Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score CCATAGGGTTTACGATCCACCAAAACGGCTTTCTCCCGGTTTAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAG:1 + chr2L 5546252 5' + Doc 411 1 58.00 TGGGGCATCTTAATGCCAGTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 18355374 5' - P-element 2832 1 24.75 CCACCCCCGAGCGAATGCCACGCCCCCAACCCTAAATATATAAGATATATATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGACGTATCCGGCAGCGCAGCTACGCAGCT:1 - chr3R 6953257 5' + 412 312 2 70.30 TANTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGATCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTT:1 - chr2R 5531173 5' + 1360 83 1 57.29 GTCTATTTGTTGACCTTGGACCATGGGGGAAGTAGTCATATCTGCCATCCGCGTATTATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCA:1 + chr2L 2651583 5' - Bica 4563 1 63.64 CATTTTGGTTATTTAATTAGCGCCCCACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATAC:1 - chr2L 12321321 5' + hobo 2665 1 74.26 AAACAGGTGCGACACAAATCGTGTCCACGATCAGCGCTGTCCGTAGTGCGAGATGATGAAAAGCATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:1 - chr2L 21863440 5' - Burdock 6382 2 70.30 AAAGCGTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGTAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATGCTA:1 + chr2R 5178579 5' - mdg3 5488 2 63.37 TATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTT:1 + chr3R 4160055 5' - invader2 243 2 72.28 ATGAAAGAATAAAAACTAATTTAATATGAAAGAAGCCATTGTGAGTGTCGCAAGTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 + chrX 22781989 5' - I-element 5342 1 57.00 GGTAGGCGCATATGTGCCGCTTCCCCCTGTCCAAAAAAAAAGCGCACACCGACCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGA:1 - chr2R 19150739 5' + Chouto 5952 1 63.37 CTAACTGAGCATACTTAAAAATAACAAAACCAAAAGAATACCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr3L 11156191 5' + 297 6580 1 79.21 AATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCAATATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 + chr3R 17243122 5' + hopper 28 1 56.44 AGTACAAGAGTATAAGTTTAATCAATTATTTAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAG:1 + chrX 14771733 5' + BS 4806 1 72.45 TGAATGCAAAAAGAGGTGCTCTGGATTTTCAAAGCTATTATTTAAAGATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chrX 9983712 5' + pogo 25 1 55.45 GTGGAGAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGAT:1 + chrX 22726188 5' - Helena 1280 1 52.48 ACATAACCTCAATTTCGTGACGGGCTCCTTGGACAGGGAAAAGGGTGTTCAATCTATTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGG:1 - chr2R 17390709 5' - F-element 4350 1 60.40 TATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1 - chr2L 4034961 5' - TAHRE 10434 1 79.59 ATTCCCCTATGAAGCCCCTCGGTCGCCAATCAATTGTCATTGAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr3R 13481528 5' + 1360 47 1 61.39 AAATCGCGGCTAACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 4022362 5' - roo 9045 1 55.45 GGTGTTTGGTGGTCCGAAGGTATGCTAAACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTA:1 + chr3R 15034244 5' - hopper 48 1 72.28 AATGAAGTTGTATTGCAGAATCAGCAAAGCAAATGTATTTTCATGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAA:1 + chrX 9187548 5' - 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chrX 20999774 5' + BS 41 1 57.43 TTNTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTTGCAGTTGCAACTGTAGCCGCTCGTTGCAGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAA:1 + chr3L 1259221 5' + Doc 472 1 71.00 AANGCTTGATTTTTTAAGTGTGTTAAGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATCGAGAACACGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 + chr2L 19644887 5' - blood 7336 1 70.30 ATNATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chrX 4806728 5' + roo 8711 2 78.22 GATAGAGCCGACAAATCAATTATAGGCCCCAATGCGTTTTCTATTTTCTATCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTC:2 - chr3R 9127437 5' - invader3 5436 2 51.49 TCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAATTCATCG:1 + chrX 9579324 5' + Tirant 29 2 62.37 ACTCGAGTGGTCAAAAAGCAGTGCAATACAGATAATATCAAGTCAGTGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATC:1 + chr3R 25842254 5' - mdg3 344 1 53.47 TTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr3L 18511078 5' + Ivk 54 1 75.25 TTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTA:1 - 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chrX 16511876 5' + micropia 5294 1 75.25 ACATATGTATGCAAAACGAATATATTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCAA:1 + chrX 22560077 5' + invader1 35 2 81.19 ATNTCTAAAATATCTGATTTATATTAATGCCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chrX 14131810 5' + I-element 47 1 69.31 TTATATTTGTATTGGTCAGTTTCACAGCAGCGGAGCAGCAACAAATGTTGCAAAAAAAAAAATGAAAAAAAAAAACGAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 5057390 5' + Doc2-element 235 3 75.56 AATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATT:1 - chrX 8027463 5' + Juan 42 1 64.36 CTTCCAAGAAAGTGTAGCCTTATTCCAGTTTTCGTTTTGCTGACACAGTTCCATTTCTTTTGCTTACACATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTT:1 + chrX 22630171 5' - Bica 440 1 71.29 TGTTTCTCGTTAGACGAAACAAAAGCCTTACATTTTCTGGAGTATAAATTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACTTGGGCAAACGATGTTATTGTGTTTT:1 - chr3R 20548250 5' - FB 197 1 65.35 TAAAATTCAAAAATTTTAACAGTTTTTCTAGATAGTTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3L 16673635 5' - 1360 3351 1 65.35 TTTTGTTATATTTTCTTATTGAATCAAATAAATGTCTCGTCGGCACCTAAAAGACATCATGCCGTTTGTAACGTGTAAGGAAATAAATTGATGGAAGGCA:1 - chr3L 11488701 5' - Gypsy12A_LTR 2247 1 60.00 AATATCACAATTTGAATCTATTTTGAAATTACGTAAAACATACATTAATTGTAGAGATTCAGCGAATATGAAAACCTTATACCCTCAAAGTGATAGAAGAG:1 - chr3R 24413054 5' + Porto1 328 1 52.48 AAGATTGACCTCTGCTAAATCAAATGTAAAAACTCTGCCAATTTGGACCCGACATCCCAACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATAC:1 - chrX 20796540 5' + I-element 210 1 72.28 TATGCAGGCTATGCTTAATTGGCGTAGATACTTTTTAAGCTAACTTTGTCTTTTTTTTTTCAATTTT:1 + chr2L 10966852 5' + Tc1-2 1397 1 64.18 AATTTAAATAAATAAACGCATTGGAAATTATGACCAGCAGCAAAAGTAAATGAATGCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTT:1 - chrX 13110137 5' - Stalker2 290 2 55.45 CAAGGATACTTATGCCCATTGATTGGCAACTGTTGCAAAGATACTTAAATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 + chrX 5912903 5' - flea 228 2 52.48 TCTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTTATTCTCTTTGAAATTATGTATGTAACAAATGTGTATAAACTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 - chr2R 19878793 5' + INE-1 88 1 62.38 TTTATACCCATTATGTAAGTATGTAATAGGCAGAAGGAAGCGTTTACGACTATGTAAAGTATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAAC:1 + chr4 400530 5' + HB 20 1 71.29 TTAGTTTAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - 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chr3L 18857680 5' - gypsy4 6496 1 66.34 CCCATCTAATTGGGTACAGAGACTTAGTTGCCAGGGTTGTCACTCTCATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGG:1 - chr2R 13759224 5' - G6 1931 1 57.47 CTTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chrX 21636182 5' - Stalker2 7618 2 57.43 CTATCTAACCAGTTTTCTTTTTTTTTTTATTTTCACCCAAGGATCGGGGGTGGCTGAAAAAAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAGGG:1 + chrX 9770935 5' - hopper 140 2 65.12 CCCATAAAAATAAAAACAATGGGGGAAAAAATCGAAGAAACTATTTAAAAGCCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 6082561 5' + roo 8688 2 55.45 TGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1 + chr2R 18344577 5' - 1360 3335 1 80.00 TGGACAATCAGTTACATTTTCCTTGGCTTGCTAGCTTAGCATATAGCGTTTAGCAAAAAATACATAATTCCAACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCC:1 - chrX 16308724 5' + G-element 4242 1 67.33 TGCAACTGCAACTATTTGAGGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 - chr3L 1259247 5' + Doc 17 1 62.38 ACAGCCTAAAACGGTGGCAGTCCAAAGTATCACAAAACAGAGCTATTAACACGAACACCCCACACCCATGCGATTACCTTAAACAACCCCACCCAAA:1 + chr3L 18556709 5' + I-element 4891 1 52.58 AGNAGTTATTATTGTAATATTGTACTTTATCAATAAATATAAGACTGTACCCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - 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chr3R 15790865 5' - R1A1-element 140 1 67.33 TTCACATGTCGCATCGGCGAAGGAACTTGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2L 810307 5' - hobo 2893 1 72.00 AAAAGCGGAAAAACAGGGAAAACCGAGGGGCAAACAGGGGGCCAACCCGGGATCAAGCCCTTAACCAACAATTATGACAGGCCCACCAAACATTTAGAAAA:1 - chrX 4419130 5' + I-element 193 1 59.41 ATTAGGACCATAGTGACGACCTGCATGAGGACAACGAAATCCTGTCCTTGTCCCCTGAAAATTCCAGTCTGTGCGTATCCAGACACATGCATCATATGCTC:1 - chr2L 19564921 5' + R1A1-element 5243 1 77.23 AAAGAACATTTGATGGCATGTTGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 + chr3R 4600431 5' + Tabor 6874 2 58.42 TAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 + chr4 1156886 5' + F-element 61 1 72.28 ATCATTATCTATTTATCCTATTAAGACAAACCAACCATAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr2L 4152949 5' + FB 39 1 64.36 ATNAGTACATTCAATGGCGGTAATGAGGAAAATTATACTAATTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTATTTTAT:1 + chr2L 12283922 5' - 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invader2 4701 1 79.21 AGTTGGGTCCTTCGGCATCCTCCCACATTTCCATCAGTCTGCCCATTGTCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGT:1 - chr3L 7840151 5' - F-element 4435 1 52.48 GTNTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 + chr3L 18337659 5' - Juan 4174 1 66.34 ATATAATGAACCCCCAACCCCCCCTGAAGGACCCACCAGTTTGCAGCCTCATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATAC:1 + chrX 7658206 5' + I-element 131 1 59.41 GTGTGTTTCATGTGAACGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chrX 6509776 5' - jockey 4959 1 58.42 CTTTGACTGGGTCACATTCTCTCCGAGGGTATTGTACAGGTGCTTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATGTAGATAACATACAAA:1 - chr3R 19481963 5' + I-element 5127 1 55.45 AACACGATCTTTCACTCTCTCTCGTACTCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr2R 21497527 5' - P-element 2839 1 29.90 TAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGAT:1 + chr3L 24213794 5' - invader2 201 2 71.29 TGTCGTGCAACAACTCCCCCGTGTATTTTTTTTGTATGCCCCAAGCTCTGTTCACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2R 18356267 5' - P-element 2868 1 57.73 AGACGGGATCGAATCAATCAGTGTATTTAGTTAACGACCGAACTCGCGCCTTCTCCTTCTGTGCGTATGAACGTCTCGATCTCAGGAACTATATAAGCTAA:1 + chrX 16548582 5' + INE-1 152 1 64.36 ACAGAAGGGGATACCATATACCCCCCACACACTAATGGGTATGAAAATCTCACTGACTTCCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 27452418 5' - roo 402 1 68.32 TGAGGGAAAATCGAAGCAATTGAAGAATTAACTTTTTGGTCTCCTATAAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTC:1 - chrX 5154099 5' - pogo 242 1 64.65 ATACAAGCTGCTAAATGTTATTGGGGTTATAGTATGTGGGTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGT:1 + chrX 14040718 5' - roo 8600 1 60.40 AAATGTCCCATTATACATATGTAGTTAGTATAACCCGCTGATTTGGATTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTT:1 - chr2R 12750950 5' - Quasimodo 83 2 58.42 CTTTTGCATAAGTATTCATCTGGCAAGATAGTTATATTTAACATCAATTTATGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3L 10891506 5' + pogo 21 1 56.44 AANATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3R 6290991 5' + Doc 54 1 78.22 AANATTGCGCAGATAAATAAATCTTAATATACTAAATTATTTATATGAATAGTGTTTTACTAATTCATTTATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2L 13229083 5' - roo 406 1 73.27 AAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAAT:1 - chr3L 23702260 5' + G4 13 1 62.38 TATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATAC:1 - chr2R 2949104 5' + 17.6 6967 2 66.34 AGTACAAACTTTCGAGAGGCAGTATTTTTTGGGCAAACGATAAAAATTTAGAAGGCTAATAAAATATCCAAAAGTTTTTCAAAAATGTGGGCGTGGTAGTT:1 - chr3L 23617236 5' - INE-1 247 1 62.38 GTACATTTAAGCTCTTTGCTTACTTAAAAACCCAAAAAAAGTGACTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 - chrX 9403437 5' + 1360 3387 2 67.33 CTTCAACACTTTTGGCCGGGGGAAATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chrX 4448556 5' - 412 442 2 71.29 TAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTATTCCGC:1 + chr4 1294995 5' - TAHRE 10402 1 67.33 TTNGAAATTCTTCGCAAAAGGCCAACAGCATGAAAGGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 10557634 5' + 412 42 2 65.35 CACGGGCACGAGCATCTGTGGCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 6557140 5' - roo 9016 2 77.23 ATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 21534245 5' + 1360 23 1 54.46 AATAGAGAAACCAACGATAACAGCCACCATCGCCAGCACTCGAGCATATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCT:1 + chr2L 2324002 5' + X-element 4429 1 61.45 TTTATCGTAATTTTCCTGGGCAGCAGGTCCTTTTTTAGGACTGCTTCATCAGCGGGTTTTGAGCGAACGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTG:1 + chr2L 2331719 5' - Quasimodo 290 2 74.26 TATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGCCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chrX 7583219 5' + I-element 48 1 72.28 CGCAAAGTTTGGGTTTGGGTGTATGAAAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2R 17938928 5' + copia 4918 2 75.25 CGCCACACGGAGGAGGTGACCTGGCTGGGAAGCTGTGTGGAAAGAGAGTAACTTTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCACCACT:1 - chr2L 13477419 5' - Porto1 337 1 57.43 ACATCTGAAGCTCATCTCCACCACGTTAATGTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chr3L 7061163 5' - I-element 5311 1 68.04 GCAATGAGCTATTTCATTAACTTTGAAAAGTGGTGTGGCAGAATTGTTTAAATTTATAAATATATACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGAT:1 + chr3R 2308531 5' - Tom1 375 1 65.35 CTCAATCGATGCACAGTTATTGTGTAAGCAGAGCAGCGGGCACACACCAGCGCCGAGGGAGGAAAGCTTACAAAAAAACGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGA:1 - chr3R 20957892 5' + accord2 49 2 58.42 TTTTCTTTAATACCTTATTTAAATTCGCAAACTTTTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATG:1 - chr2L 4325615 5' + 1360 436 1 69.31 GGCGATGGATGGCAATGGCTGGCTGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 30904199 5' - roo 9051 2 59.79 AAAATAGGTTTTAGAAAAAATAAACAATTTAAATAAATCTGCTCTAGTTTTATTCCCGTTGTATGTTTTTTTTTGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTCA:1 + chrX 7739945 5' - accord 7028 2 72.28 GTGGCAGGTTTTCGTCTTTTACTTAAGCGACATCATCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCA:1 - chr3L 24894813 5' - Doc 4381 1 65.35 TTTTTTTACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr2R 18344639 5' + 1360 14 1 61.39 TGCTATTTACCTATTAAGCCTTAAAACATGGAGGACAGTAGTATAACTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACG:1 - chrX 20858777 5' + Copia1_DM 33 1 56.44 ACGAATCCTATGCTTTCCGCTTTGCCAAATTCATAATATATTCGCATGTGGAATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTT:1 - chr3L 4312292 5' - Quasimodo 6956 2 56.44 AGCGAGGGTAATGGTTACGGTATTGGCTTACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTA:1 - chr3L 10814990 5' - GATE 8363 2 71.29 AGTGCGGACGGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 + chr3L 447308 5' + Tabor 32 2 58.00 ACGCATTTTAGCACCTTGACACACCTGTCCCCACCTCCACGTGTTTGCATTCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAAC:1 + chr2R 17876268 5' - Tc1 1568 1 58.42 TTCCTTTTTCTGCTTAATATGGATTCTTTCCTCAACTTAATTATAATTAGTCAACATGAATTTCTCTGCGTGTAATGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTC:1 - chr2L 15345477 5' - G5A 2685 1 78.22 AGAATCACAATCGAAAGCGGAATCACACAAAAACAAATCAATCTTTGCATACAATAACAACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGC:1 - chr2R 12150108 5' + jockey 140 1 73.27 AAATAATGTTATAATATAATAAACTTGCAAAAATGTCACGTACTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr3R 26255110 5' - opus 469 2 64.36 GTGTCAACAGTTGCCGAGACTGAAGCAAAAAAAAAAACAAAAAAACAACAACAAAA:1 - chrX 14984403 5' + gypsy9 454 3 92.86 AGATATTAAAGCTTTAGAACGTTACAACTACGTTATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3L 21534311 5' - 1360 3347 1 70.30 GAACACACTGACGGCAGCCACAACAATTTTAAGCTTGTTCTCTCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTG:1 - chr2L 19142347 5' - mdg1 7074 4 69.07 GGGGAGCGGCCTAGTAACAGCGAATAATAAATAAATAATAATAAATTGGTGCTGCAGGGGATGAAAAAAAAGGAGATTCTTCAAATCGACACACCTGGCAT:1 + chr3R 2446837 5' + HMS-Beagle2 6746 1 44.55 ATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTG:1 + chr3L 20756360 5' + INE-1 159 1 80.20 TCTGGACAAGAGGAACCAGTTCACTCAATAAATAACGTATCTTTACTAGCATTAAAAAATATTTTAATCTTGTATGACAATATATAAGAATATAATAACA:1 - chrX 7746960 5' + mdg1 4 2 80.00 TTGAAATGGCAAATAGGAATGGTTAACAATGCTTCAAACAAAAGTGTTGAATGTATTTGAGTTTTATCAATTTTACATACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCG:1 - chr3L 7333484 5' + Juan 3 1 79.21 AAGGAAAAAAAAGGGAGGAATCCGGAAATTATGCAAAAAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chrX 3547551 5' - roo 9036 1 63.37 ATGAATGAGCGGCGACCACTGCGAACACTCGTGACTTGAGCGACTTTTGCCAACATCAGAATCAGATCTGTTATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr3R 6003045 5' - opus 498 1 79.21 TTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr2L 23295874 5' + micropia 20 2 55.45 CAAATTAATAAAGTTTTTTAGGAGCGAGTTTCATCTCAAAACTTTCATTTCATTTATAGGATTTTTTTTTTATTATTATTCGACTTACGGTAGGAAAATTA:1 - chr2L 15915953 5' - Rt1b 5128 1 62.38 TTTTAAATATTCGTGAAATATATCTAAAAGTAGAACATATTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 - chr3R 17412624 5' + 3S18 5804 2 61.39 ATTTGACATTTGAATATTTCTTTTTTGAGCCGCTGCCGTAAAGTGTAAGAGTCATTAAGAGCGATTAAAGTCTCCTTTTTATAATATAATTTTATGCAGC:1 - chr2L 19976152 5' - micropia 5370 2 72.00 AANTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACA:1 - chrX 21636266 5' + Stalker2 16 2 60.40 CAGCGGCGAGTAACCCAAAGATCTCTAATTGTAGCCACACACGAAGTGGCCGGTTGGGACCTCAAAAATACGTCTCTCCCCTTCCC:1 + chr2R 20054229 5' - 297 6573 1 62.79 CAAAACAGATTATGGAACTATGAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 + chrX 4174915 5' - I-element 5304 1 74.26 CATCACTTAAATTAAAAAAGAACATTTGCGGCCTTAGATTGGAAAATGTCTAATACTATTTACAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACA:1 - chrX 8150509 5' - rover 338 2 71.29 CATCAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGT:1 - chrX 4175145 5' + I-element 329 1 57.43 ATTCGAATTATAAATTGTATTTTATATCATTTTTTTATATAAATTTTATAATACCAGTGACACTTCAAAGTCCGAAAAGATAAGTCGTGCCACT:1 - chr3R 22686599 5' + I-element 19 1 31.91 GCTGTGCGACAATATTTGGTTCGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chrX 17699190 5' - P-element 2833 1 25.74 CGTATGCAGTGGAAATTTTTTTGTGCTCAGCATTTTATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr3R 20373221 5' + I-element 11 1 67.33 TTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chrX 4806743 5' + roo 29 2 63.27 GAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2R 981617 5' + 1360 56 1 66.34 TCCCAAGAAAAAGCAAACCAACCCGGAAAAACCGCGAAAAATCCATTGCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr3R 17674392 5' + blood 28 2 55.45 CATTCCATGATGTTTAGCGATCTGTTTAGGGATTTATGTAGTTTGTTTGTGTGAACTTTATACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 - chrX 19820127 5' - mdg1 407 2 49.50 CANAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTTAATCAATTATTTAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGA:1 + chrX 14771726 5' + BS 4802 1 66.34 CGCAATGCAGCAAAAATGCCGGAAACTTGCACGAGTGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGA:1 + chr2L 12188041 5' + invader2 291 1 64.36 ATTGGGAAAGTCGAATTTTAGTCAATGAAAGTGGGAAAAATTTCATTTAAATTAAGAAGAAAGGAATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTA:1 - chr3R 29141058 5' + Juan 15 1 65.35 GTGTTGCATGTTGTGCCCGGACAGAGTCGGGTAAATATTTAATATCTGTACGTCATTTGCCCGGCAATGATAAAATCGGGTTCGCATTCACACTAGCTGAG:1 - chr2R 20362823 5' + INE-1 530 1 70.30 AAAAGAAAGCGCACTCAACTGACCTCAACAATGGCAATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr3R 24738996 5' + pogo 18 1 61.39 CCNAGACCAAGCACACAGACGGCAGCAAACAGGCTAAATGCAAACAGGCAAACAAAAATGATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3R 20373320 5' - I-element 5343 1 64.36 AACAATGAGTTGGCCTTTTGTTGCTGCGCGGTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAA:1 + chr3L 10111907 5' + F-element 4667 1 69.31 TTATGGGAACATATGAATACTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATGAA:1 - 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chr3R 19560953 5' - hobo 2912 1 57.43 TGTTTTTTGTTAATTTGTTGTTACATCTTCATTGGCATTTTTTGTTGGTTTTAGGGGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTT:1 - chr3L 14210331 5' - I-element 391 1 65.52 ATTTGCTTTCCATTTGGATTAGGGCTTACCTAATACAAAAAACAAAACTCACTCTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAA:1 - chr3L 19335048 5' - copia 5012 2 62.38 ATATATGTAAAAATATTAATGATAAGGTGCGATAAAAGATAATAAAACTGACACGGTGCCCCAGTTCTCAGAACCTTTGATTGTGCTCGTTGTATGATGTC:1 - chr3L 21953299 5' - F-element 4313 2 50.50 GAAGTTCATTGAACAGTTTTATTTTACTTGGAGCAGGAATCAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGA:1 + chr3R 25725033 5' + mdg1 7398 2 59.41 AAACTGCAGTGAAAGCACAACTTTCGGGGAAACTGAAAAGTGCAGTTATTGAGTGTTAGTTGCAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2L 810238 5' + hobo 13 1 66.00 GAAAAGAATTTTAATTAGTTTTGGGAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAA:1 - chr3L 6013757 5' + Max-element 2 2 77.23 AGAAGGGTAAGGTGTTATAGGTATTTCTACATGATACTCACATTCAAATATTCAGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAAT:1 + chr3R 5401816 5' - copia 95 2 59.41 CAATCCCTTTTTTATTCGTTTGCCTTTTCTATTTCTATTGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGC:1 + chr2L 12246838 5' - Ivk 5052 1 61.39 AAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGAT:1 - chr2R 2527409 5' + roo 8742 2 71.29 GTNAGCCATTTGATATATCCTTTCTATTGCTATTTACCTATTAAGCCTTAAAACATGGAGGACAGTAGTATAACTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATA:1 - chrX 20858804 5' + Copia1_DM 6 1 72.28 TGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGTTCGTTGCCTCCAGAAACGACTT:1 - chr3R 24430567 5' - Transpac 254 2 79.21 ATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACA:1 - chr3R 2689388 5' - diver2 4476 1 41.38 ATTATGATGGCGAGTGACTAATTCTTTGTTATTCTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCAAATTTTTGTT:1 - chr2R 23729718 5' + 1360 84 1 65.66 CANAACTCTGACAATGGCAAATAGTAATGGCATTGCCTTCGGCAACAACTATGGCTCAAGAATAACATCAAACACCATGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2L 18223871 5' + roo 1 2 75.25 AAAACAAAAACACAGTAAACCGTAATCCGTAAAAATTGAAGAAGATGAGTTTATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr3R 446000 5' + pogo 19 1 60.40 TGTTGTTGTTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:2 - 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chr2R 19149453 5' + diver 5932 2 64.36 AAAATCATGCCCCGGGTATTGGCCTACATCCTTCTGGTCTCAGCTTTGGCGTTAGCCATCTC:1 + chr2L 3282099 5' - gypsy8 4519 1 64.52 TGNTGTGCGGCGGCACGATTATTCACGAAGGTTCGTACTAATTATATATGCATATACATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 - chr2R 17483830 5' - roo 394 1 64.36 GATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAAC:1 + chr3R 1418286 5' + BS3 223 1 63.37 AGCCCGACTACGCCAGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2R 9658378 5' - P-element 2829 1 21.78 ACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATTATTTCGTTTGCCCACCACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCG:1 + chr2R 23000262 5' - FB 621 3 68.37 CTNCGGTTGCCCAACAACAGTTGTCTACTTTTAGGCGCTCATGTTCCGAAGTACAATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3R 19560958 5' - hobo 2918 1 56.00 TTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAATTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 - chrX 9376921 5' - TAHRE 10433 1 73.27 TGNCTTTTTGAGCTTTATTTTGCACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr2R 8314139 5' + hobo 22 1 57.43 TAGTTAAATAATACAGTAATTTTAAATGATATCCTTTTAAATAATCAAAACTATGTCATATTTTTAAATTTAATTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATC:1 - 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chr2R 17523921 5' - Doc 4365 1 72.28 CTCGCAGCCAGGAATCCCAAGCAGCAGCATAGCAGCACCCTGGAATCGTATCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAG:1 + chr3L 5738013 5' - I-element 4874 1 54.55 CTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCT:1 - chr2R 6801693 5' - McClintock 440 2 67.33 AGNTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCA:1 - chr3R 1868205 5' + G-element 49 1 68.32 TTGCGCAAAATCAACGCGCTCGTAGCGAGTTTAAAGTTTTTCGAGTTTGTTTGAATTTTGTTGCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3R 27452304 5' + roo 8676 2 64.36 CTTGGGCTTCCGCTATGCGGGCCTCGCCAGGAAGTGGACAGTTAAGCAGCAGCTCAACTCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr2R 13334899 5' + pogo 5 1 71.43 ATTATTAAGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTAATTT:1 + chr2L 8333387 5' - Doc 4699 1 75.76 ACNGAGCCCAGAGCAGCTTCCTTCGCTTTTCGACACCCAACTAACGTTTAGTCGTTACTCAGCTAGTGAAAATGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTG:1 - chr2L 11596216 5' - INE-1 514 1 55.45 TTTTTGTCATTGTTTCAGATGACAATTTCGTTATCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATGTAACCATAATAGG:1 - 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chr3R 17243208 5' + hopper 22 1 54.46 AGNCATGGCTTTGCCGAAGAAAGGGGAACACACACACACACACACAC:1 + chr3R 11601716 5' + accord 183 2 89.36 GCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 + chr2R 9788946 5' - blood 7345 2 67.33 AGATGTGAGTCGTTTTTAATGGCGCAAAGCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3R 9325580 5' - roo 407 1 77.23 GTTGTTTAACAAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATA:1 - chr3L 9909799 5' + Transpac 4919 1 79.21 AGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACC:1 + chr2R 2949040 5' - 17.6 7389 2 65.35 GCAACTATTTGAGGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 - chr3L 1259240 5' + Doc 24 1 55.45 AATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTTAATCAATTATTTAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAG:1 + chrX 14771722 5' + BS 4798 1 62.38 TTNTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATC:1 + chr4 1294992 5' - 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S2 1316 1 63.37 AGCTGCATATATATGCATATGCATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACA:1 - chr3L 10382694 5' + I-element 5025 1 79.21 AAACTTAGCTTGCATAGCGAATATATTATATTATATTACCCTCTAATTAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAAT:1 - chr3R 11735285 5' + Juan 3775 1 62.38 AAAGTGACAAATTGTTGTAAACACTGCAAGTTACGTATACGCCTCGTGGGCCTGGATAGGTTCTTTTCTATATTTCTGCCCGCCTAAAAAGTTAGAGCCTT:1 + chr3R 30631087 5' - Gypsy12A_LTR 485 1 59.41 TCNCGGTAATTGCTTCAATTTGGCGTACATATCCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr3L 7968729 5' - hobo 2897 1 66.34 TTTGTTTTACTAATTGCGTGAAACTCGAGCGCACCTTAATTATAGTGTATAAAAATGCACCGTGGAGAGGTTATTCTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGG:1 - chr2L 1911174 5' - G5A 2700 1 67.33 TGNCGATCTAGATTGCGCTCCAAAATTAAAAATCTAGGGTCAACCTGAGCGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr2R 5262659 5' + 1360 23 1 55.45 CCAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3L 13704665 5' + hobo 41 1 67.33 AAGTCTTGGATCAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAA:1 - chrX 21636278 5' + Stalker2 7252 2 71.29 AGCTGAGTGAAAAGAAAAAAAAAGCGTAAAAAAAGGAAAATGCATAGAAATTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr2L 4156134 5' + FB 27 1 53.47 AAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACAC:1 + chr3L 24213796 5' - invader2 5086 2 62.50 GCATGCAAAATTGAAATCATCAACGTCATCATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAG:1 - chr3R 9298765 5' - hobo 410 1 70.30 AAAAATGAAGAGAAGCGATAAAAGCGAGCCATATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAA:1 + chrX 12846894 5' + McClintock 6008 2 69.31 CGATGTATCTTTCATCGATAGTTGCCAAACAATATCGATTCGTTTACCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 11790039 5' - P-element 2861 1 52.48 AGCCACCTCCTTTTGCCCTCGTTGCCTTTCACGGTTCAGTTGGTCTAATAATGCAAATACACAATTAATAAGGCAATGCTTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCA:1 + chrX 5141269 5' + 1360 459 1 67.33 ATGCACGTCACAGAATATGTGAGGCAACTCATATATATATGTAACAGGGAGTAAGGCTGAAGGCTGTCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 + chrX 22259777 5' + flea 40 2 67.33 AATGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATG:1 - chr3R 15790073 5' + flea 4737 1 60.40 GATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAAATAAAACACACAAAGGCAGGAGGTGTACTCTTT:1 + chr3L 24213798 5' - invader2 204 2 67.02 AACTGAACACTTGTCGTCATCTTGCAGTCGTCGTGGTTGCAGTCGCTAGGTTACAACTTTTCTTTTTTTCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCTCTTT:1 - chr2R 20186876 5' - Doc2-element 4746 3 60.40 AGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGATGAGCAGGATG:1 - chrX 19820775 5' - Rt1b 4965 1 75.25 GTGGTGGTGCGGGTGTCACACACACACACACACACACCAGCTTACTCACACACACACACACACACAT:1 - chr3L 10187421 5' + Quasimodo 37 2 59.70 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAG:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 173 2 54.00 GGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACG:1 + chr3L 25889016 5' + gypsy8 308 1 71.43 AATCAACCAATTAAATTATTGCGCGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTG:1 - chr3R 28083725 5' - invader1 181 2 75.00 ATCAAGAACCATCGGATACCCCACTAGAATCTCTGTTTCTGTGTATCTCTTCCTGGTCTAGAATTCGATTGGCTTAAAGTCTAAAAATTGAGTTACAGACT:1 + chr2R 4716422 5' - transib2 2787 1 58.42 ATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGG:1 - chrX 4175139 5' + I-element 335 1 59.41 AATGTAATATTGCAACCAATTTAAGTTAGTAAACCAAAAGGATTAGACAGTCAGATATCTGATATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 + chr3R 19206079 5' - mdg1 7446 2 59.41 ACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr2L 12284011 5' + 297 40 2 66.34 GAAGTCAAAATGCGTGGCCTCAACGATTCTGTGTATTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3R 28288650 5' + 412 7091 2 67.00 CTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 18816142 5' - roo 9014 2 82.18 TCNCTTTATAACCGTCATAAATGTTGCCATTTGCTTCAATGTCCAATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATT:1 + chr3R 13349510 5' - Ivk 5344 1 53.47 TCGAAAGCCGTTCGTCCGTCCAAGGCGAAAGGTTAAATCCAAATCAAAAGGTGGTGCTCTAGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATCGAAGGCAAGGGGAC:1 + chr2R 23422991 5' - Gypsy12A_LTR 2240 1 57.43 AAATCAATATAAATAAATGAAGACAAATATCCAAAAAGCGCACAAAGAGAGACTACATGATATGAGTTAAGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAAC:1 - chr3L 10561884 5' + hopper2 1173 2 62.38 ACCGAGGGCTTGTCGTCATATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr3R 14688347 5' + pogo 2 1 67.33 ATGATGAACATAATTTAAAGTCTGTAAAAGATACTGGTTACAGTCCAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr4 119381 5' - 1360 3365 1 53.47 ACAAGCCCACAAGGAAAAAAAAGGGAGGAATCCGGAAATTATGCAAAAAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 3547561 5' - roo 9046 1 55.45 TTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTACTACATGCTCTATGCATAACCTTAATACGTGTCAGGGAGATCTAGCAC:1 - chr2R 5719522 5' - G4 3702 1 84.16 ACCCGCAGTTCATAGTTTAGAGTTCAGCTGTTCAGCGGCTGGTGTGTGACATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCT:1 - chrX 20330260 5' + Circe 42 2 63.86 AGTTGCCCACCTTCTTTGGAACAGTGCTCTTTGCTCTGGAAGCAGTGGGAGTGGTAAGTCTTAAAAATAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTA:1 + chr3L 1973417 5' - flea 249 2 71.29 ACGTGCAATATGTAAAGCGGCCCAAATGACGTAGCCGAGAAAACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGC:1 + chr3L 4421899 5' + hobo 2701 1 58.42 TAAATATTTTATTTTCGCCGTGCAGTTGATGTTGTCAACAAACGGGATCGAGCTCAATGAAATTAATGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 20913931 5' + P-element 6 2 71.29 TCATCCATTGCCTTAACATTGTATATTCAATTTAATCCGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr3R 22208556 5' + I-element 39 1 61.39 CAAAAAAACACACAAGTATGCAAATTTGCAGTATTTTAGTATTAATACATTGGACTTTAAACTGTTATGTTACCGCCCGCAAAAGTCAATTTAACAGC:1 - chr2L 20799551 5' - hopper2 1492 1 81.63 TCACTTGCCGCTCTCTCTCTGTCGCGGTGTTTGTGATAGTTGATAGTTGGTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGCTGAGTAACAGTGTGGTCTGGCAGAT:1 + chr3L 9401190 5' - Bica 4790 1 52.48 TAAATATCCGTATGTAGTCTGTTGCATTCAAGACCCCATTACATAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr3L 7629562 5' - opus 469 2 58.42 CAAAAAGCTACACAAAAACTTTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACAC:1 - chr3L 972601 5' - Cr1a 399 1 79.21 ATGTTTGTAAAGCTTAAGTACTTAACGGATTACAGGGCATTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chrX 14131766 5' - I-element 5323 1 62.00 TAGTATAGTTTGTATCTACTTAAAACTAAAAACAACAATACCGTTAACCCAGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAA:1 - chr3L 13145650 5' + I-element 191 1 78.22 TTGGATCAGTTGCTGGTGGTGGGGCAGAACTATGCATGGAACAGTCTTTATTTGTAAGTCTTATTCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGG:1 - chr2L 12398590 5' + Cr1a 4075 1 75.25 GAATTGCAATTACAATGAGTCGAGGAAGTTGAAATTCGGTTAGGGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCTCCAAGTCCTGGCACCGTGATTG:1 - chr2L 14033931 5' - Tc1 1268 1 51.02 TCNCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGACTATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGAATTTGTTATCTAAGG:1 + chr3R 19450204 5' + roo 8756 2 65.98 ACATATTCAATAGTTTAACATTGGTTTTATATTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGTCAATGCTTGTACTCGAAGCT:1 - chr3R 16593878 5' + Max-element 46 2 71.29 AATATGTCGTTTAAAACTTAAAAATGGTCTGTATCCTTTACTTCAGTTATCCTATCTGCCAAGTGGTTTGAGTAGCTTAAGAATTAACTTTCTTTTCTCCT:1 + chr3R 27614436 5' - HB 376 1 75.25 CGCACACGCACACAGACACCAGAGACGTGGCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:1 - chr2L 1089609 5' + hopper 45 1 70.30 GTTACTGTTTTGCACTGAGGGAAAATACTATGAATACTACTATATGAATGAATATACTATACTACACTATGAATGGATATTACTATCTATAATAATATTAA:1 - chr2L 3588602 5' - Tc3 280 1 74.26 GTNACACGAGCGTTCAAATATACCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr2L 18987289 5' - P-element 2835 1 26.73 GATTCAAGTGGGACAATGGCAATGAGGCTTCTTTAACCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGAGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTTAG:1 - chr2L 15076465 5' - mdg3 314 1 62.38 AGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 18816132 5' - roo 9024 2 72.28 AAAGTTAATGGTTTTGCACATTTTTACGAAATTTTTAAAGTAATCAATTTCTTCAGCATACTTACTTACACATAGATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr2L 9488256 5' + 297 6584 2 43.56 CGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTG:1 - chr3R 1868208 5' + G-element 45 1 65.00 GAATCCGACTCCGAATGGGAACGTATCTGTATCTGGAGCTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 - chr3L 447373 5' - Tabor 7289 2 58.42 TGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGTATAGTATACACCCTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 - chr2R 10444304 5' + P-element 20 1 59.41 TGCCCCTTGTTTCATTCGTTCCGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCG:1 + chr3L 22221159 5' + F-element 130 1 78.22 CCCAGCAATGGCAACCAGTCCCAACGTAGCAGAAGTGGATGATGGCGAGCTGCCGAAACCGTTTCTGGAGGAGGTGGGTCATGGAGTACCTGCCTACGCTT:1 + chr2R 21717924 5' + aurora-element 3770 1 61.39 AATAAAGCGTTTAATTATCACTTAAGGCCTGCTGTTTTTTTTATTTATTTATTTTTTTCTCTAAGTAACAATCTGCTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCC:1 - chrX 13337948 5' - Porto1 4515 1 66.34 TGNCGCCCCCCTTTCCCAATCCTTTGCCACCCTTTCCACGACCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGATTACC:1 - chr3R 14626077 5' + P-element 26 1 46.81 GANGCTCTCCAATTATGGAATTGTTCCGGAAAAAGGTAAACATGACAAACATTTGTGGGTGATAAAAAGCGAACGATATGTGGTAGGATGAACACTCATAA:1 + chr3R 9127333 5' + invader3 5188 2 76.24 CTACAAGATGCGAGTATTCGCTACTCACCACTTTAATGGCCGCCATGACAGTAGGTATCACAAGGGGATCAACGCGCCACCACTACTGGAAGTGCAACTAC:1 - chr2L 12298756 5' + baggins 72 1 67.33 GAAAGCNTGATTTTTTAAGTGTGTTAAGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATCGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 + chr2L 19644886 5' - blood 7339 1 70.30 GCCGTGTAATCAAAAGAAAATGTTGCCGCTAGCCGATGTTCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chrX 9906699 5' - mdg1 400 2 61.39 GCATATCGAATGACAGAAATTGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr3R 24430616 5' - Transpac 303 2 73.27 TTNTGTTCATATCCAAAAAGGATACATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 + chr3R 779360 5' + F-element 29 1 54.46 CTGTGTTTGATGTTCGGGTGATGTTTCTCTTTGAGTTTTATATATATATTTTTTTCTTTTGGCTCCTGCCTTTTCTACATTTTTTTTTCTTTTTTGGTGTT:1 + chrX 16532871 5' - gypsy7 5004 1 55.45 ACNATTGGTTTTCGCAACATTAACGTATTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chr2L 1590817 5' + opus 159 4 73.27 AACTAATAAATAAATCACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCAGCTCTCTTCACTCAA:1 - chr3L 25951922 5' + Doc4-element 41 1 80.20 TGTATGTTTTATAGGGTAAAAAATTATTTGGTATTGTGCCAGATGGAAATGAAATTATTACTTGGTCGAGCAAACTATTAATTTCATTTTATTTTGAAACA:1 - chr2R 9260206 5' - NOF 3954 1 57.43 CACCGAGGGCTTGTCGTCATATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 14688348 5' + pogo 1 1 68.32 