCTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCAAGAGCG:1 - chr3R 7949153 5' + 1360 92 1 71.92 CCACTTGGGCAAGCATTTCAGCATTATCCTATGCTTTGGTGTAGGGTATATACACAATTGTATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3R 13676227 5' - P-element 2864 1 71.23 TATTGAACCGGGAAGATTAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTTGATACG:1 - chrX 21667908 5' + gypsy2 71 2 76.47 CAGCTTGGTGGGCCACAGAAANATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTT:1 + chr3L 2668867 5' - Bari1 1623 1 75.34 AACAAAGTGTCCACTGTTCAGGTGTTAAACAATCCAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAG:1 + chr2L 16537556 5' + Transpac 5001 2 73.97 CCCTGGATGCTAAATCTGCTGGATTATCCTCTGACTTAACATGATTCCATTCAGTATTTTTTAATTTCCGAATGTCATCCGTTCTTCTTTTTATACGAACTGATAGAAAAAAAAAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTA:1 - chr3R 19446472 5' - Circe 405 1 65.07 ATTTACACCGTGCACAGAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCA:1 + chr2L 21325069 5' - invader4 288 2 80.82 TACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTG:1 - chrX 3797450 5' + gypsy 7013 2 67.81 GCTAAATACATTATGCATTTCTTAACGTGTAGCTGTGTTTATTTTTGTTCCGCTTGCTCTTGTGTTTTGTCAATTTTCTGGGTTTTGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2R 19016092 5' + roo 34 2 63.01 AGCCAGGACTTCTCCATTTACAGGAGAAGGGGTGGATTTTGGAAATCTAGATAGGTGTTTAAGTCTGTATTTTTATAATAAGAGGAGGCAGTTGAAGAATGACAATCAACTTAATTAAATATAAAACAATTTATTGACTTTTAT:1 - chrX 19508979 5' + transib4 2289 1 50.69 TTTAAACTTTGATCCATAGATCTTGTCAATTAGAAACCTCAAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chrX 12263785 5' + roo 8743 2 72.60 GTGGGCGTTACAGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTGGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTT:2 - chrX 22689478 5' + mariner2 32 1 74.66 CTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 + chrX 16490461 5' + F-element 74 1 59.59 GTTGATTCATGTTACTTTTTATCATCGAAGCTTTTAAAGTGTTTCTTAAGTCTAGTAAGTACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCGTTTTGTCTGA:1 + chr2R 7769735 5' + Transpac 57 2 55.86 CGACTAAGCCTTCCAAGGTCGGTCGTCTAGTGAAAAAAGTTCACAAATTAGCGCTCATCATCAATCAATGGTGGGCTAGCAGCTCCAGCCGAGGTCATTCTTTCAATGCATTACAGATTTTACTAGAAATATTTTAAATGTTTTAA:1 + chr2L 1524988 5' - gypsy3 495 1 65.07 CAATCGATAGTATTGTAATCACTTCCAATTTGTAACACTTTTATTTATTTCTAATTAGATTTTTCGTTATGGTGGCTTACATGCAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATT:1 - chrX 15746592 5' + F-element 149 1 59.59 TTAGCAGTTATCAAGAATCTAATCAAAATGTTATTCTATGTTTAATAAATGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCG:1 + chr3L 22361630 5' - opus 7066 4 64.75 GCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:2 + chr2L 19698076 5' - roo 9012 2 58.22 AGTTTATTTTATAAATGTTCGAAACTGGAAAAGCTCAGACACGATTTCAAAAACCATTCGTCACTATTTTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:2 - chrX 20233901 5' - pogo 2051 1 52.74 GCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCGATTTTATTTGG:1 - chr2R 10695888 5' - roo 9030 1 53.57 ATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTC:1 + chr3R 11757994 5' - invader4 235 2 77.40 CATTTAAAATTCCATATTTCGCAGCATGTCATTAAACCTTATGGACTTTTTTGTTAGAGTTATCTAAGCCTTAGTACATTTTTTAAAACATCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 - chr3L 14233171 5' + copia 32 2 63.70 GGAATTGTTGCTCAAAAAAGAATACTAATTTTACTCACAATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTTTATTAAAACGCAGCAATAACAGCTTATAGATTGTCTTTTATTAAATTCAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 - chrX 14771860 5' + jockey 4672 1 75.34 GAATACGTATTTCCATTGGGTGTCATCTGTCCACGAATTTTGTAATTAATAGTTTACGCATGAATAACTTGATCTATTCAATCCTAACTGTACCAACAAAAAGGAGTAGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAG:1 - chr2L 14937523 5' - roo 8858 2 73.29 ACGGGGGAACAATCGAAGAAGCCAGAAAGCGACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2R 23595957 5' + blood 44 2 54.11 GGAATATTGTAGCATAATTTTGGGGGCAAGCTAAGCCGACAGAAATAACACTTGAGCAAATATTAGATCAGCCTTAGCGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 - chr3R 12787402 5' + BS 5038 1 54.11 GTTGTACTATATCCTACTATAACATACTATATTTAATGTTTTTCGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATCGCAAACGGACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGT:1 - chrX 19690661 5' + gypsy 19 2 60.00 CGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTAGGCNTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATT:1 - chr3L 10814613 5' + micropia 135 4 52.05 TTACACCGTGCACAGAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAG:1 + chr2L 21325071 5' - invader4 3046 2 80.00 ATTGAAAGCCGAAATTAAAAGGATATTAAGAGTATATTTAAAGGGGTTATAAACAATAATTGCCCCGCCAACATACGGGAGTACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGA:1 - chr2L 14535302 5' - Rt1a 4726 1 60.27 CCGACACATCGAGATCCTCACGAGCCGAAGGATGATCGCCACCAAATTGCCCCTGTGCCCCGATCCACTCATTTTCAGCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTA:1 - chr3R 9416364 5' + 297 406 1 54.11 GGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATA:1 - chr3R 14401929 5' - Juan 4123 1 78.08 ATAAATAAGAACCATATTAAATAATAAGAACACCACACTTACCCTCATTTCGAAGAATGGCCCCCGAATTTTAGGCTCCACTGTAACTCGTAAAGTAAAGGGGTATACTAGATTCCTTAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGA:1 + chr2R 3526654 5' + INE-1 29 1 66.44 GATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACC:1 - chrX 21994008 5' + McClintock 5986 2 58.21 GACAACGCAATATTTTTTTGCCGGCTTAACTCTGGCATTCGCTGTTGTTTCTGATGGCAGCCCGCTTTTGGGACCCCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACGTATGGCAGCACTT:1 + chr2L 8895210 5' + 412 7100 2 54.11 GATTTAAATTAGACCAGAAACTTCAATAGCAGATGCCTAGTCTTTAAAACTCATATATCATAACAGTCAGGTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3R 4198000 5' - 1360 3342 1 54.86 CATATCCATTGAAAATTATTATTCCGCGTNTGGAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTNTGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chrX 7032690 5' + roo 8749 2 76.71 CTTTGAACGCGCTGGTGTCTTGGAATGAAGTACAATTGCACTACTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTCAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGAC:1 - chr2L 6346680 5' - flea 4942 1 68.49 CTTTAATTGCCCAAAAAGCAACTATATGGCCTTATTAAGCTGTTTGGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr3R 25962109 5' + I-element 22 1 69.18 AAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGA:1 + chr2L 13697624 5' + F-element 102 1 71.92 CCCGAGTTCAGCGGAGTTAAGTTGGGTTCGGCAGCAACAGTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3R 19725465 5' + hobo 31 1 60.00 GGAGCGCCCAGTTGAAGCACATTCGCTGCGCAGCCCTCGAGTCGTGAAGATCGGAAAATCAATAGAAATCCGGAGTGAACAAGTGTCGGAAAGGCCAAAGACAATACCTATATATTAAATTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGC:1 + chr3R 21388869 5' - INE-1 134 1 77.40 TACTTCCCAAGCAAACCGCTAATTAAAATCATCGACTCCTCATCCGAAAGTTGAGATCTCTGAATCTGGGGGTTCTGACCTCTTCCCCCAACTGATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chr3R 17996665 5' + copia 25 2 65.97 ATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr4 868715 5' - roo 325 2 75.34 AACCAAAGCTAATAGCCATGAGCAACTTGGCTTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr3R 24443971 5' - hobo 2928 1 76.09 CGCACCTTTCTCCGCGTTCTCTGAGAGACTTCCCTGGCGCAGAGAGCAGAGAGCGCTTTCTCTCAAAATAGCCCCATAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3L 739249 5' - P-element 2842 1 36.30 TCGCTGTTCGCTGGTCCGCATTTTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chrX 20456987 5' - opus 461 2 58.57 GAGATTCCGGAAAGTTGTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 + chr2L 7810682 5' + P-element 104 1 14.38 ACAATGCAAAATTTATTAGGTTTGGCGAGGGAAAACCGAAGGATAGCAAAGTGGAAACTCAGAGAGAGAAAGAGAGATGCCCTAGAATTGGAAAAGAAATCCAGCTATGCTACTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 + chr2L 5789566 5' + FB 9 1 77.24 CAGGTTTCGGTTTTTATACAAATTTTGTTTTCAAGCTGGCATTGGACATTAATGAAAGATTTCGTTACTGCCCGGAATATTGCAATGAAATTAGGTAAAATGTGTCAGTCAGGCGTCATTCTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCT:1 - chr3L 5727058 5' + invader2 4936 2 77.40 AGGGAGAAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 10504387 5' - roo 9016 2 56.16 AAAATCGAATCTTTTCTACATGAAATGTAACAAATATATGCGAAACTTGGCTAAAATAAAAAGTCTTGAAACTCAGATGGATTTGTTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr2R 15698190 5' - opus 7473 2 64.34 AAATTTTTCAAATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTCATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCC:1 + chr3R 21938128 5' + roo 27 2 63.45 GAGTAACTGTCACCCTCAGAACGAACAGATTCCATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chr2R 4788773 5' - 297 369 2 49.19 GGAACGAGTTTATTTGCAGTCGAAATATGTCCCCAGACGGCAACAATAGCAATTAGTTCATTGTCAATAGTTTGCTCGTTGAAAATTTCAGGACTAGAAAAGGCAAGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr3R 12941918 5' - hobo 2925 1 75.86 GTACCGTTCCGTTTCAGTCCCCACGGAGCAGAGCTGCAGAATGCAGCGTTGACAAGTCATCATTCCACTCCGTCCAAACAGCACCCACTTAGAGTGTAAGTCATGCGGATTGGGTTGGCACG:1 - chrX 6411507 5' - Q-element 695 1 55.74 TACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chr3R 6962433 5' + jockey 76 1 65.07 CTGGCAGAGCAAGCAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chrX 7993158 5' - opus 7443 2 59.59 ATAGCGATGGTCGAGTGTACTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCC:1 + chr3R 12789525 5' + G2 2766 1 58.10 AGGTGATATTTCTAATTTAATAGAACCAGGTATGCATTTGTACTTCTTCATAACTGAGCTCGGTCGTAAAGAGGTCCGTAAAGTATCAAGGAGGAGAGCGATTTTCAAATACCGACAAGTGTTTTAGATTTTATAGAGGATTCTGA:1 - chr2L 96671 5' + NOF 4079 2 45.89 GCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr2R 14332089 5' + jockey 86 1 71.23 GAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chr3L 20765129 5' + 297 48 2 53.42 TCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 - chr2R 21199711 5' + jockey 4789 1 65.75 TCATTTTAATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGCACAACTCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 20260882 5' - roo 403 1 56.34 GTTGAACGTAGCATATGGCATCTGTAATAAGTGTTTAATACTTCTGTATATATATATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAG:1 - chr3L 2668946 5' + Bari1 62 1 65.75 ATTCGACATCCAATCATTTGCATATGTATACACACACGCACTCACTCGCACACACACTCACACAGCCTCCAATGCACTGTGTCGCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCG:1 + chr3R 17717718 5' + Dm88 107 2 52.08 ATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:2 + chr3L 19349927 5' - 1360 3343 1 56.30 ATGCGTGTGTAGCTTAAAACTTAAATCAACTTTGATTTTAAAAGTTTCGAGCTCCCGAGCGGTAAGTCAAAGAGACAGTCTTCCATATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCAT:1 - chr2L 10187824 5' - roo 10 2 58.22 CCGGGCGCTATAAAAACGTTAATAACATTTTAGTGGAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2R 17842834 5' - roo 329 2 75.34 GGTGAGCAGATTAAATTGTGCGGCTTATTTTGCAGTGATTTAGCGGGAAATAGCCATTACTAGCGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTAC:1 + chrX 15746252 5' + jockey2 3232 1 61.64 AAGCCATTTGGCCGGGCAAATCACAGCTGCTGCTCCTTGGCAAATATTTAAATTCATTTCGTACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAA:1 + chr2L 1846291 5' + roo 332 2 57.53 CCAGGGAAAATCGCCAAATAATTTATTGGTTTCGGCCCGGCCGAGACATTTAAAAACCAATTTAAAAAAAAGGCAAAGAAGGCGCCGTCATGACTAAAGGATTCCTGTTCTCTTTTTTATATTGCGTCTATATCTTC:1 - chr2R 16985119 5' + Cr1a 4364 1 73.72 TATATTAAAATAACGAGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2L 13468323 5' - roo 9009 2 65.75 CCTCCGGAGAACAAGCAGCAGTTGAAGAAGGCCGTGGAAGAGGAATATCGAACCTGGACGTCGATGACCAATTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGGGGCCCGGGGGCCATGGT:1 + chr2R 22891658 5' - Ivk 189 1 49.66 GTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCGCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chr3L 22435234 5' - opus 7470 2 60.84 GAGCGCATTAAAGCAGTTCCTCTTTTTTTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGAC:1 - chr3R 31086571 5' - jockey 4905 1 80.14 CATGGCAAGCTGGATAGGTAACGCCCTAGGAAAGATTATGTTGAAATAAATGGATTATTTAAATAAGTCAATTAGGATGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTA:1 - chr2L 2406210 5' - roo 158 2 50.36 ACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr3L 13888915 5' + 412 7133 2 71.23 AGATTACAAAATATATAGTTATATATGTATATTATTTCGCTTACCATAGGCTATCCTTGTTGGACTGAATGCCGTTGGATGTGTTGCTGCCGTTGGATATACTCCTTGGTACATAAGGACCAGAGATATCGAACGTGATCTGAAGG:1 + chr3R 9372946 5' + jockey2 3021 1 69.18 GAAAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGAGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - 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roo 9027 1 56.85 CAATGGTAAAATCAAATAAACATTAGCAGCATAAGAGTATGCAAAAGTTAAGATAACCATCGTCTAGCCAAAAGCTGTTTTCATATTATTTCCAAATTTCTATCAATATGCCTTAAAAATAAGGAACTCGACTATATCATTTTCTC:2 + chr2R 25107842 5' + INE-1 575 1 50.68 TAAAGCGTGAAAAAATAGCCACAATTGCACAAATAATGAAATGCGAAAGCAAAATTTTAGACTTTTTCTGGGATATCCTTCAGCCTAGTATACCCTGTTACTCTTCGAAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTG:1 + chr2L 7112746 5' - HMS-Beagle 6810 2 26.03 ATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACT:1 + chr3L 22038215 5' + diver 5956 2 63.70 ATTATGGCATATATATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:2 + chrX 6186281 5' - Transpac 260 2 52.05 TGCGCCTTTGAAAAATGTGCTGACACTTTGAGCCGAAGCAGAAGCTCTACACTGCAACACACGTTTGTATGACAACTAAGACTATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGATGCATCGATAGTT:1 - chr2L 11476395 5' + pogo 10 1 73.39 GTGATGGCTTTAATGCCTATTGGAAGGAGAATATCCATCAGTTGGTTCCGAACGATAAGTCTATTGCCAAGGAGGCCAAAGACTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - 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17.6 491 2 68.49 GTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr2R 2427625 5' + Doc 47 1 54.41 GTTCCAGGTGTGCGATGTACATGGATGACCCGACATTGAGCTAATATGTGACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chrX 140135 5' + blood 19 2 71.23 GCACGGCCGACCAGCAAACGAAGTTGCTGCCAGAGCGAGAGGGATGGAGCGAGCGAGCGAGAGTTGAGCGTCGAACTCTCTCGCTCTCTCTCGTTTGGGGGCACGTTATAAGCATAGGTGAGCAAGAACGCGATCGTTTG:1 + chr2R 10535122 5' - Doc3-element 373 1 77.86 AGATGATATGAGAATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAA:1 - chr2L 16884713 5' + Bari1 52 1 45.89 ATATCGAGCATTTAATCGATACTTTCGTGTGTTTCTCAAGCCCTGGTCTAGCAAAATGAACCGAGATCAACAATTTACTCACAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr2L 7810758 5' - P-element 2847 1 55.48 CGAGAGGAAGAAAAACTCACAAAAAAATGCATTTAATACTTAATTAGTTTTTATATTCTTGTATTTTAACGAGGAGGAGGCCGATCGGCGGCGATATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 30788263 5' - 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opus 7475 2 65.07 TGTGAAATAGATAAAATTACGTATCAACCTCATTAATTTCCCCACAATTGCTTTCCATTTAAAGTTTCCCTCTGGAAATCAACATGGTGCTTACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAA:1 + chr2R 12492742 5' - Doc 43 1 68.70 ACCCGGCCAAGAGTAAGGGAAAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3R 24444126 5' + hobo 52 1 54.55 ACACCATAAAACACTGGTGCTGCCTACTGTATATACCAGAATCCGCAACTGCAATTATAAACCGAATATGATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGCTTTCCTTGCAGTTGTGTGCAG:1 + chrX 139982 5' - blood 338 2 54.48 CATTTGCATTTCGGGCTTTGGAAACTCTAGGAGAGCTCAGGAAAATGAGGAAATTCCTCATCCAATTTCAAATAGACAGAGCTCTTCTACAACCTCCTTTCGAACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 30537758 5' - roo 391 2 60.27 AATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTC:1 - chr3R 8867057 5' + Max-element 8293 2 75.73 GATTCGTATCCATCGAAAATGAGATTGAAGCGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 - 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chrX 15252405 5' - opus 7467 2 60.96 TAAATGATTTTCTTTGGTTTTGGCTCAACNTTGACTTGGGAAATATGCCCAAAAATATGCAGGGAAAGCTCTATGAATCGATTGAGCGATACTCGGCTTATNGATGTGAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chrX 4240169 5' + jockey 4683 1 70.34 AAATTCGGTTTAAGTAAATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTCGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3L 22041087 5' + roo 83 2 73.97 TTCCTGATTCAAACGAAATGAATCCTTGATTGTTTATGCTAGGGTTTATTTCGATTGGCCATGCTTTAGTTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATAATGACAGTACAACTCCAATCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chr2R 2009346 5' + I-element 14 1 79.29 ATGGGTGAAATACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAATTTTATGCAAC:2 + chr3L 10814513 5' - micropia 385 2 74.66 TGGACATATGCTGTTCTAGTTTCAGGTACTTGAGTTCAGTTGCTTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGGGTTTTTCATGGAAAACGCATCCTTCGCCTTCTATAATGTCCCTCGTTGTTTGCGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 16520769 5' - accord 7030 2 68.28 CTCCGAGCGAAGGCGTTTGGGGACATTTGTCTAACGATGACAGACCGGAAAAACATATGGACTGGTCCCAGACTTTATCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCAAC:1 - 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chr2R 10695872 5' - roo 352 2 53.62 TGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAATTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 22112655 5' + 412 7101 2 65.49 CCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 + chr2L 8553292 5' + pogo 45 1 54.79 ATTTAAAGTTGTTTGCGCTGCCGCCGTCGCTGCATTATGGCCAAAAGGGGCGGNANGGGGGCGTGTGATGTGGCCACTGCCTCTGTTAAATTAAGATTAATTATA:1 - chr3R 5134408 5' + G4 3788 1 79.05 CCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCGCCAGGC:1 + chr2R 19726867 5' + 1360 67 1 72.58 CATCTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 18737939 5' + roo 8712 2 52.74 TGTGGGCGTTACAGTTTTGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTGGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGT:1 - 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INE-1 545 1 76.71 ATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2L 18738029 5' - roo 8987 2 76.71 GCAGTAAGCCTTGTCTTTGTTTCCCGCCCCTGTAAATATCCGTTGAACGTAGCATATGGCATCTGTAATAAGTGTTTAATACTTCTGTATATATATATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTG:1 - chr3L 2668987 5' + Bari1 21 1 71.92 GAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chr3R 9550964 5' - P-element 2798 1 24.14 CGGCGGAGGAGACTGGGCTAATCACTTTTTGATTTATTCGCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr3R 5170934 5' + F-element 45 1 62.33 GGGAGAAGTGAGCGGCCAACGGGGAACTGGTTACACAGAGTTGAAGGCTGGCTGGATACACGAATAATTTTCATAATTCTGCTACAACTTATAACGATCCTCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 - chr3R 14953700 5' - mdg1 413 2 55.48 TTTTGATTTATTCGCCATGGCCGCGGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 + chr3R 5170960 5' + F-element 66 1 58.87 GTGTGTTGTGTGTCGGCACGTGTTTGTTTTGCATGCATAATGCGCTTTGAACTCGTCGCTGCAGCAGGAAAATTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - 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chrX 15308830 5' + R1A1-element 5153 1 58.90 GCTAACTAAATCACGTAATGAGTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTA:2 - chr3R 19246783 5' - jockey 4939 1 54.79 AATTGTATTGTTTATTCTTAGTTTTACATTTACATTACATTACGTATACGTCGTGTAGACTACATGTCGTATACGCAAAAACGTTGCATACATTCGGGCATATCGGCAACGATTACGATGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chr3L 2485843 5' - jockey 4988 1 73.97 GTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACTCCCTACTTGCGGCAACACAA:1 - chrX 12365367 5' - hobo 2859 1 75.71 AACCAGTATTTGGCTATAATTATTATGATTACAAACAGCGAAATATATTCCCCCAGTGTCTCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGTATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACCAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 5495137 5' + roo 8675 2 77.93 AAGCCATTTTCGGATTCTACTAGAATTTCCAGTTTCCCTCCAACTATGAATAAAAACCAACCGAAAACAAGCATTCAACGCAATCAACGGATCGAAAAAAAATTATCTTAACATCTCTCTCCCGGTCTGGAGTTTTTAATTTTGGC:1 + chr2L 20691994 5' - Transib-N1_DM 30 1 66.44 GTTTCGATGGAGAAATGAAGGAGCAACAATGTTTCTCATACTCACATACATACATACATACATACAACCATTTCCAAGGATATGATGTGTGCATATGTATGTGAGTACGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chrX 3235463 5' + 412 7128 2 74.66 GTCGATATTGTCGCAACGCTAGCGAAATACTTTCCACAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTT:1 + chr3R 4719650 5' - Ivk 5221 1 67.54 AGAGTGTAATTAAATATTTTACAGGCAATCTACATTCTTGAGATAAACTCGGCTTCAAATATATACATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr3R 8065331 5' - 297 6928 2 60.27 CTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 + chr3L 21636428 5' + 297 6640 2 60.96 GTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGATCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 - chrX 15406043 5' - opus 7438 2 63.31 GGGCAGAAAGATACTTTCGAAAATGCATAATGCGGCATAGTGCCCATTGATAATTCGATGAAGTTTGTTAGTAAAAACAATTTTTATTCTTGATTTGTGCAAGCTGTATTTCACAAAAATTAATTGTTTTTTATTGTTTGTTTTAC:1 - chr3L 6280480 5' + Penelope 108 1 53.42 GAAAGGCATAATTATAAATGTATCAACTAATGCATATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 20940686 5' + hobo 33 1 71.23 TGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACT:1 + chrX 20456867 5' + opus 7066 4 68.49 ACATAAGCGCAAGGAACAAGGATTCTCGAAAGGGGTTGTGTGTGGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCTTATAAGTTAATAATTACAGTTATTGATTTGATTTTG:1 + chr3L 8249319 5' - HMS-Beagle 235 2 76.71 AACAGCGCGACGAGTAAATTGAAATGTCCCGTTCACTGGACGTGATCACTCTCACGCTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCT:1 + chr2L 21909054 5' + transib2 60 1 57.53 TAATTGCTAAGTTCACGAAATCAAACGAATATTGGTTTAAATCGGAAATGGTTATTGTTTTTATTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTAC:1 - chr3L 8961080 5' + Doc 427 1 51.16 TCTATTTTCATCGCCCGAAATGATTCGCTGTTCGCTGGTCCGCATTTTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chrX 20457011 5' - opus 479 2 71.23 GGTAAGAAGGCAGAAATGAGACTAAAAGAGAGATATGAAATGGTATCAGGTGGCACAGGAAACTGTCCAGGCATCCTTCTGGCTGATTGGCAACTGAAATGGAGTGGGCGGAACGATTCATTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCGG:1 - chr3L 20934268 5' - Max-element 8505 2 64.38 TATCGACTGCCAAATGGCCAACACTTGTCCACTCATCCGCTCTTGGCCACATGGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chrX 13458306 5' + hobo 19 1 57.14 GCGCGGAATGTTAAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 12125242 5' - roo 9045 1 67.12 GGCAAGCAGTGGGTGGGGTGGGGTGAGGTGGGGTCGCCGAGCAGCTGCAACTCGAGCGATGCGATGCTGCCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCT:1 - chr2R 16160874 5' - mdg3 5470 2 62.33 GTATTCCATTTTGATAACATTCTTAACGTTCTTGTGTTCCGAGTTTTATTTTCCACACGATAAAATAATTGATGTCGATAGATATTGATGAACAAAATGACTAGAATGGCTATATCCAGTCGGCTATTGATCCTGATCAACCATAT:1 + chr3L 11887648 5' - INE-1 84 1 79.45 AATGCTGGGTATTATTCTGAAGCAGCAATTGACGCCAAAAAGTGTGCAACACTTTTGTGCTGCTGCTAAAAACCACTTTCGAGCAAATCCCAGGAATGCAACCTCCTTTCCCCGATGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTG:1 + chr2L 774124 5' - G6 1842 1 78.47 TGTGGAGGTCGCGCTAAATTGGAACAGTGCATTGGCATTCGGTGGGAACTGCAAGAAGAATATTTTTGGTATGTTTTCCTTGGTAAGTTGGTTTTGTATAGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTACCGTCGGAAGCCGAAG:1 - chrX 16607959 5' + P-element 20 1 68.75 GCATTCAAACTAAAAATCGGGATTCGTGACAATAATATTCATTCGTTAATATTTCAAAGCTCTGTTTAAGCTTATTGAAAGTCCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chrX 21639225 5' - 412 7509 2 57.93 TACATAGGCACTCATTCTACCTTGATTGCACATGGTCTTATGTATTCCGAAGTGTTTGCAGATGGATAAGACTGCCGATGTGGATGGATATTGTGCCCGGTTTCAAGCCAAAGATGAGCACTGTCATCGCTCTATATCTCTTGATA:1 - chr2R 12981265 5' - invader6 237 2 51.37 CGTACGACGTAAGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3L 16200698 5' - roo 9046 1 67.81 GATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 + chr3R 12941788 5' + hobo 75 1 66.44 AATTTAATTACTTTTCCTAGTGAAACTTAATCATATTACTCATATCCAAAATTGTATATCTATTTATTTTCCCAGGAAGAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3L 20268532 5' - 412 7506 2 58.22 CGGCAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATC:1 + chr3R 16881906 5' + 3S18 5836 2 66.44 TTACGATCAGCATCCAGTTGGCTGAGCAGCCAGAGTTGGTGCAGCGGTTGTAACCTCAACGAAGGCAACACCTTGTGTATGATTGCTGTACTGGTGGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTTAGAGAGACGC:1 - chr2L 14532190 5' - Doc3-element 438 1 54.48 ATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGT:1 + chr3L 22038241 5' + diver 5978 2 77.40 ATATATACGTCCTCGGCATACAACNCTTGGATGTGTCGCATATCCTTTGAAAATTATTATTCCGCGTATGGAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 7032652 5' + roo 47 2 51.37 ATAAATATAAATATCCAAATATACAATAAGATTAACAAATACTACGTAAGCACTCCAG:1 - chrX 11244795 5' + Stalker 6972 4 79.31 ACTAATAAAATTTTATAATTTATGTACAATTACATTATTCTTTTACACGTAATATAGCTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 - chr3L 3154188 5' - flea 4955 2 63.01 GGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr2L 20550945 5' + 412 51 2 52.05 GTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 - chr2L 13316940 5' + jockey 4745 1 67.12 AGGTTATAACATGAGATAACAACAAGGATGCTGATTTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 25203718 5' - 1360 3365 1 67.59 AATGTAGATGAAGAGTTTCGGGGGTGCTTCTAAAAATTATGGAACTGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr3L 20573718 5' - pogo 2086 1 75.34 CAAAGTGTAAGCGTTATCGTTGGCTTGTTTAATCTCAACTTTTTTGCTTCTATAGTTCCCGATTTCTCGGGCTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chr2L 21753996 5' - hopper 1366 1 52.05 TTGTGCTCGGGTTTTTCTTTGGCCAGGCTGGGATTTCGCTGTTACGGCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 + chr3L 20934125 5' + Max-element 8288 2 55.94 ACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATG:1 - chr2R 16185115 5' + 17.6 63 1 68.97 GGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTT:1 - chr3R 23021005 5' + INE-1 580 1 41.78 GGCGGCTCAATTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTACATTTTATAA:1 + chr3L 15099517 5' - G4 3805 1 73.29 CATTTATCACAATCATCGATATATTATCAGCATAATTCAATTGTAATTTATAGCATAACTAAATCATTTAATATTTAATCGAAATAATTTTGTGGTAAGAAATGATTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCT:1 - chr2R 13188533 5' + Circe 7067 1 71.92 GTTCATTCAATATTCAACATATTTTTAAGTGCTTGGGCGCGGAAAAATTCCGTTATCCTAAAAGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr2R 20230924 5' + jockey 4721 1 55.32 CAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 20044551 5' - roo 9004 2 65.75 AGTGCACCTGATTTTGTCACACATTTGAGCTAAGGCAGATCCCAAACCTTCTCGAATAGCAAAGATAAGAAAACAAATGTTTGAATATCAAGTGACACAGAAAACAGAAGCGACATATAGTCATGTACACCCTTACATAC:1 + chrX 4385532 5' + Transpac 1 2 49.29 CAATGTGTTGCGCATTTCGTATGCAGGGCGGCAACGGGGCGTGTGCAGGGGTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCA:1 - chrX 4893336 5' - F-element 4381 1 65.07 TCGCAAAATGTTTCCTAAGTGCGCCAAAGGCACTAGAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTCCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 - chr2R 16073070 5' - opus 490 2 78.77 CATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3R 15102326 5' + roo 73 2 67.81 GAAAGGGAAAGTTTACAAATCGAATAAAGTAGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr3L 11529580 5' - opus 7482 2 63.70 TAAAGGTATGCATGTGGCCATATTGTTTGCATATAGACAGAGTCTATTCGCTGAATTAAGCCACCGCTTTTCCGTTTTCCACCCCGCTTCACCATTAAATTTTTATTTTCATTTTTATTCTACTTTTTTTTTTATTATTTTTATTC:1 + chrX 9464296 5' - Osvaldo 1522 1 58.90 GCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr2L 19698163 5' + roo 77 2 69.86 GATTTAAGTTACCAGGAGAGANTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3R 23511667 5' + 297 6624 2 56.16 CTGCAGAAAAACCAAAAATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2R 10695919 5' - roo 9057 1 72.92 CCATTTAATTATCCATAGCTAGTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCCAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chrX 20456829 5' + opus 7028 4 66.44 CTTTATAATCGAAACCACCGATGCAAATTTTTTTCCATTTATTTCCCCGGTATTCCATGGAAACCATATAATATATATAGTGTTTCGATTCGAATATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr3R 4361713 5' + copia 25 2 69.18 CAGGTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3R 8381677 5' + Tirant 13 2 73.23 GTCTCTTAGGCAAACTCTATAGGCTTTCGAAAGACATAGACGCAGCGCAAGTTTCTTTCCAAATGTCGCCACTCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCTCAAAACTGCAACGCTGACTTGCTATGTTTTCACATTTTTATTAGTCTT:1 - chrX 23073861 5' + INE-1 284 1 77.40 GGGGTACCAGTTCCGGGGTGACCAGCACCAACAATTTTTGGTTCGAAAAATGCAGCGAATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr3L 15273207 5' + pogo 60 1 63.01 AGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGTC:1 - chr3L 27391418 5' - 1360 3361 1 61.64 AATTTAAAACACATTAAAACCCACCGTCTTTAACTTATATTAATTTGTATATGCATTCCTTCTGCATGCTTATGAATATGTATATGGAACTATATGTATATACGATAAGTATTGCACCTTAGTCCGGCCCGGAGATGTGGAAATTT:1 + chr3R 1252161 5' - baggins 195 1 76.71 CAATGCTTTCCTTCAGATTTTAATCGCTCACGTGAGAGCGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGAGTTAAGTTCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGGGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTGCAGCAGA:1 + chr3R 28045749 5' - Tirant 8447 2 54.11 CATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAACGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATT:1 - chr3L 21202099 5' + G2 2627 1 50.77 GCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3L 19349909 5' - 1360 3351 1 56.55 AAATAAAAAGTCTTGGAACTCAGATGGATTTGTTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAG:1 - chr2R 15698137 5' - opus 7417 2 77.40 TTCGCGGATGCGCTTGCATTGCTGATTGAGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCA:1 - chr3R 5977799 5' - copia 164 2 79.45 AAAGCTCATTGCCTAAACATTTGGTGACCCCGACGTGATATGTAACATTTCTTTATCGTGACCTCAAAAACAGTTTAATTAATTTCGGGCAAGGGGCTTCCAAGGGCTTCCTTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGGGTGCAGAAG:1 - chr3L 24050703 5' - Gypsy6A_LTR 311 1 60.27 GACCTCATCCCACTGCACCCGCTTACATTTGATTTTGATTTTTGTGCCCCGCGTAAGTAGATAAATGTACTCCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 17871798 5' - roo 391 2 69.18 AATTTTTCAAATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 21938129 5' + roo 8693 2 63.70 GCTCGTGGCGGTGAAAGGTCGAGGTGTCATCGTCCTTTATCCTTATCCCGTTTCCCGATTCGAGTGTCAACAATAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACACGAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAAACGAAAAATGCA:1 + chr2R 17334927 5' - Cr1a 192 1 54.79 ACTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCACTTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGCGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTACTTCTTATCTCTT:1 - chr2L 16554685 5' - blood 304 2 63.70 TCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:1 - chr2L 5341575 5' + Burdock 85 2 74.66 TTATGGCCAGCGATTGCAGAGCAATAAAGATTATGTACTGAACTGATAATTAGGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3R 6399452 5' + pogo 56 1 62.50 CCTTCGAGAAATTCTGTTTTTTCTTCTGTGTTTCTTACCACTGATGGGGGAAAACAACAGAATTTCTCGAAGGACCAAAATGTTCACACTATAAACAACAGAATCACTCGAATAACCTTGCTCTTTTTACTTT:1 - chrY 36535 5' - rooA 462 1 62.41 AGAGGGGATAAACATGACACATTGCGTTGCAGTACCATTTACAACCTATATTTTTAAAAGTTCGGATTGAAGTGTTCAGATAGTGTGCTGAATATTGCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chrX 20233746 5' + pogo 12 1 75.91 TAAGAGTGTTTACATGTTTAGATGGATTATGTTGGTTTTTTTTCCAGAAATTGAAGTAGATGTTGAAGATATTCAGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCG:1 + chrX 21083865 5' + HB 12 1 73.29 CAGAAGTATGCTAAGCATTTCAGAAATTGAAATTTATAAAACGGCTAGGAGCCGCCAGGGGGAGCCAGCCAAATGTCATGCTAAGCGCGATTTTCTCCAGTCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTG:2 - 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roo 393 1 70.55 ATCATATCGATTTTGATATTCGATTACAACCTACCTTGCAATTATCGAGCTAATTTGTGGTGTGGGATTGTATTGGGAATTTGTAAACAACTTTTATCTCAAAACCATTCCAAAATGCATGCATAAACCAAAGACACTAGAATAAC:1 - chr2L 5852911 5' - Tc3 314 2 52.74 AAATTGAATAGTTTTATAAAGCTACAAGTTCTGTGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 20044661 5' + roo 8703 2 54.79 GCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 - chr3L 21913445 5' + 297 54 2 56.85 GTTCTTTAGCCCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 21636393 5' + 297 6605 2 69.86 TTAATTACTTTTTTATTTCTGCAGCATTGTTTAGCTGATGAAATCTTCAGTGTTTGATCAAAGTTTGGCCGTAAGTGTACAAGTCAAAGTAAAAGTCAACAAGCTAGCCAAATGCATTCCT:1 - chr2L 2550714 5' - Tabor 7148 2 62.81 GATGAATTTCAAAAGATAAGCAAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTATA:1 - 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chr2R 2427620 5' + Doc 16 1 63.00 ATCGAAGCCTTACTGTACTCATCCCTTTGTTTGTTTTGCATGCAAACGTCTCAAACTANAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr3L 15273306 5' - pogo 2034 1 65.75 TGCCATTATAAATTATTTACTTTAAATGTCCTCAAGCTGAGACGACCATCCATTCTATTCGGCTTCATAGGAGTGAGTATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2L 3408857 5' + opus 7042 4 56.85 TATTTAAAAAAATGTATAATCAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr2L 20508410 5' + pogo 47 1 56.85 GATGAAGGATTAAGATGCGCTGTCGCGGGCACGGCGAGATGCTAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 6514346 5' + roo 43 2 53.42 ATAAATGTTAATTTCGTTAAATGAAAATTCGGCAAAATAAGCTTCTGATTGGATTGGTTTCTCCATTTCAGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATG:1 + chr3L 9659411 5' + mdg1 51 2 54.79 GCCAGGGGGAGCCAGCCAAATGGCATGCTAAGCGCGATTTTCTCCAGTCAATGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTGTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1 - 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flea 4951 1 56.85 GTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3R 8381725 5' + Tirant 32 2 58.16 AAGTCGCCGGCCAGCTCACGACCGTCTGCCCATCAAAGAGTTATTTATACTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGAAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 + chr3R 13453314 5' - 412 421 2 65.75 AGCCACCTGAATTTTTACTATCGTCGAAAGTTTGCCGAGATCAGGGCGTTCTCTTATTAAAAGTCGTCACATACATTTTTGTATATATTTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATA:1 - chr2L 22044595 5' + McClintock 23 2 69.18 GCTGTTAAGCTATGCAAAATGAAATTTAATTTCAGAAATCTCATTTCTCAAAAGCAAAATATAAAACTACTTGCTTACTCCGCATCGTATACAATTTTGGTTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCA:1 - chr3R 28042184 5' - Tirant 342 2 33.56 GAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3L 5398141 5' + roo 8736 2 67.81 GCAAAGCAATATCTTACGGAGTTTTGAGAAATGTCTGAAAAATTCCGTTACTAGTAGAGTAAAAGGGTATACTAAATTCTTAGAAAATGTGCTTCCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGT:1 - 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blood 7343 2 53.42 AAGTCAGCCGCAAAAAATAAATTTATTTTGTGAACAACATATAATCGTATGTATAAACAAACAATTTGTTTTTTGAAATTTAGTTTTTAAAATTATGTACATTGATTCGGCTAGTTCTAAGCTATATTTAAATAATAATAACGTTA:1 + chrX 6136500 5' - 1360 311 1 50.00 GAAATGGATTTTTTTTTTGACAGCTGTAAATATGTTGGCTGTGTTGGAAAATGCAACACACAACTAATTCTAATGATTACAAGAAAAAATAATTTTGTTCATCGATCTTCTTCCTATTACCCTATAATATTTCTTGAGGCGCTGGT:1 - chr2L 16682547 5' - G7 760 1 69.18 ATGATTTGGTGGCATGCGGCAGTTTCGGACCAGTAAATTATCCACAGATGGGAAAAATGTGGAAGCCAGGCTTTTGTCCGACTGTCAAGCAATCACTTGGCTTGCTTGAACAGGTACTACTTTTCGCTACAGACATTAATGACAAA:1 + chr2R 9116855 5' - Gypsy12A_LTR 2134 1 69.18 GACCGAGAGTAGGCAATTTGAGACTTATCTGCGCTTTTTTCTACTCCAGCATGTGCAACAAAGTGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAAATGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTAAATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 3263690 5' - accord 186 2 80.82 CTGTTGCAATTTAACTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTTATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chrX 10284930 5' + pogo 29 1 57.86 AATAAGGTTATATTTTTAATTTATATATTATAAGGTCTTACAATAAGTTATATTAATGTGTACCGCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 + chr2L 17449082 5' + Ivk 58 1 64.38 AGGCACTGAAACCTGTTCTTGGCCACACAGAAATCACTGCGAGCGGGTCTGATCGATCAGCTGTTGGTGGGCACCAGAGGTGACGCAGTGACTGCGGAAAGTAGTCACCGTATCTGACTTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr2L 1729902 5' - Transpac 5226 2 79.45 GATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 19446123 5' + 297 6628 2 54.11 GCATGCGAAAATTGAAAACATCAATTTGGATATATTATCAAACCAACACTCATCAATTATTTCATTCATAAATTTGTTAAACATGGGGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATGAAATAATAATTAAGTATAATTCTG:1 + chr4 810270 5' + Tc1-2 398 1 61.64 AAATGAATGCTAACTAAAGATTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTA:1 - chr3L 20573833 5' + pogo 2047 1 71.23 ATATTGATAAGATTAACCCGATAAGAGTGTTAGGAAGTATAATATATTTTAGCATTAACTAACAACATGCTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTAGGCACC:1 + chr3R 11166153 5' - hobo 2894 1 52.86 ATTGGCACCCTAGAGCAGCTGGTTCGAACGATACGGGATGTCCCAGAGCCCATGAAGCCCTTCCTCTACAGCGTGATCGAGCTGAGCACGGATGAATTAATTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGAC:1 + chr2R 15684824 5' - HeT-A 5741 1 75.97 TTTAAGCTTGGCTAAGCAATTGCAAAACTACTATGTTTATATGGTAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAG:1 + chr2L 5818893 5' + I-element 4900 1 69.18 AATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATGTGGAAATACCTTCGGTTTAAAGAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2L 16995506 5' - roo 8986 2 71.92 CTGACACCATAGAAAAACTAATGGGGGATAAGCGTACTTACTAAGTAGGTGCTTAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAGTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr3R 14800881 5' + pogo 62 1 61.64 AAACAAAACGTAAGAATGTGTCTGGTTCTTTTAAAATACAGACAAAACAAGGACAAGAATGCCACACAGCAGACACAGCAATAGCCTTGGGACCAAGTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr2L 3408690 5' - opus 7482 2 69.86 TTGGAGCAGCAAGTGAGAGTACGTCTCTTTTGAAAGCAGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATT:1 - chr3R 4197236 5' - P-element 2805 1 30.14 GTCACTTCATTAACATGGCAAGCAGTCGCTGAATGAAGAGATAAATGCAGCGAGCAGCCCAGGAACGTGCCAAAAATTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2R 19015947 5' - roo 9030 1 56.25 GATTGACAACAAATCGGACAGATAAAAGGACAGACTGGAATATATGTGCTTTATAGGGTCGGAAACGATTTCTACTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3L 21157132 5' + 412 7098 2 53.42 GTCTTCATCCCATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 6615505 5' - roo 8991 2 73.97 AAAGGGAAAAATGGGTGAAATACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCCTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAAT:1 + chr3L 10814503 5' - micropia 5380 2 66.44 GAGACTGCATTTGCCAACAAATCGCGAAAGGGGCAGGACGAGCCCAACTAAGAGTAGCGGTGATAGTCGAACGGAGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATTTTTTCTTCACTGGATTTTCAGAATTGTGAAATTA:1 + chr3R 25613664 5' + mdg3 497 1 51.37 GCCGGGACGAACTCGCCGACAATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGTAGTATATGCGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAT:1 - chrX 21947739 5' + mdg1 54 2 53.42 TAGCCATCTAAAAAGGAAGACAAATATCATTGTTAAAGTGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 + chr2R 22112582 5' + 412 8 2 73.29 ATCATAAAGGATATGAATGAGGCAACTATGCTGGCGAATTTATTTTCGTAAGAACGGCAAAGAAGAAACTAATTTCGCGCAAATTAAATGCAAAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 1232755 5' + roo 22 2 70.42 GTTTCTAAGCAAAGAAACTCAACAAATCTTGTTTTCCTTTAAAAAAAATTACAATATTATTGGCTTAATCTCAATTGACTGATTATGATTTTCTTGTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2R 15698019 5' + opus 7025 2 69.18 GTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTGTT:1 - chr2R 19050355 5' + Cr1a 231 1 78.77 GCAGATATTGCTCCTCGCTTTGAGGCTACAAGAGGAACCTCTCGGCGATGAGGGTCTTGCGGGAGATGTTCCGTCGCACCCAATGGCGGAACACTTGGCGCAGTAACTGAAATGGATTATTTTTAAATTATTTTGTTAAT:1 + chr3R 20612584 5' - S-element 1454 1 92.86 GAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGA:1 - chr2L 9930405 5' + opus 174 4 79.03 AAATACAGACAAAACAAGGACAAGAATGCCACACAGCAGACACAGCAATAGCCTTGGGACCAAGTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:2 + chr2L 3408723 5' - opus 7449 2 58.22 GCAGAAAGGGAAATTTATTTATGCAATTAGAATTGCACTATATACAATAATATTGCCCTTTTTTAGGAATTCGTCTGTGTAGATAACCCGTTATGTATGGAACTTCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr2L 5329523 5' + 1360 2 2 58.65 CATCATTGATTTGCCACCCCTCAATTTTTCCAGCGCCTCTTGCCGCCAGTCCAAGTTTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCATCGGATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr2R 22774656 5' + I-element 16 1 67.12 TAGTACACCAATCCATAAATTAAGTTAAAGTGCTGCCTTTATCAGATCTGGTGTGCTAATTGAATTTATTGAAATGGCCAGGTAACAAACATCGGGTGCTTGAATCTAACTGACTCGCTAAT:1 - chr3R 19850634 5' - rooA 314 2 70.49 ATCAAAAACTTATTTCATATTAGATTCATACAACAAATTGTATAAAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAG:1 - chr3L 16725598 5' + Quasimodo 71 2 72.60 ATAGCACGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 - chrX 11415785 5' - mdg1 7383 2 75.34 AGGGATTTAAAAAGCAATTATAAAGGTGTTGAAAAGTATGCAACCATATATTTTCAATCAATGCTTCTGGAGAGTATGCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 28413989 5' + pogo 41 1 56.16 GTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr2R 2427625 5' + Doc 57 1 57.53 GGTGGTGGGTGCGGATGGTGCCTTGGCCATTTGGCAGTTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 16382501 5' + hobo 40 1 63.81 AAAGAAGAAACTAATTTCGCGCAAATTAAATGCAAAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - 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micropia 5379 2 68.49 GGTAAGAAAGCTCTGACAAATTATCGCAAGCATCCATGCTGCAAATTACCTTTTTCAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 17746266 5' - roo 9009 2 60.27 TTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGTGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 12941771 5' + hobo 58 1 53.42 TAAGCCGTAAAAACCAAAAGCTACTCTCTNATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGANAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 24093512 5' + jockey 83 1 67.81 GCGTCAGTCAACCGCCGGCAAAAGCCGCAGAGCCAACAGTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 12365405 5' - hobo 2921 1 66.38 TTTTAAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2L 20550939 5' + 412 7098 2 52.05 CGTTGGTGGCGTCCCATAGGTAGCAACACAGAGCCAGTAGAACGATAACGCTTTTGACCCTCATATCACTGCTAACTGAATATCACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGA:1 + chr2L 11753959 5' + roo 8860 2 53.42 GGTGGTTCGATCGCTTGCTGCCCCTGCCATTGCTTCTATAACCGTTGTTTTTATACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCT:1 + chr2R 5037479 5' - Stalker2 7470 2 62.41 CGGAATACAAAATTAGGGGTAAAATCAAGCGAGAACTCCAACTGAATAACCATAAGAACAAATTATTATAGAGAACACATTATATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3R 17879389 5' + opus 31 4 63.70 AAAAGTAATTCCTTCCACTATGGAAGTTCTCAATTTGTGGGCCCTCAAAAGTATGCAACACTTTTCGAATGAGTGCAGACAGGCGAAGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - chr2R 21229113 5' + jockey 4706 1 59.59 GAAGTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr2R 4601686 5' + HMS-Beagle2 20 2 74.66 GTGGCGTCGCCTTTCTGTGTCCACTTTCTGCGTGAGTGGTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 - chr3R 10030839 5' + BS 5017 1 77.40 ATTTGCATTTTATGCTTTTAATGGCTCATACTGTTGACATTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTAT:1 - chr2L 5355425 5' - Burdock 291 1 73.61 TTTTTTTTAACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCCTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - 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blood 372 2 66.90 CGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCACGC:1 - chr3R 934280 5' - Rt1b 4743 1 55.40 TGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACT:1 + chr3R 11186561 5' - BS 5012 1 73.24 ATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3L 20765131 5' + 297 6625 2 54.29 TATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr2R 10695872 5' - roo 9008 2 64.38 AAATATAAATAAGAAAAGCCAGCAACAAGTTGGTTTTAAACCAGAGAGTCGAGCTATAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAACGCGAATGCGAAATTTCATTATTTTTCTGGGATATCGATAGA:1 - chr2L 4030764 5' - INE-1 501 1 71.23 CTTGTTAGCCCGATGCAACTGCAGCTGAGATGATTAGCGGTACTGAGACTGCATCTGCATTTGGAGTGCGGAGCAGGGTAGGAATGTGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 17495022 5' - hobo 2920 1 69.47 ATTTACGTAAAAGATTCAGTGTTAGTGTGTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 + chr2R 16160704 5' + mdg3 5277 2 67.81 ATACATATATATACATATGACCAAGAAAAAAAAAAACAAACCTATTGAAAAATCCCCAATAAGAAAACTTTACTCGTTGTGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 7515425 5' - roo 349 2 62.40 AAATGTAGATGAAGAGTTTCGGGGGTGCTTCTAAAAATTATGGAACTGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3L 20573717 5' - pogo 2087 1 76.03 TGTTTATGCGATGTTTAAAGTAAANATTTAAATTACTGTTGAAAGTTAAAACAATCCTTCGTTATCAAGGCAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCTTCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAG:1 - chr2L 21156772 5' - gypsy9 5248 2 46.58 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGGGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAA:1 + chr2L 19479165 5' + micropia 82 2 67.86 TATGCAAAGTTTTATGTAAGTTCGGTACCAAGTAAATATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 + chr3R 11757909 5' - invader4 3063 2 45.21 AGCTTATGATTCGTTTCGCAGCCCCGCTCTGGTATTTATAGGCAACCTGACTGGAAATTCGCCGCCTGCTCTCTCGATCACTCGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chrX 6283582 5' - P-element 2879 2 79.45 GTAAGAACACAAACAGCAACTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr3R 28045822 5' + Tirant 21 2 75.76 GTGGAAACTTGGTGCACTTGCCTGGTAAATTAAGGGCTTATTTGGAGTTTATGTTGCCGCAATTAGACATTTTCTCAAGGGGCCTGCACTTGGCCAGATAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACGG:1 - chr2L 8813058 5' + gypsy2 6497 2 76.80 GAGGTACCTAAACTCAGGTTGACAACTGGAAAGGGAAAGTTTACAAATCGAATAAAGTNGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chr3L 11529608 5' - opus 7499 2 75.34 GTCTATTTTCGTTGCCCACCAAAAGTGCATTGACATTGCCACATTGCTAAATTCATTGGCAGCCCATGCCAATTTTAATTCGTATTTTTTGCCTCTGGTTGCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACA:1 + chr3R 19996131 5' + Quasimodo 10 2 79.31 AATTATAAACCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2L 18738044 5' - roo 9002 2 66.44 ATATTATTGGCTTAATCTCAATTGACTGATTATGATTTTCTTGTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCTGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 15698072 5' + opus 40 4 59.46 GTAGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 30537628 5' + roo 77 2 70.55 AGTCTCCCAGATAGAAATTACCTTCCCTGAATGGGTTGCCCATTATCGGGTATGGAATTCCGAAATCTGGCCAACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:1 + chr2R 5037668 5' + Stalker2 49 2 50.68 ACATATCTAGCTATGGTACTGCGATACCTTTTTCGATGTAATTGATATAGCAATATATGTATATTCCCTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 + chr3L 1477358 5' + mdg3 5306 2 51.37 AAACTTTAAGTCCCCGCAGGGCTTTAATGCATTTGATTAGCTCTCTGCCTTTGGATCACGCCAAAACACATCAACCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 17494842 5' + hobo 6 1 80.14 CCCAAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCCCTTTACAACGCAACAAGGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGC:1 - chr3R 5972354 5' + Doc 291 1 58.10 CGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGTGAAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 - chr3R 12376499 5' + flea 14 2 56.25 TGTCAGAAGATTTCCCTTCGCCCAAGTACATACGTGCATATACATATGTATGTATACTCTCCCTAAACCGCCATAAATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCC:1 - chrX 5979109 5' + McClintock 5997 2 50.00 CGACGCACAACAGTTGGAATCAAATGTAGAAGGTACATTTTCAGAAATTTTAGGATAAATTGTTTGTTCAAATAGTATTATTTATAAAATATTACTATTAGATATTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chrX 12105375 5' + 412 7068 2 75.34 CAATTTTCATACAGTCATTTGGTAATGAAGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr4 490193 5' + pogo 29 1 67.12 GAGAGCGAGCGAAATTCCGTAGAATCCGAAAACCATCCGATATCGTTGCTCCCAACAAAGACCCTAGAATAACTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAGAGGCAAA:1 + chr2R 15322802 5' + Bari1 167 1 39.04 AGATTATTTTGTACTATCAAAACCAAAAATAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2R 22596036 5' + Doc 16 1 67.12 TCGACATGGAACCGCAATCTCTGCGGTTCGTCTGCTGTCAATTGTCTTGCGTGCGAACTATTCACAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 + chr2R 17609746 5' - mdg3 5441 2 54.79 GGCCTCATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAG:1 + chrX 22905216 5' - INE-1 89 1 58.90 CAGTTCCGGGGTGACCAGCACCAACAATTTTTGGTTCGAAAAATGCAGCGAATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 + chr3L 15273214 5' + pogo 67 1 67.81 AGAGCCAAATGCGTATTACGCTAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGGGCAGAAATGGACAGTAAGGAAGCGCCAGAGAATGTAACTAGTGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 5495318 5' - roo 9042 1 65.07 CTTAGGGAACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3R 12115224 5' + 1360 21 1 67.81 TCCCACACACTTCTCTCTCGACGAAATCGAATTCTTATTTATTGCATTGTTTTTAATTTAATCTCTGAGCTTTTATGTATTATAATAGTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAAT:1 + chr3L 21666047 5' - 297 6857 2 60.96 TATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAATGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAACTTATGTAAATGA:1 + chrX 8208347 5' + roo 50 2 74.49 AGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr2L 11725043 5' + F-element 69 1 64.38 CCACAATACGTCCAATAAACATTTGCCTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 27398138 5' - roo 9028 1 55.48 CTTGTTGGATTTGAACTCAACTGAACTTTTACGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 - chr2L 17470401 5' - 412 7464 2 76.43 GTACGGACAGACGGACATGGCTAGATTGACTTGGCTATTAATCCTGACCACGAATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2L 10186229 5' + 412 7102 2 58.27 TTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGA:1 - chr2L 22684607 5' + transib3 62 1 51.39 TCTTTATTTATTTTACAATCAAAGTAAACCCTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 - chrX 21227240 5' - Tabor 7296 2 64.38 ACAGAAATTAGTTATTTCCTTCGTAATACGTTTATCATAATACCTACTTTAACTAATATACTTAAATCTAAAACGGACTTGATTAGTAATACGATTTTAAGACNTCAAACTAAAATTAATTCAGATAAAATTAAAATTAAAATTTT:1 - chr3L 16942354 5' + 1360 3045 1 29.45 TTGGTTGGTTGGTCAAAATGCAGGTGCGACTAGGAAAGTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCACTGTAANTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 - chrX 13367502 5' + HMS-Beagle 6833 2 60.00 CAACACAAAATTGCACACCTCGATGGCGAGCAATGTGTATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 - chr2R 22971877 5' + jockey 4813 1 55.86 CTCAAAACTTGGGAGCTTGAGTGCCTGAGTGCAGGTAGCGGTGCTTACTTTTTGGCCAACAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr3R 21841119 5' + blood 32 2 46.58 AAGTTTGATTTGTAGAGCGCTATTTTTGCGACCCCAACTGTTTGTGCAGTCTTATGCACTTGGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTC:1 + chr3R 22260437 5' + jockey 4732 1 54.79 CTTCGTCCCTTTAGGAGCTCTAAAAGCATTTTTACTATGAAGCCTGCCCAAAACAAAATCGCCTGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTTCGTAAGCCAAGGCACTGTCCAGAGCTCGCTCACCAAGAAGACTCCACAGAAGACA:1 + chr3L 24051174 5' + BS3 1551 1 64.58 GTTGACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 16920289 5' + roo 19 2 65.22 GCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAATTTAATTTT:1 + chr3L 20573764 5' - pogo 2040 1 60.27 CAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr3R 12115233 5' + 1360 30 1 61.64 CGATACTTTCGTGTGTTTCTCAAGCCCTGGTCTAGCAAAATGAACCGAGATGAACAATTTACTCACAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2L 7810742 5' - P-element 2851 1 53.17 ATTTGTTTGAATGTCCTGTAGTCATTCGATTCCTGCTCCAGGGTATTCCTTGGTCTGCCAGCCAAAAGGGACGCCCTACTTTGCACTCCTCTAATAATCAATGTGGCAGCTGTAGTACTGCCTTCTATGCGAACTAATTAAATGT:1 - chr3L 13722826 5' - Tc1-2 226 1 69.66 TATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTC:1 - chr4 637798 5' - roo 75 2 54.79 CATTTATTTTTATCTTTTTTGGCAATCAGCATCAGCCGAAAGGAATTCCCCATTGACTATGCCGGTGTCAACAAAGTGGCGGAAAAGAATTAGGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCC:1 + chr3R 6602926 5' - gypsy 7420 2 65.75 ACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:2 + chr2R 22596104 5' + Doc 84 1 72.60 GCTGTTGGTCTATGTTTCAAATAAATATCGCTGCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 6962479 5' + jockey 23 1 72.86 TTCCGTTCTTTTTTGGCCTCCTCGCCTTTCGCATTTTATTTTCCAAAAGTAATCGCAATTGCAAGGGGATCGGTGGTGGCTCTTTAGATTTTTATGGACTAAATGTAAATTGAATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATAC:1 - chrX 21237655 5' + Stalker2 208 2 77.40 TAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGA:1 - chr3R 6603047 5' + gypsy 7060 2 67.59 TATAAACACATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTAT:1 + chr2R 18035103 5' - R1A1-element 5277 1 58.22 GCTGCAAACACAGCCGAGATTGCTAACATTCCACCGAATACTTTCTCCGCGCAAGTAGTTTACGGGCATTCCTGTTCCAGTCTCGTAATAGCCAATTGAAGCCATTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chr3L 18968578 5' + hopper 18 1 67.81 CTCTTTGCCTTTGTGGGTTTTTTTTTTGGTTAGCAGTGAATGAAGGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chrX 8363663 5' + jockey 12 1 77.52 GGGTGGTAACACTCGCACAGTGGGTAAAAATGCTATTGAAAATTGAAGTCCAAACAGGCTTATAATATAAGGATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 + chrX 1208818 5' + Burdock 48 2 53.42 CCTTGCCGCTATATGCCGCAATTGATTTAAGTTACCAGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATNTATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr3R 23511690 5' + 297 20 2 71.92 AATATGTTACTGAAGCACCACTTATCATCAAGTGTAAGAATTAGAAGTCCAAAAGGGGCATAACGTAAAAATATTTATAATTCGATTGATGTTCCCCCCTCCTTCCGCCTTCTGCAACAGAGAGTGTACATAATTTATATACATAT:1 - chrX 699542 5' - Stalker2 7510 2 54.79 AATTGATGTTTTCATTATTAGCAATTTTGTGGAAATGAAATAAAACCCTAATTATTTCTGGTCTTGAAATTCATTAGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 - chr3R 14402008 5' - Juan 4202 1 76.03 GCCAGAACCATTTGGGAATTATAAATGTGAAAGTAGAAAGTTATCGTACTTTCTATTGCATATTTAAGGGGTTTATGGTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAA:1 + chr2L 13244603 5' + jockey 4576 1 72.41 CCACAGAGGAGGTGACAACGCAACTGGGAAAAAAAGGTCGAAACCTATTCCTCCTCGGGCTACTCATTTAATTCCTCCCCTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr3R 8394530 5' - hopper 1376 1 58.22 CCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3L 12125257 5' - roo 9031 1 57.24 TTTATTTTATAAATGTTCGAAACTGGAAAAGCTCAGACACGATTTCAAAAACCATTCGTCACTATTTTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chrX 20233899 5' - pogo 2049 1 54.11 CTATTAGATTTTGAAACAACCATCCAACTGTAAGACTTTTCGGCATACCTACAGGTATTAAAAAAAATGTAATGACGGTTTGTTTCCAAAGTCGAGTCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCA:1 + chr3L 23207272 5' + invader4 162 2 69.86 AGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3L 5398143 5' + roo 8734 2 66.44 TTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGACATGTCT:1 + chr2R 5617501 5' - invader1 333 2 66.44 CCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGTCGTCAG:1 + chr3R 11757975 5' - invader4 3021 2 60.87 TGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 + chr4 906111 5' - opus 7430 2 69.18 ATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:2 - chr3R 7042087 5' + Stalker2 7301 2 51.37 CTGCTGAGGTGAAACCATGCATAATTTTAAACACACTCTGGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3L 5958750 5' + 412 26 2 59.59 TTAAAAACAACGACAGTGGCAGATTGTCCTATACGAAATTAAAAAACACTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 15540110 5' - roo 395 1 74.66 AAAAGTTGGCTAACTAAATCACGTAATGAGTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr3R 19246791 5' - jockey 4948 1 48.97 ATTTCATATAAACAATAGGGTTATATTACAATTCCGGAAGTGCTTTTATTAAGATATGTGCTTAGTTAATTATTTTATTGCTCCATTTAGTTCTTTATGTTATGTTCTGTTTCTTTTGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCT:1 + chr2L 7282933 5' + 412 447 2 52.74 GGATGAATGTCCCCAGCGCCTTCCGGAGCATTCAATTAAGAATGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 - chr3L 22038297 5' - diver 146 2 69.18 CAGAAATAAATATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGANGCACCTCCACGGCTCGCAAGCAC:1 - chr3R 8867071 5' + Max-element 66 2 71.20 CGTTTTTCGTATCTGAAAACAACGTACAAAACACGACTGGACCCTTAAAAGGCGATCTATATAGCCTGTCTATTCTGCGTGGCAAAGAAATGCCAACCTGGAAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACAC:1 + chrX 4581502 5' + gtwin 7365 2 65.75 CAAAAGTTTGGCCGTTGCAAAAATAGTAAGTGGTTTTTTACAAAACTGAAGTTATTTCTGATATTTTTATAATTCCCTCCATATCAATAACTTTACAAGTTGGTTCATAATAAAATTATACCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTT:1 + chr3R 12183446 5' - mdg3 245 2 41.78 GGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 - chrX 15252367 5' - opus 7429 2 69.86 CAAGAACAACACCAGATACTATCCGATACGAACCGATCGCAACTTCGAGTCGAGGGCAAATGACGGTCGATGTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 11663809 5' + P-element 46 1 49.31 AGAGAGATGCACAGAATTCAATTAGCAAAATTGTTAAGTAACTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 23579284 5' - roo 9014 2 59.59 ACAGATTGCTCTAATGGCACGGAACTCATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:2 - chr2L 18173730 5' + blood 7021 2 78.08 TGGTAGCTTGTAGTCCGTGCTGGGTCTCTGGTACTTGTACTCCGTGGAATCCGCTGTCTGCTTCACTGTGCGCATGGACAAATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATG:1 + chr3L 18807283 5' + FB 107 1 56.25 CGTCCATTGTCTGAACCCCCGTTAAATATGTCTGAATCAGGGTCGCCTGCCGCGGTTGCATGTAATCGCAGCTGGCAGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 - chr3L 17758053 5' - Tirant 8465 2 57.53 TTCATCCCATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 6615508 5' - roo 8988 2 76.03 AACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3R 8381691 5' + Tirant 8146 2 53.96 CTTTTATGGCAAACGATGAAATTATCATCGTTTGTTTGTTGCCTGACAGTGAAATAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr2R 17400284 5' + pogo 61 1 62.33 ACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 + chr3L 22435122 5' + opus 57 4 77.60 GTCTCCCAGATAGAAATTACCTTCCCTGAATGGGTTGCCCATTATCGGGTATGGAATTCCGAAATCTGGCCAACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:2 + chr2R 5037669 5' + Stalker2 7298 2 50.00 CACTGGAATAACAAGATGCGTAATGGCCCTACATTGGTTATGCACTATGCAGCCCCACTTTTTTGGTGACAATCAAAATTGCCCTATGTCCGGCTCGCTTACGCTAAGAGCGGAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTG:1 - 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chr3R 4361674 5' + copia 64 2 62.33 AAATGATGGAAAAGTTAAGAATTAAACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCGTANCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2R 8596902 5' - pogo 2063 1 56.85 TCATGGATACTCTTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCATCCTCTATCTTTATTTACATTCTT:1 + chr2R 7407978 5' + 3S18 5807 2 61.02 AAAACAGCGAAAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 - chr2L 3908507 5' + jockey 4742 1 66.44 GTTAACCGATAAAACTAAAGCAACTTTGTAATCTATTTGTTAAGCGCTTATTGTAATTGTCACTTACATCCACTTATTGCGGATCATTTTGCTTGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACCTTCAGAGATCA:1 - chr3R 14849150 5' - Tc1 411 1 47.95 GCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 + chrX 21227112 5' + Tabor 67 2 60.96 CGGGGTTCTGCTGGTTGGCGAGCTGTAAGAAGTTGAAAGGACTTAGTCGGTGCGCTCCTCAAAACTGGAAATCGAAGAATGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAG:1 + chr3L 22800763 5' - 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X-element 4494 1 65.75 TTGCGCCTCCCAAAAGTATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGATACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 31458351 5' + jockey 18 1 71.23 AGGGAAAAATGGGTGAAATACAAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTC:1 + chr3L 10814505 5' - micropia 421 2 61.86 ATCGTCGAACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCC:1 - chr3L 21913483 5' + 297 6596 2 75.17 GCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 5398159 5' + roo 8716 2 54.86 TCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2L 19698097 5' - roo 327 2 72.60 GGAACGAAACGGGGCAGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATCATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - 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chr2L 1441576 5' - mdg1 233 2 79.45 GGGTCACATCTCTGTAGGAAGGTATTTGTCAATCGAATCGAATCACTTTTTGCTGAGTTTTCCATTTGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGCAATAAACTGATGGACAAGAC:1 - chr3R 30618752 5' + X-element 72 1 55.48 ACCTAAACTCAGGTTGACAACTGGAAAGGGAAAGTTTACAAATCGAATAAAGTAGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3L 11529603 5' - opus 491 2 73.29 ATGGTTGTTCCGGACTCATGGAAGCCCTATAAGAAAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 + chr3R 20983815 5' - pogo 2033 1 75.57 CTCTTGTTGCATCTGCTTCACTGCTTAGCTTTAGATCCTTGAAAATCGGAGAGTCTCCGTAGGGAGAAGTTACCCTAGCTAGGATCTGCTGATGAATGGGCTGGAAACATTTACAAAATTACTTTAAAAACATACCAATCGCAATT:1 + chr3R 23779229 5' + I-element 221 1 71.23 AACGAGATCTACAAAATCAGTTCGTTACAATTTGTTCAATCAATCAATTATTAAATTGATTACGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGTCAGAACTTAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACGTATAGTTAGATCTACAATGAT:1 + chr2L 22357762 5' - Cr1a 4152 1 58.90 GACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAANAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2L 3911853 5' - roo 8991 2 71.23 AATATATAAATGTGTACGTGTTAACTACTTACTAACTGAAACTATCTTTAATATAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chr2L 7774932 5' + I-element 26 1 63.28 TTATTATGACATTGTCTCCGCCAGATTCTGGCCTTATTTTGTCGTCATAAGCTGAATATTCGACTAGAGGTTACTTATTACTTATATTACTGAAACTAGGATATAAACCAATGTATACACAGTGATTTTGTTAATTGTTTAACTTA:1 - chr2L 8760287 5' - HeT-A 14 1 79.45 CCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAACTTTTTGAAAA:1 - chr3R 8049024 5' + Q-element 134 2 58.90 GGTAAATGGTATACAATTTAAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTA:2 + chr2R 12248969 5' + Juan 4086 1 56.16 GTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTTAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr2R 10695879 5' - roo 351 2 58.22 CAATGCTATAAAAAAAGTCGAAACATTTTCTTTCATTTGTTGCGTTTTAAATTTTCATGCGCAGCGAGTGTCGGCAATTACCAAGGCCTAAACTATATATACGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 - chrX 7848338 5' + flea 4772 2 75.34 ATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACATCAGACCNTCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCTTCAGCAGGCGACT:1 - chrX 3559653 5' + opus 176 4 53.96 AACAAAGACGTCGCTAAGTGGACAGCCAAAGTTAAAGGATTTGTGATAAATGAAAAGCCAGTAGTAAAGCGTATGAATAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAG:1 - chr2L 21946311 5' + Quasimodo 7142 2 53.10 GTTGCCATTTCTGATGCTCACACATTTTGCATTCCCATTTAAATGTAATGTAAATGTAAATGCAAATCGCAAAAGGGGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 18204326 5' + hobo 23 1 65.89 TGCTAGTCAACACTTTCGTTTTTCCTTTCTCTTCTATTGTGTAGCGAAATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chrX 16219200 5' + roo 8733 2 66.44 CCTGTTTCAATAAATCTAATGAATTGCCTCTTTAAAGTGTCGTTAAATTCAAGTTATGGGATAAAACCTTTGAAGAGGAGTGGCAGACAAAAAAAACTTTATAATTGAATTGTTTGAAAATAAATACCAAATGATATTATAAAAAA:1 + chr2L 16138560 5' + HB 1540 1 67.12 ACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCGTCAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTA:1 + chrX 10547672 5' - P-element 2807 1 30.82 GCCTGCGGTTCGATGTCTCCGCCGCGTTTCTTTCTGCTATGCTTGAATATTTGATGTCTGTTTGTTTTGCTCTGGCTAATTGGAAGCGCCTTCGATCGCTGAGTGATTCAATTATTTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGT:1 - chr2L 20912713 5' + Stalker4 7235 4 78.77 CATCGCGACCCTGATTATGTTGTTGAACTGTAACGTCACTCACTCGTTAGCCTGAGTAATGTTTGCACTCCCTTTGGCCATAAGTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3L 20868160 5' - hobo 2921 1 73.10 GCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr3R 24093518 5' + jockey 89 1 72.60 AATTTTAAAATGAATGCTAACTAAAGATTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTT:1 - chr3L 20573840 5' + pogo 2040 1 66.44 GCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 - chr3L 9522130 5' + opus 172 4 65.75 TATAGAAAAAGTAACTTCTTCTGTACTCAGATACTTCAAAGCTTGTCAATAATTTACGTTCTTTGTTAAGTTTATAATCTAAATAAATGCATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 22435631 5' + roo 27 2 68.49 ACTGGGCTAATCACTTTTTAATTTATTCGCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr3R 5170945 5' + F-element 56 1 53.42 ATTTGTATTTGTATTGTGAGCAAGGTGCAGAGAGGCGATATAGAGAAGTTTGTTTTATTTCCCGAAAGTCAACGACAGTCACGACGGACATATGTAAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAAC:1 - chrX 7227571 5' + Doc 104 1 69.86 ATTGGCCGCCTCTCTTTCGGGTTCTTCACCCTCTCTTCGCTTTGTTTTTTTTTTTCGTTTTT:1 + chr3R 29791015 5' - gypsy7 5010 3 77.42 ACTGAGTTGTTAAGTGTTGTTAAGTATTTCAATTTCAACCGTTTTCTGTATGGCTTAACCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGTCGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 16004158 5' + jockey 57 1 53.38 GTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr3L 13888917 5' + 412 7134 2 72.41 AGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr3R 8381695 5' + Tirant 8124 2 66.37 AAAGTTATCGTACTTTCTATTGCATATTTAAGGGGTTTATGGTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCC:1 + chr2L 13244639 5' + jockey 4613 1 52.74 TAAGCTTGGCTAAGCAATTGCAAAACTACTATGTTTATATGGTAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGAC:1 + chr2L 5818895 5' + I-element 4902 1 70.55 GTTTCTAGCTTGCGGTTGCTGTAAGCCACAGGTTCAAGCTGAAGCTGCGTAACTGCGAAATTTCGTTTAATTATTCTGAAATCTACAAACGTGAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr2R 22964159 5' - 412 7519 2 65.07 TTTGTTTATTGTCGCGCTTTTTCTAGTGGAAGAGGAAGACTGGAGAATCTGCGACCTTAGCAAGAATTTCATGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCGGATAGTCGGTGATCCTTGCTGAAGGCGGTTG:1 + chr2L 8299942 5' - Chimpo 3825 1 54.62 CCTGGCTTTTCCTTCTATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chrX 18534576 5' - P-element 2786 1 16.44 ACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCC:1 - chr3R 17766827 5' + HMS-Beagle2 49 2 54.29 TTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACA:1 - chr3L 19350027 5' + 1360 3243 1 47.26 GCTGGCAAACGCACAAAAAACGCGTCGCAAATGGACAGGATAAGAGGAAATCGGTGGCAGGTGGGTCGGTGGCGGTGGGCGGTCGAATGTAATTGAACTCAACTGTATTCTTTCTAAAGGGAACTTGTAATTTTGCGGTCATAGCG:1 - chr3R 31867144 5' + diver 108 2 61.64 AATGCGAATGGCAATCAAAGTGCGAGTAAATCCCATGCCAAAGAGTACGAAGTTGAGAACCAGGTGCCAAGTGTATGCACTGCGACAAAAATGTGCCATTGGCAGGCTAAATGACAAGATTAAACTTTCCATGCACGTAGTAAGCA:1 - chrX 8772729 5' + Dm88 4107 1 63.01 CGGCAAAAGCCGCAGAGCCAACAGTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 - chrX 12365390 5' - hobo 2876 1 62.33 TTTGGCAAGCAGGATAATCTGCTCGTAGGATTTGGCTGCATGGAACCATGACTTGTTGTTTTCGTAACAGTCGATGGCCTTCAAAAAACAATCCTTGCTCTTATTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACC:1 + chr3R 10121135 5' - gypsy12 10177 2 68.49 GGATTGCCTTTTACACTGGGAAAGAATTTCAACTCCTTTAAGCAGTTAACACAATACAATACCCAACTGAGCCTATCCATATTTTCTTATGCTATTTTCCCTCATTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTT:1 + chr3R 8467976 5' + R1A1-element 29 1 71.23 AAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:1 - chr3R 19246747 5' - jockey 4903 1 79.45 CTGTCAAGTGTCGACCATAAAAGACGATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3L 13888856 5' + 412 7074 2 71.23 GCACGAACAACTGGCATTGCGTAGGCGTACTATGTGTACATACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 + chr3L 8158015 5' + flea 36 2 61.11 GGTTTAGGTTTGGCCTTCTACTCATGATAAAAAAAATTGTTTACCGTGAAACATCATTGTTTGGAATCTGCGTTTGAAGGATCTACTCAAGAGGTTAAAATAATTTGCTGATTTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTAC:1 + chr3R 31771946 5' - mdg1 7335 2 73.97 ACACTTTTGAATAAAAGTCTCAATAACCATATTTGTTTTACTAAATCGAATGCGTAAACGTATTGCATGCCATAACCAGAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGCGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCC:1 + chr2L 11634947 5' + I-element 5045 1 54.11 AAACTTACTTTTGCGTTTAAATTAGACGATAAATATTTGCTAAAATTTGTATACAATCAAAAAAATTAAAGTGCGTTTAAAAACATCATTATGTGGTGTGACCATAAGACCATAAACCATTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAT:1 + chr2L 16672901 5' + Tc3 315 1 67.81 ATGCTGCTCCCATTTTGTATTTTTAAGTAGTTAAGCCCCAGAGTTGTGGAACTTTATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:2 + chrX 5456522 5' + roo 31 2 64.38 CAGGGTGTCGGGTCATGCAGCCGCCAGCAATCCTAAATTGTTACTTGTTTACATGCCAACTTTACTGCACCTGAGCATACTTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGATCTGTTCGCTGTAGCGCTC:1 - chr2L 22632863 5' - 1360 124 1 54.11 TATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAAT:1 - chrY 2720344 5' + gypsy 7039 2 57.53 CGTTGGACGCAGGGGGGATGGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chr3R 18006529 5' + accord 185 2 63.11 CCATCTAAAACTTGTTAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGT:1 - chr3R 6603062 5' + gypsy 7044 2 56.94 GTAGCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGTGGAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAA:1 - chr3R 2525969 5' + Stalker2 74 2 65.07 ACACACCGCCGTCAATCAAAAGTAAACTTCAATTTCAGGGGGTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chrX 18767915 5' + hobo 45 1 52.52 ACGATTGGTAACTAAGAAATCGGTAGTGCNGATCTTCGATATACATACATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGNTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAG:1 + chr3L 3154077 5' + flea 4818 1 68.49 ATATTACCAAAACGAAAGTGTCAACCAGCCAGGTCAAAGGAGGAGGGCCATCACGAGCAGGGGAGTGGGGGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAG:1 + chr3R 13898162 5' + 3S18 15 2 73.97 GCACCGCGATAACCGATTTTCTAAAATATTAATGAGTCAATCTTCAATATATGTATGTATATTCAAAATGAAAAGATTTCATTACATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 - chr2R 14484235 5' - pogo 2068 1 66.44 CTAGCTATCCCAATTATTTGCAGCAGTTTCTGCAAATGCATCTAACGATATTATACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr3R 10900944 5' + F-element 36 1 63.01 CTTCAGTTTTACTTCTTTCCATTATCATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAA:1 - chr2R 6089123 5' + 1360 94 1 82.19 ATGTACCACAAAGTATGAATTGAAATTAAATGAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACT:1 - chrX 14347025 5' - flea 159 1 78.08 CTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr3L 9522133 5' + opus 7058 4 61.38 GTTGCCCATTATCGGGTATGGAATTCCGAAATCTGGCCAACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCA:1 + chr2R 5037702 5' + Stalker2 7331 2 71.92 GGATGGCCATGGCGCTCAGTAAAACGGTGCCCAGGCTACCTTTGGACTTTACCAAAGATTCCAGCATCTGCCAATGGTTTCCGTTAACTAAAGGTGGCAGGGGCGATGCACTTGCGCCGTCCCTTTATAGGCCGCGAGGATCCCGT:1 + chr3R 23202197 5' - gypsy8 327 1 68.49 GGTTCTAGAACTTGTCATAAAAGTGGCGAGCACGCGGAAATGGTAAGATTAGAGAATAATTAAACTATATTCGATACACTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAACTTCAGAAGGAACTG:1 + chr3R 26261072 5' + G5A 2795 1 50.68 CTTTGGCTTGAAAGACACTGAAAAAAAAACGAGCTAACTTTCTATGTTGAAAGAAAACCAGCTAACTTTCTATAGGCAGAACAAATTAAAGTAACCAGATAAGTTAATATAGTTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr2L 11476205 5' - pogo 2096 1 77.40 TGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:1 + chr3L 18010239 5' + diver 66 2 61.64 ATTTGCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTCATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3R 13453442 5' + 412 23 2 68.49 CCCTGACATCCAGTAAACGCATTCTATGCCAGCTTTGCACGGTCCCTCTCACGATTCCCAGTTTTTTTGATGGCAGCTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAA:1 - chr3R 12118235 5' + gypsy12 25 2 63.41 GAAAATAATTGTTATTTTTATAATATGATTGGTCCTAGCTGCTGATGATTATGGGAGGGTGGTTCACATATCCAGGTGTATTTCGTAAAAGAAATTCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr2L 21026773 5' + FB 12 1 74.81 AAGAAAGCATGTTTTAGTCGACTATCAGATACTGGATACTGAAAGTACTCTAAACTTTCTAGCTTATATATGTGGCGCCCACACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACG:1 + chr3L 17860601 5' + Chimpo 34 1 68.80 AAAATAAATAATGACACAAAGAGATTATTTACTTCTTAACTTTCTTAGTGCAACCGTAAATCCTATGCATGGCAATATTGTATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr2L 17851638 5' - flea 220 2 59.59 ATGAACGCTATTAAAAAAAACTTACCAGTTTGTTTATATTAAGCATCACTTATGGACGTTCGACTGTACCTTTAATTTTTGGCTTATTATTCTTGTTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 - chr3R 21854547 5' - copia 5015 2 62.33 AAATTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCAT:1 - chr3L 10814602 5' + micropia 33 2 52.50 CATTAGCTATGGACCTCCTTCATTGAGTGTTTTGCTTGCATACCCGGCAATTAAAGACTTGCATGGTATATGTATTTTCAGTACATCAAAAAACTTTACATTTTAGTATCGAAAAAGATTTTAAAAAAATTGAAAAATTTTAAAAT:1 - chr2R 10477667 5' + 1360 3030 1 60.27 ATCAAGCGAGAACTCCAACTGAATAACCATAAGAACAAATTATTATAGAGAACACATTATATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr3R 17879412 5' + opus 161 4 57.86 AGCGTAAACTGAAACAATGCTAAGTGATCTGTTAATTATCACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 22435514 5' - 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chr3L 8130440 5' - Doc2-element 250 1 79.45 TTGTACTATCAAAACCAAAAACAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 + chr2R 22596044 5' + Doc 24 1 64.38 TATGTATAATCGGCGACGTTAAACTTCAGTTTTACTTCTTTCCATTATCATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 - chr2R 6089146 5' + 1360 71 1 67.12 AAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr3L 8273972 5' - hobo 2914 1 68.06 TCCTAATTGCAGCTAGTACATGTGTTGTGTTGCACCCTAATTCCAGTTGTAAACATGCGCCCATACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTA:1 + chr3R 31031960 5' - hopper2 1556 1 53.15 AATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAACTTATATTTTTAGATTTCT:1 - chr3L 19349999 5' + 1360 3271 1 65.07 ACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2L 3911842 5' - roo 338 2 64.38 CTCCACCTGTTTCACCCTTTCGACCACTCTCTTTTCATCGATCAGACAGATGAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2R 21362748 5' + Tirant 38 2 55.65 CCTACAATGGGAATAGAGCTTGGTGCGAAGCTACTTGGCACAGTCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2R 22761247 5' - 412 7515 2 54.46 ATTTTTTTTAACTAAATCAGCAAAGGAATAAAGTTTTATGTAACGTTTTTTTTTTTAAGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAG:1 + chrX 23035836 5' - HMS-Beagle2 7135 2 58.22 ATGTGCCCAGTCGAGTCGAGTATAATTGCCATTCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCG:1 + chr3R 29543599 5' + Tirant 89 2 75.56 AAAAGGTATTTAAATAATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1 + chr2L 1729752 5' + Transpac 63 2 59.59 GTCAGTCAACCGCCGGCAAAAGCCGCAGAGCCAACAGTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 12365403 5' - hobo 2935 1 75.00 CAGAGGGTACAAACAAGAAGTCAGTAGGAATGCAGTTCTAGTTGAAGCCCCTGAAAGCGCCCTGAAATAAATTTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGA:1 - chr3L 18154515 5' + jockey 4561 1 80.00 ATACTTTAATAAAAATAGCAATTGGCTTAAGATGCTTACTTTATAAGTCAACGCAAAAATGCATATTTTGATCTATAAAAATGTCCTGAATTTCTTGGTTTTATTCACAAATATTTACTTCATAAATGGATCAGTACTTTTCTTTA:1 + chrX 20545734 5' - GATE 462 1 76.03 ACAAAGTCTTCAGTTAACTCAGAACAGTACATAGTGAGCCTATACACTGGGAAAAAAACAAGATTATTCAAACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2R 18396547 5' + pogo 46 1 51.37 CCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGTAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGA:1 - chr2L 21403523 5' + G5 4435 1 75.00 GTCGCCGAGAGAGGGAAAGAGATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATCGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATT:1 + chr3R 7041975 5' - Stalker2 345 2 54.11 ATTTCAGTTCGCCATTTTTTTTAGCACTTCAATAACTTCCGTTTCCGTTTCCCTCGTTATTAGATCTTTTCATATACGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 75423 5' - roo 9027 1 54.79 AATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 12941794 5' + hobo 58 1 65.04 ATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 27007425 5' - roo 8994 2 67.12 TGCGCATAAATTATAGATGAACGAATGGAGCTGTGGGGTGGCGGTTGGCATCTGGAAATTTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 - chr2R 17609901 5' + mdg3 5264 1 78.08 ATTTTTCAAATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 21938130 5' + roo 8694 2 63.70 GAGCATTGAGAGAACCCATAGAACCCCCCCAAATGAAGTATCCAAAACTTGATTGGGGCTCCACAATCACGAAGACAAAGACAAAGAACTCGAAACGGAAACGAATCGAATCGAATCCACAAAGTGCAGAGCTGTGCCGGCTATGC:1 - chr3R 30895752 5' - gypsy3 6634 2 76.71 AGGTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3R 8381678 5' + Tirant 21 2 68.66 GTTTTCTTCAAACATGTATTCCTTCTTGATGTAAACGCTATCCGGTAAAATGATACGCCTTGCGCTTTAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr2L 21777762 5' - pogo 2050 1 56.16 CCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr3L 9522152 5' + opus 7153 4 52.74 GCTTGGCCTGTAATCGTGGCTCTTATATTTTATACATGTGTGTAATGGGTTTGCAATTTTCAGCGACTTTTTGACACACATACCACGCTCGATCCCAAACACATATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATA:1 + chr2L 7148515 5' + HMS-Beagle2 6899 2 73.29 TATTAGTTCGCCTATCAGATACCCAGTAAAAGTATCTGAATGAAAAATTTAACAATTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 + chr2R 17649222 5' + Doc 71 1 60.96 GTATGCAACTTAGTTTCTTTTTCCTCCTTTTTTTTTTTCT:1 - chr3R 19314849 5' - Doc2-element 227 1 90.00 CCTCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 5531236 5' + 1360 70 1 69.18 ATATCTATCTATCTGTCGCACATTGTGTACCTCCATAATCCCCCTGCCCTTCGGGTTTACAGCTACCATTTTGTGATTTACCTTTTGCACAGCTGCAGATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACGAACGGTC:1 + chr3R 25595647 5' + gtwin 90 2 66.44 ATTGTCCTATACGAAATTAAAAAACACTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 15540088 5' - roo 9036 1 59.59 AATAAAGTTTAAAATAAAACTTTCTGCACCCTTATTCCTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 + chr3R 19246716 5' + jockey 4754 1 76.03 CGGCGCTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGA:1 + chr2L 5341502 5' - Burdock 6326 2 64.38 AATGTTAAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3L 12125248 5' - roo 9039 1 63.01 AGACATGTGCCATAATCCAGTCGAGCCAAGTTGCAGCTGCCAGCAAATCAGCCATCCTGATTAAGACTATGTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1 - chr2L 2609015 5' - I-element 5308 1 52.05 ATTGACGGATGGTTTGGGCCAGACCCGAACCGGACAGAATGCAATTACCTATCCACTCCTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 - chr3L 7881212 5' + FB 62 1 59.59 GTTAAACTGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3L 27391430 5' - 1360 3373 1 66.44 ACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAA:1 - chr3R 5972343 5' + Doc 257 1 51.67 GGTGTAAGGACATTTATATTGATTAGTACTTGGTAACAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 + chrX 10056690 5' + hobo 76 1 70.29 AGGTTAAATATACGTTTAAATATTTTGAAAGAATCTACATTTCTTCGAGTTTTATTGAATTTTTATCTTCTGGTGTTGATAATAGAGGGACCGAGGAATCAATCGCTCTGTGCAAAATATCACTCATCGTATTGATCCGACTATTT:1 - chrX 22562577 5' - transib2 2345 1 49.32 AAGCTTTGCATAAATCAACGTAGCAAAAAACGGAAAATGAACGAAAAGCGCCAGAAATATATTTTCCAAAAACCGAACTCAAGCGTTAAATTGAACGTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr2L 20551095 5' - 412 471 2 69.86 CAACTTCTTCAGTTTTTTGGCATTGGCCTTCTGCATTTCGTCTCGTTTTTCCGGCGTCAGATCCAATCCATCGCTCAATTTCAAGCCAAAGGAGCAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACG:1 + chr3L 8961610 5' + Doc 4447 1 67.81 TATGGAATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGCAACTGTTGGGATATTTACGTCGCTTTGGATGTGTTCACTCCGATCGTACCACGTTGCCCCATCGATGGTTCGCTGATACTTAGTTTGCGCTCGCTGAATGATGTCA:1 - chrX 16515518 5' - F-element 4312 1 76.22 CGCTATTCATGTGAGCCGTTCGATCGTTCGGAGCGATAGCCTTTCTGAACCCGCAAAGTTCAGCTTGATGGATAATATAAGCTTGGTTTACAATCTTATCGTTTTTACATATATATAATTATAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATA:1 - chrX 16778495 5' - Quasimodo 7358 2 49.32 ATACGCAGTGTGTGTGCGCGTGCACAATGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 + chr3R 23415884 5' - jockey 4951 1 56.85 GTGCCACGCCTCAGCACCTGCGTTCCCCGGCATCGAGCGGAAATTCGGGTGAAAGGGAGGCTCCCGACTTTCCGGGTTACAGAGTAAAAATAACTTGCATAAACTTTCCCTCAAAGGACACACACTCGCACATACACACACACACA:1 - chrX 4346214 5' - Stalker 447 1 65.07 AATAAATTTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATA:1 - chr3L 18154450 5' + jockey 4632 1 66.44 GTACTCCTAAATCCCCCACTTCAGCTTTAATTGGAATTAAACATACCAGTTAGAAGAACAACTATATTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3R 14138520 5' - mdg1 369 2 53.42 GGTTAATCTGATCCTGTCTCTTGCAGAACTTCTTGTTTTGGGCTTACTCATTATGGGTGCCACACAGCCGCAAAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 8930458 5' - roo 361 2 53.42 GATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 12941788 5' + hobo 33 1 52.88 GCGTGTATAAAGGAATCAAAAATCTTGATTTTGATTTCAGATACTCCACCCCTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAGATAGGTGTCATG:1 + chrX 7508107 5' - roo 337 2 65.28 ATCGAGCCATCCAGCCATCCAGTCATCCGAATGTGGATAACAATTTCGGTTGATGTATCTGATGGACCTTTATTTGTGGCCTTGCATTGTTCTTCCCTAAGCCAGGGGATTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 - chr3L 22527634 5' - 412 7460 2 77.40 GGAAATATGCAAAAGCTTGGACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr3R 20345590 5' + blood 12 2 76.03 CGTTACTCGTAGAGTAAAACGGTATACCAGATTCCTTGAAAAGTATGTAACAAGCATAAGGAAGAGTTTCCGACTGTAGAAATTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCACGTCGATCCAGCCATGTCCATCTGTCCGTATGAA:1 - chr3L 21858919 5' + INE-1 122 1 80.14 ATTTCAAAAGCTGTTCACAAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3L 19222707 5' - 412 448 2 53.42 CAACTGAACTTTACTTAACTCGTATAAAATTGTACTCCTAAATGCCCCACTTCAGCTTTAATTGGAATTAAACATACCAGTTAGAAGAACAACTATATTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr3R 14138489 5' - mdg1 400 2 70.55 AGCACGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTATATTAAGCGAGTGTA:1 - chrX 11415783 5' - mdg1 344 2 75.17 GAAGGCCTATCGATCGGACAACCTTCAGAAGCAAATGGTAAGTAAAACATGACTGCGCAAAATGTGGAGGCAAGAGACCAATCAGCTATATTGAAATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCT:1 + chr2R 5010029 5' + F-element 4345 1 56.16 CACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATATTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr2R 14431209 5' + Doc 70 1 56.85 ATAACAAATTTTCACCAATGGCAAGCTAAATTTCATCAATATCAAATGCTGAGCGACCAAAAAAATATTAAATGCATGCATTTATAATTGACTAATGTTTAGTTCTGCATAACAGAAATAAGTATAGATGGCGACACAACAAAGAA:1 + chr2L 1588675 5' - Transib-N1_DM 366 1 56.85 GGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - 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chrX 16219294 5' - roo 348 2 61.64 ATTTTCCGCTATGCAAGATCCAAGTGCATAATTATTATTCGCTAGCTAAAGTGAATTCATTTAATGTATTTTATTGTTGATCTGGGTGTGAGAAAACCGGTTTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 7495443 5' + roo 8677 2 69.86 ATTGGAAGTTGTCTAAAGGCTGTTGACCAAAATCACTTTAAGCGGCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATACTGAGTG:1 - chrX 6283719 5' - P-element 2812 1 32.88 AATACACGCAGAAAAGGTCATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:2 - chr3R 20983939 5' + pogo 19 1 72.60 AACAACACCAGATACTATCCGATACGAACCGATCGCAACTTCGAGTCGAGGGCAAATGACGGTCGATGTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr2R 11663813 5' + P-element 10 2 64.42 AAACAAAGACACTAGAATAATAGAATAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCGAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGA:1 - chr3L 25119403 5' + 1360 3300 1 78.08 CAAACATGTGCACTGGGCGAAAAGTAGTTTTAAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 24011086 5' - roo 358 2 52.05 CAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:2 - chrX 7993145 5' - opus 427 2 68.49 ATTTCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3R 20983912 5' + pogo 46 1 54.11 TGTAAGGGAATTACTTAAGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 + chrX 15405945 5' + opus 160 4 57.53 GTTCGGTTTACAATTTCCGCGAAGGTTTGAAATACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCA:1 + chr3L 24996055 5' - 1360 463 1 75.86 CCCATAAAAGTGCAGCGTCGTCTCTCAAAATGGGTAACAAAAATTATTCATAGTGCAGTTGCCATTTTCCCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3L 18119432 5' + 1360 49 1 52.05 TTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGTCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 + chr2L 18112469 5' - transib2 2786 1 58.22 GTCCTTTGCACTCCATCCTCCGAGCGCCATGTTTTTTGTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTCTTAATTCAGC:1 - chr3R 30615236 5' - X-element 4659 1 70.83 GCTCATCGATGGCTGGCTGGCTAGTCACTTAGCGCACCGGGAACACTTTACACTTTAAGCCAAAACATCGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:2 + chrX 1758935 5' - Tabor 7273 2 51.37 AAATGGCGTATTAAATTAATTTTCAGCTTGTTTGAAGTTTTGACCCGGCCAAGAGTAAGGGAAAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 24444168 5' + hobo 12 1 77.24 ATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 21636410 5' + 297 41 2 58.22 GCAGAGCCAAATGCGTATTACGCTAAATGAAATGAAATGAAATGAAATGGGCAGAAATGGACAGTAAGGAAGCGCCAGAGAATGTAACTAGTGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 5495320 5' - roo 9044 1 66.44 TTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGCGCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTT:1 + chrX 7845747 5' + hopper 56 1 68.47 CATTTTATATGCGCCTTTGAAAAATGTGCTGACACTTTGAGCCGAAGCAGAAGCTCTACACTGCAACACACGTTTGTATGACAACTAAGACTATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2L 11476404 5' + pogo 23 1 68.49 GCAATGGGCACAGTCTGAGCGAAAAGTATGCCCATGAACAGGCTCCTCTGACCGGAGGTTACAAGTTGCCACCCCGCTCCACCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 17508216 5' - roo 9019 2 52.74 CCTTTGTGGGTTTTTTTTTTGGTTAGCAGTGAATGAANGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGCCGCGG:1 - chrX 8363656 5' + jockey 36 1 63.01 AGGCCACACAAATCTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAGGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 + chrX 21227072 5' + Tabor 27 2 67.12 CAACAAATATATAATAATAATATTACTCAGCCAAAACAAATACAGACTAAACTGCTATGGATTTTATGGGCATGAAAAGGGATATCAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 - chr2R 23278493 5' - mdg3 214 2 62.50 ATCCAAAATCTAATAGGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCGACCATATAATCAAATATATAAATATATATTTTTGATCAGGATTAATAGC:1 + chr2R 5705568 5' + INE-1 86 1 64.83 AGCTGCACAGTGAGTAATCCGATCCCCGAAAATTTGTTGTAAGAACCTGCCGTCCATTCCATTCCATTTTGATGTGATGAGTTTGCCCAGCAGACATGCAGATTCATTTTAAAAATACAACTTTCGCATAACA:1 + chr2R 13498184 5' + Fw3 49 1 60.15 CCTGACTCAGGCGCAGACGAGTTGGCCCAGAAGAGCGCAAGAGAACCGCTAAGAGCGCATTTGCGATTGGCAATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCAT:1 + chr2R 11115816 5' - roo 8613 1 50.68 AAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCACACCTCACCTTGATATGACAA:1 - chr3L 22435218 5' - opus 7451 2 53.42 AATATTTTAAAACTTTCTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 + chr2R 7407958 5' + 3S18 5815 2 57.53 TTTACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr2L 3911803 5' - roo 9041 1 65.07 ACAATTGTTGACGTTCAATTCGATCAGTGCTTTTATCATCTTTGTGTGAAGAGATAGACTATCTTTAAGCCAATTTCAGTTAAAAGAGTGTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGT:1 + chr3R 27007312 5' + roo 31 2 62.33 TCTTCATCTTCCGATATATCATTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTTG:1 - chr3L 2926444 5' - Doc2-element 244 1 79.55 CCTCAGAACCTCCCGCCATCCACCCTGCTTCTCCATACATATATCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGA:1 + chrX 17495692 5' + Burdock 6185 2 57.53 CTCTATGATATAGTCATAGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTC:1 - chr3L 21202130 5' + G2 2612 1 65.07 GGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 - chr3R 20345544 5' + blood 7069 2 56.85 CTATACATATTCAAAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 15137364 5' - roo 346 2 59.59 AGAGAGATGCACAGAATTCAATTAGCAAAATTGTTAAGTAACTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTGTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 23579284 5' - roo 9030 1 53.08 AGTGCATGTGCATGCTTAAATGCAATTAAAGGGTGTCGAAAAGAATGCAGTGAAAACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAGGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3R 28413867 5' - pogo 2038 1 58.22 GTATAAACGAACAGTGGACATTTTTCAAGAGGTTTCGACGACCATCTTTGCAGGATGTATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 26605639 5' - roo 9010 2 63.70 TTCGATTGTTCGCTCAAGCCGATGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTC:1 - chrX 19690620 5' + gypsy 7053 2 63.70 AACTAACTGATATACAAAGATGGAGTAAACGAGAAAAGTTACTAGCAAAAGGATCCTGCCATAAGTCAAATGGAAATTACGGTTTTACACTCACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGG:1 + chr2R 16429829 5' - Quasimodo 7064 2 64.38 GAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3L 16200745 5' - roo 9028 1 58.97 AAGTTTTCTATACGCTTTTAAGAAATCATGGAATATCATAGGATAAACGCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1 + chr4 880303 5' - pogo 2031 1 66.90 GAGTACAGGAAGAGGGGAACGATGAGTGCCCCAACCGGGAAGAGTTTCGAGTTGCGTTCTGAACAACTGGCGGACTGGGTAAGAAAACCGGTATGTGAGCGGCGATATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACC:1 + chr2R 13195921 5' + Transpac 4873 1 71.92 ATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3R 15102325 5' + roo 74 2 68.49 CTGATGGCAGCCCGCTTTTGGGACCCCGTGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATTTTTATTTTTATGCACGCAGT:1 + chr2L 8895260 5' + 412 83 2 75.76 ACTCTGAAACACACCGGCTTATCAACTAACATATTTGGACACTTTTTAAAAGACTTTGGAAAACTAACCGCTTTCCTTGTGTATTTCCTTTGTACATAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAA:1 + chr2R 24533327 5' - mariner2 741 1 65.75 AAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 - chr2L 11725045 5' + F-element 67 1 63.01 ATGGATAAATCTGACTATTAAATATGAATAATAAGTACTATTGTTTGCTTTTATGGACCTATATTATATCAAGATATAATTATTTAGATATTTATTCCATATATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTG:1 + chr3L 3771666 5' + 412 7497 2 69.86 GGAGGTCGAAAGTGGGACTACCCTTACTTTGGTGGGGTTGTAAAATATGTACATTTAGATGTCTATCGATACATTGCAAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTCACATTCTTGTGAAATAGC:1 + chr3L 15250833 5' + copia 357 1 53.42 GGCGGAGGATGAGAACAGACTGGAAGCAAACTCTGAACGAAAAAGCGAACTGGGAGTGGAGTGGGAATGAGAATAGGACTGAGGCCATTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATCATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCCAT:1 + chr3R 11075230 5' + 1360 335 1 59.59 TATTGCTGCATTTTGCGCATATTCAAGCAGTATTGATCGCGCTTAAACGGAAAGCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAATACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 19698216 5' + roo 24 2 69.18 CCTTGGTAAATTTATTTAAAAAATTATATTGTAATTTATCTAATTCCGTTTTAAGACTCCAATGCGAAAAGAAAATAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCT:1 - chr2L 14894150 5' + 412 7525 2 54.11 CAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCTCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - chrX 18767867 5' + hobo 78 1 79.03 GCATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCTCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1 + chr3L 17602536 5' + Doc 78 1 65.07 AGTGGTACCCACATGCAGTGGATTTTAGCATTCTAAACCTCATGCAAAACTATTGTGGGCGAAGGCTGAGCACTAAACATAATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATATCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAATACCT:1 + chr3L 12072510 5' - HB 1589 1 53.42 CCGAACAAAAACAGAAAGAGAGACAGCGATTCCTTCCAGTGCACACTGGGCCAGATTCCGTGTTTTTTTGGCATAATGTCAAAAACTTTTGTAAATTGTATTTTGAATTTAACTATATATTATAAAAGAGCTTAGATTAGGGACAC:1 + chr3R 447117 5' + transib3 83 1 63.70 ACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTGGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTT:2 - chrX 22689446 5' - 1360 3364 1 52.74 TATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGA:1 + chr3R 11757961 5' - invader4 3027 2 54.79 CAGCAGCAGAAGCAGCAACAACAACGACATCAGCTAAGTCAAAACAAGAATTTTCTGTTTATCCAAAGACACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCA:1 - chr3L 13872470 5' + 17.6 41 2 59.72 CAGTTTTTGTTTTTGTCTGAATCCCGATTCCCACTTTGTCCATTATGCTAAGTGCGCCCGCTCACTTTGAAGCTGCCAATGCCTTTGCCGTGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGGAA:1 - chr3L 18968286 5' + hopper 439 1 72.66 GATGCGCTTTGCCACTGGCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chrX 14825369 5' - P-element 2830 1 46.58 TGAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1 - chr3L 21292586 5' - 412 413 2 70.55 AATCAATTGCCATAAGCACTGAGCGATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAGTAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 + chrX 21227090 5' + Tabor 43 2 54.17 TTAATCTATTTTATGCCAAATAGAAGAGCTTAAAAATGAAATAATCTCTGCCACTAACGTCCGCATCTTAATATTGCAACTAGTCTAAAATGGGAATTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chrX 13667908 5' - hobo 2915 1 65.07 TTTCGCTTCGGCTTCGTTTCCAACTCTCTCGGCGCTCTTCGGGGTCTCTGCTTATGGGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2R 10541742 5' - P-element 2841 1 48.06 ATTTTATTGGATTTCTTGCTGCTTAAGACATTTTTTTTTTCTTGTGCCCTGCTGGTTGTTACATTTAATGAAAATTTGTTGGCAACGTGAAAGGCGTGGTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGC:1 - chr3L 5224523 5' - Doc 4570 1 66.44 CCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr2R 14431230 5' + Doc 88 1 73.43 GCTGCCTACAAACTGACAAAGAGTCAACTTCTCAGCCTATGGCCAAACGTGCCGCCATGTGAGACGCATATGAAAACTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTA:1 - chr3R 9146847 5' + micropia 108 1 52.05 ATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2R 10695786 5' + roo 72 2 67.81 GAATGATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr2R 16072890 5' + opus 7150 4 58.22 CACCAGTCTCCATTCGGAGTTGGGGCCCAACTCCGTGTTTCCAGACTAATGAAGATCTTTATCGGCCGCCGATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTTACATCTTGTGG:1 - chr3L 17935042 5' + HMS-Beagle 6813 2 65.83 CTCAACAAATCTTGTTTTCCTTTAAAAAAAATTACAATATTATTGGCTTAATCTCAATTGACTGATTATGATTTTCTTGTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2R 15698036 5' + opus 7154 4 57.93 TGGTTATTTATCTGCTGCTGAGATTGGAGTTTTGAATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCC:1 - chr2L 21657080 5' + invader1 3653 2 77.40 AAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3L 5398144 5' + roo 69 2 65.75 TGTTGTTGAGCAATGCATTAAGTGCACAAATGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGGCTATTGAGCCAAAAAGGATAGAAGAAATCTTTGAAATAATTAAATTACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGATTTGT:1 - chr4 905653 5' + Helena 6 1 71.72 GCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTA:1 - chr3R 12376515 5' + flea 4821 1 61.64 ATTAAGAGCCACAATTAATCAAACAAAACTGATTGAAAAGCGAAAGGTCAACGGTTAGATATGGTTGCACAACAAATCATGCGCCTAAGTGTAAACAAAAATGTGAATTGGTTTCATGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATT:1 - chrX 11042855 5' - rover 7008 2 63.01 AAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAG:1 - chrX 21667925 5' + gypsy2 81 2 70.55 ACACGGCTTCGTTTCATTAAGCAAATGGTCCCGGGTGTATAATTTTAATACGCAATTACTGGCGTTTCAATGACACTCAATGATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2L 15917720 5' - roo 9034 1 60.96 AGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAG:2 - chr2R 18044024 5' + jockey 4641 1 72.60 CTTTAAAAAACATTTTTACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 3911789 5' - roo 9055 2 74.66 ACTAAAAGAGAGATATGAAATGGTATCAGGTGGCACAGGAAACTGTCCAGGCATCCTTCTGGCTGATTGGCAACTGAAATGGAGAGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGC:1 - chr3L 20934248 5' - Max-element 281 2 64.35 GGTGAGAAGTTGTAGGCTGGCGTTAACAGATCGTCCTGGATCTCAGATCTATTGATTGACAGATGCTATTGTTGGACAGTTCATCTTACAATTTGGCACGAAGTTCCTTGCGGCAGGTGACTGAAA:1 + chr3R 26025701 5' + G5A 407 2 56.35 CAAATGAAATCATACCATCTGCCATAGATCTATGCTATAAACATATATAGGTGCTGATCTGTGCTCTTGAATTTAGTGTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATA:1 + chr2R 17275622 5' - Stalker4 7005 4 58.90 GTCTTATCGTGGCCACAAATTGCAGCGAAACTTCATGGGAAAAGTTTGGAAATTCTTTGGATTGTCGCAGACACACATATGTTACAATGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATTTCATTAAA:1 + chrX 16982057 5' - Juan 4178 1 61.87 ATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3L 20765131 5' + 297 6630 2 52.41 ACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGT:1 - chrX 3797449 5' + gypsy 7014 2 67.12 ATATTCCAACAAGTGGTCCATCATTTGAACATAGTATCGTGGTACACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATC:1 - chr3L 22016890 5' - INE-1 148 1 68.49 GCCTTTTTCTTTCCGCATTTATTTTTATCTTTTTTGGCAATCAGCATCAGCCGAAAGGAATTCCCCATTGACTATGCCGGTGTCAACAAAGTGGCGGAAAAGAATTAGGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTT:1 + chr3R 6602911 5' - gypsy 7435 2 76.03 ATTTCAGGGGGTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1 - chrX 18767884 5' + hobo 81 1 72.92 TAATTATTATGATTACAAACAGCGAAATATATTCCCCCAGTGTCTCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGTATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAAAATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 5495153 5' + roo 8681 2 71.85 GGGCAAGAATTAAAGGATTTAGTTTCATTTATTATTACGATATAAAAAATGTTATCAATCTTATAAATGTTTTACGGCTCAGTTGAAGTTCCTGACACAAGCTTTCAAACTCACCTCTACAACTTTACGTGGAAAGTTTTGACCCT:1 - chr3L 13444188 5' - Quasimodo 7098 2 82.19 AAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATACCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 + chr3L 13992267 5' + blood 7097 2 75.34 AGTGTTGCTAGGATAATGTAATTAGAGTGTTGTAAGTTTTGATAAAAGTGTTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 8930618 5' + roo 8681 2 71.92 AAGCTGTGAAGGTCGTGTGGGTGTTTCCGTGCGGGTTGGGGAAATCAGATATGAACCACTGCCAAAATCAATGGGACCAACACACACACATTATTGTGTGCGTCTACTACTAACTATTTGTACATTTAGCAAGTG:1 + chr3R 5019518 5' - hopper2 1274 1 66.67 GAAGACAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2R 22112597 5' + 412 7076 2 64.38 GGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTTTCTGCAGCTTCA:1 + chr3R 13898232 5' + 3S18 59 2 70.00 AGGAAAGTTTTGAGTCACGATTCTTCGCAGCACGCGTAAGTTATTTCGGCATTTCCATTTCCACCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chr2R 11663920 5' - P-element 2831 1 47.26 TAAAATACATTTCGCTATATATTTGCATTTATTATTGAACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 7042774 5' - roo 396 1 77.40 AAATTTCTATCGATATACCATAAACACTTTGCCCACGCCCTTCCTGACATCTTCAATACGCCGAAAACGATCACGTCCACGTTTTTGAACATTTTAAGGGGTATGGGGTATCTAATAGTCGGGCAACTCGACTATAGCATGCTCTC:1 + chr2L 22097514 5' + INE-1 575 1 60.96 AGCGGGTAAGAAGGCAGAAATGAGACTAAAAGAGAGATATGAAATGGTATCAGGTGGCACAGGAAACTGTCCAGGCATCCTTCTGGCTGATTGGCAACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1 - chr3L 20934272 5' - Max-element 8509 2 67.12 GTTTGTTCAAATAGTATTATTTATAAAATATTACTATTAGATATTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGTTATGC:1 + chrX 17775257 5' + 412 7129 2 69.86 ACTAAGGTGGACAAAAGAGAGAGAGAGAGAGATT:1 + chr3R 19495270 5' - blood 166 2 88.24 GAAATTTTCCGCCCCTTGGCCAACTGGCAATTTGATTTGCAAATTGAAAACGGAAATCTGGTTTTGAAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3R 17996807 5' - copia 238 1 52.78 CTCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGTGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:2 - chr3R 13530031 5' + jockey 30 1 69.18 CATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chr3R 11758500 5' - P-element 2814 1 34.93 GATTTAAGAACGCAATGCCACTCATCATCTCATCTCATCTCATGTGGCAACAGAGCTTGAGATCTTTAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 5456687 5' - roo 9045 1 68.49 GCTTGTTGTATTCAATTTGCTTGTATTCAATTTTTAAATGAAATCCTTTACACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 6399318 5' - pogo 2075 1 68.49 CCAAACATAAAAATAGGAATTTCGGGTAACAGTTTATTAGTTTACGTTTTAATATATATTTATGGGACACAGGAAATAACCTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3R 32065431 5' + 1360 38 1 59.59 CCTGCGAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTGTGCTTTATTGTT:1 - chr2L 13328508 5' + BS 46 1 51.08 TAAAGATAAAATAACATTTTTCAAGCCCACATGGATGTTTGGACTAACAGTACTGTTATATTTTGTAACTGTGGTGAAACCTTAGCCGAGACACAATTGCTCTCAAACCTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGACCCCGAGT:1 - chrX 2524752 5' - opus 82 2 78.77 CACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTC:1 + chr2L 21325093 5' - invader4 3023 2 65.75 AGTTTGTGGCAAAAGTTGCGTATGAATAATAAACAGAGGCATGCCAGTAAATGGAAACTCATAGACATAGACAGCTTGGAGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:1 + chr3L 2668796 5' - Bari1 1694 1 68.49 TAATGCTGACTAAGTGAAAAACCAGATAGGCACTCGAGCATTTCGAGTGTGCTTCCAGGAGCGAATGCAGCTCGAAAACCCTCGAAACACACACAGGCACACACACCTCGCACATACACACACACACAC:1 - chr3R 18960811 5' - Stalker 446 1 79.07 GAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGCTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCG:1 + chr2L 13697637 5' + F-element 101 1 78.79 ACGCAGCCGCGTCACGCCTCCGCTGCCCACCGATTGGTGGACTCGCCTTAAAGGGGAAAGACCAATGGCTCCCAATTCAATACCAACTTGTACGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCC:1 - chr3R 24787950 5' + I-element 5046 1 52.74 GGAGCTGCCTGCTTTTCCCGGAAAATCGGGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr3L 22435073 5' + opus 7032 4 60.96 CAGGGGGTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGTGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 - chrX 18767880 5' + hobo 69 1 71.09 GTTCCCTTCCATCCTCGCCCTCCCTCGCATTTCCCGCCGCTTTTCCACTCGCTTTTCCCCGACACAACAATAATATGGCGCGCAATATGTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 + chr3L 2687156 5' + jockey 4702 1 63.70 TTGGCTAAGCGAGCATTACCATGGAAATNGGAACAATTCAAATGTTTTAAGTGCAACGCCAAATACCCAATCCTTTGCGCCTCCCCCCCACAAACTTTGCNCAAACATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 18204494 5' - hobo 2930 1 74.31 TAATTATTTGTAGCATACTTTTGTGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCGAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAA:1 + chr3L 18947241 5' + BS 4717 1 52.74 TAGCATTAAAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCA:1 - 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chr4 868718 5' - roo 328 2 73.29 AAACAACAAAATTTACCTGCTTAATTTAAAGATTTTTTTTTAATATTGCTTAAATAAAAAGGCAGTGCTTTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAA:1 + chr2R 6648190 5' + R2-element 3422 1 52.05 GTCAGAGCTATAGCATTTTTCACTGTCATTATACATTGGATAATTCCTGGGTATTATGTCTCCGAAGTTGCACAATGTTATATTATCATATTCAATCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCG:1 - chr2L 14811559 5' - roo 237 2 65.07 CAGCATCCCCAGATCTCCTCTTTTCCATGGAGACAGAGAGGAAATGCCTTAAATCAATTAGTTGAGCACTAATTGCCCCAATACCTTGTGGCATAGTTCGCCATTTGCTCAGCATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCAT:1 - chr2L 7321549 5' - 1360 497 1 78.08 AGCAGATGATATGAGAATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGT:1 - chr2L 16884716 5' - Bari1 1652 1 55.48 AGACCAGCAACAGGTCGTTTTAATTATCGAGTATCAATTTAGATGAATTTCAAAAGATAAGCAAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGC:2 - chr2L 5341640 5' + Burdock 6156 2 68.49 CACTGGGTCCCAAATCTTCGGNGAACACGTTGTTGTCTTGCTGTTGTTGCTACGTGATCGCCATGACAATTTGTCAATTGGGTTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGTTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:1 - chr2R 21530095 5' - HMS-Beagle 7032 2 75.54 CCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3R 20983905 5' + pogo 52 1 53.79 TAATCAGAAGATTAAAAGTAATTTCGTTGGTTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTT:1 + chr2L 22340104 5' + Doc 72 1 61.64 TGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3L 20573763 5' - pogo 2041 1 60.96 TCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 27007422 5' - roo 327 2 69.18 TGTTGGTGCTGTTGCAGTTGTTATTGCAGTTATTGTTGCTAAGTTATTGTTAACTTTTAACAATAACTACAGTTATTGTTGCAGTTTCAGTAGATATCGTGATTAGTGTGCTGGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGG:1 + chr3L 20914801 5' - Doc3-element 457 1 71.92 AAGACCACGAGCAAGACCACTGGTAATCCAAAACCACCTGAAGGACAAGTCGTTCAACCTGCAAAAAGGGGTATTGATGTTGCCCTACGCATTTCTATTGTTTAATCAAGGCAAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATA:1 - chr3R 9880478 5' - I-element 5346 1 45.89 CATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTT:1 - chr3L 19350039 5' + 1360 3231 1 50.00 ACCGATTGCCTACTTTAAAATAGTGCTGAGCTGTGGATGTGTAGTTTGGGACTGAACTATAGCGGTTGACTACTCCTTAATACTGCTTATACAGTATAATCCGNTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2R 25083410 5' + pogo 34 1 62.33 AGAAGTTTAACTAAAATAATAAAAGTCAAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9955448 5' - accord 7034 2 58.87 AGGAAGCAGACAGCATACAGCAGACAATGCCATTTTATGGCCCATTGAGCAGCACCCCGGCTTGTTTACACCTTTCAAAAACACTCGCCTGGTTCTCCAAAATAGCCGACTGGAAGAACTGTTTGCTCCAAGATATCTTTGAAGTG:1 - chr3L 4082044 5' + hopper2 342 1 63.01 GACGTCCTGGCTGCACCTTTAACCCCAGGGTCCTGGCTCTGAGTCTGGGTAATCCCCGTTTGGTCGCTTGGCGCAAATCAAAGTAATTACAGGCGAGAGAGTCTGCCAAGTGCCCCGGCCACGCCTCCTTCTTTTTTTTTTTCTTT:1 - chr2R 12105960 5' - Doc2-element 225 1 54.11 GAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 16219274 5' - roo 328 2 75.34 GAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr2R 14431203 5' + Doc 62 1 53.47 TTTGTTGCTCTTTGCTCGGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 16995475 5' - roo 353 2 54.79 ATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCT:1 + chr2R 5070922 5' + Tirant 8123 2 28.08 AGATTATAATGGAAAAATCAAAGGGAAAAAAACTTGAATAGAAATTAAAAGAATCGGTGGAAAAACGCACAAGAACGGAAATAACCAAAAATATAACAA:1 - chr3L 14136340 5' - frogger 2182 1 47.47 ACAAAGGTTAACTAACAGAAATAGCAACAATTTGAGATTATTTAACTTATTAGATCTATTAAGTACTAATTACTCACTAATTTCATAAAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTATTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATT:1 + chr2R 12887877 5' - Idefix 6977 2 62.33 CATAATTCGCAAAACGCTTTCTTCTCAACCAAGCTGCTTTAGAAAGATGGCCTCAGATGAAAACCCCTAGATACTGGCGATGTATAGAAATCGCTTAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTGTTGAGTCTAT:1 + chr2R 16184977 5' - 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chr3R 22352570 5' + I-element 11 1 76.03 AAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATT:1 + chr2R 12248988 5' + Juan 4105 1 69.18 GATGGGTTTTAAAAATGACAGCCCTTTATGAGCCAAAAAACTTGGTTAAAGTGGAATACAAAAATCAGTAGAGGTACACGGAAAAAAATGATAAGTAATTGGGGAAGATTCTAAAATTATAACAGTTATTATTATTATTATTTTA:1 + chr3R 7655833 5' - invader3 5056 1 69.66 TTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1 - chr2L 1451240 5' - mdg1 348 2 65.75 CTCATGTATAGACTCTTCAATACTTTGGTTACCATTTGTGTCCAAACAACAAGAGTCTTCAACATGATCTGTATTTTCAAGTTTGGATAATATGTCTTGCGATTGCTTGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGA:1 + chr3R 460041 5' + F-element 102 1 73.29 CTTGACTTTGACATGCGACTCGAACTTCATTAGGCCTGGTTCATGCGCCTGCCTGGCTGCCTACCCACTTGGCCAAATGCTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAA:1 - chr2R 23773380 5' + I-element 5202 1 57.53 TCACGCGGTAATCGCATTTTAAGCACACTTTAAGCTGCCCTCGATTAAGTGCAAGTCCGAAAAGGGGAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3L 3606753 5' + 1360 53 1 51.80 ACTTACGATACACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3L 8274037 5' - hobo 2909 1 64.08 ATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:2 + chr3R 31458418 5' + jockey 86 1 70.55 GTTGGCGGCGTTTGTCACAATGGCATTTAATATTTGGACACTGGCACATCCCAGAGCTGTCCCTTCAGGAAATTGTTGGTCGTGACAAAATATTTGATCAGGGTTTCATGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCC:1 - chr3L 19249310 5' - R1A1-element 452 1 72.60 ACAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGA:1 - chrX 21933337 5' + springer 3 4 75.81 ATAGTTTTGCCAATTTGATACATTTAAAATATTTAAAAAAATGTATAATCAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2L 20508439 5' + pogo 18 1 69.18 CTAACCCGTTATTAAGCGACAGCTTCAACACTGGGCGAATTACCCAAAAAATGCAACTCAACTAAATAGTTAACCTATATTTCAGTTATAATTATAAACTAGACCAAACTAGATTGGCAATAAGTCACTCCCATAATTTAGAAAGG:1 - chrX 19024560 5' - Helena 210 1 77.40 GCAGTCAAAGCCAATCTAAATTGAAATGGAAAATTATAAAACGAAGCCAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:2 + chrX 7042606 5' + roo 8703 2 56.64 AAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGC:1 - chr2L 5341578 5' + Burdock 82 2 72.60 ATTGCGTTAACCGCATTTCGTTTATTTGCCGCATTGCATTAAATGACCAAATTAGTGGGTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATT:1 + chr3R 11936689 5' - Idefix 319 2 59.59 GGAGGAGGGCCATCACGAGCAGGGGAGTGGGGGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATACACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 + chr3R 13898200 5' + 3S18 53 2 52.74 GTCTGCTTGGGAAAACTTTAGCAAATTGCCATTTTGGCATTTAGCTGCAGCAGGCGGAGACGGCACCCCGCCGCCAGTTTTCTTACATTTGAGAGATTATTTTGTCGTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr2R 18551836 5' + I-element 14 1 76.71 ACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chrX 7042736 5' - roo 9021 2 52.05 TGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAG:1 - chrY 2720337 5' + gypsy 49 2 59.56 CGGCTGCTATCGACTTGCTTTGTTTACATCCGCTGGGATTTATGGGCGGCGAGACGACAATAATAATCAAGGAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCGT:1 + chr3R 11613581 5' + gypsy4 130 2 50.68 TATTCTACGATGCTTTATAGAAAAAACATGTCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACGTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCA:1 - chr2R 16072996 5' - opus 416 2 77.40 CAGCACTTGGTGTCAAAAACAGGGAGAAAACTGCCAAAACTTTCTCACTGCAGCGATAAGGGGGTATATAGCATCTACAATGATTTAAGATAATGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAATTTAAGCCGACTA:1 + chr3L 9307898 5' - Cr1a 4090 1 50.00 CCAGTGTGACCACCCTAGCCCATGCACTGGCCAGCGATAGCCCCATCTATCGGAGCCACTGTCATCTCTAGCAGCACAGCACGAGTAAAGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr2L 6047968 5' - P-element 2859 1 67.12 CATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chrX 22511441 5' - roo 8988 2 76.71 AATTAACCCACATAAAGGAAACGAAAAATAATTCTAAAACGTTTTTTTTTTGGCATTTCAACTATCTGCACAACAAATTTCATTTTTATAGTCGCGTATCAATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 + chr3L 2076786 5' + Bari1 20 1 53.42 AATAACGCTAATTTCCCATTGTTGGACACAATAACAACAACTAGAGCGGCAGGGCAAAAAAACCGAAATATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACT:1 - chr2L 1386492 5' - roo 8813 2 53.42 GTACATATGAAGACCACATCATAACTGAGTTTCATACATTTTTATTGTGTTCACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGAT:1 + chr2R 7011039 5' - Quasimodo 86 2 66.44 GCCACGCCCCCGATGCCCAGTATTTCCAGCTATAAAGTACTATTTATCCCCCCGCATACCTCACACTCTCTTCGCTAGAATTCGCCCACTGGTTTATTAATATGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATT:1 - chr2R 19577504 5' + FB 758 3 69.86 GGTTGGTGATTGAGCTTTCTTTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGGTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGGGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGGTGGGGGCGAGGTGG:1 + chr4 267659 5' - G6 1830 1 80.00 TAGAAATAAAATGGCAATCCCATTTCCCACTATATTACAAAAATCTTCTAAAGATACCATCTAATGTCCTTGGATGGCATGCACGGTTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCT:1 - chr3R 9284886 5' - Rt1a 4964 1 68.89 TAAGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3L 16200707 5' - roo 9038 1 62.07 TGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 10695774 5' + roo 8724 2 59.59 ACCAACTTAGGGAACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr3R 12115219 5' + 1360 16 1 71.23 CAAAATGCAGGCTAAAATAGTACCTTCAAGGCCTCGCGGCAAGCTTAAAAAGTTTCATAGGAAATATCTTATTAACGTACGCATATTTATGTATATACATACATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCC:1 - chr2R 17696173 5' - rover 330 2 74.66 AAAATTATAGACTGCTCTGCGCCGTCTACATTTCACAGATGTACAAAAAAAAAAACAGAGAAAAAGAAATAACAACCGCCTAAATGCCAAGTCAAAAGAACAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAA:1 - chr3R 14445955 5' + Burdock 6370 2 67.81 CAATGTAATGAGCATGGGAATCGCTTGGTTAAGCACTTGTAATTATTTCTCATTCGATATTAATGCCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGACTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 + chrX 10667008 5' + jockey 4762 1 53.42 ATTTTGTATTTTTAAGTAGTTAAGCCCCAGAGTTGTGGAACTTTATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 5456533 5' + roo 8706 2 56.85 GATGCTTACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chrX 20024500 5' + 412 7094 2 51.43 CTAACTTTCTATAGGCAGAACAAATTAAAGTAACCAGATAAGTTAATATAGTTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr2L 11476266 5' - pogo 2035 1 64.38 CAAATGTCATGCTAAGCGCGATTTTCTCCAGTCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGT:1 - chr3L 18968695 5' - hopper2 1520 1 78.08 ATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAACCCGGTATAGTAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGTAGTAGTATGTCAAAAGCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGA:1 - chr2R 5924406 5' - jockey 4740 1 32.88 ATTAAAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAATACACGCACAC:1 - chr3L 19350062 5' + 1360 3207 1 66.21 GGCCCAAATGGCAGGAGCAACAGTAGCAGTAACGGCAGTGGCAATCATGTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chrX 10157588 5' - roo 9006 2 65.49 AGAGTATTCTGAGAATGTCCTCAGTTCGAGGAAGAGGTATTAAGTCGAGTTCATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACC:1 + chrX 4200914 5' + FB 68 1 65.28 CATCGGTGCAGTCAAACTGCACGTCGTCATCGTGTGTTGTTTATTTTAATTACTGAAATTGCATTCGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 - 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roo 9023 2 54.29 GCTGGAGCCTTGCCGCTATATACCGCAATTGATTTAAGTTACCAGGCGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGGAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATAGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr3R 23511697 5' + 297 6594 2 71.92 CCTAGCTATCCCAATTATTTGCAGCAGTTTCTGCAAATGCATCTAACGATATTATACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCA:1 - chr3R 10900945 5' + F-element 35 1 63.70 GACTGTCCAGGTGCCTTTCCACACGAAGAAAACCTTTTGTATTAGAAATCTAGCAGTTTTAAAAACTATTTCATGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGG:1 + chr3R 18706604 5' - I-element 67 1 50.00 AAATCAAATTTGTTGTAAGGCTCGTAACACTCGAGGGTTGACTGACTGCCTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chrX 10694366 5' - Transpac 241 2 66.44 TAACCGAAATACACAAATATGGTTGCAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCT:1 - chr2R 24807938 5' - I-element 5263 1 79.45 TTTCAGAAACATTCAATAAATAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - 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chrX 21907818 5' + 1360 9 2 39.73 TGTTGTGTTGCACCCTAATTCCAGTTGTAAACATGCGCCCATACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 + chr3R 31031982 5' - hopper2 1531 1 69.18 GCGTCCCTCGACAAAAGAAACAAAAATGTCTTCGAGTTGAGTCACTTACACGCACACACGTTACGTTATACACACACTCACACACACTCGCTGGTGCAAATAAACGATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAA:1 - chr3R 25518500 5' + 412 7475 2 70.55 GTGCGGAATGTAGCCACAGGCGCGCAGCGTTCGCATCGCTATCCGCTCCGTCCATGTGTACTTGTAGTCGGAGATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGGTTTTGTAAATGTTTGGTGG:1 + chrX 7933110 5' - I-element 196 1 55.22 ATACCATTAGGTCCATATTGTCAACAATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:2 + chr3R 24010952 5' + roo 39 2 57.53 AAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAG:1 + chr3R 11757978 5' - invader4 259 2 64.49 GGCATGGCGTATGTATGTATGTAGCATATGTGCGGGGCTGTATAAACGAACAGTGGACATTTTTCAAGAGGTTTCGACGACCATCTTTGCAGGATTTATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - 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chrX 19887175 5' + P-element 30 1 64.29 ACACAACAATGATCAGAAGGATCTGTTCGTATTAAAGAAAAATCATTTTCCGCCTGAACATCACATTGTGAAAAGGGAACCTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 12342077 5' + hobo 19 1 68.75 CCCGCGTAAGTAGATAAATGTACTCCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 17871845 5' - roo 9019 2 62.69 TAATGCGTGCGGAGCTGCCTGCTTTTCCCGGAAAATCGGGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3L 22435063 5' + opus 7022 2 67.81 AAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr2R 22774593 5' + I-element 79 1 69.86 CAAAATGTTGCATAATCATTTCGTAACAGATCCCAAAAGTATACACTAATAAGTAAACAGAGGGAGGTAAACATTACTAAGTCAACTTTAACCAAACACTATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATA:1 - chr2L 1922630 5' + BS 5018 1 56.16 GGTGGTTCCACCAGTGCTGGAAAAAGGCCGATCCCAAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 - 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I-element 5346 1 77.40 ATAAAAAAGGCAAGATAAGCACGTCAATTGAAATTCGGCAATCAATTAACAAATAAGCGTATTGTCAAATATTCATACCCATGTTGCCGTTTTGGCCAAAATAAGTAGGCGTCTTTACAATCTTCCTGAGATCTCGACGTTTATAC:1 - chr3L 10101588 5' - INE-1 137 1 50.68 GAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2L 13468235 5' + roo 72 2 67.81 TTGCTCTCATGTCTGAAGAGTGTTTGCCTTTTGCCGTTTGGCATTTGAAGTGTTTATTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 - chr3L 16697418 5' + FB 49 1 60.77 GTTGGTTACAAAAGATTGCCTATAGATACAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGGTT:1 + chr2L 22340129 5' + Doc 97 1 77.40 TCTTACCCTGATTACATTAAGAAAATCCTAATTTTGGTAATAACCAATTCCAAATGTGCATAGATTAGGCCCGACTTAGAGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATTTG:1 - chrX 7032788 5' - roo 9031 1 58.22 GGTGGAAGACCCTCGATGATAAGCGTATGAAACAGCATTTCAGGTAATTTCTTTAAGAACTACTTGAGCGAATATGGCATGACCCTTGAAAATACCCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - 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chr3L 8249502 5' + HMS-Beagle 6826 2 65.07 GCTTGGTGCTTGTGCATTGTACTTTTAAACGCTGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 + chr2R 17695992 5' + rover 6977 2 67.12 CGTGGTTTAAAAGCAATTGCTGGCTTCTTTTGATTTTTTCCCGGTCAACACGTCGTAAATGTTAGAGATGACACTGTATTATCAATTAATATTATTATTATTAAGTGGGTTTCTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTA:1 + chr3L 11833500 5' - baggins 5401 1 52.74 AGAGCTTAAAAATGAAATAATCTCTGCCACTAACGTCCGCATCTTAATATTGCAACTAGTCTAAAATGGGTATTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 - chrX 13667884 5' - hobo 2891 1 53.42 AAATCCTGTCATCTACCTTTTCAATATTTTAAATATGGCTTTGGGCTAATAAAGTAATAAACAAATCGCAAATTACGTTTTCCTCTTAACGGTGTTGAAAACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGT:1 - chr4 1063962 5' + S-element 1701 1 63.01 TTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chrX 15406057 5' - opus 7445 2 56.85 CACCATTACCATTCCTTTCTGTCAAATAAATTCGGCGTGTAGAATCGAAGCGGTTATGTATCGTTCGCAAAGAGGAAGCGTATTTTCTGGATCAGATTCAATAGCAGAGTCAGTCTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr3L 23486110 5' + 1360 6 2 53.42 GTTTCTTGTTTATACGTATACGTAATATAAGTTTCAGATACGGTAAAAACATTTGGCTTAGTTTCTCAATGTTTGAAAACAATGAAATCGCTCGTTGTTTTGTGTGATGCATATGCTTGTGTATTTATATTTTATTTTATTTACTA:1 - chr2R 11994357 5' + transib1 1901 1 65.75 GTAGATGAAGAGTTTCGGGGGTGCTTCTAAAAATTATGGAACTGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3L 20573721 5' - pogo 2084 1 73.79 CATAAAAGTGGGTCGGCGCGCGGAGTGGGAGCGAAAATTGAGCGCTGGCCACATAAAATCGAATTTATTAGCATTGCATACTTTTGGGGGCAATCAAGTAACCAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 19725310 5' - hobo 2921 1 69.86 CGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTT:1 + chr2L 20360643 5' - R1A1-element 106 1 51.80 TTTATGATTGAGTTTTTGTCTGAGACTCGCTATTCCGAAAGACAACTGGCATTTAATTTCAGCCAGATGACTTCATGGTTGTTCCGGACTCATGGAAGCCCTATAAGAAAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr3R 20983741 5' - pogo 2092 1 72.60 AAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2R 14332097 5' + jockey 75 1 65.03 TGGGCGCCAGATTTAGACCTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAATTGTGATTTACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTACATATTATGTCTATGTATGTTCATCATCATCATATACG:1 - chr3L 22747058 5' - FB 1072 1 42.47 CAAAAGGTATTTAAATAATATAGCGTCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTA:1 + chr2L 1729751 5' + Transpac 4981 2 58.90 GCAAACTTTTGAAAAGGGCTCATAAATAAGAAAGTTTTGCCTTTCAGCTTGCTTCCAGGAATTTAGGTAAATGTTATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr3L 13992188 5' + blood 7018 2 71.92 AGCAACTCCAAATCACGGAGTCTCCATTCAGGCGACGACTAAAGATTCGAAAAGATAAAGACGAATACTACCGACTCCTCTAATGCCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTATGAACT:1 - chrX 9758388 5' - Tc1 1369 1 56.16 ATTGCAACACTTTCCCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr3L 9522166 5' + opus 7026 2 62.33 CTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 + chr3L 17757961 5' + Tirant 66 2 75.42 GATGCCCACACTGATGGCCGCCAGATGGAAGTAGTCGAACAGCACCGGCAGATGGTAGTGAAGGCCGCGTCCCGGATTATGTCACAACCTTGTATCGCAAAGCTTCCTGGTTCGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGG:1 - chr3L 1288179 5' - ZAM 7968 2 51.77 ATTTTATACAAAATTTTTGATGAATTTATTTATTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 - chrX 16996156 5' + roo 59 2 58.90 AGATATAATGCATAATTCGGTTAGTAAATATTAAAAATGATGGAAAAGTTAAGAATTAGACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr2R 8596868 5' - pogo 2097 1 77.40 CAATTACTATTTTTGGGGACCTCCATTAAGTGTTCTAATCACTTTCGACCATAAATTATTGTTGATCTTTGTGCGCTGTGAATTCCCTCAATCGAAAGCAAAGTCCCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 13850580 5' + roo 13 2 75.17 CACATTGCCAACGCCCCCGAAAAATCGCTTTGATTGATGCGCAAACAAAATTATTTCGCTGCATACTTTCGGGCGAGCGCATTAAAGCAGTTCCTCTTTTTTTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 - chr3R 31086645 5' - jockey 4979 1 65.75 TTAACAAAAACATTTGGTTTTTAATTGGCTTTAAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAA:1 - chrX 7847275 5' - hopper 76 1 56.85 GGTAAATGTTATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr3L 13992253 5' + blood 72 2 67.12 AAGAGGAAGAGAAATGCAACGGATTCACAATTCACCTTAGCACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATG:1 + chr2R 16731276 5' + Tirant 78 2 71.03 GTTGTTAGGTAAATTGGATTACAGGCCAGCTAGCCAAAAGTTTCGACCCAGCCTCCTGCTTCAGCATTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTACCAAAGTTTGTGCACATTCTA:1 + chr3L 19206579 5' - Bari1 1313 1 53.10 GAAAATTCGGCAAAATAAGCTTCTGATTGGATTGGTTTCTCCATTTCAGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTA:1 + chr3L 9659433 5' + mdg1 73 2 68.49 AGTATCGATATATCGAGCACGAGGGCTATTGATCGTTGTCCAGCTCTATGGACTTTTGGCGGCAGGGTTGTCTATCTACCGATAACATTACTCATCGGATATTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTC:1 + chrX 19601831 5' + F-element 369 1 68.49 ATTAGCAATTTTGTGGAAATGGAATAAAACCCTAATTATTTCTGGTCTTGAAATTCATTAGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 - chr3R 14401992 5' - Juan 4186 1 63.70 TTGGATAATTAACGGAAAGTTTTGAGTCACGATTCTTCGCAGCACGCGTAAGTTATTTCGGCATTTCCATTTCCACCAAATAATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr2R 11663932 5' - P-element 2843 1 53.42 GTCGCCTGTCTCTCTCTCTTTCATGCTAGCCCGCTTTTTTTGCACAGAAATATGTTGCTAACTTGTTAAGACAATGGTTTTCAAATGTTGCATAAAACCGGACAGCAAAAAGATTTCATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACAC:1 - chrX 20024670 5' - 412 487 2 61.64 ATATTAAAATAACGAGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr2L 13468322 5' - roo 344 2 66.44 TATTTATCTCTCACTGGTGCTTAAATTTTTTAACAATTGCCGCCAGCTTTAGCAGCGCAAATATTTTGTCGATTCGCGAAAAGATATAGACGCGATATGAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTAT:1 - chr3L 22152357 5' - Cr1a 4319 1 53.42 CATTCCATCCACAAATGTGCTGCCAATTTGGGCAGCTTTCGGCCGTGGGCGTGGCTTATACTTTTTTGGCATATGTATTTAAAAGACTAACACTCCTGGCTCTCTCGGCTCTTCTGAGCTCGGTGGTTATCGCTGCGGCGAAGCTG:1 - chr4 223411 5' - Rt1c 5241 1 61.64 GTTTCGCTGCTGCTCGGACTCGGTTTGGGCCAACACTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCG:1 - chrX 19887128 5' + P-element 83 1 29.45 GTGCTCTCTGTCGCACTTTCACCCTGCCATGAAGTAACAGAGAGCGAGAAAGAAGCGGACCCACCTTATCTTCCTCTTCCTCCCTACGAGCCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATATCCGAAGCTTACC:1 - chr3R 11758620 5' + P-element 26 1 68.06 AAACCTTATGGACTTTTTTGTTAGAGTTATCTAAGCCTTAGTACATTTTTTAAAACATCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCA:1 - chr3L 14233138 5' + copia 65 2 63.70 CGGCGGAGGAGACTGGGCTAATCACTTTTTGATTTATTCGCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr3R 5170934 5' + F-element 39 1 65.00 CTGGAGTTCCACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1 + chr2L 19940034 5' - mdg1 342 2 71.72 CCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTCAGAGTAGGCAGA:1 - chr3L 21292580 5' - 412 7460 2 73.29 CGAGTCCGCTCTATGTGCCTTTCTCTCTTTCCAAGCGGTTTGATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chr3L 19907174 5' - P-element 2812 1 31.91 CATTGTTAATCAAGATTTAGCACTTCATTTATAAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAAT:1 + chr3R 13613109 5' + copia 4955 2 77.40 TGTAGATGTTTTGCTTATCAACACAATTTGTTATATTCGAAAGAGACGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1 + chr2R 7009385 5' + Quasimodo 31 2 63.70 CATTTTGTGAAATCTTTATTTATTTTACAATCAAAGTAAACCCTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTA:2 - chrX 21227252 5' - Tabor 469 2 72.60 AAAAACAGATCCCATTCGGAACGAAAAAGTAAACTCATGCGCAGAGAGATGCACAGAATTCAATTAGCAAAATTGTTAAGTACCTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTATTCGTTGAGT:1 + chr3R 23579242 5' - roo 393 1 74.66 ATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 + chrX 15760616 5' - Transpac 246 2 61.64 GGCCACGGTTTCGCCTTTAAGTCGGAACCGCCTTGACTGGCTTATGTTTAATTACAGTACCCCACTCGCTTGTGAATTAGTTTCGAGAGCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGAAATCACGGAACT:1 - chr2R 6516589 5' + F-element 4416 1 64.96 ATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr2R 10695862 5' - roo 334 2 71.23 GTAATATAGTATAGCCATTATTTAGTTCCCATTAATATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 - chrX 5721906 5' - pogo 2042 1 71.20 ATGGGAAATTCCTCGCATGCTGATCCTCAATTGTGTAGGTAATATATGGGTTTTATAAGAGATGGAAATATTCAAAATAAAAATTTCATTGAGTGAAAATTAGGTTATAGAATGCAAAGCGGATTGATGTTGGTGAAGGTGGCATC:1 + chr2L 7271429 5' - Chouto 6178 1 56.85 GTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1 - chr3R 19246762 5' - jockey 4918 1 67.81 GGAGAAATGAAGGAGCAACAATGTTTCTCATACTCACATACATACATACATACATACAACCATTTCCAAGGATATGATGTGTGCATATGTATGTGAGTACGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chrX 3235471 5' + 412 82 2 69.66 CTGATTGATTGATTGGTGGATGAATGTCCCCAGCGCCTTCCGGAGCATTCAATTAAGAATGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCA:1 - chr3L 22038314 5' - diver 163 2 57.53 ATTAACTTTATGACCGGCACGCCAGCTCCACTCGACATCCCAAAACATTTTGAATTGTCAATTAGTTGCGGCGGTCAGAATACTCCAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2R 8689482 5' + hobo 30 1 64.29 ATCCTGTGGGTATGCTACAAATTTTTGATTCGCCCCCCCCATCTTTATTTTTCATATTCAACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chr3R 28803959 5' + hobo 64 1 60.27 GCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chr3R 14277969 5' - P-element 2833 1 42.31 ATCTGTTGCAATTTAACTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTTATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTCGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chrX 10284932 5' + pogo 12 1 66.40 GGTTCTCAAAAACTTTGGTTAGCTTAGATGCCTTGAAACTAGTTCATCTTAATAGATATAGAAATAGATATTAGTTACATATTTATATCTTTTTAAGATTCATTTGGAAACCATAATATTGAGCCTAATTATTATTATTATTATTA:1 + chrX 14157574 5' - mdg1 45 2 41.10 CTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:2 - chrX 1759024 5' + Tabor 6922 2 71.92 GCTCCGAACAAAAAGCCTGCCAATTAATTGTTGGACAGGTGGCAGTGCACTTGTAACGTAGCTTGATAGTTTCCAGCTTGTTGGATTTGAACTCAACTGAACTTTTACGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr2L 17470477 5' - 412 480 2 74.66 ATCGATCACAAGGAAATAGCTGGATTGATTCATTAATGCAGCTATTTGGTGAAACCTAGTGAAAAGTTGAGATGCCTCACTGCTTTGAAATCATTGTAATGGTGTTCGCAAATAAGAATCATATATACTCTATTTAACT:1 - chr2L 6367414 5' - diver 6054 2 53.24 GGTATGCAAGGTATAAAAATTGATTTCATTAACAAATAAGTCTTTCTTCATATAATAATAACATATAACAAACATTTGTTTTTCAAAACTAAAACGTAATCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAA:1 + chr2R 18377936 5' - R1A1-element 15 1 69.86 CCATTAAATTGTAACAATTGGGGTCCGGACGGACAGGCGTTCAGAAACATTTATTAAGTGAAATCAGCGCAATTGGTTTAATTTTTGTTGGTTCAGCCGCCATCATAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGA:1 - 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pogo 2056 1 58.22 AGTAAAACTGTTGCCCAGATTATAGACGTTTTCAAATTGAATAGTTTTATAAAGCTACAAGTTCTGTGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 20044694 5' + roo 6 2 76.03 ATCTTTCAGGCTGCATTGTCTCTTATAAAAAAAGCGTATTCATACTTCTTGGCCAAAACACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr3R 6147197 5' - copia 235 1 76.03 CATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCCCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGT:1 - chrY 2720335 5' + gypsy 19 2 71.23 CAGGAAAAACCAAATTATCAGCCGCCAAAGTTGGAAATGATTCATTCGTTCTATGAATAAATTGGGTTCTTTTCTGGGAATTTCCTGCGGATCACGAGCTTGCATTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGT:1 + chr3L 11657554 5' + jockey 271 1 70.55 ACGTCCCCTTGTAATTCTCCACATGTGGAGGATAAGAAAAATGTAACAACAAAAACGGAAATATGGGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:2 + chr3R 4530677 5' - copia 5069 2 53.42 ATAAATTAACTTGGCTCAAATGCTCCCCCCTGCCACCATGCACCCCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATA:1 + chr2L 7094242 5' + accord 7030 2 51.61 GACCAATTGCTATAAACGGCATAGTCGCCATTTATCATTGGTATGTATTTCAAGAAATCGGATTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - 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Bari1 1687 1 70.55 GCATTACAATCCAGTGTTTCCGTTTTGGAGTGCAACCTGTAACTGCACATGCATGTGGGTGTGTGACTGGCTATCTCTTTTCGCAGCACTTTCTTACACTTACACAACAACCCGTTCATGTTATCCTTTTTTTATTTACATTCTCG:1 - chrX 11730162 5' + HB 165 1 65.07 ACGTTCGTGTGTCAGAGTTTGGCCAAAACTAAGGCGCGAAACACTCTAGGACGAAGCACATCGACATTCGATATCATTTCATTAGAGAAGTCATGAAAGAGGGTCACGTTGTGTTAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCA:1 + chr3R 23557508 5' + 1731 4191 1 71.92 CAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3L 16200748 5' - roo 332 2 69.18 AAATAATATAAAATGATAAGCAGTTTTGATATTATTGTAATCATTTTAAATATGAATAGTTATTTGGTTAAGTTAATTCGTATATTTAAAAGATCAACTAAATTGAAATAAATAAAAAATATATATTTTAGTGGGTAGAGGACAGC:1 - chrX 22454298 5' + HB 345 1 53.42 CGGAGACTCCGGACTTTGGATACTAAGCGCCACTTGACTTGTGACCCGAACCCCTCGCTGACCTCAGACCCAGTAAACGAAAGCTCCCTTGGGGGTTGTTCACACATGAACACGACTATATTTAAAGACTT:1 - chrX 7508228 5' + roo 8678 2 73.28 TTAATAATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr3R 12342198 5' - hobo 2895 1 54.69 GCTCATATGTTTGCTTGGCTCCTTCCCAAGGCTGAGACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 + chr2R 13695596 5' - blood 344 2 62.33 GGCAACTACGAGCACATGACGGTCAATGAGTTTTTTGTCCAATTAGCACAACAGTACAAACATGAACAGCAGCTGCAAGCGGTGGCAAGGGAAGATAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGAAAG:1 - chr3L 15092961 5' - Cr1a 3975 1 73.39 CGACCATAATTAATGAGACAAGCAATACTAATATTGCCGACTATCGTAAAAACCTTTCTAATAGGCAGCGGTAAATCAACTGAACTTAAAAATAAATCTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACG:1 - chr3L 7358494 5' - Gypsy6A_LTR 118 1 56.15 AAACTAAAGCACAGTTTTAAACGCTGGGCACTTAACACTGTGCATTTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 14332159 5' + jockey 15 1 77.40 ATGTTCCAGTCCCGCCGACTGGCGGATACGCTGCGCTACACGCTACCGCACTTTGAACGCGCTGGTGTCTTGGATTGAAGTACAATTGCACTACTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 - chr2L 6346730 5' - flea 4992 2 73.29 GCAAATGATGCTGCAAACACAGCCGAGATTGCTAACATTCCACCGAATACTTTCTCCGCGCAAGTAGTTTACGGGCATTCCTGTTCCAGTCTCGTAATAGCCAATTGAAGCCATTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTA:1 + chr3L 18968569 5' - hopper 1406 2 73.97 GGAGACGGGAACACAGCAACTAGCGCTGAGTGTGTGCATAAGTTTTAATCTGCTTCCGTTACAATCAGCTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAGTAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:1 - chr3R 6147346 5' + copia 4922 2 51.37 TAGCGAAGTTCATAGTAAATGTTTTGTTATATTGCTTACTCCCGAAGTGGTGTTTATATAACGATCTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 - chr3L 1477473 5' - mdg3 5443 2 53.42 AGTTTGAATATTACCCCACGAACTTAGTCAACAAATGGACATACTCTTTCCAAAACTCCGGATACTTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCATTGAAATGTTTGTATATTATTGAGTCGAACTAATGGCCCATCAGTTGACTAAGGAC:1 - chr2R 10909360 5' - 297 6938 2 61.64 AGCGTGGTTTTGCGGCATCCTGCAGCATGCGGCGAGCCAGCTTTATGAAATTCTAATAAGTGTGCGGCATGTGTCATGTGGCACGATTAGTCCCGCAAACGGGTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAG:1 - chrX 4298316 5' + jockey 377 1 69.93 AAATACTTTCATTATCGATATGTATGCGTTCCTTAGCTCTCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 + chr3R 4197179 5' + P-element 81 1 30.14 ATCTAGGCAAACTACATAAGTACATTCTCCAAATTTTAGCCATATTAGGTTGCCTTTAAACTTGTCAAAGCTCTTCGCTTTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3L 10638988 5' - P-element 2856 1 50.00 TTAAATTCGTGATTTTTGTAGTTTCTTTTCATTGCCAGTTTCCCGCCTTTTTTTGTGGTAATGTTCGCCTTCCTCGAGATGTTATTAAAAAGATAATCGCAATCTTAGACATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAAGGAAATTGGT:1 + chr2L 5785524 5' - FB 450 1 80.82 TTTTCGTTTGGTATTACCAATTCCCAAACTGCCAGTAGCTCACCAACTCCGGAACTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGC:1 - chr3R 30518945 5' - I-element 5291 1 62.33 TATTCGCTTTCATGCATATTTTCCCCCCGCCGCAGCAATGGATGCAACATCCACGGACTGTTTTACAATTTTGCTGTGGCAGGCGATTTTGCTCGCTTTTCCTAGCCACTTGCCATTCTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 14081863 5' + blood 165 2 64.29 ATTAGATGGATATAAAGGTCCAAAATTTTTTTAAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2L 20550911 5' + 412 7070 2 72.60 CACTAAGGGGAGTGACGTGTTGACAGGCGGCGGGATTTTTAATGTCTTCATTTATTGGTGTCGTTTGCGTTTCCAGATTTTATGACGATTGATTTGGCAGTTATGTATTTATTTGGTAATTTGATTTTTTTTTTCTATTTTT:1 + chrX 8659595 5' - gypsy7 5009 1 66.90 CAATTATAATTTTCACACCTGAGTGTGAGATGTGCAAATACTGAGTTGAGCAACTGGCTTTCGAATGGCAGATTCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCATTCTCGTTTTTCCACCGGCGTTTATTCT:1 + chr2L 1449572 5' + Max-element 427 1 50.00 TCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 20983909 5' + pogo 49 1 52.05 GAAACACTACCTGGAATTTGCAAACACCTTGCCGAAAATGTTTGAGTTTGACAGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr2L 9599889 5' - roo 9005 2 63.70 TTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTTTTCGATAGGTGTTCTCCCCAGCCGCTTTCAAG:1 - chr2R 21757921 5' + R1-2 311 1 63.70 CGCAAGTAGTTTACGGGCATTCCTGTTCCNGTCTCGTAATAGCCAATTGAAGCCATTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACNTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGT:1 + chr3L 18968627 5' + hopper 67 1 61.64 AAAGCTGCAGCCGGAAAGCGCCTGCGAAACATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGC:1 - chr3R 8394393 5' + hopper 1260 1 73.45 TGTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGATGTCTATATTCTGGAAGGATCAACCATTTTGAAACCGCGCTTAAAGCCAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGACG:1 - chr3L 3070659 5' + jockey 4675 1 50.36 GTCTCTTGCAGAACTTCTTGTTTTGGGCTTACTCATTATGGGTGCCACACAGCCGCAAAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 8930473 5' - roo 352 2 60.71 CATCTTAATGCCAGCTGAGCGGCAAATTACAGGGTATACGATTGCTGCCTAAGCACTACTAATCACTAGTAAAAAAATCCAACATAGCCGACTTCATGGACCTCTAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCC:1 - chr3L 6266220 5' + R1A1-element 4910 1 64.38 CAACATTCCTTTTACAACAATTACTTTACATATTTATTGATAATTTACCTACTGAAACACAACACTATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTTCCTTTTTTTTTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTT:1 + chr3R 15223365 5' - Bica 296 1 54.48 AAAAATTAGCATGAAGCCACCTGAATTTTTACTATCGTCGAAAGTTTGCCGAGATCAGGGCGTTCTCTTATTAAAAGTCGTCACATACATTTTTGTATATATTTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCT:1 - chr2L 22044609 5' + McClintock 9 2 78.77 CCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:2 - chr3R 27398098 5' - roo 8988 2 74.66 ACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:1 - chr3L 8249496 5' + HMS-Beagle 6832 2 60.96 GAACCCGACGTAATCATACATGTCATCTGGCCTTAATTTCATATGCAAACAAAACATGATTACAAATGGCAAACGAGCATACCAAAAAATCATTCAACATCAATATTGACAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTCTTC:1 - chr3R 12756747 5' - Bica 134 1 68.61 CAAATAAGGTCAAGAACGCAGAGCGTTGAGCTGGATTTAAGGGAAATTCAAAAGTAGAATAAATTTATAAGTGTAATTTGTTGTAAACTTGTGTTCCAGGTTTGTTCTTCTTAGGAAGATTATGGTGGAGGGCTTGACTTTGCCCC:1 - chr3L 23593634 5' - gypsy 355 2 74.66 AAGTTCTTACTACTCTCTATCGACATAGTTCGAAGCCCATAATCTGCCAAATTGAAAATTCAGAAGATTAAACAATCAAAGAAATATATATTGCAACCATCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 + chr2R 24807842 5' + I-element 22 1 68.49 AGTGGGGGGTTCAACTGCAAGATGACAGATAAAAGGAATGGGCATCAGGAAGACAATACATTTTAACAGATTTAACCTTAAACTAGAAGTATTGGTGACGATCACAATTATATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTC:1 - chr2R 6249404 5' + roo 8775 2 72.60 GCATGTGCATGCTTAAATGCAATTAAAGGGTGTCGAAAAGAATGCAGTGAAAACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 28413870 5' - pogo 2035 1 61.64 ATGTGAGCACTTCGCTTGTACATGTGATTTGCGGATGTGCATGTGTGGGCGATTCATTTGCTGCATATACTAAAACACATATAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCC:1 - chrX 7151283 5' + jockey 4856 1 58.22 AGTTTGTTTAAAATATTTTGTGAATCAATCTACTGAATGCTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGCGACATTTGCGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAACG:1 - chr4 655981 5' - diver2 4758 2 54.79 CCCATCTTGGCGATCTCGATTCGCACAGTACACCCAGAAAACAATCGCATATGTATCTGCTGGACTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chrX 2104681 5' + roo 54 2 56.16 AGAGCGAATAGGGATGAGGCACTGGAGGGTTAAAACTGGACAGACGGACACGGTACTTATCGTTTTTTTTTTACAGTTCAGACCGAATAGCATTAATAGATTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTT:1 - chr3R 9349769 5' - I-element 224 1 68.49 ACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2L 20044625 5' + roo 75 2 70.55 AGTGAATCAAGGTATAAAGGAGGTATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chr3R 24011007 5' + roo 8737 2 80.80 TTTACATAAAAAAATTTATAATACAATAACTAATTTGAAGAAAGGAGTAACTTACTGGTATTCTAAGAACAATTAATTACATACAGTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACAACATTAGCATCCAACTGTGCTTTTCATAGTACAGTCA:1 + chr2R 2844444 5' + Tc1-2 50 1 54.11 CATTCATGACGATCTGACGGAAAACGAGCTGAACTCTGGAGAGGAGGTGAGCCCGACCGAGAGTCTGCCCAAAATCTCCACCCCCAAGGTAAATGCCAACTCTGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGCAG:1 + chr2R 22325295 5' + Ivk 5142 1 63.70 TGTATTTCAATTTACATTCCGCCCGCAGGACTTATTGCTTTTTTCGCTTTGATCTTCCCCCTTTTTTTTTGGCCGAGAGAACCCCACCGCCACCCCACAACCCTCCATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTT:1 + chr3L 1707258 5' + Transpac 156 2 65.69 CCATTTTACGCACTTTATTTGGCTTCCTTCTGGTTTCGTTCCATATTTTTTTCATTTTTTCCTCTCGAGTTTCAGTGTGAAAGTAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATT:1 + chr3L 21478479 5' + hobo 2488 1 51.37 CGCAGTCATCCTTTTTGGTCAGCGAAGCACATCCTACCCCAACCTATGAAACCCGATTGTAACTTATAGATAAAACTAACAACAGCGGTTAACATATTAGTCCTAATAAAAAAACAGAATATATAAAAATATCTAAAAATATTTAC:1 + chr3L 10077681 5' + Transib5 33 1 79.45 GCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACTACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3R 13453438 5' + 412 7079 2 66.21 CTTGCTTGTTTTTAATACACACCGATCCGCGATTGTGTGGGTTGAGGTGAGAGATACGATTCCTATCACACTTACTTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAAT:1 + chr3R 8821805 5' - S-element 1671 1 54.79 AATTGAACCGCCACCTGAGCGGCCACAAAAATGTGTCAACCAAATAACGATTTATGTTTTGCTCCTTGGCGTGTGTAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGC:1 + chr2R 14330365 5' - blood 7162 2 57.58 TTTATTAAAATAAACATCGTAAATTGTGCAAACTGTCTACATTGAATCATTTATATTACCATTATAATTACAAACAATATTCTTATTAGAGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATT:1 + chr4 131474 5' - F-element 95 1 61.64 CAGGTGGCACAGGAAACTGTCCAGGCATCCTTCTGGCTGATTGGCAACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCGTCTGAAAATTTTCCCGAAATTAAAA:1 - chr3L 20934222 5' - Max-element 246 2 55.65 CTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3R 20983894 5' + pogo 56 1 59.42 TATTGATTAAGATTTTCTGGAGTTATCTTCCACGTTACAAGTATATTAGGCTTAATGTATTGAATGTTTTTATTTTTATTTTTTTTTTTATTTATTAAGGCATTAAGGCAAACTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAA:1 + chr3L 24213324 5' - X-element 4665 1 45.89 GGTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr3R 8381679 5' + Tirant 8141 2 62.33 ACATAAGGACTGCGAAATCCTGTTACACAATCAGACTTGCCACTCAAAGCCAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3R 8631705 5' + roo 70 2 66.44 ATGTTGTCGTCGATCTGGTCAAAAGCCCATCGGTGCAGTCAAACTGCACGTCGTCATCGTGTGTTGTTTATTTTAATTACTGAAATTGCATTCGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2L 16382618 5' - hobo 2922 1 73.05 ACATTTCTGTAGTCACTAAAACAGCACCCAAAGCTGTTTGTTTATAATAATTTAAAACGCGTCCAAAGAGGCCAAAACAAAAGTGTGCTGTTTATTTAGTTTCGCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTTGGTCA:1 - chr3R 9500293 5' + roo 416 1 71.23 CAATGTCCCAGAATCGCTTGGCATACTTTTATCCGTGGTTTCAGGTGCATTTTGTGAAATGTTTAGCCTCCTTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 + chr3R 10708213 5' + Transpac 4965 2 54.11 GTCTTTCACCGGATACAACCCTGCTTCCCTCCATCCCCCCTCATTATTTTTTCAATCAGCATCGGCCTTTTTTTTTTTGTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 23204858 5' - Doc2-element 251 5 34.04 GTTCTTAATGTACACAGCGTGTTTAGAATTGAATTATACGATTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1 - chr2L 21777863 5' + pogo 74 1 70.55 CACGGCGCAATATGAGCCCGTGGCGGAAATGGCGTTGCAAGTTAAGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr3R 23104491 5' + jockey 84 1 67.12 AGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 + chr4 836649 5' - 412 7459 2 80.14 GTCTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2L 16554597 5' + blood 52 2 55.88 ATATATGCGAAACTTGGCTAAAATAAAAAGTCTTGAAACTCAGATGGATTTGTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 - chr2R 15698157 5' - opus 435 2 64.14 GTGACTGTTTAGTAATGAAATCAAGCGTTGGTCATGTGCCATATTTATAAAGCTAACAATATAATGAAGGGGAATTCCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr2R 17059683 5' - pogo 2060 1 54.79 GTTGGAAGCAACCATGCTGCATTTTTATTTATCAATAAAATACATGTGTGTTTAAAGCAAATGGAGCAGTCACGCACTCTTCTCCATGCGGTGCACTGTGGNCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:1 - chr2L 21909185 5' - transib2 2792 1 63.70 CTGCGTCCATCCGGAGGGCGATACGCTGTGCCACAAGGCCTGGTGGTTCCACCAGTGCTGGAAAAAGGCCGATCCCAAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACG:1 - chr3R 5972427 5' + Doc 259 1 76.71 GACGAAAGTGATTTCTCTGCTGCACTCAAAACAATAACTAAGTGCAATTATTTATAATATGTACATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 - chr2L 17851773 5' + flea 41 2 55.97 GCAGTTGCCGTCATGAGTGCAATAGGGGTTTTTAGCTAAATAACATTGTAACTATTAAGAAGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTGTGTAACTGGTAGAAGGAAGCAAAAAAGAACTATCTGATTAACGGGTATCCGATAGTCGTG:1 + chrX 16116086 5' + INE-1 552 1 29.45 ATCAGGCCAAAACACATCAACCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr3R 17494896 5' + hobo 54 1 55.71 GATGTACGCGACTAAAGTGACTGTTTAGTAATGAAATCAAGCGTTGGTCATGTGCCATATTTATAAAGCTAACAATATAACGAAGGGGAATTCCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr2R 17059699 5' - pogo 2076 1 64.38 TTATGATNCATTTAACATTCCGCAATTTATATTCAATAGTATTTTGTAGTGCAAAGGGCTCCATCTAAATTAATTTAATACAATTTAATAAGCATTTTATACATATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCA:1 - chr3R 16882039 5' - 3S18 6087 2 67.12 GTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chrX 14189226 5' + 412 76 2 67.12 GGTAGGGTAGGTTGGCTGTTCGCTGTTGCCACAACATTACCACAGCAAATTAGAGCACCAGCTGCTGTAAACAATTCGCCAAATAAACAGTATCGTAATATAAACAAACTTTCTTCGGCTCTTTATTAGTCACAACAGCTATTGAA:1 + chr3L 24809962 5' + diver2 4877 2 58.22 GCGGCATATTAAAAATCATTTAAATCGAAGAGGGAAACTTTTCCCGGAAAATGGTTTAAGCCACAAACAGCAAGTAAAAACCGCAATATGAATGCTGCAAATCTGTGTTTGATAGACAACACTTTGTAGTAGGCTAGAGGTACACA:1 - chr3R 9902478 5' + invader2 1 2 75.34 GGGAATGGCGCCCGCTGTGCTCTGGATCCCAGAAGCGGCGGCGGCGGCGGTGGCTGCACTCATTGTGTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTT:1 - chr3L 1941217 5' - opus 7297 2 71.59 GTGCGTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTTGAATAAAGTTGCTCGACTTTTAGATACCCATTACTCAGCCAGTGGAAGTGCGAGAAAGAAAATCTGATAGACAAAGAACTCGACTATTGCATTCTCTTT:1 - chr3L 21427045 5' + INE-1 576 1 63.70 TTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 - chr3L 8249482 5' + HMS-Beagle 6825 2 60.00 CAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 + chr2L 13697631 5' + F-element 107 1 77.78 ATACTCGTTATATGGTGCCAAATTGTAATTATAATTTCTCGTGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACTCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 + chrX 20270946 5' + I-element 5141 1 70.55 TCAATTTCAGAACGTCAATGTTCAGATGTTTGAAATAGACAAATTGAATTCCTTGAAAAGACTCTCCCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr3R 10062273 5' + copia 4894 2 67.12 CGCATCCCCAAACAATTTCCTGGTTTGCTAATTTTCACTTCCGTTTATATAGATGTATATAGATATATATATGTATGTGTGTATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 12263332 5' - roo 9034 1 53.42 ATTTCGATTTTGCAAATATCTTCCGAACGAGCACCCAAATCTGTTGCCCTAGGATTCCGTTTAATGATTAAAACCTGCTGCGTTGATTTTAATGAAAATGTGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATG:1 - chr3L 24491991 5' - Quasimodo 76 2 73.97 CAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCGTATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 - chrX 14189223 5' + 412 79 2 67.81 AAATTTAATCAAAAACTTATTTCATATTAGATTCATACAACAAATTGTATAAAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAA:1 - chr3L 16725605 5' + Quasimodo 64 2 67.81 TTTTTTTTTAATTTTCCAAATATTTTGCCTTTCACCGGCTGGAAAAAGGGGGTAGAAAAAGGCCAAAAAAACGCACCCCTTTTCCGTAATTGTAATTATTTTACCCTTTTTTTTTCCTTTTTCCTT:1 - chr3L 18290267 5' - Doc2-element 241 1 79.37 AGATGGTGGGAGGGGGGTGGGTAGGATGTCCATTAAATGATTGCCACGATCTATTAGCAGACGAGGACGAGGGAGGATCGGATCGAATCGGATCGACTCGCTTGCAGTTCCAAAGGCCGCACGATGGGGGGAGGGGGGGGGGGAGG:1 - chrX 1318185 5' - accord2 225 1 65.75 GCAGTGAGAAAAACTCAGCTATTTAACTCAAGTCGATTTAAAAAGCTTTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 6089046 5' - 1360 3341 1 51.39 TTTTAAAAACATTTTCCCATTATGGCTGTTGCTCCTGTTGTTGCTCCTGCCTTGGATGGCTGACACACATACACAAATACCCGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTTAA:1 + chr3R 8065179 5' + 297 25 2 67.81 TAATACTTAATTAGTTTTTATATTCTTGTATTTTAACGAGGAGGAGGCCGATCGGCGGCGATATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 30788296 5' - roo 9036 1 55.81 CGTCAGATGTTCCAGTCCCGCCGACTGGCGGATACGCTGCGCTACACGCTACCGCACTTTGAACGCGCTGGGGTCTTGGATTGAAGTACAATTGCACTACTACTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 - chr2L 6346736 5' - flea 4999 2 76.55 GGTATTGCACTCTGCTCCTTTTACTTTTGCACCAATGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 - chr2L 7724187 5' - I-element 5272 1 74.66 GCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr3R 13529969 5' + jockey 93 1 77.40 CTGCACGTAGAAAAGCACCAATAAGATGCACATCCACGGAAAAGCTTTTTTGGATAACTTGTTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTA:1 + chr3L 8058261 5' + jockey 4883 1 58.22 CTTGGGCCCTAAGCCGATTAACAAACGTGACCAGTTGAATACAAAAAAAAAAGTGAAAATAATAATAATAAGCGGATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTANTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCA:1 - chr2R 15922817 5' - P-element 425 1 40.60 CGGAGGCGGGGGACACGATCATTGATTGTTATCGAGAGGGGCATAAACTGACACAAAGGCAAAGTCAAAGTTAAACAATGCAAGCAGCTTGAACTCTGGACCAGACGATCTGGCCATGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAAC:1 + chr2L 14303894 5' - hobo 2809 1 77.46 AGTTTCTCGTATTCCATTTTGATAACATTCTTAACGTTCTTGTGTTCCGAGTTTTATTTTCCACACGATAAAATAATTGATGTCGATAGATATTGATGAACAAAATGACTAGAATGGCTATATCCAGTCGGCTATTGATCCTGATC:1 + chr3L 11887640 5' - INE-1 92 1 83.56 GAAGACATGTCGACGGCAGTGGCAGCCCCGCCCCTCTTGGGTCTCCGCCCCTTTGTCTGGCTGCGGGACTCACTCACACTCATAACACCCACATTCACACACACACATATACATACATAA:1 + chr2R 18482048 5' + Quasimodo 39 2 52.50 GCAAGCACCCGGCTGTGCGCGCACCCGAATCAATACATAACGGAGGATAGAGAAGACAAACAATCAGAAAAAGACATTTGCCTAAAAAGGGATGATAGGCAAAACACTAACTGGTTTCCCGTTAAGCACATGGGTGTTTCCAAAAA:1 + chr3R 1465886 5' + hobo 242 1 60.27 CAACGGCATTAATACGAGCTAATTAAACAAATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 15549994 5' + hobo 20 1 71.92 AACTGTTTTGTCATCGTCTGCCGCCTTTTGCCAACTCATTTGATTTGCCTCCGCTTATTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTC:1 + chr2L 5643597 5' + copia 4733 1 60.96 AGAATGTGTCTGGTTCTTTTAAAATACAGACAAAACAAGGACAAGAATGCCACACAGCAGACACAGCAATAGCCTTGGGACCAAGTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2L 3408702 5' - opus 7474 2 63.38 GAAAATCTGAGGAATAACAATCTGTTGCAATTTAACTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTTATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chrX 10284951 5' + pogo 14 1 69.86 TATGTACAATTACATTATTCTTTTACACGTAATATAGCTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGA:1 - chr3L 3154168 5' - flea 4935 1 76.71 TTCATTTTTCTTCATATCGATGGGGCTACTAAAGGTAGCTCAAATGCTTGGCATTCTCGTACATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTC:1 - chr3R 22083291 5' - micropia 108 1 58.22 GCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2R 6514306 5' + roo 8747 2 76.71 GCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1 - chr3L 8249442 5' + HMS-Beagle 63 2 77.31 CAAAACAAATACAGACTAAACTGCTATGGATTTTATGGGCATGAAAAGGGATATCAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACA:1 - chr2R 23278462 5' - mdg3 5433 2 60.96 AATCAGTCTTGACAACAAAAATAAATACGACCGGCTATAGTAATGCTCTACCAAAAGGGTCAGCAACTGAATCCATTCTTTATATTAGATATGATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 17871976 5' + roo 8681 2 72.06 GTTCGCTGCCGGATTATATAAGCGGTCTCTCAGATTCTTCGTCGTCGTCGGCTCGTACCACCTAGAATTTTGCTATCTGAGTTTCCTGAATCCTGTCTCCAATTTTTGTCACATTCAGATCGCTTTCGATATCTCTGGTCCTCATA:1 + chr3L 21839756 5' - jockey2 3008 1 55.48 TATTCTTTTTAATATTATGTAATTGTTTTCATAAATGTATTTATGGCACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3R 10433166 5' - 412 7519 2 66.44 TAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2L 8930563 5' + roo 8736 2 67.81 TAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGGGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCT:1 + chr3R 12789550 5' + G2 2745 1 57.63 TCGAACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGCGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTAT:1 - chr3L 21913479 5' + 297 20 2 70.55 AGAAAAATAAATAACAAATAAATTCGGATTTCTCTTTTAAATAAATCTTTTGAAGTGTCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 20168157 5' + roo 8681 2 72.86 ATGATTTTTCCAAGAATCTCGTAGTTCAGAAAGTTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGT:1 - chr3L 18010306 5' - diver 135 2 77.40 ACACTCAAGCTCTGGGGATAAGCCGAGACCTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGC:1 + chr3R 12622130 5' - 1360 3377 1 76.92 AAAACATTTTGTGGACACCCATGTTCGTCAGCCAATCGCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGATACTCCCAC:1 - chr2L 22181206 5' - R1A1-element 4992 1 69.44 ATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCAGACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGAT:1 - chrX 21667907 5' + gypsy2 6556 2 76.52 GACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTAATGTTATTACTTGCAGATGATATGAGAATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGC:2 - chr2L 16884774 5' - Bari1 1698 1 54.79 CCACAGAAGAATCCACACCAGACCAAACGCTGCACTCACACACACAAACACACACACCTTCACACAAAATGCCACGCACACCAGACCAAACGCTGCACTCACACACACACACACACACACCTTCACA:1 - chr2L 3811327 5' + accord 188 2 53.54 CTAAAGTATCTAATGTTTGCAATATATATACACATCTTAACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTC:1 + chr3R 17766739 5' - HMS-Beagle2 7116 2 75.34 TAAGTATTTAGGAATGACATTTAGCAATAGGCCACTTTGAGCTATGCCATTCGGTAGTCATTCAGAGTGCTACGCAAATAATCATAAATATTTAACAAATTTTGTTATTGCAGCACAGATGGACTTTGCATTTAAGGCATTTGGTC:1 - chr2L 1537237 5' - looper1 1580 1 67.81 GATGCTTATTTATGCATGTGCATATGCAAAGTTTTATGTAAGTTCGGTACCAAGTAAATATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTC:2 + chr3R 11757887 5' - invader4 326 1 45.21 GGTCGCCGAGAGAGGGAAAGAGATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 + chr3R 7041974 5' - Stalker2 7594 2 54.79 ATCCCAAAAGTATGCAGCAAAGTCTAGTTCATGCTGCTTTCTTCATCATTAAATATGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGACTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 - chr3R 23415989 5' + jockey 4826 1 60.96 ATCGAAGTTTTCTTGATAGAAATACTAATTTTACTTTTATTTTGAGGAATAATAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr2R 15472050 5' - 412 427 2 62.33 GAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2L 3911856 5' - roo 8988 2 73.97 CTGTTGGGATAGCTTAGCTTCNTGGGTAATTTAAAGGATATGCGGTTGACATCTTAATTGGGGGCAGCACTTGCACGTTGATATAAATAACATAAAAAAAAAACAGCTAAACGCAAAATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAA:1 + chr2L 3646664 5' + FB 4 1 69.18 GCATTTCATTTGTTAGCAAGTTGTCAACCTTTTATCTATGTTATTATGTCTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr2L 16554550 5' + blood 15 2 74.66 CGCCAGGTTTTCGATTCGATTGGTTGGTTGGTCAAAATGCAGGTGCGACTAGGAAAGTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGTGTCTCTAACATCTTGTG:1 - chrX 13367521 5' + HMS-Beagle 6812 2 73.43 AACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr2L 18737971 5' + roo 8744 2 74.66 GACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATC:1 - chrX 22386792 5' + hobo 93 1 51.08 ACTACAGAAATTAAACAGCACGCGACGCGTTCTTTGGAGAGTTGACCAACTAAACAAGCGCTCAAAAAGAAACGTTGTCGCAAGCACGCAATTTGATCTTATTCATAAATGTCTGTGGCAAAAAGGTATCTGTACAAGCAAGACCA:1 - chr2L 3803519 5' + Gypsy12A_LTR 2160 1 50.68 AATAGCCATCTAAAAAGGAAGACAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr2R 22112580 5' + 412 6 2 76.03 GATATTCTGAATTTGATGGAAAAGTTAAGAATTAAACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr2R 8595995 5' - pogo 2073 1 53.42 TTTGCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3R 13453441 5' + 412 24 2 69.18 AATGGGTGAAATACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAATTTTATGCAACT:1 + chr3L 10814512 5' - micropia 5369 2 72.60 GTATGCGATGATAAGTAAGAACTACAATGCATCACGCGGTTATTCGGAATATACATGGTACACAATTTATTAAGTTTTCAGGTCTGTTCTGACTATAATTAACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAA:1 + chr3L 1321903 5' + Cr1a 4239 1 50.68 CTCGTAACACTCGAGGGTTGACTGACTGCCTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCT:1 - chrX 10694346 5' - Transpac 5140 2 80.14 GCACATGTGCGCGTAGATATGTTTTTGGGGCCAGCAATTGGCATAATTGACTGGCCCCAACTGACTGTCCTTCTTAAAGCAATACATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAAATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTT:1 - chr3L 18248275 5' + Cr1a 4307 1 52.05 ATTGCATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 - chrY 2720339 5' + gypsy 7002 2 75.34 AAATGTTTAATAATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 - chr3R 12342204 5' - hobo 2883 1 56.16 TTTTAAGAAAGGAGGAAAATAGCTAATAACATTCGCTCTGGAAAGCGTTATTTAAAATGATTGTCAAACATTTTACAATATCTTAAAATGAGGCAAAGATAACTCTGCAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACACTGATT:1 + chr2L 21763266 5' - Cr1a 4151 1 67.59 TAATGTCTTTGAGGGATTCCGCGTTGAACAAGCTAAGTGAAGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 + chr2L 13697568 5' + F-element 46 1 69.86 TTTGGATGTTAAAGTTGTAAATATAATATTTTACAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACC:2 + chr3L 15389558 5' + I-element 89 1 74.66 CAGGCGCAAAACAGAATCGCAAAAATTGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGCATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 13684815 5' + 412 7071 2 69.29 GACAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:3 + chr2R 22112600 5' + 412 26 2 62.33 TGTCCAAAGATGGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAACAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3L 21292512 5' + 412 7122 2 61.64 TAGGTTTTATAAATTACATGATAATTATAAACCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 18738066 5' - roo 9024 2 53.42 TATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCAC:1 + chr2L 21325109 5' - invader4 248 2 70.55 AGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 7042654 5' + roo 75 2 78.63 GTGGACATGTTGTTTTATACATTTTAATGATAAAACTGTAGTTTTGTATTATTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3L 12125371 5' + roo 67 2 66.44 CGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:3 - chr3L 9522146 5' + opus 156 4 54.79 GCATAATTATAAATGTATCAACTAATGCATATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACTGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chrX 20940691 5' + hobo 38 1 66.44 CAAAAATAAATAAAATGGAATGACGCCAGTAAGTATGCTACAATAATCGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3R 10541182 5' - hopper 1384 1 63.70 TGATTCACTTCAATTTATTTTTTTTTTCTGCAACAATCCTATATTTCTTTTGAGAGTTCAGTTACCATTCAAATTGAAATGTATATTCAACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 10695746 5' + roo 8696 2 63.70 ATACATTTCGCTATATATTTGCATTTATTATTGAACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACATTACTCGTTGAGT:1 - chrX 7042770 5' - roo 393 1 75.17 GATACTTGGATTTGCTTGTGTTTAAAACAATATACACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 - chr3R 5575019 5' - blood 293 2 76.39 CTTGGGGCACACACGTTTCGCTGAGCGCATGAAATGAGTGAATGGGTAATATTTTTATATTCAAATTAACTTTACTACTTTCATACATTGTAAAAAAACAAAAAAAAAAGAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 19336329 5' - hopper 147 107 79.03 GGTTTCGAGTTTCCAGCTTGGTGCTTGTGCATTGTACTTTTAAACGCTGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 + chr2R 17695977 5' + rover 6962 2 77.40 AATTTGATCCCATAAAAAACATAATTACAAGAAGTAATCAAGTTACCGTTTTACTTGAAATGGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGGTGGAGTGAGGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAG:1 + chrX 23202122 5' + R2-element 498 1 57.53 AATGCCGACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACAT:1 + chr3L 24272049 5' + gypsy11 4038 2 65.07 TGCTAGTTCCAGGTGTGCGATGTACATGGATGACCCGACATTGAGCTGATATGTGACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:2 - chrX 140140 5' + blood 7025 2 76.03 GGCTGCCACATGGCTGAAACACAGGTGCACAGGGAGAAACAATTAGTAAATGTAAGTTCTATAAATAATCGAAGCTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 15539914 5' + roo 8677 2 72.60 CTGATAGACATTTTACACTCCATAGGTAGCACTTCCGCGCCCAGAAGATCAAACGCAATATGTGTTTTTAATTAACTTTTTAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:2 - chrX 4469645 5' + roo 8702 2 59.59 AAATAGCAGCCGGCTGACCTTGACAGTGCGTTTCATTGCTATTAAAACTGATCGACATAGAAGGGAAACATTTTGCTAACATTTTACCTTTAATCAAATTTCTTTTTTCGACGGTACAATGCTTTCCACGACCCATGACTAGAGAA:1 - chrX 13037131 5' - Tc1 349 1 55.48 TATCCCTAATCTTGAGTCAAGGCTTCACTCTTATCTTGAAAGCTTTGGGCGCTTACATTTAACTCTGCAGATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCA:1 + chr2R 4601504 5' - HMS-Beagle2 7173 2 70.55 AAAAATAAGAGTTGTTTTCAATTTTTTTCAAAATGCAGGAATCTATTCAAAAACTTTTCAAATTATACAAAATCACTAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCACAAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGC:1 + chr3R 20644642 5' + 1360 3203 1 50.68 AATTATTTATCAAATCTGGCAGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGT:1 - chrX 16219312 5' - roo 9030 1 56.85 AGAGCGGCACTGAGAGCACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTT:1 + chr3R 9550864 5' + P-element 23 1 68.35 AATATTTTACATTTAATTAAATGTCAACGTGGCTTCCAAACAAATTATTTTCCCAATTTAAACTGGAAAATTTATATACTCCCTTCGTAAGCCCACCAATATTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 18319786 5' + jockey 20 1 75.71 AAGTAAACTCATGCGCAGAGAGATGCACAGAATTCAATTAGCAAAATTGTTAAGTAACTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 23579268 5' - roo 9030 1 58.22 TTTGGGTTTTTGTGTTTGTTTTTTTTTTCTTATTCGTTTTT:1 - chr2L 4828898 5' - Doc2-element 238 1 87.80 GTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chrX 15252384 5' - opus 7446 2 58.22 TCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chrX 10694246 5' + Transpac 4954 2 61.64 AAACAATAACAATATGTAATTATAGATATTTCAAAAGCTGTTCACAAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3L 19222734 5' - 412 475 2 70.55 AGCCGAGTGTGAGGTAAGTGTTAAGGTTTTCCCTCTTATCTGAACCAATTTACTTAACTTACTGCTTTCTCAGATATCCTGCAGCGACGTTGTGCTCTTCTGGCGCATCCAGCGGGTGATTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAA:1 - chr2R 14231151 5' - Doc2-element 4719 1 78.08 GACGAGTGGGAGCGGTAATCGGTTCGGTATCGGTTTTGGAATCGGTAGCTTTAACGGTAATCGGTACAGTAGATTGTGAGGTTTGGGTTGTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGG:1 - chr3L 21916167 5' - F-element 52 1 61.64 ACGAGCTAATTAAACAAATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2L 15549981 5' + hobo 33 1 63.01 AACTAACTATTTTGTATTTTTCACTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chrX 22511481 5' - roo 9028 1 55.48 AGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr2L 13468308 5' - roo 333 2 75.52 ACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATC:1 + chr3L 27356083 5' - Tc3 1634 1 68.49 AAGCACCATCTAATCAACATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr2L 6154039 5' - copia 221 1 61.64 AACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1 - chr3L 21292577 5' - 412 404 2 76.71 CTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 - chr3L 22435197 5' - opus 427 2 69.18 GATATCGAGAACAATAATAGTTTTGTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 - chr3L 22435258 5' - opus 488 2 77.40 GGGGGGAAAACGGGGAAAATTGCTGAAAAGTCAGGTGAAGAAAAATGTGAGCGAGCAGCGGGGAAAACAAAGCAAAGCCAAGCGGCAAAAAATGTATTTCATTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 + chr3L 10023921 5' + transib2 3 1 81.06 TTTGTGCAATTACTCTGCTGATTTTATGTTTATTTATAGTCACCCAATATATATTTGCCTTGAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCC:1 + chr2L 11705767 5' + I-element 5142 1 57.53 AACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - chrX 15252406 5' - opus 7468 2 63.01 AGCATTCTCTCTTGTTTTTTATGAAATGACTATATGTATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGTCAGAGGCAG:1 + chr2L 21820790 5' + invader4 86 2 76.55 ATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATGTTACAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chrX 23431798 5' + roo 76 2 72.41 TTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3L 12125284 5' - roo 339 2 67.12 GATGGGGCGTTTCGCGTTGCGTATACGCAGTGTGTGTGCGCGTGCACAATGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTAC:2 + chr3R 23415862 5' - jockey 4973 1 71.92 GAATAACGGGTATTAAAATAGGAAATTTAGATAGGTGGAAACTAATCCAAAAGATGCAACAAAATTTTTGGGTTAAATGTAAAGAGGAGGCCAGTGGCCTATAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCCCGCTCCT:1 - chr3L 23191981 5' + F-element 357 1 71.92 GGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 13529980 5' + jockey 20 1 58.82 GGCACGCCGCAAAAATCTCGACAAATAAAATTCATTTACAAAATGTTTTGCGTAGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGNTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 30537577 5' + roo 26 2 62.33 TTTACGTCTGGGGTCTTGTTTTGTCCATTGGATTTGTGGAAATTTATTTCTTGTCATTCATGTGTCATCCCAAATATTTAATGTTTACTTGTAGTAATTTATGTAATGTAACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTG:1 - chr2R 10482872 5' - F-element 4335 1 74.66 CGTGCAGCAAACAGACGGTAAGCACGGCGTTGAGCACACCGCACCTTTCTCCGCGTTCTCTGAGAGACTTCCAGTCGAGAGCGAAACCAAAACTTATGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3L 739288 5' + P-element 25 1 67.12 GTGGTTGTTGCATAAATTTCCTCAGTGGGTGAGAAAAGCGACAGAGCGGGGTCCTGTAACGGCTAAAAGGGGCTAACTTAAGGACTTAGGCCTGAATCCCACTTGGTTTCTTTCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTATCTTCCCT:1 - chr2L 18794004 5' + Cr1a 3990 1 69.18 GCTGCCACAATCCCAAATGCTTCAGGACGGCTAGGGTCAGGGATAGGGTGCCAGTGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCGTC:1 + chr4 906057 5' - opus 7497 2 81.20 ACAGGGGGAGCGTTAGCTGAAGTACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 6047808 5' + P-element 27 1 65.96 CAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGGGGCAGTTTTCTGCGGTTTGTAGGCGTTATTGAGGGTGTGGCCACATGGGTCAACAAACTTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATCCTGAATCTTAACCTTCTCGCTTTTACAGTTCCT:1 - chr2R 5212079 5' - INE-1 156 1 73.29 AGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 16219292 5' - roo 346 2 63.01 AGTTTCCATCATTATGTGAAATGGATCTGGCATAGTAAATTTCGCATCTGTTTGTTATAACGGGGTATTTTATATAAAAAGGTAGTCAAAAGAATTTGATGATCACCCGAACCGGGAAGACGACAACTGGAGCACCCCATCCGGCC:1 - chr2R 1893266 5' + Tirant 73 2 53.42 AAAGGGGAGTAAATCGGTTTCAGAAACATTCAATAAATAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr2R 12379639 5' + pogo 26 1 65.75 CAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2L 8930554 5' + roo 74 2 71.22 ATGGCATTGAATAAAGTTAGCTACATTTTTCAATTACCAGCACTTTCTACTGGAATTTATTTAATGCCTTTTATCGAAAAAGTGATTAAGTGAGATTTATAGGCCAAATTTGTGACGGGGGGGAAAAAAAAAAACTGCAGCTCATC:1 + chrX 16125675 5' + TART-B 10520 1 47.26 CTCAAACAAAATATAAATAAATCCTTAGGGAATCAACTCCGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 + chr3R 5518288 5' + Transpac 45 2 54.79 GATTGTTATTTAATTGAAAACAAAAGCCACATTCTGACCTATTTTAGTAGGGTTATGAGTTTAACGAGTGAACAGCTACTGTATTGGACACTTGCTCACATGAAATAAAATAATTTGCTGAATTTAAATGATTTTACCAAAA:1 - chrX 9973693 5' - HeT-A 5805 1 78.87 CCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGCCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGT:1 + chr3L 8754756 5' + mdg3 54 2 60.96 AGTAACTAACTAACTATTTTGTATTTTTCACTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 22511488 5' - roo 9035 1 60.27 TCAACGGGCGTGAAAGTGACAGGAGAATGAGGGTGGAGTGTTTTTCTTCTTTTCATTTGTATCATTCGCTTGAGGGGTGTGGATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATA:1 - chrX 10540914 5' + roo 180 2 55.17 CAGGTATCTATATAATCTATTTTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 8749249 5' - Doc2-element 233 4 75.56 TATATTTAATGTTTTTCGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTCACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAAT:1 - chrX 19690634 5' + gypsy 7039 2 52.74 CGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAATACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 27391431 5' - 1360 3374 1 66.44 CAAATTTACTTGAATCTCCAGTACTTTTTCGCTTCCCCATTTTTTGTTGCTCTTTGCTCGGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 16995433 5' - roo 396 1 72.60 CCTCAACTGGAAAATATGTTTCTCGTTTTGCATTAGCAGCAGGAGAACCTCAAATCAGCTTTAGCATTCCACCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 8631602 5' - roo 9022 2 51.37 ATCCATCAGTTGGTTCCGAACGATAAGTCTATTGCCAAGGAGGCCAAAGACTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3L 17746356 5' + roo 8734 2 66.44 CGCAGAAAAGGTCATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 20983933 5' + pogo 25 1 68.49 AAGACACTGAAAAAAAAACGAGCTAACTTTCTATGTTGAAAGAAAACCAGCTAACTTTCTATAGGCAGAACAAATTAAAGTAACCAGATAAGTTAATATAGTTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2L 11476216 5' - pogo 2085 1 71.23 GATAGCCCCATCTATCGGAGCCACTGTCATCTCTAGCAGCACAGCACGAGTAAAGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 - chr2L 6047933 5' - P-element 2824 1 43.15 TCAATATATTTAATGTTTTCTATAATTGAAGTGTGAAAATGGGTTACAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr2L 3133642 5' + Doc 12 1 70.55 TAAAAGTTAGGTAAAGCACTTGGATATTTAGCGTTAAGTAGATAACAATAAACCAATCAGCTGTAAAAACTATTTAACACAATTAATACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTA:1 - chr2L 3175232 5' - Burdock 6362 2 64.38 GTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACATGCAGTAGAAAGCGTTTCTACCTATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCTTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGT:1 - chr3R 2473817 5' - hopper 1068 2 65.75 TACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTCTTAAACGAGTGTTATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACAAGTTAACTCTACAATCTTTATTTTTAATAAAGAGCGCATCGCG:1 + chr3L 23635039 5' + gypsy6 7594 4 51.11 GAAAAAATCGGTCTTCTCTGCCTTCACTGTCCCGTTTCGAACTGCCTTCTTTCTCTCTGCCTTTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGNGAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAA:1 + chrX 22564551 5' + Transib5 59 1 62.33 ATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGAAAACATACTTATTAACGATCCGTTCGCTTCGCGGCTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTTTTGTATGTACATAAACTGCA:1 + chrX 21634158 5' + Cr1a 263 1 41.03 GAAGAACATGACAACCTGGAATAAGCAATAAATAAGTTATGATAAACCCTTTTCGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chrX 13152822 5' - pogo 2036 1 63.01 ACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr3R 9550881 5' + P-element 41 1 55.71 GCGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr2R 7622969 5' - P-element 2838 1 45.38 AACGGGATAAATAGCCCTAGCGTGTAACCATAGAAGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1 + chr2R 5394954 5' - HMS-Beagle 6959 2 74.66 TAAAAACGAATTAAAATTGTGTATATCAATGTACATTTGTAGTTTCCGTGTTCCTTACATTTTCCATTTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAACAAGAAACGCTATAGTCGAGTTTACCGACTATCACATACCCGTTACTTAG:1 + chr3R 17733199 5' - INE-1 547 1 39.04 ATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACAT:1 - chr2R 18044045 5' + jockey 4620 1 58.22 TAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAA:1 - 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invader4 3029 2 53.42 AAATCTCGTTCTCATTTTCAATTCGGAGGGTGGGCTAAGTTTTCAATGCCCCCCATCTCGGCGATTTTTCACTCCCATTTTCCTGCTGCCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAA:1 - chr3L 4615796 5' + F-element 344 1 75.22 GCAAACACAGCCGAGATTGCTAACATTCCACCGAATACTTTCTCCGCGCAAGTAGTTTACGGGCATTCCTGTTCCAGTCTCGTAATAGCCAATTGAAGCCATTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATA:1 + chr3L 18968581 5' + hopper 21 1 65.75 GGTAAAACTGCAATGCTTTCCTTCAGATTTTAATCGCTCACGTGAGAGCGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGAGTTAAGTTCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTGTGTGAAG:1 + chr3R 28045739 5' - Tirant 382 2 66.67 CAAATGGGTCTGGCACGACCGCCAGGGGAGGGGGAATGTTTCTAATATTTATAATGCGATTTAGGGCAGCAAACTGAACACACAATAGCAATGATGTGTGTGTGTTTATGCACACAGTAAATTCTTTTTGCACAGCCAAAACGACA:1 - chr2R 22011282 5' - G3 9 1 52.74 AAAAGCGTTCAAACATTTCCCACTTGGCTATACCAATTCTGGATTATACAAGCGCACGTTTCTTGATAAATATTCAGCATGATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr3R 14546458 5' - pogo 2063 1 59.59 ATGGTGAAATCAGTCAGAAAAAGGGGAGCAAATCATTTGCATGGCTGGTCGCCAATTCTAAAAAATGTTTCAAATTATTTATAGATAATTGTTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTG:1 + chr3R 8866949 5' - Max-element 288 2 77.24 CTGTTTACTTTTTTCACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACA:1 - chr2L 13293001 5' + copia 4941 2 65.75 GTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAGAAAACATTATTCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTTATATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCAC:1 + chrX 23211130 5' - R1A1-element 5307 1 69.18 AAGGGGTTTATGGTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGG:1 + chr2L 13244668 5' + jockey 4642 1 72.60 AACTGATCAGCGTTATCGGCGACGAGGACACCTGTGTGGGCTTTCTGCTCGGTGCGTAACCCGGATAAAGTACATGCTCTCGATATCTCTTACATAGACTAGACCAAAGGCACTAGAATAAAAAGATGCGTGACGCCATAGGATTT:1 - chr2R 15679933 5' + 1360 21 1 64.38 ATTGCCTAGCTTTAGGCGTTATCAGAACTACGTATGTATAATCGGCGACGTTAAACTTCAGTTTTACTTCTTTCCATTATCATAACCAAAGACACTAGAATAANAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr2R 6089178 5' + 1360 39 1 59.59 AAATTCCTGGCACTCCATAACAACATCATCAAAGGATAGTGCGCAACTTCGGTTCCCAGGAGTCCTTTCAGCTGAACCGCTCTACTGAAGTATAAATGCCATTGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATA:1 - chr2L 11962044 5' + copia 317 1 61.64 GAAAGAAGTTGGTTCCTCCGAGCCTGTCCATCAACGTTAACAACAACAAGGTTAAACGGCCGGCATTCCTTTAGGAGTTGTCAACTTGCAGTCCCATGGATCTAGTGACTTTAGTAAACCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACCAC:1 + chr2L 16226731 5' - baggins 4955 1 67.81 AGACAGCCTTGTCGTGTTTTCGGATCAAGTTTATTGACCCAAAGTAATTTCACATGCGTGGATTTAAACCAGCGTATTGGGGGACGCAATTATGTTATTAGGTGTAAATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAGAACAAT:1 - chr3R 10824112 5' + BS 334 1 69.86 GTTCGACCTTAGTTTGATTGAGTAACTGTCACCCTCAGAACGAACAGATTCCATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chr2R 4788754 5' - 297 366 2 50.00 AATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 3911808 5' - roo 9036 1 61.64 TGTTAGATTTAGTTTTAATTCAAATCCCTATATGGCTACATAGAAAAAGAGTATTTGTTTAATGCATAATTCTGTGTATTTCCTCATTTAACTCAAATGTTAAATAATATTTATTTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chrX 12105184 5' - 412 490 2 69.86 GCATTATTCCTCTCACCTCGCCCTTTTCGATTAATCCGAATCGAATCTTCCTCGTTTCCTAGGCAGGTCGCGTGTGAATTATGAAAACCGGCGATAAAAACGAAAGTAATTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAAT:1 - 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jockey 4912 1 70.55 GGGGGCAGCACTTGCACGTTGATATAAATAACATAAAAAAAAAACAGCTAAACGCAAAATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chr2L 3646723 5' + FB 63 1 59.59 TGATCTTTGATCCCAACCACTTTTCAGCTTTAGCCCTTCTCCGTACTCAGTCTTTTTCATCATTACCAAATCATTAATATTATACTGTATCTGTTGTTTTCTTTTTATTCTTTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTT:1 - chr3R 1061470 5' + blood 6965 1 73.29 CGTGTATAAAGGAATCAAAAATCTTGATTTTGATTTCAGATACTCCACCCCTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chrX 7508108 5' - roo 334 2 69.18 ACTTCCACAGAAAAACAAGCCGAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr2R 14431210 5' + Doc 54 1 55.04 ATATATTCCCCCAGTGTCTCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGGATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 5495179 5' + roo 54 2 55.48 AATTTGCGACAACATTTCGAAAATACCAATAATCAACGAGTTTTAAAATACAAAGCTAATAATAACGCATCTTTCGTTAATGACGTTACTTTTCCAAATATTTTTAATTGTTCTTTTTAGGCAAATTTTTAAAAAATTAAAATAAA:1 + chr3R 32029570 5' + G7 1143 1 54.11 ATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 + chr2L 20550982 5' + 412 7141 2 77.40 GCCACCCCTCAATTTTTCCAGCGCCTCTTGCCGCCAGTCCAAGTTTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTCAGCACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2R 22774644 5' + I-element 25 1 65.03 CAGGCAAACGCCATAAATGTAATGCGTTTCTCTTATGGGCCTCGTCATAGAGATCCAACAACAGTTGGCAACATAATTTATGCAGCACAGCCCGCCTCCTGCGCGGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTA:1 + chr2L 19201339 5' + 1360 334 1 71.23 TAACTCAGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr2L 13468226 5' + roo 63 2 61.64 GGACCCAAACTCACCAGCGCACACATACGCAAACACATACCAACACACTCGCAGAGAAAATTGTTTTCAAGTAGACAGCCACTCGACCAAAAAAAAGACCCAAACTCAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCA:1 - chr3R 20098980 5' + I-element 5114 1 60.27 TAGTAAATGTAAGTTCTATAAATAATCGAAGCTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chrX 15539957 5' + roo 8720 2 60.27 TCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGAAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGTAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGC:1 + chr3R 12622192 5' - 1360 3313 1 73.10 GATGGATATAAAGGTCCAAAATTTTTTTAAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:2 + chr2L 20550915 5' + 412 7074 2 69.86 TTGGCGCCCCCTAAAATGGAACGGAATCAAGTCGTCATAATAATTTGTAAAATATGTTCATGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGC:1 - chr2R 7373514 5' - Tirant 8199 2 62.00 AAATGTGTACGTGTTAACTACTTACTAACTGAAACTATCTTTAATATAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr2L 7774939 5' + I-element 51 1 54.79 CGATTGATTTATGATTCGATGTAGGGAATTACACAGCTCTGTTTGTTTTCCAATTTGGATTTTATTAAGAGTAGTAATTGTAAATTTGTATTGCTTTGCCAATAAACGCCCTACAACCGACCAAAACTACCACGCCCACATTTTTG:1 - chr2L 11943412 5' + INE-1 247 1 52.74 CGATTACCCTATAACATGCATGTGAGAGCNAACAACGACAGATTACTAAGTGAACAATAATAGACCGCGTTCTCTCTACCCACGATCCTCTCAACATCACCNCGAAAAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTGTG:1 + chr2R 1373049 5' - Cr1a 4019 1 37.67 GCAGCCTTGTCGCCACTACAACTGTCGCCGACGCCGCCGCAGCCAACTCAGCTTAGCTCATTGACCTAAGTAATCAGTCACAATCTTACATCTAAATAATCTCCCAATCTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCA:1 + chr3L 25850660 5' + springer 304 2 67.81 ACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGATCGCCAAATAAAATAAACTAAAT:1 - chr3R 15047384 5' + F-element 85 1 75.57 CGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chr3L 21292525 5' + 412 82 2 71.92 ATCTCAAAAAATTCATCTATCTATTTCATGAATGCATTCTGCTGCATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTTTTAAGGTGACAAGGCGGTTTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACA:1 + chr3R 28349568 5' + Transib-N1_DM 224 1 44.83 GATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAA:2 - chr3R 12622369 5' + 1360 196 1 51.37 TGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3R 15137339 5' - roo 321 2 76.71 GGGTGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTCCTATGCGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGACGTTATCACTGATGCTGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:1 - chr3L 5498516 5' + Doc2-element 251 2 61.64 AGTTCCAGTGGAATGGCCACAGCAGCCAATAGCTAAATAATAGTGTCAATAATCATTACACCTCTCAGATGAATCACCTGCAATACTCACACCAAAGGATCCCTGACGAGGAAACACCAGAATGATTTATAAGTAAAATAAATATT:1 + chr3L 13061203 5' - S-element 119 2 79.45 ATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGG:1 + chr3L 13888927 5' + 412 92 2 79.45 GATTTACAGCACTGTTAATCTTATCTACTGTCAATTATTTTATTGTAAGGGTGGAAAGTTTTGCAACGTAAATGCAGGCTGAATTCAATATGGGTTTGACCAAAGACACTAGAATATTATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGACATT:1 + chr2L 8959782 5' + Tc3 320 1 68.49 ATTCATTAATTAAAACTAATTTGTTGTAAATGCGCAAGCGATTATTAATTAAATCTATGGCAATATTAAATTGTGGTTGCTGTAGAGTTTTATGACAGGCTTGGGCGGCAGGGATCGACTCGGCTATTGATCATGATCAAGAATA:1 - chrX 15966090 5' - INE-1 85 1 62.07 CAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2R 22596084 5' + Doc 64 1 58.90 GTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATA:1 - chr3R 934268 5' - Rt1b 4724 1 45.21 CGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1 - chrX 11415779 5' - mdg1 339 2 79.45 AAATATAAGCATTGCCTGAAAGCATTTGCTAGTTCATGTTCGCCTTCTGTTTGTTGTTGTTTCTGCCCTTTTGGACCGACCCCTTGGGCTTTACTCGGCTGACTGCCCGCCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTGTGT:1 - chr3L 7205303 5' - gypsy3 416 1 53.47 AAAAATCTGTTTAGATATTGCTATAGGGCTTCGATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGTGTGATCTTATATCACGC:1 + chrX 140710 5' - blood 7100 2 75.34 ATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTG:1 - chrX 7847236 5' - hopper 101 1 53.66 GGCGAACGTGCAATTTGACTCGTATCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGAGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATA:1 - chr3R 2525990 5' + Stalker2 37 2 53.08 TCCTGAAGCTAAATACATTATGCATTTCTTAACGTGTAGCTGTGTTTATTTTTGTTCCGCTTGCTCTTGTGTTTTGTCAATTTTCTGGGTTTTGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 19016099 5' + roo 8691 2 67.81 CCTATGGGCGGGTTTTCCTCGTTCGCAAGCTAACTAGACACGATGCCGGAAAATTGTATGCAATGAAGGTTCTCAATAAGTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGAGTAGTTCATTTTGGACCCCATATAA:1 - chr3L 11085541 5' - Circe 7099 1 55.94 GCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTC:1 - chr3R 5972346 5' + Doc 319 1 74.40 GAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTT:1 + chr3R 10541235 5' - hopper 1331 1 76.03 TGGCATCTGGAAATTTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTCGAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 - chr2R 17609856 5' + mdg3 5304 2 50.00 ACACTCTGGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGTCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3L 5958718 5' + 412 7111 2 54.79 TCTCAAGAAAGATAGTACTACCCTTACCTAGCTACCAAAAGGTATTTAAATAATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAG:1 + chr2L 1729716 5' + Transpac 27 2 55.48 GATATTCTGGTGGTGTTTTGCATGAACCAACCTCAGTTCGTTTTTTACATCACTCTTTTCATGCTCGGCTGGGATTTGAAGGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 23790223 5' - roo 9033 1 58.90 AAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr3R 20345561 5' + blood 7052 2 56.16 ATGTGAATGAATTAATGTGGAAGAACAATCATAAGCAACTTTCTTCAATGTGTTTTCTTAGAAAAATGATAAAAAAAAAGGTCAGTTAAAACTTAAAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCG:1 + chr2L 19110733 5' + roo 8825 2 64.38 CGAAGGGATCGGGTGGCGTATTCCGGTAGTAGATGGTCCTGTCCAAAGATGGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTNTGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 21292473 5' + 412 30 2 65.07 ATTTTATCTCAAATTTAATTCATAATTGGCATAGTAAGTGCAAATTTGAAAGAATTATATATCTTCATTGATTGCCCGGAGATCACATTCCATATATATATATATTT:1 - chrX 2507391 5' - G3 4513 1 71.03 AGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAANACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 + chr2L 16554610 5' + blood 54 2 63.20 GCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr2R 22596069 5' + Doc 39 1 50.74 AAACGCTGCCGATTTTGTGAGTATTTATGTGTGCGTCTCTGTATTCACTCCAGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr3L 19907051 5' + P-element 17 1 74.66 GCAAACCACGCAACACCTAAGGCGACAGCTGGCTCAACTAGAGGTGGGCGTCACGATCGGTAGGGTAATGCCCGAAAGTTGAATTATTTTTTTGTTGTCTTTTTTTT:1 - chr3L 22739677 5' + Tc1-2 1388 2 75.70 AGATATCGAGAACAATAATAGTTTTGTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3L 22435259 5' - opus 491 2 79.17 GTGCATCGCATCGAATGGTGTGCCGCCAAGTGTGTCCAAGCGGATCAAAGTCAGCGCGGACTGTAAGTCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 - chr2L 6385943 5' - invader4 3075 2 76.71 TAGCTATAATAATATCCAAGAAAACTCGAGAATCGAAGTGTAATCGTTAATCAAAATTCTATTGCCTTAAACGGATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 + chr3L 14233028 5' - copia 5077 2 52.05 TTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCACTTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr3R 10433233 5' - 412 419 2 77.78 AAGTGCATTTGATATGTTTTTTTTTAATGCAATTCACTTTCATAGTAAAAAATCCAATATAAATTTCAGCCAAAATACTAATACTTAAAGCCGTGTACATTGTTTGATTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1 + chrX 15252229 5' + opus 11 2 67.12 ATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTC:1 - chr2R 4774738 5' - baggins 5328 1 71.72 CGGAAAATCGGGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 + chr3L 22435091 5' + opus 47 4 59.59 GGAGGATAGCGTAAAAAACACAATATAAAGTTCTCCACTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTATTCCCCTGCCAACCCACCCATACGGTTTGGTCACCAGGGGAATAAAAAAAACAAAAAAA:1 - chr3R 23189295 5' + Osvaldo 1520 1 44.54 TGAATAAAGATTGCTTTATTTTCGCTGTTTATGCTATGACACCCATAATACCCTTATTTTTCAAAATGTGCTCCTGGCAAAGAAAAAGTGCACAAAGATAATGCCCAAGTCGAAGACACATATACACACACACACACACACACTGC:1 - chrX 4355418 5' + accord 257 2 50.68 CACCGAGCAACAGCCAAGGTAACCTAAGCCTTCGGATTAAATTTATTGCTCCTAGCGCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 15917555 5' + roo 20 2 69.18 GAATGGCAGGCGCAAAACAGAATCGCAAAAATTGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGGGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACATTGTAGTATGAGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 13684821 5' + 412 18 2 69.86 CTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATAATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGC:1 + chr2R 7407974 5' + 3S18 5831 2 60.27 ATCATATACTGTTATTTTAACCACATCCTTTGGCAATCCCCTATTTTTGTATATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 + chr2L 20819232 5' - copia 5088 2 64.38 AGAAAGCCAATGCGGACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2R 8258288 5' + jockey 14 1 53.95 ACAAGTTGCTAGTCCTCCCAGTCCCTATATACTGAGAGAAAATAGTTGAAATAGTTGAATAGTCAAATTGATAATATATTAATTATATGATAGGGACAATATCATATGCGTCACTAAATTGAACAGTCGCGATCGAACACTCAAC:1 - 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chr2L 1729828 5' - Transpac 5154 2 69.44 CTGCATGGTATTCCTGAAAAGCTGAACTGTAGACCGAAAGCCATTTAACTCAAAAAATATATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 - chrX 13401902 5' - flea 4956 2 60.96 CATAAGTGAAATTGACTGACGCCTGTGCGTATGCAACACAAAATTGCACACCTCGATGGCGAGCAATGTGTATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 - chr2R 22971910 5' + jockey 4781 1 68.49 ATATTTATCTGAAACCAGACCACTGTGCACGAAAACACAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATAACTCGCGAAGCGA:1 - chr3R 15198189 5' - Cr1a 131 1 71.92 ATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCA:1 + chr3L 27356088 5' - Tc3 1629 1 71.23 CTTATAAACTGTTTCCTATAGGTTCCTAACTCTTGAAAACTTAATTTCATAGGACACCATCCCAAGTTAGCCAATCAAATGTGAAAACCTAGTAATTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTA:1 + chr2L 5083960 5' - 297 6862 2 59.59 TCTGGTTACTAAACTACCAAAAATAAATAAAATGGAATGACGCCAGTAAGTATGCTACAATAATCGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:2 + chr3R 10541165 5' - hopper 1401 1 75.34 GAGAAGGACCAACAAGAAGTTTTAACACCAGGTCATTTTTTAATTGGAAGACCACCTTTAGAAATAGTCGAACCAATGGAAGATGAAAACTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGG:1 + chr3R 19447720 5' - F-element 4450 1 60.96 GTGCATGGCATTGGCAAACTCAGTTTCTGGACACGTCCAGATGGGCATGTCCACACTATCTCCATTTAAGTTGCTGACCTAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:2 - chr3L 7102422 5' + I-element 44 1 49.32 AGCATTAAAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCAC:1 - chr3L 19350065 5' + 1360 3205 1 67.81 GCCTGGCGAACATGAGGGTTCCGTAGGTGATGGCTTTAATGCCTATTGGAAGGAGAATATCCATCAGTTGGTTCCGAACGATAAGTCTATTGCCAAGGAGGCCAAAGACTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 17746414 5' + roo 12 2 73.29 CATGTTTGCATTTCATTTGTTAGCAAGTTGTCAACCTTTTATCTATGTTATTATGTTTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2L 16554543 5' + blood 8 2 78.08 GGGGGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATGTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGG:1 + chr3R 13898228 5' + 3S18 5841 2 70.21 ATTGATTGATTGGTGGATGAATGTCCCCAGCGCCTTCCGGAGCATTCAATTAAGAATGCATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTT:1 - chr3L 22038311 5' - diver 6048 2 59.59 ATAAAAAATAAAGCAACAAAAAAGTGAGATAACAAAAAAATGAAATTGTGCCGCAGTATTTGCGTTTGGCGGCATTTTTCCGCTGTTGTCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGAT:1 - chrX 6910535 5' - I-element 321 1 65.75 ATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTA:1 + chr3L 8249381 5' - HMS-Beagle 6976 2 67.63 GCGTGTTTCCCGTTTTTAAAAACATTTTCCCATTGTGGCTGTTGCTCCTGTTGTTGCTCCTGCCTTGGATGGCTGACACACATACACAAATACCCGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGC:1 + chr3R 8065166 5' + 297 6589 2 80.28 AGCAACAAAAACCATGACAAACAAGTTCGCCAGATGCTGCGACTCAATCCAAATAGCCCGATGTCTAAATGAGAGCCACATGTACATATAGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATAT:1 - chr3R 28447403 5' + G3 4505 1 67.81 GTGCCTTAGTACCTCCTGTTCTATTCCTATCAATAAACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGA:1 - chr2R 16185151 5' + 17.6 6955 1 67.12 TTTCTATAATTGAAGTGTGAAAATGGGTTACAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 + chr2L 3133658 5' + Doc 28 1 59.59 ACATTTTCCCATTGTGGCTGTTGCTCCTGTTGTTGCTCCTGCCTTGGATGGCTGACACACATACACAAATACCCGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATT:1 + chr3R 8065187 5' + 297 18 2 70.99 ATTAAAAATGATGGAAAAGTTAAGAATTAAACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2R 8596897 5' - pogo 2069 1 59.31 ATGCATTATTTTCAAGTTCGTACAATTTTTGAATTTGTGTATATGGTAGGGGTTAAAATGATTTTATATATATATAGTCTTGATCAGGATAGATAGTTACATGTACATGTCTTTATTATTTTAGAGATCTCGAGAACTATAAAAGC:1 + chr3L 18917789 5' + INE-1 149 1 54.79 AAATAAAGTAAATAGTTAGCAATGCATTTCAGCTTTGTTTCACGTATTGCCCAGATTTAGCTCAATTGTTATATCTATCAGTTCACAATTATCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chr3R 18343409 5' - jockey 4967 1 62.33 AGTAAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATT:1 + chr3R 3922950 5' + Cr1a 84 1 69.18 AAAATCTGAGGCTTATTCAATGAGCCATGGGTCGCCGACTGGTCGTAAAGTGAAGGGAAATTATTGAATTATATAAAAGGCTGAGAACGAACTGCGCCGAAAAGCTACGTTTTTCAGGTCACCAACAACAATTTGCATTTTTAAAT:1 - chr3R 4965956 5' - TAHRE 10332 1 62.33 TAAGTAACTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTCGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATGAGAATCGTATCTTAAAG:1 + chr3R 23579318 5' - roo 320 2 78.17 AAAGGTCGAAACCTATTCCTCCTCGGGCTACTCATTTAATTCCTCCCCTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAAT:2 - chr3R 8394497 5' - hopper 1344 1 65.07 ATAACCAAACAAAACAAAACGTAAGAATGTGTCTGGTTCTTTTAAAATACAGACAAAACAAGGACAAGAATGCCACACAGCAGACACAGCAATAGCCTTGGGACCAAGTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2L 3408679 5' - opus 490 2 77.40 TAGGTCATTAGTTGTTTGTGCAATTAATATCAAAAGTCAGGCGGCAACATTCCATATTTGCACAGTTTTGCCAATATTTGTACTAATAATTTGCAGTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:2 - chr2R 20706900 5' + I-element 23 1 65.07 CATAAATTTTATCGCAACCTCCGACTCTGGCATTTTTACCTGTGACATTTCCATTGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATGCTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGG:1 + chr2L 12900572 5' - Doc 4491 1 60.14 GCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTT:1 + chr2R 5617462 5' - invader1 3985 2 60.27 AGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATC:1 + chr3R 11757991 5' - invader4 2997 2 75.34 CCCACTTCAGCTTTAATTGGAATTAAACATACCAGTTAGAAGAACAACTATATTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr3R 14138534 5' - 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chr2L 13328512 5' + BS 49 1 52.05 GTCGAAAAGTATGCAGCAATAAACTTTAGGCGTTTTCTTCATCACTATGCCTATTGGTGGGTTTTAGGAACTTTTACCAAATTATTTCTAAGTAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGG:1 - chr3R 18155015 5' - FB 233 1 54.79 AACAGCTTAAAAGTATTTAACTGAAGAGTATTTAACATGATAGCGTTCTGGCTCACATAGGATTTCTGCCTTTATTACAAAATCGACAAGAGAGAATGCTATATTTCTCGAGTCGAGTTACTCGACTGTCAGATACCCGTTACCCA:1 - chrX 22784161 5' - INE-1 548 1 63.70 AGAGTTAAAAATAGTTAACACATCTATTAATTGAAAATTATGATTATATTAAAGAAAGAAATACAATTTTAAAATAAACACTTGAACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 - chr2L 13676010 5' + flea 4789 2 62.33 CAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATG:1 - chrX 21667950 5' + gypsy2 6544 2 71.23 CGATTGTTTGTGTGGGCTGGCCCCATCTTGGCGATCTCGATTCGCACAGTACACCCAGAAAACAATCGCATATGTATCTGCTGGACTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chrX 2104660 5' + roo 8697 2 63.01 ATATTTTTTTATTAATTAGTACACCCTATAAAATCATTCATTTGTTCAGTCACNGNCTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTT:1 - 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chrX 10056805 5' - hobo 2918 1 70.55 AAAGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTTACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr2L 8553283 5' + pogo 36 1 59.59 AGAAGTGGTGGAGGAAATTGAGAGGACTTATGATTTAACATTGATTTGGAAGCATTATTTTATGTTACAGCACATTAATATCAAACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3L 19106500 5' + roo 37 2 54.79 ACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTNAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTNGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr3R 24011052 5' - roo 8988 2 75.34 TTGCATGATTTAATTATTTGTAGCATACTTTTGTGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCGAAATCCAACTACAACCGCATTCAG:1 + chr3L 18947231 5' + BS 4707 1 53.42 TTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCG:1 - chr3R 6603041 5' + gypsy 63 2 68.22 AAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3R 13684752 5' + 412 7088 2 61.70 ACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATTTTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 10433274 5' + 412 7089 2 70.21 AAACATTTTTACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 3911796 5' - roo 385 2 69.86 CAATATAATTTCATAAATTTTCAAATATATATTTATGTTTGCAATTATATATATATCACATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 + chr2R 14161318 5' + I-element 64 1 63.01 ATTTGCTGGCTGTCCAACAGCCATTGTCTGTTGTTCCAGCAGTTTGCTGATGATATTCGCACTGGGCATAATTTCCATGTTGCTTATGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTTAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATG:1 + chr3L 8247214 5' - F-element 4410 1 58.74 GGAAAGTTTACAAATCGAATAAAGTAGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr3L 11529575 5' - opus 7466 2 55.48 GCTGCACTGCAGTCCCTGCTGTTTTGCCCCAAAAAGTAGGCTACAAAAACAAAACAAGAGGGTGGAACGTGTAGTATGGAGCAAATTGATCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 + chr3R 25692704 5' + BS 5028 1 60.27 AGCAAGTTGTATTTTATTGCCGGGCGCTATAAAAACGTTAATAACATTTTAGTGGAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 17842815 5' - roo 9016 2 61.27 AATCATTTAAATCAATAAATTAAAACCAGCCGAATGGTGGTCGAATGTTCGGAAAATTGTGAGTTTGAGTGATTGGAGCTTTCAGTTGTCTAATATTCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3R 31419271 5' - pogo 2080 1 54.79 ATTCTATTAAGAATGCCTTTCAACATATCGCACTCTGCTAATTGAACTGCCAGACATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2R 12343182 5' - roo 9005 2 64.38 AAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 + chr3L 17602546 5' + Doc 88 1 73.29 ACCGAAGGTTAGTGTCCAACAAAAAGGGCTCTGTAATATTTTTAATTGGCAATTTTGTACCATGTATGGCATACGTGGATTTTTATTAAAAAATATATATTCCTTTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACC:1 - chr3R 6646775 5' + hopper 1049 1 72.60 ATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 19698051 5' - roo 9037 1 57.53 ACTGAAAAGAGCGGATTTCAAAGCGAGCTTGAAGTGCCGTCGGCAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTT:1 + chr3R 16881866 5' + 3S18 5795 2 65.52 AAGTGGTCTCGGATTGAGATTCGTATTGAGTTTCAGAGAACTGCATTCACAGAGCTCAAGTGTCAAGCTGAATGGGTTTCTACGCGACTCAAGGTAATTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 + chr3L 19707026 5' + F-element 66 1 66.44 AACGGCTAGGAGCCGCCAGGGGGAGCCAGCCAAATGTCATGCTAAGCGCGATTTTCTCCAGTCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 - chr3L 18968725 5' - hopper2 1557 1 55.40 CCGAATAACAACCAACAGAAATTTACATTTCCAAATAGGGATAATATAATTGCATATGCCAAATAAAAACGAAGACCAAATAAATTTCTGAATAAAAATTAAATTTAAAGTCATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAG:1 - chr3L 5043679 5' - opus 260 2 77.40 CCCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAG:1 - chrX 1759026 5' + Tabor 81 2 70.55 GTCCCAACGAATTATAAACACATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAAC:1 + chr2R 18035091 5' - R1A1-element 5290 1 52.41 GTCCATGGATGCGCTTTGCCACTGGCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 14825376 5' - P-element 2837 1 51.37 TTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCGAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1 + chr2R 5599049 5' - INE-1 82 1 71.77 CAAATTTTTGGCCAGCCGTCCTGTCAGCTGGGGATCTGGAACTTCCACTGGAGTTCTACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2L 19939987 5' - mdg1 7426 2 58.90 GTCGGGCGCTATAAAAACGTTAATAACATTTTAGTGGAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATATTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 17842833 5' - roo 8994 2 73.29 GTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCG:1 - chr3R 12376498 5' + flea 81 2 73.29 TCTGTCTCTGGACTGAATCTGTTTAGATTCGGTGTCCCTTGCCCCTCCACTTCCTTACTCATTCTGTACGTTACCTGTGCTGCTATGATGGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATG:1 - chr3R 2160137 5' + Rt1a 4718 1 58.87 AGACACAAGAAATATGAATTGGACGAGTGACAAAAAACTGGATTTTCTATAACTTCCAATATACATATATGAAAAAAGATAGAATGCTATAGCCGAATTCCCCGACTATCAGGAACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAAGC:1 + chr4 498387 5' - INE-1 528 1 60.27 AGAGGTCGGGGAAGCCGCACAGATTTGTCAGTTCATTAAAAATGAAGCGTATGTAAATGTTAATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATA:1 - chr3R 13323944 5' - F-element 4619 1 58.22 ACACAAACACACTCCAGCAATTGCCTTGCATGATTTAATTATTTGTAGCATACTTTTGTGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAG:1 + chr3L 18947206 5' + BS 4681 1 71.03 GATAGGATATGCGGACATGGTCGACTGACTGGCGAAGTAGGGATCGAGAGGGAAGTGGAGGGAAAGGGAAAGGGAGGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 - chr3R 13897290 5' + 3S18 5792 2 56.16 GCGGAAAAAATGAGAAAAAAAAACTAATCTTTTGCACACCAAAGCCGACTTCTTCGCCAAGATCATGTCCTATTTATGTGTGTAACATGCAGAAGAAAGTGATTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAC:1 - chr2R 10868189 5' + INE-1 85 1 52.05 AAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTCTGCAGCCACTTT:1 + chr3L 19349930 5' - 1360 3345 1 55.38 CACTTAGATGTCGTGGCGCAGATACAATTTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chr3L 21913356 5' - 297 366 2 66.67 GTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1 + chr2R 23596000 5' + blood 7097 2 76.55 CGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCA:1 - chrX 19690618 5' + gypsy 68 2 65.07 ATTAACGAATTGTACTTTCTATTTGCTAGCTTCAGAGTGCAATGCAAATGGCCTTATTGCTCAACTTTCCGGTTTCTTACGCTCTCAGCCGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAATGTGGCTGCATAGTG:1 + chr2L 667032 5' + 1360 3340 1 49.32 GCGTGGTTTTTATATGTTTATAGTTCGAGGATTTACATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATCATTCA:1 + chr3L 11759047 5' - invader2 406 1 75.34 CGACATATGTGTAAGTTTCCGGGAAGTTAAGCTGTTGTTTATGTGTCATAATAAATCATGTTGAATGCACACGAAACAATTTCACTTAAGTGGGTAATGGAAATTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 + chr3R 12340455 5' - hopper 1351 1 67.81 ATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAA:1 + chr4 123941 5' + HB 113 1 56.85 AGTCTCGTGGTGGCGATGAGGAGAGCCCAGACCGTTTTTTGACTCCACCTTGTGGGCCTTGTACTCCTCCACCTTGGCTAGCATTTGCTTTTCATCGAGGCCACTCAGCGAGTACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAATTTCT:1 + chr2R 11584350 5' - Tc1 392 1 76.71 ACATGTGTTGTGTTGCACCCTAATTCCAGTTGTAAACATGCGCCCATACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATA:1 + chr3R 31031977 5' - hopper2 1536 1 65.75 AGCAGCGATGGCGAGATCAGCACGAGGGGCACGTTTCGGAAGTGCTCCGAGGGAATTCGCATCTGGGAATTGTTGCTATGTTTTTGTTTATGTTTATGC:1 - chr2L 20346348 5' + 412 76 2 69.70 CATGGATGCGCTTTGCCACTGGCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 14825373 5' - P-element 2837 1 50.35 TTTTTGTGGCGGGACTCCGTTAATGCTGAGCATACTTTTAGGTAGCTTAGTGGCATTTACACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTATCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr3L 13546649 5' + hobo 28 1 55.86 ATACATGTGTGTAATGGGTTTGCAATTTTCAGCGACTTTTTGACACACATACCACGCTCGATCCCAAACACATATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1 + chr2L 7148546 5' + HMS-Beagle2 6930 2 53.42 GCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTCAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGC:1 - chr3R 21679645 5' - roo 312 2 80.82 CAAATTATCGCAAGCATCCATGCTGCAAATTACCTTTTTCAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3L 17746282 5' - roo 8993 2 71.23 AGCTGGGCAACGCCTCCTCCTCGATTTCCGCCCAGGCGGAGACGCTGCTCGATGCGAGCCTCAATGAGATATCACGCAAGCTGATCGAGACCTGCAATGCAGTATCAAAGGGATCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAG:1 - chr3R 24217189 5' - TAHRE 10423 2 72.73 CCATCTATCTGATAGAAAGGTGAGTGACAATTGACAAAAACAACATTATTTCAGTATTAAATTAACGTTTCATCATGCACGAGCGGAGCTGCAAAATTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTAC:1 + chr2L 5848468 5' - Tirant 430 1 65.75 CCATTTCTCTACATATAACCAATTGAAATGAATTTGTATCCTGTGGACACACACACACACACACACACAGCCGCACGCATGCAACAACAACAAGGAGAGCAACAAGGACGAAATTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTAT:1 + chrX 21401468 5' - hobo 283 1 77.40 GGAAAGTTTGGTTTTAATCACATCAGTGCCTAATGTTATAATTAAGGTTTTTAATTTAAATCAATTTCCCAAGGCTATACAAACTGTATTACAATTTTGTATATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTC:1 - chr3L 8200903 5' + roo 8775 2 69.18 AGGGATCGGGTGGCGTATTCCGGTAGTAGATGGTCCTGTCCAAAGATGGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3L 21292476 5' + 412 33 2 63.01 CATTAGCTGCGGTCGTAAGTGCATTTGCAGGAGCACCCTGGAAATGTGATTTCCCATTTGAGAGTATATTGGCTGATTGAATTATAAGTTTTACAAGTATGTATATAATAATCGCGTGGAGAGTGTAGTTGCACGTCCAGTAGTG:1 - chrX 5025604 5' - baggins 73 1 73.79 CTAGTTCAGTTGGCCAAAACAGTTTAAACGTGGACGTGGTCCGTCGGTGAGATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATA:2 + chr3R 25961987 5' - I-element 5287 1 63.01 ACGAAGTTTACACGTTTCTTGCCCTTTTTTCTTCTTGTTTTTGGATGCGAAATTGGAGCAAGTTGTTCTTGTGGTTTTTGTTTTGGAACTTTTGTGTTCAGAAGGTTTTGTGAGGGATACTATCAATTATTTTTTTGTTTTTTTTT:2 - chr3L 5194488 5' - gypsy11 3935 1 52.74 GTTAATTAACCTCTTTTTCATGTTGTGCTCGGGTTTTTCTTTGGCCAGGCTGGGATTTCGCTGTTACGGCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCA:1 + chr3L 20934103 5' + Max-element 8250 2 80.31 AACAGAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTA:1 + chr3L 17934927 5' - HMS-Beagle 180 2 64.38 AGAGAGAGTTTCTGTTGGGAAGGGAAAATTATCGACTGACATTGCCGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr2R 21030231 5' - opus 7481 2 68.57 CCCTGTCTATACCAACATCCGACCCCCTTCCACACTCTGGATGTGTGTGACTGGGCTTTTAGCAAGTTGCTGCGACTTTGCCCCGTGGTGTGCCACAAATAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTG:1 + chr2R 6564724 5' - Idefix 160 2 63.70 AGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2L 20550962 5' + 412 68 2 63.70 GACTTCGTTCTGCCCAACAAACATGAGTCGATGATCGAGGCCTACGACAAGTGGCGCAGCTGGGCCGATCCTAAGGTGAGAAGTGTAGGGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr3R 5574915 5' + blood 7043 2 63.70 TAATAATGCCAGCGAAACGAAAATAAGGGAAGGAGAAACAACATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3R 11758447 5' - P-element 2867 1 70.55 CGCGTGGAAAACCGCAGTCCAGAGTAAGTAATCTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3L 13546524 5' - hobo 2907 1 62.33 AAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 + chr3R 13375979 5' + 1360 80 1 78.26 CAGTGCTAGTCAACACTTTCGTTTTTCCTTTCTCTTCTATTGTGTAGCGAAATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chrX 16219197 5' + roo 66 2 64.38 TCCTGGAAACGTTTAAGCAGCGCAATATTCGCGGCATGACTAACAAACCAGACATCGTAAAGCCGTAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 21843711 5' + blood 7037 2 67.81 GCCAAAGTTTGCTGGTAAACACATTCATAAAGTAAATATGCAAACACTCGCGCACAGAGCAAGCAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chrX 7995102 5' - opus 7493 2 43.15 GAACACAATAACAATGAACTCGATCAAGAGGAAATCATTTCAATTCGGTATTTTCATTTGGCATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 + chr3L 22038153 5' + diver 6 2 81.51 AAAAAGAAAACTTCGGGCTAGCCTCAATAAAACAATTGTGTGTGAACCTTACGACCCCCAAGTCATTTTTATTGTTAGTACAAATCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chrX 762588 5' + FB 38 1 60.27 AGAACATGGGGCGGTTGCTGTTGTTGTGTTGTCGCCTGCCGGCCTATGTATGTATGTATGTATTCATTAATGAGACGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2R 21475193 5' - P-element 2842 1 52.74 CTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr2R 2529356 5' - 1360 3330 1 56.85 AAGCCGAGACCTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 12622149 5' + 1360 9 2 75.21 GGAGGAGGGCCATCACGAGCAGGGGAGTGGGGGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 + chr3R 13898200 5' + 3S18 26 2 58.82 TGTGCTGATGATGTAAAGCCGAAAACGACAAAATTGTGCCCACTTTGCAACTGTGATGTTCGAGGCCTGCAATGCAATATCGATATCCCAGATAATTTATAAAATGTCGCGTTTGCATTCACACTAGCAGAGTAAAGGGTATCTGA:1 - chr2L 21206579 5' + INE-1 544 1 52.74 AATGTTTCAAATTATTTATAGATAATTGTTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGG:1 + chr3R 8867012 5' - Max-element 8392 2 44.19 CTGAAGCCCGATCCGAATCCAAATCGCCTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 - chr3R 17944081 5' + P-element 79 1 24.81 GTAATATCGCTATTTCAATAAAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATA:1 - chr4 637828 5' - roo 105 2 65.75 TATTTAAGCTTGGCTAAGCAATTGCAAAACTACTATGTTTATATGGTAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGAC:1 + chr2L 5818891 5' + I-element 4897 1 67.59 GTGCTCCTTTCTTTGCAAGTGTTGGAAATGTATGTATCTGTCACCTAATATAAATTAAATTACTTGCGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCCTAATATGAAGTAGCCC:1 - chr3R 4353355 5' - gypsy4 178 2 60.27 CAAGACACGGTGGCCGCGAACTTTGCAAAGCTGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAGCTCATGGCAATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTAC:1 + chr3R 12118151 5' - Gypsy12A_LTR 2167 3 77.40 ACGACAAGTGGCGCAGCTGGGCCGATCCTAAGGTGAGAAGTGTAGGGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 + chr3R 5574958 5' + blood 75 2 68.49 AACGGCAGCCGATTCTGTGCACACAGACACACACACACACGTGCGGGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 + chrX 1599377 5' - 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G3 4503 1 68.66 TTGCGAACAAAAGCAAAAGGATAACTCATAGTGTGTCCGTGTGGCAAAGGGTGTGCAAGTGTGCGTGTGTTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTA:1 - chr3L 2816988 5' - G6 1947 1 57.53 AGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr3R 8381695 5' + Tirant 8157 2 51.37 TAGTTCTTTAGCCCAAAGGATTAATCTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 21636391 5' + 297 22 2 69.86 GTGGGAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACATTCCACTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATA:1 + chrX 15746314 5' + jockey2 3294 1 75.34 TTCGCTTCCCCATTTTTTGTTGCTCTTTGCTCGGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2L 16995460 5' - roo 9033 1 54.48 GGCTTTAAGCTACCAAATTTTAAACAACTCTGTATTACGCCCGTTAAAGTTGCTGCAAATAACGAGAAGTCATCTGAAATTGTTATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - 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chr2R 23278450 5' - mdg3 169 2 69.18 ATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAGGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 19698051 5' - roo 9037 1 57.53 ATGACCCCGGGAAGCAATAAAGTGACGTGAAACGACGTCTTCTTTTTCAGCTACGGATAGTAAGTTCTAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGAAGTTCTTACAATTAGTGACTATAGTAATG:1 - chr2L 22933291 5' + Doc 128 1 68.53 GCCAGTAAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGT:1 + chr3L 2668838 5' - Bari1 1652 1 55.48 GATGTGTAATACACAACCAGACAGGTTGATTTCTAGTTATACATCGCAATTGTTGTTGCCATTTACGCCACTAATTTCGATGAATTTTCGCTGATATATAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr3R 17879567 5' - opus 484 2 75.86 TATAGATTTTTAAGAATATTCTTAAATTTTTCAGATATCATTTAAGTGATTGTATTGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chrX 14189153 5' - 412 419 2 68.49 CCGAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr2R 14431201 5' + Doc 62 1 54.11 ACATATGTGTAAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - 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blood 7343 2 53.42 AAAGTGTTTGTATTGAAAGCATATCCTTCGCATTTCTATAAACACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 29384630 5' + roo 8740 2 74.66 GGCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGTTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr3L 13888980 5' - 412 7468 2 70.55 AATGAAACGGAATTGTTATCTGTGTAGACAAGTAAAGTACATTACAATAAAACAAGAAAGCATGTTTTAGTCGACTATCAGATACTGGATACTGAAAGTACTCTAAACTTTCTAGCTTATATA:1 + chr3L 17860548 5' - INE-1 162 1 73.17 TCTTTTCATGCTCGGCTGGGATTTGAAGGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr2R 23790276 5' - roo 316 2 81.51 GTAAAATGCATGTGTTTAGAATGTGAACGAATTAACCCACTTAAAGGGCCTGTTCCTTGCCCGTCCACTGGGGTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCC:1 + chr3L 16353285 5' - flea 4688 1 50.00 TTGCCATTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAT:1 + chr3R 11186530 5' - BS 5039 1 52.74 ATACCCATTTATAATCTTCTTGTTAAGGTATCAAATAGCACTAACCATGCCGCCAGCGATGACGACGAATGTTGAGTGCGTTCGCTGAATTAGCTATAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATT:1 + chr2L 13994994 5' - Porto1 4267 1 51.37 TTGCTAACTTGTTAAGACAATGGTTTTCAAATGTTGCATAAAACCGGACAGCAAAAAGATTTCATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chrX 20024616 5' - 412 433 2 57.53 CGCGTACATTTGTTTTCGTTAACATTCTAAGGGTGGAGACATCTGGCATGACTCTGGCAGGGTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 + chr2R 25083273 5' - pogo 2047 1 55.86 AGAGCTATACACATCGGTCATTTGACGAAGCAACAAAGCTACATGAATGGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTGGTTTTCCGTATTT:1 - chr4 799128 5' + R1A1-element 37 1 60.77 CAAACGCAATATGTGTTTTTAATTAACTTTTTAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chrX 4469596 5' + roo 8751 2 78.08 AGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATAAAAAAAAAGAAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAAAC:1 + chr2R 17696031 5' + rover 65 2 52.74 CAGATTTAGTACAGTATTAAACTGCATATATAACAAATATTCTACTGCTTTTTCTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 16996014 5' - roo 9049 2 71.92 TTCCAAATCGCCATGTTTAAGTTTTCTGTTGAATTTCCCTAATACCTGCATAGACTGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 - chr2R 6217183 5' + copia 67 2 63.70 TACATTTACAAAGAGTATAAATTAGGGTATAAAGATAATCCACAACATTTATACTCGGTGTAGAGAGAGAGATCACACAGTGGGTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chrX 20466798 5' + 1360 49 1 57.53 GATGCAAAAGTGTTAGCCAGTCTTAAGCCAAAACTTCGCAGAGGCGGACGCAGAACTAGCAATTTCTTAGGGCCCGAAGATTCGTATCCATCGAAAATGAGATTGAAGCGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr2R 22112786 5' - 412 482 2 73.97 CACAGTTACTAACTCATGAGTAAGTCAATTACCACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 15102263 5' - roo 8985 2 76.71 CAACTAATTGTGCGCCCTTTATTACGCTGTATTTTCAAAACTTCTAAAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1 + chr3R 12181961 5' + mdg3 46 2 54.79 ATCACAGTTCGCCGCCAGATGAGCTCGGGAATTACGCTAATACAAGTCAGACAATAAGAGCACAATAAAACATTTACTGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGA:1 + chrX 5455962 5' - 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hobo 2920 1 59.22 CAGGTTTACTGTAAGTCATCAACCCCACAATACGTCCAATAAACATTTGCCTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 27398162 5' - roo 9052 2 70.55 ATAACTACCTCATAAAAAAACGCATATTAAATTGCCTATTAAAACTGCGTCCATCCCACTAATATATGTATATATTTGGTAGTCCATCCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCCTGGCA:1 + chr2R 8106978 5' - Tc1 1277 1 57.53 CAAGTGGAAGGGTCTGCAGATGTGGCCCGCCGAGGTGGAGGCGGTCATCGACGAGCTGCCGGAGGTGAAGCGCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGTACACGCTGCATCATATTA:1 - chr3R 12208657 5' - Rt1b 4772 1 47.95 AACATGGCAAGCAGTCGCTGAATGAAGAGATAAATGCAGCGAGCAGCCCAGGAACGTGCCAAAAATTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 19015958 5' - roo 353 2 56.16 GTATCTCAAAGTGTTTCGGTTAACTATTTAATGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAA:1 - chr2R 18618523 5' - jockey 4908 1 77.40 TATAGAATGGATATTATGGGCATACATTAGCCAGAATCGAATGGAAACGATATGAAACATAATGTTATGCCGCATTCGATTAAACATTATAGATACGATAGCGCATATGCATATATAGTATAGATACACATGTATATGTATCTATA:1 - 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INE-1 157 1 72.41 AAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATT:1 - chr3L 19350002 5' + 1360 3268 1 64.38 GTTCGTCATTTCCTGTACAATTTTATTATATTTCATACATAACTGCTACCCATTCCATCGCCCCTTTCTCCCGATTTATATATATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTCAAGCATATGCCTACATA:1 + chr3L 1044789 5' + Idefix 24 2 68.97 GGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGACGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2R 7622963 5' - P-element 2848 1 47.37 AGATGCTTATTTATGCATGTGCATATGCAAAGTTTTATGTAAGTTCGGTACCAAGTAAATATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCTTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCT:1 + chr3R 11757886 5' - invader4 327 1 43.84 GGGTTTTTCTTTCATGTTTTCAATCTTTCGGCTTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGGTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACT:1 - chr3L 21636508 5' - 297 309 2 76.71 CTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2L 16995503 5' - 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chrX 4988511 5' - gypsy7 5004 1 62.33 ATTAATTTAATTCACAAATTATCATTAACTATAATTTATTGTGATTTAAGCTTATTACTTCTTAATTATTCAAAGTCGAAATTTTGATCTGATCACCGCCAATTCGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 18075499 5' + pogo 13 1 73.29 TTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3R 14278000 5' + P-element 7 2 75.44 GAAAGTTTGCCGAGATCAGGGCGTGCTCTAATTAAAAGTCGTCACATACATTTTTGTATATATTTGTATATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCTGTTAATTGAATATTCGCGCCACCC:1 - chr2L 22044570 5' + McClintock 5987 2 54.81 CCGCAGCAGCCATCATTCAAAGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATANGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 8553265 5' + pogo 18 1 72.60 ACCACCCTGCATCCCTGCCAAATTGAAGCTTTCGACGCCGTTGACAGCCGCTATATTTGTACCTTTTGGCAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2L 7336233 5' + pogo 42 1 54.79 GCCTTTCATACCCTGCAGTTCGCCAGAAACTACACACAATTTGTTGGCAATTGAACATAAGGACTGCGAAATCCTGTTACACAATCAGACTTGCCACTCAAAGCCAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 8631759 5' + roo 8680 2 74.66 CAAATAGCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chr3R 10433305 5' + 412 57 2 60.96 CGGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr2R 22596065 5' + Doc 45 1 48.63 ATTTTTACTTTAGATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCTTAAGACTAAACGTACAGAGGTTTTTGAGGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACG:1 - chr3R 15784415 5' - rover 6978 2 55.48 TCCAGGAATTTAGGCAAATGTTATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr3L 13992241 5' + blood 60 2 58.90 AATATGCAAAAGCTTGGACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:2 - chr3R 20345587 5' + blood 7026 2 73.97 CCATATTTTTATCGCATTCTTCGCACAAACGGAAATGTAAACACTGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAA:1 + chrX 19163271 5' + Burdock 6208 2 68.49 CGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCAC:1 - chr3R 7042061 5' + Stalker2 79 2 69.18 GTGTAAGTAGCGGCTGTGAAGCGTGTATTTGGTGAAATATGGGGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2R 15472181 5' + 412 27 2 69.86 AAATAAATTGATATGTAAATTACTCTTTTTGGGTATACTTTGGCCAAAGTATTCCTTCCTAATTGAAGTACCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTTCTTTACTCTTAGTCATACATACTGAATTATACATAGCCAATC:1 + chr2R 23278354 5' + mdg3 50 2 51.37 AAAAACTTTCTGCTGCGAGAAATCAACAATTTACAAAATCTAAACAATGTCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 - chr3L 4287092 5' - P-element 2818 1 36.99 AACACTGGTGCTGCCTACTGTATATACCAGAATCCGCAACTGCAATTATAAACCGAATATGATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 + chrX 139991 5' - blood 7329 1 60.96 GGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chrX 7042730 5' - roo 9015 2 56.16 TTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGCGAGTGCACACTTTAGA:1 - chrX 22824240 5' - gypsy12 10152 2 56.16 GAAATGATTCGCTGTTCGCTGGTCCGCATTTTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chrX 20456995 5' - opus 7466 2 60.96 ATTATTTCGCTGCATACTTTCGGGCGAGCGCATTAAAGCAGTTCCTCTTTTTTTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 - chr3R 31086596 5' - jockey 4930 1 63.01 ATGATTACAAAACTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTGTTACAATTAGTTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATTGACTTTAGACTTTTGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGAT:1 + chr3R 31708628 5' - Idefix 358 2 63.01 CCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTTAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 9871567 5' + roo 28 2 55.14 GCAGCAGATGGAAGCTGGAGGAAGACCGCGAGGAGTTTGGCGGTGTTGCCGAAAATTAATGAGTGGAAGGAGGAGAAGGAGAAGGAGAGGAGGACGGAGAAGGGTATGTGAAGGGGCAAGATACCCC:1 - chr2R 4948466 5' + gypsy8 4494 1 55.12 CAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 8381701 5' + Tirant 8136 2 59.66 ATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATATGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGATGCAGTTGCATGCATTGCCCCAT:1 + chr2R 5284518 5' - Doc4-element 2619 1 60.71 ATTGAGGAGTAATTTATGACTCATAAAGAGAATATTCTTAAATGTAAAATTCAAACAATTTTAAACTAATTACCCTTACCTTATACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2L 1232593 5' - roo 9039 1 63.19 CAACACTTTCGTTTTTCCTTTCTCTTCTATTGTGTAGCGAAATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 16219207 5' + roo 75 2 71.03 CTAACTTATCATTATTCTTCGTACTGTACTTGGCAGTGTTGGTTTGAGTTAATCAGTAAATTATCAAAGGTGCTTTATTTTACATGTTCCGACTTATTCATGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTG:1 - chr4 190725 5' - mdg1 270 2 68.49 AAATCCTTTAAGGCCGCCATCGAAATGAACGTATGCAAAGCAACAATAAAATATGACGGAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3R 24093454 5' + jockey 24 1 71.23 TCCAAGTTACTTTATATATACTGCTTACCAAACTGCTCCTTTCTCTTTAATTATTATGAATTAATTTTATGAAATTTAAAAACTGTACATTTTATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chrX 18786074 5' + pogo 20 1 71.13 GTAATTTATGACTCATAAAGAGAATATTCTTAAATGTAAAATTCAAACAATTTTAAACTAATTACCCTTACCTTATACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2L 1232601 5' - roo 9029 1 56.85 CAGAACGGCACAGTGTTTATATGGGTTTTTTTTGTGGAACTACCAGGGCTGAAAGCAAAATGAAGTGAATTCACAATTCGCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCTAGCA:1 - chr2L 5485589 5' + Q-element 85 2 52.74 CTGGGGAGCCTTCAGCCGTGTGAATGTGTGCGTTAGTATCTCTGCACGTACATGTACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGAT:1 - chr2L 7148656 5' - HMS-Beagle2 245 2 64.38 AATTTGGTAATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:1 - chr2R 21199722 5' + jockey 4778 1 58.22 TCTGGCTCTGACGGCGCTGGTATTCCTCTGGAGTTTCCGGGGCATGTGATTTGCTATTTATCAGTGCTTGGGTTTTGGGGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTGCTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCAG:1 - chr3R 24109700 5' - baggins 5364 1 54.79 TAATAATGAATATAAATGAGCAGTGGGTGACAAGGCGTTATTAAGCAGTAAGGTTACACATGATCGAAATAGTCTCTTGTTCCAGATAACAACAATCAGATATTGTGTAATAAGCTAAAATCCTGTAAACATATTTTGTTACAATG:1 - chrX 18223294 5' + copia 4696 1 76.71 CTAAACAATCCAAGCGTTGGCACTTAATTAACTAACGCACCCGCCGTGGAAGAGTATCCAGTGATTCCGCGTCGCTCTTGTTCAACAATAAATCTAATTAACAGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr2R 8087006 5' + 1360 13 1 75.34 ATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTCTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTC:1 - chrY 2720330 5' + gypsy 7053 2 65.75 ATAGTTTCGCATAAATAAACCAATAATTTCTTAGACACATCTTTCTTTAAGTAGGTTTTTGAATAATTAATAGACTCGATAAAATGTACTCTATAAACTAAAATCAAATCCATTTTGACGGCCAGGGGGTTGTGGTGGTTCTCCAG:1 - chr3L 16075241 5' - G2 2856 1 78.77 TTAGAGAATTATTTTAAAAATGTTTAATAATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTACAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr3R 12342221 5' - hobo 2900 1 57.53 GAACCCTGGTAGCCAACAAAATTCTGCTGGATTTCACGCAAATCTTATTTGCCCATAGCCACTGGACCCACCCTCAGCCGGAGAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAG:1 - chr3R 6582963 5' + Stalker4 330 4 55.48 ATTAGTTTAATATTTATGTAATAAGCATTACAGGTTTGGCAGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTTAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATATTATAGATTTAAAGTCA:1 + chr4 935679 5' - 1360 245 1 71.92 GTTTTGAATTTTTAAGAATTTCAACAAATGTTTGTATAGTACTTTCTTTTTTATATGAATAATAAAATTAATTTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 - chr2L 17778033 5' - Juan 4166 1 54.11 CTCGCCATTATATCATTTGTGGAAAACTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr2L 16554710 5' - blood 7343 2 49.65 CATGTGGATTTGAAAACCATCATAAGTAGGGAGAAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 - chrX 10504414 5' - roo 9043 1 67.81 CTGCAGAAAAACCAAAAATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCCGTTTCCCTCGTTATTAGATCTTTTCATATACGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 10695919 5' - roo 9044 1 41.78 GAGGAAGAGAAATGCAACGGATTCACAATTCACCTTATCACGCGCGAGTTACTTCCCCACCCCCGATACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr2R 16731278 5' + Tirant 21 2 51.16 CACAAACTGCAGCGGGATGGAAAGTAAAAGTTGCAACTCGGCCGCCCCGAATCGCTGTACGCACTAATACTACAACACTTTGCCGCAGATCCACAAGTTAAAATGAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 11055014 5' + F-element 4685 2 90.83 GGTTAGCCCTTGCCCTTCCAACTGCATTGTCACATTGGTCTCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chrX 18767827 5' - hobo 2924 1 54.32 AAGAACTTCACAAAGAACATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTCTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAGTTTTG:1 + chr3L 8273913 5' + hobo 35 1 52.94 CCGTCACACGCCTCCTTATAGTCCCACCGGTCTCAGCGGATCGGTGGCCCTGCACAACAACAACAACAATAACAGCAGCACCAGCAATAACAACATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAG:1 + chr2R 7424399 5' - BS 5051 1 65.52 AGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 16200709 5' - roo 9035 1 60.27 TTTTCGGTTTGGCAGTGAGAAAAACTCAGCTATTTAACTCAAGTCGATTTAAAAAGCTGTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2R 6089035 5' - 1360 3350 1 56.16 GTAGATGTAAACACTTGTAATGTGAAAACACTGGCTATCTGTTGCGGCGCTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 + chr2L 5341458 5' - Burdock 233 2 71.23 ACACCCATGTTCGTCAGCCAATCGCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCG:1 - chr2L 22181192 5' - R1A1-element 5129 1 68.54 GACGACGCCTGATTATTTCCTGGCGCCAGTTTCTAAATTTACGCAAATTATTTTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 - chr3R 17060080 5' + jockey 4704 1 54.81 ATTAAGCCATCTAAAACTTGTTAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATT:1 - chr3R 6603068 5' + gypsy 7040 2 53.42 GCAGGGGCGGAGGTTGAGAAAGGCAGCGGAAAGGGGGAGGGGCGGGGTACCAGTTCCGGGGTGACCAGCACCAACAATTTTTGGTTCGAAAAATGCAGCGAATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3L 15273164 5' + pogo 17 1 69.86 TTGCACAAAATTCGTATCCTGGCCCGCAGTTTCAGCTTAATAAATGTGCATTAATTTGGACAAAAAGGTTAACTTTTCGTTGCTGGCTATGCCAAGATTGCACATTATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 - chr3R 7831380 5' + flea 13 2 76.71 GCAGCCGAGCGAGTGCCGAGCGAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGNTGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGGCAAGAG:1 + chr3R 17944026 5' - P-element 2870 1 57.78 ACAAATCGAATAAAGTAGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCACACCTCACCTTGATA:1 - 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chr3R 28939987 5' + Quasimodo 39 2 73.97 CCAAGAGCACTTAGATGGCTACAAAGTCTTCAGTTAACTCAGAACAGTACATAGTGAGCCTATACACTGGGAAAAAAAGAAGATTATTCAAACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2R 18396527 5' + pogo 26 1 66.44 TTTATAATTTGAAATATTGATGAACTTAATATCAATTGGCCAAAAACTCTAAATATCAAAATTGATTTCGGCCCGAAAATTGTATTCTAGCACAAGTACGCACACATATAAACGTTTTCGTTTATTGTTTTTACTCACACAAGCAA:1 + chr2R 5666133 5' + 1360 3248 1 76.71 TATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 21938179 5' + roo 8743 2 76.03 TCCAAGTACCTCCCCATATCAGTCCTTTTGAGTTTGGGGATGAGCCAGCCAATTTCGGGGATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAG:1 - chr2R 7336803 5' + F-element 4469 1 57.14 ATCGTTAATCTATTGGTTATATACCTTAACAGAAGTCAATGTAATGACAACTTTTACATGCTTGAAATCGGCTGCAATTGAAATATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr2R 17059530 5' + pogo 32 1 62.33 GCGGCTGCTTGTGGGCCCAAAAAAGTATGCTACGGTTTAGTACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr3R 11108165 5' + jockey 56 1 53.42 AGCAACTCCGAGTGTAGATGTACTTAGAAGAGTATAGCATTGTCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTG:1 + chr3R 20000164 5' - Quasimodo 7234 2 73.29 GATAGGAAATTAGAACAATCAACTAGACACAAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAACATTCGAATACTATTTGTCTATTTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 - chr3L 8754823 5' - mdg3 160 2 75.34 AATATCTTTTATTCCGTACGAATTATTCGATGTTTTCACCTAAACTACATTTACACATTGTTCAAAACATCATTTTTATACTATATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATAATAT:1 + chr2L 23311397 5' + S-element 1609 2 59.59 GTCAGGGATAGGGTGCCAGTGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:2 + chr4 906092 5' - opus 446 2 56.16 CATTTCCAATGCAATGACTCTTTTTGTCGAATCAATTGCAATCGCTTGCAATGAACCCCCTTTTTTTATCGATCTCAGCGTTCTCACCTACTTGACACTATTAACAAAAGAGATTTATTCAGTCCTTGCTCGCTCACCGGG:1 + chrX 13224378 5' - Rt1b 5001 1 76.60 ACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATGTACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCAC:1 - chrX 3797449 5' + gypsy 7056 2 69.18 GTTTGAAATACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTGTTA:1 + chr3L 24996079 5' - 1360 438 1 58.90 TAATGTCGGAATAGAGTTTGGTTGTTTACGCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCGTCCAGATGTGGGGAACTG:1 - chr2L 21403581 5' + G5 4393 1 66.67 AAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3R 31458414 5' + jockey 82 1 67.81 TCGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTA:1 + chr3R 10541228 5' - hopper 1338 1 71.23 GCATCGAAAAGAGAGCATTGCCTAAAGTAAAATTGTATGTTAAATGGTATTAAATAGGATTTATTAAAACTTACGCTGCTGGCAAAATGATTTAAAATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2R 18396705 5' - pogo 2079 1 65.07 ATACGAGCATTGATGCATTTTAATTCGGCACTTCTGCTGTTTTAATGAATAAATACGAGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATGAGTGATCNCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chrX 3559583 5' - opus 7450 2 60.14 AATAATGACACAAAGAGATTATTTACTTCTTAACTTTCTTAGTGCAACCGTAAATCCTATGCATGGCAATATTGTATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 + chr2L 17851644 5' - flea 214 2 55.48 AGTAATCGCGTTAGCAATCGAAAGTGCAAAGGGAGTACATTAAAAAAGCAAATTACTTTTTCCTATTATTCAATAGACCGGGTGTATGATTTGGCACTCGTGAGCGTCTGACACGACGGTGAAGTATGCATTGTTCCGCTGCGAAG:1 + chr3R 10685541 5' - Doc3-element 279 1 50.68 ATAGAAAACCTACTTTTTTTTATTAAGCTCTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTGTAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chr2R 4103312 5' + Quasimodo 59 2 64.44 GAGAATATTGAAAATGTGTGTATTAATATATAAATGTGTACGTGTTAACTACTTACTATCTGAAACTATCTTTAATATAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr2L 7774908 5' + I-element 20 1 70.55 TATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr3L 21913458 5' + 297 41 2 57.53 ATTAGTGTCGGGTTTCCTCTTGGGTCCTTTTCTGCTTTTCTGCTACGTGCCACCCCCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 - chrX 1759080 5' + Tabor 27 2 67.12 TATTTAAGTGACTTACTTTAATCTCAATGAAAGCAAAGCTAAATTTTTTAAATTTTTTTTGCAGTAATCACTTTGTATTAGCTCCACCAGCAAGACAATAGTTTCTCTACAAAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTT:1 - chr2L 5488121 5' + F-element 157 1 49.32 GCAAAGTCAAGTTCATGCTGCTTTCTTCATCATTAAATATGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACT:1 - chr3R 23415973 5' + jockey 4842 1 73.29 CAACAAGCACTTACGGTTTTAAAACAATTACACACGGGCACTTTTACAGTTTGAATGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTAAGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCA:1 - chrX 11815687 5' - Stalker 7083 6 62.33 ACATGCTAATCTGATTTCGTGTTATGTGTTGAGTTGGAGGTGAGTTTTGGCCCGACTTTGGAGTCGGGGTCGCCCCTCGACTTGGGTTGGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACA:1 + chr3L 20604082 5' + Quasimodo 169 2 63.01 GTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGAATGGGACAAA:1 + chr2R 4887640 5' + jockey2 3028 1 70.55 TATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACT:1 + chr3L 18010236 5' + diver 63 2 59.59 AATATTAATAAATTTTAACCATTTCATTACTTTTTTAAGCATAGATGGTAGTTACACGTCATGTAGTTTAGCTTATATTAATTTAATAAGTACATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAA:1 + chr3L 8246669 5' + FB 648 3 63.01 GAATGGGTCATTAAAGCAGGCATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3L 17602517 5' + Doc 59 1 53.42 GTGTAGTGCAAAGGGCTCCATCTAAATTAATTTAATACAATTTAATAAGCATTTTATAGATATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACA:1 - chr3R 16881996 5' - 3S18 6044 2 58.22 CATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3L 21913440 5' + 297 59 2 60.27 AAATAATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 + chr2L 1729763 5' + Transpac 73 2 66.90 AGATTCCTATCACATAATGACGGAAGCCACATTAAATCAATGTCAGAAATGGCAACTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCT:1 + chr3R 19449225 5' - roo 243 2 57.89 TCTTGCCGCCAACGGCTTTGCAACTTAATCGCGGCTTGTTATATATATATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAAAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chrX 10147976 5' + pogo 67 1 67.12 AACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:2 + chr2L 18737978 5' + roo 8751 2 79.45 TATGTACATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTGTCGAGTGGAAGTCAGGGTTGCAGGCAGTCGAGT:1 - chr3R 5026436 5' + flea 140 1 73.29 TGTTGTATTCAATTTGCTTGTATTCAATTTTTAAATGAAATCCTTTACACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 6399321 5' - pogo 2072 1 66.44 GTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1 + chr2R 16160732 5' + mdg3 52 2 53.10 CATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCCTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAAATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATTAGTAATCTATAAGTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGG:1 - chrX 14815845 5' + INE-1 99 1 79.45 CGAAGGTTGAGAAAGGCAGCGGAAAGGGGGAGGGGCGGGGTACCAGTTCCGGGGTGACCAGCACCAACAATTTTTGGTTCGAAAAATGCAGCGAATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3L 15273171 5' + pogo 24 1 66.44 CTGCTTTTCCCGGAAAATCGGGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 22435081 5' + opus 7040 4 55.48 ACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATA:2 - chr3L 23839760 5' + McClintock 23 2 69.18 AAGGTACGGGGTATAGTATATAGATGGCGCAAAATAGATTGCGTGTAATAGGTGGCGCGATATACAGTTATCAGGGCTTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACTG:1 + chr3R 4970765 5' - 3S18 5636 1 53.42 GAAAATAAGGGAAGGAGAAACAACATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 + chr3R 11758465 5' - P-element 2849 1 58.90 TGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1 - chr3R 19246750 5' - jockey 4906 1 77.40 CTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCAATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATCTCGTCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr3L 22435214 5' - opus 7464 2 51.94 CATTTTGATTATCGAACATTTTTATCGCTAGACATTTTTACAAGTTTGTATTATATGTATATAAAATGGAGAAAAAGAAACATTAAATGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGG:1 + chr2R 11101732 5' - Quasimodo 7064 2 63.77 CCACTAATTCATGTTTCTGAAATCATTTCATTATGTACCACAAAGTATGAATTGAAATTAAATGAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 - chrX 14347057 5' - flea 4952 1 56.16 AAGGGTTAACTGTGCACTTTCCATGCCCTAGACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chr2R 7622901 5' + P-element 87 1 26.71 AGTATAATCGTTGAAAATAAATTAATATTAAATTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 22041140 5' - roo 323 2 81.25 AGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTG:1 - chr3L 10814606 5' + micropia 5097 4 56.16 CGGTCAGGCATCGCCATTTGACCGGTCTCGATGGGGAAAGTGGAGAAATTAGCTCGAGTCTTGCTCCGGTTGGGGCTATTGCAGTGTCATTATATTTTTATCTTAGCCGTAAAGAGCGACAGAATAACGAAATTGGCTGTACTTCA:1 - chr3R 5348054 5' - FB 441 1 74.66 ACTTGTCATGGGCATATAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 - chrX 19163360 5' - Burdock 6329 2 65.07 CGTAATGAGTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAA:1 - chr3R 19246770 5' - jockey 4926 1 63.70 CAGGTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3R 8381677 5' + Tirant 7 2 76.86 CTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACG:1 + chr3R 29283198 5' - hopper 1341 1 68.53 AAGAACGCGCATGCGTTGTTTTTTTTTACTAACCATCGCGTACATTTGTTTTCGTTAACATTCTAAGGGTGGAGACATCTGGCATGACTCTGGCAGGGTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr2R 25083237 5' - pogo 2082 1 76.03 CTGTCCATTGTTGTGTTGCTGGCATTGCTTATGTATGTCACATTATTGCCTCATCCTCAGCCCATTCTGACTTAGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTGTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGT:1 - chr2L 9119153 5' + Circe 105 1 51.37 GTGCGCCGACCAAAAACTTCCCACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGGACGGAATACAGATTTGGGGTATCG:1 + chr3L 18947263 5' + BS 4678 1 51.76 AAAAAAAAGAAGAGAAAAGTAAAGTTATTGCTGAAACATATCTGCAGTCCCATCGCGTGTTCGGCAGATTGTTCAATATTTTTTTTTGTTTTGAATGTCAATGTTAAATGAAAAAGAATCTGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGA:1 - chr2R 13944640 5' - 1360 3173 1 78.77 AAATGAGGCGACGAAACCGAAACAGTCAACTGTTTGAACAAACAAGCAAATTATTGTGCCAAACTAGAAGGTCAACATCCCTTTCGCTCTGCACAAACCACTCCTTTTTTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCT:1 - chr3R 31855757 5' + Tirant 8431 2 76.81 TCTCCAATCCCAAGCGGACAGCTCGACCGCCGGACGTGGACCAAAATACGGACACGAGTTCATTTAAAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr2R 21619473 5' + blood 10 2 77.54 CACTCTGGAAGAAAAGATTGGGGTCACCAGGTACTATGTACCATGCATTTCAGCCCGTTTTCCCAAGATAAACATAACATTCAAGTACCCAAAAAACCACCAACAATTACACATGTATTCCAGCGCTCAAGTAATACGATCTAACG:1 - chrX 18732679 5' + Stalker4 7102 4 54.11 AAAAGTAAACTTCAATTTCAGGGGGTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGANANCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 - chrX 18767898 5' + hobo 68 1 62.76 GGGCGGAATTTGACGAAGAACCGATCCGTGAGAGCTTAAAGCAAAGCGATGATAGCGATAAATTTATTTTCAACATACGCCTAAAGCAACTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAATATTATCGTC:1 + chr3L 3021636 5' + G2 2615 1 48.63 CAAATATTCATATACTTTATTACTTTACAGATAGTCCATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 + chr2L 3175118 5' + Burdock 79 2 71.53 GTATTCCAACGCTTGTAGGAAGAACAAATCTCAATATGCTGTTAGACTTAATTTATATTACTAAATTAGGTGCTCCTGCTGAGCTCCTAATTTGGATTTCAAGCTATCTAAATGCCAGGACACAACAAGTCCTCTTTAAAAACTCT:1 + chr4 266339 5' + Q-element 435 2 39.73 TCTTAAATGTAAAATTCAAACAATTTTAAACTAATTACCCTTACCTTATACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr2L 1232628 5' - roo 339 2 70.34 GTCGTATACGTTATCGAAACTATTTGCATAGCATACTTTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGCGCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 + chrX 7845710 5' + hopper 54 1 73.97 ACATAGAATATAAAGAACCCCGCTTGAAATAGATGATTTAAATTGCAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTT:1 + chr3R 17998441 5' - X-element 4481 1 67.86 GTGGCAACAGAGCTTGAGATCTTTAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 5456644 5' - roo 354 2 61.54 GAAAATGCAAAACCCCCGAAAACTCGTGGCAGCCCCATGACAAATCGCTCTCTTTTAAGCCTTTGTCTGTGTGTGTGTGCGTTGTACGCTTGTGCGTTTGTNTGCGGAAAAACGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr3R 10541368 5' - hopper 1409 2 78.77 TGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGGCGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 15102307 5' + roo 19 2 60.27 GGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGA:1 + chr3L 8249362 5' - HMS-Beagle 6992 2 54.93 AAGCAGTATTGATCGCGCTTAAACGGAAAGCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 19698192 5' + roo 8712 2 52.74 TTTGCACAGTTTTGCCAATATTTGTACTAATAATTTGCAGTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr2R 20706844 5' + I-element 79 1 69.86 TGAAGAGATAAATGCAGCGAGCAGCCCAGGAACGTGCCAAAAATTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTCTTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr2R 19015980 5' - roo 8995 2 69.86 ACATCGTACAGGCCCAGTTCCTTGAGCAGCGTTTCGTTCTCGCTGGCGGATTGTAAGGTGGACGAATCAACGGACGCCTTGGCCGCTTCCACATTTATAATTGTCACTTGAGCTGCAAAGTGTATGCTCAGCAT:1 - chr2L 12698628 5' - Stalker4 199 4 73.88 CAATAGATAAACTTTTTTGAAGGGGAATTAGAAGTGGTGGAGGAAATTGAGAGGACTTGTGATTTAACATTGATTTGGAAGCATTATTTTATGTTACAGCACATTAATATCAAACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3L 19106529 5' + roo 8672 2 71.92 TGACAAAATGTCACGCTGCGATTGTGCCGATAGCGAAATCTCGTTCTCATTTTCAATTCGGAGGGTGGGCTAAGTTTTCAATGCCCCCCATCTCGGCGATTCTTCACTCCCATTTTCCTGCTGCCTTCTTCTACCAACAAATCAAG:1 - chr3L 4615831 5' + F-element 342 1 78.77 ACACACATATCTCGCCATCTCTTTCGGTTCCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr2L 16995553 5' + roo 8746 2 77.54 TTGACAAATCGATTATTGAAATGAAGAGTTAAGTGTGTGGAGGTTCGACGAGGGATCTATAGAGAGTTGAGAGATAATCGTGATGTATCCATCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTT:1 + chr2R 21393735 5' - copia 5063 2 60.96 TAATTATCTAGGGTTGCATTTTTCATGTCGTATAAATATTGGACCGGAATTATGATTAGGGTGAGCCTTTTTTTTATGTCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 21654945 5' + roo 42 2 55.48 AGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCAATGTTTCCTTATGAGCATTTTTTATTAATAAGCTTGTTAGGTGGCATTTTTCTAAAATGATATTCGTATCCCCAACGAATTTTTTGAATCGCACACTCCAACCGCCTTCAGCAAGG:1 - chr3R 19447039 5' + Chimpo 3821 1 62.33 AATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAATGA:1 - chr3L 23583090 5' - looper1 86 1 49.32 CATAAAAATAGGAATTTCGGGTAACAGTTTATTAGTTTACGTTTTAATATATATTTATGGGACACAGGAAATAACCTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:1 + chr3R 32065436 5' + 1360 43 1 56.16 CAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 18173692 5' + blood 37 2 56.30 GAATGTGTGCGTTAGTATCTCTGCACGTACATGTACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCC:1 - chr2L 7148635 5' - HMS-Beagle2 224 2 78.77 CTGCAGTGGAGGAGCCTTCGAGCAGAACAGTTTCTTCACATCTGAGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGCCAACGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCTTC:1 + chr2R 24617056 5' + jockey 4745 1 63.89 AGGGAATTACTTAAGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGGGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 + chrX 15405949 5' + opus 13 2 62.96 AATATGTTTCCTATTGAAAGGAAAATATATTGATTTCTGAGTACCTATTTCATAGCTAAGCAATTTGGTTTCTTGAATAATCATTACATCAAATGTGTAGCCAGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 - chr3R 19629077 5' - Transpac 5221 2 73.38 ATATTTCAGTTGCCAACTCAGTGTGCATATTATATGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGCAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3R 20260825 5' + roo 8746 2 75.52 CACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTCTTTTTGACACCCTACTTGC:1 - chr3L 8274001 5' - hobo 2869 1 63.01 CGGAAAGGAATAGCATAAAACAATATTTTTCAACTGTTCCAGCTAAAGAGCCACCTGAGCAAAATAATAATAGAGAATATTCGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATACA:1 + chr2L 4958060 5' - Rt1b 5085 1 48.97 GTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTAT:2 - chr3L 10814594 5' + micropia 153 4 64.14 CAATTCCCAAACTGCCAGTAGCTCACCAACTCCGGAACTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATG:1 - chr3R 30518928 5' - I-element 5274 1 73.97 ATATATTATTCCGATTTGAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACNTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGC:1 - chrX 22386827 5' + hobo 65 1 65.07 ACACGTGTCCGTACGACGTAAGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 16200689 5' - roo 392 2 73.97 ACTGCAATGCTTTCCTTCAGATTTTAATCGCTCACGTGAGAGCGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGAGTTAAGTTCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTGAAGTTTCAG:1 + chr3R 28045745 5' - Tirant 8451 2 52.74 CTGCCGCCCAACTTCAAATAATTGCAGCATAGATCTGCAGATTGATATGGTTATTTAAACTTCTAAATTTTCTATGTTGACAAAGCGTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 + chr2L 13292885 5' - copia 255 1 61.64 CCAAATAAGCACTTGGGAATTACAAGCTGGCAGTCGGGCAAACGTGCTGTATGGCAAACCAAATCGGGGTGGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTT:1 + chr3R 7475039 5' + Tc3 314 2 68.10 CGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGC:1 - chrX 13367457 5' + HMS-Beagle 6879 2 74.66 TCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACT:1 - chr3L 21913468 5' + 297 6593 2 74.02 TTTAATTGTTGGAAGGAGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGACACCCATGCGGCAACTTAATCTGATCTGCTTAATTTATTTTATTATACAATGTGTCTT:1 - chr3R 19246759 5' - jockey 4918 1 63.64 AAACTTTACGCAGCCCATCAAGGCAACGGCTCAAAGGTATTCATTTTAATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGTACAAATCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 20260922 5' - roo 9031 1 57.53 AGAAAAATATAAATAAGAAAAGCCAGCAACAAGTTGGTTTTAAACCAGAGAGTCGAGCTATAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAACGCGAATGCGAAATTTCATTATTTTTCTGGGATATCGA:1 - chr2L 4030768 5' - INE-1 505 1 73.97 CCTTCGCATAAGTGCAGACAAAATATGTAAAATACACACACAAATGGCACGATGAAAAATTAAATTTTTATTATAGATTGCTGGCATGAAAATTGAATTGATGTCGTTCGATTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAG:1 + chr3R 29444075 5' + mdg1 205 2 75.34 AAAACGGCTTCATATATCGATATATCAACAAAAAAAATGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 8795368 5' + gypsy7 5006 1 74.00 TATATTATTGAGAGAGATGATAGCGATGGTCGAGTGTACTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATG:1 + chr3R 12789506 5' + G2 2788 1 54.79 ATGGATGACCCGACATTGAGCTGATATGGGACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTAC:1 - chrX 140115 5' + blood 23 2 64.62 CTAGGGTCAGGGATAGGGTGCCAGTGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTTCCTCACCTTGATAT:1 + chr4 906087 5' - opus 7456 2 54.17 TGCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAG:1 - chr2R 6271516 5' - blood 177 2 77.04 CAGGTTATAACATGAGATAACAACAAGGATGCTGATTTTGAAAACTATTTAACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGGCCATAC:1 + chr2R 25203717 5' - 1360 3372 1 69.78 ATTATCCTATGCTTTGGTGTAGGGTATATACACAATTGAATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3R 13676205 5' - P-element 2842 1 56.16 GTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTT:1 - chr3L 20868077 5' - hobo 2886 1 80.41 AACTTTAATTGCCCAAAAAGCAACTATATGGCCTTATTAAGCTGTTTGGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 - chr3R 25962111 5' + I-element 20 1 70.55 CTTATTAAATGTTGAATATCTTTTAAAAAATTAGCATCAGCATATGAAACCAGTGCACTGGTTAAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGACAAATCTATGCCGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr2L 17136253 5' - hobo 2933 1 41.10 TTTTATGAGTTTCTTATGCTTGCAATCAATTCTTTTGCGTAGGGATCAATCCTAACTACGGCTGAATCTCAACCTTTTAGCTATAGTTCCTGAGATCACGACGTTCATACGGACAGACGGACATTGATCCTGATCAAGAATATATA:1 - chr3L 22700399 5' - INE-1 81 1 58.90 CAGCTGATGCGGTATCCAGACCATGGGCGAAACTGAAACGAAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTG:1 + chr2L 6385803 5' + invader4 2833 2 71.23 CTTTTATGGTCGTGTCCTTAGTCGTAGTTCGCAACTCATTTTGGGTATCAGTTTTTTATTTAACACTAAATTATGTAACAATAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCA:1 + chr3L 13449145 5' + Quasimodo 42 2 60.27 AAAGATTGGTTCTGTTACTGGTACTGGTTACCGGGGCATTTCGATCGAAATTGAAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATA:1 - chr3L 3152400 5' + flea 4985 2 63.01 AGAATCAAACAAAACAGCGAAAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr2L 3908517 5' + jockey 4711 1 52.80 TTTGTGTCCAAACAACAAGAGTCTTCAACATGATCTGTATTTTCAAGTTTGGATAATATGTCTTGCGATTGCTTGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGTCGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAA:1 + chr3R 460075 5' + F-element 136 1 51.37 ACTTTATGCATTATCAAACTCAATTCTCACACAGGAAAAAAATATTACAATCTGTACGTAACTGTATCGTTAAACTAAATTAATTACACTTACTTTTAATTGATTTACCTTACCTAGCTAACCGTATAACTATGCTTGGAACAGTC:1 - chr3L 13079634 5' + Cr1a 4021 1 56.85 AGCTGCACGCTTTTGTGCAGCGGTTCAGAGCACCAAAGACACTAGAATATCAAGATGCCTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCATGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCA:1 - chr3R 801671 5' + 1360 92 1 78.77 CAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 9871559 5' + roo 75 2 73.29 ACACTTTCACAGTTCGCTCTTCACTGACTTACCCGCGCGTTCTCACTCACTGTCTCCTTCGGACGTTCTGAACTTTATAAGCTGCGGGGATTCCGTTATTTCCCAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATG:1 + chr3L 27130755 5' - 1360 303 1 71.23 AATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 16200728 5' - roo 361 2 52.55 CTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chr3L 21913447 5' + 297 52 2 55.48 AATCACACACACACAGGCAAACTAGCACACTCATAATTGTATATACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAACC:1 - chrX 17076834 5' - invader2 4630 1 70.55 AACAACAAAAACATTGCAGAGTGTGGGTGGCGCGTGTAGCGATCAAAATTGCGTGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3R 13684679 5' - 412 7484 2 63.70 GAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 13684764 5' + 412 7128 2 67.12 GCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1 + chr2R 16072909 5' + opus 7056 4 58.90 CCGGAGCATGCTTCTTGGAAACAAAAATGTTGCTCTGCAGGTAATCTATTTAAAAATATTAATTCACAATTTAAATTGACAGAACGCCTTCGCTTTGCTTTGGCCGAATATAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAC:1 + chr3R 16965471 5' + Cr1a 4286 1 69.86 GCAGCATACAGTCCGTAGGTCCCAAATGCCAAGTTCCGATCAAACATCGCATCTGAGCTTCGATATTCCGATGGGTCAACAACACTGGCTTGGGACTATTGACCGCATCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATA:1 - chrX 7330067 5' + mdg1 7260 2 72.60 AAAAATTATGATAGTTGCTTAGAAACATTTGCCACACTAATATCTTATATTATATTACAGTAACTGGCGGGTCTTATGATTTATTTTAAGCCGGCAACATCAACTCCTCTCCCCCTCCCCCCCCC:1 - chr3R 13237437 5' + accord2 223 1 71.20 ATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 + chrX 21227088 5' + Tabor 43 2 56.16 AAACGACTGCCTCTGACGACCGGAAGGCCTCGGAACAGACAGAAGGCAGTGTACAGAAGAAAGCGAAACAGCTGAACTACTGAGCTGCTGCAACTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAA:1 + chrX 20326154 5' + roo 9040 1 63.70 TACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr2L 6047830 5' + P-element 54 1 48.63 TTTGACTTGGGAAATATGCCCAAAAATATGCAGGGAAAGCTCTATGAATCGATTGAGCGATACTCGGCTTATCGATGTGAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chrX 4240198 5' + jockey 4713 1 55.48 GTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACA:1 - chr3R 12376509 5' + flea 4827 1 65.75 TACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCTAGTGAGCG:1 + chr2L 16554605 5' + blood 7081 2 64.38 CGAATGGTGTGCCGCCAAGTGGGTCCAAGCGGATCAAAGTCAGCGTGGACTGTAAGGCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAAGAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1 - chr2L 6385932 5' - invader4 305 2 67.81 TTTGAAAAATGTGCTGACACTTTGAGCCGAAGCAGAAGCTCTACACTGCAACACACGTTTGTATGACAACTAAGACTATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2L 11476389 5' + pogo 38 1 58.22 TTCGACTTATCGAAGCCTTACTGTACTCATCCCTTTGTTTGTTTTGCATGCAAACGTCTCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 - chr3L 15273314 5' - pogo 2042 1 60.96 TTTGCGCCGTTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 - chr3R 17766846 5' + HMS-Beagle2 36 2 57.53 TGCATAAATGTAAAGTGCATGTGCATGCTTAAATGCAATTAAAGGGTGTCGAAAAGAATGCAGTGAAAACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr3R 28413854 5' - pogo 2051 1 50.68 AAGCAACAAAGGGAAACAAAGAAGCAAAGCAGCTGTAGAAAATGAAGAGGCTGAAGACACGGCAGAAGATGAGTCTTCATCGATGCTAAAGGTGAAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGGGCTGGTGGCTTAAGAACTTGACAC:1 - chr3R 14012534 5' - Doc3-element 470 1 54.79 TCGAAAGTACAGATTCAGATATGCCCGCATAATGTTATCAGTCGACCAATTGCTATAAACGGCATAGTCGCCATTTATCATTGGTATGTATTTCAAGAAATCGGATTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 16200884 5' + roo 8674 2 76.55 GTTTCTAATGCAATCAACACCATTTTTTAAAGACCGTATACCTGGGAAATTCGATTCCGAAAATATTTAACAAAATAACTGGTACAACACTACTTAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTT:1 - chr3R 26934323 5' + FB 800 3 34.93 TAATATCTTTAGGTTTTATAAATTACATGATAATTATAAACCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 18738075 5' - roo 9033 1 59.59 TGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTT:1 + chrX 21227109 5' + Tabor 6903 2 58.90 GGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr2R 15472139 5' + 412 7122 2 58.22 ATTGAAGTGTGAAAATGGGTTACAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2L 3133666 5' + Doc 36 1 54.11 AGTGTCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3L 20168210 5' + roo 76 2 70.55 ACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr3R 20345559 5' + blood 7054 2 54.79 GACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTGGGCACTAT:1 + chr3R 12622171 5' - 1360 3356 1 56.10 AATGATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 16072891 5' + opus 148 4 57.53 AGTGCATTGACATTGCCACATTGCTAAATTCATTGGCAGCCCATGCCAATTTTAATTCGTATTTTTTGCCTCTGGTTGCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chr3R 19996154 5' + Quasimodo 34 2 63.01 ATGCCCATAGCCATGGCCCCGTGGTCCATCTGGGGATCCAGTGGTTCAGGTTCTGCGGAGACGACCTTAGATTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTT:1 - chr3L 11720225 5' - gypsy4 493 1 51.03 ATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCAC:1 + chr2R 18035112 5' - R1A1-element 5287 1 59.06 CGAGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 13468310 5' - roo 8996 2 74.66 CCACCGAGCAACAGCCAAGGTAACCTAAGCCTTCGGATTAAATTTATTGCTCCTAGCTCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 15917554 5' + roo 19 2 69.18 AAAACACACTCACTTTTGAGGGGACTAGTAAAAAATGAGAAGGGACTCGCTTCGTTTGTCCTTTATAGTTGGCCATACATATATATAAGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 - chrX 7626249 5' + Transpac 29 2 65.75 GCCCATTTAAAATTCAAGTGCGTTTTCATTTGGGAACGTGCTCTTCGAACGACGCGTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 + chr3R 7512804 5' + jockey 4696 1 69.86 CAGCTTAATAAATGTGCATTAATTTGGACAAAAAGGTTAACTTTTCGTTGCTGGCTATGCCAAGATTGCACATTATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 - chr3R 7831348 5' + flea 45 2 54.79 TGTCACATTATGTGCTTTATGGCGATTGACTAGAACTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACTAAGGAGCCCCCGAAATTC:1 + chr3R 28754781 5' - jockey 4554 1 74.31 ATCGGAAACAACATGGGGCACTCTGGGCAGATGCCAGACTATGCCGAACTGAAACCGTGCCATCTGTCATCGTGTTAGCCCGGTGAAACTCAAACAAACTGTTTCCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAA:1 - chr3R 14867717 5' + 297 6772 2 77.69 TGAAGGGAATGAATGCTGCATTCACGGTGCGAATGAATGCACGAGTGCTTAACAAAGTAACTAAATAAATATTGGGCAAAAACCGGGAGACAATCAGATGTGAATAATAATTTAACATCGTCTGCGTACTTAAGTACACGCGAATG:1 + chrX 3319320 5' - Q-element 559 2 71.92 GTTAAATATTTTAAAACTTTCTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTA:1 + chr2R 7407954 5' + 3S18 5768 2 76.70 AGGCATAACCAAAAGAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:2 + chr2L 20044534 5' - roo 357 2 54.11 TGGAGAATTGACGCTCAAAAGGTGGTAGTAAAAAGTCGTATATAATTTTCCATTGGAATGGAATGTGCCACATTGCCCCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCC:1 + chr3L 17757840 5' + Tirant 8106 1 38.36 ATTGAAATTGAACCTGGCGGCTACGAAGCGGAATGCTGCAAATGGCCACGACCCCGGGCTAGGCTTAATGAATATTTAAACGTAATTAAAGTCACACCCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCTATACTAA:1 - chrX 12562541 5' + G4 3399 1 67.41 GTTCATAGATGCCATGAAAAGTGTGCAAATCAATCCTATGAATTATGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGGATAAACGTCGAGATCTCAGAAAC:1 - chr2R 11575193 5' + INE-1 140 1 74.00 GCAGAGAGATGCACAGAATTCAATTAGCAAAATTGTTAAGTAACTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 23579282 5' - roo 9016 2 58.22 CGTTGCTTTTGGAGCATAAGAAAATGCCCATTTGATTTTGTCAATGCGCTGGTCTTTTTTCATACAACGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chr3L 20765260 5' - 297 349 2 54.79 AAGACGTTCACTTTCCACATCTATTCGATTTGCAAAAAAGATATGCCACGTTCTTAATGTACACAGCGTGTTTAGAATTGAATTATACGATTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2L 21777912 5' + pogo 25 1 67.81 CAACTTTATTGCGGAAACTCAAGCAACTAATTGTGCGCCCTTTATTACGCTGTATTTTCAAAACTTCTAAAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCA:1 + chr3R 12181938 5' + mdg3 23 2 70.55 AAGCAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 - chrX 7993148 5' - opus 7433 2 66.44 ATTATTATCAATTGTGAAGTATTAAATTTTTAGTGAATGTGTTTAAAATTGTATGCCGTAGGTAATTGTGAACGGTTCTTACCTTCTCAGTAATCTATTTAAAATCTTTGTAAATAGGTAAAAGCACTTTTCATTTTTAAATCTTT:1 + chr2L 9982575 5' - Dm88 4239 1 60.96 TATGTATGTATGTATGTATGCATGTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATCCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATAAACGCCAACGAACGG:1 - chr2L 12272678 5' + HMS-Beagle 56 2 73.39 TATAGACGTTTTCAAATTGAATAGTTTTATAAAGCTACAAGTTCTGTGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 20044674 5' + roo 8690 2 62.33 TTAACTTTTTTTTTAAACTTTGCTTTTTAACTTTATAATTGCTGGTGGAGGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTAACTTTGCTGGTTGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTT:1 + chr2R 9718290 5' - TAHRE 10386 1 65.75 CACAAAAGGTGCTAATTCACTTGATTTGCGTAGCTGGATGCGATGTGATGCGGTGGGTATGGTATGGTATGGTATGGGTTTGGTGTTCGTACTCATGTGAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chr3L 17008008 5' + FB 22 1 70.55 ATGCATCTAACGATATTATACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr3R 10900909 5' + F-element 69 1 52.78 ATTGGTCGCCGAGAGAGGGAAAGAGATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTT:1 + chr3R 7041971 5' - Stalker2 349 2 52.74 CCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 + chr3R 9550896 5' + P-element 62 1 43.15 AGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chrX 17495832 5' - Burdock 6356 2 61.64 CAAGAGTTTCGTTGGTATACATATCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3R 9551039 5' - P-element 2878 2 78.57 ACGGGGGAACAATCGAAGAAGCCAGAAAGCGACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr2R 23595957 5' + blood 7044 2 58.52 AAGCGATTTTCATCTACTAATTTAATTGCTGGGACGTGATATTGGCGGGACAAAAAAGCTAATTGGCAATCAATTAAAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2L 2316911 5' - roo 9036 1 50.00 ATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3L 21913457 5' + 297 42 2 56.85 GTCCATCCGGAGGGCGATACGCTGTGCCACAAGGCCTGGGGGTTCCACCAGTGCTGGAAAAAGGCCGATCCCAAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAAC:1 - chr3R 5972423 5' + Doc 263 1 72.60 ATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chrX 20940729 5' + hobo 67 1 67.15 GCAAATATTTAATATTGGAATTCAATTTTTGTTTGCTTTGAGCATGATAGCCTAACGAAATAGCTAGAAGAAAGAAATCCGCTGGATTTCTATAATATAATTGTTTATAATTTTTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr2L 9063178 5' - Juan 4203 1 44.52 CGTGTGGGTGGAGGGTTCTTTTGGCCTCGCACTCATTTTTTTATTTGTGTTCTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATTTTTATGTTTATGT:1 + chr2L 17470337 5' + 412 7123 2 61.64 ATGAGCGGTATTGCTTTGGCATAGAGCACCCATTGCATCTGCAGAAGAAGGATTTCTGGACCAATAGTCAGCACACGTAGGCACTACACTGCAACGGAAAAGGTAATGTTTAGCAATAGTATGGGCCGTC:1 - chr3L 6594576 5' + Osvaldo 69 1 63.85 ACATATACATATACATATGTGTAAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACGGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 2872866 5' + roo 21 2 66.44 GTGTAACGATGGTCGAGGCCATTAGCACTTACTTTTAATTATGACCCAGCCCGAAATTCAGTTCCACTCGATTTCAATTAAACACAATTCTATTTGGGACACCCTCGCAAGGCCTTTCTATTTTTGAACAGGATCAACAGCCGAGT:1 - chr3R 25001865 5' + INE-1 91 1 76.71 CTCAATGCATAATTCGCAAAACGCTTTCTTCTCAACCAAGCTGCTTTAGAAAGATGGCCTCAGATGAAAACCCCTAGATACTGGCGATGTATAGAAATCGCTTAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTG:1 + chr2R 16184970 5' - 17.6 479 2 77.40 GTTAGTTGTTTTCTCTCTGAAACTTTAAGACTGACTTTGGACTTTTAGAAAGTGTTTTGTATTATTCTAGGAAATTAATGTGTTGAATTTATGCCAAAAATATTTTTGAACTGTCTCGTTTGCACTAACTGAGTAATGGGTATCTG:1 - chr2R 13232900 5' + INE-1 543 1 80.82 CTGCCGATTTTGTGAGTATTTATGTGTGCGTCTCTGTATTCACTCCAGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1 + chr3L 19907056 5' + P-element 11 1 77.04 CTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAAT:1 + chr2L 5341507 5' - Burdock 185 2 67.81 GGAATAATACAAAGCCAACGTTTTTCTATATAATGCTTAGTTTTGGGAAAGGAATGATGAACTTTAGAAAAGTGTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 - chr3L 8936981 5' - BS 5048 1 52.05 ATAAAATTAAAAAATAATTTCACAATATAATTTCATAAATTTTCAAATATATATTTATGTTTGCAATTATATATATATCACATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr2R 14161296 5' + I-element 42 1 56.85 CATCTCATCTCATGTGGCAACAGAGCTTGAGATCTTAAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 5456657 5' - roo 391 2 63.55 GCGCTCACAGGAAGTGGTGGCAGTGGCACAGAGCGCGGTCTTTAATGCATGCCTTTAAATTGTTTATGGCCCATATGAGTAATGTGCATGCAGGCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTAT:1 - chr2R 10369622 5' + flea 4943 1 60.69 ATAAAAAGCAACAAATTGAAAATATTATAGTCGCAACACCAACACTAGATGTTGGCAGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 + chr2R 6217093 5' - copia 224 1 60.27 GATTAACAAACTCTGATTAGTTCTGGGAAAAAAAATATCAAAGTAGGAATGCCGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr2L 17136093 5' + hobo 62 1 60.43 CTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACACTGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCC:1 - chrX 1759022 5' + Tabor 6924 2 71.92 AATACTTTACACTTTTTTTTTTTAAAAAGGAATAGCTGTAAATATGGTTTAAGTAATGTTTAAATATTAATAAGCATCCAGAAACTTAACTTTAAATTTTT:1 + chr3R 12090982 5' - X-element 176 1 64.36 ATACACACATACAATATGTGCTGAAAGTCGTAATCATTCAATTTATTTCCACACATTTCGCCCTACTTTCCGTGCAGCAGCGAAACACGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3R 31419459 5' + pogo 47 1 63.01 CATATTTTTATCGCATTCTTCGCACAAACGGAAATGTAAACACTGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAAC:1 + chrX 19163272 5' + Burdock 73 2 69.18 TTCGCTGTCGTTGCATAATGGCCAAGAGGCGACAAGTCATGATGAAATAACATNANGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 + chrX 19887079 5' - P-element 2811 1 27.61 GGTGGGCCTGCAATGTCAGAAAACTGATATTAGTTCGCCTATCAGATACCCAGTAAAAGTATCTGAATGAAAAATTTAACAATTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2R 17649195 5' + Doc 44 1 43.84 CGATCTCTAATGCACGCCTGCAATAACAAATTACTTCCTGTCCACATTCCAAGCGGCCGTGTGTCTTTGGTTGTTACCATTCTGAAGACGTGTGTGTAGCCAAGGCATATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGC:1 + chr3L 8362487 5' + hopper 1360 1 73.97 CATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chrX 15252398 5' - opus 7479 2 65.35 ACTTAAGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chrX 15405957 5' + opus 55 4 64.79 TCGCAATGAGGTAGGGGTTCACTATTGTGTCCTTAGCACTTAACTGTTCGTTAAATTGTTTCCATTATAAACAATTATAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACT:1 + chr2L 9062262 5' + Juan 4070 1 52.74 TTATCCTTAAAAAAGTGTTTGTATTGAAAGCATATCCTTCGCATTTCTATAAACACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3R 29384619 5' + roo 65 2 67.12 AATCGCTGTACACAGAAGTCTNCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr3L 21636423 5' + 297 6635 2 57.53 GCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCAC:2 - chr2L 13328487 5' + BS 74 1 69.18 CGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2L 3911843 5' - roo 337 2 65.07 ACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 - chr3L 22435215 5' - opus 7448 2 56.85 AAAAACAGGCATAACCAAAAGAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACGTTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr2L 20044528 5' - roo 9027 1 52.05 GTGGTAGTAAAAAGTCGTATATAATTTTCCATTGGAATGGAATGTGCCACATTGCCCCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 + chr3L 17757861 5' + Tirant 3 2 43.41 CGGATTTAAATATATCTTGCGTTGTAAAACGAAACCCAGAAGAGTAAGATGTGGTAGTCGTTGTGTTAATATCTTCGTCAGATCCTAGGCATGCGATGCAAAGTGGCATCTCAGCGGAAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCC:1 - chr2L 178621 5' + 1360 3314 1 75.34 CACGCACAGTGGCAAAGAAAAAAAACAAGGGAGAATGCTATAGCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTG:1 - chrX 17622342 5' - INE-1 539 1 93.67 TGTATTTACAAATGAACGAAATGTTAAATCATTAAATACATATTTGTAAAAATCCTAATATGGGTAGATATATTCAAAAGGTACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr2L 6346569 5' + flea 24 2 62.22 CGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 + chr2L 8553318 5' + pogo 71 1 69.18 GTGGAGGGGGAGTGCGACTGTCATGCGTGCGGCGTAATGGGCATGAGTTAAATATGTGGATTAAAGAAATAT:1 - chr3R 7172321 5' - I-element 5029 1 58.33 TTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTGGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATAGCATCTT:1 + chr2L 19698101 5' - roo 8988 2 72.41 CAACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTCTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAG:1 - chrX 23182958 5' + Idefix 10 2 64.38 GATTTGCCACCCCTCAATTTTTCCAGCGCCTCTTGCCGCCAGTCCAAGTTTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGCAG:1 - chr2R 22774649 5' + I-element 2 1 78.40 TAAGGCCGCCATCGAAATGAACGTATGCAAAGCAACAATAAAATATGACGTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 24093462 5' + jockey 32 1 67.12 AGCAGGAGAACCTCAAATCAGCTTTAGCATTCCACCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGNAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr3R 8631639 5' - roo 321 2 75.34 GGTCTTGATGGTCAGGAGTATTTTTAATACGACTGGAACGTTTTACAAGTTTTGGAAAAGTTTTTAAGCTTCAGCCCTGTAAGATTGAAAGAGTCGTTGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr2L 18284981 5' - pogo 2081 1 71.92 TCGATTACTTGCTTGCTTGCTGTAAATATCCGCATCTGGCAACGCTTTTAACCGGTTTTAAAATGTCAAGCGTTATTTCCGTTACTATCCCCAAACATTTTTTTACTGTAAACTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCC:1 - chr2R 17514168 5' + X-element 4630 1 69.18 CCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr3L 17757944 5' + Tirant 9 2 64.56 ACATAATCAATATCGAATAATATATGTACGAGCTCTTACAATTAATAGCAATCATTAACAGAACAGATATAATATTCTCAATTAGGTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr2L 22690073 5' + copia 36 2 60.96 CTTCTTGATATTTGTTTCTAAATTTTAAAAACAGGTGATTTATCGTGTAAGGCACTGGTATTGCTTTTTAATTAGAAATGTATTTTATATCTAACCCGCGCAATTACGAAAAGTCTGGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTT:1 + chr3R 31990951 5' + GATE 8442 2 41.10 AATATTTCTTTCAAAGTGTAAGCGTTATCGTTGGCTTGTTTAATCTCAACTTTTTTGCTTCTATAGTTCCCGATTTCTCGGGCTCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 - chr2L 21754007 5' - hopper 1377 1 56.85 GGAGCGTTAAGAGTTTTGTCCTTCCTAATCATATACACACATATGCATGTTTTTGTAGTAAGTGTATATTTCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTAT:1 + chr2L 4268924 5' + hobo 34 1 58.78 ATGTATGTAATACCTCGCTCCCACCACAATTCTTGAACTCCGATCTTTGGTACAGTCATGCCCAAAAAAAATCTCATGTAAATGATTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 18231449 5' - roo 9008 2 58.90 AAGCGGATCAAAGTCAGCGTGGACTGTAAGTCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAA:1 - chr2L 6385906 5' - invader4 279 2 54.79 CCATCCAGCAAATCTGTGGGAAAGGTCTGGAAGGCATAGATTGCAGTGGAGACGGTGGGGCTCCTCTGGTTTGTCGGATACTTACATATCCATATAAGTACGCACAGGTGTAATCCCAAAGCCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAA:1 - chr2L 2128550 5' + I-element 77 1 75.34 TTTTTAGTGCCGCTCAGCCGTTAAATAACTAATAAGAGAATCTGCGAAATTTCAACATTGCTTAATTATTTTTCTTAATTAAGCCAAAACATAAATTGGTTCAGGGAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCA:1 - chr2R 11046046 5' + jockey 4861 1 72.60 TCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACC:1 + chrX 6186335 5' - Transpac 224 2 79.29 TAACAAATTAAAAATACTCAAACCTATTTTTTAATCTATACTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 21938243 5' - roo 328 2 76.71 TGGCTGTTGCTCCTGTTGTTGCTCCTGCCTTGGATGGCTGACACACATACACAAATACCCGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 8065201 5' + 297 6628 2 57.53 GGCAGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 16219295 5' - roo 349 2 60.96 GAAATGTTGTCCCACAATCGCCCGCCCAGAATTGCCAGTTCAGTTCGGAACACTCGATAAAATGCTTCTGGCTGTCGGGGGAATTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCT:1 + chr3L 5521866 5' - Quasimodo 436 2 46.58 GATAAGCGTATGAAACAGCATTTCAGGTAATTTCTTTAAGAACTACTTGAGCGAATATGGCATGACCCTTGAAAATACCCATATATATATAGTGACGTATTGGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr3L 7646351 5' + 297 35 2 60.96 GTAATCATCTTGGACCTATGGCTCATATACGACACGACTTAAGGGAAATGAATGAAAAGGAGGCTAAGCTAATGACGCTTTTATACGGAAAGACGCTTTTGTTTCATGAATGTTGCCCTTGGTCAGTGGAATTATGTGGAAACTGT:1 + chr2L 17726400 5' - Fw2 282 1 58.90 CTTATAAAGGAAATCAACCGAAAATACTTTCCAACTGAAGTGTTATATTTTTGAAGCACCTAGAGATTTCCAAGATTCAGTGAAATGTCAGCCGGCGAACCTTACGGTATCGCTACCACTACCAACGCACTCGT:1 + chr3L 9315573 5' + G-element 159 1 61.94 GGTGGCCATAAAATGGCATAAAACGGAACATTTCGGTGTTTAAATAATGCTAGAAATTGCATTTAGAATCTATCTGCCTTTGGCAGATGGGGATTGGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr2R 8689323 5' - hobo 2916 1 69.44 AGAGAACCACTTATTTCAAAAGCCTTGGGTTGAAAACCATTGGTGTGCTTACGCAGAAAAGATCGCCACTTGTTCGCGTTATTGAAAATCCAGTGAAGAAAAAATGTCGTTTCCTGGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTG:1 + chr2R 11876205 5' - mdg3 441 1 54.11 GCCCAACAAGCGGAAAGTACAATAGCCACACTCGTACCAAGATTAAAATGGTTAAAAGCCAACACAAATTAGACTGCGTCCTACCTACATAATATGTACCTACCTACATAATACCAAAGACCCTATTATTCTAGTGTCTTTGATAA:1 + chr3R 4635269 5' - Tc3 239 1 77.40 TAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1 - chr3L 10814611 5' + micropia 5092 4 52.74 GAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 - chr2L 15549943 5' + hobo 71 1 67.12 GAGGGGACTAGTAAAAAATGAGAAGGGACTCGCTTCGTTTGTCCTTTATAGTTGGCCATACATATATATAAGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chrX 7626232 5' + Transpac 4964 2 54.48 GAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 - chr3R 9550971 5' - P-element 2804 1 28.77 TAATAACTCGAGCAGCTATTCTCCGCCTCTGGAAAAGTCCTCGCCACCCCTGGAAAACATGTGAAATTAATCTTTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATA:1 - chr3R 30626127 5' - Stalker4 253 4 50.68 AAAACTAAAATAGTTAAGCAGCTTATGGGCCATGAGGACAGAGCTATGCGGATGATGGGCCAATAACCATAGCCCTTTCCAAATATGGATAAATAAACATGACCAGACCCCAAAGATCATCGTTATTATTGGGTT:1 - chr3R 6592803 5' - Tc1 1209 1 73.33 GCATGGTACTGTGCACAAAACGCTCGTCGCAGAACTGGCAAGCGTATGGCTTCTCTCCGCGGTGCTTCACCCGATTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAG:1 + chr3R 17804057 5' + R2-element 3432 1 49.32 ACGCCAGTCCAAGTTTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr2R 22774614 5' + I-element 56 1 54.86 TTCAAAACGAATTGTAGACCTCAGCAGTTTGGATTCCATGCTACTTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAA:1 - chr2L 13295523 5' - copia 3 2 69.18 TTTTCAAATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 21938132 5' + roo 32 2 63.01 AGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 + chr2L 6047879 5' + P-element 103 1 15.07 AACTCCCCATGCTTTTGCGCCAAAATGGAGCATTACAAGCTCCAACGAGCCCATTTTTGTGAAACCCCAAACCCTTTTCTGATCTTCGTGACAAATCGGTGCTGCCGGAGAGGAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCA:1 + chr2L 19850664 5' + HMS-Beagle2 6738 1 55.32 ATAAAGGTCCAAAATTTTTTTGAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 20550922 5' + 412 7081 2 63.70 TTTCAGTGTTGGTTAAAACTAAAGGTGTGCCAAGCTAGCTAGATAATATGGGCAGGAAAATCGCTAAAGAATTAGCTATAAAGTATTGCGGAATATAACTGTTAACTCTTAAAAATTTCCACATCTCCGGGCCGGACTAAGGTG:1 + chr2L 20060979 5' + baggins 205 1 70.14 GGCGGATGATGGGCTGCAATGGGCTGAAATGAGATGGAATAGATGGAATATGGCTAATTTATGCAGTTGGGTTCAATTACCTGTTAATTGAGTTTACGTTTTCTCGCAGATCAAAATTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGGACTC:1 + chr2R 11327723 5' - 3S18 5984 2 65.75 GGGGCTGGCCCCATCTTGGCGATCTCGATTCGCACAGTACACCCAGAAAACAATCGCATATGTATCTGCTGGACTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 2104672 5' + roo 45 2 54.11 CCGCTTCGTCAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAACAACTCTAGTCCATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACAGTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTT:1 + chr2R 1653633 5' - Quasimodo 7180 2 64.34 GTGACCGTGGATCTTCCTCCTATTTGCAACTTTTCCAGCAAACAATGCTCCATGCTTGGTACCCCCACTCCGTTGACTCCATTCAACTGGTAATAATGATGCGACACGGCCTTCCTGACCAGCACACGTCCTC:1 - chr2L 1459773 5' - invader6 4466 1 67.67 AATAAAAGGATATTACGTTAGCGAACAGCAGTCGTGTGTGATCAGTATTTGTTGTATTTGTCTCGTTCCACACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGAT:1 + chr3R 20957968 5' + Quasimodo 7114 2 51.06 CCCCACTTTCCGGGCACACCTCCCCCCACCCCCCCCCC:1 - chr3R 24959800 5' + accord2 223 1 81.58 ACTTTTGTTGCGCCTCCCAAAAGTATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGATACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3R 31458344 5' + jockey 11 1 76.03 CCAGTTTTATTATTCAATTTGCAAGGCAAACGTGCGGCTTCAAAATGGGCAAACACCCGTAGAGATAGTGTTTCAGACGGATTATGTTAGTGAATTGTGTGGCCCTGATTATTATCGTTGGGTTGGCAT:1 + chr3R 13365312 5' - Fw2 3818 1 74.42 AAGCGGACCCACCTTATCTTCCTCTTCCTCCCTACGAGCCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTCCCGAAGTATA:1 - chr3R 11758568 5' + P-element 34 1 46.00 GCACACACATGCAGATTTAATAACGCATACGCGTCAGTCAACCGCCGGCAAAAGCCGCAGAGCCAACAGTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 12365435 5' - hobo 2931 1 78.68 GATGATGAAGGATTAAGATGCGCTGTCGCGGGCACGGCGAGATGCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 6514349 5' + roo 8697 2 59.71 GCGTGAGGAAACGGAAGTTGCCCCGAAAATGCAGCGGAGAGCGACGGCGATTGCGATTGCGATTGCGATTGTGAGTGCGAGTGCGAGGAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGT:1 + chr3L 1101801 5' - accord2 7219 1 59.59 AGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCACGCCACAA:1 - chr3R 3080555 5' - gypsy9 5164 2 84.93 ATGTATACGAAGCTAACTTTATTATTTTCTTTACTGTTGCTTATGTTAATAGTAAAAGAGGTAATTAACTATTATATATAATGAAATAACGTTATTTATGTTAAGGAAATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCAACGATAAAAT:1 - chr2L 9440716 5' - Circe 6981 1 56.16 GTCGTTGCATAATGGCCAAGAGGCGACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chrX 19887085 5' - P-element 2794 1 21.38 GTTAACACATCTACTAATTGAAAATTATGATTATATTAAAGAAAGAAATACAATTTTAAAATAAACACTTGAACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTCTGCAGCGCTGCTGAGCAGCAACAT:1 - chr2L 13675997 5' + flea 4800 2 55.56 AATCATTAATATTTATTTAACTGGTTTATATGACAGGATATTCCAAACTATAGAATTATGGTCAAAGAGTTTTACCGCGATGTATCAAGGCTTCCACAAATAAGCGACCAGGAAATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCC:1 - chr4 6738 5' - Juan 4205 1 79.45 TGATCACTTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACAT:1 + chr3L 18010211 5' + diver 5926 2 59.59 TCGGTGTTCTCCCTTGTCTGTCTTTGCAGGTAAGTTGCCATCATCCATTAATACCACCAGCCATCAAATTATTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACCTTT:1 - chr3L 13651604 5' + Cr1a 268 1 49.31 CACACACAATCACATGCACATGGAACGCCGTGAAGTATGCAGCAAAAAGTTTGGAAATGCATCCTGCTGTCATACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chr3R 24734942 5' + jockey 4723 1 57.53 TGCCAAAACCTAATTAAAAACGATATTTCACCATTGTTTTTAGCGCCTTTTAGAATCTCTTGTGCAGTGAAACCATGATTAAAAGGACTATCTACTACTCAATTTGAATTTGCAATCAACTCCGACTATGCGTCGTAAAACATATT:1 - chr3R 9322208 5' + Gypsy6A_LTR 216 1 67.81 GCAAGACAAACATGTTTAAGTGTGTTGAGTTTATAATGATAGCAATCATATAAAACAATCCAATTCCAGCAATATATTTCAAGAACGTAAGTTCTGAAACTCTAAAATTTTACAGCCATTAATATTTTTTTAAGTTACTTTGCTTT:1 + chr3L 10381419 5' - F-element 4676 1 84.25 GGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:2 - chrX 14189237 5' + 412 7118 2 59.59 TGCTACGTGATCGCCATGACAATTTGTCAATTGGGTTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGTTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCG:2 - chr2R 21530048 5' - HMS-Beagle 6978 2 62.33 TCGTGATATGAAGTATGTGCANTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTA:1 - chr3L 10814596 5' + micropia 5021 4 63.01 GAAGGCTTTTGTTAACCCCTTTTTTGGTTCAAATTTCACTCGCTTTCTTTTTCCTCTTCTTTTCTTCTTAAAATTTTTTTTGTAATTTTAAGTTATTTCACTTCGTGGTCACTTTATGGGATTGAGTACCATTGGTTAACACTTTT:2 - chr2R 4325103 5' - rover 471 1 56.16 TTATGAGTGCTATTCCAAAAGAAATCACATCTAGTTAGTCTAAAGATTGGAACCGTGTAACTCCAGAAAGGGTTAACTGTGCACTTTCCATGCCCTAGACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGA:1 + chr2R 7622834 5' + P-element 18 1 73.61 CCAGTCGAGAGCGAAACCAAAACTTATGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 - chr3L 739218 5' + P-element 95 1 20.55 TATCAGATTTGATATCATTCCGTATAATTAGTCCTATTTTATTAACACTGTCGGTCAGTTTCAAATTCGCAATGCCAAGAAACTAGATTATAATAACTGCAAATGGTTTATCCAATCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTT:1 + chrX 6911069 5' - F-element 99 1 76.71 GCTTTGTAATGCTACTGGCGCCGATGTATCTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chr2L 15549882 5' - hobo 2885 1 71.43 CGAAGGGCTAAGGACGAAGGACGAAGGACATTGGCGGGAACAAAAGAATGCGCTCGTAAAACCGAGATTTAGGCCCGGCCACATTTGTGACCAAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 - chr3L 17106912 5' - copia 5054 2 67.12 ACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 9871560 5' + roo 8738 2 72.60 GAAGGATTGCGCAGCGGTTAGAAAATGTTTTGGTTGCAACGAAGATGGACATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTA:1 - chrX 22574769 5' + 17.6 6940 1 72.60 TTTTTTTTTGCGGGAAGCGGAGCGTTAAGAGTTTTGTCCTTCCTAATCATATACACACATATGCATGTTTTTGTAGTAAGTGTATATTTCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2L 4268906 5' + hobo 31 1 65.07 AAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGTCAACTGGAACACGG:1 + chr3R 8381740 5' + Tirant 64 2 73.91 TCGAAAAATTGTTATCATTTCAAAAACCTCAGCACCGATTTTTCGATTGCAAATCGAAATCGTAAGATACGTTTTTTCTTACTTTTCAACAAATCTAATACACCAGCTAAGTAGCGAGTTGGGAAAGTCGGGGAACTCGACTATAG:1 - chr3L 27859264 5' + INE-1 566 1 71.92 CGGTTTAGTACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr3R 11108133 5' + jockey 85 1 68.53 CCCTGGAGGTAGTGGTGGTCCCGGAGGCAGAAATGCTCCCAATGGCGGTGGTGGAGGCGGAGGATAATAAATTAATAACGATGACCGATATTAAGGGATTGCTAGCACACGATGATGTGTGATAGGTCAGGAAGGCCGCG:1 + chr3R 9744357 5' + invader1 3590 1 55.00 CTACTCTTAAATAAATACATTTTCGGAGCCCTTTTGCATTTGGTTTTAATTTTTCATGTAAATTTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 + chr3R 11208812 5' + jockey 4720 1 55.07 AGTCTGAATCCAGTCTCAATCGTAGCTGTTCTCCAACTGCCTTAATGTCGAGGTGCAAAGCAGCAAAATAGCTAACTGGAAAACCATACGACCGATCGTCCGAAGAGTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACA:1 + chr2R 19984354 5' + gypsy6 50 2 64.62 AGCGAGAAAGAAGCGGACCCACCTTATCTTCCTCTTCCTCCCTACGAGCCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGA:1 - chr3R 11758578 5' + P-element 70 1 38.36 ACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAGTTCTANTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chrX 7042707 5' - roo 8992 2 68.49 AATGTGCCAAAAAGAAATTGAAATGTTTTGCTGGTAAATAGTTAAACCATTTTATTCTTTCATTAGTTTGATTTATAAGTACTTCATTCTGTCGAGTCTTTGCACGCAAAATCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATT:1 - chr2R 2127320 5' - transib2 2695 1 69.18 TATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCA:1 + chr3R 19449914 5' - roo 8657 1 79.86 AAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGCCTTATGTATGAGCGTT:1 - chrY 3648888 5' - Stalker4 164 6 68.49 AGTTTTCAATAAATTTCACCGCTGTTTAGTTGGACATGTTGTTTTATACATTTTAATGATAAAACTGTAGTTTTGTATTATTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 12125400 5' + roo 8702 2 58.22 CTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 - chr3L 22435197 5' - opus 7441 2 66.67 TGTTAATGGTAACTTTCATTTTTAGTACGTGTCCTGTGGTGGTGATCAAAAGACTTCCTTTAAGTTCCTTGCAAGGAGGGGAGCCCAACTAATTTGTTAACTTAACCAATCAGTCTCCTCCCTTCGATCTC:1 + chr2L 14132219 5' + BS3 444 1 77.10 CGCATTTGGGCCATTAAAATTCATTAGCCGTGCACATCTTGATCTGGAGTGCGAGATCCGATCAATAAAATAAGCAAACAATAAAGAGACCGGGTCGAGCACATTCAAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAG:1 + chr3R 30307677 5' + copia 4828 1 71.92 CGACGCATCATTGGCCGCTATCTCCCGCTGCCAAATCAACCCGTGCCCGGACCCGTACCCAAGCGATCCTACGGAACTGTGCGTCTGACCACCTGCTGTATGCATTATAACACTAGTTTCATAACATATTTTATTATATTTATTTA:1 + chr3R 12002479 5' - G7 1148 1 68.49 ATGACTAATATTGCCCTTATTAACAATCTTTCTATGTTTTATTAAAAGTGCATAAAATGTTAAAATACATAAGTTATACTGCAGCTTTTTCCTTTATGTCATTAATTAGAAGCAAAGGACCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTT:1 - chr2R 15414690 5' - micropia 251 2 71.23 CGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCT:1 - chr3L 9522113 5' + opus 7078 4 77.24 TCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGTGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chrX 10694246 5' + Transpac 35 2 60.27 ATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTG:1 - chr3L 10814639 5' + micropia 17 2 72.34 TATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAA:1 - chr3L 18154442 5' + jockey 4640 1 71.92 GGGGTGCTTCTAAAAATTATGGAACTGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3L 20573738 5' - pogo 2066 1 61.64 TATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGATACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3R 31458367 5' + jockey 34 1 61.64 AATGGCCAGCAAACTAAACAAACTAAAGTCGCCGGCCAGCTCACGACCGGCTGCCCATCAAAGAGTTATTTATACTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3R 13453289 5' - 412 455 2 56.20 AATAGTCGCACCATGGGTGACACATAAATTTACAGCGTTGGCTGTTTGAAATTTTTCACATTACACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 26605533 5' + roo 50 2 59.57 ACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chr3R 11108124 5' + jockey 97 1 75.34 TTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAA:1 - chr2R 5206895 5' + G4 3772 1 56.16 AGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGA:1 - chr3R 14401933 5' - Juan 4127 1 75.34 GCTACTGGCCACTTCCAAGTACAGTTATTGGCCATTGTTCTGGGTTCTAGATGGGGATGTGCTGGGGATATGTCAGGCCCTCTGATTAGACCGCCCCGCTTGGTTGCCCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr3L 16943693 5' + opus 7136 2 77.70 TATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 - chr3L 8249502 5' + HMS-Beagle 27 2 66.43 AAGAAATCTTCCTCTATTTACTTCTATTCATTGACGACGTTTCTTTTAAATTTTTTAGCTATAACGAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3L 20867977 5' + hobo 18 1 72.41 GAAAAAAGCGGAAGGCATTTCGTTAGACGGGAAAATCTTGGCAAGAGCCAAATAGAAATCGTAACACAAATATTTGGTACCCATATCGCGAGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTTCGCAAAACTCGGG:1 - chr3L 6703730 5' + R1A1-element 5067 1 50.00 TTTTTTCTAGGACAACTCAACATTTTATTTTACGACCAAGCTAGTCCCACATTGTGCTCAGTGTAAAGATTCACACACAAACGCACGCGATCAAAAGGCATCCATGTTACATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATT:1 - chr3L 627234 5' - Stalker 6912 4 68.49 AACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTC:1 - chr3L 21913476 5' + 297 6604 2 69.86 TGGCAGTGAAAAATGAACCAGAGCCGTGGTAAAGGTAAAGGAAAAGCGGCAGGTGAAAATATTATGAAATATATGAATTTGTATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chrX 3596516 5' - copia 216 2 52.05 CCCCTCAGAACCTCCCGCCATCCACCCTGCTTCTCCATACATATATCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGCGCTTTTCCCCTCTATAGAT:1 + chrX 17495690 5' + Burdock 46 2 53.79 CTCCTAAATGCCCCACTTCAGCTTTAATTGGAATTAAACATACCAGTTAGAAGAACAACTATATTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 14138523 5' - mdg1 7404 2 55.48 GCACATTCTTTGTTCGGCTCGCAAAGTGCTCAACAAAGCGGGCAGGAGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTA:1 + chr3R 30669314 5' + hobo 74 1 65.07 TTCCAAACAGTAAACAGCTGGAAACAAAGCTCTGCACTGCATGCCTAAGTATCAGTTTTTTTTATAGTCAGAACATAAAAATCTGTAAGGGACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTC:1 - chr4 62744 5' - Cr1a 4128 1 56.85 AGCTGCCCAGCACGGAGTTTAGCACACGGTCGTGGAACTGGAATCCATCGCATATGGCCACCGCATTGGGTCGGAAAATACCCTTCGCTTCCATAATCCTGACCATCCGGGCAGCAATCAGTC:1 - chr2R 21392175 5' - BS3 480 1 60.16 ATAAATGTAAAGTGCATGTGCATGCTTAAATGCAATTAAAGGGTGTCGAAAAGAATGCAGTGAAAACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr3R 28413857 5' - pogo 2052 1 51.41 TACCGAAAATGTAATGTCACAGACACTCAGCACAAATACCGCAAAAAGTTAATTTGCACATAAGCATTAGCAAGAATCGCTCTCGCGCAGATCAAGTAAACAACCCACTAACCCAGTACATCTAAGATTTTCTCACACCATTTGTT:1 + chr3L 4607453 5' + Tom1 260 1 76.03 ACTCTCATTCGCACTCACACTCTTCGGGTTTCGCTTCGGCTTCGTTTCCAACTCTCTCGGCGCTCTTCGGGGTCTCTGCTTATGGGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2R 10541770 5' - P-element 2852 1 61.64 GTGAATATTAATTGAAATAGGCTAATAAAATAAATACGAGATGAAATTAGCATAAAGTTTATGTTTTATGTTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 + chr3R 19831855 5' + copia 49 2 53.10 ACTGCTAAATCGAGAACTAAAAACATATTTCGACAAGATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3L 23181690 5' - 1360 3357 1 72.60 ATTATTTAAAAGATTTCATTCATTTCATTTATCAGATGCAGATGCAGAACGAAATTGAAGTAATAATAACTTTCACCTATCGATAAGTATTAATTAAATAGCTGTTAAATTCAGAATGCGGAACCCTTCAAAAATGTGAGCAGCTT:1 - chr3L 18333181 5' - hopper2 442 1 82.88 GCACGATGACCCGCCAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr3L 9522019 5' - opus 471 2 54.81 GATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 29384725 5' - roo 9019 2 64.38 ATTGCTTGGCTCTTCGTCCCTTTAGGAGCTCTAAAAGCATTTTTACTATGAAGCCTGCCCAAAACAAAATCGCCTGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTTCGTAAGCCAAGGCACTGTCCAGAGCTCGC:1 + chr3L 24051163 5' + BS3 1525 1 80.62 TACAAATCGAATAAAGTAGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr3L 11529567 5' - opus 7458 2 50.00 GTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 12115268 5' + 1360 53 1 60.45 AATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 24010977 5' + roo 8722 2 61.43 CAAGGTAACCTAAGCCTTCGGATTAAATTTATTGCTCCTAGCTCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 15917569 5' + roo 34 2 62.33 AACGCACTGACTCATTTCGGTTATTAGCTTGCTCAGTGGTTAGCACATTTTAAGATCTGGTTTGGTCATTGTTAATCAAGATTTAGCACTTCATTTATAAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:2 + chr3R 13613043 5' + copia 4889 2 81.51 CAAAGGCACTAGAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTCCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - 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P-element 2808 1 28.57 TTTGTACAAATGGCCAGCAAACTAAACAAACTAAAGTCGCCGGCCAGCTCACGACCGGCTGCCCATCAAAGAGTTATTTATACTTTGTAATGATGAACTCCGATTAAGAACACAAGGCCGTTTT:1 + chr3R 13453281 5' - 412 7529 2 68.55 CCTATGCTTTGGTGTAGGGTATATACACAATTGTATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 13676200 5' - P-element 2837 1 54.11 TTAGTTGGTAAAAGTGTTTTTTTTTCTGTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr2R 22761163 5' + 412 64 2 60.27 CTAATACCTTTAGAATACGCTTGTATGCGGCGTGCCTCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAAC:1 - chr3L 6721652 5' + I-element 5152 1 75.34 GTTGCTTTCGAAGTCTTGGTATTTAATACCAACCCCCGAAATCTAGCCACCAATCAGCTTCGATGCGATTGGAACCTTTCGTTGCTAACTCCATATTTTCAAATAATAATACCGTTAAGGCAATGCAAA:1 + chr2R 22286106 5' - 1360 299 1 72.09 GTGAAATTTTCCGCCCCTTGGCCAACTGGCAATTTGATTTGCAAATTGAAAACGGAAATCTGGTTTTGAAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3R 17996809 5' - copia 238 1 52.05 ATTGCCTAGCTTTAGGCGTTATCAGAACTACGTATGTATAATCGGCGACGTTAAACTTCAGTTTTACTTCTTTCCATTATCATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTT:1 - chr2R 6089178 5' + 1360 39 1 59.59 CGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAAAGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCC:1 - chr2R 18044071 5' + jockey 4594 1 55.48 TATTCAAAGTCGAAATTTTGATCTGATCACCGCCAATTCGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAAT:1 + chr3L 18075565 5' + pogo 79 1 71.92 GTAAGTAATCTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3L 13546547 5' - hobo 2920 1 61.82 ACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - chr3R 6962432 5' + jockey 77 1 65.75 ACGTTGGCCATTAGTCACTTCATTAACATGGCAAGCAGTCGCTGAATGAAGAGATAAATGCAGCGAGCAGCCCAGGAACGTGCCAAAAATTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 19015934 5' - 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roo 8661 1 79.29 CCCAAACTGAAAAATGTAATATCGCTATTTCAATAAAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCCTTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACC:1 - chr4 637843 5' - roo 121 2 75.17 TCAGGTAATTTCTTTAAGAACTACTTGAGCGAATATGGCATGACCCTTGAAAATACCCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3L 7646329 5' + 297 53 2 63.38 GAAGGTCTATTAGGCATTACCCTCCTTTAAAAAAAGATACATTTTTGATTGCTGTTGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCAC:1 + chr2R 16749754 5' + roo 323 2 62.33 CTCAATTTTTCCAGCGCCTCTTGCCGCCAGTCCAAGTTTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTCAGTACCACTTCAAACTCCGAAGCGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr2R 22774637 5' + I-element 27 1 62.32 CTGGCACACGACGCCACAAATGCGACCAGTGCAGCGCATCCTTTTATACAGCCGCCGAACTCTGTTCCCATCATAAAACCCACACAATTAATGTAAGAAAAAATTCCGAAATTGTGAAATACCATA:1 + chr3R 11239271 5' + TART-B 10540 2 65.87 ACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAANATTTTCGACACGCGCGAGTTANCNCCCCACCCCCTAAAC:1 + chr3R 8381715 5' + Tirant 8111 2 70.00 ATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 19450149 5' + roo 8688 2 81.31 GTAGGAAGGTATTTGTCAATCGAATCGAATCACTTTTTGCTGAGTTTTCCATTTGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGG:1 - 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invader4 3002 2 71.92 ATTGTAAATACTATACTAAGTTTTCAATAAATTTCACCGCTGTTTAGTTGGACATGTTGTTTTATACATTTTAATGATAAAACTGTAGTTTTGTATTATTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 12125418 5' + roo 8684 2 70.55 AAAGTTTTGGATTGCCGCCACATGGATTTCAGGACTGCCGGAATGCCCAGCCGCCGTTCGTGGTGTTACGTTCAATTGTTCTTAATTAATTTATTAAGCG:1 + chr3R 10504634 5' - jockey2 3400 1 75.00 CTGAGTTACAGCCACTGGATTATTCAGATCCACATATATAGACGAAAGAATTTAGCGGACAAGTTAGCTTAGAGCCTCAAAAATCGCCCAAAAGAGATCTGTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCTCTCTACGTCCACC:1 - chrX 10056805 5' - hobo 2921 1 72.03 ATATTCAAAGGTGAATTGCTTTCTCATTAAATTGCACATGAAACATGAGACATACATTTTAAACAAAGCAACTAATGTTTTTCGCCATTGTAAATTTCCGGGAAAATTTAGCTTTTCATTGGAGGACACACTGCGGTGAGCTAATA:1 + chr3R 12729323 5' + aurora-element 4207 1 51.37 ATCCATTGCTCTTTGAAATATTCTAGGGGCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAA:1 - chr3L 22231511 5' + diver 92 2 79.45 GATTGCCCTATGGACCATATGTTCTAGTTTGCGGTAAATGGAGTCGTTTTTTTTTCTTCATTTTAGTATTATTGATTCGGCACTAAGCCGAAATGAATGACCGCAAGTTAAAATTTTTC:1 + chr3L 12941609 5' - 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chr4 637772 5' - roo 8713 2 71.23 GAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 + chr3L 8754767 5' + mdg3 5317 2 69.86 ATTTTCCAAAACATAACATGTATACCCGAAGATCATTACATTTTTTGATTCAAAAACAAGAGAGAACCGACTATAAGATAACCGTTTCAATACTTTTTAGAATATCGTGAAATTGGGGAAAATAAAATATTTTATTGAAAAAAAAA:1 + chr2R 5883521 5' - hopper 161 1 71.23 GAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2L 20044548 5' - roo 343 2 60.96 GCTCGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 - chr2R 8802020 5' - accord 184 3 85.19 GAAAAAATATATATGTATATACCATTAGGTCCATATTGTCAACAATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 24010934 5' + roo 21 2 69.86 TGATATAATCCGAGTAATTATAAACGGAAAATTGCTTGAATAATCTTTGTAGACCCTAAGCTCGCATTGTCAGCAAACACTAGAAGATGCCACCAAATGCGGGTAATGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACT:1 - 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HMS-Beagle2 303 2 73.29 CATTCCGATGGCAAATGGGGGAGATGCAGGGCGATGGTCAGCTCTGACCCCAATGGGTTCTCGACTCTATCAAACTTAACTGAGCAGCGCTCAAGTGATGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCT:1 - chrX 12549142 5' - R1A1-element 331 1 64.38 CAAGTATCCTCGCTCGAAGAACTTCACAAAGAACATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:2 + chr3L 8273897 5' + hobo 46 1 54.11 AAATTAAACAATTTTTAAGTTAAGACAAATAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACGACTGATCACTTTTAAGTTCTGTTTAAAAATAAAGTACAATTTAGATATTTATTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTT:1 - chr3R 1960331 5' - gypsy9 5176 2 72.60 AGCGCCCTGAAATAAATTTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGCCAAGCTCCAGAACATCG:1 - chr3L 18154460 5' + jockey 4622 1 58.22 AAGCGTATTCATACTTCTTGGCCAAAACACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr3R 6147228 5' - copia 5073 2 54.79 TCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGGTGTCGATACGTAGCCGG:1 - 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roo 9023 2 52.05 ATATGTATATTTGCACAACGGTAGGTCGATTTATAGGAAAACCCCCAAAACAAAAAAAAAAACAATAAAACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTCTGTT:1 + chrX 19121886 5' + 412 7104 2 50.00 GAAGGTTTTCAAAGGGTTTTGCATCGACATTGCTCTGTTTATATCCATACGTGTACTTATGTAAATATGTTCAATGAAACATTTTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGAAAAA:1 + chrX 22509742 5' + HB 112 1 80.87 AAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCG:2 + chr3R 16881910 5' + 3S18 5840 2 69.18 GAGTGGAAATGTTGACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 16920299 5' + roo 40 2 58.22 CTGAAGAGCTTATCTGCCACACTCGCGTGAAGTGGCATGCAAATCTGAGTTATTTAGATAAGCGAAGAGCAAATATGTACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 - chrX 19187410 5' - Transpac 273 2 59.59 AGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 + chr3R 8381695 5' + Tirant 27 2 60.98 GCGGGAAACGCGGCCAAAACGCAGCGGGCGGGGGCTGCCAAGATACAAAAAAAAACTTAAAAAAAAAA:1 - 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chr3R 6014082 5' - hopper2 1558 1 69.86 GTCACTTTAAAGTATAGGGAATATATCAATTATCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAC:1 - chr3R 4530756 5' + copia 88 2 76.71 CCTGAATATATTTTCGCATCGCCAGATTTGGCACGATACGCATCGCTTTATTCTCGCCCGCCAATCTTATGCCCCCAAAACGCCCACCTATCTATATCGTTTTGACTTCGATACAACTTATAACGTTCCTTTGTCACGGTCGCCAT:1 + chr3R 7544613 5' - mdg1 442 1 74.66 TAATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 + chr3R 7420426 5' + 412 58 2 58.22 GTGGCGCATTGTTATCGCTCCCTCGTCACTCATATTATCATCTTTATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2R 21110543 5' - roo 334 2 69.86 AGAAGCAAGGACCATCAAGTGATATTAGTGCTACTACCATCACCGATAATAACAAGCAGCAAACACCAGTTATGACTACAACACACATTAACAACTGGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATC:1 - chr3R 11754143 5' - P-element 31 1 69.18 CTAGAAATTGCATTTAGAATCTATCTGCCTTTGGCAGATGGGGATTGGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTCTTTTT:1 + chr2R 8689372 5' - hobo 2884 1 61.42 AAAACACATCAACCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr3R 17494904 5' + hobo 68 1 63.01 GAGAGACTTCCAGTCGAGAGCGAAACCAAAACTTATGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGTAAGGTTG:1 - chr3L 739227 5' + P-element 77 1 28.47 CAGTCTCCATTCGGAGTTGGGGCCCAACTCCGTGTTTCCAGACTAATGAAGATCTTTATCGGCCGCCGATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTTTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 - chr3L 17935039 5' + HMS-Beagle 6825 2 58.91 ATCCACCCTGCTTCTCCATACATACATCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCACAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAA:1 + chrX 17495709 5' + Burdock 6202 2 67.81 TTTTTTTTTTTGACTTAAAAAATATTTCAGTTGCCAACTCAGTGTGCATATTATATGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr3R 20260804 5' + roo 64 2 63.01 TGCCTCGGCGACTTCAAGTTCTGTGACGCACGGAAAATCTGGGGCAGGGGCTGTGTGTGTGTGTAGCTAGCTGTAAGTGTGTGAGGACATTTCAGTGGGTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 21572716 5' - accord 7030 2 58.54 CCAATTGCGGAATCTTTAATCTAACGCAGGTGAAATTTACTCTGGTGAACTTGGTACACACTTATTTGCAATAAAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGG:1 + chr2L 2834364 5' + jockey 223 1 49.32 GGACGCGATGTACGCGACTAAAGTGACTGTTTAGTAATGAAATCAAGCGTTGGTCATGTGCCATATTTATAAAGCTAACAATATAATGAAGGGGAATTCCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr2R 17059705 5' - pogo 2085 1 71.33 CATCAGTATTGCAGGCAGTAATCAAAACTGGAGCCATGTGGGATCCCCCGAAACTTGAGCGTAGTCGAAACCCATACTAATTTGGCTAAATAGTTGCACACTTATGCATAATTATTTTTTTTGTTTGTTTTTTATTTTTTTCTT:1 + chr2L 341567 5' - gypsy7 5014 1 74.31 ACAGTTTTGCCAATATTTGTAATAATAATTTGCAGTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 - chr2R 20706839 5' + I-element 84 1 73.29 AGGTGCCAATTTTACAAATTGGTGTTATAATAATCTAGTACATAGTTTTTGAATGAGCTTATTGTATTGTGTAGATTAACAAACAATCAAGGTCATATTCCCTTAGCAACTAAGTAGCCTCGCATAAACAATGCTGACGCGCCATA:1 + chr2L 2076256 5' + gtwin 58 4 50.68 AAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr3R 13684752 5' + 412 7140 2 75.34 ATGGAAGAATTATGGTAGGACCACTCGCACATGGCACAAAAGTCACGTAAGCCCGCTGGGTGGGGTGGGGTAGAAAACTCGAAGGGGCAGCGCAGGGAGTGCGNTTGCGTAGCTAGCCCCTCTATATTTTCTTCTTCCTTTTTTTT:1 + chr3L 3744554 5' - Doc2-element 235 1 76.71 CTTGTTGTATTCAATTTGCTTGTATTCAATTTTTAAATGAAATCCTTTACACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3R 6399319 5' - pogo 2074 1 67.81 TTTTGTGTTTAGTGAGTAAAATTTTTGTCTTATTATCATAGAAATTCAGCAGTCCCACTATAGACACAACAAAATGTATGGCATAGAAACTGATTTTACAATTGCTTGTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chrX 18786266 5' - pogo 2091 1 77.40 GAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chr3R 17944047 5' - P-element 2794 1 21.38 CAATGTAAAATCGAATCTTTTCTACATGAAATGTAACAAATATATGCGAAACTTGGCTAAAATAAAAAGTCTTGAAACTCAGATGGATTTGTTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr2R 15698196 5' - opus 7476 2 67.12 TTGATTTTGATTTTTGTGCCCCGCGTAAGTAGATAAATGTACTCCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 17871826 5' - roo 9026 1 52.74 TAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGGTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chrX 16490486 5' + F-element 86 1 72.93 GGGCTAATAGATTTCCAAATCAATAGACCATCCCTGGGGAGTTTTTCTTTATTTCAATGCGAGAGTTTTAGCAACTTCTCGGTCATATTATATGGTTTTCGNAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACT:1 - chr2R 7185308 5' - Ivk 316 1 61.64 AACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCGAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 8208411 5' - roo 354 2 56.52 TCACTTCCGAATGGTGGGAAAGGGCAGCCATTTCTCTCTTGACTGCTTCAAACCACACACACACACACACACACATATAT:1 - chr3R 6997236 5' + accord 185 2 56.25 ATCTTTCCGTGCCACGTCGCACACCCATACACACGTGTATGGGAATTGTCCATGAATTGAAATATATTCTTGATCAGGATATCCGAGTCAATCTAGCCATGTCCGACTGTTCGTTTGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 - chr3R 19952576 5' + INE-1 148 1 55.17 TACTAATTTTACTCACAATCAAATCATAAAAAGTAATTTAAATGAATTTTATTAAAACGCAGCAATAACAGCTTATAGATTGTCTTTTATTAAATTCAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - 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roo 9028 1 52.41 ATGGATGAAAGGGCTGCCGCGCCGCTGGAATTTCATATTCCAGCGCGGCGAGAGGCGATTGGGTCAATTACACGGGACAGCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGAT:1 + chrX 17970872 5' + invader2 229 2 68.75 ATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAGAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr3R 9551005 5' - P-element 2839 1 51.03 TTATGGTAGGGATCTTAGTCATATTATTTCATGTAGCTACCTGGAACGGGAATGTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTCAAATTATTTTATTTTACA:1 - chr2L 13244728 5' - jockey 4927 1 61.38 ATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 + chr3R 23415918 5' - jockey 4917 1 67.12 ATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAGAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCCC:1 + chr3L 19349927 5' - 1360 3332 1 56.85 AATTTTCCCTTTTCTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTCTTCATCCCATGGTTTNCNCATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 6615468 5' - roo 9030 1 54.23 ACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCC:1 - chr3R 934285 5' - Rt1b 4741 1 56.85 TTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGC:1 + chr3R 12789546 5' + G2 2816 1 70.90 AATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 + chr2R 22596109 5' + Doc 89 1 76.03 AATGCAGCGAGCAGCCCAGGAACGTGCCAAAAATTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 19015990 5' - roo 8987 2 77.78 TAAATATATTAAGCCATCTAAAACTTGTTAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGC:1 - chr3R 6603075 5' + gypsy 7033 2 54.11 CCCATTTCGAAGCAGTTTAAATGTTTCACCCGCAAAGTTTTCATTTGCGATTTCACAAGATTGAAAATAAATTTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGC:1 + chr3R 21636761 5' - roo 8970 2 55.48 GCTTTTCCACAGTTACTAACTCATGAGTAAGTCAATTACCACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 15102256 5' - roo 8992 2 71.92 AAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:2 + chr3L 16200741 5' - roo 9003 2 64.38 AGTTGTACTATATCCTACTATAACATACTATATTTAATGTTTTTCGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTT:1 - chrX 19690662 5' + gypsy 24 2 67.81 AAAAAAAAACAGAACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chrX 15252418 5' - opus 478 2 71.72 GATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 - chr2L 11725015 5' + F-element 97 1 82.19 AACAGTTGGAATCAAATGTAGAAGGTACATTTTCAGAAATTTTAGGATAAATTGTTTGTTCAAATAGTATTATTTATAAAATATTACTATTAGATATTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - 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chr2L 19940102 5' + mdg1 7113 2 66.44 AAATAATTGATTGCGAAAATAGTTAAATTACTTTTCGTTTATGGAAAACGGCTTTTGGGGAAATTGTGTCAATTGAGGGGGGGGGGGATAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGTATGAAATACGACA:1 - chr3L 12383881 5' + gypsy2 26 2 52.94 GCTGTTGGTCTATGTTTCAAATAAATATCGCTGCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr3R 6962479 5' + jockey 29 1 69.86 TATACAAAATTAAAGAAAATAAATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGTTTTTTCACTTGATTTTTTTTTTC:1 + chr3L 16184094 5' - Porto1 170 1 58.22 GGGGACCTCCATTAAGTGTTCTAATCACTTTCGACCATAAATTATTGTTGATCTTTGTGCGCTGTGAATTCCCTCAATCGAAAGCAAAGTCCCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2L 13850594 5' + roo 8692 2 65.07 AGGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chrX 8363620 5' + jockey 73 1 60.27 AACATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 - chr2L 6154024 5' - copia 5075 2 56.85 TAATGTACAGGTGTTATTAAAAGCCTTAAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGACGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGA:1 - chr3R 32065525 5' - 1360 3300 1 76.03 GTCAATTAATTTCTCTTCAAAGTGTAACAAGAAAAAGTGCGGCAGATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACA:1 + chr3L 8295735 5' - Quasimodo 7295 2 69.18 TTTGCCTGCAGACGCGTTATTTCCGCATCAGTTGAAAGCGGCCTATTTCTTATGCACGAACAACTGGCATTGCGTAGGTGTACTATGTGTACATACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr3L 8157962 5' + flea 4762 1 80.00 AAAGAGCAAAAACGTAATGCCAGGAAAATCCAAAGCATAAGTCAATTATGAGATACACTATTTCTGATTACAGTACAACTGATATGAGTTTGTGTACCCTAAAAATTATCGTTGGGTTGGCATATCATTACGACGAAGTC:1 + chr3L 18481092 5' - Fw2 3801 1 49.29 GGTTATGTTCTCTTAAAACGAGCTATGTATCTTGTCCTAATTGAATTCTACTTGCAGATGTTTGCTAGCCATCAGCAAGCAGCCTTTCAATATCTATTCAAACAGTCAAACACGGAATTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCT:1 - chr2R 9821926 5' - 1360 345 1 77.40 GAATAGCCCATCCGAAGTACTTTCACCATATAGCGATGTCGTGGGTGTCATGGCCCTCAGAGCCTCAATTGAACTAAGTAGATTCTTTAGCTCACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGC:1 - chr3L 9608069 5' - Quasimodo 7243 2 63.70 AAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2L 3911829 5' - roo 351 2 55.48 TAGTACATTTTCCTGTAAGCCACTACGGGGTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1 - chr2L 20508386 5' + pogo 71 1 67.81 TTGGGCTTTGTTTATGTACATATATTTTATCTTATATTTCAGCAATTATGAAAATGTATATTTAGGGGAAGGAAGCTAAACTCAAAAGTTTAAGATGGTATTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATT:1 - chr3L 3492159 5' - blood 75 2 75.34 GTTTTCTATAATTGAAGTGTGAAAATGGGTTACAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 + chr2L 3133656 5' + Doc 26 1 60.96 GGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACC:1 - chrX 22386800 5' + hobo 50 1 67.31 ACTCGCTTCGTTTGTCCTTTATAGTTGGCCATACATATATATAAGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 - chrX 7626205 5' + Transpac 4992 2 71.23 TTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chrX 15540058 5' - roo 9006 2 65.75 GTAATTATAATTACCAAACATTAAGCAAAAGTTCGTTGTTGGTCCCGTTTTAACATGAACCGATTGTCCGCTACAACCTTATAATATATGATGATCATAATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 + chrX 13367335 5' - HMS-Beagle 7023 2 71.23 CTGTTGAAATATCGTAGAGCAGAGTGTTAAGAAACGTGCTCCCAAAGTTTTTTAAATCACAAAAGTAAAATCACAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 16178885 5' + F-element 4683 1 88.24 AGATGGTGGTCACAGTGCCCCAAGGAGGAGTACATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACACTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTA:1 + chrX 12365321 5' + hobo 74 1 75.00 AGTCGTTTATTATTGGTAGACAACATTACGATTACTCAACAGGCCATGCAGGTGTATCCCAAAAGTATGCAGCAAAGTCAAGTTCATGCTGCTTTCTTCATCATTAAATATGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 - chr3R 23416044 5' + jockey 4771 1 76.71 ATGCCATTTTTAAACGGGATTCTCTAGATAAAATAATTATTCCAATTCATAAATTTTTTAGCTGCCAAGTTCGTCCAAAAATGTTATCTTTATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGC:1 + chr2L 3120659 5' - Doc 262 1 62.33 TTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 - chrX 15406038 5' - opus 7426 2 69.86 CCATCTGCCTCGATAATTGCGTAACTTCGACTTGGCCACATGGACGCTACAGTAGTGCGGCTGGAAAAACAGAAGACTGAGGCAACGAACTGCAAACAATATTTAAATGTTATAAATTGAAAAGAAAAAAAGTCGACTAAAAAATT:1 - chr3L 20557674 5' - Tc1-2 1387 1 67.81 ATCACATACGGCAGAGTCAACAAGAAGTCAACAAGAAAGATACTAAAAATGTTGTATTTAAACAGAAACTTATTAAAACAAAAAATGTTTCCAGCCTTTAGCTCAAGGAAAAACAACGTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTT:1 - chrX 3009464 5' - Transib5 2858 1 79.45 GCCACCCCCTCTTCATGCCAGNTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACT:1 - chrX 1759032 5' + Tabor 6914 2 66.44 GACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGCGTCGTCT:1 - chr3R 14277958 5' - P-element 2806 1 30.14 GAGCTGCTCCTCCGCCATTGCCAAGTGAAGGTCGAGCTTATGTAGTTTACCAGCCGCAATGGGAAACAATGGATGTGTATGCTACCTTTTTGGCATTTCACTGCCGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTCTCCCAAGCGC:1 - chr3R 16373315 5' - GATE 8335 2 72.46 GTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCCCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr3R 13529983 5' + jockey 79 1 65.07 GCAATTTAGTTTTCTGTTTGTTGTTAAACATCTAACAAAAGCGCTTCGCACGCACAGCAAACCGGTCGATTCCGAATTCAGACGTGCTAAATAACGTTTGAAAACATATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 - chrX 17301911 5' - mdg1 7372 2 76.76 CTGACAAATGGCAGGCAATTGAGAGAAATCTGTAACGAACCTGAAAGTAGGCAATACTTTCTCGAAACAAAAAGTATCTCAAAGTGTTTCGGTTAACTATTTAATGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGC:1 - chr2R 18618596 5' - jockey 4981 1 68.49 GACAGATAAAAGGACAGACTGGAATATATGTGCTTTATAGGGTCGGAAACGATTTCTACTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 - chr3L 21157116 5' + 412 61 2 59.59 ATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2L 19698086 5' - roo 338 2 65.07 GCCAATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCGTCCATGGATGCGCTTTGCCACTGGCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chr3R 30864254 5' - P-element 2866 1 70.55 ATTGAATTGCAACATAAATCAGAGACCACAACATGTGTTGAGCACTCGATGATAGCGGTATGATGTATTTATATTCAAAGTAATATATCTGACTCAATCCATATATATACATATTTACATATTTTTATCTATTTGTGTATCTATAT:1 + chr2L 18799998 5' - G3 4483 1 63.01 TAGACCTTATGGACATATCCTCTTTTTTGTTTAATGAAAATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAC:1 - chr3R 7042130 5' + Stalker2 10 2 78.77 ACCTGGTACTCGGGAATCTCCTCGAACTTGGGCGTCTCGTTGAATGCATGCCAGGACATGGGTAGCTTCTGTTCATCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATT:1 - chr2L 9653629 5' - Doc2-element 4342 1 48.63 CTTGAAAACTGGACTGACGCAGAACAGTCACATCGCCCTCGGACTTGCGATCATCTAGGCGAAAAGTTAGTTACAATGAGACATATACCGGCATTACAAGCTGATAAGACGGCGCCAATTGTGTATTATTTTCTTGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 16111533 5' - gypsy11 3934 1 78.08 GGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCTGCCGAATGCTGACATTCC:1 + chr3R 8381735 5' + Tirant 8195 2 77.08 GTGGCGTATTCCGGTAGTAGATGGTCCTGTCCAAAGATGGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 21292485 5' + 412 7095 2 56.85 ACTGCGATACCTTTTTCGATGTAATTGATATAGCAATATATGTATATTCCCTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 + chr3L 1477375 5' + mdg3 71 2 63.01 GGTGACCCCATCCGGTGTCCTTTTCCGTCGCACAGCAAAAAATGTATAGGATACAAATATAAGCACTAAAACAAATATAAATAATATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTT:1 - chr3R 29701332 5' - F-element 4393 1 56.85 CGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2R 8258234 5' + jockey 14 1 73.85 TGTTTATGACCATTGAAAGGCTATGCAAAGATTGATTAAAGTTTGACCTTTAATATTCGTAAATTTACAATCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCT:1 - chr3R 9606395 5' - flea 4811 2 52.05 ACGCTAGCATGGGTTGACAATAAAATAGGGCAAGTCCGAGGCGAAGGTAAAAAAAAAGGGACATAAAGAAAGTATTTTAGTCCTTCCGAATACCTGGAATTTCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 + chr2L 21026603 5' + FB 21 1 69.86 AAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr2R 8258287 5' + jockey 84 1 71.23 GAACCACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 - chr2L 1451254 5' - mdg1 7400 2 56.16 ATTAATTTTCAGCTTGTTTGAAGTTTTGACCCGGCCAAGAGTAAGGGAAAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3R 24444154 5' + hobo 26 1 67.59 GCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 5398151 5' + roo 60 2 60.42 AGCAGCCATCATTCAAAGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr2L 8553269 5' + pogo 22 1 70.55 ATAAATCCTACGTTTATTTGTTGCCATTTCTGATGCTCACACATTTTACATTCCCATTTAAATGTAATGTAAATGTAAATGCAAATCGCAAAAGGGGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3R 18204307 5' + hobo 21 1 69.86 ATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGA:1 - chr2L 7958671 5' + gypsy 7060 2 73.94 AGTAGCAAAATATTATCACCCTTAACTTCGGTAAACCATAATCTTATAACCTAAAAATACCACGGCGAGAGGAAGTTCGCATGGTCAAATAATATAGATTTAGAGTGTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGATATATTTTGTCAAATT:1 + chr2L 11752475 5' - 1360 208 1 48.97 GGCACTGAGAGCACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAATCTTACCGACGTATAC:1 + chr3R 9550869 5' + P-element 35 1 61.64 AGGATCCAAAGATCCGGAGACGGGAACACAGCAACTAGCGCTGAGTGTGTGCATAAGTTTTAATCTGCTTCCGTTACAATCAGCTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAGTAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chr3R 6147361 5' + copia 4905 2 60.42 AATTAGGCAAGTTACGGGCCGGGCTTAAACGCATTTACGCTTTACGCATAACAAAATGCTGGGGCGATGGGAAATTGACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTT:1 + chr3L 9610817 5' + 412 448 2 52.05 ATTCCTTGGAACTTTTTTCTTGGGAAACCTCATTATTATTATTACTTCGTATTTTTCGTTTGGTATTACCAATTCCCAAACTGCCAGTAGCTCACCAACTCCGGAACTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:2 - chr3R 30518997 5' - I-element 5343 1 71.23 AGAAGCGCAAAACTTAACGAAATTGAAATAGAAAATAAAAGGAAAAAGCGCAGAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr2L 4269072 5' - hobo 2916 1 69.86 GTATACAATGTGAACTATGTTTGCTTAGACAAATAGACAGTCTAATGGTCTCGTCATGACTCTAATACTTTTCCAAGTAAACAGTTAATATTATTAAAGTTTTTAGCCGGAAGCTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATCAATT:1 - chr2L 5741925 5' - Rt1b 4862 1 78.77 ATTAAAAAAAAAACGAAACAAAAAAACA:1 + chrX 17538999 5' + gypsy7 5008 2 89.29 GGCATCACAATTTAATTTCAGTTTTCAACCCATTGCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAATT:1 - chr3L 5398193 5' + roo 8684 2 73.29 TTGTATTGAGAAATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATA:1 + chr2R 1881353 5' - Stalker4 7205 4 58.90 CCGAAAAGTATGCATTTGTTTTGGCAGAAGATGCTTACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATCCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chrX 20024471 5' + 412 18 2 67.81 ACTGGTGCTGCCTACTGTATATACCAGAATCCGCAACTGCAATTATAAACCGAATATGATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1 + chrX 139994 5' - blood 7326 1 63.01 ACTCTGGAAAAATCAGAAGGCGCCCTGACATCCAGTAAACGCATTCTATGCCAGCTTTGCACGGTCCCTCTCACGATTCCCAGTTTTTTTGATGGCAGCTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCT:1 - chr3R 12118257 5' + gypsy12 15 2 74.07 GCATTCGTACCGGGATTGTTCCATTCGCAGAAGCCACGTGAAAGACAAGAGAGCCAGAGCAACTCTGACAACTTTGTTAGCAACACCTTTTGCAGTATATATGTAAGATGGATTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chr2L 13675843 5' - flea 231 2 76.03 GAATGAGTCTTGGGAGCTCGCATGTGTTCAACCTAAAAGCTGTTGGCTCTTCGCTCAGAACTCTGAACTCTCGCCGGATTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTT:1 + chr3R 15876408 5' - FB 482 1 53.42 TGATGCTCATCATGATCAAACTCCCACTTGGAACCACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr2L 1451284 5' - mdg1 7430 2 65.75 AGGAGAGTTCCCCCAAGAAAGCGACGCCAAAAGTCCAAGATTTAGTTTTTTCTCTTTTCTTGCTGGCCTTAATCAAGAGCCAAAAAAAAAACAACAAAAAAAAA:1 - chr2L 3341220 5' - hopper 148 109 78.85 AAAAATGTGCTGACACTTTGAGCCGAAGCAGAAGCTCTACACTGCAACACACGTTTGTATGACAACTAAGACTATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:2 - chr2L 11476385 5' + pogo 42 1 55.48 GTGGTTTGGGTGCCAATGGTGGCTTCACCATACTGGGAATAGGAATGGGCTTGGATGTAGACACTACAGCGCTGGATGCCAGAGGTGGTGGACTAATAGCCAACTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATA:1 - chrX 17127581 5' - transib2 2407 1 70.55 GTTGGGGGCTGCGATTTCCATCTGCCTTTCCCCACATTTTATTATGGTCTTTAATGAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCA:1 + chr2L 6153916 5' + copia 4934 2 63.70 GGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATA:1 + chr2L 3133693 5' + Doc 63 1 63.01 ATCTGATGTTAATTGAAGCGCTAATCCATGATTCTTAGAAAATTTACAACCATGGCTATTATCAATGGATTGGCAAAGCGAAGGAGTTGACCACCATTTAGAGGGTGGAATTTGAATTTGAATGCGAATTG:1 + chrX 9071003 5' - Rt1a 309 1 59.54 AAGTTTTGAGTCACGATTCTTCGCAGCACGCGTAAGTTATTTCGGCATTTCCATTTCCACCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGGGAGTGAAAGGA:1 - chr2R 11663916 5' - P-element 2827 1 45.21 ATTAAATTATAATGTGGAAATTATTGAAATTACCACCACTAACTGAGTATCTGTTAGTTGAGGAGCTCGTATATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 18122267 5' + 297 6622 2 54.11 CTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTGAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 - chr3L 19222677 5' - 412 418 2 64.38 GTAAATGGTATACAATTTAAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTC:1 + chr2R 12248970 5' + Juan 4035 1 68.09 GCAAACTTTATTGCATACGCCACGGCGCAATATGAGCCAGTGGCGGAAATGGCGTTGCAAGTTAAGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3R 23104471 5' + jockey 20 1 66.02 CCAGCTAACTTTCTATAGGCAGAACAAATTAAAGTAACCAGATAAGTTAATATAGTTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr2L 11476262 5' - pogo 2039 1 61.64 TAGCTCGGGATTGCGAACATGCAGTGGCTTTAAGCTACCAAATTTTAAACAACTCTGTATTACGCCCGTTAAAGTTGCTGCAAATAACGAGAAGTCATCTGAAATTGTTATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr3L 9659572 5' - mdg1 410 2 76.03 GAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2R 14431203 5' + Doc 64 1 55.48 GTTTTCATAAATGTATTTATGGCACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3R 10433190 5' - 412 442 2 52.74 TTGTTATTTGAAATGGTTTATGTTGGAATTATACTGATATTTTAGCTCAATTGCGTGAGTTTCAGTTTGCTTGTATATTTTTTGGACAGATATCGAGCGTAATGGGGGGAAATCGGGTATGGTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGG:1 + chr2L 2360026 5' - F-element 277 1 78.08 AAAATGGCATTTTATTTTCGGCTTTCATACTGTATATATACTGTATAGCCTGCGAGAGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTG:1 - chr2L 13328556 5' + BS 5 1 76.71 TATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - 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FB 623 3 59.59 AGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2L 8553285 5' + pogo 38 1 59.59 TTTAATAACAAATGAAAACATGTGCGGTTGCCGCAATATTGCATGGGCGCATGCGCAGCGCACAAATTGATCGCATTTAGGGGATAAGATTCAACAAGGGTGAATGATATAGTCGCCTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr2L 18775463 5' - INE-1 548 1 61.64 ATTTGTATTCAATTCTTTGTTGAGCATTTCTTTGTGCGCCATACTTATATTAATATGTGACTTGATGCATCTGTTAATAAGAGATTTGATCTTACATTTTTTTATTCTTTAACTAGCGCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr2L 7448021 5' + jockey 4671 1 72.60 TGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAA:1 - chrX 7847225 5' - hopper 26 1 71.23 GATGAAATTTGAATGGGTCATTAAAGCAGGCATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3L 17602507 5' + Doc 49 1 52.74 ATTAGCACTGAAGAGCTTATCTGCCACACTCGCGTGAAGTGGCATGCAAATCTGAGTTATTTAGATAAGCGAAGAGCAAATATGTACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - 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roo 9055 2 73.97 ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCAACTAGGGCTG:1 + chr3R 1875807 5' - Rt1b 4700 1 49.32 ATTTTTCAAATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 21938130 5' + roo 8694 2 63.70 ATCTTTAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chrX 5456626 5' - roo 8984 2 78.08 CTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGT:1 + chr3L 18010263 5' + diver 5978 2 76.71 AAGCAAATGGTTTTATGTTCCAACGCAGATAATTTCAGCTGCATAGTTTCCTCTTTTTTTGAGTAATTGGTTTTTGGCCTGTTTTTGTCCTTAACCCAAAATCTGTATGTCGCCAATAGTCAAATAAATAAATAAATAAATACTCA:1 - chr2L 12467322 5' - copia 225 1 78.08 AATAAATATTCTAAAACCATTGTTTCGATTATAAGATATTATGTTAGCTGTTACCAAAATAAGTATAACAATAAATGCTATTTATTTTATTATTACAATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - 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chrX 7993201 5' - opus 483 2 75.34 GGGGGCGGGCACCTACCTACATACATGGGCACATGGCCATACAACGTAACGTTCCAAATAATAAACGAAATGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAA:1 - chrX 19426753 5' + P-element 137 1 48.97 GTGGGTGCGGATGGTGCCTTGGCCATTTGGCAGTTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 + chr2L 16382505 5' + hobo 85 1 76.71 AAATTTGACAATTGTGCAGCAGGCAACATGGTGGAGTCCACTTTAAGTGACTCCCATCGAGCACTCGGGAACTTAAACTATAAAATTTTAAAAGTTTTGGTATGTAGTATGTTCCCCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCTTT:1 + chrX 14788561 5' - S-element 1392 1 58.90 TTAACTTGTTTCGGAGTCCACGTAGCGTATACGCAATATCACGCATACGCCACGTATCCCCATCTTTATTGAAATGCATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTC:1 - chr2R 22822749 5' + FB 908 3 53.42 TCTGAGTTTCTTGTTTGCCATTGTCAAAATAATTTTAAACATTTCCATCTCCCATTTTATTATTTTTGCAGTGTATTTGTCGATTCCCTGCCATTTATGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATATATTTACAAT:1 - chr2L 13447541 5' - I-element 5275 1 65.75 TCCGTACTGAAAATAATCGTGAACGCCCATTGTCTGCCAAAAAAATGCAAAGATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCG:1 - 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micropia 14 2 57.53 ATTATCAAAATAAATACGTTTGTCAGCCAAGAATGGAGGCATTTTGTTTGCATTTTCAGCCATTTAATGGCATTGGGAAGGAATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCG:1 + chr2R 16975775 5' + McClintock 149 2 55.48 ACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGA:3 + chr2L 13697630 5' + F-element 106 1 77.08 AGGAACACCCAAATACCCAAATTTCCCAGGCAACTTTCCAGTTGCTGTGAGCGATATGAAAACACTGAACAGAAATAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGAT:1 - chr2L 15822525 5' - TAHRE 10377 1 48.63 CATTAAGAGTTAGGGGTCAGTTAGAGATAAGTTAAGTACCGGTACCCGTTGTTAACTACTTACCCGACTTAAATTTATTACTTGTCAAGTGATTTTCCGAACCTGTGCAAAAATCTATCGACTATGAGTCGATGAAGC:1 - chr3R 20963461 5' + G5 438 1 77.54 GCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCA:1 - chr3R 7042056 5' + Stalker2 7331 2 72.41 AATTGTTCAAATGACTCCCGCCCCCACTGGACAAGGAGAAGAGGTGGACGTGAGAGGAGAGAAATACATAAATACAAATATGTAAAT:1 - 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chr3R 24444132 5' + hobo 49 1 52.05 AAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTCTGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAG:1 - chrX 7847243 5' - hopper 44 1 58.90 GGCAGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTGGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 16219295 5' - roo 350 2 55.86 AACTGACATTGGCATGTAGATGTTTTGCTTATCAACACAATTTGTTATATTCGAAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATATAGTAGCATATGCGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 + chr2R 7009371 5' + Quasimodo 17 2 74.66 TTTCTTATCGCGATGGTTTTTTCTTTCGCTTTTTTTTTAAGAAGAACGGTCACCGATTTTTCACAAGGATTATTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTAC:1 - chr2R 19456574 5' - mdg1 297 2 50.68 CGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTC:1 + chrX 20456878 5' + opus 7077 4 76.03 GTGCAGCTGATTCGGATTCGGCATTGATCATGTGGCATGGATTGGTTGTGGTTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAG:1 - chr2L 6727178 5' + R1A1-element 380 1 51.43 CGGCGGCGAAAAATGAATTTAATCGGTCTAGCATAATTTTGGTCAGTATTTGAATTTTCTTTGTTCGCATTCAGCGGAAACCATCCACAAGAAATATTATTTAGAATCCTGTCGTAACGAATATCTAATAAATATTGAAATATGTA:1 + chr2R 14434448 5' + Penelope 155 1 82.88 CGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAAT:1 + chrX 6283664 5' + P-element 90 1 24.66 GCTATTACATGTTGCAGCCAAAAGATTAAACGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 - chr2L 8895296 5' - 412 403 2 78.77 GCCACGCGACGCCCACGCCGCCCCCTTTTGACCACCCTGCATCCCTGCCAAATTGAAGCTTTCGACGCCGTTGACAGCCGCTATATTTCTACCTTTTGGCAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2L 7336263 5' + pogo 12 1 76.03 AACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 12115231 5' + 1360 28 1 63.01 AAGGAAGACAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2R 22112594 5' + 412 20 2 66.44 ATTACTGAAATTGCATTCGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr2L 16382543 5' - hobo 2894 1 75.53 ATGCCAAATATAAATAATTTCGGATATATTTTTGTGGATGAGACTGTTGGTCGAACTTTTGGCTAACAATGCTAACCCGATCAATTTTTATAAAAGCAGGCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTCCA:1 - chr3R 25380318 5' - Cr1a 408 1 51.37 CATACATTCATACATACATATATATGTACATCATGCCATCTTCGCCATTTCGAAACCGTCGATGATTTTGTGGAGTGTTTATTTGCATTTGGGGAACTCATCCAGCTTCTTGCGCAGAGCTGCGCTGGTGTTGGGCACGTTGTCGG:1 + chr2L 17474695 5' - G-element 497 1 68.49 AACTACCAAAAATAAATAAAATGGAATGACGCCAGTAAGTATGCTACAATAATCGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCCCTATGGGGCAGTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr3R 10541176 5' - hopper 1390 1 67.81 ACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGGCTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGTAAGTCCCAAGGTGGTCCTGTTGGAAATATAAGATTGCAT:1 - chr2L 22982918 5' - frogger 184 1 55.48 ACTTGGTGATAACCGCCGCCCAGCGGCCCAGTGATAAGCGAGTGGTTCGAACTTCCGCCCCTCGCAGGCGATTGTCGTCTCGATTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTT:1 - chr3L 2629445 5' - Porto1 230 1 70.43 AAGGCCTCGGAATGAATGTCACTGTATGTGGACTATACACACATATCTCGCCATCTCTTTCGGTTCCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCCTATCTTA:1 - chr2L 16995589 5' + roo 8705 2 51.88 GCTGCACGGTCTGCAACAATGGCATAGATAGGAAGGTAGTGGCTGGGTATGGGATTGATGGTGGTGGGGGTGATGACCTATTAAGTGGAAAAGGAAAAAA:1 + chr2R 18137713 5' - G5 4721 1 73.00 CAGCAGCCATCATTCAAAGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:2 + chr2L 8553268 5' + pogo 21 1 71.23 TCGTCTTTTAAAAACTTCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 - chr2R 5531234 5' + 1360 71 1 68.28 CTGGCATTCGCTGTTGTTTCTGATGGCAGCCCGCTTTTGGGACCCCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2L 8895241 5' + 412 7127 2 68.31 ATGGGGATTACTGCTGGGCGGCGTGCAAGACGACGAGTTGGAGCCACCATTTGGACCATGGCCATGTCCGGAGCCAGCTCCGGGCATCGAGGCTGACTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAG:1 + chr3L 20999085 5' - Transpac 4981 2 65.75 CAAGTAAAGTACATTACAATAAAACAAGAAAGCATGTTTTAGTCGACTATCAGATACTGGATACTGAAAGTACTCTAAACTTTCTAGCTTATATATGTGGCGCCCACACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACT:1 + chr3L 17860576 5' + Chimpo 30 1 56.16 AAATAGTTAACACATCTACTAATTGAAAATTATGATTATATTAAAGAAAGAAATACAATTTTAAAATAAACACTTGAACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - chr2L 13676002 5' + flea 4775 2 68.55 TAGCAAGTCTTTCACATAAAACAAATTCTAAATATATACTTTAAACAGGAATTGAACAGTATAATATATATTTAATTCACGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGA:1 - chr3R 31384862 5' - 1360 3239 1 52.05 GAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGAAGGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 16200745 5' - roo 331 2 71.23 CGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAT:1 + chr3R 5170984 5' + F-element 92 1 76.22 ACCCGTTGAAGTCCTGCTGCGACAGGACTCGTGCTTCGCTTTTCAGCCCGGCGATTGAGATGTCCTGCTGGTGCTGCTCGGCAGCGGTTTTCTCATTTCCCAATCCGATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 13850776 5' - roo 398 1 76.39 AGTGAAGTCTTTTTCGGGTTTGAGTTTGGGCTAAAAGCAAAAATCCGACGAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 + chr2R 22774529 5' - I-element 5286 1 63.70 CCTACTGTCCCTATCTACTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGACTAATACAGGTTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGG:1 - chr3R 9201035 5' + R1A1-element 4895 1 82.50 GATCAAAGTCAGCGTGGACTGTAAGTCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCC:1 - chr2L 6385901 5' - invader4 274 2 58.22 AGTTTTGTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3L 22435240 5' - opus 470 2 65.07 CCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATA:1 - chr3R 10062207 5' + copia 87 2 78.17 CAGGTGAAAATATTATGAAATATATGAATTTGTATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCA:2 - chrX 3596473 5' - copia 167 2 82.88 GAATCAAAACAAAATCGGCTTGCAACAACAACAAAAACATTGCAGAGTGTGGGTGGCGCGTGTAGCGATCAAAATTGCGTGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr3R 13684653 5' - 412 7510 2 60.27 ACATGGTCGAACGCAGGTTGTCGATGCGGCATCCCTTTACAACACGTTCGAGTCGCCTCAAAATGTTGAAATATATTGGGGTTGGAGGCACTACACGAATGCCGATGGAGGAGATAGGGGAGTAATTTTAAGGTATAT:1 + chr3L 18540019 5' - TART-A 13062 1 63.77 AAAAAGATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr4 868622 5' + roo 47 2 53.42 AAAATCGATTACACCGAAATTGTTCTTCAACAAATTATTTCCCATTTCCAAATTGATTATTTTGACTTTATTATATATACATATACAGGAGTAATTATATACAGGAAATGGTTTCTGCATTAAATTTTTTTTCTTTTTAAATAAAT:1 + chr3L 21372698 5' - transib2 2633 1 48.63 AAGTCGTGTGTTTGCGATCGCGTTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAA:1 - chr3R 7042075 5' + Stalker2 7313 2 59.59 CTGCGCTACTTACCACGGGTATGACGTGCGTCACTCCATCGCCGCTGTCCACCACGATGCCTGTAAGGGTACGCTCCTCTGCGGGCGGGCGCTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGAGGAGGAG:1 + chr3L 8115017 5' - 17.6 246 2 62.12 GTTTATCTATGACTGCTTTTCNTAGTGATTTTAGTTCGCCCATTTCCGCTTAAATCTGCCCCACACACATGCACATAAAATAATGTTTTTTTCCTTATTAGAATATGTAACGAAATCGCCTGTCATTTCTAAATAAATTAAATAAA:1 - chr3L 17152634 5' + G7 1143 1 60.96 ACTCTAGCAAATAAAGTAAATAGTTAGCAATGCATTTCAGCTTTGTTTCACGTATTGCCCAGATTTAGCTCAATTGTTATATCTATCAGTTCACAATTATCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 + chr3R 18343401 5' - jockey 4975 1 67.81 AATGGGTGCGAAGCACAAATGTTTGCTGTAGTCTCACCGCTCGCAAAGATTTTTCACTGAGAGCGGGCTAAGAGATAAGCGTTCTATCTATCAAACCAGCCGAGGTTTGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATG:1 - chr2R 7132332 5' + Cr1a 158 1 63.70 AAAAAAACCTTTCACAATAAGCCCATTTAGTTTAATATAATTGGAAATACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 16607333 5' + 412 7082 2 60.27 CAGCCGACTTCTGTCTTGTCAGTCAGCCCGAGACAACGCAATATTTTTTTGCCGGCTTAACTCTGGCATTCGCTGTTGTTTCTGATGGCAGCCCGCTTTTTGGACCCCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2L 8895179 5' + 412 7069 2 73.97 CTGTGCCTTAGTACCTCCTGTTCTATTCCTATCAATAAACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 - chr2R 16185153 5' + 17.6 6952 1 68.97 AATAATAGTTTTGCCAATTTGATACATTTAAAATATTTAAAAAAATGTATAATCAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr2L 20508443 5' + pogo 14 1 71.92 GATAGGGCGGAACATGTGCCTCACGGATACTCTTCTGCTAATAAAGTGCGACGCCATGTCTACCCTTTTTTTTACTGTTCTAAGCTTCTGTTTAAAATTTGTTAAATAAGAATTAGTAATTATACCCCATACTAGATTCGTTGAAA:1 - chr2R 5719005 5' + INE-1 5 1 58.90 GACGTAAGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 16200703 5' - roo 9041 1 64.38 CAACAATCGCTCGTCAATTGGAGTTGACTCTGTGCAGTGTTTCTAGCAATGCTGCATTATACTTGATCGAGGAAATCCAGTTAACAATTAGTAAGACCAATTATTGACATTCGAATAAGTACTTCAATGTGAAATGTGTAAATAAT:1 + chr3L 17945044 5' - Bari2 110 1 80.14 TATGACAGACGGCCATTGTTATGGTCAGTTTTGGTCTTGGCCACGTTAACTGCCGGCTGTCGCCCATTTCAAATTGTGCGACAATTAAATTCTTGCAATATTTATAAGTAAAAAAAAATTAATTTTTATTTCACTAAATGATTACA:1 - chr2R 23778789 5' - Idefix 7348 2 52.05 TCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 19698060 5' - roo 9028 1 51.37 TAGGTCCTGGGTCCGGTTTGGGATTTGTCTACCAGGTCAGCTCCCCGACGCCTCCCTCCAGCGAGGTGCTGAAAATCACCGAGCATGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTGA:1 - chr2R 6933399 5' - roo 403 1 63.43 AAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2R 9871587 5' + roo 47 2 54.11 ATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCG:1 - chrX 21667972 5' + gypsy2 6520 2 68.06 ATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAGCATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAG:1 + chr3R 25871994 5' + hobo 2583 1 54.79 AGTATATATATTAAAAATAAATTTTTACTTAATTTTTATCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 + chr3R 20345460 5' - blood 7308 2 72.60 ACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 - chr2R 2016928 5' + 1360 52 1 51.37 CTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3L 21913451 5' + 297 6629 2 52.74 GTGCCCCGCGTAAGTAGATAAATGTACTCCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 17871841 5' - roo 347 2 63.01 AAATGCCACAGCTAAATGGCAACGACATAAGAGTCTAGAAAAAAACAAAAAAAGCAAAAAAAAAAACTGAAAAAAAAAAACAA:1 - chrX 8853164 5' + gypsy7 5009 1 77.11 TATGAGGTCTAGTCTATGCTTTTACATGTTCAGTATATGTCACATACAGCAAATGAATATTGTTAAATTATTTATTTGCTGTATTCTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 - chrX 407506 5' + I-element 37 1 60.27 GCAATGTTAAGATATTGCATGGGTTCAATCCAAATGTTATATATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGA:1 + chr3R 20308171 5' - invader4 245 2 71.23 GTTTCAAAATAAAAAGCCGGTTTCATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chrX 18534550 5' - P-element 2816 1 21.92 GACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chrX 6283666 5' + P-element 69 1 27.64 ATTCAAATGGTGGTAGACATAATTTGTAATTGAGATGTGCGATATTGCAACACATCAATGACAACAGACGAATCCCGCTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGC:1 - 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chrX 12105337 5' + 412 51 2 54.17 AAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 8208388 5' - roo 323 2 74.66 AAGCGGACAGCTCGACCGCCGGACGTGGACCAAAATACGGACACGAGTTCATTTAAAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:2 - chr2R 21619462 5' + blood 7040 2 65.75 GATGAGCCACCCCCAAAAGTTGGCTAACTAAATCACGTAATGAGTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 - chr3R 19246805 5' - jockey 4961 1 57.53 TATATAAATGTATTTATGGAAAAGTTTTCACACAGTCAGATATATTAGATAAAAGAGCTTGAATTGTATACGCCTACATTTTATTTTGTGCAAAATTCTTTAATTTAAAGTCCTTAATTTGAGGCATAAAATTATATCGTTAAAAG:1 - chr2R 21077933 5' + micropia 389 2 46.58 TGTCAAGTGTCGACCATAAAAGACGATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3L 13888857 5' + 412 20 2 71.53 CCACACTTTTTGTTGATGTGCAAAATAAACTTATCTTAAAGTTTACAGACTTTAGAATTTAATACCACTGCTTATAAATACTTTCGTGCCCTAACAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGTCTGTGACTGC:1 + chr3L 8606834 5' - Doc 4530 1 63.01 AATCGGAATCGTAAAAATGCAATTCAGATAGCGAAAGGGCGGAAAACAGCTGGAAAAATTCGGTGCTAGAAGGTCGTGCTCATTTAGGGCGTTGGCAAAAAGTTTTTTTTTAGAAATCGATAGAAATGTAAAAGACTAAT:1 - chr2R 21868524 5' - INE-1 297 1 55.71 AAGTCGGACGTGGCGAAAGGTATAGCGCATACATCCGTAACTGAATCCAGGCGAAACTGTTATCAGTGGATTTGGCCACCTTTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCCAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTT:1 + chr2R 17873961 5' + diver2 310 2 56.85 TTATTCACTTAAGAAACATACACAAATATTCGGTGTTTAAAAACTTTGTATGTGTTGTTTCATTATAAAGGTTGAGAATGGCTATTCAACAGCCAGTTGATTGATTAAGAAACTAATTCCTTTTCTTGTTTTTTTTTTTCTTTTAC:1 + chr3L 9213221 5' - Doc2-element 222 1 54.79 CAAAACTGCAGCTTTTTATTATTTTGTTGTATACTTGCGGGCACCTTTGTTCAATCTTCAAGATATTATATTCCAAAATTGAATGTTTATGTTAACGAGCAAACATTTAATTATTTAGTATTTGGTATGGCCACCCTTGTTTTTA:1 - chrX 12635464 5' - Tc3 1414 1 80.00 CATTTCCATATCTCTCGAACATGGCTTCTTTCACACAGGTTGCGATCAGCATTGTTATTGCGAGATCCTGGCATTTCCGTATGCTTTCGTTTGCTTTTTCTTCGTTGTTTTTTTTTCGGGGGTTTTCCTTGTTTTTTTTTTTATTT:1 + chr3R 7179361 5' - Doc2-element 225 2 51.37 AGAAAGTCCTGTTCCTCGATTAGGTAGAANAAAAACATCAGCGTCGAGAAGCCAAAGTAAACCTGTATGGGGGGGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTNATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATT:1 - 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blood 7335 1 54.11 CACAAACCTTCAGTTTCTATAAGCTCTTGAGCCGCCGAAAGTAAAACATTTTCTAAAATCATTTAAATTCTGTTGGTTCCACCTATATAAAAACATGAGAGATCGTAATTATTGAGTTTGTGGACTATCAGATACCCGTTACATAG:1 - chr3L 11579013 5' - INE-1 547 1 47.95 CTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr2L 16554626 5' + blood 7095 2 79.14 GCCCTGCTCTCTCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGTGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 13530041 5' + jockey 20 1 76.03 GGCGCATAAATTATAGATGAACGAATGGAGCTGTGGGGTGGCGGTTGGCATCTGGAAATTTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTT:1 - chr2R 17609901 5' + mdg3 5264 1 78.08 GCATCCTTCTGGCTGATTGGCAACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 - chr3L 20934198 5' - Max-element 273 2 69.86 TCGCGTTTCAAAATAAAAAGCCGGTTTCATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAA:1 + chrX 18534546 5' + P-element 89 1 24.66 AAAAACCAAAACCGCAGTTTTCCAGAGAAAACTGTGCTGCTGCTGCTGAAGAAGCGTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr2L 13316995 5' + jockey 4675 1 77.86 TCCTGCATGAATCTCGCACTGAAATTTGTATCTCCAAGCTGGCTGGACCAAGTGAAAGTGGACAAAAAAAGAAATATATATGTAGAAATAGAGAAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAATAAAATA:1 - chr3R 11645403 5' + mdg3 5148 1 68.49 AAAATTATTTCGCTGCATACTTTCGGGCGAGCGCATTAAAGCAGTTCCTCTTTTTTTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 - chr3R 31086599 5' - jockey 4933 1 60.96 ATAGCTAGTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chrX 20456843 5' + opus 39 4 58.22 GTAACGTCACTCACTCGTTAGCCTGAGTAATGTTTGCACTCCCTTTGGCCATAAGTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3L 20868131 5' - hobo 2933 1 74.04 ATATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2L 20044625 5' + roo 8738 2 70.34 AACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAG:1 + chr3R 3590975 5' - Gypsy6A_LTR 362 1 76.03 AGTTGAGCAGGTAGAAGGCGTGGTTGCCGTTCCGACGGAGCGCGTCTCAGAGGTCGAGCGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGACTGCTATGGCTCAGTAATCTGCCACTGTATCGACTTGTATGTCTC:1 - chr2L 18452309 5' - Helena 1236 1 72.09 TTTTAAACGCTGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCAAAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATG:1 + chr2R 17696014 5' + rover 6999 2 54.11 CTCCATCGTACGGCTTCATTGCACCTTCAGCCGAAGCCAATCTCATTTCCATTAAATTGTCCTGGCCTGGCTTGCGCACATGAATCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTAG:1 - chr2R 13695750 5' + blood 7047 2 60.27 TATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 19698085 5' - roo 357 2 59.38 TTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAAT:1 + chr2R 7407991 5' + 3S18 5848 2 78.77 GTTAAGCAACTCTTTTTTCTTACAGCTGCTCAAAAATATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTT:1 + chr3R 12538081 5' + mdg1 85 2 74.48 CTCAAAAGGTGGTAGTAAAAAGTCGTATATAATTTTCCATTGGAATGGAATGTGCCACATTGCCCCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3L 17757853 5' + Tirant 8119 2 38.36 ATCCTTTGATGTGGCCAGACCGAGATGCTTCCAAAAGGTGCAGGTACACTCGGAGAAATACATTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTG:1 + chr3R 10661165 5' + HMS-Beagle 134 2 52.07 CTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - 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Cr1a 49 1 73.97 ATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2R 8258241 5' + jockey 37 1 61.64 TGACGGTAAAGTTTTTGGCCTGGCAAATGGCAAAAGTTTTGAGCTCTACTCCCGTTATCCATTCATATACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 - chr2R 18723770 5' - 297 6926 2 54.11 GTTGCAGGAAAAGCAGCGAGATCGCCGAAGGAGTTATAAAACATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCATACTGTGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCTACGCTCTCCT:1 - chr2R 4294606 5' + McClintock 75 2 65.75 CTCGCAGTTTCTAAGGAAATGAATAGCACTAAAACAATATTGTGTCGACTTGANTNGGTGATTCATTTATTTTTAGTTACAACTCACGAAACTATCGATGACAGTTTTAATTATCGCGCAGTTTTATTTAAGTTTGCTTTTTTTT:1 - chr3R 19003640 5' - HeT-A 327 1 64.83 TGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3R 8381682 5' + Tirant 8120 2 72.13 GGACATAATACACAAATATATTTACTTTGAATTCATACATATAGATTTTTAAGAATATTCTTAAATTTTTCAGATATCATTTAAGTGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chrX 14189114 5' - 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chrX 7848329 5' + flea 4781 2 69.18 AGACAAAAGCACTGACGAAACCCAGAAACAGGAGCATGAGAAGAAGGAGCCCCATTGGGGAGGAAATAATCCTCCTCCGTGTCCGATGCCGTTGGCCATGCCGGGTATGAATGGTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGT:1 - chr2R 5037834 5' - Stalker2 395 2 75.34 TCATGCATTTTATTCTGGCAATTTTTTTTGTCGAGCTTATTTCTCTGTGTTCTGCCATTTGCCCAAAATAACAAAGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 5398035 5' - roo 9025 2 50.00 AAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTGTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAATTTCTT:1 - chr3L 19222689 5' - 412 7483 2 58.22 ATGTTTGCATTTCATTTGTTAGCAAGTTGTCAACCTTTTATCTATGTTATTATGTCTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr2L 16554544 5' + blood 7020 2 78.77 TCAACACATGTTTTAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTTTTACGGTTTGTGGGCTTGTAGGTGGGATGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGTACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGT:1 - chr3L 23495949 5' - I-element 4981 1 65.75 AACTATTATATTCGGGCTTAGAGCTTTTCCACAGTTACTAACTCATGAGTAAGTCAATTACCACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 15102234 5' - roo 9014 2 56.85 TCTGATTTCAATCACTAGATTCAAAATAGAATGGTTTGAAATATTTCCGTCACTAAAATAATTTTTAACTGACTATTATCATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTA:1 - chr3R 23518027 5' - 1360 2970 1 63.70 TACGGTTTAGTACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3R 11108135 5' + jockey 86 1 67.81 CTTGTTGGATTCAATTTGCTTGTATTCAATTTTTAAATGAAATCCTTTACACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3R 6399319 5' - pogo 2074 1 66.44 AAGAGCTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCT:1 - chrY 3648929 5' - Stalker 7054 4 61.64 TTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 21938163 5' + roo 8727 2 65.07 AAAAAAATAAAACTTCGGGCTAGCATCAATAAAACAATTGTGTGTGAACCTTACGACCCCCAAGTCATTTTTATTGTTAGTACAAATCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGCATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - 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roo 9021 2 51.39 CAGTGAGAAAAACTCAGCTATTTAACTCAAGTCGATTTAAAAAGCTTTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr2R 6089047 5' - 1360 3338 1 52.74 TTTTCGAATGCCGCATGAATGAAGTCGAAGTCGACGTCGACAGCACGAGCTCTCTCTCGCCTGGCTTTTCCTTCTATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTTCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chrX 18534635 5' - P-element 2856 1 61.48 CGGCCTATGTATGTATGTATGTATTCATTAATGAGACGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAATGAATAGGATTCTGAGTGTC:1 + chr2R 21475233 5' - P-element 2810 1 29.50 AGCATGAGAAGAAGGAGCCCCATTGGGGAGGAAATAATCCTCCTCCGTTTCCGATGCCGTTTGCCATGCCGGGTATGAATGGTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTATTAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTC:1 - chr2R 5037802 5' - Stalker2 7611 2 56.16 ATATACATTTAAGCACACAACAAATAAAATGGGCGCGGCTGCTTGTGGGCCCAAAAAAGTATGCTACGGTTTAGTACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3R 11108199 5' + jockey 21 1 76.71 CGATGAGTTTTAATTGACGAAAAAAAAGTAAAGCTTAAAGTTTTATAAAGAACTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCC:1 - chr4 861553 5' + Cr1a 4398 1 58.73 AGAAGATTTACGCCACCTCGTAAAATTCTAGGAGATCCCAAGCCAACCAATGGTACTTGCGTACTAACTTCATTAGCATTGCCAATCGATGGCTAGAAATAAAGAGATCTTGAAGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATT:1 + chr2L 5775458 5' + roo 8771 2 73.97 CCGCCGTCAATCAAAAGTAAACTTCAATTTCAGGGGGGTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 18767910 5' + hobo 13 1 64.71 GACGTGTAAGTAAATGTTGCCCCAGAAAGTATGCTACGAATTTCAATCAATGTAGATGATTTTAAAAGAACACTTTTCTAATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 + chr3L 8936860 5' + BS 5038 1 51.37 GAGTTAAGTTGGGTTCGGCAGCAACAGTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 - chr3R 19725452 5' + hobo 60 1 56.85 ACGGGGCAGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATCATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCA:1 - chr2L 4631249 5' + roo 105 2 51.37 AGGATCACGGAGGCAAGGCGTTGCAGGAAAAGCAGCGAGATCGCCGAAGGAGTTATAAAACATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGT:1 - 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chr3R 13676198 5' - P-element 2835 1 52.74 GTTTAGATATATGATTTTTACCAATATTGTTATTTTTTGAAAGTTTATTAAAGTATTCAGTCGTATATGCCATTTTAATAAGTTTCTTGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATA:1 - chr3R 20332629 5' + BS 5077 1 54.11 AATTAGAGTGTTGTAAGTTTTGATAAAAGTGTTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2L 8930599 5' + roo 36 2 60.27 CCTACTTTAAAGTGACTACATGGCGAACGTGCAATTTGACTCGTAGCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGT:1 - chr3R 2526012 5' + Stalker2 32 2 61.64 GTTGACTCTGGTAATCCACCTACAAAACCGCAAGTGCCGGTGGCACATGCTATCACGACTCCTCTCCAAAATAATATTAACAGGAAATTAAATGGATTTAACGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1 - chr4 302489 5' - 1360 205 1 67.81 TTGCTATTGTCTTCTCCCACTTTTGTCGATTTTTATATCAGTATTTGTCACTGTTTACTTTTTTCACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAACATAACGTTAAACAA:1 - chr2L 13293051 5' + copia 4891 2 66.44 ATCACTTTCGACCATAAATTATTGTTGATCTTTGTGCGCTGTGAATTCCCTCAATCGAAAGCAAAGTCCCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 13850617 5' + roo 8715 2 52.05 CCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - 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412 7506 2 47.95 ATTTGTCTTTTTGCTGCCTTTGGCCGCTTTTTCCATTTTTTTTTTGTTGGTTTCTCCTTGGTCGGTCGCTTGGTTTGTTTGTTTGCTGCTTTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCAT:1 - chr3L 10711083 5' - Porto1 4399 1 65.19 GCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGTTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 - chr3L 13888979 5' - 412 414 2 71.23 CACAAACTAATTCGCTGCCATCACTTTTTTCGCACACATTTAAACCAGCAAACTTTTACATCCGCTTTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGT:1 + chr3R 7414718 5' - G2 2664 1 54.11 ACCGATTTTAAAGTCTACAAATTTTGACAGCTGCACGTCGCTGAGTTGCTGGCCAGCCTGACAGTTTAGGTTTATTAATAACTTACTTATTATTCGGGTGTTTGAATCCAACTGACTCGCTGCTGCGAGG:1 - chr3L 16832434 5' - rooA 7543 2 67.69 ACACATCTACTAATTGAAAATTATGATTATATTAAAGAAAGAAATACAATTTTAAAATAAACACTTGAACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGT:1 - chr2L 13675993 5' + flea 49 2 53.42 GATGTTTGCATGTTGATGACGTTGCCGATGGGCGCAGCTGCTAATTGGCCACGTTCACCTTACCTCCTCGAGAAATGGTTCTTTGGAAAAGAGAGAAGTTACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTCGCTATCAATCTTTTA:1 + chr2R 20213344 5' - R2-element 3222 1 67.13 AATGATAATGGCATGACTTGATGCGTTAAAGTTTTGTAAATAGTGTATTTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAAT:2 + chr3R 29195445 5' + flea 4829 1 67.12 GTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGCGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACAT:1 + chr4 1301736 5' + 1731 4386 2 63.70 CATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTATGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACTTTCATACGGTCAGGCGGACATGGGTAGATCGACTCGGCTATT:1 - chr2R 5296379 5' - INE-1 102 1 79.10 GATGTCGTTCGGCAAGGTTTGTGCGACGTTTTGTGACTGGTATTTGATATTAACCAACTGAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3L 21292644 5' - 412 471 2 69.86 ATATTTGCACAGTTTTGCCAATATTTGTACTAATAATTTGCAGTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAA:2 - chr2R 20706847 5' + I-element 76 1 67.81 TATTACGTACACTTGTATAGTTAATTACAGCAGAGTTCCTTTGTTTTGTAAATAGTATTGAATATTCCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr3R 13613193 5' - copia 237 1 54.11 AAGGCCTGGTGGTTCCACCGGTGCTGGAAAAAGGCCGATCCCAAGGAGCGACCGAAATTCTTTTAAGAAGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCACTTTACAACGCAACAATGCATAC:1 - chr3R 5972393 5' + Doc 272 1 54.40 ATCGAAGTTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATGTTATGTAAATGAACCGATAGCGATACATTATATTTAG:1 + chrX 15539981 5' + roo 8739 2 73.05 TAAACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTA:1 - chr4 829134 5' - INE-1 155 1 71.92 ATGTGAAGCCACAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGATCGCACTTT:1 - chr3R 19217686 5' - HMS-Beagle2 121 2 78.43 AATCCACAAGGCGTACGAATTTATTATCCAGCGTTGATAGTGATAAAATTTATAACCAGCATTGAGCGAACTGCCTAAAAGCGGGCAGTACAAACACAAACAGACAGAGATTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAA:1 + chrX 3649844 5' - FB 974 2 65.52 AGGGAGGGAGCAACAAGGGGTATGGAGTTGAGTTGGAGCCATGTTTACATAAGCAAATAGAATACATCAGATGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTACGTAATGTTAAATATCATGATTTATCTAGCTG:1 - chr3L 409873 5' + Chouto 6227 1 52.14 TGTGAGCGCTCGCCTTACGCTTTTGTAGCTTACACTCGCATTTGCATTTGCATCTGAATGCAATTTTAATTATACAATGCCTCCGGTGTGGTTTATTCTGCGACTATGCGCGTTCAGATGAGTTCTTAAAACTGAAGACAGAAAAC:1 - chr2R 20859212 5' - gypsy4 6771 2 58.90 ATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr3R 13529987 5' + jockey 75 1 65.07 TGCATATAAGCAAAATTTGTTGTTTTGCACTTGTAATTATATACTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGCAGG:1 - chr2R 7769827 5' - Transpac 238 2 70.83 GCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chr3R 9550966 5' - P-element 2799 1 25.34 AACGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATNATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1 - chr2R 18044073 5' + jockey 4592 1 57.53 GAGGGAGAGCAGAGAGCGGCACTGAGAGCACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGA:1 + chr3R 9550852 5' + P-element 18 1 73.29 CCTAAAAGTATGCTGCAAAGTTTTTTCGATTATAGCGTCATCGAGCATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1 - chr3L 12633319 5' - jockey 4919 1 75.34 TAGTTCACTCAAAATAAGCTATATTCTGTCTATGCGTAGTCCTGCCATCGATTGTGTTTGAGATACATAAGCTAGACAATGGACTAGACTATAAAAGTCTGCAATTGGTAACTCATGTTGTCACGCCCACTCTAACGCCTACAAAC:1 - chrX 22680763 5' + INE-1 218 1 62.33 AAAGAAAATTATTTTTTGTGATGATAAGAAAATTGAGAAAATTTTAAATTTTAAAATGAATGCTAACTAAAGATTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 - chr3L 20573886 5' + pogo 59 1 56.16 TTTTCTTATGATACATTTAACATTCCGCAATTTATATTCAATAGTATTTTGTAGTGCAAAGGGCTCCATCTAAATTAATTTAATACAATTTAATAAGCATTTTATAGATATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAAT:1 - chr3R 16882044 5' - 3S18 327 2 74.66 GAGCGGATTTCAAAGCGAGCTTGAAGTGCCGTCGGCAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 + chr3R 16881874 5' + 3S18 39 2 56.85 GAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCG:1 - chrX 15540043 5' - roo 330 2 74.13 ATAGATTCCACTTATGTATTATTTATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTAACATAA:1 + chrX 20266141 5' - BS 5054 1 58.90 CAGAAGGATCTGTTCGTATTAAAGAAAAATCATTTTCCGCCTGAACATCACATTGTGAAAAGGGAACCTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr3R 12342090 5' + hobo 50 1 53.42 TTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr2L 4268994 5' - hobo 2897 1 77.01 GATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr3R 12622175 5' - 1360 3329 1 63.01 AAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACA:1 - chr3R 2689443 5' - diver2 4476 1 69.91 TCCTTCAGATTTTAATCGCTCCCGTGAGAGCGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGAGTTAAGTTCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTA:1 + chr3R 28045757 5' - Tirant 8439 2 62.33 ATGGTTTTGAGTTTATTTGGGCCGCATTGAGCTGAGTTCGAGAAAAGCAGACTTACAAATAATAACAAAACATTTCATCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATG:1 - chrX 12332581 5' - gypsy4 6460 1 55.40 TTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr3R 13529976 5' + jockey 80 1 71.43 GTTTTGAGAGTTCCGCACGAGACGAGCAGCTAACTGCGTTCCTGACATTAGACTGAAAACTGAATCTGAAGCCCGATCCGAATCCAAATCGCCTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3R 17944146 5' + P-element 27 1 67.12 ACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTAAATATAGTGACGTATTTGTGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3L 21636452 5' + 297 6636 2 68.64 GAGATACTCGGACTGCGAGCACGCATCTGCATATATCAATCGGATGCCCGCAGCCCATGCACCCATGTTGTGCATATGCAGTGCTCAAAAACATGTGCACACCACATAAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATA:1 - chr3R 27328343 5' + roo 180 2 53.42 CATAAATACATTTAGAAGTGTTTCAGGGAATGCATAAAGAATCCTTTCAAGGAATGCTTACATAGGCGTTAAATTTATTGGCGAGCTTCTTGCGCAGAGCTGCGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCTGTGCTTTC:1 - chr2R 3175149 5' - G6 465 1 52.74 GCAGCACCCCACACTTATATTAATTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTCAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCA:1 - chrX 21907790 5' - HMS-Beagle2 7101 2 84.25 GTCTCACAATAAAATTAAAAAATAATTTCACAATATAATTTCATAAATTTTCAAATATATATTTATGTTTGCAATTATATATATATCACATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chr2R 14161288 5' + I-element 34 1 62.33 GCAGCCAAAAGATTAAACGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTATGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGGCATATATTTATTTAATTTCTTCCTTTGATT:1 - chr2L 8895283 5' - 412 421 2 77.39 CTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATATTATGTGGAAATACCTTCGGTT:1 - chrX 7042712 5' - roo 352 2 59.06 GTAATGTAATGAATGTAACTGCTTCACTTTTCTCACTTCTCACTTTTTTTATTTGATTTACAGTTAAGCCGTGTTTATTTTAACACAGTGTTATTTATTAATTTTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAAATATATATGTA:1 + chr2L 6647155 5' - Juan 4190 1 65.75 GGAGGGATTCAGTACTTATATTGTTGATTCATGTTACTTTTTATCATCGAAGCTTTTAAAGTGTTTCTTAAGTCTAGTAAGTACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2R 7769713 5' + Transpac 4955 2 58.22 GTAGACTCGTTCTTTAAGACAGGTATTTCATGTTTTTTAATTACATAATTGAAAAGTCTGTAAAATAAACAAATCAAATTATTGAAACTGTCCTAAATACAACGCATTGTCCAAGAATCTTACCTATCACTTAATCTTAATCTTAA:1 - chr2R 7774783 5' + Rt1c 5395 1 81.51 AATTAACATGGTTCGATTGTTACCGTTCATAGTTGAATGTTACAACTGTTTACAAGGAGGAGATGGAGCCATTTCAAATCCAAGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 - chrX 23035980 5' + HMS-Beagle2 6916 2 50.69 GAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr2L 13468245 5' + roo 82 2 74.66 GCTCAGAGTGTTTTTCTTTTTTCGTATTTTTATTCCCAGCCAGCCATGTGGGAGATGGCTAAAAAGGAAATGCATTTGGGCAGTGAGTAAGCAGTAAGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAAT:1 - chr3L 8676627 5' + Burdock 6074 1 56.85 ATTGTCTGCGTTGCTGCCTGCGTTAGTTACAACTGGGCAACGTGGGTTTGAGTGGGGTCTAATCCGGAAAAGGCGAAATACAAAGTTGCAGAGAAGAAAAAAAATAGTTGGTTTTTGACATAGATTTTATTTATACTTAAATTGTG:1 + chr3L 3575495 5' + Quasimodo 7275 2 73.29 ATGGTCGTATAGTCGCAGTTGGCAAGTGGTGTGTGCATGTTGCAAATGACTAGGCGCCCAGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 - chr3R 26542671 5' + FB 62 1 60.27 AATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATAAACACACGGTACTCCAGGCA:1 - chr3R 12342193 5' - hobo 2896 1 51.64 GATGCAGTGTAAAGTGTGTAAATCCAAATACAGTTTCTACTCTGCTTTAAGATTGTAACTTCCTTCCTTTTTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAG:1 - chr2R 16744596 5' - roo 445 1 51.37 TTTTGCGCATATTCAAGCAGTATTGATCGCGCTTAAACGGAAAGCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 19698206 5' + roo 34 2 62.33 AGACTTTGCACTGAACTTAAATGATAATAATTTAACGGTAAGCACGTCCTGAATATTATCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGG:1 - chr3R 6290109 5' + R1A1-element 4884 1 59.59 AGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2R 10695885 5' - roo 9021 2 55.48 CAATGCGGCACATTGCACTGTAAAATCACGCTTGAAACACTCCACAGCATTTGTAGCGACACCAACTATTTTTATAAAAGCTGCCTTCACAAAGTCAACCAATTCTTCCAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGG:1 - chr3R 8287623 5' + P-element 169 1 72.73 CAATTTCCTAAATTTAGGGAGTTTAAGGGAAATTCATTGCTGAAAATATCCCGTGTTAGTTGCACCAGCGGAAGGGTTAAGTACAGCTGTGTTCATAAAAATAGCATTGCGAGGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTTCATG:1 - chrX 22878395 5' + HB 47 1 57.53 ATTATGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTC:1 + chr2R 8258227 5' + jockey 23 1 71.23 ACACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACCCGCACTCTAC:1 - chr3L 8274028 5' - hobo 2928 1 71.93 AGCACAAATTTTGCAATGCTTTCGCTTTGCTTTTTTTTTCGGAATACTACTATGGAGGCGAATCTACTGAAACTGTTTACCTTATCTCTGGAATAAAAAATGAAAATGTTATCAATCCTCATTTGCACCACCTTTGCAGATCAATC:1 - chr3R 28571329 5' + Q-element 174 2 56.16 CCATCGCCGCTGGCCATTTGTGTGCAGTGAGTACGAAGTGATGGAGTTCTCCGACTGGAGGTTAATAAGTGTACCATTTACAGATCAAACTGATACTGCTTTGAGTTACGCTGCTTGTAAAGCGTTGAATTGCTGATCGGCACTC:1 - chr2R 11412636 5' - BS 443 1 62.76 CAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2R 22112602 5' + 412 28 2 60.96 ATCCGAACATCTGTTTCAAACAGTTAATATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr3R 13375909 5' + 1360 18 1 71.92 AAGGTGTTGAAAAGTATGCAACCATATATTTTCACTCAATGCTTCTGGAGAGTATGCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr3R 28413967 5' + pogo 63 1 61.64 AAAATCACTCTTATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCATCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 - chrX 3559665 5' + opus 7061 4 58.22 ACAGAAGGATTGCGCAGCGGTTAGAAAATGTTTTGGTTGCAACGAAGATGGACATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAAC:1 - chrX 22574772 5' + 17.6 10 2 74.66 ATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 29384709 5' - roo 9003 2 75.34 AGCCAAAATACTAATACTTAAAGCCGTGTACATTGTTTGATTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTCG:1 + chrX 15252293 5' + opus 77 4 73.10 ATAGATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCG:1 - chr3R 14278008 5' + P-element 10 2 75.20 ATGTATATACCATTAGGTCCATATTGTCAACAATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 24010946 5' + roo 8686 2 66.67 ACACTTTTGAACCATTTTTCGAAATTTTTTTCATAATTTTATAAGTCTTGTAAATTTTCTATTGAATTTCCAAAAAACTTTTTGTCTCGCCCTATCTAACGCGCGTATTTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGG:1 - chr2R 5722309 5' + INE-1 554 1 75.34 CACATGACGACCTTGAGCACTTTAAAGTTTTGCCGGCGAATCGATTGGGAAAACATGCCGTCTCTTGTTTGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCAATTTCTTTATGATTAATGGTGAAGTTCTTTCGAA:1 - chr3L 12873930 5' - I-element 289 1 62.33 ACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATAGCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTTTATTTAGGATTTTTTTATCT:1 + chr3R 24011002 5' + roo 88 2 77.24 ATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 3911859 5' - roo 321 2 77.40 GGAGAATCGTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 - chrX 17495842 5' - Burdock 6366 2 68.49 GCTGTGGTCGTTGCCGCCATCGGAGATCTTACACTGAAACTTGAAAAGCGGATTCTGAATATCAATATAACTTGAATTGTGTTCTTAGTCGGAAAAAATACTTCACTTCAATACTACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCT:1 + chr3R 14731688 5' - gypsy4 426 2 47.95 CATGAACGGAAGAAATAGTTACTTAAGACATTAAGTGATTACACAATATAAATGGGCAAAAAAATTTCGAAATTCGGTTTAAGTATATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 22041018 5' + roo 14 2 74.66 AGATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATCAATTCTATGTTG:1 + chr3R 7041994 5' - Stalker2 327 2 66.21 TTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGA:1 - chr3R 10900884 5' + F-element 96 1 70.55 GTCAATGTAATGACAACTTTTACAAGCTTGAAATCGGCTGCAATTGAAATATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAA:1 + chr2R 17059564 5' + pogo 66 1 65.75 GCTCATAAATAAGAAAGTTTTGCCTTTCAGCTTGCTTCCAGGAATTTAGGTAAATGTTATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:2 + chr3L 13992205 5' + blood 24 2 60.27 CTCGCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATT:1 - chrX 21994029 5' + McClintock 5977 2 67.81 CAATTTATCGAATTTTGTTTAAACGCCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTC:1 - chr4 829120 5' - INE-1 141 1 34.25 CAGGGTCCAAATCCAAAGCTCCATGCCGAGTCGGCATAGTTTACACGAATCACCAGCAAACAAAACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAACCACCAGAAACCGACAAAAAGCGAACAAAAAACAATAATATGCTTCTCATATTACGTTTA:1 + chr3L 8317529 5' + rover 11 2 80.14 CAACCCTCCATGAATGGAACCCAAGGATTGGGTGAGACGGCTCCTGCTCATTCATAACCTGCCAACGAGACATTAGGGTCAATAAGTCCACAGCCCAACTTAAGTAAGTACTC:1 + chr3R 24246680 5' + gypsy3 6507 1 47.79 TTATTGCTGCAAAAGTAACTCTTATAATATGTAATTTTTTAAATTAGAAATCATGACTCATAAGTTCCATATTACATCACACATTTTTTGTGCAAGTGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 21679542 5' + roo 8688 2 68.49 TTTGTTTTTATGTTAAGTCTGTTGCAATATTGCAGTGATATTGAATGCAATCTCTCATTACCTGCCCGTTCAACTCAAACGATTCTGTTAACGACCTCACCGGCTTTTGTATTGCAAGCAAATCAATTAACAGCTACAATGGCCGA:1 + chrX 19716029 5' + Doc4-element 398 1 53.42 ATTTATATGTTATTATATGGTTATGTTATTAGTAAATGGTGTAATATTGCATGGATGTCAATAAAATATAAAATTGAATAGTAAATGGCATTCGAGTTATGCTTAATTTCTCTCATCAGCTAACCCGCACATATATTGCTTATATA:1 - chr2R 16037682 5' - Stalker4 283 4 71.92 GAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 + chr3R 14277894 5' + P-element 75 1 34.25 ACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCAC:1 - chr2L 13328483 5' + BS 78 1 71.92 ATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 13529999 5' + jockey 62 1 56.55 GCTGACTATTAGATGGATATAAAGGTCCAAAATTTTTTTAAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr2L 20550904 5' + 412 10 2 77.40 ATTAGGTCCATATTGTCAACAATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 24010957 5' + roo 44 2 54.11 GCTCTTTCCCATTTTTATCGACTGCCAAATGGCCAACACTTGTCCACTCATCCGCTCTTGGCCACATGGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chrX 13458321 5' + hobo 7 1 68.32 TTTCATAAATGTATTTATGGCACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGTCAGCCGTCGGTCTGACATATATTTAT:1 + chr3R 10433192 5' - 412 7493 2 50.00 AATATTGAGAATACATTCGTGGTTAGCCAGAGGCAAGGAGATTGCTTAAAGACGGGAACATAAAATATTGAAAAGGAAGTTATAATGTAATTATGTCTTGATTATCGTTGTTGGGAGAGTTTCCCGACTACCAGATACCCGTTTCT:1 + chr3R 4956535 5' - INE-1 550 1 66.44 GGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATAAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr3L 21292523 5' + 412 80 2 69.18 CGGCTAGAGTTAGTGGTTGGTGTTGATGATGATCAGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chrX 14189282 5' + 412 13 2 73.38 GTTTAAAAAAAATCGACAGAAATTTATGCCAAATATTCATATACTTTATTACTTTACAGATAGTCCATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCT:1 + chr2L 3175089 5' + Burdock 6188 2 52.05 GTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGTCGATAGGCTGCATCGGGATCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGAGTAAAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGTT:1 + chr3L 11837714 5' - G5A 2712 1 61.72 CTGTGACAAACGTTTCCGAACTCCTGGACAAGTGCGTGTACACCACCGTCGTCACACCGGAGAGAAACCATTTAAGTGCAAGGTGAGGTATAAGAATTGAGCANCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chr2L 19733223 5' + FB 23 1 67.81 CGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3R 12115275 5' + 1360 51 1 62.40 CACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chrX 15405964 5' + opus 7053 4 66.92 AATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAGTCAGTTAGTGTTAATGCGAAATTCATCATTTGCGAAATTTCATAATTTTTCTG:1 + chrX 22519006 5' - INE-1 514 1 63.43 CAACGATTTGTATTTTGTATAAATTTTACAGCCAGCGTTTTCCACTCGCCGTTCGTGTTGTTGTTATCGCCGGGCTATATCCGTCGGTATATATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTA:1 - chr3L 1044958 5' - Idefix 7366 2 58.90 ACTCATCATCTCATCTCATCTCATGTGGCAACAGAGCTTGAGATCTTTAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 5456668 5' - roo 9027 1 55.86 ATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTATGATAGCCATGGCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAG:1 - chrX 21587769 5' + INE-1 136 1 51.72 TTACATGCGCATTTAGTGATTCTCACAGTCGGCAACACTTACACCGACTCGCGAATCTTAAATCAGCACCCATACAGCCACAATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGTGAGGTGATTAGCGCGGTA:1 + chr3R 23440426 5' + rooA 156 2 56.16 AGAAATCAGTCTGTTTTCTAACAAAAGCATTTCCTTGCTTATTTTCAATGCAGTTGCCAGTCATCTATACATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTCACACACACACACACATACATAACCACAT:2 + chrX 17477583 5' + Quasimodo 45 2 55.48 TTAAGTGTAAAAAAATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAGTCAGTTAGTGTTAATGCGAAATTCATCATTTGCGAAATTTCATAATTTTTCT:1 + chrX 22518993 5' - INE-1 515 1 57.53 GTCCGCTACAACCTTATAATATATGATGATCATAATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACACAATGTTTCCCTAAGT:1 + chrX 13367400 5' - HMS-Beagle 162 2 79.45 GAAACATTCAATAAATAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr2R 12379617 5' + pogo 48 1 54.11 CCATCAAGGCAACGGCTCAAAGGTATTCATTTTAATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGTACAAATCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 20260908 5' - roo 9035 1 54.69 GAATCCGGAGAAGTATTTATTCTCAGGGATTGTTAGGTGAATTCAAAACCCTTCTTGTTTTCAGTGTATTTATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAA:2 - chr3L 13449285 5' - Quasimodo 7321 2 54.79 AATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGCTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAC:1 - chr3R 12342185 5' - hobo 2863 1 67.12 GAACCTCCCGCCATCCACCCTGCTTCTCCATACATATTTCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chrX 17495697 5' + Burdock 6190 2 60.96 TACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1 - chr3R 10900891 5' + F-element 89 1 65.75 TCCAAGTTCTGAAGGGGTGGCAGTTTTGTCTGATTGGGGGTGTCTGGCCTTTCGCACACACACACACACACACACACATACACACT:1 - chr3R 17957881 5' + accord 255 2 77.91 GGTATTGAGCACGGACATCCGCGTACGTGCATGGCATTGGCAAACTCAGTTTCTGGACACGTCCAGATGGGCATGTCCACACTATCTCCATTTAAGTTGCTGACCTAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr3L 7102448 5' + I-element 18 1 69.18 GCAGCTCATCGATGGCTGGCTGGCTAGTCACTTAGCGCACCGGGAACACTTTACACTTTAAGCCAAAACATCGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1 + chrX 1758932 5' - Tabor 7276 2 52.05 GAGAAGGGTGAGTAGTGGGGAGTGGGTTGGGCACACATGGAGTTCGAGTTGGAGTTGGAGATGGATGGAGTCGGTAGTCCTGCTCCGGGCAGGGACCATGAAATGTCAATGTTCTTTTTCCCCCACTTTACTTTACTTTATTTCAT:1 + chrX 18775623 5' - TART-A 13105 1 72.60 ATTGTTAGATAGCTTTTCGGCATGTAATTAATCATTTGACAAGGTTCAAGCTTCGCGGTGCGAGACGCAAGGTTTCCCTATCTCCGTTTAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATTTCT:1 + chr2L 527902 5' - 1360 339 1 58.22 GGAATTATAAATGTGAAAGTAGAAAGTTATCGTACTTTCTATTGCATATTTAAGGGGTTTATGGTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTG:1 + chr2L 13244617 5' + jockey 4591 1 62.33 CGCGACGAAAAACTTTCACTGACACCGGCAATTTACCGTCAATTTACAAAATTCGATAAATTTGATGGCGTACGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTTCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTC:1 + chr2L 19290796 5' - F-element 491 1 52.05 GGTCATATGTCAAGCGGTTAACTGGACCGCATAGTGATGGAGTGCAAGAGTTTTTGGGGTGAGCAAAGCCATAACGCACTGCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGTCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3L 5958595 5' - 412 452 2 56.16 AGACAACTGAGCAACAATTTGCTGAACATTTCGTTTGAATACCATTAGTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 + chrX 19583237 5' + roo 73 2 71.92 ATTATTGGTAGACAACATTACGATTACTCAACAGGCCATGCAGGTGTATCCCAAAAGTATGCAGCAAAGTCAAGTTCATGCTGCTTTCTTCATCATTAAATCTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 - chr3R 23416036 5' + jockey 4779 1 69.18 GTGTGGGTGGAGGGTTCTTTTGGCCTCGCNCTCATTTTTTTATTTGTGTTCTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCANATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr2L 17470338 5' + 412 71 2 63.01 TCTTAACGTAATTAAGAATGCTTGGGGCTGGCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATACACCATAATTAAGGAACAGAACCCATAATATCTTGTAAGCTACACATTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGA:1 - chr3R 870140 5' + G5A 2796 1 78.77 GAACTGAATTTTGTATTTGCGTATTTGCACGCTTTTTATGGTAACTCAACGATTTTTATAATTTCTCTTGAAATTCATATACATTTACATTAAGTTTATGAGAACGAATATGGTGTGTGTGATTGTGTGTTTGTGTGTGTTTTTCT:1 + chr4 953316 5' - gypsy3 420 2 73.29 GCACAGGTTACTATACATATTCAAAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 15137374 5' - roo 356 2 52.74 ATAACAAATAAATTCGGATTTCTCTTTTAAATAAATCTTTTGAAGTGTCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 20168167 5' + roo 33 2 63.01 TCCCTGAGATGCGTTTGTGCAACGGTTCTTCGGAACTTCCGTTTTTGGTTTCGATTTTGTCGCCCCTTTGGGGCTTGGATAACATTGTTATCGCCAGTCGCTTTGTCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATA:1 + chrX 18334581 5' + invader4 2788 2 69.86 CCAAGTTAACTCACCTGCAATGGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCTCAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chrX 10284836 5' - pogo 2063 1 70.45 TATAGTTATTACCTTCACTGCTTATACATCCTTTTGCGCCGTTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:1 - chr3R 17766878 5' + HMS-Beagle2 4 2 78.08 AGCCTTGCCGCTATATGCCGCAATTGATTTAAGTTACCAGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr3R 23511692 5' + 297 18 2 73.97 AATAAAATTTTATAATTTATGTACAATTACATTATTCTTTTATACGTAATATAGCTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 - chr3L 3154185 5' - flea 4952 1 65.07 ATTGGGACACAATTTTAATGAATTAAAATTTTTTTTATTTTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGAATAATTAGGAATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGA:1 - chr2L 21895537 5' - Juan 4127 1 73.29 AAAACCGCAGTTTTCCAGAGAAAACTGTGCTGCTGCTGCTGAAGAAGCGTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 - chr2L 13316988 5' + jockey 4685 1 71.64 TTCAAGTGCCGGATCGACCCTTGCAGTTTCCGCCCACAATCGAGAGCGGAATCGAAGTCGAATGCAGGAGGGGCAACTTCAAATATGCATCAATAAACTCAATTAAACGTAAACGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 + chr2L 1451098 5' + mdg1 7045 2 76.55 GACATACGAAATGGGTTTCGTTTCATTTCGATTGTTTTGCGAGCAGTTTGTATTTTTTAGCTGAGCCGGGCTTAAGCCCAGATCGAAACTCAATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 14867199 5' + roo 8692 2 66.44 AAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGGTAGGCCAG:1 - chr3R 13684748 5' + 412 7144 2 76.71 ACGATGACCCGCCAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chr3L 9522021 5' - opus 458 2 52.74 CGAGCATTACCATGGAAATTGGAACAATTCAAATGTTTTAAGTGCAACGCCAAATACCCAATCCTTTGCGCCTCCCCCCCACAAACTTTGCACAAACATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3R 18204485 5' - hobo 2919 1 68.49 TTTTCATGATCACTTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 + chr3L 18010205 5' + diver 5920 2 63.01 GTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1 + chr2R 23596000 5' + blood 7098 2 76.71 ATTTTTAGATTTCAGCAACTTAAAGCAAATGAATTATCTTCCCGACAAGTCATGGATTGATTGATCTCCACCCTGTGGCTCTCTCTGCTTTGGCCAGGCTGCAGCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGATCCGTTAT:1 - chr3R 11257398 5' - invader3 472 1 56.16 TTATAGAAAAGTCAATATTTGGTCAGCTCTTTTATATTTGCCTTGTTGAATTACTAATGTCTCATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3R 15102388 5' + roo 8671 2 76.06 TGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTTGATATG:1 - chrX 2950649 5' - Porto1 294 1 71.92 GACCACCATAACCAGGGTCACATCTCTGTAGGAAGGTATTTGTCAATCGAATCGAATCACTTTTTGCTGAGTTTTCCATTTGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAA:1 - chr3R 30618766 5' + X-element 58 1 48.63 GAGCGGATTTCAAAGCGAGCTTGAAGTGCCGTCGGCAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGCCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 + chr3R 16881874 5' + 3S18 5804 2 56.85 CATTTTGTGGACACCCATGTTCGTCAGCCAATCGCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGATACTCCCACCAC:1 - chr2L 22181202 5' - R1A1-element 4989 1 72.03 GAGCAAAAAGACGAGCGAATGCAATTTGCATGCAAAGGGCATGCGCTCGTCTTTTTTCTCCCTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 22097026 5' - Doc2-element 231 6 40.00 ATTGCATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCACGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 - chrY 2720339 5' + gypsy 15 2 73.97 GACATTGATGGTTCTGAATTTGTTGTGGCATTAAATGTGTCTTGTTCCCGGCTTATGCACGTCAGCTAATTATGGTCTAGATATACATATATGTATGTGTATGCAGGCAAGGCGTAGAGGCCATCTGTCCTCCAAGAGCTCGGC:1 - chr3R 21978582 5' + R1A1-element 464 1 76.39 CTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr3R 12115249 5' + 1360 43 1 51.75 ATTAGCCATGGGTTGCACAAAAGTTGCATTAGATTTTCGGGCAGGGGGGTACTATTTGGCACCACTTCCAATGCTTACCACTCTGATAATAGTATATTCCCCAAAATCTATCGACATCTGATAGTCGGGCAACTCGAATATAGCAT:1 + chrX 17952910 5' + INE-1 569 1 65.75 AAGTGTCGACCATAAAAGACGATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAATAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3L 13888861 5' + 412 26 2 67.81 ACGAGAAAGCAATGCGAATTCCATAATCAAGTTTTTATTGCCTGCTTTTGGGCGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 - chr3R 8381806 5' - Tirant 334 2 63.70 CGGGCGTTTTATTACAAAGTTCTTTGATTAACATGATACCATGCTTTCATTTTAATTTCGGTATCCAGAATTTCAAACACATACATGATTATGTTAATTTATATGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGTGACGAAATCAATT:1 + chrX 6698975 5' - 1360 3184 1 70.34 CGTTGTTGTGGGGGCTTGTGTGCACTGCATCGCCAACTCCCAAAGGGGGCGAGGAAGGAAAACACAACGAGGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAATTTAATCTTTTATGTTCACTTGCTGTAACACC:1 - chr2R 22573394 5' - I-element 451 1 51.37 CGATGCCCCATTTATTTTCCCGCCGACAATTGCTACTGTATGGCATATGATCACTTCATTGTGGATCATTTATGAGCCAGTACCCACGGAAAAACACAGAACACTTTATGAATGACGCTCTCTGCAGAGTGGTGAGTCGATCAGTC:1 - chr2L 12671952 5' - mdg3 136 2 77.40 AAATAACTGAAAATAGCAAACAGTGCAAACAGCAAGCGCATAAGACTCCTGTAAAAATACTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1 + chr2R 652301 5' + copia 4929 2 61.38 AATGTCAGCAACAATAATGTATTTCTTATTAAGTATAATTTTACAATATAACAACTGCGTTTGGAAGTTAAGTTTAAGTTAAAGTTGGCTAAACACATTCAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTG:1 - chr2R 16748893 5' - roo 474 1 65.52 CTAATGTACAGGTGTTATTAAAAGCCTTAAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTGTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTG:1 - chr3R 32065526 5' - 1360 3301 1 75.34 AAAATGAGAAGGGACTCGCTTCGTTTGTCCTTTATAGTTGGCCATACATATATATAAGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 - 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chr2R 10541775 5' - P-element 2857 1 65.07 CTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTGCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 + chr2L 4631166 5' + roo 91 2 78.08 AGATTCAGATATGCCCGCATAATGTTATCAGTCGACCAATTGCTATAAACGGCATAGTCGCCATTTATCATTGGTATGTATTTCAAGAAATCGGATTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3L 16200874 5' + roo 8685 2 70.55 TATATATAATTAAATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAAAACTTTTTATTTGAGAAGAACACCGACCTGTTACAATTAGTTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAA:1 + chrX 6704039 5' - Idefix 420 2 76.71 ATATCTAGCTATGGTACTGCGATACCTTTTTCGATGTAATTGATATAGCAATATATGTATATTCCCTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 + chr3L 1477360 5' + mdg3 56 2 52.74 GAAATACATATACATTAAAACACTTACGATACACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3L 8274058 5' - hobo 2928 1 77.78 ATTCATAGTCAAGAAAGAATGGAAATACATAGCTTAAAGTGAACATTTATCTTTACAACAAACCTTCTAAGTTGTTAGGTTGTTCTTTTTGGGCGTTTATTTTATTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAG:1 - chr3L 5832421 5' - jockey 232 1 66.44 AATAATAAGTGGTCAGTAATAAGATGACGATATCGCGACGAGGGGTGCTATTTTTGTGCGGACACATCATATGTATGTACGTATCAGCGTTGGCGATTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGA:1 + chrX 1623075 5' - F-element 318 1 66.67 ACAAAATATTCAGTATATTTAACCAGCAAGAGGCAAGCAGATACAAGTGACGTCATGGGCCTGGCATTGGCATTGAAACTCTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCAAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAAA:1 - chr2R 8737765 5' + 1360 3206 1 54.11 GAACCTCAACCCATCTCACTTCCGCAACAGTGAAACGTCTTTCGCAATTTCGATTCGATTTTTCAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGC:1 + chrX 19129656 5' - 412 7344 2 58.52 CGCACAGATTTGTCAGTTCATTAAAAATGAAGCGTATGTAAATGTTAATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGA:1 - chr3R 13323929 5' - F-element 4604 1 68.49 AGGAATCAAAAATCTTGATTTTGATTTCAGATACTCCACCCCTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGCATCT:1 + chrX 7508117 5' - roo 8989 2 73.97 ACAGAACATGGGGCGGTTGCTGTTGTTGTGTTGTCGCCTGCCGGCCTATGTATGTATGTATGTATTCATTAATGAGACGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr2R 21475191 5' - P-element 2856 1 58.96 ATATACGAGAATATTGAAAATGTGTGTATTAATATATAAATGTGTACGTGTTAACTACTTACTAACTGAAACTATCTTTAATATAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chr2L 7774902 5' + I-element 14 1 76.03 AACAACGCACCACACACTGAAAATTGCGGACGCGCGAAGCCACTGAAGAAAAACTGACNACTGACGCGACTTTCCGCTGGTGCTCGAAAAAACGAAAGGTTCCCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 + chr2R 10541605 5' + P-element 20 1 71.23 CGTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACT:1 + chr3R 7512858 5' + jockey 4731 1 62.20 GCCGACTCCTCGATGTCCTCCTCAGTCTTAGGTTATATGTACATACAGATGCATACATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 + chrX 7993050 5' + opus 7061 4 67.81 CTTTCCATCTGCGACGATCGTTTTTGAAAAATGTGTTCAATAAACGCGTTACTTGTAGAGTAAACAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr4 407128 5' + jockey 65 1 54.11 GTTCGGCAAGGTTTGTGCGACGTTTTGTGACTGGTATTTGATATTAACCAACTGAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:2 - 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chr2L 13043542 5' + Doc 4699 1 54.79 TAAGTTAGTTTAATTTTATCAGATTAAGGGATAAATAATCTTAATAGGTTATGGATTTTGCAAGTGTAATATATATGAGCCGTGAGCTAAACTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr2R 12379465 5' - pogo 2075 1 63.70 GAACTCTCTGTCATAGTACAGCCAGCTTACACTACTGTACACTTTTTATAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCA:1 - chr3R 97124 5' + Juan 93 1 52.05 TATTTGCGAGGGGAAAATATATATAAGTCCTCGGCATACAACGCTTGCATGTGTCGCATATCCTTTGAAAATTATTATTCCGCGTATGGAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 7032634 5' + roo 8686 2 69.06 GCTCAAGGATGAGGCTTCAATTCATTCGTCCTGGAGTGATAGGGAAAGATTGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr2L 16607208 5' - 412 7477 2 63.01 CCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr2L 15549951 5' + hobo 63 1 61.64 ACTAACTGGACTGGCTGCTCAAACAATCGTCTAAAAACTAATTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 - chr3R 21843827 5' - blood 7308 2 75.34 TTTATTCTGGCAATTTTTTTTGTCGAGCTTATTTCTCTGTGTTCTGCCATTTGCCCAAAATAACAAAGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3L 5398043 5' - roo 9017 2 54.79 AAGTGTTTACGATGTCAGCAAAGGAAGGCGTTTTTACGGCCCAGGTGAGTGCTAGGCTATAAATATTTGAATTTAAGTTGTTCCTAAGCTTACATTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGAT:1 - chrX 15889324 5' - pogo 185 1 65.73 GAGTTCTACAAGGCGTCAAGTGAGTAAATCCCATAATCCACCTGGTAAAGGAGAAGTGCGACTGCGTTCCCAAAAACCCCTCAGCAGCCAAAAGATATATGTATTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGG:1 + chrX 11404178 5' - jockey 4774 1 71.72 CTTTAATTACTTCATAAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 21679686 5' - roo 9017 2 54.11 ATAAGATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr3L 27415344 5' + transib2 32 1 63.70 GGCGACTGACACTGACAGCCACTGACTATATCATCCAGACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAAT:1 - 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P-element 2821 1 40.41 GAGTTAGTCGATGCGGTGGTCAAATAAATCAGAAAAAACCCAAAAGTCACGCGCCATACCATCCACCCTTAACCTTGACTAATAATAGGCCAATATAACCACTACAAAGGCTTAACTTAAAGCGAAAGTTTTGATTTTGG:1 + chr2R 17560124 5' - FB 155 1 65.00 TAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTCCAAGCTACGAATA:1 + chr2L 3133709 5' + Doc 36 1 63.11 CGATGTACATGGATGACCCGACATTGAGCTGATATGTGACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTCTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chrX 140123 5' + blood 7042 2 64.38 CAAACATGAGTCGATGATCGAGGCCTACGACAAGTGGCGCAGCTGGGCCGATCCTAAGGTGAGAAGTGTAGGGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 5574932 5' + blood 49 2 52.05 AAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCGAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCA:1 - chrY 1076855 5' - INE-1 91 1 72.63 AGTTGGCTGCCCAGTCATTAATAACATTTGCTGCTATTAATAGCGAGAGGTGTTTGAAAGTTTTGCACACTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 4631097 5' + roo 22 2 65.75 TCGTGCTGCCTATAAAAGCGACCATCACGAGCCCATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTT:1 - chrX 19008979 5' + Doc 4230 1 68.81 AGCGGAGCATTTTGGCCCTTTTCATGCATCTTTCATACGCTTAGCGTGTTAATTATCCAGAAATTCGGTCTATTAAAGTTTCAGTAGCCGCAGAAGATACGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chrX 13429122 5' - hobo 2924 1 76.03 ATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGTAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGTGCGTGATAT:1 + chr3L 13992263 5' + blood 76 2 72.86 TTAAACAGGGGGAGCGTTAGCTGAAGTACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGGCAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGGGG:1 + chr2L 6047804 5' + P-element 2 2 79.17 AAAATGTCAAAGTTAAAGGATGGAGGGGGTGATGAGGGGATGGTCGTTGAGGGAGTAACTCCGCAAAATGATTATTTTTCATGCTTTCTCATTTCGTTTTACTGCCTCCGTTCGCACACATACACACACATACACACACATAC:1 - chr3R 6415913 5' + accord 193 2 81.82 AAACATAAAAATAGGAATTTCGGGTAACAGTTTATTAGTTTACGTTTTAATATATATTTATGGGACACAGGAAATAACCTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr3R 32065433 5' + 1360 40 1 58.22 GAATGTTAAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3L 12125247 5' - roo 9040 1 63.70 ATATGTATGCGTTCCTTAGCTCTCTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 + chr3R 4197196 5' + P-element 94 1 19.01 CAATTAGTCAAGTCATAAATAAACAAGTATTCCAAGCTGGCGGTTTATATATATAACTATTATGTAAACCCTTCACATTGCTCAAATAAAATGCTGAAAATATCAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr2R 17400442 5' - pogo 2086 1 72.60 CTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATC:1 - chr3R 25962062 5' + I-element 69 1 61.64 AGATGAAAAGCAAGAATTTGACTATCAGGGGCAAGTTTTCTATACGCTTTTAAGAAATCATGGAATATCATAGGATAAACGCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr4 880271 5' - pogo 2062 1 60.27 GTAAATACTATAAGTTTGCGATTATTGCAGCGGATAAAGCAGCTGATAGCGCTGCCAACTTGGCGCAGCGGGCGATCTGGATCAACCGTGTGATCAGTGTTGTGTTGCGACAGTAGAGCGCGAAATTCAAAATTAAACTTAAAATT:1 - chrX 22711661 5' + Rt1b 93 1 69.18 ATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 18173703 5' + blood 37 2 59.59 AATCAATACATTAATTTAGAACTAGATACACATACAATTTGCATAGTTGTATAATTAAGTTGTAAATATATATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTCTTTGGAA:1 - chr2R 6087906 5' - roo 9028 1 55.48 TTTGCAAACACCTTGCCGAAAATGTTTGAGTTTGACAGGAACTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr2L 9599873 5' - roo 9006 2 69.77 CCCAGGAAAAAAAAACTCTTTTAATATCAAATAAAACAACATATTTCTGAAACCCTTTTCCACTCAAATTGAAGGTATGAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGG:1 + chr2R 11171742 5' + Burdock 6263 2 55.48 TTCTAGGCGTAGAGAGCTGGGGTATATCAATCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGACAAGCGCCAAT:1 - chr2R 21531539 5' + HMS-Beagle 6763 1 76.12 GAAAAAGTTCATTGCCTAAACATTTGGTGCCCCCGACGTGATATGTAACATTTCTTTATCGTGACCTCAAAAACAGTTTAATTAATTTCGGGCAAGGGGCTTCCAAGGGCTTCCTTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGGGAGCAG:1 - chr3L 25412871 5' - Gypsy6A_LTR 314 1 59.59 ACACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCGTCAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 + chrX 10547660 5' - P-element 2826 1 41.01 TTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAAT:1 + chr2L 17550615 5' - Transib-N1_DM 439 1 79.45 TGGCTTCCAAACAAATTATTTTCCCAATTTAAACTGGAAAATTTATATACTCCCTTCGTAAGCCCACCAATATTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr3R 18319757 5' + jockey 56 1 52.74 CTGGTTAAGGGAAGCTGACAAACTAAACTACGCTTATGAACAGCCAGTGATAGAGATAATTAAAAAATCGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGC:1 - chr2L 20550454 5' + 412 442 2 53.42 AAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr2L 17136165 5' - hobo 2915 1 52.17 TATTATAGAATATATACTCGTACAAATGGCAGACCGGCTGAATAGAAAGTACCGGGAAAGTACCAGTTGATTTTTTGTATATATTTCTATGATACATTTACCTCGAAAAATAAGGCGCTTGCATTTCTTGATTTTATATAAATAAA:1 - chr2L 10052622 5' - Bari1 1402 1 47.26 CAACTCGGCCCGGCACAAAATATCGAGTTCATTTATCAAATAGTCGTCCTCCGTGCTGTGCGGTGTGTGTCCTGCCATATAATTTAAACAAAACGATAAAAATATAACAAGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGAGTATCAGA:1 - chrX 12815774 5' - INE-1 561 1 51.37 CGTGACTAACAAACCAGACATCGTAAAGCCGTAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTCTAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr3R 21843745 5' + blood 60 2 55.48 AATATTTATTCTTCTAAGCAAACAAAACCCAGTGATTGACTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGA:1 + chr2R 11574958 5' - INE-1 146 1 66.44 TATGCAGCGCAATTTTGAAGCTGACATTTTGTTTGTTCGGTCCTACGAGTATTCGTGCGTGTGTGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCT:1 - chr3R 17505020 5' - F-element 4396 1 56.16 TTTTGCGCATATTCAAGCAGTATTGATCGCGCTTAAACGGAAAGCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACATTTT:1 - chr2L 19698206 5' + roo 8685 2 68.42 AACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCTGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 12115231 5' + 1360 28 1 61.64 CGGTGGCCTCGAACTCATCCAGAAAGCCATCGTCCGCCAGTTGCTCCTCGGGCACTCCCATGTCTGCACGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATG:1 + chr3R 29130228 5' + G3 4508 1 53.42 GGCGTCGCCTTTCTGTGTCCACTTTCTGCGTGAGTGGTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1 - chr3R 10030837 5' + BS 5019 1 76.03 GTTGCCCACCAAAAGTGCATTGACATTGCCACATTGCTAAATTCATTGGCAGCCCATGCCAATTTTAATTCGTATTTTTTGCCTCTGGTTGCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 + chr3R 19996141 5' + Quasimodo 21 2 71.92 TCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3R 9551016 5' - P-element 2875 1 72.50 CGCAGAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 4269024 5' - hobo 2893 1 58.68 AGAAATTGCATAGACAAAGTCAGGGCGCTTTACCGCCGGCGGACCTTGTGCTCTCAGATTAAGACAACTTTATCAACTTAATTTGTATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 + chrX 3596374 5' + copia 4904 2 61.64 TGAAGCTGAACATGAAGCTACTGAACACCTTGGAGAAGGATCAGTTGAAGCCCGAGTTCGTCAAGCTCAATCCACAGCAATTGCTTATATCTAAGTATTCTNACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACC:1 + chr3R 12375834 5' - Stalker 228 4 52.74 CTATCAGCTTAGAAGATGAAAAGCAAGAATTTGACTATCAGGGGCAAGTTTTCTATACGCTTTTAAGAAATCATGGAATATCATAGGATAAACGCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:2 + chr4 880258 5' - pogo 2075 1 69.18 GCTCATTGCCTAAACATTTGGTGACCCCGACGTGATATGTAACATTTCTTTATCGTGACCTCAAAAACAGTTTAATTAATTTCGGGCAAGGGGCTTCCAAGGGCTTCCTTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGGGCGCAGAAGATT:1 - chr3L 24050700 5' - Gypsy6A_LTR 308 1 58.22 AGCGAAAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAC:1 - chr2L 3908502 5' + jockey 4741 1 68.57 CGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 5398157 5' + roo 8720 2 56.85 TATTGAATAAACAACGATAGCCTGCAGCAGTCAAATTAAACTAATTGTGCTTATTGGGCGGCCAAATACGTAAATATCACTCAAAAGCCGTTATAAGGAACAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACG:1 - chr3L 3148338 5' - roo 50 2 69.66 ACATGTGGATTTGAAAACCATCATAAGTAGGGAGAAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 - chrX 10504415 5' - roo 9044 1 68.49 CCGCGCTTCTTCGAAACCACACGTTCCGAATTCCACTTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTTGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCG:1 - chrX 19034873 5' - jockey 4600 1 73.29 AATTTAAGGTATCTGGGAGTCGAATCTGCGGCATGTGAGTACCAAATTTGAAATTCAAATTTATGAAACTGCAGTGGAGGAGCCTTCGAGCAGAACAGTTTCTTCACATCTGAGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr2R 24616988 5' + jockey 4679 1 76.71 TTTTATACAAAATTTTTGATGAATTTATTTATTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 16996155 5' + roo 8724 2 59.59 TGACCAGGAATAAGTGCATTTGATATGTTTTTTTTTAATGCAATTCACTTTCATAGTAAAAAATCCAATATAAATTTCAGCCAAAATACTAATACTTAAAGCCGTGTACATTGTTTGATTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGC:1 + chrX 15252218 5' + opus 113 3 73.29 AAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3R 19446102 5' + 297 6605 2 68.06 AGTTACCAGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 23511661 5' + 297 49 2 56.85 TTGGGTTTACTTAGAGCCACTCAGTGCAGGACTGGGTGAGCTGCGATGCTATTTCTGGCACAGCCAGTGGGGTGAGGCTTAAGCGAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATT:1 - chr3R 29273790 5' - Idefix 6977 2 52.74 CGCTGCGATTGTGCCGATAGCGAAATCTCGTTCTCATTTTCAATTCGGAGGGTGGGCTAAGTTTTCAATGCCCCCCATCTCGGCGATTTTTCACTCCCATTTTCCTTCTGCCTTCTTCTACCAACAAATCAATAA:1 - chr3L 4615818 5' + F-element 344 1 77.78 ATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGCATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTT:1 + chr2L 1729768 5' + Transpac 4986 2 66.42 AAATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2L 15549966 5' + hobo 41 1 55.40 CGCTTTACCGCCGGCGGACCTTGTGCTCTCAGATTAAGACAACTTTATCAACTTAATTTGTATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1 + chrX 3596399 5' + copia 4929 2 60.96 CTGCTTTTTCTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chrX 16996058 5' - roo 341 2 67.81 CGCTTGGTGTGCAGGATCTTCTTCTCGGCCTCCAGTTCAGCGGCTATGTTGGCCTGCAAAATTAAAAGGGATCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTAT:1 - chr3R 29996541 5' - mdg3 5030 1 51.37 ATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 + chr3L 20765143 5' + 297 6643 2 60.27 TACCTAGCTACCAAAAGGTATTTAAATAATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 + chr2L 1729740 5' + Transpac 51 2 51.37 TATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAG:1 + chr3L 19349960 5' - 1360 3299 1 80.82 CATTAAAACACTTACGATACACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr3L 8274046 5' - hobo 2914 1 68.49 AGTCTATGCTATTACATGTTCAGTATATGTCACATACAGCAAATGAATATTGTTAAATTATTTATTTGCTGTATTCTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chrX 407496 5' + I-element 47 1 54.11 GCCGCCGAATGAGTTGCTATTATTTATGGGTTGCTGCCTAGGGTTCAGTTGGATGTCAGTTTTGGGACAGTTATTGTTGGACATGACAATGGTTCATGTTCATATCGGGCATATATTAAAAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCA:1 - chr3R 25543795 5' - I-element 358 1 73.97 CAGGACGGTGTCTCAAAAAAAAAGAAGCAGTATTTTATTGGAGTCTCATCAGCCGTCTGTCCAAAGGATTCGTAGCTGTTTAATTTTAGACTCATTTTAATATAAAGATAATCACGCCGTGGCTCTAGATGTGGCTCCAGGCTCTC:1 - chrX 340856 5' + 1360 71 1 78.08 GGAAATGGCGTATTAAATTAATTTTCAGCTTGTTTGAAGTTTTGACCCGGCCAAGAGTAAGGGAAAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGTAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3R 24444170 5' + hobo 11 1 78.08 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTACTATTGGGCCAACATGGTTACGGAGTTCAAGGGCTTCTCTAATTCATGTGACACTCTATAAAGACCTCAATATTCACACAGTTGAGACACAAATTGGGAGACATACAAGTCGATACA:1 - chrX 14317415 5' + Helena 1234 1 56.85 ATCATCGTAGGGCTAGAAAATAAACTCATAATTGCCTGAACTTTCAGTTTGGGAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTATTT:1 + chr3R 18868210 5' + 3S18 106 2 62.33 CATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATAC:1 - chr2L 22684599 5' + transib3 72 1 57.53 CAAATACTCATTGCCATCCCATTTGCCATCCTCTGCAGCGCACCCGGCGGTGGCCGCCAAGATCACCCACGTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGCATGCATATTTTCT:1 + chr3L 12807055 5' + Bari1 1520 1 51.37 ACCGTTCATAGTTGAATGTTACAACTGTTTACAAGGAGGAGATGGAGCCATTTCCAATCCAAGTGTATACGTTATTGCCCTCTAAGTTATCGTCCTACATTTTATAATTCAACATCATTTCTGGGTAAACAC:1 - chrX 23035959 5' + HMS-Beagle2 6925 2 44.70 GTGTGTAGGGGGCCCCGCCCCCAATTTTCGCAGCCGCTTCTTTTCCATAAATGCCGCAGCGGCAGCAAAGAGCAAAAGCAAGCTGAATACTCTAATAACAATTATTCTAATATAAAGTCATTTTTGATATTTATTTTGT:1 - chrX 7364123 5' - 1360 369 1 53.24 CCAATTACTCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAATGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCNTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAG:1 - chr2L 18689249 5' - Gypsy6A_LTR 251 1 69.86 ACATGGAAAATCGCACGAGCTTGTCAAACGAAATGTGCAGCTTGCAGTTCAAAGGTTGTTGAAAGTGCGATAGCAAAATAAACATTGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chrX 6910032 5' - I-element 5324 1 63.01 CCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTG:1 - chrX 21667960 5' + gypsy2 40 2 61.43 GTGTTGGTGTGGGTGGGAAAACCGTGTATGAGATGGAAAAGTCGGGGAAAGCAAAAATAAATTAAATGAAAACCGTGCGCTCTCACGTTTTTGCAAGAGATTCTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGGACGCC:1 - chr3R 13424666 5' - 412 305 2 73.29 GCAAACAACCCCTAAAGTATGTTTATGGGAGGGATCTTAGTCATATTATTTCATGTAGCTACCTGGAACGGGAATGTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 - chr2L 13244750 5' - jockey 4964 1 54.62 CCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAG:1 + chr3R 5170989 5' + F-element 99 1 80.00 TTCTAGCTCTGTTTGGAATCTGCGCATACAACGTGTCACCTGTCCCGTACATATTTTGATAATTTCTGAGGCTGTGGCCCGCATTTCCTACCAAAAACGAATTTTCCTTACGCAATTCCTCCTCTTTTTATTTTTCCTTTTTTGTT:1 - chr3R 2161022 5' - Doc2-element 234 1 54.79 AGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr3L 19907102 5' + P-element 17 1 61.05 TAATGGCTTACGAAACCACGTTTACGTCCATTTCGTTCTGGTGTTTTCTCACACCATATGCAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATGTAAGAATATTGGTCATTAGAGTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCA:1 - chr2R 4825983 5' + 1360 433 1 58.90 AGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGTTATGACAACCAA:1 + chr3L 9522067 5' - opus 444 2 78.07 GGATCTGGCTGTTGGAGTCGGGATTTCGGATCTCGGGGAAGGGAGGAGGAACAAAAATCTCGGATTAGTTCGAAGTCATATAAATGCAACGCGAAACGTTTAGGTTTAGTGTTTGTTTTGATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGTAT:1 + chr3L 3352318 5' - BS 5103 10 71.72 TAGTTGCTAGATGCAGGCTGCAAGGATGACCGGATTGTTGTATTAAAATATTTAGATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTA:1 - chr3L 6720879 5' - I-element 5289 1 60.27 AAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 29384688 5' - roo 8982 2 88.36 ACTGAAACTATAATGCCATAGCTTTATTACTGGCAATTTCCCTCATTGTCCCACAATCAGGCATTAAGCAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACA:1 + chr3L 14912253 5' + I-element 5025 1 53.42 CGTCCTGTCAGCTGGGGATCTGGAACTTCCACTGGAGATCCACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 + chr2L 19940003 5' - mdg1 372 2 50.68 CGATACAAAGGAATATTTACGACACAGTCGATAAAGAGGCATGCGAGTGATTTCAGATAATAACGACGGCGCAGGAGAAAAAGAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGC:1 + chr3R 8833796 5' + accord 7055 2 60.71 AGATGCGCTGTCGCGGGCACGGCGAGATGCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 6514334 5' + roo 43 2 53.73 GTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 13684778 5' + 412 7092 2 50.00 ACAATTGTTTGCCAATTAATTAGGTCGTGTGCATCACACAATGGTAATTAACCAAGTTCAATCTACCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chrX 5721813 5' + pogo 53 1 54.11 AAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3L 12125254 5' - roo 9033 1 58.90 GCTAGAGATTCATTGGGGTTGCTAGTATTAGGATGTTTGTATTTAACAATCCTTAAAAACAATCTGGCAGACCCAATAAAACTAGCCATTGAAGGTAGTTCAGGGTAATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAAT:1 - chr3L 384008 5' + Tc1-2 1440 1 72.60 TAGACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTAATGTTATTACTTGCAGATGATATGAGAATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAAC:1 - chr2L 16884776 5' - Bari1 1700 1 54.79 CAGTTTGTATTTTTTAGCTGAGCCGGGCTTAAGCCCAGATCGAAACTCAATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 + chrX 14867242 5' + roo 71 2 67.81 CGTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr2L 13316941 5' + jockey 4693 1 51.58 CGTTGGCGTTTAAAATAAAAACACTTTCATTTCTACCTTGTATGCGTACTGTGAACTTTGCTCTTCAAAATCGAAGATAATTATCTACGTGTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGA:1 + chr3R 14401841 5' + Juan 4088 1 62.33 GGTTAATCTGATCCTGTCTCTTGCAGAACTTCTTGTTTTGGGCTTACTCATTATGGGTGCCACACAGCCGCAAAGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2L 8930458 5' - roo 9030 1 55.32 ATACGAAATTAAAAAACACTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAATTGATTTTATTTGG:1 - chrX 15540080 5' - roo 9030 1 54.86 ATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3R 24010998 5' + roo 8746 2 76.92 CTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr2L 3133715 5' + Doc 84 1 77.93 CTTATAGTTATTACCTTCACTGCTTATACATCCTTTTGCGCCGTTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCG:2 - chr3R 17766880 5' + HMS-Beagle2 2 2 79.45 GAAGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1 + chr2L 13697606 5' + F-element 84 1 62.33 AATAAATCTATTAGGCTTAAAATAAATAAATTTGAAATAAAGTGATAGCTGCTGACAAACTTTTACTTATTGCACTTGAGTAAAACAGAGACGCAAGTTACATTTTATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCG:1 + chr3R 15047862 5' + F-element 199 1 76.03 TTCCGCTTTTCCTCCAAATTTTGCCCTTTTTTGTTTGTTCAGTCAGTTTGCCGTATTTGTTTTTGGCAGCTCGAAACTGCTGGATCCTAAATCCAGTATCCTGGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTC:1 - chrX 5123478 5' - Doc 4402 1 73.29 AACTCCGTGTTTCCAGACTAATGAAGATCTTTATCGGCCGCCGATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCG:1 - chr3L 17935014 5' + HMS-Beagle 65 2 65.00 ACATATAATTGACAAAGCAAATAGTTTTTGTTGACAACTGTCTTTTAATATAACACTTAAGAACATGCCTACACACTAATATACACCCTACAATACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATAGTTATATGATC:1 - chr3L 24240881 5' + Idefix 6934 2 65.75 ACCGTCAAATCAGCAGGTTGCGGTCGGTCCGTAAGTGCGAGTGGGAGAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTG:1 - chr2R 16731351 5' - Tirant 327 2 69.18 ATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATG:1 - chr2R 18044016 5' + jockey 4649 1 78.08 ACTTTTGGGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCGAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGC:1 + chr3L 18947257 5' + BS 4733 1 63.70 ACACTTTCCCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:2 - chr3L 9522160 5' + opus 7145 4 58.22 TTTTTGTGAGCCTTAATAAAAATGCGAATAAAACGTGCGGACGTCATAACTTGGCCCACTGATTGATGGCTATGTTTCGTCTGCCGTTTTGCCACTGCGTCATGAGGTATTTGGCGCTCTGAAGTTTACTTCCGTTT:1 - chr3L 4961677 5' - Fw2 342 1 75.18 ACGTGCGAAATAAAACTCAAGACGATATACGGTGTACACTGTACATGTATGGTATGCGCCAAAAGTTATGATTGCCCTGGCTTGCCCATAATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGAT:1 - chr2L 16373576 5' + Quasimodo 7317 2 55.48 AGCATTCCAGGGTGATGTTGAATCCAATGGGAATACCCACCAGCTGATGCGGTATCCAGACCATGGGCGAAACTGAAACGAAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGCTTTCATATTCTG:1 + chr2L 6385763 5' + invader4 2793 2 63.01 CCGTGCTGAAGACTACCGTGCACCACGCCCATCATCCCCATGCCATTTCATATGTGTTCTAGAACCCGAATAAAACTCTTTAAATCATCGGGAAAAGGTCCAAACTTAGGGAAAACCTAAAACTCCTCCTGTACAATGC:1 + chr3R 6685072 5' + G-element 3873 1 60.43 GTTTTATAAATTACATGATAATTATAAACCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2L 18738063 5' - roo 9021 2 53.42 TTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chr3R 6962423 5' + jockey 86 1 69.18 CCTAGATGTATAGGCAGCATCTGAAGCATCTGAAGCAAATCCAGGGCTCTGCCGTTGTATCCGTTATGATGATGATTATGACCCAGCAGCTGCTGTGGGCAACGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCA:1 + chrX 20339182 5' - Tc1 1586 1 70.83 GTACGGGTGTGCAGAAATATATGTTTTTCGACGGATGACGCACGGATAAATGCGTTTTGTAAGAGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCA:1 - chr2R 9274810 5' + Circe 7076 1 59.59 ATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1 - chr3R 18873667 5' + micropia 5092 4 52.74 ATGGGAAATACTCAGTCGATTTTTGACCGTCAAATCAGCAGGTTGCGGTCGGTCCGGAAGTGCGAGTGGGAGAGCGCGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGCTTTTA:1 - chr2R 16731376 5' - Tirant 8459 2 52.05 ATTATAAAGCTCACAAACATGTTGCTCAAAATAAATTATTATGAACACAGTTAAATGCAATAGGCAGCTACACTAAAACAGTATCCAATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3R 14801004 5' - pogo 2072 1 46.58 TTCCACTGATTTTTGGTTGGATATATTTGGTTTCTCATTATCTGTATCACCACAGGGGGTTATGCAACCCCAATTCACTGTTACACTTATATGTAAAGCAATAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGG:1 - chr3L 20005629 5' + accord 303 2 70.55 TAACACATCTACTAATTGAAAATTATGATTATATTAAAGAAAGAAATACAATTTTAAAATAAACACTTGAACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 - chr2L 13675995 5' + flea 47 2 53.42 GAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGGTGAGAGGAAAG:1 + chr3R 14277894 5' + P-element 73 1 34.72 AAGTAATTTGCATTTCAGGCTAATGCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 12941742 5' + hobo 29 1 65.07 TACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 + chr2L 16554605 5' + blood 70 2 65.75 AATTAAAACCATGCAGCTCAATCGAAGTTTTCTTGATAGAAATACTAATTTTACTTTTATTTTGAGGAATAATAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr2R 15472030 5' - 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chr3R 10433315 5' + 412 47 2 54.11 GCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - chrX 14825352 5' - P-element 2820 1 36.69 ATCTGTTTCTTGTTGTTCCTATTTTATAGGTACACATGCGTGTTTTTTTTCCCCTATTTTTTTTTAATTTTTTTTTTGTA:1 + chrX 12723471 5' - G2 3075 1 51.25 TTTTACTTCAAATGGTTGCCATATTGAGCGCGGAGGAGCAACAAGAAGCGGCGAGGGGGTGAAGACGGTGGTGCGCGCCATACACAGTGCGACCGTGACAGTGTTCACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAG:1 - chrX 2283190 5' + Stalker4 467 1 60.96 TATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1 + chr2R 16160752 5' + mdg3 73 2 67.12 TGGTATTACCAATTCCCAAACTGCCAGTAGCTCACCAACTCCGGAACTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTA:1 - chr3R 30518937 5' - I-element 5283 1 67.81 GACACTGGAAAAATTATATTGGTCGTGATTTAAGATCGCAATGAGGTAGGGGTTCACTATTGTGTCCTTAGCACTTAACTGTTCGTTAAATTGTTTCCATTATAAACAATTATAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTC:1 + chr2L 9062232 5' + Juan 4035 1 72.60 GTATTAGCGTTTTTTAAGCTTACCAAATACTGTCATTTAAGATCGCTCTCAATTTTAGTGGGTGGAAAACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTTATAAAGGAAGGAAAAGCATATAAGGACATTCAAAA:1 + chr3L 17472167 5' + HB 418 1 65.07 CACATAACAGTAAAAATGCAAGCAGTGGTGGTGAGTAGGGGTGAAATGAAATGGAAGGATGTTAGATGGATTAATGTTAGGTTTACGCAAATTAATGTAGTGTGTATTTATGTTCAGTACGATAACATTTAGAAGATTTTAATTTT:1 - chrX 13073879 5' + Rt1b 5113 1 77.40 ACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCT:1 + chr2R 17696035 5' + rover 69 2 65.75 AGGATCTGTTCGTATTAAAGAAAAATCATTTTCCGCCTGAACATCACATTGTGAAAAGGGAACCTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 12342094 5' + hobo 6 1 72.45 ATAAACATTTGCCTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGATTTA:1 - chr3R 27398124 5' - roo 350 2 54.11 TTTATACACTGAGTAAAAATGTACTTACTTGAAAAATCACATTGATATGCTAGAAATGGAAAGACATTTAATGTTTCTAAATATTGGGATCAATTTTACTGTACTACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAG:1 - chr2L 7233272 5' - INE-1 562 1 63.19 GGGGATCACAACTTTTACATTTCTTACAGAGAAAAAGAGTGAGTTACCGTTTCACAATGGTAAAAATCTAATGTACATAGTTTGCAAATCGGTGCTGCCGGAGAGGAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAA:1 - chr2L 2282943 5' + HMS-Beagle2 6750 1 57.53 CTTAAACTGAATATTTCCTTTGTTTATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTTATTTGTGGCGAATGTGGCTATGTGGCGAGTATACAGCTGTGTTCATAACACAGCGGGACCTGCGAGTTTAAGATAAAAAATTCCTA:1 + chr3L 17244970 5' - HB 1588 1 56.16 CTCATTTTGTTGTTTAAAAACAATATACTGTTGTAAACAATTTCATCATTGTGAACATCTGTTCAAGCAATGTGACCGCGCTTCTCAATCAATGTTAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 13667736 5' + hobo 24 1 67.12 GAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3R 9550885 5' + P-element 25 1 61.67 CACACACCGTCAGGGAAATTGGAATTGGAATTGAAATTGGTTTTTATTGGTCCCATTTTCGGGGTGATTGCAGCGCACCTTGCCGTCTGAACGTCTGAAAACGTTTATGACCTCCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 4469479 5' - roo 398 1 73.29 ATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAG:1 - chr3R 7042054 5' + Stalker2 7334 2 73.97 CTTTCTATTGCATATTTAAGGGGTTTATGNTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGNCCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCC:1 + chr2L 13244651 5' + jockey 4625 1 60.27 TGTAAGTTTTGATAAAAGTGTTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2L 8930588 5' + roo 8711 2 54.11 TACCGCGAAAAAATAATTGCCTAAAATGTAGCAAAGACTTTTGGAATTAAAAAAAAAATCACTCTTATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTC:1 - chrX 3559722 5' + opus 4 2 78.08 AGAGTTAGTGGTTGGTGTTGATGATGATCAGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chrX 14189277 5' + 412 24 2 66.90 ATAAATATTGTGTTCTTTTTTTTTTTGGGAAGTTTGTTGTGGGGGCATTGTCATTTTACAATCGCATTATTTCACAAATAAGGCGGATTCGTCGTTGCTAGCTTCTGAACTTTTTTTTTTGTTTACCTTTTTTTT:1 + chr2L 18148216 5' - Doc2-element 254 1 73.33 ATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 - chr3R 14277945 5' - P-element 2816 1 25.20 AGCTGAAGAAGTCCTTATCACGCAGCAGAGCCGAGAAGAGTTGCTTAAGGTCCTTCAAGAGAATTCAAAGAATAAGGCCTCTGAAGACTGGGATAACGTGCGTACGATCGTGTAATAAAGCATAAAAAGAAACTCCTAATCTTTCA:1 + chr2R 4131396 5' + gypsy2 258 2 77.40 GAAGTGAAAACGTTTCGCACTCCAATTGCTGGTACAGATCTTCCCATCTCCCTCTTCGCCACTACCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCACTCTTTCTTTACAATACTGTAGACATTACAGTAGATTACAAAAAAACGATAACCAAA:1 + chr3R 22110082 5' - Circe 70 1 66.44 ACGCCGAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3L 15035243 5' + pogo 37 1 61.64 AAAACTAAAGCACAGTTTTAAACGCTGGGCACTTAACATTGTGCATTTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 14332160 5' + jockey 14 1 79.45 TAGTTCCGAAGACTTTCATACCGGTGCTAACTATTTGAATTCTCCCAATAAACTAAACATTTTTATGACCTGAATATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCG:1 - chr3L 20758913 5' - 3S18 6047 2 53.42 TACTTAACTTTACTTAGCTGCTGATTAAAAGGCGATTTGGCTTTCTATACAACATGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 19583320 5' - roo 9041 1 53.64 ATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAACTATATGGAAAGGCTTAATG:1 - chr2R 18044016 5' + jockey 4649 1 76.71 CATAAAAAAGGAAACAAACTGGATGCAAGCAATTACTTCAAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTTCTCATTTGCAGCACCTTTCTAGATTAATTATATCACCGTGTCAGCACAGTTTTATGAAACGCAGATTAACAACCACTAAC:1 - chrX 12130936 5' + Q-element 225 2 71.92 CATTAAGAAAATCCTAATTTTGGTAATAACCAATTCCAAATGTGCATAGATTAGGCCCGACTTAGAGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chrX 7032774 5' - roo 353 2 53.42 CATTTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 14332117 5' + jockey 58 1 52.05 CTTGGACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr3R 20345575 5' + blood 27 2 65.75 ACTGAATACAATTTACCCGTTGTAGGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 + chr3L 13888892 5' + 412 7110 2 55.48 CCGCTTGCTCTTGTGTTTTGTCAATTTTCTGGGTTTTGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2R 19016043 5' + roo 8747 2 75.34 ACCTTCATGAAATCATCGTTTTGGTAACTTCTTATAGGTTCCTCAACCAGGAAGCGTTCCTGTCCAAAGTCTGGCTCAATAACAGGCTTCCACAATATCAAGGGATTGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 9599746 5' + roo 8677 2 77.40 GCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCA:1 + chr3L 20934171 5' + Max-element 8296 2 73.33 GCCTATCAGATACCCAGTAAAAGTATCTGAATGAAAAATTTAACAATTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr2R 17649231 5' + Doc 80 1 67.12 TCAATAAATAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 - chr2R 12379610 5' + pogo 55 1 58.90 ATTGGCCAATTCATGCGCTTTAATTACTTCATAAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTAT:1 - chr3R 21679703 5' - roo 9034 1 59.59 CCCTTGTAATTCTCCACATGTGGAGGATAAGAAAAATGTAACAACAAAAACGGAAATATGGGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1 + chr3R 4530682 5' - copia 195 2 56.85 AATGCTATAAAAAAAGTCGAAACATTTTCTTTCATTTGTTGCGTTTTAAATTTTCATGCGCAGCGAGTGTCGGCAATTACCAAGGCCTAAACTATATATACGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 7848337 5' + flea 16 2 74.66 AGTTTGATTTGTAGAGCGCTATTTTTGCGACCCCAACTGTTTGTGCAGTCTTATGCACTTGGCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr3R 22260438 5' + jockey 4710 1 50.41 AATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 13888896 5' + 412 7083 2 55.65 TAATAACAACCATTATTACGCTTGGCTGCATCTGCTCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATCTACT:1 - chrX 17564308 5' + I-element 484 1 73.97 GATCCCGACTTTTGGACAATTGGCCAATTCATGCGCTTTAATTACTTCATAAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 21679721 5' - roo 9052 2 71.92 GCGTAGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr3R 30537626 5' + roo 8739 2 69.18 TTTGCGCGGTTCGTTATGCGCATTTTTAAGGATTTACCCAGGAATATTCCACTTACACCCATTCCCGTGGCCCTCTTTTCTCCAGTTATATGATGATGATATGACTGTTATCTTACGCTTTCGATTTATTTATTTATTTTATGTGA:1 - chr2L 592766 5' - Doc3-element 78 1 76.03 TTAGTCGCATACATAACACTTTGCTGACCCAATTCAAGAGTCGAGAGTGTGCTTGGGCTCTGAACCTTTTAAAGAGCTATTACATGTTGCAGCCAAAAGATTAAACGGGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr2L 8895371 5' - 412 7531 2 75.34 TGGCTCTAGCCAAATCTACGGGATACCCTGAATATTATAAAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr2L 11725084 5' + F-element 28 1 69.18 GGGTGGGTGGTAAGAGTTGGGTGATGTCGAGAAAACCTCGATGACTTGGCAGGACCCATTACGGCCAGTGTCCGTTTCCTGCTCTTTGCCATGGGATTAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATG:1 + chr3L 20252864 5' - pogo 21 1 74.66 CAAAAACAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:2 + chr2R 22596059 5' + Doc 39 1 54.11 TTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCAT:1 + chr3L 8754759 5' + mdg3 5309 2 64.38 ATATGTAAGAACACAAACAGCAACTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr3R 28045826 5' + Tirant 68 2 82.91 CATGCGCAGCGAGTGTCGGCAATTACCAAGGCCTAAACTATATATACGTATGTATGNAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGC:1 - chrX 7848283 5' + flea 4795 2 62.28 ATGAGAATGAGTAATGCTCCAGTGTTTCGAATTGCCCGAAGATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2L 3632185 5' - P-element 2848 1 31.71 AGTGAGTAAAATTTTTGTCTTATTATCATAGAAATTCAGCAGTCCCACTATAGACACAACAAAATGTATGGCATAGAAACTGATTTTACAATTGCTTGTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - 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chr2R 4192037 5' + 1360 3281 1 56.85 AGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chrX 14189248 5' + 412 7107 2 52.05 CGCACAATGCAAAATTTATTACGTTTGGCGAGGGAAAACCGAAGGATAGCAAAGTGGAAACTCAGAGAGAGAAAGAGAGATGCCCTAGAATTGGAAAAGAAATCCAGCTATGCTACTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 + chr2L 5789563 5' + FB 1 1 80.71 AACCGGAAATACGGACTACAAGGAGGGACGCTACAGCTTAAAAGGCTACAATTGCAGGGATACAAAACACACACAATAAACGGCAACAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGG:1 - chr3R 26599505 5' + hobo 159 1 61.87 GTGGGGTAGAACTTGTTTTCGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 - chr2R 7622987 5' - P-element 2840 1 52.74 ATTTCCAAGGATATGATGTGTGCATATGTATGTGAGTACGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGGC:1 + chrX 3235532 5' + 412 177 2 71.92 ACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGTATTTGTGGTCTCTGTTCACACAGGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 5495204 5' + roo 8743 2 71.23 TTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGT:1 - 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412 7515 2 55.97 AGCTCGCCATTATATCATTTGTGGAAAACTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCATTTGGGTGCAGCCGTCA:1 - chr2L 16554712 5' - blood 7344 2 50.00 CACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 + chr3R 10433212 5' - 412 7473 2 67.81 AACTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTTATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chrX 10284918 5' + pogo 47 1 54.11 CAGGCCAAAACACATCAACCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3R 17494898 5' + hobo 41 1 53.60 ATAAGTTAAAGTTCAAGCTCGACAAACCCCCAGCAGACCCGAAAACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1 - chr3R 11903528 5' + FB 76 1 68.49 GCAGTTGACATCTGCATTTGTNCGGAGTTTTAACACCTCAAAACTTGTTCACACTTTTCAACGATACTATTTTCGTTTACCATTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chrX 21183946 5' - S-element 1677 1 58.22 TTCCTCAACCAGGAAGCGTTCCTGTCCAAAGTCTGGCTCAATAACAGGCTTCCACAATATCAAGGGATTGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 9599784 5' + roo 50 2 52.41 ATTAGTTCGGGCTAGCAGACAAACGGACTGGGTGTAAGGACATTTATATTGATTAGTACTTGGTAACAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chrX 10056660 5' + hobo 54 1 52.74 TATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCCGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACG:1 - chr4 829123 5' - INE-1 144 1 63.01 GAAGGATTAAGATGCGCTGTCGCGGGCACGGCGAGATGCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2R 6514343 5' + roo 46 2 52.74 CATATTTGGACTATCTTATCGAGTGTTGTTTATGGATTAATTGCACCCAAAAAATCATTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCCAGACTAAGGGGAGAGTT:1 + chrX 14601512 5' - Doc2-element 4303 1 60.96 AGGAGGAGGCCGATCGGCGGCGATATATATATATTGTAAAATTCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 30788334 5' - 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1360 324 1 66.44 GTAATCCCTATAAATGTTTGAAAACGCATTTGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCA:1 + chr2R 18372605 5' + jockey 4743 1 65.07 ATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2L 8553298 5' + pogo 51 1 55.48 ATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2L 4631209 5' - roo 321 2 77.40 GTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAAT:1 - chr3L 22435191 5' - opus 421 2 73.29 TCTTAGTTGGTAAAAGTGTTTTTTTTTCTGTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr2R 22761161 5' + 412 7115 2 58.90 TCATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACGCTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr2L 18173705 5' + blood 7046 2 59.59 TATGAATATTTTTCGTGCGTAAATGAATGTACAAACATATATGTATGTAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCT:1 + chrX 19690530 5' - gypsy 412 2 50.00 ATAATCTTGGATGACACGATGGCCTCTGGAGATGAATTCTTCACTGCCCCCGGGAGTCTGTAATCTGCGGGAGATTTATTAGATTGCGTATACGGAACCCTTTTTGCAACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGG:1 - chr2R 23638694 5' - S-element 1244 1 66.44 GAATCGATATTCTGGTGGTGTTTTGCATGAACCAACCTCAGTTCGTTTTTTACATCACTCTTTTCATGCTCGGCTGGGATTTGAAGGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:2 + chr2R 23790218 5' - roo 9038 1 62.33 CGAAGAGAAAAAATTCTGATAAGTACTCAAAATGTCAACAAGCACAATGCTTAAAAGTTGAGAATAATTTATTATCTGTATATCTAAAAAAAAAAATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr3R 19628876 5' + Transpac 18 2 72.60 AGTGCACTTGTAACGTAGCTTGATGGTTTCCAGCTTGTTGGATTTGAACTCAACTGAACTTTTACGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 - chr2L 17470434 5' - 412 438 2 54.79 GGATGATACAAAAAAGCATCGTTCCTCTGATGAATTGCTGCTGGTCCTCCGTATTTGCCTAAAAAATGTCCGCGCTTTTCAGTTTGCCTTTTTTTTTTGATACTTTTTTATTTACTTTACTTTTTTATTTACATTCTTGAGTAAAA:1 + chr2L 1674726 5' + HB 172 1 69.18 ACAATAACAGAGACTGACGTAAATAAAGCCTCAAAATAATACAAATTATTCGAGGAATGGCTAGAGAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chrX 17583275 5' + FB 54 1 56.16 GTTGGGTATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTGTCCTCGAACAACCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 23773152 5' - 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chrX 19690624 5' + gypsy 54 2 58.70 GACAGTTAGATAAGTTGCGAATTGTAAATGCAATAAACATTTCTCAGTTTTTAATTCATTTGGTCAGTGTAAGGGAAATTATCCGATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTA:1 - chr2L 5350054 5' - Burdock 263 1 60.96 CTAATCACTTTTTGATTTATTCGCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr3R 5170951 5' + F-element 61 1 53.79 CGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAG:1 - chrX 15406029 5' - opus 7417 2 76.03 AATTTGTTGGCCCATAAAAGTGCAGCGTCGTCTCTCAAAATGGGTAACAAAAATTATTCATAGCGCAGTTGCCATTTTCCCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr3L 18119422 5' + 1360 39 1 56.85 CTGCAGACAGTCTTTAAAAATTATGTTTATGATAATTATTATGGCATATATATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 + chrX 6186244 5' - Transpac 297 2 40.41 ACACGTTGAGTGTAATTTTCCAATGACGANAAGCATTAGTTTTCCTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 15494669 5' + pogo 2021 1 92.98 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTG:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 381 2 68.49 TTTGAAACAAAATTTAAATAATAATCGTTTATTATGTATAATAAATATAATTGTTATAAAAATCAAGAAAATTATGTGATATTTAAGATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - chr2R 17385661 5' + copia 4904 2 59.59 AATCTCGCAGAGTGCATTGATAATTTAGCTTGATGTACATAAGTGTTTTAGCTCTTGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr2L 17353098 5' + 297 58 2 64.38 CAGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 23511655 5' + 297 6 2 73.20 TTTAAATGAATTTTATTAAAACGCAGCAATAACAGCTTATAGATTGTCTTTTATTAAATTCAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGAC:1 - chrX 14771802 5' + jockey 4730 1 58.22 TACTGAGGCAAATGAATGAATCACATCCGAGGCATCCGCACAGCCTCAGTAACAATATGTTGACATAACATGGAGTAAGGCTGAA:1 - chr2L 1432511 5' + flea 4757 1 74.12 TAATGCCAAATTCTAACAAATAACAATCAAAACCAAACTTAATAAATTTCGAACGAAATTTTTGCGTATAACGTATTTACTGCTCTTGATAATTAAGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGCCCGTCACTAAAA:1 + chr2R 13811265 5' + 1360 3324 1 63.01 TAATGAAGTATATAATGCCCAAATAAATGTTTCCGAAATGTCAAATCTTTTGAGATTTTACACTTTTATCAATTTATTTTATTATTTCTTCCAATTTCTATCTCGTTCGCATTCCTACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chr2R 18139954 5' + INE-1 550 1 58.90 ACTCTGTCAAGTGTCGACCATAAAAGACGATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATACAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3L 13888853 5' + 412 18 2 73.29 TCGAAACTGGAAAAGCTCAGACACGATTTCAAAAACCATTCGTCACTATTTTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - 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Tc1-2 342 1 76.71 CTGTTATTTTTCGCGCACAATTACCGATGATTTTCAAAAGCAACCACAGGAGTATTGGAGCGGAGTTCATTCAAAGATATGCAATAGAGGTGCCAGCGTGAGAACTTACCCAATCCTTATTTTAAGAAACAAACGAAGTATATCGA:1 + chr3L 4724917 5' + Doc 4458 1 71.23 AAGATTTTACATGCCTAGCCCACTGAAGATATAAGCTCATAAATATTACAATTAACCAGATCGCAAAACGCCGCATATTCTTTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGATCTTATCAGCGGAATCAACGTAAGCAT:1 - chr2L 21723119 5' + 3S18 5856 2 58.65 TCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3L 20168214 5' + roo 80 2 71.92 GACGGCAATCTTAAGTTGACACACTTATGTAAGTTGTGGCCTGTAATACTTGGTTATCATTACTTACCATTTCCATTGCATCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 - chr2L 102952 5' + opus 57 4 54.79 ACGCCAGTCCAAGTTTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chr2R 22774614 5' + I-element 58 1 55.48 CGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - 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roo 339 2 73.97 CGGGATACAGCAACGAAAGGGACAAGGGCAAAAACCGGAAACCGAGAGACCGAAAAGAGAATATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCC:1 + chr2L 21249035 5' - Stalker4 7151 4 57.93 TTTTATTTACGCTCATTTGTTCACATTCGAATGGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGGTTTGTTTTTCCTGTTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTTTTACTATATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAG:1 - chrX 11906365 5' + INE-1 28 1 43.15 CAATGTGTGTAAGTAGCGGCTGTGAAGCGTGTATTTGGTGAAATATGGGGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr2R 15472187 5' + 412 21 2 73.97 GTCAATGTTCAGATGTTTGAAATAGACAAATTGAATTCCTTGAAAAGACTCTCCCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 - chr3R 10062260 5' + copia 38 2 58.22 CAGGCCACCGCCCCCACAGCTCGCCATTATATCATTTGTGGAAAACTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 - chr2L 16554729 5' - blood 347 2 60.96 CGCTGCGATTGTGCCGATAGCGAAATCTCGTTCTCATTTTCAATTCGGAGGGTGGGCTAAGTTTTCAATGCCCCCCATCTCGGCGATTTTTCACTCCCATTTTCCTGCTGCCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCCC:1 - chr3L 4615818 5' + F-element 355 1 73.29 AGTTATCGTACTTTCTATTGCATATTTAAGGGGTTTATGGTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAG:1 + chr2L 13244641 5' + jockey 4615 1 54.11 GCTAGAGACGGAAAATTGTTTAAAATATTTCTTAATAATATATCTTTTTTGTGTAAACTTAAGTACTTACATTGGTGCAAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 + chr2L 7724103 5' + I-element 19 1 65.04 ACAAATATTCTACTGCTTTTTGTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATTTTCGGT:1 + chrX 16996046 5' - roo 353 2 58.22 CGCAAATTACATCGATTGCTCCTCCGGCTGGCCTGCAATCGCATTCGCATTTGTCGATAACGAATGACAAAAAAAAATGCCAACACGACAAGCTGTCTCGTTTTGTGTGTATGTACATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3R 14688637 5' + FB 1 1 72.54 TTTAAGCTACCAAATTTTAAACAACTCTGTATTACGCCCGTTAAAGTTGCTGCAAATAACGAGAAGTCATCTGAAATTGTTATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 - chr3L 9659544 5' - mdg1 7420 2 56.85 CAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATC:1 - chrX 21933336 5' + springer 5 4 74.40 AATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3L 20765136 5' + 297 6636 2 55.48 CCTTTAGGAGCTCTAAAAGCATTTTTACTATGAAGCCTGCCCAAAACAAAATCGCCTGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTTCGTAAGCCAAGGCACTGTCCAGAGCTCGCTCACCAAGAAGACTCCACAGAAGACATCCGAAGGA:1 + chr3L 24051181 5' + BS3 1560 1 58.90 CTGAATGCAAATTTTAACTAGAAACCTAAATAGTATTCTGAACTGCTTTTACAAAGTAATTTTAGACTTCTCTAAATATCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr2R 17385520 5' - copia 246 1 54.79 CTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr3L 9522148 5' + opus 34 4 52.52 AAAAACCAAAAATTTAGAGGTGACAGCAAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2R 10695913 5' - roo 9049 2 68.49 CAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTGACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3L 20573784 5' - pogo 2041 1 68.00 CTGCTGATGCTCTTTAGCATCCTTTTCCTGTCACACGACAACTCTCTCTTTTCTTATGCTCTCTGAAGTGTGTATGCGTTTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAACGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAACAA:1 + chr3R 4608990 5' - invader3 5281 2 69.18 CTGCAGAAATGCTGCACTCACAGACAATGCAATCCATACCCACTCTGCACCAGCCGCTACACTCCAAGGTATCGAACTATTACGTTAATTAGGCGCTCTCTCGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACG:1 - chr2L 12048848 5' - Quasimodo 7115 2 54.79 CTAATGTGGAAATGGCATAATACGCAGATGTTAGTGGCTTGATGGTCAGTTAAGACAATACTATACTTATGGAGATAGCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATG:1 - chr3R 30514602 5' + I-element 5038 1 56.85 CCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chr3R 17494916 5' + hobo 62 1 68.75 CCTCAATGAAACAAATAAAACAAGATACAGTAAGATAAACAAGTGGAAATTACACACAAAGAAATGTTGGTATTGAATCAATAGATTCAACAAAACTGTTGCAACATGAGGGGACAACGAACTAGCGGCTCAGC:1 + chrX 7338550 5' - gypsy5 7066 2 70.90 GCCCACTGGCTGCCTACGGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr3R 15047416 5' + F-element 59 1 54.74 AAAGATTCAGTGTTAGTGTGTACTCGTGCATTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCAGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAA:1 + chr2R 16160713 5' + mdg3 34 2 60.27 AATTGCCATGCATGATTTAATTATTTGTAGCATACTTTTGTGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCGAAATCCAACTACAACCG:1 + chr3L 18947224 5' + BS 4700 1 56.85 GGGGTGCAGTTAAATTGAAACCGCGACAAAACTGCTTTCTCATAGTATTTCTCAAAAATATTTGTGAACGGCATTTTGACAGTCGTTTACTTGTACGAATTTCTGATTATAAATTTAAGAGCGGCAGTGAGTCAAGATTACAGATA:1 - chr3L 15871173 5' - Cr1a 4228 1 76.71 CATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCC:1 - chr3R 934284 5' - Rt1b 4742 1 56.94 GGGGGAGGGGCGGGGTACCAGTTCCGGGGTGACCAGCACCAACAATTTTTGGTTCGAAAAATGCAGCGAATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:2 + chr3L 15273196 5' + pogo 49 1 55.48 ATTCGCCTAGGCTTGTTAGGTGCTGCTTTTGCTTTTGCCGCTGCTTGGACTTTGGCAACCGCACGCCCAAATCGTTGTCTGCCTAGCTTTGTTATAAGCAGAAGGATAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAACATACCTCTCGCGTGT:1 + chr3R 27745839 5' - Tc1-2 121 1 61.64 CATGCTTCTGCCCTGCGGAATCTCGGTCTTCTCCGGAGTGGAGTTCGTCTGCTGTCCCAAGCACTTCAAAAGTGAGTACTGACTACATAAACATATTTTAAAATATATTTTAATCCTAGACTGTGCTTGCTGTACTTTGTCGATGT:1 + chrX 571282 5' - Doc3-element 4364 1 77.40 AGTGAGGAGGGGTTGTGGGGGGGTACTTTTGGGGGTCTTTGGAGACCAAGTTTATGCTATTGTCATATGATTTTTCCAAGAATCTCGTAGTTCAGAAAGTTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGG:1 - chr3L 18010371 5' - diver 201 2 66.44 AAAGCGGCAATAAATTGTACATCTGCGGATTGATTTTTTTCAGCTGGCAATTGCGACACTTGAGCACTTTGAGTTCCTGCGACAAGCAATTTCTATGTATTCAGAACTAATTGTAAGCGTGCCTTTTGCTCTTATCTGCTCATTCT:1 - chr2L 18064906 5' + looper1 71 1 58.22 GTTTATTTTTGTTCCGCTTGCTCTTGTGTTTTGTCAATTTTCTGGGTTTTGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr2R 19016056 5' + roo 8734 2 66.44 AGGGGGGGTTTTGAAATAAACTCGTACAAACATATAGTACATCCTGCATACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chrX 6445007 5' - hobo 2902 1 55.75 GTAATTTAAAGAGAAAAAGAAATTACATTTTATAGACTGTAGTGTGCACAATTGTCATATAAACATTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 - chr2L 5818969 5' - I-element 5300 1 55.48 ATTCAAAATGCCATAAACGTAAATGGGAACTCATTTTAACTGTGATACAAGACACGGTGGCCGCGAACTTTGCAAAGCTGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAG:1 + chr3R 12118104 5' - gypsy12 10153 2 53.42 TATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATT:1 - chr2R 22971840 5' + jockey 4851 1 81.51 ATCAGCCGAAAGGAATTCCCCATTGACTATGCCGGTGTCAACAAAGTGGCGGAAAAGAATTAGGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGT:1 + chr3R 6602956 5' - gypsy 403 2 56.16 GCGAGTGTCATGAAAATTCAATATTTGCGAGGGGAAAATATATATAAGTCCTCGGCATACAACGCTTGCATGAGTCGCATATCCTTTGAAAATTATTATTACGCGTATGGAAACACCTGATCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chrX 7032613 5' + roo 8671 2 78.62 CCATCTTATATGACCCGTCGGAGAACTTAGAATCCGAGAATCTCCAAGAGCCTTCGTCGGATACGGAATCCTCCAGAGGTAAAGGGCTTCCTTGTTGGCTGGTCCGGGGATTCCGGGGAGCAGAAGATTAACTTTCCTCTTTTAAC:1 + chr2R 7448084 5' - Gypsy6A_LTR 273 1 55.48 GCATCAATCAAAGTTTTCAACATTTTGCCCGTGAAATGAATCTTGACTTTTGGTCAGGGAATTCATCCCTTAGATATGAGATTTGATGCATGAGCCTATCAATAAATTGAACAAATATCCACAAGGAGCTTGGAATGCCATGGGTA:1 - chr2L 16387038 5' + G-element 4041 1 71.23 TTTTTGTTGCTCTTTGCTCGGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 16995473 5' - roo 9019 2 52.05 ACAATGTACACTTTATTTACTAAATTTTATATGGCTATAAAGCATCAGAAAATGAGGTTTCTTTAGGTTTTGCAATATAACAACAAGTCACATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTTTTTTTGTCAT:1 - chr3L 6754592 5' - 1360 497 1 61.94 AGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr3R 10433277 5' + 412 7138 2 80.14 AAAGTGCTCGTCATATTGAAGTTTATAAGCATTTAAATGCATATTTGTAAAGTGCTCGTCATATTGAAGTTTATAAGTCAATTAGATGTTGATCGATTACGATAGTGAATATAAATTGGAAAATATTTTATATTTCATCATAGAAT:1 - chrX 8325669 5' + gypsy3 6774 2 72.60 ACTATTTCAAAGTGAACACGATTCACTGACTATAACTTAAGTAAACTAAATTACGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCAGATC:1 + chr3L 2529232 5' + I-element 5027 1 60.27 CCATATATAAGCAGATCCATGAAGCAAGAAATAGAGCCGCTCAAGGATGAGGCTTCAATTCATTCGTCCTGGAGTGATAGGGAAAGATTGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 + chr2L 16607170 5' - 412 7546 2 75.65 AGCGACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 + chr2R 23595984 5' + blood 7081 2 65.52 TTGGTTAGCTTTATTTTAATGGAATTTGATTGATTTGCATACTATAACTCGTACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 8208284 5' + roo 35 2 64.38 CTGGACACGTCCAGATGGGCATGTCCACACTATCTCCATTTAAGTTGCTGACCTAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCT:1 - chr3L 7102396 5' + I-element 70 1 61.64 CCTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr3R 12622158 5' - 1360 3346 1 56.16 CGAAGGATAGCAAAGTGGAAACTCAGAGAGAGAAAGAGAGATGCCCTAGAATTGGAAAAGAAATCCAGCTATGCTACTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:1 + chr2L 5789602 5' + FB 46 1 53.42 TGGTCCGCCGCATTTCCTCGATGGCGCTCAGCGAAAAGCCGGCCACCTTGAGCTCCTGCTCCTCGTCTTCCCTTGCACATTTTTCGCACGAGAACAGAACGTGCTCTGGGGCTTCGCTCCGTCCACTTCCGCACCATGAGCAAACA:1 - chr3R 31618649 5' - Rt1c 5067 1 54.79 CATTCGTTTACTCAATCATTTGTATAGATTACAGTTTCACCCAATGATTTATGCTTGATCACCCAAGAATGAAAAATTCCCATGCCGCGATCCTCAAGCCTTGCCACCCTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 21655113 5' - roo 397 1 77.40 GTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATG:1 + chr3R 7512859 5' + jockey 4751 1 67.81 AAAATTTCAAAGAAATGCCTAATTAAATAAAGTATCTTTCAAAAGTAAGTTTTAGTAATCAAGCTAACGAAATGGCTTTAAATTGTATGCAACATTTTGGAACTGCACATGGTCGCGTAAGTATGTTAAATATCTGGTTTATAGAA:1 - chrX 18670336 5' - I-element 5033 1 78.77 CGTTGACTAGTCTTGGCAATGAATTTCCTAACTTTAAAACAACTCTGTACATACATACATATGTAGATGTGTATGGTGTATCCTTGTCCGGCAGAAGGAAGCGTCTTAGACCATATACAGTATATACATACATGTATATTCTTGAT:1 + chr4 58843 5' + INE-1 73 1 61.64 CGCAGCTATGAGATTTATGCTTTCAAAGTTCATAAGTTAAGTAGGCTCATTAAAATGGCATTTTCATTGATTCGAAACCCCTTTGAAACAAACATCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCATCATCTTAAATCATTG:1 - chr3R 9609735 5' + Cr1a 4137 1 66.20 TCATACTAATAAAACTTTTATTTCAAAATCATTACGACGAAGTCGGTTTCGGCTGGATAGCCGGGTTAAGTCTCTCGCAAGCCTGTTCGGTTGGGCACGGAATTTGTTGCGATATTTTTACATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTG:1 + chr3L 22169673 5' - Fw2 3700 1 70.34 ACTGATAGACATTTTACACTCCATAGGTAGCACTTCCGCGCCCAGAAGATCAAACGCAATATGTGTTTTTAATTAACTTTTTAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chrX 4469646 5' + roo 24 2 66.17 TGTTACCGTTCATAGTTGAATGTTACAACTGTTTACAAGGAGGAGATGGAGCCATTTCAAATCCAAGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAA:1 - chrX 23035963 5' + HMS-Beagle2 6935 2 53.42 GCGGTAATTTGCTTAGCGTAATTTGCATTTCGCAAATGAATAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 3520610 5' + BS 5094 1 65.45 TTTGATTCACTGAAGCTACGGGTATTGGGCAAGTCGATGAAAACGTTCGGGGATTTGTAAATTATGTCATTAATCCCACATCTTTCGTTTGCCCTGCTCTGCTCTCTGAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 - chr3R 28829216 5' + FB 16 1 73.29 AAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGTCAGTAGACAA:1 + chr3R 5518329 5' + Transpac 86 2 76.71 CACAATGTCCTATGTTTATCGATGCACAGAGGCCCAACCTTAAGGTCCTGCTTACTTTGCTCTCACTCGGCTTTGTTGTGCGGTGATTGGCCTTTTCGGTTGTAAACATTAAGATCCGCTGCCTAATCCGTAATTCCCACCAAAGG:1 + chr3R 4397653 5' + Quasimodo 6929 2 69.18 GTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAAT:1 - 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roo 8954 2 76.42 CTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATATACCCACAAG:1 + chr2R 18035133 5' - R1A1-element 5266 1 74.02 CCATATGCATTTCAAATGAAATGTTTAAAGGCAAATGAACTGAGCCCACCAATAAGGCTCAACAAACTTGAGCTGCGTCTAGATCTCTAGAATCAGTACGCTTAATCTCATCCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGT:1 - chr4 413568 5' - INE-1 143 1 60.27 CGCCGGCGACAGAGTGCACATAACAAACAGCCAGCCCAGTTGAATGGATGTGGCTGCCAGCATCTCGTGCAATGCACTTCGGGAATGGGAGTAAGCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATAT:1 + chr3R 18060541 5' - 1360 219 1 63.70 GAAGAGTATCCAGTGATTCCGCGTCGCTCTTGTTCAACAATAAATCTAATTAACAGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chr2R 8086958 5' + 1360 61 1 58.90 AAGGATTAAGATGCGCTGTCGCGGGCACGGCGAGATGCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2R 6514342 5' + roo 47 2 52.05 TATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGCAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 - 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hopper 1373 2 57.53 ACGAGCATTGATGCATTTTAATTCGGCACTTCTGCTGTTTTAATGAATAAATACGAGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAGGACAACCAACA:1 + chrX 3559585 5' - opus 7445 2 65.75 GCGCCATCCGTCGTCCGTCCGGTGAACCAAGTGACCTCTTCATTACCTCACGGCGATAATCTTGGCGGGGCTGTTTTATGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCTCAACTTGGGACTCTCAACCTTCTAGCTTTT:1 - chrX 15693527 5' - INE-1 165 1 67.14 AAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGATT:1 + chr2R 977520 5' + F-element 50 1 51.91 CTGCACTACGAGAAATAAGGTTATATTTTTAATTTATATATTATAAGGTCTTACAATAAGTTATATTAATGTGTACCGCGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTA:1 + chr2L 6104819 5' + Ivk 45 1 54.11 ATTTCAGGCACGTTGCAGGTACATAACAACTACAATGGAGGCAGTTTTTGATGTTCGACTGGCTGTTGTTGTTCTGCCTTTTCCTTTTTATTTTTTTGCT:1 - chr2R 9955950 5' - Doc2-element 227 1 85.00 AGCCTTGGAGCAAAGTGCAAGATTATCGTAAGCAGCTCTAAATGCCTGTTGGTTTAATCGCTCGCAATAGTTAAGTTGCCAAATCACACAACCACCACTGTTCTAAATCACCCTTCTTGCTTTTATAGATCATGATCAAGAATATA:1 - 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gypsy12 10147 2 49.32 TCTGCTTTATGGCATAATCAAATCAAATCAATTTCGTGTAATTATCTAGGGTTGCATTTTTCATGTCGTATAAATATTGGACCGGAATTATGATTAGGGTGAGCCTTTTTTTTATGTCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 21654907 5' + roo 4 2 81.51 ACATGGCTACCCATCAATCGAAATCGATCGAGCTTGCATGCATAAACATGCAAAACGAAACCAAAATAAAATTAACGAGAACAACAATTCTTGATTTGTTGGCAGAAGAAGGCTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATG:1 + chr3L 11119730 5' - F-element 308 1 60.00 AGGGGTTTAACTTTAATTGCCCAAAAAGCAACTATATGGCCTTATTAAGCTGTTTGGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3R 25962119 5' + I-element 10 1 76.39 TCCCACCAGGACTACGGGCAAAGCATACTCGGATGAACTTGGCTGTATTATACCAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACACCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATAGT:1 - chr3L 24152371 5' + hopper2 1275 1 62.07 AATGTTAACAGTTTTCATTTATGGCTATTGGTTTTAGGAAGCCATTATCGCTGGCTTGGAAAATTCACACTGAAATATGTAGAATATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 3453081 5' + roo 35 2 54.79 ACTTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGANTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTA:1 + chr3L 18010216 5' + diver 5930 2 57.24 AAAATAACCTAATATATGTCACTTTAAAGTATAGGGAATATATCAATTATCCCCTGTTAGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAAC:1 - chr3R 4530773 5' + copia 71 2 65.07 CACATCCCTAGCCGGTCAGCTGGTCAGTATGACCGTGTTGTGTAACTATATTCCCTACGATTTTGATCGGAATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr3R 10708341 5' - Transpac 5189 2 53.68 TATATAATTTTGGCAAGCGGAGAGTGAAAGTTTCTCGAATGAATACTTTTTCCCAAAACGGCAGCTCTGACTTGGAGTAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 11644849 5' + Osvaldo 1521 1 78.95 GTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGCGAGGAAAG:1 + chr3R 16349212 5' + P-element 73 1 35.17 AGGGCTGCGCCTGAATTCAAATTTTTGGCCAGCCGTCCTGTCAGCTGGGGATCTGGAACTTCCACTGGAGTTCCACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr2L 19939970 5' - mdg1 406 2 72.41 CGTTGTTATCCAACGTGATGTGATTCATTGGATTATCTGAGGCATACGAGGTAGCTTAAAACCCTTTTGTCACC:1 - chr3L 20698390 5' - BS3 1733 1 60.81 AAAGAACAAAGTGCGGTAGAGAGCTACAGTTTCAAATAATTGAAATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAANGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTT:1 - 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Q-element 549 2 58.22 TTTGGTGTAGGGTATATACACAATTGTATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chr3R 13676193 5' - P-element 2830 1 49.32 GATATTTTGAAGATTAGTCTGAATCAGGACGAGATCGTGAACAGTTTCAAATTAAAGAGAACCAATTAAAAAAAGTCCTAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGAGAC:1 + chr2R 1845007 5' + Doc3-element 95 2 56.85 TCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr3R 19446109 5' + 297 33 2 62.33 CAGAAATATATTTTCCAAAAACCGAACTCAAGCGTTAAATTGAACGTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCCGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 - chr2L 20551044 5' - 412 420 2 67.12 ATACATGAAAACCTTCAATCATATTCAAGGAAAATCCGCAAGTATTTGCTTCTCAAGTCGTTGATTAACTAAAATTAATCAAAAGCTTTACTTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGGCA:1 - chr3L 4210856 5' + Rt1b 4963 1 57.93 AAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGCCTTATGTATGAGCGTTA:1 - 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chr2L 8251951 5' - springer 7391 4 73.40 GTTTTGGCAGAAGATGCTTACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTCTGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chrX 20024488 5' + 412 19 2 64.62 ACGAGATAAGAAAACTACTCATTCTTGAGATATATCTACCTCTTTGAAACTGAGACAAGCAATTTGCACTGGTATACTGATACTGAAATAAAGTTTAAAATAAAACTTTCTGCACCCTTATTCCTTGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 + chr3R 19246624 5' + jockey 4668 1 81.51 AATTCTAAGTATTTCTCTAGGATTTCACCTCGAAACCAAGTTCATTTTCCTCTCTTTGAAGTGCATTTAACTGACATCCTGAAAGGGGAAAACGGTTCGGTGAGTAAGCATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 11443856 5' + hopper 148 105 50.76 ATTTTTTTTTGTTTTAGTTTTAAAATTTTTTTTTTCCTTTTTTTTATAAA:1 + chr3L 27359766 5' - HMS-Beagle2 480 2 66.00 ATACTAATATGTACATAAATGCTTAAATGGTTAGTTTCTACTTCTTTGGTGTTTGTGATTGTACAATAGTTTGGATCTATGCATTTCTCCAAGTGTAGCACAGCTGCGTCTCCGTCGCACTCTCTTTCTCTTTCGCTCTC:1 - chrX 19106973 5' + Cr1a 297 1 66.43 GAAATTAAAAAACACTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATAATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 15540076 5' - roo 360 2 52.05 GAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3L 19222675 5' - 412 7470 2 65.52 GTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 - chrX 13367454 5' + HMS-Beagle 6851 2 70.43 TATTTATATGGTATTATTTTCTCATCAGTTACCCTTTTGGTACTAAATCTCTCAAAAACTCTAACTCTTTCGAATGTTTAGATTCATTAGTAATTTAGTAAAAACCAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACA:1 - chr3L 9170215 5' + HMS-Beagle 6609 1 55.48 GACTTTCTCAAATTGTTTAAATGAAGGCAAAAATTATTTGTGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATAGTCGGGTACCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACG:1 + chrX 22806259 5' - INE-1 529 1 53.79 CATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3R 19446117 5' + 297 6604 2 64.84 GTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATAC:1 - chrX 21667968 5' + gypsy2 6526 2 64.38 CAAGTCAGCTAATCAACGTATGTTGTTACNTCACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATNTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr3R 27398046 5' + roo 8751 2 75.34 CTGTGCTCATATGTTTGCTTGGCTCCTTCCCAAGGCTGAGACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1 + chr2R 13695592 5' - blood 348 2 65.07 AATTTAAAAACGAATTAAAATTGTGTATATCAATGTACATTTGTAGTTTCCGTGTTCCTTACATTTTCCATTTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAACAAGAAACGCTATAGTCGAGTTTACCGACTATCACATACCCGTTAC:2 + chr3R 17733195 5' - INE-1 551 1 37.67 TGAACTTGAGTGGTAACACTCGCACAGTGGGTAAAAATGCTATTGAAAATTGAAGTCCAAACAGGCTTATAATATAAGGATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chrX 1208811 5' + Burdock 41 2 57.53 ATGATAATGTAACATTATTTGAGTGCGTTCCCTTTTCAGCAATTATCGCATTGCACAATAATTTCTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTG:1 + chr2R 8261576 5' + jockey 4907 1 60.27 ACCAATTAAGATACAACATGTATTACGAATAAAGACTTAACTTAACTGGCATGCAGAAAATGCAATGTTATCATGCCGAAGACTTTATCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTAT:1 + chr3R 30455251 5' - Quasimodo 77 2 60.27 TCTATGATATAGTCATAGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCG:2 - chr3L 21202129 5' + G2 2613 1 64.38 GCTTTTTGGGTTTTCGGGTTTTCTGCCGCTGGTGTCTGAATGTGGCCAGAGTATTTCGAAATAAATCATAAAGAGTGAAATACATAAGTAAGCCCAAACATCCAGACATCCCGACATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr2R 16367509 5' + hopper 6 2 78.77 TGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:2 - chr2L 11725030 5' + F-element 82 1 73.29 GACGGTTATCACCAATTATACACCAAATGCCTGCCAAAATGGTAAGTTCGACTTGGAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 15137233 5' + roo 8693 2 63.01 GTCAAATACTACAGCACCCTCAACTGGAAAATATGTTTCTCGTTTTGCATTAGCAGCAGGAGAACCTCAAATCAGCTTTAGCATTCCACCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 8631585 5' - roo 394 1 71.88 CGTTCTTAATGTACACAGCGTNTTTAGAATTGAATTATACGATTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1 - chr2L 21777864 5' + pogo 73 1 69.86 ACTGACAACTGGAACGACGAACACTCAACAGCCAAATACGTCAATGGGCTCCCAGTCTCAGATTAAGAATCTGCTATATCTATACAACTCCGAACCCAGAANCGATAAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGG:1 - chr2L 6954900 5' + F-element 4340 1 72.60 GAGATTTATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr3R 27007432 5' - roo 337 2 62.33 GCCGAGTCGATATAGCCATGTCAGTCCGTCTGTCTTTCCGTCCGTTTCCGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGAGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTGATAAGA:1 - chrX 188412 5' + Tc1-2 156 1 65.07 ATCGAGAACTAAAAACATATTTCGACAAGATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACAGCCATACATTGGTT:1 - chr3L 23181682 5' - 1360 3365 1 75.38 AAGATGAGCCACCCCCAAAAGTTGGCTAACTAAATCACGTAATGAGTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:2 - chr3R 19246807 5' - jockey 4963 1 58.90 ATTAATTCACTAAGCAAGTGAGCTGCACACAGCTCGAGTTTGGGAATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 - chr3R 19446272 5' - 297 366 2 66.44 GTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCAATACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATCTCTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATT:1 - chrX 22906792 5' - Transib-N1_DM 35 1 67.81 GCTTAATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr3R 7420423 5' + 412 7108 2 56.16 CTAGACGCCGGAATGTCCCACATAAGGATACAAAAGCACACATACATATTTGGCCACATTTGTTCTTCAATTTATCCACACAAGTGTCCGAGAAAAGTTCTTAAAGCGAAATTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCG:1 + chrX 16218125 5' + R2-element 3320 1 76.03 AGAAAACAAGCGGCAACAGAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAA:1 + chr3L 17934913 5' - HMS-Beagle 194 2 54.79 AGAAATAGAAATTAACATGACAAATAATTTAACAAAAATCAACCATCTGTTGAGGTGGCGTGCCAACATTTGAAAACAAACTTGAGTTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTA:1 + chr2L 21874800 5' - INE-1 164 1 62.59 GATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGCCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAG:1 + chr3R 12115298 5' + 1360 94 1 81.12 AATATTAAAAACAATTTCTGAAACCTTAGCAAAAACACAGTTTGAACATATCTAGTTAACAAGGTTAGGTTAACAAATGATTCAAAATGATTAAGAAAATAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAG:1 - chrX 689856 5' + Quasimodo 414 2 67.81 AGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr3R 23511654 5' + 297 6636 2 61.38 ATGCATTTATTCATTAATGCCGTGGCAAACAAACAAAGAAAGTCCCAACGAATTATAAACACATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAAC:1 + chr2R 18035050 5' - R1A1-element 5330 1 78.77 ACAAAATCCTTTCATCTACCTTTTCAATATTTTAAATATGGCTTTGGGCTAATAAAGTAATAAACAAATCGCAAATTACGTTTTCCTCTTAACGGTGTTGAAAACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAAC:1 - chr4 1063965 5' + S-element 1698 1 70.55 AGCATGCCGTAAAGTAATTTGCATTTCAGGCTAATGCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3R 12941731 5' + hobo 18 1 72.60 GATGGGGCGTTTCGCGTTGCGTATACGCAGTGTGTGTGCGCGTGCACAATGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGT:1 + chr3R 23415862 5' - jockey 4976 1 73.43 GTATGCGTACTGTGAACTTTGCTCTTCAAAATCGAAGATAATTATCTACGTGTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAA:1 + chr3R 14401880 5' + Juan 4127 1 64.38 TGGAAACTCTAGGAGAGCTCAGGAAAATGAGGAAATTCCTCATCCAATTTCAAATAGACAGAGCTCTTCTACAACCTCCTTTCGAACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 30537740 5' - roo 9036 1 47.95 GAACGCACTAAAAAACCAAAGCTAATAGCCATGAGCAACTTGGCTTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:2 + chr3R 24443958 5' - hobo 2933 1 80.82 ACGAAAGTAAGCAAAAGAAATGGCTTCAATTAATTGAGTTGAGGAAAATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCT:2 - chr2L 16553602 5' + BS 5069 1 69.86 GTGGAAGGATTGCATTGAATCCCCGTTTGACCTCCGCACAGGTTACTATACATATTCAAAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 15137409 5' - roo 391 2 71.23 AGTAGGGTATTGTGTAAGTGGGGTGTGAACCGCGTCCTCTGCCATCATTTACAGGTCATTCATCACAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3R 10751756 5' - hopper 1387 1 67.81 ATTTAATTGCTGTAACCAGCATTATACACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr3L 19222595 5' + 412 7118 2 60.96 TTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chrX 20024510 5' + 412 56 2 57.24 GCGTCCTCTGCCATCATTTACAGGTCATTCATCACAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAA:1 - chr3R 10751725 5' - hopper 1356 1 53.42 AGCTCTTTGCCTTTGTGGGTTTTTTTTTTGGTTAGCAGTGAATGAAGGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chrX 8363665 5' + jockey 27 1 69.86 GATGTGAGTGAAAACTGATTTCCATGGCAGATGATTTCATTCTTAAATTTTATCGTTTTAAATAAGTACTCCAAAATAGCCGACTGGAAGAACTGTTTGTTCCAAGATATCTTTGGATTGAACCAATATTTTGTGGACTGTCGCTG:1 + chr3L 22183218 5' + hopper2 368 1 53.42 AAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATT:1 - chr4 637808 5' - roo 8749 2 52.05 ATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chrX 7042704 5' - roo 325 2 73.97 ATCGAATCAAAACAAAATCGGCTTGCAACAACAACAAAAACATTGCAGAGTGTGGGTGGCGCGTGTAGCGATCAAAATTGCGTGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 13684650 5' - 412 7513 2 62.33 AATTCATCTGAACATGAATCAGTGATAACCCAACAAATTGATTTCAACAGATTAAATATCATTCCATTTCGCAATACAAAAATTTTTTTAGGCAAATCGAGGGNAAGACTAATAAAATTATAAAAAAAAAAATATTAAAACATTTT:1 + chr3R 24113152 5' + transib4 106 1 49.32 AAAAACGCCGAAAAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATACTTAGCTGCATCGGCACGATATCTG:1 - 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mariner2 789 4 55.48 GACAGCGCTGGTATCGGCAGGCTCAGTTTGTCAATCGCTGGCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGGTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chr3L 13889019 5' - 412 493 2 73.83 GAAAAGATCTAGAAAATAAATTGCTTGATTTACACAGAATGCTTTTTATTTTAGTATAATCGTTGAAAATAAATTAATATTAAATTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3L 22041192 5' - roo 9037 1 62.33 ACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3L 19222678 5' - 412 7472 2 63.70 AATAGTTTTATAAAGCTACAAGTTCTGTGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 20044655 5' + roo 8709 2 50.68 CTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAGACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATGATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr2L 8930549 5' + roo 8750 2 76.03 ATCCTAAGTAATATAGGTAAAAGGGTTTTTTTCCTTCCTTATACTAATGTACAGGTGTTATTAAAAGCCTTAAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 32065569 5' - 1360 3344 1 54.79 AAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGTTGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGGGAAAGGAATAGTAT:1 - chr3R 9550987 5' - P-element 2820 1 38.36 TGGTATACATATCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3R 9551027 5' - P-element 2861 1 67.59 GTTTTATGAGCCATAAATATGNATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 16072900 5' + opus 157 4 52.74 AAATGTAAAATTCAAACAATTTTAAACTAATTACCCTTACCTTATACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2L 1232632 5' - roo 334 2 73.29 ATAAATATATTTTACGTATTATAATTATTTTGGAACAACGGTAAATAGCGGTATTTGCGGCATAAATTATAATCATACGTTTGTCTGTCGCGATCTCGGGAACTGTTTTAGATAATATATATATATATTCTTCATCAGGATCAATA:1 - chrX 20344462 5' + INE-1 84 1 82.19 ACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chrX 20024507 5' + 412 54 2 55.48 TTATGTTTCGGGCACTATTTGTTAAAAACCACCTTAATTTTAAGGACATAGCACGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chrX 11415832 5' - mdg1 7430 2 65.07 ATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1 + chr2L 8553316 5' + pogo 69 1 67.81 AATATCCATACGGTTCATGATCTTCGAGGTGCAAGGCTATGCCATCCTGGCTACGGTCTGGGCAATCACTGGACGGAGGTCCTGGCTAATGTAATTGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTC:1 + chr2R 16227870 5' - Tirant 8036 1 68.99 ATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATA:2 - chrX 17495795 5' - Burdock 184 2 67.12 CGCATAAATTATAGATGAACGAATGGAGCTGTGGGGTGGCGGTTGGCATCTGGAAATTTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTAC:1 - chr2R 17609899 5' + mdg3 5266 1 77.40 ATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:2 + chrX 10694254 5' + Transpac 43 2 56.16 TTTTGCACACCACGCACTACACAAAAAAAAACCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 - chr2R 5599049 5' + opus 173 4 63.70 AAAATTATATCTTTCTCAAAAGCTCTGCAAATAATTAGTAATCAGATTAATATTTGTTGGCTACGAAAATAATCCTCAATGACTACCCTGCGTGGTACTATCGTTAATACGCATCCATTAATTATAGTAAAATGTGGAATATAAAT:1 + chrX 21229960 5' + transib2 262 1 57.53 CACAATCAAATGTGATAAATATAACGGAATATTGTAGCATAATTTTGGGGGCAAGCTAAGCCGACAGAAATAACACTTGAGCAAATATTAGATCAGCCTTAGCGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTT:1 - chr3R 12787427 5' + BS 5013 1 71.23 GGTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTG:1 - chr3R 10030802 5' + BS 5054 1 52.05 CTAATAATAACAATAAATTTCGTGCATGAAACCATTCAGTGAAATGGGGAAAAACCCGAGGAAAAACCGCTGGCTTAATGACCGAACTTTGCAAAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAA:1 - chrX 2980635 5' + Doc3-element 4522 1 64.38 GAGCTTGCCACTCCTGCTACGCTTTAATTCATTTTCGGCCCAACGTTCAATGGTAGTACCATCGAATTGATTGCAGTCGCGTGTGCGCACAGAGTGTTTCGTCACTAAGACCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATT:1 + chr3R 24614870 5' - Circe 7186 1 72.60 CTCTGCCTTTCCGCCTGCTGTAGGCTACATGAGCCTTGTGTGACATCAGTGATGGGAAAGGTATTTACTTTGCATTAAGTTTGTGTACAAGATGTAATGTACCTAGGATCTAAGGATAACGAGGAGTCTACAGACCCTGGATCGCC:1 + chr3R 21089633 5' + invader5 4016 2 78.77 CAATGCTCGGCTCAAAGCTAACTAATCTTCTGACATTTTTGGGACAGCATGCACAATACGAGTATCAAATGCATAAACAATTATTTGGGACCACAGGAATGAAACCTCGCCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGACTCACGACCAGCT:1 + chr2L 18342915 5' + BS3 144 1 68.49 GGAACTTCCACTGGAGTTCCACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 + chr2L 19940024 5' - mdg1 351 2 65.07 CGACTGGTGTTCCGATGATGTTATTAATGGGTGAAGGGCATGGAAAATTCCTACATGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATCCGCGACTCC:1 - chr2R 4787997 5' + Quasimodo 7043 2 58.09 ATGAGGCAACGGGTGGAGCTGGACTGGGAATGGGAGCTCATAGCAGAAGGAATGTCTCTCAGAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGCCAAA:1 + chrX 7948577 5' + R1A1-element 335 1 50.77 GCAGAGGCTCCCCATTTGCAGGGCGCTTGGCAAGTGTCGTCTGGAGTGTGGATGTTCACTTACCCATTATCGCTTAATGCAAATCAAAGACTAATCTTCAATTTGCACTGTGTAAATAATTTTGACGCGTAAAAATTGTGTATAAA:1 + chr2L 19015992 5' + Bari2 960 2 52.74 GTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAG:3 + chr2R 22761191 5' + 412 91 2 78.77 AATATCGGAATAATAATAATGATATGCAGGGCCATCCGGCAAGGGCGAAATGAAACAAAAACATGTCATTAAACGCCCCAAAAACATCATTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGTTACTGTCTAAAATCCAAGATTACAAAA:1 + chrX 6472938 5' + HeT-A 5880 1 61.64 GGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr3L 5398136 5' + roo 77 2 71.23 CAGAACAAGCTGGGCAAGCGTCATGCACCCATCACTTTTGGGGAGAAAGCCGCTGCTAACGGCAAGGATAAGGATCAGGAGCCAGAGAAGAAATCGCGGCCATCCATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTC:1 - chr2L 17475824 5' - invader1 4000 2 76.26 GCTAAAGTCGTCTCTCGGGTTCGGTTTTCCTTTCCATTTTTTTTTTTGCTTTTTT:1 - chr2L 8622361 5' + hopper 141 1 74.55 ATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 8381687 5' + Tirant 29 2 62.41 ATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 - chrX 7993142 5' - opus 424 2 70.55 AACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAAGAAAATCCCGTTAGCTTTTCATGTTATCCTTTTTTATTTACATTCTTGCGCAAAT:1 + chr4 123993 5' + HB 172 1 75.34 CCACCGATATATCGATAGGTACATACTTTCACATCCCTAGCCGGTCAGCTGGTCAGTATGACCGTGTTGTGTAACTATATTCCCTACGATTTTGATCGGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTGCCGAGCAGAGACCG:1 - chr3R 10708370 5' - Transpac 5209 2 70.34 CGAGCAACAGCCAAGGTAACCTAAGCCTTCGGATTAAATTTATTGCTCCTAGCTCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 15917558 5' + roo 8687 2 69.18 AGGAACGTGAATAATTAATGATGTGCATACCCATGCTGCTCTACTTCTCAAATGTTTCGTTTTTAATTAAAAACATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAG:1 + chr2R 18108923 5' + mdg1 232 2 50.00 GGCGCAGACAAATTGTTTTGCGTATCTCACAGATACAGAGCAGCCGAGGCGCACAAAAGATACTACACAAAAAAACACACCACACACACACACACACACACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAAT:1 + chr2R 16637406 5' + Quasimodo 74 2 65.07 TAACAAACTCTGATTAGTTCTGGGAAAAAAAATATCAAAGTAGGAATGCCGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr2L 17136096 5' + hobo 67 1 63.12 GAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATATTCGCGGGAAACTAAAATCAACAGCATTTCTTTGGCCATACCCGCTTGACTGGACTGGGCAGGTGTAGTATGTGCCTACGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chrX 21639380 5' + 412 7079 2 66.90 GCTAAATCGAGAACTAAAAACATATTTCGACAAGATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTATG:1 - chr3L 23181687 5' - 1360 3355 1 73.10 GATGTAAACACTTGTAATGTGAAAACACTGGCTATCTGTTGCGGCGCTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 + chr2L 5341461 5' - Burdock 6366 2 69.86 AAAGCAAATTTACATTTAGTGCTGCATATTTAAGGGGGCTCCTCGGTCGTCCTTTGTATCGCATCGTATCGTATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 - chr3R 24074852 5' + jockey 4808 1 54.11 GAAAGCATGTTTTAGTCGACTATCAGATACTGGATACTGAAAGTACTCTAAACTTTNTAGCTTATATATGTGGCGCCCACACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTC:1 + chr3L 17860603 5' + Chimpo 46 1 71.85 CAATTTGGGGATGAAAGCGTAAGCTTATCAGTGCAAATTCTCAATTTTCAACATATACCATTCTTGGCGTTAGCACTACTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGTAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTCAAA:2 - chr2L 13593006 5' + HB 417 1 49.32 ACGGTCATATGTCAAGCGGTTAACTGGACCGCATAGTGATGGAGTGCAAGAGTTTTTGGGGTGAGCAAAGCCATAACGCACTGCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3L 5958593 5' - 412 454 2 57.53 AGTGTTTTTGCACCAACTCCACACATGGATGTCCTTTAGCAACAACAACGATAAATCGACACCCAACTAACAACAACAAGTGGTGAACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:3 + chrX 7626085 5' - Transpac 279 2 64.38 ATATTACAAAAGTAGCTAAAGTGGCCACTTAATTGAAGGGGAGCTGCTAGAAGGTACTTTTCAATCAGATTTAGATTTCTATCTCACAAATACATTATCTCTTTAGGTAGCTGACGAACAGTTCTTATTATTCTTATTCTTATTAT:1 - chr3R 30338569 5' - mdg1 7067 2 69.86 AGTTGTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1 - chr2R 19726932 5' - 1360 3322 1 63.70 TGAACTACGAACTGACACAGACGAAGAACTTGCTCGACACTGTGATCCTGGCAAAGACAAGGAAAACTAGATCGATAAATCTTATTAGGTATTTCATATTCCATCCTGGAATTTATGGTCTCTGGAGTGTTCCGGAGCCATACCGG:1 + chr3L 26386249 5' + Circe 389 1 58.22 GGCATTTTATTGAGGAGTAATTTATGACTCATAAAGAGAATATTCTTAAATGTAAAATTCAAACAATTTTAAACTAATTACCCTTACCTTATACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 1232585 5' - roo 9045 1 67.81 GATAAAAGAATTGTCAGCTAGAATTAAATCAAAATAAAATAGTACAATAATGGCTATTGAAAATGGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAACAAGAGAGAATGCTATCCCGACTATCAGATACCCTTTACCCAGC:1 - chrX 14770809 5' - INE-1 546 1 91.10 GCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATATTGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAAT:1 - chr3L 10814578 5' + micropia 5039 2 73.97 CTAATCGAGGTTAAATATACGTTTAAATATTTTGAAAGAATCTACATTTCTTCGAGTTTTATTGAATTTTTATCTTCTGGTGTTGATAATAGAGGGACCGAGGAATCAATCGCTCTGTGCAAAATATCACTCATCGTATTGATCCG:1 - chrX 22562584 5' - transib2 2352 1 54.11 CAGTGTAAGTTTTAGCAAGATTCCCTTTACTTCGCTTTTAGAGTTCGATTGAAAAAAAAACAATCATATATATATATTAGTTTACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chr3R 4197868 5' + 1360 39 1 57.53 GAGCGAGAAGAAGGTAACGATCGCTGGGAAACTTTTGACTGTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGATGTCTATATTCTGGAAGGATCAACCATTTTGAAACCGCGCTTAAAGCCAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGC:1 + chr3R 17777453 5' + jockey 4643 1 74.66 CGCGAAGAAGCGATACACAGATCGTGATTAACGTTTTATTAAAATAACCTAAAATTTGTTGACCTGATTATGTACGACAAAAATAAAATCTTACAAGTAAACAGTTGTCAACAAAAAATATTAAAATTTTCTTATACATATTTACT:1 - chr3R 31976598 5' + TART-B 10184 1 75.34 ATCAACCCCACAATACGTCCAATAAACATTTGCCTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3R 27398145 5' - roo 9035 1 60.27 GTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCNCNCGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACG:1 - 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chr2L 7931626 5' - blood 432 1 51.72 GTCTTCAACAGGCTTTGCACCAAAGTGATGAGTTCCGCAATCTGTAGAGTATTTCCAAGGCGAATTCTCAAAACTTTTTGGGACAATAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chr3L 16697298 5' + FB 34 1 63.01 TGCCTAAACATTTGGTGACCCCGACGTGATATGTAACATTTCTTTATCGTGACCTCAAGAACAGTTTAATTAATTTCGGGCAAGGGGCTTCCAAGGGCTTCCTTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGGGAGCAGAAGATTGTTATT:1 - chr3L 24050694 5' - Gypsy6A_LTR 302 1 52.74 AAGTAACAAAATGCAGGCTAAAATAGTACCTTCAAGGCCTCGCGGCAAGCTTAAAAAGTTTCATAGGAAATATCTTATTAACGTACGCATATTTATGTATATACATACATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAA:1 - chr2R 17696179 5' - rover 336 2 78.77 CATTACGTCTACCTATCAAAAATTGTAAAAATCAAAATATATACTTTAAGAATTTCTCGTAGTGTTTGTTTTTCCACCCACACAGATGCTACAACACACAAAAATAGGTGTACATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 17568206 5' - accord 7032 2 65.38 AAATCACTCTTATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCA:1 - chrX 3559664 5' + opus 169 4 59.44 ATATAATTTTATGAATTGGTAATGATCGGAAAAAGCGTTTAAAAGCGTCCATACTGAATATGGCAAATAAAAACACTAAGTATATTTTAAAATACAGTTTTGCTATATCTTTTTTAACATAAGGGATTCCTAAGCCTTTATGGATA:1 - 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chr3L 739294 5' + P-element 19 1 71.23 TTTTTTTTCGTTGTACTCAAAAACAAATATTTCGTATTCGCTTATAAAGTAGATATTACTGGCGCAATTGGAAAATGAGAGCGAATAATTTATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGAGC:1 + chr2L 7096090 5' - 1360 278 1 58.90 CATTGGTAACCGCCCCCTGTGGTGCGTTGAATCAACAAGTCCCTAACTTATTATTTAACTCAGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2L 13468176 5' + roo 8672 2 76.71 TAGTCAGAAGATCCTTGGCATTGAACTCGTTGACCTTGTTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAA:1 + chr2L 3912266 5' - roo 413 1 73.29 GGCAAGCTTAAAAAGTTTCATAGGAAATATCTTATTAACGTACGCATATTTATGTATATACATACATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTC:1 - chr2R 17696136 5' - rover 293 2 60.96 GTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 13684785 5' + 412 7107 2 52.74 GACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACANTNTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGC:1 + chrX 21948982 5' - 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roo 341 2 66.44 ATTACATTTAAAATTCCATATTTCGCAGCATGTCATTAAACCTTATGGACTTTTTTGTTAGAGTTATCTAAGCCTTAGTACATTTTTTAAAACATCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chr3L 14233175 5' + copia 28 2 66.44 AACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACCTAGTCTCCG:1 - chr3L 8249493 5' + HMS-Beagle 6829 2 61.43 ATCTAGTCCGCCAAACTTTACGCAGCCCATCAAGGCAACGGCTCAAAGGTATTCATTTTAATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGTACAAATCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 20260934 5' - roo 9043 1 65.75 ACTATTTGTTAAAAACCACCTTAATTTTAAGGACATAGCACGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 - chrX 11415819 5' - mdg1 381 2 56.94 GATGAATTTATTTATTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 16996138 5' + roo 8739 2 70.83 CGACAACGAAAATGAACAGCGGCAACAATTAACGCGCGTCATCAACACTCGACGCGTATCCGTAAGATACAAATAGCGACAGATAGATAGATAGACAATCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTC:1 + chr2L 12493250 5' + roo 210 2 66.44 AGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGTTATGT:1 + chr2R 22112632 5' + 412 58 2 56.85 TTTAGTTTTTCCCCGTTTCGCCCACATCACAATGGTGTATCATCAATTCCAAGTTAACTCACCTGCAATGGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chrX 10284788 5' - pogo 2074 1 61.60 ATTGTATACTGAGCATGCCCTATATAGGCAAGGGATATGGAAATTTGTAGAAAATTTGAAGCTATTAGCTCTAGAACTTGATAATATTATATATAAGTTGCATGATTCTTACAGAATATTGTGTTCTGACTATAATAGTCATTATC:1 - chr3L 3979963 5' + Cr1a 4202 1 64.38 AAATCTGGCAGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 - chrX 16219301 5' - roo 9019 2 56.85 GTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTCTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATC:1 - chrX 18767874 5' + hobo 93 1 78.77 TTCATTAGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTC:1 - chr3R 14401939 5' - Juan 4133 1 71.23 ACTTTCGTCCTTTCGTCCTGCTGCCACTTCGCATTTCGATGTACATTTGCCTAGCAGCTTAGGTTGTTTGTGGCATTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTT:1 - chr2L 11616692 5' - P-element 8 2 54.79 CGAACGCACTAAAAAACCAAAGCTAATAGCCATGAGCAACTTGGCTTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr3R 24443957 5' - 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chr3R 27499990 5' + gypsy7 5013 1 55.77 CGAAGCTGTAGTGACCGAAGGGATCGGGTGGCGTATTCCGGTAGTAGATGGTCCTGTCCAAAGATGGCGCAGTAAAGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGCAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr3L 21292458 5' + 412 7068 2 75.34 CCAAAACATTTTGAATTGTCAATTAGTTGCGGCGGTCAGAATACTCCAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr2R 8689443 5' + hobo 54 1 61.60 GTGTACGTGTTAACTACTTACTAACTGAAACTATCTTTAATATAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 + chr2L 7774943 5' + I-element 55 1 57.53 CCCGAGAACTTCCTAGGTTACACCATAAACTTTAGTTAGGGCCTTGTCATGAACCTTCATTAGCCGTTAATTGTGCTGCATTGCGCTGCAATGTTGCAACAAGTGGCCAGGCGGATTTTTCGCTTATTATTATTATTATTATTGT:1 - chr2R 14344796 5' - mdg1 7061 4 52.41 AAGGGAAAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGT:1 - chr3R 24444112 5' + hobo 69 1 65.07 GGTCTGAGCGAGTTAAGGCGGAAAATTTGTTGGCCCATAAAAGTGCAGCGTCGTCTCTCAAAATGGGTAACAAAAATTATTCATAGTGCAGTTGCCATTTTCCCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATAC:1 + chr3L 18119399 5' + 1360 16 1 73.97 CACACACGCTCATATCAAACCATGCTGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTATTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3L 19907139 5' + P-element 97 1 15.22 CAGCCCATCAAGGCAACGGCTCAAAGGTATTCATTTTAATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGTACAAATCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - 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chr3R 16225042 5' - Transpac 4782 1 72.41 GAGACCCGAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCGAAATACTACAAC:1 + chr2R 14431196 5' + Doc 57 1 47.95 AGTCCAAGCCACCTTCAGACATGCATACGTAAAAATGGAAAAATAACATATGATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGT:1 + chr3L 11148315 5' + 1360 3223 1 65.07 CTTCAATGCTAGTGGGATGGATATCTACTCTCAAGCCGTGTTTTAATGCCTCAAGGATTCCGCTTTCTTGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTT:1 + chr3L 277669 5' - accord 150 2 52.41 TTGCTAATCAAATTGAGATACTACAGTTTTAATGTTAGCTATCTCTGAACTTAATCCCATATTAGTTGTCGCCTTTTCGGATGTGTCGCTAAAGGATCCCTGTGTGTTATATCAACAAACTCAAATATATGTACATACATATAGCT:1 + chrX 16201919 5' - 1731 4409 1 54.79 GTTGGAAATGAGAATGAGTAATGCTCCAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 - chr2L 3632192 5' + P-element 94 1 21.23 GTATCTAAATTTTAATTTTACATGCAAGCAATCCTTCGACTTATCGAAGCCTTACTGTACTCATCCCTTTGTTTGTTTTGCATGCAAACGTCTCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3L 15273348 5' - pogo 2076 1 71.92 CCATCTAGTTTTTTTTAACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chrX 15406078 5' - opus 463 2 54.79 GGCTGAAACTAGCAAGCATTTAGCACAATTTCTCGCACCTCATATGATCACTATAAAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr3R 14546586 5' + pogo 60 1 61.64 CGTGAGAGACTGACTAAGAAGTCAAAGAGCTATGAGTCAGAGTATTCTGAGAATGTCCTCAGTTCGAGGAAGAGGTATTAAGTCGAGTTCATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chrX 4200876 5' + FB 32 1 63.70 TTGCATTGAATCCCCGTTTGACCTCCGCACAGGTTACTATACATATTCAAAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 15137400 5' - roo 9045 1 65.75 AACTTGGCTAAAATAAAAAGTCTTGAAACTCAGATGGATTTGTTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGAGGTTCTCCAA:1 - chr2R 15698147 5' - opus 7429 2 68.75 CAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1 - chr2R 17609823 5' + mdg3 5341 2 77.93 ACAGTTGGAATCAAATGTAGAAGGTACATTTTCAGAAATTTTAGGATAAATTGTTTGTTCAAATAGTATTATTTATAAAATATTACTATTAGATATTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chrX 12105366 5' + 412 7077 2 69.18 AACGAACCTGAAAGTAGGCAATACTTTCTCGAAACAAAAAGTATCTCAAAGTGTTTCGGTTAACTATTTAATGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr2R 18618563 5' - jockey 4948 1 50.00 ATTATGTTTATGATAATTATTATGGCATATATATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 + chrX 6186263 5' - Transpac 278 2 39.73 CATTTCTGATGCTCACACATTTTGCATTCCCATTTAAATGTAATGTAAATGTAAATGCAAATCGCAAAAGGGGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCGTACAATTT:1 + chr3R 18204331 5' + hobo 33 1 59.70 AGATTTGCTGCAACTCAACTATGTCTGGCAGTGAAGTCTTTTTCGGGTTTGAGTTTGGGCTAAAAGCAAAAATCCGACGAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chr2R 22774500 5' - I-element 5315 1 54.11 TTATTTAGATAAGCGAAGAGCAAATATGTACATACATATAGTTATGTGGAAGGNTNATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTC:1 - chrX 19187362 5' - Transpac 5163 2 76.98 AAGCACTTCAATTTAATTGCTGTAACCAGCATTATACACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr3L 19222585 5' + 412 55 2 54.11 ATCTAAAAAGGAAGACAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr2R 22112587 5' + 412 13 2 71.23 CACGACCGGCTGCCCATCAAAGAGTTATTTATACTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr3R 13453330 5' - 412 7508 2 66.67 AAAATCTCGCAGAGTGCATTGATAATTTAGCTTGATGTACATAAGTGTTTTAGCTCTTGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr2L 17353100 5' + 297 6637 2 63.01 TATACATGTGTGTAATGGGTTTGCAATTTTCAGCGACTTTTTGACACACATACCACGCCCGATCCCAAACACATATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGT:1 + chr2L 7148545 5' + HMS-Beagle2 6929 2 52.74 ATGTCCTCAAGCTGAGACGACCATCCATTCTATTCGGCTTCATAGGAGTGAGTATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr2L 3408832 5' + opus 50 4 60.61 AGCATCACACACCGCCGTCAATCAAAAGTAAACTTCAATTTCAGGGGGTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chrX 18767921 5' + hobo 46 1 54.11 AACACGCACACACCCGCACATACACAGATGTGGTCCCTCTCATTCAGGTTACATATTTGTATATGTATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 5450265 5' - accord 7037 2 85.23 ATGAACAAAAATTATCAGAAAAAAATTAATATTATTAACTTTAAGAGACTTGTCGATTTAATAGACATATATACTCTATATTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGAT:1 - chr2R 17874761 5' - I-element 184 1 45.89 AAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATNTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGG:1 - chr2L 23034056 5' - FB 360 1 54.11 TAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTAAACGTATGCTT:1 + chrX 20330535 5' - P-element 2849 1 49.58 CCAAAGAAGTGCGACTTTTAACATCCAACTGTTCCCGCTTCCTTCTGTTTTCTCAAATGGAATTTCAAATATTGTACCTACATACGATACATATATGAGAGAGTATACATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chr2R 20899141 5' - Quasimodo 38 4 83.70 GGAGCCTTACTAAGTAAAATTCCAAAAACNAAGAGTTCCAATCACATTTAAAAGTATGCAAATTCAAAAACCTTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAANAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTA:1 - chr3R 11254478 5' - FB 851 2 50.00 AAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:2 - chr3R 20983887 5' + pogo 71 1 66.44 AATACACACATACAATATGTGCTGAAAGTCGGAATCATTCAATTTATTTCCACACATTTCGCCCTACTTTCCGTGCAGCAGCGAAACACGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3R 31419460 5' + pogo 46 1 64.38 TTTTTTTTTTGCTGTTTACTGTTTTTAGAATGGATCTTTTCAGAAGGGGAACTGTTGTCCCACTGGGAGACCAATCAAACTTCCACAGCAGCCGATATGTCC:1 + chr2R 17277866 5' + G5A 2596 1 44.12 CCTTTCGCTGACTTGTTTTCCGGCTTCAATTGCCGGGGGCGTCGAAAATTCGTAAGCGAAATTGAATGATAGTTGAGCGCCAATTATTTAAAGATTGATCGCAACGTCTTGCGATCGTCGTCGTCAGGAATCCTCTAGAG:1 - chrX 14431756 5' - Gypsy6A_LTR 360 1 50.71 AAGCACTTGTAATTATTTCTCATTCGATATTAATGCCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 + chrX 10667038 5' + jockey 4792 1 75.34 TCGGCAAGGTTTGTGCGACGTTTTGTGACTGGTATTTGATATTAACCAACTGAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chr3L 21292636 5' - 412 7517 2 64.83 ATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr2L 15549964 5' + hobo 50 1 52.74 AATTATGAATTGAAGTACATGTGGATTTGAAAACCATCATAAGTAGGGAGAAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 10504431 5' - roo 397 1 79.45 AGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGTGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAA:1 - chr2R 6271505 5' + mdg3 247 1 63.70 CATTATTAGCAATTTTGTGGAAATGAAATAAAACCCTAATTATTTCTGGTCTTGAAATTCATTAGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 - chr3R 14401996 5' - Juan 4190 1 67.81 GGCATCTGTAATAAGTGTTTAATACTTCTGTATATATATATATATATACAGTCATGCTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAA:1 - chr3L 2668930 5' + Bari1 78 1 75.34 GATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chrX 140076 5' + blood 7038 2 51.58 TGCGATACACAGGAAAAAATGTCGATCTTGTAAAGGACACTAAAACTTCAAAACCTCAATAATACAACAGTAATTATAACAAGAATAAAGAAAAAAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGT:1 + chrX 10549080 5' - HMS-Beagle 6705 1 59.59 CCTACAAGCGTTTTGCAGTCTTCCAGAACTGACCATAAACTAAACATTTTAGGGTTAGGTGGGATTGTTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCAGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCGATTTTTTGC:1 + chr3R 11903438 5' + FB 53 1 55.48 ACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCG:1 - chr2R 4601624 5' + HMS-Beagle2 82 2 76.03 AAAGCTACAAGTTCTGTGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 20044644 5' + roo 8718 2 56.94 TAAATAAAGAACAAAAAGTAAGCAAGTTGTATTTTATTGCCGGGCGCTATAAAAACGTTAATAACATTTTAGTGGAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 17842795 5' - roo 9034 1 57.64 TTCAGCATTTAAAGTGTACACTAATCTCAACCATTCACATGATTTATTATTTATTTGGTTATTTTTTTTTTTAAGTAAATAAAACATTTTT:1 - chr2R 13696729 5' - Stalker2 7189 1 40.66 AAAAGTGCGAAATGCAATATGGAATAAATGGAAATTTTTGTAGCCTGCACACATAAATGGGGAAATGTCGTCGCGATTTCAATTTAACTGCAATCGATTATATGTGAAAAAAAATATAATGTTAATTTCACGAAATGATTACAATA:1 - chr2L 507977 5' - Idefix 7345 2 65.75 CCAAATCAACGCAAATTACAATAACTAAATGCTTTTGCTTGCCCTATAAAAAACAATTCAGGAAAAAATGCCCATATTACGTATGTATAATCAGTTCGAATTTGCATTTGTCTGAATAAAGAGCGACAGCTCCTCAACTCCGA:1 - chr3R 9091071 5' + Gypsy6A_LTR 195 1 62.94 GACCCCCGAAAGTCGCAATAAAAATTTAATTTTAATGCCGGTTTCCCTTCACTCTCGTTTCTCGAAAAAGAACTTGAATTTCTTTTGATTTTTATAGTCGCGTATCAATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCAT:1 + chr2L 16884558 5' + Bari1 14 1 75.34 ATAAAATGGAATGACGCCAGTAAGTATGCTACAATAATCGATACGAGTGTGCGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr3R 10541191 5' - hopper 1375 1 56.16 GGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr3L 13888884 5' + 412 7102 2 52.05 CAATCTTGACATCGACTTGTTGCAGCAGTTGACCTACAACCTGTGCCACATGTTCCCTCGTTGCAATCGCTCGGTTTCTTTCCCTTTTCTATATCGCGTCTATCTTCTGGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCG:1 + chr3L 15560438 5' + Cr1a 4403 1 54.79 AACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3L 21913471 5' + 297 28 2 66.44 GCCAGCCAAATGTCATGCTAAGCGCGATTTTCTCCAGTCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTG:1 - chr3L 18968701 5' - hopper2 1526 1 73.97 CATTTTTCATGACGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTATAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCG:1 - chrX 23108353 5' + BS3 1439 1 54.48 TTGCGCATCTCATGCGTAAATTGTTTGGGCTGAAACTAGCAAGCATTTAGCACAATTTCTCGCACCTCATATGATCACTATAAAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 14546613 5' + pogo 33 1 64.38 ACACAATTTGTTATATTCGAAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 + chr2R 7009405 5' + Quasimodo 19 2 65.79 TGTTACTTATAATAAAGTATATTATCATCCGTACTAATTTGTTTCTCAGTTCTTTTTGAACACGGGACTTGGCTCCGCGGATAATAGGAATATACGCTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAG:1 - chrX 23283647 5' - R2-element 3244 1 67.81 TCTTGGGTCCTTTTCTGCTTTTCTGCTACGTGCCACCCCCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chrX 1759063 5' + Tabor 6882 2 55.86 TGAAAATCTGAAATCTGGATTGTTGTTACTACAGACGACAACGGCAATTGTTGGCTCATTAGAAACTCATTTAAAAACAATTTGGCACGTTAATGCATATTATGATTCAGGGATTTAATACGAAAAACTTATCGAAGTAAAAATGA:1 - chr2L 9821134 5' + Dm88 299 1 66.44 AGTGGAAATGTTGACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:2 - chr3L 16920298 5' + roo 8705 2 57.53 GCGTATACGTGCTGGCTGTGTGTGGCCGTGCCGCAGAGTGTAATTAAATATTTTACAGGCAATCTACATTCTTGAGATAAACTCGGCTTCAAATATATACATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr3R 8065365 5' - 297 6962 2 77.40 TCCTGGTCCAAATGAAACCAGTAAACAGCAAGGGGCACAAGTTAAAGATCTATCGCAGCATAAAGGACTGACACAAGTGGTGGGGATATTTATAGTTAAAATAAATATTGTTGAATTATATTTCATAAAAAAATTCCGTTTAATTA:1 + chr3R 23271680 5' - S-element 82 2 58.90 CTCTTTGTTATTGTAAAATTGAATGAAATGGTAATTGAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGCCCAAACCAGCCAC:1 + chr3L 20765093 5' + 297 11 2 78.62 TTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chr2R 22112642 5' + 412 7121 2 64.38 ATACATTTTCGGAGCCCTTTTGCATTTGGTTTTAATTTTTCATGTAAATTTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 + chr3R 11208826 5' + jockey 4733 1 64.96 GAGGGGAAATGAGAGGATCTTGGATGAGAGAGGCTTATAATTTGAGGGCTCGAACTCGCGCTTTGGTAAATTGCTTTCTTCATCGTATGTTATCGGTGTTCTTCTTTGACGTCTTGTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGG:1 + chr3L 18896540 5' - diver 472 1 57.14 ACGGGATAAATAGCCCTAGCGTGTAACCATAGAAGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1 + chr2R 5394955 5' - HMS-Beagle 163 2 75.17 GTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3356 1 56.16 CTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGCGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 16920284 5' + roo 55 2 56.16 GACAGATGGTGAGCTAGTGGCTATCGGTTATCGATTGCTGATAACATCTTTTCATAAACATGTTTACAACGCTCCACAGCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAAT:1 - chrX 6688778 5' + Tirant 430 1 57.78 CCGAAGTTGAATTTTCGAATGTCGTTAATTTTCGAATGCCGCATGAATGAAGTCGAAGTCGACGTCGACAGCACGAGCTCTCTCTCGCCTGGCTTTTCCTTCTATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chrX 18534663 5' - P-element 2873 1 76.03 ACATTGCGTTGCAGTACCATTTACAACCTATATTTTTAAAAGTTCGGATTGAAGTGTTCAGATAGTGTGCTGAATATTGCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chrX 20233764 5' + pogo 39 1 58.90 AATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGC:1 - chr2R 4774758 5' - baggins 5347 1 58.22 TTTTCATTTGGCATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1 + chr3L 22038203 5' + diver 54 2 54.86 AGTTATGAGCTACTGGCTCCTTCATCCTGTTGCTCACCAATTGCAAACATATTCCAGAGCCGAGCACTTCAATCATCCATGAAATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chr3R 5977683 5' + copia 15 2 75.34 CATTGTTAAGGAAAATTAAATGTAGCAAGTATCGTTAGAAAGAAAACTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chrX 16589167 5' - pogo 2046 1 65.12 GTTAATCATTACGCACTCAATCAATAAAATGATTTAATAGTCTCCACTAATTATGAGCAGCTTACTCTGAGCCTATGAAACAGGTTTATCTTTAGTCATTAATATACCAGATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAA:1 + chr3R 20892314 5' - R2-element 3221 1 73.97 GAGCGCAATGAAATTATATTTGTCTAGAAAGGAGACAAGCTCCCCAACCACAGAGCCCCCAAAAGGCACAGAGAAATAAATTATCAAACATAACTAAGCATCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGA:1 - chr3R 30556622 5' + P-element 379 1 67.12 ATGTATGTATATATTCTTGATCTGAATCAATAGCCGAGTCGATATAGCCATGTCAGTCCGTCTGTCTTTCCGTCCGTTTCCGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCTTT:1 - chr4 559332 5' + Tc1-2 124 1 52.74 CAGAGAGCAGAGAGCGCTTTCTCTCAAAATAGCCCCATAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGA:1 + chr3L 739177 5' - P-element 2803 1 28.08 AACAGGCCATGCAGGTGTATCCCAAAAGTATGCAGCAAAGTCAAGTTCATGCTGCTTTCTTCATCATTAAATATGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:2 - chr3R 23416007 5' + jockey 4808 1 51.37 GATTTATAGGAAAACCCCCAAAACAAAAAAAAAAACAATAAAACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTCTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chrX 19121913 5' + 412 65 2 65.41 ACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chr2L 18173693 5' + blood 7058 2 52.74 GCATAAACAGGGATATAATTTTATTTTATACTTTGAAGAAACCCTAAACCCTCATGGCAAAAATTACAAAATTTAAAACAAATTAACCTTTTTCATAAACCCATTATCCTTTCCCT:1 - chr3R 5505453 5' - 1731 4238 1 43.97 ATCCGAGCTCAACTAAAAGTCAAANATAATTTATGGGACATAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAGAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATATTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chrX 2104772 5' - roo 330 2 69.18 GTGCCACCCCCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:1 - chrX 1759034 5' + Tabor 6912 2 65.07 GTATACTCGTTATATGGTGCCAAATTGTAATTATAATTTCTCGTGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACTCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTT:1 + chrX 20270944 5' + I-element 5139 1 69.18 CGCAGTTGACATCTGCATTTGTGCGGAGTTTTAACACCTCAAAACTTGTTCACACTTTTCAACGATACTATTTTCGTTTACCATTTACAGTTTGTCAATACACNGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 - chrX 21183947 5' + S-element 37 2 60.00 AAGTTTGTTGGCATTTTAAAGCACGTGGAGCGACAGTTGTCAGGGGCGATGACGGCACTGAATCCATTTTACGGACCCCTAAAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGC:1 - chr3R 22348936 5' + HMS-Beagle 6745 1 58.90 GCTAAATCGAGAACTAAAAACATATTTCGACAAGATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 23181687 5' - 1360 3354 1 74.66 AACAGGTGCTTTTGGCGGTTAAATGTTGGGATCTTTCTTGTATCGGTGGTACTTGACATGCATCTCGTATTATATAGCATATATATGTATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - chr3L 18122425 5' - 297 369 2 70.55 CTAACAAATTTTCGCAGGTAAACAAAAACAGACACGATGAATAAATAAATTGCGGCGACATGTAATAAAATGGAAACATTTTCACAAATGCATAATGACAAATAATTTGTGTGAGACAAAAATTAGCAAATTGTTGTGCTTGCTT:1 + chr2L 16568437 5' - G3 226 1 77.24 GTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr3R 12941800 5' + hobo 66 1 70.40 TGCATATCCTTGCGTCTATTTGTCTCATATATGGGGTATATAATAATTACCCTNTNCAAAGAAAGTACGGGGCTTACTAAAGTCAATTGCAGCCCTGAACCCTAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTTAGGGGG:1 + chrX 8328835 5' + baggins 5356 1 55.48 CATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGT:1 + chr3L 22065787 5' + gtwin 65 2 59.59 AGTGGACATTTTTCAAGAGGTTTCGACGACCATCTTTGCAGGATTTATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 26605627 5' - roo 334 2 69.18 GGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2L 16995492 5' - roo 9000 2 63.70 TATTGAAAGGAAAATATATTGATTTCTGAGTACCTATTTCATAGCTAAGCAATTTGGTTTCTTGAATAATCATTACATCAAATGTGTAGCCAGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chr3R 19629066 5' - Transpac 284 2 62.33 AATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3L 15035218 5' + pogo 56 1 62.86 CACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr2L 6047832 5' + P-element 56 1 47.26 GTAGCGAACTTAATATAGTTGGCCGGACTTGGGGATTCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTAG:1 + chr3L 18148244 5' - blood 7175 2 90.00 ATCAGCATGCATCAGTCAGCGGTTTTCAAAGAAAGTGCAGAGTCGGCGGAAAAAAATATGAGAAAACTCGCAGTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTT:1 - chr2L 18112634 5' + transib2 2561 1 73.24 ACGGTTATCACCAATTATACACCAAATGCCTGCCAAAATGGTAAGTTCGACTTGGAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 15137234 5' + roo 30 2 62.33 ATCAGTTGAAAGCGGCCTATTTCTTATGCACGAACAACTGGCATTGCGTAGGTGTACTATGTGTACATACATATGTATGTAACATGGAGTAATGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr3L 8157988 5' + flea 16 2 67.83 GCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1 - chr3R 20345542 5' + blood 7071 2 56.85 CGGTTGGTGTTGATGATGATCAGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chrX 14189269 5' + 412 7086 2 60.27 CCATGGGTGACACATAAATTTACAGCGTTGGCTGTTTGAAATTTTTCACATTACACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 26605543 5' + roo 63 2 67.36 TCTGTATTCACTCCAGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr3L 19907088 5' + P-element 27 1 60.50 CTTGGCANATGTTAACAGTTTTCATTTATGGCTATTGGTTTTAGGAAGCCATTATCGCTGGCTTGGAAAATTCACACTGAAATATGTAGAATATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 3453074 5' + roo 22 2 61.43 GCTTGTAAGGGAATTACTTAAGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chrX 15405942 5' + opus 7155 4 54.61 CATAGACAAAGTCAGGGCGCTTTACCGCCGGCGGACCTTGTGCTCTCAGATTAAGACAACTTTATCAACTTAATTTGTATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1 + chrX 3596382 5' + copia 4912 2 56.16 AAGATATACCCAGCATACCCACCACACAAGCGTAAAATTAACACACACTTAACGCAAACGGGGAGCCCCCGACTCTGACATTGATTAGGATCAATAGCCGTGTCG:1 + chr3L 22001723 5' + INE-1 93 1 76.19 TTTATACAAAATTTTTGATGAATTTATTTATTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - 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chr3R 13530003 5' + jockey 59 1 54.11 AGAGGGAAAGAGATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATCAAT:1 + chr3R 7041984 5' - Stalker2 7584 2 60.96 AAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAATTTCTT:1 - chr3L 19222689 5' - 412 7483 2 56.16 ATGGTCCCGGGTGTATAATTTTAATACGCAATTACTGGCGTTTCAATGACACTCAATGATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTAACTCGTTGAGCTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTTA:1 - chr2L 15917696 5' - roo 350 2 52.82 CTATGCTGGCGAATTTATTTTCGTAAGAACGGCAAAGAAGAAACTAATTTCGCGCAAATTAAATGCAAAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2L 1232730 5' + roo 51 2 54.11 GGAGACGTGTAAGTAAATGTTGCCCCAGAAAGTATGCTACGAATTTCAATCAATGTAGATGATTTTAAAAGAACACTTTTCTAATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTA:1 + chr3L 8936857 5' + BS 5035 1 53.42 GATTCCGCGTTGAACAAGCTAAGTGAAGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 + chr2L 13697582 5' + F-element 60 1 60.27 TTCGATGACTTCATGGCGATAGGGATATGGTATATGGGAACGGGTGGCTGCAGTTAGAAATCAATCTTACAGCACAGCAACAACTGAACGGCTAAAAGTCGGCCACGGAAGAATAAGAGGTAGGTAAATTGAAAAAATTTTATTTT:1 + chr3L 16438045 5' + HB 328 1 58.90 TAGGGAACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3R 12115226 5' + 1360 23 1 66.44 CATTTTGAGCGAGTGACAGTGATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - 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chr3R 22105927 5' - roo 328 2 73.97 CAGCCGAGATTGCTAACATTCCACCGAATACTTTCTCCGCGCAAGTAGTTTACGGGCATTCCTGTTCCAGTCTCGTAATAGCCAATTGAAGCCATTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 + chr3L 18968588 5' + hopper 28 1 60.96 TGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 + chrX 21227097 5' + Tabor 6891 2 50.68 AAGGTGAAAGTTTAACTTATGTAGTTGGTATCTATTAGCTAAATTTGCTTTTATAAACAAAATGTTGCCTATTTATATTTTAAATGGCTTACTTAAAAACATTGTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAAGTTCTTACCATCTAAT:1 + chr2L 12286677 5' - rooA 7499 2 69.86 GTGCGAGGGGAATGCACCCCACTGTGCAGGCGCCTCTTCTCGATTAAATTCAGTCTGAGGTCATCGAGGCACATGCAGAAAATATGATTTCGATTTATTTCCAGAAAAATTATGAAATTTTCCATTCGCACTCACACTTGCTGAGT:1 - chr2R 7724054 5' + INE-1 531 1 66.44 GTCGGGGAACGAGTGACAGTTGGCACGGAAGTGGTTTTGATTTAATGCCGCTTGGCGCTGAATGACGCAAGATAAACAGATGCTACGCGGCGAAGAGCAGGTGTCGACATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAA:1 - chr3R 17957574 5' - BS 5068 1 73.29 AGAGACCGAGGTTTGGACAACTTCGCTCTAAATACTTGTGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTA:2 - 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P-element 2821 1 37.78 TGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3R 8381731 5' + Tirant 41 2 65.35 CGGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chrX 7042653 5' + roo 89 2 80.14 CGAGTTTCCAGCTTGGTGCTTGTGCATTGTACTTTTAAACGCTGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATAC:1 + chr2R 17695982 5' + rover 16 2 73.97 AGTGGTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCA:1 - chr3R 10030805 5' + BS 5051 1 54.11 GCGCCGTTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1 - chr3R 17766843 5' + HMS-Beagle2 6922 2 56.16 ATAGAAACTGATTTTACAATTGCTTGTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chrX 18786184 5' - 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chrX 12105352 5' + 412 38 2 59.59 CTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 9871008 5' - roo 9042 1 59.59 GTCATTATGAAACAATTTAAATTTCTTACATAGAAACTATACTTTTGATTTCACAGGCTTTTAAAGCAACGTTCATACACGGGTATGCATAAGCAATGGCAAAACCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACC:1 - chr3R 7475194 5' - Tc3 235 1 72.60 CGCAGGCAGATGTCGGTATTTTCAAATGCAGCAGTGTTGTATAGCGATGCAGCGGAGTTATCGAATCGTTGGCAATTCGAAAAGCATTTGTAACAGAATATATTAACAATAAAACTAAATGACTACATGTATTACGACATTTCTTT:1 - chr3L 18622702 5' + Stalker 6817 2 58.90 CATATGTGGAGGCAATTTAATACTATCTGGATTCATGTTACTAATAGGTGTTTTAAAGGTTATATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTGACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAA:1 - chr3R 13529008 5' - jockey 4853 1 56.16 TACGTTATCGAAACTATTTGCATAGCATACTTTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGCGCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 + chrX 7845716 5' + hopper 60 1 69.86 CATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 + chrX 21227100 5' + Tabor 6891 2 51.75 CAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chr3R 8381701 5' + Tirant 55 2 55.17 GGTTTTAAAAATTACATGATAATTATAAANCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTNCTCGTTGAGTTTTTG:1 - 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roo 9034 1 60.27 GCAAGGGGGCTTATACTACTATACTTATATACAATTACTACTCGTACAGTACAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAACCATTTACATTCTTGATCAGGACCAATAG:1 - chr2R 2864305 5' + INE-1 85 1 78.08 CAAGGGTCAGAATTTCATAGTCGGATTCTGATAGTGCAGATAGGGTAAATAGTAAATTGCAGTCATAAAGCGCATGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTC:1 + chrX 14696897 5' - Quasimodo 134 2 51.37 AGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 13468308 5' - roo 9010 2 73.08 GAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chrX 10504367 5' - roo 8996 2 69.86 ACAGAAGTTTGTGGCAAAAGTTGCGTATGAATAATAAACAGAGGCATGCCAGTAAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1 + chr3L 2668791 5' - Bari1 1699 1 77.40 GTAACACACTTTTCAACGAATCTAGTATACCTGTTTACTCTTATCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1 + chr3L 25482715 5' - jockey 4918 1 64.38 GCTGGGCCGATCCTAAGGTGAGAAGTGTAGGGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 + chr3R 5574973 5' + blood 7101 2 78.77 CAAAAATGTTTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr2R 19726839 5' + 1360 54 1 56.83 CTATTTCCACCGATATATCGATAGGTACATACTTTCACATCCCTAGCCGGTCAGCTGGTCAGTATGACCGTGTTGTGTAACTATATTCCCTACGATTTTGATCGGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr3R 10708376 5' - Transpac 5214 2 73.97 ATGGGTCATTAAAGCAGGCATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:2 + chr3L 17602519 5' + Doc 61 1 54.79 AAAATCCCATACCCATTCCGCCACTCAGCTGGGTTCATTCAATATTCAACATATTTTTAAGTGCTTGGTCGCGGAAAAATTCCGTTATCCTAAAAGTATTGTACACACCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 + chr2R 20230892 5' + jockey 4678 1 74.62 GGATAAAAGCTTCTTGTCATTTTTGTTTTTAAAGCTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATC:1 + chr3R 3589949 5' + 1360 3184 1 77.40 GCTGTTTAATTCTCTTACTTGTTGTATTAAAATATTTAGATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGT:1 + chr3L 6721590 5' - I-element 5273 1 71.23 CAATAAACAGTGCATATTATAGTACCGAAAGTTTCGCACTGCATTTTTCCGTCGACATCAACGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGG:1 - chrY 864983 5' - accord 480 2 58.90 AATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTC:1 + chr3L 2668845 5' - Bari1 1645 1 60.27 GTACTTACTCGGTGCCAAATTGGGCTGACGATATCGTCCTGAGATGATCTCCTCATGAGCTCGTCGCGCCTTCACACGTCGTCCTTCGAAGTCGATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGG:1 - chr2L 6776065 5' + P-element 2844 1 69.63 ACAAGAAAATGATACTTATCAGTTGATTATTACGACACCGAAAGTCGAGGACACCGGCAAGTACACGATTGAAATCGGCGGTGTTTCATTACCTCAGTCAACTACGTTCCGTCTATTCCTTC:1 + chr4 745404 5' + gypsy5 6885 1 72.13 TTTGTTCCACTTTGGTGGTTTTCTCTCTTCTTTATGGTACTCCACCCACTTTGTGCATTTTTGTGCTAAGTTCTCTCTATTATTTGTTCCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 26768628 5' - hobo 2907 1 62.33 TTAACCTTAAATGTAGTTTCTACGTCATACATGCCACAAATATGCCATATAACCTATACTTAATGATCGGCTCAGATCTGCAATCACATGCCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAA:1 - chr3R 23322662 5' + I-element 5019 1 63.01 GCCATCTACCAGAGCGACGCTGGCAAGGAGGACTCCAGCGTCTTCAAGGTGGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCT:1 + chr3R 7182369 5' - 1360 85 1 58.87 AATTAAACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 + chr2R 8596921 5' - pogo 2044 1 57.53 ATTCTGAGGCGATTTGAGACTATTTCTAGGGTTTGTTGTCATATTCTGGCTAATGATGAAAGAGCCTAAGGGAATGGATAAATAATAAGTCTTAGTTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTC:2 - chr3R 22563450 5' + Juan 4035 1 59.59 ATGCAACACAAAATTGCACACCTCGATGGCGAGCAATGTGTATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCA:1 - chr2R 22971880 5' + jockey 4811 1 54.11 GTGCAGCAAATAAATGCACGAATTAGTTATACGACGAAAGTGATTTCTCTGCTGCACTCAAAACAATAACTAAGTGCAATTATTTATAATATGTACATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 - chr2L 17851805 5' + flea 21 2 71.92 ATAAATCAGAAGACATGTCGACGGCAGTGGCAGCCCCGCCCCTCTTGGGTCTCCGCCTCTTTGTCTGTCTGCGGGACTCACTCACACTCATAACACCCCCATTCACACACACACATATACATACATAA:1 + chr2R 18482040 5' + Quasimodo 39 2 58.59 TAATGCATTTGATTAGCTCTCTGCCTTTGGATCAGGCCAAAACACATCAACCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr3R 17494866 5' + hobo 30 1 65.07 GCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 5398159 5' + roo 54 2 55.48 ATGGTACGTTCTGCGGATGCGGGTGGGTGGTGGGCAGTGGACATGGGTCGAAAAGTTGCGATGGGCTTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACGTTCTAGCTTTTATACAATAGTTCCTGAGATCTCGACGCTCATACG:1 - chr4 402009 5' - INE-1 136 1 78.77 AAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr2R 15472131 5' + 412 7124 2 62.14 AATAATGCCAGCGAAACGAAAATAAGGGAAGGAGAAACAACATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr3R 11758448 5' - P-element 2872 1 73.57 TTGTTATTGTAAAATTGAATGAAATGGTAATTGAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr3L 20765097 5' + 297 6597 2 75.34 ACGGTATCATAATGTAAATAAGTAAATATATGCGGGATGATAATTTAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGA:1 + chrX 16610414 5' + P-element 421 1 32.19 GATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3L 21636419 5' + 297 6628 2 53.85 CGGGATTCGTGACAATAATATTCATTCGTTAATATTTCAAAGCTCTGTTTAAGCTTATTGAAAGTCCTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chrX 21639242 5' - 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chr2R 652396 5' - copia 257 1 47.26 TTTTGGCCTGGCAAATGGCAAAAGTTTTGAGCTCTACTCCCGTTATCCATTCATATACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 - chr2R 18723758 5' - 297 333 2 62.33 CGTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3R 24093510 5' + jockey 81 1 67.12 CATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATCCAGTTGGGGGACTCCTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTA:1 - chrX 21227194 5' - Tabor 7283 2 43.15 CCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 + chr3R 12941786 5' + hobo 54 1 59.84 TAAAATGGCATTTTATTTTCGGCTTTCATACTGTATATATACTGTATAGCCTGCGAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATCGAGATCGGTT:1 - chr2L 13328557 5' + BS 4 1 78.77 AGTTGCATAAATGTAAAGTGCATGTGCATGCTTAAATGCAATTAAAGGGTGTCGAAAAGAATGCAGTGAAAACACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr3R 28413851 5' - pogo 2054 1 52.05 CGTATTCCATTTTGATAACATTCTTAACGTTCTTGTGTTCCGAGTTTTATTTTCCACACGATAAAATAATTGATGTCGATAGATATTGATGAACAAAATGACTAGAATGGCTATATCCAGTCGGCTATTGATCCTGATCAACAATA:2 + chr3L 11887647 5' - INE-1 85 1 80.14 TGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTNCNCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCAATACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATCTCTCCCCGTTCTGAAGTTATTAAT:1 - chrX 22906793 5' - Transib-N1_DM 36 1 67.81 CAGTTTGTTAAGAATAACAAATGATTGGAATTTTTCAGCATATTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTT:1 - chr2R 16367042 5' - hopper 1039 1 69.18 GATGGGGGCCAATTTGAGCTGTCATAAAAATGTACAACAACCGGCTACAAAGCAAACAATGCGACGAGTGCCAACAGCAATGTTCGTTTATTACACACAGCCTGCATTTTGGAATCGCATTAATTTAGCCCTGTTGGCTCCCGTCC:1 + chr3L 3967040 5' + mariner2 236 1 54.79 TTTAACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATTAGGGGTCACGGCACTCGCTGCCG:1 - chrX 15406065 5' - opus 7474 2 53.60 TTTCAACCTATTTTATTGCAGTTCTTAAAAATTTATCAATCCCAAGGCTGACTATTCCAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGA:1 + chr3R 10030649 5' - BS 5083 1 76.03 CTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGTAA:1 + chr3L 22038243 5' + diver 5980 2 78.77 TAAAAGGATACTCTTTTTTTGGGGATTTAAATTAGACCAGAAACTTCAATAGCAGATGCCTAGTCTTTAAAACTCATATATCATAACAGTCAGGTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 4198023 5' - 1360 3369 1 70.71 AGCATGTTTTAGTCGACTATCAGATACTGGATACTGAAAGTACTCTAAACTTTCTAGCTTATATATGTGGCGCCCACACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATAT:1 + chr3L 17860606 5' + Chimpo 60 1 76.71 GTTTAATAATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACA:1 - chr3R 12342200 5' - hobo 2879 1 58.90 CAGCACCCCACACTTATATTAATTTACACATTATTTTCTCCCCGACACGGCCATTCTAACATTTACACGCTTTTGATACCGAGATACCAAAGACAGTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chrX 21907789 5' - 1360 3351 1 53.42 GTGGGTGGCGCGTGTAGCGATCAAAATTGCGTGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTGAGTAGGCA:1 + chr3R 13684701 5' - 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chrX 7626253 5' + Transpac 25 2 68.49 TTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACG:1 + chr2R 1320669 5' - diver2 314 2 49.32 ACTGCATATATAACAAATATTCTACTGCTTTTTCTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 16996034 5' - roo 9029 1 58.22 ATCCTGTTACACAATCAGACTTGCCACTCAAAGCCAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 8631689 5' + roo 86 2 77.40 ACTGCTGTCGTAAATCTGGTATCTATATGGACCAGTCTGGGGTTTGTAGTTCTATGTANGGGCGGGAAATTAGTAGAGCACTGGATCAGTGTAGGCGGCTGCATGACTCAACATCCTACCCCC:1 + chrX 10845758 5' - diver2 4523 1 68.29 CACAGCAGATGTAATAAAATAATAAAAATGTCAAATGCGAAACTACAGCAACTAATGATAAAAGCACACATGCACACAAAAAGTGTCATAATCCAAATAATCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGC:1 - chr3R 20153205 5' - 1360 80 1 45.21 AGAGTGGATCCAATTGCCAAGAATTTGTACAGTGAACTCACGATCAGGGTCGTTTTGAGTTCCACATAAAAAGATTTCGGGTTACTGTTTTGCAAATCACATTAGAATTTGTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGG:1 + chr3R 4796100 5' - F-element 332 1 78.62 TTGGACAATTGGCCAATTCATGCGCTTTAATTACTTCATAAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTC:1 - chr3R 21679710 5' - roo 9041 1 64.38 ACTTGGAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 15137283 5' + roo 8743 2 74.66 CAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGT:1 + chr3L 17934935 5' - HMS-Beagle 172 2 69.86 TTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCCTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 - chr3L 9522122 5' + opus 66 4 69.66 GCAATTGAACATAAGGACTGCGAAATCCTGTTACACAATCAGACTTGCCACTCAAAGCCAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr3R 8631713 5' + roo 62 2 60.96 CATATCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chr3R 9551020 5' - P-element 2853 1 62.33 GTAAATCACTTTCATTTTACTCTTAAATTTAAGGCTTTTTATCATTTTAAATTATGTAAGTAACTTTAATACTATCATATCTATTATCCCCTTTCCCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGA:1 - chr3L 18317246 5' + Idefix 247 2 71.92 CGATACGAGTGTGTGTGTGAGCTCTTGTTGTTTTAACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTTACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 + chr3R 10541229 5' - hopper 1337 1 70.55 AATTCAAGAGTCGAGAGTGTGCTTGGGCTCTGAACCTTTTAAAGAGCTATTACATGTTGCAGCCAAAAGATTAAACGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr2L 8895341 5' - 412 7501 2 54.11 CAATTTCTATTTGGCTAGGAAATTCGTTACCATTTTTGTAGCATACTTTTCAGCGCTCGAACAACAGATTCTAACAGTTTCTAACAACAATCATAAGCTTTTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTT:1 + chr2L 5515357 5' + BS 5015 1 59.59 AAAGGTGTTGAAAAGTATGCAACCATATATTTTCACTCAATGCTTCTGGAGAGTATGCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3R 28413968 5' + pogo 56 1 59.29 GGGAATGTTTGCAATCCTAAGTAATATAGGTAAAAGGGTTTTTTTCCTTCCTTATACTAATGTACAGGTGTTATTAAAAGCCTTAAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - 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chr2R 17455624 5' + Doc3-element 4558 1 57.53 CTAATTCCTTAAGCTAAACGTTTTGAACCCTACATTTTTACGATTGTTAACTAAGAAATCGGTAGTGCAGATCTTCGATATACATACATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr3L 3154038 5' + flea 22 2 69.18 ATAAATAAATAAGCAACAACCGAAACCGACTGCACTACCAATCCGAGCTCAACTAAAAGTCAAAGATAATTTATGGGACATAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAGAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 2104812 5' - roo 9034 1 59.59 ATGCCGAAACTCTTGGCATATCCCACCTTCAGTTCGTTGAACACCGTCTCCCAGTTTTCGTTAAGGAATCGATTCACTAAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGAT:1 - chr3R 24527362 5' + R1A1-element 319 1 50.68 AAATAACGTGGAACAAATGAAGGAGGAAGCGCAGGAATGAGGCGATGTGAAGCAAAAGGACAACGAGGACAGCAAGGAACACAACAAAGGCATCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACAACCACTGCCGTCACAT:1 - chrX 8330074 5' + accord2 7353 1 62.33 TTCGAGGGCCAGTTTCAGATTGATCCACGACAATTGCGGGTTTGGGAACCAACTGCAATAACCAGGTCCCTGGAGACTTTTGTAACGTTTTTTTTTGGCTTGTTCCAAAATGGTAAGGATATATGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 - chr2L 20819392 5' + copia 4871 2 78.08 GCTTACAACTCTCTTGCAGAGTTTGGAGCAGCAAGAGAGTTGGATAAGTGGGGGGAGAGGGCCGACGCCAACGAAATAACGAAACAATTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTT:1 - chr3L 21023551 5' - invader2 342 1 77.19 TAGGACAAGCCCCTATCATTCACTTGTGCGTGAAATGAATGAGATTTATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:1 - chr3R 27016554 5' - roo 377 1 58.22 GCGGTGGGCCTGCAATGTCAGAAAACTGATATTAGTTCGCCTATCAGATACCCAGTAAAAGTATCTGAATGAAAAATTTAACAATTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2R 17649193 5' + Doc 42 1 45.21 TAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAA:1 - chr3R 12376508 5' + flea 4828 1 66.44 TAAGTTGAGTTTTTCAGCCAGTTTCTGCACAGCGTCACCAGCCGTATCCGTCGGGTGTACATCAATTGCTTTGGTGCGTGTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCACATTATTTGCTTACTTTTGCACGTGGTACG:1 - chr3R 1961227 5' + transib2 215 1 55.17 CTCCCATATTCGTACAGAGGAGTCAACTGTCGTTTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAA:1 - chr4 405220 5' + jockey 285 1 77.40 GGCGGTGGAGTAAGAAAGAGATAGAAACAAAGTGTCCACTGTTCAGGTGTTAAACAATCCAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 + chr2L 16537531 5' + Transpac 4976 2 56.85 AATCAAGGCTCTAAAGTCATTCGACCTCCTCTCAGTTGCCATCGCCACACACACTTGCCAACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCCAGAAATAA:1 + chr3L 7646218 5' - 297 342 2 60.96 GTGAGAGTTATGTGTCCTAATTGCAGCTAGTACATGTGTTGTGTTGCACCCTAATTCCAGTTGTAAACATGCGCCCATACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr3R 31031946 5' - hopper 1374 2 58.22 AGTAAAAGTACTTAATGACAAATTAAAACGAAAGATTCAGCCGAAATAAAAACAAATCATCGGAAAGTATATATAGAATTACATTATATTTCCTTTTGTGCGATACGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTG:1 - chr3L 17570757 5' - gypsy4 6647 2 73.97 GGAAACAACCCTCGCGTTTCAAAATAAAAAGCCGGTTTCATTCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 + chrX 18534535 5' + P-element 77 1 32.41 AGGTATATCGGTATCCTCGTAGACAGAGTAGCTATTTGGATCCTGGGGAAACTGGCTGTTTTGGAGAGCAGTTTGCTGGGTAGGGACAACACTGAATTGTTCATCGCAACACAAAATCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATACCGGT:1 + chr3L 21557065 5' + Circe 7373 1 65.75 AATCGAAGCTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chrX 15539980 5' + roo 79 2 76.03 CGAAAAAACGAAAGGTTCCCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAC:1 + chr2R 10541689 5' + P-element 104 1 14.38 TTTCTTTCCGCATTTATTTTTATCTTTTTTGGCAATCAGCATCAGCCGAAAGGAATTCCCCATTGACTATGCCGGCGTCAACAAAGTGGCGGAAAAGAATTAGGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGCTATGTTATTTC:1 + chr3R 6602916 5' - gypsy 7430 2 71.23 AATAAGCCCATTTAGTTTAATATAATTGGAAATACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr2L 16607318 5' + 412 7097 2 51.37 TGGCGAAGAGGGTGTGGCCAGCAAGCGCAATGTAATGAGCATGGGAATCGCCTGGTTAAGCACTTGTAATTATTTCTCATTCGATATTAATGCCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:1 + chrX 10666981 5' + jockey 4735 1 63.70 GAGCGGCACTGAGAGCACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCT:1 + chr3R 9550865 5' + P-element 22 1 68.61 AACAAGGGGGTTAATAGGGCGGCTGTTGAGGGGCAAAAGTCATAGGAGAAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGATTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAAAC:1 + chrX 9958241 5' - F-element 282 1 69.18 CCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGA:1 + chr2L 6047876 5' + P-element 100 1 17.12 TGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2L 20044628 5' + roo 8736 2 68.49 ATTTATGAATTATGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:2 + chr2R 8258219 5' + jockey 15 1 76.71 CGAGACCGACAAACGTCGGCAGGACAAAAATCCTTTCACAAGCCTGCCGAATATGAGCTCCTGCGAAAAAATTTAAAACAAAGACATTGCAACAATTTACATTTGGCAACACATAATAGGAGGCAACATGATGCTGCT:1 - chr3L 7490134 5' - gypsy2 6350 1 74.64 AGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTG:1 - chr3L 23839742 5' + McClintock 5993 2 56.85 AGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGTTTTTGTTATCTAA:1 + chrX 7042654 5' + roo 90 2 79.45 CATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 + chr3L 17602537 5' + Doc 79 1 67.12 GAATTGCAAAAATTTGGACGGGAAATGAAAGTCACTAAATAGCGAAACATAATAGAATAGTGAATTTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAA:1 + chr3R 31525469 5' + Juan 4135 1 54.11 GTACGCTGTCCGACTCCAACATAATAATTGTGCAAAGTGTCCGAAACCGATAGTTGCGCACAATCACCAACGCGCCCTGACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAC:1 - chr2R 5637729 5' + 1360 3201 1 54.48 TCTGGTCAAAAGCCCATCGGTGCAGTCAAACTGCACGTCGTCATCGTGTGTTGTTTATTTTAATTACTGAAATTGCATTCGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 16382605 5' - hobo 2921 1 69.77 AAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTCCTATGCGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGACGTTATCACTGATGACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAA:1 - chr3L 5498503 5' + Doc2-element 250 1 71.21 GGGCGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTCCTATGCGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGACGTTATCACTGATGACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:2 - chr3L 5498516 5' + Doc2-element 251 2 64.38 ACAATCAAAGTAAACCCTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 - chrX 21227226 5' - Tabor 443 2 54.79 ATTGAAAAGAACGCGCATGCGTTGTTTTTTTTTACTAACCATCGCGTACATTTGTTTTCGTTAACATTCTAAGGGTGGAGACATCTGGCATGACTCTGGCAGGGGGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr2R 25083231 5' - pogo 2088 1 78.77 AATGTACATATTAACAAAAACATTTGGTTTTTAATTGGCTTTAAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACG:1 - chrX 7847285 5' - hopper 86 1 63.70 TTTGTCTACACGCGAAAGGTGAGGCGGCGGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 - chr3L 8249468 5' + HMS-Beagle 6836 2 56.56 AGCACAAACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 8208417 5' - roo 352 2 58.90 ATCGAAGCTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chrX 15539981 5' + roo 8744 2 76.71 GAGTGCATTTTCCCGCCAACGACGACAATCCTCCTTCACCGTTATCCCCATGCCACGCCCCCTCTTCGAGGGCGTTCATGTGTGCGTGCTAGTCTCCTTCTTAGTTGTTTTTTTTTTTCGTTTT:1 - chrX 18225049 5' - gypsy7 5011 1 79.84 AGATACTCGGCATTATGCAGCATGGCCCACATGCCGCCGCGCTGACAAATAGTCGAAATTGAAATTGAAGTTCGATCGGGGAGCATCGGTTACCACGCATTTTGGCGATCATGAGCGACAGCTGCAATAATAATAATAATAATAAT:1 + chr2R 24322030 5' + mdg1 36 4 65.75 ACATACGAAATGGGTTTCGTTTCATTTCGATTGTTTTGCGAGCAGTTTGTATTTTTTAGCTGAGCCGGGCTTAAGCCCAGATCGAAACTCAATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 14867200 5' + roo 8693 2 65.75 TAATCCCTCACACATGGCAGGCCCGGATCTTTTTCCTCCAGACGGAAGGGCGTGCCGTCCGGTAAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCA:1 - 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chr2L 7810753 5' - P-element 2842 1 52.05 AAAATACATTTCGCTATATATTTGCATTTATTATTGAACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 7042773 5' - roo 395 1 76.71 TTTAATTTTAAAATCTCGCAGAGTGCATTGATAATTTAGCTTGATGTACATAAGTGTTTTAGCTCTTGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr2L 17353109 5' + 297 47 2 56.85 GACAAGATTTCTGTTTCGGGTGCATGAATATGAAATATTTCGCTTTATTTGCAAATCATTTAGCTGAGGTCCTTGAAAATACCTATTGACCTGATAGCTTTCGATCTAGTTATCATATATAGATGATTAAGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 16890874 5' - accord 7031 2 49.32 ATTAAATTTGGATAGCATATATTTCAGTCTGAAATATTGTTTCGGCAATTAGGTCAATGCTTTCTATGCAGCCAGCAAAATATTCGGCCATGACTATATTAATTCTGTATTGGTTCCCGAAAGAAAGGGCAGACTAATCCGTGG:1 - chr3R 8456957 5' - aurora-element 32 1 75.69 GCTGTTCAAGTGTTTCTACTCGAAGTCGAAACTTTTCTTTTAAATATTTCCCATACTTATCCCCAGTCATGTGCTGCAAAGTTTTATGCATACGCATTAACGTGAAAAGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAG:1 + chr2R 23315160 5' + 1360 314 1 73.97 AGATAAACCAATTTGAAACGGCTAGTTCATTTCACGGCTCGATTGCTTGGCAAATATTTGGCCTGTTTTGTTCGAGCATCGAGATACTGTTACTCAATCAAGCCCAACAAAATCGGAGGAAACAAATTAATCTATTCGGAAGGAGA:1 + chrX 577266 5' - 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chr3R 29384769 5' - roo 400 1 79.45 AGCACTTCAATTTAATTGCTGTAAGCAGCATTATACACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3L 19222586 5' + 412 56 2 54.79 ACTTAACCTGCTTTGCCAAAGTAAAAGCCATTTATTCATGCATTGGTTTGCTATTCAAACACAACAATTCGTTCATTCATACACCCATCCTTACTATATACATACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTGATCGACTCAC:1 - chr3L 8754940 5' + mdg3 129 2 54.11 AATTTATATACTCCCTTCGTAAGCCCACCAATATTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 - chr3R 18319718 5' + jockey 95 1 78.08 CTGCTGGCAATTGTTTATGGCCCAGGTCCGCAACTCGAAAGCCAGGCCAAAACAAAGACCAAATCTTCGGGGCCTTTTCAGCTGCCAGCCGAGTGAAAGAGATTTCATAAGAATGTGAAAAAAAAAAGCTATTTCACCAGAATG:1 - chr3L 3341740 5' - copia 362 1 70.14 ACATTTCGCATTCGGTTTTTGGGGTAGAACTTGTTTTCGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2R 7623005 5' - P-element 2858 1 65.75 CTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCG:1 - 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chr3R 16349334 5' - P-element 2851 1 60.96 GCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3R 21938165 5' + roo 59 2 65.00 GGTAACCTAAGCCTTCGGATTAAATTTATTGCTCCTAGCTCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr2L 15917572 5' + roo 37 2 60.27 CTGTAGCAGTTTGGCTGTGACAGTGACTTGTTCCCATCACTATTTGGTGGCATGAATCATCTTCATCTGGGCACGTCGGCATAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chrX 13521742 5' - 412 419 2 58.99 CCAGCTTGGTGCTTGTGCATTGTATTTTTAAACGCTGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATAGAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACT:1 + chr2R 17695989 5' + rover 6974 2 66.44 ATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:2 - chr3R 15137346 5' - roo 328 2 71.92 AAAAGAGTTTGGCCGGGGAGTTGAGCCGAAGTCCTTGCAAGGAAATGAACTTCCTTTTTAACTATGCACCCTTTTTGCTCCCACACTCTTTAAACATTTTCCATATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAAT:1 - chr3L 3538687 5' - Quasimodo 7307 2 69.86 AAAATAGACGAAAAGCATCGCGACGCTGATTATGTTGTTGAACTGTAACGTCACTCACTCGTTAGCCTGAGTAATGTTTGCACTCCCTTTGGCCATAAGTTATGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3L 20868175 5' - hobo 2935 1 80.14 ATATACATTTAAGCACACAACAAATAAAATGGGCGCGGCTGCTTGTGGGCCCAAAAAATTATGCTACGGTTTAGTACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 11108199 5' + jockey 18 1 76.92 ATATTCTACTGCTTTTTCTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chrX 16996050 5' - roo 9013 2 62.33 TCTCAGCTTCACTCAACAAAAATTAATCCCATGTGTATAAATGTTTCGCGCTGNGNTAAAAAAAATGGACTTTCGCTTTCGCCCCAATATAACCTGTAAAATGAATTCCCATACGCTTTAAAAATAAAAATAATAATAAAAATAT:1 - chrX 13137293 5' + mdg1 32 2 73.10 TCTACACCAACTTTCCACCAGCTGAACATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGA:1 + chr2L 3059376 5' - P-element 2797 1 23.97 ACTGAGAGAAAATCCCTTACAACTTGGCAAAAAAAACGGAGTCCTAATTGTTGGAAAGTGCTATGGAATAATAGAGTATATTAAACTAGAATTATAAAGCTTTCATAGTTATGAAGAAAAAACTAAAAAATCAAATAATAATTAAA:1 - chr3L 16169124 5' + Tc1-2 388 1 69.18 TTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr3R 8867040 5' - Max-element 8508 2 78.26 ATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTA:1 - chr3L 21202094 5' + G2 2647 1 60.69 GCGTTGTCATTATGCTGCTCCCATTTTGTATTTTTAAGTAGTTAAGCCCCAGAGTTGTGGAACTTTATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chrX 5456511 5' + roo 8684 2 71.92 CACCCTGCTTCTCCATACATATATCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTG:1 + chrX 17495712 5' + Burdock 6205 2 71.23 AAGTCATTGGTAACCGCCCCCTGTGGTGCGTTGAATCAACAAGTCCCTAACTTATTATTTAACTCAGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGACAAGTGTGTCAATATGTGCTCACACATGAACCCGAATATAT:1 + chr2L 13468172 5' + roo 8668 2 78.08 CTACATAGGTTTATAGAAAGAGATCCGGTCGGGCTTTTCCGAGCATAAGTGCAAAATTTGTAATCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGTCTACGCGGCGG:1 + chr2R 8838981 5' - HMS-Beagle2 7027 2 55.48 AGGCAGCGAAAAGTGGGCGAACAGAGCAAAACTTTAGAAAAGTTTGGGAAAAACACTAGGAAAATCTGTCTGTTGTTCTCTACCAGCAGAGTAGAAAGCAGGAGCAAGATATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTC:1 - chr2L 10591212 5' - Stalker4 7029 4 76.71 AAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCG:1 + chr3L 25272555 5' + 1360 115 1 68.49 GTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chrX 8208382 5' - roo 8981 2 78.77 TAGCTCCAGGATGATGGAGGCGACACAAATCTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 + chrX 21227055 5' + Tabor 6849 2 77.40 ACGGCGCAATATGAGCCCGTGGCGGAAATGGCGTTGCAAGTTAAGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3R 23104492 5' + jockey 69 1 63.85 AGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGACCGGTTAAGCGC:1 - chr3L 8249452 5' + HMS-Beagle 6860 2 70.00 AATCAAAACAACACCAGCTATTCCACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAG:1 - chrX 21933344 5' + springer 18 2 69.18 TTTTGTGTCTGATTTCGACACGGGGGAACAATCGAAGAAGCCAGAAAGCGACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr2R 23595938 5' + blood 25 2 65.75 GTAAATAAAATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2R 9871593 5' + roo 29 2 61.19 ATATATGTTTGGTCGTTTTTCCATACTCTTCGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAAGTCCCTTAGTGGGAGAGC:1 - chrX 7505367 5' + roo 8862 2 76.09 ACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGC:2 - chr3L 10814609 5' + micropia 52 4 54.11 GTCTGCTGTCAATTGTCTTGCGTGCGAACTATTCACAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1 + chr2R 17609775 5' - mdg3 160 2 74.66 CCCATAAAAAGTACATAGTCCTACGCAAAATAGGCTAATTAACCGAACTCACAGAAAAGACAGAAACTAATTTTGAAAATTTTTCCCTCGTTTGTCTACCCGCAGCATTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGG:1 - chr3L 13113725 5' + R1A1-element 5318 1 55.48 GGCCCCATCTTGGCGATCTCGATTCGCACAGTACACCCAGAAAACAATCGCATATGTATCTGCTGGACTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 2104678 5' + roo 50 2 53.79 CGCTTTGTCTTTATTTGAAAGGAAAAGGGCTTATCAGACAAAGCGGCAACATCTACTGCTGCTTCTTATCTTTCCAATAGTTCCCATGCCTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCT:1 - chr2L 16268631 5' - Tirant 432 1 62.33 ACAAGGGGTGAGTAAAACTTTGGTGTTGCATTAATTAGTATAAGTAAATAAAAAACGAACAAATAATGAGATTACAAAAATCAGATTCATTTTATTTAAATAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCG:1 + chr3R 8379032 5' + Tirant 155 2 73.29 GAAGTTGTAATTATATATATGTATGTATATATATGTATGTATGTATATATGTATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTAT:1 + chrX 8272628 5' + micropia 5104 4 65.75 CGTTAACATTCTAAGGGTGGAGACATCTGGCATGACTCTGGCAGGGTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGACGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr2R 25083289 5' - pogo 2034 1 64.79 CTAGGTCATTAGTTGTTTGTGCAATTAATATCAAAAGTCAGGCGGCAACATTCCATATTTGCACAGTTTTGCCAATATTTGTACTAATAATTTGCAGTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr2R 20706901 5' + I-element 22 1 65.75 CACTGAATGCGTGGGAGAATCTTAATGACACACACCTGAGCTTTGAGCCCTCCAGATGCCAAAGCCTTTCTTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:1 + chrX 7209898 5' - Stalker2 359 2 48.63 TGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTACCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTC:1 - chr3R 7042063 5' + Stalker2 77 2 67.81 GAGAGAGACCGAGGTTTGGACAACTTCGCTCTAAATACTTGTGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAG:1 - chrX 6186392 5' + Transpac 75 2 69.18 AACGGCCAGTTTTGAGAGTTCCGCACGAGACGAGCAGCTAACTGCGTTCCTGACATTAGACTGAAAACTGAATCTGAAGCCCGATCCGAATCCAAATCGCCTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr3R 17944154 5' + P-element 18 1 73.10 TTTCACAGAAATGGTAGCTCCAGCCCAAAACATGAGTGAGTATATGTTTCTTTTTCTTTAAATAAAAACATTTATTTTGTTTTACACATTATACCACGCGGGACTACGGGGCTTACAGCTATGTTTATTTACAATGTTATTATATC:1 - chr2L 8643759 5' - I-element 5264 1 65.07 AAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCTGCTCTCGTGTTGTCGGG:1 - chr3L 9522111 5' + opus 7161 4 69.03 CGATGGAGAAATGAAGGAGCAACAATGTTTCTCATACTCACATACATACATACATACATACAACCATTTCCAAGGATATGATGTGTGCATATGTATGTGAGTACGGCAGCACTTTGTTGCTATGCTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chrX 3235467 5' + 412 79 2 71.92 CTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTCAGATAATATTAAATGCA:1 + chr2L 17550618 5' - Transib-N1_DM 436 1 78.08 AGAGTTGGCATCTCGTGCTTGCATATAAAGAACATTATTAAATCGTATGTTACAGATTGCGTATCGGGACCAGATGGTGGCCACGATCAGTGACTATAGCTGAAGTGATCAACTGGAATAAACCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCC:1 - chr3R 30707279 5' - Chouto 198 1 67.36 CACCTATCGGGGATTGTCGGAATCTCCTGTTGAAAATAAATCAATTGGCGATACACTAAGGAAACCACCTCAAAAAGAGAGGAAAATAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGC:1 - chr3R 11741152 5' + HMS-Beagle 6999 2 58.90 TATCATATCATTCGTGAAAAGCTTCACAAGTTTGATTAACAAACTCTGATTAGTTCTGGGAAAAAAAATATCAAAGTAGGAATGCCGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2L 17136060 5' + hobo 24 1 43.28 GAAGACTTTTCTATAGTTAGGGAAGCCAAAGAGCTACTCTTAAATAAATACATTTTCGGAGCCCTTTTGCATTTGGTTTTAATTTTTCATGTAAATTTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 + chr3R 11208779 5' + jockey 4695 1 67.81 ACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3R 19446128 5' + 297 52 2 57.53 AAAGCACAGTTTTAAACGCTGGGCACTTAACATTGTGCATTTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:2 - chr2R 14332154 5' + jockey 20 1 75.34 CGAGATGGTATAATACGTTTAGTACATCTTAAAAAATGAATGTGCGATTGACTACTCAACTTATTTTAGTCAGAAGAAATGGCTAACCGGTAGTCCACTATATTGACTCATTGGAGCTTGAGACTAAACATATAAAGGTTATTTAA:2 + chr2L 15202182 5' - Copia1_DM 21 1 61.64 GCAACACTTTCCCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:2 - chr3L 9522163 5' + opus 139 4 60.27 CCTCCAAGATGCACTCTTTAATAGACTCGTGGCCTTCGAAAGGTTGTCGTAAACTGATATTCTCATATATGAACATTCCAAATGAGAAGCAGTCCACCTGACGAAAACAAAGAATAGATAATAGTTGTTGGCACAAATCATTTCTC:1 - chr3R 20642606 5' - transib3 414 1 69.86 TGGAGTGCCGAAGTTCTTACTACTCTCTATCGACATAGTTCGAAGCCCATAATCTGCCAAATTGAAAATTCAGAAGATTAAACAATCAAAGAAATATATATTGCAACCATCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 + chr2R 24807832 5' + I-element 12 1 75.34 GTAGTTAAGCCCCAGAGTTGTGGAACTTTATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 5456548 5' + roo 8717 2 57.04 GCTAATGCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3R 12941760 5' + hobo 41 1 55.00 GCAAGGTATATACAACCCATGTATATGGTGCAGCTATATGTATGTGCAGGTTGCACGTGTACTGGTACTGTGTACTGGTATTTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCT:1 + chr3R 7938881 5' - micropia 303 1 71.30 ATTCATTCATGCCCAAGAGCTACTCTTAATGGAACACACGAACACGGGTGTTGGAATACTCGAATGCATAGAGATTTATTTATTTGTGGGTGTCTTTAATCAAAAGGAAACAAGAGAGAATTCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATC:1 - chrX 17540840 5' - INE-1 564 1 51.37 ATTTGATGTCACTGCAGTAGGATCGATTGTTTTTGTACTTCATGAATGGTTTGGTTTGGTGTGTATCTGTGTGTGCGGAGCGAGCGAACGAGGCAACGAGAAATAAAGTTAAAAAGGAAAAAAAAAAAGGAAAAGGGGAA:1 - chr3R 17713636 5' + Bica 343 1 55.00 TGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1 - chr3L 15035212 5' + pogo 68 1 68.49 ATAGATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3R 14278008 5' - P-element 2856 1 64.38 AAGTAAATATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:1 + chr3R 11757954 5' - invader4 275 2 53.42 CACCTGCGACAGCGGCAAGAACAACAAGAACGATTGACGGTAAAGTTTTTGGCCTGGCAAATGGCAAAAGTTTTGAGCTCTACTCCCGTTATCCATTCATATACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr2R 18723804 5' - 297 6960 2 76.03 AAAGACATTTCAGCCAAGTACCAAGGACACGTTGGTCCTGCTGACTTTTCCCCCAAATGATTGCTCAAACTTATAATTGGACTTTATCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGCGAGACCAGATCTGATCAGTATATG:1 + chr2R 15294530 5' + invader4 376 1 58.90 AAATCGAATTAATACGATTTTTTCATTAGCAATTTGGTAATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:1 - chr2R 21199752 5' + jockey 4748 1 62.33 AATGAGAATTCACTTTTTTTTATTGTTTTGATGTTCAACTTTTGAATATATTTTTTTTCTTTCAAACTGTCGTTCTTGGAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGC:2 - chr3L 21996926 5' - Tc1 1340 1 52.74 GCAGCGAGTGTCGGCAATTACCAAGGCCTAAACTATATATACGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGGTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATC:1 - chrX 7848278 5' + flea 57 2 69.53 ATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:2 + chr3L 8754762 5' + mdg3 5312 2 66.44 TGTTAGAGAATTATTTTAAAAATGTTTAATAATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3R 12342223 5' - hobo 2902 1 58.90 ATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTAGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGAACCCTATATACCCACAAGTGAG:1 + chr2R 18035140 5' - R1A1-element 5262 1 75.81 GTGAAATTGAGGCCACTAAGCGAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTG:1 - chr2L 16884679 5' - Bari1 1650 1 74.77 ACAACGAGAGGGATATGAATCATATGAATCACAGTGTGGCCTCATGAAAAGGGAATTAATTGAATTAAAATGCATCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAA:1 + chr3R 8853187 5' + invader2 126 2 49.32 ATTCCAAGTGAAACTAAAATACGTATTGTTATGCAGCCTAGCGGTATATACTCTCCTGCCCATTAATATAAAATCAAATATTTGCATTGAAAATCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGAACATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGA:1 - chr2R 21848260 5' - INE-1 505 1 57.53 ATATAAAGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTGAAAGAAGAAAAGGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2R 9871584 5' + roo 50 2 56.16 GATGGCGCGTTTTACCTGCTGAAACGATTTTTGATTACAAAGGTTGCTATCGCAACAGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr2L 22578048 5' - 1360 3329 1 61.38 CTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTCTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1 + chr3R 12622184 5' - 1360 3320 1 67.81 GGGTCGCCGAGCAGCTGCAACTCGAGCGATGCGATGCTGCCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGG:1 - chr2R 16160844 5' - mdg3 188 2 56.16 AAAACACACACAAACACACACACACACTTACAAACACACACACACACTAACGCAGGTCAAGGATGCAAGTGAGAGAGACAGACATAGGACGGTAGAAATATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTC:1 - chrX 7903724 5' + Doc2-element 4408 1 59.59 ACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTT:2 - chrX 13367463 5' + HMS-Beagle 6873 2 70.55 GATTATGCATTACTTAAGAAATTACTTAAAGCAAAGTGGCAGGGAAAAATTGGAAAATTTCTACACAGAAAGCAAAGAGAAAAACTGAATTTAAACAGAAGAGAGTCCTGAAGTCGAGTTCTTCTACTATCAGATACCCATTACTC:1 - chr2L 20934324 5' - INE-1 549 1 76.71 ATAGGTTACAACTTAAAATATTAAAATAAAATTGAAGACACACACGCAGGTTATAATTTCTCAACGACACAAACTTTACACGACTTGAAAAATAGAATAAATAAATAAATAAATATAACGGAAACTCAAGCCGGGGTCTAGGCCAT:1 + chrX 22824251 5' - Gypsy12A_LTR 226 1 69.86 ACTCGCCATAAACAAATAAGCAATGAAAAATATTTAAATATTGAAATAAAAAGTAACAGAAATAAATATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATG:1 - chr3R 8867127 5' + Max-element 31 2 64.38 TGCGGTAAAAAATATTTGCCTTGTTGAATTACTAATGTCTCATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 19445189 5' + roo 8696 2 55.86 AAGCCAAAGAGCTACTCTTAAATAAATACATTTTCGGAGCCCTTTTGCATTTGGTTTTAATTTTTCATGTAAATTTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr3R 11208801 5' + jockey 4711 1 55.00 ATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTCT:1 + chr3R 7420428 5' + 412 60 2 58.22 CGATAAATAAATTTTCTCTAAACCCACCAGACTTTCCAAAGGTTCTGATAAACTGTCAGGAATTAGAGTCTAACAACCTTCGAGCCCAATTGGCAAATACGACAAGCATGGTTAGAGGAACCAATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTA:1 + chr2R 3514952 5' - R1A1-element 4857 1 67.81 ACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:2 + chr2R 23595988 5' + blood 7086 2 68.49 TGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3R 29384708 5' - roo 9002 2 76.03 CTTAAGCCCGACAAACACTATTAGCAGTTATGAATAAATAATTAGGGGAAAATATTATAAATAATCGAAATGAACGGCTAAGATAATTACCCGGGCACATTTGGGCTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTAT:1 + chr3R 10061070 5' + Idefix 273 2 73.61 ACCAAAGGACAGTTGGACAAAATGACAGCAAAACAGGCTACGTCCAACTTGACAGAGATTAACATGGAAAGGATTAACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 - chr3R 14138644 5' + mdg1 7085 2 52.05 GCCTGGCAAATGGCAAAAGTTTTGAGCTCTACTCCCGTTATCCATTCATATACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTAGG:1 - chr2R 18723753 5' - 297 6909 2 65.75 GAAATGCCGACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAAC:1 + chr3L 24272047 5' + gypsy11 60 2 66.44 AGGTGTGAAGGCTTTTAAGTTTTAAATACGAGATGCTGGATCTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCTTTTATTTTTG:1 + chrX 21083939 5' + HB 86 1 68.49 TTTTCCAGTCTGCAAGCCCTGATAAATCATTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAATTT:1 + chr2L 18284862 5' - pogo 2014 1 80.82 GAGATACAAAAACAATGTTGACTACACACACAAAGGCACACACCAAAATAAAAGGAAAACAATAAAAAACGAAAACGACGAAAGCAGCGCGCATAATAAACGTCATTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1 + chr3R 16229288 5' + copia 4945 2 70.55 GGTAAGTCTATTTCAAGGACAAGCACTTTCCCAGCCATTGATTGGAAAACAAGTCCCAAAACATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGA:1 - chr3R 29770167 5' - invader4 3031 2 57.53 TTAGATCCTCTCAATGCAACGCTGACACTGACAGCCGCCATATCGAAAGTGGCATGCGGTAAATCAGAGTTTTGGCAACATTGATGCAGATGAGGCTTGCCATGGGCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAG:1 - chr2L 18281245 5' + pogo 1646 1 57.53 GGACAACTGAGCAACAATTTGCTGAACATTTCGTTTGAATACCATTAGTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 19583237 5' + roo 72 2 71.72 GGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAAT:1 - chr3R 15047399 5' + F-element 85 1 69.18 GATTGACGGTAAAGTTTTTGGCCTGGCAAATGGCAAAAGTTTTGAGCTCTACTCCCGTTATCCATTCATATACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 - chr2R 18723773 5' - 297 348 2 54.79 GCACGTTAATTAACCTCTTTTTCATGTTGTGCTCGGGTTTTTCTTTGGCCAGGCTGGGATTTCGCTGTTACGGCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAAT:1 + chr3L 20934099 5' + Max-element 30 2 72.60 GAGCGAGGAAGATGGAGGCAGACAGATGAGTTGACACAGCGACCGAAGCAGAGCAAAAATCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCT:1 + chr2L 249411 5' - Stalker 7138 4 59.59 TGCATGTTATTGCATCAACATTATTTCTTGCTCTCCGAACGTGCGCTGGTGTGCGTGGATGTGCGCCATAAAGTACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACACAAATTAATACCTCCTACACTATTGGAGATATTT:1 - chr3R 31032084 5' + hopper 45 1 59.59 ATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCC:1 - chr2R 18044055 5' + jockey 4593 1 51.94 GCTGGAAAGAACTCATTTCTTATATATTTTTCTACGCTTAATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 7420388 5' + 412 20 2 68.49 CAGGGGGAGCCAGCCAAATGTCATGCTAAGCGCGATTTTCTCCAGTCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACT:1 - chr3L 18968709 5' - hopper2 1534 1 68.49 CGGGGGAGAGACCAGTGTAATCCTCGTGAGCGGTCACTAGATAATGGATACGAGACCCACGCACACGCCGTGATGGGCTTGTAGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGGACTACCCCTTCATG:1 + chrX 14089840 5' - baggins 5388 1 49.29 AAATGCCTATCTGGTTATTTTTTTTTTATAAAAATAATTATTTATTGGTTTAATTTAATAAATTTGAATATTGACCATAGTATCATATTTGTAATTTTCTTAGCCTTAGCTTTAGTACTAGTTTTTTTAATTTTTTTTTTAAATTT:1 - chr2L 12874482 5' - TART-C 11097 1 75.34 ATTTGTATTTTTTTTCCGCGTTGCTGAACCAAAGGCAAACAATTCCCGCAGAGGTCTGAAAATGGTCGGAAAAGTGGGAGTAACTGAAAATATTTAGAATANTTGGATAATAGAAAATATTAATATATGTCGAAGAGTCATCAGGA:1 - chr3R 8617573 5' - invader1 405 1 56.85 AATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAA:1 + chr2R 1881364 5' - Stalker 7087 6 51.37 ATAATTATAAATGTATCAACTAATGCATATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:2 + chrX 20940693 5' + hobo 40 1 66.44 CATCTAAATTTCTGTTTGCACTTTTCATTGTGGCAGCACAAACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGT:1 - 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chr3R 9345570 5' - hopper 1111 1 64.38 AAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 + chr3R 8381739 5' + Tirant 8154 2 71.72 TGAGCCCATGTCAAGATGTACAGTGGTTCCAGATTCAGTTTATTATGTGGTAAATTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCA:1 - chr3L 14116763 5' + BS 5064 1 63.01 ATTGGTTGGTTGGTCAAAATGCAGGTGCGACTAGGAAAGTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 - chrX 13367503 5' + HMS-Beagle 37 2 60.27 GCGGCCGTAGTGGTGGCCACTTGTCGTGCTGTCGCTGGTCTGAGGTTACCGGTAAGTGACTGGATGACCCGATGTTATGCTTTATACAAGACTTATCCACAACAGACTTTGAGCATTCACAAATTGAAATCAAGAATCAAAAACAA:1 + chr3L 8621146 5' + P-element 2646 1 52.05 TATTCCCCCAGTGTCTCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGTATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 5495182 5' + roo 51 2 55.71 GTGAAGAGATAGACTATCTTTAAGCCAATTTCAGTTAAAAGAGTGTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGG:1 + chr3R 27007357 5' + roo 8740 2 69.18 CCGCTTTCTATTTGCTCACAGTTGAGCGCAATAAAGCCGCAATTTGTGCGTATACGTAACGTGCTCAAGAGTCGCACCTTTTACGCATATGTACGCACTCGAGCTCGAGTTTTGCCGGATGTCGATACGTAGCCGGCAGACACTGC:1 - chr3R 28450247 5' + gypsy2 6576 2 74.66 CCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 17871869 5' - roo 320 2 79.31 TATTATATTTATTACAAGTATTTTTAGTGCAGAAATCAGTCTGTTTTCTAACAAAAGCATTTCCTTGCTTATTTTCAATGCAGTTGCCAGTCATCTATACATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATAC:1 + chrX 17477553 5' + Quasimodo 15 2 76.03 AGCTTAGGTGCAAATGAGCGACTCATCCTCGCTCTACATATACTCTCTGCTATGCAGGAGTATATGCATGTACATACTTTCTAACACGCCACATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGG:1 + chr3R 1944480 5' + Rt1b 4797 1 66.67 CGCATAAAAAATAGCACAATTAAATCATATACCCGGTACTCAGCTAATGGAAATGTGAACGCGTAAGTTCATAATTTTCTGGGATATCGATAGATATTAAAAAACATCACCCGCCCCTACCAATGCACACACACACATATGCACAC:1 - chr2R 5177808 5' + accord 189 2 70.55 ATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCA:2 - chr3L 10814629 5' + micropia 32 2 63.01 ATGACAATTGTATGTGATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGAAAAGAGAACAATTTTTGCCGTCACTAAAAAA:1 - chr3L 24504994 5' + 1360 3326 1 74.12 ATGGCCAGCAGAAGGACAACCAGACAATCCTTTTGCGGGCATAAAAAATATGGTAGTTGCCGAAATAAAATCAACGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATCGGTTAAGTTCAGACACTTAA:1 - chr3R 13898325 5' - 3S18 296 2 58.22 CCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACCCCTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3L 12125257 5' - roo 9037 1 59.71 GGGGAAAATAAGTTAAAGTTCAAGCTCGACAAACCCCCAGCAGACCCGAAAACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCA:1 - chr3R 11903535 5' + FB 69 1 63.70 GTTCCCCGCAACCCAAAAAAAAAAACAAAAACAAA:1 + chr2R 17641950 5' + G2 3077 6 74.29 AAAGTACAGTGTTTTTGCACCAACTCCACACATGGATGTCCTTTAGCAACAACAACGATAAATCGACACCCAACTAACAACAACAAGTGGTGAACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 + chrX 7626078 5' - Transpac 5205 2 69.18 GCAAGTCACTGGGACTTGGCAAAATTTGCATATCGAATAGCGAACAGGCAACAGCAAAATGTCGGAGAAGAGGCGCCAAAAAAAAACCCCCTCTGGCTCCTTGAGTTTTCTCCCCCCTTTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 10929915 5' + hopper 145 103 59.59 TTACCACCAAATTTGTAAGAATTTTTCAAGCTAATCTTTAGTTATTTTCTGGCTATGTGGGCGGTTTTTCCCCGATTTGGTCTAAAATTGTTGTCCGTTTGATTATCGAAATTCCTCGGAATAACAAAATAGAAAACAAAAGAGAA:1 + chr3R 1062187 5' - S2 235 1 69.18 CAGGATTCTCCTCCCTTCTTCCTTGAGCAGCAGCATTTACCGCAGCAACCGCAAACTTCTGAAATGCAAAAATAAAATATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGG:1 + chr2L 326004 5' - roo 187 2 54.35 ACAGCATAAAAAAATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACT:1 + chr3L 27356030 5' - Tc3 1687 1 74.66 TTTAACTTTTAGTCACTTTTATGGCAAACGATGAAATTATCATCGTTTGTTTGTTGCCTGACAGTGAAATAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2R 17400269 5' + pogo 46 1 52.05 CTTTTTGAACACATATATATATAATTTCTGTTTTCCATATATGTATGCGTATTTAATTGGATATTAAGCACCAACAAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr2R 652418 5' - copia 245 1 55.48 TTATGTTGTTGAACTGTAACGTCACTCACTCGTTAGCCTGAGTAATGTTTGCACTCCCTTTGGCCATAAGTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 - chr3L 20868146 5' - hobo 2906 1 63.01 TTTGCGTAGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 30537623 5' + roo 72 2 67.12 GAATGTTCGGAAAATTGTGAGTTTGAGTGATTGGAGCTTTCAGTTGTCTAATATTCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr3R 31419327 5' - pogo 2038 1 63.01 GAAATCATTCTTCGGCGAAATCTATGGCCAACTTCGCGAGCTCATCAACTTCCCTTTGAGCCGTGCAATTTGTACGTTTCGGCCAACGAAAAGAAACGAAAATAATGAAAAACGTATATATGATAAATTTAAAATAAACATTAAAA:1 - chr3R 12542563 5' - hopper 181 1 76.71 GAAAAGACTCTCCCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 - chr3R 10062219 5' + copia 47 2 64.04 GTGGCGAGCGCGAAGGGGAACGGGAACGGCTGCAAGACGGAGTCAAGAAGGCCCGAAGAAACGAAGAAATAACCCATAACCCAACGAACCTTCTTGTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATT:1 - chr2R 17804798 5' + ZAM 3 2 53.79 GGCAGAGCAAACTTTATTGCATACGCCACGGCGCAATATGAGCCCGTGGCGGAAATGGCGTTGCAAGTTAAGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAATACAAAAACGTAATTGT:1 + chr3R 23104465 5' + jockey 58 1 52.05 ATCGTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 - chrX 17495837 5' - Burdock 225 2 65.07 AGCATAAAAGTTACAAGCTCTACAAAAGTTTTAATTATTAAGTAGTGTATGTAGACTTTAATAGATTGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 - chr2L 14892959 5' + copia 4925 2 54.79 CTAGTAGGTGTAGACTTAAGTTTCGATTTAAAGTGGTCTGTGCAACTGAAACATTTCCAGAGGGCGCATTAAAAAATGGCTCTCGATTATATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGT:1 + chr2L 4779184 5' - Stalker 7197 4 59.59 CTTTGTTTACCAAAGCGTTCATCTACGTCAATTTGCCATCGATCACAATGAGAAGGAAGAGTAATGAAAGAGATTTCGGCAAATCTAACGGAATCGAAGGGCAACGGGACTTAGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCG:1 - chr3L 20881452 5' - diver 412 2 53.96 AAATATATCAATAGAGAATACATATCTGTGCACATTCGTAGAAAGGTAGATGTGTGATTTATGACATATAGATTAGGAAGATGTAAGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3R 11166287 5' + hobo 35 1 58.90 CGCATCGAATGGTGTGCCGCCAAGTGTGTCCAAGCGGATCAAAGTCAGCGTGGACTGTAAGTCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCGTCCATATTATTTATT:1 - chr2L 6385937 5' - invader4 310 2 73.97 AAGAATTTAGCGGACAAGTTAGCTTAGAGCCTCAAAAATCGCCCAAAAGAGATCTGTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 10056760 5' - hobo 2921 1 60.20 ACAACAAGACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTGTACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr3L 19907110 5' + P-element 51 1 34.71 TCCTCATCCAATTTCAAATAGACAGAGCTCTTCTACAACCTCCTTTCGAACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr3R 30537702 5' - roo 336 2 68.49 TTTAGGCTGCAGACAGTCTTTAAAAATTATGTTTATGATAATTATTATGGCATATATATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 + chrX 6186238 5' - Transpac 5222 2 44.52 AAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAA:1 + chr2R 3338780 5' + Juan 56 1 54.79 ACGTACAGTATGAATGTGTGTGTGTATGTTGCTGGGCAGGAGTGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGAGGCGACATGGGTCTACAAACTTGAGCTGGGTCTAAGTCTCTGTATATATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGT:1 - chr2R 17462234 5' - INE-1 160 1 67.12 AACCTTGGGCGTGTGCTCGTATGTATATTCGTTTTGCATATTGTTCGCCGTCTCATATCTAATACCTTTAGAATACGCTTGTATGCGGCGTGCCTCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACC:1 - chr3L 6721710 5' + I-element 5094 1 63.70 TTGTCATTTGCGCTAAGTACTCTTGGCCGTTCATTTTTTTTATTTTCTGGGCAAACATGACAGCAAACATTAATTTCGCCAGCACAGCGCGGTAATAATAAGAAAAATCAATTTCAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATAT:1 - chrX 7785730 5' + Stalker 6773 2 65.75 AGAATAGTATCATTGATAAGTTGTTGAAAAGTATGGATTAAAAGATTTTAAATATTTTGGCCACTTTTATGATACAAATTGATTTTATGTTGTTGTCTTAATTTAAGCTTTTATCCAATCTTTTATTTTATTTCACTTTATTTTCT:1 - chr3R 29772625 5' + transib1 1900 1 80.14 CAAAACCTTTGGTTACGGATGCATTGTATTAATATGTTTTGAACTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGAACTGGC:1 - chr4 1121541 5' + INE-1 100 1 54.79 ACCATGATGTAGTTCTTTAGCCCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr3L 21636382 5' + 297 13 2 77.40 TTTGGTTACTCTGTCAAGTGTCGACCATAAAAGACGATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATTTATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr3L 13888846 5' + 412 6 2 79.43 CCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chrX 140081 5' + blood 7040 2 50.98 CATACGTCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chrX 10694240 5' + Transpac 4948 2 65.75 AGTTGTCGTCGTCTTCCACATTTCGCATTCGGTTTTTGGGGTAGAACTTGTTTTCGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - 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chr3R 5972372 5' + Doc 314 1 60.27 TAGAAGGCACATTTTCAGAAATTTTAGGATAAATTGTTTGTTCAAATAGTATTATTTATAAAATATTACTATTAGATATTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chrX 12105349 5' + 412 7094 2 56.16 CCAGCGCCGTGAAGCGTCGCCGCACCGTGATCGATGAGAGCGAGGATCGCACTCTGTCCGAGTACTCGGTGAATGCCGCCGCCAAGGGAGATCTGAAATCGAATGTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 - chr2R 14571812 5' + FB 32 1 76.61 CGTTGGTATACATATCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr3R 9551030 5' - P-element 2863 1 69.18 TTGCTAAAATAAATTGATATGTAAATTACTCTTTTTGGGTATACTTTGGCCAAAGTATTCCTTCCTAATTGAAGTACCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAG:1 + chr2R 23278348 5' + mdg3 44 2 54.11 AATTTTAATACGCAATTACTGGCGTTTCAATGACACTCAATGATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 15917680 5' - roo 332 2 70.14 CTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:2 - chr3L 9522123 5' + opus 7182 4 70.55 TTAGCGCTGTGATAGAGCAGGTCATAAAATATGCTGCTTAATCCAGTACGGAGATTACCTAATGCGGAATGGATGCGCTAATCCCTTTGTTGACAGACCCAAAACAATATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGA:1 + chr2L 13229649 5' - Stalker2 389 2 71.92 GAACGAAAAGCGCCAGAAATATATTTTCCAAAAACCGAACTCAAGCGTTAAATTGAACGTGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chr2L 20551057 5' - 412 7486 2 59.59 TTCTGGAGTTATCTTCCACGTTACAAGTATATTAGGCTTAATGTATTGAATGTTTTTATTTTTATTTTTTTTTTTATTTATTAAGGCATTAAGGCAAACTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCA:1 + chr3L 24213338 5' - X-element 4656 1 53.90 GTGTGAATAGAAAATAGAAAATAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAATGGAAAAATAATGCAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 13244235 5' - pogo 2080 1 57.53 ACCTTATTCACTTAAGAAACATACACAAATATTCGGTGTTTAAAAACTTTGTATGTGTTGTTTCATTATAAAGGTTGAGAATGGCTATTCAACAGCCAGTTGATTGATTAAGAAACTAATTCCTTTTCTTGTTTTTTTTTTTCTTT:1 + chr3L 9213218 5' - gypsy7 5013 1 52.74 CAATCCCTCTCACCACAAAACTATTTTGGAAAGCATCACGTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1 - chr3R 5518389 5' - Transpac 5151 2 71.23 TCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAG:1 + chr3R 5170988 5' + F-element 99 1 79.45 AAGGATGCTGATTTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGTGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 25203741 5' - 1360 3341 1 52.74 AAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAAACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 + chr3R 14277914 5' + P-element 95 1 20.55 CTCAAAACACGCAAACAAATTAAACTCCTATGAATTGAACTTGATTGCATACCAACACAACTGATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGAATACCACCAATA:1 - chr3R 7679544 5' - R1A1-element 232 1 54.55 GAAATCTCAGTACTTGGCATGTGCTTGTGTTTGAACAGGATATGCTCGTGCTCCGCTTATAATTGGAGCATAAAGAGAAGCTGTAAGAGATGTGCAAGGCCGTAAAAAAGGCCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAAT:1 + chr3R 20100202 5' - 412 496 1 77.40 AATAGAGGGTACAAACAAGAAGTCAGTAGGAATGCAGTTCTAGTTGAAGCCCCTGAAAGCGCCCTGAAATAAATTTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAA:1 - chr3L 18154517 5' + jockey 4565 1 78.77 GGGCTTCCTTCTAACACACAAGTTATGCACTTTGCCAAAATATTTGCCAGCAAAGTGGCATCAATGAATTTGTCCCAAGAGGTCTCCTCCTGTACTTTATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2L 7336069 5' - pogo 2081 1 70.55 GAGGGGTATAATATATTTCGTCCAAGGAATATGAAAAATATACATAATTTTTATTTGAATAACAATATTAATTTCTCAGATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTA:1 - chr3R 15585660 5' + I-element 5331 1 56.16 TGGACAGTTAGGAATTGAAGTCATACTGGGATAATAGAGTTGACATATTTACTAGGGGACACGCTTTCAACCCTATAAAGTACTCTTGATCAGGATCTTAAGCCAAGTAAAACGGACCACCTCCGTCCGTATGAACTTCGATATCT:1 + chr2R 8048603 5' + INE-1 133 1 76.03 GGAAGGTAGGCTACGGTTTTTATTGCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGTCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAATACGATGCGTAAC:1 + chr3L 19349885 5' + 1360 9 2 74.29 AGCCTGCCTTCGAAAGGGTTACTTTTCCAACTCATTGGCAATGGGTAAATGGTATACAATTTAAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAA:1 + chr2R 12248926 5' + Juan 4043 1 73.97 ATTGAAATTAAATGAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGATAACTCGACTGACTGCAACGCTG:1 - chrX 14347007 5' - flea 141 1 89.04 AGCTACCTTCGAGGAAGATCGATGGACATGATGCCCACGCTTTGAACAATTTATAAATTTCTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTGAGGATATCTCAAAAAAAAAATGATGAAATTTGCGTTCGAATTCACACTAGCTGATTAACG:1 - chr3L 20033481 5' + INE-1 535 1 55.48 CTTGGACTTTTTCCCGCGACGGTTATCACCAATTATACACCAAATGCCTGCCAAAAAGGTAAGTTCGACTTGGAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3R 15137216 5' + roo 12 2 71.92 AGTACCGACTTTTAGGTACCTCTACAAATAATTTAATGGCAATATTATAGAAAATGAATATGTTCATTATATATTTATTTATAGTGTACGAAAAACGATTTAAAATGCTTGTATAATCCACACAAGCTGAATAAATATAAATAAAT:2 - chr2R 16726845 5' + Burdock 306 1 69.86 AAAACAACAAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGGAAAAAAGAGTATGCTAACATAAAAATCAACAAAAAGAAATCAGAGAGATGTACACACACACACACACA:1 + chr3R 11096935 5' + accord 7026 2 67.77 GTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGT:1 + chr3L 27356086 5' - Tc3 1631 1 70.55 GTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAAC:1 - 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chrX 18767898 5' + hobo 69 1 63.70 TACAACTACAATGCCGAAGGTGACGGATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr3R 14277898 5' + P-element 26 1 47.31 ATGGGAGCCAGTGGCTCTTTCTCCGTTTTGGGTTTCTGATAAGAAGCTCCATATCTTTTGCCATATGGGCCGTAAACCCGAACCTGTGGGGGTACCTTAAACAATATGTGTCGAATAACTCCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTG:1 - chrX 4565529 5' + HB 1208 1 50.34 AATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 + chr2R 22596099 5' + Doc 79 1 69.18 ATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTTAAAAATACTTTATCTTGTATTCTTCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGACATCTTGG:1 - chr2R 5265147 5' + Q-element 488 2 62.12 CGAGCGCAGCAATGGAAATATGGGAAAATACACACACTCACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTGTT:1 - chrX 20942227 5' - hobo 2887 1 51.37 AGCTTGCCACCAAAAGTCACGAGTTTGATCTGCTACTTATAATGGATTGCTTGAGGGGATTCGGGACCTATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACAT:1 - chrX 4167878 5' - roo 8917 2 52.41 GATAGAGATGATTGTAGCCAATTTAAAAATCGAATGTAAAATCGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTTTAATTGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTTTCCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAATCAAAAATTTC:1 + chrX 19502111 5' + FB 150 1 71.23 GTTGAACGTAGCATATGGCATCTGTAATAAGTGTTTAATACTTCTGTATATATATATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACA:1 - chr3L 2668946 5' + Bari1 36 1 58.33 AACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGC:1 - chr2L 18173671 5' + blood 7080 2 62.33 GTAAAAGGAAGCGCAGAATTGGAATGCGGCATTGAATTAAGACCTCCTTTCAGAATAGGTCGGCCTAAAATATGTAAGTCAAAATAATAATGTGTAAGTCTTACGTTGGACATTGAGGGCTTTCTTCGCCGTGTTTCGTTCTTTTC:1 + chr4 952398 5' - Tc1 497 1 68.49 GCCAGCCCAAACAATCGGACGACCCTGGGGTGTGGTTTTAAAATTGGTTGGTAACAACACTGGTATTTCCTTTATCATTGCCAGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 17875924 5' - opus 7476 2 55.48 CCAAACAAATTATTTTCCCAATTTAAACTGGAAAATTTATATACTCCCTTCGTAAGCCCACCAATATTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 18319751 5' + jockey 62 1 55.48 AAATGATGGAAAAGTTAAGAATTAAACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2R 8596902 5' - pogo 2063 1 55.48 TATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr3R 24010997 5' + roo 8747 2 76.55 GAGCGCCAACTTACTATAGAGGAAAAATGGTGTGAAAAACATTTTGTGGACACCCATGTTCGTCAGCCAATCGCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTAC:1 - chr2L 22181241 5' - R1A1-element 5121 1 48.63 CATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 9551014 5' - P-element 2847 1 58.22 AAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAACTCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTGTATGTAAGACTTT:1 + chrX 21227122 5' + Tabor 77 2 65.07 TGCAATTTGACTCGTAGCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACA:1 - chr3R 2525982 5' + Stalker2 7309 2 57.53 ATAGTGGATGGTCCATCGTTATTAATTAATTTTATGAACGATTTCCCCACCCGAAACGAAGATCCTAACACACTCTATCACTTGCTCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATT:2 + chr3R 10062111 5' - copia 254 1 55.48 CCTCAGGTTGCACATGTGGTGAACAGCGCGACGAGTAAATTGAAATGTCCCGTTCACTGGACGTGATCACTCTCACGCTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 + chr2L 21909033 5' + transib2 39 1 57.53 ATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chrX 10694260 5' + Transpac 4968 2 55.48 CTGGGCGTGAGAGACTGACTAAGAAGTCAAAGAGCTATGAGTCAGAGTATTCTGAGAATGTCCTCAGTTCGAGGAAGAGGTATTAAGTCGAGTTCATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chrX 4200871 5' + FB 27 1 67.12 AAATGTAATATCGCTATTTCAATAAAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACC:1 - chr4 637832 5' - roo 8785 2 74.63 ATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 + chr3L 27415198 5' - transib2 2779 1 54.79 AAAAAAGATATGCCACGTTCTTAATGTACACAGCGTGTTTAGAATTGAATTATACGATTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2L 21777879 5' + pogo 58 1 59.59 TTATAAAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr2L 11725050 5' + F-element 62 1 59.59 ACTTTAATTGGTTTAAATATGTTACCCCTATACCATGAGTGTCACAACTTCAAAAAGCATTCAACTTAAAAGCCGTGTCCGCTATGAACATTGAATACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAAT:1 + chrX 9483089 5' + S-element 461 1 65.52 AGACAACATTGTTAATCTTGCTAATATCCTTATAATTATCGATATACAACAGCCATAATAAATTACATGTTTCGGCAGTGATTTGGCACATTCCAATCATAATAGATTATTCCAATATATTCCAATATTTATCGATATCCCAGAAA:1 + chr2R 17263449 5' + INE-1 498 1 72.60 GCTGCGCACTCTCCTCGCTGCACCCAAGCTCTTCAACAGAGCTAGCATTTTGTCCATGCTGTACAGGTGGGTGGCTTTGTTCAACTCAAGTGAAAAAGATGAACTGAACGAATCCCCAAACAATAATAATAATAATAATAATAACA:1 - chr3L 15135650 5' + mdg1 28 13 68.49 AACAGTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 - 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pogo 2038 1 60.96 ATTGCAACACTTTCCCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCATGACTCACCAGC:1 - chr3L 9522166 5' + opus 23 2 62.33 ATGTATAATCAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2L 20508399 5' + pogo 58 1 64.38 TACGACAAATTTCAAATAATTTTGGAGTATCGTAGAAATTGGGAAAAAAGAATGGGCGTGGCAAAAAGTTTTTTTTTGTCAAATCAATAGAAATTTACATGACTAATAAAAATGTGAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTGTG:1 + chr3L 24159205 5' - INE-1 259 1 67.81 ATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 21938156 5' + roo 8718 2 59.72 CTTCTGAAACTATTCTACTAATGTGTGCGTTAAGCTCTTGTTGGTTCATATTGACTCTGTTTTGTTCTGTCTGGCTTACTGAAGGAGTGGGTGGTCTAATTAAGTTATTAGTATTTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCA:1 + chr3L 25191711 5' - jockey 4785 1 79.45 AATGTGTAACATACCTTAAGGGCGTTTTCTTTTAATGTTTTTACTGTTATGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 - 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chr2R 2016895 5' - 1360 3305 1 73.97 ATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATATA:1 + chr2R 18035126 5' - R1A1-element 5274 1 68.25 ATGCCAATTTTAATTCGTATTTTTTGCCTCTGGTTGCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGC:1 + chr3R 19996196 5' + Quasimodo 76 2 72.60 TTGGAATGGAAAAGCGAAAAGCATATCAATTAACGCAACGCCATATAGGAGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1 + chr3L 8249376 5' - HMS-Beagle 178 2 65.75 GTGTTTTGCAATCATTTTCTGGCCAATGTCTTGGCATGCAGTCTCGGCGTTATCTAATTCATCACATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACC:1 + chr2R 5716450 5' + mdg1 135 2 55.86 AGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 13684789 5' + 412 7103 2 50.00 GAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr3L 21292585 5' - 412 412 2 71.23 AGGAAGTAGGAGGCCACCGTCAGACCGAAGAACATGACAACCTGGAATAAGCAATAAATAAGTTATGATAAACCCTTTTCGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chrX 13152848 5' - pogo 2073 1 63.70 ATGCTCTACATGTTCTCTCAAGAAAGATAGTACTACCCTTACCTAGCTACCAAAAGGTATTTAAATAATATAGCATCATTCAAAAACCAAGTATAAATAGGAGGAAGCTATAAAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr2L 1729701 5' + Transpac 12 2 65.75 TAATCCGAGACCCGAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr2R 14431190 5' + Doc 41 1 44.85 TTTTCTATAGTTAGGGAAGCCAAAGAGCTACTCTTAAATAAATACATTTTCGGAGCCCTTTTGCATTTGGTTTTAATTTTTCATGTAAATTTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chr3R 11208785 5' + jockey 4686 1 70.99 AACATAATTATGCAATACGAGGGGGAATGGCAACGGAAAGTTGGCCAATCTGATAACACGCAACGAGATTTGTCATCATCAAACAAAGTGGGCGTGAAAATTGCGGATGAAAATGGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAGAGGACTT:1 + chr2R 14805233 5' - Doc3-element 4286 1 76.03 GTAATATAAGAGCTGAGAGAGAGGAGAGAGCAGTGATCGTGTACATGAAAACACGCACACACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCGTCAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 10547602 5' + P-element 10 2 77.40 GCGAAGGTGGCTACATAAGGCCTAAACCAAAACCAAACTAGGCTAGGCAACATTTAGATGAATGGCAGAGGGCGCAGTGCCAGTGGGTAGGGTATATGGCGAGGATGCACTGCAAAAAATTGCCCGCCGTCACCCAGGACGCCTGT:1 - chrX 11653367 5' - Rt1b 4833 1 81.51 ATTTCCTCATTTAACTCAAATGTTAAATAATATTTATTTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 + chrX 12105261 5' - 412 7467 2 76.55 AGCCAGTTATTTTGATACCCTGAAACCGAGGTATATGCCTTTTTATGAGAAGCGTGTACAATATAACCGAAATACACAAATATGGTTGCAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr2R 24808001 5' - I-element 5326 1 67.12 TTTGGGCTATAACTAAAAAAAAAAGGATTTACAAAAAAAAAAATAGTTAAAAACGAGTCAATAGTAACAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 + chr2R 13491884 5' + FB 49 1 54.93 CAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAG:1 - chr3R 10751691 5' - hopper 1322 1 76.03 CTTCCAGTCGAGAGCGAAACCAAAACTTATGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTT:1 - chr3L 739221 5' + P-element 92 1 22.60 GACACACACACACACACATGACCGCTTCGGGCAATTTCATTGCCGCTCAGCTCTCACACAATTGAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAA:1 + chr3R 30350082 5' + jockey 4816 1 54.11 ATGTGTACTGACCAATATTTCTGTTTTAAGAAACACTCACTATTGGCTCGACATATTTTTTACAAATTTTGGTCTTACGACTGTGTGCGCATAGCTTACGTAAATTTGAATTAGAAGGTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGC:1 + chr2L 8981305 5' + invader4 261 2 76.03 TCTATGCCAGCTACTCAAACAAAATATAAATAAATCCTTAGGGAATCAACTCCGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr3R 5518275 5' + Transpac 32 2 63.70 TGTACCAAAATATTGTGCAGAAAGCTGCTCATTCTTTGCCTCTTTTTCAATTTGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr4 919188 5' - opus 484 2 55.24 TACCATTTGACGGGCTCATTCATTAAAGTTCCACTGGACACCCTACGGCATTTACACCAGAAATAATTTATCGCATCAGCGACAATTAGCATCGACACATAGAATGTTAATCCGCTGTTATGACAGCTGTAGCACCGGGTGACTCC:1 - chrX 18031761 5' - diver 5905 2 56.16 AATAATGGTCTTCCAGCTGATTTCGTTGCTTTTGGAGCATAAGAAAATGCCCATTTGATTTTGTCAATGCGCTGGTCTTTTTTCATACAACGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 - chr3L 20765283 5' - 297 372 2 70.55 AAATTTTGTGTTGGATGTCAAGAGAGTGGGTGCCCAGTGCAGTTTATGTGCATAAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCTCAGTTTT:1 + chr3L 21362684 5' + G6 47 1 52.08 CGCTGGTCCGCATTTTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chrX 20456979 5' - opus 7466 2 56.92 ATAATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGTTATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTATAACATCTTG:1 - chr3L 8249514 5' + HMS-Beagle 6810 2 73.94 CCCCTCCCCCCTGTTTTTGCACTGTGTATTGGCGGACGCAAAATTGACGTCAGCATTCTTTATTGTTACTCGTTTCCACGGTCCGCCAGTGATGGCTCTCNGANTCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGC:1 - chrX 18368839 5' - F-element 4299 1 50.00 GGATAATTAACGGAAAGTTTTGAGTCACGATTCTTCGCAGCACGCGTAAGTTATTTCGGCATTTCCATTTCCACCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2R 11663930 5' - P-element 2841 1 54.79 GGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAATATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGA:1 - chr3R 17766816 5' + HMS-Beagle2 6943 2 60.71 GACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCC:1 + chr3R 8381714 5' + Tirant 69 2 64.38 AAAATTGTAATTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATATATTGGTTTGGC:1 + chrX 3831440 5' - 1360 3361 1 47.22 AATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 - chrX 3559634 5' + opus 7073 4 77.95 GGTTCGACTTTTGTTGCGCCTCCCAAAAGTATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGATACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGC:1 + chr3R 31458338 5' + jockey 5 1 80.14 TAATGAACATTAATTGCGCCACCAGAGTCTTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 - chr3R 7042099 5' + Stalker2 41 2 53.42 TTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACA:1 + chrX 6283679 5' + P-element 105 1 14.38 AATTAAATCTAACTTTATTAGCACATTTCTGGGCCCTACAATGGGAATAGAGCTTGGTGCGAAGCTACTTGGCACAGTCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr2R 22761281 5' - 412 451 2 56.16 ATACGAACCGGCATATAATGTAAGCCATATACATTTAATGCACAAACATATACATGTATTAATTGTTTTCTTAGAGTCTGACAGTGCCGTTTAAAAAGTCGAATCAAGTTATACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACT:1 + chr3L 7793716 5' + Ivk 4932 1 37.67 CTGGTGGTCCATCGGAACCCAGATCGTGCTATTGAATCCCATCTGCATATGCATTTACACACTGGTCAGCTGGCTGTTCTTCCACGATCGCATCTACGTCGAGGATTTATTAACCATGTCCCCCGGGCACTCAATTTGTGGGATAA:1 + chr3L 13019274 5' + Ivk 202 1 71.92 GATCAGAGCAAAATGGAATTAGTTCCGGATTAATGTTTTAGTTCTACTTGAAAGGACAACTAAATGTCACGTACTTGTTTTATCGAGAATGGGAAAGCTTGTTCACTGCCCGCCTTATTACTCCAGACGCGGTCCTCAATTCTGCA:1 + chr2R 22578409 5' - diver2 4426 1 61.64 GTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1 + chr3R 9550902 5' + P-element 63 1 40.43 TGGAAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTTAAAGATCC:1 - chr3L 25350821 5' - baggins 5376 1 58.27 ATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 20168282 5' - roo 8997 2 65.75 GAACGGAAGAAATAGTTACTTAAGACATTAAGTGATTACACAATATAAATGGGCAAAAAAATTTCGAAATTCGGTTTAAGTAAATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 22041021 5' + roo 8681 2 73.97 GCAACAACCGAAACCGACTGCACTACCAATCCGAGCTCAACTAAAAGTCAAAGATAATGTATGGGACATAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAGAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCA:1 - chrX 2104800 5' - roo 358 2 50.68 GAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 16200745 5' - roo 9001 2 66.67 AAGTGCTGAGCTGTGGATGTGTAGTTTGGGACTGAACTATAGCGGTTGACTACTCCTTAATACTGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 - chr2R 25083390 5' + pogo 54 1 54.79 TGGATATAAAGGTCCAAAATTTTTTTAAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr2L 20550917 5' + 412 22 2 67.59 ATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGCGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAAG:1 + chr3L 8249381 5' - HMS-Beagle 174 2 68.28 CTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATATAGACGTTCATACGGACGGATCCTGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chrX 392290 5' + flea 4802 2 59.38 GGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTATAATCAACTAATAAATAAATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAAACGTAGCGATCCAGTCTGCATGACCGAATTCGGGCGGCC:1 + chr2R 5532342 5' - Doc4-element 448 1 73.29 GATTTTATACAAAATTTTTGATGAATTTATTTATTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chrX 16996157 5' + roo 58 2 58.22 ATGTATATTTGTCGCCGGCTAATGTATGGAATTTAAATTAACAAATTTTCACAGCATTTTTGGAGCTTGTCTCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAG:1 + chr3R 17199919 5' - R1A1-element 220 1 50.68 ATAAAATGATTCTATTTTCATCGCCCGAAATGATTCGCTGTTCGCTGGTCCGCATTNTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chrX 20457021 5' - opus 7492 2 77.40 GGCAGATAAAATGTATCTGAATGTTCGCTCTCGATGTGGTGTGGGCTCCAGATCCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr3L 8754703 5' + mdg3 15 2 73.29 ACACCAGCACCAAAAGCGCCCACATACACACGAAAAAAATCACACGATATTAATATTACACTTAGTATTTCAATTCGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - 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chr3L 21202077 5' + G2 2657 1 71.01 ATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCG:1 - chr2L 21657039 5' + invader1 3687 2 81.16 TTTTCCCCCTGCAAGTTTATCATTTGCAGCCTTAGTTATGCATAGTGTTCCACACACACACACAAGCACATAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGC:1 + chr2R 20449369 5' - X-element 4641 1 52.05 GCATACTTTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGCGCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCCCCAGGA:1 + chrX 7845740 5' + hopper 84 1 69.86 GTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGCATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 13453406 5' + 412 42 2 54.26 GGGCAGCGCCACGTTTTCAAATTGGAAAACAACCGATATGGTCATACTATCGGGGTCCGGAATTTACTGGCTAACAGGTGTGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 16349329 5' - P-element 2846 1 57.53 ACTAGACCCCATTTTTTATACAGATCAACTGCTCAACCTAAATTAATTATGACAGTTTGTTTGTAATTAATTAAATCATTATTATTATTAAATAATAATCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAA:1 + chr3L 5276486 5' + McClintock 5989 2 67.12 GTCATTCAAATACATGAGACTCGCCTGTTCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATATTATTCTATCCTCCGGGTA:1 + chr2L 21400960 5' - G5 4668 1 79.45 TTTCGTCTCGAAAATTGTAAACAAAGACTGCAGTCTTTTCAATGTTGATCAATTATGAATACAGTCAATTTGGTACATAAAATAGATATGTTGCTTGCAGCGGCTGATTCAGGGTAACTCCTTTTAGCCGGATTTGAGGGGTGTTC:1 - chr2L 13568424 5' - Helena 843 1 56.16 GGCGCAATATGAGCCCGTGGCGGAAATGGCGTTGCAAGTTAAGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3R 23104494 5' + jockey 86 1 68.97 TATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chr3R 13684782 5' + 412 57 2 54.79 ACACACACACACACACTAAGCACACACACACACACAATAAGACAAAACACTAATACCAGTACACACAAAAAAAAAAATAGTTAAAAACGAGTCAATAGTAACAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGCCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr2L 6110891 5' + FB 15 1 47.89 CCTTGGAACTTTTTTCTTGGGAAACCTCATTATTATTATTACTTCGTATTTTTCGTTTGGTATTACCAATTCCCAAACTGCCAGTAGCTCACCAACTCCGGAACTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 - chr3R 30518994 5' - I-element 5340 1 69.18 ATTTCGTTCATGGCAGTTGTTGAAAAGTATATTAAAAACAGGCATAACCAAAAGAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCCCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 20044495 5' - roo 397 1 74.66 TATATTAAGCCATCTAAAACTTGTTAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGA:1 - chr3R 6603071 5' + gypsy 50 2 51.37 GGTAACTTCTTATAGGTTCCTCAACCAGGAAGCGTTCCTGTCCAAAGTCTGGCTCAATAACAGGCTTCCACAATATCAAGGGATTGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 9599768 5' + roo 22 2 68.42 TTGGCCAGGCTGGGATTTCGCTGTTACGGCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTTTAAGCGGCCAATGCT:1 + chr3L 20934143 5' + Max-element 33 2 59.05 CGTCGTTGGCGTTTAAAATAAAAACACTTTCATTTCTACCTTGTATGCGTACTGTGAACTTTGCTCTTCAAAATCGAAGATAATTATCTACGTGTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACT:1 + chr3R 14401838 5' + Juan 4085 1 64.38 CGAAATGGGGAAAAATGAGTAGAACTGGGGAAAGTTGCCAGCCAGCAGGTGCTGCTGCTGCTGCCTCCCTTTCCCCATGCCTCTTTCCTGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAG:1 + chrX 6171025 5' + copia 4752 1 60.27 GAGGAAAAATGGTGTGAAAAACATTTTGTGGACACCCATGTTCGTCAGCCAATCGCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTAC:1 - chr2L 22181223 5' - R1A1-element 5121 1 53.91 GCTGCTGTTCCCTTCCATCCTCGCCCTCCCTCGCATTTCCCGCCGCTTTTCCACTCGCTTTTCCCCGACACAACAATAATATGGCGCGCAATATGTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr3L 2687150 5' + jockey 4689 1 71.22 TATTACTAGTAGTAAATACAAAACACCTAACGAAGCCCAACATACTTGAAAAGTATGAAAACGATATATCGATAGCGATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACT:1 + chr2R 4902258 5' - Quasimodo 7329 2 60.96 TACATGATAATTATAAACCCATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr2L 18738052 5' - roo 346 2 60.96 ATTATATGGATATTTTTTTATATGCCGATAAATTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGATACAAATCACAATAATAAAGCTTTATTGAAAAACGCTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - chr2R 5395073 5' + HMS-Beagle 6818 2 70.55 ATACTCTATGATATAGTCATAGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATT:1 - chr3L 21202133 5' + G2 2609 1 67.12 ATAATATGTAATTTTTTAAATTAGAAATCATGACTCATAAGTTCCATATTACATCACACATTTTTTGTGCAAGTGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 21679565 5' + roo 8711 2 54.11 AATGGCATTTTATTTTCGGCTTTCATACTGTATATATACTGTATAGCCTGCGAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGT:1 - chr2L 13328554 5' + BS 6 1 77.24 AAAATATTAATAAAAAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGCGACGTATTCACGCCAACTCATCACG:1 - chr3L 23839776 5' + McClintock 5959 2 80.14 AGAGGGGGAGAATCGTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 - chrX 17495848 5' - Burdock 6372 2 71.92 ACGGGATACCCTGAATATTATAAAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 - chr2L 11725067 5' + F-element 45 1 57.53 CCTTTGTCTGTCTAATATTTTATATGCTCGGTTTCAAAAGTAACTACATTTGATAACCACAAAAATGTTGCAAAAATAAGTTGCTAAGGTGAAGTTAAAAGTGAAGTCGTTAACTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 + chr2R 15406167 5' - I-element 5346 1 76.03 AAAGGCACTAGAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTCCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:2 - chr2R 16073045 5' - opus 465 2 63.01 TAATTTACGTTCTTTGTTAAGTTTATAATCTAAATAAATGCATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATAAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 22435582 5' + roo 8740 2 70.55 TGTGACTTATGCACCGCGATGCCTTGACTTTATCCCGCCATTAGCCGGGATGCAATTGTCGTACCTACATGTATGTATCTGATGACTCAAATTGGGTCACCAGATAGTGCTCAGATTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTACTTATTA:1 - chr3R 9596182 5' + Q-element 514 1 80.00 AATCAGCTGTAAAAACTATTTAACACAATTAATACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTG:1 - chr2L 3175178 5' - Burdock 173 2 73.97 GGCCGATTTCTGAGCTATATATGTACGTCCATTGTCTGAACCCCCGTTAAATATGTCTGAATCAGGGTCGCCTGCCGCGGTTGCATGTAATCGCAGCTGGCAGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 - chr3L 17758078 5' - Tirant 394 2 80.74 CCGAGCGCATGCGCATGCGCCACACACGTTTTCTCGCTACGCCGCCTGCCGGACGAATGACGAATTGCCCGAAGATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr2L 3632095 5' + P-element 10 2 77.95 CCCACATTGTCGTTCTGGAAGGAAGATATCATTATCAATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTACATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chr3R 13676114 5' + P-element 84 1 28.08 ATTTGGGAACGTGCTCTTCGAACGACGCGTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 + chr3R 7512831 5' + jockey 4714 1 54.74 ACTAAAAGAATGATAGAGTTTTATGAGCCATAAATATGAATTAAACATGCGATGCCGAGATGGAAAATGTTAGATATGTGCTCGAAAATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr2R 16072883 5' + opus 7030 4 63.01 AAAAATAAACTGATTAATGCAGATGGCATAAAACGATTTCAAGAATTTTGTAGTTTTTATTCGGGCAACGATACGATACGATACGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 + chr3R 24074725 5' - jockey 4956 1 58.22 CAGAGTACGCATACGCACGTAGACAGCAGCGGTCAAGGAAATAGGATCGATGCCTGGCATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCA:1 - chr3L 611594 5' - mdg3 156 2 60.27 GATATTTGAGAGCAGTTAGAGCCGATAAAGAGCGGCCGAAACGGATGCGAAACGAAAAGGAACGGAACGGAAACGAGACACACACACACACACACACACACATAA:1 - chrX 3465897 5' + Quasimodo 39 2 66.67 ATTTCTTATGCACGAACAACTGGCATTGCGTAGGTGTACTATGTGTACATACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTAT:1 + chr3L 8158006 5' + flea 4822 1 65.07 GTTGCGTATGAATAATAAACAGAGGCATGCCAGTAAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTC:1 + chr3L 2668810 5' - Bari1 1680 1 65.75 AGCGAATGGACTTTTTGAAAGAGCGTTAAATGAACCAGTTCTTAAATGTACAAGTTCCAATGTACAACTTCAGCCCTGGTAAGTTCCGGTTCCACGGACAGCTGAGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chr3L 4286961 5' + P-element 14 1 30.82 AGGTTTGACAGCCAGTGGGTGGACGTGGTCTCGGGAGGATCATTTTTATTTCTTAGATTTTACAGGTTACATATGTATGTTCCGAACTTAAAGCAGTCCTGAGTGCTTAAATATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2R 14484048 5' + pogo 6 1 77.40 GCCCTTTGTTGCAGGCGAAGACATCGTCATAAGATACTTTGCTGCCACCCCAGAAAGCCTTTCAACCCCTTATTCTATGTTGGCTCGACTGCTTAGATATGCTATATATACTTTATATAGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTTA:1 - chr3R 12293653 5' - INE-1 33 1 69.86 CACTCTTGTCTCCGTCCCCACAGGACACGCAGCAGCAGCAGCATCAGCAGCAGCATCAGCAGCCACACCAGCATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATA:1 - chr3R 21343050 5' - 412 56 2 50.68 TTCCGCATTTATTTTTATCTTTTTTGGCAATCAGCATCAGCCGAAAGGAATTCCCCATTGACTATGCCGGTGTCAACAAAGTGGCGGAAAAGAATTAGGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTA:1 + chr3R 6602921 5' - gypsy 7425 2 69.18 ATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 27007423 5' - roo 328 2 68.49 CCAAGGGCAGCGCTTATCTCCTGAATGTCCTGCACCATGAGCAATCATCCGCCTCCTCATGTCTAAAGGGCTTCAGGTAGCTGCGAAAGCAACCGTGCCCGCTGATCAGCTGCGTTAGGTGGAACGTTATTTCGCCATGCTTCCG:1 + chr2R 1807214 5' - Rt1c 4969 1 73.10 ACATTATAATAATGGTCTTCCAGCTGATTTCGTTGCTTTTGGAGCATAAGAAAATGCCCATTTGATTTTGTCAATGCGCTGGTCTTTTTTCATACAACGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr3L 20765290 5' - 297 379 2 75.34 AAGTGTAAGTTTAACGAGTGTTTTTTTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCG:1 - chr3R 23021036 5' + INE-1 550 1 61.64 ATGTATGCATGTATTTGATTTAACCCATCACAATCATTTATTCATCTGCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTTTTGTTATCTAAG:1 - chrX 3452924 5' + roo 91 2 65.75 AACAAACATTTCATAATTAAATATACGAGCATTGATGCATTTTAATTCGGCACTTCTGCTGTTTTAATGAATAAATACGAGTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chrX 3559561 5' - opus 7469 2 50.68 ATAATGCAAATGTTTACATGAGAGGCAACGGGAGCACGAAGGTCTTGAACAACACTGCATAAATCAAAAGTAAATATGACGACAAATGTGTTCGATGGATAAAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGACGAGATA:1 - chr3R 17966183 5' + G6 426 1 72.34 CTGAACCCCCGTTAAATATGTCTGAATCAGGGTCGCCTGCCGCGGTTGCATGTAATCGCAGCTGGCAGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 - chr3L 17758043 5' - Tirant 8457 2 53.47 CATTGTGGCCATTGTTGTGCTGCTAAAGTGCGACAATTTGTGTTAAACAAAAGACTTGGACAGCCAACAGAGGCGAATATATCCATCAATTCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGCGGAGTTACGTATTTG:1 - chrX 9742644 5' + 297 6573 1 57.86 TTTATACAAAATTTTTGATGAATTTATTTNTTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACNATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chrX 16996154 5' + roo 55 2 57.86 GGGTGTTAGAGTGGGCGTGGCAATATGGGTCTAGAATCTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTGGCTTTCATGCGGGCAGATGGACATACGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCC:1 + chr2L 18111227 5' - INE-1 97 1 45.52 GTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr2L 20550969 5' + 412 7107 2 63.20 AAAAAAAGCGTATTCATACTTCTTGGCCAAAACACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:2 + chr3R 6147223 5' - copia 209 2 58.22 ATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr2L 17136153 5' - hobo 2897 1 67.35 CGGAGTTAAGTTGGGTTCGGCAGCAACAGTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCCACTCGCCACGC:1 - chr3R 19725454 5' + hobo 58 1 54.11 AGAGAGCGGCACTGAGAGCACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr3R 9550862 5' + P-element 28 1 66.44 AGGGGAAAAATGAGCGAAATGAAAATGCTACATAAAAACAAATTGAGTCCGCAAATCGCCTCAATCAAAGTGAGGAACGTATAAGCAAGACGGACATAGACAGCAGAAAGAGACGGAAATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATA:1 + chr3R 24016567 5' + copia 236 1 80.14 TTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr2R 15472119 5' + 412 7142 2 71.92 GCACAATGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1 + chr3R 23415905 5' - jockey 4930 1 58.22 ATTCAGATCATAAAACTTATACAACTTGCCACGCCCCGCAGCCCACTGCTACACTCAACGAAATGGGTATTAGGTTTACGCGTTATGAGTCTTGATCTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGC:1 - chrX 8629662 5' - F-element 331 1 66.67 GAAGATGCTTACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chrX 20024497 5' + 412 38 2 53.57 GGGACTTGTGAGCGGCAGCCCCTCAATCGACACACACCCCCCCAAGACCGCCCGAAATCCTTCGGTTATTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAGAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATT:1 + chrX 9492897 5' - hopper2 1342 1 53.42 GTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAA:1 - chr2L 22684608 5' + transib3 63 1 51.37 AACAGAAATAAATATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTT:1 - chr3R 8867073 5' + Max-element 85 2 74.66 CGAGCAGCGGGGAAAACAAAGCAAAGCCAAGCGGCAAAAAATGTATTTCATTCAGTGCTCTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAA:1 + chr3L 10023972 5' + transib2 68 1 65.75 CCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGT:1 - chrX 21667960 5' + gypsy2 6534 2 71.23 TCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATAAAGATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTAT:1 + chr3L 24796712 5' + Cr1a 443 1 50.00 GGTGCTCGCATGCCATAAGTGAAATTGACTGACGCCTGTGCGTATGCAACACAAAATTGCACACCTCGATGGCGAGCAATGTGTATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 - chr2R 22971923 5' + jockey 4768 1 77.40 ATAATCAATTTTGTTTTAGATGAAATTGTAAAAACGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAG:1 - chr2R 18044105 5' + jockey 4560 1 77.40 GTGGTGGCGAGAAATAGTGTTGCATATTTATGTATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCG:1 - chr3R 25573560 5' + R1A1-element 5172 1 73.17 TTGACCTGCCCCCCTCGCCCACTGGCTGCCTACGGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 - chr3R 15047432 5' + F-element 16 1 69.09 GCGGGCACGGCGAGATGCTAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGTTACTGTTCACACATGAATACGACTATATTTAAAGA:1 - chr2R 6514322 5' + roo 8675 2 57.78 TGGCTATGCAATAAACGCTTTAGCGAAATTCGAACTCGTCCCCCGCGAATATAGAAAAATTCAAATTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGA:1 + chr2R 17355196 5' - Doc 44 1 55.48 GACTTTCTCTCGTCGTCTTTGGTCGTTTGNTTGCCGCCTTTTGCGGTTGCCGGTTTTGGGGTCAAAGTTCAGGCTTCCACTCTGAAAAGTGGATTAAGTGANATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACT:1 + chr3R 30619774 5' + X-element 81 1 60.96 GTTTTATTTTATCTTTTTTCGATGTGCACGTACTCGTTGTCTACAAGCAACTGAACTCGATCTCAGCATTGCAAAGAGACCCGAACAAAAACAGAAAGAGAGACAGCGATTCCTTCCAGTGCACACTGGGCCAGATTCCGTGTTTT:2 - chrX 22908588 5' + transib3 4 2 63.70 GCTGTGGATGTGTAGTTTGGGACTGAACTATAGCGGTTGACTACTCCTTAATACTGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 25083381 5' + pogo 63 1 60.96 CCTTATGGACTTTTTTGTTAGAGTTATCTAAGCCTTAGTACATTTTTTAAAACATCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAA:1 - chr3L 14233135 5' + copia 4937 2 65.75 ATTTTAANGAGGAGGAGGCCGATCGGCGGCGATATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 30788325 5' - roo 9047 1 64.04 GGTTTTTATTGCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr3L 19349899 5' - 1360 3360 1 63.01 AAATTAAGTATCATCCATTGATTTAAAATGAAATTGTGTTTCCCCTAAGATAGATGAATAGATAGTACCTACGTATAAATTCAAATTGTTCTCTGTGTCTTTTGTGTGACGGAGGGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCT:1 + chr3R 28827648 5' - jockey 245 1 77.40 AAGTCACAAACAAATGCGGGAAAAAAACCTTTGAACAAAAAAAACGACTTGGCTAAAAAGCGGCTTAAAACCGCTTCTCGTAAATCGCAAGCATGGAAAGGTATGTGGGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAGATA:1 + chr2L 3847376 5' + 1360 200 1 65.75 GCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1 + chr3R 5170973 5' + F-element 84 1 69.18 ATTGGGCATGCATCATGCACCATGACCCCGCATCAACCTCCTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTT:1 - chr3L 1480128 5' + mdg3 5363 2 73.97 ACTGGAAAAATTATATTGGTCGTGATTTAAGATCGCAATGAGGTAGGGGTTCACTATTGTGTCCTTAGCACTTAACTGTTCGTTAAATTGTTTCCATTATAAACAATTATAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTT:1 + chr2L 9062235 5' + Juan 4038 1 70.55 AAATCAACAATTTACAAAATCTAAACAATGTCTGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chr3L 4287073 5' - P-element 2799 1 23.97 GGTCTAGTCTATGCTTTTACATGTTCAGTATATGTCACATACAGCAAATGAATATTGTTAAATTATTTATTTGCTGTATTCTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 - chrX 407501 5' + I-element 42 1 56.85 GAGTGCCTGTAATCCGAGACCCGAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr2R 14431181 5' + Doc 42 1 47.95 ATATTAAATATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTT:1 - chr3L 23583096 5' - rooA 296 2 94.52 AGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 + chrX 20024523 5' + 412 7123 2 66.44 CTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACACATNGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chrX 21227085 5' + Tabor 40 2 58.22 TGATGATAGACAACAAATCGGACAGATAAAAGGACAGACTGGAATATATGTGCTTTATAGGGTCGGAAACGATTTCTACTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 21157136 5' + 412 41 2 57.53 AGTTGACAGCCATCCAGAAGACTCTATCCGATATCGAAAGGAAACTCGTGCTGCAGAGATATCAACAGATAGGATCGAGATATTTCTACATCGAACACATGCCTCCTCTTATTATAAAGGCAATTAAATTCGTCTTCCACTTCCAC:1 + chr2L 7411370 5' - transib4 2210 1 67.81 TGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTC:1 - chr3R 7042063 5' + Stalker2 77 2 67.81 CGCCAAACATCTGTCTAAGTCTCTTGCAGCGGCATTGGTGCTGATGGTGTTTCCTATTATAGAGTCAGTTTGGATTTCAGTAGATTTCTTAGATTGCTTTGAGTGAACTTAAACTAACTGTTAACAGGTAAGTTAATAGATAAAAC:1 + chr4 902182 5' + Bari2 214 1 74.66 GAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3R 13684770 5' + 412 69 2 61.64 AGCAGGATAATCTGCTCGTAGGATTTGGCTGCATGGAACCATGACTTGTTGTTTTCGTAACAGTCGATGGCCTTCAAAAAACAATCCTTGCTCTTATTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTT:1 + chr3R 10121142 5' - gypsy12 10170 2 63.70 TATTTTGGCCATAGTAAAATAAATTTCTGAGCATTAATAAAGCACAGCTGTAAAATCCTAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr2R 16749829 5' - roo 331 2 70.55 CTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAG:1 + chr3R 12789544 5' + G2 2821 1 70.92 CATCGTAGACCCCATATACCATATCATACCCCTCAGAACCTCCCGCCATCCACCCTGCTTCTCCATACATATATCACCACGCCGTACATACATACATGTACGTATACGTTAACACAATCACAAAACACCC:1 + chrX 17495662 5' + Burdock 6139 2 78.46 CATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAATAAAAT:1 - chr3R 13453437 5' + 412 7075 2 68.57 ATGGATGACCCGACATTGAGCTGATATGTGACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chrX 140115 5' + blood 7043 2 61.87 AGCTAAGCTCGGATATAAAAGTGCACTTGGTTAGCTCGGCGGATTGCAAGGGAAACGTACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGG:1 - chr3L 19130447 5' + Idefix 246 2 60.96 ATACACAAACAAGCAAACAATATAATGATTATACTAATCAAGCAAACAGAAGAGCGTATGTATTTCGCATTAAAGTATGGGTAAGAATGTCATATTATGTTTAAAAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 19731882 5' - roo 394 1 75.34 AATGTTATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 + chr3L 13992257 5' + blood 76 2 69.18 CTTTGTTTCACGTATTGCCCAGATTTAGCTCAATTGTTATATCTATCAGTTCACAATTATCTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1 + chr3R 18343441 5' - jockey 4935 1 58.22 AACGATCGCTGGGAAACTTTTGACTGTGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGATGTCTATATTCTGGAAGGATCAACCATTTTGAAACCGCGCTTAAAGCCAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCA:1 + chr3R 17777468 5' + jockey 4658 1 64.38 CAACTCAACTATGTCTGGCAGTGAAGTCTTTTTCGGGTTTGAGTTTGGGCTAAAAGCAAAAATCCGACGAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr2R 22774510 5' - I-element 5305 1 50.68 CACTTACGATACACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACCCGA:1 - chr3L 8274038 5' - hobo 2918 1 68.66 CGCATACACTGTAAAAAATGTACATATTAACAAAAACATTTGGTTTTTAATTGGCTTTAAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCT:1 - chrX 7847301 5' - hopper 102 1 74.66 ATTCTTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAATCGTTTTCTACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCTAACCGAGTCGATGTGGCCATGTTCGTCTGTCCGTATGAACGTCTCGATCTCAGGAACTATAAAATCTGGAAGGTT:1 + chrX 124082 5' + INE-1 158 1 79.45 TTAACACCTACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr4 868740 5' - roo 9014 2 58.22 CTTTTCGATTCTAATAATGCTGATCACTCGAGAGGTCTTGGGAAAGAGGCAGTCGCATATGTTTTTGAACGCGCCTCCTTAAATTAATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCTTTGCTCTGTGAAAGAGATCTGCGAAGCTA:1 + chr3L 17874104 5' + hopper2 222 1 71.92 CGCGAGCATGGGTTAAATTGAAATGAATAATTGACTAGAGCACTTTTTGATTGCGTTAGCTGCACTTTGAGGTACGTGTTATTTTATTTATTTATGGTGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr2R 18767289 5' - pogo 2081 1 71.92 TATTCATATTTTTGACAGTCTTTTACTTGGAGGGATTCAGTACTTATATTGTTGATTCATGTTACTTTTTATCATCGAAGCTTTTAAAGTGTTTCTTAAGTCTAGTAAGTACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 + chr2R 7769685 5' + Transpac 4927 2 74.66 TCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAATTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGG:1 - chrX 21933292 5' + springer 7207 2 65.07 TAATTAGTGTCGGGTTTCCTCTTGGGTCCTTTTCTGCTTTTCTGCTACGTGCCACCCCCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chrX 1759082 5' + Tabor 6864 2 68.49 ATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTA:2 + chr2L 18112462 5' - transib2 2793 1 63.01 GCTAAATCTAATTTCGTGTAGTAACTTTACCTCAAACAGAATTACACCTTACTTTATTCACAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACACGAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAA:1 + chr3L 17454841 5' - Cr1a 204 1 56.85 AGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chrX 16490434 5' + F-element 47 1 53.42 GACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chrX 6283666 5' + P-element 87 1 24.11 CCGTCAAATCAGCAGGTTGCGGTCGGTCCGTAAGTGCGAGTGGGAGAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 - chr2R 16731350 5' - Tirant 326 2 69.86 CGGGCTACTTTGGGTGTATTTTTAGTTTGAAGGTTATCAGTGTCACTTTGGGTTTTTTTTTCGATTTCAGTTCCTTCTTCGGAAATTTCGATATTGCTTTCCCCGCTTTTCCCATTTCAATGGCTGTGTGTGTGTGTGCGTTGTT:1 + chr3L 16828595 5' - gypsy3 422 1 66.21 CTTTTTAGCCTTCACTGAATCTTGGTTGAACGCAATGCAAGTAAAATGTTTCAGCTAGTCATTTCTGGCATTAAGGATAAGATAACTATTTCATTGCAATGTAATTTAACCATTACTCTTACATGTCCATTACGTTGAGTTTTATA:1 - chr2L 3909098 5' - G4 251 1 69.86 CAAAATAAGCAAATAAAGCCGTCTCCAGCGGTACAACAACAATAGCGACAACTACACCATCGCACACACACATAAGCAATTATTTAAACAATACAAAAAGAAAAAAAAATAAAAGAAAATAAATAAAAA:1 + chrX 15497883 5' + F-element 90 1 50.39 GGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3L 5398155 5' + roo 58 2 58.22 TTTACATGCAAGCAATCCTTCGACTTATCGAAGCCTTACTGTACTCATCCCTTTGTTTGTTTTGCATGCAAACGTCTCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTTCA:1 - chr3L 15273332 5' - pogo 2086 1 74.17 GGTATCTGGGAGTCGAATCTGCGGCATGTGAGTACCAAATTTGAAATTCAAATTTATGAAACTGCAGTGGAGGAGCCTTCGAGCAGAACAGTTTCTTCACATCTGAGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chr2R 24616995 5' + jockey 4686 1 71.92 GTCATGAAAATTCAATATTTGCGAGGGGAAAATATATATAAGTCCTCGGCATACAACGCTTGCATGTGTCGCATATCCTTTGAAAATTATTATTCCGCGTATGGAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 7032619 5' + roo 14 2 76.03 CGTAAGTTAGTTTAATTTTATCAGATTAAGGGATAAATAATCTTAATAGGTTATGGATTTTGCAAGTGTAATATATATGAGCCGTGAGCTAAACTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2R 12379463 5' - pogo 2077 1 65.07 CTACTGCTTCGGTAATAATCTCATATGAAACAATTCAAAATGCCATAAACGTAAATGGGAACTCATTTTAACTGTGATACAAGACACGGTGGCCGCGAACTTTGCAAAGCTGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGAC:1 + chr3R 12118072 5' - gypsy12 10186 2 75.86 TTCATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr2L 19698048 5' - roo 9040 1 59.59 GATTTCCACCCCCTAATTTATTGGGGTTGCAGTTGCCGGGACTCTGACGACACTAATCAGAATTAGTTCCTGCTATATCCTGGCCAAATGCCGACACCGCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAGTGCGAT:1 - chr2L 8615713 5' - BS 89 1 59.26 AATGAGGGGGAGAATCGTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 - chrX 17495850 5' - Burdock 238 2 73.97 ATGTATGTTGGGTGCCATAAAACCTGAAAAAGGACTGAGCGGCGTGCGGACAAGGTGGAATAAAGAAAAGGCTGCGTTTCCACTGGGGAGAGTGTATACTAGATTGTTGAAAAGTATAAAGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGG:1 - chr3L 18233649 5' + INE-1 86 1 65.75 ATCATTGTGAACATCTGTTCAAGCAATGTGACCGCGCTTCTCAATCAATGTTAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chrX 13667780 5' + hobo 62 1 61.43 ATTGTGGCAAACGTATTGAAATGTAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAA:1 + chrX 7480727 5' + Doc2-element 227 1 73.48 ATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATCTATGAACAC:1 - chr3L 10814589 5' + micropia 72 2 66.44 TTGATGAATTTATTTATTTTTTTGTTGCCTTCCTTGCGTGTCACACCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 16996140 5' + roo 75 2 69.86 GCAAGCAGGTCCAACGCGGCGGAGCCTCAACGCCATTTGGGCTATAACTAAAAAAAAAAGGATTTACAAAAAAAAAAATAGTTAAAAACGAGTCAATAGTAACAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGCCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 + chr2R 13491849 5' + FB 18 1 63.01 TACCAAGAGAAGATTCAATAAAATTCACCACCCCATTTAAATAAAAAGAAAACTTGGTTTGATTTAGAACAGAAACGATGAAATTAATATAATGTAAAATAACTCTAATATATATTAGTGTTATGTACTAAAAAAGTTAAAATTGA:1 - chr2R 5284495 5' - Cr1a 4265 1 58.90 CAGTTACAATTACTCAGCGTTTTGCATACGGCGTTTAATTTAATTAGTTTGTTTGCTTTTGGAGACACACAATAATTGGTGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3L 3267754 5' - pogo 2063 1 51.37 GCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTT:1 + chr3R 12941766 5' + hobo 6 1 71.72 ATAATCAAGTTTTTATTGCCTGCTTTTGGGCGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAA:1 - chr3R 8381784 5' - Tirant 8419 2 78.77 ACTCTCCCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAA:1 - chr3R 10062213 5' + copia 4954 2 74.66 GTTGTTTCTGATGGCAGCCCGCTTTTGGGACCCCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chr2L 8895253 5' + 412 90 2 77.40 ATTTAAAATGTTTCTAATTTTTATTTGACTAGTTCCATTGCATAAACTTAAATACATGTTCATTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 + chr2R 21619323 5' - blood 7334 1 54.79 TGGGGGCAAGCTAAGCCGACATAAATAACACTTGAGCAAATATTAGATCAGCCTTAGCGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATT:1 - chr3R 12787382 5' + BS 5058 1 58.22 GGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACAACAGTAT:1 + chr2L 3133692 5' + Doc 62 1 62.33 AAATGACACAAGGCACAGCTCGCAGCGCGGAAAATCAAAATCAAGTCGAGAAACAAAAGCGGACTTGGCAGGCAACAGGCATAAAAGTCGTGATACTAACAAATTTCCCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAA:1 - chr3L 6772357 5' + Doc2-element 4514 1 70.55 AAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAAACCCA:1 - chrX 21227191 5' - Tabor 408 2 65.07 ATGTTTTTTTTTAATGCAATTCACTTTCATAGTAAAAAATCCAATATAAATTTCAGCCAAAATACTAATACTTAAAGCCGTGTACATTGTTTGATTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chrX 15252242 5' + opus 137 4 58.22 GTTGCCATGATAAGGTCAATGCTCCGGTTGATGTGCCACGTCCCCTTGTAATTCTCCACATGTGGAGGATAAGAAAAATGTAACAACAAAAACGGAAATATGGGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr3R 4530640 5' - copia 237 1 73.29 AGCCACACACAAGCCCGATTATCCCGCCCACTCCCCACTTTCGCCGCCCCATTTGCCCACGCCCCCTTTTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAC:1 - chr3L 10829747 5' - F-element 37 1 52.41 ACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGTCAACC:1 - chrX 15406061 5' - opus 7449 2 52.74 AGCCCGCCCCCAAAAAAGTGTTGCATGCAAATGCATCGACGACAACGAAAAACGAGTGCAACAATCACAGCAGCTGTGTGTGTGTATGTGAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGG:1 - chr2L 12897063 5' - accord 7101 2 75.44 GGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 + chr3L 22435101 5' + opus 7170 4 65.73 AGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr3R 20345538 5' + blood 7075 2 59.59 ATATTTGCATTTATTATTGAACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 7042756 5' - roo 9041 1 65.07 CGGGAAAACTGAACTGAAAACTGGCTGGGAAAACGGAGTCTGACGGTGTCAGCTCCTCGATGGTGGTCACAGTGCCCCAAGGAGGAGTACATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 12365264 5' + hobo 25 1 67.14 ATGAATTGAAGTACATGTGGATTTGAAAACCATCATAAGTAGGGAGAAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 10504427 5' - roo 393 1 76.71 AAGGTAAAGGAAAAGCGGCAGGTGAAAATATTATGAAATATATGAATTTGTATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 - chrX 3596491 5' - copia 5054 2 70.55 GGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTA:1 + chrX 20940723 5' + hobo 70 1 65.07 GGTATCCGAATCCGAGTATTGGTGCGATTGAGTGGAGCGATCAAGAGACATACTGACAGCCAATTATATCTAATCAAGTACATATATATTCAAATGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr2R 23596111 5' - blood 7364 2 68.49 GCTTCATTTTCGTCTCCAGCGGCAAAACGAAGTACTCCTGTCCATTTTGAGTGGCCAAGCCGTCGGCATAGCCATTCGGGGGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGCTATTGTCACC:1 + chr3L 13449941 5' - Quasimodo 147 2 62.31 TTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 + chrX 16490450 5' + F-element 63 1 52.05 ACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTG:1 - chr2L 18173668 5' + blood 7083 2 64.38 AGTGCTAGTCAACACTTTCGTTTTTCCTTTCTCTTCTATTGTGTAGCGAAATGGTTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chrX 16219198 5' + roo 8731 2 65.07 GTCCTGAGGATCCGTATTCGCAAGAGGCACAGATGAAGATCAAATCGGCACTTGAAATGGAGCACGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCG:1 - chrX 7872188 5' + R1A1-element 5109 1 55.86 ACCACCCACCCTCGGAAAAAAAAAAACACACACACACAAATCAAATTTGTTGTAAGGCTCGTAACACTCGAGGGTTGACTGACTGCCTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGGG:1 - chrX 10694401 5' - Transpac 5204 2 63.31 AATGGAATTTGATTGATTTGCATACTATAACTCGTACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chrX 8208301 5' + roo 52 2 54.11 CGGTCGTTGTATGCACCATTATTATCCGATCTTCATTTCGAATTGGCACCGGAATAAGCCTGAACAATTTGGATGGATGCCTGCTAAACAGAGTACTGGGCTTACTAAAGTCACTAGATGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAA:1 - chr3R 19449178 5' + baggins 5007 1 64.38 CGAGGCTCGGCCACTCAAGACAAATAGGCCAGGCGGGCACAACACCTGGCGGAACTGGCAAGTCATAATTTGCACTTTAATGAAAGCGGCATCGATTCGAACAGGTTACGTTTACTCCGCAAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCATT:1 + chr3L 658227 5' + Cr1a 144 1 72.60 ACTCTGGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr3L 5958716 5' + 412 60 2 57.53 GTACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chr2L 6047829 5' + P-element 50 1 50.35 TTTGACCTCCGCACAGGTTACTATACATATTCAAAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 15137384 5' - roo 9053 2 65.57 TTTTGTGCTGCACTGTGCCGCAACATATTGTTGTTGCAACAGGAAATGGCTTCAATTTGCGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAATCAAGCCAATTCAATTTTTAGATGTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGAAAG:1 - chr3R 28211610 5' + 1360 3299 1 59.59 AATTGGCCAATTCATGCGCTTTAATTACTTCATAAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTA:1 - chr3R 21679704 5' - roo 9035 1 60.27 AAAGGTCCAAAATTTTTTTAAGGTCTTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr2L 20550924 5' + 412 30 2 63.70 ATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 13468300 5' - roo 8999 2 79.70 ATTTGGCTGTTTCGGTAGCATCTCTACCTTGTCGAATTTCCCGAGAATACTTAACTTTACTTAGCTGCTGATTAAAAGGCGATTTGGCTTTCCATACAACATGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 19583367 5' - roo 9052 2 71.23 GTTTTTACTGCCCAACAAATTGGGACCCACTGCGACTGCTCGTCATTTCCCTAATTTGGTGTACTAATGGAAATCAACCAATACCGAATGTCATTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGAC:1 - 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1360 2960 1 53.42 TACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCATACTC:1 - chr3R 433144 5' - 1731 4571 2 58.65 ATAATTTCACAATATAATTTCATAAATTTTCAAATATATATTTATGTTTGCAATTATATATATATCACATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 + chr2R 14161309 5' + I-element 55 1 56.85 GCAATTGATTTAAGTTACCAGGAGCGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGCGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 23511673 5' + 297 6618 2 59.59 AACAATCAATATCCTAAGCGGGCGATCTCGCTCCCTAAATAATATAAAAAAATGGCCCCTGTTTTAAACGGCTACCTATGTGGAAAACCAGCTTTTAACATTGAGGGTTGTTCCGGAGGTTTGTTCTCGGTCACCAGAGCCTCTGC:1 + chr3L 25674193 5' - Rt1b 247 1 32.88 GTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3R 8381725 5' + Tirant 8 2 63.51 GGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAA:1 - chr3R 25962064 5' + I-element 67 1 60.27 TAAGTTCTATAAATAATCGAAGCTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 15539966 5' + roo 60 2 65.25 CTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACAC:1 + chr2R 17696052 5' + rover 7037 2 77.40 GTGTCGGGGGAAAATAAGTTAAAGTTCAAGCTCGACAAACCCCCAGCAGACCCGAAAACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCAGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 - chr3R 11903541 5' + FB 63 1 58.22 TATTACACTTAGTATTTCAATTCGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCAATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAACTCATACGTTTGCTG:1 - chr2R 8596997 5' + pogo 93 1 79.45 AGGAGTGGAAGAGGAAGAGAAATGCAACGGATTCACAATTCACCTTAGCACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATCG:1 + chr2R 16731268 5' + Tirant 29 2 53.85 TGCCACTGGCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chrX 14825360 5' - P-element 2835 1 44.70 GTCATGTTTTTTTTTTTATTATTTGACTGACGGTGGGAAAGTTAAAATCTTTTAAAGAGACGACCTTCGGTCCGTAGGTGGCGTGCACG:1 - chr3L 20178217 5' - Rt1b 5083 1 80.90 GGCGTTACAGTTTTGGGCGTTATGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTGGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGAT:1 - chrX 22689475 5' + mariner2 35 1 71.23 CTCTATATTTTATTTTTTCCTAAGCATTTGAGGCAATTTAACAAGCGTAACAAAAATGCGCCATCCTACACAACAGTTATTGCCTTATTAATTTTTCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAA:1 - chr2L 7547468 5' - 1360 380 1 52.05 ATGTGTTGTGTTGCACCCTAATTCCAGTTGTAAACATGCGCCCATACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACT:1 + chr3R 31031979 5' - hopper2 1534 1 67.12 GGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr3R 13529972 5' + jockey 90 1 75.34 AAGTATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGATACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr3R 31458364 5' + jockey 31 1 63.70 ATGGGCAAAAAAATTTCGAAATTCGGTTTAAGTAAATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3L 22041069 5' + roo 8729 2 63.01 CCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAA:1 - 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chr3L 17870917 5' + 1360 3379 2 67.12 ATTTTCCCGCAAATTCATTTGAAAAAAAGAACCGCGACTTTCTCTAGTTTTGGATTATAGTTAACCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr2R 18618462 5' + jockey 4725 1 55.48 ATCTAGAAAATAAATTGCTTGATTTACACAGAATGCTTTTTATTTTAGTATAATCGTTGAAAATAAATTAATATTAAATTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 22041186 5' - roo 9031 1 58.22 GTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3359 1 55.24 AACAGTTGACAAGTGGCTGCAAGGAGTGGCCAAAAGGGGGTTGGGTGGAGGGGAGGTCGAAGAGCTACAAAAACTGTAGCACGCTTTCGAGATTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCA:1 + chr3R 11833669 5' - Stalker4 7028 4 60.27 GTCATAACTGCCAAGTGCAGACGTTGGCCGGAGTGCGGTGCTCCGTACGGCAGACTGCAGTTATTACGGCCGTAAGCGTAATGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGGCAGGAAGGCCGCGTCGGAGCGCGACTC:1 + chr2R 15628683 5' + invader4 2754 1 55.48 CACGATGACCCGCCAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chr3L 9522020 5' - opus 7463 2 51.72 AACACAAACAGTAGACAGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAATATCTANAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTT:1 + chr2L 18112433 5' - transib2 2822 1 78.08 AAGCGGCCTATTTCTTATGCACGAACAACTGGCATTGCGTAGGTGTACTATGTGTACATACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAAT:1 + chr3L 8157997 5' + flea 4813 2 58.90 GTATTAAACACAAATTCTTACCTGTTTAAAAAAAATCGACAGAAATTTATGCCAAATATTCATATACTTTATTACTTTACAGATAGTCCATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGC:1 + chr2L 3175066 5' + Burdock 6165 2 61.64 ACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCC:1 - chr3R 13376038 5' - 1360 3315 1 69.86 TATGGTGCCAAATTGTAATTATAATTTCTCGTGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCGAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACTCAATCCAGATAACATACAAACACTCATACTTTTCCTCAAAAAAA:1 + chrX 20270956 5' + I-element 5151 1 74.66 ATGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:2 + chr2R 8258230 5' + jockey 26 1 69.18 ACGGTGTTATCGTTGCCGCTTTCGAAATGCTGGAATGTGTTTATCCTTGTCACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 + chrX 22741174 5' + Quasimodo 39 4 76.40 AAACTACACACAATTTGTTGGCAATTGAACATAAGGACTGCGAAATCCTGTTACACAAGCAGACTTGCCACTCAAAGCCAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 8631733 5' + roo 8704 2 56.25 CAAAGGAATAAAGTTTTATGTAACGTTTTTTTTTTTAAGTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCC:1 + chrX 23035856 5' - HMS-Beagle2 7115 2 71.92 AAGTTTTGCACACTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr2L 4631154 5' + roo 79 2 71.23 AAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGNCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3R 12115258 5' + 1360 55 1 56.16 TGAATGAGTTAAGAAAAACTATATTATCGAATGATCTTAATAAATCCTACATCAATCAGTGAAAATAACTTAAACTAAGAAAGCTTAGAACTTATTCTACAAACCAAAGATTAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCCCGA:1 - chrX 22672492 5' - INE-1 569 1 52.74 CATAACTCATAGTTCAATTATCTCGAATGCAATACACTCTAACTTGAAAATAAATGTTATTTAGTATATTAAAAAAATATTTTATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 22964304 5' + 412 7091 2 50.00 CATTTTAAAACCCTACTTTCTAGTGGCAGAGCACGAAAATTTATGGCCAGCGATTGCAGAGCAATAAAGATTATGTACTGAACTGATAATTAGGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 6399492 5' + pogo 26 1 67.81 AATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 + chrX 21227087 5' + Tabor 41 2 57.24 TTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 + chr3L 18010218 5' + diver 45 2 55.48 CCCTCCTTAAGTGGACGAAGCTTTGACCACGACTCTGGCTTAATTAAGCACTTGTCTGCATACATTAATAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAAC:1 + chr2R 8300142 5' + Transpac 469 1 52.45 TCATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 19698049 5' - roo 9039 1 58.90 AAAGTGAACTCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGATTTGCTGCAACTCAACTATGTCTGGCAGTGAAGTCTTTTTCGGGTTTGAGTTTGGGCTAAAAGCAAAAATCCGACGAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAG:1 + chr2R 22774470 5' - I-element 5345 1 74.66 AAAGTATGGGTAAGAATGTCAAATTATGTTTAAAAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2L 19731953 5' - roo 322 2 78.08 CGTGGCAAACAAACAAAGAAAGTCCCAACGAATTATAAACACATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTC:1 + chr2R 18035070 5' - R1A1-element 5310 1 66.44 AAGCAGGGTATATATTGTTTGTGATTTATTTATTGCTTTCAAATCGCCACATTCACTATACTTTTGATTCACGATCTCTAGAAATATTTTGAATCAAAAGTATAGTGGGTGTGGCTGCGCTAATAGCACTAAAGATTAGGGCTATA:1 + chr3R 14123821 5' - Helena 69 1 65.75 CAGCGCTGGTATCGGCAGGCTCAGTTTGTCAATCGCTGGCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGGTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3L 13889017 5' - 412 466 2 58.33 ACGCCGCACTTAGATGTCGTGGCGCAGATACAATTTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAAT:1 + chr3L 21913350 5' - 297 6902 2 74.31 ATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 - chrX 15252371 5' - opus 430 2 67.12 GTAACTTCTTATAGGTTCCTCAACCAGGAAGCGTTCCTGTCCAAAGTCTGGCTCAATAACAGGCTTCCACAATATCAAGGGGTTGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 9599769 5' + roo 10 2 73.33 CAGCACGGCTACAATGTAATCAACAAGGTTAAGGTTACGAAATATGTACATATGTCCATATTTTTATCGCATTCTTCGCACAAACGGAAATGTAAACACTGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 + chrX 19163216 5' + Burdock 17 2 72.60 ATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chrX 16996077 5' - roo 336 2 72.73 TACAGCATTCTCTCGTTTTCATTTATAATAAAGCGTATTCTTGAGGAGAACACGCAAAATAATTCCATTAAATTTTTTAAAGTATTACTTACTAAAAGGCTCAACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACC:1 + chrX 20447168 5' + I-element 5107 1 75.34 CTGCTGTCGATCTGTCCATCTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2L 18737923 5' + roo 8696 2 63.70 GTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chr2L 18173663 5' + blood 77 2 67.81 TCACTAATTTAACAACCAAGTTCTTTTCGACAGTAGCAACATAAAATTAACCAGGGATTTTAAGTACATTCACTTGAACGTGCTTTCTGTTTGTTTCAGTGTGGGTGCGAGTGGTTTTTGCCCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTT:1 + chr2R 15582104 5' + 1360 3171 1 74.66 GTTAATATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr3R 13375931 5' + 1360 40 1 56.85 AAACACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAAC:1 + chr3R 6147252 5' - copia 5049 2 67.81 GTGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 8258230 5' + jockey 18 1 72.46 GGGAGAGCACCAGGAATTCCCTGGCCAGCAGTCGCATGGGCGGCGAACAGAGCGATGGGTGAGTTCATCTGCCCGAAAAGGGGGTCGGGTCAAGGATGGTGTCGAAACTTTCAGAACACACACACACACACACACACAGATAGTCA:1 + chr3R 8622800 5' + accord 7032 2 49.32 CTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGA:1 + chr3L 20756369 5' + INE-1 560 1 60.27 ACGACGTTTCTTTTAAATTTTTTAGCTATAACGAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chr3L 20868010 5' + hobo 52 1 52.05 AAAATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGAC:1 - chr3R 7042094 5' + Stalker2 7294 2 54.11 GAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTT:1 - chrX 7847216 5' - hopper 33 1 74.62 CTCGACTTTGGATGGCCTTGCTGCGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTG:1 + chr2R 15700842 5' - opus 7358 2 80.95 AAAACCATCATAAGTAGGGAGAAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 10504402 5' - roo 9046 1 66.41 ATTTCAATAAAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTA:1 - chr4 637817 5' - roo 8758 2 58.22 ATAACGGAATATTGTAGCATAATTTTGGGGGCAAGCTAAGCCGACAGAAATAACACTTGAGCAAATATTAGATCAGCCTTAGCGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGT:1 - chr3R 12787407 5' + BS 5033 1 57.53 ACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAA:1 - chrX 15406030 5' - opus 415 2 75.34 CACCTTCAGCCGAAGCCAATCTCATTTCCATTAAATTGTCCTGGCCTGGCTTGCGCACATGAATCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 - chr2R 13695729 5' + blood 57 2 56.16 AATTTCGACACAAAGTTCTGATAACTTCTCATATGAGATAGATAAACATGATACTAGGACACTAGCTTGCGCCAATTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 + chr3R 31046527 5' - I-element 5313 1 54.79 TTTCGATTAGAAAGAAAGTGCCAAACAAAAAGTGAATGTTATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTT:1 + chr3R 26888084 5' + FB 82 1 77.40 CTGACGTGGACAGTATGTACAACTGGTGCACTAAAAATAATCTACCTTTAAAGATAAATAAATGCAATGTTGTTACATATAGCAAATACATGTCCCTTCTTCATCATATTATCTAATGTCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTG:1 + chr2L 22642020 5' - invader4 174 2 66.44 AATGTATCTGAATGTTCGCTCGCGATGTGGTGTGGGCTCCAGATCCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACTCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 + chr3L 8754712 5' + mdg3 24 2 65.75 GTTGTTAGTGTTGCAGTTGATAAGTGGAAACTCGCTTCATGTGACCGAAATTTGCGCTACATAGCAGCATAAAATGTGTGCTCTTAATATACCCCAACATTTTTCGATTATAGCGAATTGAATAAAAAAAATTAAATTTAATT:1 - chr3L 11848892 5' + TAHRE 41 1 67.83 GCATTTTTATGGGCTTACGAGTGTCGCGGCTCTGCAAGTTCTTCCGCTAGTTCAGTTGGCCAAAACAGTTTAAACGTGGACGTGGTCCGTCGGTGAGATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr3R 25961941 5' - 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chr3L 17880428 5' + invader4 305 2 61.38 AATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3L 20168283 5' - roo 8998 2 65.07 GAAATCAGTCTGTTTTCTAACAAAAGCATTTCCTTGCTTATTTTCAATGCAGTTGCCAGTCATCTATACATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTCACACACACACACACATACATAACCACATA:1 + chrX 17477584 5' + Quasimodo 46 2 54.79 ATTTCAAAGAAAATTATTTTTTGTGATGATAAGAAAATTGAGAAAATTTTAAATTTTAAAATGAATGCTAACTAAAGATTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 - chr3L 20573891 5' + pogo 54 1 59.59 AACATGGGGTACACGGTGCGGGAAAACTGAACTGAAAACTGGCTGGGAAAACGGAGTCTGACGGTGTCAGCTCCTCGATGGTGGTCACAGTGCCCCAAGGAGGAGTACATAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACC:1 + chrX 12365246 5' + hobo 10 1 78.32 TTACTTTTCCAACTCATTGGCGATGGGTAAATGGTATACAATTTAAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATA:1 + chr2R 12248944 5' + Juan 4061 1 60.27 GTTGTGATGTAATTTTTAAAAAGAATGCAAAAGAAAATAAACAAATGATATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGT:1 - chr2L 1892642 5' - 297 6915 2 71.23 GACATATAAATATGTCCCTCCTGCTTTCCAGAAAAACAATGTACAAATAAAACAATACAAAATCATCAGCCATCACGATGTACCCAGCCTCTGGTTCGAAAATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCCAGAAGGACAGACGTTTT:1 - chrX 9837830 5' - baggins 5007 1 51.37 TAAGTGCTAAAAGCAAGCTTTTCCATTTGCATATTGCATGGCGGAATGCTTCCTGTTTTCGCCGGCAAGGGAAAGGGGTCAGGACGAAACTAAAACTAAGANCGAAACAAAACTAAATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTAAAT:1 - chr3L 2921057 5' + Q-element 106 2 79.45 AATGGTCTTCCAGCTGATTTCGTTGCTTTTGGAGCATAAGAAAATGCCCATTTGATTTTGTCAATGCGCTGGTCTTTTTTCATACAACGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - chr3L 20765280 5' - 297 369 2 68.49 GATATTTTATGTATAAACATTTTTTAAATGTTGCCAAGCCCATTCTAACGCCTTAAAACCGCCCAAAACTGCCACGCCCACATTTTTGAATAATTATTAGATATACAGGCTGCGGCATTTTTCCCTTTTTCAGAACTCAATGATAA:1 + chrX 22784237 5' - mariner2 868 1 80.14 ATGGCGAACCTCTAAAAAAGCTTACGATAAATACAACAAATACAAATACAAATACAATAAAAATACAAATACAACATAAACATTACAATAAAACCGGCCACTTAAATTATTTTAAAAGAAACAGTAATGCACTTTAGTAATTTTCA:1 - chr3L 5873426 5' + 297 6637 2 60.96 GCCCACACTTTTGAAAAATGTTTTGATATTTTTCATTTTTGTATTAGTCATTTTAATTTCTATAGATTTTCCTAAAAACTTTCTGCTAATCTCACTCTAACGCCCAAACACCACAAAGACTCTAGAATAACAAAATGCGTAACGG:1 + chr3L 24300788 5' - 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chr2L 18689246 5' - Gypsy6A_LTR 248 1 71.23 ATAGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAG:1 - chr3L 21202115 5' + G2 2621 1 57.14 TTGCTATAAACGGCATAGTCGCCATTTATCATTGGTATGTATTTCAAGAAATCGGATTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 16200835 5' + roo 60 2 61.64 AGTTGGAATCAAATGTAGAAGGTACATTTTCAGAAATTTTAGGATAAATTGTTTGTTCAAATAGTATTATTTATAAAATATTACTATTAGATATTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chrX 12105364 5' + 412 7079 2 67.81 TTTTAAGGAACATTTTTCAAATATCATATCATTCGTGAAAAGCTTCACAAGTTTGATTAACAAACTCTGATTAGTTCTGGGAAAAAAAATATCAAAGTAGGAATGCCGGCCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2L 17136039 5' + hobo 14 1 71.72 ATAGCCCACCCTTTTGTCAAATGGTTATAAATGTTTAAAGTTACTCGCTCTAAATGCAAAAGAAGATTTCAAATTTTTGCAGTTGCTGGAAGTGATAAATAAAATAAATTAAAATCAAATCA:1 - chrX 16673601 5' - transib1 1898 1 81.15 TGGCACACATGCAAGCAATCATGTTTATTAACACTGCGAATGCGTAATTTGATATACAGCCTCTTATCAAGTATACGCCTAATTATCTTGTGGTAAAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAA:1 + chr3L 8625844 5' + 17.6 400 2 61.64 CGACTGCGCGGCATCACCTGATTTGCAATTTCTACACCAACTTTCCACCAGCTGAACATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr2L 3059346 5' - P-element 2827 1 44.52 CATTTTCATTGACACTGATTTCTTTTTCGTTCTTCTTGGGCGAAATAGAAATTTTTTTTATTTCGGTGGGAAAGAACCTTCAAAAGTGGTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 13306056 5' - roo 395 1 57.53 AGAAAGTTTTTAGCCCGAAAACGCGTCACTGCCCAAACAGAAAACAAGCGGCAACAGAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr3L 17934875 5' - HMS-Beagle 7028 2 73.29 TACTCATTCAACTTTATTGCGGAAACTCAAGCAACTAATTGTGCGCCCTTTATTACGCTGTATTTTCAAAACTTCTAAAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACT:1 + chr3R 12181930 5' + mdg3 15 2 76.03 TATCAAGAAGTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTA:1 - chr2R 4601692 5' + HMS-Beagle2 14 2 77.40 ATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAA:1 + chr3L 8249381 5' - HMS-Beagle 177 2 68.31 GCAGCCATCATTCAAAGTGCTTCCATTCATTTTGTGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2L 8553270 5' + pogo 23 1 69.86 GGCAGAGCAAGCAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 - 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chr3R 24011092 5' - roo 9028 1 54.11 ATATTCGCGGGAAACTAAAATCAACAGCATTTCTTTGGCCATACCCGCTTGACTGGACTGGGCAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chrX 21639351 5' + 412 45 2 51.52 AGTAGACGTGCTGGATCACGGGAAACTTGGAGAGAATCTGTGGATAGTTTATAGTAGTTTCTGAGTACTTGGTATTCAATTACTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCGAAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACGGAGTTAT:1 - chr2L 3378171 5' - Doc3-element 4298 1 54.79 CCTGGTACCCCTTGTTCGCAGCGAGGAAAAAGTTAGACATGCGAATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATCCCA:1 + chr3R 31887741 5' + HB 76 1 70.55 ATATGTACATACGTCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTAT:1 + chrX 10694233 5' + Transpac 22 2 70.55 GAGAAGTACCTGGACTCGGGACTCACCGCCGAGCAGAGGAATGTCTCGTACGCCACGATTGCCATTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGACCGCCTAATTA:1 - chr3L 16407221 5' + Quasimodo 426 2 49.23 ACTCTTTTCATGCTCGGCTGGGATTTGAAGGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr2R 23790274 5' - roo 8982 2 80.14 CATTAATTCTTTTCCGTGTTCAGCGTGCACTGAAAGAAAAATATATATTTAAATTTTTTCTTTAAGTAAAATAACTCAGCAATAAGGCAACCTATTACTAGGCGAACATAGCTATTTTTGGAATTATACATTATTTTACTTCATTT:1 + chr2R 21783550 5' - diver 6048 2 41.10 GCTGGGCCGATCCTAAGGGGAGAAGTGTAGGGGGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGATGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAGCAC:1 + chr3R 5574973 5' + blood 7095 2 74.29 ATAAAACAGCAAATGGCAAATCAATGATAACATCTTTTGATATAAAACCCAAGCTGCAGAAGAAGTATTAAGACTTTCTTACTAATTTCATTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGC:1 - chr2L 7949989 5' - opus 286 2 60.27 TCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGTGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGT:1 - chr3R 13530030 5' + jockey 31 1 68.49 GCGATGGTCGAGTGTACTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGG:1 + chr3R 12789528 5' + G2 2789 1 54.40 TTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTTGCATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCTATAT:1 - chr2L 23069853 5' - 412 7108 2 77.24 CTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGA:1 - chr2L 18173667 5' + blood 7084 2 65.07 CTTTGCTGTCGCCGCCAAAATCACCACCACCCAGGAGTTCAGCCAGTCGTCGGGTCTTGGCAGGTGCCTCGTTCTGGAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGAGGTGGACAAC:1 + chr2R 21618002 5' + Circe 7408 2 58.22 GAAGGGTCGTGGGCTAAAACAATGGCCACAGCTGAATNTCATAGATGGCAAGCTTAATGTGAATAGTTAAGCGGCAGTAGAAGGAAATAGCTTGTACATCGAATTTTCGATTGAAATATTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAA:1 + chrX 8728636 5' + Rt1b 5139 1 77.40 AAACAAATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr2L 15549970 5' + hobo 38 1 57.86 TTTTTCTTGGGTTCCAAAAGCGTTACAATACGCTGAGGTTCACTCTGTGTTAATTCTGTGCTTTTATTTTAATTTTCTATTTATAGTTTGGCAATTTGGAACAACAAATTTCAAGTTTACACATTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTC:1 - chrX 13263072 5' - S-element 1511 1 56.16 TGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1 + chr3R 23415911 5' - jockey 4924 1 62.33 AACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATG:1 - chr3L 10814610 5' + micropia 5093 4 53.42 GAAAACTGGCTGGGAAAACGGAGTCTGACGGTGTCAGCTCCTCGATGGTGGTCACAGTGCCCCAAGGAGGAGTACATAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 12365279 5' + hobo 33 1 59.40 AAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 24093522 5' + jockey 70 1 70.73 ACAAACAATCCCTCTCACCACAAAACAATTTTGGAAAGCATCACGTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 - chr3R 5518394 5' - Transpac 5156 2 67.81 CAGCGATTATCGAAGGAGCCCTATGCCCACGTGGTGAAGGTGGCGTACTTGAGCCCACGGATTTCTTCTTCCTTTATTTTCAAATAATAATAACGTTAGGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAA:1 - chr2L 12399001 5' - 1360 264 1 49.32 AAAAAGAATACACCCTTTTTGAAGCTCCCATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTGG:1 + chr2R 2833320 5' - 1360 491 1 78.77 GGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr3R 19450093 5' - roo 8981 2 62.33 CGCTGTTGTTAGTTAGAGTAGGCTATAATTCCCAACTGGTTAAGGCCAATCTAAGTTCTGATGACAAGGGGCAGCTACACTTAAAGTTCTCTGGTTTATAATGCATCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGC:1 + chrX 11661657 5' + Stalker 7008 6 67.81 ATAACAATGAACTCGATCAAGAGGAAATCATTTCAATTCGGTATTTTCATTTGGCATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTC:1 + chr3L 22038160 5' + diver 5901 2 76.71 CACTGCCCAAACAGAAAACAAGCGGCAACAGAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATT:1 + chr3L 17934901 5' - HMS-Beagle 7002 2 56.85 GATGGTACTTTCGATTATGGGGCAACGTAAATGCGTAATCTTGTGACTTCGATTATCTGTATCTTTATGGTCGGAAACGCTATTGATCGTGATCAAGAATATATATACTTTTATGTGGTCGGAAACGCTTCCTTCTACTTGTTACA:1 + chrX 16548439 5' - INE-1 31 1 55.48 ATGTTTAATAATTAACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 12342202 5' - hobo 2893 1 52.24 CCTATACGAAATTAAAAAACACTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 15540083 5' - roo 9031 1 56.16 CAGCTTGTTGGATTTGAACTCAACTGAACTTTTACGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 - chr2L 17470404 5' - 412 7461 2 75.34 TTCCTCCGAATTATACATAATTATTATTTTCTTAAATACTTTAAGAAAATCTTTTACTTTTCTGTCTTTATGTTTTGTTTACTCTCATTTTCATACCCGTTACTAGTAGAGTACTTATACAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 + chr3L 24791922 5' + INE-1 17 1 58.22 ACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCACAGAAGGCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 + chr2R 8258303 5' + jockey 97 1 79.02 TGTTGCGCCTCCCAAAAGTATACCAAGAATTATTGTTTGGCAGTGAAGAAACCGATACACCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3R 31458349 5' + jockey 16 1 71.23 AATTGATCTCGGGGCGTTAATTGAAGAAGGCATAATTTGCAGTGGAGCTAGCCGACTAGATGATGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATAGAATAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACA:1 - chr2L 18761484 5' + 1360 3206 1 43.15 GATGGAAAAGTTAAGAATTAAACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr2R 8596906 5' - pogo 2059 1 52.74 GGCGACTTTCTCAAATTGTTTAAATGAAGGCAAAAATTATTTGTGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATAGTCGGGTACCCCGACTATCAGATACCCGTTA:1 + chrX 22806256 5' - INE-1 552 1 54.46 GCCGTCGGCAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGC:1 + chr3R 16881901 5' + 3S18 66 2 63.01 AAACCAAAGCTAATAGCCATGAGCAACTTGGCTTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 24443970 5' - hobo 2921 1 72.60 TCTTTCACACAGAACATGGGGCGGTTGCTGTTGTTGTGTTGTCGCCTGCCGGCCTATGTATGTATGTATGTATTCATTAATGAGACGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr2R 21475183 5' - P-element 2852 1 59.59 AGCGGGAGGACTCGTTCCAAAGGATCGACAATGTCCCAGAATCGCTTGGCATACTTTTATCCGTGGTTTCAGGTGCATTTTGTGAAATGTTTAGCCTCCTTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr3R 10708185 5' + Transpac 18 2 73.29 GAGTGACAGTGATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 29384735 5' - roo 9029 1 57.53 ACAAGACAATTGTTTGCCAATTAATTAGGTCGTGTGCATCACACAATGGTAATTAACCAAGTTCAATCTACCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCATGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chrX 5721808 5' + pogo 48 1 49.32 AATTGAATGAAATGGTAATTGAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3L 20765109 5' + 297 6609 2 67.12 GTTAGTGGTTGGTGTTGATGATGATCAGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chrX 14189274 5' + 412 7081 2 64.38 CCAATTGGAGATGCTTCCGATGCGAGGCGTGTAACATCGGCGGCAGCACGAGTGCATCCAGCGAGTAGGAGGGATGGGGATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGG:1 + chrX 2700040 5' - I-element 5012 1 51.59 TTTTACTAACCATCGCGTACATTTGTTTTCGTTAACATTCTAAGGGTGGAGACATCTGGCATGACTCTGGCAGGGTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr2R 25083260 5' - pogo 2059 1 60.27 CTCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGGGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGACTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr2L 15917610 5' + roo 8739 2 69.86 GCGAAACTCATATTTCGGAGCACTTACGGTAGGAGCCATCTTGTCAGTCGAAAACCACGAGGAAAAAGAACAGAAGGCGCTATTGTGGAGTGAAAAATGATTTGTGCCAACTTGTGCCAAAAACTAAAACCTG:1 + chrX 765057 5' + transib3 434 1 59.40 ATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3R 12115271 5' + 1360 59 1 62.77 TTTGTTTTAGCCGGCACAGCTGTGCCCGCCCGTCGCTCGAATGGGCATTATTGTGATCCAATGAACGTGCCGGTTCTTGTACTTCACCAGTGAAAGTGCATTCCCCATTCCCATTCAAGGTCACACACACAAACACACACACAAAC:1 + chr2L 2938873 5' + gypsy3 416 4 50.00 GTGGGCGGATGGGCAGCGGGGCGGCGCGGCGCAAAGGGAATTAAATGCGAAAAGCGAAAGGACCACGACAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 + chr2R 18551686 5' - I-element 5306 1 50.68 TTTCACCGCTGTTTAGTTGGACATGTTGTTTTATACATTTTAATGATAAAACTGTAGTTTTGTATTATTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 12125387 5' + roo 50 2 55.17 ATATGGGTGAAATACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATATGTTGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAATTTTATGCA:1 + chr3L 10814511 5' - micropia 387 2 71.92 TGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGT:1 - chr3R 23021006 5' + INE-1 579 1 42.47 CAAAGCGACCAAAGGACCAAAGGACAGTTGGACAAAATGACAGCAAAACAGGCCACGTCCAACTTGACAGAGATTAACATGGAAAGGATTAACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 - chr3R 14138659 5' + mdg1 7070 2 63.70 GATTGTTAACATTCGACTTTATAAAGATTTTATCCTAAACATATTTGAAAGTTCAAGAAAATATTATGATTCCTTATCAAACCGTATGTTTGAAGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGG:1 - chr3L 24085278 5' + Tc3 1439 1 60.96 AGTAGCCGCAGAAGATACGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chrX 13429040 5' - hobo 2893 1 75.79 AGTTACCAGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATCGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAGTGCACTCTAGTA:1 - chr3R 23511661 5' + 297 6630 2 54.11 ACATTGGCTGCATGTGCAACTTTTCCTGCTCCTCCTTTGAGTGTGGACTTTATTTTCTCTTTTTTTTTAGCCTGATCTGGCTTTCAGCTTTATCTGTGGCATTAGCCTCCTTACCACGGCACCAAGTTTTTTTATTTTTTTTATTT:1 + chrX 17539261 5' - HMS-Beagle2 489 1 79.45 CCAATACCAATTAGTGGCACCTGGGGACATGGACATATTTAAATGGCGGCTAGTACAATATAGCGACATAGAGGGACGCAGCCAGCGTCGAACGCCGGTACGAACGGGTCGCAGCCAG:1 - chr2L 11417367 5' + aurora-element 316 1 50.85 TAGAAAGATGGCCTCAGATGAAAACCCCTAGATACTGGCGATGTATAGAAATCGCTTAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTG:1 + chr2R 16185016 5' - 17.6 7360 2 60.96 TGCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTATATAAAATAGCA:1 - chr3R 13453439 5' + 412 7079 2 67.81 GCACTTTTCATTGTGGCAGCACAAACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chrX 8208434 5' - roo 9033 1 60.27 GTGTCCGTACGACGTAAGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 16200693 5' - roo 388 2 71.23 GAGAGCTACAGTTTCAAATAATTGAAATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3L 20168322 5' - roo 9037 1 61.64 AGATGTATATAGATATATATATGTATGTGTGTATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr2R 16643291 5' - roo 325 2 78.72 TAGGTTTAATGACCACCCTAATTAGCCAATACCGTATCATTTAAAAAAAAAATGCGCTGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGCAGTGTT:1 + chr3R 13210787 5' - I-element 4978 1 58.90 GGGGGCAAGCTAAGCCGACAGAAATAACACTTGAGCAAATATTAGATCAGCCTTAGCGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTG:1 - chr3R 12787381 5' + BS 5059 1 58.90 ACATAAATAAAGTATCGAATCAAAACAAAATCGGCTTGCAACAACAACAAAAACATTGCAGAGTGTGGGTGGCGCGTGTAGCGATCAAAATTGCGTGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3R 13684637 5' - 412 473 2 71.23 ACACGATATTAATATTACACTTAGTATTTCAATTCGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1 - chr2R 8597009 5' + pogo 81 1 73.97 AGTCAAAATAAAAACGTATGAAATTGTTTTAGCAGGGAGAAGGGGACATAAATGTCAACAGTATGGCATTAAGGTTGCATCTCCTCCCTTCATTATTGTAAAGGAAAAAATACGTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAG:1 - chr2L 17328241 5' - gypsy4 334 2 69.18 TTAAACTGCATATATAACAAATATTCTACTGCTTTTTCTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chrX 16996030 5' - roo 9033 1 60.96 CAAACTAAAGTCGCCGGCCAGCTCACGACCGGCTGCCCATCAAAGAGTTATTTATACTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 + chr3R 13453307 5' - 412 7481 2 62.33 TTTTATTCCCGTTACTCGTAGAGTAAAATGGTATACTAGATTCCTTGAAAAGTATGTAACTGCCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAAAAATATCGAAGAAATAGTTTAGTCTTTATTCTTTTAATCTCAGCTTAAGACTAA:1 - chr2L 17178414 5' - 297 6861 2 62.33 TAAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr3R 24011056 5' - roo 328 2 73.97 ATGGACATATCCTCTTTTTTGTTTAATGAAAATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:1 - chr3R 7042122 5' + Stalker2 7266 2 73.29 AGCAGTGAATGAAGGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chrX 8363632 5' + jockey 59 1 51.39 AATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2L 18738030 5' - roo 324 2 76.03 TTAGCAAATTGCCATTTTGGCATTTAGCTGCAGCAGGCGGAGACGGCACCCCGCCGCCAGTTTTCTTACATTTGAGAGATTATTTTGTCGTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2R 18551819 5' + I-element 25 1 67.86 CGAAATTCGATATGCAATTTCATTTGAGCAATTTTTTTGCACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr2R 21110611 5' + roo 8743 2 73.29 GGGTAAGCGCCTGAGTCCCGAGGTAAAGCACGAATCTCTTTTTTGGGATCATAGGAGGTTGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTT:1 + chr3R 31522754 5' + Transpac 5086 2 58.90 AGCAAACCGCTAATTAAAATCATCGACTCCTCATCCGAAAGTTGAGATCTCTGAATCTGGGGGTTCTGACCTCTTCCCCCAACTGATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr3R 17996674 5' + copia 4905 2 59.59 AGACAAAAGCACTGACGAAACCCAGAAACAGGAGCATGAGAAGAAGGAGCCCCATTGGGGAGGAAATAATCCTCCTCCGTTTCCGATGCCGTTTGCCATGCCGGGTATGAATGGTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGT:1 - chr2R 5037834 5' - Stalker2 395 2 78.08 GCTTCTGTTGCAGTGTCAACAAGATCAGCACGCTGTCGACCTTCGAGGATTGCACCAAACTGCAGGAGCTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGCCTGGC:1 - chr3L 4098191 5' - Gypsy6A_LTR 253 1 68.63 TATATACTGTATAGCCTGCGAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTT:1 - chr2L 13328522 5' + BS 39 1 54.79 AACTATGGGAAATCTTTATACAAAGTTATTCGATTTAAGCCCCGCCCACACTCTCATGAATAGAAGTAGTAACATTTTCCTTGATTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2L 23068975 5' + 1360 8 2 75.78 GCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACA:1 - chrX 21933269 5' + springer 7151 2 66.13 GAAGTCGAAGTCGACGTCGACAGCACGAGCTCTCTCTCGCCTGGCTTTTCCTTCTATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 - chrX 18534615 5' - P-element 2825 1 43.15 GGGGTGTTGAGTCGAGTCAAGACAAGGTGAGAGATCTCCTCTCCCAGGCCTAAATGTCATTTCGATGAATAATTTTGTTCTCATATTTTCCTCACATATCTATCGCGTTCGCTTTCATAGTCGGGGGAACTCGACTGTAGCATTCT:1 - chr3L 18289071 5' + INE-1 572 1 52.74 CATCATGATCAAACTCCCACTTGGAACCACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chr2L 1451277 5' - mdg1 7423 2 60.96 CAAGAACTGTGAAATATATTCAATGCTAGAAACCTTTGTGCAATTCAGCAAAATAATTTGCCACAGAAGCCATAGGCATCGACAAAAAGGCAAAACTCCGGCGAAAAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 6615634 5' + roo 13 2 76.71 TACCAATTTAAAGAGGAAACTGGTCTATATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGCCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATTTAATTTTATGCAACTGTGCGCAG:1 + chr3L 10814523 5' - micropia 5361 2 80.00 AGGTTATGAGTGCTATTCCAAAAGAAATCACATCTAGTTAGTCTAAAGATTGGAACCGTGTAACTCCAGAAAGGGTTAACTGTGCACTTTCCATGCCCTAGACTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr2R 7622831 5' + P-element 17 1 74.66 TTTGACTATCAGGGGCAAGTTTTCTATACGCTTTTAAGAAATCATGGAATATCATAGGATAAACGCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr4 880287 5' - pogo 2046 1 57.53 GGACAGAACGTTGACTGGCTTCTGTTCTCTAGTTACCCTTTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGG:1 - chr2L 11732518 5' - F-element 452 1 57.89 TAGATGAAATTTGAATGGGTCATTAAAGCAGGCATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 + chr3L 17602505 5' + Doc 47 1 54.11 TGTTGGTAAGTTATATTTTACCCCGTGAACTTATTATTTGCAAAATTGTATTAAGTATCTGATCAGGTAAAAACAAAGCATTTACATAGATTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAT:1 - chr2L 11378401 5' - jockey 8 1 62.33 GCCGTAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1 + chr3R 21843772 5' + blood 7098 2 75.34 AATTAGTTGTTGTCTGTCTCTGTCTTTATCACTGATGAAAAGCGCTTGCGGTGGAGGAAGAAAGAGATAGAAACAAAGTGTCCACTGTTCAGGTGTTAAACAATCCAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 + chr2L 16537485 5' + Transpac 4930 2 73.29 TGGCTGAGACTCGCCTCCCCCATCGCAAGCGAAGATTCTGCTCCTAGAGGAGGCCCCCGTCTAACGGCCATACATTGGTTTGGCATTATGAAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCTCTCGCTCACGC:1 + chr3L 12109135 5' - 1360 3303 1 57.04 ATGAAGTCATCGAATCCTTGGCAATGAAAATATAGGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2L 3911909 5' + roo 73 2 78.20 ATCATTTGTGGAAAACTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr2L 16554699 5' - blood 7350 2 51.20 ATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1 + chr2L 17861775 5' + Doc 82 1 55.22 GTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 20550969 5' + 412 7091 2 55.96 AAGAGTATGTGTCTGTGGGTTTTGTCGCTCGCCGTATTGATCATTGTTTTTGGTTGACTGCGCTGTCTTAATTTTTGTTTGGCTGAAGCAATCCTTTTTGTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTA:1 + chr2L 21019256 5' - Porto1 4405 1 65.75 ACCATCATCATCTAAATTTCTGTTTGCACTTTTCATTGTGGCAGCACAAACAGCGAACGGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGA:1 - chrX 8208459 5' - roo 395 1 76.03 TTTCCAGCGCCTCTTGCCGCCAGTCCAAGTGTTCGCAAAAGTTTCTCGGTTCGTTTTTCTTTCCATTTTATTTCGTCGGATTTTAGTACTACTTCAACCCTCGAAGAGATAATTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2R 22774630 5' + I-element 25 1 60.47 CAGAACATGCAGCACGCCCAGAGGCGACTCACAATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAATAGATTTTAGGAGAAATAGTTTCACGA:1 + chr3R 23511571 5' - 297 6892 2 74.48 AGCGAGTTGTTGCCTTTTTTTTTGTTTTTAGATTTTTTGTTATAATTTGGTCTTGTTGAGGGAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGGTTGG:1 - chr3R 25092269 5' - I-element 5128 1 74.74 ATTTTTAAGTATGCAAAGTCGTTTAAAAAACAAATTGAAATAGCTAACATTACAATCCATATCCGTATTCAATCGAGGGATAGCCTTTACCCATTGCCGATTACCGGAGAAAAGGGACGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAG:1 - chr2L 9057963 5' + 297 227 2 75.34 AGTTATTACCTTCACTGCTTATACATCCTTTTGCGCCGTTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCA:1 - chr3R 17766875 5' + HMS-Beagle2 6890 2 76.03 AAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGA:1 - chr2L 3908497 5' + jockey 4752 1 73.29 GAAGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chrX 16490432 5' + F-element 44 1 55.17 ATATTCAAGCAGTATTGATCGCGCTTAAACGGAAAGCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 19698198 5' + roo 8706 2 56.85 AGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACANATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGAC:1 - chr3R 12622371 5' + 1360 194 1 50.00 TTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 - chr2L 18173651 5' + blood 85 2 75.35 AACCAACGAAATTTACTTGCTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGC:1 + chrX 16607861 5' - P-element 2787 1 17.12 AACTGGCAGAGCAAGCAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chrX 7993160 5' - opus 442 2 58.22 ATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCAT:1 - chrX 21933313 5' + springer 44 2 50.35 AAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTACTTGCGAGTGCACACT:1 - chrX 22824243 5' - gypsy12 10157 2 53.47 TATGCATTTGTTTTGGCAGAAGATGCTTACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chrX 20024479 5' + 412 7079 2 63.70 CAGCCCTGGTAAGTTCCGGTTCCACGGACAGCTGAGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chr3L 4287025 5' + P-element 84 1 26.71 GTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr3R 24010983 5' + roo 70 2 67.12 ACCGAGGGAGATTTATGAATGAGCATAAATTAGGGGGACTCGTAAAAGGATGGGTGATTAAGCGGATGGAAAACACTGGCCAAATATGGCGACGTCATTTGACAGACGCAGAGATGAGCAATGATTGCCATTAATTTAAATTAATA:1 - chr2R 16974991 5' + Transib5 2589 1 70.55 GGCCGAAAGTTGAAAAACCATTTAAAAAGGTATGCAAACAATGTGTGTCCGTCTGGATTTCTGGCTGTCCGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr2R 16367342 5' - hopper2 1558 1 51.37 CTGTTTAATTCTCTTACTTGTTGTATTAAAATATTTAGATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTT:1 + chr3L 6721591 5' - I-element 5272 1 71.92 GCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chrX 15406034 5' - opus 7422 2 72.60 ATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTNAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGT:1 - chr2R 4774738 5' - baggins 5330 1 70.63 AAACTTACAGTGTACACATCTGAGTTATTTGCACATGAAAATCATTCATGCAGTTAGTTAACATTCGGCAGCAGTGAATCATCTGCCGTTTGTAAAACATTTAATTGCCATAATTGCGTTTGTCTCTTTATTCATCGTCTTTAATG:1 + chr3R 25565056 5' - ZAM 299 1 74.66 TATATATATTAAAAATAAATTTTTACTTAATTTTTATCTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 + chr3R 20345462 5' - blood 7315 2 72.26 AGCAAGTGGTAACCGCCAGGATGCGGAGGGTTAAGGGCCCAGAGCTGAGGTGGCAGATGGGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 - chr3R 7600584 5' - hopper 1354 1 57.53 CATGAGTGTATAAAACGAAATGTAAATGCAAAAGAGGTATAAATCTAACAAATAAACATATACTCGTGCAAATGAACATGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTG:1 + chr2L 10364562 5' - Rt1b 4974 1 65.00 ACCAGGAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3R 23511657 5' + 297 53 2 59.59 TATTCGCGGGAAACTAAAATCAACAGCATTTCTTTGGCCATACCCGCTTGACTGGACTGGGCAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACCTTGTTGCTATGTTT:1 - chrX 21639350 5' + 412 60 2 55.48 TAGTGCAGTCTTGCATCATAAAGGTTTCCTTTTGAAGATTCTAAATCAATTGTAGCACTAAAGTATCTAATGTTTGCAATATATATACACATCTTAACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTTTTTCGTAGATCGCA:1 + chr3R 17766682 5' - HMS-Beagle2 290 2 64.38 GTGGGGGCGAACGAAAACATTTGCACAACATTCGAGATACACTCGCATATCTCCAACTTGCCGCTGGGATGGGCAACTGTGTCTCCGGCAAATTAAGGCGGGCGCAAAGGAAAAATTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTAT:1 - chr3R 31631759 5' - Transpac 325 1 78.77 AAATATATATGTATATACCATTAGGTCCATATTGTCAACAATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 24010938 5' + roo 22 2 68.53 GTTAAATAGTCAGCACAAAAGTATGCTAAAATATATTACAAAGTTGCAGGATATCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTATTTAAACTATATTTATGTAANATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chrX 13401466 5' + flea 4769 2 47.69 ATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 - chr3L 8249511 5' + HMS-Beagle 6817 2 71.23 ATAATATTTGCTGCTATTAATAGCGAGAGGTGTTTGAAAGTTTTGCACACTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCAT:1 + chr2L 4631117 5' + roo 8706 2 53.42 AATTGAATGCTATGTTGTTGCGCAAACAGCTCCGCAAGTGTCGCCGGGATATACTATAGTTTGTTGTTGAAATCGTTCTAATGCACTACAAGTTAGTTCCTGCCCAAAACATTTCTGGGCATGATCTGGCAACGCCTCCCTCTCCA:1 + chr3R 4484000 5' - Rt1b 28 1 71.92 CCATGCATAATTTTAAACACACTCTGGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - 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Helena 1198 1 67.12 AAGCGAATGGACTTTTTGAAAGAGCGTTAAATGAACCAGTTCTTAAATGTACAAGTTCCAATGTACAACTTCAGCCCTGGTAAGTTCCGGTTCCACGGACAGCTGAGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1 + chr3L 4286960 5' + P-element 11 1 31.94 TATATAAATTAAAATCGAATTAATACGATTTTTTCATTAGCAATTTGGTAATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr2R 21199763 5' + jockey 4737 1 69.86 CTTTTGTTTTGCGTATTTCTATTTCCGTTTTCAATTCGCATTTTACGCGATTTGACACGTTTGGGCGCTTCGACTATTCACTATTTTGCAAAATTCACACAAATATGCGCTTAAACAAAACTAAAAACATTCAATAGGCAAACAAA:1 + chr2L 8013585 5' + TAHRE 212 1 50.00 AGTCTCCATTCGGAGTTGGGGCCCAACTCCGTGTTTCCAGACTAATGAAGATCTTTATCGGCCGCCGATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGCGGTTCCACATAGTCTCC:1 - chr3L 17935038 5' + HMS-Beagle 6828 2 57.25 TGTTATCATTAATGTAGTTCTTATATAATCTACTTAGGTATAGAATTCTCGGCGTCGTGTTTCATCGGTCTATGATCGGTGCTCATGCATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCAGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGG:1 - chrX 16742184 5' - F-element 4350 1 62.33 CTTAAGGGCAATTAATAAATAAAATTATTAAGTATGTAACAGGCAAAAGGGAGCGTTTCCGACCATATATGGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGGGGATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAT:1 + chr2L 21938706 5' + INE-1 143 1 78.08 ACACACAAAAAACGGATTGTGGCGCATTGTTATCGCTCCCTCGTCACTCATATTATCATCTTTATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTA:1 + chr2R 21110525 5' - 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Doc 83 1 50.00 TTTGAGTTAAATATTTTAAAACTTTCTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 + chr2R 7407949 5' + 3S18 5806 2 57.53 GGCTGTAGTGGTCCTTTCGAAGCTGACTTACTAGCCGAATTTGTGTCCAGGTGATATATTCCCTTCACGCCTTCACTTACATTGGTGAGTGGTGATTATTATTAATATTATTATTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTA:1 + chr2L 8064000 5' - mdg1 7071 10 63.70 GAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGG:1 - chr2L 13328503 5' + BS 58 1 58.22 CATCTAATCAACATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr2L 6154033 5' - copia 215 2 57.53 CAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chr3R 8381689 5' + Tirant 43 2 55.86 AATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - 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blood 7334 1 57.53 AAAATGTAATATCGCTATTTCAATGAAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTT:1 - chr4 637833 5' - roo 8774 2 67.81 ATGGAATTTGATTGATTTGCATACTATAACTCGTACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chrX 8208302 5' + roo 52 2 54.48 TTGTCATTATGCTGCTCCCATTTTGTATTTTTAAGTAGTTAAGCCCCAGAGTTGTGGAACTTTATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACAGGACCACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 5456514 5' + roo 8680 2 73.38 GACTAGGGCCTACGGTTTAGTNCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 - chr2R 7622931 5' - P-element 2784 1 14.38 CATTTTCTTTTCCGGGCTTCCGATGGGTTCGCCTCCTTCTTCAATATAAAAAAACAAAATTTCTCTAAGTTTCGAGATTTCTTTGGAGTGAACCAATATTTTGTGGACTGTCGCTGTCATGGGAAGCCATGGATATTTGTCAACAA:1 + chr3R 31623809 5' + hopper2 398 1 50.68 TTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 + chr3R 12622185 5' - 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pogo 2067 1 66.90 GTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr3R 12115247 5' + 1360 39 1 53.90 ATTGTTCAAGGCCAGCCATATTTTATGTTATTATTTTACAAATAGCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr3R 10433343 5' + 412 19 2 72.60 ATAAATTTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATAT:1 - chr3L 18154449 5' + jockey 4633 1 67.12 TCCATTTCGGACAGTCGAAATGGGCTCACCCAGCATAAGAGGATAAGAGGGTAAGAAACGGGCGTTTCTTGCTGAGGGGTTACAATTTTTCCAAAGCCGACTTTCACTGCTTCCACATTTGGTGTGTAGTGTGTATGTGTGTGTGT:1 + chrX 10136937 5' - accord 258 2 60.27 CTTATCGATCACAAGGAAATAGCTGGATTGATTCATTAATGCAGCTAATTGGTGAAACCTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCAT:1 - chr2L 6367417 5' - diver 162 2 60.27 ACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 - chr3R 10900890 5' + F-element 90 1 66.44 ATAATCTGCCAAATTGAAAATTCAGAAGATTAAACAATCAAAGAAATATATATTGCAACCATCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr2R 24807880 5' + I-element 60 1 60.96 AGAAGCCATAGGCATCGACAANAAGGCAAAACTCCGGCGAAAAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chrX 6615570 5' + roo 8741 2 71.92 TGTTATTATTTTTAAAGCATTATTTATACTATATACTGGTCCATAAATATTGTATTTCTATGATAGATGTTATTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGGAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr4 880412 5' + pogo 46 1 54.79 GAGGCGGAGGCCTTGATAGGACAGACGGATAGTGCCGCGAATGAGTATGCCAAAGCTGGTATGTATTTCAAGGCAGCAACCGCATATCGAATTGCCAAAAGTTTCGATAATGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCT:1 - chr3R 10121323 5' + gypsy12 15 2 75.34 GAGGAGGAGGCCGATCGGCGGCGATATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr3R 30788333 5' - roo 324 2 82.86 AAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATT:1 - 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INE-1 544 1 52.05 CACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCACACTGCAACGTAAGC:1 - chrX 21667956 5' + gypsy2 6538 2 69.86 TTTTATCTATGTTATTATGTCTTGCCTACNTAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGNGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2L 16554579 5' + blood 7055 2 54.11 CGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGAAGCTTATCAGCGGAAT:1 + chr3R 16881914 5' + 3S18 79 2 70.55 ATAATCAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:2 - chr2L 20508395 5' + pogo 62 1 67.12 CGATTCGATTGGTTGGTTGGTCAAAATGCAGGTGCGACTAGGAAAGTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:1 - chrX 13367510 5' + HMS-Beagle 6826 2 65.07 GTGTGTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr2R 16160728 5' + mdg3 5301 2 52.74 GGCCGTGGATTCCGCATCTATCGCCTCGATGACGGAGGTAACTATGCATCTCGGTATCTAATCCAGATGCAGCTGCAGGCCTGCAGCTTCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTT:1 + chr3R 31535941 5' + 17.6 7355 2 59.59 AAAATATGACGTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 + chr3R 24093501 5' + jockey 72 1 60.96 CTGAGTTGATAACTATTTTTTCCAAGTATCCTCGCTCGAAGAACTTCACAAAGAACATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3L 8273875 5' + hobo 24 1 69.18 GGGAGAGTGGGGATTTTTATGGAATGTATTAAATCAATTCAGCGTGGTGATTATTTTCGGGAAAATCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAG:1 + chr3R 16015261 5' + roo 8891 2 54.86 ATTCAAACTGCAGTTTCTTTCATAAATTGGAATGAGTCAGTTAACACAGAACGTGTGATCAATAAAAACGGGTTAGCCTAATCAATAATTCAAGAGAAACTATTCTAATGAAAGCTTTGTTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGA:1 - 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copia 236 1 52.05 ACCAACTGAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 - chr3L 21292592 5' - 412 419 2 66.44 ACATGATTGGTACAAACAAAATACATAACATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTACAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTAT:1 - chr2R 9091895 5' + 1360 3094 1 50.68 TCATTTAAAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTGGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chr2R 21619414 5' + blood 77 2 67.81 GGATCGACCCTTGCAGTTTCCGCCCACAATCGAGAGCGGAATCGAAGTCGAATGCAGGAGGGGCAACTTCAAATATGCATCAATAAACTCAATTAAACGTAAACGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACACG:1 + chr2L 1451108 5' + mdg1 18 2 69.18 CGGGCTTTGGAAACTCTAGGAGAGGTCAGTAAAATGAGGAAATTCCTCATCCAATTTCAAATAGACAGAGCTCTTCTACAACCTCCTTTCGAACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 30537747 5' - roo 9043 1 50.00 TGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGA:1 - 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chr2R 611223 5' - 297 334 2 61.64 CGTTCTTTGTTAAGTTTATAATCTAAATAAATGCATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATAAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 22435575 5' + roo 8747 2 75.34 CAGAACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAGC:1 - chrX 15252409 5' - opus 7497 2 79.17 GGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 - chr3L 8249499 5' + HMS-Beagle 33 2 63.01 CCGCATTTTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chrX 20456972 5' - opus 7443 2 66.44 CAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAAC:1 - chr3L 8249478 5' + HMS-Beagle 6850 2 56.85 CAAAAACGCCTTGTCTTTACTGTGCGGTTTGTTCTCTCCGTTGAATTCTCCTGCGGGGTTTAAGGTGCCGATAATTGGTTTTTATTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTACGAAGGTC:1 + chr3R 2973255 5' - I-element 5112 1 54.17 GATCAATCGAGTCCATATTGAACTCTGGTACTCCCTGATACCTCAATTTGGGCGCAAATGACTGGATTAAGCCGCGTATGCATTCATTCAAGTCCGGAGAGTTCAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAAT:1 - chr2L 13249262 5' + jockey 4648 1 71.92 AATCAATTTTCATACAGTCATTTGGTAATGAAGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr4 490190 5' + pogo 26 1 69.18 TTATGAATTATGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr2R 8258221 5' + jockey 11 1 78.57 CAACACTTGTCCACTCATCCGCTCTTGGCCACATGGCCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chrX 13458288 5' + hobo 24 1 57.65 AGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr3R 13684763 5' + 412 7129 2 67.81 AACTGAATGTTTTATATAATGAAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr2R 8596926 5' - pogo 2039 1 59.59 GTACCCTCTCTAAGGTTGCTTAGATTTTCAGATTTAATATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGC:1 - chr3R 6398042 5' - pogo 20 1 73.05 GGTGTGCCGCCAAGTGTGTCCAAGCGGATCAAAGTCAGCGTGGACTGTAAGTCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chr2L 6385927 5' - invader4 301 2 67.59 ACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr2L 16607285 5' + 412 71 2 67.14 CAGAGTGGCGATTCCACGCCATGTACGCTAGCTGTATACAATAAATATCTTAAGTGGGCGATCCCGCTCCAGAAATAATGTAAACATAGGCAGTATAAGAAAGATTTTTGACTCGACAAAAGGTCATAAATTTACACTTGGAGCCA:1 - chr4 1183510 5' - Q-element 664 2 73.97 ATACTTATGTTTTCATTTACAAAAGTTATAATAACAATTGCAGATAGCAATTTTACTTATTTATAATTTGAAATATTGATGAACTTAATATCAATTGGCCAAAAACTCTAAATATCAAAATTGATTTCGGCCCGAAAATTGTATTC:1 + chr2R 5666074 5' + 1360 3190 1 63.70 GCTTGAATCAAAATAAACTATTGGGACACAATTTTAATGAATTAAAATTTTTTTTATTTTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTT:1 - chr2L 21895556 5' - Juan 4146 1 63.01 AATTGAGTGGAAATGTTGACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 16920303 5' + roo 8697 2 62.24 CCATCAGTTGGTTCCGAACGATAAGTCTATTGCCAAGGAGGCCAAAGACTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATATT:1 - chr3L 17746354 5' + roo 8736 2 65.07 ATGTGTGTAAAGAAAACGCAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATTAGTGCGCGTGAAAG:1 - chr3R 9550996 5' - P-element 2829 1 44.52 AACGAATTGCAATCAAACCGTTAAGTGGAAGCGGTAAAAGATACCCGTTACCTAAAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTTGTTCGCTATCACTGTCCATATTAACTCCGAGATCTCAGGAACTATGAAAGCTAGAA:1 - chr3R 4548403 5' + INE-1 154 1 72.60 ATCCCAAGCGGACAGCTCGACCGCCGGACGTGGACCAAAATACGGACACGAGTTCATTTAAAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr2R 21619467 5' + blood 24 2 69.18 CACCAAGTCGTCTGTGGGCGTGGCAGGCAATTTATACATGACGACGTTATTATTTGCCTGCCTCCTAGGCTCGCCCCCCCGGAAAACTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGC:1 + chrX 7848160 5' - flea 215 2 65.75 ATACCCAATCCTTTGCGCCTCCCCCCCACAAACTTTGCACAAACATTCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 18204432 5' - hobo 2911 1 55.45 TAGGAAGCCATTATCGCTGGCTTGGAAAATTCACACTGTAATATGTAGAATATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chrX 3453114 5' + roo 69 2 66.44 TTAATAAACATTTATCATAGTCAAATTAACCTATTTCAGTTAAATGGTAAAAAGCGTATACAAAATTCGTCGAAAAGATTGTAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr3L 21156989 5' - 412 480 2 71.77 CGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTG:1 + chr3L 13546562 5' - hobo 2870 1 66.90 CATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 + chr2L 16554607 5' + blood 72 2 67.12 CAAATCTGAGTTATTTAGATAAGCGAAGAGCAAATATGTACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1 - 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412 442 2 56.55 GGCGCGTGTTGCTAGATTTATGGCCAGGCAAATGGGATCGAAGTGTGTAAGCCGATTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACTTATATTCACCGATCGTGGCCACTACCTGGTCC:1 - chr2L 10609744 5' + Chouto 401 1 55.30 CAGTTGCACGATGACCCGCCAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr3L 9522014 5' - opus 468 2 55.24 AGATTATGTTTCAACTTTAATAATGAAACGGAATAACTATGTACTTCTATTACATTTCATCACAAAAAGGTGTGAAAATTGTACGCCATATATTTAAACCATGTGTACATACAGCTGTGTTCAAAAAAATAGCAGTGCAAAAGAAA:1 + chrX 8459761 5' + HB 19 1 52.05 CCACACAGAAATCACTGCGAGCGGGTCTGATCGATCAGCTGTTGGTGGGCACCAGAGGTGACGCAGTGACTGCGGAAAGTAGTCACCGTATCTGACTTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr2L 1729880 5' - Transpac 285 2 64.38 CTTATACATATTTGTAGATGTAAACACTTGTAATGTGAAAACACTGGCTATCTGTTGCGGCGCTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:1 + chr2L 5341445 5' - Burdock 246 2 80.14 AGGGAGTGGCTACAGACAACAACATATGAATTTTACCTCGGATCGGAGAGGGATTGTACGTACATATATGTATATACATAGCATATAAGTTATTGTCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr2R 21529927 5' + HMS-Beagle 6827 2 59.71 AGCGAGAGGTGTTTGAAAGTTTTGCACACTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr2L 4631138 5' + roo 8727 2 60.27 ATCACAATATTACAATTAACTTGCCATATACTTATTAAATTTAAAGTACATTATAATTTTTACATGATTAATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGCTGGTCATTTTAT:1 - 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P-element 2791 1 19.86 GTATGAATAATAAACAGAGGCATGCCAGTAAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 + chr3L 2668815 5' - Bari1 1676 1 62.76 AATTAACCTATTTCAGTTAAATGGTAAAAAGCGTATACAAAATTCGTCGAAAAGATTGTAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 + chr3L 21157012 5' - 412 7488 2 59.59 TGAGAATGAGTAATGCTCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chr2L 3632184 5' - P-element 2786 1 14.48 CAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr2R 22596065 5' + Doc 45 1 50.00 TTATCGTCGAACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTC:1 - chr3L 21913485 5' + 297 6595 2 76.03 AACTGCCAGTAGCTCACCAACTCCGGAACTTTTTTATTTATTTATTTATTTTGATAGATAGAATAGTTTACAACACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATAT:1 - 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Doc3-element 396 1 53.62 GTTATATTCGAAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATATA:1 + chr2R 7009414 5' + Quasimodo 34 2 56.67 TCTCCCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATA:1 - chr3R 10062211 5' + copia 87 2 76.03 GAGTGCTAAGATATTTATTATTCTGTTAATTTTATGATTTTCAGATATTAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAA:1 - chr3R 13683339 5' + P-element 2785 1 39.73 CAGTTCATTAAAAATGAAGCGTATGTAAATGTTAATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTT:1 - chr3R 13323916 5' - F-element 4609 1 74.22 TTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1 + chr3L 8754770 5' + mdg3 5320 2 71.92 GGTGCGACTAGGAAAGTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAA:1 - 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mdg3 165 2 71.23 GAAAGGGTTCATGAATTCATAGAACAAACCCTACGCAGGATTGGATCCTAGAATTCTTATGGAATGTGCTTGCGGATTTGAAACTTGAATTAGTCATTTAATGAATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGAT:1 - chr3L 3203704 5' - accord 448 2 67.12 GGTTACCTCAAAAGTGATGACATCGAAAAATATTTTAGAATACCGAATATTTAATAGCCTTGACAATTTTAAATGCTTCAATGTGTCTTTATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCT:1 + chr2L 6244192 5' - jockey 4521 1 58.22 ATTTGCCTAGTAAAATGCAAAAATAATTGTTTGAGGAACCACAACAAAGCAACGGCAAATTAGAGAAGCCAAAAACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGAC:1 + chr3L 2528613 5' + Quasimodo 131 2 52.74 CAAAGCTAATAGCCATGAGCAACTTGGCTTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 24443974 5' - hobo 2917 1 69.86 GTAGCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAA:1 - chr3R 2525969 5' + Stalker2 7322 2 66.44 TATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 24010997 5' + roo 84 2 76.71 CCGTGTGGCAAAGAGTTTGCTAAGACTGTGGATCGGAAGCACTGGCTTAGAGCTTCATCGGCTTGATTGGCGACGTACATATGTGCATCTTCACTTTCCATTTAATTATCAAATCGGATTTAAAATGAATGAAATAAAAAAAAA:1 + chr3R 8037727 5' + X-element 4719 1 73.61 CGAGCGTGTTTGTGTGTCTGTATTTGCATTTTATGAAGCATTTATTACCGCTCCTCAGCGCTCTCCTCCCTTCCCTTCCTTTCCTTTTTTCATATTTGTTTTTTTTTTCTTGTTT:1 + chrX 8210892 5' - Porto1 165 2 84.35 AAGATTCAGTGTTAGTGTGTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chr2R 16160714 5' + mdg3 35 2 62.33 ATGCACGAGATATTTGACAAGGTATGTAGGACTTATAATACTCGCAATTCCCTTCCCCAGCACAAGTGGCAGCTCCTCCTAAGTATTAGATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGC:1 + chrX 11600306 5' - P-element 350 1 69.86 TCGGTGCGCGGGTTAAGTTTTGCGTTTGTTTTCCAGGCAAAACCGTATATTACCTCATTTTTCCAGTATACTACTTTTAATTAATTTACCTTAACCTTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTATTTATTTGTAAGCTTATCCGT:1 - chr2R 2639439 5' + Cr1a 4042 1 75.34 ATATTTGCTTAGCTTTAACTAATTTAAATAATTCCACGACGCGCAGTTCCGTTCGCATTCGCGCGTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3R 16349148 5' + P-element 10 2 78.77 GTGCAACGCTGCAGCTCATCGATGGCTGGCTGGCTAGTCACTTAGCGCACCGGGAACACTTTACACTTTAAGCCAAAACATCGGAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 + chrX 1758922 5' - Tabor 7286 2 58.90 CTACGCTTAATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3R 7420419 5' + 412 51 2 53.42 GGTATTCCATGGAAACCATATAATATATATAGTGTTTCGATTCGAATATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACAT:1 - 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chr3R 17494987 5' - hobo 2897 1 57.14 ACGATCCACACCAAATGGATTATACCCCCAGATGGCATGCTCGTGTTTGCATATATGTTTAGAGTGTAGATTCGTTTAGATGACTCCATCGCTTTCATTGTGCAGTAACAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTG:1 + chrX 10490391 5' - Doc 494 1 72.60 AAAGAGAGAAAATTATATAGCATACTTATATGGGCATGCAAAATCTATGCCGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr2L 17136174 5' - hobo 2937 1 70.89 TGACTTGTGACCCGAACCCCTCGCTGACCTCAGACCCAGTAAAAGAAAGCTCCCTTGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAAGATATTTAATG:1 - chrX 7508194 5' + roo 8674 2 64.52 GCGATTGAGTGGAGCGATCAAGAGACATACTGACAGCCAATTATATCTAATCAAGTACATATATATTCAAATGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr2R 23596088 5' - blood 7341 2 52.74 AAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:1 - chr2L 3908496 5' + jockey 4753 1 73.97 TGGGTGCCCCGCACCAGAACAAGGAGATTGTAAAGCCACCTTACTCGTACATCGCCCTGATAGCCATGGCCATCCAGAATGCGGCGGACATTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAG:1 - chr3L 21475998 5' - Q-element 242 2 61.64 TATCAAAGGCATTTTTGTTGCAACATGTTGTGACAAACGCGACAAGCCACGCCCACACTGTTGAACAATTCTATAATTTCTCTCAGAAATTATGATTTTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTTAGTTACGGGTATCTGATTGTCGG:1 + chr4 537515 5' + INE-1 551 1 71.23 GAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAA:1 + chr3L 17934931 5' - HMS-Beagle 6972 2 67.12 AGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1 - chr2L 20508385 5' + pogo 72 1 70.55 TAGTCAATTTTTATTTCTGTTCCTATATTGCTTTTAAAAATATATATATAGTTCATGTAACCATATACCAACAATGGTATCCCGAAAGTATGCTGCAAATGAGTTACGGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGG:1 + chr2L 8974593 5' + R1A1-element 5260 1 57.93 ATCTTAAAGCGCTTTAAGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCAT:1 - chr3R 12622387 5' + 1360 178 1 57.53 TTTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTTGCATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCTATA:1 - chr2L 18093451 5' - 412 7109 2 76.71 CAAATTAGAAAATATGTTTCCTATTGAAAGGAAAATATATTGATTTCTGAGTACCTATTTCATAGCTAAGCAATTTGGTTTCTTGAATAATCATTACATCAAATGTGTAGCCAGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 - chr3R 19629087 5' - Transpac 305 2 76.71 GCTGCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:2 - chr3R 6962450 5' + jockey 59 1 53.42 CGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCT:1 + chr3R 5170984 5' + F-element 94 1 76.55 ATAACTGGCAGATCTTTCTTCCATTTCAAGCTACACAGCGAGTTTTTTGCAATAATGGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCG:1 - chr3R 15284287 5' + hobo 2707 1 51.33 CTATACGAAATTAAAAAACACTATTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTATTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chrX 15540082 5' - roo 9030 1 54.11 ATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGTACAAATCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3R 20260874 5' - roo 8984 2 79.31 GATTACACAATATAAATGGGCAAAAAAATTTCGAAATTCGGTTTAAGTAAATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 22041054 5' + roo 50 2 52.74 GCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3R 10433299 5' + 412 7102 2 61.36 TTGATATTAATTTTCAGAGCATTTACTTATGCTATATAAAATTATGATACCATACAATCCTGTTGAGTATACGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCC:1 - chr3L 21135257 5' - jockey 4527 1 51.37 GAGAAAAACTCAGCTATTTAACTCAAGTCGATTTAAAAAGCTTTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr2R 6089051 5' - 1360 3335 1 55.17 GTTATATTCTATAGAACAAAGTTACAATATTAGTATTTTTGTGTATTTACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAG:2 - chr3L 8295816 5' + Quasimodo 71 2 73.29 ATATTTGCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 13453444 5' + 412 7074 2 71.23 CAAGAATGCCACACAGCAGACACAGCAATAGCCTTGGGACCAAGTCTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 + chr2L 3408743 5' - opus 426 2 71.92 AGTACGTGGCCTGCTCGGTGGAGGCGCAGATCTGTGACTTGGTTAGTTGCTATGGCAATATCACGCAGAATCTATCCGCATATGTGGCGATGAGTATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCTAACCG:1 + chr3R 20024984 5' - flea 36 2 66.44 AGAAGTTTAACTAAAATAATAAAAGTCAAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGAGTGTGTGTGCGGGGTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 9955448 5' - accord 7033 2 56.80 TGGTCTTCCAGCTGATTTCGTTGCTTTTGGAGCATAAGAAAATGCCCATTTGATTTTGTCAATGCGCTGGTCTTTTTTCATACAACGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 - chr3L 20765278 5' - 297 388 2 78.40 AATCATCATATGGAAGATAGGTGACTGATAAATTTAATTTTCTAGCATCTCATAACTCTCCGTCGCCGACAAACGGATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCC:1 + chr3L 11934920 5' + Doc 4542 1 52.86 GTTTTATATGGCAGATAAAATGTATCTGAATGTTCGCTCTCGATGTGGTGTGGGCTCCAGATCCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCT:1 + chr3L 8754694 5' + mdg3 5258 1 79.45 CTATGCTTTTACATGTTCAGTATATGTCACATACAGCAAATGAATATTGTTAAATTATTTATTTGCTGTATTCTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chrX 407493 5' + I-element 50 1 56.16 TGAATATTATAAAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGATTGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGGGTGAAGACGTGTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2L 11725056 5' + F-element 33 1 57.72 AGTCCCCGCAGGGCTTTAATGCATTTGATTAGCTCTCTGCCTTTGGATCAGGCCAAAACACATCAACCTCCCATCACACAAGTCAGGCAAGTCGCCGCAGAAACTACACATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTT:1 + chr3R 17494850 5' + hobo 7 1 79.86 TAAACCGTTTAGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACG:1 - chr2R 16185118 5' + 17.6 41 2 61.90 AAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAGCACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 - chr3R 20345528 5' + blood 74 2 65.07 GTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGTCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAACGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCACCAGAACATAGCCCAAAAATATATGG:1 - chr2R 18044027 5' + jockey 4637 1 64.83 AAGCAACAGCGCAGGCCCTGAAAGGCCTCGGAATGAATGTCACTGTATGTGGACTATACACACATATCTCGCCATCTCTTTCGGTTCCACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2L 16995610 5' + roo 8694 2 62.94 GCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAGAT:1 + chr3R 17944058 5' - P-element 2782 1 13.70 ATTTTGTTATTTAAATGAAAGAAATGTGAAATTTATATTAACAATTTTACTAGACCTAAAATAGTCTTTAGGTATCTGTCTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 + chr3L 18289697 5' - blood 335 2 54.79 ATCCGAGACCCGAAACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr2R 14431192 5' + Doc 52 1 47.59 ACAGTTACAAGCTAGGGATGGGCGCGTCAGCGAGTAACTTGTAATGTTGCAGTTTGAAAAAATAATATTCATACCACAGAAACATTATTATGGGCGGAGAAGAAGGCGTTGTCAGATCAAAAAATAAACAAAATCCAAAATTCTAT:1 + chr2R 17420941 5' + transib4 2545 1 61.64 CAATCAAAAGTAAACTTCAATTTCAGGGGGTTAACTCAACAAACGCGACAGAGGGCGAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 - chrX 18767903 5' + hobo 64 1 60.27 AATGCTAACTAAAGATTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTG:1 - chr3L 20573828 5' + pogo 2051 1 74.48 TGATCGCCATGACAATTTGTCAATTGGGTTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGTTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGC:1 - chr2R 21530041 5' - HMS-Beagle 6979 2 65.22 CAACTAAAGCACTTCAATTTAATTGCTGTAACCAGCATTATACACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr3L 19222579 5' + 412 7102 2 50.68 ACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 - chrX 140085 5' + blood 69 2 62.33 AGTTTCCCGCTGCAATCAACACGCTCAGCTGCGTATCCAGATGCCAGCGCGTTGTCGGGGAGTAACGTTCGGCGGCCAGTATCATGCCCGAGCTGCACTGTGCCTTGAATCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAA:1 - chrX 9114348 5' - roo 40 2 70.55 CATGACTTGATGCGTTAAAGTTTTGTAAATAGTGTATTTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGT:1 + chr3R 29195456 5' + flea 4833 1 73.38 GGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAGAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTT:1 - chr3L 5958711 5' + 412 65 2 58.22 GCAGGGAAAGCTCTATGAATCGATTGAGCGATACTCGGCTTATCGATGTGAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1 + chrX 4240227 5' + jockey 4742 1 65.07 TTCTCTTCTAAGGTCACTTGGTGGGATGTGTACTCTACTAGACGGCCTGACTCGGTTCATTCCTCTCTTTCTGTCCGTCTAAAAAGTCTTCGCGTCAACTAACAGACTGCACCAGTCGAGCCTTGGGGTC:1 + chr3R 14304670 5' - Gypsy12A_LTR 418 1 40.77 TTACACCTTCTGTTGTTGTTGTTGTGGTCATTTAGCTTTTTGCCTTCTATGCTATCTTATTGATGGCCGGAAGTATACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTC:1 - chrX 7694377 5' + Cr1a 4040 1 54.81 TTTCAGTTTTCAACCCATTGCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCAT:1 - chr3L 5398178 5' + roo 8699 2 63.01 GAAATGGAAAATTATAAAACGAAGCCAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chrX 7042628 5' + roo 8728 2 63.01 CACCTCTTCAATATAAATTTCTTAGTTGGTAAAAGTGTTTTTTTTTCTGTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2R 22761142 5' + 412 35 2 58.70 AGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3R 15102319 5' + roo 8744 2 72.60 GTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 - chr2R 4601683 5' + HMS-Beagle2 23 2 72.60 AAGTGAGCCAAAGGCACTAGAAACATTCTAAATTTAGCGCGCAATAGCTTCCGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr2R 16073054 5' - opus 7477 2 69.18 GGTGTAGTTCAATTCAAACTTAATAGACTAGATTGTTTTTTAATCTACTTGATTTGGCTATAAACCAGTTGAGTTAACATCACTTGTGACCAGTTGAGGGCGTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAACGA:1 + chr3L 6641660 5' - diver2 266 2 68.49 GTATTATTACACATATTAATAAACATTTATCATAGTCAAATTAACCTATTTCAGTTAAATGGTAAAAAGCGTATACAAAATTCGTCGAAAAGATTGTAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 21156974 5' - 412 473 2 71.23 GAAACGTGCGAACGCCGTGGGACTGGAGCCTTCGCCGGGAAAGATGATGGCCTGATGCTGGGGCTCAGTATGGGACTCGGCTTGGCCAGCAGTGGACCTGGGAATTTTTTTTTTATTTTTATTTGACTTACGGGAGGGAAATTAAA:1 - chrX 652794 5' - Rt1b 5126 1 69.18 GAAGTATTTATTAATTGATTGAATCACTAAAAATCAGATTAGATTAGTATCTCTGATTTTCCCAGTGCATCATAGCAATGCTGTGAGAAGAATCCTTCCAAATGGCTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 22868248 5' - accord 7032 4 83.06 CATAAATCACGGGCACGATCAATGTCCGTCTCTATATATCTATATGCCATGTCTTCGATGCATTCCAAAACAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAAT:1 - chr3L 5244392 5' + I-element 419 1 53.42 GACTAGTTCCATTGCATAAACTTAAATACATGTTCATTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 + chr2R 21619349 5' - blood 7308 2 72.60 GTAGTCTCTAGGCCACGCCGCACTTAGATGTCGTGGCACAGATACAATTTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 + chr3L 21913336 5' - 297 333 2 65.07 ATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGAT:1 + chr2R 12248994 5' + Juan 4111 1 73.29 CAGCAACAGTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr3R 19725434 5' + hobo 22 1 52.22 AAAGTTGACACGCTACACCAGCAACAACAAAAGCGACTAAAACAGCCCAAGTAACAACAACTTTGACGAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - 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chr3R 15137344 5' - roo 326 2 73.29 AGTGCCATCTATAAGGCTGAGGTCTGGGTGGATGCTGCCACCCAGGTGTTTTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGC:1 - chr2R 16560477 5' + blood 439 1 65.07 CGGCTTTTCCGGCATTTTTCGTCGGTGTGCCAAAGTTGATTTTCATTAGTTTTAATGCCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCG:1 + chr2L 13555697 5' - F-element 236 1 58.99 ATTTGTAAAATGTATGGGTGCACTATGAATGTATGTTATTGTAAGCAAACACAGCGGTATACTATGAATTCAAACAATTTTATATGCAGACTAAATTTTTATTTTAACCTGCTTTAATATTTACCATCATAAATATAAATATACCA:1 - chr2L 19906427 5' + Stalker4 7039 4 72.60 CACTGGCTGCCTACGGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGCTGTTTTGAGTGAA:1 - chr3R 15047413 5' + F-element 58 1 54.14 TAGTCTTTTAGTTGATTTCGTATTTCATTTACTTACGACATTTACGACATTTTTAAGATTCTGGGCTCAACTACCCAAAATTTTCACTTCTATATTATATTCACTTCTAAATCTGGGGTATTGCAGCAAAATCCAACTACAACCGC:1 + chr4 87890 5' + BS 4701 1 76.03 CTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCAT:1 - 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chr2L 19791093 5' - Stalker 6832 2 54.79 ACAGTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCC:1 - chrX 12365370 5' - hobo 2876 1 72.22 TATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCAC:1 - chr3R 8867061 5' + Max-element 66 2 80.00 TCAGGAGTATTTTTAATACGACTGGAACGTTTTACAAGTTTTGGAAAAGTTTTTAAGCTTCAGCCCTGTAAGATTGAAAGAGTCGTTGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr2L 18284970 5' - pogo 2088 1 73.44 ATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGAC:1 + chr3R 11757962 5' - invader4 267 2 55.48 ATCTGTGCCACACAGATGCAGTAGTAAATGCCGTCGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 6514251 5' - roo 323 2 74.66 GAAGAACTTCACAAAGAACATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr3L 8273912 5' + hobo 61 1 59.59 AATTGGAAATACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTT:1 - chr2L 16607295 5' + 412 7119 2 60.00 ATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAA:1 - chr3R 12622368 5' + 1360 197 1 52.05 AAATTGAAATGAATAATTGACTAGAGCACTTTTTGATTGCGTTAGCTGCACTTTGAGGTACGTGTTATTTTATTTATTTATGGTGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 - chr2R 18767275 5' - pogo 2067 1 62.33 GAGGGCTCGTGCATGTGAGTAGTTCGAAAAGAGTTGCTTCCATTCAGAGTAAAAGTTTCAGAGATTCTCAGTCCATATGGTGTTTCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGA:1 - chr3R 11919809 5' + HMS-Beagle2 161 2 71.68 GTTGAATAATTCATAGAAAACCTACTTTTTTTTATTAAGCTCTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTGTAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCAT:1 - chr2R 4103324 5' + Quasimodo 57 2 59.31 GAAATATGGGGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:2 - chr2R 15472148 5' + 412 7113 2 52.05 AAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACG:1 + chr2L 13697632 5' + F-element 110 1 78.77 AAATTAGTTGAGACCTATATTCGAAACTCATTATTGGATGAAATATATTTGGAAAGGATTAATACAAAAGAATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTA:1 - chrX 2668009 5' + 17.6 175 2 51.03 CGAGACTTCTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chr3L 15700772 5' - Doc2-element 223 5 75.68 GTGGGCGTTTGAGTGTTTGCACTTTTGACTTTTCCCATGCAACATTTTTCGGGTTTTCGACAGTTTGAATTTTGTAGGTGAGTGATTGGAGTGGATTTTTGACTTTGTTGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTA:1 - chrX 6496168 5' - I-element 489 1 74.66 AAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACC:1 - chr3L 19350023 5' + 1360 3243 1 47.89 CATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGGGCGGGTGCTACTCGCCACGCACACCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr3R 19725414 5' + hobo 85 1 78.20 CATATTTAAGGGGTTTATGGTTCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATAT:1 + chr2L 13244661 5' + jockey 4635 1 67.81 ATGAATTTCAAAAGATAAGCAAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTATA:1 - chr2L 5341598 5' + Burdock 6197 2 58.62 CTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGCCCCAGCTCCCAAGCCC:1 - chr3R 934264 5' - Rt1b 4741 1 49.60 ATTTTTACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 3911800 5' - roo 9044 1 67.12 GGAACCGATTCGCTATTAATGGCACTGACGGGACCGAGTAAGGGACCTAGTACGGGACCGACTACGGAACTACGGGTATCTAAATTTAGATACATTTTATTTGTCAGTGCAAAATCGATGTACCCTGGCGTTACGCATCTTGTTAT:1 - chr3L 17870921 5' - 1360 14 1 69.86 TACTGACTCCACTGACCCTTACGACACGCCAGCTCCTTCTCCTTCACTCCCAGGATCTCTTCTCGTTTGTAGTGGTCTTCCTTCCGTGTCCTTCGGGCTTCTCCTCAATCCAATTTCCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATC:1 + chr2L 22646380 5' + 297 6858 2 65.07 CTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3R 13375947 5' + 1360 56 1 57.53 AGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACT:1 + chr2R 17696047 5' + rover 7032 2 73.97 AATTACAAAGTTAATGTTCTTTGGTGAAAGGATTAAATTGCTAGTTTGTCCAGGGATATCGGAGAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCC:1 + chrX 17419099 5' + Doc 373 1 56.16 GAACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTT:1 - chr3L 21913477 5' + 297 22 2 70.55 AATGCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTCGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr3R 12941763 5' + hobo 50 1 50.68 CTCGTGTTGTGTGTGTGTGAGTAGTGCACCCTTTTCGGGCATTGAATTCCGCACTAATATAATTATAGAGCCTGGCCGGTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATA:1 + chrX 9768456 5' + 297 6954 2 54.11 AATGGCAGGCGCAAAACAGAATCGCAAAAATTGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGACGCGTGTGGGAAACAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr3R 13684820 5' + 412 7072 2 65.75 GTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGC:1 - chrX 13367456 5' + HMS-Beagle 6879 2 75.17 ATAGTTATCTTTGCTTGTTGTATTCAATTTGCTTGTATTCAATTTTTAAATGAAATCCTTTACACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:2 + chr3R 6399306 5' - pogo 2087 1 76.71 TAAGTGACTCATAAATGTTATATTAATATTGTGGCACAATGACTTGCACTTCAGTGGCGTGCTGAGGGGAGAAATTCAACAGGGAATAAATACATAGCATGAGCCAGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACG:1 - chr2L 11907789 5' + Doc2-element 306 1 67.36 GCAATTACTGGCGTTTCAATGACACTCAATGATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr2L 15917669 5' - roo 8983 2 78.08 ACGAGATGGTATAATACGTTTAGTACATCTTAAAAAATGAATGTGCGATTGACTACTCAACTTATTTTAGTCAGAAGAAATGGCTAACCGGTAGTCCACTATATTGACTCATTGGAGCTTGAGACTAAACATATAAAGGTTATTTA:3 + chr2L 15202181 5' - Copia1_DM 22 1 62.33 CCTTGTTGAATTACTAATGTCTCATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 15102348 5' + roo 8715 2 52.74 GCGAATGTTGAAGTGCACAATTGTATAAAGTATATACATATATAAAATATATAATGAAGTTCAATAAAACAAGTCAGCTAATCAACGTATGTTTTTACATCACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 27397961 5' + roo 8682 2 47.26 TAATGGCACGGAACTCATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr2L 18173719 5' + blood 7032 2 70.55 CAAGATAAATATGCTCGAAGCACGCACTCCGCCGGGCATCGGATCGAATCGGAGAACTGGAACAGGAATCGCTGGATCGAGAAGGGAGATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATG:1 - chr3R 10485791 5' - pogo 54 1 61.15 TGATAGACAACAAATCGGACAGATAAAAGGACAGACTGGAATATATGTGCTTTATAGGGTCGGAAACGATTTCTACTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 21157133 5' + 412 43 2 55.86 TTATAAAGCGAGATGTTTTTTTAATATTTGGTTGTGATAGGTATTTCATAGTCAGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGC:1 - chr2L 5783483 5' + FB 297 1 63.01 GTCTAATTTCGCTAAGGTAAGCATAGGCTCAATTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCTAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGT:1 + chr2L 19733114 5' + FB 90 1 78.08 AAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:1 - chr3L 10814623 5' + micropia 125 4 58.90 CTCCCTGTGCTCATATGTTTGCTTGGCTCCTTCCCAAGGCTGAGACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2R 13695588 5' - blood 7364 2 67.81 GGGAAGGGAAAAACTAAACAAAAAGTACTTTTAAGGGGCACTCTACACTGTGGTGTGGGGCTTTCCTTACCCTATACTATAAATATTAAAGTATTAAAGGTGTAAAAGAATGAGACTCCAAAAACTCCCTCCTTTAAATAACTTTA:1 - chr2L 19890259 5' - invader3 249 2 60.96 GGGTATATACACAATTGTATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:2 - chr3R 13676184 5' - P-element 2821 1 43.15 ATATCGTGTCTACGAAAAATGAAGTCATCGAATCCTTGGCAATGAAAATATAGGCTTTGTTCACACATGAGCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr2L 3911927 5' + roo 57 2 63.70 CTTTGTTATTGTAAAATTGAATGAAATGGTAATTGAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3L 20765095 5' + 297 14 2 76.71 GAAGGGAGTGGCTACAGACAACAACATATGAATTTTACCTCGGATCGGATCGGGATTGAACGTACATATATGTATATACATAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCCG:1 + chr2R 21529925 5' + HMS-Beagle 6832 2 63.01 AGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTA:1 - chr3L 8273978 5' - hobo 2900 1 66.30 GCTCAGCAGCCACGTGTCCTGGAAGTCCGACGGATCCACAGCCTGCAACGCCACCGCAATGAGGATGGCTACTTTACAAATAAAGACTGTTCCACGCACAGTTCTACGGTTATCTAGGGACGGTAAATTAATTA:1 + chrX 19258032 5' - Cr1a 3993 1 45.52 CTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr3R 20345518 5' + blood 7095 2 73.29 TACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCAT:1 + chr3L 8754776 5' + mdg3 5325 2 75.86 TATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCGT:1 + chrX 16996072 5' - roo 327 2 70.55 GTACGGTACTTTTCCTCTCTAGACCTTCTGGTCCTAAATCTGCGGCTGACCGTCTCTTCATATATAATTTTGAAAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCC:1 - chr2L 23369994 5' + hopper 80 1 52.08 CTATTCTTACCCTGATTACATTAAGAAAATCCTAATTTTGGTAATAACCAATTCCAAATGTGCATAGATTAGGCCCGACTTAGAGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTA:1 - chrX 7032792 5' - roo 9035 1 60.96 CACTCACACACACACACACACACACACGCGCACGAGATCTGCCTTGTTTTTCTCTTCTTTTTTTT:1 + chr3R 27499995 5' - 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chrX 5721955 5' - pogo 2070 1 61.64 GCTCTAAAAGCATTTTTACTATGAAGCCTGCCCAAAACAAAATCGCCTGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTTCGTAAGCCAAGGCACTGTCCAGAGCTCGCTCACCAAGAAGACTCCACAGAAGACATCCGAAGGACCTCATCAA:1 + chr3L 24051190 5' + BS3 1569 1 52.74 AAATATCGAGCATTTAATCGATACTTTCGTGTGTTTCTCAAGCCCTGGTCTAGCAAAATGAACCGAGATGAACAATTTACTCACAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACACCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2L 7810760 5' - P-element 2849 1 58.22 CTTCGAGACGAGAAGATGCCACCGAGAGCGGGGATTGGGCAGGGGACTTCCAACTGATTGACGTCTTTGTCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACANAAACATCCGCAGCCGCATTC:1 - chr3L 17394332 5' + Quasimodo 7035 2 54.92 CCATGATGTAGTTCTTTAGCCCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3L 21636383 5' + 297 6595 2 76.71 GCTATTTTCATTTTCATTTTTTAAGCCGACGCAGCAAAATTGAGAACGCATAGTTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTGAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGT:1 + chr3R 11547688 5' - HMS-Beagle2 7094 4 63.70 TAATTGGGATCTGCATTTTGAGCGAGTGACAGTGATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 29384758 5' - roo 9052 2 73.29 GAATTTGATTGCGAATCAAAGTTGCTTGTAAGGGAATTACTTAAGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chrX 15405919 5' + opus 7024 2 68.49 TGAAAGGAAAATATATTGATTTCTGAGTACCTATTTCATAGCTAAGCAATTTGGTTTCTTGAATAATCATTACATCAAATGTGTAGCCAGGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 - chr3R 19629063 5' - Transpac 5200 2 60.27 ATTGGAAGGATTGCATTGAATCCCCGTTTGACCTCCGCACAGGTTACTATACATATTCAAAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 - chr3R 15137410 5' - roo 9055 2 72.60 AGTAAGAAAGTCTCACAATAAAATTAAAAAATAATTTCACAATATAATTTCATAAATTTTCAAATATATATTTATGTTTGCAATTATATATATATCACATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr2R 14161279 5' + I-element 25 1 68.49 TTTTTTAACAATTTATTTAAAACAAGTACATCATATTTTTGCATTTCGCAATACATCGGTAACAAACTCCTGATAAGATAAAAAAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTGTACGGTTAGCTATGGAAGGTAAATTAATTGAAAGTAGTT:1 - chr3L 13919053 5' - Cr1a 3984 1 50.68 GGTGTAGGGTATATACACAATTGTATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTATAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr3R 13676190 5' - P-element 2827 1 47.26 GGCGGGGGGAAAGTCATTTGGCATTTTGCAGCATAATGCATTATGTTATCGATAACAAGCTACTTGACCGCTGGGAAGGCGGCAAGGTCAGAGCGGTGCCATTGAAAGCGATTTGAAACCATCTAAAAATTGTGCTAAAAAATATT:1 - chrX 5356317 5' + HMS-Beagle 334 1 73.29 AAAAAAAAATCACTCTTATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chrX 3559670 5' + opus 7055 4 55.86 TGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr3R 13529981 5' + jockey 81 1 69.18 GCTGGCCGATTTGAAATGGGTAGAGATTTAGTTGAATTAATTAAGGTATGCCATTAGTGGTCTCATCATGACAGTAAGCAACTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCCAAACTGCGAGAGAAACTAA:1 + chr2R 24529380 5' + G2 2604 1 58.27 TTTTTTTTTTTGCGGGAAGCGGAGCGTTAAGAGTTTTGTCCTTCCTAATCATATACACACATATGCATGTTTTTGTAGTAAGTGTATATTTCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 4268904 5' + hobo 29 1 65.75 ATAAAAAGAATACAAAACTTTGGCGCAGTTTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGATGTG:1 - chrX 10547722 5' + P-element 79 1 24.44 TTTTCAAGTTTGCCTTTTCGGGTTTACGATTTGCGTCTTGCAATTGAAAGTTGCCTGAGCTGATTGATGATTTGCTAGTGGCCAACTGCTCAATATATAGCCAAAATTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACA:1 - chr3L 16556874 5' + roo 118 2 71.23 ATCTGCTTACGTTTTAACCGGTGCAATCCGGTCCACTGGCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCG:1 + chr3R 3697629 5' + Doc 304 1 95.89 TGATGCACTTGGCCTCTTGTGCGGCGCATAAATTAAACATAATTTGATTTGCTGATGCAGTTGCAGTTTCAGTTCAGTGCGACGCCTCATCCATAACAATGCGGCACGATTAGACATTCTCCGCCAGTAGTCGTCTCTCATTTATG:1 - chrX 13912128 5' - rooA 7197 1 71.92 CCAGCAATTGCCTTGCATGATTTAATTATTTGTAGCATACTTTTGTGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTCCGGAATACAGATCTGGGG:1 + chr3L 18947219 5' + BS 4673 1 72.58 TTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGCGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAA:1 - chr3L 18154443 5' + jockey 4639 1 69.86 CTTAATCGCCTTTTGGCGTGACAGGAGGCCACCAAATACCAAAAATCAAAAAACGAAAACCAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAAC:1 - chrX 10025266 5' + Doc2-element 332 1 59.59 GCAAAAGCTTGGACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGGACCTATAAG:1 - chr3R 20345582 5' + blood 20 2 70.55 AACAAGTATTCCAAGCTGGCGGTTTATATATATAACTATTATGTAAACCCTTCACATTGCTCCAATAAAATGCTGAAAATATCAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr2R 17400421 5' - pogo 2065 1 56.85 ACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1 - chrX 23439056 5' - P-element 2495 1 61.54 TAGTAAATAACTTGTTATGGTGGATTATTTCCGTACCAGTGCCTGCCTGCCTAGTCAAGCTGACAGGCCTGGAAGCCTCGTCTTGACTTGGCTAAATATCTGTCTGCGGTATTCCAGTAGTGTGTCACAATTAAGGCGCGTACCAC:1 + chr3L 5861073 5' - baggins 49 1 73.29 CGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3R 14277921 5' + P-element 97 1 16.31 ATTATAAAACGAAGCCAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:2 + chrX 7042638 5' + roo 8738 2 69.86 GTTTTGCAGGCACTTCGGTAGGATTGCATTGGTAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTCT:1 + chr3L 19908758 5' - P-element 2744 1 54.43 CCTTACAAGCACCATCTAATCAACATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 - chr2L 6154045 5' - copia 227 1 65.75 ATTCTAAAAAATGTTTCAAATTATTTATAGATAATTGTTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTTAA:1 + chr3R 8867003 5' - Max-element 265 2 52.63 TTCCAGAACCAGCTGGTCAATTTGCAGGTTGGTTTCGAACTTCTTAAATTCCACATCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTTCTTCCACCCTTTAGACGCCTTTTACGACGAGCCGGGAACGCTGAG:1 + chr2R 4571475 5' - Rt1b 4870 1 56.59 AGATTATAGACGTTTTCAAATTGAATAGTTTTATAAAGCTACAAGTTCTGTGAACATTTTTGTATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 20044678 5' + roo 22 2 65.07 GATGGACGTGTTAAATGATCTCGGATTTTGAAAGTGATCATGATATATAAACTTGCTAAGTTGTATCATTCTACCCGTTATATGCTTTACAACCAATTTAAAATACCCCTTACTCAGGTAGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTT:1 + chr2R 5729355 5' - INE-1 518 1 62.33 ACTGCCTTCCGTCGTTGGCGTTTAAAATAAAAACACTTTCATTTCTACCTTGTATGCGTACTGTGAACTTTGCTCTTCAAAATCGAAGATAATTATCTACGTGTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAAC:1 + chr3R 14401829 5' + Juan 4076 1 70.55 TTTGCATTTCATTTGTTAGCAAGTTGTCAACCTTTTATCTATGTTATTATGTCTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:2 + chr2L 16554547 5' + blood 12 2 76.71 CAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2R 22596065 5' + Doc 44 1 50.34 ATGCCTATTGGAAGGAGAATATCCATCAGTTGGTTCCGAACGATAAGTCTATTGCCAAGGAGGCCAAAGACTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTCAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 17746376 5' + roo 8714 2 51.37 ACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGCAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 + chr2R 9091823 5' - 1360 3334 1 56.16 GAAAAGTCAGGTGAAGAAAAATGTGAGCGAGCAGCGGGGAAAACAAAGCAAAGCCAAGCGGCAAAAAATGTATTTCATTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGT:1 + chr3L 10023945 5' + transib2 41 1 58.22 CAATAAGCCCATTTAGTTTAATATAATTGGAAATACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2L 16607319 5' + 412 43 2 52.05 GTGAGGGCCGCCCTACGCCTGCCGGCCTTCGATTCCTACGAGTGGAGCGATGCCGATGTCATCCATCTCATGCAGACCATGTTCGTCGAGCTGGGATTCATTGTTTAATTGTGTCTTCGTTTATTTTTCTTGTTGCCTATCCAATG:1 - chrX 12812364 5' - invader3 5004 1 70.55 ATTTACAAAAAAACTGGGATTATCACTGCTTAATAAGGCGCAAAATATATGAATATTTCTAGACGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:1 + chr2L 2120376 5' + jockey 4717 1 61.64 TGTAAAATGCCAGAGCAGAAAAAGAAAATACCATTAGAATTCATTTTAAATTAAATACGAGAGCAAGAGGTACGAAATTCGATCAAGAACAAACATGATACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAA:1 + chr2L 12540902 5' - blood 6990 1 67.12 CTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAGCCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTGTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr2L 16554684 5' - blood 305 2 64.83 ATTATCGCTGGCTTGGAAAATTCACACTGAAATATGTAGAATATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chrX 3453123 5' + roo 78 2 79.45 GATTGAGTGGAGCGATCAAGAGACATACTGACAGCCAATTATATCTAATCAAGTACATATATATTCAAATGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2R 23596086 5' - blood 7339 1 53.42 CGGAATTAAACAGGGGGAGCGTTAGCTGAAGTACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chr2L 6047799 5' + P-element 23 1 69.86 CGCAGCTATGAGATTTATGCTTTCAAAGTTCATAAGTTAAGTAGGCTCATTAAAATGGCATTTTCATTGATTCGAAACCCCTTTGAAACAAACATCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTCATCTTAAATCATTGTAGA:1 - chr3R 9609735 5' + Cr1a 4141 1 64.38 TCATCAGTGCTACAAGCAGATAACTGTTGAGTCGCGAATGTGCTTCGACGCCAAGCCAATCGGTAAGTGCCTTCTGTGTTCTTACCGAACATATAAAATGATGTTCGTCTGTCACTCCGCTTTTATTTTTTTTTTTAATTT:1 + chr2L 8051637 5' - Doc 4699 2 54.61 CCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:2 + chr3L 13888889 5' + 412 54 2 53.42 GACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1 + chr2R 23595987 5' + blood 74 2 67.81 AATTAGTTTAGAGCAGAGCAAAGTTGGCTACTTATATTCAATGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chrX 6910135 5' + I-element 79 1 73.97 AATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3L 21913443 5' + 297 6637 2 59.59 GTTTTTTTTGTTAATTTTTTCCCATTTATTGTTAATCCGGAATCCACATAGTGGTTACGGACTAACTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTT:1 + chr3R 6627792 5' - P-element 147 1 15.75 GAATGCGAAGAAAAACTGTGCCAGTCATTACATTTATTGCGAGCACATTCAATATTGAACGAATGGCCCGCATGGATTTTCTATTTGATCACTGCCGTTAAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAATCGCTATCGCCACCAGGC:1 - chr2L 3964120 5' + gypsy 316 2 60.27 GAACGCACTAAAAAACCAAAGCTACTAGCCATGAGCAACTTGGCTTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACACACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3R 24443958 5' - hobo 2933 1 78.08 CATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGA:1 + chr3R 5170986 5' + F-element 96 1 77.93 CGTCGGCTGGGAAATAAAAATATAAAGAATAATAATAAGTGCCATTCTAGTTACACCTCGCATGCATTCGAGTAGCCACAAGATTCACAAAATGCATAAAANTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATC:1 + chr2L 20500407 5' - Quasimodo 6985 2 67.81 AAATAAAAAGTAACAGAAATAAATATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCGCGCAAGCACCGCTGCTC:1 - chr3R 8867084 5' + Max-element 8309 2 67.12 ACATTTGCTTTTGTTACTACAACATTTGGTCGAAGCCCCCAAGCGCGAACAAACAACAAGGAAGTTGAGTGAGTTAGAATGTGGGCGAAGAGGGGGTCTTTTTCATATATACATTCTTGATCCGGATCAATAGCCGTGTCG:1 - chr3R 9198929 5' + INE-1 93 1 73.05 CAGTCATGCCACTCTGGGGACCCTTCAGCCGTGTGAATGTGTGCGTTAGTATCTCTGCACGTACATGTACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAA:1 - chr2L 7148669 5' - HMS-Beagle2 258 2 55.48 TGAAAAAAATCTTAAAGCGCTTTAAGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGT:1 - chr3R 12622395 5' + 1360 170 1 63.01 GTTGGAAATAAGTTTGTGGCCCAGACATGTGCCATAATCCAGTCGAGCCAAGTTGCAGCTGCCAGCAAATCAGCCATCCTGATTAAGACTATGTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGAC:1 - chr2L 2609037 5' - I-element 5330 1 67.12 AAAACCTACAAGAAGTTCTGCCCCTCAAGATGTCGATTCCTGGCGAGATGATGAAAAATTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCA:1 - chr2R 23312670 5' + FB 917 3 60.27 TGGTTTCCTTAGCTTTGCCTTTGGGTTTATAAATAAGAATGCCATCGCAGCAGCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGTGCCGGAGCGTGGGTCCAGAGGTCCAGATGTGGTCCAGTTGTGCCGGAGCGTGGGACCTCAATAAGG:1 - chr3L 22119297 5' + roo 260 2 63.70 CGAGTAGAAAATGCGGGCAGTCGCATGCAGATTGAAGGTTGGAATTCGCTTCATTCGAAAAGTTTGTGTCAACATGGCGGACCATCCACGAGAAAATAACAACAACACGATAACATAATCAAATTAAGTTTTGGCAAGTGAAAGTG:1 - chr3R 1167910 5' + G5 126 1 72.60 ATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTC:1 - chr3L 19350046 5' + 1360 3224 1 54.79 CGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:1 + chr3L 18010224 5' + diver 51 2 51.37 CTATTGAAAATTGAAGTCCAAACAGGCTTATAATATAAGGATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:2 + chrX 1208850 5' + Burdock 80 2 75.34 TTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 19698052 5' - roo 9042 1 59.29 CACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 - chr2L 1451250 5' - mdg1 358 2 58.90 AGCCATAGGCATCGACAAAAAGGCAAAACTCCGGCGAAAAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chrX 6615567 5' + roo 8744 2 73.97 CTAAACGAATCTCGGGAAAAGCTGATCCGCCTTGAAGAATGCTAACTTCCCGTACCCATAATCGCTCAGTGTATTGTGAATTTAGGTGTTTTTTTATTATTCGACTTACGGTTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTC:1 - chr3L 25968134 5' - Rt1b 5034 1 65.07 AACAAACGGACAGAACGACTTGGTACAGTGAAGCTTGCTTAATGACAGTCAGCAAAGCAAGCCGTTTTAAAGGAATCTGATGAATTTTACGTGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGG:1 + chr2R 11593590 5' - Chimpo 56 1 69.77 AGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCNATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAANTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2R 22112630 5' + 412 7091 2 51.56 CTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATTTTTGAAGATTTGCAATTTTGGGTTCCGTTCTTATCTTTAGTTAATGATTCGATTGCGATTATTTATATTTAGGATT:1 + chr3R 19450205 5' + roo 8743 2 77.78 ATATATTAAGCCATCTAAAACTTGTTAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCGAGACAGTATACCAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAG:1 - chr3R 6603072 5' + gypsy 49 2 52.05 CTAACGGATCAAATATTTTTGCTAGCGTTGATAACACAACGCGCTTATTTATATTTTTTGATTCATTACAATTTACGCTGAATTTAAATAAATCATTCCGTGATTGTTTCAGCCGTCGAACCTTACGGT:1 - chr3R 19445911 5' + G-element 133 1 75.19 AACCCAAAAAAAGGAGGAAAATTTCGGAAAGCCGAAAAAATGAAACGGGATAAAAGAATGCTAGAAAGTTGGCAGAAGAAGCACGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACAC:1 + chr2L 1197120 5' - R2-element 3538 1 63.28 GCAGCTTGCCACAAAGTAGGTATGCCTCAAAAGTCTTACAGTCAGCAATTTCTTGAAGAGCTTCAGATGGAGATCTAGTATAGCAGATGGAAAAGGTGGATTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTT:1 - chr2R 9100241 5' + copia 4690 1 69.86 GGTAGCATCTCTACCTTGTCGAATTTCCCGAGAATACTTAACTTTACTTAGCTGCTGATTAAAAGGCGATTTGGCTTTCCATACAACATGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chrX 19583354 5' - roo 9039 1 62.33 GTGGGGTGGGGTGAGGTGGGGTCGCCGAGCAGCTGCAACTCGAGCGATGCGATGCTGCCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 - chr2R 16160862 5' - mdg3 5458 2 55.48 AAGAAATAGAGCCGCTCAAGGATGAGGCTTCAATTCATTCGTCCTGGAGTGATAGGGAAAGATTGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTATGTTGAAGGCA:1 + chr2L 16607195 5' - 412 7517 2 52.10 GGAAGACAAATATCATTGTTAAAATGGAACCAAAAGAAAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr2R 22112596 5' + 412 22 2 66.44 TGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chrX 20024533 5' + 412 80 2 73.29 AGATGATACAAATCACAATAATAAAGCTTTATTGAAAAACGCTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACT:1 - chr2R 5395019 5' + HMS-Beagle 6872 2 71.23 CGGGGTAACTGGTAAATTATTTAATTAAAATTCATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2L 19698018 5' - roo 407 1 79.45 GAAGAAGGAGCCCCATTGGGGAGGAAATAATCCTCCTCCGTTTCCGATGCCGTTTGCCATGCCGGGTATGAATGGTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTATTAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 - chr2R 5037795 5' - Stalker2 356 2 51.37 AAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3R 29384689 5' - roo 319 2 88.36 AAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 - chr3R 9550962 5' - P-element 2817 1 26.61 TTATGATACATTTAACATTCCGCAATTTATATTCAATAGTATTTTGTAGTGCAAAGGGCTCCATCTAAATTAATTTAATACAATTTAATAAGCATTTTATAGATATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCA:1 - chr3R 16882039 5' - 3S18 6087 2 71.23 CCACATATGTACATACGTCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chrX 10694229 5' + Transpac 18 2 72.60 CACAATACGTCCAATAAACATTTGCCTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGCAGACNTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 27398137 5' - roo 9029 1 55.56 ATTACAAAAGTTTACACGACTCTGTTGGCCCTGTTGATGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGTTTATTTTTGTGGCTAGCTGTTTTTTTTATTTTTTAAGCTTTTT:1 - chr2R 21434124 5' - 1360 3021 1 70.69 ATCGTCCTAAAAGTATGCTGCAAAGTTTTTTCGATTATAGCGTCATCGAGCATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1 - chr3L 12633324 5' - jockey 4924 1 64.38 ATGTTGCTAACTTGTTAAGACAATGGTTTTCAAATGTTGCATAAAACCGGACAGCAAAAAGATTTCATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chrX 20024619 5' - 412 7490 2 55.17 AAAAGCTGTTCACAAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3L 19222702 5' - 412 7496 2 50.00 GCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGGTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGT:1 - chr3L 22435179 5' - opus 7412 2 80.14 TCCAGGATGATGGAGGCCACACAAATCTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 + chrX 21227059 5' + Tabor 12 2 77.08 GTGTGCAGCCGAATGCCTTCCATTTGCCTTCAAAGCGAAATTCGATATGCAATTTCATTTGAGCAATTTTTTTGCACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2R 21110646 5' + roo 44 2 49.32 ACTGAACCTCCAAGTTACTTTATATATACTGCTTACCAAACTGCTCCTTTCTCTTTAAATATTATGAATTAATTTTATGAAATTTAAAAACTGTACATTTTATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chrX 18786066 5' + pogo 16 1 73.29 AAGTGCTATGATTCTAAGCAAGAAAACGCTTCCCTCTTGACAATAGGGACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chr2L 22690186 5' - copia 5085 2 69.86 TGGAGACCAAGTTTATGCTATTGTCATATGATTTTTCCAAGAATCTCGTAGTTCAGAAAGTTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCAT:1 - chr3L 18010333 5' - diver 6050 2 58.90 GTTGATAACTATTTTTTCCAAGTATCCTCGCTCGAAGAACTTCACAAAGAACATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3L 8273879 5' + hobo 28 1 66.44 AATGCCTTCTCGTTTCTGACTTTGATGAGCGTGCAGCTGGAAACAACAAAAGAATCAAACAAAACAGCGAAAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chr2L 3908567 5' + jockey 4676 1 77.86 CTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr2R 22596093 5' + Doc 57 1 60.77 ACACAAATCTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 + chrX 21227077 5' + Tabor 32 2 63.70 TTGAAGTTTTGGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr2L 20550949 5' + 412 7107 2 54.48 ATCGATGTGTAACTACTAGGTTTTAATGGAAATTTCCCGGAACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr2R 9091782 5' - 1360 3375 1 76.03 AATTAAACGCATTTTAAGCGTTATGTGCTGCAAAAGTCTTGTGGCAAAGTACTTAGGTGTCAGGAAGATTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACTTTAAACTGT:1 + chr3R 22499593 5' - hopper 1332 1 52.05 AAAGTGGCATCAATGAATTGGTCCCAAGAGGGCTCCTCCTGTACTTTATGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTTCCACGAGTACTTTGC:1 + chr2L 7336120 5' - pogo 2087 1 53.93 GTACTATATCCTACTATAACATACTATATTTAATGTTTTTCGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTA:1 - chrX 19690658 5' + gypsy 7015 2 65.07 GTCATCTCTAGCAGCACAGCACGAGTAAAGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCT:1 - chr2L 6047908 5' - P-element 2799 1 26.03 ATTTAAATTTTCAATATGCGAGGCGACAAACAAGACGATGACAATGAGATGTGAAGCAAAGTTCACGCCCCAGAGCGACGAGCAAGTCAACAAACAATGAAAACCTTGTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCG:1 - chr2R 8190298 5' + Quasimodo 7355 2 76.03 AATGGAGAAATTCAAAATAATAAAAACCAAAACCGCAGTTTTCCAGAGAAAACTGTGCTGCTGCTGCTGAAGAAGCGTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 - chr2L 13317027 5' + jockey 4669 1 66.44 TGATTCATGTTACTTTTTATCATCGAAGCTTTTAAAGTGTTTCTTAAGTCTAGTAAGTACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 + chr2R 7769737 5' + Transpac 60 2 58.90 ATGTTACTTCGTCATTATAATTCTTAAACACTCCCATTTGAAGAATTTTTGTATAACAACAAACAATCCCTCTCACCACAAAACAATTTTGGAAAGCATCACGTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr3R 5518452 5' - Transpac 295 2 76.03 AAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTGGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 - chr2R 21619401 5' + blood 90 2 76.71 CGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr3R 9550882 5' + P-element 46 1 53.47 TGCACTACCAATCCGAGCTCAACTAAAAGTCAAAGATAATTTATGGGACATAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAGAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chrX 2104782 5' - roo 9004 2 63.70 AGGTCATTGCTTTTGCCTGCCTCAATCGTATCCACTAACTTTCTAACTGCGCTTGTTCTCGAAACTAACCTAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATAC:1 + chr3R 5576902 5' + mdg1 132 2 52.05 CATTTAATACATATCTTGAATCACTTATGTACATTTTATAAATTTATCTAACTCTTCTCAATAAAATACAAATTAATCAGCACCAAAATATTCCCATGACTAATTAAAAATGCTTAGGAATTCATTCTTTTATTCTTTTTTTTTGT:1 + chrX 17718000 5' - gypsy7 5005 1 62.33 AGAGGTCCTGGATAAATGTTACTATTACTATCAGATATGTCTCAGTTTTTTTTTAATTCATGCAACACTTTATCGATTGAATTCAATTGCTTAAATAAATAATTATCCATATTGTATGTGTCCTGCGACCCAGTCGGATCTTTGGT:1 + chr3R 10661256 5' - baggins 5402 1 74.66 CAAGAGGAAATCATTTCAATTCGGTATTTTCATTTGGCATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr3L 22038177 5' + diver 5918 2 65.07 AAGAAGGTTTTTCTTGGAATCGAAAAACTGTCGCACGTAAAATGTAGAAAATGAAATGATGTTTTGAAATGATGGAACGCTGAGTTGATCTGGCCATGGCCGTCTGTCTGTAAGAAACCCTCGATTTCAGGAACTATAAAAGCTAC:1 - chr4 453760 5' + INE-1 152 1 59.59 GAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACAC:1 + chr3L 20868043 5' + hobo 83 1 72.41 GATCAAGGTTTAAATTAGTCACATTGGGGCATCATAGCAGATTTTCAATTTTAAGGCTGCATAAACTCAAAAAGAGTTTAATAACACAGAAATTACAATTTCATTACTGAGTAAGAATTAAATCATTCTATTTATTTTGGTTCCAA:1 - chr2L 21944451 5' - G5 4821 1 41.78 AAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGTGGCCTGTCTAG:1 + chrX 20456881 5' + opus 7080 4 76.71 CAGCGGGTTAACTCGTTTAGCATTTAGTTGCAGGCGCCTAACCAGCTAACTTTATCGTGTAGTTTGCATCTTGATGCCCATTTGGTGTTTATACGCCAAGTTATTGACGTCGTCGCAAAGCAAAAAGAAAAAATTGAATAAATAA:1 + chr3L 9038440 5' + 412 7479 2 55.86 TGGGTCCCAAATCTTCGGAGAACACGTTGTTGTCTTGCTGTTGTTGCTACGTGATCGCCATGACAATTTGTCAATTGGGGTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGGTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 - chr2R 21530092 5' - HMS-Beagle 7022 2 69.18 TAGAACCCGTTTCGTCGCGATTGTACGACGTTTTCTGGGCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 + chr3R 26542598 5' + FB 84 1 75.34 ACAGGCATAACCAAAAGAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 20044532 5' - roo 9023 2 52.74 AGAGATGATAGCGATGGTCGAGTGTACTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATG:1 + chr3R 12789518 5' + G2 2788 1 50.75 GCGGAGACGACTTTGCAAAATAATCGTCACAAGAAATTAGCACACATTCGTTTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCANTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTA:1 - chr3R 4774306 5' - Doc 66 1 64.38 AGAAGAAGAAGCAAATATTAACCATCAACCATCGTGATCCGTCCTATAAAACCAAAAGAAAAAAAACCAACGAAATTTACTTGCTATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chrX 16607797 5' - P-element 2851 1 60.96 GGCGTTTCGCGTTGCGTATACGCAGTGTGTGTGCGCGTGCACAATGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTACCCATG:1 + chr3R 23415867 5' - jockey 4968 1 68.49 AATTTATTCTATTTTCCCCGACAGCGTTTTCCCAAATGGTCGAGTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATG:1 - chr3L 18154446 5' + jockey 4636 1 69.18 CCTTGGCAAATGTTAACAGTTTTCATTTATGGCTATTGGTTTTAGGAAGCCATTATCGCTGGCTTGGAAAATTCACACTGAAATATGTAGAATATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chrX 3453073 5' + roo 8685 2 62.86 ACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2R 23595988 5' + blood 53 2 62.90 GCGCAGAGAGCAGAGAGCGCTTTCTCTCAAAATAGCCCCATAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 + chr3L 739174 5' - P-element 2823 1 34.11 GCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 + chr3R 14277892 5' + P-element 73 1 35.62 TACACCAAATGCCTGCCAAAATGGTAAGTTCGACTTGGAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 15137251 5' + roo 44 2 51.75 GAGAAGTGCACCCTCTATCTATCGAATGCACCGCCGGGGACTTTGATGTTCTTCCTGCGGACGATCTTCGTTAAAATGAACGGAAACGATGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGGTTGAATCGTTTTATTTGAATCAATTCTATGT:1 - chr2L 3469630 5' - Stalker2 329 2 60.96 CATTTATTCCTGAAGCTAAATACATTATGCATTTCTTAACGTGTAGCTGTGTTTATTTTTGTTCCGCTTGCTCTTGTGTTTTGTCAATTTTCTGGGTTTTGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 19016106 5' + roo 8684 2 72.60 TCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGGATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 5495197 5' + roo 72 2 67.81 ATGCATATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chrX 20940715 5' + hobo 62 1 59.59 TGATTATTCATTTAATTACTGCGCTATCTGGCAGATAATCCCGTAATTAATTAAATTGTTCATTAGTTGTAGATTACTTTAATAGGGATTGATGATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACAT:1 + chr2L 1744073 5' + roo 119 2 65.07 AAAATTCTCATGCATTTTATTCTGGCAATTTTTTTTGTCGAGCTTATTTCTCTGTGTTCTGCCATTTGCCCAAAATAACAAAGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3L 5398028 5' - roo 9034 1 55.56 GTATCAGTTTTTTATTTAACACTAAATTATGTAACAATAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATAT:1 + chr3L 13449189 5' + Quasimodo 86 2 78.08 TTTCAATAATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTT:1 - chr3L 8249519 5' + HMS-Beagle 13 2 76.71 ATTTGTTTTATTTATTTAATTCTCATTGGTTTTGCATTTTGCTATTAAGGTTGGCCAACTTTAAGTATCAATATTTTTTCACTCACGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATTGGGAGAGCGAGATATGTATGTAC:1 + chr2L 16178063 5' - 412 234 2 57.53 TAATGCTACTGGCGCCGATGTATCTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chr2L 15549888 5' - hobo 2910 1 67.90 CCCAGAAAACGTCTACAAAACCTTAAAGTTAGCATTACAGAAGACCAGCAAAAAAACAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTT:1 + chr3R 21679205 5' + I-element 464 1 64.38 AACACATAAGAAACATTGTCATAAAATACTAAGTTCTCTCAATAAAAGATTGATCAAAGTGTGCTGAAGGTGGGTTCAGCTAACCCGCACATATATGGCTTATATCTATGTCTTCTTACTTAC:1 - chr3R 1047961 5' - Stalker4 266 4 54.47 TAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chrX 7042703 5' - roo 8988 2 74.66 ATTTCCTTTTTTCTGCGCCTCACCGCCAGACGATACCCATAAGCTGGCAGGAGTATTTGGACGCACCAAATACAAATGGTGGAAGCTTATTAAGTAACTAACGTTTTAACAACGATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3L 69516 5' + roo 6 2 53.42 ATAACAAATTATTAAAACATATTAAACCAATAAACTTGCCCCATATCATCTCAAAAACACCATACTCACCATTCTATATGGCAGTAAAAAATATTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 - chr3L 23331354 5' + flea 4780 2 69.86 AAGCTTTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCACGCTGAGAG:1 + chr2R 6089088 5' - 1360 3297 1 79.45 CGGTGGCTTGCTTGCAAAGGGAACCAGGTAAAATAAAGTTATATTAAAATATTAAAGACAGAGTGTGTCCTCATCTTGTGCAACATGAGAAGTGATCATAACAAATTTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAA:1 + chr2R 6418505 5' + Juan 17 1 69.86 AATTTTGTTAATTATTCAAATAACTGGAAGGTTTACGCCTGACTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 17842902 5' + roo 8739 2 71.03 ATTGAGAAGGGAGTGGCTACAGACAACAACATATGAATTTTACCTCGGATCGGNTNGGTATTGAACGTACATATATGTATATACATAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr2R 21529920 5' + HMS-Beagle 31 2 66.44 TTTACACCGTGCACAGAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAG:1 + chr2L 21325070 5' - invader4 287 2 80.14 CATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chr3R 12941768 5' + hobo 55 1 52.74 ACATTTAAAATATTTAAAAAAATGTATAATCAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3L 18921893 5' + pogo 37 1 56.16 GTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1 - chrX 15252382 5' - opus 441 2 59.59 ACTTCCAGTCGAGAGCGAAACCAAAACTTATGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1 - chr3L 739222 5' + P-element 91 1 23.29 ACGTGTCCGTACGACGTAAGTAAATCGAAACAAACTTAATGTTTCTTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 16200691 5' - roo 9053 2 72.60 GACTTGCACGGGCGGAGAAAACGAAAGACTTAAGGCACGAACTTGACAGTCATTCGACAAGAAAATTGGCACACAAGTGGCTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCA:1 + chr3L 11713467 5' + pogo 1848 1 55.48 ACGGACTCATTTGTTGTACTTCATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGATGTTTTGAG:1 - chr3R 15047401 5' + F-element 54 1 58.12 ATTCAAATATTTGTAGTCTGTGCTTAGGCACAATAAAAACAGAACGCAAATTGAATATGAATGATGGAGGAGCGGTTTAGCTTGACGGGCAAGCTGGTGTGGGGCATGATTTCAGATAAACATGCAAACCTTAAATGTTGTCTGCT:1 + chr3R 9084906 5' + Cr1a 438 1 69.86 CTTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 + chr3L 18010217 5' + diver 5932 2 56.16 GAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGA:1 - chrX 21667945 5' + gypsy2 6549 2 69.86 ATCAACTCCGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGT:1 + chr3R 5518319 5' + Transpac 4995 2 69.86 GACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3L 16920286 5' + roo 53 2 54.79 CAATGGCTAAATTTTATTAACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAACATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr3L 27415169 5' - transib2 2809 1 73.79 AGTCTATTTTAAATGCAAGGGGGCGCCCAAAGACACTAGAAAAACAAGATGCGTAACGGACATACATTGGCTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCCTTCTTTCCGC:1 - chr4 1168909 5' - 1360 3313 1 95.16 ACTACAGCACCCTCAACTGGAAAATATGTTTCTCGTTTTGCATTAGCAGCAGGAGAACCTCAAATCAGCTTTAGCATTCCACCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTT:1 + chr3R 8631592 5' - roo 9032 1 58.22 TTTCAATTCCGGTTACTAATCCTGCATAATCTTTGCTCCTTTTCTCATGCCCAGTGGAGAGCCTAAAGGAGGCGAATGGCCAGCTGGAGCAGCGGCTCAGCAGCAGCGAGAGTCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCAT:1 + chrX 15509664 5' - flea 4706 1 76.71 ATTATGTAATTGTTTTCATAAATGTATTTATGGCACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 10433179 5' - 412 454 2 57.93 AAGTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGA:1 - chr2L 23034079 5' - FB 383 1 41.78 TATGGTATTGGTTAAACAAAAATTTCCCAAAATTAAGCTGCAAAACATGCGGCTTGACATACTAAATTACCAGGTGAGGCAACAATTCTTCGTATTTTCTCCTGGTTT:1 - chr3L 12945546 5' - TAHRE 320 1 62.04 AAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chr3L 20168220 5' + roo 8750 2 77.40 ACATCATGGCATAGGTTTTAATTCATTTTATTTTAGGCCACACCAGCAACAAGTGATTCAAACGCTAAGAAAATGAGTTTGTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCATTAGTCAGTAGGAACCGTTCAGTTCCTTCTCAAC:1 - chr2R 12429486 5' - G5A 2802 1 54.79 CGTTCAGACGTATGACCAGCTAAAGTTTTTTGGTATGTCCACGGTTACGGATTGGAAAGTGTTTGGAGGTACTGTTCTAGAAAACAGATAAAAGCGTTTCCGACCATATAGAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAG:1 - chr3L 27170518 5' + INE-1 90 1 65.07 TTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr2R 14332114 5' + jockey 32 1 61.02 AAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTG:1 - chr2L 11725017 5' + F-element 95 1 80.82 GCTACACCCTATGTGTGGCACTTCGCCATACACGCGCACAAGTTTTGGGTTTTTGCGGGTTTCCCCAACCCAATCCAAACCGATTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr2L 2892740 5' - copia 221 1 56.85 CGCGCGTTTCTCGTTGCGCGCTCCTTGCTTTGCGAATTACAACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr3R 14277861 5' + P-element 42 1 56.85 CTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGT:1 + chrX 21227108 5' + Tabor 6902 2 58.22 GTTTTCATAGCTGTTGGTCTATGTTTCAAATAAATATCGCTGCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 6962488 5' + jockey 20 1 76.03 AACCGAGGTTTGGACAACTTCGCTCTAAATACTTGTGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTAGTA:1 - chrX 6186386 5' + Transpac 5000 2 72.60 TATGTACCACAAAGTATGAATTGAAATTAAATGAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAAC:1 - chrX 14347026 5' - flea 160 1 77.40 GATAGACATTTTACACTCCATAGGTAGCACTTCCGCGCCCAGAAGATCAAACGCAATATGTGTTTTTAATTAACTTTTTAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chrX 4469643 5' + roo 40 2 58.22 GACTACGACACCCGAAGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chrX 16490419 5' + F-element 32 1 63.70 CACAATCCATTGCAGTTTGGCATGCAATTTCCAAATGCAACTTACTCGCACAGCCTACAAAATTGTTCACTAGTCCATGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGA:1 + chr2L 2903022 5' + 412 237 2 53.42 CCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCTACATGTT:1 + chr3L 9522060 5' - opus 438 2 73.23 GCATGTCTGGTTTGAGTTCCAGTTCCGCTCTTATCTTCCACGGTCTATTGGCCCTCGTGGGTTCTATCTCCGAGGGGCTTCTGTGCATGTATCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTA:1 + chr3L 6919513 5' - Gypsy6A_LTR 227 1 62.33 CTTTAAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCACTAGTT:1 - chrX 7847247 5' - hopper 50 1 54.17 TGCCAAATATTCATATACTTTATTACTTTACAGATAGTCCATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 + chr2L 3175115 5' + Burdock 74 2 69.01 TAAAATTCAAACAATTTTAAACTAATTACCCTTACCTTATACCATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2L 1232637 5' - roo 8993 2 76.71 GCTTTTGCGTTTGCGTTGGCGACGACGCCTGATTATTTCCTGGCGCCAGTTTCTAAATTTACGCAAATTATTTTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCACAAGA:1 - chr3R 17060100 5' + jockey 4726 1 50.68 CTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTTTTCAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGAGTT:1 + chr4 1294989 5' - TAHRE 10368 1 91.78 TCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr3R 12941785 5' + hobo 61 1 61.48 CTGGGGATAAGCCGAGACCTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr3R 12622141 5' - 1360 3363 1 67.81 TGAGTCGATGATCGAGGCCTACGACAAGTGGCGCAGCTGGGCCGATCCTAAGGTGAGAAGTGTAGGGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr3R 5574938 5' + blood 7066 2 54.79 CAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 + chrX 21227127 5' + Tabor 82 2 71.23 AAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 13684772 5' + 412 66 2 61.38 ATGAAATGGTAATTGAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3L 20765115 5' + 297 34 2 63.01 TTCTCTTTTAAATAAATCTTTTGAAGTGTCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 20168186 5' + roo 49 2 53.15 TGTCGAATTTCCCGAGAATACTTAACTTTACTTAGCTGCTGATTAAAAGGCGATTTGGCTTTCCATACAACATGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 19583338 5' - roo 9053 2 64.66 TCAGATTGCTAGGGGATTCCTTGAAGCGTAAACTGAAACAATGCTAAGTGATCTGTTAATTATCACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 22435490 5' - roo 9017 2 53.42 TTCAGTTAACTCAGAACAGTACATAGTGAGCCTATACACTGGGAAAAAAAGAAGATTATTCAAACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chr2R 18396555 5' + pogo 54 1 56.85 TTGTTTTGGCAGAAGATGCTTACGTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chrX 20024486 5' + 412 7086 2 58.90 TCTAGCTATGGTACTGCGATACCTTTTTCGATGTAATTGATATAGCAATATATGTATATTCCCTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 + chr3L 1477363 5' + mdg3 5311 2 54.79 AAAAGACAAACAATGCGTAGAAGTTGACATTGTATCGAATATTAATTGGAATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTT:1 + chr3L 6994441 5' - copia 5053 2 69.18 GAAATAATTCTAGTTCAAAATCATGTTTTGATTCTAATCATTTTAAGGTTGAATAACTACTTGAAAAATGTATTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATT:1 - chr3R 13367405 5' - I-element 320 1 50.68 ACAATCTGTTGCAATTTAACTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTTATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chrX 10284935 5' + pogo 30 1 58.90 GTGCATTTGCAGCAGTTGGCTGCCCAGTCATTAATAATATTTGCTGCTATTAATAGCGAGAGGTGTTTGAAAGTTTTGCACACTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2L 4631084 5' + roo 8672 2 76.55 GGTGATAGGGCTGCGCCTGAATTCAAATTTTTGGCCAGCCGTCCTGTCAGCTGGGGATCTGGAACTTCCACTGGAGTTCCACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:2 + chr2L 19939964 5' - mdg1 7449 2 76.03 GCGTATGCAACACAAAATTGCACACCTCGATGGCGAGCAATGTGTATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chr2R 22971884 5' + jockey 4807 1 51.37 TCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chrX 14825336 5' - P-element 2839 1 33.65 AGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGATCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCTAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCT:1 - chr3L 21202113 5' + G2 2629 1 53.42 CAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAAAAACTCTCACGCGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTGTATTCCGTCCGCAAAGTTTGAACCGCGACGATACAAAC:1 + chrX 8976036 5' + TAHRE 194 1 74.66 AAGAAGTGTGAGAATTCTCCGGTTTGTAAACGGCCCTTTGTCTGGCCGAAATTAAAAGTATCTGCCTCTTTATACTCTTTTTACTCGGTGTTCATTTCGTGCATTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACTGCGATCGTTTGCATTCTG:1 - chr4 1156819 5' - Doc3-element 366 1 62.33 GGGTTAGTAGGCAGACAATTGTACATCTGTTTAATTTTTTAAACGATCTAATAAAGTCCATTTACGAAACTTAATTTCAATTGTAAAATTCTAGTGTGAATGCGATCGAGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGACAG:1 - chr3R 27597811 5' - INE-1 502 1 63.12 CTATTGTCATATGATTTTTCCAAGAATCTCGTAGTTCAGAAAGTTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACA:2 - chr3L 18010316 5' - diver 145 2 70.55 TTTTGCCGAATGGCCATGTTCGTCCCACACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3R 24444002 5' - hobo 2905 1 56.92 TTCGTGGAACTTTTTGTAAAAATGTATTAAACACAACTTCCTACCTGTTTAAAAAAAATCGACAGAAATTTATGCCAAATATTCATATACTTTATTACTTTACAGATAGTCCATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAA:1 + chr2L 3175043 5' + Burdock 6 2 74.66 AGTATTTAATTGTTGGAAGGTGTGCTATTAAGGAATAAGGGTTGCGTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:3 - chr3R 19246763 5' - jockey 4919 1 68.49 AAAACTTGTTGTCTGTGTAAGCCCCCCTGTTATTTTCGGCCTTTTTTGCCCGGCAATTTAATCCCAAAAAAACAAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chr3L 6473252 5' - hopper 146 110 80.00 GGCCGATCCCAAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTA:1 - chr3R 5972361 5' + Doc 324 1 67.59 AACAGTTAATATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr3R 13375927 5' + 1360 36 1 59.59 AAACCCTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:1 - chrX 21227215 5' - Tabor 7271 2 52.74 GATTTTGTGAGTATTTATGTGTGCGTCTCTGTATTCACTCCAGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr3L 19907061 5' + P-element 27 1 67.81 CCCCATTGGGGAGGAAATAATCCTCCTCCGTTTCCGATGCCGTTTGCCATGCCGGGTATGAATGGTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTATTAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 - chr2R 5037785 5' - Stalker2 7594 2 54.11 CATTTTGTGGACACCCATGTTCGTCAGCCAATCGCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGATACTCCCAC:1 - chr2L 22181202 5' - R1A1-element 4992 1 71.43 CAGGCGGAGAGGCAATCTCTACCGAAAGATTCGCAGCCCAAGTTCGAGAGACTTCTATCCGATGTCTTGGCCGATGAAGGCGAGCAAGTGGTTCTTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAG:1 - chr3L 2132074 5' - jockey 4862 1 65.07 ATTTATAAAAAACGTAAACACAATTAGTTTATAACATATTCTAGTTTTACAAGATGACAATTGTTTATAACTGGTTGATAAAATAAAAAAAATTTAAACAAATTTTAAAAAATTCTAATGCCAACATTATTTTTAAAACTATTTTT:1 + chr2L 16256699 5' + Juan 3779 1 47.26 CAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTG:1 - chr2R 3760470 5' + accord 84 2 74.66 ATAATAGATTGAAATAATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 - chr3R 12376550 5' + flea 4786 2 65.75 GGTATTTTCATTTGGCATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 + chr3L 22038199 5' + diver 52 2 52.74 AACACAACGAACTTTAAATATTTCCTACGTTGGTATAATCTCCTTAGCTTTGGTTTAAATAAGTAAAGTATTAATGATTCAATTTAATTAATGGTAAGAAAGTGCCTTCAATGAAAACGAGATATCTAAAAATAGAGTTTGCTTG:1 - chr3L 11423234 5' - 1360 3267 1 60.69 AGTGTCGGGTTTCCTCTTGGGTCCTTTTCTGCTTTTCTGCTACGTGCCACCCCCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 - chrX 1759077 5' + Tabor 12 2 74.22 CAGTCACCAGTCTCCATTCGGAGTTGGGGCCCAACTCCGTGTTTCCAGACTAATGAAGATCTTTATCGGCCGCCGATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACCTAGTCTCCGCTGCCA:1 - chr3L 17935046 5' + HMS-Beagle 6835 2 56.85 TTTAAGCATTTAATTTGTGCCATCCCATCTTTGGTCTGCCATAAATTCGGTAAATTGAATTTGGCAAATTTAATTTGTTAATTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTC:1 + chr3R 31351968 5' - R1A1-element 4865 1 56.85 GATTTTCAAGAAACATAAGTACTACAGAAAACGCAATAGTATTGCTTGGTATGTCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1 + chrX 3533024 5' + jockey 4575 1 60.58 GAAATTGAAATAGAAAATAAAAGGAAAAAGCGCAGAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2L 4269054 5' - hobo 2908 1 61.76 GCAGTCCGAAGGACTGAAAGTGCAGCCATCTGTCGGTAGTTAGTGCAGCACAATGACAGCAATTGTTAACTTTGATTAAATTCGATTAGTCCCAGGTTGGGGAGGTCATGAGGG:1 - chr2L 13317823 5' - jockey 4765 1 50.00 ATGAGCAAGAAAGTTATATAAGGCCCGAACCGGATTTATTTATTATACAATGGAACTGAGCAAATCCACAAACTGAAAAAATCACTTTAAAGTTTTAAGAGGACTTAACAACTTGTAATATAATAAATAAAATAAAACACTATGAT:1 + chr2L 9450226 5' + Doc2-element 265 1 50.00 GCCGAGTTTTTGTTTGTTTTCCAGTGTGTTGGGCACACAGTTGTGGTTAAAGCAATGGTAGTGCTTGGCTTACTATGTTAACTTTATTTTATTTGTCAGTGCAAAATCGATGTACCCTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 22557995 5' + 1360 3383 2 52.05 CAATAACGTTAAGGAAATTATGGAAGAATACAGTTTGAATTCAAATATCGATAAATATATTTCTGTTCCGCTTGTATGGAGCAGCGGCCATAAATACTTCCAGTGTAGCCAGAAGCCTAAGATTTCGTTT:1 - chr2L 22983839 5' - Transib5 2929 1 45.38 GTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGTCAGTAGACAAGA:1 + chr3R 5518331 5' + Transpac 88 2 78.08 TCTATAAATCGCATTTTGCAAATCTCGTTCGTTTGAAACAAAGCGACTGGGAAAATGTATGCCTCACTGCTTTGGCAACACTTTTTTTTACATTTTTTTTTAGTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTTC:1 - chr2L 21263276 5' + INE-1 35 1 79.71 ACAGAACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chrX 15252410 5' - opus 7472 2 65.75 GATGGCATAAAACGATTTCAAGAATTTTGTAGTTTTTATTCGGGCAACGATACGATACGATACGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1 + chr3R 24074746 5' - jockey 4935 1 56.16 TCCGCCGATGGCATTAGTGTGAGTCTGTAGGTGAGGTGGGGAAAAAAAGCGGACCCAAATCGCCGAGGATTTGAAGGTTTCAGGTTTCCTGAGAGAGAGAGAGTAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCT:1 - chr2L 2126378 5' - Transpac 47 2 70.55 GAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGACAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 - chr2R 21199700 5' + jockey 4800 1 71.92 TGTGTTGTTATTTACGAAATGTGAAAATGCATATAAGCAAAATTTGTTGTTTTGCACTTGTAATTATATACTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 - chr2R 7769854 5' - Transpac 5182 2 54.11 AACAATGGGCCGCATGATATCCATCTGTCCATTGTTTCCGCTTTGGCCTACATTAAAATAACTACCCAGTTTTATTGGCTTGGATTTAGTTCAATGTTGGAGTCCACATAAATATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAA:1 - chr3R 27163375 5' - R2-element 3364 1 75.34 GCGCTGCTTCTTTGACAAAATAAATGGCGTCAAGTTCAACGCCGCCAAATGTCGATGTGGAAATAGGGAAAATGCTGCTAAAAATAAATAGTAAGTTTAATAAATACTATTGTTATTATTATTATTAT:1 - chr2L 19847244 5' - mdg1 7058 2 71.88 AAAAGAGCGGATTTCAAAGCGAGCTTGAAGTGCCGTCGGCAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 + chr3R 16881870 5' + 3S18 5797 2 63.64 GTACCAGTTCCGGGGTGACCAGCACCAACAATTTTTGGTTCGAAAAATGCAGCGAATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 + chr3L 15273210 5' + pogo 63 1 65.07 CAAAAATCTCGACAAATAAAATTCATTTACAAAATGTTTTGCGTAGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACA:1 + chr3R 30537586 5' + roo 8681 2 65.62 GCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTCCTATGCGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGACGTTATCACTGATGACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAA:1 - chr3L 5498499 5' + Doc2-element 217 2 72.87 GACATATCCTCTTTTTTGTTTAATGAAAATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 - chr3R 7042119 5' + Stalker2 21 2 71.23 TGTATTTTTCACTAATACTACATATGTACATATGTATGTCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 22511469 5' - roo 9016 2 57.53 GGCGTGACCTTAACCCGCCAGCGATCCATTAGCACGCACTGGGACATCCCGATCTCGCGCAGTATCTTCCCGATCGGTTCGTCCGTGTTGAAAAGAAAAAAAAGTCAACTAAAAGTCACTTTTTGAAGACGTTTTGGTACAGACTA:1 - chrX 9020952 5' - Tc1-2 1316 1 64.38 AGGCCAAAATAATACGTCGGCATTCCATTGCCCCAAAAAGTTGGCAACACATTTTCCAATTCACTTTGCAAGCCCCTAAATTGAACGCTTAACGTGTATATGTGTAAATTGTAATCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTC:1 - chr3R 20231966 5' + F-element 4472 1 76.71 TTTTTGTCTTCATCCCATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chrX 6615500 5' - roo 8996 2 70.55 ATAGGCCTGTATTTTTGGGGTGCATTTGTTTAAGTTTGGATCATATATTTGTTATATTACATTTCAATGCATTTAAATGATGAAAAGCTAATTTTGTTATTTGTATTCATTCATTAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGT:1 - chr2L 12534982 5' + Idefix 7131 2 74.66 CAGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr3L 19907101 5' + P-element 49 1 46.09 GCAAAAATTGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 13684797 5' + 412 7095 2 54.11 GGACTCACACTTTAATAAAGGCTTAAAGTTGCTGCAAGGGCAGCAGGACGAGAAAACTAAAACATAAAGAAATATATATGTAGGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr2R 18723629 5' + 297 34 2 63.70 ATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCATCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTT:1 - chr3L 19349998 5' + 1360 3272 1 64.38 GGGCAAGGAAAAAGTTTTCTCCGCCAAATGCGACTAGACATCATTTGTTTCGGATTGGATTAAATTCATAGCAGCAGCACACATGCTTAATATATATAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGAC:1 + chr3R 25909601 5' - flea 4942 1 65.75 TCTCATTTCCATTAAATTGTCCTGGCCTGGCTTGCGCACATGAATCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATAT:1 - chr2R 13695710 5' + blood 76 2 69.18 ACTACTGTCTAGTGGAGTGATTTGCAACTTTTTATTTATTCGAAACAGATGCTTACAGGAGCGGCTAAACTGCGTAGGGAGGAGAATATTCGTAGTTGGACTGATTTAAAGGCTACAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTACCAC:1 - chr3R 1227723 5' + gypsy11 173 2 77.40 AGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATA:2 - chrX 23182944 5' + Idefix 24 2 56.16 CGGTATTCCCAAAGGGGGCATACTGAGCTCTTTCGAGTTTAAAACCAGAGTGGTCTTTATTGTGTCGGAGAAGTCTCCTCTAGCTCTTGGTTACTCAAGTTTTTGGCTGGTCGGGTTGCTTGCGGACAATGTTGCTGTGCAACTTT:1 - chr2R 5071099 5' - Tirant 8239 2 71.92 ACCACCGATGCAAATTTTTTTCCATTTATTTCCCCGGTATTCCATGGAAACCATATAATATATATAGTGTTTCGATTCGAATATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 - chr3R 4361700 5' + copia 4907 2 60.27 AGGTGCACAAGTTCGTTTTCGTTTGAAAATCAATGCAAAGTTTGATCGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTGCGTTGCCGATACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGAC:1 - chr3L 2486040 5' + jockey 4687 1 59.31 ACCAGAATCCGCAACTGCAATTATAAACCGAATATGATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAGTTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 + chrX 140016 5' - blood 293 2 76.71 ACTTGTTAAGACAATGGTTTTCAAATGTTGCATAAAACCGGACAGCAAAAAGATTTCATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chrX 20024610 5' - 412 7480 2 61.64 CACTTTCCCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr3L 9522159 5' + opus 7146 4 57.53 AAATGCACTGGAAAAATATCTAGCAGTATGACAAGGAAACACATTTCATCAATATCGTACATTGACTTGTTTGCTATAAATCTGTTTAATCTTTATTATAGGTAGTTATATATAGGTATAACATTTTCATATTTTGCTGCAAAGCT:1 - chr3R 29331088 5' + P-element 161 1 84.25 CTCCGAACGTGCGCTGGTGTGCGTGGATGTGCGCCATAAAGTACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTTATGCGTTACACATGC:1 - chr3R 31032052 5' + hopper 76 1 67.81 AGTGGAATCACCTCACCGCTGACTGGGTCGCGCACCGATATCGACTGAATGTCCAGCTTGCCACTGTTGATGGCCTCAACAATGGAGCAAACCCGACCATCGTCATAGCCATTTTATTATAACAATTATTTTGCGATGTTTATGC:1 + chr2R 13887561 5' - R2-element 3410 1 72.41 AAGAAATTTTATAATTTCGATTGTCTGAATGTGTTGTGTTTAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAAAATGTTCTATTTATGGGCTACAATAAACATGTCACCGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCG:1 - chr3R 7462804 5' + rooA 101 2 73.97 GAGCGAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGACTAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGA:1 + chr3R 17944043 5' - P-element 2797 1 23.97 AATTCTAAAAAATGTTTCAAATTATTTATAGATAATTGTTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGG:1 + chr3R 8867002 5' - Max-element 8385 2 40.41 TCTAGTTTTTTTTAACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGNCNTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - chrX 15406075 5' - opus 7484 2 60.00 CCTGCGTGCGTGGATCCTCCCACTGGGTGGTTCGGTTCTTGTGGTTAACAAAGTACACTCTGTTGTCCGATTGGATCTGCGTAAGGATTAAGTAAATAAAGGAACGAGTTAAAGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTT:1 - chr2L 2041701 5' - hobo 451 1 77.40 AGGGATAAAAAGCTCAGATTCAAATTAATTGAGGCACATGGTAGTTTTTGAGATATTTTTGGGTTCCGAATTCTTAAGGGTGTGCAGTGGCAACCAAGATGATGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chr2L 9237142 5' + 1360 61 1 71.43 ATTGAAGTTCGGCTGCCTTGTATGCCTTGTATGCCTTGTCTGCCGACCTGTTTTTCGCCTTAAGTTTCCCTATTACAACACCCGTTCTGCAATGCGAATTTCGTTGAGCAGATTTCCATTACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCG:1 - chr3L 11916979 5' + accord 35 2 76.03 GACGCGCAGTTCCGTTCGCATTCGCGCGTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr3R 16349185 5' + P-element 47 1 53.42 ACAAGACAAAGCGTAAATAGTTTAACACTGCACAACGGTAAACACAAGTCGACACGACACTCAACGAACGTGGTTAACCCGAACGATACGAAAACAATGATCGAACACAATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATT:1 + chr2R 20835858 5' - hobo 495 1 75.34 TGGCTCTTCGTCCCTTTAGGAGCTCTAAAAGCATTTTTACTATGAAGCCTGCCCAAAACAAAATCGCCTGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTTCGTAAGCCAAGGCACTGTCCAGAGCTCGC:1 + chr3L 24051169 5' + BS3 1525 1 79.67 GGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTGTATATAGGTGTCATGAGTATCGCATCTTAAAGTAAATGGC:1 - chr3R 21679642 5' - roo 8976 2 76.92 CTCGCAGAGTGCATTGATAATTTAGCTTGATGTACATAAGTGTTTTAGCTCTTGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 - chr2L 17353095 5' + 297 6642 2 66.44 CTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr2R 8258267 5' + jockey 64 1 57.53 ATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCAATATAGCTNTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:1 - chr3R 7042091 5' + Stalker2 7297 2 52.05 GACACAAAGAGATTATTTACTTCTTAACTTTCTTAGTGCAACCGTAAATCCTATGCATGGCAATATTGTATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATT:1 + chr2L 17851650 5' - flea 208 2 55.48 GAGGTTGGGTCCAACAACCGATTGCCTACTTTAAAATAGTGCTGAGCTGTGGATGTGTAGTTTGGGACTGAACTATAGCGGTTGACTACTCCTTAATACTGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2R 25083426 5' + pogo 18 1 73.29 AAAGTCACTAAATAGCGAAACATAATAGAATAGTGAATTTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAAT:1 + chr3R 31525496 5' + Juan 4162 1 72.60 GAGAAGGGACTCGCTTCGTTTGTCCTTTATAGTTGGCCATACATATATATAAGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chrX 7626213 5' + Transpac 4984 2 65.75 AGAACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chrX 15252408 5' - opus 7471 2 64.83 AGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:2 - chr3R 9550967 5' - P-element 2800 1 26.03 ATTATCTTGTTGAAGAGATTCAAACTGTGGCAGCCGCTTTCATGTAATTTATTTGTTTATTGTTTTGGCCAGGGCCAGGCCAGAAACACACAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCA:1 - chr3L 21125288 5' + F-element 284 1 63.01 GCAGTTTGTATTTTTTAGCTGAGCCGGGCTTAAGCCCAGATCGAAACTCAATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chrX 14867241 5' + roo 70 2 67.12 CTGAAGAAAAATTATAAATAAATATTTCAAACTATTATATTCGGGCTTAGAGCTTTTCCACAGTTACTAACTCATGAGTAAGTCAATTACCACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 15102205 5' - roo 9043 1 64.38 ATGGGTTAGATTCCTATAGAAACCAATAAATTCTAAACAATAATTCTATATACTATTTTGAGTTATGTTTACTTTGACGACCTACATAATCATAAGTGAAAGTAAATGCATTAAATTAATGGTGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTC:1 + chr2L 14580037 5' - mdg3 126 2 77.40 ACTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chrX 22511459 5' - roo 9006 2 64.38 ACTCATTGGCAATGGGTAAATGGTATACAATTTAAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAA:1 + chr2R 12248955 5' + Juan 4072 1 54.11 CAAACATATCAAATAGACACAATTACGCACACACACACACACACACACATATACA:1 + chrX 18237388 5' + accord 186 2 67.27 CTTTAAGATCTCGAAATAAAGGTTCAGTGGAGTAGATAAAGACTTATTTGGGATTTACATATTTTGTATATCTTATTAGTGGTTTAAACATTAATTTCAAAATTCCCCAATATCTATCAATATCCCAGAAAAATTATGTAATTTCG:1 + chr3L 3813922 5' + INE-1 513 1 62.33 GCAACATTTGTCTCAGGCAATCTATATAAAGTTAGCAGTTGTAATCAAATCCTATATTTTTAATAAATGAAATGAAACTCTTATCCGGCTAAAATATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 + chr2R 18045692 5' - jockey 4920 1 49.32 ATGTAATATATATCACAATATTACAATTAACTTGCCATATACTTATTAAATTTAAAGTACATTATAATTTTTACATGATTAATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGCT:1 - chr3R 12538181 5' - mdg1 7422 2 57.53 CTTCGTTCTCAAATTATTCAAACTGAAGATGCCTCGTTTGCGTAGAATCTCATTAAGACACAGCAATTATGGCATAACTAACCTTTGTTTCCTAAAATGCTTAGAAATAAATTTGCCCACCTTGATTTGGCTATTGATCCTGATCA:1 + chr2L 9381915 5' - INE-1 91 1 63.70 CGGGGCTGGGCGGAAAGTCGGGGTATCCCTGATCGGGACTGGAATCGTTGCTCAGATCGGAGACGTTGTTGCTACTGTGGAGGCGGTGCTTATAAAGGACCTTATATAGTAACAAAGGTC:1 + chr2L 19080368 5' + Bica 4740 1 73.33 AAAACCTTTAGGCTGCAGACAGTCTTTAAAAATTATGTTTATGATAATTATTATGGCATATATATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 + chrX 6186232 5' - Transpac 309 2 48.63 GTTTTAAGGAATTAGAAGCGGTTAGGCGCTACAATCAAGGATCCCTGGAGAGTATTTGGAAACAGGGTATAATTATTAACAAGTCTTATTAATTAAGAAACCTAACAATGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGT:1 - chrX 2320445 5' + BS 4836 1 72.60 AACAGTAGACAGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 + chr2L 18112439 5' - transib2 2816 1 77.40 TCGGTTTAAGTAAATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATTAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3L 22041091 5' + roo 72 2 74.05 AGACAACAAATGGTAGGACAAGCCCCTATCATTCACTTGTGCGTGAAATGAATGAGATTTATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 27016567 5' - roo 9053 2 60.96 AGTTGGCGTGTCCTGATCGACCTTGTTGCATGCCAATATTAATAACAACAATGGCAATAAAGCCTATTACAGCCGGCACACATTCGGGCCATTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGAGTTCCACACTGAAGGGATTACA:1 - chrX 4063649 5' - R1A1-element 5292 1 62.33 CCCATGCCGCGATCCTCAAGCCTTGCCACCCTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr3R 21655035 5' - roo 8982 2 77.40 GTTATCTAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 + chr3L 13992260 5' + blood 79 2 71.92 ACCGCTGTTTAGTTGGACATGTTGTTTTATACATTTTAATGATAAAACTGTAGTTTTGTATTATTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 12125383 5' + roo 55 2 58.22 CATGACAATTTGTCAATTGGGTTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGTTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCC:1 - chr2R 21530034 5' - HMS-Beagle 6964 2 71.92 AAAGAATTTAATATGAAGAATGAATATGTAACTACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGT:1 - chr3R 4159245 5' + HMS-Beagle 6811 2 75.34 GACGCCGTTGACAGCCGCTATATTTCTACCTTTTGGCAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGT:1 - chr2L 7336200 5' + pogo 75 1 73.97 GCCGATAATGATGAAAAGATAAATTTTATNTACTTTGTTGGCCCGGAAAAATTATTAAATTTCTCGTTCGCATTCACACTAGCTGCTGAGTAAAGGGTATCNAATAGTCGGGGAACTTGACTATAGCATTTTCTCTT:1 - chr2L 22051799 5' + INE-1 577 1 64.96 AGCTGAAGTACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2L 6047822 5' + P-element 46 1 54.11 ATAAAAGACGATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3L 13888872 5' + 412 7090 2 60.27 ATGTCCATATTTTTATCGCATTCTTCGCACAAACGGAAATGTAAACACTGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 + chrX 19163267 5' + Burdock 68 2 65.75 CCTGGCGACATATTATCCTGCGACTAAATATGTAAGAACACAAACAGCAACTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr3R 28045853 5' + Tirant 8152 2 61.16 CGGTTGCTGTAAGCCACAGGTTCAAGCTGAAGCTGCGTAACTGCGAAATTTCGTTTAATTATTCTGAAATCTACAAACGTGAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGTC:1 + chr2R 22964171 5' - 412 7518 2 61.48 AAAGATAAGCAAATCTTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGGTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:1 - chr2L 5341588 5' + Burdock 6180 2 57.63 AATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCTAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 - chr3L 21913443 5' + 297 6637 2 58.90 GGTGACCTTCTTCTTCGGATTCAGCTGCAATTGGGTCTGGTGGTAGGTATATTCGATGTCCTTCGCCGGGGACAAGGATTGCAGCCGATTTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATCA:1 + chr3R 23222965 5' - Bica 4832 1 60.27 ATAGATCCTTTATCAAATTATCACCAATTTTTTTTTTGAGCGTACGCTCCGACTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr3R 14278008 5' - P-element 2857 1 64.83 ATATTTTTAACACCTACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr4 868746 5' - roo 9020 2 54.11 AGTGGTGCAAAGTATCCGCTGTCAACATGATTGCAGAAACCATGACTGCAGAAACCAAAAAAGCGAGAGTATACGCAGTGTGCACAGCATTGTGGGAGTTTATCTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGT:1 - chr3L 9910580 5' + Tc1 1548 1 66.44 CGTGCACATAAAGCTTAAGTCGACAGCAATTCGAAACACTCACACACGGGGCCATGGCAAAAACCCCAGCGGAGAGAGAGCTCAGTGGGAGCAGTGGCGCCATCGAATGGGGCGGCTTTAAGATACAGGATCAATAGCCGAGTCGA:1 + chr3R 17700376 5' + INE-1 94 1 80.14 CTGAGAGAGCGATTGAGCGCGTCAAAAGCAAAAAGCCGAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 - chr3R 14277956 5' - P-element 2804 1 28.77 ACAAAGTCCGATTGAGAAGGGAGTGGCTACAGACAACAACATATGAATTTTACCTCGGATCGGATCGGTATTGAACGTACATATATGTATATACATAGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 + chr2R 21529910 5' + HMS-Beagle 21 2 74.66 AAATACACGGCGATCGCTGATACAAACACACATACATATATGTATGCACACGAATACTCGCAAATTATAAACATACTCCCCATCACATTAAAAATGGACTCTCGTCCGTCATATCAAGGATTTGCGTTGTCGACATTGAGGCTCCA:1 - chr2R 22570163 5' - Chouto 6254 1 50.00 ATCCAGAACTTCTCATACCACCCACCCTCGGAAAAAAAAAAACACACACACACAAATCAAATTTGTTGTAAGGCTCGTAACACTCGAGGGGTGACTGACTGNCTGATATAGTTATGGGGAAGGGTGATAGGGGCTTCCGAGCAGAG:1 - chrX 10694417 5' - Transpac 294 2 69.18 GTGCATTGTACTTTTAAACGCTGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAA:1 + chr2R 17696003 5' + rover 6988 2 60.96 AAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATATGATATGAACG:1 - chr4 637772 5' - roo 50 2 69.66 AAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGTAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGCACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCT:1 - chr2L 3908497 5' + jockey 4747 1 69.50 CATTTAAAGTATTATTACACATATTAATAAACATTTATCATAGTCAAATTAACCTATTTCAGTTAAATGGTAAAAAGCGTATACAAAATTCGTCGAAAAGATTGTAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3L 21156966 5' - 412 7534 2 76.71 CTGGACGTTTGGCGATTGTCACGCCCTTTGCTCATTACTCACTTAGGCCAAGACAATATCATTCGATTGGGCCAGTAATTACCAGTGTCATTGAATGGCCCACGCATCTAATCTAAATAAAACAAAGGATAACATGAAAAACTAA:1 - chr3R 25859160 5' - HB 148 1 75.17 CCTGGCGCAGAGAGCAGAGAGCGCTTTCTCTCAAAATAGCCCCATAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr3L 739170 5' - P-element 2836 1 40.00 CTAAAACGTCACTAAGAAAAGAGCTTCAANTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTNTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATT:1 - chr3R 10030798 5' + BS 5058 1 50.00 GCTCATATGTTTGCTTGGCTCCTTCCCAAGGCTGAGACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGAGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 + chr2R 13695596 5' - blood 344 2 62.33 ATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 20983920 5' + pogo 29 1 63.50 GTTGCTGCGCCAAAATGGGGTAAGTTAGGAATCTGATCAGATTTGGATATGATTTGTAATCATTCGTTATATCTATATTCATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTAC:1 + chrX 12603448 5' - micropia 116 1 45.89 ATTACAATATTATTGGCTTAATCTCAATTGACTGATTATGATTTTCTTGTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGC:1 + chr2R 15698066 5' + opus 7185 4 66.44 TTTGTATAAAAAATATTTAAACAAGTCTTGGGCAAATACTTGACGCAGGTTAAGCTGAATAGTTAACCGAAAAGGCATAAACAACTTGGCGCAGCGGGTGGAAGTTATGACAAACAACTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGC:1 + chr2L 16476273 5' - G2 450 1 78.77 ATGAACAAGTAAAAGCAGGTTAAGGGGCGAAAAAAGCCACATGTGGTGTACACTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3L 70199 5' - roo 9004 2 65.07 AGGGTTTCGATATGCGCCTCGTTGAGTTCCTCGATGTTTAGCGAGTCTTCAGCTGGCTCATTTAGTTCGTAGAAGATTTCCGGCGTTTTGGCGGGCTGCTCATCCTCATCCGGAAATATACAGGGTGTGGCAGCATAACTTCCTTT:1 - chr3R 22125563 5' + mariner2 5 1 75.34 CACTACCCATTTGATGGCAATGCTGGCTGTCCTAGCTCGTGTGACGGCCACGCCACGGCTTATCAACTATCACTGGAATATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCAC:1 - chrX 21933321 5' + springer 7150 2 66.10 GAAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAT:1 + chr2R 7009423 5' + Quasimodo 69 2 71.92 AATGGAGAGTATTCCTCTGACGTGACTGATAAACACGAGTCATCATCGTACCCAAATAGTTGTTGTTCTAGTTTGTATCTAACCACTTGTATCTCGTACTCAACTTTCGTCGCCGCCGTCAATTATAGTCTCATCGCTGGACACCA:1 + chr2R 14119511 5' + TART-C 10684 2 70.55 TATAAAAAAGGAACTCCTCTTTACGTATTTGAGCAATCGACGCGCTGACGCAGCCACAGACTTTAGCAAGGCAGACCTCATAGCCAAGGTTATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTG:1 + chr3L 206437 5' - R1A1-element 399 1 70.45 ACTTTCCCTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGC:1 - chr3L 9522158 5' + opus 113 3 72.17 TATGAGAAGCGTGTACAATATAACCGAAATACACAAATATGGTTGCAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTACATTTA:1 - chr2R 24807958 5' - I-element 5283 1 64.38 ATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGAGACATGAGAATCGCGCCTTAAAGT:1 + chrX 16996094 5' - roo 319 2 79.55 GTTCAGTTTACGAGGCACATTTACAGAGAGGAATGCAATGAAATATGTCAGGGCAAAATTGAATTTAGAACAAAGAGTTTGAAAGAGGTTTTAATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3R 9161107 5' + opus 140 4 63.01 ATGGCCAATACCCGCGAGCATGGGTTAAATTGAAATGAATAATTGACTAGAGCACTTTTTGATTGCGTTAGCTGCACTTTGAGGTACGTGTTATTTTATTTATTTATGGTGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGCGTA:1 - chr2R 18767301 5' - pogo 2093 1 80.14 CTGAGGTGAAACCATGCATAATTTTAAACACACTCTGGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 5958747 5' + 412 29 2 57.53 TTCTAGTGTCTTTGATATAACTCAGTCAGAATACTTCCAAAGATGAAGATCGATCTCCGACGTAAGTCGCTGAAACGAAGTTAAAGGGTCCCTTTTCATTTAGCATGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTG:1 + chr2L 14588754 5' - 1360 50 1 70.34 AATTGCATGGCACATGCACACAAGGTTAGTAGGCAAGTTCACAAGCCAAATATGCTGTGCGTATGCCATGGAATGTGGGTGGAACGTGTAGTATGGAGCAAATTGATCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATC:1 - chr3R 25696563 5' + BS 5011 1 54.79 AATTTCTGTTTGCACTTTTCATTGTGGCAGCACAAACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTT:1 - chrX 8208445 5' - roo 390 2 72.26 CATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr2L 6154022 5' - copia 204 2 58.22 ATCCAGAACTTCTCATACCACCCACCCTCGGAAAAAAAAAAACACACACACACAAATCAAATTTGTTGTAAGGCTCGTAACACTCGAGGGTTGACTGACTGCCTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chrX 10694417 5' - Transpac 5213 2 71.23 CAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 + chr3L 9522033 5' - opus 7449 2 60.96 AATTCCCCTTCGTTCCCATCATTACGCTAATTTAATCACCTAGTCGCTCCCCTATTCAGCCGTAATGGTACTCCTCACCTGTTTATGTAATGCTCGCTCACGAAATTCACTTAAGTAAAAGCGGAGGAAAAAGAAAAAAAAATAAA:1 - chr3R 20273100 5' + Doc2-element 220 1 70.55 ATTACCGACCCATTGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATAC:1 - chrX 21667983 5' + gypsy2 22 2 75.17 CAAATTGAATTCCTTGAAAAGACTCTCCCTCAATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 - chr3R 10062234 5' + copia 4933 2 61.64 CCGAATCGATATTCTGGTGGTGTTTTGCATGAACCAACCTCAGTTCGTTTTTTACATCACTCTTTTCATGCTCGGCTGGGATTTGAAGGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2R 23790216 5' - roo 9040 1 63.70 AAGCCCATTTAATTATCCATAGCTAGTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chrX 20456825 5' + opus 7023 2 71.03 TCTGGAAATTTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 - 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chr3R 15047440 5' + F-element 44 1 57.53 AGGATCTCTAATTATGGCTCGAAAACTGCAATTAACATTTGATCCAGCCTGTTTCGTATGGCTGCCACGAGTGTATTGGTGAGTGGGTTCCGCGGGAGGTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATTTTTTAGCAAAA:1 - chr3L 8249854 5' - HMS-Beagle 339 1 65.71 TTGCTCAAAATAAATTATTATGAACACAGTTAAATGCAATAGGCAGCTACACTAAAACAGTATCCAATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 14800983 5' - pogo 2051 1 55.48 CGTTGACTGACTGACTGCAGTTGAATTTATATTTTATTTCATTTCATTTCATATTATTTTATTTCAAAATTTATGCCAGCTGCCAACGCTCGCTTACGTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGATTTTTAATAATA:1 - chr3R 27421539 5' - invader2 445 1 67.12 GCCCACATTGCCAACGCCCCCGAAAAATCGCTTTGATTGATGCGCAAACAAAATTATTTCGCTGCATACTTTCGGGCGAGCGCATTAAAGCAGTTCCTCTTTTTTTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1 - chr3R 31086648 5' - jockey 4982 1 67.81 AAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr2R 14332096 5' + jockey 79 1 66.44 AACCCCACAATACGTCCAATAAACATTTGCCTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 27398142 5' - roo 9033 1 58.62 GGACGAAAAACGTGCAGAGGATTTCCCTTGTTTGCCACTGTATGTGTAGCAGCTAACTTGGTTACCGGGTTTACAAGCACAACGAGGGAACGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTAC:1 - chr3L 20052432 5' - R1A1-element 4980 1 63.83 TCTTTCGCAGCTCTTTGCCTTTGTGGGTTTTTTTTTTTGGTTAGCAGTGAATGAAGGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 8363673 5' + jockey 18 1 74.66 TAATTAAAATTCATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 19698039 5' - roo 9050 2 66.21 CGGAAAATCGGGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3L 22435091 5' + opus 152 4 57.25 CTTCCGTCGTTGGCGTTTAAAATAAAAACACTTTCATTTCTACCTTGTATGCGTACTGTGAACTTTGCTCTTCAAAATCGAAGATAATTATCTACGTGTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTC:1 + chr3R 14401834 5' + Juan 4081 1 67.12 AATAAATGTGCATTAATTAGTGCAGCGCAGTCAAAGCCAATCTAAATTGAAATGGAAAATTATAAAACGAAGCCAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 7042580 5' + roo 16 2 73.29 TGGTGTAGGGTATATACACAATTGTATTTTGAGTACATTCTTTTGTTTATGCTGTANAGCATTGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3R 13676191 5' - P-element 2856 1 58.47 CTCAAACAAAATATAAATAAATCCTTAGGGAATCAACTCCGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATANCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 + chr3R 5518288 5' + Transpac 45 2 54.79 ATAATAACAAATAATCGTGACACTTCACTATACTTGAAACCATAAAGAGCGCTACGTGGATTTTCTCGACTAGCAGATACCCGTAACTCAGCTAGTGATTATGCGAACGCGAAAATTGTTCTTTTTCTGGGATATCGATAGATAT:1 - chr2L 20026792 5' - INE-1 498 1 57.93 AGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 + chr2L 13468232 5' + roo 8733 2 65.75 CTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 - chrX 15406053 5' - opus 7441 2 59.59 TCGAGAGCGGAATCGAAGTCGAATGCAGGAGGGGCAACTTCAAATATGCATCAATAAACTCAATTAAACGTAAACGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 + chr2L 1451137 5' + mdg1 7085 2 54.11 GATCAGCTGTTGGTGGGCACCAGAGGTGACGCAGTGACTGCGGAAAGTAGTCACCGTATCTGTCTTATAGTTATGTGGAAGGTGGATAGGGCCTTATTAGGTGNGGACGTTGTGTCCAAACGATCGTTGCCCCCAGAAAC:1 - chr2L 1729848 5' - Transpac 259 2 42.86 GTACATACGTCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGNGNCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 + chrX 10694237 5' + Transpac 25 2 66.90 AAATAATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 - chr3L 8249516 5' + HMS-Beagle 6812 2 73.97 ATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3L 20168296 5' - roo 9011 2 56.16 AACAAATAAAGCTTAATGTATATGGGCTAAATCACATGTAATTGTAGTGCACAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTATTTTTTGACACCCTACTTGCG:1 - chr3R 12342189 5' - hobo 2868 1 65.07 CGTGGCTTACTTTCGTTTTAACCTTTTTTCCAGTTGAACTTCTTCTATCTAAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCC:1 + chr3R 11188917 5' - BS 4838 1 64.75 CTTATCGATAGAACGCGTCATATTATTTAATCAAAAGTGTGAATTCAAAATACATAAATTGGAACATAAAAAACAAAATATATGACAAAATATTCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAAT:1 + chr3R 22526166 5' + 1360 254 1 56.16 AATTTCAAATAGACAGAGCTCTTCTACAACCTCCTTTCGAACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 30537693 5' - roo 8991 2 74.66 ATTCACTTGTGCGTGAAATGAATGAGATTTATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 27016537 5' - roo 360 2 58.22 AGTCTTGCATCATAAAGGTTTCCTTTTGAAGATTCTAAATCAATTGTAGCACTAAAGGATCTAATGTTTGCAATATATATACACATCTTAACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGCTCGCATGCGA:1 + chr3R 17766688 5' - HMS-Beagle2 285 2 60.69 TTACGAATTAATTCATTTTTGATTAAATAACATCAATGAACACCCAGAGATGGTTAAGCAGCCAAGTAGCATTTAAGTTCGCAAACAAAAACAGCAATGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGGTATAAACCCTGAGCAGCCAAAAA:1 + chr3L 12160000 5' + Cr1a 483 1 67.12 GAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGAGATTNCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCGGTCTAGTAACAT:1 - chr2L 9930405 5' + opus 7086 2 77.40 CAATGCACTTAGATAAATTTGGACCTATATGTATGGTATTCATTAAGCGATGAACTAAAAAGCATGATTAACAAAAACAAAACAGCCATCGATGCTCTTAAAGTATGTACTGTGCACCGTCATGTTCGAACCAAGTGCCCCCCAAA:1 + chr3L 11554465 5' - mariner2 442 1 48.63 CAACAACTGGAGCAGACTTGGGTTGGGGGATTTCCCATTTGCCGTTGATTAACAGTTTGTGTGCAATTCCCCTTTGCCCTCTGAACCGAAGGAAGAAGAATGGATCGAGTTACCCGACTATCAGATACCC:1 + chr2L 4254773 5' - INE-1 556 1 79.23 CGCCCACGCCGCCCCCTTTTGACCACCCTGCATCCCTGCCAAATTGAAGCTTTCGACGCCGTTGACAGCCGCTATATTTCTACCTTTTGGCAAATATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 7336254 5' + pogo 20 1 70.34 ACTATAAAAGCTAGAAGGTTAATATTAAGCAGACCGATCCTAGAGACACCGACGCAGCGCAAGTTTGTTACATGTTGCCATTTATGAAATTTCGAGTTCTCACTTCCAGTCGGAAAAGTCGACCATAGCATTCTCTCT:1 - chr2R 1751258 5' + INE-1 576 1 54.35 TTAAAGGCTCTCCTCATTCATAATTGTGTTGTTATTTACGAAATGTGAAAATGCATATAAGCAAAATTTGTTGTTTTGCACTTGTAATTATATACTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2R 7769878 5' - Transpac 5206 2 66.44 CACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 - chr2L 13316919 5' + jockey 4749 1 79.07 GCACTCCCTTTGGCCATAAGTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr3L 20868096 5' - hobo 2892 1 67.27 CACTTCCTTTTTTTGGGGGGCTTTCCACTCCAATTAAATTCCCATTTGGCATTTGGCAGCTGAATGTGCAGAATAAATTGTGTCAAGCCTTTGTTTTGTAAAGTGTTTCATTGTTTGGGGGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCG:1 + chr2L 9778048 5' + copia 4726 1 76.71 GTGTGTAATGGGTTTGCAATTTTCAGCGACTTTTTGACACACATACCACGCTCGATCCCAAACACATATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAA:1 + chr2L 7148552 5' + HMS-Beagle2 53 2 54.11 ATTATCCATAGATAGTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chrX 20456836 5' + opus 7035 4 61.64 TCGTAAGAACGGCAAAGAAGAAACTAATTTCGCGCAAATTAAATGCAAAGATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATTGACTTACAATTTTGTGCTCTGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATAT:1 - chr2L 1232710 5' + roo 8735 2 60.96 GAGAGAGTTGGAAGCGGGGCAGTAGGTATGCCAAAATATGGTATGGTATATATGAGAATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3R 23511652 5' + 297 58 2 63.01 GTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATTCTTCTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAG:1 - chr2L 21657041 5' + invader1 3693 2 76.71 ATGAACCGATTGTCCGCTACAACCTTATAATATATGATGATCATAATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATG:1 + chrX 13367389 5' - HMS-Beagle 173 2 73.29 CTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chr2R 22596095 5' + Doc 75 1 66.44 ATGTTCAGATGTTTGAAATAGACAAATTGAATTCCTTGAAAAGACTCTCCCTCAATNCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGATTATACTATTCAACCTTCAAAAAT:1 - chr3R 10062256 5' + copia 4879 2 70.18 TGAAACAATGCTAAGTGATCTGTTAATTATCACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAG:1 + chr3R 22435523 5' - roo 320 2 74.66 TAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACTCCAAATCTCCAAATGCGTTTTTTGCTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGAACCGTTATAATAAAGAAT:1 - chr3L 23583092 5' - looper1 88 1 49.32 TATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCAT:2 - chr3L 10814628 5' + micropia 33 2 62.33 AAGCGAGAACTCCAACTGAATAACCATAAGAACAAATTATTATAGAGAACACATTATATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:2 + chr3R 17879415 5' + opus 7173 4 61.64 ATCACGACTTGTTCGAGAAGAATGACGAGATTGAAATACGAAGTAAATGCATTAAGCGGTTGCCTCGAAAGATCAAGACTAGTTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1 - chr2R 8468722 5' + 17.6 33 2 52.74 AAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAG:1 - chr2R 4774755 5' - baggins 5344 1 60.27 CTAAAATAAAAAGTCTTGAAACTCAGATGGATTTGTTATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTC:1 - chr2R 15698140 5' - opus 417 2 75.34 GCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr3L 22435130 5' + opus 22 2 75.61 ATGTATGTAGTACACATTCGTTCTCATTCATTATCGTTCTTAGAGACGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTG:1 - chr3L 11085869 5' + accord 364 2 68.49 ATTACAAAAGACAAGCACCGTTTTGCCAACTTAAGCATGTCCGATCGGACCCCTCGGATAAGTTTCCACATGCTCATGCATCATTTTGACTTTTCATTTTCCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCG:1 - chr2L 14696930 5' - 412 99 2 65.07 AAATATTTTAAAACTTTCTGTTCATGGATACTCTTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTC:1 + chr2R 7407957 5' + 3S18 49 2 56.85 CTCATATGATCACTATAAAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3R 14546548 5' + pogo 52 1 82.00 TAAGCCCATTTAATTATCCATAGCTAGTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCGTCGTCAGGACTCACC:1 + chrX 20456824 5' + opus 7023 2 71.23 CCGAGAATACTTAACTTTACTTAGCTGCTGATTAAAAGGCGATTTGGCTTTCCATACAACATGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chrX 19583327 5' - roo 348 2 61.64 TAATGTACAGGTGTTATTAAAAGCCTTAAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAANATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGA:1 - chr3R 32065525 5' - 1360 3300 1 76.71 ACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 + chr2R 977538 5' + F-element 83 1 67.81 AGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCA:1 - chr2R 6271505 5' - rover 6919 1 78.08 AACTCAGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr2L 13468227 5' + roo 8728 2 62.33 GTTGAATTTTCGAATGTCGTTAATTTTCGAATGCCGCATGAATGAAGTCGAAGTCGACGTCGACAGCACGAGCTCTCTCTCGCCTGGCTTTTCCTTCTATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chrX 18534658 5' - P-element 2868 1 72.60 ATCAACCAATTCCCCCCACAGTTGCGCCACCCCAACCCGATTTTCCAACCCGATTTTTCCATGTAAGTATCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTATCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCA:1 + chrX 9933640 5' + Quasimodo 7129 2 51.03 CATGTATGTACACGCCACCAAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAA:1 - chr4 490350 5' - pogo 2061 1 57.53 GAGTCTCCCAGATAGAAATTACCTTCCCTGAATGGGTTGCCCATTATCGGGTATGGAATTCCGAAATCTGGCCAACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 + chr2R 5037667 5' + Stalker2 7296 2 51.37 CCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 20983908 5' + pogo 50 1 52.05 ACTGCAAATGGCGAAGAGGGTGTGGCCAGCAAGCGCAATGTAATGAGCATGGGAATCGCCTGGTTAAGCACTTGTAATTATTTCTCATTCGATATTAATGCCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chrX 10666973 5' + jockey 4718 1 73.72 TTGGGGAGTGGTTTGTTTCATTTCTTCAGAAATCGTTGGCAATTCACGTTATTCGTTTTGTTCTCGTCTTAGTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 - chr3L 15131467 5' - pogo 2034 1 49.32 GAATTAAGCATAATTATCAATAAAGTTACGTGGCTTTTGGTGGTCAATATTAANANCAATATATTTTGCGATTTCAGCGATGCGATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGCCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGG:1 - chr3R 24775262 5' - Cr1a 4222 1 57.53 GCTTAAGTTTTATTTAGAAAATCATATGGGTGATTGCCTAAACTCCTGTTAAGAATATAAGTATTTAGTAGCAACATTATCTTAACTCCTAGGTGCTAGCATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr2L 8553457 5' - pogo 2085 1 75.34 GGTGGTAGTAAAAAGTCGTATATAATTTTCCATTGGAATGGAATGTGCCACATTGCCCCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGATACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3L 17757860 5' + Tirant 7 2 41.79 CAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGAC:1 + chr2L 13697631 5' + F-element 109 1 78.08 AATGAATAATTGACTAGAGCACTTTTTGATTGCGTTAGCTGCACTTTGAGGTACGTGTTATTTTATTTATTTATGGTGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr2R 18767268 5' - pogo 2060 1 57.53 GCTAGCAGACAAACGGACTGGGTGTAAGGACATTTATATTGATTAGTACTTGGTAACAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chrX 10056670 5' + hobo 64 1 59.59 ATTAGTTTGGGCAAAACATTTTCCTGGTTTGCTAATTTTCACTTCCGTTTATATAGATGTATATAGATATATATATGTATGTGTGTATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chrX 12263675 5' - roo 9038 1 63.70 TTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATTGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGATGGCTTCAGGCTCTC:2 - chr3R 26435576 5' + 1360 71 1 74.66 CGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATA:1 - chr2L 13328491 5' + BS 70 1 66.44 TTTATAGTGGATGGTCCATCGTTATTAATTAATTTTATGAACGATTTCCCCACCCGAAACGAAGATCCTAACACACTCTATCACTTGCTCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 + chr3R 10062108 5' - copia 257 1 57.53 ACTTACAATACTTACAAGGGCAGAGTTTGCATAATTATTTAAAAAAAATTATGTTTTAATGACATACATTCTTACCATAGATTAAGATTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTT:1 - chr2L 19771910 5' - Doc 470 1 58.22 ACTAATTGATGCAAGTAGATTAAGGAGTTATTAATGTCGATGCGATTCGAATCAACTATTTGAATCTGATCAACTATTCAGTGGTATCAAGGCAAACTGCAATAAGGCTACAGTGCTGTTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAAAGTA:1 - chr3R 16035506 5' + Stalker3T 48 1 63.01 GAGGGGATAAACATGACACATTGCGTTGCAGTACCATTTACAACCTATATTTTTAAAAGTTCGGATTGAAGTGTTCAGATAGTGTGCTGAATATTGCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chrX 20233747 5' + pogo 22 1 70.55 GTTTAATGACATGTACCACGTGAAATTGTAATATCGATTCAGTGCTTACCGTATGACGTAATCAGAAAAATCTCCATTCATGCGATTAGTGTTCAGTAAAAATACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTC:1 + chr3R 6896015 5' - invader1 3701 2 71.23 AACCAAGTTCAGAGTTATCGATTATATATCGACACGCAAAGCTGTTGCATAACGCGACGTGAGCATTAACAGAATGTTAATGTAACTTAGTGTGACCGGATGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAG:1 - chr3L 1342470 5' - roo 206 2 68.49 GCGGGCACCTGGCGTATACGTGATTTTTACCAAAATTGCTGTTTTTTGTTGAGAATATTTTGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTG:1 - chr2L 3646806 5' + FB 62 1 60.27 GGATCCCGACTTTTGGACAATTGGCCAATTCATGCGCTTTAATTACTTCATAAAAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 21679722 5' - roo 390 2 72.60 CCATTTATCATTGGTATGTATTTCAAGAAATCGGATTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 16200814 5' + roo 81 2 76.03 CTAAATCCGCTCCTCGGATTTTGCTTAAATTTATAGTGGATGGTCCATCGTTATTAATTAATTTTATGAACGATTTCCCCACCCGAAACGAAGATCCTAACACACTCTATCACTTGCTCCCTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 + chr3R 10062079 5' - copia 255 1 79.02 CAACATTACGATTACTCAACAGGCCATGCAGGTGTATCCCAAAAGTATGCAGCAAAGTCAAGTTCATGCTGCTTTCTTCATCATTAAATATGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 - chr3R 23416024 5' + jockey 4791 1 63.01 GTGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - chr3R 13684761 5' + 412 7131 2 69.18 CTTCGAACGACGCGTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 + chr3R 7512846 5' + jockey 4704 1 53.57 GGAAATATTTATTCTTCTAAGCAAACAAAACCCAGTGATTGACTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCT:1 + chr2R 11574955 5' - INE-1 149 1 68.49 CAGGTGCATTTTGTGAAATGTTTAGCCTCCTTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAG:1 + chr3R 10708254 5' + Transpac 5006 2 78.08 TCGAAGCGGAAAATTTGTCATTGTTGCCATTGCGTTTATTAATTAATTTGGCCGACAGTCTGGCTGTGTGTGCGGGTAATAAAATATTTGCACATGACTGAAATTAAATTTTAGCCCGTTCAGTCACTTCGTTGTCGCCTCTGTAG:1 + chr3L 22565105 5' - Chouto 450 1 70.55 AATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTC:1 + chr3R 7420427 5' + 412 59 2 58.22 AAGCGGTAATGGGTGAAAGAAGTTTATATAGGTTGGGATCAAAAAATCCTGGGCACGCCGACGTTGAATCATTTCGTAATTTCATTTCATTTCCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATATTT:1 - chr3L 24820694 5' - mdg1 7203 2 53.42 ATAAATGCAGTGGAATCCAAATGAAACTGCCGTAGTTTATTGCTGATGAAATGTTTAAATGCAAATTATTCATAATGGTAAGAAAACAACGAATCTCATCATAATCACAAATTTTGTGAATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATG:1 - chr3L 8277152 5' - Quasimodo 52 2 76.71 GGTTGCTCGGTATCCGAATCCGAGTATTGGTGCGATTGAGTGGAGCGATCAAGAGACATACTGACAGCCAATTATATCTAATCAAGTACATATATATTCAACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr2R 23596119 5' - blood 7372 2 72.60 GCGCGAGCGCAGCAATGGAAATATGGGAAAATACACACACTCACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chrX 20942230 5' - hobo 2892 1 51.39 ATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 - chr3L 22744721 5' + FB 65 1 64.38 AGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr2L 19698078 5' - roo 346 2 59.59 CTATATTTAATGTTTTTCGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1 - chrX 19690635 5' + gypsy 45 2 51.43 AGACAGTCTTTAAAAATTATGTTTATGATAATTATTATGGCATATATATGCACGACAATATATATATATTAAAGTTCTGCTTTGTCCCACCAACTTTTGCTGACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chrX 6186248 5' - Transpac 293 2 37.67 TAAAGTATCTAATGTTTGCAATATATATACACATCTTAACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCC:1 + chr3R 17766740 5' - HMS-Beagle2 232 2 76.03 GTGCTACTTGAGCGGTGGATTAGGCTGCTTCAAAGGTCCCGGATGACCGGAGAAATTTATTCAATTAAAGTAGAAAGCTTCGAGGGAAGCCAGACAGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 10504244 5' + roo 8688 2 67.12 ATCGCAGATATCCTGGAAACGTTTAAGCAGCGCAATATTCGCGGCATGACTAACAAACCAGACATCGTAAAGCCGTAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3R 21843701 5' + blood 16 2 74.66 AACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 24011053 5' - roo 325 2 76.03 AAACGCTGGGCACTTAACATTGTGCATTTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATGTGTTTGCACTGAAAATACTAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 - chr2R 14332141 5' + jockey 13 1 73.81 AAAAATTCCCATGCCGCGATCCTCAAGCCTTGCCACCCTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 21655042 5' - roo 325 2 72.60 AGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAATATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTATACCAAATAAGGAGGGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 19449471 5' - roo 9046 1 34.25 TTAACTTTAAGTGACCCAAAAAAGAAAGGGAGGGTGGTTTTAGGTCAGCCGGCAAAGTTGCGTGCTGGGCTACGTTGTATGTTCTGGTTTCATGCCAAATCTAGAGACCCAATTAAATATGTATATATGTATATATGTATATATGT:1 + chr2L 455959 5' + G3 4507 2 78.77 ACTAATGCATATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chrX 20940711 5' + hobo 58 1 56.85 GGTGGGCATCACAATTTAATTTCAGTTTTCAACCCATTGCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 5398197 5' + roo 8680 2 76.03 CAAAAACGCATAATCATTTTAACACTTTAATAATCGATTTAGCAGGAAGCTCAGTTCGTCGTTTAAATTTTCCAAGCTTAAGAAAGTGAATTAACACCATACACGAAATGATATATTTTATTCATTTTATTAATTTGATTCTCATT:1 - chr2R 18495681 5' - transib4 2264 1 78.77 CAAGCGGATCAAAGTCAGCGTGGACTGTAAGTCCATTGATATCCGGACTTAGTTGGGTTTTCTTATATTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1 - chr2L 6385907 5' - invader4 3039 2 54.11 GTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGC:2 - chr4 637769 5' - roo 8710 2 73.29 AGCTAGCAGGATTGCCAAAGGATGAGAGATCTCTACACCTCCTGCACTCCTGCTGGTTAGAGATATGATAAAAACTTAGGCAAGAAATATATCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGGAAAATTGTTTAATAATT:1 - chr3R 19489732 5' - Tc1-2 1554 1 54.11 AGTTCTTTAGCCCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3L 21636392 5' + 297 6604 2 70.55 TTGGCCAATAAATTAACTTGGCTCAAATGCTCCCCCCTGCCACCATGCACCCCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 + chr2L 7094235 5' + accord 183 4 50.50 AACCCTCGGCATCCACCAGTGGTCCACTCATGCCCACATTGTCGTTCTGGAAGGAAGATATCATTATCAATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 + chr3R 13676082 5' + P-element 52 1 48.63 CTGTTGGTCTATGTTTCAAATAAATATCGCTGCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:2 - chr3R 6962478 5' + jockey 30 1 69.18 TAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 + chrX 21227089 5' + Tabor 43 2 55.86 AAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 3911828 5' - roo 352 2 54.79 CTGGGCGCCACCGTCTACATGGCACTGCAGGTCATCGCCTCGGCTCGTTGGTCACTGCCGTCATCAATATTCAAAATAAATCCGGATCTTGGGTTCCTTGTCGCGCCCTGCTTGATTCCGGCTCGCAACTAC:1 + chr2L 22226618 5' + G3 467 1 65.15 AAAACAAGATATGGTTGGGTGATTGATTGAATATTTTCCACCAGGTAATCTCTTTCTTTATCTCAGAGAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 + chr3R 28829067 5' + FB 50 1 51.41 TTGTGCGTGTATCTTTGTATCTTTTGTGAGAGAAAACAAAGGGGGAGAGCTATCCGGCAGATAAAAATAGAATCTTGCTGTTAAAGGACCGGTCATATACTNTGCAGGGAACCCTAGATAGAGTAACCGCTGCGTTTGGTTCATAT:1 - chr2R 16519239 5' - R2-element 327 1 48.63 AATGCGGAATTTAAGCAAATATTATAAAAAACCAGGCTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTC:1 + chr3R 7513900 5' - jockey 4673 1 79.45 AGGAAATCTAAGGCAAATATTGAGAATCAATTTAGCAGAGGTCCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCG:1 + chr3R 31264440 5' - F-element 4431 1 72.41 ATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 8273931 5' + hobo 65 1 69.47 GTGGATTTTCCCAGAAATATTTATAAATAATTTTGATAAGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:1 - chr3L 11124560 5' + jockey 4753 1 76.71 GCTCCAATTGGTATCGGTAGCGGGGTGTATAATGCGCGTGTATAAAGGAATCAAAAATCTTGATTTTGATTTCAGATACTCCACCCCTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTAT:1 + chrX 7508072 5' - roo 9034 1 59.59 AGGGCACTATTTGTTAAAAACCACCTTAATTTTAAGGACATAGCACGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chrX 11415824 5' - mdg1 384 2 58.90 GCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATC:1 - chr3R 6962447 5' + jockey 62 1 54.11 GTAAGTTAGTTTAATTTTATCAGATTAAGGGATAAATAATCTTAATAGGTTATGGATTTTGCAAGTGTAATATATATGAGCCGTGAGCTAAACTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2R 12379464 5' - pogo 2076 1 64.38 GCTGATCCAGAATAGATTGAAAAACATTTAGATTAAGCTTTAATTCGCCGCAGTTGCGAGACAATGGAAATCTTTTAATATAACTAGCTGTCGGGCGGCAGTTATTGAGTTGGTGAACGCAGAACGTGTAACGAACTAAATTGATT:1 - chr2R 22566872 5' - Gypsy12A_LTR 2254 1 50.68 TTGTAGGCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTGGAATGCTAAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTATCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGAT:1 + chrX 21581824 5' - INE-1 99 1 79.14 AAAACCGCAGTTTTCCAGAGAAAACTGTGCTGCTGCTGCTGAAGAAGCGTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr2L 13316988 5' + jockey 4688 1 70.07 GTTGTTTTCTCTCTGAAACTTTAAGACTGACTTTGGACTTTTAGAAAGTGTTTTGTATTATTCTAGGAAATTAATGTGTTGAATTTATGCCAAAAATATTTCTGAACTGTCTCGTTTGCACTAACTGAGTAATGGGTATCTGATAG:1 - chr2R 13232896 5' + INE-1 547 1 79.45 GCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGGGCGGACGAAT:1 + chr3L 19907124 5' + P-element 90 1 24.66 ATTTCATGTATGTTTATTTAAAACAAAGGTGAAAACAAATTATGATGAGGTTATATTGTATATATTTTTGATCAATAGCCGAGTTGATCGGGAAATGTCCGTCTGTCGGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAACTATAAAATCTAGA:1 + chrX 15841177 5' + INE-1 153 1 65.75 TTTGTTTAATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 15540059 5' - roo 9034 1 57.14 TTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTCTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr3R 7420446 5' + 412 7131 2 70.55 TAATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 - chr3R 12376536 5' + flea 4788 2 61.19 GAGTCGATCGATCGACGCTTCCCCTTGGCAGACAAACTGATTTATGGCAATGCAAACGGGGACACATCAGACATGAAGACAGACATTTTTGGGGACGTCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTT:1 + chr3R 12269983 5' - 1360 3307 1 68.00 ACATAAATTGAGTTAAAAGGAAAATGCCAAATTGAATTTTATTTACGTTGAACATTCACGCTCGATTTCACACACGAAACAAATACCTCAATGTAAGTGCATTATCTTCTACAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAA:1 - chr2L 2071062 5' - hopper 145 112 62.22 ACAGTCACCTACTTCCATCTCCGATAGAACTAGAGAACATTCCTGTTGGTCAAATACCAGCCCCTCTAACGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 - chr4 863310 5' + 1360 3387 2 52.05 ATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAG:1 - chr2R 21199713 5' + jockey 4787 1 64.38 CCAACCTATTGGCCTTAATATCTGCTGTCGATCTGTCCATCTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 18737902 5' + roo 8675 2 78.08 GTAAATAAAGCCTCAAAATAATACAAATTATTCGAGGAATAGCTAGAGAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 + chrX 17583293 5' + FB 71 1 68.28 TTTTGCGTGGGTGGATAGCTTTATCAGTGTCCCAGTGTGTGTGTGCTTGTGAGTGTGTGTGTGCAGATGAGCTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTG:1 + chr3R 29638347 5' - Porto1 381 1 55.75 GCAGTTCCGTTCGCATTCGCGCGTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr3R 16349190 5' + P-element 34 1 57.03 CGTTTGCCCAAAATATTGCTATTCCTTTTGATTTGCTGTGATGATGTGGGTACATACATAAATGTGCAAATTTGATGCCCACGTCAAAAGTTGCCTAAATTCAAGGCACTTGACAGCAGCAATTAGTTTAGCAGTTTCTTCTTCTG:1 - chr2R 13017679 5' - G7 157 1 62.33 GGGCGTTAGCTTGGTTAGCTTTATTTTAATGGAATTTGATTGATTTGCATACTATAACTCGTACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 8208274 5' + roo 8688 2 71.72 CGAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1 + chr3L 20868042 5' + hobo 82 1 73.10 TATCGGAGCAACTCCCAAGTGACTGTTTCCGGGGAAATCCAATTCGGAACACAGACTGATGACACGGCCTATGTCCTGAGGTTGGAGACACAACGGAGCATTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTAC:1 + chr2L 8434224 5' - Rt1b 5104 1 69.18 AGAAGTCGGTCAAACGTACATTCATAAGCAATTATCGTGAAAGGGTCCTTTGGCTAGAGATTCCCCCCACACACACACACTCACACACACTCTCACACACACACACACACACATAGACACA:1 + chrX 19528374 5' + accord 188 2 59.50 CGATTAACACTAATAAAATTTTATAATTTATGTACAATTACATTATTCTTTTACACGTAATATAGCTATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:2 - chr3L 3154196 5' - flea 204 2 57.53 TTTACTTCTATTCATTGACGACGTTTCTTTTAAATTTTTTAGCTATAACGAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3L 20867993 5' + hobo 24 1 65.93 GTTGGGTCAAAGTCTACACGCCATATGTAAGTTTGGATGTGGAAAAGTGCAATATAGTGTGTAATATAGTATAGCCATTATTTAGTTCCCATTAATATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chrX 5721966 5' - pogo 2081 1 69.18 ACTGAAATTGCATTCGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACTTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2L 16382540 5' - hobo 2902 1 73.49 TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTGCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCG:1 + chr2L 23069854 5' + Stalker 172 6 69.93 CTGTCCCCACTATCTGTACTTGGCTCTGTATCTGTCTCAGTTCTGCTCTCTCAGCCGATCGCTCAGTTGGAAATGAGAATGAGTAATGCTCCAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr2L 3632245 5' + P-element 29 1 55.48 CAGGCCACACACGGCCGCAATGGACACGCACACGGGTAAAATATACATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 + chr3R 23877852 5' + Transpac 4988 2 69.86 CTCCGTTTTCCACTGCAATTAAAGTTGACACGCTACACCAGCAACAACAAAAGCGACTAAAACAGCCCAAGTAACAACAACTTTGACGAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 23790375 5' + roo 8683 2 69.92 AATGTCCTCAGTTCGAGGAAGAGGTATTAAGTCGAGTTCATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTT:1 + chrX 4200927 5' + FB 81 1 74.31 AAGAAATCCAAAATTGTTAGTATGAAAGTTTATACTTATAATGGTTATATTCTATAGAACAAAGTTACAATATTAGTATTTTTGTGTATTTACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chr3L 8295859 5' + Quasimodo 28 2 65.75 CGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr3R 20345534 5' + blood 7079 2 62.33 AAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 21938153 5' + roo 8717 2 58.22 TAGGCTGCAGACAATTTATTCTTCATTTTTGTTTTTCTTTCCATCTGCGACGATCGTTTTTGAAAAATGTGTTCAATAAACGCGTTACTTGTAGAGTAAACAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr4 407092 5' + jockey 28 1 71.23 ATATAATTGGAAATACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chr2L 16607299 5' + 412 63 2 58.90 ACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3R 20983895 5' + pogo 52 1 57.78 CAATTCTGATTTTGTGAAATTTCTGCCTTCTATTTTCCTCATTGCTGCTGTCTTCATCTTTATGCGTTTTTCCACTTTGTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGA:1 + chr2L 13555378 5' - blood 7189 2 54.79 GCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 16200758 5' - roo 8986 2 76.03 AATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGTTCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCT:1 - chr2L 5341577 5' + Burdock 6219 2 73.29 AGAACCTAATTCCTTAAGCTAAACGTTTTGAACCCTACATTTTTACGATTGTTAACTAAGAAATCGGTAGTGCAGATCTTCGATATACATACATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 + chr3L 3154033 5' + flea 4774 2 72.60 ATAATAGTTTTGTTGCCTTCTTCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3L 22435245 5' - opus 476 2 67.59 TTTTAATTGTGCAAGTATCCCAAGTTTTTGGGGCGAAAATAAGGCGCCTTGCCTTATCCGTCAAGCAGACAGGTGTGTTGCATACAAACCTACACGCACACACACACACACACATGTT:1 + chr3R 23623786 5' + accord 184 2 61.02 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCACTGTCCCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTCGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 48 1 69.18 AAACTACTCATTCTTGAGATATATCTACCTCTTTGAAACTGAGACAAGCAATTTGCACTGGTATACTGATACTGAAATAAAGTTTAAAATAAAACTTTCTGCACCCTTATTCCTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr3R 19246635 5' + jockey 4679 1 73.97 ACCCACTCTGAATACTTCTCGTGTTGGGTGTGGTGAGATATACCGTGTGACGTATAAAAGCTAAAAACGTTGGCAAATATATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGACCATATAAAGTATATGTATTCTTGATCAGGATCAGTAGCCGA:1 - chr3R 16248381 5' + INE-1 89 1 58.22 ATTAAATGCGAAAAGCGAAAGGACCACGACAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1 + chr2R 18551725 5' - I-element 5267 1 76.71 TCTTATAGGTTCCTCAACCAGGAAGCGTTCCTGTCCAAAGTCTGGCTCAATAACAGGCTTCCACAATATCAAGGGATTGTTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 9599775 5' + roo 8689 2 65.12 AGTCGAAATTTTGATCTGATCACCGCCAATTCGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACG:1 + chr3L 18075572 5' + pogo 86 1 76.71 CACATTGTCGTTCTGGAAGGAAGATATCATTATCAATGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 + chr3R 13676116 5' + P-element 86 1 26.71 ATTGATATATATGCATAAAATAATCTGTTTTTGTTGGTCTGGCCCTCATACTCCAGCAGGATAATGCTCCCTGTTATAAGACCAAACTGATTACTGTTTCTGAAAAATGTTTGCATAAAAACATTGGATTGGCCACCTCAAATTCC:1 + chr3L 25120697 5' + Tc1-2 1152 1 67.81 AGGCTCGCCCCCCCGGAAAACTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACCGACTGCA:1 + chrX 7848226 5' - flea 147 1 86.99 CCCCGTGAATATTCACCCCAACCGCAATTTGAAAGTGCGAACTTGATTATAATGCACTCACTGCATTCAAAATTCGAATGTGTTCACACATGAACACGAATCTATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 12343294 5' + roo 45 2 55.48 AAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATACACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGT:1 + chr3L 2668844 5' - Bari1 1646 1 56.85 ATCTGCATTTGGAGTGCGGAGCAGGGTAGGAATGTGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 17494970 5' - hobo 2920 1 56.96 TATATATTTTTTTTTTTGGGTGTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTT:1 - chr2L 3476759 5' - Porto1 310 1 60.96 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:3 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 AAAACTAACCTTGCACAATTTGCGCGAAAGTGATCATGACAAAACTGACAGTATAAAAACTGAGAGTATATAGGTAGTCAAGTATATATGTATGTATCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTC:1 + chr3R 11204014 5' - Doc 425 1 65.75 CATTAAACTCCTCTTTTTCACTCCTTGCAGCATCAAGGAAGACCGCCTTTTGTCCTTTAAGAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAAAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCACGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAA:1 + chr3L 13747409 5' + R1A1-element 5141 1 56.55 CAAGTCGACCAAATTAAATTCGGTCCACTAACAACTATGAACAACTATATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGC:1 + chr3R 16881909 5' + 3S18 5839 2 68.49 GTACATATGTCCATATTTTTATCGCATTCTTCGCACAAACGGAAATGTAAACACTGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 + chrX 19163261 5' + Burdock 62 2 61.64 GCAACCCCCTTCCACCACCAGCCACCTCCACCTGTTTCACCCTTTCGACCACTCTCTTTTCATCGATCAGACAGATGAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2R 21362723 5' + Tirant 38 2 59.29 TTTGGTACAAACAAATAAGGCTATCAGTGAATTTCCAATAATTAGTTTAGAGCAGAGCAAAGTTGGCTACTTATATTCAATGTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chrX 6910174 5' + I-element 40 1 58.22 AAGTGACGGGCTATCCGTCGAGAATCGTGAATTACACGCTCGCTTAACCACGGACCACCCCGAAATTGACTGGAGTGCGATCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAG:1 + chr3L 21577529 5' + roo 8895 2 61.54 AACCAAGAATACGCTGGCAAACAATTACTAAATCCCATGCTGCAGATTTAAAATATTTTTATCTTTGCCTTAAATCAAAAAGAAACGAGTGAGTTAAGTTCATTATAATAAAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACT:1 - chrX 5140633 5' - INE-1 550 1 75.86 GCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3R 13453394 5' + 412 7123 2 67.59 GATTCTGGGCAGGTAAGAATCGAACTACACTTGTCGTGAACTCAAACCTCTTATCAAATCCTTTTAAATTCAGTTGAAGAGTAATTGATCCTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAAAAT:1 + chrX 11696529 5' + TLD2_LTR 97 1 78.08 AAACCCTACTTTCTAGTGGCAGAGCACGAAAATTTATGGCCAGCGATTGCAGAGCAATAAAGATTATGTACTGAACTGATAATTAGGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 6399485 5' + pogo 33 1 63.01 CCTCTACTTGGGGGTGACATTGAAATAAAGAAGTACTGTATTTTCATCAGAATTCACTTAGTTGTCAATTATTGGTGGAGTCAAGCGGGTGTTTCCTCTTCAGACGTCTTAGGAATTGACTATTGTCTAGGAGGTTGATGGCCAGG:1 - chr2R 5192319 5' - G2 2876 1 80.82 ATACAGCAAATGAATATTGTTAAATTATTTATTTGCTGTATTCTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 - chrX 407463 5' + I-element 80 1 76.71 ACGGACATCCGCGTACGTGCATGGCATTGGCAAACTCAGTTTCTGGACACGTCCAGATGGGCATGTCCACACTATCTCCATTTAAGTTGCTGACCTAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr3L 7102438 5' + I-element 28 1 62.33 TGCGTGTTGACAACCCTGCCCGCAACCCCCTTCCACCACCAGCCACCTCCACCTGTTTCACCCTTTCGACCACTCTCTTTTCATCGATCAGACAGATGAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 21362702 5' + Tirant 8 2 79.39 AAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGA:1 - chr2R 4774754 5' - baggins 5343 1 60.96 CATCATCTCATCTCATCTCATGTGGCAACAGAGCTTGAGATCTTTAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 5456665 5' - roo 9023 2 53.42 GGGCATATAAGCAAGTTCATTTATTTCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATAAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATA:1 - chrX 19163351 5' - Burdock 184 2 69.86 AAATGTACAACAATTGAAATTTTAATTCATTTTAATGAGAATTTTTGATTTGAAGATTTGTATGTTTAAGTAACTGAATGGACCACATACATATATGTATGTATATGTACATACATATATGTACATGTATACATATGTACATACAT:1 + chr2L 6644054 5' - invader3 5086 1 65.07 AAATTGCAAAAGGCAGATGATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATTTTCG:2 - chr3R 6014079 5' - hopper2 1555 1 69.86 ACAGAAATATTTTTTCGCATGGCCCATTGGCGAACTGAAAACCCACAACAAAAAGTGCATAGTAAATTTCCTAACGAGTTGACAGACTAAGAACATATGAACATAACTTAGCCTTAAGTTTGGCAAATAATAATAACAACGAAAGA:1 - chr2L 21915789 5' + G4 3662 1 54.79 TGTTAGTTTATTTTATAAATGTTCGAAACTGGAAAAGCTCAGACACGATTTCAAAAACCATTCGTCACTATTTTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chrX 20233905 5' - pogo 2075 1 63.49 AGGAGCTCTAAAAGCATTTTTACTATGAAGCCTGCCCAAAACAAAATCGCCTGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTTCGTAAGCCAAGGCACTGTCCAGAGCTCGCTCACCAAGAAGACTCCACAGAAGACATCCGAAGGAC:1 + chr3L 24051186 5' + BS3 1561 1 57.04 CTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTTATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chrX 10284916 5' + pogo 49 1 55.48 ATCAAAAAGCTGCCAACGAGGCGANATTANTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACG:1 + chr3R 12789561 5' + G2 2799 1 72.55 AGCAGGCAGCGAGAAACGAGAGACTTTCGGATGTCTGCTCATCGATTTGGGGACTTTTCCGACTGTTTTCCTCTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATC:1 - chr2R 21922921 5' - Burdock 6201 2 50.68 ATACAAGCGCACGTTTCTTGATAAATATTCAGCATGATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr3R 14546503 5' - pogo 2035 1 75.97 CATAATGCGCTTTGAACTCGTCGCTGCAGCAGGAAAATTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACT:1 - chr2L 12987471 5' + jockey 4842 1 74.66 GCCTGAGCTACTTTATTTATATGTCCGGGAACTGATGTGCCGTACGTGATTTGCTGAATGCATACGAGATTAGCCAATGATGTTTGTGGGCTTTAGAGTGGGCATAGCAACCTGCTAAATCTCAACCTTCTATCTTTTATAGTTCA:1 - chr3L 20911525 5' - INE-1 157 1 50.68 AAAACATTTTGTGGACACCCATGTTCGTCAGCCAATCTCAACCACCCTGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGATACTCCC:1 - chr2L 22181206 5' - R1A1-element 4994 1 69.01 ATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATCAATT:1 + chr3R 7041996 5' - Stalker2 7583 2 65.93 ACAGAAAGAAAAAAATACGACGAATGAAGCAAAGACTTGAATAAAATGTATTCAACATTTTGATGAATAGAAATCAACTTATGATAAATGTTTATTGGTCAAATATTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGC:1 + chr3R 25453267 5' - opus 350 2 73.19 ATTTAAAGCAGATGTTATATGCAGATACAATACCTTAGAAATCAAATGAATAGCTTCTAATAACCCCGTCAAGTTAATGGTCTTTTTTTTTATATAAATATATATTTAAATATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 + chr3L 12634129 5' - BS 5069 1 47.92 GTATGCAACACAAAATTGCACACCTCGATGGCGAGCAATGTGTATTTGGCTTGTGAGCTTCCACAACCTTAAATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 - chr2R 22971882 5' + jockey 4809 1 52.74 GTTTATGCTATTGTCATATGATTTTTCCAAGAATCTCGTAGTTCAGAAAGTTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTC:1 - chr3L 18010323 5' - diver 152 2 65.75 AGTCCTCACGTCACCCTTCTGCATCAACAGAAGTTCTCAGACAACTAATGCTCTCGCACTTTCTATGGGATACGGACTGCTGACATTACAGGGTACTGTCAAAGACACTAGAATAATATAATATAGAATATTCTAGTGTCTTTGGT:1 - chr3R 12236556 5' + Tc3 312 1 67.81 ACAACAAAAGTGAATCATCGCTAACAAACCGCTATAAAAATAATAATAGCGGTTTGTTTGCTTGATGGGGTTCAACACGGGGTAAGATTTTTTTTTTTCATTTTTTTT:1 + chr3R 29461650 5' - gypsy7 5007 9 45.37 ATCTGTCCATCTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 18737932 5' + roo 40 2 57.93 GTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTTGAATAAAGTTGCTCGACTTTTAGATATCCATTACTCAGTCAGTGGATGTGCGAGAAAGAAAATCTGAGAGACAAAGAACTCGACTATTGCATTCTCT:1 - chr3L 21427041 5' + INE-1 574 1 59.29 GTACTATTATTTACGCATTTATTGAAAAATGTAGGGTGTATGTAAATGCTCGTCCTTGTGTGCACTCAAATCCTTCATGTCGTTCTTCGCTTTTCTAAACCCCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3L 17264167 5' + 297 48 2 69.18 GGAAGGGCGCTGCCATCCAAAGATTTCGACCACCATAACCAGGGTCACATCTCTGTAGGAAGGTATTTGTCAATCGAATCGAATCACTTTTTGCTGAGTTTTCCATTTGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTA:1 - chr3R 30618793 5' + X-element 31 1 59.59 GAACATGAGCCGTATTCATGGGATTCCCCTCCCGGAGGACTTGCCATTTAACTGGCTGGCTGGCTGCCTGGACGAACCTGAGCCTCACGGGACTCGGCGCACTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTCTTTTGGCATGAAGTCTAAA:1 - chr3L 10024114 5' - transib2 2803 2 69.18 CATAACAAACAAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 - chr3R 12115354 5' - 1360 3319 1 64.38 CTAAATGAGTCGCATTTAAAGTCAAATAAATCTATACTTCCATTTTACTGCGAGATCTTTCTGCGAGAGCTTAGTAGTATTTGTCTTTTACGAAATGATGGNTACGAAGTATTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGG:1 - chr2L 11374413 5' - roo 469 1 52.52 TTACTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 16200736 5' - roo 9008 2 60.96 TCGAATTCGCTGGAATTCTTGGATACTCACGTTTATGCTAGTTGCATCGCATGGCATTTGCTGTTCCAGTTGGTTATATTTGTTTATGGTTATGTTGGAGTTTGGGGGTTCCCTGGGGGAGGATTTAACGCCAAATCATATTCATG:1 - chr3R 18937649 5' + Transib5 2697 1 50.00 TTTGTATCTAAATTTTAATTTTACATGCAAGCAATCCTTCGACTTATCGAAGCCTTACTGTACTCATCCCTTTGTTTGTTTTGCATGCAAACGTCTCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3L 15273351 5' - pogo 2080 1 74.48 CTATATCAACGCTCATTTTGTTGTTTAAAAACAATATACTGTTGTAAACAATTTCATCATTGTGAACATCTGTTCAAGCAATGTGACCGCGCTTCTCAATCTATGTTAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chrX 13667725 5' + hobo 13 1 71.92 AACCAATCAGCTGTAAAAACTATTTAACACAATTAATACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTA:1 - chr2L 3175182 5' - Burdock 177 2 71.23 ACAGATAAAAGGACAGACTGGAATATATGTGCTTTATAGGGTCGGAAACGATTTCTACTACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3L 21157115 5' + 412 62 2 60.27 GTGGCAGGCAGGTGGCCATAAAATGGCATAAAACGGAACATTTCGGTGTTTAAATAATTCTAGAAATTGCATTTAGAATCTATCTGCCTTTGGCAGATGGGGATTGGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2R 8689313 5' - hobo 2931 1 77.70 CTAGAGTTAGTGGTTGGTGTTGATGATGATCAGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAGTAAATAAAATA:1 - chrX 14189279 5' + 412 7076 2 67.81 TAGATGTAAACACTTGTAATGTGAAAACACTGGCTATCTGTTGCGGCGCTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGT:1 + chr2L 5341459 5' - Burdock 6368 2 70.55 GTTCGAAGCCCATAATCTGCCAAATTGAAAATTCAGAAGATTAAACAATCAAAGAAATATATATTGCAACCATCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 + chr2R 24807869 5' + I-element 49 1 53.42 AAGAACCCCAATTCTAATCCCGATTCCAGTTGGAAGTTTTTTAAGCTATTCGTTAAAAAATGTTTTACATACATATGTATTTGTCGGAGCGCGACTCTTCGNATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGT:1 - chr3R 11758083 5' + invader4 44 2 54.79 CTTCTTAACTTTCTTAGTGCAACCGTAAATCCTATGCATGGCAATATTGTATACATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 + chr2L 17851669 5' - flea 4948 1 68.49 AAAAAGCAAATTTACATTTAGTGCTGCATATTTAAGGGGGCTCCTCGGTCGTCCTTTGTATCGCATCGTATCGTATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:1 - chr3R 24074854 5' + jockey 4806 1 52.74 CATTGGTGGTGTTTTATAATTACANTGTTACAAAAGAAGTCACTATTTAGTGCTGAATAAGGTGCAGAAACATTGACATGTATTCAATATTACAGAGATGCATATGCATATATATCGAAGGCTAATTAATATTGTTTGATTTATTT:1 + chr2R 17266630 5' - HeT-A 5768 1 64.38 ACCCCCGTTAAATATGTCTGAATCAGGGTCGCCTGCCGCGGTTGCATGTAATCGCAGCTGGCAGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:1 - chr3L 17758039 5' - Tirant 8451 2 56.85 ATGTGTGTGTGTGGGTGGAGGGTTCTTTTGGCCTCGCACTCATTTTTTTATTTGTGTTCTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 + chr2L 17470330 5' + 412 7116 2 58.22 CTAAGAAATCGGTAGTGCAGATCTTCGATATACATACATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGATGAGCAGCAA:1 + chr3L 3154088 5' + flea 4797 2 68.42 AACTTTTTTCGTTGATAAGAAAAGGAAAAAAAGACTACAGTTTAAAGACACGTTTAGTTTAAACAGCTGTAAAGGCAGAGTACTTAAGTCTACAATTATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTG:1 - chrX 14133296 5' + TLD2_LTR 168 1 64.38 ATTAAAGTAGAAAGCTTCGAGGGAAGCCAGACAGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCAAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chrX 10504307 5' + roo 87 2 78.08 TAAAAATATTATAGAATTTCATTTTATTATGAATTAATCTATTCATATTTGTTTGATATTTTTGATTTTTTTTTTTATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - chr3R 29195553 5' - flea 4973 2 54.48 AAGCAAGAAAACGCTTCCCTCTTGACAATAGGGACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 - chr2L 22690171 5' - copia 201 2 80.14 CATTTGGGAACGTGCTCTTCGAACGACGCGTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAA:1 + chr3R 7512830 5' + jockey 4722 1 52.05 AGGACGACACTTTTGTTGCTGGCAAAATGAAACAACAGCGCGTGTCAGCTGCCAAAGAGTTGCTTTTGTTTCAAGTGCTGCCAGCGGTAAAAAAAAAAGACAAACATGGAAACAATAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGCTG:1 - chrX 7638547 5' + Cr1a 454 1 58.22 CTGCAGGCGATTGCCAGGGATGAGATCATCCCCTTCCTGGCTCCGTTTGCCAAGTCCTCGAAGCGTGGCGAACCCACCCGGGCACTGCTCCTGACCATTGGTATTTGTCAGTGCG:1 + chr2R 23913891 5' + gypsy2 362 1 78.26 ACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAAATAAAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATTGTAACAAAATGCAACTTGACTTAGAACGAACTTG:1 + chr2L 21675226 5' - HB 1380 1 57.24 TCCCGCTTTTAATAGTAGATACAAAAAGATGCCTACCTATTTTATTTAATTTTAAAGTCTCGCAGAGTGCATTGATAATTTAGCTTGATGTACATAAGTGTTTTAGCTCTTGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr2L 17353153 5' + 297 3 2 80.14 AAAGTTGCTGCAAGGGCAGCAGGACGAGAAAACTAAAACATAAAGAAATATATATGTAGGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:2 + chr2R 18723653 5' + 297 58 2 65.07 GACAATTGTTTGCCAATTAATTAGGTCGTGTGCATCACACAATGGTAATTAACCAAGTTCAATCTACCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chrX 5721812 5' + pogo 52 1 53.42 TATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2L 19698087 5' - roo 337 2 65.75 TATGTAATTGTTTTCATAAATGTATTTATGGCACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 10433181 5' - 412 7505 2 56.55 GGAAACTCAAGCAACTAATTGTGCGCCCTTTATTACGCTGTATTTTCAAAACTTCTAAAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1 + chr3R 12181950 5' + mdg3 5287 2 62.33 GGGAATAGAGCTTGGTGCGAAGCTACTTGGCACAGTCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTGGGC:1 - chr2R 22761239 5' - 412 410 2 72.41 GGCTTCATTGCACCTTCAGCCGAAGCCAATCTCATTTCCATTAAATTGTCCTGGCCTGGCTTGCGCACATGAATCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr2R 13695739 5' + blood 7039 2 60.63 AAGCATTAATAATCTGGTAATTTAAAGAGAAAAAGAAATTACATTTTATAGACTGTAGTGTGCACAATTGTCATATAAACATTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr2L 5818985 5' - I-element 5316 1 56.16 GCACTTCAATTTAATTGCTGTAACCAGCATTATACACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3L 19222587 5' + 412 7104 2 53.57 GGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTA:1 + chr3L 8249370 5' - HMS-Beagle 6981 2 61.38 TCCTTTAAGGCCGCCATCGAAATGAACGTATGCAAAGCAACAATAAAATATGACGTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr3R 24093457 5' + jockey 27 1 70.55 CATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATATACCCAC:1 + chr2R 18035111 5' - R1A1-element 5269 1 62.33 CGGCATACAACGCTTGCATGTGTCGCATATCCTTTGAAAATTATTATTCCGCGTATGGAAACACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 7032665 5' + roo 8724 2 60.27 ATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr3R 13453376 5' + 412 89 2 80.14 ATACATACTTCTCAACAATTGTTGGAATATATATATTTCATTTTTTACCATATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCATG:1 + chrX 22905222 5' - INE-1 89 1 60.00 AAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCC:1 - chrX 19690605 5' + gypsy 81 2 73.97 CGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGTGCCCAGTGCAGTTTATGTGCATAAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCC:1 - chrX 9023561 5' + G6 53 1 50.00 TTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr2L 16607281 5' + 412 7134 2 71.23 CGAATGGCAGGCGCAAAACAGAATCGCAAAAATTGCAGTGTATTGTGGGAAAGAAGAAGAGGCGTGTGGTAAAGAAAAATGCCGTCTCTCCACCACACGCATTCACACTGTAGTATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3R 13684822 5' + 412 7070 2 71.23 AATTATGAGGGAATTTTTGTGTCTGATTTCGACACGGGGGAACAATCGAAGAAGCCAGAAAGCGACCGAAGAACGCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr2R 23595924 5' + blood 7021 2 75.86 GTGTGTTAATTGTCGATGGAAGGCATAACATGCCTATCATGCTCGGGAGTAGAATTATCGGTTTTATACTTACTTTTATATATTTCTTTTTATTATTGTTTTACAGGCTTAAGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATTGTA:1 + chr3L 25203540 5' - Tabor 494 1 58.90 ACATGTTGTTTTATACATTTTAATGATAAAACTGTAGTTTTGTATTATTCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr3L 12125367 5' + roo 8735 2 69.18 TAATTATTCTGAAATCTACAAACGTGAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACTTATATTTATTCAATGTCTTCTTTTGATTT:1 + chr2R 22964226 5' - 412 7473 2 79.20 AGCAGCATCTTTTCTGCTGCTGCGTTCGCTGTGGCAGAGCAAACTTTATTGCATACGCCACGGCGCAATATGAGCCCGTGGCGGAAATGGCGTTGCAAGTTAAGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 23104433 5' + jockey 23 1 75.00 CTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAG:1 - chr2L 18173675 5' + blood 7075 2 59.31 AGTTAGCCATTGGTATTGCCATTAAATCGCTGGTTGCAATCGCCTTTGCCCTGGCTGCGCTTTAAGCCCTCACAACTGGCTAATTTTTATATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATA:1 + chr3R 11186515 5' - BS 5066 1 61.94 TTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGGAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAAT:1 - chr3L 21202089 5' + G2 2653 1 63.01 AAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGGTCCGAT:1 + chr2L 21325086 5' - invader4 271 2 69.18 GTAAACGGAAATCGGAATACAAAATTAGGGGTAAAATCAAGCGAGAACTCCAACTGAATAACCATAAGAACAAATTATTATAGAGAACACATTATATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3R 17879377 5' + opus 19 2 71.92 CAAGACCTTTATCAACTGGATACATATGAATGCGCCCACGCACGAGGTGAAAGTGGGTGGAAGTTGTAGCAGAACACACAACACACAAATCAATTTGCATGCCCATAGAACTTCCACACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGC:1 + chr2R 24616563 5' + hobo 156 1 78.08 TATTCTACTGCTTTTTCTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 16996051 5' - roo 9015 2 62.24 GCTGTGGATGTGTAGTTTGGGACTGAACTATAGCGGTTGACTACTCCTTAATACTGCTCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr2R 25083381 5' + pogo 63 1 59.59 AAAAGAAATTACATTTTATAGACTGTAGTGTGCACAATTGTCATATAAACATTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 - chr2L 5818955 5' - I-element 5286 1 65.07 AAAATTAAACATAAATCTTTTCAGTCAGCCATGCCACTCTGGGGACCCTTCAGCCGTGTGAATGTGTGCGTTAGTATCTCTGCACGTACATGTACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACC:1 - chr2L 7148694 5' - HMS-Beagle2 7166 2 61.64 AAAAGAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2L 20044544 5' - roo 9011 2 60.96 AGGATCGACAATGTCCCAGAATCGCTTGGCATACTTTTATCCGTGGTTTCAGGTGCATTTTGTGAAATGTTTAGCCTCCTTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3R 10708205 5' + Transpac 37 2 60.00 CTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr3R 20345569 5' + blood 33 2 61.64 ATTACATGATAATTATAAACCNATAATGTATTTATTGGCTAACCAAAGAAGGAGTTTATTCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2L 18738054 5' - roo 9012 2 59.59 CCCGCGTAAGTAGATAAATGTACTCCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 17871845 5' - roo 343 2 65.75 AATACGACCGGCTATAGTAATGCTCTACCAAAAGGGTCAGCAACTGAATCCATTCTTTATATTAGATATGATACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 17871953 5' + roo 50 2 53.42 GTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chr3L 13888910 5' + 412 75 2 67.81 CCGACGATAAGGGGGGTGCTATATAGGGGCAGGGGATGGGGGATATAGCCAGCGTGTACATGTGAAGTTTCTTTTCGATTTTCACACCAAATACACAATGAAAACCGAAGAGCTGACTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTG:1 + chr3L 15258822 5' - F-element 4507 1 64.54 ATAACGAGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chr2L 13468314 5' - roo 337 2 71.72 ATATACTGTTATTTTAACCACATCCTTTGGCAATCCCCTATTTTTGTATATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr2L 20819235 5' - copia 5085 2 66.44 GTACTGTACATAAAAGTTAGGTAAAGCACTTGGATATTTAGCGTTAAGTAGATAACAATAAACCAATCAGCTGTAAAAACTATTTAACACAATTAATACGTGTGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 - chr2L 3175242 5' - Burdock 6372 2 71.23 GTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr3R 8381680 5' + Tirant 8125 2 69.77 GCGTGCGGAGCTGCCTGCTTTTCCCGGAAAATCGGGAATAGTCATGCATTCACACACACAGCCGCATTAATTTAGCATAATATGCATGTTCATACATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr3L 22435067 5' + opus 23 2 65.07 AGCTGAAGATGACTTATGGGGTATCTTTGACAGGATATATATAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAA:1 + chrX 4135169 5' + pogo 480 1 71.23 ATTAGTTTTTATATTCTTGTATTTTAACGAGGAGGAGGCCGATCGGCGGCGATATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACTATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 30788305 5' - roo 9010 2 63.01 AGGGGAGTAAATCGGTTTCAGAAACATTCAATAAATAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2R 12379637 5' + pogo 28 1 64.38 ACAACGCACAAAGACGGTTAGCCCGAAGACGCTATGCCACACAATTGCATTCGCCGCTGCTTCAGTTTCTGTTGCAGTTGCATGTGCAATTGTGTTTGCTCGCTGGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr2L 8839110 5' - jockey 4966 1 73.24 AAATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAAGC:1 + chr2L 23020627 5' - Transib5 2943 1 50.68 CTGAACTCCCAACCATGCGCTCAGATTGTGGTATTCCTGGTCCTATGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 - chr3L 21292587 5' - 412 7467 2 69.86 AAACGAAGCCAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chrX 7042644 5' + roo 8744 2 73.97 ATGGAAACCAGTGTCATGGAGATGACCAGCATAGCCACAGAGGAGGTGACAACGCAACTGGGAAAAAAAGGTCGAAACCTATTCCTCCTCGGGCTACTCATTTAATTCCTCCCCTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - 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roo 153 2 64.38 GTTAAATAGTCAGCACAAAAGTATGCTAAAATATATTACAAAGTTGCAGGATATCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTATTTAAACTATATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 + chrX 13401466 5' + flea 28 2 42.47 ATATTTTAGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATGTTACAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 23431783 5' + roo 62 2 62.33 AATGTTTTCTATAATTGAAGTGTGAAAATGGGTTACAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr2L 3133653 5' + Doc 23 1 63.01 GGGTCGTCTAGTGGGCGTGGCTCTTGCGCTCAACAAAAACGAATATATGTATATACATATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1 - chr3L 13186541 5' + Quasimodo 35 2 62.88 GTAATCGCACAAAATTTATCATCGAAGTTCAATTAAAATGTAATTGTACAATTTGTAACAGAGCAAGGACTATAAAAACACGATTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1 - chr3L 16629514 5' - Tabor 418 2 56.85 AGGACGGCTAGGGTCAGGGATAGGGTGCCAGTGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAGTAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr4 906080 5' - opus 7483 2 68.55 GGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 - chr2L 11725024 5' + F-element 88 1 77.40 CTAATTCGGAAACAAATCTTTGTAATTGCATTGTGAATATGTATTGTGAAAATATAATTATGTAAAAAGCATTGTAATATATTTTGTAATATTTTGTAATCCATAAATTGTTACAAATCATAAAAATAAAAAAAATAAACAAAAAA:1 - chr2R 10927254 5' + BS 5102 5 62.33 GGGCACATACATATGTTGCTCGTTGTGGGGAACTGGTGGATTGGGGACTGTATGTTCAATTGGGTAGCCTATGGCTTATGACGACTGACAGGCGGGGTTTTCTTCTCCCTTTTTTTTTT:1 - chr3L 7825085 5' - Doc2-element 233 1 75.63 GTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr2L 18737947 5' + roo 8720 2 58.22 CTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 + chr2L 16554599 5' + blood 64 2 61.64 CAATTCTAAAAAATGTTTCAAATTATTTATAGATAATTGTTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGG:1 + chr3R 8867001 5' - Max-element 8393 2 43.17 ATGGCTACGAGGGCCACCGAAAGTGCGTAGTCTCTAGGCCACGCCGCACTTAGATGTCGTGGCGCAGATACAATTTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3L 21913310 5' - 297 360 2 62.76 AATCGCTGGCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGTTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr3L 13888987 5' - 412 7516 2 52.38 AAGTATTCAACAAATTGAATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr3L 15035235 5' + pogo 45 1 56.16 ACAACAAAAGAATCAAACAAAACAGCGAAAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGNAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr2L 3908525 5' + jockey 4710 1 50.76 TCAATAAAATGTTGTTTATTGTTTAGCCCCTTATTTGCAGTCAAAGTCACCGCATTTAAGTAGTTAATAAGACTAAGGCCCCTGTACTTAAATTACGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAA:1 - chr4 637814 5' - roo 92 2 56.55 AGAAGACGCCAATAAAGTCGTACGTCAGTCCGAAGGAGAGTGTCCGGAAAAAAGGAAAATGCTGCAAGTTGCAACAGACGTGCCATGAACAGCAACGCTTCTACTTCGGCCTTGCATTCATTTGTTGTCAT:1 - chr2R 9808671 5' - Chouto 5942 1 67.94 ATTAAGCAAAAAATAAACTCATTTTGCTAGCTGCAGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTT:1 - chr2R 9619653 5' + G2 2994 1 73.08 CAAGCATTTCTTGTTTGTAATGTGNATTTGAAAATCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTATTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATA:1 + chr3R 4190917 5' + pogo 84 1 76.71 GAGAAACCCTTGTGATGCCAAGTCGACTTAGAACCCAAACCAATATTACATTCAGTTACACAGTCCCGGTGTGTTTATCAGTTTTCTGCTTAAAAACCGCATATTCTTAATTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAG:1 + chr3L 567061 5' - Stalker2 7493 6 67.83 CTCTGGAATTGACCTGCCCCCCTCGCCCACTGGCTGCCTACGGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 - chr3R 15047440 5' + F-element 22 1 67.74 CTACATAACTAGAAGAAAGAAATCCGCTGGATTTCTATAATATAATTGTTTATAATTTTTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGT:1 - chr2L 9062359 5' - Juan 4148 1 63.01 CAGTTTTCTTACATTTGAGAGATTATTTTGTCGTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTANGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAC:1 - chr2R 18551762 5' + I-element 88 1 75.34 TTACAGACTACTTCTCCCAGGGACTCTGAGAATCTTAAAATCAAGGTTCCAGAAAAGCGGAAAACAGACGATAATGATCAGATAAAAAGGAAAATGCGCATATAGTACATATGCATATAAATATACATACATACATATTACATATA:1 - chr2L 10466435 5' - Dm88 12 2 59.59 GGCGAGGGAAAACCGAAGGATAGCAAAGTGGAAACTCAGAGAGAGAAAGAGAGATGCCCTAGAATTGGAAAAGAAATCCAGCTATGCTACTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr2L 5789589 5' + FB 33 1 60.96 TGTCAATAATTTACGTTCTTTGTTAAGTTTATAATCTAAATAAATGCATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATAAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 - chr3R 22435588 5' + roo 8734 2 66.44 GAATCTAAATTAAAGTTATAGGTTACATAGTGGACATGTTAAAATAAATAAAACCTTACTGTGTTACAGGACAATAGCTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTCGACGCTTGTCTTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTG:1 - chr3R 25986694 5' - HMS-Beagle2 6828 1 52.05 GAAATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAAG:1 + chr2L 23020626 5' - Transib5 2944 1 51.37 GAAGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACACAATCGGT:1 + chrX 16490432 5' + F-element 45 1 54.79 TGGGCGTTTTGGAATGACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTGGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGC:1 - chrX 22689462 5' + mariner2 48 1 63.70 TTGGTATACATATCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3R 9551028 5' - P-element 2861 1 67.81 AAGGGTACAAATATTTCTTCAATCACCTCTTCAATATAAATTTCTTAGTTGGTAAAAGTGTTTTTTTTTCTGTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2R 22761119 5' + 412 7073 2 71.23 CATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAG:1 - chrY 2720340 5' + gypsy 7036 2 58.27 CGTTCTCTGAGAGACTTCCAGTCGAGAGCGAAACCAAAACTTATGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGT:1 - chr3L 739235 5' + P-element 78 1 32.19 CTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGTATCTTAAAGTAA:1 - chr3L 20168266 5' - roo 317 2 75.34 CTACAATGTAATCAACAAGGTTAAGGTTACGAAATATGTACATATGTCCATATTTTTATCGCATTCTTCGCACAAACGGAAATGTAAACACTGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 + chrX 19163224 5' + Burdock 6161 2 67.12 AATTTCTCCAATCCCAAGCGGACAGCTCGACCGCCGGACGTGGACCAAAATACGGACACGAGTTCATTTAAAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr2R 21619477 5' + blood 7025 2 76.03 CGTTAAAGTTGCTGCAAATAACGAGAAGTCATCTGAAATTGTTATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:1 - chr3L 9659506 5' - mdg1 344 2 71.23 GGAACATTTTCCCCGTCTAGCAATAAATCTTCTGAGTGCTGCTAAAAATGCGTCTGATTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCAC:1 - chr3R 19447392 5' + Idefix 214 2 60.96 CTGATTTGCAATTTCTACACCAACTTTCCACCAGCTGAACATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 + chr2L 3059363 5' - P-element 2812 1 33.33 GAAGGATCAACCATTTTGAAACCGCGCTTAAAGCCAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAGGCT:1 + chr3R 17777524 5' + jockey 4702 1 69.67 AGAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCC:1 + chr2L 21325084 5' - invader4 3033 2 71.03 ATTAATAGCAGTTTGTGGATGGAGTCCACAGAGGAAGTATTGCCAGGCGATGAAGTGTTGATCCCGGAGAAGTCACGTATAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTA:1 - chr3R 9088122 5' - R1A1-element 251 1 69.57 GATTCCTTGAAGCGTAAACTGAAACAATGCTAAGTGATCTGTTAATTATCACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 22435504 5' - roo 9003 2 63.01 ACTCCCGAAGTGGTGTTTATATAACGATCTTAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAG:1 - chr3L 1477436 5' - mdg3 155 2 78.62 AAGTTTGGATGTGGAAAAGTGCAATATAGTGTGTAATATAGTATAGCCATTATTTAGTTCCCATTAATATTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chrX 5721938 5' - pogo 2053 1 53.42 ATTGAGGCAGTCAGTGCGGTCTACATTTATAGCAAGCTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTT:1 + chr3R 29283162 5' - hopper2 1567 2 58.22 CAATTAGTACAGTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:2 - chr2L 20508390 5' + pogo 67 1 70.55 ATTTGAATGGGTCATTAAAGCAGGCATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 17602513 5' + Doc 55 1 50.68 AGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 + chr2R 9091847 5' - 1360 3316 1 71.43 ACATAATAAGATAGCAATTATTTATCAAATCTGGCAGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 16219327 5' - roo 9045 1 67.12 GCCTATTTCTTATGCACGAACAACTGGCATTGCGTAGGTGTACTATGTGTACATACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCTCTGTTGAGC:1 + chr3L 8158002 5' + flea 4792 2 53.33 CACACGCCGGCCCCAAAGCACTCACACAAATGCACTCTCACTCAGTTGCAGCAGCTCGCTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTT:1 + chr3L 1586433 5' + blood 169 2 78.82 AAAGTGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATGCCTTCTGCATACATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGCCTTATGTATGAGCGT:1 - chrY 3648888 5' - Stalker2 154 6 68.28 GTGAGATTAAGTGTGAAGCCGAGAATGGGTAGTATAAATGTGGAAGCCGGGAGCATTTATACGCTTATACTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGA:1 - chr3R 12874212 5' - R1A1-element 5049 1 52.41 AGTTTAGCATGAGCCATTTGAATTGGAATTGACGATGACATTTATGACATCCCGAGATCACTGGGGTTGGAACAGCCCGTCGAACTACTCGTATAGACCTCATGCTATCTACTGCCTTTGAGGCAATAAACACACACTCCAGCCG:1 - chr2L 1191009 5' + BS3 1464 1 63.45 GTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACAC:1 - chrX 13367465 5' + HMS-Beagle 75 2 69.18 AAATGTTTCGTGCTTCATCGAGTTTGCCATTATAAATTATTTACTTTAAATGTNCNCAAGCTGAGACGACCATCCATTCTATTCGGCTTCATAGGAGTGAGTATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 - chr2L 3408881 5' + opus 15 2 70.55 AGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGGCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTT:1 - chr2L 16884680 5' - Bari1 1616 1 78.77 ATTTGTTGCATATCGCATTGCGCATACGCCCTGTACATCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAGGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAATTATTATCACTAG:1 - chr3R 6604658 5' - gypsy 337 2 70.40 AGTGTTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAGAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2L 8930572 5' + roo 8727 2 61.64 CACACACACCGTCAGGGAAATTGGAATTGGAATTGAAATTGGTTTTTATTGGTCCCATTTTCGGGGTGATTGCAGCGCACCTTGCCGTCTGATCGTCTGAAAACGTTTATGACCTCTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTC:1 + chrX 4469477 5' - roo 400 1 72.60 TACTCACGCGAGTTTGTGTTAGCGATCTCGTTGATTTCATTGGGATCCAACCAGACCTTCTTCTTGCCGCATAGAGTGGGCCTGGCAGTATGTCTGTAGAATCTGTATGCTAATCTCAAACTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGAT:1 + chr2R 24969111 5' - INE-1 151 1 51.37 AGAACCTCCCGCCATCCACCCTGCTTCTCCATACATATATCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chrX 17495696 5' + Burdock 6189 2 60.27 CTAATCTTGTCAACACATTTTGATGCTGTATGCATCATTTGATGTATCAATGCATTTATCGCCTTTTAATTTTTCAAATGGTTTTCTTTGGATGTTAAAGTTGTAAATATAATATTTTACAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 + chr3L 15389472 5' + I-element 3 1 81.51 CTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATA:1 - chrX 21994020 5' + McClintock 5975 2 66.67 CATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGGACGAATGGAAAACGAACTCCATAGGGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 + chrX 21227114 5' + Tabor 28 2 49.52 TCTTTTTTGTTTAATGAAAATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAA:1 - chr3R 7042110 5' + Stalker2 29 2 65.52 ATTGGTGGCCGCCACCATATCGTGTCTACGAAAAATGAAGTCATCGAATCCTTGGCAATGAAAATATAGGCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2L 3911943 5' + roo 8716 2 56.85 CCAAAAAATGTTGCAGGTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGGGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3R 8381664 5' + Tirant 13 2 74.29 ACGTGCACATCGGAGTTGTGCACCGAAAAAAATAATAACTATAATAATTATTATTTACAAAATGTCACATGGAAGTAAAATATGTGAATCTAGATAAATTATTAGTTAATTTAAAATGACCTAATTTAACTCACAAGTTAATTGTT:1 + chr3L 10242327 5' - copia 304 1 29.45 GTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 - chrX 17495834 5' - Burdock 6358 2 63.01 GGGGAGGCGATATTTTCCTTTATCATCACATAAATTCCATTTCAGCCTGATAAAGAGTGATGACGAAGGGGAGGGGCAGAAATGGCGAGCGAGCGGCGTAAGGCGACATGGGCGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTATGTACA:1 - chr3L 22423279 5' + roo 133 2 68.06 AGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - 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roo 344 2 65.07 AACAAACCAGACATCGTAAAGCCGTAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1 + chr3R 21843752 5' + blood 63 2 60.56 ATAAATTTGTTTTTATAGTCTGCGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGC:1 - chr3L 21202098 5' + G2 2634 1 55.15 CGGGTGTCTGGAGTCCACCAGAGCCACATCGTCCCGATGCCAACGGACGTAGCGGAAGGGAGCTGGGTATGTGAGGTAATAAATTTGATGAACTTATGTGTTTTATTTTTACACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAG:1 - chr2R 22380892 5' + G2 2881 1 76.03 AAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCT:1 - chr2L 3908490 5' + jockey 4759 1 78.08 AAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGGTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTGTGACCATATAAGTTATTGCCTTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1 - chr3R 17766835 5' + HMS-Beagle2 21 2 59.17 CGCTGGCTTGGAAAATTCACACTGAAATATGTAGAATATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chrX 3453128 5' + roo 56 2 78.99 ATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3L 12125288 5' - roo 8999 2 69.86 AATGAAGTCAAGGGTATATCTATATATACTATACAAACAAGCAAAATATTATGGTGCATACATGTATAATAAAAAATCCCAAAAATATTTCCTAAAAATACAAATATTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACAT:1 + chr3L 11282422 5' + R1A1-element 5230 1 45.89 ACGAAAAGCATCGCGACCCTGATTATGTTGTTGAACTGTAACGTCACTCACTCGTTAGACTGAGTAATGTTTGCACTCCCTTTGGCCATAAGTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3L 20868168 5' - hobo 2928 1 76.71 AAAATATGGCAGTTGCCGAAATAAAATCAACGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGGTAAGTTCAGACTATTAATATTAATTATTTCGTCACCGATGCGTACGGTTTCTCGCAGATGA:1 - chr3R 13898281 5' - 3S18 252 2 68.49 ACGCGGATGAGGGTAAATATCAATATAACATTTATTAAATAATGTTTAAATAGTTTCAAGATAGTGCAATTATGCTGTTAGACGATAGTGCGAATGCTTAAGCAAGGAATGTTTAAATTAGGCAACGGATGTTTAGTCTACCAGTG:1 + chr3R 25075112 5' - Idefix 6995 2 57.53 ATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1 - chrY 2720330 5' + gypsy 45 2 61.60 ACACAATAAACTCTAAGAGAAAAGTCTTANTTCAAAAAGGTGGTTTTTTTTACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTNTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTG:1 - chr2R 3104513 5' - Gypsy6A_LTR 383 1 60.27 ACATAATCAATTTTGTTTTAGATGAAATTGTAAAAACGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATAT:1 - chr2R 18044107 5' + jockey 4557 1 79.31 AACTTTAGCAAATTGCCATTTTGGCATTTAGCTGCAGCAGGCGGAGACGGCACCCCGCCGCCAGTTTTCTTACATTTGAGAGATTATTTTGTCGTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr2R 18551823 5' + I-element 27 1 67.81 GCAGAGTAGAGCACATTTTTAGCTCACAGTGCCCTCGTATTTATTGTCGGCATTCTATTTTTAGATGTCTTAGGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGATAGAGTGCAATTTTGGCCGTCAGCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACC:1 + chrX 7705656 5' + 1360 3347 1 65.07 TGGGTAACCAGAGTAGGAGCAGTTCTGCTCCTACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTA:2 - chr2R 5542302 5' - Quasimodo 7284 2 80.14 GAATGTAATAAATAAAATACATATATTAATCAAAACATTTTATGTTTCTTGAAACACTTAAGTGGAATCTTAAAAACCGTTTCAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATAT:1 + chr2R 11708755 5' - pogo 1941 1 56.85 ACGAATGGACAACCCGCTGCACAAAGGCAAAAAGAAAACGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGG:1 + chr2L 17353011 5' - 297 6908 2 73.13 ATAGCGAAATCTCGTTCTCATTTTCAATTCGGAGGGTGGGCTAAGTTTTCAATGCCCCCCATCTCGGCGATTTTTCACTCCCATTTTCCTGCTGCCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCT:1 - chr3L 4615802 5' + F-element 360 1 67.41 AATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTCGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTT:1 + chr3R 11757993 5' - invader4 236 2 76.71 TTTAGAGTCCTTCGATTTAAAAAAAAAATACACACATACAATATGTGCTGAAAGTCGGAATCATTCAATTTATTTCCACACATTTCGCCCTACTTTCCGTGCAGCAGCGAAACACGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 31419485 5' + pogo 4 1 78.77 GCCATATTTTATGTTATTATTTTACAAATAGCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3R 10433329 5' + 412 33 2 63.01 CGGAACTCATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2L 18173711 5' + blood 29 2 65.07 CACTTGGGATTATAGCAGCCGGACACTCTTGTCCATCTGGGCAAAAAAAGGTAACGGTTCTTATCAGGACCTCTTTCTTATCCTCAAAGAGAGAGGAAATCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCCTT:1 + chr2R 4747877 5' + Cr1a 186 1 71.23 ATAAATGTATCAACTAATGCATATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chrX 20940699 5' + hobo 46 1 62.33 GTCTGGACATTTTGCAGCCACAGTTTGCGGAGCAGGCATAAATAGATTTATTGAAATTTATATGTGCGGCACGTATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACTAGAAAACGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAAT:1 - chr2R 8763945 5' - 1360 3185 1 56.16 GCAGCGGTGGAAAAACGCCAAACATGTGCACCCGCTTACATTTGATTTTGATTTTTGTGCCCCGCGTAAGTAGATAAATGTACTCCTATTTTGGATCGGAGGCAATAATTGCTCTGGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3R 24011104 5' - roo 404 1 61.64 GTCGTCAAAAATTGAAAAAATAAAATATAATACACAACTACAACGGCAGCCGATTCTGTGCACACAGACACACACACACACGTGCGGGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 + chrX 1599336 5' - hopper 1383 1 62.33 TAGGGAACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGGTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3R 12115226 5' + 1360 23 1 65.07 CATTGTTGACATCGCGCCATTCGCGGAAAATCGGTCTGATCAAACCCATGGTTAACCACTGGATGGGAATGCGAAAACCACAAGATTCTTTTGTATCTTTTGCTTTTTATATTTATACTCTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAA:1 - chr2L 13467706 5' - roo 463 2 56.16 ATTTCGCAAATTAACAAAGACGGAAAAACACAGCAACAGGAAAATCCATAGGAAAACTGCAATATCGAACGCCACTTTCTCAGGACAGAGCAAAGGTCATTGACATTGCTTTTTTTTTGCTTGAAGAACCCGAATTTTATTCAGGT:1 + chr3L 491271 5' - jockey2 2944 1 73.29 AAGTCGCGCGAAAGTAGCGATGGACAGCGACAGCTATAAATACTTTATGGGCCGGCCAGTCGGTTTGGATGGTACCCTACCTCGGGGTCTTTGGAGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAA:1 - chr2R 7622346 5' + P-element 129 1 68.49 ATGTAAATCGGTAGCCAAAACAAATGTTAAACACGATACCCAGTCAGCTTTTCAGTCCATTCCTCGATATTCTGTTTACTTTGCTGAGCTTTCAATATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 - chr2L 3949001 5' + Stalker2 7298 2 65.07 CTTTGCTTTGGAAACATTTAATGGTAAAACGGTTGTACTCATATTTCGTAAAACTAAAAGGAAAAACAAAGAATATGTGAAGATATGCATACCCGTTGGCCTGCTGACGGGTCCCGAAAACACGAGAGCCGAGC:1 + chr2L 16127820 5' - opus 45 4 38.06 AAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 + chr2L 7774986 5' + I-element 55 1 81.55 TCTCAATTGACTGATTATGATTTTCTTGTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGC:1 + chr2R 15698087 5' + opus 69 4 77.60 TTTGGCCAGGCTGGGATTTCGCTGTTACGGCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1 + chr3L 20934142 5' + Max-element 8276 2 55.26 ATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2 + chr4 868655 5' + roo 8744 2 75.34 ATTTACGTAAAAGATTCAGTGTTAGTGTGTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTAATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTTCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 + chr2R 16160704 5' + mdg3 24 2 66.90 AACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACNGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 16200746 5' - roo 334 2 67.12 GGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 + chr2L 23068835 5' - 1360 3334 1 60.27 GCTTGCCCATTTACCAGATAGATTCCACTTATGTATTATTTATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACAATG:1 + chrX 20266124 5' - BS 5071 1 47.26 ATTAATGCCGTGGCAAACAAACAAAGAAAGTCCCAACGAATTATAAACACATTTTTAGCTTCGAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTG:1 + chr2R 18035062 5' - R1A1-element 5318 1 70.55 AGTCTACTTCGAAAACCGCCCACCCACCATCTAGTAACTCGTATCACTCGTATCGTGATCACTAGCATTGCTCTAGCCAAGTCGATTTGGCCGGACGGACGGACATGTCCCGATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAC:1 - chr2R 6039209 5' + INE-1 145 1 56.43 GAAGGAGTTATCCTTTAAAGTGGATTCAAATGAGCACTTCAAGACTGAGATTTGAGACCATTAACTAAGTCCTCACATGAGTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGT:1 - chr3L 12634244 5' + BS 5044 1 54.41 TTAGTCACTTCATTAACATGGCAAGCAGTCGCTGAATGAAGAGATAAATGCAGCGAGCAGCCCAGGAACGTGCCAAAAATTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr2R 19015944 5' - roo 9037 1 60.00 GGCAGAGAGAAAGAAGGCAGTTCGAAACGGGACAGTGAAGGGATGGTGCCTTTGAAGGTTGCTCTTGGAATGCAGAAAGTACAATGCATGCAATTTCGCTTCACAAATG:1 - chrX 22564590 5' - Transib5 170 1 52.29 CAAGGCTGAGACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 + chr2R 13695622 5' - blood 7330 1 60.27 GATGACCCGACATTGAGCTGATATGTGACATCCCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chrX 140112 5' + blood 7042 2 61.48 TAGAGCTCTCGTCTTTCACCCGACACTGGGAGCCCACAAGGAGGAGCGCTTCATATGCGCACATTCGTATGCGGAGGCATTTTATTCTGTCCAAAGGGCCCCCACTTAGAGTGTAAGTCGTGCGTACACGCGCATGTTTTATTATT:1 + chr3R 27578575 5' - Q-element 549 2 58.22 ATTTACTTGAATCTCCAGTACTTTTTCGCTTCCCCATTTTTTGTTGCTCTTTGCTCGGGCTTATTTGCTTAATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGACGACTCTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 16995436 5' - roo 393 1 70.55 AAACAGTAAAACCCACAAATGGAACATAAAGTCCTATAGTTTATGCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - 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chr3L 6079709 5' + Quasimodo 6938 2 76.03 CCGGTCCGCTAATTGCATAATCAATTAACACATTTGATACTTTAATTATACACAACCATCGGCAGCAGGAGCAGCATGAGCAGCAGAGCAGTAACATTGCCTGTAATTAAACCTGGCCGAAAAGTTGCATTGAACCCAAGACTGCA:1 + chr3R 20445385 5' + Bari2 437 1 69.18 GTAATAAAATGTTACACAGTTTAATGGTTATGATTAAAACGGGGATTTTCTTTAGTTTTATTATTGCGTTTTATTAGCAGATATCAATTTAATTCAATACAAGAGAGAAGGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTT:1 + chr4 165223 5' - INE-1 553 1 77.40 AGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3R 21679666 5' - roo 333 2 67.81 AGAGCTTATCTGCCACACTCGCGTGAAGTGTCATGCAAATCTGAGTTATTTAGATAAGCGAAGAGCAAATATGTACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chrX 19187406 5' - Transpac 269 2 55.48 ACCAAAGAGCAGGGCCACTTCACCTCGTAGGTGAAAGCGAAGCACTCGAGGCCGCTAAGATCGAGGCGAGGCTGTGCCTGCCAGTTCTCCTCCTTCTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTG:1 + chrX 19563160 5' - 1360 453 1 72.34 ACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCATCGTCCACCCGA:1 - 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accord2 7233 1 63.70 GCTAGTACATGTGTTGTGTTGCACCCTAATTCCAGTTGTAAACATGCGCCCATACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 + chr3R 31031971 5' - hopper2 1542 1 61.64 AATGCACGTTAATTAACCTCTTTTTCATGTTGTGCTCGGGTTTTTCTTTGGCCAGGCTGGGATTTCGCTGTTACGGCCTGTTGCCTGCCGGCTCTTAAACGTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAG:1 + chr3L 20934096 5' + Max-element 16 2 80.74 CCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCACATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 7042735 5' - roo 356 2 52.74 GTGGTGGGGTAGAGGAAGCGGAATTCGGACAGGGACCGGAATAAAGTGGCGTGCGCTTTACTTTATGGGGCTCATAACCACGTATATATAGGTATAGTCGGGGCTCCATCCTAAGTCTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAA:1 - chr3L 17776176 5' - G4 3532 1 69.86 TTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr3R 13529995 5' + jockey 67 1 59.59 TATTTGTATTCAATTCTTTGTTGAGCATTTCTTTGTGCGCCATACTTATATTAATATGTGACTTGATGCATCTGTTAATAAGAGATTTGATCTTACATTTTTTTATTCTTTAACTAGCGCTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 - chr2L 7448022 5' + jockey 4670 1 73.29 CATTTCACTTTCACAACTTGCCAACTGGCAGAGCAAGCAGATAGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 - chrX 7993182 5' - opus 464 2 62.33 ATGGCAAAATCAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chrX 20940721 5' + hobo 66 1 63.19 ACAATTCACCTTAGCACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr2R 16731302 5' + Tirant 12 2 69.81 GCCGCGCTCGGTATCCTCCAGTTTGTCCACCATCACCAGTTGCGGATAGAAGATGCGCTCGCAAATGAACTGGGCGATGCGGTCGCCATGCTTCACCTCAAAATAAAGGATGTATATACATATATACTTGCTCAGGATCAATAGC:1 - chr2L 11011869 5' + INE-1 86 1 67.59 CTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGC:1 + chr3R 9550916 5' + P-element 82 1 29.45 AAACAAATTCAGCGCAGTCCGTAGGCGTAAGTGCATGATCTTTGTCAGCTTCTTCTGCTTGCCTATATGATTCCATCTGAAAATTCGTAGAGTCTAAATCATTGTAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAAC:1 - chr3R 17675646 5' - FB 58 1 78.77 AGCGAAACGAAAATAAGGGAAGGAGAAACAACATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3R 11758457 5' - P-element 2857 1 64.38 CCACCCCTCCCTCCTTTGGCCATTCAGGCAATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGACTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chrX 17726339 5' - pogo 2082 1 55.70 CCAGGGCCTCCAGATTCCGACGCTCTATCCACTCGCCCAGATCCACTGCATCGGTCACATTGCCGCAGGCATTCCGCAGCGGGCACAGCTTGTGATCGTGGGCAATGGAGCATCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTT:1 + chrX 10611385 5' + Ivk 4935 1 73.97 AAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTAATGTTATTACTTGCAGATGATATGAGAATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACA:1 - chr2L 16884771 5' - Bari1 1695 1 54.79 CATTTTCCCATTGTGGCTGTTGCTCCTGTTGTTGCTCCTGCCTTGGATGGCTGACACACATACACAAATACCCGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATT:1 + chr3R 8065188 5' + 297 21 2 69.17 AAGTAAATATACCATTTCGGCCACATGGGTACAACTATCGCATCACGTATACGCACTGTGCACCCGTGTACACATGCACAGTTGAGGCCATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGC:1 - chr2L 6901189 5' - I-element 5122 1 60.27 AAATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr3L 10814641 5' + micropia 20 2 71.23 TCCTGAGCGTGCATATTTATATATTCGCGGGAAACTAAAATCAACAGCATTTCTTTGGCCATACCCGCTTGACTGGACTGGGCAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chrX 21639371 5' + 412 7092 2 58.90 AGTGTTAGTGTGTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAGTATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr2R 16160721 5' + mdg3 42 2 56.16 CTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chrX 7042709 5' - roo 8994 2 70.55 GATAGGGTGCCAGTGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 + chr4 906098 5' - opus 7446 2 59.44 AACGACTTTAACTACATTTTTTTCCAGTGCACGACGAATGGACATTCACTGGCTCTCGGCATGACGTCAACAAACTCATTTTCTGGGTCACTCTCCGACACGGACAATAGGCGCTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGG:1 + chr2L 7513063 5' - G-element 339 1 75.54 GCCATTTACGCCACTAATTTCGATGAATTTTCGCTGATATATAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCT:1 - chr3R 17879510 5' - opus 7433 2 73.94 CTCAGCCTGTGTCAATAAGATATATCATCGATTCCTGCGTCCTTTTGCATTGTCTTGGCTTTAGCCACAAAAATGGGATATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCA:1 - chrX 454040 5' - copia 4790 1 54.79 AAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr3R 24093513 5' + jockey 84 1 69.18 ATGACATTGTCTCCGCCAGATTCTGGCCTTATTTTGTCGTCATAAGCTGAATATTCGACTAGAGGTTACTTATTATTTATATTACTGAAACTAGGATATAAACCAATGTATACACAGTGATTTTGTTAATTGTTTAACTTAGTTTA:1 - chr2L 8760282 5' - HeT-A 9 1 74.66 CTCATCAACGGAGAAAAATAAATAACAAATAAATTCGGATTTCTCTTTTAAATAAATCTTTTGAAGTGTCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 20168146 5' + roo 8674 2 78.47 CGAGGCTTTCATATGGACAGAAATGCATATATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chrX 22511305 5' + 1360 16 1 59.59 TTCGTAATTGAGTCGGATGGAAATCTGTGAAATACTTACGAAGAAACAATGAGAGCACAAAATATTAGATGAAAACCAGAATTAGTTGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 + chrX 2801941 5' - Quasimodo 235 2 59.31 ATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 + chr3L 8754758 5' + mdg3 5308 2 63.70 CACACACACCCAAACACACACACATTCACATACAAATGCAGTTGGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 9449642 5' - hobo 2921 1 55.17 GCTTTCTGCCGACACCTTAGATTAGATTGTGTTCATTTGTGGATAGAGCTCCGACATGAGCGGACTGAATTGTGAAACTAAACATAAGGGTCCATATGCAATAGAGAAGGTATTGAAAAATGATAGGTTTTTAATTAAAGATGTTG:1 - chr3R 23534779 5' + invader2 4629 1 47.95 GTCAACTTCCATCTGACATGAACCTCTTTCGACCATAACTCCAACGAAATGACTGCGCTGAACTTGTCCGAAATTCGTATAAAGTTTGGTTTAACTTAACTTATCGCACTCAAATGGCACGGAGTAAAACTTGTGTGTAAATATTT:1 - chrX 3892902 5' + Bari2 965 2 62.33 GCAAAGCGTAAGCAAGTGTCATGATAACGAAAAGTGGATTTTCCCAGAAATATTTATAAATAATTTTGATAAGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 - chr3L 11124593 5' + jockey 4720 1 54.79 ATATGGCACTATATCTTCGTTTCCCACCTATCATAACACCATGTTTTTTTTTATTCCTGTCCCTAAAATAAATTATCCAGTAATAACGCTTAGGTCAATTAATTGAAATAAGAAAAACTTGTAGGTTAAACCAAAGACACTAGAAT:1 + chrX 20493787 5' - Tc3 317 1 75.34 TGACATCTTCTAGATTCTGGTGCGCAATGTTAAGATATTGCATGGGTTCAATCCAAATGTTATATATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGA:1 + chr3R 20308148 5' - invader4 268 2 55.48 AATGCCGCATGAATGAAGTCGAAGTCGACGTCGACAGCACGAGCTCTCTCTCGCCTGGCTTTTCCTTCTATCCGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chrX 18534629 5' - P-element 2839 1 52.74 TTTTGCGGATTGACCTTTAAATTCCATCTTTTGCACCATGCAGCCAGAGTGGTGAGGTACTCTTGGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2R 25225499 5' - hobo 2919 1 62.04 AATGTGCTTGAATTACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chrX 15540052 5' - roo 336 2 69.86 CCATCAACCTGAATGGCTACGAGGGCCACCGAAAGTGCGTAGTCTCTAGGCCACGCCGCACTTAGATGTCGTGGCGCAGATACAATTTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 + chr3L 21913298 5' - 297 371 2 70.55 GCTTATCGGCGCTCGTCATTGAGGCAGTCAGTGCGGTCTACATTTATAGCAAGCTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chr3R 29283145 5' - hopper 1391 1 69.86 CATAGTGCAGTTGCCATTTTCCCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 + chr3L 18119480 5' + 1360 61 1 80.00 ATAACGCATACGCGTCAGTCAACCGCCGGCAAAAGCCGCAGAGCCAACAGTTTTGGGAGTTTCGGGAGTTACGGGTGGCACTATGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chrX 12365416 5' - hobo 2928 1 73.33 TTTTAGCACTTCAATAACTTCCGTTTCCGTTTCCCTCGTTATTAGATCTTTTCATATACGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 75441 5' - roo 9009 2 63.01 GCAGGGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGATATTTAGATTGCCTCTCATTTTCTCTCTCATGTTATAAAGAGAAAAATGATCCCGTATGCGAGAGTAATGTGCGTTTACGTGCGTTTATTGCGTTTATTTATTTAAAATCTG:1 - chr3L 25985554 5' - G6 2009 1 39.73 TCCCCAATCTTTTGTTCACACTCTGCCAAACGTCTTGGTTGTTGGATTACTGGTAAATCATCGGTTAACAGTATTTTCACCTTCACTGGTGTCGAACATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr2L 22512972 5' + Doc 31 1 67.12 AGAGAACGTTTTTAATTTGAGAAACAAATGAAAGTTTCCGAGTTTCCTTGGTTTTTATTTTATTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGG:1 + chr3R 31357005 5' - G2 2999 1 63.01 AAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTAT:1 + chr3L 20189599 5' - FB 205 1 49.32 GAACCTTTTAAAGAGCTATTACATGTTGCAGCCAAAAGATTAAACGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr2L 8895310 5' - 412 7470 2 69.18 GCACACGAGATCTTCAAAAAGAAGCGCCAATTGCAAAGTCAGTCGCACTCGAAAAAATATTGAAAAAGCAACAACCAGGTGAGGAGGGTTTTTAAATCTTGTAGGGTTCTTGGACGGTTCACATAAACACGGGATTTCAAGAAACC:1 + chr3R 10561140 5' - mariner2 608 1 57.53 CCTGTCAGCTGGGGATCTGGAACTTCCACTGGAGTTCCACTCGAGTTGTCCGTAATTACAACTCGGGACAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2L 19940006 5' - mdg1 369 2 52.74 AAAAGCCCTTATATACCATCATTTATTATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATA:1 - chr3L 19350058 5' + 1360 3212 1 63.01 AATTCAAATCCCTATATGGCTACATAGAAAAAGAGTATTTGTTTAATGCATAATTCTGTGTATTTCCTCATTTAACTCAAATGTTAAATAATATTTATTTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chrX 12105200 5' - 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roo 9047 1 70.55 TAGTTTATTTGCATTTACGTAAAAGATTCAGTGTTAGTGTGTACTAGTGCCTTTTTTTGTTATCATTTTATACTGGCCATCTGCAATATGTGCCCAATAACTAACGTACTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chr2R 16160692 5' + mdg3 5265 1 76.03 ACATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr3R 11758487 5' - P-element 2827 1 43.84 CTATATGGCCTTATTAAGCTGTTTGGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 - chr3R 25962088 5' + I-element 43 1 54.79 CTTACAAAACTCCATACGCTTTTTACAACACTGGTTCGGGAACCACCTAAACATCTTCGACCACGCCCAAGCCCCAAACTCACCCCATTCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATC:1 + chr3R 24401183 5' + HeT-A 5989 1 58.22 AGCTGAGCTGTTTTGCATTAATAGAATAAAATCAGTATATTAAGTGGAATTCATCTGCCAGTTTTGTCCGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCG:1 + chr2L 7064422 5' + hobo 2647 1 52.74 GGGGTCTCTGCTTATGGGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 - 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chr3L 22435229 5' - opus 459 2 57.53 AATGCTATTGAAAATTGAAGTCCAAACAGGCTTATAATATAAGGATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 + chrX 1208846 5' + Burdock 76 2 72.60 ATTTCGAAATTTTGGATCCCCAAAACCGCAAAATGCATAACACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGC:1 + chr3L 627850 5' + Chimpo 284 1 72.90 GGTTGATGTGCCACGTCCCCTTGTAATTCTCCACATGTGGAGGATAAGAAAAATGTAACAACAAAAACGGAAATATGGGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 + chr3R 4530665 5' - copia 5081 2 56.16 GACACATTGCGTTGCAGTACCATTTACAACCTATATTTTTAAAAGTTCGGATTGAAGTGTTCAGATAGTGTGCTGAATATTGCATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chrX 20233761 5' + pogo 36 1 60.96 TATGAATTATGGTGTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 8258222 5' + jockey 18 1 74.66 CAATATTATGTGGAGCAGTGTTGTATTCTAGACTGAGGGGAGAGTTGTAATTAATAAGCCAGTGAAGATTTGCTGCTTTAAGCTTCATATGAGTCCTCTTAGATTCTATATGGATGCTTTCGCTGCG:1 + chrX 4615233 5' - Doc2-element 4474 1 68.50 ATTTTGGTAATAACCAATTCCAAATGTGCATAGATTAGGCCCGACTTAGAGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chrX 7032758 5' - roo 337 2 64.38 AAAATAACCTAATATATGTCACTTTAAAGTATAGGGAATATATCAATTATCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAAC:1 - chr3R 4530773 5' + copia 71 2 66.44 TGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2L 19698102 5' - roo 8986 2 76.03 GAGGAACATGCATTAACTTATCAGTTATCCTCACTTTAATAACTTGTTATTGTTAACCAATCCCATATTTCATCTCCCTATGATTGCATAACAAACTCCATTATATTTGTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:2 + chr2R 18819976 5' - roo 341 2 65.75 ATTAAAATCGAATTAATACGATTTTTTCATTAGCAATGTGGTAATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 - chr2R 21199756 5' + jockey 4744 1 63.70 GGATGATGGAGGCCACACAAATCTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chrX 21227063 5' + Tabor 6857 2 73.29 TAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:1 - chr2L 16554681 5' - blood 300 2 70.55 CTGGTGCGCAATGTTAAGATATTGCATGGGTTCAATCCAAATGTTATATATGTCGGCGAGACGGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTTTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACT:1 + chr3R 20308164 5' - invader4 3011 2 66.44 ATTTTGTTTGCATTCATCAGTGCTTAAGTGTTTAAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr2L 20044615 5' + roo 8749 2 77.40 TGTTGAAAAATGTTTGTAAGAAAAATCAAAATGATGCACTTTGAATGCGCGAAAACAGCGAATGAAACAACGAAAAATGCACAATCGATTTACGGATATCCTTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTAATTTCATGTGTTCTTAGTCTG:1 + chr3R 3626385 5' - G4 3620 1 69.86 GCGCAGTCAAAGCCAATCTAAATTGAAATGGAAAATTATAAAACGAAGCCAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTACGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chrX 7042604 5' + roo 40 2 56.85 AATCGAATAAAGTAGGATTAAACTGGATTTTATATGACACGGATGTACAAATGTACAAATCTTCACGTTTAAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chr3L 11529563 5' - opus 451 2 52.05 GCGATTGAAGAGTTTTGAATTGACAATTCTGCTGAAAATAAAATCAAAAAAAAGGAAGGGATAAATATTTTATAAAATAAATACCATATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGG:2 + chr3R 24661913 5' + jockey 4544 1 52.74 TTTGGCAGTGAGAAAAACTCAGCTATTTAACTCAAGTCGATTTAAAAAGCTTTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr2R 6089042 5' - 1360 3349 1 55.00 CCAGCAACAGGTCGTTTTAATTATCGAGTATCAATTTAGATGAATTTCAAAAGATAAGCAAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTC:1 - chr2L 5341637 5' + Burdock 23 2 66.44 GTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr3L 20168287 5' - roo 338 2 62.33 GGGAAACTGTTACAGTTTCGACATGGAACCGCAATCTCTGCGGTTCGTCTGCTGTCAATTGTCTTGCGTGCGAACTATTCACAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTG:1 + chr2R 17609729 5' - mdg3 207 2 58.22 TTTTTCGAACTCACACTCTCATTCGCACTCACACTCTTCGGGTTTCGCTTCGGCTTCGTTTCCAACTCTCTCGGCGCTCTTCGGGGCCTCTGCTTATGGGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr2R 10541784 5' - P-element 2866 1 69.86 AACTAAACCAAAACAGCCTATCAAAAACATTAACTGAAAAAGTTTTTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3R 7523163 5' + 412 7127 2 68.49 TCAGTCAGTCATGCCACTCTGGGGACCCTTCAGCCGTGTGAATGTGTGCGTTAGTATCTCTGCACGTACATGTACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATT:1 - chr2L 7148674 5' - HMS-Beagle2 263 2 52.05 ACATATGTACATACGTCTTAAACATGTACATATATACTCACTCACCTTTTCGAGACATGAGTCAGTCAGTCATTTAGTCAGTTAGTCAGTTAGGCGAAAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 + chrX 10694231 5' + Transpac 4939 2 71.92 TCTAGCTCTACTAACATAAAATAATTGATTTGGCCACAGTCTTTCCCTACGTTACGTAGTTAATTGCTAAAAAACAAATTCATTCATTCATTGCAGGCCAATTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCG:1 + chr3R 2610418 5' + FB 192 1 67.12 GCATTCGGCATTCGGTCGTTTGTCGTCACTTGAGAGCTAAACGAATGCGGGTTCAGAAAAAATAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAAATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGA:1 - chr3R 19996315 5' - Quasimodo 7338 2 63.70 AAAGTGAAGAATTATTATCAACACCTTATATAGGAGAAGTTAGTGAAGTGCCGAAGATTATTCGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAATCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTG:1 + chr3R 19449602 5' + R1A1-element 5069 1 71.92 GAACAGTACTTTCGGCACTATGTTAATTCTATTTGAGCATTTTTTTGTTTTGTTTTGCACAAGTTAAAGCACAACGAAGCAAACGTCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTG:1 - chr3R 9650484 5' + hobo 316 1 58.90 GCTTGAGGGTATGCCGTAGAATTCACTTGTAGAACTTGGGGTGGAAAGGGAGCAGCTAAGAACGCTGTTAGGTTCGCCATGTTGTCGAACAGCGAGGCATGGGAGCTGGGACACAGCCTAATCATTAATATGATGAAGCGAGTCCG:1 - chrX 21171451 5' + Rt1b 4771 1 71.92 GCCATATACTTATTAAATTTAAAGTACATTATAATTTTTACATGATTAATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGCTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 - chr3R 12538148 5' - mdg1 351 2 65.07 ATGGCGACCCCCTTGATGCACTCCCAAATAGTTTCCCACCGTTCTGCGATAATCGACCTGCCTCATTTCGAAAGTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCC:1 + chr3L 20686396 5' - I-element 340 1 52.63 GCTCTGATATGTTTTTATTTTTGCATTTGTAGTATTCACTTTATCCTTAAAAAAGTGTTTGTATTGAAAGCATATCCTTCGCATTTCTATAAACACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 29384579 5' + roo 25 2 67.12 CGATGTCCTCCCCAGTCTTAGGTTATATGTACATACAGATGCATACATATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGT:1 + chrX 7993060 5' + opus 7167 4 71.32 ATATAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAA:3 - chrX 19163347 5' - Burdock 6316 2 73.97 TGCAGTAAAATAGCAGCGTTGACATTTGCATATGTATTAGTCATATTCTTTGCTCTTACAGATCAATAGGCTTTTGTATTGTATTCAATACACACACATAGGGACATTTGCAAAAATATCTCTCCCCGTTCTGAAGTTATTAATTT:1 - 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roo 387 2 70.55 GAAACCTTTGTGCAATTCAGCAAAATAATTTGCCACAGAAGCCATAGGCATCGACAAAAAGGCAAAACTCCGGCGAAAAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chrX 6615606 5' + roo 41 2 57.53 CTAATTTAAAGTATTTTTTTGAGTGTACTACTATATCTGCTGCTGGTCGCTCTTGCTTTATTATTTGTACTTCACTTGCGTTGTTTCCATTGTTGCTTTAGCCAAGTAATAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 + chr3R 11042693 5' - jockey 4909 1 75.34 GTTGACACGCTACACCAGCAACAACAAAAGCGACTAAAACAGCCCAAGTAACAACAACTTTGACGAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 23790352 5' + roo 8719 2 59.59 TAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGAGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGTTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTGGTC:1 - chr2L 21403541 5' + G5 4459 1 67.12 CTTTCATTAAAACTCCGTGAGCTACTCGGCAATAAAAGTTTTGCATTTCACTTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTGGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTCTAA:1 - chr3R 27398112 5' - roo 349 2 59.26 AAAGGTATGCAAACAATGTGTGTCCGTCTGGATTTCTGGCTGTCCGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 + chr2R 16367367 5' - hopper2 1533 1 68.49 ACAAGAAAAGCCCATGTATAAATGAAGCTTATTCGCATTCAAATGGTGTGCGTATGTATGAATGTGTATGGGCTTTTGTATGTCTACTAAGGGAGGCGAGGAAAAATATATAAATAAAAGTTGGTTCTGTTTGAAGTATTATAAAA:1 - chr2L 14074206 5' - looper1 248 1 78.77 GGGTTTCCTCTTGGGTCCTTTTCTGCTTTTCTGCTACGTGCCACCCTCTCTTCATGCCAGCTTCTTGAAAGCTTCAGAAAGGGATCTCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 - chrX 1759071 5' + Tabor 6875 2 59.59 GAACAATAATAGTTTTGTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTGGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr3L 22435250 5' - opus 7483 2 71.92 ATATGTACGAGCTCTTACAATTAATAGCAATCATTAACAGAACAGATATAATATTCTCAATTAGGTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTT:1 + chr2L 22690094 5' + copia 57 2 55.48 ACAATAACCATATCCTTACAAGCACCATCTAATCAACATCCTTTTCTTTCAGCTCGGACAATGGCAATTACATTGGATAGCATAATAAAAATATGTTCCCGTTGTTTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chr2L 6154058 5' - copia 240 1 74.66 TTTCAAAGAAATCTTCCTCTATTTACTTCTATTCATTGACGACGTTTCTTTTAAATTTTTTAGCTATAACGAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 20867972 5' + hobo 14 1 75.34 CCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 - 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roo 8988 2 80.14 AAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr2L 13697631 5' + F-element 64 1 70.30 GCAGGAGGGGCAACTTCAAATATGCATCAATAAACTCAATTAAACGTAAACGAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAAC:1 + chr2L 1451161 5' + mdg1 71 2 70.55 AGCAACAATAAAATATGACGTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3R 24093492 5' + jockey 63 1 54.79 CTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 - chr3R 15047396 5' + F-element 65 1 65.85 GCAGCCTTTGTGAGTGCGACACACACTGCAGCCACTTTTTGTGTGGCTCTGGGTCTTGCCAATGTGGCCACAATTGCTGCAGATGGATTTGCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCCCTAAGGGACTATT:1 + chr3L 5151196 5' - roo 8862 2 60.96 GCCGGCTATAAAGACGCGGACGATATGGAACAAGACATCATTGGGTTCAATACTAGCGACACAGTTATTGATCTTGATCCAGAATATATAGACTTTATATGGTNGGAAACGCTTTCTTGTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATC:1 + chr3L 22899141 5' - 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pogo 2070 1 63.12 TACCTTCCCTGAATGGGTTGCCCATTATCGGGTATGGAATTCCGAAATCTGGCCAACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATA:1 + chr2R 5037686 5' + Stalker2 67 2 60.96 TGCACGTAGTACGAGATACATGTGCTCCTACATACAAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3L 18239439 5' - roo 8985 2 76.03 CGGAGAACTCTGCGCAGCAGAAGGGGCTGTAGAGCGAGAATCACATCGTGGAGTTCGAGGACATCGAGTCGATATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATC:1 - chrX 9237337 5' + invader1 299 2 50.68 CTTATCTACATATTAATAATAAGAATAATATGTTGTTACGATTTGATTATTCTATTAAGAATGCCTTTCAACATATCGCACTCTGCTAATTGAACTGCCAGACATTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 12343134 5' - roo 9053 2 71.23 CGGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr2L 13468231 5' + roo 68 2 65.07 CCAGAGTAAGTAATCTTTTCCGGCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGT:1 + chr3L 13546542 5' - hobo 2889 1 52.05 TAACTGAGAAAAAAGCAGTAGAAATTAATATTCGAAGCAGGGTAAAGAAGTTCAAATCGAATGCCAAAGCAGTTACAAAGCAGTATAATGGTTATTTAGCCCAGACGCAAGCCAGGCGCCGGAAGTAAAGTAATGTAAAGTAAAGT:1 - chr3R 25194053 5' + TART-A 13120 1 81.51 TGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr2R 8258274 5' + jockey 71 1 59.59 GATGAGCGCGTGAGTTCTGAGACTCGTGAATTCGATAGATTATAGTTAAGATAGACCAAGACCAACACTAGATTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGG:1 + chr2L 9499740 5' + roo 477 1 51.37 GAGAGAGACCGAGGTTTGGACAACTTCGCTCTAAATACTTGTGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTGTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAG:1 - chrX 6186392 5' + Transpac 4994 2 67.81 GGATATATGTATTTAGTCAGCTGGTTTTACAAATTACAAATTCGGAGCGCAGAAGAAAAAGGCATTAGTTATCAAAATCCCTTTCCCACACAACGCATAAAGCGTAAATGACGACTATGTACCGTTTGATTATCGAAATTCCCCAG:1 + chr3L 23233587 5' - S2 265 1 57.53 TTTTAGAATCTAAGAAACGCCAAGTTCTTTTGCAAACATATTGACCCTTTAATTGTCCAAAACTCCAAATATTGTACATCTGTATTCAATGAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAAGAAATACAAAGCTATTTTTCCATGTCTCTTT:1 - 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mdg1 7308 2 54.11 GTAAGCCACAGGTTCAAGCTGAAGCTGCGTAACTGCGAAATTTCGTTTAATTATTCTGAAATCTACAAACGTGAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr2R 22964179 5' - 412 446 2 52.74 AATTGACAAAGACGTTCACTTTCCACATCTATTCGATTTGCAAAAAAGATATGCCACGTTCTTAATGTACACAGCGTGTTTAGAATTGAATTATACGATTTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr2L 21777920 5' + pogo 11 1 76.43 AAGTATTTCAATTTCAACCGTTTTCTGTATGGCTTAACCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGCGTGC:1 + chr3R 16004179 5' + jockey 91 1 71.92 TAGCAAAATTGTTAAGTAACTAAATTCGAATCCCATATATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCAGA:1 + chr3R 23579306 5' - roo 8992 2 72.60 AAAATCTTAAAGCGCTTTAAGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCT:1 - chr3R 12622390 5' + 1360 175 1 59.59 AGACAACTTTAGCCAAGCAGAATGAAGCGCCGAAGGTAAACTTTCGTCCCAGTCAAGTTTTTCTCTTCAGATTTGCTGCAGAGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - 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Doc2-element 228 1 53.49 ATATATCGATAGGTACATACTTTCACATCCCTAGCCGGTCAGCTGGTCAGTATGACCGTGTTGTGTAACTATATTCCCTACGATTTTGATCGGAATATAGTGATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3R 10708364 5' - Transpac 283 2 65.75 CATAGGCATCGACAAAAAGGCAAAACTCCGGCGAAAAGGTAGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 6615564 5' + roo 8713 2 66.96 AACTTTCTGCTTTCTATTGCAGGTTTTAAATATACATATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1 + chr3R 4361601 5' - copia 170 2 78.77 GTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 + chrX 20456850 5' + opus 46 4 56.85 CAGTAAGGAAGCGCCAGAGAATGTAACTAGTGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3R 5495259 5' - roo 8983 2 78.08 ATTCACTAAGCAAGTGAGCTGCACACAGCTCGAGTTTGGGAATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 - 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S-element 1689 1 67.12 AAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATC:1 - chr3R 5972351 5' + Doc 303 1 67.54 GAGGCTCAAGAGCAAGTGGTAACCGCCAGGATGCGGAGGGTTAAGGGCCCAGAGCTGAGGTGGCAGATGGGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTTTGCAAATTTGA:1 - chr3R 7600594 5' - hopper 1372 1 52.90 TGGTATTATATCTCATTTTCGGTTTGGCAGTGAGAAAAACTCAGCTATTTAACTCAAGTCGATTTAAAAAGCTTTCTCTTTTTGTCCAGCTTGGGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 6089020 5' - 1360 3365 1 67.81 CGTTAACTCTTAAATTTAAGACACATTAATATGATTTTTGTGCTTTCAGCTTTCTTATCATTAAATGCTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGAGCCGGTTTGTTT:1 - chr3R 19138967 5' + Bari1 287 1 52.05 TTTTAGCTATAACGAAAGAAAATTCTAACCAACTCCCTTGAATAGACACCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1 + chr3L 20868030 5' + hobo 71 1 65.07 AATGATTCTATTTTCATCGCCCGAAATGATTCGCTGTTCGCTGGTCCGCATTTTCCTCGATGTTTGTTTTGATGTGAACACGGCTAAATATATGTATTCATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - 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chr2R 17696167 5' - rover 324 2 70.55 AGTACATGCACACAGATCTAAAGCAGATTTATATGTTCTCATTAAACCTACAATGCAATTAAGCGAAACAACGATATTCACACAACAACAATCAAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGT:2 + chr2L 4981333 5' + mdg3 5185 1 65.75 AGGAAATGTATCTTTTTGGTTTAAACTGTGCTTATATGCATAAATTTATTTAAACATAAATTTAAATTTGAGTAATCATGGATGCACCAACACTGAACGCATCTGGATGCTCCACGTTTCATAGGAGCCATCCTCCAGCTTATCGA:1 + chr3L 19007221 5' - 1731 450 1 56.16 CAACAATTGTTGACGTTCAATTCGATCAGTGCTTTTATCATCTTTGTGTGAAGAGATAGACTATCTTTAAGCCAATTTCAGTTAAAAGAGTGTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 27007310 5' + roo 8693 2 63.70 GCTCTTCCGGCGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3L 19349909 5' - 1360 3356 1 58.57 AGATGAATTTCAAAAGATAAGCAAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGGTCGAGCTTTACCTAT:1 - chr2L 5341600 5' + Burdock 60 2 57.53 TACCTTCACTGCTTATACATCCTTTTGCGCCGTTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCT:1 - chr3R 17766869 5' + HMS-Beagle2 12 2 72.41 TCTTAAAGCGACGACAGCCTTGCAGTTTTCCGCAACCAATTTCAGTGAGGAGGGAGGGGGAATCGAAAGAGGGTCCTTTTGAGTTTCCCCATTCGAATGCGAGCCACAACAATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGA:1 - chr2L 955396 5' + invader4 2609 1 71.23 GTAGGTGTGAGGAGTGGAAGAGGAAGAGAAATGCAACGGATTCACAATTCACCTTAGCACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr2R 16731259 5' + Tirant 8143 2 54.17 ACCATGGGTGACACATAAATTTACAGCGTTGGCTGTTTGAAATTTTTCACATTACACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chr3R 26605542 5' + roo 62 2 66.67 AGCTGGAAACAACAAAAGAATCAAACAAAACAGCGAAAAAGCCAAGTATTTCGCTGTTGTTTTTATGCCCGAAATTGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 - chr2L 3908533 5' + jockey 4701 1 57.25 ACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTAAT:1 + chr2L 3911806 5' - roo 9039 1 63.45 GACGTCAACTTATTTTTCGAACTCACACTCTCATTCGCACTCACACTCTTCGGGTTTCGCTTCGGCTTCGTTTCCAACTCTCTCGGCGCTCTTCGGGGTCTCTGCTTATGGGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2R 10541796 5' + P-element 9 2 79.45 AACGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1 - chr2R 18044073 5' + jockey 4592 1 58.22 CTCTGCTTTTGATTCACTGAAGCTACGGGTATTGGGCAAGTCGATGAAAACGTTCGGGGATTTGTAAATTATGTCATTAATCCCACATCTTTCGTTTGCCCTGCTCTGCTCTCTGAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 - chr3R 28829223 5' + FB 9 1 78.08 CTTATTTCTCTGTGTTCTGCCATTTGCCCAAAATAACAAAGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3L 5398070 5' - roo 8990 2 73.29 CTCGAGCGATGCGATGCTGCCAAAACCCACGGCACAGTGGAACAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 - chr2R 16160824 5' - mdg3 189 2 64.80 GGACGCGCGAAGCCACTGAAGAAAAACTGACGACTGACGCGACTTTCCGCTGGTGCTCGAAAAAACGAAAGGTTCCCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr2R 10541632 5' + P-element 47 1 53.42 CTCTTGCACTCTCTCTTTCTTCCACACAGAACATGGGGCGGTTGCTGTTGTTGTGTTGTCGCCTGCCGGCCTATGTATGTATGTATGTATTCATTAATGAGACGGTGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr2R 21475166 5' - P-element 2869 1 69.86 GACTTCACCTTGAAAGCTCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3L 15035122 5' - pogo 2058 1 64.46 GACATTTATATGACAACCAAGGTTTTCTTGTGTGCAAGGTTGTTGTTTCTGTTGTTCCTGTTGCTCAAGCCCCTTGAGTATATGTGCTTTCGTTTTCGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 20702839 5' - Doc2-element 232 1 83.49 GTATGAAACAGCATTTCAGGTAATTTCTTTAAGAACTACTTGAGCGAATATGGCATGACCCTTGAAAATACCCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3L 7646344 5' + 297 6623 2 56.16 ACCAGAATCCGCAACTGCAATTATAAACCGAATATGATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1 + chrX 140016 5' - blood 293 2 78.08 TTTTTCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATC:1 + chr2R 5667269 5' - INE-1 150 1 55.48 CATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 12125281 5' - roo 9006 2 65.07 CATCCGGAGGGCGATACGCTGTGCCACAAGGCCTGGTGGTTCCACCAGTGCTGGAAAAAGGCCGATCCCAAGGTGCGACCGAAATCCTTTTAAGCTGAGACCCAAATGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAA:1 - chr3R 5972420 5' + Doc 265 1 72.41 CTTGATGCCGTCTGATAAGAACGCGCCCGGACATCTCGAGGGTTGCCCGCTCGGCATTGAGCCATCAGGATTCAGGAACGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACC:1 + chr3R 18707763 5' + jockey 4774 1 52.78 CTGATCGATCAGCTGTTGGTGGGCACCAGAGGTGACGCAGTGACTGCGGAAAGTAGTCACCGTATCTGACTTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 - chr2L 1729854 5' - Transpac 259 2 52.05 CAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGATCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTATTTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 8258295 5' + jockey 70 1 69.35 GGTCGGCGGGTCAGATTAGCAGGACATGTCGGCGGGACAATCCAGCGAGATAGGTCGGAACGCAGCGCGGGACATGGAGGGACACAGTTTCGGAGCTCTGCGTTTTGGACTGCGGAGCCACTAGCTAAGTAACGGGTATGTGATAG:1 - chr3R 17733413 5' + INE-1 547 1 73.97 CTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACA:1 + chr2R 17696052 5' + rover 7036 2 77.24 ACCTGAATGCACAACAAAGTGGGGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCGAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGC:1 + chr3L 18947285 5' + BS 4729 1 78.07 AACTTTTCGCATAGTACGTAAATTTCCGGATTTTTTGTGGCGGGACTCCGTTAATTCTGAGCATACTTTTAGGTAGCTTAGTGGCATTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - 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INE-1 94 1 55.48 GCAGAAATCGCCAAACTATAGCCAAAACAAGTAAACTTATGGAAATATCACCTTGGCAAAACGTACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGCTATGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTTTATT:1 + chr4 148358 5' - I-element 4931 1 74.66 TCATTTCAGGAAACTGATGATTGATCAAATATAGAAAATATATCTATATATCTTTCAATTTAAATATTCTGCCATTAAAACCAGCGCACTTAGTAAGCACCCTTCTATCACATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAAGTTTT:1 - chr2L 8916291 5' - Cr1a 485 1 53.42 CTGCTTTTGCCATGAATGCGGCAATAAAAAATGCATCTTTTTTTTTGTTACAAGTCAGTGAATCCATATTCGGCAGTCATGGCAAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACG:1 - chr3R 19992096 5' - pogo 106 1 50.00 CGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3R 8381713 5' + Tirant 8169 2 62.14 AAATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 15137351 5' - roo 352 2 63.78 TTTAAGATTTATCGATTTATTTTGCTTCTGAGAATTGTGCCATTGTGCGTATACGTGTTTTTTGTGTGAGTTAAGCTGTTTATAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAGTGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCT:1 + chr3R 11001986 5' - Stalker4 6910 2 60.96 CTATTATATTCGGGCTTAGAGCTTTTCCACAGTTACTAACTCATGAGTAAGTCAATTACCACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3R 15102236 5' - roo 348 2 58.22 GCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATC:1 + chr3R 5170982 5' + F-element 93 1 75.34 TTTCTATTTCAATCGTAAAATTGCCTTTCCAATTTCTCTCTGTGTTTTAGGTGAAAAACATTAATTACACACACGTATGCAAGAGGTCCAGAAGGTGTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTA:1 - chr3L 3489797 5' - blood 187 2 65.07 AGAGTTGGCCTAGTCCCACTGAAATACCTGATTTTGATTAACACCGCTATTCTCAGCCGATCGAAATGCCCTCTGCAAGCATCAGCGCACCTGGCTGGTCACCTAACTGTTGTGGAGAATTGACTGGCTAACTGGCGTATTGCAAT:1 + chr2L 16861289 5' + Doc4-element 2306 1 72.60 GCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chr3R 10433299 5' + 412 63 2 65.07 GTTAAAGTAATCAACTTGGTTTCTAGCTTGCGGTTGCTGTAAGCCACAGGTTCAAGCTGAAGCTGCGTAACTGCGAAATTTCGTTTAATTATTCTGAAATCTACAAACGTGAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr2R 22964141 5' - 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P-element 2831 1 47.26 AATGGTAAGTTCGACTTGGAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3R 15137270 5' + roo 8730 2 65.75 TTTAAAATATATAATTTTTTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAG:1 - chrX 7847246 5' - hopper 47 1 56.85 GACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:2 + chr2L 3911833 5' - roo 347 2 58.22 GTCTTCTGTTATTAACAAGTTAACAAGTTATATATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGGGGA:1 + chr2L 22092928 5' + INE-1 554 1 60.96 CGTAAAGTAATTTGCATTTCAGGCTAATGCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 12941738 5' + hobo 25 1 67.81 ATCATCAATTCCAAGTTAACTCACCTGCAATGGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTTCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chrX 10284826 5' - 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P-element 71 1 19.31 GGGTATACTAGCCTTTCAAATGTGTAGCCATTGCAGTTTTGGTCAGCATGCGGGTGTGTAGGGGTCACAAGAGTCTACATGTCCAATGGTAATGCCCATGTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 4191041 5' - pogo 2084 1 75.17 ATAAAATATGACGTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 24093499 5' + jockey 70 1 59.59 ACTTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCT:1 + chr3L 18010216 5' + diver 21 2 66.94 TTTCAGCCAAAATACTAATACTTAAAGCCGTGTACATTGTTTGATTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTC:1 + chrX 15252289 5' + opus 7077 4 71.92 TCTCTGTAGGAAGGTATTTGTCAATCGAATCGAATCACTTTTTGCTGAGTTTTCCATTTGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATAC:1 - chr3R 30618744 5' + X-element 80 1 63.70 ACTTGCATCTAGTAAATTACATTTAAAATTCCATATTTCGCAGCATGTCATTAAACCTTATGGACTTTTTTGTTAGAGTTATCTAAGCCTTAGTACATTTTTTAAAACATCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAAC:1 - 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Doc3-element 48 1 67.81 ATGGAAGACTCGTCCTATATGCTGTGTAAGTAAACAAGCTGCGGTCAAAACTCGTCATATTTATTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTG:1 + chr3R 4198748 5' - jockey 4681 1 54.35 ATGAACTTGGGCTAATTACTCAATGCAAATTAAAATTCATGTCAAGCAGATTGGATTATCCTCACGCAACATTTAATGTCGCAGTTTGAATTTGCATATGTCTGAATAAAAAGGGACAGCTCATCAACTCCGGCTAAGCGTCGTAA:1 - chr3R 13621831 5' + Gypsy6A_LTR 208 1 56.85 AACAGAGGCATGCCAGTAAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTG:1 + chr3L 2668827 5' - Bari1 1668 1 56.03 ATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCA:1 - chr3L 19349989 5' + 1360 3281 1 73.29 GCTGATTAAAAGGCGATTTGGCTTTCCATACAACATGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 19583301 5' - roo 8986 2 79.45 GAAAAGTAGTTTTAAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGGGG:1 - chr3R 24011068 5' - roo 342 2 62.50 ATCATGCGGGTGGTTTTTGTTGTTGCTCGGGGAAATTGTTTAAACAAAATAGGCAACTTTTACTTTGCCATGAAATCGCGCCAAGCGAAATGTTGCAATACAGCCGCCACATTCATACTCATTTTTTTATATTTATTTATTTAGAA:1 + chr3L 17969041 5' - Tc1-2 476 1 80.14 TGGTGCATCGACTCCTGCCAGCAAAGAAAAAAGTCGGAAAAAAAATCGGTATTGATAAAAAGCACGCCAGCAACGTTGGCAAACTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCC:1 - chrX 12292224 5' + Cr1a 4399 1 53.42 GGATCTGTTCGTATTAAAGAAAAATCATTTTCCGCCTGAACATCACATTGTGAAAAGGGAACCTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 12342095 5' + hobo 35 1 55.56 GGTTGTTCCGGACTCATGGAAGCCCTATAAGAAAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 20983817 5' - pogo 2034 1 76.56 GATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAACTTATATT:1 - chr3L 19350010 5' + 1360 3260 1 57.53 AGTTTCTATTGCCCCAATCTTATTCGCGACATTATTTACGTCCACCACATTTCTCGTCACTTTTTCGTATTCATTTCCGTTTTAATTTCTGATTATCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAA:1 + chr3R 21600453 5' + Circe 7049 1 65.07 GCGTAAACAAACCATAGGATCCCGCCCCCAACTCACACATCCACATGTCGATGTACATGTGTATGTAAATGTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 + chr2R 20389387 5' + copia 4919 2 54.79 AATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - 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roo 347 2 58.90 ACGACACCCGAAGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 + chrX 16490423 5' + F-element 31 1 63.12 TAATTGCTGGGACGTGATATTGGCGGGACAAAAAAGCTAATTGGCAATCAATTAAAGGCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr2L 2316933 5' - roo 344 2 63.01 CACCTCTTCAATATAAATTTCTTAGTTGGTAAAAGTGTTTTTTTTTCTGTGTGTATGACTTGCATGCATTGCTTATTTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2R 22761142 5' + 412 42 2 55.86 GGTTGGGGTTTCGTCCATGTCGGATCGATCGTATATCAACTCCGTTGGTATACGATCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGCCCCGGGCAACTGTAACACTGCAATAAC:1 - chr2R 17783905 5' + Doc 484 1 47.75 GAGAAAGGATTCCGAGAAATATGACCTCAAAGATGAAGGTGAAGCTGTTGATTAATATAAAAAAATGCTTTATTTCCAGCGATATGACAATTAAATGTTTGAATTTTTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAT:1 + chrX 20453683 5' + INE-1 545 1 79.45 ACCGTTATATGATACCTTTTACACCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGCACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - 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roo 398 1 32.19 GCTTTTAAAGTGTTTCTTAAGTCTAGTAAGTACCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGATAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 + chr2R 7769764 5' + Transpac 80 2 74.82 GAAAAACTTACTTTTGCGTTTAAATTAGACGATAAATATTTGCTAAAATTTGTATACAATCAAAAAAATTAAAGTGCGTTTAAAAACATCATTATGTGGTGTGACCATAAGACCATAAACCATTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGT:1 + chr2L 16672898 5' + Tc3 312 1 69.86 TACTGCGCCAGTGTGACCACCCTAGCCCATGCACTGGCCAGCGATAGCCCCATCTATCGGAGCCACTGTCATCTCTAGCAGCACAGCACGAGTAAAGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr2L 6047975 5' - P-element 2866 1 71.92 AAGCTGGGTAATTTCTGCAGTTGCACGATGACCCGCCAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3L 9521997 5' - opus 483 2 66.21 AACATTCTGACCGCAGTCAATGATTACGATCCTCTCCTCTTTCTTCTGTCCACTCTTGCATACCTACATATTTACTGGGCTTTTATCTTTAGTTCTACATAGCCTCGGTTCGACGATGCGTTAGAATGAGACAAATGCTTGTCCTG:1 - chr3R 9918557 5' + invader6 4686 2 61.64 GATGAACTTTACCAAGGCTCCACCGCCGGACTCGAAGTACACAGATATAAATTTCATTAAATATAAATATGATTAATACGATATACCTATAGCTTAAAAAATCATTTTTATTTGAACTATTTTATTTATTTTAATTAATTTATCAA:1 - 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chr3L 22497536 5' + Ivk 445 1 78.62 GGGCATGGGCACGCAAGGAGCAGCAAGGAGTACGGAAAAGGATGTAAAAAGGAGCTTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTCAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTAT:1 - chr3L 10068957 5' + hopper 1269 1 60.96 AAGCTCGCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAAT:2 - chrX 21994032 5' + McClintock 5974 2 69.86 AGCCGGGCTGCATGATTAAGGCACAGCCTCTATTTTCGCTGTTTAATTCTCTTACTTGTTGTATTAAAATATTTAGATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 + chr3L 6721553 5' - I-element 5310 1 53.42 AATTAATTGCGCCACCAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 - chr3R 7042092 5' + Stalker2 7296 2 52.74 CACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCGTCAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chrX 10547661 5' - P-element 2829 1 41.48 TGGGGGTTCTGACCTCTTCCCCCAACTGATTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTC:1 + chr3R 17996731 5' + copia 93 2 80.14 ACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 + chr2R 13695632 5' - blood 7320 1 67.12 ACACCGACTTACAGCTAGAGAATCCGTTCCGGATGTCCAAATCGCCTTGACCGACCACCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCA:1 - chrX 6328377 5' - flea 40 2 62.33 TCGTATATTAAAATAACGAGAAGACAATGGCTGGGTCAGCAGAAAGCAGAAAGTGCCTGACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:2 - chr2L 13468326 5' - roo 348 2 63.70 AAATTGATGTTTTCATTATTAGCAGTTTTGTGGAAATGAAATAAAACCCTAATTATTTCTGGTCTTGAAATTCATTAGTTGGCTTATGAAATTCAATATCACGTAGATAATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 - chr3R 14402009 5' - Juan 4203 1 75.34 GCATCCCCACTTCCATCTCCATGCCGCATCCACTTAAATTTTGGTGGAAAGGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:1 - chr2R 13117930 5' - 297 6909 2 63.70 GTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCAAATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAG:1 + chr3L 8249371 5' - HMS-Beagle 6980 2 59.31 GATCCCTGAGTGCCTGTTTGAAGTCTCATAAAATGTATTATATGGATGTATATTAATTAGTATTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAACCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chr3R 22352522 5' + I-element 58 1 57.93 AGATCCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3L 8754752 5' + mdg3 5302 2 59.59 AAACAGAACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACAGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chrX 15252412 5' - opus 471 2 65.75 GTTAATATATAAATAATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTA:1 - chr3L 10814651 5' + micropia 4966 2 78.08 AGAGCGGCACTGAGAGCACGTGAGAGGACCCACCTACTGTGCATACATGTGTCTGTTGGCAGCTCCTATTGTTGTTGCTATTGCGTAGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 9550864 5' + P-element 30 1 65.07 ATTAAGCGGTGATCACTGGACAAGTACAAATCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGT:1 - chr3R 20260874 5' - roo 8983 2 79.45 AAATTGTCGCCGAAAAATGCTAATAAATAAACATTTGGCGGAAATTTTAGTGCATACCTCACTTATTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGTTTCTGTCA:1 + chr3R 22201134 5' + HMS-Beagle 494 1 55.48 CTGAAACTATCTTTAATATAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 + chr2L 7774967 5' + I-element 79 1 73.97 ATAACAACAAACAATCCCTCTCACCACAAAACAATTTTGGAAAGCATCACGTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCT:1 - chr3R 5518400 5' - Transpac 5162 2 63.70 CTGAAAGTCGGAATCATTCAATTTATTTCCACACATTTCGCCCTACTTTCCGTGCAGCAGCGAAACACGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 31419439 5' + pogo 5 1 74.00 ATTTTTGTTCCGCTTGCTCTTGTGTTTTGTCAATTTTCTGGGTTTTGTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 19016052 5' + roo 74 2 69.18 ACACGTTGTCAGCCAATCTGCTGACTAGTGTTACCAGCCGACGGCTAAGTCAGCTGCTCGAACAGCTCTTCAAGTGGTGTCTTGGCTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTG:1 - chrX 23460951 5' - Idefix 7238 2 63.01 GTGACCCGAACCCCTCGCTGACCTCAGACCCAGTAAACGAAAGCTCCCTTGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chrX 7508188 5' + roo 69 2 67.12 GGCCAACAAAATGCAACGCAAAGTGAAATGTAAGTAGACTTGAGACTTAAAGCGATGGGTCTTATGCATACAGAATGGGCCGTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGG:1 - chr2L 9305597 5' - FB 75 1 57.53 CTTAAGACTAAAGCCAATTATATAACTCTAACATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 19106240 5' - roo 348 2 59.59 ATATATCGATAGGTACATACTTTCACATCCCTAGCCGGTCAGCTGGTCAGTATGACCGTGTTGTGTAACTATATTCCCTACGATTTTGATCGGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3R 10708364 5' - Transpac 5202 2 65.75 GAGAGCCGAGGCTAAATGGAGCAGCGGTTTGGGAGCCCCAAAGAGCGGGAGCGAGGCCACACTGAGAAAAATGAAGTAGTTTATAAGTTTATGAAATAAACATATTTTGTTTTATGTTTTTGGTATAATAATTTTGAAATTATTAA:1 - chr2L 2830687 5' + P-element 2507 1 79.45 CTCTCTCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGTGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr3R 13530035 5' + jockey 26 1 71.92 CAAACTCCCACTTGGAACCACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCTCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGCGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr2L 1451268 5' - mdg1 7414 2 54.11 GGGCGAGGGCGACTGCTGGTCNAAACAAAAAAAAAAGGAAAAAA:1 - chr3R 14654821 5' + Doc2-element 229 3 95.45 GTTTCCTGTAAGCCACTGCGTGTTGTTTTCTCTTTGGATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1 - chr2L 20508379 5' + pogo 78 1 71.23 ATAAGATTAACCCGATAAGAGTGTTAGGAAGTATAATATATTTTAGCATTAACTAACAACATGCTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTG:1 + chr3R 11166159 5' - hobo 2882 1 57.53 GTTGACGCTGGGTTATGTTGCATGCAAACTTGATACCACCAAATCGAATTCGAAATTGAAATCGAAATTGAATTCAAAAATCCTCCACCCAAAACGGCATTTCCATTAAAAAGCTTGATTTCATATTCTGATGAAATTATAATATT:1 + chrX 9062298 5' + invader4 50 2 77.40 AACTGAACTGAAAACTGGCTGGGANAACGGAGTCTGACGGTGTCAGCTCCTCGATGGTGGTCACAGTGCCCCAAGGAGGAGTACATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chrX 12365270 5' + hobo 37 1 59.59 GCCCGTTTGAGTACAGTGGTTCAAAAGGTAATCTATCTGATTCAAATTCAAAACAATTTGAAGTCTGAAGACAAAGCTCTTATTTCAATTAAAGGGATAGCATTAGCATCATCATAGCATCATTATTAAATTTGATTATCTACATT:1 + chr3L 2869101 5' - Penelope 353 1 30.82 GACGATTTCCGTAAGATCTGTGGACCGGAAGCGAATCGCTTTGAGCTTGGTTTGTGCGGCATCCGCTGGGCTTATCCACTGGCCATAATAGATGTGGTAACTCCTCCCCCCCTTGAATAAAGTGACGGCCATAACGAAGGAATAGA:1 + chr3L 1890665 5' - gypsy5 6896 1 56.85 AGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 + chr3R 17944056 5' - P-element 2784 1 15.07 AGATCAACACGATCTCAGTGCTGACACCATAGAAAAACTAATGGGGGATAAGCGTACTTACTAAGTAGGTGCTTAATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 14800861 5' + pogo 42 1 52.05 CTGGGTCCCAAATCTTCGGAGAACACGTTGTTGTCTTGCTGTTGTTGCTACGTGATCGCCATGACAATTTGTCAATTGGGTTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGTTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 - chr2R 21530093 5' - HMS-Beagle 227 2 71.23 GTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACT:1 - chr2L 11725031 5' + F-element 81 1 72.60 TATAGATTACAGTTTCACCCAATGATTTATGCTTGATCACCCAAGAATGAAAAATTCCCATGCCGCGATCCTCAAGCCTTGCCACCCTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3R 21655091 5' - roo 9038 1 62.33 TACATATACATTAAAACACTTACGATACACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3L 8274054 5' - hobo 2922 1 73.97 GATACTCCCGTTTCGTGTTTCAACAAGTATATAAAAAGACGATTCCATTGCGGATCTATCATAAGAGATTCCGTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCG:1 + chr2R 5196341 5' - Quasimodo 6927 2 50.68 GGGAAAACTTTTGCCGTAAGGCATTTACGTAAGTGCTTGGCCATGGAGTTCGTGGTATCCGTAGGCGGACGATGCGGCTGTGGATAGGGTAGCCTTTTATTTATTATTTAA:1 - chr3R 17767521 5' - G2 3055 1 72.97 CTTGTAATGTGAAAACACTGGCTATCTGTTGCGGCGCTGTGATAATAGATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2L 5341471 5' - Burdock 220 2 63.70 AAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1 + chr3L 20765135 5' + 297 6635 2 54.79 CCATCGAAAGGTAAGTATCTGGCAAACCATAAAGAACTCTATCCATCCTAAAATGACATCAATATATTAGTTTGAAATAGTGTTTTGTCTTAAATTATGGTCTATATACATTTAAGATGTATATATATAATAATATTTTTTCTTTG:1 - chr2R 21847357 5' + transib1 1958 1 76.71 TGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGAC:1 + chr2L 21750457 5' + F-element 427 1 80.82 GTCGAACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTA:2 - chr3L 21913480 5' + 297 6600 2 72.60 CAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTACACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 - chr3L 8249508 5' + HMS-Beagle 6808 2 75.37 ACAGCAAAACATTTTTACAACGCATCGTTTGACTTCTTTTGTGGAGTCAATTTCAGCAACGGATGGCATAATAAATAAATAAATAACATAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 - chr2R 20389527 5' - copia 257 1 63.01 ATTGGCAAACTCAGTTTCTGGACACGTCCAGATGGGCATGTCCACACTATCTCCATTTAAGTTGCTGACCTAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr3L 7102413 5' + I-element 53 1 50.00 CCTGGATCCTTACATAGATCCTGGTGTTTCCCTTTTCCACGTCATATCATCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1 - chrX 140080 5' + blood 72 2 65.28 TGTTCCTATAAACTATTTAATCTATTTTATGCCAAATAGAAGAGCTTAAAAATGAAATAATCTCTGCCACTAACGTCCGCATCTTAATATTGCAACTAGTCTAAAATGGGTATTAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 13667924 5' - hobo 2931 1 77.40 CAATGACTTTGAATGGTCGCCATAAAATCCAATGGTTGGTCTCGGTTGGTGCACCCGTGTGGCACCAAAAGGGTCCAAAGACACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 + chr3L 8769860 5' + 17.6 6958 1 50.68 AAATATGGGAAAATACACACACTCACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCATTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chrX 20942212 5' - hobo 2915 1 54.37 AACAGCTTATAGATTGTCTTTTATTAAATTCAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAACAGAAGACTCAAGCGACACC:1 - chrX 14771772 5' + jockey 4742 1 74.22 GTGTGTAAGTAGCGGCTGTGAAGCGTGTATTTGGTGAAATATGGGGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr2R 15472183 5' + 412 7078 2 71.23 CCTGTACTTTTCCCGATTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 15863393 5' + hopper 139 1 75.76 GATTTATTCGCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr3R 5170964 5' + F-element 49 1 55.00 CATTTTGAGCGAGTGACAGTGATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 29384745 5' - roo 9040 1 63.01 GGTTAAGCTGGTACAAGCCTATTTGTTTAAATATTTGTATATTTGAGCACTGTATTACATTTGTAATCCCTATAAATGTTTGAAAACGCATTTGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 + chr2R 18358384 5' + jockey 4679 1 40.97 ATGGTGTTCCAGCTTTCCAACGGCAGCATGATGTTCTATCCCTTTACGGCCGAGAAGTACCGCCACGAGGTGCATGCCACAGTCTACAGGTGATAAAACATATTCTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAA:1 + chr3L 8255386 5' + Gypsy6A_LTR 258 1 59.59 CATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2L 4631210 5' - roo 8986 2 76.71 CCCTGCCACAACACCGGCAAGCTAACTTATGAGTGCGTATTGCATTGCGGTGTGCATATATCTGGCAATGGGTCTGATTTTCTAGTTTACAATAATTTTACTACAATGACTCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGG:1 + chr2R 13506932 5' - X-element 4503 1 52.74 AAGACTATCTAAATCCTGTGCTAATCCAAAACTAGCGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAA:2 + chr2R 8596947 5' - pogo 2017 1 74.66 CGGTGGGGATAAAGGGACGGATCGGGTTTCGTGTCGGGGGAAAATAAGTTAAAGTTCAAGCTCGACAAACCCCCAGCAGACCCGAAAACAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 - chr3R 11903571 5' + FB 33 1 63.01 CCTACATTTTATTCAGTTATGTGCCTTATTTCAATTTGGTTTCCACACATTTGCCATAACAATTCCATATTAATGGACTCAATTTATTTATAAAATTAAACAATTGAGTTTTTTAATATATTTTTTTAAT:1 - chr3L 10303767 5' - BS4 725 1 45.38 ACTCGTAGCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAA:1 - chr3R 2525973 5' + Stalker2 7316 2 63.19 GGCCCATAAAAGTGCAGCGTCGTCTCTCAAAATGGGTAACAAAAATTATTCATAGTGCAGTTGCCATTTTCCCTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3L 18119430 5' + 1360 47 1 52.74 GAAAAAATTCTGATAAGGACTCAAAATGTCAACAAGCACAATGCTTAAAAGTTGAGAATAATTTATTATCTGTATATCTAAAAAAAAAAATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 + chr3R 19628882 5' + Transpac 4927 2 75.38 GTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 + chr3R 12115268 5' + 1360 64 1 63.45 CTAGTGCGGGTAATTGAGTGGAAATGTTGACTATGTCGTCTGCAAATTATTCTTTAATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 16920314 5' + roo 25 2 68.49 GTGAAACCATGCATAATTTTAAACACACTCTGGATTTGCAGTATTTTCCTGACTGACTTTAGTTTTCCTCTTGCTGTAGTTTTCTTTGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3L 5958742 5' + 412 7087 2 54.11 CTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chr3L 18010260 5' + diver 87 2 73.97 ACCCTCAACTGGAAAATATGTTTCTCGTTTTGCATTAGCAGCAGGAGAACCTCAAATCAGCTTTAGCATTCCACCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 8631600 5' - roo 9024 2 52.74 TTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCA:1 - chr3L 22435186 5' - opus 416 2 76.71 ATGCAAATGCTATGGCTCCCCATATGGACAAGCCCGGTTCAGGCCACACACGGCCGCAATGGACACGCACACGGGTAAAATATAAATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3R 23877813 5' + Transpac 9 2 73.60 GATTAGATGTGCTACTTGAGCGGTGGATTAGGCTGCTTCAAAGGTCCCGGATGACCGGAGAAATTTATTCAATTAAAGTAGAAAGCTTCGAGGGAAGCCAGACAGTAACTGTTCACACATGAACACGACTATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 10504236 5' + roo 16 2 72.60 AATTAGCTTTCAGACACGGCTTCGTTTCATTAAGCAAATGGTCCCGGGCGCTATAAAAACGTTAATAACATTTTAGTGGATAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGACACT:1 - chr2L 15917733 5' - roo 9042 1 40.71 AGGTAATGTGTGGACTTTGTACTTGAAACTTTGCTATTTGTATTACCAATATGTTAAGCATGTATCATACATATGTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAA:1 + chr3R 20354137 5' - 1360 261 1 52.05 CGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGG:1 - chr2R 18044071 5' + jockey 4589 1 58.87 ACTATCTTGACTACGACACCCGAAGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:2 + chrX 16490411 5' + F-element 24 1 68.49 GCTCGGGCGGACTAAAACCAACCCCCTAGACGAAATCACCCTAAATCTCCCTAACCTCCCAGCTCTTGTTCTTTTTTTTTTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTT:1 + chr3L 901728 5' - I-element 315 1 59.56 ATTTCACAGCACAAAAGGCACCGAAAAGGGACTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 + chr2L 16995507 5' - roo 321 2 76.71 TTCGTCGAGAATGTTACGAAGGCAAGGCCGATAGCACAGGTCTAACTGTCAAATACTCAACTAAACACAACATTTTCACCAAGATAACATAAATAAAAGTTAAACAAGATGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr2R 19413485 5' - 297 6968 2 75.34 TCCCTTGACCAAGCAGCAAACACGTGGCCAAAGCACGGCGCAATGCTCATGCAGGGCCAAACAACCATATATGTATGTCCACAATACATACCACCTACATACGAATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTG:1 + chr2L 15174443 5' - 17.6 7406 2 76.03 GTTCCACACAAAATAGCAGGAAGTTGCATTCTAAAGTAGCAAACGAGCACAATACATTGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chrX 20024509 5' + 412 30 2 54.17 ACGCATTCGTAATTGGGATCTGCATTTTGAGCGAGTGACAGTGATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 29384767 5' - roo 398 1 78.77 AAAGAAGACGGGCGTATTGGGATCGAAGCCACGGAGCAGGTGCTGCAGATTCTCCATGACCACGTACCTGTGGACAGACTCGTAAGTAAAGATCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTT:1 + chr2L 2837220 5' + F-element 253 1 60.96 GTTGGATTTGAACTCAACTGAACTTTTACGAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2L 17470398 5' - 412 440 2 72.22 CTATGGATTTTATGGGCATGAAAAGGGATATCAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCT:1 - chr2R 23278439 5' - mdg3 5411 2 76.55 ATTATTAATGAAGTGTGTCAATAAATTTGTTTACGAAAAATCATAATTTTTCTTATAATATTAATAAACATTTTTAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACAATATGTTGGCTATCTGAGCAAGAAATTTGTACTCTCTCAATGG:1 - chr2L 22063140 5' + Tc1 134 1 50.68 GTAAATATCCGTTGAACGTAGCATATGGCATCTGTAATAAGTGTTTAATACTTNTNTATATATATATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTG:1 - chr3L 2668956 5' + Bari1 40 1 55.22 TCATTGAATAATTTACGCCCTGCGCCGGCACAAATGAAAACCCAAACGGAATGGTGAATGGGGGGCGGGGAAACGGATGCATCCAGCAGATGGGTGTGGAAAACTGCACGTAGATGCCATCTGGCCTCCAAGAGC:1 + chr2R 24721463 5' + R1A1-element 459 1 79.26 AATTAGTAAATGTAAGTTCTATAAATAATCGAAGCTTAAATTAATAGTCTTCAATTACAAATAAGATCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 15539954 5' + roo 53 2 58.22 ATCTTGACTACGACACCCGAAGATTTTAACTTCAATTTGGTATTCTGCTAATCGATGTTGACCCTTATCTACTAAAAGCTGATCGAAATCTAATTATATGCGGCCGAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chrX 16490414 5' + F-element 27 1 67.12 ATTTTGTGAGTATTTATGTGTGCGTCTCTGTATTCACTCCAGCCGAAAACAACAACACCTTCGCTTCGGAAGAGCGACACACACGCTCATATCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 + chr3L 19907062 5' + P-element 23 1 69.50 GGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr2L 15917615 5' + roo 8744 2 76.03 AGATGAACAAGTAAAAGCAGGTTAAGGGGCGAAAAAAGCCACATGGGGTGTACACTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3L 70201 5' - roo 343 2 63.45 AAATTCTCGAGTTCGAAACTTATTTCCTTTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 10504381 5' - roo 9010 2 60.27 AGCAAATGTTTGTTTATTTAAGCTTGGCTAAGCAATTGCAAAACTACTATGTTTATATGGTAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCC:1 + chr2L 5818877 5' + I-element 4884 1 58.22 AATGATATATATCGATTTTTAAGAATTTAACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTC:1 - chr2L 22130808 5' - INE-1 574 1 44.52 TTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chr3R 6962424 5' + jockey 85 1 71.23 ATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chrX 15540035 5' - roo 9001 2 78.91 GCCCTTCAGGTCCGATCGGATGTCACCATCTAGTTTTTTTTAACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGG:1 - chrX 15406103 5' - opus 490 2 72.92 TATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACTAAATTTCGTGATTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGCAGACAA:1 + chr3L 26544694 5' + invader1 3684 2 97.26 ACAAATACACAAGGACACAAGTGGGCACTGAAATGGAACTGAATCTGCAGCTATAAGGCCATGGAAATGGCATTTCTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 8274026 5' - hobo 2894 1 54.79 TAATTCGCAAAACGCTTTCTTCTCAACCAAGCTGCTTTAGAAAGATGGCCTCAGATGAAAACCCCTAGATACTGGCGATGTATAGAAATCGCTTAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTA:1 + chr2R 16184979 5' - 17.6 470 2 71.23 ATATGCGCCTTTGAAAAATGTGCTGACACTTTGAGCCGAAGCAGAAGCTCTACACTGCAACACACGTTTGTATGACAACTAAGACTATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2L 11476398 5' + pogo 29 1 64.38 CAGATAAAATGTATCTGAATGTTCGCTCTCGATGTGGTGTGGGCTCCAGATCCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chr3L 8754705 5' + mdg3 5269 2 71.92 TTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:2 + chr3R 8381684 5' + Tirant 39 2 58.90 TAAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3L 12125253 5' - roo 9034 1 59.59 GATCTGCATTTTGAGCGAGTGACAGTGATGCCTAAATCATAAATGTTAATCTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 29384751 5' - roo 9045 1 68.49 GACGGGAATTCACACTGAATTGATGAATACTAATCTTTCACTTTATTTGTCCACTTGCACCCTATTAAGAACACAAGAGCGAGACTCTCCCGAAATACAAATATTATTCAAATACTGAGACTTTTCCTCAATCCAATTTGCATATG:1 + chr3L 82648 5' + 297 254 2 54.11 TACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 8208335 5' + roo 8699 2 65.26 ACGAGTACGCATTTCGGTCAAAAGGGGCAGGACGAGGGGCTTGAGGTGCGGGTGGGGGTGGTGGTGGTGTGGCAGTTGTTAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAAAAAGATTTCACGTGCTAGATCTCTCTGA:1 + chr2L 14096508 5' + G4 3697 1 55.48 ACTTATTTCATATTAGATTCATACAACAAATTGTATAAAATATATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCT:1 - chr3L 16725591 5' + Quasimodo 78 2 76.03 CGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTNCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTNTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr2R 2016825 5' + 1360 51 1 57.69 GCGATTTCATTTCACAATATTTCTTTAGCTTTGCAAAGCGTAAGCAAGTGTCATGATAACGAAAAGTGGATTTTCCCAGAAATATTTATAAATAATTTTGATAAGTTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3L 11124625 5' + jockey 4688 1 76.71 GTGATTCAAAGTGGGCAGTACGAATTTTTGTTTGTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGA:1 + chr2R 4193263 5' + 1360 1 2 76.71 GAATTATTCGAGCTGACTTGATGCAAAAGCGTTCAAACATTTCCCACTTGGCTATACCAATTCTGGATTATACAAGCGCACGTTTCTTGATAAATATTCAGCATGATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3R 14546434 5' - pogo 2087 1 76.03 AGGTGGTACAGTGGTCAAAATACATTCATAATGGGACATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGAACTGGCCCTGTCTGTCTGACCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAAGTATAAAAGCTAGAAGGTTGAG:1 - chr3R 1540031 5' + INE-1 161 1 74.66 GAATATACTCTATGATATAGTCATAGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAA:1 - chr3L 21202137 5' + G2 2605 1 69.86 CTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 18737942 5' + roo 51 2 54.79 GTTAAGAGTTTTGTCCTTCCTAATCATATACACACATATGCATGTTTTTGTAGTAAGTGTATATTTCGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCC:2 + chr2L 4268929 5' + hobo 54 1 55.48 TTTAAAGCGAATGGACTTTTTGAAAGAGCGTTAAATGAACCAGTTCTTAAATGTACAAGTTCCAATGTACAACTTCAGCCCTGGTAAGTTCCGGTTCCACGGACAGCTGAGCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3L 4286956 5' + P-element 9 2 60.27 GATAACCCACCAACTTAGGGAACAAACAACAAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3R 12115211 5' - 1360 3381 2 76.71 AAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 8208391 5' - roo 326 2 72.60 GTTACGCGCGGAATGTTAAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 12125237 5' - roo 9050 2 70.55 CTCCTGTTAAGAATATAAGTATTTAGTAGCAACATTATCTTAACTCCTAGGTGCTAGCATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr2L 8553415 5' - pogo 2049 1 58.57 CTTGTCCCAATCGAAATGGCAACTCACTCCCATAATGGCCAAATGCTTTTTCAAATGAGAAATATTTTCGGTAGCAAAGTAAAAAAAATAAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTCCAAG:1 - chr3L 17175883 5' - accord2 7284 1 54.11 AAGTGCGGTAGAGAGCTACAGTTTCAAATAATTGAAATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 20168332 5' - roo 9047 1 68.49 CTTAAGATTGATTTGATTGCACAAACACGTTTCCAATTCCATATACTCCTCGCCACTTACACGATTAGCACGTGAAACATGAATGATAGTCTATATAGTAAGTAAGTTAGTGCTGCCTGTAATACGTGTCTTTCCTGTCGATTTGT:1 - chr2L 12488042 5' + TART-C 63 2 67.12 AAATTACCTTCCTCAACCGTAAAGAAAGTTGTTCTCGATTTTAAGACTGTGATTTATGTCTTCGTATGCAGATACACAGAGATCTATCCATTATATTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATA:1 + chr2R 24016953 5' - micropia 5382 2 65.07 TAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGA:1 - chr2L 18173673 5' + blood 7078 2 60.96 TTTTCTTCGATATTTTCAACATATTTATTACATTTAGATTTATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAG:1 - chr3L 18164310 5' - jockey 4795 1 71.92 GACACTCTTCAAGTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATTCATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGT:1 - chr2L 23034089 5' - FB 393 1 47.26 AAGTATGAATTGAAATTAAATGAACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTG:1 - chrX 14347015 5' - flea 149 1 84.93 CAATTTGGTAATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - 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chrX 7995168 5' + opus 7111 2 64.35 GTAAATAGTGTGAAATAAAGTTCAAGGAGCGATTGGAGGGGTTTTGAAAACTGCAGCCAAATTATGAAGTGAACAAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAATCTTCACTGAAGGGATCTTCTTACACGTCCCTTCTTCATCATATT:1 - chr3L 3522195 5' - invader4 210 2 48.63 GCGAGTGCCGAGCGAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAANTNACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chr3R 17944034 5' - P-element 2806 1 30.14 CGGGGTGATTGCAGCGCACCTTGCCGTCTGAACGTCTGAAAACGTTTATGACCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chrX 4469538 5' - roo 350 2 61.19 TTATGTGCATCCATCGTTGTCAAAGCTTGTTAGCCCGATGCAACTGCAGCTGAGATGATTAGCGGTACTGAGACTGCATCTGCATTTGGAGTGCGGAGCAGGGGAGGAATGTGTAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 17495047 5' - hobo 2930 1 75.34 AGGTTATAACATGAGATAACAACAAGGATGCTGATTTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr2R 25203718 5' - 1360 3364 1 67.12 CCCACATTTTTGAAAAATTGTTGGATATTTTTTTCGTAATTTTATTAGTCTTGTAACTTTATATCGATTTGCCAAAAAACTTTTTTTCACGCTCACAGACAGAAAATTTCGCGCTTGCCTTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chr2R 1652241 5' + INE-1 542 1 68.49 AAGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCA:1 + chr3R 23020783 5' - INE-1 563 1 63.01 AAACTGGAAAAGCTCAGACACGATTTCAAAAACCATTCGTCACTATTTTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chrX 20233880 5' - pogo 2033 1 66.43 CTTTATACAAAGTTATTCGATTTAAGCCCCGCCCACACTCTCATGAATAGAAGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 - chr2L 23068962 5' + 1360 39 1 58.90 GTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr2R 23596000 5' + blood 85 2 76.39 GTATAAGCGATGCTTGATTGCGTTTCCGGTTTATGAAATTTGTGGCCGGGCCATGCAATAATTTCTCGTGGCTTATGTGACGTCATGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAG:1 - chr3R 13622843 5' + Q-element 189 2 56.85 TCGTAATTGAAAAACTTCAAGTCGGTTAAGCTGCCTTGCTAAAATAGCCAAAAATGTTAAAACTTTAAGGAGTTATTTGGAATTACTTCGTTTCTCCAGTGGTCGATATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 + chr3L 5398396 5' - copia 227 1 58.22 ATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAA:1 - 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chr2R 16073039 5' - opus 459 2 58.90 GCGGAAACTCAAGCAACTAATTGTGCGCCCTTTATTACGCTGTATTTTCAAAACTTCTAAAGAATCAATTTGGACATTATACTTATTGGGTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr3R 12181948 5' + mdg3 5285 2 63.70 CAGTCAAGGCCAGGTCGAAGCGCAGTAAACAAAGTTGTTATGATGACGTTGGATATTTGGCAGCCGAAAAGTAAATTTGGAAAATACCTAGGGAACTTGGTTTTATTTTTTTTTTTAATAAAAGTGTTTATATTGTTGTTTTAAAA:1 - chr2L 9288768 5' - transib2 2610 1 68.49 TTTGACTAAGTTAGAGATTAGTCACCAAACCTAAATTTACTGTAAATTAACGAAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCC:1 - chrX 6281065 5' + P-element 2731 1 40.41 ACTGTAATATAAGAGCTGAGAGAGAGGAGAGAGCAGTGATCGTGTACATGAAAACACGCACACACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCGTCAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chrX 10547599 5' + P-element 7 2 79.45 GGCAAAAACATTTAACGAGGCGTGCATTAAGCAAAAGCGATCAAATTATGGCGAACTCAACTATACACAAGCCACCTATAAAAAGAAACAACAAAACATCAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 21060656 5' + jockey 4999 1 59.13 AAAATATTAATAAAAAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACG:1 - chr3L 23839776 5' + McClintock 7 2 80.14 CGCAAGCACAAGGAGCGCAAAACTGTGGGTTCTGGACCGGCCAAGACCAAGATCGATTGGCAACGTAGAGCAAAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCA:1 - chr3L 4256190 5' + G-element 3957 1 73.00 AGGTAGTTCGAGTAAAGTGAAAAGAGAGTCATTTTCCAAGATCTACCCGCCCTTATTTCAGGGTAATCAAGTTATTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTAT:1 - chr3R 20596934 5' + copia 4729 1 50.68 GCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTA:1 - chr3L 10814596 5' + micropia 152 4 63.01 TTTCGCTGGCTGCTGTTGGTCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATGGGTAAACACTTGACTTATCATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chrX 14189244 5' + 412 58 2 54.79 CAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAATCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr2R 22596084 5' + Doc 64 1 57.53 GACGGAACATCTCTTCCCAAATTTGTTTGCCTGTTCAAGGCCCAATTGCCAATGTTGCCCTTAAGATTGCCCACTTCGAATCCACCAACTGCTCCATTTCGTGAGTCATCGTATTCTGGCGTATGTAGTTCCTGAGATCTCGACGT:1 - chr2R 12316559 5' - INE-1 143 1 77.40 CTGAGCCAATTGTTAAGCCGTTGATATATGCCTGGTTTAGATATAAGCATAAGTATGTATGTAAGTATGTATGCCTTCTTGAGTGGATCACTTATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAG:1 + chr3R 21421855 5' - Quasimodo 6970 2 61.16 CACCCTAATGGGTTAGCCCTTGCCCTTCCAACTGCATTGTCACATTGGTCTCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chrX 18767817 5' + hobo 2708 1 73.97 TTTTGTATACAAATTATTGTGAGCTGTTGTTGTTCTTATTGCTTTTGCAGTTGTTGTTGCTTTAAGCTTTTATGGGCAGTGCATTTCACTTGTTTGTGTCGAAGAAGTCCCCGACGTCTAAGACTCAGATTTGGCAAGTTGTGCAG:1 + chr3L 22743371 5' + HB 1221 1 66.44 ATGCTCATCATGATCAAACTCCCACTTGGAACCACAATGCATTTCCCTTTCCCAGCGCGCCAGGTTGTGCTTTTCGCCCGAATCGCACTCTCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr2L 1451282 5' - mdg1 7428 2 63.01 ATGGGCATATAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAA:1 - chrX 19163353 5' - Burdock 6322 2 69.86 ATATGAATTTTACCTCGGATCGGATCGGTATTGAACGTACATATATGTATATACATTGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAA:1 + chr2R 21529950 5' + HMS-Beagle 6856 2 65.52 ACTGCTTCTGATTTTATTTAAATAAAGAAAGTATTTTTTGACTTAGAATTAATAAAATTGCATTTAGAATCTATCTGCCTTTGGCAGATGGGGATTGGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 21712611 5' - hobo 2915 1 40.41 AACACGTTCGCATTTTCACACAATGTTTTCCTTTGAATTCCGCAAATGGTTTGCATTGCAAATTGTTTATTTATGCACCGTGAAATATTGCCAATGGTTTTTCTCACCCTGAGTGCGACCACCGGCACTCGTTCCGAATGCACACA:1 - chr3R 22057525 5' - opus 227 2 69.18 GCACTACCAATCCGAGCTCAACTAAAAGTCAAAGATAATTTATGGGACATAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAGAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chrX 2104781 5' - roo 9003 2 64.38 ATGCATTTGCTTCACTGAGACGGATGTGCAGCGTTTTTAGGGTTCATTGCGTTCACCTCATCGAACCGCACAAGATGTTCGTTCACATGACTCGACAGTCCCGAAAAAATGTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGC:1 - chr3L 15201190 5' + jockey 4579 1 76.55 GAAAGGACCAAAACACAACTGACACACTCTCTCTCTGCACACACACACACACACACACACACACACACACAACAACGCACACACACA:1 - chr3R 29468033 5' + gypsy3 417 1 47.13 TTAAAAAAAAAATACACACATACAATATGTGCTGAAAGTCGGAATCATTCAATTTATTTCCACACATTTCGCCCTACTTTCCGTGCAGCAGCGAAACACGTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chrX 10959286 5' + pogo 36 1 67.81 AAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3L 12125286 5' - roo 9001 2 68.49 TAAGTTTTGATAAAAGTGTTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 8930586 5' + roo 49 2 52.74 ACTCGTCGCAAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAAACCAATGTACATATATGTATGTAGTGACGTATATTTGCTCTCTTTGTATATTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAGGCTCACCCGAAATACAAATATTGTGC:1 - chrX 3663227 5' + 297 6798 2 69.86 GCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGC:1 - chrX 21994026 5' + McClintock 5980 2 65.75 AAAGTGTCAACCAGCCAGGTCAAAGGAGGAGGGCCATCACGAGCAGGGGAGTGNGNGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 + chr3R 13898176 5' + 3S18 5794 2 63.01 AGCATCCATGCTGCAAATTACCTTTTTCAGGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:2 + chr3L 17746294 5' - roo 317 2 79.45 TTCTCTTTTAAATAAATCTTTTGAAGTGTCTAGTAAAACAAAGGCAATTCAAGGGTGATTAAAATATTCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 20168186 5' + roo 8716 2 54.11 GCATAGTGATGGAGTGCAAGAGTTTTTGGGGTGAGCAAAGCCATAACGCACTGCTGACATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr3L 5958623 5' - 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chr2R 15472138 5' + 412 70 2 58.90 AGAACACGGCAATTGCGGAAAAGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chrX 15252408 5' - opus 467 2 64.38 ACGTTTTTGAAACTTTAAACCTGATTATTTTGTATTTACAAATGAACGAAATGTTAAATCATTAAATACATATTTGTAAAAATCCTAATATGGGTAGATATATTCAAAAGGTACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr2L 6346540 5' + flea 4762 1 75.34 CATGGCCACTGTCGCCTCGCCTCGCTGTGAGCATCGTTTTGGCCCCCATTTGTTGCCAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTC:1 - chr3L 13404495 5' - copia 154 2 60.69 ACTTAACATTGTGCATTTAGCACTGCAGCGCTTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 14332130 5' + jockey 18 1 73.33 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAATAAGAAGAAGCAAGAATTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTC:1 - chr2L 22211545 5' + INE-1 134 1 73.97 GTATTTATGGCACCCAAAAAACTGTATTGTTTTAGCAACTCTTTCTGCGTTCTATTCTCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 + chr3R 10433202 5' - 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Stalker4 269 4 62.60 TTTTAAAAGAACTTGTCAATTTAATTTAGAAACTAAACAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGA:1 + chr2R 7407990 5' + 3S18 77 2 77.30 GTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 + chr2R 22112652 5' + 412 7131 2 71.23 GGAACGTTAGCTGAAGTACACGACTCGAATTTTGACGGCAATCTCGGAATTATTGAATATTTCCGAGACAAGTTACGAGAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr2L 6047814 5' + P-element 38 1 58.22 ATAAGCGCCATAAACGCTGAATTCATTATGACAACGCCAGAGACGTGACTCTTGTTCGTTGGACGCAGGGGGGATGGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACACA:1 - chr3R 18006585 5' + accord 253 2 60.27 ACACATTATGCATCTACACATACCCCTTTACTACTTTAATTTAGCATCCTTTTGTGATTTTCAATTAGCAGCATGAGCGGATTACTCGATACGTGTGCTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGT:1 - chr3L 12680942 5' - Q-element 558 2 60.27 GCCATGGACTTCGGAGACTCCGGACTTTGGATACTAAGCGCCACTTGACTTGTGACCCGAACCCCTCGCTGACCTCAGACCCAGTAAACGAAAGCTCCCTTGGGGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 7508239 5' + roo 8681 2 73.79 ATAAGGGAAGGAGAAACAACATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr3R 11758469 5' - P-element 2845 1 56.16 AATTGACTAGAGCACTTTTTGATTGCGTTAGCTGCACTTTGAGGTACGTGTTATTTTATTTATTTATGGTGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2R 18767261 5' - pogo 2069 1 59.23 GTATGTTCCACATTCTTTTTTTTTTGTTGTTGCCACTGTTGATTGCCACAGTCTACAGTTGGGCAGGCACTGCTTAATCATTTAACTGAGGGGTTAAAATGACCATAAACTATGAGTTCACTTGAGTTGTATCGTGTTTTATTTTT:1 - chr2L 2938638 5' + transib1 343 1 65.75 GAAACGGGGCAGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATCATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 4631252 5' - roo 9028 1 54.11 AAGCAATTGCAAAACTACTATGTTTATATGGTAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATA:2 + chr2L 5818906 5' + I-element 4913 1 78.08 TAATGTGGAAATTATTGAAATTACCACCACTAACTGAGTATCTGTTAGTTGAGGAGCTCGTATATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3L 18122276 5' + 297 6630 2 57.93 TTTTATGTTATTATTTTACAAATAGCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr3R 10433323 5' + 412 7092 2 58.90 ACTGGTAAATTATTTAATTAAAATTCATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 19698025 5' - roo 400 1 75.34 AGAAGGTTTCATTTGATTTCCGTACTTTGTTATGCAATAAGTGCGTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTTGAATAAAGTTGCTCGACTTTTAGATACCCATTACTCAGCCAGT:1 - chr3L 21427085 5' - INE-1 542 1 70.00 ACGCACCACACACTGAAAATTGCGGACGCGCGAAGCCACTGAAGAAAAACTGACGACTGACGCGACTTTCCGCTGGTGCTCGAAAAAACGAAAGGTTCCCACATGATGAAATAACATAAGGTGTTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr2R 10541609 5' + P-element 17 1 72.66 CTTGAAGCGTAAACTGAAACAATGCTAAGTGATCTGTTAATTATCACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 22435509 5' - roo 8998 2 66.44 ATAATTCGAGTAACTGCCCAAATAAAACAATAAAACTGACAGTATTCGAGATCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATC:1 - chrX 22574719 5' + 17.6 7018 2 45.89 AATATTAAATGAAGTTAAGCAGGTGAAGAAGGCAAGGTGTTAATTTGATTACCCCTACCTGTCAAATAGAATTTATAAAAATATTTCATCTACATTTCACAGTTTTTTCAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr2L 20508238 5' - pogo 2094 1 79.45 GCGTTGAGTAAATGCACATTCTGGAATATTTATATAGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr2R 23595998 5' + blood 85 2 75.34 CGACGACGCCTGATTATTTCCTGGCGCCAGTTTCTAAATTTACGCAAATTATTTTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 - chr3R 17060081 5' + jockey 4745 1 65.75 ATTTACACGAATGGACAACCCGCTGCACAAAGGCAAAAAGAAAACGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAAT:2 + chr2L 17353005 5' - 297 321 2 71.23 TTTTAGAGATAACTGCCTCTTGCAACTTAAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chrX 10504353 5' - roo 8982 2 79.45 AAAAAACCATTGGCCAATTAGCCAATAAATCATACTTGTCATGGGCATATAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 - chrX 19163393 5' - Burdock 225 2 65.07 CGGGTTGTAAACTTGTTGTTTTTCGCCCAGTAACTTCCTTGTAATAAATTTTTAGGAACTTTGCGAGATCCACACTACTTATATTACCCAGACATGACGAAGTGAATCTAGGTTGAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3L 18119597 5' + 1360 7 2 73.97 TTTCCATCTGCGACGATCGTTTTTGAAAAATGTGTTCAATAAACGCGTTACTTGTAGAGTAAACAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr4 407129 5' + jockey 66 1 54.79 GCCAGTGCACACTGGGCCAGATACCAGATAATTTTACTTTTGTATCTGTTTAATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAA:1 + chr4 906106 5' - opus 444 2 62.69 TTCATAACAGAGCTACGTTGCTGCCTTTGACGCTGGGTGCCCTTAGCTTTAAAGAGTACATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 21679676 5' - roo 345 2 60.42 GCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAA:1 - chrX 19690597 5' + gypsy 7048 2 74.58 AAGTGATTACACAATATAAATGGGCAAAAAAATTTCGAAATTCGGTTTAAGTAAATGCTCACTGCAGTATGAAACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 22041050 5' + roo 46 2 54.11 CGGTGGAAAGGTGATTTCCACTCCCACACGCCCCTCGAAAATGTCAGAATATCACCAGAAATGTGTTTCCCAAACCAGAGCAAACACATCCGCAGGAGAGCAGAAAAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGC:1 - chr3R 30098126 5' - Quasimodo 476 2 73.79 CCAATTCTAAAAAATGTTTCAAATTATTTATAGATAATTGTTGAAAGCAATTATCCTTATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACC:1 + chr3R 8867000 5' - Max-element 154 2 42.36 GAACTGTCTTTCTTGGATCAATTAATCTTATTTTCATTTCGCCAACTTTAACCTTAGTACATGGGATACCCTTTATAAGAGGCTTATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCAAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTC:1 + chr2R 3203505 5' - Cr1a 4075 1 55.48 ACAAATCAAATTTGTTGTAAGGCTCGTAACACTCGAGGGTTGACTGACTGCCTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAACCGACTTCGTTGTCGTCT:1 - chrX 10694368 5' - Transpac 243 2 63.70 CTCCTTAGCAGCAAAGCACTTATGCGACTATCGTCGATTCTTGTTTCCAAGTTTCTACTAATGTTAGTTTTAAGCTAAAAAAGATTTGATTCTTTAAAGCAAAAATATTTAAATTCTAAATGAAGAAGAAGACTTAAAAGATTTCA:1 + chr2L 8776759 5' + G4 3679 1 76.71 TACAATTGTATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 3911805 5' - roo 9039 1 63.70 GCTTCATCACCGCCTTCGTGTATCTGGGCCAGATATTCATGTGCCTGACCCCACCGAAATACTACTGTTATGTGCCGGAACTTTTAGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGTTGAGACGTAGGAGA:1 - chr3L 5906265 5' - F-element 274 1 54.79 AAAACGAAAGACAGAAAGAATCTCCAGAGGAGGCAAAACTTATATTTATATATAGAAACACCAGCTTTCTATATCAGCCGCACTTTTGAGTCCGTTGAATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 28803825 5' - hobo 2916 1 69.86 TCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGTATC:1 - chr3L 20168275 5' - roo 326 2 69.18 GAGCATGGGAATCGCCTGGTTAAGCACTTGTAATTATTTCTCATTCGATATTAATGCCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 + chrX 10667017 5' + jockey 4771 1 60.96 ATTGGCCTTAATATCTGCTGTCGATCTGTCCATCTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 18737909 5' + roo 18 2 73.29 AAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTTTTGAGTGGATCAC:1 + chr2R 21757921 5' - Quasimodo 7000 2 54.20 TAACGAAATTGAAATAGAAAATAAAAGGAAAAAGCGCAGAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr2L 4269058 5' - hobo 2902 1 60.27 TTGGAAGCTTATTAAGTAACTAACGTTTTAACAACGATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3L 70128 5' + roo 84 2 77.40 CAATTAGCAATTACCAGCACACTCACATCAACAGATGAAGTGCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 + chrX 20940731 5' + hobo 78 1 70.55 CAGAAGCCACGTGAAAGACAAGAGAGCCAGAGTAACTCTGACAACTTTGTTAGCAACACCTTTTGCAGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:2 + chr2L 13675870 5' - flea 204 2 56.16 ATGCATATATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chrX 22511327 5' + 1360 38 1 64.38 CTATAATTTTTCCCTGTTTATCGCCCGCCTAAAATTGCTATGAATTTTACAGTTTAGAGAGAGACCGAGGTTTGGACAACTTCGCTCTAAATACTTGTGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 - chrX 6186448 5' + Transpac 19 2 71.92 AAAATTCTCATGCATTTTATTCTGGCAATTTTTTTTGTCGAGCTTATTTCTCTGTGTTCTGCCATTTGCCCAAAATAACAAAGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 5398028 5' - roo 9032 1 54.79 AATAAGATAGCAATTATTTATCAAATCTGGCAGGGGGCCGAAATAAATCGAAAGAAACGAGCATTTATTTCTCCAAATTTTTGATTAATGAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 16219323 5' - roo 9041 1 64.38 TATAGAACAAAGTTACAATATTAGTATTTTTGTGTATTTACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGG:1 - chr3L 8295807 5' + Quasimodo 82 2 78.77 CGGGGCAGCCAACATGCGAAAAACTAATTTCGGTGCACACATCGTTTGTCTTGGCTCTCCATGCCGGAAGATGTTTCAATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCAC:1 + chr3R 14505623 5' + accord 6988 2 57.86 CTTGTATCGCCGTCCTGCTCGCGCAGATCCTCTCGCCCGCTCCCATGCTACTCTCGAAAGTATGCAATAAATTTCAAGCAATCTTAAAAAAGGATGACAATAAGTAAATTTTATAATTAATCTTAAATTAAAAGAGGCATTAGTTA:1 + chr2L 1258640 5' - G4 3775 1 50.00 TCAATAATATCAGTGCAACATGTGATAGCTGAGAACACACACTATCAGGATCTAGATTTCCTATCGAAGGAGTCGTCAGCATGGGGATTTAGTGATCATAACTTTGTTACGTGAAAACTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGG:1 - chr3L 19146747 5' - roo 8935 2 76.71 AAATATCTTTGTAAAGATTTCGAACTGTATCCCAAACGAAAGAAACTTAAGAGAAATTCGTTGAAAATAATTTATTTTTGGTCCATTTTTATAATGACAATTTTTAATCAAATTCAATTCAGTCAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAA:1 - chr3R 24229316 5' + Doc2-element 216 3 71.23 ATCGCTGGCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGTTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr3L 13888986 5' - 412 7474 2 66.44 AATCAACTCCGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAG:1 + chr3R 5518318 5' + Transpac 4994 2 69.18 ATGTGCCTTTCTCTCTTTCCAAGCGGTTTGATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGT:1 - chr3L 19907162 5' - P-element 2795 1 22.60 GAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACTAACAAAACAAACAATTTTTTTAAATGCCCATTTTCGGGATCCACTTTATTCCACCTATTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGGAA:1 + chr4 123938 5' + HB 110 1 58.90 CACACGAAAAAAATCACACGATATTAATATTACACTTAGTATTTCAATTCGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chr2R 8597024 5' + pogo 65 1 63.45 CAAGAATTCGCGAGCAGGATCCCTTCCGGTCTCGGAAATATATAGTTTCCTATGCCAGCATTTCCCTTACTTTATGTTGCAGTTTACGGCTGACCGGACT:1 + chr3R 10359310 5' - 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chrX 6910130 5' + I-element 84 1 77.40 CTTGGGTGACACATAAATTTACAGCGTTGGCTGTTTGGAATTTTTCACATTACACACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3R 26605544 5' + roo 8730 2 67.81 TCTATGTGCCTTTCTCTCTTTCCAAGCGGTTTGATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAGTGAGTCTG:1 - chr3L 19907165 5' - P-element 2798 1 24.66 TATCCTTTACATTGACCACAAAATGGGTTTTACTACTGCAGACCCGCAGCCTCAAAAATAAATAGTGTCGCAAAGACTCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAA:1 + chr2R 8092172 5' - 1360 462 1 50.68 AAAGTGAGTGAGTTTTTGATTGATACTTACAGTTTTTGTACATACGTATGTACAATATTTTCGATATAAAGATCAGTATTATATTATAATATTATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chrX 1208967 5' - Burdock 6364 2 65.75 TTAGATTCAAATTTGTGAATTCCACTTCATTAATAACATTACAATTTCTAAAATGTGCTAGAATAAACAATAAAGTTCAAGTGGAAGTGTTATATGATCGCGCACTTATGAAGCACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCATTCCCAC:1 - chr3R 3355995 5' + gypsy11 4149 2 61.64 ATATTACAAAAATCTCCTACACCAAAAGAATAGTCAAAATGTTTAGTCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3L 17602538 5' + Doc 80 1 67.81 TGTTTCGTTGACATCGAGAAAGTTAACGAAAAGTGCGATGGGAGTTAAAGATACAAAACATACGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr2L 8553304 5' + pogo 57 1 59.59 TTTAAAAATAAATTTAAAAAGTTGGGCATTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGATGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCG:1 + chrX 22596323 5' - INE-1 570 1 65.52 GCGAATGGGGAGCCCAGCGACCCGAGCAGTTGGAGATTCCGGAAAGTTGTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr2L 7810650 5' + P-element 69 1 37.06 GCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCG:1 - chr2R 6271515 5' - blood 161 2 70.55 TTGGCTCTGCATCGTAGACCCCATATACCATATCATACCCCTCAGAACCTCCCGCCATCCACCCTGCTTCTCCATACATATATCACCAGGCCGTACATACATACATGTATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chrX 17495653 5' + Burdock 10 2 78.77 ACATTTCGCATTCGGTTTTTGGGGTAGAACTTGTTTTCGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr2R 7623005 5' - P-element 2875 1 74.42 GAAAAAATAATTGCCTAAAATGTAGCAAAGACTTTTGGAATTAAAAAAAAAATCACTCTTATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chrX 3559716 5' + opus 10 2 73.97 AATATTAATAAAAAACTCGTATTATTTTTGAAAGTTGTACGTCAGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCT:2 - 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hobo 2911 1 64.79 GTTCCCGTGTGTGTCCATGATATATTGGTCGCCGAGAGAGGGAAAGAGATCCACGGAAAGGTTTGGCTCGATCCGCATCCGCGGTTGGGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAG:1 + chr3R 7041948 5' - Stalker2 372 2 63.70 GCCAATGCTCCGGGAATGACTTTATCGGTACTCAATGGCTCAATTGTTGGACCAGCCTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTT:1 + chr2R 15704603 5' - opus 294 2 58.65 CCGTAGTTGTACTATATCCTACTATAACATACTATATTTAATGTTTTTCGATTGTTCGCTCAAGCCGCTGCTGTAATAAATCAATTGCAAACGTACATATGTACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTA:2 - chrX 19690666 5' + gypsy 20 2 70.55 GTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTAATGTTATTACTTGCAGATGATATGAGAATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTC:1 - chr2L 16884781 5' - Bari1 1705 1 54.79 ATTTAAACCATTTATATATTAGTTGAAATGTAAATAAGTAATTCGATGATAGATACTAACTTGCGCTGGGTCTACATATGTCTCTGGAAACTGTATTCTAAATCTCAACTCTTCATACGGATGGACAGACGGACATGGCCAGATCG:1 + chr3R 4161088 5' - INE-1 113 1 60.96 GTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACG:1 - 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mdg1 7396 2 58.90 ATTGTTGGCGATTGTTGTCAGGCCTCAGGTTGCACATGTGGTGAACAGCGCGACGAGTAAATTGAAATGTCCCGTTCACTGGACGTGATCACTCTCACGCTTCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr2L 21909011 5' + transib2 17 1 72.60 TATACCGGAAAACCATTTGATATTAAGAAGTCCATTCGACCCTATCATTTGATCAAGAGTGGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAATTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 - chrX 12406689 5' + INE-1 88 1 55.48 ATTTTTCTACGCTTAATATTTATTTATTTATTTTTATAGCTCACAAAATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3R 7420413 5' + 412 7098 2 52.74 GGGCAGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATCATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:2 - chr2L 4631246 5' - roo 9022 2 52.05 ACACTTTACACATTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTTTCTTTGGATATAGTTTCGCATATTTGGAACAATTTTAAAATTTTTTCTCATTTTATTCTCCCATATCTATCGATATCCCAGAA:1 - chr3R 19447113 5' + INE-1 497 1 58.22 ATGGGGAACTATTCAAAAATGAGATATTGATTGCACACACAAAAAACGGATTGTGGCGCATTGTTATCGCTCCCTCGTCACTCATATTATCATCTTTATAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 21110491 5' - 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chr4 868781 5' - roo 392 2 73.97 GGCATACTTTTATCCGTGGTTTCAGGTGCATTTTGTGAAATGTTTAGCCTCCTTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 + chr3R 10708232 5' + Transpac 65 2 64.38 AGAGTATAAAATTGTTTGCCTCGGACCAAAGACACAAACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTC:1 - chr2R 15374793 5' - 1360 328 1 76.03 CCTTCCTTTCAAGGAAGTCAGTCACGAAAGCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACA:1 - chr2R 11692515 5' - P-element 2532 1 20.55 TTACGCAATTTTATTGGATTAACAGGCACAACCTGAAATGCGGATAAAAACAAATTTAAATATGCCGCACACATCAAAGTGTAGGACCAAATACATGTGATTTAGTAATGAAACTTATTAAAGACATCAACTTTTGTCTGAAC:1 - chr3R 30740200 5' - Helitron 272 1 51.75 AAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTTTTTAAAGTCAGATTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGGACATTTCGTGTTTGTCCCATCGTTTCTGTATTTTCTGACACTTTTTCATTATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACA:1 + chr3L 12972510 5' - Tc1 1556 1 71.23 CTGCGTAATGTAAACGCTTTTGACAATAAGCCAGAGTGTCCACGTCAGTTAACTGCCTAGAAAAAGCATTCAAAGGCTAATCCCAAAGCAAAACTATTAATCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGACGCGGTGCC:1 + chr3R 13481796 5' + HMS-Beagle2 6767 1 67.12 TCTTGTCAACACATTTTGATGCTGTATGCATCATTTGATGTATCAATGCATTTATCGCCTTTTAATTTTTCAAATGGTTTTCTTTGGATGTTAAAGTTGTAAATATAATATTTTACAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr3L 15389476 5' + I-element 7 1 78.77 AGTTTTAAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2 - chr3R 24011061 5' - roo 333 2 70.55 AGATTGCTCTAATGGCACGGAACTCATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr2L 18173728 5' + blood 7023 2 76.71 AATCGTGGCTCTTATATTTTATACATGTGTGTAATGGGTTTGCAATTTTCAGCGACTTTTTGACACACATACCACGCTCGATCCCAAACACATATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 + chr2L 7148526 5' + HMS-Beagle2 27 2 65.75 AACTATATCAATAATGTACATTATTTAGTAATTTTTTTTTTAAGTATCGATCCTACGACGTTGTGGATCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:1 - chr3R 7039857 5' - Stalker2 7596 2 53.42 AATATTTGATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGCT:1 - chr3L 10814637 5' + micropia 19 2 70.92 AGATGAGATTGTAGAAGGAATGAAGTTAACGGCGCAACAGCTATCATGATGGCAGAAGAACAATAAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 75547 5' + roo 8718 2 56.85 CTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTG:1 - chrX 21227210 5' - Tabor 427 2 56.16 ATCCACACATTATTAAATTATAATGTGGAAATTATTGAAATTACCACCACTAACTGAGTATCTGTTAGTTGAGGAGCTCGTATATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3L 18122256 5' + 297 6611 2 61.64 CCTCATCCCTCAACCCACCACAACTATCTCTCGCCCCAATTATTAGTTTCGTAGGCGTACGATTTGTTTTCACATTCTTTTAAATCGTATACATATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chrX 16589299 5' + pogo 18 1 71.13 GCTTGGCCAAAAACACTCACTCAAAACACACGCACACACAACCCCCTCACTTCATACCCATCAAACGTTGTGTTTACAAGTTTCAGCATTTCCATTAGGCGAAAAACACACACAGACACACATACATAAA:1 + chr3L 6810722 5' + Quasimodo 40 2 76.15 ACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTG:1 - chr3L 21202072 5' + G2 2670 1 76.03 GTCCGGGGATTTCAGGCTATATACAAACTGTGATTTCGTACCCGCACAATCGCCTTGCGATCTACGAGGTGCGATTCGCAAACTGTCGATCGATCGCTGGACTTTCACATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 - chr3L 17008190 5' + FB 15 1 75.34 GCGAATGCGAACAGCGAAGCCGAATAAAATAATGCTCTATCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCG:1 + chrX 8668528 5' + I-element 216 1 78.08 AAAATCCGAGCTTAAAACGTAAATGAAGAGAGACAGTTATACGAGTACAAGCACGGTGGTTAGAGAAGGGCGGCCAATAAATCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGG:1 + chr3L 22589133 5' + HMS-Beagle2 67 2 56.85 GTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAACGTAACTCCACACTTCATAAAG:1 + chr3L 23797675 5' + Helena 1180 1 46.58 CAACAATGCGACTTAAATTGAGAGCCACCGAGTAGTGGAGTTGCGAGAAAGAGACTTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAT:1 + chr3L 22132080 5' - roo 8686 2 61.64 ATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATAATTGAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr3R 13453376 5' + 412 7142 2 78.62 TATTTAAGAATATTTAACAGAAAAAATCAGTTAACGGGTTTTTCTTTCATGTTTTCAATCTTTCGGCTTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAAT:1 - chr3L 21636543 5' - 297 6925 2 54.11 GCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3R 8381700 5' + Tirant 8146 2 55.38 CTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAG:1 + chr3R 12789544 5' + G2 2815 1 69.63 TAGTTGATGCATATTTAAGTGTAAAGATAACCTGCAATTACATATCTAGCTATGGTACTGCGATACCTTTTTCGATGTAATTGATATAGCAATATATGTATATTCCCTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chr3L 1477319 5' + mdg3 5267 2 75.34 ATCTGGTCAAAAGCCCATCGGTGCAGTCAAACTGCACGTCGTCATCGTGTGTTGTTTATTTTAATTACTGAAATTGCATTCGAGTGCCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr2L 16382606 5' - hobo 2905 1 62.33 GAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTTAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACCAGAAAAATTATGAAATTTCGCAAATGATGAATTTCGCATTAACACTAACTGACTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 + chr3L 23746964 5' + INE-1 559 1 71.23 AAGTCGCCGGCCAGCTCACGACCGGCTGCCCATCAAAGAGTTATTTATACTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 + chr3R 13453314 5' - 412 421 2 65.75 TTTCGCAGGCGCTTTCCGGCTGCAGCTTTTAATGGAGTTTTGTTAGTTATTTTAAGTGTGCATTAGTTGCACGGGAGCCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGAT:1 + chr3R 8394386 5' + hopper 41 1 57.53 TCGAAAATTAATATTTTATTCGATATTTACGGCAATAACCAACCCTTTGAGAGTGTTCAGTCAAAGACACTACAATAATTCTTTATTATTCTAGAGACTTTGGTTCAGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 22577899 5' + 1360 11 1 76.03 TCTCCAATGTGACATGTGCCAGCCCCCTTCCATTCAACCCCCCCTCGAAAACGCCACCCCTCCCTCCTTTGGCCATTCAGGCAATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chrX 17726392 5' - pogo 2072 1 64.79 AAATGTTAAATCATTAAATACATATTTGTAAAAATCCTAATATGGGTAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr2L 6346587 5' + flea 22 2 65.94 ATGTATTTCGCATTAAAGTATGGGTAAGAATGTCATATTATGTTTAAAAATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2L 19731939 5' - roo 336 2 68.49 CTAACGATATGTTTTTATTGGTTTCAGAGAACGAGATTTTGAATCGATGTGATGTGTCCAAGATCACGAAAGTGAATGAAAATTAGAGAAAATTGGTTTGGCACATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 - chr4 909190 5' - 1360 3316 1 60.96 CACAAATACACACAGACACACACACACACACATGACCGCTTCGGGCAATTTCATTGCCGCTCAGCTCTCACACAATTGAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 - chr2L 13311342 5' + jockey 4789 1 58.65 CGCAAATGCTACTTTTTATGTGTACATATACATATACATACATATATACAAAAAATATGAAAACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAACTCCTAAACTACGGGAGATATTTGGATGATTTTTC:1 - chr3R 4679555 5' + hopper 57 1 54.11 TGGGGCGGCTAGAGTTAGTGGTTGGGGTTGAGGATGATCAGAGTTTCGCTGGCTGCTGTTGGGCCAACTAACACTGGACTACAGGGTATTGGGAAACACTTGTCTTCGCATGTAGCATGTGCCTATGCAATAATACGAACAATTAA:1 - chrX 14189287 5' + 412 15 2 61.64 TTTTGCATTAGCAGCAGGAGAACCTCAAATCAGCTTTAGCATTCCACCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3R 8631627 5' - roo 8997 2 67.81 ATCTGTGTTTATGTTACGCCTTTAACCTTTGTTCTGAGTTAATTGGTTGCTTTAATTCACGTGGTTAACATACATAAATTTGTTGGGAAATAGCACCCTTTGCAATGGGTAATCCTCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTT:1 + chr2R 21309469 5' - Doc 4510 1 78.77 AAGAGAGATGAGATTGTAGAAGGAATGAAGTTAACGGCGCAACAGCTATCATGATGGCAGAAGAACAATAAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 75552 5' + roo 8713 2 53.42 ATCACTTTAAAGTTTACTTTAAGATTTTTGCAGTCTAAGAAAGGAACTTGAGCTAGATAAATATGCTCTATTTCCATTGCATAATTGGTTTTCAAAAAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATAT:1 + chr2L 17052263 5' - INE-1 84 1 65.75 GCGGCTGCTTCGTCGTCAAAAATTGAAAAAATAAAATATAATACACAACTACAACGGCAGCCGATTCTGTGCACACAGACACACACACACACGGGCGGGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1 + chrX 1599325 5' - hopper 1394 1 68.49 GCTGCGATTTCCATCTGCCTTTCCCCACATTTTATTATGGTCTTTAATGAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACA:1 + chr2L 6153923 5' + copia 4941 2 68.49 TTCCAAATCGCCATGTTTAAGTTTTCTGTTTAATTTCCCTAATACCTGCATAGACTGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 - chr2R 6217183 5' + copia 4936 2 63.70 GACTCCTCTGCTTTGACTCCTCCATCCGATGCATAAATCGTAGCCACTGCTGCTCCAGCTCCTTCGAGCATGGCTAAAACGAGGCAGCCCCCATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAA:1 + chr3R 5258706 5' - micropia 77 2 75.00 ACAACTTTTCTTTGGTCATGGCGGCTGCCCTTTGTATCAAATTGGACTAAACTAACCTAAAGAGACAACCGATGATTGGGCATAACATAGCGTCAATACATTTAGACACCTTGTCATAATAAATATAA:1 + chr3R 9304552 5' + Stalker4 75 4 78.12 ATAATGGGGTTGCAAACGATATAAGCATTAACCTGACCTAAGATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3R 15137349 5' - roo 8995 2 69.86 AGTGTTGAAATAAATCCTACGTTTATTTGTTGCCATTTCTGATGCTCACACATTTTGCATTCCCATTTAAATGTAATGTAAATGTAAATGCAAATCGCAAAAGGGGTGGGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:2 + chr3R 18204298 5' + hobo 12 1 77.40 AGCTTTTTATCCCATAGTAAGAAAGTCTCACAATAAAATTAAAAAATAATTTCACAATATAATTTCATAAATTTTCAAATATATATTTATGTTTGCAATTATATATATATCACATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 + chr2R 14161264 5' + I-element 10 1 77.40 CAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTCCGGTTTAAAAAGGTGACATGCGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3R 29384691 5' - roo 321 2 83.56 AAGCATTATTTATACTATATACTGGTCCATAAATATTGTATTTCTATGATAGATGTTATTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGGAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 - chr4 880398 5' + pogo 60 1 62.33 TACCGCCCGTTCCACAATTACCGCCATGTGTTGACGATAGCTTGGCTCGGTGTAATAAAGCATAAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGTCACGGCTCCGCTTGACACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAA:1 + chr2R 4130929 5' + gypsy2 6806 2 73.29 TACTATCTAATTTTACTTAATTATATTATTTCAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 15540039 5' - roo 8987 2 78.77 CCGAAGGGGCTAATTAGTTTCGCCTCGAGGGGTATAATATATTTCGTCCAAGGAATATGAAAAATATACATAATTTTTATTTGAATAACAATATTAATTTCTCAGATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAG:1 - chr3R 15585686 5' + I-element 5305 1 72.60 GGATTGCATTTGTGCACATGCTGCCACATCTTGTCTTTATGTTTTGTTTACTCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGTGATCGCCTGCATTCTGCAGGTG:1 + chr2R 18671436 5' - Doc3-element 360 1 60.31 ATTTGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:2 + chr3R 21938139 5' + roo 39 2 58.22 TTGCACAAAACGCTTTAGACAAATTTGAGAATCACTTGAATGGCACCGTGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 - 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chr2R 14567824 5' + Ivk 428 1 67.12 AATTATCCATAGCTAGTTGTAAGTGCTCCAAATGGTTCAGGGTCGTAAAGCCGAAATGAAACGAAATCCCTGCATCTATATATATATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chrX 20456835 5' + opus 30 4 64.14 AATCAAAGTAAACCCTTTCATATTAACAATCATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATT:1 - chrX 21227224 5' - Tabor 7288 2 56.52 CTTGTGGGCCCAAAAAAGTATGCTACGGTTTAGTACGATGCCCGGTATCCTGCAGTCTGCATGCTGGGCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr3R 11108158 5' + jockey 63 1 52.05 AGCCAGGTCAAAGGAGGAGGGCCATCACGAGCAGGGGAGTGGGGGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGGATACGCGAA:1 + chr3R 13898188 5' + 3S18 11 2 70.69 AACAAATAAGCAATGAAAAATATTTAAATATTGAAATAAAAAGTAACAGAAATAAATATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1 - chr3R 8867117 5' + Max-element 8276 2 57.53 AACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 3911841 5' - roo 9022 2 58.27 TTTAACTTTTCTCTGTATTTTTGTTTTTTTGGCCAACGAAATGGCGTGCAGCTGGCATCGTGCACATCCTATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chrX 15406065 5' - opus 458 2 48.55 TAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3R 27007420 5' - roo 325 2 70.55 GCTAATCAACGTATGTTTTTACATCACCAAGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGGTAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCG:1 + chr3R 27398053 5' + roo 8758 2 78.77 GAACATCTGTTTCAAACAGTTAATATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3R 13375913 5' + 1360 22 1 69.18 CATAGTGATGGAGTGCAAGAGTTTTTGGGGTGAGCAAAGCCATAACGCACTGCTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr3L 5958624 5' - 412 7477 2 63.45 GTTTTGTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr3L 22435239 5' - opus 7472 2 64.38 ATGCTGAGTGATTTAATAATAAAATATATTCTTTGATCTACAGATTTAGAATAATAGACTATATCTAATAATTATAAAAATAACGCTTTTTACTCTTAAACTAAAACAAAGGCAATTTCAAAACATTTTATTTTTTAATTTACTTT:1 + chr3L 18080982 5' - HeT-A 309 1 59.59 AAATGGTAATTGAATTGAAATTTAGATAGGAACTACTCAAAGAGTCTTGAAATTAAAGTAGACAGCGTAAAAAATGTGAAGTCCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3L 20765118 5' + 297 6618 2 60.96 AGGGCGAATGAGAAGCGCGGAGAGAGGCGATTCATAATTAAAAGGAATTGCACTTGTATTCAAGATTGAGACGCTTTTGTTGGGCGTTGAAATAAAACAACAATGTGCGACTACCATTAAAAAAATGCAAAAGACTTTGTATATTT:1 + chr2L 7287443 5' - Cr1a 175 1 70.55 ACTGGGAAGGTGTGTGTGTGTGTGGATCGCTTTTAATGCCGCTTTCCGTCTACGAGATTTTCGGTGGTGGCTGTGTTGCCATGGTGGGTGCTTTTCCCACTGACTTTTCCCAAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATG:1 + chr2L 10571055 5' - R1A1-element 5024 1 78.77 TTCTTATCTAAAGCAAACACGGTACAAAGTAGTTAAAAGTCTCGTGACGAACGCTCAACGCAATTGAGATAGTACATTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCG:1 - chrX 3399558 5' - hobo 152 1 52.41 CAGTGGAGATAAGCAAATATGGATTTCGAAATGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chrX 7042653 5' + roo 8753 2 80.14 GCTTCGCCTCGCATTTGCTGATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:1 - chrX 14979317 5' - accord 180 2 36.36 ACAATCTATACAGCTGATTAGGTTGATCTTAGATCGCAGGTTACGTACATTGCGGATTCATTGGCTGATTTGAAGGTGGCATATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAA:1 - chrX 5750631 5' - roo 183 2 54.79 AAGGATTCTCGAAAGGGGTTGTGTGTGGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCACATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 + chr3L 8249336 5' - HMS-Beagle 218 2 65.07 TTTTTTTTTGTCTTCATCCCATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATTTCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chrX 6615496 5' - roo 9006 2 65.00 CATGCTGAGATACTAAAAAAAGAAACCTTTCACAATAAGCCCATTTAGTTTAATATAATTGGAAATACATTTTGAAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 - chr2L 16607351 5' + 412 11 2 71.23 TTAAGAATTTACTAAGCCTTCGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1 - chr3R 17766837 5' + HMS-Beagle2 6928 2 52.74 TTGCGTGCTGTTTGCGGAGCGTGTAAATATTTTGTTTTACAGCTTCGAGCCGAGGCAGCCGCCCCTACATGCCGACTAATAGATTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCAC:1 - chr3L 15772028 5' - P-element 68 1 55.48 TTTCAAATAATTGAAATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 20168311 5' - roo 9026 1 54.11 GGAGCGAATGCAGCTCGAAAACCCTCGAAACACACACAGGCACACACACCTCGCACATACACACACACACAC:1 - chr3R 18960754 5' - Stalker 446 1 62.50 CACTGTACCACTTTAATTCGCCCTTAAATCAGGCAATTAATGTCCCGAATTCGCCGCGTGTCCATAAACAGTTCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAA:1 - chr3R 23173401 5' - Cr1a 4121 1 52.74 GACGGTAAAGTTTTTGGCCTGGCAAATGGCAAAAGTTTTGAGCTCTACTCCCGTTATCCATTCATATACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAAT:1 - chr2R 18723769 5' - 297 344 2 54.79 AAAATTCAAGTGCGTTTTCATTTGGGAACGTGCTCTTCGAACGACGCGTGAGCCGATCTACAACAGATCGCCAAACGCCGCCACAAAATAGATGACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chr3R 7512812 5' + jockey 4701 1 65.73 AACTTTTTTCGGATGATTACGAATTTCCCTATGTAGACCAGTGCTACCTCATGTGGCATCGTCTTCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATGTCAGATAAACATGGAAACCGTATATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGC:1 + chr3L 11313222 5' + Cr1a 455 1 54.79 TACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAACATATAAAGTATATTTATTCTTGATCTGGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 - chr3L 22721121 5' + INE-1 96 1 80.14 AAGACTTTTGGAATTAAAAAAAAAATCACTCTTATTTGTAGGCCATTTGGTAAATTTCAAAATAAAGGCATTAAGAAGAATGCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chrX 3559689 5' + opus 37 4 55.48 ATGCAGGCAGTTACTAGAGCTCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACAC:1 + chr2R 17696023 5' + rover 57 2 60.27 CGTTCAATATTCTAAGATGCTTTATAGAAAACACATATCAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 - chr2R 16073003 5' - opus 423 2 74.66 GGGTATACATGGCAGGTCCCATATGCATAAAGTTATCGTTGGTGACAACTAGCACTGCCAAGAGTGTTCCGCATAGAGAGAACCTAAAAACAAGAGAGAATGGTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAG:1 - chr4 183983 5' - INE-1 547 1 63.64 TATTTTACAAATAGCAGAGCATAGGGCAAAAGGGTAGGACCTTGCACAGAATAAAGAAAAAGGATAATAGGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 10433312 5' + 412 50 2 56.16 GTGCAATTTGACTCGTAGCAGAAGTGACAAACGCACCAGCGGCAGCACAACAACCAAGGCGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTT:1 - chr3R 2525983 5' + Stalker2 7302 2 55.00 GTTATATTCGAAAGAGAAGACAAATATGATAATTATTGCTTTGCGTTAATGTAGAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1 + chr2R 7009414 5' + Quasimodo 60 2 65.75 TTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTATAGCGGTATGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTA:1 - chrX 7847228 5' - hopper 29 1 69.18 TAGCCCACGTTTAGATTTTATGGCCGCTTCCCACATCCCCGCCCCTTTGCAAACTTTTCTCTCTCCTCCGGCCAACATGCACTTTGTATGCACTTGAGTGTAAAACTGAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATAAAGTAGCCCGTC:1 + chr3R 18867702 5' - gypsy4 6745 2 67.12 GATATTTGACTTTCTACTGCCAGATGGTTCCCCGAAATTGAAAAGTTTTTGCTTGTAAGTCAAATGATTTTCATTTCAGTTGATTATTATAATATTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCAAAATAAAAAAATT:1 - chr3R 31024373 5' - Tc1 1529 1 53.42 CATCAGTTGGTTCCGAACGATAAGTCTATTGCCAAGGAGGCCAAAGACTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3L 17746353 5' + roo 8737 2 67.12 ATGCGATTTTCCAGCCAGACAGCGCTGGTATCGGCAGGCTCAGTTTGTCAATCGCTGGCTCTTAATAGTTGTCCATAATGGGGGTCTATCTATCAAGCATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr3L 13889036 5' - 412 487 2 73.85 GAGCTTTGCGGTCTGTGTTGATTCGAAAGGGTTAAAAGGCGTAAACAAACCATAGGATCCCGCCCCCAACTCACACATCCACATGTCGATGTACATGTGTATGTAAATGTTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 + chr2R 20389349 5' + copia 12 2 76.03 TGTGATGTTCCGGCATTTTCCACCTACAGAGAAAATTATAGCTTGGACTTTCAAAATTACTTGAATTTAAGCATGGGCCTAGATATTTTTTCCTGACTTTCCTTTACGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATT:1 - chr3L 14262827 5' + blood 225 2 73.53 GCCCGCAACCCCCTTCCACCACCAGCCACCTCCACCTGTTTCACCCTTTCGACCACTCTCTTTTCATCGATCAGACAGATGAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chr2R 21362719 5' + Tirant 8127 2 69.05 ATTCAATTAAAATGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTATGCCTGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:1 - chr2R 21199713 5' + jockey 4748 1 51.40 GAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 20983916 5' + pogo 41 1 57.24 CCTTAAATGGGGATTATAGCTGACCACAAAACTGTTACAATTATGGCTTGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCG:1 - chr3R 20308242 5' + invader4 2830 2 67.81 ATTAACTAGTCAAGGCTACGCCTGAATTAACATGGTTCGATTGTTACCGTTCATAGTTGAATGTTACAACTGTTTACAAGGAGGAGATGGAGCCATTTCAAATCCAAGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATT:1 - chrX 23036004 5' + HMS-Beagle2 11 2 66.44 GACGAACCTGCAAAATTTAAAATATCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGG:1 - chr2R 5540421 5' - Quasimodo 6926 2 74.56 TTCATCTATGTCCTGCGCGTTTCTTACTGTCCGACCTTCTGCGCGGAAAGCTTCCAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGTTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCT:1 - chr2R 1861781 5' + accord2 112 1 71.92 AGTATTTTCAAGTTATGTTTCGGGCACTATTTGTTAAAAACCACCTTAATTTTAAGGACATAGCACGGATTCTTTTTGTTACTTTATAACCATATTTCCTATGCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 - chrX 11415844 5' - mdg1 404 2 73.29 TCCATTCGCAGAAGCCACGTGAAAGACAAGAGAGCCAGAGTAACTCTGACAACTTTGTTAGCAACACCTTTTGCAGTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:2 + chr2L 13675862 5' - flea 212 2 61.64 AAGCTATGTTTTTGTATAAATATTATTTCATTCATTTTGCCTACAAAAAAAAACATTTAGATTTCAATTTATGTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:2 - chr2R 10695886 5' - roo 358 2 54.79 GTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chr3R 9550990 5' - P-element 2823 1 41.78 CATAACAATAGCCAACTGAACTTTACTTAACTCGTATAAAATTGTACTCCTAAATGCCCCACTTCAGCTTTAATTGGAATTAAACATACCAGTTAGAAGAACAACTATATTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr3R 14138477 5' - mdg1 7450 2 78.77 CCGCCGTTAATCGTTTATGCGATGCTCTGGATAACAATCAACAGTAATTCGCGAATTAGCGAGCGAAGAATACGCGAAGGATGATGGATTTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chrX 11691855 5' - mdg1 7429 2 64.14 TGATGGAGACAAAAATTTATCTTGCTACATATGTACATATATGATATTTATGTGAAGTATCATAGTTTGGAATATATTCATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 21938142 5' + roo 42 2 56.16 TGGCTCCTTCCCAAGGCTGAGACTTTATTACTTTCCTTGGCGAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr2R 13695611 5' - blood 329 2 52.74 CAACAAGCACAATGCTTAAAAGTTGAGAATAATTTATTATCTGTATATCTAAAAAAAAAAATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGT:1 + chr3R 19628911 5' + Transpac 53 2 60.27 ACCGAAACCATACCAAGATACTTGTTTAAATCCCCAAAGTAGCGCTAAAATACGTAGCTGCTAACGCACAATTCATACCAACCGAGCACTCCTCATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCAC:1 - chr2R 13871524 5' - Bica 74 1 62.33 GAACTATTCTTGCCAGAAAGAAAGAACGTGAAGAAGGTGGAAATAAAAAACCCAAACGAAAGCGATAAAGAAATCAAAATCATCGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 17506117 5' - roo 9036 1 62.33 GTTGATCTTTGTGCGCTGTGAATTCCCTCAATCGAAAGCAAAGTCCCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr2L 13850640 5' + roo 8738 2 67.81 TTTTTGACTTAAAAAATATTTCAGTTGCCAACTCAGTGTGCATATTATATGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 20260810 5' + roo 58 2 64.18 AACTACAATGCCGAAGGTGACGTATCCGCTCGACAGCCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 + chr3R 14277901 5' + P-element 81 1 29.66 GGGGGAGAATCGTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCCTGCGATATCATTTATCATACTAAATTGAAGGGAGTTGAGAAGTGTAGTGGAGATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chrX 17495845 5' - Burdock 6369 2 70.55 ACATGCAGTGGATTTTAGCATTCTAAACCTCATGCAAAACTATTGTGGGCGAAGGCTGAGCACTAAACATAATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATATCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAATACCTATGATTTACA:1 + chr3L 12072520 5' - HB 1579 1 50.00 CATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3R 20983921 5' + pogo 35 1 61.11 GCTCTAGCCAAATCTACGGGATACCCTGAATATTATAAAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chr2L 11725082 5' + F-element 30 1 67.81 ATTTGTTGCGTTTTAAATTTTCATGCGCAGCGAGAGTCGGCAATTACCAAGGCCTAAACTATATATACGAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 - chrX 7848304 5' + flea 4761 1 71.29 CGCCTCCACACGTTCACATTAATAACTAAAAGATAGCAATATAAATCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGC:1 + chr3L 23690747 5' + micropia 102 1 68.06 GCCCATCGGCCTTGGTATTTGGTCCTTGGTACTTGGCACTGCAGTAGTACTAGCTACCAAAATCAACGCCTATGCAAATTTGCCGAAGGACCAAGGTGATAAGAAACACAGAAGAAAAAACAGTGCTTCAAAGTAAAAAGAGCAAG:1 - chr2L 16202820 5' + rooA 457 1 66.44 CGGCAAATTTCTAGTTAAAGAGTATTTCTATCTCAGCAAGTCGAAATTCCTTGAGTTTCTAAGCGACGGCAATTGGTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAG:1 - chr3R 17653388 5' - opus 7211 2 52.41 ATTAAAAGCATTATAAGCGATGCGTTAAGCGCCCGATCTGGGAACAGTGCCACAATTTCAGATGTACTCACTGCCTCGAAACGTGGTAAAGATTAAGATCGCTCGATTGTCTATTTTTTTTATTTTTTTTTTGTA:1 - chr4 868076 5' - G2 3075 1 77.04 TATCCCAATTATTTGCAGCAGTTTCTGCAAATGCATCTAACGATATTATACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr3R 10900939 5' + F-element 41 1 59.59 TTAAGCTGTTTGGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTANTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr3R 25962075 5' + I-element 45 1 48.89 GAATCCAGTCTAGACGATATAAATCAAGATGCCCCCAGAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGGGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCAC:1 + chr2R 18035124 5' - R1A1-element 5282 1 65.00 CTGCAGTTGGAAATTTCTCTTGACTTAGTATGTTGTATTGCTGAGGGGAGATATATAATATTAATAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCTGGTTTCCTTATT:1 - chr3L 18555183 5' - Transpac 355 1 55.48 GATCTGTCCATCTCTCGTAGTTGTGACTTGTTTAATTGTTAACGATTAACTGCCGTTAGGTGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 18737931 5' + roo 40 2 58.22 AATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATA:1 - chrY 2720372 5' + ZAM 8150 2 77.40 GAATGGATCATTTTTAGTGTTGCTCGTGTGGTTGTTGTGGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCGTCTG:1 + chrX 16473988 5' - F-element 403 1 65.83 ATAGTAAAATAAATTTCTGAGCATTAATAAAGCACAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr2R 16749819 5' - roo 322 2 78.62 ATCAACAATGTTGAAATATCACTACACTTTGTCACTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 + chrX 5456577 5' + roo 8750 2 78.08 AAAATTATTTTTTGTGATGATAAGAAAATTGAGAAAATTTTAAATTTTAAAATGAATGCTAACTAAAGATTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1 - chr3L 20573882 5' + pogo 63 1 53.42 GTGCTGACACTTTGAGCCGAAGCAGAAGCTCTACACTGCAACACACGTTTGTATGACAACTAAGACTATTTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAGATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr2L 11476379 5' + pogo 48 1 52.05 TTTTGTGTTGTATTATTAAATTTCTACATTGTAATTTTTGTTTTATTTTTATATGTTGGTTTTAAAACTTAGTTGCCTTTGGACTGAATGGATTACAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTTTTTTTTTCGGATACTTTTT:1 + chr3L 6536325 5' - 297 433 1 60.27 TCTGAGCTTCTTTGGACCATAGAAATGCATAGACAATGATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTT:1 + chr2R 17696043 5' + rover 7028 2 71.23 CATGCGGTCGCACATAAGGAGCTTTTAGAGAGCGGTGGAGAGGATCCAAAGAGTGGGAGTAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 + chr3R 11758488 5' - P-element 2826 1 43.15 GCTGATGCACACTGATGGAAANTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 - chr3R 13529967 5' + jockey 81 1 76.52 GGGTAGGATCACGCAGATCCTTGAATCGCTGCTGCAGCTCCTTGGTTTCGGCCTCGATATTCTGTGTATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGACCATATAAAGTATATGTACTCTTGATCAGGATCAGTAGCCGAGTCGATCTG:1 - chr3L 3358846 5' + INE-1 98 1 51.37 ATTTCCAAGGATATGATGTGTGCATATGTATGTGAGTACGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTC:1 + chrX 3235532 5' + 412 7230 2 73.29 AAGAACAAAGTGCGGTAGAGAGCTACAGTTTCAAATAATTGAAATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTT:1 - 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chr3L 8754816 5' - mdg3 5405 2 78.77 CTTGTTGAATTACTAATGTCTCATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 15102347 5' + roo 52 2 53.42 AGATGTATATAGATATATATATGTATGTGTGTATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGCGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr2R 16643291 5' - roo 8984 2 78.08 CTCTTCCGGAGAAGAAAACAAAAAATGAAATCAGAGAGCCGAAGCCCGAGAAACGTTACATAAATGAGAAAAAAAAAATGTCGCATAAGCCGGCGCAGGACATACTGCAATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCC:1 - chr2L 8752023 5' + Quasimodo 420 2 74.48 CGTCAATCGTAAGAAGAAGTCACCGCGCAAACACCAAATATACGCTATGCTGGACAGCATCGAGACCTACAAGAGTCAGCAATTGGAGAGGCTGAGAGAGAACTATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAA:1 - chr2L 13186787 5' - mdg1 422 1 73.10 ACAGTGGCTTTTATTGCCGAAACAACAATAAATATTTGTCACGGCATATGAATTAATTAAAAGCGTAAAATGCACCCACTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGG:1 - chr3R 9114023 5' + opus 7253 2 55.63 AATTGAGAGAGATGATAGCGATGGTCGAGTGTACTTTAATAAACGCATAAATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTC:1 + chr3R 12789511 5' + G2 2777 1 56.92 GATCCTGATTATTACACCAACAACAACAACAGCAGCAACGAAGGCATGAAGGACCCGACTTCACCTGAGTGCCCGCAACCCAGGACATTAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAAT:1 - chr2R 16495220 5' + copia 235 1 58.22 ATGCCGCGGTTCAAAAGTACCATTTAATCTGTGACGATTCTATTTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCA:1 - chr2R 12249038 5' - Juan 4132 1 71.92 ACAAACAGCGAACAGCGAACACCAAAAAATAAGTAAGAGCTAAAAACTGTCATCGTTTAACAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTCTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 8208414 5' - roo 349 2 59.59 ACGAATTTCACACTTTTTTGGCCGCTCGATTATAAAGATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr2R 6514406 5' + roo 78 2 73.29 ATTTTATACATGTGTGTAATGGGTTTGCAATTTTCAGCGACTTTTTGACACACATACCACGCTCGATCCCAAACACATATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 + chr2L 7148541 5' + HMS-Beagle2 32 2 59.56 ATGAAGCCACCTGAATTTTTACTATCGTCGAAAGTTTGCCGAGATCAGGGCGTTCTCTCATTAAAAGTCGTCACATACATTTTTGTATATATTTGTATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTG:1 - chr2L 22044599 5' + McClintock 19 2 70.55 TCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGG:1 + chrX 21227134 5' + Tabor 89 2 76.03 GCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAAC:2 - 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mariner2 486 1 78.08 GCTGCCAGCGTCGCAGTCGACGTCGCAGCCGAGCGAGTGCCGAGCGAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr3R 17944002 5' - P-element 2839 1 52.41 GTGCAAATTGTAATAAATAACCAAATTGTGTTTAATTGAAAACTCATTAGTTTAGGCGTTACAGTGTATAAAGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAA:1 + chr3L 4584196 5' + Tirant 95 2 52.17 TCTAAATTACATTCCTAATCAACAAGACAATTGTTTGCCAATTAATTAGGTCGTGTGCATCACACAATGGTAATTAACCAAGTTCAATCTACCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chrX 5721787 5' + pogo 27 1 63.70 GGAAGAATATGTTTGGGCCCAGTATGCCTTTGTATTTGTGCGATTCCTGGGTATACAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr2L 20550959 5' + 412 7118 2 61.64 AGTGGAAATCAAACGAAACATAACGGCACAAATAGTTGGCTTAAACACAGCCACTATCACCGAAATCACCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATTTAATGTATTTATATTTATTTATAAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGC:1 + chr2R 24960045 5' - diver2 420 1 73.79 AACTATATGGCCTTATTAAGCTGTTTGGCTTTTTATTTAAATACTCATTTTACTTTGAATAGACGCACCAATATCTCACCGACGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3R 25962090 5' + I-element 41 1 56.16 GGAAATCCCACTTTTCCAACTCCAGAAAAATCTAAAATAGAAAGAGAAAAATAAAAAATCTTCCTCGTTTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTC:1 - chr2L 3845869 5' - invader2 379 1 60.27 ATCGTAAAGCCGTAAACCATATACTTTATTTACCCATTAAGTAATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr3R 21843764 5' + blood 77 2 69.44 CAGGCAGGTGGCCATAAAATGGCATAAAACGGAACATTTCGGTGTTTAAATAATGCTAGAAATTGCATTTAGAATCTATCTGCCTTTGGCAGATGGGGATTGGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr2R 8689317 5' - hobo 2920 1 72.60 AAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:2 + chr3L 16200756 5' - roo 8988 2 74.66 CCAAGTGGCCGAGCTGGCCATCAGGCCATGGACCAATAGGACGGGTGTGGCTCCAGACCGCGGAATCCGATGCAGGCAGAGCTTGTAGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGGT:1 - chr2L 10644686 5' - F-element 422 1 72.27 GCGGCATCACCTGATTTGCAATTTCTACACCAACTTTCCACCAGCTGAACATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 + chr2L 3059353 5' - P-element 2820 1 39.73 CTAATTTTGGTAATAACCAATTCCAAATGTGCATAGATTAGGCCCGACTTAGAGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chrX 7032761 5' - roo 9004 2 62.33 CTCGGATTTTGCTTAAATTTATAGTGGATGGTCCATCGTTATTAATTAATTTTATGAACGATTTCCCCACCCGAAACGAAGATCCTAACACACTCTATCACTTGCTCCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:1 + chr3R 10062091 5' - copia 240 1 69.18 GCCAACAAGCATATCAAAAGGATCTACCATGTGGGATTGAATGCTAGACGGTGAGTAAAACATTTATAAATTTGGATCTATTTTGGAGATCTAAATGCCGTTTATATAGTGGTCAAAAATCTGTACAATAAACAGAACAAAAGTAT:1 + chr3L 15980904 5' + Porto1 191 1 52.74 AATTCGGCAAAATAAGCTTCTGATTGGATTGGTTTCTCCATTTCAGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATA:1 + chr3L 9659436 5' + mdg1 76 2 70.55 AGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 + chr2R 14431218 5' + Doc 79 1 65.75 GCCAAAGAAGCTCTTACGGCTGGACTCACGGTTTCCTCTTCCTTGAACGTATAGCGAGTATCTGATAATCGGGGAAGTTGACTATATCATTCTCTCTTGTTTGATATACATATGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTA:1 + chr4 419912 5' + S-element 1 2 63.01 GTTGATTTGCCAATTATTGAAACAGGTGCGTGTTAGTTAAGCCCAAAAATGACTAAACAACGCGCACTAATCGCAGCACTTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAA:1 - chrX 3560538 5' - opus 7418 2 66.40 CATACTTATGGGGGCTGCACTAATGCAATCTGCAAATTTGAATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACACTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGC:1 + chr3R 9657756 5' + jockey 4736 1 66.15 AGATGAAATTGTAAAAACGAAGTGATCAGTGAAATAAAGTCGCATTGGTTTCAGACGTTTAGTTAGTTTATAATGTGTACTATTGTACATGCCTAGTGACTAAGTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAAC:1 - chr2R 18044088 5' + jockey 4577 1 67.12 GCGGCAACAGAAGCAGCATGAGTGCCAAGAAACTGTGAAGAGTGTTTCATAGAAAAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTA:1 + chr3L 17934922 5' - HMS-Beagle 6981 2 60.96 ACGACTTCCCAGTCTTATCTTATAAATTAAATAATAAACTAACGCCCAACTGGATTCAGATAAAGCTGGGTAAGATTCTGCCTCGAGGCTCGTTATTGAATCAACAATGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATTGAGAGACTAA:1 - chrX 20677968 5' - Tc1 141 1 67.81 CTATAAATCGAAAGATCAAGCATTATTATCTTGGATGTTCCAAATGCAGCTGGATGAATCTATTAGTGACTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAA:1 + chr2R 15013821 5' - pogo 14 1 58.22 GAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCATTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 - chr2L 4269020 5' - hobo 2873 1 67.15 GGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAG:1 + chr3R 23020785 5' - INE-1 562 1 65.52 ATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAA:1 + chr3R 8381730 5' + Tirant 8183 2 73.72 AGAGAAGGATATTTTACTATATGTATGGCAATTTTATCTCTGCCTCAAGTACTTTTTGCTTTGAACTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:2 + chr2R 22112630 5' + 412 56 2 56.16 GTTGCCTCCCACCCTCCATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACC:1 - chr3R 8049039 5' + Q-element 119 2 66.44 TGTGCAGCCGAATGCCTTCCGTTTGCCTTCAAAGCGAAATTCGATATGCAATTTCATTTGAGCAATTTTTTTGCACCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 21110645 5' + roo 45 2 50.00 GCAATTAAGCACGAAAGCTCAGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 + chr3R 17673701 5' + FB 17 1 74.66 GTGCCGGTATATGCGCGGTCAAAGCTCCGACTGCGCGGCATCACCTGATTTGCAATTTCTACACCAACTTTCCACCAGCTGAACATTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:2 + chr2L 3059319 5' - P-element 2854 1 63.01 CTATATCAGCCGCACTTTTGAGTCCGTTGAATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGCCACCCTACTT:1 + chr3R 28803893 5' - hobo 2871 1 75.61 CCCCTCGAAAACGCCACCCCTCCCTCCTTTGGCCATTCAGGCAATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chrX 17726352 5' - pogo 2035 1 66.91 GCTTATTTATGCATGTGCATATGCAAAGTTTTATGTAAGTTCGGTACCAAGTAAATATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGTGAGTCTCATC:1 + chr3R 11757890 5' - invader4 3082 2 45.21 CGTGTGTATGTAAAATATTTTAAAAGAACTTTTCGTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCAT:1 - chr2L 17318853 5' + blood 7099 2 78.08 GAGATAGAAACAAAGTGTCCACTGTTCAGGTGTTAAACAATCCAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 + chr2L 16537548 5' + Transpac 4967 2 61.67 TTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCGTCTTAAA:1 + chrX 16996078 5' - roo 8985 2 74.66 CTAAATCGAATGAATGCTATATTTGTCACCAAAAATAAACTGATTAATGCAGATGGCATAAAACGATTTCAAGAATTTTGTAGTTTTTATTCGGGCAACGATACGATACGATACGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 + chr3R 24074695 5' - jockey 4986 1 76.03 TCTATGATATAGTCATAGGGCAATATAAATCATAAATTTGTTTTTATAGTCTACGACACAAACATATTTTTAATTAAAAACCAAAAAAATTGTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTC:1 - chr3L 21202129 5' + G2 2612 1 64.83 CCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATNTCTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAAT:1 + chr3L 9522058 5' - opus 421 2 76.03 CTTAAAAAAGTGTTTGTATTGAAAGCATATCCTTCGCATTTCTATAAACACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1 + chr3R 29384624 5' + roo 70 2 70.55 AAAGGTTTCCTTTTGAAGATTCTAAATCAATTGTAGCACTAAAGTATCTAATGTTTGCAATATATATACACATCTTAACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAT:1 + chr3R 17766701 5' - HMS-Beagle2 7154 2 52.74 AATCACTTTTTGATTTATTCGCCATGGCCGCCGCATCCTGAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chr3R 5170953 5' + F-element 64 1 55.48 TTAGCAAGTTGTCAACCTTTTATCTATGTTATTATGTCTTGCCTACATAGCTGCTCCTTTTTTACTGGCTTCGCTCCTTTGTGTTCTACTTTATCTTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr2L 16554562 5' + blood 7017 2 77.60 TACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGTACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGA:1 - chr3R 12622344 5' + 1360 193 1 59.32 CTATTAGTTTGGGCAAAACATTTTCCTGGTTTGCTAATTTTCACTTCCGTTTATATAGATGTATATAGATATATATATGTATGTGTGTATATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2 + chrX 12263673 5' - roo 9040 1 65.07 GCAGATGGCATAAAACGATTTCAAGAATTTTGTAGTTTTTATTCGGGCAACGATACGATACGATACGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 + chr3R 24074743 5' - jockey 4938 1 54.11 CCCACAATATCCCGATACTGACTTGACAGAAATCAAGACCCACACTTGATTGCATCGAAAGGAAACCCGAGCGAAAGCAAACCCAACTCCCCTTTTCGGGACAAAAGAAACAAAGAAAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAG:1 + chr2L 15735207 5' - I-element 4982 1 80.14 GCTCCTTCATCCTGTTGCTCACCAATTGCAAACATATTCCAGAGCCGAGCACTTCAATCATCCATGAAATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 + chr3R 5977698 5' + copia 30 2 65.07 CCCCAAGAAAAATATATAAGAAGAGTTACTCGGAATGTGGAAGGTTGGTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 - chr2R 6085962 5' + FB 75 1 67.81 TAATTCAGTTGTTTAAGTATTTGTTAAGTAATAGTTGAACTTTCACCGTTTTCAGCTGAAGTGCGACTCGAGCTTGTCAAATCATCTTTAATGAGTTCCTCATCAATGTGTTTTGTACGCTTGTGATTAATTGGTTTCTTGGCAAT:1 + chr2L 3607800 5' + frogger 410 1 67.81 TACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr3L 12125291 5' - roo 8996 2 71.92 AACCAATTTTAATGCGAAAGAATTTAGAATATGTATCGGCTAAAAATGAATGTGAAATGCATTTAAATACAGACTTACTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAAT:1 - chr3L 2352730 5' + I-element 4921 1 52.74 CATATGTTATGTCCTCATAAAAAAACTTTCGATTCGAGCGACATTGGGGACCACACCTGGTAGAGCCACAGCTTCGGCAATTATATATAGTATTGGACTTATCGTGAAGGTTGGGCCGCAACGTCAGTAGGTATCACAAGGGGATC:1 - chr2R 4829645 5' + baggins 12 1 56.85 GGTAACTGGTAAATTATTTAATTAAAATTCATTAAACATTCGAATATGATTGTGAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTCCACTCGATCGCAATGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 19698021 5' - roo 404 1 76.71 GATAGATTCCACTTATGTATTATTTATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTAACATA:1 + chrX 20266140 5' - BS 5055 1 58.22 GAGGAAATTTGCGTTTGTGCGCGGATTTATTTATGGCCTGACGAGAGGTCGGGGAAGCCGCACAGATTTGTCAGTTCATTAAAAATGAAGCGTATGTAAATGTTAATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCT:1 - chr3R 13323987 5' - F-element 4662 1 73.29 GAAAATTTCCCATCAGCAATTATGCAAGGAATAACAAACAATCCGTGAAGCCGGGAAGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr3R 14688451 5' + FB 24 1 66.42 TCCATCGTACGGCTTCATTGCACCTTCAGCCGAAGCCAATCTCATTTCCATTAAATTGTCCTGGCCTGGCTTGCGCACATGAATCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2R 13695749 5' + blood 7048 2 59.59 CAGCATTATACACAAAGAAATGTAATAAGATTGTTTGTCGAGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr3L 19222611 5' + 412 81 2 71.92 TTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTA:1 - chr2R 4774765 5' - baggins 5354 1 53.42 AAATATAGGCTGCACATTCGCATAACCTGTGAACCTAATCTGTACCAAAATGCATATTGACTACTTACAGACTTACTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGGAATTCTGAAGATTCCAGAGA:1 + chr2R 25074622 5' - Q-element 19 2 52.05 TTCTAATTTTTATTTGACTAGTTCCATTGCATAAACTTAAATACATGTTCATTTATGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 + chr2R 21619334 5' - blood 7323 1 62.33 GTGCGAATGGGGAGCCCAGCGACCCGAGCAGTTGGAGATTCCGGAAAGTTGTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGA:1 + chr2L 7810648 5' + P-element 70 1 37.67 TAATCAATTTTCATACAGTCATTTGGTAATGAAGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr4 490189 5' + pogo 25 1 69.86 GTTGTTCCGTCACTTTAAGCCTAGCACTCTTTCGTGGCACAGTTTCTCGGACACAGAATGCAAACAAATGTTTGAATATCAAGTGACACAGAAAACAGAAGCGACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr3R 31497785 5' + Transpac 16 2 71.23 GCATCCCGTCCAGGCAACCAAGGTCCACCCTAATGGGTTAGCCCTTGCCCTTCCAACTGCATTGTCACATTGGTCTCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chrX 18767792 5' - hobo 2938 1 77.45 GCGGTTGCAGCTCCAGGGAGCAGTCAATTAATTTCTCTTCAAAGTGTAACAAGAAAAAGTGCGGCAGATATATATAATTACAACTNNGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTC:1 + chr3L 8295713 5' - Quasimodo 7317 2 52.74 TAGTCGCTACACCAACACTAGATGATGGCAGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATA:1 + chr2R 6217120 5' - copia 197 2 78.77 GCTTTGCCACTGGCTTTTCCCTCTCTTCTCCACGTTCCTCTGTCTCTTTGCCACACACACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGATAGGAAT:1 - chrX 14825364 5' - P-element 2825 1 43.15 TTGGACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr3R 20345574 5' + blood 7039 2 65.07 TTGATCGCGCTTAAACGGAAAGCTTAAATTAAAAAATCATATTTCTTTTAATATGATACTGAGCTTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 19698184 5' + roo 8720 2 55.48 TCTTTAAGCCAATTTCAGTTAAAAGAGTGTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1 + chr3R 27007373 5' + roo 8756 2 80.14 TATGCAAACAAACCTATTACATGTTCTGAAAGTTATTTACAAAGTAGATATACAAAAAAGAAATCGAACTCAACTCCAATGCTGTTACGCGTAATGAAAATNTAATTTTGATTGGGTGAAAATGAATTAAAGTTGTGCACACGTTT:1 + chr2R 20842901 5' + Transib5 147 1 63.01 TTTTTCGAACTCACACTCTCATTCGCACTCACACTCTTCGGGTTTCGCTTCGGCTTCGTTTCCAACTCTCTCGGCGCTCTTCGGGGTCTCTGCTTATGGGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr2R 10541784 5' - P-element 2867 1 71.72 CTTTTAAATGCAAAAAAAGGTTTCAATTTACTCAGGGTTTTTTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3R 29384701 5' - roo 331 2 80.82 GTGGGCTCCAGATCCATTGATAAAGAATTTAGATACAAATTTGCTCATTGTTTGGTTTTTTGGTTGGGATTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3L 8754743 5' + mdg3 41 2 53.42 GGTGAACGTAAAAGTAACGGAACGCATTTTAAAAAAAATATCGAGCATTTAATCGATACTTTCGTGTGTTTCTCAAGCCCTGGTCTAGCAAAATGAACCGAGATGAACAATTTACTCACAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr2L 7810796 5' + P-element 3 2 78.77 AATGCCCTTGTCAGCATTGGTGATCCCATTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGCCTATGTTTATGTTTATGCACGCAGCTAG:1 + chr3R 7420459 5' + 412 86 2 75.89 CCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATATACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3L 9522139 5' + opus 50 4 59.59 ATTTAAATATTGAAATAAAAAGTAACAGAAATAAATATAAATAATAAAAAATGAAATAATAAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGATCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr3R 8867096 5' + Max-element 8288 2 57.66 GTCGATTTATAGGAAAACCCCCAAAACAAAAAAAAAAACAATAAAACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTCTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1 + chrX 19121910 5' + 412 75 2 67.12 AGTTGAAAAGTCCACTTCTGGCGACCTCTTCTCGATTGTCCTTGTTATTGATGGTGCCTATTTCCAAAGGCACTTTCTTTGGGTTGTGTTCCAGCAAGGAGGCTAGGAGGTTCACATTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTT:1 - chr3L 21813577 5' - rooA 349 2 75.34 GGGCTCCGTTCTCAATAGTAGAGTCCTAATCGTGCATGGAGGCTTCTCGGACAGCACAAGCCTGGATCTAATAAAGAGTATCGATAGGGGAAAGGTAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAATCACTTTTTAAAACTAACTTAA:1 + chr3L 20262368 5' - pogo 1891 1 70.55 CAAAGAGAGAGAGAGATGCACAAACAAAATGAAATGAAGACTCCGGAAAGGTGCTCCAGGCTTAAGGAGATGGATGTTATGCAACGCATCCACTAGGCATAAGGGAAAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGC:1 + chrX 11769002 5' + micropia 5206 1 71.23 GATTGCTGCCCAGTCCTGCCTCACTCTTACTCACACACACACACACACACATGCACA:1 + chr2R 20426503 5' + accord 7034 2 71.93 CACCACCATAGGTTCGGATACAAGTCTTCGCTCACTATTACTTAAGTTCGATAATATAGTTGTTGTCACAGAAATATCTGATGGCGACTGATCTCAGCCTCCCCTAACATGAACAAATTAATTGAGTAATGGGTATCTTATAGTC:1 - chr2R 3340111 5' + INE-1 549 1 55.86 ACAAAGAACATCCCATGCAAAAGAAAACTTGTGCCTGCATTTGCCATTTAGAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 + chr3L 8273922 5' + hobo 65 1 65.00 CTTAATATTAATTATTTGACGCACAATATAATATTATCGTAAAAACTGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:2 + chrX 16996067 5' - roo 332 2 73.97 GAACTTTACTTAACTCGTATAAAATTGTACTCCTAAATGCCCCACTTCAGCTTTAATTGGAATTAAACATACCAGTTAGAAGAACAACTATATTGTTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chr3R 14138494 5' - mdg1 395 2 67.12 CTAAGAGAACAACTTTCAAGCACGACATCATTGTGGATCATCTTTGGACGGGAAATATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3L 16200739 5' - roo 341 2 63.01 GCCGAGTATCTCTTGCTTTTACCCAAAATTTGATACTTATGAAGGCTGATTGAACTGACTGAATAAATGCATTTGTAGGTTACAACATTTCATCATATAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 + chr3R 31032515 5' - hopper2 1533 1 67.12 CTAAGGCCAAAGGGGCGGGAAGGATTGTCAGCAGTCAAAGGAAGCCAGTGTGCGTGTGAGAGTCCTGTGTGTGATTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGGAAAGTCCAGTGAAACAATGCGCACATACACACAATCACACACACAAACAC:1 + chrX 8817792 5' + gypsy3 418 1 80.82 CTTCTCGTGCCACCTATCCTTGCAGTTTCTTCGGGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - 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pogo 2037 1 62.33 AGTGCTCTCTGTCGCACTTTCACCCTGCCATGAAGTAACAGAGAGCGAGAAAGAAGCGGACCCACCTTATCTTCCTCTTCCTCCCTACGAGCCTACTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3R 11758621 5' + P-element 27 1 67.81 GAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr3L 19349923 5' - 1360 3363 1 57.14 GTCGAAGTCAGCTTCCCATCTTCGTGGGCATCCAACAGATCGAAACAAAATTTCTCCCTGTCCACGCGTTGATGCTTTCCTCGCTGATAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTAT:1 + chr3L 13318277 5' - 297 6805 2 59.59 CTGCGAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTC:1 - chr2L 13328507 5' + BS 54 1 55.48 CTCTTGTTCAACAATAAATCTAATTAACAGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr2R 8086932 5' + 1360 81 1 74.47 TTTTGTGTTCCGTGTGTCTGTTTTACTCACTTTGCTGTCTGTTCTGTCTGCTGTGTTCGCTGGTGGTGGTGCTTTATGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGA:1 + chrX 5020408 5' + invader4 2691 1 61.29 GATGGTGGCCTACTGAATACAATTTACCCGTTGTACGTCCATACACATATATGTAATATATTTGTGCATATACGGGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3L 13888881 5' + 412 46 2 54.11 ATATTAGATTTGTTGAAAAGTATGCAACAGGAAGAAGGATGCGTTCCCGACCATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTAGCAATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAG:1 - chr3R 13936197 5' + INE-1 136 1 84.89 CCTAAACATTTGGTGACCCCGACGTGATATGTAACATTTCTTTATCGTGACCTCAAAAACAGTTTAATTAATTTCGGGCAAGGGGCTTCCAAGGGCTTCCTTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGGGAGCAGAAGATTGTTAT:1 - chr3L 24050692 5' - Gypsy6A_LTR 303 1 53.85 AAATTACAATATTATTGGCTTAATCTCAATTGACTGATTATGATTTTCTTGTTATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 + chr2R 15698064 5' + opus 7162 4 59.20 TGACCAGACTTTTGTAATGAAGCGTTGAAGTTGCTGTTGACGCTGGTGTTGCAGTTGCTGTTGTTGCACGTTACTGCATCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATC:1 - chr2L 18359944 5' + 17.6 366 2 52.05 CAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3R 13453430 5' + 412 7088 2 61.64 CATCTTTGTGTGAAGAGATAGACTATCTTTAAGCCAATTTCAGTTAAAAGAGTGTCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 27007348 5' + roo 58 2 62.04 GATAACTTAAAATAAATTTGTTGTTACGAGTCACGAAAAATATATTTTCTATCTGAAAACGTAGCCTTTTCTCTTGCCAACTTGCAATTGATTTAAATACTTCAAGCACTTTCATCATATAATACAATAGATATTTTTTTTTGTGT:1 + chr2R 10917407 5' - gypsy10 499 1 76.03 GTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCT:2 - chr2L 13328490 5' + BS 63 1 65.22 AGTAAATGGAAACACATAGACATAGACAGCTTGGTGGGCCACAGAAACATATATACACACACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGT:1 + chr3L 2668841 5' - Bari1 1649 1 57.53 AATTAGCACAACGAGCACGCAACTCGTCTCGAAAATCGAATGAGTAATGCATGCAAATAATAAATTAATAATAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAACGTAATCATCGTAATTCTCCAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAG:1 + chr3R 5208437 5' + gypsy3 6873 2 51.37 TAGCTGTTGGTCTATGTTTCAAATAAATATCGCTGCATACTTCTAGGTTACTGCTAGTTTGGTGAGCGAGAAATTTGAATGGATAGAGAAGCCACTATATTATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3R 6962481 5' + jockey 27 1 71.23 GTAAGCCGCAAAAACCAAAAGCTACTCTCTTATTAGCGCACTGAAAAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3R 24093511 5' + jockey 82 1 67.81 AAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr2L 13468243 5' + roo 8744 2 73.29 TTCGTGTCCTGTCGCCCCGAGTTCAGCGGAGTTAAGTTGGGTTCGGCAGCAACAGTTTCTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 19725480 5' + hobo 25 1 65.47 ATGAATGAGATTTATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 27007438 5' - roo 9007 2 58.22 TCATTAGTCCGACAATCATTTGGCCCGGCCCGCACACAGCTCATTTCATTACGCCGTTCATTAAATTGTCTCCCATTTCAGTCTGTACTTTTCCCCCTTTATATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAG:1 + chr3R 22889227 5' + Idefix 10 2 50.00 AATTTTATAAAGTCTAAATGAAGTGAAATTGAGGCCACTAAGCCAATTCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGGCCGATTTGC:1 - chr2L 16884701 5' - Bari1 1637 1 64.38 CTTCATTATATAATTTTTCCACAAAGTAGATAACAAATTGTAACAATTGTTAAATTGTTCATCTTGTACTATTTCTTAAGCTATTGTATATTAATATACCTAACAAGTCCCAAGTGTTTTCCATGTTTTTTTTTTTGTTTTGCCAC:1 - chr3L 11759477 5' + Tc1 1475 1 53.42 AACATGTATGACCATCATGTAAACCTGAAAAAACAATAAGGAAAGTAGTTATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAA:1 + chr4 1023657 5' + Idefix 58 2 66.44 GTAGGAGGCCGCCGGGACGAACTCGCCGACAATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGTAGTATATGCGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTA:1 - chrX 21947749 5' + mdg1 44 2 50.68 GGAGTTTCGTGGCAAAAGGTGGACGAGTGGGTCGAAGTGCCACAACAATGGAAGCATAAAGGGGAATCCCCGGCGAAATCAATTTCAGTATCTTATTTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGG:1 + chrX 20038873 5' - Doc2-element 417 1 76.38 CCTCGACAGCTATACAGCATTATACTCTCCCCAGGTAAATGCTCCGGAAATAGNCNATAGATCTGTGATTGCAGCCTTGAAAGCAAAAGTTCACTGCCTTTGAAGAAATTACAGAAATTACAATGCATGCAATTTCGTTACACAAA:1 + chr3R 2863763 5' - Transib5 172 1 60.96 GGACTCGCTTCGTTTGTCCTTTATAGTTGGCCATACATATATATAAGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1 - chrX 7626207 5' + Transpac 4990 2 69.86 TGTTGAAAAGTATGCAACCATATATTTTCACTCAATGCTTCTGGAGAGTATGCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCNAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr3R 28413963 5' + pogo 67 1 63.70 GCTTATTTATGCATGTGCATATGCGAAGTGTTATGTAAGTTCGGTACCAAGTAAATATGTATAAAAATACCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATC:1 + chr3R 11757890 5' - invader4 323 2 45.21 CATTGCATGAATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCANTNCATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATGCATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAAC:1 - chrY 2720340 5' + gypsy 7001 2 74.66 GCAGAAAACTGGATAGAGATCCACCGTCTACGAATTCCATCAGCAGCAGGGCGCATCCCTCGTGCCTCGATGTGCCGTAGAGCTCAACTATGTTGACATGGCTGGCCTTTGTCATTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGA:1 + chr3R 22733473 5' + Tabor 99 2 79.14 AGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATTATGATGCATGGTCTATGCCACGTTCTATGTAGGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr2L 4631242 5' - roo 9035 1 48.06 CATAAATCTTTCTCATATGTCTTTTTACACCCGTTACTCGTAGAGTAAGACGGTATACTACATTCGTTAAAGGGTATCCTATGTTGCTATCAAAATTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTGGAGATC:1 - chr4 422790 5' + INE-1 132 1 54.11 TAACACATCTACTAATTGAAAATTATGATTATATTAAAGAAAGAAATACAATTTTAAAATAAACACTTGAACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 - chr2L 13675995 5' + flea 4797 2 56.12 GGATTCCGCGTTGAACAAGCTAAGTGAAGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr2L 13697581 5' + F-element 54 1 63.12 TAGCTCCCGGTGTTAGCAGAGTAGAATTATGTTCCAATCCTACCACATATTCGGGCTTGTGTCGCTTCAAAAAATCGTAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTC:1 + chr2L 3912473 5' + roo 8810 2 60.74 CATGGTGGGCAAGCGTTATCAACGCAAACGTTGGCAGCTCAAGAATTATTATGCTTTCCGCTAAATATAATAATCTGGACTTATGGCCCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTC:1 + chr2L 15346958 5' + Doc 4338 1 50.00 CAAGCGTTGGTCATGTGCCATATTTATAAAGCTAACAATATAATGAAGGGGAATTCCATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - 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chr3R 14800997 5' - pogo 2065 1 45.89 CGGTGGGCCTGCAATGTCAGAAAACTGATATTAGTTCGCCTATCAGATACCCAGTAAAAGTATCTGAATGAAAAATTTAACAATTCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 + chr2R 17649194 5' + Doc 43 1 44.52 TTTCAACCCATTGCCGGGCAGCCAGGAAAGGAAAAGGATATGTGTGCTACCAACACAATGGGGCTAACAATTTTGAAGCTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3L 5398171 5' + roo 8706 2 58.22 GCAAATAAATCACACCATTGCCAGTGGGAGTCGCAGTCGAAATTAGTGTAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3L 13546564 5' - hobo 2901 1 58.93 ATGAAAATTATGTCTACAATATGAAAATAATAGAACATAAACTCAATTGCTCAAAACTTTATTAAAACAGTAACTGTAACATAAAATATTTTTGTCACAAGAGGGCATAAATCATTTCTCACTCCACCATAGACGAACACTTTG:1 - chr3L 16407688 5' - transib3 390 1 55.56 GTACATGCTGTATATCGATGTGCAGGTGATAGATTCCGAGGCATGTGCCAAATGGCTAAGAGTTCCATCCGTTGAGCATGTGACGCATCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGCATGCAAATAGCCTAAAAATAGTTCTTTG:1 + chr3L 9250953 5' + G2 268 1 56.55 GGAATTCCTCGACCATTCCCAGACCACTTTCACTGCAACTCTACGAGTATATATCTAATGATCGCCTATAAAAATATGAATATGAATTATGCCTCAATTCAATAATAACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTAAAGGCGCGATGCGCTC:1 - 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P-element 2826 1 45.89 CCTCATTTAACTCAAATGTTAAATAATATTTATTTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1 + chrX 12105265 5' - 412 410 2 79.31 TTTGACTTAAAAAATATTTCAGTTGCCAACTCAGTGTGCATATTATATGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr3R 20260812 5' + roo 72 2 68.49 ACTTTTGCCCAGACGCAAACATAGACACCACCGCGCACTCACACACCCACCGGATCCACCGCTCTCCGGCTCATTTATTCCGCTTTATCACGGCCCACACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 + chr3R 17059822 5' + jockey 4785 1 69.18 GTAGTTCTTTAGCCCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCATTTCCATTATT:1 + chr3L 21636390 5' + 297 21 2 71.92 TATTTGTTAGGTACTAGCGAATAGCTTTTAAATAGGGAACAGTTTCTACTTGTGTTTTCTTTGACATCATCTTCAGTTAAAATGAATGATATAATGTAAAAGAGAGAACAAATCCTGGAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTT:1 - chr3L 6353793 5' - G5A 427 1 75.34 ATTTAATTTTAAATATTATAAAATCAGTTACAATTACAGAAAAGCATTAGTTCGGGCTGGCAGACAAACGGACTGGGTGTAAGGACATTTATATTGATTAGTAGTTGGTAACAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 10056615 5' + hobo 9 1 76.03 TTAACGGCGCAACAGCTATCATGATGGCAGAAGAACAATAAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAATTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3L 75522 5' + roo 60 2 68.50 AAATTGTGTAATAAAAGGAAATCGCTTATAAATGCCGAAAATGAAATATTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGTTTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCACCTTTTT:1 + chr2L 7147312 5' - HMS-Beagle2 6733 1 67.81 AATTATCGTCGAACCCAACTCAGATGCGTTATACGCCTGTCTGCAATCATAGACGAATTTCTCGGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACT:1 - chr3L 21913487 5' + 297 12 2 77.40 CATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr2L 15549954 5' + hobo 51 1 56.93 TGAAGGCGCAACGATTTTATCTATTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGACGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chrX 8363623 5' + jockey 70 1 56.85 TTGTTTTTAATTTTCACACTTTCTCTACCGCCATTTGTAAATTTTTCGGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAA:1 - chrX 22731864 5' - Ivk 5148 1 75.34 GCTGAGTGTGTGCATAAGTTTTAATCTGCTTCCGTTACAATCAGCTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAGTAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTG:1 - 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opus 7486 2 66.44 AAATAGAAAATAAAAGGAAAAAGCGCAGAACTAAGAAAGCAACTTCCTTCCGTTTTATGTATAGTAAAGGTACGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr2L 4269047 5' - hobo 2907 1 59.23 ATTTTGTGTCGACTGGAGAATCATTTCTTTTCTCATTAAGCTGGTCGATTTTGTCTATTTTCTTTTATTATCATATATTGTTAACATAATTATTTAATAGCCGTGCGCTTCGCGGGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAA:1 - chr2R 3931726 5' + Cr1a 151 1 61.64 CTCCTCGATGGTGGTCACAGTGCCCCAAGGAGGAGTACATAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACA:1 + chrX 12365316 5' + hobo 80 1 73.43 TAAACACTTCTACTATTTCATGGATATTGAATATTGATGTAATATATATCACAATATTACAATTAACTTGCCATATACTTATTAAATTTAAAGTACATTATAATTTTTACATGATTAATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 - chr3R 12538217 5' - mdg1 7458 2 79.45 GAAAGGCAACAAAAGCAATAAAAAGAATACAAAACTTTGGCGCAGTTTTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1 - chrX 10547739 5' + P-element 73 1 33.56 ACTGCACACATCTAATATTTAAGCCATCAGCGTAGTCGGCAATTGCCACTCGACTTCAGCGAAGACCACCACTTCACCTCATCCTGGTTCGCTGTTCGACTNCTATGTTAGCATGGCTTTACGTTGTAGTTGCCACTTTTGCTGAC:1 + chr3L 14286206 5' - rooA 82 2 58.22 TCCACGACGCGCAGTTCCGTTCGCATTCGCGCGTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr3R 16349180 5' + P-element 41 1 57.24 ATTTGGTCAGCTCTTTTATATTTGCCTTGTTGAATTACTAATGTCTCATATTGAGGAATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3R 15102372 5' + roo 27 2 67.12 TTCGTGTCCTGTCGCCCCGAGTTCAGCGGAGTTAAGTTGGGTTCGGCAGCAACAGTTTTTGGCGGGCATCCTTCCCTGCTCCGGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGGTGCACTTTT:1 - chr3R 19725480 5' + hobo 5 1 74.79 ATCTAACTTTATTAGCACATTTCTGGGCCCTACAATGGGAATAGAGCTTGGTGCGAAGCTACTTGGCACAGTCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr2R 22761275 5' - 412 445 2 52.05 GGTAAGAAAGCTCTGACAAATTATCGCAAGCATCCATGCTGCAAATTACCTTTTTCAGGCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 17746266 5' - roo 345 2 59.59 TGCTAAGTGATCTGTTAATTATCACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAGTAAATGGC:1 + chr3R 22435531 5' - roo 312 2 78.77 GAAATTCCTTCAGTTAAATAATTCTCATAAATGCTAATCAATTGCATCCTATATCCTCAAAGCATAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 20168299 5' - roo 350 2 54.11 ACTTTATGTTCCGGTCGCCGAGCGGGAAAACGAATGTCGAAGGAAGGGATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATTGAAATTGGCAAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAG:1 - chr2L 21401131 5' - pogo 131 1 66.67 AGCCCTGCTCTCTCCATGGCTTTTGAAAGCATTTCACGCGGCAATTTTTAATGGCATTTGTTGGCCTTTGGGTGCGCTGATGCACACTGATGGAAATTGTGATAGACAGAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 13530042 5' + jockey 18 1 75.86 AATCCGCTGGATTTCTATAATATAATTGTTTATAATTTTTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:1 - chr2L 9062339 5' - Juan 4128 1 76.71 CTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:2 + chrX 21227085 5' + Tabor 40 2 58.22 GGGTACGAAAACAATGTTGTCTTTGGCTCACACATATTTACATACTTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCC:1 - chr3L 9522118 5' + opus 183 4 73.79 GCGAGAGGTGTTTGAAAGTTTTGCACACTTCACAATCGGCATGGAGCATTGGGTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr2L 4631139 5' + roo 64 2 60.96 TCTCTGCAGCCCATTGATTTTTTCAGCTGTTTCTTGTTTGGCAGCCAAAAAACGAAGACATGCATGTTCGAAAACGCTTATGCAATTGCAAGGGAAAAGTGAAAATTCTGAAAACAGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAA:1 - chr3R 27152393 5' + Doc3-element 165 1 80.14 GTTGATGGGCTGCCTTTTGGCGAGTGTGCGCCGACTGTTCCGGGAGTCAGTCCTATAGCTTAACGGCTCCGGCTGCACTTCACGATCAGGGGGACTGCCCCCC:1 - chr2L 15971631 5' - Rt1b 397 1 79.61 TTTTTGCTTAGTAATATTTTTTTATTCAAAGTAACGCTTACGTATCAACTTTTCTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATATTAAGACAAATTGTTATTGCTTCATTTTATATTTCAAATGC:1 + chr2L 19817779 5' + G4 3526 1 36.99 GTTCGGGCTAGCAGACAAACGGACTGGGTGTAAGGACATTTATATTGATTAGTACTTGGTAACAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chrX 10056664 5' + hobo 53 1 53.90 AGTGCTGAACACAAAGATGACTAAATAAATGGCAATCAGTTTTATGTACACAATCAAAACAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAT:1 + chr3R 5635875 5' - 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chr3R 7831318 5' + flea 4832 1 69.86 CCAAGGCGCCATTGTGGGCACCATGATTCGGACCCGGAGGACCACCTGGACCGCCGGGAAGAGCACCGAAATGGAAGGCAGTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAA:1 + chr2L 11437498 5' + mdg3 120 2 58.27 CTTGGCTATACCAATTCTGGATTATACAAGCGCACGTTTCTTGATAAATATTCAGCATGATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chr3R 14546480 5' - pogo 2041 1 63.01 GAAAAGTAGTTTTAAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr3R 24011068 5' - roo 341 2 65.52 AAGAAAACCAGCTAACTTTCTATAGGCAGAACAAATTAAAGTAACCAGATAAGTTAATATAGTTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1 + chr2L 11476255 5' - pogo 2046 1 56.85 AAGGTGAGTGGAAAAGGGACGGCATGCTGCCGGGTCGCGTGTTTACAAGCTCTTCTCCGTTAGTTCTAATGCACCATATACTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGT:1 + chr2R 16730808 5' + R1A1-element 5287 1 54.33 CATTAGCTTGATTATAAAGCTCACAAACATGTTGCTCAAAATAAATTATTATGAACACAGTTAAATGCAATAGGCAGCTACACTAAAACAGTATCCAATCCTTATACAGTAAAATTCGCTTAGCCGCCTCGTGTACTTTG:1 - chr3R 14801014 5' - pogo 2088 1 54.29 TCTGCAAACACAAAGTATTGGATAATAATTCCAAGAACTCGAGTTTCCGCCATAAACTCATATTGCTGGGCCCTAAAATGATTACAATAGTACGTTGTACGTACGTCATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAC:1 + chr2L 5961162 5' + S-element 2 2 75.91 CTGTGTATTTCCTCATTTAACTCAAATGTTAAATAATATTTATTTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chrX 12105255 5' - 412 419 2 72.60 ATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATACATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACG:1 - chr3L 23839725 5' + McClintock 6010 2 58.22 CGGTTTTAGCCTTTAGTCAATCTTGTTTGTTTTCATTTAACTTTCTATTTTGACCATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAA:1 - chr3R 17766817 5' + HMS-Beagle2 65 2 63.01 CAGCAGAAGGACAACCAGACAATCCTTTTGCGGGCATAAAAAATATGGTAGTTGCCGAAATAAAATCAACGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTA:1 - chr3R 13898320 5' - 3S18 291 2 54.79 ACTAAATGCTTACTCTGGCAGACAACAAATGGTAGGACAAGCCCCTATCATTCACTTGTGCGTGAAATGAATGAGATTTATATCTAATTTAAATATAATTTGAAGAGTGATGTTATGACACAGACTGTAAAATCCCCAATAAGAAG:1 - chr3R 27016586 5' - roo 409 1 48.63 ACACGGAGTTAAACATGCTGCTCTCCGGCGTCACAATTACACAAGGATGCTCTCTGTTGCCTAAAAAGTCAGAAAAGAAGGCCTAAACGTTTCAAAGGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAA:1 - chr3R 2156980 5' + Quasimodo 7270 2 71.23 ATCGCCCGCCTAAAATTGCTATGAATTTTACAGTTTAGAGAGAGACCGAGGTTTGGACAACTTCGCTCTAAATACTTGTGAAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 - chrX 6186429 5' + Transpac 30 2 62.32 AGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 30537630 5' + roo 8743 2 71.92 GCAACAGGTCGTTTTAATTATCGAGTATCAATTTAGATGAATTTCAAAAGATAAGCAAATCGTGAGCAGAACTTTCCACTCGCTTGATGATAATATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 - chr2L 5341634 5' + Burdock 26 2 64.38 CGTGGCAGTGAAGGTGGGCGTTAGCTTGGTTAGCTTTATTTTAATGGAATTTGATTGATTTGCAAACTGTAACTCGAACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chrX 8208259 5' + roo 8674 2 77.40 AAATATCGGCCCAAGGCCCATCGCCTTGACATAGAAACATGTGTTTGTGTTGCATTTTTTGGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCT:1 + chrX 19424583 5' - Doc 254 1 57.93 TATCGCTGCAGCGGAAACAGATACTCCGACAGGGACAAAGACAGGCATATTGCGTGTGTGCTGCCTCATGAATAATACATGTGCTCGAAGTGGGCGTGGCACGTCTGGTTGTATGTCTGACTGGATATGCGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 20419913 5' - accord 186 2 68.53 ATTCGAGGGCCAGTTTCAGATAGATCCACGACAATTGCGGGTTTGGGAACCAACTGCAATAACCAGGTGCCTGGAGACTTTTGTAACGTTTTTTTTTGGCTTGTTCCAAAATGGTAAGGATATATGTTGGAATATACTATTCAACC:1 - chr2L 20819393 5' + copia 1 2 76.03 AGTATACAACATTTATGTCCGAATGTCAAAAAGTTACAGTGCATGTCAGCTAAATATTTTTCAGTTTCTAAAATGTCATATTGCTTAGGTCACCGCACCTTCTTATCTTTTTACTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATA:1 - chr3L 14273655 5' - gypsy2 196 2 77.40 GCACGCCGCAAAAATCTCGACAAATAAAATTCATTTACAAAATGTTTTGCGTAGTTTTCTCGGCTCTGAGCTACGAAACAGAAGGGAAAAAAGGGGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 30537578 5' + roo 8691 2 61.64 GTATTCAATTTGCTTGTATTCAATTTTTAAATGAAATCCTTTACACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:2 + chr3R 6399325 5' - pogo 2068 1 63.70 AAAACAAACTCTGCCATATTTATGTATTTACTTATCCTTTTTTGATCAGTTGATTACAATTTTTGACTAAATATATCTGTGAAAATTTCTAGTTCGGAATANACGTTTTACAACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr2L 12394503 5' + Tirant 12 2 72.60 TGCAACGGCATTAATACGAGCTAATTAAACAAATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 15549996 5' + hobo 18 1 73.29 TAGTTTATTTTATAAATGTTCGAAACTGGAAAAGCTCAGACACGATTTCAAAAACCATTCGTCACTATTTTGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGACTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chrX 20233902 5' - pogo 2057 1 54.61 AAACGTATTGAAATGTAACGCATTGATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAA:1 + chrX 7480735 5' + Doc2-element 227 1 70.16 TACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chr3R 15047385 5' + F-element 63 1 71.82 ATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCA:1 + chr3R 23020797 5' - INE-1 563 1 59.09 AAAACAATATTTAAGCGAAAAGATAACAGACCAACATTTTACCATTTCTCCTGGGAGCAGTGCTGTCCTCTACCCACTAAAATACATTTTTTTTTTAATTATTGCCCCTTTAAATACGCGAATTAACTTAACCAAACTCACTTTTT:1 - chr2L 21917620 5' - HB 274 1 65.07 CCGGAGACGGGAACACAGCAACTAGCGCTGAGTGTGTGCATAAGTTTTAATCTGCTTCCGTTACAATCAGCTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAGTAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 - chr3R 6147348 5' + copia 51 2 50.68 TTTTGCTTCTGGCTACTACTTAAATAACTTTCAGCGTCTTAGACGTTAATTGCAACAAATCGATTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCT:1 + chr3R 12557938 5' + pogo 1931 1 59.22 TTAACCACATCCTTTGGCAATCCCCTATTTTTGTATATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chr2L 20819248 5' - copia 5072 2 75.34 CGCCCCGAGTTCAGCGGAGTTAAGTTGGGTTCGGCAGCAACAGTTTTTGGCGGGCATCCTGCCCTGCTCCTGCCTCTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3R 19725468 5' + hobo 18 1 67.50 GTGAGAGCCGCCTTTCTTGGAAGACAGGTGTTTAGATAGACTGCAAGCAAAGAATGGGGCACATTAGTTTATGGCAATGGAACGAGGGAACACGTTAAGCTCTACTACGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTC:1 - chr2L 18813316 5' - roo 8741 2 71.92 AAAGTATCGAATCAAAACAAAATCGGCTTGCAACAACAACAAAAACATTGCAGAGTGTGGGTGGCGCGTGTAGCGATCAAAATTGCGTGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 13684645 5' - 412 465 2 65.75 AAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGA:1 + chr2L 13697628 5' + F-element 106 1 76.03 GGGTTGTGTGTGGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chr3L 8249351 5' - HMS-Beagle 203 2 56.16 CAAAACAACACGCACACGAAGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 4868094 5' + gypsy7 5005 2 85.71 ACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACAAAACCTCTCAC:1 + chr3R 10030719 5' - BS 5013 1 69.86 AGGCTCATTGTCTAGGAGGGCAGCTCGAAAAATATGGGATAAAGAGAGAAGGTGGAGACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTCTTCAAAGTTGCAATTTTTTTTAAACAGCTACATGTGGACACCACTTGCT:1 - chr3L 20616742 5' + hopper2 1260 1 58.22 GCGAAAACTTTCCGCAGGCCATAATGGCAGTGAAAAATGAACCAGAGCCGTGGTAAAGGTAAAGGAAAAGCGGCAGGTGAAAATATTATGAAATATATGAATTTGTATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chrX 3596540 5' - copia 240 1 68.49 ATCTACATATAATTAAAATGGATATAATATATTTTTCCAAAATAAAGCTGTATTTTAGAAGACNGCTTAATCAAAAACTTTGAAACTTCATAATTGTGGAAATTTTNNNANAATCTGTTGTAATTACATNGTGAGAAACAATATAA:1 - chr3R 16925039 5' - TLD2_LTR 191 1 59.59 AAAGAAAACATTTTCTGACATTTTAATATTTAGTTTTTATTATAGTGTCGCACTCGCACACACAACGGACACGCATTTGCTCTTAAATAATTCAGACACATNTTGTAATGCTCCATTCGAACGACAACGCCTAATCGAACCAGAGA:1 + chr2R 22790441 5' + gypsy9 4946 1 73.97 TGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATATATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCCTAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCG:1 + chr2R 5617512 5' - invader1 343 2 68.00 ATGCGGGGTAACATGGACACAACAACCACGTCATGAACGGCAGCCAGAAACAACAAGGACAGCACCAAAAAGCCAATCTCTTTCCAGGCATTTCATTAAATGTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTAGATCAACAAAATTTCACAAG:1 + chrX 4290577 5' - S-element 349 1 52.74 AGCCTTGTTTGCCTTGGCTCTGGAATTGACCTGCCCCCCTCGCCCACTGGCTGCCTACGGACTCATTTGTTGTACTTAATTTGGATGCCATGCGTTCCCACTCAAAAACCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr3R 15047457 5' + F-element 21 1 72.14 AAGCATGTTTTAGTCGACTATCAGATACTGGATACTGAAAGTACTCTAAACTTTCTAGCTTATATATGTGGCGCCCACACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATA:1 + chr3L 17860605 5' + Chimpo 59 1 76.03 AGTGTGATTTTCGATATTATTTAAAAGTGAACACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 + chr2L 18112449 5' - transib2 2806 1 70.55 ACTCATAAATTTCAACAACCTTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGGAC:1 - chr2L 18173707 5' + blood 23 2 66.91 CATAATTGAAAATTACGAAATGTTTGCTCAACTTGCACACTTGCCCCACACTTCTCGGTCCCTATCTACTCTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGA:1 - chr2R 17332716 5' + R1A1-element 4857 1 53.10 AACTTTTGAAAAGGGCTCATAAATAAGAAAGTTTTGCCTTTCAGCTTGCTTCCAGGAATTTAGGTAAATGTTATCTAAAAAATTAAATTTACTAGTCTATTTTTAAATGGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3L 13992191 5' + blood 7020 2 69.18 ATTTGTCAAGTGCGCGGGCAAAGAAGCCAAAGTTGCGCCCTTGGCCCTGTGGGGCTCGTCATCAGGACATTCCACTGCGGAAGTAGCCCATGAATAGCAAAACTATAGGTATAAGTAAGTAAGTTCGTCATATAAAT:1 + chr2R 18202453 5' - pogo 1937 1 50.36 CTATGGAAGTTCTCAATTTGTGGGCCCTCAAAAGTATGCAACACTTTTCGAATGAGTGCAGACAGGCGAAGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAA:1 - chr2R 21229096 5' + jockey 4723 1 51.37 CTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAAAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGTTCATGGGGGTTGTTCATGGGGATGTATTCTC:1 + chr3L 11837726 5' - G5A 2688 1 66.44 ATATTTTACATTTAATTAAATGTCAACGTGGCTTCCAAACAAATTATTTTCCCAATTTAAACTGGAAAATTTATATACTCCCTTCGTAAGCCCACCAATATTTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 18319785 5' + jockey 25 1 72.92 GAATTATTTCCATTATGTTTTCGCATTCGGAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGTCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACG:1 + chr2R 13695652 5' - blood 7300 2 79.45 ATCGTACTTTCTATTGCATATTTAAGGGGTTTATGGTGCATATACTACAGACATTCCCGTTCCTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACA:1 + chr2L 13244645 5' + jockey 4619 1 56.85 GGGGGTGCTTCTAAAAATTATGGAACTGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:2 + chr3L 20573737 5' - pogo 2067 1 62.33 GGATTTTAGTTTAAGTCTCTCTCATGTTCTACATTCTCTATATTAAGCACGCATTTTTCCCATTCAACTGATCTCGAAAAGTTCGTCTATCAATAACTACTGGACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAACCGAGCTGGCATTCT:1 + chrX 4464263 5' - pogo 241 1 69.18 AAACACTACCTGGAATTTGCAAACACCTTGCCGAAAATGTTTGAGTTTGACAGGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 9599888 5' - roo 9004 2 64.38 GAACCATGATGTAGTTCTTTAGCCCAAAGGATTAAACTTGATCAATCGCTGTACACAGAAGTCTTCGTAGTGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3L 21636380 5' + 297 6592 2 78.77 TATAAAGCTCACAAACATGTTGCTCAAAATAAATTATTATGAACACAGTTAAATGCAATAGGCAGCTACACTAAAACAGTATCCAATCCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr3R 14801002 5' - pogo 2095 1 54.55 ATATCGAATTGCCAACGATCTGGCAACATTGTACTCTTGTTTCATATCATATCGCATCATATTCTTATCTACAGCTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGATTTTAAGTTTTAATGTGTAATCTTTTTTTATAATATCATTTGGTATTT:1 + chr2L 21149194 5' - HB 1537 1 65.75 ACTGACGCGACTTTCCGCTGGTGCTCGAAAAAACGAAAGGTTCCCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 + chr2R 10541664 5' + P-element 68 1 34.07 AGTATTTGGCTATAATTATTATGATTACAAACAGCGAAATATATTCCCCCAGTGTCTCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGTATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 5495141 5' + roo 16 2 74.66 AAACGAATGGCAAACTGAGCATCAGTTGGAGGCACTTTTCGACGTAAGTAGCGTGGGTGGGCTGCATGAAGTACGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCAT:1 - chr3R 14377556 5' - Quasimodo 483 2 54.79 GCTTGTAAGGGAATTACTTAAGCACACGACTACTAGGTAAACATACGGGGAGGGGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chrX 15405942 5' + opus 143 4 56.82 AGGAGAGAGCAGTGATCGTGTACATGAAAACACGCACACACGCGATCACACTCAACTTGAACGTGGGAGAGCCCTTCGCTCAAATCGTCAAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chrX 10547623 5' - P-element 2856 1 64.38 AAAGTTGACACGCTACACCAGCAACAACAAAAGCGACTAAAACAGCCCAAGTAACAACAACTTTGACGAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 23790355 5' + roo 49 2 56.64 GTAAGCCGAAAAAAGGCGTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 + chrX 14825309 5' + P-element 103 1 15.07 ATAAATAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 - chr2R 12379607 5' + pogo 58 1 60.96 ATTAGCCTGCCTTCGAAAGGGTTACTTTTCCAACTCAGTGGCAATGGGTAAATGGTATACAATTTAAAGACATCGAGGTATGTATTTAAGTTGAAAAGAATCGTCACAGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAA:2 + chr2R 12248923 5' + Juan 4040 1 74.66 AATATGGGGATACTACAGCGGAATCCTTTATAAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr2R 15472146 5' + 412 7115 2 53.42 ATATCTGTGTACGCAGACTGGCTTATTTGCGAGTGTGTTGGTGGGGAAATTCGCCGCCTGCTCTCTCGATCACTCGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 - chrX 6283767 5' + P-element 14 1 45.83 TTAAAAGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chr2R 14332099 5' + jockey 76 1 64.38 GTTGCTTTTGGAGCATAAGAAAATGCCCATTTGATTTTGTCAATGCGCTGGTCTTTTTTCATACAACGTTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 - chr3L 20765259 5' - 297 348 2 54.79 GCCAATCCGACAATCCCGTAATGCGCCATCAATAACAATTATCCGTATAGCCACTTTCCACTTTCCTAGGTGCAAATCGCTAAGCATCAAAAACAGATTTCAGACTATATAAAGTATACGTTCTTGATCAGGATCAAT:1 - chr2L 21326902 5' + INE-1 83 1 75.36 CAAAGTCGTGTGTTTGCGATCGCATTTAATTGCATTTCTTACACTCGTATCCCCCAGCGATCCGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGAACATACATTGTGACACTTTGTTGAAAACA:1 - chr3R 7042077 5' + Stalker2 7309 2 53.47 CTATGATTTTGTATCACTATTTTTTCAAGTCTATATATAAAAAAAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGG:1 + chr2R 6218896 5' - copia 21 2 71.92 GATAAAATAAAACCGCATTGCGCCTGCGTGCAGACAAAAGTTTTGCGTACCTTTTCCTACTCCTATAAGGTGCATTTTTTAAACAAAAATAACGCAATTTTGCGTGAAATTCGTTGGGATAACGTAATTATAAATATATAAATATA:1 - chrX 15811086 5' + Stalker 88 4 68.49 AGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTCTAGTCAGTAGACAAG:2 + chr3R 5518330 5' + Transpac 5006 2 77.40 GCATCTGCGTCTGTCGCTTGACAAATTACAAAAATATATTTTCGAGAACAAGGTATTTTCACTTACAATTATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCG:1 + chr3L 350277 5' + 412 278 2 52.41 CTTCCCTGAATGGGTTGCCCATTATCGGGTATGGAATTCCGAAATCTGGCCAACCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAAC:1 + chr2R 5037689 5' + Stalker2 7318 2 63.01 ACTCACTTCCACAGAAAAACAAGCCCAGGATCTTCAGCCAGGATCTTCAGCCAGGATCGATTTTCCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 + chr2R 14431206 5' + Doc 67 1 57.53 TCCATATCAATAACTTTACAAGTTGGTTCATAATAAAATTATACCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr3R 12182059 5' - mdg3 167 2 69.18 GTTTTTGCACCAACTCCACACATGGATGTCCTTTAGCAACAACAACGATAAATCGACACCCAACTAACAACAACAAGTGGTGAACACATATAGTTATGTGGAAGGATGATAGGGCCTTCTGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 + chrX 7626088 5' - Transpac 276 2 62.33 GCTAAGTGAAGTTCGTTAGGTAATTAAAAAAACAAGGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCTAAA:1 + chr2L 13697599 5' + F-element 70 1 53.96 GCTCACCCTTGGAGCGAAGCAGGTCTGGCTTAGCGATAGCGGACTGTGATAATTTATGCAATAATCGCACAAAGGATGCGATTTCCTGCGGAAAGTGAAAATGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTGGTGTTTTTGGGAGA:1 + chr3L 9587934 5' - 17.6 276 2 58.22 CTGGTCAGTATGACCGTGTTGTGTAACTATATTCCCTACGATTTTGATCGGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1 - chr3R 10708322 5' - Transpac 5160 2 65.07 ATGCGAAATGATAGCAATTGCAATTTATCGTATGACGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTTTT:1 - chr3R 15102315 5' + roo 8748 2 73.97 TTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr2L 8930568 5' + roo 8731 2 64.38 GCATGTGCATATGCAAAGTTTTATGTAAGTTCGGTACCAAGTAAATATGTATAAAAATNCCAAAGGTATTTTTAAAGAATCAATGCACATTGTCCTTAGCAATTTATAAATATGTCGGCGAAACGGGAGTCTCATCCATATTATTT:1 + chr3R 11757900 5' - invader4 3072 2 44.52 TCATCTCATCTCATCTCATGTGGCAACAGAGCTTGAGATCTTTAAAGGATTTCAGCTGCACGCTTGATTATGAGTGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 5456663 5' - roo 9021 2 52.05 AGAGATGAAGAATTCATGAATACATCCCAAGAAATGTCATGTATATATAAGTTNANGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 - chrX 7993140 5' - opus 423 2 70.34 TGGACAAATTTGTTAGGGGCTGCGATTTCCATCTGCCTTTCCCCACATTTTATTATGGTCTTTAATGAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr2L 6153905 5' + copia 54 2 56.16 TTGACTCCGGGCCAGTGCAAACAAGAGATTTCGGTTTATGGCCCCGGACCGGAAGTGTTAGGCCAAGCGGCCAAGTGGCCAAGTGACCAAGTGGCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTTGCACTCTACGTCCACC:1 + chrX 13458188 5' - hobo 2921 1 63.50 GAAGCGTTTATCCGTCAGTCCACTGATGATATCATTCACATTGTTCACACATGAACACAAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 15137288 5' + roo 8748 2 76.71 CTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTACTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr3R 31458421 5' + jockey 89 1 72.60 TTTGATAAAAGTGTTAATTAATCTGATCAAAACTAAAATTCATCTGGCGAACCTAAAACGTTTGTTCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 8930581 5' + roo 8718 2 55.48 GCTAAACACATCTTATCTCAATCTTCTTTGACTTGACAGTCTGCCCACAACTGGGANTTTATATATCCTCTCTTCTCGGTCTGTTGTGTATGTGTGTGTTTGTG:1 + chr3R 16281218 5' - Quasimodo 40 2 87.50 TGAGGCCATCATAAGGTTCACTGGGTATTTATGGAACTTTTTACATAGAGGGAAGTGGGTAATAATACAGAGTTTGCTGTACTTGCAGAACTTTTTTATGAAAAAGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGT:1 - chr3L 3898864 5' + Tc1 1612 1 65.07 CAATGATAAATGAAGGACTAGTCCTAGAAAAATTTTATTTCATTTTAAATTAAAACACTTACGGAACAGGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTC:1 + chr2L 13468963 5' - roo 261 2 52.74 AATAGTTTTGTTGCCTTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3L 22435243 5' - opus 473 2 67.12 AATAAATGATTTTCTTTGGTTTTGGCTCAACTTTGACTTGGGAAATATGTCCAAAAATATGCAGGGAAAGCTCTATGAATCGATTGAGCGATACTCGGCTTATCGATGTGAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 + chrX 4240167 5' + jockey 4682 1 71.23 AATAGAGCTTGGTGCGAAGCTACTTGGCACAGTCCAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - chr2R 22761236 5' - 412 406 2 76.03 CAAGTCCCTAACTTATTATTTAACTCAGCGAGGAACGAAGAGAAGCAACGAAAATCAATCATACGCCAAGTGTGTCAATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2L 13468206 5' + roo 8707 2 56.85 CTGCCACTTAGTTATTTTATAAAAAATTAATTTCTGACAACACCTCAGATTATACAAACAAAATTTTGCTGTCCACAAACAAATTTTCGATAAGGACTCAAGCTCTTAACCAACAATAATGACAGACCCACCAAACA:1 - chr3R 4199836 5' + I-element 184 1 41.61 ATTCTAGTGGACTTCTGTTGTTTTTTTTTTCGCGGGGGGCCAGCTTTGTATGTTTTTTTTCCGTTTGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 14667226 5' - HMS-Beagle2 488 5 59.55 AAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATAT:1 + chr2R 3338784 5' + Juan 60 1 57.53 CTACTTTTGGCCTTTTCGAGTGTGCCATAATTAAGCGACAAGTTGCACGAGTGACATGAAATAAAAAAAATTGGGCTGAAGAAAGGCAGTGAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTAT:1 - chr3R 12796279 5' + mdg3 5126 1 61.64 AATTTAGCTATAATAATATCCAAGAAAACTCGAGAATCGAAGTGTAATCGTTAATCAAAATTTTATTGCCTTAAACGGATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr3L 14233024 5' - copia 5082 2 53.79 TTTTAATGACTGCTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 - chr2L 18173687 5' + blood 53 2 53.42 AAAATCGTGGAAATACTGGGAAGAGCTGATGGGAAAACCACTCAGTGGATTTTCACTCAACACGCTCGGCATCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATA:1 + chr2R 17215727 5' - diver 91 2 51.37 AATTCCTTGAAAAGACTCTCCCTCNATTCGAATGGTAAAGTTCGTTTTTGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTNCTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAAC:1 - chr3R 10062227 5' + copia 71 2 65.75 TCGTTGGGTACTTAAGTATGTCAAACTGATCGGCCAATATATCTTCAGTGTCGCAGTTTACTTTTCCCAGGATCACACGGCCGTTTTCAGGGAATTTCCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAG:1 + chr3R 7316848 5' + diver2 4775 2 67.12 GCGAATTGTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3L 11257447 5' - 1360 3376 1 73.85 CGTTGTTGTCGCTGCCAGCGTCGCAGTCGACGTCGCAGCCGAGCGAGTGCCGAGCGAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCGTG:1 + chr3R 17943992 5' - P-element 2848 1 58.90 ATATTATAAAAGCCTTTGGACTGTGTTGCGGTTAATAAGATTTCAAGGTATAATTTCAAATTAGAATGCAATACTTTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2L 11725053 5' + F-element 59 1 57.53 CCCGCCCATCCATTTCCATGTGTGCGGAACGAAACGGGGCAGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATCATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 4631282 5' - roo 395 1 74.66 AAACAGGCATAACCAAAAGAACAATTAACCATTTTTGCTTTTAATTTTAAATACATTCAATTGACAGCTCTCAGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2L 20044530 5' - roo 361 2 52.05 AATGTTTGAAAACGCATTTGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCT:1 + chr2R 18372617 5' + jockey 4755 1 73.29 GAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGCTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr3L 22435219 5' - opus 449 2 54.11 AACTAGAAGAAAGAAATCCGCTGGATTTCTATAATATAATTGTTTATAATTTTTAATTTTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCT:1 - chr2L 9062353 5' - Juan 4142 1 67.12 CAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr3R 8381716 5' + Tirant 9 2 66.67 GAAGGGGAATTAGAAGTGGTGGAGGAAATTGAGAGGACTTATGATTTAACATTGATTTGGAAGCATTATTTTATGTTACAGCACATTAATATCAAACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 19106511 5' + roo 8690 2 60.96 AGACAATTTGTTATGCAAATTGCTTATTAACTTTATGACCGGCACGCCAGCTCCACTCGACATCCCAAAACATTTTGAATTGTCAATTAGTTGCGGCGGTCAGAATACTCCAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr2R 8689507 5' + hobo 11 1 78.77 CACCATCCTCTCCGCCCCCACCCGGTGCAGTTATAATGAGTTGCAGTTGCAAGTTGTGCGCATAGTTTTCGTCTGGGGGACGAACGTCAATTCAAAACTGAGCACAAGGTGGAAAGTTCATTTTCAAAAAAAAATTATTAAATGT:1 + chr3L 7151801 5' + Tc1 51 1 77.93 CCCGTGGGTAATGGGTAATGGGTGGGATGATGGGGTGTTGGGCTGTGGGTGGCATTTGGGGGCAGGACGGAGGCGTTTGGCCCTATCGCTAATGCACACGCACAATGAACGTGCACGATGCATATACGCTGCTCTTCTG:1 - chr2L 13575110 5' + blood 7205 2 79.14 AGCGCGTACAATGGATTAGTTGAACTAGGACTAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCA:1 + chr3L 21292533 5' + 412 90 2 77.40 GGGTAATTTCTGCAGTTGCACGATGACCCGCCAAGCAGAACAAAAGCCCACATGCTCCCCAGAGGAGATACTATAAAATCTCACTATATATATATCTATANATNAGTTAACGCAAGATCCACTTGCATC:1 + chr3L 9522002 5' - opus 7497 2 70.54 AAATTAAACAATTGTTATTTCAAAGAATAATCATTATTCTTTATTAAGTGCATCAGAATACAACTGATCACTTTTGAGTTCTGTTAAGAACTAAAGTACAATTTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACA:1 - chr2L 13330260 5' + flea 4675 1 75.17 AAAGGAGGAGGGCCATCACGAGCAGGGGAGTGGGGGGTACATGGGGCAGCGCCGGTAAAAAGTCATAAACATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 + chr3R 13898197 5' + 3S18 50 2 52.74 CTAGCTAGCATGCCGTAAAGTAATTTGCATTTCAGGCTAATGCCATTTGCATGCGCATATTCCGATTACAATTTAGTTAAATTTGCCCCCACCCCCTCTGACGATGTCCTTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 12941725 5' + hobo 12 1 75.34 CCTCTGCGTTAGTGTGTGTCTAAGAAAAGAGGCAGATAGAGTGTGTTGTGTGTCGACACGTGTTTGTTTTGCATGCATAATGCGCTTTGAACTCGTCGCTGCAGCAGGAAAATTTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGT:1 - chr2L 12987548 5' + jockey 4767 1 73.29 GTTCATTTAAAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATGGAAACCCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTGGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 - chr2R 21619416 5' + blood 7086 2 66.44 ATTTATATACAAAAAAAGAGACAAGTAAACGTAAACCACGACGAAATTTAAGGCGAATAAAACATAGGAAAATTCTCTAAGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 3911814 5' - roo 9030 1 57.53 TTGTAATTTTTAAGCATCCATTATAAATGTGTGTGTGTGGGTGGAGGGTTCTTTTGGCCTCGCACTCATTTTTTTATTTGTGTTCTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 17470304 5' + 412 7090 2 60.96 CGGTTCGTCTGCTGTCAATTGTCTTGCGTGCGAACTATTCACAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 + chr2R 17609769 5' - mdg3 166 2 70.55 ACATTTCATTTATCTTTGCTACATTTTATAGACATAGGATCGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTACTTTTTTTTT:1 + chr3R 6399369 5' - pogo 2035 1 66.67 GAAACTTTTCCCCACAGTTCATATTTTTCTTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAA:1 + chr3R 5170992 5' + F-element 103 1 82.19 GGCCAGACCGAAAATGCGCGACAGAGATGGAAAAATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGCTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGTAACATGGACTGGTAACATT:1 + chr3R 10608177 5' - HeT-A 5857 1 76.71 ATTCACGGTTGCCAAGCAAGACGACAGTTGTGAAAAACAGGGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 16920258 5' + roo 81 2 73.97 TGGCATTTTATTTTCGGCTTTCATACTGTATATATACTGTATAGCCTGCGAGTGTTCCTGGCGTTGCATACTTCGGAGGGCTCTCGCTATTTGTGGCAATGTCCTTGAGCAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 - chr2L 13328552 5' + BS 9 1 75.34 AAATCCTTAGGGAATCAACTCCGAAGTCAAGTGTTGATTTCAACTCAAGCCACTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 + chr3R 5518306 5' + Transpac 4976 2 60.71 GCGTAAATATGGCAAAATGAGGGGAAAATGAGCCAAAGATGCTATAGGATACATTTTTGGTAATGAACTTTGCAGTCAAAGTTTATTAGAATCAGGGCAAAGTTTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCG:1 - chr3L 13132411 5' + F-element 192 1 70.55 AATTGGAAATTACACACAAAANACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGGAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGC:1 - chr2L 21570262 5' + invader1 3641 2 56.85 TATTGCTGAACCCTCCTCTACCACATATGCCACACCTTATCTCCATTCATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGGCAAAACTT:1 - chr2R 11792170 5' + Quasimodo 7089 2 60.48 TTTAGCACTGCAGCGCTTAAAGGTAGGCAACGATTTGTTTGCACTGAAAATACCAAGGAACCTTGTAAACACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2R 14332115 5' + jockey 33 1 59.17 ACCTAAATTTTCTCAGTCCATCAGTCTTATTAAAATTATTAAAATTGCTGGTGCGATGTTTAATTAATTATAAAATTATAAAGATTTAAAAAAAACTCATAGAAAAAAATCACAAGGGGGTAGATCGGGAGAGCGTGCGGGCCATT:1 + chr3L 25842857 5' - mariner2 558 1 63.70 ACAGTGCATGAGTAAGATCTCAGATCAAACTCTATAATATACTAGAATGACTAATATTATACAACGATTTACTTTACGATTTAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr2R 22596064 5' + Doc 44 1 50.68 TTTCGATTCGATTGGTTGGTTGGTCAAAATGCAGGTGCGACTAGGAAAGTACTATTCGTGTATTCGAGTGCGTTCTATTATGGTCTCAGGATCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 - chrX 13367513 5' + HMS-Beagle 27 2 67.12 GCAGGTGAAGAAGGCAAGGTGTTAATTTGATTACCCCTACCTGTCAAATAGAATTTATAAAAATATTTCATCTACATTTCACAGTTTTTTCAATTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2L 20508256 5' - pogo 2076 1 68.49 TTCGACTTGGTCGAAAAGGAAATCATGTGGCCTGAAAGAAATTCCAAGAAATAGCACATGGTGTCTTTTTGGGGGGTATATGTGTATGGGTATATTGAACCTATAGGCTCTTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGA:1 + chr2R 11795927 5' - roo 8985 2 77.78 ATTAAATTCAGTGGCGAGTTCATCTCTTATTAGATTCAATACAATGCCGCGGTTCAAAAGTACCATTTAATCTGTGACGATTCTATTTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 - chr2R 12249081 5' - Juan 4175 1 56.16 CATAAATATAAAATTTCCCAGGCTAATCGTTGTACGCTACTGTTTTCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGAC:1 - chrX 21227194 5' - Tabor 7250 2 67.12 CATCCTGTTTCTGAAGTCCGTAAGTTAGTTTAATTTTATCAGATTAAGGGATAAATAATCTTAATAGGTTATGGATTTTGCAAGTGTAATATATATGAGCCGTGAGCTAAACTCTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr2R 12379445 5' - pogo 2095 1 77.40 AGAAGTAACTTTTCGCATAGTACGTAAATTTCCGGATTTTTTGTGGCGGGACTCCGTTAATGCTGAGCATACTTTTTGGTAGCTTAGTGGCATTTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACCTTTTTACC:1 - chr3L 13546686 5' + hobo 10 1 74.62 ATATCGAGAACAATAATAGTTTTGTTGCCNTCTGCCATGAAAACTCATTCACAACAAAAGCTTTACGTTTATTATGTGGCCCCCATCAAAGCCACAAAAAGNTGCATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr3L 22435257 5' - opus 7490 2 75.34 AGGGGGTGCTTCTAAAAATTATGGAACTGCATACTTCAGTATAATCCTCAGAAGCAGTTTTTACTTGCGATTAAATTTAAGAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr3L 20573736 5' - pogo 2068 1 62.33 AGGAACGAGTTTATTTGCAGTCGANATATGTCCCCAGACGCCAACAATAGCAATTAGTTCATTGTCAATAGTTTGCTCGTTGAAAATTTCAGGACTAGAAAGGGCAAGGACCAGAGAACTGCAGCCCTCCACTCGC:1 - chr3R 12941919 5' - hobo 2935 1 77.94 TCCACCCCCTAAGCACATACATCGCAAACAAGCATCCCAGCACAAATGCGCACAGCCCGGGCAAAAATAATGTCTCCATCAGAGCCAGAATATTTTGGCGTCTCGATTCATTTACAGAAGATATGAACGGAG:1 + chr3L 3976093 5' - roo 47 2 71.21 CGAAATATATTCCCCCAGTGTCTCTGCCCACTCACTGGCTTCCAAAGCGGAGGACCAAGGGGTATTTGTGGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 5495175 5' + roo 8714 2 52.74 CAAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCNCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAATTTCT:1 - chr3L 19222690 5' - 412 431 2 54.79 GCGAGAGGTTAAAATGGGTGGGAATATTTTCTGATTTCCTAACTGGTACTCGATTGTTTGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTAT:1 + chr3R 11379059 5' - mdg3 5030 1 59.59 GCCCCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3L 17757941 5' + Tirant 8148 2 57.89 CGCGTTGCGTATACGCAGTGTGTGTGCGCGTGCACAATGTGATAATTGTGCGGGTAAAAATGGGTTAATCATGTCTGGCACATATTTAATGATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCGCTGTTACCCATGCGGCAAC:1 + chr3R 23415874 5' - jockey 4961 1 63.70 TTCTGCTTTTTAGCTCATGTGAAAGCGGAACTGGACAAACTAGAATCTATCCCTGTATAGTTTTCCAGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTGATAATAAAACATTCGCGTGTACTTAAGTACGCAGACGATGTT:1 + chr3L 16457835 5' + Q-element 570 2 54.11 AGTGTGTCATGCCAGAATACGGTAGATTTATACTGCCACTCCGAACATAAATCATCTGGCGAACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCACATTGATATGACA:1 - chrX 15252387 5' - opus 449 2 52.45 GATATTTGCATACTCCAACAAACTAAAACTAGGGATGCCGTACGACTATCTGCGGGGAATTGGAGGTGTATGGGGGACTCGGACTCATCGTCGGCATTAATAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:2 - chr3R 13453445 5' + 412 20 2 71.92 GAGCAGGATGATATATACGCTGTTCTTTTGAAAAAGAATGAACGTTTTACACTCGATCGCAATGTTATGTAAAACCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2L 19698074 5' - roo 9014 2 55.48 CAAAATACTCAATTTCTCTGCAAGTGTAATCTTATCTCAAGTGTCTAGATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATG:1 + chrX 11424753 5' - P-element 2758 1 33.79 GTGTACTTTAATAAACGCATAGATCAAAATGCTGCCAACGAGGCGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGAC:1 + chr3R 12789539 5' + G2 2795 1 61.67 GATACCCATCAGCAAAGCCCAAACAAGCATTTCTTGTTTGTAATGTGAATTTGAAAATCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr3R 4190894 5' + pogo 61 1 63.01 TAAGTGTAAAGATAACCTGCAATTACATATCTAGCTATGGTACTGCGATACCTTTTTCGATGTAATTGATATAGCAATATATGTATATTCCCTAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr3L 1477334 5' + mdg3 30 2 65.07 TAGGTAGCACTTCCGCGCCCAGAAGATCAAACGCAATATGTGTTTTTAATTAACTTTTTAGAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - 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chrX 20233887 5' - pogo 2037 1 62.33 GTGGAGATCGTTGATGCCCCATCAGACGTCATGGGGCCAGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAATATGAATATAAATAGAAAACAAAAGAGAAGTGTGCAAACAATTTCTTGACAGTGTCAAATCTGTGCAAACTT:1 - chr3R 2474431 5' + S2 1521 2 62.33 CGAATGGAAATGGGAATGGAAGTGAGAGAAAGTAATAGAAGAGCATTTGAGTCGTATTGAACACTTGTTGTTTATTTCTCGCCAAGGTGATTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCC:1 + chr3L 20399206 5' + McClintock 225 2 53.42 CTTCATCCCATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chrX 6615507 5' - roo 325 2 75.34 AAGGAACATTTTTCAAATATCATATCATTCGTGAAAAGCTTCACAAGTTTGATTAACAAACTCTGATTAGTTCTGGGAAAAAAAATATCAAAGTAGGAATGCCGGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 17136043 5' + hobo 19 1 68.49 AATACTGCTGGTGAAAAACTGAACTATATAGTCGGAAAGATGATGGAGTTTCGTAGGAGTCAGGTTCAAAGACTGAAATTGGTTGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAATGATCAGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAA:1 - chr3R 10676303 5' + Tc1 487 1 50.68 ATGAATGCACAAGGAAATGAACGAAACGGGCATGTGTTCGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTAGCCAAATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCT:1 - 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chr3R 19446402 5' - Cr1a 3971 1 62.33 AAAGGCCAGGCATTCTCTCCGATCGAGTAACCCATGTATATTTGCACCGGATAGTCGTTTAAAGTGTACATTTCGTTGGATCCCCGTTGTTGATGTCGATATTGCATTAGGTATTTAATTTTAAACAATTCAACAAGTGTTTCACT:1 - chr2R 9046233 5' - HB 1507 1 71.23 AAATGGAGAAATTCAAAATAATAAAAACCAAAACCGCAGTTTTCCAGAGAAAACTGTGCTGCTGCTGCTGAAGAAGCGTTGCATACTTTTGGGTGCATCACGTGCAACGGGGCGTATGCTTTTGCAGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 - chr2L 13317028 5' + jockey 4668 1 66.44 ACTAAAAATAATGCCATTAGGGTGATTTGAAATTTTTCGATTTTTCTGAATTTTCGCATTTTTGGTAAGGGGTTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 29185328 5' + 412 47 2 50.68 ATTTTCATGATCACTTAATGCGGGTTACATTTTATTGGGTACTTCACATTATGAGCCTTCTCTGGTCAAGTGACTCAATCTGGTCAAAGAACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGG:1 + chr3L 18010204 5' + diver 5918 2 64.14 TTAAGCCATAACAACATAAAAAGCCGTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr3L 12125252 5' - roo 9035 1 60.27 GAACCTATAGCCACCCGGCGATTGTCCCAAGGTCAGTGCAATTGTCTCGCCGCAGCCATTGTTCGCCTCAAATGAGCTAACATTTGTTCGAGAGCAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTGCGCATACAGTGAT:1 - 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chr3L 20168330 5' - roo 9045 1 67.12 TACTTGAACTAAAAAAAGTACAGTGTTTTTGCACCAACTCCACACATGGATGTCCTTTAGCAACAACAACGATAAATCGACACCCAACTAACAACAACAAGTGGTGAACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 + chrX 7626064 5' - Transpac 5219 2 78.77 ATAAACAAGTGCACTTTATGTTTACTTGCTTGTTTTTAATACACACCGATCCGCGATTGTGTGGGTTGAGGTGAGAGATACGATTCCTATCACACTTACTTATACAGTTTGTCAAGAGACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGA:1 + chr3R 8821781 5' - S-element 1695 1 71.23 AGGATGATGGAGGCCACACAAATCTAATAATCAATTGCCATAAGCACTGAGCCATTATCCAAGTGCAGTGTCTCAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:2 + chrX 21227062 5' + Tabor 17 2 73.97 TGGCCATACCCGCTTGACTGGACTGGGCAGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chrX 21639316 5' + 412 7141 2 75.34 ATAAGATAAGACCATCATATACTGTTATTTTAACCACATCCTTTGGCAATCCCCTATTTTTGTATATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr2L 20819219 5' - copia 232 1 55.48 CCTGTTCTATTCCTATCAATAAACNGTTTGGAGTAATAAAACACAGTGCGGTTTTATTTATAGTACTTTTGTAATATATATATAGTGACATATTCACATACGAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGT:1 - chr2R 16185137 5' + 17.6 42 2 55.48 TTTTGCTTAAGGGGCGCTAACCTGGTGACGCGCAGTGTATATATTAAGATGTATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTATACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTA:1 - chr3L 23143350 5' + S-element 66 1 65.75 TTGGCTCTGGAATTGACCTGCCCCCCTCGCCCACTGGCTGCCTACGGGATCATTTGGTGTACTTAATTTGTATGCCATGTGTTCCCACTCCAAAACCAATTTGATCGCCGACGGGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 - chr3R 15047444 5' + F-element 32 1 56.52 GTTACATTTAAATTTACAAGAAAGGTTAATTGGAATAAATGGTTAAATTCATTAAATGGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3L 12125277 5' - roo 346 2 62.33 GCCATGACAATTTGTCAATTGGGTTTTTATTGAGCAAAGCATATATATAAGTTATTAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTT:1 - chr2R 21530036 5' - HMS-Beagle 6966 2 70.55 GTCTTTGTTTCCCGCCCCTGTAAATATCCGTTGAACGTAGCATATGGCATCTGTAATAAGTGTTTAATACTGCTGTATATATATATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1 - chr3L 2668975 5' + Bari1 24 1 66.42 TTGCTCCTAGCTCTTGGTTTTGTAATGGTTGGGGTGATAATGGTGTCTGTTATCAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr2L 15917600 5' + roo 8729 2 65.75 ATAAACGACTTCGTCTCCGTTTTCCACTGCAATTAAAGTTGACACGCTACACCAGCAACAACAAAAGCGACTAAAACAGCCCAAGTAACAACAACTTTGACGAGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - 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chr2L 3950212 5' + invader3 5048 5 76.71 CAGACAATTTATTCTTCATTTTTGTTTTTCTTTCCATCTGCGACGATCGTTTTTGAAAAATGTGTTCAATAAACGCGTTACTTGTAGAGTAAACAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr4 407099 5' + jockey 35 1 66.44 AGGGCAGGAAAAGCCCGGAAAGGAAAAGGCGGGAAGGGAATGCAAACAAACATAAAGAACAATTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGTG:1 + chr3R 19994156 5' - Quasimodo 6921 2 51.85 CAAGTAATTATAATTACCAAACATTAAACAAAAGTTCGTTGTTGGTCCCGTTTTAACATGAACCGATTGTCCGCTACAACCTTATAATATATGATGATCATAATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGAT:1 + chrX 13367332 5' - HMS-Beagle 7026 2 74.66 GGGCACGGCGAGATGCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr2R 6514320 5' + roo 8733 2 67.12 ACATGTGCACTGGGCGAAAAGTAGTTTTAAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 24011083 5' - roo 355 2 55.48 GCTTATTACTTCTTAATTATTCAAAGTCGAAATTTTGATCTGATCACCGCCAATTCGTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr3L 18075548 5' + pogo 62 1 60.96 ACAATGTTGTCTGCCACACAGCTGATGCCTGTTGCCCGATGGTCGATGGTCGATGCCGATCCCGATCCCACTGACTATATGATTTATGTCCCGGCAGTTGGGAGATACATTTATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCA:1 + chr3L 10459279 5' - accord2 7510 2 65.75 AATAATGGTGTAAAACCATCAGACGGTAACAAGAACACAATAGCCTTAATCGCAATGCAGGAAACTAACTTTTTAAACAATTATAAAAGGAGTGCTTTCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGG:1 - chrX 14662431 5' - R1A1-element 5097 1 58.90 TCGGAAAATTGTGAGTTTGAGTGATTGGAGCTTTCAGTTGTCTAATATTCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCT:1 + chr3R 31419333 5' - pogo 2032 1 65.75 GAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1 + chr3L 8249391 5' - HMS-Beagle 6959 2 76.03 AAGTATTTAATGTAAATACACGATTTCACTTGTATATGCGTTAACCACAAGCTTATATTCAAGCGTCGATAAGGTAAGACTTGTGACCACACACCCATACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 - chr2L 22716339 5' - 412 446 2 57.45 CATAGGCATCGACAAAAAGGCAAAACTCCGGCGAAAAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chrX 6615564 5' + roo 82 2 75.86 CGGAAAATCTGAGGAATAACAATCTGTTGCAATTTAACTTTCTTGTTCCTCGTTGGCTGATTTCATCACCCCGTTTCGCCCCTAATGTTTTATTCATTGTTCCTTTCCGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chrX 10284953 5' + pogo 12 1 69.86 ATTTTATGAGGTTATGTGGTAATCCCACCTTATTATCAGGTAGTGAAGGTTTTCAATTAAAATTTCTCGATCCATTAACTACATTATCCCAAATCACTATCTTAATGTTTTTTACTTTCATAATTACATACATGTATATTTTTTAT:1 + chr2L 7418864 5' + INE-1 73 1 65.07 CCGCAATGTGACATCTTTTGGTCACGCCTGTCCAAGCTGGCTGACAATTGTGGTGGTCGCTTCATTTACGCAAAATTCATTAACATTCATTAATGAATTAATTCATTAACATTATATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chr3R 13323824 5' + F-element 20 1 58.22 CCCACACCGAAAAAATATATATGTATATACCATTAGGTCCATATTGTCAACAATATGGTTGCAAATTGGTTTATTTACTTGAGTGAATCAAGGTATAAAGGAGATATCCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 24010926 5' + roo 8677 2 75.34 CCTGCTGGTGCTGCTCGGCAGCGGTTTTCTCATTTCCCAATCCGATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2L 13850713 5' - roo 8996 2 68.49 CAAATATTGTGTTCATCCGACTACGAGTGTCCATGCATGAATGTGTGCGAGCTGTTGTTGCGATTAGGTGGTGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr2L 15549967 5' + hobo 15 1 68.42 GGGGAGTTGCAGAATCTTGTGTTCCTATTTACTCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATCAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCG:1 + chr2L 13697634 5' + F-element 101 1 77.04 CATCTGTAATAAGTGTTTAATACTTCTGTATATATATATATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGC:1 - chr3L 2668928 5' + Bari1 22 1 63.64 ACATTGCTAAATTCATTGGCAGCCCATGCCAATTTTAATTCGTATTTTTTGCCTCTGGTTGCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1 + chr3R 19996171 5' + Quasimodo 51 2 55.48 GTCTCCATTCGGAGTTGGGGCCCAACTCCGTGTTTCCAGACTAATGAAGATCTTTACCGGCCGCCGATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 - chr3L 17935037 5' + HMS-Beagle 6830 2 54.55 TTCTATAATTGAAGTGTGAAAATGGGTTACAATGGGTTTTTTATAATTATTAAACCCTTTAAAATTAAATCATTTTATTTTACGAATAAAATTGGAATGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2L 3133659 5' + Doc 29 1 58.90 ACCTGTTTTATGGCTCCCTTTCCCCAGCCCCCACAGCCACACACACACACACAGAGGCACATCGCAAACAGACCAATACACTGGCACATTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAAAAGTAATATTTAATATAGTTATTT:1 + chr2L 12657543 5' + Cr1a 4307 1 56.16 ATTCTCAACCACAAGGATCAAGCCATATATAAGCAGATCCATGAAGCAAGAAATAGAGCCGCTCAAGGATGAGGCTTCAATTCATTCGTCCTGGAGTGATAGGGAAAGATTGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr2L 16607148 5' - 412 484 2 74.66 GACAGTAAGGAAGCGCCAGAGAATGTAACTAGTGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 5495261 5' - roo 8986 2 75.34 GACTAGCAATAAACCAAACAAAAAACAGGGCACAGTTCGAGGCAAGCAATACTCTTGGAGCTTATACTTTTCATGAGATAGTAAAACATACTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr3R 20345571 5' + blood 7042 2 63.01 ATAAATTGATAATTATATGTAGAGTCATGTGCATTTTACGACCAATTGGGAGTTAGCGGGGCACGGCCATATGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 - chr2R 24547390 5' + hobo 62 1 51.37 AGATAAGGCCAAAAAATGTTGCAGGTTGTTAATCAAACAAGCAGGCAGACAAACACACGACAAGCTAACGTTGCATGTTGGACAAAATGAAAGTGTAAATATTTTCGACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 + chr3R 8381656 5' + Tirant 10 2 78.62 CGAGATGCGAAGATACATTTGGCAACATGCGATACCCGACAGAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 - chr2R 6514312 5' + roo 77 2 72.60 GGTTAGCTTTATTTTAATGGAATTTGATTGATTTGCATACTATAACTCGTACATACATTCATATATGCGAAACGAAGCCTGTCAGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 8208286 5' + roo 36 2 63.45 AGATGGGTAGAATACAATATTTACAATGAATATTTGAAACGAGTTCCCGGTGCCTTGGACTGAACTTTAGCCCGTGGTGGTGCTGTGCGCCACATGTCCTGCCCCAAGCATGTCCCGCTCGGAAAAAATATCCAAATATTTTACTT:1 - 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chr2R 4103312 5' + Quasimodo 67 2 65.03 GAATCGAACAAATGAATTTGATTGCGAATCAAAGTTGCTTGTAAGGGAATTACTTAAGCACACGACTACTAGATAAACATACGGGGAGGTGGTGATATATATACATGTACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chrX 15405906 5' + opus 7 2 76.55 CAAGTGGGCGTACGAATGGAAAACGAATTCCATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 + chrX 21227135 5' + Tabor 6926 2 76.22 TGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATA:1 + chr2R 977532 5' + F-element 77 1 63.70 GATCTTAGACTTGCGCTTTTGGCTTCGGTGCTGGTCATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGT:1 + chr2L 5341518 5' - Burdock 6310 2 75.34 CCTACGCCCAAGTGCAGGATGTCGCCGTCCTGGTGATGACCGAGTTTGCCCTGGACTTACTTCGCATCATGCACGACATTCGGTACAACTACGTGTTCTCGGAGCATTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGT:1 + chr3L 2252059 5' - I-element 281 1 71.83 GTTCAGCAATCAAGGCTCTAAAGTCATTCGACCTCCTCTCAGTTGCCATCGCCACACACACTTGCCAACAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chr3L 7646211 5' - 297 349 2 57.53 CTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGTTGCAAGCGACGCGCATTCAGCGTCCACAACAAGCCCCAGCTAGAATACAACAAACACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCTTCCAGCGACTCGGTGC:1 - chr4 1294990 5' + TAHRE 10079 1 79.51 CCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCATATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTAT:1 - chr3R 10030799 5' + BS 5057 1 50.00 ATAATGAGAAATTGTCCTATAATCTGAAATTATTTTGGGTGGGGCAGCATGGGTCAACAAACTTTCGCTGCGTCTTTGTCTTTAGATTCTGTACGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATA:1 + chr2L 180141 5' - INE-1 138 1 71.23 CGTTCTGCCCAACAAACATGAGTCGATGATCGAGGCCTACGACAAGTGGCGCAGCTGGGCCGATCCTAAGGTGAGAAGTGTAGGGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3R 5574920 5' + blood 37 2 60.27 TTCACAAGTGCCAGAGACTGAGAGGGAAATAAGCTGCAGATTGTTGAAACAAGTTAGTGAGCTCTTGTAATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTCTCAAT:1 - chr3L 19222694 5' - 412 7488 2 52.05 GTTTGATGGTAGATCTTGTATATTTTTATTGATTTAATGTTTCTACATTTGGGATTTTATTACAATGTGTAAATCAGATTCCATTACAACTAAAGTACCACNACCACTCCCTTTTCAAGAAGTGCTGTGGTATTTTAATATTTTTA:1 - chr2L 19414869 5' - baggins 412 1 79.45 CATTTGAAAAAAAGAACCGCGTCTTTCTCTAGTTTTGGATTATAGTTAACCGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 + chr2R 18618477 5' + jockey 4733 1 64.03 AAATATAGTAAAATATAGAAAAAATTGCATTTATATATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGG:1 - chr2R 15472115 5' + 412 7146 2 74.66 AAGCTTGGCTAAGCAATTGCAAAACTACTATGTTTATGTGGTAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACT:1 + chr2L 5818896 5' + I-element 4903 1 71.23 AACCAGTGTCATGGAGATGACCAGCATAGCCACAGAGGAGGTGACAACGCAACTGGGAAAAAAAGGTCGAAACCTATTCCTCCTCGGGCTACTCATTTAATTCCTCCCCTCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:2 - chr3R 8394559 5' - hopper 1405 2 78.08 ATATGCCTTTTTATGAGAAGCGTGTACAATATAACCGAAATACACAAATATGGTTGCAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGTGGCTTAC:1 - chr2R 24807969 5' - I-element 5294 1 56.85 GTCGCAGTCGACGTCGCAGCCGAGCGAGTGCCGAGCGAGAGCCGAAGGCAGCGTTTTAAGTTCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3R 17944011 5' - P-element 2829 1 45.89 GATATTCAAAACTTGAGCGTAACCAGAAAAAGTTTCGTGATATGAAGTATGTGCAGTTTAGCCAGACTGTGGAAAATGGGTATATTCTCATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCC:1 - chr3L 10814630 5' + micropia 31 2 63.70 CCAATGTGACATGTGCCAGCCCCCTTCCATTCAACCCCCCCTCGAAAACGCCACCCCTCCCTCCTTTGGCCATTCAGGCAATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chrX 17726389 5' - pogo 2089 1 72.95 ACACTAATAATAATATTAATAATAGTTATTTTACCTTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTGCTATACCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACATGACAGCGCCCCTC:1 - chr3L 13905027 5' + Cr1a 4402 1 80.65 TTTTTTTGTTCATATCCAAAAAGGATACATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTTCGTACTTTATTCAGTAACGTAACAGTTTTTTTTTCCATGTTTTGCCTATTTATTGTATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAAT:1 + chr3R 779357 5' - Doc3-element 4683 1 51.37 GTTAAACTTCAGTTTTACTTCTTTCCATTATCATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAG:1 - chr2R 6089129 5' + 1360 86 1 78.47 TACATTTCGCTATATATTTGCATTTATTATTGAACCATTGGATTACGTTTGCCTATCCTGCTACAATAATGAAATATGCAAACCAGTCAAATATTCCCAAAGCCGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 7042769 5' - roo 391 2 73.97 GGCCAATTAGCCAATAAATCATACTTGTCATGGGCATATAAGCAAGTTCATTTATATCAAAAACACATCGTGTATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chrX 19163382 5' - Burdock 6350 2 57.53 TTTAAAATAGTGCTGAGCTGTGGATGTGTAGTTTGGGACTGAACTATAGCGGTTGACTACTCCTTAATACTGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr2R 25083397 5' + pogo 47 1 53.42 GATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 + chr2R 9091829 5' - 1360 3328 1 60.27 GATAAGAAAACTACTCATTCTTGAGATATATCTACCTCTTTGAAACTGAGACAAGCAATTTGCACTGGTATACTGATACTGAAATAAAGTTTAAAATAAAACTTTCTGCACCCTTATTCCTTGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 + chr3R 19246628 5' + jockey 4669 1 80.42 AGGAATTNCTAGCTATCCCAATTATTTGCAGCAGTTTCTGCAAATGCATCTAACGATATTATACACATTTTTAATATAAAGTATTTGTTGTTAAATATTTAAATATTGTCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTG:1 - chr3R 10900952 5' + F-element 28 1 67.81 GTAATGTTCCTTTTTTCTAAGTGCATAAGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGC:1 + chr2R 14430013 5' - Doc 359 1 77.60 AAGTTTGTCTTCGCAGCAAATTCGCTCGTCATGTCGATGGAAAGAAGTTGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3R 12115241 5' + 1360 38 1 56.16 GGCAGTGGCAAGGGGCGGCACTGGTTCCGCTGCATCATGATGCATGTTCCATGCCACGTTCTATGTATGCATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr2L 4631245 5' - roo 9029 1 52.17 TACATAATATACGATACTAAATATATGAATATGTATGCATATGTACATACAGTTGTGGTAACAATAATAGCACCACAAGCACATTTCGAGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAAAC:1 - chr2R 5412755 5' - Tc1 1568 1 66.44 GCGGGAGGGGTTGGTAAACGGGTTACGATTTCAAGTTCGACTAGGGCCTACGGTTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 - chr2R 7622969 5' + P-element 87 1 40.41 ATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCC:1 - chr3R 934274 5' - Rt1b 4730 1 49.32 ACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - 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chr3R 25962063 5' + I-element 68 1 60.96 GTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAGAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1 - chr3L 23871307 5' + Doc 93 1 74.66 TGGACAGTAAGGAAGCGCCAGAGAATGTAACTAGTGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3R 5495263 5' - roo 8987 2 75.34 ATTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3R 19446094 5' + 297 6599 2 72.60 CGCATAATGTTATCAGTCGACCAATTGCTATAAACGGCATAGTCGCCATTTATCATTGGTATGTATTTCAAGAAATCGGATTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 16200859 5' + roo 36 2 60.27 TTTTTATTTTTCAGGCACGTTTTGTAAGAGCTAATTTGGCGGCCCTTTATTTTTGTGCTGTCGCAGCTGGGATGCCGCGGTTTTGTAGTTATCGAGTTGGCAGTTAGATAAGTATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAG:1 + chr2R 10396106 5' - HeT-A 6050 2 78.08 AGGAAAAAACTCCCCTCAGTGTCTGAAAACATTGTAAGTGTGGAAACTTCGACCCTCAAAGGACAAAAAAAAAACGCAACCAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCACTTC:1 + chr2L 22968468 5' - 1360 3183 1 55.48 GCTCTCACGGAAAGTGAAATAAATAAGGTGTCAGTAGATGTGGAAAGTTTGTTTAACAATATAAACCTTATATACTGTACATCTAGCAGCACAGCACGAGTAAAGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2L 13565960 5' - P-element 2874 1 56.16 TCCCTTTGGCCATAAGTTGTGTATCGGAAAATACGGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 20868092 5' - hobo 2894 1 69.23 TTTTTTTTTTTGTCTTCATCCCATGGTTTTCACATTTCTGATTTGATACTCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chrX 6615494 5' - roo 9009 2 64.75 CATCGGTTGTCCTTTCTTCTCGACGCATTGACCCAAGCATCTAGATTTGCGGCCAAAGTTAGCGTTTGACATTTATGCCGGATGTCAAGTTGTCCCAAGGAGCAGAGCTGAATGTGTGTTGCGACACGTTGCTGCTCACAACAC:1 - chrX 7488017 5' - Chouto 333 1 73.61 AGAGGAAATCATTTCAATTCGGTATTTTCATTTGGCATGCATAATTTCTGGCTTTCCAATCTGCCTTCCCGATGCATATAGATTTAAATGCATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACTCGGTG:1 + chr3L 22038179 5' + diver 9 2 75.61 AAAAAAACCTAACTTGGGATCTTAAGACGCTCGTTTCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 - chr2L 16607277 5' + 412 85 2 73.97 TTGATTTTGACATTTGACGCGCATCGTTCGAGTCCGCTCTATGTGCCTTTCTCTCTTTCCAAGCGGTTTGATACATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 - chr3L 19907202 5' - P-element 2836 1 50.34 TTGGTGCCTGGTGCTCAGTCCTTTTGTAGCCGTTGGGTTGGCCCAGCTCCCGTTTCATTCTTTCGGTTAAACTGCATAAATTCAAAAAATTTTGTAAATTGTATTTGGAACTTAACTATATATTATGAAAGAGCATACATTAGGGG:1 + chr3R 6604844 5' + transib3 80 1 52.74 GGCGACCAGTGCATTTTATAGGACAAGTTATCTGCCCCAGATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3L 21913424 5' + 297 27 2 57.14 AGGCGATGGGTTAGTGACCTTAACTTATTTTAAGGTGACTGTTACAGCTTACAAAAATGCCATAAATTTTTCATGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTT:1 - chr2L 3504743 5' - I-element 297 1 50.00 TATGTCACTTTAAAGTATAGGGAATATATCAATTATCCCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAA:1 - chr3R 4530759 5' + copia 85 2 74.66 GTGCATTTTCTTATAAAAGTTCACATAAATTAAGCCAATTAATTTCGTGTCTGCCAGCGTTCCGTGGAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTNTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATT:1 + chr3R 10830453 5' - 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chr3L 17756325 5' - Tirant 289 2 51.37 GTGTGTGTGGGTGGAGGGTTCTTTTGGCCTCGCACTCATTTTTTTATTTGTGTTCTCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2L 17470334 5' + 412 7098 2 54.03 GAGTGAAATACATAAGTAAGCCCAAACATCCAGACATCCCGACATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCT:1 - chr2R 16367437 5' + hopper 78 1 71.23 CCTGTAGATGTTTACTTGAAAATAACTCGACTAAAATATCAGTGGATGAGTGTCTTTCACTAGGGTATATGTGCTGTGTGGTCTATATGAATCGGTGTTTGTGGGTGTGTGGGCTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACAAG:1 + chr2R 20465126 5' - accord 7026 2 70.55 TGAAGGTTAAGCTGTAAAATCAATTTTCCAACTATCATTGCTCTATAAAGTAAAGTAAAAAGAGTGGAATATTTGTTAAAGAACTTTTTTCGATTTATTTTATGAGGTACTTTTGTTGTATTTCTTTATATGTTTTTT:1 - chr2L 7537825 5' + S2 108 1 70.29 ATATCCATATATTCATATAATCAATGTGTGTAAAGAAAACGAAACTAAGAAAAGCGAAAAAGAGCATTCGATGAAGTTGACTGTCATGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:2 - chr3R 9551019 5' - P-element 2852 1 61.64 GTAGAAATCTATAATTTTAGTTCCCAGTCATCCTGCGATTGTCCACTGTACGAAGAAAGCCAATGCGCACAACGCTTTTTACTTCGTGCTTTTTTTTTCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2R 8258235 5' + jockey 31 1 65.75 CAGAAACATTCAATAAGTAATGAAAATAAATAAACAGTGTGGTTTTTATATCAAGGTATATAAAACTTTAATAGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr2R 12379619 5' + pogo 46 1 52.74 AAATAAACAGAAAAATCGCTTGCAAGGGCATTCCACGCATTCGCATTCGCCGGGGAATCCGGAATTTAATCGCTGTTTTATGGCGTTCTCTTCGACATTGGTTTTTATTGATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACC:1 - chr2L 4788907 5' + Q-element 331 2 71.23 GTAACGGGCATTCGAGCATGGCCAGCAGAAGGACAACCAGACAATCCTTTTGCGGGCATAAAAAATATGGTAGTTGCCGAAATAAAATCAACGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGT:1 - chr3R 13898342 5' - 3S18 6078 2 69.86 CGAGGGTCACGATCAAAAAGCAGACCTTTACCACCACTTCCACGTCGCAGGTCAATTCCTATGAGGGAAATGCACCTCATTCAATAGGTTTATCATCATTATCATCGTCTAAAGTTTGTAGTGGACGAAAATAATTTGTAAATTGC:1 - chr3L 2131356 5' - Juan 235 1 50.00 GTTTGACTAATGACAGGCCACCGCCCCCACAGCTCGCCATTATATCATTTGTGGAAAACTTTAAATGCTTAACTTTAGGCTAAGCAAAAAAAAGCGTGGAAAATAAGTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - chr2L 16554742 5' - blood 7378 2 72.86 AAAACGATTTGATATTACACATTTTAAACCTTTAATTTCATAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 24011055 5' - roo 8991 2 74.66 ATGTTGGGATCTTTCTTGTATCGGTGGTACTTGACATGCATCTCGTATTATATAGCATATATATGTATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr3L 18122403 5' - 297 6928 2 63.01 ACATTTTTCAAGAGGTTTCGACGACCATCTTTGCAGGATTTATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3R 26605622 5' - roo 329 2 72.60 ATTTCGCAAATGATGCTGCAAACACAGCCGAGATTGCTAACATTCCACCGAATACTTTCTCCGCGCAAGTAGTTTACGGGCATTCCTGTTCCAGTCTCGTAATAGCCAATTGAAGCCATTGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTGTT:1 + chr3L 18968564 5' + hopper 4 2 77.40 GAATCTTCTTCAAAGGTAATTTAAAATTCATTGACTTCTGCGCTTGGAAAGAAATAGCATATGCTAGGCCAAAGCTATGATATATTAATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAG:1 - chr2L 18885458 5' + Idefix 10 2 52.74 TAAATATTTTTGATCGCCAAAATATCCAATCCATAGCTAGTGAGAGCGCGAGAAAGTCACATCTATCAGAAACCCATAGTTATATAAACAAGAGAGAACGTTGTAGTCAAGTTCCTCGACTGTCAGATACCCGTTACTCAGCTAGT:1 + chr3R 4624642 5' - INE-1 542 1 73.97 TGGGCGGCCAACTTGGCATCCAACTGGCCCAGATCAACGCCCAGTTCCCTGAGCCGTCTCTCCTGCTCCTTGGTGTCCACGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGGGATCCACTCAAGAAGGCACCCA:1 + chr2R 8164069 5' + Quasimodo 274 2 54.86 CAATTGTTTTGCGTGTATAGAAGGATGTGGGGCTTAAGGAGCGAAATGAACAGACAACGTGCAACATTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCC:1 - chrX 6520976 5' + FB 55 1 54.79 TTCCAAAGGGACAGGAAATGGTTTTAAGATGCCAACAAATGAAATTAAGTTTATGGTTACGCGATTTATGACTGTTATAGAAATTAAATGATGTTTTGCTTCCGTTCTTCCGCATAGCACACAACACACACACACACATATATAAA:1 - chrX 7568134 5' + Quasimodo 40 2 67.12 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTATGTTACACATTTTCCAACTGCACGTCAAGTATTCCGTAGTCGACTATAATGATACTCGTACATATATGTTCC:1 + chr3L 5538151 3' - jockey 4679 1 78.08 ACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATTGATACGCGACTATAAAAATCAAAAGAAATTCAAGTTCTTTTTCGAGAAACGAGAGTGAAGGGAAAC:1 - chr2L 16884598 3' - Bari1 54 1 54.11 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCAAT:1 + chr3R 13684791 3' - 412 7101 2 50.00 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATG:1 + chr3L 22435222 3' + opus 452 2 52.74 CTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCCCATTGAGGAACGTGTGAATGGTGAAAATGGTTGGTATGTGCCTCAGGTAGACGGCAGTTTCGAGTGG:1 - chr3R 27019554 3' + roo 8999 2 52.74 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAATGTACATATATATCTAGCACACTCGCTCGCTATCCCTGTCTCTGTTTTGTTCAACTTTGACCCGTGCATTGACATC:1 + chrX 21247411 3' - blood 7035 2 51.37 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTGTCGCAGCAGGACTTC:1 + chr2L 13850769 3' + roo 392 2 72.03 AGGTAAAATAAATATTGTTTTATTATATTTTATAAAAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTA:1 + chr3R 20119942 3' - S-element 113 2 82.19 AAGAAATATAAAGTACACAAAATGAAAATGATGTGACTCACACACACACACAATCACGCAAAATACATCAACACAAACGACAAACACCCACACACACATCCATACAATAACGCCTAGCTAAGCACACATGCAAGCAACTTTCACTC:1 + chrX 12650351 3' + Tabor 7305 2 48.63 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGCATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAGGCGAGAGAGAGCTCGTGCTGTCGACGTCGACT:1 + chrX 18534607 3' + P-element 2817 1 37.67 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCGTACCTTTACTATACATAAAACGGAAGG:1 + chr2L 4269002 3' + hobo 2920 1 61.11 AGGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCACAAGCACCAAGCTGGA:1 - chr2R 17695988 3' - rover 6973 2 69.86 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAAC:1 - chr3R 8381732 3' - Tirant 78 2 75.91 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATAACAATTTCAGATGACTTCTCGTTATTTGCAGCAACTTTAACGGGCGTAATACAGAGTTGTTTAAAATTTGGTAGC:1 + chr3L 9659539 3' + mdg1 377 2 53.42 TGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTATTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTATATTCTACTAGATTCACTATACACCCCTTATTTTAATAACTTGGTTACTGGTGGCGGTCACAGCGGCAGCGGG:1 - chr3L 19424762 3' + Cr1a 4063 1 71.32 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGGTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCAACGCTTCTTCAGCAGCAGCAGCACAGTT:1 + chr2L 13316966 3' - jockey 4718 1 51.03 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGGCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGG:1 + chr3L 9522134 3' - opus 50 4 60.28 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGC:1 + chr3L 17757996 3' + Tirant 367 2 75.00 ACGTGTTTTTAACAAAGCTCCAGTTAATATCGAAGTTTAGGTGCAAAATTCAAGCCCAAGCCCAACCATCATATCAAATGCGCCGTTCGTTGTTCAATCCTAATCAGATTAGTTTCTTTGACCTACCCTAATCAAATTTCATGCAA:1 - chr3L 15349220 3' + Porto1 24 1 50.68 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAG:1 - chr2R 18372612 3' - jockey 4747 1 69.23 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTGG:1 + chrX 14825335 3' + P-element 2799 1 23.78 CGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTACCGTGTACCGCACGGCTCAATTCGCGAAAAGATAGACGCGATATAGTAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAACAACCCAGACAGACGCTTAGCCACATATTCGGAAAAGTTGGC:1 - chrX 607946 3' - Cr1a 4415 1 66.91 GCAGCGAGCACATGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCTATTATAACAATGTTTCAATTATAATTGAAAAAAATGCACTCAATTTTATCTGAGAATGTACTATTTAAGACAATTCAAACATATAAATACAAACGAT:1 - chr2R 705521 3' - Bica 52 1 67.12 CTCACTCAGACTCAATACGACACTTAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAA:1 + chr3R 14277944 3' + P-element 2792 1 20.55 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGTA:1 - chr3L 21913315 3' + 297 6938 2 60.14 GTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAAATCCGTGGTCCACCAGTTCACTACGATTCCGGCTAGCATGGCAG:1 + chr2R 16224129 3' + invader1 242 2 67.16 GCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCGGATGATTTGTTTAGAGGCGTAAGTTACAAAATTTATGAGCTTCTTCTGGTTGGGGCTGCCGGCATT:1 - chr3R 7034797 3' - Tirant 79 2 58.97 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGT:2 - chr3L 16200724 3' + roo 9020 2 52.74 AAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACAGCTTTGCAAAGTTCGCGGCCACCGTGTCTTGTATCACAGTTAAAATGAGTTCCCATTTACGTTTATGGCATTTTGAATTGTTTCATATGAGATT:1 - chr3R 12118088 3' + gypsy12 10170 2 64.83 ATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTCCCTCGTCGAAGGTCAGGAATCCGGATTGGATGTCGTTGCAACGGTTTCCTGCCCAATGGTCTCCATAGTTGATTGAACTTCTATTCGTTCATTTGCAAAAACTTG:1 - chr2R 5927932 3' - GATE 8146 1 50.70 CGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATAATGTGCAATCTTGGCATAGCCAGCAACGAAAAGTTAA:1 + chr3R 7831312 3' - flea 81 2 73.97 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATAGCATACAAGAACCAGGGATCGCCATGTGGACACCCTACCATCGAAATACGGTATTTTTATT:1 - chr2R 6165167 3' - pogo 56 1 60.96 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGTGGAAATGGAAATGCCGAAATAACTTACGCGTGCTGCGAAGAATCGTGACTCGAAACTTTCCGTTAATT:1 + chr2R 11663926 3' + P-element 2842 1 52.48 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAGGCATAGCTCTAGTTCCAGCTCTTCCTGGTGATTCC:1 - chr2L 184598 3' + opus 494 2 59.59 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAA:1 - chr3L 12125252 3' + roo 9036 1 60.69 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTAGAAAAGTGTTCTTTTAAAATCATCTACATTGATTGAAATTCGTAGCATACTTTCTGGGGCAACATTTACTTACACGTCTCCGTTTATTTAGCCAATAATG:1 - chr3L 8936838 3' - BS 5016 1 65.07 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTGATATTTTCAGCATTTTATTTGAGCAATGTGAAGGGTTTACATAATAGTTAT:1 + chr2R 17400390 3' - pogo 67 1 64.38 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCAGATCCCAAT:1 + chr3R 29384756 3' + roo 9051 2 72.41 CAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTAATAGAGAGTATATAATATCTAAG:1 + chr3R 7477511 3' - BS 5032 1 58.22 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAA:1 - chr2L 1232642 3' + roo 324 2 80.14 AAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGTGCGCTGGTTTTAATGGCCGTACAAGTGATGACCTAGCAAAGGGTAAAAATCTAAATTACTGTTGTGATCTACAAGCAAACAGAGAGCGATTTGCGCC:1 - chr2R 15672985 3' + Cr1a 486 1 79.45 TTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCATCACTGCTTTACTGTTACGGTGGTTAGTTTATTTATAAGTG:1 + chr3R 19242377 3' + Ivk 43 1 71.92 TTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCCGCAAAAACCACATGATCAAGTGCGATTTAATTAGCTTATCTGTAAGTGAGATTGC:1 - chrX 16146137 3' + gypsy5 7282 2 63.70 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCGGG:1 + chrX 140107 3' - blood 7058 2 53.42 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTCAAAATACAATTGTGTATATACCCTACACCAAAGCATAGGATAA:1 + chr3R 13676204 3' + P-element 2853 1 61.94 AGTCGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACG:1 + chr2L 19940105 3' - mdg1 7110 2 64.38 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCAAT:1 - chr3R 19996165 3' - Quasimodo 23 2 65.32 GGAAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACAATTAAAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACATTCGATTTTTAAATTGGCTACAATCATCTCTATCTGCTCTACTCACTATTTAAAGCGCAAGCCACAAACAAATCGCTATC:1 - chrX 19502067 3' - FB 86 1 44.52 ACAGCTCTTTTCTACGCATACCGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATTCATTGTAAATTTGACAAAATATTAAAATAAAACAAAACAATAAAAAAGGAGAAGAGAATATACGGTTAAAGAAGCATATTCAC:1 + chr3L 27992989 3' + 1360 138 1 58.22 TTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTC:1 + chr3R 6147319 3' - copia 4949 2 69.86 GAAGGATACAAAGGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATTAATAATAAATTAATTAAATAATTTAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAATATATAAATAAATTCTATTAAAATTGCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATTAAC:1 - chr3R 16799787 3' + X-element 4676 1 40.41 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACAGTTGCGATAGCAACCTTTGTAATCAAAAATCGTTTCAGCAGGTAAAACGCGCCATTCCAACTGGATTTTCTATTGTTTCAAACTATATGGGCGTTCATCAAT:1 + chr2L 22578129 3' - 1360 4 2 24.44 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCGAA:1 - chrX 6283639 3' - P-element 61 1 42.96 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGT:1 + chrX 20024610 3' + 412 7481 2 61.38 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCCAAAACTGTTGGCTCTGCGGCTTTTGCCGG:1 + chrX 12365391 3' + hobo 2919 1 60.58 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCCTAGATAATTACACGAAATTGATTTGATTTGATTATGCCATAAAGCA:1 - chr3R 21654909 3' - roo 8670 2 80.14 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCA:1 - chr2L 19698082 3' + roo 9006 2 62.33 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGGGGAAAAGCG:1 - chr3L 2687205 3' - jockey 4747 1 70.42 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTTGCCTTTTCTAGTCCTGAAATTTTCAACGAGCAAACTATTGACAATGAACTAATTGCTATTG:1 + chr3R 12941875 3' + hobo 2908 1 56.30 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATTCGTGGTCAGGATTAATAGCCAAGTCAATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGT:1 + chr3R 8005046 3' - 412 70 2 65.07 GTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGG:1 - chr2R 5037707 3' - Stalker2 88 2 75.34 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGC:1 - chr3L 1477378 3' - mdg3 5326 2 65.07 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAATGCATGAGAATTTTAAAT:1 - chr3L 5398024 3' + roo 9036 1 57.53 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCAGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTTCA:1 + chr3L 2486017 3' - jockey 4711 1 56.16 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAATAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCAA:1 + chr2L 13316939 3' - jockey 4705 1 58.10 GCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATATATATAAATGCAATTTTTTCTATATTTTACTATATT:1 + chr2R 15472114 3' - 412 94 2 75.34 TTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTATTAGCTTCTTTTTTCTGCCCTTTTCGGTCACAAAGTATTTTTATAGCTCAATTAG:1 + chrX 17384953 3' - Porto1 4519 1 61.64 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGC:1 + chr3R 31086585 3' + jockey 4920 1 70.34 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTACACGTTAAGAAATGCATAATGTATTTAGCTTCAGGAATAAATGCAAT:1 + chr2R 19016110 3' - roo 16 2 75.34 AATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCA:1 + chr3L 23839721 3' - McClintock 6014 2 63.70 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTACTTGATTGCCCCCAAAAGTATGCAATGCTAATAAATTCGCTTTTATGTG:1 - chr3R 19725359 3' + hobo 2908 1 50.91 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATA:1 - chrX 12105260 3' + 412 414 2 76.03 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAGGTTGGTTCATGCAAAACACCACCAGAATATCGATTCGGATTCGAGTGAGTCA:1 - chr2R 23790202 3' + roo 9054 2 73.29 TGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAGACCAGAAATAATTAGGGTTTTATTTCATTTCCACAAAATTGCT:1 + chr3R 14401989 3' + Juan 4183 1 63.01 CGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATG:1 + chr4 829126 3' + INE-1 147 1 66.44 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAA:1 + chr2L 19940144 3' - mdg1 33 2 63.70 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATC:1 - chr3L 20765142 3' - 297 6642 2 59.59 TTAGTAATACACAGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAACACAAGAGATATACATCCCGCAACGGCAGCACCACCAACTGGTGCATCACCGTCTCCAGCATGGCGTCC:1 + chrX 10492022 3' - Tc1-2 460 1 57.81 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTTTGGC:1 - chr3R 15137265 3' - roo 54 2 60.43 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACCATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAGCTGGGCGTTGGAACTTTATATTTTATTTACACATA:1 + chr2R 9871598 3' - roo 8700 2 59.59 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTGAAGTATCTGAGTACAGAAGAAGTTACTTTTTCTATAACTTACCACTA:1 + chr3R 22435642 3' - roo 8680 2 76.03 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGAATTTTTATCTTGTGTTTTAAATGAACTCGTGTCCGTATTTTGGTCCACGTCCGGCGGTCGAGCT:1 + chr2R 21619454 3' - blood 37 2 60.27 ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATGTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTT:1 - chr3R 5170994 3' - F-element 76 1 77.78 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGTGTTGTTGTTTTCGGCTGGAGTGAATACAGAGACGCACACATAAATACTCACAAAATCGGCA:1 - chr3L 19907057 3' - P-element 23 1 70.55 CTAAAAAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAAACGGGAAGTATGAATTCTGCAGACGTTCTTTTTGGTTACCCATTTTCCGGAGGAGGGGCGAACCAATAATTTTCATTCCAACTTGGCATT:1 + chr2L 15557377 3' - diver2 4566 2 59.59 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAAAAGGTTGACAACTT:1 - chr2L 16554567 3' - blood 7043 2 63.01 TGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAATTTTCCTGCTGCAGCGACGAGTTCAAAGCGCATTATGCATGCAAAACAAACACGTGCCGACACACAACACACTCTATCTGCCTCTTTTCTTAGACACACACTAATGCAGAGGCGGGGTTT:1 + chr2L 12987556 3' - jockey 4759 1 80.14 CTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAAAATTATTGTATGCAATTTTAAAAGAATTTATTAATGGAACAGTTTCATTACAAATCTGGGGCAAAGGTTTGATTGA:1 + chr3R 16799864 3' - X-element 4620 1 68.49 ATACTGTTGTAGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGCATAATATTACGTTGGGTT:1 + chr3L 23871315 3' - Doc 62 1 63.41 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCC:1 + chr3L 20868085 3' + hobo 2878 1 77.88 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGTGTGATGGGAGGTTGATGTGTTTTGGCCTGATCCAAAGGCAGAGAGCTAATCAAATGCATTAAAGCCCTGCGGGGACTTAAAGTT:1 - chr3R 17494843 3' - hobo 7 1 80.82 TCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTGATTTAGAATCTTCAAAAGGAAACCTTTATGATGCAAGACTGCACTATATTC:1 - chr3R 17766677 3' + HMS-Beagle2 7178 2 67.81 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTTAGGGCTTCCCTCGAAAG:1 + chr3R 19246825 3' + jockey 4981 1 71.23 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTAAGTGTGATAGGAATCGTATCTCTCACCTCAACCCACACAATC:1 - chr3R 8821835 3' - S-element 75 1 68.49 CATGTTTATCTGAAATCAGAACACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTATGCATATAGGTTTCGTTTTCTTCTAAGCTATAAACCATATATAAAGTATAATGTTAT:1 - chr3L 20597507 3' - Cr1a 416 1 63.70 TAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTTAAAACAAAAAAAAAAATGATCACATTGCAAGGCCAAAAAG:1 - chr3R 9955960 3' + transib2 2576 1 80.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTA:1 - chr2L 4631118 3' - roo 8707 2 52.74 ATAGCAACAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGTGCAAATATA:1 - chrX 19121891 3' - 412 56 2 54.11 TTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTTCACAGTACGCATACAAGGTAGAAAGGAAAGTGTTTTTATTTTAAACGCCAACGACGGAAGGCAGTCTGC:1 - chr3R 14401825 3' - Juan 4072 1 71.92 TAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTAGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCC:1 + chr2L 13328474 3' - BS 65 1 72.58 TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATCGCTATCGATATATCGTTTTCATACTTTTCAAGTATGTTGGGCTTCGTTAGGTGTTT:1 - chr2R 4902278 3' + Quasimodo 7355 2 69.00 AAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTT:1 - chr3L 8249385 3' + HMS-Beagle 6966 2 71.72 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTTTTTCTGTG:1 - chr2R 14431215 3' - Doc 76 1 63.70 GTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAATAGATTTAGAATACCTATAGATGTATAGTAAAATGTTAGATCATTGTAAAACAAAGATTAATCGTTTTTCCATATCAATCGACGTTGCT:1 + chr2R 22272249 3' - S-element 351 1 57.53 TTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTCCAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAATTAAAA:1 - chr3L 15389535 3' - I-element 66 1 58.90 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAA:1 + chrX 12365357 3' + hobo 2880 1 79.82 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGA:1 - chr2L 18112508 3' + transib2 2747 1 70.55 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTTAT:1 - chr3L 13888872 3' - 412 7090 2 60.27 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGAAATTTCGCAGTTACGCAGCTTCAGCTTGAACCTGTGGCTTACAGCAACCGCAAGCT:2 - chr2R 22964165 3' + 412 460 2 60.96 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCGTTTTTCCGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAGTTTTCGG:1 + chr3R 10541353 3' + hopper 1412 2 78.91 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCGATGTTTTGGCTTAAAGTGTAAAGTGTTCCCGGTGCGCTAAGTGACTAGCCAGCCAGCCATCGATGAGCTGCAG:1 - chrX 1758930 3' + Tabor 7304 2 65.00 GAGAAACATTTGTTAAATTCTTTTAAAAAATATAATTTTTTTTTTAGCCAACTAGAACAATAAATGTTCAATATTTTACGTTTTTAAGTATAAATATAGTTCAGTAACTAGTATAAAATATTGTGTTCAGTGTAATAGTGAGAA:1 - chr3R 23303346 3' + HB 1508 1 37.50 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGAGCTCTCTGGGCGAGACCAATGTGACAACG:1 - 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pogo 69 1 49.32 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAACAGATCTCTTTTGGGCGATTTTTGAGGCTCTAAGCTAAC:1 + chrX 10056743 3' + hobo 2856 1 71.92 GGAGACGAAGAATCATAAAGAACAAAAGCTAAATCCACCAGCATAGCAAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAAGTTTGGAGGTGGTTGGTAGTAAGAGGGGGTTGGATGGAGGTCGGTTTGCCACGTCATGGTCTTGTCT:1 - chr2R 9951458 3' + HeT-A 261 1 54.79 ACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTGTTTACTCTACAAGTAACGCGTTTATTGAACACATTTTTCAAAAACG:1 - chr4 407146 3' - jockey 83 1 65.75 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTTGTTGGTGCTTAATATCCAATTAAATACGCATACATATATGGAAAACAGAAATTATATATATATGTGTTCAAAA:1 + chr2R 652416 3' + copia 243 1 54.11 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACCCACCATC:1 - chr2L 16382501 3' - hobo 54 1 68.07 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGGATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTGCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTAGCTGCATACTTCAC:1 + chr3R 24734913 3' - jockey 4735 1 63.57 CAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGAAACTGGACCTGATGCAGCTCCTTTTCATCACAATTGTACTTAAGTGAGTAGAGTGAGAGATTTTTTCGCCGCCTAAGATGGTCTTTG:1 + chr3R 23617456 3' + gypsy5 385 2 81.38 AAAGAAGAAATTGAGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCCCTCTCAGTCTCTGGC:1 + chr3L 19222685 3' + 412 7479 2 58.90 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGG:1 - chr3L 12125257 3' + roo 9030 1 56.85 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGC:1 + chr2R 16749848 3' + roo 9014 2 58.90 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATG:1 - chr2L 20044537 3' + roo 354 2 56.16 AACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGCTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCCAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACATTTTTGT:1 + chrX 22689446 3' + 1360 3365 1 53.10 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACTTAAGTTGCAAGAGGCAGTTATCTCTAAAAAGGAAATAAGTTTCGAACTCGAGAATTTCTCCCTACTTATGATGGTTTTCAAATCCACATGTACTTCAATTCATAATT:1 + chrX 10504431 3' + roo 397 1 79.45 ACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATA:1 - chr2L 21325109 3' + invader4 3017 2 68.38 CGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGATCGAGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGCCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACATTTATTTAGCTTATTGATTATGGCTGGGG:1 - chr3R 27571214 3' + invader1 85 2 72.00 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATTTCTCAGATAGGATAATCGATTATATGGGGTTTCGAAAATATAACCTATTGATAATCAAATTGGCGACGTTTCTCCCATTTAATTGTAAGCCAG:1 - chr3R 15585516 3' + I-element 5327 1 67.12 ATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTATTTATTCGTGAGCGTCAATAGAACCTACTTAGAAAGTTTTGTAAGAAAAGA:1 - chr3R 18323186 3' - jockey 4967 1 64.38 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAAA:1 - chr2L 16554580 3' - blood 7052 2 55.63 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGGG:1 + chr3R 27398140 3' + roo 9030 1 56.85 GTATATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCATATATTTATTTCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCCAAGTGATATGCCAAGAAAACAAGACACAACCGTTTGAAAAGAGAAAGTTTGTCATAAATTCCTAT:1 + chr2L 17152092 3' - Stalker4 7204 4 79.45 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCTCTCCAGCACNTCCACATCCGACAG:1 + chr3R 27048839 3' - blood 7176 2 93.18 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCGGTTGTTGCTTATTTATTTATTTTGATTTTTATCGCAA:1 + chrX 2104829 3' + roo 388 2 71.23 CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGAACTTCATTAGTCTGGAAAC:1 + chr3L 17935006 3' - HMS-Beagle 6857 2 67.97 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCC:1 + chr2L 4631246 3' + roo 391 2 64.04 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGTTGCAGTTCTCTGGGCGAGACCAATGTGACAATGCAGTTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGGGTGGAC:1 - chrX 18767814 3' + hobo 2891 1 53.54 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTGACGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTGTGCGTGTTTTCATGTACACGATCACTGCTCTCTCCTCTCTCTCAGCT:1 - chrX 10547612 3' + P-element 2867 1 70.55 TTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCGCCTTGGTTGTTGTGCTGCCGCTGGTGCGTTTGTC:1 + chr3R 2525958 3' - Stalker2 7333 2 73.97 CTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATAAGAAATAGGCCGCTTTCAACTGATGCGGAAATAACGCGTCTGCAGGC:1 - chr3L 8157965 3' - flea 24 2 69.18 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATATCGCCGCCGATCGGCCTCCTCCTCGTTAAAATACAAGAATATAAAAACTAATTAAGTATTAAATGCATTTTT:1 - chr3R 30788285 3' + roo 9036 1 59.29 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTG:1 - chr3R 14546491 3' + pogo 2036 1 69.29 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACTGTCTGGCTTCCCTCGAAGCTTTCTACTTTAATTGAATAAATTTCTCCGGTCATCCGGGACCTTTGAAGCAGCCTAATCCACCG:1 - chrX 10504256 3' - roo 8700 2 58.90 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAA:1 + chr2L 16382548 3' + hobo 2898 1 70.53 AACCTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATAAGCCGAAAGATTGAAAACATGAAAGAAAAACCCGTTAACTGATTTTTTCTGTTAAA:1 + chr3L 21636531 3' + 297 332 2 60.96 TATAGGTAAAGCTCGACCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATC:1 + chr2L 5341599 3' - Burdock 6197 2 58.22 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGGAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTATAGCTAAAAAATTTAAAAGAAACGTCGTCAATGA:1 - chr3L 20868004 3' - hobo 46 1 53.42 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGGGAATGCATGCCGATTCCCGATTTTCCGGGAAAAGCAGGCAGCTC:1 - chr3L 22435074 3' - opus 7142 4 57.75 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGGAAAGTAGGGCGAAATGTGTGGAAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCAGCACATATTGTATGTGTGTATTTTTTTTTTAA:1 + chrX 10959286 3' - pogo 3 1 76.74 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGTAGAAATCGTTTCCGACCCTATAAAGCACATATATTCCAGTCTGTCCTTTTATCTGTCC:1 + chr3L 21157117 3' - 412 7113 2 58.90 AGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTG:1 - chr3L 20934148 3' - Max-element 33 2 57.00 CGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCACCTTTTGAGCGTCAATTCTCC:1 - chr3L 17757841 3' - Tirant 8107 1 38.36 AATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATCTGCCGCACTTTTTCTTGTTACACTTTGAAGAGAAATTAATTGACTGCTCCCTGGAGCTGCAACCGCAACCTAGTTCCGAGTCAGGATAGCCCTCA:1 - chr3L 8295684 3' + Quasimodo 7346 2 71.23 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGTGTACACCACATGTGGCTTTTTTCGCCCCTTAACCTGCTTTTACTTGTTCATCT:1 + chr3L 70201 3' + roo 355 2 60.15 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTC:1 - chr2R 8258238 3' - jockey 32 1 64.58 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAG:1 + chr2R 10541731 3' + P-element 2874 1 60.00 AATGTAGATAATCAAATTTAATAATGATGCTATGATGATGCTAATGCTATCCCTTTAATTGAAATAAGAGCTTTGTCTTCAGACTTCAAATTGTTTTGAATTTGAATCAGATAGATTACCTTTTGAACCACTGTACTCAAACGGGC:1 - chr3L 2869101 3' + Penelope 353 1 30.82 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGCAGGCAAATAATAACGTCGTCATGTATAAATTGCCTGCCACGCCCACAGACGACTTGGTGGCTT:1 - chrX 7848156 3' + flea 4978 2 68.49 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGAC:1 + chr3R 20983923 3' - pogo 35 1 61.64 TTATTCAGTGTGGCTTGTATTATGTGTTTGTGACTGTGAAAACTAACAAAAAATCGTGTTGTCCCCTTAATACCGTATGACCGGAGATTGGCCCCGGAGGAGTGGTCGGGGTG:1 + chr3L 1825284 3' - Transib-N1_DM 232 1 68.14 TAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTT:1 + chr3R 19246747 3' + jockey 4903 1 79.45 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTTGGTGCTGGTGTTGGCCGGCTAATG:1 + chr2R 8597063 3' - pogo 27 1 67.12 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATCAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTT:1 + chr2L 18738037 3' + roo 331 2 69.86 GCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGGCCTTGTGGCACAGCGTATCGCCCTCCGGATGGACGC:1 + chr3R 5972425 3' - Doc 260 1 75.86 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCTTTACTCGTGCTGTGCTGCTAGAGATGACAGTGGCTCCGATAGATGGGGCTAT:1 + chr2L 6047932 3' + P-element 2828 1 43.97 TTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCC:1 + chr3R 14138609 3' - mdg1 7120 2 72.60 TGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGGGTATCTGATAGGCGAACTAATATCAGTTTTCTGACATTGCAGGCCCACCGCCCA:1 - chr2R 17649190 3' - Doc 39 1 47.26 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAA:1 + chr2L 8895304 3' + 412 411 2 73.29 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCG:1 - chr3L 19907128 3' - P-element 47 1 32.32 CCCATTACAATGATGTCAAAGCAGGGAGGAATCACAACTATTCAAACTTTCTGAACTACGAGATTCTTGGAAAAATCATATGACAATAGCATAAACTTGGTATCCAAAGACCCCCAAAAGTACCCCCCCACAACCCCTCCTCACTT:1 + chr3L 18010372 3' + diver 202 2 65.75 AGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAAGCGCCCAAAGCT:1 - chr2R 4601544 3' + HMS-Beagle2 250 2 60.27 GGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTAAAAATGTGTATAATATCGTTAGATGCATTTGCAGAAACTGCTGCAAATAATTGGGATAGCTAGGAAT:1 + chr3R 10900948 3' - F-element 32 1 65.75 AGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTTCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATAGTGACGAATGGTTTTTGAAATCGTGTCTGAGCTTTTCCAGTTTC:1 + chrX 20233881 3' + pogo 2031 1 65.07 CGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGGTGTAACACCATTTGTTCGTTCGTTGGCCTTGTG:1 + chr3R 4668843 3' - FB 68 1 74.40 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCCCGCTACCGATACCAATTGGAGCAGGGGTCGTTCGGAGTTTACTTTG:1 - chrX 7508048 3' + roo 400 1 77.30 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAAGTGCTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGAATTTTTATCTTGTGT:1 + chr2R 21619405 3' - blood 86 2 72.60 GCTAACAATAAGATTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATATTATGAAATGATTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATAAGTCTCTGTGTATAAAATTATATTTTTTATTAAATATAACTGCTTAAGCGG:1 - chr2L 9065970 3' - Doc3-element 4670 1 74.66 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCTTA:1 - chr3R 9657762 3' - jockey 4751 1 72.66 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGACTTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGC:1 + chr3R 21655061 3' + roo 347 2 58.74 CGAAGATCTTTCCAAATAAAATTACTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAAT:1 - chr3L 5398041 3' + roo 355 2 49.32 CGATGCAGCTAACTTTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATATATATATAACAAGCCGCGATTAAGTTGCAAAGCCGTTGGCGGCAAGAACTGTTTCAAATCTTCGTTGAAAAACGTCAGGAAAATAGGCCGATCT:1 + chrX 10148023 3' - pogo 20 1 71.92 GAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCATGAATTGGCCAATTGTCCAAAAGTCGGGATC:1 + chr3R 21679721 3' + roo 400 1 77.78 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGT:1 - chr2L 23372624 3' + 1360 3339 1 67.81 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATTGCCTGAATGGCCAAAGGAGG:1 + chrX 17726330 3' + pogo 2042 1 78.18 ACGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATGGATAATACTTTTCGTACTGTGTTTGATTGTATAAATGAGGATGCCACACTAACTAGACACGTTTGTCGCGAAACCCACGCACACTTTGGTGGCTATTAAAACACTTTGGT:1 + chr2L 3679611 3' + Transpac 4773 1 52.74 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAATTTCTCGCTCACCAAACTAGCAGTAACCTAGAAGTATGCAGCGATATTTATTTGAAACATAGACCAACAGCTATGAAA:1 + chr3R 6962486 3' - jockey 22 1 74.66 GCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCACTCCTTTGGCAGTATTCGCATGCAGATCGCCGAGAATTATTATTCCGACAGCTCGGATGAGGAGA:1 - chr3R 22638471 3' + F-element 138 1 55.17 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCATGAAGTCATCTGGCTGAA:1 - chr3R 20983798 3' + pogo 2035 1 66.44 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTG:1 + chr3L 9907335 3' - BS 5080 1 75.34 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACAATTACATAATATTAAAAAGAATATCAGAAATG:1 - chr3R 10433157 3' + 412 7528 2 72.60 GTTGCGAATGCGGATGCGGATGCGGATGCGAATGCGAATGCGAATGCGGATGAGAATGATGATGATGATGAGGTGGCCGGGTCAGGTGAACTGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAAGGACTCCGGACTCCGGACACTCATTCCCCTGC:1 + chrX 12426078 3' - Quasimodo 7040 2 80.82 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAACTGCAAATTATTAGTACAAATATTGGCAAAACTGTGCAAATATGGAATGTTGCCGC:1 + chr2R 20706860 3' - I-element 63 1 58.90 ACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTCGTTTTAAGAAAGTTTAGTTTTGACACTTTTGAAAAAACCTGGTAGTTTATCGGGAAAACAGC:1 - chr3R 7517787 3' + jockey 4703 1 67.81 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATAAATCATTGG:2 + chr3R 21655073 3' + roo 9020 2 51.37 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATAGTGACGAATGGTTTTTGAAATCGTGTCTGAGCTTTTCCAGTTTCGAACATTTATAAAATAAACTAACAAAA:1 + chrX 20233908 3' + pogo 2059 1 57.24 CCAGAGCGGGTGCAGATTTTCGTCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTCAATTTAGTTGCTGGATGTTTTGTGAAAGGGCGAACGCTCCTGCATATCCTTGCATTTGTGGC:1 - chr3R 9628123 3' - G4 3366 1 63.79 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCATTAATCAAAAATTTGGAGAAATAAATGCTCGTTTCTTTCGATTTATTTCGGCCCCCTGCCAGATTTGATAAATAATTGCTATCTTATTATGTCGATTGTCGTTG:2 + chrX 16219339 3' + roo 396 1 76.39 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTG:1 + chr2L 13850754 3' + roo 9037 1 60.27 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGGATTTGCTGCGATTGACAGCTGAACAGTTGTGGAGTCCTGTTGATCATTTGCCCGTGGTTGCGGGGCCTTATACTGGGACCCATACTGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTAGT:1 + chr3L 16047629 3' + Transpac 305 2 54.79 CGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAGGTGGTAGTAAAAAGTCGTATATAATTTTCCATTGGAATGGAATGTGCCACATTGCCCCAATGTGCCACGAGATCTGTATAATCGGGGACACATGCGCTGG:1 + chr3L 17757966 3' + invader2 458 1 33.56 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTAAATCATAAGTT:1 - chr2L 13468215 3' - roo 8716 2 54.11 CTTGAGCGGCGAGGACCCTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTATTATTCGCAAAATCCGCAAAGAGAGCTTCAACGGGCAGTTCATCTGCCATAG:1 - chr2L 11098296 3' - roo 223 2 63.01 TAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATTATTAATAAGTGTCAGAAAATACAGAAACGCTGGTACAAACACGGAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATCCGGTAACTACACCTTTCTCCTATCAGCTGCACATT:1 + chr3L 15051249 3' + Tc1 1558 1 74.66 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTAAATCATTTTGCCAGCAGCGTAAGTTTTAATAAATCATATTTAATACCATTTAACATACAATTTTACTTTAGGCAATGCTCTCTTTTCGATGCGACAATGGCTTCC:1 + chr2R 18396718 3' + pogo 2098 1 78.57 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTCT:1 - chr2L 16607202 3' + 412 7483 2 58.90 AACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATGGGATCTTTAAAGGGGTAGGACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGT:1 + chr2R 4774740 3' + baggins 5329 1 69.18 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAACGTGATGCTTTCCAAAATTGTTTTGTGGTGAGAGGGATTGTTTGTTGTTATACAAAAATTCTTCAAATGGGAGTGTT:1 + chr3R 5518426 3' + Transpac 5189 2 58.62 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACACGCAACCGCGGC:1 + chr3L 17758005 3' + Tirant 391 2 55.38 TCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAATATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGATTTAAATTGAGAAATCGCTTTGTGTACGCTCTGTTCGGTTCG:1 + chr2R 10369004 3' - 1360 3163 1 71.03 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAACATCCGGAAATTTACGTACTATGCGAAAAGGTACTTC:1 + chr3L 13546685 3' - hobo 27 1 64.38 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGGCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTAATCTGATAAAATTAAACTAACTT:1 - chr2R 12379466 3' + pogo 2074 1 63.01 AATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTACGTTGATTTTATTTCGGCAACTACCATATTTTTTATGCCCGCAAAAGGATTGTCTGGTTGTCCTTCTGCTGGCCATGCTC:1 + chr3R 13898329 3' + 3S18 6085 2 70.63 GGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATG:1 + chr3R 4361649 3' - copia 89 2 78.08 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTT:1 - chr3R 24093520 3' - jockey 91 1 73.97 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTATATTTCAATTGCAGCCGATTTCAAGCTTGTAAAAGTTGTCATTACATTGACTT:1 - chr2R 17059562 3' - pogo 64 1 64.38 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATAGTTTAAATACATTCAACTGGTAAAACATAATTCGATATCCTGCAACTTTGTAATATATTTTAGCATACTTTTGTGCTGACTATTTAACGA:1 - chrX 13401464 3' - flea 26 2 43.15 TTGACACCCCCATACTGTATGTCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATGTAAGCAACCTAGCGCTCAAATTCGTATTCTCTTCTGTAACCGTTAAATTTACTGAGAGTTTCTTTGATTTCTTCCATTATGAAAGACGGTACAAGAATT:1 + chr2R 1691030 3' + 17.6 124 2 73.29 TAGTCGTCATTTACGCTTTATGCGTTGTGTGGGAAAGGGATTTTGATAACTAATGCCTTTTTCTTCTGCGCTCCGAATTTGTAATTTGTAAAACCAGCTGACTAAATACATATATCCGCCCTTATCTCTTTGGAAGAAGTCTCAAA:1 - chr3L 23233558 3' + S2 294 1 77.40 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATTCGCTGCATTTTTCGAACCAAAAATTGGTGGTGCTGGTCACCCCGGAACTGGTACCCCGCCCCTCCCCCTTTCCGC:1 - chr3L 15273189 3' - pogo 12 1 66.38 CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGAGAAAATGCTTTGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 - chr3L 23747153 3' + 412 7461 2 76.03 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATTTGGAATTATTGTACA:1 + chr2L 19940154 3' - mdg1 7060 2 69.66 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGAAAATTTGTATGTCAAATGCTTAATCAGCCGCACACACA:1 - chr2L 12987421 3' + jockey 4910 1 75.34 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGAGATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTGGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAA:1 + chr3R 15137355 3' + roo 9001 2 64.38 TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTTTGCGGCTGTGTGGCACCCATAATGAGT:1 - chr2L 8930503 3' + roo 8980 2 82.88 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAGGGTTCGTTGTGCGTAATTTCTGTGTAAATACTT:1 + chr3R 23579405 3' - roo 8708 2 55.48 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGGGGCATTTAGGAGTACAATTT:1 - chr3R 14138515 3' + mdg1 7412 2 52.74 GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCGTTCCATGTACATGTGATT:1 + chr3R 24734935 3' - jockey 4730 1 62.33 ACATAAACATAAACATAGCAACAATGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATTCCGACGATGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCCCGCA:1 + chr3R 13453395 3' - 412 7123 2 66.44 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCA:1 + chr2R 21229060 3' - jockey 4759 1 76.03 ATCGATATCCCAGAAAAATGATGACATTTCGCGTTCGCAATCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATTCGATAGTCGTGAAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTAGTATACCTCAGAATAACAACACACCTTTGACAACTTT:1 + chr3L 14538599 3' + INE-1 504 1 73.97 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTG:2 - chr3R 12115254 3' - 1360 51 1 54.11 GAAGACCTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATAAGCCGGTGTAAGTTGTTCTTTTTTACATCGTCAAAGGAGGTCAGGCGTGGTTCGATGGGTGGACCCCATAAGAAGGCTTGCAGGTATGCCGTATACAT:1 - chr2R 15505338 3' - F-element 4216 1 53.19 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAG:1 - chr3L 1477385 3' - mdg3 5333 2 69.86 CTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGATAGACTTCGAAATTAAAGGTACGACACAAAGACTAACGGGCTAACAATTG:1 - chr3L 24724872 3' - Burdock 117 2 65.75 GAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGAAGAGCGAAAGAAGAAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCATAAAATAATAACTCGGATTGCGGTGATACCTTGTCGTGCATTAACCACAAG:1 - chr2L 4528713 3' - Cr1a 337 1 70.55 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGC:1 + chr3L 14116798 3' - BS 5026 1 61.54 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTG:2 + chr3L 21913467 3' - 297 6613 2 63.70 AAGTGAGATGGTGAAAGTGATGTCACTGCTTACGATCGGTCTTGACAATACTTCAGCTTTAGGCTACCTATGTGTCGGAGATTCTTCAAGCTTAGCTCATGGAGGTAGCTGAATAGCAACTTGTTTGACATTTAAATTAATTATGC:1 - chr3R 22061445 3' - gypsy9 4879 1 73.97 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGGTGTGACACGCAAGGAAGGCAACAAAAAAATAAATAAATTCATCAAAAATTTTGTATAAAATCGTAAACTACCACGAAAAAGTATGTGCAAA:1 + chrX 16996186 3' - roo 29 2 64.38 AGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCTCTCGAATTAGCTACCGTTTACATACATACAAAACGAACCGCCGTTTTTCCATTTGATTTTATTTTTCAGTTTGCATTGGCTTACAGTCGTGTTCGCGG:1 + chr3R 15671584 3' - 1360 3007 1 42.64 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGGGCTTGTCCTACCATTTGTTGTC:2 + chr3R 27016566 3' + roo 389 2 60.96 GCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCGCA:1 - chr3L 20934153 3' - Max-element 56 2 61.02 GCGAGATGTCCGTGACGAACGCCGAACTCTTCGGCTGTATATCGCCGGAAAACACAAGCAGGAATTATTTCGCGCACCACTATAGGCAAAGGTTGCGCTTGATGGACTGGATGTCAGCGAAGTCGCCGCGCCCGCCGAG:1 + chr3R 5357690 3' - gypsy12 434 2 60.43 AGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATACATTGACTGAAAGTTACGGCCTTGATCCGAGTAGACGAGCTGTTCGGTGAGGCAGAGCTATACACAT:1 - chr4 799136 3' + R1A1-element 5279 1 54.79 CCACTTGCTAAATGTACAAATGGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAGCAACACATAATAAGAACATCTTGCCGCACGATCTGCAGCGCTTGGAGAGCTACGCCCGCCAGCAGTCCGAGTTTCGTCTAATCAT:1 - 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chr2L 5341493 3' + Burdock 6352 2 55.47 ATGACAAAGTATCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACATTTCCCAGTCTTTGTTGTCACCCGATGACAAACACAGTTCAGTGTCCCGTCTTGGCTTTT:1 + chr3R 13166984 3' - Stalker4 64 4 62.76 AGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAGCCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCAGTTAGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGGTCTTTTCCTTACACAACAGTGATATTATCGTG:1 + chr3L 16005905 3' + Circe 269 1 80.14 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTGCTATACTTTTAATATGTTTGTTTTAAATTATTGTACCCATTACTCGTAGAGCAATGAAGCGTTTCCGATCATGTAAAATATAAATATTCTTGATCAGCA:1 + chr4 572597 3' - 1360 20 1 71.92 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAA:1 - chr3R 29283188 3' + hopper 1349 1 62.07 AGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATTTACATATCAAAACTTCAAACTATTTACATTTTCCATGAAAAATTGTCATTTGACAAAATCGTTAGCCCTGATAAGATACCAC:1 + chr2L 11957435 3' - invader4 2630 1 69.86 ATCTAATACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAACCATTCATACCCGGCATGGCAAACGGCATCGGAAACGGAGGAGGATTATTTCCTCCCCAATGGGGCTCCTTCTTCTCATGCTCCTGTTTCTGGGTTTCGTCAGTGCT:1 + chr2R 5037827 3' + Stalker2 388 2 73.29 CCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAACTTTAAAGACCCAATAATACCATAATACCATTAAAGTTAAAATGAATTTTTAGGCGTTTAAAGTCTTTTTTCCT:1 + chr2R 5422103 3' + G6 1975 1 50.34 AAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATATAAAGGGGGAAAAGTACAGACTGAAATGGGAGACAATTTAATGAACGGCGTAATGAAATGAGCTGTGTGCGGGCCGGGCCAAATGATTGTCGGACTAATCACAG:1 - chr3R 22889224 3' - Idefix 7 2 50.68 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGGCTCGTAGGGAGGAAGAGGAAGATAAGGTGGGTCCGCTTCTTTCTCGCTCTCTGTTACTTCATG:1 + chr3R 11758593 3' - P-element 55 1 48.63 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTA:1 + chrX 7032748 3' + roo 327 2 71.23 CGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATGTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTAAATTGATACTCGATAATTAAAACGACCTGTTG:1 + chr2L 5341633 3' - Burdock 4 2 73.98 TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCTTTACACTTAAATAT:1 - chr3L 1477329 3' - mdg3 5277 2 68.49 CGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCATCTTTTTTCATTCCACTTAATTATTGATTCTAACGAATTTTCTATTGGCCAAAGGTCAATGCAATGTCAGAGCGAACTCCTGGGA:1 - chr3R 15170040 3' + F-element 240 1 58.62 GTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAGTTACCGTATTGATTCATGGTTTTGGTTTGTTTATGTTTTATGTTTTTGGGTGCG:1 - chr2L 16177601 3' - Transpac 4814 1 70.83 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTC:1 + chrX 140098 3' - blood 7067 2 53.42 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATACAAGCAATTGTAAAATCAGTTTCTATGCCATACATTTTGTTGTGTCTATAGTGGGACTGCTGAATTTCTA:1 + chrX 18786228 3' + pogo 2053 1 51.37 TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATCTCACCGACGGACCACGTCCACGTTTAAACTGTTTTGGCCAAC:1 - chr3R 25961995 3' + I-element 5279 1 68.49 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTCGTCAAAGTTGTTGTTACTTGGGCTGTTTTAGTCGCTTTTGTTGTTGCTGGTGTAGCGTGTCAACT:1 + chr2R 23790353 3' - roo 8718 2 58.90 CGGACACAAACACTCAAGAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCGAGATGAATACTCTAAAGACAAATATTCTCTTCACCGGAGTAATATAAAATGTCAAATTAATTGTCTATAATATTATATTAAAACACACTGTATTA:1 + chr4 1166630 3' - 1360 457 1 57.53 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCG:1 + chr3R 29384736 3' + roo 9030 1 58.22 CTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGACACATCACATCGATTCAAAATCTCGTTCTCTGAAACCAA:1 + chr4 909173 3' + 1360 3299 1 49.32 TATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAATTTTGCGTTCGCATTCACACTGGCTGAGAAACGGGTAATGGGGAACTCGACTATAAAATTCTCTGTACTTGTACATAGGTACATACATATTTATCAGCGGACATACGTCGGTGC:1 + chr2L 21205597 3' + INE-1 499 1 64.14 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAAC:1 + chrX 407479 3' - I-element 64 1 65.75 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCGTATGCAATAAAGTT:1 - chr3R 23104474 3' - jockey 67 1 55.48 ATTGCGGCTGCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATTATTAATAAATAACTATCTGACAAGCGTCAGGGACTGTGTTAAACGCAGTCGTGAATATTATTTTATCTGACCAGGAGTCAGGGGCTGTACTAATAGTATGAGCCGGT:1 + chr2R 3289925 3' - Idefix 7072 2 76.71 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGAAAATTTGTATGTCAAATGCTTAATCAGCCGCACACACACTTGCGC:1 - chr2L 12987414 3' + jockey 4917 1 70.55 TATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAATATTATTGTGCCCAGTTTTAATCCGGAAAGCGGGAATTCCCTTCCGCTCGCTGCCTGCACTGCGCTGCGCAGACGCATCGG:1 - chrX 15624797 3' + I-element 5179 1 54.48 GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATAATCCAAAACTAGAGAAAGTCGCGGCTCT:1 - chr2R 18618489 3' - jockey 4744 1 72.46 GAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTT:1 + chr3L 19350000 3' - 1360 3270 1 65.75 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGACCAATGTGACAATGCAGTTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGG:1 - chrX 18767820 3' + hobo 2891 1 57.85 CTGTCGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTTCTCATCTCTCGCTCTTTTCTGTGTCGCCA:1 - chrX 17264284 3' - X-element 4420 1 63.41 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGC:1 - chr2R 17696041 3' - rover 7026 2 69.86 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAAT:1 - chr3R 15102228 3' + roo 356 2 52.74 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATTG:1 + chr2L 19940150 3' - mdg1 7065 2 67.81 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGAACTTANTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAAC:1 - chr2R 23596000 3' - blood 87 2 73.29 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCA:1 + chr2L 11725037 3' - F-element 62 1 65.41 AGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCAGCCTTAACATGGAAGTTTCAATATATGTCTTCTTTTAAGAGTTCATAAACAGAAATATGTTTATGCGTTGTATATTATTTCTAA:1 - chr2R 5116956 3' + mdg3 5292 2 57.53 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGCCATGGTG:1 + chr3L 14116805 3' - BS 5022 1 65.07 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGG:1 + chr3L 9522139 3' - opus 163 4 59.59 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGAGTTGGAAAAGTAACCCTTTCGAAGGCAGGCTAATCAC:1 - chr2R 12248920 3' - Juan 4037 1 77.40 GTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTCTTAAACGTCAACACATAATTTTCGGCACTAAACATGAAACTATTTGCGGCTTCGGGCCATAAGACCCAGACCGGGCCAGACGGAGCAAAAAATCATAATAAA:1 - chr3L 2687046 3' + jockey 4670 1 80.69 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACACACGATGACGACGTGCAGTTTGACTGCACCGATGGG:1 + chr2L 16382593 3' + hobo 2913 1 62.40 GATCTTATATCACGCTCACTTNAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTT:1 - chr2R 23595995 3' - blood 7093 2 72.60 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCATAAACTATAGGACTTTATGTTCCATTTGTGGGTTTTACTGTTTTCCCTTACTCTTGGCCGGGTCAAAACTTCAAACAAGCTGAAAATTAATTTAATACGCCAT:1 + chr3R 24444166 3' - hobo 15 1 75.34 GCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTACTGGCATGCCTCTGTTTATTATTCATACGCAACTTTTGCC:1 - chr3L 2668803 3' + Bari1 1687 1 70.55 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACTGTCTGGCTTCCCTCGAAGCTTTCTACTTTAATTGAATAAATTTCTCCGGTCATCCGGGACCTTTGAAGCAGCCTAATCCACCGCTCAAGTAGCACATCTAATCCGGC:1 - chrX 10504232 3' - roo 12 2 75.34 TTGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACGTACAAATTTAGACATTATGCCAAAAAAAAAACAAATTCTGGACTGCACTGCACTGACTACAAA:1 + chr2R 21257948 3' - transib2 108 1 79.86 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATAGCTGCAGAGTCAGTTCCATT:1 + chr3L 8273995 3' + hobo 2889 1 60.00 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAG:2 + chr3R 10751720 3' + hopper 1351 1 56.85 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCT:1 + chr3L 21913437 3' - 297 6643 2 62.33 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCATTTTGCTCAGTTCGCCAATAAAGACGCTGCAAC:1 - chr3L 739121 3' + P-element 2859 1 66.44 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGAAAAAATCGTATTAATTCGAT:1 + chr2R 21199750 3' - jockey 4750 1 60.96 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATTAAACAGATACAAAAGTAAAATTATCTGGTATCTGGCCCAGTGTGCACTGGCACCCTATCCCTGACCCTAGCCGTCCTGAAGCATTTGGGATTGTGGCAGCATG:1 - chr4 906054 3' + opus 7487 2 76.03 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGCCGGCAGGCGACAA:1 - chr2R 21475222 3' + P-element 2814 1 34.93 AAAGGGAATATAAATTATAAACTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATGTTATTTATTTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACTCCACAAAAGAAGTCAAACGATGCGTTGTAAAAATG:1 + chr2R 20389518 3' + copia 248 1 56.85 GCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCATATAAATTATAAATCCAAATAGAAAAATAAGTTACAAACTAAAATATCAGACAAATAAATAGTCAGTGT:1 + chr3L 10517390 3' - Doc 478 1 52.74 TATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCATTAGATGAACCGAAACAACGCGCACCGCTCGAGCGACGTCCTCACTGTCGAAAGTGGAGCGCCCAACTGCGTCTTGTG:1 - chr3R 31499383 3' + roo 105 2 53.42 ACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATTCATG:1 + chrY 2720335 3' - gypsy 19 2 72.60 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAACATTCCGCGCGTAACAGCA:1 - chr3L 12125233 3' + roo 9055 2 73.79 ATGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTGTCTAAAGCGTTTTGTGCAAATTTCCAGATGCCAACCGCCACCCCACAGCTCCATTCGTTCATCTATAATTTATGCG:1 + chr2R 17609899 3' - mdg3 5263 1 79.02 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAACACTTA:1 - chr2R 6514197 3' + roo 9041 1 60.96 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAACATAAGACATGAAAGGCCGCAATCAGTCGGCAATGCCAAGGTCTCGG:1 - chr3R 12622152 3' + 1360 3352 1 59.59 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGCTTAACCTAATCAGTTTTGAACAAAGAAGTACGCAAAGTTTGCTACGCCATCTGCCAGACAAT:1 + chrX 826278 3' - FB 59 1 58.62 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCGAATGAAACCGGCTTTTTATTTTGAAACGCGAGGGTTGTTTC:1 - chrX 18534536 3' - P-element 79 1 30.14 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTGCACCAATGTAAGTACTTAAGTTTACACAAA:1 - chr2L 7724150 3' - I-element 84 1 75.89 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGGGTATCTG:1 - chr2R 17649237 3' - Doc 86 1 71.23 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTTCGCCTAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAG:1 - chrX 10694267 3' - Transpac 56 2 60.27 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATAGTGTTTGGTTAAAGTTGACTTAGTAATGTTTACCTCCCTCTGTTTACTTATTAGTGTATACTTTTGGGATCTGTTACGAAATGATTATGCAACATTTT:1 + chr2L 1922629 3' - BS 5019 1 55.48 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGG:1 - chr3L 21913326 3' + 297 6929 2 56.74 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGAAAAGGGTTTATCATAACTTATTTATTGCTTATTCCAGGTTGTCATGTTCTTCGGTCTGACGGTGGCC:1 + chrX 13152837 3' + pogo 2051 1 52.74 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTTTTAAACATAATATGACATTCTTACCCATACTTTAATGCGAAATACATACGCTCTTCTGTTTGCTTG:1 - chr2L 19731920 3' + roo 9019 2 55.48 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACATACGTAGTTCTGATAACGCCTAAAGCTAGGCAATTATGAGCGGCAAAC:1 + chr2R 6089192 3' - 1360 25 1 69.18 AGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAGCGATATCTACCTAGCCACAGGCACATCACACCCAGCAGTTCCCATCGCCAATGCCACCACCACCTTTT:1 + chr2R 19343045 3' + 412 266 2 52.08 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAATTATATAAGCCCCATAGATACACGTGTATGGATATATATATATATATACATGACAAGTAGCCAGCAGACGTCTCCAGAAAGGGAG:1 + chr3R 23877965 3' + Transpac 5211 2 60.66 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAAACTTGCCTCCAAACGTGGCCCAATACTTTGAGGATCCGCTTCGATTCCAGCA:1 - chr3R 27927930 3' - FB 68 1 63.01 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCAGTCTCGGGAAAATTCATTCTGGGAGTTGTGCTAAATTGTCTAACGAAAATTCCATTAAAATGCGTCATTAA:1 - chr3L 16920164 3' + roo 360 2 54.79 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTGCGAAAAC:1 + chr2R 22774602 3' - I-element 38 1 53.51 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAAATTCCAGGTATTCGGAAGGACTAAAATACTTTCTTTATGTCCCTT:1 - chr2L 21026657 3' - FB 76 1 69.86 GATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATTAAAAATTATAAACAATTATATTATAGAAATCCAGCGGATTTCTTTCTTCTAGTTATGTAGTAGTAGGATTTCTACTCACCTTATATGAGCCCAGATTTTTCACGGAGCAACCGAGTTTA:1 + chr2L 9062418 3' + Juan 4207 1 78.77 AAAAAAAAAATTGTATAAAAAATAACAGCAGTATAGTATATAGGCTTGTTTAAAGCTTCGCAAAATATGTTCTTTTCCATCTTTCATAAAATTTTTCACTTCAATTGAAGAGGTTTCAATTTATTAAACCTTTTAAACCAAAGAAC:1 + chrX 18209986 3' - Tc3 78 1 80.14 TCTTCGGTTGGAGGCAGCGGTCCCAGCAGAGCGCTTAGTCAGCGCCTCGTGCCGTCTGGAGTTCCGTGCCTTCGACGGTCACCCAGCGCGCACACGCGGGAGGATGAGTAATTACAACTAATGCTGC:1 + chr3R 30275181 3' - gypsy10 5873 2 74.02 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAAT:1 + chr3R 27398118 3' + roo 344 2 60.96 CATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCT:2 + chr2L 2608981 3' + I-element 5274 1 71.92 GTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAAAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTAGCAAATATTTTGTGTGCAAATCTATAAAAA:1 + chr3R 11730867 3' - INE-1 534 1 51.37 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTACACCTGCTATATATGTATACTTGATTTCTGCCTTTTATGATACATATTCTG:1 - chr3R 4668783 3' - FB 68 1 67.36 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAACATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCAATTTTTGC:1 + chr3R 13684797 3' - 412 31 2 58.52 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTACCTGACTGTTATGATATATGAGTTTTAAAGACTAGGCATCTGCTATTGAAGTTTCTGGTCTAATTTAAAT:1 + chr3R 4197999 3' + 1360 3352 1 51.88 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCTCACATTTCTCTTCACCTG:1 - chr3L 10023952 3' - transib2 48 1 53.42 ACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAA:1 - chr3L 18947261 3' - BS 4731 1 65.00 TAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAATACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTCCTGGATGTTTCTAAATAAAGATTATCAATGCGATGCAGCA:1 - chr2L 15834465 3' + hopper2 1531 1 66.44 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAACATTTACATACACATGTACATCGACATGTGGATGTGTGAGTTGGGGGCGGGATC:1 - chr2R 20389404 3' - copia 4936 2 66.44 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGT:1 - chr3R 27007369 3' - roo 88 2 77.40 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATTTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTTGTGTTGACCGATTCTCATAGATACCGAATAAGCACATGTTTTTATTGTATTTATAAATTCTCATTTACATG:1 + chr3L 15833891 3' - 1360 54 1 74.66 AAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAANCTTGTCCATTCCATGAAAAAAAGGCTTTAACTTGTAGCTAAATAAATACAGAGCAAGGTCTTAACTTTTTANGAACTTGCGGATGTGTCTGTTGGTTAAACATAACAAATTTTTTA:1 + chrX 7939530 3' + S-element 1343 1 50.68 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCACCCAAAGGCCAACAAATGCCATTAAAAATTGCCACGTGAAATGCTTTCAAAAGCCATGG:1 + chr3R 13530029 3' - jockey 32 1 67.81 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTTCGGCTGAAGGTGCAATGAAGCCG:1 + chr2R 13695740 3' - blood 7050 2 56.12 TACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCCAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATATGTATGTAAAACATTTTTTAACGAATAGCTTAAAAAACTTCCAACTGGAATCGGGATTAGA:1 + chr3R 11758071 3' - invader4 2815 2 58.90 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGTTGA:1 - chr3L 14233016 3' + copia 227 1 61.87 AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAATATGAAAAATAAAGATGGGGGGGGCGAATCAAAAATTTGTAGCATAC:1 + chr3R 28803950 3' - hobo 73 1 67.81 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGTAAAATAATTTTTACTTAAGATAATGTTTTCGATTTCGATTCTGGATTGTTTTACTGTAATAATTTTGTTTTCCTTTATTTTGACA:1 - chr3L 12034351 3' + 1360 3379 2 73.29 CACTGGCTGAGTAATGGGTATCTAAAAGTCGAGCAACTTTATTCAACCTTTGTCTGCACACCTTTGCCTTTCCCAATCGATGGGAACGCACTTATTGCATAACAAAGTACGGAAATCAAATGAAACCTTCTTGGGATGCCAGCAGA:1 + chr3L 21427100 3' + INE-1 541 1 72.60 CCGTGGCTCTATAGGTGGCTCCAGGCCCCCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCCAAAGAGCCAGAGATACAGTGATAGCAGACAACTGTGTGTGTGCACACGTATCCATGCATTGTAAATTTGACAATATATGTACATATGTATGCCCT:1 - chr2L 1669343 3' + 1360 63 1 66.44 ACCCAGGACGCCAGTTTGGGCTTAGACTTCCACTCTGGTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTATGCTCGGATTTGTGGCCTATTGCC:1 - chr2R 11413810 3' - Rt1b 4826 1 72.00 AATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACATCTGAGTAAATATAGAGATTCCTGGCCTGATATTTCGGTTGACTATA:1 + chr3L 16726478 3' + Quasimodo 6929 2 67.95 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATA:1 - chr3R 15137296 3' - roo 92 2 83.56 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTGCGTTTGATCTTCTGGGCGCGGAAGTGCTACCTATGGAGTGTAAAATGTCTATCAGTCTGCT:1 + chrX 4469651 3' - roo 32 2 63.70 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGTGGAAATGGAAATGCCGAAATAACTTACGCGTGCTGCGAAGAATCGTGACTCAAAACTTTCCGTTAATTATCCAAAATATTC:1 + chr2R 11663939 3' + P-element 2850 1 60.96 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCGTACCTTTACTATACATAAAACGGAAGGAAGTTGCTTTCTTAGTTCTGCGCTTTTTCC:1 + chr2L 4269032 3' + hobo 2928 1 65.96 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGGAATATTCAATACTATTTACAAAACAAAGGAACTCTGCTGTAATTACCTATACAAGTGTACGTA:1 + chr3R 13613190 3' + copia 249 1 51.15 GCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCG:1 + chrX 19690601 3' - gypsy 7072 2 76.71 ATCGCTCTTGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTCAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACTGTCTGGCTTCCCTCGAAGCTTTCTACTTTAATTGACAGTTATAATAGTTGCATAATC:1 + chrX 10502701 3' - roo 62 2 59.59 CGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCATATAGTTAAGATCCATCAATATATTTTAAACACATATCACATAAGATCAAGTCATTACAGT:1 + chr3L 20174872 3' + 412 7422 2 58.22 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACATTGAATATAAGTAGCCAACTTTGCTCTGCTCTAAACTAATTATTGGAAATTCACTGATAGCCTTATTTGTTTGTACCAAAT:1 + chrX 6910175 3' - I-element 38 1 59.31 ATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATAATGTGCAATCTTGGCATAGCCAGCAACGAAAAGTTAACCTTTTTGT:1 + chr3R 7831321 3' - flea 4829 1 67.81 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAATTTACAACATAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTACCATATAAATAATTTCCTAGTATTTATAGTGCAGACTAAAAATAGCTTACATA:1 - chr2R 4854947 3' + copia 244 1 52.74 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACAC:1 - chr3R 9550912 3' - P-element 78 1 32.19 CGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACCTGTCTTAATAAATACGGTATTAAATGACAAAATAGATGATCCTATTTACGAATCTATTTATGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTATACTGGAATACCTTTCTATTAATTCGTA:1 - chr3R 19446646 3' + roo 8778 2 50.00 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCAACGCTTCTTCAGCAGCAGCAGC:1 + chr2L 13316960 3' - jockey 4704 1 54.40 TACAAATTTTTTAATATTTTTTAGAAGTGTTCTTCTTAATTTAAAGTAAAGTATTCGAAAGTAAACAAAAATGTTAATGCTTTACAGCGGATTACAAGGTAGCAGCAAGTTGTTGACCTATCTCGTGTCTGCTTTTGACG:1 - chr2R 13084831 3' - Transib-N1_DM 291 1 35.71 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTGCGTTTGATCTTCTGGGGGCGGAAGTGCTACCTATGGAGTG:1 + chrX 4469630 3' - roo 53 2 54.79 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGC:1 + chr2L 1451228 3' + mdg1 7374 2 73.97 AGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGAGCAAAAATTTCTCCCAAACGTTGCCGGGACCTGGTGGTCAAGTTCGAACTAAGTAACGAACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTACCCATTTTCCTAAAAACAGAA:1 - chr2L 12525532 3' + HB 1217 1 46.58 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTA:1 - chr3L 16200727 3' + roo 9017 2 54.79 ATATTGTATCATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATATGCGAAGCTATAGAAGACATCAAAGTAGCGACCAATTCGGGCATTAT:1 + chr3R 7205972 3' + hopper 205 1 36.99 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATCATATCTAATATAAAGAATGGATTCAGTTGCTGACCCTTTTGGTAGAGCATTACTA:1 + chr3R 17871939 3' - roo 8728 2 63.01 CGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGGTTTAACGTCAAC:1 + chr3L 27391436 3' - 1360 10 2 67.81 CCCAAAGACAGCAACATAGAATTGATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAA:1 - chr3R 7042010 3' + Stalker2 7564 2 76.43 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATTCTTGATCAGGATCGATAGCCGAGTCTATCTAGCCATGTCCGCCTCTCCCTCTCTCCGTCTTTTCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 - chr3R 4487815 3' + HMS-Beagle 7015 2 62.76 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTAAAGTTTGGCGGACTAGATAAT:1 + chr3R 20260937 3' + roo 9046 1 67.81 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATGTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAGAATGCAACTTCCTGCTATTTTGTGTGGAACGTAAGCATCT:1 - chrX 20024499 3' - 412 46 2 50.00 TTCTGGCGCATCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGC:1 + chrX 19690597 3' - gypsy 7038 2 70.37 GGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAGGATAGGATATAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCGTGCAACTCATAGTTAGATCTACAAAAAGTCATGTCGGTACAAAGGTGAGAGTTTTCCTATATAGATTTAGTG:1 + chr2L 21764269 3' - Cr1a 4230 1 62.33 CGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCACTTCTACGCAATTACTAGAAATGTCGTTATATTTAAATGATCTGCGACATATATATTCTTCTAAGAAAGTTAAACATAAAACACAACA:1 + chr3R 3953134 3' - invader1 3787 2 55.48 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCNAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCA:1 + chr3R 13529970 3' - jockey 92 1 76.03 TGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAATATTAATTAAGTTATTGAAGTGGAAAAAAAGCCGCAAAGCTAACAAAATTAGGGCTTTGTTAAAATGTATAAACAAACCTCAAAGAACCAAAGAGACAGCTCAATTAATCAAA:1 - chr4 464348 3' - diver2 4542 2 66.21 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTNGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCANCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGTAC:1 + chr3L 13546667 3' - hobo 44 1 54.48 GACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTA:1 + chr2R 6271497 3' - blood 7228 2 74.66 TTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGACTGTGCCAAGTAGCTTCGCACCACGCTCTATTCCCATTGTAGGGCCCAGAAATGTGCTAATAAAGTTAGATTTAATTA:1 + chr2R 22761282 3' + 412 493 2 77.14 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTG:1 - chr3L 13546585 3' + hobo 2882 1 77.27 TATCTGATAGTCGGGGAATTCGACTTTAGCATTCTCTCTTGTTGCTTTATTCATCTGACACCCAGTGCCTTATTCATTTCACCATCGTATTGTCCAATCTGTGGGCTTAAGCTGTTGACCGTTGTCCTTGGCTAGCAGGATTTGCA:1 - chrX 11278670 3' + INE-1 559 1 65.75 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGGGTATC:1 - chr2R 17649239 3' - Doc 88 1 72.60 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAAGGTAGAGATGCTACCGAAACAGCCAA:1 + chrX 19583365 3' + roo 403 1 78.46 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCACTAGTTACATTCTCTGGCGCTTCCTTACTG:1 + chr3R 5495259 3' + roo 8983 2 78.08 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTC:1 - chr2L 19698074 3' + roo 9014 2 56.85 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAATTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTTGACGAGTAACGGCTATAAAAGAATGACATTAACTCTTTGAAAATA:1 - chrX 21183833 3' - S-element 74 1 69.18 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGAGTGTGTTTAAAATTATGCATGGTTTCACCTCA:1 + chr3L 5958746 3' - 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412 7101 2 52.74 CAAAATATTTATTTATTTTTCTAATGCCAACATTTCTATTAGTTCTTGGCCAAGGTTAATTGCCAGCCCAGAAAACTAGACAAGGACAATCCGAAACTACTCAAAGGCAACTCTGGCAACTCTTGAGCGTAATTAATCATTTCTTG:1 + chr2R 19926378 3' - mariner2 831 1 60.96 GCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATTTAATACCATTACGTTAAAGTGCTGACCCCAGCATCGGGCCGGAATTGCAGGTGTCTTGAGTGCAGCGACCCACGCACAGAGGAAACAGCTGCCGGTGCAGCAGCAAAG:1 + chrX 14809155 3' + Gypsy6A_LTR 12 1 56.16 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCTAC:1 + chr3L 11529552 3' + opus 440 2 59.59 GGGGGGGTGGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGACTATTTTCCAACATTACAACAAGCAGAAACCCCAATTTTGTAACTAATAACGCAGATGTTTGTTTACT:1 + chr3L 12224485 3' - gypsy5 95 2 52.41 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTC:1 - chr2R 22112631 3' - 412 57 2 56.85 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACTCCATTACAGTGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCGGGGGACATTCATCCACCAATCACTC:1 + chr3L 22038308 3' + diver 172 2 54.20 CGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTCCACTGTGCCGTGGGTTTTGGCAGCATCGCATCGCTCG:1 + chr2R 16160822 3' + mdg3 178 2 68.66 TTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAACTTTCTGAACTACGAGATTCTTGGAAAAATCATATGACAATA:1 + chr3L 18010315 3' + diver 6032 2 71.23 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAGTANCANTTTTACCCACTGTGCGAGTGTTACCACTCAAGTTCAAGTGAC:1 - chrX 1208805 3' - Burdock 35 2 58.90 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGTGGTGGAAGGGGGTTGCGGGCAGGGTTGTCAACAC:1 - chr2R 21362705 3' - Tirant 8131 2 70.14 GCGAGTGGCGAGAACCCTGATGCAAGTGGNACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCTTNTTTTGTCTGTATTTTAAAAGAACCAGACACATTCTTACGTTTTG:1 - chr2L 3408693 3' + opus 476 2 67.12 AAAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGCCTTTATCAGCGTTGCGCCAGGGAAAGTTGTTGACTTTTATGGCAAAT:1 + chr3R 18833155 3' - 1360 3045 1 78.77 CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCCCTCTCA:1 + chr3L 19222676 3' + 412 7470 2 65.07 GTGACGTGCAGCTCTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGGAGTCATCATGTAATAGTCATCGATGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATA:1 + chr2L 21403538 3' - G5 4449 1 69.17 CTGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTCGTGATGGCCCTCCTCCTTTGACCTGGCTGGTTGACACTTTCGTTTTGGTAATATTT:1 - chr3R 13898160 3' - 3S18 5766 2 82.09 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTACTTGT:1 - chr2L 3911834 3' + roo 346 2 58.90 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCA:1 - chr3L 15035119 3' + pogo 2036 1 68.49 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATANNNNACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACG:1 + chr2L 19940105 3' - mdg1 7053 2 60.67 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACGG:1 + chr2R 2427627 3' - Doc 44 1 52.59 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTTGTGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACC:1 - chr2L 16382508 3' - hobo 56 1 68.42 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTAT:1 - chr3R 9550906 3' - P-element 72 1 36.30 AACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGG:1 - chr2R 6514222 3' + roo 9038 1 53.23 GACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCCCGCT:1 - chrX 7508090 3' + roo 9016 2 56.16 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATACGTAGTATGCCGATTATGTCCACATCAATGGTAGCAAAGTCAATGGAAATTGAGCATGTTAAGC:1 + chr3L 14784379 3' - blood 74 2 56.16 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAAC:1 + chr2R 10541727 3' + P-element 2809 1 32.19 ATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGAT:1 + chr3R 5972356 3' - Doc 302 1 64.41 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGCCCCATAGATACACGTGTATGTATATATACATATATATACATGACAAGTAGCCAGCAGACGTCTCCAGAAAG:1 + chr3R 23877961 3' + Transpac 5184 2 52.41 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTCAACGCGGAATCCC:1 - chr2L 13697580 3' - F-element 57 1 62.07 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGAAAGTGTTGACTAGCACTGTCCAACATGAAAAAAAAAAATGGGGGGGCGACATCGAGATGACCCCAGAGAA:1 - chrX 16219143 3' - roo 8678 2 75.34 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGTTTTCTTAAATTTAATCGCAAGTAAAAACTGCTTCTGAGGATTATACTGAAGTATGCA:1 - chr3L 20573763 3' + pogo 2041 1 60.96 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAAAAGGTTGACAACTTGCTAACAAATGAAATGCAAA:1 - chr2L 16554547 3' - blood 7023 2 76.71 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGATGTCTGGTTTGTTAGTCATGCCGCGAATATTGCGCTGCTTAAACGTTTCCAGGATATCTG:1 - chr3R 21843705 3' - blood 7030 2 72.41 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTTTGATATTAATGTGCTGTAACATAAAATAATGCTTCCAAATCAATGTTAAATCATAAGTCCTCTCAATTTCCTCCACCACTTCTAATTCCCCTTCAAAAAAGTTTATCTATTGGAAA:1 + chr3L 19106533 3' - roo 4 2 76.03 ACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCAATATTTACCTCTGGCACAGCATTTATAATTCAATTAGTTTGA:1 - chr2L 5820266 3' + I-element 4960 1 71.23 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGACCTAATTGAGAATATTATATCTGTTCTGTTAATGATTGCTATTAATTGTAAGAGCTCGTACATATATTATTCGATATTG:1 - chr2L 22690080 3' - copia 42 2 56.55 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGT:1 + chr3R 5575026 3' + blood 298 2 71.92 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTAGGATAACGGAATTTTTCCGCGCCCAAGCACTTAAAAATATGTTGAATATTGAATG:1 - chr2R 20230927 3' - jockey 4716 1 56.39 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGTTTGAATAATCTTCTTTTTTTCCCAGTGTATAGGCTCACTATGTACTGTTCTGAGTTAACTGAA:1 - chr2R 18396555 3' - pogo 54 1 56.85 AATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTACTTAGAAATAATTTGGTAAAAGTTCCTAAAACCCACCAATAGGCATAGTGATGAAGAAAACGCCTAAAGTTTATTGCTGCATACTTTTCGACAGCTTTT:1 + chr3R 18155022 3' + FB 240 1 59.59 AACAAAAAGAACAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAATGGGGGAAAAA:1 - chr3R 11367160 3' + Doc2-element 220 1 90.91 GAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAAATGACAGCAGACGA:1 - chr2R 17609773 3' + mdg3 162 2 73.29 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTC:1 + chr3L 23871325 3' - Doc 75 1 62.33 TTTTTCAGATTTTTTGTTTTTTTTGTTGCTCGTGTCCGTGGTCGTCGTGTTCGATTCAGGCGGCCCTGCATTTCTTAACGCATATTTTGTAATTGTTGCCGCCGTTGTCTGTTGTCCCAGGTTGACCTTTTTGGCGGATCCAT:1 - chr2L 4599597 3' + FB 175 1 77.62 GGCACATCTGCTTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTTTAAGCAAACTTCTTACATCAAATACATT:1 + chr3L 4937029 3' - roo 8902 2 78.77 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGC:1 + chr3L 14116760 3' - BS 5067 1 65.07 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAACTTATTTTTGCAACATTTTTGTGGTTATCAAATGTAGTTACTTTTGAAACCGAGCATATAAAATATTAGACAGACA:1 - chr2R 15406171 3' + I-element 5342 1 73.29 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTAATTGGAGTGCAACCTGTAACTGCACATGCATGTGGGTGTGTGACTGGCTATCTCTTTTCGCAG:1 - chrX 11730098 3' + jockey 4936 1 53.85 AATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATTAACATTTACATACGCTTCATTTTTAATGAACTGACAAATCTGTGCGGCTTCCCCGACCTCTCGTCAGGCCATAAATAAATCCGCGCACAAACGCAAATTTCCTCGCG:1 + chr3R 13323990 3' + F-element 4672 1 79.14 GAAAAGCGCTTGAGGCTTACGACTGTATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGATAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATGATATGGTAT:1 - chrX 17495677 3' - Burdock 6170 2 62.33 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTAGCATAGCTGGATTTCTTTTCCAATTCTAGGGCATCTCTCTTTCTCTCTCTGAGTTTCCACTTTGCTATCCTTCGGTTTTCCCTCGCCAAACCTAATAAATTTT:1 - chr2L 5789573 3' - FB 17 1 71.92 CTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGCTAAAAATTCCTACCCTGCTCCGCACTCCAAATGC:1 + chr3R 17494966 3' + hobo 2849 1 76.03 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAATTTCTCGCTCACCAAACTAGCAGTAACCTAGAAGTATGCAGCGATATTTATTTGAAACATAGACCAACAGCTAT:1 + chr3R 6962482 3' - jockey 26 1 71.92 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTCTATTTCTTGCTTCATGGATCTGCTT:1 - chr2L 16607178 3' + 412 7511 2 55.63 GAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCAAAGACCTTTTGCGATCCCTCTTGAAAGGTAACGTCCATGTTTTCCGGCGGAATCCTGACCTCCTGAAATA:1 - chr3R 15841842 3' + G2 2840 1 52.82 TTTTAATTTAATTTTTAATTTGCCTGAACTCTAATTTCTATACCTGTATTTTCATAGAAATAAAATAGTTTTTTAACTCTTAGACAGCCTACCCATTTGATAACTTCTCCCTCGGCGATTCAACTTAACTATTTGCAAATTAATTT:1 - chr2R 11682164 3' + Rt1b 126 1 53.42 CTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTATTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACAAAATAGACTCAGACATTTGAAATAGGTGCAGTTGAAGCCATGGA:1 + chr2L 9564805 3' - BS 4898 1 67.81 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGAT:1 + chr3R 17944071 3' - P-element 102 1 16.44 TCGAAAACCACGACATGCCAACTGCGGGACACTTGGGAAGTCGCATGACGAATGCAAGGATTGCAGCTCGTTATCATCGTTATCCAGCGATCGGTTGGTGGCCGCGGGTACGCTAATCTCCTCTGTGCAAAGAGAACACCAGACC:1 - chr2L 8207742 3' + Osvaldo 497 1 73.10 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATACACACATACATATATATATCTATATACATCTATATAAACGGAAGTGAAAATTAGCAAACCAGGAAAATGTTTTGCCCAAACTAATA:1 - chrX 12263674 3' + roo 9039 1 64.38 GTTTTGTGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCTATCGATTCTGACCAAGAATATATATCCCTTATATATTATATATATAGAAGGTATAAGAAGTGTTAATGTTGTACTCTTGGCCCGAGGAGATTATTCTGAGATATATCTGTGTC:1 - chr3R 20689173 3' - INE-1 345 1 49.32 CAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGGG:1 - chr2R 21362760 3' - Tirant 81 2 73.29 GAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTTAAGCTTGC:1 + chr2R 17696135 3' + rover 293 2 61.38 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCTGGCTACACATTTGATGTAATGATTATTCAAGAAACCAAATTGCTTAGCTATGAAATAGGTACTCAGAAATCAATATATTTTCCTTTCAATA:1 + chr3R 19629066 3' + Transpac 5203 2 62.33 GGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGATTTAAAGGTTAAGGGGGGGCGTTCGTCACG:1 + chr2R 11642016 3' + Doc 318 1 79.45 CTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCGTCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAATATCGA:1 - chr2L 18112459 3' + transib2 2796 1 63.70 AGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAG:1 + chr3R 30618743 3' - X-element 81 1 64.38 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTCGCCCTCTGTCGCGTTTGTTGAGTTAACCCCCTGAAATTGAAGTTTACTTTTGATTGACGGCGGTGTGTGATGCTCTAAGCCAGAAATGCTAGCATGTGTGCGC:1 + chrX 18767950 3' - hobo 17 1 73.97 ATTTTTTAAAATCATTTTATATGCTTCTTGTGGCTTTAAAAACAAAAGCTAAACAAATAAGCCAGACATATTTTTAAGCAAACTATGTAACAGCTAAAAACCCTTCTCAAACACAAAATACTACCCCATCACATGAGTATTGTA:1 + chr2R 14043840 3' + 1360 3091 1 74.31 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACATGTCTGGGCCACAAACTTATTTCCAACTTGTT:1 + chr2L 2609042 3' + I-element 5335 1 70.55 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTG:1 - chr3L 12125263 3' + roo 9024 2 52.74 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATA:1 - chr3R 10541215 3' + hopper 1351 1 62.33 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACGTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAA:1 - chr3R 4530691 3' + copia 5055 2 61.64 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATA:1 + chr2L 20044616 3' - roo 84 2 75.34 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTCTTCTTAATGCCTTTATTTTGAAATTTACCAAATGGCCTACAAATAAGAGTGATTTTTTTTTTAATTCCAAAAGTCTTTGCTACATTTTAGGCAATTATTTTTTCGCG:1 + chrX 3559719 3' - opus 7 2 76.03 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACTCGTATTTATTCATTAAAACAGCAGAAGTGCCGAATTAAAATGCATCAATGCTCGTATATTTAATTATGAAATG:1 - chrX 3559567 3' + opus 7463 2 54.79 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATGTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTG:1 - chr3R 14546491 3' + pogo 2040 1 64.71 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGCTATATTACGTGTAAAAGAATAATGTAATTGTACATAAATTATAAAATTTTATTAGTGTTAATCGCGAACATCAAATGAT:1 + chr3L 3154211 3' + flea 219 2 59.59 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCT:1 - chr3R 23579307 3' + roo 331 2 74.65 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAACATTGTTTCATTAAAAGTTTTAGAGGGAAAATACTTTCCACTTGCACTGTGTTGTTTATCAGCTGTTC:1 - chr2R 9091821 3' + 1360 3338 1 54.17 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTCCACTAAAATGTTATTAACGTTTTTATAGCGCCCGGCAATAAAATACAACTTGCTTACTTTTTGTTCTTTATTTAAATGTTGTGTATTCATTATAATTA:1 - chr2R 17842771 3' + roo 393 1 73.29 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACTTATCAAAATTATTTATAAATATTTCTGGGAAAATCCACTTTTCGTTATCATGACACTTG:1 + chr3L 11124581 3' - jockey 4732 1 62.33 ATGATTGGTAAAACAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAATCTAAACGAGGCTTATCGAGACAATGAATTGAGCTCTGAGATATTTAAGGTTGATGCATTGCTACATCAGTCTGAGGCCACACATGACCACATCTCATTTATCCG:1 - chr4 891301 3' - Tc1 1479 1 71.92 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTT:2 - chr2R 24807890 3' - I-element 70 1 67.81 CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATAAGAAATAGGCCGCTTTCAACTGATGCGGAAAT:1 - chr3L 8157980 3' - flea 4786 2 63.24 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAA:1 + chr3L 20168286 3' + roo 337 2 63.01 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACTTTAAGCCTTTATTAAA:1 - chr2R 18723639 3' - 297 44 2 56.85 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATATCGCCGCCGATCGGCCTCCTCCTCGTTAAAATACAAGAATATAAAAACTAATTAAGTATTAAATGCATTTTTTTGTGAGTTTTTCTTCCTCTCGTTTTTTTG:1 - chr3R 30788255 3' + roo 397 1 77.40 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCTCAGCTGTCCGTGGAACCGGAACTTACCAGGG:1 - chr3L 4287028 3' - P-element 79 1 26.09 AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATAC:1 + chr3R 19246762 3' + jockey 4918 1 69.18 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTGCAAAAAAATTGCTCAAATGAAATTGCATATCGAATTTCGCTTTGAAGGCAAACGGAAGGCATTCGGCTGCACACATATGACATGAAAGTCGAGG:1 + chr2R 21110666 3' - roo 8688 2 60.96 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAACATTTACATACACATGTACATCGACATGTGGATGTGTGAGTTGGGGGCGGGATCCTATGGGTTGTTTACGCCTTTTAACCCTTTCGAATCAACAC:1 - chr2R 20389363 3' - copia 4877 2 74.22 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGGAACAATCACG:1 - chr2L 13675853 3' + flea 227 2 69.29 ACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTACT:1 - chr3L 2668841 3' + Bari1 1649 1 57.53 AATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACAC:1 + chr2L 13328501 3' - BS 52 1 57.25 CCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAAC:2 + chr3R 17766815 3' - HMS-Beagle2 67 2 64.38 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCATTTATAGA:1 - chr2L 3133660 3' - Doc 30 1 56.85 GCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACCAACCAATCGA:1 + chrX 13367506 3' - HMS-Beagle 34 2 62.33 AGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACATACGTAGTTCTGATAACGCCTAAA:1 + chr2R 6089168 3' - 1360 49 1 52.74 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAAAAGCACTGAT:1 - chr3R 27007334 3' - roo 53 2 54.79 CAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGGCTGTGTCAACGTCATAGACTACGACCTTCGGCTTCTCGGCCGCGTTCCGTGCCACATCCAGCCCAACTTCAGCGAATCTTTTCGATGTAGATCGGAAG:1 + chr2R 25002378 3' - Doc 20 1 66.67 AAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATA:1 + chr2L 23034069 3' + FB 403 1 43.97 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCATCACCTACGGAACCCTCATGTTCGCCAGGCACC:1 + chr3L 17746417 3' - roo 9 2 75.34 TGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGGCAACCCAT:1 - chr2R 5037698 3' - Stalker2 7326 2 68.97 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTACATTTAAGAATATTCTCTTTATGAG:1 - chr2L 1232612 3' + roo 354 2 59.59 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACA:1 - chr3L 8249359 3' + HMS-Beagle 7007 4 56.92 CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAGTATGAAAGACGAAAATAAAATGCCATT:1 + chr2L 13328554 3' - BS 7 1 75.34 ACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCATTCAGCTTGCCAGTTCGGTTGTCGTTGTTGTTTACG:1 + chr3L 6376104 3' - R1A1-element 5052 1 74.48 GTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTTCGGCGGTTTCAATTTTATAACGTTAAACCAATTAACAGGTTTTACACACGCA:1 - 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F-element 76 1 63.01 CATTGGAAATACCGCGGGACCGCGTAGTGTTGAATACCTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGTTAAAATTGAGCATCATTAAGATG:1 + chrX 4751049 3' - Max-element 153 2 76.71 AAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATTAACGGAAGAA:1 + chr3R 2999859 3' - McClintock 51 2 54.79 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTACTTACTAGACTTAAGAAACACTTTAAAAGCTTCGATGATAAAAAGTAACATGAATCAACAATATAAGTA:1 - chr2R 7769725 3' - Transpac 4967 2 51.37 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAATAATTCCGAGATTGCC:1 - chr2L 6047850 3' - P-element 68 1 36.43 AGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAACAGAAAAGACGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGCAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATACATATGTATGTATGTAATATATTCGTTTTGCAAAC:1 - chrX 22560083 3' - invader1 3698 2 68.49 TTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTT:1 + chr3R 7042075 3' - 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invader3 5050 7 78.77 CGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTC:1 + chr2L 22036462 3' - INE-1 298 1 51.03 TACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATATAAAAAAAATTCCGAAAATTCGTTGCATTTCAATGATACCATGGAAGAAATGGAGTA:1 - chr2L 6962493 3' - R1A1-element 5274 1 60.96 GTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCCCGGCATTGTTATTGTTATTGTGTGTGGTTTCTGGGCCTTCTTCTTCCTCCTCACCGTATTCCCACTTATTGTTATTCTCTCTTTTCCGCGGCTAAGTGCGGCCCACTCAAGGT:1 + chr3R 5517698 3' - Transpac 469 1 80.14 TCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAGGACTTTCAATAAGCTTAAACAGAGCTTTGAAATAT:1 - chrX 21639273 3' + 412 7460 2 73.29 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAACGTGATGCTTTCCAAAATTGTTTTGTGGTGAGAGGGATTGTTTGTTGTTATACAAAAATTCT:1 + chr3R 5518411 3' + Transpac 254 2 56.16 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGT:1 - chr2L 7148548 3' - HMS-Beagle2 49 2 52.05 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTACATGGGCATTACCATTGGACATGTAGACTCTTGTGACCCCTACACACCCGCATGCTGACCAAAACTGCA:1 + chr3R 4191010 3' + pogo 2052 1 55.48 GCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCA:1 - chr3L 17757940 3' - Tirant 72 2 66.44 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAG:1 - chr2R 25083265 3' + pogo 2055 1 57.24 ACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGGACTATCTGTAAAGTAATAAAGTATATGAATATTTGGCATAAATTTCTGTCGATTTTTTTTAAACAGGTAAGAATTTGTGTTTAATACATTTTTACAAAAAGTT:1 - chr2L 3175050 3' - Burdock 6149 2 72.60 AATGAAATAAATTATTTTTAAAATGTTTAAAGTTACGTTCAGATAAAGTATAAATATCAAAAATTTTCATATGTGATCATTAAAACATTGACAATTTAACATTTTTCTAAAGGCACAAAATGCTTCTTAATTTCACTAAGACCTGA:1 - chr2L 5080495 3' - FB 849 2 23.97 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGT:1 - chrX 19163238 3' - Burdock 6175 2 58.90 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCC:1 - chrX 4469539 3' + roo 337 2 65.07 ATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCAC:1 + chr3R 5972373 3' - Doc 302 1 56.30 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTTCTTCGGTCGCTTTCTGGCTTCTTCGATTGTT:1 - chr2R 23595964 3' - blood 51 2 52.05 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAACAAATACTCTTTTTCTATGTAGCCATATAGGGATTTGAATTAAAACTA:1 - chrX 12105193 3' + 412 7534 2 63.70 TATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTATTTTCACAGCCGTGGCTAACTAGAAAATAACGAACAAACATATTAAAGCACACACGCAGAAAATCAATGGCAACGGAAGTGCAACCTGGGGCCATTCCTC:1 - chr2R 7624333 3' - P-element 365 1 65.75 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTTGAGCAATAAAAAGACGTTTTTTTATTTAGTGATT:1 - chr2L 22340062 3' - Doc 30 1 67.12 TTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTCAGCAAAAGTTGGTGGGACAAAGCAGAACTTTAATATATATATATTGTCGTGCATATATATGCCATAAT:1 - chrX 6186281 3' + Transpac 260 2 52.05 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCGGCGGGGTGCCGTCTCCGCCTGCTGCAGCTAAATGCCAAAATGGCAATTTGCTAAAGTTTTCCCAAGC:1 + chr2R 18551832 3' - I-element 18 1 73.97 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCT:1 + chr3R 5575065 3' + blood 7349 2 57.24 TGTATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTTACCCAAAAATTCAGTTAATAAAATATCGATTGTGAAAAATTTGTGCAATGTGTGTTCATATTAGTAGTTAATTAATTTAAAGTAAACTAATTTATTTAGA:1 + chrX 5128464 3' + 1731 100 1 74.66 CTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTG:2 + chr3L 21913472 3' - 297 6608 2 67.12 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTTGAGGGCCCACAAATTGAGAACTTCCATAGTGGAAGGAATTACTTTTTTTTTTGGCGTCAATCGATAAG:1 + chr2R 21229136 3' - jockey 4683 1 73.79 ATTAGTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAATATTTATTTTTTATCTAGAAGGTAATGATTTCACACTTGAGTCTCAAAGTAACTGCCACTAAGT:1 + chr3L 4045792 3' - Circe 7103 1 59.59 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGNTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAG:1 - chrX 17495701 3' - Burdock 6187 2 61.87 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCG:1 + chr2R 10541739 3' - P-element 5 2 69.41 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCTACTTTATTCGATTTGTAAACTTTC:1 + chr3L 11529574 3' + opus 468 2 57.14 TCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAGTCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCATACAAACGAGCTCCAATTATATAATCCTTTGTAGTGTGGGAGGCAGTTTTACTATACTTCATACGTAGTGGAGTGGGCGCAAGGCTTTCATTG:1 + chr3R 17665657 3' + 1360 228 1 61.64 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACC:1 + chr3R 13684755 3' - 412 84 2 73.29 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGTACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTATACCCAACAAGAGTAATTTACAT:1 - chr2R 23278366 3' - mdg3 62 2 61.64 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCA:1 - chrX 20330547 3' + P-element 2810 1 32.88 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACCCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGGGAAAATGGCAACTGCACTATGAATAATTTTTGTTACCCATTTTGAGAGACGACG:1 - chr3L 18119447 3' - 1360 64 1 62.33 GAAATATAAATTATAAATTACAACATATACAAATTCATATATTTCATAATATTTTCACCTGCCGCTTTTCCTTTACCTTTACCACGGCTCTGGTTCATTTTTCACTGCCATTATGGCCTGCG:1 + chrX 3596528 3' + copia 252 1 72.13 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACNCNTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAAT:1 + chr2L 11725051 3' - F-element 61 1 57.53 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCAC:4 - 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chr3R 9977215 3' + BS 5043 1 52.05 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAG:1 - chr2L 4631166 3' - roo 91 2 79.45 GCACACAGCCTTTCCTCTCAACAATCAAAGGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGTGT:1 - chr3L 19907116 3' - P-element 82 1 30.14 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAATTAATAATAAACATTAGTAATAAACAATAATAATAAACAACCTTACATAAAATATAAAATTTCAAGATAGACTAAACGAGCTAACCAACTCGTTAAATAGAATCCA:1 + chr2L 21556091 3' + flea 4949 1 56.16 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAATTAAAAGGCGATAAATGCATTGATACATCAAATGATGCATACAGCATCAAAATGTGTT:1 - chr3L 15389483 3' - I-element 14 1 73.97 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAA:1 - chr2L 6047874 3' - P-element 98 1 18.49 AGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTA:1 - 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chrX 21227121 3' - Tabor 76 2 67.12 AAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTGATATCCCTTTTCATGCCCATAAAATCCATAGCAGTTTAGTCTGTATTTGTTTTGGCTGAGTAATATTATTATTATATATTTG:1 + chr2R 23278490 3' + mdg3 209 2 59.59 TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGTACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTATACCCAAAAAGAGTAATTTACATATCAATTTATTTTAGCAATTAAGTTGAT:1 - chr2R 23278338 3' - mdg3 5286 2 60.96 TACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTATTAATTGTGTTAAATAGTTTTTACAGCTGATTGGTTTATT:1 + chr2L 3175186 3' + Burdock 181 2 68.49 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTATATATTTGAAGCCGAGTTTATCTCAAGAATGTAGATTGCCTGTAAAAT:1 + chr3R 8065316 3' + 297 332 2 70.55 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACATAAATTTCCAGTTAACTAAGTGTTTAAGCAGTCATTAAAAGGTTGTTGAAATTTATGA:1 + chr2L 18173705 3' - blood 35 2 60.96 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACAGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGAAATTTCGCAGTTACGCAGCTTCAGCTTGAACCTGTGGCTT:1 - chr2R 22964181 3' + 412 444 2 52.74 AAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATATTTTCCAGTTGAG:1 - chr3R 8631603 3' + roo 357 2 51.37 ACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGTGTATCTCAACGTGAAAATCTTACAAATTAACTTTGACTTTCATTTGCATTTC:1 + chr2R 10859134 3' + hobo 2487 1 63.70 CAAGGTGCCGTATCTAAATTCAAGGCACTTGACAGCAGCAATTAGTTTAGCAGTTTCTTCTTCTGTGACCGTTGGTATGGGCTCAGCGTGCTCGAGGGGTTCTTTGGTGAAAACTAATGCAAACACTCAGCATCTGCACCTGCACC:1 - chr2L 13330998 3' - G7 200 1 68.49 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGGATTTTTCGCTGTTTT:1 + chr2L 3908507 3' - jockey 4742 1 66.44 TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACA:1 + chr2L 11725030 3' - F-element 82 1 73.29 GGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTGGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCATGGGAGATTAATTAAATTACAGGCAATATTTGTTAT:1 + chr3R 17834575 3' - R1A1-element 149 1 70.68 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACATTGAATATAAGTAGCCAACTTTGCTCTGCTCTAAACTAATTATTGGAAA:1 + chrX 6910143 3' - I-element 71 1 68.49 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGT:1 + chr4 868737 3' + roo 9011 2 60.27 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCATAAGTTTTGGTTTCGCTCTCGACTGGAAGTCTCTCAGAGAACGCGGAGAAAGGTGCGGTGTGCTCAACGCCGTGCTTACCGTCTGTTTGCTGCACGTGTTTTCCG:2 + chr3L 739297 3' - P-element 16 1 73.29 CGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACT:1 - chr3L 25232692 3' + accord2 203 1 80.14 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAG:1 - chr3R 13676128 3' - P-element 98 1 18.49 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCAC:1 - chr3R 16349233 3' - P-element 24 1 40.00 GGGTAAAAATTGTTTGTAAATAAAACTCGTTTACCACGGAAAAAACAAAAAAGTGGCAAAGAAACCTGTACTTAGCTAACATGCATGCGTATAGTGTTGATGGTTATATATGGATAATGTTAATGCAAATTGTGCAAGTGAAAAAG:1 + chr2L 7522182 3' + Bari2 962 2 54.11 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAACAACAAA:1 + chr3L 19907215 3' + P-element 2848 1 58.90 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGTGAGTAAATTGTTCATCTCG:1 + chr2L 7810697 3' + P-element 2786 1 11.64 AAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACAGCTTTGCAAAGTTCGCGGCCACCGTGTCTTGTATCACAG:1 - chr3R 12118143 3' + Gypsy12A_LTR 2175 1 71.92 TTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAGCGTAATAAAGGGCGCACAATTAGTTGCTTGAGTTTCCGCAATAAAGTTGAATGAGTAATCCAGATACTTATTAAATTTGGGTCAAGTATTCAG:1 - chr3R 12181894 3' + mdg3 38 2 67.81 AAGTGTCGATGTTGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTC:1 + chr3L 8249455 3' - HMS-Beagle 77 2 71.23 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACT:1 - chr3R 31458415 3' - jockey 71 1 65.67 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTGCACTACAATTACATGTGATTTAGCCCATATACATTAAGCTTTATTTGTTAATTATTAAACATTTTTAAAATAATTCTCT:1 + chr3R 12342219 3' + hobo 2898 1 56.16 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTTGG:1 - chr3R 5495216 3' - roo 8747 2 79.71 CGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTT:1 + chr3L 8249454 3' - HMS-Beagle 55 2 68.29 GTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAGTTAAGCCAAAGGGGGCAATTGGGGGA:1 + chr3R 23104536 3' + jockey 4901 1 80.00 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGAA:1 - chrX 16219214 3' - roo 83 2 76.03 TAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACC:1 - chr3R 23415926 3' + jockey 4909 1 72.60 ACCCTTTCGCGCCCAACGTTGCATTTGAGCAATTTAAATAAACTGTTATGAGGTCAGACTTAGTTAATAGTAAACAACAAGTAAATAATTTTCTAAGTTGTTTGTGAGCAATTATGGGAGTGTCCATCCGATCAGAGTGCTGAATC:1 + chr3R 31424483 3' + looper1 4 1 74.66 AGATTAGGGGTATGTAGTTTCTAGTGAACCTACGTGGAACAGGGAAGTTCAACCGACAAACCAAGTCTGGACTAGCAACATCGCCACGAATATGCATTATTGATAGCCTTTAACATTATCCTGGCGGCTTAACTTTAGTGTTCCAC:1 + chr2L 2591127 3' - Cr1a 4127 1 61.64 GCCGTCACCAATAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCCATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 3333 1 95.00 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAAATAAGCAATGCATGCAAGTCATACACACAGAAAAAA:1 - chr2R 22761183 3' - 412 83 2 73.29 ATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGGCAACCCATTCAGGGA:1 - chr2R 5037691 3' - Stalker2 72 2 64.38 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTTCGCCAGATGATTTATGTTCGGAGTGGCAGTATAAATCTACCGTATTCTGGCATGACACACTTTTCCGCAATTGCCGTGTTCTGTTTTTTT:1 + chrX 15252416 3' + opus 7478 2 69.86 ATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTG:2 - chr3L 8754751 3' - mdg3 5301 2 58.90 ATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGACAACAGCGGAAAAATGCCGCCAAACGCAAATACTGCGGCACAATTTCATTTTTTTGTTATCTCACTTTTTTGTTGCTTT:1 + chrX 6910526 3' + I-element 313 1 60.00 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGG:1 + chr3L 2485985 3' - jockey 4742 1 61.38 AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCGATGTTTTGGCTTAAAGTGTAAAGTGTTCCCGGTGCGCTAAGTGAC:1 - chrX 1758958 3' + Tabor 7249 2 66.44 GGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGATTTGGGTAAACAACCAAACTCTATTCCGACATTAAAGATGTCGTACGGGACAATG:1 + chr2L 21403602 3' - G5 4398 1 69.18 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCGTTTTATAAATTTCAATTTCTGAAAT:1 + chr3L 18968748 3' - hopper 12 2 71.54 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGATTTATTTAAAAGAGAAATCCGAATTTATTTGTTATTTATTTTTCTC:1 - chr3L 20168156 3' - roo 8686 2 70.55 GCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATTATGATCATCATATATTATAAGGTTGTAGCGGACAATCGGTTCATGTTAAAACGGGACCAACAACGAACTTTTGTTTAATGTTTGGTAATTATAATTAC:1 - chrX 13367335 3' + HMS-Beagle 227 2 72.60 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGNTGCCCGCCAAAAACTGGTGCTGCCGAACCC:1 + chr3R 19725442 3' - hobo 56 1 59.85 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACTCAGGGATCAAGTGACCGGCGTTGGAAAGATTTTTGCCCGGCAA:1 + chr3R 22352557 3' - I-element 24 1 67.12 CTTAAGACTGAAACAAGTGGCGTGAGAAAATCTTAGATGTACTGAGTTGTTTACTTGATCTGCTCGAGAGCGCTTCTTGCTTATGCTTATGTGCATACATAAGGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGAAAAATAGCTCAAACAATA:1 - chr2L 12159658 3' - Tom1 271 1 75.34 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTTTGCAATTGGTGAGCAACAGGATG:1 - chr3R 5977705 3' - copia 37 2 60.27 GTCGCGCTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAACAATTGATTTGCGTTCAGGGACAGGAGCCAACAGTGCTAAATTAAAGCGATATAAAACGGTAAACAATAAAACCATACAGAAATGCAATCAAATTTACTAAAATAT:1 - chr2L 7642384 3' - mariner2 294 1 63.01 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTT:1 + chr2R 10695912 3' + roo 9048 2 67.81 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACATGTATATATATCACCACCTCCCCGTATGTTTACCTAGTAGTCGTGTGCTTAAGTAATTCCCTTACAAGCAACTTTGATT:2 - chrX 15405932 3' - opus 147 4 59.59 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCTACATTAACGCAAAGCAATAATTATCATATTTGTCTTCTCTTTCGAATATAACAAATT:1 - chr2R 7009409 3' - Quasimodo 55 2 62.33 CCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATAACCTTTATACACATATTAGGTTATTCTTATTTGCCCTTCGCCAGGATAAGAGCCCTGGCAGCTGCCAAGCCGCTCAGCTTGGCAATGCAACAAGTCATTATCCTGC:1 - chr2R 21598108 3' + G5 4727 1 52.74 ATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTCATAAAATTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCT:1 + chr2L 5460075 3' + Dm88 4382 3 66.44 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGA:1 + chr3R 9550999 3' + P-element 2832 1 47.95 TTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAGTGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGATGTAATCAATTTTGTTCTAGCGGGTTCTCTATCCCTGTTT:1 - chr2L 5901698 3' - Stalker4 6965 4 72.22 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTATAAACT:1 + chr3L 8295833 3' - Quasimodo 54 2 61.64 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTTGGAAGCC:1 - chr3R 5495211 3' - roo 8750 2 77.40 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTCTTTT:1 + chrX 10547719 3' - P-element 93 1 21.23 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTACTTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAACGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTCTAT:1 - chr2L 16607200 3' + 412 7491 2 54.29 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAAGGTAGAGAT:1 + chrX 19583348 3' + roo 9033 1 58.22 AAAAAAATAAAAAAAAAACACTGTGGTGTTTTTAATGTTTATTTAATAATTGCAACATCTATTATTATTATGCATCATACAATAATAATAACAAATTTACCCGGCCATCGCTTTAAATCAGAAATTGCCAAGGGCAGGCAAAGA:1 + chrX 14023269 3' + HMS-Beagle2 489 1 54.86 AAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACA:1 - chr3R 27007354 3' - roo 8737 2 67.12 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACC:1 + chrX 13367496 3' - HMS-Beagle 44 2 55.48 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATTCGCATTGCTTTCTCGTATCGCATGACTCTTGTTGCTAAACACTG:1 + chr3R 8381834 3' + Tirant 362 2 60.27 TAAATAAATAATAAACAACAAATCGCGGTGAATACGATCGGATATAGCCATCTATATAGTGATGCCTCTGTCGCAGGGCTATTGCCTAAAGCCCTCGTCGAGGNCGATGAAGGTGCTCCGTCAGCAGGAGCAGCAGGATCA:1 - chr3L 7804363 3' + BS 5093 1 73.76 TTTCACTTTTCTTATGAAATTTAAACAGGGGCAACCCTAGTGTCAGTGTAATGTAATTCCCCAGGTGCGCTAACATAAAGAGCTCCCACGACACTTAATAATTTGTAAAGCAAATAACATTAAAATGTCGTAAGAAACCGATTATG:1 - chr3R 16820404 3' + S-element 339 1 78.77 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAAAACTAAAAA:1 - chrX 10284786 3' + pogo 2055 1 54.11 GTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATCTGGATGGGACAAAAGGTGCAATAAAACCGAGAACCCGTGCGGATGA:1 + chr2L 597941 3' + I-element 349 1 67.81 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCTATGGCTTCTG:1 + chrX 6615571 3' - roo 8730 2 69.12 ATGTACCGTTTGATTATCGAAATTCCTCGGAATAACAAAATAGAAAACAAAAGAGAAGTGTGCAAACAATTTTTTGACAGTGTCAAATCTGTGCAATTATAATTACTCTGCAGTTTAACTATGTTTATGTAAATATACATATATAC:1 + chrX 11995430 3' - S2 273 1 65.75 TATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGT:1 - chr3R 29283211 3' + hopper 1325 1 78.08 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAGAAATAATGTTGATGCAATAACATGCAACTTTGACACCATCACAAGTG:1 + chr3R 31032105 3' - hopper 24 1 77.40 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGATTTTAAGCGGATTTTGGAGTTTCTACAATGAAAATA:1 - chr3R 10751597 3' - hopper 36 1 59.59 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCCTAGATAATTACACGAAATTGATTTGATTTGATTATGCC:1 - chr3R 21654917 3' - roo 14 2 74.66 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCCAAAACTGTTGGCTCTGCGGCTTTTGCCGGCGG:1 + chrX 12365394 3' + hobo 2897 1 54.26 CAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCCCA:1 - chr3R 3617305 3' + micropia 178 2 78.08 TCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCCATAGCTCGGAACCATAGGTCCATATGGGTTTCAAAACGGAGTTATTAGATAACATTTTGGCCAGGTCCCTCGCAAAGATTTGGATAATACTTGAGGCTCTG:1 - chr2L 3491904 3' - Doc3-element 4362 1 60.56 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCACCCAAAGGCCAACAAATGCCATTAAAAATTGCCACGTGAAATGCTTTCAAAAGCCATGGAGAGAGCAGGGCT:1 + chr3R 13530042 3' - jockey 19 1 76.71 TGGAACAGAGAAGTTAAGCCGACTTATCAAGTCGGGATTCTCAACATCATTCTCAACGAATAAGCTTGTTGGCAGATTAGGGAAATTATTTAGGTCTTTGGGAGTGAGTGTTTTCGTTCCCGTCACGTTTGCCATATTAAGATATC:1 + chr2L 1553469 3' - Cr1a 4093 1 53.42 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCGCGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCA:1 + chr3R 22352512 3' - I-element 69 1 63.70 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTTAAATAAA:1 + chr4 868755 3' + roo 9029 1 56.16 AAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGACATACAGCTTTGGGGTACTGCCAGCAACTTAAATATTAAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAGTATTAAGACAATAAAATGTATAGAGTTTGATTTATAACATGTAGAATG:1 - chr3R 4711364 3' + G4 3407 1 71.92 ATTCAATATCTAATACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAACCATTCATACCCGGCATGGCAAACGGCATCGGAAACGGAGGAGGATTATTTCCTCCCCAATGGGGCTCCTTCTTCTCATGCTCCTGTTTCTGGGTTTCGT:1 + chr2R 5037820 3' + Stalker2 7629 2 68.49 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGA:1 - chr3R 4530692 3' + copia 5054 2 63.70 GTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGTGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTNGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 7573 2 61.60 TATGCCAAAAAAATCGAATTCNGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGAGC:1 - chr2L 18112517 3' + transib2 2812 1 51.39 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTGACGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTGTGCGTGTTTTCATGTACACGATCACTGCTCTCTCCTCTCTC:1 - chrX 10547618 3' + P-element 2861 1 67.81 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATATGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCCAGTCGAACTTACCATT:1 - chr3R 15137270 3' - roo 19 2 55.56 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGGCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGTGCTTCTGCTTC:1 + chr2L 11476361 3' - pogo 64 1 65.28 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATTAAAAATTATAAACAATTATATTATAGAAATCCAGCGGATTTCTTTCTTCTAGCTATTTCGTTAGGCTATCATGCTCAAAGCAAACAAAAATTG:1 - chr2L 9063200 3' + Juan 4181 1 40.41 TGGGAAATGGAATTTCTTCAATTTCTATTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTTTCTAATATTAAGTGTTGCATACAGCATCATAAATGGCTTAAATGATCGGCCCCAAAAGAGAGTGAAAGCTGCACGAGCACATTGCTATCGCATT:1 - chr3L 4051555 3' - 297 6507 1 65.75 ATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTAAGGTTACAGTATGTTTATAGATTGAAGGCCAAGGACCTGGCCAGTGGTATCTTGGATGGAGTGG:1 + chr3R 30515404 3' - I-element 5228 1 55.48 AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCGCCTTGGTTGTTGTGCTGCCGCTGGTGCGTTTGTCACTTCTGCTACGAGTCAAATTGCACGTTCGCCATGTAGTCACTTTAAAGTAGGGCCGGCAATGCCTAGTACTTT:1 + chr3R 2526033 3' - Stalker2 11 2 76.03 AGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCA:1 + chrX 21994004 3' - McClintock 6002 2 54.79 AAGAGTGCCGTGGGCGCCAATTAACAGACAACAATTTTAGTTATTGTGGTTTATTCTGCGACTATGCGCGTTCAGATGAGTTCTTAAAACTGAAGACAGAAAACTTTGTTGAAAGGATGTGTGTAAATTATATGTATTCTTGATTA:1 - chr4 769336 3' - gypsy4 279 1 72.60 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATT:1 - chr3R 15102225 3' + roo 359 2 50.68 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTGTCGCAGCAGGACTTCAACGGGTG:1 + chr2L 13850777 3' + roo 399 1 77.08 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAACATTGAATATAAGTAGCCAACTTTGCTCTGCTCTAAACTAATTATTGGAAATTCACTGATAGCCTTATTTGTTTGTACCAAATCGAATTAATATGGAA:1 + chrX 6910190 3' - I-element 24 1 69.18 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTT:1 - chrX 4240234 3' - jockey 4749 1 69.86 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGCTATATTACGTGTAAAAGAATAATGTAATTGTACATAAATTATAAAATTTTATTAGTGTTAATCGCGAACATCAAATGATTTGTAAGCAACTGCAGCTAAGA:1 + chr3L 3154233 3' + flea 241 2 73.29 ACTAGAATAACAAGATGCGTAACTTCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAAAATTGCCCTCTGTCCGCCCGCTGAGAGCGCTTGAAATCATCTTCATTTGTTTTAATTTATCAGAAGTTTGCATGATCATTAGCGGGTTAAG:1 + chr3R 4051610 3' + 1360 8 2 63.70 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGTTAGCAACATATTTCTGTGCAAAAAAAGCGG:1 + chrX 20024640 3' + 412 457 2 41.10 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAACCGTGAATTAAAGAATAATTTGCAGACGACATAGT:2 + chr3L 16920285 3' - roo 8718 2 55.48 TTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTAAGCGGAAGTGAGCGGAAAGAGAGTATCTTATTGTGGAATGACATTGAAAAAATGTGTTAGAATGTGTTTAAAACGTTCCAATCTGGAAAATATTTT:1 + chr3R 11663808 3' + 1360 3252 1 51.37 GAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAAAATTAATTTTATTGGTTTTGGTCAATGACTTGTATTGTGAAAGAAAACAGGCTAATAATTAATGAATCGCATTAATTAATTGTC:1 + chr3L 18660159 3' - 1360 128 1 58.22 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAGCAAGTAG:1 + chr3R 6399480 3' - pogo 35 1 59.44 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGCGACCCTGATTCAGACATAT:1 + chr3L 17758028 3' + Tirant 333 2 64.38 CCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCGCAAAATTTTCACTCAAAGGCCGCAAACACAGAGCTT:1 + chr3L 5281689 3' + hobo 2542 1 74.66 CTACATCTAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACATTATCGAAACTTTTGGCAATTCGATATGCGGTTGCTGCCTTGAAATA:1 + chr3R 10121260 3' - gypsy12 77 2 67.59 CTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGAGTAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAATAATGTGAATACTTTATATAGGGGAAACGCTTTTAAGCCTGCTTGGCAGACACAAGCACCCACACAAACAGCGTTGCA:1 + chrX 13006571 3' - INE-1 136 1 65.75 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAACGTATTTCTGAGCTTCATTACCAAATG:1 - chr4 490208 3' - pogo 44 1 56.85 CGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAAC:1 + chr2L 19940108 3' - mdg1 7107 2 62.33 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTATGCGGTCCAGTTAACCGCT:1 - chr3L 5958607 3' + 412 440 2 52.05 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAACAGATCTCTTTTGGGCGATTTTT:1 + chrX 10056727 3' + hobo 2891 1 73.68 TATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTG:1 + chr3R 22435595 3' - roo 8727 2 61.64 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTAATGAAATCTTTTCATTTTGAATATACATACATATATTGAAGATTGACTCATTAATATTTTA:1 + chr2R 14484214 3' + pogo 2047 1 63.01 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTGGGAATTGGTAATACCAAACGAAAAATACGAAGTAATAATAATAATGAGGTTTCCCAA:1 + chr3R 30518978 3' + I-element 5324 1 58.22 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGGTGCTGCCGAACC:1 + chr3R 19725441 3' - hobo 71 1 64.38 ATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGTACACAGCAAGAAATACGCAATGGCATTTGACACCGTTTCAATGTTTCATGCAATTAAAGCACATA:1 - chr3L 19907828 3' + P-element 2731 1 47.95 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGGGG:1 - chrX 17495711 3' - Burdock 68 2 70.55 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCCCAGCATGCAGACTGCAGGATACCGGGCATCGTACTAAACCGTAGCATAC:1 + chr3R 11108141 3' - jockey 76 1 62.68 TAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGTTTTCTAGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATACGTGCCGCACATATAAATTTCAATAAATCTATTTATGCCTGCTCCGCAAAC:1 + chr2R 8763923 3' + 1360 3163 1 64.38 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAANTATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTATAAGAAGTTACCAAAACGA:1 - chr2L 9599761 3' - roo 25 2 68.53 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTTTAATTGAACTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAA:1 - chr2R 8086851 3' + 1360 3336 1 58.90 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGCCATGGT:1 + chr3L 14116804 3' - BS 5023 1 64.38 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACCCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGGGAAAATGGCAACTGCACTATGAATAATTTTTGTTACCCATTTTGAGAGACGACGCTGCACTTTTATGGGCCAACAAAT:1 - chr3L 18119423 3' - 1360 40 1 57.53 TTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGG:1 + chr3L 21913473 3' - 297 6607 2 67.81 TAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACC:1 + chr3L 20168326 3' + roo 9041 1 64.38 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATCATATCTAATATAAAGAATGGATTCAGTTGCTGACCCTTTTGGTAGAGCATTACTATAGCCGGTCGTATTTATTTTTGTTGTCAAGACTG:1 + chr3R 17871973 3' - roo 30 2 65.07 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAGCTCTGGTATTTCCGTTCAAAATATCTTAATTTTTACAAAATTCCCGCTACGCTCTCAGCTGGTTAGGCCAACACCTAGGGCCAGTTTTCCACCTTTTT:1 - chr3L 6838056 3' + 1360 3368 1 66.44 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGAAATAATTTTGTTTGCGCATCAATC:1 + chr3R 31086614 3' + jockey 4948 1 50.68 AATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAATGGGGTAATATACGGTTTGCATCCCGATTTAGGCGACGCAAGGCAAAAAGTAAGAATTTTGTTTGGACCGATTCAATGTGTTTTAACAGTACATTTTGGGTTTCACATAGTAAATGC:1 + chr4 404931 3' - Cr1a 3980 1 71.92 GTCACGAGGCGCAACGTTGACAGANGTGNCGCTATAAATATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGCTGCAAAAAATAATTATTACGAATTCCTAAAGACATGCAATTTCA:1 + chr3R 7533409 3' + gypsy9 5178 2 59.59 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGAACGCAGTTAGCTGCTCGTCTCGTGCGGAAC:1 + chr3R 17944137 3' - P-element 12 1 72.95 CTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGATATGCCACTCAGCGCACTCAGGTCTAGCAATATTAATGATGGCC:1 + chr3L 8215292 3' + Quasimodo 477 2 69.86 GAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCATCACGCACTATTAAAAACATTCAAACAACATTCATAAGCAAATCGATTCTGCCTAGTGAAAGG:1 - chr3R 15289792 3' - Quasimodo 7302 2 56.55 TTTTCCTTTTCGTTTTTTTTTTTCCAATTCCTTTTGGTTATGAACTGAAGACTCCAATAGGTAGACTCTTAGTTCATCATAGGGCATAATTAAGACTCAATTCAGTTGCAGTGAAACAGATTTCAGTACTGCTCGAATGTGCCTGC:1 + chr2R 20127030 3' - Doc2-element 233 1 74.66 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAAT:1 + chr3L 9907387 3' - BS 5028 1 59.59 AACATCAGACGAGTTCAGTATTTAAGTTTTTAGAAATTCATTTTTTTTAATTTATGGTGCTGACTCGTAATTAATAACAATATTTATAACTGATAATAATAAGTACATAATAAATTAAATAAGTACATAAATAAATACAAACTAAA:1 + chr3L 26265114 3' - Gypsy12A_LTR 1877 1 77.40 ATGTGTACCTCTAGCCTACTACACGTTGCTACAACTGCGGCTCTAATGAACACATGAAAATAGACTGCAAGGCAGAAACATCACGCCTCGCCCTTGCCAGCCCCCAACACCCAATGGGCCCACCACCCACTGCAGACGCAGACGCA:1 + chr2L 21886586 3' - invader2 2 2 54.79 AAATATAAAAATATTTTTTCTTTTTGCTATTTTACTATCATATTAGTATATCATCACATCCTAGATCCTAGATCCCATCTAGTTTTCATGTTCATCCCATCCACTTGTGCATTTAAAATTCCTTCAACTTTTTCCCCATTTAC:1 + chr3L 18653131 3' + transib1 1956 1 68.53 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGTCCTTATAGCTGCAGACTCAGTTCCATTTCAGTTCCCACTT:1 + chr3L 8274008 3' + hobo 2905 1 49.57 GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCA:3 - chr3R 19996187 3' - Quasimodo 67 2 66.44 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTTTTCGTTCCGAA:1 - chr3R 23579256 3' + roo 9042 1 66.44 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAAATTTGTTATGATCACTTCTCATGTTGCACAAGATGAGGACACACTCTGTCTTT:1 - chr2R 6418558 3' - Juan 50 1 46.58 TTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGGTCTGNGGGGTATGATATGGTATATGGGGTCTACGATGCAGAGCCAACTG:1 - chrX 17495650 3' - Burdock 6143 2 78.77 AACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTATGGGCGCATGTTTACAACTGGAATTAGGG:1 - chr3R 31031994 3' + hopper2 1519 1 77.40 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCNTAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTNGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTT:1 + chr3R 13684773 3' - 412 66 2 60.27 TTTTTTTTTTTGTTTTATTTAAAAGGGGTAAATAGTGCTAATTAAAGGGTATATTTATTTTTAGTTAATGGTTTTTTCTGATCCTGACTTGGGTAAACTAATTTTTCAATATTTCTATATCCATTTTTAAATCTTTCATATAAGG:1 + chr3L 7148850 3' + hopper 151 6 82.76 GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACA:1 - chr3R 6147258 3' + copia 177 2 71.33 TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAATGGGAGTGCTTAGAAGATATTTAAAAATTTAGATTGAAATGGATAAGATTTTGGTCATGATACCAAGGACACCATGGACACCCCGGAAGACCTCGAGCTTCCAGAGAACTTAAAGTTCCTT:1 - chr2R 10940039 3' - INE-1 546 1 81.51 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTACTCCCACTCTTTGGATCCTCTCCACCGCTCTCGAAAAGCTCCTTATGTGCGACCGCATGTTGTTTCTAC:1 - chr3R 11758478 3' + P-element 2836 1 47.26 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATATCCTTACCATTTTGGAACAAGCCAAAAAAAAACGTTACAAAAGTCTCCAGGGACCTGGTTATTGCAGTTGGTTCCCAAACCCGCAATTGTCG:1 + chr2L 20819365 3' - copia 29 2 64.38 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATGCCTGTTTTTAATATACT:1 - chr2L 20044520 3' + roo 9036 1 59.31 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGAAATATACACTTACTACAAAAACATGCATATGTGTGTATATGATTAGGAAGGACAAAA:1 - chr2L 4268937 3' - hobo 62 1 62.33 GAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTATCAATTATGTATGTTAGTTCGCCCAGGAAGGA:1 - chr3R 16888816 3' + roo 163 2 63.70 AAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAG:1 + chr2R 5531181 3' - 1360 127 1 63.38 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTCAATTACCATTTCATTCAATTTTACAATAA:1 - chr3L 20765100 3' - 297 6600 2 73.29 ATAGGAGAGCTTTGAACTCCACGCTAAGTGGAGAGCGAGCATGAGCCAGTGAAGGTTCCTTGCATCTTATTGCGACTTCAGTAGCTTATGTATGTTTTGGAACAATATGCCGTCATCGTGATCATCTGGCTGACGCTAGAAATTAG:1 + chrX 8639461 3' - Doc 4244 1 73.29 GACTGGGCTATTGAACCTGATCAAGATTTCATATCGGATACCCTTTAACGAATGTAGTATACCGTCTTACTCTACGAGTAAACAAACCTAATGCACAAACACGAAAACCCCGACAAACAAAGGGAAATAT:1 - chr3L 13200295 3' - INE-1 92 1 62.31 GCAGGAACAATTTTTATGTTTATGGCAAAAAGCGACGCCTAATTTTATTTTCTTTGCCGCGGGGCCGGATGCCTTCCCGACACACATATCTCAAACTAATGCCAAAAATTAATTCCATAGTGCTGTTTGAATCCTAATCCCAGCGC:1 + chr2R 8372005 3' - 3S18 356 1 73.97 ATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAA:1 + chr3L 14116766 3' - BS 5061 1 60.96 ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAG:1 + chr3R 6147321 3' - copia 4944 2 67.83 TATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAATACTTACTTT:1 - chr3R 3922948 3' - Cr1a 82 1 68.49 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTACGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACAAATTCATTGATGCCACTTTGCTGGCAAATATTTTGGCAA:1 - chr2L 7336100 3' + pogo 2050 1 52.74 ATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAAGCCACCCCGATGTCATTCGATACCTGTGGTTCCGCTGAAAGCGATACCTTCCACTTGCAACTCTTCCTCCTAGTTGCGTAACCTGGTATCTGCTGCCG:1 - chrX 1206604 3' + Burdock 111 2 69.86 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAGGGGTAAGCACTTTTAACACCCCCACCCTTCGGCGGAGTAACTTTTGCATT:1 - chr3R 31275345 3' + mdg1 7391 2 66.67 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAATATTAATGGGAACTAAATAATGGCTATACTATATTACACACTATATTGCACTTTTCCACATCCAAACTTACATATGGCGTGTAGAC:1 + chrX 5721955 3' + pogo 2070 1 61.64 CCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAAATTGCTGCGCTGTCGCACAAAATCGCGTAGTGAATAAAAGACTGGATGAGACGCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGT:1 - chr2L 21325116 3' + invader4 242 2 67.59 GTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTGAACAGGTAACAAATGAATATGACTTCTTATTTTATCTGAAAATTACATTTAAGGTGTAGAGTTAGTGTGT:1 + chr3L 27391097 3' + 1360 160 1 51.37 TGTATCCAAGGGATGGGTTTAAAATAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGTAAGGGTTGCGAGGTTAGGAGGGCCGCCGTGCTTATATAGGCGGGGAGTACAGTTAGCCAGGGCCTTT:1 + chr2L 2753987 3' + Dm88 4259 1 57.86 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTACATTCCGGACCCCGAT:1 + chr3R 16349281 3' + P-element 2811 1 25.56 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTTCGGCTGAAGGTGCAATGAAGCCGTACGATGGAGAATGGAAATACGCCTGGTAAG:1 + chr2R 13695771 3' - blood 15 2 73.29 TTGGGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCGTATTAATTTTTGGCTTTTGAGGGTGGTGACTAAAAGGGGAGGAGCGGATTATGGCGCCTCAGTCTGTTTAGCTTCCAGTAAAAATGATAACCCGCTTAAGAA:1 - chr2R 18214827 3' - 1360 472 1 60.96 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTACATAATAAGTTAGGGACTTGTTGATT:1 - chr2L 13468200 3' - roo 8699 2 60.42 TCATATCCCCGTTAGGAATGTGCACATAATGTGAATGTGTGCTTAAAGGGAAAGGTCGAATAAAGGCATGGTGAAATTATTTAAAGATTGAGTACATATATTCATTTTTCGGCGTCCACAGTATGCAGATCCTGCAATCAATTGCG:1 - chr2L 20165732 3' + invader3 5252 2 72.60 CATTATAATTAAGGAACAGAATCGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGAAGAACAACTTTTACGTCTGAAGTCTTTTAAATGAACATTAAATTATTATTTACTGCAGTTGCAATAGATAAATT:1 - chr3L 11837654 3' + G5A 2747 1 76.03 AGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATATGAGTCAATGAGTATTATACTCGTATCATGATTAGCTCTCCGACTGTTGGAATACTGGACTATTCG:1 + chr3L 21284890 3' + Doc 90 1 52.52 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAGCCAAGTGGGAAATGTT:1 - chr3R 14546469 3' + pogo 2052 1 55.48 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTGCTTGGAAGCAGTATATAAGCAGTATAGCAGGTACTTGACCTTTTAATTTCTTTCTATAATAACAATTTGAAATAATCCTATACTAATCATCGCCAAGTCGACCCACTTGTTGTAAGC:1 - chr3L 8323642 3' - mdg1 37 10 79.45 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCAC:1 - chr2L 13850657 3' - roo 8752 2 79.02 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTAAAACATATTTATTTAGATTTCGTTTTATTCGCTTGCGGGCGCTCT:1 + chr3R 27724922 3' + Tabor 7277 2 72.60 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTGCGTTTGATCTTCTGGGCGCGGAAGTGCTACCTATGGAGTGTAAAA:1 + chrX 4469635 3' - roo 8712 2 52.74 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATT:1 + chr2L 19940146 3' - mdg1 7069 2 65.07 GGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGTAGGCTCGTAGGGAGGAAGAGGAAGATAAGGTGGGTCCGCTTCTTTCTCGCTCTCTGTTACTTCATGGCAGGGTGAAAGTGCGACAGAG:1 + chr3R 11758615 3' - P-element 16 1 72.09 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTGGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGAACTATGTCGATAGAGAGTAGTAAGAACTT:1 - chr2R 24807842 3' - I-element 22 1 68.49 ACTTGGATTCAGTTGTTTTTCTCGTTCAGTGACAGAAAATATAACTTATTTTCATTGTCCAAACAATTTCTTGATTACCATATCATTGCCAATTCGATCGATCTCCTTGGTTTTCTCTGTAGCTAAACTATGATTTTAGTACTTAA:1 - chr3R 23230241 3' + S2 1539 2 50.68 GTTAGCTGGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAAAAAGTACGAAGCTTTTTGTATTATACCCGTTACACGTAGAGCA:1 - chr2R 24197612 3' - Cr1a 3997 1 76.30 ACTCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACGAGAAG:1 + chr3L 9522151 3' - opus 38 4 52.05 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGCGTCAGTCAATTTCA:1 + chr2R 22971904 3' - jockey 4784 1 65.73 AAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATTAAGGAAGCGCCAAAGATATTTGCATTTCTGTGGCAAATA:1 + chr3L 802906 3' - hopper 986 2 64.60 AATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAA:1 - chr3R 14401898 3' - Juan 4145 1 76.71 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAG:1 + chrX 18534575 3' + P-element 2798 1 17.29 AAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTGACATTTTTAAATAAATTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATGTGCAAAAAAA:1 - chr2R 5667266 3' + INE-1 167 1 57.93 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGGGTATCTGATA:1 - chr2R 17649234 3' - Doc 82 1 68.97 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCAACGACTCTTTCAATCTTACAGGGCTGAAGCTTAAAAACTTTTCCAAAACTTGTAAAACGTTCCAGTCGTATTAAAAATACTCCTGACCATCA:1 + chr2L 18284976 3' - pogo 25 1 68.49 CACGTAAGATAGCATAATCTCTTCACTGTACATTTTTACACATTATAATTAAGGAACAGAATCGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGAAGAACAACTTTTACGTCTGAAGTCTTTTAAATGA:1 - chr3L 11837694 3' + G5A 2714 1 67.81 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTGCAAAAAAATTGCTCAAATGAAATTGCATATCGAATTTCGCTTTGAAGGC:1 + chr2R 21110621 3' - roo 8733 2 65.07 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCTTCCACTCCTCACACCTACGC:1 - chr2R 16731257 3' - Tirant 54 2 56.43 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATACCAAATTGAAGTTAAAATCTTCGGGTGTCGTAG:1 - chrX 16490421 3' - F-element 34 1 62.33 GATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATGCAAATGCGAAGTTTCATAATATTTCTGGGATATCGACAGATATTGGGCAAAAAAATTATAAAAATTTAAACATTGTTCCAAAGTGTCGGCGTTGATCCTACCTCAATATGATGGGTT:1 - chr3L 27339668 3' - INE-1 541 1 73.10 GAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTCTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCA:1 - chr3R 7041965 3' + Stalker2 7611 2 53.62 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATT:1 + chr3R 21655046 3' + roo 329 2 69.86 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATTGTACATGCACACAAAACA:1 + chr2L 19940167 3' - mdg1 9 2 80.00 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAATGGCTTCAATTGGCTATTACGAGACTGGAACAGGAATGCCCGTAA:1 - chr3L 18968637 3' - hopper 77 1 69.18 CTGAACCCCAATAAAATTCTGGCAATTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAATTCTTGTTGCTAAAGTTTCGCCTTATCGAGTGATCA:1 - chrX 8101596 3' + baggins 5326 1 71.92 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGAAATATACACTTACTACAAAAACATGCATATGCGTGTATATGATTAGGAAGGACAAAACTCTGAACGCTCCGCTTCCC:1 - chr2L 4268917 3' - hobo 42 1 54.79 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATACAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAACAACAAAAACCATTAT:1 + chr3L 19907224 3' + P-element 2857 1 63.70 TTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGGGCTTGTCCTACC:1 + chr3R 27016556 3' + roo 9043 2 60.00 AAAAGAAATAGAACGGAAACTCAAGCCGGGGTCTGGCTGTGGTGGACAACAGCTTCCAGGAGGTTAAGCTGGAAGACTACAGGGGCAAGTACCTGGTGCTCTTCTTCTACCCACTGGATTTGTGAGTAAACTGAACTTTG:1 - chr3R 17545891 3' - Gypsy12A_LTR 245 1 78.57 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCC:1 + chr3L 18968706 3' - hopper 11 2 57.50 AACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGATGGCCTTGGCTGTGGTGGTAAGTATTTCATTTATAAAATGAGTACAATGGTGAAACTTTATGGAATTGATTCGACTTGGCC:1 - chr2L 6347396 3' + flea 4817 1 66.40 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCTGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAACAATCCCACCTAACCCTAAAATATTTAGTTTATGGTCAGTTCTGGAAGACTGCAAA:1 - chr3R 11903449 3' - FB 57 1 62.59 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATAGTGTATAACCAATTTAATAGATTTTGTTTTCTTAGACAGCGATTCTACAGCGACTTCATCTTCCAACTCACCATCAGATCCCCGCCCAGGTGAAGCGG:1 - chrX 13152691 3' - pogo 19 1 71.85 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCA:1 - chrX 10667033 3' - jockey 4777 1 69.85 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTTTTCTATGAAACACTCTTCACAGTTTCTTGGCACTCATGCTGCTTCTGTTGCCGCTTGTTTTCTGTTTGGGCAGTGACGCATTTTCGTGCTAAAAACTT:1 - chr3L 17934878 3' + HMS-Beagle 7025 2 71.23 AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGCTCGTCTGGAGATTATGTCGCGGTGTGT:1 - chr3L 21934597 3' - G2 3023 1 72.00 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAGGTTGGTTCATGCAAAACACCAC:1 - chr2R 23790232 3' + roo 360 2 52.74 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAG:1 + chr3R 5575032 3' + blood 7315 2 67.81 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATAAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGG:1 - chr3L 21913326 3' + 297 6925 2 56.55 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTA:2 - chr3R 23415916 3' + jockey 4919 1 65.75 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTGAGCTTTCGTGCT:1 - chr3R 17673708 3' - FB 24 1 69.86 TAACGTCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTACTTAGAAATAATTTGGTAAAAGTTCCTAAAACCCACCAATAGGCATAGTGATGAAGAAAACGCCT:1 + chr3R 18154988 3' + FB 206 1 53.42 GTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAG:1 - chr2R 17696052 3' - rover 7037 2 77.40 ATTAACTGTAATTATTAACTTACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAAAATATTAGGTGTCCAATATGTTATTATAGTTTTCGAAAAGCAAATACAAATTCCTTGGATTTCTCGAGCCCAGCTTTGAATGCCAGCATGAAAGAA:1 + chrX 1428653 3' + HMS-Beagle2 7196 1 63.01 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTTGGT:1 - chr2R 22596057 3' - Doc 36 1 55.86 TCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTTACA:1 - chr3R 12789491 3' - G2 2773 1 65.07 TTTTATTTTATTTTATTTTTTTGAGTAAAAATTGGTTTAAGCATTTTTTGGAAAGCCCTTAAGGTGGTACATCGATCCGATCGATCGGCTCAGTTTTGCCAACTCAATTTTTGGATAAGGAATGAAAACTCATAAGGCGTTTGGGT:1 - chr2L 17046404 3' + transib1 1901 3 68.49 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTATTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAGTTGCAGGTTATCTTTACACTTAAATATGCATCAACTATTGCTGA:1 - chr3L 1477312 3' - mdg3 5260 1 78.77 ACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATTAACATTTACATACGCTTCATTTTTAATGAACTGACAAATCTGTGCGGCTTCCCCG:1 + chr3R 13323938 3' + F-element 4613 1 62.33 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACT:1 + chr3L 17746349 3' - roo 8741 2 71.23 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGC:1 - chr3R 23415899 3' + jockey 4941 1 52.48 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGAGCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGGAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATGCGCATTGCTTCCTCGTATCGCATGACTCTTGTTGCTAAACACTGTCAT:1 + chr3R 8381838 3' + Tirant 381 2 65.65 CAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGATCGAAAGGTGAAAGGAAAACAGTCGGAG:1 - chr3L 4748617 3' + flea 4813 2 75.49 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGTAGTCGGATGAACACAATATTTGT:1 + chr2L 15549968 3' - hobo 45 1 54.48 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGATGTTTTAAAAAATGTACTAAGGCTTAGATAACTCTAACAAAAAAGTCCATAAGGTTTAATGACATGCTGCGAAATATGGAATTTTAAATGTAATTTA:1 + chr3L 14233178 3' - copia 25 2 68.49 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTANCNCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGTTAACACGTA:1 - chr2L 7774946 3' - I-element 58 1 58.22 ATAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACAAAATAGAAAGTATAGTTTACGAAACTCTGTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACATAGTATTTCTCTACATAAATGTTTAAAACATTCGTG:1 - chr2R 25038644 3' + mdg3 5021 1 75.34 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGA:1 - chr2L 16554598 3' - blood 63 2 60.96 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTG:2 + chr3L 7102391 3' - I-element 75 1 65.07 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAATGGTAAACGAAAATAGTATCGTTGAAAAGTGTGAACAAGTTTTGAGGTGTTAAAACTCCGCACAAATGCAGATGTCAACTGCGGAAGAAGGGCCTGCCTGTTGCCAG:1 + chrX 21183971 3' + S-element 1706 1 78.17 AGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAAAAAAACCAATTACTGAGAAAGAATTTTTAACAGAATTAAGAGAGCATTTAACCGAAATTCACAATGAAGCGGGGCGCGTCATTTTAGAAGGGGAGAGTTA:1 + chr3L 23782224 3' - Doc 29 1 67.12 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTTTGGC:2 + chr3R 24011088 3' + roo 360 2 52.05 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAAAGCTTATGATTGTTGTTAGAAACTGTTAGAATCTGTTGTTCGAGCGCTGAAAAGTATGCTACAAAAATGGTAACGAAT:1 - chr2L 5515378 3' - BS 5036 1 45.89 CTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCTGCCAGTTACATACTTTTTTACGACATCCTGAGCTCGTTCCCAAGGGAAACGTCAGCGTAAATACATCAAAGAATTTAT:1 + chr3R 19425941 3' - INE-1 90 1 56.83 TTTATGAAGTGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTG:1 - chr3L 23797680 3' - Helena 1179 1 48.57 GGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTACCATATAAACATAGTAGTTTTGCAATTGCTTAGCCAAGCTTAAATAAACAAATATTTGCT:1 - chr2L 5818877 3' - I-element 4884 1 58.22 GAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACA:1 - chrX 15746268 3' - jockey2 3245 1 53.15 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTC:1 - chr2L 13675886 3' + flea 4947 1 64.38 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTCGAATTTTGAATGCAGTGAGTGCATTATAATCAAGTTCGCACTTTCAAATTGCGGTTGGGGTGAATATTCACG:1 + chr2R 12343291 3' - roo 44 2 54.93 CCGCTTCTTTTTACCTTATTTATTAACGACCTCCCCTTAGTAATATGTACGTAGACTATGTTAAATAGACAGCTTTCAAGGGAAAGTCTGATGCCAATCGCCGGCAGCGCCGAAAATCGG:1 + chrX 22541597 3' + Q-element 511 1 65.83 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATGTAATATGGAACTTATGAGTCATGATTTCTAATTTAAAAAATTACATATTATAAGAGTTACTTTTGCAGCAATAAATTGAATACAGTG:1 - chr3R 21679529 3' - roo 8675 2 76.03 GAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATATAAGAGCCACGATTACAGGCC:1 - chr2L 7148519 3' - HMS-Beagle2 6903 2 70.55 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAAC:1 + chr3L 8249451 3' - HMS-Beagle 6877 2 75.34 GGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGATAGTTCCTGATCAGCTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATGTGCATATGTATATACTATATATGGTC:1 - chr2R 13979149 3' - G2 2853 1 50.68 GGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAAT:1 - chr3L 20934157 3' - Max-element 27 2 56.47 GCTAGAAGGTTGAGATTCACCATACAGGTTCTAGAGTTATAGACGCAGCGCAAGTTTGATCCATGTTGCCACGTCCCCTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACAACCATACTCACACTAACACACTCACTAATATTTTTTTCTTT:1 - chr2R 4387416 3' + INE-1 169 1 71.23 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCAATTAAATTAGTAGATGAAAATCGCTTCCCTTTTGTCTTTGGCGAAGTCAAAGAGTTTAACTTTGT:1 - chr2L 2316872 3' + roo 9032 1 45.89 GGGAGAGCGAGAGAGGGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGCGGGAAAAGCGGGCAAAGGTTCGT:1 - chr2R 14041185 3' - Cr1a 299 1 79.37 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATA:1 + chr3R 15137363 3' + roo 9009 2 60.27 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATTGGATACTGTTTTAGTGTAGCTGCCTATTGCATTTAACTGTGTTCATAATAATTTATTTTGAGCAACATGTTTGTGAGCTTT:1 + chr3R 14800999 3' + pogo 2068 1 44.14 TGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCTCAGCAAGGAGGGGGGACTTGCCCGGCAAGCAATCACGAAAACGAAAGCTTCATGCTGAAGCTGACCGAACATCAGGAGTATG:1 + chr3R 19478343 3' + R1A1-element 5067 1 60.27 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTA:1 - chr3R 10433197 3' + 412 7488 2 57.53 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAATCAAACAATGTACACGGCTTTAAGTATTAGTATTTTGGCTGAAATTTATATTGGATTTTTTACTATGAAAGTGAATTGCATTAAAAAAAAACATATCAAATGCACTTA:1 - chrX 15252228 3' - opus 10 2 67.81 AAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAATGGA:1 + chr3R 4361680 3' - copia 4927 2 58.22 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTCCTCCCCCCTCATTTTCAAAGCGCAAATCGCCAAGATGCCGAAACACAGAGCACACACAAATATGACGACTGCAATTTGATGGTGGC:1 + chr3L 10566511 3' - opus 38 4 51.37 ACTAATAAAAATAATAATAATATCAAGAAATAGTATTATAATTCAATTAATTAATTCAATTTTTAAAAATGTAAGTTAATTTGTTTGGCAACTACGTAATATTTTTCAAGAATTTCAAATTTTCAATCCAACTAGATTTTGAATGA:1 + chr2L 3969264 3' + mdg1 7066 2 73.97 GATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCG:1 + chr2R 18551765 3' - I-element 85 1 73.97 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATTCTATTTCATCATGATCCGAATGAAACCGGCTTTTT:1 - chrX 18534560 3' - P-element 64 1 20.56 AATTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAAATGCGGAATCAAAACAAAAAAAAGAAATGCTCAGAATAATCACAAAAACCGAATGGTACATTATCAACATATATAAAGGCGATTATAATAACTATTAA:1 - chr2L 13336082 3' + Porto1 4295 1 75.34 GCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTATACATATTTACTTGGTACCGAACTTACATAAAACTTTGCA:1 - chr3R 11757911 3' + invader4 302 2 45.21 TAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAAAAAGTGAGAAATGCTAGATGCTAGCAAAAATAGCA:1 + chr2L 15238457 3' + Quasimodo 389 2 75.34 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCATTTCGTAATCCATATTTGCTTATCTCCACTGGCTTCGTTTTATAATTTTCCATTTCAATTT:1 - chrX 7042623 3' - roo 58 2 59.31 ATCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATTTT:1 - chr3R 31771978 3' + mdg1 265 2 52.05 AATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGAAGGACGAAAAAGCATTAGCAAGTATTCTCTTGCAGTGATTTCGGTGCCGACCAGCACGATGAGCACCAGC:1 - chr2L 19515999 3' + Dm88 411 1 68.28 TTGCTTGTGTGAGTAAAAACACGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATT:1 + chr3L 19350022 3' - 1360 3248 1 47.95 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCCCTCTCAGTCTCTGGCACTTGTGAACAGCTTTTGAAATATCT:1 + chr3L 19222711 3' + 412 7505 2 56.16 TGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTA:1 + chr2L 21909133 3' + transib2 2740 1 73.97 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAAGCGTTTTTCAATAAAGCTTTATTATTGTGATTTGTAT:2 + chr2R 5395014 3' - HMS-Beagle 6877 2 74.66 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGC:2 + chrX 7042710 3' + roo 8995 2 69.86 AAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGAATAATTAGCGGGGAAAGAAGACCCTTTTGATTGAAGGATATTCTCCTGTGCGATAACCGCTTC:1 - chr2L 21687928 3' + R1A1-element 5324 1 76.03 CCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGGGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATG:1 + chr3R 10751714 3' + hopper 1348 1 60.14 GTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGGTAATA:1 + chrX 21667984 3' - gypsy2 22 2 75.34 AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACGAGAAGGGAAA:1 + chr3L 9522156 3' - opus 7036 4 55.48 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTAATTTAATATTAATTTATTTTCAACGATTATACTAAAATAAAAAGCATTCTGTGTAAATCAAGCAATTTATTTTC:1 + chr3L 22041181 3' + roo 9026 1 58.22 GTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGCATACCTAACTGAATCTCTTTCATATAGCTATCAGAAAGAGCATTTGTTCTTTCGGTGACTGGCT:1 + chr2R 19075982 3' + roo 255 2 52.55 AATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATTGAATCTAATAAGAGATGA:1 + chr2R 12249062 3' + Juan 4156 1 55.48 ATCATAGTAATGGGGTTCGCAAATACAAATCATATATGCACGATTTATCTTCAGTTTATTTCTCCAGTTAAATTCATTTTTTTGTACACATGAAAAATTCAGGCGTTATTAATAAAAAACTATTTGTTAAATGATGTCAACGAGAC:1 + chr2L 21580637 3' - diver 6082 2 64.38 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTCAATTGTGTGAGAGCTGAGCGGCAATGAAATTGCCCGAAGCGGTCATGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGT:1 - chr3R 18994318 3' - jockey 4809 1 49.32 ATTTAGAATTAAACTAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTCATTTAATTTCAATTCATACTTTGTGGTACATAATGAAATGATTTCAGAAACATGAATTAGTGGCACCATCTATATTATAGTGAAACG:1 + chrX 14347081 3' + flea 4976 2 66.44 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTACATATGTAGTATTAGTGAAAAATACAAAATAGTTAGTTAG:1 + chrX 22511483 3' + roo 9030 1 56.85 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCGCCTTGGTTGTTGTGCTGCCGCTGGTGCGTTTGTCACTTCTGCTACGAGTCAAATTGCACGTTCGCCATGTAGTCACTTTAAAGTAGGGCCGGCAATG:1 + chr3R 2526022 3' - Stalker2 7265 2 70.92 GGGGAACTCGACTATAGCATTTCCTCTTGTTTTTATTTTTTATTAACATACATAATATAACTTTTGTATTTACCTTCAGTGGGTTTCTTGGCTCTTCGCCTTACCTTTCTTTTTCGAACGAACATTTCCGCTTTTATTGTTACTGT:1 + chr3R 9940924 3' + INE-1 571 1 56.85 GAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGATACATTTTACCTTTAGCCGTACTCAAGCCCTTTGGAAATGAGTTTTCACATTAAACCCATTCATTC:1 - chr2L 9675064 3' + micropia 250 2 54.17 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACAT:1 + chr2L 11476381 3' - pogo 46 1 52.74 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTTCCATTTAAAAATAGACTAGTAAATTTAATTTTTAGATAACATTTACCTAAATTCCTGGAAGCAAGCTGAAAGGCAAAACTTTCTTATTTATGAGCCCTTTTCAAA:1 - chr3L 13992195 3' - blood 14 2 67.12 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAATTTATTTCGGGAAAACCTAACACCACCACCAACCAAAAGTAAATTCAAGGCGTTTA:1 - chrX 471155 3' - S-element 62 1 65.07 ATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAGGATCAATTACTCTTCAACTGAATTTAAAAGGATTTGATAAGAGGTTTGAGTTCACGACAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATC:2 - chrX 11696529 3' - TLD2_LTR 97 1 78.08 GCGAGTGGTTTGTGCGAAACATCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCATTCCGCAATTTTCCTTGTGCTAACTCTTAGGAAAATTTCCCTACTTTTCCTGG:1 - chr3R 28047281 3' + X-element 4330 1 59.85 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAACTCGAAC:1 - chr3R 15137278 3' - roo 8736 2 70.83 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCATAAACTATAGGACTTTATGTTCCATTTGTGGGTTTTACTGTTTTCCCTTACTCTTGGCCGGGTCCAAACTTCAAAC:1 + chr3R 24444139 3' - hobo 42 1 55.48 ACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTCGCCGGTTTGCCCATTTATACATATATTCTGCGGCTGTGTCTGTGCTGCTTTTCTATTGTTCATGAGTCCGGCTTTGTATATAAAGGTGATCAATCTCGC:1 + chr3R 8821968 3' + S-element 1698 1 73.29 TCTGATTTTTAATTATACAAATTCCAAAATTCATTGGAAAACAAAATGTTCCGAAACTCAAAGGAATAAACATTTTGGGAGCCTTTGCGTACCATTCATCATTTCAAAAAACAAAAAAAACGAGACCTGTAATCATTTCCAGTTCT:1 + chr2L 19157782 3' - invader2 4734 1 73.29 AAATAAATAATAAATATTGTTAAGAAACAAAAATTTGATTACCATTACGATTTCTAATCGTAATTTAGTGCCACCTGTCGGCCCAGTGATTATTGCTTCAATACTCGTATCTTAAACCAACGACTTGGGTAGCGTATCCATAAGAT:1 - chr2R 15052009 3' + Juan 4059 1 56.16 CCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAATCTCTGTCTGTTTGTGTTTGTACTGCCCGCTTTTAGGCAGTTCGCTCAATGCTGGTTATAAATTTTATCACT:1 - chrX 3649882 3' + FB 781 3 50.68 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTAAGCTTTCCGTTTAAGCGCGATCAATACTGCTTGAATATGCGCAAAATGCAG:1 + chr2L 19698211 3' - roo 8693 2 65.75 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAAATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGANGNAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTATATTTCAATTGCAGCCGATTTCAAGCTTGTAAAAGTTGTCATTACATTGACTTCTGTTAAGG:1 - chr2R 17059553 3' - pogo 54 1 55.86 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTTTAGGCAATCACCCATATGATTTTCTAAATAAAACTT:1 + chr2L 8553453 3' + pogo 2081 1 72.60 GGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTACCATATAAACATAGTAGTTTTGCAATTGCTTAGCCAAGCTTAAATA:1 - chr2L 5818891 3' - I-element 4898 1 67.81 TATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAACCTAGTGAAGTTATTTTGATTATTAAATGCAATATCTAAGTCTTGGATCCGATGTGGGCAAAAGGGAGACTCTTATTTGTGGGTTCTCTAAGATATC:1 + chr2L 20658027 3' - 412 1 2 55.48 ATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTGA:1 - chr3R 17766727 3' + HMS-Beagle2 7128 2 67.12 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATAAATCCTGCAAAGATGGTCGTCGAAACCTCTTGAAAA:1 + chr3R 26605618 3' + roo 325 2 75.34 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAGAAATAATGTTGATGCAATAACATGCAACTTTGACACCATCACAAG:1 + chr3R 31032103 3' - hopper 26 1 76.03 AATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAAATCTTTGGATGGCAG:1 + chr3R 30618784 3' - X-element 40 1 53.42 GCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTATANTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTA:1 + chr2L 23068909 3' - 1360 91 1 77.93 AATTTGAATTTGAATTTGAAATATATTTACAATAAATTTAAATGAGGTCTGGATATTCAACTGTTATTACTAAGTCAATAAAACCGTAAAAAATATAAAACTAATTTTTACCGACATGTGAAAAATAGTTAGATGATTTGGTATCA:1 - chr3L 14920325 3' - Rt1a 310 2 53.42 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCAACGACTCTTTCAATCTTACAGGGCTGAAGCTTAAAAACTTTTCCAAAACTTGTAAAACGTTCCAGTCGTATTAAAAATACTCCTGACCATCAAGACC:1 + chr2L 18284981 3' + pogo 2081 1 71.92 ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCG:1 - chr2L 3632171 3' + P-element 2782 1 15.75 ATTAGGTAACCAATATGCGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTTTCCTTAATTAATATTATTCTGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAGGAAAATCCGCATGGAGCAAAGCTGACAGTTGTTGGTATCCACCC:1 - chr2L 10424850 3' - gypsy7 402 1 77.40 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACAAATTCATATATTTCATAATATTTTCACCTGCCGCTTTTCCTTTACCTTTACCACGGCTCTGGTTCATTTTTCACTGC:1 + chrX 3596514 3' + copia 215 2 51.03 AATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCAAACAG:1 - chr2L 17550611 3' + Transib-N1_DM 443 1 79.45 CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGA:1 - chrX 21227134 3' - Tabor 6928 2 76.03 ACCGAAGATATTTCCAAATAANATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTA:1 - chr3L 16200727 3' + roo 353 2 54.11 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTTTGATATTAATGTGCTGTAACATAAAATAATGCTTCCAAATCAATGTTAAATCAT:1 + chr3L 19106471 3' - roo 8730 2 67.12 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTAATGAAATCTTTTCATTTTGAATATACATACATATATTGAAGATTGACTCATTAATATTTTAGAAAATCGGTTATCGCGGTGCTTGCACAAAAGTAC:2 + chr2R 14484249 3' + pogo 2082 1 76.03 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAGTTTTCAATCACGCGCGAATGCGAA:1 - chr3R 16349199 3' - P-element 35 1 53.33 CAGAACCAAAGACACTAGAATAATTATTTATTCTAGTGTCTTTGCCAGAACTATGTCAAAGTTACGTAAAAGCTCTTGATAACTACATAAGTTCGATAACAGTATAAAATATACAAAATTGTTTAAGAAAAACCAACCACGCCTTC:1 + chr2L 11329279 3' - Tc3 316 1 48.63 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTG:1 + chr3R 19246792 3' + jockey 4954 1 50.71 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAATCGTATAATTCAATTCTAAACACGCTGTGTACATTAAGAACGTGGCATATCTTTTTTGCAAATCGAATAGATGTGGAAAGTGAAC:1 + chr2L 21777907 3' - pogo 30 1 64.38 TCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAACACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTC:1 + chr2L 22684605 3' - transib3 66 1 52.05 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGGGGCATTTAGGAGTACAATTTTGTACGAGTTAAGTAAAGTTCAGTT:1 - chr3R 14138490 3' + mdg1 7437 2 68.49 CGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATCCACCTACAGCCACTGCTCCAACCGGACGTGCTTACATATATCGATTGACTACTCGCCCCAGC:1 + chr3L 1523201 3' - R1A1-element 5313 1 54.68 TAGCAATAGCATCTGTCCATCTAAAAGTCGGAGGGCAGTATACTGAGGCAGCATTAAAGTTTCCTCTGCTTGCAATCAGCTCAATAGTTACTGGATATGATTTTTCTTTTTGGAAGAGATGGAAAGGTATACGGGCGAGATGCCCT:1 - chrX 1954423 3' - G5A 355 1 72.60 TGAATTTATCAATTTTTTTTTTCATAACTTTCATTATTGCTTGCTTTTGATTTATTGATTATTTGAGCATTTGTTTGATAATACACGCGGTTTTTGTTTGATTATTTTGTATTTGTATATTTCGCACTTGCCGCTTCGTTATCACT:1 + chr3L 18797413 3' + accord2 342 1 67.81 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGTGCTGCGTAAAGTTTGGCGGACTA:1 + chr3R 20260931 3' + roo 9040 1 62.33 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGAAGCGAGTCCCTTCTCATTTTTTACT:1 + chrX 7626223 3' - Transpac 4974 2 58.90 CGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTCACAAACTATTTTACCGCACAAAAAATAGGCTTCTACACCTACCAGCTTAAAAGCAGCAAGGGCCTGCAAGTAGTCCTGAAGGGCATTGAGTCTGATGTTA:1 - chr3L 23358751 3' - Doc2-element 379 1 74.47 GGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCTACATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGAATCCCCGGAGCAGCCAACAAGGATTTTTTCAAAATAAACTCACAATTACTTTACATTTGCCATTTTACATTTCGAGACCGTTA:1 + chr2R 13963638 3' + Gypsy6A_LTR 265 1 58.33 CGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTCATATAGATATTTGAGTTAGTATTCGTGTTGCCTCTATTTTTGCTGCCGCGTT:1 - chr3L 756193 3' - roo 8661 1 65.75 ACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATATCATCTTGTCAATTCTGTTTCTTGAAGTTGAGGGTTATATTTCAGCCATTCTTAACTTA:1 + chr2L 6114136 3' - F-element 4349 1 59.59 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCGTACTCACATACATATGCACACATCATATCCTTGGAAATGGTTGTATGTATGTATGTATGTATGTGAGTATGAGAAACATTGTTGCTCCTTCATTTCTCCATCGAAACGACAG:1 - chrX 3235458 3' - 412 67 2 78.32 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTAATGAAATCTTTTCATTTTGAATATACATACATATATTGAAGATTGACTCATT:1 + chr2R 14484205 3' + pogo 2038 1 68.49 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCCTAGATAATTACACGAAATTGATTTGATTTGATTAT:1 - chr3R 21654920 3' - roo 17 2 72.60 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAACATAA:1 - chr3R 12622194 3' + 1360 3347 1 67.89 GCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGG:1 + chr3L 17935002 3' - HMS-Beagle 83 2 74.66 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGNGNCTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGTCTCATATTGCGCC:1 - chr3R 23104494 3' - jockey 87 1 67.81 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAATCAAACAATGTACACGGCTTTAAGTATTAGTATTTTGGCTGAAATTTATATTGGATTTTTTACTATGAAAGTGAATTGCATTAAAAAAAAACATATCAAATGCACTTAT:1 - chrX 15252227 3' - opus 7115 3 73.53 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTTTTTT:1 - chr3R 6147224 3' + copia 5077 2 57.53 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCA:1 - chr3L 13888894 3' - 412 59 2 56.85 ATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGACTTTATATAATTCTCATATCATCTGCAAGTAATAACATTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATT:1 + chr2L 16884767 3' + Bari1 1691 1 53.42 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAAT:1 - 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Transpac 4980 2 63.01 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGTAGAAATCGTTTCCGACCCTATAAAGCACATATATTCCAGTCTGTCCTTTTATCTGTCCGAT:1 + chr3L 21157120 3' - 412 57 2 56.85 ATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAACTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATAAAGCTTAGAAATAGACTTGATGTCCTGCAGACAGGAGAGCGATTCGATTTTTATTATTTTTCGATT:1 - chr2L 11481426 3' + 1360 254 1 64.38 CGATTCTCATGTCACCTATTTCAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATG:1 + chr2R 10695858 3' + roo 8994 2 72.60 AAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACAATTAAAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACATTCGATTTTTAAATTGGCTACAATCATCTCTATCTGCTCTACTCACTATTTAAAGCGCAAGCCACAAACAAATCGCTATCAAA:1 - chrX 19502064 3' - FB 83 1 46.58 GTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAACATAAATGCCACACACAGTCAAATTCGCATTCCCCATTTGCCATTCTCTCCGCACTCCGAATGAAAATCGCATA:1 - chr3L 15186537 3' + R1A1-element 8 1 53.62 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATNAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTANATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTT:1 + chr3R 29384718 3' + roo 348 2 69.18 GACCACCCCGGTAGCAAGTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCATTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTATTTTTCACTGTAACATTGGCGTTGATTAACAGACCAGTTGAGCACGGTCATTGTAAGTCGTCTGACCCCTATTAT:1 - chr3R 2211208 3' - R1A1-element 5171 1 51.37 AAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTAGGAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTAACAATGTTTGATGACATTCAG:1 + chr2R 5542343 3' + Quasimodo 7328 2 57.34 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGAT:1 + chr3L 17746352 3' - roo 74 2 69.18 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTCGTCAAAGTTGTTGTTACTTGGGCTGTTTTAGTCGCTTTTGTTGTTGCTGGTGTAGCGTGTCAACTTTAATTGCAGTGGAAAACGGAGACGAAGTCGTTTATGTG:1 + chr2R 23790392 3' - roo 8679 2 73.97 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCG:1 - chr3L 21913354 3' + 297 315 2 77.40 CGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAACAG:1 + chr3R 25962070 3' - I-element 56 1 52.48 AATACATTGTTAGTTGTTAACTACTCCCCCCTCAAGTTTATGACCGTCCTCGGTCATGTTGAAAGTGTCGTAGCTTATAGCCTTAAATCTGAGAGAGTATTTGGCGTAGGAACAAGCAGGCAAACTGACTATATAAGCTCGG:1 + chr4 504671 3' - gypsy 1 2 50.70 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCCTACCAACTGATAAAAACAGGTAGAGTTGGTCA:1 + chr3L 7881167 3' - FB 88 1 76.71 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTT:1 + chr3R 6399456 3' - pogo 62 1 62.33 AGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAATGTTTTGCATTCCGTTCAAACCGTAATAATTATCACCGTACCGACTTTGTTAAGCTCAG:1 - chr3R 6611030 3' - mdg1 170 2 61.64 AGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGATTCTTCCCATGGGGTGCCTGCCCATTGTGGCCCATTGTGGGCCATTGTTGC:1 + chr2L 20260331 3' + Doc 4420 1 57.14 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGTGAATGCATGACTATTCCCGATTTTCCGGGAAAAGCAGGCAGCTCCGCACG:1 - chr3L 22435068 3' - opus 22 2 65.28 ACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTGTTTTCCGTGTCGTCGCGATGCTCAACACA:1 - chr3R 16075085 3' - 1360 185 1 73.08 ACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGGGGTTGTTCCAC:1 + chr2L 16553616 3' - BS 5055 1 60.27 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACGACGTATACGTAATGTAATGTAAATGTAAAACTAAGAATAAACAATACAA:1 - chr3L 2485845 3' + jockey 4986 1 72.60 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTCCTCAAAATAAAAGTAAAATTAGTATTTCTATCAAGAAAACTTCGATTGAGCTGCATGGTTTTAATTGAATATCTTAAAAGTTGA:1 - chr2R 15472012 3' + 412 465 2 57.53 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTA:1 + chr3R 27007415 3' + roo 8985 2 73.79 CACACACACACGGACACACACACACGGACGCACACACACGGACGCACGCACACAGACGCACGCATATAGCATATAGCATAGCATATAGCTGTTCAACATGTTGTCTTTTATGCCATTTTCTGCGGTTT:1 - chr3R 27844145 3' - Stalker 445 1 32.03 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAACTTTCTGAACTACGAGATTCTTGGAAAAATCATATGACAATAGCAT:1 + chr3L 18010319 3' + diver 148 2 68.49 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATTCTTACTAGCAAGGACGGTTCATGAAGACTATAAAACATTTTAGTGAGACAGT:1 + chr2R 19728657 3' - 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chr3R 9657761 3' - jockey 4741 1 70.00 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAAC:1 + chr3R 25962068 3' - I-element 63 1 57.53 TATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTAGCAAGCAGGCGGATAGCGATAACTACGGCGGGG:1 - chrX 9104705 3' - F-element 4433 1 69.09 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACG:1 - chr2L 19940003 3' + mdg1 372 2 50.68 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATGTTGCACGTTGTCTGTTCATTTCGCTCCTTAAGCCCCACATCCTTCTATACACGCAAAACAATT:1 + chrX 6520975 3' - FB 56 1 55.48 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGTTAACACGTACACATTTATATATTAATACACACATTTTCAATATTCTCGTATATACA:1 - chr2L 7774899 3' - I-element 11 1 78.08 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTT:1 + chr3R 24011066 3' + roo 9002 2 67.12 GCACAACAAATCATGCGCTTAGGTGTAAGCAAAAATGTGAATTGGTTTCATGTTTCGTGTGCAAGATTGTATGTGCGGTGCAAGATTGTATGTACAATGCTTATGTAAGCGTAGAGCGTGTTGTATTAATCCTAGTCGGTGTTATT:1 - chr2R 3142416 3' - rover 7059 2 77.40 ACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAAATCTTTGGATGGCAGCGCCCT:1 + chr3R 30618790 3' - X-element 34 1 57.53 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGGCGCAGCGAG:1 - chr2L 3632127 3' + P-element 2853 1 52.94 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACAT:1 - chr3R 17673765 3' - FB 81 1 73.97 GGAACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAGAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTCATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGTGC:1 + chrX 22672496 3' + INE-1 573 1 50.00 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAAT:1 - chr3R 12941795 3' - hobo 66 1 67.69 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTT:1 - chr2R 22596061 3' - Doc 41 1 52.74 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTATGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGACTAATGGTATTCAAACGAAATGTTCAGCAAATTGTTGCTCAGTTGTCTGT:1 - chrX 19583235 3' - roo 8735 2 69.18 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTAT:1 + chr2L 13316935 3' - jockey 4750 1 70.55 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGCTCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATTCGCATTGCTTTCTCGTATCGCATGACTCTTGTTGCTAAACACTGTCATATAAAAAATTGTGT:1 + chr3R 8381852 3' + Tirant 8487 2 72.60 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGATTTATTTAAAAGAGAAATCCGAATTTATTTGTTAT:1 - chr3L 20168167 3' - roo 33 2 63.01 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATNANTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACA:1 - chr3L 17757948 3' - Tirant 78 2 70.14 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTATAGTCCACATACAGTGACATTCATTCCGAGGCCTTTCAGGG:1 + chr2L 16995595 3' - roo 48 2 51.37 ATTTTTATCGTGAAGCTCCTATCAGTTGTAAAACTCGACTGACTCTTAAAGCTAACACAATATTCCTCTTAGGCTTGAAGTGCGCCTTATGCTTGGATCGAAAGGGATATGTGCTAGGCGAGGGAGGGGCTCTCAAATAAGGCAGG:1 - chr2R 22286012 3' - gypsy11 4358 2 59.59 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATAGCTGCAGATTCAGTTCCATTTCAGTGCCC:1 + chr3L 8274004 3' + hobo 2908 1 52.73 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACTGACTGGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTTCATCACTATGCGGTCCAGTTAACCGCTTGACATATGACCGTCAT:1 - chr3L 5958590 3' + 412 7510 2 58.22 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTTCACCGCTTGTTGTTGTTAGTTGGGTGTCGATTTATCGTTGTTGTTGCTAAAGGACATCCATGTGTGGAGTTGGTGCAAAAACACTGTACTTT:1 - chrX 7626078 3' + Transpac 286 2 67.81 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGGGGCATTTAGGAGTACAATT:1 - chr3R 14138516 3' + mdg1 7411 2 52.05 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGCGTCAGTCAATTTAACTTATG:1 + chr2R 22971910 3' - 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jockey 4809 1 52.05 ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATAATTGCTTTCAATATTGTTATCAGATTGTTTATAGCTAAAACAAATATA:1 - chr2R 13825798 3' - Quasimodo 74 2 67.12 CCCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTCTATTTCTTAGTAAGATGTTTTCAAGTTAGCTCGACTTATCTGCACTAATCTTGACCCACTTATTTCTTTCAGTGTTCGAACTATCGCAACGTGCCTCTCGACAACCCTAGTTGGCGCATT:1 - chr3L 5509487 3' + INE-1 577 1 56.16 GACTATAGCATTCTCTCTTGTAGTACAGTAAAATTGATCCCAATATTTAGAAACATTAAATGTCTTTCCATTTCTAGCATATCAATGTGATTTTTCAAGTAAGTACATTTTTACTCAGTGTATAAAAGTATTGGTATTTTAACTTA:1 + chr2L 7233292 3' + INE-1 580 1 65.07 GGTTTTTTGAGAAATATTATGTTTTAGGAAGCAATATCTCGATTGCCAGTGCTGACCTGCTGGAAATGGCGGGAGTCTGGGTTTTATTAAGCAAATGTGCATGAAAATCTATGCACGGATACGCGCGCAATAATGCG:1 - chr2L 17062953 3' - hopper2 1107 1 56.20 AATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTTCTATAATTTCAATAAATTTAATCAATTTAATATCCATAAAAGT:1 + chr2L 4916282 3' + 1360 3150 1 69.44 GGCGCGCATCCATCGCCCGCAACATGCCCCAGCCAAAGTACAACAATTTGTGCACTTTCTTTTGTTTGCCAGCAAACAGTTTGAAAGTGCCCGCGGAAT:1 - chrX 13934825 3' + HeT-A 5648 1 56.57 GTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACGCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACG:1 - chr2R 5070930 3' - Tirant 8126 2 29.79 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAACCCAAGCTGGACAAAAAGAGAAAGCTTTTTAAATCGACTTGAGTTAAATAGCTGAG:1 - chr2R 6089059 3' + 1360 3326 1 60.96 AGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCCCTGATCTCGGCAAACTT:1 + chr2L 22044568 3' - McClintock 6002 2 60.27 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAGTAGAAGATGAGTCTATTA:1 - chr4 372924 3' + pogo 2069 1 63.70 AATATCTCCCGTAGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATG:1 + chr3R 4679568 3' - hopper 44 1 54.11 TCCTGAGATCTAGACCTTCATAGGGACAGATGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTT:1 + chr2R 5198439 3' - INE-1 138 1 72.60 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCCCGTTTCGTTCCGCACACCTGGA:1 + chr2L 4631268 3' + roo 9044 1 63.70 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCG:1 - chr3L 739156 3' + P-element 2848 1 50.82 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATAAATCCTGCAAAGATGGTCGTCGAAACCTCTTGAAAAATGTCCACTGTTCGTTTATACAGCCCCGCACATATGCTAC:1 + chr3R 26605658 3' + roo 9029 1 58.22 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGA:1 + chr3L 9522124 3' - opus 7181 4 67.81 ATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTGAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAATTCGGAGATATGTTTTCCAAAGAATCGGAGCAAGTAGCTTTGGCTGTCTACGAAGCGTATGACCCGAATGTTGGATCCA:1 + chr3L 6321856 3' + gypsy4 380 1 55.48 ACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGGGGTTGTTCCACTGTCACAAATTTTCTCGTCTGAC:1 + chr2L 16553639 3' - BS 5021 1 61.48 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCGTAATAAAGGGCGCACAATTAGTTGCTTGAGTTT:1 - chr3R 12181952 3' - mdg3 37 2 60.96 CTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTG:1 - chr3R 10708254 3' - Transpac 5006 2 78.08 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGATGACCTGGCGACGGTCACTTGGGCTTCACTTTAAATATACTCTATATGTG:1 - chr3L 950391 3' - BS 5076 1 65.75 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAGGGTTCGTTGTG:1 + chr3R 23579383 3' - roo 66 2 63.01 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTGGTTTTCTTT:1 - chr2L 11476254 3' + pogo 2047 1 56.16 ACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTAGAAGTTAACTGCCGTCGCGGTGACAGCGCGACGTCGACTGCGACCG:1 + chr3L 15634476 3' - I-element 444 1 55.29 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCTGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCGGCGG:1 - chr3R 5170980 3' - F-element 69 1 67.74 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAG:1 - chr3R 17777521 3' - jockey 4723 1 73.97 CCGGCAAAAGCTCTGCACATTGACAGAGGACGCTATGAGGTTTTTTCTATGTTAGCATTTAAGTCAGTTCGCTTTGGGCATGATAGAACTATGTGCTCAGCAGCGGAACATTTTAACGTTAAGTGAGGCAACAAAAGTAGAGCAAA:1 - chr3R 20235209 3' + springer 7225 2 53.42 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAG:1 - chr2L 19940028 3' + mdg1 7385 2 67.81 CAGGCACACACACACACACACACACACATGCTCACACACGTGCACAAACACCCGCACAACCCGCACACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTGTTTGTACACAGTTTGACTTTTATTATTTTAGTTAAACTTCTTTTCCGC:1 - chrX 9955441 3' + accord 180 2 55.17 ATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTTGGGTGGTCTCTAAGTCTGTGGGCATATCGGCTGCTGTGGAAGTTTGATTGGTCTCCCAGTGGGACAACAGTTACCCTTCTGAAAAGATCCATTC:1 + chr3L 11837976 3' - G5A 2648 1 76.38 ACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACAAGTGGTTATTTCTGTGC:1 - chr2L 21325080 3' + invader4 277 2 73.29 ACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTGGACAATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAAAATACTTAATCATACTTAACTAAATATTTTAATTGAAAATGCG:1 + chr3L 6527594 3' + G2 2869 1 80.16 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTCAAAATACAATTGTGTATATACCCTACACCACAGCATAGGATAATGCTG:1 + chr3R 13676209 3' + P-element 2872 1 71.67 GAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGTGTATCACGCATCTGAGTTGGGTTCG:1 + chr3L 21913478 3' - 297 19 2 69.44 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCATAAACTATAGGACTTTATGTTCCATTTGTGGGTTTTACTGTTTTCCCTTACTCTTGGCCGGGTCAA:1 + chr3R 24444129 3' - hobo 52 1 53.42 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCGGCGGCCATGGCGAATAAATCAAAAA:1 - chr3R 5170959 3' - F-element 70 1 59.59 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCT:1 - chr2L 6047879 3' - P-element 64 1 20.56 GTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTC:1 + chr3L 8249448 3' - HMS-Beagle 75 2 75.91 CACATTCACACTAGCTGAGTACCGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTAGTGAAGTTGCCACGCCCACAAACCACCCAAACCTGTTACGCCCACACATTCTCCGGGGTACTGTTTAAAAACAAA:1 + chr2R 5525443 3' + INE-1 533 1 63.70 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTCAATT:1 - chr3L 20765125 3' - 297 6625 2 56.16 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTACACATTCCTACCCTGCTCCGCACTCCAAATGCAGATGCAGTCTCAGTACCGCTAATCATCTCAGCTG:1 + chr3R 17495001 3' + hobo 2901 1 54.26 AAAAAAAAAAATAAATGGGGCATTTAATATGATTAGATATATTTTCATATACTTTTTCATGCATAAAAGTAAACA:1 - chr2R 18337485 3' - hopper 137 1 85.33 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGT:1 - chr3R 23415886 3' + jockey 4949 1 55.48 ACTTTAAGATACGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACA:1 - chr3R 23579315 3' + roo 319 2 79.45 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTTTGCAATTGGTGAGCAACAGGATGAAGGAGCCAGTAGCTCATAACTC:1 - chr3R 5977682 3' - copia 4883 2 76.03 ATGTTTTTATAAGCTCTATTAGATGCCTGAAACGAAATCTTAGGCTTCTGGCTACACTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAACAGAAATATATTTATCGATATTTGAATTCAAACTGTATTCTTCCATAATTTC:1 + chr2L 22983826 3' + Transib5 2900 1 50.68 CCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCCCTGATCTCGGCAAACTTTCGACGA:1 + chr2L 22044575 3' - McClintock 43 2 55.48 GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGGAAACACGGAGTTGGGCCCCAACTCCGAATGGAGACTGGTGACTGGGTGACCCCAAT:1 + chr3L 17935058 3' - HMS-Beagle 6817 2 67.86 AGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATG:1 - chr3L 23456270 3' + Gypsy6A_LTR 256 1 68.49 TATTGAAGAAATAAAAGTGAATCATTTGTTGAATTGTTTGAAAATAAATACCAAATGATATTATAAAAAAAGATTACACATTAAAACTTAAAATCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTAGATAAGAATATGATGCGATATGAT:1 + chr2L 20949378 3' + HB 1492 1 65.07 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTGCCCAGTCCAGTCAAGCGGGTATGGCCAAAGA:1 + chrX 21639320 3' - 412 84 2 72.60 CACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATACAATATTGCCATGCATAGGATTTACGGTTGCACTAAGAAAGTTAA:1 - chr2L 17851673 3' + flea 4944 1 71.23 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCGTCCTA:1 + chr3L 15035255 3' - pogo 25 1 69.86 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTTATTGTTCTTCTGCCATCATGATAGCTGTTGCGCCGTTAACTTCATTCCTTCTACAATCTCATCTCTCTTATTTCACGCTT:1 + chr3L 75563 3' - roo 38 2 59.59 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACAAATTCATTGATGCCACTTTGCTGGCAAATATTTTGGCAAAGTGCATAACTTGT:1 - chr2L 7336086 3' + pogo 2064 1 58.90 CAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGA:1 - chr2R 1320658 3' + diver2 325 2 52.74 TCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCTTAGATCTCAGGAACGATGAAAGCTAGAGAGTTGCAATCATAAAGATTCGCAAAAAAATTTTGAAATATTTTTTAAAACGGGGGGAAACTGACATTCCGAACTCTAGGAATCTCA:1 - chrX 5975579 3' + INE-1 116 1 73.29 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTTTTAAGGATA:1 - chr3R 29384620 3' - roo 66 2 67.81 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTACATATGTAGTA:1 + chrX 22511454 3' + roo 337 2 67.81 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGTGTGCTGGTAATTGCTAATTGATTTTGCCATATGCATTAGTTGATAC:1 - chrX 20940705 3' - hobo 52 1 58.22 CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAGGTCAATTCCAGAGCCAAGGCA:1 + chr3R 15047448 3' - F-element 17 1 72.44 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAACAGGAGGTACTAAGGCACAGGCTTG:1 + chr2R 16185158 3' - 17.6 6948 1 71.92 ATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCATCACATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAATATAGAATGAATATGCCATTGGACGATGAATTGAGAGTTCAGTTCACGACAACGTTATTCGCTTTGATTCG:1 - chrX 11949081 3' - 1731 4582 2 48.95 CTAGGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAATTTCGAATTTCTTTCTCATAAGTATAAGTATCTATATAAGTAGGAAGTACTTGATAGCCGAGTTATATTTTTGGAAGGCTTAACTTTGCTTTGGATAGCAGCGATTTCAAGCTCTT:1 - chrX 19228545 3' + INE-1 153 1 80.14 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTGCATAGGAAATATGGTTATAAAGTAACAAAAAGAATCCG:1 + chrX 11415779 3' + mdg1 339 2 79.45 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCTGCTTTCAAAAGAGACGTACTCTCACTTGCTGCTCCAACGATCG:1 + chr3R 4197242 3' + P-element 2811 1 34.25 AAAACAGTCCACATGCCCCATAGTTCAATTGCTTCAATTGGCTATTACGAGACTGGAACAGGAATGCCCGTAAACTACTTGCGCGGAGAAAGTATTCGGTGGAATGTTAGCAATCTCGGCTGGGGTTGCAGCATCATTTGCGAAA:1 - 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chr2L 15917554 3' - roo 8664 1 74.80 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCGGCGGGGTGCCGTCTCCGCCTGCTGCAG:1 + chr2R 18551792 3' - I-element 37 1 54.40 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACNTNTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAAAGTTAAGCATTTAAAGTTTTCCAC:1 + chr2L 16554692 3' + blood 7322 1 61.64 ATGTAAAGGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACATCAGATCAGGCGGCGGATTGAATGGATAGCTGGACCAAATCCAACCGCAAAAC:1 - chr3R 27795075 3' + roo 8726 2 62.33 TTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAATATTCAGGGTATCCCGTAGATTTGGCTAGAGCCACTGCCACCAACAGA:1 + chr2L 11725098 3' - F-element 13 1 79.31 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGNATTATACTGTATTTCGTTTTCTTAAATTTAATCGCAAGTAAAAACTGCTTCTGAGGATTATACTGAAGTATGCAGTTCCATAATTTTTA:1 - chr3L 20573748 3' + pogo 2056 1 54.79 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAA:1 - 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chr2L 1451099 3' - mdg1 8 2 75.86 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCGGCGGGGTGCCGTCTCCGCCTGCTGCAGCTAAATGCCAAAATGGCAAT:1 + chr2R 18551812 3' - I-element 38 1 60.27 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAAAATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTACTGCGCCATCTTTGGACAGGACCATCTACTACCGGAATACGCCAC:1 - chr3L 21292485 3' - 412 7078 2 64.34 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCCGTTATATTTA:1 + chr3R 12787412 3' - BS 5028 1 60.96 GTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACTTGGCGGCACACCATTCGAT:1 + chr2L 6385934 3' + invader4 3066 2 71.92 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGGAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTATAGCTAAAAAATTTAAAAGAAACGTCGTCAATGAATAGAAGTAAATAG:1 - chr3L 20867990 3' - hobo 32 1 63.01 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGAAAGGGTATACATGACTATATGTTTTCGCCTAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAG:1 - chrX 10694267 3' - Transpac 4974 2 58.62 TAGTTGCGAGCCGGAATCAAGCAGGGCGCGACAAGGAACCCAAGATCCGGATTTATTTTGAATATTGATGACGGCAGTGACCAACGAGCCGAGGCGATGACCTGCAGTGCCATGTAGACGGTGGCGCCCAGGGCCACGAAGAAGGC:1 - chr2L 22226603 3' - G3 466 1 58.22 AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTACTTACTAGACTTAAGAAACACTTTAAAAGCTTCGATGATAAAAAGTAACAT:1 - chr2R 7769743 3' - Transpac 4985 2 63.01 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAG:1 - chr3R 16349239 3' - P-element 34 1 30.38 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTATACCCAGGAATCGCACAAATACAAAGGCATACTGGGCCCAAACATATTCTTCCAAAACTTCAAGACCTTAAAAAAATTTTGGACCTTTATAT:1 - chr2L 20550920 3' - 412 26 2 65.07 AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATAT:2 - chrX 19163257 3' - Burdock 58 2 58.90 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAATCGGAATATGCGCATGCAAATGGCATTAGCCTGAAATGCAAAT:1 - chr3R 12941747 3' - hobo 34 1 61.64 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAA:1 - chrX 10284795 3' + pogo 2046 1 55.48 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTTTGTTCTGCTTGGCGGGTCATCGTGCAACTGCAGAAATTA:1 - chr3L 9522005 3' + opus 7477 2 60.27 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTGGGCGCCTAGTCATTTGCAACATGCACACACCACTTGCCAACTGCGACTATACGACCATGTGGA:1 + chr3R 26542676 3' - FB 57 1 56.85 GGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGTAGGGTCCTAGAAGCTCCACCGGACCACAAGATGATGGCATGGCCGGCGGCT:1 - chr2L 16840475 3' + Rt1b 4958 1 59.38 GGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCCCTGATCTCGGCAAACTTTCGAC:1 + chr2L 22044573 3' - McClintock 5997 2 56.85 TGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGTCATGGGTTCGCAACAAGGTTCTGGAGATGATCGTAGCGAACTTGGAAAAAATCTTTATAAGCACGTCAGTATGTACGTAGCTTAAAATCTTTATT:1 + chr3L 16689951 3' - Burdock 5966 1 74.66 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGCCGTTTATAGCAATTG:1 + chr3L 16200838 3' - roo 57 2 59.59 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGACTTTGTAATCCTCGCGAGCTTCACAATAAACACGAAAATATAATTTGCAACGTTTTTGCAGGCGACGCGCTTCCGCTGCCAAAGCG:1 - chr2L 12374630 3' - roo 91 2 57.53 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATTCGCATTGCTTTCTCGTATCGCATGACTCTTGTTGCTAAACACTGTCATATAAAAAATTGTG:1 + chr3R 8381851 3' + Tirant 8486 2 71.92 CGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTA:1 + chr3R 8867081 3' - Max-element 8312 2 70.55 TTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGACCAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAAATCTTTGGATGGCAGCGCCCTTC:1 + chr3R 30618792 3' - X-element 32 1 58.90 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGTCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTAATCTGATAAAATTAAACTAACTTACGGACTTCAGAAACAGGATGTAG:1 - chr2R 12379442 3' + pogo 2098 1 78.08 AAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTTAAACCGAAAAATTAAGCCACGAATAAGCTACAAATATAGACCGTTCCAAGAATAGTTCTACGGTTACTCGTTCGCTTGCAAAACTTCGACGTTTCATAACAATAGGGAA:1 - chr2L 17362588 3' - Cr1a 4123 1 67.38 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTATCAGTGTT:1 - chr3R 6147253 3' + copia 5048 2 68.49 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGAAATAATTTTGTTTGCGCATCAATCAAAGCGATTTT:1 + chr3R 31086625 3' + jockey 4970 1 56.30 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTC:1 - chr2R 16072907 3' - opus 164 4 57.53 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGGAAGCTATTGCGCGCTAA:1 + chr2R 16073021 3' + opus 7444 2 62.33 CTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCTATGACTATATCATAGAGTATATT:1 + chr3L 21202136 3' - G2 2606 1 69.18 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTTCACCACTTGTTGTTGTTAGTTGGGTGTCGATTTATCGTTGTTGTTGCTAAAGGACATCCATGTGTGGAGTTGGTGCAAAAACACTGTACTTTTTTTAGT:1 - chrX 7626071 3' + Transpac 293 2 73.97 ACAAAAGAAAATGAAAATGAAAGCCCCATGGAACGCGGCGGAAGAGGTCGGCCAGGTTACGACTTTGACAAATTAACGCTCCATAAAGAGACTCGTAATTGGCTTTAATTATATACCTTGCATCATTTTTAGCCCGATCCCGATCT:1 - chr2R 17421667 3' - gtwin 7140 2 80.82 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACGAGAAACGCGCGCGAAAAAGAAATAAATAAATAAATAGCCAA:1 - chr2L 3228444 3' - P-element 12 1 77.40 TTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTCAACAGGTTGTCCACTATTAGCTGGTCTTAATCGTTTTATTGGTCGATTGGGTACATAGGAACATGAATTTTGTGATGTTGTTGGTG:1 + chrX 10198555 3' - I-element 470 1 50.00 TTTCGGGTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAAATATACGTCACTACATACATATATGTACATTGGTTTGCGTTTTAAATTTGAATGGAAATGAACTTGCGACGAGTTCGCAATCCGCACG:1 + chrX 3663241 3' - 297 6784 2 70.55 CCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGTGAATGCATGACTATTCCCGATTTTCCGGGAAAAGCAGGCAGCTCCGCACGCATTATGTATG:1 - chr3L 22435057 3' - opus 13 2 71.92 CAGATCGACTCGGCTTTTGATCCTGATCAAGGATGTACATTTTTGGGCGAACGAGCCATGACATCGACGCACTGAACGCTACCTCTTCCACTCTTCATTCGCGCCCACTATTTCTGTGGATTCTGCATGTAATGTGTG:1 - chr2L 12295501 3' - INE-1 98 1 65.94 GGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCTTGCGCGTGTTAACTTATATGTAGTTCAGGCTAACTTCCCTTTGCCCCTCATCCTGGCCAAATCCGAAGGCAAAGACCAAACTAAAGGCGAAGCGGTGCCAATTTGCTAAGCAAAC:1 - chr2R 19542028 3' - gypsy4 6594 2 54.79 TAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGCGAAATTCCAACAATCAAGGGCACTGGGGTATTTTAAGCCGATTGCGTTCTCTTGTTTAACGTGATTAGGCCACCTAATTGGTTCAATCAAAGTGTCTTCAGATTTAATTAAAT:1 - chrX 10162427 3' + roo 8973 2 76.03 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTTTA:1 + chr2L 8553419 3' + pogo 2047 1 57.53 CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGA:1 + chrX 13367458 3' - HMS-Beagle 6878 2 73.97 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTTCGGCTGAAGGTGCAATGAAGCCGTACGATGGAGAG:1 + chr2R 13695752 3' - blood 7045 2 60.96 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGCGACCCTGATTCAGACATATTTAACGGGGGTTCAGACAATGGACGTACATATA:1 + chr3L 17758061 3' + Tirant 366 2 63.01 ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACACTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTACCTAATAATAATTAATTATTTTCTCTTCAAGCGGTTTGAAATGGAATAACT:1 + chrX 4292952 3' - S-element 64 1 65.75 GTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGGTGTAAAAAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAACTAAACAAACTTTCTTCAGCTATTTATTATTTGCAACAGTTTCCATTCAAGGTTCATTCGCCGCAGTTACTCGTT:1 - chr3R 20601050 3' + diver2 4782 2 73.97 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCGT:1 - chr3L 16200701 3' + roo 9043 1 65.75 GTTTCTGGGTAAACACAAGTGCTCAAAATGCTGACCATAGGTCAGAGGAATTCGCTGAAATAAGCAATGTATCCATTATTGTCCTAATTCCAGTTTCATCTGTTACTGACAATATAACCGTTTGGCAGTACTCATTTTCTTGTGGT:1 + chr3L 27968936 3' + HMS-Beagle2 6931 2 76.03 AAATAAAAAAAATAAAAAAACTTGGGGCCGTGGTAAGGAGGCTAATGCCACAGATAAAGCTGAAAGCCAGATCAGGCTAAAAAAAAAGAGAAAATAAAGTCCACACTCAAAGGAGGAGCAGGAAAAGTTGCACATGCA:1 - chrX 17539269 3' + HMS-Beagle2 489 1 76.81 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCAAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACA:1 - chr3L 15035115 3' + pogo 2040 1 64.38 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTAT:1 - chrX 8208322 3' - roo 73 2 68.49 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAACATTCCGCGCGTAACAG:1 - chr3L 12125235 3' + roo 389 2 71.92 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATGTATACAATATTGTCATGCATAGGATTTACGGTTGCACTAAGAAAGTTAAGAAGTAAATAATCTCTTTGTGTCATTATTTATTTTTTTTT:1 - chr2L 17851633 3' + flea 236 2 66.67 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGTAGTCGGATGAA:1 + chr2L 15549956 3' - hobo 58 1 58.22 TTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAAATATACGTATTTTATGGCCAAATGCCATCTGTTTTGGCAAATGT:1 + chr3R 29754795 3' + opus 426 2 72.60 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATACTTA:1 - chr3R 10541211 3' + hopper 1355 1 59.59 ATTGATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGC:1 - chr3R 7042013 3' + Stalker2 7584 2 76.07 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGCCGTTTATAGCAATTGGTCGACTGATAACATTATGCGGGCA:1 + chr3L 16200863 3' - roo 32 2 63.01 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTGAAAAAACTGTGAAATGTAGATGAAATATTTTTATAAATTCTATTTGACAGGTAGGGGTAATCAAATTAACACCTTGCC:1 - chr2L 20508268 3' + pogo 2064 1 60.27 AATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGGTTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAGCACAAATTATGG:1 + chr3L 8754846 3' + mdg3 239 2 63.64 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTTTGGCAGGCA:2 - chr3R 15137260 3' - roo 56 2 58.90 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCACGGCCAGCTTTACAGCCAGACAAACAGCAACAAATGTCTGGCACACCCACAACTCATTCCACTCGAATCATGAAAACGGACA:1 + chr2R 19726960 3' + 1360 3350 1 59.59 AAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCCTGTCTCGCCGACATATGTATATTTATTATCAGGCTGCGGGCTATATGCTGGAATGG:1 + chr3L 15215652 3' + invader4 296 2 65.96 ATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCCCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAATAAATGGTAACGAAAAATCTTAATG:1 - chr2L 18043828 3' + Doc 322 1 81.48 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAGAATGAAATGAGATGAAATTATTGGCGACTGAGGAGAGGAGAGAAA:1 - chr3L 18392773 3' + roo 8994 2 69.86 AAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATCAATACAAATAAGGAAATGCACAACTTAAATTATGCTAAACAATACTAAAAACAGTGCCATTAAA:1 + chr2R 5265222 3' - Q-element 426 2 66.21 TCAGGGAGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAATACAATAGATCCGACTGAGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAATATGCGATATAAGTGTAAACCTACGCCCAGTTTGATGACACTTGTCACAATGGC:1 - chr2R 16556264 3' + baggins 5370 1 61.43 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTTTTTTTATAAGAGACAATGCAG:1 - chr3R 6147207 3' + copia 225 1 69.18 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTG:1 - chr3R 17673720 3' - FB 36 1 61.64 CGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAGTACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATTAACGGAAGAACACCTCTCCTTTCGGGAGAATAGA:1 + chr3R 2999883 3' - McClintock 5979 2 67.81 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAAACTTGCCTCCAAACGTGGCCCAATACTTTGAGGATCCGCTTCGATTCCAGCAGCTCTACCGCAAGATCAG:1 - chr3R 27927912 3' - FB 50 1 51.37 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACGCCTGGCCAAAAATTTGAATTCAGGC:1 - chr2L 19939978 3' + mdg1 7446 2 70.37 CATAAACCATTCGCCACTCTATCGCAAAATCATATCCAGGCAGTAACTATTAAGGTGACTGCAAGCAGAGGAAACTTGAATGATGGGAAAAGGACAAGTGTACACTGCAGCATTCATTTGACATAACTTTTGACCAAGAGAACATA:1 + chr2L 22538791 3' + G5A 244 1 56.85 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTTCGAGAAAGTATTGCCTACTTTCAGGTTCGTT:1 + chr2R 18618563 3' + jockey 4949 1 49.66 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATG:1 - chr2R 24807879 3' - I-element 59 1 60.27 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGTTATGAACGGAGCCCAAAATTGTCAGTCTTTAAATATATTCGTGATCATGTGTGAACATAAGGTGCAAAACAATTGCTCACTTGAAATTGCATATCGAATCTCGCTTT:1 + chr2R 21110615 3' - roo 75 2 65.75 AAATAATAAAGAAATAATTCAATTTGAGCATTGCCTATTCCACTTTGTTTGCCAATGGAAACGTATAAAATAAAATCGCATTAGGGGAATGAAAATGTCGTAGAACTCAGTTCTCGAATGTTGTGAGATCCAGTGATTTTCAGCTG:1 - chr2L 1534884 3' - Tc1 1393 1 53.42 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTGCTCTGCCAGTTGGCAAGTTGTGAAAGTGAAATGCGAGACATGCCATGTTCTTTTTCACAA:1 + chrX 7996577 3' + opus 491 2 68.49 ATGTTTTAATACTTAAAAACTGTCCGGGAGATATAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGGAAACAA:1 - chr2L 8776799 3' - G4 3719 1 75.34 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTCATTTAATTTCAATTCATACTTTGTGGTACATAATGAAATGATTTCAGAAACATGAATTAG:1 + chrX 14347054 3' + flea 4949 1 58.22 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAAAAAATAAATTGAAGTGAATCACTTTTACTGAGCGCCTCA:1 - chr2R 10695728 3' - roo 8678 2 76.03 AGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAAT:1 + chr3R 8867088 3' - Max-element 8305 2 65.75 GCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGC:1 - chr3L 18947253 3' - BS 4729 1 60.96 CGGGACCACCTTATGTTATATCATCATGGTTGTGAGTAAATTGTTCATCTCGGTTCATTTTGCTAGACCAGGGCTTGAGAAACACACGAAAGTATCGATTAAATGCTCGATATTT:1 + chr2L 7810760 3' + P-element 2880 2 73.91 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCT:1 + chr3R 13684771 3' - 412 68 2 62.33 ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATT:1 + chrX 21227190 3' + Tabor 407 2 69.86 GCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCATGGACACACACGGGAA:1 - chr3R 7041949 3' + Stalker2 371 2 63.01 AAGTGGCAACTACATATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGTTCCGATCTATAAGATCTTTAAGTTGTCAGGC:1 + chr3R 8598198 3' + rooA 7325 2 74.19 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGCCGGCAGGCGACAACACAACAACAGCAACCGCCCCATGTTCTGTGTGAAAGAAAGAGAGAGTGCAAGAGAGTGAACGA:1 - chr2R 21475157 3' + P-element 2878 2 77.40 ACTCGACTATAGTATTCTCTCTTGTTAAACCTTTACATTGACCATTTTATTGGGTGACCCCGTGATTTAACATATGGGTTATATACTATATGAAAAAAATTTATTTCGTGTTTTTTTTAGTGCTTCACAGCTTTTTATGTGTCGT:1 - chr2R 21643845 3' + INE-1 576 1 68.28 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCG:1 + chr2L 3911934 3' - roo 8699 2 55.00 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAAGGCTCCTCCACTGCAGTTTCATAAATTTGAATTTCAAATTTGGTACTCACATGCCGC:1 - chr2R 24617015 3' - jockey 4706 1 58.22 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCCCGTTTCGTTCCGCACACATGGAAATGGATGGGCGGGCAAAACGGC:1 + chr2L 4631291 3' + roo 404 1 80.82 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTGCATAGGAAATATGGTTATAAAGTAACAAAAAGAAT:1 + chrX 11415776 3' + mdg1 7374 2 81.51 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATAGCTGCAGATTCAGTTCCATTTCAGTGCCCACTTGTGTCCTTGTGTATTTGTG:1 + chr3L 8274027 3' + hobo 2897 1 56.25 CTAAATATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGACTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGACGCTGTGCAGTCGGCGTGGCTATCAGATAGTTTGTTNAACTAGGGGTGGGGTGCTGGCCAAATATTGATAACGTCGCGC:1 + chr3L 24186312 3' - Doc3-element 4634 1 55.48 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTNANTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTAAAGTTTG:1 + chr3R 20260923 3' + roo 9044 1 61.94 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACATAAATTTCCAGTTAACTAAGTGTTTAAGCAGTCATTAAAAGGTTGTTGAAAT:1 + chr2L 18173699 3' - blood 7052 2 56.85 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGGGGTGGAAGGGGGTTGCGGGCAGGGTTGTCAACACGCAGCGAAAACATT:1 - chr2R 21362691 3' - Tirant 12 2 76.03 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACA:1 - chr3R 25692723 3' - BS 5047 1 50.68 GGATGTTTGGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGCACCCAATTAACAGTGGACATCGACACCTCCCTGGAGCCTTTCTCTTTCCCACACCTGCAACTTGCAGCACCACAAATTTGAAATGAA:1 - chr2L 606558 3' - Idefix 177 2 60.69 TTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATATCATATATCATACATATGCCTGTGTGTGG:1 - chrX 3753437 3' - S-element 86 2 78.08 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAGACAAGAAATAA:1 + chr3R 14401957 3' + Juan 4153 1 58.33 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATGCCTGTTTTTAATATACTTTTCAACAACTGCCATGAAC:1 - chr2L 20044500 3' + roo 9055 2 72.60 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTAC:1 - chr2L 1232636 3' + roo 8994 2 76.03 ACGACGAGATCTTAGGAACTATAAAAGTTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTAT:1 + chr2L 22045844 3' + INE-1 143 1 78.77 GCACAGGCAACGATCGGCCGCAAGTAATTTTCTGTACGCCTAAAATTTGTACACACGTCGCAAGCTGAATACTCTACAATACTTATTATGTGACATTACGAAGTATTTTTATCAGTATTTTTTATTTATTTTTTAATGTGCCTCCA:1 + chr3L 25846036 3' - hobo 2745 1 53.42 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGA:2 + chr3R 10030790 3' - BS 5066 1 56.16 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCTACTTTATTCGATTTGTAAACTTTCCCTTTCCAGTTGTCAA:1 + chr3L 11529590 3' + opus 478 2 64.38 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCACAATTGTCAGCCAGCTTGGACAGGCGTGACCAAAAGATGTCACATTGCGGGCAG:1 - chr3R 13323820 3' - F-element 16 1 60.96 ATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAATCGAATCCGGAGGAAGAGAATGGGGAACACTTTCACATTTAGCTACGTTCTTAAACCACATCCAAAATGTAAGATTAGTAAAATG:1 + chr3R 18650891 3' + I-element 79 1 58.22 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATG:1 + chr2R 21199729 3' - jockey 4771 1 53.42 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACGAATTGGCGGTGATCAGATCAAAATTTCGACTTTGAATAATTAAG:1 - chr3L 18075559 3' - pogo 73 1 67.81 AATTATTATAATTATTATTATTATTTTATGTAGAGCGACTCGGAACCCGAGGACAGCAACCGCTTGCGCAGTGCCAGCAACGGACAGGGACGCAGCAACGGACCC:1 + chr2L 1942021 3' - mdg1 7081 2 76.19 TTAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTAGTACAGTAAAATTGATCCCAATATTTAGAAACATTAAATGTCTTTCCATTTCTAGCATATCAATGTGATTTTTCAAGTAAGTACATTTTTACTCAGTGTATAAAAGTAT:1 + chr2L 7233277 3' + INE-1 565 1 63.70 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTTTTAAG:1 - chr3R 29384624 3' - roo 70 2 70.55 AAGCGTGCGCCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAATAAGAGCAAGGATTGTTTTTTGAAGGCCATCGACTGTTACGAAAACAACAAGTCATGGTTCCATGCAGCCAAATCCTACGAG:1 - chr3R 10121156 3' + gypsy12 10156 2 54.11 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCGTTTTCTTTTTGCCTTTGTGCAGCGGGTTGTCCATTCGTGTAA:1 - chr2L 17353007 3' + 297 321 2 72.22 AACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACCAGCCACTTTCCAGCTTTGTTGTAACCTCGTGTTGTGCCTGCTTTTTAATCCCGCTTTGTTGTAACGCAGGCCATTTGCTGTTTTTG:1 - chrX 525075 3' - copia 5030 2 74.58 CAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTATGCTGCCATCCCCAGACTTATCTGACCCCATTCTTGGCCAGCACTCACCTCCTCATCGCCATCG:1 - 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chr3R 23922567 3' + Gypsy12A_LTR 1811 1 65.07 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATAATCAAGCGTGCAGCTGAAATCCTTTAAAGATCTCAAGCTCTGTTG:1 + chrX 5456640 3' + roo 8998 2 68.49 GTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAA:1 + chr3L 19350028 3' - 1360 3242 1 46.58 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTT:1 - chr3L 16200746 3' + roo 334 2 67.81 AAAGTTGAATAATATATATAAAAACTAATGCAAAATCTACTATTTTCCTGAAAAATAAAATTGCTTAATAAATTTACAGTTTTAGCCAGTAAGAACTCTACTATTACATATTTACGGGACACATAGCTTCCACTG:1 + chr3L 9920768 3' - copia 4666 1 62.22 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACCCACCA:1 - chr2L 16382503 3' - hobo 83 1 75.34 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGCCGTGTCTGAAAGCTAATTAGGTTGT:1 + chr2L 15917740 3' + roo 391 2 74.66 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGGTATTTTCAAGGGTCATGCCATATTCGCTCAAGTAGTTCTTAAAGAAATTACCTGAAATGCTGTTTCATA:2 + chr3L 7646343 3' - 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chr3L 16200765 3' + roo 315 2 80.82 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTCGTCAAAGTTGTTGTTACTTGGGCTGTTTTAGTCGCTTTTG:1 + chr2R 23790328 3' - roo 8743 2 76.03 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGC:1 + chr2R 10541732 3' + P-element 2841 1 43.70 CTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTTCGTTGTAGCCGCGGCCTGAGAAGTCCAAACAAAACAGCGAACCAGCCACGAAATTACATAATCGCA:1 + chr3L 5569860 3' + invader4 16 2 54.11 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAACATTCCGCGCGTAACAGCACACT:2 - chr3L 12125229 3' + roo 395 1 76.03 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATGTATACGATTTAAAAGAATGTGAAAACAAATCGTACGCCTACGAAACTAATAATTGGGG:1 + chrX 16589266 3' - pogo 38 1 55.81 CAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTACTGGCATGCCTCTGTTTATTATTCATACGCAACTTTTGCCA:1 - 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Doc 202 1 59.59 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACAAATTCATTGATGCCACTTTGCTGGCAAATATTTTGGCAAAGTGCATAACTT:1 - chr2L 7336088 3' + pogo 2062 1 57.53 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGGAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTC:1 - chr2R 9871066 3' + roo 320 2 80.82 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGAACTATGTCGAT:1 - chr2R 24807860 3' - I-element 40 1 56.16 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTGAAAAAAGTAAACAGTGACAAATACTGATATAAAAATCGACAAAAGTGGGAGAAGACAATAGCAAGTCAGAATGG:1 + chr2L 13293061 3' - copia 4881 2 73.29 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCCATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAATC:1 + chr2R 16731359 3' + Tirant 8490 2 62.24 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGC:1 - chr2L 16554602 3' - blood 7075 2 62.94 GGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGTGTTTATAATTCGTTGGGAC:1 - chr2R 18035091 3' + R1A1-element 5289 1 52.05 CACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCATTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAATGAGGAA:1 + chr2L 18689258 3' + Gypsy6A_LTR 260 1 73.29 AAAGCTAACTATAGTTAGCCTAACTAGCTAACTATAGTTAAAAAAAAAATGCTGTTCGTTGTGAGTCATATTTTCAATTGTTGCCTATTCAAATGGCGCCGTAAAGAGCGCATACAAAGGCATTCTTATTGGGGCAAAAAGAATTA:1 - chr2L 19399509 3' + X-element 4624 1 80.14 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCT:1 + chr4 490322 3' + pogo 2042 1 62.77 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTTAAGGCTTTTAATAACACCTGTACATTAGTATAAGGAAGGAAAAAAACCCTTTTACCTATATTACTTAGGATTGCAAA:1 + chr3R 32065575 3' + 1360 3350 1 58.90 TATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATCTGAGAAATTAATATTGTTATTCAAATAAAAATTATGTATATTTTTCATATTCCTTGGACGAA:1 + chr3R 15585644 3' - I-element 5347 1 56.85 ACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATATATATATACAGAAGTATTAAACACTTATTACAGATGCCATATGCTACGTTCAACGGATATTTACAGGGGCGGGAAACA:1 + chr3L 2668970 3' - Bari1 38 1 60.27 ATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACT:1 - chrX 21227137 3' - Tabor 92 2 78.08 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGACCAATGTGACAATGCAGTTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGGGTGGAC:1 - chrX 18767814 3' + hobo 2879 1 58.99 CAAATAAAGATAAAATGACCAGCTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATTAATCATGTAAAAATTATAATGTACTTTAAATTTAATAAGTATATGGCAAGTTAATTGTA:1 + chr3R 12538160 3' + mdg1 364 2 56.55 AAAAGCGAAGAAAACAAAAAATATTCAAGAAAAACAAAAAAACTTAATTTATGTACAACTTTTCGTAGACCTTTGCTTACTTTAAGTTCTTTGCGATATTTTCCAAATTCCTTTTCCGTTACGCTTCGTTATAAACGTCAGCTTCT:1 + chr2L 17751983 3' + HeT-A 5883 1 72.60 ACATACAAACCTACTTAATAATAATAAAGAATGCATCGTCCAAGGATGCAATTGGATTATAAGCAATTGTTTCGAGTGCAATTGTTGGGTATTGTATTGCCTGACTGTCTGGCTTAGTTAGGCAACTGTCATCCTTATTTTTTCCA:1 + chr2R 20062405 3' + baggins 5429 1 50.68 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAACATGTAAAAGCATAGACTA:1 + chrX 407497 3' - I-element 46 1 54.11 ATAAAATAAACTAAATACATAATGTAACATAAATCAACCCTATAACTATGGATCAAAACCAACTTAGGCACTTATATGCACTTATAATCCTTAAGATTAGGTTCCTTAATACATTAACAAACAGAGAAATGTTTCTTGATATTTTT:1 + chr3L 8333858 3' + F-element 91 1 76.71 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAAC:1 + chr3R 15137341 3' + roo 8987 2 75.34 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCAGATCC:1 + chr3R 29384752 3' + roo 9046 1 69.18 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGT:1 - chr2R 22596064 3' - Doc 44 1 50.68 AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTNATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAA:1 + chr3R 19246754 3' + jockey 4910 1 73.97 GACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACCTAATTCTTTTCCGCCACTTTGTTGACACCGGCATAGTCAATGGGGAATTCCTTTCGGCTG:1 - 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chr2L 16382507 3' - hobo 42 1 68.32 CGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGTAGCGAAGCAGAGGGCTGCTGCATTGGACGGTTGAATGGCACCCCGACCAGCTAATCCCCGCCTGGAGTGGCCTGCA:1 - chr3R 5511860 3' + Transpac 462 1 57.86 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGCAGTCGGATGAACACAA:1 + chr2L 15549961 3' - hobo 51 1 54.17 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTT:2 - chr2R 22596077 3' - Doc 57 1 54.11 AGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACAGCTTTGCAAAGTTCGCGGCCACCGTGTCTTGTATCACAGTTAAAATGAGTTCCCATTTACGTTTATGGC:1 - chr3R 12118113 3' + gypsy12 10144 2 51.37 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATGTTGCACGTTGTCTGTTCATTTCGCTCCTTAAGCCCCACATCCTTCTATACACTCAAAACAATTGTGTTCGTATATATAAATCAAACATTGATATA:1 + chrX 6521007 3' - FB 7 1 74.42 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATACTTACTGGCGTCATTCCATTTTATTTATTTTTGGTAGTTTAGTAACCAGAC:1 - chr3R 10541164 3' + hopper 1402 1 76.03 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGGTTTCAAACATTTATAGGG:1 - chr2R 18372610 3' - jockey 4748 1 68.49 TAGAATTAAACTAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTCATTTAATTTCAATTCATACTTTGTGGTACATAATGAAATGATTTCAGAAACATGAATTAGTGGCACCATCTATATTATAGTGAAACGTAC:1 + chrX 14347084 3' + flea 220 2 68.49 GTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATTTGGGCAAACAAACGATAGACTAGCACATACATACCTTTGCATCTTCCAGATATCCTTCGAGACGCTGGAGATC:1 + chrX 10485728 3' - F-element 242 1 49.32 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGACCTAATTGAGAATATTATATCTGTTCTGTTAATGATTGCTATTAATTGTAAGAGCTCGTACATATATTATTCGATATTGATTATGTACGTCCTGTTCCTCTAATACACA:1 - chr2L 22690050 3' - copia 13 2 76.71 ATTATTTACACATTTCACATTGAAGTACTTATTCGAATGTCAATAATTGGTCTTACTAATTGTTAACTGGATTTCCTCGATCAAGTATAATGCAGCATTGCTAGAAACACTGCACAGAGTCAACTCCAATTGACGAGCGATTGTTG:1 - chr3L 17945044 3' + Bari2 110 1 80.14 AGAAAACTGTCGCCTCAAGATTGCTTACAGGAGGCAAAAAGGTTGGCTTCATGCCAAAACTGCCTTCGAGGTGGTCTGGGCTGCTGCAACGCGTTGATTTCAACTGGAAAATGAGTGGGAAATCCAATAGTTTAGTTGCTGTGCC:1 + chr3L 9898223 3' + G3 108 1 51.03 GAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAG:1 + chrX 19690608 3' - gypsy 66 2 69.40 AAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAANTNTAAATATACAAATATACAAAAAAGACCACCAATGTTTGCCCTCATATATGTATGAATGTCCTGGCTCCTTTTCCTTTTCTTGTCCCCTCT:1 - chr3L 15285186 3' + Stalker 6887 4 58.90 TAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAGA:1 + chr3R 14401947 3' + Juan 4141 1 65.75 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCG:1 + chr3L 18968723 3' + hopper2 1548 1 58.90 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACATACATATATAGATCATATATAATTACCGCGATATAATTTCGCCTCTCTGTACGCGGAAATGAAGTCTCAATA:1 + chr3L 8158121 3' + flea 4971 2 57.53 AAAACACTAGAGCCGAGCGCTGGTAAGTCTTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACGAG:1 + chr3L 9522148 3' - opus 7157 4 50.00 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGGAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTATAGCTAAAAAATTTAAAAGAAACGTCGTCAATG:2 - chr3L 20868005 3' - hobo 47 1 52.74 AAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGGAATCTCAGTTTCGCGATTTCAATCTTAAAGGGTTATT:1 + chr3R 30223644 3' + roo 8812 2 73.97 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTG:1 + chr2R 22971862 3' - jockey 4828 1 66.21 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTTATGGTCGACACTTGACAGAGTA:2 - chr3L 13888852 3' - 412 7070 2 73.97 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAACAATAATTTATGGTCGAAAGTGATTAGAACACTTAATGGAGGTCCCCAAAAATAGTAATT:1 - chr2L 13850581 3' - roo 15 2 73.97 TAAAGAGGTCACTTTGATAAATTTGTCACTTACTTCCCTGGAGTTAACCAGCAGGTTCTTTCTCTGCAGAATATTGCGTGAGGTGGTCATAAAATTTGAGGGCCAACTGACTGACTTTATTGATTTCTGGTCCCCGGCTTCTTACC:1 + chr3L 7934825 3' - Ivk 497 1 62.33 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTACATTCCCGTTCCAGGTAGCTACATGAAATAATATGACTAAGATCCCTACCATAAACATACTTTAGGGGTTGTTTGCGTTTTACAAACATTATGAT:1 + chr2L 13244769 3' + jockey 4967 1 61.64 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGATTTATTTAAAAGAGAAATCCGAATTTATTTGTTATTTATTTTTCTCCGTTGATGAGTG:2 - chr3L 20168144 3' - roo 10 2 78.77 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTCAAAATACAATTGTGTATATACCCTACACCAAAGCATAGGATAATGCTGAAATGCTTGCCCAA:1 + chr3R 13676223 3' + P-element 2860 1 68.49 GAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTCATCTATTTTGTGGCGGCGTTTGGC:1 - chr3R 7512881 3' - jockey 4732 1 76.19 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTCCATACGCGGAATAATAATTTTCAAAGGATATGC:1 - chrX 7032689 3' - roo 84 2 76.71 AAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGCCCATCTGTTTCGCTTTCTGCTTCCCTTGCTGTTGCGGTGTTTAGTGGTGGTGACAGATTTCTTGTGGC:1 + chr3R 9010573 3' + flea 402 1 52.74 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGTTGACCGCTTGAGTTATTCAGTTGCTA:1 - chr3L 14232993 3' + copia 243 1 74.66 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTTATGGTCGACA:1 - chr3L 13888864 3' - 412 29 2 65.75 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTACTGCGCCATCTTTGGACAGGACCATCTACTACCGGAATACGCCACCCGATCCCTTCGGTCACTACAGCT:1 - chr3L 21292461 3' - 412 7071 2 73.29 ATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGAGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTACTCTAGTGATGGAACCCATATGGGCTCCGTATCCTTCAAGTTTGGGGGTGCCAGGGTAGG:1 + chr2L 14109980 3' - baggins 5316 1 65.07 TGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Cr1a 457 1 52.11 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACAGCAGAGATGCAATACTAATAGGCATGCTTCCTTTAAGTTATGTAACTATAGTGGCATGTACATATGTATATGTACATATATCTATATCTA:1 + chr3R 21859134 3' + pogo 2074 1 67.12 ATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGTGTTTATA:1 - chr2R 18035103 3' + R1A1-element 5277 1 58.22 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGATTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCA:1 + chrX 8208421 3' + roo 356 2 52.05 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTTTTAAGGATAAAGTGAATACTACAAATGCAAAAATA:1 - chr3R 29384594 3' - roo 8704 2 56.85 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGCACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGTAGTCGGATGAACACAATATTTGTTTAATTAGCTCGT:1 + chr2L 15549981 3' - hobo 33 1 60.96 AGTGATTTTATACGGAGCTCGAAGCCAAGTGGGTGTTGCGCGGTAATTATTACAAATACAATTATAATCTGGAGAATTTATACGCTTATCAGGGTTATTATTGCTCTCGGTTCTTTGCAGACGTCATTTTCATGGTACTCTTCTG:1 + chr3L 9452301 3' - Doc3-element 31 1 52.41 TTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGATAAAATTAATCTTGAGCATTATTCCCGGTGTGTTTGCGCCGTTTGCTTACATTAAAGTTTCCCCATTTT:1 - chr2L 17777924 3' - Juan 4101 1 52.05 TGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACA:1 - chr2L 7148551 3' - HMS-Beagle2 51 2 53.10 CTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAAGAGCAGGCAGCATATAGTACAAATACGTGCGGATATATATAAG:1 + chr2R 16134960 3' - Tirant 412 1 69.86 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATATAGACCAGTTTCCTCTTTAAATTGGTATTTCACCCATTTTTCCCTTT:1 - chr3L 10814503 3' + micropia 407 2 64.93 TGTATGCTTTTCGGATCCCTTCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGATGTATAATTTTAATTAACAAATATTGCAGCAAATTTCATCTACTAAATTATGG:1 + chr3L 22257846 3' - R1A1-element 5334 1 65.07 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATAC:1 - chr3R 6147232 3' + copia 5069 2 54.11 TCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGCAGAGGCGCGCTCCGACATATATATATTTCGTTTCAGTTTCGCCCATGGTCTTGAGACCGCATCAGCTGGTGGGTAT:1 - chr2L 6385795 3' - invader4 35 2 53.04 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGGG:1 - chr3L 2687213 3' - jockey 4759 1 76.03 GTAAAATAAAATAATTCAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACGGAAATGGTGTGTTTCCTTCGGAGGGGACGGCACTCCAATTTAATCGCATGTCACAG:1 - chr3R 13213035 3' + jockey 4928 1 60.27 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGCGCTAGTTAAAGAATAAAAAAATGTAAGATCAAATCTCTTATTAACAGATGCATCAAGTCACATATTAATATAAGTATGGCGCACAAAG:1 + chr2L 7447995 3' - jockey 4700 1 55.48 AAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATAGCTGCTTGTATTGTATAATA:1 + chr3L 23871303 3' - Doc 97 1 77.40 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGCGTCCAGAAACTGAGT:1 + chr3L 7102405 3' - I-element 61 1 55.48 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGAAAACCATACGGAAAATAATGATATCGAACCAAACTGAATTGAACTCAAGGGAACTCAAAAGGTGGTTAC:1 - chr2R 16643835 3' + P-element 2799 1 53.57 CGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCG:3 + chr3R 21679688 3' + roo 9019 2 52.74 AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACANGNATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGG:1 - chrX 17495704 3' - Burdock 22 2 57.94 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAACTCCTTCGATATAATCCAATGGAGGCCACTCCACA:1 + chr3L 12634272 3' - BS 5026 1 61.64 CTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCAT:1 + chrX 21772472 3' + Stalker4 213 4 72.87 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAG:1 - chr3R 9657749 3' - jockey 4745 1 65.07 ATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGACCAGCACCGAAGCCAAAAGCGCAAGTCTAAGATCTATTATCACAGCGCCGCAACAGATAGCCAGTGTTTTCACATTACAAGTGTTTACATCTACAAATATGTATAAG:1 - chr2L 5341445 3' + Burdock 6382 2 80.14 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCT:1 + chr3L 11529550 3' + opus 438 2 60.96 AAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATAAATACACTGAAAACAAGAAGGGTTTTGAATTCACCTAACAATCCC:1 + chr3L 13449260 3' + Quasimodo 7298 2 71.53 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATACACACATACATATATATATCTATATACATCTATATAAACGGAAGTGAAAATTAGCAAACCAGGAAAATGTTTTGCCCAAACTAATAGAGAGGCCAGATGGTTTC:1 - chrX 12263656 3' + roo 394 1 76.71 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGCCGCACCTGCATTTTGA:1 + chrX 13367490 3' - HMS-Beagle 44 2 52.14 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTACATATGTAGTATTAGTGAAAAATACAAAATAGTTAGTTAGTTACTTATCTAACGAATGCATTTGTCAAAC:1 + chrX 22511513 3' + roo 397 1 76.03 GTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGTGCCAAATTGAGCGATGATCAGCTCGACGTCAGCCTCCGTCCACCTGAGATTAGGAGGGCAGTACACCGAGGCAATGTTAAAAGTATCAAATGAAATATTAATGCAGGTCACTCAAC:1 - chr2R 21934323 3' - G5A 408 2 78.77 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCCTACCCTTTTGCCCTATGCTCTGCTATTTGTAAAATAATAACATAAAATATGGCTGG:2 + chr3R 10433332 3' - 412 30 2 65.07 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAGCCTTGCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCTCAGCTGTCCGTGGAACCGG:1 - chr3L 4287040 3' - P-element 99 1 16.44 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTGTAGGCAATCACCTATATGATTTTCTAAA:1 + chr2L 8553445 3' + pogo 2079 1 67.14 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCAATGTATGTTTATTTTTAATGAATTCTTGGGG:1 + chr3L 27091719 3' + 1360 3350 1 56.85 TTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTACAACAACAACAGCAATA:1 - chr3R 17939878 3' - P-element 146 1 15.75 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCAGTATTAAGGAGTAGTCAACCGCTATAGTTCAGTCCCAAACTACACATCCACAGCTCAG:1 + chr2R 25083385 3' - pogo 59 1 58.22 GTGTGTGTGTGTTTATGCCCACGTGTTCTAGTGTTTGTGTTTGTATTTGTGTGCATTTTGTTGATAGTTGGGATTATTTTGGGGCACTTGGGCCACTTGGGCCACTTGTTTGCCTGCTAATTCCAAAAGTCTCGGTCAAAAGGTTT:1 + chr3L 20565161 3' - G3 40 1 58.90 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTTTTCACTGCATTCTTTTCGACACCCTTTAATTGCATTTAAGCATGCACATGC:1 - chr3R 28413870 3' + pogo 2035 1 61.64 AGAGATACGGTAGATTAAAAAAAAAACGCTAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTTCCGCCGATCCCAAGGCGCAAGCGCAAGGAG:1 + chr2R 8371659 3' - Circe 85 1 74.38 GGAGGCAACGATCTTTTGGACNCAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAACGTGATGCTTTCCAAAATTGTTTTGTGGTGAGAGGGATTGTTTGTTGTTATACAAAAATTCTTCAAATGG:1 + chr3R 5518419 3' + Transpac 5184 2 54.55 AGCCGTACGATACATGACAGCGCCCCTCCGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGCGGTACCCGTGCGGAAAAAGAAAAATAATAATAATAGTATTCGAATTATAAATTGTCTTTTATATCATTTTTTTATATAAATTTTATAATAC:1 - chrY 356543 3' + Cr1a 4396 1 47.95 GCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGCTTAGAAATAGTAATAAGCCTAAGACGTTCAGTATGCCAAATGCATAATTGACGTTTATAATCTCTTTTTATGCAGTTAGTAATGAAATATAAAATATGGAAATTATTTATG:1 - chrX 434687 3' + 1360 302 1 67.12 AAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCTTCTAGTGTCTTTTATCTGAGGAACAGGTATGAAATATTTTTTTGGGAGCTCATTAGCCAAATGTGTT:1 + chrX 10580239 3' + 1360 3318 1 77.40 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCCAATTATACTGTATATATATATGTATACGATTTAAAAGAATGTGAAAACAAATCGTACGCCTACGAAACTAATAATTGGGGCGAGAGATGGATGTGG:1 + chrX 16589282 3' - pogo 18 1 67.20 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCC:1 + chr3L 18968707 3' + hopper2 1532 1 69.86 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAGCTCACTTGCTTAGTGAATTAATCCAAAG:1 + chr3R 19446278 3' + 297 6953 2 70.55 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAACAAATACTCTTTTTCTAT:1 - chrX 12105223 3' + 412 453 2 50.00 GATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAAATCCGCTCTTTTCAGTTCCG:1 - chr3R 16881862 3' - 3S18 27 2 67.81 TAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATATCATAGTAATTATTATTTATTTGACTATTCTAATGAATCATATGAGTATTGAATGATGTTCCATCTCAATTACGAGTAATCAATGTAA:1 + chr2L 7082059 3' - jockey 4889 1 63.01 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGCCGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTACAATCTTTTCGACGAATTTTGTATACGCTTTTTACCATTTAACTGAAATAGGTTAATT:1 - chr3L 21157012 3' + 412 435 2 58.22 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAACAAATACTCTT:1 - chrX 12105230 3' + 412 7497 2 55.48 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGA:1 + chr3R 10751722 3' + hopper 1353 1 55.48 GTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGCGCGTATTCAAAACTCCTAGTTGTAAAAGAAATTCAAAATAAAAACATAAACATCGAGAATAAAGTAATGGAATTAACAACAAT:1 + chr2L 21608057 3' - F-element 4459 1 63.70 GCATTCACGCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGC:1 + chr2R 20361470 3' + INE-1 534 1 89.13 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGGTCGCGCACTTTATTTTCAAAAACGTTACGCCCGTCGTGCTCTTTTATCCTCTTAAAGCCACTTGTTGTGAGCGTCGTTTTAAAGCATACAATCTGCAATGAGAACATTTTTCTCT:1 - chr2L 21753826 3' - hopper 4 2 80.82 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCTAAAGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCG:1 - chr3R 9657681 3' - jockey 4677 1 75.34 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATT:3 + chr2R 13695696 3' - blood 90 2 78.77 ATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACAAGTTGACATTGGCCTTTTACAGCACGCGGTCGTC:1 - chrX 6143231 3' + micropia 336 2 76.22 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTTTTGGGCATATTTCCCAAGTCAAAGTTGAGCCAAAACCAAAGAA:1 - chrX 4240178 3' - jockey 4693 1 65.07 AAATGATCAATATTTTTTAAAAAGTGCGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCGCGCTCATGGGACAGTATGG:1 + chrX 21084026 3' + HB 256 1 47.26 GCAATATGTCCACGATCGCAACGAAAATTTGTCCGTCGTTAATCCATTCAGGCGCGTAGATGGAGACATTGTATTCATTTCGAATCGCTT:1 + chr3L 5966520 3' - R1A1-element 14 1 56.67 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATTGCTGCAGATTCAGTT:1 + chr3L 8273990 3' + hobo 2885 1 65.55 AATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTTCAAAATATTTGTGTTGATTATATTAAAGAATATATACTTTACCATTTATTAATTAGTCCACATAGTGAAAAGAATTTGTTTCTTA:1 + chr2R 7009551 3' + Quasimodo 7340 2 66.44 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTAATACACTGAGCTATTACTTATTACTGATTACAAACCATTCATACCCGGCATGGCAAACGGCATCGGAAACGGAGGAGGATTATTTCCTCCCCAATGGGGCTCCTTCTTCTCATGC:1 + chr2R 5037801 3' + Stalker2 7610 2 55.48 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGGTTCCATGTCGAAACTGTAACAGTTTCCC:1 - chr2R 17609729 3' + mdg3 214 2 61.15 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAAAATTATTAATGACTGGGCAGCCAACTGCTGCAAATG:1 - chr2L 4631087 3' - roo 8667 2 74.45 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCTGTAGGC:1 - chr3L 13888888 3' - 412 7071 2 63.06 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTATAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTGCACTACAATTACATGTGATTTAGCCCATATACATTAAGCTTTATTTGTTCATT:1 + chr3R 12342193 3' + hobo 2872 1 62.33 TAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTCGTGATGGCCCTCCTCCTTTGACCTGG:1 - chr3R 13898190 3' - 3S18 5800 2 57.97 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTAATTTCGTATAGGACAATCTGCCACTGTCG:1 + chrX 15540100 3' + roo 402 1 76.74 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTGATATCCCTTTTCATGCCCATAAAATCCATAGCAGTTTAGTCTGTATTTGTTTTGGCTGAGTGATATTATTATTATATATTTGTTGATACT:1 + chr2R 23278498 3' + mdg3 5469 2 63.70 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGAATGTGGTTTCACTGCATTCTTTTCGACACCCTT:1 - 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opus 7174 4 65.07 AAACTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTGTTTTATGTGAGCGGAGATGTCACCAAAAAGTGGCTGCATATCGCAAAATGATTTCGCAAAGCTTTAGTATGACNTATGCGATAGATTTTCGTGATTGATTTATTCTACAATATCTG:1 + chr3R 5421829 3' + 1360 3272 1 55.48 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAGCACAAATTATGGCCGAGGTGTGGCTACTGAATG:1 + chr3L 8754867 3' + mdg3 5497 2 77.67 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAGGTTG:2 - chr2R 23790250 3' + roo 342 2 63.70 AAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTT:2 + chr3L 19350001 3' - 1360 3269 1 65.07 CAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGCACTCAACGCTTGCGGAAGGTGTTGTGCCCCACCAGTGTAGTGGTCCTCAAACGCAGCCGCGGCC:1 - chr3R 1922110 3' - diver2 139 2 78.89 ACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGATTATTTTAAAATCAACCTGGTGACAGTCATGAACATCACGGACGTTGACGACAAGATCATTAAGCGGGCCCAGCTCGCTGGACTGGA:1 - chr2R 14160711 3' + I-element 5 1 60.27 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGGCAACCCATTCAGGGAAGGTAATTTCTATCTGGGAGACTCTACAGGC:1 - chr2R 5037660 3' - Stalker2 41 2 56.16 TCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCTTTATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTGAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAA:1 + chr2L 23034038 3' + FB 342 1 63.70 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAG:1 - chr3R 4530693 3' + copia 184 2 64.38 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATACATATATATATAGATGCAGGGATTTCGTTTCATTTCGGCTTTACGACCCTGAACCATTTGGAGCACTTACAACTCGCTATGGATA:1 - chrX 20456838 3' - opus 34 4 60.27 AAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAATCCAATCCAAATACGAATTTCAAATCGTTAGGAGCACTTCAAATCCGATTCGTATCTCCTACCAATGGAAAAGGGCTGAGGAAGCG:1 - chr3R 20600040 3' + Doc 162 1 58.90 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAG:1 + chr3L 21913447 3' - 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I-element 64 1 59.59 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAATACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAGAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCAATTATAGAAAACAT:1 - chr2L 3133654 3' - Doc 24 1 60.96 AAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATGTATATTTTACCCGTGTGCGTGTCCATTGCG:1 - chr3R 23877867 3' - Transpac 4992 2 78.52 CCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTCCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGC:1 - chr3L 20934146 3' - Max-element 55 2 55.65 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCTCCACCCACACTCTGCAATG:1 - chr3R 13684690 3' + 412 420 2 71.23 ATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCATAAGGTGAAAAGCGCTGGGACATTGTTGTTT:1 - chr2L 17874502 3' + Idefix 453 2 78.77 AACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGATGGACAGGCGGACATTTCCAGGTCGACTCGGATCTTTTGTTTTACATTCAACATTTCCATTTCCATTACCAATGGCGCCTCTGTTTATGTTAAACTCAGC:1 - chr2L 1447126 3' - INE-1 158 1 54.79 CGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATTCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCTCTTGATCGAGTTCATTGTTAT:1 - chr3L 22038160 3' - diver 6 2 79.14 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATATAATGTGTTCTCTATAATAATTTGTTCTTATGGTTATTCAGTTGGAGTTCTCGCTT:1 - chr3R 17879415 3' - opus 7173 4 61.64 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGGGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCGGGTTT:1 - chr3L 13546531 3' + hobo 2920 1 63.49 GAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAAGCGTTTTTCAATAAAGCTTTATTATTGTGATTTGTATCAT:1 + chr2R 5395017 3' - HMS-Beagle 78 2 72.60 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTT:1 + chr2R 21229067 3' - jockey 4750 1 70.83 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGGTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTAT:1 + chr3R 15137349 3' + roo 8995 2 69.18 GAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGATGTTTGACTGGTAGAGTTGATCGGAGCTTCCTGCGCTGCCGCACCAAATTACAAAGTGAATAAACGAAATTAATGAGATAACAAGTGCTCTTCTGAATGAGCAGACTGAAGAGTATACTT:1 + chr3L 23446474 3' + invader4 226 2 71.23 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAATATTGGTGGGCTTACGAAGGGAGTATATAAATTTTCCAGTTTAAATTGGGAAAATAA:1 + chr3R 18319742 3' - jockey 71 1 61.64 ATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGAC:1 + chr2R 16731348 3' + Tirant 339 2 67.94 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAAAGCTTATGATTGTTGTTAGAAACTGTTAGAATCTGTTGTTCGAGCGCTGAAAAGTATGCTACAAAAATGGTAACGAATTTCCTA:1 - chr2L 5515372 3' - BS 5030 1 50.00 AAAAAGAAAAAAAAAACAAGTGCCAAGGGGCAAGGAGGGAGGGGCAAGGCAGAGGGCTATTGCGTCTCTGTCGCTCGTCCACTATTTCGCACTCTGTCTAGCTTGGGGGCGTTGCAGTGCAAAACTATAGTTGAAGGTGATTTCAT:1 + chrX 12725311 3' + Porto1 166 1 57.53 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAAACAATGGTTTTAGAATATTTATTGTTAAATTATGTA:1 + chr3R 24662067 3' + jockey 4972 1 69.86 CACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATTGATACGCGACTATAAAAATCAAAAGAAATTCAAGTTCTTTTTCGAGAAACGAGAGTGAAGGGAAACCGGCATTA:1 - chr2L 16884590 3' - Bari1 46 1 53.42 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAACGTATTTCTGAGCTTCATTACC:1 - chr4 490213 3' - pogo 49 1 53.42 GCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAACGATTTTTGTCTCGACTTTTCAGCCGAAGGCT:1 + chr3R 24526586 3' - Transpac 5197 2 78.08 CTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAATTAAGAGGCTGTAAAAGTCACGCTGTGAGTGAAA:1 - chr2L 8652716 3' - roo 472 1 76.71 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGAAGAAAACTGTTTCAATCCAT:1 - chr2L 21777749 3' + pogo 2063 1 64.38 TACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAGGTAAACAACCCCATTAACTTTACGGACATCGCACATTAGGAATACGTCGGTGTCGCA:1 + chr2R 4009140 3' + Juan 4158 1 57.53 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCA:1 + chrX 7042731 3' + roo 9016 2 55.48 AAGTGCGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCGCGCTCATGGGACAGTATGGAGTGTCCTAGACGTAGTCTTA:1 + chrX 21084047 3' + HB 277 1 60.27 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGTTTGTTCCCTAAGTTGGTGG:2 - chr3R 12115217 3' - 1360 14 1 72.60 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATTGCCTGAATGGCCAAAGGAGGGAGGGGTGGCGTTTTCGAGGGGGGGTTGAATGGAAGGGGGCTGGCACATG:1 + chrX 17726380 3' + pogo 2056 1 54.79 CTAAGTAACGGGTATCTGTTAGTCGAGGTACTCTTCTGCGCCGTGATCTGTTCTTATATCTAGAGATGTATTGTATTAAAAGCACCACATTATTGCATAGTGTAAATAAATAGTTAGTACATGGTGTAAATGAAAGTAGTGCCAGC:1 - chr2L 14381322 3' + INE-1 547 1 63.01 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTCTAT:1 - chr2L 16607200 3' + 412 7485 2 57.53 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTTCTTCGGTCGCTTTC:1 - chr2R 23595981 3' - blood 68 2 63.70 CGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCA:1 - chr3R 8381734 3' - Tirant 8196 2 76.71 ACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATGCCAAGTGTGAGAAGGGAATGTGAAGGACAACAAATG:1 - chrX 21567872 3' + Quasimodo 448 2 74.66 ACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATACAGCTGCTCACTCACTCACTACACACGCCCTCTCTTTCTTCGCCTATCGGTGTATCCTTTGGACCTCCAGCCGCTC:1 - chr3L 3826939 3' + flea 4787 2 56.72 CGGGAGATATAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTAGCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTGGAAACAAGAATCGACGATAGTCGCATAAGTG:2 - chr2L 8776775 3' - G4 3695 1 76.71 TTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGGTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCACTGACGTCAATCGATTGATTTTCGAGTGTGTTTTCCGTTTCGCTCC:1 + chr2R 10375597 3' - Doc 4479 1 66.44 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAGGCAACAAAACTATTATTGTTCTCGATATCTG:2 + chr3L 22435260 3' + opus 490 2 78.77 AGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAAATAAGAGACCCACCGCATACACTCTCAAATTGGTCAATTATGTGGGGTC:1 + chr2L 15428627 3' + invader2 52 2 67.12 AATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAATTTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTNTGCCCACCTCTTAAAAAAAAAATTTGTACATATGTATGTAATAA:1 - chr3R 25883830 3' + FB 801 3 79.45 GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATT:1 + chr3R 17766832 3' - HMS-Beagle2 50 2 52.74 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCT:1 + chr3R 14277953 3' + P-element 2838 1 35.78 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGAACGCAGTTAGCTGCTCGT:1 + chr3R 17944125 3' - P-element 48 1 52.74 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTANAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGA:1 - chr3L 5398065 3' + roo 8995 2 69.18 GCGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCATTTTGTTTTGATTTTAAATTTGCGCCTTCTTCATTTAAG:1 + chr2R 13132516 3' - McClintock 242 2 71.92 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAG:1 + chr2L 13328527 3' - BS 34 1 58.22 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATATTCTACATATTTCAGTGTGAATTTTCCAAGCCAGCGATAATGGCTTCCTAAAACCAATAGCCATAAATGAAAACTGTTAA:1 - chrX 3453085 3' - roo 8703 2 52.74 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAG:1 + chr3R 23579372 3' - roo 77 2 70.55 GACCGATAGTGCTGTTGCTGAACGTGGTTAAAGTGCGAAAGAGATACGAGAAAAGGAAATGAACCATGTTAGAGGCGAGAGCGTCAGTTGTTGGTTAGAAGCCAAAGCAGAAAGAAGATGACGAAACGGTATGCCATCAAAAGTGC:1 - chr3R 15763346 3' + micropia 5188 1 78.08 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACAAATTGTC:2 - chrX 10147879 3' + pogo 2039 1 63.70 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCAGTCTCGGGAAAATTCATTCTGGGAGTTGTGCTAAATTGTCTAACGAAAATTCCATTAAAATGCGT:1 - chr3L 16920170 3' + roo 354 2 55.48 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTTGAGGTTTCTAATTGACAAGATCTATGGATCAAAGT:1 + chrX 12263780 3' - roo 8748 2 76.03 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTATACCAACGAAACTCTTGTTGG:1 + chr3R 9551043 3' + P-element 2876 1 78.08 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATGTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAGAATGCAACTTCCTGCTATTTTGTGTGGAACGTAAGCATCTTCTGCCAAAACAAATG:1 - chrX 20024483 3' - 412 7083 2 60.96 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTTGCCTTTTCTAGTCCTGAAATTTTCAACGAGCAAACTATTGACAATGAACTAATTGCTATTGTTGCCGTCTGGGGACATATTTCGACTGCAAATAAAC:1 + chr3R 12941911 3' + hobo 2917 1 70.55 CTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACATATACACGATGTGTTTTTGATATAAATGAACTTGCTTATA:1 + chrX 19163346 3' + Burdock 179 2 74.66 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTATAA:1 - chr3R 15102216 3' + roo 9032 1 56.85 ATAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGCCAAAAACTTTACCGTCAATCGTTCTTGTTGTTC:1 + chr2R 18723786 3' + 297 6942 2 63.70 TCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGAGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCTATGACTA:1 + chr3L 21202120 3' - G2 2622 1 58.22 CTCACACAAGCAAGCTAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAACGGGAGCGAGCGGCTAGAGAGAGCATGTGCGCAAATGTGTGTGTGTGGGTGTGGGCTCTTGCTATAAATCATT:1 + chr3R 13133459 3' + 1360 3257 1 58.33 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATGGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAAC:1 - chrX 19887088 3' + P-element 2790 1 19.18 GTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATCCAGCGAAATACGTGGCTCCAGTGTCCTGTGCAACCGTCTGTCCGTCG:1 - chr2R 16248253 3' + G3 4386 1 58.22 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTACACGTCAAGAAATGCATAATGTATTTAGCTTCAGGAATA:1 + chr2R 19016102 3' - roo 8688 2 68.49 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTGTAGACAACTTCCAATTTCCCCACCAACACACTCGCAAAT:1 + chrX 6283743 3' + P-element 2836 1 47.95 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATAGCTCTCTACAAATCAAACTT:1 - chr3R 22260437 3' - jockey 4732 1 54.11 ATGCATGAGCATACGTGTGCAGACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATGCCGTATGACGCCATTGCAGTTTAATGAATCCTTAAAGCGCTTTA:1 + chr3R 12622383 3' - 1360 182 1 54.79 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCTGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAACAATCCCACCTAACCCTAAAATGTTTAGTTTATGGTCAGTTCTGGAAG:1 - chr3R 11903457 3' - FB 72 1 69.86 CATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTT:1 + chrX 21667943 3' - gypsy2 63 2 69.86 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCGTTTTATAAATTTCAATTT:1 + chr3L 18968741 3' + hopper 1394 1 64.80 AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTATAGATGACTGGCAACTGCATTGAAAATAAGCAA:1 - chrX 17477617 3' - Quasimodo 79 2 76.03 TTTATAAAGTTTTAATTTATTATAAAATTTAAAAATCAATCAAATCAAATCACGATTAAACCAGACTTTCGCTCGCAAATGGGAACAGTTTTCCCCTAGCCACAGCTACCTTGCTCTACCCTCTAATTACAGCTATTAGAGCTGAA:1 - chr2L 19629395 3' - HeT-A 458 1 74.66 TTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAAAAAACAACAAATTCCAAGTTTAAACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACATTAATTATGTTAATCATATTATGTTAATATCATAAGAA:1 + chr2R 9024737 3' - S-element 1589 2 73.61 AGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAATAACCAGTTACCAGTTAGCCAAGTTGGCC:1 - chr3L 15217232 3' - roo 186 2 78.83 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCACCCAAAGGCCAACAAATGCCATTAAAAATTGCC:1 + chr3R 13530003 3' - jockey 56 1 53.15 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCAT:1 + chr2R 12379600 3' - pogo 65 1 65.75 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCT:1 - chr3R 12115255 3' - 1360 46 1 52.86 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAG:1 + chr3R 15047419 3' - F-element 52 1 51.13 CGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTAATAACTTATATATATGCTTTGCTCAATAAAAACCCAATTGACAAATTGTCATGGCGATCACGTAGCA:1 + chr2R 21530048 3' + HMS-Beagle 6978 2 62.33 TTTTTTATTTTGTTTAGTTTATTAAATACTTTACTTTACATCGTTTGTATCAGCTTATAATCCAGGGGGAACTATCCGTCGCTTCTGTAGCCAGCTAATGTTTAAAAATTAAAACTGCGGCTGGCGCTATGCGAAAACGGCGAGG:1 + chr3R 6032395 3' - F-element 91 1 64.14 TTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAACTTAGTCACTAGGCATGTACAATAGTACACATTATAAACTAA:1 + chr2R 18044026 3' - jockey 4639 1 71.23 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCGACAGTATG:1 + chr3R 16349287 3' + P-element 2804 1 27.40 CGTTTTGGCTGTGCAAAAAAGAATTGACTTTTTGCATAAACACAAACAGCAGCGAAGGAGGATTCTTTAAAGCTCATCTTTACTTTCCTAAAGAATATCCGTTGCGTCCTCCTCGAATGAAGTTTGTT:1 + chr3L 24035486 3' + G3 12 1 62.50 TACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATTAACATTTCCATACGCTTCATTTTTAATGAACTGACAAATCTGTGCGGCTTCCCCGACCTCTCGTCAGGCCATAAATAAATCCGCGCACAAACGCAAA:1 + chr3R 13323980 3' + F-element 4655 1 67.12 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACCAACCTTCCACATTCCGAGTAACTCTTCTTATATATTTTTCTTGGGGTTTGCCTTCTCTTTACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGACACTATTTTATTCT:1 + chr2R 6086016 3' - FB 21 1 71.23 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTCAGTTGGTTAATATCAAATAC:1 + chr3L 21292605 3' + 412 434 2 56.94 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAATTATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGG:1 + chr3L 9522139 3' - opus 163 4 56.16 CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAGTAGTTTTCTT:1 - chr3R 19246631 3' - jockey 4675 1 76.71 TTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATACAAAACTGGGCAACTACAAAGGCAAACTTGCGAGTGCAAAACCCCCATCGCCCCCCAA:1 + chrX 17723645 3' + Burdock 186 2 55.64 ATTAAGTTAAGTTCAGAAGGAATAAAAATGAATAAAAATAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACAGGAGGCGACCAACGATTTGTTGGTTTTCAGTAGACACCCGCTACTGAGTATGATGGCCT:1 - chrX 6952020 3' + G5A 2792 1 40.41 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCCAAGC:2 + chr3R 20345576 3' - blood 7037 2 66.44 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGC:1 + chr3R 19725415 3' - hobo 6 1 52.73 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTGTGCAATTGGTGAGCAACAGGATGAAGGAGCCAGTAGCTCATAAC:1 - chr3R 5977684 3' - copia 4885 2 73.29 GCCCTTAATCAACAATCATGACAGACCCACAAAAACACTGCAAAACAAAAAACAAAATGCCAAAACCAAAAATAAACGACATTAACTGGCTCTAAGCGCCATCAATTTGTTACACCAAGGAAAAAGTGGTAAGAA:1 - chr3L 17940178 3' + I-element 170 1 77.78 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCGTAAAAGTTCAGTTGAGTTCAAATCCAACAAGCTGGAAACTATCAAGCTACGGTACAAGTGCACTGCCACCTGTCCAACAATTAATTGGCAGGCTTTTTG:1 + chr2L 17470469 3' + 412 7531 2 72.14 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGACGCAATTGAAAGTAAATTAAGTAATAAATTTGGTGATGTTCCTGTCACGCTTAAATACTCAGTTCGGGGACCGATTTCAAAGTGCACCTCGCAAAT:1 - chr3R 2766641 3' - Doc 31 1 69.18 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATACAAGCAATTGTAAAATCAGTTTCTATGCCATACATTTTGTTGTGTCTATAGTGGGACTGCTGAATTTCTATGATAATAAGACAAAAATTTTACTCACTA:1 + chrX 18786257 3' + pogo 2082 1 71.23 AAAAAAAAAATAATGTGAAAAAATGAGAAAATTTATAATAAAGAAACAAACGGCCAACGAACGTTAAAAAATCTTGGCCACAATATCCGAATCGGATTTGGAGTAGGCGATCTGCATGGGCTTGGCGTAGAACGGGAAGCCCTGCA:1 - chrX 5309559 3' + Tc3 137 2 50.68 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACAGTTAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGAAACAAAGCTGAAATGCATTGC:1 - chr3R 18343427 3' + jockey 4949 1 48.63 AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTACATATGGCTGAAATTCTGAGGAGAATCCTTCCCGGCTTC:1 - chr3R 14688497 3' - FB 82 1 73.29 GGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAACC:1 + chr3R 29283264 3' - hopper 79 1 70.34 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTGAAACCGATTTACT:1 + chr2R 12379632 3' - pogo 33 1 60.96 ATAATAATAATAATAATAATTAGGCTCAATATTATGGTTTCCAAATGAATCTTAAAAAGATATAAATATGTAACTAATATCTATTTCTATATCTATTAAGATGAACTAGTTTCAAGGCATCTAAGCTAACCAAAGTTTTTGAGAAC:1 - chrX 14157575 3' + mdg1 7082 2 41.78 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCTCGACAAACAATCTTATTACATTTCTTTGTGTATAAT:1 - 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F-element 71 1 64.38 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGTACTATGCGAAAA:1 + chr3L 13546677 3' - hobo 35 1 61.64 AGCAGCTCCTCGGAGTCAGAGCCTGGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCTTAGGAAGCCGCCGACAACGTGCCCAACACCAGCGCAGCTTTACTTTACATATTGTACACATGCCACGTCCCGTGGCACGCCTTTAT:1 - chr3R 11399478 3' + G-element 427 1 66.44 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATCTTTATAATCGAGCACCTAACGGCAG:1 - chr2L 18737980 3' - roo 89 2 80.82 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTTGACGAGTAACGGCTATAAAAGAATGACATTAACTCTTTGAAAATACAATGAATACTTTTAGTTTAAACAACAG:1 - chrX 21183805 3' + S-element 1702 1 69.30 GCATATATTGGTTTATTACAATACGACGTTACTATTTACATATTTCTATTTTAGGAAGAAATAAATTATTTAGATTCTCTAGATTCGTACATAGGATTATGATTATCTACACGGAATGGTTAATTGTTTCTTGTTAAAAATTGAGA:1 + chr3L 13992398 3' + blood 379 1 69.18 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGACTAATGGTATTCAAACGAAATGTTCAGCAAATTGTTGCTCAGTTGTCTGTCGTTTTTT:2 - chrX 19583227 3' - roo 63 2 65.07 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATTAAACAGATACAAAAGTAAAATTATCTGGTATCTGGCCCAGTGTGCACTGGCAC:1 - chr4 906104 3' + opus 7477 2 57.55 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGGAACAATCCCGGTACGAATG:1 - chr2L 13675844 3' + flea 230 2 73.97 CAGATCGACTCGGCTATTGATCTTGATCCAGACAATATTCTAGACTTGATTCTAGTATACCCTTTTAATCACGAGTAACGGATATAACAACCAAAACCTTTNTAATATATTATATATAGTCAGAAATTGTGTGTGCTTTTTTTTCT:1 + chr3R 20786633 3' - INE-1 98 1 85.62 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGAAAATTTGTATGTCAAATGCTTAATCAGCCGCACAC:1 - chr2L 12987424 3' + jockey 4907 1 77.40 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTATAAGAAGTTACCAAA:1 - chr2L 9599765 3' - roo 8696 2 64.38 CCTTGGTCGCTATTAATCCAGCCCTTTCAGGCCCGCCGGCTAACAAAAGTTAGCTGTAACATAAAAGCGAGCCACACTAGGCAGCACTAAAAATTATAGTAAATTTGGACCACAAAGCATTTCTAGTTGCTGCTGAAAAAATGCTG:1 + chrX 12846976 3' - BS3 1713 1 54.11 AATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATCACCGATCGGAGCAGATGTTTTCTGACTAAAGTCAGACCGATTATCCG:1 + chrX 17477701 3' + Quasimodo 7306 2 66.21 GGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATA:1 - chr2R 18358423 3' - jockey 4720 1 49.32 TTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGGTTTGAATGCGCCGGAAATACGCTTCACGTTTTACTGAATTTGAAAATTTGAAAATTATTCATGAGCATGTGGAAATTAAATTCAAGTCCGCACAAAGAGATTTA:1 + chr2L 20621242 3' - HMS-Beagle2 6793 1 67.81 TCTAACAAAAATTTGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAACCCACTGTGTGATCTCTCTCTCTACACCGAGTATAAATGTTGTGGA:1 + chrX 20466760 3' - 1360 87 1 68.49 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAATGCATGAGAATTTTAAATGCAATCCATTT:1 - chr3L 5398013 3' + roo 9047 1 65.07 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGAT:1 + chr3R 20260906 3' + roo 351 2 57.53 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTCGTCAAAGTTGTTGTTACTTGGGCTGTTTTAGTCGCTTTTGTTGTTGCTGGTG:1 + chr2R 23790340 3' - roo 8720 2 65.19 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAG:1 - chr3R 9550929 3' - P-element 92 1 20.98 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGATGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCC:1 + chr3R 13453391 3' - 412 74 2 69.86 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAAT:1 - chr3L 15389540 3' - I-element 71 1 62.33 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCNTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTNATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGC:1 + chr3R 17944076 3' - P-element 97 1 19.18 ATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGG:1 - chr3R 8065212 3' - 297 6612 2 57.14 ATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACACGTAATTTAAGTACAGGGGCCTTAGTCTTATTAACTACTTAAATGCGGTGACTTTGACTGCAAATAAGGGGCTAAACAATAAACAACATTTTATTGA:1 + chr4 637814 3' + roo 91 2 56.16 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAATCGTATAATTCAATTCTAAACACGCTGTGTACATTAAGAACGTGGCATATCTTTTTTGCAAATCGAATAGATGTGGAAAGTGAACG:1 + chr2L 21777908 3' - pogo 29 1 65.07 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTATACAAAACCAACTTACCAAGGAAAACATACCAAAAATATTCTTCTTGCAGTCCACACCTAATGCCAATGCACTGTTCCAATTTAGCGCGACCTCCACAGCGCC:1 + chrX 16607964 3' - P-element 17 1 72.60 CGGATATGGATCCTGATCAAGAGGTTGTAAACTTGTAAACGCTTCTTACCTGTTACATACATTTTAAGAAATTTAGTCAGCCGTTTTACTCTATGAGTAACGAGCATAAAAGATAAAGATAGATATTATGCACAGGAATGTTAAAA:1 - chr2L 22196888 3' - INE-1 88 1 30.14 AATTTTTAATTTTTTTGATAATTTATTTAATATAACATTAAACGTGTTTTTTTTGACAATTACTTGGCTATAATACACCTTTTTAATCTAATCTAATCCATATATATGTGTAGTAGACTATGGAGTGAAACAAGCTGTACCGTTA:1 - chr3L 4379053 3' - S-element 1454 1 84.83 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGAAAGTGTTGACTA:1 - chrX 16219203 3' - roo 8736 2 68.49 GGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATG:2 + chr3R 6147310 3' - copia 4958 2 76.03 CAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATAAGGATAATTGCTTTCAACAATTATCTATAAATAATTTGAAACATTTTTTAGAATTGGCGACCAGCCATGCAAATGATTTGCTCCCCTTTTTCTGACTGAT:1 - chr3R 8866957 3' + Max-element 279 2 71.23 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAAACTAGA:1 + chrX 15406075 3' + opus 7481 2 60.16 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAATCACAGTGGGCAAAAATATATGGTTTATACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAA:1 - chr2R 15155212 3' + flea 5001 2 60.27 AGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATCTGAGAAATTAATATTGTTATTCAAATAAAAATTATGTATATTTTTCATATTCCTTGGACGAAATATATTATACCCCTCGAGGCG:1 + chr3R 15585666 3' - I-element 5325 1 60.27 GTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATT:1 - chr2R 17609761 3' + mdg3 5428 2 64.58 CCGATCGTTGACTGGGCGTCCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAATACACCTTGACTACATCGCGCCGGCGGATTTGGTTTTGATCTG:1 - chr2R 19440331 3' + hobo 2750 1 61.86 TGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTACGTTGATTTTATTTCGGCAACTACCATATTTTTTATGCCCGCACAAGGATTGTCTGGTT:1 + chr3R 13898308 3' + 3S18 279 2 58.22 AATCGTATGGCGTTACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTC:1 - chr3L 24152588 3' - 1360 20 1 75.69 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTTGCTTTGCAT:1 - chr3R 24093486 3' - jockey 57 1 50.68 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCATTTATATTGTGTAATCACTTAATGTCTTAAGTAACT:1 - chr3L 22041034 3' - roo 30 2 65.07 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGGCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTAATCTGATAAAATTA:1 - chr2R 12379475 3' + pogo 2065 1 56.85 CTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCTAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAAAAGATGAAGTTTTTGTTTTGCAGCTGGATGATCCATTTGGCCCCTGGGTTGCTGCGAAT:1 - chr3R 26286309 3' + accord 27 2 57.53 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGGAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCTAGTGCCTTTGGCTCACTTAGGAA:1 + chr2R 16073059 3' + opus 479 2 72.60 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTTCAAAACCAGATTTCCGTTTTCAATTTGCAAATCAAATTGCCAGTTGGCCAAGGGGCGGAAAATTTCACCTTTCAACTTTGACGACAAGTTTTTCGAACACCCCGTTTTT:1 + chr3R 17996850 3' + copia 245 1 78.77 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTTTTTCCCAGTGCTGTTCAGTTCAGCATTTTCGCCGCGTCTCTGTCCATTGCTCTCTGGCTAAGAGAGTGTTT:1 - chr3R 24304699 3' + pogo 2055 1 50.68 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGG:1 - chr3R 8065224 3' - 297 53 2 68.22 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATAAAGATGATAATATGAGTGACGAGGGAGCGATAACAATGCGCCAC:1 - chr2R 21110543 3' + roo 334 2 69.86 ACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGATTGCGATTGCCGCATTCGCCAAATTCGATACGCTG:1 + chr2R 22244184 3' + Doc 342 1 72.44 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTTTTAAACATAATATGACATTCTTACCCATACTTTAATGCGAAATACATACGCTCTTCTGTTTGCTTGATTAGTATAATCATTATATTGTT:1 - chr2L 19731897 3' + roo 9042 1 65.07 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGAATGTGTGTGTGAATGCATGAGTATTCCCGATTTTCCGGG:1 - chr3L 22435089 3' - opus 7161 4 58.22 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGGGGCTCAGCAGATGCCCAGGGAAAATCCGTAGCCAGGAGGCTGGCTGAAGCCAGTCAATTTCCC:1 + chr3R 22276339 3' - jockey 4739 1 62.11 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCCGTTATATTTATCA:1 + chr3R 12787415 3' - BS 5021 1 64.79 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTACATTCCCGTTCCAGGTAGCTACATGAAATAATATGACTAAGATCCCTACCATAAACATACTTTAGGGGTTGTTTGCGTTTTACAAACATTA:1 + chr2L 13244765 3' + jockey 4969 1 61.43 CATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCGCCGAGTCCCGTGAGGCTCAGGTTCGTCCAGGCAGCCAGCCAGCCAGTTAAATGGCAAGTCCTCCGGGAGGGGAATCCCATGAA:1 + chr3L 10024100 3' + transib2 2812 1 70.73 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACATGTCTGGGCC:1 + chr2L 2609020 3' + I-element 5313 1 55.48 CTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATCTGAGAAATTAATATTGTTATTCAAATAAAAATTATGTATATTTTTCATATTCCTTGGACGAAATATATTATACCCCTCGAGGCGAAACTAATTAGCCCCTTC:1 + chr3R 15585684 3' - I-element 5305 1 73.61 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTT:1 - chrX 4240221 3' - jockey 4736 1 60.96 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAGTAT:1 - chr3R 17777518 3' - jockey 4700 1 67.46 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCA:1 - chr3R 23415913 3' + jockey 4922 1 63.70 AGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTGAGGAAGACTCAAGGCCATATACTTTTTTGCAAAACTTTAATTTC:1 - chr2L 18112920 3' - transib2 2770 1 69.18 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATTGGATACTGTTTTAGTGTAGCTGCCTAGTGCATTTAACTGTGTTCATAATAATTTATTT:1 + chr3R 14800976 3' + pogo 2044 1 60.27 GGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTC:1 - chr2L 13675893 3' + flea 4941 1 68.97 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAAACTAGATGGTGACATCCGATCGGACCTGAAGG:1 + chrX 15406101 3' + opus 7489 2 70.55 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTACTTGATTGCCCCCAAAAGTATGCAATGCTAATAAATTCGCTTTTATGTGGCCAGCGCTCAATTTTCGCTCCC:1 - chr3R 19725336 3' + hobo 2924 1 67.52 GACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCGAATTAGAGGGTTCTCTGCTCTTTCCTGGCTAGGTTGTCCGCTAGATAACCAAGACAAACGGTAAAACGCTCTGCCGAGACACCGACGATC:1 + chr4 355728 3' - baggins 4973 1 68.49 AGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTATTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCA:1 + chr2L 13328506 3' - BS 55 1 54.79 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGGAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTATAGCTAAAA:1 - chr3L 20868030 3' - hobo 57 1 61.36 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTC:1 + chrX 2104785 3' + roo 9007 2 61.64 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAGGGGAGGAATTAAATGAGTAGCCCGAGGAGGAATAGGTTTCGACCTTTTTTTCCCAGTTGCGTTGTCACCTCCTC:1 + chr3R 8394525 3' + hopper 1394 1 65.04 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTGTGCACTACAATTACATGTGATTTAGCCCATATACATTAAGCTTTATTTGTTAATTATTAAACATTTTTAAAAT:1 + chr3R 12342211 3' + hobo 2892 1 51.39 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGTACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTATACCCAAAAAGAGTAATTTACATATCAATTTATTTTAGC:1 - 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chr3R 30486950 3' + Cr1a 114 1 74.66 GATATTTAAAAACATTTAAGTTGCAACACTGAATTTTTTATGCGATTATGTGATTCTGTTAAAAATACACAACGTGTCCGAATATTTACAAATAAAATGGTTTCTTTTGCCTTCGCATCATTTTCTTTCATTTGATGGATCACATT:1 + chrX 409238 3' + transib3 111 1 68.49 TTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTGAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGTAATCATCTGACCCCTAGAAGTACGACAAGAGGCTGTGCAACA:1 - chr3L 256569 3' - Circe 7102 1 73.97 ATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCGATGTTTTGGCTTAAAGTGTAAAGAGTTCCCG:1 - chrX 1758972 3' + Tabor 396 2 76.03 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCT:1 + chr3R 13684768 3' - 412 71 2 64.38 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTAATTTCGTATAGGACAATCTGCCACTGTCGTTGTTTTTAACG:1 + chrX 15540112 3' + roo 397 1 76.03 GACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGATGCTTCAACCTGAATGGGCTTATATGGGCTTTATGCGGGCATG:1 + chr2R 15772863 3' - Tabor 338 2 68.80 GGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCAC:1 - chr3L 24039752 3' - springer 7305 4 53.42 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATAAAGATGATAATATGAGTGACGAGGGAGCGATAACAATGCGCCACAATCCGTTTTTTGTGTGTGCAATCAATA:1 - chr2R 21110515 3' + roo 9026 1 50.68 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATT:1 + chr2L 19940149 3' - mdg1 7065 2 67.59 ATCAATACAATGCAATAACAGTAATATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGCTCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCC:1 + chr3R 12787379 3' - BS 5061 1 58.90 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTTAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTCAATTACCATTTCATTCAATTTTACA:1 - chr3L 20765104 3' - 297 6604 2 69.18 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTC:1 - chr2L 19940037 3' + mdg1 338 2 73.97 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACCTTAATGTGTAAAGTTGGCAG:1 - chr2R 21619297 3' + blood 348 2 65.07 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATAATCCAAAACTAGAGAAAGTCGC:1 - chr2R 18618495 3' - jockey 4751 1 76.98 AAGATACGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTAT:1 + chr3L 20168273 3' + roo 324 2 67.81 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTGAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTT:1 - chr3R 15137269 3' - roo 8729 2 63.70 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTCAGCAAAAGTTGGTGGGACAAAGCAGAACTTTAATATATATATATTGTCGTGCATATATATGCCATAATAATTATCAT:1 - chrX 6186272 3' + Transpac 289 2 37.30 GTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCACTGCATGTGGGTACCACTGTGGCGGAGCCAAGTTTTGTTACCTG:1 - chr3L 12072484 3' + HB 1615 1 71.23 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGGGTTGATGACTTACAGTAAA:1 + chr3R 27398158 3' + roo 9062 1 75.00 AAATAGAATTGGCTTGCTTGTGTGGGTAAAAACCGTAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTAGTTGTGCTAGCCACGCTCGGTTCTTGACACAACACACGCTTCGATGCACAACCACTTTCAATCGGTGCGAAATAGGAATCAGG:1 + chr2R 23862458 3' - 1360 3261 1 50.00 GAACTATTTCAGGCAAATCGGCCAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTT:1 + chr2L 16884686 3' + Bari1 1625 1 74.13 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCACCTTTTGAGCGTCAATTCT:1 - chr3L 17757843 3' - Tirant 2 2 38.36 GCAGTCCTAAAGCCAGTATGGACCTACGCGATGCAACTGTGGGGAACATCTGGCAACTCTAACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCAATGGTATATGACTAGTGATGACATCCACATGTTTCAAACTAAAATATATTTTTGTATAT:1 - chr2R 5299230 3' + G3 4178 1 78.08 CAAACATGCCACAATTACGCTTAATAGGCGTAGCTGTCCCCCATTAACTCTAAACAATGTCCAAATTCCACGAAGTGATGTTTTTTGGGGGATACTAATTAAAAGATCATTTTATTTCGTGATCGTGTTAAGAACACTTGAGGATT:1 - chrX 6610789 3' + Doc4-element 2343 1 54.11 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTG:1 + chr3L 23871311 3' - Doc 89 1 71.92 GACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCATACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAATT:1 + chrX 21587780 3' - INE-1 126 1 45.89 CCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCAT:1 - chr3L 8273936 3' - hobo 68 1 72.87 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACAT:1 - chrX 19163267 3' - Burdock 68 2 65.75 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAACTTATTTTTGCAACATTTTTGTGGTTATCAAATGTAGTTACTTTTGAA:1 - chr2R 15406199 3' + I-element 5315 1 55.86 AGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATACACATGTCAAAATTATAATACCCACTCGACGATCAAAATCACACCTTGACTCCATGGCAAGAGAGACACCAATTACTACTATTACTAGCTGCTGGGAGAAGCGGCAGATAT:1 + chr3R 31742453 3' + copia 276 1 80.82 TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTATTAATTGTGTTAAATAGTTTTTACAGCTGATTGGTTTATTGTTATCTACTTAACGCTAAATATCCAAGTGCTTTACCTAACTTTTATGTACAGTACTTGC:1 + chr2L 3175246 3' + Burdock 6376 2 73.97 CCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAAATACAATAAAAATTACTCAACCGAATGCATCATAATGTTTATGTCAAAAAT:1 + chr3R 23548177 3' - Tc3 1651 1 53.40 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGTCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAAATTAAGCAAATAAGCCCGAGCAAAGAG:1 - chr2L 16995482 3' + roo 9010 2 59.59 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCG:1 - chr3L 13546536 3' + hobo 2906 1 58.52 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGAT:1 - chr3L 22038186 3' - diver 39 2 58.90 TAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAATATCGAAAATCACAC:1 - chr2L 18112450 3' + transib2 2805 1 69.86 CATCTATATACATATATACATATATATATAGACGTACCTGTAGTTTGTCCCCTTATCTTTGTTGGCGAGCCGATTCAAGCGGAAATATCCGCACACACTGGCCTTGAGCTGGCGTATGATTCACTGACGACACTTAGCC:1 - chr2R 24422912 3' - G3 4508 1 56.12 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGATATCTCCTTTATACCTTGATTCACTCAAGTAAATAAACCAATTTGCAACCATATTGTTGACAATATGGACCTAATGGTATATACATATATCTAGTCCAACTTGGATGTATTCTT:1 + chr3R 24004607 3' - roo 5 2 64.38 AGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGTTCTAGGGTAATAGTACACCAGTTCA:1 + chr3L 23871348 3' - Doc 52 1 50.68 CCTACTCTAAAATCAAAAGAATAAATTGAGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCC:1 + chr3L 19222670 3' + 412 7464 2 67.81 CACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGAGTTTATAATTCGTTGGGACTTTCTTTGTTTGTTTGCCACGGCATTAAT:1 - chr2R 18035062 3' + R1A1-element 5318 1 69.18 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAATGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTATGTCTATAAAATGAAGCAAAGAT:1 - chr3R 6399380 3' + pogo 2035 1 72.58 GTGTGTGTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTATAGATGACTGGCAACTGCATTGAAAATAAGCAAGGAAATGCTTTTGTTAGAAAACAGACTGATTTCTGCACTAAAAATACT:1 - chrX 17477569 3' - Quasimodo 31 2 65.07 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGCGGAAAAGGGAAACAAAAGGATCTATGTAAGGATTCAGG:1 + chrX 140080 3' - blood 67 2 64.03 GGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGTTGACATATGATTGATCTACAAAGGTGTTGCAAATGAGGACTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGATCAATGGAAATTATGTTTTATGGCCTGCAATT:1 - chr2L 12297297 3' - Q-element 219 2 76.71 GCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAATTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGAT:1 - chr3L 17757959 3' - Tirant 91 2 76.71 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTT:1 - chr3R 12181998 3' - mdg3 5335 2 71.23 GAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATGTTATTTATTTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACTCCACAAAAGAAGTCAAACGATGCGTTGTAAAAATGTTTTG:1 + chr2R 20389523 3' + copia 5120 2 60.27 TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGAATTTTTATCTTGTGTTTTAAATG:1 + chr2R 21619413 3' - blood 7089 2 68.49 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGAAAATAATTTGCGTAAATTTAGAAACTGGCGCCAGGAAATAATCAGGCGTCGTCGCCAACGCAAACG:1 + chr3R 17060093 3' - 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chr3R 8381679 3' - Tirant 8141 2 62.33 AAGTTCTCATCATATTGCGAAGCACATAGATATTAAGTATCATTTTGTTCGTGAATTGTATAGTTCTAATTAAATTAACCTTTATTGCATACCCGTTCCACTTTTGACACAGTGTCCGCTTGCCTCAGCACGTCCTCAAACAAGTC:1 - chr3R 12417922 3' + Copia1_DM 4081 1 62.33 GTGAGGAGTCTTAAAACTCCTCACAAGTCTTGTGAAGGGGAGAGGCCCCTTCCTTCCGGGATTCCTGCGGTCTAAAAAGGGTCGGCGCAAGAACGGATCGGTACCGGACCGGTAGTCCATTGCAATTCGGCTATATAGATATTT:1 - chr2R 3189747 3' + gypsy8 4651 1 70.14 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCT:2 + chr3R 15137370 3' + roo 9016 2 55.48 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTT:1 - chr2L 9599790 3' - roo 57 2 56.85 ATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATATCCTTACCATTTTGGAACNANCCAAAAAAAAACGTTACAAAAGTCTCCAGGGACCTGGTTATTGCAGTTGGTTCCCAAACCCGCAATTGTCGTGGATCAATCTGA:1 + chr2L 20819378 3' - copia 10 2 70.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTG:1 + chr3R 20260899 3' + roo 9050 2 58.65 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGTGAATGCATGACTATTCCCGATTTTCCGGGAAAAGCAGGCAGCTCCGCACGCATT:1 - chr3L 22435064 3' - opus 20 2 67.12 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAAAACTAAAAAAAAAGATACGTATAACTAAAGCTATCGAAGTGTA:1 - chrX 10284754 3' + pogo 2089 1 75.34 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAA:1 + chr2R 21199712 3' - jockey 4788 1 65.07 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCTACATTAACGCAAAGCAATAATTATCATATTTGTCTTCTCTTTCGAATA:1 - chr2R 7009418 3' - Quasimodo 64 2 68.49 TACCCTAATATGTACAATGTTAATTCTTGTTGTAATCTATTAACTGACATTATGGCTGCTAGCTTTAGGACCCTCGAAAGCTAAGACCTTACCCGCATCATAATTTTCTGGGGCGTGACT:1 - chr2R 3172260 3' + 1360 3144 1 77.50 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTTTGCGGCTGTGTGGCACCCATAATGAGTAAGCCCAAAACAAGAAGTTCTGCAAGAGACAGGATCAGATTAACCGGACTTGAT:1 - chr2L 8930449 3' + roo 9034 1 59.59 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCTAAATG:1 + chr2R 14332117 3' - jockey 58 1 52.05 GGTAAAATTAAAAAACAAATAGTAATAGTATAAAACGTAATATTTTTTGAAGGCTATTAGCCAGAAAAGTTCCAGCACTCACAATATTAAACTTTAATAATAACTCACCTGGTAAAGAAAGACTCCAGAAGGTAGGCACTATGAGG:1 + chr3R 30155931 3' + Doc3-element 173 1 45.21 AATAAAAGAACCATTTATTAATACAAACCTATTTGGTTTAATTGACGCCCAACGCGCTTAAGTGTCGTAATAACGTAAAGGTTGAAGGCACGGAGAAAATATAAAGAAAAATTCACTACTGATTTTTAAGTTCAGCATATTTTTCG:1 - chr2L 10131776 3' + gypsy10 322 2 54.11 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTAATAACTTATATATATGCTTTGCTCAATAAAAACCCAATTGACAAATTGTCATGGCGATCACGTAGCAACAACAGCAAGACAACAACGTGT:1 + chr2R 21530071 3' + HMS-Beagle 7001 2 56.16 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAAATAAGCAATGCATGCAAGTCATACACACAGAAAAAAAAACACTTTTACCAACTAAGAAATTTATATTGAAGA:1 - chr2R 22761146 3' - 412 7100 2 52.74 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTAGCATAGCTGGATTTCTTTTCCAATTCTAGGGCATCTCTCTTTCTCTCTCTGAGTTTCCACTTTGCTATCCTTCGGTTTTCCCTCGCCAAACCTAATAAATTTTGCATT:1 - chr2L 5789568 3' - FB 12 1 75.34 AGGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATCTTTTTTTCTTAACCCCACCCAATAAAGAGACCTTATCGGGGCAACACCATCTGCATCTTGTGTGT:1 + chrX 5194828 3' + blood 164 2 90.00 AAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTT:1 - chr2R 12248989 3' - Juan 4106 1 69.86 CAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTGAATATAAAATCAAACTGAACTTAGGGCTAACAAAATATGAAATTGTTAATTGATCTCTAAAAATGGTTACGATCTTAACGCCTCATC:1 - chr3R 16496388 3' - gypsy6 215 2 69.18 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTNANACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACGCGGGCAAAA:1 - chr2R 977534 3' - F-element 64 1 59.54 CCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCATGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTGCGAAGCACTCACCTTGCCCGAGGCCATCTCGACAACCACACAGCCCAC:1 + chr3R 18733768 3' + 1360 231 1 66.44 CAATTGGCACCATGCGAAAAATTATTGTTTTGCATTGCCCTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTTCCCTCCCCACCTTCTGCAGGCACACAGCCCATCCCGACGCACTAAGCCGA:1 - chrX 1382602 3' + 1360 272 1 65.07 CAAAAGCTGGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTGTGAGCGTG:1 + chrX 22913204 3' - gypsy7 55 2 69.18 ACACAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGATGTCTTTCTGGCCTATGCCCAATTGGGACTAC:1 + chr2L 12400866 3' - jockey 4832 1 76.71 AATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCACTGACTGCCTCAATG:1 - chr3R 29283161 3' + hopper 1375 1 58.90 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGCATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTT:1 - chr3R 12181997 3' - mdg3 5334 2 70.55 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCTATGGCTTCTGTGGCAAATTATTTTGCTGAATTGCACAAAGGTTTCTAGCATTGAATA:1 + chrX 6615618 3' - roo 8693 2 65.75 AATTCAGAAAATTAGTCAAAACACTTAGTAATGATTGTGTGAAGTACCACACATACCAGCTTAAGGAAAACAGAGCATTTAGAGTTGTTATTAAATCTGTATGTTCTTCGGTTTTAACGCCCCGCAAAAACAAATTGTAGTTAACC:1 + chr2R 10121294 3' + G4 303 1 65.75 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGTGAAGTTCTTCGAGCGAGGATACTTGGAAAAAA:1 - chr3L 8273890 3' - hobo 39 1 58.90 CAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACA:1 - chr3R 9550933 3' - P-element 99 1 17.81 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCTACTTTATTCGATTTGTAAACTTTCCCTTTCCAGTTGTCAAC:1 + chr3L 11529591 3' + opus 479 2 65.07 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTATAGTCCACATACAGTGACATTCATTCCGAGGCCTTTCAGGGCCTGCGCTGTTGCTTTTTATATTTA:1 + chr2L 16995620 3' - roo 23 2 68.49 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCGAGGAGCAATAAATTT:1 - chr2L 15917593 3' - roo 8700 2 54.03 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCGTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGTGTGATGGGAGGTTGATGTGTTT:1 - chr3R 17494905 3' - hobo 63 1 62.14 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGCC:1 + chr3L 16200824 3' - roo 71 2 69.18 GCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCATATACACATATATATAGTAACATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAAC:1 + chr2R 6271494 3' + blood 7151 2 56.16 TGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGG:1 - chr2R 21362740 3' - Tirant 61 2 59.59 GTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGTGTTTATAATTCGTTGGG:2 - chr2R 18035093 3' + R1A1-element 5287 1 51.37 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTTCCATTTAAAAATAGACTAGTAAATTTAATTTTTAGATAAC:2 - chr3L 13992260 3' - blood 7090 2 71.92 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATACAAATATTTAAACAAATAGGCTTGTACCA:1 - chr2R 18358392 3' - jockey 4689 1 40.41 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTT:1 + chr3R 19246789 3' + jockey 4945 1 50.68 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGTCAAACGGGGATTCAATGCAATCCTTCCAATCCTGT:1 + chr3R 15137415 3' + roo 397 1 76.03 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTC:1 - chr2R 8258238 3' - jockey 34 1 63.70 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTC:1 - chr3R 17944032 3' + P-element 2839 1 40.00 AGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTCTTCTTAATGCCTTTATTTTGACATTTACCAAATGGCCTA:1 + chrX 3559648 3' - opus 75 4 71.23 GCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTCGCTTAATGACGACACGAAGCCGCCGTTTGAGCCGCGACAGAAAGGGAAAGAGATGGCGGCATGCTGGGCGAAAGAGAGGGGCTG:1 + chr2R 21362873 3' + Tirant 393 2 75.83 CGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTAAGTGTGATAGGAATCGTATCTCTCACCTCAACCCACACAATCGCGGA:2 - chr3R 8821830 3' - S-element 70 1 65.07 CCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCGGGCGTGATGAAAATTATTTTAAGAGCCAAAAAATAC:1 + chr3L 22038352 3' + diver 6090 2 69.66 GTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCC:1 + chr3R 19246749 3' + jockey 4905 1 78.08 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTATA:1 - chr2R 16160760 3' - mdg3 81 2 72.60 TCACATATTATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGAGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATTTTGTGCAAACAAGTGGTTGTTGTTGCTACACAGGGGTTTTTGGCAACCGAAATCCTTTTAAGCTTTAATGG:1 - chr2L 10611374 3' - baggins 5231 1 56.16 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTATCGGTTTCTTCACTGCCAAACAATAATTCTTGGTATACTTTTGGGAGGCGCAACAAAAGTCGA:1 - chr3R 31458341 3' - jockey 7 1 78.62 AAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCACTTGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGACAAGTCGAAAAATCCTGAATCCCGAATCGTGAAACGAGCTCGGGG:1 - chr3L 20891662 3' + invader3 5314 2 73.97 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATGTATAAAAACGTCTTCCTTACCCAAGCTTTACTTCCAAAAATATA:1 + chr3R 12376533 3' - flea 4803 2 52.74 ATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAAGGAATCTGGCCCAGTGTGCAATGGAAAATTTGCAATAATCCTTCCAAATAACGCACACACCTTACGATTTTTACTCGCGAATTCTAAACTTCATTAATTTTAAAAACGTTTTCTACTTT:1 - chrX 4703483 3' + transib2 2800 1 75.34 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTG:1 - chrX 17495695 3' - Burdock 51 2 59.31 AATTGTTTTTTTTTTGTTTTTATATTCATATGGGTTGTGTGGCAAGCATTTGTTCATCGTTAATAGCACAAAGGCACACAAAAACACATTGTGAATCGAAACTCCAACAGGGGCAAATGCAACTCTGTGGCCAAGGTGCCAACACA:1 + chr2L 16201495 3' + Tc3 88 1 77.40 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTA:1 - chr3R 13375944 3' - 1360 53 1 55.48 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCATAAGTTTTGGTTTCGCTCTCGACTGGAAGTC:2 + chr3L 739223 3' - P-element 90 1 23.97 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGATATGTCCATA:1 + chr3R 7042123 3' - Stalker2 16 2 74.48 TGTACAAATTCTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATTACAACACAGAAATGCATCGCTGACTGACCTTTTGCAATAATCGAAAGTGAACGATGCGATGCCGAAAGAAAACCAAAATTTCCCAATCGAAAAAGACT:1 - chrX 9062173 3' + hopper 1081 1 60.27 GTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGAAGCCCATGAAGGATATGATGGCCGTGCTGAAGAAGCTTAAGCCATCCGTACTAGTTG:1 - chr2R 16415833 3' - flea 209 2 60.96 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATT:1 + chr2R 21199722 3' - jockey 4778 1 58.22 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGCCAAAAACTTTACCGTCAAC:1 + chr2R 18723772 3' + 297 347 2 53.42 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTTTTGGGCA:1 - chrX 4240214 3' - jockey 4728 1 66.21 TGTAAGTATTTAAATGTAATATTTAGAATAATCAATTTTTATGTGTAATATCGCATCTTAATCATCATGGTTCGTAATGTCTTATATCTTCCAATCCAAACCAATTCCCAATAATTGAGTTCGCTTAAGCAATCATTCAATTTAAA:1 - chr2L 2624940 3' - rover 21 2 69.86 CAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATT:1 - chr3L 22038240 3' - diver 89 2 76.71 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAAT:1 + chrX 19583332 3' + roo 9017 2 58.22 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGGGCTGAAGCTTAAAAACTTTTCCAAAACTTGTAAAACGTTCC:1 + chr2L 18284947 3' - pogo 41 1 52.63 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAA:1 - chr2R 10695790 3' - roo 76 2 70.55 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTAGTTTTTAGACGATTGTTTGAGCAGCCAGTCCAGTTAGTCGAGCAC:1 + chr3R 21843834 3' + blood 7315 2 70.55 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTTTAATTGATTGCCAATTAGCTTTTTTGTCCCGCCAATATCACGTCCCAGCAATTAAATTAGTAGATGAAAATCGCTTCCCTTTTGTCTTTGGCGAAGTCAAAGAGTT:1 - chr2L 2316881 3' + roo 397 1 67.12 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTGCAGTTTGTGCCGCAAACATTGAACGTAGGCCAATGATAAAAGCCATTTCCTCTT:1 - chr2R 20706775 3' + I-element 5291 1 60.27 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTACTTATCAGCAAAGTTCGGCAGCCAAGTAAAACGAGAACATATATTTCTCATTCATTGCAAATTCAATATTCTAACAAACCTTTCACT:1 - chr2R 14638289 3' + opus 7474 2 67.12 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATATTTGCTCTTCGCTTATCTAAATAACTCAGATTTGCATGCCACTTCACGCGAGTGTGGCAGATAAGCTCTTCAGTG:1 + chrX 19187412 3' + Transpac 5194 2 60.96 AAACTAAACTAAATATAAAATCAGATAGTTACCTAAAAGATGCGAGTATATCCAGGCCATTTCGCAATTTTTCCCCACTCTTCATGTACATGCTCCCACTTGCGATGGTTTAGCGAATTGAAATCCGGGCAGTGGTGAGCGATTTT:1 - chr3R 23062599 3' + F-element 93 1 61.64 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCTTACATCTTCCTAATCTATATGTCATAAATCACACATCTACCTTTCTACGAATGTGCACAGATATGTATTCTCTATTGAAATCGTTGAGATAAATCCCTCGCATTTCGTTTATAACTA:1 - chr3R 11177208 3' - hobo 3 1 54.11 AAAAAAAAGAAAAAAAAAAGATTCAGCATGCTTAAAGTGTACATATGATTCAAAAGGAAGCTGTGTAAAAAAATACATAATAAGCTTGGTAAATATGTTTCTCCACTTTTGGTTAATTCTGGACCAATAAACTTTGCTTATAAGCA:1 + chr3R 18796523 3' - hopper 143 10 76.71 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTCTTGAA:1 - chr3R 24074762 3' + jockey 4932 1 63.91 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTTTTGTGCGCATTAGCAC:1 + chr3R 24074868 3' - jockey 4792 1 61.64 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGGGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGGGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTAATACCCATTTTAGACTAGTTGCAATATT:1 + chrX 13667839 3' + hobo 2870 1 77.87 CGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTATTTATTTTGAAGTTATTGATTTTGGCCACAAAAAGGTTTCCATAGTGCAACGTAAAAGTCAAGCCGATGACCAGCCTGACAAAATATGTACATATGTACATCTCC:1 - chrX 22575918 3' - INE-1 93 1 63.01 CCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTATGTATATACATATATGTACGTTCAATACCGATCCGATCCGAGGTAAAATTCATATGTTGT:1 - chr2R 21529945 3' - HMS-Beagle 6852 2 57.53 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTTGAGGTTTCTAATTGACAAGATCTATGGATCAAAGTTTAAA:1 + chrX 12263785 3' - roo 79 2 72.60 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAAGGTGCTCACGAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATT:2 - chrX 19887040 3' + P-element 2838 1 52.05 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCCAAAAACGAACTTTACCATTCGAATTGAGGGAGAGTCTTTTCAAGGAATTCAAT:1 + chr3R 10062231 3' - copia 67 2 63.70 TATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCACTAGCTGAGTAACGTGTGTTTGATACAGCATTCTCTCTTGTTTTACGTATTCTTGAAAACAG:1 + chrX 160113 3' + Cr1a 4169 1 56.85 CATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTTATTTGTTTATGGCGAGT:1 + chr3R 8867127 3' - 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F-element 368 1 64.38 GTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTTACATTGGC:1 - chr3R 12789486 3' - G2 2768 1 68.49 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTCTCTTAATTTTACGCAGGGGAGTTGCACATACCAAGGCCTGTGAAAGACGTTCCATGTATGTTTTACATTCCCTAACGTCCATATATGTCAATCGGCAGCCTGCGTG:1 - chr4 186087 3' + 1360 3379 2 63.70 TCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAA:1 - chr3L 25232775 3' + accord2 7547 2 71.92 GTAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTGTTTTTTAGTTTTAAGTAAATACAAGCAATACAAGATGTGATGTTAAATATTGCAGTGGAAAGAATGCACTTTGCATTCCACATTGCAATCATC:1 + chr3R 10269670 3' - rover 6873 1 63.70 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCG:1 + chr3L 8249480 3' - HMS-Beagle 26 2 60.83 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAAT:1 - 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chrX 6615496 3' + roo 9038 1 56.48 CTACTGACTAGAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCG:1 - chr3R 5518327 3' - Transpac 5001 2 75.00 CTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAACACACACACACACACTCACACGCACACGCACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACATCTTAAATATTTTCTAT:1 + chrX 8364656 3' + jockey 480 1 59.59 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCCTTTCCACCAAAATTTAAGTGGATGCGGCGTGGAGATGGAAGTGGGGATGCGGTTGGGGTGGTGAGAGTGCTTGCCAT:1 + chr2R 13117957 3' + 297 6942 2 60.00 CTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCACTGCATGTGGGTACCACTGTG:1 - chr3L 12072507 3' + HB 1610 1 63.28 AAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATGGGATCTTTAAAGGGGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTT:1 + chr2R 4774749 3' + baggins 5338 1 64.38 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGT:2 - chrX 21227107 3' - Tabor 62 2 57.53 ATTCTCAAACTTTCCTCCCATTCTAGAACTGTCCGCTTCCGAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGATTTCGCTTATTGCCGGCCACACTTCATCATGATTGTTCGTTGCGAAATGACACTGCGATTGGAGCGAGTGTCCA:1 + chr3R 10119880 3' + gypsy12 9968 2 54.11 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTT:1 + chr2R 10695910 3' + roo 9046 1 66.44 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAAATCCGCTCT:1 - chr3R 16881873 3' - 3S18 38 2 60.27 AAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACCTAATTCTTTTCCGCCACTTTGTTGACACCGGCATAGTCAATGGGGAATTCCTTTCGGCTGATGCTGATTGCCAAAAAAG:1 - chr3R 6602939 3' + gypsy 420 2 56.85 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCAAGCGCTTTTCA:1 - chr2L 16537520 3' - Transpac 46 2 50.68 CTGCATTTAATATGACTCTAAATTAGAATCTCACAGCTGAGCGCAAGCTTCTTAAAGTTTGCCTATTAGGAGCTTTCTAACAATACCGCTTTAGTCGCTACTATGCTGGCTTCGTGGTGTGTGGTGCAAACCGGCAAATAATTCGT:1 + chr3R 4914133 3' - Gypsy12A_LTR 84 1 70.55 CAATTATACAGTGCATTGGACTTAAGGGGGATCTATGAGTCATGAAGGGGCAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAATACACATAGAAAACCCACTTAATAATAATAATAATCGCTAGCACGTTTATATTTAACTACCTAGAATG:1 - chr3R 31132164 3' + baggins 5348 1 77.40 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTTGAGCAATAAAAAGACGTTTTTTTATTTAGTGATTTCGAA:1 - chr2L 22340057 3' - Doc 25 1 70.55 TGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTT:1 + chrX 22574694 3' - 17.6 113 2 46.85 TACTTCTTGCTACATCTAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACATTATCGAAACTTTTGGCAATTCGATATGCGGTTGCTG:1 + chr3R 10121250 3' - gypsy12 86 2 74.31 GAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTCGTTTCAGTTTCGCCCATGGTCTGGATACCGCATCAGCTGGTGGGTATTCCCATTGGATTCAACATCACCCTGGAATGCTTCATCGAG:1 - chr2L 6385755 3' - invader4 26 2 68.49 TTTCTATCGATTTGCCAAAAAACTTTTTGCCACGCCCTCTCTTCAGCCATTCCATGCATTGCCAAACACATTTTCCATTCCCAGTTCATCCAGTGGATTCGTTCAATTCAATTTGACTGCTGTTTTAAATATGATTTAGGGATTAC:1 + chr3L 22977673 3' + INE-1 311 1 80.14 ACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCTCTGAGATAAAGAAAGAGATTACCTGGTGGAAAATATTCAATCAAT:1 - chr3R 28829088 3' - FB 75 1 67.12 CGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACACAGGGATCAAGTG:1 + chr3R 22352527 3' - I-element 41 1 50.38 ATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTT:1 - chr3L 8158020 3' - flea 4836 1 74.66 CAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAATTTTCCATAGACAATTGCACTTTCAGGTAATCCCAGAACGGCCAAAT:1 + chr2R 21043011 3' + hobo 104 1 67.81 ATCAGTGTAAAAACTAACCACGCTGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTCTAGTGTTCGCTTTCCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTTGGCCCACTGCAGTCCTTGTCGTTTTTCGTTCCTGTT:1 - chr3R 13617496 3' + GATE 8368 2 74.66 CATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGAAAAAGAATATCATTCAAAAGCTAAAGTTTTTTCTTTTATCTTGAA:1 + chr3R 20125758 3' + mdg1 7282 2 68.49 AAGTAACAATAATAATAATAATAATAATAATGTTAAGTACGGAACAGAGTATAGGAGTTTTGAAAGACACGTGACTTTAATGTGCTGTGATTTTGGGGAGTGAAAGTGCGTGATTCGATTCGGAAATCGTTCTCTCGGCCAATCA:1 + chr2R 19425215 3' + mdg1 30 2 55.17 AAATGATTAATTCGAATTTTTAATGTCAACAATTGGATAAATTGAATAAAGCCATCAAGGAGAAGCGACCAGAATTGGCTAGACTGCACACATCTTTGGTTGCCAGGAAGATTACAAAAGGTTATCGAACAAAATGACAATTATAT:1 + chr4 1172239 3' - Bari1 334 1 67.12 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTGCCAACATCTAGTGTTGGTGTTGCGACTATAATATTTTCAATTTGTTGCTTTTTATTGTTAACAACAGCAACAGGTTCGTTGACCAGTCAACGAGCGCTCAGAGAGCAAAACAAA:2 - chr2R 6217034 3' + copia 249 1 79.45 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGACGCGGTTCA:1 + chr3R 10751731 3' + hopper 1362 1 52.05 TTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCGTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTGTGAATAAAGTAAGGTGTAATTCTGTTTGAGGTAAAGTTACTACACGAAATTAGATTTAGCA:1 - chr3L 17454840 3' + Cr1a 205 1 56.16 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCANGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGC:1 + chr3R 13529967 3' - jockey 95 1 78.08 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTAC:1 - chr3L 21636446 3' - 297 59 2 69.53 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTATGGGCGCATGTTTACAACTGGAATTAGGGTGCAACACAACACATGTACTAGCTGCAAT:1 - chr3R 31031965 3' + hopper2 1549 1 57.24 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGTGAAGTTCTTCGAGCGAGGAT:1 - chr3L 8273902 3' - hobo 50 1 52.41 AGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATATGTATGTAAAACATTTTTTAACGAATAGCTTAAAAAACTTCCAA:1 + chr3R 11758054 3' - invader4 2832 2 71.92 GCTGTCTCACTCAGACTCAATGCGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATAC:1 - chr2R 21475249 3' + P-element 2787 1 17.12 CTTTCACTCGCACTTAATGCCAAAGTAAACGCAATGGCGGCGAAAGTTGTGCAACAACTTTTACGACCAGAGAACTGAAGTGCAGGCAAAGTTTGCATTTGTCTACTGGATTCTATGGAATGACATTCACTTGAATTTATTGCCG:1 + chrX 12823604 3' + P-element 2829 1 51.03 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCAT:1 - chr3L 22041069 3' - roo 8729 2 63.01 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAATGCCAGAGT:1 - chr2L 8895238 3' - 412 75 2 67.12 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAGTTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCC:1 - chr3R 15102247 3' + roo 337 2 67.12 TTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTACTGGGATTCGGATTGGGATTCGAGTTGGCATTGAGATTGGTGGGCGTGGAACTGCGACGACTGCTGGGAAAGGA:1 + chrX 8526008 3' - I-element 5148 1 53.79 GAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAGATGCAAAACGATATAAAGGTTTGGGCTTACGCTTTTAAATGTTCAACTCGACATTCCGGCGACTTTTTTTTTTATTTCTGTGTCGTTGGGTATTTGGTTT:1 + chrX 2328970 3' - Circe 118 1 58.90 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTNANTATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCAAGGGAGCTTTCGTTTACTGGGTCTGAGGTCAGCGAGGGGTTCGGGTCACAAGTCAAGTG:1 + chrX 7508198 3' - roo 8723 2 58.90 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACA:1 - chr3R 13375941 3' + 1360 3339 1 52.74 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCCCAGCATGCAGACTGCAGGATACCGG:1 + chr3R 11108117 3' - jockey 76 1 75.42 AGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACATAAGCTGAAACCAGAACAGGTCGACCCCTGCATTCCCAGCCCCGCTTTGAATTGC:1 - chr2L 1154444 3' + roo 8962 2 62.33 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGCATTTGTTGGTCTCAAGCGATTTTACATAAGGCCTCAGT:1 + chr2R 16749886 3' + roo 9052 2 69.18 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGGTGTGACACGCAAGGAAGGCAACAAAAAAATAAATAAATTCATCAAAAATTTTGTATAAAATCGTAAACTACCACGAAAAAGTATGTGCAAAGAATCACAAA:1 + chrX 16996196 3' - roo 8683 2 71.23 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGTCTGGCAGTTCAATTAGCAGAGTGCGATCTGTTGAAAGGCATTCTTAATAGAATAATCAAATCGTAACAACATATTATTCTTAT:1 - chr2R 12343152 3' + roo 9039 1 59.15 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGC:1 + chr2L 3911953 3' - roo 15 2 69.75 TATTATTAAAAAAAAAACAGAAGAAAAAGGATAGCTAAGAAAAACAAGTACCATAAAAAGCTGGCAAGCAGATAGATATTAGTCCACGTTTTGCAGGGAGTTTCTGTGCAGGAGTGGAGTG:1 + chr3R 26043191 3' - hopper 156 1 90.08 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGA:1 + chr2R 10695859 3' + roo 8995 2 73.29 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCC:1 - chr3L 10023981 3' - transib2 77 1 73.29 TTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGGGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAGAACTGCAATAAAATAGGTTGAA:1 - chr3R 10030650 3' + BS 5082 1 73.29 TGTAACGCATAAAAAAAAATTCATGCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTATATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAG:1 + chr3R 31032058 3' - hopper 71 1 63.70 AATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCTCATTTGTTGTCTTTATTTGCCCACGTTTGGCCACTCATTTGGCTAGGCCTAGCACATCGTCCGTTTTAAGGAATAGGCTACCATCTCCTTTTAAAAAGGATTCAGCACTTCATCTTAATAG:1 - chr4 474623 3' + FB 40 1 58.22 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACACGCCTTTTTTCGGCTTACGGC:1 - chrX 14825306 3' - P-element 58 1 24.04 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAAGAGGGGGTGGCACGTAGCAG:1 + chrX 1759041 3' - Tabor 6905 2 60.27 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACT:1 - chr2R 18723655 3' - 297 6641 2 65.07 AGTTTAGGAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATAT:1 + chr3R 4679580 3' - hopper 32 1 62.33 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTATATACGAGCTCCTCAACTAACAGATACTCAGTTAGTGGTGGTAATTTCAATAATTTCCACATTATAATTTAATAATGTGT:1 - chr3L 18122260 3' - 297 6615 2 58.90 GGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCCATGCTCATTACATTGCGCTTGC:1 - chrX 10667001 3' - jockey 4755 1 50.00 AAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGGTC:1 + chr3L 21913477 3' - 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BS 5004 1 75.86 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATCTTATTTGTAATTGAAGACTATTAATTTAAGCTTCGATT:1 - chrX 15539980 3' - roo 79 2 76.03 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTC:1 + chr3R 14277942 3' + P-element 2805 1 21.37 GCGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCGCGCTCATGGGACAGTATGGAGTGTCCTAGACGTAGTCTTATAAT:1 + chrX 21084051 3' + HB 281 1 63.01 TTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTT:1 + chr2L 21909132 3' + transib2 2739 1 74.66 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAACATTCCGC:1 - chr3L 12125244 3' + roo 9044 1 66.21 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCATTAATCAAAAATTTGGAGAAATAAATGCTCGTTTCTTTCGATTTATTTCGGCCCCCTGCCAGATT:1 + chrX 16219300 3' + roo 354 2 57.53 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTTTAATTGATTGCCAATTAGCTTTTTTGTCCCGCCAATATCACGTCCCAGCAATTAAATTAGTAG:1 - chr2L 2316924 3' + roo 353 2 56.85 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCTCGACAAACAATCTTATTACATTTCTTTGTGTATAATGCTGGTTACAGCAAT:1 - chr3L 19222600 3' - 412 7123 2 64.38 GCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGGCAACCCATTCAGGGAAGGTAATTTCTATCTG:1 - chr2R 5037675 3' - Stalker2 56 2 53.42 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACGAATTGGCGGTGATCAGATCAAAATTTCGACTTTGAATAATTAAGAAGTAATAAGCTTAAATCACAATAAATTATAGTTAATGATAATTTGTGAATTAA:1 - chr3L 18075505 3' - pogo 19 1 69.18 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTATATTGTATTCA:1 - chr3L 13888894 3' - 412 58 2 56.55 TTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGA:1 - chr2R 12248957 3' - Juan 4074 1 52.74 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTCTTTT:1 - chr2R 22112627 3' - 412 53 2 54.11 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTC:1 - chr3R 5574960 3' - blood 7085 2 69.23 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTC:1 - chr3L 8249346 3' + HMS-Beagle 7010 2 62.14 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTTCGCCTAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAGTATATATG:1 - chrX 10694259 3' - Transpac 48 2 54.79 ACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGATCATTGTTGTTGCCGGCAGAGAATCGGTTTAATGTTTCGGAAGATAATCTAATTTGGTTACTTATATGCGAATA:1 - chrX 5532018 3' + F-element 4363 1 50.00 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTCGTAGGCCTCGATCATCGACTCATGTTTGTTGGGCAGAACGAAGTCGACTAGGGAAGTGGTCAG:1 - chr3R 5574897 3' - blood 14 2 74.66 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATC:2 + chr3L 21913465 3' - 297 34 2 62.33 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTA:1 - chr2L 16554624 3' - blood 7100 2 78.77 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTTGAGGGCCCACAAATTGAGAACTTCCATAGTGGAAGGAATTA:1 + chr2R 21229108 3' - jockey 4711 1 56.16 CTGAACCTTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTAGGCGTTTATGGGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCAAGAATATGTATACTTTATGCTGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAATGAATCTAG:1 + chr2L 22211544 3' - INE-1 161 1 70.83 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCT:1 - chr2R 8258288 3' - jockey 84 1 71.72 GCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCC:1 + chr3L 18592072 3' - Cr1a 474 1 43.33 ACTTTATATTAAAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCGTGCGACGTGTGAAATTAACTATCCTTATGGTCCCGACGGACATGGACTACCTGAAGTCGATAAGGGGAGCGGAGTATGGGGATGCG:1 + chr2R 24518651 3' + 1360 390 1 51.61 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACGTACGTATTTAGCAACCTAGAGTAGCAAATAATAACAGACCGATACGCATCCTGGCTGGAGAAG:1 - chr2L 6527656 3' + pogo 2052 1 54.48 CCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTCAAAGGAATACATTTGGCTCCTGCATTGAACATCTATTGCTGCAAACGGTAAGCCACCT:1 - chrX 14346942 3' - flea 4778 2 64.29 TGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAACGTTAAGCATTTAAAGTTTTCCACAAATGATATAATGGCGAGCTGT:1 + chr2L 16554714 3' + blood 7386 2 69.23 CATGCACACATACACACACACAAGCGCAGCAGACAAAAGAGAACGCGCGTCTTCATCAGCAACTTAATTATTAAATTAATATGTGTTTGTACATCCAATCGAAAAAATTTCTCACAAATTCACTTACAAGAACTAAAAGTTTCT:1 - chr3L 16378862 3' + accord 180 2 50.00 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTAGACAACT:1 + chrX 6283713 3' + P-element 2806 1 28.77 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGAT:1 - chr3R 9657699 3' - jockey 4695 1 64.38 AGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCACAGCAAATGGATGTAAACACATAATGGACGCGATGCGGCTTCCAATCAGTTGATTGACTACAAAAA:1 + chr3L 18822811 3' + R2-element 450 1 71.23 TCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAGGCAGTCAGTCAACCCTCGAGTGTTACGAGCCTTACAACAAATTTGATTTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTTCCGCGGGTGGGTGGTATGAGAAGTTCTGGATTTTTGA:1 + chrX 10694423 3' + Transpac 5219 2 73.97 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTTATTTCAAGACTCTTT:1 - chr3L 20765156 3' - 297 44 2 59.13 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAATATATTCCAAACTATGATACTTCACATAAATATCATATATGTACATATGTAGCAAG:1 - chr3R 21938162 3' - roo 8726 2 64.38 ATCAATCATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACAACCACTAATAAAAATTACAATAACAATTATAACACGAACTGACAAAAGCAAGGGAACAGTTACCGGGACAGCGAACCAACATCGGAAGCTACAACAG:1 - chr2R 4634415 3' + Q-element 189 2 69.18 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTCGAATTTTGAATGCAGTGAGTGCATTATAATCAAGTTCGCACTTTCAAATTGCGGTTGGGGTGAATATTCACGGGGG:1 + chr2R 12343295 3' - roo 44 2 56.16 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTTTCCTTATGTGAACATCTATTCGTCACTTGAATGTGAAAAAAGTAAACAGTGACAAATACTGATATAAAAATCGACAAAAGTGGGAGAAGACAATAGCAAGTCAGAATG:1 + chr2L 13293060 3' - copia 13 2 71.23 GAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGATATGTCTGTTTCCAACGGGAGTTCATTTTGATTTTGGATCGAAATGTTTTTCCTTTGCCCATTTTGGATGCCATAAATTATGATTAGCT:1 + chr3L 20878550 3' - hobo 347 1 60.96 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACCTTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAA:1 - chr3L 20765132 3' - 297 6632 2 52.74 GGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACTCGTATTTATTCATTAAAACAGCAGAAGTGCCGAATNAAAATGCATCAATGCTCGTATATTTAATTATGAAATGTTTGT:1 - chrX 3559562 3' + opus 7468 2 51.37 AATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGC:1 + chr2L 13328509 3' - BS 52 1 54.11 ATATCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTATACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATT:1 - chr3R 31771980 3' + mdg1 7301 2 50.68 CATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTACATACATATATGTTTGTACATTCATTTACGCACGAAAAATATTCATAAAGTAGATGGGCGATTAGATACCGCTATTTTCGGTAGA:1 - chrX 19690492 3' + gypsy 7437 2 51.37 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATAATCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAG:1 - chr3L 20168203 3' - roo 69 2 64.38 GTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCG:1 + chrX 21667962 3' - gypsy2 6532 2 71.23 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGTTGTCTAC:1 + chr3R 23416029 3' - jockey 4785 1 66.90 AAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTATTCGGCGGCTGCGATTGGTATCCCCACTATTCAGTTTCTAC:1 - chr3L 20189557 3' + FB 247 1 48.63 ATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTTTTCGCATAACTTCTTATTGGTAACTAAGCCACATTTGACATTCCACAGCTTCACTAC:1 - chrX 6206324 3' + mdg3 5345 2 58.27 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCC:1 + chr2R 10541712 3' + P-element 2876 1 50.00 TTAGAGAATATGATAAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGACTGGTAGCGTTGATCGGAACTTGCTGCGCTGCCGCACAAAATGTTTTCCATTTTCCCCCACATTTCACCCCTTTTTCCCCATCAGCTCTTTGCCGTTT:1 + chrX 10953653 3' + invader4 204 2 61.64 AAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGACTTTATAAAATTCTCATATCATCTGCAAGTAATAACATTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACAC:1 + chr2L 16884783 3' + Bari1 1707 1 54.79 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAATGGCGTGATAAAATATAGTTAATCCTCTATCCCAAACAGATTATTAAGTGCCCAAGGTCTTCTTCTTCTTCAACTATTACCTAAATCATAAATTTTGAAATGACAATT:1 + chr3R 12042975 3' - jockey 4750 1 75.86 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTA:1 - chr2L 11476267 3' + pogo 2040 1 63.57 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTATAGT:1 + chr2L 16995558 3' - roo 85 2 75.34 AACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCACGATAGCGCCGCCGGCTGTGCGTGCCCCCCATGCCACACCATACCACTCCATG:1 - chr3R 28976656 3' - pogo 1880 1 62.14 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAAT:1 - chr2L 8895246 3' - 412 7115 2 68.00 AATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAA:1 - chr3R 27007353 3' - roo 8736 2 66.44 ACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCATGGACACACACGGGAACACACACTGC:1 - chr3R 7041939 3' + Stalker2 7645 2 78.46 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATTTCTCAGATAGGATAATCGATTATATGGGGTTTCGAAAATATAACCTATTGATAATCAAATTGGCGACGTTTCTCCCATTTAATTGTAAGCCAGAGTAAAC:1 - chr3R 15585509 3' + I-element 5334 1 71.92 AAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGGTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATAAACAATCGAAGGGTATACGCGATGAATTTCAGGTGTTTGGCAATTAGGAATTTTCACATAAT:1 + chr2R 15307209 3' - Stalker 311 4 57.24 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAGCCTGCCGATACCAGCGCTGT:1 + chr3L 13889018 3' + 412 453 2 54.79 ATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGG:1 + chr3R 29283258 3' - hopper 86 1 74.66 TATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTACACAGGCATCGACTGAGGTTCGTAGCCCTGAACCAGGTCCTTTATAGCACCCAATCACGACTGGAATCGG:1 - chr2L 16994717 3' - roo 1 2 53.42 AACAATGCGTACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCATGGCAGCCAAAGTTTTATTAATGCTTTGGCTCTGCTG:1 + chrX 7118155 3' + Doc 282 1 70.23 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAGGCAACAAAACTAT:1 + chr3L 22435242 3' + opus 472 2 66.44 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAGAATATAGACATCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCACAGTC:1 - chr3R 17777489 3' - jockey 4679 1 50.00 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTTTGCGGCTGTGTGGCACCCATAATGAGTAAGCCCAAAACAAGAAGTTCTGCAAGAGACAGGATCAGATTAACCGGACTTGATCACT:1 - chr2L 8930445 3' + roo 9038 1 62.33 ACTCCCCCTTGATGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAATTTCACTTTTTTATTAGGTTTTTAAGAAATTTGTTTCA:1 + chr3R 6999734 3' - R1A1-element 5128 1 72.60 GTTTGGCTCTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGATTATTATTTTTATGTCCCTGCCACTTATTGTAAAGCAGCAAATTGCCTGA:1 - chr2L 1233134 3' - 1360 3346 1 57.63 TAGCATGCACGATTCGTTGCTCTATCTGAACCGAAGTTCTGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCGTCATAGCCATTTTATTATAACAATTATTTTGCGATGTTTATGCACGCTGAGGGTGCCCCTCAAAAGTGCGAGGCAT:1 + chr3L 19272545 3' - R2-element 3497 1 77.46 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGGTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTCTTTTTATTGCTTTTGTTGCCTTTCTTGGCCTCTTATTTTC:1 + chrX 10547755 3' - P-element 57 1 43.84 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGGGCTTGTCCTACCATT:1 + chr3R 27016559 3' + roo 9045 1 60.96 ATAAAAAAATTAAATAAAAAAAATCTAATCTAATAATTAAATGCTTACATTTGGATGGGGCTATTCGAAAGGTGAGCTCAGGTAATAATGGCCGAACAGAAGCAGCTGGAAGCAATTGCGAATGAGACCTCATCAGTCACCGGATT:1 + chr2L 7613442 3' + X-element 4717 1 65.75 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAG:1 + chr3L 13888998 3' + 412 7486 2 58.22 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTT:1 - chr2R 18723664 3' - 297 6633 2 68.99 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTATGCGGTCCAGTTNACCGCTTGACATATGACCGTCATCATTTAGCGCATATATGTATC:1 - chr3L 5958569 3' + 412 7531 2 73.29 CAGCAGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCAGTTAGGTATTTCATATTCCATCCTGGAATTTATGGTCTCTGGAGAGTTTGTTTATTATTTCAGAAAACTTGAGACATAGAATAATTTTTAGTTTTCTTAT:1 - chr4 244264 3' + Circe 302 1 64.38 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAAATTCCAGGTATTCGGAAGGACTAAAATACTTTCTTTATGTCCCTTTTTTTTTACCTTCGCCTCGGACTTGCCCTATTTTATTGTCAACCCATGCTAGCGTCATTTATGTT:1 - chr2L 21026593 3' - FB 5 1 80.00 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACACTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTACCTAATAATAATTAATTATTTTCTCTTCAAGCGGTTTGAA:1 + chrX 4292941 3' - S-element 75 1 73.29 CAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCGCCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAATAAGAGCAAGGATTGTTTTTTGAAGGCCATCGACTGTTA:1 - chr3R 10121199 3' + Gypsy12A_LTR 2174 1 70.55 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTACTGCGC:1 - chr3L 21292524 3' - 412 81 2 71.23 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATCTTATTTGTAATTGAAGACTATTAATTTAAGCTTCGAT:1 - chrX 15539981 3' - roo 8744 2 76.71 GTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCCTATATATAACTTGTTAACTTGTTAATAACAGAAGACCAATAAAAATATTTTAACTC:1 - chr2L 22092908 3' - INE-1 534 1 74.66 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTGTTCTTCAGCATGATGGGCGGTGTACCGCA:1 - chr3L 20693578 3' - jockey 4759 1 79.17 ATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTATACATATTTACTTGGTACCGAACTTACATAAAACTTTGCATATGCACAT:1 - chr3R 11757902 3' + invader4 311 2 45.21 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAG:1 - chr2L 19940022 3' + mdg1 353 2 63.70 ATGGGCCACCAATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATCCCGCTTGGGGCTCAATGGGGTTAATAAGCTGCTGCTTAGATGGTT:1 - chr3L 22414463 3' - diver 236 1 68.49 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACGGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCGGGTCATCCATGTA:1 + chrX 140118 3' - blood 36 2 60.96 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATCTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCT:1 - chr3R 17944050 3' + P-element 2790 1 19.18 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTCAGTTGGTTAA:1 + chr3L 21292595 3' + 412 7475 2 64.38 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGT:1 + chr3R 20345554 3' - blood 7059 2 51.37 GGGGACCACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAAAGGGGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCATCAAATCTAATCAAATATTTTCTTTGAAGGATATAATTTATAAATAATCTTTGCTTGCCATGCAA:1 - chr2L 12225460 3' - R2-element 132 1 54.11 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGAATCTGAATGACTGCA:1 - chr3R 19446111 3' - 297 35 2 59.59 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACG:2 + chr3L 21913461 3' - 297 38 2 59.59 AGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGTGGTAACAAAAATAGCACCGATCACGTATTTGCTGAATACTTTGAAATGATTTATATAATGCGGCATTGTCTGGTGATGCCAGACACC:1 + chr3L 3689213 3' + Tc1 129 1 67.12 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAA:1 - chr2R 10695767 3' - roo 8717 2 54.79 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTNACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAG:1 - chr3R 14277881 3' - P-element 33 1 53.85 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACA:1 + chr2L 16382557 3' + hobo 2863 1 73.38 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTATAGTCCACATACAGTGACATTCATTCCGAGGCCTTTCAGGGCCTGCGCTGTTG:1 + chr2L 16995607 3' - roo 36 2 59.59 CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGCATTTTTATCTTGTGTTTTAAATGAACTCGTGTC:1 + chr2R 21619423 3' - blood 7079 2 61.64 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTGCTGTGTTCCCGTCTCCGGATCTTTGG:1 + chr3R 6147356 3' - copia 42 2 56.55 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATCTCACCGACGGACCACGTCCACGTTTAAACTGTTTTGGCCAACTGAACTAGCGGAAGAACTTGCAG:1 - chr3R 25961972 3' + I-element 5302 1 52.74 GAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTATTCGGCGGCTGCGATTGGTATCCCCACTATTCA:1 - chr3L 20189565 3' + FB 239 1 43.15 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGCAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACGGCTGGCCAAAA:1 - chr2L 19939992 3' + mdg1 7421 2 55.48 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGT:1 - chrX 8208324 3' - roo 8738 2 69.66 AAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTATGCTACAAATAAGGAAGAGTCGATGTGAAAATGGAAGGGCAAAGGTGGAAGGGGAAAGCCTATCCCACCATTGGTTTGCT:1 + chr3L 2923186 3' - flea 379 1 58.90 GCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGTTTCTATTATTATGATTACCTTCTATAATGTTAAGACAAAG:1 - chr3L 1660221 3' + Tirant 138 2 71.92 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTTTTGTGTGCATTAGCACAT:1 + chr3R 24074870 3' - jockey 4790 1 61.64 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTTTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTA:1 + chr2L 16607301 3' - 412 7113 2 55.86 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTGAGAATTGCAAATTTTTTTGTTAAGATATAAAAATAGGCCAAACAATTTTAAGAAAAATTTAAATTATGTCGACAGACCA:1 + chr3L 18189395 3' + S-element 1680 2 60.96 ATAAAAAAAAAGAAAACAAAATATCATCAAGCTATTGAAGAGTCTTATGGTCGACCTAAAGTGTTAGTCAACTGTTACCCAATGGGGAAATCTTCTTGGTACTACAAGAAGGGTTTTTCAATGGATAGCATAAGACTGGGACTTTG:1 + chr2L 16769041 3' + gypsy11 3931 1 51.37 GGATAAAGCACAAATAAAATAAAATAAAATAAATAATAGAATAGTGTTAGGAAAATGCCCCAGACCTGTGAAAAGTGAAACCTCTCTAATAGCCAATAATAGCTTACATTCGAAAAAAAAGATTCCACAACGCCAGGCATCATTAA:1 - chr3R 31486332 3' + Juan 4206 1 72.60 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATAAAAAAAAAATCAAAAATATCAAACAAATATGAATAGATTAATTCATAATAAAATGAAATTCTATAATATTTTTAGTATATTTTTCTCTGTGTAGCGTAACAAGACCTG:1 + chr3R 29195587 3' + flea 5005 2 78.08 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGTAAATAACAA:1 + chr2R 7769850 3' + Transpac 259 2 56.85 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAGAAAGTAGGGTTTTAAAATGTTACCAGGAGGGCAG:1 + chr3R 6399507 3' - pogo 11 1 78.08 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACCACTGGTGGACGCCG:1 - chr3R 13676088 3' - P-element 36 1 54.03 TGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCCAAAAATTCTTAATCTACGTTTATTTATTAAATGCTCAACTTAAGCACTTGTCATTAAAAGTGGGTAACTGGAGGCAGCCAGTGGGTAACTGGG:1 - chr2R 11439403 3' + 1360 428 1 70.83 TAATATTATTATTATTAAAGTTTATCATTATTATATGATCTGGACGATTATCCTGCGCTTCGCCATTCAGGACATCTCCGTGGAGGAGATGACCGCCAAGGAGGGTCTGCTGCTGTGGTGCCAGCGCAAGACGGCTCCCTACAAGA:1 - chrX 2030478 3' - mdg1 7072 2 77.40 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGT:1 - chr3R 12115236 3' - 1360 33 1 59.59 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCTCCCGTGCAACTAATGCACACTTAAAATA:1 - chr3R 8394433 3' - hopper 88 1 75.34 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGT:2 + chr3L 21913455 3' - 297 6625 2 55.48 AGTCTTAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTTGTTATAAAAGGCTCTGGCCATTTGATTAATGGGCTTTTCACTTT:2 - chr2R 17227758 3' + S-element 1523 1 72.60 GTTTTTTATTTCGCTCCTATTCTGGGGAATTTCGATAATCAAACGGTACATAGTCGTCATTTACGCTTTATGCGTTGTGTGGGAAAGGGATTTTGATAACTAATGCCTTTTTCTTCTGCGCTCCGAATTTGTAATTTGTAAAAC:1 - chr3L 23233610 3' + S2 244 1 57.64 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCGGTTGAGTAATCGTAATGTTGTCTACCAATAATAAA:1 + chr3R 23416039 3' - jockey 4770 1 75.00 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAAAGCTTATGATTGTTGTTAGAAACTGTTAGAATCTGTTGTTCGAGCGCTGAAAAGTATGCTACAAAAATGGTAACGAATTTCCTAGCCAAATAGAA:1 - chr2L 5515361 3' - BS 5019 1 57.53 GCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCCAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACATTTTTGTCATTCCAAAACGCCCA:2 + chrX 22689462 3' - mariner2 48 1 63.70 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGACTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGTTGACCGCTTGAGTTATTCAGTTGCTAAGA:1 - chr3L 14232990 3' + copia 246 1 75.34 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAAAAAA:1 - chr2R 25083257 3' + pogo 2062 1 62.33 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACT:1 + chr3R 13376033 3' + 1360 3311 1 73.10 TGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAAT:1 - chr3R 16881921 3' - 3S18 81 2 75.89 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATT:1 - chrX 21227094 3' - Tabor 6888 2 52.05 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGATATTAACTGTTTGAAACAGATGTTCG:1 - chr3R 13375912 3' - 1360 21 1 69.86 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTTATTGATTAAAAGTCAAAGGAAAGTTTTAAGCAATTAAAGCGA:1 + chr2L 2317017 3' - roo 8741 2 71.92 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGGAGCCAAGCAAACATATGAGCACA:1 - chr2R 13695593 3' + blood 347 2 64.38 CCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTATGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGACCAGCACCGAAGCCAAAAGCGCAAGTCTAAGA:1 - chr2L 5341520 3' + Burdock 172 2 75.34 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCNGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCC:1 - chr3L 13546589 3' + hobo 2899 1 75.28 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTTTTCA:1 + chr2L 11476387 3' - pogo 40 1 56.85 AATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTTTGTTTAAGGTTGCGCAGCGAAGTCAGTAAATGAGAAA:1 - chr3R 12215324 3' + R1A1-element 4869 1 73.97 TCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAACTTAGTCACTAGGCATGTACAATAGTACACATTATAAACTAACTAAACGTCTGAAACCAATGCGACTTTATTTCACTGATCACTTCGTTTTTACAATTTCATCTAAAACAAAATTGATTA:1 + chr2R 18044104 3' - jockey 4561 1 76.71 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTACATGGGCATTACCATTGGACATGTAGACTCTTGTGACCCCTACACACCCGCATGCTGA:1 + chr3R 4190999 3' + pogo 2041 1 63.01 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTTTAATTAA:2 - chr2L 19698038 3' + roo 387 2 66.44 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATACAAAAATAGGGGATTGCCAAAGGATGTGGTTAAAATAACAGTATATGATGGTCTTAT:1 - chr2L 20819224 3' + copia 227 1 58.90 GCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTTACATTGGCCACTTTTTCCAGTTTA:1 - chr3R 12789470 3' - G2 2752 1 79.45 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTAGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAATTGAGCCTATGCTTACCTTAGCGAAATTAGACATTTGTTAATTGATTTATTGCAATTTTCTGTTTCCCCTTTGCAGATATGCTCGTTAG:1 - chr2L 19733057 3' - FB 33 1 63.01 ACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCATCTGCACACAAAATTTTTGGGTGTGTGTCGAGTGGCAAAAAAACCCCTGGAGGGCAAACTGCAGTTTCCGTGGACTCCGCAACTTCCTGCCCATTT:1 - chr3R 8644886 3' - hobo 86 1 76.98 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCAATGGTTCAATAATAAATGCAAATATATAGCG:1 + chrX 7042762 3' + roo 9047 1 69.18 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGAATTTTTATCTTGTGTTTTAAATGAACTCGTGTCCGTA:1 + chr2R 21619427 3' - blood 64 2 58.90 AAAACTAATTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGCCAA:1 + chr2R 18723756 3' + 297 331 2 62.33 CAAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCCAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTACGGACTGCCTGCTCGTCGGGGGGG:1 + chr3R 17245840 3' + R1A1-element 35 1 80.82 CATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTTTTGTGTTCGGCATGAGGGGGAGGTGAGAGGCTGGGAAAGCGTCAATGATAATTGCGACCAGAGCAATTAGGGCGATTAGTACGCTATTAGTGCC:1 + chr3R 19561239 3' - I-element 168 1 68.49 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATCATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCGTACGGACACGTGTG:1 - chr3L 16200688 3' + roo 393 1 73.29 ACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTTGCTTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGACCACTCTGGTTTTAAACTCGA:1 + chr2R 5071067 3' + Tirant 8189 2 50.00 GAAAAACTTCACGAGGCGATCAGCTGTGAGAGCTTTAAGAGCTGTAAGAGCTTTAAGCCCTGGCTGGTTCGTGTCCACGGTACACTACTACTTACAAGGCGTGTATTGCTGTATTTTCATACAGGTTACATGTGTGGTTA:1 + chr2L 20491448 3' + G5 210 1 73.57 CAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATATAAGAGCC:1 - chr2L 7148532 3' - HMS-Beagle2 33 2 61.64 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTTGAGCAATAAAAAGACGTTTTTTTATTTAGTGATTTCGAACGATAAG:1 - chr2L 22340050 3' - Doc 18 1 75.34 TATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAA:1 - chr2R 15406247 3' + I-element 5266 1 76.71 GTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCATGCCTTGT:1 + chr3R 5972395 3' - Doc 255 1 70.91 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTCCATACGCGGAATAATAATTTTCAAAGGATATGCGACACATGCAAGCGTTGTATGCCGAGGACTTATATATATTTTCCCCTCGCAAATAT:1 - chrX 7032633 3' - roo 28 2 66.44 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCTCTTGATCGAGTTCATTGTTATTGTGTTCG:1 - chr3L 22038152 3' - diver 5893 2 82.19 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGACTAAACATTTTGACTATTCTTTTGGTGTAGGAGATTTTTGTAATATGCCTGCTTTAATGA:1 - chr3L 17602524 3' - Doc 66 1 58.22 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGATATTAACTGTTTGAAACAGATGTTC:2 - chr3R 13375913 3' - 1360 22 1 69.18 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCC:1 - chrX 19121921 3' - 412 86 2 74.66 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGA:1 - chr2R 24807871 3' - I-element 48 1 53.85 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGANATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTNCGG:1 + chr2R 13695720 3' - blood 7036 2 54.29 GCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTC:1 - chr3L 18947270 3' - BS 4746 1 72.60 CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGC:1 + chr3R 6147322 3' - copia 77 2 67.81 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTTTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATATATATATAACAAGCCGCGATTAAGTTGCAAAGCC:1 + chrX 10147963 3' - pogo 41 1 73.83 GCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTGACGTACAACTTTCAAAAATAATACGAGTTTTTTATTAATATTT:1 + chr3L 23839775 3' - McClintock 8 2 79.45 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCCCTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATCCTCCCGAGACCACGTCCACCC:1 - chr2R 14484064 3' - pogo 22 1 65.07 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGGGGAAAAGCGAGTGGAAAAGCGGCGGGAAATGCGAG:1 - chr3L 2687179 3' - jockey 4693 1 61.40 CAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGG:1 + chr3R 27016544 3' + roo 367 1 58.22 GGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCTTCTATGGTTACACGCTAGGGCTATTTATCCCGTTAG:1 - chr2R 5394952 3' + HMS-Beagle 168 2 72.73 GACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAGAAAATTTCCACAATTATGAAGTATTACAAGAAAACAAATTAATGTTCTTTTCCTTGGCCCAATGATTACGCCGATACGTTCGGTTTTTTAC:1 - chr2L 2521032 3' + TLD2_LTR 176 1 54.11 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATAAGAAATAGGCCGCTTTCAACTGATGCG:1 - chr3L 8157985 3' - flea 38 2 57.86 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATCATATTCGGTTTATAATTGCAGTTGCGGATTCTGGTATATACAGTAGGCAGCACCAGTGTTTTATGGTGTTGTCG:1 - chrX 139977 3' + blood 7345 2 52.78 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCTTTACTCGTGCTGTGCTGCTAGAGATG:1 + chr2L 6047906 3' + P-element 2826 1 30.77 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGT:2 - chr3L 1477375 3' - mdg3 5323 2 63.01 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGC:1 + chr2R 22971852 3' - jockey 4839 1 73.29 TCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAACAGGAGGTACTAAGGCA:1 + chr2R 16185150 3' - 17.6 6955 1 66.90 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACTGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTAGCGATACCCTTCATTCGGCTGGAAGCCCAGCATC:1 + chr3R 29283310 3' - hopper 23 1 62.96 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGAT:1 - chr3R 21843764 3' - blood 7090 2 69.86 ATATACATAATAAAATAAAATAAAAGTTAAGTTCTAGCTAGCAGAACATCTCATCACCTTTTTTGTAGAATTACTATAGTTTGAAATTTCGCTCAGTGTTCTAACTACAAAACTTGAGGCCATGGCACGACCCACACTCGCAGC:1 - chr3L 1986230 3' - transib1 1904 1 79.17 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCGGAGCATTGA:1 - chr3R 4530655 3' + copia 222 1 63.01 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACGGCTGGCCAAAAATTTGAATTCAGGCGCAGCC:1 - chr2L 19939972 3' + mdg1 403 2 70.55 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGTT:1 - chrX 19163237 3' - Burdock 38 2 59.59 CGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGGAGCAGCAGGAGCTGGAGCAACATTGGCCGGAGCAGTAGCTGGAGATACCGCAGGGAAA:1 - chr3R 7345891 3' - micropia 5202 1 77.38 GTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACC:1 - chr3L 8754740 3' - mdg3 5253 1 73.68 GGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTATAGGTAAACAGCAACAAAGTAAATATCAAGTTAACACGCCTGCGGCTCTTCACTTGGCCAACTG:1 + chr3R 12801989 3' - G2 2922 1 55.48 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTTTTCTGCTA:1 - chrX 16589149 3' + pogo 2094 1 66.67 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGT:1 + chrX 22511442 3' + roo 8989 2 76.03 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTTCAAACGAAAACGAA:1 + chr3L 2486029 3' - jockey 4699 1 51.37 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACGACGTATACG:1 - chr3L 2485885 3' + jockey 4946 1 47.95 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATACTCACTCCTATGAAGCCGAATAGAATGGATGGTCGTCTCAGCTTGAGGACATTTAAAGTAAATAATTTATAATGGCAAAC:1 + chr2L 3408860 3' - opus 149 4 57.53 TATCTATCGATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTCGCATTCGCGTTTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATGCGAGAAACTCGACTATAGCTCGACTCTCTGGTTTAAAACCAACTTGTTGCTGGCTTTTCTTATTTATAT:1 + chr2L 4030762 3' + INE-1 499 1 67.12 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATAGTGACGAATGGTTTTTGAAATCGTGTCTGAGCTTTTCCAGTTTCGAACATTTATAAAAT:1 + chrX 20233896 3' + pogo 2046 1 56.16 TAGGTAAAGCTCGACCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTA:1 + chr2L 5341601 3' - Burdock 6195 2 56.85 CGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGAATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGA:1 + chr2R 17696119 3' + rover 309 2 62.83 GAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCTGGCTACACATTTGATGTAATGATTATTCAAGAAACCAAATTGCTTAGCTATGAAATAGGTACTCAGAAATCAA:1 + chr3R 19629048 3' + Transpac 266 2 50.68 AGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTTGCGGCCCCAACCAATGTCAGTGACACTCAGCTCAGAAGTCAGTGTCAATGTCTG:1 + chr2R 22199237 3' - Rt1b 5095 1 62.33 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGTGTAGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACG:1 + chrX 19887129 3' - P-element 55 1 35.29 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTTTTCACTGCATTCTTTTCGACACCCTTTAATTGCATTTAAGCATGCACATGCACTT:1 - chr3R 28413866 3' + pogo 2039 1 58.90 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATT:1 + chr2R 12249044 3' + Juan 4138 1 67.81 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAA:1 + chr3R 22435579 3' - roo 79 2 72.60 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTTAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTGGCTTTGAGTGGCAAGTCTGATTGTGTAACAGGATTTCGCAGTCCTTATGTTCAATTGCCAA:1 + chr3R 8631716 3' - roo 59 2 57.53 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGTGTTGTTGTTTTCGGCTGGAGTGAATACAGAGACGCACAC:1 - chr3L 19907079 3' + P-element 2878 2 73.64 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTCTTTTTATTGCTTTTGTTGCCTTTCTT:1 + chrX 10547741 3' - P-element 71 1 34.25 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCG:2 + chr3R 9550980 3' + P-element 2813 1 34.93 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGC:1 - chrX 21227098 3' - Tabor 53 2 51.37 TGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATAACAAATCCATCTGAGTTTCAAGACTTTTTATTTTAGCCAAGTTTCGCATATATTTGTTACAGTT:1 + chr2R 15698168 3' + opus 445 2 56.16 TGAGATCTGGACGTTCATACGGACGGACATGGCCAGAATGACTTAGCTTTGATCCTGATCAAAAATATATATACTTTATTGGTTCGGAAAATCCACCTTCTTCGTGTTACACACTTTTTCTCTAAAAGTGAATTGTATATCTATAA:1 - chr4 708186 3' - INE-1 135 1 56.16 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTGCGAAAACTTGGACTGGCGGCAAG:1 + chr2R 22774618 3' - I-element 54 1 52.74 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAGCTTGTATATGGATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGTGAATACATGACT:1 - chr3L 22435106 3' - opus 7027 4 48.15 GACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAACTTCTCTATCTAGCTTTGTTACTCA:1 + chr3R 5575075 3' + blood 7358 2 62.33 TGGCTCCGAGCGATGGGGCAACGAATCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGTATTCTGAGAATCACTGGAGCTCCGTGGTATCTTCGGAACGAGAATATATGATCTGAAAGTAGCTTTAGTTTTCTATTTG:1 + chr2R 19220563 3' + Doc3-element 4329 1 78.77 CAGGCGTTCTTCGCGTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTGGTATACTGTCTCGGGTGGCTGTTTATACCCTTCTACT:1 + chr3R 6603034 3' - gypsy 83 2 76.06 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCG:1 + chr3L 15273312 3' + pogo 2047 1 60.43 CGAAAATGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTCATCGCTGGAAATGCCAACGAAATCAGAGTAGGAAAACAGGCGGAAACAGGAAAAGTATGCGGTCAAACA:1 + chr3R 21248884 3' + R1A1-element 497 1 57.35 GGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTTTTCGGGTCTGCTGGGGGTTTGTCGAGCTTGAAC:1 + chr3R 11903518 3' - FB 86 1 75.34 AATCTTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATTCCTTAATCCCTATTTCATACTCTATGCATAACATGTTTTAATACTTAAAAACTGTCCGGGAGATATAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTT:1 - chr2L 8776852 3' - G4 3781 1 69.86 CACGTCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGTAAATTGGATTGAGGCGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATATCGGGAGAAATAGTTTTCACGTCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAA:1 - chr2L 22076769 3' - 297 294 2 62.33 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGCGACCCTGATTCAGACATATTTAACGGGG:1 + chr3L 17758037 3' + Tirant 8466 2 52.71 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAA:1 - chr3R 13375940 3' - 1360 49 1 52.74 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAACTTCATATACCTCCAAAAAATCCTAGACTTTCCCTTCAATTTATTGCTGAAGCCTAGATAATTTATGTGTTCC:1 - chr3R 27512910 3' - BS 5076 1 49.32 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTGGAGCATTACTCATTCTCATTTCCAACTGAGCGATCGGCTGAGAGAGCAGAACTGAGACAGATACAGAGCCAAGTACAGATAGTGGGGACAGCTGAGCACGTTTTGTTTGTTTGTGGG:1 + chr2L 3632271 3' - P-element 3 2 71.92 AAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACACAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCA:1 + chr3R 21679690 3' + roo 357 2 50.68 AGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAACCACC:1 + chr2R 3104475 3' + Gypsy6A_LTR 346 1 69.86 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATACCAAATTGAAGTTAAAATCTTCGGGTGTCGTAGTCAAGATAGTTCGAAAGCT:1 - chrX 16490402 3' - F-element 15 1 73.97 GTTTTTTTTTTTGTTTTTAAATATTTTCTAAAACATTTGTATTTAATAGTTTTTTTTCCTTGCTTTTAAAAAAGTATAATTTGCAATAACCCCTTTTGTTTAATACTACAAACACATTTATATCTTGTATATTTTTGAAAATTATT:1 - chr3R 18104925 3' - TART-C 11099 4 48.63 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACGTGCCTGACTTGTGTGATGG:1 - chr3R 17494920 3' - hobo 67 1 72.09 TCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTCCACAATTGACACATTCTCGCCCCTCAGTGAAATA:1 - chr3R 16000630 3' - P-element 315 1 23.97 GGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGTAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCAGGGTGGTTGCGATTGGCTGACGAACATGGGATTCCACAAAATGTTTTTCACACC:1 + chr2L 22181213 3' + R1A1-element 5120 1 58.82 GTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCATAGATATTATCTATCTATATTATATACATTTATAGAAATCGAAATCGATTTGTTTATCGTCATGTAAATGAAAATCAAATAGCACTCTGTTT:1 - chr2R 18466317 3' + 1360 190 1 53.42 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACG:1 - chr2R 23595999 3' - blood 7097 2 76.03 GGTTGCTGGTCGGCGGCCGTGATTTGTGCCCTACAGCCCTCTGGTGGAGGATGCAGTCATCTTCCTCTCCCTTCGAACATTCAACACAACCGCCGTGAACAACTCCGTCAATCTAGCC:1 - chr3L 19804101 3' + Chouto 64 1 75.42 CGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAAATACACTATTTACAAAACTTTAACGCATCAAGTCATGCCATTATCATTGAGTT:1 - chr3R 29195440 3' - flea 4824 1 63.70 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCGTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGG:1 + chr3R 20260909 3' + roo 9018 2 54.11 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGTTTGTTCCCTAAGTTGGTGGGTTAT:1 - chr3R 12115212 3' + 1360 3380 2 76.03 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCA:1 - chr2L 16537531 3' - Transpac 57 2 56.85 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTATCGGTTTCTTCACTGCCAAACAATAATTCTTGGTATA:1 - chr3R 31458367 3' - jockey 34 1 61.64 CAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAATTGTTTTATCTTTCGGCAATTATTTCAAAGTCATGTTGATTTCTCTTTTTAATGCTCTCTTGAAAACTGATGGCCAGCTGACTTCTA:1 + chrX 9583999 3' + Tabor 7257 2 59.59 CCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTT:1 - chr3L 9522045 3' + opus 434 2 69.18 GTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACG:1 + chr3L 21913481 3' - 297 11 2 76.98 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGAAATACTCTGGCCACATTC:1 + chr2R 16367472 3' - hopper 43 1 53.42 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGATGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCCCGCAG:2 + chr3R 13453396 3' - 412 69 2 66.44 ACATAAACATAGCAACAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGT:1 - chrX 19121900 3' - 412 64 2 59.31 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAAATTGGTGATAATTTGATAAAG:1 + chr3R 14278001 3' + P-element 2849 1 59.59 CTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTGTTTAGTTTCTAAATTAAATTGACAAGTTCTTTTAAAAGAGTATCCA:1 - chr2R 7407981 3' - 3S18 5838 2 71.92 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCTCACATTTTTCTTCACCTGACTT:1 - chr3L 10023948 3' - transib2 38 1 58.57 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACTCGTATTTATTCATTAAAACAGCAGAAGTGCCGAATTAAAATGCATCAATGCTCGTATATTTAAT:1 - chrX 3559576 3' + opus 7456 2 60.42 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGACGCAGCATGCAGTGGGGTTGGTTGCGGATAGATTTTTTCCACCGCCGCACACACACACACACACACGCTGACTCTTTTTTCCTGCCGC:1 + chrX 1607812 3' + hobo 2928 1 75.41 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTATGTATATANANATATGTACGTTCAATACCGATCCGATCCGAGGTAAAATTCATATGTTGTTGTCTGTAGCCACTCCCTTCTCAATCGGACTTTGTGCATTT:1 - chr2R 21529904 3' - HMS-Beagle 15 2 77.40 GAAAGAATCACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCAATTATAGAAAACAT:1 - chr2L 3133654 3' - Doc 24 1 62.33 GATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAACAGCGACAGTAGCATAGAGAAAAATCTCAGCTCTTCCACCAAAATTGGACCAAATGCTTCTTCCCCTCCTTCTCATGCACACACACACACTAGCA:1 + chr3L 13198149 3' + TAHRE 10399 1 57.53 ACTTAATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAACATCTCACCCTCAGCTGAACAGCATTGT:1 + chr2L 3588629 3' + Tc3 278 1 78.46 TTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAA:1 + chr3L 19350026 3' - 1360 3244 1 47.95 GTTTACGGATTAGGTTTAGGAAAATGTGTCGAAATACTATCCTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGACCACACATGTAACTGCCTGCAACGTGGCAACGTTTAATGTATTTGATTGAA:1 + chrX 21242780 3' + Circe 7047 1 62.33 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGC:1 + chr2L 13850744 3' + roo 397 1 69.03 ACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCGATGCGGAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAGAGGACTTTTCCGTGAAATGGGAATGCAAAAAGGAGCAAAGTGGAAAAGCGTTGCACTCCCCACGGAC:1 + chr3R 13255383 3' - Doc3-element 4355 1 59.59 TATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAGATCTCAACTT:1 - chr3R 17996712 3' - copia 4943 2 70.55 TACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTCGCTTAATGACGACACGAAGCCGCCGTTTGAGCCGCGACAGAAAGGGAAA:1 + chr2R 21362838 3' + Tirant 8439 2 63.70 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTTTGCAATTGGTGAGCAACAGGATGAAGG:1 - chr3R 5977701 3' - copia 33 2 63.01 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTG:1 - chr2L 9599810 3' - roo 77 2 69.86 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTT:1 - chr3L 22041076 3' - roo 72 2 67.81 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGGACCTCCAGTTCGTTCTTCAT:1 + chr2L 3911984 3' - roo 8674 2 77.24 AATAATAATATAATATTAATCAATTTTTGTGTACTAAAGTGAATTCTGTACTTGATAATGCTCGTTAATCTTTAAACTTCCTTTTCCTCTACTTAATAGAATGAAAACATATACATTTAGCTTAATTGGATTGTGGCCCCACAAAT:1 - chr2R 17088317 3' + invader3 5051 6 54.11 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCATTAATCAAAAATTTGGAGAAATAAATGCTCGTTTCTTTCGATTTATTTCGGCCCCCTGCCAGATTTGATAAATAATTGCTATCTTATTATGTCGATTGTCGTTGCTG:1 + chrX 16219342 3' + roo 397 1 77.40 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAG:1 - chr3R 9550916 3' - P-element 82 1 29.45 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCTAGGAGCAATAAATTTAATCCGAAG:1 - chr2L 15917584 3' - roo 48 2 54.48 TACGACAATAAGTACATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTGCTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACAA:1 + chr3L 15099689 3' - G4 3807 1 58.22 AAAGAGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAAGAGGGGGGGCCAGAGGGGGGGAGAAAGCGGAAA:1 + chrX 13026697 3' + blood 7000 1 76.55 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGGAACAATCCCGGTACGAA:1 - chr2L 13675846 3' + flea 228 2 69.18 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTT:1 + chr2L 18738037 3' + roo 331 2 71.23 GACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATTGATGCGCGACTATAAAAATCAAAAGAAATTCAAGTTCTTTTTCGAGAAACGAGAGTGAAGGGAAACCGGCATTAAAATTAAATTTTTATTG:1 - chr2L 16884573 3' - Bari1 29 1 63.70 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGATGAGTCCGAG:1 + chr3R 13453368 3' - 412 7091 2 75.86 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTGCATAGGAAATATGGTTATAAAGTAACAAAAAGAATCCGTGCTATGTCCTTAAAATTAA:1 + chrX 11415799 3' + mdg1 359 2 67.12 GGCCGGCGATTAACGCGCGCGGCTGTTACNAACCAAGTGTCAGGCGGAGCCGTGACAATAAAAGATTAGGAGTTACTTTTAATGTTTTATTATACCGAGCTNTTATCTTTTGAAAAGCAAAAGATATTATTCAAATGAGAAAAAAA:1 - chr3L 19635023 3' - gypsy2 316 2 67.12 GTGGAAGTGGAAGTCGTATTCACATTGGATCTCTTTGGCCATTTTCCGGGTGCGGGCTTAGCACTTGCGCTTTTCTGGGTGGTAAAATGGTGAGGGAAAAACCGGGGGAAATGGAATGGAAACATAGACATAG:1 + chr2L 17040292 3' + transib4 2210 1 72.93 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACAAATTCATATATTTCATAATATTTTCACCTGCCGCTTTTCCTTTACCTTTACCACGGCTCTGGTTCATTTTTCACTGCCATTATGGCCTGCGGAAAGTTTTCGCG:1 + chrX 3596541 3' + copia 241 1 69.18 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATCCTCCCGAGACCACGTCCACCCA:1 - chr2R 14484063 3' - pogo 21 1 67.12 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAA:1 - chr2L 18112465 3' + transib2 2790 1 60.96 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTCTCATATATACCATACCATATTTTGGCATACCTACTGCCCCGCTTCCAAC:1 + chr3R 23511646 3' - 297 40 2 60.66 AATAACGCTTTTTGTTGTAGGCCTGATAGGTGAAAACCGGAACTGAGCCAGGGGAGACTAATGTACGATTGTTTATTACACACGTGAAGCTGAGCTCTGAAATGTTTTTGATTATTTGTGTACTGCCGAAAATGATTGTTAAATTA:1 - chrX 14759202 3' - BS 140 1 72.60 AGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACC:1 + chr3R 10751703 3' + hopper 1334 1 68.49 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAACCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATG:1 - chrX 12105248 3' + 412 428 2 65.97 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGAAAAAATCG:1 + chr2R 21199738 3' - jockey 4762 1 52.74 GATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTATCAAGCTTTATAATGCGCCTGGGTCGCTTGTCAATCCGAGTCTTCTGGCCAGGCTCTCGATTTTCCATGTGCGCAGT:1 + chr2L 7365928 3' - Quasimodo 7132 2 52.74 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATGTTCAGCTGGTGGAAAGTTGGTGTAGAAATTGCAAATCAGGTGATGCCGCGCAGTCGG:1 - chr2L 3059345 3' + P-element 2828 1 45.21 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAACTTGTAGCTTTATAAAACTATTCAAT:1 + chr2L 20044659 3' - roo 8703 2 54.17 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCT:1 + chr3R 24074850 3' - jockey 4810 1 55.48 GTTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACTAATTGCCACTTTGGCGCACATTAAAGTCAACTTATGCCGAGAATTGACTGCTGCAACAGCCGAGGCCTAT:1 + chr2R 20454958 3' - F-element 268 1 50.35 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAATGCCAGAGTTA:1 - chr2L 8895236 3' - 412 7124 2 65.28 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTAATTTAATATTAATTTATTTTCAACGATTATACTAAAATAAAAAGCATTCTGTGTAAATCAAGCAATTTATTTTCTAGATCTTTTCA:1 + chr3L 22041193 3' + roo 9038 1 63.01 CTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCATGAGATCTCGACGTTCGTACGGACATGATGACAAGCGTAAAGCCAAACGAAGCCGAATCAGGTTGCCAAATGCACTGGTACGGGCAATGGCCAATGAAGATTTATGG:1 + chr3L 170365 3' - INE-1 161 1 52.63 GCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTT:1 + chrX 21667949 3' - gypsy2 6545 2 71.23 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTGTG:1 - chrX 21227076 3' - Tabor 24 2 67.63 GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGCGGCGGACAAAAGTTGTGCATAAAACAGGAAACGGAAACACATCAGCGTGGCGGAAGTCAAAAAGTCGTCACATTCACATAACAATGATGGCAGCCATCACATC:1 - chr3R 10440367 3' - roo 213 2 71.92 ATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAAAATTCACTATTCTATTATGTTTCGCTATTTAGTGACTTTCATTTCCCGTCCAAATT:1 - chr3R 31525479 3' - Juan 4144 1 60.69 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTAAGCTTTCC:1 + chr2L 19698168 3' - roo 8736 2 66.44 AATTTAAGTGTATACTTCGGTNAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCATAAGTTTTGGTTTCGCTCTCGACTGGAAGTCTCTCAGAGAACGCGGAGAAAGGTGCGGTGTGCTCAACGCCGTGCTT:1 + chr3L 739269 3' - P-element 44 1 54.11 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTTTTCACTGCATTCTTTTCGACACCCTTTAATTGCATTTAAGCATGCACATGCACTTTAC:2 - chr3R 28413863 3' + pogo 2042 1 56.85 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGTTAGCAACATATTTCTGTGCAAAA:1 + chrX 20024633 3' + 412 7506 2 44.76 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTACTCCCACTCTTTGGATCCTCTCCACCGCTCTCTAAAA:1 - chr3R 11758510 3' + P-element 2804 1 28.08 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACATAAATTTCCAGTTAACTAAGTGTTTAAGCAGTCATTAAAAGGTTGTTGAAATTTATGAGTT:1 + chr2L 18173708 3' - blood 7043 2 63.01 ACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAG:1 - chr3L 18010263 3' - diver 90 2 76.71 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACCAACCAATCGAATCG:1 + chrX 13367510 3' - HMS-Beagle 6826 2 65.07 TTTTTATTTCTTACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCATTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGT:1 + chr2L 18689234 3' + Gypsy6A_LTR 236 1 71.23 AGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAATAATGAAGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGAGGATAATGTTAATGGGGATAAATAAGACAGAAAGGAGTTAGGACCAAAAGCAAAG:1 + chr2L 21781287 3' + pogo 1740 1 64.38 TAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACAGCCAGAGTCGTCTTTTCTGCACCAATAGCTCAGTAACCACTTCGTTACCAAAAACCCTG:1 + chr3R 31274654 3' + mdg1 7369 2 58.16 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTTCGAGAAAGTATTGCCTACTTTCAGGTTCGTTACAGATTTCTCTCAATTGCCTGCCATTTGTC:1 + chr2R 18618594 3' + jockey 4979 1 67.12 ACGTAGAGGGCGAGCGGCGGGCTGCAGTTCCCTGATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCAAATAAGAATGACATATAATTTTCTCTTTTTAAC:1 - chr2R 15511417 3' + hobo 2926 1 52.69 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTGAAATGGAGAAACCAATCCAATAAGAAGCTTATTTTGTCGAATTTTCATTTAACGAAATTAACATTTATTACATGAATACATTTT:1 - chr3L 9659395 3' - mdg1 7041 2 75.44 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATATAAGAGCCACGA:2 - chr2L 7148528 3' - HMS-Beagle2 29 2 64.38 CTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCAGTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGCAAAGTGTTGCATACTTTTGA:1 - chr3R 22341216 3' - jockey 4735 1 64.89 AATTAGGTGTTCCATCTTGTAATTGTTGTTGTCTTCGGTTAGGATCGCAAATCGCGAAGCAATCATGCACATTGTGGCCAACGTGATGGCTTAGACAAAATACATTTTACATAACGCAACTTAACGCTTAATCAACTGGTGCTGTT:1 + chr2R 18118522 3' + transib3 324 1 75.34 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCAATGTCAATGCACTTTTGGTGGGCAACGA:1 - chr3R 19996139 3' - Quasimodo 19 2 73.29 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTG:1 + chr3L 12634218 3' - BS 5079 1 75.17 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCTCCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGTATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAA:1 + chr3R 24011047 3' + roo 8983 2 76.03 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAACACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTTAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGA:1 + chr3R 15137354 3' + roo 9000 2 64.38 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAAAAGCACTGATCGAATTGAACGTCAACAATTGT:1 - chr3R 27007312 3' - roo 8695 2 62.33 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAGAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCGGCATTCCTACTTTGATATTTTTTTTCCCAGAACTAATCAGAGTTTGTTAATCAAACTTGTGAAGCTTTTCACGAATGATATGATATTTGAAAAATG:1 - chr2L 17136049 3' - hobo 25 1 47.26 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAATGATATCGCAGGGATATCGGTAGGAGGTTCTCCGCAATTCTCTACGAT:1 + chrX 17495837 3' + Burdock 6361 2 65.07 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATAATCAAGCGTGCAGCTGAAATCCTTTAAAGATCTCAAGCTCTGTTGCCACATGAGATGAGATGAGATGATGAGTGGCATTGCGTTCTTAAATCAATCAAATTCAGCATT:1 + chrX 5456703 3' + roo 398 1 79.45 CTTTTATGACTTTATGACTTTGACTTATGACTTTCTCACAAAAATATTTTAGTAAGACGACTTATATTTTTCCGGTATTAAACGACTTCCGTCGGATGCCCAGCAGGCGGTTACGTACATCGACAAGGCTGGCGGAGTGCGGCTGG:1 - chr3L 2187421 3' + Transib-N1_DM 105 1 56.16 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAGCCTGCCGATACCAGCGCTG:1 + chr3L 13889017 3' + 412 7508 2 55.24 TTTTTCGTTTTTTTTTTAATTTTCCGCTCTTGGCTTGACAATTTCATTAAAATATTATTAATTATGCCCACTATAGAATTGCAGTCATAAATATACATTTTGATTGGTTTT:1 + chr2L 13043507 3' - Doc 4699 1 56.76 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAGTTTGTGCC:1 + chr3L 8249499 3' - HMS-Beagle 6829 2 63.01 ATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACTGCCGCGCATCGCCTTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGTCACCGTTTTTGAGAAATTTTGGTCCATGAATCCTTGATCCTCGAATGCAGAGGACAAACTAGAGATCTACAGG:1 - chr3R 29061984 3' - Tc1 1330 1 72.60 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCGCTTCTGTTTTCTGTGTCACTTGATATTCAAACATTTGTTTGCATTCTGTGTCCGAGAAACTGTGCCACGAAAGAGTGCTAGGCTTAAAGTGACGGAACAACCTCGGGGTGT:1 - chr3R 31497775 3' - Transpac 5 2 78.62 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAATCGACTGAGTATTTCCCATTGGAGTTTTA:1 + chr2R 16731386 3' + Tirant 8469 2 60.27 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGAGTGCTGTGCAACAAACTTGTGGCAGAGCGAGCGCTAATTAATTAGCAGTATTTCTCGCTCACACAACTGCCATTAAAAATTATGTAAGGCGGCACGCGATGAACGCCGGCG:1 + chr2L 5961366 3' + S-element 1709 2 76.71 CACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACTATTGGCGAAACGCTCCGCAATCTGGGCAACTTTAATT:1 - chr2L 5814948 3' + I-element 4878 1 71.43 CATTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGCCAAAATTTATCTCTGTCCACTCGCTTACGCTGAGGGCGTATCCAGCTGGTAGAGATCGGCGATGCGCTCGTCCATCATCTTTTCGATTCCCAATTCAAGAGATTGCATACGGCGAAGG:1 + chr3R 4505361 3' - 1360 3340 1 53.42 GGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGG:1 + chr3L 4615748 3' - F-element 424 1 71.03 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTAATTTCGTATAGGACAATCTGCCACTGTCGT:1 + chrX 15540101 3' + roo 9050 2 68.97 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGNTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAANACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGAGTGTGTTTA:1 + chr3L 5958723 3' - 412 53 2 52.05 TTTCACGTGCTAGATCTCTCTGACAGGTTTTAAGTATTAAAACATGTTATGTATTGACTATGTAGTAGGGATTAATGGATAATTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTTGCTCATTTTCGGCATACTCATTTCTTGGTTGCTTTTTT:1 + chr3R 9286292 3' + G4 3696 1 73.97 AAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACTTGGCGGCACACCATTCGATGCGATG:1 + chr2L 6385940 3' + invader4 313 2 76.03 TTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCC:1 + chr2L 16553581 3' - Tc1-2 476 1 80.82 AATTTTTTTGTTTTTGTTTAGACCGTAGGCGGTATTCGTTTCGTTCCCAGTGTTTATTTATTTGATGGCCCTTTTTTCCGCTGAAGTTTCAAAAAAAAAGAAATCCTCGTCTTCGTTAGCCAGGGATTACTGCCCCAG:1 - chr3L 22927980 3' + Tc3 88 1 60.87 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATAT:1 + chr3R 9551005 3' + P-element 2838 1 52.05 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAG:1 - chr2R 6514206 3' + roo 9032 1 56.16 TATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCGGATCGTACCAATGTGAACCAGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:1 + chr2R 10572710 3' - F-element 4433 1 57.53 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGATAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTG:1 + chr2L 11476372 3' - pogo 54 1 56.55 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGCATACTCTCCAGAAGCATTGAGTGAAAATATATGGTTGCATACTTTTCAACACCTTT:1 + chr3R 28413968 3' - pogo 62 1 60.96 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCCTGTTTTGCTGTCATTTTGTCCAACTGTCCTTTGGTCCTTTGGTCGCTTTGTCCTT:1 + chr3R 14138664 3' - mdg1 27 2 67.12 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCC:1 - chr3L 21636470 3' - 297 6597 2 75.41 GGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTTACATTGGCCACTTTTTC:1 - chr3R 12789477 3' - G2 2759 1 74.66 AAAACAAAGACACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTAAAGCAAATTTAGCAATTAAAAAGAGTATTTAATGGTCGTATAACTCCCACTTATTGTTTGACTGACACT:1 - chr3L 11314352 3' - Tc3 314 2 61.38 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCCCAGCATGCAGACTGCAGGATACCGGGCATCGTACTAAACCGTAGCATACTTTTTTGGGCCCACAAGCAGCCGCGCCCATT:1 + chr3R 11108172 3' - jockey 32 1 65.38 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACA:1 + chr2L 3911921 3' - 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Tc1-2 147 1 56.64 TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTACGCAAAAGGTGGAAAAGCGAAGGTTGGACCGGCGAAATGGTTTCTGGGGTGTGGTAGGGG:1 + chr2R 12343989 3' - TART-B 10199 1 57.55 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTACACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAG:1 - chr3R 19246641 3' - jockey 4685 1 68.49 CAGGATCAATAGCCGACTGGATATAGCCATTCTAGTCATTTTGTTCATCAATATCTATCGACATCAATTATTTTATCGTGTGGAAAATAAAACTCGGAACACAAGAACGTTAAGAATGTTATCAAAATGGAATACGAGAAACTATT:1 - chr3L 11887637 3' + INE-1 95 1 83.56 TTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCAATTGCTCACCATCACCATATGTTTAAAGCTCCATAGATATTTTGTTAATATACAGAGTTGTGTTTTATTTATTAATGAATTTTAAAAGCTCTAAAAAGGGCATTCAGTAGCCA:1 - chr3R 20001595 3' + FB 58 1 66.44 CATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTATATAGATATAGAGATATTCCGTTCGACGGTGGGGCAAACGGCGATGATGATGATTACGACGGAGAG:1 + chrX 10039818 3' + McClintock 6068 2 61.38 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTCAAAGGAATACATTTGGCTCCTGCATTGAACATCTATTGCTGCAAACGGTAAGCCACCTCA:1 - chrX 14346940 3' - flea 9 2 72.55 GGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGCATTTACTTTTGACAGCTCATGGCACCTTTATTGGAACACTCAGATTGGAAGCGCACA:1 - chr2R 17004656 3' - roo 8862 2 60.27 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGC:1 + chr3L 21913445 3' - 297 6634 2 56.55 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTTAAATAAACATGAATTTTGAATTTT:1 + chr4 868772 3' + roo 9046 1 67.81 CACACAAGCAAGCAAACTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTGTTTTATGTGAGCGGAGATGTCACCAAAAAGTGGCTGCATATCGCAAAATGACCCTTACGCATCTTGTCAACAATTTCCCATTACAAATCCCATTACTGTTTCA:1 + chr4 578025 3' + 1360 3259 1 76.71 TTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGAAAATGAGAACGAGATTTCGCTATCGGCACAATCGCAGCG:1 + chr3L 4615818 3' - F-element 344 1 79.26 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAA:1 + chr3R 19725425 3' - hobo 49 1 66.67 GAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCGCGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGAGTTCAAACAGGCACTCAGGGATCAAGTGACCGGCGTTGG:1 + chr3R 22352538 3' - I-element 37 1 55.00 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTTTTGGGCATATTTCCCAAGTCAAAGT:1 - chrX 4240196 3' - jockey 4711 1 54.11 AAAATAGCAATCACAAAATAAAAAAGGGATTATTGATCAAAATGTAATCACCGAGATTAAAGATCCATTTTAAAGCTTATCTAGGCTGGCCAAGTTCCGAGCAACTTTGGAAGCTCCATGTTCTGCAATGTATGGTACCAAGTGCT:1 - chr3L 1692277 3' - transib4 41 1 65.07 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCAACGACTCTTTCAATCTTACAGGGCTGAAGCTTAAAAACTTTTCCA:1 + chr2L 18284929 3' + pogo 2035 1 65.00 AGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCCCTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGTGTTCAGCGAGTGATCAAGGTTAATCCTTTGGGCTAAA:1 - chr3L 21636397 3' - 297 6593 2 69.23 ACATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATA:1 - chr3R 22260457 3' - jockey 4752 1 67.81 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATGTTCAGCTGGTGGAAAGTTGGTGTAGATATTGCAAATCAGGTGATGCCGCGCA:1 - chr2L 3059350 3' + P-element 2836 1 44.36 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATATATATGTGTACATATACATATATTTTTTGTAAATTATTTCGCAAGAACAAAAGCTAGAGAATCCAAAAGCAAAAGCAAATGCAAA:1 + chr2R 6523825 3' - roo 34 2 63.01 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCCCAGCATGCAGACTGCAGGATACCGGGCATCGTACTAAACCGTAGCATACTTTTTTGGGCCCACAAGCAGCCGCGCCCATTTTATTTGTTGTGTGCTTAAATGTATATTT:1 + chr3R 11108201 3' - jockey 19 1 78.08 AATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGTCGACTTAATTGTGAGTAGAACGCATATACAGTACATATGCCACCACCAACATCTATGTACTATATACGTGTATAAGAAACCACTTAT:1 + chr3R 9953878 3' + 17.6 450 2 58.90 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTTTTGTGCGCATTAGCACATTCCCCA:1 + chr3R 24074876 3' - jockey 4784 1 67.12 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTGGGCGCCTAGTCATTTGCAACATGCACACACC:1 + chr3R 26542644 3' - FB 89 1 78.77 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATCATTCTTTTAGTGTCGCGACTCTTGAGTATCA:1 - chr2R 16072863 3' - opus 7 2 76.71 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTACTTGTCTCTTTTTTTGTATATAAATA:1 - chr2L 3911813 3' + roo 9031 1 58.22 ACTGAAGTGTCATTCGACCCGTGCCGAGAGTCTGCCAGGCTGAGGGCCCGGGAAACAACTAGCCCAGTCGCTTACGGACATTTAGTAATGCATACGTTGTAATATTCATATATCCTTATCAAGCAA:1 + chrX 5114374 3' + baggins 218 1 61.90 GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCGTTTTGTGCGCATTAGCACATTCCCC:1 + chr3R 24074875 3' - jockey 4759 1 79.17 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGCCGTTTATAGCAATTGGTCGACTGATAACAT:1 + chr3L 16200853 3' - roo 42 2 56.16 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAAACAATGGTTTTAGAATATTT:1 + chr3R 24662051 3' + jockey 4956 1 58.90 TTTGCTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1 + chr4 1294987 3' - TAHRE 10438 1 69.62 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGCCCTAAGAAATTGCTAGTTCTGCG:1 + chr2R 22112738 3' + 412 7508 2 52.80 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTTTAATTAAATAATTTACCAGT:2 - chr2L 19698025 3' + roo 400 1 75.34 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGGTCGCGCACTTTATTTTCAAAAACGTTACGCCCGTCGTGCTCTTTTATCCTCTTAAAGCCACTTGTTGTGAGCGTCGTTTTAAAGCACACAATTT:1 - chr2L 21753847 3' - hopper 25 1 69.18 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTAAATTGATACTCGATAATTAAAACGACCTGT:1 + chr2L 5341631 3' - Burdock 6165 2 62.33 GCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACTTTAATGCGAACGGCAACTGCTTGTATGAATTATGAATTCGTTTCGCTCTTTATGATTTCCCAACATCGATAATCGATAACCGATCAACAA:1 - chrX 16484039 3' + F-element 213 1 67.59 GAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAG:1 - chr3R 4530693 3' + copia 252 1 69.23 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATAAATCCTGCAAAGATGGTCGTCGAAACCTCTTGAAAAATGTCCACTGTTCGTTTATACAGCCCCGCACATATGCTACATAC:1 + chr3R 26605662 3' + roo 9033 1 60.96 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTT:1 - chrX 16589157 3' + pogo 2039 1 62.33 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTACTTGTCTCTTTTTTTGTATATAAATACAATTGTAAAAATGTTTT:1 - chr2L 3911795 3' + roo 9049 2 70.55 AGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAGAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTA:1 - chr3R 25692745 3' - BS 5069 1 64.38 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTTGCATTTAAA:1 - chr2R 19394882 3' + roo 9040 1 73.00 CGTAGTCTGTTCGCGAGTAGGAGCGTGGGAAGTAGATGTCTGCTCGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCAGTTTGCATCTCTCTTGACAATTATTTAAGTATCGCGTTCATAA:1 - 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BS 5068 1 67.12 GTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAAAAGCTATAACTATAGAAGCTATAAGACGCAGTGAAAGTTGGTTGACCCATGTTGCCATTGAGATGTTAGTTAGCTACGGAAGTTCAACTATTTTTAGCAGTT:1 + chr3L 13878729 3' + INE-1 125 1 67.36 TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGA:1 - chr3R 4530680 3' + copia 197 2 55.48 CGGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACGACGTATACGTAATGTAATGTAAATGTAAAACTAAGAATAA:1 - chr3L 2485854 3' + jockey 4977 1 67.81 AAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATTTTTGGTAGAGTTTTTCTTTCGTTTTTCCCCCGG:1 - chr2L 1384437 3' + roo 8693 2 76.71 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATA:1 - chr3R 9657695 3' - jockey 4685 1 70.00 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTNATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATT:1 + chrX 10547714 3' - P-element 97 1 18.62 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAGCTCACTTGCTTAGTGAATTAATCCAAAGACTAAA:1 + chr3R 19446284 3' + 297 378 2 74.66 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGAT:1 - chr3L 20168201 3' - roo 67 2 64.38 AAGCACATATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTATGAAAAAAGAAAATGGCAAGAGGGAAAAAGTTGAAATTGGGAAGTGCATTTGCGGC:1 + chr3R 16563300 3' + TLD2_LTR 127 1 65.07 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGAAGTTTTTAAAAGACGAGGTTTATTTGTCGATT:1 + chr2R 5531250 3' - 1360 56 1 78.77 GGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTTGACATCCCCTTGCAACAACGGTGTCAGCTTGAACCGTTTGTATCATAAATTATTTATTTTTATGCATATTGCGA:1 + chr3R 12101487 3' + Chouto 468 1 65.07 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAATTCGCATTC:1 - chr3R 25692693 3' - BS 5017 1 67.81 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCGAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGG:1 + chr3L 21913452 3' - 297 6628 2 53.42 GTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTTTGGGCCACTTGTGTTCCTGTCCGTGTGTTTCCTGCATTTCCACGAGATTTAATTGCTCAGCCCTCGAAGGGAATGTGG:1 + chrX 7031030 3' + roo 462 2 46.90 GCATCACCGCAGTGCACGCAGGAATCGACAACAAAGTCCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGCTCACGGATTGTGCATACAGTCTGGCGTCGACTGCGTAGCCGATTGCAAGGGATTTCCACCGAG:1 - chr2R 16975007 3' + 3S18 5627 1 56.45 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCT:2 - chr3R 8381718 3' - Tirant 73 2 67.12 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAA:1 + chr2L 11725022 3' - F-element 90 1 78.77 ACTCAACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTATGTGGTTTCGGCAGAGCTATTTGTTTTCTTTCTGGTATTCCATAATTTAAGAATAACTCAGTTTTTGGGACTGATTTATAGCCCTTTTGGCCAGTACGCAAACCAGCCATAAGTT:1 - chr2L 21780664 3' + INE-1 576 1 38.19 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGCACAACAAAAACCATTATCGAAGCGACCTAGTGTTGT:1 + chr3L 19907243 3' + P-element 2876 1 76.71 TCTGAGCTATTCAATATCTAATACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAACCATTCATACCCGGCATGGCAAACGGCATCGGAAACGGAGGAGGATTATTTCCTCCCCAATGGGGCTCCTTCTTCTCATGCTCCTGTTTCT:1 + chr2R 5037811 3' + Stalker2 373 2 62.76 AGAATAACTATGAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAACTAAAAATGTATACATCTCCTGTGCGCACCTACATGCGCACATTGGGCACTTCCGCTTGTCAAAATTCAATGTCAGTATTGTCACTT:1 - chr3R 13063867 3' + Idefix 7278 2 54.79 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAGCTTTGTTTCCATGAACTCCACCGAACAAACAGCTGAGCTGTGCTGAGAGGGGGGTG:1 - chrX 17726261 3' - pogo 62 1 62.33 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAA:1 + chrX 19583339 3' + roo 9024 2 53.42 ATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACATATCTGGGTTGTTCCAGATTCAGCTTAATTTT:1 + chr2R 10779531 3' + Doc 141 1 77.93 GCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAG:1 + chrX 19690599 3' - gypsy 64 2 73.98 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTACACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTGCATGTAAAA:1 + chr3L 15273333 3' + pogo 2061 1 61.64 AAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCATATCGGGGGGTTAATTGGATGGACGGTCATT:1 + chr3R 13185256 3' - 412 465 2 75.97 GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTT:1 - chr2R 12248972 3' - Juan 4089 1 58.22 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGACGCAATTGAAAGTAAATTAAGTAATAAATTTGGTGATGTTCCTGTCACGCTTAAATACTCAGTTCGGGGACCGATTTCAAAGTGCACCTCG:1 - chr3R 2766646 3' - Doc 36 1 65.75 AACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACCTAATTCTTTTCCGCCACTTTGTTGACACCGGCATAGTCAATGGGGAATT:1 - chr3R 6602969 3' + gypsy 390 2 65.07 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTTTAAATATAAGCTTGATGTGCCTTCAATGATTTTACAAAGCTGATTTCCTTTATT:1 - chr3R 10997307 3' + Tirant 8462 2 64.38 GGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGA:1 - chr2R 5070916 3' - gypsy5 24 2 28.08 ATAAGTGAAAAAAATATAATTNTTATTTCACTGAATGATTACAATCTTTTTATTTGAGAAGAACAAATGAGAAACTGAGCTTGTTTATAAAACGTTAGGCAACATTACCCCTTTTGCCATTCATCTTTTCCATTAAGAACGCCATA:1 + chrX 1910353 3' - Idefix 7369 2 56.16 ATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAACACCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGA:1 + chr2L 6385866 3' + invader4 2998 2 79.45 AGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTT:1 - chr3R 14401894 3' - Juan 4141 1 73.97 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATTCGCTGCATTTTTCGAACCAAAAATTGTTGGTGCTGGTCACCCCGGAACTGGTACCCC:1 - chr3L 15273207 3' - pogo 28 1 55.26 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGCGCTAGTTAAAGAATAAAAAAATGTAAGATCAAATCTCTTATTAACAGATGCA:1 + chr2L 7447959 3' - jockey 4736 1 62.33 GTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTT:2 + chr3R 7042094 3' - Stalker2 7294 2 54.11 ATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAATTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGATAATTATACTCTTCTTCTTTTCCTTTTAAATTTGCAATTCTTTGAACT:1 - chr3L 18801690 3' - I-element 337 1 71.63 ATTCAGCTGTTGGGCACTGCAAGCACTTCGCATAGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAGATCTATAGACACAGTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCG:1 + chrY 1428633 3' + G-element 3923 1 76.71 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGTCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAAATTAAGCAAATAAGCCCGAGCAAAGAGCAACCCAAATGAAACCAGTAAACAGCAAGGGGCACAAGTTAAAGATCTATCGCAGCATA:1 + chr3R 23271720 3' + roo 406 1 45.89 GCGTGCATAAACATAAACATAAACGTAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAATGCC:1 - chr2L 8895243 3' - 412 7133 2 69.18 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTAACGGCGCAAA:1 + chr3R 17766846 3' - HMS-Beagle2 6919 2 57.53 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAAT:1 - chr3R 23579299 3' + roo 335 2 69.86 TGTTCCGTTATGCGAGTTTAACGGATTTTGCTCTATTCTACATAGCCTCGGTTCGACGATGCGTTAGAGTGAGACAAATAGTGGAACAGTGAACCAGGTGGACCAGCCATTTCTCATTGTTTGCCCGCAGCCGGTTTTCCTCGCTT:1 + chr3R 30987211 3' + invader6 127 2 52.74 CTAATGTATATTTTAAAAACAATTGGTAAAACAAATAAAAACCTTTAAATTTAGGCGGTAAGAGCAAATAATTGTTGGAAAATCAATTAAGAAGATTAGACCTGAATGATAGAAAAATGTTTACAATTTTGTCACAAAAGTAAATA:1 - chr4 783085 3' - Tc1 1497 1 60.96 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGA:1 - chr2L 19940041 3' + mdg1 7390 2 73.44 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTT:1 - chr2R 9871044 3' + roo 9006 2 67.12 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGCCA:1 + chr3L 14116800 3' - BS 5026 1 62.07 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAGTCCAGCAGATACATATGCGATTGTTTTCTGGGTGTACTGTGCGAATCGAGATCGCCAAG:1 - chrX 2104686 3' - roo 53 2 57.86 CAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTGTGGGCGCCACATATATAAGCTAGAAAGTTTAGAGTACTTTCAGTATCCAGTATCTGATAGTCGACTAAAACATGCTTTCT:1 - chr3L 17860602 3' - Chimpo 49 1 72.66 TTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTTA:1 + chr2R 17696128 3' + rover 285 2 65.75 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATAACAATTTCAGATGACTTCTCGTTATTTGCAGCAACTTTAACGGGCGTAATACAGAGTTGTTTAAAATTTGGTAGCTTAAAGCCACTG:1 + chr3L 9659551 3' + mdg1 7427 2 61.64 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTG:1 + chr2L 3911931 3' - roo 63 2 64.83 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATATCTAAATATTTTAATACAACAAGTAAGAGAATTAAACAGCGAAAATAGAGG:1 - chr3L 6721579 3' + I-element 5284 1 63.70 ACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTTCACAGTAC:1 - chr3R 14401886 3' - Juan 4133 1 68.49 CCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCATCATATCATATAAATTCATCAAATTTGATATCCCTTCCTCAAAACGAATCATCAAGG:1 + chr3L 21079907 3' - accord 7322 2 60.96 CTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAA:1 - chr2L 7148565 3' - HMS-Beagle2 66 2 63.01 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGAATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTACATTTAAGAATATTCTCTTTATGAGTCATAAATTACTCCTCAATA:1 - chr2L 1232592 3' + roo 9038 1 61.64 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGGCAACCC:1 - chr2R 5037700 3' - Stalker2 7329 2 70.55 ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTATAGATGACTGGCAACTGCATTGAAAATAAGCAAGGAAATGCTTTT:1 - chrX 17477605 3' - Quasimodo 57 2 65.44 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCCAACTTAACTCCGCT:1 + chr3R 19725456 3' - hobo 33 1 56.10 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAAACAATGGTTTTA:1 + chr3R 24662043 3' + jockey 4948 1 53.42 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGACGCGGTTCACACCCCACTTACACAATACCCTACT:1 + chr3R 10751756 3' + hopper 1387 1 67.81 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACATAAATTTCCAGTTAACTAAGTGTTTAAGCAGTCATTAAAAGGTTGTTGAAATTTATGAGTTCCGTGCCATTAGAGCAA:1 + chr2L 18173725 3' - blood 15 2 74.66 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTCAGGCACTTTCTGCTTTCTGCTGACCCAGCCATTGTCTTCTCGTTATTTT:1 + chr2L 13468317 3' + roo 339 2 69.86 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACAATTACATAATATTAAAAAGAATATCAGA:1 - chr3R 10433161 3' + 412 471 2 69.86 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAA:1 - chr3L 17746262 3' + roo 349 2 57.53 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGA:1 + chr3R 20983901 3' - pogo 57 1 56.85 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGATAAGTCAAGTGTTTACCCATACCCTGTAGTCCAGTGTT:1 + chrX 14189218 3' - 412 7137 2 72.60 GGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATCACCGACATAAATATTAATGGAACCTAAAGTTGGTCAGGAATA:1 + chr2L 291463 3' - 412 7166 2 70.55 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTGTGGCCTCCATCATCCTG:1 - chrX 21227061 3' - Tabor 16 2 74.66 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTNGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCAC:1 - 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chrX 18767817 3' + hobo 2876 1 61.15 CCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAA:1 + chr2L 6385872 3' + invader4 3004 2 77.40 GTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATT:1 + chr2R 16185120 3' - 17.6 59 1 65.75 TTCTGTAAACTGCGGCTAAACTTGTTCCACTGGGCCGTTAGCAAGACAAAGCCAAATGCAGTATCAAGAGGAAGACAAAACGTTGTAG:1 - chr2R 16160500 3' + mdg3 248 1 60.23 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACTCAGGGATCAAGTGACCGGCGTTGGAAAG:1 + chr3R 22352542 3' - I-element 23 1 63.85 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1 - chr2R 981617 3' - 1360 29 1 60.00 ACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGGTCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATTTTTTTTAT:1 - chr3R 31771972 3' + mdg1 7309 2 56.16 GAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAATTGAATCGAGAGCAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATCAATGGCCTCCGTCATGGATCTGCAGGTGCGATTCGTG:1 + chr3R 8864840 3' + roo 8676 2 72.60 CCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTTACAT:1 - chr3R 12789490 3' - G2 2772 1 65.75 TTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTGTTCTGTATTCTGGGTTTTGGGCTCAGGTTCAGGTTCAGGTTCAGCCGCTCGTTCGGTAGCCGCTAGACTTGGACATTAATCGATAACACTT:1 - chrX 4471662 3' - I-element 452 1 66.44 CTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTG:1 + chr3L 4615753 3' - F-element 417 1 67.13 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCT:1 - chr3L 13546544 3' + hobo 2900 1 53.38 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATT:2 - chr3L 13888896 3' - 412 7114 2 58.22 CCAGATCGTTTATATGGCAGCTATATGAAAGTTGACCAAATCACTTGAAACTATGTGAACCATCTTGGAGGAAGTAAAAAGTAACACAAACCAAATTTGGTGAAGATCCGCCCTTGCATAATATTTCCGATGGCTTCCCAATCGCG:1 + chr2R 11863327 3' + transib1 2009 1 71.92 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACACGCCTTTTTTCGGCTTACGGCGGCGG:1 - chrX 14825301 3' - P-element 50 1 29.70 GGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGCGACCCTGATTCAGACATATTTAACGGGGGTTCAGACAATGGACGTACATATAT:1 + chr3L 17758062 3' + Tirant 8499 2 76.86 CGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTTACATTGGCCACTTTTT:1 - chr3R 12789478 3' - G2 2760 1 73.97 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTGGGCGCCTAGTCATTTGCAACATGCACACACCACTTGCCAACTGCGACTATACGACCATGTGGATGTATGGATATATGTACATATGTATGGATATATGGCAG:1 + chr3R 26542714 3' - FB 19 1 71.92 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACTTTTCGTTAACTTTCTCGATGTCAACGAAACACAAAATGAATGGAAGCACTTTGAATGATGGCTGCTGC:1 - chr2L 8553267 3' - pogo 20 1 71.92 GCATTCACACTAGCCGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGGGGAATTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTGTATATTGCAATCAATTTTCGTTTCATTTTAAAACTAAATGGTATGTACCATGTCATGAAAATGTCCATATATATTAA:1 + chrX 15585768 3' + INE-1 534 1 47.26 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTGTTTAGTTTCTAAATTAAATTGACAAGTTCTTTTAAAAGAGTATCCATGAACAGAAAGTTTTAAAATATTTA:1 - chr2R 7407956 3' - 3S18 48 2 56.16 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACTCA:1 + chr3R 22352516 3' - I-element 65 1 62.33 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACA:1 + chr3L 14116747 3' - BS 5080 1 73.97 ATACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATTGTAGGTGAGATCCATTTGGGTTCCAAAGAGCTTAACTCAATGAGACAGATTTACTTACCGCATTCTTACGCCAAC:1 - chr3R 5420674 3' - Doc3-element 452 1 51.37 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGC:1 + chr3R 22352511 3' - I-element 70 1 65.75 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGA:1 + chr3L 19907175 3' + P-element 2808 1 31.51 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCCATGTGGCCAAGAGCGGATGAGGGGACAAGTGTTGGCCATTGGGCAGTCGATAAAAATGGCAAAGAGCCTAAG:1 + chrX 13458326 3' - hobo 47 1 49.32 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTTTGCATTTAATTTGCGCGAAATTAGTTTCTTCTTTGCCGTT:1 + chr2L 1232703 3' - roo 78 2 72.60 GCAAGAACGCGCTCTTTCTTGCGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTAGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTATCACATCGTTGTTGTTCGTATGCGGATTGCTGGTGTCCTGG:1 - chr3R 25191621 3' - Doc2-element 443 1 73.97 CGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATGCCGTATGACGCCATTGCAGTTTAATGAATCCTTAAAGCGCTTTAAGATTTTTTTCAG:1 + chr3R 12622396 3' - 1360 169 1 63.70 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCCC:1 + chr2L 4631247 3' + roo 360 2 51.03 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGA:1 + chr3L 13888977 3' + 412 412 2 72.60 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGTACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAAACTAGATTGTGACATCCGATC:1 + chrX 15406090 3' + opus 482 2 64.75 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATAAAGATGATAATATGAGTGACGAGGGAGCGATAA:1 - chr2R 21110554 3' + roo 323 2 77.40 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAG:1 - chr3R 4530684 3' + copia 5062 2 58.22 TATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGCACAGAAAATTGCTCAGCTCGTCCTCCCTTTTGATCTGAAAGGCATGCTCTTAGTTTTC:1 + chr3R 10161029 3' + pogo 152 1 59.59 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGTAAATAACAACACAATTA:1 + chr2R 7769858 3' + Transpac 267 2 52.74 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGTTGTCTACCA:1 + chr3R 23416031 3' - jockey 4784 1 67.81 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTT:1 + chr3R 13684752 3' - 412 7139 2 75.17 CGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTATGTATATACATATATGTACGTTCAATACCGATCCGATCCGAGGTAAAATTCATATGTTGTTGTCT:1 - chr2R 21529940 3' - HMS-Beagle 6847 2 54.11 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAAATAAGCAATGCATGCAAGTCATACACACAGAAAAAAAAACACTTTTACCAACTAAGA:1 - chr2R 22761161 3' - 412 62 2 58.90 CATGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGGTATAGCAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAACTATTATTAATATTATTATTAGTGTGAGTAGGACCTAATTATGTAGTAAAAAATTTAAA:1 + chr2L 259003 3' - Cr1a 4390 1 77.40 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCGCCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAACTTCGTTAGGCAAACGTGTTTAATTTCCTCTTCAATTGCCCGGGAAACCAAGCGAAA:1 - chr3L 6521207 3' + roo 319 2 58.74 GATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTCCAGG:1 - chrX 20453679 3' - INE-1 541 1 79.45 AAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAGATGATGA:1 + chrX 8208455 3' + roo 9054 2 74.66 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCG:1 - chrX 6283664 3' - P-element 90 1 24.66 AAGTATGAGTTTTTGTATGTTNTCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTCAAGGCAAATATATATTGGGTGACTATAAATAAACATAAAATCAGCAGAGTAATTGCACAAAGCAA:1 - chr2L 11705763 3' - I-element 5138 1 54.11 ATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGCTTACACTCG:1 + chr2L 21400823 3' + Doc3-element 4683 1 37.24 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGAAATACTCTGGCCACATTCAGACACCAGCGGCAGAAAACCCGAAAACCCAAAAAGC:1 + chr2R 16367509 3' + hopper 1409 2 78.77 GAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGACATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCTTTAATTTTTTCGCGGAAAATTGGTCTACTTTTCCCCCTAACCCGTTATTCTTTTGTGCCTACCGCTTGC:1 + chrX 14987566 3' + invader4 167 2 52.05 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTGAAAAAACTGTGAAATGTAGATGAAATATTTTTATAAATTCTATTTGACAGGTAGGGGTAATCAAATTAACACCTTG:1 - chr2L 20508270 3' + pogo 2062 1 58.90 TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGG:1 - 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chrX 13458220 3' + hobo 2903 1 44.72 ATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAAAATTCACTATTCTATTATGTTTCGCTATTTAGTGACTTTCATTTCCCGTCCAAA:2 - chr3R 31525481 3' - Juan 4147 1 62.33 TCTTGTATACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCTATGACTA:1 + chr3L 21202120 3' - G2 2622 1 58.22 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATCTAATATGGAACTTATGAGTCATGATTT:1 - chr3R 21679589 3' - roo 70 2 67.59 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAGTCCAGCAGATACATATGCGATTGTTTTCTGGGTGTACTGTGCGAATCGAGATCGCCAAGATGGGGCCAGCCCACACAAACAATCGGACGGC:1 - chrX 2104654 3' - roo 27 2 67.12 AGCGAGAGAGTGAGAGAGAAAGAGGTGGGGAAATCGGTATTTTTACGGGGGAGGGCTGGGCGGAAAAGCTTCCATTGGATCTTTACTGCTTATTTTATTTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTGCTATTTTCCCTTGGAAGGTGTTGTC:1 + chrX 4405109 3' - Cr1a 286 1 53.10 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGC:1 + chr3R 15137338 3' + roo 8990 2 76.43 ATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACATATCTGGGTTGTTCCAGATTCAGCTTAATTTTC:1 + chr2R 10779532 3' + Doc 141 1 77.40 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATTCTGGGACATTGTCGATCCTTTGGAACGAGTCCT:1 - chr3R 10708191 3' - Transpac 4943 2 69.18 GACAAACACAAAATAAAAATCGGAGCGCAACTAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTTCAGAGGGACCTTTTCCCAGGGCCCTTTATGTTGGGACCTCTGTATCGTTATGCATTTATGTTTTTTAATTTTTACCTCATTTTC:1 + chr3R 13638126 3' - Cr1a 39 1 72.60 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAATATTAATGGGAACTAAATAATGGCTATACTATATTACACACTATATTGCACTTTTCCACATCCAAACTTACATATGGCGTGTA:1 + chrX 5721952 3' + pogo 2067 1 59.59 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGGACAT:1 + chr2L 3911968 3' - roo 27 2 67.12 AGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATATCAACTTTTTTTTTCTTCGTCCGGATTCGGTGCGTGCTTAAATGTTTAAATGCCAGCGCGGAAAATGCAGGTTGGTCTCGCTAT:1 + chr3R 22889385 3' + Idefix 7359 2 60.27 AAAAAAAAGGAAAAATTAAAAACAAAGAGCGTTCTATTCGTTCCATAAGTGTTCCATGATTAGAAGAGCTGCTTTTGGCACACATTTTCATCGCTTTTAAAATGAAAATGTCCGAGTAAAAAGTGAAATGTTTACAACCATTGAGA:1 - chrX 12132245 3' + Doc2-element 235 1 65.07 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGGGTTGATGACTTACAGTAAACCTGCAC:1 + chr3R 27398165 3' + roo 392 2 72.60 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGCCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAAT:1 + chr2L 15917679 3' + roo 329 2 71.23 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTTCCATTTAAAAATAGACTAGTAAATTTAATTTTTAGATAACATTTACCTAAATTCCTGGAAGCAAGCTGAAAGGCAAAACTTTCTTATTTATGAGCCCTTTTCAAAAGTTT:1 - chr3L 13992190 3' - blood 7020 2 70.55 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAGTATAGATTAAAAAATAGGTTTGAGTATTTTTAATTTGTTAA:1 + chr3R 21938244 3' + roo 329 2 76.03 CCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGTACCCTCGCATCCACAATTTGGCTTAGCG:1 - chr2R 5531382 3' - Max-element 348 1 76.98 ATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACGA:1 + chr3L 21913482 3' - 297 17 2 73.97 TTTGATTTTGAAATTAAGTTAAGAACTAAATATATACCAGGGGCAGATTGACTCGCTTTCGGAACTCTAAAACTGCTCTTCTCCATTCCCCAACTCCAACTCCGCATTAAAGTTTTTGATTGTACTATACCGATGAATAATCCGGC:1 + chr3R 23950441 3' + Dm88 4297 1 69.86 GTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTATATTATCTACGTATGTAGTATATGAGGAAGTAGTCCCGGGCAATCTGGTG:1 - chr3L 8380031 3' + Cr1a 4062 1 53.27 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTTCGAAAGGAGGTTGTAGAAGAGCTCTGTCTATTTGAAATTGGATGAGGAATTTCCTCATTTTCCTGAGCTCTCCTAGAGTTTCCAAAGCCCGAAATGCAAATGAAAATA:1 + chr3R 30537764 3' + roo 397 1 64.38 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATNGNGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCT:1 - chrX 19163241 3' - Burdock 42 2 56.85 AGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCATGTGCCACAAAATTGCATGACGTTACGCAACATAACAACAGTGATTTATTAGAA:1 + chr2R 15373241 3' - 1360 122 1 87.67 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCACCCAAAGGCCAACAAATGCCATTAAAAATTGCC:1 + chr3R 13530003 3' - jockey 59 1 54.11 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAG:1 - chr2L 7774956 3' - I-element 68 1 66.44 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAA:1 + chrX 15540055 3' + roo 339 2 67.81 GCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAATCCACGCCGGCACCGAACAGGTAAACATTCTAATGATCGCAACACGCA:1 + chr3R 9871119 3' + HMS-Beagle2 7102 2 67.12 AGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGAAGCGAGTCCCTTCTCATTTTTTACTAGTCCCCTCAA:1 + chrX 7626234 3' - Transpac 4961 2 56.25 TCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGGAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACT:1 + chr3L 9522128 3' - opus 174 4 67.81 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAA:1 - chr3R 4530691 3' + copia 186 2 63.01 GCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCGCCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTGACAATAAGAGCAAGGATTGTTTTTTGAAGGCCATCG:1 - chr3R 10121206 3' + Gypsy12A_LTR 2173 1 72.86 CTTGAAGTATGTGCTGTTGCACCGCCTTGTTGGAACCAATTTTTGTATATAAAAAACACTTTGGCCACAAAACGAGGAAACTAAAAATTCTATAAATGTTCTTGGTATTTCAAAATGGGAGTTTAGTGTTTTTTTGGCTTTTCAAC:1 + chr4 1097970 3' - mariner2 471 1 54.79 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGGGCATGTGTTTGTGTTCGCGTG:1 + chr3L 15035209 3' - pogo 61 1 68.38 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGAT:1 - chr2R 22596080 3' - Doc 60 1 56.16 GTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTAC:1 + chrX 22511444 3' + roo 8991 2 73.97 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGAGTTGTTGTTTTC:1 - chr3L 19907106 3' - P-element 66 1 37.14 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTGGTTT:1 - chr2L 11476259 3' + pogo 2042 1 59.59 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAG:1 - chr3R 16349223 3' - P-element 85 1 27.40 GTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCGAACACGTCAAGAACGATACGCTTAGTTATCCTGATCAGGA:1 - chrX 22689042 3' + transib3 28 1 80.14 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTATACCAACGA:1 + chr3R 9551031 3' + P-element 2864 1 69.86 GCGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAGCAACTAAGTAATTTCGTCACGCACTGTGCGCGCTGCATTCGTTACCCCACAAAATGCGGCT:1 - chr2R 23042072 3' - copia 4727 1 56.85 TACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAAT:1 - chr3R 16881921 3' - 3S18 5851 2 76.71 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTGCTTGCCATGTTAATGAAGTGACTAATGGCCAACGTAGTCGGCTA:1 - chr2R 19015925 3' + roo 9050 2 70.55 GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTATGGATAAAGGCAACAACA:1 - chr2L 21325097 3' + invader4 3023 2 64.79 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAGTTTTCAATCAC:1 - chr3R 16349212 3' - P-element 74 1 34.93 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCCATGTGGCCAAGAGCGGATGAGGGGACAAGTGTTGGCCATTTGGCAGTCGATAAAAATGGCAAAGAGCCTAAGGGGGCATC:1 + chrX 13458334 3' - hobo 19 1 65.08 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTT:1 - chr3R 24093495 3' - jockey 66 1 56.85 CTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATCATCTCCAAACTGAAAATGCTTTGAAAAAAATTATAAA:1 - chr3R 21588795 3' - roo 8812 2 73.97 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTCATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACAACAGTGCAGTGCGCCGAGTCCCGTGAGGCTCAGGTTCGTCCAGGCACCCAGCCAGCCAGTTAAATGGCAAGTCCTCCGGGAG:1 + chr3L 10024086 3' + transib2 2780 1 50.35 TAATAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATG:1 + chr3R 12622339 3' - 1360 224 1 68.75 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGT:2 - chr3R 8381708 3' - Tirant 8170 2 60.27 AAAACTATTTTTTATTTCTTTGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGATTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACT:1 - chr3L 21913338 3' + 297 331 2 63.70 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTACAATCTTTTCGACGAATTTTGTATACGCTTTTTACCATTTAACTGAAATAGGTTAATTTGACTATGATAAATG:1 - chr3L 21156997 3' + 412 7503 2 55.48 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACGTAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGA:1 + chr3L 22435227 3' + opus 7460 2 54.79 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATGGTNTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTTGGTGCTGGTG:1 + chr2R 8597049 3' - pogo 40 1 55.86 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGGTGTAACACCATTTGTTCGTTCGTTGGCC:1 + chr3R 4668838 3' - FB 8 1 56.67 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATATTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGCAAAACCAATGGATGGCCGTTACGGCTTAGAGGGCTGCATAACACCA:1 - chr3L 24531162 3' + 1360 3317 1 75.18 CGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGA:1 - chr2L 13675867 3' + flea 4973 2 57.55 AATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGATACAGCCACCCCAGAAGTAGGCAACACAAATTCATATTCCGCATGTGCACTTTCTCCGCCCGAAGA:1 - chr2R 24299637 3' - roo 8771 2 53.52 TATATATTTTTAAATTTTATTTAAAACACATTTCAATTTGGAACGATTTGCATTAAAATATTTGCGAAACCAATGAAAAAACAAAGTTAAGTTAAAAAACGTTTTATTTTATCGGAATAGTGAAGATCTTGGTAACCATAATA:1 - chr3L 8208290 3' + hopper 174 1 57.34 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCTACATTAACGCAAAGCAATAATTATCATATTTGTCTTCTCTTTCGAATATAACAAATTGTGTTGATAA:1 - chr2R 7009399 3' - Quasimodo 45 2 55.48 AACCTAATTATTACTATTATTTATGCTTATGCTTGTGTTTCATTGTATTTTGAAATTCAAACCTATGATTCCTCTATTTTCAGTGAGTGTGTGTGAGAGAAAACTTGCGTCATCCGTTGCGGGGTCTTGACATTGCTTGTGATTT:1 + chr3R 15243222 3' - invader6 4390 1 51.03 GGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTGCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAA:1 + chrX 1759021 3' - Tabor 6925 2 72.60 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTACACGTTAAGAAATGCATAATGTATTTAGCTTCAGGAATAAA:2 + chr2R 19016104 3' - roo 22 2 71.23 CTTTTATTGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACAGACATGATTTAGGGTTTATATGGTTGTCCGTTTGACGCTCGGTGTTCTTCTAATGTCCGACCAGTCCTATATATTAGGGATTTTCTGAGCACGACTTCAGATTTTCAGGCTA:1 + chr3L 25352320 3' - INE-1 148 1 76.71 TTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGACTTTATAAAATTCTCATATCATCTGCAAGTAATAACATTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACT:1 + chr2L 16884770 3' + Bari1 1694 1 54.79 GTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCC:1 + chr3L 4615764 3' - F-element 409 1 60.27 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCA:1 + chr2L 15917695 3' + roo 345 2 60.27 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTC:1 - chr2L 20044548 3' + roo 343 2 60.96 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTATATTTAAAACCTGCAATAGAAAGCAGAAAG:1 - chr3R 4361603 3' + copia 168 2 80.14 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGC:1 - chrX 20330558 3' + P-element 2799 1 25.34 GCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCG:1 + chrX 21667946 3' - gypsy2 6545 2 70.63 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCGGCCGTGTGGCATTCTTGTCCTTGTCTT:1 - chr2L 3408733 3' + opus 7443 2 64.08 GATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATAAAAACAACGTGGGACATGCAGACATTCGGCACGAAAAGCTCTCATTCCTGTCCATTCAGCATTTGTTGTTGTCCTTGTGTGCATGCACAAATGCATCT:1 + chr3R 28661280 3' + R2-element 422 1 60.27 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCGTTCCATGTGCATGTGATTGTGTGTGTAAGGAGTTAACAAACAC:1 + chr3R 24734960 3' - jockey 4703 1 62.50 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATGGTAC:1 - chrX 20233777 3' - pogo 52 1 54.79 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGCCA:1 + chr3L 14116800 3' - BS 5027 1 61.64 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAATCGTATAATTCAATTCTAAACACGCTGTGTACATTAAGAACGTGGCATATCTTTTTTGCAAATCGA:1 + chr2L 21777888 3' - pogo 49 1 53.42 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTTTTCGGGTCTGCTGGGGGTTTGTCGAGCTTGAACTTTAACTTATTTTCCCCCGACACGAAA:1 + chr3R 11903545 3' - FB 59 1 56.85 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTCCTCAAAATAAAAGTAAAATTAGTATTTCTATCAAGAAAACTTCGATTGAGCTGCATGGTTTTAATTGAA:1 - chr2R 15472027 3' + 412 450 2 47.95 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCCATGCTCATTACATTGCGCTTGCTGGCCACACC:1 - chrX 10666991 3' - jockey 4745 1 56.85 AATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAA:1 + chr3L 10814598 3' - micropia 5019 4 61.64 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCT:1 - chrX 19121920 3' - 412 7086 2 63.83 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAG:1 - chr3R 16349239 3' - P-element 44 1 26.97 TTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAACTGAACGCCGTCGAAGCAGGAAGTGCAAATGAGTTAAGTGGTGTCTTTTTTAGAGGCCAACTTGGCCCGCATCTCGCA:1 - chr3R 9977212 3' + BS 5046 1 52.74 GTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTCAAGGCAAATATATATTGGGTGACTATAAATAAACACACAAATCATATCGAAAGGCTATGTTAGCTTATCAGCCTGTCATATAA:1 + chr2L 11702004 3' - I-element 5120 1 42.47 TTTCTAGCTTGTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACTGACGGACAGATAGAGGGGCATTGGGACATGGCCACATCGACTCGACTCTATTTGCCACCACTGTTGGCTCAAACGCCTGTTGACT:1 + chrX 14841130 3' - INE-1 155 1 73.81 ACAATAAGGGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCATTAGCCATTCCCTGGCGACACATTAGCCGGCATTATTCATGTCTGATGACTGAGCGAAACCAACAATTCGGCCTGTATGAGTTATGGCCATAAATATATCTTGT:1 - chr3R 26198728 3' - Doc 4638 1 74.66 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGACTGTGCCAAGTAGCTTCGCACCAAGCTCTATTCCCATTGTAGGGCCCAGAAATGTGCTAATAAAGTTAGGTTTAATTACGTGCG:1 + chr2R 22761288 3' + 412 7511 2 59.59 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCATATCCGTTAAAAAACCTCCCT:1 - chr3R 4190845 3' - pogo 12 1 77.40 CCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACAGCAGAGATGCAATACTAATAGGCATGCTTCCTTTAAGTTATGTAA:3 + chr3L 18075640 3' + pogo 2029 1 67.12 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTGCAACCATATTTGTGTATTTCGGTTATATTGTACACGCTTCTCATAAAAAGGCATATACCTCGGTTTCAGGGTATCAAAATAACTGGCTTAAA:1 + chr2R 24808005 3' + I-element 5330 1 69.86 CCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATATCTTGCAGCGNNTCGATAGTTTGTAAGGTTCTATCGATAGTGGTCC:1 + chr2R 9177313 3' - hobo 185 1 73.29 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATCATATCTAATATAAAGAATGGATTCAGTTGCTGACCCTTTTGGTAGAGCATTACTATAGCCGG:1 + chr3R 17871946 3' - roo 57 2 58.22 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTTAATTACCATTTCATTCAATTTTACAATAACAA:1 - chr3L 20765097 3' - 297 15 2 74.48 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTG:1 + chr2L 16553591 3' - BS 5079 1 75.86 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCACATCGACCGTCATTTGCCCTCGA:1 - chr2R 11663853 3' - P-element 76 1 22.40 TAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTTATTAGTAAGTGGTGATTATATCCTCGGAGATAGCGTTTTTTGCCTTCTTGGACCTGGTCGCAGCGGTGG:1 + chr2R 9682817 3' - accord2 7388 1 60.27 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAACAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGAAGCGAGTCCCTTCTCATTTTTTACTAGTCCCCTCAAAAGTGAG:1 + chrX 7626241 3' - Transpac 37 2 60.27 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCG:1 + chr3R 13529968 3' - jockey 94 1 78.08 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGTTGGCAAGTGTGTGTGGCGATGGCAACTGAGAGGAGGTCGAATGACTTTAGAGCCTTGATTGCTG:2 - chr3L 7646214 3' + 297 6933 2 57.86 AAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATATTTTCCAGTTGAGGGTGCTGTAGTATTT:1 - chr3R 8631588 3' + roo 9036 1 60.96 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGAATTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCACAATT:1 - chr3R 13323869 3' - F-element 64 1 51.37 AGTATAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGGTTTATGGTCTTATGGTCACACCACATAATGATGTTTTTAAACGCACTTTAATTTTTTTGATTGTATACAAATTTTAGCAAATATTTATCGTCTAATTTAAACGCAAAAGTAAG:1 - chr2L 16672904 3' - Tc3 318 1 65.75 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATCCCCCATAGTGGGGTGGTTTGCCTTGAAAAAGAATTTCGCGCAGTAAAATCTAAAGCGAAATTGCCGCGTTCTGCGTAGAAAGGGGGAGG:1 + chrX 1599481 3' - hopper 46 1 54.79 GTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGGGAAAGGGGATAATAGATATGATAGTATTAAAGTTACTTACATAATTTAAAATGATAAAAAGCCTTAAATTTAAGAGTAAAATGAAAG:1 + chr3L 18317238 3' - Idefix 7071 2 66.90 CCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGA:1 + chr3L 9522121 3' - opus 181 4 70.55 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCGTATGCAATAACGTTTGCTCTG:1 - chr3R 23104467 3' - jockey 60 1 50.68 ACAATAAATACGTGAAACGAATATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTATTAGTTTTTTACTATTGCTGGTGCGAATGTTGCTGTTATTGCTGTTGTAGTTGTTTTTGTAGCGAGCTAACTGCGGATTGAC:1 - chrX 8999652 3' + Dm88 176 2 54.11 ATATTTTCTAAAATATAAATATATTTCTAAAATTTTAAATTCAGAACATTTAAATTAACATAATTTCTTTTTAAATATTTTTGGTCGCAATAGTAAGTACAATAACGAACTAAATGTAACATATTTGATAGAAATTTCACAGGGTA:1 + chr3L 16689299 3' - FB 250 1 52.74 GGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCATGGCTGCAACAGCGGATGTTCATTTGTCCG:1 - chr3R 18817124 3' + R1A1-element 4904 1 71.79 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACTTTTCGTTAACTTTCTCGATGTCAACGAAACACAAAATGAATGGAAGCACTTTGAATGATGGCTGCTGCGG:1 - chr2L 8553265 3' - pogo 18 1 73.29 GTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAATGCCCCCAGTTATTTATTCTATAGAAAATATGATTTATGTGCTGCTTTT:1 + chr2L 18544650 3' + Tirant 464 1 66.44 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAACTCCTTCGATATAA:1 + chr3L 12634251 3' - BS 5047 1 53.42 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGT:1 - chr2R 22596104 3' - Doc 84 1 72.60 GAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGACGAAATAGCGCAAAAGCTGTGAAATTAGCATGGGTAGTTCACTCTATAGAGGAATCTATACAA:1 + chr2L 3123167 3' - R1A1-element 5108 1 54.35 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAGCCAAGTGGGAAATGTTTGAACGCTTTTG:1 - chr3R 14546457 3' + pogo 2064 1 60.27 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTCGTCGGATTTTTGCTTTTAGCCCAAACTCAAACCCGAAAAAGACTTCACT:1 - chr2R 22774529 3' + I-element 5286 1 63.70 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATG:2 - chr3L 13888920 3' - 412 7137 2 74.48 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGTTGTTTGTTCCCTAAG:1 - chr3R 12115224 3' + 1360 3379 2 73.33 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGGCAGTATTGACCACAGTTGCAGTTCCTAGGTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGAT:1 + chr2L 13316921 3' - jockey 4746 1 71.09 ATACCGCAGGCCTTGACTGCGGGAAATGTCGCAAGACAGTTCGAGGACCGTCTCATTGACGGGGAGCGGCAACACCAAAAATGCTCTTAATCGGAGTGGGCCAACGGTCGTTTGTGTTTAAATGTACTTCTGGATTCGTCTTTATT:1 - chr2L 2969943 3' + baggins 425 1 73.29 AGATCTCAGGAACTATAAAAGTCATTCAGCTTCTGGAGACATAGGCGGAGCGCAAGCCGCCCCAAAGCCGCCGAACCGGTCACGCCCACATTTTTGAAACATTTTAAAATTTTT:1 + chrX 20360192 3' + INE-1 149 1 39.47 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCTGGTTACGCTCAAGTTTTGAATAT:1 + chr3L 10814629 3' - micropia 4987 2 63.45 ATTTATTATTAATTTATTTATTTATAAATTTATTTATTTATAAATTTATTTATATTTTAATTATATAATATTTTATAACATAGTAAAAATCAATAAGCATTCCTTTCTGATAACCATTTGGGTGACACATGCTCATCCTGAACACG:1 - chr3R 9822241 3' - flea 232 2 54.11 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTAGTTTTTAGACGATTGTTTGAGCAGCCAGTCCAGTTAGTCGAGCACTTCTTTCCCTATCTGGATTTGGTTTTCAATTTGGCTAATGACATGGTGG:1 + chr3R 21843883 3' + blood 352 2 65.07 GTTTAATTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 76 1 37.67 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCGGA:1 - chr3R 4530662 3' + copia 5087 2 59.44 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCNGNGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTATAAATGTGTATA:1 + chr3R 10900893 3' - F-element 85 1 63.19 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAATTGAGTTGTCCGTGTG:1 + chrX 20942187 3' + hobo 2898 1 77.65 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTANTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTTTGCAATTGGTGAGCAACAGGATGAAGGAGC:1 - chr3R 5977698 3' - copia 4899 2 65.07 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGGTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTGAATTGGGTCAGCAAAGT:1 + chr2L 8895354 3' + 412 461 2 61.64 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATAACAAATCCATCTGAGTTTCAAGACTTTTTATTTTAGCCAAGTTTCGCATATATTTGTTACATTTCATGTAGA:1 + chr2R 15698176 3' + opus 7456 2 54.79 ACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAATGACCCACTTTGCGCCCAGCATCCCAACAGTTTGGCCGTGTGCCC:1 - chr2R 21821076 3' - R1A1-element 308 1 69.18 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAAC:2 + chr3L 9522127 3' - opus 175 4 67.81 CACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACACTCAATTGCCATTGATCTCCGACGCTTGATTAGCCCCAGCCCGCTGGCCAACTAGAATTTCGGACCTGA:1 + chr2R 24585642 3' + I-element 37 1 52.74 ATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCATGCATTTGCCATTATTATTGAATTTGGTCTAATGTGCAAATAACATTG:1 + chr3R 28777173 3' + jockey 434 1 67.12 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTACCCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAATATTCAG:1 + chr2L 11725057 3' - F-element 55 1 54.79 ATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTG:1 + chrX 21667950 3' - gypsy2 6543 2 71.03 GACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGATGAGTAGGAAAAAACAAAAGAAAAGCAGAGAGCTGTGGGCCAGAGGCTT:1 + chrX 4961427 3' + Rt1b 4953 1 61.24 ATGTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAATTTACATGAAAAATTAAAACCAAATGCAAAAGGGCTCCGA:1 - chr3R 11208834 3' - jockey 4750 1 71.23 CCTTAGATAACAAAATCCTAATTATAATTTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAA:1 + chr3R 22435566 3' - roo 8756 2 80.14 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACAAATTGTCACCATCA:1 - chrX 10147872 3' + pogo 2046 1 58.90 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATAACAAATCCATCTGAGTTTCAAGACTTTTTATTTTAGCCAAGTTTCGCATATATTTGTTACATTTCATGTAGAAAAGATTCGATTTTACATTGTTGGT:1 + chr2R 15698201 3' + opus 7481 2 70.55 CGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTA:1 - chr3R 23415885 3' + jockey 4966 1 63.08 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAG:1 + chr3L 7102404 3' - I-element 62 1 56.16 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGGCCGCAAATCCGTGAAT:1 - chr3R 19446124 3' - 297 6601 2 62.71 CCTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCATC:1 + chr3L 13546625 3' - hobo 86 1 76.55 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATGTACTCCTCCTTGGGGCACTGTGACCACCATCGAGGAGCTGACACCGTCAGACTCCGTTTTCCCAGCCAGTTTTCAGTTCAGTTTTCCCGCACC:1 - chrX 12365260 3' - hobo 23 1 69.01 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATAGCGCTCTACAAATCAAACTTTTTTGATAGTGCAATCAAATCTTAATAA:1 - chr3R 22260409 3' - jockey 4704 1 62.33 ACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTGAAATGGAGAAACCAATCCAATCAGAAGCTTATTTTGCCGA:1 - chr3L 9659439 3' - mdg1 7117 2 72.60 ATTAAAACTGTTTTTTTTTCATAATTTCTTCCATCGGTGTATGTGAAGAACAACTCTCTAAAAGCCCAGTTTCACAAATAGGACAACCTCGGCATTAATTCGAGATTTTCTTTCTACGGTAACTGGCGGTAACTTTCGTTTGCATA:1 - chrX 3765015 3' + looper1 1624 1 67.81 ATTGTAAGTCTTTAAATATATGCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAAAAAATAAATTGAAGTGAATCACTTTTACTGAGCG:1 - chr2R 10695733 3' - roo 8683 2 72.60 CTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACANGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGAT:1 + chr3R 7042114 3' - Stalker2 7274 2 67.12 TCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCTTGCAGTACCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGCTTGGCTTGAGAATAGTGCGGATCTAAGGCTTTGCTGCAGTCGTCAGCTTCTC:1 - chr3L 14303330 3' - G2 2714 1 72.09 AAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAATCATACATATGTATACGTTGGAAAACTCTCTCAAAATATTACTCATCCAACATGTTGTCCATATATATGATAAAACATAGT:1 - chrX 16121164 3' - diver2 4736 2 54.11 TTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATAAGAAATAGGCCGCTCTC:1 - chr3L 8157995 3' - flea 54 2 57.53 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTCTTTTGGTTCCATTTTAACAATGATATTTGTCTTCCTTTTTAGATGGCTAT:1 - chr2R 22112581 3' - 412 7 2 75.34 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAAACTTGCCTCCAAACGTGGCCCAATACTTTGAGGATCCGCTTCGATTCCAGCAG:1 - chr3R 27927929 3' - FB 67 1 62.33 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCGCTTCTGTTTTCTGTGTCACTTGATATTCAAACATTTGTTTGCATTCTGTGTCCGAGAAACTGTGCCACGAAAGAGTGCTAGGCTTAAAGTGACGGAACAACCTCGGGGTGTT:1 - chr3R 31497774 3' - Transpac 5 2 78.77 AGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAAATTGGTGATAATTTGATAAAGGATCTAT:1 + chr3R 14278008 3' + P-element 2856 1 64.38 CCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAG:2 + chr3L 9522123 3' - opus 66 4 70.55 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTAAGCACCTACTTAGTAAGTACACTTATCCCCCATTAGTTTTTCTATGG:1 - chr3R 14800887 3' - pogo 68 1 67.12 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAAAAGGTTGACAACTTGCTAA:1 - chr2L 16554562 3' - blood 27 2 66.44 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGGAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCTAGTGCCTTTGGCTCACTTAGGAAACA:1 + chr2R 16073062 3' + opus 7485 2 74.66 AGGGAGGTCATGAGGGCGGTGTCGCTTGNGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGNTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACT:1 + chr2L 3908489 3' - jockey 4759 1 75.86 AAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTATTTC:1 + chr3L 20168345 3' + roo 9060 1 77.40 AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTG:1 - chr3R 4530676 3' + copia 5070 2 52.74 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATACAAGCAATTGTAAAATCAGTTTCTATGCCATACATTTTGTTGTGTCTATAGTGGGACTGCTGAATTTCTATGATAATAAGACAAAAATTTTACTCAC:1 + chrX 18786255 3' + pogo 2080 1 69.86 GGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGTTTTATAATCTCCAATGGGCGAACATGTGTCGCTATCGCCAGGGCCTTCAGCATAATTAGACTCTGGGGCCGCATAAAAT:1 + chr2L 18498902 3' - Doc 435 1 54.11 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTTGAGCAATAAAAAGACGTTT:1 - chr2L 22340077 3' - Doc 45 1 56.85 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTTAGGGCTTCCCTCGA:1 + chr3R 19246822 3' + jockey 4978 1 69.18 CCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGACACATCACATCGATTCAAAATCTCGTTCTCTGAAACCAATAAAAACATATCGTTAGAAATCGCTAAATAAACCT:1 + chr4 909208 3' + 1360 3334 1 73.29 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCATAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTGCGTAAGGTCTGCTTTCATTATGTTTCAGGTGCCCTAGTCTTTCTTTTAGTCAAACGAGTAACTTATCT:1 + chr2L 16276558 3' + S-element 1671 1 54.11 ATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGACGAATATCAGAAATTGAATTGGTAAGAGCAGTATATCTTCGTCTTAACCAACCTATTGATTCGCA:1 - chr3R 30893330 3' - hobo 403 1 55.48 GAAAAGACCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTACCAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAAATTACCTATTATCATTTTATAGCTAAACTAAGTACCTTCCTTTAAACGTGT:1 + chr3L 24034885 3' - 1360 128 1 65.07 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATA:1 + chr3L 23456277 3' + 1360 3335 1 58.22 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACAAATTCATATATTTCATAATATTTTCACCTGCCGCTTTTCCTTTACC:1 + chrX 3596489 3' + copia 183 2 71.92 AGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAGCTTCGTGAGCAGCTA:1 + chr3R 2689473 3' + diver2 4473 1 74.66 AATAAAAAAAATAAAAAAACTTGGTGCCGTGGTAAGGAGGCTAATGCCACAGATAAAGCTGAAAGCCAGATCAGGCTAAAAAAAAAGAGAAAATAAAGTCCACACTCAAAGGAGGAGCAGGAAAAGTTGCACATGCAGCCAATGT:1 - chrX 17539261 3' + HMS-Beagle2 490 1 79.31 GAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGTCAATCACTGGGTTTTGTTTGCTTAGAAGAATAAATATTTC:1 - chr2R 11574956 3' + INE-1 148 1 67.81 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCTCCCGTGCAACTAATGCACACTTAAAATAACTAACAAAACTCCAT:1 - chr3R 8394417 3' - hopper 72 1 64.38 TTCAACGGTTTAATTTTAAAATTTAATTTTGAATTTCACGCCCTACTGTCGCAACACAACATTGTTCACACTGTTGATCTGGCAACGCCTCCCTCTCCAGAGCGCCCGCCGCGCCAAGTTGGCAGCGCTATTAGCTGTTTTATCCG:1 + chr2L 22373917 3' - Rt1b 104 1 84.93 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACCCCTTTTTTCCCTTCTGTTTCGTAGCTCAGAGCCGAGAAAACTACGCAAAACATTTTGTAAATGAATTTTATTTGTCGAGATTTTTGCGGCGTGCCCCAA:1 - chr3R 30537573 3' - roo 22 2 65.07 CTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCACGCACAGTTCTACGGTTAAAAAATGCACTCGAGCAATTAATAAAATGTGAAATGAAAACGGCAGATGAAAAGTTGGGGGAGTTTTGCCAGATGATGACAATGA:1 - chr2L 6271810 3' - Cr1a 4054 1 58.22 AACTGACTTTAGTAAAGCATTTAACTCTGTTAACTAGATTTATTAGGATTTTATATTGGATTTTAAATTATCGGAATGGCAGGACGCAACGGGTCCTCTTTAAAAGTTTCCTTTCTTGTATTCTCCGAGTCACATC:1 + chr3L 25058773 3' + Q-element 312 2 57.35 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATTAAACAGATACAAAAGTAAAATTATCTGGTATCTGGCCCAGTGTGCACTGGCACCCTATCCCTGAC:1 - chr4 906092 3' + opus 7481 2 64.04 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCCAACTTAACTCCGCTGAACTCGGGGCGACAGGACACGAAATCCTTTA:1 + chr3R 19725488 3' - hobo 24 1 69.18 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCC:1 + chr3R 20345572 3' - blood 30 2 63.70 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACC:1 - chr3R 10708249 3' - Transpac 82 2 74.66 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTTCGCCAGATGATTTATGTTCGGAGTGGCAGTATAAATCTACCGTATTCTGGCATGACACACTTTTCCGCAATTGC:1 + chrX 15252400 3' + opus 459 2 58.90 ACTCTAATGACCAATATTCTTACATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGCACATAGATTTGGCTATTTCTATTCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAAAAGGGATAATTTACGAAATTTGAATCTTAG:1 + chrX 19791854 3' - 1360 398 1 78.08 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCAGTATTAAGGAGTAGTCAACCGCTATAGTTCAGTCCCAAACTACACATCCACAGCTCAGCACTATTTTAAAGTAGGCAATCGGTTGTTGGACCCAAC:1 + chr2R 25083423 3' - pogo 21 1 71.23 TCTTCTGTGGAGTCTTCTTGGTGAGCGAGCTCTGGACAGTGCCTTGGCTTACGAACCATTCGCAGCCGGTAATCATCCAGGCGATTTTGTTTTGGGCAGGCTTCATAGTAAAAATGCTTTTAGAGCTCCTAAAGGGACGAAGAGCC:1 - chr3L 24051170 3' - BS3 1549 1 66.44 GGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTACATTTATTTTGATACTATCACAAAAAACTTAGCCAGGACCCATAAAAAGTGAGATCATGTTGGTAAGGATATC:1 - chr3R 20766304 3' - 412 7444 2 52.05 GGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCTCTTATGTACTTAACTTTGGCATTTTGTACCAACATATTGACAACGCCATTCTAACGCCTACGAGCC:1 + chr2L 22645103 3' - Tabor 7162 2 68.97 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTCGGCGTGTTGTACAGTACAAAATATTACGAAAAAGATGCATCGCATTATGACTCCATCAATTTGATTTATTTTGAAACGGAAATAAAATGT:1 - chrX 12325457 3' - I-element 5136 1 64.38 TGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCATGGCGGAAAATAAGACTTGGGGACTTGGGGGTTGCCACCCGACACCTGGGC:1 - chr3R 30520199 3' + I-element 5019 1 62.86 GTGCTAGATCTCCCCGAAAGGTTTTACGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGATATGTAGTAGGGATTAATGGGTAACTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAAAGAAGTGGAATGCCTTCAAGGAGCACCAGACGGAG:1 + chr3R 22493496 3' + G4 3702 1 74.64 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTTTTAAGGATAAAGTGAATACTACAAATGCAAAAATAAAAACATATCAGAGCGCATCATTC:1 - chr3R 29384570 3' - roo 16 2 73.29 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGGACGGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCC:1 + chr3R 20345515 3' - blood 74 2 69.92 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGAGAGCTAAGGAACGCATACATATCGATAATGAAAGTATTTTCAACGTAACGAACCTCTGCGCGCATCAGCTGTTACTCAGAATTTCGTGTTCAA:1 - chr3R 4197125 3' - P-element 27 1 67.12 TTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCG:1 - chr3R 12115263 3' + 1360 3329 1 60.96 GGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAACAGGAGGTACTA:1 + chr2R 16185145 3' - 17.6 34 2 63.01 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATACGTACGTATTTAGCAACCTAGAGTAGCAAATAATAACAGACCGATACGCATCCTGGCTGGA:1 - chr2L 6527660 3' + pogo 2047 1 57.53 TTACCTACTTATCATATCTAAACACATATTAAGGCATTCCCTTGAGTGTACGGCCAGTATAATTGAGCGCATATTTGTAATGCGAGCATATTAATTGGCCCACAAAGAGTATGAATAACTGCCGAAGTGCACTTGAAAATATCTCC:1 - chr3R 28406575 3' - rooA 7250 2 59.59 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGAGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCA:1 + chr3L 7102395 3' - I-element 60 1 57.78 TATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTCACCTGGAAAGCATTTGGACATGAAATTGTCGCTTTTCAGTATGTGGCACACACACAGATACTCACACATACAGTTTCCTCT:1 - chr3L 12607033 3' - copia 236 1 56.85 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATACAAATATTTAA:1 - chr2R 18358410 3' - jockey 4694 1 44.36 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCGATAGTATGACCATATCGGTTGTTTTCCAATT:1 + chr3R 16349310 3' + P-element 2840 1 48.87 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAACCTGCAACA:1 - chr3R 8381672 3' - Tirant 27 2 67.12 ATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATATGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGTGCTCCTTATCGGCATCGCAGTCGCATCTTGTTTGCCGGGTAAGTG:1 - chr3R 8443386 3' + R1A1-element 5240 1 67.12 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGGCGTAGCGAGAA:1 - chr2L 3632125 3' + P-element 2870 1 66.35 AGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCTCTTGATCGAGTTCATTGTTATTG:1 - chr3L 22038158 3' - diver 11 2 78.08 TTTCATATTTTTATTTATTTGTTAACTCCGTTTGGTTACCAAAATGCTTTCAGGTTTGACTAAAATCCAGAGCAACCTAAAATTCTCCGAAAATACCCCTTAAGTGCGGAATAAATTCATTCAAATTAATGTGCTCTTTTAGCCGA:1 - chr2L 17660827 3' - G3 4493 1 69.18 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACCCACCA:1 - chr2L 16382503 3' - hobo 42 1 65.71 GTATATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGNAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAA:1 - chr2R 18035114 3' + R1A1-element 5273 1 61.87 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCGTTTTATAAATTGCAATTTCTGAAATGCT:1 + chr3L 18968751 3' + hopper 1408 2 73.55 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATAACAATTTCAGATGACTTCTCGTTATTTGCAGCAACTTTAACGGGCGTAATACAGAGTTGTTTAAAATTTGGT:1 + chr3L 9659536 3' + mdg1 380 2 53.57 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACA:1 - chr2L 19940008 3' + mdg1 7405 2 54.11 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTGGGCGCCTAGTCATTTGCAACATGCACACACCACTTGCCAACTGCGACT:1 + chr3R 26542661 3' - FB 72 1 67.12 ACATTTGGTAGTTAATAATGAAATACTTTATGATCTACGTGATAGATTTGGTGATTTATTTACGCCACTTGTCTAAATGCGGAAATATAGTAGAACTTAATATTAATAGGATTTTTATGGGTTGTTATTGGGTGCTTTTACAAATT:1 - chr3R 24015327 3' + copia 4802 1 58.22 GCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTAGAANGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGTTTTTATTTTGTTTGT:1 + chr3R 12115350 3' - 1360 66 1 52.05 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCT:1 + chr3R 20260911 3' + roo 9020 2 54.11 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACG:2 - chr3L 16200705 3' + roo 9039 1 63.01 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCACTGTCAGGCAACAAACAAACGATGATAATTTCATCGTTTGCCATAAAAGTGACT:1 - chr2R 17400279 3' - pogo 56 1 58.90 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGGAGTGCAAACATTACTCAGGCTAA:1 + chr3L 20868114 3' + hobo 2933 1 68.97 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTAACATAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAGTTGGGATTTTACAGTTAGAGTATCAAATCAGAAATGTGAAAACCATGGGATGAAG:1 - chrX 6615507 3' + roo 327 2 70.83 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTT:1 - chr3L 19349924 3' + 1360 3335 1 57.53 TATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAGAATGTATTGCCA:1 + chr2R 5198493 3' - INE-1 84 1 63.01 AGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAATAAGAGCAAGGATTGTTTTTTGAAGGCCATCGACTGTTACGAAAACAACAAGTCATGGTTCCATGCAGCCAAATCCTACGAGCAGATTATCCTGCTTGCCAA:1 - chr3R 10121136 3' + gypsy12 10176 2 67.81 GCAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCAATCCCAAAACTTTTTGTAATTGTTATCACTCCTCATCACAATCACCGTGTCAGCACGGTTTTGTGAAACGTATTTTTTTGGACTCTTATTTATTTGAGTTATCGCCGGTGTCTC:1 + chr3L 10370175 3' + Q-element 104 2 69.86 TTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTATAATTGCAGGAGCGGAGCAGGACATTCTGGCAACACTTACCCCATCCGGAATGCACTTGGGCGTGCTG:1 + chr2R 7859169 3' - FB 308 1 50.00 AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTG:1 + chr3L 2485973 3' - jockey 4755 1 69.86 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATACGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAAAAAATACAAACTG:1 - chrX 14867242 3' - roo 71 2 66.44 GGGCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCTACGAATTTTCAATGGGGCTAGATTCATTAAAATTGACTTGCTTAGCTATGAAAACTAAATGCTATGTACACGGGTACATATTTATAAGTCAT:1 - chr3R 12501123 3' - S-element 1274 1 57.81 GTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATTAGGTTGTTAAGATGTGTGGGCGTGAAATCTTGGTACGGTTTGTGGGCGTTAAGTTGAGCTAGGAAACATCGGAAAGAGCAGTGCATGCAGCCATATTGAAAGATCGCCAA:1 + chr3R 19322003 3' + INE-1 551 1 73.97 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGCTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAATGTTTATATGACAATTGTGCACACTACAGTCTATAAAATGTAA:1 + chr2L 5818947 3' + I-element 5278 1 69.18 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGA:1 + chrX 7032740 3' + roo 319 2 76.71 TTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAG:1 + chr3R 14401946 3' + Juan 4140 1 66.44 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTACGCCCTGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAACAATATATATCACATCATAAACAAAAGCATTCCAAACATTTTGTA:1 + chr2R 14161387 3' + I-element 5273 1 67.12 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGC:1 - chr3R 6147248 3' + copia 5053 2 65.07 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCT:1 - chrX 10667039 3' - jockey 4793 1 76.03 CCGTAACTCAAATGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACATCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGACACCTGGCACACTTTGTAGCAATTTTTTATGACAAATATAACCCCAAAA:1 + chr2L 7160844 3' - R1A1-element 5045 1 63.19 GAAATTTGAATTTGAATTTGAAATATATTTACAATAAATTTAAATGAGGTCTGGATATTCAACTGTTATTACTAAGTCAATAAAACCGTAAAAAATATAAAACTAATTTTTACCGACATGTGAAAAATAGTTAGATGATTTGGTAT:1 - chr3L 14920327 3' - Rt1a 312 1 52.05 GTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGTTATGTTTTGAAATGGTACAATCTAAGTGCGATGGTTTTAGCGACCGAACAGTTTATTGACAATAAAAAAATAAGGACTCACAGCGCGCCCAGTCGATTGACCCCTGGAG:1 - chr3R 28317996 3' + Cr1a 480 1 63.70 TCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGGGCAGGAGTTTGTCCAGTAGTATCGTGTTTGGTTTTGTGGTTGTAAATGTAGAGTAATTCTTAAGTAATTGATTAGGATGTAGGGCTATAAAACGAATAAATTAACAT:1 + chr2L 8209294 3' + S-element 1705 1 63.01 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGACTGAGAGTGTGAGTTCG:1 + chr2R 10541779 3' + P-element 2881 2 76.98 CGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGG:1 - chr2R 17609757 3' + mdg3 5430 2 62.33 ATAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAAGGAAAGAACGAGAAATTTCAACATATATCCGGCACATCAATAGAAATTGTGATGCGGGTGGTGAGAGCAGTCTAGCTAGCAATGAAAAGGACGCAGA:1 + chr3L 16720170 3' - INE-1 564 1 65.75 TTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTGAA:1 + chr3L 12634220 3' - BS 5078 1 73.97 GTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACC:1 + chr3L 19349996 3' - 1360 3274 1 67.12 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGCGTCAGTCAATTTCACTTATG:1 + chr2R 22971910 3' - jockey 4760 1 80.00 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATATAAGAGCCACGATTACAGGCCAA:1 - chr2L 7148517 3' - HMS-Beagle2 6901 2 71.92 CCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCATTCGCATTTCCACTAGCTGATTGAGGAGAATTTAAAAATGCATATGCATATTTATTTTCAATAATTGCATTATCAATCGACTGTAATGCCAGTGATCGTATCGTATCTTCGAAC:1 + chrX 22517582 3' + INE-1 505 1 78.77 TGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCAAGTTATCAGTCCACTGAATATGTTTAAAAAAAATTAGGCAAGCGTTGTGTGTTTTCTAAACGAAACGAATA:1 + chrX 4113672 3' - hobo 2662 1 64.46 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGG:1 + chrX 6283693 3' + P-element 2786 1 16.44 AGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAGCGAACAATCGAAAAACATTAAATATGGTATGTTATAGTAGGATATAGTACAACTACGGTTAAG:1 + chrX 19690671 3' - gypsy 15 2 72.60 TACACATTAGGTTAAGTTCAAAAGAAACTGAACTATTGCTAGTGACTAATGAATAATAAATTTAAAAAAAAATAAAAAAAATTATATTAATTTTTAAGAACCCATCGATCCACCCTCTCTTTTCTAGCTTTTTGAGTTGTTGTTCG:1 - chr2L 15203989 3' + G5A 2787 1 72.60 AGCATGCACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCACGTCATGTGCGGGTAACTCCACTTAACGCAAAGTTGCTGATAAACCATCAAAATATAAATCACTAAACTATAGGGTTTTAAG:1 - chr2R 7997575 3' + Stalker3T 176 3 52.74 GCTCGACCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTAAATTGATA:1 + chr2L 5341609 3' - Burdock 51 2 51.37 GGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACT:1 + chr2R 21229064 3' - jockey 4755 1 72.60 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGC:1 - chrX 21227112 3' - Tabor 67 2 60.96 TTTTTAGTTAATTTAATTATTATTTAATTATTTATATTTACGTTTCAGACCCCTTTGAATTTTTACGTAGCCAGCCACAAGTTCTATTTACATCCGGCAAAAATGCAAATAATGTCAACAGACTCACTTATAACAAGTTGCGAAAT:1 - chr3R 4568256 3' - X-element 4715 1 54.11 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCTGGCTACACATTTGATGTAATGATTATTCAAGAAACCAAATTGCTTAGCTATGAAATAGGAACTCAGAAATCAATATATTTCCCTTTCAATAGGAAACA:1 + chr3R 19629073 3' + Transpac 291 2 64.38 TAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTATGGGCGCATGTTTACAACTGGAATTAGGGTGCAACACAACACATGTACTAGCTGCAATTAGGACAC:1 - chr3R 31031957 3' + hopper2 1556 1 52.05 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCAC:1 + chr3R 24734913 3' - jockey 4746 1 76.43 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTAATCAAAAATAATATAGATTTAAAAACTAAAAACATTTTGTGTTCAAATTGTTTTTTTTTTTCTCAACAAACATTCGGTTTCTTAAGTG:1 + chr2L 22968219 3' - 1360 306 1 59.31 GCTCCAAGTGTAAATTTATGACCTTTTGTCGAGTCAAAAATCTTTCTTATACTNCNTATGTTTACATTATTTCTGGAGCGGGATCGCCCACTTAAGATATTTATTGTATACAGCTAGCGTACATGGCGTGGAATCGCCACTCTGTA:1 + chr4 1183512 3' + Q-element 666 2 73.97 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCTCACATTTTTCTTCACCTGACTTTT:1 - chr3L 10023946 3' - transib2 42 1 57.53 TACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCATAGCATTGGCTAAACAATTAATTTTAAATACAAACGTACTAGCTATCTTA:1 - chr3L 20721968 3' + Quasimodo 34 2 65.75 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTGTTNCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACCTTGATTATAT:1 + chr3R 9551005 3' + P-element 2838 1 48.63 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAGGCGAGAGAGAGCTCGTGCTGT:1 + chrX 18534596 3' + P-element 2829 1 35.77 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCATTTTGCTCAGTTCGCCAATA:1 - chr3L 739134 3' + P-element 2846 1 57.53 CGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCCCATCGTTTATC:1 - chr3R 23415855 3' + jockey 4980 1 76.71 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTGCTCTGCCAGTTGGCAAGTTGTGAAAGTGAAATGCGAGACATGCTACCCGAAAA:1 + chrX 7993202 3' + opus 7487 2 76.03 AACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAGATGATGATGGTTT:1 + chrX 8208461 3' + roo 397 1 78.77 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGAAATTATATATATATACATCTTTTTACTCAGCGATTAGCATGAATTGGTTGA:1 - chr2R 5277141 3' + Quasimodo 7300 2 74.07 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACACGTTCAATTTAACGCTTGAGTTCGGTTTTTGGAAAATATATTTCTGGCGCTTTTCGTTCATTTTCCGTTTTTTGCTACGTTGATTTATG:1 + chr2L 20551087 3' + 412 470 2 67.63 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGG:1 + chr2L 16553605 3' - 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Stalker 7169 4 73.97 GCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGAAAAACCCGAGCACAACATGAAAAAGAGGTTAATTAACGTGCATTC:1 - chr3L 20934095 3' - Max-element 26 2 75.34 CATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATA:1 + chr2L 13328522 3' - BS 18 1 64.00 TAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAAGTTGTGAAGTACCAAATTGTCGCCACTGGACTTGCAGTGCCGTGCTCCCTACGCCTTC:1 + chr3R 22135623 3' + Tirant 465 1 71.92 AGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCTAACTAGCTAACTATAGTTAAAAAAAAAATGCTGTTCGTTGTGAGTCATATTTTCAATTGTTGCCTATTCAAATGGCGCCGTAAAGAGCGCATA:1 - chr2L 19399541 3' + X-element 4620 1 78.81 ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTT:1 - chr2L 13697607 3' - F-element 85 1 63.01 AGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTTGTAGAATCGAAACTTTATTCACGTTAAATCCCCAATTATGTTGGTCTAAATAATGCTTGGTATTAAATAGTAGTATTCCCTGCAGAGG:1 - 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P-element 91 1 22.22 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAACCTGCAACATTTTTTGGCCTT:1 - chr3R 8381660 3' - Tirant 15 2 75.34 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACAGTA:1 - chr3R 9550898 3' - P-element 58 1 43.57 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTT:1 - chr2R 16731287 3' - Tirant 8184 2 75.19 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAATTTCTTTTACGAAATACACCTGGATATGTGAACCACCCTCCCATAATCATCAGCAGC:1 + chr2L 21026736 3' - FB 58 1 60.00 ATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATTCCCTACTAATTAGTTCAAAGAATTTAAATTAAAACTTTGAATTGCAGTAAACAACTCTTTCAGAAACAGAGCTGCTTAAATAGTTCAAAGTGCATCTTGAACAAATGCAACGA:1 + chr3L 6579089 3' - HeT-A 31 2 80.14 GAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTCGTTTCAGTTTCGCCCATGGTCTGGATACCGCATCAGCTGGTGGGTATTCCCATTGGATTCAACATCACCCTGGAATGCTTCATCGA:1 - 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chr3L 12365305 3' + P-element 2501 1 64.38 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTTTGCATTTAATTTGCGCGAAATTAGTTTCTTCTTTGCCGTTCTTACGAAAATAAATTCGC:1 + chr2L 1232722 3' - roo 59 2 59.59 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGAAATTTCGCAGTTACGCAGCTTCAGCTTGAACCTGTGGCTTACA:1 - chr2R 22964178 3' + 412 7501 2 52.41 AAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGAAGCCAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCGCCGCCATATAGACCCGGCCGAATAGAATCTATGTCAAGCTATGGCACGC:1 + chr3L 16937180 3' + GATE 339 1 72.60 CTTGGCAGCTATTAATTCAGCCCCCAGCCTAGTCTACGGTCTACATGTGTCACCTGAATATGACACTAAGAAGGATTTCTGAGGCTCTTTGTTACATCAGAACCAGGGACATCGAAATCGAATCGACCCCCGACCGGGTTTTGATA:1 - chr4 413913 3' - BS3 1712 1 58.22 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGCATTTATTGTAGTAAGCTTACCTTTTTCCTATAGTTATCCATTCATAAAAGGGGGTTTCTTCGTTGTTTGATGAGATTCGTTGCGTT:1 + chrX 839910 3' + S-element 1684 2 63.70 CATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACAGGATCAATTAATATACCTATAAACTATGAATATTACTATTTGTCCGTAAACTTAACAAAGACCGAACAAACTTTTGCAAATTTAATTAAA:1 + chr3L 6570174 3' + Quasimodo 7034 2 63.01 TTCGGCTATCGACGGGACCACCTTAGGTTATTTCATCATGCACACGCCTTTTTTCTGCTTAC:1 - chrX 14825309 3' - P-element 19 1 32.26 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTTTAATTGAACTTGTGCA:1 - chr2R 8086876 3' + 1360 3311 1 76.03 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTCGTCGGATTTTTGCTTTTAGCCCAAACTCAAACCCGAAAAAGACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAATCTTTTTCCATT:1 - chr2R 22774491 3' + I-element 5324 1 60.27 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAG:1 + chr2R 10541717 3' + P-element 2800 1 25.52 AATAATAATAATATTTTTTAATATTGAGTAAAGCGTCGATGGTAATAAGACTTCACTATTCCCAGAGTCTTAATTAGCATTCAGTTGACAAGCATTGACAAGGATATCTCTGATTGGATTGCAAAGTTTGACTATTTATTAGTTGT:1 + chr2L 20296652 3' - Burdock 499 1 58.22 GGTGAGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGGTTGGTTGACGGAGAAATTTGGAACGGC:1 - chr2R 6085913 3' - FB 68 1 76.47 ATTATTTGAAGCTTTTCCTTTTGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAAGGGAGACACCATTGCTGAAAAAGACAAACAATGCGTAGAAGTTGACATTGTATCGAATATTAATT:1 + chrX 132411 3' - pogo 374 1 54.11 AATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAAATCTTTGG:1 + chr3R 30618777 3' - X-element 40 1 51.08 CTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAG:1 + chrX 8208448 3' + roo 9047 1 69.86 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCATTTTGCTCAGTTCGCCAATAAAGACGCTGCAACATGGA:1 - chr3L 739116 3' + P-element 2864 1 69.86 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTGCTTGCCATGTTAATGAAGTGACTAATGGCCAACG:1 - chr2R 19015935 3' + roo 9052 2 69.40 TGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGGGAGGCATCACAACTATTCAAACTTTCTGAACTACGAGATTCTTGGAAAAATCATATGACACTAGCATA:1 + chr3L 18010320 3' + diver 195 2 51.00 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGT:1 + chr3R 27398131 3' + roo 357 2 52.05 GGGTTTCTGTGTGTACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCGCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACCTTATTACTCGACTCTTATTTGACTCCAGAGCCTCGACCCTCGA:1 - 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chr2R 20230943 3' - jockey 4745 1 68.49 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTACAAACTTAACAAAGAACGTAAATTAT:1 + chr3R 22435583 3' - roo 8739 2 73.29 CGTCTGTCTGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCATGAAATATTAAGTTCCTTTGCAATTTGCAATCTACTTGGTATATATTCGTAGGAAAGCTGGAAGTAGATCTTACGTCTAGCGAAGG:1 - chr4 712351 3' + INE-1 128 1 58.22 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCAAATATTTAATACTTGAAAAGATTTC:1 - chr2L 18284819 3' - pogo 44 1 55.48 TAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGTATGTATATATTATATTATTAAATAAAATCT:1 - chr3L 14143116 3' - X-element 4695 1 54.11 GTTTCACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTCGTTTCACGGTATGTTCTGCTCCCTGGCCGTAGGAACGTATTTCGGGAACTAAACGAAAGAGAGGGAAGTGTTTGATATACTAGAGCATGCAAGCTATCCAACCCAGTT:1 + chr2L 22003566 3' + Tc3 236 1 72.60 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGGGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAGCCTGCCGATACCAGCGCTGTCTGG:1 + chr3L 13889022 3' + 412 459 2 58.33 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGGCGAGACCAATGTGACAATGCAGGTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGGGGGGACCTTGGTTGCCTGG:1 - 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chr2R 22596106 3' - Doc 86 1 73.97 CCCACTCTAACGCCTACAAACAGCCAAAAACTTGTAAGCGTACATTTTTAAATAATGTGTTGAAATTTGCTCAATTTATTAATTGTCTATCGTTTGTGTCATTGGTTGTGTCTTTTTGGTCAGTAGATTTCAAT:1 - chr2L 22009233 3' + INE-1 219 1 92.54 GCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAAATGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTCATCGCTGGACACTCGTTTCTATTCCCAAACTCATCCTGCCACAGACGATAA:1 + chrX 19525734 3' + R1A1-element 469 1 69.86 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAAT:1 - chr2R 14484089 3' - pogo 46 1 53.79 TAAGCATTGAGTTATTTTAAAACTAAAAGGGTCGTATAACAATATTATAAGTACTTTTGTAAAATTTGTCTAAAAATATTATAAAGTGGAAAACACTTTGCCTGGAATCTGAGAAGTGGAGTACTGGGAATCTAAATTGCTTCGAA:1 + chr3R 30633592 3' + gypsy12 9789 2 84.93 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGAATATTAGACAACTGAAAGCTCCAATCACTCAAACTCACAATTTTCCGAACATTCGACCACCATTCGGCTGGTTTT:1 - chr3R 31419306 3' + pogo 2059 1 56.85 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAAATACTGGGGCTTCTTAGTAAGCTCAAGCGAACTTAACATCCG:1 + chr2R 23841693 3' - roo 89 2 73.29 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATACCAAATTGAAGTTAAAATCTTCGGGTGTCGTAGTC:1 - chrX 16490419 3' - F-element 32 1 63.70 GGCGTCAAATGAAAAGTGTTTGTACACCGTCGTTGAGTGGAAATAATGCCGGTTGTTCTGGTATTGAAATTGGATATTTATTTTCATTTAATTTACTACAACTTAACCGAACTGAGAGCTTTATGAGAGGGAAACTAATACAATAT:1 + chr3R 13778719 3' + invader4 466 1 50.68 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGAAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGT:1 - chr3L 1477358 3' - mdg3 5306 2 50.00 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTTTATAGTGATCATATGAGGTGCGAGAAATTGTGCTAAATGCTTGCTAGTTTCAGCCCAAACAATTTACGCACGAGATGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAG:1 - chr3R 14546485 3' - pogo 3 1 65.22 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAAC:1 - chr3L 12125251 3' + roo 9042 1 63.57 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGAGTGTATAGTCCA:1 + chr2L 16995561 3' - roo 8742 2 72.54 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCNANCCAGAATGAATTGGATCGACGNATAAATTAATAGAGAGTATATNATATCTAAGCTCAAAGCCTTGNAAATGCAAGCCTCGGG:1 + chr3R 7477540 3' - BS 5003 1 74.66 AGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGC:1 + chr3R 24074832 3' - jockey 4828 1 67.81 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTTTGTTCTGCTTGGCGGGTCATCGTGCAACTGCAGAAATTACC:1 - chr3L 9522003 3' + opus 7479 2 61.64 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAA:1 - chr3L 13888911 3' - 412 76 2 68.49 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATACCAAATTGAAGTTAAAATCTTCGGGTGTCGTAGTCAAGATAG:1 - chrX 16490412 3' - F-element 25 1 68.49 AGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCGGTTTTCCACGCGGCGTATTCTTAT:1 - 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GATE 408 1 77.24 AGAACACAAAGGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAATATATAAATTAAACAAAAGGATTCAAACGCAGTCACAATCACTAAATTGCTTCCAGCGAGTAAAAGATGAGAGAAAGAGTGAAAGAATGCGAGGGAAAGTGGAATA:1 + chr3R 14175384 3' + X-element 4678 1 64.38 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACATACATATATAGATCATATATAATTACCGCGATATAATTTCGCCTCTCTGTACGCGGAAATGAAGTCTCAATACCCCGTTGTGGCACACAAACTCGAAAACTTGA:1 + chr3L 8158153 3' + flea 244 2 78.77 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAA:1 - chr3L 12125290 3' + roo 333 2 71.23 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCGGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCCTAGATAATTACACGAAATTGATTTGATTTGATTATGCCATAAAGCA:1 - chr3R 21654909 3' - roo 8670 2 78.77 TATTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTTGATCTTTTTGTACTTCGCCTGCCTGTCACCGATCATCACGTTCGGAGGACTCCTGGCGGAGGCCACTGGCAAGCACATGGCTGCGATGGAGTCCTTGGTCTCTGTTTTCGTTTGTG:1 - chr2L 7230051 3' + INE-1 87 1 76.92 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTT:1 + chr3R 24074852 3' - jockey 4808 1 54.11 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAGCCAAGTG:1 - chr3R 14546478 3' + pogo 2043 1 61.64 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACAAATTCATTGATCCC:1 - chr2L 7336125 3' + pogo 2051 1 65.00 GGGAACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAGAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGTG:1 + chrX 22672495 3' + INE-1 572 1 50.68 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTT:1 - chr3L 12125286 3' + roo 337 2 68.49 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCAGTTGCTGTTTGTGTTCTTACATATTTAGTCGCAGGATAATATG:1 + chr3R 28045845 3' - Tirant 8185 2 71.92 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTATTTTTCTTGAATTAATTGAGTGGTTTTTTTTTGTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTA:1 - chrY 1076847 3' - opus 27 4 65.96 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAAAATATTTTTTTAATATACTATCCCTTCCATTTTTTTCTAATATTATTTC:1 - chr3L 21124831 3' - 412 70 2 63.70 GCATACACACACACACACACACACACATACATAGTATATCTGTTAACAAAAATATTATATAAATTCTATATGCAGGCCAGCACACAGAGACATTTATCGACTTGCATATGCGTGTCATATGAATTAAACTCTCAGTTAAATCAGTT:1 + chrX 6417881 3' + accord 7025 2 79.45 CGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCGTTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACGGGCTACTTTATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTCATGCTTACAAACTCGGGTCGAAAAGTCACTTCTTCAGTGTGTTTGCTCAGTGCTT:1 + chr2R 17969043 3' + gypsy4 124 2 63.01 AATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAGAGGACGAAGGAATGGTAATGGAAGTGCAATTTCCCCCC:1 + chrX 10504182 3' + roo 437 1 68.03 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGTGAGTAAATTGTTCATCTCGGTTCATTTTGCTAGACCAGGGCTTGAGAAACACACGAAAGTATC:1 + chr2L 7810741 3' + P-element 2836 1 47.14 AACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTNGNATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTATGGGCGCATGTTTACAACTGGAATTAGGG:1 - chr3R 31031994 3' + hopper2 1519 1 76.03 CGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTA:1 + chr4 829115 3' + INE-1 136 1 34.25 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGC:1 + chr3L 21913445 3' - 297 54 2 56.85 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGGTTCCATGTCGAAACTGTAACAGTTTCCCATGACGATAG:1 - chr2R 17609719 3' + mdg3 229 2 70.90 TAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAGCTGCCATCAAAAAAACTGGGAATCGTGAGAGGGACCGTGCAAA:1 + chr3R 12118202 3' - gypsy12 70 2 67.41 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTC:1 + chr3R 13684774 3' - 412 7118 2 60.27 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCGTACTCACATACATATGCACACATCATATCCTTGGAAATGGTTGTATGTATGTATGTATGTATGTGAGTATGAGAAACATTGTTGCTCCTTCATTTCTCCATC:1 - 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Doc 299 1 50.69 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTNCNTTGAGCTAGAAATTCCAGGTATTCGGAAGGACTAAAATACTTTCTTTATGTCCCTTTTTTTTTACCTTCGCCTCGGACTTGCCCTATTTT:1 - chr2L 21026624 3' - FB 42 1 55.48 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGTGACAAAGTGTAGTGATATTTCAACATTGTTGATAAAGTTCCACAACTCTGGGGCTTAACTACTTAAAAATACAAAATGGGAGCAGCATAATGACAACGCCATAAAA:1 - chrX 5456504 3' - roo 13 2 76.71 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAAACAACGGGAACATATTTTTATTATGCTATCCAATGTAATTGCCATTGTCCGAGCTGAAAGAAAAGGATGTTGATTAGATGGTGCTTGTAAGGATATGGTTATTGTAT:1 + chr2L 6154060 3' + copia 242 1 76.03 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAA:1 - chr3L 22041090 3' - roo 8750 2 77.40 GTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGGAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTAT:1 - chr3L 20868038 3' - hobo 79 1 70.55 GTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAAC:1 - chr3R 19246722 3' - jockey 4760 1 78.77 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGGATAACTCCTTCGATATAATCCAATG:1 + chr3L 12634258 3' - BS 5040 1 52.05 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGT:1 + chr3L 7102392 3' - I-element 57 1 59.69 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTAGGAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTAACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAACCGCATAAC:1 + chr2R 5542362 3' + Quasimodo 7344 2 69.18 ATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACACAACAAAAATAACCCATACAACAACCTCCAATCAGCTGCAGCAACAACAACGGCGCCGTGTGGCACCCAAGCCGCTGCCACGCCCACCGCGACGTACCCGCCCAACGGGAC:1 - chrX 10575676 3' + I-element 104 1 75.54 TTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGGCTATCATGATTGTCCTGCTTCTTTGAACCTTTATACTTAGCTTTGAATGTGCTCTATGTCTGTGCTTAGTCTCGTTATCCTTCG:1 - chrX 811967 3' + FB 214 1 62.33 CTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTA:1 - chr3R 11757967 3' + invader4 262 2 58.90 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTATAAGAAGTTACCAAAACG:1 - chr2L 9599762 3' - roo 29 2 66.44 ATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTTTTTATAAACAATTACGTTGATTTTATTTCGGCAACTACCATATTTTTTAT:1 + chr3R 13898285 3' + 3S18 6092 2 60.00 ATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATCAAAATGAGGTATGATAAATCAGTGCATTTTTGGTTACAATTTGCA:1 - chrX 8045686 3' + Stalker 7048 4 68.49 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTGAAATGGAGAAACCAATCCAATCAGAAGCTTATTTTGCCGAATTTTCATTTAACGAAATT:1 - chr3L 9659420 3' - mdg1 7098 2 60.96 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGG:1 + chr2L 11725041 3' - F-element 71 1 65.75 AAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACAAGTTACTGTGTGTGATGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGATAAGGCACCGGGACGATCTGCTAGACATTAAGAACCTAAGCAGCGTGCAA:1 - 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chr3R 23579244 3' + roo 9054 2 74.66 TGCCAGACCGGGCTTCAGTGTGGGCGCCACATATATAAGCTAGAAAGTTTAGAGTACTTTCAGTATCCAGTATCTGATAGTCGACTAAAACATGCTTTCTTGTTTTATTGTAATGTACTTTACTTGTCTACACAGATAACAATTCC:2 - chr3L 17860556 3' - Chimpo 10 1 56.16 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGGGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAACCTGCAACATTTTTTG:1 - chr3R 8381665 3' - Tirant 8127 2 70.55 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCCGGAAGAGCAATAAAAACCGTAGCCTACCTTCCGGC:1 - chr3L 19349882 3' - 1360 9 2 76.22 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAAT:1 + chr2L 11725051 3' - F-element 60 1 58.62 TTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAAATATAAGGGAAAAGTTAAACAGGATCAAAATACAAATGTTGTACAAGATAGGAAGGAAGAGTTAAAGCTATTAAGCATTTTC:1 + chr2L 22235055 3' + Bica 284 1 53.42 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGAACTATGTCGATAGAGAGTAGTAAGAACTTC:1 - chr2R 24807841 3' - I-element 21 1 69.18 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAATGGAAAAAAA:1 + chr3R 4361686 3' - copia 52 2 54.11 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAA:1 + chr2R 10695877 3' + roo 9013 2 60.96 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATGGTACTGCAACGCAATGTGTCATGTTTATCCCCTC:1 - chrX 20233747 3' - pogo 22 1 70.55 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCTCTGAGATAAAGAAAGAGATTACCTGGTGGAAAATATTCAATCAATCACCCAACAATATCTTGTTTTCACCGTATCGAATGCTGCCCGTC:1 - chr3R 28829044 3' - FB 29 1 62.50 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCCTTTCCACCAAAATTTAAGTGGATGCGGCGTGGAGATGGAAGTGGGGATGCGGTTGGGGGGGTGAGAGTGC:1 + chr2R 13117950 3' + 297 6929 2 54.11 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAGTAGTTTTCTTATCTCG:1 - chr3R 19246625 3' - jockey 4669 1 80.82 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATGATATGGTATATGGGGTCTACGATGC:1 - chrX 17495661 3' - Burdock 6154 2 73.29 CTATTTGTATATTTATTTTTATGTAGAATGACATTTGCACCAATATCAGAGGAAGCTACAAATGTACTACCGTTAATTGTCCACTTGGATACAGCATTGACCCAGTACAAAAATGTTACACACAAAACACCGAGAAATACACCCAC:1 - chr2L 11604571 3' - Stalker 87 4 76.03 TACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAATTACACCGATGACGATGGATTTACCGGAAAACGAG:1 - chrX 847313 3' - 1360 338 1 76.03 TCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCCTCCGTTCACCTTCATCACTTTCGTTCGCCTTCGTCCCTTAGACAAAGGCCAGTGCAAACAGAACTACACTGAGATATATTCAAAAAAATGGATACATAAAAACTACACTCGCTTCCTTACATTC:1 + chrX 20985554 3' + blood 7181 2 54.79 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAATGATATCGCAGGGATATCGGTAGGAGGTTCTCCGCAATTCTCTA:1 + chrX 17495833 3' + Burdock 6357 2 62.33 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCCTAGATAATT:1 - chr3R 21654946 3' - roo 8707 2 54.79 GGCGAGAGAGTTAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGTAGAGTAAACAAATCTCCACACAGAGATCCTCCCACCTGGACGACTCC:1 - chrX 13685995 3' - Cr1a 286 1 70.99 CAAATAAATAAATACAAATAAAATTCCAGCTTTGGTTTATTCAAAATGTTATTGAAGTATTTAGTTATTGTGCATCGATACCATTGTTAAATAAGTTTTGTTTTGAAATTTTTGAATGTAGGAACACTTTTTAGAACGCTTCTTTG:1 + chr3L 16302409 3' + Tc1-2 479 1 67.81 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGAAAAGGGTTTATCATAACTTATTTATTGCTTATTCCAGGTTGTCATGTTCTTCGGTCTGACGGTGGCCTCCTA:1 + chrX 13152842 3' + pogo 2056 1 54.79 GCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCTCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATACTCTCAGCAGGTGAGAGTGGGAGTGCGAGAGAAAGCAAATTATGTTATGC:1 - chr2R 14008359 3' - micropia 5201 1 65.75 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAGGTTGGTTCATGCAAAACACCACCAGAATATCGATTCGGATTCGAGTGAGTC:1 - chr2R 23790203 3' + roo 390 2 72.60 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTAGGAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTAACAATGTTTGATGACATT:1 + chr2R 5542340 3' + Quasimodo 7359 2 72.48 CAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAACCACCTTTTTGAATTAAGACTTTTCTCTTAGAGTTTATTTTGT:1 + chr2R 3104513 3' + Gypsy6A_LTR 383 1 59.59 CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCNGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCT:1 - chr3R 5977745 3' - copia 77 2 69.18 TTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCTATGACTATA:1 + chr3L 21202122 3' - G2 2620 1 59.59 TGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAGGAACGGGAATGTCTGTAGTATATGAACCATAAACCCCTTAAATATGCAATAGAAAGTACGATAACTTTCTACTTTCACATTTATAATTC:1 - chr2L 13244618 3' - jockey 4586 1 64.29 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATTCGCATTGCTTTCTCGTATCGCATGACTCCTGTTGCTAA:1 + chr3R 8381828 3' + Tirant 8465 2 55.56 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATGTTGCACGTTGTCTGTTCATTTCGCTCCTTAAGCCCCACATCCTTCTATACACGCAAAACAATAGTGGTCGTATATATAAATCAAACATTGATATAAGGTGCAATGTG:1 + chrX 6521019 3' - FB 12 1 75.34 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATATATATAAATGCAATTTTTTCTATATTTTACTATATTTATAA:1 + chr2R 15472119 3' - 412 89 2 71.92 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATATATATAAATGCAATTTTTTCTATATTTTACTATATTTATAAA:1 + chr2R 15472120 3' - 412 7141 2 71.23 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTCTCATATATACCATACCATATTTTGGCATACCTACTGCCCCGCTTCCAACTCTCTCCTGGTAACTTAAATCAATTGCGG:1 + chr3R 23511675 3' - 297 35 2 62.33 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAGTATAAATAACTCTTTGATGGGCAGCCGGTCGTGAGCTGGCCGGCGACTTTAGTTTGTTTAGTTTGCTGGCCATTTGT:1 - chr3R 13453286 3' + 412 456 2 57.55 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACG:1 + chr3R 27398130 3' + roo 9038 1 57.03 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCTGCTTTCAAAAGAGAC:1 + chr3R 4197214 3' + P-element 2783 1 15.07 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGNTNTGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAAT:1 - chrX 21227095 3' - Tabor 50 2 51.37 ATAAAAATTAAAAAACAAAGAACTTAGAATACTATCCAAATGTCAAGAAGTATGAAGGAACTTATATGAATTCTACTTAATACTTCAGATACTACAAATACTTTGTCATTTTTCGTTATGGCACATTGCGTGATAATTGCATTGTA:1 + chr3L 3532211 3' + Doc 4695 2 81.51 CTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAATA:1 - chrX 1208851 3' - Burdock 6217 2 76.03 GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAAAGTTAAGCATTTA:1 + chr2L 16554681 3' + blood 308 2 68.84 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGC:1 - chr2R 21475235 3' + P-element 2801 1 26.71 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTCTACACCATAATTCATAAATA:1 - chr2R 8258218 3' - jockey 14 1 77.40 TAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCTACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCTACAAATAATTAAATCATGCAAGGCAATTGCTG:1 - chr3L 18947220 3' - BS 4694 1 59.03 TATTATTATTATTGTTAATATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCCTGTTTTGCTGTCATTTTGTCCAACTGTCCTTTGGTCCTTTGGTCGCTTTGTCCT:1 + chr3R 14138663 3' - mdg1 7066 2 66.44 GTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTC:1 + chr3R 22352503 3' - I-element 78 1 71.23 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACAAAAAAACTAATCGCCCGGCATCCCGCTCC:1 + chr2L 3059419 3' - P-element 86 1 24.83 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGAGTATCAAATCAGAAATGTGAAAACCATGGGA:1 - chrX 6615512 3' + roo 8984 2 78.77 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTT:1 + chr3R 21655042 3' + roo 325 2 72.60 CGGCGCGTACCACCGTTGGTGGGGCGTTGATGCCCTTGTGATACCTACTGGGATGCCAACATACAAGAGAGTATTTACAGTTCTTGGATACTCAATTATAACTTCAAAAATAAATAAATACTTTAATTGGAAAATTGAACGTTTCA:1 + chrX 17714868 3' - baggins 40 1 66.44 ACAAAAATTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTCTACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTTT:1 + chr2R 10695913 3' + roo 387 2 67.59 CAAATTTNAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTGAGCTTTCGTGCT:1 - chr3R 17673708 3' - FB 24 1 69.86 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTAAT:1 + chrX 7032773 3' + roo 352 2 54.11 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTATGTCTATAAAATGTAGCAAAGATAAATGAAATGTGTAAAGGATTTCATTTAAAAATTGA:1 - chr3R 6399344 3' + pogo 2049 1 53.42 TCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCT:1 - chr2L 13675890 3' + flea 4943 1 67.12 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTT:1 - chr3L 16200749 3' + roo 8995 2 69.86 AAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAAACTAGATGGTGACATCCGATCGGACCTGAAGGGCGCATA:1 + chrX 15406108 3' + opus 499 1 78.57 GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACCCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAAGAACTATA:1 - chr4 649083 3' + 1360 3315 1 67.81 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTCCATAGGCACATACTACACCTGCCCAGTCCAGTCAAGCGGGTATGGCCAAAGAAATGCTGTTGATTTTAGTTTCCCGCGAATATATAAAT:1 + chrX 21639357 3' - 412 7106 2 50.68 AAAACGAAATCAAGTTCAAATATCTAAAGGATTATTCGAGCAAAATTCAATGACTATTATTTTATTACTACTCATAGTTATTAACTTCAGATACCTTATGAATAGTTTATAATATGTAAAGTAAGATTTAATGTTTGTTTTGATAA:1 + chr3L 16258028 3' - accord2 7242 1 61.64 GGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAGACCAGAAATAATTAGGGTTTTATTTCATTTCCACAAAATTGCTAATAATGAAAACATCAATTTTAC:1 + chr3R 14402012 3' + Juan 4206 1 78.77 TATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGACGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGGGGTTGTTCCACTGTCACAAATTTTCTCGTCTGACGCTGATCGTTT:1 + chr2L 16553650 3' - BS 5018 1 65.73 GCACACACACACACACACACATACACACATACACATCTACACGCACGCACACAGATACGAGTGAAAGCAATCAAAGTGAATGGCGGAAATAAACACACACATACACAGAAACACTTCATCGTTTGTCGGTCTTTTGCCTTTTTTGG:1 - chr2L 7326028 3' + accord 183 2 74.66 GTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAATTTCTTTTACGAAATACACCTGGATATGTGAACCACCCTCCCATAATCATC:1 + chr2L 21026730 3' - FB 70 1 65.07 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGAATGAGAGTGTGAGTTCGA:1 + chr2R 10541780 3' + P-element 2862 1 68.49 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAATGGAAAAAAATTTGCATCGGTGGTTTCGATTATAAAGTG:1 + chr3R 4361715 3' - copia 23 2 70.55 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCGGGTCATCC:1 + chrX 140113 3' - blood 7052 2 57.53 TCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAACTTAGTCACTAGGCATGTACAATAGTACACATTATAAACTAAC:1 + chr2R 18044027 3' - jockey 4638 1 70.55 TCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTA:1 + chr3R 30618758 3' - X-element 66 1 54.11 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATATATATTTACAACTTAATTATACAACTATGCAAATTGTATGTGTATCT:1 + chr2R 6087883 3' + roo 344 2 67.13 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTG:1 + chr3L 14116797 3' - BS 5030 1 59.59 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACAAAAAAACTAATCGCCCGGCATCCCGCTCCAGAGAGCGAAAGCTCTGCGCTTGCGGGTGGTGAAGAGCTTTTGCTTAA:1 + chr2L 3059467 3' - P-element 33 1 58.57 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATACACACATACATATATATATCTATATACATCTATATAAACGGAAGTGAAAATTAGCAAACCAGGAAAATGTTTTGCCCAAACTAATAGAGAGGCCAG:1 - chrX 12263664 3' + roo 386 2 71.23 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCNAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATCTCACCGACGGACCACGTCCACGNTTAAACTGTTTTGGCCAACTGAACTAGCGGAAGAACTTGCAGAG:1 - chr3R 25961970 3' + I-element 5304 1 50.68 CTTAGATAACAAAATCCTAAAAATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAGAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTTATAACAGACACCATTATCACCCCAACC:1 - chr2L 15917626 3' - roo 91 2 79.45 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCAATTTTTGCGAT:1 + chr3R 13684800 3' - 412 39 2 56.16 ATGTATATGATATGTATGTATACAAGCCGTTTAACCATCGCATAAGGGGGAATTCGCCGATTCGGGGCATTGGAATCCCAGTAAGCGAGTTAAAGCGGTTACCAAGGACTTCGTCTACGACTTGG:1 + chr3R 5797612 3' + Dm88 11 2 61.60 AAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGGTCGCGCACTTTATTTTCAAAAACGTTACGCCCGTCGTGCTCTTTTATCCTCTTAAAGCCACT:1 - chr2L 21753879 3' - hopper 57 1 58.22 AAGGGAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATGTTATTTATTTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACTCCACAAAAGAAGTCAAACGATGCGTTGTAAAAATGT:1 + chr2R 20389519 3' + copia 249 1 57.53 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAG:1 - chrX 20330566 3' + P-element 2791 1 19.86 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGAC:1 - chr3R 25692715 3' - BS 5030 1 56.20 ACGAAATATGCTTATGGTGCTATTATTGTTATACAACTGTATATATATAAGTTTAAGTTTGTTTGATAAAATCTAAGGAAAAAATCTACGGATAAAATCTAAGGATATTAACTATATTTACTGTTTTAAAGGTTTTTAAAATTCTC:1 - chr2L 10694400 3' + Tc1 1625 1 73.29 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATA:2 - chr3R 27007371 3' - roo 90 2 78.77 GGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACGAAACAAAAGGCAAAACACATATGAGGATACACACATAGAGATTTCGTTTGGAATTGTAGCAGGCGTTGATGATC:1 + chr3R 5244380 3' - Quasimodo 172 2 52.74 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGG:1 - chr2R 13695616 3' + blood 7337 1 55.86 GCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAATAAAATACAAAGATTTTTAAAAAAATGCAGTTCTTGATTATATGATTATAATCC:1 - chr3L 6679322 3' - gypsy5 414 1 63.01 AGTCGAGTGGGAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCC:1 + chr3R 19725417 3' - hobo 18 1 56.52 AGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCA:1 - chr2L 21325120 3' + invader4 237 2 78.08 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGTATCTTCTGCGGCTACTGAAACTTTTATAGACCGAATTTCTGGATAATTAACA:1 + chrX 13429076 3' + hobo 2920 1 60.58 GCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATA:1 - chr3R 22260457 3' - jockey 4752 1 67.81 TGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGAC:1 + chr3L 7102374 3' - I-element 92 1 76.71 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTACTGCGCCATCTTTGGACAGGACCATCTAC:1 - chr3L 21292501 3' - 412 7111 2 55.48 CATGGACACACACACACACACACACACACATGGAGTGAAGCACTATTTACCCG:1 - chr3R 11323132 3' + accord 7026 2 71.70 GGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTT:1 - chr3R 17766741 3' + HMS-Beagle2 7114 2 76.71 CTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTCACGTTATTTCCGAATCAATTGCACTTTTGAATCATATTGGGCT:1 + chr2L 18541083 3' - micropia 277 2 69.86 GAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGT:1 + chr3R 10030793 3' - BS 5063 1 54.11 ACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCATGGACACACACGGGAACACACACTGCCATGCGG:1 - chr3R 7041932 3' + Stalker2 395 2 78.42 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAA:1 + chr3R 22352506 3' - I-element 75 1 69.18 AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGGGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCCAAAACTGGTGGCTCTGC:1 + chrX 12365379 3' + hobo 2872 1 68.35 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTTGCACCAATGTAAGTACTTAAGTTTACACAAAAAAGANATATTATTAAGAAATATTTTAAACAATTTTCCGTCTCTAGCATG:1 - chr2L 7724100 3' - I-element 39 1 56.16 CTTGTGGGTGTATATGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCATATGAGTGGATCAAAAGAGCTTACCCTTATTGGCTCCCT:1 + chr3R 19247783 3' + R1A1-element 5266 1 71.92 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACACCTTATAAAGATGATAATATGAGTGACGAGGGAGCGATAACAATGCGCCACAATCCGTTTTTTGTGTGTGCAATC:1 - chr2R 21110519 3' + roo 358 2 52.05 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCACCT:1 - chr3L 17757859 3' - Tirant 17 2 38.62 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAAAACTTAAAGGCGCTTAAGCAGCCATCG:1 - chr2R 6514176 3' + roo 399 1 76.71 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCCTAGATAATTACACGAAATTGATTTGATTTGATTATGCCATAAAGCAG:1 - chr3R 21654908 3' - roo 5 2 80.82 TAGAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGGTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACA:1 - chrX 10147886 3' + pogo 2032 1 65.75 GGGTGATCTTATATCACGCTCTCTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCA:1 + chr3R 20345516 3' - blood 86 2 73.29 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGTTAGTGCAG:1 + chrX 2104783 3' + roo 9007 2 62.50 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGTTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTG:1 + chr2R 22971847 3' - 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chr2L 14867328 3' - BS4 228 1 52.05 ATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTT:2 + chr3R 23415971 3' - jockey 4844 1 74.66 AATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATTCCAAACCTCTGAATTTCTAGAACAATGGATCATAGATCATATTTTAATGACTCTCGACTTCAACTCG:1 + chrX 7568247 3' + G6 1950 1 51.41 GGCGAAAGAGCTAATCTGACGCTTGAGGTTGACGAAAAGGCGCCGAACGTCCTTGAGCAGACCGGGCGGGTCTATATCAAGTGGTTCAGTTACCGTTGCCGGTCGGTATGTGTCCTGGTGCTCGACGGAAGGATTCGCCAGGCCAC:1 - chr3L 8285433 3' + R1-2 375 1 73.97 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAGGCGAGAGAGAGCTCGTGCTGTCGACGTCGACTTCGACTTCATTCATGCGGCATT:1 + chrX 18534629 3' + P-element 2840 1 53.10 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTAAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGC:1 + chr3L 14116760 3' - BS 5067 1 65.07 AGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACACTAGTAGTGCGTTATTAAAGTGGCCATTCGTCTATCGGTCATCTCACCTACTTCTTTATCCAGTTCGCCGATGAGCTGTTGCATTCT:1 + chr3R 3396659 3' + invader2 5064 2 63.70 GGCGCCACAATAAAGATATCAGCTGTGTCACGCCCACAATTTTAATCTAATGTAGCTTTGTGTTAAACAAGAAAAATTAAAAAGAGCCTTATAACTTGTATTACTAATGAAAACATACAATTAATTGATACAATTGATGGAACTGA:1 - chr3L 21784568 3' - Transib-N1_DM 361 1 72.60 TAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATT:1 - chr3R 23415932 3' + jockey 4903 1 76.71 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGTATATGAAAAGATCTAATAACGAGGGAAACGGAAACGGAAGTTATTGAAGTGCTAAAAA:1 - chr3L 75440 3' + roo 346 2 62.33 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGG:1 - chr3L 27415191 3' + transib2 2786 1 59.59 TAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCAGCAGCGAGTGCCGAGACACATTGCCTGAATGAGGTTAAAACTAAGTTGAAATTCCTGG:1 + chr3L 18656061 3' + opus 385 2 69.86 TCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTCATTGATCCTTTAATAGGTTACTTTGTGGTAAACTAGGGGTTTGGAGCTGCGTGTCGAAGCTAA:1 - chr3L 5443008 3' - 1360 491 1 55.07 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTTTGCAATTGGTGAGCAACAGGATGAAGGAGCCAGTAGCTCATAACTCA:2 - chr3R 5977681 3' - copia 4882 2 76.71 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATAATGTGCAATCTTGGCATAGCCAGCAACGAAAAGTTAACCTTTTTGTCCAAATTAATGCACATTTATTAAGCTGAAAC:1 + chr3R 7831352 3' - flea 41 2 57.53 TTAATCTTTTTTTTTATGGAAATGAAAGGTGGTTAAATAAATTTTCAAGGGTTATCTTATAGAAATCCGTTTTATATTAGTATTTTAATACATTTTTGATTTGTAGATATTTCCAGAGTATACCCTCGTCTAGACCCATAACATGG:1 + chr3L 55153 3' - pogo 2026 1 71.23 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTTTTTTTATAAGAGACAATGCAGCC:1 - chr3R 6147205 3' + copia 227 1 70.55 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATC:1 + chrX 140064 3' - blood 90 2 76.71 ACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTTGATGTGTTTTTATTTAGATTTTTTATTATCGCGCGCTTTTTCTTTTTT:1 + chrX 12753909 3' + copia 4777 1 66.44 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGTCGTTCTATGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGT:1 - chr3L 8273922 3' - hobo 14 1 60.67 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTGCGTTTGATCTTC:1 + chrX 4469602 3' - roo 8745 2 73.97 GGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTTGATGTGGAACTCAAGGTTAAGGTCATGANCAAGAGCTCAGAACAACCGAAGCAGAGAAGCCATTGTCCAGA:1 - chr3L 5780268 3' - Cr1a 4325 1 50.68 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTCTTTTTATTGCTTTTGTTGCCTTTCTTGGCCTCTTATT:1 + chrX 10547752 3' - P-element 60 1 41.78 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACAGTAGGTGGGTCCTCTCACGTGCTCTCAGTGCCGCTCTCTGCTCTCCCTC:1 - chr3R 9550852 3' + P-element 2880 2 79.26 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTCAGCAAAAGTTGGTGGGACAAAGCAGAACTTTAATATATATATATTGTCGTGCATATATATGCCATAATAATTATCATAAACATAATTTTTA:1 - chrX 6186258 3' + Transpac 5202 2 36.30 CAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCAAAAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATATATAACATTTGGATTGAACCCATGCAATATCTTAACATTGCG:1 - chr3R 20308170 3' + invader4 246 2 70.55 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGAAAAACCCGAGCACAACATG:1 - chr3L 20934121 3' - Max-element 8242 2 83.17 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAGCTTTGTTTCCATGAACTCCACCGAACAAACAGCTGAGCTGTGCTGAGAGGGGGGTGGGGGGAGAGAGGGAGCGGGGAGAG:1 - chrX 17726237 3' - pogo 37 1 57.24 GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTT:1 - chr2R 14431223 3' - Doc 78 1 67.86 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGT:1 + chr2R 9871560 3' - roo 8738 2 72.60 CAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGATGCACATTAAGCCTCGCAATGGAAATCAAAGGACAATTGTAAGTCTTATTCCAATATTGATTAATAA:1 - chr2L 5931681 3' - HMS-Beagle2 7077 2 52.14 AAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCG:1 - chr3L 19907128 3' - P-element 94 1 21.92 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAAC:1 - chr2R 18372620 3' - jockey 4757 1 75.17 ATGCTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAATAATTTTAACATTGAAACAGTCAACGAAAAAAGAGAAAAAACGCAGAAAAAAAAACAAGGGGCACCGCAATATAG:1 - chr2R 15483773 3' + Porto1 4344 1 61.83 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATATATATAAATGCAATTTTTTCTATATTTTACTATATTTATAAAGGATTCCGCTGTAGTATCCCCATATTTCACCAAATACACGCT:1 + chr2R 15472162 3' - 412 7099 2 58.22 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTANTTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAANAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATT:1 + chr3R 14401941 3' + Juan 4135 1 68.49 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGATTTATTTAAAAGAGAAATCCGAATTTATTCTTGCTTGCTCGCTTGCGCCAACGGAAAAGCGCGCAT:1 - chrX 16096225 3' - roo 2 2 58.90 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGG:1 + chr3L 20868091 3' + hobo 2928 1 55.07 GCATTCACACTGGCTGAGAAACGGGTAATGGGGAACTCGACTATAAAATTCTCTGTACTTGTACATAGGTACATACATATTTATCAGCGGACATACGTCG:1 + chr2L 21205593 3' + INE-1 534 1 52.00 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTTCGCCTGTTATAATTAGGAAAAAAGCATATCTTACAAATTATTTGTCGGTTTCGCGCTATACAGATTTTAGGCAACTA:1 + chr4 549221 3' + flea 244 2 78.77 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATTTGCCAAAAGGTAGAAATATAGCGGCTGTCAACGGCGTCGAAAGCTTCAATTTGGCAGGGATG:1 + chr2L 7336224 3' - pogo 25 1 61.67 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAATAGCATTTTTACCCACTGTGCGAGTGTTACCAC:1 - chrX 1208820 3' - Burdock 50 2 54.79 GCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAACAGTATGCT:1 - chr3L 18947252 3' - BS 4724 1 59.15 CGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGTCTGCCTTTTCACATTAAAGGTAATTTTCATATTTCTGCAAATGGCACGGCAGACTTA:1 + chr2L 15124916 3' - jockey 349 1 60.27 TTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCATAAAATAAATTTACTACTTTGTTAGACCTTTTAATTTTGGTCTCTCCTTCGGCGGGCGGTGGAGTAAATGAGCAAATACCTGAAGATGCA:1 + chrX 17200854 3' - Cr1a 4238 1 55.48 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATTTGCCAAAAGGTAGAAATATAGCGGCTGTCAACGGCGTCGAAAGCTTCAA:1 + chr2L 7336211 3' - pogo 57 1 65.47 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAATACATATATTTAGCCGTGTTCACATCAAAACAAACATCGAGGAAAATGCGG:1 + chrX 20456972 3' + opus 441 2 66.21 GTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCCCATC:1 - chr3R 23415862 3' + jockey 4973 1 71.92 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTT:2 - chr3R 10433218 3' + 412 414 2 71.92 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAA:1 + chr3L 19907208 3' + P-element 2848 1 56.83 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCC:1 + chr3L 18968717 3' + hopper2 1558 1 58.46 GCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACA:1 - chr2R 17696009 3' - rover 6994 2 56.85 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAATGATATAGCNGGGATATCGGTAGGAGGGTCTC:1 + chrX 17495821 3' + Burdock 6365 2 58.73 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTATTGTTACATAATTTAGTGTTAAATAAAAAACTGATACCCAAAATGAGTTGCGAACTACGACTAAGGACACGACCATAAAAGATTTATCTTTTCCGAAATTC:1 - chr3L 13449125 3' - Quasimodo 18 2 73.97 AACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATAGACCAAGAAAAGGTAAGGCAAATAGGCCGAAAATGAAAATGAAA:1 + chr3L 7943092 3' + F-element 4348 1 69.86 CTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTACCAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAATGCAAGGACATAGATTAAATTTGATTTACCATCAAAGGAAATGGTATATTTTCTAAACGATAAGCCAAAA:1 + chrX 19599640 3' - 1360 113 1 52.05 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTAAATAATAAGTTAGGGACTTGT:1 - chr2L 13468205 3' - roo 8706 2 57.53 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCCATG:1 - chrX 10667020 3' - jockey 4774 1 63.01 GTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTACATGTACGTGCAGAGATACTAACGCACACATTCACACGGCTGAAGCGTCCCC:1 + chr2L 7148654 3' + HMS-Beagle2 243 2 65.75 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATACATATATATGCTATATAATACGAGATGCATGTCAAGTACCACCGATACAAG:1 + chr3L 18122389 3' + 297 6914 2 72.60 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGACCAATGTGGCAATGCAGTTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGGGTGG:1 - chrX 18767816 3' + hobo 2922 1 56.38 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAACTTGTAGCTTTATAAAACTATTCAATTTGAAAAC:1 + chr2L 20044667 3' - roo 8697 2 58.90 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTAT:1 + chrX 7042704 3' + roo 8989 2 73.97 CCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTAAATTGATACTCGAT:1 + chr2L 5341615 3' - Burdock 45 2 51.37 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTTGACCATAGTGCGGTGGAAGCGTGAGAGTGATCACGTCCAGTGAACGGGACATTTCAATTTACTCGTCGCGCTGTTCACCACATGTGC:1 - chr2L 21909042 3' - transib2 48 1 52.74 GATCTCGACGTTCATACGGACATGGCTAGATAAACTCGGCTATTGACCCTTGACCATCATCATCGACTTCTCGTAGTCG:1 + chr3L 16480756 3' - INE-1 132 1 63.29 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTGTGGC:1 - 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chr2R 12343829 3' + S-element 1706 1 77.40 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCTTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGC:1 + chr3L 22435224 3' + opus 7458 2 54.48 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGTTAGCA:1 + chrX 20024615 3' + 412 432 2 58.22 GAACGTCGAGATCAGAGGAACTATAAAGCTAGGAGGTTGAGACGCAGCGCATTGTTGTTGACCCATGTTAATATATTTTTTACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTGGATATTTATCTATCTATCTTTTATATATTTTTATTTATT:1 - chrX 7696912 3' + INE-1 141 1 60.96 GGTTATGGTGTTGGTAACATCTGCGTGCGAATTGTTGCAGGGCTTGCTCCAGTTATTTTTTTCATCTCCTTTAGCTTTTTCTCTGGATAGGGAGTGAATCACAGTTTTAATATCCATTATTACATAATCTATCACCTGTCAGCACC:1 + chrX 7556675 3' - jockey2 268 1 38.36 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATATAATGTGTTCTCTATAATAATTTGTTCTTATGGTTATTCAGTTGGAGTTCTCGCTTGATTTTACCCCTAATTTTGTATTCCG:1 - chr3R 17879389 3' - opus 144 4 63.70 CCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTAACACTCACGCACACTCACACAGGAAGAGAGTCAAAAGGGCGCAGGATATGCACAATGTATGCA:1 - 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mariner2 725 1 56.16 CTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTGTCTAAAGCGTTTTG:1 + chr2R 17609837 3' - mdg3 75 2 67.59 CTGTTGCACCCGATGATGAAAGCGGCATGAACACACACACACACATATTCACACA:1 - chr3R 25705521 3' + accord 155 2 94.55 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATA:1 - chr2R 10695785 3' - roo 8735 2 67.12 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCAT:1 + chr3L 22435221 3' + opus 477 2 63.33 ACCATCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCACATAAATTGGATGCTGCTTATAAAGGACCTTATATAGTAACAAAGGTCCTCATACCCAATTGAAGGGGACTTAAAATCATACCCTAACGGACACTTATATTTAAA:1 - chr2L 11246699 3' + Bica 4684 1 59.26 TCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTATAAACCAAACATAGACTATTGTATGCTTGTCCAGTTTATTTTAAGCTTATCAAGAGATATACAAATGAGGCAA:1 - chr3R 17784189 3' - Transpac 114 2 50.00 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTATACAAAACCAACTTACCAAG:1 + chrX 16607881 3' - P-element 92 1 18.12 TGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAATACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAGCATGTTGTTAGTTAATGCTAAAATATATTATACTTCCTAAC:1 - chr3R 11166181 3' + hobo 2860 1 71.23 AACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATGCTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCGGCTTAAGGCTACCCCAGATTTCCTTGTAAACTGAT:1 + chr3L 16973515 3' + S-element 1706 1 73.97 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAGCACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCTCTGCAGCAAATCTGAAGAGAAAAACTTGACTGGGACGAAAGTTTACCTTCGGCGCTTCATTCTGCTTGGCTAAAGTTGTCTG:1 + chr2L 22227844 3' - Doc 44 1 56.16 GGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATTATGATCATCATATATTATAAGGTTGTAGCGGACAATCGG:1 - chrX 13367394 3' + HMS-Beagle 6964 2 76.71 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAACTGCAAATTATTAGTACAAATATTGGCAAAAC:1 + chr2R 20706836 3' - I-element 84 1 74.83 CCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAACCGTATATGCACAAATATATTACATATAT:1 - chr3L 13888927 3' - 412 92 2 79.45 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATAGC:2 - chr3R 22260455 3' - jockey 4750 1 67.12 TATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAAAAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1 - chr3L 22511717 3' - INE-1 565 1 70.34 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTAATAACTTATATATATGCTTTGCTCAATAAAAACCCAATTGACAAATTGTCATGGCGATCACGTAGCAACAACAGCAAGACAACAACGTGTTCTCCGA:1 + chr2R 21530078 3' + HMS-Beagle 212 4 60.96 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAAAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCGGCG:1 + chr2R 18551768 3' - I-element 82 1 67.81 GTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAAGTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCATTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTAACTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCATAAATGTTATCGCAAGCAAAC:1 - chr3R 10944638 3' - R1A1-element 5180 1 79.39 AAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGCCGCGAACAGATCAAGAAGGATAATCCCGGCAGCAAGGTGACAGACATCGCCA:1 - chr2R 21698429 3' - copia 4965 2 63.70 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCG:1 + chr3L 15273304 3' + pogo 2049 1 63.57 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCAC:1 - chr3L 5958636 3' + 412 412 2 71.72 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAAAACTTAAAGGCGCTT:1 - chr2R 6514188 3' + roo 9050 2 68.49 GACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTAAAAATGTGTATAATATCGTTAGATGCATTTGCAGAAACTGCTGCAAATAATTGGGATAGCTAGGAATTCCTGCCCAGATG:1 + chr3R 10900961 3' - F-element 19 1 74.66 CAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGC:1 + chrX 19690603 3' - gypsy 83 2 75.34 AATAATATTAAATAATAAATAAATAATATTGTACCATGTAAGATGATAATGATACTAAATATTTCTGTAGACAATAAAATCCAGTTATACTTTTATTTTCCATTTTTTTTAAAGCTCCCCTTAAGTCATTGATTTTATTTTTAGTT:1 - chrX 16769682 3' - Tc3 269 1 70.55 CGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACAA:1 - chr3R 18204324 3' - hobo 26 1 64.93 GTTGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCG:1 + chr3R 7042057 3' - Stalker2 7330 2 70.34 CTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTGATATCCCTTTTCATGCCCATAAAATCCATAGCAGTTTAGTCTGTATTTGTTTTGGCTGAGTAATAT:1 + chr2R 23278474 3' + mdg3 5445 2 52.74 GTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATTTAGAAACTCCTCCGCGGGAAAACTTTGTTCACCCCACCTCAAACGGAGATCAAACTGTTTTGAACGAAACGCTGGCA:1 - chr2R 5970479 3' - blood 240 2 54.79 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCCGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAACCGGAATATGCGCATGCAAATGGCATTAGCCTGAAATGCAAATTACTTTACGGCATGC:1 - chr3R 12941732 3' - hobo 14 1 73.05 TGAGACTCCCGTTTCGCCGACNTATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTATACATATTTACTTGGTACCGAACTTACATAAAACTTTGCATATGCACATGCATAAATAAGCAT:1 - chr3R 11757888 3' + invader4 3084 2 45.21 AGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGAGCCAAACCAATTTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGTATATTCGTTGCCAAGTATGTAACAGG:1 - chr2L 22112998 3' + 1360 3312 1 78.77 AGGAGCCCCCGAAATTCTTCTCAAGGTCTTCGCCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATATGGTATTTATTTTATAAAATATTTATCCCTTCCTTTTTTTTGATTTTATTTTCAGCAGAATTGTCAATTCAAAACTCTTC:1 - chr3R 24661919 3' - jockey 4549 1 48.97 AGGGAGGGCATGAGGGTGGTGTATGTAAGATTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGCGTCAGTCAATTTCACTTATGGCATGCGAGCACCCATCGCCCC:1 + chr2R 22971932 3' - jockey 4759 1 80.14 TCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTG:1 + chr2R 16731338 3' + Tirant 326 2 76.12 ACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTGCAGATAATAGGATAACTGATCTCAACATTTAGAAGAGATAAAAGTCAAGCACGTGCGAATTAGAATGGAAA:1 + chr2R 17994544 3' - Cr1a 4287 1 61.64 GCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTTGTATGAATTATGAATTCGTTTCGCTCTTTATGATTTCCCAACATCGATAATCGATAACCGAT:1 - chrX 16484045 3' + F-element 474 1 57.14 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTAAA:1 - chr2L 13468224 3' - roo 8725 2 60.27 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCAC:1 + chr2L 1451216 3' + mdg1 7423 2 69.41 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAGAATATAGACATCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCACAGTCAAAAGTTT:1 - chr3R 17777481 3' - jockey 4671 1 55.48 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCTCATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGC:1 - chr3R 5574973 3' - blood 90 2 77.40 TTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACTTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGATGACAGTCCAAATTCTTTTTATAGGTCATCGGCAAGTCACGTAAGCCC:1 + chr3L 19014157 3' + G5 4724 1 67.12 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCCGCATGGGAATT:1 + chr3R 21655039 3' + roo 8986 2 74.66 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACG:1 + chr3L 9522146 3' - opus 156 4 54.79 GTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCAATTAGAATTAAACTAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTCATTTAATTTCAATTCATACTTTGTGGTACATA:1 + chrX 14347026 3' + flea 160 1 76.03 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAACAACAAAAACCATTATCGAAGCGACC:1 + chr3L 19907234 3' + P-element 2868 1 72.41 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACA:1 - chr2R 21619331 3' + blood 7326 1 60.27 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTTAGG:1 + chr3R 19246811 3' + jockey 4967 1 61.64 GTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTCAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAAT:1 + chrX 8208444 3' + roo 9043 1 67.12 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAG:1 + chr3L 17746372 3' - roo 54 2 55.48 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAATAATTCCGAGATTG:1 - chr2L 6047852 3' - P-element 73 1 34.27 AAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAGTTTAAGATGTTTCGATTTGGCTTCTATATGTACATTTCGGTTTGTTGTGTTTGCTTATTT:1 - chr3L 18143977 3' - Doc 4257 1 80.14 AATTAAACACGGCATTTGTTGATTTTTACTTTTTTTTTTTGGTATTTCATAGTTGAAGCTTGGACAGGAAACCGAAATGAAAACGAAACATTCGATCGATCGATAAGCT:1 + chrX 10057167 3' - hobo 2532 1 80.73 AGGAACACGCATAATAGCAAATGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTT:1 + chr3L 10814601 3' - micropia 147 4 58.22 TCTTTGTATTTTGTTTTTATTTAACTTCCTTATTAAAGCTAATTTAGCGCATTTCGGGGATTTTATATATCCACCTTTAAAAAAAAGATTTATATAAATTAAATGGAAATAATGTGATTTAAGTAGTCATAAATCAACAAAACTTT:1 + chr2L 8891064 3' - Penelope 251 1 90.41 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATAC:2 - chr3R 23415882 3' + jockey 4953 1 58.22 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAATGCCAGAGTTAAGCCGGCAA:1 - chr2L 8895227 3' - 412 57 2 57.55 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAACCGTGA:1 + chr3L 16920256 3' - roo 83 2 75.34 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGAAGTTCTCTGATGGCCACTTGGGCACTTGGCCACTTGGCCGCTTGGCCTAACACTTCTGGTCCGGGGCCAT:1 - chrX 13458225 3' + hobo 2886 1 57.04 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACAGTTGCGATAGCAACCTTTGTAATCAAAAATCGTTTCAGCAGGTAAA:1 + chr2L 22578038 3' + 1360 3318 1 67.81 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCCAAAAACGAACTTTACCATTCGAATTGAGGGATAGTCTTTTCAAGGAATTCAATTTGTCTATTTCAAACATCTGA:1 + chr3R 10062252 3' - copia 4915 2 51.37 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTACTGCG:1 - chr3L 21292525 3' - 412 82 2 71.92 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGG:1 - chrX 10284798 3' + pogo 2043 1 57.53 ATTTTTCAAGAGCGTGGGCGTGGCTGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTGGCAACAGTGGCTGCGCCAATCATTGATTTTCGCAGAATAAATTTCCGCCTGTTAAATAATTGATTTATAATATTTGACCAGGAAGATCAGAAA:1 + chr2L 9564729 3' - INE-1 253 1 70.92 ATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATATTCTGCGATTTACAAATATTTTTCTTGCGCTCTTCAAAACAAATTTAATTTTCAA:1 - chr3L 10471005 3' + 1360 318 1 62.33 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCCCAGCATGCAGACTGCAGGATACCGGGCATCGTACTAAACCGTAGCATACTTTTTTGGGCCCACAAGCAGCCGCGCCCATTTTATTTGTTGTG:1 + chr3R 11108184 3' - jockey 36 1 66.44 GCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCCGGACTCCCGGAGCAGCCAACAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGATTCCGGACGACGACGCTCTAATCGGACAAACCTACAACGACGACAACAATACATCAATAACATCAACAACATCA:1 + chr3R 7014403 3' + Gypsy6A_LTR 270 1 59.59 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGATAAGTCAAGTGTTTACCCATACCCTGTAGTCCAGTGTTAGTTGGACCAACAGCAGCCAGCGAAA:1 + chrX 14189244 3' - 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1360 73 1 64.83 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGAGCACCAGCGGAA:1 - chr2R 10541676 3' - P-element 91 1 23.29 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGTAAATAACAACACAATTATGAATGAGGAGAGCCTTTAAATTCCAAC:1 + chr2R 7769886 3' + Transpac 5214 2 71.92 GATCAAATAATAAAAACATCATTGCAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAAACAATNGTTTTAGAATATTTATTGTTAAATTATGTAAAGTTAAATAAAAT:1 + chr3R 24662081 3' + jockey 4986 1 78.77 AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATTCCAATTAATATTCGATACAATGTCAACTTCTACGCATTGTTTGTCTTTTT:1 - chr3L 6994440 3' + copia 185 2 68.49 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTGGCTTTGAGTGGCAAGTCTGATTGTGTAACAGGATTTCGCAGTCCTTATGTTCA:1 + chr3R 8631708 3' - roo 8731 2 64.38 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGAC:1 - chr3L 21913339 3' + 297 6911 2 67.12 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAAC:1 + chr3R 15137368 3' + roo 9014 2 56.85 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTGTG:1 - chrX 21227076 3' - Tabor 6869 2 64.83 TACCAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAAATTACCTATTATCATTTTATAGCTAAACTAAGTACCTTCCTTTAAACGTGTACTTACTAAAAGACGATCATGAGTTCACCACCTTTGTTGGCCA:1 + chr3L 24034928 3' - 1360 85 1 64.38 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAGTTTG:1 + chr3L 8249495 3' - HMS-Beagle 6832 2 60.69 AGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTNTTTGTCGATTGAAAGCTTAAGATTAAATTTGCGATACACGTTTC:1 - chr3R 19663408 3' - Transpac 279 2 78.08 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGA:1 + chr4 868713 3' + roo 8987 2 76.71 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTA:1 + chr3L 13546662 3' - hobo 50 1 52.05 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAATAGCATTT:1 - chrX 1208845 3' - Burdock 6211 2 71.92 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTA:1 + chr2L 2609003 3' + I-element 5305 1 54.01 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATATTTGCTCTTCGCTTATCTAAATAACTCAGATTTGCATGCCACTTCACGCGAGTGTGGCAGATAAGCTCTTCAGTGCTAATGTGACCGCCAG:1 + chrX 19187428 3' + Transpac 291 2 71.92 CAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAATCTTTAGTTAGCATTCATTTTAAAATTTAAAAT:1 + chr3L 20573846 3' - pogo 2034 1 62.33 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACACCGAAGAGCGCCGAGAG:1 + chr2R 10541717 3' + P-element 2816 1 27.13 ACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTC:1 + chrX 21994024 3' - McClintock 5965 2 72.87 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCTTTACACTTAAATATGCATCAACTATTG:1 - chr3L 1477316 3' - mdg3 5264 1 77.40 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGT:2 + chr2R 14332109 3' - jockey 66 1 57.53 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTT:1 + chr3R 8867110 3' - Max-element 8283 2 52.74 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAATAGCATTTTTACCCACTGTGCGAGTGTTACCACTCAAGTTCA:1 - chrX 1208811 3' - Burdock 41 2 57.53 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAAATGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTATAAAAGTAA:1 - chr3R 4679412 3' + hopper 1392 1 67.12 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGATAAGAGTAAACAGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTGTG:1 - chr2L 22211545 3' + jockey 4914 1 67.12 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAAT:1 - chr2R 17696007 3' - rover 6971 2 68.00 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATANAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGA:1 - chr3R 5977735 3' - copia 4936 2 62.33 AGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTCCAATCCCCATCTGCCAAAGGCTGATAGATTCTA:1 - chr2R 8689386 3' + hobo 2853 1 77.08 AACCAGTCGGATCTATTTTACTACCCCTTCATTACTCAAAGACCTCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATACCATCGTGGCCAGCCTGGGC:1 - chr3R 27750534 3' - baggins 5399 1 77.53 CTTGCCGATGCAGCTAACTATGGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTATATTTCAATTGCAGCCGATTTCAAGCTTGTAAAAGTTGTCATTACATTGACTTCTGTTAAGGTATATAACCAATAGATTAACGATGATAGTA:1 - chr2R 17059523 3' - pogo 25 1 68.49 ATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACTTGGCGGCACACCATTC:1 + chr2L 6385931 3' + invader4 3079 2 78.46 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTGGAGAAGAGAGGGAAAAGCCAGTGGCAAA:1 + chrX 14825362 3' + P-element 2829 1 43.57 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGGCTTCGGAGTTG:1 - chr3R 5518321 3' - Transpac 37 2 61.90 GACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGATCTTCTTAATTCTTCATGTAAATGGTGAAAC:1 + chr2R 19310797 3' - roo 146 2 78.77 ATAGAAGCATTGAACTGATCCTTGTCTGTTGTCAAAAGTATTTACACACAATTTTTACGCGTCAAAATTATTTACACAGTTCAAATTGAAGATTTAAAGTCTACTTTTTGGGGCTATTATTGTTTTAGTTCTACAGATTTTTAAGC:1 + chr2L 12228347 3' + Bari2 44 2 67.12 GGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGATGATTTATGGGAATGGAATGGTGGGGCGTATTGCTTATACACCTGTACGATTGGCGCCTAATATGATTCGAGAAT:1 - chr3R 8790276 3' - Max-element 149 2 51.37 GGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCG:1 + chr3L 8249444 3' - HMS-Beagle 6843 2 72.38 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAANATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCCCGCTACCGATACCAATTGGAGCAGGGGTCGTTTGGAGTTTACTTTGT:1 - chrX 7508047 3' + roo 396 1 76.03 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAATGCATG:1 - chr3L 5398036 3' + roo 9024 2 50.00 TACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAATATACGAATAAAACTTTATTGTTTATTAAATAATGAAAATGGAAATCGAAA:1 - chr3R 10583253 3' + Stalker 6881 4 67.12 AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAACACTTTTCTAAAGTTCATCATTCCTTTCCCAAAACTAAGCATTATATAGAAAAACGTTGGCTTTGTATTA:1 + chr3L 8936977 3' + BS 5044 1 54.79 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTTCAAACGAAAACGAACTTGTGCACCTTTTTTTTG:1 + chr3L 2486048 3' - jockey 4680 1 64.38 AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTCAATTGTGTGAGAGCTGAGCGGCAATGAAATTGCCCGAAGCGGTCATGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTATGTGTGTGCAGCTCGCTGTGCCTGTGTGTGGGTGTGT:1 + chr3R 15061418 3' - jockey 4769 1 70.14 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATGTTCAGCTGGTGGAAAGTTGGTGTAGAAATT:1 - chr2L 3059372 3' + P-element 2801 1 26.71 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTAACGGCGCAAAAGGATGTATAAGCAGTGAAGGTAAT:1 + chr3R 17766871 3' - HMS-Beagle2 11 2 73.29 CTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCACGCAATCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCATTTATCTTTGGATTTCGCTCTGCTCTCGGCAGCT:1 - chr3L 22318542 3' - baggins 5302 1 76.71 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGGACA:1 + chr2L 3911967 3' - roo 8692 2 66.44 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGACATTGTTTAGATTTTGTAAATTGTTGATTTCTCGCAGCAGAAAGTTTTTTTTTCGTAGAGCTAAAT:1 + chr3L 4287108 3' + P-element 2835 1 47.26 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGC:1 + chr2R 18551764 3' - I-element 75 1 72.59 ATGTGTAGTTGCGAGCCGGAATCAAGCAGGGCGCGACAAGGAACCCAAGATCCGGATTTATTTTGAATATTGATGACGGCAGTGACCAACGAGCCGAGGCGATGACCTGCAGTGCCATGTAGACGGTGGCGCCCAGGGCCACGAAG:1 - chr2L 22226608 3' - G3 471 1 61.64 TTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAATGCATCATATCGAAAACCTCGTTGCCCACATGAAAGGTTTCGCTGC:1 - chr3R 20116440 3' - G2 308 1 65.41 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCTCGACAAACAATCTTATTACATTTCTTTGTGTATAATGCTGGTT:1 - chr3L 19222608 3' - 412 7131 2 69.86 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACCTCTGGTGCCCACCAACAGCTGATCGATCAGACCCGCTCGCAGTGATTTCTGTGTGGCCAAGAACAGGTTT:1 + chr2L 1729894 3' + Transpac 299 2 73.97 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCTTTACTCGTGCTGTGCTGCTAGAGATGACAGTGGCTCCGATAGATGGGGCTATCGCTGGCCAGTGCATGGGCTAGGG:1 + chr2L 6047956 3' + P-element 2856 1 62.77 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATC:1 + chr2L 13850724 3' + roo 9007 2 60.96 TAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAATAAGAAATTTATACACTTAATATTGCCTGTAACGCTTCCCAGAATGTGGTAGACCCATTTACT:1 - chr2L 172545 3' - I-element 411 1 56.85 TTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTACGCTATATATTTAGGCCACCATGCTGAAGAAAACGAAGAGTAAACGCCGCCTCACGGAGCCTCATATCTCGCCGGCGGTTCT:1 + chr3R 23980574 3' + Cr1a 251 1 58.04 ATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAATCATGTCCAGCGGGAAGGCCTTGAAGGCATAAGACGCGTAGGTGGCAAAGG:1 - chr3L 2981703 3' - roo 256 2 65.07 GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTATACATATT:1 - chr3R 11757959 3' + invader4 3029 2 53.42 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGACAAACTTGT:2 - chr3R 12115239 3' - 1360 36 1 57.53 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACCGCC:1 + chr2L 4631245 3' + roo 9047 1 58.33 CGGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACTTGGCGGCACACC:1 + chr2L 6385927 3' + invader4 3059 2 67.12 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAAAATATTTTTTTAATATACTAAATAACATTTATTTTCAAGTTAGAGTGTATTGCATTC:1 + chr2R 22964280 3' - 412 62 2 58.22 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATG:1 + chrX 8208426 3' + roo 9038 1 60.15 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCGTATGCAATAAAGTTTGCTCTGCCAC:1 - chr3R 23104463 3' - jockey 56 1 53.42 ATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGGATGCTACAAATAATTAAATCATGCA:1 - chr3L 18947232 3' - BS 4687 1 60.00 AGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATATAGACCAGTTTCCTCTTTAAATTGGTATTTCACCCATTTTTCCCTTTTCAGCTTTTCCTCTCAACTGCCTTTCTCATTCCATCACTGGCGCATCCTCTTTTCCG:1 - chr3L 10814446 3' + micropia 5436 2 80.14 CTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCTGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGTCAAGCGAAAAAGGTAAATAAATAAAAGGGGAGAAGAGGAACC:1 + chr2R 11510503 3' - R1A1-element 251 1 69.18 AAATACCAGAATTATACTTAATTATTATTTCATTTTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTCCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAATATATATAGAGAGATCCACTGAAAGAACGCAGTTTAAACGTACATAACGAAAAT:1 - chr3R 30151665 3' - Tc1-2 404 1 61.64 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGAGCACCAGCGGAAAGTCGC:1 - chr2R 10541670 3' - P-element 85 1 27.40 TAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGGGGTTGTTCCACTGTCACAAATTTTCTCGTCTGACGCTGATCGT:1 + chr2L 16553648 3' - BS 5023 1 63.01 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTANTTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCNGCTCAGTTTGAGGTTGCCATGGTGTGTGTTTAAAATAATTGCCA:1 + chr3L 14116825 3' - BS 5002 1 77.40 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGGAAAGTAGGGCGAAATGTGTGGAAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCAGCACATATTGTATGTGTGTATTTTTTTTTTAAATCGAAGGACTCTAAA:1 + chr3R 31419485 3' - pogo 4 1 78.77 ATCTTGTTATTCTACTGTCTTTGGTATCTCGGTATCAAAAGCGTGTAAATGTTAGAATGGCCGTGTCGGGGAGAAAATAATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGCCACTG:1 + chrX 21907825 3' - 1360 2 2 43.15 TGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTGGCCCCAAAAAGT:1 - chrX 7845744 3' - hopper 81 1 72.66 TTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCAATGANAACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAGTATGAAAGCCGAA:1 + chr2L 13328540 3' - BS 21 1 62.33 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTATAAT:1 - chr3R 15102215 3' + roo 9033 1 57.53 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAGACCAGAAATAATTAGGGTTTTATTTCATTTCCACAAAATTGCTAATAATGAAAA:1 + chr3R 14402000 3' + Juan 4195 1 71.03 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCA:1 + chr3R 21655062 3' + roo 9009 2 58.90 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACATGAGCAAGCG:1 + chr2R 19016042 3' - roo 8748 2 76.03 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGTGTGATGGGAGGTTGATGTGTTTTGGCCTGATCCAAAGGCAGAGAG:1 - chr3R 17494882 3' - hobo 46 1 54.11 AGTAAAAACAAAGACACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTAAAGCAAATTTAGCAATTAAAAAGAGTATTTAATGGTCGTATAACTCCCACTTATTGTTTGACTGAC:1 - chr3L 11314355 3' - Tc3 318 1 58.90 CTCGACGATCATACAGACAGACAGGTGGAGATGGCCAGATCAACATGGGTCAATATATCATTTATAAGGTCGGAAAAGCTACCTTCTACCTGTTACATACTTTCTAAAGAATCAAGTATACCCTTGATAGAAAACTAGCTTAAATT:1 - chr3L 11104237 3' - INE-1 129 1 47.26 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTT:1 - chr3L 12125294 3' + roo 8993 2 73.97 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAATTTTCCTGCTGCAGCGACGAGTTCAAAGCGCATTATGCATGCAAAACAAACACGTGCCGACACACAACACACTCTATCTGCCTCTTTTCTTAGACACACACT:1 + chr2L 12987538 3' - jockey 4770 1 72.66 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAATTGAGTTGTCCGTGTGAGAGTGTGTGTGAGTGTGTGTATTTTCCCATATTTCCATTGCTGCGCTCGCGCGCCCGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTACGTGTGTGGGAGG:1 + chr2L 9832876 3' - hobo 2710 1 77.14 AGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTTCAAAGAT:1 + chr3L 11257433 3' + 1360 20 1 56.16 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATC:2 - chr2L 19698080 3' + roo 9008 2 60.96 GGTGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTATCGGTT:1 - chr3R 31458398 3' - jockey 66 1 55.48 ACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACAGCTTTGCAAAGTTCGCGGCCACCGTGTCTTGTATCACAGTTAAAATGAGTTCCCATTTACATTTATGGCATTTTGAATTGTTTCATATGAGATTATTACCGAAG:1 - chr3R 12118078 3' + gypsy12 10180 2 70.34 TGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACATGTATATATATCACCACCTCCCCGTATGTTTACCTAGTAGTCGTGTGCTTAAGTAAT:1 - chrX 15405954 3' - opus 56 4 62.33 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAATTTCGTGCCTGGGTTTTTCGGCCCTTCCAGCTATTTTCTTACTTGATACTTTATACTTGCTTACAACGTAACT:1 + chrX 471274 3' + S-element 1671 1 53.42 CTTCGATCAATTTATTTCGTTACACGTTACTAGAGCACCACCTTTTGAAGGCAGTCGAAAAAGAAGCTGCGAGCTATGCGCTTTAGGACACCCTCATTCACAGATACGAAGCTCTGTCCGCCGTAGTACCGCTGACCATCC:1 - chrX 9273648 3' + Gypsy12A_LTR 2250 1 56.74 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATAGCTGCAGATTCAGTTCCATTTCAGTG:1 + chr3L 8274001 3' + hobo 2874 1 63.12 AGTGGAATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGAACGCACTCGGGACAAGAAGC:1 - chrX 21626870 3' - HB 78 1 56.85 GGTGTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTAAGGCACATATGCTACTATATATATATGTATAGATGACTGGCAACTGCATTGAAAATAAGCAAGGAAATGCTTTTGTTAGAAAACAGACTGATTTCTGCACTAAAAATACTTGT:1 - chrX 17477566 3' - Quasimodo 28 2 67.12 ATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATTGAATGCTGTTTTTATCAGTTAATCGTTACAGCAGTTGTTGTCTTTTTTAACGCTATTGTAATTCCGTTGATTGCTTACGCTCATTGCAGCTGTTATTGCTGTT:1 + chr3R 17939866 3' + P-element 2742 1 76.03 AGAGCGAAAGAGAAAGAGAGTGCGACGGAGACGCAGCTGTGCTACACTTGGAGAAATGCATAGATCCAAACTATTGTACAATCACAAACACCAAAGAAGTAGAAACTAACCATTTACGCATTTATGTACATATTAGTATTTCTTTA:1 + chrX 19106980 3' - Cr1a 296 1 67.12 TCTCATGTCACCTATTTAAACNGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGT:1 + chrX 2104776 3' + roo 8998 2 67.12 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGATCGCCGCTTTCGAAGTCCTCCTCGCCTGGCAATTGGAATTTG:1 - chr3L 19586518 3' - jockey 4809 1 70.55 TCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTAT:1 - chr3L 14233033 3' + copia 203 2 55.48 GTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTCGACCATTTGGGAAAACGCTGTCGGGGAAAATAGAATAAATTTATTTCAGGGCGCTTTCAGGGGCTTCAACTAGAACTGCATTCCTACTGACTTCT:1 + chr3L 18154500 3' - jockey 4582 1 67.12 CTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTTCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAATGTTATCGATGGTTAAAAATATCTCAATTTAAATAAG:1 + chr3L 13462645 3' - R1A1-element 198 1 74.66 ATTTTCGATTGGGTTCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGCCATAGGTCGACTAACCGCAGTGCGTAAGCTGTTCAACACGCTCTCGTTTTGGATTCCGGCTGCCGCCCTGATCGGCATT:1 + chr2R 22841898 3' - Fw2 3603 1 51.37 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTACACATTCCTACCCTGCTCCGCACTCCAAATGCAGATGCAGTCTCAGTACCGCTAATCATCTCAGCTGCAGTTGCATCGGGCTAACAAGCTTTGAC:1 + chr3R 17495029 3' + hobo 2923 1 71.11 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCATTTTGCTC:1 - chr3L 739146 3' + P-element 2834 1 49.32 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACAAATCTATCTGGGAGAAAAGACCTATTCAATTTATTTCGCTTGA:1 - 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pogo 40 1 67.81 CTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACTCTTGTGGTTCCTGAATCATACGAAAGGACAGACAG:1 + chr2L 20935317 3' - INE-1 547 1 51.09 GTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGTTATTTATTAGATCATTTGGTCAAAGAAAATATTGACACAAAACGCTGAAAAAATGTACAGTGCAAGATATTTATAGA:1 + chr2L 7285409 3' + rover 310 2 52.74 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTTTGCCAATGCCATGCACGTACGCGGATGTC:1 + chr3L 7102435 3' - I-element 25 1 62.86 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTGAAAAAACTGTGAAATGTAGATGAAATATTTTTATAAATTCTATTTGACAGGTAGGGGTAATCAAATTAACACCTTGCCTTCTTCACCTGCTTAACT:1 - chr2L 20508250 3' + pogo 2082 1 72.60 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCGGCGGCCATG:1 - chr3R 5170975 3' - F-element 86 1 70.55 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCACAACTTTCCGGAATCTCCAACTGCTCGGGTCGCTGGG:1 - 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Doc 4268 1 77.40 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGCATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCG:1 + chr3R 20345534 3' - blood 25 2 51.46 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTATGTCTATAAAATGTAGCAAAGATAAATGAAATGTGTAAAGGATTTCATTTAAAAATTGAATAC:1 - chr3R 6399340 3' + pogo 2053 1 53.42 TCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGC:1 - chr2L 1729773 3' - Transpac 83 2 73.79 ATGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATAGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCATAATCCTTAAGTTCTGCACATTTTGTGGCAAACACTTTGTGGGATTGGGATTGTGTCTATA:1 - chr3L 22415830 3' + Stalker4 7196 6 58.22 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAATTTAATAGATTTTGTTTTCTTAGACAGCGATTCTACAGCGACTTCATCTTCCAACTCACCATCAGATCCCCGCCCAGGTGAAGCGGCG:1 - chrX 13152689 3' - pogo 15 1 74.44 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGCGTAGACAAAAG:1 + chr3L 8249470 3' - HMS-Beagle 62 2 62.33 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTAACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTCATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAACCCGCATTAAGTGATCATGAAAATGTTGGAAAA:1 - chr3L 18010195 3' - diver 22 2 69.86 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTTTTTCTGTGGAAGTGAGTTTCGGGTCTCGGATTACA:1 - chr2R 14431188 3' - Doc 49 1 45.21 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGATAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGGAACAATCCCGGTACG:1 - chr2L 13675848 3' + flea 4985 2 69.86 CCAAGATGGCTCCCTTGTGGGAGATGGCTGATTGATTTGATTTGATTTAATTTGATTGAGTATGAGTAGTGTATGAGTCTAGTGGGCTGTGAATCTGTAGGTGGCTAATTGGATCTGTCTGCTGCAGCTGGCGGGTAACTAAAACG:1 + chr2R 12269727 3' - Q-element 488 2 72.60 ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGC:1 - chr3R 5977741 3' - copia 4942 2 66.44 GCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTAGGCAGCCAAAATGGAAAGCAGCGGCGAAAACTGCAGCAACAACAATAACTGACAACTGTCATAAACATAAC:1 + chr3R 13999542 3' + Doc 4454 1 55.48 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGGTGTAACACCATTTGTTCGTTCGTTGGCCTTGTGGCTCGT:1 + chr3R 4668849 3' - 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chr2L 10268204 3' + HB 1576 1 51.80 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCTCGACAAACAATCTTATTACATTTCTTTGTGTATAATGCTGGTTACAGCAATTAAATTGAAGTGCTTTAGT:1 - chr3L 19222581 3' - 412 7104 2 51.37 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTCTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGTTGTGGTTGCTGA:1 + chr3R 17673844 3' - FB 59 1 56.85 CTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAAACCGTAGGCCCTAGTCGAAC:1 + chr2R 7622935 3' + P-element 2788 1 17.81 TCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTATTGTTACATAATTTAGTGTTAAATAAAAAACTGATACCCA:1 - chr3L 13449186 3' - Quasimodo 83 2 76.03 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGGGGTTGTTCCACTGTCACAAATTT:1 + chr2L 16553628 3' - BS 5043 1 52.05 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGATTTTAAGCGGATTTTGGAGTTTCTACAATGAAAATAACAACTTGGTAAACCT:1 - chr3R 10751581 3' - hopper 20 1 70.55 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACTCAGGGATC:1 + chr3R 22352522 3' - I-element 59 1 58.22 AGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAA:1 + chr3R 19446215 3' + 297 309 2 78.08 TTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAA:1 - chr2R 4601556 3' + HMS-Beagle2 7122 2 67.59 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAAATAGTTATATAGTATTAACATCAATTACATCTTTCGGAAACTCGAAAAAGAAAAGAG:1 - chr2R 5542216 3' - Quasimodo 55 2 64.38 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGTTCGGCTCTGGAAT:1 - chr3R 5977733 3' - copia 4882 2 61.70 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCCGGACGAGCAATAAAAA:1 - 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HMS-Beagle2 19 2 62.40 ATTATATTGAATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTGAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGGTGCTTATACAATGGCGCAACAAGCTGCATGTGTTGTAAAAAGGAACTTTTCATA:1 - chrX 22559201 3' - S-element 92 3 56.85 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACACAC:1 + chr2L 16382560 3' + hobo 2890 1 63.48 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGATTTATTTAAAAGAGAAATCCGAATTTATTTGT:1 - chr3L 20168170 3' - roo 8699 2 61.38 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGTGGTGGAAGGGGGTTGCGGGCAGGGTTG:1 - chr2R 21362712 3' - Tirant 17 2 72.31 TTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAG:1 - chr3R 19246712 3' - jockey 4750 1 72.60 GAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACAC:1 - chrX 21227129 3' - Tabor 6923 2 72.60 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAA:1 + chr3L 27391415 3' - 1360 31 1 58.90 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAATGGGAGTGCTTAGAAGATATTTAAAAATTTAGATTGAAATGGATAAGATTTTGGTCATGATACCAAGGACACCATGGACACCCCGGAAGACCTCGAGCTTCCAGAGACCT:1 - chr2R 10940050 3' - INE-1 545 1 79.85 GCAAGGTATACATTCTTATCTCGCAGTTGCCCTGGTTTCGATTGTTTCGGTGAGCAAATCAAA:1 + chr3R 23998852 3' - invader3 5316 2 69.84 CTTATATACATACATACATATAAAAATCTAATTGAAAAGTTTTCTAACCGAAGGAATACTTTTACTGACTTAGGCTCATTTGCTAATTAAATGGAAATATTCTGCTTAAATTATTTGCCAAGCTCTCCTTGGGACATCTCTCACCG:1 + chrX 3311843 3' - 1731 4412 1 67.81 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:3 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCGCTCTTGCGGTACATTTAACTGTTTTCGTGTAAGTGTTTATTATTGTTTCCATGTACAGTGGTCCGAATTAAGAATAATATGGAAATAATTGTTGT:1 + chrX 10324368 3' + mdg1 397 2 67.12 CCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTG:1 + chr3L 8249460 3' - HMS-Beagle 56 2 65.38 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAAAAGCTGGAGAAAGC:1 - chr3L 15035086 3' + pogo 2069 1 63.70 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCCAA:1 + chr3R 20345574 3' - blood 27 2 65.52 TTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGAACTTAACTCGCGCTCACACACACACACACACTCACGCTCTCACGTGAGCGATTAAAATCTGAAGGAAAGCATTGCAGTTTTACCTTTTTTTTT:1 - chr3R 28045730 3' + Tirant 360 2 57.93 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACTTT:1 - chr2R 18723653 3' - 297 52 2 63.57 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTCTTTTGGTTCCATTTTAACAATGATATTCGTCTT:1 - chr2R 22112598 3' - 412 7075 2 63.19 ACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAATGCAATTTCAGATGTCTTGGCCTATTAAGCCAATA:1 - 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chr2L 6385753 3' - invader4 23 2 70.34 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAATTTCGTGCCTGGGTTTTTCGGCCCTTCCAGCTATTTTCTTACT:1 + chrX 471244 3' - S-element 75 1 70.55 AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCG:1 - chr3R 12181985 3' - mdg3 70 2 62.33 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACC:1 - chr3R 7041974 3' + Stalker2 7608 2 50.76 CCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTTTTTGAGGCTTGCGTCGCTTCAGCTGCTGAACCTCCTGTTCGCTG:1 + chr3L 19893345 3' + copia 70 2 60.18 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATT:1 - chr3R 21654979 3' - roo 76 2 69.18 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCCCAGCATGCAGACTGCAGGATACCGGGCATCGTACTAAACCGTAGCATACTTTTTTGGGCC:1 + chr3R 11108152 3' - 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chr3L 19349955 3' + 1360 3311 1 76.26 ACATTTGAAAAATATTTTTATATTTTTTCATATTTCATATTAGTCTTCCAAATTTCTAACGACTTGCTAAAAAAAACTTTTTACCACACTTGACCACTCACACGAACCTATAAAGGTGGATATATTATTGTACAC:1 - chrX 7595076 3' + Transib5 2727 1 64.44 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATGGTACTGCAACGCAATGTGTCA:1 - chrX 20233760 3' - pogo 35 1 61.64 CCTATATGTATGTATATATATACATATATATAACTCATGGGATGTCATTTGAAGGCGGCAAGTGTAAAAATTAAGCAGCTAGGGGGCGAGGCAATGAGTGAGATAAAATTACCCGGAAAACGAAGGGCG:1 - chr2L 9109797 3' + 1731 4410 1 83.72 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTCAGTTGGTTAATATCAAATACCAGTCA:1 + chr3L 21292611 3' + 412 438 2 53.42 TTTACATTATATTCATTTTCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCACGTCTTCCTTGACTCTCTGGCGTCCATTCACCACATAGGCCAGTGGATCGTCGCGACTGGATTCCATTAGATTGTCGCACGATTCCTGCCCGATGTTA:1 - chrX 11791554 3' + Cr1a 4327 1 59.72 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGGTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCTAAATGCACAATGTTAAGTGCCCAGC:1 + chr2R 14332137 3' - jockey 37 1 63.70 ATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGTGTAAGGGGAATCCACTTTTAGTAAGTGTACATAGCAGTAAGAAAGAAGTCAGTATTGCAGCCATAAAATACCCGGTT:1 + chr2L 16103922 3' - micropia 5153 2 49.32 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTGAATTGG:1 + chr2L 8895343 3' + 412 7506 2 56.64 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGAAACAAAGCTGAAATGCATTGCTAACTATTTACTTTATTTGCTAGAGTGCTTCA:1 - chr3R 18343395 3' + jockey 4981 1 71.92 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTAATTTAATATTAATTTATTTTCAACGATTATACTAAAATAAAAAGCATTCTGTGTAAATCAAGCAATTTAT:1 + chr3L 22041177 3' + roo 9022 2 60.96 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTC:1 + chr2L 8895327 3' + 412 434 2 57.53 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCT:3 + chrX 140065 3' - blood 7100 2 76.03 ACCAAATACACTTGAATAATATTTCACATACAATGCTTT:1 - chr3L 16752560 3' + Tc3 241 1 66.67 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTCTCTCAGAGAACGCGGAGAA:1 + chr3L 739242 3' + P-element 2841 1 37.86 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAGGCGAGAGAGAGCTCGTGCTGTCGACGTCGACTTCGACTTCATTCATGCGGCGTTCG:1 + chrX 18534631 3' + P-element 2841 1 50.68 CTTTTGGATCCAAAATAAATAGAATGAGGAAATACCATTAGGTTAAGTCCAATGTTGTAAAAATTGTCCCTCCCTGTAACTTCTCAATCAAGTTTGAACCACTGGAAATTTTCAAATCCTAATTAAATTGTTTTAATAGGTTAAAT:1 - chr3R 23949137 3' + G5 4818 1 73.97 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACTTTTCGTTAACTTTCTCGATGTCAACGAAACACACAATGAATGG:1 - chr2L 8553292 3' - pogo 43 1 54.17 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGGAGTATTCTGACCGCCGCAACTAATTGACAATTCAAAATGTTTTGGGATGTCGAGTGGAGCTGGCGTGCCGGTCATAAAGTTAATAAGCAATTTGCATAACAA:1 + chr2R 8689500 3' - hobo 18 1 73.97 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGG:1 + chr2L 1451231 3' + mdg1 7377 2 71.92 ATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCACTGCATGTGGGTACCA:1 - chr3L 12072512 3' + HB 1587 1 52.05 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGGACTAAAATTATAGATTTCTACACCA:1 - chr2R 8258231 3' - jockey 27 1 67.12 CAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCGTAATAAAGGGCGCACAATTAGTTGCTTGAGTTTCCGC:1 - chr3R 12181948 3' - mdg3 33 2 63.70 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTAT:3 - chr3R 19246709 3' - jockey 4747 1 71.23 TTCAGGCTTTCCAGGCTTATGAATCATGGAGATGATACCGAGCTTCCACTGTGGAGGGAAGTGCTGCAGCCTCACCATGGCGTTGAATAAAAACGTAATGTACGCGGGTCAGCTATTTGTTTTAGAGCCATTAGAATGCGAAAAC:1 - chrX 22516004 3' - BS3 397 1 68.97 ATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATTCCCTTAATTTTTACCTATAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGCGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTTATGGTCGCAAAGAATTTGCGGGATGCCAAACTTTG:1 - chr2R 5421083 3' + S-element 1601 2 75.34 TTGCGAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGGCTTATATGTTGAGCGTAAAAGAGGCTCTCTTATGTATTCATATGAATTCGAAATTTATGAGCGGACATAAAAGCGGTGCGCCTAGGGATGCTCTGGGTATTTTCTCCCAT:1 + chr3L 10966703 3' - Quasimodo 7241 2 57.53 AAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACTTGGCGGCAC:1 + chr2L 6385924 3' + invader4 297 2 65.07 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAG:1 + chr3R 15047427 3' - F-element 45 1 52.99 CTATCAGATACCCGTTACATAGCAAGTTTAAGAGCGATGAAGATACAGATATGCAAAATATAAAGAAATAAATATTCTTACCAAGATTGCTTACTTATACATATAAGATAAAGTCGATATAAAGCTTAAAAGCTGACCGATTTTTG:1 - chr3L 11578824 3' - INE-1 547 1 30.14 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGTGAATGCATGACTATTCCCGATTTTCCGGGAAAAGCAGGCAGCTCCGCACGCAT:1 - 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297 18 2 65.55 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCNGCCAGAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCC:1 + chr3L 5958711 3' - 412 65 2 58.90 TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTACATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACC:1 + chr3L 8295817 3' - Quasimodo 70 2 71.23 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATAATTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTT:1 - chr3L 16200749 3' + roo 331 2 69.86 CACGCACTGTAGTTCTCATCATCAAGTTTTTCTATTTGGTTTATTGATGAACTCATTTTCACTTCGATAAGTTTTTCGTATCATCGGCATTAAATTGTTGCCCCCCCGGACTCGTTGAACCCACCTCGCATCCTCTTAACCCCACC:1 + chr2R 12909784 3' - Dm88 351 1 55.48 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACT:1 + chr2L 15549942 3' - hobo 60 1 64.93 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAACCCCTTACCAAAAATGCGAAAATTCAGAAAAATCGAAAAATTTCAAATCACCCTAATGGCATTATTTTTAGTTAGAATAGAGTCTTA:1 - chr3R 29185617 3' - 412 7083 2 61.81 TCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTGCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAAT:1 - chr3R 19246691 3' - jockey 4729 1 57.53 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTAATGTAATCAGGGTAAGAATAGAGTATTCAATAGCACATGTAATAA:1 + chrX 7032816 3' + roo 396 1 77.40 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCCAAGTGGGAGTTTGATCATGATG:1 + chr2L 1451277 3' + mdg1 7423 2 60.96 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCAATGTC:1 - chr3R 19996162 3' - Quasimodo 42 2 57.53 ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAATTAATAATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAAATATAAAATTTCAAGATAGACTAAACGAGCTAACCAACTCGTTAAATAGAATCCA:1 + chr2L 21556091 3' + flea 4949 1 58.90 ACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGGACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGAT:1 - chrX 21585270 3' - mariner2 351 1 59.03 AGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACT:1 + chr3R 5972374 3' - Doc 312 1 58.90 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAACATGTAAAAGCATAGACTAGACCTCATATAAAAACAATTAACATTATTTTTA:1 + chrX 407530 3' - I-element 13 1 76.71 ATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGACCTCTGTCCTTCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTTAAAATAGAATTATGTGCAGGGTTTTAATGAGCTATCGAGACTGGTGGGTGGTGCGTTTGCTGGTGTCCTTGGAAG:1 - chr3L 22611178 3' - 1360 3336 1 54.79 CACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGAC:1 + chr4 909135 3' + 1360 3261 1 75.34 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTACATTTAAGAATATTCTCTTTATG:1 - chr2L 1232614 3' + roo 9016 2 60.96 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTTTAGGCAATCACCCATATGATTTTCT:1 + chr2L 8553442 3' + pogo 2070 1 65.07 AGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCCAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAAAAGAAATTGTGAATCAATATTAAAAATT:1 - chr3L 3765121 3' + G2 2853 1 79.45 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCCAAGCTTTTG:1 + chr3R 20345581 3' - blood 21 2 69.86 AATGCAGATATCTTGCCGATGTAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACTTTTCGTTAACTTTCTCCATGTCAACGAAACACAAAATGAATGGAAGCACTTT:1 - chr2L 8553283 3' - pogo 36 1 59.59 CGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACA:1 - chr3L 20934174 3' - Max-element 68 2 77.06 TTAGTTGTTTTTTTTTTTCGTTTTTGG:1 - chr2R 16246006 3' - gypsy7 5013 1 96.30 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGATCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGAAATTTCGCAGTTACGCAGCTTCAGCT:1 - chr2R 22964195 3' + 412 7483 2 62.33 CTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAATGAAGGCAATGATTGTTGAGTGCGTGTGTCCGCCCTTTAAAGAGGAAATTTGTCAAAAACGATTTATATGTGTATTTTTGATTATATTATATGGGGTCGATTAGAGTTATATAA:1 + chr3L 23318687 3' + 1360 129 1 63.70 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGATTCCCTAAGGATTTATTTATATTTTGTTTGAGTAGCTGG:1 - 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chr2L 1451104 3' - mdg1 4 2 77.21 AAATTAATTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACGAACGGTCAGCAACAGAAACTTAGTAGCTACCCGCGCATGTAGGTCACATCCTCGGGCGTCATATGCATCACGGTGTAGGGCAGATG:1 + chr2R 17531245 3' + gtwin 6961 2 51.37 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGAGAAAATGCTTTGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTTACACAGCTAGTGTGAATGCAATCGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATAT:1 + chr2L 7112794 3' + 412 467 2 67.81 TGGTACTTATTATTCATGCAATCTGACTTAAAAAAAATACGAGAAATATAAGAGTAATAATAAACAAATGATAAAACGGAAAGTTTCGCATTACAAAAATATATATTTAAGCCTGAGCTCGGTTCCCTCGCATAAATACGCCCACT:1 + chr2R 21460432 3' - Tc1 92 1 80.14 TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTTTTTC:1 - chr2R 14431219 3' - Doc 80 1 66.44 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTTT:1 - chr2R 14431222 3' - Doc 60 1 62.60 GTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATTGTGAGTCGCCTCTGGGCGTGCTGCATGTTCTG:1 - 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X-element 226 1 54.87 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCAACGCTTCTTCAG:1 + chr2L 13316950 3' - jockey 4735 1 60.27 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATATTTTCCAGTTGAGGGTGCTGTAGTATTTGACATTTGTAATT:1 - chr3R 8631575 3' + roo 9049 2 69.86 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTAAGCTTTCCG:2 + chr2L 19698169 3' - roo 8735 2 65.75 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAA:1 + chr3R 31086578 3' + jockey 4912 1 75.34 TTTTATTTATTATAATTTTAAGGTTTCAAATGTGTAATATTTACACGTCGTTTAAAGAAAAGTTCAATGTAAATCCAGAAATATGCGCATCACATGGGTGTATAGATCTCTTTTCAATACAATTATTTCCAGTGTAGCACCACACC:1 - chr3R 13135782 3' + INE-1 424 1 63.70 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAAGGCTCCT:1 - chr2R 24617065 3' - jockey 4748 1 73.91 TTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATTGATTTATTCGAACCCATCCATAAATAAAAACCTTTGGTCTCGACAACCGTATCGAAATACATTGATATCCAATTTTTAACT:1 - chr3L 14852812 3' + R1A1-element 5042 1 57.53 TCAGCATTTTTGGCACTTGTGCTTACCCAGAAACAATGTAGGAACACAAGATGTGGGACAATCACTTGTAGGGAAGAGAGCTCGAAGAGTATTTTTCAGCTTTAACCGCACATGAAGAACGCATTCGCTAAACAAAATTAATGCAG:1 - chr3L 25668824 3' - HMS-Beagle2 6943 2 51.37 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTGGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCG:1 + chr2R 10541761 3' - P-element 8 2 71.82 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTTTATAGTGATCATATGAGGTGCGAGAAATTGTGCTAAATGCTTGCTAGTTTCAGCCCAAACAATTTACGC:1 + chr3R 14546600 3' - pogo 46 1 55.48 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGCAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTT:1 + chr2L 11725044 3' - F-element 68 1 63.70 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCAGATACATTTTA:1 - 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chr3R 10708211 3' - Transpac 4963 2 55.48 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTAGAAAAGTGTTCTTTTAAAATCATCTACATTGATTGAAATTCG:1 - chr3L 8936895 3' - BS 5074 1 71.23 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCATTTATATTGTGTAATCACTTAATGTCTTAAGTAACTATTTCTTCC:1 - chr3L 22041025 3' - roo 21 2 71.23 GCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGAGTTACCACAGTCACCACACCCCCTAAACCCCCACGCCTACACATGTCCAATATTCTCTTAACGCGATAAAAATGAAGTAGCAACA:1 + chr3L 12687938 3' + F-element 314 1 41.10 CACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTA:1 - chr3L 18947256 3' - BS 4732 1 63.01 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAG:1 + chr3L 21913447 3' - 297 6633 2 55.48 GGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGATACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTTAGCATTCCAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGCCTACAAGCTGC:1 - chr2R 6208471 3' + INE-1 97 1 78.77 AAAACATATGCATAAATAAATAAACGAACTAGAAATAAAATTTCAACAAATTTCTGGGGCCTAAGCAATCTATATAAATCAATCGGACATCTAAAATTATTACAGTAAAATCATGCTGGATTGTATTTTATGTTAATGTGTGGAAT:1 + chrX 21632500 3' + S2 1608 1 64.38 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCGTTTTTCCGCACACAAACGCACAAGCGTACAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATG:1 + chr3R 10541333 3' - hopper 14 1 68.07 GCCTTTTTACGACCAACTGAGNGTACCAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACGGGGGTACTCCTTATTTCACACACACACAGCACACACATCAATTCACAATCATGGGGGTGGGGATACGGTGGGTGGGTAACGGCAAAGG:1 - chr3R 26427314 3' - Rt1a 4829 1 49.32 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGTGTATATCTCCCGCTTAATGTTCTTTCAAACTTGGTCACAATCATTTTATTCAATTACATTTATTTGAAAATTGAAATAGTCCGTGACATGG:1 + chr3R 31772133 3' - mdg1 21 2 69.34 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCTCGACAAACAATCTTATTACATTTCTTTGTGTATAATGCTGGTTACAGCAATTAAATTGAAGTGCTTTAGTTG:1 - chr3L 19222579 3' - 412 7101 2 51.03 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGAAACAA:1 - chr3R 18343443 3' + jockey 4933 1 59.59 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATACAAATATTTAAACAA:1 - chr2R 18358406 3' - jockey 4702 1 40.69 AAACAAAAAAAAAAACTATGAATTGCAATTTCTGGAAAAAATAGCTTAAAAAAAAAATAGCTACCAGCTGGAGTATAAATTTGAATTTATGGAAAAAAATACCCCTTTATGGTACCACTCACCTTTGTGGGAGCTCGTTAATTGCT:1 - chr3R 30161790 3' + transib2 2641 1 62.33 CGCATACAGTGATAGCAGACAATTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTACAATTCGATTGAAATTTTATTGGTAAATTGAATAAAGTACACGGCGGCATAA:1 + chrX 17791951 3' + 1360 152 1 64.38 AAAACGTTTGCCCAACCATTATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTA:1 + chr2L 23034045 3' + FB 349 1 61.64 AAAATACTTGAACTAATAAAATGCATATATCAGTTTGCAGCTCGTCCGTCAAAAGAGTTGTGTCACTTTGAAAAATGTGTCGACGTGAGGTACCCTCGCCAACTTTTAGTCAACTTGCTCCCAGCTATATATAACTCGATTTATGT:3 - chr3R 30255521 3' + G7 1162 1 65.75 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACCACTGGTGGACGCCGAGGGTTTTCCGCGCAACGACATCGACGTTTACC:1 - chr3R 13676055 3' - P-element 9 2 76.92 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTCCACTAAAATGTTATTAACGTTTTTATAGCGCCCGGCAATAAAA:1 - chr2R 17842826 3' + roo 9001 2 69.86 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATATGTTAGTATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATACCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAAC:1 + chr2L 16607304 3' - 412 7111 2 52.74 TTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGCAATCAATGGGAAACACCTCTTTAATGAAAGTCGCCTTAAAGGCCCTTCTCAGCTTTTTCAAACGAGCCCCAACAAGAAACACGCAAAG:1 - chr3L 10560511 3' + Quasimodo 143 2 74.40 TAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTTCACAGTACGCATACAA:1 - chr3R 14401878 3' - Juan 4125 1 63.01 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTAATGTAATCAGGGTAAGAATAGAGTATTCAATAGCACATGTAA:2 + chrX 7032813 3' + roo 393 1 75.34 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAG:1 + chr2L 3911952 3' - roo 8694 2 61.65 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCCTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGATTAGTCAAGAAACTATGGGTTGTTGGATATCTT:1 - chr3R 10030709 3' + BS 5024 1 62.76 ATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGTGCAGTCTCCGCGTCGCGAGTGCGCCAATAACGAGAAATAACGAGAATTGAAAAAGTTCCTTAAGAGGTG:1 + chr2R 8600537 3' + pogo 340 1 66.96 TAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTAACAATTGCGGAAAATATAAAATGTATTTCAAACCTTCGCG:1 - chr3L 24996072 3' + 1360 445 1 63.70 ACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTTATTTGTTTATGG:1 + chr3R 8867122 3' - Max-element 8271 2 60.96 ATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAA:1 - chr3R 1135321 3' + Cr1a 4319 1 78.05 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTCAGAGAGCAGAGCAGGGCAAACGAAAGATGTGGGATTAATGACATAATTTACAAAT:1 + chr3R 28829164 3' - FB 68 1 63.01 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTATGAAATTGAAACCGCAAAGATGTGAATACCACGGAATAGGTGGACCAAAAATATTAATTTTTGCAAAAATGGAGTGCATTTTTATTCGTAGAAGATACATTATTATAATTATAAAT:1 + chr3R 8589290 3' - FB 7 1 72.60 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAAAGTTAAGCATTTAAAGTTTTCCACAAATGCTATAATGGCGAGCTGTGGGGGCGGTG:1 + chr2L 16554724 3' + blood 368 2 70.00 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGAAT:1 + chr2R 10541764 3' + P-element 2871 1 69.42 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAA:1 + chr3R 14277980 3' + P-element 2850 1 53.23 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTAT:1 + chr3L 21913457 3' - 297 6623 2 56.85 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTCTACATTAACGCAAAGCAATAATTATCATATTTGTCTTCTCTTTCGAATATAACAAATTGTGTTGATAAGCAAAACATCTACA:1 - chr2R 7009385 3' - Quasimodo 31 2 65.07 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAATTGAGTTGTCCGGGTGAGAGTG:1 + chrX 20942193 3' + hobo 2889 1 75.00 AAGAGAGCAGTCTGCACGCTGAAAAATTTAGATTTTGTGTGGGCGCATGCAAANANCCACACCAAACAGCACTGCGAACAACGTACAAAAGGGAGAGTAAACATAACACAAGATGCGGTGTGCCTGTTTATTATTTTTTTTTTTGC:1 + chrX 12350910 3' - Cr1a 339 1 76.71 GGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGTGCGTGGCCGTGCTCATGGGCATAACCGATTTTAATAAACATTTATCAGTCGACCGGA:1 + chr3L 11528562 3' + opus 7256 2 58.65 AATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCGGGCGTGATGAAAATTATTTTAA:1 + chr3L 22038338 3' + diver 210 1 70.73 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAA:1 - chr2L 1729761 3' - Transpac 72 2 65.75 CTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATCTTAAATATCACATAATTTTCTTGATTTTTATAACAATT:1 + chr2R 17385613 3' - copia 4952 2 77.40 CCCGGCTCTCTCGAATTTATGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACATCCTTTCGTATTTAAATTCAATTGTATATTGAAAATTCTTCATGTTCTTGTCAAT:1 + chrX 11898419 3' + 1360 83 1 62.07 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCTTCC:1 - chr2R 16731274 3' - Tirant 77 2 69.86 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTGAAAAAACTGTGAAATGTAGATGAAATATTTTTATAAATTCTATTTGACAGGTAGGGGTAATCAAATTAACACCTTGCCT:2 - chr2L 20508267 3' + pogo 2065 1 60.96 ATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGAT:1 + chr3R 7042059 3' - Stalker2 81 2 70.55 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCCCATCTGCCACCTCAGCTCTGGGCCCTTAACCCTCCGCATCCTGGCGGTTACCACTT:1 + chr3R 7600581 3' + hopper 1351 1 60.27 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGT:1 + chr3R 14277965 3' + P-element 2813 1 34.93 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAACCC:1 - 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chr3R 12789525 3' - G2 2781 1 47.50 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTGCACTTTTAAATA:1 - chr2L 18112466 3' + transib2 2789 1 58.90 CTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGACTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCC:1 - chr3R 2689360 3' - diver2 4474 1 52.00 CAACGAGTAAAGTCTTGTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAAGGTAGAGATGCTACCGAAACAGCCAAATCCAGCGG:1 + chrX 19583374 3' + roo 396 1 76.03 CGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACCAGTACGGGACCGAGTACGGGAACGAGTGTACGGGACCGAGTACAGTTCAACTACGGGACCGATTACGGGACCGA:1 + chr3R 16535296 3' - Stalker4 39 4 45.26 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCCTGTTTTGCTGTCATTTTGTCCAACTGTCCTTTGGTCCTTTGGTCGCTT:1 + chr3R 14138657 3' - mdg1 34 2 62.33 CCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCAAAGTTTCATCATTTTTTCTGAGATATCGATAAATATTGGTGAAAAGAATCTTTGATAATGTAATTTGTAAAGTTTTTTTCTACCTTTTCGAATGTATTCT:1 + chr2L 7256394 3' - INE-1 551 1 58.22 CAATAAAATAATATATTATAAAAAATACTTTGATGAACAAAAAGTATTTAAAACCGAAGCGGCAATGGGTGAAGGAAGTTTACATAGCTTGGGATCAAAGAATCCTGAGCACGCCGTCGTTGAGTTTTCCGACAATGAAAAAATTC:1 - chr3L 26763332 3' + BS4 724 1 71.23 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAAAAAAAAC:1 - chr2R 25083254 3' + pogo 2065 1 64.38 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGANTNAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCA:1 - chr3L 1477377 3' - mdg3 73 2 63.01 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTTTTAAGGATAAAGTGAATACTACAAAT:1 - chr3R 29384603 3' - roo 49 2 56.16 TACGACTGACTTTCTTGGAGTTCAAAATCAGTCTGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTTAAGATTTTCTAAAACATTTGAAGTCAATCTATCGCAGCCTC:1 + chr3R 30641039 3' - Tirant 287 2 65.75 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATACAAGCAATTGTAAAATCAGTTTCTATGCCATACATTTTGTTGTGTCTATAGTGGGACTGCTGAATTTCTATGAT:1 + chrX 18786232 3' + pogo 2057 1 51.37 GTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTAAAAATGTGTATAATATCGTTAG:1 + chr3R 10900903 3' - F-element 36 1 48.57 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGTGTAATGTGAAAAATTTCAAACAGCCAACGCTGTAAATTTATGTGTCACCCATGGT:1 - chr3R 26605542 3' - roo 8728 2 67.12 TTATTTATTTATTAAGAAAGGGAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATGTTATTTATTTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACTCCACAAAAGAAGTCAAACG:1 + chr2R 20389502 3' + copia 232 1 56.16 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCAAGGGAGCTTTCGTTTACTGGGTCTGAGGTCAGCGAGGGGTTCGGGTCAC:1 + chrX 7508188 3' - roo 69 2 67.12 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAAAATATTCTCAACAAAAAACAGCAATTTTGGTAA:1 + chr2L 3646780 3' - FB 88 1 78.08 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAANTNCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCGGT:1 + chrX 2104794 3' + roo 353 2 55.17 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGGTATTTTCAAGGGTCATGCCATATTCGCTCAAGTAGTTCTTAAAGAAATTACCT:1 + chr3L 7646327 3' - 297 59 2 65.75 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGAGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGCTCGATGACGCTATAATCGAAAAAACTTTG:1 + chr3L 12633304 3' + jockey 4925 1 72.80 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCCGCTGTTAACGAATTTTCCTCCTCTCAGGTTGGCTAAGCAGATTGGCATAAATTTGTACTTGGCTTTCAAATATTTGCCAGGCCTTTAATTTTGATGAA:1 + chr3R 31275472 3' - mdg1 7060 2 69.66 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGTGTACAGCGATTGAGCAAGTTTAATCCTTTGGGCTAAAGAACTA:1 - chr3L 21636391 3' - 297 19 2 71.33 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACT:1 - chr2L 16537539 3' - Transpac 43 2 55.65 GTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATCGAACTATTGTCAGAAAGATAGTGCGAAAGTGCATCGACCAGGAACCCATCGTGCGTCTCGA:1 + chr3L 20806484 3' - R1A1-element 5062 1 57.53 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACA:1 + chrX 8208439 3' + roo 9038 1 63.70 AGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCAACAAAAACAATATAAATTATGTTCGTGGAAAAGCACAAGCAGCAGG:1 - chr3L 13992605 3' - blood 348 2 67.81 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGT:1 + chr3R 15137380 3' + roo 362 1 52.05 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATAAATCATTGGGTGAAACTGTAATCTATACAAATGAT:2 + chr3R 21655099 3' + roo 9046 1 67.81 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATC:1 - chr2R 22596079 3' - Doc 59 1 55.48 TTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACATGTTCGCATACACTATATAAGGTATAAATGGTTGAAAGAAAG:1 + chr3R 6374793 3' + invader2 4938 2 71.23 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTTGGAAGCCAGTGAGTGGGCAGAGACACTGGGGGAATATATTTCGCTGTTTGTAATCATAATAATTA:1 - chr3R 5495153 3' - roo 8692 2 66.44 GTTTGATGAGGTCCTTCGGATGTCTTCTGTGGAGTCTTCTTGGTGAGCGAGCTCTGGACAGTGCCTTGGCTTACGAACCATTCGCAGCCGGTAATCATCCAGGCGATTTTGTTTTGGGCAGGCTTCATAGTAAAAATGCTTTTAGA:1 - chr3L 24051192 3' - BS3 1571 1 51.37 TGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGAT:1 - chr3R 10751632 3' - hopper 71 1 64.38 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCCTGTTTTGCTGTCATTTTGTCCAACTGTCCTTTGGTCCTTTGGTCGCTTTGTCCTTCT:1 + chr3R 14138666 3' - mdg1 7063 2 68.49 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGTTGTCTACCAA:1 + chr3R 23416032 3' - jockey 4783 1 68.49 TGGAGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGTTATTATTGGGTTTGGCTTCGGAAACCTTTTTTAGTCTGATATATGCTGATTTTGGATTTGAAACTGACGGAACTGTAGGACTTCCCAA:1 - chr2R 5910081 3' - Tc1 1277 1 61.38 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATGTATACGATTTAAAAGAATGTGAAAACAAATCGTACGCCTACGAAACTAATAATTGGGGCGAGAGATGGTTGTGGTGGGTTGAGGGATGAGG:1 + chrX 16589299 3' - pogo 22 1 70.55 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAAT:1 + chr2R 22971868 3' - jockey 4823 1 62.33 AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCANANTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACAGCAGAGATGCCATACTAATAGGCATGCTTCCTTTAAGTTATGTAACTATAGTG:1 + chr3L 18075648 3' + pogo 2037 1 60.96 AAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTTAAGCTTGCCGCGAGGCCTTGAAGGTACTATTTTAGCCTG:1 + chr2R 17696166 3' + rover 323 2 69.86 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTT:1 - chr3L 16200718 3' + roo 9026 1 54.11 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTATTAA:2 - chr2L 4631114 3' - roo 39 2 55.48 GCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAGTATGAAAGCCGAAA:1 + chr2L 13328541 3' - BS 13 1 71.22 TATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTATTTTCTTCGCTCGGCTTTCGTGCTTTTATCATT:1 + chr3R 9516817 3' - jockey 4976 1 74.22 AAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGACTGTGCCAAGTAGCTTCGCACCAAGCTCTATTCCCATT:1 + chr2R 22761242 3' + 412 7473 2 70.29 AGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAG:1 + chrX 21994014 3' - McClintock 40 2 57.53 TAATAACAATAATAATAGCAAACGGCCACGAGAGCGCGAATCAAAAGGGGATGTGCAGCAAATTGCGCTGGATGCTGGTTTGGGTGGAGCAGTGAAGCGCTAAATCCTTTGTCGCAATTGTATTGCATGTTTGGTTTTTAAATAAA:1 + chr3R 30332443 3' + mdg1 18 2 66.44 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGTGAATTATACTGTATGTGTTTTCACTGCATTCTTTTCGACACCCTTTAATTGCATTTAAGCATGCACA:1 - chr3R 28413873 3' + pogo 2032 1 62.33 CATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGACTCGACTTTGGAAACAAACCGTCATTACATTTTTTTTAATACCTGTAG:1 - chr3L 23207320 3' - invader4 2969 2 67.12 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACCTTAATGTGTAAAGTTGGCAGTTTT:1 - chr2R 21619293 3' + blood 7364 2 67.81 CTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAATTCGCAT:1 - chr3R 25692695 3' - BS 4996 1 78.86 CAAAGCGGAGAGACCGTGAATTAACGGTACCCCGTTAGGCCTTGAACTCGAGCTGGCCAAGGGCACAGAGGTCAACCGGTAACGTGACCGGTAGTTCACGGACGCACCGTGAACTAACGGTACCGCTCT:1 + chr4 249255 3' + gypsy8 4720 2 65.12 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTAT:1 + chr2L 19940138 3' - mdg1 21 2 67.97 CTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGTATTCTGTCTGGACTCGAAGGACTTTATGCAGATCAGAAACGCACTGA:1 - chr2L 2140758 3' - F-element 4525 1 65.47 ATAAGAAGATATTATCCTATTGTCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCATACTAAAAGTTACCCTTACCCTTCAAACATGCGAAATGAGGTT:1 - chrX 21792092 3' + gtwin 7313 2 69.18 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAGAAGCCGTAAAAAAAAGTGACTAAGGGAAATCCTAAAAGGCTGTTG:1 - 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chr2L 5961213 3' - S-element 62 1 62.33 GCGTGCATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCCTACCCTTTTGCC:1 + chr3R 10433288 3' - 412 7133 2 71.92 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAAT:1 + chr3R 4361677 3' - copia 4930 2 60.27 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATTTTTTTTTTTAGATATACAGATAATAAATTATTCTCAACTTTTAAGCATTGTGCTTGTTGACATTTTGAGTACTT:1 - chr3R 19628896 3' - Transpac 4957 2 58.90 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATTTTTCTAGTACCCTCATTTCACTGACGTGTTGTCTTAGCCATATTGTATTTCTCGTCCAAGTTTCCAGCTTTGTCATTGCACTTTCATTTTAAGC:1 + chr3L 5435371 3' - 412 26 2 67.81 ACTTTAAAATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGTCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAA:1 - chr2L 16995509 3' + roo 319 2 76.71 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTC:1 - chr3R 17944036 3' + P-element 2839 1 37.84 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATA:1 + chr3R 24734907 3' - jockey 4758 1 81.51 GAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATACATGTTTAGAACAGCTTCAATAACAGTCAATTAGGCCGCTTGTTTTCAGCATCTATAAACATTAATTAAAAC:1 + chr3L 15633627 3' + 412 373 2 52.74 ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGA:1 - chr2L 19940041 3' + mdg1 7372 2 76.71 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGCCCTAAGAAATTGCTAGTTCTGCGTCCGC:1 + chr2R 22112743 3' + 412 7492 2 56.16 GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGATGTCTGGTTTGTTAGTCATGC:1 - chr3R 21843744 3' - blood 7070 2 56.16 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTTGGTTTTGATAGTACA:1 - 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chr3R 14546463 3' + pogo 2058 1 56.16 AGCGCTCTTCGCTCTCTCGCCCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTGACTCACTGAAATGAAGTTTTCTTTCATTT:1 - chr2R 4262572 3' - 1360 109 1 73.97 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTT:1 - chr2L 16537555 3' - Transpac 5000 2 73.29 GCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAGCTTCGTGAGCAGCTA:2 + chr3R 2689473 3' + diver2 4474 1 75.17 ATTTAATAACAATAATAATAACTATTACCAATAACTTTTTAAGTGTTGGGGTGACATTTTTGTATGGATTGTGGTCGTCAGAAATTGGCAAGATAAATATTGAAACGGAAAAAGAATAAATTGACTTTTGGGAGGTTTGTAGGCGT:1 + chr2L 22805229 3' + mdg1 7053 2 53.42 AACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTTCCTGCCGTGCTTTCCAAAGCGCCAAGCAATAGT:1 + chr3R 24166630 3' + opus 7279 2 76.22 CTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAGTATGA:1 + chr2L 13328532 3' - BS 24 1 63.83 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCTCACATTTTTCTTCACCTGACTTT:1 - chr3L 10023947 3' - transib2 43 1 56.85 TAAACATTCCACTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCAAGTCTCTTGGTACTCTACGCTGCGGTCGGCGCACTCTAGTATTGTGCCTTATTTTGACTTGATTTTATCCCGATTTGGCCAATAAAAAAAAACTTTTTAGTGTTGG:1 + chrX 15746179 3' + jockey2 3258 1 73.29 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTT:1 + chr2L 11476383 3' - pogo 44 1 54.11 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAACTTGTAGCTTTATAAAACTATTCAATTTGAAAACGTCTATAATCTGGGCAACAGTTTTACTAACTTG:1 + chr2L 20044700 3' - roo 8664 1 78.77 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATTGTACATGCA:1 + chr2L 19940158 3' - mdg1 19 2 73.29 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACNGNATTTCGTAATCCATATTTGCTTATCTCCACTGGCTTCGTTTTATAATTTTCCATTTCAATTTAGATTGGCTTTGACTGCGCTGCACTAAT:1 - chrX 7042595 3' - roo 31 2 61.64 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACT:1 + chr3R 23415969 3' - jockey 4846 1 76.03 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGTTAACACGTACACATTTATATATTAATACACACATTTTCAATATTCTCGTATAT:1 - chr2L 7774902 3' - I-element 13 1 76.55 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGGTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGC:1 + chr3L 8249445 3' - HMS-Beagle 6840 2 68.93 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAAGCTAACCAAGCTAAC:1 - chrX 8208278 3' - roo 8693 2 68.49 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCATTAGGAAGTGGTTCGCA:1 - chr3R 13685332 3' - 412 7104 2 50.68 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGGTGATGTAAAAACATACGTTGATTAGCTGACTTGTTTTATTGAACTTCATTATATATTTTATATATGTATATACTTTATACAATTGTGCACTTCAACATTCGCAG:1 - chr3R 27397959 3' - roo 8680 2 48.63 CAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCAGAAACTTTATTAGGGAAATAATTAAATATTTAAATATTTAAATTTTGGAA:1 + chr2L 16537630 3' + Transpac 242 2 65.75 ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCT:1 - chr3R 29283192 3' + hopper 1344 1 65.07 GCTCTCCCGAAATACAAGTATTGTTAAAATACTCAGGCTTCTCTTTAATCCAATTTACATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGATATCCGAATCATGTTAGGGTATAGTTGAGGTAAAAAAAAAACCCACGCCAATTCCGACGAGCAT:1 - chr2R 3119866 3' + 297 213 2 62.33 TATCATTCTACCCGCCTAAAAAGTTAGAACCTTCGCGTCTACTAACATATTACTTTTCGCCCCGATATTCACTATCCTGTGGCTACCCCAATCGAAACTTGGGGTCTGGGCGGGGGCGCCCATTATCCTGCTGCATAATAATGCTA:1 + chrX 19597249 3' - Gypsy12A_LTR 496 1 80.14 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATTATGATCATCATATATTATAAGGTTGTAGCGGACAATCGGTTCATGTTAAAACGGGACCAACAACGAACTTTTGTTTAATGTTTGGTAATTA:1 - chrX 13367342 3' + HMS-Beagle 220 2 67.81 GCTCCCTCCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGTAGTCTCCGCTGCGCTTAGGATAGCCCAACTAATTAGAATAATTGGAACACTAGCCATCCCGGCTG:1 - chr3L 20067290 3' + GATE 48 2 74.55 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTAATGAAATCTTTTCATTTTGAATATACATACATATATTGAAGATTGACTCATTAATATTTTAGAAAATCGGTTATCGCGGTGCTTGCACAAAAG:1 + chr2R 14484246 3' + pogo 2080 1 74.48 TTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATATATATATACAGAAGTATTAAACACTTATTACAGATGCCATAT:1 + chr3L 2668934 3' - Bari1 74 1 73.97 AAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGCCACTCGATGTCAATATCAATTCACTCACTTTAGCTTTTTGGG:1 - chr2R 11664601 3' + P-element 2708 1 30.82 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGCGGAGAAGAGAGGGAAAAGCCAGTGGCAAAGCGCATCCATGGACGGCACACACACACACACACACGCATTGGCAAGATGAGAAGAGTG:1 + chrX 14825428 3' + P-element 2881 2 78.08 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGCGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGT:1 - chr3R 17494927 3' - hobo 63 1 72.03 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTATACCCAGGAATCGCACAAATACAAAGGCATACTGGGCCCAAACATATTCTTCCAAAACTTCAAGACCTTAAAAAAATTTTG:1 - chr2L 20550931 3' - 412 7090 2 57.53 TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGAATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTGTGTTCTGCTTGGCG:1 - chr3L 9522030 3' + opus 7452 2 58.90 GGTTTAAAAACAAAATGTACATAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACC:1 - chr2L 18112497 3' + transib2 2758 1 61.64 TAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGATATGTCCATAAGG:1 + chr3R 7042126 3' - Stalker2 14 2 76.03 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACGTCATACGATAAATTGCAATTGCTATCATTTCGCATTCCTCAATATGAGACATTAGTAATTCAACAAGGCAAATATAAAAGAGCTGACCAAATATTG:1 + chr3R 15102376 3' - roo 22 2 70.34 AAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATACAGTCTGTGATCCGATGTCTCGGGTCGGGTGATTGCCCTCTTTGCCGGTTGCTGCGGTTCTTCTCCGTCCGCTGAATGAGTCCCCA:1 - chr2L 17747599 3' + jockey 4894 1 60.96 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTATTTCACTGTCAGGCAACAAACAAACGATGATAATTTCATCGTTTGCCATAAAAGTGACTAAAAGTTAAAGGCTACGTAATAAATTAAACAAAGGCTGACGACATTCGCCTATT:1 - chr2R 17400225 3' - pogo 2 1 82.19 CAATAAAAAATTTAATAAAATAAGCCCCCAAATTATTAGATAATTGATAACTTACCCATAAATCCAAGTGGACCAAAGGGCAGCAGGGGAAATTTGGCGTGAGCATGACCTAGAGCGTGCATTTCTTCGCGATCAGCTGCCATGAG:1 - chr2L 11368918 3' + transib1 1933 1 64.38 CTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGCTAGTTTTGGATTAGCACAGGATTTAGATAGTCTTC:1 - chr2R 8596946 3' + pogo 2019 1 73.79 ATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACACGTAATTTAAGTACAGGGGCCTTAGTCTTATTAACTACTTAAATGCGGTGACTTTGACTGCAAATAAGGGGCTAAACAATAAACAACATTTTATTGACATAGCGATATTAC:1 + chr4 637828 3' + roo 106 2 64.83 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTNATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTNACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGGAACA:1 - chr2L 13675859 3' + flea 4974 2 63.01 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTAATTTATTATTAATTTATTTTCAACGATTATACTAAAATAAAAAGCATTCTGTGTAAATCAAGCAATTTATTTTCTAGATCTTTTCACGTAGAA:1 + chr3L 22041200 3' + roo 9045 1 65.75 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTGA:1 + chr2L 8895338 3' + 412 445 2 52.05 GTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGT:1 - chr3L 8273922 3' - hobo 71 1 66.44 AGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCGGCACCATCCTGTCCAGCATACTCGCCAATGGCCACGCACTCCTGACTGTGC:1 - chrX 5306071 3' + HMS-Beagle 166 2 63.70 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCAATTTTTGCGATTCTGT:1 + chr3R 13684805 3' - 412 34 2 59.59 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGT:1 + chr2R 7769841 3' + Transpac 250 2 63.01 CTATGTGGTTATGTATGTGCGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCA:1 - chr3R 19996167 3' - Quasimodo 47 2 54.11 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTG:1 + chr3L 15273324 3' + pogo 2068 1 62.31 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTCTGTCGGGTATCGCATGTTGCCAAATGTATCTTCG:1 + chr2R 6514305 3' - roo 84 2 77.40 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGACTTTTACATTTAAGAATATTCTCTTTATGAGTCATAAATTACTCC:1 - chr2L 1232598 3' + roo 9032 1 57.53 ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCACCACATGTGGAGAA:1 - chr3R 4530691 3' + copia 186 2 63.01 GATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAATCATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCATTTATGCTCGATTATTACCGTAGACTTATTGGGTCCTGCGAAGCGTTCTAAATG:1 - chrX 4025307 3' + roo 81 2 61.64 GCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAATAAGAGCAAGGATTGTTTTTTGAAGGCCATCGACTGTTACGAAAACAACAAGTCATGGTTGCATGCA:1 - chr3R 10121171 3' + gypsy12 10168 2 52.10 GCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTNAATCATACTTAATGCTGTGTGTATGTTGCACTTAACCGCGAGAGGGGCATATGCCACAGTTGGGTTGCAAGGAGTGCCGACATGGATAT:1 - chrX 18504732 3' + G2 2902 1 52.74 ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATA:1 - chr2L 1729758 3' - Transpac 4988 2 63.70 AATAAATATAAAAATACAATTAAATAGGGAAAACAACATAAGTATGCAGTGCAGAACAAACAAAACATATGGTTTAAGTATCCAATGAAGTAATAAAGATGATTGCACTTAAACTTATCGTTGTTGCATTGTTAATAAATTGGGCC:2 - chr2L 1535126 3' + Stalker4 7042 4 80.14 GAAGATCATACTCGATAACCANTGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATATTTAGGATTAGGATGGACCTAAGGATCTAGGGTGACATTTTTGGATGGAAAGAGAGGGAAGAGGATCGCGGTAGCAG:1 - chrX 21368604 3' - mdg1 215 2 70.55 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGAAGTTTTTAAAAGACGAGG:1 + chr2R 5531236 3' - 1360 70 1 69.18 ACACACACACATACACATATACATATGCATGGAACTGGGTGATACGGGCTCCCTTTTAACCCATCACTGTCCATCCCAAGCCAAGCGGAAAAAAGGCTTGCTGCACGATAATGAGGACTGGGAAAAGATCCACTAAACGCGCCACT:1 + chrX 16286912 3' + accord 7031 2 74.66 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAATATATTCCAAACTATGATACTTCACATAAATATC:1 - chr3R 21938184 3' - roo 8748 2 79.45 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTT:1 - chr2L 22340097 3' - Doc 51 1 52.27 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACATACGTAGTTCTGATAACGCCTAAAGCTAGGCAATTATGAGCGGCAAACCAGGTAGT:1 + chr2R 6089200 3' - 1360 17 1 73.97 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCG:1 + chr3L 15273304 3' + pogo 2051 1 62.99 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTGAAAAAAGTAAACAGTGACAAATACTGATATAAAAATCGACAAAA:1 + chr2L 13293031 3' - copia 4911 2 54.11 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGTCCTGTTTTTTGTTTG:1 + chr3R 20345557 3' - blood 45 2 52.05 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACACGCCTTTTTTCGGCTTACGGCGGCGG:1 - chrX 14825301 3' - P-element 49 1 30.00 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGAT:1 + chr3L 15273306 3' + pogo 2034 1 66.44 TCTCCAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGGTTTTGATTATTCTTTCTAGGCCG:1 - chr3L 25272529 3' - 1360 89 1 51.37 AGGATCAATAGCCGAGACGATATGGAAATGTCCGTCTGTCGGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGCTAGATTTTAACCGATCATTTCCTTCATTTCGTCGCAGCCATTACACAATGCCACAATGCCGAG:1 + chr3R 13569140 3' + INE-1 96 1 59.59 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACACACGATGACGACGTGCAGTTTGACTGCACCGATGGGCTTTTGACCAGA:1 + chr2L 16382605 3' + hobo 2914 1 66.18 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTCA:1 - chr2R 5070906 3' - Tirant 8107 1 34.25 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAAAATGGGACCAATAAAAACCAATTTCAAT:1 - chrX 4469508 3' + roo 9032 1 51.37 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGTGGAAATGGAAATGCCGA:1 + chr2R 11663875 3' + P-element 2786 1 17.12 AAACGTGTCCTACTACCACGGATTAGTCTGCCCTTTCTTTCGGGAACCAATGTGGAGTGGAAACTGCGGCGGGCAGAGGTGACTGCCAGCTGTTTACTCGTTTCTGCTGCGGCTGCACTTCACTTTGATTTATCAATAAAAACCAA:1 + chr3L 22437857 3' + aurora-element 17 1 67.81 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTTATGGTCGACACTTGACAGA:1 - chr3L 13888855 3' - 412 20 2 71.92 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTCAATT:1 - chr3L 20765125 3' - 297 6612 2 61.65 GGTTACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGCAGGCAAATAATAACGTCG:1 - chrX 7848201 3' + flea 4941 1 68.12 GAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCGCTTGTGTTTACCCAGAAATGTGGTTGAAATATGAGAGAATTAGAGAGAGCGTGAGTGATACGGTGAGGGAGAAAAGGGAGCGCACTAGCAAAGTAGTAAAAATAATCAATAATTT:1 + chr2L 16286992 3' - HMS-Beagle2 76 2 52.74 TTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTGCGAAAACTTG:1 + chr2R 22774605 3' - I-element 67 1 61.64 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATNCTGTATTACAATATTAATGGGAACTAAATAATGGCTATACTATATTACACACTATATTGCACTTTTCCACATCCAANCTTACATATGGCGTGTAGACTTTGACCCAACGTGCTGGCTTATC:1 + chrX 5721979 3' + pogo 2094 1 77.40 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGCGGAATGCCGAATATTCATTATACATGTGATTTTCCCGCGAGCAGCAA:1 + chr2R 5938344 3' - Doc 76 1 75.97 AGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATA:1 - chr3R 25554216 3' - micropia 5082 4 56.85 GTGTGAATAGAAAATTTGTACGTTTTGTAATTTGTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACA:1 - chr2L 7336139 3' + pogo 74 1 57.53 ACCTCCGCGTGCTCTACAGGCCTTGCCCCTTCTTCTCTCCTCCTCCACCTCCGCTCGATCTTTATAGCCAGTTCCGGCGAACTGTCTTCAGCTGCTGCTCCTCCTCCTC:1 - chr3L 1349493 3' - Rt1b 5017 1 76.15 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCCAACCGCATTTGTATGTGAATGTGTGTGTGTTTGGGTGTGTGTGTGGGACGAACATGGCCATTCGGCAAAAGCCAAGTTGCTCATGGGTATTAGCTTTGGTTTT:1 - chr3R 24443969 3' + hobo 2937 1 78.63 AAATAAAGATAAAATGACCAGCTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATTAATCATGTAAAAATTATAATGTACTTTAAATTTAATAAGTATATGGCAAGTTAATTGTAAT:1 + chr3R 12538162 3' + mdg1 7403 2 55.48 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTTAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTTATTCCCTAAGGATT:1 - chr3R 5518307 3' - Transpac 4983 2 63.01 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGAAAGTGTTGACTAGCACTGTCCAACATGAAAAA:1 - chrX 16219183 3' - roo 8716 2 54.79 TTTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATAGTTTAAATTGAAAAGAAAAAAAGTTAACTAAAAGATTATGACAAATTAATAAAAAACTCCCCTCCCCTCCGCGACGCAAAGTGTCTCATTTAATCCT:1 + chrX 1764050 3' - Tc1-2 1449 1 71.92 ACTTTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTATGTTCAAGAACGAGAAGGAGCTGATCTTTTATCGTATCTATACGCGACTCA:1 + chr2R 22428778 3' - Burdock 6084 1 65.07 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTTTTGGGCATATTTCCCAAGTCAAAGTTG:1 - chrX 4240194 3' - jockey 4709 1 54.11 AATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGAAACCGTTCATTTAAATAAACATCCAGT:1 + chr2L 20505678 3' + accord2 83 2 80.14 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCATTTTGCTCAGTTCGCCAATAAAGACGCT:1 - chr3L 739126 3' - P-element 9 2 75.41 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTCGTAGGCCTCGATCATCGACTCATGTTTGTTGGGCAGAACGAAGTCGACTA:1 - chr3R 5574910 3' - blood 7038 2 67.12 ATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGATTCTTCTATTGGCACCATGCGATTCTTGTTTTGTATTGCCTTAGTGGGTGGTGGCTGCTGACTGATGGCTGGTGACTACCAAAACAATTATTCTTATCTAGGGTATTTGGCTGCCATTG:1 + chr4 851578 3' + 1360 263 1 53.10 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGA:1 - chrX 8208332 3' - roo 8747 2 75.34 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCCAAAACTGTTGGCTCTGCGGCTTTTGCCGGCGGTT:1 + chrX 12365396 3' - hobo 2710 1 77.27 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTAACATTGATTGAGAAGCGCGGTCACATTGCTTGAACAGA:1 - chrX 13667793 3' - hobo 81 1 71.92 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGA:1 - chr3R 5977735 3' - copia 4935 2 62.07 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCTACTTTATTCGATTTG:1 + chr3L 11529565 3' + opus 7456 2 50.68 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCCTACCCTTTTGCCCTATG:1 + chr3R 10433293 3' - 412 69 2 69.18 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCCAACTTAACTCCGCTGAACTCGGGGCGACAGGACACGAAATCCTTTAA:1 + chr3R 19725489 3' - hobo 23 1 69.86 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCAC:1 - chr3L 21913332 3' + 297 6960 2 66.35 ACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCGGTAATATAAGACAGAGAATGAGAGGCAGTCATTATAAATTCAAGCTTGTTTTCAGCGGTCATTTTTTT:1 - chrX 22383338 3' - Doc 4254 1 52.74 GAGATCAGAAACTTTGCTATTAAACAAATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTTATTTCGCTTAAATTGGATTGCATATAACCTAGTTACAACGGTAATTAAGCCCAATTATAATGCACAGCTACACTGTGAGAATAGAAATAT:1 - chrX 7048432 3' + Tc3 1601 1 67.12 GTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCGT:1 - chr3R 12181984 3' - mdg3 5321 2 61.64 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACAAATAAACGTAGGATTTAT:1 - chr3R 18204307 3' - hobo 21 1 71.23 ACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTTCGCTGTGCTCCGTCATTATGGCCAGTCGTAAACATTGATGACAGTGGGGCTGCA:1 + chrX 7015965 3' - roo 149 2 64.08 CGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAATCCTT:1 - chr3L 8249336 3' + HMS-Beagle 218 2 66.44 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTAAATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAA:1 - chr4 868661 3' - roo 86 2 78.08 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAAGGTAGAGATGCTACCGAAACAGC:1 + chrX 19583362 3' + roo 9047 1 67.81 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCGGTTGTTGCTTATTTATTTAT:1 + chrX 2104812 3' + roo 9034 1 59.59 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTAC:1 - chr3L 21913336 3' + 297 333 2 65.07 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTTCGCCTAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAGTATATATGTACATGTTTAAGACGTATGT:1 - chrX 10694239 3' - Transpac 4947 2 66.44 GGCGATCACTTCACTCAAAACAACCGAGTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCC:1 - chr2L 13697635 3' - F-element 67 1 70.00 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGG:1 + chr2L 3911964 3' - roo 31 2 64.38 ATCAGCGGTTTGCATTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTAGGAGATTATGACTTGGAATGAAAATTGAAGTTAATCCAGAAATAAGTTTGTTTTCTTCATCATTTCTGGGCTGTAA:1 - chr2L 12255752 3' - diver2 4626 2 50.68 GAGTGAACCAATATTTTGCGGACTGCCGCTGTCATGGGAAGCCATGGATATTTGTCAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chrX 10664376 3' + hopper2 359 1 60.96 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCGGAGCATTG:1 - chr3R 4530656 3' + copia 221 1 62.33 TGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAATCGCTCGTTTTTAAAGTGCAAATTTAATTTCCTCTAGCTGTAGGATGAG:1 - chr3L 18567748 3' - Tirant 469 1 65.75 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGGGTATCTGATAGGCGAAC:1 - chr2R 17649227 3' - Doc 76 1 64.38 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATAATCCAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTTTTTTCAAATGAATTTGCGGGAAAATCCCGGCTGGTAAGACC:1 - chr2R 18618446 3' - jockey 4709 1 57.53 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTTTGCCAATGCCATGCACGTACGCGGATGTCCGTGCTCAATACCCATC:1 + chr3L 7102452 3' - I-element 14 1 71.92 ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGCACCCTTCCACAGTTTATAAACCAAATTCAATTC:1 + chr2R 611226 3' + 297 337 2 59.59 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAA:1 - chr3R 12181994 3' - mdg3 79 2 68.49 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTGTTTACTCTACAAGTAACGCGTTTATTGAACACATTTTTCAAAAACGATCGTCGCAGATGGAAAGAAAAA:1 - chr4 407123 3' - jockey 59 1 50.34 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCACAAGCACCAAGCTGGAA:1 - chr2R 17695987 3' - rover 6971 2 71.03 CGTCTCCATGGGTCGGGTTACCGACTTCTCTGGTGGAGGATCTCGAAAGTCGGTGTCACCTCTTGTACGGGTCGTTGCGCTCAGACACTCTGTGCAGCACTACGAAGGCATTCTAATGATATATGATGCATACATGTATATCGGAC:1 + chr3L 27980690 3' - Rt1b 473 1 41.78 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAG:1 + chr2R 10541751 3' + P-element 2833 1 48.63 GGAATTGTCAGAAATGTTTTCTGCATCGCGGGGAACAATTTATAACGTAATTAATCGCACAAAAACGCGGGCAGATTGGAATCAAAATTTTGGAGAACTTGCGTGGAGGAACTAATATAATAACACTTTTAGCCGTTGTCAAGGAC:1 + chr3L 23102533 3' + S2 477 1 58.90 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTG:1 + chr3R 19725428 3' - hobo 3 1 63.08 GCTGAGTAACGGGTATCCAATAGTCGGGGAAGTCGAATATTGTATTCTCTATTGTTTTGTTTTATAGAATTACAAATTTTTGTATGCTTTTTGTTTGGTTTGTTAAAAACTATGTCACTTAACTTTGGAATTGCTTTTAGTTATCA:1 + chr3L 3956921 3' + INE-1 546 1 65.07 ATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGATGGTATATAAGGGCTTTTT:1 + chr3L 19350059 3' - 1360 3211 1 63.70 GTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGGCTTCCCGAACTGAAGCATAGTAGTATTTTTACTACATTTCTTTGATTGGAGTTCTGCTTTCACCTGCGAAACAATTAT:1 - chr2L 21880456 3' + roo 479 1 45.52 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTAGTATAGCTGGATTTCTTTTCCAATTCTAGGGCATCTCTCTTTCTCTCTCTGAGTTTCCACTTTGCTATCCTTCGGTTTTCCCTC:1 - chr2L 5789592 3' - FB 36 1 58.22 ATTTCATTACATTTAATAATACAACCAATTAAATTCTAACTAACTCAATCAAACATCACTCAATTTGTTTCTGTGTAGCTGCTGTTGCTTTTGCTGTTGCTGCTGCTGGTTGCTGTTGCACTAGTGGATGCGTTTTGATTTACTTT:1 - chr2L 16558888 3' - S-element 384 1 46.58 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTA:1 - chrX 20233785 3' - pogo 60 1 60.27 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAG:1 + chr3L 9522138 3' - opus 49 4 59.72 CTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTGGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAG:1 + chrX 8208448 3' + roo 9047 1 68.49 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATCAAAAAGTGCTCTAGTCAATTATTC:1 + chr2R 18767265 3' + pogo 2064 1 58.27 AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCGATGTTTCGGCTTAAAGTGTAAAGTGTTCCCGGTGCGCTAAGGGAC:1 - chrX 1758958 3' + Tabor 410 2 66.44 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTTCGAAAGGAGGTTGTAGAAGAGCTCTGTCTATTTGAAATTGGATGAGGAATTTCCTCATTTTCCTGAGCTCTCCTAGAGTTTCCAAATCCCGAAAT:1 + chr3R 30537751 3' + roo 9047 1 54.11 GTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAA:1 + chr2L 16382555 3' + hobo 2854 1 76.03 GTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAATTTGACATGTCTTTATATAAGAATATTTGTCCAATCGTTCATTCAATGGTTTTACACAATTGCATTGGACCACCACTCCTAGTTGCATCTGAACCATTCCCTGCTCC:1 - chr3R 10355338 3' + 1360 180 1 52.05 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGCTAGTTTTGGATTAGCACAGGATTTAGATAGTCTTCATTATATAAAACATTCAGTTTAATTCTTAACTTTTCCATCATTTTTAATATTTACTA:1 - chr2R 8596889 3' + pogo 2076 1 64.38 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAG:1 + chr3L 13888998 3' + 412 444 2 54.81 CGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCCGAA:1 + chrX 22576492 3' - Burdock 6323 2 55.17 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCACTAGTTACATTCTCTGGCGCTTCCTTACTGTCCATTTCTGCCCATTTCATTTCATTTCATTTCATTTAGCGTAATACGCATTTGGCTCTGCGGTTGTT:1 + chr3R 5495327 3' + roo 388 2 71.23 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAGGCAAC:1 + chr3L 22435234 3' + opus 471 2 64.03 ACAGCAACACTTAGTGGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAAATTTTCCCATTATTCTCACGGTTCACAAAATTGCACAGGC:1 + chr2R 19068329 3' + blood 7056 2 54.79 TTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATTTGGGGGGGGTTGCTTTTTGTTGTTGGACGTGTG:1 - chr3R 32065801 3' + 1360 3288 1 74.81 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTTCGCCTAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAGTATATATGTACATGTTTAAGACGTATGTACATA:1 - chrX 10694234 3' - Transpac 4942 2 69.86 GAACGGGGAACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCTCTTTCCGCCGTGAACCTGGAGCAGTGCATTAGCACATGTTCTGCTATTTCTTCATCGCGGAGATTGCTGAAAGGTAAGTGGAAATGCTTCAGCGAATCTGATTGTGAGTATT:1 - chrX 7111417 3' - Rt1b 4679 1 60.27 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGAGGCGCATATTTCTGCGCGTGGCATTGTGTTGTATAATATTTTAACTACACTTTGAAATGTTACGTGAGTG:1 + chr3L 4774454 3' - Quasimodo 39 4 52.00 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGTAGCCATTC:1 - chr3L 21913308 3' + 297 362 2 64.14 TATTAGTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATGCAAGGATGCGTTTTTTGACAGCACCATGTGTGCTGACACCTCTGAAAACCGCCGTTCATTTGATTTAAATTACAAATTCTTGA:1 + chr3L 12778543 3' + 1360 259 1 57.53 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTG:1 + chr2L 19940132 3' - mdg1 7072 2 60.00 TCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGG:1 - chr2R 5037706 3' - Stalker2 87 2 74.66 TAAACATAAACATAGCAACAANGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTATACCCAGGAATCGCACAAATACAAAGGCATACTGGGCCCAAACATATTCTT:1 - chr2L 20550961 3' - 412 67 2 62.33 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATAAGAAATAGGCCGCTTTCAACTGATGCGGAAATAACGCGTC:1 - chr3L 8157972 3' - flea 4787 2 64.83 CCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATATGTATGTAAAACATTTTTTAACGAATAGCTTAAA:1 + chr3R 11758044 3' - invader4 2842 2 78.77 GCTGCATCTTTAAGTTACCTGCATTGAGGGATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAGAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTG:1 + chr3L 15273324 3' + pogo 2052 1 54.11 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGTGTCTGTGTGTTTGCGCTGTTT:1 + chr2R 21475272 3' + P-element 2805 1 23.29 TACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCGGACAGCCAGAAATCCAGACGGACACACATTGTTTGCATACCTTTTTAAATGGTTTTTCAACTTTCGGCTCTTGTTGTGCCAACCAGC:1 - chr2R 16367324 3' + hopper 1383 1 60.96 GAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGGCCTTGTGGCACAGCGTGTCG:1 + chr3R 5972409 3' - Doc 277 1 63.01 ATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATTCGC:1 + chr3R 8381793 3' + Tirant 8429 2 72.41 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGAT:1 - chr2R 14484086 3' - pogo 30 1 56.82 CGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTAGGTTTCACCAATTAGCTGCATTAATGAATCAATACAGCTATTTCCTCGTGATCGATAAGAATATAG:1 + chr2L 6367424 3' + diver 6085 2 44.92 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAG:1 - chr3L 13888893 3' - 412 7111 2 56.16 GTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCA:1 + chr3R 29283266 3' - hopper 78 1 69.18 TAACGCATAAAAAAAAATTCATCCGAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACT:1 + chr3R 29283275 3' - hopper 69 1 63.01 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCG:1 + chr2L 1729819 3' + Transpac 5187 2 65.69 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTACTTACTAGACTTAAGAAACACTTTAAAAGCTTCGATGATAAAAAG:1 - chr2R 7769749 3' - Transpac 72 2 67.12 AATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAG:1 + chr3R 10030798 3' - BS 5058 1 50.68 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCCCATCTGCCACCTCAGCTCTGGGCCCTTAACCCTCCGCATC:1 + chr3R 7600565 3' + hopper 1388 1 56.99 GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGG:1 - chr2R 8258294 3' - jockey 91 1 76.03 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAA:1 + chr3R 20983911 3' - pogo 47 1 53.42 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAGTATAAATAACTCTTTGATGGGCAGCCGGTCGTGAGCTGGCCGGCGACTTTAGTTTGTTTAGTTTGCTGGCCATTTGTACAAAACACCTTT:1 - chr3R 13453273 3' + 412 7515 2 63.70 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTAAATAATAAG:1 - chr2L 13468217 3' - roo 8716 2 54.86 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTGTTGTTGCAAGCCGATTTTGTTTTGATTCG:1 - chr3R 13684652 3' + 412 7511 2 60.96 ATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATGACGGACACTCATAATTGATACAGGATCTTGAAGTAGTTTCGAAACTATTTTTCTCTGTGTAAAAGTTTGGCTGCCCAAAACGCACTCACAC:1 - chr3R 13793998 3' + Doc3-element 4422 1 62.33 ACAGAGGCACAACACAGAGGCAGACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATATGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATGGTGGGTAGCTGGCGCAAGAACACGCAGTTGGATGTCTTGTTGACAGCCTGGCC:1 - chr2R 16291953 3' - Stalker2 451 1 61.64 TGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGAATGTTCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCA:1 - chr2R 17696024 3' - rover 58 2 58.22 CCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTATGTGTCATTCCCTTGTACACTTTTGCTTTTCATGAGACATTAGTTGTCGCTTGTTTT:1 - chr3R 21716145 3' + 297 6550 2 60.96 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGAT:1 + chr3R 9551017 3' + P-element 2850 1 60.27 AAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGAAAAAGGGGAAGAACTGCGGAAAAAACACACACATAATAC:1 - chrX 5608387 3' - roo 344 2 72.60 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTC:1 - chr2L 3911853 3' + roo 327 2 71.92 ATTTATATTCTTGATCAGGATCGCTAGCGTAGTCAATCTGGTAATGCCCGTATGTCTGTCCGTATGAGCGCAGGATCACCTGAACTATAGAAGCTATTTTGGAAGATGTTTTACCTTGTAAGCGGCACTGCCAACTGTTCCCCCTA:1 + chr2R 12750826 3' + INE-1 80 1 64.38 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCTCACATTTTTCTTCACCTGACTTTTCA:1 - chr3L 10023944 3' - transib2 31 1 62.77 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTT:1 - chr3L 12125269 3' + roo 9019 2 56.55 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACGGCTGGCCAAAAATTTGAAGTCAGGCGCAGCCCT:1 - chr2L 19939970 3' + mdg1 405 2 70.55 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATT:1 - chr3R 29283221 3' + hopper 1350 1 80.18 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGTC:1 + chr3L 8249439 3' - HMS-Beagle 6838 2 74.74 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCGGCATTCCTACTTTGATATTTTTTTTCCCAGAACTAATCAGAGTTTGTTAATCAAACTTGTGAAGCTTTTCACGAATGATATGATATTTGAAAAATGTTC:1 - chr2L 17136046 3' - hobo 22 1 66.44 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTAACGGCG:1 + chr3R 17766842 3' - HMS-Beagle2 40 2 56.16 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGACAAGGAATAAGGGGGCAGAAAGTTTTATTTTAAACT:1 - chr3R 19246721 3' - jockey 4759 1 77.40 CCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTC:1 + chr3R 8867103 3' - Max-element 8290 2 55.48 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGCATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGC:1 + chrX 21947739 3' - mdg1 7092 2 53.42 GAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGCATTTAAACGAATTGAAATACTAAGCGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGG:1 + chr2R 8597031 3' - pogo 11 1 64.29 TGAGATTTCGAAGTTCATACGGAAAAACGGACACGGCTAGATCGACTCGACTATTGATTCTGATCGAGAATATATATACTTTCTATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTCCCTGTTACTATGTTCTCCACAGATGCAAAACGAGCATTA:1 - chr3L 24752798 3' - INE-1 135 1 74.66 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGCAACGAA:1 - chrX 19887074 3' + P-element 2835 1 34.78 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGAAA:1 + chr2R 21199732 3' - jockey 4768 1 51.37 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGTAGTCGG:1 + chr2L 15549951 3' - hobo 63 1 61.64 ATATCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGAGTATCAAATCAGAAATGTGAAAACCATGGGATGAAGACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 6615494 3' + roo 9002 2 65.07 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTTTAATTAAATA:1 - chr2L 19698035 3' + roo 9053 2 68.49 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTGCGTTTGATCTTCTGGGCGCGGAAGTGCTACCTATG:1 + chrX 4469625 3' - roo 8722 2 58.22 AATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAGAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAA:1 - chr2R 17609787 3' + mdg3 210 2 68.24 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCACCTTTTGAGCGTCAAT:1 - chr3L 17757846 3' - Tirant 8112 2 38.36 GAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAATATCAT:1 - chr3R 9657713 3' - jockey 4709 1 54.79 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAATATCTAATAGTAATATTTTATAAATAATACTATTTGAACAAACAATTTATCCTAAAATTTCTGAAAATGTACCTTCTACATTTGA:1 + chrX 12105356 3' - 412 34 2 62.33 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTTATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGCAGTTAGATGGCTGCGCATGCGCAGTTTGG:1 - chr2L 10032582 3' - jockey 4839 1 74.63 ATCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGATCCTTGTGCTCCCACCATACTCACTTCCTCAACGTGGCCACAAAGCTGTAGATGTAGA:1 - chr3L 9606470 3' - R1A1-element 5325 1 58.45 GCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCATGTATGAAAAACTTAGCTCAAAACACAACGTTTGTTCTGTTGAAAAACGTTTTTGTCTGGGATTAGTG:1 - 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chr2L 3911834 3' + roo 346 2 58.90 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAATT:1 - chr3L 17746260 3' + roo 351 2 54.79 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAAAAATCCGGAAATTTACGGACTATGCGAAAAGTTACTTCTTTGCGCCC:1 + chr3L 13546694 3' - hobo 18 1 71.92 CAGGATCAGTAGCCGAGTCGATCTGGCCGTGTCCGTCTGTCTGTGCCATCAGCCGCTATGTGAGCTGGTGATGGCATTAATGCTCCGGTATGGATCCTTTGCCTAATGACCACCACCAACACGCCACCTGTCGTTCGGTTCCTGCG:1 + chrX 16820851 3' + INE-1 95 1 64.38 CTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGGTTCCATGTCGAAACT:1 - chr2R 17609742 3' + mdg3 5445 2 52.05 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTC:1 + chr3R 20345571 3' - blood 31 2 63.01 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTC:1 + chr3R 20983916 3' - pogo 36 1 59.29 GGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGGGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAAGTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGC:1 + chr3L 8249442 3' - HMS-Beagle 89 2 78.62 TTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTTGAGATGTGTGTCATGTGTGAAATTGTATATGTGCATACATTCC:1 + chr2L 426945 3' - jockey 4911 1 69.86 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACCCCTTTTTTCCCTTCTGTTTCGTAGCTCAGAGCCGAGAAAACTACGCAAAACATTTTGTAAATGAATTTTATTTGTCGAG:2 - chr3R 30537593 3' - roo 8706 2 52.74 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTTTTAAACATAATATGACATTCTTACCCATACTTTAATGCGAAATACATACGCTCTTCTGTTTGCTTGATTAGTATA:1 - chr2L 19731911 3' + roo 9028 1 55.48 ATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGCATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTTT:1 + chrX 21947758 3' - mdg1 27 2 67.46 TATTGAGGTCTTTATGAAGTGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGT:1 - chr3L 23797684 3' - Helena 1189 1 52.05 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACGAATTGGCGGTGATCAGATCAAAATTTCGACTTTGAATAATTAAGAAGTAATAAGCTTAAATCACAA:1 - chr3L 18075537 3' - pogo 51 1 54.11 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTT:2 + chr2R 22112710 3' + 412 414 2 77.54 CTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACG:1 + chr2L 6385889 3' + invader4 3021 2 66.44 CAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCG:1 - chr3R 5170984 3' - F-element 95 1 76.71 CTACCACCATAGCAAGTAGCCCCTGACAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGATTAAATGGTAATTTCCCTACAAGTTCCATAGCTAAAATTCTTAGCCACCAG:1 - chr3R 26100179 3' + R1A1-element 300 1 59.57 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTGGCAAACAATTGTCTTGTTGATTAGGAAT:1 - chrX 5721797 3' - pogo 37 1 56.85 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTTCGGCTGAAGGTGCAATGAAGCCGTACGATGGAGAATGGAAATACGCCTGTTAAGT:1 + chr2R 13695772 3' - blood 7025 2 75.34 CGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACGCACACATGTCTGCCTCAATTGCTTCCGCGTACATGGGGCATACGCGAATTGGCAACGGCCTTT:1 + chr3L 15294778 3' + 17.6 61 1 56.16 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTAAAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACAT:2 - chr3R 4530670 3' + copia 5076 2 52.74 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCGGCGGGGTGCCGTCTCCGCCTGCTGCAGCTAAATGCCAAAATGGCAATTTGCTAAAGTTTTCCC:1 + chr2R 18551828 3' - I-element 22 1 71.23 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTT:1 - chr3L 15389547 3' - I-element 70 1 65.22 AGCTGGGTAACGGGTATCTGACAGTCGAGTAACTCGACTCGAGAAATATAGCATTCTCTCTTGTCGATTTTGTAATAAAGGCAGAAATCCTATGTGAGCCAGAACGCTATCATGTTAAATACTCTTCAGTTAAATACTTTTAAGCT:1 + chrX 22784158 3' + INE-1 545 1 65.75 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTA:1 - chr2R 16160762 3' - mdg3 5335 2 73.97 ATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTAAAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGTTGAAGTCTATTCTATCCTCGTTTTTTTTATC:1 + chr3R 18702721 3' - G5 4824 1 78.08 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGAACAAACGTTTTAGGTTCGCCAGATGAATTTTAGTTTTGATCAGATTAATTAACAC:1 + chr2L 8930571 3' - roo 8728 2 62.33 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGCCAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATT:1 + chr2L 16884685 3' + Bari1 1621 1 75.34 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGCTCGATGACGCTATAATCGAAAAAACTTTGCAGCATACTTTTAGGACGATGCCAGGACACG:1 + chr3L 12633335 3' + jockey 4935 1 65.07 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATCACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTTTTTTTATAAGAGACAAT:1 - chr3R 6147211 3' + copia 221 1 65.07 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTTTTCGTTCCGAATGG:1 - chr3R 23579253 3' + roo 9045 1 68.49 TTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTTAAGCT:1 + chr2R 17696132 3' + rover 7240 2 60.96 TTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGTG:1 + chrX 21994035 3' - McClintock 5968 2 73.43 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTGTTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGTGCAAAT:1 - chrX 19121894 3' - 412 7087 2 51.24 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTTCAAAATATTTGTGTTGATTATATTAAAGAATATATACTTTACCATTTATTAATTAGTCCACATAGTGAAAAGAATTTGTTT:1 + chr2R 7009547 3' + Quasimodo 7336 2 63.70 AAATTTAAAAAAAAAACACAAATTGACGAGACGAAATAGAAAAAAACAAAAATATATAGCAGTCTAATATGCAGTATTATAAGTTGGATGTGTTTATATCTGCGGGATACTTCAGTTATGGACTGCAATTATTG:1 - chr2R 19071295 3' + TART-C 11097 1 80.60 CCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTCACCAAAAGTTGGTGGGACAAAGCAGAACTTTAATATATATATAT:1 + chrX 8011448 3' + Transpac 238 2 68.06 GTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGTTACATGCAAAATGTTTACTCAACACCAGTCGG:1 - chrX 5205832 3' - baggins 5294 1 71.30 ATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGC:1 + chr3R 10030776 3' - BS 5080 1 64.38 AGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCGGCGGCCATGGCGAA:1 - chr3R 5170970 3' - F-element 81 1 67.12 GAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCTA:1 + chr3L 21202114 3' - G2 2628 1 54.11 ATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTCGGAAAACAGCTGGAAAAATTCGGTGCTAGAAGGTCGTGCTCAGTCGTCTT:1 - chr2R 21868456 3' + transib2 342 1 65.07 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGAAATACTCTGGCCACATTCAGACACCAGCGGCAGAAAACCCGAAAACCCAAAAA:1 + chr2R 16367507 3' - hopper 8 2 77.40 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCG:1 + chr3R 24734917 3' - jockey 4748 1 74.66 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGG:1 - chr2L 13675863 3' + flea 211 2 60.96 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGAGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGTGGGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGTGGTGGAAGGGGGTGGCGGGCAGGG:1 - chr2R 21362715 3' - Tirant 28 2 61.59 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTTTTTCTGTGGAAGTGAGTTTCGGGGCTCGGATTACAGGCA:1 - chr2R 14431184 3' - Doc 45 1 44.52 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTT:1 - chr2R 14431226 3' - Doc 82 1 70.21 CTGTGAAACACATCTGCGAAGCTACAAATACGATTATGCTTCCTTGCATGGTGAAGTCTGTCTGACTTGTAAACTTTATTCCTCACTACTTTTTGATTATGAGATCCAATTTACAAGTTTTTAATCAAATGCTTCAACATCATCGT:1 + chr3R 4676972 3' + hopper 382 2 57.53 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATAGCAAGTAAATTTCGTTGGTTTTTTTTCTTTTGGTTTTATAGGACGGATCACGATGGATGATGGTTAATAGTTGCTTCTTCTTCTACAT:1 - chrX 16607793 3' + P-element 2861 1 63.57 GACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGG:1 + chr3L 22038285 3' + diver 6022 2 77.40 TACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACACAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATAGTTTTCAAAAGCATTTAAAATCTTGCTGAACAGCACCATGTCCCCTTCTAAAGCTAAA:1 - chr3L 23451576 3' - Cr1a 167 1 60.96 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAGCACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCTCTGCAGCAAATCTGAAGAGAAAAACTTGACTGGGACGAAAGTTTACCTTCGGCGCTTCATTCTGCTTGGCTAAAGTTGTC:1 + chr2L 22227842 3' - Doc 46 1 54.79 TCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTACGTCCTGGTAGGTGTTTCCAAAAGGACAAACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAATGGAGCCACTTGGACTCAAAGGTGGCCGGATCCACCATAAAATCACCGTTATCCGCCCGC:1 - chr3L 15109405 3' - baggins 5048 1 57.53 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCATTTATATTGTGTAATCACTTAATGTCTTAAGTA:1 - chr3L 22041037 3' - roo 33 2 63.01 GCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAA:1 - chr2R 17696015 3' - rover 49 2 54.79 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTATGCGGTCCAGTTAACCGCTTGACATATGACCGTCATCATTTAGCGCATATATGTATCT:1 - chr3L 5958568 3' + 412 479 2 74.66 ATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACT:1 + chr3R 7042074 3' - Stalker2 66 2 60.27 GTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAGGGATAGCAGAACTTAAAGCATAAATCTCGTTTAGTACCGCTGTTTCCAGCTCCAAACGACTGAGGTATCTCAAAGATACAAAGATACATGCAACCCCCGAAAGCGGCTGAAGT:1 + chr3R 19993257 3' + Quasimodo 2 2 74.66 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGAATGAGAGTGTGAGTTCGAAAAATAAGTTGAC:1 + chr2R 10541793 3' + P-element 2875 1 77.40 TTGGCCCACGTGGGAACCCCTTTTTAAAGCTGGGTCCTTACCTAGGTAACCGTAGGCCGTAATTAATGAACAGTTCAGTGGGGGGCAGTCCCCGCTAAAAAAAACAGCTTTCTTTTTAATTTCTAAACACAAAACAGTGGTTTTAA:1 + chrX 7343822 3' + Rt1b 313 1 64.38 CCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCCAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACATTTTTGTCATTCCAAAACGCCCAAAA:1 + chrX 22689465 3' - mariner2 45 1 65.75 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCAC:1 - chr3L 15035108 3' + pogo 2047 1 60.96 AAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGCGTAGAGCTGGGATACTATCGATGGTACTATCGAGGTATCGAAAATTGAATTTTTTATGATTCTTTCAAGTAGTAAACTAATAACTTTTGCTTATTTTACTGCAGAATTCAATG:1 - chr3L 1745582 3' - 1360 3269 1 59.59 ACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGGAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGGCGAAACAAGCTGAGACACTTTACGCTTGGATGGAGCGAG:1 - chr2L 21936051 3' - INE-1 12 1 45.45 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAATAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGA:1 + chr3R 7477463 3' - BS 5080 1 72.60 CTAGCTTTTATAGTTCTCGAGATCTCTAAAATAATAAAGACATGTACATGTAACTATCTATCCTGATCAAGACTATATATATATAAAATCATTTTAACCCCTACCATATACACACATTCAAAAATTGTACGAACTTG:1 - chr3L 18917801 3' - INE-1 152 1 59.85 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCAAGGGAGCTTTCGTTTACTGGGTCTGAGGTCAGCGAGGGG:1 + chrX 7508178 3' - roo 8743 2 73.97 ATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATGGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAATGACATGACACGTCCTCCATTTATCATCTGCTCCAGTGTCTT:1 + chr2L 11263943 3' + 1360 274 1 71.23 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCT:1 - chr2L 9599794 3' - roo 8725 2 58.90 AATTAATTAAATGTAATAAATTAGTTTATATACCATTTTTATATAATTTCCAAGTTATTTCCTAATCTGATCATTTTACCAATCAAGTTGTACCCATTAAGTTGTACGATAAATAGCCTTATCTAACTAAAATATAACTTTCATAG:1 + chr3R 13825331 3' - Tc1-2 1413 1 23.97 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCAACGCTTCTTCAGCAGCAGCAGCACAGTTTTCTCTGGAAAACTGCGG:1 + chr2L 13316984 3' - jockey 4701 1 63.01 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTT:1 + chr2L 15917698 3' + roo 348 2 58.22 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGCG:1 + chr3L 22435214 3' + opus 450 2 55.71 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGTGTGATGGGAGGTTGATGTGT:1 - chr3R 17494907 3' - hobo 57 1 62.88 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTACAT:1 - chr2L 1232634 3' + roo 332 2 74.66 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGATGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCCCGCAGATAGTCGTACGGCATCCCTAGTTTTAGTTTGTTGGAGTATGCAAATATCGTTGATC:1 + chr3R 13453452 3' - 412 12 2 77.24 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGTTTATTGTAGCATACTTACTGGCGTCATTCCATTTTATTTATTTTTGGTAGTTTAGTAACCAGA:1 - chr3R 10541165 3' + hopper 1401 1 73.97 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTCCCAGA:1 - chr3R 13676127 3' - P-element 97 1 15.07 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGATATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAAACGTTGTATGAAAAAAGACCAGCGCATTGACAAAATCAAATGG:1 + chr3L 20765233 3' + 297 6903 2 71.23 GGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTTTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTA:1 + chr3R 9551022 3' - P-element 6 2 75.83 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGANTTATTTGCCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGCGGTTTTCC:1 - chr3L 13546529 3' + hobo 2903 1 58.62 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTAATTTCGTATAGGACAATCTGCCACTGTCGTTGTTTTTAACGAC:1 + chrX 15540114 3' + roo 399 1 77.40 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAGGGGTAAGCACTTTTAACACCCCCACCCTTCGGCGGAGTAACTTTTGCATTAA:1 - chr3R 31275343 3' + mdg1 7394 2 65.00 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCACAACTTTCCGGAATCTCCAACTGCTCGGGTCGCTGGGCTCCCCATTCGCACTCGAAATATCCAAAAATA:1 - chr2L 7810630 3' - P-element 52 1 50.00 GTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTTCTGGACAACCTGGGCAACGAGTTCGAAGAGGACA:1 + chrX 8130063 3' - 412 269 2 74.82 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTTCGCCTGTTATAATTAGGAAAAAAGCATATCTTACAAATTATTTGTCGGTTTCGCGCTATACAGATTTTAGGCA:1 + chr4 549217 3' + flea 5002 2 77.62 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGGGCTTATTGTGAAAGGTTTTTTTTTTTAGTATC:1 + chr2L 16607343 3' - 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chr3R 17673729 3' - FB 45 1 55.48 AGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAAACGTGCATGCCACCTACGGACGGTGGTATCTTTAGAATATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCTAAACGGCGATCATCGCATACTGATATAGATAATTACGTTGATAATGATGGTCACAC:1 + chr3L 17997959 3' + Rt1b 5055 1 60.96 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGGTGTGACACGCAAGGAAGGCAACAAAAAAATAAATAAAT:1 - chr3L 21649137 3' - roo 8745 2 74.48 CGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGC:1 + chr3R 31419386 3' - pogo 2056 1 76.71 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTC:1 + chr3R 12787401 3' - BS 5039 1 53.42 GGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAGGCCATCTTTCTAAAGCAGC:1 - chr2R 16185009 3' + 17.6 7367 2 56.16 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTCACTTTTAAATAATA:1 - chr2L 18112463 3' + transib2 2792 1 62.33 AATTTGCGCAAGAATGTAAATAAAAAAGGATAACATGAAAAGCTAACGGGATTTTCTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGT:1 - chr4 123994 3' - HB 173 1 76.03 GAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGGAGCAACAGCCACAAT:1 - chr3R 8065197 3' - 297 23 2 65.87 CGCGAGCNGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTT:1 + chr3R 8867080 3' - Max-element 8312 2 70.34 AGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGC:1 - chr3L 18010258 3' - diver 85 2 73.29 GGGATACAGAAAACATTTCTACTAATTCTGAAATAGATTTTCCCAACTGGTGTTTATAGCTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTCGAGGCATTTTATTAAATTTAACCCTGATGCGTATGTGCATATGTATCTCGGGTGTATCT:1 - chrX 11961736 3' - S-element 485 1 69.18 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGANAAGGCTCATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAACCCGCATTA:1 - 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HMS-Beagle2 84 2 76.03 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCA:1 + chr3R 29384747 3' + roo 9041 1 65.75 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATTGAATCTAATAAGAGATGAACTCGCCACTGAA:1 + chr2R 12249075 3' + Juan 4169 1 52.05 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTTGCCCCAAAAAGTATGCTATGCAAATAGTTTCGATAACG:1 - chrX 7845718 3' - hopper 61 1 68.97 GCTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATGTCATAAGTCAACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCATTTCGTTTTGTGTTCGTTGGCAATAAATTTTATTT:1 + chr3R 4598685 3' - G4 3443 1 76.03 GTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGATGGG:1 + chr3L 21913474 3' - 297 6592 2 71.97 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTATATATCAGCGAAAATTCATCGAAATTAGTGGCGTAAATGGCAACAACAATTGCG:1 + chr3R 17879523 3' + opus 440 2 65.52 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAA:1 + chr3R 20345503 3' - blood 7024 2 66.67 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTAGTCTAGGGCATGGAAAGTGCACAGTTAACCCTTTCTGGAGTTACACGGTTCCAATCTTTAGACTAACTAGATGTGAT:1 - chr2R 7622857 3' - P-element 43 1 56.85 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGTCTATGCAGGTATTAGGGAAATTCAACAGAAAACTTA:1 + chr2R 6217166 3' - copia 4953 2 75.34 ACACACACACACACACACATTTTGTCAGAGTCACACACAGATAT:1 + chr3L 19039590 3' + accord 7031 2 54.55 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGT:1 - chr3R 5977729 3' - copia 61 2 56.85 AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGATTCCCTAAGGATTTAT:1 - chr3R 5518304 3' - Transpac 61 2 60.96 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTTT:1 + chr3R 24011085 3' + roo 360 2 53.15 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTTCCATTTAAAAGTAGACTAGTAAATTTAATTTTTAGATAACATTTACCTAAATTCC:1 - chr3L 13992245 3' - blood 64 2 61.64 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAATTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTGAATTGGGT:1 + chr2L 8895345 3' + 412 7505 2 56.85 GCGGCAAGAGGCCCGAAGGACACCGAAGGACGATCACCACAAGTGAAGAGTGATCCTGGAGGGGAGAAGGAGAAGGATCTGGCGTGCCTTAAAGGGTCAGTGGAGTCAGCGGCCAGCAAAAGTGG:1 - chr4 145846 3' + gypsy8 488 1 78.40 ATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTCAAAGTAAATAAAGGTTAAAGGCATCGCAAATGGATGATCTTCATTTTGTAAATAGTTTTAT:1 - chr3R 23795466 3' + Stalker 7103 4 61.64 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAAT:1 - chr3L 8249340 3' + HMS-Beagle 214 2 62.33 CAAACATACCGGCCCCCCTGAACGGTTGTTCAGCAGAGAGGCAGTACAGCGATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTGTATTTTTTATGATTGTCAAGGATTAGATATAAATGTTTTATGATCTTGGCCCGCTACCGCGGTGC:1 + chr3R 13898844 3' - 3S18 5750 1 52.52 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACGGCTGGCCAAAAATTTGAATTCAGGC:1 - chr2L 19939978 3' + mdg1 416 2 76.38 GTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAGGGGAGGAATTAAATGAGTAGCCCGAGGAGGAATAGGTTTCGACCT:1 + chr3R 8394495 3' + hopper 1353 1 63.70 GATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGTCATTTAACAAATCCCAAAAAAATATTTCAAAAACATAGATAATGGCATTAAAATTGCTGGG:1 + chr2L 18520244 3' - Porto1 278 1 59.59 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTAAAGTTTGGCGGACTAGATAATCTATATA:2 + chr3R 20260944 3' + roo 9053 2 72.60 TATGTTATCTGGATTGAGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCACGAGAAATTATAATTACAATTTGGCACCATATAACGAGTATACGGCCAGGACTAATTAG:1 - chrX 20270928 3' - I-element 5123 1 58.22 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCG:1 - chrX 20330553 3' + P-element 2804 1 28.77 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATGTACTCCTCCTTGGGGCACTGTGACCACCATCGAGGAGCTGACACCGTCAGACTCC:1 - chrX 12365298 3' - hobo 53 1 59.70 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTCATTAAAGACCATAATAAAATGTGGGGAAAGGCAGATGGAAATCGCAGCCCCTAACAAATTTGTCCACCAATCCTTTCGCGAATCCGCTTAAG:1 - chr2L 6153879 3' - copia 4897 2 66.44 AGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTATCCCTTCACCAAGCCAGCAATGTCCACGACGTTCA:1 - chrX 9780528 3' - copia 112 2 76.03 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCTTTGTTACTCATTTAT:1 + chr3R 5575080 3' + blood 351 2 67.12 TAGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAAAAAAGGGCAACTGGACGTGGAGTGGTACTTGGACATTGGACGTTGCGCTGGGCAACAAACTAACACAAAACATAAAACT:1 + chrX 3915966 3' + mdg3 5022 1 57.64 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATTAGAGGGCTGCATAACACCATTCAAACCATTCAATATAACAGTCGTGCTGAA:1 + chr2R 4616594 3' + 1360 3345 1 62.76 AAAAAAAAAAATCGTAGAAAAATGCTGCGTTATCCGGAACCCAATTACGCGTCGCCATGTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGGGTGGACTACGGTGGTGCACGGTGGTTCAGTAGGGCTCAGGGGTGCGGCATGCAAATGTCGAATG:1 - chr2L 3925566 3' - Tc3 79 1 38.36 AATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAGCTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATTAATCATGTAAAAATTATAATGTACTTTAAATTTAAT:1 + chr3R 12538137 3' + mdg1 7378 2 71.92 ATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGAGTTGGAAAAGTAACCCTTTCGA:1 - chr2R 12248935 3' - Juan 4052 1 67.81 CATAATTTTTCTGGGAAATCGATAGATTTGGGGAATAGAAAAAATTTAAAAACTGTACATAAAGGGAGTGACCGTTTTGGGCGTTTTGTGAACGTTAGATTGGGCGTGGCTTAATCCCATCACATCTTCAGCTCTGTTTTCATTTT:1 - chr3R 26303427 3' - INE-1 505 1 73.97 CGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTTCATTTAATTTCAATTCATACTTTGTGGTACATAATGAAATGATTTCAGAAAC:1 + chrX 14347045 3' + flea 4940 1 64.38 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCTCCCGTGCAACTAATGCACACTTAAAATAACTAACAAAACTCCATTAAAAGCTGCAGCCGGAAAGCGCCTGCGAAA:1 - chr3R 8394386 3' - hopper 41 1 57.53 AAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCNTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCC:1 + chr3R 29283285 3' - hopper 59 1 56.16 GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAAT:1 + chrX 21227203 3' + Tabor 420 2 60.96 GGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGCTATATTACGTGTAAAAGAATAATGTAATTGTACATAAATTAT:1 + chr3L 3154174 3' + flea 4941 1 72.60 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTTCAAAACCAGATTTCCGTTTTCAATTTGCAAATCAAATTGCCAGTTGGCCAAGGGGCGGAAAATTTCACCTT:3 + chr3R 17996812 3' + copia 241 1 54.11 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCACAAAATTTCACAAAAATCGTAAAAAATTTTTTCACAAAACTTTAAATGTAATTGTTT:1 - chrX 19768356 3' + 412 432 2 57.53 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCATGAAGTCATCTGGCTGAAATTAAATGCCAGTTG:1 - chr3R 20983783 3' + pogo 2050 1 56.16 CTATTTAAACCGAAGATATTTACAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGACTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGTGATAATTAACAGATCACTTAGCATTGTTTCAGTTTACGCTTCAAGGAATCCCCTAG:1 - chr3R 22435498 3' + roo 9009 2 57.53 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACGAGAAACG:1 - chr3R 14277865 3' - P-element 29 1 61.24 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATA:1 + chrX 140091 3' - blood 7074 2 58.22 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAACATGTAAAAGCA:1 + chrX 407490 3' - I-element 53 1 58.22 GGAACTATAAAAGCTATAAGATTGAGATTCAGAATACAGATTCTAGAGACAAAGACGTAGCGCAAGTTTGCTGAACCATGTTGCTACGCCCACAAGCTGCAAAAACTACCACACCCACATTTTTGGAAAATGTGTTGATATTTTTT:1 + chr2R 5466806 3' + INE-1 157 1 68.49 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTCATTCGGCTGGAAGCCCAGCATCCTGGCACTGAAC:1 + chr3R 29283322 3' - hopper 22 1 67.81 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAATATCTAATAGTAATATTTTATAAATAATACTATTTGAACAAACAATTTATCCTAAAATTTCTGAAA:1 + chrX 12105337 3' - 412 53 2 55.48 AATATATTAATATTAAATCCAAGATACGAGGAAAAAGAATTTCGATTTGCCAGCTTTAGTACTTAATTACGTACGATTTAAGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 4308239 3' + gypsy7 5066 1 67.74 CGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAATTCAGCTTGTCAGTGATATATCATCGGACAAG:1 - chr2L 21949980 3' + hobo 2751 1 75.00 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGTCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTG:1 - chr2R 19015969 3' + roo 9006 2 63.70 AGTTACTCGACTATCAGATACCGACTAAGTTACGCTTGTGAGATCGCAAGCAAGCAAGTAAAAGGTTATTTTGGCATATTAACACAAATTCTCACAAATAAACTTACATAATTGTGGAACTATTTCCATTCATTATTATTTCACTC:4 + chr2L 9086026 3' - INE-1 557 1 56.16 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATATAAGA:1 - chr2L 7148535 3' - HMS-Beagle2 6919 2 59.59 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTC:1 + chr3L 15035238 3' - pogo 42 1 58.22 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGATGTCTG:1 - chr3R 21843759 3' - blood 74 2 66.44 GCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGTCAGCACTTTAACGTAATGGTATTAAATTTCGTGCACTGATCCCGTTCTGGTCCCGCACTGGTCCCGTAGTAGGACNGTACTCGGTCCCGAAGTCGGTCCCGTACTCGGTCCC:1 + chr3L 18592065 3' - Gypsy6A_LTR 71 1 47.86 TCCGTTGTTGACTGCCCTTAAGGCTAGCCAACCAATTCAATGATAACAGCAGTAGCTGGAGTTGATTGAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAGTACAAAATCAAACTGAACTTAATGCTTATGAAATCCACTCTGTAGGCGATTTA:1 + chr2R 5201588 3' - springer 238 2 82.88 CTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCG:1 - chr2R 1320650 3' + diver2 339 2 60.71 AGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCAATATTATGCTGTAATCACCGTATTGGCATTGTATAAATTGTTCG:1 - chrX 15188899 3' + BS 4984 1 69.86 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAAAAAATACAAACTGCTCGCAAAACAATCGAAATGA:1 - chrX 14867221 3' - roo 8707 2 53.96 TAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTTATCTACTAATAACAAGGTACAGTTTCTTATAAGTAAAGCTCGATCTATAAATAGGAAAAACACTTGATCTCTTTTCTTCTCCAAGTGCCTTCCTTGTGTGGGGGCATCAATCAAAGCA:1 + chr3L 1408198 3' - Burdock 6241 2 63.70 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACACGTTCAATTTAACGCTTGAGTTCGGTTTTTGGAAAATATATTTCTGGCGCTTTTCGTTCATTTTCCGTTTTTTGCTACGTTGATTTATGCAAAGCTTG:1 + chr2L 20551096 3' + 412 479 2 74.10 AGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGGTTGGCCAGATTTCGGAATTCCATACCCGATAATGGGCAACCCATTCAGGGAAGGTAATTTCTATCTGGGAGACT:1 - chr2R 5037668 3' - Stalker2 49 2 50.68 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCCATGTGGCCAAGAGCGGATGAGTGGACAAGTGTTGGCCATTTGGCAGTCGATAAAAATGGCAAAGAGCCTAAGGGGGCATCTGTGTG:1 + chrX 13458340 3' - hobo 33 1 61.64 CCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATACTACAATTTTTTATATTATCTATTTTAAGAGAGTTATTTGGCTACGGTCTTATAAACTTTATTCAGCTTCAATGCACTATTACAGTTGATTCCTTTACCAGATATATGCATTAT:1 - chr3R 12375294 3' - flea 4763 1 75.34 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATT:1 + chr3R 9550997 3' + P-element 2830 1 46.58 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCAATGTTTATTTTGCTATCGCACTTTCAAC:1 - chrX 6910089 3' + I-element 5267 1 75.34 CAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTTATTTGTTTATGG:1 + chr3R 8867122 3' - Max-element 8270 2 61.38 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTACCTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACCATTTAAAATAAATCAGCAATGCGTAGGCGTTACTAGAGTAACTAAGAAATGCAAACAGACGGA:1 - chr2L 9336769 3' + mdg1 7402 2 54.79 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCAGTTTTTACGATAATATTATATTGTGCGTCAAATAATTAATATTAAGAAAAAGCAGTAGAATATTTGTTATA:2 - chrX 16996042 3' + roo 357 2 56.85 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGATCCTTCACTTACCGGCGGTGGCAGACTTATGTAGCGTATAACAAATCCAGCTCCTAGGAGAAAGACATCCCGGAACACCACGATGCCC:1 + chr3R 25685822 3' + roo 8991 2 61.27 AGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCAC:1 + chr3R 10030808 3' - BS 5048 1 56.16 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGATTCCCTAAGGNTTTATTTATATTTTGTTTGAGTAGCTGGCATAGAACCATACCCC:1 - chr3R 5518265 3' - Transpac 4941 2 69.86 GAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAATGAATGGATGTGCGACTAATGTTGTGTGTTCCCC:1 + chrX 2060928 3' + P-element 411 1 23.29 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGC:1 - chr2R 2016839 3' - 1360 63 1 68.75 AGTTGAAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGTCCACTAGTGTATGTATGCAGTAAAATAGTTGTTATATTTAATCCGTTTTCCTAATTGTTGTCTTCGGGACAAGCTTGCTTTACATTTGATAAAAAAAATTTAACTTAACATAA:1 + chrX 22924651 3' - Tc1-2 21 1 52.05 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATACAAATATTTAAACAAATAGGCTTGTACCAGCTTAACCTAAGC:1 - chr2R 18358379 3' - jockey 4676 1 40.41 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATT:1 - chr3R 19246716 3' - jockey 4754 1 76.03 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTATTAATGAC:1 - chr2L 4631110 3' - roo 34 2 58.62 CAAAGACCGTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACAC:1 + chr3L 11257399 3' - 1360 3388 2 36.64 CGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAATGATGATTACAAAAATGTAAACCCAAATACGAGATTTTTGGGTGATGATAGACGATTTATAGTACTTACGCACTTATAGAT:1 - chr4 52427 3' - 1360 3294 1 55.48 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTATATATCAGCGAAAATTCATCGAAATTAGTGGCGTAAATGGCAACAACAATTGCGATGTATAACTAGGAATCAACCTGTCTGGTTGTGTATTACACATCTA:1 + chr3R 17879569 3' + opus 7488 2 75.34 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTTGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGTGCGAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCTTCC:1 - chr2R 16731274 3' - Tirant 30 2 51.52 CATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGACCAGCACCGAAGCCAAAAGCGCAAGTCTAAGATCTATTATCACAGCGCCGCAA:1 - chr2L 5341499 3' + Burdock 6329 2 62.33 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACA:1 - chr3R 21654970 3' - roo 8725 2 61.43 AACACAAAAAAAGAATAAAAAAATAGACAAAAGGGTGGGATTTTGGGTGGTTGNTNGAGGGGGGCTGTTGTCAAAGGGCGGACACCGAACACCGAACATCGACCGCCGC:1 - chrX 8202317 3' + gypsy7 5004 1 86.24 GCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCAAGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGTTATTCTACGGTCTTTGGTATGGCCGGTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - 1360 114 1 72.60 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAACAT:1 + chrX 407481 3' - I-element 62 1 64.38 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGAACTATGTCGATAGAGAG:1 - chr2R 24807854 3' - I-element 33 1 60.69 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGT:1 + chr2R 10695891 3' + roo 9027 1 53.42 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGGGCTTGTCCTACCATTTGTTGTCTGCCAGAGTAA:1 + chr3R 27016577 3' + roo 400 1 59.59 GGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATAT:1 + chr3L 21202107 3' - G2 2635 1 52.05 GCTTTTACAGTTCCTGAGATCTCGACGTGCATACGGACGGATAGGCAGACACGTCTAGTTCGAATCGGCAGTTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAATGGTACCTATTTATAAAAATCAGCTTTAAATTT:1 + chr2L 14885057 3' - INE-1 149 1 57.53 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGTAGCCATTCAGGTTGATGGCTG:1 - chr3L 21913295 3' + 297 6955 2 72.60 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAG:1 - chr3L 15035130 3' + pogo 2033 1 74.64 ATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGATCGAGCGTCTAAGCCCGGGTACTCGCAAGATCGAGCTCTTTGGGCGTCCGCACAACATCCAACCGAACTGGATA:1 + chr3R 24033994 3' + roo 8770 2 51.37 TCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTACCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCAATTTCTCTCGTTATTTAGTTAATTTAATAAATGGAATATATTACAATTTTTTTAAATGTATTTGTTTACCTTTAAAAGTAGATTTCAA:1 - chrX 21387990 3' + INE-1 532 1 87.67 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGAGCACCAGCGGAAAGTCGCGTCAGTCGTCAGTT:1 - chr2R 10541656 3' - P-element 71 1 36.99 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCAT:1 - chr2R 16072905 3' - opus 49 4 56.16 GTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTCGCAGCTTTCGGAGTTGACCTCCTTCAGACCTAATTATATTC:1 + chr3R 3854496 3' + INE-1 28 1 58.90 GCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCCCATCGTTTAT:1 - chr3R 23415856 3' + jockey 4979 1 76.03 AAACCATTTTTCAAAAGTGTGGCGTGGGCGCGGGAACATGGGTCAACTTGTCTATAGAAACTTGTCTTTAGATAGAATCTGTATGCTTAATCCCAACCTTCCAGCCTTTATAGTTCCTGATCAGCTCGGCTATTGATCCTGATCAA:1 + chr2L 21737998 3' - INE-1 258 1 77.40 CTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACATCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTATTATTATCTCCTATATATAAGTATAGCGATAAAGCAGCCGAACCGCCAGCTAAACGTTCA:1 - chr3L 16661606 3' - gypsy4 463 1 62.24 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGGCTTTTTCGCTG:1 + chr2L 3908503 3' - 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Burdock 6177 2 47.26 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGTACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTATACCCAAAAAGAGTAATTTACATATCAATTTATTTTAGCAATTAAGTTG:1 - chr2R 23278340 3' - mdg3 5288 2 59.59 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCGTCTGCTTCG:1 + chr2L 11476362 3' - pogo 38 1 57.14 GTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTG:1 + chr3R 5972352 3' - Doc 315 1 70.08 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGCTGCGCAGTTGTGAG:1 + chr2R 9871563 3' - roo 71 2 70.55 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAG:1 + chr3R 31032058 3' - hopper 65 1 63.57 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCGGCAATCACCCCGAAAATGGGACCAAT:1 - chrX 4469524 3' + roo 9054 2 50.93 AAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTTCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGCATGTATATATTATATTATTAAATAAAATCTCTGTATGGTAAATA:1 - chr3L 14143102 3' - X-element 4681 1 54.11 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAGTTTAAATAACCATATCAATCTGCAGATCTATGCTGCAATTATTTGAAGTTGGG:1 - chr2L 13292891 3' + copia 249 1 57.53 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAAT:1 - chr3L 13888902 3' - 412 7119 2 62.07 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGA:1 + chr2L 8553414 3' + pogo 2043 1 60.69 ACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGGTCAGAGGTTAGCCATAAATATGTACGTGT:1 - chrX 6417686 3' - Quasimodo 40 2 73.33 CATTCACGCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGCCAGTGATAT:1 + chr2R 20361479 3' + INE-1 535 1 89.73 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTTGTCCTGGCTTTCCTCTTTTTTTGTTTCAATTGCTTTCTTTTTTCCTACGCTGTTATTTTCTTTTCTTTTTTGTGGTAATGGTAACTTTGCTCTTTAATGCTGATTTTGAAATAACGTG:1 + chr3R 26353058 3' - G2 3076 1 68.84 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTACACCTGCTATATATGTATACTTGATTTCTGCCTGTTATGATACATATTCTGACATACTCTGAGTCAGAAACCTCTACATCTA:1 - chr3R 4668752 3' - FB 27 1 60.45 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATA:1 - chr3L 2485912 3' + jockey 4919 1 66.44 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGTAAGGGTAGTACTAT:1 - chr2L 1729727 3' - Transpac 38 2 47.95 CGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGGCCTTGTG:1 + chr3R 5972396 3' - Doc 290 1 55.48 TGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAAAATAACTTGAGCTAAAAGGTTACATTTTAAAATATTGGAAAAATGATAAAAAAAAAATTGAAAATATATTTCATATCATATTT:1 - chr3R 11831133 3' + R2-element 3391 1 56.85 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTTTTCGTTC:1 - 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FB 10 1 78.77 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAGTTTTCAATCACGCGCGAATGC:1 - chr3R 16349202 3' - P-element 57 1 43.88 GAACAAGAGACGGCAACCTGCTGATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCCTAAAACTAATGTCCGTGTCTTGATTGCGGTTTCT:1 - chr3L 12437866 3' + I-element 365 1 73.40 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATACAAGCAATTGTAAAATCAGTTTCTATGCCATACATTTTGTTGTGTCTATAGTGGGACTGCTG:1 + chrX 18786220 3' + pogo 2045 1 57.53 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTGCCAACATCTAGTGTTGGTGTTGCGACTATAATATTTTCAATTTGTTGCTTTTTATTGTTAACAACAGCAACAGGTTCGTTGACCAGTCAACGAGCGCTCAGAGAGC:1 - chr2R 6217042 3' + copia 241 1 73.97 GCCACGGCCAAAAAATAGTGTGCGAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGGACTCACGAGCATTAAATTCATCTCCTATCTTCCAAGTCTATCTATCTTTAATATAAGCTACCAAAATCAAAA:1 - chr2R 15374739 3' - 1360 48 1 50.68 CTAGTGAATCTACTTGGAACCTAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATTTCCTGGGTCTCATCGGCTTCAGCCTGGAGATCCGAAATGGCTTCATGTGCTTGTTCCTCCTCGTTTTCCGAGTTGGCCTCCACC:1 - 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G2 2638 1 54.48 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTTTTTCTGTGGAAGTGAGTTTCGGGGCTCGGATTACA:1 - chr2R 14431188 3' - Doc 42 1 43.88 GCATTTTTGGCACTTGTGCTTACCCAGAAACAATGTAGGAACACAAGATGTGGGACAATCACTTGTAGGGAAGAGAGCTCGAAGAGTATTTTTCAGCTTTAACCGCACATGAAGAACGCATTCGCTAAACAAAATTAATGCAGAGT:1 - chr3L 25668821 3' - HMS-Beagle2 57 2 49.32 GAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCATTGGTCCATGAACGTTGTCATAAGAAATATGCAGAAAAGTGTGA:1 - chrX 2301432 3' + accord2 206 1 56.16 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATTGTGAGTCGCCTCGGGGCGTGCTGCATGTTCTGTTGT:1 - chr3R 23511567 3' + 297 321 2 71.94 GTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTACTCCCCCCCTATTTAATTCAATTAGACATGGCATTTGACATGTGCGCCCACTTTCACACGCCCTCCCCCCATTTGGATCCCGA:1 - chr2L 8424321 3' - gtwin 41 2 50.68 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTTAGGGCTTCCCTC:1 + chr3R 19246820 3' + jockey 4976 1 67.81 CTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTATAATCAACTAATAAATAAATCACAAAATC:1 - 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chr2R 22112583 3' - 412 9 2 73.97 TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAG:1 - chr3R 17996722 3' - copia 4953 2 76.03 ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGA:2 + chr2L 1451239 3' + mdg1 347 2 66.44 GGTCTTGAATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAAAATCTTAGACTGCCCAAGTCCTGGTAGGTGTTCCCAGATACATTTTTAGGAATATATTTATACCTGATCAATAGGAATATGTTTATACCTGAAAATCTCTCTGATCTCTC:1 - chr3L 17840919 3' - baggins 5073 1 50.68 AGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAGGCACGCCGCATACAAGCGTATTCTAAAGGTATTAGATATGAGACGGCGAA:1 + chr3L 6721667 3' - I-element 5137 1 63.70 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGGAGCCAAGCAAACATATGA:1 - chr2R 13695598 3' + blood 342 2 60.96 GTCGACCCTATTTCCCTTCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACAACCCCCATGAACACGTAAGATAGCATAATCTCTTCACTGTACATTTTTACACATTATAATTAAGGAACAGAATCGGGTCAGAACCCGATGCAGCCT:1 + chr3L 11816246 3' + G5A 2659 1 66.44 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACATAAATTTCCAGTTAACTAAGTGTTTAAGCAGTCATTAAAAGGTTGTTGAAATTTATGAGT:1 + chr2L 18173707 3' - 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chr2R 12379451 3' + pogo 2089 1 73.29 CCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACATAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATATTTATTTGTAAGCTTATTTGTAGGTAATGATTGACACAACGTGAAACGGCCAAACCAGAGC:1 + chr2R 13266929 3' - invader4 2813 2 57.53 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTCGCTCACGGCGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGG:1 + chr3R 27398127 3' + roo 9044 1 55.46 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAAC:1 - chrX 19887077 3' + P-element 2801 1 26.71 GGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTAACGGCGCAAAAGGATGTATAAGCAGTGAAGGTAATAACTA:1 + chr3R 17766876 3' - HMS-Beagle2 6889 2 76.71 CAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGTACAAAAATCGGCAC:1 - chr2R 2307899 3' + Stalker4 7058 4 49.32 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAG:1 + chr3R 21679652 3' + roo 8983 2 77.40 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCTTTGTTACTCA:1 + chr3R 5575075 3' + blood 7358 2 63.70 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAACATGTAAAAGCATAGACTAGACCTCATATAAAAACAATTAAC:1 + chrX 407520 3' - I-element 23 1 69.86 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCAAGCGCTT:1 - chr2L 16537524 3' - Transpac 4965 2 52.82 ATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTTTTCAGACCCTTGGCCCCGTAAGGCATCACTTGCTACTCTTAGTATCGGGCTTAT:1 - chr2L 21911060 3' + transib2 2420 1 62.33 TTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAGGATCAATTACTCTTCAACTGAATTTAAAAGGATTTGATAAGAGGTTTGAGTTCACGACAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATCT:1 - chrX 11696528 3' - TLD2_LTR 96 1 78.77 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACAT:2 + chr3R 24011081 3' + roo 9017 2 56.85 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGT:1 - chr3L 2485901 3' + jockey 4937 1 56.83 AATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTGGCGCAAGTCGGGTTCTACAATCAATTGCAGAAGGTGGTACT:1 + chr3L 8699310 3' - accord 83 2 74.66 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGG:1 - chr2R 17649244 3' - Doc 89 1 75.35 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAGTTTGTGCCATAAAACTGAATTATTGAAAG:1 + chr3L 8249520 3' - HMS-Beagle 12 2 77.40 ATTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTGGTTTATCACACTGTGCGGATCGTCGCATAAAATTTAAATATTTTTGTTTTATTTTTATTTGCTTTTATAATTCTGCTAAATTTACTATGTAAATTCGCTATGTATGAGTATGCGTAAATACTT:1 + chr2L 13677696 3' + hopper 143 8 52.74 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTTTTCGGCTAGGCC:1 - chrX 16589145 3' + pogo 2051 1 54.11 GCGCCAGTTAAGTTCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTATGCATTCGAGAGCCAATAATCCACTTTCGTTTTGTTATCACTCCCCAGCCACCCAGCCTCCCAGCCACCCAAC:1 + chr2R 8819259 3' - Tirant 403 1 48.63 GTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCCATGTGCAGAAATGCTGCGGTAAAAAAAGTCGGGCATTATGTAGAAAAAGCCAGTGACGCCAAATATTTTTTGCCATTATTCATGGGGCTTTCATTTTTCACAAA:1 - chrX 1601265 3' - hopper 957 1 71.92 ATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGCTTTCTTCGATATCTTGGCGGATTTCATAGGTGGATTCCAAGCGGAATAGGTTAAAGTTGCGTAGGAGATAATCGTGGAGAG:1 - chr3R 11888981 3' + pogo 1683 1 54.11 CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAGATC:1 - chr3R 17996719 3' - copia 4950 2 71.92 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCAATTCTTATACCTCACCTTGCACTTAAATGGTTTCTCTCCGGTGTGACGACGGTGGTGTACACGCACTTGTCCAGGAGTTCGGAAACGTTTGTCACAGT:1 + chr2L 19733224 3' - FB 22 1 68.49 GAGGTGGTCAGAAGTATTTGCACAGCGAGCATTTATTCTGCATAAATGTTATTCTGCTTAGCAATGTTGTAATATATTTAGTAATTGTTATTCTTCTGCCATCTTCGCTTTTTAAATATATACCTCCCCTTATAGACTTTTTAATT:1 - chr2L 18190152 3' - Bari1 1704 1 63.01 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTCTTNCATCATGGAGTAGGCTCGTAGGGAGGAAGAGG:1 + chr3R 11758548 3' - P-element 90 1 19.12 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTCAATTACCATTTCATTCAATTTTACAA:1 - 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P-element 26 1 55.45 TAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCGCGTCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTTTTATTTAGTTTTTCCGTGGCAATGGTTTCAGTGTCAATGTCATGAGGG:1 - chr2R 21792528 3' - X-element 4695 1 65.07 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTT:1 - chr2R 22596060 3' - Doc 39 1 53.79 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTCAAAATACAATTGTGTATATACCCTACACCAAAGCAT:1 + chr3R 13676197 3' + P-element 2834 1 52.05 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACAAAAAAACTAATCGCCCGGCATCCCGCTCCAGAGAGCGAAAGCTCTGCGCTTGCGGGTGGTGAAGAGCTTTTGCTTAACAGC:1 + chr2L 3059471 3' - P-element 16 1 67.72 GGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACTTAAGCTGATAAAATTTTTTTTTCTTCGATGAAATAATTTCAGTTTCTTTTTACTGTTATTATACAGTATTCTTAAAAAACTTATT:1 + chr3L 15409935 3' + Transpac 492 1 60.96 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTGCGAAAACTTGGACTGGCGGCAAGAGGCGCTG:1 + chr2R 22774626 3' - I-element 40 1 53.57 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATAATCCAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTTTT:1 - chr2R 18618485 3' - jockey 4748 1 71.23 TTTAATTTCGGGAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTTGCCAATCAGCCAGAAGGATGCCTGGACAGTTTCCTGTGCCACCTGATACCATTTCATATCTCTCTTTT:1 + chr3L 20934245 3' + Max-element 8482 2 51.37 TATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAA:1 + chr3L 22038306 3' + diver 6066 2 56.10 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAATATATTCCAAACTATGATACTTCACAT:1 - chr3R 21938191 3' - roo 91 2 84.25 ATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTACTTCTAGTCAGTAGACAAGAATATCCATGGATTATCCTCAACTCCTTTCCCATTTGACTGTATTTTGAATTACTTTGAG:1 - chr2L 6807828 3' + Transpac 4948 2 55.71 TCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACAGT:1 - chr3R 9550899 3' - P-element 65 1 41.10 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCGTTTTTCCGCACACAAACGCACAAGCGCACAACGCACACACACACAGACAAAGGCTTAAAAGAGAGCGATTTGTCATGGGGCTGCCACGAGTTTTC:1 + chr3R 10541351 3' - hopper 23 1 66.44 ACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAACTGGGCAGAAATAATGGAAAAGAAGGACACAAAGGCGGTCCAAGATTTCCCCGAATGCCTTAATAAATAAAGAAGGGTGTAAGATCCTCCGAAGGACACCAGCAGGAGCAGGTGCAGAACG:1 - chr3R 6291928 3' + X-element 4631 1 65.52 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAGC:1 + chr3L 13888999 3' + 412 434 2 57.53 AATATATTTCAGCCCGACGGCTGCCTTCANCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTANAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACA:1 - chr3R 10433189 3' + 412 7496 2 50.00 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTT:1 + chr3L 2486015 3' - jockey 4713 1 43.15 ACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATAAACATAAAACATAAACTTTATGCTAATTTCATCTCGTATTTATT:1 - 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pogo 31 1 65.75 CACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGACATTGTTTAGATTTTGTAAATTGTT:1 + chr3L 4287068 3' + P-element 2794 1 20.55 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGTGTACAGCGATTGATCAAGTTTAATCCTTTGGGCTAAAGAACTACAT:1 - chr3L 21636388 3' - 297 19 2 73.29 GCGCGAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGGAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGAC:1 + chr3L 829960 3' - G6 80 1 68.49 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCT:1 + chrX 6615561 3' - roo 8750 2 78.08 ACGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCCATGCTCATTACATT:1 - chrX 10667009 3' - jockey 4760 1 53.15 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCAAATTGAGTTGTCCGTGTGAGGGTGTGTGTGAGGGTGTGTATTTTCCCCTATTTCCATTGCT:1 + chrX 20942220 3' + hobo 2906 1 50.00 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGT:1 - chr3R 8381715 3' - Tirant 8177 2 65.07 AAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTAAGTGTGATAGGAATCGTATCTCTCACCTCAACCCACACAATCGCGGATCGGTGTGTATTAAA:1 - chr3R 8821815 3' + S-element 1661 1 54.79 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGA:1 - chr2L 8895248 3' - 412 84 2 73.79 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGAAAATAATTTGCGTAAATTTAGAAACTGGCGCCAGGA:1 + chr3R 17060063 3' - jockey 4763 1 78.08 ATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCA:1 - chr3L 22038244 3' - diver 93 2 79.45 TTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTATTAAAATTTCGGCAAAGGATGTTTGCATAAAGTTTTTACTGTTTACTA:1 + chr3R 6863545 3' + G6 1754 1 67.12 AATTAATTTTTTATTTTTTTGCGTTAGCGTTGTTAATTAA:1 + chrX 14595820 3' + Tc1 1396 1 67.50 CCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTTCCTTTTTTTATTATCCTTATCTTCAACTGGGTTCGTTTGTTTTCCATCCGCT:1 - chr2L 12233108 3' + Quasimodo 6900 2 62.22 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTCAGTTGGTTAATATCAAATACCAGTCACAAAACG:1 + chr3L 21292618 3' + 412 7499 2 52.41 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGNTCTCTTGTCTTTCACGTGGCTTCTGCGAATGGAACAATCCCGG:1 - chr2L 13675852 3' + flea 4982 2 68.28 GCGCTTACCAAATACCTGAACGATGCCAAGAAAAACTTTTAAACGTACCAGCTAAAAAGCAGCAAGGGGCTACAAATAGTTATTAAACAGATCAGTCTGAGTCACCTAACCCACAGTCCTCGGCGATGACTGCCTCGTCGGAGGGT:1 + chr2L 14104725 3' + Fw2 362 1 58.90 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACC:1 - chr3L 22041093 3' - roo 8753 2 79.45 AGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCAGATACATTTTATCTGCCATATA:1 - chr3L 8754698 3' - mdg3 5262 1 76.71 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCA:1 + chr2L 3911908 3' - roo 87 2 80.82 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAGCCCCATAGATACACGTGTATGTATATATACATATATATACATGACAAGTAGCCAGCAGACGTCTCCAGAAAGGGAGAAACCGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGA:1 + chr2R 16112346 3' + Transpac 294 2 63.01 AAAGTTAAATTAATAATAAATAAAATTGAAGTAATCATAGGTTGATAGAAAAGGTTGCAAGGATGAAATGTTGATGATAGTGTCTTCAAAAATTTAGGCGATTGCCATCACTGACTGGATTTTCACATAAGTAAG:1 - chr3L 18740144 3' - INE-1 427 1 74.81 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCGGAAGTGAAGAGTGGGACACGCAGACACTCATGCCATTTTGTGTTAGT:1 + chr3R 31191089 3' - jockey 4676 1 66.44 GGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGGCTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGTAAGTCCCAAGGTG:1 - chr2L 22318162 3' + INE-1 557 1 61.81 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGT:1 - chr3L 2485904 3' + jockey 4930 1 60.14 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTA:1 + chr3R 21679679 3' + roo 346 2 58.90 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTAAATCATTTTGCCAGCAGCGTAAGTTTTAATAAATCATATTTAATACCATTTAACATACAATTTTACTTTAGGCAATGCTCTCTTTTCGAT:1 + chr2R 18396703 3' + pogo 2077 1 65.07 TGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAAAAGCAGGCCCACAAAAGGGACCAAAAGTGGTATGAATGCATAAGGTTG:1 + chr3R 22842217 3' - 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mdg1 28 2 66.44 TCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGC:1 - chr3R 19996192 3' - Quasimodo 72 2 69.86 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTTAAGGCTTTTAATAACACCTGTACATTAGTATAAGGAAGGAAAAAAACCCTTTTACCTATATTACTTAGGATTGCAAACATTCCCAATA:1 + chr3R 32065586 3' + 1360 3361 1 66.44 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGTTGATTACATTGTAGCCGT:1 - chrX 19163220 3' - Burdock 21 2 69.86 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTCATTAAAGACCATAATAAAATGTGGGGAAAGGCAGATGGAAATCGCAGCCCCTAACAAATTTGTCCACCAATCCTTTCGCGAATCCGCTTAAGCCTTTTACAT:1 - chr2L 6153869 3' - copia 4887 2 73.29 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATGTAATATGGAACTTATGAGTCATGATTTCTAAT:1 - chr3R 21679584 3' - roo 66 2 64.38 AACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACC:1 + chr2L 1729824 3' + Transpac 229 2 72.60 AAATTAAATAAAATCATATTANGGGTTTTTTAGGGTTTTAGTGAATTTACTTATATCATGCGACGCATTTCAATCCATCTTATTCCTCAAATCAGGCGAATTAAAAGCGTATTTAATGAAATGTTACACTGGAAAACAATATTCGA:1 - 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chrX 10694262 3' - Transpac 4970 2 56.85 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCTATGGCTTCTGTGGCAAATTATTTTGCTGAATTGCACA:1 + chrX 6615598 3' - roo 8713 2 52.74 TGAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAATCTGGATGCAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCGAAGAAGGCTGCGATGCAAGAAGAGTCAAGAGTGCTCAAAAGGGATTTACCATTTGAAAGCAATTATTTGTTTTAGAGTTCCAGGTTGC:1 - chrX 6079971 3' + gypsy8 4652 2 59.59 GGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCACCCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGACAACCTACACACTTTGTTCTATTAACTGGGCCCAGAAGTATCTCAACTAGTTCAAGCATATTCTTATCAAGCT:1 + chr3L 19434897 3' + G-element 3920 1 49.32 ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGACTAAACATTTTGACTATTCTTTTGGTGTAGGAGATTTTTG:1 - chr3L 17602544 3' - Doc 85 1 71.72 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCTATATGTTGGTATGCTATTATACTTACATATACACCCCTCTTCCGACCATTTCCCAATATTAATTACATTACAGGATGGGCTACTTATACTCCGCGTCGTGCTCAAACAAATCGATTAAAGG:1 + chr2L 5716439 3' - 412 62 2 71.92 CTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGNTATTTACTAAACACGATAGGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACGGCAGCAGTTTCAAANTATTTTACGTAATATCATTGTTCGCACTCGTAACTAACTTTTGC:1 - chr3R 13531850 3' - jockey 311 1 56.85 CGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGGGCGTGCCGGCATGTCTGAAAATTAAATTTGCACCACACAAAAACACGGAGAGTTGGTGAAACAAAAATTGCGATACAGAGAGAGAAACAGC:1 + chr2L 4063174 3' - accord 258 2 54.61 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGC:1 + chr2R 9871549 3' - roo 85 2 80.14 GGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAACCTGCAACATTTTTTGGCCT:1 - chr3R 8381661 3' - Tirant 16 2 74.66 GGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGAAAATG:1 + chr3L 4615784 3' - F-element 389 1 50.00 ATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGCATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTT:1 + chrX 21947757 3' - mdg1 7065 2 67.20 TGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCCCTGATCTCGGCAAACTTTCGACGATAGTAAAAATTCAGGTGGCTTCAAGC:1 + chr2L 22044601 3' - McClintock 5957 2 78.36 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACAATTACATAATATTAAAAAGAAT:1 - chr3R 10433167 3' + 412 465 2 65.75 GCGGGGACACAACATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGTAAAAAGTATCTCCTGCCAAGTGGCACGCTCCACTGCCTCCGCAGGG:1 + chr3L 7079030 3' + Rt1b 4751 1 67.59 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAAGAGGGGGTGGTACGTAGCAGAAAAGCAGAAAAGGACCCAAGAGGAAACCC:1 + chrX 1759071 3' - Tabor 36 2 58.22 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTCAAAGGAATACATTTGGCTCCTGCATTGAACATCTATTGCTGCAAACGGTAAGCCACTTCAAAGC:1 - chrX 14346936 3' - flea 28 2 60.80 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGACCTAATTGAGAATATTATATCTGTTCTGTTAATGATTGCTATTAATTGTAAGAGCTCGTAC:1 - chr2L 22690098 3' - copia 61 2 58.22 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTCAATAGCTAAAACACTTATGTACATCAAGCTAAATTATCAATGCACTCTGCGAGATTTTAAAATT:1 + chr2L 17353106 3' - 297 28 2 59.68 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAA:1 - chr2L 16554581 3' - blood 46 2 53.42 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGGTTTTATTTTGTTTGTTAT:1 + chr3R 12115353 3' + 1360 3330 1 63.43 CGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAAGCAACCTACATTTTGCCCAAACTTGGGCCACATTTCAGTTTTGTTTTGTCGTTTTCAATTTGCTC:1 - chr2L 3390963 3' + I-element 54 1 57.53 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGTGTACAGCGATTGATCAAGTTTAATCCTTT:1 - chr3L 21636405 3' - 297 6617 2 61.64 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGGACATCCAGTTCGTTCTTCATTC:1 + chr2L 3911986 3' - roo 9 2 79.45 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCCGATCAAAATCGTAGGGAATATAGTTACACAACACGGTCATACTGACCAGCTGACCGGCTAGGGATG:1 + chr3R 10708339 3' + Transpac 5201 2 58.20 CGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACCTCAAAAACCTCTGTACGTTTAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCTAAAGTAAAAAT:1 + chr3R 15784415 3' + rover 6978 2 55.48 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGATGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCCCGCAGATAGTCGTA:1 + chr3R 13453405 3' - 412 7113 2 60.27 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAGGGTT:1 + chr3R 23579376 3' - roo 72 2 67.59 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAACATAAGACATGAAAGGCCGCAATCAGTCGGCAATGCCAAGGTCTCGGCTTATCCCCAG:1 - chr3R 12622141 3' + 1360 3363 1 67.81 TGCTCACTTGTGGGTATATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAG:1 - chr2R 18035120 3' + R1A1-element 5260 1 68.49 AAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGTTTTTATTTT:1 + chr3R 12115344 3' + 1360 3318 1 69.34 CGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTTTCTGTATTATTTTGCATTAGTTGCATTATTGTATCTGTTTCGTTTCACTTCTTGC:1 + chrX 2470854 3' + diver 5 2 61.64 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCCGCAACTTTAAGCCTTTATTAAAG:1 - chr2R 18723638 3' - 297 6604 2 65.08 GTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAGGCCATCTTTCTAAAGC:2 - chr2R 16185012 3' + 17.6 7364 2 58.22 TTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATG:1 - chr2R 12248958 3' - Juan 4075 1 52.05 TAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATGTATATCTCACCATCCAGTTGGAAATCAATGGCCCGTCTACTCTTTTCTAAT:1 - chr2R 12343881 3' - S-element 62 1 63.70 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCCTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCTAGG:1 - chr2L 15917605 3' - roo 8734 2 67.81 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTAAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAGCCTGCCGATACCAGCGCTGTCTGG:1 + chr3L 13889022 3' + 412 7510 2 57.53 CGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGAAAAACCCGAGCACAACATGAAAAAGAGGTTAATTAACGTGCATTCGA:1 - chr3L 20934093 3' - Max-element 8259 2 76.71 TTAAAACAAATTAATAAAAAATATACCCTCTCTTAGCGTCTATCCCTTTAAAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGGTATAATCTATTGAAATATCAGGCTTTGTTTAATTTCAAGCAGTCAGCCCATTATAATTGG:1 + chr2L 6705580 3' - Tc1-2 1367 1 66.21 ATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCT:1 + chr3L 21913466 3' - 297 6601 2 69.17 CATTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTCTCATATATACCATACCATATTTTGGCATACCTACTGCCCCGCTCCCAACTC:1 + chr3R 23511648 3' - 297 6643 2 64.38 AGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAAATGTGGAGCCTCCTCGACGTTTATGGCCCAGTAAACG:1 - chrX 2039148 3' - FB 929 3 77.14 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTT:1 - chr3L 19907131 3' + P-element 2805 1 19.86 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTACACGTTAAGAAATGCATAAT:1 + chr2R 19016083 3' - roo 8707 2 56.85 TAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTGTACTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTCAATCAACTCCAGCTACTGCTGTTATCATTGAATTGGTTGGCTAGCCTTAAGGGCATTGCCTGCCTTGGCCCAATAACAAATGAAATCGAAAGT:1 - chr3L 11183181 3' + gypsy6 149 2 72.60 GAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTACTTAGAAATAATTTGGTAAAAGTTCCTAAAACCCACCAATAGGCATAGTGATGAAGAAAACGCCTAAAGTTTATTGCTGCATACTTTTCGCCAGCTTTTGAGAT:1 + chr3R 18155027 3' + FB 246 1 62.07 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACAGGTTCCCTTTTCACAATGTGATGTTCAGGCGGAAAATGATTTTTCTTTAATACGAACAGATCCTTCTGTAACCAGCATCGAAAGTCGACA:1 - chr3R 4398269 3' - hobo 28 1 51.37 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTTAAATAAACATGAATTTTGAATTT:1 + chr4 868771 3' + roo 9045 1 67.12 ACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAAAATCAGCAGGGACATACTACTTTGCATACAGC:1 - chrX 17063951 3' + gypsy4 465 1 75.34 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTGGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGACGTCTACCAGGAATGTCCCCATTAGTGGTGCCAAGGGCTGGCGAGG:1 + chr3L 19593217 3' - Tirant 8180 2 60.48 GAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGGTGGCATTCTTGTCAGGGCGGGCCTTTAGAATGCCTGTGCCACCTGAGATTGCTGGCGAATGCAAGTGCGA:1 + chr3R 12579835 3' - pogo 297 1 56.12 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATAATCCAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTTTTTTCAAATGAATTTGCGGGAAAATCCCGGCTGGGAAGACC:1 - chr2R 18618446 3' - jockey 4709 1 56.16 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAAACAATG:1 + chr3R 24662037 3' + jockey 4942 1 53.42 GAAACTTCAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAATCGACTGAGTAT:1 + chr2R 16731369 3' + Tirant 8453 2 55.17 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGCCGTGTCTGA:1 + chr2L 15917724 3' + roo 9038 1 63.70 GTTACGCATCTTGTTATTGTAGTGTCTTTGTTGTAACTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGAAATTTTGGGAACTATAAAAGCTACAAAGTTAAGATTTCATCACTCGCTAGCCCTGCAAAATATGCAGTTCTCTCACTTCGTTGCA:1 + chr3R 14574897 3' - 1360 9 2 63.70 AATGTGTGGGCGTGACAGTTTTGACCGGTTTGTGGGCGGTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCTTCTTTGACAAGAGATTAACGGGTATCACCTACCCCAAGTATTAGCTTTCTTTAGAAAACTATATT:1 + chr2L 18788267 3' - INE-1 245 1 47.26 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGCGCTAGTTAAAGAATAAAAAAATGTAAGATCAAATCTCTTATTAACAGATGCATCAAGTCACATATTAATATAAGTATGGCGCA:1 + chr2L 7447990 3' - jockey 4705 1 52.05 GTCACAAAGGGGTTCTCAGCTACTCCGTATGCCTTAATAAAATTATAAAAAAAAACCCATAACGTTAAGCGTTATACAACCGGACAGATACCAGCTTATATTCTACTTTACACTGAGAGCACGTCGTTTATCAACTGGCGGTGGAA:1 + chr2L 13740625 3' + BS3 1734 1 77.40 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAATGCATGAGAATTTTAAATGCAATCCATTTGAAATG:1 - chr3L 5398007 3' + roo 9053 2 69.18 CTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATACATTGACTGAAAGTTACGGCCTTGATCCGAGTAGACGAGCTGTTCGGTGAGGCAGAGCTATACACATCGGTCATTTGACGAAGTAACA:1 - chr4 799115 3' + R1A1-element 5300 1 58.22 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGCCACTTGGTCACTTGGCCACTTGGCCGCTTGGCCTAACACTTCCGGTCCGGGGCCATAAACCGAAATCTCTTGTTTGCACTTGCCCGGAGT:1 - chrX 13458191 3' + hobo 2923 1 62.12 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGT:1 - chr3L 14233019 3' + copia 5086 2 56.85 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAACATTGTTTCATTAAAAGTTTTAGAGGGAAAATACTTTCCACTTGCACTGTGTTGTTTATCAGCTGTTCCGG:1 - chr2R 9091818 3' + 1360 3339 1 52.74 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTACTCCCACTCTTTGGATCCTCTCCACCGCTCTCTAAAAGCTCCTTATGTGCGACCGCATGTTGTTTCTCCTTCCC:1 - chr3R 11758473 3' + P-element 2841 1 53.42 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGGACATCCAGTTCGTT:1 + chr2L 3911978 3' - roo 8680 2 74.48 TATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGGCTCTGATGTCTGGCGCGTGGAGATATTCAAAGGGCACCATCTGCCGTCCTGATAATGGATCATTTTGGCAG:1 - chrX 19021925 3' - Doc 4475 1 53.42 AACATAGCAACAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGTGCAAAT:1 - chrX 19121894 3' - 412 7112 2 56.16 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAGGTCAATTCC:1 + chr3R 15047436 3' - F-element 48 1 54.79 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCGGACAGCCAGAAATCCAGACGGACACACATTGTTGTTTTAATTGTGCGCCAGCTTTGCCCCGCCCCTCAACGCCTTTTACTTGGGAAATTTA:1 + chr3L 22927576 3' + hopper 1387 1 43.84 TAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGG:1 + chr3L 18968696 3' + hopper2 1550 1 71.79 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACATTTGAATATATATGTACTTGATTAGATATAATTGGCTGTCAGTATGTCTCTTGATCGCTCCACTCAATCGCAC:1 + chr2R 23596090 3' + blood 331 2 54.11 ACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCATATAAGTGTTAACAGGTTACTTTTCAATTTGGAACATTCGATTCACATACAAAGCTTTTCAAATATGCGCGGCAATGTAGAGATGTGAGCTAA:1 + chr2L 16879401 3' - Bari1 1537 1 69.18 CTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCTCGTCGACGTATGTAAATGTCAAATTTTCTTTTACCTTGTCACTGATTAAAACCGGGAAATAAAGATGGGAGTCCTGTTGGACACCGCAAAAGTGACGCAGC:1 + chr2R 13716083 3' - P-element 2440 1 36.99 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCTCCCGTGCAACTAATGCACACTTAAAATAACTAACAAAACTCCATTAAAAGCTGCAGCCGGAAAGCGCCTGCGAAACATTTTAAG:1 - chr3R 8394377 3' + hopper 1414 2 80.87 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTACTCCCACTCTTTGGATCCTCTCCACCGCTCTCTAAAAGCTCCTTATGTGCGACCGCATGTTGTTTCTCCTTCCCTTATTTTCGTTTCGCTGGCATTATTTGAATTTAAATC:1 - chr3R 11758436 3' + P-element 2878 2 78.77 ATTATTTGAAAATATATTAGAAAAAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATTACCAGTGGGACTTTACCAATTTAACTAGCCACGTTGAACTTTGGCCAGACCAAAACGGGCGTCATTA:1 - chr3R 26418030 3' + 1360 321 1 54.79 GTGTGCAACTTGGCACCACATCCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGACAACATTTAATTAAAAATTCTATAATCTACGCCACAAAATTTAACATTTTCTTTGCGCAAT:1 + chr3R 9203328 3' + Rt1a 4876 1 58.22 CAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACAGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAGGCAGTCAGTCAACCCTCGAGTGTTACGAGCCTTACAACAAATT:1 + chrX 10694360 3' + Transpac 5154 2 69.18 CATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGA:1 + chrX 21667939 3' - gypsy2 6544 2 68.89 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTA:1 - chr2R 18723686 3' - 297 6621 2 78.95 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAATTTCGTGCCTGGGTTTTTCGGCCCTTCCAGCTATTTTCTTACTTGATACTTTATACTTGCTTACAACGTAACTGAT:2 + chrX 471277 3' + S-element 1674 1 55.48 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTTACATCAAGGAGGAATACATGTTTG:1 - chr2L 21777770 3' + pogo 2043 1 61.38 AACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCA:1 + chr2L 13328494 3' - BS 46 1 58.40 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCGTTTTATAAATT:1 + chr3L 18968734 3' + hopper 1413 2 74.75 AATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAA:1 - chr3R 3922962 3' - Cr1a 96 1 76.03 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAA:1 + chr2L 20044633 3' - roo 56 2 62.22 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTA:1 - chrX 10667047 3' - jockey 4794 1 80.58 AAGTGTACGTACAAGTTTATAGTGTGAACAACCAGGAATCCACATTATTTTAATTTTAGGAGCATATTGCGTTATTAGCGATCGTATTCTGTTGGGGTAAAAGTTGTTTTTATTTGTATTTTGGATGCCAAATGTCCCATCGCAGA:1 + chr3R 10658791 3' + rooA 7592 2 60.96 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACTCACAGGCGTC:1 + chr2R 22971893 3' - jockey 4797 1 55.86 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCAAATATTTAATACTTGAAA:1 - chr2L 18284826 3' - pogo 51 1 54.79 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCGGGATGGATGGATGGATGGGAAGAGGCAAAAGGACAGGAGCGAAACAACATTTTAAGTCCTCGAATTC:1 - chr3R 13443387 3' - 412 43 2 58.20 CGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAGGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAG:1 + chr3L 22435229 3' + opus 459 2 56.16 ACATCCGTCGCCTAATTTAAACATGCCTTTCTTAAGCGCTCGCAACATCGCCACGTTCCCACGCTCAAAAAGGAAAAAAGAGGAAGATGGCGAAGCCGTGGCTGTAC:1 - chr2R 3186242 3' + Idefix 193 1 60.75 AGAGCGAAAGAGAAAGAGAGTGCGACGGAGACGCAGCTGTGCTACACTTGGAGAAATGCATAGATCCAAACTATTGTACAATCACAAACACCAAAGAAGTAGAAACTAACCATTTAAGCATTTATGTACATATTAGTATTTCTTTA:2 + chrX 19106980 3' - Cr1a 296 1 68.49 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAAATAAGCAATGCATGCAAGTCATACACACAGAAAAAAAACACTTTTACCAACTAAGAAATTTATATTGAAGAGGTGATTGAAGAAATATTTGTACCCTT:1 - chr2R 22761119 3' - 412 21 2 70.55 TAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTGATTTAGAATCT:1 - chr3R 17766717 3' + HMS-Beagle2 7138 2 60.27 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATTCAACGGACTCAAAAGTGCGGCTGATATAGAAAGCTGGTGTTTCTATATATAAATATAAGTTTTGCCTCCTCTGGAG:1 - chr3R 28803846 3' + hobo 2911 1 62.31 CGCTTAATAAAAACCAAATAAGGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAGGGGTAAGCACTTTTAACACCCCCACCCTTCGGCGGAGTAACTTTTGCATTAA:1 - chr3R 31275343 3' + mdg1 350 2 65.07 CGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACATATAAAGGACTATGTGGCTGTACACATGTAAGATAATGAGGGTGTCAGAGGTCGACTTCTCGACTCCGGGCCACTCGACTCCTCGGTTCTGTGTCATCAGCGAAACG:1 + chr3R 29191536 3' - flea 328 1 73.97 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATACACACATACATATATATATCTATATACATCTATATAAACGGAAGTGAAAATTAGCAAACCAGGAAAATGTTTTGCCCAAACTAATAGAGAGGCCAGATGG:1 - chrX 12263660 3' + roo 9053 2 73.97 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATG:1 - chr3L 13546579 3' + hobo 2878 1 72.50 CTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGGTATCAATCCAGAAGCATTATACAATATATGAGGAATGCTAAGTTAAAAACGTATTGAAAAATATTTAATTCTAC:1 - chr2R 14050363 3' - Stalker2 7395 6 53.10 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATG:1 + chr3R 9551014 3' + P-element 2848 1 58.62 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAATCGACTGAGTATTTCCCATTGGAGT:1 + chr2R 16731382 3' + Tirant 358 2 57.53 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAATTTCTCGCTCACCAAACTAGCAGTAACCTAGAAG:1 + chr3R 6962442 3' - jockey 67 1 58.90 AAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACTTGGATTTGAAATGGCTCCATCTCCTCCTTGTAAACAGTTGTAACATTCAACTATGAACGGTAACAATCGAACCATGTTAATTCAGGCGTAGCCTTGAC:1 + chrX 23035996 3' - HMS-Beagle2 6902 2 60.96 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTCGCCCTCTGCCGCGTTTGTTGAGTTAACCCCCTGAAATTGAAGTTTACTTTTGATTGACGGCGGTGTGTGA:1 + chrX 18767917 3' - hobo 50 1 50.68 AAGTGGAATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGAACGCACTCGGGACAAGAAG:1 - chrX 21626871 3' - HB 79 1 56.85 ATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCCGTTATATTTATCACATTTGAT:1 + chr3R 12787423 3' - BS 5017 1 68.49 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAACCCCTTACCAAAAATGCGAAAATTCAGAAAAATCGAAAAATTTCAAATCACCCTAATGGCATTATTTTTAGTTAGAATAGAGTCTTAGACGTAAAA:1 - chr3R 29185608 3' - 412 7076 2 67.12 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGGCTTT:1 + chr2L 3908496 3' - jockey 4753 1 73.97 ATGTTAATGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTG:1 + chr2R 17609823 3' - mdg3 5342 2 76.71 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACCTT:1 + chr2L 11476382 3' - pogo 45 1 52.05 TTTTGTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAGCGTGGGAACGTGGCGATGTTGCGAGCGCTTAAGCAAGGAATGTTTAATCACAAACACCGCATCCAATCCGATGACCAGAGCCGGCTTCTTGTTCACAA:1 - chrX 20406572 3' - Idefix 269 2 61.65 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGAGCGCTGCAATCACCCCGAA:1 - chrX 4469536 3' + roo 9012 2 60.87 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGG:1 - chr2R 21362744 3' - Tirant 8170 2 61.81 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAATAACATCTATCATAGAAATACAATATTTATGGACCAGTATATAGTATAAATAATGCTTTAAAAATAATAACATAGATATACTGCAGCTTTTTTAATTTA:1 + chr4 880439 3' - pogo 19 1 73.29 TAAGAAAAGAAAAAAGAATGTACGCTCTTTAAAGGATCCTTGACTAAATGTTCAATTCTTGCATGGAATTTAGTATATTCCCAAGTGATATACAGATGGCAACAGTTGGCCCACAAAAGACTTCACAGTCAAAACAAAACCGAATG:1 + chrX 6184504 3' + invader2 4751 1 53.42 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTNAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTACTGCGCCATCTTTGGACAGGACCATCTACTACCGG:1 - chr3L 21292495 3' - 412 7105 2 50.68 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTGGCTTTGAGTGGCAAGTCTGATTGTGTAACAGGATTTCGCAGTCCTTATGTTCAATTGCCAACAAATTGTGTGTAGTTTCTGGCGAACTGCA:1 + chr3R 8631746 3' - roo 29 2 65.75 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACAC:1 + chr3R 19246744 3' + jockey 4920 1 78.57 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATTCTGGGACATTGTCGATCCTTTGGAACGAGTCC:1 - chr3R 10708192 3' - Transpac 4 2 80.00 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATTTTAAATCATTTTGCCAGCAGCGTAAGTTTTAATAAATCATATTTAATACCATTTAACATACAATTTTACTTTAGGCAATGCTCTCTTTTCGA:1 + chr2R 18396702 3' + pogo 2076 1 64.38 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGTGGTGGAAGGGGGTTGCGGGCAGGGTTGGCAACACGC:1 - chr2R 21362703 3' - Tirant 8131 2 69.18 AGCTAAGTAACGGGTATCTGTTAGTCGAGGTACTCTTCTGCGCCGTGATCTGTTCTTATATCTAGAGATGTATTGTATTAAAAGCACCACATTATTGCATAGTGTAAATAAATAGTTAGTACATGGTGTAAATGAAAGTAGTGCCA:1 - chr2L 14381324 3' + INE-1 545 1 61.64 AAGTTTAGAAGGAACTAAACGATTCCTAGTGACTTTAAGATTAATGAATAATAAAAAAAAAAGGTCAAGCAGTCAAGTCCCGAAGTGATGGGACGCAAAGTGTTAAGTTTCATAGTTTGAAACAACTGTACAACTCCATTTGCAAT:1 + chr3R 2846370 3' + G5A 2800 1 77.40 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAATTTACATGAAAAATTAAAACCAAATGCAAAAGGGCTCCGAAAATGTATTTATTTAAGAGTAGCTCTTTGGCTTCCCTAACTATAGAAAAG:1 - chr3R 11208784 3' - jockey 4700 1 64.38 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTTTGTTCTGCTTGGCGGGTCATCGTGC:1 - chr3L 9522019 3' + opus 7463 2 51.37 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGG:1 - chr3R 13676115 3' - P-element 85 1 27.40 CTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAGAATGTATTGCC:1 + chr2R 5198492 3' - INE-1 85 1 62.33 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCT:1 - chr2L 3408739 3' + opus 7433 2 69.18 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCTGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTCATTCG:1 + chr3R 29283293 3' - hopper 51 1 52.74 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAAAAAAAA:2 - chr2R 25083255 3' + pogo 2064 1 63.70 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTG:2 + chr3L 20168308 3' + roo 359 2 52.05 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACT:1 - chr3R 23415890 3' + jockey 4956 1 57.04 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAG:2 + chr3L 8754834 3' + mdg3 5423 2 67.81 AATTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAACCCATTTATTATGATTTGCAGCTATTTGGTTATTTCGCTAGAATTTAAGAAAAACGTGCTATAGAACTGGTTTGTGATTCACATGAGTCGCGAATTAAATACGTTTAGGCTTTTTTTCTC:1 - 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chr2R 17649195 3' - Doc 44 1 43.84 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCG:1 + chrX 2104792 3' + roo 350 2 56.85 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAAGGC:1 - chr2R 24617069 3' - jockey 4746 1 75.76 ATTTTCCAATGTATTGATTGTGTGTTTATTGTGCGTTTATTTTGTTTACTTTTTGACCGATGACTTAGTGTGATTGGTCTTATTTAGACTACGCTACACTACACGCACGGGCTGCGAAAATGCGAGGAGCAACTGCCTTTGCTGGC:1 - chr2R 16924940 3' + transib4 346 1 77.40 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTA:1 + chr3L 8249462 3' + HMS-Beagle 6988 2 63.57 ACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATCTGCTTATTCAAGTTTTAATTGGTTGTTTTAATTCAAGGTAGGGTATCTTCAACTCTTTTTCGTTCAATGTTTTAATTCTCTTCCTTTTTGTC:1 + chr3R 30276806 3' + jockey 4793 1 65.07 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTTCGAGAAAGTATTGCCTACTTTCAGGTTCGTTACAGATTTCTCTCAATTG:1 + chr2R 18618581 3' + jockey 4966 1 58.22 GCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTTTTACCTGACTCACCTGTAATACGTATTCCCCTATCTACTCCAACCATCCCCCCTGCGTCCAACGAACAAGAGTCACGTCTCTGGCGTTGTCATAATGAATTCAGCGT:1 + chr3R 18006572 3' - accord 185 2 51.37 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACTAGCAAATGCTCTTTTAATATAAATTTTTTTGTATTTTCTTTTTAAACATTATTGCCTTGTGTGGCAGAACTTG:1 - chr3R 18154868 3' - FB 46 1 48.61 ACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAGAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATAAACTAAATAACTGCAATTATTGGAGTGCATTTATTG:1 + chrX 4744363 3' + INE-1 576 1 49.32 ACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGTGAACGCGAATTTGCATAATTTTTCTTGGATATGGATAGATATCGGTGAATAAAATGCGAACAAATTCATTGTGCGTCTTGTTCTCAAACTCCCTTTTCACTGGTG:1 - chr2R 10944066 3' - INE-1 538 1 67.94 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTAT:1 + chr2R 12379607 3' - pogo 56 1 60.42 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGC:1 + chr3L 17746382 3' - roo 8708 2 52.05 GAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCC:1 - 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roo 8714 2 52.74 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATA:1 - chr2R 21475238 3' + P-element 2798 1 24.66 GTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAG:1 - chr3R 23020779 3' + INE-1 568 1 66.21 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGACCAATGTGACAATGCAGTTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGGGTGGACCTTGGTTGCCTGGACGGGATGCACTCCAACGGAACAGGTGGAGG:1 - chrX 18767770 3' + hobo 2916 1 69.18 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGTGTCTGTGTGTTTGCGCTGTTTACCTTGACAACGCACATACAGAAAGTAAGCAAAAAGGGGAACCAT:1 - chr2L 1338394 3' - P-element 52 1 28.08 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCAATTATAGAA:1 - chr2L 3133659 3' - Doc 29 1 58.90 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAACTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAA:1 + chr2L 8895305 3' + 412 412 2 71.23 GGAAAATAAAATAATTGAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGAGCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCTACCCTTAGTCCTTAATAGCACACCT:1 + chr3R 19246746 3' + jockey 4928 1 69.17 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTACCTAAATTTCAATTC:1 - 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chr3L 20934124 3' - Max-element 39 2 62.31 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTACACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACGAATTCAGACCGAGAGCTTAATAAAAAAAAGTAGGTTTTCTATGAATTAT:1 + chr2R 4103319 3' - Quasimodo 61 2 61.81 TAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATGTATATTTTACCCGTGTGCGTGTCCATTGCGGCCG:1 - chr3R 23877863 3' - Transpac 4987 2 75.37 TGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACGAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCC:1 - chr2R 12248968 3' - Juan 4085 1 53.42 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTACTAACTGTTAACTTTAAATACCCCACAAAGCCGAAAATACCCACTTTAGATTCCGAAACCCGATGCAAAGTGCGTTTAAATGTTCAATGGATCCATTAGCCTCCATG:1 + chr3L 8323887 3' + mdg1 37 10 65.75 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTT:2 - chr3L 12125271 3' + roo 9016 2 58.22 GATCCTGATCAATAATATACATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTTTGCCTGTTAAATTCCTACAGGCCCTCCGCATCTACAAGCTGATCGCCNGAACAGACAACCATCGCGTGGCGCAGCTGGAAGGG:1 - chrX 1953786 3' - INE-1 80 1 51.82 AGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATACGTAACACAGACCCTGGAATAATAGAATAGTTATGTAAACAACTA:1 + chr2L 16721083 3' - Idefix 72 2 68.49 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTACTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAAT:1 - chr3L 5398041 3' + roo 9019 2 50.68 AACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAGGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAAACGCATGCAATACAAAAAAATCTCACTGGCCAAACTATAACAACTGCGAATAA:1 - chr3L 20607145 3' - Cr1a 4155 1 63.70 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAATATTGGTGGGCTTACGAAGGGAGTATATAAATTTTCCAGTTTAAATTGGGAAAATAATTTGTTTGGAAGCCACGTTGACATTTAATTAAATG:1 + chr3R 18319777 3' - jockey 35 1 66.44 GTTACCCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGGGAAAATGGCAACTGCACTATGAATAATTTTTGTTACCCATTTTGAGAGACGACGCTGCACTTTTATGGGCCAACAAATTTTCCGCCTTAACTCGCTCAGACCGAAAGTG:1 - chr3L 18119392 3' + 1360 3380 2 78.77 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAAT:1 - chr3R 18204332 3' - hobo 46 1 54.11 ATAATTTTTAAAAATTCGCGCTCTGACCATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATAAACAACTGTTAGCTTCCGACTAATTCGCAAACAAAACAAGTTCC:1 + chr2R 20051758 3' - 1360 3084 1 69.86 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCACAACTTTCCGGAATCTCCAACTGCTCGGGTCGCTGGGCTCCCCATTCGCACTCGAAATATCCAAAAATACATAAATCGCCGGGG:1 - chr2L 7810615 3' - P-element 37 1 60.27 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAGAATA:1 - chr3R 17777517 3' - jockey 4719 1 71.23 GATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTTACTTCGTGATAACATTGTAGACGGTCTTACGGGATACAGGAAACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTTAACCAGCTACCAGCAAAACACG:1 - chr3R 10634775 3' - invader4 339 1 42.47 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTTTAATTGAACTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCTTAAAGTTAGATCAATTTTCGCA:1 - chr2R 8086808 3' + 1360 3379 2 78.77 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCAC:1 - chr3L 13888885 3' - 412 7103 2 51.37 ATCCTATTATCTGTAATCTTTACTCTTTGCCGCTCCTAACCTAAGAAATTCTATCTTTTTTCAGACATAAATACTAATGATGGGCATACAAATGCTGATCCAAAAGGATTTTACTTACAAACGAGCGAGCAGAGGAAAAAGTG:1 - chr2L 15558745 3' + Cr1a 4221 1 54.55 GAGTGTATAAGCTTATGACTAAATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTATAAAATGATAA:1 - chr2R 16160751 3' - mdg3 5323 2 64.83 AGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACGAGCTCCAACCCTTAGTTTGGAGGATAATCAAGTAAGGCAGCAGACGAAA:1 - chr2R 25240142 3' + INE-1 96 1 57.53 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTGAATTGGGTCAGCAAAGTGTTATGTATGC:1 + chr2L 8895365 3' + 412 7532 2 74.10 GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGTGATTTTTACCTTTTTTTTTTGTATTGGTGTTTCTGTTTACAACTGGCAAATATTGACCCGCATTGATTGTCGTTTTTCCGCTTGTAAATTACTGAACTGAGGGGAATGAAT:1 + chr2R 16479855 3' - Quasimodo 40 2 79.45 TGGATGTTGCTTTTCAAATCTTGTACGGTTCACATAAGCACCGGATTTCAAAAAACCCCATAGAAAAAAATCACAAGAGGACAGATCGGGAACAAAGGTGAGGCATGTAGACGGTCTCAGTCGAGTGGAATGTTTTACATGAGGCT:1 - chr3L 25485215 3' - mariner2 654 1 62.33 CTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTAAAGAAAGGTGACA:1 + chr2L 22200704 3' + FB 407 1 48.28 CAGTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAATATACGGAATAGAAGGCGAATGGGTGCAATGGCAGGGGGCCCTGCAACAGCTG:1 - chr3L 13657657 3' + F-element 4354 1 64.38 GAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAA:1 - chr3L 20756367 3' - INE-1 558 1 61.64 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATATTTGCCAAAAGGTAGAAATATAGCGGCTGTCAACGGCGTCGAAAGCTTCAATTTGGCAGGGATGCAGGGTGGTCAAAAGGGGGCGGCGTGG:1 + chr2L 7336251 3' - pogo 14 1 72.79 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTT:1 - chr3R 23579267 3' + roo 9031 1 58.90 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGTCTGGCAGTTCAATTAGCAGAGTGCGATATGTTGAAAGGCATTCTTAATAGAATAATCAAATCGTAACAACATATTATTCTTATTATTAATATGTAGATAAGCACATTGCG:1 - chr2R 12343125 3' + roo 9062 1 77.40 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTTCCATTTAAAAATAGACTAGTAAATTTAATTTTTAGATAACATTTACCTAAATTCCTG:1 - chr3L 13992243 3' - blood 7073 2 60.27 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAAAATATTTTTTTAATATACTAAATAACATTTATTTTCAAGTTAGAGTGTATTGCATTCGAGATAATTGAACTATGAGTTATGAGCAGTCATAAATATCTCCCGATTTAGCAG:1 + chr2R 22964334 3' - 412 5 2 72.03 GATTAGTCTGCCCTTTCTTTCGGGAACCAATGTGTGGGGTAGCCGTTTAAGGCAACTCCCTGGATGCACGACGACATGGAGGCAGAATGGTCTGCAGCGTCATTGGATGTGTGTTATCCATCTGTTGCTGCACCACATCCATCTGC:1 + chr3L 2722248 3' + aurora-element 37 1 50.68 CTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACATTTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGCTAATAACATTAATTCCAATTTTTGGTAAATTTGTTAAAGACTGAGG:1 - chr2R 18720048 3' + 297 6872 2 64.12 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTT:1 + chr2R 18618532 3' + jockey 4917 1 71.23 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTT:1 + chr3L 15035248 3' - pogo 32 1 65.07 AATTATTAAAGATCCGTTTACTCCTCAAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCATTAGTTTAAATTGACCTCCTCAATAATTTCCTCCTCCTCAACCTCCTCGTATTCCTCCACAACGTAGATAACCTCAACGTTGGACACATCCATTAC:1 + chr2R 15967836 3' + Cr1a 114 1 56.16 AACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAATAAAAACTTGATTATGGAATTCGCATTGCTTTCTCGTATCGCATGACTCTTGTTGCTAA:1 + chr3R 8381828 3' + Tirant 8463 2 56.16 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTAT:1 - chr2L 1729765 3' - Transpac 4995 2 68.49 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCA:1 + chr3L 19907159 3' + P-element 2804 1 22.39 ACGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATGCCGTATGACGCCATTGCAGTTTAATGAATCCTTAAAGCGCTTTAAGATTTTTTTCA:1 + chr3R 12622395 3' - 1360 170 1 63.01 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATACATATATATATAGATGCAGGGATTTCGTTTCATTTCGGCTTTACGACCCTGAACCATTTGGAGCACTTACAACTAGCTATGGATAATTAAATGGGCTT:1 - chrX 20456825 3' - opus 7024 2 70.55 AGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAA:1 + chr3R 12622336 3' - 1360 212 1 70.54 CCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCATGTAGAAAAGGAAGGAGAAGTCAAAAAAGGAGAATTAAAGCTGGTAGAACACGCGAAATCCTAGACCTCCGGTCCGATTGCAGACTGTCGCACAGCAGACACG:1 - chr3R 5934989 3' - Quasimodo 324 2 73.29 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATTAAACATTTATGATGGCAGTTTTTCCTTGTTGGCTTCAGTAAAACATGCACAGCAAGCAGGCAGTAAAAATTATATGAACGGTGCCCCGTACTCG:1 - chr3R 7831195 3' + flea 4989 2 69.18 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAGGGGAGGAATTAAATGAGTAGCCCGAGGAGGAATAGGTTTCGACCTTTTTTTCCCAGTTGCGTTGTCACCTCCTCT:1 + chr3R 8394526 3' + hopper 1385 1 60.90 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGA:1 - chr2R 21362767 3' - Tirant 8195 2 78.08 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATCCTCCCGAGACCACG:1 - chr2R 14484071 3' - pogo 29 1 61.64 CGAAGCAGGCAGGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTACGCTTAGGGCAGCAACTTTGCCGCCTGCCAGG:1 + chr2R 15629071 3' - Doc 389 1 67.68 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTG:1 + chr3L 12634218 3' - BS 5080 1 75.34 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAGATCGTTATATAAACACCACTTCGGGAGTAAGCAATATAACAAAACATTTACTATGAACTTCGC:1 + chr3L 1477471 3' + mdg3 234 2 64.71 ACAAAATCGCGAAGTGAATAAATACTATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACT:1 + chr2L 6385915 3' + invader4 294 2 61.43 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAGGCAGTCAGTCAACCCTCGAGTGTTACGAGCCTTACAACA:1 + chrX 10694356 3' + Transpac 231 2 73.29 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCCCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTC:1 + chr3R 20345571 3' - blood 31 2 61.64 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCTCGTCAAAGTTGTTGTTACTTGGGCTGTTTTAGTCGCTTTTGTT:1 + chr2R 23790330 3' - roo 77 2 74.66 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCGG:1 + chrX 2104793 3' + roo 351 2 56.16 GCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGATTACA:1 + chr3R 934295 3' + Rt1b 4751 1 63.70 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCAC:2 + chrX 8208422 3' + roo 357 2 55.48 ATGGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATGATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAGAACTTCTANGGTGAAATGGACATGTTGCTGTCGGAAAAAAACAGGTTCAATGG:1 - chr3R 30510654 3' - 1360 335 1 61.64 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGT:2 + chr2L 4631226 3' + roo 9002 2 65.75 AACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCATGAATTGGCCAATTGTCCAAAAGTCGGGATCCGT:1 + chr3R 21679724 3' + roo 392 2 73.97 AATATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTTTAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAACATTTATTAAAATTTTCAAGATGGAGATAAGCTCAAAGAAATGCCAAA:1 + chr2L 17166441 3' + HMS-Beagle2 6829 1 69.18 GGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATATCAGACTTTATTTAGCCTGCACTCAAAATGAAAAACATTCATCAAAGAAATTCCTCTACACAC:1 + chr3L 9571358 3' - copia 4764 1 57.53 GGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACACGTAATTTAAGTACAGGGGCCTTAGTCTTATTAACTACTTAAATGCGGTGACTTTGACTGCAAATAAGGGGCTAAACAATAAACAACATTTTATTGAAATAG:1 + chr4 637819 3' + roo 96 2 59.59 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCAATGGTTCAATAATAAATGCAAATATATAGCGAAATGTAT:1 + chrX 7042770 3' + roo 392 2 74.66 GTTCGCCGGCATAGCCGCGAACAAGCCACNAGGGCCGAACGAGGTGCCTGACAGCGTCTTTAGCGGCTGTCTCGCCGCCG:1 + chrX 13114946 3' - Rt1b 4715 1 86.25 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATAGTGACGAATGGTTTTTGAAATCGTGTCTGAGCTTTTCCAGTTTCGAACATTTATAAAATAAACTAACAA:1 + chrX 20233906 3' + pogo 2068 1 60.45 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGGAAAGTAGGGCGAAATGTGTGGAAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCAGCACATATTGTATGTGTGTATTTTTTTTTTAA:1 + chrX 10959286 3' - pogo 36 1 67.81 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTTAGGGCTTC:1 + chr3R 19246816 3' + jockey 4972 1 65.07 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCTAGGAGCAATA:1 - 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roo 11 2 71.90 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCGACATAATAAACGTAAAGCTTTCGTTGTGAACGAGTTTTCATGGCAGAAGGCAAC:1 + chr3L 22435234 3' + opus 490 2 69.17 AACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTATTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATACAGCCAGCAATGAAACTG:1 + chr3L 22721151 3' - INE-1 32 1 60.66 ATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAACTTTAAAGACCCAATAATACCATAATACCATTAAAGTTAAAAGGAATTTTTAGGCGTTTAAAGTCTTTTTTCCTGCTGTTTAAAAAA:1 + chr2R 5422116 3' + G6 1987 2 60.27 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGGGTTGATGACTTA:1 + chr3R 27398151 3' + roo 9041 1 63.01 ACGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTGCTCTGCCAGTTGGCAAGTTGTGAAAGT:1 + chrX 7993176 3' + opus 458 2 58.22 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTAGTTTTTAGACGATTGTTTGAGCAGCCAGTCCAGTTAGTCGAGCACTTCTTTCCCTATCTGGATTTGGTTTTCAATTTGGCTAATGACATGGTGGTATATTAATTGTTACGAAATGG:1 + chr3R 21843905 3' + blood 7386 2 80.14 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGCATTTGTTGGTCTCAAGCGATTTTACATAAGGCCTCA:1 + chr2R 16749884 3' + roo 9050 2 67.81 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTCTA:1 - chr2R 8258236 3' - jockey 32 1 65.07 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATATCTAGGGTGGCTAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGTATTT:1 + chr3R 21655040 3' + roo 8996 2 70.80 TAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTAATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTAAAAG:1 - chr2L 3133715 3' - Doc 53 1 66.67 AGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATATGGTGCCCTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGACACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAATCAGGCTGCCAAAATCCGCTGGCAATGTGGTGAGCGACATG:1 - chr3R 26554490 3' + R1A1-element 5244 1 69.86 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTCGAATTTTGTATGCAGTGAGTGCATTATAATCAAGTTCGCACTTTCAAATTGCGGTTGGGGTGAATATTCACG:1 + chr2R 12343291 3' - roo 8701 2 56.30 ATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTCGACCATTCCCT:1 - chr2R 1320635 3' + diver2 348 2 68.49 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTTAGGGCTTCCCTCG:1 + chr3R 19246821 3' + jockey 4978 1 68.97 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGAAATACTCTGGCCACATTCAGACACCAGCGGCAGAAAACCCG:1 + chr2R 16367495 3' - hopper 20 1 69.18 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGAT:1 - chr2R 24807883 3' - I-element 63 1 63.01 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGC:2 + chr3R 20345530 3' - blood 7083 2 65.07 TCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGGTTCC:1 - chr2R 17609753 3' + mdg3 249 1 76.25 ATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGCATGAATGGAAGAAAGCCAGCCCAGTTTGCTGTTTTCCATG:1 + chr2R 24807638 3' - 297 256 2 41.78 AATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGACATTTCCTAT:1 + chr2R 17696117 3' + rover 7225 2 73.29 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCGTATGCAATAAAGTTTGCTCTGCCACAGCGAACGCAGC:1 - chr3R 23104451 3' - jockey 20 1 73.17 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTT:1 - chr3L 20168222 3' - roo 8752 2 78.77 AGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGATTAC:1 + chr3R 934294 3' + Rt1b 4750 1 63.01 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTTCGACGGGTCTAAACCAGCGAAGAGAACGTTAGTGTCAACACGTAAGAGCAATTCCTACGATATTCGTTTCTAA:1 - chr3R 28654694 3' - blood 165 2 90.53 CCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGT:1 - chr3R 9657748 3' - jockey 4736 1 61.59 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCGTTCCATGTGCATGTGATTGTGTGT:1 + chr3R 24734941 3' - jockey 4724 1 58.22 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGAACTTAACTCGCGCTCACACACACACACACTCACGCTCTCACGTGAGCGATTAAAATCTGAAGGAAAGCATTGCAGTTTTACCTTTTTTT:1 - chr3R 28045732 3' + Tirant 8466 2 56.34 TGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGTTTAAGTGTTCGGGTTTTCTTTTAATATAATCTATAGACACACTTCTCCT:1 + chr2R 5711819 3' - Quasimodo 410 2 65.75 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCGGCGGCCA:1 - chr3R 5170977 3' - F-element 86 1 71.53 AAAATTTCTTAAATATTTTTTTTTTTAAGTAGAACTCTTCTTTTTTTTTATTACATTTGAATGAAGTCACAATATTATCTTCCTATTTCAAAATATAGAAATCAAATCAACAATTTTTACCGTGTACTTGCAGCCACTATGCTTAA:1 - chr2R 18893665 3' - blood 6918 1 79.45 TCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTGTCTTTTTTATTTATTTATTGTCT:1 - chr2L 102440 3' - P-element 2627 1 19.86 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTAT:1 - chr2L 1729770 3' - Transpac 5000 2 71.92 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCT:1 + chr2R 12379618 3' - pogo 47 1 53.42 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACG:1 - chr3L 2485894 3' + jockey 4937 1 54.11 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATAGCGCTCT:1 - chr3R 22260450 3' - jockey 4745 1 63.70 TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGCAATTAANTTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTATCG:1 - chr3R 31458401 3' - jockey 69 1 58.90 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTAC:1 + chr2R 19016064 3' - roo 62 2 60.96 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTTTGCGGCTGTGTGGCACCCATAATGAGTAAGCCCAAAACAAGAAGTTCTGCAAGAGACAGGATCAGATTAAC:1 - chr2L 8930459 3' + roo 360 2 52.74 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTCGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGCATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACGAC:1 - chr3L 2485892 3' + jockey 4939 1 51.37 GTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGCACTT:1 + chr2L 18112602 3' - transib2 2597 1 50.68 GTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAGGAACGGGAATGTCTGTAGTATATGAACCATAAACCCCTTAAATATGCAATAGAACGTACGATAACTTTCTACTTTCACATTTATAATTCCCAA:1 - chr2L 13244614 3' - jockey 4582 1 65.71 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAATTCGCATTCATAG:1 - chr3R 25692689 3' - BS 5013 1 70.55 AGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGA:1 + chr3L 4615779 3' - F-element 394 1 50.00 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCATATCCGT:1 - chr3R 4190859 3' - pogo 26 1 67.81 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCA:1 - chrX 10667033 3' - jockey 4787 1 71.92 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAAAAGCACTGATCGAATTGAACGTCAACAATTGTTGCCTATCT:1 - chr3R 27007303 3' - roo 22 2 68.49 AGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAAT:1 - chr3R 9657718 3' - jockey 4714 1 51.37 TTTTCCTTTTCGTTTTTTTTTTCCAATTCCTTTTGGTTATGAACTGAAGACTCCAATAGGTAGACTCTTAGTTCATCATAGGGCATAATTAAGACTCAATTCAGTTGCAGTGAAACAGATTTCAGTACTGCTCGAATGTGCCTGCC:1 + chr2R 20127031 3' - Doc2-element 233 1 75.34 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTCGTAGGCCTCGATC:1 - chr3R 5574947 3' - blood 64 2 60.96 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCCCGCTACCGATACCAATTGGAGCAGGGGTCGTTT:1 - chrX 7508061 3' + roo 9045 1 67.12 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCAAAAACTGTGGCCAGGCTGCATCGTTCGGTAAATTAATTTGCATTTGACAAAGCTTTTATGCTCTTCATCCTTGAGGTCCTTTCCTCCTACTCGGATTCTCGATACCGGAATTGGAAT:1 + chr3L 11334555 3' + 1360 3383 2 62.33 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTAGACAACTTCCAATTTCCCCA:1 + chrX 6283726 3' + P-element 2819 1 37.67 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCACCTTT:1 - 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chr2L 23075093 3' - 1360 3 2 80.14 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAACAAATACTCTTTTTCTATGTAGCCATATAGGGATT:1 - chrX 12105206 3' + 412 468 2 54.79 GTGAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAATGACGACAACTGCACTTCGGGTCAGCTGGTGATCGCGTCGCGGGCGTCGCAGTACAAG:1 - chr2L 10434456 3' - TLD2_LTR 185 1 44.52 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGTAGGAGTGGATAGGTAATTGCATTCTCTTCCTCAT:1 - chr3L 7881124 3' - FB 88 1 77.40 CATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTATTGTTTCTTAATAGGTATTTAAAAGATATTTACTTTGACGTATAGTATAGTTCATACAATTTGC:1 - chr3L 11620268 3' + I-element 309 1 55.24 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTTACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTT:1 - chr3R 19246715 3' - jockey 4750 1 73.43 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACACTTGGCGGC:1 + chr2L 6385922 3' + invader4 321 2 77.50 TATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACACTTCTTATCTCCAAATATCGACTAATGATTAAAAATTATATCTCTTAAGATAACCCTACGTTCTTCAGCAAAGCTTAGCTCTTCTCCC:1 + chrX 22576489 3' - Burdock 6327 2 52.74 GTAAGAGCGGCAGAGAGTAAAGATTACAGATAAAATCTATGTTGAGGCAATGAGCTTTTTCATTGACCGGAGAAGTGGTGTGGCAATTTATAAACACGGTACAAAATCTACTTTATAAAATAAGTTGTGGTCCAAAAAAATCTATA:1 + chr4 401707 3' - Cr1a 4238 1 67.12 GAGCTTCCGGCCAAATCCTTGGCCAGCAATTTGGCCGGGAGCTCATGCTTGGGCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCCTACATAATAAAGAG:1 + chrX 21772481 3' - springer 7195 2 44.94 GCAAAACCAATGTATGGCCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCCAGACAATTTCAATCGATATCGTAAATACATTTT:1 + chrX 22689443 3' + 1360 3361 1 50.68 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCC:1 - chr3R 10433210 3' + 412 7475 2 66.44 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAG:1 - chr2R 8258280 3' - jockey 77 1 66.44 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTATTTTACCCTGTAAATAGGGGTTCCCACCTGCTGTATGGATGATTGAAACAATGCCCAATAT:1 - chr2L 4180744 3' - roo 8683 2 58.22 TGTGAGGTATAAATACCCTGGTTTTTAATTTGTGGCGTATCCTTAGGTTTTAGTAGTCTCCTTTATTAGCCTTTCCTCCTTTTCCTCTTTTAATTTTTATGGCTGGTCATTAGGGAATATGTATCATTTTTTTTAACGATTTATTT:1 + chr3R 19675692 3' - TAHRE 402 2 67.12 AATTCGTACGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTCTTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACA:1 - chr3R 13676121 3' - P-element 91 1 23.29 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTATACGACATGAAAAATGCAAC:1 - chr3R 21654957 3' - roo 54 2 54.11 AAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCATCAGCCAGCCGGCCAATAAGGATGCCGAGCTGCGCCGGCGCAAGCTGAACTTTCTGGGCCACTGCCTG:1 - chr3L 707347 3' - roo 9025 2 53.42 CAGATAACAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACTTAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATTGGCTAAAACACTACCGCGAACCCAACACNCCAACAAAATCGCCATCCCACTGGAGTTCTTTAAAGTTCTCTGG:1 + chr2L 16973626 3' - Cr1a 4212 1 50.68 ACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATTATCGGGGACAGTCAAAGTGTCAGCCCAGGTTGTTCATTCACAGCG:1 + chr3L 12683254 3' - I-element 5215 1 68.49 TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTC:1 - chr3R 13676131 3' - P-element 101 1 16.44 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAA:1 - chr2L 13850641 3' - roo 8739 2 68.49 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAAC:1 - chr2L 18112486 3' + transib2 2769 1 55.48 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAA:1 + chrX 15406069 3' + opus 454 2 48.63 GTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGCGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGG:1 - chrX 17495711 3' - Burdock 67 2 68.97 AAAATTCCGTATGACCGCAAGTTCAAATTTTTCGACGCACTTTCGCAACTTGACGCGTTGACTGTTCAGATCGAAAAGAAGGCAAACCGGAAACATTAGTCGTCCCGCAGCACGTGCAACAGCTGTTCGGAAACGCG:1 + chrX 1456484 3' - 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chr3L 19328987 3' - G5A 2426 1 58.22 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCGT:1 + chr3R 24734918 3' - jockey 4747 1 73.97 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAATATTGGTGGGCTTACGAAGGGAGTATATAAATTTTCCAGTTT:1 + chr3R 18319727 3' - jockey 86 1 71.92 GTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAATGATATCGCAG:1 + chrX 17495800 3' + Burdock 6325 2 63.70 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTT:1 + chr2L 8553417 3' + pogo 2045 1 58.90 CCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAA:1 + chr3L 21202092 3' - G2 2650 1 62.33 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCTAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGAAATATACACTTACTACAAAAACATGCATATGTGTGTAT:1 - chr2L 4268956 3' - hobo 81 1 73.97 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATATCCTTACCATTTTGGAACAAGCCAAAAAAAAACGTTACAAAAGTCTCCAGGGACCTGGTTATTG:1 + chr2L 20819337 3' - copia 57 2 56.16 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAANAATGCAGATATCTCGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTAAGCACCTACGTAGTAAGTACGCTTATCCCCCATTAGTTTTTCTATGGTGTCAGC:1 - chr3R 14800880 3' - pogo 61 1 60.27 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGGCA:1 - chr3R 17871842 3' + roo 9010 2 63.70 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCTCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGGAAACCAGAATGAACTACCGATACC:1 + chr3R 29283284 3' - hopper 60 1 57.53 CGCAATAACATCGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTAGAAAATATAGGGCTTTTAATTAAAATATGCAAGCGGCTCCAAATTACTTTCACTTGTGCGTGATCTGGGATTGGGAGTTTGGAGTTGCACAGCC:1 + chr3L 8642606 3' + FB 201 1 52.05 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGGTATTTCTGTCGCCTTAGCTTGCCCCCAAAAT:1 + chr3R 12787386 3' - 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hopper 80 1 69.86 AGATCAATAGCTGAGTCGATCTAGCCATCTAGTCCGCCTGTCCGTATAAACTTCGAGATCTCAGGATCTATAAAAGTTAAACCGGTGGGCCACTACGTGGGAAGAGGAGATGGTGGATGCCGGAG:1 + chrX 19122736 3' + INE-1 97 1 62.40 AAATTCGCAAGCTAACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATACTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAATTAGATGGGGGAAACCGAAACCCCGGCGCAA:1 - chr2L 19344261 3' + hopper 273 1 78.77 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCCGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGCGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACGCTTGCACTCCATCACTATG:1 - chr3L 5958624 3' + 412 427 2 59.86 AATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACATTATGAAATGCACCATCAAACAGATAATCGCCCGTTATATTGATAAG:1 - chrX 10094689 3' + jockey 27 1 67.81 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAATTGGCGCAAGCTAGTGTCCTAGTATCATGTTTATCTATCTCA:1 - chr3R 31046560 3' + I-element 5280 1 71.23 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTACTTGTCTCTTTTTTTGTATATAAATACAATTGTAAAA:1 - 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McClintock 5978 2 67.12 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACATGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCCTGCTCACAACTTTCCGGAATCTCCAACTGCTCGGGTCGCTGGGC:1 - chr2L 7810661 3' - P-element 83 1 28.77 CCATACATTGGTTTGGCACTACGCAGCCACATTTTTGGTGACGGGCAAAATTACCCTTTTTCCGCTCGCTTATGACTTACTTTTATTGCAGTTTCCCACAACCTTGGTCGCGATCCATATCGGACCTTCAGCCCAGAAATGTACCC:1 + chr3R 20772829 3' - 1360 3356 1 50.68 CCACCAGTGGTAAGAAATACAGAATAAAAGACCACGCCTTAAAGTACTAGGACCATAAGGTGAAGCTCTGACCTTATCAGGGTTTGTCTTAGCGCATAAAAATGTGACAGTTTCGCAGCGCGT:1 + chr4 715964 3' + rooA 421 2 52.03 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGAAAAGGGTTTATCATAACTTATTTATTGCTTATTCCAGGTTGTCATGTTCTTCGG:1 + chrX 13152824 3' + pogo 2038 1 61.64 TACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGATGCAGGCAGTTGCAGTTGGATTTGCTGGCT:1 + chr2L 17505050 3' - roo 9046 1 73.45 ATAAACATATAAACCAAAACAACAAAAACGCAAAACAAAAAATAAAAAACCCCAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCACGGCCGGTTTATATGTAACATATATAACGAAAACGCACAGCAACAGCAACAACAAC:1 + chr2L 8984606 3' + gypsy9 443 1 28.08 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCGATAGTATGACCATATCGGTTGTTTTCCAATTTGAAAA:1 + chr3R 16349316 3' + P-element 2849 1 54.62 ATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCAAAAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATATATAACATTTGGATTGAACCCATGCAATATCTTAA:1 - 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chr2L 7148551 3' - HMS-Beagle2 6935 2 53.42 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATAC:1 + chr3R 20260886 3' + roo 332 2 71.03 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTTTGGCGTTTTTCCACCGCT:2 + chr3R 24011102 3' + roo 9038 1 60.96 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATA:1 - chr2L 3133706 3' - Doc 76 1 73.29 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGCCCACTCGATTGCCCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTG:1 + chr2R 14332062 3' - jockey 61 1 79.79 TAATAATAATAATTTCTTTTAAAATATTCACTTCTCAATACGAATACTCATAATAGACTTTGTTGATATTTTAAACATCGTGTTAATCATTCGGTAGGGTGACACACAAGGAAATTCTTTTAGTTCATAAGCCAAATATTTGTCAC:1 + chr3L 17634858 3' + invader6 4393 1 65.75 TACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGTGTGGAAAATGGGGGAAAATGTCAACGCATGCAACATGCCCGGCGCCCAACTGA:1 - chr2R 18720604 3' + 297 242 2 55.66 GAGGATCTTTGGGGTGTTGTCAAGGATTAATGGACCAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTAGTGGACTCCATGCCAAGGCGATGCGCAGTTGTCACTATATACGATATGTGACCAGCCCGAGCGCCTGCAGTGATGAGCAC:1 - chr3R 7185086 3' + Tc1 1223 1 68.49 CTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAG:1 + chr3L 21913469 3' - 297 27 2 66.43 ATAAATTTGATTTGTAGTTATTTCGTAACAGACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAAACCATTTATGAATTAATCGCATGTCTTTTTTTTTCTAAAAATAGGTGGGGAAAGAAGAAGACTCGAGCTTATCTTCATTGC:1 - chr3L 1569778 3' + gypsy10 266 2 74.66 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATGACCTAACGAACTTCACTTA:1 - chr2L 13697601 3' - F-element 61 1 53.12 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTAATTTCAAGACTCTTTGAGTAGTTCCTATCTAAATTTCAATTCAATTACCATTTCATTCAATTT:1 - chr3L 20765108 3' - 297 6608 2 67.81 GGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTCAGAGAGCAGAGCAGGGCAAACGAAAGATGTG:1 + chr3R 28829140 3' - FB 92 1 79.45 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTCGTAGGCCTCGATCATCGACTCATGT:1 - chr3R 5574935 3' - blood 7063 2 52.74 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCCACTTTGCAACAACACACGCACATACACTGGAACTCCCGACACA:1 + chr3L 11119665 3' + P-element 2813 1 27.78 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCAGGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATATGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTG:1 - chr2R 6514259 3' + roo 8979 2 77.40 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTCA:1 - chr2L 13697592 3' - F-element 70 1 53.42 AGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATCTGAGAAATTAATATTGTTATTCAAATAAAAATTATGTATATTTTTCATATTCCTTGGACGAAATATATTATACCCCTCGAGGCGAAACTAATTAGCCCCTTCCGCAG:1 + chr3R 15585689 3' - I-element 5302 1 76.03 GGGGATCTTTGAGTGATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACACCTTTCGGGGTCCAGGAGGGACCACGGCATTCCAGCGAGGGTGTCGGCAGCCATCGGTTATATAGGTCGACAAACTT:1 + chr3L 2826223 3' + baggins 5374 1 50.68 TCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAATGGTCGGCATCATTTTCGGTATTTTGAAGACACTTTTGGGA:1 - chr2R 7116562 3' + jockey 4776 1 75.34 AAAATCAGTTTCTTACAAAAAATCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACAGACCCAAAGATTTCGAATTTCAATTATGGTCGATGTGCGTGGAAAATTTTCGCACCCGAAATTGGTATTGGAATTGGAACTTGG:1 + chr3R 5495414 3' + roo 9036 1 43.84 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTACAATCTTTTCGACGAATTTTGTATACGCTTTTTACCATTTAACTGAAATAGGTTAATTTGACTATGATAAATGTTTATTTATATGTGTAATAAT:1 - chr3L 21156976 3' + 412 471 2 68.49 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAGGTCAATTCCA:1 + chr3R 15047437 3' - F-element 47 1 55.48 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAGGGCTAAACAAA:1 - chr2R 9870997 3' + roo 390 2 66.44 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGAACTATGTCGATAGAG:1 - chr2R 24807856 3' - I-element 36 1 58.90 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGA:1 - 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chr3L 8754782 3' - mdg3 80 2 80.14 ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCGATGTTTTGGCTTAAAGTGTAAAGTGTTCCCGGTGCGCTAAGTGACTAGCCAGCCAGCCATCGATGAGCTGCAGCG:1 - chrX 1758928 3' + Tabor 7282 2 55.56 GATTCCTCTATAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGATATTTAACGTGAGTACCTAAGACACCTAACACCGATTGCGACCCGAATATATAACC:1 - chr2L 1015945 3' - Q-element 99 2 57.04 TATTCAATATCTAATACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAACCATTCATACCCGGCATGGCAAACGGCATCGGAAACGGAGGAGGATTATTTCCTCCCCAATGGGGCTCCTTCTTCTCATGCTCCTGTTT:1 + chr2R 5037809 3' + Stalker2 7628 2 65.44 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTT:2 - chr3L 21636438 3' - 297 6624 2 60.83 TGCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAG:1 + chrX 19690599 3' - gypsy 86 2 77.93 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGCCGTGTCTGAAAGCTAATTAGGTTGTCG:1 + chr2L 15917742 3' + roo 393 1 76.03 ATGCATGAATATGTGTGTGTGTGTGTGAGGGCGGATGTCCTTCTTATTGGGGGCGTGGTCATAGTCAACGCCTTTTCATACAACTTGAGTGTTTTCTTAACTTTAGAAACATTGGTTTTGCAATATGCAGCCATTGTTCTGAGG:1 - 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chr3L 9522017 3' + opus 468 2 54.29 GTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATTTACTTTATGTAATTTTCTAGGCCCATAAACAAACTTTAACTGTGCGATGAGCGTGGTAAATGCTTCGGCGGTTGCCAGGAGCAGGCCGCTCCAGCCGAAGGACATTTGCATTT:1 + chr3R 14187104 3' - Quasimodo 33 2 71.32 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATGTACTCCTCCTTGGGGCACTGTGACCACCATCGAGGAGCTGACACCGTCAGACTCCGTT:1 - chrX 12365295 3' - hobo 26 1 57.27 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACC:1 + chr2L 13316926 3' - jockey 4758 1 76.55 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAGGGTTCGTTGTGCGTAATTTCTGTGTAAATACTTGAATGGAACGACAAAGTCTAGGGCAAAC:1 + chr3R 23579433 3' - roo 8680 2 74.66 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAGGTTGGTTCATGCAAAACACCACCAGAATA:1 - chr2R 23790225 3' + roo 9031 1 57.53 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGAGAAAATGCTTTGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAC:1 - chr3L 23747150 3' + 412 7464 2 73.97 GTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGATAAAATTAATCTTGAGCATTATTCCCGGTGTGTTTGCGCC:1 - chr2L 17777953 3' - Juan 4130 1 71.92 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGC:1 + chr2R 19016061 3' - roo 8716 2 59.40 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACCCACC:1 - chr2L 16382504 3' - hobo 63 1 72.00 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCAAATATTTAATACT:1 - chr2L 18284831 3' - pogo 56 1 58.22 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAGTATAAATAACTCTTTGATGGGCAGCCGGTCGTGAGCTGGCCGGCGACTTTAGTTTGTTTAGTT:1 - chr3R 13453300 3' + 412 452 2 51.94 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATAT:1 + chr3R 9551011 3' + P-element 2845 1 56.55 CGCTCTCTCGCTCTCTAACATAAATTCGAGAGAGCCGGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCCGAACTGTCGCAATTGACATCCTATCCAATTCTGAG:1 + chr2R 3898432 3' - 1360 100 1 75.34 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAGTTTTCAATCACG:1 - chr3R 16349211 3' - P-element 37 1 47.27 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACA:1 - chr3L 15035107 3' + pogo 2048 1 60.27 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGGGGCATTTAGGAGTACAATTTTATACG:1 - chr3R 14138509 3' + mdg1 380 2 56.85 GTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACAAATTTGAATCCTTTATGACGTTCTTCCAGTTATCTGAGGCAAAAGTCTAGTTCTTTTCCCTTGT:1 - chrX 19024327 3' - Doc 4470 1 56.78 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGAGTAGTAGTGGGTATGGGAATAGTTCTCGTAGTCTCTGATCAGGATT:1 + chr2L 15917835 3' + roo 9015 2 55.48 ATTATTATTATTATTATTATCGTTATGATTTATTCAAAAACCTACCTGCTCCACAGTTAACGAATCGACGATCACCAAGAGAGGCTGCACCACCGCCAGGAGGAGCAATCAGACGGGAGGATGCGATG:1 + chr2L 8344122 3' - mdg1 7062 4 85.16 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGCTGTCTACCA:1 + chr3R 23416031 3' - jockey 4784 1 66.44 AAAATACAAATCATAAAAATCAAACATTCACTTTATAATGGAACATAATTAAAAAATTGAGTTGAACAAGCTGAGTTTTAACATATATTTTATTTAAAGCCAACTCAATTCATAAGTAATATTTTAATATTTTGGAATAAGCCTTT:1 - chr3L 10920771 3' + copia 193 2 71.23 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGCGGTGGGAAGACTTCTCCAGGACATCAGCCGCATAAATT:1 - chr3R 7600506 3' - hopper 83 1 70.55 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCGGCATTCCTACTTTGATATTTTTTTTCCCAGAACTAATCAGAGTTTGTTAATCAAACTTGTGAAGCTTTTCACGAATGATATGATATTTGAAAAATGTTCCTTAAAAAA:1 - chr2L 17136037 3' - hobo 13 1 55.48 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGCATTTGTTGGTCTCAAGCGATTTTACATAAGGC:1 + chr2R 16749880 3' + roo 9046 1 65.07 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAGAAATA:1 + chr3R 31032063 3' - hopper 65 1 61.38 AAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTCATAATGT:1 - chr3L 18010249 3' - diver 5964 2 68.49 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCTGTTACCAAGTACTAATCAATATAAATGTCCTTACACCCAGTCCGTTTGTCTGCTAGCCCGAACTAATGCTTTTCTGTAATTGTAACTGATTTTATA:1 - chrX 10056631 3' - hobo 24 1 68.28 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTTATTGTTCTTCTGCCATCATGATAGCTGTTGCGCCG:1 + chr3L 75518 3' - roo 83 2 76.71 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGTGTACACTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAA:1 - chr2R 24617072 3' - jockey 4748 1 76.34 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGTGATATATATATAATTGCAAACATAAATATATATTTGAAAATTTATGAAATTATATTGTGAAATTATTTTTTAATTTTATTGT:1 - chr2R 14161293 3' - I-element 39 1 58.90 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGACGCGGTTCACACCCCA:1 + chr3R 10751738 3' + hopper 1369 1 56.85 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTTCGGCTGAAGGTGCAATGAAGCCGTACGAT:1 + chr2R 13695746 3' - blood 40 2 57.53 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCACAAA:1 + chr3L 13546647 3' - hobo 65 1 62.33 GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACAACTACCTGTTTCAAATGCAAATACTCATAAAGCATTTTCGGCTCCCACACTCA:1 - chr3L 7562071 3' - FB 64 1 59.72 CCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTCGCCGGTTTGCCCATTTATACATATATTCTGCGGCTGTGTCTGTGCTGCTTTTCTATTGTTCATGAGTCCGGCTTTGTAT:1 + chr3R 8821948 3' - S-element 38 2 59.59 TGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATT:1 - chr2R 18035125 3' + R1A1-element 5283 1 66.95 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGTCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAAATTAAGCAAATAAGCCCGAGCAAAGAGCAACAAAAAATGGGGAAGCGAAAAAGTACTGGAGATTCAAGTA:1 - chr2L 16995439 3' + roo 390 2 68.49 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCACTGACTGCCTCAATGACGAGCGCCG:1 - chr3R 29283151 3' - hopper 6 2 78.69 CTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCCATGCTCATTACATTGCGCTTGCTGGCCACACCCTCTTCGCCATTTGCAG:1 - chrX 10666974 3' - jockey 4728 1 68.49 GAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCAGATACATTTTATCTGC:1 - chr3L 8754704 3' - mdg3 5257 1 78.52 GATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGT:1 - chr3L 27356083 3' + Tc3 1634 1 68.49 ACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTGCTCACACAAGCAAGCTAATTCTATATTTAGATTTCTTATGCTCTCAACGGGAGCGAGCGGCTAGAGAGAGCAATTTTGCCATTTTGCCATCAAACGCCATTTAAGTCGCTACAA:1 - chr3R 2740339 3' + 1360 3225 1 75.34 GTTAATGTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGCTTCTTGTGTTATTGTGTTTACTTAGATCTACATTACAGCAATCGTAATTCGTAACTCTGGTACAGTACTCGCAACTCAATACGTACTAAATAA:1 + chr2R 13183617 3' - Quasimodo 6896 2 56.16 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTA:1 + chr3R 6399472 3' - pogo 46 1 54.11 GGCTACCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACAATTACATAATATTAAAAA:1 - chr3R 10433171 3' + 412 7514 2 63.01 TCGCTCTCTAACAAAAATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTCGTATGCCGTTACGCATCTTGTTATTCGTGTCTTTGATTCACATAAAATTGGTAGCACAATGTTCGCCACAACAACGTTGGCGTTGTAAGCGGAGAA:1 - chr3R 20045112 3' - 1360 93 1 56.93 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGG:1 - chrX 10284798 3' + pogo 2046 1 56.64 ATGGGTGTATGAGTGTACAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGAACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTATAC:1 - chr2R 23278386 3' - mdg3 5333 2 71.03 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAATTCAATTCAATATTATTAAAT:1 + chr3L 13056526 3' - Doc 69 1 41.78 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAATGTGCNCTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCNTGACTACGCAATAGCAACAACA:1 - chr3R 9550933 3' - P-element 77 1 20.16 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGAAAGTGGACA:1 + chr3R 10030822 3' - BS 5034 1 65.75 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGC:1 - chr3R 18204329 3' - hobo 43 1 56.16 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCGG:1 + chrX 140106 3' - blood 48 2 52.74 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTATAGTCCAC:1 + chr2L 16995562 3' - roo 81 2 72.60 TTCTGTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGAACAACAATAATAAATCTCATGCCACTCGATACCGAACACACTTTTAAAT:1 + chr3R 17964906 3' + G5 4729 1 73.29 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATC:1 - chr3R 12115276 3' - 1360 63 1 66.91 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAA:1 + chr3R 24011059 3' + roo 331 2 71.92 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCCGTTATATTTATCA:1 + chr3R 12787415 3' - BS 5025 1 63.01 CCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTCAGCAAAAGTTGGTGGGACAAAGCAGAACTTTAATATATATATATTGTCGTGCATATATATGCCATAATAATTATCATAAACATAATTTTTAAAGACTGTCTGCAGCCTAAAGGTTT:1 - chrX 6186233 3' + Transpac 308 2 47.95 TTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGC:1 - chr3L 22038213 3' - diver 5954 2 62.33 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGGCCATGTGGCCAAGAGCGGATGAGTGGACAAGTGTTGGCCATTTGGCAGTCGATAAAAATGGCAAAGAGCCTAA:1 + chrX 13458325 3' - hobo 48 1 51.37 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCCCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAACGTGATGCTTTCCAAAATTGTTTTGTGGTGAGAGGGATTGTTTGTTGTTATACAAAAATTCTTCAAATGGGAGTGTTT:1 + chr3R 5518427 3' + Transpac 270 2 58.90 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGTTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTG:1 + chr4 490332 3' + pogo 2067 1 54.92 GTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCC:1 + chr2R 5532368 3' - G4 3777 1 52.41 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTACTTGTCTCTTTTTTTGTATATAAATACAATTGTAAAAATGTT:3 - chr2L 3911797 3' + roo 9047 1 69.18 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTG:1 - chr3L 13888900 3' - 412 7118 2 60.96 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTACTTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTAT:1 - chr2R 19015987 3' + roo 324 2 77.40 CCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCATACCGCTATAGCGGTATAAAATTAAAAAACTCGAAGTTACAAAAAAAATTATATATTT:1 + chrX 7847242 3' + hopper 43 1 59.59 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAATATTCGCAGAAAGACTGCTCCAACTTTAGCCTGGCGTTTAAATCTGGCATAATCACAACATCATAACTTAACGCTGTCTTACCT:1 + chr2L 14436768 3' - roo 8745 2 54.79 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTCTATTTCTTGCTTCATG:2 - 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chr2R 21475250 3' + P-element 2786 1 16.44 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCGGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACG:1 - chr3L 2485894 3' + jockey 4937 1 54.11 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAATTAAAAGGCGATAA:1 - chr3L 15389527 3' - I-element 58 1 53.42 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGTCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAAATTAAG:1 - chr2L 16995503 3' + roo 8989 2 73.97 CCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCG:1 + chrX 21667946 3' - gypsy2 60 2 69.86 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAA:1 - chr3L 22041095 3' - roo 91 2 80.82 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGATATCTCCTTTATACCTTGATTCATTCAAGTAAATAAACCAATTTGCAACCAT:1 - chr3R 24010980 3' - roo 58 2 62.77 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGTAAGGGTAGTACTATCT:1 - chr2L 1729725 3' - Transpac 36 2 49.32 AAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATACAAGAGCAGTATCGAGTTCGCCGGCATATCCGGCCTTTATGCCAGGCAATGGACTTTTACTCGGACAGTGGAAGAATGTTG:1 - chrX 19121401 3' + 412 179 2 65.62 CAAGGGGGGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCTAGGATTTGGCTTTTGGCCTTGGGGCGAAGGGCTGCTGGCCATTAAGGGAATTGCCGATGGAGGAATCTTTAATGAGAAACTAACAGCTAATAGTATTCCCTTTTCGG:1 + chr3L 13281936 3' - Cr1a 4403 1 79.31 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTA:1 - chr3R 23579271 3' + roo 9027 1 56.16 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCATGAATTGGCCAATTGTCCAAAAGTCGGGATC:1 + chr3R 21679721 3' + roo 9052 2 71.92 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATGCCTG:1 - chr2L 20044533 3' + roo 358 2 53.42 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGAGCACCAGCGGAAAGTCGCGTCAGTCGTCAGTTTTTCTTCAGTGGC:1 - chr2R 10541643 3' - P-element 52 1 47.86 CTGCCAGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTCAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAG:1 + chrX 19690599 3' - gypsy 7074 2 76.71 AGTCGTGAAACATTTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAAC:1 + chr2R 18723735 3' + 297 309 2 75.34 TGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAATTCGTTTTGCGAAATGCGCTCCTAAACTCTATTGTATGATTACAAAAAA:1 - chr2L 18176992 3' + INE-1 548 1 70.55 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCA:1 + chr3R 13684789 3' - 412 50 2 50.00 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATAATTGTTTATAATGGAAACAATTTAACGAACAGTTAAGTGCTAAGGACACAATAGTGAACCCCTACCTCATTGCG:1 - chr2L 9062263 3' - Juan 4070 1 53.10 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATTACGAATTACTGAGTTTCAGCTAGTGTATGTGCTGAACTAAATAATACACTAACCTAATCGCATCTTAGTTCAAATACATTCATATGAACATAATTTCA:1 + chr3L 13896135 3' - pogo 16 1 71.92 ACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGATTCAATTTGAGACTTTTGCGTTGCTACTATTTTAATTAACGTTTTCGTTTCTTCACTTATGT:1 + chr2R 22928973 3' + Doc 4404 1 57.53 AAAGTACATTATTAAAAAAAAAAAGTTTTAGAAAATTCCAAGCCATTAGGAGGTTTCGAACATTCCAATTAAATAGGTTCTTGATTAAGTTCTTTTATAACTAACGCTAAAACCAAAATAAAACCAAAAA:1 + chr3L 7012674 3' - hopper 162 1 81.54 ACGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAGAATATAGACATCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCACAGTCAAAAGTTTC:1 - chr3R 17777480 3' - jockey 4670 1 56.16 GTAACGGGTATCTGATAGTCGAAAAGGTGCAAAATTGAAAAGATGTGCGCAAGTATTTAAATAGCTGCGTGAAATCTCTGTACAGCAATTCATTTTGGTAATCTTTTGGTTTGTTATTAGCCTGCTGATTAGTTTTAAATAATTTA:1 - chr3L 12416135 3' + INE-1 551 1 69.86 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACCTGCTGACACCCCATCGGCTTGGTGGGGTTAATTTCTT:1 + chr2R 7955149 3' - FB 68 1 70.77 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGT:1 + chr3R 21679662 3' + roo 8993 2 70.55 AAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTT:4 + chr2L 18112585 3' - transib2 2614 1 60.27 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTCTGTCTATAAAATGTAGCAAAGATAAATGAAATGTGTAAAGGATTTCATTTAAAAATT:1 - chr3R 6399346 3' + pogo 2047 1 54.79 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTCCTCAAAATAAAAGTAAAATTAGTATTTCTATCAAGAAAACTTCGATTGAGCTGCATGGTTTTAAT:2 - chr2R 15472031 3' + 412 7499 2 50.68 ATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAA:1 - chr3L 16973322 3' + S-element 158 2 68.49 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACNCNGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATC:1 - chr2R 14484085 3' - pogo 15 1 62.71 GTGGGCAATCGAAATTATTTATTTTTAAATGGCGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATTAAGAAGTTGCCAAAATGTAGGCATAATTCTGTCGGTAATTTC:1 + chr2R 19931378 3' - FB 918 4 69.18 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTT:1 - chr3R 16881885 3' - 3S18 50 2 53.42 CTGCTGTAAACAACTCGCGAAATAAGCAGTATCGTAAAATATCGTAAAATCAATAGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGATAGTGTTAATTTGCATGCATTTATAAATAAATATAAATA:1 + chr3R 24106453 3' + diver2 4814 2 62.33 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGCTCGATGACGCTATAATCGAAAAAACTTTGCAGCATACTTTTAGGACGATGCCAGGACA:1 + chr3L 12633333 3' + jockey 4939 1 56.43 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCCGGAAGAGCAATAAAAACCGTAGCCTAC:1 - chr3L 19349890 3' + 1360 3369 1 69.18 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTATATTTAAAACCTGCAATAGAAAGCAGAAAGTTGAATGCTTTGTGCAGAAAAAACGTTT:1 - chr3R 4361575 3' + copia 5065 2 60.96 TAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGCACAAATCCCAAAGGAATCACTCGCGAAGCGAACGCATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGGTGTGTTTGCTTTGGCACATGAC:1 + chrX 20777224 3' - Cr1a 198 1 79.45 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTA:1 + chr3R 15047381 3' - F-element 67 1 75.45 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGTACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTA:1 - chr2R 23278389 3' - mdg3 5337 2 77.40 CTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATAATCCAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTTTTTTCAAATG:1 - chr2R 18618477 3' - jockey 4725 1 61.83 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACAGGTTCCCTTTTCACAATGTGATGTTCAGGCGGAAAATGATTTTTCTTTAATACGAACA:1 - chr3R 12342100 3' - hobo 60 1 60.27 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTATAAACTTACATACTAACAATTTTGGATTT:1 + chr3L 8295856 3' - Quasimodo 31 2 65.07 GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGG:1 + chr2L 3908492 3' - jockey 4757 1 76.71 CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCA:1 - chr2R 22596111 3' - Doc 91 1 77.40 GGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAATTTTCCTGCTGCAGCGACGAGTTCAAAGCGCATTATG:1 + chr2L 12987471 3' - jockey 4842 1 73.97 ACACGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTGCAGAGTGCGGATCGGGATCAGGTGGTGTCCACGATCGGTGACTATAGCTGATAACATTTTGCTCTGAAATAATTATATATTCTATGA:1 + chr2L 16378094 3' - Chouto 332 1 75.34 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGTAGCCATTCAGGTTGATGGCTGCTCA:1 - chr3L 21913291 3' + 297 6959 2 75.34 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTT:1 - chr3R 29384629 3' - roo 75 2 73.97 GCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGACTTTATAAAATTCTCATATCATCTGCAAGTAATAACATTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTC:1 + chr2L 16884774 3' + Bari1 1698 1 54.79 GGTGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGT:1 - chr3L 20934168 3' - Max-element 51 2 66.33 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAG:1 - chr2R 21475237 3' + P-element 2799 1 25.34 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGA:1 - chr3R 12182003 3' - mdg3 5340 2 74.66 GTCTGTTAGTTGACGCGAAGACTTTTTAGACGGACAGAAAGAGAGGAATGAACCGAGTCAGGCCGTCTAGTAGAGTACACATCCCACCAAGTGACCTTAGAAGAGAAGCAACCGCAGCCGCCAAAAAAAATCGAGTAGGGTTAAGC:1 + chr3R 4718171 3' + Gypsy12A_LTR 468 1 36.30 AGAAGGTTAAGGTTCAGCATACAGACTCTAGAGACAAAGACGAGGCGCAAGTTCGTTGACCTAACTTGCCACGCCCACTCCAACGTCACAATCCGCGCAAAACTGCCACTACCACACTTTTAAAAAACGTGTTGATATTTTTTCAC:1 + chr2R 5466809 3' + INE-1 172 1 66.44 GTTTGGGCGCCAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGTAACCTTTGTTATTTTGTTACTCTCCTGTGACTGTAATGTTTTTATTGGATGCATATATAAAGCATTT:1 - chr3R 23627710 3' - Burdock 265 1 53.10 GTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCATACCATTTTCATGTTGACCAGACAAACAATAGCGGCTGGAATT:1 + chr3R 8067782 3' - 297 6510 1 67.48 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTTCAAACGAAAACGAACTTGTGCACCTTTTT:2 + chr3L 2486044 3' - jockey 4684 1 61.64 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAATTAAAAGGCGATAAATGCATTGATACATCAAATGATGCATACAGCATCA:1 - chr3L 15389492 3' - I-element 23 1 67.81 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTACATGTACGTGCAGAGATACTAACGCACACATTCACACGGCTGAAGGGTCCCCAGAGTGGCATGACTGACTGAAAAGATTTATGT:1 + chr2L 7148686 3' + HMS-Beagle2 7158 4 57.53 CTCAGAATATTCACAAAAGCCGAAGGGTATATTAGAAACGAAGATACACAGATACACACCGCACGCACACGGAGTGCAATTCCAGACAATACTTAAAGCAAACAGTTGAACAAGAGCCTAAATACACCGAAAGGAAAGGAAAGAG:1 + chr3R 29653026 3' + Porto1 4347 1 66.90 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTATATACGAGCTCCTCAACTAACAGATACTCAGTTAGTGGGGGTAATTTCAATAATTTCCACATTATA:1 - chr3L 18122274 3' - 297 48 2 56.85 GAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTTTCTCTCATCTAAATGATTTATTGATGTCTATAGATGTCTTGTTTCAACTAGGCTATACTACTTTATTAAGACTTTGATAACAAGACATCTATAGACAT:1 + chr4 909820 3' - 1360 2973 1 41.10 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGACGGCTGATTTGCTGGCAGC:1 + chr2L 2608980 3' + I-element 5278 1 71.63 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGTGTCTGTGTGTTTGCGCTGTTTACCTC:1 + chr2R 21475277 3' - P-element 92 1 26.71 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTAAGCTTTCCGTTTAAGCGCGATCAA:1 + chr2L 19698184 3' - roo 8720 2 55.48 CAAATAAATAAATACAAAAAACAAAAAAAAATCCTAGACATAACATGCTGCAAACATGTGTTAACAATAAAAAAAAAACTATTGGATATTGGCATTAAATAAATGTATGTGGTAATTCAAGGGCAAGCTTGCATTATTTTGCTCAG:1 + chrX 19763685 3' + Tc1-2 479 1 76.71 CCATTCAAGAAACCACAATCGTTATTAAATGTTCCAAGTGGGTTACTTCCCGANANCAAGAGATGAGATGTTTTTCCAGTTTTAATTTGATAATAACAATTAAAGTCATTCCCACTTGATTTTCTACACAATGTCTTATCAATTCG:1 + chr2R 11189611 3' - hopper2 249 1 45.89 AATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTGATTTAGAATCTTCAAAAGGAAACCTTTATGATGCAAGACTGCACTATATTCTTAAATATATGTT:1 - chr3R 17766664 3' + HMS-Beagle2 308 2 76.71 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCCCGTTTCGTTCCGCACACATGGAAATGGATGGGCG:1 + chr2L 4631280 3' + roo 399 1 76.43 CCACGGAGAGCTGGTGACCAACAAGCCGTAGTCACCCTATTATATCATCTGAAGGAGTTCGCCAAGGCGCAAGCCACAATCGAGCGAATGCCCAACTACGGGG:1 - chr3R 21118022 3' + Rt1a 393 1 53.40 TAATTTGATATTAAAAATGAATATTCGACATATATAGACCCCAGATGCCACAATAAAAAGATTGCATATTGCAAAAACAAAAAAAATGTATATAAATAAACCTTCTGTTGAATTGGCATTTGTAAACATGGAGCAGCTGATTCGGA:1 + chr3L 11681198 3' - invader5 3695 2 67.81 ATACCCGTTACTCAGCTGGTTTTAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGCTAGATATTGGGAAATAAAATGAGAAAAAAATGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTAAGAAGTCAAATTTCTCTTAAAAAC:1 + chr2R 25223219 3' - INE-1 540 1 81.51 AAAATAATCAAGATACGAATGCAAATACTGGTATTTAAGTTTACATTAATGCTTTTGTTTGTTTGACTTACTTTACGTTAGAATTATGTATGATTAATGTATGCCCGCACACCGCCTCTTTCCCGCCCAGTTGGTTCTGGGGTGGT:1 + chr2R 21566496 3' - Circe 6953 1 67.12 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCATGGACAC:1 - chr3R 7041958 3' + Stalker2 362 2 56.85 CTGGAGGTAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTTCACCACTTGTTGTTGTTAGTTGGGAGTCGATTTATCGTTGTTGTTGCTAAAGGACATCCATGTGTGGAG:1 - chrX 7626101 3' + Transpac 5182 2 52.05 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATAAATCCTGCAAAGATGGTCGTCGAAACCTCTTGAAAAATGTCCACTGTTCGTTTATACAGCCCCGCACATATGCTACATAC:1 + chr3R 26605662 3' + roo 9034 1 61.38 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCACTCTTGATTAACCACAAAAAGCATTTTGACGGCCTACCAAC:1 - chr3L 5915220 3' - jockey 4792 1 68.94 AAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAG:1 + chr3R 29283254 3' - hopper 90 1 77.40 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAA:1 + chr3L 19907198 3' + P-element 2831 1 47.26 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAATTTCTCGCTCACCAAACTAGCAGTAAACTAGAAGTATGCAGCGATATTTATTTAAAACATAGACCAACAGCTATGAAAACTTTAAG:1 + chr3R 6962494 3' - jockey 14 1 77.40 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTTTGCCAATGCCATGCACGTACG:1 + chr3L 7102427 3' - I-element 35 1 56.34 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTGTTTACTCTACAAGTAACGCGATTATTGAACACATTTTTCAAAAACGATCGTCGCAGATGGAAAGAAAAACAAAAATGAAGAATAAATTGTCTGCAGCCTAAAAGTTGACT:1 - chr4 407082 3' - jockey 18 1 76.71 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCAAATATTTAA:1 - chr2L 18284835 3' - pogo 60 1 60.96 CTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAAATCCGCTCTTTTCAGTTCCG:1 - chr3R 16881862 3' - 3S18 15 2 73.88 CATATGTATATGTATAAATTTATTAATTTTCCCACTTTAATCATTTGTTGTAATAAAATTAAATACGTTTTCTTCGTTTTTCTTTTAAGCCTTTTACTTATATGATGAAGTTCCAGATTATTTCAAGTCGTT:1 - chr3L 18456788 3' + Stalker 247 4 82.58 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCC:1 - chr3R 5574977 3' - blood 77 2 79.07 ACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGCCAAACGGACGATGAGGGCTCCCTTTTGCGATGACGCCTAACGACTTGTGAAGCAATCGAGT:1 + chr3R 22886334 3' - Idefix 6969 2 57.53 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCCCCTTATGTTATTTCTTCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGAACGCAGTTAGCTGCTC:1 + chr3R 17944123 3' - P-element 34 1 57.69 TCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTTCTTCGGTCG:1 - chr2R 23595986 3' - blood 73 2 67.12 TAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCGGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGTCACAAATAGCGAGAGCCC:1 + chr2L 13328475 3' - BS 65 1 72.00 ATATAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTTGGGCGATATGTGTGCGATGTACATCCCCTTAGCTTATATATCCAATCGCAATTTATTGCTGCCGTGAAGCGAAAACTTTCAATCGGTGCCAATGTATATATATCTACAAATCGGTGTG:1 - chr2R 16137525 3' - gypsy3 429 1 81.25 ATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCTGTCAAACTCAAACATTTTCGGCAAGGTGTTTGCAAATTCCAGGTAGTGTTTCTATAAATTAAATATATTTACA:1 + chr2L 9599910 3' + roo 9026 1 56.16 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGG:1 + chr3R 24734915 3' - jockey 4750 1 76.03 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAATGGAAAAAAATTTGCATCGGTG:1 + chr3R 4361698 3' - copia 36 2 60.56 AATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAG:1 + chrX 21994029 3' - McClintock 25 2 67.81 AGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTA:1 + chrX 21667967 3' - gypsy2 39 2 63.70 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATAATCAAGCGTGCAGCTGAAATCCTTTAAAGATCTCAAGCTCTGTTGCCACATGAGATGAGATGAGA:2 + chrX 5456660 3' + roo 9018 2 54.79 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCACAAGCACCAAGCTGGAAA:1 - chr2R 17695986 3' - rover 20 2 71.23 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGCGGCGGATTGGCCCTGGCCTCCTGGCCCCGGG:1 + chr3R 17783682 3' - jockey 4810 1 73.08 GCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCTACAAATAATTAAAT:1 - chr3L 18947238 3' - BS 4714 1 50.68 GCGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAA:1 + chr3R 934263 3' + Rt1b 4719 1 41.78 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATGTATACGATTTAAAAGAATGTGAAAACAAATCGTACGCCTACGAAACTAATAA:1 + chrX 16589260 3' - pogo 61 1 64.38 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTTGCTTTGCATACGTTCATTTCGATGGCGGCCTT:1 - chr3R 24093463 3' - jockey 21 1 72.39 TCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAATATGTAAGGGTTTACTTTGATTGTAAAATAAATAAAGATT:1 + chrX 21227242 3' + Tabor 7298 2 64.38 ATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATCTGAGAAATTAATATTGTTATTCAAATAAAAATTATGTATATTTTTCATATTCCTTGGACGAAATATATTATACCCCT:1 + chr3R 15585659 3' - I-element 5332 1 55.48 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATGATATGGTATATGGGGTCTACGATGCAGAG:1 - chrX 17495657 3' - Burdock 14 2 76.03 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGATTTTAAGCGGATTTTGGAGTTTCTACAATGAAAATAACAACTTGGTAAACCTTCGATA:1 - chr3R 10751575 3' - hopper 14 1 74.66 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCAATTATAGAAAA:1 - chr2L 3133657 3' - Doc 27 1 60.27 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATCTTATTTGTAATTGAAGACTATTAATTTAAGCTTCGATTATTTATAGAACTTACATTTACTAATTGTTTCTCCCTGTGCACCTGTGTTTCAGCCAT:1 - chrX 15539923 3' - roo 22 2 66.44 TGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGGGGAAAAGCGAGTGGAAA:1 - chr3L 2687197 3' - jockey 4743 1 65.75 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTAAGCACCTACTTAGTAAGTACGCTTATCCCCCATTAGTTTTTCTATGGTGTCAGCACTGAGATCGTGTTGAT:1 - chr3R 14800863 3' - pogo 44 1 50.68 ATTCATTATTATTCTCATTTCACACCACAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTTGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATG:1 + chr3L 25232858 3' - accord2 7499 2 56.85 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATT:1 - chr4 868659 3' - roo 8747 2 77.93 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTT:1 + chr3R 13684769 3' - 412 70 2 63.70 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCAT:1 - chr3R 9657763 3' - jockey 4759 1 74.66 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAATTTCCGGAACTTCGCTGTTGCCGGTGGGGATCAAAATCT:1 - chr3L 17746223 3' + roo 389 2 68.49 ACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAA:1 + chrX 17495789 3' + Burdock 178 2 71.23 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGNACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCANTGTCTTAACAAGTTAGCAACATATTTCTGTGCAAAAAAAGCGGG:1 + chrX 20024641 3' + 412 7511 2 41.10 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCG:1 + chr3L 21913454 3' - 297 6626 2 54.79 ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCAT:1 - chr2R 22596110 3' - Doc 90 1 76.71 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTT:1 + chr3R 20983926 3' - pogo 32 1 63.70 CATGCTAGCTCCTAAGTTTGAAAGTACAAGAACTTTAAATTCAGTTCTGATTTTGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGG:1 + chrX 21667965 3' + gypsy2 6649 2 64.14 TATGAATCATTTTTGCATCTCTGGTTATAAAAAGCGCACGTTTAACCGGTCCAAGGGTTATATTTGGGTCTCGCGCACAACACAAGGTCAAGCTACAATAGAAGTGCTTTTTCGT:1 + chrX 16374892 3' + pogo 209 1 84.35 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTT:1 + chr4 868748 3' + roo 9022 2 52.74 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGC:1 - chr2R 8258269 3' - jockey 66 1 58.90 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCTGAAATGGAGAAACCAATCCAATCAGAAGCTTATTTTGCCGAATTTTCATTTAACGAAATTAACATTTATTACATGAATACATTTTCGCGTTTGGTTG:1 - chr3L 9659383 3' - mdg1 7060 2 70.34 CGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTACCATATAAACATAGTAGTTTTGCAATTGCTTAGCCAAGC:1 - chr2L 5818898 3' - I-element 4905 1 72.60 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAAGCACATACTACAAAATAAAATATTTTTTTAATATACTAAATAACATTTATTTTCAAGTTAGAGTGTATTGCATTCGAGATAATTGAACTATGAGTTATGAGCAGTCAT:1 + chr2R 22964313 3' - 412 29 2 56.16 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAAC:1 - chrX 10667035 3' - jockey 4789 1 73.29 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCAT:1 - chr3L 739153 3' + P-element 2861 1 58.04 AGAAAAAAAAAAACAAGAAAAAGAATTAGTTTCTTAATCAATCAACTGGCTGTTGAATAGCCATTCTCAACCTTTATAATGAAACAACACATACAAAGTTTTTAAACACCGAATATTTGTGTATGTTTCTTAAGTGAATAAGGTTG:1 - chr3L 9213216 3' + Doc2-element 227 2 49.32 GTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAACTTTCTGAACTACGAGATTCTTGGAAAAATCATATGACAATAGCATAAACTTGGTCTCCAAAGACCCCCAAAAG:1 + chr3L 18010347 3' + diver 6065 2 52.41 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATGGTACTG:1 - chrX 20233775 3' - pogo 50 1 53.42 GACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACATGCATTTTAAAAATCCGCCCACTGAATGGCTTTTATGCTGCTGTGTTGGCCATTCGAGATGGCCATTCACCCAG:1 + chr2R 12068890 3' + baggins 5366 1 49.32 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATAAATCATTGGGTGAAACTGTAA:1 + chr3R 21655085 3' + roo 9032 1 58.22 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTTTTCGGCTAGGC:1 - chrX 16589146 3' + pogo 2052 1 54.17 CTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAGGTGGAATAAAGTGGATCCCGAAAATGGGCATTTAAAAAAATTGTTTGTTTTGTTAGTTTTCTTGCCAATATTCTGTTCAGCGATTTGCTGTTTCAAAATGGGAATAATATTT:1 - chr4 123939 3' - HB 111 1 58.22 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCAT:1 - chr2R 8258297 3' - jockey 94 1 78.08 CAGATCCCCGTAACTCAGCTAGTGATTATGCGAACGCGAAAATTGTTCTTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGTGGAATAAAATGATTAAAAATTTTAAAATTCTCGGGAATCGGAAGTGGTAGTGGGCGGCTAGAGGATGACAT:1 - chr2R 22342057 3' - INE-1 543 1 69.18 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGAAAGTGCACACAGAAA:1 + chr3R 10030828 3' - BS 5028 1 68.49 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAGTCCAGCAGATACATATGCGATTGTTTTCTGTGTGTA:1 - chrX 2104709 3' - roo 81 2 75.17 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATT:1 + chr2L 19940149 3' - mdg1 21 2 70.50 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATTGCCAAAGGGAGTGCAAACATTACTCAGGCTAACGAGTG:1 + chr3L 20868120 3' + hobo 2911 1 55.65 GTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAACAGTACAATGCACAA:1 - chr2R 17696001 3' - rover 35 2 60.96 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCATGAAGTCATCTGGCTGAAATTAAA:1 - chr3R 20983792 3' + pogo 2041 1 62.33 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAA:1 + chrX 7032756 3' + roo 335 2 65.75 TGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATC:1 - chr3R 12789530 3' - G2 2812 1 62.33 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTC:1 + chrX 140104 3' - blood 7061 2 51.37 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGACATAAAAAAAAGGCTCACCCTAATCATAATTCCGGTCCAATATTTA:1 - chr3R 21654977 3' - roo 8738 2 67.81 CAGAATGTTTACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCTTATAAGTATGCCTTTGTGGGGTACACGTGTGTTAGTTAAAAATATATGTATAAATAGAAAGCATGAGTTGCTATTCGCAGTGAG:1 - chr2R 5704926 3' + roo 8660 1 56.94 TATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATATTTAGCTTGGTTTGATTTGCAATCATGTTGAACTCTATTG:1 - chr3R 6042036 3' + roo 8687 2 71.92 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTTTGCCAATGCCATGCACGTACGCGGATGTCCGTGCTCAATACCCATCCCAAATC:1 + chr3L 7102459 3' - I-element 6 1 77.24 CGTGCACACACACACACACACACACACACAGACGAACACTTAGAGTCGCGTGGGAGATGAGAAAAAGGAGAAAATGGGAGCGAATCGTAATGAAAAATTTCT:1 + chr3L 7036676 3' + accord 180 2 76.47 CTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGTATCTGAAGTTAAGCGGAAAACGACCTGCTAAGTGAGCACTCAGTGCCAATCAGTGGGTAAGGTTAGG:1 - chr2R 19331108 3' + I-element 488 1 62.33 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTG:1 - chr2L 20044551 3' + roo 340 2 65.75 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTA:1 + chr3R 27398105 3' + roo 8995 2 69.86 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAANATTCAATAATTCCGAGATTGCCGTCAAAATTCGAGTCGT:1 - chr2L 6047833 3' - P-element 52 1 45.39 AGATATGAACGGTGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTGAAGTATTTGAGTACAGAAGAAG:1 + chr3R 22435617 3' - roo 39 2 58.33 CAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCCCGCTACCGATACCAATTGG:1 - chrX 7508075 3' + roo 9031 1 57.53 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACCTTAATGTGTA:1 - chr2R 21619307 3' + blood 338 2 58.22 CCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCCGCTCAAGTGGTCAATGTCTTCTGCATACATATGTATATGTATCATCTTTTCCGTTTGCATTTCGAGTGGAAAACGAAGCACTTTC:1 - chr3R 5524940 3' + Stalker4 180 4 64.00 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGG:2 - chr3R 4530683 3' + copia 5063 2 57.53 ATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCC:1 - chr2R 12248962 3' - Juan 4054 1 59.50 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGTTAACA:1 - chr2L 7774950 3' - I-element 62 1 62.33 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTA:1 + chr2L 16995554 3' - roo 39 2 66.67 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGTCCCTTTTCGGTGCCTTTTGTGCTGTGAAATTAAGCAAATAAGCCCGAGCAAAGAGCAACAAAAAATGGGGAAGCGAAAAAGTACTGGAGATTCAAGTAAATTTGTTAG:1 - chr2L 16995429 3' + roo 400 1 75.34 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATACCAAATTGAAGTTAAAATCTTCGGGTGTCGTAGTCAAGATAGTT:1 - chrX 16490410 3' - F-element 23 1 68.49 AATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAA:1 + chr3R 7042064 3' - Stalker2 76 2 67.12 TATGGGTTTTAAAACGGATTTATATAAGAGGACTTTGTACTCTAAGCTTAGAGGAGAGTGAATGTTTATAAGCCAGTGTACTGCCGCACGCCTAATGCCCGACATTTTCGACAAACGCTTTGTAATTG:1 + chr2R 11495896 3' - Doc3-element 4299 1 62.50 TAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGTATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATT:1 - chr2L 18112493 3' + transib2 2762 1 60.27 ACAATGCAATAACAATAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTA:1 + chr3R 7477488 3' - BS 5055 1 55.48 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATT:1 + chr2L 16607288 3' - 412 7127 2 66.44 CGTTACGCATCTTGTTATCCAAGTGTCTTTGGTTTAACTGTCTCAAACGTTGGCATATTTATGAAGTAGAGATTTAATTCCAATCCCATTTGCATAATTGATCGGCATCGGGAGCGAATCGCTGGCGTGGATTGTAATCGCCAGC:1 - chr3R 19724483 3' + 1360 3379 2 54.48 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTAAACACACATGTATT:1 + chr2L 21909147 3' + transib2 2754 1 64.38 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAATAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTG:1 + chr3R 7477471 3' - BS 5071 1 66.90 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCTTAGGGCAGTGAACTTTATGGCGAACATCCACCCACACCAGCGCAC:1 + chr3R 31032044 3' + hopper 1404 2 36.11 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACCACTGGTGGACGCCGAGGGTTTTCCGCGCAACGACATCGACGTTTAC:1 - chr3R 13676056 3' - P-element 26 1 67.81 ATTTTTGTTTTGTTTATTTTATTAAGACATCTTATAAATTCGATGTAATGTTTGTATTAGCCGAAATTAATGGTAATCAAGTCCAGACTAAATGGAGGGCCACTCCAGTTTCAAAAAAACGCCAATATGCACCAAGTTCGCATGTC:1 + chr3R 31356354 3' - Porto1 189 1 91.78 GTTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTAACGGCGCAAAAGGATGTATAAGCAGTGAAGGTAAT:1 + chr3R 17766871 3' - HMS-Beagle2 11 2 73.29 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGCTGCGACGTCGACTGCGACGCTGGCAGCGACAACAACGATT:1 - chr3R 17943989 3' - P-element 4 2 78.07 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGATATTAACTGTTTGAAACAGATGTTCGGATT:1 - chr3R 13375908 3' - 1360 17 1 72.60 GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAAATAGTTATATAGTATTAACATCAATTACATCTTTCGGAAACTCGA:1 - chr2R 5542228 3' - Quasimodo 67 2 72.60 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACG:1 - chr3R 14277872 3' - P-element 40 1 54.14 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCCTC:1 - chr3R 14277913 3' - P-element 38 1 32.22 CTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTATTGCACTTTCGAACGAACTTCTCAAATGAGATTAAAATTTACACAATTCAGGACTCGGCGAGGC:1 + chr3R 7133831 3' - Tirant 220 2 56.16 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTCTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTCAGTTGGTTAATATCAAA:1 + chr3L 21292602 3' + 412 7482 2 58.22 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAG:1 + chr2L 13850709 3' + roo 8992 2 71.23 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGGATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGGTACTTCAATTAGGAAGGAATACTTTGGCCAAAGTATACCCAAAAAG:1 - chr2R 23278378 3' - mdg3 74 2 68.49 TAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAAATCC:1 - chr3R 16881878 3' - 3S18 43 2 56.85 ATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTCGACCATTTGGGAAAACGCTGTCTGGGAAA:1 + chr3L 18154434 3' - jockey 4648 1 77.40 GGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTACAATTTCAAATGAAATTAAAGCTTTTTGTTTACCCATGGCTCAAGTAGAGTCGAGGGTTCGTTACACACAGCACTGTGGACAGAAAAATAGGA:1 - chr2L 1393999 3' - S-element 1328 1 63.70 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGC:1 + chr3R 19725419 3' - hobo 62 1 73.91 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTATAATTTTTCT:1 - chr3R 15102209 3' + roo 9039 1 61.64 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACANCCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACNGTGGGGAAAAGTTTCAGGATGCGGCGGCCATGGCCAA:1 - chr3R 5170970 3' - F-element 74 1 64.75 TAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACATTATCGAAACTTTTGGCAATTCGATATGCGGTTGCTGCCTTGAAATACATACCAG:1 + chr3R 10121268 3' - gypsy12 70 2 62.33 GTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGA:1 - chr2R 21619356 3' + blood 290 2 77.40 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATCGCTATCGATATATCGTTTTCATACTTTTCAAGTATGTTGGGCTTCGTTAGGTGTTTTGTATTTACTACTAGTAATACCAT:1 - chr2R 4902254 3' + Quasimodo 7333 2 63.70 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTTTGTTCTGCTTGGCGGGTCATCGTGCAACTGCAGAAAT:1 - chr3L 9522007 3' + opus 7475 2 58.90 GTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACATAGACAGACAAATTGTCGCGTCATGCTAGGTACAACAAATAAAACAAAAGCGTTGCTAAAAATTCATTTAAAAATAAATTTGAAAACATTGTCAAATG:1 - chr3L 16156493 3' + blood 7011 1 67.81 CTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGCATATATTATGCCGAGTACATGACGGTATTAGAGCAATAATCTCTGGCCCTAAAATAGCACTGCCCTGTGGGATACTCCTTTTGCC:1 + chr3R 22879780 3' + Tc3 1617 1 56.85 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCCCCTAGCCGGTTTAAAAATTTCAATTTCTGAAATGCTTAGCA:1 + chr3L 18968756 3' - hopper 10 2 69.77 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAG:1 - chr3L 1477364 3' - mdg3 60 2 55.48 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTT:1 + chr3L 12634228 3' - BS 5070 1 68.49 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTT:1 - chr3R 5495218 3' - roo 76 2 79.84 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATGCCTGTTTTTAATATACTTT:1 - chr2L 20044518 3' + roo 9037 1 60.27 ATATTTCCAAATAAAATTAGTNTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTT:1 - chr3R 15102224 3' + roo 9024 2 51.37 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCATGAATTGGCCAATTG:1 + chr3R 21679705 3' + roo 9036 1 60.96 AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCC:1 - chr3R 5574976 3' - blood 7100 2 80.28 TAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGCATTAGTTTACACTACACTGCATAGAGTGGTCTACACCCAGTGCATCTCGTATGTACA:1 + chr2R 13653500 3' + R1A1-element 5327 1 43.84 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTNANACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGC:1 - chrX 21227112 3' - Tabor 67 2 59.59 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCACAAGCACCAA:1 - chr2R 17695994 3' - rover 27 2 66.21 ATTAGATTCGGCTGCAATTCCCCAAATCTGGATCCCGTATAACTACATCGGTACGATACAGTGCGCATACACAGCTCTTTTGCACCTCAGCGAAAGGAGCTATGTGCAGGACTGGAAGCGACTCGGGTTCGATGCGGAATCACAGC:1 - chr3R 11792642 3' - Helena 1092 1 65.75 ATCTTATTATAAAACTTAAATTTCTAATTATTGCTTCTCTTGTTAAGTCCGGAAAAAAAAGAAAAGTTTAATTATTCATCTGACTAAATCTATGCAAAATTCATTCGTCACTACGGTGGATAATATATTGATCATGTTGGGTTAAT:1 + chr2L 16223206 3' - Doc2-element 4698 1 86.30 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGCATTTGTTGGT:1 + chr2R 16749858 3' + roo 9024 2 52.05 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAATTTCCGGAACTTCGCTGTTGCCGGTGGGGATCAAAATCTCAGCTGGCGACAA:1 - chr3L 17746210 3' + roo 403 1 76.55 AACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTTCCAGCACAAAGCGTCCATCGAGGCTCCGCTGGATGCGGCTTAC:1 - chr2L 4319490 3' + rover 74 2 66.67 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAA:1 - chr3R 18204334 3' - hobo 48 1 52.74 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGGTCACGTTGAAGACTCTCCAAAACTACGTCTGCAAGGTTTGCTCAGCCGTCAGCCCGGAGGCAGTGCCCGTTGCCGAA:1 - chrX 20161638 3' + Bari1 1660 1 52.05 AGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTANANAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTCGTGATGGCCCTCC:1 - chr3R 13898203 3' - 3S18 56 2 55.48 GTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCG:1 + chrX 21667946 3' - gypsy2 6532 2 67.69 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATTAAACAGATACAAAAGTAAAATTATCTGGTATCTGGCCCAGTGTGCACTGGCACCCTATCCCTGAC:1 - chr4 906092 3' + opus 7466 2 56.59 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGATAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGGGTTGATGACTT:1 + chr3R 27398150 3' + roo 9057 1 69.77 ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACCTTTCG:1 - chr2L 8553330 3' - pogo 83 1 77.40 ATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATACAAAAATAGGGGATTGCCAAAGGATG:1 - chr2L 20819255 3' + copia 5065 2 80.14 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCATTCTTAATATATTTAT:1 - chr4 868628 3' - roo 53 2 56.85 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACGAGAAACGCGC:1 - chr3R 14277862 3' - P-element 17 1 68.33 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCNCTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATNGCAAGTAAATTTCGTTGGTTTTTTTTCTTTTGGTTTTATAGGAC:1 - chrX 16607837 3' + P-element 2811 1 32.88 ACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGAAAAACCCGAGCACAACATGAAAAAGAGGTTAATTA:1 - chr3L 20934105 3' - Max-element 36 2 68.49 TAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGAGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTA:1 + chr3R 10751707 3' + hopper 1338 1 65.75 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTCTGGTTACTTGATTGCCCCCAAAAGTATGCAATGCTAA:1 - chr3R 19725377 3' + hobo 2875 1 68.00 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTTTTCAAAGGCGCATATAAAATGGCAG:1 + chr2L 11476408 3' - pogo 19 1 71.23 GATGCCAGACCGGGCTTCAGTGTGGGCGCCACATATATAAGCTAGAAAGTTTAGAGGACTTTCAGTATCCAGTATCTGATAGTCGACTAAAACATGCTTTCTTGTTTTATTGTAATGTACTTTACTTGTCTACACAGATAACAATT:1 - chr3L 17860558 3' - Chimpo 12 1 54.79 AATCAAACGGTACATAGTCGTCATTTACGCTTTATGCGTTGTGTGGGAAAGGGATTTTGATAACTAATGCCTTTTTCTTCTGCGCTCCGAATTTGTAATTTGTAAAACCAGCTGACTAAATACATATATCCGCCCTTATCTCTTTG:1 - chr3L 23233572 3' + S2 280 1 67.81 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGCCGAAACGGGGAAAAACTAAAAAAAAAGATACGTATAACTAAAGC:1 - chrX 10284766 3' + pogo 2077 1 65.75 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGCTAGTTTTGGATTAGCACAGGATTTAGATAGTCTTCATTATATAAAACATTCAGTTTAATTCTTAACTTT:1 - chr2R 8596912 3' + pogo 2053 1 51.37 AGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATGTATATAAAGGGGGAAAAGTACAGACTGAAATGGGAGACAATTTATTAAAATTATAGATGCTATA:1 + chr3R 15599037 3' - Idefix 51 2 58.90 CCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACAGCTTTGCAAAGTTCGCGGCCACCGTGTCTTGTATCACAGTTAAAATGAGTTCCCATTTACGTTTATGGCATTTTGAATTGTTTCATATGAGATTATTACCGAAGCAGT:1 - chr3R 12118074 3' + gypsy12 10183 2 73.97 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGTTAG:1 + chrX 20024613 3' + 412 7483 2 59.59 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATA:1 - chr2R 21475242 3' + P-element 2806 1 23.88 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTACACATTCCTACCCTGCTCC:1 + chr3R 17494953 3' + hobo 2890 1 79.35 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATGCCTGTTTTTAATATACTTTTCAACAAC:1 - chr2L 20044510 3' + roo 9045 1 65.75 TAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGTGACATTTTAAAGGAATGAGCAAAGAGCTTAAATGCACAAGTGAGTATCTAAGCGCGAATCGCTTAAAAGCCTAATGGGT:1 - chr2L 4570817 3' + hobo 498 1 56.16 AGCCTTAGACGTCGGGGACTTCTTCGACACATATTGTTTAATATCCCCCTACAGGTTTTCAATCGGGTTTAAATCAGAAGATGGTGCTTGCTACGGCATTGCAGTTTTTTTTCGCTCACACATCCGAGTGGGAGTCTGAAACTGC:1 + chr3R 31877787 3' - HB 1200 1 70.34 GCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGG:1 - chr3L 20934172 3' - Max-element 78 2 77.69 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTAAAAATGTGTATAATATCGTTAGATGCATTTGCAGAAACTGCTGCAAATAA:1 + chr3R 10900931 3' - F-element 49 1 54.11 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATGTAATATGGAACTT:1 - chr3R 21679603 3' - roo 8749 2 77.40 ATTAATAATAATTTTGAAATTAACTTACCCACGTACCAAGTGTTTTCTCTCAGTGTTGCTTTATATGTATTTTTCCTACGCCTATTCTACGTTCTGGCATAGAGTAAACCGGCGTTGATGTCGTTGTCGTTGTCAGTGTCTGTTTT:1 - chr3L 12365303 3' + P-element 2503 1 65.75 AATAATAAAGAAATAAAAAAAAACATGACATGTACTTGGAAACTAACCTTTCCGCTCATTGTGAGCTCTATAATATACCCTAAATTCTATTTTGTTTAGTTTTNGATTGCGTATTTTCCATCACTCTTTACG:1 + chrX 12596911 3' + Rt1b 5149 4 58.33 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTACACGTTAAGAAATGCATAATGTATTTAGCTT:1 + chr2R 19016094 3' - roo 32 2 64.38 TCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGCGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTCCCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCG:1 - chrX 6283641 3' - P-element 65 1 39.58 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTATTA:1 - chr2L 4631115 3' - roo 40 2 54.79 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGTTGATTACATTGTAGCCGTGCT:1 - chrX 19163217 3' - Burdock 18 2 71.92 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGAGCACTGAATTTAGGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGATCACCAGCGG:1 - chr2R 10541678 3' - P-element 80 1 22.56 CGGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTTATGTGTGTATAAAGGTATATTAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTACAAAAGGGAAAATGTATCTAGTTATCCTCGACCTGCAGATGCACCGCATCCAGTGCGCCGTCAGATTGCA:1 - chr3R 27516002 3' - G5 4788 1 69.18 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATGTAATATGGAACTTATGAGTCATGATTTCTA:1 - chr3R 21679586 3' - roo 8731 2 65.52 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACCAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGC:1 + chr2R 22971890 3' - jockey 4801 1 53.42 CGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTC:1 - chr3R 22260466 3' - jockey 4759 1 73.61 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTTCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTT:1 - chr3R 5170994 3' - F-element 64 1 75.24 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATTTTGCGTTTAGCTGTTTTTTTTTTATGTTATTTATATCAACGTGCAAGTGCTGCCCCCAATTAAGATGTCAACCGCATATCCTTTAAATTACCC:1 - chr2L 3646687 3' - FB 27 1 54.11 TATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTATGGGCCATGTTTTATACAACTAGAAGTGCACACTTTAATCGCGC:1 - chr2L 4691783 3' - I-element 5067 1 69.86 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAATATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTACACCTGCTATATATGTATACTTGATTTCTGCCTTTTATGATACATATTCTGACATATTCTGAGTCAGAAACCTCTAAATCTAGT:1 - chr3R 4668750 3' - FB 37 1 60.96 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTG:1 - chrX 4469549 3' + roo 327 2 71.92 CGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTACTTGATTGCCCCCAAAAGTATGCAATGCTAATAAATTCGCTTT:1 - chr3R 19725365 3' + hobo 2868 1 65.28 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTA:1 + chr3R 20260916 3' + roo 9025 2 53.42 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTCTTGAAATCGTTTTATGCCATCTGCATTAATC:1 - chr3R 24074736 3' + jockey 4945 1 50.68 TATCGATATCCCAGAAAAATAATCATGTTTCGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATTGCTTTCTCTCTTGTTTTGACTTTGAAAATTTACAATTATGTAGATGACAGAAAATCGTC:1 + chr2R 4929334 3' + INE-1 503 1 62.33 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATCAAAAAGTGCTCTAGTCAATTATTCATTTCA:1 + chr2R 18767271 3' + pogo 2063 1 59.59 CAAGCAAGGAATTATTTAAATTAGGGAACGGTTGTTTAGTCTACCAGTGGGTGGTGAAGTCGGCTGATGCGACGAGAGGGGGCTTGTAAGTGTGAGGGAGTGAGGGTGGCTGGGGTCTTAGCAATAATTAAGTAAAAAATTGTAGT:1 + chr2L 21341967 3' - Idefix 206 2 68.49 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTTCGCCAGATGATTTATGTTCGGAGTGGCAGTATAAATCTACCG:1 + chrX 15252368 3' + opus 7430 2 69.18 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGA:1 + chr3L 7102397 3' - I-element 68 1 60.69 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAA:2 + chr3R 21679680 3' + roo 347 2 58.22 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGAAATATACACTTACTACAAAAACATGCATATGTGTGTATATGATTAGGAAGGACAA:1 - chr2L 4268939 3' - hobo 64 1 63.70 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTGAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTAGGATAACGGAATTTTTCCGCGCCC:1 - chr2R 20230958 3' - jockey 4759 1 78.62 GGGAGTATCGTGGTGGCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGTAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCAGGGTGGTTGCGATTGGCTGACGAACATGGGTGTCCACAAA:1 + chr2L 22181199 3' + R1A1-element 4994 1 72.59 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCCAACTTAACTCCGC:1 + chr3R 19725455 3' - hobo 24 1 60.18 TTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGAAATCTTTTTGCTGTCCGGTTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGTTAGCAACATATTTCTGTGCAAAAAAAGCGGGCTAGCATGAAAGAGAGAGAGACAGGCGACGGG:1 + chrX 20024673 3' + 412 7543 2 63.70 CAATTTCATCCGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCAAAGAGTCGCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGTTTGTGTATTAAATTAAATTACGAGAACTTTACTTGTACTACAGTCATTTTAA:1 + chr2L 8340680 3' - invader4 43 2 68.49 AGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGGTATAATTTTATTATGAACCAACTTGTAAAGTTATTGA:1 + chr3R 12182053 3' + mdg3 5413 2 73.29 ATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGTAGACTATTCGATTTAGCACGCCGTACGTTGGTTCTGCTCGCGTTCCGCCAATTTGTACCTTTGCAGAATTATTTACTTTTTAAATTGATGGTTCATTTATATTCCAATATGAAATATAGTTAA:1 + chr2R 25163184 3' - Doc2-element 4444 1 50.68 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGAGAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCGTTCCATGTGCATGTGATTGTGTGTGTAAGGAGTTAACAAACACCAC:1 + chr3R 24734963 3' - jockey 4702 1 60.27 TACAAAAAAAAAAACAAAGAAACCGCACCGGGCACACACTTCCACACAGAGACACATAGCTGAAAACATTCGCACGCGCGCAGTTCAAATGCCTTCG:1 - chr3L 9710585 3' + G2 3075 1 82.47 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTTTTGAGCAGCTGTAAGAAAAAAGAGTTGCTTAACAGCATGTAGTTAAACCCCTAGATGAGCTTATCCCACTCACACGCACATTAATCATCAAACCCAGAAATAAT:1 - chr3R 12538010 3' - mdg1 15 2 71.23 GAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAA:1 + chr2R 16731357 3' + Tirant 346 2 61.65 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTTTCGCCTAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAGTATATATGTACATGTTTAAGACGTA:1 - chrX 10694242 3' - Transpac 31 2 64.38 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCTAAATGCACAATGTTAAGTGCCCAGCGTT:1 + chr2R 14332140 3' - jockey 34 1 65.75 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTTGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAATGCATGAGAATTTTAAATGCAATCCAT:1 - chr3L 5398015 3' + roo 9045 1 62.33 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATGTTCAGCTGGTGGAAAGTTGGTGTAGAAATTGCAAATCAGGTGATGCCGCGCAGTCGGAGCTTTGA:1 - chr2L 3059337 3' + P-element 2873 1 67.89 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAGGTTGGTTCATGCAAAACACCACCAGAATATCGATTCGGATTCGAG:1 - chr2R 23790209 3' + roo 400 1 76.92 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCG:1 - chr3R 4530664 3' + copia 213 2 56.85 TCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAGCTGCCATCAAAAAAACTGGGAATCGTGAGAGGGACCGTGCAAAGCTGGCATAGAATGCGTTTACTG:1 + chr3R 12118225 3' - gypsy12 47 2 50.37 ATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTTCAAGTGTTTATTTTAAAATTGTATTTCTTTCTTTAATATAATCATAATTTT:1 + chr2L 13675977 3' - flea 4822 1 64.38 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTCAGGCACTTTCTGCTTTCTGCTGACCCAGCCATTGTCTTCTC:1 + chr2L 13468309 3' + roo 8995 2 75.34 CCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGC:1 + chr2R 18723753 3' + 297 6909 2 65.75 TTTTTTTTTTGTTTTTATTTTGGAATTGTGTTTTCGGTCAGAAAAAGCTGAAGGACACAATAAAAGAAGTTTCGTTTTTGCTAGTTGTAACAGATTTACGCCATCCAATTAGCTAAGAAAACTAATCTGCCTAATCTTTCAGGAAG:1 + chr3R 4401583 3' - F-element 4685 8 47.26 ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGCCAAAAACTTTACC:1 + chr2R 18723766 3' + 297 344 2 55.94 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTGGGAATTGGTAATACCAAAC:1 + chr3R 30518940 3' + I-element 5286 1 65.75 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGGAGCCAAGCAAACATATGAG:1 - chr2R 13695597 3' + blood 344 2 62.07 AATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATCTGAGAAATTAATATTGTTATTCAAATAAAAATTATGTATATTTTTCATATTCCTTGGACGAAATATATTATACCCCTCGAG:1 + chr3R 15585663 3' - I-element 5328 1 58.22 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCCCATCGTTTATCTCAA:1 - chr3R 23415851 3' + jockey 4984 1 79.45 GGGGAACTCCACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAAATTTGATTATTATTTCTTGGACTGAATTCTCGTTTTATATTAGATTCTTGACATGACCTTTAAGCTTAGTCTTTATTAGGCTAACGGCTAAAGCTTCAAGCGATTCCTTCA:1 + chr2R 332536 3' + INE-1 571 1 27.40 TTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTCTGTGGTCTGTTTTGACAGTGAAATGTCTACCATAAATATATGGTCTGAAATGATGTTTTTTTTTTTGCATTTTAATTGAAGGCAACGGCAAACGTTGTCATAGAACGGC:1 - chr2L 10561709 3' + Cr1a 368 1 36.99 AAATATTGAAAAATAAAAAAAATGCATTACTGGAAAATAAGTTTCGCATTGCAACACGTTTACAATTGAAGTTTAGGCATTAACCAAATATATAAGAATTTTTGGGATTAATATTTACAGTGTAAAATAGTTACTTTTTTTCATA:1 + chrX 9601937 3' + TART-B 10508 2 73.79 ATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACTGCACTATATAAACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTC:1 - chr2R 18723680 3' - 297 20 2 59.26 CCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGCTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAAC:1 + chr3R 17766815 3' - HMS-Beagle2 67 2 64.38 ATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGGGAAAAATTCATGTTTTGCATGTATGTGTTGACAGGCCAAAACATATGTGGCACGCCA:1 + chr3L 9605328 3' + 1360 198 1 74.66 TTTTTTTTTTTATTTTACCAAACCTTTTCTCAATCTCCCACAGGCGGGCCCTT:1 - chr3R 24063300 3' + Tc1 1476 1 88.68 TGTTGTGTATATAAACGTTATATCTAATGTTAAAGTTACATTTTGCTTACTTATTATCTATCTTATATTATTATTTGTTCCTTATGAAATATACTCATTCTTGCAGAGCTGAGTTTGCTGGCGAGAACTTTGTACGCTTTTCTGGA:1 - chr3R 29038002 3' + accord2 394 1 62.33 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCCAAGTGGGAGTTTGATCATGATGAGCATCATATTTTT:1 + chr2L 1451291 3' + mdg1 7437 2 70.55 TAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCT:1 + chr2L 21400808 3' + Doc3-element 4667 1 47.95 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAACTTATTTTTGCAACATTTTTGT:1 - chr2R 15406225 3' + I-element 5288 1 61.64 GCCGATATGCCGACAGACTTAGAGCCCACCCGAACCCGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCTTACAATATTAAATACCTTAATTAATCGCCCGCTTTC:1 + chr2R 2947560 3' + G5A 2606 1 77.46 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGTTTGTGCAAAGTTTGTGGGGGGGAGGCGCAAAGGATTGGGTATTTGGCGTTGCACTTAAAACATCTGAATTGTTCCAATTTCCATGGTAATGCTCGCTTAGCCAAATGA:1 + chr3R 18204498 3' + hobo 2932 1 76.03 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGGCCATAAAGCGCGTAGCACCTAAAAACAGCGGAGCGAACTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 11599882 3' + P-element 2825 1 41.01 AATTAAGTTAAGTAAAATTAAGTTTCATAGATAACGAAAACATTACAGTGCCAACAGAGTAAGAAGATTATCTAGCGAATTGTTAACTGATTAGAAAAAGTTAACAAAATATATAAACAATATAACTAGATACAACTAAAAAGTGT:1 + chr3L 7425282 3' + Transib5 335 1 79.45 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAACCGTGAATTAAAGAATAATTTGCAGACGACATAGTCAACATTTCCACTCAATTACCCGCACTAGCAG:1 + chr3L 16920317 3' - roo 22 2 70.55 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGC:1 + chr3L 8249487 3' - HMS-Beagle 19 2 66.67 CTTACAATTCGCCTCATTAAGTGCAAGCCTTATTATAATTAATAAACCTACACTAATAAATATATTGAAAAAAAAAACTTAGGGAGAACAGACAGTATTAACGAAATTGACTAAAAATATATACAAGCTCAAGATCTCGGAAGGCA:1 - chr3L 25255852 3' + Burdock 6315 2 54.11 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCTTCCACTCCTCACACC:2 - chr2R 16731262 3' - Tirant 65 2 61.64 CTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGCTACTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCGAAATTTCGTCATTTTTCTGGGATATCAATAGATATTGGGGAAGAAAATGAGAGAAAAATTTTAAATTGTTTAAAAGTGTGGGCGT:1 + chr3L 24073184 3' - INE-1 566 1 78.77 TGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCT:1 - chr3L 18947252 3' - BS 4726 1 59.72 TAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCA:1 - chr2L 16537536 3' - Transpac 4981 2 60.27 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAACTCGACCATTTGGGAAAACGCTGTCGGGGAAAATAGAATAAATTTATTTCAGGGCGCTTTCAGGGGCTTCAACTAGAACTGCATTCCTACTGACTT:1 + chr3L 18154498 3' - jockey 4573 1 71.11 GCTTCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATATAGTAAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAACAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCGTAAATAAA:1 + chrX 11906364 3' - INE-1 29 1 43.84 ATCGTCCTCGCGAAGCAATGCAGCCATACGCTGGGGGTCCTGGATTTGCCATCCTTACTGTTACATTGTTAATCTGTTAATCTTAAATTCGCTGCTGTTGCCGTTGCTCCAACTCCTGCCTTTGTTTGATTACCAGCCG:1 - chrX 6650082 3' + Rt1c 5318 1 61.15 GTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTT:1 + chr3R 2999831 3' - McClintock 79 2 73.97 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTGGCAAACAATTGTCTTGTTGATTAGGAATGTAATTTAGAGAGGTCAG:1 - chrX 5721779 3' - pogo 19 1 69.18 GGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATGCCGGTCGCTCAGAAAACTGTTTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCCTGCCGTAGGATGGCTGTTTTGCAACCCCAGTGAAATTTGGTCGCTCGCCCGCAGGTTAAGAGTGCGG:1 - chr2L 19518101 3' + GATE 8109 1 76.71 AATGACCAGCTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATTAATCATGTAAAAATTATAATGTACTTTAAATTTAATAAGTATATGGCAAGTTAATTGTAATATTGTGATATAT:1 + chr3R 12538174 3' + mdg1 7415 2 52.74 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGACCAGCACCGAAGCCAAAAGCGCAAGTCTAAGATCTATTATCACAGCGCCGCAACAGATAGCCAGTGTTTTCACATTACA:1 - chr2L 5341473 3' + Burdock 6354 2 62.33 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGGGCTTATTGTGA:1 + chr2L 16607322 3' - 412 7093 2 52.74 CGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACT:1 - chr2R 5070934 3' - gypsy5 6963 2 27.91 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGG:1 + chr3L 19907169 3' + P-element 2802 1 27.40 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCC:1 - chrX 10667023 3' - jockey 4777 1 65.07 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTGACATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACGACATACGATAACTTGTCATTGCTATCATTTCGCATTCCT:1 + chr3R 15102319 3' - roo 8743 2 68.97 AAACCTCTCACTAATCGTGGGAGGACTTAGATCAATTTGCGCCATACTACACGTTCCACCCGCTTGTTTTGTTTGTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGG:1 - chr3R 25692717 3' - BS 5002 1 64.49 CGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGATAATATGCATATTGTAATTCTAGTGTATATGTGTAGATGTAATATTTCTATCGAAAGAGGTGGAAGTAGAAATATTTTATTTTTTATTTTATATAATTACAAGTCT:1 - chr4 798425 3' + baggins 5144 1 26.71 AGTGAGAATGCTATAGTCGACTTGGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGCTTGTCGGCGTAAGAGGGATCGTTCAAAATGTGTAAGGTTGATCTAGAGCTTGATTTGCAACCCATAGACAGTACAAACCAAGTATCTTATCTGTGTC:1 + chr2R 20536218 3' - INE-1 576 1 65.07 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGTTG:1 + chr3R 23416024 3' - jockey 4791 1 63.01 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAATAATTCCGAGATTGCCGTCAAAATTCGAGTCGTGTACTTCAGCTAACGCTCCCCCTGTTTAATT:1 - chr2L 6047802 3' - P-element 26 1 67.81 AAAAACTCATACTTTTCCTAAAAAAAACTGAATTATACCACAAAATCTGAAAACAAGAAGGCAAATGTGTAAGTAAATAATTACATTAATGGCCAAATTCTTCTCCATGTAGCAGTGAAGTAGGTCAGTTAAGGGATTTTCCACAC:1 + chr3L 15789423 3' + I-element 5146 1 58.22 GAAGCTACTAATGGTTTCTGCCTTGGCTGGGTTTAACAAAAGAGTTTTAAGTATGGTTGCAAGATCCCACAGAGGTTTTGGAATCTACACAAATGGTAATAAATGTAATGTAAGATAATAGAAAATGTACCGATACTTGAAATTAT:1 + chrX 3470377 3' + hopper 399 1 54.79 TCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGG:1 - chrX 17495692 3' - Burdock 49 2 57.53 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAGTTGTTTTTTGTAGTTATATAAGTTATAAATAAAAGCATTTTGTCCACCCCCCACTCTAACGCCCTTAGACCGTCTAAAACTGCCACGCCCACACTT:1 - chr3R 4322611 3' - F-element 41 1 39.73 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAGTTTGTGCCATA:1 + chr3L 8249502 3' - HMS-Beagle 29 2 65.52 GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAGATCGTTATATAAACACCACTTCGGGAGGAAGCAATATAACAAAACATTTACTATGAACTTCGC:1 + chr3L 1477471 3' + mdg3 5469 2 53.78 TAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGG:1 + chr3R 23415986 3' - jockey 4829 1 64.38 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATACAAAAATAGGGGATTGCCAAAGGATGTGGTTAAAATAACAGTATATGATGGTCTTATCTTATAATGGTTTTGCATTTTATACCAA:1 - chr2L 20819196 3' + copia 255 1 58.90 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTCATGTTATTTCATCATGGTATAGCAAGTAAATTTCGTTGGTTTTTTTTCTTTTGGTTTTATAGGACGGATCACGATGGTTGATGGTTA:1 - chrX 16607815 3' + P-element 2833 1 48.63 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAGTCCAGCAGATACATATGCGATTGTTTTCTGGGTGTACTGTGCGAATCGAGATCGCCAAGATGGGGCCAGCCCACACAAACAATCGGAC:1 - chrX 2104657 3' - roo 8694 2 65.07 CAATAGCCGAGTTGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTATTATATATTCTTTGTTGAGTGCTTATAAGCTAATTTTATTAGGCATATTTAATCTTTAA:1 + chr3L 16657142 3' + INE-1 101 1 57.93 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTCATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAAC:1 - chr3L 18010227 3' - diver 54 2 53.42 GTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATAATAATTAATAAAATACATCTCCTAATTAATTATGTA:1 + chrX 9246073 3' - I-element 5297 1 73.97 GTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATTAAGCGATTTCTATACATCGCCAGTATCTAGGGGTTTTCATCTGAGGCCATCTTTCTAAAGCAGCTTGGTTG:1 - chr2R 16185002 3' + 17.6 447 2 55.48 ATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGAGTTGGTGAAGAGAGCGGTGGAGACTGAAAGATTCACTCTTCACCGTTAGAAT:1 - chr2L 7809058 3' + P-element 10 2 37.67 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACAAATTGTCATCATCAT:1 - chrX 10147871 3' + pogo 2053 1 56.43 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCATCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTA:1 - chr3L 5958626 3' + 412 421 2 63.70 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTTTAGGCAATCACCCATATGATTTTCTAAATAAAAC:1 + chr2L 8553451 3' + pogo 2080 1 71.72 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGAG:1 + chr3L 5958715 3' - 412 61 2 58.22 ATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTTAAGAAATTCTTTACACATTTGGTTTTCCTACTTTGTTTGTTCTTTCTCAATTACATTTAACAAATCGTTTTCCTCTAACAGTGCCCTTACTCAGAACTTCCAAAT:1 - chrY 685048 3' - S-element 1539 1 58.22 ACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATTAAACATTTATGATGGCAGTTTTTCCTTGTTGGCTTCAGTAAAACATGCAC:1 - chr3R 7831239 3' + flea 4945 1 65.07 GCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACTGCTGGATCCATTGGTCGAACTGGAGCACGAAGACATGGGCGAG:1 - chr2R 13001664 3' - Bari1 217 1 63.33 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGGTATGACTTGTTAACTTATGATTATTATTATTTAAATAGATAAAATCGTTGCGCCTTCATTCACTGCTAACCAAAAAAAAAACCCACAAAGGCAAAGAGCTGCGA:1 + chrX 8363669 3' - jockey 23 1 72.60 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAG:1 + chrX 7042709 3' + roo 330 2 70.55 AATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTC:1 + chr2L 13328503 3' - BS 52 1 56.43 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAATTTACATGAAAAATTAAAACCAAATGCAAAAGGGCTCCG:1 - chr3R 11208835 3' - jockey 4751 1 73.29 AAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGTAAAT:1 + chr2R 7769845 3' + Transpac 254 2 60.27 AATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATTAACATTTACATACGCTTCATTTTTAATGAACTGACAAATCTGTGCGGCTTCCCCGACCTCTCGTCAGGCCATAAATAAATCCGCGCACAAACGCAAATTTCCTCGCGGTC:1 + chr3R 13323993 3' + F-element 4668 1 77.40 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGGTATGACTTGTTAACTTATGATTATTATTATTTAAATAGATAAAATCGTTGCGCCTTCATTCACTGCTAACCAAAAAAAAAACCCACAAAGGCAAAGAGCTGCGAAAGAAC:1 + chrX 8363675 3' - jockey 17 1 76.71 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTTTTCGTCCTAATGACCG:1 + chr3L 15035262 3' - pogo 18 1 74.66 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGG:1 - chr3R 17871844 3' + roo 9008 2 65.07 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTCCTTGTCTCTTTTTTGTATATAAATACAATTGTAAAAATGTTTTTTA:1 - chr2L 3911792 3' + roo 388 2 69.86 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTGAAGTATCTGAGTACAGAAGAAGTTACTTTT:1 + chr3R 22435625 3' - roo 8697 2 64.38 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAATATGAAAGGGTTTA:1 + chrX 21227216 3' + Tabor 7272 2 52.05 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGTGGAAATGGAAATGCCGAAATAACTTACGCGTGCTGCGAAGAATCGTGACTCAAAACTTTCCGTTAATTATCCAA:1 + chr2R 11663932 3' + P-element 2843 1 56.16 ATAGCAACAAAGTGCTGCCAAACTGCAGTTCGTTTCGCATATTTTAAGCGGCCCCCCATCGATTGAGGCCAGAATCTTTGCGAATGCGTGCCATTACAGCAATTATTCGCCAAGATTTATGTGCT:1 + chr3R 29187290 3' - 412 7109 2 84.80 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATAAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATA:1 - chrX 16490454 3' - F-element 67 1 54.79 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGTTGATTACATTGTA:1 - chrX 19163225 3' - Burdock 26 2 66.44 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTCTTCTTAATGCCTTTATTTTGAAATTTACCAAATGGCCTACAAATAAGAGTGATTTTTTTTTTAATTCCAAAAGCCTTTGCTACATTTTAGGC:1 + chrX 3559704 3' - opus 112 2 76.42 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGTAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTATAGCTAAAAAATTTAAAAGAAACGTCG:1 - chr3L 20868011 3' - hobo 53 1 52.74 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTG:1 + chr4 490332 3' + pogo 2064 1 53.60 CGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGAAGCTGTTGAAAGAGGCAGTAGCGAAATTGTTGAAGCTGTTGAAAGAGACAGTAGCGAAATTGTTGAAGCTGTTGAAAGAGACAGTAGCGATATTGTTGAAGCT:1 + chr3R 2585604 3' - Max-element 77 2 76.87 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGTAAATAACAACACAATTATGAATGAGGAGAGCCTTTAAATTC:1 + chr2R 7769882 3' + Transpac 5210 2 69.18 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTA:1 + chr3L 5538079 3' - jockey 4747 1 70.42 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATGATACAGATCTCGTGGCACATTG:1 - chr3L 17757945 3' - Tirant 8177 2 68.35 TTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATATACAATGTAAATTCGTTTCTTCCCATGAAATTTATGATTTGTGTGAATACTCGGCCAAGGAAAAGCAGAGGTTCTGATTAAAGT:1 - chr2R 2017152 3' + 1360 3092 1 56.16 TTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCAAAAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTCTCGCCGACATATATAACATTTGGATTGAACCCATGCAATATCTTAACATTGCGCACCAGAA:1 - chr3R 20308162 3' + invader4 3013 2 65.07 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAGGCAACAAAACTATTATTGT:1 + chr3L 22435248 3' + opus 7481 2 70.55 GGTCCTCCGCTCCGGTGTCTCCTCGCATAGGCAGCTTCCTTGTTCCTTCCACCCATCCACCCCGCGCCCTTCGTTTTCAGCCTGGCAGTGAATGAAAACGTGCAGAGTGAAGATCGAACTGTG:1 + chr3R 2452254 3' - gypsy8 4584 1 73.17 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCTTTACACTT:1 - chr3L 1477335 3' - mdg3 31 2 64.38 TTGCAGATGTGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAATATTAAACTTCTCTAAGGGAGAGAAAAATAGTAAAAACTATTTTTATTTTATTAACGATGATGGAAATGAAGTAAGTAAAATTCAATCTTTGCGGCGCGCTCTGTACAAC:1 + chr2L 11887226 3' + I-element 440 1 39.04 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCT:2 + chr3R 20983917 3' - pogo 41 1 57.53 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAG:1 - chr3L 13888890 3' - 412 7108 2 54.11 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTGGGAATTGGTAATACCAAACGAAAAATACGAAGTAATAATAATAATGAGGTTTCCCAAGAA:1 + chr3R 30518981 3' + I-element 5327 1 60.27 TCTCCATCGGCATTGCTCCGATGTTGGCTCCTCCTTTTGCCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCATCTCCAGTTCCTGGGTGAGGGCGTTCTTCT:1 - chr2L 6728074 3' - R1A1-element 370 1 76.71 CCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGAAAAACCCGAGCACAACATGAAAAAGAGGTTAAT:1 - chr3L 20934107 3' - Max-element 8260 2 73.68 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGTTTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAAACGCTGGCCCACAGGGAAAACAAGGGAAAAGCACGAAAAATTCGGGCGCGGAATGTAAGAGCGCTTACAGCAGAGCA:1 + chrX 19887203 3' + P-element 2879 2 79.45 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCCGAAGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATACGACTTGGTCCCCAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCTTG:1 - chr2L 3408737 3' + opus 435 2 60.84 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACAACTAAGTGAACTACAATTATAACAGTTAAACTAAGTGAAAACCAAATAAACTACAAATAAGCGAACAATAATAACAACAATAACAATAACAGCGAAAATAAGTGAAAATTAAATAA:1 + chrY 473542 3' + 1360 3385 2 44.52 CCACACTTTTGAAAAATGTTTTGATTTTTCTTGGTTTTATTGTTTGTTTTACCAATTTCTGTCGGTATACCAAAAACACTTTTGCCACGCCCCTCCTTACACCTACAAAAATACGCGTATTTTTATTATTCCCTATTATGGATCTT:1 - chrX 23012243 3' + INE-1 258 1 75.34 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCTATGGCTTCT:1 + chrX 6615570 3' - roo 8719 2 66.94 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAACCCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTGTCGCAGCAGGACTTCAACGGGGGG:1 + chr2L 13850778 3' + roo 398 1 73.97 AAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTTAAGCACCCGAATTTTATTTAAAGCCGTTTTATTTTATATTTCTTTAATAGTGATACGCCCTGGCAAATATCAATTTGTTTTGGATTATACATACACATAGCATAGGT:1 + chr2R 16751573 3' + rooA 296 2 66.44 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTNAANATCATATTCGGTTTATAATTGCAGTTGCGGATTCTGGTAT:1 - chrX 140014 3' + blood 7308 2 74.31 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCACCCAAAGGCCAACAAATGCCATTAAAAATTGCCACGTGAAATGCTTTCAAAAGCCATGGAGAG:1 + chr3R 13530033 3' - jockey 28 1 70.55 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACTCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGC:1 + chr3R 20345542 3' - blood 7071 2 55.48 GGACCACCCAAATACGTCACTATATGTGTATCTCTGGAGAGAGTGCGAGTGGGATGGAGCATGGCGATGGAGGTAAGTGTTTGGCAAAAGTTGTGGTTCCAGATTTCTCATTGTCTTGTTTGCTTTGTTGCAGGTGATTAAGCTG:1 + chr3L 890855 3' - 297 6581 1 51.72 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAAGAGGGGGTGGCACGTAGCAGAAAAGCAGAAAAGGACCCA:1 + chrX 1759060 3' - Tabor 44 2 54.55 TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAG:1 + chr3L 22435197 3' + opus 7430 2 69.18 CTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGAGTGCTGTGCAACAAACTTGTGGCAGAGCGAGCGCTAATTAATTAGCAGTATTTCTCGCTCACACAACTGCCATTAAAAATTATGTAAGGCGGCACGCGATG:1 + chr2L 5961356 3' + S-element 1699 1 69.86 GTCGCGAACAAGTAGCTTGCCGAGATTGGTCTCAAAGTTCAGCCGAAGAAGAGCCAACAACAAAAACCAAAACTCAGGTGTAAGTGTAATGAGAGCGCAGCAGCACTCACGCACGCACACAGGCACAGGC:1 - chr2R 23067523 3' + R1-2 174 1 60.00 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTATAGATGACTGGCAACTGCATTGAAAATAAGCAAGGAAATGCTTTTGTTAG:1 - chrX 17477600 3' - Quasimodo 60 2 63.89 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATGTTCTCNGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGCAGAAAAC:1 - chr2L 21777762 3' + pogo 2050 1 53.42 TAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTAAATGCGAACGCTAAAATTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAACTTTTATAG:1 + chr2R 1751257 3' - INE-1 563 1 78.77 AAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCAAAGCGAACGGATGCATTTTGCACATCACTTGCTTTGCACTTACACTTGTTGATTATTTATTGTGCAATATTTTTATTGCGTT:1 + chr3L 3787574 3' - Cr1a 177 1 51.39 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGAT:1 - chr2R 8258264 3' - jockey 61 1 55.48 TCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTCGTAAAATCAGTATAGATGACATCTGTTTAATCGATGTGAGACTAAATATTTGAAATGATATGCATGCTATGTCTATATCTACCTATTCTAATAGTTAAATTTTAAT:1 - chr3L 10939316 3' - Q-element 342 2 52.05 GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTGCATTTAAAAAGGACACCGAGAGAGATTTACTTTTTT:1 + chr3R 30517670 3' - I-element 5052 1 74.66 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGCGTCAGTCAAT:1 + chr2R 22971900 3' - 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chr2L 7578741 3' - Ivk 65 1 66.44 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTATTTGGGCAGTTACTCGAATTATGTCCATCTTCGTTGCAACCAAAACATTT:1 + chrX 22574747 3' - 17.6 6962 2 57.53 ACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCGAGACGCTTACTCCCGGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAGAAAGGATGGGCTTCGAAAGACGGATTATGGAAGTACAACTGAAATGGTCG:1 - chr3R 28848717 3' + BS 4843 1 68.15 GCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGATATATTTGGTTACAAAATAGTTGTATTTATTTTTATAGCTTTTA:1 - chr2L 18238622 3' + Tirant 8269 2 69.86 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCATAAACTATATGACTTTATGTTCCATTTGTGGGTTTTACTGTTTTCCCTTACTCTTGGCCGGGTCAAAACTTCAAACAAGCTGAAACTTAATTTAATA:1 + chr3R 24444160 3' - hobo 21 1 68.49 ATGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTACGTTGATTTTATTTCGGCAACTACCATATTTTTTAT:1 + chr3R 13898285 3' + 3S18 6021 2 73.29 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTA:1 + chrX 7032771 3' + roo 350 2 55.48 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATT:1 - chrX 12105244 3' + 412 7483 2 65.07 AGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAG:1 - chr3L 22038243 3' - diver 79 2 78.20 AGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCTGGTTACGCTCAAGTT:1 + chr3L 10814621 3' - micropia 4996 4 57.53 AAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGATGTTCTGAAAAGATATGTCAGAGAAATGGGTCTTGTGGCTTGGAAAAACATTGATTTTCTCAGGATTTATATAATCTGAATGTTGCCATGATGAAGTTTACCAA:1 + chr2R 14336812 3' + jockey 4660 1 69.18 CAATATTTTCTAAAACGTGAGTTTGGTTAGATAATTCGTATTTTTAAAAGGGCAATAAGTTAAAAAAATTATATTTTAGTGGGTAGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGATGCAAAATCAACCAATAAATCAAATCAAGACCTTTCG:1 - chr3L 16064438 3' + HB 263 1 74.66 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGACATCCGCGACGAACTTGTTCTCGTAGGGCTTACTGGCCTTGCCGCAG:1 - chr3L 20222542 3' + mdg1 408 2 40.29 AAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTGGCTGCTCCCTGCTTCGGAGGTTTTG:1 - chr2L 14831910 3' - FB 954 3 57.41 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGC:1 - chr3L 17757941 3' - Tirant 8180 2 65.75 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGATTATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGTCAAACGGGGATTCAATGCA:1 + chr3R 15137399 3' + roo 9044 1 63.70 GTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGTCAATCACTGGGTTTTGTTTGCTTAGAAGAATAAATAT:2 - chr2R 11574959 3' + INE-1 145 1 65.75 TACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTTAAAACCAGGGTTTAGCGCGGCAATAAATGCCAGCAACATAAAAAAACTCAGGGATTCGGG:1 + chr2R 24771646 3' - roo 9046 1 58.22 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCCTGTTTTGCTGTCATTTTGTCCAACTGTCCTTTGGTCCTTTGGTCGCTTTGTCCTTCTGAC:1 + chr3R 14138669 3' - mdg1 7060 2 70.55 ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATTGAATCTAATAAG:1 + chr2R 12249056 3' + Juan 4150 1 59.59 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGAGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATC:1 + chr2R 22971856 3' - jockey 4827 1 68.84 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTT:1 + chr2R 8597039 3' - pogo 51 1 53.42 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAA:1 + chrX 15540058 3' + roo 342 2 65.75 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGGAGCCAAGCAAACATATGAGCACAGG:1 - chr2R 13695591 3' + blood 349 2 65.75 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACACACGATGACGACGTGCAGGTTGACTGCACCGATGGGCTTTTG:1 + chr2L 16382599 3' + hobo 2919 1 65.60 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATATCGCCGCCGATCGGCCTCCTCCTCGTTAAA:1 - chr3R 30788327 3' + roo 8988 2 79.45 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCCTACCCTTTTGCCCTATGCTCTGCTATTT:1 + chr3R 10433304 3' - 412 58 2 61.64 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCG:1 - chr2L 8895249 3' - 412 7139 2 74.66 GGTGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGGGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAATCGGAATATGCGCATGCAAATGGCATTAGCCTG:1 - chr3R 12941757 3' - hobo 24 1 61.90 ATGTGCGGGTTAACTGAACCCAAAATCAGCACACATTGGGGATCGACTACGAACCAAGAGCACCTACCAGCTCATTATTTCATTTCATTTCATTTCGCCAATGCAGCCAGTGTCCAGCGGCAGCGAAGGAGGCTAAGGAAAATTGA:1 - chrX 13514377 3' + Stalker4 7253 4 51.37 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACCAACCAATCGAATCGAAAACCTGGCACATTT:1 + chrX 13367526 3' - HMS-Beagle 14 2 76.03 GCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACA:1 + chr3L 8754829 3' + mdg3 166 2 71.23 GAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACNTGCTGCGCTGACGTACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTNATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCT:1 - 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pogo 15 1 72.66 GCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTG:1 + chr2L 16553603 3' - BS 5068 1 69.18 GTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTAATAGACCCGACTATGGGATTATTCGAAAAAGTTGTTTATAGACTGAAGCACAACGCA:1 + chr2L 5105001 3' - jockey 4901 1 65.07 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTTTATAATTATCATGTAATTTATAAAACCTAAAGATATTATTTTTTATTATAGCCAA:1 + chr2L 18738092 3' + roo 9050 2 71.23 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGAGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTT:1 + chr3R 24011084 3' + roo 9021 2 54.48 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGTAGTCGGATGAACA:2 + chr2L 15549958 3' - hobo 56 1 56.85 GTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACAGTAGGCGGGTCCTCTCACGTGCTCTCAGTGCCGCTCTCTGCT:1 - chr3R 9550859 3' - P-element 25 1 67.12 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGAGCAAGTGATAGAGTGTGTTAGGATCTTCGTTTCGGGTGGGGAAATCGTTCATAAAATTAATTAATAACGATGGACCATCCACTATAAATTTAAGCAAAATCCGAGGAGCG:1 - chr3R 10062086 3' + copia 245 1 72.60 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAATAAACACTTCAAATGCCAAACGGCAAAAGGCAAACACTCTTCAGACATGAGAGCAAACT:1 + chr3L 16697421 3' - FB 51 1 60.00 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGCATACTCTCCAGAAGCATTGAGTGAAAATATATGGTTGCATACTTTTCAACACCTTTATAATTGCTTTTT:1 + chr3R 28413981 3' - pogo 49 1 52.05 AAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCTCAGCTGTCCGTGGAACCGGA:1 - chr3L 4287039 3' - P-element 98 1 17.12 ACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAACATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATG:1 + chr2L 23034041 3' + FB 345 1 60.27 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGAAATA:1 + chr2R 16367458 3' - hopper 51 1 55.00 ATCGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAA:1 + chrX 12365357 3' + hobo 2889 1 76.