AAAAAATGAGAAGGAGTTTGAAAAGAAGTTTGCTGTTGCAGTTATTCATGTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCC:1 - chrX 17550319 5' + 1360 456 1 58.42 GGCTAACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 4022355 5' - roo 9038 1 60.40 GTTGGATATCTAATGGGTAATTGTTTGTAAGCGTTTTTTACACCATCAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 2505961 5' + R2-element 3582 2 69.23 AGTTTGTTTGTGTGAACTTTATACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 - chrX 19820100 5' - mdg1 7406 2 77.23 TANACATTTTTTAAATGTTAATTTTTTAATTCAATAACGTCTATTATTGTAGTACGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 - chr2R 5178669 5' + mdg3 33 2 54.46 AATCTTCGAGTGCTGTTTCATCTAATAAAATATCTTAGTATCACAATATCTAATGTAATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr2L 1590745 5' - opus 482 2 61.39 GTGGGTGTGTGTGCCTTTCAAATTGTATGCAAGCAGGTCAAATAATGGCAACAAACGAACATTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr2R 17938859 5' - copia 241 1 65.35 GATATCTTTTCGATGAAGATGAAGTGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 + chr3R 6776533 5' + copia 33 2 61.39 AANTAGGAAGCCGGAAAATTCCAAATACCTCGTGGCCAGAAAAAATATGAAGCAACGGGAACGGAAGAAGAAACTGCTAAACTAATTGCTGCAA:1 + chr2L 18934693 5' + G7 168 1 73.40 AANCTAAAATTTGTTGACCTGATTATGTACGACAAAAATAAAATCTTACAAGTAAACAGTTGTCAACAAAAAATATTAAAATTTTCTTATACATATTTACT:1 - chr3R 31976553 5' + TART-B 10184 1 64.36 AACGAAACATGAAATAATGGGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTT:1 + chr3R 6611178 5' - HMS-Beagle 242 2 75.25 AAATAATTGGATTAATACTCATATTAACTATCATGCACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:3 + chr3L 12352890 5' + Tirant 39 2 62.38 AGAGCCGTCGAGTTTGTTTCGCTCGGATTGCAGCTGCATATTTGACGGGTGTGTATTTTTTGTAGTTATTTTTTTTCATTTTTTTTTTT:1 - chr3R 26828405 5' + hopper 143 7 64.04 GTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr2R 18723096 5' - opus 454 2 74.00 GCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTATATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3R 24461835 5' + F-element 59 1 73.00 TTTGAATTTATGCGATTGTTTTTACTACAACGGGGTTTTACGCTTGATAACTTAAAATATAATTCATAT:1 + chr2L 3532721 5' + copia 5056 2 66.67 TGACCTCAACAATGGCAATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr3R 24739015 5' + pogo 36 1 62.00 GTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGGACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAAC:1 + chr3L 25889017 5' + gypsy8 307 1 71.88 TTTGCGCCCACCTCCTGCCCCGCCCTCTGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGT:1 + chr3R 19842823 5' - F-element 4279 1 73.27 CACAGCCCGATGGCGCCACCCACGTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAAAAATAATTA:1 - chr3L 10672816 5' + jockey 4826 1 79.21 ATNAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAG:1 - chrX 4175129 5' + I-element 325 1 61.73 AGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTT:1 + chr3L 26719160 5' + Tc1-2 36 1 73.27 TATTCTTCATCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr3R 4971171 5' - 1360 3348 1 66.34 TCNAGGAGAAGAGGAAGCGCAGCATACGCGCCGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGAT:1 - chr2R 7012600 5' + accord 7237 2 68.32 CATATCCAAAAAGGATACATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 + chr3R 779367 5' + F-element 36 1 50.50 TANTGCTTTAAGGACTTCCCATCACTGCAGTGCACTGTCGACACGCACACGCAGCAAGAAAGAGAGACAATCACACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTT:1 + chr3R 22310754 5' + hobo 4 1 59.41 TGGCATATTAAGTTATGCTCAACAGTTTTTTAAGAAGTCAGGGTAAATTTTTTCTTTAAATACGACATTGAAAAGCTTGAAAACCAACGACACTAGAATAA:1 - chr3R 3748821 5' - Tc3 315 1 75.25 AATGGTGAATGTACACAACACAAATAATAATTAATATTAGGAAAAGCTTGAGAATTGGTTGCTAGCGAAACACCGCTGTAGTCGTGTTCACGGATTGCCCT:1 + chr3R 4721486 5' - Gypsy12A_LTR 1968 1 62.38 TTTAATTCAATAACGTCTATTATTGTAGTACGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCAT:1 - chr2R 5178645 5' + mdg3 57 2 78.22 AATGGTTGAGTGAGATAATATCTAATCGGAGCACACAAGCAATGCATGTATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTA:1 - chr3R 2476381 5' + S2 21 2 75.00 AACTGAAGCGAAAAATTCACGAAATAAACCGCAGCAACAAAAGTTTGAAATAAATGCAGACAACATTTCGGTTTCCATGTTTATCTAAAATAAGACCACT:1 + chrX 12155439 5' - Cr1a 413 1 56.00 TTTATGTAAAATGATCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3L 13652789 5' + hobo 36 1 57.43 GGNTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCATACCTTG:1 + chrX 19820626 5' + Rt1b 4970 1 61.39 TAAGAGACAGAGAAACATCAACATACAGTGAAGTATGTTATGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr2L 4790838 5' - pogo 2070 1 61.22 TCAGCGACCTAGTCAAATCTTCCTTCGCACTTGTTTTCCTCGCCTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTT:1 - chr3R 17989877 5' + hopper 147 111 70.00 ATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGC:1 - chr2L 23034040 5' - FB 389 1 51.49 ATGAGGACCACGATCCTTTCACCTGGATGCGGGTTACCCCTACAAATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr2L 19602841 5' + hobo 30 1 51.49 AACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGAC:1 - chr3L 18476517 5' + accord 48 2 75.25 GGATTTGGCACTACTTTCATTTAATATGCTTCCTTTGTGCATTGATTTGCGGTCTGGGATGGGAGCCAACTGGGCTAAATAAAAGCGATTCCAAAATGCA:1 + chrX 10460030 5' - mariner2 214 1 60.00 AAATATTGTATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATC:1 - chr3L 14638692 5' - 1360 53 1 56.44 TTTGTGCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3R 23601773 5' + jockey 14 1 64.21 GTCCTGACCCACGAAAGTTTTGGCTTTTTAAAGCCGGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTA:1 - 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Doc4-element 2591 1 78.22 GTTGCGTGTCACATGCGCATTTCGAATTTCAATGAGCTCTCTCGTTTAGTTCAAAGACTCTCAGATTCCAGTAATTAATTTTTCTGGAATATCGATAGAA:1 - chr4 276578 5' - INE-1 500 1 58.00 TTATTTTTAATTATGGAAAAACAAGTCAGAGAATGTAAATTATTCGTAAATACAGGTTTTCCGATAATTG:1 - chr2L 6277512 5' + transib4 307 1 92.86 CCCACAGTGCTTACTTTCCAGCCGGAGACTGGATTGAACGGTGGTACATATACGTTCCAAGCCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 + chr2L 8297305 5' - Tirant 387 2 67.33 AGATCTCCTTCCAGGGATTTGGTGGATACATGAAGATCCGTTGAAAAGTATATAACAGGCAGAAGGAAGCGTAAAATATTTATATTCTCGATCAGGATCAA:1 + chr3R 18304141 5' + INE-1 82 1 69.31 TANTATATATATAATGACGTATCATATCCGATTATATCAAAAACTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 + chr4 1269542 5' - Transpac 5196 2 59.41 GACTGCTGTCTCTTTGCGTCTCGCTTTTGAACTCAACTATCGGGCGATAAATCATTTGAAGTCTCCAACACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr2L 2685832 5' - hopper 1411 2 75.25 AAGGCAAGGTCAACGAAGCAGGCAACTTATAAAAGTTTTAAATATTCGTGAAATATATCTAAAAGTAGAACATATTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTAT:1 - chr3R 17412659 5' + 3S18 5769 2 76.24 ATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCC:1 + chrX 21087558 5' + mdg3 5255 1 74.26 AANGATGTGAGTCGTTTTTAATGGCGCAAAGCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3R 9325578 5' - 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1360 69 1 65.35 AACTCCCGATTCCTCACTCCAACTCCGGCTGAGAGCACGAGAAAAACCGATTACTGATTATTACATACATTACACATATTTAATTATCAACATAAATATAA:1 - chr3L 22160641 5' + 1360 2951 1 74.26 TTAATAGTTATTAGTTTATTTGTGGCGAATGTGGCTATGTGGCGAGTATACAGCTGTGTTCATAACACAGCGGGACCTGCGAGTTTAAGATAAAAAATTCC:1 + chr3R 23385918 5' - HB 1590 1 46.53 TTTCCGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCC:2 - chr3R 1868237 5' + G-element 17 1 63.37 TACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 5485152 5' - 1360 3375 1 63.37 AGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGC:1 + chr3L 26852650 5' + 1360 48 1 67.33 TAGGACACTTCGTGATGTAAGCTATTCAAGGCAATATACAAGAAATTGAGATACAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3R 27900508 5' - roo 408 1 76.24 GCTCGGAAAAATGGGCGAAGTTTACTAATTAGGAGGGAAAATGGCTGGGACTGCTCTTACGAGGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCAGACG:1 + chr3R 29649013 5' + 1360 169 1 70.30 TTGCTTAACTCGGCATTTTCTTCAATGAATGATTCAATAAGAAAACAGAATGAATCGTTTCCGACTATATAAAGTATATCTATTCTTGATCAGGTTCAATA:1 - chr2R 6205062 5' + INE-1 84 1 54.46 GCAGCAACTGCGAGTGCTACTGGCGACTATCTAGCGCATCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2R 18005647 5' - hopper 1407 2 62.16 TTTCTGTGCTTTTGGAGGCCACCAGAGTTTTGGGCTGGAGCCTGGTTTCGAGTTTTGGGGTCTTTGGCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chr3R 26434776 5' + Tabor 10 2 69.31 GTCGACTATTTGGTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTCGAGT:1 + chr3R 18346610 5' - INE-1 576 1 61.39 GTGCGTTAAAAGCAGTCTGCAAATGATTTTCGAGCTTTGGCTTACCTTTTTTCCAGGCAAACAAATCAGCATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTT:1 + chr2R 10613605 5' + Cr1a 10 1 52.48 GGTCGATGGATCGCACCCAGCGAATGAAGCGCTGGTTCGTCCACACAATGGGGTCCGTGTCCACCGTCTCGGATTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATC:1 + chr2R 22339073 5' - invader4 386 1 76.24 AAAGAAACTGGTGACTGGAATGGATAAGGTAGATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACCAATATTCTAATGTAAAGTCATTTTTGAAATTT:1 + chr2R 4265340 5' - 1360 376 1 68.32 AAATAAATAAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGTGCGCTGGGACAAACGCTGGGACAAACACATAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTG:1 - chr3L 3290579 5' + Tc1 1643 1 53.47 CANTGTCGCTGAATTTCGAAGCTTAGTAAAAAAAATAATGAATATAACAAACGAACACATATCAAATCAGGAGAGAATTCTATAGTCGAGTTCCCCGACTA:1 - chr2R 5204065 5' - INE-1 566 1 76.24 AGTTAGTTTCTGGCGACCTGCATGCATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 + chr3L 19413955 5' + Burdock 50 2 72.28 ATTTTTTTCGCAAATGTACCCAACAGACATTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGT:1 - chrX 21741728 5' + HMS-Beagle2 6929 2 73.27 TAAAGTTAGGTTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr2L 12322972 5' + hobo 26 1 54.46 TGCAGCGCTGGGGCAAGGACTTCCTGCGCCGCCGTCTGGATTGGACCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGT:1 + chr2L 13669576 5' - micropia 5367 2 55.45 TGTGACAAAGAAGAAAGTGCGGTGGCTGTCAGTTGTTGTTTGTATTTGTTTTCAGATTTTTTGTTATAATTTGGTCTTGTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTT:1 - chrX 2989659 5' - I-element 5146 1 56.44 GATTGTGCCTGGTACGTGGCCATATCAGTGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3R 20584346 5' - 1360 3345 1 72.28 ATCTGGGAGCGGACAAGACGATTTGTCGCGCTCGCTACCAGCAAAGTCCCATGGTGCGAAAGTGGACGGTGCGAAACCCCAGAGCACGTACTCTTCTCGTG:1 + chrX 6228318 5' + Rt1c 5105 1 53.47 TCAAACACTGGCTTGTTGTGCTCCTGACTCCCGATAATCTCCCTCACCTTGGTCATGTCCAACTACGATTAGCCAGCACTCTTAGCAGAGA:1 - chr2R 15856675 5' - baggins 141 1 64.84 AAATCAATACACCCAAGGGGGGTCATGGGCTCCCATGGCAGGCAACAAAAAAATATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAG:1 - chr3L 12172901 5' + 17.6 6941 1 66.34 GTTGAGTGGAGCGCTGATCGCAGAACGTGGGATTGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGTATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGT:1 + chr2L 11021314 5' - Idefix 180 1 74.26 AAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chrX 10644813 5' - hobo 2909 1 53.47 GGATTTTCTGAGTGCGTTTCCGGGGGCAAATGCGCAATAGTCCGGCTGATCAGTATCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAA:1 - chr3R 16332178 5' + Quasimodo 7017 2 58.42 TANACTCAATCAAAATCCATTTAAGGCGGCGCAAAACAGAACCAAATAAACGCGACCCAGCCACTGAATGCAAGAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCT:1 + chr3R 9129188 5' + HMS-Beagle2 227 2 75.25 TTTTCAAGTGCCTTTATTATTAAGGGGTGTTAAAAAAACGCAAAGGTCAATTGTATTGGTACATATAGAATTATTCTTCAAATTAAGCATAGTTTAAAGAT:1 - chr3L 10784234 5' + Transib5 438 1 77.23 TAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTC:1 - chrX 21575412 5' + INE-1 92 1 43.56 TTATACAACAACAAAAATGAATGCAATTAAAATATTTGCATTGCATATTTGTTAGTTGGTTTGTTGTACAACTGTTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTG:1 + chr3R 16567794 5' - gypsy3 421 2 84.16 CGTGGCAAAAAGGATTTTTTTTTTAAATTATAAAAAAAAACAGGAGAGAATGCTGTAGTCGGGTTTCCC:1 - chr3L 14671919 5' - INE-1 571 1 47.83 TCGTATCGAACAACACACACACACACTCAGCTCTCGTCTCTCTATGTATGTCTCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCA:1 - chrX 16478268 5' + Doc 4515 1 58.42 CGATGGCAGTTGATCCGCTTTATTAGTATTCCCACAAACGGAACCGGCACTTAGTGTGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAATCATTTTTGGCTGCTCA:1 - chr3R 26043066 5' - Cr1a 491 1 58.42 TTTGTCTGAAATCAAAGAACACAAGAAAGAACACAATCGCTGGCCAATTGCCAATTGACAATTGAAATGAAAGTTGGTAGATGGTAATTACGCGATA:1 + chr3R 19038214 5' - Ivk 65 1 78.35 CGAGAATGCATTCACAATCATTAGAGGAAAAGCATACTATAACTGTCTTTTATTGAAACTAACACGCACATAGTATGTGCAAAGACACTCGAATAACAAGA:1 + chr2R 4615357 5' + 1360 1 2 69.31 AATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr2R 3824677 5' + 297 33 2 65.66 AGTCGTTGTTTGTTTTTGCCACACACATTTTAACGGAGAGCCACCACGGCTAATTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chrX 4448617 5' + 412 7074 2 58.42 GTTGGCGTAAGCACCACAACATTGAACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAGCCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCT:1 - chr2R 1343652 5' + I-element 5098 1 75.25 ATCTTTTCCCAAAATGTTTTCCTTGTGAGAGCGTGAAATATGCAAATTGCCTGTGGGTCTGCCAGCGGGTGAAGTGGGGAAGTTGATGGACAGCGCAGTGG:1 - chrX 9876827 5' + Rt1b 377 1 77.23 TCTAAAATATCTGATTTATATTAATGCCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chrX 14131807 5' + I-element 50 1 72.28 TTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTTTATTTAACTTTGAGACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATT:1 - chrX 3646353 5' - TAHRE 10415 1 64.36 AGGGATGTAGTGTATAAAACGAACGGCGGCAGTGCCCGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3R 2308640 5' + 1360 38 1 64.00 CANTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1 + chrX 21636195 5' - Stalker2 357 2 70.30 GAGGGAGTCGCAGACGAGCGGAGCAAATCAATTATGCCACCAGCAACGAGATCTCTCATAAACCATTCGCCACTCTATCGCAAAATCATATCCAGGCAGTA:1 - chr2L 5400680 5' + G5A 267 1 51.49 GANAATGCTTGAAAGGCAACAAGAACAACACTGAGAACCATCACTTCCTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGACACCTGAAAATCAAATTAGAAATCGA:1 - chr3R 17496766 5' + Doc 4425 1 77.23 CACGCGCCTCCTTTTACTACAATACGCCCAAAACGGTCACGACCATTTTATTCCCCAGTATCTATCGATATCCCTTTGGCATTCCCACTAGCTGAGTAACG:1 - chr3R 23891354 5' + INE-1 535 1 68.32 TTTTTAAATAAAAAAAATTTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGA:1 - chr3L 16825188 5' + Doc 330 1 81.19 AAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATG:1 - chr3R 15790073 5' + flea 4737 1 60.40 TGCGCCCCGCTAGACCACTGACAACTAGGACCTTTAAGTCGCCTCATCATTAAACCCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGC:1 - chr2R 6934268 5' + Quasimodo 7126 2 64.36 GCNATCTTCGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 6814332 5' - roo 9026 1 67.33 TGTATTTATTCATTAAAACGGTGATAACTGTTTCAACCAAACACGCTTTCATATGCAAATTTCTTTCATTTCACAGAGCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3L 22046396 5' + roo 1 2 78.22 TANCATAAATCAACATGAAAGAAAGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 12398105 5' - roo 402 1 71.29 ACTGAGGCCCAGCAGCTGGAAAATCGAAAATCGATGGCTCAAGTGGAAAGCGAATCGCTGGGGGCGGGACGGTCGTTTGTCGATGCGAGAGGAG:1 - chrX 3263922 5' - Doc 453 1 72.34 CCGAGCGCTTTCGGTTTATTCAAAACAGCTTTTTACCCAACGAAAGAAGAAGTGGAAAAAATAACTGTTTAGGGTTTAAAAATAGAAGCATTGAACTGATC:1 - chr4 895890 5' + Bari2 42 2 80.20 GGNATTTGAGTTGTCGTTTTCGCTCTGTTTCGCTCTTTCTCTCTGCGTTTCTGTTTCTCGGTTTCGTTTGAGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCA:1 + chrX 2658686 5' - F-element 473 1 72.28 ATATCCACTCCCATCCCATCACATTTTGCACAGCCAGAGGCCAGACCCAGTGCTGCACATTTGGTTCTGTCTTTATGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCA:1 + chrX 4351081 5' + Doc2-element 4414 1 80.20 CTACAAAGTTCAGCTTTTAAAAGCGGATAGTCAAAGGGAAGCTGCGTGTTTGCGCGCAGAACACCGTGGAGATCGCAATATTGACGCTCCCACTGCGTCAA:1 - chr3R 3468926 5' - mariner2 363 1 77.23 GTGAAAACAAAGTAGGCAGCGGTGTTCTTGGCAAAACAGCGAGCGAAAATGCCGGCGATGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr2R 8314232 5' - hobo 2924 1 64.36 TAAAAAGCCAACGTGCGTCCATTCTAATGACCAAGATGCGTAATGCTATGCGATTTTTTTGCATACGACTTTTTCGGCGTGACTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr2L 22632231 5' + 1360 62 1 68.04 GTNGCTGTTGCTGTTCTCTTCTCCTTTCTTTGGCACATGCATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGA:1 + chr3R 6991861 5' - hobo 2630 1 60.40 GTTCTACCTGCGCATTCAGCCCGGGACCCACTTGTATATGGCTATATGGCCTATAGAATCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACAC:1 - chr3L 569271 5' + accord 175 2 51.49 GTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:1 + chrX 21087568 5' + mdg3 5264 1 65.00 GAAACTTTTCCACCTTAAAGTTTATACCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 1698572 5' - roo 358 2 77.23 TGTACATTGCGTTGTCAAACCTCTTAGCTAGTACAATTAACCAAATTGTAAATAAATTGATTATCAGTTTGTGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAA:1 + chr2R 6669996 5' + Tabor 4 2 75.25 AATCAATGCGCACCTATGATCGAATGAGTTGGCTATTTGGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 6082634 5' - roo 9036 1 63.37 GACTCACCATACATCTACAGCTTGCGAAACACATGGGCCTTTGTCTTGCCGAAAATTTGAATTATACCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACT:1 - chr2R 4895861 5' + S-element 7 2 61.39 ACGTATTGAATATGAATGCAAAAAGAGGTGCTCTGGATTTTCAAAGCTATTATTTAAAGATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chrX 9983724 5' + pogo 13 1 66.34 AAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGG:1 - chrX 4175119 5' + I-element 356 1 78.22 CAACCTGCAATCTCTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATA:1 - chr3L 5662694 5' + jockey 369 1 54.46 CANGCTCCTTTAGGCTTTGTGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chrX 4806767 5' + roo 8 2 70.30 GGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACG:1 - chr2R 2879464 5' - Stalker4 131 4 54.95 GTTCAATCTAAATGAGGCAACAATAGTTCAATTTATTTTTATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCG:1 - chr2L 16479521 5' - micropia 98 2 60.40 CTAAGACTTTTGTAGAGCTCTTAACCAAGTTCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 - chr3R 20878199 5' + Doc 24 1 66.67 TTGAATGGCGCAAAGCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 9325594 5' - roo 393 1 61.39 CAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATG:2 + chr3R 19450207 5' + roo 8763 2 62.38 ATACCCTCAAATAATAATATTGAAACGCAATTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 5291620 5' + roo 42 2 72.00 GGGGACTCTCATCGGGGAACTGCCTTATTTTTCCGGTTTACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGA:1 - chr2L 2318176 5' + Doc 330 1 61.62 CAATGAGTACTTGTCGTCGATGATCAGTCGTTGCTGGTCGAGCTCTTGGTAGATGGGCTTAGTAATTAATATTATTTTTTATGTAATCAGGAAATTTTTAT:1 - chrX 15032500 5' - Burdock 389 1 58.42 GCCATAATACACTGGGAAAAACAGGTGATTATGCGGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCT:1 + chrX 13234234 5' - 1360 85 1 65.35 AGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGGGTAGTCGCTGTTT:1 + chr2L 20360647 5' + micropia 20 2 58.42 GTTGTCAACAAACGGGATCGAGCTCAATGAAATTAATGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chr2L 20913961 5' + P-element 33 1 44.90 CTCCACGGACACAAACCCGGTGAAAACAACCACCCGAGAATCCGACACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAG:1 + chr3R 16923720 5' + Idefix 93 2 54.46 TTTATTTTCATTTTTTTAATCTTCAAAGTGAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAA:1 - chr2L 1283456 5' + Stalker2 7381 2 70.00 CATGCTCCTTTAGGCTTTGTGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chrX 4806767 5' + roo 8 2 71.29 GATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCACATAGGAAC:2 - chr3L 5067855 5' + Quasimodo 51 2 76.24 CCAACAATACCATCACGTATTCACCGAAACGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTAAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGC:1 - chr3R 16598845 5' - F-element 245 1 69.31 ATACAAAGTGGACTGCTGAGAATTTCGTCGTTTTCTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chrX 9126940 5' - Doc2-element 223 1 62.00 AAAATGACGGACGATTGTTCGGCGAACAATGCGACATTGTTGTGCTCACACTTCCCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 - chr3R 12566789 5' + Doc 28 1 59.41 CGAATAAATTCTGAATACTGGATTCTGGATTTTTTGGGGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATG:1 - chr3L 5745427 5' - I-element 5045 1 62.38 GTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2L 12284007 5' + 297 44 2 70.30 GCNCTGGTAGGATAAGAGTGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTT:1 + chr3R 24006920 5' - P-element 149 1 27.72 GGAACAGCGGCAAAAAGCATCTGGGATCTGAGGAGGCTTCGATAGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACA:1 + chr3L 20745788 5' + F-element 4560 1 56.44 TTAAAAAAGCGTTAGGCACACAAAATATATAACGGTCGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAG:1 - chr3L 19583620 5' + opus 7297 2 63.00 ATTTCCTCCTAGTCCTCGTTTTTATACGGCGCCTAATTGCCGAGCTTTAGAGCTGAAGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3L 22923047 5' - 1360 3378 1 41.84 TGTCAGTCAGTCATCGGATCCAAAGCCAAACGTTGCCGAATGATCGTTGACAGAATCGTTTGAGTTGAAGAGCCTGTTGCGGTTGTTGTTGTTGTCGATGC:1 - chr3R 19267338 5' - Doc4-element 310 1 55.45 AAGTTAGGTTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 12322974 5' + hobo 28 1 52.48 ATNACGGACGATTGTTCGGCGAACAATGCGACATTGTTGTGCTCACACTTCCCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr3R 12566786 5' + Doc 31 1 55.45 AACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGCACAATCAAAAATCCTGCGAACAATAACTGGACAATAACAATAACTGAAATTGTCCAGCAGAAGGCTAAATAC:1 + chr2L 21637281 5' + Doc4-element 2763 1 58.42 CTCGAAGGACCAAAGCCTTTCGAACAATTCACTCATTGTGCAGTGAATTGTTCGAAAGGCTTTTGTGCTTTGCCATGAAATGTACATATATATATAAGGG:1 + chrX 9788840 5' + Juan 4186 1 50.00 CCNATCTTATAGACGATAATATCTTGCCTTATAGCCAGCTATCAGCCAGATCCAATCTCCGCCCGACCCCACACACACACATAAAGACACACACACACACA:1 - chr2R 21846655 5' + accord 180 2 32.67 AGCGTCAGCTCGACGTGAGTGAGACCGCTCTCAAAAATACCGTAATATACCAGTTGATAAAGTAATTATATGTAACCCGCACAAACACCATACACCATACA:1 + chr3L 1876308 5' - Stalker2 485 1 55.45 TTATTACTGTTCGACTTACGTAATAAATCTTATTTTTATAACCATATAAATTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 - chr3R 17377421 5' + Juan 4066 1 50.50 AATGCGAGTTTTCAGCACATTTTACCATAGTCATCAATGCACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAA:1 + chr3R 14366238 5' + Doc 4455 1 61.39 GGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGGATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAA:1 + chr3L 24213772 5' - invader2 223 2 52.48 ATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAA:1 + chr3R 19450121 5' + F-element 408 1 65.35 CATTAAGGGCACTCCCCAAAAACTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTAATAACAGTA:1 + chr3R 6622942 5' + Cr1a 4288 1 78.22 GCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 - chr2R 18344614 5' + 1360 39 1 64.36 CTTCAGTTTCAGTTTCAGCTTCAGCTTGGTAAATCCTTTTTATTTCACTTATGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 7171897 5' - Porto1 169 1 67.19 TACGCCGACATCGGTGTGCTAGTGTGGCTGCCTGTTTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 6015115 5' - accord 7032 2 71.67 TTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACA:1 + chr4 941837 5' - TAHRE 10395 1 82.00 CGGGATCGAGCTCAATGAAATTAATGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 + chr2L 20913973 5' + P-element 48 1 31.68 TGCTATATAGTTAACCTAGTCGATCAGTCTGCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 10522086 5' + roo 43 2 75.76 TTGCACATTTTTACGAAATTTTTAAAGTAATCAATTTCTTCAGCATACTTACTTACACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr2L 9488243 5' + 297 16 2 46.53 ACATGTTTTCAGCGGGATTTTAATGTTTATAAAAATATTGGAATGCAATGGAATGGAATGAACTATTTGTATCTTTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 18754345 5' - roo 408 1 69.31 ATTCGAATTTAATGATGAAGATGCCGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 9868955 5' + roo 17 2 64.71 ATGTGCCTGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGTATAGTATACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAA:1 - chr2R 10444311 5' + P-element 13 1 66.34 ACATTTGGAAATTCTTCGCAAAAGGCCAACAGCATGAAAGGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3L 10557638 5' + 412 38 2 61.39 CCTAGTTGCACATACATACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 - chr3R 17666047 5' + Transpac 4948 2 54.46 CCGGCGAATGATAAACAAAACAGCGCCAAGTTGACCAGAGGCATCATAAACATAAACGCCTAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGATTCAA:1 + chr2R 20736434 5' + INE-1 167 1 58.42 GGAGAAACGTTAACGGCAGCGGGAAACGTGGGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTGTCGTTATACTTCGTTTTTTTGTCAGCTATTACTTCGATTACT:1 - chr2L 1263691 5' - Doc 4438 1 65.35 CTGCTGTTTCTCTCTCTAGCTAACTAGTTTCCTGCAAGTGGCTTTTCCCCAAGTTTTCCTCGTTTTCCTCGCTTCCCCATTTTTTTGTTTTTGTTTTATTC:1 + chrX 2799926 5' - Osvaldo 1522 1 82.18 GCAGGTGTTGCTTTTGTTGTAGCCGCCGCTCTCTCCCACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr3R 24006954 5' + P-element 40 1 40.59 TTGGCTTCGGTTTTTCGACCGGGCTTGGGCCAGTTTGTCAATTGTCACTGTTTGGTCGCAGACTTTTGTCAGCCACCGTACGGCAATAATTAAAAACATAA:1 + chrX 7615653 5' - copia 4832 1 59.41 ATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 4806728 5' + roo 8710 2 79.00 CCNAAAGTATTTTGCTCAAGGATCAAACCGCAGCAAAGTGAACAGACGAGACAAAACAAGCTAAAGGCGATAATATAACAATATGGACGTATGGAATAGAA:1 - chr3R 17845319 5' + Porto1 4265 1 66.34 TGGCTGCCAAAAAATGTATTCAAGGTTTATGTTTTTTTTTTCTTGGGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGGGTATGGTACCGATGGGTCGGGAAC:1 - chr2L 16840706 5' - ZAM 7964 2 53.47 ACAAGTCTTCGCTCACTATTACTTAAGTTCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAA:1 - chr2R 3340092 5' + ZAM 124 2 66.28 GATGGGCGGTAGGCGGTGGGTGGTTTCGGTGATGGTTGATGGGTGGGGCGCGCGGGTGTCGCACCCATACACCACCCCGAACCAGGAAGCTTTGCGATACA:1 + chr2L 18908664 5' + ZAM 74 2 59.41 CACTGAATAAAGACATTTTTTAAACATTTCCTGCAAACGAATATTTTTATCTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGAGGAGTTGCTTGCGAGATGTCAGGG:1 - chr2L 17118087 5' + Bica 30 1 52.48 AAAACAAGAAAACTAAACGATCTAGAACTCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2R 8951019 5' + P-element 45 1 32.67 TTTCATCGGTCCTTTTGCGCAAGATATCACACAGGATGTGCTATCATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr3R 6002938 5' + opus 140 4 53.47 TTGTGACGGCAGGTCCGCCAATGCCAAACAATTAACACAGATCTTACGCTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCACACCTTCAACTAACTCGAAACT:1 + chr2R 22463636 5' + Doc 334 1 53.47 GGNAAAACAGCGAGCGAAAATGCCGGCGATGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr2R 8314203 5' - hobo 2895 1 72.28 TTCTTTCTTAAAACCTTACTTCCGGCTTGATCATCTCATGCTCTCCCTCCTCTCGCTCTTTCTCACTGTTTCTGAACGGAACAGTTGAGTGTGTGTTTATT:1 + chrX 8412865 5' - Porto1 462 1 73.27 ATNCTCCGGTTGCCCAACAACAGTTGTCTACTTTTAGGCGCTCATGTTCCGAAGTACAATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 19560961 5' - hobo 2920 1 58.42 GANATGTACATAAATTTAATGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCC:1 + chr3L 7295186 5' + G2 2980 1 81.19 TAGCTATAATTGTAAAATTGACTACGAGTACGTTGTATGAGGTATAAGGTAAAAGAAGGCCACAGAGTTATATTCCATACGTCCATATTGGTTTTAT:1 - chrX 1655401 5' - Porto1 4257 1 70.10 GTATGCCACATTGCCCGTGACGAGGAGATTATTGCTATTGTCGTATCGGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chrX 8922331 5' + jockey 27 1 51.65 CTATTCGTTTGGGGCTCGGCGGTGTCGGGTAATTTACAATAATTACAATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGGCTTATTGCAG:1 + chr3R 14432441 5' - Helena 400 1 55.95 GGNCCAGATTTCCTTCTTCGCTGGCTTCCAGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGTTATAATTTGGTCTTGTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTT:1 + chr2R 16793754 5' - I-element 5146 1 76.24 AANTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 19450184 5' + roo 53 2 50.50 TTGTTGACATTTTCGCAATTTGTATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chrX 5521087 5' - 412 440 2 77.23 AANGTTCTTCTATATGTGAACAAAGGAACAGTTTCTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 12398192 5' + roo 39 2 65.35 AATATATTCCATTTCGTTATTCAGCCTTTTTCAGTTCAGTTGCAGCTTAAGCTTAATATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 19952302 5' + roo 17 2 62.00 CTATGTACAATCCAGAGAAATTTCAAAGAAAATAACTTGAATTTTTAGCGAGTACAAACTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTA:1 + chr2R 9213626 5' - Burdock 240 2 64.36 AATATCTCCGCTGCCCCGTTCTGACGGTTTTAATTAGTGTTCGGTTTTGGCCAACAACATTCGGCCAGCTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr2L 11314248 5' + 297 6624 2 72.28 TGNTGCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 + chr3R 17665977 5' - Transpac 5194 2 61.39 ATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGT:1 - chrX 12813735 5' + BS 45 1 71.29 CAGAGATTTGAGTTTCGGGTAAGCCATTTCTGGGTTCGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTC:1 - chr2L 14180970 5' - Porto1 237 1 63.00 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCT:1 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 77.23 AGAAGATAGTTTCGGAAAACGTGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 + chr3L 22775926 5' - flea 4963 2 78.35 TCTGTTTCCAGCCTCTATCTCTATCTTTCGGTGGCAGCAGAAATCAGAGCTCGTTAAAAACGCTCACACATGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTA:1 - chrX 7568659 5' + I-element 4934 1 65.35 ATCTTCAATAGTTTAACATTGGTTTTATATTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGTCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 - chr3R 16593876 5' + Max-element 8283 2 73.27 GCGTTCCAGAACAGATAAAAATTGATCAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGAC:1 + chr2L 13226870 5' - accord2 7228 1 81.19 TGNAGTTGAACTTGCTCGACCGGATATTGCAGTATCAATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 9322901 5' - 412 7530 2 61.39 TCAGGCAGCACAAAAACCGAAACACGAGGCAGTCACGAGCAAAAACAAATACTACAAATAAGCGAACTTTGATGATATTCATTGAAATTGGCAAAAAAAAC:1 + chr3L 6895303 5' - pogo 160 1 68.32 TTTTTTTTTTGTTTTTGGTAAAGAAAGGGTAATTTCCCCCTGTTCACAAATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 16839762 5' + roo 9 2 52.86 GTGTTTCATGTGAACGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 + chrX 6509778 5' - jockey 4957 1 60.40 TAAGTTAGGTAACTGTTGATTAGTCCATAGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2L 18754432 5' + roo 46 2 74.26 AATGGCATTGCCTTCGGCAACAACTATGGCTCAAGAATAACATCAAACACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 18223846 5' + roo 8690 2 58.42 CTTCCAACATCCCACCTTCAACCTCCGTTTTCCTTCGGCAGCAGCAGCAACTGGATCACCTCCAACAACAACAGCCGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTGAG:1 - chrX 2035221 5' + F-element 438 1 66.34 TTTCCCTACGTTCTCCTGACGATTCTACTGGTTCGCGGAAAGTTTTTACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGG:1 + chr4 632602 5' - Quasimodo 339 2 54.22 CAAATCTTCGTCGGTGAGAGAGGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCA:1 + chr2L 2215899 5' + 1360 403 1 78.22 AGGGCTGAAAAAAAAAAGTATGGAAAAAA:1 - chr3R 27609021 5' - Tc3 78 1 89.66 TGTCACATTGTTCTCTGCAGGATCTAAGATCATTTTCCCATGGTGTATAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 18223776 5' - roo 401 1 61.11 GCTCTCGAAAGCTGACATTTTTCGTTGAAGTGGACGTGATTCGATTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:2 - 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Stalker2 385 2 56.00 TCCTATCCATCACAAGATCTGTGTCCCACTAATCAGAGCCCCCATTGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTC:1 - chr3R 3771832 5' + Rt1b 4962 1 63.37 TTCCATTTCCGCATCACGGGTCCGGCCACACTGCCCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCATC:1 + chrX 17951959 5' - Dm88 353 1 70.30 TTATTAGGTAAAAAATTAGATTTTAAATCGAAACATGTTTCAAAAGTGTAGGCGTGCTCTGCATGCCTAGTTGAAGTTCTCTAGCTTTCATAGTTCCTGAG:1 - chr3L 22942578 5' - INE-1 153 1 76.24 ATAATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTT:1 + chr3L 14585799 5' + Tc1 121 1 50.50 AATATCTATTGAAAGAAATAATAATATCCAGATTAAACAAAGACAACAACAATTACAACATGTGTTCCATGTCCATAATTCTAAATCAGTAAGTTATATCT:1 - chrX 22908662 5' - transib3 303 1 65.35 CGGGGGGTTGCGGATGTTTAGCGAAAAGAAATTAAATCGGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTC:1 + chrX 7317990 5' - Doc2-element 4424 1 61.39 ACNTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3R 7885593 5' - 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chrX 19053046 5' - roo 9041 1 59.41 CTTCTTTATCAAAAATATACCCAAAATAAAATATATATTTTAGTGCGTAGAGGACAGCACTACTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTA:1 - chrX 22457319 5' + HB 383 1 71.88 ACATTCTAATATTTGTACGCAATTTACGCATGAAAAAAAACTGCATGAAAACCCTCCCAACTGGGTTAATAAAAGATCAACCATCCTTTCAATTGCGCAGT:1 + chr2L 5395642 5' - invader2 330 1 69.31 TATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chr2R 9788949 5' - blood 7343 2 70.00 CAGCCGTTTTCAATTTTCAAAACAAAGTCCATTTCCATTGTTGGTTGGTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCT:1 - chr2L 9179445 5' - I-element 415 1 52.48 TAGGCAATCGATTCCGTTATTTTGCAGGCACTTTGCCTCTTCACTTCACTGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2R 5262574 5' - 1360 3366 1 54.46 CATGTTTCGTGGTGATTTGTGGGCCAGATTGCCGAGCTTTAGAGCTGAAGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 22920457 5' - 1360 3370 1 59.18 GCTTAATTTTGGATTTAAAAGTACCACGATGCGATGAGTTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr3R 7382616 5' - copia 252 1 59.41 AAAAAAAAATGGAATTGAAGAATTTTCATGGCGAACTAAAAACCTGGCTTTTCTCGATTTTTCAACTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chrX 14505547 5' + pogo 11 1 41.58 CCAATTACAATTTCACACCACTTCCCCCAACTCAGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACG:1 + chr2L 1446388 5' - R1A1-element 22 1 74.26 ACNTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 + chr3L 11920059 5' + Tabor 6886 2 76.53 AAATATTTAGCCTAAAACTGCGACCTTAAATTTTCAACTGAGATATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 + chrX 9951400 5' - I-element 5325 1 53.61 GGNATGACAACCCTGCTCATGTGCAACAACATTGGCAACACCTGCCGCGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAAT:1 - chr2R 11050449 5' + G-element 4196 1 53.00 TGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 + chr3L 23146490 5' + 1360 35 1 60.40 GGATGGCATTCACGTTGCTTGTAAAACTGTTCAACATATTGTTTTCCAAATACGATGGTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 + chr2L 6806012 5' - I-element 5343 1 61.39 CAATCCGCTGAACTCCTTCCGATTGATTAGACATATGCAACAGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGC:1 + chr3R 30602489 5' - Quasimodo 6969 2 58.42 TTTTTTTAAATTAAAATCTAATTAAAACGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAAT:1 + chr3R 9192534 5' + invader3 63 2 76.24 ACNCACAAAAACACACAAAACACACAGACACAAGCGGCAATTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTCTTGCTGTC:1 - chr3L 28063325 5' + gypsy6 203 2 60.00 GTCAACAAATAGAAAACAAATCAAAAATTACACGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCT:1 - chr2L 11920255 5' - R1A1-element 4965 1 68.00 GACGTGTTTCCTGCGAAATTCAGTTCAAGGCAACGCCTCGAGTCCTGCGTATGCGCTTGTATTTGTGCGTGCGTGCTTTTGTGCATTTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 4530974 5' - accord 7034 2 59.41 CTAATGGGTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3R 27452387 5' - roo 9034 1 67.33 ACCCCCACGCAGGCATGCAGTGCAAACTTCAACATTGCAGCCAAGAACGCCATATTCCTATATATGTACATATGTATATAAGTTAACACAATCACACAACA:1 + chr3R 28443668 5' + Burdock 6136 1 77.23 ATNTCGAGGAAGATGTCGTCTTAATGACTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 6442678 5' - roo 9045 1 53.47 ATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTAGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 14688319 5' + pogo 30 1 56.44 GACCACGGCGACACCTCGAATTTGTTGTTTGTTAAAAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATTTTTTAGCAAAATTT:1 + chr2R 15426376 5' - HMS-Beagle 336 1 76.34 AAACGCAAAAGCAACATTTATAAAATATATACTTGTACTTACTAACGAATAACACATGTAATTGGTCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 + chr3L 4091542 5' - flea 5011 2 77.23 AATGATTAAATAATAAAATGAAAAGAAACAGATAAAAGACAAACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCA:1 - chr3L 22604367 5' - P-element 251 1 24.75 TTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTA:1 + chr3R 4504055 5' - INE-1 552 1 64.00 AAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTA:1 + chr3L 27356070 5' - Tc3 1692 1 76.24 GACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 - chr2R 18344619 5' + 1360 34 1 59.41 CTTCGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 6814327 5' - roo 357 2 72.28 TTGCATTTTAATGGGTTTATTTGAAGAAATTCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3103740 5' + TART-A 13401 1 79.07 TATGCAGTGGAAATTTTTTTGTGCTCAGCATTTTATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chr3R 20373223 5' + I-element 13 1 65.35 AACACTTTTGGCCGGGGGAAATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGA:1 + chrX 4448560 5' - 412 469 2 64.29 CCGAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3R 6290988 5' + Doc 51 1 75.25 CANGAAAGTATCGATTTAAGCTTATGTAAATTCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr3L 11891328 5' - Tabor 7281 2 64.36 AATCTCCTTCAGCTGAAATATGTATATATCTTGGGAAATGTTGCACATAGACATTTTCTCTACTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCAGTCTTAAAAA:1 + chrX 14963400 5' - G4 3831 1 65.35 AAGCATGGCGTGTTAACTAATATGCAAATTGTGCCAGACGAACGAAAGACACGAATAACAAGATGCGTAACGGCATACGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTAGA:1 + chr2R 9012904 5' + 1360 75 1 56.44 GAAGGCCGAACCATTTTGTAGATGGGAGGGGGTTTTTTCCGAAGGGGTGGCAGGGGGTGGGGTGAATTTCGCTGTTCTGGGCTTGAGGAGATTGAGTGAAC:1 - 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chrX 22218690 5' - roo 9048 2 51.49 GGTGAGGGTACAGCTGCGCATCCGTGCTTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTCCT:1 - chr2L 6326642 5' - HMS-Beagle 6794 1 72.28 TGTCGTATTTGCTGCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 + chr3R 17665968 5' - Transpac 5207 2 53.61 AATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAA:1 + chr3R 4160065 5' - invader2 5091 2 62.38 GGNCATTTCAAGTCGATTCCCAGCACTTAGACCTTATAACGCCGGCCAAAAGGGACTGACACTTGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATA:1 + chr2R 16422187 5' + hopper 21 1 68.32 AAATTCTCCGGATAGCGCTGCAACAACAAATCTTGGCACAAACAGTATCCTGGTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTAC:1 + chr3L 12816842 5' + Porto1 4206 1 78.22 CGATAAGAAAGTACACTTTTGTTAAAAGTTTAAAGTTATTGGGTTACATTTTTATGATATAAATTGTCGTGAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGT:1 - chrX 13954822 5' + Juan 4031 1 66.34 CTTGCCCCGTATCCCCCGGAGATCCAACCGTAGACCCCGTAGACCCCGTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr3R 11538526 5' - 412 7516 2 51.49 TCTTTCACTCTCTCTCGTACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2R 21497520 5' - P-element 2829 1 22.00 CAGCAAACACTTAAAAATGCTAAATAAAACATATTCCACTTACACATAAATACACATACATACATATACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCA:1 + chrX 7465073 5' + Quasimodo 92 2 59.00 GCTTTGTGCAAGAATTGGGTTCAAAGCGCTGCTGATGAGGGCAAGCTACTTGTTCGCGACGACCTTCTTCATCTCGATCACCGATGGTGTGAGGATGACAG:1 - chr2R 10390902 5' - R1-2 133 1 61.39 CGTATACGCATCTGTGTGTGCGAGGGTAAGTGTCTGTGTAGTGGTGTATGAAAGAGAATGAGAAAGAGGAACGCCTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAA:1 + chrX 21594220 5' + invader5 234 2 72.28 TTNTAAATTAAAATCTAATTAAAACGTGTGGTAGGATGAAAACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1 + chr3R 9192537 5' + invader3 5251 2 77.00 GATCCCCTCTGCAGTACCCCACACTTATATTAATTTATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGT:1 - chrX 21907800 5' + accord 6983 2 65.35 TGNAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATAT:1 - chr2L 21570259 5' + Dm88 4382 2 58.42 GTCAACGATACCTCCATCCACACATTCGCTTTCTGTGCTGCTGCCGTCACGCCTGCAATGCCACCATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGC:1 - chr3L 7900262 5' - flea 4708 1 74.26 TTATAGACAATACTATCATCTCTAATAAATAAATAAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGTGCGCTGGGACAAACGCTGGGACAAACACATAATGTGCTT:1 - chrX 22641741 5' + Tc1 1616 1 62.00 AGAGCAGGACCTTCGCCCCCCTACCCCCCCTCCCCAAAAAAACCCAGCTCCAAACTCAACAATCATTATGTATGGCG:1 - chrX 8339963 5' - hobo 320 1 66.23 CGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 - chr3L 24208212 5' + Quasimodo 12 2 64.36 TGCCGATGTCGTTTTCCGAAGGAAGCAGCTACGAAGGGGCGGCGAGAATGGAAAACCCCCACACAGAATTAGGCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGAT:1 - chr3L 19425441 5' + X-element 29 1 72.28 AGGAAAAACTTTTAATAAGAGATTTGTGTTTTAAAATCAAAATTACTTCTAGTGCTGGTTAAATTGCATTATATTTCAATTTTGTTTTTTTTTTATTTTGT:1 + chr2L 12867630 5' - G2 3076 2 36.63 CCCCCCGACCCAACAAGCCTTGTTCTTAACTGGCGCCTGCTCACGTGCGGGTACGGGACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCA:1 - chr3R 32014469 5' + BS 4734 1 63.37 CCATAAAAATGGATGCACTTTTGCCCCTGGTTCTTTTCTACAAAATATTGTACCATTCTTAAAATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 20419025 5' + roo 10 2 64.65 CCAACTGGTTCCTTTTCAGCACAGTTGCTCCGCGGCGAACGGAAGCTTTACGAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGT:1 - chr3R 17040606 5' + mdg3 5116 1 54.46 TAGTCTCGGATAGCTGGTTGTTCTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 446067 5' - pogo 2051 1 78.22 AAAGGGACTCGTCTCATAACGAGTTAACTCTTTACACAGAAATGGCAACCAGTTTGACGTATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACA:1 - chr3L 14209108 5' + Quasimodo 10 2 65.35 CGGCTTCTGTGTAGTTTTTTAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGT:1 - chr3R 19588804 5' - I-element 5100 1 79.21 AGCGTAGCGGACACTTGTAAAGAGAGCGAGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCACGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 13640729 5' + P-element 10 2 67.33 ACTATTAGCAGTAAATTTTCGGCCTCCACCCACACAACCACCCCAGGGCACCCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACGT:1 - chr2L 18892126 5' + G2 117 1 57.43 AACATATGAAAAAATATAAAAACATTTTTTAAAAGTGTGAGCGTACGATTTTTGGGTCACTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 22902340 5' + roo 16 2 63.37 TTTTCTTTACTTCAGTCTTGATTTATCCTTTTAAAGGTTGAGGTTAGTGAGTTGGTGAGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTT:1 - chr3R 20967306 5' - I-element 4930 1 60.40 TGCTTGAGGTTTCTTAAGGAAATATTTGAACTTTTTAACATTTGAAAGGCAACAGGCGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAACA:1 + chr2R 25216735 5' + INE-1 568 1 62.38 AATCTACAAAGGATAATCGTTTATAATCCGAATCTAAACGATTATCCTTTGTAGATTGGAGAACGATAAGCTGAGGCAGATGTTCTAACCAAGGATTTGAA:1 - chr3L 16077173 5' + Dm88 4218 1 60.40 TTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACTACATATAT:1 - chr2R 21757921 5' + Quasimodo 15 2 92.08 AAAAAAGGTGAAAAGAAAGCGCACTCAACTGACCTCAACAATGGCAATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:2 + chr3R 24738986 5' + pogo 8 1 71.29 AAGCTATTCAAGGCAATATACAAGAAATTGAGATACAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 27900490 5' - roo 9053 2 60.40 TACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCC:1 - chr3R 1868199 5' + G-element 55 1 74.26 CCGTTTATGGTACGCTGTTTTCGTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAGCT:1 + chrX 22596365 5' - INE-1 545 1 74.26 CTNGAAGGGGAACTCCCCTGGGCGACCCACAGTACATACATACACACATACTTATAGCCGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 + chrX 5649331 5' - S-element 1702 1 64.36 ATNTTTGACTTATACGATTACACTTTATTTTACACCAAGCTCACAGTCATAAAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATAC:1 + chr2R 11435334 5' + HeT-A 5982 1 53.47 ACAGGTGCAACCAAACGAAGCCCAATAAATGAATCCCTTTTCGTTTTGTTATCTATCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAA:1 + chr3L 14651153 5' + diver2 4724 2 57.43 TAATATTTCAATGCGAGCTGGATGCTTAGACGGGCGCTTGAAATAGCATTGAAACTCTTGTGTCCTCACGCCAATCCCCCAGGAAAGACACCTCCG:1 + chr2R 5462888 5' + transib4 2362 1 64.58 ATTATTTCAGATACTCTAGCACAACAATTAATCATTGGGATCTAGGTGGTATTATGTGTGTGTGACGGTGCCGGCAAAACAAAACAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 4840397 5' + Doc2-element 217 7 68.32 ACGAGTACTGTTGGGGAGGTTAAGGGAATACAGAACCGGACTTGTAAGCAGTTATTGATGCCAAAGGTGGTGTTACAAAATATTAGTATTGTATTTATATA:1 + chr3R 19517555 5' + Bari1 1392 1 58.42 AGCTGAAAATTTATTTAACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr2R 9789024 5' + blood 10 2 69.00 GGNCAAGCAGGGACGCGTCAAGCGGAGACGAATTGCAGCAGGTCACGAAGCCCGACATCCTATGGGCTGCGAGAGCCGCTGAATAAATATTCAATTCACCT:1 - chr2R 4932826 5' + G7 1081 1 74.26 ACGAAATTAATGGAGTTTTAAGTAACAAGATCGCTGAGCACGCAAGGACTGAAGAGCACGCGGAGGTTTTTGCTTTAGTATGTAGGTATAATTCC:1 + chr3L 3462483 5' + Rt1b 5045 1 62.11 AANGAAAGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 12398122 5' - roo 9048 2 57.43 TAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chr2R 5531200 5' + 1360 61 1 66.34 CTTCTTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGA:1 + chr2L 4858912 5' - R2-element 3584 6 89.66 TTTTAATTGCATGTTGCGCCCGAAAGTATGCAACTTGTCCAGCATGGCCTGTATGTGTGTGATTGAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr3R 22310854 5' - hobo 2936 1 73.86 AACGCCAAGAAAATGAGTTCATCAACTAATAAATTAAAAAAAAAAACTTTTG:1 - chr2L 12200263 5' + HMS-Beagle2 493 1 88.46 TTTATTTATAAACACACGTGCGTGTGTACTTAGTCAGTTAGAGTGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGC:1 - chr2R 19463009 5' - Cr1a 242 1 59.41 ATAAATCATTTGAAGTCTCCAACACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTT:1 - chr2L 2685786 5' - hopper 1365 1 76.24 TTTAATTAGGTATTGCCAATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTT:1 - chr3R 9192599 5' - invader3 260 2 62.38 CTTAAAAATAACAAAACCAAAAGAATACCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3L 11156204 5' + 297 6593 2 66.34 GCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 30904223 5' - roo 9027 1 73.20 ACTAAGAGGCAGCTGGATGAGATAGTGGGCATCCTCCTGCGCGGCTTGAGGAGATCGACTGATATGGCCTTCTCTTGTCCATGAATGCTGATGATGTAGA:1 - chrX 5025170 5' - Chimpo 4047 1 58.00 GTNGTTGGCCCAAAGCTATCGACTGCACAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 4806663 5' - roo 9050 2 55.45 CCGTACGTCACACATTTGGTTAATTGAAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAATCAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAAC:1 + chr3R 19735221 5' + Porto1 282 1 73.27 GATGTCTGGCCACCCACTTTTCCCTTCAGCAATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 + chr2L 1204069 5' - roo 9031 1 69.31 AGTGTGTGGTGGTAGGCACATTATACAAATTGAAACGCATTCAATTACGTTTTACTACAAATATGTAAGAAAACTCATTTTAAATGATTTTTTTTTACAAT:1 - chr2L 438260 5' - jockey 4925 1 53.47 TGNCCCGAGCATAATTGATAACAACTTGTGTGCTCATGTGGCTGTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3R 4805054 5' - 1360 3356 1 60.40 GCACACAGTACGGTGCACGTTTGTGGTGCGAGGAGGAGCTGTCTCCTTTTTCTGTTTGGAAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATT:1 + chr3R 4533612 5' - Stalker4 388 1 68.32 TANAAAACGAAAACAAAATCGCGGCTAACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 4022377 5' - roo 397 1 66.34 ACAGACAGCCTTGTCGTGTTTTCGGATCAAGTTTATTGACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTCACTTATG:1 - chr3R 10824114 5' + 412 7091 2 59.41 TGCAACGAAGCAGCAGACTTTGCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCC:1 + chr2R 14756146 5' + Idefix 199 1 78.22 ATTTTCATCCGAAGTCTTCAAAGTAATACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1 - chr3L 23155744 5' + gypsy 7002 2 59.57 ATGCAAATACGTACGTCTACTTCTCTGTGGTATCATTGTATCTCCCCCTCCATCATCTGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 13899221 5' - roo 395 1 67.35 TGTGCTTTTGCTTCCGTGTGTGTTCGTTCGCCTTGATTTTTCCATTTAACTGGGTTTACGTCTTTATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGCTAT:1 - chr3R 8747210 5' - Idefix 7250 2 73.27 AAGATTCAATTCGAAAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAA:2 - chr3L 18476555 5' + accord 10 2 66.34 AACTCGTTTCAGTTTCGATTTCATTTTTAAAGGCATTTTTTACACAACACCCCCACTAGTTCCCCTCGCCACCCCACACATTTTATTTTATTTAATTTTAT:1 + chrX 9739305 5' + transib1 1900 1 88.12 TACTGTTGGCCGCCCTCTTTTTGGCCTGGTCCTGTTTCGAATTTTATTGTTTGCTTAAATATTTACACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGC:1 - chr3L 5487899 5' - F-element 138 1 70.30 TANTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTT:1 + chr3L 15099558 5' - G4 3809 1 64.36 CACATACTTAACGCACACACATACGCACACACGCACGTGCGATTACCTCAAACAATCCCACCCAAATTTTACCGGACTCGAGCAAATAAAAATAATACGAC:1 + chrX 13434121 5' + I-element 4926 1 67.33 CACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGT:2 - chr2R 4181304 5' - accord 7354 2 55.45 CAAGTGCCTCACATTGTTGACCATCGCACAATATGTGGAGCATGTGTTTGTTTGTGCTGAGCACTTAACACGCCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAA:1 + chr2L 7772178 5' + I-element 202 1 79.21 TACATTAGCTGCCAGAACAATTTGTCTCTCTACTTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATG:1 + chr3L 22920351 5' + 1360 3 2 76.24 ATGTATATATCCGAAACCCCTAGCCAGTCGAAGCCCCTCGTCGAAATCCCACTCCAGAGGCTTCCAGCGAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGG:1 + chr3R 23901294 5' + HeT-A 5735 1 53.06 ATTTCTTCCAAATTAGTTGAAAATTTTATAAGTTTGCCTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGG:1 - chr2R 5141020 5' + 1360 3356 1 57.47 ATGACAATTGACAGCTGATGATATTTTTGCTTGAATGCGCTGTCTGTAAGGCAAACGGCCCCAAACCATTCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 15744497 5' + pogo 4 1 75.25 CAGTGGGATGAGTTTGAAAGGTATTTAAAAATTCCGCCTTCTCTAGTAGAAGTACTACAGCCGATCCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGG:1 + chr2R 12180270 5' + Tc3 311 2 64.36 AATGCCTGGCTTTAGTCGCCTGCCCCTTACATGTTGTATGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chrX 678775 5' - Tirant 363 2 64.36 AGCTGTTCAGCCGAACCAGTTAGCTCTGCTGGCGTTTTATATATCATCGTTTATTCACAGCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCG:1 + chr4 853633 5' - 1360 3310 1 42.57 AGCCCAGTAGCTCTGATCCGTTGAGGGATTGTAAACATTTCAAACTTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCC:1 + chrX 4571690 5' - gypsy2 120 2 62.38 CCNTTTGTTAATTAAGTTTCGTTTGTTTTGCGAAAGCCCTCAGACCGCACCGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGC:1 + chrX 14086190 5' - F-element 379 1 50.00 TGATATTTAATTCCATATACTAGCTCAAATCATTTCTCTCAGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr3R 28117761 5' + I-element 35 1 61.39 CTGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 30904221 5' - roo 9025 2 72.28 TCTGTTATGGCTTGGGTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTTATTTT:1 + chr3R 16747656 5' - gypsy7 5008 4 80.95 CAAAGTATGGGTTAAATAATAATTAGAAAGTAGCAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTCCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr3R 17674327 5' - blood 7349 2 63.37 AGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 + chr2R 544816 5' + HMS-Beagle 6845 2 75.25 TTGTTGCCACTCGTTGAACAACCGCCACGCCCCACTGACTCCGTCCCGCCCCCTATCGCCCACTTACACACTAGCTGAGTAACGGGTTCCTGATAGTCGGG:1 - chrX 19112001 5' + INE-1 552 1 70.30 GGNGTCAATGAGGAAGTCAGCCATCGAATTCTATTGTTTCATCTAACGATGCAGCAGCTGCATATATATGCATATGCATAACCCACCAACACTACCTAAAT:1 - chr3L 10382749 5' + I-element 4970 1 74.26 TAAACACTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:3 + chr3L 11920054 5' + Tabor 6884 2 72.28 TACAGCGTGTACATAAATCTTGGCGATATATTTGCAGTATAATTTTTAGTCATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr3L 13878041 5' + flea 23 2 52.48 TTTTCCTCCTGTTTGTTGTTTGTTCGAAAATTGCAGGCAGCGAAAAGTATTCAGATGAAGAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCC:1 - chrX 18937220 5' + Doc2-element 4556 1 59.41 AAAATTTATTTAACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2R 9789019 5' + blood 16 2 63.37 AACACATCTTGACCCACTTTCTTTCATTTGCAATTCTTAATGCAAAGGCATTGCCTTAACTTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTA:1 - chr3R 17962966 5' + 1360 334 1 57.43 ACAACACATTTGTTGTGCGGCGGCACGATTATTCACGAAGGTTCGTACTAATTATATATGCATATACATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 17483840 5' - roo 404 1 75.25 TATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATACATTAACGTGGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr3R 20373256 5' + I-element 40 1 62.38 GCCGGGAATCGAGTTGCTCGGCGTGTTGAAGACTCCGTAGATCAGTTTCGCTCTCACTCTTTCGCTCTGCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGA:1 - chr2L 8655776 5' + Cr1a 329 1 54.46 ATAAAATCCTGTTTATCTTGTGATTATTTTTGTTTATATTGTGAAGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACA:1 + chr2R 17938264 5' + copia 197 2 55.45 GATTTGTTTTCTATTTGTTGACTTTTGTAATTTTGAGGGCCAAGTTTACCACTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTTCCTCACTACTGTC:1 + chr2L 11920255 5' + Doc2-element 460 1 56.44 AAGCGAAAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr2L 18214130 5' - hopper 1380 1 60.40 ATTAAAAACGTATGCCATTCATATGAATGTTTGATTAGCTATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr2L 7393657 5' + opus 7148 4 58.42 AATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTCCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTC:1 - chr3L 23702258 5' + G4 15 1 60.40 TTNTTGTGGGCCTGGAAAGGGCGTGTCTGCCATCTTGGTGTTGCTGCTTATATGTCTCGTAAGTTATTTCTTCACCTGGTTGTCCAATTCCTTTTTATTTC:1 - chr2R 4579172 5' + accord2 7312 1 69.31 TTACAACTCATAGGAGACGGGACATGCATTACATAAGTTACAGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAGCGGCCTA:1 - chr3R 20793071 5' - roo 309 2 56.00 CAAGTATTTTCTCCAGAGTTAAAGTAGAAATATTAAAGAAACCGAGGGTATATCATATAAAATTTATATATGGTTTAAAAGCAATGTATGTACGTATGTAA:1 + chrX 5115970 5' - 412 226 2 57.43 ATGCAAAGTATGGGTTAAATAATAATTAGAAAGTAGCAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTCCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr3R 17674324 5' - blood 340 2 60.40 TTNAAACAGGTCAGGATCAAAAGTCAAATGGAACACTGTATAAATGCCAAAATTTTATTGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATG:1 - chr2R 9595598 5' - baggins 5292 1 67.33 ACACAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTC:1 + chrX 19820618 5' + Rt1b 4962 1 70.30 GTATACAATTTCAAAGACCGCGATATTCAAAATTGTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAAT:1 + chr3L 15610466 5' - transib2 2388 1 65.35 TTTTGTGCACTCGCCGCCGCTCTTAATCAACGCCCCTTTGCTGTACTGGTGGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTTAGAGAGACGCT:1 + chrX 4053834 5' - Doc3-element 437 1 63.37 CTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGT:1 + chr3L 23146514 5' - 1360 173 1 76.24 ATATGGCAGCTGGTCCTGCAGGGATATGCGCTCGTGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATGCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGGGGGT:1 + chr2L 7905365 5' + G5 4628 1 66.34 TTAAATTAAGAAGAAAGGAATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACAT:1 - chr3R 29141012 5' + Juan 41 1 62.38 TGTTTCTGGGCCGCCAGGATTTATGTGCCATCATGTGGTGGTCAATGGCACAAAGCATACATCACATATATGTATTGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGG:1 - chr2R 9199988 5' + G6 1641 1 72.28 TGCAAAGTTTCTACGCCCCCCCTAAAGTTAGGTTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr2L 12322950 5' + hobo 4 1 74.26 ATGAAATATGGTTTCAGATCCCACGAGGAAACGCATATTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3L 10890766 5' - pogo 2075 1 61.70 AAAACACGAAATCTCTTTGCCTTTTCGGACAAATCAAGTAGTTGCCGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACAGAGTCACCTCGTTGTCGCCTCT:1 - chr2R 10955731 5' - Chouto 454 2 63.37 CAAGTCGATAAATGTCTCTGTGTGCTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGATATACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGC:1 - chrX 6417839 5' - accord 7025 2 74.00 AGAGGAAGCAGGAGAAAGCTGTGCAGGACGAATAAGGGGCGCAAATTTATGTAGAAAATGTGAAAGAAAAAAATCAAAAAAATCAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 19629817 5' + R2-element 3584 1 55.79 CTTTCATTGCATAGTGACCAAGTGTGTTAGTCACCCATACAGTTTATTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAAGGCACAAAAGG:1 + chr2L 13879200 5' - Cr1a 225 1 69.31 AGGATAGCTGGATCTCCAACAGCAACTGGAGTTGATGGTGCTGGTGGGGTTGGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAG:1 - chrX 20074464 5' - G2 79 1 58.42 AAAACACACAAATCAAATTAAGACCTAATTCAAGCATAAATTAAATTTTAAACGTTTTAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAG:1 + chrX 12942320 5' - Doc 362 1 70.30 TGAACCCGATTCTGATTAGCGTTGTGATGGGCTTGCTAGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAAC:1 - chr3L 15317103 5' - I-element 5015 1 66.34 AAACAAAAAACATTAAAAAAAAAACTTTAAAA:1 + chr2L 17800870 5' + P-element 2690 1 90.62 GATGGATGGCAATGGCTGGCTGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 30904202 5' - roo 9044 1 54.46 TCAAGAACGAAAGACGTGTTTTAATAAATGCATATTTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTAGCCAATGTTTATTATTTTGACTACTCCAAACACCTTGAT:1 - chr3R 2247495 5' - invader2 4678 1 65.35 CAAGCAATTTTTGCCCTTTTGTTGGTGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAG:1 - chr3L 11372852 5' - Quasimodo 7008 2 74.00 TACCTTGGGGCAACCTTGTCATTTACCTTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACTCACACACACACACACAAACACACTGGG:1 + chrX 5107931 5' + accord 258 2 72.73 AANAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr2R 3824677 5' + 297 35 2 66.34 CTGCGTTAGTAACGTAAACAGAAATCAAATTTCACTTGTAAGAGATTTCAACAAAATTACCAATCTCGTGTTCTAAGGAATTAATATAATAATAATAATAA:1 - chr3L 12174634 5' + invader3 5054 1 70.30 CAATCGCACAATGGAGCACAATTTCTTTTTTATCGCCTTTGAAGGTTGCTTTTGGAATGCAGAAATTACAATGCATGCAATTTCGCTTCACAAATGAACAC:1 + chr3L 8421571 5' - Transib5 165 1 64.36 TGNTTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAA:1 - chr2R 2949135 5' + 17.6 9 2 70.30 ATTCAAAAACTATCATAGAATTAGGTGTAAAACTTCAATTTACTTTAAAAGCTAGTTGGTGGATTTACGAGTTAGGGAAATTTTTGTTTTTTTATTTTGAT:1 + chr3R 30737890 5' - Fw3 3055 1 58.42 ATTTTAACACATGTGGGCTTTATAGTGGGTCTTTGTGTCTAGAATCTGTATTCTGAATATTAACCTTCTCTTTCCTGATATATCGACGTTCATACGGA:1 - chr3L 27908643 5' - INE-1 134 1 69.39 GGGAATATTTCAACATTTTTCACTTATACACAGGAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTA:1 - chr2L 7133585 5' + X-element 53 1 68.00 GCACCCTTAAATGCGGCACTATTTAAAATGCAATAGTTTTGATATCAGCTTTTGTGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chr3R 4679244 5' + copia 22 2 57.43 GCCTCGCCAGGAAGTGGACAGTTAAGCAGCAGCTCAACTCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr2R 13334879 5' + pogo 35 1 61.39 GTGTTTCGGCTTCGTATCCGTGGTGTTTTTCCGTATTTCTCTCGTTTTTCTATGCTTCAGCCTTGTCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAG:1 - chr3L 6276459 5' - invader3 5284 2 74.26 TATGGGACAGCAAGAATGCGTAGCATAGTTTTTGGCATAGCGAAGAATGAGATAATTATATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr2R 23601899 5' - jockey 4985 1 62.37 GTCGTATGATTTACTAGCTAGCAATGCCTTTTTCGCCGCTGTTCAGTTATGTATCGACAAAACAACCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAA:1 - chrX 16461422 5' + accord 6999 2 66.00 CAAACTAAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr2R 18723117 5' - opus 474 2 55.45 TACTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGATGA:1 - chrX 19820783 5' - Rt1b 4973 1 74.26 CGGTACTTGTGATCTTGCCCGCTGAAAGATCTAATTGATCGATTTGCGAAAGGAGCTGGCGATAATCGATGGATGCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 - chr2R 19149493 5' + diver 5892 2 76.24 CCGATACTGATATCTTTTCGATGAAGATGAAGTGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chr3R 6776525 5' + copia 25 2 54.46 TGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGGTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAA:1 + chr2R 544820 5' + HMS-Beagle 6849 2 77.23 TGTCATTTTCCAGGAGGTAGGCGGTGAAAATTTTTTAAAAATTTAATTTAAATTTAA:1 + chr2L 11789964 5' - 1360 3046 1 78.95 TTTCATTTCTCGTTTTCCTCGCCTAATGAAATTATAATTTGAGATACTTGAAAATTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTA:1 + chrX 514980 5' - I-element 95 1 62.38 GATGGGACCTTACAAGATTGGGATATAAGGAAGAGATTTTTAGCAGGCGAGATGGAATTCTTGGTGGATCAATCAATATATAAATATATATATACCAATAT:1 + chr3L 5622444 5' + Stalker4 7043 4 52.48 TACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGAATCGTTGAAAAGTATGTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3L 25245596 5' - 1360 3357 1 55.45 TGAGGCACTTGAAGAGCCGCAGGTCGCTGTGTGGCTTGTTCTTGTGCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTG:1 + chr3L 22800253 5' + R1A1-element 5254 1 54.46 GANCGTGTATCCTGGAGCGTGCACTGTAGCTCTAAGGCGGTCTTTTGGGTTTATGTATTGTATAAATATGTTTATTATAACAAAGTGTTACAATGTATTGA:1 + chr2L 76448 5' - Stalker4 61 4 63.37 CCGCCTTAAATGGATTTTGATTGAGTTTAATTAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTA:1 - chr3R 9129195 5' + roo 131 2 69.31 TCTAATTATTTATTATGTTTTATACGTTTTGTGTTCGTATCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr3L 4118157 5' + hobo 36 1 58.42 ATTCTGCGAGGCCTTCATCACCACCTTTCGCACCTTCAACCAGCCATACGTCAAGAAA:1 - chrX 6783756 5' + Transpac 362 1 74.14 TATGTATTTTAAGAAGGAAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chrX 9579301 5' + Tirant 8120 2 68.00 ATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTC:1 + chr3R 18717468 5' + Cr1a 183 1 85.15 GGTCGTCCAACCGCCTGCGATGACAGGCAGAGATGGAAATGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTT:1 - chr2R 8826135 5' - F-element 4439 1 61.39 TTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chr3R 29357090 5' - 412 437 2 81.19 GCGTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGTAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATGCTAATA:1 + chr2R 5178582 5' - mdg3 5485 2 60.40 ACCAACTGACCGATCCGACAAGGAACATTTCACACAAAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAA:1 - chr2R 16243404 5' + Doc3-element 4494 1 69.31 GAAAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chrX 9439836 5' - roo 9039 1 55.45 CGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3L 1259224 5' + Doc 40 1 58.42 TTAAATGTACATATATTATAAAACTAAAAGTAATCTCATATTTTCCTTAAATGTTTTTAAAACGAGATTGTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 - chr3R 29923647 5' + blood 7018 2 72.28 TCCATCAAATCGAATGGAAACTTTTACGACGGTTGTATAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr2L 8841126 5' + P-element 33 1 49.50 GAATCGTTTGCATGTTGCAAGGGAACGGCGCTGCAAATGCCTTTCCCCCCCCTTCCCGTGCACATCGGCATGCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 + chr3R 28288558 5' - 412 7546 2 76.00 GCCACCCACTTTTCCCTTCAGCAATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 1204077 5' - roo 359 2 77.23 TTTATATTTATTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chr3R 26434688 5' - Tabor 7289 2 60.40 ACATTTGCAACCGAGATCGGCTACTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACT:1 + chrX 6580522 5' + accord 7335 2 75.53 GTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTATTTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 + chr2L 12283966 5' - 297 353 2 75.27 TCATTGCTGTTTTTTTTTTTCATACGCGCAAGTTACCATGACCAGCATTAACCCCCCTCA:1 + chr3R 1680705 5' + accord 9 2 58.33 AATATTGGAATGCAATGGAATGGAATGAACTATTTGTATCTTTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2L 18754378 5' - roo 9038 1 56.44 CCTCCTTTTACTACAATACGCCCAAAACGGTCACGACCATTTTATTCCCCAGTATCTATCGATATCCCTTTGGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGA:1 - chr3R 23891348 5' + INE-1 537 1 64.95 CATACTTTTACGCGTCTCTTTAGTATTAATTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr2L 19602894 5' - hobo 2892 1 72.28 AACATTCTTAGACAAAACCCTAGCATAGTTCTTGTATTCTTCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCACATTGGTCCCCTTCTTTTTACCTTATTT:1 + chr3L 14495011 5' + Q-element 510 1 71.29 AATAAAAATAGTGATTAATAACAGCAGCCAGAACCAGCAACTTAACTGGCTACTAGGAAAACACTCAAAAATAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACA:1 + chr2R 17802695 5' + Porto1 4227 1 66.34 ATTTTGTTTATTTGTGTGCCTACTAACTTTTCTCATAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTA:1 + chr3R 12726256 5' - hopper2 1177 2 64.36 TAAAAAGTTTTGCCTTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGGTTTCGTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 + chrX 22596337 5' - INE-1 579 1 72.63 AATTGGCTTTAACAGAAAACAACTATAGTAAAATTAGCTTAAGATGAAATAACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTTCCCGACTATCAGGTACCCGTTAC:1 - chr2R 5863233 5' - INE-1 551 1 65.35 AANTAATAACAAGTAAAATGTCACTGACGACATAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr4 119449 5' + 1360 39 1 68.32 TGACATAATTTCAAACACCTGAAAATATTTTGTATCTCGAATCAAACAAATCTTCAAATCGATAAAAATACATATATGTATGTATGTATAATGTATGTAT:1 - chr3L 13910314 5' + Dm88 4370 2 73.00 ACTGGTTATTCCGGTTCCTCTAACGCCGAAGAAGCCGGGCTTTTTCTTTCCCCAAAACCAGCGATGTAACCAAAAAAACAAAAAATGAAAAAAAAAAACA:1 - chr3L 10531179 5' + gypsy7 5008 1 60.00 TCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTG:1 + chr2R 5582180 5' + Cr1a 454 1 54.46 GATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCG:2 - chr3L 18476530 5' + accord 35 2 62.38 CAAGAAGAGCTTCATCAAGTGGCAGCCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGA:1 - chr2R 9303960 5' + invader4 361 1 73.27 TATTCTAAAGACCTTTTCTATATTTTTCACCCACAGTAAAATCTGTCATGCCCTTTCCTGCAGTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTT:1 - chr3L 23716626 5' - flea 4860 1 73.27 TTACTCGGTTTTGCCTTCTGTTTCGTCATTGTTTCCTTTCAACTTTTATTTTATTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCT:1 - chr2L 14093274 5' - Bica 466 1 60.40 GTNTGGATCTCAGCTAGTTATTCTGCTACTATGTACAGTGGAGCTTCGCTAAAACAAGATTGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATA:1 + chr3L 10683896 5' - 297 231 2 59.41 ATATTTAAAACGTGGCAGTTTCGATTTTCAGTTTTTGTGTAACCAATTACACAATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGA:1 + chr3L 23891297 5' + 1360 308 1 54.46 TAAAGCTTATGATGGCTGACAGTCGCCTTAATGGATCGCGTCCCAATAGCCCTTCCCTCAAACTTCAAATCCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCTAA:1 - chr2R 20745237 5' + S-element 1392 1 71.29 AATCGCATCCTGCACCGAATCAAGTGTCCTTAGGCGCATTAAAAAAAAATAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 6144968 5' + BS 5094 2 87.50 TTTTATATTTATTTCCTGATTGAGCTCTAGCTTTTAACATATTCAATAGTTTAACATTGCTTTGCTATCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 - chr3R 16593914 5' + Max-element 11 2 56.44 AAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCT:1 + chr2L 19364080 5' + BS 4784 1 47.52 CTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAAT:1 - chr3L 5662681 5' + jockey 382 1 67.33 GGGCTAGGTGGTAAGTTGGTTGGCTGGTTTTGCTGCCACGCTCATTTCGGTGGCAGCTCACTCTTGCCTGAATATGTGTTTAGACGTGATAAGTAGGCAAA:1 + chr3R 12580423 5' + rooA 16 2 66.34 TTTTCATCGCCACAAAATGAGGGGGAAAAAATATAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 6443176 5' + G3 4583 1 37.62 ACTTCGTGATGTAAGCTATTCAAGGCAATATACAAGAAATTGAGATACAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 27900502 5' - roo 403 1 71.00 TANTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr3L 20209570 5' + Burdock 41 2 73.00 TTTCTCAAAGGTCAAGCTTAAAAAGGGGGAACAAAAATTATGGAAACGGGGGGGCAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAAAAGGAAAA:1 - chrX 16111128 5' + Doc2-element 246 1 80.95 AGGACGCTTCCTGTATATGTGTGTGTGTTTTTTTTTTGCGTTTTTTTT:1 + chr2L 13332164 5' - gypsy7 5007 3 87.50 AATCTGGTTATTTGGCTAGAACTCTATTTAAGGCGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 5925559 5' + roo 43 2 69.00 CCATTTTCCTCTGCCAACATTCTGCAATCGGATTGTCTTTGAATTTGTGTTTGCCTGTGTCTTTGCCTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACG:1 + chr3L 8152154 5' - rover 6978 2 72.63 GCNGACACATCCACTACACCAAACACTCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGG:1 - chrX 4245294 5' + F-element 4211 1 73.27 TTCGGACGGCCTTTCAGCACGCCCCGAAGTTATGTGAAGTAATTTTGTAATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGT:1 + chr3R 28441416 5' - I-element 137 1 66.34 ACGAGGAAATCAGTTTTAAAGCGATGACTTCATAAAAGTATTTCGCGTGGCATTTTAGGTGAGGCAAAAAACCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 - chr3R 12554973 5' - mdg1 7455 2 72.28 TAATAAAATAAATACTGGTAATACGATCTTGATACAGAAACGATCTAAAACATCCCATTCTTTGCAGCGTAGCAGCTGGGAAAGCGGTGCTGGTAAA:1 + chrX 22717158 5' + Rt1c 321 1 60.82 AAATCATATATGTGTTTGCAACGGGTCTAGAAATCCTCCTATTTGCGTGTGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3L 13704732 5' - hobo 2928 1 65.56 CAACGTGAAGAGCCTAATACAGTTTTGGGCCAGGAGCCATAAATATGCGTAACGCCATCCGATTTTTTTGCACACGATTTTTT:1 - chr2R 17293616 5' + 1360 39 1 57.83 GGCTTTCTCCTAGCACTCCTTCTCTCTCAAAAAAATATTAAATTTCGCGTTCGCACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTAGAGC:1 + chr2R 2750955 5' + INE-1 567 1 70.30 TTGCACATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2L 12284039 5' + 297 6593 2 68.32 CCCTGTTCTATTCAATGGTTACTGGGTGTGGAGAACAAGTTTCGCCCTTCTGTCTGTCCGTTCGTATGAACCTCGAGTTCTCAGGAACTATAAAAGGTTGA:1 + chr3L 498693 5' + INE-1 153 1 58.42 TACAAGTTCTTTGCCAATTAAGCCCAAAGTTTATACGATATGGAAAGCTGTCTAGCATAATTTTTGGTTTCGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chrX 6731887 5' + hobo 3 1 73.47 CAACAGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAAT:1 - chrX 21087684 5' - mdg3 242 2 66.34 GACTCTTTCGTTCCAACTTTTCACATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCA:1 + chrX 8150428 5' + rover 6995 2 76.24 AANCCGTCTCCAGCGGTACAACAACAATAGCGACAACTACACCATCGCACACACACATAAGCAATTCTTTAAACAACACAAAAAGAAAAAAAAATAAAAGA:2 + chrX 15497898 5' + Doc2-element 223 3 48.51 AAAAAAGGTGAAAAGAAAGCGCACTCAACTGACCTCAACAATGGCAATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr3R 24738986 5' + pogo 6 1 72.73 AAAAAAAAATTTTGAAAAAAGTGAAATTTTTGATTTTCATATATTTTCGAATTTCAAAAACTGGACGTGGTTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTT:1 - chr3L 5955227 5' - FB 25 1 50.50 CANGTATATGGGCGAGCTGGTGCGTCTGGTGCTGGTGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCC:1 + chrX 9587337 5' - opus 78 2 64.00 CAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr3R 13225499 5' + hobo 33 1 57.43 ACTGACGCATGCTAATTTTACGGCTTTGGTCTTCTTTCTGATAATATACATCGTATCGAGCATCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTG:1 - chrX 21298083 5' + Cr1a 471 1 68.32 GTACAAGATATGGCGATGCAAACTGCAATCAATAAAACTTAAATAAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAAC:1 + chrX 7610869 5' + G6 1888 1 60.82 AGAGGTTGGGGGTAGTGGTAGTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAATTGGAAGTGTTATATAATCGCCCACTTATGAAGCACACTGCATAAGTGC:1 + chrX 19409208 5' + gypsy11 156 2 79.21 AGTAAGATGGGGTATGTTGGACTGCGCTGCTGATCGCTTGGAATGTAGGTGTTGTGTATGCAAAACTTGCACGCCGCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAA:1 - chr2L 23390125 5' - Doc 4653 1 80.20 CATTGCTGGCATACCAAAGTGGGTTCGTGCCCCACGTTGGGCGCCAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGAT:1 - chr3R 17361122 5' - gypsy 7414 2 59.41 CAATTGTTTACGATTATGACTGCGTTCTATATAGACCATATACATACATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 + chr3L 11450467 5' + Transpac 4944 2 54.46 GGCAACCTTGTGACGAAAGTTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 20419119 5' - roo 9043 1 58.42 AACTAAAGTCAACGGATACCGTAAAGTCGAGTAAAGGGTATTTGATAGTCGAAGCACTCGACCATAGCATTCAGTCTTTTTTTTTATTTCATTTTTATTTT:1 - chrX 14345207 5' - Tc3 1571 1 46.53 TCNTTACCCTTGCTGCGGTCGTTGCAACGAGAATTTTGCCACATAGCTGACTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chrX 10119638 5' + FB 23 1 53.47 GAGTGCGGACGGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 + chr3L 447307 5' + Tabor 20 2 53.93 ACCTCTTTTCCTTGCCACCGTGCAGTACATTTGGTGCTATTGTCACCTAGTATTTTTGGCACAAGCGAAATCAATTTGTAAAATTTGTTCAGTAAGTGTTT:1 + chr2L 3739907 5' - hopper2 1191 2 77.23 TTNCCCGAAATACTGGTATTTCTCCTAAAAAGAAACCAATTAAAAACAATTTAGCCAAATTTTATATCAAAACTTACTAATAAAGACTGTTCCAAGCATCG:1 + chr4 1173007 5' - Cr1a 4026 1 76.24 AANTAGTTTTGGGAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 - chr3L 6013745 5' + Max-element 8246 2 66.33 TTTTAAGAAAATTTTGAAATTTTTTTTTGAAATTTTATTATGTGGCAAAAAGATTGTTGAGCTTTCTCGTTCTCACTTCAACTAGCTGAGTAACGGGTAT:1 + chr2L 3994136 5' + INE-1 540 1 80.00 CGCAAGGTTATAAATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTATAAAAATTATAATAGCAATTATGCGGTCTGCACTTAATGAGGCG:1 + chrX 22576296 5' - Burdock 6324 2 73.47 TAGAGTTGCTTTCCTATTAAATCTCAGTTGGCATAATTTCTTCCCAATCTCGAAAATTTTTGTGAAAGTGAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 9439740 5' + roo 4 2 73.27 GACCGCATCGGCCGTGTTTAGATTTTGATAAGATGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACA:1 + chr2L 3808189 5' - Rt1a 4794 1 69.31 GTGTTGGTCAAGGATTTTGCCAGTTTTCTTTTTTGTTTTTTATTAACTCACGGGAGTTTCTCCGCTACTTAGAATATTTGTCGTTCGCGTTTATTCGCTG:1 + chr3R 14029548 5' - HMS-Beagle 284 1 72.00 GCCCGGCGAGCAGCTGAAGAATAAATTGACGCACACCAAGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAG:1 + chr3R 14106657 5' - HeT-A 6048 1 59.46 AATTAATATTTAGCATTTTTACAAATTACTCCTGTGCAGGCTATATTTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr2L 7393736 5' - opus 475 2 56.44 TTAACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2R 9789010 5' + blood 7036 2 54.46 AATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 4806726 5' + roo 8708 2 80.21 TCCAACAAAAATGGTTGCAACTCTATGCAATATGTTTTTGCTGACCCCCTTTGAACATCAACCCATCACTGCTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 + chr2L 17204926 5' + hopper 1 2 59.41 CAAAATACTTTAGCTAGGGCCACTGTTAAGATACCCTCCTATACGCGAGTAAAAAGTTTTTAATATGATTTTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCT:1 + chr2R 16738208 5' - micropia 249 2 76.24 CANGTGCTGTACGGATATCGTTACACTAAATTGTTATGTCGGTTATGTCTGCTGAAGAAAGACGCTCGGAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACTGAG:1 + chr2R 22144578 5' - Doc3-element 4302 1 67.33 GAGTGGCGGCCATAACAGTGGGACGTCGCGTGGAGAGTGTAGTTGCACTTCCAGTAGGGTGTCACAATTACGGCGCGTACC:1 + chr2L 10211789 5' - baggins 51 1 69.14 GCNCAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGT:1 + chr3R 178125 5' + BS 45 1 72.28 GTATTTGGACACAGTTCGAAAGTGTTCTGCGCATTACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTAATTTTATT:1 - chr2R 5202361 5' - roo 9033 1 60.40 GTTAAAGCATTTAAAAAAAAAATAAAATAAAAAA:1 + chrX 15863797 5' - hopper 145 108 91.18 CATTTCGGCGTGCAGCCAAGGCAATTACGTCTGCCGATATTTAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr3L 7781186 5' + 297 6607 2 63.00 AAAATATGTACTGCAATTAAATCACTAAAAAAAAGCTAAATCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 5959715 5' + roo 8687 2 60.67 CCATGTCAACTGCAACCAGCTGGCATTCGTTTCGCTGACCGTCAGTTCTGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTAGA:1 - chr3R 7181993 5' - Burdock 292 1 56.44 AATGAAGAGCTCTCAACGTGCCAATGAGTAATGAACAATTAAAAGCTACAGTAGAGGACGTATGTAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTT:1 + chr3L 23155646 5' - gypsy 448 2 63.37 GGNATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 - chr3L 27415303 5' + transib2 28 1 52.48 AGCCGTAATCCCCGGCTTTGATCTGTGGCAAAATCGAATTGGGCAAGTTGTTAGGTTGGCGAATAATCTTGTCGACCCTACTTCCCTACGACGTCTGAAGA:1 - chr2L 2405789 5' + G5A 2668 1 58.42 TAGTTAAGGCGTGGCTGCGTGATTGTTATTTTTCTACGTACATAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 - chr3R 23846892 