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCTAGGAGCAATAAATTTAATCCGAAGGCTTAG:1 - chr2L 15917578 3' - roo 8707 2 56.16 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCAC:1 + chr3R 13684778 3' - 412 33 2 50.85 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGTTTTGCATATTTCATTAT:1 + chrX 7042704 3' + roo 393 1 55.70 GAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGGTATAATTTTATTATGAACCAACTTGTAAAGTTATTGATATGGAGGGAATTATAAAAATATC:1 + chr3R 12182077 3' + mdg3 185 2 56.85 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAG:1 - chr3L 20168203 3' - roo 8733 2 65.75 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTG:1 + chr2R 22774595 3' - I-element 75 1 68.06 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTGCAAAAAAATTGCTCAAATGAAATTGCATATCGAATTTCGCTTTGATGGCAAACGGAAGGCATTCGGCTGCACACATCTGACATGAAAGTC:1 + chr2R 21110662 3' - roo 28 2 55.48 AGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGG:1 + chr3L 14116758 3' - BS 5069 1 66.44 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTATATATTTGAAGCCGAGTTTATCTCAAGAATGTAGATTGCCTGTAAAATATTTAATTACACTCTGCGGCACGGCCACACACAGCCAGCACGTA:1 + chr3R 8065360 3' + 297 6957 2 73.97 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGAATGAGAGTG:1 + chr2R 10541771 3' + P-element 2853 1 62.33 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCAT:1 + chr2L 4631209 3' + roo 8985 2 77.40 GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCTGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAACAATCCCACCTAACCCTAAAATGTTTAGTTTATGGTCAGTTCTGGAAGACTGCAAA:1 - chr3R 11903449 3' - FB 64 1 64.38 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTAAATAATAAGTTAGGGACTTGTTGAT:1 - chr2L 13468201 3' - roo 8700 2 61.11 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGTTCAAGAGCTAAAACACTTATGTACATCAAGCTAAATTATCAATGCACTCTGCGAGATTTTAAAATTAAATAAAATAGGTAGGCA:1 + chr2L 17353124 3' - 297 6613 2 61.64 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGGAAAGTAGGGCGAAATGTGTGGAAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCAGCACATATTGTATGTGTGTATTTT:2 + chr3R 31419462 3' - pogo 44 1 65.07 ATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATTTGGTTCCCTGTGACTCGGGTCAAGGCCTACACGTGGAAAATGTGGCCAA:1 - chr2R 18003361 3' - roo 8788 2 64.54 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATGGAATTCCCCTTCATTATATTGTTAGCTTTATAAATATGGCACATGACCAACGCTTGATTTCATTACT:1 + chr2R 17059673 3' + pogo 2050 1 55.48 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGATGTTATTGCTGTTGTTATTGTTGTTGCCACTGCAGCTGTTTGGCTGCTGTAAGCTTGT:1 + chrX 2839141 3' - jockey 63 1 56.06 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGAGTGCTGTGCAACAAACTTGTGGCAGAGCGAGCGCTAATTAATTAGCAGTATTTCTCGCTCACACAACTGCCATTAAAAATTATGTAAGGCGGCACGCGATGAACGCCGG:1 + chr2L 5961364 3' + S-element 1710 2 76.92 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCAACGCTTCTTCAGCAGCAGCAGCACAG:1 + chr2L 13316964 3' - jockey 4694 1 60.50 CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGC:1 + chr3L 9907348 3' - BS 5067 1 67.12 CGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTATACATATTTACTTGGTACCGAACTTACATAAAACTTTGCAT:1 - chr3R 11757910 3' + invader4 303 2 45.21 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGGTATGACTTGTTAACTTATGATTATTATTATTTAAATAG:1 + chrX 8363603 3' - jockey 90 1 71.92 TTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTACAAATTGCCAAGTGTTTGAGAGCTGGCATTCCAGGGG:1 + chr2R 18260465 3' + Juan 4009 1 74.66 TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCG:1 + chr3R 9550951 3' - P-element 101 1 15.28 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGTTGTCT:2 + chr3R 23416027 3' - jockey 4788 1 65.07 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGAGCAAGTGATAGAGTGTGTTAGGATCTTCGTTTCGGGTGGGGAAATCGTTCATAAAATTAATTAATAACGATGGACCATCCACTATAAATTTAAGCAAAATCCGAGGAGCGGATT:1 - chr3R 10062082 3' + copia 251 1 76.39 CAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTAACTCTTGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAACTCCGGTTATCCTGTCTGTCCTCGTCCTGGCCGCCTCCTTCCC:1 - chr2R 24710984 3' + roo 489 1 70.55 TTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATAACTCAAAGATTAAAAGTTAAAACGGAGGTGCATTCATTAAGGATATATAAATAACCAAACAGAGACCTACAACTGCTT:1 - chr2L 442912 3' + McClintock 450 2 54.11 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGGAGCAACAGCCACAATGGGAAAATGTTTTTAAAAACGGGAAA:1 - chr3R 8065171 3' - 297 11 2 77.86 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTTCTTCGGTCGCTT:1 - chr2R 23595983 3' - blood 7081 2 65.07 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGACTAAACATTTTGACTATTCTTTTGGTGTAGGAGATTTTTGTAATATGCCTGCTTT:1 - chr3L 17602529 3' - Doc 71 1 61.64 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTAAACACACATGTATTTTATTGATAAATAAAAATGCAGC:1 + chr2L 21909170 3' + transib2 2777 1 53.42 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCT:1 - chr2R 3338785 3' - Juan 61 1 58.22 GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATG:1 - chr3L 8754757 3' - mdg3 55 2 63.01 CTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGCGCTTTCCTTCCCAAACACAGTCGCACCTCCCGCNGTCATCATCATCATCGGACTACCCAT:1 + chr2L 14785334 3' + F-element 374 1 52.34 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCG:1 + chr2R 10541713 3' + P-element 2795 1 22.60 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATNACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGAAACAAAGCTGAAAT:1 - chr3R 18343434 3' + jockey 4942 1 53.42 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTTGA:1 + chr2R 21229069 3' - jockey 4750 1 69.86 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGA:1 + chr3R 20983922 3' - pogo 36 1 60.96 TTCATGCTGCAGAGTGAGGCGGAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGAGATAACTACCTTGCATGCAGGTGGACACTAAAGCGCGTCCTGCATCCTTCGTGCCCATCCTACAGTTCTCGTGCTTCGTGGGGGCAGCA:1 + chr3L 20285811 3' + Rt1c 5203 1 55.63 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGAGCTTCAAAATTGTTAGCCCCATTGTGTTGGT:1 + chr3L 5398123 3' - roo 90 2 80.14 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGGTGGGAGTTCAGTTGGTTAATATCAAATACCAGGCACAAAACGTCGCACAAACCTTGCCGAACGA:1 + chr3L 21292640 3' + 412 467 2 64.38 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATGTTGCACGTTGTCTGTTCATTTCGCTCCTTAAGCCCCACATCCTTCTATACACGCAAAACAATTGTGGTCGTATATATAAATCAAACATTGATATAAGG:1 + chrX 6521010 3' - FB 21 1 70.55 ACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAA:1 - chr3L 8249382 3' + HMS-Beagle 172 2 69.86 TAAATATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTC:1 + chr3L 12634213 3' - BS 5085 1 76.03 CGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGCATTTCAGCATAATTTGATGTAATTTCAGTGGCCTC:1 + chr3R 21647444 3' - McClintock 149 2 74.47 GAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGAACGCACTCGGGACAAGAAGCTGCGACAGAACCGCCAGCTGCG:1 - chrX 21626848 3' - HB 56 1 71.23 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCCGTTATATTTATCACATTTGATTGTGC:1 + chr3R 12787428 3' - BS 5012 1 71.92 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTGGAAAGTTTAAAGAAACAATTAGAGATGAATACAAATGATAAAAGGGTCCGATTTAGTGTACCAACACCTTACAGCAATGAAAGAGTGTTGTCAGCAGAAAAATATGTTCTTCTTGAA:1 + chr2L 16609553 3' + 412 7530 2 77.40 TCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTG:1 - chrX 17495712 3' - Burdock 6185 2 66.67 CAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGGGCGTCAAAACGACAAAAAAAGATTCAGATGGGTGATACATTGTGTCACTTCAATTCAAGGAGGATGTCACCTTAGGAGAT:1 + chr3R 19445034 3' - R1A1-element 215 1 51.45 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATGATATGGTATATGGGGTCTAC:1 - chrX 17495666 3' - Burdock 6155 2 71.83 TATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCGCCTTGGTTGTTGTGCTGCCGCTGGTGCGTTTGTCACTTCTGCTACG:1 + chr3R 2525970 3' - Stalker2 73 2 65.75 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACG:1 - chr3L 23146438 3' - 1360 28 1 66.44 CGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAA:1 + chrX 15406057 3' + opus 7463 2 50.00 GATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGTATGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATATGGTAAAAAATGAAATATATATATTCCAACAATTGTTGAGAAGTATGTATGAGGCCTTTCCGAAC:1 - chrX 22905207 3' + INE-1 98 1 52.74 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGTTGAC:1 - chr3L 14233015 3' + copia 221 1 59.59 TGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAATATGAAAAATAAAGATGGGGGGGGCGAAGCAAAAATTT:1 + chr3R 28803941 3' - hobo 82 1 73.97 AAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACAAAACTATGAATAAAGTCGCAGGCACACACG:1 + chr3R 6963751 3' + jockey 4648 1 78.77 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCCAACTTAA:1 + chr3R 19725449 3' - hobo 26 1 56.88 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCAGATCCCAATTAC:1 + chr3R 29384759 3' + roo 9053 2 73.97 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTAAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCATAAACTATAGGACTTTATGTTCCATTTGTGAGTTTTACTGTTTTCCCTTACTCTTGGCCGGGTCAAAACTTCAAA:1 + chr3R 24444138 3' - hobo 43 1 54.79 TGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGCGCCCACTTATTCATCAGCGGCTGTGGAAACTGCTCGATAGCCGGGGGCG:1 - chr3R 4363635 3' + opus 231 2 60.00 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGCTCGATGACGCTATAATCGAAAAAACTTTGCAGCATACTTTTAGGACGATGCCAGGACACGGCCTGACGGCATTTCCTACAGGGCA:1 + chr3L 12633360 3' + jockey 4960 1 56.16 AGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACGATAAT:1 + chr3L 21913486 3' - 297 6593 2 77.24 TCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACTGGTTCACATTGGTACGATCCGAGTGATTAATTTACGTGTAAAACTTG:1 - chr2L 1651418 3' + F-element 4239 1 56.16 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTTGCTTTGCATACGTTCATTT:1 - chr3R 24093476 3' - jockey 29 1 65.12 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTACTGGCATGCCTCTGT:1 - chr3L 2668828 3' + Bari1 1662 1 53.42 AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCA:1 - chrX 21227109 3' - Tabor 64 2 58.90 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAACAGCTTAATAAGGCCATATAGTTGCTTTTTG:1 + chr3R 25962098 3' - I-element 33 1 61.64 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTACTCCCACTCTTTGGATCCTCTCCACCGCTCTCTAAAAGCTCCTTATGTGCGACCGCATGTTGTTTCTC:1 - chr3R 11758479 3' + P-element 2852 1 55.81 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACAATTACATAATATTAAAAAGAATATCAGAAA:1 - chr3R 10433159 3' + 412 7527 2 71.72 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTCAACG:1 - chr2L 13697589 3' - F-element 67 1 55.48 CCTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGGGCCAAATTGTGTGATGAACTGCCTAACACCAATCAGCTGCCCCTGTTACGGACCCAGCAAATCCTCCGACTCCTTATACAGATATC:1 - chr2L 12955064 3' - G5A 438 1 60.27 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTAATGTAATCAGGGTAAGAATAGAGTATTCAATAGCACATGTAATAAG:1 + chrX 7032817 3' + roo 397 1 78.08 GTTATTGCAGCACAGATGGACTTTGCATTTAAGGCATTTGGTCATCGGCGTTGCAGTTTTGCACAGTCTGCAACGTCTTCTTTCTCCAAAAACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGTCTGAA:1 - chr3L 26696868 3' - looper1 1601 1 86.30 GTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGGAAACA:1 + chr3L 17935007 3' - HMS-Beagle 67 2 68.89 CTTATATATATACTTACATATATACGACTAGTTGCCAAACCAGAAACACAGACAGTACACGAAACCACTAAAAACCACAAATTGAAATTGAAATGAACCTACCTATTTATGTAATAAATGCAATTTTCAATCGCAGCCCATTTCAC:1 + chr2L 17879836 3' - 1731 4412 1 78.77 ATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGGCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACAATGAAGGCGTAGGTGACGATAACTGAAGGGCATGGATTAAAGTTTTGTTTTTTAATTATGAAATAATTAAGAAGTAATAATT:1 - chr2L 1180453 3' + Bica 17 1 50.68 CTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTACATACATATATGTTTGTACATTCATTTACGCACGAAAAATATTCATAAAGTAGATGGGCGATTAGATACCGT:1 - chrX 19690505 3' + gypsy 437 2 43.84 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACCCTGGTTGAAGTTACCTCGGCCTCTTCCTTGGTTTTGGCCCCTTCTTCCTCCACTTGTTTAGTTATTATTATTGTTATTGTT:1 - chr3L 10785588 3' - GATE 32 2 59.06 TACACCTCCTTTTTTAAAGAAATGACGTAATACATCTAGTCATTAAGTTTTTTAGTGTTAATATATTGTGTTACAAAATATACTTTTTTTGAAATCGTATTGATTGTGTGCTTAGCCCGCTTAAGCTATCTCTACGGTGCCGCATG:1 - chr3R 4324401 3' - Stalker 6832 2 71.92 CTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAATGTGTTTATAATTCGTTGGGACTTTCTTTGT:1 - chr2R 18035082 3' + R1A1-element 5300 1 58.04 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTGTCTAAAGC:2 + chr2R 17609831 3' - mdg3 5334 2 72.60 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTTAAGGCTTTTAATAACACTTGTACATTAGTATAAGGAAGGAAAAAAACCCTTTTACCTATATT:1 + chr3R 32065560 3' + 1360 3335 1 54.11 ACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACATCGCTTCCAAGGCGCCATATCTTTTGCACGTACT:1 + chr2R 11647455 3' - micropia 99 2 71.19 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTTTTTTTATAAGA:1 - chr3R 6147217 3' + copia 5084 2 62.33 TAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATAC:1 - chr3R 23415882 3' + jockey 4974 1 68.00 ATATTGAAACCAATCTGGAGCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGAATAATTAGTTTTAATATGTATTTTGGTGAATAATGCCAGTCGATTGCACCACAAT:1 + chr2L 14376468 3' + F-element 4250 1 62.33 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTGCCAACATCTAGTGTTGGTGTTGCGACTATAATATTTTCAATTTGTTGCTTTTTATTGTTAACAACAGCA:1 - chr2R 6217079 3' + copia 238 1 50.68 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGGGGCATTTAGGAGTAC:1 - chr3R 14138520 3' + mdg1 7407 2 53.42 CCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGATTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTTGCATGAGTACGTTGTGTCAAATTATGTGTAAATATGTGTA:1 - chr2L 23281049 3' - invader2 135 2 72.60 TTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATAAATACACTGAAAACAAGAAGGGTTTTGAATTCACCTAACAATCCCTGAGAATAAATACTTCTCCGGATTCTATTAGCCAC:1 + chr3L 13449295 3' + Quasimodo 7331 2 60.96 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTGACAAATATCCATGGCTTCCCATGACAGCGGCAGTCCGCAAAATATTGGTTCACTCCAAAGATATCTTGGAGCAAACAGTTCTTTCAGTCGGCTATTTTGGAGAAGAAGCAGCA:1 + chr3L 17863092 3' + copia 247 1 74.66 GTCTCTTGCCGACGGGACCACGTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGCTGCGAC:1 - chr3R 17944023 3' + P-element 2868 1 57.89 AAAGGGAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTATGTTATTTATTTATTTATTATGCCATCCGTTGCTGAAATTGACTCCACAAAAGAAGTCAAACGATGCGTTGTAAAAATG:1 + chr2R 20389518 3' + copia 248 1 56.85 CAAGCATACGTTAAGTGGATGGCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCGCTCTCTGCTCTCTGCGCCAGGGAAGTTTAGCACCGCATTTTGCGCAGTTCGCCAATAAA:1 - chr3L 739132 3' + P-element 2848 1 57.53 GACCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTACCAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAACAATTACCTATTATCATTTTATAGCTAAACTAAGTACCTTCCTATAAACGTGTACT:1 + chr3L 24034888 3' - 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chrX 7845735 3' - hopper 79 1 67.81 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAA:1 + chr2R 19016050 3' - roo 8740 2 70.55 GCGCGAACAAGGCACCCTTTATCTTTGCTTACATAATGCTTTGTCCGCCGCTTCACTTGTCAGTGAACTCTTAACTCCTTATCCGATACCCGATATGGGTATCCGATACCCGAATTCGGCCATCAACCAACGCATCATAGC:1 + chrX 19820410 3' + 3S18 26 2 43.26 AAGATACGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGATTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGAT:1 + chr2L 4631212 3' + roo 324 2 69.86 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAAGGTAGAGATG:1 + chrX 19583349 3' + roo 9034 1 58.90 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGTGAAGTTCTTCGAGCGAGGATACTTGGAAAAAATAGTTATCGACTCAGGA:1 - chr3L 8273873 3' - hobo 22 1 69.18 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTCATTCGGCTGGAAG:1 + chr3R 29283301 3' - hopper 4 2 72.90 TTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGC:1 - chr3L 18947265 3' - BS 4718 1 63.41 CTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTAATCCGCAGGGCACCGAGCAGGTAGACCACTCGGACCAGCAGTCCCATT:1 + chr3L 12069027 3' - F-element 384 1 53.91 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGGGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGGTGTAACACCATTTGTTCGTTCGTTGGCCTTGTGGC:1 + chr3R 4668845 3' - FB 87 1 76.03 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGCCGTGTCT:1 + chr2L 15917722 3' + roo 9036 1 62.33 CAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGGACGTTTGCATTTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAGCGAACAATCGAAAAACATTAAATATAGTATGTTATAGCAGGATATAGTACAAC:1 + chrX 19690661 3' - gypsy 6989 2 74.80 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAATTAAAAGGCGATAAATGCATTGATACATCAAATGATGCATACAGCATCAAAATGTGTTGACAAGATTAG:1 - chr3L 15389472 3' - I-element 3 1 81.51 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACT:3 + chr3R 29384728 3' + roo 9022 2 62.33 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTA:1 + chr2L 19940147 3' - mdg1 30 2 65.75 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCA:1 + chr2L 4631240 3' + roo 9039 1 54.47 ACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGAT:1 - chr3L 22038241 3' - diver 90 2 77.40 ATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCACATTATNGCCTTGTCGCCTGTCCCTGACCTGACCC:1 + chrX 15234027 3' - invader4 2950 2 73.08 AAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGGGTACTTGATTGCCCCCCAAAGTATGCAATGCTAATAAATTCGCTTT:1 - 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chrX 20270944 3' - I-element 5139 1 69.18 CTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATTTTTTTTATCATGAGTAGAAGGCCAAACCTAAA:1 - chr3R 31771948 3' + mdg1 7333 2 72.60 CAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCG:1 - chr3L 18947269 3' - BS 4745 1 71.92 GAACTATTTCAGGCAAATCGGCCAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGA:1 + chr2L 16884689 3' + Bari1 1625 1 72.60 CGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATAATTAAGTCTCTTTGGATGTGTGTGTGCTTCTCGCCAAGGAAGGACATGCAAGGACAAACGGAAG:1 - chr3R 30652583 3' - F-element 4465 1 67.81 TATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGTCCTGTTTT:1 + chr3R 14138615 3' - mdg1 7114 2 68.49 GCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAATGCGAGGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAAAACCCGAATTGAACTCATTAATCTCATTGGCAACTAGATCGTGATGGGTGCCATTAATCACA:1 + chr3L 19693989 3' + rooA 254 2 71.92 GATCGCCGACGTGTGAAGACGTTCTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAATCACCTTGGAGGACAGCTGGAGCTGCCGGGCGAAACGAATGTCCCTTCGCACAACATCAGGTGG:1 - chr2L 4396969 3' + F-element 18 1 56.16 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTCCCAACAGACACATGTACGCACAGTAGGTGGGTCCTC:1 - chr3R 9550887 3' - P-element 53 1 46.58 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTTTGTTCTGCTTGGCGGGTCATCGTGCAACTGCAGAAATTAC:1 - chr3L 9522004 3' + opus 7487 2 64.96 ATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTCCAGAACGAGGCACCTGCCAAGACCCGACGACTGGCTGAACTCCTGGGT:1 - chr2R 21618030 3' - Circe 225 1 66.44 CGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATAGTTTAAATACATTCAACTGGTAAAACATAATTCGATATCCTGCAACTTT:1 - chrX 13401505 3' - flea 4824 1 67.12 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGC:1 - chr3R 12115256 3' - 1360 53 1 55.48 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTT:1 + chr3R 9550968 3' + P-element 2801 1 26.71 AAGCAAGTACTCGAATTGCTACCAGGGTGGTTGCGATTGGCTGACGAACATGGGTGTCCACAAAATGTTTTTCACACCATTTTTCCTCTATAGTAAGTTGGCGCTCTTTGGGCACGTGATCTATTTCGGGAAACTTGTGCACCATC:1 + chr2L 22181281 3' + R1A1-element 5161 1 76.03 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTCGGGATACACCTGCATGGCCTGTTGAGTAATCGTAATGTTGTCT:1 + chr3R 23416027 3' - jockey 4788 1 63.70 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAACTGCAAATTATTAGTACAAATATTGGCAAAACTGTGCAAATATGGAATGTTGCCGCCTGACTTTTGATATTAATTGCACAAACAACT:1 + chr2R 20706891 3' - I-element 32 1 58.90 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAACAATAATTTATGGTCGAAAGTGATTAGAACACTTAATGGAGG:1 - chr2L 13850599 3' - roo 33 2 61.64 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAACAATAATTTATGGTCGAA:1 - chr2L 13850623 3' - roo 8721 2 56.16 CCATATATTTTTGGGCGATGTTCTTGAGCATGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTGCCCATGGTGCGGTGGGCTGATTTCTTGNCCTCTGTCAGGACGCGGGGTCCATCGTTCTGGAGGATAATCGA:1 - chr3L 2596103 3' - jockey 4637 1 47.59 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACA:1 + chrX 140089 3' - blood 7076 2 59.59 ACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTAACGGAGTCCCGCCA:1 + chr3L 13546643 3' - 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chr3L 8249382 3' + HMS-Beagle 6968 2 69.86 GGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAGGCACGCCGCATACAAGCGTATTCTAAAGGTATTAGATATGAGACGGCGAACAATATGCAAAACGAATATACATACGAGCACACGCCCAAGGTTCCAGAAGT:1 + chr3L 6721718 3' - I-element 5086 1 69.18 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGAAGCGAGTCCCTTCTCATTTTTTACTAGTCCCCTCAAAAGTGAGTGTGT:1 + chrX 7626246 3' - Transpac 32 2 63.70 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACATTTAAATATGCAAACTGGCAAACAAACACACAGATAACTCACACATATTAAACTTAATTTGGCGCAGCTCATTAATAAAACACAAGCAGG:1 - chrX 6520842 3' - FB 30 1 65.07 CAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTATTT:2 + chr3L 20168344 3' + roo 9059 1 76.71 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAAT:1 + chr2L 15917679 3' + roo 8993 2 71.23 TGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAATCCTTGTTCCTTG:1 - chr3L 8249328 3' + HMS-Beagle 7022 2 71.92 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTCCAATCCCCATCTGCCAAAGGCAGATAGATTCTAAATGCAATTTCTAGCATTATTTAAACACCGAAATGTTCCGTTTTATGCCATTTTATGG:1 - chr2R 8689328 3' + hobo 2909 1 65.07 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAATAGCATTTTTACCCACTGTGCGAGTG:1 - chrX 1208827 3' - Burdock 6193 2 59.59 TATGTATATATATATATTTGTAATAACTTTATGCTCGCTGAGAGATATTTCGACTGCTATCTGCCTGTTTGGCTCGACCTCCATATAGATACATATATGGATAACTGTATACATTAAAAACTAAACAATAAACTACATAGGTACAC:1 - chr3R 19976801 3' + 1731 4414 1 78.08 TTAAATAACCTTTATATGTTTAGTCTCAAGCTCCAATGAGTCAATATAGTGGACTACCGGTTAGCCATTTCTTCTGACTAAAATAAGTTGAGTAGTCAATCGCACATTCATTTTTTAAGATGTACTAAACGTATTATACCATCTCG:1 - chr2L 15202182 3' + Copia1_DM 21 1 61.64 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAGTAGATAAGGGTCAACATCGATTAGCAGAATACCAAATTGAAGTTAAAATCTT:1 - chrX 16490433 3' - F-element 46 1 54.11 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATACATATATATATAGATGCAGGGCTTTCGTTTCATTTCGGCTT:1 - chrX 20456882 3' - opus 184 4 77.70 CAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACGAGCTCCAACCCTTAGTTTGGAGGATAATCAAGTAAGGCAGCAGAC:1 - chr2R 25240146 3' + INE-1 95 1 55.94 AAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGC:1 + chr2L 15917715 3' + roo 389 2 68.29 CTCAAAAACATCTCATCCTTTTTTCTAGGGAAATAATTGGGACACGATCCACATTCTCATCAATACGATATTTCTTATGATAAGAAATATGAAAAGAATGATTTAAATAGTAAAATATAGGAAAATCGTACTTATTTTTAAAAATA:1 - chr3R 28043836 3' + HMS-Beagle 6736 1 86.30 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTGTTGTTGCAAGCCGATTTTGTTTTGATTCGATACTTTATTTATGTATACATA:1 - chr3R 13684630 3' + 412 7533 2 76.03 TAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGGCCTTGTGGCACAGCGTATCGCCCTCC:1 + chr3R 5972415 3' - Doc 254 1 77.52 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGGAGCAACAGCCACAATGGGAAAATGTTTTTAAAAACGGGAAACACGCAAA:1 - chr3R 8065163 3' - 297 6590 2 78.77 AATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAATGCTCATTCCCAAAAGATGCACAAACATTGCACATACGAACTCTAGGATAAAC:1 + chr3R 15256314 3' + roo 8683 2 63.70 CACGTCCACTCGATTGCTCATTTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCACAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTCTACACCATAATTCA:1 - chr2R 8258224 3' - jockey 20 1 71.92 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATAGGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTA:1 + chrX 6283706 3' + P-element 2800 1 25.52 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGATATGTCCATAA:1 + chr3R 7042124 3' - Stalker2 7264 2 74.66 CAGATACGCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTTAATATTTTTCTGGTATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGATTAACTTGACTCAAGCACTATCGAATTTCACAATTCGTCAGGGTTTGATTGAGGTTTA:1 + chr2L 16779974 3' - INE-1 543 1 60.27 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTGCT:1 - chr2R 19015967 3' + roo 345 2 62.07 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCATCACCTACGGAACCCTCA:1 + chr3L 17746402 3' - roo 8684 2 66.90 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACTTAAGTTGCAAGAGGCAGTTATCTCTAAAAAGGAAATAAGTTTC:1 + chrX 10504367 3' + roo 332 2 69.86 GGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAACCGAGTCGCGACACAGAAACTGCCAAACGAAATCGAAA:1 + chr2L 7604417 3' + 412 330 2 73.43 AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTGTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAAT:1 + chr3R 4361662 3' - copia 4945 2 69.18 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCCATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGAATTTTTATCTTGTGTTTTAAAT:1 + chr2R 21619412 3' - blood 7090 2 67.81 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTTGGT:1 - chr2R 22596057 3' - Doc 37 1 55.48 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACG:1 + chr2L 13850747 3' + roo 9031 1 55.86 GTTATGGAAAATTACTAGAGTTCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAA:1 + chr3L 21913410 3' - 297 6642 2 74.58 TTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGTTTTGTAATTTGTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTC:1 - chr2L 7336147 3' + pogo 67 1 57.93 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTNTAAACTTACATACTAACAATTTTGGATTTCTTAATATCTTTAAA:1 + chr3L 8295871 3' - Quasimodo 16 2 74.66 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAAT:1 - chr3L 17746261 3' + roo 9014 2 56.85 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTCATTAATCAAAAATTTGGAGAAATAAATGCTCGTTTCTTTCGATTTATTTCGGCCCCCTGCCAG:1 + chrX 16219297 3' + roo 9015 2 59.59 GCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAG:1 + chrX 21667940 3' - gypsy2 57 2 69.34 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGCAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTT:1 + chr2L 11476383 3' - pogo 44 1 52.74 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGTAGCCATTCAGGTT:1 - chr3L 21913303 3' + 297 6947 2 67.12 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGAAACAAAG:1 - chr3R 18343441 3' + jockey 4935 1 58.22 AAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGTCACGGCTCCGCTTGACACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGTTGTGTGTGTATTGTTTGTTTGTTGATGGTGCACTT:1 + chr4 826420 3' + gypsy2 257 2 73.72 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCCAACTTAACTCCGCTGAACTCGGGGCGACAGGACACGAAATCCTTT:1 + chr3R 19725487 3' - hobo 17 1 72.46 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAAAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCGGAGCATTG:1 - chr3R 4530656 3' + copia 221 1 60.96 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCCCCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGATTTCTCGTCCTGCTGCCCGTGCAGCAACTTTAAGCCTTTATTAAA:1 - chr2R 18723639 3' - 297 6609 2 60.77 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAATATATTCCAAACTATGATACTTCACATAAATATCATATATGTACATATGTAGCAAGATAAATTTTT:1 - chr3R 21938152 3' - roo 8716 2 57.53 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATTCAACGGACTCAAAAGTGCGGCTGATATAGAAAGCTGGTGTTTCTATATATAAATATAAGTTTTGCCTCCTCTGGAGATTCTTTCTGTCTTTCGTTTT:1 - chr3R 28803825 3' + hobo 2916 1 69.86 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCTATGGCTTCT:1 + chrX 6615570 3' - roo 8740 2 71.72 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGAAACAAAGCTGAAATGCATTGCTAACTATTTACTTTATTTGCTAGA:1 - chr3R 18343403 3' + jockey 4973 1 66.44 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCG:1 + chr3R 14277947 3' + P-element 2795 1 22.60 AATTCTACTTGTTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTCGCCGGTTTGCCCATTTATACATATATTCTGCGGCTGTGTCTGTGCTGCTTTTCTATTGTTCATGAGTCCGGCTTTGTATATAAAGGTGATCAA:1 + chr3R 8821962 3' + S-element 1692 1 69.18 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGTGTTGTTGTTTTCGGCTGGAGTGAATACAGAGACGCACACATAAATACTCACAAA:1 - chr3L 19907064 3' - P-element 19 1 71.11 GCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATATATATATACAGAAGTATTAAACACTTATTACAGATGCCATATGCTACGTTCAACGGATATTTACAG:1 + chr3L 2668958 3' - Bari1 50 1 57.53 AATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAGCACAAATTATGGCCGAGGTGTGGCTACCGAA:1 + chr3L 8754865 3' + mdg3 239 2 71.03 TATGTATGTATATATTATATATGACCGAGGTCAGGAGATGCCTCTATGTCTGAATTTGTAAATAACACACATTTAAAATTTAATTTTTAAGACTTGAGTAACTCCTAATTGTATTTTTAGTTCTCATTGGGATAGTACAGATTTCT:1 + chr3R 28546831 3' - INE-1 61 1 80.82 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCATTAATTTACTTATGTGTTTGGGATCGGGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATATAAG:1 - chr2L 7148536 3' - HMS-Beagle2 6918 2 56.94 TAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAATCGACCCACTTCCCAGGCCATTGCGATGCCGATTGGCTCTGGGCGAAACACTCTCACACACTTGATGATAGCAGC:1 - chr2L 3617750 3' - hopper 387 1 51.37 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTAAATGCCACTAAGCTACCTAAAAGTATGCTCAGCATTA:1 + chr3L 13546629 3' - hobo 83 1 74.66 CACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCGTAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAATCACCAGTCCGACAATTGGTCACATGCCACGCATTTTTTATGGCTCTTAAT:1 + chr2R 16711504 3' - Rt1b 5089 1 56.56 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTACACATTCCTACCCTGCTCCGCACTCCAAATGCAGATGCAGTCTCAGTACCGCTAATCATCTCAGCTGCAGGTGCATCGGGCTAACAAGCTTTGACAACG:1 + chr3R 17495033 3' + hobo 2930 1 74.24 CCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGACTGGACTTTGCCTCCAATGTGAGTGGTTGTACAGCGG:1 - chr2R 24423715 3' + I-element 15 1 73.57 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAG:1 + chr3R 6399473 3' - pogo 19 1 66.67 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCCCGTTTCGTTCCGCACACA:1 + chr2L 4631264 3' + roo 9051 2 67.41 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGC:1 - 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chr2L 8553263 3' - pogo 16 1 74.66 AAATCGATAGAAATTTAAAGGATTAATAAAATTATGAATTATGTCGGAAACGCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTAAACCCTCTATACTCTACGAGCAAAGGGTATAATTATTTATGCTATCTACTTGTCAGTC:2 - chr2L 5120244 3' - INE-1 302 1 61.64 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTCTCATATATACCATACCATATTTTGGCATACCTACTGCCCCGCTTCCAACTCTCTCCTGGTAACTTAAATCAATTGCGGCATA:1 + chr3R 23511679 3' - 297 31 2 65.07 ATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTGTTAAACTTTGTTAAGAAAAATAAAAATCAAATTACACAGAGAATTGACCAACAAAATATACC:1 - chr2R 5401659 3' + 1360 3327 1 60.96 ACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAATATCTATATAAACTCGTCAGTTGAACTAGGCAGTAACAACCTTCTCTTGAAAT:1 - chr3L 9601307 3' + Bica 4575 1 63.70 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGNCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGGAAACACGGAGTTGGGCCCCAA:1 + chr3L 17935023 3' - HMS-Beagle 6821 2 55.05 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATAAAATGAAATTACG:1 + chr4 373096 3' - pogo 22 1 69.18 CGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGTGCAAGGGCAAATAATATTTCCTATTTGTATCGGAGGAAATGGAAATCGT:1 + chr3R 23238625 3' - Burdock 6194 2 65.07 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATATTTATGAGCAGCATTGGGAAGGGTCCNCAGAACAGAGCACATTTAATCTCCCTGTTAGAGATGATTCCATT:1 - chr3R 12171743 3' - F-element 65 1 54.79 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCCGCC:1 - chr3L 19349917 3' + 1360 3342 1 52.74 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCGTACGG:1 - chr3L 16200697 3' + roo 9047 1 68.49 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATCCTCCCGAGACCACGTCCA:2 - chr2R 14484067 3' - pogo 25 1 64.38 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCAGATC:1 + chr3R 29384751 3' + roo 9045 1 68.49 AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGC:1 - 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F-element 39 1 60.96 ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAG:1 + chr3L 15035213 3' - pogo 67 1 67.81 GTCCGTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAATGATATAAGGTACATTCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGTTATTCTCTTTCTTAGCAAGTATAATAAT:1 + chrX 10939939 3' + INE-1 133 1 77.40 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGA:1 - chr2L 19940005 3' + mdg1 370 2 52.05 AATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGTACTGGCCAATCGTAATTTGCGAATTTTTTTTGTGCAGACCAAAGAAAACTGC:1 - chr3R 23442454 3' + roo 198 2 61.87 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTT:1 + chr2R 14332096 3' - jockey 32 1 54.00 ATTTTCAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATG:1 + chr3R 8049023 3' - Q-element 135 2 59.59 ATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTTCACAGTACGCATACAAGGTAGAAATGAAAGTGTTTTTAT:1 - chr3R 14401855 3' - Juan 4102 1 52.74 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGAGTGTGTTTA:1 + chr3L 5958723 3' - 412 53 2 52.74 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTATGCGGTCCAGTTAACCGCTTGACATATGACCGTCAT:1 - chr3L 5958590 3' + 412 457 2 59.59 GTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGGGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGGTACAAATTAAGAGTTCTTTGATTAATAAAACGCAATTTCTTTATTAAATATAATTAATTCGTCTTCCTCTTCATCGATCTCATGATGGT:1 - chr2L 14299419 3' + S-element 3 2 78.08 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACA:1 + chr2R 6089144 3' - 1360 73 1 68.49 ACAAAAAAGATTACATTAATCCGACTATAAATGATGTTAGATGTGTAACAGATGATTAAAACTGAGAGATAAATGCCTGCCTATTCTATTGCGTTTTTGGGTTTCTGTTGTAATGTTTGTAATGTTTCATAATGTTTTTTGAGATC:1 - chr2L 15742537 3' - transib4 29 1 65.75 TCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAATCTGCGAATTAAAAGTAATGTTAATTGCGCCCCGACTGCGTTCATCCATAATCAATTTTGGCCGCTGGCCCAGCAC:1 + chrX 7483198 3' - Doc 348 1 52.05 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGAGTTGGAAAAGTAACCCTTTCGAAGGC:1 - chr2R 12248931 3' - Juan 4048 1 70.55 CACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACTGTAAATCGGCTTTTGGCCACTGCAGCTTGCCGTTTTTCCGTTTCGGTCCGTGCGGA:1 - chr3L 21220303 3' + G2 2687 1 57.55 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTGATCTCTTCGGAGGTTGAAGAGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTG:1 + chr3L 7102385 3' - I-element 68 1 63.16 GAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCTTGATTTTTAAATTGAGATAATAAACAGTCAGTGTG:1 - chr2L 12469802 3' + F-element 337 1 75.17 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAAT:2 - chrX 4469545 3' + roo 331 2 69.18 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGCGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGC:1 + chr3R 27398114 3' + roo 361 2 57.60 GCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTC:1 + chr3L 19350024 3' - 1360 3246 1 49.32 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACCTTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTTTTCGGCTA:1 - chrX 16589149 3' + pogo 2053 1 55.00 ATATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTAGCAATGTCCGTCTGTCCGTATGAAGGAAATGGTTATCATCCCCTTCATTCAATCGAAACTCCATGTAAACAAGAAGGGGTAACATGGGTTAAATATGTTTTCCAAGTC:1 - chr2R 18124419 3' + INE-1 82 1 56.16 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAGGACGGCTGGCCAAAA:1 - chr2L 19939992 3' + mdg1 410 2 69.75 GAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCTGGTTACGCTCAAGTTTTG:1 + chr3L 10814624 3' - micropia 4993 2 59.59 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCCCAGAAAACGTCGTACAATCGCAACGAAACGGGTTCTAGATACATTTTTCGGCGTAGATATATATCTAAACGGACGCATCTACCAGCCACCGAAA:1 - chr3R 26542541 3' - FB 21 1 67.14 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGGAAAGTAGGGCGAAATGTGTGGAAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCAGCACATATTGTATGTGT:1 + chr3R 31419455 3' - pogo 51 1 61.64 TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGT:1 - chr2R 14431224 3' - Doc 73 1 67.16 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTCCATACGCGGAATAATAATTTTCAAAGGATATGCGACACATGCAAGCGTTGTATGCCGAGGACTT:1 - chrX 7032658 3' - roo 53 2 55.48 GGGTCTATGGTTCATGGATCCCACGAGTTGCAGAGAAGAAGGGAATTCCTGGGTGTCTTGTACGTGCTCGAAATGAGAAATCGCCAAGCGGATTGCTGCTCAACTTATTCAAATGGCAAAATTCGCAATTTCGCTTACAAACAAAC:1 - chr2R 7633605 3' - baggins 391 1 78.77 GTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGGATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAAT:1 - chr3R 9657718 3' - jockey 4713 1 50.34 AAAGTCGTGAAACATTTTCTCCTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAA:1 + chr2R 18723733 3' + 297 307 2 76.71 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTACATGTACGTGCAGAGATACTAACGCACACATTCACACGGCTGAAGGGTCCCCAGAGTGGCATGACTGAC:1 + chr2L 7148671 3' + HMS-Beagle2 7155 2 51.49 CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTT:1 - chr3R 31458414 3' - jockey 82 1 67.81 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTC:1 + chrX 2104791 3' + roo 349 2 57.53 TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAAAAGGATTGTATAAAATGCTTATAAGGTATAAAAG:1 - chr3R 4679415 3' + hopper 1389 1 66.44 CCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAGCCACCAGACGGATTTTTGATTGCTGATTTTGGGGTGGGCTGAGCGGGGAAATAGTGAGCAGGGGAATGGAAATTGGGTGGAAAAGCGGGTGGAAGGCGG:1 - 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chr3L 21292520 3' - 412 77 2 68.49 TTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCATACCGCTATAGCGGTATAAAATTAAAAAACTCGAAGTTACAA:1 + chrX 7847226 3' + hopper 27 1 70.55 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCT:1 + chr3R 9550972 3' + P-element 2805 1 29.45 AGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGAAATGAAATGAAATTACGAAATGATTCAACGTCGGCGTGCCCAGGAT:1 + chr3L 24820649 3' + mdg1 7136 2 67.81 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCAC:1 - chrX 20330555 3' + P-element 2802 1 27.40 GTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCGTTGACAACTTGATTGCTTCTATTAAAATTCTGGTTTCAATTCCCGAAGGTATTATCTAACTGTGTACCAGACATAATTTTACGTATGTCACTTTAAATAACCAAATAT:1 + chr2L 16426222 3' - HMS-Beagle 6638 1 49.32 AGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAA:2 + chr3L 19349993 3' - 1360 3277 1 70.55 AAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGCACACACTTGTTATTAGGGGAAACGGAAATGAAAATGGAAGGGCACAGGGGACTGGGAATGGTGCTGGGAAAACTCTGTTGCCGAATTTGTGTATACGAAAACCGGAAGG:1 - chr2L 18120570 3' + transib2 2590 1 76.03 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTTTGCCAATGCCATGCACGTACGCG:2 + chr3L 7102429 3' - I-element 35 1 56.94 GGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCTCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGG:1 - chr2R 4730083 3' - gypsy8 322 1 77.70 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGAGCTTCAAAATTGTTAGCCCCATTGTGTTGGTAGCACACATATCCTTTTCCTTTCCTGGCTGCCCGGCAATGGGTTGAAAACTGAAATTAAATTGTGATGCCCAC:1 + chr3L 5398196 3' - roo 17 2 75.34 ATCAATAGCAGAGTCGATGTTGTAATATCCGTCCGTTCGTATGAACGTCGAGGTCTCGGGAGCTATAAAAGCGGGACTTGTAACAGTGTAAGTTTCTATAAATATAGAAGGAGTAACTCCCGGCGTTCCGTGTCATGTGCGTTACT:1 - chr3R 27513989 3' + INE-1 99 1 69.86 TAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTACCAGCCTTGTGGTCTAGTAGAGAAATTAATACAAGTATGATTTGCGACGAACAGTCGGACATTCTGATTACATAAGGAGCTCCGATGCTCAGGATGAGGATGTAGGCCA:1 - chr3R 25114634 3' - Gypsy6A_LTR 280 1 60.00 TAAATAAGTAAAGTATTAATGATTCAATTTAATTAATGGTAAGAAAGTGCCTTCAATGAAAACGAAATCGATAAAATCGGTATTAATAAACTGAACTTTTAATTCAGAAATTTCTAGAACTTCAAAAACTTAATTTAATCAAAATG:1 - chr3L 11423049 3' + Tc1-2 74 1 82.88 AAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGGGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGATCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGAT:1 + chr3L 19350041 3' - 1360 3228 1 50.34 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCA:1 - chr3R 8381727 3' - Tirant 8172 2 69.77 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGCAATTATATATATAAATACACTGAAAACAAGAAGGGTTTTGAAATCACCTAACAATCCCTGAGAATAAATACTTCT:1 + chr3L 13449277 3' + Quasimodo 7344 2 62.61 TACAAATATTGTTGAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTTGAATTTTAGTCTTAAACTGATATCCGAATAAAGAAGTTAAATAAAAACCTTCTTTAAATAATTCTTTGTTTATAGCTATGATGACTTACTAATGGC:1 + chr2R 16048983 3' + 297 225 2 79.45 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCATTTCGTAATCCATATTTGCTTATCTCCACTGGCTTCGTTTTATAATTTTCCATTTCAATTTAG:1 - chrX 7042621 3' - roo 8720 2 57.93 CCGGAGAAACATCAGCCGAATTCAGTATTTAAATTTTTAGAAATTCATTTTTGTATTCTGGGTCTCGAGCTCAAGAAAATTGCCCGTCCCTCGCAATCCGTATACCTCGTTTTGCGGTGCGTGTGAAAGC:1 - chrX 17083058 3' - Gypsy12A_LTR 1884 1 53.08 CTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTATGATGGATCGTCGGTGGCCGTGTGCCTGACCCAG:1 + chr3R 21261874 3' - FB 285 1 76.55 TATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTCTACCCAGAAACACCCAAAGCCCCCAAACCGAAC:1 - chr2R 18320593 3' - Idefix 7231 2 76.55 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAAAAGGTTGACAACTTG:1 - chr2L 16554566 3' - blood 31 2 63.70 AACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAAACTGAGCGAGGCCGAGCTACAGGGCATGCAGTCTGCCAATGCCGATGTTTTGTGCAGCGAGCGTTTGCAG:1 - chr3R 6390734 3' + F-element 4540 1 50.79 ATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAAAATTGTTGTTTAATTTTTATTTGTTAAGCATTTGGGCAGC:1 - chr2L 17392704 3' + jockey 4890 1 72.60 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACATACATATATAGATCATATATAATTACCGCGATATAATTTCGCCTCTCTGTACGCGGAAATGAAGTCTCAATACCCCGTTGTGGCACACAAACTCGAAAACTTG:1 + chr3L 8158152 3' + flea 5002 2 78.08 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGCGACCC:1 + chr3L 17758014 3' + Tirant 8466 2 64.15 ACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACCTTTCAAAGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATACGAGATTTTTTTTCACTTTTTTGAAAGAAGGAAACAACTTATCACACATAAATAGAGTAGCAAGAAA:1 - chr2L 18421509 3' - INE-1 31 1 67.12 CAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTAATGTAATCAGGGTAAGA:1 + chrX 7032788 3' + roo 9031 1 58.22 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATT:1 - chr3R 10708224 3' - Transpac 57 2 58.90 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGGCG:1 - chr2L 3632134 3' + P-element 2861 1 57.69 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATATTCTACATATTTCAGTGTGAATTTTCCAAGCCAGCGATAATGGCTTCCTAAAAC:1 - chrX 3453110 3' - roo 62 2 69.93 TCGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGGAACTAAAAACTAGGGCAGTGTGTTTCCGTTTCAACGACATGCCGCAGGCGAAAGGACGAGTCCGTCCG:1 + chr3R 24663697 3' - jockey 4760 1 56.80 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTCCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCGGAGCACTGACCTTATCATGGCAACATCA:1 - chr3R 4530636 3' + copia 241 1 73.29 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATACTCGTATTTATTCATTAAAACAGCAGAAGTGCCGAATTAAAATGCATCAATGCTCGTATATTTAATTATGAAATGTTTGTTGTTTCTAA:1 - chrX 3559553 3' + opus 474 2 45.21 CAGGAGGAAAAGCTAGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAGCACAGGTGGAATCGTGTTTGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGTTATGTGGCACCCCTCAATCTTAGGCATTTCACCA:1 - chr3L 13790541 3' - Gypsy12A_LTR 2013 1 76.03 ACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACCCTGGTTGAAGTTACCTCGGCCTCTTCCTTGGTTTTGGCCCCTTCTTCCTCCACTTGTTTAGTTATGATTATTGTTATTGTTGTAATTGCTGC:1 - chr3R 23184751 3' - GATE 8275 2 60.27 CTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGACAAGTGTTGCATACTTTTGAGGGCCCACAAATTGA:1 + chr2R 21229084 3' - jockey 4735 1 59.59 GTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGTAGATACATCGGCGCCAGGAGCATTACAAAGCAATTTCACTA:1 - chr2L 15549872 3' + hobo 2861 1 68.49 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCAATTCTTATACCTCACCTTGCACTTAAATGGTTTCTCTCCGGTGTGACGACGGTGGTGTACAC:1 + chr2L 19733188 3' - FB 58 1 56.85 GTGGATGGCGGAATTTTCGTGGGAGGGGTGGGCGCTGGAGACTAATCTCGCCCCGTTGGCAGCATTTTGGTTTATGCGGTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCTTCTCTCTCAATTATATAGCAATTTAT:1 - chr3R 12789497 3' - G2 2768 1 58.52 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGG:1 - chr3L 14233020 3' + copia 216 2 56.16 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGCACCACCTTATGTTATTTCATAATGCATATGGGGCTATTTTGAGAGAAAGCG:1 - chr3L 739191 3' + P-element 2838 1 25.77 AAAAAAAAAAATATTTAAAAAAAAAGGGAGGGGAAAAATTACTTTTTTTAAAGCCGCAAAAAAAAAACAATTTAAAAA:1 - chr2R 24698924 3' - FB 175 3 50.00 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACTTTAAGCCTTTATTAAAGTGTGAG:1 - chr2R 18723632 3' - 297 37 2 61.64 CTCGCTCACGCGCCAGAAAACGTTATGCAACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAA:1 - chr2R 5617501 3' + invader1 3950 2 64.49 TTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAATGGAATTTCAGCAAAAAAATCGAAATATATTAAAAAAGAAACTAGCTTAAATATTTGGGCATAAGTTC:1 + chr3L 3510626 3' + G4 3507 1 53.42 TGTGAATTTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAATATATCCTTTTATCGTTTTAATTTGCAAATCCAATAATTTAAAATGAATGACTTCAAAAGAATTCCTTATGGTGTACAAATTATTGGATTTGCAAATTAAAACGATAAAAGGATA:1 - chr4 629235 3' - HB 177 1 55.48 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTT:1 + chr3L 14116789 3' - BS 5038 1 54.11 TCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACAGAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACACAGATAACTGAACAGCACACCCACACACTCACGC:1 - chr2R 17028453 3' + Porto1 274 1 76.71 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAAATTCCAGGTATTCGGAAGGACTAAAATACTTTCTTTATGTCCCTTTTTTTTTACCTTCGCCTCGGACTTGCCCTATTTTATTGTCAACCCA:1 - chr2L 21026612 3' - FB 30 1 63.70 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGGGCT:1 + chr2L 16607314 3' - 412 7101 2 48.63 ACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAA:1 + chr2R 6271498 3' - blood 216 2 75.34 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTGAGCTTTCGTGCTTAA:1 - chr3R 17673705 3' - FB 21 1 71.92 GAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGG:1 - chr3R 5518326 3' - Transpac 4991 2 73.33 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATTGGATACTGTTTTAGTGTAGCTGCCTATTGCATTTAACTGTGTTCATAATAATTTATTTTGAGCAACAT:1 + chr3R 14800986 3' + pogo 2055 1 53.10 CCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGACTAGCAAATGCTCTTTTAATATAAATTTTTTTGTATTTTCTTTTTAAACATTATTGCCTTGTGTGGCAGAACTTGGACTGGCGTATGAAATTAGGCGCTGCCAATTCGCCGCCAGCCACTTC:1 - chr3R 18154821 3' - FB 1 1 45.89 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGAACAAACGTTTTAGGTTCGCCAGATGAATTTTAGTTTTGATCAGATTAATTAACACTTTTATCAAAAC:1 + chr2L 8930583 3' - roo 8716 2 54.11 TAGTTTCTAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTACATGTACGTGCAGAGATACTAACGCACACATTCACACGGCTGAAGGGTCCCCAGAGTGGCATGA:1 + chr2L 7148666 3' + HMS-Beagle2 255 2 56.16 GGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATTATTCGTATCGTTCTTTGGTTTCCATGATTTGATATCCGTTTCGTAGTTTATTCT:1 + chr3L 10743690 3' - pogo 1710 1 62.33 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAAAGCTTATGATTGTTGTTAGAAACTGTTAGAATCTGTTGTTCGAGCGCTGAAAAGTATGCTACAAAAATGGTAACGAATTTCCTAGCCAAAT:1 - chr2L 5515365 3' - BS 5023 1 54.79 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTAGACAACTTCCAATTTCCCCACCAACACACTCGCAAATAAGCCAGTCTGCGTACAC:1 + chrX 6283761 3' + P-element 2854 1 61.64 GCTTCATCATATTAATGATAANGCTGTGACCCAGCTCCCATGCCTCGCTGTTCGCCAATAAAGCCGCGAACAGGCCACAATGTTCTTAATTTAATGTGCATAAATATATGTGATACGATCAGACCAGGATTAGCTACTAATAAATC:1 - chr3R 13608793 3' - Rt1b 4764 1 51.37 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACCTTAATGT:1 - chr2R 21619310 3' + blood 335 2 56.16 GCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAAACTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTGCTTTGCGACGATTAGTATGTGCCCGAAAGAGAGCACCTACACATGCG:1 + chr3L 616813 3' + Ivk 402 1 62.96 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGGGCTTATTGTGAAAGGTTTTTTTTTTTAGT:1 + chr2L 16607340 3' - 412 7070 2 67.38 GTATACGTGGATTGTATAGCCCCAACTGACTTAAAAGACTGGGATTCAGCAAGACGATTCGTTAATCGTCCAGCCCTCCCAAAACCTGCTAGTAATCCTCGTGAGTGCTTTTGCTTAATCCGTTCATCGGGCATCAT:1 - chr3L 5882620 3' + BS4 547 1 76.64 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCATAAGTTTTGGTTTCGCTCTCGACTGGAAGTCTCTCAGAGAACG:1 + chr3L 739235 3' - P-element 78 1 32.19 ATTTTTCTTTTTTCCACGTAAGAACGTCTTCAACCCTAACCAAGACGAAATTTTATAATATTTTACGGCACAAATATAATATTGTAATATAAAACAAGGCGAAACAAAAAGCTTATGGTCTCTCTATGTTTGCATAGAGAGTTTGC:1 + chrX 8810557 3' - P-element 133 1 48.63 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAATTGGCGCAAGCTAGTGTCCTAGTATCATGTTTATCTATCTCATATGAGAAGTTAT:1 - chr3R 31046547 3' + I-element 5293 1 62.33 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATT:1 - chr2L 4631119 3' - roo 44 2 52.05 AAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACTTGGATTTGAAATGGCTCCATCTCCTCCTTGTAAACAGTTGTAACATTCAACTATGAACGGTAACAATCGAACCATGTTAATTCAGGCGTAGCCTTGACTAGTTAA:1 + chrX 23036003 3' - HMS-Beagle2 12 2 65.75 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATTCTGG:1 - chr3R 10708220 3' - Transpac 4972 2 56.16 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTCGTGATGGCCCTCCTCCTTTGACCTGGC:1 - chr3R 13898189 3' - 3S18 5807 2 55.48 ACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACATACGTAGTTCTGATAACGCCTAAAGCTA:1 + chr2R 6089172 3' - 1360 45 1 55.48 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTGTT:1 - chr3R 13684679 3' + 412 431 2 63.70 AGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCGAGTGAAAATGCTGAAACAGACTGAAAAGATAAACAAAAAAGAATTGGGCAACTGAATGAAGCCATCAGCAGAGCGCCATG:1 + chrX 6910321 3' + I-element 353 1 69.77 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTGAGAATTGCAAATTTTTTTGTTAAGATATAAAAATAGGCCAAACAATTTTAAGAAAAATTTAAATTATGTCGACAGACCAAAG:1 + chr3L 18189398 3' - S-element 33 2 63.01 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTGGCAAACAA:1 - 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F-element 95 1 74.66 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAG:1 + chr2L 4631216 3' + roo 9026 1 64.29 GGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAGGCACGCCGCATACAAGCGTATTCTAAAGGTATTAGATATGAGACGGCGAACAATATGCAAAACGAATATACATACGAGCACACGCCCAAGGTTCCAGAAGTCACAA:1 + chr3L 6721723 3' - I-element 5081 1 72.60 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCGTTTTCTTTTTGCCTTTGTGCAGCGGGTTGTCCATTCGTGTAAATGGCAATGATTTATGGGTCGCACAAATTTGCTGTTCCCTTCTTTAT:1 - chr2L 17352960 3' + 297 6947 2 65.75 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATGTATATTTTACCCGTGTGCGTGTCCATTGCGGCCGTGTGTGGCCTGAACCGGGCTTGTCCATATGGGGAGCC:1 - chr3R 23877826 3' - Transpac 4956 2 57.86 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAAGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATACCTTTGGTATTTTTATACATATTTACTTGGTACCGAACTTACATAAAACTTT:1 - chr3R 11757914 3' + invader4 299 2 43.84 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACTATTTT:1 - chr3R 15137268 3' - roo 8708 2 58.73 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTAACATTGATTGAGAAGCGCGGTCACATTGCTTGAACAGATGTTCACAATGATGAAATTGTTTACAACAGTATATTG:1 - chrX 13667756 3' - hobo 44 1 53.42 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGTGAAGTTCTTCGAGCGAGGATACTTGGAAAA:1 - chr3L 8273892 3' - hobo 41 1 57.53 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGTAAGGGTAGTACTA:1 - chr2L 1729728 3' - Transpac 4958 2 47.26 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGA:1 - chr2R 23790272 3' + roo 8987 2 78.32 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATACGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAG:1 + chr4 868733 3' + roo 344 2 62.76 TTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTTACGCTGAGAGAAATATAGAAATAGAATTTGCTAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAATGGAAATCGTTGCCATTTTAAAACCCAAATGAAATTAAA:1 - 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chr3R 30706390 3' - micropia 191 2 50.00 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACGAGAAGGGAAAGTGTTG:1 + chr3L 9522162 3' - opus 7030 4 59.59 GCATTTTTTTCGCACGAGAAGAGTACGTGCTCTGGGGTTTCGGCGTATTAAATAATAATGATTATGAAAAAGTGAGGAAGTGGAGGAATCTTTATGAGAGATAGATCAACTGGGACCGCAGCAGCCCCGTCCTCTTCAATGGCCAG:1 + chr2R 8751976 3' - Rt1c 5117 1 73.97 AATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACG:3 + chr3L 21913481 3' - 297 18 2 73.29 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATT:1 + chr3R 12787359 3' - BS 5081 1 73.97 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAAGCTAACCAAGC:1 - chrX 8208282 3' - roo 8697 2 65.75 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAACTGCCCCATAGTGCACCCCCCGCACGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGCACAGAATCGGC:1 - chrX 1599384 3' + hopper 1398 1 51.81 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTTGAGGGCCCACAAATTGAGAACTTCCATAGTGGA:1 + chr2R 21229100 3' - jockey 4718 1 51.03 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCCAAGCGAATTATACTGTATATATGTAATGAAATCTTTTCATTTTGAATATACATACATATATTGAAGATTGACTCATTAATATTTTAGAAAATCGGCTATCGCGGTGCTTGCACAAAAGTACCTT:1 + chr2R 14484252 3' + pogo 2085 1 76.71 AATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGGTATAATTTTATTATGAACCAACTTGTAAAGTTATTGATATGGAGGGAATTATAAAATGCCCTCCAAGTCCGAGGTGGAACCACCG:1 - chr3L 19985599 3' + mdg3 210 2 41.10 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGTAAGGGTAGTACTATCTTTCTTCAGAGAACATGTAGAGCATAATC:1 - chr2L 1729697 3' - Transpac 4927 2 67.12 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGAC:1 - chr2L 9599814 3' - roo 81 2 72.60 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGAGTTGGAAAAGTAACCCTTTCGAAGGCAGGCTAATC:1 - chr2R 12248922 3' - Juan 4039 1 76.71 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGT:1 - chr3L 21913316 3' + 297 6934 2 58.22 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGA:1 + chr2R 21199730 3' - jockey 4770 1 52.74 AGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGATTAGCAATAGTCTAGTGCCTGGGGAGCGGCTTAGGCTATGTCCCACTGATCTG:1 - chr3R 17562723 3' + R1A1-element 5244 1 63.70 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCT:1 + chr3R 29283286 3' - hopper 58 1 57.53 AACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCCCATCGT:1 - chr3R 23415860 3' + jockey 4975 1 73.29 CGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGCACAAGTTGGTATTGAATTGGTATTTAGGTAGTGTTAGTTAATGTTAGTTAGTTAGTTAGAAATAACTGTTTTAAACCGTCAGGATTTTGGGAGTC:1 - chrX 2109632 3' - I-element 5042 1 60.27 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAACTTATTTTTGCAACATTTTTGTGGTTATCAAATGTAGTTA:1 - chr2R 15406207 3' + I-element 5306 1 50.00 AAAAGAGCTAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTATTTAGCAGCTTAGCAAGTATGGCAACTTCAATTAACCCGACATGATATGCCGGCGGGCATC:1 + chr3R 19119362 3' + P-element 2469 1 41.78 GCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATAAGGATAATTGCTTTCAACAATTATCTATAAATAATTTGAAACATTTTTTAGAATTG:1 - chr3R 8867001 3' + Max-element 8387 2 41.38 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAG:1 + chr3L 8249491 3' - HMS-Beagle 6831 2 60.00 GTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAAAATATATATAAAAATTTCATTCAGCATTCGATTGGTCGTCTTGCAGCAAACCCAATTTCTTAAATGGCTAGTTTAGGATACTTTTGATAGATAGATTATGGGATGTTGATATTGATTACA:1 + chrX 14801068 3' - copia 4680 1 56.85 CTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATC:1 + chr3R 27007430 3' + roo 335 2 63.70 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTATGCGGTCCAGTTAACCGCTTGACATATGACCGTCATCATTTAGC:1 - chr3L 5958582 3' + 412 465 2 65.07 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATTGTGAGTCGCCTCTGGGCGTGCTGCATGTTCTGTTGTAAGTAATAAGCATTTTTATGTCGCAATTGGCCAGGGAGGGGTTAAGGGCAGGCCAAAAGTAATGCTTAA:1 - chr3R 23511498 3' + 297 382 2 78.08 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTCCAGTTGGTTAATATCAAA:1 + chr3L 21292602 3' + 412 7482 2 59.59 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATAATGCACTATTACAAACTATTTACAAACAATCTTTATCACGCTTACCTTTCCTGTTGACGTAGTGAAGCATTAGCTGATGC:1 + chr2R 6181320 3' - 1360 33 1 63.31 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAGGGGAGGAATTAAATGAGTATGCATACATAAATAATTTGTTATTGTTTTTGTGTGCGGGAACTATTATTATCAATTAAGCAATAATCT:1 + chr2L 16683370 3' + hopper 1384 1 47.95 CTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATAAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATATATATATAAATCGGGAGAAAGGGGCGATGGAATGGGTA:1 - chr3L 1044835 3' - Idefix 86 2 59.59 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTTGGTGCTGGTGTTGGCCGGCTAATGCGTTA:1 + chr2R 8597068 3' - pogo 22 1 70.55 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGAATGGTTGTGCAAAGTTTGTGGGGGGGAGGCGCAAAGGATTGGGTATTTGGCGTTGCACTTAAAACATTTGAATTGTTCCAATTTCCATG:1 + chr3R 18204475 3' + hobo 2909 1 60.27 GTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCG:1 + chr3R 7042061 3' - Stalker2 7327 2 69.18 TATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTCGTTTCAGTTTCGCCCATGGTCTGGATACCGCATCAGCTGGTGGGTATTCCCATTGGATTCAACATCACCCTGGAATGCTTCATC:1 - chr2L 6385758 3' - invader4 2788 2 66.44 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCTTGTTTTGTCTGTATTTT:1 - chr2L 3408722 3' + opus 7450 2 57.53 AAAAAGAAAGGAAATAGAAAAAATAAATATTAGAATATTATATTCACGGACATTTAGTATATATCTAAAAGTACGCCTGATCCATTGAATCGAATGCCTACTGTAGCCCACCTAGCTAGTGCTCAATCAAATTTGATGATTCTGTT:1 - chrX 12782075 3' + Doc2-element 234 2 78.77 AAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAGATGAT:2 + chrX 8208453 3' + roo 389 2 73.29 CTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCATGACTCGAGGAGGCACGCGAGCTGTTCAGCAA:1 + chr3R 28718158 3' + Ivk 237 1 78.08 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAA:1 + chr3R 24662031 3' + jockey 4936 1 57.53 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCTTTGTTACTCATTTATGCTAGCTAAA:1 + chr3R 5575090 3' + blood 361 2 73.97 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGCTTGATTAACAACCTGCACCATTTTTTGGCCTT:1 - 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roo 9037 1 54.11 AAAAAAATACAAAAAAAAAACTACAAAAATACCCAAAAATAGAAAAAAAAACAATACACCAAACAAACATACAAACGAAAAGTGTCCGCACCATATTTGGTTAATGGGAAGTCTTCACCCCGCGAGTCCCCTATCCCC:1 + chr3L 13914961 3' + HMS-Beagle2 489 1 56.52 CGCATCCTTCTGCCTGTTGCATACATAACAAACCTAACTAACACCTTTAAGCAAATTGACGATTGGGGCGACCACTCTGGCTCAGTCTTATCAAAAGACAAGTGTCAAATCATCCAAATCTTCTACAAGTATAACTTCATGGGAAA:1 - chr2R 5529246 3' - INE-1 30 1 50.00 CTGCACATATTATATGAGACTGCATGGAGCTTTCCATCAGGAGGAACAGAATCCTGGGCATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGTATACACTCCTGGCTATGAACAACTATAGAGTTG:1 + chr2L 22969358 3' + baggins 5234 1 59.59 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTCAAAATACAATTGTGTATATACCCTACACCAAAGCATAGGATAA:1 + chr3R 13676204 3' + P-element 2841 1 56.85 AACTTTAAAAAAAAATATCTAAAAAGTGCATTAGATCGAGCATTTGAGTAATGGACCTTTTAGGTATTCTAGTAAAATGGTTTTAAGGAACCGTAAAAAGATATCAAATTTATATATTGCTTGATATCAGAGTTTACTTTTAGT:1 - chrX 12465727 3' + gypsy2 430 1 81.94 AGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGAATATGAGAACGAGTTTTCGCTATC:1 + chr3L 4615803 3' - F-element 370 1 60.27 GACTGACGGGTATCTGATAGTCGGAGAATTTTTGCTTATTTACTAAATTGTTTCTTCTCGTTTTTGTGCGGTTGTCAACAAAAACATCGGTTTCATCAACAATTTCAGCTTGAATTAGTTCTTCAATTACATCTTCCAGAGTAACT:1 + chr2R 3918656 3' + INE-1 549 1 67.12 ATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCCCGAAGCTGCCAACAAGGAAGCCCTTGGAAGCCCCTTGCCCGAAATTAATTAAACTGTTTTTGAGGTCACGATAAAGAAATGCTACATATCACGTTGGGGTCACCAAATGTTTAG:1 + chr3L 24050691 3' + Gypsy6A_LTR 299 1 49.32 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAAATTCTCGCTCACCAAACT:1 + chr3R 6962426 3' - jockey 66 1 65.89 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTGAATTGGGTCAGC:1 + chr2L 8895349 3' + 412 7510 2 60.00 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAAACCGTAGGCCCTAGTCGAACTTGAAATCGTAACCCGTTTACCAA:1 + chr2R 7622959 3' + P-element 2881 2 64.94 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTAGACAACTTCCAATTTCCCCACCAAC:1 + chrX 6283731 3' + P-element 2824 1 41.10 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTACTCCCACTCTTTGGATCCTCTCCACCGCTCTCTAAAAGCTCCTTATGTGCGACCGCATGTTGTTTCTCCTTCCCTTATTTTC:1 - 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jockey 4761 1 77.05 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGGAAACACGGAGTTGGGCCCCAACTCCGAATGG:1 + chr3L 17935033 3' - HMS-Beagle 8 2 68.63 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCCGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTTGGTTTTG:1 - chr2R 22596053 3' - Doc 32 1 57.24 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATGTGTTC:2 - chr2L 18112477 3' + transib2 2778 1 52.74 ACGTTGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACGCGACGCGAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAATGTTAATTCCTATTGCCCTTTGAGCAGGAAGCTAGATGAATGCCAGGCGCGAGTGTCACTCATTTG:1 + chr3L 6394719 3' - G6 121 1 54.17 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAATCGGAATATGCGCATGCAAATGGCATTAGCCTGAAATG:1 - chr3R 12941752 3' - hobo 39 1 58.22 GAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATAATTGTTTATAATGGAAACAACTTAACGAACAGTTAAGTGCTAAGGACACAATAGTGAACCCCTACCTCATTGCGATCTTAAATCACGACCAATATAATTTTTCCAGTGTC:1 - chr2L 9062232 3' - Juan 4035 1 71.23 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTTTTCAAAGGCGCATATAAAATGGCAGTCATACA:1 + chr2L 11476415 3' - pogo 10 1 77.08 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCGGGTCATCCATGTACATCGCACACCTG:2 + chrX 140131 3' - blood 7034 2 69.86 CATATGGGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACGGACATACTTTANCACATTGCAACACCAATGTAAATAGGCGCATTCGCCACTAGA:1 + chrX 5569105 3' + Quasimodo 6 2 70.48 CCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTAACATTGATTGAGAAGCGCGGTCACATTGCTTGAACAGATGTTCACAATGAT:1 - chrX 13667780 3' - hobo 68 1 63.01 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTGCTCTGCCAGTTGGCAAGTTGTGAAAGTGAAATGCGAGACATGCTACCTG:1 + chrX 7993198 3' + opus 7487 2 73.94 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACCTCTGGTGCCCACCAACAGCTGATCGATCAGACCCGCTCGCAGTGATTTCTGTGTGGCCAAGAAC:1 + chr2L 1729888 3' + Transpac 306 2 76.69 AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCGCCGAGTCCCGTGAGGCTCAGGTTCGTCCAGGCAGCCAGCCAGCCAGTTAAATGGCAAGTCCTCCGGGAGGGGAATCCCATGAATACGGCTCATGTTCGCCATGTTGCTGTTCTGTT:1 + chr3L 10024133 3' + transib2 2822 1 82.19 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGGCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTAATCTGATAA:1 - 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roo 63 2 79.46 TGCGTAACGGCCATACAATGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTAACGGCCTAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTTAGAACGTAATTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACT:1 - chr3R 19447073 3' - 1360 3366 1 64.38 ATATACATACATATATATTTTTTATGCTTCGGGCAAGGCTCACATTTGCTTTATGGCGCC:1 + chr3L 13264540 3' + INE-1 70 1 88.33 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAA:2 + chrX 15406068 3' + opus 7456 2 49.32 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCCGATCAAAATCGTAGGGAATATAGTTACACAACACGGTCATACTGACCAGCTGACCGGCTAGGGATGTGAAAGTATGTACCTATCGATATATCG:1 + chr3R 10708366 3' + Transpac 301 2 75.38 AATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGAAAAATTAATAAGGCAATAACTGTAGGAGCTATGTGGTTTGCGATGTGGCATATCACAACGTCAATAACTGGTTGTGGTCGCCGTTTATCGATCGTGGATCA:1 + chr4 613716 3' + 1360 386 1 56.85 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAACGAACTGAG:1 - chr2R 23790254 3' + roo 9002 2 66.44 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTGCAACCATATTTGTGTATTTCGTTTATATTGTACACGCTTCTCATAAAA:1 + chr2R 24807961 3' + I-element 5286 1 63.70 TTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAACTGAACGCCGTCGAAGCAGGAAGTGGAAATGAGTTAAGTGGTGTCTTTTTTAGAGGCCAACTTGG:1 - chr3R 9977225 3' + BS 5033 1 55.48 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGATTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTG:1 + chrX 8208433 3' + roo 9033 1 58.62 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCNGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGACCAATGTGACAATGCAGGTGGAAGGGCAAGGGCTAACCCATTAGGG:1 - chrX 18767819 3' + hobo 2899 1 53.51 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTCATCTATTTTGTGGCGGCGGTTGGCGATC:1 - chr3R 7512877 3' - jockey 4745 1 76.23 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGTCTGGCAGTTCAATTAGCAGAGTGCGATATGTTGAAAGGCATTCTTAAT:1 - chr2R 12343187 3' + roo 9000 2 67.81 CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAA:1 + chr3R 4361661 3' - copia 4946 2 71.23 TAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATGTTTA:1 + chr4 829134 3' + INE-1 155 1 71.92 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAACACCCTTCTGTCTGAGCAGCTGCTGCCAATTTGTAAAGGTCTTAGGTCATTTGCCCACCCTTATTATAATTACTTGGAATGCAAGT:1 - chr3R 30813335 3' - FB 35 1 61.64 TATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGGTAGTAGATAAGAAGACTATGTTAAAATGGATCCTTTTTGTACATTATTTCTGGCAT:1 - chr3R 18268967 3' + Transpac 4927 2 69.86 ACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCTG:1 + chr3L 10814607 3' - micropia 5096 4 55.48 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTTTTCAAAGGCGCATA:1 + chr2L 11476397 3' - pogo 30 1 63.70 ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAGAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCG:1 - chr3R 10541234 3' + hopper 1355 1 69.11 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACAAATAAACGTAGGATT:1 - chr3R 18204310 3' - hobo 24 1 69.18 TTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGA:1 - chr2R 22964221 3' + 412 405 2 81.38 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGCTGTCTCCACCCTTTGAATGTTAACG:1 - chr2R 25083289 3' + pogo 2063 1 57.52 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGGACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATG:1 + chr2R 13695701 3' - blood 34 2 60.00 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAATCTCTTTGGATGTTTTCATAGTCACTGTATTCAGGATGGTTTGGTCGTAGTTCTGGTAATC:1 + chr3L 21284296 3' - F-element 4462 1 70.55 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAAGGCTCCTCCACTGCA:1 - chr2R 24617057 3' - jockey 4748 1 69.86 CTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGG:1 - chr2R 18372611 3' - jockey 4728 1 64.00 TAGGCTATTTTCTGCGTTATCTACGTGTCGATCGTGTATTACTTCACTTCCCAAGTTTCTGTTGCTGTGATGGTCTTGCCAGCTCCATTCCTCCACAATGGTGTGCTCCGTTTGCACCTGTACTGCGAATGACAG:1 + chr2L 116087 3' + McClintock 6089 2 64.44 AAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGCCTTTATCAGCGTTGCGCCAGGGAAAGTTGTTGACTTTTATGGCAAATG:1 + chr3R 18833156 3' - 1360 3044 1 78.77 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTTGCCTTTTCTAGTCCTGAAATTTTCAACGAGCAAACTATTGACAATGAACTAATTGCTATTGTTGCCGTCTGTGGACATATTTCGACTGCAAATAAACTC:1 + chr3R 12941913 3' + hobo 2928 1 75.18 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAAGAGGGGGTGGCACGTAGCAGAAAAGCAGAAAAGGACCCAAGAGGAAACCCGACAC:1 + chrX 1759076 3' - Tabor 31 2 64.38 CTGGGCAAAATGCTGCAGCAGCTGTCCCGGCCGGAGTTCGATCTCAACCGCGTTGCCCACCGCCTGCGTCTGTGGGTCAACGTCGGTCGGTGTGACCAGGTCCCGGATCTTGTTCCGCGTCGTGT:1 + chr2R 7157351 3' - R1-2 2824 1 61.60 TACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCACAAGCACC:1 - chr2R 17695996 3' - rover 6981 2 65.75 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGACGCGAGTCCCTTCTCATTTTTTACTAGTCCCCTCAAAAGTGAGTG:1 + chrX 7626243 3' - Transpac 35 2 60.27 GAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCTATGACTATATCATAGAG:1 + chr3L 21202130 3' - G2 2612 1 65.07 TATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAGTTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCAATGTCAATGCACT:1 - chr3R 19996154 3' - Quasimodo 34 2 61.64 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCTAAATGCACAATGTTAAGTGCCCAGCG:1 + chr2R 14332138 3' - jockey 36 1 65.75 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATATATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTT:1 - chr2R 9871060 3' + roo 8990 2 75.34 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGC:1 - chr3R 14277910 3' - P-element 91 1 23.29 AATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAATCTTGGCAGGCACAGACTTTCACTGCGTGTGACAGCGATCGCTAGTGCAAGTTACCCGTTCGCAGTCAAAGTGACACAGGCA:1 + chr3L 22267726 3' + flea 412 1 56.16 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAATCGGAATATGCGCATGCAAATGGCATTAGCCTGAAA:1 - chr3R 12941754 3' - hobo 41 1 56.85 ATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAAA:2 - chr3R 27007343 3' - roo 8726 2 59.59 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAA:1 - chrX 4469536 3' + roo 9004 2 63.01 CCTTCGAGAAATTCTGTTGTTTTCCCCCATCAGTGGTAAGAAACACAGAAGAAAAAACAGTGCTTCAAAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTCGAGTGATTCTGTTGTTTATAGTGTGAACATTTTGGTCCTTCGAGAAATTCTGTTGT:1 - chrY 36537 3' + rooA 395 1 73.29 TAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGAACGCACTCGGGACAAGAAGCTGCGACA:1 - chrX 21626863 3' - HB 71 1 60.96 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAATAATTCCGAGATTGCCGTCAAAATTCGAGTCGTGTACTTCAGCTAACGCTCCCCCTGTTTAATTCCGTT:1 - chr2L 6047797 3' - P-element 6 2 79.39 TAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTCCCTCTACTTCCTTCTGATTGAGTGTATTAAATATTTCACTGAAATATTTTTCTTTTTCATTAATGCAAATGGCTTTTGAACTATTCCACAC:1 - chr3L 19233187 3' - 412 7527 2 65.75 TAATTGTGATTGGTATATTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTG:1 - chr2R 2146570 3' - I-element 222 1 71.23 TGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTTTTG:1 - chrX 4240218 3' - jockey 4733 1 58.90 CTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAG:1 + chr3L 4615762 3' - F-element 411 1 61.64 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAAAGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATACAAGCAATGCATGCAGCTTCAGACAAATAGCATGATTGTGATGAGTTTTGCAAAGCTTTAGTATAAAATG:1 + chr3L 27973800 3' + Burdock 245 2 50.68 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATAGTGACGAATGGTTTTTGAAATCGTGTCTGAGCTTTTCCAGTTTCGAACATTTATAAAATAAAC:1 + chrX 20233900 3' + pogo 2051 1 53.10 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATGCCCACATACTTATGTACATCATTGCTCCAACACACATGCAGGGTGCATATGCGACTGACAAAAGTGTGAAATGAAA:1 - chr2L 16276415 3' + S-element 1673 1 53.42 CGCGAACACAATGACACCGGTGTTTCGCTGGCAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTCGTCCGAATATATTCTTCTTTTCAATACGATTACCCAGTGCGCATAAGTAGATCCGTAATTCTTGTCCTTAGC:1 + chrX 2093212 3' + Gypsy12A_LTR 1977 1 59.59 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGCTGC:1 - chr3R 17944026 3' + P-element 2835 1 41.60 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATTGAATCTAATAAGAGATGAACTCGCCACTGAATTTAATGTAATATTAACTGCTA:1 + chr2R 12249097 3' + Juan 4191 1 67.12 TAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAGGGGAGGAATTAAATGAGTAGCCCGAGGAGGA:1 + chr3R 8394481 3' + hopper 1330 1 75.69 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTCATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAACCCGCATTAAGTGATCATGAAA:1 - chr3L 18010206 3' - diver 33 2 62.33 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAATTTCTTTTACGAAATACACCTGGATATGTGAACCACCCTCCCATAATCATCAGCAGCTAGGACCAATCATATTATAAAAATAACA:1 + chr2L 21026764 3' - FB 36 1 60.96 AACTATATTTAGCCGGCGAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGCTTCAAGTTTGCCTTAATGCCTTAATAAATAAAAAAAAACATAAAAATAAAAACATTCAATACATTAAGCCTA:1 - chr3L 24213370 3' + X-element 4630 1 71.11 ATCTGCGTTTCATAAAACTGTGCTGACACGGTGATATAATTAATCTAGAAAGGTGCTGCAAATGAGAAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTTGAAGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGTTTCCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAA:1 - chr2R 5062003 3' - Q-element 211 2 76.71 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCAATGGTTCAAT:1 + chrX 7042741 3' + roo 9026 1 54.79 GCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGGCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGT:1 - chr3R 12115301 3' - 1360 91 1 81.02 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACATATACACGATGTGTTTTTGATATAAATGAACTTGCTTATATGCCCATGACAAGTATGATTTATTGGCTAATTGGCCAATGGTTTTTTATGGATTTCACAG:1 + chrX 19163406 3' + Burdock 238 2 73.97 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGGGGGAACGCATGGCACCCAAATTAAGTACAAC:1 + chr3R 15047389 3' - F-element 61 1 68.75 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACAGTTGCGATAGCAACCTTTGTAATCAAAAATCGTTTCAGCAGGTAAAACGCGCCAT:1 + chr2L 22578047 3' + 1360 3327 1 61.64 CATACAATTCCATATACATATGTCGGAGCACAATTATTATTCTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACTGAAGATCTACACACAATTAATTTGTGTCACTCACAAATCAACAAAGAGCGCAAGTTACCGACCCATCGGTACC:1 + chr3R 443019 3' + ZAM 8148 2 65.75 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGAAGAAAACTGT:1 - chr2L 21777759 3' + pogo 2053 1 57.53 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGCGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCATATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGAACGCA:1 + chr3R 17944112 3' - P-element 61 1 42.47 GTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACACGGAAAAGTTCATCAACAACATGTCCAAGTCTGGCATCGTGGAGTCTGTGCTGGCATGGGCCAAGTTCAAGGCC:1 - chr2L 19450963 3' + flea 4588 1 50.68 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGGTGCACGTGATGCACCCAAAAGTATGCA:1 + chr2L 13316938 3' - jockey 4736 1 65.93 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCCAAGTGGGAGTTTGATCATGATGAGCATCATATTTTTCTTC:1 + chr2L 1451295 3' + mdg1 403 2 73.29 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCAT:1 + chr2R 18723744 3' + 297 6931 2 64.35 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATTTCTCAGATAGGATAATCGATTATATGGGGTTTCGAAAATATAACCTATTGATAATCAAATTGGCGACGTTTCTCCCATTTAATTGTA:1 - chr3R 15585522 3' + I-element 5321 1 63.01 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACGAATTGGCGGTGATCAGATCAAAATTTCGACTTTGAATAATTAAGAAGTAATAAGCTTAAATCACAATAAA:1 - chr3L 18075533 3' - pogo 47 1 52.74 AAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGGGCTTGTCCTACCATTTGTTGTCTGCCAGAGTAAGCATT:1 + chr3R 27016582 3' + roo 405 1 59.59 TATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTNATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAAGTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATATCATATATCATACATATGCCTGTGTGTGGCAT:1 - chrX 3753434 3' + S-element 1633 2 74.66 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACT:1 + chr3R 13684786 3' - 412 50 2 51.05 AATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGACTCGATTAGTCGATAATTTCCATTGTCTGAAGTGCAAAGATTTCTGCTCTGGTCGT:1 - chr3L 13257559 3' - mdg3 215 2 73.29 CTAGCTTTTATAGTTGCTGAGCTTGAGGGGTTCATACGGACATACAGACATACGGACAGACGTACGGACAGTCTAAATACCTTATTCCGCTTTGCACATAATTTCAACCTTATTTATTTTAAGTAAGTTTTGTAATGTAAAAGATC:2 + chr3R 18141526 3' - INE-1 152 1 29.45 GCAAAAGGTCATAACTTTACACTTGGAGCCATTTAAGTTTAGTACGCTATCACGGCACCATATTTGAAAGCTATTAAGATTGGATTGTAAGTCCAAATGGCAGGAAATTTCCATCTTCTGGATATATAATTAAACATCTTTTGC:1 - chr2L 10966628 3' - Q-element 673 2 70.83 AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCTCTTTGTTCTT:1 + chr3L 20168339 3' + roo 391 2 71.92 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCTGCT:1 - chr3R 5977740 3' - copia 4940 2 65.52 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATT:1 - chr3R 8381686 3' - Tirant 23 2 65.62 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTGCTGTGTT:1 + chr3R 6147337 3' - copia 4931 2 57.53 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGC:1 + chr3L 16200823 3' - roo 72 2 69.86 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAA:1 + chr3L 8249467 3' - HMS-Beagle 7 2 68.18 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTCATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACNGNGCAGTGCGCCGAGTCCCGTGAGGCTCAGGTTCGTCCAGGCAGCCAGCCAGCCAGTTAAATGGCAAGTCCTCCGGGAGGGGAATC:1 + chr3L 10024093 3' + transib2 2788 1 57.14 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAG:1 - chr3R 16349223 3' - P-element 80 1 28.37 CCTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCCACTCTGGCTACTTTTGTTGTCACTTCATTTCGCGGCACACCGAAAACTATGCCACACTTTTCACTGTTTCAGAGCATTTCCGGTTATTTGGTTGTAGTTATTTCGCATTTATTAGTTATTTT:1 - chr3R 11338405 3' - Doc2-element 223 1 80.14 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTATACCCAGGAATCGCACAAATACAAAGGCATAC:1 - chr2L 20550980 3' - 412 86 2 76.03 AAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATAATCTTAACCCGACATATATATATATATATATAGACCAGTTTCCTCTTTAAATTGGTATTTCACCCATTTTTCCCTTTTCAGCTTTTCCTC:1 - chr3L 10814490 3' + micropia 5393 2 57.53 AATAGTCTTTAATATTTGTAATTTAAAAGGTGAAAATGAATTGTAACTTCTTTAAGAGATCGCATCTTATACATGTTCCAAGAACAATGTCTGAATGAATCNATTCACCAGGTCAATATCTATTCTTCCAAGTGACACATCTGCCC:1 - chr3L 1320687 3' + gypsy7 5092 1 80.82 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGATGTCTGG:1 - chr3R 21843758 3' - blood 7083 2 65.52 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTTGCCACTGCCCCGTTTCGTTCCGCACACATG:1 + chr2L 4631266 3' + roo 9042 1 63.70 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGCTTGTT:1 - chr2R 14431223 3' - Doc 84 1 69.18 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGGGTACAGCGATTGATCAAGTTTA:1 - chr3L 21636412 3' - 297 6603 2 64.80 TGAAAGGAGAATAGAAAAAATAGCATTTAGTTATGTTCAGGTGCACGTGAAGGCAAATCTTAAACATAAAGAACAAGTTGCTTTAATATAACGCAATGAACCTCTCCTTTCCCTCGGCATTTTAAGAAATCATTCAGTTCAACCAA:1 + chr3L 18170192 3' + Bari1 138 1 77.40 TTTTTAAATTTAAAACTTTTTAAAATTTACTTCCTCCCAAAGGAGATTTAATAATTCAAAATAATATTAGCTTATTATGAAACGCAAATTTTAAACTTTCTAGTGGTGCGTCATATTCAACATTTGGCTTGGGCTTTCAATTAAAT:1 - chr3L 15267494 3' - 1360 3020 1 39.04 CCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATATGTATGTATATCGAAGATCTGCACTACCGATTTCTTAGTTAACAATCGTAAA:1 - chr3L 3154074 3' - flea 4809 2 65.71 CTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATCATTTGTTGTTGCCCCCGCGCTCTGTTGTTCCCATTGCAATCCCATTTAAATG:1 + chr3R 20234856 3' - Quasimodo 478 2 59.23 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGA:1 + chr3R 21655036 3' + roo 8983 2 76.71 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATGCTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGAGTGTGTTTAAAATTATGCATGGTTTCACCTCAGCAGGTTG:1 + chr3L 5958754 3' - 412 7075 2 60.96 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATACCTTCTTTCA:1 - chr2L 23068827 3' + 1360 3342 1 54.79 GAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTTATTTGTTT:1 + chr3R 8867118 3' - Max-element 40 2 58.22 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCAATTATAGAAAACA:1 - chr2L 3133655 3' - Doc 25 1 61.64 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAGGGCTAAAC:1 - chr2R 9871000 3' + roo 387 2 64.38 GACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCATGGACACACACGG:1 - chr3R 7041952 3' + Stalker2 368 2 60.96 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAATTCGCATTCAT:1 - chr3R 25692691 3' - BS 5015 1 69.18 GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACCCAC:1 - chr2L 16382505 3' - hobo 60 1 67.77 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAATTCGCATTCATAGAACA:1 - chr3R 25692685 3' - BS 5009 1 73.29 CATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATT:1 - chr3R 3617311 3' + micropia 172 2 73.97 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGATTATGGGCTTCGAACTATGTCGATAGA:1 - chr2R 24807857 3' - I-element 37 1 58.22 GTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCAAATTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAA:1 - chr3L 13727326 3' + P-element 82 1 21.23 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGGAAACACGGAGTTGGGCCCC:1 + chr3L 17935021 3' - HMS-Beagle 32 2 50.88 ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTCTTGAAATCG:1 - chr3R 24074758 3' + jockey 4923 1 64.38 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACC:1 - 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chr3L 13888853 3' - 412 7071 2 73.29 CTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGT:1 - chr3L 21913350 3' + 297 319 2 74.66 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATTTTTTTTTTTAGATATACAGATAATAAATTATTCTCAACTTTTAAGCATTGTGCTTGTTGACATTTTGAGTACTTATCAGAATTT:1 - chr3R 19628886 3' - Transpac 4947 2 65.75 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGTTGACCGCTTGAGTTATTCAGTTGC:1 - chr3L 14232995 3' + copia 241 1 73.29 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTCTCCCCTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTGAAGTATCTGAGTACAGAAGAAGTTACTTT:1 + chr3R 22435624 3' - roo 34 2 58.22 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCCGCATAGTGCCAAACCAATGTTTGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAA:1 - chr3R 12622199 3' + 1360 3330 1 71.90 ATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAGATCCAGGTTTATTGTTTCTGTTTCATTCCATTTTATTGTCGTATGTCATACAATGGCGTAACATTTACATTTCCCATTAAACTTTCCGCTA:1 + chr3R 8058674 3' + 297 241 2 61.64 AAAAACTGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGAGGGGAGGAATTAAATGAGTAGCCCGAGGAGGAATAGGTTTCGACCTTTTTTTCCCAGTTGCGTTGTCACCTCCTCTGTGGCTATGCTGGTCATCTCCATGACACTGGTTTCCAT:1 + chr3R 8394564 3' + hopper 1410 2 81.51 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCCTTCAAATCCCAGCCGAGCATGAAAAGAGTGATGTAAAAAA:1 - 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chr2R 24807874 3' - I-element 54 1 56.85 AGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCGGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTACAGTGGTGCTGGTGGTGGTGCTGATTGGGATTTCTGAGTCCATTAAGACTGATTCTCTGAT:1 + chrX 17212383 3' - 412 397 2 56.85 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTA:1 + chr2L 3911917 3' - roo 78 2 74.66 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGGAGGGCAAACAT:1 + chr3L 20868102 3' + hobo 2908 1 58.00 TATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTACAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAA:1 - chr3R 27007344 3' - roo 8727 2 60.27 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGTTGATTACATTG:1 - chrX 19163227 3' - Burdock 28 2 66.44 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAAAACTAAAAAAAAAGATACGTATAACTAAAGCTATCG:1 - chrX 10284761 3' + pogo 2086 1 72.54 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGATATCTCCTTTATACCTTGATTCACTCAAGTAAATAAACCAATTTGCAACCATATTGTTGACAATATGGACCTAATGGTAT:1 - chr3R 24010952 3' - roo 39 2 57.53 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACNTNTAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGC:1 + chr3R 12787368 3' - BS 5072 1 66.44 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCA:1 - chr3L 20934153 3' - Max-element 67 2 64.34 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATCACCGATCGGAGCAGATGTTTTCTGACTAAAGTCAGACCGATTATCCGGCGCTGCCTGAGCAAACATCCATTCA:1 + chrX 17477727 3' + Quasimodo 7363 2 75.65 GAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCAAAATTTGTGAGGAAAATGAGGATGGGGAAAACTGGGC:1 + chr3R 12941348 3' + hobo 216 1 74.66 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGCCAAAATCAAGAAGAACAACAAAAACCATTA:1 + chr3L 19907223 3' + P-element 2856 1 63.01 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACATTTGAATATATATGTACTTGATTAGATATAATTGGCTGTCAGTATG:1 + chr2R 23596063 3' + blood 7327 1 66.67 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAAT:1 - chr2L 19698051 3' + roo 9037 1 57.53 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATGTACTCCTCCTTGGGGCACTGTGACCACCATCGAGGAGCTGACACCGTCAGACTCCGTTTTCCCAGCC:1 - chrX 12365286 3' - hobo 25 1 61.02 TCTTTGTAATTTCAAAATTATGTGATTTCTAATTAAGGATTAAAGTTGGTTTTAGTTATTTATTCGCTAAATAAAACACAGTTCTCTACGTATGGGGAAAAGCGAGGGAACAGGCTGAGTGACATTGCTCCCCTGAGGTCTTTTGG:1 + chr2L 17208964 3' - P-element 2509 1 43.84 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGCCTTTAATTGATTGCCAATTAGCTTTTTTGTCCCGCCAATATCACGTCCCAGCAATTAAATTAGTAGATGAAAATCGCTTCCCTTTTGTCTTTGGCGAAGTCAA:1 - chr2L 2316887 3' + roo 391 2 64.38 GTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAATTGTGATGGTGTTGTCTGTAATTGCACCGAATCATTCTCGTATTTCTCCATTTCCTCCCCGATTCGCTGTAAAAAGTCCAGCAATT:1 - chr3R 14650314 3' + Bica 93 1 57.93 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATG:2 + chr3R 30618760 3' - X-element 52 1 48.51 CTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATTAGGTTTCCTGAATTTTAGGTTTCCTCAATTAATTTATGCCTTACCAGCTAAGA:1 - chr3R 9137447 3' + blood 7230 2 63.01 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCCAAAAACGAACTTTACCATTCGAATTGAGGGAGAGTCTTTTCAAGGAATTCAATTTGTCTATTTCAAACATCTGAACATTGACGTTCTGAA:1 + chr3R 10062268 3' - copia 4899 2 63.70 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGC:1 - chr3R 9550925 3' - P-element 91 1 23.29 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTAC:1 - chr2L 3911838 3' + roo 342 2 61.64 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACT:2 - chr2R 22596074 3' - Doc 54 1 52.05 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTTCGAGAAAGTATTGCCTACTTTCAGGTTCGTTACAGA:1 + chr2R 18618568 3' + jockey 4953 1 49.32 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTAT:1 + chr3L 21913457 3' - 297 6621 2 57.64 CGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTTGATTGCCTTTCAAGGCGGAAACAATCCATTGGCATCTACGGCCATGCTTAT:1 + chrX 10956506 3' - R1A1-element 110 1 64.38 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATCCTCCC:1 - chr2R 14484080 3' - pogo 38 1 55.48 AGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTG:1 + chrX 21667920 3' - gypsy2 86 2 73.97 GATATTATTATTATTATTTTTATTTCTATTATCATAACAGTCAGTAATCACTTAAATTTGCAGCTATGGGCTTAGGGGTCGTCTTATATCTACTTGGAAACGGGCTTGGTTTTGGGTCATCCGTTAAATAAACGACAACGTGACTC:1 + chrX 7330476 3' - mdg1 33 2 69.86 GCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTACAAACTTAAATTTGTACAAGAATAACAAGATGCGGAACGCCATACGATTTTTTGGCATCACCGCTGCCGCTGCGAATGCACTGCCCGTTTGTCTGCTACCTCCAACA:1 + chr2L 22966975 3' - 1360 18 1 37.14 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATACACACATACATATATATATCTATATACATCTATATAAACGGAAGTGAAAATTAGCAAACCAGGAAAATGTTTTGCCCAAACTAATAGAGAGGCCAGATGGTTTCGG:1 - chrX 12263654 3' + roo 396 1 78.08 AAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGGAGAATGTGTCAAGAGTCTTAAGCTGAGCTTAAGTGGGGCAGCGAAAGATTACACACACTCTCGTATGTCCCGGCAAGGACTCGAAGGATGTCCCCAAGTTT:1 + chr3L 17285717 3' - accord 7031 2 53.85 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTT:1 + chr3R 27398103 3' + roo 329 2 71.23 CGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATATTACTGTCTACTGTTCTTCGTACCTGTTATAAACTTTTAATCTTATATTAATAGCTTTTTGTTATTTT:1 + chr3R 20597311 3' - roo 8825 2 53.42 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCG:1 - chr3R 23104496 3' - jockey 89 1 70.55 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATT:1 - chr3R 23579303 3' + roo 331 2 72.60 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTC:1 - chr2L 13697593 3' - F-element 71 1 53.42 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCAGTATTAAGAAGTAGTCAACCGCTATAGTTCAGTCCCAAACTACACAT:1 + chr2R 25083374 3' - pogo 48 1 63.71 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTA:1 - chr3R 15102219 3' + roo 9029 1 54.79 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCCAAGTGGGAGTTTGA:1 + chr2L 1451269 3' + mdg1 7415 2 55.48 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTGTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATCATT:1 - chr2R 16072891 3' - opus 7038 4 56.16 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCGGGCGTGATGAAAATTA:2 + chr3L 22038332 3' + diver 181 2 55.48 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATGTATGCATCTGTATGTACATATAACCTAAGACTGGGGAGGACATCGATGAGTCGGCGAACAATTTGTATTCAAACGATTTGAGAGCACTCCT:1 - chrX 7993014 3' - opus 22 2 67.81 CGGAGAGAGGGGGCATGTTAACTCCTCTCCAAAGAGAAGGCCATAAGGGGAAATGGCCGGATCGGAGAAAGTGGCTGACGCGCTGAGCGATTAGGCGAAGAGGCCAGGAGGACGGAATAATCAATAGTTAGGCTCTTGAACTGG:1 + chr3L 2673798 3' + accord2 202 2 55.56 GGGTCGTTGCAACTCTCTGACTTGGTCGTGTTAACTCCTCCTTGTCTTAAGATGAAGACGTCCCCGGATTCAATGGTCTTAGACGGTTGTTGACATAATGATTNTAGACGGTAGACGGTTATCGAGGCTGTGGAG:1 - chr2R 3925300 3' - gypsy10 15 2 74.81 CAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGG:1 - chr3L 2687214 3' - jockey 4760 1 76.71 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAA:1 - chr2L 19698099 3' + roo 8989 2 73.97 GCTCAAGAATGCAAATAAAAGAAGGATAACATGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTTCCTTATCTAAGAAATTTTAGCTGCTTATGCCATTTTTCTAGCCTGCCTGTAATTAATCATCATACCATTTTTTATCCGCTTTTTTG:1 - chr3L 5632207 3' - HB 168 1 53.42 AGTGTTTTTAAGTATCGTTTTGGTGTCCCTAATCTGTGCTCTTTCATAATATATAGTTAAATTAAAAATACAATTTATCAAGTTGCCATTCGGTTTACCACCCATAGCCGCTAACCTGAACAACCTCTTATCTAGTCCACCCGCCG:1 + chr3L 14404749 3' - transib3 105 1 52.74 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAAT:1 - chr2L 6047865 3' - P-element 89 1 24.66 AACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAGAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGTGCAA:1 + chrX 22672498 3' + INE-1 575 1 50.00 TTCTTGGTGAGCGAGCTCTGGACAGTGCCTTGGCTTACGAACCATTCGCAGCCGGTAATCATCCAGGCGATTTTGTTTTGGGCAGGCTTCATAGTAAAAATGCTTTTAGAGCTCCTAAAGGGACGAAGAGCCAAGCAATAGGAATA:1 - chr3L 24051156 3' - BS3 1535 1 76.03 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTATGCATTCGAACTCGATATTTCATCATTTTTCTGGGATACCAATAGATATGAGAAATAAGCTTTTGTCAGGACTACAAATGTCGAACGGGTCGTATGAGTAATATTATAACACTTTG:1 - chr2L 8331187 3' - INE-1 549 1 58.90 ATGTTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCACAAGTATTAAACGCAGTGTTTAGAACAGATTTTGCAGATTTTAAACAACGTAAAAATTTTTTTGACACGGTCACAACGTAACT:1 + chr3R 6408180 3' - Cr1a 424 1 58.90 CAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGCAGGCAAATAATAACGTCGTCATGTATAAATT:1 - 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chr2R 913986 3' - Cr1a 4255 1 54.11 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCA:1 - chr2L 19940015 3' + mdg1 7400 2 58.33 ATTTGGGATTTTACATTTGGTNAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAATACCTTATTCCGAGTCTCTGGCCAACATTAACCCCCATATCTTTCGTTTCAGTGTCAGTTTGAT:1 - chrX 16771684 3' + roo 415 1 55.48 CAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAAACATAATAAATGAT:1 + chr3L 19350041 3' - 1360 3229 1 51.37 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATACCTTCTTTCAAGGTA:1 - chr2L 23068822 3' + 1360 3347 1 55.48 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAANTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTANATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAACATTCC:1 - chr3L 12125246 3' + roo 9041 1 63.70 AATTGAATAAATATATGTCAGNCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATCACAAAATTTCACAAAAATCGTAAAAAATTTTTTCACAAAACTTTAAATGTAATTGTTTTT:1 - 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chr4 258125 3' - INE-1 149 1 53.42 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTTTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCAATTT:1 + chr3R 13684793 3' - 412 46 2 51.37 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTTGCCTTTTCTAGTCCTGAAATTTTCA:1 + chr3R 12941839 3' + hobo 2894 1 70.10 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAAAATGGGACCAATAAAAACCAATTTCAATTCCAATTCCAAT:1 - chrX 4469496 3' + roo 9044 1 59.59 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTCTGTCTATCACAATTTCCATCAGTGTGCATCAGCGCACCCAAAGGCCAACAA:1 + chr3R 13529985 3' - jockey 23 1 59.14 GTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGATGAATTTTAATTAGCAACCTAAGC:1 + chr2R 9514477 3' + R1A1-element 4901 1 80.17 GGGAGGTGTGGCCGTCTGACCCGTGCGAAAAAAGTTTTAATTCTTTTTTTTAAGTTCGTATTATTATTATTAATAACTTCCTAAAATTGCTTGAAATACACCGTTATTTTTATATATTTTACCAACACTGGTTACTCTCTTTTAC:1 - chr3R 10190386 3' + Cr1a 4436 1 54.48 GTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGAAGGACGAAACAAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGCTT:1 - chr3L 233212 3' + Dm88 437 1 59.59 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTTTAATCTTCTGATTAGCTATTTTGAGCAAT:1 - chr2L 22340089 3' - Doc 57 1 51.37 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGAGCTTCAAAATTGTTAGCCCCATTGTGTTGGTAGCACACATATCCTTTTCCTTTCCTGGCTGCCCGGCAATGGGTTGAAAACTGAAATTAAATTGTGATGCCCACCA:1 + chr3L 5398198 3' - roo 8679 2 76.71 GTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGC:1 - chrX 7848219 3' + flea 155 1 82.88 AGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCCCTGATCTCGGCAAACTTTC:1 + chr2L 22044570 3' - McClintock 48 2 58.90 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATAATCAAGCGTGCAGCTGAAATCCTTTAAAGATCTCAAGCTCTGTTGCCACATGAGATGAGATGAGATGATG:1 + chrX 5456665 3' + roo 9023 2 53.42 TTTTTTTGGAAAAATAAAGAATCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATAGCATACAAGAACCAGGGATCGCCATGTGGACAC:1 - chr2R 6165195 3' - pogo 2016 1 69.86 GGAGTGCGACCTGGCCACACATCCTGCTCATCGAAGTCATACCTTGACTGCCAGTCCCGGTGAGCGTCGACGGACTGAAGAGCACGCGGAGTAAATAATGCACTGCGCTCAGTAAGGCATCATGGACAGAATCC:1 - chr2L 9579251 3' + Rt1b 4946 1 68.66 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGCCGTGTCTGAAAGCTAATT:2 + chr2L 15917733 3' + roo 9047 1 69.86 CCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAA:1 - chr3R 11757987 3' + invader4 3001 2 72.60 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAACCGTGAATTAAAGAATAATTTGCAGACGACATAGT:1 + chr3L 16920285 3' - roo 53 2 55.17 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACCTCTGGTGCC:1 + chr2L 1729833 3' + Transpac 250 2 63.43 ATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAGGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACA:1 - chr3L 8754737 3' - mdg3 5287 2 50.00 GCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTTTAATTGACTAGTAGTAAAATAGGTAATAAATAAGCATTTTTGATAAAAGTTATTGCACA:1 + chr3R 16173609 3' - Quasimodo 234 2 58.90 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACAAATTGTCAC:1 - chrX 10147877 3' + pogo 2053 1 58.96 TACATACACACATTTTCACTTTGTTTTCATTTCGATTTTCTGGCCGTTTTTTTCAGCGCTGTTCCGCCTGACATGATATAACTATGATACATCCACGGCCATCCTTATTGGTCTGCAATTGCTGGCGAGGAGTAAAAGTTTTCTCC:1 + chr2R 10201594 3' + ZAM 272 2 73.97 TCGACCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTAAATTGATACT:1 + chr2L 5341611 3' - Burdock 6185 2 49.32 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAGTAGTAGTGCAATTGTACTTCAATCCAAGACACCAGCGCGTTCAAAGTGCGGTAGCGTGTAGCGCAGCGTATCCGCCAGTCGGCGGGACTGG:1 + chr2L 6346725 3' + flea 4991 2 71.83 AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCTTTACACTTAAATATGCATCAACTATTGCT:1 - chr3L 1477314 3' - mdg3 5262 1 78.77 ATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCAT:1 + chr3L 7102382 3' - I-element 84 1 71.23 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCAACGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACACAATCATTGATGCCACTTTGCTGGC:1 - chr2L 7336114 3' + pogo 2050 1 58.33 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCAAGCGCTTTTCATCAGTGA:1 - chr2L 16537513 3' - Transpac 4958 2 58.90 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCNCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAACAATAATTTATGGTCGAAAGTGATTAG:1 - chr2L 13850614 3' - roo 48 2 51.37 GAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAAACGCAAATGTTGGTATGAAGGTTAGCAACGAA:1 - chrX 16544999 3' + I-element 466 1 71.05 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAGTTTAAATAACCATATCAATCTGCAGATCTATGCTGCAATTATTTGAA:1 - chr2L 13292897 3' + copia 243 1 53.42 TATTTATTAAGTGCATCAGAATAACACTGATCACTTTTGAGCCCTGTTCAAAATTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGAGTTGCGTTCTTATAGCTCGTATCTTTGCATCTCCAGCTTCCTAATAATCGGTTTATTAT:1 + chr2L 5935662 3' - gypsy9 5285 2 58.90 CCCCGTAGCTAATGCTATACTNTCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAACTTATTTTTGCAACATTTTTGTGGTTATCAAAT:1 - chr2R 15406214 3' + I-element 5299 1 53.42 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTG:1 + chr3R 20345539 3' - blood 61 2 58.33 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCAATTCTTATACCTCACCTTGCACTTAAATGGTTTCTCTCCGGTGTGACGACGGTGGTGTACACGCACTTGTCCAGGAGTTCGGAAACGTTTGTCACAGTAGCTGCACTG:1 + chr2L 19733234 3' - FB 12 1 75.34 GTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGTGACG:1 - chr3R 23020774 3' + INE-1 573 1 69.66 TTTTGGATTTGCGGTATTTATACGCGCTTAGTTACAAGTGTTAATTTAGGAATGACCAGCTGCCAATTTGCGACTCCGTATGGGATACCGCTCTATCCAGAGTCTGTTGCCATTTATCTCCGTTTCTAGTCAGGTGCGATGACAGG:1 + chr2L 7295557 3' - TART-C 10987 1 60.96 GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGTGTA:1 - chr3L 21636431 3' - 297 56 2 62.86 CCCTGCAGCACCACCACATTTAATAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACACATGTTCAAGTTTTCCAGTCTTGCCAGTTTTGCCAGTTTTCTCAGTTTTATGCTAATACTTTTTGCAAAGAT:1 - chrX 16984740 3' + gypsy3 6946 2 53.85 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTC:1 + chr2L 1451254 3' + mdg1 7400 2 56.16 AATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTTGAATAATTGGCCAGATTCATTGCGAAATTCTGTTGATTTACCCAACAATCTACTTTGAAAAATCAA:1 + chr2L 13598521 3' - Tabor 133 2 53.79 AATGATAAATTGCAATAAACGGCCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTTTTCTATGAAACACTCTTCACAGTTTCTTGGCACTCATGCTGCTTCTGCTGCCGCTT:1 - chr3L 17934920 3' + HMS-Beagle 199 2 54.48 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTATA:2 + chr3R 9551024 3' + P-element 2857 1 65.07 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCTTTGT:1 + chr3R 5575069 3' + blood 340 2 59.59 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCA:1 + chr3R 5972369 3' - Doc 316 1 62.07 GTAGTCTGGTCGCGGGCGGGAGCGAGAGCGAGAGAGAGATTTCTTAACGGGAAAGAATGGGACTAGCAAGGATTTGACAAAAATGCCATAATGTGTGTTGGTATTAGTGTGTGTGTGGAGTGAAGTAAGTCTCCAAAGTGTGTTTG:2 + chr3R 4565283 3' + invader1 3727 2 78.08 CTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAGAGAAGATTCAATAAAA:1 - chr2R 5284494 3' + Doc4-element 2637 1 76.03 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAGTAGTT:1 - chr3R 19246636 3' - jockey 4680 1 73.29 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATGTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAGAATGCAACTTCCTGCTATTTTGTGTGGAACGTAAGCATCTTCTGCCAAAACAAATGCATACTT:1 - chrX 20024476 3' - 412 23 2 65.75 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGAAGCGAGTCCCTTCTCATTTTTTACTAGTCCCC:1 + chrX 7626230 3' - Transpac 4966 2 53.79 CCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAATCTATTCCTTCATGACTCGAATTTTAAGAGATGAAAGCATTACGCAACAGTCCGTCTCATAACAACCA:1 - chr2L 11201558 3' + G2 2934 1 51.43 CTTTGAGTCATGAAGGGGTAATACAATAGATCCGACTGAGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAATAACGGGAATACTGTTGCACTTGCTTGTTGTTGCCGCCAAAACATAATTGATCAATTAAAAATTAATAC:1 + chr3R 18058950 3' + baggins 5380 1 60.27 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGA:1 + chr3R 31086590 3' + jockey 4924 1 67.12 ACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTCCGCTTACCGTTTCATTTTTGGCCACTTCG:1 + chrX 6587751 3' + mdg1 239 2 79.31 TATATTGCCCTTTTAAATATACGAATTTACTTAACCAAACTCCCGATCATTTCGGGACTTTACGTTGGTCAAAACCACTGCTATTCTTATGAAAAGCCAAAAAATTGCGTTGTCTAGATGTATGTCTCTCTGTGGTCGAAAATCAT:1 - chr2R 25177764 3' - HB 301 1 44.52 ATGTAGATAATCAAATTTAATAATGATGCTATGATGATGCTAATGCTATCCCTTTAATTGAAATAAGAGCTTTGTCTTCAGACTTCAAATTGTTTTGAATTTGAATCAGATAGATTACCTTTTGAACCACTGTACTCAAACGGGCA:1 - chr3L 2869100 3' + Penelope 354 1 31.51 ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCTCAC:1 - chr3L 10023967 3' - transib2 63 1 63.70 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAAATCCGCTCTTTTCAGTTCC:1 - chr3R 16881863 3' - 3S18 9 2 77.17 GCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATTCGTTTGACACTGTAATGCATCCGCTCCTCCCATTCCTCCTCTAGTCCTGCAGTCCTTGGTTGGTGGGACTGTGCCTGC:1 + chrX 538576 3' - Doc 240 1 53.42 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGGAAATGAGATTGGCTTCGGCTGAAGGTGCAATGAAGCCGTACGATGGAGAATGGAAATACGCCTG:1 + chr2R 13695766 3' - blood 7031 2 71.23 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCATGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAACAGCTTAATAAGGCCATATAGTTGCTTTTTG:1 + chr3R 25962098 3' - I-element 33 1 61.64 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTGCTCTGCCAGTTGGCAAGTTGTGAAAGTGAAATGCGAG:1 + chrX 7993186 3' + opus 468 2 65.07 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTCCACTTAGCTTGTTCAACGCGGAATCCCTC:1 - chr2L 13697578 3' - F-element 52 1 63.38 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATCAAAAAGTGCTCTAGTCAATTATTCATTTCAATTTAACC:1 + chr2R 18767279 3' + pogo 2071 1 65.07 CAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATTCATTGTAAATTTGACAAAATATTAAAATAAAACAAAACAATAAAAAAGGAGAAGAGAATATACGGTTAAAGAAGCATATTCACTAGGGACAACAAGAATATTAGTAACAGAATATT:1 + chr3L 27993022 3' + 1360 171 1 70.55 ATTGCGTTTAATTAAGCAAAACACCCTTTATTTTTAGCTTTAAATTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTTGACGAGTAACGGCTATAAAAGAATGACATTAACTCTTTGAAAA:1 - chrX 21183835 3' - S-element 74 1 68.75 ATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTTTGAATGTAATGGGCACAAATGATGCGGTTG:1 - chr2L 2167586 3' - jockey 4620 1 77.70 ATAAATATAAATATAAAAATGTATAAGACATAAAACAAAAAAGTAAATGAAAGAAAATTATGCCCGAAAGTATGCTACAAAGGGTACAAACTTCGTTATCTAATACACAAACCGTTTTAACCGGTTAAAAGTGACAATCGGGAATA:1 - chr3L 16741809 3' + Stalker4 7043 4 80.82 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTTCTTCGGTCGCTTTCTGGCTTCTTCGATTGTTCCCCCGTGTCGAAATCAGACACAAAAAT:1 - chr2R 23595936 3' - blood 7034 2 67.12 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTTGGTGCTGGTGTTGGCCGGCTAATGCGTTATGT:1 + chr2R 8597071 3' - pogo 19 1 72.60 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACANTNTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATC:1 + chrX 140093 3' - blood 7072 2 55.48 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGCCCTAAGAAATTGCTAGTTCTG:1 + chr2R 22112736 3' + 412 7485 2 60.96 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCNATTTTCACACTTCAATTATAGAAAACATTAAATATATTGACCGG:1 - chr2L 3133638 3' - Doc 8 1 72.60 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCACTAGTTACATTCTCTGGCGCTTCCTTACTGTCCATTTCTGCCCATTTCATTTCATTTCATTTCATTTAGCGTAATACGCATTTGGCTCTGCGGT:1 + chr3R 5495323 3' + roo 9047 1 68.49 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGGCAGTCTCGGGAAAATTCATTCTGGGAGTTGTGCTAAATTGTCTAA:1 - chr3L 16920192 3' + roo 8996 2 70.55 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTGCATGTAAAATTAAAATTT:1 + chr3L 15273342 3' + pogo 2070 1 67.81 TTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTCGGCCGCATATAATTAGATTTCGATCAGCTTTTAG:1 - chrX 16490485 3' - F-element 98 1 76.03 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCTTCCACTCCTCACACCTACGCAGAG:1 - chr2R 16731253 3' - Tirant 8163 2 55.48 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCGGGCGTG:1 + chr3L 22038322 3' + diver 6060 2 51.72 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACCGGCGT:1 + chr3L 21913455 3' - 297 44 2 54.11 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTGGTTTTCTTTCAACATAGAAAGTTAGC:2 - chr2L 11476237 3' + pogo 2064 1 56.85 GTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATTTTTTTTATCATGAGTA:1 - chr3R 31771964 3' + mdg1 7317 2 61.64 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCC:1 + chrX 12365362 3' + hobo 2897 1 72.16 TGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACATAAATAACGTAACTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCTTTATCTTCAATTTTGGAAACGATTAGGTTGGTGGCGGCGTATCAATAG:1 - chr3L 236734 3' + Circe 6991 1 72.60 GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGTCAAACGGGGATTCAATG:1 + chr3R 15137397 3' + roo 379 1 63.70 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCA:1 + chr3L 27391409 3' + 1360 3352 1 55.48 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAG:1 + chr3R 19725410 3' - hobo 23 1 68.66 CATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTCGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTATGCACGGGTAATAGTAGGGCACCGAAGCTAT:1 + chr2R 5709180 3' + flea 396 1 78.77 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGCTGC:1 - chr3R 17944026 3' + P-element 2856 1 50.00 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAAC:1 - chr3R 9550918 3' - P-element 72 1 30.60 ATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCC:1 - chr3R 23415866 3' + jockey 4969 1 69.18 TACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTTCTTTTGCCCATAGTGAGAAGATTTTCATCTAGATTCTGCACAGATG:1 - chr3L 3714335 3' - Quasimodo 104 2 67.81 TTTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGC:2 + chr3L 9907331 3' - BS 5084 1 78.08 ATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTCCAGGG:1 - chrX 20453678 3' - INE-1 540 1 79.45 AAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGGCTAAATAATTTCAGTAAACAAAAATACGTATATGTCCATA:1 + chr2L 15549190 3' + hobo 218 1 71.72 TAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCT:1 + chr3R 10030779 3' - BS 5077 1 62.33 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATTGAATCTAATAAGAGATGAACTCGCCACTGAATTTAATGTAATATTAACT:1 + chr2R 12249093 3' + Juan 4187 1 64.38 ATACCCCTTACTCAGCTAGTGGAAGCGTGAATGACAAATTTCAACTTTTTTCTATAATTTCGATAGAAATTGGGGGGAAAAATATAATAATAGCATTTATTTTAGAAAATAGCATTTATAGTTATGAGATCTTGACGTTTATACGG:1 + chr3R 4464180 3' - INE-1 540 1 78.08 CCGCTCATAATCCGTACATGCCGCCCGCCAATGCGTCGTCCCGCATGAAGGCTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGAAATCGGAAGTGGACAAATGCATCCTTTTTGCACACACACATACACACTCAT:1 - chr2L 514729 3' - diver 5885 1 75.34 TGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGTTCACTACATTTTAAATCATTCCATTTGAATCGCATGACGCGCCTG:1 - chr3R 9945761 3' + pogo 1624 1 67.38 TTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGTCA:1 + chr3R 15137382 3' + roo 364 1 53.42 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGCGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGG:1 + chr3L 21913419 3' - 297 48 2 65.79 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTGAATTTAATAAAAGACAATCTATAAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATAAAATTCATTTAAATTACTTTTTATGATTTGATTGTGAGTAAAATTAGTATTCTTTTTTGAGCAACAATTCCATC:1 + chrX 14771863 3' - jockey 4669 1 77.40 CTTTATTTGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCAC:1 + chrX 21907815 3' - Stalker4 328 4 67.12 ATACGATCTAACGCTCATACATAAGGCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGA:1 + chrY 3648879 3' + Stalker 7004 6 74.66 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGATGCCCGCCAAAAACTGTTGCTGCCGAACCC:1 + chr3R 19725442 3' - hobo 48 1 57.26 CCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTT:1 - chr3L 23456273 3' + Gypsy6A_LTR 254 1 70.34 GAAGGATAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAATATACCTCTCGCGTGTAACTTTAATTGCACTCCTTTTTATCATCAATAATTCAATGTGAATAAGCCCTTAAATTTAATAAAGGTGACATGTGCGATCATGTGGTATTCTTGTG:1 + chr3R 4487647 3' - Tc1-2 145 1 54.55 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAATGTTTATATGACAATTGTGCACACTACAGTCTATAAAATGTAATTTCTTTTTCTCTTTAAATTACCAGATTATTAAT:1 + chr2L 5818981 3' + I-element 5312 1 53.42 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGT:1 - chr2L 16537557 3' - Transpac 76 2 73.38 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATA:1 + chr4 373083 3' - pogo 35 1 60.27 AGAATACAATTCCTTTCACTCGCATTTATCGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTGACGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGT:1 - chrX 10547662 3' + P-element 2817 1 37.67 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTATATACGAGCTCCTCAACTAACAGATACTCAGTTAGTGGTGGTAATTTCAATAATTTCCACATTATAATTT:1 - chr3L 18122270 3' - 297 44 2 54.11 GTCGAGTGAGAAATGATTTGTGCCAACTTGTGCCAAAAAATAGTAACTGATGTTTTATCATGTTTTATTTTGCCTTTTAATCGCCAAGACCCATTTTTAATTATTGCTCGCCTCTGGGTAACCCATTTGGAGTGGAGTGCAGATCT:1 + chr2L 7464626 3' + transib3 407 1 53.42 AGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAAATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGAATCTTCCAGCCAATGGGCTATTTCAACAAACACNNANTTGTATCCCTCCTATTTTTATANGCATTTAGCCGGG:1 + chr2R 22037832 3' + F-element 4627 1 73.29 AAGCTTGGAGTACAAAGTCCCCTTATATAACTCCGTTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCTCCGAGCTATGGGGCAACGCATCGAGAAGCATGAAAAAGAATTGCGCGCTAATCTCTGCTATGTTT:1 + chr3R 21406857 3' + Doc3-element 4272 1 72.44 AGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACAACTACCTGTTTCAAATGCAAATACTCATAAAGCATTTTCGGCTCCCACAC:1 - chr3L 7562074 3' - FB 69 1 61.64 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATATATTTCAAATAAACTTATGAAATACTATTATTCGTATGCAATTAAATGGTGATAAGGCGTTTTCAATTGACGTTAAGGGTTCGAT:1 + chr2L 7775071 3' + I-element 5326 1 64.38 TGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCC:1 + chr3L 4615772 3' - F-element 401 1 54.79 AAGTGATTAAGATATGAAAAGATACAAATAATTTAATAGAATAATACATTCCATTTGGATTAACTAGGAGCATTTCCTTCCTGTAAAACAAATATATATCTTGAAGGAAATCTTAAACTTAAACTACAACTTAATAATTTCTTGAT:1 + chr3L 13437601 3' + Stalker3T 195 1 73.97 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAG:1 - chrX 6283650 3' - P-element 76 1 34.25 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAG:2 - chr2L 19698093 3' + roo 8995 2 69.86 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAACAGATCTCTTTTGGGCGATTTTTGAGGCTCTAAGCTAACTTGTCCACTAAATTCTTTCGTCTATATATGTGGATCTGAATAATCCAGTGGCTGTAACTCAGATAGCGTGTTTA:1 + chrX 10056817 3' + hobo 2930 1 77.40 TAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAATTTCATGTAAACTAATTTCCGTTGGGAGTATGTCATCAAGTACTGCATAAATATCAACGTGCCTGATCCTTGGTGCATTTTGATCGCCTTTCCATAATCATGGGCTCG:1 - chr2R 22778827 3' - I-element 366 1 69.86 GCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTTTTCTATGAAACACTCTTCACAGTTTCTTGGCACTCATGCTGCTTCTGTTGCC:1 - chr3L 17934924 3' + HMS-Beagle 183 2 62.33 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGG:1 + chr2R 16731350 3' + Tirant 353 2 63.03 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGTAAGGGTAGTACTATCTTTCTTGAGAGAACATGTAGAGCATAATCCAAGA:1 - chr2L 1729692 3' - Transpac 3 2 71.92 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAACATTGTTTCATTAAAAGTTTTAGAGGGAAAATACTTTCCACTTGCACTGTGTTGTTTATCAGCTGTTCCGGGAAATTTCCATTAAAACCTAGTAGTTACACATCGATTTCG:2 - chr2R 9091778 3' + 1360 3380 2 79.31 AACTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAAAGGAGTGTGCGTTGTTTGGATAGTTATACAGATTCGTTGAGAAACACAAACGCGGTGTAGT:1 - chrX 16571293 3' - gtwin 6982 2 58.22 GTAAGATAGCATAATCTCTTCACTGTACATTTTTACACATTATAATTAAGGAACAGAATCGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCATCAGCTGGAGGCGCCTCTGAAGAACAACTTTTACGTCTGAAGTCTTTTAAATGAACA:1 - chr3L 11837691 3' + G5A 2717 1 67.81 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTGCAACCATATTTGTGTATTTCGGTTATATTGTACACGCTTCTCATAAAAAGGCATATACCTCGG:1 + chr2R 24807976 3' + I-element 5301 1 53.42 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATGTTCAGCTGGTGGAAAGTTGGTGTAGAAATTGCAAATCAGGTGATGCCGCGCAGTCGGAGCTTTGACCGCG:1 - chr2L 3059332 3' + P-element 2862 1 63.20 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGA:1 + chr3L 13888989 3' + 412 7477 2 64.38 GAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAAGCTTCGTGGGTTACAGCACCGAGGAGGAGGCCCAATC:1 + chr3L 9624537 3' + Quasimodo 7305 2 68.64 GCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGTACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTGTCTCGCCGCCGTGAACCTGGAGCAGTGCCTTTGCATTCATTTATTCAACCGACATCAAGACTAGAGTAAATACTTATTTCT:1 - chr3R 16611270 3' - Rt1b 4711 1 68.49 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAATTCGCAAAGCAAGGAGCGCGCAACGAGAAACGCGCGCG:1 - chr3R 14277859 3' - P-element 19 1 68.00 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGATATCTCCTTTATACCTTGATTCACTCAAGTAAATAAACCAATT:1 - chr3R 24010989 3' - roo 76 2 71.23 TTAAGGCTAAGTTATTTTCATATGTTCTTAGTCCGTCTATATATTTTTTTACTATGTTTTGCTATTAAAATGGAGCATTAACAATTTGTATGCAGACTGCAGCATTAATGCTTTGACCTGAAAATTCGATCTGCTTAAAGTTGCCA:1 + chr2L 2694550 3' - G4 3633 1 62.33 TTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAAAAATATTTTGATATTTTTTCATATTTGTTTTACTTGTTGCATGCAACGTAAGCTGTGAAGTG:1 - chr3R 2418491 3' - S-element 1588 2 61.64 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAAAAAATACAAACTGCTCGCAAAACAATCGAAATGAA:1 - chrX 14867220 3' - roo 49 2 52.74 ACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGATAAATTTGATCTTACTTTGATCACTGTTAATC:1 - chr3R 19446369 3' - G2 346 1 77.40 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGGTATAATTTTATTATGAACCAACTTGTAAAGTTATTGATATGGAGGGAATTATAAAA:1 + chr3R 12182072 3' + mdg3 180 2 60.27 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAA:2 - chr3L 1477386 3' - mdg3 82 2 70.55 ATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGT:1 - chr3L 2668860 3' + Bari1 1630 1 70.55 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAACAACAAAAACCATTATCGAAGCGACCTA:1 + chr3L 19907236 3' + P-element 2869 1 73.29 AGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCC:1 - chr2R 12248968 3' - Juan 4085 1 55.48 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGCCGGCAGGCGACAACACAACAACAGCAACCGCCCCATGTT:1 - chr2R 21475195 3' + P-element 2864 1 61.48 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATCTTTATAATCGAGCACCTAACGGCAGTTAATCGTTAACAATTAAACAAGTCACAACTACGAGAGATGGACAGATCGAC:1 - chr2L 18737928 3' - roo 37 2 60.27 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAACCTGCAAC:2 - chr3R 8381673 3' - Tirant 28 2 66.44 GGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCTAGAAACACCAGGTGGTCTTACTCGTCTGTTTTCA:1 - chr3R 30603970 3' - FB 374 1 74.82 AAAAAAAGAAAAAAAAGTACAAGCAAAAAAGGCCCAAGCCAATTGCAGTAAATTTTCGACGATGTGGCAACGCTAAACTAAGAATTAGTTCGGCAGACTCTACATTTCCCCACCTCTGCCGACTGCTGAAAGTTAACTCATGGGAA:1 + chr3L 16271830 3' + gypsy7 5009 1 56.16 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAAAGTTAAGCATTTAAAGTTTTC:1 + chr2L 16554689 3' + blood 7334 1 61.07 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGTATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTGATTTCATCATGGAGCAGACATTGTTTAGATTTTGTACATTGTTG:1 + chr3L 4287069 3' + P-element 2795 1 19.86 TGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACGATAATTAC:1 + chr3L 21913489 3' - 297 6591 2 78.77 TAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAAT:1 + chr2R 5206896 3' - G4 3771 1 56.85 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTG:1 - chr2R 21362741 3' - Tirant 11 2 68.42 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGGGTCATCGAAATTCGAATACAATGAACGAATTGCGTTAATTGAGCAAG:1 + chr2L 3096927 3' + roo 8999 2 70.55 AGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCG:1 + chrX 19887124 3' - P-element 87 1 26.71 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTGCTGAGGGGTATGATATGGTATATGGGGTCTACGATGCAGAG:1 - chrX 17495657 3' - Burdock 14 2 74.66 GGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTA:1 + chr2R 21199726 3' - jockey 4774 1 55.48 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAAT:2 - chr3R 25692701 3' - BS 5025 1 62.33 ATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATCTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTT:1 + chr2R 16185100 3' - 17.6 7006 2 78.08 ATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCAC:1 + chr3L 22038299 3' + diver 6036 2 67.81 ATTTAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATGCTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTAT:1 + chr3L 16973461 3' - S-element 64 1 63.70 CAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTC:1 - chr2R 16731278 3' - Tirant 8188 2 71.23 TCTTGATCAGGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACGAGCTCCAACCCTTAGTTT:1 - chr2R 25240173 3' + INE-1 88 1 48.78 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTA:1 + chr2L 16607306 3' - 412 7109 2 54.11 GCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATTT:1 - chr2L 23020627 3' + Transib5 2950 1 53.24 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTCAAGAGCTAAAACACTTATGTACATCAAGCTAAATTATCAATGCACTCTGCGAGATTTTAAAATTAAATAAAATAGGTAG:1 + chr2L 17353121 3' - 297 35 2 60.96 CTAAAAACCTAAATGCTGACTCGGCTGATGTTTCTCCTGACGTAGGGCACTAAAGGGGCCGCTAGAGCCATGCTCTGAAGGAAAGTGGCCTAAGGTAGCACGTTCTTTCGATGTCTTCAATGCGAAATGCAATTTCCTGAGCGCGT:1 + chr3R 30331160 3' + gypsy12 9821 2 63.01 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAGTTTTCAATCACGCGCGAATGCG:1 - chr3R 16349201 3' - P-element 63 1 42.47 TGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGCTTCTTGTATTTCCTGCTTTATCGCTCACCTCTTTGGCTCTCTTCTCTCCCTGTCTCGCTGCCTTTCTCTATCTGACCGAGACGCTAATTTGTTGTTGCTAGTGGTGCTATATAG:1 - chrX 7702660 3' - Porto1 448 1 48.63 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTATAATTTTTCTTCAGTCACAT:1 - chr3R 15102199 3' + roo 386 2 68.49 CCTCGTGTGTCTAGTCCACCAATCAAGTCCAATCTAGCTTTGCCCAATCTGTCTAAAATGTCTGCAATATTAGGATGTGATACTTGTCAGATATAGTTTTTCCATTGAGTCGAAAGAACAAAAACAATAGCAACTTTGTGTGCGGC:1 + chr3L 17601347 3' - invader4 2713 1 75.34 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAATATGCAAAATAAAGATGGGGGGGGCGAATCAAAAATTTGTAGCATACCCACAGGATGACGTGCCAGCCGCA:1 + chr3R 28803974 3' - hobo 49 1 50.68 ATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTTATATATGATTACAATTAAGTTAATATCTCTGCTCTGCTCTAATGCATGTGCACGCGCGAGACA:1 - chrX 10865828 3' + roo 8753 2 56.16 GTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGGCTTTTTCG:1 + chr2L 3908500 3' - jockey 4748 1 65.52 AGCAACAGAGAGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGGTTTCCTATAA:1 - chrX 19121916 3' - 412 7107 2 62.18 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTGACGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTGTG:1 - chrX 10547657 3' + P-element 2822 1 41.10 TTTTGATATATTTCTTCTTGTATCTTTAAGTGAATTAGGATCTTAAAGATTTTGTTATTTGACAGTAATTTAATGGTTGAACTCACCCTGAATGGTCTGCTGGGCATGGGCCGCC:1 - chrX 16731975 3' - Bari1 1651 1 71.30 TCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCATGAATTGGCCAATTGTCCAAAAGTCGGGATCCGTGG:1 + chr3R 21679726 3' + roo 395 1 75.86 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATGCCAACTGCATTTGTATGTGAATGTGTGTGTGTTTGGGTGTGTGTGGGGGACGAACATGGCCATTCGGCAAAAGCC:1 - chr3R 24443999 3' + hobo 2928 1 68.18 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCA:1 - chr2R 22596072 3' - Doc 52 1 50.68 TTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTGTCT:1 + chr2R 17609826 3' - mdg3 5339 2 76.03 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTT:1 + chrX 2104790 3' + roo 9012 2 58.22 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTATTGTTACATAATTTAGTGTTAAATAAAAAACTGATACCCAAAATGAGTTGCGAACTACGACTA:1 - chr3L 13449163 3' - Quasimodo 60 2 60.27 TAACAAAATCCTAAATATAATNTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATT:1 + chr2L 3911910 3' - roo 85 2 78.77 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCCCAGAAAACGTCGTACAATCGCGACGAAACGGGTTCTAGATACATTTTTCGGCGTAGATATATATCTAAACGGACGCATCTACCAGCCACCG:1 - chr3R 26542544 3' - FB 30 1 63.70 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATG:1 - chrX 20233781 3' - pogo 52 1 56.34 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGTCTATGCAGGTATTAGGGAAATTCAACAGAAAACTTAAACATGGCGATTTGGAAA:1 + chr2R 6217184 3' - copia 4935 2 63.01 CTCGATGAAAACACGTCTTTTCACTTGAAATGCCACAGGCCACGCACATTCCCTCAAAAGAAAACCGTGTTCCCAATTGGTTTTGCAGTTTAAGACCACAGTACTATTGAAAGATATATTTTTAGGCCAGTCTCTAAAAACACTGG:1 - chr2R 8957588 3' - Doc3-element 14 1 58.90 AAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGC:1 + chr2L 13328496 3' - BS 64 1 62.76 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGGCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTAATCTGATAAAATTAAACTAACTTACGGACTTC:1 - chr2R 12379457 3' + pogo 2083 1 69.18 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTCAGAGAGCAGAGCAGGGCAAACGAAAGATGTGGGATTAATGACATAATTTACAAATCCCCGAACGTTTT:1 + chr3R 28829177 3' - FB 55 1 54.11 AGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTG:1 + chr3L 9907330 3' - BS 5069 1 76.92 AGTCTTCCACTTTAACCCAAGAGAGGTGAGGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCATCAAAACCAAAAACCACTTGACACAGTTCCAATA:1 - chrX 4942633 3' + Bica 4479 1 72.60 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTATAAGA:1 - chr2L 9599775 3' - roo 42 2 57.53 CTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATTACAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGATAAATTCTTTGATCCCAACTAGAATTTGGTTCAGATAAATGGTGACATTAT:1 - chr3R 5506688 3' - Circe 101 1 63.01 AAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATATGGTATTTATTTTATAAAATATTTATCCCTTCCTTTTTTTTGATTTTATTTTCAGCAGAATTGTCAATTCAAAACTCTTCAATCGCATATAA:1 - chr3R 24661907 3' - jockey 4538 1 56.85 GCTGCTGTTTGCTGTCTTTTCATCTGATTTCCACTTTTGCTCTTTGGGAATGGGCCTATGTGATCCATATTTATTGTACGGAATGGTATAGGTATGTTTTTAATGCATGATAATAATCGTTGAGGACTTGGTACAACTAAACTTAG:1 - chr3L 14738683 3' - Bica 4568 1 61.64 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATACATCATTGTGCCGTCGATTTCTCGATGGCCATGACAACTCAAAATTGCGTCC:1 - chr3L 11272230 3' + Transpac 265 2 64.38 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCCAATGTCAAAATCA:1 + chr3L 19907201 3' + P-element 2835 1 48.28 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTGATATGTGTTGTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGGAAGCT:1 + chr2R 16073009 3' + opus 430 2 70.34 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGAAGTAGAATTCGTTTCCGACCCTATAAAGCACATCTATTCCAGTCTGTCCTTTTCTCGGTCCGTTTTGTTGTCTGTCATCATTATT:1 + chr3L 21157141 3' - 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chr3L 19181794 3' + mariner2 734 1 67.12 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCCAAAACTGTTGG:1 + chrX 12365373 3' + hobo 2925 1 56.25 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATGATA:1 - chrX 17495683 3' - Burdock 6176 2 58.22 CAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTTTTCGGGTCTGCTGGGGGTTTGTCGAGCTTGAACTTTAACTTATTTTCCCCCGACACGAAACCCGATCCGTCCCTTTATCCCCACCGCAGG:1 + chr3R 11903575 3' - FB 17 1 71.64 GACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTTAATATCCGTCCAAAAAACTTTTTGAAGCGCACTTCC:1 - chrX 20770433 3' + F-element 290 1 74.66 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGAT:1 + chr3L 9522136 3' - opus 165 4 61.38 AGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAACAAGAAAATCATAATCAGTCAATTGAGATTAAGCCAATAATATTGTAATTTTTTTTAAAGGAAAACAAGATTTGTTGAGTTTCTTTGCTTAGAAACATAGAA:1 - 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jockey 32 1 66.44 ATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATCTGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTC:1 - chr3L 24272058 3' - gypsy11 70 2 59.31 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATACAAAAATAGGGGATTGCCAAAGGATGTGGTTAAAATAACAGTATATGATGGTCTTATCTTATAATGGTTTT:1 - chr2L 20819210 3' + copia 241 1 49.32 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACTTTGAAATCTTATTAACCGCAACACA:1 + chr2L 11725032 3' - F-element 69 1 69.63 ATTAATGTAAAAAAAAAAGTATTTATAAAACGTTAAACATTTATTATATAACAATACACACTCTTTATTACTTTTAAGTCTTTAGGCTGGCGTACGAAATTATGAATCTAGTTTCCTTTTAAATTCGCCCAAGGCTTTGTCAGAAT:1 + chrX 5845262 3' + Doc 4589 1 79.45 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATCAAAAAGTGCTCTAGTCAATT:1 + chr2R 18767261 3' + pogo 2053 1 52.74 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTTTAGGCAATCACCCATATGATTTTCTAAA:1 + chr2L 8553445 3' + pogo 2073 1 67.12 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAGTAGTAGTGCAATTGTACTTCAATCCAAGACACCAGCGCGTTCAAAGTGCGGTAGCGTGTAGCGCAGCGTATCCGCCAGTC:1 + chr2L 6346714 3' + flea 4983 2 65.47 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGC:1 + chr3R 23415997 3' - 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chr3R 17969502 3' - mariner2 866 1 68.75 AAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATCCGCCCGCCAAGACAAGCTGCAAATCTTCGCCGGTTCTTTAT:1 - chr3R 29189628 3' + 412 181 2 71.23 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTAT:1 + chr3R 9551003 3' + P-element 2857 1 59.20 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCCTACCCTTTT:1 + chr3R 10433285 3' - 412 7088 2 64.42 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCA:1 + chr3L 17746384 3' - roo 8706 2 52.74 GGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGTATGTATATATTATATTATTAAATAAAATCTCTGTATGGTAAA:1 - chr3L 14143104 3' - X-element 4683 1 54.11 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAA:1 + chr3L 21913459 3' - 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chr3L 17933190 3' - HMS-Beagle 6744 1 71.92 CTGCTGTAAACAACTCGCGAAATAAGCAGTATCGTAAAATATCGTAAAATCAATAGCAACAGCTATTGAAAATGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGATAGTGTTAATTTGCATGCATTTATAAATAAATATAAATA:1 + chr3R 24106453 3' + diver2 4814 2 60.96 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGACCAGCACCGAAGCCAAAAGCGCAAGTCTAAGATCTA:1 - chr2L 5341516 3' + Burdock 6312 2 73.97 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAAAAAATACAAACTGCTCGCAAAACAATCGAAATGAAACG:1 - chrX 14867217 3' - roo 40 2 56.43 CCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTC:1 + chr2R 16185107 3' - 17.6 72 2 74.66 AAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGCCAGAAATATATAAGTACTGAAATGCCTAATATATGAATGTAAAACATTTATCGCTTTTAATAGATTGTTATCAAAGTTGATAGGGTTTGATG:1 + chr2L 18114307 3' + transib2 2661 1 65.07 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCATCACCTACGGAAC:1 + chr3L 17746397 3' - roo 8693 2 61.64 CATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTNNNNNCATTTATACATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTC:1 + chrX 21907813 3' - Stalker 278 4 53.68 TTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTATTACTTAGCACGGAATAGGTGCTATTTTTTCGACCGCAGCTGTGCGCCTGCAGCTGTGAAATGTCAAC:1 + chrX 8831628 3' - roo 9013 2 53.42 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCACCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTTGCCC:1 - chrX 7845752 3' - hopper 75 1 74.40 GGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGATTATGTGTACATTAAGATTCCATGTGTGGTTGTCCAGAAATGAGATTGTGTTAACTTTTTTTTTACTT:1 + chr3L 22020065 3' - Quasimodo 485 2 53.42 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACATGTCTGGGCCACAAACTTATTTCCAACTTGTTGTGGTTAATCA:1 + chr2L 2609053 3' + I-element 5346 1 78.08 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACTTTTCGTTAACTTCCTCGATGTCAACGAAACACAAAATGAATGGAAGCACTTTGAATGAT:1 - chr2L 8553276 3' - pogo 18 1 69.63 AAGTGTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTGAAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCA:1 - chr2R 676144 3' - rover 88 2 60.27 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTG:1 - chr3R 25692747 3' - BS 5071 1 67.12 AAGAGCGGCAGAGAGTAAAGATTACAGATAATAGGATTACGTCTATTATAGTCAGAACATAACATGAACATACAGAATGATTTAAGATTAGGGGTATGTAGTGCTGCAGTGCATCCGATTCATATCGCCCAACGACTTGGCATTCG:1 - chr2R 19905262 3' - Cr1a 4236 1 68.49 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACT:1 - chr2L 13697608 3' - F-element 86 1 63.70 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATA:1 - chr2R 22112649 3' - 412 75 2 69.18 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAA:1 - chrX 8208294 3' - roo 45 2 57.53 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAAC:1 + chr3R 22352507 3' - I-element 74 1 68.49 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATGTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAG:1 - chrX 20024539 3' - 412 86 2 77.40 CAGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTCAATGTGCAACGTGGAGATCAAGCGCTTGCGATTTGACCATACTTTAACTACTCCTTCATCGACCTTCACCTCTGGCCAGAATGGAATTATA:1 + chr2R 11741855 3' + Tc1 475 1 55.17 AACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATTATTATTTTAGAAAGTGCATTTAGTAACAGGGGTTGTTGTATGCATATTTGCCACTGGCAACTGTGACTCACCTCACCTACTTTCCACTGTG:1 + chr3L 18076693 3' - pogo 1818 1 67.41 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATCGGCGGCCGATAAAGATCTTCATTAGTCTGGAAACACGGAGTTGGGCCCCAACTCC:1 + chr3L 17935027 3' - HMS-Beagle 8 2 66.67 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTAGATGCACATATATCGCCGCTAATGAGAGACTGCCGCCTCAACT:1 + chr3L 8249452 3' - HMS-Beagle 15 2 46.91 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATAAATCCTGCAAAGATGGTCGTCGAAACCTCTTGAAAAATGTCCACTGTTCGTTTATACAGCCCCGCACATA:1 + chr3R 26605652 3' + roo 9029 1 56.43 AGCGATCTTGCATCGCATAGANCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAATTACGCTCGAGTTTTGTGTATATTTTCCGTTTGATGTTGGGGCTGCTTTTCCATT:1 - chr3R 14230588 3' - F-element 132 1 59.71 CAGCCCAACTACGATTAGCCAGCGCACGCTGTTTCCAGCCGCCCTCGCGTGGAGAGTGTAGTTGCACTACCAGTAGTGGGTCACAATTACGGCGCGTACCATCGTTGGTGACAAACTTACGAGTGCTCACCAACGAAAGCTGTTGG:1 + chr3L 8449816 3' - baggins 156 1 75.34 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCTGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTGTCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTC:1 - chr2L 16607203 3' + 412 7482 2 58.22 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTAAAGTTTGGCGGAC:1 + chr3R 20260929 3' + roo 9038 1 62.33 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCC:1 - chr2L 16537537 3' - Transpac 4982 2 60.96 AGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGAAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGTATTTTGATTTGTGGTCGCACGCATAGTTGCGAT:1 - chr2R 24243475 3' + 412 7375 2 74.66 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGACATGATTGCCACTGCCGTTACTGCTACTGTTGCT:1 - chrX 10157603 3' + roo 8987 2 76.71 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTGTCGCAGCAGGACT:1 + chr2L 13850767 3' + roo 9050 2 69.18 ATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTT:1 - chr2L 3133678 3' - Doc 48 1 53.42 AGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGG:1 + chr3R 5972359 3' - Doc 327 1 69.18 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTCAAGAGCTAAAACACTTATGTACATCAAGCTAAATTATCAATGCACTCTGCGAGATTTTAAA:2 + chr2L 17353103 3' - 297 6634 2 60.96 AGATATTTACAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGTGATAATTAACAGATCACTTAGCATTGTTTCAGTTTACGCTTCAAGGAATCCCCTAGCAATCTGAAAG:1 - chr3R 22435487 3' + roo 358 2 50.69 ATTTGGGCGCGCTGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAAAATTATTGTATGCAATTTTAAAAGAATTTATTAATGGAACAGTTTCATTACAAATCTGGGG:1 + chr3R 16799849 3' - X-element 4635 1 59.59 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATAACAATTTCAGATGACTTCTCGTTATTTGCAGCAACTTTAACGGGCGTAATACAGAGTTGTTTAAAATTTGGTAGCTTAAAGCCACTGCATGTTCGCA:1 + chr3L 9659561 3' + mdg1 7437 2 68.49 CGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTTAGTTTTTGCCACTTTCTACAGAGTATTGAATATCGTAATGACTGGCTGTCATT:1 - chrX 6979610 3' + Tirant 113 2 61.43 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGA:1 + chr3L 5958714 3' - 412 62 2 58.90 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTCGTACCTTTACTATACATAAAACGGAAGGAAGTTGCTTTCTTAGTTCTGCGCTTTTTCCTTTTATTT:1 + chr2L 4269040 3' + hobo 2911 1 58.82 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTTTTAACTTATATAATACTCACTCCTATGAAGCCGAATAGAATGGATGGTCGTCTCAGCTTGAGGACATTTAAAGTAAATAATTTATAATGGCAAACTCGATGAAGCACG:1 + chr2L 3408873 3' - opus 23 2 63.70 GTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTTATTTATGTCTCTGGTCAAATTTGCGTTGCTATTTTGGGACTTATTTGACAGAGCCGGCGTTTGGTTATTGTTAT:1 + chr3L 722870 3' - G2 309 1 63.20 GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGC:1 + chr3L 8249445 3' - HMS-Beagle 54 2 73.45 ATCGATCAGTTCCTTCTGAAGTTAACCTAATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCCACTCCCTAATTGGCGGATCGATATAGCGCGGTGGCAAATGCCGCGGGAGCTATTTCCTCCGCCGC:1 + chrX 19662803 3' - G5A 2801 1 58.06 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTGTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACATGTGGAGAATTACAAGGGGACGTGGCACATCAACCGGAGCATTGACCTTATCATGGCAAC:1 - chr3R 4530640 3' + copia 237 1 71.92 TTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGGGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAG:1 - chr3R 19246712 3' - jockey 4750 1 72.60 TGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTG:1 - chr3L 18947273 3' - BS 4749 1 74.66 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTTGGTTTT:1 - chr2R 22596054 3' - Doc 34 1 57.53 CGATGAAATACTTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTTTTTATCATAGCATAGTTGATCCTGTCCATTCCAGGTGTGTTTCCTTT:1 - chr2R 5617102 3' + Rt1a 4906 1 60.87 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACCTCTGGTGCCCACCAACAGCTGA:1 + chr2L 1729846 3' + Transpac 267 2 52.31 TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATAT:1 + chrX 140092 3' - blood 7073 2 57.53 ATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCA:1 - chr2R 17696004 3' - rover 6989 2 60.27 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAA:1 + chrX 15406040 3' + opus 7428 2 68.49 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTA:1 + chr3L 17746378 3' - roo 48 2 51.37 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGCTCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAA:1 - chr3L 16200733 3' + roo 348 2 57.93 GCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATAT:1 + chr2L 13328521 3' - BS 13 1 66.39 CAAATTCTATTTTAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGGGATATGACGTCTAACCGTTCTAATTGTTTGTGAGGACTCAAACCATTTACTGTGAAATATTTTTATAACAAATGAAAAACATAAAACTACAAATAAAACATTCATA:1 + chr2R 3089727 3' + 1360 3271 1 72.60 CTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCATACCGCTATAGCGGTATAAAATTAAAAAACTCGAAGTTACAAAAAAAATTATATATTTT:1 + chrX 7847243 3' + hopper 44 1 58.90 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGAATATTAGTTGCATTTCACATTTGAAGTTCAACTGTTTTATCCAAAAGTTTTAC:1 - chr3R 6722988 3' - roo 8696 2 72.22 GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAA:1 - chr3R 14138556 3' + mdg1 333 2 78.08 AGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGNGNATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAGGTTGAGCCGTCATCGATATGGTCGCAACAACACCGGCTACAACAACCATGCTGGCTATGT:1 + chr3L 21157560 3' + 412 7115 2 56.85 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTGGAGAAGAGAGGGAAAAGCCAGTGGCAAAGCGCATCCATGGAC:1 + chrX 14825376 3' + P-element 2837 1 51.37 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGTTGGCAAGTGTGTGTGGCGATGGCAACTGAGAGG:1 - chr3L 7646245 3' + 297 6896 2 80.82 CGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTTCACCACTTGTTGTTGTTAGTTGGGTGTCGATTTATCGTTGTTGTTGCTAAAGGACATCCATGTGTGGAGTTGGTGCAAA:1 - chrX 7626091 3' + Transpac 5192 2 60.27 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGC:1 - chr3R 25692743 3' - BS 5066 1 64.14 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTAAACACACATGTATTTTATTGATAAATAAAAATGCAGCATGGTTGCTTCCAACGCACGGCGAAGGAAGCC:1 + chr2L 21909202 3' + transib2 2809 1 75.34 TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTA:1 - chr2L 13697619 3' - F-element 97 1 69.86 AAACATAGACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATGGGATCACCAATGCTGACAAGGGCATTTTGTGAGCTATAAAAATAAATAAAT:1 - chr3R 7420434 3' - 412 66 2 62.33 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGATTTATACTGAATAACCAATTTAATAGATTTTGTTTTCTTAGACAGCGATTCTACAGCGACTTCATCTTCCAACTCACCATCAGAT:1 - chrX 13152710 3' - pogo 36 1 56.39 GATTTTCCCGACTATCAGATACTCGTTACTCAGCTATTGGAATTTTAAATTTTTCAATAGAAATTGGGAAAAATGACAAGTTCGTTGCTTAAGTCATTCGTGTTTGTGTGACAGCGTTTGGCTTAAAGTCAACACAACAATTTAGC:1 + chr3R 21714987 3' - INE-1 558 1 52.05 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGGTGTGACACGCAAGGAAGGCAACAAAAAAATAAATAAATTCATCAAAA:1 + chrX 16996142 3' - roo 73 2 68.49 ATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCAAATAAATGTAAGCTCTAGGTCATAGAATGATTATGATAATTTTTTTCTACCTTTGGTCGCCTTGCAAATAAAATTACTCCTGACTTTTTTTTGTTGGGCGGCCCCTTC:1 - chr2L 22216702 3' + INE-1 82 1 36.30 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACAGGTTCCCTTTTCACAATGTGATGTTCAGGCGGAAAATGATTTTTCTTTAATACGAACAG:1 - chr3R 12342099 3' - hobo 56 1 58.74 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTTT:1 - chr3R 15137268 3' - roo 8728 2 64.38 TTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGG:1 - chrX 17495715 3' - Burdock 6208 2 73.29 AGTGCAAAACAAACTAAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCAGCCGCATTAACAGGGCTGTAGCAACAAAACAAGTGCTTGTGACCACTGTTGTTTGAAATTATGTTCAATGCCTACTTTGTTAAACAAATTTAAATCGAAAT:1 - chrX 9688087 3' + gypsy2 457 1 68.49 TTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGGAATTGTCGCGCTCATGGGACAGTATGGAGTGTCCTAGACGTAGTCTTATAATTT:1 + chrX 21084053 3' + HB 284 1 62.33 AATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCGAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAGATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAG:1 + chr3R 14401927 3' + Juan 4121 1 76.71 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGGGTTGCGCTGCTGCACGGAAAGAAGGGCGAAATGGGTGGGAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCA:1 + chr3R 31419438 3' - pogo 33 1 56.76 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTGTGGCCTCCATCATCCTGGAGCTA:1 - chrX 21227055 3' - Tabor 10 2 78.77 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTATAAAAGGGTATGAAATACATCTTGAAATGAATACATAAAGTT:1 - chr4 1241773 3' + copia 5037 2 71.23 GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAACCCAAGCTGGACAAAAAGAGAAAGCTTTTTAAATCGACT:1 - chr2R 6089076 3' + 1360 3315 1 71.43 TCTTACAAAAACTCAACGAGTTAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGCATTTGTTGGTCTCAAGCGATTTTACATAAGGC:1 + chr2R 16749880 3' + roo 9046 1 65.07 TAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAGATTATCCATGGCCAATTCGGCTTGGAAACCGTCAAAAAATATGATAT:1 + chr2R 21590941 3' + Stalker 16 4 66.90 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTAACATTGATTGAGAAGCGCGGTCACATTGCTTGAACAGATGTTCACAATGATGAAATTGTTTACAACAGTATATTGTTTTTAAACAACAAAATG:1 - chrX 13667738 3' - hobo 26 1 65.75 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCTGTCAAACTCAAACATTTTCGGCAAGGTGTTTGCAAATTCCA:1 + chr2L 9599878 3' + roo 330 2 71.23 AACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAGAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTCCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGTGCAA:1 + chrX 22672498 3' + INE-1 575 1 48.63 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTGCGAAAACTTGGACTGGCGGCAAGAGGCGCTGGAAAAATTGAGGGGTGGCAAATCAATGATG:1 + chr2R 22774656 3' - I-element 16 1 71.92 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAATAATACAAAACTACAGTTTTATCATTAAAATGTATAAAACAACATGTCCAACTAAACAGCGG:1 + chr3L 12125382 3' - roo 8720 2 58.90 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACCAACCAATCGAATCGAAAACCTGGCA:1 + chrX 13367521 3' - HMS-Beagle 19 2 72.60 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCC:1 - chr3L 13888887 3' - 412 52 2 52.05 ACTAATAATAATAATAATAATAATTTCGTACTATTTAGTAATATATTTGAGTAAATTATATAGTAAATAATTATTTATTTGTATATTTATTAGAGTAGATATGATAGAAATTATGGTATGTGTTATCTTTAATAATCTATTATATT:1 + chr3L 10942797 3' + mdg1 37 10 80.14 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTAGTTTTTAGACGATTGTTTGAGCAGCCAGTGCAGTTAGTCGAGCACTTCTTTCCCTATCTGGATTTGGTTTTCAATTTGGCTAATGACATGGTGGTATATTAATTGTTACGAAATGGT:1 + chr3R 21843906 3' + blood 375 2 79.45 TAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTATTTTGTCTCTCATCAGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTATGACTAATCCAATATGTCACGCGAGGATCAGTGCCC:1 + chr3R 15608789 3' - 1360 2969 1 72.41 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGAAGAAAACTGTTTCAATC:1 - chr2L 21777752 3' + pogo 2060 1 62.33 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAGATCTCAACTTTCGGATGAGGAGTCGATGATTTTAATTAGCGG:1 - chr3R 17996680 3' - copia 42 2 55.48 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGTGAAATG:1 + chr2L 1451243 3' + mdg1 352 2 63.45 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACCGCAAATCCAGAGTGTGTTTAAA:1 + chr3L 5958725 3' - 412 51 2 51.37 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGCTCAGCTGTCCGTGGAACCGGAACTTACCAGGGCTGAAGTTGTACATTGGAACTTGTACATTTAAGAACTGGTTCATTTAACGCTCTTTCAAAAAGTCCATTCGCTTTAAAAAA:1 - chr3L 4286953 3' + P-element 2881 2 59.59 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCTTTGTTACTCATTTATGCTAGC:1 + chr3R 5575086 3' + blood 7369 2 71.23 TGCGGAGTGTGATTCAACAACGGGGCTTCTGCAAAAGCCAAATTACTCGTGCGCATAATAATGCCTTAAAATTTGTTGATGACATTCATTCAGTGCAAACAATGGATGGTATGGAAATTATTCGCAAGTGGCAAAAGTTATGCCAG:1 - chr3L 14648614 3' + 3S18 498 1 70.55 GCGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTTGCCCCAAAAAGTATGCTATGCAAATAGTTTCGA:1 - chrX 7845723 3' - hopper 67 1 65.07 TATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCAATAAAATTTTGGCATTTATACAGTGCATTAAACTTCAGGGCTTACCTCTGGTCTCTCGGAGCGCGGAGCAATTAGCAGGGAAAAAAAGGCCACAAACATGTAGATG:1 + chrX 2697378 3' + baggins 5296 1 54.48 TAGTCAGAACATAAAACTTTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATCAGCTGGCTTGTCGTTGTTTCCTCTGACAGCGACCTTGCCTCTGGTCCCCGCTGCTGCTTTTTCCGCTTTTCCACGGCATTGGTTGCG:1 + chr3L 15870713 3' - Cr1a 4188 1 60.96 GGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGG:1 - chr3L 18947272 3' - BS 4748 1 73.97 TCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGATTCCTTTTGCCTATTACATACTTCTCAGCTAATCTATTATAGCCTTTTACTCTTGGCGTCGCCGGACGCGTCCAACTGGCACCCAAGTTGAGTGAAGATGT:1 - chr3L 241216 3' - INE-1 138 1 63.43 TGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTNGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAA:1 - chr3L 8754782 3' - mdg3 80 2 79.45 CTCCTCAGCAAGGGGTAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCAGGGTGGTTGCGATTGGCTGACGAACATGGGTGTCCACAAAATGTTTTTCACACCATTTTTCCTCTATAGTAAGTTGGCGCTCTTTGGGCACG:1 + chr2L 22181251 3' + R1A1-element 5131 1 55.48 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAATATTCAGGGTATCCCGTAGATTTGGCTAGAGCCACTGCCACCAACA:1 + chr2L 11725096 3' - F-element 16 1 77.40 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTCATTCGGCTGGAAGCCCAGCATCCTGGCACTGAACCCAGGTGAC:1 + chr3R 29283331 3' - hopper 12 2 74.48 AGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAATCGGCTCACC:1 - chrX 15746252 3' - jockey2 3208 1 75.41 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACNGGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGAAGAAAACT:1 - chr2L 21777761 3' + pogo 2051 1 55.48 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAAT:1 + chr3R 29384744 3' + roo 9038 1 63.70 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAATTTCTCGCTCACCAAACTAGCAGTAACCTAGAAGTATGCAGCGATATTTATTTGAAACATATACCAA:1 + chr3R 6962475 3' - jockey 28 1 68.09 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACCT:1 - chr2R 21619316 3' + blood 330 2 52.41 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTCCATACGCGGAATAATAATTTTCAAAGGATATGCGACACATGCAAGCGTTGTATGCCGAGGACTTATATATATTTTCCCCTC:1 - chrX 7032641 3' - roo 8700 2 60.96 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAGATCTCAACTTTCGGATGAGGAGTCGATGA:2 - chr3R 17996693 3' - copia 4924 2 57.53 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACGTCATACGATAAATTGCAATTGCTATCATTTCGCATTCCTCAATATGAGACATTAGTAATTCAACAAGGCAAATAT:1 + chr3R 15102355 3' - roo 44 2 55.48 ATAAAAACAAAAAATGAATTGCACAGAGAAAAAAAAAAACGGACTGAATAGTGGACAAGAGTTGCGGCTTAATAATTATGTGCAAATAAATGAAATGCGAAAAGAGCCTTTAAGTGGCCAGATTAA:1 - chr3L 5065533 3' + I-element 388 1 51.59 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCTAGGAGCAATAAATTTAATCCG:2 - chr2L 15917587 3' - roo 8716 2 56.85 TTTATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCTTCAGCATTTGGCCGG:1 + chr3L 25824662 3' - Juan 4191 1 58.33 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGAGCAAGTGATAGAGTGTGTTAGGATCTTCGTTTCGGGTGGGGAAATCGTTCATAAAATTAATTAATAACGATGGACCATCCACTATAAATTTAAGCAAAATCCGAGGAGC:1 - chr3R 10062087 3' + copia 251 1 75.54 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTNGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCG:1 + chr2L 13850698 3' + roo 317 2 78.08 AATCATTTAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATATCAACTTTTTTTTTCTTCGTCCGGATTCGGTGCGTGCTTAAATGTTTAAATGCGAGCGCGGAAAATGCAGGTTGGT:1 + chr3R 22889377 3' + Idefix 7351 2 56.16 GAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAATAGGGTGCTGTGATGTAGACCTCTAATTACAATTCCGTGCGGTTTTTCCG:1 - chr3L 27200962 3' - 1360 221 1 65.75 GTATTTGTTTTCTTTAGCTTGACGTGGCATCCGGACAAAGGGGGATTTTTTGGCGGGGAAGGTGTTTTGTTCGGTTTGGTTTGGTTTGGATGGGTCTGCATGGGTTTGCTCAGCTTGGCTCGGTC:1 - chr2L 1249899 3' - Porto1 249 1 88.00 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCACATCGACCGTCATTTGCCCTCGACTCGAAGTTGCGATCGGTTCGTATCG:1 - chr2R 11663827 3' - P-element 60 1 38.52 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCTGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTATGTCTATAAAATGTAGCAAAGATAAATGAAATGTGTAAAGGATTTCATTTAAAAA:1 - chr3R 6399348 3' + pogo 2045 1 54.79 TCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGTTTTCCCCGCTGCTCGCT:1 - chr3L 10023970 3' - transib2 66 1 65.75 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGATCTAATTTGTAATTGAAGACTATTAATTTAAGCTTCGATTATTTATAGAACTTACATTTACTAATTGTTTCTCCCTGTGCACCTGTGTTTCAGCCATGTGGCAGCCATGAGG:1 - chrX 15539908 3' - roo 7 2 75.34 AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTG:1 - chr3R 24093526 3' - jockey 97 1 78.08 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAACTTATCAAAATTATTTATAAATATTTCTGGGAAAATCCACTTTTCGTTATCATGACACTTGCTTACGCTTTGCAAAGCTAAAGAAATATTGTGAAAT:1 + chr3L 11124617 3' - jockey 4696 1 71.23 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAAGAGCTAGGAGCAATAAATTTAATCCGAAGGCTTAGGTTACCT:1 - chr2L 15917571 3' - roo 36 2 60.96 CATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAGCGAACAATCGAAAAACATTAAATATAGTATGTTATAGTAGG:1 + chrX 19690649 3' - gypsy 7024 2 58.90 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGTGAAGTTC:1 - chr3L 8273915 3' - hobo 64 1 61.64 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTT:1 - chr2L 13468252 3' - roo 89 2 79.45 AACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGGGGGCCTTATGAGTGTTTATCCTACCACTCGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAATTTGAACGATTGAATAATGAAATTAAATTTATTAAAGA:1 + chr3R 19449722 3' - invader3 57 2 54.11 CTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCCACTTGCCTAAGACTTCCGCCCACTTTTGGGGCCACAGACCCGACTCTAAAGTTCATTTCTTCGCTCATTACACTTTTGCTTACGAAAATTGTTTTCCAAGCCGCAC:1 - chr3L 15388854 3' + I-element 16 1 76.71 GGTTGTTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATA:1 + chr3L 21913458 3' - 297 9 2 73.68 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAG:1 + chr2R 10541717 3' + P-element 2834 1 33.33 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTTGCCTTTTCTAGTCCTGAAATTTTCAACGAGCAAACTAGTGACAATGAACTAATTGCTATTGTTG:1 + chr3R 12941878 3' + hobo 2900 1 52.31 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACA:1 - 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chr3L 18968631 3' - hopper 64 1 63.31 TACAAAGACTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGTTTACTCTCCCTTTAATCTGTAGATAGATAGATTAATGGAATACATAAGTTAAAAGAATGGTTGTGTATTTCGATGAGTTAATTTTACAAGGTATATGATGCCTTTCCGAC:1 + chr3R 871175 3' + Cr1a 180 1 67.81 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGAGAGCTAAGGAACGCATACATATCGATAATGAAAGTATTTTCAACGTAACGAACCTCTGCGCGCATCAGCTGTTAC:1 - chr3R 4197143 3' - P-element 34 1 59.26 GACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATTAAACCAGGTGGTCCCGCATTTCACCTTCGCTCCTGGGACAGGTTGAATCCGTCTACGGGAAACTCAAA:1 - chr2R 18509442 3' + jockey 4758 1 52.11 AGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTAATTGTCCTTGTCTTTGATCTGCTTGGGTCTACCCT:1 - chr2R 12637220 3' + Rt1a 4950 1 80.00 ACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTGGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCATTATTTGTATAATTACAAATGTTT:1 + chrX 23280952 3' + blood 7039 2 66.44 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTC:1 - chr2L 13468235 3' - roo 8732 2 66.90 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACATATACACGATGTGTTTTTGATATAAATGAACTTGCTTATATGCCCATGACAAGTATGATTTATTGGCTAATTGGCCAATGGTTT:1 + chrX 19163390 3' + Burdock 6358 2 63.01 TGTCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATTAACAACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAAGAGATGTCATCTACACTGTTTTCCCTGCTTTCACTTGCAGCAGCTTCAAAGG:1 - chr2L 17544741 3' + Q-element 205 2 78.77 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATCTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAA:1 - chrX 8208308 3' - roo 59 2 57.53 ATGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTCCACTGTGCCGTGGGTTTTGGCAGCATCGCATCGCTCGAGTTGCAGCT:1 + chr2R 16160832 3' + mdg3 5474 2 53.00 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATAAGAAATAGGCCGCTTTCAACTGATGCGGAAATAACGCGTCTGCAGGCAA:1 - chr3L 8157963 3' - flea 4779 2 70.55 GACTATAGCGTTCTCTCTTGTTGAAGCTGATCCTGTAAATTAAAACTAGTATTAAGCTATTTGTAGTGTTTTTGAGAAACATCCAAGGTGGTAAGCCGGATATAACAATACTTTTTGTTGTACTTGCTGTTGCAGCAGCCAAATGA:1 + chr3R 22042598 3' + INE-1 580 1 73.97 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGCGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATTTTGTGTTGCATACGCACAGGCGTCAGTCAATTTCACTTATGGCATGCGAGCACC:1 + chr2R 22971923 3' - jockey 4768 1 77.40 CAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATTAACATTTACATACGCTTCATTTTTAATGAACTGACAAATCTGTGCGG:1 + chr3R 13323930 3' + F-element 4605 1 67.81 AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGAT:1 - chrX 10284813 3' + pogo 2039 1 65.19 CGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTACCATTTGCTTCCAGCACTTCAACTCATTGGGATTTTTGCGTTTTA:1 - chrX 13245657 3' + micropia 5029 2 69.18 GACCTATTTGCCCTTGGCCCGCTGGAGTTCAAGGTCCAGTACTATACTGTAATTCACGGTCTTTCCGCTTTACCCTGCACTTCTCCCGCTAGCAACTTCTCGTAGGAGTCCCTCT:1 - chrX 10011674 3' - gypsy8 207 2 56.52 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTACATT:1 - chr2L 1232633 3' + roo 9039 1 63.46 ACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGG:1 + chrX 21667960 3' - gypsy2 46 2 71.23 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAATTTACATGAAAAATTAAAACCAAATGCAAAAGGGCTCCGAAA:2 - chr3R 11208832 3' - jockey 4748 1 71.23 TCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCATCATTTGCATAAACTTCCACAAAGTGTTCATCAACTTTAGCGGGGGACCATTCGCATTTGACACCGCGTTGAGTGAG:1 + chr3R 17955110 3' + gypsy4 6441 1 50.00 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGG:1 + chr3L 17746373 3' - roo 53 2 54.79 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACAT:1 - chr2R 21475243 3' + P-element 2872 1 46.27 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCGTTAATTTATTTACTTGTTAATTATACACTTGAACAACTTCGTGCGAGAATTGT:1 + chr2L 6527767 3' - pogo 65 1 65.75 GCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAATGAGATTATCATCAAATTGATTGGATTGCAAAATCGC:1 - chr2R 22400569 3' + roo 8788 2 73.57 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCCGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCG:1 + chr3R 29384736 3' + roo 394 1 69.75 TCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCGTTTTCTTTTTGCCTTTGTGCAGCGGGTTGTCC:1 - chr2L 17353017 3' + 297 6892 2 79.17 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCACTGACTGCCTCAATGACGAGCGCCGATAAGCGACTCTCGCG:1 - chr3R 29283135 3' + hopper 1401 1 76.71 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGACTTTATAAAATTCTCATATCATCTGCAAG:2 + chr2L 16884718 3' + Bari1 1654 1 54.11 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTTCGAAAGGAGGTTGTAGAAGAGCTCTGTCTATTTGAAATTGGATGAGGAATTTCCTCATTTTCCTGAGCTCTCCTAGAGTTTCCAAAGCCCGAAATGCAAA:1 + chr3R 30537756 3' + roo 9052 2 58.90 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGATGTC:1 - chr3R 21843761 3' - blood 74 2 67.36 ATATGTGTGTGTGTGTGTAACTATACTACACTCTACTATATACTAGAATACAGTACAGTACTCGGTTGTGTGGGTGCGACATTGGGGGAGCGGGTTTTCCCGGCAAAATTCTTCTTACAAGTTGCGCCTG:1 + chr3R 23103962 3' - Quasimodo 35 2 77.69 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAGATCTCAACTTTCGGATGAGGAGTCGATGATTTTAATTAGCTGTTTGCTTGG:1 - chr3R 17996671 3' - copia 30 2 61.54 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGGAGTGCAAACATTACTCAGGCTAACGAGTGAGTGACGTTACAGTTCAACAACATAATC:1 + chr3L 20868148 3' + hobo 2921 1 70.68 TGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATTCCGGTTACCCAAAACCCAAACGCACCCATACTATAGCTACACT:1 - chr2L 2453296 3' - roo 135 2 74.66 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGGAAAGTAGGGCGAAATGTGTGGAAATAAATTGAATGATTCCGACTTTCAGCACAT:1 + chr3R 31419444 3' - pogo 38 1 64.75 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTAAACACACATGTATTTTATTGATAAATAAAAATGCAGCATGG:1 + chr2L 21909174 3' + transib2 2781 1 56.16 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTT:1 - chr2L 21777794 3' + pogo 2033 1 75.57 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAGAAATAA:1 + chr3R 31032064 3' - hopper 64 1 60.69 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTG:1 - chr2R 19015969 3' + roo 342 2 63.70 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTAATACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAAACCATTCATACCCGGCATGGCAAACGGCATCGGAAACGGAGGAGGATTATTTCCTCCCCAATGGGGCTCCTTCTTC:1 + chr2R 5037795 3' + Stalker2 357 2 51.72 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAAAATGGGACCAATAAAAACCAATTTCAATTCCAATTCCAATTTCCCTGACGG:1 - chrX 4469485 3' + roo 392 2 67.12 AAACAAACTTAAAAAAAAAATAAAATCTAACTCCAATGGCAAAACAAATTAAAA:1 + chr3R 26200899 3' + gypsy2 425 1 83.33 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATGTTGCACGTTGTCTGTTCATTTCGCTCCTTAAGCCCCACATCCTTCTATACACGCAAAACA:1 + chrX 6520972 3' - FB 57 1 56.94 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTTCATGGCCTTATAGCTGCAGATTCAGTTCCATTTCAGTG:1 + chr3L 8274001 3' + hobo 2935 1 66.25 ATAAGTAAGAGCGAGATAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGTAAACTAGTTTTAACCTTGTCGCAAAATTTTTGCGATGCACGAAATGACAACCACAATTAAAACTCA:1 + chrX 7377974 3' - invader3 5281 2 54.11 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTACACATTCCTACCCTGCTCCGCACTCCAAATGCAGATGCAGTCTCAGTACCGCTAATCATCTCAGCTGCAGTTGCATCG:1 + chr3R 17495012 3' + hobo 2895 1 55.48 TGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACCGCTGGTGCCCACCAACAGC:1 + chr2L 1729843 3' + Transpac 5200 2 48.67 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTTAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATT:1 + chr3R 29384717 3' + roo 347 2 68.49 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTGAAACCGATTTA:1 + chr2R 12379630 3' - pogo 35 1 59.59 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATATTTGCTCTTCGCTTATCTAAATAACTCAGATTTGCATGCCACTTCAC:1 + chrX 19187385 3' + Transpac 247 2 65.75 TATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGGGGCGGGAGGGGCCTTTCAGGGTGGCA:1 - chr3L 6642456 3' + Quasimodo 6936 2 71.43 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGGCACAAAAATCAAAATCAAATGTA:1 - chr3R 17871821 3' + roo 9031 1 54.79 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTCTAAATGGCAAATGCAGGCACAAGTTTTCTTTTGCATGGGATGTTCTTTGTGA:1 - chr3L 8273920 3' - hobo 66 1 64.34 TAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTGTCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGCGGGGGCGTGGCATATTTGCGCATTTCAGATGCCGCACACGTAAAAC:1 - chr3R 7431640 3' - I-element 5173 1 66.44 AAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTAT:1 - 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Stalker2 468 1 51.37 GATACGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTG:1 - chr3R 23579309 3' + roo 326 2 75.17 CAGTCACAGCTTAGTGAATATCGGGGGGGAAAGTGATCTGTTAGTTAACGCGTAGGCTCTTACTTTTTTAGGCTGGCAGAAAGATAGATTATAATATGAAATGTTTTGCAATTTTACGTTGGCGGGAAGCTAATCACTTGGAAGGA:1 - chrX 21504578 3' + Gypsy12A_LTR 439 1 60.27 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTTGGAAGCCAGTGAGTGGGCAGAGACACTGGGGGAATATATGTCGCTGTTTGTAATCATAATAATTA:1 - chr3R 5495153 3' - roo 28 2 65.07 TATTGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAA:1 - chr3R 27007344 3' - roo 8727 2 60.27 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATAGCAAGTAAATTTCGTTGGTTTTTTTTCTTTTGGTTTTATAGGACGGATCA:1 - chrX 16607831 3' + P-element 2817 1 37.67 AAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATAACAAAAAAACACCTAATCAAACAAAACTAAACTGAAGTGTTATTAATTAAATTGACCAGAATGCAAGAAGTCTTAAAGAACGAAGATAAAAACACACAGCAACAGAAA:1 + chr3R 2216830 3' - 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chr3L 20934112 3' - Max-element 43 2 62.33 ACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTG:1 + chrX 19690606 3' - gypsy 27 2 58.06 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCA:1 - chr3R 9657754 3' - jockey 4750 1 68.49 AAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGCTCCGCACTGAAGGCTTCGCGCATCTTCTGAGCATGCTGCTGCTGTCTGGCC:1 - chr3R 29795362 3' - copia 4993 2 58.40 CTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTNATTTAGAATCTTCAAAAGGAAACCTTTATGATGCAAGACTGCAC:1 - chr3R 17766684 3' + HMS-Beagle2 288 2 62.33 CTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAGATCCAGCATCTCGTATTTAAAACTTAAAAGCCTTCACACCTGAATATCTTCAACATCTACTTCAATTTCTGGAAAAAAAACCAACATAATCCATCTAAACATGTAAACACTCTTTCGTA:1 - chrX 21083861 3' - HB 8 1 76.71 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTT:1 - chr3R 15137269 3' - roo 65 2 65.07 TTTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGACACCGAGACACAATTGCTGTTGTTTTTTTTTGTCGGCAAATTGCTTGCCTG:1 + chr2R 5627694 3' + TLD2_LTR 96 1 78.77 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTGCAAAAAAATTGCTCAAATGAAATTGCATATCGAATTTCGCTTTGAAGGCAAACGGAAGGCATTCGGCTGCACACATATGACATGAAAGTCGAGGAAAAGCCGTGCAACTTGGCA:1 + chr2R 21110686 3' - roo 8668 2 74.66 CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTG:1 - chr2R 17649245 3' - Doc 94 1 76.71 AGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGTCACGGACAGGGTGGCTTGTTCGAAAACCTTGTTGTGCTGTATGTGATGCATT:1 - chr3L 5881879 3' - R1A1-element 5111 1 63.70 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACTAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCC:1 + chr2L 13850727 3' + roo 9033 1 49.59 GGAGATTTCGTACTTATCTTATAAGTTGATCGCTGAAGGACTAACTTGAAAAATCCAGGATATCCGGCTCGATTAATGGCAGTTCTAGCATTTTTCACACCATCTGCCTGCGTTTATCTTGCCGAAAGAGTTCATTAGAAAGTACG:1 + chr2L 1246126 3' - GATE 332 1 50.68 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCAACCTAGATTCACTTCGTCATGTCTGGGTAATATAAGTAGTGTGGATCTCGCAA:1 + chr3L 18119537 3' + 1360 3322 1 63.01 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCATGAAGTCATCTGGCTGAAATTAAATGCCAGTTGTCTTTCGGAATAGCGAGTCTCAGACAAAAAC:1 - chr3R 20983752 3' + pogo 2081 1 66.44 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTCGCTTCTGTTTTCTGTGTCACTTGATATTCAAACATTTGTTTGCATTCTGTGTCCGAGAAACTGTGCCACGAAAGAGTGCTAGGCTTAAAGTGA:2 - chr3R 31497794 3' - Transpac 4944 2 65.07 TCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTAGGAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTAACAATGTTTGAT:1 + chr2R 5542334 3' + Quasimodo 7322 2 56.43 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCGTATGCAATAAAGTTTGCTCTGCCACAGCGAACGCAGCAGCAGAAA:1 - chr3R 23104443 3' - jockey 35 1 67.12 CGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTTAAGCTTGCCGCGAGGCCTTGAAGGT:1 + chr2R 17696152 3' + rover 309 2 60.27 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGTCTGGCAGTTCAATTAGCAGAGTGCGATATGTTGAAAGGCATTCTTAATAGAATAATCAAATCGTAACAACATATTATTC:2 - chr2R 12343156 3' + roo 9031 1 56.16 TCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGG:1 + chr3L 4615747 3' - F-element 422 1 71.13 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAA:1 + chr2R 10695878 3' + roo 350 2 60.27 GGATCAATAGCCGAGTCGATCATGTCAGTCTGTCCATATGAACGTCGAATTCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATCTGTAAAAGCTATTTGGTTGTATGGAACACCATCGGTAACGGTAGATTTAATGGCT:1 - chr4 175501 3' + INE-1 97 1 61.64 CCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTTTAGCCGGCCCTACAGCACGGCTAACTGATAAA:1 + chr2L 7180865 3' + Doc 4396 1 73.17 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCCCTCTCAGTCTCTGGCACTTGTGAACAGCTTTTGAAATAT:1 + chr3L 19222709 3' + 412 450 2 54.79 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTTACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTTTGTGTACAGCGACTGATCAAGTTTAAT:1 - chr3L 21636410 3' - 297 39 2 54.86 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAATATGAAAGGGTTTACTTTGATTGTAAAATAAATAAAGATTT:1 + chrX 21227243 3' + Tabor 460 2 66.44 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTAGGATAACGGAATTTTTCCGCGCCCAAGCACTTAAAAATATGTTGAATAT:1 - chr2R 20230933 3' - jockey 4735 1 63.01 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATA:1 + chrX 17495787 3' + Burdock 6312 2 72.60 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGCCGGCAGGCGACAACCCAACAACAGCAACCGCCCCAT:1 - chr2R 21475198 3' + P-element 2848 1 51.85 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAG:1 - chr3R 23579275 3' + roo 359 2 53.42 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGT:2 - chr3R 31458420 3' - jockey 88 1 71.92 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCATATAATATGCACACTGAGTTGGCAACTGAAAT:1 - chr3R 20260827 3' - roo 8751 2 78.77 AGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAACAGGATATATAATACCCCTACAAATGGTACTTTAAGACCGCATGATTACAAATTCGGGCAGGTGATTGGGACCTTACCACCACCAGCTGCTGGTCATGTGGTTGCCGCC:1 + chr2R 13552118 3' + invader2 5066 2 52.74 GAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGAAGGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAGTAGTTCTCAGTGCATCTGTCGGCATTCCTGGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGACGC:1 - chrX 11664156 3' + invader1 92 2 64.38 CATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAACACGGCAATGGTCGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGATCGAGAAGATTCGAATGCGTTCATTCGCGTTAAAAGCTTTCACT:1 + chrX 22851056 3' + 1360 411 1 69.86 AAAAATGGCTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTATTTTTTGCTGACTAACTTTTGGCTTTGCGTCTGGCAAAAGTCAACAGCAACGTAAAGA:1 - chr3R 26318774 3' + 1360 383 1 57.86 TATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTCGACCA:1 - chr2R 1320641 3' + diver2 4876 2 65.28 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGAGTGCTGTGCAACAAACTTGTGGCAGAGCGAGCGCTAATTAATTAGCAGTATTTCTCGCTCACACAACTGCCATTAAAAATTATGTAAGGCGGCACGCG:1 + chr2L 5961353 3' - S-element 7 2 74.44 AGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATATCTCCGCCCAGTTCATTGTTGATGGTCTCCAGCTGGGTGGCTTGGGTGTACAATTTGTCCACGTTCTTTCCATCAAA:1 - chr3L 18918571 3' + F-element 119 1 52.41 CATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACATGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCGGACAGCCAGAAATCCAGACGGACACACATTGT:1 - chr2R 16367379 3' + hopper2 1521 2 75.34 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCG:1 + chr2L 3908482 3' - jockey 4736 1 77.39 CAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGCCTGACCGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCAGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCAT:1 + chr2R 5296378 3' + INE-1 95 1 80.00 GAGTCGGGGAACTCGACTATAGTATTCTCTCTTGTTTTAATTTTAAATTTATCTAGTTTTTACTTACATTTCGGGCACTGACTCACATCCGTGGACGACGTGAAGCCGATCAAAGCGGCGAAGATCACAAATAATCCTAAGCTCA:1 - chr3R 14091324 3' + INE-1 566 1 73.79 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAAAACTAA:1 - chrX 10284789 3' + pogo 2052 1 52.05 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCAATGTCAATGCACTTTTGGTGG:1 - chr3R 19996146 3' - Quasimodo 25 2 68.97 ACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTCAAGTACAAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 43 1 65.75 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTTA:1 - chr3L 13888873 3' - 412 38 2 59.59 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTCAACGCGGAATC:1 - chr2L 13697582 3' - F-element 60 1 60.27 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAGTTTTCAAAATCAGCATCCTTGTTGTTATCTCA:1 - chr2R 25203729 3' + 1360 3353 1 59.59 TATGCAAAGCAACTAAGTGTTGCTGTGTANTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGNATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCG:1 + chrX 140105 3' - blood 49 2 51.37 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATATTCTACATATTTCAGTGTGAATTTTCCAAGCCAGCGATAATG:1 - chrX 3453122 3' - roo 8741 2 78.77 CTTAAAAATCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATTTCGATTCTTCTACGAGGAGCAACGAGGAGTAATTGGTTACATTTTTTTCTCTCCTACT:1 + chr3R 7604956 3' - hopper 428 1 58.22 TAACTTGCTTAACTGACCACAAAACAGATCAAATACGGATCAGTTTTGCTGATAAGCATAAATTTTATTTTCCCCTTCAGCGGCTCTGCGCGGGGTGAGGGAAATAATCGCTGCGTTTCAATATGCGTTTCTGAATTGAAGAACAA:1 + chr3L 13666671 3' - BS 287 1 71.92 AATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTGAACATATCGAGGCAGTAAGTTTAGGTATGTGAACGATAGGGTTAGTACTAAACCAAGGGCAA:1 + chr3L 17748250 3' + roo 19 2 60.27 TTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAATTCTATTTAGGCCGACAATCTAATGCTGGGACTGCGTGCATATTGTATCTGCCAGTT:1 + chrX 662872 3' + 412 7139 2 55.12 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCCAAGTGGGAGTTTGATCATGA:1 + chr2L 1451275 3' + mdg1 7421 2 59.59 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTGAAACCGATTTACTCCCCTTTAATT:1 + chr2R 12379643 3' - pogo 22 1 68.49 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCG:1 - chr2L 6047877 3' - P-element 95 1 17.14 GCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCATAAGCTTTATTTGCATTGAGCATATTTGATTGGATTTGATGTACGAATACACTGAGGATTCGG:1 - chr2R 21595899 3' + Cr1a 161 1 56.85 CAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTATAATTTCCTTTCCCTCGTGAAATTAAATTAAAAAT:1 - chrX 14071422 3' + BS 4836 1 72.22 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCTCTTGTCTTTCAAGCGGCTTCTGCGAATGGAACAATACCGGTACGAATGCAAG:1 - chr2L 13675840 3' + flea 234 2 72.60 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAACAATAATTTATG:1 - chr2L 13850629 3' - roo 8727 2 60.27 TTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTT:1 - 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chr3R 23415902 3' + jockey 4933 1 56.16 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAGAATACAGCAAATAAATAATTTAACAATATTCATTTGCTGTATGTGACATATACTGAACATGTAAAAGCATA:1 + chrX 407492 3' - I-element 51 1 56.85 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAA:1 + chr3R 22435578 3' - roo 80 2 73.29 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTCAGAGAGCAGAGCAGGGCAAACGAAAGATGTGGGATTAATGACATAATTTACAAATCCCCGAACGCTTTCATCGACTTGCCCAATACC:1 + chr3R 28829196 3' - FB 36 1 58.22 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTATGTATATACATATATGTACGTTCAATACCGATCCGATCCGAGGTAAAATTCATATGTTGTTGTCTGTAGCC:1 - chr2R 21529934 3' - HMS-Beagle 45 2 58.22 GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGGTATATAATTTTCTCT:1 + chr2L 17136170 3' + hobo 2866 1 65.07 GGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGT:1 + chrX 21667948 3' - gypsy2 6546 2 71.23 CACTAGTTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAATCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTATAGCCGTTACTCGTAGAGTAATATGGTATACTAGACGATTAGCTAATGTGAGGCAGGGCCACTGACTATAAATCAAATCTTGCG:1 + chr2R 11398477 3' + INE-1 541 1 66.44 GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTG:1 + chr3L 21913444 3' - 297 6636 2 57.53 TTTAAAGAATCTTAATTTTTGGTTTCGTAAACTTTGGTAGCAATGACAGCTGCACATCGTCTTTGTTTGTTTTACAGCTCGGCTTTAAAGCATATATTTTTAATTATATTTTATTTTCATGACTTTATTGTTTTTAGGTTTCCGAA:1 + chr3L 273537 3' - Tc1 1344 1 57.53 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTGCCGGGAGCCGGTGACCAGGACATCCAGTTCGTTC:1 + chr2L 3911979 3' - roo 8679 2 75.17 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTGTGGCC:1 - chrX 21227073 3' - Tabor 6866 2 66.90 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTC:1 + chr3R 20983889 3' - 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chr3R 18343407 3' + jockey 4969 1 63.70 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAGTTTTAAATGGAGTTATTTGTAAATTTAAGCATA:1 - chr2L 23313624 3' - S-element 31 2 65.75 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGGG:1 + chr3R 27398140 3' + roo 9032 1 57.64 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCA:1 - chr2R 19015980 3' + roo 8995 2 71.23 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGG:1 + chrX 7042718 3' + roo 9003 2 64.38 TGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCCAAGTGGAGGTCGTCTTCCCATCCCTACCAA:1 + chr3R 9825703 3' + F-element 193 1 68.69 AAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGAATCATTTAGTGTTGTTCTTTATATTTTGAATAATACATAACTCTAAGTTCGTAATCATTTGAATACTTCAAAGGAACTCACAGTGTATGTGTGTAAGGAGCGACAGCAT:1 - 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chr2R 1270861 3' - X-element 4516 1 57.53 GCCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTAAATTTTTTCTGCTGAGCCGCAAAACAACTAAGAAAGAATTCTAAACATCTATATTTACATGTCGTTCGCCACTTCCTCTTTATCACCCACTCTCCTTCACACACAGTGCCTGCAAATTG:1 + chr3L 4344016 3' + blood 446 1 50.68 CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTAGTATTGGTCTGCACCTCAATGAGTTCCACTCGACGAGCTAGGCCCACAACTACCATTCCAG:1 - chr3R 22352424 3' + I-element 5318 1 52.42 GTTGACTGCGCACAGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGGCGCTGATGGCCGGGCTTTGGCTTTGGCCAACTTCAAGATGCTGCTCCCAGGGCATGGGCCACTCGCTTTTCACTTTCTTGGCACTTTATTTTAA:1 + chr3R 7348611 3' + micropia 5356 2 65.75 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGG:1 + chr2L 16607311 3' - 412 51 2 50.68 ACACATACATATGTGCAGTTCAATGCCAGTATTGAAACTTTCACTTGCCTGTCGTTTCGTTTGACTGCCTTAATATTGACACTTTGCTTTCGGCTTTTCCATAAATTTTAGATTAGCTGGCCGAAAAAGCATCGGGCTTG:1 + chr2L 2494480 3' + invader2 4876 2 55.71 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTCAGTGGGTTAATAT:1 + chr3L 21292598 3' + 412 7478 2 62.33 GTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTCAAA:1 + chr3L 19350027 3' - 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chr2L 16537550 3' - Transpac 76 2 69.86 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTGCTTCTCTTCGTTCCTCGCTGAGTTAAATAA:1 - chr2L 13468221 3' - roo 8722 2 58.22 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAACTAATATATATATATGATTGTTTTTTTTTCAATCGAACTCTAAAAGCGAAGTAAAGGGAATCTTGCTAAAACTTACACTGAAAG:1 - chr3R 4197864 3' - 1360 35 1 59.59 AACTTAGATATTTAGATTCGTTTAAATTGATACCGATGAGATTAAGTTCTCCAAGAAGGGTATAAAATATTTCGAAAAAGTTAAATAATATTTTCATTTTTAAATTGTTTATCTAGATTTCATAACCGTTTTAATTCTAATATTAA:1 - chr2R 3106588 3' + jockey2 3306 1 59.59 TATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAGGCACGCCGCATACAAGCGTATTCTAAAGGTATTAGATATGAGACGGCGAACA:1 + chr3L 6721669 3' - I-element 5135 1 63.70 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATCATTCTTTTAGTGTCGCGACTCTTGAGTA:2 - chr2R 16072866 3' - opus 10 2 74.66 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATC:1 + chrX 19583298 3' + roo 9003 2 78.57 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAACCGT:1 + chr3L 16920254 3' - roo 8749 2 76.71 TCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGTACATGTACGCCTTGCAGTATTGGCCAAAGG:1 + chr2L 2286341 3' + jockey 130 1 78.77 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAA:1 - chr3R 16881882 3' - 3S18 46 2 55.86 TCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCAGAAACTTTATTAGGGAAATAATTAAATATTTAAATATTTAAATTTTGGAAAACAAAGAACTGAACTCCTT:1 + chr2L 16537650 3' + Transpac 5181 2 54.11 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTCGCCTCTTGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAAGGTGCTCACG:1 - chrX 19887064 3' + P-element 2814 1 35.62 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCA:1 + chr3R 17944080 3' - P-element 93 1 21.92 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTCGCCCTCTGTCGCGTTTGTTGAGTTAACCCCCTGAAATTGAAGTTTACTTTTGATTGACGGCGGTGTGTGATGCTCT:1 + chrX 18767923 3' - hobo 44 1 55.48 AACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTGGGAAT:1 + chr3R 30518926 3' + I-element 5272 1 75.34 AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATCATATTCGGTTTATAATTGCAGTTGCGGATTCTGGTATATACAGTAGGCAGCACCAGTGTTT:1 - chrX 139990 3' + blood 7332 1 59.72 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTGAAATCCGCTCTTTTCAG:1 - chr3R 16881867 3' - 3S18 5797 2 64.38 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGAATCTGAATGACTGAAGAACTGTTTGAATTAATCCACCT:1 - chr3R 19446088 3' - 297 9 2 78.32 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGAAAAACCCGAGCACAACATGAAAA:1 - chr3L 20934117 3' - Max-element 8283 2 60.27 TATAAAGAAAAATATTTCATATTCTGTAAAATATAAAAAAAAAAACACTGCTTAAACACCACTACTGCCCAACGTTGCTCACAAGCAACTTTCCTGGAGTCGTTGGGCCAGCACAACGACAGAA:1 + chr3R 11363448 3' + looper1 1665 1 73.39 AGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTA:1 - chr2R 24807910 3' - I-element 90 1 80.82 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGCCGGCAG:1 - chr2R 21475229 3' + P-element 2807 1 30.82 GCATGTATGTGTGTGTGTGTGTGGTATACACACATACGTATATGATTTTAAGTTGTATGTACAGCGTGATTGATATGGCCACTGTCCGATTCGCGGATGCATGAATGGTTGGATGATTTGGCGGCTTTCCCTTGAGCACAGCT:1 + chr2L 8583870 3' - Quasimodo 39 2 67.13 GGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATTTTGCGTTTAGCTGTTTTTTTTTTATGTTAT:1 - chr2R 7847773 3' - FB 86 1 77.46 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGTGGAAATGGAAATGCCGA:1 + chr2R 11663875 3' + P-element 2787 1 17.24 CGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTNGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACACAGCTTTGCAAAGTTCGCGGCCACCGTGTCTTGTATCACAGNTAAAATGAGTTCCCATTTACGTTTATGGCATTTTGAATTGTTTC:1 - chr3R 12118098 3' + gypsy12 10159 2 56.85 TTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATATTCCAATAAGAACATCAATCATCGACCCCTCCACTCGCCGCTCCTGACAGGGCTCTCTATCACTCGTAG:1 + chr3L 19019270 3' - roo 9033 1 50.68 GATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACC:1 - chr3L 8249352 3' + HMS-Beagle 202 2 55.48 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGAAATA:1 + chr3R 31086594 3' + jockey 4928 1 64.38 AATATCAAAATTTCCGGCTTTTTAGCCACAGTGCACTGGTAATCATCAAGTGGGCGCATATGCCTCTGTTTTGTCGACATTTGTCGATACATTTTTGGTCGNAGCTTTTAGCTTAATTGAGCCAGCCGCTCATCAATACGAATCTG:1 + chrX 2548717 3' - transib4 12 2 60.96 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCCTTTCCACCAAAATTTAAGTGGATGCGGCGTGGAGATGGAAGTGGGGATGCGGTTGGGGGGGTGAGAGTGCTTGCCA:1 + chr2R 13117956 3' + 297 354 2 58.22 TATATATACATATTTACAGATACATATTAAAATTGAAGCGGACATAAATTACAAAGGAGTCAAGATAGAAGGCTCAAAAAGATTACTCACCTAAACACAATCGGGGCGGGCAAACAGAACTTGATGAGGATTCGTTTAATGTTGTT:1 - chrX 18872471 3' - G3 4506 1 71.23 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGGAAGCTATTGCGCGC:1 + chr2R 16073018 3' + opus 438 2 64.38 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGAAATAATTTTGTTTGCGCATCAATCA:1 + chr3R 31086615 3' + jockey 4949 1 50.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATAGGGGCTTGTCCTACCATT:1 + chr3R 27016559 3' + roo 9047 1 59.03 CAACTTTGTCATCGGTATTTCTCTCAAGTTTGAGTTTAGGTGGCTAAAGAGGTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCCATTTTTTAATAGTTTCGTTACATCTGTGACTCGTAAGGGACCCTCTGGGGGGCCCGGTTTGTCTAAGACTA:1 - chr4 756336 3' - Porto1 4494 1 64.38 GCACACAAAATTGTAGGGTGCGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTCGCCCTCTGTCGCGTTTGTTGAGTTAACCCCCTGAAATTGAAGTTTACTTTTGATTGACGGCGGTGTGTGATGCTCTAAGC:1 + chrX 18767927 3' - hobo 40 1 58.22 AAGATATTAGGATAATTTTCTTAACTAAACTATTTTTTTGATTATATATCTAGTGATATACTAGTGATATCTACTGATAATTAAGAGTAACTTTCAAATATTTATAGGACCGTTCCTTTTGAAACTTCGATGTTCAACCCAACTT:1 + chr2L 12331943 3' + Transib-N1_DM 58 1 51.03 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGTGTTGTTGTTTTCGGCTGGAGTGAA:1 - chr3L 19907094 3' - P-element 60 1 45.21 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTCTTCTTAATGCCTTTATTTTGAAATTTACCAAATGGCCTACAAATAAGAGTGATTTTTTTTTTAATTCCAAAACTCTTT:1 + chrX 3559690 3' - opus 7152 4 54.79 AATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTTCTATAATTTCAATAAATTTAATCAATTTAATATCCATAAAAGTAG:1 + chr2L 4916284 3' + 1360 3150 1 68.49 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTT:1 - chr2L 1729752 3' - Transpac 63 2 59.59 CTGCATTATTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGGCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTAAT:1 - chr2R 12379487 3' + pogo 2053 1 48.63 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATA:1 - chr2R 22596101 3' - Doc 81 1 70.55 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAATGGAAAAAAATTTGCATCGGTGGTTTCGATTATAAA:1 + chr3R 4361712 3' - copia 4895 2 68.49 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGAGCTTGAAAATTGTTAGCCCCATTGTGTTGGTAGCACACATATCCTTTTCCTTTCCTGGCTGC:1 + chr3L 5398154 3' - roo 59 2 58.22 GGAATCATAATATTTTTTAATTTAATTTAGTGAAATTGTTGCCCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTTTTAGACAAGTTTCGTTGCCTATATCGAAGTTGGATAACCCGATT:1 + chr3R 4567682 3' - Tc3 1366 1 69.18 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCAAAGAAAACTACAGCAAGAGGAAAACTAAAGTCAGTCAGGAAAATACTGCAAATCCAGAGTGTGTTTAAAATTATGCATGGTTTCACCTCAGCAGGTTGGGAATAATG:1 + chr3L 5958763 3' - 412 13 2 67.12 AAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTG:1 - chr3R 29283194 3' + hopper 1365 1 60.16 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATC:1 - chr3R 18204338 3' - hobo 52 1 54.11 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTTTAATTAAATAATTTAC:1 - chr2L 19698029 3' + roo 396 1 72.60 AAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGATGGCATTCAAATAAAACGTGCCCACCCGCATTACAAAATCAAATTCAAATTTCCCAAACGAGCAACCGCAGAATGCAAAATGCAGCCGATGACGATGTCG:1 + chr2L 21931373 3' + Stalker2 290 2 56.16 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGTTTGCCTTGAAAAAGAATTTCGCGCAGTAAAATCTAAAGCGAAATTGCCGCGTTCTGCGTAGAAAGGGGGAGGAGGGG:1 + chrX 1599486 3' - hopper 41 1 58.22 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTGTTGTTGCAAGCC:2 - chr3R 13684669 3' + 412 7494 2 56.85 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCACTCCTGCTCAGTTTTCAATCACGCGCG:1 - chr3R 16349207 3' - P-element 49 1 44.44 TACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCCGATCAAAATCGTAGGGAATATAGTTACACAACACGGTCATACTGACCA:1 + chr3R 10708321 3' + Transpac 5159 2 65.75 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATTCAATGGACTCAAAAGTGCGGCTGATATAGAAAGCTGGTGTTTCTATATATAAATATAAGTTTTGCCTCCTCTGGAGATTCTTTCTGTCTTT:1 - chr3R 28803831 3' + hobo 2910 1 64.38 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTTTGCCAATG:1 + chr3L 7102414 3' - I-element 52 1 49.32 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTAGTCTAGGGCATGGAAAG:1 - chr2R 7622917 3' - P-element 102 1 15.86 ACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCACGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCGGTTCATTTTTGGCACAGCATTCGTCATTGTTTTTTGTGCGATTTTTTTGGTGGCTTCTTCGGCAGATTACGC:1 - chr3L 11138595 3' + invader2 4821 1 52.78 TATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTAATCCTTTCCATGTTAATCTCTGTCAAGTTGGACGTGGCCTGTTTT:1 + chr3R 14138615 3' - mdg1 76 2 68.49 CGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGAGTCCGCCATATGACCCAACTCCAGCGAATATAAAGTGTATGCAAAGGAGGCAGCTCTGTAACAACAG:1 - chr3L 13186402 3' + Quasimodo 7323 2 52.74 AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAAAGTTAAGCATTTAAAGTTTTCCACAAATG:1 + chr2L 16554697 3' + blood 7333 1 57.86 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGAAATTTCGCAGTTACGCAGCTTCAGCTTGAAC:1 - chr2R 22964190 3' + 412 435 2 60.27 GTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGTATAGTATGACTGCTTGCAAATACAAATTTACGGTCCTTACTCCAAATGATT:1 + chr2L 21777987 3' + pogo 356 1 64.38 ACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTA:1 + chr2R 16185109 3' - 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chr3L 25782379 3' - F-element 94 1 74.66 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGAGGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCCCGCAGATAGTCG:1 + chr3R 13453403 3' - 412 62 2 61.64 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTGATATGTGTTTTCTATAAAGCATCTTAGAATATTGAACGGAAGCTATTGCGCGCTAAATTTAGAATGTTTCTAGTGACTTTGGCTCACTTAGG:1 + chr2R 16073057 3' + opus 7485 2 72.34 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCAAGGGAGCTTTCGTTTACTGGGTCTGAGGTCAGCGAG:1 + chrX 7508175 3' - roo 8728 2 72.66 TTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTAAAAATGTGTATAATATCGTT:1 + chr3R 10900901 3' - F-element 79 1 58.90 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTA:1 - chr3L 13888905 3' - 412 7123 2 64.38 ATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAAC:1 + chr3R 8049018 3' - Q-element 140 2 63.01 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTG:1 - chr3R 13684681 3' + 412 429 2 65.07 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCACATCGACCGTCATTTGCCCTCGACTCGAAGTTGC:1 - chr2R 11663842 3' - P-element 86 1 26.71 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTG:1 - chr3L 16200748 3' + roo 332 2 69.18 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAGCACGACACAAAAGCTAAGTGAATGTATCAGATTTTGCAGAAATGTGATGCGACC:1 - chr2R 18767148 3' - pogo 59 1 64.29 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTT:2 + chrX 8208389 3' + roo 8988 2 73.97 AAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCG:1 + chr3L 22038316 3' + diver 6053 2 56.16 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCATCACCTACGGAACCC:1 + chr3L 17746399 3' - roo 8691 2 63.01 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGTGTTGGCCCAAACCGAGTCCGAGCAGCAGCGAACCGCTGGCC:1 + chrX 19887135 3' - P-element 50 1 40.00 GTTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCGGTTAACTATNATCCAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTTTTTTCAAATGAATT:1 - chr2R 18618473 3' - jockey 4736 1 61.64 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTAGCTTTGTTACTCATTTA:1 + chr3R 5575079 3' + blood 350 2 66.44 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAACAAGAAAATCATAATCAGTCAATTGAGATTAAGCCAATAATATTGTAATTTTTTTTAAAGGAAAACAAGAT:1 - chr2R 15698044 3' - opus 7050 4 52.05 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAAAACTTAAAGGCGCTTAAGC:1 - chr2R 6514184 3' + roo 9054 2 71.23 GAGGGCTTATGCCTACATACTAAACAAAAACCTCCGCTATCTGATAACCCTTTCACTATTTCAAAATGTAATCATTTATTCCTAATCCTATTTGTTTAGATATAGGCAAGCTTGCTAGAGAAACATGAGACTTAAAAGAATTTTTC:1 + chr4 251691 3' - Rt1a 4975 1 79.45 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACAT:1 + chr3R 9550996 3' + P-element 2829 1 45.89 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAATATTC:1 + chr2L 11725055 3' - F-element 57 1 56.16 ACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATG:1 - chr2R 5284529 3' + Doc4-element 2602 1 52.05 CAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGATTTCTTAATTATTGAGTAGAAAAGGAATCCTTTTCAGCTACTGGATGTACTCAGCTCATCTCTGTTCCTTTCTCCCGTCTGCGCATCTTCTT:1 - chr3R 10432262 3' - G5 4784 1 55.48 GATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTCAAGGCAAATATATATTGGGTGACTATAAATAAACATAAAATCAGCAGAGTAATTGCACAAAGCAATAAAATTCATCAAAAATGCGCTAGCA:1 - chr2L 11705737 3' - I-element 5112 1 63.70 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTCGGATATTATTATAGCTAAATTAGGGTTGACCGCTTGA:1 - chr3L 14233008 3' + copia 228 1 63.01 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAAGTATACTGTACAACGAAAAGGGTTTATCATAACTTATTTATTGCTTATTCCAGGTTGTCATGTTCTTCGGTCTGACGGTGGCCTCCTACTTCCTGTCCTTCGTGGTGTC:1 + chrX 13152863 3' + pogo 2077 1 69.18 TAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGATAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCGCAAGGCAATTACGTCTACGAGCACGGATCGGCAGATCGAGGTGGATATACCGCGCTGCCATCAG:1 - chrX 4916693 3' - Cr1a 3995 1 61.64 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTATATTGTTTTAAACACAAGCAAATCCAAGTATCAGGGAGTAGTAAGTTAGTAAGCAACTAGGAAATTCTCTATCTA:1 + chr3R 5575062 3' + blood 7345 2 54.79 AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTCACGTTTGTAGATTTCAGAATAATTAAACGAAATTTCGCAGTTACGCAGCTTCAG:1 - chr2R 22964197 3' + 412 7481 2 65.07 TAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGAGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAAATCTTTGGATGGCAGCGCCCTTCC:1 + chr3R 30618793 3' - X-element 31 1 58.22 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATCAAAAAGTGCTCTAGTCAATTAT:1 + chr2R 18767263 3' + pogo 2055 1 54.11 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTAC:1 - 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HB 473 1 66.90 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGCCATGGTGTGTGTTTAA:1 + chr3L 14116814 3' - BS 5013 1 71.23 CAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGATAAGAGTAAACAGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTGTGTTACATTCGGAAGAAAACATTGCCGTTATTACAATATATTCTTGATCACGATATCTATGTATATAGCGTTCTCTC:1 + chr4 407274 3' + jockey 4989 1 76.71 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTA:1 + chr2L 21909133 3' + transib2 2741 1 73.79 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGT:1 + chr3L 22435207 3' + opus 454 2 57.36 GTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTT:1 - chr3R 17494929 3' - hobo 75 1 78.91 ACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCTGGTTACGCTCAAGTTTTGAATATCAAATATTATTTATATATTA:1 + chr3L 10814649 3' - micropia 12 2 76.71 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCCAA:1 + chr3R 20345574 3' - blood 28 2 65.07 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTAACGGCGCAAAAGGATGTATAAGCAGTGAAGGTAATAAC:1 + chr3R 17766874 3' - HMS-Beagle2 8 2 75.34 ACCTAGCACCTGCAGAGTGCAAACGATCGCGTTCTTGCTCACCTATGCTTATAACGTGCCCCCAAACGAGAGAGAGCGAGAGAGTTCGACGCTCAACTCTCGCTCGCTCGCTCCATCCCTCTCGCTCTGGCAG:1 - chr2R 10535148 3' + Doc3-element 354 1 62.41 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAAGCGTGAGAGTGATCACGTCCAGTGAACGGGACATTTCAATTTACTCGTCGCGCTGTTCACCACATGTGCAACCTGATGCCTGACAACAATC:1 - chr2L 21909020 3' - transib2 26 1 65.07 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATAATCAAGCGTGCAGCTGAAATCCTTTAAAGATCTCAAGCTCTGTTGCCACATGAGATGAGATGAGATGATGAGTGGCAT:1 + chrX 5456673 3' + roo 9031 1 58.90 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAGTAGTTTTCTTA:1 - 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jockey 4757 1 80.82 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGGTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTTCATGGCCTTATA:1 + chr3L 8273975 3' + hobo 2871 1 74.58 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTT:1 - chr3L 16200708 3' + roo 9037 1 61.38 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCC:2 - chrX 4240231 3' - jockey 4746 1 67.81 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAA:1 + chr3R 23579360 3' - roo 8723 2 73.28 CAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGGTGTGTGTGCCTGTGTGTGTTTCGAGGGTTTTCGAGCTGCATTCGCTCCTGGAAGCACACTCGAAATGCTCGAGTGCCTATCTGGTTTTTCACTTAGTCAGCATTATGCAAATGCGA:1 + chr3R 18960822 3' - accord 256 2 79.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTACATATGTAGTATTAGTGAAAAATACAAAATAGTTAGTTAGTTACTTATCTAACGAATGCATTTG:1 + chrX 22511507 3' + roo 9054 2 73.29 CGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGGGAGTGACCGGTTAGGCGACTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCGAAAAGTTTTTTTTTCTATAAATAAATATACATTTCTATCGATTTCAAGACTAATAAAAATGTAAAA:1 - chr2L 22063440 3' - INE-1 559 1 75.34 TCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTG:1 - chr3R 8381738 3' - Tirant 82 2 79.26 ATTATTATTATTATTATTATTCAATCATTAAATCCAATTTATTCTGAACTATTTTAGTTACATGCTTTTGAAACTTTTAATAAACCCCCATGAGCCACCCTAGCACACAAATATTTATAAGGCTATTCCGCTCATCCAAATCAATC:1 - chr2L 3559757 3' - mdg1 7068 12 76.03 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATTTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAGAATGCAACTTCCTGCTATTTTGTGTGGAACGTAAGCATCTTCTGCCAAAACAAATGCATACTT:1 - chrX 20024476 3' - 412 7076 2 64.38 AAATTTGTTAAACATGGGGAAAACCCAATAACAACAAAATAAATAAATAGATAAGTTCAGACAAGTCAGGCGCTAATTCC:1 - chr3L 26717341 3' + Tc1-2 343 1 73.75 CTGAGCGATACATAAGTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATAGATAAAAATATGTAAATA:1 + chr3L 26170623 3' + G3 4371 1 84.25 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGCATTATTTTTCTTGAATTAATTGAGTGGTTTTTTTTTGTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTGAATTG:2 - 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412 66 2 56.16 CTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTGTGGGCGCCACATATATAAGCTAGAAAGTTTAGAGTACTTTCAGTATCCAGTATCTGATAGTCGACTAAAACATGCTTTCTTGTTTTATTGTAATGTA:1 - chr3L 17860585 3' - Chimpo 39 1 62.33 GACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTGTTTAGTTTCTAAATTAAATTGACAAGTTCTTTTAAAAGAGTATCCATGAACAGAAAGTTTTAAAATATAT:1 - chr2R 7407957 3' - 3S18 5814 2 56.85 TTTTTTTTATGTCATTTATTTAAAGGAATTTCAGAGATTGGTGTAAATTGCAACATAGTTTAATATTGAATATTGTAACTTTTTTTTCCCCCGCAAGCCGGTGCTCAGAGTAAATTATGCACCTTGCTACCTTCAACACCTGTAAG:1 + chr2R 8499133 3' - X-element 4718 1 21.92 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTC:1 + chrX 2104768 3' + roo 8990 2 73.29 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTNACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTG:1 - chr3L 12125293 3' + roo 8994 2 73.29 ATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGCCTAGAGGCAAAAGAAGACTCAAGCGCCACCTCCAATGTTTCGACTGAATTCAATA:1 + chr3R 12036626 3' + jockey 4655 1 76.87 TTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTGAATTTAATAAAAGACAATCTATAAGCTGTTATTGCTGCGTTTTAATAAAATTCATTTAAATTACTTT:1 + chrX 14771809 3' - jockey 4723 1 53.42 AGTTAAATTAGGTAACATAAACATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTTCTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATCGAGTACTCGTAACGCCGAGGGTTTTACGGAAGAACACAAACAAAAG:1 - chr3R 5309558 3' - Tc1-2 1509 1 67.81 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTT:1 + chr3R 9550960 3' + P-element 2813 1 24.60 GTATCTGAGAGTCGGGGAACTCGACTATAGAATCCTCTCTTGTTATTGTATAAAAACTTAAACCATAGGGATTTTTAATTTTTAATGTTTTATAGATGGCTAGTGGTTTATTATTCGGTGATAAAACCGCTCCGATAGCTACATC:1 - chrY 3572602 3' + INE-1 558 1 73.79 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCATTTATATTGTGTAATCACTTAATGTCTTAAGTAACTATTTCTTCCGTTCAT:1 - chr3L 22041019 3' - roo 15 2 75.34 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTATGTATCTGATTAGGCTGTGTTTAACGCCACCGTTGTTGGTATTTCTCTTGCCCATCTTGCTGAGTTTTAAGTGTCGTTTGATTGGTTAACGGGGCGTATGCGTAA:1 - chr3L 5055646 3' - Quasimodo 59 2 75.34 CGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGCAAAACCCGAGCACA:1 - chr3L 20934126 3' - Max-element 8276 2 59.23 ACGTGGCTGCTGCTGAGTTGTTCGCAGTAACTTTAGCCGAATGTAACTGTTGGTACCGATAACACGCACGCACGAGTGCGTTGGAAGTGGAAAGAGGCCAGTCTCGACAATTTAGGCGCTCTAATTAGATCACG:1 + chr2L 956175 3' - G-element 230 1 64.18 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGTGTGATGGGAGGTTGATGTGTTTTGGCCTGATCCAA:1 - chr3R 17494892 3' - hobo 49 1 53.96 CTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATTCATGCAATGTATA:1 + chrY 2720344 3' - gypsy 6997 2 78.77 GCGTAACGGGTATCTGTTAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTCTCTCTTGTAGTACAGTAAAATTGATCCCAATATTTAGAAACATTAAATGTCTTTCCATTTCTAGCATATCAATGTGATTTTTCAAGTAAGTACATTTTTACT:1 + chr2L 7233261 3' + INE-1 549 1 62.33 AGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACATAAAGTACAGGAGGAGACCTCTTGGGACAAATTCATTGATGCCACTTTGCTGGCAAATATTTTGGCAAAGTG:1 - chr2L 7336096 3' + pogo 2054 1 52.05 CTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATTAAATTATTTTCCTATCCATGTTTTAATTTTTTTCTTGATTTTACATATTTCTATTCTCTCTTATTTTTAATTTCTTCTATTTT:1 - chr3R 2527708 3' + INE-1 547 1 48.63 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACNCCCCGCTACCGATACCAATTGGAGCAGGGGTCG:1 - chrX 7508064 3' + roo 390 2 69.63 ATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGATATGTC:1 + chr3R 7042119 3' - Stalker2 21 2 71.23 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGGCACAAAAATCAAAATCAAATGTAAGCGGGTGCAGT:1 - chr3R 17871809 3' + roo 9043 1 63.01 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTCTGTCGGGTATCGCATGTTGCCAAATGTATCTTCGCATCTCGCCGTGCCCGCGACAGCGCATCTTAATCCTTCATCATCGTCATCGCGGCCCTCGTAATCATCATA:1 + chr2R 6514376 3' - roo 8677 2 75.34 GTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAACACAAGCAAGAGGAAAGGCCAAGCACAACTCTTAACGCTTTTTGGTCTATTTTCAACCCCAAG:1 + chrY 3473449 3' + HeT-A 6005 1 54.11 ACACGCCCACACTTTTGAAAGATGTTTTAATATTTTTTAATATTATTATATGTCTTTCCAATTGTCTTTTGTATCGATTTGCGAAATGACCAGTGTCCTCGTCCTTCACCCAGAATTATTTTTGTACACTTTTTTTCGGGCGCGCC:1 - chr3R 11274947 3' + INE-1 252 1 58.90 TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTGTCTAAAGC:1 + chr2R 17609831 3' - mdg3 5332 2 72.22 GGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTATAAACTTACATACTAACAATTTTGGATT:1 + chr3L 8295855 3' - Quasimodo 32 2 64.38 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATCTTTGCATTTAATTTGCGCGAAATTAGTTTCTTCTTTGCCGTTCTTACGAAAATAAATTCGCCAGCATAGT:1 + chr2L 1232731 3' - roo 8713 2 53.10 TGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAAT:1 + chr3L 22435187 3' + opus 7445 2 71.07 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGA:1 - chr3L 17746289 3' + roo 338 2 73.08 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCAC:1 + chr3L 9522145 3' - 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chr3R 9977224 3' + BS 5034 1 54.79 GTGCTAGAAGACGATTTTCGGTACGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATCTATTCATCTATCTATAGCAAAGTTTCTGATCTGCTAAACGTAATTAGTTCGCTTTGATGGCAGTTTAAATATTCATTCGTAATCT:1 + chrX 2089738 3' - 1360 3196 1 67.81 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTATTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGT:1 + chrX 8208410 3' + roo 9026 1 58.91 AAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTATATTTCAATTGCAGCCGATTTCAAGCTTGTAAAAGTTGTCATTACATT:1 - chr2R 17059567 3' - pogo 69 1 66.44 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATATTTTCCAGTTGAGGGTGCTGTAGTATTTGACATTTGTAATTTTTGAGTGTATTTAT:1 - chr3R 8631560 3' + roo 401 1 80.14 GTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTT:1 + chr2R 17696127 3' + rover 7235 2 64.38 CGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTCACGATTTTTTACGTCAAGTTTGTATATATTTTCGTGACCA:1 - chr2L 2209436 3' - 297 6567 1 75.34 GTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGTTGGCGCAATTAATT:1 + chr3R 7042092 3' - Stalker2 7296 2 51.37 CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAAGAGGGGGTGGCACGTAGCAGAAAAGCAGAAAAGGACCCAAGAGGAAACCCGACACT:1 + chrX 1759077 3' - Tabor 6869 2 65.07 CAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTAATAGACCCGACTATGGGATTATTCGAAAAAGTTGTTTATAGACTGAAGCAC:1 + chr2L 5104995 3' - jockey 4907 1 69.18 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTCTATACCCAACGACTCTTTCAATCTTACAGGGCTGAAGCTTAAAAACTTTTCCAAAACTTGTAAAACGTTCCAGTCGTATTAAAAATA:1 + chr2L 18284963 3' + pogo 2063 1 59.59 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAANTNCGGCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACTTTAAGCCTTTATTAAAGT:1 - chr2R 18723637 3' - 297 42 2 58.22 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGGGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAACAGCTTAATAAGGCCATATAGTTGCTTTT:1 + chr3R 25962096 3' - I-element 18 1 66.67 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAA:1 - chr3R 19996174 3' - Quasimodo 54 2 57.53 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCATCAC:1 + chr3L 17746388 3' - roo 38 2 55.48 TCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATCATTCTTTTAGTGTCGCGACTCTTG:1 - chr2R 16072870 3' - opus 14 2 71.92 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTAATAGAGAGTATATAATATCTAAGCTCAAAGCCTTGC:1 + chr3R 7477524 3' - BS 5019 1 67.12 CATTTTTTCTGAGATATCGATAAATATTGGTGAAAAGAATGAGAAACAAATTAAAAACTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTTCAGCTTTTAATTCAATTGAACAAATTGTAATTTAATGCCCACACTTACAACTAAACTAC:1 + chrX 19810390 3' - INE-1 503 1 61.64 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAA:1 - chrX 8208293 3' - roo 8708 2 58.22 GCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATTTAGGAATATATTTGTTAGCAT:1 - chr3R 9949345 3' - blood 7230 2 80.00 ATAAATAGATATTCATAAAAAAATTTATGAATTTTAATAAACGGTCTTTATATTTTTGCATTGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTATGCATTAAACATAATTATCAGTGCCCGCTTGTTCCGACAACGCCTGCCAAATCA:1 + chrX 11342967 3' + S2 1619 1 65.07 GACATTCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTAGGAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTAACAATGTTTGATG:1 + chr2R 5542335 3' + Quasimodo 7317 2 57.53 GAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGAATAATATTATGAGTCATAGTTGGATAATATTCATGATACATGCTTTTGATATTTACACTGGCCTA:1 + chr3R 23132867 3' + flea 4766 2 55.48 TCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTATCATCTCTCTCAATAATATAGCAATTTATGTT:1 - chr3R 12789494 3' - G2 2770 1 65.71 GAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr2L 20360641 3' - micropia 4993 2 52.17 TTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGACAATATTTAAATATTTAACAACAAATACTTTATATTAAAAATGTGTATAATATCGTTAGATGC:1 + chr3R 10900907 3' - F-element 73 1 55.48 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATACACACATACATATATATATCTATATACATCTATATAAACGGAAGTGAAAATTAGCAAACCAGGAAAATGTTTTGCCCAAACTAATAGAGAGGCCAGATGGTTTCGGTT:1 - chrX 12263652 3' + roo 398 1 79.45 TCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACTAGCCTAAACAAGAATCAATTGTAAGCCTCTAACACGCTGAATTTTTAATCTAGAAATCAAACTACTTCCGTTAAA:1 - chr2L 16249070 3' - accord2 184 1 51.37 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATAAATCATTGGGTGAAAC:1 + chr3R 21655080 3' + roo 9028 1 55.17 AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTT:1 + chr3R 23415970 3' - jockey 4845 1 75.34 GATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTACTGCCACCTCGCTTTATGGCTTTCGGTGTGCGCGGACTTCAATTAAAAAATCTCAGCAAAATCTCAGCTAAAAGTCCAAAAGATATACTCGTTTCTT:1 + chr2R 10345187 3' - FB 950 3 65.07 TTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTCAAGGCAAATATATATTGGGTGACTATAAATAAACATAAAATCAGCAGAGTAATTGC:1 - chr2L 11705772 3' - I-element 5147 1 60.96 TTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACGAGCGATCTGCCTGTAGACCACACCAAGTTCAGTTATGAATCAGGAATAGATCAAGAATGTACACATGCTGAATAAAAACAAACTGAAACTAGTCCACGTTGAGCTTTCTAAAGGAAC:1 - chr3L 4366462 3' + mdg1 256 2 73.97 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTG:1 + chr3L 22435208 3' + opus 7443 2 61.11 GAATCAATACAATGCAATAACAATAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGT:3 + chr3R 7477480 3' - BS 5063 1 60.96 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACTGTCTGGCTTCCCTCGAAGCTTTCTACTTTAATTGAATAAATTTCTCCGGTCATCCGGGACCTTTGAAG:1 - chrX 10504271 3' - roo 51 2 54.79 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGAC:1 + chr2L 3911920 3' - roo 57 2 68.75 GTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTACAATAGATACATACGTTGACAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTCCGACCATAGAAAGTATGTAC:1 - chrX 22511337 3' + 1360 3348 1 54.35 GAAATAAAGAAAAAGAAAAAAAAGTTTTAAAAAGACTTTAGAAAAAAAAGTTTTAGAAAGACTTTCGAAAAGTTATGAGTTCTTCCAGCAGACCCTATAACCCTATTAAAATTGTCTTAAAATGTATGTTCATCTGATATTTTTCT:1 - chrX 3346427 3' - McClintock 6159 3 34.93 CCCGAAGATATTTCCAAATAANATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAA:1 - chr2R 9871033 3' + roo 353 2 58.22 GAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGAATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAATTTTTTTGAGAATGAGGTATCACAGCCAGTAATTTCAAGCAAGAAC:1 - chr2R 8097754 3' - hopper 1352 1 67.12 AAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATACCCTTAATTTTTACCTATAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGCGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATTTATGGTCGCAAAGAATTTGCGGGATGCCAAACTTTGAC:1 - chr2R 5421081 3' - S-element 113 2 76.71 ACGCTGCCCTGCGGAACTCCAGCTCTCATAACGCGGGGAATCGAGTAGGAGTATATGATCGTCACTGCATTGAAAACTTCTAACTTAAATCGATTTACCCCCTGCAAGAATAGCAAATCA:1 + chr4 409411 3' - BS4 71 2 56.67 AAATATACGAATTATAAACTAACAATAAAAATGTCTTATTTCATGGGACCTTAACCTTAACTTTTTAACATCTTACAAAAAGAAAAGATGTTATTTTCGAGTCGAAAATGCCGGAAATACGCAATACGCAAGCCAAACACAATTGT:1 - chr2L 13216151 3' + HeT-A 5899 1 47.95 CTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTAT:1 + chr3L 20168342 3' + roo 9057 1 75.34 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTACACCTGCTATATATGTATACTTGATTTCTGCCTTTTATGATACATATTCTGACATA:1 - chr3R 4668778 3' - FB 65 1 64.38 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCT:2 - chrX 20330536 3' + P-element 2821 1 40.41 AAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAA:1 + chr2L 23034091 3' + FB 416 1 58.40 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTAACCTGNAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGC:1 + chr3L 8249487 3' - HMS-Beagle 6825 2 56.15 GGAGCTCGAAGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGATGTTAATGGTGTTTCTACTTGTCTTAGCGTTGTTGATCCGGTACAGTGCCAATTTTCTGTTTGGCCATTTTCATTGTGACCATTTTCGCACACGTATTTTTCCGGCCTTC:1 - chrX 4506113 3' - Doc2-element 24 2 42.47 ATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCA:1 + chrX 21667970 3' - gypsy2 36 2 65.75 GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATG:1 - chr3L 9522052 3' + opus 7442 2 71.64 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTCATTAAAGACCATAATAAAATGTGGGGAAAGGCAGATGGAAATCGCAGCCCCTAACAAATTTGTCCACCAATCCTTTCGCGAATCCGCTTAA:1 - chr2L 6153880 3' - copia 29 2 65.75 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACT:1 - chr2L 4631155 3' - roo 8744 2 71.92 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGAAAAATGGGCGAAGGAAGCGGTTGGAAAAACTGTCTGTCAGACAAA:1 + chrX 15029181 3' - blood 168 2 79.35 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAG:1 + chr2R 10695883 3' + roo 9019 2 56.85 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTC:3 - chr2L 4631141 3' - roo 66 2 62.33 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAAAATGGGACCAATAAAAACCAATT:1 - chrX 4469513 3' + roo 9046 1 55.12 ATTTTTTATAAGTATTTTATTTTATAAAAAAAAATCTATATTTTGAAATGATAAGCATGTTCTAACAATATAAGAAAAGTATAGTTAATATAAAATAACTCGTTAGTAATTCTGAATAATATTTGTGTGCCTTCCTGCTAAAGCTC:1 + chr3L 16476962 3' + 1360 3091 1 65.07 TATTAGTATATTGGAAATACTATAAACTGTTATGTTACAGCCCGAAAAAGTTAATTTAACAGCGCATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGAGCACATCCTTTGTTTTCGCTTGCCAATTTTTGCTGGCCATCGA:1 - chr2R 22044651 3' - hopper2 1533 1 73.29 GTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGCGAGTTAAACTCACCCGTGGAGACTGGAACTTCGCCCTGG:1 - chr2R 15036483 3' - 1360 3363 1 67.74 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGNGNATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATA:1 + chr3R 13676144 3' + P-element 2810 1 19.66 GTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTTGCTGTAGTGCTCTCCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGATAGCCAAAAGCAAATTTACTACAGATTCACTACGATTTTCTCGCTGTG:1 - chr3R 21899188 3' - 1360 166 1 65.75 CACAACTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGGGACTCCAATTCTTCGCATTCTCGCAGTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAACAATTGATTTGCGAAAGCACCGGGTAATGGATGATGATCGTGTCTCTA:1 - chr2L 8349953 3' - mariner2 352 1 76.03 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCAGGGACCATTTGCTGAATGAAACGAAGCTGTGTCTGAAAGCTAATTAGGTTGT:1 + chr2L 15917740 3' + roo 391 2 70.55 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCC:1 + chr2L 1451255 3' + mdg1 363 2 55.48 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTCTTTTGGTTCCATTTTAACAATGATATTTG:1 - 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jockey 4614 1 54.11 TTTCATTGGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAAAAATAGACAAACAAACATGGCCAACCAGTCGTG:1 + chr3L 2887737 3' - Stalker2 123 2 76.55 AATGTTTTTTTTTTTAAATCCCTTGAAA:1 + chr3R 29060105 3' + FB 182 1 85.71 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAATTTGCTGTATTCTTACTAATGTGAAAATGTCCTTTATGTCTTGAAGGGGAGTGTACAAATCTCGTTGACTGTTGACAAAGAAAATAAT:1 - chrX 407366 3' + I-element 5323 1 60.96 CAGTTCTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTTGCCATACATTGCGTTTATCATCTTCCTCAAACGACCATGGCAGACCGGCAATTGAGC:1 - chr2L 13540616 3' - mariner2 791 1 59.29 AGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAATTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAACGGCAGCGGATGCGAAGGAGTGGAAATAGAAGTACGCAAGTGAAGTAACAACAAAAACAGG:1 - chr2L 7811929 3' + P-element 410 1 49.62 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATANGTCGCTTCTGTTTTCTGTGTCACTTGATATTCAAACATTTGTTTGCATTCTGTGTCCGAGAAACTGTGCCACGAAAGAGTGCTAGGCTT:1 - chr3R 31497801 3' - Transpac 32 2 59.59 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTTGTGGGTGTAAATCCATTATGTCCGACATATAAATACTTCGAGTATCAAACTTTATT:1 + chr3L 7562159 3' - FB 65 1 65.07 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATTTATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCATTCTTAATATATTTATCTTTTTTGTATCATGGCGACTTCAGCG:1 - chr4 868601 3' - roo 8690 2 67.81 AAAAAATATTAAAAAATTTGTAATTTGTATGTATATTTAAGGAAGATTATTTGCGACANACTTAAGAAATCAAATTGCAATCAAGCTTAAGTTTTCGAATCGTATTTATATCAATATCAATATATTCAATCAATACTAATTGAGTT:1 - chr2R 10563781 3' + Transib-N1_DM 291 1 43.15 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTGGCTTTGAGTGGCAAGTCTGATTGTGTAACAGGATTTCGCAGTCCTTATGTTCAATTGCCAACAAATTGTGTGTAGTTTCTGGCGAAC:1 + chr3R 8631742 3' - roo 8697 2 63.01 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGTTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACACTTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGAAAAAATCGTAT:1 + chr2R 21199741 3' - jockey 4759 1 53.42 GGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGAAAATGAGAACGAGAT:1 + chr3L 4615794 3' - F-element 379 1 56.85 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGTCCCGAGTTGTAATTACGGACAACTCGAGTGGAACTCCAGTGGAAGTTCCAGATCCCCAGCTGACAG:1 - chr2L 19940007 3' + mdg1 7406 2 53.42 GGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCC:2 - chr3R 4530706 3' + copia 5040 2 73.29 CAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTGATATGGCGGCTGAAGTGAGTGAGCTAGCATCCAAATAACCAGCACTATTTTCATGACTACTTGGCTGCT:1 - chr3R 29024957 3' - S-element 1524 1 67.83 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACATTTGAATATATATGTACTTGATTAGATATAATTGGCTGTCAGTATGTCTCTTGATCGCTCCACTCAATCGCACCAATA:1 + chr2R 23596095 3' + blood 7348 2 57.53 GGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAG:1 + chr3L 8249491 3' - HMS-Beagle 6834 2 58.74 AACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCT:1 - chr3L 2668864 3' + Bari1 1626 1 73.29 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCTTTACTCGTGCTGTGCTGCTAGAGATGACAGTGGCTCCGATAGATGGGGCTATCGCTGGCCAGTG:1 + chr2L 6047944 3' + P-element 2850 1 56.49 GACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAACAAAAATAGTCCACTGATTTCCTGCTCGTCTGGAGTTGTTTATGCGTCTGGGTCCGTTCGTTTCCTTTCTGGGCTTC:1 + chrX 7142524 3' + flea 4711 1 53.10 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTG:1 + chr2R 10541755 3' + P-element 2837 1 51.37 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATGTAATATGGAACTTATGAGTCATGATTTCTAATTTAAAAAATTACATATTATAAGAGTTACTTTTGCAGCAA:1 - chr3R 21679545 3' - roo 27 2 63.01 TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTTCCATTTAAAAATAGACTAGTAAATTTAATTTTTAGATAACAT:1 - chr3L 13992258 3' - blood 77 2 70.55 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATAAAATATTTTTTTAATATACTAAATAACATTTATTTTCAAGTTAGAGTGTATTGCATTCGAGATAAT:1 + chr2R 22964288 3' - 412 54 2 52.74 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAATATGAAAGGGTTTACTTTGATTGTAAAATAAATAAAGATTTCACAAAATGTTCT:1 + chrX 21227256 3' + Tabor 7312 2 75.34 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTTAAAACAACAAGAGCTCACACACACACTCGTATCGATTATTGTAGCATACTTACT:1 - chr3R 10541209 3' + hopper 1357 1 58.22 TTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTTTTTTTTTACGTCGCCTGCATTTGAAATATTCTTCAAATTGAATT:1 - chr2R 19212860 3' + P-element 2769 1 30.14 ACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAACAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAACTAACAAAGGCAACAAACATAACATAATAGCAATGATGAATTTGAATTTAAAAAAGAAACAATAATTTGGATT:1 + chr2R 1880469 3' - 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chr3L 6637010 3' - roo 8742 2 58.90 AGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTACTGGCATGCCTCTGTTTATTATTCAT:1 - chr3L 2668817 3' + Bari1 1673 1 60.96 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTGCATAGGAAATATGGTTATAAAGTAACAAAAAGAATCCGTGCTATGTCCTTAAAATTAAGGTGGTTTTTAACAAATAGTGCCCGAAACAT:1 + chrX 11415830 3' + mdg1 390 2 63.70 CACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATATATATATACAGAAGTATTAAACACTTATTACAGATGCCATATGCTACGTTCAACGGATATTTACAGGGGC:1 + chr3L 2668962 3' - Bari1 46 1 54.79 TCTTAAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTAGGTAAGAATGTATATGTATAAAATAGAAGAGGAAGCACATAGATTTATAAGTATACATAATATACGATACTAAATATATGAAT:1 - chr2R 5412747 3' + Tc1 1372 1 56.85 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAAGCTAACCAAGCTAACGCCCACCT:2 - chrX 8208270 3' - roo 8685 2 73.97 ACGAAGATATTTGGGAGATACATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAACTAGGCAACGATTTATCTTTATATGCGACTGTTTCGATTTGATTTCGCTCGTAAATGTCCCGGGTCAGCGG:1 + chr3R 13320526 3' - accord2 116 2 53.42 CCTCCACGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTGCAACAGTGTAGGCGGAAACAGCTCATTGTGTTTTTTTTTTAAACATCGCTGCTTAAAACATCGATGTTTTTCGATATCAGGGACATCGATGTTTCTGGCAGTAAGT:1 + chr2L 8403431 3' + gypsy5 120 2 52.74 TGGGACCCCGATGAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGCAGAAGGAAGGACGAACAATAAAACCGGAGATCGATCATTGGAGTGCATA:1 + chr3R 2533780 3' + roo 8930 2 64.54 ATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGAT:1 - chr3R 5977754 3' - copia 86 2 75.34 ATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACGAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACAT:1 + chr2L 18173648 3' - blood 92 2 76.71 TCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTTCCGCTTCCCTTTTCGCAACCTAGGTCAATCAGAGCAAGCCCAAAATGGCCCTGTCCAAGATCGACTCCGAGATCGAGCAG:1 - chr2R 18617702 3' - 1360 149 1 55.48 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGTTGTCATACAAACGTGTGTTGCAGTGTAGAGCTTCTGCTTCGGCTCAAAGTGTCAGCACATTTTTCAAAGGCGCATAT:1 + chr2L 11476398 3' - pogo 29 1 64.38 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTACATGGGCATTACCATCGGACATGTAGACTCTTGTGACCCCTACACACCCGCAT:1 + chr3R 4190994 3' + pogo 2036 1 66.44 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATA:1 + chr3L 21913458 3' - 297 6622 2 57.53 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCG:1 + chr3R 16349279 3' + P-element 2820 1 27.87 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGAGCTTCAAAATTGTTAGCCCCATTGTGTTGGTAG:1 + chr3L 5398125 3' - roo 8752 2 78.77 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTG:1 - chr2L 16607211 3' + 412 422 2 64.83 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATATATATATTTCAAATAAACTTATGAAATACTATTATTCGTATGCAATTAAATGGT:1 + chr2L 7775036 3' + I-element 5291 1 60.27 GCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTGGGAATTGGTAATACCAAACGAAAA:1 + chr3R 30518945 3' + I-element 5291 1 62.33 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGGAATATTCAATACTATTTACAAAACAAAGGAACTCTGCTGTAATTAACTATACAAGTGTACGTAATAG:1 + chr3R 13613194 3' + copia 238 1 53.42 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTT:1 + chr2L 16553599 3' - 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chr2L 7064437 3' - hobo 2662 1 62.33 CTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCAATTCTTATACCTCACCTTGCACTTAAATGGTTTCTCTCCGGTGTGA:1 + chr2L 19733172 3' - FB 74 1 67.81 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTG:1 + chrX 14825334 3' + P-element 2795 1 22.60 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCA:1 + chr2L 13850705 3' + roo 8988 2 73.97 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAG:1 + chr3R 27398112 3' + roo 9002 2 65.07 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGGCCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGCGCTAGTTAAAGAATAAAAAAATGTAAGATCAAATCTCTTATTAACAGATGCATCAAGTCACATATTAATATA:1 + chr2L 7447979 3' - jockey 4716 1 47.26 AATTCCGAACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAA:1 + chr3L 21202088 3' - G2 2654 1 63.70 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAA:1 + chrX 21227202 3' + Tabor 7258 2 61.64 AACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTTTAATTCATTAAAATTGTGTCCCAATAGTTTATTTTGATTCAAGCA:1 + chr2L 21895557 3' + Juan 4147 1 62.33 CATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAA:1 - chr3L 20934142 3' - Max-element 8266 2 60.58 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTCATCTGTCTGATCGATGAAAAGAGAGTGGTCGAAAGGGTGAAACAGGTGGAGGTGGCTGGTGGTGGAAGGGGGTTGCGG:1 - chr2R 21362721 3' - Tirant 31 2 62.96 AATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAAAAAAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGACATACAGCTTTGGGTGCACCCGTCTCCGAACTGCTGATGCCCTCGTCCTCGTGCTCCGAACTGTTCTGCTTGTTTTTCTTGGGT:1 - chr3L 1231328 3' + G4 3370 1 52.05 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAA:1 + chr2L 1451240 3' + mdg1 7386 2 65.75 CTTCACAATTCCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGATAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTTGGCCGACGACTGTAATTGTTTTTGCGCGGGTGTAAAGTGCACGTGTGTGT:1 + chr3R 15804473 3' + Q-element 29 2 63.70 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTGGAGAAGAGAGGGAAAAG:1 + chrX 14825351 3' + P-element 2812 1 34.25 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCAATGGT:1 + chrX 7042736 3' + roo 357 2 52.05 ATTAAAAGTAGTCTACTGAAATAAGGAGGTAATATAAGATTTGCATGCCCATTCAGACGCCGCAAGGCAAACAGTAAGAAGTTTTTTTTGGATGTGGATATTTCACTCGGACCCGCTGAGTG:1 + chr2R 21736797 3' - Cr1a 3975 1 75.41 CGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGTGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGG:1 + chr3R 5972389 3' - Doc 297 1 50.68 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAACCTG:1 - chr3R 8381677 3' - Tirant 32 2 63.70 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCCTATCTGAAGGACTAAAATTTTATCGCATTTTAAAATTTGTCGCCAGGTGAAGCAATAGATTCGAATGTGATTTTCATGCCAAACACAAATAAA:1 + chrX 14973964 3' + 1360 3366 1 37.67 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGA:1 + chr3R 29283280 3' - hopper 16 1 60.20 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAAAACTTAAAGGCGCTTAA:1 - chr2R 6514186 3' + roo 389 2 69.86 TACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGC:1 + chrX 22386794 3' - hobo 87 1 48.15 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTCAAAGGAATACATTTGGCTCCTGCATTGAACATCTATTGCTGCAA:1 - chrX 14346956 3' - flea 4777 2 60.82 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTG:1 + chr3L 11529526 3' + opus 7424 2 76.26 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGTTTATAGAAATGCGAAGGATATGCTTTCAATACAAACACTTTTTT:1 - chr3R 29384627 3' - roo 8737 2 72.60 TGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCA:1 + chr2L 6385887 3' + invader4 260 2 67.81 AACCGAATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGACTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTACATTTACGACTATTGGAACTAACAAGCATCTTCAAG:1 - chr3R 24564174 3' + McClintock 6294 2 75.34 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTTTTCGGGTCTGCTGGGGGTTTGTCGAGCTTGAACTTTAACTTATTTTCCCC:1 + chr3R 11903535 3' - FB 69 1 63.70 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAAT:1 - chr3R 9657752 3' - jockey 4747 1 66.90 AAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACTTGGATTTGAAATGGCTCCATCTCCTCCTTGTAAACAGTTGTAACATTCAACTATGAACGGTAACAATCGAACCATGTTAATTCAGGC:1 + chrX 23035985 3' - HMS-Beagle2 6913 2 53.42 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTT:1 + chr3R 10030794 3' - BS 5062 1 53.42 TCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATTTCCAATTTATACACACCCCTACCTCCCTTTATCAGCCACCAAAATCGTAGAC:1 + chr3R 28008328 3' - accord2 180 1 65.71 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGTGTGCTGGTAATTGCTAATTGATTTTGCCATATGCATTAGTTGATACA:1 - chrX 20940704 3' - hobo 51 1 58.90 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATA:1 + chr3R 19246761 3' + jockey 4917 1 69.86 AATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTACGAAAACAAAACTTGTATGCATAAATAGTGATTGCATGAATAGCGATAACGACGAGAAGACTGAATTGCAGAGAGCAG:1 - chr3L 23556136 3' + P-element 2530 1 53.42 CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGTCTATGCAGGTATTAGGGAAATTCAACAGAAAACTTAAAC:1 + chr2R 6217169 3' - copia 4950 2 73.29 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGT:1 - chr3L 16200750 3' + roo 8994 2 70.55 AATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGAAAAAATCGTATTAATTCGA:1 + chr2R 21199749 3' - jockey 4751 1 60.27 CAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGGGCAAATATACATATGC:1 - chrX 19121884 3' - 412 7102 2 50.00 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGA:1 + chr3R 23415988 3' - jockey 4827 1 63.01 ATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATAAGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTGTACAAGACTAATTAAATTATGAAAAATCGATGACACGAATCCCGCCAAGGAGACG:1 - chr3R 23957354 3' - gypsy2 6556 2 79.45 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATT:1 + chr2L 3911944 3' - roo 8715 2 56.16 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAAAATGGGACCAATAAAAACCAATTTCAATTCCAATTCCAATTTCCCTGACGG:1 - chrX 4469485 3' + roo 393 1 67.59 TATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAAGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATAATTGTTTATAATGGAAACAATTTAACGAACAGTTAAGTGCTAAGGACACAATA:1 - chr2L 9062284 3' - Juan 4092 1 60.27 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTA:1 - chr3L 16200711 3' + roo 9033 1 58.90 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTC:1 - chr3R 17944054 3' + P-element 2804 1 18.75 TTGGACTCAGGCTAATCCGCGTAGTTGCGGTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTATGTTGAAAATATTTCGATTTATTTTTTTTTGTATCGGGCCCTATCGGTCTTCGATAACGACGT:1 - chr2L 8043450 3' - 412 7379 2 52.74 TGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTTNNNATAAAATATTTAAAGAACGACGCGCCGCAAGCTTTTATTTTTGGTTATTTCTGTTTGTGTTG:1 + chr3L 13798401 3' - frogger 82 2 65.26 GTATTAAGAATTTAAACATGTTTTGATTCTTTCGGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCGAATTTCCAGTCAGGTTGCCTATAAATACCAGAGCGGGGCTGCGAAACGAATCATAAGCTG:1 - chrX 6283581 3' + G4 3722 1 75.17 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCTGTTAATTAGATTTATTGTTGAACAAGAGCGACGCG:1 + chr2R 8086939 3' - 1360 80 1 71.92 CTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATAAGGATAATTGCTTTCAACAATTATCTATAAAT:1 - chr3R 8867025 3' + Max-element 8362 1 40.41 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACAGTAG:1 - chr3R 9550897 3' - P-element 57 1 44.29 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAATAGGCATTAAAGCCATCACCTACGGAACCCTCATGTTCGCCAGG:1 + chr3L 17746413 3' - roo 8677 2 72.60 GAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAAAGTTTCGATTAAACTAATCAGGAAGGTTTATTACTTAGTTATCTAGTAACAAGACAGCATGCTATAGCCGACTACCCCGACTATATGCCAT:1 - chr3R 31045901 3' - I-element 5048 1 68.28 TACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATACATATACAGATACTCATGCACTAGCACTCGCACAACTGTTGCTCGCGATGTTGTTGCTG:1 + chr2R 23716188 3' - X-element 53 1 53.85 CTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTATACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTCTACACGAATTACTTGCCAATTGCTGGCACACAAAACTGCGACGCT:1 + chr2R 14922679 3' + McClintock 493 2 65.75 CGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACA:1 + chr3L 829961 3' - G6 55 1 62.30 CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGC:1 + chr2R 22112715 3' + 412 7464 2 75.34 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAACTTGT:1 + chr2L 20044638 3' - roo 62 2 61.64 CAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAATAAGAGCAAGGATTGTTTTTTGAAGGCCATCGACTGTTACGAAAACAACAAGTCATGGTTCCATGCAGCCAAATCCTACGAGCAGATTATCCTGCTTGCCA:1 - chr3R 10121137 3' + gypsy12 10175 2 67.12 AAAAAACATATAAAGAAATACAACAAAAGTACCTCATAAAGTAAATCGAAAAAAGTTCTTTAACAAATATTCCACACTTTTTACTTTACTTTATAGAGCAATGATAGTTGGAAAATTGATTTTACAGCTTAACCTTCACCCAATTT:1 + chr2L 7537833 3' - S2 108 1 74.66 AATTTATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCGTCACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATGCTTTTTATGAATTTTGTATTTGTGC:1 - chr3R 19958296 3' - hopper 54 1 82.07 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATACGATACGATGCGATACAAAGGACGACCGAGGAGCCCCCTTAAATATGCAGCACTAAATGTAAATTTGCTTTTTGTGCGCATTAGCACATTCCCC:1 + chr3R 24074875 3' - jockey 4785 1 66.44 CCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGCCAAAGCAAAACCCGAGCACAAC:1 - chr3L 20934124 3' - Max-element 55 2 54.11 GGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCTACAAATAATTAAATCATGC:1 - 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chr3R 4679461 3' + hopper 1393 1 53.12 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGAGCTTCAAAATTGTTAGCCCCATTGTGTTGGTAGCACACATATCCTTTTCCTTTCCT:1 + chr3L 5398148 3' - roo 8729 2 63.01 ATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGG:1 + chrX 21667941 3' - gypsy2 6543 2 69.12 AGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAATATAAGAAAACCCAACTAAGTCCGGATATCAATGGACTTACAGTCCACGCTGACTTTGATCCGCTTGGACACAC:1 + chr2L 6385914 3' + invader4 3060 2 64.39 GATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATATGAAATAGGCCGCT:1 - chr3L 8157998 3' - flea 4814 2 59.59 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGACTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTCATGGCAGAAGGCAACAAAACTATTATTGTTCTCGAT:1 + chr3L 22435255 3' + opus 7488 2 75.34 CTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATGAATTTTCTTTAATATGTATAATTCTGCATTGGTATGTTATCCCCAATGGACCTCTGAGC:1 + chrX 18150778 3' - INE-1 152 1 71.23 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTA:1 - chr3L 13888891 3' - 412 7109 2 54.79 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAACAGCTTAATAAG:1 + chr3R 25962079 3' - I-element 52 1 50.00 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATCATATCNAATATAAAGAATGGATTCAGTTGCTGACCCTTTTGGTAGAGCAT:1 + chr3R 17871934 3' - roo 69 2 65.75 GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCT:1 + chr3L 14116761 3' - BS 5066 1 64.38 CTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAAACTCGTTTAGCAGCTAATTTGAGCGGCAAAACTTTTCCGATTCAAATACTATAAATAGATAAGACGAGATGGCCTCCTGTGGCTAATAATCCTA:1 + chr2R 21496419 3' + R2-element 113 1 63.70 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACC:1 + chr3R 20260887 3' + roo 8996 2 70.55 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAGTGATTCAATTTGTTGAATACTTTTCGGCGTTTT:1 + chr3L 15035246 3' - 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roo 8692 2 62.33 GCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGCATGCAA:1 + chr2L 13328489 3' - BS 72 1 67.81 GTTATTATAAAGATAAATATTTTACATTTTTTACCAAAACGTATATGAAACAATTTACAATTTACAATTTTTTTAATATTTTCGTATATAATGCAAGTAAAATATTTAAAAGGATTACTTTATGAAAATAAGAACAGAAATATATA:1 + chr3L 10167928 3' + looper1 1660 1 75.34 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCATATNATATGCACACTGAGTTGGCAACTGAAATATTTTTTAAGTCAAAA:1 - chr3R 20260811 3' - roo 8735 2 67.81 GGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCCCCAAAAAAAAAAACACCAAAAGAAAAACTCAGAAAAGGTTGACAACAACAGGCCGCCGCCCGGAGTCCGTTAACAAGAGCAAAACGCAGCCCGTAATTGTTAATGGGTTT:1 + chr2R 11002063 3' + I-element 163 1 72.60 ATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAAT:1 - chrX 15746266 3' - jockey2 3202 1 76.47 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAAAAATTGCCAGAATAAAATGCATGAGAATTTTAAATG:2 - chr3L 5398023 3' + roo 9037 1 58.22 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTGGACTGTGCCAAGTAGCTTCGCACCAAGCTCTATTCCCATTGTAGGGCCCAGAAATGTGCTAATAAA:1 + chr2R 22761268 3' + 412 7492 2 53.79 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGAGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTTTTACAGTACATTTGAATATATATGTAATTGATTAGATATAATTGG:1 + chr2R 23596052 3' + blood 307 2 71.43 CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCATCCTTGCTATTTTGTCTT:1 + chr2L 15086430 3' - P-element 68 1 26.21 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAAACCGTAGGCCCTAGTCGAACTTGAAATCGTAACCCGTTTACCAACCCCTCCCGAAAACAAGTTCTACCCCAAAAACCGAATGCGAAATGTGGAAGACGACGAC:1 + chr2R 7623018 3' + P-element 2879 2 78.99 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAAGCTA:1 - chrX 8208289 3' - roo 8704 2 60.96 GAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCATCAGCGGCAGTCGACTATCCATTCTTATATATATTCATCTGTATATATAACTTTTTATTTGTCCAACCGTGCGCACGCAT:1 + chr2R 16860142 3' - Dm88 4408 2 54.79 CTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTTTAAT:1 - chr2L 19698041 3' + roo 9047 1 64.38 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGG:1 + chr3R 15137379 3' + roo 361 2 51.37 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTCTGTCGGGTATCGCATGTTGCCAAATGTATCT:1 + chr2R 6514302 3' - roo 87 2 79.45 CTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCCACAGGCAAAGGCCACAAGATCTCGGACTGGATACCCGCTTGAAATGCGTGGCGGGATTCACTTTCCTCACGGGTTCCCTCAGCGCATCGCGCA:1 - chrX 17909810 3' + Tirant 8266 2 52.94 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCA:1 + chr3R 19246765 3' + jockey 4921 1 67.12 GTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCGTAATAAAGGGCGCACAATTAGTTGCTTGAGTTTCCGCAATAAAG:1 - chr3R 12181941 3' - mdg3 26 2 68.49 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGA:1 - chrX 20330562 3' + P-element 2802 1 23.74 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACAAACCGAGAAACTTTTGCGAAAAC:1 + chr2R 22774602 3' - I-element 34 1 51.82 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACTTATTAATGCCGACGATGAGTCCGAGTCCCCCATACACCTCCAATTCCCCGCAGATAGTCGTAC:1 + chr3R 13453406 3' - 412 7112 2 59.59 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATT:1 - chr3L 15389548 3' - I-element 79 1 67.81 CCTATTTCAACCGAAGATATTTCCCAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGTCATAAACGTTTTCAGACGTTCAGACGGCAAGGTGCGCTGCAATCACCCCGAAAATG:1 - chrX 4469532 3' + roo 9008 2 57.53 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTTTTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTATGGAATATTCAATACTATTTACAAAACAAAGGAACTCTGCTG:1 + chr3R 13613166 3' + copia 210 2 71.23 GACAAAAGGCAATTAAAGGAAATTACTACTGTGATAATAGATGATGAAAAAAATATGATTTAAATTGGTAATAATACTGCCCTCAGTAGAGGTTCAATATACTTATAACTACCAATTTAAATCATATTTT:1 - 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roo 18 2 72.60 ATGGTTTACATTGATTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTACATACAATATTAATCTGTTATTATATAGCATAGACATTGCAGCCAAGGCTATTGGCCAACTTGTGAGCACTTCCTCATTTCTTAC:1 + chrX 7961780 3' - invader3 5132 1 59.59 TAGATCCAACTAGCACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTCCGATTTTGATTCCGATTTTGGTTTCCCAGAAGGACAATCTCTGTCACTCTTAGGCAGCTCGTGTTTCAGTTA:1 - chrX 15419766 3' + Cr1a 4292 1 50.68 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAAC:1 - chr3L 12125251 3' + roo 9036 1 60.96 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACCCTGGTTGAAGTTACCTCGGCCTCTTCCTTGGTTTTGGCCCCTTCTTCCTCCACTTGTTTAGTTATGATTATTGTTATTGTTGTAATTGCTG:1 - chr3R 23184752 3' - GATE 8273 2 60.84 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATTGACACACTTGGCGTATGATTGATTTTCGTTG:1 - chr2L 13468251 3' - roo 88 2 78.77 TCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGACATATGTATG:1 - chrX 17495725 3' - Burdock 6185 2 74.34 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATAAATCATTG:1 + chr3R 21655072 3' + roo 355 2 50.68 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTAGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAATTGAGCCTATGCTTACCTTAGCGAAATTAGACATTTGTTAATTGATTTATTGCAA:1 - chr2L 19733091 3' - FB 67 1 62.33 TTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTGTTGCCCTTTTTGCTGCCACCGCCTTGCACATGACATGCATTTTTTAAAAGCCGCCCACAAAAAGAAGTCCACCGCC:1 - chr3R 10964159 3' - gypsy7 5004 1 87.88 GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTGAAAAAAGTAAACAGTGACAAATA:1 + chr2L 13293010 3' - copia 4932 2 59.59 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATC:1 + chr3L 2485997 3' - jockey 4709 1 45.16 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTCCACTAAAATGTTATTAACGTTTTTATAGCGCCCGGCAATAAAATACAACTTGCTTACTTTTTG:1 - chr2R 17842806 3' + roo 357 2 56.16 CTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAGCCTTAATAATGCAGTTTTTCTGAAATAGTACTTGTTATGAACAAGTGTTTAACTGCCTGTCATGTTCTTCAAAATTCAGATGATTTCCTCCAATTGAGTTAA:1 - chr3R 30164832 3' - R1A1-element 278 1 66.44 TAAGTCTATTTTTAGAAAGTACCGTTAGGCTTGAAGCAAAAACTGGTTTTGGCTGGAAGTATTTAAACTATTTGGAGACAAGTTGGTTACTTTATGGCTCGAGAGAGGAGTTGCCAGCCCTGGCTCAAGAGAGGAGTTGCCAGCCC:1 - chrX 22575245 3' - Transib5 130 1 74.66 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGGTATTTTCAAGGGTCATGCCATATTCGCTCAAGTAGTTCTTAAAGAAATTACCTGAAATGCTGTTTCAT:1 + chr3L 7646342 3' - 297 6625 2 55.48 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATNGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAGCCAAG:1 - chr3R 14546480 3' + pogo 2052 1 59.26 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTCGTAGGCCTCGATCATCGACTCATGTTTGT:1 - chr3R 5574931 3' - blood 48 2 52.74 CAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAATTTCACTTCATTTAGACTTTATAAAATTCTCATATCAT:1 + chr2L 16884711 3' + Bari1 1647 1 58.90 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAANGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAA:1 + chr2R 10695901 3' + roo 9037 1 59.59 ACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 491 1 43.70 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATAGCTGCAGATTCAGTTCCATTTCAGTGCCCACTTGTGTCCTTGTGTATTT:1 + chr3L 8274024 3' + hobo 2925 1 69.03 ATGGCATGTTGGATTGTTATGCAAGATAAATACCCTTCTCCCTGCGCCCTACTTCTGTATTTTTAAGTCATATCTGGAAGGACGAGAATTTAAAATCACCACCGAAACGGACATCTGGGCCTTTGGGATCGTCCTCTGGGAGATCG:1 - chr3L 4512187 3' + Helena 423 1 67.81 CCTGCCCTTTCTTCACTAGTCAAACGAAGAAATGCTGCAGCATATAACTGGTTACAATATACTGCTTACAATCAGATGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTATAGTTGGAGCCATCAAGGCCACTCTGTAATTAA:1 - chr2R 24141051 3' + Chouto 6108 1 77.40 GTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGAATAAATTATTTATAATTAATTTGTATGCACGCGGTTTTGTAACTTCTGGCTGCTTTCGCCTATGCCGCTG:1 - chr3R 13103346 3' + roo 150 2 51.45 ATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTACGTTGATTTTATTTCGGCAACTACCATATTTTTTATGCCCGCAAAAGGATTGTCTGGTTGTCCTTC:1 + chr3R 13898315 3' + 3S18 286 2 53.42 AAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAATAAAATAAATAATAGAATAGTGTTAGGAAAATGCCCCAGACCTGTGAAAAGTGAAACCTCTCTAATAGCCAATAATAGCTTACA:1 + chr3R 31525571 3' + Burdock 6390 2 50.68 GTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGAATAATATTTTGATTTGCATTTACAAAAGCAAATATATGGCGATTTATCAATAATTGGTCACTGGAAATCCT:1 - chr2L 15975405 3' - Stalker4 226 4 54.11 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCACTTAAATGATATCTGAAAAATTTAAGAATATTCTTAAAAATCTATATGTATGAATTCAAAGTAAATATATTTGTG:1 - chrX 14189124 3' + 412 7501 2 50.00 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATATATATTTACAACTTAATTATACAACTATGCAAATTGTATGTGTATCTAGTTCTAAATTA:1 + chr2R 6087895 3' + roo 9017 2 59.59 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAGTAG:1 + chrY 311463 3' + 1360 3388 2 58.90 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTTATGGTCGACAC:1 - chr3L 13888863 3' - 412 28 2 66.44 ACTGATTTCTTTGAAATGATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCAT:1 + chr3L 21913464 3' - 297 6616 2 61.64 ACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATACATTGACTGAAAGTTACTGCCTTGATCCGAGTAG:1 - chr4 799169 3' + R1A1-element 5246 1 76.71 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATCTTTATAATCGAGCACCTAACGGCAGTTAATCGTTAA:1 - chr2L 18737969 3' - roo 8739 2 72.73 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATAAAGATGATAATATGAGTGACGAGGGAGCGATAACAATGCGCCACAATCCGTTTTTTGTGTGTGCAATCAATATCTCATTTTTGAATAGTTCCCCATCGTCCTTGATGG:1 - chr2R 21110479 3' + roo 399 1 73.97 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCTCTTGATCGAGTT:2 - chr3L 22038169 3' - diver 22 2 70.55 TCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATATGTATGTAAAACATTTTTTAACGAATAGCTTAAAAAACTTCCAACTGGA:1 + chr3R 11758059 3' - invader4 68 2 68.49 CTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGCAAAAATAGCGCTCTACAAATCAAACTTTTTTGAT:1 - chr3R 22260430 3' - jockey 4725 1 50.00 GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTTTTCTATGAAACACTCTTCACAGTTTCTTGGCACTCATGCTGCTTCTGTTGCCGCTTGTTTTC:1 - chr3L 17934914 3' + HMS-Beagle 193 2 55.48 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCG:1 + chr2L 15917670 3' + roo 320 2 77.40 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAA:1 - chr2R 25083261 3' + pogo 2059 1 60.00 GAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAAAAAACAAATTTTTACAAATTCGTAACCAGCACGCGTTAACAAATTCATTTAATTTGGCCAAAACGAGAAAGGCAGACTTT:1 - chr2R 12099809 3' - 1360 3156 1 56.85 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAACTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATGATAAGTCAAGTGTTTACCCATACCCTGTAGTCCAGTGTTAGTTGGACCAACAGCAG:1 + chrX 14189235 3' - 412 7120 2 59.59 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAGCCAAGTGGGAAATGT:1 - chr3R 14546470 3' + pogo 2051 1 56.16 TGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGA:1 - chr2R 17696051 3' - rover 7036 2 76.71 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTCCATACGCGGAATAATAATTTTCAAAGGATATGCGACACATGCAAGCGTTGTATGCCGAGGA:1 - chrX 7032661 3' - roo 56 2 57.53 GCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAGACGGGCAGATCGATTAATTGATCCTGAACAAGAATATATACACTTTATACAGAATCTACGAGTAATGGTTATAAAAATATACAGAGATAGAT:1 - chrX 15408715 3' - INE-1 514 1 71.23 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCGTACGGACACGT:1 - chr3L 16200691 3' + roo 9053 2 72.60 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTTGCCCCAAAAAGTATGCT:2 - chrX 7845739 3' - hopper 83 1 70.55 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATA:1 - chr3R 8631616 3' + roo 344 2 60.27 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTCTACACCA:1 - chr2R 8258231 3' - jockey 27 1 68.49 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTATAATATTCAG:1 + chr2L 11725057 3' - F-element 55 1 54.79 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAGGCGAGAGAGAGCTCGTGCT:1 + chrX 18534594 3' + P-element 2804 1 28.77 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTCGTAAAAGTTCAGTTGAGTTCAAATCCAACAAGCTGGAAACTATCAAGCTACGTTACAAGTGCACTGCCACCTGTCCAAC:1 + chr2L 17470448 3' + 412 452 2 56.16 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTAAAGTTTGGCGGACTAGATAATCTATA:1 + chr3R 20260942 3' + roo 388 2 71.23 TGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATT:1 - chr2R 12248973 3' - Juan 4090 1 58.90 AATCTTATTATAAAACTTAAATTTCTAATTATTGCTTCTCTTGTTAAGTCCGGAAAAAAAAGAAAAGTTTAATTATTCATCTGACTAAATCTATGCAAAATTCATTCGTCACTACGGTGGATAATATATTGATCATGTTGGGTTAA:1 + chr2L 16223205 3' - Doc2-element 4699 1 86.30 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAATGAAATACATTTTTTGCCGCTTGGCTTTGCTTTGCTTTCCCCGCTGCTCGCTCACATTTTTCTTCACCTGACTTTGC:1 - chr3L 10023945 3' - transib2 34 1 58.27 TTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCGTTCCGACTTATAGTTTTACAACCTCGGGGGTCCGATGGAAGGTCCCTTGTTTTCTATAATTTATGCCGATGGGCAAACAGGAAAA:1 + chr3L 20069206 3' - F-element 231 1 50.37 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTGCGTTTATCCTATGATATTCCATGATTTCTTAAAAGCGTATAGAAAACTTGCCCCTGATAGTCAAATTCTTG:1 - chr4 880281 3' + pogo 2053 1 53.79 GAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGCTACGCCGGCAGCGCTGCTCCTCGACTTT:1 + chr2R 2308850 3' - McClintock 1 2 64.58 GCCCCTTTGTGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAAAGTAAATTGAGTATCAACTGATTTCCAAAAGAAATGTATGTATATATTATATTATTAAATAAAATCTCTGTATGGTAAATACATCAAGTGA:1 - chr3L 14143092 3' - X-element 4671 1 62.33 TTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAAAGAATTTTGCGTAA:1 - chr3R 13323889 3' - F-element 84 1 65.07 ACAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCGTTGTGCAAATATACATATG:1 - chrX 19121885 3' - 412 50 2 50.00 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCTGTTACCAAGTACTAATCAATATAAATGTCCTTACACCCAGTCCGTTTGTCTGCTAG:1 - chrX 10056671 3' - hobo 65 1 58.90 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAA:1 + chrX 19583317 3' + roo 338 2 68.49 CAATTTAACCAACGAATATTTTTTAGCAAAATTTTGATTTTGCTCCGCGACTTAGAATTTTGTCTTTCGTTCGCGTTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTATTTGTTCAGCTTTTTCAAAGCCTCCACATCTAGGCAAT:1 - chr3R 15037670 3' - HMS-Beagle 348 1 73.97 GACTAATAAGAATGTGAAAAAATATCAACAATTATAGAGACTTTGTCTCTGTGAGAGAGTGGCACAAGCGACCAACAAGAAAGTGAAGGCAAGCAACGGTGGGATTACCTTTCAAAATCGGTAAAGAGCGATTTCGCCAGGGACGA:1 - chr2R 5439256 3' - INE-1 282 1 65.75 ATTTTATGAAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCATTTCCCGTTTCATTTCCTGGCCTAATTGCGCATGGCGTCCTAGGCCTTCCACTTCTCCCCGTCTGTGCC:1 + chr2L 17023286 3' - micropia 375 2 54.79 TAATGACTGAAGTATCTGATGTTCTGGCGCAACCCTCGGAAGTAAACAAATACGAGCACCTGAAGGAGATTATTATCAAGCGATTATCGCCGGACAGACAGTTGCAGCGCGCTTTATCAAATTGTTTGTTTCAATCACTTTTGGTG:1 + chr2R 18904708 3' + Chimpo 478 1 78.77 ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTGCAACCATATTTGTGTATTTCGGTTATATTGTACACGCTTCTCATAAAA:1 + chr2R 24807961 3' + I-element 5286 1 63.70 AGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAATCAAATGGCCTCGAGTGTGAGTGTCCATTTCAGTACCTACTCAATTAATGAACTGCTTTAATTATGCTTGAC:1 - chrX 8519836 3' + jockey 4682 1 50.68 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTTTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGGACTAGANTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTAT:1 + chr3L 20168305 3' + roo 356 2 48.63 CGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAG:1 - chr3L 23635041 3' - gypsy6 185 2 55.94 TCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCATGTTCGTTAACAGTGTTACGACGGTAATAATAGAGCATCCCGACTCCGTTTT:1 - 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jockey 4739 1 61.64 TTTATAGTCTGTAGCTCAATTTAATAAAAATCTAATTCTGGACCACAGAAAACAGGCCAAATCTACCCCCCC:1 - chr2R 2119477 3' + transib2 2782 1 65.28 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCCAAGCTTTTGCATATTTCCGCT:1 + chr3R 20345593 3' - blood 7020 2 78.08 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACNTAAAAATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCC:1 + chr3R 10433276 3' - 412 86 2 78.77 TACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATGACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCGGGCCCAAAATCCAGTTAACATATTCGATGAGAAC:1 - chr3R 17805097 3' - BS 83 1 78.77 CACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTCGTTTCAGTGTCGCCCATGGTCTGGATACCGCATCAGCTGGTGGGTATTCCCAT:1 - chr2L 6385789 3' - invader4 2780 2 59.81 TGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTACCATATAAACATAGTAGTTTTGCAATTGCTTAGCCAAGCTTAAATAAACAAATAT:1 - chr2L 5818882 3' - I-element 4889 1 61.64 TCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAGGTCAATTCCAGAGCCAAGGCAAA:1 + chr3R 15047450 3' - F-element 12 1 75.81 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAAGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTC:1 + chr3L 14116785 3' - BS 5038 1 52.82 TCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACAAATACATATGTATGTAAAACATTTTTTAACGAATAGCTTAAAAAACTTCCAACTGGAATCGGGATTAGAATTGGGGTTCTTTAAAGTTAAAAAAAAAATTAACCGAGAGGAAGGACA:1 + chr3R 11758118 3' - invader4 2767 2 76.71 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCCGGCATTCCTACTTTGATATTTTTTTTCCCAGAACTAATCAGAGTTTGTTAATCAAACTTGTGAAG:1 - chr2L 17136081 3' - hobo 56 1 53.79 GTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGA:1 - chr2R 5070916 3' - Tirant 10 4 27.40 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTTTTCGGGTCTGCTGGGGGTTTGTCGAGCTTGAACTTTAACTTATTTTCCCCC:1 + chr3R 11903536 3' - FB 68 1 63.01 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAATAATTC:1 - chr2L 6047860 3' - P-element 84 1 28.08 GCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCATGATGTGGTACAGTTGTGCGCTAGATCCATTAATTTACCTAATCATGATCAGAGTATCTAGCGATGATG:1 - chrX 2098843 3' - blood 7131 2 52.74 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGAAAGTGTTGACTAGCACTGTCCAACATGAAAAAAAA:1 - chrX 16219180 3' - roo 8713 2 52.74 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTT:1 + chr3L 2485981 3' - jockey 4747 1 64.38 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGAATAATACAAAACTACAGTTTTATCATTAAAATGTATAAAACAACATGTCCAACTAAACAGCGGTGAAATTTATTGAAAA:1 + chr3L 12125398 3' - roo 8704 2 56.85 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCCTGGCTACACATTTGATGTAATGATTATTCAAGAAACCAAATTGCTTAGCTATGAAATAGGTACTCAGAAATCAATATATT:1 + chr3R 19629054 3' + Transpac 5191 2 54.11 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATATAATGTGTTCTCTATAATAATTTGTTCTTATGGTTATTCAGTTGGAGTTCTCGCTTGATTTTACCCCTAATTTTGTAT:1 - 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chrX 20330563 3' + P-element 2794 1 21.92 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATTCTGG:1 - chr3R 10708220 3' - Transpac 27 2 60.00 AATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGCAATAAAATGAGAAAAACTTTAAAAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGGGACCGGCTTTAGGGTGTTAGAGTAGGCGTCGTAAAATTTTATTGACAAATCGATATAAATTTACAAAACTA:1 + chr3L 14408127 3' - INE-1 502 1 75.34 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTATGGGCGCATGTTTACAACTGGAATTAGGGTGCAACACAACACATGTACTAGCTGCAATTAGGACACA:1 - chr3R 31031956 3' + hopper2 1557 1 51.37 AGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCATGACTGAATGGGATCAAACAATTCGCTAGTTTACACCTTGGACTCATTTAATTATATTCATTGTACCAGTCT:1 + chr3R 11942117 3' - 17.6 7056 2 50.68 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAATTTCCG:1 - chr3L 17746256 3' + roo 355 2 53.42 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCTTGTTTTGTCTGTATTTTAAAAGAACCAGACACATTCTTACGTTTTGTTTTGTTTGGTTAT:1 - 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chr3R 30295560 3' + gypsy4 6758 2 66.44 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCGTT:1 + chr3R 24734919 3' - jockey 4746 1 73.29 AGGAAGCTTGAGCTTAGCTTTGTGGATTCTGAATTAGGGTCATATTAAATGCAGAGTTATGCATCGGGAATATACTAGACAAGATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:1 + chr2L 16999509 3' + Gypsy12A_LTR 53 1 61.64 CCAAGGTGATCTTTCTTTACACAGTTGATCTATGTCTAAAGGTTGCTACAATGAAACCTAGATTACATAAAATACCGCATTTTTGTCTTAGTTTTGATTATATACCAACCCACGCCTACTACCGACCACATGGC:1 - chr3L 14282484 3' + I-element 5021 1 78.36 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCATGTCTTGAAGCATCATTGGGGATGTGCGTATGATATATATATTTATATAGTTGCGTTAAGTTAATCTTTTCTCTTTCATG:1 - chr3R 11008182 3' + jockey 4925 1 54.79 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAC:1 - chr3R 12115261 3' - 1360 58 1 58.22 GAGTTTGGGGATTGGACATAGATTTAGTATTAACATTAAGAGGTAAGTATTTTTTTGTAAACTTAGGTTTTTGGCAGTAACATGGACTGGTAACATTATCAGTTTCTGGCCTTAAATAACATTTAAATGCCATGTCATTTGATAAC:1 + chrX 11244361 3' - 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INE-1 253 1 57.86 TTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGACACATCACATCGATTCAAAATCTCGTTCTCTGAAACCAATAAAAACATATCGTTAGAAATCGCTAAAT:1 + chr4 909202 3' + 1360 3328 1 69.18 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTTTCTGCAGG:1 + chr2R 10695920 3' + roo 9056 1 71.92 ATGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTCAAATGATGACGCCGGTCGACTACAACTCAACGTCGAGCGTNTGGTCGCAGGACAAGTGGAGGGGCAAGTTCAAGGTGAAATGG:1 - chr3R 25035333 3' - Quasimodo 321 2 57.64 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCGGATAGAAGGAAAAGCCAG:1 + chrX 18534575 3' + P-element 2791 1 16.43 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATGTATGAACATGCATATTATGCTAAATTAATGCGGCTGTGTGTGTGAATGCATGACTATTCCCGATTTTCCGGGAAAAGCAGG:1 - chr3L 22435080 3' - opus 148 4 56.55 ATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAACTGCAAATTATTAGTACAAATATTGGCAAAACTGTGCAAATATGG:1 + chr2R 20706849 3' - I-element 74 1 66.44 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCTGTTAATTAGATTTATTGTTGAACAAGAGCGACGCGGAATCACTGGATACTCTTCCACGGCGGGTGCGTTAGTTAATTAAGTGCCAACGCTTGGATTGTTTAGCAAT:1 + chr2R 8087010 3' + 1360 3380 2 78.08 GCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATATGAAAATCGGAAAAAATGTACGGAATCCGCACTACGGATGCCC:1 - chr2R 14719344 3' - roo 169 2 70.55 ACCACAGATAGGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGTATTTACAGGGAGGTTAAAGACATATAACACTGCGTAAAAAGAGTCAAATGTAGATGAATATCATGAAACTGAAAAAA:1 - chr2L 18229603 3' + roo 217 2 53.42 ATTTACATAAGATATGAACGGCGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAA:1 - chrX 8208297 3' - roo 48 2 55.48 TATGTTTGAAGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGGGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGCCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTTTTATGTTTAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 17467142 3' + Tc3 1399 1 76.71 AGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCNTTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGCTGAGTGTAGTCCGAATGGCATCACTTTCCANTGGAACAATCCCTTTCCTGGCACCGTAAACGCCGTATACTGCCG:1 - chr3L 25232688 3' + accord2 207 1 81.51 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATTGTACATGCAC:1 + chr2L 19940159 3' - mdg1 7056 2 73.97 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGGATATCTCCTTTATACCTTGATTCACTCAAGTA:2 - chr3R 24011001 3' - roo 88 2 79.45 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTGGAGCATTACTCATTCTCATTTCC:1 + chr2L 3632189 3' - P-element 97 1 19.18 GTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTGTGGGCGCCACATATATAAGCTAGAAAGTTTAGAGTACTTTCAGTATCCAGTATCTGATAGTCGACTAAAACATGCTTTCTTGTTTTATTGTAAT:1 - chr3L 17860588 3' - Chimpo 41 1 64.14 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAATTTAATAGATTTTGTTTTCTTAGACAGCGATTCTACAGCGACTTCATCTTCCAACTCACCATCAGATCCCCGCCC:1 - chrX 13152702 3' - pogo 41 1 58.90 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCCCATAAGCAGAGACCCCGAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGAATGAGTGTGTGAG:1 + chr2R 10541775 3' + P-element 2859 1 64.58 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTAATTTCGTATAGGACAATCT:1 + chrX 15540090 3' + roo 9038 1 60.96 AATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCAGTACAATAAATCGTATAGTATCCAAGTTAGCAGTTTTTCAACAACACGTAGTCGAGGAAAAAAGGGAAAAGTTGCTGGAAAACTGCGAGACCA:1 - chr2L 1850259 3' - Circe 7021 1 55.48 CATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAGGACACTAGAACCAATCGGCAGTGAGCTGTTGCTGTTCCTCTTCGCTGACTGCTC:1 - chr3L 5697391 3' + 1360 423 1 68.49 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTAGAAAAGTGTTCTTTTAAAATCATCTACATTGATTGAAATTCGTAGCATACTTTCTGGGGCAACATTTACTTACACGTCTCCGTTTATTTAGTCAA:1 - chr3L 8936843 3' - BS 5021 1 63.01 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTTTTCGGCTAGGCC:1 - chrX 16589145 3' + pogo 2059 1 54.35 GTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCTATTCTTATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCTTAGCAATATGATAATTCGGTGTCCTCTAATGCTGGTATTTATTCTATATTT:1 + chr2L 9445800 3' - 1360 3201 1 73.29 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTTTTCGCCGGAGTTTTGCCTTTTTGTCGATGCCTATGGCTTCTGTGGCAAATTATTTTGCTGAATTGCACAAAGGTTTCTAGCACTGAATATATTTCACAGTTCTT:1 + chrX 6615633 3' - roo 14 2 74.66 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAGTTTAAATAACCATATCAATCTGCAGATCTATGCTGCAATTATTTGAAGTTG:1 - chr2L 13292893 3' + copia 247 1 56.16 CTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGA:1 + chr3L 23747152 3' + INE-1 89 1 60.27 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCG:1 - chr3R 23104488 3' - jockey 78 1 64.34 GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGG:1 + chr3R 19725411 3' - hobo 58 1 78.64 GACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCGATAGTATGACCATA:1 + chr3R 16349293 3' + P-element 2810 1 32.88 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAAAGTTCACAGTACGCATACAAGGTAGAAATGAAAGTGTTTTTATTTTAAACGCCAACGACGGAAGGCAGTCTGCCTG:1 - chr3R 14401822 3' - Juan 4069 1 75.34 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGAAAATAATTTGCGTAAATTTAGAAACTGGCGCCAGGAAA:1 + chr3R 17060065 3' - jockey 4760 1 76.55 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAGAAATAATGTTGATGCAAT:1 + chr3R 31032076 3' - hopper 53 1 57.53 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCTTGCACTCCATCACTATGCGGTCCAGTTAACCGCTTGACAT:1 - chr3L 5958601 3' + 412 7499 2 52.05 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTTCGCCTGTTATAATTAGGAAAAAAGCATATCTTACAAATTATTTGTCGGTTTCGCGCTATACAGATTTTAGGCAA:1 + chr4 549218 3' + flea 5000 2 76.71 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCGATAGTATGACCATATCGGTTGTTTTCCAATTTGAAAAC:1 + chr3R 16349317 3' + P-element 2836 1 50.00 AACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAAAACTGGCAC:1 + chr2L 23034100 3' + FB 404 1 56.16 AAAATTGCGTTTAATTTAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATGCTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAAT:1 + chr3L 16973448 3' - S-element 77 1 71.23 GAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGCCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCA:1 + chr2R 4601626 3' - HMS-Beagle2 6963 2 73.29 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGGTTTATTGCTAGTCCAAGCTTTTGCATATTTCC:1 + chr3R 20345590 3' - blood 7022 2 76.55 AGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCAGATACATTTTATCTGCCATATAAAACGT:1 - chr3L 8754692 3' - mdg3 5256 1 80.82 AATAAATAATAATAATAATCAAAAAACCTTGGGGATAGAACATCAAAACGACCTTATTGGATATGAGGAACCCAAGTTTTCTGTTTGTTTTATATAAAACATATATGTCGCGTTTTGGTGTATTTTTTGGCGCCTTGGAGACGGTA:1 + chr3R 17088270 3' + flea 5006 2 56.16 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTCGCCCTCTGTCGCGTTTTTTGAGTTAACCCCCTGAAATTGAAGTTTACTTTTGATTGACGTCGGCTTGTTATGCGCTAAGCCAGAAATGCTAGCATGTGTG:1 + chrX 18767947 3' - hobo 20 1 63.70 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTATGTCTATAAAATGTAGCAAAGATAAATGAAATGTGTAAAGGATTTCATTTAAAAATTGAATACAAGCAAATTGAATACAACAAGCAAAGATAACTAT:1 - chr3R 6399306 3' + pogo 2087 1 76.71 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGTGAGTAAATTGTTCATCTCGGTTCATTTT:2 + chr2L 7810706 3' + P-element 2795 1 21.23 AGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACCTAATTCTTTTCCGCCACTTTGTTGACACCGGCATAGTCAATGGGGAATTCCTTTCCGCTGATGCTGATTGC:1 - chr3R 6602947 3' + gypsy 7399 2 50.00 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTATTAATG:2 - chr2L 4631112 3' - roo 37 2 56.85 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTTTTCGTTCCGA:1 - chr3R 23579257 3' + roo 9041 1 65.75 CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTG:2 - chr3R 17944059 3' + P-element 2781 1 13.01 GTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCTAGC:1 + chr3R 5972371 3' - Doc 315 1 60.96 GGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACC:1 + chr3R 30618751 3' - X-element 73 1 58.90 AATAAAAAAAAAAATAAAAAAAAACTAAGTAAAAACTCAATAATCAAAGCCAATGGTTGGCCATAAGATTGAGAAAAGGGGGTCTAATTACGACGGCTGCCAGCCAGG:1 - chr2R 13678015 3' + BS 5102 4 62.96 TTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACATTCGATTTTTAAATTGGCTACAATCATCTCTATCTGCTCTACTCACTATTTAAAGCGCAAGCCACAAACAAATCGCTATCAAAATGGAAGTAATTCGTCCGATAAAATGACGAAGAAG:1 - chrX 19502029 3' - FB 27 1 70.55 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAGGCCAATTCCAGAGCCAAGGCAAAC:1 + chr3R 15047451 3' - F-element 33 1 63.70 TGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTNANGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTA:1 + chr2R 16185118 3' - 17.6 61 1 65.75 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAGCTTTGTTTCCATGAACTCCACCGAACAAACAGCTGAGCTGTGCTGAGAGG:1 - chrX 17726267 3' - pogo 42 1 59.17 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATATATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTTTTCGTTCCGAATGGGA:1 - chr3R 23579251 3' + roo 9047 1 69.86 AGAATTGATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCC:1 - chr3R 7041987 3' + Stalker2 333 2 61.64 AACAAGGCACCCTTTATCTTTGCTTACATAATGCTTTGTCCGCCGCTTCACTTGTCAGTGAACTCTTAACTCCTTATCCGATACCCGATATGGGTATCCGATACCCGAATTCGGCCATCAACCAACGCAT:1 + chrX 19820404 3' + 3S18 5796 2 42.31 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTTTTGGGATACACCTGCATGG:1 + chr3R 23416001 3' - jockey 4814 1 54.11 GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAA:1 + chr3R 15047391 3' - F-element 93 1 74.66 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAG:1 - chr3R 25692744 3' - BS 5043 1 58.68 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAAGGTNAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATTAACAAC:1 - chr3R 8381680 3' - Tirant 8142 2 59.59 CAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTTGCCTTTTCTAGTCCTGAAATTTTCAACGAGCAA:1 + chr3R 12941847 3' + hobo 2870 1 71.32 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTTTGGCGTTTTTC:1 + chr3R 24011095 3' + roo 9031 1 56.16 GACGCTATGTTATACCCAATCATCCATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACAACCCTACCTTCTGTCTGTTATGTACTTTTAACTATTTAAACTTCTCGACCCTCCCTCGTTCTTGTT:1 - chr2R 14591806 3' - Stalker 6890 4 71.54 ACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACACATAAGCTTGGCATTTATATTCCACATTTTACTATAATTAATGGATGCGTATTAACGATAGTACCACGCAGGGTAGTCATTGAGGATTATTTTCGTA:1 - chrX 21230021 3' - transib2 424 1 68.97 TTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCA:1 - chr3L 8249365 3' + HMS-Beagle 6985 2 58.22 TATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCA:1 - chr2R 12248975 3' - Juan 4092 1 60.27 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTATACC:1 + chr3R 9551026 3' + P-element 2859 1 66.44 AGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGT:1 - chrX 10284816 3' + pogo 2032 1 67.63 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTATGTACTCCTCCTTGGGGCACTGTGACCA:1 - chrX 12365327 3' - hobo 28 1 68.75 ACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGATGATACCGATCTCGCCGCCGGCGTTGCCACCTGACTCGAAATGGGGCAGGCCCATTGATTT:1 - chr2R 12401217 3' + Quasimodo 379 2 58.22 ACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAA:1 - chrX 6417756 3' - Quasimodo 40 2 49.23 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGAGAAATGATATCGCAGGGATATCGGTAGGAGGTTCTCCGCAATTCT:1 + chrX 17495830 3' + Burdock 218 2 58.90 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAGTTTAAATAACCATATCAATCTGCAGATCTATGCTGCAATTATTTG:1 - chr2L 13292899 3' + copia 241 1 52.05 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCATGAAGTCATCTGGCTGAAATTAAATGCC:1 - chr3R 20983788 3' + pogo 2045 1 59.59 ATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTCTTACTCACACAAGCTCTCAGCGTTAGCGAGCGGACAGATGGCATAGAATTGCGTTTCTGTATGAAGATAAACGATAT:1 - chr3L 18838235 3' + 1360 3185 1 73.97 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATGTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAGAATGCAACTTCCTGCTATTTTGTGTGGAACGTAAGCATCTTCTGCCAAAACAAATGCATA:1 - chrX 20024479 3' - 412 7079 2 63.70 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAGTTTAGGAAATCACCCATATGATTTTCTAAAT:1 + chr2L 8553446 3' + pogo 2074 1 66.44 ATGCTCAGAAAAAGCACAAAAGTCTAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCAACGAAACTGTTAATTACCTTAATCCGCTTGGGGAGGATTGATGACTACTGGCAAATCGGAAATGCAA:1 + chr2L 21057969 3' + Porto1 4344 1 63.01 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAA:1 + chr3L 16920250 3' - roo 89 2 79.45 ACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTATTTCTACGATACAAATTAAAAACTGCACACCCTTTCCGCTAAT:1 + chr3R 8971298 3' - Quasimodo 242 2 68.84 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGCCCT:1 + chr2R 22112718 3' + 412 415 2 73.10 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTCCCTATTGTCAAGAGGGAAGCGTTTTCTTGCTTAGAATCATAGCACTTCC:1 + chr2L 22690188 3' + copia 218 2 68.49 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCATATTTAATGATGAAGAAAGCAGCATGAACTTGACTTTGCTGCATACTT:1 + chr3R 23415982 3' - jockey 4833 1 67.12 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTT:1 + chr3R 24011084 3' + roo 356 2 54.79 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGGCCACCTTTGGC:1 - chr2R 2016826 3' - 1360 66 1 63.19 CATAACCAGAAGCAAACATAAACTCACACACACACACGCACACAAATACACACACACAGCAAGGGCTGGCAACAACAAGTGGAAAACTGTCATTATATTTGAGTTATTGATGGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 22753848 3' - Transib5 2644 1 45.53 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGGAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAA:1 - chrX 19163277 3' - Burdock 78 2 71.23 ATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGTCAAACGGGGATTC:1 + chr3R 15137393 3' + roo 375 1 60.96 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATT:1 + chr2L 3911910 3' - roo 85 2 79.45 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTGTTACTATTGACTCGTTTTTAACTATTTTTTTTTTTGTAAATCCTTTTTTTTTTAGTTAAAGCCCAAATGGCGTTGAGGCTCCGCCGCGTTGGACCTGC:1 - chr2R 13491853 3' - FB 16 1 61.43 GTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAACAGGAGGTACTAAGGCACAGGCTTGTC:1 + chr2R 16185160 3' - 17.6 10 2 78.10 TTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAATCCTTGTTCCCTGCGCT:1 - chr3L 8249324 3' + HMS-Beagle 7029 2 74.83 AAATAGAATTTGCTTGCATGTTAATGTTAAATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGTTTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGC:1 + chrX 23362226 3' - 1360 3261 1 76.03 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGAGGATCACTACAGCGAGGAGAGATCCT:1 + chr2L 23197591 3' - Transpac 4945 2 66.67 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATTCCAATTAATATTCGATACAATGTCAACTTCTACGCATTGTTTGTCTTTT:1 - chr3L 6994441 3' + copia 184 2 69.18 AACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGGTTGGTTGACGGAGAAATTTGGAACGGCGACAATTGTCGCCG:1 - chr2R 6085899 3' - FB 76 1 71.63 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATAACAAATCCATCTGAGTTTCAAGACTTTTTATTTTAGCCAAGTTTCGCATATATTTGTTACATTTCATGTAGAAAAGATTCGATTTTA:1 + chr2R 15698191 3' + opus 7471 2 63.70 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAANTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTGGTTTTCTTTCAACATAGA:1 - chr2L 11476245 3' + pogo 2056 1 50.00 AGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACATATATATGTATACATATATATATATATATATCCCACGCATCACGATATGCTGCGCATGGCCTCGCTGGATCTGACACCGAATAC:1 - chrX 10604567 3' - invader6 13 2 53.39 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAATATTAATGGGAACTAAATAATGGCTATACTATATTACACACTATATTGCACTTTTCCACATCC:1 + chrX 5721932 3' + pogo 2047 1 57.53 CTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCAC:1 - chr3R 13898226 3' - 3S18 5838 2 70.00 CTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTAC:1 - chr2L 22340121 3' - Doc 89 1 73.29 GTTTGCCAACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAATTCTCAGTGTGATAGAAGGAGTCAGAAGTGCCCCAAAGGAGGGGAAGAAAAGGTTGTTCTCATATTTTCGTCTTATTTTCTTGTTTTATGAATTGAAGTATTCAAGC:1 + chr3L 22755676 3' + FB 213 1 78.77 TTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGT:2 - chr2L 7774955 3' - I-element 67 1 65.75 ATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGTAGTGGTCACTTTGTGGTATTTCCCATCCAAAGT:1 + chr3L 958445 3' - pogo 2037 1 76.55 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTCTCTCGGCGACCAATATATCATGGACACACACGGGAACACAC:1 - chr3R 7041944 3' + Stalker2 376 2 66.44 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAATTGAAAAAACTGTGAAATGTAGATGAAATATTTTTATAAATTCTATTTGACAGGTAGGGGTAATCAAATTAACACCTTGCCTTCTTCACCTGCTTAACTTCA:1 - chr2L 20508247 3' + pogo 2085 1 73.29 GAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAACTCTTGTTGTCTTATTATGAATATAAAGAAACATTATTTTGTTCTTACTAAA:1 - chr2R 913719 3' + micropia 10 2 64.38 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAAC:1 + chr2L 8553410 3' + pogo 2038 1 63.70 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAAC:1 + chr3L 21913460 3' - 297 39 2 58.90 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTATACCCAGGACTCGCACAAATACAAAGGCATACTGGGCCCAAACATATTCTTCCA:1 - chr2L 20550958 3' - 412 7117 2 63.70 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTTGGGAGTTTAGTTGGTTAATATCAAATACCAGTCACAAAACGTCGCACA:1 + chr3L 21292625 3' + 412 452 2 55.48 ACCAAATGATATTATAAAAAAAGATTACACATTAAAACTTAAAATCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTAGATAAGAATATGATGCGATATGATATGAAACAAGAGTACAATGTTGCCAGATCGTTGGCAATTCGATATTCAA:1 - chr2L 21149190 3' + HB 1541 1 68.49 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATGGGATCACCAATGCTGACAAGGGCATTTTGTGAGCTATAAAAATAAATAAATAAATATTAAGCGTAGAAAAATAT:1 - chr3R 7420411 3' - 412 43 2 54.11 TACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGATGCAGGCAGTTGCAGTTGGATTTGCTGGCTAGAATGGTGACCGATCAACAGGC:1 + chr2L 17505073 3' - roo 9046 1 61.03 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTTATAAATGAAGTGCTAAATCTTGATTAACAATGACCAAACCAGATCTTAAAATGTGCTAACCACTGAGCAAGCTAATAACCGAAATGAGT:1 - chr3R 13613052 3' - copia 29 2 75.34 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTCTGTCGGGTATCGCATGTTGCCAAATGTATCTTCGCATCTCGCCGTGCCCGCGACAGCGCATCTTAATCCTTCATCATCATCATCGCGGCCCTCGTAATCA:1 + chr2R 6514371 3' - roo 8681 2 71.03 TGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTAGGAGCAGAACTGCTCCTACTCTGGTTACCCAATTTACGTTAAATGTCACTAACAATGTTTGATGACATTCAGATAGGTTAAA:1 + chr2R 5542353 3' + Quasimodo 7335 2 63.01 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCATTTATATTGTGTAATCACTTAATG:1 - chr3L 22041046 3' - roo 42 2 56.85 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACCACTGGTGGACGCCGAGGGTTTTCCGCGCAACGACATCGACGTTTACCAGGTGCG:1 - chr3R 13676048 3' - P-element 17 1 73.79 GGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCTACAAATAATTAAATCA:1 - chr3L 18947236 3' - BS 4699 1 54.89 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTTTCTCGGAAATATTCAATAATTCC:1 - chr2L 6047859 3' - P-element 22 1 47.06 AGGACCACCTTTTTTCCTCTCCGGCAGCACCGATTTGTCACGAAGATCAGGACAGCAATCATCATTAGTATTGTTGCGCCGATCCCTTAATTGGGCGATCAGCGAAAGATAAATCGGCGAAATTAATACGAGCAACGTGCATTGGA:1 - chrX 563592 3' - HMS-Beagle2 6725 1 56.16 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACACTTATTTTCCACGCTTTTTTTTGCTTAGCCTAAAGTTAAGCATTTAAAGTTTTCCACAAATGATATAATGGCGAGCTGTGGGGGCGGTG:1 + chr2L 16554724 3' + blood 7354 2 57.53 AGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAATAATTAAAAATATAAATATTAACATTTAACGGCAATAGTTGAACAATCCATTGTCATCGTATC:1 - chr2L 9738015 3' - roo 8932 2 56.85 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCATAAATGAACATGTATTTAAGTTTATGCAATGGAACTAGTCAAATAAAAATTAGAAACATTTTAAATGTAACCTTAATGTGTAAA:1 - chr2R 21619305 3' + blood 7352 2 59.59 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTCAACGCGGAATCCC:1 - chr2L 13697580 3' - F-element 45 1 67.67 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGCGCATAAGAAATAGGCCGCTTTCAACTGATGCGGAAATAACGCG:1 - chr3L 8157974 3' - flea 4776 2 68.18 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGACTAATGGTATTCAAACGAAATGTTCAGCAAATTGTTGCTCAGTTGTCTGTCGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 19583222 3' - roo 8695 2 56.30 GCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAG:1 - chrX 17495701 3' - Burdock 51 2 61.87 GTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAA:1 + chr2R 16185133 3' - 17.6 46 1 56.85 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTTTGGCAGGCATTTGGTGTATAATTGGTGATAACCGTCGCGGGAAAAA:1 - chr3R 15137223 3' - roo 8683 2 68.49 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTCGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCAC:1 - chr3L 17757861 3' - Tirant 20 2 38.36 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTATACCAACGAAACTCTTGTTG:1 + chr3R 9551042 3' + P-element 2875 1 77.40 CAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCGTTTTATAAATTT:1 + chr3L 18968735 3' + hopper2 1563 1 52.45 GCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAATTGCATCATCCTGCAGTTTCCCACTCTGGCAAT:1 - chr3L 17697673 3' - roo 169 2 72.50 AAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTAAATTTACTAATTTGTAAATAATTATGATAGCTTGTTTTTGGGATAACGATAAT:1 - chr2R 8051691 3' + pogo 191 1 63.01 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATGTATACGATTTAAAAGAATGTGAAAACAAATCGTACGCCTACGAAACTAATAATTGGGGCGAGAGATGGTAGTGGTGGGTTGAGGGATG:1 + chrX 16589296 3' - pogo 19 1 70.00 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTT:1 - chr3R 25692734 3' - BS 5012 1 58.00 TTTTTTTTTTTAACTTTTTGCCTGGGGGATGGGGTAAGCAACCGAAAAATCTTTTAAACTAATGATGGGAATTTGAAAAA:1 + chr2L 10339266 3' - Doc2-element 4768 1 85.00 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAGA:1 + chr3R 6399474 3' - pogo 44 1 55.48 ACGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAAATAGGAGTCAAAACGCAATCGGTCATATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCAC:1 + chrX 21907815 3' - gypsy11 452 2 64.54 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTA:2 + chr3L 21913456 3' - 297 43 2 56.16 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTAGTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCACTGTTTTTGGTTTTGAT:1 - chr2R 22596051 3' - Doc 31 1 59.59 GTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCGTTAGCAACAGCAGGTCTTATACCCTGCAATGGGATCCATTTCGATTTCGAAAAATGCTGTAAATTATATATGTTGTAAATTAGCCCAAACTATTCAATTTTCCTCA:1 - chr3L 10813152 3' + micropia 27 2 70.55 GCCTATTGACCCTGATCAAGAATTTATATACTTTATATGGACGAAAACGCTCCTTCAACTTGTTATATGCTTTTCAACCCTTTTATTTTGTTAATTAAAAAAAA:1 - chr2R 14766335 3' - INE-1 87 1 75.00 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGAAGAAAACTG:1 - chr2L 21777760 3' + pogo 2056 1 58.45 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGA:1 - chr2L 19698097 3' + roo 8991 2 72.60 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTTGCTTTGC:1 - chr3R 24093488 3' - jockey 59 1 52.05 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGC:1 - chr3R 23415923 3' + jockey 4912 1 70.55 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGACTAAACATTTTGACTATTCTTTTGGTGTAGGAGATTTTTGTAA:1 - chr3L 17602541 3' - Doc 83 1 69.86 TCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTCGAGTATCTGTATCTGAGTGTGTGTTTCTCTGGCTGTCTGAAAGGAGTTGAATGCAACGCGGTGGCCACATCACATCA:1 + chr3R 16893760 3' - roo 8820 2 53.42 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAA:1 + chr3R 20345517 3' - blood 7096 2 73.97 CCGAAGATATTTCCAAATAAAACCNGTTTATTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGACGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATATTTTCCAGTT:1 - chr3R 8631606 3' + roo 354 2 51.37 ATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACA:1 - chr3L 27356049 3' + Tc3 1668 1 67.12 CAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAAATTAAAAATTATAAACAATTATATTATAGAAATCCAGCGGATT:1 + chr2L 9062339 3' + Juan 4128 1 76.71 AGTATCGTAAAATAAACGAACATTGTAAGAA:1 + chr2R 3161995 3' + diver2 4841 2 61.29 TTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTATAATATAGAATTGTAGATGTGTATGTCACTTTTTGTCAGTTTAGCTGATAGACACAAATCACTT:1 - chr3L 5631157 3' - F-element 4316 1 67.81 GGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATG:1 + chr3R 1446143 3' + 1360 3376 1 27.40 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAAGTATATAATTACAAGTGCAAAACAACAAATTTTGCTTATATGCATTTTCACATTTCGTAAATAACAACACAATTATGAATGAGGAGAGCCTTTAAATTCCAACCTCAAGCCAATT:1 + chr2R 7769898 3' + Transpac 5226 2 80.14 CGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTTAGCTGGTCGTTGACTGGCGTGATTCCTTTCGACCGTGTTTACACAAGGTTGCCGTCCCCATCTTCGG:1 - chr3R 17767084 3' - HMS-Beagle2 7046 2 58.65 GAATATTTCCAATAGTTTAGGAATAATAATGTATTTTTGTAAAAATCTATTTATTAATCAATCTAAGCATCTAATAACGTTGAATAAAAGAAAGGGAAACAAAAATAATATTAAAGAATAGCGTTTCTTGTATATATGGATAACTT:1 - chr2R 14528116 3' - hopper 45 1 50.68 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACTAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATAGGTAGTGCAGTCGGTTTCGGTTGTTGCTTATCTATTTATTTT:1 + chrX 2104815 3' + roo 9039 1 59.72 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTGGAGA:1 + chrX 14825338 3' + P-element 2799 1 25.34 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTTCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACG:1 - chrX 10284801 3' + pogo 2040 1 62.33 TAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATGCTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAAT:1 + chr3L 16973478 3' + S-element 1669 1 53.42 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCTCTTGATC:1 - chr3L 22038174 3' - diver 5915 2 67.12 ACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGTAAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAACAAACCCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCGAATGTGAACAAATGAGCGTAAATA:1 + chrX 11906362 3' - INE-1 31 1 45.21 ATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTCATTTTTACCTTTAAAGTCAAAAATTCACTTATTTCACAGTGTGTAAACATTCTTTTTATTGATATCATTAGAAATCCAACCAAAAAAAGAATCTGAAAGCGTTTTGCAC:1 - chr3L 11352854 3' + S-element 1634 2 61.64 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCCAAGTGTCGATAGCACAAAAAAAAAAATGAAATGTGGTTGC:1 - chrX 710323 3' - Burdock 6180 2 50.68 TTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCATTCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGATAATGCATGTT:1 + chr4 829132 3' + INE-1 153 1 69.18 CCCATTTTTTTTTTTGTGTTTTGGCCCGGTTTTAAGCTGAGCCAGCGAAGTAGCTACTGAGCAAGCCATTCAAGCGGGCATTAGACATGCTTAGGAATGCAATGGAGCATGGGCAGCTT:1 - chr3R 31271518 3' + hopper 140 1 52.94 TAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGCAGGCAAATAATAACGTCGTCATGTATAAATTGCCTGCCACGCC:1 - chrX 7848176 3' + flea 220 2 64.00 AAAGTCATTTTTGAAATTTATTGTGACATTATGTACATAGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTATATTTAAATAATAATACTTTGGCTGTCAGCCTAAAAATAACATTTTCTTTAATTTGAGCCAGAGAAAGGCGAAGACTTTA:1 + chr3L 15780252 3' - 1360 373 1 55.48 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGG:1 + chr3R 16349273 3' + P-element 2790 1 19.18 CAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATT:1 + chrX 22574691 3' - 17.6 7046 2 45.89 CACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCT:1 + chr3L 10814606 3' - micropia 5097 4 56.16 ACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACAAGCCATAATTGTAACAGTTTTGTGGTCAGCTATAATCCCCATTTAAGGTAATACAAGCAGATTAAATATAGATCTAGAGTTTCGAATCAGATGGTCG:1 + chr3R 20308291 3' - invader4 20 2 69.44 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAA:1 - chrX 14867255 3' - roo 84 2 76.71 CGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGGAGCAACAGCCACA:1 - chr3R 8065199 3' - 297 45 2 55.48 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAA:1 - chr2R 16072903 3' - opus 160 4 54.79 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAG:1 + chr3R 17944081 3' - P-element 92 1 22.60 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTA:1 + chr2L 16553595 3' - BS 5076 1 73.97 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATCACCGATCGGAGCAGATGTTTTCTGACTAAAGTCAG:1 + chrX 17477689 3' + Quasimodo 7300 2 73.38 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTATACAAAACCAACTTACCAAGGAAAACATACCAAAAATATTCTTCTTGCAGTCCACACCGAATGCCAATGCACTGTTCCAATTTAGCGCGACCTCCACAGC:1 + chrX 16607961 3' - P-element 19 1 72.41 TGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCATCTGATAAGCCAAGATAGGCTGACCCACCTAATCTGTCTGCTCTTCGCTCTTGTTTATGAATA:1 - chr3R 31461373 3' + jockey 4723 1 56.16 ATATATATATATATATAAGAGAGATTACTTGTCATTTGTCAGGTTCTTAACTATATAATATTTGGTATGAGTTGATCGCTGTCATCCTCCTCGTCGTCCTCGTCCTCATCCTCCTCCTCAATCAGACTTTCACCGTGGCCTCGAAT:1 + chr2L 9830748 3' - blood 182 2 77.40 AAGGTTTTTTTTTTGTTTTACCAATTATTTTATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTCGATTGAAAATCACAACACTTAATCTAAGCTGTCAATGTGGATGCAACACCAGCGGTAAGAACTACAAAACTTGGCCAACAG:1 - chr3L 7508435 3' + Tc1 1473 1 51.03 CTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGA:1 + chr3R 17944107 3' - P-element 66 1 40.41 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGAAATATACACTTACTACAAAAACATGCATATGTGTGTATATGATTAGGAAGGACAAAACTCTTAACG:1 - chr2L 4268928 3' - hobo 53 1 56.16 AAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGATCAGACAAATGGAACAGAACGAATACTGATTTCAAAT:1 + chr3L 18074747 3' - Transpac 166 2 79.45 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTAAGCACCTACTTAGTAAGTACGCTTATCCCCCATTAGTTTTTCTATGGTGTCAGCACTGAGATCGTGTTGATCTGCCT:1 - chr3R 14800857 3' - pogo 32 1 57.14 TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTGGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATT:1 - chr3R 23415917 3' + jockey 4926 1 63.04 CTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCAGAACAATGATGAAACCCACTATGATGGGCATAACGCCAGGCTCGAAACCCACTGCCATGTATAGCTGGG:1 + chr2R 16997463 3' + R1A1-element 4931 1 50.70 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACGTGCGCTTGTATAATCCAGAATTGGTATAGCCAAGTGGGAAATGTTTGAACGCTTTTGCATCAAGTCAGCTCGA:1 - chr3R 14546441 3' + pogo 2080 1 71.23 GATCCTGATCAAGAATATACATATATACTTTTCATGGTCGGAAACACTTCTAGTCTAGTATACCCTTTTACTCTACTAGTAACGGGTGTAAAAAGGTAATAAACAATTGCATAATTCTTTCTGAAATATATGTGTATTAAAAAAGG:1 + chr3R 18215272 3' - INE-1 80 1 89.73 ATCTCGCTCCTCATCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATACATTGTCATTTTTGTAGCTGTTCTATGAACACTCCATTCTCATG:1 + chr4 545072 3' + R1A1-element 5125 1 62.90 AGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAAGGATGGACTATTTGCCGAAAGACAGCCCAAGCTGTATGCGCAGGCGGTAAAGGAGAAGGGGGCCATGTACGGGCT:1 - chr3R 24661013 3' + jockey 4695 1 60.27 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACGAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTTTATAATTATCATGTAATTTA:1 + chr2L 18738057 3' + roo 9015 2 56.16 CTGTGTGTGTGTGTGTGTACATCTCTCTGATTCCTTTTTGTTGATTTTTATGTTAGCATACTCTTTTTTCCTCCTGGTCAGTATGTGTATGAAAAACAAGGCTCCCATATTTTTGTTGTTTTTCCTGCAGAGGTGATGTAATGGGT:1 - chr3R 11096911 3' - accord 7027 2 71.23 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAAAACTAAA:1 - chrX 10284788 3' + pogo 2069 1 59.23 AATTCGAATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAAGTCGATGAACTCGACTATAGCATCTTTCCCGACTGACTTGCACTATTTTTAGTTAAGTGCAACATTTGCCCATGTCTGCGGCAGGGCCAAAAATTGGTCAGTCCGTC:1 - chr2R 6735842 3' + INE-1 529 1 58.22 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATATTAAACAGATACAAAAGTAAAATTATCTGGTATCTGGCCCAGTGTGCACTGGCACCCTATC:1 - chr4 906098 3' + opus 440 2 60.27 CACAACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAAAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAATAAGCGAATCTGATGCTCCCTTTAGTCATACGAGCAA:1 + chr2R 6049033 3' - copia 5013 2 71.92 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACATGTCTGGGCCACAA:1 + chr2L 2609024 3' + I-element 5317 1 58.22 GCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAATTTCCCTTTTTATCTCTGACCGCAGATGCAACAGGATGTGGAAATATTGCTGCGGGC:1 - chrX 14991533 3' - Doc 219 1 62.33 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACATTTGAATATATATGTACTTGATTAGATATAATTGGCTGTCAGTATGTCTCTTGATCGCTCCACTCAATCGCACCAATACTCGGATTCGG:1 + chr2R 23596106 3' + blood 7362 2 66.43 TATACTTCGGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTATAAAACAATATATTTCCTTTCAGACTCCTTGAGGACGAAGTACGTCGCAAGATGTCGGAGCG:1 - chr3L 12137740 3' + Chouto 56 1 57.53 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTG:1 + chr3R 20260899 3' + roo 9008 2 62.33 GTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGC:1 - chr3R 12789528 3' - G2 2798 1 57.46 ACAATGCAATAACAATAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGGATAAATTA:1 + chr3R 7477488 3' - BS 5055 1 55.48 AGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGTTAAAAGGAAGATATGCCATCGTCTGGCGAAAAACTCCACCCAAGATGATGATGGGC:1 + chr3L 10404117 3' + rooA 7465 2 59.59 AAATCAAAAGAAGAAATTGAGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGTGCAGTTCCGCCTCAAGTTTGGTCTGGTGCATCGTCAACGAGCTGACCTGCCGCTTGAGCACCTGCATCCGCGTGG:1 - chrX 9150159 3' + 412 420 2 55.07 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGCTG:1 - chr3R 17944027 3' + P-element 2862 1 52.58 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGCATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACG:1 + chr3L 27391399 3' + 1360 3346 1 50.36 GCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACT:1 - chr3R 23415890 3' + jockey 4964 1 60.63 GCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAACGTTGAAAAGAGCAATTAG:1 + chr2R 3104455 3' + Gypsy6A_LTR 338 1 65.67 CAATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATA:1 - chrX 7508112 3' + roo 8994 2 70.55 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTAACAGTTAATGAGGCTGACAAACGCACATACACTCA:1 + chr2R 15270211 3' + roo 9011 2 71.93 ACCACAAAACAGATCAAATACGGATCAGTTTTGCTGATAAGCATAGATTTTATTGCCCGCTTCAGCGGCTTTGCGCGGGGTGAGGGGAATAATAATGCGGCTGTGGCCGATGGGAAGCTCT:1 + chr3R 29812022 3' - BS 272 1 74.38 ATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGC:1 + chr2L 21400807 3' + Doc3-element 4666 1 48.63 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTTGAGGGCCCACAAATTGAGAACTTCCATAGTGGAAGGAATTACTTTTTTTTT:1 + chr2R 21229118 3' - jockey 4699 1 63.89 CGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCAGTTGCTGTTTGTGTTCTTACATATTTAGTCGCAGGATAATATGTCGC:1 + chr3R 28045849 3' - Tirant 8181 2 69.18 AAAAAAAAATATTTTAAATGAACTGCAGTAAAAGTGAACACAAATGAAAATTGATTTGGAAACCAAGGAAATATTAGAAATATATTCATTTTTTAAATGGATATTTAAATTATTATTACAGTTCCCAAAATGAGCTCTAATTTCAA:1 + chrX 17277253 3' + transib1 40 1 74.66 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATTAAACATTTATGATGGCAGTTTTTCCTTGTTGGCTTCAGTAAAACATGCACAGCAAGCAGGCAGTAAAAATTATATGAACGGTGCCCCGTACTC:1 - chr3R 7831196 3' + flea 4988 2 68.49 TTGTGGGTATATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAA:1 - chr2R 18035113 3' + R1A1-element 5267 1 63.70 GATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCGTTTATATTCTTATTAGAACTATTGAAAACAATGACAACCCCGAAAAACACGTGGGAGTTCTTCGACGCAACC:1 - chr3R 11165710 3' - mdg1 123 2 50.00 TTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATTTACTTTGCCTATAAAATGTGAGCCACAAAGCGTACAAGGCATCGAGCAGCAGCAACCCAATAAGCTTAC:1 - 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jockey 37 1 63.01 TGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATATTCCTGCTGCCGCTGTTTGTTGTTTGCTGTTGTTTTGC:1 + chr2R 19606122 3' - 17.6 61 1 73.97 TATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGTTCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTATGAACGTCAAGATGGGCAACAAAAATGGAAGGAATCTTAGCTTAGCGGAAGTCGACTATGGGATACTCTGTACTCATTATCATGCTGTG:1 + chr2L 20027412 3' + INE-1 83 1 51.37 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTGAAACCGATTTACTCCCCTT:1 + chr2R 12379638 3' - pogo 27 1 65.07 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTT:1 - chr2L 3632166 3' + P-element 2787 1 19.18 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGGAACCGAAAGAGATGGCGAGATATGTGTGTATAGTCCACATACA:1 + chr2L 16995567 3' - roo 8740 2 69.18 CTTTATATTTGATATGAATGGTCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGCCTTCTACTGAAGTGCCTGCCTATGGGGCGTATGCTTAATATTTATGAGATT:1 + chr3L 14229622 3' + copia 49 2 63.01 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTGTACATCA:1 - chr2L 21777788 3' + pogo 2061 1 65.14 GAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTAGTTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCTGGACTGTGGTAGTATTCTCGTTTAGTAAGTTATAAGACAATCAAGCGATATGATATTTGCAGTGAAAATGAATAG:1 - chrX 16305052 3' - R1A1-element 4952 1 45.21 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAGCCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCAGATCCCAATTACGAATGCGTG:1 + chr3R 29384768 3' + roo 399 1 77.40 GAAATCGTACTGTTGCAGCTCCAACGCGCACCGTGCTATCCTGCCGGAAGGACTTTCGGTGATATTCAGCAATTTCAGATCCATATGGTCCGTGATGACCTTGAATAGAGCTGCCAGGTGGGTGCAACTAAATGGGTAGTGCTTTG:1 + chr2L 6199352 3' - Osvaldo 181 1 55.48 CAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAGATCTACTGTGGAAACTGTTACGATGCC:1 + chr3L 16913331 3' + Juan 127 1 77.42 GTACCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGTTTGTACCCCTTAAAAAAAACGAACTGACAAGCCCCCTTAAAAAATAAGTTATTAATAGATTAGTTCGTATATAATTGCATATGTAAATACTTTAAATAGAACAAATT:1 + chr2R 14746645 3' + Tc3 239 1 66.44 ATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTATTAACCAATGGATTACGCTGAAATACCTCTACCTTAACGGAATTGTGATCAT:1 + chr2L 1794688 3' + FB 484 1 64.38 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATAAATCCTGCAAAGATGGTCGTCGAAACCTCTTGAAAAATGTCCA:1 + chr3R 26605625 3' + roo 8996 2 70.55 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACATTTAAATATGCAAACTGGCAAACAAACACACAGATAACTCACACATATTAAACTTAATTTGGCGCAGCTCATTAATAAAACACAAGCAGGCAAACAAACAAACATGCA:1 - 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mdg1 7111 2 65.75 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTT:1 + chr3R 6399457 3' - pogo 61 1 61.64 CGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCTTCTATGGTTACACGCTAGGGCTATTTATCCCGTTAGTCGATGCTTACAAAGTAGAGACGAAAGCCCTTTTTTTTTAGATT:1 + chrY 311395 3' + HMS-Beagle 7024 2 70.08 GAGAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCCCTCTCAGTCTCTGGCACTTGTGAACAG:1 + chr3L 19222697 3' + 412 438 2 50.68 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAACCCCTTACCAAAAATGCGAAAATTCAGAAAAATCGAAAAATTTCAAATCACCCTAATGGCATTATTTTTAGTTAGAATAGAGTCTTAGACGTA:1 - chr3R 29185611 3' - 412 26 2 65.07 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCTCTTGAT:1 - chr3L 22038175 3' - diver 5910 2 69.29 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACC:1 - chr3L 22041093 3' - roo 88 2 79.31 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTACACTAATTTCGACTGCGACTCCCACTGGCAATGGTGTGATTTATTTGTCGGAAAAGATTACTTACTCTGGACTGC:1 - chr3L 13546537 3' + hobo 2907 1 57.14 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAAGCTAACTAAGC:1 - chrX 8208282 3' - roo 33 2 64.38 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAGGAAGCGGAGTAGCGGAGTGGCGGAGTGGCGGAGTATAGGGGAATCGGGGTGTCGGGGAACCCGAGAACCGGAGAAACCAGACGTG:1 - chr3R 6962047 3' - jockey 4795 1 61.64 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAA:2 - chr3R 6147264 3' + copia 168 2 76.03 GAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTAACTTAAGGCTTTTAATAACACCTGTACATTAGTATAAG:1 + chr3R 32065532 3' + 1360 3307 1 72.60 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATGTATATCTCACCATCCAGTTGGAAATCAATGGCCCGTCT:1 - chr2R 12343894 3' - S-element 75 1 72.60 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGNCNAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTTGCCCCAAAAAGTATGCTATGCAAATAGTT:1 - chrX 7845727 3' - hopper 50 1 71.20 CGATTTGAAGGACCACCTTTTTTCCTCTCCGGCAGCACCGATTTGTCACGAAGATCGGGACAGCAATCATCATTAGTATTGTTGCGCCGAATACACCCATTGTTTTGCGAAATCTAATTTCCTCCCCATTGTAAGTGCATTCCACA:1 - chrX 2528859 3' - HMS-Beagle2 6733 1 60.96 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGANTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACACTTGCACAAAAAATGTGTGATGTAATATGGAA:1 - chr3R 21679606 3' - roo 8752 2 78.77 ATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCGTAATAAAGGGCGCACAATTAGTTGCTTGAGTTTCCGCAATAAAGTT:1 - chr3R 12181939 3' - mdg3 24 2 69.86 TACTTAATACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGATCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCGTGTATTGTGTTGTGATCGAGGGCATGGGACGCGCCCTGCACACAAATCTGAATGCCCGCTT:1 + chr2L 5095055 3' + Stalker2 407 1 63.01 TTAATAAAAAAATATTTTAAAATTCCCTAGCACACAATCCAAGCTACTTTTTCACCTTAAGCAAAGTACTTACCACTATAATTTAGTATGGTTATTAGTTTATTTTTTTTAAGCGATGATCATTGTGCAAGTCCCCAAAAGGTTTA:1 - chr3R 14992897 3' + BS4 723 1 65.07 TTATATAAGAATATTTTTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTAAAGTGCAAGTGCCAGATACTTGACAATGCCAGAGACTTCTCGAGACCCCAAGACCCCAAGACCTCAGAGGCACAGAG:1 + chr3R 20318537 3' + 1360 393 1 54.79 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTTAGTATTGCTGTGCCAATTTGATTTTTACTTACTTAGATTTTCATTCCA:1 + chr3R 10209119 3' - 1360 74 1 68.49 TCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCCCATCTGCCACCTCAGCTCTGGGCCCTTAACCC:1 + chr3R 7600557 3' + hopper 1327 1 76.71 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGCTATATTACGTGTAAAAGAATAATGTAATTGTACATAAATTATAAAATTTTA:1 + chr3L 3154183 3' + flea 4950 1 66.44 TTTTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGC:1 + chr3L 25824646 3' - jockey2 3405 1 60.14 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTC:1 + chr3L 2485982 3' - jockey 4746 1 63.70 AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAA:1 + chrX 15406046 3' + opus 438 2 62.59 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAACAACAAAAACCATTATC:1 + chr3L 19907225 3' + P-element 2858 1 65.75 TTTGCACTATGCAACCACTTTTTTGGTGATGGCACTCTCTCCGCTCTCGTAAAACTGAGATCGTAATAAATCTTTAAATAAAAGCATATTATTGCTTGCTTGTGCTAGTGCTTCTTTTAAAACTTACTTGCGCTTGACATTAACAA:1 - chrX 21399128 3' - 1360 3344 1 73.97 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAATATATTCCAAACTATGATACTTCACATAAATATCATATATGTACATATGTAGCAAGATAAATTTT:1 - chr3R 21938153 3' - roo 53 2 58.22 CCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTGTGGGCGCCACATATATAAGCTAGAAAGTTTAGAGTACTTTCAGTATCCAGTATCTGATAGTCGACTAAATCATGCTTTCTTGTTTTATTGTAATGTACTTTACTTGTCT:1 - chr3L 17860573 3' - Chimpo 26 1 53.79 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCAT:1 - chr3L 13888882 3' - 412 47 2 53.42 TTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGG:1 + chr2R 4206657 3' - 1360 321 1 71.92 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGTTTTCGGGTCTGCTGGGGGTTTGTCGAGCTTGAACTTTAACTT:1 + chr3R 11903526 3' - FB 78 1 69.86 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCC:1 + chr3R 10433276 3' - 412 86 2 80.82 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATGTATGCATCTGTATGTACATATAACCTAAGACTGGGGAGGACATCGAGGAGTCGGCGAACAATTTGTATT:1 - chrX 7993036 3' - opus 7040 4 56.83 CATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAA:1 + chr2R 16185110 3' - 17.6 6996 2 72.60 GACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTTCGTGCATCAGAAATAGGCCGCTTTCAACT:1 - chr3L 8157991 3' - flea 4807 2 54.79 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTCTACA:1 - chr2R 8258234 3' - jockey 30 1 66.44 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTCGCCCTCTGTCGCGTTTGTTGAGTTAACCCCCTGAAATTGAAGTTTACTTTTGATTGACGGCGGTGTGTGATGCTCTAAGCCAGAAATGCTAGCATGTGTGCGCTTA:1 + chrX 18767953 3' - hobo 12 1 77.08 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGGTCAAAATAGAAAGTTAAATGAAAACAAACAAGATTGACTAAAGGCTAAAACCGAAGGCTTAGTAAATTCTTA:1 + chr3R 17766836 3' - HMS-Beagle2 26 2 60.32 GAAGACTGTGGAATGCCGAATCTAAATCGTAAAGTAAATCGTTGTATAATATTAGTCATTCTATTATATTATAGAGTTTGATCTGAGATCTTACTCATGCATTGTTTTTGGTTTTGATAGT:1 - chr2R 22596048 3' - Doc 3 1 71.07 AGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGGGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCT:1 - chr2R 16731277 3' - Tirant 8187 2 71.92 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGGCTTAGCTAAAGATAGTTTAGTGATAGTGATCTCCTTAGCAA:1 + chr2R 2534685 3' - 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FB 86 1 75.34 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGAACGCAGTTAGCTGCTCGTCTCGTGCGGAACTCTCAAAACT:1 + chr3R 17944147 3' - P-element 26 1 67.81 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGGTATTTTCAAGGGTCATGCCATATTCGCTCAAGTAGTTCTTAAAGAAATTAC:2 + chr3L 7646325 3' - 297 61 2 67.12 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTTTGGCGTTTTTCC:1 + chr3R 24011096 3' + roo 9032 1 56.85 GGAGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTAGTTTTTAGACGATTGTTTGAGCAGCCAGTCCAGTTAGTCGAGCACTTCTTTCCCTATCTGGATTTGG:1 + chr3R 21843856 3' + blood 7337 1 54.11 GTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGAT:1 - chr3L 14233070 3' + copia 5035 2 80.82 ATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCTCACAACCTTTCCCGCTGCCGTGGAGAGCAGAAAGAAAAGAG:1 + chr2R 10541572 3' - 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Cr1a 4429 1 73.97 GAACATAAAACTCTGTAAGGATCATGCATTTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGAGGCTTATAATGTGAAGTCCGCCGCCGCTGCCTGTTTATAAATGAGTCGAGTTATGGAGAGCT:1 - chrX 4472626 3' - Cr1a 4182 1 56.80 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATCCGACGAAATAAAATGGAAAGAAAAACGAACCGAGAAACTTTTGCGAAAACTTGGACTGGCGGCAAGAGGCGCTGGAAAAATTGAGGGGTGGCA:1 + chr2R 22774645 3' - I-element 27 1 64.38 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCTTTGTTATTTTGGGCAAATGGCAGAACACAGAGAAATAAGCTCGACAAAAA:1 - chr3L 5398059 3' + roo 9001 2 65.75 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAGGCAGTCAGTCAACCCTCGAGTGTTACGAGCCTTACAACAAATTTGATTTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTTCCGAGGGGGGGTGGTATGAGAAGTTCTGGATTTTTGAGAG:1 + chrX 10694426 3' + Transpac 303 2 76.03 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTTGAATATACATTTCAATTTGAATGGTAACTGAACTCTCAAAAGAAATATAGGATTGTTGCAGAAAAAAAAAATAAATTGAAGTGAATCACTTTTACTGAGCGCCT:1 - chr2R 10695730 3' - roo 8680 2 74.66 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTG:1 + chr2R 12379619 3' - pogo 46 1 52.74 ACCCAACTGCAAGGAAAACACTTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACATTTGAATATATATGTACTTGATTAGATATAATTGGCTGTCAGTATGTCTCTTGATCGCTCCACTCAATCGCACCAATACTCGGA:1 + chr2R 23596101 3' + blood 342 2 61.64 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGGGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTC:1 + chr3R 19446237 3' + 297 6913 2 62.76 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAATCGCAGGATGACTGGGAACTAAAATTATAGATTTCTACACCATAATTCATAA:1 - chr2R 8258221 3' - jockey 17 1 75.34 TTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATGCCACAGCGAATGAATTTATGGAGAATTTATGGACATAAATTGAAAAGCCCACACATTAGTGTGAAAACGGTGGTGCGTTTAAATTTATTATTTATTTTTGTTT:1 + chr2R 8534851 3' - Doc3-element 25 2 56.85 ATCGATATCCCAGAAAAATTATGCAATTTCGCGTTCACATTCAGACTAGCGGGTTCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCTCTTGTTTTTAATGTAACTTCATGATAAATATTCGATAAGTTAATGGGATTGCC:1 + chrX 18812901 3' + INE-1 504 1 51.88 GTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGATATAAATAAAATGTATATTTTAGATTTGTTGGTGTGGGCAATGCTTATGTCCAGTACACCATGGAGCTAGAGACAAATTGGATGCAGCAG:1 - chr2R 12683418 3' + Bica 4504 1 60.27 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCTCTCCTGCT:1 - chr3R 16349226 3' - P-element 76 1 26.12 CGTTACGCATCTTGTCATTGTAGTGTCTTTGGTATGACCGTCCCTCCAGACGGGGAGGTGGAGTCTTAATTGCGGTTAGATCTATCCTCTCGTCAGAAGAGTTACTTTTGTGTTAGTCATGAGGTCCAGGACCCGGAGAGCTTGTT:1 + chr2L 14673059 3' + 1360 3379 2 75.34 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGGGCTTATTGTGAAAGGT:1 + chr2L 16607327 3' - 412 7088 2 56.16 TGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTCCACTGTGCCGTGGGTTTTGGCAGCATATTTTACAGCACTGTTTTTAAAGTGC:1 + chr2R 16149897 3' + mdg3 181 2 60.96 AGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATATGTCATCCATTGCTCTTTGAAATATTC:1 - chr3L 22231510 3' - TLD2_LTR 182 1 59.59 ACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGAGTGCTGTGCAACAAACTTGTGGCAGAGCGAGCGCTAATTAATTAGCAGTATTTCTCGCTCACACAACTGCCATTAAAAATTATGTAAGGCGGCACGCGAT:1 + chr2L 5961355 3' + S-element 1698 1 69.18 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCAGTGCAGCAATTCGCATT:1 - chr3R 25692694 3' - BS 5018 1 67.12 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAG:2 + chr3L 15273315 3' + pogo 2043 1 60.27 AACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' - micropia 4992 2 52.73 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGGATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCTTTACACTTAAATA:1 - chr3L 1477330 3' - mdg3 5278 2 66.44 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTTGTCGGCGCCTTTTGTTCTTCTTTATTAAAAAGGCGTATAATCATAAT:1 - chrX 4471926 3' - roo 10 2 47.27 ATGGAGGAATTGTACGCCAACAATTTCAAGGAGGAGTTCTCCCCAAGCGCTTTCAAGAACGTCGGAATGCGGTTGAAGCTAGAACAAGCTAACTAAAAATATTCAAAATTACTAAATAAAAGGTACATATATGTTTGTTATTGTAA:1 - chr3L 12125433 3' + R1-2 277 1 56.85 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTAACGGCTTTTTATGTTGTTATGGCTTAACATTCCGCG:1 - chr3L 12125243 3' + roo 9044 1 66.44 GGCTCTTGATCCTGATCAAGAATATATTTACTTCGTATAGTCGGAATAGTCTTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAAAGAATCTAGTTCAAAGAGTGTTAGTTTCTATTCAAATACGAACATTACTGAGAAATATATCGTTCTAGAT:1 + chrX 17479589 3' - INE-1 87 1 58.90 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATACATATATATATAGATGCAGGGATTTCGTTTCATTTCGGCTTTACGACCCTGAACCATTTGGAGCACTTACAACTAGCTATGGATAATTAAATGGGCTTAAATGGC:1 - chrX 20456818 3' - opus 7 2 79.14 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAGTCTATGCAGGTATTAGGGAAATTCAACAGAAAACTTAAACATGGCGATTTGGAA:1 + chr2R 6217183 3' - copia 4936 2 63.70 GAGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCCTATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACA:1 + chr3R 4679587 3' - hopper 25 1 65.75 AAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAANANACATTGCTCGCCATCGAGGTGCGCAATTTTGTGTTGCATACGCACTGGCGTCAGTCAATTTCACTTATG:1 + chr2R 22971910 3' - jockey 4760 1 75.20 ACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTTTTTTGAATCACTTTTAATGTTAATGTTACATCATTTTAATTGTTTATTTATTGGCACAACAAGCAAATTG:1 - chr3L 2161036 3' - 1360 2964 1 77.40 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCTCCCGTGCAACTAATGCACACTTAAAATAACTAACAAAACTCCGTTAAAAGCTGCAGCCGGAAAGCGCCTGCGAAACATTTTAAGCGCTTGCGTTGCCACCTCC:1 - chr3R 8394358 3' - hopper 13 1 75.34 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTC:2 + chr3R 21679667 3' + roo 334 2 67.12 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTATGTAAATTGTATCTGCGCCACGACATCTAAGTGCGGCGTGGCCTAGAGACTACGCACTTTCGGTGGCCCTCGTAGCCATTCAGGTTG:1 - chr3L 21913302 3' + 297 6964 2 76.15 GGCCTCTAAAGCGTGCGCCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAATAAGAGCAAGGATGGTTTTTTGAAGGCCATCGACTGTTACGAAAACAACAAGTCATGGTGCCATGCAGCCAA:1 - chr3R 10121166 3' + gypsy12 10148 2 47.22 TATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGAGTTGGAAAAGTAACCCTTTCGAAGGCAGGCTA:1 - chr2R 12248925 3' - Juan 4042 1 74.66 GGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCATTCAGTGCTCTTCTTTGCCCTTTATATCAGCCACACAATACACCTGCGCTACACCCTGAGCTGTCGCTCAGATTCTCAGGCAGACCAAATATACAC:1 - chr3L 22506157 3' + I-element 4915 1 73.68 GAAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGCACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGATTTCATCGCTGGAGGATGCCCGGGCACCAACTTGGAGACGCATATTCCTTCGGAATCA:1 - chr3R 4496672 3' + R1A1-element 498 1 72.50 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAATCAGTTGGGGGAAGAGGTCAGAACCCCCAGATTCAGAGATCTCAACTTTCGGATGAGGAGTCGATGATTTTAATTAGCGGTTTGCTTGGGAAGTA:1 - chr3R 17996665 3' - copia 27 2 65.07 ATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAA:1 + chr3R 30618769 3' - X-element 55 1 46.58 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAAT:1 - chr3R 23415918 3' + jockey 4917 1 67.12 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATC:1 - chr2R 14484085 3' - pogo 43 1 52.05 GATGCGAATCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATT:1 - chr2L 1232640 3' + roo 8990 2 77.40 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTAC:1 - chr3R 23415927 3' + jockey 4924 1 70.00 TATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATATTCCAGTGATAGTTGATAAGCCGTGGCG:1 + chrX 21933276 3' - springer 65 2 76.67 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACAC:1 + chr3R 9550992 3' + P-element 2825 1 43.15 CTATCGATATCCCAGAAAAATTATACAATTTTGCGTTCGCATTCACACTCTATTTGCAGATCTGATTTTGGGGATCTGATGAACCAAATATTTTTTAACTTAATTACCTGAAAACAATCCACGATAGGAACAGACGGAATTGTATA:1 + chr2R 5185592 3' + INE-1 502 1 69.18 GCGGTCGGTCTTTTGTATAAGAGAATTATGAGGAAGGCATAATTACGTTACTATATATGTATGTATGTATATAAATATATAAAAATACGTACCGCCCACCATGCACCGTCCGGTGTCCTGTGCTCCTGATGTCC:1 - chr2R 16394962 3' - Tom1 31 1 68.66 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGATGTTTTAAAAAATGTACTAAGGCTTAGATAACTCTAACAAAAAAGTCCATAAGGTTTA:1 + chr3L 14233139 3' - copia 62 2 62.50 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTTATTATATGAATATATGGATATGTATACCAA:1 + chr3R 9551028 3' + P-element 2861 1 66.44 TTAACCAATGGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGAAGTGAAATAACTTAAAATTATCCTGTAACTCTATAAATGCAAACGAACTGCGCCGCGTGGAGCAGGAGGTGGAATCCATTGATGTACCGCTGCCATCGACATCCAGCTT:1 + chr3R 10010797 3' + rover 478 1 63.01 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATT:1 - chr3L 8249380 3' + HMS-Beagle 6970 2 68.49 TGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGTGGGACTGATGTTGGGTGCAATATATATTTCTTTGTTTGTTTAATCTTCT:1 - chr2R 24807903 3' - I-element 61 1 69.35 AAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTCAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAATGTTCTTAAATTTTTAATTACCTTT:1 + chr2L 5304969 3' - Max-element 227 2 81.51 AACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCATAATTTGTCTCTTGATAACTGGCTGAATCTTAAAAAATCATTCGATTAGTGAACT:1 + chr2L 15123103 3' + I-element 5040 1 62.33 AAAGGGACAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCCGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGAAATAAAGTCAGAAGTCAGAAAATATATAATATCAATCTCAATTTAAGCATTTTTG:1 + chr2R 4896820 3' + Quasimodo 6946 2 60.14 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGGTTCC:1 - chr2R 17609753 3' + mdg3 5466 2 53.04 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTGCTTGCCATGTTAATGAAGTGACTAATGGCCAACGCAG:1 - chr2R 19015932 3' + roo 9044 1 64.83 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACG:1 - chr2R 25083275 3' + pogo 2055 1 54.07 TGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCGACCCTGACAAACAAACGCGGA:1 + chr3L 10974364 3' - opus 7305 2 77.78 GGGCTAGAGGGTTGGGGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGATTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTGTAATATGTGTCTTATTTAAATATCACCTTGGCAAAA:1 - chr3L 23909056 3' - I-element 5094 1 88.00 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGCACAAGCACCAAGCTG:1 - chr2R 17695990 3' - rover 6969 2 71.43 AGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCCTTATATTATAAGCCTGTTTGGACTTCAATTTTCAA:1 - chrX 1208853 3' - Burdock 6219 2 77.40 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGAATGTTCAGCTGGTGGAAAGTTGGTGTAGAAATTGCAAATCAGGTGATGCCGCGCAGTCGGAGCGT:1 - chr2L 3059340 3' + P-element 2839 1 49.29 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACTGAGAGCTGTCAATTGAATGTATTTAAAATTAAAAGCAAAAATGGTTAATTGTTCTTTTGGTTATGCCTGTTTTTAATATACTTTTCAGCAACTGCCAT:1 - chr2L 20044504 3' + roo 9051 2 68.49 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTTTGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTC:1 - chr3R 13898216 3' - 3S18 5793 2 49.52 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAATGAGAGTTAGTTTTCGGCT:1 - chrX 16589150 3' + pogo 2068 1 56.45 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTATAAACTTACATACTAACAATTTTGGATTTCTTAATATCT:1 + chr3L 8295866 3' - Quasimodo 21 2 71.92 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGAGTTTGAAATACAAATATATTCACAATGAATGTCTTTTAAGGG:1 - chr3L 7972257 3' - S-element 76 1 73.29 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTTGCCTTGATTAAACAATAGAAATGCGTAGGGCAACATCAATACCAGGATATTTCATAATTTAATGGTTGCTTT:1 + chr2L 11705873 3' + I-element 5306 1 54.11 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTAATTTCGTATAGGACAATCTGCCACTGTCGTT:1 + chrX 15540102 3' + roo 387 2 69.18 ATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTANTTNTTAAGGACACGTAGATAATTATCTTCGATTTTGAAGAGCAA:1 - chr3R 14401898 3' - Juan 4144 1 75.17 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGA:2 + chr2L 4631220 3' + roo 332 2 69.86 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGGTTGAAATGGAAATGCCGAAATAACTTACGCGTGCTGCGAAGAATCGTGACTCAAAACTTTCCGTTAATTATCCAAAATATTCGATTTGAGGCGTGGAGTAACAGATGAT:1 + chr2R 11663966 3' + P-element 2878 2 77.24 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTAGGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAAT:1 - chrX 8208296 3' - roo 47 2 54.79 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAGATATATATATAGTGAGATTTTATAGTATCTCCTCTGGGGAGCATGTGGGCTTTTGTTCTGCTTGGCGGGTCATCGTGCAACTGCAGAAATTACCCAGCTTTCA:1 - chr3L 9521994 3' + opus 7490 2 68.75 ATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGTGCTGGAGTTGCACTGCCTTACTTGATGCCCAGTC:1 - chr2L 22923885 3' + R1A1-element 5277 1 74.66 CCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAAAAGTTAAAATACNTCTAAATCGAATATGTAAGGACTTGAATTGGAGGTGATGAAGTA:1 - chr3L 22821223 3' - Circe 7372 1 63.70 ATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGCTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGGTAATACC:1 + chrX 21667986 3' - gypsy2 6508 2 75.34 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAACGTGATGCTTTCCAAAATTGTTTTGTGGTGAGAGGGATTGTTTG:1 + chr3R 5518393 3' + Transpac 5155 2 68.49 AGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATC:1 + chr3R 5972357 3' - Doc 312 1 66.67 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGAGCACCAGCGGAAAGTCGCGTCAGTCGTCAGTATTTCTTCAGTGGCTTCG:1 - chr2R 10541639 3' - P-element 26 1 58.47 AGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATATAGACCAGTTTCCTCTATAAATTGGTATTTC:1 - chr3L 10814519 3' + micropia 384 2 78.01 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATCAAAAAGTGCTCTAGTCAATTATTCATTTCAATTTAACCCATGCTC:1 + chr2R 18767286 3' + pogo 2078 1 69.86 TAGGGAAATAACGGGATCCCTGCGGCCTGTAAGGGGTAGGCGCGAGCACGGATGGGGGGCAGTTAGTGAGACATCAATGCATTTTCGGAATATATATTTCTAGAGACACTAAAAGAAAAAAGATGTAAAAACTATTTTTGGTGAGG:1 - chr3R 20495742 3' + gypsy8 317 1 50.00 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCTAAATGCACAATGTTAAGTGCCCAGCGTTTAAAACTGTGCTTTAGTTTT:1 + chr2R 14332160 3' - jockey 14 1 79.45 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGNCNTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGCCC:1 + chr2R 22112717 3' + 412 413 2 72.60 TGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGGCGTGTCACCTCAAAGCTGGGCAATATCAAGTCTTTGAGTGGAAGATGCATAAGTGGCGGA:1 + chr3R 28457991 3' - mdg3 5328 2 58.22 CAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAACGTGATGCTTTCCAAAATTGTTTTGTGGTGAGAGGGATTGTTTGTTGTTATACAAAAATTCTTCAAATGGGAGTGTTTAAGAATTATAATGACGA:1 + chr3R 5518444 3' + Transpac 287 2 70.55 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGCCAA:1 + chr2R 18723756 3' + 297 6912 2 63.70 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTNCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTCTCTAGCTATTCCTCGAATAATTTGTATTATTTTGAGGCTTTATTTACGTCAGTCTCTGTTATTGTGGAATTAT:1 - chrX 17583267 3' - FB 46 1 51.37 CACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCAT:1 - chr3R 13676111 3' - P-element 81 1 30.14 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACCTACCG:1 - chrX 19121904 3' - 412 7095 2 57.98 GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTC:1 - chrX 4240232 3' - jockey 4741 1 67.14 GCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTGAATTGGCTTAGTGGCCTCAAT:1 + chr2L 16884674 3' - Bari1 91 1 67.12 GATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCTACAAATAA:1 - chr3L 18947244 3' - BS 4720 1 54.79 CTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACAT:1 + chr3L 22435184 3' + opus 414 2 78.08 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGCTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTATAAT:1 - chr3R 15102215 3' + roo 9033 1 57.53 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCGCCTTTTCTTCTTTCAGTCCGCAGAGAAACGTCGAG:1 + chr2R 9871548 3' - roo 86 2 80.82 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATTANANATTTATGATGGCAGTTTTTCCTTGTTGGCTTCAGTAAAACATGCACAGCAAGCAGGCAGTAAAAATTATATGAACGGTGCCCCGTACTCG:1 - chr3R 7831195 3' + flea 4989 2 67.81 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATTTCTCAGATAGGATAATCGATTATATGGGGTTTCGAAAATATAACCTATTGATAAT:1 - chr3R 15585554 3' + I-element 5289 1 60.96 CGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAG:1 + chrX 21994012 3' - McClintock 36 2 58.57 TCGCACGGGTCCCACGGCTACACCTCCCGCTCAACCGACCTCGGGGCGGCTGTGACTGACCATCTAATTACGTGGCTAACTATTGTTTCCGCTCACCCAATCGCAG:1 + chr3R 6289081 3' - Cr1a 4442 1 65.09 TATGAGACCAAGTGGTTTCTTGATTATTAAGTACAAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATAATATAATTTTCGAATTTGCTAAATTAGCACAAATGGGCCATAAAACACTAGGCACGCCAAAATGTACT:1 - chr2L 149263 3' - G5 4745 1 55.48 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAGTA:1 - chr3R 19246639 3' - jockey 4683 1 71.23 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGA:1 - chrX 16219215 3' - roo 8748 2 76.71 TCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGC:1 - chr3R 9550904 3' - P-element 70 1 37.67 ACTTGTGCTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGAGAATAGAACGCAGAAAGAGTTGCTAAAACAATACAGTTTTTTGGGTGCCATAAATACATTTATGAAAACAATTACATAATATTAAAAAGAATATCAGAAATGGCAAAAAA:1 - chr3R 10433149 3' + 412 7536 2 78.08 CAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGAAATAAAATCCAGCAAAGTGTACAGCGCTGTTGCCGCACTGTTAACTAATAA:1 + chr3R 24830246 3' + Idefix 451 2 69.86 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTGGGCGCCTAGTCATTTGCAACATGCACACACCACTTGCCAACTGCGACTATACGACCATGTGGATGTATGGATA:1 + chr3R 26542686 3' - FB 47 1 50.00 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTAATGTAAATGTAATCTAAAATTGAGTGTACTAATTTATGTATGATACTATATTCATACGAAAGTCAACAGTAGTTACTTAAATAAAAAACCT:1 - chr3L 21590797 3' - Max-element 31 2 65.07 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATTAAAGCTGAAGTGGGGCATTTAGGAGTACAATTTTATACGAGTTAA:1 - chr3R 14138503 3' + mdg1 386 2 60.96 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAGGCGATTTGGATTCGGATCGGGCTTCAGATTCAGTTTTCAGTCTAATGTCAGGAACGC:1 + chr3R 17944111 3' - P-element 62 1 43.15 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCGTACGGACACGTGTGATTG:1 - chr3L 16200684 3' + roo 397 1 77.40 GAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGGCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAAGAAATCTGGTGAGAAATTTAACCTAATCC:1 + chr2R 22273497 3' - 297 6739 2 78.77 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACAGGTTCCCTTTTCACAATGTGATGTTCAGGCGGAAAATGATTTTTCTTTAATACGAACAGATCCTTCTGATC:1 - chr3R 12342087 3' - hobo 47 1 53.42 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGA:1 + chr3L 19907179 3' + P-element 2812 1 34.25 TTTAACAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAAGAAGCAAGGAAAAACGAATTTCTTTGGGCATACAAAATGTTTTGGCTGCCACATTTGAGGCGG:1 - chr2R 18330972 3' + TART-C 11100 1 72.04 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTCGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCGGTTGTTG:1 + chrX 2104799 3' + roo 9022 2 51.03 TGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAAGGCTCCTCCACTGCAGTTTCATAAATTTGA:1 - chr2R 24617042 3' - jockey 4733 1 59.59 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTAATGAAATCTTTTCATTTTGAATATACATACATATATTGAAGATTGACTCATTAATATTT:1 + chr2R 14484212 3' + pogo 2045 1 64.38 GCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATGGCCCCTGAGAAGTCAACGTTGTCAGCGAAATTTGTCAAAGCAAATCAA:1 + chr2L 12642596 3' + Quasimodo 232 2 60.64 TATTGATCCTGGTCAACAATATGTATACCTTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCGACCTGCCACATAGTTTAAAAAAAATCTAGTACACACTTTTACTCTACGAATAAAGGACAAGAAGAATATTTAATTGCACATTTGTTTCTAG:1 - chr3R 4377606 3' - INE-1 84 1 71.23 GAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGATAAATTCTTTTTTTGCATTGCCTTAACGGTATTATTATTTGAATGACAAGAAACTGAGGATTTCGAGAATGAACGTACCAGAAAACGGTTTAA:1 - chr2R 22097530 3' + 1360 236 1 65.75 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACCGTATTTGCATTGCCTGAATGGC:1 + chrX 17726321 3' + pogo 2062 1 79.01 ATATAATAACAATAATAAAAAGTACTTTTAGTTCAGCAAATGGCTCTCCTTAAAATTTTGTCATTCAAACGAGACCCTGACGAAAAAGCTAAAATCCGCGCGCTCACTACGGAAACACACAAATATAATATAGCATACATCTGGGC:1 - chr2L 13625511 3' + mdg1 7053 2 80.14 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTATTAATGACTGGGCAGCCAACTGCT:1 - chr2L 4631094 3' - roo 8683 2 69.18 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCAAGC:1 - chr2L 16537528 3' - Transpac 54 2 54.79 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATATTTAAGCACTCAGGACTGCTTTAAGTTCGGAACATACATATGTAACCTGTAAAATCTAAGAAATAAAAATGATCCTCCCGAGACC:1 - chr2R 14484074 3' - pogo 32 1 59.59 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATCAATCATTGGGTG:1 + chr3R 21655076 3' + roo 9026 1 51.75 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTTCGCCTGTTATAATTAGGAAAAAAGCATATCTTACAAATTATTTGTCGGTTTCGCGCTATACAG:1 + chr4 549207 3' + flea 230 2 69.18 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGCTAGGCTGCAGCTAGCTGGCCTTGCCCCAAAAAGTATGCTATGCAAATAGTTTCGATAACGTATACGAC:1 - chrX 7845710 3' - hopper 54 1 73.97 GTAATACGATCTAACGCTTATATAAGCATGCACTTTGCAGCTCAATTGGTCAAGCTACACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTACATATATATAATATATATGTATGATATAATTTTTCCATTTGCTGAT:1 + chr2L 8603234 3' + Stalker4 152 4 73.38 GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTGTCCGTGGATCTCTTTCTCTCTCTC:1 - chr3R 7041981 3' + Stalker2 7601 2 55.30 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTCATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAACCCGCATTAAGTGATCATGAAAATGTTGGAAAA:4 - chr3L 18010195 3' - diver 22 2 69.86 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGATATAGTTGTTCATAGTTGTTAGTGGACCGAATTTAATTTGGTCGACTTGCCGACGGCACTTCAAGCTCGCTTTG:1 - chr3R 16881884 3' - 3S18 5813 2 54.48 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGGCTTTTT:1 + chr2L 3908498 3' - jockey 4713 1 62.96 GAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCGGGCGTGATGAAAATTATTTTAAGAGCCAAAA:1 + chr3L 22038347 3' + diver 198 2 66.67 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTA:1 - chr3R 19246704 3' - jockey 4742 1 67.81 AGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACATTTCTTTTGAACCCTTTACTTTATGTATACTTTGTAGTCCAATGCGATGCC:1 + chr3L 3540188 3' - transib2 397 1 65.07 ACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTACAATATTAAAGAGTATCAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACATATAAATCACGTATTACTCATATCCCCGAATTCGCGAGACTCTGCTGAACGCGCCCGTT:1 + chr2R 17852297 3' - diver2 66 2 61.64 ACCCAAAGACAGCAACATAGAATTGATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTT:1 - chr3R 7042005 3' + Stalker2 315 2 73.97 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCCAAT:1 + chr3L 17746370 3' - roo 8720 2 56.85 ATGCAGCTAACTATCGATGTAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAATAACATCTATCATAGAAATACAATATTTATGGACCAGTATATAGTATAAATAATGCTTTAAAAATAATAACATAGATATACTGCAGCTTTTTTAATTTAA:1 + chr4 880440 3' - pogo 18 1 73.97 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCA:1 - chr2L 3133668 3' - Doc 37 1 53.10 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACCAACCTTCCACATTCCGAGTAACTCTTCTTATATATTTTTCTTGGGGTTTGCCTTCTCTTTACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGACACTATTTTATTC:1 + chr2R 6086015 3' - FB 22 1 70.55 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCTATGTATATACATATATGTACGTTCAATACCGATCCGATCCGAGGTAAAATTCATATGTTGTTGTCTGTAGCCACTCCCTTCT:1 - chr2R 21529924 3' - HMS-Beagle 6828 2 66.43 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTCTCTAGCTATTCCTCGAATAATTTGTATTATTTTGAGGCTTTATTTACGTCAGTCTCTGTTATTGTGGAATTATACAA:1 - chrX 17583263 3' - FB 42 1 54.11 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATGTATATTTTACCCGTGTGCGTGTCCATTGCGGCCGTGTGTGGCCTGAACCGGGCTTGTCCATATGGGGAGCCATAGCATTTGCATTAAAAATCCAT:1 - chr3R 23877802 3' - Transpac 19 2 71.92 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTGCATGTAAAATTA:1 + chr3L 15273336 3' + pogo 2064 1 63.70 TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCT:1 - chr3L 1477343 3' - mdg3 39 2 58.90 AAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGCGAGTCTGATTTGAAATGCGAATCACTTGAACTTTCTCATTTGACTCCCGAATCGTCGGAAATGAGATAAAAGCTTTTTACTCAATT:1 + chr3R 19044523 3' + X-element 4393 1 60.96 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTCAAAGGAATACATTTGGCTCCTGCATTGAACATCTATTGCTGCAAACGGTAAGCCACCTCAAAGCACCCTATAAAATTGCTGTTTGAGAACATAATTAA:1 - chrX 14346902 3' - flea 14 2 77.24 ATGAATCAATACAATGCAGTAGCAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAATGGTCTCAAATCTCAGTCTTGAAGTGCTCATTTGAATCCACTTTAAAGG:1 + chr3L 12634233 3' - BS 5065 1 63.70 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATATTAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCA:1 - chr3R 23415898 3' + jockey 4937 1 52.05 CATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCCCCTTTACTCAAGTCGATCTCCGGCTCGATTTCAAAGATGGGCGCCCCCGTCTCCTCCTCGATGACGTTCTTCTCAATCGAGT:1 + chr2L 17803217 3' + R2-element 64 1 50.77 GCATTGGACTTCAGGGGGATCGTTGAGTCATGAAGGGGTATGAGAAGAACGCGTGTTCCTCCTGCAGAACGTAGTAGAAAAAGGAGCCCGCTGAATGAACTTGGCGTGCCTCCAAGCTGCTCTGCACCTGCCGAACGACAGCAGCA:1 + chrX 1028947 3' + baggins 5360 1 76.03 TGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACGAT:1 + chr3L 21913483 3' - 297 16 2 74.66 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTAT:1 - chr2L 9599779 3' - roo 35 2 59.26 TCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACA:2 - chr3R 9550901 3' - P-element 67 1 39.73 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAGAAATGCCATTTCCATGGCCTTATAGCTGCAGATTCAGTTCCATTTCAGT:1 + chr3L 8274000 3' + hobo 2899 1 55.65 CAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTTATTGCGGGGTCACCAATATGGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTGTGTTTTATTGCTTGATCTTTATTTACTGTCATCGACCG:1 - chr3L 14611235 3' - Chimpo 233 1 73.29 GTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAAATATTCTAAGTAGCGGAGAAACTCCCGTGAGTACCCAATCACTCCCAATTACATAACGCATTTCTACAATTTCTCTAGACTAGATTACCCAT:1 - chrX 19288457 3' + HMS-Beagle 254 1 58.62 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGAATTGTTAAATTTTTCATTCAGATACTTTTACTGGGTATCTGATAGGCGAACTAATATC:1 - chr2R 17649220 3' - Doc 69 1 59.59 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTACAATCTTTTCGACGAATTTTGTATACGCTTTTTACCATTTAACTGAAATAGGTTAATTTGACTATGA:1 - chr3L 21157003 3' + 412 7497 2 53.42 GACTGTTCCAAACATCGTTCTACTGTTAGCCAGGGAAGATAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGAAAGAAAAAAAGTAGAAGTGAAAATTAAAAAAGGTAATATAAACAGCTTCCCTTTTAATGAGTTTCACTTGCATTCACACAT:1 + chr2L 12482984 3' - Cr1a 4021 1 73.29 ATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCACATCTCATGTCTCAATCGAGTCGTTAATCAATTC:1 + chr3R 15590024 3' - S-element 1551 2 50.00 ACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAATGTTCCCACTGGTGGGCTGGTGGCCAC:1 + chr2L 13031224 3' + F-element 271 1 77.87 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGA:1 - chr3L 16200715 3' + roo 9029 1 56.16 GAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATCAAAAAGGGGAATAAATGAGTTAGGCACTGTTTGGAAATGGTTACCTG:1 + chr3R 3484043 3' - diver2 4737 2 67.12 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTTTATAATTATCATGTAATTTATAAAA:1 + chr2L 18738062 3' + roo 356 2 54.11 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTTTTAAACATAATATGACATTCTTACCCATACTCTAATGCGAAATACATACGCTCTTCTGTTTGCTTGATTAGTATAATCATT:1 - chr2L 19731905 3' + roo 9034 1 58.22 GTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGC:1 - chr3L 18947267 3' - BS 4743 1 70.55 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGA:1 - chrX 21227084 3' - Tabor 39 2 58.90 CCGACGTCTGAAGAAAATACATCCCCATGAACTTCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATACACAAATTTAAACTGTTGGACTTAAATAAAATTTGGTTAGAGTGCAGGCTGGAGAAACTCAAAGATAA:1 - chr2R 10889470 3' + G5A 2676 1 55.48 ATTATTAAAACTCAAACTTTAATGACTTAAATGACTTAACTCACATTGGTTTGGATTTCCTTTTTGATGTACGATCGGCTGACTTAGACATATCGAGGTGAAGTCTTTCGATTCCATTTACTTTTGGGGTGATTTCTATACAATAC:1 + chr2L 14429647 3' + P-element 2688 1 84.93 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTACTTGATTGCCCCCAAAAGGATGCAATGCTAATAAATTCGCTTTTATGTGGCCAGCGCTCAATTTTCGCTCCCACTCCGCGCG:1 - chr3R 19725326 3' + hobo 2914 1 62.77 CTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAGATCTCGACGATCATACGGACAGACAGACAGACATGGCTATTATATATTTTGGCCATAAAAAGCAGATATATAAACTTGCCGCTCGGTGATTAATGCGTCATAATTAGAATCTCT:1 + chr3L 14891089 3' - INE-1 161 1 52.08 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGGTTACAAGGATCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCTAAATGCACAATGTTAAGTGCCCAGCGTTTAAA:1 + chr2R 14332144 3' - jockey 14 1 69.23 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATACAAAAATAGGGGATTGCCAAAGGATGTGGTTAAAATAACAGTATATGATGGTCTTATCTTATAATGGTTTTGCATTTT:2 - chr2L 20819203 3' + copia 248 1 54.11 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGATTCCCTAAGGATTTATTTATATTTTGTTTGAGTAGCTGGCATAGAACCATACCC:1 - chr3R 5518266 3' - Transpac 23 2 69.86 GCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCG:1 - chr3L 11115123 3' - micropia 5 2 72.00 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGG:1 - chr2L 3911849 3' + roo 8995 2 69.18 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGTCTCATTAATGAATACATACATACATACATAGGCCGGCAGGCGACAACACAACAACAGCAACCGCCCCATGTT:1 - chr2R 21475195 3' + P-element 2847 1 53.96 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTCCCTATTGTCAAGAGGGAAGCGTTTTCTTGCTTAGAATCATAGCACTTCCCATGAATAACCAGAATTCCCAGAATTTGTGATTACACCGAATTATCTGTCAATTCATCATG:1 + chr2L 22690241 3' + copia 245 1 69.86 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGTTCGAGTGTGATCTCTTGAGTACAGTGCGTTATGTGGCTATAAGGATACAGGCTA:1 + chr3R 22163332 3' - roo 65 2 63.97 AGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Cr1a 488 1 51.96 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAATGTCTGGCAGTTCAATTAGCAGAGTGCGATATGTTGAAAGGCATTCTTAATAGAATAATCAAATCGTAACAACATATTATTCTTATTATTAATA:1 - chr2R 12343144 3' + roo 9043 1 64.38 AAATAGAATTTGCTTGCATGTTAATGTTAAATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGC:1 + chrX 23362226 3' - 1360 3261 1 77.40 TATATGTATATATATATATCAGTGTTTTGTATATCAGTGTTTGGATCAAATTTACCAATAAGAAAATATATGAAAGAACCCACACATTTTAGTTATGTAAGAAATATAGTTTTTTTTTAAAGAATTTTTCGAACTATTTTTTTGCT:1 + chr3R 13554912 3' + 1731 4412 1 53.42 CTAGAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGGTGAAATCAACACTTGACTTCGGAG:1 - chr3R 5518324 3' - Transpac 4994 2 72.14 GAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTATCAATTAGTCGAACGAAATCTTGTTTGCTCTTTTATTGCTGCACATAAACGAAATTGTTAGAATAACAAAGTACTCGGCAGA:1 + chr2L 6683351 3' + jockey 350 1 56.16 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAG:1 - chr2L 13697600 3' - F-element 72 1 56.43 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACTTTAAGCCTTTATT:1 - chr2R 18723642 3' - 297 40 2 57.55 AAGTCCTCTTATATAACTCCGTTTTGAAACCCATATGGACCTATGGCTCCGAGCGATGGGGCAACGAATGTTATGTTGTATTTATTGAGCCATCGCTTTCGATGCGCGTGATCTCCAGAAGATGAATATTGTGTCCGCCCATAAAC:1 - chr3R 16050507 3' + Doc3-element 4286 1 52.05 GGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTACGTTGGTAACTGATGATCCTGAATGCCTTCCGATGGCTGGTCGCGATCGGTGC:1 + chrX 10469885 3' - F-element 4496 1 72.60 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAGGGGTAAGCACTTTTAACACCCCCACCCTTCGGCGGAGTAACTTTTGCATTAACAAACCAGGCTCGTAAAAAAGACAAACAGCCCATGA:1 - chr3R 31275307 3' + mdg1 7425 2 61.38 CAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCA:1 - chr3R 13684693 3' + 412 7470 2 71.92 ATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACATACTTATGTATATATATAGTATGCTTTTAGGGGCATTTGCAGTTTCGCAGCTTAATCGACTGATTTAGAAGTTTATTGCAT:1 + chr3R 20497449 3' - jockey 499 1 57.34 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAATCGGAATATGCGCATGCAAATGGCAT:1 - chr3R 12941764 3' - hobo 51 1 50.00 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAA:1 - chrX 20330546 3' + P-element 2811 1 33.56 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACCACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCA:1 + chr3R 13684789 3' - 412 7099 2 50.00 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACAAATAAACGTAGGATTTATTTCAACACT:1 - chr3R 18204298 3' - hobo 12 1 77.40 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATATTCTACATATTTCAGTGTGAATTTTCCAAGCCAGCGATAATGGCTTCCTAAAAC:1 - chrX 3453110 3' - roo 65 2 70.55 CATACGTCAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGTGAGTAAATTGTTCATCTCGGTTCATTTTGCTAGACCAGGGCTTGAGAAACACACGAAAGTATCGATTAAATGCTCGATATTTTTT:1 + chr2L 7810763 3' + P-element 2852 1 60.27 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTCATTAAAGACCATAATAAAATGTGGGGAAAGGCAGATGGAAATCGCAGCCCCTAACAAATTTGTCCACCA:1 - chr2L 6153902 3' - copia 51 2 54.11 GAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGTCGAAATACATTTTTATAAAAAAAACCATTTTATGAGTTTTTAATATCCAAAGGAGTA:1 - chr2R 18440632 3' - Transpac 146 2 60.27 CTGCAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTACTG:1 - chr3L 2668840 3' + Bari1 1650 1 54.79 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTGTATACCCAGGAATCGCACAAATACAAAGGCATACTGGGCCCAAACATATTCTTCCAAAACTTCAAGACCTTAAAAAAATTTTGGACCTTTATATC:2 - chr2L 20550919 3' - 412 7078 2 65.75 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTACTTACTAGACTTAAGAAACACTTTAAAAGCTTCGATGATAAAAAGTAACATGAATCAACAATATAAGTACTG:1 - chr2R 7769722 3' - Transpac 4928 2 70.91 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGTTAACACGTACACATTTATATATTAATACACACATTTTCAATATTCTC:2 - chr2L 7774908 3' - I-element 20 1 71.92 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCAAGCGCTTTTCATCA:1 - chr2L 16537517 3' - Transpac 43 2 56.16 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGNATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTGCATGTAAAATTAAAATTTAGATACAAATTG:1 + chr3L 15273354 3' + pogo 2082 1 75.34 GGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCTAGTGGCACATTGGGGCAATGTGGCACATTCCATTCCAATGGAAAATTATATACGACTTTTTACTACCACCTTTTGAGCGTCAATTCTCCA:1 - chr3L 17757840 3' - Tirant 8106 1 36.99 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGCATAAACTATAGGACTTTATGTTCCATTTGTGGGTTTTACTGTTTTCCCTTACTCTTGGCCGGG:1 + chr3R 24444125 3' - hobo 55 1 55.86 ATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCNGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATGTACACATAGTACACCTACGCAATGCCAGTTGTT:1 - chr3L 8158020 3' - flea 4836 1 73.97 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTCAGGCACTTTCTGCTTTCTGCTGACCCAGCCATTGTCTTCTCGTTATTTTAATATACGATTTTATATATATCTATATATATATTATACTCTGATTTGGCCCTGAGGTCA:1 + chr2L 13468388 3' + roo 399 1 51.37 GCGTGCCGGCCATTCCAAATCGCCTCTTATTGAGATCAGGCGCTTTGGAAAGTGTTCCCTCCAAACATAACTAAAAAATGTATACATATGGTTTATACTCGTATTGTCACACATGTCTCCTTTGCTGCGTTGCAAACTAATGACTG:1 - chrX 23041914 3' - mariner2 550 1 56.85 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGAT:1 - chr3R 8381687 3' - Tirant 42 2 56.85 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGCATCTATTTTGTGGCGGCGTTTGGCGGTCTGTTGTAGAT:1 - chr3R 7512867 3' - jockey 4684 1 52.11 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTAGGCAAGACATAATAACATAGATAAAAGGTTGACAACTTGCTAACAAATG:1 - chr2L 16554556 3' - blood 21 2 70.55 GATTGGTAGAGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGTACCCCAAAGCTGTATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTCATGCGAATTTGGCAAGAAAGTGCAATCGTTGTTGACAGATCCGCATGCTTATA:1 + chr3L 20268710 3' - G4 3478 1 63.01 TTTCGAACAGCTGTGAGAAGCCACAAGCAGTTTCCGCAGCCTAGGAAGCGTAGACACGGAAGAGCTCTCGTGTGCCATCAGCCGCTATGATTCAATGGAACAGCCATCCTGCTCGGGAAATTAAATTTCC:1 - chrX 17472376 3' + R1A1-element 210 1 70.00 CTAGAGGGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATATGTCACTATATGGACTTCACATTTTTTACGCTGTCTACTTTACTTTCAAGA:1 - chr3L 20765162 3' - 297 6628 2 61.61 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAATGCCAGAGTTAAGCCGGCAAAAAAATATTGCGTTGTCTCGGGCTGA:1 - chr2L 8895201 3' - 412 7091 2 60.27 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTCAATTATGCAATGTATTGTGCTCGTTTGCTACTTTAGAATGCAACTTCCTGCTATTTTGTGTGGAACGTAAGCA:1 - chrX 20024502 3' - 412 7102 2 52.05 ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTTCGAGAAAG:1 + chr2R 18618540 3' + jockey 4925 1 65.75 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGAAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATCCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGG:1 + chr3R 12787367 3' - BS 5073 1 67.12 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTAGCATAGCTGGATTTCTTTTCCAATTCTAGGGCATCTCTCTTTCTCTCTCTGAGTTTCCACTTTGCTATCCTTCGGTTTTCCCTCGCCAAACCTA:1 - chr2L 5789582 3' - FB 5 1 76.80 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTCATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAACCCGCATTAA:2 - chr3L 18010218 3' - diver 45 2 55.48 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGGTGGAAGCGTGAGAGTGATCACGTCCAGTGAACGGGACATTTCAATTTACTCGTCGCG:1 - chr2L 21909059 3' - transib2 65 1 60.96 TCACACCTTCAAATTGTATTGCTGGTGTAGCAAGCCTTTAAAGTGTGAAACATGGATTGAATGTTTTTAAAGGATTGAATTGACAGAAGTCGCTTATTGAAGACTACTGGCATCCAGAAGGGCCACCATCCATGGCACTTCCGCCT:1 + chr2L 15837338 3' - BS4 358 1 53.42 GGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGACATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAGCCGTTGCTGATGAAGTTGCCATAGACATTTTCCGAGTGTGGGCGTTCCCAAAGTTAAATTC:1 + chr3L 19436510 3' - 1360 3314 1 57.24 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAGGATCCAGGGATGTCACATATCAGCTCAATGTCGGGTCAT:1 + chrX 140111 3' - blood 7050 2 57.75 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGACATTGTTTAGATTTTGTAAATTGTTGATTTCTCGCAGCAGAAAGTTTTTTTTTCGTAGAGCTAAATAATAAAAAAAACATTCGAAATGGATCCAGCACTGCT:1 + chr3L 4287145 3' + P-element 2871 1 71.23 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTCGTTTACGTTTAATTGAGTTTATTGATGCATATTTGAAGTTGCCCCTCCTGCATTCGACTTCGATTCCGCT:1 - chr2L 1451142 3' - mdg1 52 2 57.53 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACGGTATTTTTAAACATAATATGACATTCTTACCCATACTTTAATGCGAAATACATACGCTCTTCTGTTTGCTTGATTAGTATAATCATTAT:1 - chr2L 19731903 3' + roo 9036 1 61.64 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTAACATTGATTGAGAAGCGCGGTCACATTGCTTGAACAGATGTTCACAATGATGAAATTGTTTACAACAGTATATTGTTTTTAAACAACAAAATGAGCGT:2 - chrX 13667733 3' - hobo 21 1 69.18 AGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGG:1 + chr3R 5972353 3' - Doc 327 1 72.14 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTCTTTTGGTTCCATTTTAACAATGATATTTGT:1 - chr2R 22112601 3' - 412 27 2 61.64 GGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGATAAAAATTAAGTAAAAATTTATTTTTAATATATATACTCTTGTTCAGACTAAAGTAAAAAAAAATTGAAATCAAAAAGGTATGGGTGATGTACTAAAATAATAATCTTGATAGCGAC:1 - chr3R 20345382 3' + blood 375 2 80.14 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTGAAGTATCTGAGTACAGAAGAAGTTACTT:2 + chr3R 22435623 3' - roo 8699 2 63.01 TTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACCAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTATTTATTTCGGGGGCGCTGGAAAATGTTGCAAAAGTTATTTCTTCACGGGTTTGCCATGGCTCTTAATGA:1 + chr3R 11359049 3' - Stalker4 92 4 56.85 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGATTATTAGATTTGTG:2 - chrX 21227078 3' - Tabor 6872 2 63.01 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAAAGTATTGCATTCTAATTTGAAATTATACCTTGAAATCTTATTAACCGCAACACAGTCCAAAGGCTTTTAT:1 + chr2L 11725048 3' - F-element 64 1 60.96 TTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTAAGTGTGATAGGAATCGTATCTCTCACCTCAACCCACACAATCGCGGATCGGTGTGTATTAAAAACAAGCAAGTA:1 - chr3R 8821803 3' + S-element 1673 1 56.16 ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGGCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATCAGTTGCTGACCTATAAATTCTTAGCTAACACTATCGCTTGG:1 - chr3L 7102335 3' + I-element 5275 1 68.53 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTCAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGTAGTTTCTGCGGCGACTTGCCTGACTTGTGTGATGGGAGGTTGATGTGTTTTG:1 - chr3R 17494903 3' - hobo 56 1 59.26 GTACCGACTATTACACATATTACACATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTAAATGATATGATAAATATGAGAAAAATATTTAAAATTGCTAATATTTTTATTATTTAAAAGTTACGTACAAAAATCGATACTATCGATA:1 + chrX 21963498 3' + 1360 2922 1 57.53 AGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGTGTTTATAAT:1 - chr2R 18035101 3' + R1A1-element 5279 1 56.85 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTACATGTATATATATCACCACCTCCCCGTATGTTTACCTAGTAGTCGTGTGCTTAAGTACTTCC:1 - chrX 15405951 3' - opus 7168 4 61.38 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTCATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGATGTTCGAGTTGACGGTGTTGTTGGGTCTTTAATGAGCCCACGTGACCTTTCCGAC:1 - chr3L 5479203 3' + roo 396 1 59.31 CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATG:1 - chr3R 5977730 3' - copia 4931 2 58.90 GATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTATTGAATCTAATAAGAGATGAACTCGCCACTGAATTTAATGTAATATTAACTGCTAGTATATTCAGCTGTTC:1 + chr2R 12249113 3' + Juan 4207 1 78.08 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTC:1 + chr2L 16607290 3' - 412 7125 2 65.07 GCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTTGCCAATCAGCCAGAAGGATGCCTGGACAGTTTCCTGTGCCACCTGATACCATTTCATATCTCTCTTTTAGTCTCATTTCTGCCTTCTTACCCGCTGGAGAC:1 + chr3L 20934278 3' + Max-element 281 2 71.72 GGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGGTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTTTTCTTTTTCTTTAATATTTTTTTCAATGACTTCTCCAAGGCTAGCTTGAATTTATTTATGGTTTTTATTTGTATTTATTTTGC:1 - chr2L 9177180 3' - I-element 140 1 59.59 TTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAATCCTCTGCCGACGTCTAATAACAATTTTCTAGCCATATTTATGTGG:1 + chrX 3709276 3' - hobo 470 1 68.49 GGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAACTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGCTTGTGTCTTGTAAAAATGGAAGTTGTTGCACTTATTTTTCCCTTTTATTTTGTTGCAATCTCTGGCCATCT:1 - chr3L 4714699 3' + R1A1-element 201 1 49.61 TAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATGTATGTATATACATAAATATGCGTACGTTAATAAGATATTTCCTATGAAACTTTTTAAGCTTGCCGCGAGGCCTT:1 + chr2R 17696146 3' + rover 303 2 56.16 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTATT:1 + chr3R 20983939 3' - pogo 19 1 72.60 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAACTACAATGGGGGGCTGTAGTATCTGGAATTATTGTA:1 + chr2L 19940152 3' - mdg1 25 2 69.18 AATTTTTGGTCTTCGGTTGGAACAAATTCAAATAAAACCTTTAATGCAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAATTCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTTATTTGACAACTTATATTGATATGCCTCCAAAAGTTTTCT:1 - chr4 687091 3' - Tc1 329 1 75.34 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAA:1 - chr3R 15137285 3' - roo 80 2 75.86 CGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTGATTTAGAATCTTCAAAAGGAAACCTTTATGATGCAAGACTGCACTATA:1 - chr3R 17766680 3' + HMS-Beagle2 7175 2 65.75 TGAATTTTCGTAAAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAAT:1 - chr2L 18284857 3' - pogo 82 1 74.66 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCTTGTTTTGT:1 - chr2L 3408731 3' + opus 7443 2 63.19 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATAT:1 - chr2R 22112648 3' - 412 74 2 68.49 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAACAGGAG:1 + chr2R 16185139 3' - 17.6 6967 2 58.90 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTTCGAAAGGAGGTTGTAGAAGAGCTCTGTCTATTTGAAATTG:1 + chr3R 30537694 3' + roo 8992 2 73.97 CCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGTCTACGATTTTTTGAAGCGACACAAGCCCGAATATGTGGTAGGAT:1 - chr2L 3912509 3' - roo 193 2 69.18 CTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGAT:1 + chrX 21227196 3' + Tabor 7252 2 65.75 CGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGGGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACATTTGAATATATATGTACTTGATTAGATATA:1 + chr2R 23596047 3' + blood 289 2 78.77 CCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACATCAACTTCGTCATTCAAGTGTGTCACTCAGTATACCCAATTCCGTCTGGAATCATTTGGCAAAAATAGCGTTTAAAGACGT:1 + chr3L 21433779 3' + Doc 475 1 52.74 ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCCAATT:1 - chr3R 14138548 3' + mdg1 7379 2 72.60 TGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATATTGTCGAAATTGAATGTAAATATTTATTTTTATTTGCATCCGACTGCATGCAT:1 - chr3R 22205448 3' + mdg1 7267 2 63.70 ATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGGGAGGC:1 + chr3R 8049036 3' - Q-element 116 2 67.86 GCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTTGCCAATCAGCCAGAAGGATGCCTGGACAGTTTCCTGTGCCACCTGATACCATTTCATATCTCTCTTTTAGTCTCATTTCTGCCTTCTTACCCGCTGGAG:1 + chr3L 20934276 3' + Max-element 278 2 69.86 CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATTATTGTTACATAATTTAGTGTTAAATAAAAAACTGATACCCAAAATGAGTTGCGAACTACGACTAAGGACACGACCA:1 - chr3L 13449151 3' - Quasimodo 48 2 56.16 TTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCACTGCATGTGGGTACCACTGTGGC:1 - chr3L 12072505 3' + HB 1594 1 56.85 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTGGCAAACAATTGTCTTGGTGATTAGG:1 - chrX 5721800 3' - pogo 30 1 57.35 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAAT:1 + chr2R 21199698 3' - jockey 4802 1 74.66 CAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCAT:1 - chr3L 2668846 3' + Bari1 1647 1 60.14 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATGATACTGTATATTGAATATTAGACAACTGAAAGCTCCAATCACTCAAACTCACAATTTTCCGAACATTCGACCACCATT:1 - chr3R 31419317 3' + pogo 2077 1 61.54 ATTAGTTTGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATTGTGAGTCGCCTCTGTGCGTGCTGCATGTTCTGTTGTAAGTAATAAGCATTTTTATGTCGCAATTGGCCAGGGAGGGGTTAAGGGCAG:1 - chr3R 23511516 3' + 297 379 2 71.76 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGGAGTTCATCATTACAAGAGCTCACTAACTTGTTTCAACAATCTGCAGCTTATTTCCCTCTCAGTCTCTGGCACTTGTGAACAGCTTTTGAAATATCTATAATTACATATTGTT:1 + chr3L 19222727 3' + 412 7521 2 65.75 AATTGATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGATCCCCAACCGCGGATGCGGATCGAGCCAAACCTTTCCGTGGATCTCTTTCCCTC:1 - chr3R 7041985 3' + Stalker2 7583 2 60.96 CTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCTCGCCACGCTTTTTGTGCACCTTTTCCGGCTTGAATTCTCCCTAAATGGGCATTCAGTCAAAATGTTGCACTCATTGAAATGCAAATCAAACAATTTCA:1 - chr2R 5856931 3' + opus 7329 2 49.25 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTTCAAAACCAGATTTCCGTTTTCAATTTGCAAATCAAATTGCCAGTTGGCCAAGGGGCGGAAAATTTCACCTTTCAACTT:2 + chr3R 17996819 3' + copia 248 1 58.90 GAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTATACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTT:1 + chr3R 8867084 3' - Max-element 74 2 67.12 GAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCA:1 - chr2R 13695628 3' + blood 7324 1 64.38 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGA:1 - chr3R 8631622 3' + roo 9002 2 64.38 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACGAGAAGGGA:1 + chr3L 9522154 3' - opus 35 4 54.11 GTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACACGTAATTTAAGTACAGGGGCCTTAGTCTTATTAACTACTTAAATGCGGTGACTTTGACTGCAAATAAGGGGCTAAACAATAAACAACATTTTATTGAAATAGCGATATT:1 + chr4 637826 3' + roo 8767 2 64.38 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAAC:1 + chr3R 13676147 3' + P-element 2784 1 17.81 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCCATTGCAGGTGAGTTAACTTGGAATTGATGATACACCATTGTGATGTGGGCGAAACGGGGAAAAACTAAAAAAAAAGATACGTATAACTAAAGCTA:1 - chrX 10284764 3' + pogo 2080 1 68.97 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAA:1 + chr3R 27398111 3' + roo 337 2 65.75 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGCCGTTTATAGCAATTGGTCGACTGATAACATTATGC:1 + chr3L 16200858 3' - roo 37 2 59.59 TTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAG:1 - chr2R 24807885 3' - I-element 65 1 64.38 GAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGTCCTCGTCGCCAAAGGATCAGTACGAGCCGCAGCAGCTGCAGCATC:1 + chr3R 18237037 3' - Stalker 202 4 64.00 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAGACTTGGTCCCAAGGCTATTGCTGTGTCTGCTGTGTGGCATTCTTGTCCTTGTTTTGTCTGTATTTTAAAAGAACCAGACACATTCTTACGTTTTGTTTTGTTTGGTTA:1 - chr2L 3408680 3' + opus 7492 2 76.71 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAATGAAAGGCAAATGTTTATTGGACGTATTGTGGG:1 + chr3R 27398139 3' + roo 9029 1 56.16 ATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAACTTAGTCACTAGGCATGTACAATAGTACACATTATAAACTAACTAAACGTCTGAAACCAATGCGACTTTATTTCACTGATCAC:1 + chr2R 18044067 3' - jockey 4598 1 54.11 GTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCTCAGTACAACGCCTTCTTTTTGTATTGGCAGACTTCGTTTATGGCCATGG:1 + chrX 7625742 3' - 1360 227 1 65.75 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTA:1 + chr3R 20983937 3' - pogo 21 1 71.23 TCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGATAAATCATCAAAATTTGACGGAATTGTGATGCATGCTGTCTTTCATAAATATACTAGATAAACTAAAGG:1 + chr2R 16480841 3' - Doc 4439 1 51.72 CTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACC:1 - chr3R 12789533 3' - G2 2815 1 64.38 GGCTATGCGAGGGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGAGCTTCTGTGCGGACGATCGGTCCGGTTAATTCACTTAACTTAGATATATTCGGATGTTCAAATCGGTAGAATGATTCATTTTCCTTTTGGCCGCCCC:1 - chr3L 4368068 3' - gypsy6 80 2 69.18 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGA:1 + chrX 15406056 3' + opus 441 2 57.53 AGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCG:1 + chr3L 20168327 3' + roo 9042 1 65.07 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCGGAAAGGAACAATGAATAAAACATTAGGGGCGAAACGGGGTGATGAAATAAGCCAACGAGGAACAAGAAAGTTAAATTGCAACAGATTGTTA:1 + chrX 10284937 3' - pogo 28 1 60.27 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGAC:1 - chr3R 12115268 3' - 1360 65 1 63.70 AAATAACGTTGAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTTGTTATTGCAATTAACTTGTTGCCGCAGTTCGCC:1 - chr3R 5979593 3' + copia 4897 2 75.34 AAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCA:1 - chr2L 18284844 3' - pogo 69 1 67.12 GCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTTAAACGACCTTTCTCGGCTCATTCGAATCTATTGCGCACCTTTTTAGCTCT:1 - chr2R 10159804 3' + 1360 3385 2 57.53 TAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATTAACCTTCGCAATGCCGTTGCTGTTGTTGTTTTTTCGACTTTTGTTGCTGG:1 - chr2L 9227693 3' + 412 186 2 65.07 GAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCAGA:1 - chr3L 8754718 3' - mdg3 5282 2 63.01 AGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAACTTAGTCACTAGGCATGTACAATAGTACACATTATAAACTAACTAAACGTCTGAAACCAATGCGACTTTA:1 + chr2R 18044054 3' - jockey 4611 1 52.05 ATGAGTATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATGTATTGCTTTAAGAAGGGCAGAGAGTCAAGAAAACAGATGGCCTTTTTATTTGTCGTTGGCTCGTCGGATA:1 + chr3L 3519299 3' - Cr1a 4321 1 78.08 AGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGCTTTCTTCATCTTTTGGGTATTCAAATATATCGTAAACTTACAGT:1 + chr2R 21355042 3' + accord 6924 2 69.18 ATATCCCAGAAAAATTATGCAATTTCGCGTTCACATTCAGACTAGCGGGTTCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCTCTTGTTTTTAATGTAACTTCATGATAAATATTCGATAAGTTAATGGAATTGCCGTAACGAGTAACCGTTT:2 + chrX 18812918 3' + INE-1 508 1 45.21 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATTAAGCACCTACTTAGTAAGTACGCTTATCCCCCATTAGTTTTTCTATGGTGTCAGCACTGAGATCGTGTTGATC:1 - chr3R 14800862 3' - pogo 43 1 51.37 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTCATTACGTGATTTAGTTAGCCAACTTTTGGGGGTGGCTCATCTTT:1 + chr3R 19246808 3' + jockey 4964 1 59.59 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGTGCTTTATTAATGCTCAGAAATTTATTTTACTATGGCCAAAATAATGATTTATTCACCCAAGCATTTGTTGGTCTC:2 + chr2R 16749861 3' + roo 9027 1 52.05 GGGGTGCATAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGGAGGGCAAACATTACTCAGGCTAACGAGTG:1 + chr3L 20868120 3' + hobo 2892 1 53.73 AGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCATTTATATGCAGGCCGCTAGAATCAATGAGAAGAAAGTTCTTCCATGCCACTCCAGCATCCCAAATGAAACGAGTTTCTCTCTCTCTCTCTATGGATC:1 + chr3L 14523154 3' - Doc 163 1 69.18 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTCAAAATACAA:1 + chr3R 13676170 3' + P-element 2811 1 34.51 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATTAGAAAAGTGTTCTTTTAAAATCATCTACATTGATTGAAATTCGTAGCATACTTTCTGGGGCAACATTTACTTACACGTCTCCGTTT:1 - chr3L 8936853 3' - BS 5031 1 56.16 TTCGTTTTTTTTTTTCTTTTTAACCAATTGTTCCGATTTACCGACGCGGGATATTTAAGTTGTAGTTCTTTAGCGGAT:1 - chr2R 4122833 3' - Doc2-element 244 2 88.46 GAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTACCGCCTTGTAAGAGCGGCCAAAGAAAGCGCGCTGAATTTGTAAGAAAAGGTAAACATA:1 - chr3R 9619720 3' - 412 484 2 58.90 GTTCTTGGACGGTTCACATAAACACGTTGTGAAATTCCTGCACTATCGCCATCTCATACCGATGGAATTTAAGGTCATCATAAAGAATTCTCGTCCTGCAGTTGTTACTTTGCTGGGAAGAGGACCTGTCGAACGTTT:1 + chr3L 20768436 3' - mariner2 627 1 65.94 AATATTAATATTAATATTCCAGGCTGAGCCATAGCTGCTATAAGTTGTGTTTAGGCCATAACTATTCCCGAGCAATTGAATGGGGGACCCGAGTGGAATCAATGCGAATTTATGCCCCAATCAAGCCTAAGAAGTTGGGAAAATTG:1 + chr2L 2091628 3' + Tc3 302 1 63.01 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGATTGGATACTGTTTTAGTGTAGCTGCCTATTGCATTTAACTGTGTTCATAATAATTTATTTTGAGCAACATGTTTGTGAGCTTTATAATCAAGCTAATGAAAGTGTTGCTATTCA:1 + chr3R 14801030 3' + pogo 2098 1 63.01 AAGAAAAAGAAAAAAAAAAAGCAGCCAAAGCACGACTGAATATCAATTAGCGGGCCATTAAATGTGCTAATGGTTTATTACCACTAAATGTTTGATTAACAAATCTAACATTTTGTATGGAAGATTTTATACCTTGAAATATTCAA:1 + chr3L 3544397 3' + Doc2-element 220 4 78.77 TCTCTCGCTCTCTACCAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAAATTACCTATTATCATTTTATAGCTAAACTAAGTACCTTCCTTTAAACGTGTACTTACTAAAAGACGATCATGAGTTCACCAC:1 + chr3L 24034916 3' - 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invader2 367 1 78.77 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGGCTGTCGAGCGGATACGTCACCTTCGGCATTGTAGTTGTAA:1 - chr3R 14277897 3' - P-element 62 1 36.15 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTAGGTCAGCAACTTAAATGGAGATAGTGTGGACATGCCCATCTGGACGTGTCCAGAAACTGAGTT:1 + chr3L 7102406 3' - I-element 60 1 54.79 AATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTT:1 + chr3R 10030796 3' - BS 5053 1 50.36 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTAATAGAGAGTATATAATATCTAAGCTCAA:1 + chr3R 7477516 3' - BS 5027 1 61.64 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTATTAATTGTGTTAAATAGTTTTTACAGCTGATTGGTTTATTGTTATCTACTTAACGCTAAATATCCAAGTGCTTTACCTAACTTT:1 + chr2L 3175230 3' + Burdock 224 2 63.01 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACCTACATATGTACATGTATATATATCACCACCTCCCCGTATGTTTACCTAGTAGTCGTGTGCTTAAGTAATTCCCTTACAAGCAACTTT:1 - chrX 15405936 3' - opus 7154 4 56.85 ATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAA:1 + chr2R 16185111 3' - 17.6 68 2 71.92 CACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAAACACTCGTATAATTGCATGTATGGCAACAGTAAAGCCAATCTATTTAAATGTTTACAAAACTACTGTGAAA:1 - chr2R 12164961 3' + roo 15 2 50.00 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTTGCCTTGATTAAACAATAGAAATGCGTAGGGCAACATCAATACCAGGATATTTCA:1 + chr2L 11705855 3' + I-element 5288 1 63.70 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGACGTACGTACAACGTACTATTGTAATCATTTTAGGGCCCA:1 - chr2L 5961228 3' - S-element 77 1 72.60 CATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGGGTTTCCATTTTACTTATCGAATTTTTAT:1 + chr2R 21619398 3' - blood 7104 2 78.77 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGGTTCAGGATGCGGCGGCCATG:1 - chr3R 5170975 3' - F-element 86 1 70.55 ACCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATCGGCAACGCACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTT:1 + chr3L 2486015 3' - jockey 4712 1 55.17 CGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGGTTTCGTACCCCGAAGAAACTG:1 + chr3L 9522129 3' - opus 60 4 66.44 CGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGCAGGCAAATAATAACGTCGTCA:1 - chrX 7848198 3' + flea 4936 1 69.18 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATATATACTTCTCGAGTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGTAGTTAACACGTACACATTTATATATTAATACACACATTTTCAATATTCTCGTATATAC:1 - chr2L 7774900 3' - I-element 12 1 76.03 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAG:1 + chrX 19583318 3' + roo 339 2 67.81 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCGTGTACATACATACAAATATGTATGTTTAATTGATATTTTTTTTTTT:1 + chr4 490384 3' + pogo 2095 1 80.82 TTTTTACATTATTTTTATGCTAGCCTGCGACTTACAATTTCGTTATTTGTGACCGTGTCTTGTGATTGTTGCTATTGCTGTTGACTGTCTTCATTTCTAGGTCTTCAACGCTAGAACCCAGAAAACCGCACAAAATCACACACAAA:1 + chr3R 16529647 3' - transib4 100 1 67.12 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGGAGGGCAAACATTACTCAGGCTAACGAGGGAG:1 + chr3L 20868122 3' + hobo 2933 1 67.37 CACGAACACTTCATGCTTTTGTAATGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTNGNCACGGACACTTCAAGCTTTAGGAAACAATCAATAAATGTGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTTCTAAAGTACACTTTAA:1 - chr2R 1225306 3' - Stalker4 475 1 51.37 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATG:1 + chrX 8208426 3' + roo 9027 1 55.56 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACATAGTGCCACCCGTAACTCCCGAAACTCCCAAAACTGTTGGCTCTGCGGCGTTTGCCGG:1 + chrX 12365391 3' + hobo 2908 1 53.04 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGATATCTTTTTGCTGTCCGGCTTTATGCAACATTTGAAAACCATTGTCTTAACAAGTTAG:1 + chrX 20024613 3' + 412 7506 2 51.22 AGGGAGGTCACGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGGCATTAATATCGAATGAGAAATAATTACAAGTGCTTAACCAGGCGATTCCCATGCTCATTACATTGCGC:1 - chrX 10667005 3' - jockey 4759 1 51.37 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGAAAAAAAAAGCACGAAGTAAAAAGCGTTGTGCGCATTGGCTTTCTTCGTACAGTGGACAA:2 - chr2R 8258273 3' - jockey 70 1 61.64 GACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTATTATATATCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCAGGCAGGAATGCTCCATCGTTTGCAGCTCCTTCGTGCCCGC:1 + chr2R 14114588 3' - Tabor 392 2 51.37 AAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTGCTCTGATGGGTAGGCTATTTTTGGTGTGTCCTTCCC:1 - chr3L 13680591 3' + hobo 2883 1 74.07 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATAATCAAGCGTGCAGCTGAAATCCTTTAAAGATCTCAAGCTCTGTTGCCACATGAGATGAGAT:1 + chrX 5456656 3' + roo 9014 2 57.53 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTTCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTTCGTTCGCCAAATTGCGTTACACATTTAGCCAGCTTTGTCCATGTCTGGCAGTTT:1 + chr2R 7293760 3' - 1360 62 1 55.28 GGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATCGATCCAACGCGGCGGTGCCGTGCGCAGTAGCCTGCAGGCTCAGAAACGTACGGAGTTGAATAACTCACGTAGAAA:1 + chr3L 3184004 3' + Stalker4 188 4 51.37 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTT:1 - chr3L 21636438 3' - 297 6604 2 57.00 GCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATCATTGAAGGGCTCATCCACTGACTGGGTGAAATAAGTCGCAATGCTCGTAATTGATGTGGATTACCC:1 + chrX 19019141 3' + accord2 1 2 54.11 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTAAAGCTTTTGTTGTGAATGAGTTTTC:1 + chr3L 22435219 3' + opus 7455 2 53.15 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGGGGGCAGGTCAATTCCAGAGCCAAGGCAAACA:1 + chr3R 15047452 3' - F-element 31 1 66.21 GGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGAAAATGAGAACGAGATTTCGCTATCGGCACAATCGCAGC:1 + chr3L 4615817 3' - F-element 356 1 72.60 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATTGCGCCGTGGCGTATGCAATA:1 - chr3R 23104479 3' - jockey 72 1 58.90 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACTTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCT:1 - chr2L 16537547 3' - Transpac 52 2 62.40 TTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTGCGTAAGGTCTGCTTTCATTATGTTTCAGG:1 + chr2L 16276518 3' + S-element 1632 2 77.40 ATTTTTTTTTACTTTTTATTATTTTTTTATTTTAAAATACATTTTATTCTTATGGGAGGGTAAAGGGCACGAAATATTTAGTTATTTTGTTTGTCCAAGTGAGTGCAGATACACCATTATTTGATATATTTAATAAAACAAAAAGG:1 - chr3R 25710273 3' - Doc 4692 1 74.66 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACATACCCAATGCTCCATGCCGATTGTGAAGTGTGCAAAACTTTCAAACACCTCTCGCTATTAATAGCAGCAAATATTATTAATGACTGGGCAGCCAACTGCTGCAAATG:1 - chr2L 4631087 3' - roo 12 2 73.97 AAAACGTGTGCACAACTTTAATTCATTTTCACCCAATCAAAATTACATTTTCATTACGCGTAACAGCATTGGAGTTGAGTTCGATTTCTTTTTTGTATATCTACTTTGTAAATAACTTTCAGAACATGTAATAGGTTTGTTTGCAT:1 - chr2R 20842902 3' - Transib5 148 1 64.38 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCAATCGCTCTCTCAGTCGGAGCGTACGCTCAAAAAAAAAATT:1 + chr3R 14277983 3' + P-element 2882 2 72.63 AAACATTCAATATTTTTTTTTTTGGAAATCAACTTTCCACATGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTATATAGGTTAAATTATTTATTCTTTTTTAAAATTGGTATCTGTAGTATAGCACTCTCTATCGGT:1 - chr2R 8251777 3' - Tc1 53 1 61.31 GAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGAGAATATATTTATTATTTGCTTTTAAGTACTATGTGAAATGGGGAAA:1 + chr2L 15312086 3' + jockey 4540 1 63.85 CTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATCTCCACTACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAATGATA:1 + chrX 17495794 3' + Burdock 6319 2 67.81 GAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCACCATAAATAAATAAAATAACACGTACCTCAAAGTGCAGCTAACGCAATC:1 + chr2R 18767241 3' + pogo 2033 1 65.07 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTTTGCGGCTGTGTGGCACCCATAATGAGTAAGCCCAAAACAAGAAGTTCTGCAAGAGACAGGATCAGATTAACCGGACTTGATCACTCGGTT:1 - chr2L 8930440 3' + roo 9043 1 65.75 AAAATTCTAAGTCGCGGAGCAAAATCAAAATTTTGCTAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTGCCGAAGAAACTCCCGCGGAACCCACTCACCAATACACTCGTGGCAGCCATACGAAACAGGCTGGATCAAA:1 + chr3L 8249817 3' + HMS-Beagle 309 1 60.15 AGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACATATACACGATGTGTTTTTGATATAAATGAACTTGCTTATATGCCCATGACAAGTATGATTTATTGGCTAATTG:1 + chrX 19163379 3' + Burdock 6348 2 55.86 TTTATTATTTTTTTTTTTATATAGTTCAACTGGAATCACAGCACGGCATCATGACCCTATCCTCTTTGATCCGTAAGAGGCCAA:1 - chr3L 11815112 3' - gypsy11 3929 4 89.29 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCAGACATTGTTTAGATTTTGTAAATTG:1 + chr3L 4287066 3' + P-element 2792 1 19.18 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAAAAAAGAGGAACTGCTTTAATGCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGAAATAATTTTGTTTGCGCATCAATCAAAGCGATTTTTCGGGGGCGTTG:1 + chr3R 31086637 3' + jockey 4971 1 60.27 AGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAGGCAGTCAGTCAACCCTCGAGTGTTACGAG:1 + chrX 10694346 3' + Transpac 221 2 80.14 TACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTTCTTGTGCCCATAGTGAGAAGATTTTCATCTAGATTCTGCACAGATG:1 - chr3L 3714335 3' - Quasimodo 104 2 67.81 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAAAAAAAC:1 - chr2R 25083255 3' + pogo 2064 1 63.01 GCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAGCGAACAATCGAAAAACATTAAATATAGTATGTTATAGTAGGATATAGTACAACTACGGTTAAGGCAC:1 + chrX 19690675 3' - gypsy 11 2 76.71 GACAATAAGTACATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGCGCTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACAATAA:1 + chr3L 15099692 3' - G4 3804 1 58.90 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACATACGTAGTTCTGATAACGCCTAAAGCTAGGCAATTATGAGCGG:1 + chr2R 6089187 3' - 1360 30 1 65.75 AGATTCTCTTTGATTTGGCACCACTTAGGACGAGTTTGCAAGTGTGACAACCAATCACGAGACCATTGGGACCAGAATTGTCGCGTCATGTGTTTTTTCATTTGAAACAAACTTTGAATTCAAGCATACATATTTCTTTCCAATAT:1 + chr3L 16453217 3' - diver 5615 1 64.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACAAAAAAACTAATCGCCCGGCATCCCGCTCCAGAGAGCGAAAGCTCTGCGCTTGCGGGTGGTGAAGAGCTTTT:1 + chr2L 3059461 3' + P-element 2878 2 69.09 TTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGGAGCA:1 - chr3R 8065208 3' - 297 6597 2 66.67 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGGTTACTTGATTGCCCCCAAAAGTATGCAATGCTAATAAATTCGCTTTTATGTGGCCAGCGCTCAATTTTCGCCCCCACTCCGCGC:1 - chr3R 19725327 3' + hobo 2930 1 71.67 AAGATATTTCCAAATAAAAGCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCTCTAAGTCGGGCCTAATCTATGCACATTTGGAATTGGTTATTACCAAAATTAGGATTTTCTTAATGTAAT:2 + chrX 7032778 3' + roo 9021 2 51.37 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTACATTCCCGTTCCAGGTAGCTACATGAAATAATATGACTAAGATCCCTACCATAAACATACTTTAGGGGTTGTTTGCGTTTTACAAACATTATGATTCCCAACATGTTCAAG:1 + chr2L 13244785 3' + jockey 4983 1 72.60 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGAGCAAACAAATCG:1 + chr2R 14332085 3' - jockey 90 1 73.97 TAGCTGAGTAACGGCTATCTGATAGTCTTTTGTCTGGAAAATATAAATAGATTTTTAAACAATTTGGTAGATATTAAAATGTTTTTTTTTCTCTTCTTAAATAAACATGTATGTAAATGTAAGGCCAGCTTATGTTCGCATTCAT:1 - chr2L 12156835 3' + INE-1 544 1 51.72 ACTTCCTTCGTAATACAGGGCTTCAGAAATAATATTCAAACAGGTGTCATCTACACTGACTTTAGTAAAGCATTTGCCTTTATAAATAATTCTCTTCTAGTAAGCAAACTTGATTTATTACCAACTTTTCGCACCAAGAAGTTGGC:1 + chr3R 6123917 3' + Q-element 259 2 80.82 GTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATAGTTAGTGAACTTGGAACGAT:1 + chrX 21667933 3' - gypsy2 6532 2 62.39 GGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTATTTATTTTGAAGTTATTGATTTTGGCCACAAAAAGGTTTCCATAGTGCAACGTAAAAGTCAAGCCGATGACCAGCCTGACAAAATATGTACATATGTACATCTCCCCAAAC:1 - chrX 22575912 3' - INE-1 87 1 67.12 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGC:1 - chr3R 17944029 3' + P-element 2853 1 47.12 GTTACTTAATAAAATCTCTAACTTTCATAACGACCTTTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAATAGATGCATGATCCAACTTTGACTCGGACTTGGTGAGATTCTGTTTTAATTTGCGATTTTCCGCTTGTTT:1 + chr3R 18840271 3' + gypsy7 414 1 59.31 ATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTTTGATATTAATGTGCTGTAACATAAAATAATGCTTCCAAATCAATGTTAAATCATAAGTCCTCTCAATTTCCTCCACCACTTCTAATTCCCCTTCAAAAAAGTTTATCTATTGGAAAAATT:1 + chr3L 19106537 3' - roo 8664 1 78.77 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTGCATGTAAAATTAAAATT:1 + chr3L 15273341 3' + pogo 2069 1 67.12 CCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCCTTTCCACCAAAATTTAAGTGGATGCGGCGTGGAGATGGAAGTGGGGATG:1 + chr2R 13117929 3' + 297 327 2 64.38 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATA:2 - chrX 21227117 3' - Tabor 6911 2 64.38 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTTTTCTATGAAACACTCTTCACAGTTTCTTGGCACTCATGCTGCT:1 - chr3L 17934933 3' + HMS-Beagle 6970 2 68.49 CATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAAAATTCACTATTCTATTATGTTTCGCTATTTAGTGACTT:1 - chr3R 31525497 3' - Juan 4163 1 73.29 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCAC:1 - chr3R 9550902 3' - P-element 52 1 43.85 AGGTAAAGCTCGACCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTATCATCAAGCGAGTGGAAAGTTCTGCTCACGATTTGCTTATCTTTTGAAATTCATCTAA:1 + chr2L 5341602 3' - Burdock 58 2 56.16 GGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGATCTCGAATACTGTCAGTTTTATTGTTTTAT:1 + chrX 22574698 3' - 17.6 7039 2 45.89 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGT:2 + chrX 8208403 3' + roo 9002 2 68.49 CTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCACTTTTTTTCGCAAGTGCAGCTCCGCGGTGTCGATTCCGTAATGAGCCCGCGCATCGATTGCGTAAGTTCTCCGCGGATGCATCTG:1 + chr3R 29515347 3' - mdg1 7305 2 55.86 AAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAG:2 - chr2R 17696036 3' - rover 70 2 66.44 TTTTTTTTATTTTTATGATTTGTAACAATTTATGGATTACAAAATATTACAAAATATATTACAATGCTTTTTACATAATTATATTTTCACAATACATATTCACAATGCAATTACAAAGATTTGTTTCCGAATTAGGAACTCTGTTT:1 + chr2R 10927265 3' - Rt1b 5147 1 69.86 GCTCAAGCGGTCAAGCTATACATAACATATGTATGCAGAAGGCATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAGCAGAAGCTCTTCTCTTGTTATTTAAA:1 + chrY 3648944 3' + Stalker2 7457 2 73.97 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTGCTGTGTTCCCGTCTCCGGATCTTTGG:2 + chr3R 6147356 3' - copia 4912 2 56.16 AGCTCTATTAGATGCCTGAAACGAAATCTTAGGCTTCTGGCTACACTGGAAGTATTTATGGCCGCTGCTCCATACAAGCGGAACAGAAATATATTTATCGATATTTGAATTCAAACTGTATTCTTCCATAATTTCCT:1 + chr2L 22983828 3' + Transib5 2911 1 50.36 TAATATATTAATATTTATATTCAAATATTAAAAAGTTCTGCATAATTTTGATTTTTACAAGCCAAGCCCAAAACATGATATTTATTTATAGACGAATGAAAGCTACTCTATAATTCTTGTAGATTTTAACAAAAGATGTTTCTAAT:1 - chr2L 7770642 3' + Tc3 299 1 43.15 GTGGTGTGGTCAAGGATTCATGGAGTAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTGGTGGAAAATTTATTTTTTTATTTTCTATCGTGTTAACGAATTGAATTTTTATAGAGTGTTAGAAATTTGGTGGTTCATCTCCATTCATAT:1 + chr2L 23071846 3' + Tc1 1233 1 58.22 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGGATACATGACTATATGTTTTCGCCCAACTGACTAACTGACTAAATGACTGACTGACTCATGTCTCGAAAAGGTGAGTGAGTATATATGTACATGTTTAAGACGTATGTACAT:1 - chrX 10694235 3' - Transpac 4943 2 67.81 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAGCTTCGTTTCGGCTCAGTTTGAGGTTGCCATGGTGTGTGTTTAAA:1 + chr3L 14116815 3' - BS 5012 1 71.92 GCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGC:1 - chr3R 23415868 3' + jockey 4967 1 67.81 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGGAGCCAAGCAAACATATGAGCACAG:1 - chr2R 13695592 3' + blood 348 2 65.07 GAGCATACGTGTGTACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGTTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAATGGAGCCGCTACCAGACCGAGAACCAGACTTTGAGCGGCTG:1 - 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chr2R 18723640 3' - 297 6626 2 56.16 AAAATAAAATAAAAACCTATTATTTAAATGGAGCCTATGGAAAAATTATTTAAATTAAATTAATTTTATAAACAAATAGCTTGAAAAACACCTTACCAATTTCTGACCCGATCACCAAACAAAGTTAATGCCAAATTGCTGCACTC:1 - chr2L 14332581 3' - transib1 1893 1 69.86 ATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTAGGTTTCACCAATTAGCTGCATTAATGAATCAATCCAGCTATTTCCTTGTGATCGATAAG:1 + chr2L 6367417 3' + diver 162 2 60.27 TCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATNTNTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTTGTT:1 + chr3R 9550982 3' + P-element 2815 1 34.93 ATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGACGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACACTGGGATTTCCCCAAACTGTCATAAATTTTTTTCGAATGCTGCACAAAACTTTGAGTCGCCTGGGAAAAAGTTTTCCCAGCTTATAAATCCATG:1 - chr3L 2816368 3' + Tc1 1562 1 59.59 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTGGATTGTTTAACACCTGAACAGTGGACACTTTGTTTCTATCTCTTTCTTACTCCACCGCAAGCGCTTTTCATCAGTGATAAAGACAGAGACAGACAACA:1 - chr2L 16537492 3' - Transpac 4937 2 73.29 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATTACTTAATGGGTAAATAAAGTATATGGTTTACGGCTTTACGATGTCTGGTTTGTTAGTCAT:1 - chr3R 21843746 3' - blood 7072 2 57.53 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCAATGGTTCAATAATAA:2 + chrX 7042746 3' + roo 9031 1 58.22 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCA:1 - chr2R 19015976 3' + roo 335 2 68.49 GGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCA:1 + chrX 21994019 3' - McClintock 5987 2 60.96 AAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCGCGGGCACAGCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGATTCTTCAGTGGTTGGCTGGGTG:1 - chrX 10737093 3' - roo 301 2 77.39 GTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGATTTCCACATAGACTCGTACTGCTATACTTTATCGGGGCTTTCACTTATCTATTTTTGTAATTTATAGTTCGGTTATCAAGCTG:1 + chr3R 23684378 3' + accord2 7394 1 57.53 GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATANGNGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCTCAGTGCTTATGGCAATTGA:1 - chrX 21227092 3' - Tabor 6886 2 53.42 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAGGGTTCGTTGTGCGTAATTTCTGT:1 + chr3R 23579395 3' - roo 8718 2 54.79 CGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGG:1 - chr3L 20189604 3' + FB 201 1 52.41 TACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACG:1 + chrX 7626197 3' - Transpac 81 2 76.71 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAAAAGCACTGATCGAATTGAACGTCAACAATTGTTGCCTATC:1 - chr3R 27007304 3' - roo 8687 2 67.81 AATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGC:1 + chr3L 17758009 3' + Tirant 321 2 76.26 CAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATGTGTGTGTATATATGTTTCTGTGGCCCACCAAGCTGTCTATGTCTATGTGTTTCCATTTA:1 - chr3L 2668843 3' + Bari1 1647 1 58.90 GTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAGCACAAATTATGGCCGAGGTGTGGCTACTGAATGAACGAATTGTTGTGTTTGAATAGCAAACC:1 + chr3L 8754896 3' + mdg3 232 2 75.17 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTAGGGTGGCAAGGCTTGAGGATCGCGGCATGGGAATTTTTCATTCTTGGGTGATCAAGCATAAATCATTGGGTGAAACTGTAATCTATACAAATGATTGAGTAAACG:1 + chr3R 21655109 3' + roo 393 1 74.66 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGATAATGGAAAGAAGTAAAACTGAAGTTTAACGTCGCCGATTATACATACGTAGTTCTGATAA:1 + chr2R 6089160 3' - 1360 56 1 57.24 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAGCTTTGTTTCCATGAACTCCACCGAACAAACAGCTGAGCTGTGCTGAGAGGGGGGTGGGGGGAGAGAGGGAGC:1 - chrX 17726245 3' - pogo 46 1 51.37 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTG:1 + chrX 2104774 3' + roo 8996 2 69.18 GAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAAACGCGGCTTCACCGACAGGACGCAGCTGTTCAATCCCGCAT:1 + chrX 17153812 3' + roo 176 2 71.23 AGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGCATTTTAATTACATGTAAGAGGAATTCAGCTTACTGCTGAAATCCGCTTACAGAAAGCAAGCGAACTGA:2 - chr3L 18091069 3' + pogo 1833 1 56.16 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAATCGTATAATTCAATTCTAAACACGCTGTGTACATTAAGAACGTGGCATATCTTTTTTGCAAATCGAATAGATGTGGAAAGTGAACGTCTT:1 + chr2L 21777912 3' - pogo 25 1 67.81 CAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATCGTTTGCAACCCCATTATTTTGAATATGTATAGTAACCTGTGCGGAGGTCAAACGGGGATTCAA:1 + chr3R 15137395 3' + roo 377 1 62.33 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGTTGGAAATGGAAATGCCGAAATA:1 + chr2R 11663879 3' + P-element 2790 1 18.49 CCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCA:2 + chr2L 23034090 3' + FB 394 1 49.32 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTT:1 - chr2L 19698045 3' + roo 9043 1 61.64 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGA:1 + chr3R 10030813 3' - BS 5043 1 59.59 TTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAATCGGCTCACCTGCGACCACCGATGGCGATTA:1 - chrX 15746231 3' - jockey2 3211 1 77.40 CTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTAAATACACAAAAATACTAATATTGTAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTATAAACTTACATAC:1 + chr3L 8295840 3' - Quasimodo 47 2 56.85 AACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGGTATTAACCCTGAGCAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAATAAGTTGTTTGCATTTTTCTATGACTTTTGGTTCGATATTCCA:1 - chr2R 23699043 3' + Cr1a 440 1 70.34 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTTTAACCAGTGCACTGGTTTCATATGCTGATGCTAATTTTTTAAAAGATATTCAACATTTAATAAGTA:1 + chr2L 17136255 3' + hobo 2935 1 42.47 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACATATAGTAAAATATCCTTCTCTTT:1 - chr2R 22112628 3' - 412 7107 2 54.79 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAAC:1 - chrX 12105240 3' + 412 7487 2 62.33 AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTAAGTGTGATAGGAATCGTATCTCTCACCTCAACCCACACAA:1 - chr3R 8821837 3' - S-element 77 1 69.86 CCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAATAAGGATAATTGCTTTCAACAATTATCTATAAATAATTTGAAACATTTTTTAGAATTGGCGACCA:1 - chr3R 8866994 3' + Max-element 158 2 45.89 GCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGTTATGGAGAAAAATGTTCAGAAAAAAGAGGCAGAGAAAGGCTTACCAAGAATGTTGGCCCA:1 + chr2R 14129789 3' + 1731 4566 1 62.33 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACA:1 + chrX 22511437 3' + roo 8984 2 79.45 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCCTATTATCCTTTTTCTTTATTCTGTGCAAGGTCCTACCCTTTTGCCC:1 + chr3R 10433289 3' - 412 7126 2 71.92 CAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAAT:1 - chr4 1267786 3' - Stalker4 7139 4 80.82 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTTGCTTTG:1 - chr3R 24093489 3' - jockey 60 1 52.74 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGG:2 - chr2R 25083269 3' + pogo 2050 1 54.11 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATACAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCAAATATTTAATACTTGAAAAGATTTCACGAAAAGCTTATTAAAAG:1 - chr2L 18284800 3' - pogo 24 1 67.59 AAATATATTCGTGTTCATGTGAGAACATAAGGTGCAAAAAAATTGCTCAAATGAAATTGCATATCGAATTTCGCTTTGAAGGCAAACGGAAGGCATTCGGCTGCACACATATGACATGAAAGTCGAGGAAAAGCCGTGCAACTTGG:1 + chr2R 21110684 3' - roo 8670 2 73.29 ATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGACGATCTGGTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCACGATTACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGATGAGATTCATTTTCGCCTATCGAATTGCATTTAGCCTGAAGACAAATGTCGAA:1 + chrX 7980034 3' + INE-1 86 1 69.86 CTCAGTTCAAATCTTGTGACGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCACTGCCGTTAAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAATCGTCCAAACACGTTTTCTTTGTGGAAAAATCCTTTAAAAAATAAAAC:1 + chr3R 10967467 3' + gypsy 7222 2 66.17 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGAAACGAGCGTCTTAAGATCCCAAGTTAGGTTTTTTTCAAAATGTATTTCCAATTATATTAAACTAAATGGGCTTATTGTGAAA:1 + chr2L 16607324 3' - 412 7091 2 54.11 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATTTTTGAGCAGCTGTAAGAAAAAAGAGTTGCTTAACAGCATGTAGTTAAACCCCTAGATGAGCTTATCCCACTCACACGCACATTAATCATC:1 - chr3R 12538025 3' - mdg1 30 2 60.96 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATAT:1 - chrX 19163273 3' - Burdock 74 2 69.86 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTATTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTGAAACCGATTTACTCCCCTTTAATTGGCAACGTAGGCAAG:1 + chr2R 12379658 3' - pogo 7 1 76.03 TCAGACTCTACTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTGATATGTACATACATACTCGGATGTAGTACCCCAAAGCGTAGTGTGTCATAAATCAAGTTATTCTACCAGGCTTACGAACGAGATAAATATGATT:1 - chr2R 17653203 3' - hopper 233 1 63.01 GCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTG:1 - chr3L 20934148 3' - Max-element 60 2 59.84 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCTGTTTTTTGTTTGG:1 + chr3R 20345558 3' - blood 7055 2 54.11 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAATCAAACAATGTACACGGCTTTAAGTATTAGTATTTTGGCTGAAATTTATATTGGATTTTTTACTATGAAAGTGAATTGCATT:1 - chrX 15252254 3' - opus 36 4 50.00 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAATGTTTAATGAATTTTA:1 - chr2L 19698043 3' + roo 9045 1 63.01 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTGTAAAATATTATATTTACAACTTTAACATCCAAAGAAAACCATTTGAAAAATTAAAAGGCGATAAATGCATTGA:1 - chr3L 15389518 3' - I-element 49 1 51.37 CACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGCCACTGCTGCTGGCCAGGCCAAAGGTACTCGGCTTCGGAAGGCGGGAGACGCCATCCAGGCGGGGAATGCGAG:1 + chr2L 3127756 3' + Doc 494 1 71.15 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGTATGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTTGCCTCGAACTGTGCCCT:2 + chr3R 20345545 3' - blood 7068 2 56.85 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCT:3 + chrX 8208417 3' + roo 352 2 58.90 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGATTCCCTAAGGATTTATTTATATTTTGTTTGAGTAGCTGGCATAGAACCATACCCCCGATAA:1 - chr3R 5518259 3' - Transpac 4935 2 74.66 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGGGAATGGTTGTGCAAAGTTTGGGGGGGGGAGGCGCAAAGGGTTGGG:1 + chr3R 18204429 3' + hobo 2871 1 68.12 GCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTTTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGATCTCTCGCTCTCTTGAGGTTGCATTTGCCATCGGGCCAGAATCCCGGCTGAGTGATCTATGCC:1 - chr2L 20555342 3' - 1360 180 1 64.38 TTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATG:1 - chr3L 22038214 3' - diver 5954 2 62.76 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACGCTTCAATCTCATTTTCGATGGATACGAATCTTCGGGCCCTAAGAAATTGCTA:1 + chr2R 22112730 3' + 412 426 2 65.07 ATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTCTGGGGGCATCTTGATTTATATCGTCTAGACTGGATTCGAAGCTAAAAATGTGTTTATAATGCGTTGGGACTTTCTTT:1 - chr2R 18035084 3' + R1A1-element 5296 1 55.48 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATATCCTTACCATTTTGGAACAAGCCAAAAAAAAACGTTACAAAAGTCTCCAGGGACCTGGTTATTGCAGTTGGTTCCCAAACCCGCAATTGTCGTGG:2 + chr2L 20819368 3' - copia 4895 2 66.44 GAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAACTATACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCTCTATTAACGGAAGAACA:1 + chr3R 2999861 3' - McClintock 49 2 53.42 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCACGACAAAATAATCTCTCAAATGTAAGAAAACTGGCGGCGGGGGGC:1 + chr2R 18551774 3' - I-element 70 1 66.43 ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGTTAATGATATCTTCCTTCCAGAAC:1 - chr3R 13676125 3' - P-element 80 1 21.37 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATCTTTATAATCGAGCACCTAACGGCAGTTAATCGTTAACAATTAAACAAGTCACAACTAC:1 - chr2L 18737947 3' - roo 56 2 58.22 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAATTTTTGGCACGTTCCTGGGCTGCTCGCTGCATTTATCTCTTCATTCAGCGACTGCTTGCCATGTTAATGAAGTGAC:1 - chr2R 19015947 3' + roo 9028 1 55.48 ATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAGATCCAATTTATTGTAATGTAATTAAATCTTAAATTCTTAATATTACCCCCTTCTATTTCCCTTCCACATTTGTT:1 + chr2R 18860194 3' + 297 224 2 52.05 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGG:1 - chr3R 17944041 3' + P-element 2817 1 28.91 CGCACACATAAACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGAAATAATTCCATCGTACTTACTCGATGGTATTGGCGTCGAACTATGAAGTACAACGTTCCTGTGACGATCCCTATCATGTG:1 + chr4 201479 3' + 1360 3222 1 60.96 CTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAACATTTTATATCAACGCAAGCCTGAAAATTACTGGAGCTGC:1 - chr3R 20948337 3' - 297 6772 2 73.29 TTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATATAAGAATATTTAGTCAGCTGGCTGCAGACCGCAACCACACCCACCGCCCCTCAACTGCCGCATCTA:1 - chr3L 11363560 3' - HMS-Beagle 53 2 54.11 GAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATTTTCGAGCACATATCTAACATTTTCCATCTCGGCATCGCATGTTTAATTCATATTTATGGCTCATAAAACTCTATCATTCTTTTAGTGTCGCGACTC:1 - chr2R 16072873 3' - opus 17 2 69.86 GCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATA:1 + chr3R 8867089 3' - Max-element 8304 2 65.07 ATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATA:1 - chr2L 18284848 3' + pogo 2012 1 56.85 AGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAA:1 + chr2R 3104470 3' + Gypsy6A_LTR 341 1 69.86 AGCTGAAGTGACCATCTGGAATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCACGCCCACCACCGCCCACTTTTCCCCACTTTCGCCCACAATTGCAGTGGCCGCACCTTTGT:1 - chr2R 23314479 3' - Chouto 223 1 50.40 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTTGGTGCTGGTGTTGGCCGGCTAATGCGTT:1 + chr2R 8597067 3' - pogo 23 1 69.86 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCTTCGATATATGCACATACTACACTAGTAAGTTTTACTATCTCATGAAAAGTATAAGCTCCAAGAGTATTGCTT:1 + chr3R 20345528 3' - blood 64 2 63.24 AATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCAATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATTTCGTTGAGATGAATTTAATGAAATTCTTTCTGCGTCTTGTAGCAATGGCAAGGATCTGCTACTTTTGGACATTACTC:1 - chr3L 5241766 3' + F-element 95 1 45.21 TGATTTCGGACCGAAAATCGTCTTATAGCATGAGTACGCACACATACATATACACGTGTATACACGTTCTCGCATCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATCTATTTTAGTACTCCATTTGGTGGAAGACCGAAAATGTAGCA:1 + chrX 4353062 3' + 1360 3187 1 76.03 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGGGAATTATACTGTATAACATTATTTCACTGTCAGGCAACAAACAAACGATGATAATTTCATCGTTTGCCATAAAAGTGACTAAAAGTTAAAGGCTACGTAATAAATTAA:1 - chr2R 17400251 3' - pogo 28 1 64.38 CGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACCAGCGCATGTGTCCCCGATTATACAGATCT:1 - chr3L 17757957 3' - Tirant 89 2 78.08 AATACTGGAAATTTGCATATTTTTTCGAGGCAAAGACAGCCAGCCATCGAGGGCGACAAGAAATTTAACAAAGTACAAATTGTTATTTGATTTGATTATATAATGACGCCACACATACCCCATCATCTGCCTTTTGCAATTTGCCT:1 + chr3R 6014083 3' + hopper2 1559 1 69.86 CTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTCGTTTCAGTTTCGCCCATGGTCTGGATACCGCATCAGCTGGTGGGTATTCCCATTGGATTCAACATCACCCTGGAATGCTTCATCGAGGCG:1 - chr2L 6385752 3' - invader4 2766 2 79.23 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGCTCCCGTGCAACTAATGCACACTTAAAATAACTAACAAAACTCCATTAAAAGCTGCAGCCGGAAAGCGCCTGCGAAACATTT:1 - chr3R 8394381 3' + hopper 1411 2 78.07 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAATTTCTTTTACGAAATACACCTGGATATGTGAACCACCCTCCCATAATCATCAGCAGCTAG:1 + chr2L 21026739 3' - FB 61 1 59.59 CGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAGGCACGCCGCATACAAGCGTATTCTAAAGGTATTAGATATGAGACGGCGAACAATATGCAAAACGAATATACATACGAGCACACGCCCAAGGTTCCAGAAGTCACA:1 + chr3L 6721722 3' - I-element 5082 1 71.92 TGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCC:1 - chr3R 23415935 3' + jockey 4900 1 78.77 CAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAA:1 + chrX 22383291 3' - G6 18 1 65.52 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAATTGCACAATTTTTCTGGGATATCGATAGATAAAAGATAAAATGAGAAAAAAAATTAAATTTATGCCTTTCACCTCGCTCTTGGCGATGGGGATTCCGATTAAGAG:1 + chr2L 5060586 3' - INE-1 549 1 67.81 CATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACC:1 + chr3R 5972383 3' - Doc 267 1 61.82 TTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGGCGTTCTAGTGTGCTATAGTCGAGTTTCCCGGCTATCTGATAGTGGAAGTAAGAATGTGAAAAGTTAAAAAAAAGGTTTAAAATTGTGGTTATGGCGG:1 - chr2R 5246642 3' - INE-1 249 1 67.46 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTC:1 + chr4 490317 3' + pogo 2053 1 61.98 ATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTG:1 + chr3R 30518921 3' + I-element 5267 1 78.77 CCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCG:1 - chr2L 21325117 3' + invader4 241 2 75.86 GGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTGGTCGGCGCACAAAAGTATGCTACAAATA:1 - chr3L 18947245 3' - BS 4699 1 51.61 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATACATATATATATAGATGCAGGGATTTCGTTTCATTTCGGCTTTACGACCCTGAACCATTTGGAGCACTTACAACTAGCTATGGA:1 - chrX 20456840 3' - opus 36 4 60.27 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATAGCAAGTAAATTTCGTTGGTTTTTTTTCTTTTGGTTTTATAGGACGGATCACGATGGTTGATGGTTAATATTTGCTTCTTCTTCTACATACAGATTGGGTTTTGGAT:1 - chrX 16607775 3' + P-element 2873 1 76.03 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAGATAATTGTGAACTGATAGATATAACAATTGAGCTAAATCTGGGCAATACGTGA:1 - chr3R 18343448 3' + jockey 4928 1 63.01 GACTTGGCTATTAATCCTGATCAAAAATATATATTTATATATTTGATTATATGGTCGGAAACGCTTCCGTCTGCCTGTTGCATACTTTTCAACGACTTCACCTCTCTTTTCAAAAAATGTCCGTCTTGCAGATTATTTTTCCTCTT:1 + chr2L 15910748 3' - INE-1 92 1 68.49 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAAATCGTATAATTCAATTCTAAACACGCTGTGTACATTAAGAACGTGGCATATCTTTTTTGCAAAT:1 + chr2L 21777885 3' - pogo 52 1 55.48 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTTTCATACTGCAGTGAGCATTTACTTAAACCGAATTTCGAAATTTTTTTGCCCATTTATATTGTGTA:1 - chr3L 22041057 3' - roo 8717 2 54.79 GCGTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTT:1 + chr2R 21229067 3' - jockey 4736 1 66.15 ATGAATCAATACAATGCAGTATCAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGAT:1 + chr3R 10030791 3' - BS 5065 1 54.11 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTTATTGTTCTTCTGCCATCATGATAGCTGTTGCGCCGTTAACTTCATTCCTTCTACAATCTCATCTCTCTTATTTCACGC:1 + chr3L 75561 3' - roo 40 2 58.22 GAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAAACAATTATTCCATAGGAAATTTAATCAAAGTTTT:1 - chr3L 18025669 3' + F-element 4488 1 76.71 GATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATTATGATCATCATATATTATAAGGTTGTAGCGGACAATCGGTTCATGTTAAAACGGGACCAACAACGAACTTTTG:1 - chrX 13367360 3' + HMS-Beagle 6998 2 55.48 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATCTTTATAATCGAGCACCTAACGGCAGTTAATCGTTAACAATTAAACAAGTCACAACTACGAGAGATGGACAGA:1 - chr2L 18737933 3' - roo 42 2 56.85 AAGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCAAATTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCA:1 - chr3L 8754720 3' - mdg3 5284 2 61.64 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGGTGTGACACGCAAGGAAGGCAACAAAAAAATAAATAAATTCATCAAA:2 + chrX 16996141 3' - roo 74 2 69.18 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTGTCGCAGCAGGACTTCAACG:1 + chr2L 13850773 3' + roo 396 1 74.83 TTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTT:1 + chr2R 4294597 3' - McClintock 6036 2 77.40 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTACATATGTAGTATTAGTGAAA:1 + chrX 22511463 3' + roo 9010 2 61.64 ATAAATATAAATAAATTTAATCAACTGATAATATCTAAAGGTTATGCTGTATCTAGTTGATGTGTATACTTCATGATATTGTCTTGTTATTAAAATAGTATTCTGTGGTAAATAATAAATTTACATATCTATCGATGATTTGCAAA:1 - chrX 12439426 3' + diver2 451 1 34.25 GTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTGTTCCACTGTGCCGTGGGTTTTGGCAGCATCGCATCGCTCG:1 + chr2R 16160822 3' + mdg3 172 2 70.00 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACCGCATGGAGAAGAGTGCGTGACTGCTCCATTTGCTTTAAACACACATGTATTTTATTGATAAATAAAAATGCAGCATGGTTGCTTCC:1 + chr2L 21909182 3' + transib2 2789 1 61.64 AGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATTTTTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTATTATTTGTTGTATGTTTTTTTTTTTGCTTGCTTTTTTAAAGAACAATGGTT:1 - chrX 11506615 3' + Idefix 7256 2 54.05 ATTAATCAGCTAGTGTGAATGCAAACGCAAAATTTCATTATTTTTCTAGAATATCGGTAGATTTTGGGTAGTAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAAT:1 - chr3L 27282407 3' - INE-1 534 1 39.73 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTTTTGTTTTTGTAGCCTACTTTTTGGGGCAAAACAGCAGGGACTGCATTGTCTCCCTGTCAGTCGGAGCT:1 - chrX 20079550 3' - BS 5012 1 55.48 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACGGGTATTTGTGTATGTGTGTCAGCCATCCAAGGCAGGAGCAACAACAGGAGCA:1 - chr3R 8065208 3' - 297 51 2 61.54 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTCAGCAAAAGTTGGTGGGACAAAGCAGAACTTTAATATATATATATTGTCGTGCATATATATGCCATAATAATTATCATA:1 - chrX 6186271 3' + Transpac 270 2 45.21 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTAGTAGAAATCGTTTCCGACCCTATAAAGCACATATATTCCAGTCTGTCCTTTTATCTGTCCGATTTGTT:1 + chr3L 21157125 3' - 412 7105 2 53.42 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACGAATTGAAATACTAAGTGTAATATTAATATCGTGTGATTTTTTTCGTGTGTATGTGGGCGCTTTTG:1 + chr2R 8597040 3' - pogo 33 1 58.14 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGA:1 - chr3R 13676109 3' - P-element 53 1 38.33 GGGTAGAAGTAGCAGCCTACTACAATCCCAACCAAAAAACCAAACAATGAGCANANTTGTATCTAAATTCTTTATCAATGGATCTGGAGCCCACACCACATCGAGAGCGAACATTCAGATACATTTTATCT:1 - chr3L 8754706 3' - mdg3 5255 1 77.86 TTTGACTGGCAGTCCCGATGAGCTTGATAAGGACAGTAGAGAGGGGGGAGGTTTTGGTTCAGTACGTAGACATAATTCCCTAGCTAAGGGTTAAGAATATTGCGCAACACAACTAACAACCTAAACAGCCAAACCTACTAAAAACC:1 - chr2L 9823060 3' + Rt1b 4988 1 67.12 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATTCAACGGACTCAAAAGTGCGGCTGATATAGAAAGGTGGTGTTTCTATATATAAATAT:1 - chr3R 28803866 3' + hobo 2897 1 55.65 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAGTTAACGACTTCACTTTTAACTTCACCTTAGCAACTTATTTTTGCAACATTTTTGTGGTTATCAAATGTAGTTACTTTTGAAACCGAGCATATAAAATATTAGACAGACAAA:1 - chr2R 15406169 3' + I-element 5344 1 74.66 AAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACAAATGGAAAACTCAGCAAAAAGTGATTCGATTCGATTGACAAATACCTTCCTACAGAGATGTGACCCTGGTTATGGTGGTCGAAATCTTTGGA:1 + chr3R 30618778 3' - X-element 46 1 49.32 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATGTTTGGCGTTTTTCCACCGCTGCCAGCTACC:1 + chr3R 24011112 3' + roo 385 2 67.81 GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATA:1 - chr3R 5977732 3' - copia 4933 2 60.27 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATAACAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATATCCTTACCATTTTGGAACAAGCCAAAAAAAAACGTTACAAAAGTCTCCAG:1 + chr2L 20819323 3' - copia 71 2 64.38 ATTAAATGATTATATTATTTAAATTGAATAGTGTCGCTATCAATACATATGTATACNCATACATAATTAATGGAAAAACAAGTTTCGGGGCGCTCTTCTCACCGAGATCCTACAGCTGCACAAGAGATACATATACTCGTACGAGC:1 + chrX 586506 3' + Tc1 64 1 52.74 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAGAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGTTTTCCTATAAATCGACC:1 - chrX 19121909 3' - 412 74 2 66.44 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGATATACTCTGGCCAC:1 + chr2R 16367468 3' - hopper 41 1 51.43 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTT:1 + chr3R 20260890 3' + roo 8999 2 68.49 AGCACAAATAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTTTAATTCATTAAAATTGTGTCCCAATAGTTTATTTTGATTCAAGCAGAAGCGGCTGACTTTTTCACAATAACTTCGTTTTTGTTGCAGGCTGCATTTTTTATTCAATGGA:1 + chr2L 21895621 3' + Juan 4212 1 77.93 TAGTTGACATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGC:1 + chr2R 22971848 3' - jockey 4843 1 74.66 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTTAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAAAAAAAACAACGCATGC:1 - chr2R 25083245 3' + pogo 2074 1 70.55 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTTAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGCTCGATGACGCTATAATCGAAAAAACTTTGCAGCATACTTTTAGGAC:1 + chr3L 12633321 3' + jockey 4921 1 65.07 ACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTTATTTGTTTATGGCGAGTCCATTGTCCACACT:1 + chr3R 8867141 3' - Max-element 17 2 73.97 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGC:1 + chrX 8208416 3' + roo 9015 2 59.59 ACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATTTAGATG:1 + chrX 8208451 3' + roo 9050 2 71.92 TATGGTCCAAAACGCTTCCTTCTTTTCAAAGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTATTCTGGTCACAAGTTATAATTTTAATCTTTCGAAGTGTAGATTTAGGATTTTTTTTATTGAATTTTTATTGTATATATTTTTCGCAGTGTT:1 - chr3L 18555885 3' - INE-1 42 1 63.70 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAGATCGTTATATAAACACCACTTCGGGAGTAAGCAATATAACAAAACAT:1 + chr3L 1477455 3' + mdg3 180 2 64.03 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACC:1 - chr3R 13676102 3' - P-element 72 1 36.30 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACACCCTACACTTCTCACCTTAGGATCGGCCCAGCTGCGCCACTTGTCGTAGGCCTCGATCATCGACTCATGTTTGTTGGGCAGAACGAAGTCGACTAGGGAAGTGGACAGG:1 - chr3R 5574896 3' - blood 13 2 76.71 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTCTTGAAATCGTTTTATGCCATCTGCATTAATCAGTTTATTTTTGGTGACAAAT:1 - chr3R 24074715 3' + jockey 4966 1 63.70 AAGTAAAATAAATATTGTTTTATTATATTTTATAAAAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTA:1 + chr3R 20119942 3' - S-element 113 2 83.56 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGAGANCTAAGGAACGCATACATATCGATAATGAAAGTATTTTCAACGTA:1 - chr3R 4197171 3' - P-element 73 1 34.93 TGGGAGGCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAATTCTAACCAACTGCCAGATGCGCCGTCATCCGTCAGAGCTGTTTCTTTTCCAGGG:1 - chr3L 294633 3' - Quasimodo 7045 2 60.96 CACGGCCACACCTCCCGCCCAACCAACTAAGGGGCCCTGCAAAAACTCCTGCGACGACGTTGTATTATTACAATTGTTTATTATATTATAAACATTTAGCAAAA:1 + chr2R 4938065 3' - Cr1a 4430 1 62.50 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTA:1 - chr3L 16200737 3' + roo 9007 2 61.64 CAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCACACACACTGCGTATACGCAACGCGAAACGCCCCATCG:1 - chr3R 23415861 3' + jockey 4977 1 74.13 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAAAAACATAGCTTGCTGTCACCTCTAAATTTTTGGTTTTTCTG:1 + chr2R 10695916 3' + roo 389 2 70.55 CTATTATTAAAAATAAAAAAAATAAGAGTTAAAACATTATGTTTCTAAGGTTGCCTCAATAGCTGTTCCATGTCGTCCTCATTGGTTGCCTTCGACACAGTCTTTGCTTATCCATCTCAATTTCCCATAATCAATTTTACTGAGCT:1 - chr2R 20523343 3' - hopper 157 1 56.16 CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCACGGTGCCATTCAAGTGATTCTCAAATTTGTCTAAAGCGTTTTGTGCAAATTTCCAGATG:1 + chr2R 17609853 3' - mdg3 5312 2 57.53 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACTATATAAATATTCCAGAATGTGCATTTACTCAACGCGTTCTTCGGTCGCTTTCTGGCTTCTTCGATTGTTCCCC:1 - chr2R 23595960 3' - blood 7052 2 54.29 GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACGCAACCCTTATTCCTTAATAGCACACCTTCCAACAATTAAATACTC:1 + chr3R 19246764 3' + jockey 4920 1 67.81 CGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAA:1 - chr3R 12789546 3' - G2 2760 1 51.28 GAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATATAGACCAGTTTTCTCTTTAAATTGGTATTTCACCCATTTTTCCCTTTTCAGCTTTTTC:1 - chr3L 10814492 3' + micropia 417 2 57.04 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCCCAGAAAACGTCGTACAATCGCGACGAAACGGGTTCTAGATACATTTTTCTGCGTAGATAT:1 - chr3R 26542575 3' - FB 61 1 59.59 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTTTTCAGTGCGCTAATAAGAGAGTAGCTTTTGGTTTTTGCGGCTTACGTCATATTTTATTGTTGCTTTGCATACGTTCATTTCGATGGCGGCCTTAAAGG:1 - chr3R 24093458 3' - jockey 28 1 69.86 GGCATCTAATAGAGCTTATAAAAACATGCGAAAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCAAAACACAGATTTTCTTTTCGTTGTTACAAAAAGTTACTTACATCCGGATAGCCCTCGACTCGCATCTCACCCTTGAGGCTG:1 - chr2R 19172485 3' - Transib5 2905 1 47.26 ATTATATTTTATTATATTGCTAAACTTATTTATAAATTTGAAAAGTATTGTATAGCACTATAACTATTTCAACTATTCTCTGTTAAGAATTCGAATTAGAGCGTTCGACCAATTTTTACAACACTCATTTCCTGCGCCTGGAAGCA:1 - chr2L 5307345 3' + 1360 3104 1 51.37 CTCTTTTTATTCCTTTTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCATCTCCTCGGTGTGCTCGGCATCGTTGTCCAGTTCGCCCCACAC:1 - chrX 1354719 3' + copia 112 2 69.18 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCCCGCTACCGATACCAATTGGAGCAGGGGTCGTTTG:1 - chrX 7508060 3' + roo 9046 1 67.81 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAAAGCTTATGATTGTTGTTAGAAACTGTTAGAATCTGTTGTTCGAGCGCTGAAAAGTATGCTACAAAAATGGTAACGAATTTCCTAGCC:1 - chr2L 5515369 3' - BS 5027 1 52.05 TATGTTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATGGGCTGCATAGTGCCAAGCCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCATACATATATATAGTGTACATACCTG:1 + chr3L 17048770 3' + 1360 3293 1 91.10 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAACAGCGAATGCC:1 - chr2L 8895243 3' - 412 7127 2 69.29 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGCAAATACTCTGCCATGCGATAAAGAGCGATTTCAGATCACCCAG:2 - chrX 1127753 3' - FB 78 1 70.55 AATAATAATAATACTTTAAATTAACATTATCGGACACTAAAATGTAATATAATCAGAAAATGATGAGATGTTATTGTTAAAACTTTTTAAAATAGAAGATAATTGCTTTATGACATAGTGCTAATTAATTACCACAATTGTGCCAC:1 + chr3L 16762446 3' - Burdock 499 1 65.07 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTGCCAAATGGCCCAGGCACCATCCGCACC:1 - chr2L 16382508 3' - hobo 85 1 78.32 CTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAAATGCAAAACGATAACTAAGCGGTTAAGAACCAAACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGTCCAGATGTTATTGGCAATAATATCGTGTTGGAGGAGCTCGTCAATCA:1 + chr3R 3255571 3' - Circe 101 1 76.98 CGGCTCGGCTATTGATCCTGATCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACCTACAACGAATCTAGTATACCATATTATTTAACAAGTAACGGGTATAAAAGAATCTAGTATACCACATTATTTAACGAGTAACGGGTATAAAAGCAT:1 - chr3L 16164927 3' - INE-1 93 1 64.14 ACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGGATGTGTACCTCTAGCCTACTACACGTTGCTACAACTGCGGCTCTAATGAACACATGAAAATAGACTGCAAGGCAGAGAAAATTGTTTTGCCTCGAAATTGCAATGCTGATTTCAT:1 + chr3R 22202007 3' - invader2 33 2 71.92 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACTCTTACTCTCCCAGTTCGCAGCGTCGGCTGGCCGTCCACTTGACGAACGAACAGCTACAATTACAATGGGG:1 + chr2L 19940127 3' - mdg1 7060 2 62.71 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACCGTATTTTCCGATACACAACTTATGGCCAAAGGGAGTGCAAACATTACTCAGGCTAACGAGTGAGTG:1 + chr3L 20868124 3' + hobo 2917 1 61.95 AGGGAAAATGGGCGTGCGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAAATGCAAAACGATAACTAAGCGGTTAAGAATGTTCGCAAGTTTAATTCTTTATAAATTAGTATTATAAC:1 - chr3L 21004788 3' - Circe 150 2 73.29 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCGTA:1 - chr3L 16200700 3' + roo 9047 1 67.83 TTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTCACGCGCTCCGGTACGGTTAAATATCTGGCT:1 - chrX 4949261 3' - copia 5034 2 78.77 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAACAAATACTCTTTTTCTATGTAGCCATATAGGGA:1 - chrX 12105208 3' + 412 7519 2 53.42 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAGTA:1 + chr2L 13328529 3' - BS 32 1 59.59 CATATATACATATACATATACATATACAACAAAGAGTTGAATCCGAAACACTTTTTTTCCTTAAAACAAAAGCATTCAAGATTATTGTGCAGTCTGATATAAATCAATCATATGTTGTGGTTAGATAAATTAAAATTGTAAATTGC:1 + chr3L 11672286 3' - Stalker4 245 4 72.60 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAACAAAACCCAGAAAATTGACAAAACACAAGAGCAAGCGGAACAAAAATAAACACAGCTACACGTTAAGAAATGCATA:1 + chr2R 19016081 3' - roo 45 2 55.48 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATC:1 - chr3R 9657688 3' - jockey 4684 1 71.92 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTGGGCGCCTAGTCATTTGCAACATGCACACACCACTTGCCAACTGCGACTATACGACCATGTGGATGTATGGATATATGTACATATGTATGGATATATGGCAGTAT:1 + chr3R 26542717 3' - FB 16 1 73.97 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACAAATAGACAAATAGTATTCGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAGCACA:1 + chr3L 8754838 3' + mdg3 5427 2 65.07 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGGAATAGAACAGGAGGT:1 + chr2R 16185141 3' - 17.6 6965 2 60.27 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTACTTTATGGCGCACATCCACGCACACCAGCGCACGTTCGGAGAGCAAGAAATAATGTTGATGCAATAACATGCAACTTTGACACCATCACAAGT:1 + chr3R 31032104 3' - hopper 25 1 76.71 GTATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGACATCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCACGACAAAATAAAGGAAAAATAGTTAATTGTCGGCTGACAAGAAATACAATTC:1 - chr3R 21669995 3' - Circe 7062 1 77.40 GGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAATGATGTCGTTCATTTTTGCCCACAGAACCCAACGATGAGAGCGGCGCTAATGTGGATGCAGCAATTATGTGGCG:1 + chrX 16594718 3' - jockey 4855 1 50.68 GAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTGTATCCACAGCTTGGTAGTCTGTACCAAAACGTCTTCAAAAGGTGACGCTTAGGGATCCTTCGTTCGGCGCTTTTAATGGCACTTCATGCAATTAAA:1 + chr2L 6286624 3' + Tc1-2 1250 1 70.55 CGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACATAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTA:1 - chr2L 13697623 3' - F-element 101 1 72.60 TGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCAC:1 - chr3R 907905 3' - gypsy11 4341 2 28.67 AAATTGCGTTTAATTAAGAAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGAGTGCTGTGCAACAAACTTGTGGCAGAGCGAGCGC:1 + chr2L 5961289 3' - S-element 76 1 72.46 ACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTCGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCCCCACTTTGTTGTGCATTCAGGTGTGAAGTTTTTTGTCATCGCAACGCTCGGATTTTGTTAG:1 - chr2L 8835989 3' - BS 4722 1 56.16 GACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTAATCTCGCCTCGTTGGCAGCATTTTGATTTATGCGTTTATTAAAGTACACTCGACCATCGCTAACATCTCTCTCAATAA:1 - 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accord2 7319 1 73.29 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATGTATGCATCTGTATGTACATATAACCTAAGACTGGGGAGGACATCGAGGAGTCGGCG:1 - chrX 7993049 3' - opus 41 4 63.08 CAAAAACAACAATACCGCTAATCTGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACATCGGCTAAAACGAATGGCCAGAGCCGGTAGAAAATCAAATTTTACTTTCACGCAAAGCCAACTGGACAATCACAAGTCATAAAGATGATCG:1 - chr2L 11505604 3' + I-element 138 1 62.33 TTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGTGGCCCTGAGCGAGCGAACCGAGCGAGGGAATCCTGTCGCTCCAGTTAAGGCCGTG:1 - chr3R 16902160 3' - 412 7460 2 60.28 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATTCGAATTTTGAATGCAGTGAGTGCATTATAATCAAGTTCGCACTTTCAAATTGCGGTTGG:1 + chr2R 12343277 3' - roo 8726 2 62.33 AATATAATTTATCGCTCTTGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACTGTCTGGCTTCCCTCGAAGCTTTCTACTTTAATTGAATAAATTT:1 - chrX 10504296 3' - roo 72 2 69.72 AATACCAATAGTAATAATAATAATAATAATCGGACAGCAAGCAACAACAAGAAACTAAAAGTCAAGTAATAAATGATATGCACACACACACACACACAACAGTGGGGCACACATGAAACTGCATTTAGCTGCGATTGTCTCTCTT:1 - 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chr2L 8776808 3' - G4 3728 1 76.71 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATATATTTCTTTATGTTTTAGTTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAAC:1 - chr2R 18723656 3' - 297 61 2 67.12 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGGGACTTTGCTTTCGATTGAGGGAATTCACAGCGCACAAAGATCAACA:1 - chr2L 13850639 3' - roo 8737 2 67.12 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCAAGGACATCGTCAGAGGGGGTGGGGGCAAATTTAACTAAATTGTAATCGGAATATGCGCATGCAAATGGCATTAGCCTGA:1 - chr3R 12941756 3' - hobo 41 1 56.25 CGCAACTAGCACCGTAACTCAAACTTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 5056 1 60.80 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGCTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGACATTTGCCAGGCCAAAAACTTTACCGTCAATCGTTCTTGTTGTT:1 + chr2R 18723785 3' + 297 6941 2 61.64 AAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTTTTTATAAACAATTACGTTGATTTTTTTTCGGCAACTACCATATTTTTT:1 + chr3R 13898283 3' + 3S18 6063 2 62.75 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGTGTCTGTGTGTTTGCGCTGTTTACCTCAGCAGACAT:1 + chr2R 21475286 3' - P-element 83 1 32.88 CAAATAAAATTAGTTTCTTACGAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATGTATATGGGATTCGAATTTAGTTACTTAACAATTTTGCTAATTGAATTCTGTGCATCTCTCTGCGCATGAGTTTACTTT:1 - chr3R 23579267 3' + roo 9031 1 57.53 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATATGACATATCCCCGCCCATCGTTCCCGAATAAAGCCCAGCTAAGGGTTCGTTGTGCGTAATTTCTGTGTAAATACTTGAATGGAACGACAAAGTCTAGGGCAAACTTTG:1 + chr3R 23579437 3' - roo 8676 2 77.40 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCCTGAAAAAGGTAATTTGCAGCATGGATGCTTGCGATAATTTGTCAGAGCTTTCTTACCGAAATTTCCGGAACTTCGCTGTTGCCGGTGGGGATCAAAATCTC:1 - chr3L 17746222 3' + roo 393 1 70.63 TTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATGTAAAATGTTAATCCGCTGTTAATCTAACTACATCTTGTATTAAATAATTTTAAAT:1 - chr3L 559029 3' - diver 133 2 76.03 TCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACCCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGGGAAAATGGCAACTGCACTATGAATAATTTTTGTTACCCATTTT:1 - chr3L 18119458 3' - 1360 75 1 69.86 CAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGACAATCCTTGTTCCTTGCGCTTATGT:1 - chr3L 8249319 3' + HMS-Beagle 7031 2 76.71 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACGATCCTATGTCTATAAAATGTAGCAAAGATAAATGAAATGTGTAAAGGATTTCATTTAAAAATTGAATA:1 - chr3R 6399341 3' + pogo 2052 1 52.74 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGGA:1 - chr2L 1729740 3' - Transpac 4970 2 51.37 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATGATATGGTATATGGGG:1 - chrX 17495671 3' - Burdock 28 2 66.44 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTATTGTCCCAAAAAGTTTTGAGAATTCGCCTTGGAAATACTCTACAGATTGCGGAACTCATCACTTTGGTGCA:1 - chr3L 16697313 3' - FB 49 1 52.74 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGAGAGTGCGATTCGGGCGAAAAGCACAACCTGGCGAGCTGGGAAAGGGAAATGCATTGTGGTTCCAAGTGGGAGTTTGATCATGATGA:1 + chr2L 1451278 3' + mdg1 386 2 61.64 GGGTCCTTGTACTGGAGGTATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCTTTAATGAATAAGGTATAAAGAAGCGACGAAGAGATTCGTGGGCCAGGTGATGATCGGCCATCTGT:1 - chrX 16939547 3' - Q-element 596 1 73.29 GGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAATCAATATTTCCAATCAGTTCCCATTGATAAGGTCTCCAGTGTCA:1 - chr3L 16826332 3' - 1360 3176 1 69.86 TTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGT:1 - chr2L 13697595 3' - F-element 73 1 54.79 GTTTTGCCAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGGTTTGCCATTGCTTATGCATACCCGTGTATGAACGGTGCTTTAAAAGCCTGTGAAATCAAAAGTATAGTTTCTATGTAAGAAATTTAAATTGTTTCAT:1 + chr3R 7475188 3' + Tc3 236 1 70.50 ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATNTATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGG:1 - chrX 17495690 3' - Burdock 46 2 55.86 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCTGTCAAACTCAAACATTTTCGGCAAGGTGTTTGCAAATTCCAGGTAGTGTTTCTATAA:1 + chr2L 9599894 3' + roo 346 2 60.27 ATATTTAATTATATTACATTAGGGATAATGGTAAAACTCAATGTTAATTATTTAATAGTGTATTTATAGTATTTAGTAAAAACATTTTCCGCACTATAACTCACAGCACAGTCACCCTTAAACATATGGAAATCCACCACAGTTCG:1 + chrX 20499055 3' - TAHRE 433 1 48.63 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCTGCTTTCAAAAGAGACGTACTCTCACTTGCTGCTCCAACGATCGGATCTGAATCGTCGGGCAAAGCGATACATTCGTTGTTCGTGAGTCAG:1 + chr3R 4197289 3' + P-element 2859 1 66.90 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCCTATATTTTCATTGCCAAGGATTCGATGACTTCATTTTTCGTAGACACGATATGGTGGCGGCCACCAATTG:1 + chr2L 3911945 3' - roo 40 2 55.15 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACACCTGTTAGCCAGTAAATTCCGGACCCCGATAGTATGACCATATCGGTTGTTTTCCAATTTGAAAACGTGGCGCTGCCCCGCCGATAAATGAGTACTTTTATCGA:1 + chr3R 16349355 3' + P-element 2872 1 75.34 ACTAGAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGAT:1 - chr3R 5518319 3' - Transpac 76 2 69.86 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATATATTCGAATCGAAACACTATATATATTATATGGTTTCCATGGAATACCGGGGAAATAAATGGAAAAAA:1 + chr3R 4361685 3' - copia 53 2 54.79 AACACCAGAATTTCTGCCTGTTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTCAAGAAATGAAAGTGAAACATTTGTTAAATTGTTTGAAATTAAACTGTAAATCATAGGAATATTTCGGTCCCCAAGTTGAAGTTCATATTGC:1 - chr3R 22164180 3' + HB 1443 1 78.77 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCGGAAAGGAACAATGAATAAAACATTAGGGGCGAAACGGGGTGATGAAATAAGCCAACGAGGAACAAGAAAGTTAAATTG:1 + chrX 10284924 3' - pogo 40 1 51.72 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGGGGAAAAGCGAGTGGAAAAGCGGCGGGAAATGCG:1 - chr3L 2687181 3' - jockey 4686 1 64.76 ATGTGTGTGTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATGTATAGATGACTGGCAACTGCATTGAAAATAAGCAAGGAAATGCTTTTGTTAGAAAACAGACTGATTTCTGCACTAAAAATA:2 - chrX 17477571 3' - Quasimodo 33 2 63.70 CGAGAAACTTAACTTTGTATTTTTGAATGAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTAAAATTTAAAAACTCTTGTACGGCTTTTTGACTCAAAATCTTTGCTTACAAAAAAGATTTGTCCCCGCATAAGTCAACACGGTGTTGACAT:1 + chr3L 23287274 3' - X-element 178 1 67.12 TATAATTTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACA:2 + chr3R 22435588 3' - roo 8734 2 66.44 ATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCGCCTTGGTTGTTGTGCTGCCGCTGGTGCGTTTGTCACTTCTGCTACGAGTCAAATTGCACGTTCGCCATGTAGTCACTTTAAAGTAGGGCCGGCAATGC:1 + chr3R 2526023 3' - Stalker2 21 2 69.18 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAAGGGGGAAGAACTGAAAAAAAAAT:1 - chrX 19187280 3' - Transpac 4975 2 64.38 AGTTCGAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATTAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACATGTCCTTCACATAGTCACAAATGTCTTCTTGACTGCGTT:1 + chr2R 7669710 3' + G4 4 1 73.29 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTT:1 + chr3R 24011053 3' + roo 325 2 76.03 CGGACCATCCGAGCAGCAATCAGTCTCTCAAACACCTTCGTGATCGAAGGGAGGAGACTGATTGGTTTGTGAATCATGGAATCGCACAAGGTGAATGACAACTTCATAATGCGATTGTATTACCAGAAGGACATACTCACATTCA:1 - chrX 15702330 3' - BS3 483 1 55.86 GATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCACCTCTACATTATCGAAACTTTTGGCAATTCGATATGCGGTTGCTGCCTTGAAATACATACCAGCTTTGGCATACTCATTCGCGGCACTATCCGTCTGTCCTATCAAGGCCTCCGCCTCT:1 + chr3R 10121324 3' - gypsy12 14 2 76.03 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGGCACAAAAATCAAAATCAAA:2 - chr3R 17871825 3' + roo 9027 1 53.42 AAACAAAAACCTCCGCGTGATCTTCAGTCCTTTCACGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAAGATGTGACTGCGACATTGTTACAAAATTTTATGCGTTTTTAAATTAAACGTTATATGCACTAGTCTCG:1 + chrX 391982 3' - Rt1b 5025 1 56.85 ATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACAGCAGAGATGCAATACTAATAGGCATGCT:1 + chr3L 18075623 3' + pogo 2012 1 78.77 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGGCTTTTTGCTTTTGACGCGCTCA:1 + chr3R 14277943 3' + P-element 2791 1 19.86 TTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAGCTATATTACGTGTAAAAGAATAATGTAATTGTACATAAAT:2 + chr3L 3154171 3' + flea 4938 1 74.66 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAACTTGTAGCTTTATA:1 + chr2L 20044647 3' - roo 53 2 55.48 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTTGGAAGCCAGTGAGTGGGCAGAGACACTGGG:1 - chr3R 5495188 3' - roo 8721 2 60.00 TAATGTCCTTATATGTTTTTCCTTCCTTTCTAAGCTTAAAATTTAACATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTGCTGTCCTCCACCCACTAAAATATAATTTTAAACTCAACCCGCTCCGACAATCACATGTTGAAGAGACACAACATAA:1 + chr2R 25093500 3' - HB 414 1 67.12 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATGGT:1 - chrX 20233779 3' - pogo 54 1 56.16 AGAAAGGAAATATAAATCATAAATTACAACAAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAGTTTAAATAACCATATCAATCTGCAGATCTATGCTGCAATTATTTGAAGTTGGGCGGCAGAGAAACTTCCAATTTTTAACACAGA:1 - chr2L 13292860 3' + copia 246 1 77.40 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTGGAGCGGCTCTATTTCTTGCTTCATGGATCTGCGTAT:1 - chr2L 16607176 3' + 412 456 2 52.74 TTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAG:1 - chr3R 10030672 3' + BS 5059 1 60.27 TTAAAAAGAAAAACGACTGCAATACTATGAGGCTAATGCGCGCAGAAACGAGCAAACGGACAGACGGGCAAACTTATAAGTGTAATTGAACCCCAACACACACAAAAACACATACACCCACATAAAATACCCAAGAATACAAACAA:1 - chr2L 17371856 3' + Tc1-2 1208 1 47.26 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAATTGTATTCAGTAGGCCACCATCGTCTTTT:1 - chr3L 13888874 3' - 412 39 2 58.90 ATTAGTTGCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCGCCGGGCTGAAAAGCGAAGCACGAGTCCTGTC:1 + chr2L 13850756 3' + roo 9039 1 61.64 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCTGACAGGCTTCGTTTCGCATATATGAATGTATGTACGAGTTATAGTATGCAAATCAATCAAATTCCATTAAAATAAAGCTAACCAAGCTAACGCCCACCTTC:1 - chrX 8208268 3' - roo 8683 2 75.34 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCAGTATTAAGGAGTAGTCAACCGCTATAGTTCAGTCCCAAACTACACATCCACAGCTCAGCACTATTTTAAAGTAGG:1 + chr2R 25083402 3' - pogo 41 1 57.24 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTGTTGTTGCAAGCCGATTTTGTTTTGATTCGATACTTTATTTATG:1 - chr3R 13684638 3' + 412 472 2 70.55 GTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTAATACCCATTTTAGACTAGTTGCAATATTAAGATGCGG:1 + chrX 13667848 3' + hobo 2861 1 77.14 CGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATA:1 + chr3L 23839700 3' - McClintock 77 2 76.43 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTCTGCAATGTTTTTGTTGTTGTTGCAAGCCGATTT:1 - chr3R 13684664 3' + 412 7524 2 63.64 GCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGG:1 + chr3L 14116759 3' - BS 5068 1 65.75 AAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACGCCCACGCAGATTTGCTCCCGGATGGAATAGCAGAGGCGCGGGTCGTCTGGCGCGAAGAGCAGGCCTTGGTTGTACCGCTGGGC:1 + chr2R 9090224 3' + 1360 3164 1 63.57 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCCGTTA:1 + chr3R 12787406 3' - BS 5034 1 56.85 TTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGGGACCAGGATGAGCACCGCCTCTATGGTCTCCGCAATCCCTATGTGGGCGATGAAATTGTGGCCGGAGGAGCGCGGATGCGAG:1 - chr2R 24483103 3' + R1A1-element 5267 1 66.93 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACATTGCGATCGAGTGTAAAACGTTCATTCTTTTTCAAAAGAACAGCGTATATATCATCCTGCTCACAATCATATTCGAAT:1 - chr2L 19698058 3' + roo 9030 1 52.74 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATAACAAATCCATCTGAGTTTCAAGACTTTTTATTTTAGCCAAGTTTCGCATATATTTGTTACATTTCATGTAGAAAAGATT:1 + chr2R 15698183 3' + opus 7463 2 59.59 CTGTGGAGTCTTCTTGGTGAGCGAGCTCTNGACAGTGCCTTGGCTTACGAACCATTCGCAGCCGGTAATCATCCAGGCGATTTTGTTTTGGGCAGGCTTCANAGTAAAAATGCTTTTAGAGCTCCTAAAGGGACGAAGAGCCAAG:1 - chr3L 24051167 3' - BS3 1545 1 68.28 TAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACAATATTGGAATTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAGGACCTTAAAAAGGATGTCNAAAATAATATATCTTAAAGACTTCGACCTTTTAGCTTTATATCA:1 - chrX 21470347 3' + Copia1_DM 158 1 72.60 TACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGA:1 + chr3R 7042110 3' - Stalker2 28 2 65.97 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATATATCCTTACCATTTTGGAACAAGCCAAAAAAAAACGTTACAAAAGTCTCCAGGGACCTGGTTATTGCAGTTGGCTCCCAAACCCG:1 + chr2L 20819356 3' - copia 38 2 56.85 TCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACT:1 + chr3L 20168331 3' + roo 9046 1 67.81 ATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGGGCGTGGCGGGGAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAACCTGTAGTTTCCGTGG:1 + chrX 22386760 3' - hobo 88 1 60.78 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAGACAACGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGAACTTAGATCAATTTGCTCCATACTACACGTTCCACCCTCTTGTT:1 - chr3R 25692756 3' - BS 5080 1 69.18 TTTTTTTTTTGAAATGGGTATCTTAATGTTAAACATGAGTGTTGTGTATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTGGCTAATGGCTATCGACTACTTTATTTACGTAATTAAAGTGTCTAAATTGAAGCTATTCCTACTTTAT:1 + chr3R 3121108 3' + accord2 355 1 67.81 CTATGGCTCACAGTTATGGGGTAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAATTAACTAAGGAATTGATGTAAATGTAATTCTAAAAAGCTTAAATTCCTAGTTCAATAGGGTAAAATATATATATCCTACT:1 - chrX 6202769 3' + F-element 4270 1 56.16 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAGAGGCAGGAGCAGGGCAGGA:1 + chr3R 19725412 3' - hobo 44 1 74.44 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACAAAATAGTGACGAATGGTTTTTGAAATCGTGTCTGAGCTTTTCCAGTTTCGAACATTTA:2 + chrX 20233890 3' + pogo 2040 1 60.27 CATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCCAAAGCCAATGGGGTCATACTAAATACTAAAACTTTTCAAATATTAACAAAATAATTAAAAATTTAGGATTAAACTTAGGTTTATGCAGAAAGGAAAACTTAAATTAGTTTATTTATG:1 - chr3R 15048568 3' + S-element 1384 1 75.17 GGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACTGCAAAAGGTGTTGCTAACAAAGTTGTCAGAGTTACTCTGGCTCT:1 - chr2L 13675892 3' + flea 4941 1 68.49 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAAATGATTTATCAGGGCTTGCAGACTGGAAAATAAATATAAGTATAGGCAAATATTTA:1 - chr2L 18284836 3' - pogo 61 1 61.64 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTCAACCTAGATTCACTTCGTCATGTCTGGGGAATATAAGTAGTGTGGATCTCGCAA:1 + chr3L 18119537 3' + 1360 3322 1 63.01 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACCACTGGTGGACGCCGAGGGTTTTCCGCGCAACGACATCGACGTTTACCAG:1 - chr3R 13676053 3' - P-element 23 1 69.86 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAAATAAGCAATGCATGCAAGTCATACACACAGAAAAAAAAACACTTTTAC:1 - chr2L 1692846 3' - 412 7124 2 65.07 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGTCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGCTAGCACCTAGGAGTTAAGATAATGTTGCTACTAAATACTTATATTCTTAACAGGAG:1 + chr2L 8553415 3' + pogo 2043 1 58.90 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTG:1 - chr2L 23068853 3' + 1360 3316 1 71.23 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGCAGTGCGTTATGGCTTTGCTCACCCCAAAAACTCT:1 - chr3L 5958641 3' + 412 7463 2 74.65 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACCATTTAATGAATTTAACCATTTATTCCAATTAACCTTTCTTGTAAATTTAAATGTA:2 - chr3L 12125279 3' + roo 9008 2 63.70 ATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACACGTAATTTAAGTACAGGGGCCTTAGTCTTATTAACTACTTAAATGCGGTGACTTTGACTGCAAATAAGGGGCTAAACAATAAACAACATTTT:1 + chr4 637809 3' + roo 8750 2 52.74 TCTTAGAGCAATCAATTTTAACTCTTTTATTACATAATTAGATCCAACTAGCACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTATAAAGGGTATCCCATGTACTAAGGTTAAAGTTGGCG:1 - chr2R 3203544 3' + Cr1a 4254 1 73.29 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCATTGAAAGGTTATTATATGGTATACATAAATTTCCAGTTAACTAAGTGTTTAAGCAGTCATTAAAAG:1 + chr2L 18173688 3' - blood 7063 2 52.74 AAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTNCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAAACTACTATGTACAAGATAAAAGCAAAAGCCCAAACAATTACGAAATACAAATATTTATTAGA:1 + chr3L 16931173 3' + roo 8693 2 56.16 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCTAGTCCTAGTTCAACTAATCCATTGTACGCGCTTTA:1 - chr3L 21292530 3' - 412 7140 2 75.34 ATTTAATTATTATTTGATTTTTTAGTTTTTTCTTCATAACTATGAAAGCTTTATAATTCTAGTTTAATATACTCTATTATTCCATAGCACTTTCCAACAATTAGGACTCCGTTTTTTTTGCCAAGTTGTAAGGGATTTTCTCTCAG:2 + chr3L 16169123 3' - Tc1-2 389 1 69.18 GCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTATTTAAATAAAAAGCCAAAG:1 + chr3R 25962068 3' - I-element 63 1 57.53 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAACCATTTCGCTACACAATAGAAGAGAAAGGAAAAACGAAAGAGTTGACTAG:1 - chrX 16219202 3' - roo 71 2 67.81 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTGGCAAACAATTGTCTTGTTGATTAGGAATGTAATTTAGAGAGGTCAGCTGCAC:1 - chrX 5721773 3' - pogo 13 1 73.29 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAATTTCTTTTACGAAATACACCTGGATATGTGAACCACCCTCCCATAATCATCAGCAGCTAGGACCAA:1 + chr2L 21026745 3' - FB 55 1 55.48 TAATAAATTATTTAAAAAATAAAATCTTATACGAATTTTCTGTTTATTTGTTTAATTGTTTATTGTTTCATGCAATACACCCTGCTTATAAAGTTTATTTATAAAATTTAAGTTATGCGTGCGACAAGTTCCTTACTTTTTGTTCG:1 + chr3R 28046165 3' + jockey2 3404 1 68.49 AAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAGGAACGGGAATGTCTGTAGTATATGAACCATAAACCC:1 - chr2L 13244671 3' - jockey 4645 1 74.66 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTAGGGAATATACATATATTGCTATATCAATTACATCGAAAAAGGTATCGCAGTACCATAGCTAGATATGTAATTGCAGGTTATCTTTACACTTAAATATGCATCAACT:1 - chr3L 1477320 3' - mdg3 16 2 74.66 AGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATTTCCGTATGATAATTCTGTAATTTTTATACACCTGCCATAGTGTTTG:1 - chr3R 7467976 3' + BS 4891 1 67.81 CTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAACTGCCAAATGGCCAAGGCACCATCCGCACCCAC:1 - chr2L 16382505 3' - hobo 85 1 76.71 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTATAAGAAGTTACCAAAACGATGATTTCATGAA:1 - chr2L 9599749 3' - roo 16 2 75.34 GAAATAAGGGAAGTGGCTGGTTTGCACCAACCAAATACGTCACTATATATGTTTCAAGAGCTAAAACACTTATGTACATCAAGCTAAATTATCAATGCACTCTGCGAGATTTTAAAATTAAATAAAATAGGTAGGCATCTTTTTG:1 + chr2L 17353132 3' - 297 6604 2 68.97 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACATAGTGGCTTGAGTTGAAATCAACACTTGACTTCGGAGTTGATTCCCTAAGGATTTATTTATATTTTGTTTGAGTAGCTGGCAT:1 - chr3R 5518278 3' - Transpac 35 2 61.64 GTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGGCCTTGTGGCACAGCGTATC:1 + chr3R 5972408 3' - Doc 263 1 70.99 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACATGTCTGGGCCACAA:1 + chr2L 2609024 3' + I-element 5317 1 58.22 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATGCTTGATAGATAGAACCCCATTATGGACAACTATTAAGAGCCAGCGATTGACAAACTGAGCCTGCCGATACCAGCGCTGTCTGGCTGGAAAA:1 + chr3L 13889030 3' + 412 7518 2 63.01 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATGTACATATTATAAATAATTGCACTTAGTTATTG:1 + chr2L 17851742 3' - flea 4804 2 73.39 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGAGAAAGGTCGTTTAAATACAATAAATTAGTTTAAACCGCCCTTTTTCGACAGTGCATAATTCGATTGTTCAGTGCCTTTTTTAAGCGCTGCCA:1 + chr3L 3449966 3' + 1360 3384 2 37.67 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAAAGCG:1 + chr3L 9907344 3' - BS 5071 1 69.86 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACG:1 + chrX 7042724 3' + roo 9031 1 53.23 TGAGACATTTATTTATGCAATGCCACTAANTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGGTTTCCATTTTACTNATCGAATTTTTATCTTGTGTTTTAAATGAACTCGTGTCCGTATT:1 + chr2R 21619429 3' - blood 62 2 56.85 TTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCC:1 + chr2L 22044551 3' - McClintock 6019 2 71.92 CATATTATAATTATTATTAATATTGTTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCCGCTGTTAACGAATTTTCCTCCTCTCNGGTTGGCTAAGCAGATTGGCATAAATTTGTACTTGGCTTTCA:1 + chr3R 31275442 3' - mdg1 7089 2 52.78 TAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTATGGAATTCGTTTTCCATTCGTACGCCCACTTGAGACACTGCACTTGGATAATGGCT:1 - chrX 21227111 3' - Tabor 66 2 60.27 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGCGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGCGTATTAAAATTATACACCCGGGACCATTTGCTTAATGAAACGAAGCCGTGTCTGAAAGCTAA:1 + chr2L 15917731 3' + roo 9045 1 67.12 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCAATGCTATACAGCATAAACAAAAGAATGTACTC:1 + chr3R 13676161 3' + P-element 2852 1 43.48 CTGCCTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCC:1 - 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Stalker2 7259 2 78.08 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAATCG:1 + chr2R 16731360 3' + Tirant 8461 2 57.81 AGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATANTTAGATATAATATTGAGCTTACTGCTCATGGTTCTCTTTACAAT:1 - chr3R 17903242 3' + Stalker4 7134 4 76.03 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCNTCCACATAACTATATGTGTTCACCACTTGTTGTTGTTAGTTGGGTGTCGATTTATCGTTGTTGTTGCTAAAGGACATCCATGTGTGGAGTTGGTGCAAAAACACTGTACTTTTTTTAGTTCAAG:1 - chrX 7626066 3' + Transpac 5217 2 77.40 TATTCTAGTGTCTTTGGTCTGACCTTCCATATGAACTGAGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTGTACCA:1 + chr3L 22016851 3' + Tc3 316 1 72.60 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGC:1 + chr2L 8895296 3' + 412 7497 2 70.48 TATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCCTGTCAAACTCAAACATTTTCGGCAAGGTGTTTGCAAATTCCAGGTAGTGTTTCTATAAATTAAATATATTTAC:1 + chr2L 9599909 3' + roo 361 2 55.48 TCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTATAAGGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACTTTCGCAATTTAAATTTTTATTTAAGGTCTTTTGTTTATGAGACTCAAACTTGCAGATCTATTGAAAA:1 - 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chr3R 11208805 3' - jockey 4720 1 52.41 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATAAGCCGAAAGATTGAAAACATGAAAGAAAAACCCGTTAACTGATTTTTTCTGTTAAATATTCTTAAATATAATCATA:1 + chr3L 21636551 3' + 297 6933 2 56.85 AAATGACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGCCAAACAGAGCGCCAGAAATCGGAGCAGACCGAGAAGGAGTTGAAGCTTAAGACCGAGGCACTTGACTATCTA:1 - chr3R 16623265 3' + hobo 2737 1 50.00 GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGCAAATACTCTGCCATGCGATAAAGAGCGATTTCAGATCACCCAGCATTTCGCGAAAA:1 - chrX 1127740 3' - FB 65 1 61.64 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGATATGAGCGTGTGTGTCGCTCTTCCGAAGCGAAGGTGTTGTTGTTTTCGGCTGGAGTGAATACAGAGACGCACACATAAATACTCACAAAATCG:2 - chr3L 19907060 3' - P-element 26 1 68.49 TTTTGTTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTATGGTCTAACGAGGGTGCAGAGTTTGCCCATTGACATGAAATCGTTTGACATCATTAGGGCCGCCATAAATTGGCCGGCAAAAGTGTGAAATATGG:1 - chr3L 21695391 3' - McClintock 6274 2 61.15 GCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGATTTCGTCGGCTCCGCCCGAGCTCCTGACCCCCAAAAAGCTGAAAGTGGCC:1 - chr3R 23543110 3' - micropia 5 2 42.42 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGACGCGGTTCACACCCCACTTACACAATACCCTACTGCGGAACACCCACAC:1 + chr3R 10751771 3' + hopper 1402 1 78.08 ATTAATATTATTAATATTATTACTTCTTGGTAAATATAAAATATATCTTGTATTATGAGATGCCAATGTAAATAAATAAGCCTTTGCTTCGCACTCGCACCTATGTGGATATACCCTACCCTATACCCTATAAGTGAAGCAATCAT:1 - chr3R 21725612 3' - mdg1 45 5 61.64 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATCGGATTGGGAAATGAGAAAACCGCTGCCGAGCAGCACCAGCAGGACATCTCAATCTCCGGGCTGAAAAGCGAAGCAC:1 + chr2L 13850746 3' + roo 407 1 74.29 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCACAATTGTCAGCCA:1 - chr3R 13323861 3' - F-element 56 1 47.26 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATCAAAGCGCATGAATTGGCCAATTGTCC:1 + chr3R 21679708 3' + roo 9039 1 61.64 CGAAGATGTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTGAAATAATATAATTAAGTAAAATTAGATAGTAATTCAAGCACATTAAACAAATAGTGTTTTTTA:1 + chrX 15540071 3' + roo 9019 2 55.48 AACCAAACCGCTTTTGCCACTCAACCGAACACATCCAGCAAAGTGTAGGACCAAATACATGTGATTTAGTAATGAAACTTATGCTGTAAAAAATAATAGAGTAAGGTCGGCCCATTGCAACAGTGCCGCCAAGGCGACG:1 - chr2R 8729400 3' - Helitron 357 1 57.55 AAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTTAAGATGTGTATATATATTGCAAACATTAGATACTTTAGTGCTACAATTGATTTAGAATCTTCAAAAGGAAACCTTTATGATGCAAGACTGCACTATATTCTTAAATATAT:1 - chr3R 17766667 3' + HMS-Beagle2 7188 2 74.66 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGAGACGTTTGCATGCAAAACAAACAAAGGGATGAGTACAGTAAGGCTTCGATAAGTCGAAGGATTGCTTGCATGTAAAATTAA:1 + chr3L 15273337 3' + pogo 2065 1 64.38 GAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTT:1 + chr3R 5972351 3' - Doc 319 1 71.54 GATATATATATATAAGAGAGAGCTTCATAAATCTCCNCCGACTTACAGCCGGTTGGTTGTTAAATCCTTGGGCCATCCACATC:1 - chr2R 17350921 3' - blood 7190 2 85.54 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTAATAGAGAGTATATAATATCTAAGCTCAAAGCC:1 + chr3R 7477520 3' - BS 5023 1 64.38 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTGCAGTGCT:1 + chr2R 14332112 3' - jockey 61 1 54.86 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATACCTTCTTTCAAGGTA:1 - chr2L 23068822 3' + 1360 3347 1 55.48 GCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATCTGATTTCCACTTTTGCTCTTTGGGAATGGGCCTATGTGATCCATATTTATTGTACGGAATGGTATAGGTATGTTTTTAATGCATGATAATAATCGTTGAGGACTTGGTACAACTAAACTTAG:1 - chr3L 14738683 3' - Bica 4568 1 63.01 CTATGCAGCCTCTTTTCTGGTGGCAGCCAAAATTGCTCTCTCTCTCTCTCCGCTTGCGTAAAATTGAGAGCGTGATTACATAAACGCATTTATGCATTCTAGCTTAATAAACAGGTATATTGATTTTTTCTTTAGGTGAATATA:1 - chr2L 19196797 3' - 1360 3338 1 52.08 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCTGTTACCAAGTACTAATCAATATAAATGTCCTTACACCCAGTCCGTTTGTCTGCTAGCCCGAACTAATGCTTTTCTGTAATTG:1 - chrX 10056645 3' - hobo 20 1 66.93 CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTCTCGTAACTTGTCTCGGAAATATTCAATAATTCC:1 - chr2L 6047859 3' - P-element 83 1 28.77 TCCAATGCTTGAGAGCAAGGTCGCGCTCTTCCATCACTTTAAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTTTTTTAGGTCGTTTTGTTTATTTTTTTCACTGCACCGATAAATGGGCAGAAATATTTGCC:1 + chrX 11625523 3' - Porto1 353 1 58.90 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCCCCAAGGGAGCTTTCGTTTACTGGGTCTGAGGTCAGCGAGGGGTTCGGGTCACAAGTCA:1 + chrX 7508194 3' - roo 63 2 63.01 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACAAATTGTCACC:1 - chrX 10147876 3' + pogo 2042 1 61.64 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCAATCTTTCCCTATCACTCCAGGACGAATGAATTGAAGCCTCATCCTTGAGCGGCTCTATTTCTTGCTTCATGGATCTGC:2 - chr2L 16607180 3' + 412 7505 2 52.74 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTAAGTATGTAAATATGTGTGAGCCAAAGACAACATTGTTTTCGTACCCCGAAGAAACTGCAAGGATAGGTGGCACGAGAAGGGAAAGTGTTGCAATGAA:1 + chr3L 9522169 3' - opus 7023 2 64.38 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTTAAACACTTAAGCACTGATGAATGCAAACAAAATACAAAAATGTTCACAGAACTTGTAGCTTTATAAAACTATTCAATTTGA:1 + chr2L 20044663 3' - roo 37 2 56.16 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAGCGTACAATCGAAAAACATTAAATATAGTAT:1 + chrX 19690638 3' - gypsy 36 2 54.48 GTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTATTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACATTAAATGCTTTTCAATTCGTAGCCATCCATTGTATCATTGCATGCTTGCACCGAAAACAAATTCTTGTCTATTGAA:1 - chr3R 15285017 3' - flea 419 1 52.05 CTAACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTTTTGTCGCGCTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAATATATTTAACTTGAGCGTGCCGAAGCAGATTAAAATAATTTCGGGCAAGTCGTCGCC:1 - chr3L 19325483 3' - mariner2 327 1 56.15 GGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATAGTTTTCCGGGGGGGCGAGCCTAGGAGGC:1 - chrX 7848219 3' + flea 154 1 82.88 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCG:1 - chr3R 8381713 3' - Tirant 68 2 60.96 GGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAACTGAACACGGGAAAATATTTGTTAGGCCATTCTGGTAATTCTTAGGCATAT:1 - chr2L 15088474 3' + invader2 84 2 72.92 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAAAAAATACAAAC:1 - chrX 14867244 3' - roo 8737 2 69.18 GTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAATGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGG:1 + chrX 21667951 3' - gypsy2 44 2 67.41 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGTTGTTCGAGGAAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCAACGATACCCAACAAA:1 - chr3L 23773149 3' + roo 9054 2 54.11 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTA:1 + chr2L 19698160 3' - roo 80 2 71.92 ATAAAGTAATTGTTAAAATTTATGGGAATATTGCTAAGTTATAATTACATACATCTAATATCATGGTATAATAAATTAGATTTAATTAAAACTTTTGGCCATGCTATACACTCACATGCTCCTTTAGGCGATCCAACATTTTCTTG:1 - chr2L 6122380 3' - 1360 375 1 60.96 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATGCATACATAGAACGTGGCATGGAACATGCATCATGATGCAGCGGAACCAGTGCCGCCCCTT:1 + chr2L 4631236 3' + roo 348 2 58.90 AATATAACTGGTTACAAATGCTTACAATCAGATGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTACGTAATGTTAAATATCATGATTTATCAAGCTGCATGAATTTATATTTATTTAGTTGGAATTAAGTTTGCTGGGGGTG:1 + chr3L 4562495 3' + Chouto 6148 1 70.55 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTTTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCGAGGCTGTTGGGGTGTACAATACTTTTAGGATAACGGAATTTTTCCGC:1 - chr2R 20230962 3' - jockey 4746 1 77.34 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGTGATATATATATAATTGCAAACATAAATATATATTTGAAAATTTATGAA:1 - chr2R 14161327 3' - I-element 73 1 69.18 AAAATTCAAGGTTTTTTTTTTTGGTATATTTAAGGTTACATTTTTTAATCATAATTCACTCAAATCCACTCACGCACGCACCCCCCACTTGAAACCGCAAAAAAGTTCCATGTTTAGCGAGCCACTTTGGCTTATCAACCCAAGTT:1 + chr2L 4998690 3' + Tc1 1465 1 71.92 ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTG:1 + chrX 7993149 3' + opus 436 2 64.54 GTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACGAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCCGTTTCGCCGACATATTTATAAATTGCTAAGGACAATGTGCATTGATTCTTTAAAAATAC:1 - chr3R 11757981 3' + invader4 248 2 68.49 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAAAATAAGCAATGCATGCAAGTCATACACACAGAAAAAAAAACACTTTTACCAACTAAGAAA:1 - chr2R 22761159 3' - 412 7113 2 57.53 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTATATATTTGAAGCCGAGTTTATCTCAAGAATGTAGATTGCCT:1 + chr3R 8065309 3' + 297 325 2 75.34 AATGCTATAGTCGAGTTTCCCGAATATATTTGGTGGAATTAAATATATATTTCAACTTTCTCCATTTTAGAAATTCTTTTACAATGCTCTTCTTATAATCTATAATATATCATATTTTTATGTGATAATATATCATATTTTTTGGC:1 + chr3R 27024900 3' - INE-1 570 1 70.55 AAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTNTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTTTCA:1 - chrX 7685270 3' + Tc1-2 1594 1 59.31 GAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTGCTTCTATTAAAATTCTGGTTTTTACTAAATTACTAATGAATTTATATTGGGTTCCTCCGCAGCCAGAGAGCAGTTTCCACAACTGGGCAACCGAGAGGAGC:1 - chr3R 30595927 3' - HMS-Beagle 6630 1 63.01 ATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCATGACTTTGGTGAAAGGATAAGCACTTGGGGCTCACAAACTTTTCAGCGCGCAAATAAAT:1 + chr2R 24435436 3' + roo 68 2 59.59 TGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTCGTGATGGCCC:1 - chr3R 13898206 3' - 3S18 18 2 60.95 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATA:1 - chr3L 22038201 3' - diver 5942 2 54.11 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATCAAACCGCTTGGAAAGAGAGAAAGGCACATAGAGCGGACTCGAACGATGCGCGTCAAATGTCAAAATCAAGAAGAACAACAAAAACCATTATCGAAG:1 + chr3L 19907229 3' + P-element 2862 1 68.49 CTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAAGAAAAATATGAACTGTGGGGAAAAGTTTCAGGA:1 - chr3R 5170988 3' - F-element 99 1 79.45 ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATCCAAAGAGAAAACAACACGCAGTGGCTTACAGGAAACTGTACTA:1 + chr2L 20508386 3' - pogo 71 1 70.55 GATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAATGTTGAGATTAAGCGTACAGATTCTAGAAGTTGGGAGACAAGGTCCATAGTGTCAGATGGTATAGAAACTCTAGCGCACAATAAGTGCTGTACTTTCTCTTAAATAATGAAATTACTTAA:1 + chr3R 4361264 3' + INE-1 150 1 64.38 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTACATGGGCATTACCATTGGACATGTAGACTCTTGTGACCCCTACACACCCGCATGCTGACCA:1 + chr3R 4191002 3' + pogo 2065 1 56.00 ACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGA:1 + chr3L 21202080 3' - G2 2661 1 70.34 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATCATGCTGAATATTTATCAAGAAACTTTAGGATTATGCAAACTTATATCCAAACAAATCTCATTTTCTCTCTCT:1 + chr3L 3394734 3' + pogo 2055 1 53.42 TCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGT:1 - chrX 19163263 3' - Burdock 64 2 63.01 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCACAATT:2 - chr3R 13323869 3' - F-element 64 1 52.74 TATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAACTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGCCAATTGGTTCGGATGGTTAATGACTTTAAT:1 - chr3L 16973321 3' - S-element 1557 2 67.81 AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTG:1 - chr3R 19996200 3' - Quasimodo 79 2 75.17 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACGTATATATAGTTTAGGCCTTGGTAATTGCCGACACTCGCTGCGCATGAAAATTTAAAACGCAACAAATGAAAGAAAATGTTTCGACTTTTTTTATAGCATTG:1 + chrX 7848338 3' - flea 4772 2 75.34 CGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAACATAAGACA:1 - chr3R 12622190 3' + 1360 3314 1 73.29 GTCGGTTGGACGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGAATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAGTTCATGTTTAAATCTCTAGTTAAACATTACTAATTGTTTCAGCTAATACTCCTACAACACTCAACTACAGGGAAAGCCACAAGAAAT:1 - chr3L 18590595 3' + Cr1a 4425 1 68.75 CTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTCGAGAAATAAGGAACTACAAAAGCTAGAAAGTTGAGAATAAGGATACAATATTTTCTTACAGTGCACTTGTGTATCTGTGTGCAAATG:1 + chrX 20863980 3' + INE-1 89 1 73.29 AATAAAAAAATTAAATAAAAAAAATCTAATCTAATAATTAAATGCTTACATTTGGATATCTTATTTTGTAAATATTTGTAAGAATATTAAAGTCATAAACGATTGATGAAGTAATTTATTAATTAGGTTTTCAGGATTTAACTAGG:1 - chr2L 7613177 3' + X-element 4716 1 64.38 AGTCTTTAATATTTGTAATTTAAAAGGTGAAAATGAATTGTAACTTCTTTAAGAGATCGCATCTTATACATGTTCCAAGAACAATGTCTGAATGAATCCATTCACCAGGTCAATATCTATTCTTCCAAGCGACACATCTGCCCATT:1 - chr3L 1320684 3' + gypsy7 5095 1 62.33 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCAAGTGAAATGCAAAACTTTTATTGCCGAGTAGCTCACGGAGTTTTAAT:1 + chr3R 27398107 3' + roo 8997 2 68.49 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTGATAACAGACACCATTATCACCCCAACCATTACAAAACCAACAGCTAGGAGCAATAAATTTA:1 - chr2L 15917592 3' - roo 57 2 60.27 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTATAATTGTTTATAATGGAAACAATTTAACGAACAGTTAAGTGCTAAGGACACAATAGTGAACCCCTACCTCATTGCGATCTTAAATCACGACCAATATAATTTTTCC:1 - chr2L 9062238 3' - Juan 4041 1 68.49 GGTGGCGTGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATACAAATATATACAAAAATGTATGTGACGACTTTTAATAAGAGAACGCCCTGATCTCGGCAAACTTTCGACGATAGTAAAAA:1 + chr2L 22044584 3' - McClintock 34 2 61.64 TTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTTCGGGAGAGGCTAGCCTTTCTGGCCGGGGCCCCTCGGGGAAAAGAAATCCTTAAACAGAAATTGCAAAACAAAATTT:1 - chr3R 20138957 3' - Doc2-element 217 6 72.55 CTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTACAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGTGATAATTAACAGATCACTTAGCATTGTTTCA:1 - chr3R 22435523 3' + roo 8984 2 74.66 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCAATTTCGGGCATAAAAACAACAGCGAAATACTTGGCTTTTTCGCTGTTTTGTTTGATTCTTTTGTTGTTTCCAGCTGCACGCT:1 + chr2L 3908540 3' - jockey 4709 1 56.16 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTCCCACTCGCACTTACGGACCGACCGCAACCTGCTGATTTGACGGTCAAAAATCGACTGAGTATTTCCCATTGGAGTTTTAGCCGGCA:1 + chr2R 16731393 3' + Tirant 374 2 67.38 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACATTAAATAGTTAACCGAAACACTTTGAGATACTTTTTGTTTCGAGAAAGTATTGCCTACTTTCAGGTTCGTTACAGATTTCTCTCAATTGCCTGCCATTT:1 + chr2R 18618591 3' + jockey 4976 1 65.07 TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAACAATATAGTTGTTCTTCTAACTGGTATGTTTAATTCC:1 - chr3R 14138552 3' + mdg1 337 2 75.34 CTATCGATATCTCAGAAAAATGATAAAATTCCGCGTTTGCATTTACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTGTGAAACCACGCGAAACGGAAAGTCACAGATATACCGTCATTCATTTA:1 + chrX 3535915 3' + INE-1 502 1 67.12 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTAAGATCGTTATATAAACACCACTTCGGGAGTAAGCAATATAACAAAACATTTACTATGAACTTCGCTAAGAAGAAAGTGATTAGAAAATTTTCAAAATTGTTA:1 + chr3L 1477508 3' + mdg3 5479 2 69.86 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAATGGCTTCAATTGGCTATTACGAGACTGGAACAGGAATGCCCGTAAACTACTTGCGCGGAGA:1 - chr3L 18968621 3' - hopper 61 1 58.22 GCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAAT:1 + chrX 21667972 3' - gypsy2 6522 2 67.12 ATTTCTCAAAAACGGTGACAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAAGGCGATGCGCGGCAGTCATTGCCAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTATTTAAACATAGTTCTTAAGAAAAAAATTTATTCATATGATTTTGACAA:1 - chr3R 4658885 3' + Tc1 1262 1 78.08 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACTCAGATGTGAAGAAACTGTTCTGCTCGAAGGCTCCTCCACTGCAGTTTCATAAATTTGAATTTCAAATTTGGTACTCACATG:1 - chr2R 24617019 3' - jockey 4710 1 55.48 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATTCTGGGACATTGTCGATCCTTTGGAACGAGTCCTCCCGCTAATCAGTCG:1 - chr3R 10708176 3' - Transpac 9 2 79.45 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACA:1 - chr3R 18204325 3' - hobo 29 1 63.24 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGATATGTCCA:2 + chr3R 7042121 3' - Stalker2 19 2 72.60 CTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGAT:1 - chr2R 982344 3' + rooA 7477 2 44.52 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATTGCCTGAATGGCCAAAGGAGGGAGGGGTGGCG:1 + chrX 17726341 3' + pogo 2064 1 64.65 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAAAACTTAAAGGCGCTTAAGCAGCCATCGAA:1 - chr2R 6514174 3' + roo 401 1 78.08 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGCTCGATGACGCTATAATCGAAAAAACTTTGCAGCACACTTTTAGGACGATGCCAGTACACGGCCTGACGGC:1 + chr3L 12633345 3' + jockey 4945 1 50.00 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGCATTTCGTAATCCATATTTGCTTATCTCCACTGGCTTCGTTTT:1 - chrX 7042643 3' - roo 8739 2 72.54 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAGCAATGTGACTCCAAAGGCCGTT:1 + chrX 21976897 3' + P-element 2828 1 42.47 GATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTAAAAGTACAATGC:1 - chr2R 17696005 3' - rover 39 2 59.59 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGGTGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAGTGGTAGAGAG:1 + chr3R 20983904 3' - pogo 52 1 52.78 GATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAGGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACACAAATTAAAGTCAGTCATTCGGGGCAT:1 - chr3R 21456254 3' - jockey 346 1 80.14 ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTCATTTCATCATGTGGGAACCTTTCGTTTTTTCGAGCACCAGCGGAAAGTCGCGTCAGTCGTCAGTTTTTCTTCAG:1 - chr2R 10541647 3' - P-element 62 1 43.15 CGTGACTCTTGTTAAAATAGCAGGTGTTAGGTTGGCAAGTTCCATTTGGATTTTGGTTTTTGGTTTTCAAATCTTTTGAAATAAATTTCAAAAATTCATCCCAACTCTTAAAACGAAGAAAGCTGGGTATATTTCAAAAATAACTA:1 - chrX 7541594 3' - mariner2 700 1 51.37 AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAG:1 - chr3R 9550926 3' - P-element 92 1 22.60 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATCATTGAGTGTCATTGAAACGCCAGTAATTGC:1 + chr2L 15917669 3' + roo 319 2 78.08 AACACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACATGTACTCTTTAAAGCTAAGGGCACCCAGCGTCAAAGGCAGCAACGTAGCTCTTTTATGAAGTAATTAAAGCGCATGAATTGG:1 + chr3R 21679698 3' + roo 390 2 67.21 AATAACAGCAGTTAAGGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAGAAGAAGAATAGCCATTCATTTTGTTGTTGTGCTCACGACACCAACTCTATGTTTTTCCA:1 - chr3L 661793 3' - hopper 1267 1 65.07 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGGTATAAGGTAAGGGTAATTAGTTTAAAATTGTTTGAATTTTACATTTAAGAATATTCTCTTTATGAGTCATAAATTACTCCTCAATAAAATGCCAATAACATCGCTTG:1 - chr2L 1232571 3' + roo 396 1 77.40 ACGATTTTATGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCTCATAATAG:1 + chr3L 25411054 3' + 1360 51 1 52.63 TGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAGCTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTTAGCGAACAATCG:1 + chrX 19690618 3' - gypsy 68 2 59.59 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCGTATGTTTTGTATCTTTAACTCCCATCGCACTTTTCGTTAACTTTCTCGATGTCAACGAAACACAAAATGAATGGAAGCACT:1 - chr2L 8553285 3' - pogo 38 1 59.59 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACCCCTTTTTTCCCTTCTGTTTCGTAGCTCAGAGCCGAGAAAACTACGCAAAACATTTTGTAAATGAATTTTATTTGTCGAGATTTTTGCGGCGTGCCCC:1 - chr3R 30537575 3' - roo 24 2 63.70 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGCTGGGGGTGCGCGGTTGCCACTGTGTGTGTGCGCTCTTTATTCCTTTTTCTCTGCGCGAGCGCATTTCCGCCCCGCAGACACTGAA:1 - chr2R 18069627 3' - accord 7031 3 82.20 CTGTGACACTCTTGTTCATCGCAACACAAAATCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATACCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACATAAAAAATGTTTTATTTATTACATAGTGATTAGTATTCATAGCAAATTTCTT:1 + chr2R 19409124 3' + Circe 123 2 60.27 GGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGGGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCA:1 + chr3R 8867104 3' - Max-element 8289 2 52.74 GTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTAGGAGGAGGGGGCTGAAAGTGCGGGGCCAGACACTTGTTACGTCGCTGGGATAACAACGATGGCAACAACAACAGCAACGACAACTGCCGACGCCAGTACAATAATAA:1 + chr2R 24810647 3' - I-element 5120 1 76.03 GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTA:1 - chr3R 4530709 3' + copia 168 2 75.34 GTGCTGTTCGGAATCGCTTTAATTAAGCCCCGTTGGCCTTCGCCCCAGACTGCTACAGTACATCGAGTCTTATGCCTTATGTGAACTGCACTGTGCACTTTGATATTTTATTTTATACCTTATTAGCGGTCTCACTTTCGAAAGCG:1 - chr2R 2947575 3' + mariner2 213 1 69.18 TTTAAGTTTAGTAAGTAAAATNATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACTCGAAATGTGCTTGTGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACTTTATATATGCATACATATTCATATATTTAGTATCGTATAT:1 + chr2R 5412749 3' + Tc1 1563 1 75.34 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGGTAGCTAGGTAAGG:1 - chr2L 1729737 3' - Transpac 4967 2 49.32 AGAAGGAACTAAACGATTCCTAGTGACTTTAAGATTAATGAATAATAAAAAAAAAAGGTCAAGCAGTCAAGTCCCGAAGTGATGGGACGCAAAGTGTTAAGTTTCATAGTTTGAAACAACTGTACAACTCCATTTGCAATTATCTT:1 + chr3R 2846376 3' + G5A 2806 1 80.14 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTTTAATTGCACTTGTGCAGTG:1 - chr2R 8086873 3' + 1360 3315 1 73.79 TTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACT:1 + chr3R 7042074 3' - Stalker2 7313 2 60.00 ATAAATAATAAAATGAAAAAAAAGAAAATCGCTGCAAAGCAAGCAAAACAATATTTTCCTAATTTTCGCGCGCGCACGCGACCAAGGAAATGAACAGCAATTGGCAGCAGCCACCAATTCAGGAGAGGCTTCACA:1 + chrX 9824062 3' + BS 5096 2 66.67 TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTCTTGAAATCGTTT:1 - chr3R 24074755 3' + jockey 4926 1 62.33 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTG:1 - chr2L 11476263 3' + pogo 2038 1 62.33 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGCTAAGGTGAATTGTGAATCCGTTGCATTTCTCTTCCTCTTCTACTCCTCACACCTACGCAG:1 - chr2R 16731255 3' - Tirant 51 2 54.68 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGAAGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTATATGAATGGATAACGGGAGTAGAGCTCAAAACTTTTGCCATTTGCCAGGCCAAAA:1 + chr2R 18723758 3' + 297 335 2 60.42 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATAGTTTAAATACATTCAACTGGTAAAACATAATTCGATATCCTGCAACTTTGTAATATATTTTAGCATACTTTTGTGCTGACTATTTAACGAGTTGCCCTCCC:1 - chrX 13401453 3' - flea 4772 2 50.68 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTACACACCACCTAATCGCAACAACAGCTCGCACACATTCATGCATGGACACTCGTAGTCGGTTGAACACAATATTTGTTTAATTAGCTCGTATTAATGC:1 + chr2L 15549989 3' - hobo 25 1 67.12 AAAAGATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTCTACTAAAATCTGTTTGAAGATTATTTCCGTCGGCCCTCAACACGGAAACGGACTACATTGTCACCGTGGTCAGTTGGGTGGACGATGACAACGT:1 + chr3L 14745213 3' - Q-element 356 2 47.95 ATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCAAAATACAAATAATAAT:1 - chr3R 15677499 3' + P-element 53 1 15.07 GCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACATTCGATTTTTAAATTGGCTACAATCATCTCTATCTGCTCTACTCACTATTTAAAGCGCAAGCCACAAACAAATCGCTATCAAAATGGAAGTAATTCGTCCGATAA:1 - chrX 19502042 3' - FB 29 1 66.67 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCCACGANTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTGGTAATTGACTTACTCATGAGTTAGTAACTGTGGAAAAGNTCTAAGCCCGAATATAATAGTTTGAAATATTTATTTATAATTTT:1 - chr3R 15102212 3' + roo 9036 1 60.27 AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGACCAAAAAATTGGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATAACACAGCTACCAAATGGCCGATATGGTCGTCTTGTAT:1 + chr3L 27390342 3' - 1360 78 1 71.23 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACAAATCTATCTGGGAGAAAAGACCTATTCAATTTATTTCGCTTGAGAAGAT:1 - chrX 762479 3' - FB 72 1 65.07 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCTTAACTTGCAACGCCATTTCCGCCACGGGCTCATATT:1 - chr3R 23104499 3' - jockey 76 1 69.23 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTCAGGCACTTTCTGCTTTCTGCTGACCCAGCCATTGTCTTCTCGTTATTTTAAT:1 + chr2L 13468320 3' + roo 9006 2 67.81 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATG:1 + chr2L 18738033 3' + roo 327 2 73.97 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAGGGC:1 - chr2R 9871005 3' + roo 9046 1 61.38 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATTCTTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCGATTGCCAATGAGTTG:1 - chr2R 12248953 3' - Juan 4069 1 54.48 ATAAGCTCCATTTTTTTTTTTATGGATTCGCTACCATTTCACTTTTATTTGCCCCCCCATCTGGCCAGAACTTTTGGCCAACGATTCTTTGCATGAAATTTGCAAATCGTTTGGCCATTCAA:1 - chr2R 9668926 3' - Fw2 252 1 52.46 CTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAATAGAATCGTCACAGATTAAATGGTACTTTTGAACCGCGGCATTGTAT:1 + chr2R 12249043 3' + Juan 4139 1 68.06 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCACCCTGCCAGAGTCATGCCAGATGTCTCCACCCTNAGAATGTTAACGAAAACAAATGTACGCGATGGTTAGTAAAAAAA:1 - chr2R 25083257 3' + pogo 2062 1 61.64 ATAAATAGGAACACGCATAATAGCGAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCGAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 66 4 58.52 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCATGTTGTATGGAAAGCCAAATCGCCTTTTAATCAGCAGCTAAGTAAAGTTAAGTATTCTCGGGAAATTCGACAAGGTAGAGATGCTACCGAAACAGCCAAATCCAGCGGCTTATC:1 + chrX 19583380 3' + roo 402 1 80.14 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATGATATCATCAGTGGACTGACGGATAAACGCTTCCAAGTCGAACTTACCATTTTGGCAGGCATTTGGTGTATAATTGGTGATAACCGTCG:1 - chr3R 15137232 3' - roo 8679 2 69.92 AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTATGCTTTGAGGATATAGGATGCAATTGATTAGCATTTATGAGAATTATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTT:1 + chr3L 20168339 3' + roo 391 2 73.29 ACAGTTCACTTCGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTGGGCGCCAATTAACAGACAACAATTTTAATTATAGTTTAAAAAATGTTTACTTGGATCTGGTTAA:1 - chr2L 12398224 3' - gypsy4 349 1 76.71 AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCGTTTTCTTTTTGCCTTTGTGCAGCGGGTTGTCCATTCGTGTAAATGGCAATGATTT:1 - chr2L 17352994 3' + 297 6913 2 63.70 ATTAATTAATAAAATAAAATTAATTCAGTGTATAATTGGTGTTTAGCTGGATTTCTAGTAATATTTAACATTAGCAAGTCAGTAAAATGTGGTTGATGACATGAAGAGGCAAAGTACGTAAAATGTAACCCATGTTTACACATCTT:1 - chr3L 8321624 3' - transib3 2667 1 45.89 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAGTTCCGGAGTTGGTGAGCTACTGGCAGTTTGGGAATTGGTAATACCAAACGAAAAATACGAAGTAATAATAATAATGAGGTTTCC:1 + chr3R 30518975 3' + I-element 5321 1 56.16 GCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGGGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGGGTAAACAAAGGGGAGTAAGGGCATTCATGGGCAG:1 - chrX 17475223 3' + Quasimodo 194 2 77.40 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAG:2 - chr3R 12182001 3' - mdg3 5338 2 73.29 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATACTTCATTATTGTAGCAGGATAG:1 + chrX 7042717 3' + roo 9002 2 65.07 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGAGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACACACGATGACGACGTGCAGTTTGACTGCACCGATGGGCTTTTG:1 + chr2L 16382599 3' + hobo 2921 1 68.29 AGGGAGTTGCCTTAAACGGCTACCCCACACATTGGTTCCCTAAAAGCATTATAGAATTTTATAACAAAGTAAACAAGAAAATGACATTACAAATAAAACTATATTGACATATAGAAAAGACAGCAAAAAATCCAAGGAAACAAATA:1 - chr3L 26764017 3' - aurora-element 76 1 75.34 GACTATCATATACCCATTACTCCAACCGTATTCATACGCTTGGGATTAAGCATTTATTATTGGGACAACTTTATTATAAACATAGCTGCCATTATTATATAACAATATTTTTTATATACTTACAGGTTTCCTTTTCCACGTATTGT:1 + chrX 15264644 3' - INE-1 549 1 44.52 AACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATATATATATATACAGAAGTATTAAACACTTATTACAGATGCCATATGCTACGTTCAACGGATATTTACAGGGGCGGGAAA:1 + chr3L 2668968 3' - Bari1 39 1 59.31 GTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAAACCGCCTTGTCACCTTAAAACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTTTGAGAT:1 - chr3R 28349568 3' - Transib-N1_DM 225 1 45.21 CGATACAGTGCGCATACACAGCTCTTTTGCACCTCAGCGAAAGAGTGCTCCTTCTATTCATGAGCCATCTCAATGCCACTGTGCGCAATCTCAACAGCAGCATG:1 + chr3R 7847665 3' - Helena 1039 1 66.35 GTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCATCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGTTCGACGATAATTACG:1 + chr3L 21913490 3' - 297 8 2 78.62 TGTATTACTTAGTTTCCCTTGCACTGCTATTTTTCTGAACACGCATATATACAATATCAAAGGAAGACAAAAACAAAGATGAAGAAAAATGTATTGTATTTTATTAAAGGAATTGTTTTCTGTGCCTCATTTTTCTCAGAACAAAG:1 - chr4 516506 3' - HB 31 1 73.97 TATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGACAAAAATC:1 + chr2R 2879485 3' + Stalker 6947 4 48.97 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGTTCAAAGCAAAAAGTACTTGAGGCAGAGATAAAATTGCCATACAT:1 - chr2R 22112650 3' - 412 76 2 69.86 AGAATACAATTTTCGGGCCGAAATCAATTTTGATATTTAGAGTTTTTGGCCAATTGATATTAAGTTCATCAATATTTCAAATTATAAATAAGTAAAATTGCTATCTGCAATTGTTATTATAACTTTTGTAAATGAAAACATAAGTA:1 - chr2R 5666075 3' - 1360 3191 1 63.01 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATAATGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAAAATACAGCGTAATAAAGGGCGCACAATTAGTTGCTTGAGTTTCCGCAATAAAGTTGAATGAGTAATCCAG:3 - chr3R 12181924 3' - mdg3 5261 1 80.14 ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGCAGCTTTTTGTGGCTTTGATGGGGGCCACATAATAAACGTA:1 + chr3L 22435194 3' + opus 424 2 71.23 TACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCACGCAATTTTGATCGCTACACGCGCCACCCACACTC:1 - chr3R 13684697 3' + 412 413 2 74.66 TTATGAAAGCAAACAACATTTACTGGTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACTACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAACTGTTAAACGCTGCCTCACTGCCCTCCCATTGGCACTCCTG:1 + chrX 1424602 3' - Cr1a 445 1 70.23 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTCTCATATATACCATACCATATTTTGGCAT:1 + chr3R 23511625 3' - 297 53 2 76.32 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCGGCTTTGGGAATATTTGACTGGTTTGCATATTTCATTATTGTAGCAGGATAGGCAAACGTAATCCAATGGTTCAATAATAAATGCAAATATATAG:1 + chrX 7042760 3' + roo 9045 1 67.81 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTAATATGAAAGGGTTTACTTTGATTGTAAAATA:1 + chrX 21227232 3' + Tabor 7288 2 58.90 AGTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTTTTCATATTTTTTGTATATATGTATGTATATGTATATGTACACATAAAAAGTAGCATTTGCGAACTCTCCTGATGCGCTTGGTATATATGTACAT:1 + chr3R 4679588 3' - hopper 24 1 67.81 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGTTGTGGCTGTTCGATCAAACAAACTGATATACATCAATTGAATGACATTGCAAAAACTAA:1 - chr3R 4679449 3' + hopper2 1548 1 56.85 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCAGAGCAAGACGTGACTAATGTGTGTACCAACGTCCTCGAGTTGTTTTCTCCAG:1 + chr3R 20983894 3' - pogo 58 1 60.00 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCATTGATAATGATATCTTCCTTCCAGAACGACAATGTGGGCATGAGTGGACCACTGGGGGACGCCGAGGGTCTTCCGCGCAACGACATCGACGTTTAC:1 - chr3R 13676056 3' + P-element 2882 2 76.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATGTGTGCTGTCTTATTTTGCAGCAACTAGCGAAGCACTTGGCACAACAAATTGTCACCATCATCGTCGACATCATCATCATCATCATCAT:1 - chr3R 24263644 3' + pogo 2074 1 67.12 GCGGGGACTATTTACTTACGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAAAGAGCCTATAGGTTCAATATACCCATACACATATACCCCCCAAAAAGACACCATGTGCTATT:1 - chr2R 11795976 3' + roo 8945 2 54.07 GGGAGGGGTGGTGTTTGGTACCGATGGGTCGGTAACTTGCGCTCTTTGTTGATTTGTGAGTGACACAAATTAATTGTGTGTAGATCTTCAGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAGAATAATAATTGTGCTCCGACATATG:1 + chrY 2617193 3' - ZAM 7978 2 60.27 TATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCACATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGAACTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAAATTATTTATTTATGTAACTTACTTATACTTATAATGTA:1 - chr3L 25752882 3' - F-element 4289 1 69.18 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGC:1 - chr3R 23415899 3' + jockey 4936 1 54.11 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGTTCACCACTTGTTGTTGTTAGTTGGGTGTCGATTTATCGTTGTTGTTGCTAAAGGACATCCATGTGTGGAGTTGGTGCAAAAACACTGTACTTT:1 - chrX 7626078 3' + Transpac 286 2 69.18 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACAAATCTATCTGGGAGAAAAGACCTATTCAATTT:1 - chrX 762496 3' - FB 89 1 76.71 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATCCGTTTAAGGCAATAAAATTTTGATTAACGATTACACTTCGATTCTCGAGTTTTCTTGGATATTATTATAGCTAAATTA:1 - chr3L 14233023 3' + copia 5082 2 54.11 CGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGGTATAATTTTATTATGAACCAACTTGTAAAGTTATTGATATGGAGGGAATTATAA:1 + chr3R 12182070 3' + mdg3 178 2 61.64 GAGGTTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACTCAGGGATCAAGTGACCGGCGTTGGAAAG:1 + chr3R 22352542 3' - I-element 33 1 59.29 GTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATT:1 + chr3L 25508749 3' - 1360 339 1 60.96 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAATTAGTTTTTAGACGATTGTTTGAGCAGCCAGTCCAGTTAGTCGAGCACTTCTTTCC:1 + chr3R 21843842 3' + blood 7323 1 65.07 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAACGAATTGGCGGTGATCAGATCAAAATTTCGACTTTGAATAATTAAGAAGTAAT:1 - chr3L 18075552 3' - pogo 66 1 63.70 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATG:1 + chr3R 20260907 3' + roo 354 2 56.25 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTCAAATTTCTCGCTCACCAAA:1 + chr3R 6962424 3' - jockey 85 1 71.23 GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATG:1 + chrX 140068 3' - blood 7097 2 73.97 GTTTATTAAATAAGTTTATTTAAGTGAAAAACTGACAAATAGCGTCAAATATATAATTTTTCAAATATAAAACAAGCAAAAAAGGGTATTATGCGAATTCTTTAATATTTGATTGATATGTATAAGATTTTCGATTTATTTTTGAA:1 + chrX 12914652 3' - HeT-A 355 1 62.33 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACGACGGCATTTACTACTGCATCTGTGTGGCACAGATTCATTTTAGTGCCGATGTGGGCTTGTGGGCAAGGCCCCTTAAAAGCAAAAC:2 - chr2R 6514200 3' + roo 9038 1 60.27 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACCCGTATATGCACAAATATATTACATATATGTGTATGGACGTACAACGGGTAAAT:1 - chr3L 13888902 3' - 412 7118 2 61.81 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGCATTTCACTCGCCAGTGATATTTGCTCAATCTTT:1 + chr2R 20361492 3' + INE-1 549 1 91.03 GCAAAAATCAACACCAAACAGCACCGCGAATAAGCACAAAAGGGAGAGTAAACTAAACACAATATTCTCAGTTATTCTCCCTCTGGCTGCCTTTGCGCCTGGGAAATTCTTTTCCAGTTCAAACATTGGCGGATAAACGATTTG:1 - chr2L 11555688 3' - Cr1a 247 1 56.94 TGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGTAAAATAACGCACACACACCTATTCACCAACCAAACAAATATACAAAATCGCTATTGAAT:1 - chr3R 23264644 3' + opus 7226 2 58.90 TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGCAACCAGAGGCAAAAAATACGAATTAAAATTGGCATGGGCTGCCAATGAATTTAGCAATGTGGCAATGTCAATGCACTTTTGGTGGGCAACG:1 - chr3R 19996140 3' - Quasimodo 20 2 72.60 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCACAATTG:1 - chr3R 13323868 3' - F-element 63 1 52.05 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGATGCCAACGGATCCCTGCTGGC:1 + chrX 16301338 3' - diver 54 2 59.09 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTAAGCTTTCCGTTTAAGCGCGATCAATACTGCTTGAATATGCGCAAAATGCAGCAATAAATA:2 + chr2L 19698220 3' - roo 20 2 71.92 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATATGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAGAAAGAGG:1 + chr3R 10030819 3' - BS 5037 1 62.33 CTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAG:1 - chrX 6417724 3' - Quasimodo 39 2 63.54 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAATGGCTTCAATTGGCTATTACGAGACTGGAACAGGAATGCCCGTAAACTACTTGCGCGG:1 - chr3L 18968624 3' - hopper 64 1 60.27 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTCACATCGATAAGCCGAGTATCGCTCAATCGATTCATAGAGCTTTCCCTGCATATTTT:1 - chrX 4240220 3' - jockey 4724 1 57.04 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGATATATCTGGACCTAAGCCCAAGGAAAAGTGTTTACAGTTTCGGCGC:1 - chrX 9406370 3' - blood 168 2 73.33 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGAGTTTGAAATACAAATATATTCACAATGAATGTCTTTTAAGGGGGGAGTTCATGCTTATAAGCTTTAAATAGAA:1 - chr3L 7972226 3' + S-element 1671 1 54.79 TCTTAAATAATAAAACTATGAGTCGGAACGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCATGTCCCTCAACTCGAAAAGCAGATCGATCTGCAGCCGGCGATCGGTGCGCTTCTTGCCGCGAG:1 - chr2R 17667081 3' + F-element 175 1 56.55 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTCT:1 + chrX 10547716 3' - P-element 73 1 21.95 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTATCGTATCGTATCGTTGCCCGAATAAAAACTACAAAATTCTTGAAATCGT:1 - chr3R 24074757 3' + jockey 4924 1 63.70 GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTCAAGGCAAATATATATTGGGTGACTATAAATAAACATAAAATCAGCAGAGTAATTGCACAAAG:1 - chr2L 11705766 3' - I-element 5141 1 56.85 AAAATGAATAATAAAAAAAAAAATNGTGGAATACGAACATTTAAATACTTCTGCTATTTGTATCGCAAATAGTCGCATATTGTGTAAGTAAAAATGCCTATATCATTGCGCGGTAACTTATTTTGAATTTTTTAATG:1 + chrX 16991666 3' + BS 5093 4 78.10 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTCGTCGGATTTTTGCTTTTAGCCCAAACTCAAACCCGAAAAAGAC:1 - chr2R 22774535 3' + I-element 5280 1 67.81 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTTTATAATTATCAT:1 + chr2L 18738049 3' + roo 343 2 63.01 TAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGCGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTG:1 - chr2L 1729751 3' - Transpac 4981 2 57.53 TGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGGTCCCAAAAGCGGGCTGCCATCAGAAACAAC:1 - chr2L 8895253 3' - 412 7143 2 77.40 ACTGTAAATCAAAGGATTTTTTCTTAAACTCACAGGACCCAAGCACTGATATTTTTATGAACTCAGCTATATATACTCGTACTTCATAGGCTAATAAACGTGTNCTTCTGCCTGTTGCATCATTTTTATCTAATCAAGCATACC:1 + chr2R 5740031 3' + HB 1577 1 79.17 TGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGATGGTTGCAATATATATTTCTTTGATTGTTTAATCTTCTGAATTTTCAATTTGGCAGA:1 - chr2R 24807884 3' - I-element 64 1 63.70 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTA:1 + chr3R 22435582 3' - roo 76 2 70.55 TAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATTTGCGATGTGTTGCTTCCAACCATATTGTTTTTAATGCCTACCCTTCCTCTTGGT:1 - chr2R 8478972 3' - 1360 224 1 62.33 GTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAATGATCTGCGGTCGCCGTCAAATTTGTG:1 + chr2R 5777876 3' + F-element 282 1 73.79 AGAGAATGCTATAGTCGAGTTCGCCAAATATCAGATACCCGTTGCTTAGCTAGTGGAATTGCGATTATGTTCTCCATGATGCAGATTTTGTTGTTGCTGTTTCTGTTGGTCGCGCTTCGGTTTTTGTGTCGTCGCATTTT:1 + chr3R 9430983 3' - INE-1 574 1 55.00 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTCTCATATATACCATACCATATTTTGGCATACCTACTGCCCCGCTTCCAACTCTCTCCTGGTAACTTAAATCAATTG:1 + chr3R 23511672 3' - 297 6619 2 60.27 AGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGATCCCCGATGGCGGGCTGTCGCGAACACTCACCGAACCCGTGGTCGACCTGGTTTTCCACCAGCGTCGCGTG:1 - chr2R 6865171 3' + TLD2_LTR 149 1 64.04 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAGCTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATTAATCATGTAAAAATTATAATGTACTTTAAATTTAATAAGTATATGGCAAGTTAA:1 + chr3R 12538155 3' + mdg1 7396 2 60.27 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGGCACAAAAATCAAAATCAAAT:1 - chr3R 17871824 3' + roo 9028 1 54.11 AATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATATATATATATATAGACCAGTTTCCTCTTTAAATTGGTATT:1 - chr3L 10814521 3' + micropia 5384 2 76.61 TACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAATTTACCACATAATAAACTGAATCTGGAACCACTGTACATCTTGACATGGGCTCAAAATGCAG:1 + chr3L 14116771 3' - BS 5056 1 57.53 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTGG:1 - chr2L 11476262 3' + pogo 2046 1 59.71 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAATCAAACAATGTACACGGCTTTAAGTATTAGTATTTTGGCTGAAATTTATATTGGATTTTTTACTATGAAAGTGAATTGCATTAAAAAAAAACATATC:1 - chrX 15252239 3' - opus 7024 2 60.27 GCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATTACAAATCATGTTTCATGCAGGGGGATCCCGGATCCGTGATGTGTGCCCTCATTTCCCCAGAGTTCACTTTATTCAC:1 - chrX 15428670 3' - X-element 4625 1 52.05 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGAACTTAAAACGCTGCCTTCGGCTCTCGCTCGGCACTCGCTCGGCTG:1 - 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chr2R 22774505 3' + I-element 5310 1 52.05 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGCTGCTCCGTTTTACGCAGAGGCAC:1 - chr3R 16349233 3' - P-element 95 1 20.55 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATATTTCCCGTCCAAAGATGATCCACAATGATGTCGTGCTTGAAAGTTGTTCTCTTAGTAAGAAACATTAAGTTTGTTTCGATTTACTTACGTCG:1 - chr3L 16200702 3' + roo 9042 1 65.07 CGAATGTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTTGTGTCTAGTTGATTGTTCTAATTTCCTATCCACACAAATAGCACAAATTATGGCCGAGGTGTGGCTACTGAATGAACGAATT:1 + chr3L 8754875 3' + mdg3 237 2 73.95 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACCTACATATCTATTTCTTTATGTTTTAGGTTTCTCGTCCTGCTGCCCTTGCAGCAACTTTAAGCCTTTATTCA:1 - chr2R 18723640 3' - 297 4 2 72.38 CTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATGTTTATGACTTTTTACCGGCGCTGCCCCATGTACCCCCCACTCCCCTGCTCGTG:1 - chr3R 13898213 3' - 3S18 65 2 61.38 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGTTTCCATACGCGGAATAATAATTTTCAAAGGATATGCGACACATGCAAGCGTTGTATGCCGAGGACTTATATATATTTT:1 - chrX 7032647 3' - roo 38 2 58.45 CTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGCAGCAGGAAAATGGGAGTGAAAAATCGCCGAGATGGGGGGCATTGAAAACTTAGCCCACCCTCCGAATTGAAAATGAGAAC:1 + chr3L 4615789 3' - F-element 384 1 53.42 ACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTATATATACAGTATGAAAGCCGAA:1 + chr2L 13328540 3' - BS 15 1 70.00 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTCATAACATCACTCTTCAAATTATATTTAAATTA:1 + chr3R 27007420 3' + roo 325 2 70.55 AAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTA:1 - chr2L 1729762 3' - Transpac 73 2 66.44 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTGTTTTCACTGCATTCTTTTCGACACCCTTTAATTGCATTTAAGCATGCACA:1 - chr3R 28413873 3' + pogo 2032 1 63.70 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTGACGATTTGAGCGAAGGGCTCTCCCACGTTCAAGTTGAGTGTGATCGCGTGTGTGCGTGTTTTCATGTACACGATCACT:1 - chrX 10547633 3' - P-element 10 2 73.04 GGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTTCGCCTGTCTGCACTCATTCGAAAAGTGTTGCATACTTTT:1 + chr2R 21229067 3' - jockey 4720 1 63.16 AGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCCTCAAATGTAATTTATGTGATTTTTACAACTTTTATTGGCTTAATTTGTTT:1 - chr2R 20429023 3' - 412 7496 2 69.18 AGGTGCCAAAAATTGGAGACAGGATTAGACGTGAAATAGCGAAAAAATACACTGACAGACTTTCTAGTGGGATTCTTCCCATCCTAATAGTTTAGCGCTCCCTGTCCATTTCATCGATCATTAATTCGCTGGCGAGATGCCAAAGG:1 - chr2R 14012887 3' + jockey2 3040 1 65.75 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTCTAAAAAGTTAATTAAAAACACATATTGCGTTTGATCTTCTGGGCGCGGAAGTGCTACCTATGGAGTGTAAAATGTCTATCAGTCTGCTAATATTCTTAATGAAT:2 + chrX 4469667 3' - roo 16 2 74.66 AGTGTATTTAAATAAAATAAAGTTAAAAAAATTAGTGTAATTCGCC:1 - chrX 12647620 3' + Bari1 1400 1 91.30 AGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACATATACACGATGTGTTTTTGATATAAATGAACTTGCTTATATGCCCATGACAAGTATGATTTATTGGCTAATTGG:2 + chrX 19163380 3' + Burdock 212 2 56.16 GACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATATTTGCTCTTCGCTTATCTAAATAACTCAGATTTGCATGCCACT:1 + chrX 19187381 3' + Transpac 5163 2 68.28 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATTTTCAAATTCACATTACAAACAAGAAATGCTTGTTTGGGCTTTGCTGATGGGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCATATCCGTTAAAAAACCTCCCTTT:1 - chr3R 4190843 3' - pogo 10 1 78.77 AGTCAGATTGCATGAATAATAAATACCATATGTAGTGTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACCCCCTTAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGTTTTGTACCTCTTGAAATATCCCAAAAGTAACGGCTT:1 - chr2L 12675882 3' + Tc1 86 1 74.66 GCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCCGACGGTCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATATTCCAGTGATAGTTGATAAGCCGTGGCGTGGCCGTCACACGAGCTAGGACAGCCAGCATTGCCAT:1 + chrX 21933308 3' - springer 7170 2 52.00 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAATGGCTTCAATTGGCTATTACGAGACTGGAACAGGAATGCCCGTAAACTACTT:1 - chr3L 18968630 3' - hopper 64 1 62.86 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGATTTGTACTTGTCCAGTGATCACCGCTTAATTAAAATGAATACCTTTGAGCCGTTGCCTTGATGGGCTGCGTAAAGTTTGGCGGACTAG:1 + chr3R 20260932 3' + roo 9041 1 64.38 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGGTACTTACTAGACTTAAGAAACACTTTAAAAGCTTCGATGATAAAAAGTAACATGAATCAACAATATAAGTACTGAATCCCTCCAAGTAAAAGACTGTCAAAAATATGAATAAA:1 - chr2R 7769683 3' - Transpac 6 2 76.03 CATTTGTTGAATTGTTTGAAAATAAATACCAAATGATATTATAAAAAAAGATTACACATTAAAACTTAAAATCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTAGATAAGAATATGATGCGATATGATATGAAACAAGAGTACAATGTTG:1 - chr2L 21149217 3' + HB 1514 1 50.00 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCCACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATCATTTGTTTATTTTCTTTTGCATTCTTTTTAAAAATTACATCACAACATATTAC:1 + chr2L 1892649 3' + 297 6928 2 63.57 TTTTTTTTAATTCTTCTTATTTTTTCTAATATTTTATAAAATCAAACAGGGGATTCGTTATTTCTCCCAGTGTTTCCCTCCCTTGGTATATTTGTACACGTGAACACGCAGAGATTTACTCGTTTGGTTTGTGTTTTTAAAAGGCC:1 + chr3R 28073934 3' - Doc 4690 1 72.60 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATGCAATATTCAGCACACTATCTGAACACTTCAATCCGAACTTTTAAAAATATAGGTTGTAAATGGTACTGCAACGCAATGTGTCATGTTTATCCCCTCTTTAAACA:1 - chrX 20233739 3' - pogo 14 1 76.03 CGGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTATTTGAAACATGTTTGCCAGTTTGGCAATCGACAAATGTTGCACACACTGTGAGAATTAGCATAATTTAGTTTTCGCGCTCTGATCCCCTTGTTTGGCAGCCAGCTGCCAAGGACCAAGGACC:1 - chrX 2386276 3' - accord 7105 2 69.86 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGCAAATGTATGATTCCCGCGGAGAGAAAAAAGAATACACTCAAAAATGCGTATGG:1 + chr3L 27382973 3' - P-element 84 1 38.36 GGAAGATGTGTGTACCGATCGGTCAGAGGCAGCGCGTCATGAAAGAAAATGACGGCAAGCCAACTGCGGGACACTTCGGAAGCCGCAAGACGATTGCCAGGATTAGAAGTGGAGATGAGGTGGAGAGAATCAAAAGTAAA:1 + chr2R 7344973 3' + Osvaldo 455 1 71.43 GTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCACGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCTGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAGTTCAACTTAATTGTGTGTCTAGCCTTAGGCCAAAAGTTACCATAC:1 + chr3R 28977400 3' - Chimpo 78 1 77.40 GGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTATAAGGAAAAGTACATAGAACTGCTCACATATCTTGTGATCGCCGTGGACGGGCAGTAGAATATTC:1 + chrX 20427816 3' + GATE 299 1 50.00 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTAAGCGCTG:1 + chr2R 14332105 3' - jockey 70 1 60.27 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTGCGTTTATCCTATGATATTCCATGATTTCTTAAAAGCGTATAGAAAACTTGCCCCTGATAGTCAAATTCTTGCTTTTCATCTTCTAAGCTGATAGGGA:1 - chr4 880255 3' + pogo 2078 1 71.23 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACTGCCAGCTGCGATTACATGCAACCGCGGCAGGCGACCCTGATTCAGACATATTTAACGGGGGTTCAGACAATGGACG:1 + chr3L 17758053 3' + Tirant 8465 2 57.53 ATTTGTTATTGTCATCAAAATTGGGGTTCTTATGGAATACTTGAATTTATGACTTATATCTAAGGCATTCTATATTCCGGAATTGTTCCACTTGTTCGGGGTCACTCCAACCTGGTTCCAGGCGGCGCTTTCCGGACTCCAGTT:1 - chr2R 21015042 3' - Quasimodo 141 2 51.39 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATATGTATGCATCTGTATGTACATATAACCTAAGACTGGGGAGGACATCGAGGAGTCGGCGAACAATTTGTATTCAAACGATT:1 - chrX 7993027 3' - opus 35 4 60.27 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGCCAAGTGCATAAGACTGCACAAACAGTTGGGGTCGC:1 - chr3R 22260464 3' - jockey 4759 1 73.29 CACGACTATCGGATACCCGTTAATCAGATAGTTCTTTTTTGCTTCCTTCTACCAGTTACACACTTTTCAACGAATCTAGTATACCTTCTTAATAGTTACAATGTTATTTAGCTAAAAACCCCTATTGCACTCATGACGGCAACTGC:1 - chrX 16116086 3' - INE-1 552 1 29.45 GAAGCAGACACAGCTCATTCACTCCCCGCTTCGTGAATCCTGTTGGTGTCCTCAGCACAGCAACTGGAGCGACTCCATCTCTTCCAGGCAGCAGCTCAAATACTCTCGCTAACGGCCACTTCAGGGCCACTAGTTTTCATCCTTAA:1 - chr3R 2689331 3' - diver2 4466 1 44.52 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGAGCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACAAAAAAACTAATCGCCCGGCATCCCGCTCCAGAGAGCG:1 + chr2L 3059427 3' - P-element 58 1 35.20 ATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACTGCCTGCAGCGTTTA:1 - chr2R 17696017 3' - rover 7002 2 56.16 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAATAGTCTTAGCTGTCATACAAACGAGGGGTGCAGTGTAGAGCTTCTTCTTCGGC:1 + chr2L 11476364 3' - pogo 63 1 63.70 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCACATATTGCGCGCCATATTATTGTTGTGTCGGGGAAAAGCGAGTGGAAAAGCGGCG:1 - chr3L 2687190 3' - jockey 4724 1 57.46 CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAAGATAAAGTAGAACACAAAGGAGCGAAGCCAGTAAAAAAGGAGCAGCTATGTA:1 - chr2L 16554605 3' - blood 70 2 65.75 CAGTGCTTTGCGGATCATTTTGTTTGAACAACCGACAATGCGACTAATTTCAGCGTAGGTTTTACGTTCAGAAATCATGTTTTTATCCAGTTTCGTGAGCGATGCCTTCGACCTGGACGAGATCGAGCGGGAGCGACGGCGATCCC:1 + chrX 21111034 3' - Tc1 466 1 56.85 ACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAATTTTCCAGCCGCTTAGCCCAGTTTTTTTTTTCCGC:1 - chr3R 10986156 3' + Doc 4404 1 76.03 AGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGACTATAAAAACAAATTTATGATTTATATTGCCCT:2 + chr3L 21202113 3' - G2 2629 1 53.42 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGTCGGCTTAGCTTGCCCCCAAAATTATGCTACAATATTCC:1 + chr3R 12787402 3' - BS 5038 1 54.11 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAGA:1 + chr3R 6399474 3' - pogo 2 1 77.88 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGGGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCG:1 + chr3R 15047417 3' - F-element 67 1 56.85 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACAAATAAACGTAGGATTCATTTCA:1 - chr3R 18204303 3' - hobo 17 1 72.60 TACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAATTGTAGTTCAGATGGTCATCGGTTGCCGGTTGCCATTTGCCGGGGTTGGATTAATTCGATATGTATCGCCCCTTTTTC:1 - chr3R 24735378 3' + jockey 4846 1 48.28 GGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTT:1 - chr3L 8249386 3' + HMS-Beagle 6964 2 72.60 ATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGAT:1 + chr3R 10751695 3' + hopper 1326 1 73.29 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACAATACTAATTAATATACATCCATATAATACATTTTATGAGACTTCAAACAGGCACTCAGGGATCAAGTGACCGGCGTTGGAAAGATTTTTGCCCGGCAAT:1 + chr3R 22352558 3' - I-element 23 1 67.81 AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAATGTTTATATGACAATTGTGCACACTACAGTCTATAAAATGTAATTTCTTTTTCTC:1 + chr2L 5818959 3' + I-element 5290 1 62.33 TTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTTTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGACAACGAATGGCGATTATTCCAGCTATATTCTTATCAG:1 + chr3R 10040782 3' + copia 4946 2 73.10 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGG:1 - chr2L 9599786 3' - roo 8717 2 54.11 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTGTAATAACATAAGACATGAAAGGCCGCAATCAGTCGGCAATGCCAAGGTCTCGGCTTATCCTCAGAGCTTGAGTGTTCATCTC:1 - chr3R 12622123 3' + 1360 3382 2 79.31 CATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGATGAGCAAATGGTAAGGCATAACTAATAATATATGGGCATTAAATCCGATTTTTCAAATAGTTTTT:1 - chr2R 5970103 3' + Chouto 14 1 55.48 AATAATTGAAGTGGCCGGTTTGGACCACTCAAATACGACACTCTCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGTATATAGTGCCCTTTACAATCCTGGTT:1 - chr2R 9600308 3' - 297 21 2 73.45 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTGGCAAACAATTGTCTTGTTGAT:1 - chrX 5721804 3' - pogo 44 1 52.05 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATAATATAGTGGCTTCTCTATCCATTTAAATTTCTCGCTCACCAAACTAGCAGTAACCTAGAAGTATGCAGCGATATTT:1 + chr3R 6962457 3' - jockey 36 1 59.54 AATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGCATTCTTAATTGAATGCTCCGGAAGGCGCTGGGGACATTCATCCACCAATCAATCAATCAGCGGGCGTGATGAAAATTATTTTAAGAGCCAAAAAATACTCGCAGCAT:2 + chr3L 22038361 3' + diver 210 1 75.34 GAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATGCATATGTATGTATATGGAGATGTAATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAAT:1 + chrY 2720330 3' - gypsy 7053 2 67.12 TAAACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGTATAT:1 - chr2L 22113020 3' + 1360 3259 1 55.48 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAATCCGATTTCTTGAAATACATACCAATGATAAATGGCGACTATGCCGTTTATAGCAATTGGTCGACTGATAACATTA:1 + chr3L 16200855 3' - roo 40 2 57.53 GACTAAACTTGTGCATTCGATATACCTCTTTGGCGGCCCTAGCTGCCGTAAACAATTCGCAAAATTAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGTAGATAGAGTAGCAAGTCTTTGCCGCAAGCCAA:1 - chr3R 21573296 3' + diver2 4772 2 77.40 GATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCTTGGGATCGGCCTTTTTCCAGCACTGGTGGAACCACCAGGC:2 + chr3R 5972390 3' - Doc 296 1 51.37 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCAGTATTAAGGAGTAGTCAACCGCTATAGTTCAGTCCCAAACTACACATCCACAGCTCAGCACTATTTTAAAGTAGGCAATCGGTTGTT:1 + chr2R 25083414 3' - pogo 30 1 65.07 CGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCCCACCCCTTTTGCGATTTGCATTTACATTTACATTACATTTAAATGGGAATGCAAAATGTGTGAGCATCAGAAATGGCAACAAATAAACGTAGGATTTATTTC:1 - chr3R 18204304 3' - hobo 18 1 73.29 GCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACGA:2 + chr2R 6271501 3' - blood 213 2 77.40 GAAATAATGGAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATCTGGGGCAGATAACTTGTCCTATAAAATGCACTGGTCGCCGAGAAATTCGTCTATGATTGCAGACAGGCGTATAACGCATCTGAGTTGGGGT:1 + chr3L 21913476 3' - 297 23 2 68.49 TGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATGTACGTTTGCAATTGATTTATTACAGCAGCGGCTTGAGCGAACAATCGAAAAACATTAAATATAGTATGTTATAGTAGGATA:1 + chrX 19690652 3' - gypsy 34 2 60.96 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCCAAAAACGAACTTTACCATTCGAATTGAGGGAGAGTCTTTTCAAGGAATTCAATTTGTCTATTTCAAACATCT:1 + chr3R 10062250 3' - copia 4917 2 51.37 AGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTA:1 + chr3L 23112568 3' + R2-element 3196 1 54.11 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGTGGAATGCTAAAGCTGATTTGAGGTTCTCCTGCTGCTAATGCAAAACGAGAAACATATTTTCCAGTTGAGGGTGCTGTAGTATTTGACATTTGTAATTTTTGAGTGTATTTA:1 - chr3R 8631561 3' + roo 400 1 79.45 TGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGAATACATATATTTAGCCGTGTTCACATCAAAACAAACATCGAGGAAAATGCGGAC:1 + chrX 20456974 3' + opus 445 2 63.64 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTACATTCCCGTTCCAGGTAGCTACATGAAATAATATGACTAAGATCCCTACC:2 + chr2L 13244724 3' + jockey 4922 1 65.75 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAACCTAGTGAAGTTATTTTGATTATTAAATGCAATCATTAAAAGAAACAATTGGGCAAACATCAGAGAACGTAATC:1 - chr3R 17120308 3' - 412 24 2 71.23 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAAACTAGATGGTGACA:1 + chrX 15406083 3' + opus 468 2 58.22 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACGACGTATACGTAATGTAATGTAAATGTAA:1 - chr3L 2485866 3' + jockey 4971 1 62.14 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATCTTACAGGGGTGGAGTATCTGAAATCAAAATCAAGATTTTTGATTCCTTTATACACGCGCATTATACACCC:1 - chrX 7508094 3' + roo 9016 2 58.45 GATGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATGACAGCAGGATGCATTTCCAAACTTTTTGCTGCATACTTCACGGCG:1 + chr3R 24734917 3' - jockey 4748 1 73.29 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGCCCAAGCACACTCTCGACTCTTG:1 + chr2L 8895337 3' + 412 444 2 51.37 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCAGTGTTTACATTTCCGTTTGTGCGAAGAATGCGATAAAAATATGGACATATGTACATATTTCGTAACCTTAACCTTGTTGATTACATTGT:1 - chrX 19163226 3' - Burdock 6163 2 66.44 GCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATGCATTTATTTAGATTATAAACTTAACAAAGAACGTAAATTATTGACAAGCTTTGAAGT:1 + chr3R 22435599 3' - roo 8723 2 58.90 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTATATATTTGAAGCCGAGTTTATCTCAAGAATGTAGATTGCCTGTAAAATATTTAATTACACTCTGCGGCACGGCCA:1 + chr3R 8065343 3' + 297 6940 2 62.33 ATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGATAAAAATACAAACAGAAAGCAGGAAAATAATACAAACAAAATATCCAGCTATTTC:1 - chr3R 17835734 3' + 1360 3231 1 63.70 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTATGAATAAACTCCTTCTTTGGTTAGCCAATAAATACATTATGGGTTTATAATTATCATGTAATTTATA:1 + chr2L 18738059 3' + roo 353 2 56.16 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACCAACC:1 + chrX 13367500 3' - HMS-Beagle 40 2 58.22 GCCGCCGCTGCTGCTGCCGCCGCCGGTGATGCCGGGTATGGAAATGTGATTGCCCAGCAATGGGTGGCCATTT:1 - chr3L 3948502 3' - TART-A 419 2 91.78 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCT:1 + chr3R 9550959 3' + P-element 2792 1 20.55 CAGCACTTGGCTGTCACAAGATATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATTTTTT:1 - chr3R 31771976 3' + mdg1 7305 2 53.42 AGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAATCCTGTGAGTATCTTCGCGTCGCGTAACGGTAAATCATTGCGCCCT:1 + chr3R 22134291 3' - pogo 1815 1 68.49 CTAAGAGCAATCCAAGTGGACGCCCAAATTCGGTCATGCAGACTGGTATGGATCTCTACGTTTTTGTAAAACGTAAACGGAGTCCGAAACGCACAACAGGTTATAGTTGAATTCAACAACCGAAGTTTGTACTTTCTGTTACTCTA:1 - chrX 19006196 3' + Doc4-element 431 1 72.60 TCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTCGCTTAATGACGACACGAAGCCGCCGTTTGAGCCGCGACAGAAAGGGAAAGATACAAAGTTGCCGCTGACGTTGACGCCACAGCAAATGCGTGTAACTTTTTAATCAAATTATGTGCAAA:1 + chr2R 16459421 3' + Tirant 402 1 46.58 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAATTTTCCTGCTGCAGCGACGAGTTCAAAGCGCATTATGCATGCAAAACAAACACGTGCCGACACACAACACACTCTATCTGCCTCTTTTCTTAGA:1 + chr2L 12987530 3' - jockey 4785 1 63.70 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGTAATAATAAAATAAATAGCATTTATTGTTATACTTATTTTGGTAACAGCTAACATAATATCTTATAATCGAAACAATGGT:1 + chr3R 24662039 3' + jockey 4944 1 52.05 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTATGAAATTAAAGGTTTAAAATGTGTAATATCAAATCGTTTTAAAACTACTTTTCGCCCAGTGCACATG:1 + chr3R 24011082 3' + roo 9018 2 56.16 TGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATAAGTCAGATACGGTGACTACTTTCCGCAGTCACTGCGTCACCTCTGGTGCCCACCAACAGCTGATCGATCAGACC:1 + chr2L 1729857 3' + Transpac 281 2 55.91 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTGCCAACATCTAGTGTTGGTGTTGCGACTATAATATTTTCA:1 - chr2R 6217109 3' + copia 5077 2 71.23 GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCCCATATTTCCGTTTTTGTTGTTACATTTTTCTTATCCTCCACA:1 - chr3R 4530700 3' + copia 5046 2 69.18 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACAAATTCATATATTTCATAATATTTTCACCTGCCGCTTTTCCTTTACC:1 + chrX 3596489 3' + copia 5052 2 70.55 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGG:1 - chr2L 3632136 3' + P-element 2836 1 45.67 TATGTATGTATGTATGTAATGTATGTATGTATATATTATTTATACAAAAAAAATGTATAAATATGAATAATTTTTTACTTGCAAAAATCCTTAAATCCACTTGAACACAATTTTATTTCGTTATTTAAAAACTAGATTTCTTTTTA:1 - chr3L 14284463 3' - 412 7276 2 76.71 AACCGTGTCGGAACAAAACTTTACAGTAGCCCCTCTATGACATCAACCAACTGATTGGCGCGCATTTTAAAAAAGGAAGTTATGCTGCCGCACCCTGTAGTAATTGCCTTTGATCCGGTAACTACTTCATAAATAAGATCACACAC:1 + chr3R 10317504 3' - mariner2 101 1 77.40 CCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATAATCAAACAATGTACACGGCTTTAAGTATTAGTATTTTGGCTGAAATTTATATTGGATTTTTTACTATGAAAGTGAATTGCATTAAAAAAAAACATATCAAATGCA:1 - chrX 15252232 3' - opus 14 2 65.07 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCGTTTACATCAAGAAGGAATACATGTTTGAAGAAAACTGTTTC:1 - chr2L 21777756 3' + pogo 2056 1 59.59 TTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGTTGCTCATTGCATTTATATTGTATATTCAATGATGAGTATGTTATTTTACCGAAATGAAACATTATTTTGCGCAATATTTTTGCCTTTTACGATGCC:1 - chr2L 14968119 3' + 1360 3238 1 66.44 GCTTCTGCCATTATTGTGACCATTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAACGGATTGAAAGAAACACCTGAGTCTGCGTCTCGAGAGCATCACGGGTG:1 + chr2R 21947430 3' - hobo 452 1 65.28 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATCGTTGTTAAAACGTTAGTTACTTAATAAGCTTCCACCATTTGTATTTGGTGCGTCCAAATACTCCTGCCAGCTTATGGGTATCGTCTGGCG:1 + chr3L 69493 3' - roo 8693 2 39.73 CGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACACACGTATTAATTGTGTTAAATAGTTTTTACAGCTGATTGG:1 + chr2L 3175180 3' + Burdock 175 2 72.60 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATACAAATATACAAAAAACAAGGTTGTCGGAATGAGTTCTTCAGCATAGACATCGTATGTAAAATCG:1 + chr2L 13581655 3' + flea 4961 2 55.48 GAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGGGTTTAATAATTATAAAAAACCCATTGTAACCCATTTTCACACTTCAATTATAGACAACATTAAATATATTGACCGGCAATC:1 - chr2L 3133633 3' - Doc 3 1 75.34 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAAGTACGTTAGTTATTGGGCACATATTGCAGATGGCCAGTAT:1 - chr2R 16160761 3' - mdg3 5334 2 73.29 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATACATGTATGTATGTACGGCCTGGTGATATATGTATGGAGAAGCAGGGTGGATGGCGGGAGGTTCTGAGGGGTATG:1 - chrX 17495686 3' - Burdock 6164 2 62.60 AAAAAAAGCAAAAAAAAAAACAAAAACACAGACCAAAACCAAAACAACAACAAAGCGGCCAAGTAGGAAAAGAGAAAAAATAACTGCAACAACG:1 - chrX 6632019 3' + gypsy7 5008 3 67.02 CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGGAGATCCCTTTCTGAAGCTTTCAAGAAGCTGGCATGAAGAGGGGGTGGCACG:1 + chrX 1759035 3' - Tabor 72 2 64.38 GCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTGTAGACAAAAGGGTG:1 + chr3L 8249474 3' - HMS-Beagle 37 2 52.80 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAATAACCCGAGTGAAATGAGTTGCC:1 + chr3R 12275240 3' - Transpac 4975 2 64.38 CCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAATCAGCAAATTATTTTAACCTCTTGAGTAGATCCTTCAAACGCAGATTCCAAACAATGATGTTTCACGGTAAACAATTTTTTTTATCATGAGTAGAAGTCCAAACCTAAACCTA:1 - chr3R 31771944 3' + mdg1 7340 2 75.52 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTCTGTCGGGTATCGCATGTTGCCAAATGTATCTTCGCATCTCGCCGTGCCCGCGACAGCGCATCTTAATCCT:1 + chr2R 6514341 3' - roo 8712 2 52.74 CATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTCGATCAGTGAG:1 - chr3R 27975370 3' + P-element 337 1 12.33 TTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 322 1 71.23 GTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGTTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGAAATACTAACGACGTCCGGAGGGGGTGAATATATATATTCTATGTGCATAGAGGGTGAGCTTCTAGGG:1 + chr2R 14430280 3' - Doc 427 1 52.05 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACATGACATTTCTTGGGATGTATTCATGAATTCTTCATCTCTATCTGCTTGCTCTGCCAGTTGGCAAGTTGTGAAAGTGAAATGCGAGACATGCTACCC:1 + chrX 7993197 3' + opus 479 2 72.60 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTAAAGCGCAAGGCGTATCATTTTACCGGATAGCG:1 - chr2L 21777797 3' + pogo 2034 1 77.17 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGATGATATGACGTGGAAAAGGGAAACACCAGGATCTATGTAAG:2 + chrX 140072 3' - blood 82 2 71.23 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAATATTAATGGGAACTAAATAATGGCTATACTATATTACACACTATATTGCACTTTTCCACATCCAAACTTACATAT:1 + chrX 5721944 3' + pogo 2059 1 54.11 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGTTTAATCTTTTGGCTGCAACATGTAATAGCTCTTTAAAAGGTTCAGAGC:1 + chr2L 8895315 3' + 412 422 2 65.75 TTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGTTCGCTGTTCGCTGTTTGTGCTGCCACAATGAAAAGTGCAAACAGAAATT:1 + chrX 8208445 3' + roo 9044 1 67.81 CGACTATCGGATACCCGTTAATCAGATAGTTCTTTTTTGCTTCCTTCTACCAGTTACACACTTTTCAACGAATCTAGTATACCTTCTTAATAGTTACAATGTTATTTAGCTAAAAACCCCTATTGCACTCATGACGGCAACTGCAA:1 - chrX 16116084 3' - INE-1 550 1 29.45 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGA:1 - chrX 6283651 3' - P-element 56 1 39.20 ACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGACCAAGTAGTTATTAATTACTTAATGTGTGATATATAATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGATGGGGTGTATGGCTTAGTATAAAACCCATTAGCTAGTCGAATATTTATT:1 + chr2L 1260072 3' - G5 4772 1 72.60 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACACCATTAATAGCTGGAGAAAGC:1 - chr3L 15035086 3' + pogo 2069 1 62.33 CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATAGGAGCTGCCAACAGACACATGTATGCACAGTA:1 - chr3R 9550898 3' - P-element 64 1 41.78 CTCATTAAGTGCAGACCGCGCCAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATGACCAGCACCGAAGCCAAAAGCGCAAGTCTAAGATCTATTATCACAGCGCCGC:1 - chr2L 5341501 3' + Burdock 191 2 62.33 AGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAACTTAGTCACTAGGCATGTACAATAGTACACATTATAA:1 + chr2R 18044021 3' - jockey 4644 1 74.66 AGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTTATAGCTTCCTCCTATTTATACTTGGTTTTTGAATGATGCTATATTATTTAAATACCTTTTGG:1 - chr2L 1729750 3' - Transpac 60 2 57.93 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCACTAGTTACATTCTCTGGCGCTTCCTTACTGTCCATTTCTGCCCATTTCATTTCATTTCATTTCATTTAGCGTAATACGCATTTGGCTCTGC:1 + chr3R 5495320 3' + roo 9044 1 66.44 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAAGCTCAGTATCATATTAAAAGAAATATGATTTTTTAATTTAAGCTTTCCGTTTAAGCGCGATCAATACTGCTTGAATAGGCGCAAAATGCAG:1 + chr2L 19698211 3' - roo 29 2 64.38 TATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCTGTGACGATNCNTTTCAACTTAAATACATACCTCGATGTCTTTAAATTGTATACCATTTACCCATTGCCAATGAGTTGGAAAAGTAACCCTTTCGAAGGCAG:1 - chr2R 12248929 3' - Juan 4046 1 70.55 CAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCC:1 + chr3L 8249446 3' - HMS-Beagle 80 2 77.86 AAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTACATTCGATTTTTAAATTGGCTACAATCATCTCTATCTGCTCTACTCACTATTTAAAGCGCAAGCCACAAACAAATCGCTATCAAAATGGAAGTAATTCGTCCGATAAAATGACGAA:1 - chrX 19502033 3' - FB 31 1 67.81 ATATATTTATCAAATATAAATTTAATGAATTATGATCATTCGAAACGCGAATTCTCCAGCTGAAGTATTTCCAAAAGTTCTTTCGTCATTGTAGATGTTAACTTCTCTTATTGGATGGATCGTATGAGTTAGTGGAATGCAACATT:2 + chr2L 9222789 3' + copia 4671 1 57.53 GGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAAATAGTTATATAGTATTAACATCAATTACATCTTTCGGAAACTCGAAAAAGAAAAGAGTTTTATTGGTCAAGAAGTCAAAATGTG:1 - chr2R 5542189 3' - Quasimodo 28 2 67.12 GCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAACTGAACGCCGTCGAAGCAGGAAGTGGAAATGAGTTAAGTGGTGTCTTTTTTAGAGGCCAACTTGGCCCGCATCTCGCATCCA:1 - chr3R 9977208 3' + BS 5050 1 56.85 GTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTTCCATTTCTGAGCTCTTCGAAGACAAGGCGGGTAGTCAGCGGATTCCTCGTCAAAGCCATTGCCCTT:1 - chr2L 18587837 3' - F-element 403 1 53.68 AATAAATATTGAAATATGTAAAAGATACATCCTTGTAAATTTGTAAATATATTAAATGTTATATTTAATACAATAATATAACTAATTCATATTCATCACAGTATATAATTGGTTCAGCTGTCTTACTATGTCTGTACTATGTGCAA:1 + chr2R 14434691 3' + Penelope 157 1 76.03 CAATAAAAAAAACAAAAATATAAATAATTAAAATTAAATTGAAACACCATCCTGTAACAAACCTAATAAACTACCTTCCTGCTGTTTCATGGGTAGTACTTGTGAGTGATTAAGCCATAAGATTGCAAAATCTCTAGATGTGCTTG:1 + chr3L 12160997 3' + Porto1 192 1 54.79 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAACTAATATATATATATGATTGTTTTTTTTTCAATCGAACTCTAAAAGCGAAGTAAAGGGAATCTTGCTA:1 - chr3R 4197880 3' - 1360 51 1 54.11 CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAGGCATAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCATTTTAATTGAATTACCAAATTGCTAATGAAAAAATCGTATTAATTCGATTTTAATTTATATATT:1 + chr2R 21199765 3' - jockey 4735 1 71.23 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTG:1 - chr3L 22038193 3' - diver 46 2 54.11 GATGGATCACAATTACGTTTTCGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGTTTACAAGGTTCCTTGGTATTTTCAGTGCAAACAAATCGTTGCCTACTTTTA:1 + chr2R 14332098 3' - jockey 66 1 60.74 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATTGAGTTTCGATCTGGGCTTAAGCCCGGCTCAGCTAAAAAATACAAACTGCTCGCAAA:1 - chrX 14867234 3' - roo 63 2 62.33 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGAACCTATAAGAAGTTACCAAAACGATGATTTCATGAAG:1 - chr2L 9599748 3' - roo 8679 2 76.03 AAACTTAAGACTTGTACTTCTGCATCCAAATTCGCTGTGTTGTACAAAATATCACGTAAAACTGTGTACAATTTAGTGTTTTGGCTCAGTTATAGCTGGCTTATCATTGCCAATTTTCTGTTTGGCCATTTTCATTGTGACCATTT:1 - chrX 4506138 3' + Bari2 306 1 50.00 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCGGACCACTGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACG:1 - chrX 20330550 3' + P-element 2825 1 35.16 GGGGCTGCCACAGGTTAGTGAATATCGGTCTGTTAGTTGACGCGAAGGTTATGCGTGTTAATTCCCTTTGATAAAATAATGCCCGGGATAACCTTTAAATGGTTTTCGATGTGTGCCCGCATGCCAAATCCTTTTCCCTTTCCATT:1 - chr2L 17035019 3' + Gypsy12A_LTR 435 1 67.81 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCGTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCATAACAGTAAAAACATTAAAAGAAAACGCCCTTAAGGTATGTTAC:1 + chr3L 5538085 3' - jockey 4745 1 67.12 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGGGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGCAAGTTAGCTGGTTTTCTTTCAACAT:1 - chr2L 11476248 3' + pogo 2084 1 60.87 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCCCTGTTTTTCACAACTGTCGTCTTGCTTGGCAACCGTGAATTAAAGAATAATTTGCAGACGACATAGTCAACATTTCCACTCAATTAC:1 + chr3L 16920305 3' - roo 34 2 62.33 GATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGACTTGTTCATTTGGGTCTCAGCTTAAAAGGATTTCGGTCGCACCATGGGATCGGCCTTTTTCCA:1 + chr3R 5972369 3' - Doc 296 1 54.40 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATGCCGGCATAGATTTTGCATGCCCATATAAGTATGCTATATAATTTTCTCTCTT:1 + chr2L 17136173 3' + hobo 2869 1 63.01 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGACTGGAGAAAATCGCGCTTAGCATGACATTTGGCTGGCTCCCCCTGGCGGCTCCTAGCCGTTTTATAAATTTCAATTT:1 + chr3L 18968741 3' + hopper 1392 1 63.78 ATAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTAATAGAGAGTATATA:1 + chr3R 7477502 3' - BS 5041 1 52.05 TTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCA:1 - chr3R 13323874 3' - F-element 69 1 54.79 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGTTTTTGAGTGGGAACGCATGGCATCCAAATTAAGTACAACAAATGAGTCCGTAGGCAGCCAGTGGGCGAGGG:1 + chr3R 15047421 3' - F-element 52 1 50.37 CTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACCGACCGACATGCTCAGATCGACTCGGCTAGTGACCCTGATCAGGAATATTTGTATTTTATAGTCGTAACGGGACGGATCGGATTACTATATCATATAGGTGCCATAGAAGTAAGCGG:1 - chr4 973339 3' - INE-1 136 1 63.01 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACAAATTTTCCTGCTGCAGCGACGAGTTCAAAGCGCATTATGCATGCAAAACAAACACGTGCC:1 + chr2L 12987492 3' - jockey 4821 1 60.27 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTCTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTATGTCCCATAAATTATCTTTGACTTTTAGTTGAGCTCGGATTGGTAGTGCAGTCGGTTTCGGTTG:1 + chrX 2104796 3' + roo 9018 2 54.11 CATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATCCGTTTGTCGGCGACGGAGAGTTATGAGATGCTAGAAAATTAAATTTATC:1 - chr3L 11934946 3' - Doc 4574 1 65.75 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGGTGTCTATTCAAGGGAGTTGGTTAGAATTTTCTTTCGTTATAGCTAAAAAATTTAAAAGAAACGTCGTCAATGAATAGAAGTAAATAGAGGAAGATTTCTTTGAA:1 - chr3L 20867973 3' - hobo 15 1 74.66 GAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAAC:1 - chr3L 20934165 3' - Max-element 80 2 73.85 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTAATTTAATATTAATTTATTTTCAACGATTATACTAAAATAAAAAG:1 + chr3L 22041151 3' + roo 332 2 73.97 AGAAAACTGTCGCCTCAAGATCGCTTACAGGAGGCAAAAAGGTTGGCTTCATGCCAAAACTGCCTTCGAGGTGGTCTGGGCTGCTGCAACGCGTTGATTTCAACTGGAAAATGAGTGGGAAATCCAATAGTTTAGTTGCTGTGCCA:1 + chr3L 9898224 3' + G3 108 1 52.05 GCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCC:1 + chr2R 4999688 3' + Max-element 98 2 60.27 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCATCGTAATCGTTGCCGATATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGACATGTAGTCTACACGACGTATACGTAATGTAATGTAAATGTAAAACTAAGAATAAAC:1 - chr3L 2485852 3' + jockey 4979 1 67.81 CTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTACTACGCTCTGGCCAATCAGCAGTTCAAGAAGACCTTTACGCGTATCCTCA:1 + chr3R 8085688 3' + Tirant 444 1 65.28 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTGCTCATTACAACCCATGTACGCAATTTTGATGGCTACACGC:1 - chr3R 13684710 3' + 412 7474 2 74.40 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCNCCTTTCATTATCCATCGCTCTACCCCTTTCGGCTACGGTAAT:1 - chr3R 2474255 3' + Juan 4181 1 57.53 TGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCTTTTTGCTCCGTAAAAATCCGCCACATAAATCAAATTGCCACAAAACTTTTATCGGCATAGGCACATCTCTTTTGGGCCTGTTGCCTTTGTAGG:1 + chr3R 18634089 3' - R1A1-element 4943 1 55.86 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAGAAAGTAGGGTTTTAAAATGTTACCAGGAGG:1 + chr3R 6399503 3' - pogo 15 1 75.34 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGAATGCGTGTGGTGGAGAGACGGCATTTTTCTTTACNACACGCCTCTTCTTCTTTCCCACAATACACTGCAATTTTTGCGA:1 + chr3R 13684799 3' - 412 7093 2 54.79 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTG:1 - chr2L 9599793 3' - roo 60 2 58.22 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACATAGGACCAGGAATACCACAATCTGAGCGCATGGTT:1 + chr3L 21292577 3' + 412 404 2 76.71 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGCTTGTCGTGTGTTTGTCTGCCTGCTTGTTTGATT:1 - chr3R 8381686 3' - Tirant 8148 2 57.53 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACCAGAGCAATTATTGCCTCCGATCCAAAATAGGAGTACATTTATCTACTTACGCGGGGCACAAAAATCAAAATCAAATGTAAGCGGGTGCAGTGGGATGAGGTC:1 - chr3R 17871798 3' + roo 391 2 69.18 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCAAATAAATATTATTTAACATTTGAGTTAAATGAGGAAATACACAGAATTATGCATTAAACAAATACTCTTTTTCTATGTAGCCATATAGGGATTTGAATTAAAA:1 - chrX 12105196 3' + 412 478 2 61.64 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAAAGCNTATGATTGTTGTTAGAAACTGTTAGAATCTGTTGTTCGAGCGCTGAAAAGTATGCTACAAAAATGGTAACGAATTTCCTAGCCAAATAG:1 - chr2L 5515363 3' - BS 5021 1 55.48 AATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTGCGTAAGGTCTGCTTTCATTATGTTTCAGGTGCCCTAGT:1 + chr2L 16276527 3' - S-element 75 1 71.92 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGAATATTTTAATCACCCTTGAATTGCCTTTGTTTTACTAGACACTTCAAAAGATTTATTTAAAAGA:1 - chr3L 20168189 3' - roo 55 2 56.16 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTCCGAATGCGAAAACATAATGGAAATAATTCGCCAAGGAAAGTAATAAAGTCTCAGCCTTGGGAAGGAGCCAAGCAAACATATGAGCACAGGGAG:1 - chr2R 13695588 3' + blood 352 2 67.81 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCCTAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACA:1 + chr2L 2609010 3' + I-element 5304 1 50.34 GCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACATGCTTTGCAATTACTAAACTGATTTATTCGGCCC:1 - chr3R 18497390 3' - 1360 265 1 76.71 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAG:1 - chr3R 9657684 3' - jockey 4679 1 73.97 AATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTCCCATGGTGCCAATTGATCAAAAATCTCGGTGCGGCCCGGCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGG:1 - chrX 683597 3' - 1360 317 1 60.63 GCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTACCTTCG:1 + chr2L 22150641 3' - S-element 71 1 83.56 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCATCACTGTCACTCGCTCAAAATGCAG:1 + chr3R 29384748 3' + roo 9042 1 66.44 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGCACTCGAATGCAATTTCAGTAATTAAAATAAACAACACACGA:1 + chr2L 16382562 3' + hobo 2892 1 63.48 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATGGGATCACCAATGCTGACAAGGGCATTTTGTGAGCTATAAAAATAAATAAATAAATATTAAGCGTAGAAAAATATATAAGAAATGAGTTCTTTCCAGCTTACCCTTTATATAT:1 - chr3R 7420373 3' - 412 5 2 78.77 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTTTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATATATATATAACAAGCCGCGATTAAGTTGCAAAGCCGTTGGCGGCAAGAACTGTTTCAAATCTTCGTTGAAAAACGTCAGGAAAATAGG:1 + chrX 10148016 3' - pogo 27 1 67.12 AAATGGATTATATCTTAAGAACTANGTTTGAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGGGACCGCGCATTGTGTACATTTTAAAGGGACTAGGAAATGCAAAGAGTCTAAGTGGCAATACGGTAGCTGCAAAACCTTGGGCTACAAGCTCC:1 - chr4 1068239 3' - Tc1 1370 1 44.52 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCAGTCTTTGGCCTCCTTGGCAATAGACTTATCGTTCGGAACCAACTGATGGATATTCTCCTTCC:1 + chr3L 17746367 3' - roo 8723 2 58.90 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTATTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGANTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGACTGGATTATGGCACATGT:1 + chr2L 2609013 3' + I-element 5306 1 51.37 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACACGACTTTGGTGGCGCAATTAATTTTCATTAAACAAAAAAGAGGATATGTC:1 + chr3R 7042119 3' - Stalker2 7268 2 71.72 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTGCTCAAGGACATTGCCACAAATAGCGAGAGCCCTCCGAAGTATGCAACGCCAGGAACACTCGCAGGCTATACAGTA:1 + chr2L 13328518 3' - BS 43 1 52.05 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTACCTGACTGTTATGATATATGAGTTTTAAAGACTAGGCATCTGCTATTGAAGTTTCTGGTCTAATTTAAATCCCCAAAAAAAGAGTATCCTTTTATACG:1 + chr3R 4198027 3' + 1360 3368 1 71.03 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGC:1 + chr3R 9550966 3' + P-element 2799 1 25.34 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATTAATAGAGAGTATATAATATCTAAGCTCAAAGCCTTGCAAAT:1 + chr3R 7477528 3' - BS 5015 1 69.86 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGTTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAAGTTCTTTGACCAGATTGAGTCACTTGACCAGAGAAGGCTGATAATGTGAAGTACCCAATAAAATGTAACCCGCATTAAGTGATC:1 - chr3L 18010212 3' - diver 5927 2 58.22 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATATGTGTTTGGGATCGAGCGTGGTATGTGTGTCAAAAAGTCGCTGAAAATTGCAAACCCATTACACACATGTATAAAATAT:1 - chr2L 7148539 3' - HMS-Beagle2 6923 2 56.85 TCACACCTCAAGCTACTCAGTCGTNTTTTAGTAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCCACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTAGGTTTCAACACTTTCTTCGCTTCTGCTTTT:1 + chr2L 7575754 3' - accord2 49 2 72.73 TACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGTTTTGTCTGAAATTTGTACTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAATGATACCACTGAGCTTTCTCTTTCTGCATTTGTTGGTCGACCTT:1 - chr3L 25911958 3' - looper1 1508 1 76.71 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACCATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGGTAGATTGAACTTGGTTAATTACCATTGTGTGATGCACACGACCTAATTAATTG:1 - chrX 5721825 3' - pogo 65 1 60.96 GCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTTATTATTTCATTTTTTATTATTTATATTTATTTCTGTTACTTTTTATTTCAATATTTAAATATTTTTCATTGCTTATTTGTTTATGGCGAG:1 + chr3R 8867126 3' - 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chr3R 17879403 3' - opus 158 4 54.11 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGTATCTATAGGCAATCTTTTGTAACCAACGAAATTACTTT:1 - chr2L 22340118 3' - Doc 86 1 71.23 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACAATCCCTTGATATTGTGGAAGCCTGTTATTGAGCCAGACTTTGGACAGGAACGCTTCCTGGTTGAGGA:1 - chr2L 9599785 3' - roo 8716 2 53.42 ACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGACAGGTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTATGTGTTTCTGTGGTGGCCGTTTTTGT:1 + chr2L 3881095 3' - invader1 268 2 82.19 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGTACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAGAGAGCTAAGGAACGCATACATATCGATAATGAAAGTATTTTCAACGTA:1 - chr3R 4197171 3' - P-element 73 1 35.62 ACTAGACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATCCAGCGTGGTTAGTTTTTACACTGCCGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGTACAGAATCCACGACGAACTGAAGTGGAGTGCCAACTTCGAA:1 + chr2L 3199704 3' - GATE 8415 2 71.23 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACACGCCTTTTTTCGGCTTACGGCGGCG:1 - chrX 14825302 3' - P-element 90 1 20.71 GCTCAAATAATTCACTGTTTTATTTTATTTACCTTAATTTGCAATATTTTTGCGGGAAAGTTTGTTTTGTGTCTAGATGGCAGGTATATTTTGGCCATCGTAACCCAAAATGCTGTGATTGCTAACGAGGGGGAGTACTTCCGCTA:1 - chr3L 2321309 3' - TAHRE 244 1 57.53 AAGAGGACTTGTTGCGTCCTGGCATTCAGATAGCTTGAAAATTGGATTTCAGAAGAGCAACAATCTAAAAGATCAAGTTTTCTTACTAGAAGGTAATGTTTCTATACCATTTTCATTAGACCTCAGGCCAAAGGAGTACGGATC:1 + chrX 22498310 3' - Q-element 425 2 66.67 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTTAAACGTGAAGATTTGTACATTTGTACATCCGTGTCATATAAAATCCAGTTTAATCCTACTTTATTCGATTTGTAAACTTTCCCTTTCCAGTTGTCAACCTGAG:2 + chr3L 11529596 3' + opus 7487 2 68.49 AACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTGTTTACTCTACAAGTAACGCGTTTATTGAACACATTTTTCAAAAAC:1 - chr4 407147 3' - jockey 84 1 65.75 CAGGAAATATAAAAGATAGAAGATCCAGCATACGGATTGATTATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACACAAATAACTAATTTGCAATTTGGTACACGTGGCTTGGAACAGAGAATGTATTTTCCAGCTGAAATAATCTGACATAA:1 + chr2R 18487428 3' + INE-1 155 1 62.33 GTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAATGCGATCGCAAACACAC:2 + chr3R 7042070 3' - Stalker2 70 2 63.01 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCGCTAAGGCTGATCTAATATTTGCTCAAGTGTTATTTCTGT:1 + chr3R 12787364 3' - BS 5076 1 70.55 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAGGAATAAGGGTGCAGAAAGTTTTATTTTAAACTTTATTTCAGTATCAGTATACCAGTGCAAATTGCTTGTCTCAGTTTCAAAGAGGTAGATATATCTCAAGAATGAG:2 - chr3R 19246641 3' - jockey 4685 1 69.86 AACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATTTTCCTCAACTCAATTAATTGAAGCCATTTCTTTTGCTTACTTTCGTGGGGGTTGTTCCACTGTCACAAATTTTCTCGTCTGACGCTGATCGTTTGCGTCATTTTCATGCGGGCA:1 + chr2L 16553670 3' - BS 5001 1 78.08 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAAAGGAGGCTAAACATTTCACAAAATGCACCTGAAACCACGGATAAAAGTATGCCAAGCGATTCTGGGACATTGTCGATCCTTTGGAACGAGTCCTCCCGCTAATCAGT:1 - chr3R 10708178 3' - Transpac 4930 2 78.08 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAAAACTGCGCCAAAGTTTTGTATTCTTTTTATTGCTTTTGTTGCC:1 + chrX 10547735 3' - P-element 75 1 31.94 GGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATCATTGTCTATGCATTTCTATGGTCCAAAGAAGCTCAGAGCTCTAGTAACT:1 - chr2R 17696031 3' - rover 65 2 64.38 CAAGTGCAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCGGCCGATAAAAGTGATACGAAAAAATTGTGGAAATTTGTGCGTAAAAATAGTNTGTCGGGCTGTGAGCCAAATCCTTGCACAAAGCGTTAAGTCAG:1 - chr3R 26711189 3' + opus 498 1 69.66 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCAC:1 - chr3R 13323873 3' - F-element 64 1 54.23 CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTATTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCATTCCAATTTTATTCGTAAAATAAAATGATTTAATTTTAAAGG:1 - chr2L 3133714 3' - Doc 84 1 77.40 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGCATTTAAATCTATATGCATCGGGAAGGCAGATTGGAAAGCCAGAAATTATGCATGCCAAATGAAAATACCGAATTGAAATGATTTCCT:1 - chr3L 22038181 3' - diver 5921 2 62.76 GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAANTNTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAAAAAACCCTGAGTAAATTGAAACCTTTTTTTGCATTTAAAAGATTAACATTTATGATTTAGGCA:1 + chr3R 29384723 3' + roo 353 2 63.70 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTAAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGGAAAATCGATCCTGGCTGAAGATCCTGGCTGAAGATCCTGGGC:1 - chr2R 14431228 3' - Doc 68 1 66.40 TGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATTCAAATTTGCAGATTGCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATAATATCATAG:1 - chr3R 9657711 3' - jockey 4706 1 56.55 AACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTAATAACTTATATATATGCTTTGCTCAATAAAAACCCAATTGACAAATTGTCATGGCGATCACGTAGCAACAACAGCAAGACAACAACGTGTTCTCCGAAGAT:1 + chr2R 21530082 3' + HMS-Beagle 216 2 63.70 GCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTATGCATGCAACTTAATAACGCGCTAGGAGCTCATTTC:1 - chr2L 11687085 3' - R1A1-element 389 1 75.34 GGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCTAAACCAATGTATGGCCGTTACGAATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTTAACCCAACCATGCTTTGTCTTACTGGACCTCAGCTACCTGTGTCGATTCGGATCTT:1 + chr3L 23317419 3' + 1360 3323 1 63.01 GTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAGTACCCCTACAGATATGTTATAACTATATTCCAATATATATATGTACGTTTTTCCATGTCCTAAATTTCATGTCCTGGTCTTATTCTAAATTCACAAAG:1 + chr2L 16772230 3' + invader2 209 2 55.48 CGTTAAATAAACAAACATTTCTCGATATTNCGCATCCACTCAAGCCGTAATTAAAACCCAGCCACTAGGCAGGCACATAGCCACGTAGCGAGTTGTGAGTGNCATTAGATTTTCGCCCCTGTTTCAAATTCGATTCAGATTTGTTT:1 - chrX 22920248 3' + Tom1 76 1 54.79 TTTCTATCGACTTGCAAAAAAATTTTTTGTCACTCTCATTCTATTTTTCTATCTTATTTTATTCCCCATATAAATGGCATATATAGCATTCTCTCGTTTTAGAGTGTATTTTATACCTCATACAAGATTTCCAGTGCAAGCTGCCA:1 + chr2R 5744789 3' + INE-1 311 1 65.07 GAATCACAAGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTGCGGGCATCAACACCAATAGAAGGAGTGGAAGCATAAGCTTCCCTTTTAAAGGGAGGCGCTGCCGACCATCTTGCGGGGGGCCTG:1 - chr3R 20993765 3' + rover 6855 1 77.24 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCCTCCTGGCAACTTCTTTCCATCGACATGACGAGCGAATTTGCTGCGAAGA:1 - chr3R 12115248 3' - 1360 45 1 51.37 TCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTGATATGGACTTCAGACTTTAGGGTTTTGATCAAATGAAGAGAATGATTCGGCGGCAGTTGATGGTGATGGCTGTGGGAAGAGG:1 - chr2R 23642471 3' - Idefix 7259 2 68.00 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTACATAGTCTTAATCAGGATGGCTGATTTGCTGGCAGCTGCAACTTGGCTCGA:1 + chr2L 2608995 3' + I-element 5288 1 62.33 CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGTGTGCTGGTAATTGCTAATTGATTTTGCCATA:1 - chrX 20940720 3' - hobo 67 1 63.01 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAACTATATTAACTTATCTGGTTACTTTAATTTGTTCTGCCTATAGAAAGTTAGCTGGTTTTCTTTCAACATAGAAAGTTAGCTCGTTTTTTTTTCAGTGTCTTT:1 - chr2L 11476215 3' + pogo 2089 1 72.73 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACAGCGCTAGTTAAAGAATAAAAAAATGTAAGATCAAATCTCTTATTAACAGATGCATCAAGTCACATATTAATATAAGTATGGC:1 + chr2L 7447987 3' - jockey 4708 1 51.37 AAAAATAAAAAATAATAATAAATACGAAANAGCGACGGCTGGCGACCCCAAGAAATGACGTCCACTACTTGAATAACTTGGCATTTTAAGTTAAATATTTANTTTTCAATTAAATGTGTCAGATTCTCTGGGCAGTCAAGCATAAT:1 + chrX 15301643 3' + flea 244 2 72.60 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTATCTTTTGAACTAAAATGAAGTTTTATTCGAACCAGAATGAATTGGATCGACGTATAAATAAATAGAGAGTATATAATATCTAAGCTCAAAGCCT:1 + chr3R 7477521 3' - BS 5021 1 64.14 AGAGAGAATGCTCTAGTCGAGTTTCCCGAACATCAGATACCCAGTTACTGAGCAAGTGTGAATGCGAACGCAAATTTCATAATTTCTAAGGGATATCGATAGATATTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAAAAG:1 + chr3R 4078935 3' - INE-1 576 1 65.67 GCTAGGGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACATAATCTCCATAAACAGTGTCTTAGACGAACCTCAGCGAAAGAGAACTTTCGCAGGTCCAACACAAAAACGCTACCGTCG:1 - chr2L 417595 3' + gypsy 7323 2 66.39 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTCGTTTTCTTTACACACATTGATTATATGAATATATGGATATGTATACCAACGAAACTCTTGTTGGC:1 + chr3R 9551044 3' + P-element 2877 2 78.77 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACAGTCAACTTCATCGAATGCTCTTTTTCGCTTTTCTTAGTTTC:1 + chr3R 9550979 3' + P-element 2812 1 34.25 AGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGATCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGACGTTTAAGAGCCGGCAGGCAACAGGCCGTAACAGCGAAATCCCAGCCTGGC:1 - chr3L 20934146 3' - Max-element 70 2 61.87 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATACCCAATAAGTATACTGTCCAAATTGATTCTTTAGAAGTTTTGAA:1 - chr3R 12181994 3' - mdg3 79 2 68.49 TTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGGCATTTAATTATATAAACCTTTACTATACTGTATGTAATAGAGCCAAAATATTTAAACGAGA:1 + chr2R 20533888 3' - Bica 198 1 46.58 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCGTCGGTGAGATATTGGTGCGTCTATTCAAAGTAAAATGAGTA:1 + chr3R 25962049 3' - I-element 82 1 70.55 TCTTTTTTTTTTTGTTTTTTGACTGATTGACTTGCGAAGCGGACGCTTAACCATCGCCTACTGCTTCATTTCTCACACCATTCGGCAAGGACTTGCGTCTACATTTCGGCC:1 + chr3R 11356700 3' - R2-element 3584 1 75.68 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGTGAATAGTTCGCACGCAAGACAATTGACAGCAGACGAACCGCAGAGATTGCGGTTCCATGTCGAAAC:1 - chr2R 17609743 3' + mdg3 5476 2 61.74 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGGAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGT:1 - chr3R 8381723 3' - Tirant 78 2 67.81 TCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCAAAAGCATACGCCCCGTTGCACGTGATGCACCCAAA:1 + chr2L 13316930 3' - jockey 4752 1 73.43 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACTTATATATATGTATGGCCAACTATAAAGGACAAACGAAGCGAGACCCTTCTCATTTT:1 + chrX 7626218 3' - Transpac 22 2 58.33 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGAACAAACGTTTTAGGTTCGCCAGATGAATTTTAGTTTTGATCAGATTAATTAACACTTTTATCAAAACTTACAACACTCTAATTACATTATCCTAGCAACACTTT:1 + chr2L 8930620 3' - roo 8679 2 73.29 AACGTCTTCACACGTCGGCGAGTAAATAGGAACACAAGATTCTGCAACTCCCCTTGTTTTTTTAATTACCTAACGAACTTCACTTAGCTTGTTCAACGCGGAATCCCTCAAAGACATTTGCCGTCCCTCTCTGGCTGTCTTTTATC:1 + chrX 17417499 3' - F-element 19 1 69.18 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTT:1 + chr2R 16367440 3' - hopper 75 1 69.18 TGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGGCGTGTCCCGGTCGATTTGATATGCAGATGGTGGCATGGGCATGCCGTTGTGACTC:1 + chr2R 16073894 3' - opus 7134 2 58.82 CCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAGTTTAAGATGTTTCGATGGGCTCGTGATGGTCGCTTTTATAGGCAGCA:1 + chrX 19008976 3' - Doc 4270 1 78.77 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGAAAACAGTAGCGTACAACGATTAGCCTGGGAAATTTTATATTTATGATTGTTA:1 + chrX 21227201 3' + Tabor 419 2 62.07 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACCTAATTATCAGTTCAGTACATAATCTTTATTGCTCTGCAATCGCTGGCCATAAATTTTCGTGCTCTGCCACTAGAAAGTAGG:1 + chr3R 6399481 3' - pogo 37 1 60.27 GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATAACNCATCATATTCGGTTTATAATTGCAGTTGCGGATTCTGGTATA:1 - chrX 140013 3' + blood 296 2 73.29 TGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCAACTACGTCGGAGAGTTCTAAGCCTAATTTTAATAAAGTTGAATATTT:1 + chr3R 2208285 3' + Doc3-element 4476 1 75.34 GGCGATAAGCTGGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCGCACACAATTGGCGCCAGAAGGAAATGGCTGGAAACTTTGTTGGCTTGCTGGTCGCTGCAAATGCCAAGAATTCGATGGACGGGCGACTGGGAAACGAAAAG:1 + chr2L 8608448 3' - Ivk 76 1 63.64 AAAAGTCTCTTCCATAATTTAGAAAGGGAGGGTAAGAGGCTTATAGGCCGATACGACTCAGGATCATCTTCTGGTTTTCCAGGCTTGTGGATCATCAAAATAACATGATTCCCTAGAACAATGGGCCATGCAGCGATGCGTCTGT:1 - chr2L 20326646 3' - Helena 215 1 72.41 GTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCAAAGCATTTTCTCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 + chr3L 5685502 3' + INE-1 551 1 69.18 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTGTTAAACGATGACAGTTTTTAGCTCTTACTTATTTTTTGGTGT:1 + chrX 8208396 3' + roo 8995 2 73.29 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGTAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTATCGGTGTCTTCACTGCCAAACAAT:1 - chr3R 31458380 3' - jockey 35 1 55.97 GTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAACTGTGGAACACCCCCTACCCCTCTCCCATCGTGTCACTGTAAATTCGCACGCACGCGGAGCACTTACA:1 - chr3R 22945409 3' - Quasimodo 454 2 53.42 GTATATGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCCGCGCGCGAGTTTACCGTTATGATTCATCCAGCTGTGTGCGC:1 - chr2L 16530873 3' - accord 7031 2 80.88 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTGTGTGTGGCAAAGAGACAGAGGAACGTGGAGAAGAGA:1 + chrX 14825343 3' + P-element 2804 1 28.77 AAATAAAATAAACTAAATACATAATGTAACATAAATCAACCCTATAACTATGGATCAAAACCAACTTAGGCACTTATATGCACTTATAATCCTTAAGATTAGGTTCCTTAATACATTAACAAACAGAGAAATGTTTCTTGATATTT:1 + chr3L 8333856 3' + F-element 89 1 76.71 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCTATTAAAGTTTTATATACCTTGATATAAAAACCACACTGTTTATTTATTTTCATTATTTATTGAATGTTTCTGAAACCGATTT:1 + chr2R 12379629 3' - pogo 20 1 66.15 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCCCAGAAAACGTCGTACAATCGCGACGAAACGGGTTCTAGATACATTTTTCGGCGTAGATATATATCTAAACGGACGCATCTACCAGCCACCGAAAGCAGCTGAGC:1 - 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F-element 98 1 82.88 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAATGGCTTCAATTGGCTATTACGAGACTGGAACAGGAATGCCCGTAAACTACTTGCGCGGAGAAAGTATTCGGTGGAATGTTAGCAATCTCGGCTGGGTTTGCAGCA:1 - chr3L 18968577 3' - hopper 17 1 67.12 GTCCCAAAATGATCAATATTTTTTAAAAAGTGCGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATTGTATGTGATTGGAGGGCGATGCAATCGTCTAGGATTTGGGGAATTGTCGCGCTCATGGGACA:1 + chrX 21084020 3' + HB 250 1 51.37 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCGCCCAAAAGCAGGCAACCCAAACTTGTGGACCACGCCCTACGCGTCCTTCACGCCC:1 - chr3R 8412569 3' + Tirant 8482 2 48.15 TGTGAAAAACACATTATTGTANAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGACGCGGTTCACACCCCACTTACACAATACC:1 + chr3R 10751751 3' + hopper 1387 1 66.67 CTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGATCGCTGGGGGATACGAGTGTAAGAAATGCAATTAAAT:1 + chr3R 7042054 3' - Stalker2 7334 2 73.97 AAAATAAAAAAAATAAAAAAACTTGGTGCCGTGGTAAGGAGGCTAATGCCACAGATAAAGCTGAAAGCCAGATCATGCCTTATGAATGAGAAGGGGGGGGGGCACCAAAAGGGGAGTGG:1 - 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chr3R 6399330 3' + pogo 2063 1 59.59 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACCACAAATACCCCTTGGTCCTCCGCTTTGGAAGCCAGTGAGTGGGCAGAGACACTGGGGGAATATATTTCGCTGTTTGTAAT:1 - chr3R 5495164 3' - roo 39 2 58.90 GAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGACGGTGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCATGGGGGAATCACCAAACCAAGGCATAGATTTACCTAGATATAGATTTA:1 - chr3L 4187280 3' - springer 58 2 60.00 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATGGGATCACCAATGCTGACAAGGGCATTTTGTGAGCTATAAAAATAAATAAATAAATATTAAGCGTAGAAAAATATATAAGA:1 - chr3R 7420405 3' - 412 7086 2 59.86 ATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTCCGATGTTTTGGCTTAAAGTGTAAAGTGTTCCCG:1 - chrX 1758972 3' + Tabor 7235 2 76.03 AAGATAAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTTAATCTTTAGTAAATGTGGGCAAAAAATAGAGATGATATTGAGCGCTTGTATCTATTAGATACATTTAATTTTCCATCTTTAGGGGCAATGACTCATCCCAGTACGAGTTTCATTT:1 + chr2R 6991648 3' - HB 1583 1 71.92 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGTCGGGATGTCTGGATGTTTGGGCTTACTTATGTATTTCACTCTTTATGATTTATTTCGAAATACTCTGGCCACATTCAGACACCAGCGGCAGAAAACCCGAAA:1 + chr2R 16367498 3' - hopper 17 1 71.23 ACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTACAAAAGTACTATAAATAAAACCGCACTGTGTTTTATTACTCTAAACGGTTTATTGATAGG:1 + chr2R 16185126 3' - 17.6 53 1 61.64 AGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGCACAAATCGAGTTACACTGATTTGGCTTCTGAAAAAGAACTTACCGAAATAAAAATAGCAATATATATTTAATTAAAATG:1 + chr2L 89194 3' + I-element 345 1 59.71 AATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACACAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCATGTCCATCACAGGCAATGCCTCTCTTCGTTTATTGA:1 - chr3R 5695200 3' + F-element 90 1 75.34 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAAACAAAGAGGAACTGCTTTAATCCGCTCGCCCGAAAGTATGCAGCGAAATAATTTTGTTTGCG:1 + chr3R 31086606 3' + jockey 4940 1 52.05 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATATAATGTTAATGAATTAATTCATTAATGAATGTTAATGAATTTTGCGTAAATGAAGCGACCACCACAATTGTCAGCCAGCTTGGACAGGC:1 - chr3R 13323849 3' - F-element 42 1 41.67 ATTGGTATTATTATTATTATTAGTATTATTCTGTTTAGGAATAAAGCAAAATCTCCAAACAAATATTATATGTCTAGACTTAAAAGGAAAATACGTGAAAGGAAGTCGTAAATTACTCATACGCAATGTAGGACGACCTTGGTTGG:1 - chr2L 8637025 3' - mdg1 7056 2 72.60 CGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTATTAAAATTGCTAATTTTTGGAGGCATTCATTTTATTCCGCTTGCTCTATTTGTTTTCCGTTGACACTGAAAAGGCTGGCGTACAATTTCAGCACA:1 - chr2L 19417296 3' + Gypsy6A_LTR 92 1 65.75 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATTTTTAAACATAATATGACATTCTTACCCATACTTTAATGCGAAATACATACGCTCTTCTGTTTGCTTGATTAGTATAAT:1 - chr2L 19731909 3' + roo 9030 1 56.85 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGAGTTTAGCTCACGGCTCATATATATTACACTTGCAAAATCCATAACCTATTAAGATTATTTATCCCTTA:1 - chr2R 12379489 3' + pogo 2051 1 54.11 CATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGATTAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCCAGTGGACAATTTTTTTGGTTTTTAATTAAAAATATGTTTGTGTCGTAGAC:1 + chr3L 21202081 3' + G2 2703 1 63.45 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAAGATAGTCTATCTCTTCACACAAAGATGATAAAAGCACTGATCGAA:1 - chr3R 27007330 3' - roo 49 2 52.05 GTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGATTCATGTGCGCAAGCCAGGCCAGGACAATTTAATGG:1 + chr2R 13695702 3' - blood 7095 2 74.66 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATTTAAGGTTGTGGAAGCTCACAAGCCAAATACACATTGCTCGCCATCGAGGTGTGCAATATTGTTGCTGCGTTATCAATTTATCCTGGCTGCTTTCCCACTTCCCACTCCCCCCTTT:1 - chr2R 22972525 3' - jockey 4765 1 41.78 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGTGTCTGTGTGTTTGCGCTGTTTACCTCAGCAGAC:1 + chr2R 21475284 3' - P-element 85 1 31.51 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCATGACTACGCAATAGCAACAACAATA:1 - chr3R 9550930 3' - P-element 90 1 20.71 TTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACTATTTTCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTGTATTTGTTTTGGTTTGCTGTTCAGTTGATGTCCCGACGATGGCGTTGATAATTATTATTAGTTTTATTATGT:1 + chr3L 3534614 3' - X-element 126 1 49.30 CGTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTCGAAAATATTTACACTTTCATTTTGTCCAACATGCAACGTTAGC:1 - chr3R 8381719 3' - Tirant 46 2 58.47 ACTCATGCCCATCCCTCCTACAAGCCAAACAAGACATATTTAACAACACAGAAAAAGGTGCTGGCATAAATGGAATGGAAATTGAAATAAATCGATTTGGGTCAGTGGCGTTAAAAACGTTTTAACGAGAGCTTAAAATAACTTAA:1 + chr3R 11835310 3' + I-element 5053 1 75.34 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTTGACGATTGGAGCGAAGGGCTCTCC:1 - chrX 10547688 3' + P-element 2795 1 19.01 CCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGTATATAGGATGTGCACGATGCCAGCTGCACGCCATTTCGTTGGCCAAAAAAACAAAAATACAGAGAAAAGTTAAAAAAAACTAGATGGTGACATCCGATCG:1 + chrX 15406091 3' + opus 491 2 70.99 GATAACATTGCCGGCTACCGCTTATAATGGTTAAAGCGTTGACCGTAGTCAGGGTGTCGCATGTTAAAAATATCAATTTGTTGTCTGCCCAGACTTCTGACTTTGTCCGTTCCTGACCAGACACTTTGGCCC:1 - chr3L 18256860 3' - gypsy7 5154 1 57.58 AATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATAATTATGTATATTGTTTTGAGCTTAAGACACCTATTATTTGTTAGTAGTAA:1 - chrX 4292855 3' - S-element 65 1 67.81 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACATAAATTGAAATCTAAATGTTTTTTTTTGTAGGCAAAATGAATGAAATAATATTTATACAA:1 + chr2R 10695875 3' + roo 347 2 62.33 TTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTCGCTTAATGACGACACGAAGCCGCCGTTTGAGCCGCGACAG:1 + chr2R 21362829 3' + Tirant 360 2 59.63 GCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGTGTTTCGCTGCTGCACGG:1 + chr3R 31419390 3' - pogo 2052 1 73.97 ATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATTATCTACGTGATATTGAATTTCATAAGCCAACTAATGAATTTCAAGACCAGAAATAATTAGGGTTTAAT:1 + chr3R 14401969 3' + Juan 4208 1 69.31 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTTCTTCAGTTTTAACTATATTTCAAGTATTTTACATATTTCTAGCCTATTTTCAAATCTCGCGCGCACCATAAACCGCTATTTTAGTCTTTTTTGTAGGCCGCAGATACCTGGTCTT:1 + chr3L 4277926 3' - P-element 75 1 75.34 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGCGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATCATTAAATATGTGCCAGACATGATTAACCCATTTTTACCCGCACAATTATCACATTGTGCACGCGCAC:2 - chr3R 23415897 3' + jockey 4938 1 52.74 GCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGANGNCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCTTTCATAAATATTTCCAAGTCACTGCCACCTATCATA:1 + chr4 815545 3' - 1360 114 1 71.13 GCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATGAGAATATACCCATTTTCCACAGTCTGGCTAAACTGCACATACTTCATATCACGAAACTTTTTCTGGT:1 + chr3L 10814609 3' - micropia 52 4 54.11 GATGATTACCGGCTGCGAATGGTACGTAAGGAACACAATAAACGTGCACTCGAGCTCTCTGATATCAGTGAATTGGGACGCCGCATGCTACCCTTTCCAGGCTCAGAGTGTCGCAGTTTGGGAGCTACGCAAAGATCATCAAGGAA:1 - chr3L 7638135 3' + BS3 1387 1 62.33 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAATGGGATCACCAATGCTGACAAGGGCATTTTGTGAGCTATAAAAATAAATAAATAAATATTAAG:1 - chr3R 7420424 3' - 412 7109 2 56.85 ACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTGAATATAAAATCAAACTGAACTTAGGGCTCACAAAATATGATTATCAACATTTCAGCAGCAGCTGAAAATGCCCAATTTTGGTATTTCACCATTTGCACGG:1 + chrX 21071627 3' - gypsy6 7621 2 57.53 GATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATATATATCTANACTTCTCGACTTTATATTAAAGATAGTTTCAGTTAGTAAGT:1 - chr2L 7774958 3' - I-element 69 1 67.59 CATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTGGCTTTAAGCGCGGTTTCAAAATGGTTGATCCTTCCAGAATATAGACATCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCACAGTCAAAAGTTTCCCAGCGATCGTTACCTTCTTC:1 - chr3R 17777459 3' - jockey 4649 1 70.55 CACGCCCACATTTTTGAAAAACTTTCGATATTTTATTGGTCTTTTCAAATAGGAATTCCCGAGACTAAAACGTTCGCAAGCATTCCGCTTCCAGAACGATTTAATTTGTTTTTGTTATCAAATGCAGGGAATAAAGCATGTTCATT:1 + chr3L 25846635 3' + INE-1 253 1 78.08