5' - Bari1 1676 1 61.39 AGTGTTGTGTCTTGGGTTGAGCATGCTCTGCGGCTTGGATAATCCATTGATTTTTCGCCCGTGGGGAACCCTGCCTCTAAGACTCAGCTCAATAGG:1 + chr3L 1756540 5' + G5A 2460 1 72.92 AGTATTTCGCGTGGCATTTTAGGTGAGGCAAAAAACCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 - chr3R 12554937 5' - mdg1 381 2 63.37 TGGACGGAAAATTAAAATACCGATTTTTTACCCGTTTTACTCATGTTTCCAACCATATAAACGTTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAAA:1 - chr4 1225017 5' + INE-1 162 1 77.23 CATAACCAGTCGCCGTACCACCAGCAGCAGCACTCACCATATCATCCACCCGCGGCTCAGCAGCAACAGCAATCCTCTCGCATCGACAAACGACCGTCCCG:1 - chr3L 6733423 5' + Doc 461 1 76.24 TCATAAAAATCTCAAAAAAAAAAAGTTTCAAAAAA:1 - chr2R 17849861 5' - FB 174 1 74.29 GGACATAGACACACACACACACACACACAGACACATACTGGCGCGCGTGCACATACACTTACGTAGGGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chrX 9985403 5' - hopper 1407 2 62.38 TCCTCCAGGCGATGGCCAGTGTTGCGGAAAAGAACTTGGAGTGGGACAGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTT:1 + chr3R 14302910 5' - 17.6 257 2 57.43 ATGTCATATAATTTTTCTTAGGTATATTAATTAAGTACACCATCAACCAATCGATAAAAGAAGCTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 - chr3R 4600516 5' - Tabor 474 2 66.67 CCACCGCCACTTAACCCCACACCAGATCCTGCCCCTTATTCCTTGTTTGTCGGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTG:1 - chrX 20616228 5' - F-element 260 1 62.38 AACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 19450184 5' + roo 8717 2 51.49 TTTTGCGAGTGCTTTGGGTTATACTGTTATTGAATTACCGTCTCCAAGCACGAAAAAATACTGACACCCTTTTCAGCAAGCCCTGCACCATCAAGCTCCCA:1 + chrX 974990 5' + G2 27 1 73.27 AANCCAGCAATTACAGCTTGAGGGGAGGCGATAGTTACCATCCAACGACGCGTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCC:1 - chr3R 11350774 5' + HeT-A 5643 1 53.47 CAATTTCTTCATCTTCATCTTCATGACGGCGACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr2R 19603592 5' - 412 7474 2 69.31 AANGATTTCACAATTTCAATTTGCTTGTGGTTTCCTCGGAATCGTTGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3R 5329407 5' + blood 7041 2 54.46 CCTTTACGACAGCCCCCTCACCCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTT:1 + chr2L 10760059 5' + jockey 4833 1 82.18 GTAGAAGCAGAATTATTTTATGATAATTTCATATTTTGATCGGAGATTATGTACGTCTACAAGTGTTTGCTGCTTGCACTCGACTGCCGTCGTCTTTATTC:1 + chrX 916571 5' - ZAM 312 2 66.34 AAGGTACTTGACGGCCAACTTAGACAATAAAGAATTATAATCATTCAAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chr3R 7382682 5' + copia 5 2 62.34 TTACTTTGCAATCATAAATATTTAATCATGAAAAGAGTTGGAATGTTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chrX 10453451 5' - hobo 2911 1 53.47 TGCGATTCTATAAAATCTAAAATAATAAGCACTTGCTCTAGCTCGATGGCATTGGGTGTGGTGGCCTTGCTTGTACAGATTCCTTTTCGCTACAGACATTC:1 + chr3L 14820543 5' - Gypsy12A_LTR 2142 1 66.34 TAAAACATAAAAAGCATTCAACAATTGGAAAACGGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCG:1 + chrX 1134075 5' + accord 7227 2 66.00 TTCAAAGCCAGCTGTCTTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr3L 9076568 5' - 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Q-element 509 2 64.36 TGNAAACATCTACAATTGGCTAAAACTGAGTAGGGAGCACATTTCCCAGCTGATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTAT:1 + chrX 11978097 5' - 17.6 7399 2 46.53 CAGCGGTTGAGTTTAGCCATTACAACTGCTGCTTATTAATTAATGGCAATTAATTTATGTCTAATTGATTTGCGGAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCC:1 - chr3R 21985576 5' + Stalker4 128 4 84.16 TACGAAAAAAAAATATAAAGTCCAATGAGAAGAGCTTGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAA:1 - chr3R 10539578 5' - accord 7050 2 64.36 AANAGGTGGCGCATTTAACTTATGTATTTGGAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3L 24764790 5' + 1360 38 1 97.00 ATTAGTAAAAAATCATATATCATCTAGTTTTTTTTGATTTCTCCTATATTATAATTATATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr2L 14365478 5' - blood 7374 2 58.42 CTAAAGAACAGCGTAAAAAGGTTGCCTGCTTATAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGG:1 - chr2R 4900395 5' + Doc 6 1 64.36 GATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTATGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAGAA:1 - chrX 21587711 5' + INE-1 138 1 78.22 GAACTAAGACTTTTGTAGAGCTCTTAACCAAGTTCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - 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chr3R 908411 5' + Cr1a 4219 1 61.39 ATAAAGCTTTTCCGTCAATGGGCCAAACAGCAGCCCAAACAAGCGGCAGTCGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 6184177 5' + roo 8686 2 54.08 TATGAATTTGCTAATTATAAAAAGATATCATTGTTTTTGTTTTTTTT:1 + chr2L 13950744 5' - transib2 2642 1 80.85 GCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCT:1 - chr3R 1868207 5' + G-element 47 1 66.34 ACATACACACACACACGCGCCGCAACTTCACAACATGCTGTGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTT:1 + chr3R 21531075 5' + S-element 32 2 58.42 CCTCTTTCTGGGTAACTAAAATCGATTACTGGTGTTAGTCTCTCTTGTGCTATCTCTGTGTTTCTATCTCCGTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAA:1 - chrX 2500164 5' - gypsy5 343 2 70.30 CTAACAAATGTTCTAAATGTACACTGAGTAATGAAAATCCGGAACCCAATCCAGATAACATACAAAAATTCATACTTTTTCTCAAAAAAACCAAATTATAC:1 + chr3R 11400624 5' + I-element 5162 1 58.42 GTAATAGGGTATACTAGATTCGTTGAGAAGTATGTAGCAGGCAGGAGGAAGCGGTTCCGACTATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATCCATAGCC:1 + chr2R 4618504 5' + INE-1 87 1 78.00 AANACTGCGTCACGCAAAAAGAACATTTGATGGCATGTTGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chr3R 4600414 5' + Tabor 18 2 61.39 TAACTAAAGTCAAAGACTTTAAACTTAAGGAAAGTTAAAAATCAAACTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 12427876 5' - I-element 5328 1 54.46 AGTGCCATGACTCCTGGCGGTCCCAGTCTCTGCCTAGCCTTCGTTGCATACGGACGTTCGCGATTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACATCAACTA:1 - chrX 11564582 5' + jockey2 38 1 75.00 AAGTTATGAGTTTAATCAAAATGTTTATAAACTGGAGCCATCGATAGATGGGCTCGGTGGGCTGATATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCC:1 + chr3R 8402674 5' - F-element 4524 1 71.29 CTGACCCTCGGCTGCTGTAAACGCGATAAGATAGCCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCA:1 - chr3L 16958937 5' + jockey 4839 1 66.34 TGTCTGTAAGGCAAACGGCCCCAAACCATTCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3R 15744537 5' + pogo 44 1 69.31 CCNAGAAACTACGGAGTCAACAGCAACCACCACAGCTGAAACTACCGATTCCACAGTGACTGAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACA:1 - chr3L 3189210 5' - roo 8727 2 69.31 TTNCTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCTTGGGCCTACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chr2L 9313989 5' - hopper 1379 1 57.43 AGNTGACCTAAACGAGATCAAGTTGCTTATCTCCAAGAAGTTTGACGTGGTCGACGGCGGCGATCTTAAACATTGTAGTTAATTTGATTTCCAATACTTCT:1 + chr2R 912929 5' - mdg1 7453 2 72.28 AAATAAGAGACAGATCAANAGTTTAATGTGCCAAATGCATAAAATGGCNNGAAAGCAGGTCAATCTANNNNNNNNTAAAACACACGCACACACATACAGAA:1 - chr3R 21626970 5' + Quasimodo 39 2 87.13 TCCAAAAAGAATAACTATCTGAAATATCCAAGAAGAATTATGAAATTTCGAGTTCGCTGTCACACTAGCTGTGTAACGAGTATCTAATAGTCGGGGAACTC:1 + chr3L 2038091 5' + INE-1 558 1 82.18 GATAAGAGCCACATGCCTTTCGCAAAATCTTAAAAGGTTTTTGTTCATAAATTAGATTAAAAGTGGTGTGTAATGATGAACTCCTATTAAGAACACAAGTC:1 - chr3R 26140834 5' - 412 7535 2 67.33 TANTTTTGTTTTGAAACTGATTTTCACTCTCTGTTTTCCGGCTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATT:1 + chrX 11807096 5' - roo 143 2 59.41 AGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAG:1 - chr3R 29588499 5' + Transib5 2929 1 48.00 CGGCCAACCTGCAATCTCTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTG:1 - chr3L 5662698 5' + jockey 364 1 50.00 AATATTAAGCAATCTTTAATTCTTAAATAAGGTCACCGTACTCTTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 + chr3L 18511035 5' + Ivk 7 1 68.32 TAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2L 13229215 5' + roo 8693 2 56.44 TCGTCTAAACACTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 + chr3L 11920049 5' + Tabor 39 2 67.00 TAGTTGTGTAAAAAAACGTAAAACGAACAAAATGACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr2L 21951242 5' + opus 7152 4 64.36 AGCAGACCTAGTATTTAAGGCTACATAATCATATTTATCGAACTAAAAACCTGGCTTTTCTCGATTTTTCAACTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chrX 14505874 5' + pogo 4 1 74.26 AAATATGCATAAAATTAAAAGAAAGGATAACATTTTATATAAGCCATATAAGCCTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3L 17448055 5' - hobo 2920 1 54.46 AAAAGATTATTAGACCTTCGGCTATTTGAATGGTATTTTCAACATTTTCCTGCTGTGCGCAGTCAGCGGTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACATT:1 + chrX 6374532 5' + HMS-Beagle2 491 5 71.58 TAAAAACTCGACTCGCGATTAGTTGGACACATGCTTACATCCGAACACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTA:1 - chr3R 20286046 5' + jockey 4786 1 49.50 TATTTGTGATTGATATTTTAAAGCTGCTTTCATTTTTTTTATTCCTAAGTAACAAGATAGCATACAAATAAATTTAGAACATTTTTAAGAGTTATCGTTTA:1 + chr2L 12132782 5' + transib4 122 1 83.17 ATATATTTCCCCTTTTTAAGCAATCAAATCTATCCGTTTGAATGAAGCTAAAACCACTGTAACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2L 1089533 5' - hopper 1407 2 71.13 CAGATTCCCAGCAATAACTCAAGTGCCAAGAACAGTTCCAAAATCTTGGAAATCCACAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACATACTCCGTTAACCA:1 + chr3L 4997500 5' + Doc4-element 214 1 77.23 AAGAGCGATTCGTTTGATTGATTCAGTTAACAAAAGTGAAGCACTCAAACTGAGCGCAATAAACACGATTTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACA:1 + chrX 4171732 5' + I-element 5125 1 44.55 CCAATGGAAGATCCGGAAAAGGTCTTGGCAATATTCAGACTTATTCCTTTTCCAATAAGTGTGTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACT:1 - chr2L 17373603 5' + diver2 17 2 40.59 TAAACGCATGCAGGAATGTGTATTTTTTTAATTATTTCCCAAATAGTGATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATA:1 - chr3L 11891415 5' + Tabor 3 2 72.28 GAACGAGAAATGAGGCAACTCCTTAGACCCCAGCAATGTGGCACTTGAGGCGATAAACCTTGTACTGCGATCGCATTATATCCTAAGGCATTCTATGATTT:1 + chr2L 10456057 5' - Quasimodo 84 2 75.25 GATCGTTTTCGCCGGGTGAGTCCGCATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCCACATGAGTCAGTGACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAA:1 - chr3L 19520306 5' + roo 8841 2 75.25 CACCTCCTTGCCAACCGGCAGCTGACCAAATTAATCAAGCGTGTGCCAAAAAAAAAAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAAT:1 - chr2L 14620350 5' + invader2 413 1 58.00 CCATCCCACACTATCCCAAACACTTCCCCATCATCATCAAGACACTAGTTTTAGTTAGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGATCTCGGGAGAGT:1 + chrX 7000280 5' + Circe 373 1 56.00 CTCGGATCGCCAGCGGTTGTTGCAAAAGCGCGAACGCGAAATCCACCAGAAAGCACCCAGCTACAGGGTGGCATCAAGGACATAAACACACACACACACAC:1 - chr3L 6172261 5' + accord 179 2 54.46 GAAAGATGTGCGATAAATCGCCGACCAGGGCCTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCT:1 + chr3R 23603840 5' + jockey 495 1 69.31 TGTGTGTGTTATTTGGAAGGATTATTGCAAATTTTCCATTGCTCACTGGCCCAGATTTGTTGGCCTTTTTTTGGCATAAAGTCACATAATAAAGCTAGAGA:1 + chr2R 5469097 5' - transib3 2828 1 66.34 AAGCTGATATCTTTGTCCAAAATGTGTGTTTTTTTTTTTCATCCATTGCCTTAACATTGTATATTCAATTTAATCCGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3R 22208479 5' + I-element 1 1 53.47 CAAAAAGCTACTTTACCAAATTAAATTTATAAAACGATGAACCATGGCATTCAACATTCCGTTTTCCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAA:1 + chr2L 13483188 5' + I-element 94 1 67.33 GATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAT:1 - chr3L 24208211 5' + Quasimodo 13 2 63.37 ACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGACGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCA:1 - chr3R 1977612 5' - micropia 5401 2 60.40 AATAATTAGAACACCTAACAAGCTGCGAGGTCAAGGGATCGGTTCTTAAATGTATTTTCAAATTGTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr3R 27156615 5' + pogo 5 1 74.26 GTACTCCGCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chrX 678837 5' + Tirant 36 2 60.61 TAGAGCTCTTAACCAAGTTCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr3R 20878187 5' + Doc 37 1 58.00 TGCGAAGCAATCCATCCCAAAGCATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATT:2 + chr2R 19149418 5' - diver 171 2 76.24 CTCAAAGCAATGGTCAATTGACATGGCAGCAACAACAATTGTGGCCCACTTAGTCGTCCGTCCATGTCCATACACACACAAAAACACACACACACA:1 - chrX 3064045 5' + gypsy3 417 3 57.29 CTGCCTTTTCCAGTTTAATCTATTTTCCTCTTTTTTCCTATTTAATTTTAATTAACGCTCAAAATGAAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGA:1 - chrX 708526 5' - F-element 4342 1 71.29 ATACGTTTTATCAAGAACAAAGGGGTATTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chrX 8302848 5' + 297 32 2 71.29 ACACGTCGAGGAGACACGATTTTCCGATTTCACACTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCC:1 + chr3L 1362599 5' + HMS-Beagle2 7018 2 66.34 AGAGCGAACGTAGGAAAATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAAGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCAGACAAGCAA:1 - chrX 7150520 5' + 1360 3248 1 47.31 AAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 + chr2R 544802 5' + HMS-Beagle 6831 2 61.39 GTTATTTTTTTCTTTTTTTTGGGTTTCCATTTGGCTTAGTGCAAGTATTTGACTGTGCACCTGTGTGGGTGCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTT:1 - chrX 2565964 5' - gypsy3 422 1 71.88 GCTAAGAGCACTGCGAGAGAGGAAGAGAATGTGAGTTGCGAGCAATGCGTTTAGGCTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr3R 21206668 5' - P-element 2868 1 58.42 CCAGCTAACAAGTATTTAACGTGTAATATGACATGCAACTTTAGATCATTATTTTAATTAGCATTTTATTGTTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCAT:1 + chr2R 23185801 5' - Doc 286 1 72.28 TTGGAGCTCAGCAAGCCAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 13704650 5' + hobo 25 1 54.00 GCCGGTTGGCCCACTGCCACTCCCACCACCGTAAGCGACTGCGGCAGAACCATTCCCTGCTGCTGCTGTCGCTAGCGCCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGGTG:1 + chr3R 23292224 5' - TART-B 152 2 38.61 AGNATGTTGTCTACAATCTCGCTCGTATTTCATCCTGTTGGCCTTTTCGCTATGTTATCGCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATAT:1 - chr3R 6415504 5' - Stalker 7 4 61.39 CCTACATACCAGCAAGGATCCCCCATCTCCATCCCAATTTCAGTCGCCATGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGTGAACAAGCCACTAGGTCTGAACGGG:1 - chr3L 6626059 5' - Rt1b 4694 1 54.46 GGCCACTTTCAACAATAATATTAGCGTGAACGATTCTTGTTTTTCCATAAGTTCTGTGATTGCATTGATGACTAGTGGAATATTTAACTCTTTTTGGATGT:1 - chr3R 2465931 5' - F-element 4386 1 61.39 ACAATGGGCGCATTTTTGCGAGTGTGAGTCCGGGTCCGAGAAATGAAATGGTGGTATTTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGCAGACTAATCT:1 + chr2R 10572033 5' + diver2 4554 2 65.35 TAACCCCTAGCCCTAGTTGCACATACATACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 - chr3R 17666058 5' + Transpac 18 2 62.38 TAAACCGTAATCCGTAAAAATTGAAGAAGATGAGTTTATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 446015 5' + pogo 33 1 60.00 TGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGCCATCGCCAAACAAA:1 + chr3R 1418285 5' + BS3 221 1 60.00 GCCAACTTGTAATTTAATGCTATTATCAGTTCATCTGCTCGAAATACACGGATCAATTTATAGTTACATATGTATGTACATATATATACATATGTACATAT:1 + chrX 19455071 5' - G3 4507 1 76.24 AANACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 - chr2R 4900355 5' + Doc 46 1 67.33 CTCGAAAAAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr3L 21534225 5' + 1360 3 2 76.24 TCNGCAGGATTTGCCTGTTTGTCTGCCTTTTGCTTTGCGCGTTTTTTATACTCTTGAATTTTTTGTGTTTGTATTTAAAAAAAAA:1 + chr2R 12118863 5' + Stalker2 497 1 65.88 GCAAAACAGAAACACGCCGCTGATTGCTTAAAAAAACAAAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTT:1 + chr3L 12173270 5' + 17.6 7351 2 66.34 CAACAACGCCTCGCAAACAGCACGCGGATAATGATAAAAAGAAAATAACACGCGCAGTTCGCATCCAGTGCCCGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACT:1 - chr3R 31936955 5' + I-element 4927 1 77.23 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCG:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 15 2 72.16 ATTATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chrX 21564763 5' + diver 5895 2 73.00 CATATATTCTTTGCCAAGTACATTCCCACTTAGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3L 14088118 5' - hopper 1372 1 67.33 AANCGGGCTATGGGACTAAAGGATGACAGTACTAAGGACAAACAAGGACATAGCAAAGACCCTATAATAATAATAATAATAATAATATT:1 + chr3R 17615090 5' + mdg1 7071 2 53.93 AGGCAACCGAGGAACAACCCATAGACTACTCAGTGAAGTACAGCGAGAATGCCACCAAGACCTCAACATATCAGGAAACGGCGCCTGCATAGCGCGTGCCA:1 - chr3R 28838477 5' - invader1 3653 2 76.24 TCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr2L 19845914 5' + F-element 53 1 64.36 TATGATGGGTATTCAGTCGACCCGAAGTCATTGGTCGTCCAGTTCCTGGGATTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGC:1 - chrX 17332410 5' - Bica 265 1 54.46 GTTGTTGATAGCCTCAAAACGTGAACTTTCAAGTAACTTCATGATTTATAAATTAAATTTAAATGATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 + chr2R 1516579 5' + Transpac 11 2 69.31 CTACAGCGCCAGATAGCTCAAATATAGGCCTATATATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chrX 14265025 5' - Burdock 6353 2 66.34 GAACTCGAATCTCCTCCGCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGAAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTC:1 - chr3L 15305360 5' + Max-element 293 2 78.22 CGNGCTCTATCTCTGATTTCGCCTCGGATTTGATATCGTTCTCGAGTTGGTGGTCTGGTGTGCTTTGCTCTGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACA:1 + chr2L 11440045 5' - Stalker4 80 4 74.26 TGAACTTGAACCCGGGTGATTAGCAGCAGAGAATCCAATCCAACCATTCGACCGTCTGTTATTTTTATTCCATATTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 30106903 5' - roo 405 1 74.26 GGGATTTATGTAGTTTGTTTGTGTGAACTTTATACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chrX 19820111 5' - mdg1 379 2 66.34 AAAATATAAAAAAATAATAAAAACCGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAAA:1 + chr2R 551045 5' + Bica 318 1 79.21 CTCCAGACAAAAAGAATTTTATTGGCCTTCACTTAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAAC:1 - chr3L 16197081 5' + Doc 322 1 66.34 GGTTATTTAAGCTCACCTTTTTCGTTACTAATAAATGTTGAACATTAGTTCTTGTTAATAGCTCAATAGTTGCGATTAGTTAACTTTTTTTTTATATTCT:1 - chrX 8644539 5' + Tc3 381 1 71.00 AGTCGGTGAGATAGTCAGCTGTTCAGCCGAACCAGTTAGCTCTGCTGGCGTTTTATATATCATCGTTTATTCACAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAAT:1 + chr4 853617 5' - 1360 3327 1 50.50 GGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 22494193 5' + 297 15 2 63.00 ATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1 + chr3R 14049344 5' + transib2 27 1 53.54 AAAAGCGTGTACCATTTAATTGATATCTCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 5291663 5' - roo 9025 2 72.28 CCGCTCATGCTCACGGTCATGCAGATCGATGGGCTGGCCATTGTTGTAGCACCGGACATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTACGTCCTGGTAGGTGT:1 - chr2R 15468597 5' - baggins 5028 1 63.37 CTGGAACTTTTCTCGGCACGTACGTCACGACGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 - chr3L 20669133 5' + Transpac 4961 2 67.68 CATTTCACAAATTTATCTTACTAAAAAAGAGTTTAAGAACCATGTCAATTTACACTCAGAAAAGCGCTTAGGGCAACTAAAAACAAATTTAAAAAAAAAAC:1 + chr3R 25810941 5' + gypsy2 424 1 42.57 AANGGTTTTTTCCGCAGCCAACAGCCATGAAACAGAATCGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chrX 6731799 5' - hobo 2904 1 61.00 ATCAAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3L 22751985 5' - roo 9036 1 69.31 CCATTTCTCAGTTTTGTTGCGAAAGTAAAGTGGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chrX 17729046 5' - hobo 2899 1 69.31 ACACTCGCACACAGTTGCAGGCCAATTTAGGCTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 21206737 5' - P-element 2844 1 25.74 ACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:2 + chr3R 13225498 5' + hobo 32 1 56.44 TCGCGAGATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr3R 17243219 5' - hopper 1404 2 63.37 AGNTGTTGATGGTGATGTAGTTTTAGTAGTTGTTGTTTGCTCTGTAGAAGTTGTTGTTCCTTCCGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGT:1 - chrX 12968773 5' - I-element 111 1 69.31 AAGCTGGGTCTACGCTTTAATAACTTTCAGATACTTTTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATA:1 + chrX 7583048 5' - I-element 498 1 78.22 GACTATCACATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAAGGAAAGAACGAGAAATTTCAACATATATGGTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 - chrX 14260353 5' - INE-1 18 1 58.95 AANTTCGAATTTAATGATGAAGATGACGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATGTAAAT:1 - chr2R 9868957 5' + roo 8712 2 71.29 GTCTGGTAGATCCAGTATAGCCCGTCTGAGTTTCTGATTTGCAATCGCAACTCATTTTGTGGATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr3L 4091660 5' + flea 10 2 69.31 ATNTCCCAAATAGTGATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 - chr3L 11891382 5' + Tabor 6875 2 57.43 ATATGTATGCAAAACGAATATATTACATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCAAGC:1 + chrX 22560079 5' + invader1 37 2 79.21 AGATTGCTTGAAATGATCTAATTTATTTATTTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chr2L 8649200 5' + F-element 33 1 52.48 TANGCGACAGCTTTTCCGATTGTGCCTGGTACGTGGCCATATCAGTGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 20584363 5' - 1360 3362 1 55.45 CCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chrX 20331826 5' - mdg1 376 2 71.29 TANTACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1 - chr3L 23155721 5' + gypsy 7032 2 67.33 ACCGCCGTTGGCATTGGCAGGAGCCAAGCAATCAGCACACGCAGCACCGCAGACAAACACCTCAGCCACTTTAACGCCCTACAACCGCCCAAAACA:1 + chr2R 10926949 5' + INE-1 346 1 71.88 ACTTTTATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr3R 22494205 5' + 297 6585 2 74.26 ACATACACGTGTACATGCATAGCAAGAGAGGCGGGGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr2R 18356201 5' + P-element 22 1 45.12 CTTTTGGCTCTACAAAAACACGATCTTTCACTCTCTCTCGTACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr2R 21497543 5' - P-element 2860 1 48.91 TCTTCTTATAGAGTATCACAGCTTCGGCAGTTATCGTTTCCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 4022291 5' + roo 35 2 62.38 ATTGAATTGAATAAATTAAAGTCGGCAACGAGCGCGTTCTCACTCCCAAAATTCCTTTTTCGACGCACTATCTCCTTCCACGCGCGATCTTGCGGTCTC:1 - chr3L 26031148 5' - gypsy8 384 1 53.54 AAAAACTGAATTACAAAACGAAAACAAAATCGCGGCTAACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chrX 4022388 5' - roo 408 1 78.22 GTTTCATTTGCATTTCTCATCGGTTTGTTGAACGCATTCATACTATTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 9179608 5' + hopper 148 103 44.87 TAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 14688316 5' + pogo 33 1 61.39 AAACTAATTTAAAAACAAAAGAAATTAGACAAGCAAACACACACTTTGCAAAGTGTATTTATAGACCACAAATAATAAAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAA:1 - chr3R 16291052 5' - S-element 316 1 75.25 CGATGGCGCCTGCTGAAAGCTTTTCAAGCTGCGCTGTGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGCCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGAC:1 + chr2L 5082749 5' - F-element 464 1 63.37 GTTATCCTGTCCCGCGTCGATGTGGGAACTGTGAACAATAGACCTAAAAATATTAAAATACCGCAGGCCTTCACTGCGGGAAATGTCGCAAGACAATTTGA:1 - chr2R 4833367 5' + baggins 447 1 79.21 GAAGTATACAATACATGAGCCATTGAGAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr4 1269592 5' + Transpac 51 2 72.28 AAGAGTGAGAGAGGAGAGAAAGCAGAGGAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATAAAAACAACTCCTACCTCTCATTTACCCACATATCAA:1 - chrX 13840160 5' + Porto1 280 1 72.00 CCTCTAACATGCACTCGCCACCGCCCAGGGATCTGATGCTGCAGCAGCATCCCCACCTGGCCCATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTG:1 + chr3R 10398374 5' - R1A1-element 5160 1 69.31 AAAAACCTGTCGCAGTCCCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGGATCTAT:1 - chr3R 16687334 5' - baggins 5405 1 53.47 TATACACAGCGTTCCGTTCCGCGATGCAACAGCCACATAACAGACCGTTCTGGGCCACCCAAAATCAGGCATCCCAGAAGATGGGACATTGGGTCCTCCGA:1 - chrX 8177864 5' - flea 4640 1 69.31 ATCGGACGCTCGGCGATTCTGCGGAACATCTCCAGGCAACGGTCCAGCAAAACCTCATTCGTCTCATACATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAAC:1 - chr3R 4483037 5' + 17.6 7390 2 74.26 TTCTCGAATCAGCGGAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chr3R 20984306 5' - hopper 1406 2 55.00 TCATCTGCATGTGGAACAAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 19959901 5' + roo 8678 2 66.34 AAAATGCGTGCGTTGAAATTGATAAAAGCAAGCGAAAATTAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTTAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGC:1 + chrX 5254284 5' + Porto1 339 1 60.40 GTGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr2R 18723032 5' + opus 138 4 56.44 GCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTG:1 - chr2R 544896 5' - HMS-Beagle 7037 2 74.26 GGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chr3L 21144061 5' + jockey 4724 1 67.33 AAAAAGGAAAGAAGATAGTTTCGGAAAACGTGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 + chr3L 22775917 5' - flea 209 2 70.30 GTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTT:1 - chr2R 2879455 5' - Stalker 112 4 56.44 GACCAGAGCACCCAGCGTCGTTGTTTGTTTTTGCCACACACATTTTAACGGAGAGCCACCACGGCTAATTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chrX 4448632 5' + 412 6 2 74.26 GCAATAGTTTTGATATCAGCTTTTGTGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr3R 4679273 5' + copia 40 2 73.33 AATAAAAACTAATTTAATATGAAAGAAGCCATTGTGAGTGTCGCAAGTATTTTTTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAAC:1 + chrX 22781996 5' - I-element 5335 1 50.00 TGGAATACGCTGTTATAAGCAGTTTGTAGACATGACAGTGGGCATGGTAAAATATTTTTGTTTATAAGAATGTTAAATAACAGAAGGAATTCCTAGAATGC:1 + chr2L 22642246 5' - invader4 2779 2 65.35 AATTTTCAAATGTTCTGCATTTTCGAGTTTATTACGGCTTCTAGCATTTCGTACTCTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCC:1 - chr2R 9213729 5' + Burdock 3 2 76.14 ATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 22751975 5' - roo 9028 1 78.79 CATCACCGACTATGAGGTCTATACCCTTTCCTCGCCGGCAGGAAGTAGTAATAGTGGAGCAAGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCAC:1 - chr2L 7883663 5' - R1A1-element 5066 1 65.96 CAAAGTGAACATCCTTTTTTAGAATTCTTTCATTGCTTTCGGCGAAGGTAGGCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATA:1 + chr2R 25118847 5' - hobo 2661 1 53.47 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATAAATAAAAACTCCAAATGAATCCGCTTTGCGTTTTTGTTGATTGAATATCAGCTTAAG:1 - chr3L 14971177 5' - Tom1 287 1 63.37 TATATCATTTGGTGTGTGGTCTGTACAGCTATCGTTTTGTGGACCGCTTACAGATATATTCTTTGTTCGTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:1 - chr2R 6670122 5' - Tabor 482 2 75.25 ACGCCGTGCCATTTGAGTGCGATAAGTTAAGTTAAACCAAACTTTATACGAATTTCGGACAAGTTCAGCGGCATTTTAATATTTTTAGGTCTATTGTTCAC:1 - chrX 3892244 5' - baggins 398 1 74.26 GTAATCTCATATTTTCCTTAAATGTTTTTAAAACGAGATTGTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr3R 29923618 5' + blood 7047 2 58.42 GGAATAAACGCCGTATTCTACGGGGATAAGTTGGGGGAGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGG:1 + chr2L 7850631 5' + accord 40 2 68.32 ATGTGCACGTTGCTCATTTTGAAGTGTCAAACTTCTAACCATGCACCCATTTTTTCTGTCTGTGTAAAGTTATGTGTGCGTATTGGGTTGACACGACAAAA:1 + chr3R 11555787 5' - Q-element 689 2 81.19 GTAACGTTATTATTATTCTAACGTTAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1 - chrX 7583248 5' - I-element 5308 1 70.30 AATTTTGAGGTTATTGTGGCGTGATAACGGCAATTTTTGTACTTGCTCTTGTTTCTCCAGCATTCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chr2R 13304417 5' + hobo 5 1 72.63 TGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGTCGAGTTCGCCGACTATCA:1 + chr3R 18346623 5' - INE-1 563 1 50.50 CAACCCTGGCCCGAGCATAATTGATAACAACTTGTGTGCTCATGTGGCTGTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 4805048 5' - 1360 3362 1 54.46 TGGGGAAATGGCCTCGGTTGCCCAGCGAAGACGCATCGTAAATCATCAATGTGAAACTTGTGCTGGCAGCACTTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCT:1 + chr3R 22643634 5' - R1A1-element 397 1 75.25 GACTTGAGCGACTTTTGCCAACATCAGAATCAGATCTGTTATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chr3R 6003013 5' - opus 7469 2 61.39 GAAAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCC:1 - chr3L 18476543 5' + accord 21 2 55.00 CCTCTTTCGTCCCTCTCCCCAGCGAGTGCGGGCCACCCACACAACGCATAAAGCGTAAATGACGATTATGTACCGTTTGATTATCGAAATTCCTCGGAATA:1 - chr3L 17148964 5' - S2 261 1 68.32 TGCACTATGTTTCAGTTCCATGAGTAGGTTATAGTTTGGTATTTGATTTACGGCGTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTG:1 + chr2R 12088570 5' + opus 7115 2 60.82 ACCACGATCCTTTCACCTGGTTGCGGGTTACCCCTACAAATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr2L 19602847 5' + hobo 21 1 50.00 CAAATGATAATTCAAAAATAAGCCTTAACTTTTCATTTAATTCAAATGATATAGGCTAATCGAAGGGTCAAAATAACACATAATGTTCACACATGAACACG:2 + chr3L 20986983 5' + roo 8661 1 76.24 GTAGATCAGCAACTGATAAAAGCATTTTATGTTAGTTTAATCTTGGAAGATGTTCTTGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCG:1 - chr3L 24513029 5' - Quasimodo 7001 2 65.35 AATAGCGAATAGCAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 11914092 5' - hopper 145 103 78.05 GANATTAAGCTATAAAGTTTATTTATTCTTAATTCCCCTAACAGGACGCCGGGGTAACAGTTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAAC:1 - chr2L 22940504 5' - F-element 4282 1 68.32 AAGAACAAAGGGGTATTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:2 - chrX 8302836 5' + 297 6625 2 83.17 CANATGTATATACATGGATTCAACGGTATATACATATATGTGGGTGTGTGTGCATTGGTGTATTGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAA:1 + chrX 13869233 5' + copia 5064 2 62.38 ACCACTGGTCCTGAATATCCTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGG:1 - chr2R 2879462 5' - Stalker 121 4 52.53 TAGTGGGATGGTCTGTTTTGGTTGGTGTGTATGTCTGGTGTTTTCATTCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCA:1 - chr2R 9526889 5' - Doc 4456 1 57.43 CCCCCCACCACTACTATTTCGAACTGTTTGTCATTGTTGTTGCCCATGTTTTGGTGCGGCAAGGGTAATAAACTTATGGACAAGTCCAGAATACTGGCACA:1 - chrX 10677810 5' + X-element 87 1 66.34 ACGGATGGCAGGCGCACATTTGCCAGCTTAATTTTTTTTTTATTTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 + chr3R 23561973 5' - I-element 5319 1 62.38 AANATGAAAGAAAGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 12398116 5' - roo 9054 2 60.40 CCTATTTATGGCAGAGGTCAAGCAACTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 26592636 5' + roo 8715 2 79.21 AGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGT:1 - chr3L 23583082 5' - rooA 7574 2 91.01 TGTAATTAGCACACTCTCACACCACACTAGCACACTCATCGCCTAACTCGAGATGACGCGATGAAATTTTTGACTGAAGCAAAAAAAAAAAGAAAAAAACA:1 - chr2R 13316985 5' + G2 3077 8 70.30 GTTTGGGGTTCGCCTGCGGGTTTTGCGGTTGTTAAGCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 - chr2L 6184244 5' - roo 9031 1 66.34 ACNTTTGGATGCATGCTAGCCGGTCTGGGTGTACGAAGGACACGTCTATGAATTTGCTTTTCACCCGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATC:1 + chr2R 22456162 5' - diver 213 1 64.36 GAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2R 18344569 5' - 1360 3342 1 71.29 AATCATTTTTGCCTTCATAAGCCAAAGTATGGAGAATTTCGAATACCAAATATCCGAGAATAATAATTGTTTTTGAAATGTAGTGGGCGGAAAGATTCCCT:1 + chr3L 6013633 5' - 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chr2L 21307548 5' + gypsy3 181 2 72.28 TCCGGAAATTATGCAAAAAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 3547531 5' - roo 352 2 83.17 CTNATAAGAAACTAAAGCGGACCACCTAAATAGTTGGTGACAAGAATGGTTAGTTCGAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATGTTAAGAACAATTAAA:1 + chr2R 18434445 5' + 412 7069 2 62.00 TAAATCACAGATACCGTGTTAGCTAAGTTGTTCGAAATAATTTATTCCAAACAATAAACCACTTTATGGGCTATCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:2 - chr3R 25634987 5' - P-element 2883 2 75.25 GCGAACACTCGTGACTTGAGCGACTTTTGCCAACATCAGAATCAGATCTGTTATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr3R 6003025 5' - opus 478 2 59.41 TTTACAATATTATTAATATCCATCTAGACAAATATTAAACTGTTTGAAAGCGCGTAAAACCTGTATTTAACTATTTTATTTTATTTGTTATTATGTTTTTT:1 - chrX 21309051 5' + S2 108 1 47.52 CGCAGTGCTTATTCAATAATTTATTGCTGGCAGCCGGGTTAAATCAGCCATGAAATGCCATCTACACTATGGCAAGCCATAAAAATAATTCAACAAAGGG:1 + chr2R 14628767 5' - Tc1 1386 1 72.00 ATTGCCACCAACTTCTAATTACGAATGCAAAATAATTGGTCTGAACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2R 20804678 5' + hobo 32 1 55.56 GAGGGAGTGGAACAGTGCGCTGGGAGGAAATTGGCGCTGTGGAACTCAAGACGGAGCTTTGAGCACCGAGGGAATCTCAGGAGGCCCACCGAGCCTATTTT:1 - 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Stalker2 385 2 56.44 CGTTTGTCGTTGGGATTTGGTCTATTGGGAGAGAGCGGGTCAATAAACATTCGGATTCGGTTGCATACTCGAATAATTTTTCTTGCCAGAGGATTTTGATG:1 - chr3R 13578161 5' - Doc3-element 4525 1 63.37 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAACAGCCGTGTTTTTCCTGTCGATTTATCGAAGTCCAACAGCCCGCCTTCGCTCCGAACACAAATCGACAAGTCAGTAG:1 - chr4 1294995 5' + TART-C 114 2 76.24 TTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 + chr2L 8649230 5' + F-element 63 1 76.24 GAACTTAATTTGTTTTGGGAGAGAGAAAATAGAAGTAAGAGAATTGTAAGATTAGAATTGCAAAATTAGTTCGTTACAAGATGGCCAACAGAGTGGGTGCC:1 - chr2R 1092139 5' + Rt1b 4802 1 68.32 CCNGGATTCGTTTCTATTTTCGGAGTCAGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAT:1 - chr3L 19275724 5' + mdg1 7088 2 73.27 TATGTAGCATTTATACATTTATTCTTCATCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3R 4971152 5' - 1360 3368 1 58.00 AAGAAGGAAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 + chrX 9579311 5' + Tirant 24 2 57.43 TACTGAGCGCGGTGCGATCAGGATGCCATTCAAGGATTCAAGAAACAGAACAAAACAGAAGCCCACATCTAACAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTA:1 + chrX 5692567 5' + Porto1 306 1 75.25 AATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTG:1 + chr2L 260983 5' + Juan 4056 1 53.47 AGAAACTGATCGAGATACTGAAAACCAGCTACCGATAAGATATGGAAAGGCAAGGGTCAACAAATTACTAATATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAA:1 + chr3L 10365941 5' + I-element 5063 1 53.00 TAAACGTTGCATAGTTCGACAAACGAAGAAGTGTCAATTGGCGGGACAGGCAGCCGAAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGGAGATAACAAAA:1 + chr2R 7367764 5' - 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I-element 201 1 59.41 TTNTGACTTGAAAGCATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAAATTGGTTTGTAGAGAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1 - chrX 21452834 5' - INE-1 557 1 50.50 AGGCGACTCCTCGCTTTTGTAAATCACACATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCA:1 - chr2L 17599416 5' - micropia 5043 1 76.24 TGNTGGTTTCGGTTACATTTTTGAACCAGAAAAGTTCTTAACTTTTACAGGACGCGCTAATACTCTCCGGGACGACAGATATGTCAGGTTGATCTTCATGT:1 + chr2L 17117981 5' - Bica 145 1 73.27 GTATGCCACAACTAGTTTTCTACACGTCGGGGAAAATTAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 - chr3L 7629634 5' + opus 7149 4 63.37 CATCATCAGCATGCGACTGCTGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 17729085 5' + hobo 51 1 72.28 CTTTCTCTCTGCCTCTCAATCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATACAGTAACCAAATTGTCTCCAAATA:1 + chrX 22564599 5' + Transib5 62 1 71.29 TANAAATTGGCTTGAAGCAATAAAGCCTTTATTTTGTTTTGCTAAATCATTGTCTTAAATACTTTTGCCACGGCCCAAATCGTTGCCTGTCTAGCTTTC:1 - chr3R 3579759 5' - Tc1-2 176 1 63.64 GGGGGATCGTGATCCACCACCATCCACACGTGTAAGAGTACGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGAAAGC:1 + chr2R 21497485 5' + P-element 15 1 55.00 TCAATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3R 9322867 5' - 412 7496 2 72.28 TATGTGTTATCAACATGGAGCGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 + chr2L 6157199 5' + jockey 4723 1 76.24 AATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATA:1 - chr3L 24208222 5' + Quasimodo 2 2 74.26 AATCTGGATTTGACTGCAGATTCGCTAGGCGAAGTGCATGTTGTTGTTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3R 29357139 5' - 412 7539 2 69.31 AGACCCCCATCCAATCCACCATCTGGATATCCATCCGCGCTGTTCAGAGGACCAGAAACAAATATAAACAAAGTGAGGAAATGTTAAATTGTTGCAATTTT:1 + chrX 16234650 5' - Transib5 2611 1 56.44 CATCCTGAAAAGAAGAAATCTTCTAAGATAAGTTCCCACGCTCAATGCTCGGACCCGAAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATA:1 - chr3L 2054017 5' + Idefix 7112 2 69.31 CTCATGTCGTTCAGTCCAGCTTCTTCATCGATTTGGCGGTGAATCGCCACGCGTTTCTGGGGAAATGGCCTGCAGACGCACTATTAGTTCCGCTTTTGTGC:1 - chr3L 13040400 5' - invader3 403 1 70.30 TGCGTGATTGTTATTTTTCTACGTACATAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATT:1 - chr3R 23846877 5' - Bari1 1661 1 76.24 AAGCAGAGCAGGTATTACCAAACCAAAGGCCAGCAAACACGCGCCCAGCACACGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGG:1 + chr2L 6821542 5' + Ivk 5078 1 63.83 TGGGGGATAAGCTCGTGGCCTTGGCAAATCAAGAAATTTCAATTCAATAAAAGTTAATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTC:1 + chrX 1584011 5' - HMS-Beagle 6713 1 44.55 TTCGCCCAGCAGGTGATGGCAAATTTCAAGCATTTTAAGCCGCCCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACA:1 + chr3R 28372105 5' + Stalker4 7110 6 57.43 TTAGGTATATTAATTAAGTACACCATCAACCAATCGATAAAAGAAGCTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:2 - chr3R 4600499 5' - Tabor 455 2 58.42 GTTGTGGCAACTGACTGCAAACGATGAACTCGTAAGGGGGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTG:1 + chr2L 1416250 5' - hopper 458 1 76.24 GTTACCGAAGAATAGACATTTCAAATGTACCTCAGACTGTTCCACGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chrX 364837 5' - hopper 1388 1 54.08 GAACTTTAATTATTCTGCGTGCACAGTTGCTTGTTGCCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 19947359 5' + roo 8703 2 63.37 AAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACG:1 - chrX 4175119 5' + I-element 355 1 79.21 AGNAATTGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - chr3R 24430602 5' - Transpac 289 2 58.42 TAGTTTCGATAAAAGACAGTTATGGTATGCTGAGTTCGTGTTTTTGTATTATTACAGTTTGTCACTGTACACACTGTGAAATAATTGGAATTTTTGACTTT:1 + chr3L 27262314 5' + S-element 33 2 55.45 CTGTCTTTATCACAATTTTCTTCAAGACTGCAACGCTTTATTCTCTGAGTAGATCGAGGTAAACTTATATGTCATATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTA:1 + chr3R 22224169 5' - FB 246 1 67.33 TGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2L 20266006 5' - roo 357 2 77.23 TCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr2L 21951157 5' - opus 485 2 66.34 TCAGCACAAGTTGACGTAACAACAATGTCGTCAAATCGCTCCGAGATTTTTGAGAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGGT:1 + chr3L 25331892 5' - 1360 230 1 53.47 GTTGGGTTCGGCTCTGCTGTGTGCACTGTGAAAAAACTCTACATTCAATTAAAATACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGC:1 - chr3R 12728115 5' + accord 209 2 57.43 GGACACAGTTCGAAAGTGTTCTGCGCATTACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr2R 5202355 5' - roo 363 1 66.34 CTGAAAGTAAAAGTAAAGTGGGCAACTTGCGCAAATATTTCATTTTCTTAATTATAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 + chr2L 9488125 5' - 297 6964 2 64.00 AAGGTATTTATGACCATCAGGAGGATCACCACGAACTCAGACAGAATCGCAGTCCAATGATTTTCCTACTTTGCGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATA:1 + chr2L 13758628 5' + invader2 5090 2 75.00 AACGGCGACGATGTTGCCAACGTCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAG:1 - chr3R 19687190 5' + F-element 143 1 80.20 CTTGGCGATATATTTGCAGTATAATTTTTAGTCATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 + chr3L 13878059 5' + flea 40 2 68.00 AGGAAGTTTAAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 + chr2R 544793 5' + HMS-Beagle 6822 2 53.47 CTTCTGCGGCTGAAATGTTTCTGTCACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chrX 3547503 5' + roo 49 2 79.21 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 18 1 71.00 AANATCGGAGGAATAGCAGGGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAG:1 - chrX 19810581 5' + INE-1 566 1 59.41 CATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTT:1 - chr2L 23373500 5' - Tc1-2 1580 1 67.33 AAATAACTTTATTTTAAGTTAAGTTAGGTAACTGTTGATTAGTCCATAGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 18754451 5' + roo 26 2 55.00 CTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 19450186 5' + roo 8719 2 49.50 TCATTAAAGGGTATTTCTGATTCGCCGTCCCTGCGAGATTCTGACTCTCTGCTGTGCGACAATATTTGGTTCGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chrX 17699140 5' + P-element 4 2 75.25 GGTGAATAAATATTTTGAAATATATACTAGACTAAATTGAATATATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 20309327 5' - roo 9041 1 59.41 TATGATATCTATATTCTATCTATAATCTGATCCTCACCCTTACTTATGCACTATATGCACAAACCCTTACACACACTACAAATTAATAATAGAAAAAAAAA:1 + chr3R 2646908 5' + BS 5094 1 75.25 TCATGAAAGTATCGATTTAAGCTTATGTAAATTCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 + chr3L 11891327 5' - Tabor 443 2 63.37 TCGTAAAAAAGGGCAAAAAACATTAATACCATTTGATAAAAACATACAACTTTAACCTTGGTGCTTCATTGTCCCATACAAAAGTAATATTCCACAG:1 - chr2R 23198925 5' - transib4 406 1 54.64 TCGTCTAAACACTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chr3L 11920049 5' + Tabor 6879 2 67.33 CCTTTTTTTGTTTATTTTCATAACTATGCAAAACAGAAATAACACGCTGGCCAAAAGCGAAATATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr3L 12160240 5' - pogo 2093 1 71.29 AGAGCGTGTTGTCGTGTTTATAGGTGAATAAATATTTTGAAATATATACTAGACTAAATTGAATATATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTC:1 + chr2R 20309305 5' - roo 400 1 72.28 TCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAG:1 + chr3L 24213786 5' - invader2 5073 2 61.05 GGGAGAAAGAGAGAGAGAGACTCCCACACACACGCACACACCACACACAGACACTACACCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGT:1 + chr3L 7935680 5' + Idefix 109 2 55.10 GTGCGCATACATTTGTCCGAGTTTCAAAAATATCGCTTTATCTGTGACAAATGTCAGATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 + chr2L 10904466 5' + GATE 8266 2 57.43 AAACAATGGCTGACAGGATACACGAGCAGGTCCTTCCTGTGCTGACTTCTCGCCGCATCGAAGCGTTAAATGGTTAACTCAATCCAGATAACATACAAAAA:1 + chr3R 26786977 5' + I-element 5129 1 69.31 ATCAAAATTATTGCGTTGCATTTGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 + chr3L 10382677 5' - I-element 5306 1 73.27 CTTGGCCACTCGGTCATACATGTGTACATATTCACACATATGCATACATATACAAGCCATACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGG:1 + chr2L 20255130 5' + accord 203 2 77.17 CATTCCCCATCTCGTTTGTTAGCTTTGGTCGACGTCAATTTATCGATTGCAAGCAGTTAATAAAAATTATTCAGCAATAAAAGCGAAAAAAAAAATAAAAA:1 + chrX 5129698 5' + gypsy4 497 1 55.45 TTCTTCTCAGTGCATTCCCTTTTCTCTTACCCACTCACTTTGGCCTTTTATCTTCTGACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCT:1 + chr3R 15984672 5' - micropia 5189 1 60.40 TACCCAAATAGCTACTATATCTCTCCATCTTGTTCCGGCAAGAACTATTTGAGCTGACCACCCATTCAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGC:1 - chr2L 9803964 5' + Doc 4510 1 64.36 GAACATTTGCGGCCTTAGATTGGAAAATGTCTAATACTATTTACAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACT:1 - chrX 8150490 5' - rover 7270 2 55.45 CCATTTCACCGAAGACGGCGACCAATGGGCGCGTGACCATCGATCCCAAGTGCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACC:1 + chr3L 15549573 5' + Doc 358 1 59.41 TTNCGATCCGTTGCTCGTTTTGCTTATCATTAGAGGGGACAGTTATAAGTAGATTTTAGAGTAATATGTAAGTTGATTTGCATTAGACAGGCGTTGGCGTG:1 - chrX 5587497 5' - TART-C 10704 1 81.19 TAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 4806727 5' + roo 48 2 80.20 TTTATCAGCGGCGTCATGTCAATGTTATTCTTGGTCCTTGCTCGCGTCCTTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGT:1 + chr3L 9990762 5' - Porto1 263 1 65.35 TCTAAAGTATCTGAAGTTCATGATCTATTAATAAGGTTTTCGGAATTGGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr3L 15681528 5' + pogo 18 1 58.51 ATTGTATCTTTACAATTGTTCCATACATTATGATAAGATTCTTTTGAGAATGGTGTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr2R 7454165 5' - 1360 3368 1 59.41 AACAACCAGCGAAGGAAGTCGGAAAAAGAGCAGTGAAAAACGCCGAGGGAGGGTGCAAAGCGGATCCGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3L 7968650 5' + hobo 9 1 64.36 CACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 22046505 5' - roo 385 2 58.42 CTTGGCAGCCAAGTATGTAACCGAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGGTGTTAATTGCCCCTTTTTTGT:1 - chr3L 16446207 5' + hobo 371 1 75.25 GTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 + chr3R 19450199 5' + roo 91 2 71.29 CANCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 - chr4 311582 5' + 1360 1 2 65.15 CAGCGGCGGAACGAACGGCGGTCAGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCAC:1 - chr3R 6841998 5' - jockey 154 1 76.24 GAACGGTTTGTCCGTCGAGTGCCGTTTCATGTGCCGCTCCAGGCTCGGATTGTTCTGGAAGCGCTGTATGCGGTTGCGGTTTGAGACGCTGGCA:1 + chr2L 11802525 5' - G-element 3940 1 56.38 CAATAAAGTGTAATTCGTGCGCCACTTTCATGTGCATTCATTTGTCGCACCCCAAAACCACCCACTCACCCAAAAACACCGCATGAACGCACACACACACA:1 + chr3L 4633648 5' + accord 178 2 50.50 TGTTTAGGAGCTTCACTCATTTAATGCCAAAAAGATCTATGAAAATTCTCTGTTTACTATACAGAAGCACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 - chrX 8422151 5' + jockey 4769 1 69.31 GGGCAGACAAATGAACTTAGTTTTGGGTCGAGTGGGAATGGAAACGGAAATGGCAATGTTTGGGATGGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTT:1 + chrX 8348006 5' - accord 253 2 72.28 ATACAAATACAAATCCAAGGATTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:2 + chr3R 19560903 5' + hobo 53 1 75.25 CCCATTTCTACATGCTAAGAGCACTGCGAGAGAGGAAGAGAATGTGAGTTGCAGGCCAATTTTGGTTTAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 21206655 5' + P-element 8 2 51.49 ATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:2 - 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chr3L 19861711 5' - 1360 3369 1 57.43 AGTAGCAAATACAAATACTAACGAAAAATAGAGAAAGCTGGCGATGGGTGAAATGGGGTGGGGGAAGGTTTAAATTAGGGAACGGATGTTTAGTCTACCAG:1 + chr3R 6637506 5' - Idefix 6997 1 69.31 TACGACCATTAGTTTGGGCTCCTCCTCTTTGTTGGTTACCGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAGATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3L 19861698 5' - 1360 3356 1 58.42 CACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCAGCTCTCTTCACTCAAAAACAACGCGTATT:1 + chr3L 16995274 5' + Doc4-element 55 1 80.00 AACAATGAAAATCACATATTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTTGGATTTAAAAGGAATCGTT:1 + chr2R 9499980 5' - G5 4810 1 56.44 TATCATTTTATGTTGATAGTTGTTTAGCCAACGAGCTTTTTCAATGGCAATTGAATAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr2R 4559150 5' - pogo 2088 1 66.34 TCATCCATTACGTCTCTATAATTTATTTGCGTCATGGGGATTGCGTCATATATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGATGACGATGATCACGTGAGC:1 + chr2R 4635200 5' - Rt1a 4713 1 50.50 AGCAGACAAATCTCTTGGATTTTCTATTCAATGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGAC:1 - 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roo 9039 1 58.42 GTGTGTTGGTAACATTCAGTCCAGAGTCCAGAGTCGTTCGTCCATTTTGTGGGTCAAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr3R 24739100 5' - pogo 2087 1 63.37 GAACTATATTACTGAAATATATATGATGTTGTATTAAATTCTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr2L 21612901 5' + 297 6610 2 68.32 ACNTTTGAGACAATTTCCGTAAGGCATTTGAGCAAGAGTTAAATTTAATTTGTACAGTTTCCACCTAGGAAGTGGAAGCTCCCCGACTATCAGATACCCCT:1 + chrX 20464257 5' - INE-1 554 1 71.29 CAAGCAAGTTCCGTTAAGATTTCCAAGTACGCACTGACTTTCAACTTTCAACCAACCCCCACCACGCAGCACCCAGCACCCCAACATTTTGGTCCTTCGA:1 - chrX 10826036 5' + GATE 265 1 77.00 GTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTG:2 - chr2R 2949117 5' + 17.6 6954 1 55.45 ATATGTATGTTTAGGAGCTTCACTCATTTAATGCCAAAAAGATCTATGAAAATTCTCTGTTTACTATACAGAAGCACCACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chrX 8422158 5' + jockey 4762 1 76.24 TCGACTTTATTTCCATTCATGAAAGTATCGATTTAAGCTTATGTAAATTCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:1 + chr3L 11891311 5' - 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chr3R 27900473 5' - roo 9036 1 62.38 ATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTG:1 + chr3L 23456279 5' - gtwin 436 2 60.40 AACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 - chr2R 18344619 5' + 1360 34 1 59.41 CAAATCGAGGGTTTTCAAACATATATTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACAT:1 - chrX 1600218 5' - BS 5039 1 76.24 TATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTC:1 + chr3R 25277628 5' + 3S18 40 2 60.40 ACTGGATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCACATAG:1 - chr3L 5067859 5' + Quasimodo 47 2 72.28 CTGCTTTTCATTTCGAACTTTTATCTAACAACAAAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr2L 10712126 5' + I-element 32 1 60.44 AATGCGCATATGCATACAAGGGTATGCCTTACATTGTATATGGGGGAAACTGAAGAGTCGATTTAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATGAGA:1 + chr2L 16147849 5' - roo 411 1 64.36 GATTACAAAAACATAGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTG:1 + chr2R 2949023 5' - 17.6 479 2 68.32 GGGTACTATTTGCATAGTTAAGATGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAAC:1 - chrX 22782083 5' + I-element 4878 1 56.44 CCGATGAAAAATGTTCAACGTTTCATGAATGGCGACAACCAATAAAATGGGGGCAAATAACCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 29423589 5' + roo 8678 2 61.39 CAGTCGCCACAACAACTAAACATAGACATCCATACAGCCTCATAAATTGGAAACATACTTCAAAGCGAACGGTCGTTTTTTTTGCGCCCCGATTTTTATTT:1 + chr3L 24293664 5' + Cr1a 29 1 67.33 CCAATCATTTTTGCCTTCATAAGCCAAAGTATGGAGAATTTCGAATACCAAATATCCGAGAATAATAATTGTTTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCC:2 + chr3L 6013631 5' - Max-element 8531 2 72.28 GGGGCTGTGGTAGAACCCCCACTGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGCTTAGACCT:1 - chrX 1409629 5' - F-element 4489 1 76.00 AAACAAAACATTTTTTAATAATATAATTAGCTTTCAAAGCAAACGGTCGTATTTTTTTTGCGCTCCGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTAGT:1 - chr2R 18665720 5' + Cr1a 53 1 67.33 GCGTGTAAGTGGCAATTAAGGGAGCAAAAGAAACCGAGACCCAAAAAAAAAAGTGAGAGTGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAA:1 - 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G7 89 1 58.42 ACNGAATAAGCAGAATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 9437182 5' + roo 16 2 62.38 AAGGAAAAAGGTCTTTCAAAAATAAGAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAG:1 + chrX 3547985 5' + Doc 4512 1 73.20 GTAGAGAAAATGTTACTTACCTTACTTACTTTGCAATCATAAATATTTAATCATGAAAAGAGTTGGAATGTTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chrX 10453476 5' - hobo 2936 1 74.26 AGTGGGGTGGGGTATGAAGGGGTTAGTGAAGTGCCATGAAGTACGTCGCATGTGCAACAATTAGCGGCGTTTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr2L 21323222 5' - hobo 2938 1 74.49 CTTATATAAATATGATTGTATGATTGTAAAATAACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chrX 6883316 5' + Burdock 38 2 68.69 GCATACGCCCCGTTGCCCCACCATCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCA:1 + chr3L 16974094 5' - F-element 4357 1 77.23 TTTGGCACGAAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACACATATACA:1 + chr3L 9183574 5' + accord 7032 2 77.27 TTTGCAAAGTGTCTGGTATATCGTACGAAAATTGACTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2L 18177915 5' + 412 39 2 63.37 ACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAG:1 - chr2R 9500079 5' + G5 4695 1 60.40 GAAAGAAAACTTCATTTCAGTGAGTCAGGCCAAAGACAGTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGT:1 + chr2R 4262576 5' - 1360 3339 1 71.29 CCCCCTCTCCATTTGCACCAGATCAGAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 - chrX 19109336 5' - roo 9053 2 59.41 GTTAAATGCCCCATTTTTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chr2R 18337532 5' + hopper 141 1 78.12 GTGCGTATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1 - chr3R 10030769 5' + BS 5042 1 57.43 ATACAAAGACAGATACGCAATACGGCGTATCTATCGATATTCCAGAAAAACGATAAAACATCGAGTTCGAATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTG:1 - chr2L 22699579 5' + INE-1 543 1 73.74 AAGAAAATTTTGAAATTTTTTTTTGAAATTTTATTATGTGGCAAAAAGATTGTTGAGCTTTCTCGTTCTCACTTCAACTAGCTGAGTAACGGGTATGTG:1 + chr2L 3994140 5' + INE-1 543 1 79.80 AATGCGCAACAGATTCCATTAATCAAGTTTGTACTGGCCGGGTAAGTATTTATTGTGGTTTCATGTATAGAGAGCAAATGGTTCTTGATAACGTGATACTA:1 - chr4 218267 5' + Tc1-2 301 1 77.23 ATGCACAGTTGTGCCAGCCAGATTAATAATAATCACTCCTACATGTATTTATACTCGTTAATTGCATAGTAAAGGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chr4 362092 5' + INE-1 10 1 58.42 GTCGTTGTCCTAACCCTTCTTCATGGTGGCCAGTATCAACCCCTCGATGAATTGCGTTGGACCATCCAACTTCTCCGCTCGTTGTCCTGCATCCTTCTGGT:1 - chr2L 21014852 5' - gypsy8 4543 1 67.33 TATATAAATATGATTGTATGATTGTAAAATAACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chrX 6883314 5' + Burdock 6178 2 71.29 CCTGTGCCCTGCCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:1 + chr3L 9909671 5' - Transpac 5223 2 73.27 TTTAAACTGGCTTTTGGTTGTTCGAATGCTATGGGACGGACTGTGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTG:1 - chr2R 22436748 5' - F-element 222 1 56.44 CATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr2L 13250362 5' + pogo 28 1 59.41 ATTTCGCGTGGCATTTTAGGTGAGGCAAAAAACCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 - chr3R 12554934 5' - mdg1 382 2 64.95 TAAGGTTTCCATAGTATATAATCGTTTGTGCGAATTGTGGGCGTGGGTCAACAAATACGGGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - 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mdg3 5051 2 66.25 CCNTCGTTTTTCACTTTTAATTATGCGAGCTAGATTTCAGTAAACAAGGAAGCGGATTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chr3R 22208625 5' - I-element 5338 1 61.39 TTATTGAAACTAGGTAAAGGTAGCAGAAAACGTTTAAGATATGATCAATATACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chr4 226246 5' - S-element 1708 2 52.69 TTTTAGCACCGAAAGTCGCTCTTTCGGCGCTTTTTCAACAACGGACCGCTGAAGAGAAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAA:1 - chr2L 9667526 5' + Bica 292 1 61.70 TCCAAAGTCAGTAGAAGTATGATGTAAACTCCGCCGGCAGACAATGTTCCTTGAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAA:1 + chrX 5041195 5' - Juan 443 1 55.67 TTTATCTTTTGACACAAAATACAAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAA:1 + chrX 19820074 5' + mdg1 53 2 78.00 CANAATGCCGCAAGGCCAAAGCCATCAAAAGAGCCATAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGGTGTTACAGCAAGTGAACATAAAAGATT:1 - chr2R 18946507 5' + I-element 458 1 67.33 ATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chrX 23211090 5' - HMS-Beagle 6998 2 76.24 TGATTGGAGTTGAACTTGCTCGACCGGATATTGCAGTATCAATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 - 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HeT-A 5652 1 70.30 AAGTAGTAAGGGATCTACCCTTCAAAGTCTTATATAACTATTGTATATTTTTTACAGCCGCAACAACAAGCAATTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTC:1 + chr3L 22548396 5' + Max-element 309 1 64.36 AAATAATAAATTTCTTAAAATAATTTCATCGCTGGATTCCTGCGCCACCACAAATTACTTTTAGAATACACTTAAAAACTGTACCCACTAATGCTAAAAAA:1 - chr3L 18377029 5' + TART-B 10165 1 81.19 TGCGTCATCCTGGCATGCCAGGTGAGCCCTAGTTGTGCTCCCCATTTCTTTTTTTCCTCGAACATTTTGGTATCTTTTTGGCCAATGTGTGCCTGTATTCC:1 - chr2L 10098291 5' + Bica 4853 1 78.22 AATCGGATTCGTCAATAGCTTTCCCAATTTGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTC:1 - chr2R 14886179 5' - P-element 141 1 36.63 ATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCC:1 - chr3R 1868224 5' + G-element 17 1 57.95 GAGTATGTATTGTGAAAATATAATTATGTAAAAATCATTGTAATATATTTTGTAATATTTTGTAATCCATAAATTGTTACAAATCATAAAAATAAAAAAAA:1 - chr2R 10927220 5' + Rt1b 5147 1 56.44 GTGCTTTTGGAGGCCACCAGAGTTTTGGGCTGGAGCCTGGTTTCGAGTTTTGGGGTCTTTGGCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1 - chr3R 26434771 5' + Tabor 6854 2 64.36 TATTCGTTTGTGTCTTGGCAACCTTGTGACGAAAGGTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTGTACTCGTTG:1 - chr3R 20419135 5' - roo 9059 1 65.35 ACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATC:1 - chr3L 22016845 5' - INE-1 148 1 54.46 CAAACGATAAAACCCATTTTTTAAGTGTGGGCAAACTTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAACTGGACGTGGGCAAAAGAAACT:1 - chr2R 5180267 5' - FB 94 1 64.36 TTAGGGGTTCCCAAAATTGTCAGCAGTCATGGTAACCGACAGAACAAAGATTAGAAATTAGGTTTCAGCGGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGG:1 - chr2R 1732719 5' - 17.6 7125 2 76.24 TATTATTGGTTAGCGAGGTGCGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATACTAGTGTTAGTAGGATC:1 - chr2L 5363600 5' - Cr1a 4294 1 80.20 AANTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACG:1 - chrX 4175130 5' + I-element 344 1 68.32 AAAAGGGCAAACCAGAGAATCCTGCACACCTCGATAACATTCAAAGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAG:1 + chrX 5052911 5' - blood 177 2 54.08 TCCGGAGTTGTCGGGTTGCGGATTTTCGGGTCTGGAATGGGTGGTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACA:1 - chr2R 12908261 5' - Doc 489 1 56.44 AAATTTATTTAACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr2R 9789018 5' + blood 7028 2 62.38 AGGGCACACACGCTTTAAGCGATCTGATGTTGCCATAGGAAAGGAAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 16662451 5' + jockey 33 1 50.53 AGAGGTAGAAAGAGCTTCCAGAAGTCAATAATAATAGAGTGACCGAACGGATATAAAAACCTGCGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAG:1 - chr3L 25256215 5' + Burdock 317 1 53.00 CCCTAGTTGCACATACATACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:2 - chr3R 17666048 5' + Transpac 4947 2 53.47 TATCCGAATTACCCTAAACAACCCAGACCTCACACACAGTCTGAAATACATTAACGTGGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3L 7061220 5' + I-element 19 1 57.43 TTAAGGCGGCTCGTGCTCGGGCCGCTGCCACTAGGCTTAGAGTTGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCC:1 + chrX 20507774 5' - Doc 4246 1 56.44 AAATATGATTATTTGATGACCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2R 17208492 5' + jockey 15 1 72.28 GAGGTGACTGTGAGGTGATGACTATCGCGTACGTAATTTTTTTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 12375225 5' + pogo 30 1 63.37 AGATATTCCAACTTTTGTTTACCATTTTAAAAGTGCTTGTGCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCAACTTAACG:1 - chr2R 10468637 5' - P-element 2856 1 45.92 ATNTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTC:1 - chr2L 23295857 5' + micropia 37 2 63.37 TTTGGAAACTAACACCATAGTTACCAAGGATACTTATGCCCATTGATTGGCAACTGTTGCAAAGATACTTAAATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 + chrX 5912879 5' - flea 252 2 73.27 TCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr2R 5311509 5' - 1360 3373 1 44.55 ATTCAATACTAAATTATGGTAAATTAAAGCAAAAGTCTTTAAAATGGCAAAAACTTTGTTAGTATTAAGATTTTGTGGTCAACATACGTAGGCATTTATTT:1 + chrX 18980747 5' - transib2 276 1 55.45 GAAAGTTACAAACATAAGATCATTTAAATTTTTATGAATGCACTGGAAGTATGTAACCTGAAGGAGGACCCCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 21311236 5' + 1360 5 2 69.31 ATGGTGGGACTGAAAGAAAGCTATAGAAATAACTAGGGGAATGGTAGAAAGAAAATCGCTTAAGACAGCAAATGTGGTTACAGATCACAACAGCTGATATG:1 - chr2L 9104815 5' + Helena 974 1 73.27 AAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTA:1 + chrX 14317416 5' + 1360 52 1 69.31 AAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 20266011 5' - roo 9026 1 72.28 GACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACTGCAACACTTAGTTG:2 - chr2R 9788995 5' + blood 7051 2 66.34 TTGATAGTTAGTGGATGAATCTTTATAATTTTTTTTTATATATTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATGAATAGCCAAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATA:1 + chr3L 23400879 5' - diver2 4843 2 58.42 AGCTCCGTCAAATGGGCATCGAAGGTGGGCAGGTGCAGGCTGGCAACATACTCGTCCATCTTCTTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGA:1 + chr3L 2769457 5' - Porto1 427 1 67.00 GAGGTAGAAAATAAGAAAAAAAAAAAGGACAAAA:1 - chr2L 2166912 5' + Doc2-element 248 1 67.65 AAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 9439834 5' - roo 9037 1 59.41 CTCGTGCGTTTCGAGGCGCTATAATATACGCAATACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTG:1 - chr3L 17264762 5' + G5 4456 1 66.34 AAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 5531190 5' + 1360 70 1 57.00 GANAAATGTGGCAGGCGAGTTTAAATTACTTTAGCTGGACATTGCTGGAGTTCGGAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAA:1 - chrX 18125139 5' + I-element 372 1 58.42 GCAAAAACAAATTATGAGCACATGTGGAACAAAAAGTTGGAAGCAAAAGCGTTAAGGCTTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 + chr2R 7048687 5' - 297 6963 2 67.33 AGCTATTTATTGCATTTTTATGTAAAATGATCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr3L 13652773 5' + hobo 20 1 59.41 CGAATCCAAACAAAAAACACACAGCAAACAGTCAGAAAAAGGAAAAGGCCTAACAAGGGATGAGTAACAAAAACACTTATTGGTTTACCGTTAAACACATG:1 - chr3L 2149667 5' + hobo 228 1 77.23 ATTTTGTCAAATTTACAAAGCATGAGCCCACGTGTGCGCACATAGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATC:1 + chr2R 4745223 5' - 1360 38 1 56.44 CCAACCCCCACAGTGCTTACTTTCCAGCCGGAGACTGGATTGAACGGTGGTACATATACGTTCCAAGCCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGC:1 + chr2L 8297299 5' - Tirant 8500 2 73.27 TTTCCCGCTGCTGAACTTATCGTTGCTTTCCTTTGGACTTTCTTCACTCTCTCTTTGGTTTATTTGGTACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGAC:1 + chr3L 5269941 5' - invader2 5017 2 57.43 GAGTCCATTCATTCTGCACACGGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 + chrX 8337922 5' - hobo 2889 1 75.25 CTGGCAATCGAAAACTGTTGCATACTTGGCAGCTGCACAGATATATATATGTACCTATATACGAGTATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr2R 13403823 5' + jockey 19 1 67.33 CGTATGATGTTGGAGTCTTGGAGGGAGTTTATTCTCGTTCCGAAGATACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTTGCTGTACTA:1 - chr2R 4580108 5' - Doc3-element 4373 1 71.29 AATGTCCTTTGCATTGAACTGGAAATGAGTTAATCGAGCAGTTTTACATTTTTTTTTTGTTTTTCTTCATCTAGTGACTTTAGTAAGCCCAGTACTCTGT:1 + chrX 13899198 5' - baggins 4970 1 64.00 CTTCTGCGAAGCAATCCATCCCAAAGCATTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACAC:1 + chr2R 19149414 5' - diver 175 2 72.28 CTGCTTAATACCTATAAAACAAATCATGTGATTATTGCTATTTATAAACTTAAGTTTCTAAACCGTAGTTGAAAGTGGAAAAATTAAAATATTTTAATATT:1 - chr3R 15126402 5' + 1360 3031 1 71.29 TTTCAACCAAACACGCTTTCATATGCAAATTTCTTTCATTTCACAGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 22046426 5' + roo 8695 2 59.41 AAGGACTTATTTTTCTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 12956376 5' + hopper 144 111 81.58 ATGTTTACTTGGATCTGGTTAAGAAACACGACAAAGTTCTTCTATATGTGAACAAAGGAACAGTTTCTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 12398224 5' + roo 7 2 73.27 GTTTTGGAATAATTTAATAATATAGATCAGTACCTGCAGCCACTGAACCTCACCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGAATCACGACCAGCTGTCCCAAGCAC:1 + chr2L 22189712 5' + BS3 155 1 64.00 GAGACAAACACCCTAAAAAAATGAAATAAGACCACTGCACTCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTT:1 - chr2R 19012175 5' - Doc2-element 4400 1 59.41 TCNAATAAAATATCTTAGTATCACAATATCTAATGTAATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chr2L 1590765 5' - opus 7465 2 63.37 AGCGTTGAGCTGTGAAAATTTGTCAGTCAGTCGCTTGGTCCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCC:1 + chr2L 1377042 5' - Doc 4246 1 60.40 CATAAGGTCAGGTTTTCGCACTTTCGGGGAGTGGCACAACATATTTGCAGGCTTTGGCAAGCAAAAATCCTCGAATAGGGAAAAAAATATATTAAAAAAAA:1 + chr3R 29440812 5' + BS4 727 1 81.19 CAATGGGGTTCGAGTGGAAAGGGATCTTTCTGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAA:1 - chr2L 15212219 5' + INE-1 555 1 40.59 GTTCTTTCTTGTTTTCAAATCAAATTCGCAGGCGGACTGAAAGCTAGCCGATTTTCCTCGATTCAATAGCGATACATAAGTAAACTACACGACCATGATA:1 + chrX 11390898 5' + G3 4385 1 76.00 CTACATAATCATATTTATCGAACTAAAAACCTGGCTTTTCTCGATTTTTCAACTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chrX 14505854 5' + pogo 24 1 56.44 TATTAATTCATAATACTTAGAAAGATAGTGTTTGTGATTAATGCCCTCGTAAGTTTGTTGCTGGGCTGGGAGTTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGC:1 - chr2L 10365730 5' - Doc 4530 1 77.23 GTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCGCACATGATTAGTG:1 + chr3R 19589896 5' + BS 4994 1 75.25 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAG:1 - chr3L 23730764 5' + Stalker4 304 4 70.30 CCTCAACGCATCTATATAGCTCTATACCTATAAATATGTAGAACCGAACAAAAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 11175842 5' - roo 9050 2 55.45 ATGTCGCATTTATGCATTAATTTTGACTGATACTCGAATGATGGATGGTGAGAGTCCATTCATTCTGCACACGGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 + chrX 8337871 5' + hobo 2710 1 80.20 GCCTCAACGATTCTGTGTATTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chr3R 28288634 5' + 412 55 2 83.17 GTCTGCTGATGCTAAGGAGGCAGTAGGTTGGGCGATGGGCCTCGAAAAAGTGGGAAAAGTCACGCCCTCCGACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTA:1 + chr3R 19716591 5' + gtwin 394 2 59.41 TTNCCGCCCCATCCGGAGTTGCTACCCCATCCGGAGTTACCGCCCCATCCCAGTTGATATGAAATGATAACAACTTAATTGAAATCAAAGTAAAATAAAAA:1 - 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Doc 421 1 65.35 CTNATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATG:1 + chr2L 23286584 5' + Tirant 416 1 59.41 TGGATTGATTTATTACATGGCGACCGTGACAGGACAGGAGCCTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:2 + chr3R 991865 5' + Tirant 38 2 58.42 TATAGTGCTTTGTATGCATATAGCCTGGGTCCTCGAGACGAGCCGTCTGCCTGCCGCATCCTTACTCCTTTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAG:1 - chr3R 26397250 5' + S-element 1258 1 71.29 CGAGGGAAAATAAGTATGAGGGAAAAAATATCAAATTAAATATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCC:1 - chrX 16125291 5' + Ivk 177 1 60.40 TGAGGAATTTGAACGATTGAAAAATGAAATTAAATTTATTAAAAAGAAAAATAAAAAA:1 + chr3R 19449699 5' - hopper 153 1 82.76 CCAAAAAAAAAACACCCGACTGACAGGGTAAATAATGATGATAATGTGTGCGTGAGTGTGTGTGTGTGAGTGTCTGCGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 - chr3R 16382639 5' - accord 183 3 72.28 ATATAAAAACAAAACAAAAAAAAAAACAAATTTAAAAAAAAAACCAAAA:1 - chrX 12277685 5' + TART-C 11097 1 71.43 ATACCCTTCGGGCACGTTACGTATACGCCCCCAAATGACATGTACATAAATTTAATGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACA:1 + chr3L 7295150 5' + G2 2932 1 65.17 CCAAAGTCGAGGAGCAGCGCTGCCGGCGTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCAAGCCAACTC:1 - chr2R 2308852 5' + McClintock 1 2 64.29 TANCCTAAACATATTTGAAAGCAGAAAAAAACCCTAAAGTAAAGCTTCAGCCTTCGATGGGAGATGGGATTAACTAGGATATTTGCCAGTCGGTTCGGGTA:1 + chr2L 22306960 5' - G5 4588 1 56.44 GTGACCCGCGCGATATGGCCCAGTGATAATATTAACTGTGTGCGATTTACGAGTGCACGAAAGTATTGGGTATACTATAAATATGTACATATGTGTATATA:1 + chrX 18130285 5' + G3 4506 1 71.29 GTNAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTG:1 - chr2L 23295886 5' + micropia 4964 2 66.34 AAAAATTGAAAGATTTACATTTCCATCATATTTCCGGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTT:1 + chr3R 19449752 5' - roo 278 2 64.36 CTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGA:1 - chr3L 23155716 5' + gypsy 50 2 72.28 AATGATGAACATAATTTAAAGTCTGTAAAAGATACTGGTTACAGTCCAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr4 119380 5' - 1360 3366 1 54.46 AAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATAAATGTTCTTGATAAGGATCACCGGGCAAATGGATCTGGTCATGTCGGTATGTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCAC:1 - chr2R 1461346 5' - Cr1a 4449 1 48.51 TCTTGCATACAGGACTCTATGTGTGTGCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr3L 11450530 5' - Transpac 264 2 75.25 TAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACA:2 - chr3R 2689431 5' - diver2 4476 1 66.34 GGNAATTCCGGAGGAGACTGGCCGGAGTAGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGC:1 + chrX 17769047 5' - diver2 119 2 71.29 AGNTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 20419102 5' - roo 9026 1 73.27 GCAACAGCAAAGTCCCGAAGCTTGCAGAAAGTGAGTAGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGT:1 - chr3R 11901525 5' - 1360 49 1 65.35 ATNGAGAGCCTTGTCCCTAGAATGTTCGGCCAATGATCTAACTATGAGTTGCATGCATACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTGTCTGC:1 - chr2R 2743484 5' + Cr1a 4229 1 63.44 GGCTAAATGCAAACAGGCAAACAAAAATGATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:1 - chr3R 20373289 5' - I-element 5312 1 67.33 CTAAATCAATTAATTGTAGTAGTAGTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGCAGAAGGCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chrX 22651445 5' + INE-1 88 1 64.36 GGGTCCATTGTGTTTGTAAATGGCATCAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTG:1 - chrX 4175168 5' + I-element 306 1 79.21 ACAGGGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTT:1 - chrX 19810566 5' + INE-1 581 1 57.43 TGTTTTCACTTTTTTTTGGGCTGGAGAATGGTTTCGTTTTTGCCATTCGCAGGTCACATAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 - chr3L 15983146 5' + INE-1 559 1 59.38 GAAGGCAAAAAAGAAAAACCTGCTCCTGTCTGCCTTCTATTGAGAGCGGCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGG:1 - chr3L 13180802 5' + F-element 450 1 56.44 TTTTCCCTTTTTCCGCTTTTCCCTCACTTTTTCAGCTGGATTCTGGACTTTTTTTTTAACCGTTATCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACC:1 - chr3R 21909446 5' - Bica 496 1 62.24 TGGAAATATTTGAAAAATTCCATAAATAAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 19952369 5' - roo 9023 2 82.18 AGAGGATTAGATGTTGGTAACATGTACTCACATCGCCAAAAGTAATTGAATTTGGACTTAGGTAGTATTGGTGGGTATGCTTGTGTGTCCTAGTCGATGTC:1 - chr2R 10514058 5' - I-element 4945 1 56.44 AGTTCATTTTGATCAGAATCCTCTCCTGCATGCAAACCGTTTCTTTAGTATATAAATTCTGCAAGGCTATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 - chr3L 22776000 5' + flea 4761 1 74.26 CCAATATTTTTTATTTTTGGTTAAACAAGGAAAGACAAGCTCTCAGAATATTTGTGGCGAAATCAATGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTC:1 - chr2R 4626659 5' - Bica 4912 1 69.31 GGTGTCGATGTGGCGTCTGTCGGGGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTT:1 + chr2L 19845886 5' + F-element 22 1 58.16 CANGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCC:1 + chr3R 4971181 5' - 1360 3338 1 74.26 ATTATATTCCCATTTTGTTCTCGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTAT:1 + chrX 15073167 5' - accord 127 2 74.26 ATGGGCCACACACAACCAATTACAAAGTCAACCGCTGGTAGCTACTACCATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chr2L 10711701 5' - I-element 5328 1 51.49 AACATTTTTCGAGGCCATTGCTATTTTTTTTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAAT:1 + chr3R 19992767 5' - HMS-Beagle2 7121 2 71.29 TCACCCTAGATGGGCTCAAAATACTAAGAATGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATATC:1 - chr3R 24677647 5' - Porto1 4389 1 67.33 GCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTTTACTCCCCAATATCTATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGTGTTCGCATTCACACTAGCTGAG:1 - chr3R 2473819 5' + INE-1 530 1 66.34 GCNTTTTCGAGTTTATTACGGCTTCTAGCATTTCGTACTCTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 - chr2R 9213713 5' + Burdock 6168 2 58.42 ACCCTGGCCGATAAGAACCTAAGCTCCACCCTTTTAACAACCGCAGCTTTACTTACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTCGACCCC:1 - chr3R 7944977 5' - Circe 7105 1 76.24 TAAGCTGACTTATAGCTTCTTCTTTCGGAGATCCTATTTATAAGGTTTCACCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chrX 21388503 5' + 1360 26 1 57.14 GCAAAGAGTTTCCCTTGAATTTGCCACACTTAAATCGAAATTATCGTAAATTAATTGTGAAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAG:1 - chrX 17983023 5' - BS 4900 1 64.36 AAACTGTTGCATACTTGGCAGCTGCACAGATATATATATGTACCTATATACGAGTATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2R 13403812 5' + jockey 29 1 57.00 AACATAATTTCTAAATTTCCATACAAAAACCAAAGAACTCATTCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATG:1 - chrX 15240576 5' - mdg3 100 2 57.43 TCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chrX 9579324 5' + Tirant 8144 2 67.33 CTTCGCACTCTTTGCTTGAAACTCGATTTGTATAAACAAGACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATA:1 + chr3R 21350154 5' + I-element 5010 1 63.37 ATGCTGCAGATAAATAGGTGCTGATTAAAAACGTATGCCATTCATATGAATGTTTGATTAGCTATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 + chr2L 7393634 5' + opus 9 2 65.35 CAGCTATCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAA:1 + chr3R 2914328 5' - Circe 7042 1 73.27 CGGATTTGAGGCGAGTGGGCGGGCGAAAAGTTTACGGAATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr2R 16940326 5' + flea 4779 2 60.00 GCNTCGTAACGATCCACTTTTTGATCGCTTTTTCGGTTGCTTTTCGCTGCTTTTCGGTTAGAAAGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTG:1 - chr3L 562928 5' + micropia 270 2 54.46 AACAAACCGATTCGCGTCCAGCATGTCGATGCGACTGCCATAGTTGATTTGTGTATTTTTTGCTGCTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGCTTA:1 - chr2L 23048891 5' - Porto1 4405 1 60.40 GAAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATCTAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCA:1 - chrX 22576485 5' + Burdock 153 2 75.76 AANTCGCGGCTAACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 4022362 5' - roo 9045 1 55.45 TGAAAATTCCCAAAGCAAAGGAGCAAACGAAGTTTTCGCCAAATAACAACAACAACAGCGACTGCAGAGTAAACAACACACACACACACACAAATAATCA:1 - chrX 6441619 5' + accord 7032 2 60.00 CTCCCAACTTTGGGGAATAGACGGCGGAACAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr2L 18177966 5' - 412 7503 2 67.33 TGAGCTGCTTGAATGTACTAAGCGATTGCGATAGTTATTTTTGGCGGCGGCTAGGCAACACCTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTAC:1 - chr3R 26185632 5' - diver2 4665 2 65.35 GANATTGCATTTTCCCACAGGACAAACGCATGGGGTTCACTGGTGAAGGGCGATGGTGGAAAATTGCATGCAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACA:1 + chr3R 8921366 5' - 1360 175 1 72.28 CCNGAGCGAAAATGCACTCTTCAATGGACTGTGTGTGTGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGCG:1 + chrX 16087670 5' - accord 7032 2 70.33 GAAAATAGTCTTAAAGCAGTACAGGAAAATATGTCTGCCCAGGAAGGTCAGTTTAAACAAAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAG:1 + chr2L 11275707 5' - I-element 52 1 76.24 ACGTTTTATCAAGAACAAAGGGGTATTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chrX 8302846 5' + 297 6615 2 73.27 AAGCCTAAATCTGGATTTGACTGCAGATTCGCTAGGCGAAGTGCATGTTGTTGTTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chr3R 29357146 5' - 412 493 2 76.24 GGNTATATCACATGGATATTTCGGTTATTATTGGCCATATTTTAATGCTCTCGCTGCTCCGTCTGTTTTCGGCCGCCCTCGCGTGGAGAGTGTAGTTGCAC:1 + chrX 21019053 5' - baggins 84 1 72.28 GATGGCGGGTCAACACTCATGCACAGACCGAAAGATACACAGAAACAAACAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAA:1 - chr3R 10644475 5' + I-element 254 1 54.46 TTTATATTTATTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAACTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chr3R 26434688 5' - Tabor 450 2 58.42 GATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr2R 4900360 5' + Doc 41 1 62.38 CACATCACTTACACATGTTTTGAGCTGCTCAGAGGAGTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chrX 18952054 5' - mdg1 384 2 61.39 AATATCATCTGACTGTCTTGAATATTCTCACAGTGTAAGGAGGCAGGTCCACGGGCACGAGCATCTGTGGCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 6557091 5' - roo 9065 1 75.25 CGATTTACCCTCTCAGTTCGATCTTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCG:1 - chr2L 14654371 5' - Ivk 5010 1 72.41 TANGTACATTTTTCCGGTGCGGACCGAGCGGGGAGGTGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAA:1 + chr3R 28102618 5' + Stalker 6954 4 40.59 CAAGTGAATATTAATTGTGACCTTATAAGTACTTGATCCCAATAAAAGAGTTTAGATACTTCATCGAATTACTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAACAA:1 - chr2L 16889568 5' + FB 6 1 72.28 TACTGCTTTAAGGACTTCCCATCACTGCAGTGCACTGTCGACACGCACACGCAGCAAGAAAGAGAGACAATCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 22310754 5' + hobo 4 1 60.40 TAATTAATTATTGTAATTATCCAATTCCTCATAGTATATATGATCAATTTTTGACCATATGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTC:1 - chr2R 5197334 5' + INE-1 110 1 58.00 ACTCTAAAAATTAATGTATACTAACCAGGACTACAACTTGTTCTAAAACACTCTTTCGATTCCTAAACCTATTATAATTTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCA:1 + chr2R 22878254 5' - F-element 4286 1 80.20 TAAAGAGAGCGAGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCACGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chrX 13640712 5' - P-element 2860 1 50.50 GTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGTAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATGCTAAT:1 + chr2R 5178584 5' - mdg3 234 2 60.20 GATTTAAAAGTACCACGATGCGATGAGTTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr3R 7382627 5' - copia 241 1 70.30 CTCGTTGGCGTTTTGCGTTGCCAACTGCCTTCAACACTTTTGGCCGGGGGAAATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTG:1 + chrX 4448528 5' - 412 7523 2 55.45 AGNGAAACCCGAAGAGTGTGAGTGCGAATGAGAGTGTGAGTTCGAAAAATAAGTTGACGTCGCCTGTTTGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGA:1 + chr2R 10541757 5' - jockey 116 1 69.31 CTTTCGGAAATAGAAAAGTTTTCGTTTTTACCGAAAACGTGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAAT:1 + chr2R 16908737 5' - diver 192 2 58.16 AACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAAAAA:1 - chr3L 24916683 5' + Porto1 156 1 63.37 CAAGACCAAATGGCAGTACGCCGAGTGGCGCAAGCACATCAAGAAACTGCAGCAGCAGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 - chr3R 14702113 5' + flea 45 2 62.38 GCTGAAAAATAATTGGATTAATACTCATATTAACTATCATGCACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACACCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr3L 12352884 5' + Tirant 33 2 54.46 AACTACCCCACAAAAAAAAAAACAAAAAACTGGG:1 - chr3R 7571278 5' - hopper 140 1 73.53 TGCTTTTAATTGAATTGCAAAACAGATTATGGAACTATGAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 + chrX 4174898 5' - I-element 5321 1 57.43 CTNTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGAT:1 + chr2L 23300000 5' + invader4 367 1 79.21 ACAAAAAGAAAATGCAACTCTCAAAAGCCATTTAAGCATAATGTGCAATAAAATTATGAAACTTCTCGTTAGCATTCCCACTAGCTCAGTAACGGGTATCT:1 - chr3R 9481699 5' + INE-1 542 1 56.44 TCACTTCTTCTTGTTCTGCAGTGCTTTTTGCAGTAGGTCCAGAGATCCTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTAAGACACTGTTTATGGAGATTATGTTGGA:1 - chr3R 21361067 5' - gypsy 7359 2 70.30 CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGC:1 + chr3L 25232764 5' - accord2 7604 2 50.00 CTTATCTTTCATTTTCCTTAGTATCATTACTTTTTCCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chrX 19053039 5' - roo 9034 1 66.34 CCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAA:1 - chrX 21667941 5' + gypsy2 6507 2 67.00 AAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATT:1 + chr3R 4160064 5' - invader2 5097 2 66.67 TGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 - chr2R 2949107 5' + 17.6 6958 1 63.16 AAGAGCGTTGTTGATAGCCTCAAAACGTGAACTTTCAAGTAACTTCATGATTTATAAATTAAATTTAAATGATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:1 + chr2R 1516573 5' + Transpac 4924 2 75.25 CCTATTTCGTATTTGGGCAGTGATTTGGCAGAAATAATTGCCTGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 + chr3R 24430519 5' + Transpac 4950 2 61.39 ATTTGCCACCTGGAACATTTCTTTTTCGCTGTCTCACTTTTGGCTGTCTCACTTTGGCCCGGCAATTTGCTGTTTATTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTT:1 + chr2R 17254313 5' - Porto1 4415 1 64.36 ACATTTGATTTATGGACAATGGAAATGTCTGAGCCCAAGAACAGGCGACAGCGGGGCATGGGAGCTGGAACACAGCCTTATCATTTATATGATGAAGCGTG:1 + chr3L 2987582 5' + Rt1b 4767 1 56.44 AAAAACAATTCCCTCATAAACAATATTATTATTGAATAGCATCTATATTTATTTATAGTTAGTTTCTTAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3L 17446876 5' + hobo 7 1 29.70 TTATTCCGTGTTGAATGCAAACGTAAAACTGAAAAATTTCCCCCTTTCTGATGTTTGACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 9410784 5' - roo 9052 2 66.34 GAACAATTTTTTGCGAACAGTTGTCCCATTTTCAAGTGTGTGGCACCACCATAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCATT:1 - chr3R 2974659 5' - 1360 3358 1 73.27 CATATCTTTGCTTCGCCTTCATCCGCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCAACATGCTAACTATGC:1 - chr2L 4032094 5' + Ivk 5101 1 77.23 TGTGCTCGAATTGAAAGCTTGATTTTTTAAGTGTGTTAAGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATCGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr2L 19644874 5' - blood 7352 2 58.00 GTAATAGCCAACTAAAAGATTTCTGCACTGAATAAAGACATTTTTTAAACATTTCCTGCAAACGAATATTTTTATCTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAG:1 - chr2L 17118112 5' + Bica 4 1 77.23 CTCCTAGGCTTAGGATAGAGAGATTCCCAATGTCTGAGGACGGTATAAAAATTGGAGAGGGACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGA:1 + chr2R 2110048 5' - mariner2 294 1 60.40 CGAGCAGCCATTTTCCGCATGCATTCGAATACATTTAATTTAAACTTTTCTCCGCACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCG:1 + chr3L 22370392 5' - invader2 5042 2 64.36 AAAATCTCATATGTACGCATGAGTTGATGGATGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 - chr3L 12352944 5' - Tirant 8463 2 69.31 ACCAGTATTCGAAACTTACCCCAACTCCCGCCAATAGGAACCCAAATATGCCTTATTGTGCACCTGATCCGGTGGCCATCTCGTCAGATCGGA:1 - chr2L 4870834 5' - Rt1b 4789 1 78.49 GTNATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATG:1 - chr3L 27391398 5' + 1360 3 2 75.25 GTATTTTGTGTTTTATTGTGTCGTGTTTGCTGCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 + chr3R 17665950 5' - Transpac 302 2 71.29 CTCTATGCCAACTTGGAATAACCTAAATATTTGATAATACCACAAATCAAAGTCAAACTGCAAGTGCCAGCCCTGAACCTCAATAAAATTCTGGCATTTAT:1 + chr3R 23075499 5' + baggins 5333 1 71.29 TGATCTAATTTATTTATTTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 + chr2L 8649213 5' + F-element 46 1 59.41 GAGTGCGTCGATCTGGTGGCGGTGGAGACGGAATTTGTTATCATCTTGAACTCGCGCACACTCACACTCACACACGCACGCAGGAACACACACACACACA:1 - 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roo 8622 1 62.38 TGCAGCTTTCCTCGATGTGCTGCTGCCTATTTTTATGTCAGCAAGCAAGAACAGGAATCAAAAGGCGATTTTCTCGACTATCAGATACGCGTTACTCAGCT:1 - chr3R 19716157 5' - INE-1 545 1 58.42 GTTGCCTACTTTCAAGCGCAGTTTAAGTCACCGTTTAAATCACCAAATGTACCGAACATACAAGTCAACATTACTTTACTTTACATATTACTTACTTAAC:1 + chr3R 16041120 5' - Stalker3T 41 1 79.00 GGCTGTTTGAAAGGGACTAACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr2L 16887945 5' - P-element 2829 1 22.77 GGTTCAGTTTACAGATTAGAATTATAGCCACCTGAAAAACACCAATTATTATAGCAGTTTTTTTACGACTTATTACGAACTTATTATTTGTATAAAGCAAA:1 + chr2L 11326543 5' - P-element 2490 1 58.42 ACACAGTTGCAGGCCAATTTTGGTTTAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr3R 21206729 5' + P-element 44 1 29.47 CTNCAAAATTAAAAATCTAGGGTCAACCTGAGCGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 - chr2R 5262642 5' + 1360 40 1 65.35 ACATGGCGCACACTTATCTATCATTATCATCAGTAACACACACACACACACACACACACATCGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACAC:1 + chr3R 22158803 5' + accord 7285 2 65.35 ATNTTTTGAGCTGCTCAGAGGAGTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chrX 18952068 5' - 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P-element 2849 1 39.60 CAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTG:1 + chr3L 25804310 5' + gypsy 7128 2 83.13 TATGCACAATATTCCCTTTTTTGGCAATACAGCTCCATTCATCAATTACGAGCAGACCCCGAACCTACCTCAATGCGTAACCCATGACATGGAGAATCAGC:1 - chr3L 18062387 5' + Burdock 5930 1 76.24 GTGGCAACCCTAACATCTGTTTTCCGGCCAACCTGCAATCTCTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCT:1 - chr3L 5662722 5' + jockey 341 1 73.27 TATTCATCTGACCGCTGCTGTTGAGGCGTGTGGTGTGCTTTTTTTGAGAACCTCAGCATAGAAGGCAAACTGAGGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCA:1 - chrX 7701732 5' - F-element 193 1 79.21 TAACGAATCCACGGTAGATTAGATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTTAAGTAT:1 + chr3L 25519857 5' - Quasimodo 7283 2 76.24 AANTCGAGGTAAAATGGGCGTGAAAACGTAATTAAACACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 22751925 5' + roo 36 2 67.00 TTTTCGGGTATTTTTTTTTTTCCTTTTTTT:1 + chr3R 17896579 5' - Doc2-element 236 6 80.00 GAATCGCTAGCACCAAGTTGCAGCTGACAAACGAGCTCATCCAGCTGCAGCAGCGTCGCCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAA:1 - 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chr3R 22341211 5' - hopper 1378 1 62.00 CTNTAAAATTGCAAAAAAAAACGGACTCCCCCTTGCTAAGCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTA:1 + chr2R 5410943 5' - Tc1 1419 1 66.34 TCCCATGCCCGTGCTTATCAATATATATTTTTTGTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAAT:1 + chr2R 13746013 5' - G6 1987 2 62.22 CTGGAGGAAGTTTGCCGGTGGCCTGATAATTTAATATAGGCCTGATAATTTAGCGCAATTAAGTTAAGATTGGACTAGGAAAGTGCGGCGACTTTTGTTAG:1 - chr3L 9033833 5' + G5 142 1 39.60 TTNTAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr2R 4900366 5' + Doc 35 1 56.44 CCTTCACTGATGGACCTTCACCCCTTGGAAAAACCCCCTTGAACCCCACCCACATGACTCTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGGGCTTCAGTCGGCTCTGACT:1 - chrX 5589500 5' - Doc2-element 4606 1 69.31 CCTGCCACTTGGCGTTGCATACTTTTACGCGTCTCTTTAGTATTAATTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr2L 19602911 5' - hobo 2909 1 55.45 ACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCT:1 - chrX 22386752 5' + hobo 94 1 72.00 AANAGTAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr4 1156881 5' + F-element 56 1 69.31 TTATAAAATATATATTTTTATAATATTATATTATAATTTAATATAATAATAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3L 23392833 5' - pogo 2080 1 62.38 GAGCTTACTAGTATTTTTCTACGACAATATTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 + chr3L 3967233 5' - jockey 4951 1 72.28 ACAGTAATATTTCACTTTATTAACCTAATCACTATTATTAAATAAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTG:1 + chr3L 5067802 5' - Quasimodo 7339 2 62.38 TAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCG:1 - chr3R 1977616 5' - micropia 420 2 58.42 AATGGGAATGGAATATTAAATTAGTAATTAGCTCAGCAGCGTCAGCAACAACAACCAGATGTTGTCACAGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGA:1 + chr2L 7835968 5' + jockey 463 1 74.26 TCAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCC:1 + chrY 2346868 5' - micropia 5436 2 67.44 TGGGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 4806750 5' + roo 8689 2 57.43 CCATTTCTGCTGTTGTTCCTGCTGGGGCAAATACAAAATGGGGTACTCCTGCACTATGGGCATCGCAATTGCTACCACTGACTACTTCTGCTTACAATATC:1 - chrX 19992406 5' - diver2 4586 2 52.48 TTTTATGAACAGAGAGCGAGAGCGAGAGTGGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGG:1 + chr2L 2319985 5' - accord 6983 2 66.67 AAAATCAAAGCAAAAAAGAAAGGTGTACTAAGAAAAGGTAACAGCTGCCAATGAACCCGGCGATTCAGCGTCGTCGATGTTGTTGTTGGAACATCCGGTGT:1 - chr3R 17737324 5' - gypsy10 5695 2 58.42 AANGATTACACTTTCAAAACATGTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr3R 26255167 5' + opus 7164 4 79.21 GTNCACCTATTTCGTATTTGGGCAGTGATTTGGCAGAAATAATTGCCTGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr3R 24430514 5' + Transpac 4945 2 56.44 CCATCTAAGCATTAAGGGCCCATGGCATCGGGCCAAAACAATGACATTGAGGTGTCGAAGTGGCGCGGCGTGGAGTGGAGATACGGTATATTAAAAAAAAC:1 - chr3R 8499716 5' - Circe 82 1 79.21 ATGGACTAGTAAAAACTAAGGAGGAAAGTAAATACATAATAATGTACATAATTTGTACATAATGTATCATATGTTGGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGT:1 + chr3L 14585802 5' + Tc1 124 1 47.52 GGTGAATACAGGTATGCCCTTCGTGAAGCTAACACCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCACCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3L 17503207 5' + pogo 39 1 62.38 CAGCTTATTAGTAACGCGCATCAAAAGTATATTAAATCTCGTTACAACACCTTATAAAAATTAAAATACCCCAGCACCAAAGACACTAAAATAACCAGATG:1 + chr3L 14297082 5' + 1360 3 2 67.33 TTTGATTTTTAATCAGTTTTAATTGTGGTAAAAGTGAAATCTGGGGGATCAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCGGAATAATCAAGT:1 - chr3L 4403775 5' - Cr1a 4083 1 56.44 TTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 - chr3R 13349574 5' + Ivk 28 1 51.49 GATAGTAACGACAAATCTGTAGCTTGAAGAATACCGTTAATTTGTTCCAGAATTTAAACAAAATATATGTTTAGACAAACTATAAATATGTTATATTTATG:1 + chr2R 5018779 5' + rooA 38 2 69.31 CGNTGATTCGCCAAACTGCCAAAGCTGCCAAAGTTTTTCGCCTTCAATGTTGGGAAATCGAGTGAGGAATGTCTCCGATTTGCTGAGCTGTTTCCGCCGAC:1 + chrX 18903796 5' - gypsy5 7106 2 73.27 TGATGGTCAGGAAAAGCTTTGAGTTTTTAGCACACAGATTTTCCAATTTCTGTTTGCCATCCCGTGGCGAACAGGGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCAT:1 + chrX 4479318 5' + Rt1b 4744 1 73.27 AAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 9439822 5' - roo 361 2 73.27 AAAATTATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCC:1 - chrX 21564766 5' + diver 5 2 75.25 GTGCTCTCACAAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTG:1 - chr2R 18232691 5' + blood 169 2 69.64 CGNAGCATGGGCCCAATATCAGAGGTCGATATGGTATGAATACAATATAGAAATATAGAATTTAATTAATTAATTAATTAATTAATAATATTAT:1 + chr3L 17831157 5' - Tc3 263 1 75.53 GCAACATCGCAGCGGCAACAACGCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAAT:1 + chrX 14132335 5' + I-element 235 1 77.23 GTCCTGTGGCCCACTTGACGGCTACGTAACGAGAGGGCCGAACACCTTTGCTTTGCATTTACTGTCTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCT:1 + chr3L 9915784 5' + Bica 50 1 67.33 CTATCTGTCAATGTATCTGTGTCTAATCGACTATTTTTTTTTAAATTAAAATCTAATTAAAACGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCAT:1 + chr3R 9192500 5' + invader3 5202 2 61.39 CCCTTTGCCCATGTTTTGACCAAAACAAAGGAAAAGCTAGGAAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGA:1 + chr2R 3037012 5' + I-element 4906 1 59.41 AACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAA:1 - chrX 8027505 5' + Juan 5 1 69.77 CCGGAAAACCAACGATATGCATGTGAAGTGGGGCTAAGACAAACGGGAAAAAAGCCAGGAAACACAAGCACAGTCTAGAATCTTATCCGAATAGTCTAGC:1 - chr2L 2509875 5' + jockey2 3100 1 56.00 TATCTAGCGAGTTCCTTGGCGACATTTAAAATTTAAGTTGCAACACTGCAATTTTTATGCGATATCAAATTCATATGTTTGATCAGCTGTTTGTTCAAGCA:1 + chrX 354040 5' + transib3 173 1 77.23 ATTTACTTCACTTTAATTGCTTTTAATTGAATTGCAAAACAGATTATGGAACTATGAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAAATAGAATAGTTTACAA:1 + chrX 4174881 5' - I-element 5338 1 65.35 ATATGGTGCTCTGCCAAGCAAAAACCAAGTCCTATCTAAGATTTTAAAGTATCTGACACAGCTGAAAGTATGAGTATGTTTATAAGTATGTATATGGAATT:1 - chr3R 7615564 5' - ZAM 8153 2 57.43 CANGTCCTGGCCTCCTCGTTCACCTATTTCGTATTTGGGCAGTGATTTGGCAGAAATAATTGCCTGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3R 24430497 5' + Transpac 9 2 68.32 CGATAGCCCGCTTGTTCTTCTATTTCGCCACCAATACGGACTTGCTCTACGCCGTCACCCAGGACGCCCGTTTGGTCTTAGACACCCACTCCGTTGGCCAT:1 - chr3L 16492447 5' - Rt1b 4803 1 53.47 CCTGTATCTGTAGTCTATGAGCAACCCTCATTTTTACAACAAAAATAATTGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 - chr4 150707 5' - 412 430 2 55.45 ATCCAAATCCAGAAGCCCAATCAAATTGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGTTCGTCTTCCCGGTTCGGTGTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGG:1 - chrX 17709152 5' - Tirant 19 2 75.25 TTTCAAGTGCCTTTATTATTAAGGGGTGTTAAAAAAACGCAAAGGTCAATTGTATTGGTACATATAGAATTATTCTTCAAATTAAGCATAGTTTAAAGATT:1 - chr3L 10784233 5' + Transib5 439 1 77.23 AGGAGGGTCAGACACATGACCAAGTGAGACAGAAAGCCGCCGTAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 + chr2L 9313933 5' + hopper 35 1 57.43 CATGGAGTAATTGAAGCCTGCCGTCGGTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTAGAT:1 + chr3L 16438124 5' - Bica 4836 1 79.21 ACAACGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATACGAATATTAGAATTCAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTTTG:1 + chr3R 4577497 5' - 1360 185 1 72.28 GGATTGCCCCCGAAGCTGGTTGGCTTGGTTAACGCAACAATTTAACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2L 15013938 5' + jockey 4685 1 60.49 CCNCAGAACCATCCAATGCAGGTGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTC:1 + chr2R 18723011 5' + opus 4 2 74.26 ATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAAATTGGTTTGTAGAGAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCATCTAGT:1 - chrX 21452819 5' - INE-1 542 1 63.37 GATGTGGGTGCCTTAATTGGTGCCCTTACCGGTGTGATTTCCACTTTATTTGGGGTTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTG:1 - chrX 9979081 5' + accord2 7593 2 51.00 TTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTAC:1 + chr3R 4504055 5' - INE-1 551 1 63.37 CACCCCCCTCCCCCATTTGATACCCCTTTTTATGCACCACCACCACCACCCACTCACCCCATCGTCACGCTCCCACGTTCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCC:1 - chr3L 14812861 5' + Idefix 7075 2 57.43 CCGAACAATCGAAATCGAACTCAGTCCGGACTCTCTGCTGTGCGACAATATTTGGTTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGA:1 + chrX 17698802 5' + P-element 18 1 31.68 GANCATACTTAAAAATAACAAAACCAAAAGAATACCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3L 11156197 5' + 297 6585 2 73.00 CCATAGAGCTGCTCCTCCGCTAAATACAATGAAAAACTTCCAACGAAAGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACT:1 - chr2R 9637371 5' + I-element 4988 1 53.47 ATTGATAGAGAAGGGCTTTCTGCACGACGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCTTTAATTAATGTACTTATCCCATTTATAAATAAATATAAATACATTAA:1 - chr2L 23052979 5' + diver2 448 1 67.33 ATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCACATAGAAACA:1 - chr3L 5067854 5' + Quasimodo 52 2 75.25 CACAAAGCAACACATTTGCCGCATTTATTGCGATTTCCCGTTAACTCGCGCACACTACACCCTCACACACACACACATACACACACACACATTCACACATT:1 + chr3R 22825117 5' + accord 7038 2 69.31 GAGGAGAGTATGGCCGCTGGGTGGTGGCCGGGTACACGTTGGCGGCGCCCGTGAAAATGGATAATAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGA:1 + chr2R 24675761 5' - GATE 444 1 61.39 TTTAACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr2R 9789011 5' + blood 24 2 55.45 AAATAAACTGGATTAGGCGTAAACCAATAAGCCCATGGGCACATTGAACATGAGAAACGAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 + chr3L 16709314 5' + FB 18 1 61.39 AGTGTTAAATTATCTGACTAATTGGCTATTTATTAAGGAGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTT:1 - chr2L 13804452 5' - roo 373 1 62.63 GCAAAAAATCATTTAGCTCATTGCCTTATGCGTTATCAAAATTATTGCGTTGCATTTGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 + chr3L 10382643 5' - I-element 5340 1 60.40 GAGCTTTTTCAATGGCAATTGAATAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr2R 4559118 5' - pogo 2056 1 76.24 AATTTTTCACAATAATTCCCTATTACTTATCTCATGGAAAAAAACAATATTCCTTATATACAATACATAGGTGATACTAACATGCCCAACAATGATAACCG:1 - chr2L 18784537 5' + Fw2 120 1 80.20 TCATCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr3R 4971177 5' - 1360 3342 1 72.28 AAAATTTAAAAATGCGGCTCCATTACTCAACTTTTTAAAAATATTAATGATTTCGGGACTTTGCGTTGGACAAAACCAAACACTGCTGTTCTTACGAACAG:1 - chr2L 16946520 5' - HB 208 1 71.29 ATAAAAGATTGACAAGTGATTTTCGCACCTAAGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGA:1 - chr3R 30540148 5' + Doc 4437 1 68.32 GTCAGCGACTCTTTCTTTCTTTCCCTCCGCATTTAACCACATCTCGTGTGCCAGTTGCGCGTTGTCCTTGGCACTAATTAGCCATTCTTGTAAACAAATCT:1 - 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1360 94 1 65.35 TCATAATTAAGTGAAATTGGTACCAAAAATAGGAGAATTATTGCAGCAACTCTGTCACTTTTCATACGTCTTTTCAAATGTTTTTTTTTT:1 - chrX 2415015 5' + FB 174 1 91.11 CATACCCTCAAATAATAATATTGAAACGCAATTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr2L 5291619 5' + roo 42 2 71.29 ATATTCGTTTGTGTCTTGGCAACCTTGTGACGAAAGTTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 20419136 5' - roo 9060 1 68.32 ACCACAGAACCATCCAATGCAGGTGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 + chr2R 18723010 5' + opus 3 2 76.24 AAGTTTCGAGTTGTTAAAAATTACAAATAAAATAAGTGTGGAGGGGCTCTTGTAGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATT:1 - chr3L 22498693 5' - Stalker4 104 4 53.47 ACAAGTTAAGCAAGCAAGAAGTTAACCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATC:1 - chr3L 10015470 5' + R1A1-element 351 1 70.11 CGGTCCCGTACTCCGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGCCCCATACTGTGTCCCCCACCTTGGGTTTCCACGGCCGTCTTCATAGATT:1 - chr2R 13676423 5' - Osvaldo 1270 1 56.44 GACATCGGTGTGCTAGTGTGGCTGCCTGTGTGTGAATGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 6015109 5' - accord 190 2 78.00 GTGCCCTGTCCTGTCCATCCTCTCATGTTCGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGATTCGCTGGAAGCCTCTGGAGACGTTGCAG:1 + chrX 14010982 5' - HeT-A 5701 1 70.30 GTTGCACTTTTCCCCTGCCACCTCTTTGCCCGCTGAATGCGCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3L 6442606 5' + roo 8667 2 58.57 GAGTTTGCTCGTATATATGTAACTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr3L 1535403 5' - 1360 3367 1 77.23 CAAGAAAATCGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr3R 14688248 5' - pogo 2065 1 64.36 ATTTTACTCCCGATACTGATATCTTTTCGATGAAGATGAAGTGTAAGAGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 + chr3R 6776516 5' + copia 16 2 61.39 CCTCTGTATTAGGGGAAAGTTTGAAGTACTTGGCCAAAGTTATAGTATAAATAGTTCAGCTCGAGCCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 - chr3L 11920133 5' - Tabor 7315 2 74.26 GGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 - chr3L 13345525 5' - Transpac 5205 2 53.47 TTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr3R 14688318 5' + pogo 31 1 59.41 AGGAGGATTAAATTCGAATAAAAAAAATATATATAACAACTAATATGTTTATTAATGCATAAAATCGTAAAAAGTAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACA:1 + chrX 13509947 5' + invader4 154 2 79.21 GGTGTGGGAAAAAGTTAAATTATATATTTAAACATTGCAATGCAAATTTTCCGACTGACTAATAGGTGCAGGTTCAAATGCACGTTGGGCGCCAATTAATG:1 - chr3L 12866641 5' - gtwin 488 1 65.35 TTTATTTAATAAAATTAAACGTGCTTCGTCTGCAAAATATTCTCACACATAAACATAATTAAAATCGACTTTCAAGTTTAAAAATTAAAAGTTTAAAATTT:1 + chr2L 422528 5' + HeT-A 460 1 84.16 CATTGAAACACAGTTTGGTTATTTTTAGCCATCACCTGACGATTTTTGTGTTAGGGTTCGGGTTTTTGGGGGTGATTAGGCGGCGTGTTGTTGGTATATGC:1 + chr2R 15268516 5' + accord2 300 1 72.28 TATTTCTCATATTATTACGTTGCACTATCTTTCTCTCAGTGTAGCACGGACTGATTTTTGATCTAACCCTTTTTAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTCCG:1 + chr3R 31030564 5' - gypsy8 319 1 64.00 TTGAAACTAGAAAAACAGGACTTGGTTATATTGTGTCTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chrX 2172289 5' + I-element 40 1 64.36 ATCGTTTTGTGGACCGCTTACAGATATATTCTTTGTTCGTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 - chr2R 6670092 5' - Tabor 7291 2 54.46 GACCATGGTCCACACACAGCGATGTCCCCAAAAAGGACCTCTCTTTTCATCCCCCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGT:1 - chr3L 13192877 5' + Ivk 4995 1 58.42 TAGAATTTGCTTGCTTGTCTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 + chrX 8852857 5' + HMS-Beagle2 30 2 55.45 AAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3R 12115339 5' - 1360 3350 1 65.00 GTNTCTTTAATTTAAAAACTAAAATTTTGTGGAAATATTTGAAAAATTCCATAAATAAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 19952398 5' - roo 9052 2 59.41 ACNGATAAAAAGATATATGCTTTTCATATACAATAAAAAAAGCTAATAACTGCGTTATTGTTAGAGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTT:1 + chrX 20858698 5' - Copia1_DM 161 1 55.45 TGGGTTACATTTTTATGATATAAATTGTCGTGAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACT:1 - chrX 13954783 5' + Juan 4070 1 65.35 AGCAACCCACTAAAAAAGCATGGGAAAAATTATACTAATTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTATTTTATGAGTCG:1 - chr2L 12283895 5' - 297 386 2 43.56 GANCCGACAAATCAATTATAGGCCCCAATGCGTTTTCTATTTTCTATCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAA:1 - chr3R 9127433 5' - invader3 246 2 55.45 CGATGAACTCGTCACGGGAGGAGCGCTTCCTGCCGTGCCTGCACTGGGAGAAAATCCGTGCTCTGTTAGTTTCAACATTTATAAACAACATTTGCAAA:1 - chr2R 19153546 5' - NOF 3943 1 79.59 AACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2R 13122017 5' + pogo 43 1 71.29 TAAGTTTCGCCGTTGTTTACGAGTTGTCGGTTGCTGTAGTTGTTAATAGTTATGAGTTTCTGGAGTTTTAGTTTTTCCAATGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 8435058 5' + FB 175 1 69.89 AAATATATAGCTGAATCATGTTTTCTGTGATGTATGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTTGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3L 12990593 5' + hobo 34 1 63.83 CACTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGAGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 + chr3L 11920058 5' + Tabor 6882 2 72.63 AAGCTTAACTCCAAAAAGGATCTCATCCCGCCCCCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chr3L 9064310 5' - jockey 4947 1 64.36 CTTGAAGGGCTGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAG:1 + chr3L 14944570 5' + G5 4778 1 60.40 ATATTTCGTATTATTTTATAAATACAAAATATATCCGATTGTAAATATTTTCTCTTTAAATAACAATCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAA:1 + chrX 9476158 5' + I-element 4915 1 63.37 TAAAAGACAAAATTATTCATGATGTTTTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2L 20152994 5' - opus 476 2 57.43 GACAAGGATAAGCCGGCGTACTCGTTCTTTTTCGGCACGCCCCCACTTTTCCGCTTTTCCAACATGCCATGGCCGTATTTTATTGAAATTCATGTATTTTT:1 + chr3L 11473426 5' - S2 1638 1 73.27 GTCCTCGATTTCCAGGTTTAACTAGCTATATCACTCGCCAGCGCGTTAGGATTCAGTATGATTTGGAAGCCAAAGAAAAAGGTCGCAATAATGGCAGG:1 - chr3R 30673365 5' + hobo 449 1 68.37 TATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCC:1 - chrX 23182921 5' + Idefix 18 2 58.42 GCTGCAAGTAGAAAGAAAGAGACTTGGTTAAAATAAAGAGGGATAGTCATGCCACGTACATGAATAAGAAATATCATAATTTTTCTGGTATATCGATAGAA:1 + chrX 843174 5' - INE-1 500 1 76.24 GGAACTGCAGACGAGATTGGTAGTCCAGTTGGGAAAGGTAGATGAATGGGTGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGA:1 + chr3R 14754182 5' - transib4 2387 1 64.95 AGGAAACTAATAAAAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACC:1 + chr3L 27182005 5' + F-element 268 1 66.34 TTTAATTGAATAGCTAATTTATCAACAAGGTTATTGATTATCAACACTATTGCTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATC:1 + chr3L 9915560 5' - I-element 25 1 57.43 CGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATAACAAAAAAAATATAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGA:1 - chr3R 19449954 5' + gypsy6 7430 2 62.38 CGCGGCGAAAACTAATTTCACCTTTTCAAGTTGTTCAGCTGAAATTATTTAATTTAATTGACTAGCGTACTATTACCCTTCTTAGGCAA:1 - chr2R 21270190 5' - jockey2 3352 1 55.06 AGAAGTACAAATGCATATGCTTTTGATCGTATATGATTAGTTCATTAGCAATTTCAGCTTTTAACTGTCTCATATGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTAC:2 + chrX 21493316 5' + BS 4695 1 65.35 CGTCATCATCAGCATGCGACTGATGTTTGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 17729088 5' + hobo 9 1 58.06 CCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTC:1 - chr3R 1977611 5' - micropia 417 2 62.63 TCNAACAAAAAATAAATCATTTTTATAAACATAATATAAGAAACGGAAATAATTTGTTGAAGGCTACAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTACCACGCCG:1 - chr3L 895832 5' + 412 192 2 64.36 AACGAAATAGAAACAATTGGTTTTCGCAACATTAACGTATTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2L 1590829 5' + opus 7150 4 61.39 GTAGATTTTCTTTTATGGGTTGCGCAGACGGGAAAAATGCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAAACTA:1 - chr3R 19498716 5' + 1360 334 1 69.31 AGCTGCGATTTAACGTGGCGCACATTATTCATTCCGTACGTTTTTATTACTTCATGTTCGTGTTATTTGTATGCTGAAGCTTAACCTTCTAGATTTTATAG:1 - chr3R 29527499 5' - INE-1 161 1 70.30 CCGTTTTGTATTCGAAATGCAGCCTTAATAAAATATAATTTAGAATTCGACGGCGGCTATAACATTCCAACAAAAGTAATTGTAATTTATAATTTATTTAT:1 + chr2R 8518581 5' - copia 5120 2 73.27 CANTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCC:1 - chr3L 19339425 5' + Tc1 30 1 52.48 TTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAG:1 + chr3L 25272574 5' + 1360 88 1 74.00 TACACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGAT:1 - chr3L 22016848 5' - INE-1 151 1 57.43 AATTAAATAAGAGCTATTATTCAGCTTGTACTTTAATCTTGCGTTAAGCTCAAAGTATCGATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTA:1 + chr3R 5763717 5' - Stalker2 394 2 68.32 ATGCAGCGATGCCATACGTGACATATGGACAAAGGTACATAAACAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGA:1 - chr3R 15814229 5' - F-element 16 1 57.43 TTCAGAGGGAGCACTGTATCTCTACATTCATGGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCA:1 - chr3L 684779 5' + BS 4828 1 68.32 TTATTTAATTAGTTTAACTTATTTATTTAATTTGTTTTATTGTTTGGTTGGAACTTTAACTTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATG:1 - chr3R 5779050 5' - TAHRE 10415 1 68.32 CTAAAATAATGTTATAATATAATAAACTTGCAAAAATGTCACGTACTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 26255107 5' - opus 7476 2 61.00 ACATGTCGACGGCAGTGGCAGCCCCGCCCCTCTGGGTAGTTTAGTATCATAAGAAGTTGTTATAAGAACTTTATAAGTCATGAAAATATTTTTACCAAATA:1 + chr2R 18482052 5' + Juan 434 1 70.30 AACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 4022351 5' - roo 9034 1 64.36 TTTTCCACATTGTCGTTGTAGTGCAGTTGCCAAAGTAACGGTATCTGTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 10522027 5' - roo 9043 1 56.44 GAATCGCACCTGAAACGACGGAGTGAAGGGGGGAAGTTAGAAAAAAGTTGGTCCAAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3L 1698634 5' + roo 21 2 58.42 CGNACACACTTAGTCGGATGATGAGACGAAGACGAAGACAGAGACGGAGGCGGAGATCGGCAGACACTGCAGATTTGCGTAGCCGCTACGAATATGAGATC:1 - chrX 12297682 5' + gypsy2 6607 2 64.36 TTTGGCCATGTCAATGCAGCTTCGGCTTCAAGCGCAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAGCCTAAGTCTACAAAATACTAACTACTTT:1 + chr3L 13728469 5' + TAHRE 10258 1 66.34 TGAGGACGAAAAGTGGCGAGAAGATTTTAAGGAAGAACAGGCGGCAGCTCGTCAACTCCGACTAAGCGTCGTAAAACATATTTTTATTACTTACTCTGCCA:1 - chr3R 23125932 5' + Gypsy6A_LTR 235 1 60.40 GTNTTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr2R 5485075 5' + 1360 40 1 66.34 AAATTAAAAATTGTACCATGCAAATGGATGAATTCTTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATG:1 - chr4 149105 5' - Gypsy6A_LTR 232 1 46.53 GCTTTTAAGCCGAAAACTTTGCGATGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1 + chr2L 7162060 5' + FB 72 1 74.26 AAAAAAATTAGAGGCCAGAAATAGCTAAACATTTTATATTAGTGTTAAGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 - chr3R 7009999 5' + copia 27 2 54.46 CATGCAACGATATAATTTGAAAATTAAGAAAACGTGCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAG:1 + chr2R 9788911 5' - blood 368 2 65.35 AGCAATTAACTAATTAGAATTGCGTACAAATTTGAGAAGATGCAAAAAGGGATGTCACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 26140733 5' + 412 7073 2 57.00 GCATTTCCGCAGCCCGTGTTTATTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTG:1 + chr2R 20881449 5' - Quasimodo 6942 2 77.23 GGAATTTGCTATTTTGGGAATTTGCCCAATTGGTGCCAATGTCCTTTCCAATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCA:1 + chr2L 17834473 5' + Quasimodo 7032 2 59.41 CGAAATCAAACTTTGTTGTACACTTATTCAGTTCAGTTCATCACAATTTATTTACGAAATCTCTTGATTTAATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 - chr3L 18635028 5' + FB 6 1 77.23 TGNACATTACTGCGGCTACAACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTC:1 - chr3R 16652233 5' + GATE 8293 2 68.25 AAATATTAAGCAATCTTTAATTCTTAAATAAGGTCACCGTACTCTTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 + chr3L 18511034 5' + Ivk 6 1 69.31 TTGCCTGGTATTTTGTGTTTTATTGTGTCGTGTTTGCTGCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 + chr3R 17665943 5' - Transpac 5228 2 78.22 TGNTTTCGTTTTGAAAGGCTTTCGAAAGAAACCTTTGTGATTTGGCCAGGTGAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2R 18649392 5' + opus 7024 2 57.43 ATAGGGGGCTTTGTGTATGTTGGGAATGGGGCCTTCGCTTGGTTCGATTTAAGTGCGATTATGTATTATGCATTTAGTCGGCGTGGTAATGCTGACCATGC:1 - chr3L 18545971 5' - 412 7244 4 58.42 TAATCAGATGCCAGCTCGGACACAACTCAGCTACCATCTGATGCTCATTCCAAGTAATTGCGAGTAGTTGCACAGGAATCATAAATAAATAAATCTCATCA:1 - chr2L 13723625 5' + G3 348 1 74.26 CGGAGTAAAAGTGTCAATTTCCTAACGATTCAATCTAACTCTGCTTGTTGGGCAGTTGGTTTTTCCACGGCCGCTCTCACGCACAAAAACCGCCCAAAACT:1 - chr3L 15330769 5' + INE-1 346 1 63.37 ATNACCCTCAACCCAAATTGCCGTTCGTCTTGGTGGCCACTTAACAGCTCGTAAAGCCAAAGGCCGTCACACCTAATAAATATTGTAATTGTAAAATAAAA:1 + chrX 4763234 5' - P-element 2593 1 65.35 CCCGACTTTGTATCTGCATCTGTGGGTTGAGGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGA:1 - chr3R 18325213 5' - roo 131 2 67.37 GCCTTCCTGGCTGCTATGCGAATTCAATAAATTTGCCTCAGGATATGTGGGTGTGCTTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGT:1 + chr2L 8620612 5' - accord 288 2 55.45 GCTCTGTGTGAATGGCTGCGAGCATGTCTGCGTGCGCCTTCTGCTATGCTAAACTTTTTACAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCC:1 + chr2L 15013875 5' + jockey 4625 1 66.34 CCAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAAT:1 + chr3R 10030705 5' - BS 5072 1 54.46 ACGGGTCTCATTTGCTCCGGCTTTAATTAGCGCAGACTCGTAGTAGTATGCAAATTGGCGTTACGTGGCGATGACCGACGTAGCAAGAGTTCTTATCTCTA:1 - chr2L 9783425 5' - Burdock 106 2 67.33 AATGGGGTATGAGTAAGCCCGAAAGTCAGATACTGCATACTACAGATGAGTTATCCTTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr3R 27539251 5' - Burdock 6376 2 62.38 AAGTGTGAAATTACTAACTAATTACTAACATGTGAAATTTAATGGAATACGGTTGGGGTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGGAGCACCGA:1 + chr3L 3722536 5' - HeT-A 5730 1 58.42 CCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAAT:1 - chr2L 21403553 5' + G5 4402 1 53.47 ACGCATACAAATACAAATCCAAGGATTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 19560899 5' + hobo 49 1 71.29 CTTAACGCAAACCCACACAAAAAAGAGAAAAAAAAACAA:1 - chr3R 6618672 5' + gypsy7 5009 1 79.49 ATGCAGCAGCCACGCAATGGGCTAACAATTTTTTTTTTTGTATTTATATTATTTTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr2R 15608360 5' + pogo 4 1 59.77 TANGAATTTAATATATTTCGATTCAAAATATGTTCAATTAGGCGTACCAATGCGATAAAAACAAATAGTCTTCTTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAA:1 + chr3L 4553741 5' + G2 2802 1 69.31 AAAAAATATCTTTTGAGGGGGCAGGGTAGCGAGGGTAAGTCTGTCTGGATGGTCGCAGTCGTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAATACACAG:1 + chrX 17949750 5' - Tc1-2 468 1 68.82 CCATTTTCCATTTCAATAATTATTTGTGTGTTATTATTATTATTATTATT:1 + chrX 20042947 5' - mdg1 16 13 92.00 ATCGCCAAAGTGTCAATAATTTTAAGTGCAGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATC:1 - chr2R 11516309 5' + F-element 129 1 75.25 CATATGTATATAGGGATGTCTGAAAGGTGAGAAAATTATGCGAACCGCTGGTGGTGTAGGTGTCTGTACACAGCTATAAAAATCCAAAATTACATTTAAAT:1 - chr3R 31992314 5' + transib4 2551 1 72.28 TTAAATTCCATGCCTGTTTCGCTTTTTACTATGCGACGCACATACAAAGAGTGCCATAAACGAAAATGGCCGCCCCGTGACTATGTGTGTGTGTGTGTGTC:1 - chrX 14348331 5' - accord 184 2 67.33 TCTTAATTAAATTGCATTGAGAAGCTGGTGGGGATTCGGTGCTCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGA:1 + chrX 17036526 5' - F-element 389 1 57.43 CGAAGACTTTCAAATAAAACAACAACAAAATTCAAGCCCAAGCCCAACCATCATATAATAGCGAAAAGGCACTAACACATATTTATCTGTGTTAAAAACCA:1 - chr3L 8441275 5' + Porto1 121 1 75.25 GTGAATACAGGTATGCCCTTCGTGAAGCTAACACCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCACCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3L 17503206 5' + pogo 40 1 63.37 TTTATTTTAAGTTAAGTTAGGTAACTGTTGATTAGTCCATAGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 18754444 5' + roo 8697 2 62.00 TAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3R 19450187 5' + roo 8720 2 50.50 GAATGTGAGATGAATATCCGTTTGGTGCTTGGGATGGTGGGGTGGTGAGATGTGGGTTGGCAGTGGGAGGCGATGGGAACGGCTGCTGAGCTGGGTTAGAC:1 - chr3L 10120525 5' - F-element 4491 1 76.24 AANTCCAACGATTCTACTTTAAATGTTATTCTCATTACATGATTTTGCCGCTATCGGAATACTCCAGAATGTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAAT:1 - chr3R 11860722 5' - invader4 2809 2 75.25 GGTATCCGAATTACCCTAAACAACCCAGACCTCACACACAGTCTGAAATACATTAACGTGGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr3L 7061222 5' + I-element 17 1 59.41 AANCATTTATCACGTCACCATGCAGGCTCTCCTTACAGATACTCCCCACATAAGCACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAA:1 + chr3L 20552555 5' + Burdock 6154 2 60.40 ATTATTTTTTACAAAAACCAAAGAAAAAGAAATATTTAAAATATGTAAAAAAAGAGATTTTTAAAAACCGAAACAAAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAA:1 - chr2R 24696225 5' - accord2 7273 1 77.00 CAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGA:1 - chrX 4175142 5' + I-element 332 1 56.44 CANCGACGACGATGAGCACGAGAATGAACGCGAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 18356199 5' - P-element 2848 1 39.60 TGAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTA:1 - chr2R 4339511 5' - G5A 2787 1 78.22 ATATAATTTAAGTATGATTTGGGTTAATAGGCTTTGAGATATATTTATTTATTATATTCTTAATGTTTTATTTTTGATTTTTCAATTCGATCGCCGACGTG:1 + chr3R 25971151 5' + F-element 9 1 71.29 CACTCGTTTGCTCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 + chr3L 20669101 5' - Transpac 5213 2 71.19 AATCGGGGAAGTTAACGTGGTTGTCTGCCCTCGTGGCGCGTTAAGTTGTTGATTCCTGGCAGAGACGGCGTCGCTCGAGTTGCAGAATTGAGGACCGCGTC:1 - chr2R 11102375 5' + diver2 4425 1 53.47 TTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2L 12322982 5' + hobo 36 1 60.40 ACAGAATGACAAATTGTCAACTGAACAGTGAGCAAATACTGCAAGCCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr2L 6645646 5' - mdg1 7430 2 52.00 TCNCTATACGCACACGCACCTGGACAATGCGTAGCGAAGAAAGTGCGTTTGTATTGTCATAGGCCAAATTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3R 7886091 5' + jockey 16 1 70.30 GGAAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chrX 9579316 5' + Tirant 8136 2 59.41 CGAAAACAGCAATGAAAACCACAAAATGTTGTCCGCTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTATTATTATTATATGAAAATAGATTAGAAATAGC:1 + chrX 4257075 5' + 1360 326 1 64.36 AATATCAAAAGCAAATTAATTTCAAAGCGATTTGTATGCCGCTCTCTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTAGCATAAAGTCTAAAATTTTATGT:1 + chr2L 6646958 5' + transib2 30 1 64.36 CGCCAAACCAGAGTGGCGAAAAACCAAACAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAA:1 + chr2L 16027823 5' + HeT-A 5991 1 76.24 TTNTTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 + chr3R 26434695 5' - Tabor 7282 2 67.33 GCNCACCCCAGGGTAATTATTGAACATGTTTATTATTTGGCTAATGGGCCGCAAAGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCAATTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr3R 9297112 5' + hobo 22 1 57.43 AGAGCCAACTGCTAAAAACCAGATGGAATAGCACCACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACA:1 - chr2L 18175007 5' + accord 7085 2 66.34 AAAAGAAAGGATAACATTTTATATAAGCCATATAAGCCTTCTAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr3L 17448039 5' - hobo 2904 1 58.42 AATTTATTTATTTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr2L 8649219 5' + F-element 52 1 65.35 AGGAAGCCGCAAATAAAGCGACAAATTCCCAAAACCGCAATTCGGTGTACATAGATACGAATATACAGTATAATTCGCTGAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3L 6522369 5' - pogo 2086 1 61.39 GCAATGTCCAATGTCCACAAATATTTTTATTTTCACATCTGAAAATTGGTTCTTCATAATTCAATTCGCCTTTTATTCATTCTTAAATAGGTTCTTATCAT:1 + chr3R 4400153 5' - rooA 269 2 72.28 ACAATTGCTGTGCCATTTCACAGATGCTGAACTTGCCCCCCACTGCGGCAACTTTCTACTGTCAATGTCAGCATGCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGGAAAC:1 - chr2L 13254700 5' + gypsy4 156 2 66.34 GCAGGATCTAAGATCCTTTTCCCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 18223792 5' - roo 355 2 76.24 CTTTGTGCTTTTAATTAGGTATTGCCAATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCT:1 - chr3R 9192608 5' - invader3 5455 2 71.29 CTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:2 + chr3L 22400260 5' + 1360 16 1 63.37 TTNCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTCGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chrX 7768921 5' + hobo 37 1 64.36 TTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACT:2 - chrX 23182905 5' + Idefix 34 2 63.37 CGNCTCTTAACCCATTGAAGCCAGCGACTGCAGGTACAAATGAAATGTAAATAATTTAAGAGGAATAAGTTTAACGGCAGTGAGCCGGAGCAAGCTGTGGT:1 + chr3R 24465186 5' - gypsy 7249 2 76.24 CCAGAAGGTCCTTTGTCAGGCTGGAGCCCAGCAGACGCACGAGAACGGCGACGACGGACGCACCACATCGAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1 + chr3R 19590478 5' - BS 5025 1 76.24 TATATGCATTGTTGTTTCGGTTCGTTGCATTTTCGTATTGCATTTTCTGTTTCTTTTTGGCTTTGTTTTTCGATTTCTTTTTATTTTGTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3L 4430916 5' - gypsy11 3934 1 56.44 CCAGAATTTTAAGTACTTGCCGATCTGGCCGTAATCTTGAAGGGGGAGTAGTTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAATTGGCTCAGTGTATGAAACATA:1 + chrX 4576385 5' + Gypsy6A_LTR 30 1 74.00 ATAAATTAGGTTTGAGCTCTGAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCACATAAATTGGA:1 + chr3R 20230185 5' + Bica 4703 1 77.42 TTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTG:1 - chrX 21534509 5' + 1731 4449 1 70.30 GAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3R 23601764 5' + jockey 12 1 63.10 GGGCAACCAATTGAAAAATGTGGAAAGTACGCTTATTGATATAAATTATCTTAAAGCTTTTAAATGTTTTTAGACAATTTATGTTTTTATTACTTAGATTT:1 - chrX 19881526 5' + hobo 2489 1 54.46 CAACTGAATCTGGAGGTGGCTCTGCTGGTGCGTGCCCACGACCAGGACATTGTGGTGCGGCAGTTGCAGCAGAGACGCTAATGTAGCCGCCGACAACGTGC:1 + chr2L 3532422 5' + G-element 487 1 70.30 TGTACAATTCTATTAGCCAAAATGAAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCTCCCCGATTTTTATTTTGTGTCTGTCAAACCAGCCGTGGTTTT:1 - chrX 5280499 5' + Cr1a 56 1 75.25 TTNCTCCATTTTATGTATGTCCTTCCTCATCGTTACTCGTCGAGTAAAAGGGTATAATAGATTCATTGAAACGTTTGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTT:1 - chrX 19122438 5' + INE-1 34 1 77.00 TTTATTTCTCTTGCCAATTGGTTTAGAAATGACGAAGAAGTTTAAAATATACTCCCAGCACTTCCTTTAGCTGCTTAATGGGTATCTGGTAGTCGGGAAAC:1 - chr2R 7316171 5' + INE-1 556 1 87.13 AANGTGACAGGGAAAATTTCCATATACAAGCTGCTAAATGTTATTGGGGTTATAGTATGTGGGTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATA:1 + chrX 14040695 5' - roo 8623 1 62.38 TTATGGCAGTTTCGAACAGGAAATGTTAAGCACGGAAATCATGCGCGCCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 - chr2R 10763717 5' + FB 30 1 52.48 TATTTCTTCCTCAGAAGGTTATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chrX 20331793 5' - mdg1 7447 2 61.39 GAATACACATCCAAAATAAAAAACTGGAGGGACAATAAAAAGGAAAGAAGATAGTTTCGGAAAACGTGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 + chr3L 22775881 5' - flea 5004 2 68.32 AAAATCAGTAACAGACCCAGTTGGGATTTTCTATATATCAAGAAAACTATCAGCAAGAGAGAATGCTATAGTCGTTTTCCCCAACTATCAGATACCCTTTA:1 - chr2R 5965314 5' - INE-1 552 1 55.45 TTTATGATTTATAAGCACAAGCACACACATAATAGCAACAACGAAATTTCACAAAAAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAA:1 + chr3L 17210598 5' - S-element 303 1 59.41 CACACTCTTTTAGTTTTAGGTTTATCTTTTGACACAAAATACAAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTA:1 + chrX 19820054 5' + mdg1 7072 2 58.42 TTAAGTAAGAAATATAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 17420616 5' + HMS-Beagle2 482 2 82.35 ATNACTAATAACAAGTAAAATGTCACTGACGACATAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr4 119451 5' + 1360 37 1 66.34 GATAAAGTGTTGGTTGGTTTGGGTTTATGTGTGCTTGTAACACCGAAAGCGGAACAGTGGCTCTAAAACTCTTAATAAATATTAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 14008278 5' + Doc 4697 5 57.14 GCNTGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr2L 21863356 5' + Burdock 41 2 70.30 CGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr3L 13345500 5' - Transpac 261 2 75.25 CACTACCCACTACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3L 22349298 5' + jockey 14 1 72.28 CGTTTTTTACGATATATCGTAGCGAATACCAAATTTATGTTAATTGTATGCCAAACATACAAACAAAACAACAAGGACAACACAATAAACAAAACAACAA:1 + chr3R 13232449 5' + Porto1 188 2 73.00 AGCCAAACGAGTTTCAAATAATTCTCCCCTTTTGTTGGGCTCAATGGATTTTTATTTTCGCAAATATTTCTTTACCCAGTTCTTTTTTTTTTTCATAAATG:1 + chr3L 8703103 5' - HMS-Beagle2 478 1 82.18 CGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:2 - chr2R 4900351 5' + Doc 50 1 71.29 TTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 18816136 5' - roo 356 2 76.24 AAGTGCATGTTGTTGTTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr3R 29357108 5' - 412 455 2 63.37 ATNGAATGGAAACAGAGACGAGGCAACCGAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTGTGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACAAACCAGCTCAG:1 + chr3R 22624530 5' + Doc3-element 4581 1 67.33 GGNGTGGGTGTTCTGGGTTCTGGGGTTTCGTTGGGCTTTTCGCCGTTCCTGAGATACGGACAGTCGGACACCGCCAGGTCGGCTCGGCTATTGATCCTGAG:1 + chr3R 9208607 5' - INE-1 93 1 54.46 AACTACTCCTTTACCAATTAAAATTTGAAGAAATGTGTGCTCGAATTGAAAGCTTGATTTTTTAAGTGTGTTAAGATGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr2L 19644839 5' - blood 374 2 73.27 AAATGAAGAGCTCTCAACGTGCCAATGAGTAATGAACAATTAAAAGCTACAGTAGAGGACGTATGTAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGT:1 + chr3L 23155645 5' - gypsy 7436 2 64.36 GCNGGTTTAAATCCACGCATGTGAAATTACTTTGGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chr3R 10824061 5' - 412 7504 2 66.34 ATGGATTGTACGTTTGTTTTAAACCAAGACTTGACGCTCCGAAAAAATTGTGTGCAAAAAAATTGTATGGCATTACGCATCTTGTTATTAAAGTGTCTTTG:1 - chr3R 21851546 5' - 1360 1 2 64.36 GCCTTTAAAATTAATATAATAAATAATAGTTTCTTGGCACTTGATTTTTAGATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 14040790 5' + roo 16 2 61.46 GTATGGTCGATTCGGCAACTCCTCCCCCCCCCCTGGAATAAAGTGAAGGC:1 + chr2R 5400702 5' - gypsy5 6913 1 80.00 GCATCTGCTTTAGCCGATCCTCGTACTCCTGCTGCTTCTTTTCAGCGGGCTCGAGCAGAGCCAGAAAAAAAAAACAAAAAACTAAA:1 + chrX 8874817 5' + gypsy7 5018 4 54.65 TCNCACATTATTGTATAATAACTATGAGAGTATTTGTATTTGGCTTAAATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 11764882 5' - roo 9044 1 55.45 AANACTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 + chr3L 11920056 5' + Tabor 6886 2 74.26 CGCCCAACTTGACAAATCTGCTACGCCCACGCTGATTAACAATCACAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTT:1 + chr3L 6372044 5' - flea 330 1 54.46 CTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 + chr3R 20373265 5' + I-element 55 1 76.24 GTAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr4 1156885 5' + F-element 41 1 67.07 AANAATTGGTTTTCGCAACATTAACGTATTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - 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chr3R 12514930 5' - opus 7485 2 63.37 AAAACAACGCCGAGATGAGCCATGCGCCAGCCACTTCTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCACACGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAA:1 + chr3R 25925262 5' - 1360 3281 1 73.27 TTATGTCATAAACAGTTTGAATGGCAAATATGCGATAGAAGTTCAATTCGTTCAAGGCGATATTATTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGC:1 + chr3R 9419041 5' - Doc 4565 1 71.29 ATAAAAAGATATATGCTTTTCATATACAATAAAAAAAGCTAATAACTGCGTTATTGTTAGAGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAG:1 + chrX 20858702 5' - Copia1_DM 157 1 52.48 TCTTCGCCTAGTCGTCGGTTTAGTGAAGGCGCTAGATAGTTGCTGTTATAAAAATTGCTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAATAATGATTTGTTGGC:1 + chr3L 23854073 5' + Cr1a 495 1 55.45 GTTTTGAAAGGCTTTCGAAAGAAACCTTTGTGATTTGGCCAGGTGAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCCGCGCTCG:1 + chr2R 18649399 5' + opus 141 4 52.48 CTNCGGGTTTTGCGGTTGTTAAGCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 6184231 5' - roo 355 2 79.00 TCCCTTTTACCTCTTTATCTATAGAGTACGTTGGCCATCAGTTAATGGGTTTTTCGACTTGCTGAAGATCCGCACTTTGCATATTCTTTTGTATTCAGTTT:1 - 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chr2L 10588771 5' + Cr1a 282 1 77.23 GCTGCTGATTGAGTGTCCACTTGCTAATGGATATGGCTTTTCCCCACCCGCGACACCAGCGAAGCCCCATTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTT:1 - chrX 4711521 5' - Doc2-element 230 3 52.48 ACTCGCTTTAATAGTTATCCCGATTGCCTGTCACGGGGTTCCCTCTCCCATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTA:1 + chr2L 16954811 5' - Quasimodo 7348 2 61.39 GAAAATATTGTTATTTCCGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGA:1 - chr3R 1868250 5' + G-element 4 1 76.24 AAAAGTTTTCGGGTTGCACATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:2 - chr2L 12284052 5' + 297 6580 1 81.19 AGGATGCGAGAAGATTGAGGAAGGAGGGACGTGGTTTTTGGTACACCGATAAAAATTGCCAATACAAAGAGAAATCTAAACATTTTTCAAAAGTGTGGTC:1 + chr2L 12893488 5' - INE-1 256 1 80.00 CATCCATCACTTGCCAAGTTAGCCCACAAACTTCATCAGTAGATCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCA:1 - chr3L 8966433 5' + Max-element 114 2 57.43 TGTTAATTAACAATTATCCGAAAAGGTATCATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCATTAATTAAT:1 + chr2L 7153275 5' + diver2 410 1 70.30 GGTTGCCTGCTTATAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr2R 4900376 5' + Doc 25 1 46.53 ATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr3L 9909684 5' - Transpac 291 2 60.40 AAAACAACGATAACGGCTTAGCTAAAATTCAAAAATTTTAACAGTTTTTCTAGATAGTTTTATCTAAAAAACACGTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCT:1 - chr3L 16673657 5' - 1360 3321 1 62.00 TAAAAAATATGCTTAAAAGTATGCTAAGCATTTTGTCAAAACAATCGTTTTTATGTCATAAGATCAGATCATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 - chr3L 7868794 5' + jockey 4677 1 64.36 GGGGAAATTTAATTTTGGCACACATTTTGCGACGGAACGAAGTGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCA:1 + chr3L 1073610 5' + 1360 177 1 61.39 GTTATTCCACCTCCACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTT:1 - chr3L 22046518 5' - roo 9061 1 71.29 TGTGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chrX 4806750 5' + roo 25 2 57.43 ACCAAAGCCAAACTCTTTCATTCATCAAAACCACAAATAATACAAAAATTAAAACTGTAACACCACCACCCAAAGCGGCATTTGGTTAGCGTGGGAATGCT:1 - chr3L 698165 5' - gypsy11 184 2 75.25 AAGTTGATTGCCACATAAATTTCATGTAATCTAATAAAATTTGAATTGTCGTCGCTCAGAAAACTGTTTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCCTG:1 + chr2R 21239984 5' + GATE 8168 1 62.38 CTCTGTCCATCTTGAATTCCACCAGCTCCCGGGAGGTGCAGCATTCCGACCGAGCCACCTGGCGGTGTCCGACTGTCCGTATCTCAGGAACTGTAAAAGCT:1 - chr3R 29493975 5' + INE-1 150 1 57.43 CTGCCAATGCCAATGCCATAAAAATGGATGCACTTTTGCCCCTGGTTCTTTTCTACAAAATATTGTACCATTCTTAAAATGTATGTTCACACATGAACACG:1 + chr3R 20419010 5' + roo 8661 1 78.22 CTGCTTATAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr2R 4900370 5' + Doc 31 1 52.48 GANCTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCACCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chr2L 17205156 5' - hopper 1410 2 71.29 AGCCACATATAGATGCAATGCCATTAGACACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chrX 9983648 5' - pogo 2057 1 76.53 AANACAGGACTTGGTTATATTGTGTCTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chrX 2172278 5' + I-element 51 1 75.25 ATCATTTAAATACATCGAATGTTGTTTGAAAACAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1 + chrX 1600197 5' + BS 5039 1 72.28 TAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 - chr3L 6013714 5' + Max-element 8279 2 68.00 GAATTAGCCAAATTACCTACCAAAACACACCCAAACAGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 + chr2L 7558683 5' + FB 41 1 68.32 CATAGTTAAGATGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAA:1 - chrX 22782071 5' + I-element 4890 1 57.43 GGCCCCCGTCCAATGCATAAAAGTGGGTCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3L 12230772 5' + jockey 59 1 74.26 CTGCGGTTCTCCAGCTGAAGTGGGGCGCGTTGGAGGAGGAGGAGCAAACTGTTTACTTGGAACAGACTGTCCTCACACACACACACACATACATACACA:1 - chr2L 1754760 5' + Quasimodo 42 2 60.61 TTCATGGGTTTTGTAACATGGTTCAATTACATTCCCACATATATGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACA:1 + chr3L 15180946 5' + Doc3-element 4710 1 60.40 ACGACAAAGTTCTTCTATATGTGAACAAAGGAACAGTTTCTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 12398197 5' + roo 34 2 60.40 TAGCTATACCCGTAAAAAATTCATTTAATGCTAATGCTTAGATGAAGATTTCCCGATATTCAACCCCCGTGAACGTTTGCCAAAAGGCCAATAATCAAAAT:1 + chr3L 19126295 5' - 3S18 417 1 81.19 CCCGGGAAGGATTCTGTTTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr3R 6288316 5' + Doc 51 1 68.32 CATTACATTTTAAGCAGTATTATTTTAATTTAAAATGCTTGCCAATATGAAAAATTGTTAAGTTCTTTTCAATGTCTTTTGCCCACAAACAGCGCAAAACT:1 + chr2R 5509525 5' + INE-1 229 1 54.46 CTNACTCTGCTCCGGCGACCGGCTGCATTCGTTTCAAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACAACCCCACCCCCTAAAC:1 - chr2L 8297425 5' + Tirant 4 2 72.28 CGGCGATGGATGGCAATGGCTGGCTGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 30904198 5' - roo 9048 2 58.42 AAACCCTTTCGTTTGAATTTGTTATTCAAATTGCAGAAACGCACACACAAAACATCGGAAGGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCCACTCGAAGGCA:1 - chr3R 14999213 5' + 412 7210 2 61.39 AANATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 - chrX 21564749 5' + diver 5910 2 57.43 TATGGAAAGCGAGTACTGTCGCCGAGTCGGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCG:1 - chr2L 2686316 5' + F-element 4491 1 71.29 TGCACAAAAATCTATCAATGTTGTTGTTTTTTGTTCACTGATATTCCCTCTCTCAAACGTTGCACTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAA:1 - 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I-element 5321 1 60.40 TTTGAACCAGAAAAGTTCTTAACTTTTACAGGACGCGCTAATACTCTCCGGGACGACAGATATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTA:1 + chr2L 17118000 5' - Bica 126 1 55.45 AGNTGCACACAGCTCGAGTTTGGGAATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr3R 19446252 5' - 297 391 2 75.25 CCCCGCTGCCAGCGGAAGCGGAAGTAATGCCAATGGGCAAATGGGCACGGGCAGGAAAAATGAACAAGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTT:1 - chr2R 7079082 5' + 412 7526 2 69.31 AAGTTTTCTTAAGTGACAGTTTTCGAAAGAGTACGTTCGAAATATGGGAAATAAAATGGGCTAAGGGTGCGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCAT:1 + chrX 6883226 5' - Burdock 6386 2 71.29 ACGGATTTTAGATTTTTCGTCAGGGTGTCGTTTGAATGACAAAATTTTAAGGACAGCCATTTGCTGAACTAAAAGTACTTTTTATTATTGTTATTATATTT:1 + chr2L 13625558 5' - mdg1 7051 3 76.24 ACAATTAAAGTGTTTCAGCTGCTTGGAAATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2L 11314082 5' + 297 30 2 71.13 TTATCATTTAAATACATCGAATGTTGTTTGAAAACAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATG:1 + chrX 1600195 5' + BS 5037 1 70.30 CGNATACGCCCCCAAATGACATGTACATAAATTTAATGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTA:1 + chr3L 7295169 5' + G2 2963 1 64.36 GGNGGCAAACTAGAGAGTTGACCACCGACCAGCAAACGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 - 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roo 398 1 71.29 GACAGGTGACGACACTTCAGGTGTCAAGTGCGCAAAATTCGGTGGAGATCGGTTGCCAAAACAGTTTTGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 + chr3L 2392345 5' - Transpac 306 2 72.28 GAAAATGACAACAAGCCCACAAGGAAAAAAAAGGGAGGAATCCGGAAATTATGCAAAAAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 3547571 5' - roo 393 1 65.35 CTCCACAGCCTCGATAACCGTCTACCGTCTGAAAGCCGAAGGTCAACAACCGTCTAAGACCATTGAATCCGGGGACGTCATCATCTTAAGACAAGGAGGAG:1 + chr2R 3925300 5' + gypsy10 5623 1 77.23 AANTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr2R 3824673 5' + 297 39 2 70.30 CTAGAATACTTTTTTAAAGGGTTAACAATTTTGAAGTAATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAAGTTACAGGTATCCGGGAGGCAGGACGGTTGCCGCAGA:1 + chrX 9301222 5' - gypsy6 7739 4 62.38 CGGGGTGCAAAATTAATTTGATGGCATTCGAAATATTCAACGCCCACCGGCAACCCTCCCGCCCAACCGACCGAGG:1 + chrX 12927162 5' - Cr1a 4420 1 80.26 TGTTGCTAAAAGATCTGCATCTCCACCTCCTACGCGCTGCACATGCCAAAGTGTAAATTTGGCAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAA:1 + chr3R 31879651 5' + 1360 232 1 55.45 ACNGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 13225494 5' + hobo 28 1 52.48 CAAAAACCACACTCGCACTCACACCAGCACGCATACAAATACAAATCCAAGGATTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3R 19560871 5' + hobo 21 1 58.42 AATCTTTAATTCTTAAATAAGGTCACCGTACTCTTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCT:1 + chr3L 18511045 5' + Ivk 15 1 59.60 AAAAATGCCAGATAAATAATGTTAGAGCAGCCAGAAAGCGTTTCGTTAAGGAAACAGAAGAAGACTCTTGTAACGAGGAGTCTACTGACCTTGGATCGACA:1 - 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chr3L 13823346 5' + Idefix 7085 2 58.42 CTAGATTCGTTGAGAAGTATGTAGCAGGCAGGAGGAAGCGGTTCCGACTATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATCCATAGCCGAGTCGATCTAGCC:1 - chr2L 22211544 5' + INE-1 101 1 85.15 CGAGAATGGAAAACCCCCACACAGAATTAGGCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAG:1 - chr3L 19425399 5' + X-element 70 1 69.00 GTTTTGCATTTAACAGAAATTAAATATTTTGGTTTGGTGTGGACCCCTTTGATAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATA:1 - chr3L 18476030 5' - accord 6943 2 49.50 GAGCGGGTGTGGGAGTGGGCGGGCGGATTTGGCCTCCACCTCTACTTTACAGGCTAATCATTTCAATCTGTCCAGCTACACATTAGGTTGAGTTCAGAAGG:1 + chr2R 18154870 5' + G5A 2790 1 76.24 ATNGTTCCGGAAAAAGGTAAACATGACAAACATTTGTGGGTGATAAAAAGCGAACGATATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAG:2 + chr3R 9127352 5' + invader3 5207 2 57.43 GTGTGGGTGTGTTGGCCTTTTGAAGTGTTGCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCA:1 - chr2L 3968591 5' - accord 182 2 70.30 CGCAAGCTGAAAGTGGAGCCAAGTGATCGTACTGCTCGATTCGCGAGAAGATAGAAGCGATATAGAAAAGGGAACAGAAACGAGGAAAGGAATATAATGTA:1 + chrX 16503506 5' - 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Doc2-element 4480 1 65.35 AATATTTTTATATTTTCCCCCAATTGGGCGCTATTCTTTGCAAAGTGTCTGGTATATCGTACGAAAATTGACTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:2 + chr2L 18177879 5' + 412 3 2 77.23 CTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 6442651 5' - roo 354 2 78.22 GGCGCATGTCAAATTGGGCGTGATTTTCAAGTGGCTGGTACTCGCTGCTCCCCGTCGTACTTTTGATTTTATATGGGTTTTTTTGAAATCCCGTGTTTATA:1 - chr2L 8802238 5' + mariner2 611 1 67.33 TTNTGTCTATTCTATTCTGGCTCCTAATGAAGGCATCAAATCCGAAGGCGACAAAATGTTTACCACCATTTTTTATAATTTTTTGTTTTTTTTTTGTTT:1 - chr3L 13234891 5' + hopper 143 8 73.74 ATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGATCGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGG:1 - chr2R 5924408 5' - jockey 4727 1 42.57 ACTCTTATTTAAGGTATCTTTTGTTTAGGAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTGAATTATTAAGATTTGATTTATGTCAAGTGGTCAGTCAGGTCTTGAGGG:1 + chr2R 6526668 5' - jockey2 3188 1 79.21 TTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chrX 23155226 5' + blood 56 2 77.23 TAAAACAAACATTTTATTCCCCAATATCTACCCATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCACTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGT:1 + chr3R 29980379 5' + INE-1 548 1 81.19 AAAAAGGAAACACAAAAGGCGCGCAAAAATCAAGGTCTCGTAACCGGGTTTTCTTTGAAAACGCTTCGGACTCGCACGCTGCACAACAACAGTGAACATCA:1 + chr3R 21679311 5' + gypsy10 475 1 76.24 ACCCGGTTTTGGTCCTGAGTCCTGCTGCGCCTGTTTCTGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACG:1 + chr3L 7033171 5' + Doc 452 1 62.38 ACATGTAGCAGTGTCCGCTTTATCTTGTGATTACAAAGGCATGTATCCGTTAGATACCAATAAATATTAGCTGATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGG:1 + chr3R 7620752 5' - 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Quasimodo 7335 2 63.37 ATTATTCACGAAGGTTCGTACTAATTATATATGCATATACATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2R 17483813 5' - roo 9041 1 69.00 ATNGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 - chr3R 13349567 5' + Ivk 35 1 56.44 TTGTAAATGGCATCAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTG:1 - chrX 4175155 5' + I-element 319 1 66.34 TCGGGTACTATTTGCATAGTTAAGATGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAA:1 - chrX 22782085 5' + I-element 4876 1 58.42 ATGTCATTTAGCAATAATTTGTGTATAAGTAATTTGAATTGAAATATTTTTGTTTGCTGTTGCTAGATAAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 + chrX 19872609 5' - INE-1 563 1 89.11 CACAGACATGCCGGCGGCGACCCCCACAAAGTGCAACAGCAACATGCAACTGCAACAACAACAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAA:1 + chr3L 2578425 5' + I-element 241 1 64.00 GGAGCATAGACATTGGCCAAAAAGGGCGCAGGAGGGTCAGACACATGACCAAGTGAGACAGAAAGCCGCCGTAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chr2L 9313904 5' + hopper 6 2 71.29 AAACAATTAGTATGACAATTTATCATATGCCCACAGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCA:1 + chr3R 26696661 5' - X-element 4388 1 65.35 TTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 - chr3R 6611273 5' + HMS-Beagle 35 2 60.40 TTGCTGTTTTTTTTTTTCATACGCGCAAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAG:1 + chr3R 1680708 5' + accord 53 2 80.20 CCGCAACTTCACAACATGCTGTGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTAAGGG:1 + chr3R 21618910 5' - S-element 1665 1 77.23 CAAGGCGGCTTTGCACGTGTGTGTGTGTGAACAACAACAACAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGTACAAAAGGGAGAGTAAACATAACACAAGG:1 - chrX 13985773 5' - Cr1a 204 1 55.00 CAGCCAAAAACTGTTAGTGGGGAGAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACG:1 + chr2R 18728172 5' - opus 168 4 76.24 TAATATTTCACTTTATTAACCTAATCACTATTATTAAATAAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCA:1 + chr3L 5067806 5' - Quasimodo 7335 2 66.34 AAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTA:1 - 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I-element 316 1 73.27 CGGTCAAATCGATTTGTTGCTTTGTAAAAGTGAAAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTAAAAACCTTATGTCTCTCTGTGAACATGATAACCAAAAA:1 + chrX 17691579 5' + Porto1 152 1 76.24 TGCCGCCAAGGAGTTGAAGTTGTATACGAATCCGACTCCGAATGGGAACGTATCTGTATCTGGAGCTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCT:1 - chr3L 447400 5' - Tabor 477 2 70.30 TGTCTTGAATATTCTCACAGTGTAAGGAGGCAGGTCCACGGGCACGAGCATCTGTGGCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 6557104 5' - roo 389 2 62.38 TATAAATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATACGAGACTAATTAAATAATGACAGTATCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACTCAG:1 + chr3R 19449908 5' + I-element 22 1 68.32 GCGGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 30904220 5' - roo 9026 1 71.29 TAAACATACATATACATAGCTTTCGGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACC:1 - chr3R 3915829 5' + F-element 4451 1 78.22 ATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:1 - chr3R 13349560 5' + Ivk 41 1 62.00 ACNCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 + chr3R 178123 5' + BS 43 1 70.30 TATACGAACTCTTATACCCAGTGGGCTTAGCCTCAAAAAGCTCTCGCTCTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - 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Quasimodo 6971 2 79.21 GTNATTGGCAAACCAGGTCACGGATCTATTACGCAGCAGAGCTGCACTCTCCCACTAAAATATAATTTTTTATTATTTTTTTAATTTATTCCCCTTTTAAA:1 - chr2R 18445929 5' - HB 306 1 51.49 AGTTGCACATACATACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 - chr3R 17666044 5' + Transpac 4951 2 57.43 AATCCCATTTGCTGTAAGTTTTTTTCTTTTTGCAGTTGGGCCAATTGTTTGGATTTTATAATATTTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTA:1 + chr3L 12107980 5' - Bica 129 1 67.33 ATAGAGTTTTCCGGCTGGGGACTCCCGGTAATTGCTTCAATTTGGCGTACATATCCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3L 7968751 5' - hobo 2919 1 60.40 ACNTTATAGATTAGTTTAGATACATACATGATAAATCCTAAGTCCCAATGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCAA:1 + chr2L 11163106 5' - 1360 105 1 53.47 CGTGATGCCGAAGATTGTCAAGCGAGTGGTGCTCAATTCGGGCTTCCGCATCATCAAGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAA:1 + chr2L 3865374 5' + copia 5042 2 67.35 CATATTAACTATCATGCACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGAAACTGG:1 + chr3L 12352909 5' + Tirant 8164 2 79.00 CTTTAATTTCGATCAATACTGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCATCAACCTTCTGGACAATAGCCAATCCCTTAGACGCCTGCAGAGAACGC:1 - chr3L 14729303 5' + G2 2910 1 78.22 TAATGTATGTATCTCTTCAGATATTCAAGAAAAATGAATAGAAACTACGGTTATGAAAAAGGAATATGATAGTTGGTTTTTTTAGTTTTTTTTCTCATTTC:1 + chr2R 9985160 5' + INE-1 471 1 84.16 TAGATTTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 20266042 5' - roo 394 1 60.40 GCATGTTGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACT:1 + chr3R 4600446 5' + Tabor 50 2 73.27 ACACCCGTCTATATTTTTAATCGCAGGAATTTTTATGGGACTTCAAGATAAGCGGGCTGATTGGTGTTTATCCGAAGCCTTTTATTTTACTTTTTTTTTTA:1 + chrX 19188692 5' - Doc2-element 251 1 76.24 CCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGTACCCCACACTTATATTAATTTATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCC:1 - chrX 21907818 5' + accord 119 2 60.40 AATATCCACTGTATGGTCCAAGTTCTTCTTTGACGTCTTGGTTTTTGAGTTGAAAGAGATTTCGGCAAATCTTATGGAATCGAAGGGCAACGGGACTTAGC:1 - chr2L 3915995 5' - diver 436 1 77.23 CTTTAACTCCCACATTATTGTATAATAACTATGAGAGTATTTGTATTTGGCTTAAATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 11764875 5' - roo 9051 2 51.49 TTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTA:1 - chr3L 5662671 5' + jockey 392 1 77.23 TTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 + chr3R 17665989 5' - Transpac 5183 2 73.00 GAAACATTAATTAATTCAATTTAAGCATTAAAAGACATCGCGGAGCTGAAGTTTTTGTGTGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAG:1 - chr3L 20226294 5' - Chimpo 68 1 59.79 CCAGGAGAATCCTGCCGATTGCGGAACACGTGGCTTAACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGA:1 - chr3L 24351680 5' + Idefix 7093 2 63.37 GTGGGTCTACAGAATGACAAATTGTCAACTGAACAGTGAGCAAATACTGCAAGCCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2L 6645638 5' - mdg1 399 2 56.44 TTCAATAAAGAGGCTGCGTATTGTCGTCCACCTTTTCATCCGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCC:1 + chr4 1183134 5' - invader4 409 1 66.34 TTTTCAACCTCAAGCATTGATAGAGACAATTGATTTTGAACTTTAGATAATGATAAATCGACATTTCGCCTTACCTTTACCTGAGTAACGGGTATCTGATA:1 - chr2R 1438155 5' + INE-1 546 1 69.31 GGTGACCCTCTGGCGCACCGACCCCACCCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1 - chr3L 10556962 5' - 412 7463 2 71.29 TTTTATATGCCAATAAAAAAATTAAATATTAGTTTAAGATTCAACTTCAAAGTTACTGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 16699085 5' - roo 390 2 63.37 AANTTTAATCATTTTTCTGACACAGTTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 29423497 5' - roo 9045 1 54.46 TAAGGCACCGCAGCTCGGAGCCAATGACAATGATAAACTCTCGATCATCTCCGAACTCAATTAGGTAGCCCCAGAAAAAGTGTTTTTATTTCATTTTTATT:2 - chrX 4474477 5' - Tc3 1573 1 64.36 AATTATGCGAGCTAGATTTCAGTAAACAAGGAAGCGGATTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 - chr3R 22208607 5' - I-element 5320 1 61.39 TANTTTGAAAGGGTTTCATCAACAATTCAATGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTAT:1 - chrX 20999783 5' + BS 32 1 65.35 TCGTTTGGTTTTGGTTTTGGCTTGCAGGTAAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTA:1 - chrX 1577212 5' + R1A1-element 255 1 70.30 TCTCTTTATGGTTTTCATTTAAAATAAACAAGGTGTGAAAATGCAGTCAAAGCATCAACATGAGATTAAATCAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAATAAC:1 - chrX 5375726 5' + HMS-Beagle2 488 10 57.43 TTNATGTGAACGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 + chrX 6509782 5' - jockey 4953 1 64.36 TGCCAGTCGGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGAAACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3R 12115327 5' - 1360 3359 1 68.35 ATCTTAAACAAGCTTAACTTATAGTTCTGCTATCACTTTATGCGCTGAAAAGACCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTACCAAAAATTC:1 + chr3L 24031483 5' - 1360 95 1 75.25 GATTTCGCCTTACAGCTTTATCCTGTCCCGTCGCTCTTATTTCGTCATTTTTTTTGTGTTTTGTTTTGTTGTGGCTGGTTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCC:1 + chrX 14337079 5' - I-element 162 1 75.25 AGTTTTCGCACAGCTGTGAGCACTGTCAAATGCCCCACGTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTACTAATCAGGTGTCAGGCGGAGCCG:1 - chr3R 18530961 5' - gypsy2 6774 2 54.00 CGATGAGATTGTAAAGACGGTCCAGCGATTGTATTACTCTAAGCCTATTGAGCTGAGTGTAAGAGGCTGTTCCCCACACTTGGATGGCGTATGTCAGTGTT:1 - chr3R 13913870 5' - G5A 2424 1 76.24 TCCAATCCCGTATTCAAGAGTTTCACCGTTTGAGTCGAAATTTTGGGGATCAATATGCTGTTGACCGCATGCCATTCCGCCTCACCCTGCAGCATAAATGG:1 + chr2L 22226243 5' - Rt1c 5200 1 63.37 TACAAAAGCATAATATCATAATATAGATATTTACAATTGGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 16699006 5' + roo 36 2 63.37 TGNTGGAGTTTCTACTTTAGCTTGTGGTGTTGTTGGTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATTATTATGTATGTCTTCGTTT:1 - chrX 12445696 5' - Porto1 4382 1 64.36 AATAAAACAGGAAAATATATTCAGGCTTTTATATTAATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATAC:1 - chr2R 5953166 5' + 17.6 6967 2 73.27 GTGGCAGATCATCGGCCACAGGGTTGTGAACCTCCTCCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTT:1 + chr3R 10160126 5' - Quasimodo 181 2 39.60 AAAATTATTGCGTTGCATTTGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTACCTTAGATAGTATAGC:1 + chr3L 10382680 5' - I-element 5312 1 71.74 TTTCAACAGCTCTTCCACACACATTATTTCTCTGCGTATCCGAATATCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGGTTG:1 - chr2R 2832560 5' - 1360 3263 1 54.46 TGTGTTTGTATGGGTGCTCTCCTGTTTGTTTGCTTGCTTGTGTGTGTGCGTGAGCCTTTTATTGTTAGTGTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAA:1 + chr2R 14552220 5' - Doc2-element 4395 1 77.23 ATAATTCAACATTTACAAGATACTTTTTGGTTGCGTAGTGCTTCAAAAGGGAGTAGGGAGCAAAAAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 9127644 5' - roo 391 2 77.23 GAAGTGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTGTATTTGATATGAATGGCCACA:1 + chr3R 6776553 5' + copia 53 2 79.21 AGAAATAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGTTTAACCAAAGACACTGGAATAACAAGATG:1 + chr3L 21316255 5' + 1360 3 2 73.27 CTAATATATTTTCAATTAATTTATAATAAAACATCAAACTAGCATTGTGCAGGGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGC:1 - chr2R 10092102 5' + R1A1-element 356 1 49.50 AATTTCATAAATAATGTGCTTTGCTGATAAATTAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGG:1 + chr2L 14732174 5' + Bica 6 1 66.33 CTATTTGAGGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1 - chr3L 1259236 5' + Doc 28 1 51.49 AATCGATGCTGAATGGTGCAGAAAATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATGGTATTTAATTACAAAATTAAGGGCTCTTTGTTT:1 - chr2L 21396594 5' + S2 60 1 75.25 ACTGCAATACGGAAATGTATTCAATAGGAAATTACTTATCTTAAGGAGTAAATAAAAAATGAGGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGT:1 - chr2L 18682244 5' + 1360 3230 1 65.35 GACAATTTTTGCCTGCTTCAAGTTGGAAACTTGCATGCGAAGCATTCGTTTTTTGTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTC:1 + chr2L 12264564 5' - gypsy4 478 1 52.48 GTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAA:1 + chr3R 4160061 5' - invader2 5095 2 66.34 GGGAAGNGGAACGCCTCAGGTATGCTACAAAAAACATGACACACAAAGAAGGGTGCCAGGTGAGCGAAGACTAGTTGGCCGATCCTTGATATGCGTGCTAG:1 + chr3L 13897079 5' - Chouto 6047 1 60.40 TGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAA:1 - chrX 21667935 5' + gypsy2 19 2 64.89 GAAATGCAATCGACAATTTGCTGAAATCCCACGAGGGCCATCTTTAAGTGACTTCTGCACTTGGGACAGCCTAACTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAA:1 - chr2L 16964293 5' + GATE 8358 2 61.39 CGTTATCGACTTCGGCTTCCGTGTTGCAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATTTCTGTACTGATAGCTAAAGAACTTGACTTCGTTTGGAAT:1 + chr2R 22467617 5' - Doc3-element 460 1 79.21 GCNAATCGACTCTATCTCAAGTGCGCCGTAAAAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAA:1 + chr3L 959815 5' - 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Chouto 240 1 77.23 CCGAGGTGGAAGTACAATCTGGTTATTTGGCTAGAACTCTATTTAAGGCGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 5925544 5' + roo 8693 2 54.46 CTTTCGCACTTCTGCGCGAAAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 9439853 5' - roo 9056 1 62.38 TCTTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCTAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2L 12284016 5' + 297 24 2 54.44 AGGATATGTGTTTAGCCAAATTGTAAGAGATGTGGAATTTTCTTGAATCCCACAAACTACTTAAAATGCTTACTAGAACTTGCTGCAAAAGCGCGCGAAAT:1 - chr3L 2836987 5' + Tc1 181 1 57.43 CAAAAGAACATTATAGTACTTAAAAAAAAAGAACACTTGAAATTCGAATGTACAATATAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAA:1 + chrX 11424555 5' + 1360 3181 1 57.73 TAATTTTTCACCATCAGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAG:1 + chr3L 13345442 5' + Transpac 4946 2 58.42 ACNCACTTTTGGCCATTTTAGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 10074739 5' - HMS-Beagle2 489 1 78.05 GGCCAGCGGTTTAATGAGTGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCC:1 - chr3R 18944749 5' + Max-element 8384 2 81.19 CTTCCCGACAAGAAGCCGCAACACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAG:1 + chr2L 7611858 5' - Burdock 6106 1 79.21 TTTATTTAAGCTTGCAGGCGACAGGAAGAAGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTA:1 + chr2L 4119747 5' - Burdock 368 1 71.29 CATCGTTCCACAAAGTAGTGACGTGGTCGCAGTACTCCTAAAAATACAAAAAAGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTC:1 + chr3L 16663703 5' + jockey 98 1 55.45 AANAACTGCGTCACGCAAAAAGAACATTTGATGGCATGTTGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 + chr3R 4600413 5' + Tabor 6856 2 62.38 AGCCTGAGCGGCGACTCTGGATCCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3L 19275694 5' - mdg1 369 2 76.00 TTTAATTACATTACATTACATTACATTACATTACAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAATTTTCATA:1 - chr3L 14294168 5' - TLD2_LTR 134 1 76.24 TTAGAATTGGAGGCAGAATAGTTGCTCGCAGGCACTTCAGATGTCAAACCCTTGAAATTTTGCTTTATACTAATAAATGTATACTTTATTAAATAGTTTTA:1 + chr2R 4716678 5' + Tc3 1518 1 51.49 TCATACCCTCAAATAATAATATTGAAACGCAATTATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 5291618 5' + roo 8705 2 70.30 CTCTCTGCTTGACCAAGTGCAAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCA:1 - chr2L 8749625 5' + transib2 337 1 79.00 AAAATTACAACTTTCCCTTGGCTGAAAAATAATTGGATTAATACTCATATTAACTATCATGCACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3L 12352864 5' + Tirant 13 2 66.34 TATAGCTGGTGGATACCAGAAAAGGAAACTTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr2L 20153066 5' + opus 7043 4 70.30 CTAAAACTAAAACTAATGTTTTATTAAAGCCGATCGCATATTAACTAAAAAAACGAGAGAACGTCATAGTACAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACT:1 + chrX 12086034 5' - INE-1 550 1 83.17 TGTAAATAATGGTCGACGTGGTCGAAGAATGGGCCACATCATCTGCTCTCCACAATATTTAAAGCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chrX 11808868 5' + roo 11 2 66.34 AAGTGTAGCATACTTCAAAGGGCACACACGCTTTAAGCGATCTGATGTTGCCATAGGAAAGGAAGGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3L 16662469 5' + jockey 21 1 61.39 ACAACAATTAGTTTTTTTTTCCCAGTGCACTGTAGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 - chrX 522177 5' - transib2 2771 1 77.23 CANCTGCTTTTCATTTCGAACTTTTATCTAACAACAAAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr2L 10712123 5' + I-element 39 1 61.39 GATTAGTTTGTGCCTTCGCCAAAAGCACTCACGCTGCCATCGCTAGCGGGGAACTCACAGCTACGCGTTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2L 16888010 5' + P-element 5 2 72.73 TTGCTATTTATGAATGAAAGTTGCGTTTGTTTACTTTTGCGCACAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr3L 20186072 5' + FB 31 1 56.44 AAAACAGAAATAACACGCTGGCCAAAAGCGAAATATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGAATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr3L 12160211 5' + pogo 37 1 70.30 TGGGGTGCACTGGGAAAATTTTGAAATAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACG:1 - chr3L 20878083 5' - F-element 4365 1 74.26 TTNACGGGCGTCAACCGAAGTCGAAACAGACGATGAAAGTCGAAACGAGATGAATACCAGGTGGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr2R 1341060 5' + 1360 13 1 59.41 TGGGTCTTAAGTCGAAAGATGTGTAATGGTAACGTTATTATTATTCTAACGTTAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 - chrX 7583276 5' - I-element 5336 1 59.41 AAAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAG:1 - chr4 156605 5' + INE-1 148 1 83.17 ACAACACAAAGACGTAAACCAAGAAATAGCAAAATAAGAAACATAGATTAATTAAGCTTTAAATGTTAATTTCGCGCCCAACGAGCGTGCGGCCGAATGA:1 + chr3L 22951655 5' - Rt1a 281 1 74.00 CATCTAAATAAACGACTACCAGACACGAGAGTTGGGGACCACATCACATCTCTCAATTTCCGGCTTTCCCTACGCTTTTTGAAAATTGTATCACTCTTCAT:1 + chr3R 28746446 5' + Q-element 150 1 53.47 ATTTATAAATCCCGTCTGAAAAAAACAGTAATTCAGCTCAAAGAAATTATTTATTTTTAAATGGTGGGCAA:1 + chr2L 16889489 5' - FB 839 3 47.89 GAAAAATAATCTTTGCGGTATCTAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGG:1 - chr2L 9274709 5' + hobo 298 1 77.23 ATGTCGTTCTAATTGGATTCGGTAGTGACCGCCAGAATTATTTCAATGGTGAAGACACAAGAATGTTTTGCTTTTTCTGGAGCACAGCTCCGTTTATATTT:1 - chr2R 1340140 5' - gypsy11 398 2 31.68 AACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGTTTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAACTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATA:1 - chr2R 4794832 5' + 3S18 6063 2 70.30 CTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 9325624 5' - roo 9026 1 71.29 GAAACGAACGGCAATTATTACATCAAATACCGAAAGATTTATACTCGTTCTGTATGCAGTAGGTTTATACAAAGACCCTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGT:1 - chrX 22577147 5' + Tc3 312 1 68.32 CGAAAATCACATTTACATACATATATTTAGTTATTTTTCCCACAACTATGAATAAGATAAATAAGTTATTACATAAATAATTTAAAGGTTTTTATTTTTGT:1 - chr2R 9129041 5' + Tc1 1467 1 44.55 TCCAGTTACATATGCTTTCCTCCGTATATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr3L 24351921 5' + roo 8666 2 73.27 CACTGCTGCGGCCTCTTTGTTTATCAAGTCTCGTATTTGAAGATAGTCTTTCGTTCTTATTTTAACACCAACCAGCCGAAGCCGACTGCACCGGAACGACC:1 - chr3L 24157193 5' + Doc3-element 4570 1 74.26 GTTTCTGCTTGTGATTTGTAATTATTCCATTCTAGCACGAAGCAATAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 27900402 5' + roo 27 2 55.45 AGNTAACTGATCGAAACTTTTTCGGCTAAATATGTGTTAAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTCTATTTATGGGCTGCAATTAACATGTCAC:1 - chr2R 8564119 5' + rooA 58 2 75.25 GGNGACAAACTTTCAGTTAGCTACAGTGCGTTCCATAAGCTAATAGAGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTA:1 + chr3L 18343521 5' - hopper 1275 1 53.47 TATAGTTTTTATACGCGTTACTCGTAGATAGATATATAGAAAGATATAGATTTCAAAATTTTTGCAACGCCCACTCTAACGCCTTAAAACCGACCAAAACT:1 - chrX 22672117 5' + INE-1 346 1 74.26 AATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTCGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 7768915 5' + hobo 31 1 58.42 TCGCACTCTTACACTCGCACTTACAGCGTGTACATAAATCTTGGCGATATATTTGCAGTATAATTTTTAGTCATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGG:1 + chr3L 13878020 5' + flea 4759 1 73.27 AAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGAT:1 - chr3R 15790091 5' + flea 4719 1 68.32 CAACAGTTACAGTAAGCACACATCTAACGTATACTTTGGATGTATTTAATGGTAACGAAAACCAGAGAGAATGCCTTAATCGATTCTCCCGACTATCAGAT:1 - chr3R 4357466 5' - INE-1 560 1 72.28 ATAAGAAACTAAAGCGGACCACCTAAATAGTTGGTGACAAGAATGGTTAGTTCGAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2R 18434448 5' + 412 20 2 59.41 ATACAACACCATTTCTCAGTTTTGTTGCGAAAGTAAAGTGGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:3 + chrX 17729038 5' - hobo 2907 1 61.39 GATGGTGATGATTAGTTAAATGTGTGTTTTTTTTTATTTTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAA:1 + chr3L 4119244 5' + hobo 221 1 61.39 TAAAACGGTGATAACTGTTTCAACCAAACACGCTTTCATATGCAAATTTCTTTCATTTCACAGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 22046409 5' + roo 14 2 65.35 GTGAGCAAAATTATGGATATGGATAGCTATAGATTGGAGCAGGTTATAGGTAGGATCCAAGCTAATGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTG:1 + chrX 5092369 5' - Quasimodo 282 2 70.30 TATCAAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3L 22751986 5' - roo 9037 1 68.32 CCCAACGATCCTCAGCTGGCCTGGAAGGTAAGTCGTTTTGACAATCCCTGAAAAAGAGATAAATAATTTTTTAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGA:1 - chr2L 18779810 5' + F-element 106 1 69.31 CACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - chr2R 18344605 5' + 1360 38 1 70.33 AAAAAGCATGCAACGATATAATTTGAAAATTAAGAAAACGTGCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCA:1 + chr2R 9788905 5' - blood 7386 2 71.29 GGGCGGGATTGGCACGGGCAACTGGAGCTTTTTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGACGTCAGCAATATCGCTGGGGGTGATCGGTTGCATAAGCAAGTCCATT:1 - chr2L 2008727 5' - BS3 181 1 79.21 CCNGAAAAACCGCGAAAAATCCATTGCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr3R 17674370 5' + blood 7061 2 77.23 TTAGTTAGTTTAATTTATTTATCGCTTAAAATGTAGCTATGCTTATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCCAACTGTGAGTTGCATGACCCTTACAGA:1 - chrX 20451356 5' + Cr1a 4171 1 68.32 TTNTTTGGCGGCTAATTTTTTTATCGGTCTGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTG:1 + chr3L 5078345 5' - X-element 4480 1 70.30 AAGCGATATGATATAAATGTAAATTAAAGTAAGCAATCAATAATTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAA:1 + chrX 14137821 5' + I-element 113 1 57.43 CCACAAGTAGCACAAGTAGTAGCAACACCATCACCACAACCATCAGCACCACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAA:2 - chrX 20474148 5' + accord 7068 2 51.49 AATGGGGATAAATAATAAGAACGGCAAACAGAACGAACGAGAAATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATA:1 - chrX 1249788 5' - rover 6962 2 57.43 CCNATCAGCGATGCCAAATACAAAAGAGGTCCTTAACAAGCTGCTCGATGGGCGGGAGGACAGGAGGGTCCACGAGTGAGGAAATCCTGATCGTCCTCGC:1 + chr2L 12383439 5' + Rt1c 5307 1 69.00 CCCTTTCCCATGGATTGGATAATCTAGGTGTCATTATCTTCCCTAACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGA:1 - chr2R 17096448 5' + I-element 4906 1 55.45 ATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGT:1 + chr2L 260984 5' + Juan 4057 1 54.46 TCCAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTT:1 - chr2R 2879477 5' - Stalker 134 4 62.38 TACGATGATGCCATCATCGGTGAACACTAAAATCAGACAGGGTTTTCCAGTGGTTTTCTTTTTCCCCCATTTTTTTTTTATTTTCTTTTTTTTTAT:1 + chrX 16769414 5' - BS 5103 13 77.08 ACACTGATATTCAGCCAGCACTGGTAGGATAAGAGTGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATT:1 + chr3R 24006903 5' - P-element 166 1 40.59 TAAATGCTGCTTCAGAGTCAATTTGCATCCCGTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCA:1 + chrX 18816694 5' - I-element 339 1 69.31 CGNGTTGCACATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr2L 12284043 5' + 297 8 2 71.29 TTTCAATTTTAAAAAGGGGGCATTGTAAAATTAAAAAAAAAATAGTAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 + chr4 1156842 5' + F-element 16 1 68.32 ACTTGTGGTATAGTAATTTTATATAATTTATAAGAACACAATTTCAAACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 8331292 5' - roo 9045 1 58.42 CTCTCGCCACAGAAAAGTGGCTGTGCTTGCTAGCCTGCAGATTACACAACCTGTAATTTTAGCTTAACGTAAGACATTAAATAAAACAGTTTTAAAAAATT:1 - chr3L 1668976 5' - 1360 3090 1 83.17 GCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACC:1 - chrX 22386763 5' + hobo 84 1 61.39 GTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATC:1 - chrX 21667930 5' + gypsy2 6519 2 55.45 ATAATAAAACAACGATAACGGCTTAGCTAAAATTCAAAAATTTTAACAGTTTTTCTAGATAGTTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 16673662 5' + 1360 3 2 74.19 CGTAGTAGAAGTTCGTGCACGGATAAAAACATAATGCCTCATCCAAGTTATTATTGTTTTAAAATCAAAATTCCGGACTATAAAAATATATATATATGTAT:1 - chrX 20008746 5' + G3 4501 1 69.31 ATTCAATCCGATTTCTTTTCCAATTTCCAACGAGAGTGAGGCGCTATCCATGTCCACATGCCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGATT:1 + chrX 19715389 5' - Max-element 373 1 66.34 CAACCCCTAAACACTCGAGACTCCACAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCT:1 + chr3L 14964180 5' + Doc 312 1 74.26 ATNTCCCTTGTTGCTTGAACTGTGAGGTTTCATTGTTGATCTTCTAAACTGGATTTCAAGCTATCTGAATGGCCGGTCGCAACAAGTCCTCTTTAAAAATT:1 - chr2L 9873592 5' + Q-element 433 2 76.24 AACATTCCAATCCGATCGGATCGGATCGGGTCTAACCTTCAGTCAACTTGTCGCTCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1 - chrX 17699246 5' + P-element 16 1 63.92 CAATACTATCATCTCTAATAAATAAATAAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGTGCGCTGGGACAAACGCTGGGACAAACACATAATGTGCTTATGGTGCT:1 - chr3L 21576904 5' + Tc1 1624 1 56.44 TTTATTGTTGTTTAGTTTTTTTCTTGTTAATGTCATTGTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCTGGCTCACGTGGCTGCTGCTGAGTTGTTCGCAGTAACTTTA:1 + chr3L 4053717 5' - G-element 217 1 60.40 GAAGGAAGCAGCTACGAAGGGGCGGCGAGAATGGAAAACCCCCACACAGAATTAGGCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTT:1 - chr3L 19425424 5' + X-element 46 1 55.45 TTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAG:1 + chr3L 25232775 5' - accord2 7605 2 55.68 TCACATGTTTTCAGCGGGATTTTAATGTTTATAAAAATATTGGAATGCAATGGAATGGAATGAACTATTTGTATCTTTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2L 18754343 5' - roo 410 1 71.29 AAAACTGTATCGGTCCCGTATTAGCATTCACCCACATATCAAACTACACACAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAGAGAGACCCAACAATTGCTCTCAG:1 - chr3L 10179394 5' + Porto1 375 1 76.24 CTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr2R 18723052 5' + opus 45 4 76.24 CCCTATGTGGTCCTTCCACGTGAGAAACTTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAG:1 + chr3L 26644009 5' - HMS-Beagle 6821 2 71.00 AAGGAAGGTGTTGCTTTTACACTTGAATAAATGCATCTCGAAGTTTGTGGTAGTAATGCAATATACAAAGATATTTAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCC:1 + chr2L 260954 5' + Juan 4027 1 81.19 CCCCAATTTGTAGACCCAATCGTCCAACCACACCATCCCCCGTGGAAGCGGAACTGGAAACGGAAACACAAAATCAAAAATTTCAAGCGAGCTGTTAAAAG:1 - chr3L 16622663 5' - Cr1a 367 1 65.35 GCNCTCGTACTCCGCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 678843 5' + Tirant 32 2 55.45 GGGGATCGTGATCCACCACCATCCACACGTGTAAGAGTACGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr2R 21497486 5' + P-element 25 1 48.31 TGTGGGCAAATAAATGCCAAGCGCTACGTAAACCAAATAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCG:1 - chr3R 28935376 5' + Doc 4503 1 62.38 TGTTATTGCCGAGTTGTTTGACCGTCCCTAAATCATATTGACGAATGGATAGATACCACGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGTCTAGTTGCTA:1 - chr3R 27444968 5' - R1A1-element 309 1 64.36 GCTGCGGGCTAGAAAACTTGCTTGTTTCAGTTTGATTCCGATTGTTGGTGTTGTGTGCCGGACTGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chrX 6518862 5' + pogo 9 1 76.24 CTAATTTTTCTAAATAAATCGATCATTTTAAAAGCAATATGTTTCGAGAGTATATAAATCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAAAAGCTG:1 - chr2L 4949954 5' - diver2 4888 2 68.32 GTNAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTT:1 - chr3R 1868218 5' + G-element 36 1 55.45 TGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 + chr3L 11156237 5' + 297 45 2 74.26 ACNCTACACAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTCACATCCTGCTCATCG:1 + chrX 19820613 5' + Rt1b 4957 1 73.27 ACTGTCTTGAATATTCTCACAGTGTAAGGAGGCAGGTCCACGGGCACGAGCATCTGTGGCTTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 6557102 5' - roo 9054 2 64.36 ATTTTGATTTAACAAGAGCAATTTACGTTTATTCCTTTAAAGCTTAAACTAATGTTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3L 15681624 5' - pogo 2086 1 64.36 TTNCCAATTAGCAGTACCTCAAGTCGAGGTAAAATGGGCGTGAAAACGTAATTAAACACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 22751905 5' + roo 8681 2 64.36 TTTTCATTTTCCCTCGTTTTTCACTTTTAATTATGCGAGCTAGATTTCAGTAAACAAGGAAGCGGATTAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAA:1 - chr3R 22208635 5' - I-element 5348 1 72.28 TTNAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3R 6290963 5' + Doc 25 1 57.00 GATTTTTCGCTCTTCTGACAGACAGCCTTGTCGTGTTTTCGGATCAAGTTTATTGACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr3R 10824131 5' + 412 21 2 58.42 ATTGTGATGATGTTTTTCAAATTGACTCTGGGCCTGTGGAGTGGAAGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAAATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGA:1 - chr2R 18351739 5' - Circe 108 1 54.46 ATCTCTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGA:1 - chr3L 5662685 5' + jockey 378 1 63.37 TGGAAACTAACACCATAGTTACCAAGGATACTTATGCCCATTGATTGGCAACTGTTGCAAAGATACTTAAATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 + chrX 5912881 5' - flea 5009 2 71.29 TTGCCAAAAAAAAATAAAAAAAAAAGGGG:1 + chr3R 25634662 5' - hopper 139 2 82.76 GAACTGAAATCTAAATTAAAATTAAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAAC:1 - chr3L 13112842 5' - P-element 95 1 41.58 TTATTTAAAGCAACTACAAAGAATATCAATCGTTAGCATTCACCAAGTTGTAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACGATTTTTTCGCCGTG:1 - chr3R 25829718 5' + 1360 46 1 58.42 AGCATGCATAATGAGGACCACGATCCTTTCACCTGGATGCGGGTTACCCCTACAAATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2L 19602831 5' + hobo 20 1 59.41 TCTCATTTGGCATTTCTAATCCTAATAGCAACAAGCACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAG:1 + chrX 8348792 5' - opus 7162 4 65.35 GTAACAAAGTTTTACACGTTCAGGCAGTACTGGAATAAAAGGTGTCGAGAAGGGATCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTG:1 - chr2R 4942091 5' + Ivk 369 1 61.39 ATNGAAAACTTTAACGAGAGGGTATGTTAAGTAAGCAGCTTGACGCAAAGAATATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTA:1 - chr3L 23869160 5' - gypsy 7425 2 54.46 GCGTGTGTGGAAACAAAGTTTCAACTGCCACAGAAATATAATCCAAGAACTGAAACTAGATCTGTTTCCCACGGAGCGCTGGGGACCAACAAGCCATAATC:1 + chr2L 21850348 5' + Rt1a 404 1 62.38 ACAAACAAAAAGGCAAATTTACATAACAAGCATAACAATTGATTAGCCTATTAGTTATTAAATAGATTAAGATACAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chrX 3237103 5' + blood 7013 2 77.23 CTCTTGTTCGTCGGACGCAGGGGGGATTGTTGGAGTAGATAGGGGAATACGTATTACAGGTGAGTCAGGTAAAACCAACATACACACACACACACATACTC:1 - chr3R 18006537 5' + accord 185 2 51.49 ATATTTATCTGAAACCAGACCACTGTGCACGAAAACACAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATAT:1 - chr3R 15198189 5' - Cr1a 177 1 61.62 TTGGCCAATACGTTTTCATGCGGCTCCCTCTTTCTCTTCTCGTTTGCCTTTCTCCTTCTCTTGCCTTTCTCACGCACTTCCTGGCATCTCGCAAGCAACTC:1 + chr3R 20791272 5' - Bica 29 1 78.22 ATTTCCCCCTTTCTGATGTTTGACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 9410819 5' - roo 9017 2 80.20 TACACAGAAATGGCAACCAGTTTGACGTATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAC:1 - chr3L 14209076 5' + Quasimodo 40 2 72.73 AAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 18816126 5' - roo 9030 1 66.34 AAAATTCAAAATAAACACGAATACAAAGTGCAACAGTATACTTGTGTTCTTTGTATTATCTATAAGTTGTTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 + chr3R 27539136 5' + Burdock 6140 2 75.25 GCNTCGAACAGGTATGGCTAGCAATGCGCTACTCTATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAACAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAAT:1 - chr3L 17556363 5' - pogo 1864 1 63.37 CTATAAGAAATTTTAGTCGTGTTTAGATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACACACACACACATACATTACC:1 + chr2L 23016844 5' + Quasimodo 41 2 70.30 ATGTCATTGTCTCCACCAGGGACTAAGGGGTATGGAACAACGAGTTAAGGATCGCTGGACGCATCAGCTGATCCCCAATCTCAAGCCGTGGATAGAACGGA:1 - chr2L 18096222 5' + Rt1c 4951 1 68.32 ATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1 + chrX 21087561 5' + mdg3 5258 1 71.29 ATNCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCC:1 - chr3R 15790078 5' + flea 4732 1 55.45 AANAAGTACAAATGCATATGCTTTTGATCGTATATGATTAGTTCATTAGCAATTTCAGCTTTTAACTGTCTCATATGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTA:1 + chrX 21493315 5' + BS 4694 1 65.35 TTTGGTCAAGAAAGTGTAATTTCCCGCTGTTCACACATGAACACGATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 19109276 5' + roo 22 2 69.57 AAAGACAAAATTATTCATGATGTTTTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2L 20152996 5' - opus 474 2 56.44 TGNAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGA:2 + chr3R 19450181 5' + roo 50 2 53.47 GAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 18816131 5' - roo 387 2 61.84 CAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCATA:1 + chrX 19820621 5' + Rt1b 4965 1 67.33 TTTGCTCCCGGCTCTTTCTAATGTGCTTCTTTTGTTTCGTTTTCGGTTTTCAGTGTTCACTTTTCGGTATTCAATGTTGCTTAAAAATTAATAACAATATT:1 + chr2R 21906731 5' - gypsy12 9771 2 67.33 ATNAATTATAGGCCCCAATGCGTTTTCTATTTTCTATCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATT:1 - chr3R 9127423 5' - invader3 5422 2 65.35 GCTGTTCAAATACGGCTACTTCGGTAAGGATTTGTAAGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGAT:1 - chr3R 25321524 5' - Doc 4430 1 71.29 AACATTCTAAGAATTCAGCAGAAGACATTTCGTTTTTGTTATTGTGTTACTGGCAAATTAAAGAGCGGCTACACACACACACACAGACACACATATTCG:1 - chrX 20434658 5' + accord 7032 2 66.67 TTNACAATTTTTTTGCATCTGACTTTTTGAGCTTTATTTTGCACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr2R 8314120 5' + hobo 3 1 76.24 TTNCATGAATGGCGACAACCAATAAAATGGGGGCAAATAACCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 29423569 5' + roo 8698 2 62.38 CTGCTCAACGATGCGACGATAAGCTTTTATAAGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCT:1 - chr3L 23694062 5' - Idefix 186 1 73.27 TATATATTCTTGTTCAGGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAA:1 + chr3L 8397728 5' + INE-1 533 1 68.32 GAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCT:1 - chr3L 23702220 5' + G4 47 1 72.63 ATCGAAAATGTTGTTTAAATATTTCTTCCATTGTATTAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr2L 14365400 5' + blood 7050 2 62.38 GTAATTGCTTCAATTTGGCGTACATATCCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr3L 7968724 5' - hobo 2892 1 71.29 TGCTTACTTTCCAGCCGGAGACTGGATTGAACGGTGGTACATATACGTTCCAAGCCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 + chr2L 8297312 5' - Tirant 380 2 60.40 CAGATGNAACGAACAAAGGACTTCTTGCTAAACTTTCTATTTGCCAGATCCGGCACACAAAGAGCAATGTCAACGCTGCGACATCAGAAGTGGGATCTGCT:1 + chr2L 11630010 5' + micropia 473 5 71.29 GGTGCAATTGGAGGTTCCTTTGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGTCTAGAAGGTTGATGGCCAGGTGGTTGTGGTGG:1 + chr2L 13535604 5' - G2 2864 1 77.42 AACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGCCTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3L 18816127 5' - roo 9029 1 63.37 GCAGCGTGCGTTTCGAGACAGCTCGAAACCAGATTCAGACGACTACGTAGATTCCATCCCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCG:1 - chr3R 6008162 5' + opus 369 2 64.36 TACATTTTTAGAAATGCTATTGGCTTTTGCCAGCTTTTGAATATTTGGTGAATGTCGCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTA:1 - chr2L 12145025 5' - invader2 254 1 67.33 AGATGTCATTCGAAACAATTTAATTTAATAAAAAGAACACATTTTTATAAAGGGTTCAGCTAGTGTGAATGCGAACCAGAAATTTCATAATTTTTCTGGGA:1 + chr2L 21718011 5' - INE-1 511 1 46.53 CTATATATTTTTTTGTGGTTCTTGGTTGTTTTTTTCAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTT:1 + chr3R 2200430 5' - Doc2-element 4715 1 77.23 GTTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:1 - chr3R 13349591 5' + Ivk 11 1 66.34 AGNGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATGGAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 4 1 56.44 TGAATGAAATTATGACAACAGATTATAAAATCAGTGAGCAAAGTAAAGTGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - chr3L 11156301 5' - 297 369 2 57.43 CATTATTTTAATTAGGTGTAAAAACTGCCAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGG:1 + chrX 1627259 5' + Dm88 408 1 76.24 CAATTGGGCGCTATTCTTTGCAAAGTGTCTGGTATATCGTACGAAAATTGACTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 + chr2L 18177899 5' + 412 7076 2 57.43 ATNTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2L 21951185 5' - opus 7460 2 68.32 CCGCAGAAAGAGAGATACGAGAGCAAACGTAGAGCCATTTGCATTTGCTCTTCATTAGCCTGTTGAAGCGCTTTGATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGG:1 + chr3R 31902238 5' - I-element 4972 1 78.22 ATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATA:1 - chr3R 1960321 5' - gypsy9 5228 2 89.11 TGTTGGAAATGATTGCTATACAAGTAACATATGTTTTCAAGAATGCAATTATAACGATTTAACATTTTTTAAATATATTCTTGTATATATCTTATATATCT:1 - chrX 10438197 5' - 412 266 2 55.45 AGNGCGATTCTGCTTTGCTAATCCGCCTCGTTCCCATGCCCGTGCTTATCAATATATATTTTTTGTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTC:1 + chr2R 13745982 5' - G6 2007 1 55.45 AANTGGGTTGTAAGAAATAGTCCAAGAACTCTCGACGAGGACGGACAGGCGGACAGACAGACGGACGTGGCGAGATCGACTAGGCTATTGATCCTGATCA:1 + chr3L 23230707 5' - INE-1 91 1 62.00 CGCCAGCCCTGCCGCTTCTACCTCGACTTTAGCCGAAAATCTTATCGAGCTGATCAATTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACC:1 + chrX 10901362 5' + mdg3 5420 2 59.41 ATCTTGATGCTGCCTGCAATGCAGCTGCAAAACAGCAATTGCACTCGGCGATCGCAGCCTGATGTTGCTGTTGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3R 26085646 5' - roo 406 1 77.23 TATTGCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3R 22494200 5' + 297 6590 2 69.31 TANCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTA:1 + chr3R 2914332 5' - Circe 7038 1 77.23 CTTAGTTTTTCGATTGAACCTTTCAAATTGACGTCCTAATTGAAAATTAATGAGTCTTA:1 - chr3L 11919853 5' + Tabor 7234 2 62.71 CAACTGGTTATAACTGAGCGGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2R 18723102 5' - opus 7462 2 68.32 TTCCGAGGTCGGCTGCATTTATTAACAATTTGCGTCATAAATAAAATTGAAAAACATTCATAATGTCAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCC:1 - chr3L 6014714 5' - Max-element 388 1 73.27 GGGCGCTATTCTTTGCAAAGTGTCTGGTATATCGTACGAAAATTGACTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 18177904 5' + 412 7081 2 52.48 GGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:2 - chrX 4022341 5' - roo 9024 2 74.26 TGGGCGAGGCAGTTTTGTGCGGTTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTGTGGGACACATGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 19271024 5' - 1360 3377 1 67.33 CGTGGGTGGGTCTGGAAAATTGACTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGG:1 + chr2L 15608309 5' - accord 140 2 67.39 ACNAACGAGATAAAGACATTTGGAAATTCTTCGCAAAAGGCCAACAGCATGAAAGGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 10557653 5' + 412 7076 2 55.45 TTTTGCTTCCCATGTTGCGCCTTGTTTAATTTGCCGCCTGTGGCACGTGACAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 30904284 5' + roo 8688 2 55.45 TTAAACAATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAA:1 - chr2R 3824683 5' + 297 29 2 60.40 GAGCAATGACTTGTGGTATAGTAATTTTATATAATTTATAAGAACACAATTTCAAACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 8331300 5' - roo 390 2 59.41 TCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 - chr3L 24208219 5' + Quasimodo 5 2 71.29 TTTTTGTATCTGTATCTGTATCCGTGTATCTGTAACATCCACACCTGCAATTTTTGTTAGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTT:1 - chr3R 12669202 5' - I-element 361 1 71.29 GTAAGATTCAAAGCGTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGTAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTT:1 + chr2R 5178570 5' - mdg3 5497 2 72.28 ACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:2 + chr2R 5485087 5' + 1360 52 1 78.22 TTTCAAATGCAAATACGTACGTCTACTTCTCTGTGGTATCATTGTATCTCCCCCTCCATCATCTGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 - chr2R 13899227 5' - roo 398 1 71.29 TTCGGCTATTTGAATGGTATTTTCAACATTTTCCTGCTGTGCGCAGGCAGCGGTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 6374548 5' + Rt1a 5080 10 61.33 GCGAACTCAAGACGACGGCAAAGAAATATTCTTTAATTTAGACCGCGACCCCTCCCTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCACGAATGCGGCCGCGGATGTTTA:1 - chr3L 1091147 5' - Quasimodo 7036 2 63.00 AACCTGAATTTCACTTCCTTCACCTGCTGAAAGCTGCTTAACTTCAAGAGCCGCGGTTTTCACTTGCTCGCTCTTTTATTGTTGTTGTTATTATTATTGTT:1 - chr3L 5258647 5' - mdg1 22 3 79.21 CAACCCCTTGCGGGGGCATTGGCACAGCTGATGTATTATTATGGCCCTCTAGATTGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGG:1 + chr3L 13620467 5' - Ivk 360 1 61.39 ATTGTTGATGTTGTTGTCGGAGTCGGTGCAACGATGTGAAAATGAAAATTCATTCAGATGCTTTGGCGTAAAATATTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGCT:1 + chr3R 16823672 5' + Cr1a 334 1 77.23 TGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 19450181 5' + roo 50 2 54.46 AGNAAAGTAACGATGTGGCTGCCGGGAAATTTATCGGAGTGGGCGGAAAACTGCGGATGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAG:1 + chr2L 19881474 5' + Bica 82 1 57.43 ATTGGGTGGTATATCTATGGGGGTTGTGCATCCTAGTCTGTGCATCGGGACTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAG:1 - 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chr2L 9488244 5' + 297 15 2 45.54 GTGGGAATTCAAAGGAAAAAATACAGCGTTTCGACTTCGGTTTTTGGTTTTTCTGGCTTTAAAGCATAAATACATAAAGCATAAAAATAAATAAATATTTT:1 + chr2R 12786076 5' + mariner2 830 1 78.22 TGATTGCTAACTTTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATT:1 + chr2R 3919667 5' + 1360 35 1 58.42 GACATTTCAAATGTACCTCAGACTGTTCCACGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 - chrX 364823 5' + hopper 44 1 65.35 TAGAACGTGTACATAACTACACACCTATATGGATGGTACATTATATATCGAGCTATGTACATATGTATGTACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTT:1 + chrX 5933814 5' - Burdock 254 2 76.24 CATCCTTCATATATCCCGCCACCAGACCAATCCTTTGATCACAGTCGATGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATTCAAACTGAAAATTAAAAA:1 - chrX 11618137 5' - Gypsy6A_LTR 154 1 56.44 GCATTGCGGGGGTAATAACTTCCCGCCCTCCCAACTTTGGGGAATAGACGGCGGAACAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr2L 18177993 5' - 412 484 2 67.02 AATGAAGCTCATTTCCGTTGGGCAAACGAAAATATGCATATGCCTCGGATAGTTGGTCATGGCGTTGATTAGTCCAAAAATGAAAATGAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 6810979 5' + Doc2-element 218 2 55.56 AAGTAATGAACCTCAACGCATCTATATAGCTCTATACCTATAAATATGTAGAACCGAACAAAAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 11175832 5' - 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McClintock 6108 2 66.00 ATTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTA:2 + chrX 21564656 5' - diver 207 1 56.44 GGATTACATTGTGTTCTGTACAATTTGACACCTGTTGAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3L 18816179 5' + roo 38 2 66.34 AGTGCGGACAATAAAAAGGTGCGAGCTGGAAGAATTTATGGGCCAGCCAGCCAGTCGATAAGCCAGGCGAAATAAGTAAAATAAAATAAAATAAAATAA:1 - chr3R 29507360 5' - transib1 1898 1 92.93 TTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCC:1 - chr2R 4181291 5' - accord 7342 2 68.00 AACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAA:1 - chr2R 4339508 5' - G5A 2792 1 76.34 TTTTAAGTGTAAAAAAATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAG:1 + chrX 22518991 5' - INE-1 551 1 70.83 AGTGGTGGTGGTTATCCTGAAACTGGTTGCTCGCCAACTTGAGTTCTTTTCCATTTACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr2L 10174190 5' - mdg1 402 2 55.45 TAAAACAGGAAAATATATTCAGGCTTTTATATTAATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 - chr2R 5953164 5' + 17.6 6963 2 74.74 ATACGGAGAGCATCTGGCTGCAACGTTCATCGTTGGTTGTCTCTGGCGTCTTAGCGTTCTAGAACTGTCCCCTTCTGAAGGTATTAATTTGCTTCCTCC:1 - chr2R 5653824 5' + Gypsy12A_LTR 2056 3 66.67 CGAGGTGAGCCAAATACGAACCATCCGGACCGAGCCGAGCCAAAACGAGCCCGACTACGCCAGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2R 9658425 5' - P-element 2876 1 68.32 CTTTTTGCGCCGCAACTTCACAACATGCTGTGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAA:1 + chr3R 21618901 5' - S-element 1674 1 68.32 ACAGGGAAAATTTCCATATACAAGCTGCTAAATGTTATTGGGGTTATAGTATGTGGGTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTT:1 + chrX 14040701 5' - roo 8617 1 57.43 CGAATAAGTAAATTTAAGATTCTGTGCTTAATTAGTTAAGTATTAAATCATTTTCATTCCGTCACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATG:1 - chr3R 4679340 5' - copia 241 1 64.36 AAAAAAAGGTTGAGAGCCAGAGAATCCAGACATTGCACTATGGTCAAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCT:1 - chr3L 25401128 5' + transib2 44 1 69.00 AAACATTAGCCAAAACCAAACAAATTGCGTGCCGTAAACAATTCGCAAAATAAACAGTATTCGCAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTTTTATTCGC:1 - chr3R 9599328 5' + diver2 4864 2 65.35 CGAATTCAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chrX 7583196 5' + I-element 24 1 55.00 AAGCTGCGAGGTCAAGGGATCGGTTCTTAAATGTATTTTCAAATTGTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 27156634 5' + pogo 24 1 55.45 CAATCTATTTACATGCCTCGCTCTATAAGTCTTTTGCAACAAAGGAGCCTCGATGTCGACAACGCAAATCCTTGATAACATAGACATGGACGAGGACGCCC:1 - chrX 3582627 5' + Chouto 6291 1 57.43 ATCAAATCAAAATGGCAGGCCCATAATTTTCTATGCCTTTGGCTAAACCCTTCATGGAATTAAGCGTATTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 - chr3L 18938965 5' + blood 7 2 67.00 GGGTCAATGAGGAAGTCAGCCATCGAATTCTATTGTTTCATCTAACGATGCAGCAGCTGCATATATATGCATATGCATAACCCACCAACACTACCTAAATC:2 - chr3L 10382748 5' + I-element 4971 1 74.26 AAGGAAATCGGTGTCGATGTGGCGTCTGTCGGGGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 + chr2L 19845877 5' + F-element 16 1 65.35 ATTCCTTCCTTTCTTCGACTGAATTTCCTAAAGCATTTTGTCTGCCAATTTACGCCTCAACGATTTTCCATGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCG:1 + chrX 8303073 5' + 297 423 1 73.27 TAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCA:1 + chr3L 10557601 5' - 412 7517 2 73.61 TATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTTAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACCAGAAAAATTATGAAATTTCG:1 + chr2R 2749407 5' + INE-1 513 1 72.28 TATAATATATATGTATATATAAAAATAGAATTAGAGCACATGCCAAAAACAACACAAAAAGGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAACAAAACA:1 + chr3L 9112451 5' - Cr1a 209 1 62.38 TAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:1 - chr3R 13349578 5' + Ivk 24 1 55.45 ACCGAAGTTTATATTGACCGGCTTAGGGGTATTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGAGTAGTGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTTTGTTGG:1 + chr3L 24148985 5' - G-element 267 1 64.29 GGNGATTGTCACCCTGCACGGAGAATAATGCGATTATTTAGTTCATGAAGGGGCCTAGAATATATAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr3L 8657051 5' + pogo 10 1 66.34 TTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGTACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGTGC:1 + chr2R 2666336 5' + Rt1a 26 1 47.42 TATACCTATAAATATGTAGAACCGAACAAAAGTGCCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 11175864 5' - roo 9028 1 70.30 CGCTCCTGGTGGCAGGGACTCTCTGCGGACACTGGCAGTACCCCGAAGATGTATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACAGACTT:1 - chr2L 11556912 5' - G4 3394 1 69.31 CANATCAGAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 19109318 5' - roo 9035 1 59.41 AGCCCGAGAAGAGGAAGTGCTTAGCTTAGCTTAGCTAAGCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chrX 6518769 5' - pogo 2067 1 63.37 TGTAATTTTAACGTGCGATATCCGAGGTGGAAGTACAATCTGGTTATTTGGCTAGAACTCTATTTAAGGCGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 5925523 5' + roo 8 2 69.31 GCGGTAATGAGGAAAATTATACTAATTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTATTTTATGAG:1 + chr2L 12283938 5' - 297 389 2 65.88 GGNACAAGGCCACCAAGGAGATCGTCGCCGCAGCGGCCGCATCCCTACAGCAGGACAAGAACAACCACTGCTGTCAAAAAAAAAAATAATAAAATAAAGC:1 - chr2L 13029004 5' + TAHRE 26 1 65.00 ATTCCAAGAAAATTAGGCCTAGGAATTTGCTGTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3R 27430076 5' + pogo 26 1 60.92 TTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr2L 12284013 5' + 297 38 2 64.36 TTGTATTTCTGCTTAGCTTTTATAATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 17172680 5' + roo 8716 2 78.22 CANTGCCTGCGATCGCGGAAGAAGGAGCACGACCGGTGTATGTTTATTCGGTGTGGTTAGTTTTTACACTGCCGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTCTCCCA:1 - chrX 8142943 5' - GATE 105 2 69.31 ATACAGCCTTTTTCAGTTCAGTTGCAGCTTAAGCTTAATATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 19952320 5' + roo 8700 2 62.38 AAAATTGTACAAACTTTTTCCGTTTACTTTGTGTAATTTTAATTTTTTTATTTGTATTATATTAGGTCGATACTTGTAAGGTATAAATACCCTGGCTTTTA:1 - chr3L 5658178 5' - TAHRE 397 1 49.50 TATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCA:1 + chr3L 27356087 5' - Tc3 1675 1 62.38 CGGAAATCCCAGTATAAAGCCAATCCACGATTGAAACATTCGGACTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGC:1 + chrX 16334324 5' + F-element 4255 1 56.44 AGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chrX 9579326 5' + Tirant 8146 2 69.31 ACATTTTTATGATATAAATTGTCGTGAATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAAC:1 - chrX 13954777 5' + Juan 4076 1 71.29 AGAAATTGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - chr3R 24430602 5' - Transpac 5208 2 59.41 AGCCTCGACGGATGAGGAGAGTGGGCGAAAGCATTGTTACCACATTTGGTTGGCAGGGATGACATCGAAGCCGCTAATGCTAAA:1 - chr2L 15568871 5' - G2 399 1 59.52 AGTGCTAAGGAAGCCGCAAATAAAGCGACAAATTCCCAAAACCGCAATTCGGTGTACATAGATACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr3L 6522376 5' - pogo 2093 1 68.32 TAACGATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 4022352 5' - roo 9035 1 63.37 ATTCGATTTGTTTTGTTGTCTATGGCCACAGCTACCTCCCACCCACCGTTCATGATTTGTTGTGTTTTTTTTTCTTT:1 - chrX 18135349 5' - gypsy7 5013 1 51.95 TGNCACACTCTGGCTTTAATATTTTAATATAACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 - chr2R 6381848 5' + copia 46 2 72.28 TGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCG:1 + chrX 21636200 5' - Stalker2 7600 2 75.25 GATGAGAGGGGATATTGGGGCGATGTTGTGGGTATGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr2L 17269837 5' - hopper 1374 2 64.36 GGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAA:2 + chrX 6509793 5' - jockey 4942 1 75.25 TACGTTTCGGTATCACAAAATTAATAACATGATAATTTTTACATATATAAAAACATGGCATACATACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr3R 27156739 5' - pogo 2094 1 73.27 ACATGTTTATTATTTGGCTAATGGGCCGCAAAGCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr3R 9297089 5' + hobo 45 1 67.33 CTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACGCTG:1 + chr4 431239 5' - 1360 3301 1 77.23 GCATAGTTAAGATGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCA:1 - chrX 22782072 5' + I-element 4889 1 56.44 GGTGACAAGAATGGTTAGTTCGAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 18434480 5' + 412 48 2 75.26 GGTAACTGAAATTCCATTGAATGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGG:1 + chr3R 28119169 5' - I-element 6 1 79.21 AAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACT:1 - chr3R 9192570 5' - invader3 5417 2 73.27 GCTGAATTCCCGGATAGTCCACAAAGATGGGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:2 - chrX 7768972 5' - hobo 2897 1 68.32 GCCATATATACGAACTCTTATACCCAGTGGGCTTAGCCTCAAAAAGCTCTCGCTCTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 11764960 5' + roo 21 2 55.45 GAATGGAAAACTGTGAAGCGTTGCGCACAAATTAACGCATAAACAACAGACAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGC:1 - chr2R 6656327 5' + HMS-Beagle 6636 1 54.46 ATATATATGTACCTATATACGAGTATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2R 13403779 5' + jockey 11 1 66.67 AGCATACTTAAAAATAACAAAACCAAAAGAATACCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3L 11156198 5' + 297 6587 2 72.28 CATGGTCTACGACCATTAGTTTGGGCTCCTCCTCTTTGTTGGTTACCGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3L 19861705 5' - 1360 3363 1 57.43 AAAGCCCCACCATCCACTCGATGTTTGTGTGTGTGTGCAAAAAATTTAATTATTGTCTACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAAAA:1 + chr3R 16696695 5' + G2 3063 1 61.39 AATCATTTCAAACTCATAAATTAAGCAACGTCCGTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr3L 2392436 5' + Transpac 4958 2 65.35 GCTCGAAACAGCGAGAATCACATATATTTGGCGGATAGCAAATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGC:1 - chr2R 18670888 5' - accord 7070 2 59.41 GTCTGTAGATGGTCTATTTAATTGATCTAACCTAGCGTTGTGGTATTCCTCACCTGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAG:1 - chrX 18213913 5' + Cr1a 4054 1 58.42 GGGGGCGCTTCTTTTGGGTGCTCCATCACCCGTTCCCGCTACATTCAAATTGGCACTTCCTCTGGATCCTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGG:1 + chr3L 508137 5' - F-element 4498 1 72.00 TGNGCGCATACATTTGTCCGAGTTTCAAAAATATCGCTTTATCTGTGACAAATGTCAGATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 + chr2L 10904465 5' + GATE 30 2 57.43 GCTACAGTTGCAACTGCAACTATTTGAGGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr3L 1259255 5' + Doc 8 1 69.00 CGAAAGTGAATTTATTTTCAATACTTACTTAACTTACTTACTTACTTACTTTACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAA:1 + chrX 6620678 5' + I-element 156 1 48.51 TGTATGCATGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCTTTGGTTATAACGCGCTTGAGTAGGTCGGTCATTGAACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGT:1 - chrX 6820852 5' - Ivk 4962 1 66.34 TTACTCCATTCCCCACCCAAAAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGT:1 - chr2R 13102538 5' + roo 320 2 79.21 GGTTCATTTGAAGCGAAAGTCAAACTCTTGCTAGCTGAATTAATTAGGAGCGTTTTTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAG:1 + chr2L 19645549 5' + blood 410 1 64.36 ACTGGCCGATTTTTGAATTAATACAATTTTTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTTAAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGC:1 - chrX 22519223 5' + INE-1 29 1 73.27 AATTTCCGGCGGCTTAACTCCGAGTGCATCGCCATTGGTTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2R 20804739 5' - hobo 2919 1 56.98 ATGAAAACGGAAGAGTCATAACACAAACAAATAGAAAGGGGCTTTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTG:1 - chr2R 23336833 5' - 1360 3263 1 59.41 GCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 678830 5' + Tirant 39 2 66.32 TGACGAAAAGCACAGTGAGTGGGGTGCGTAAGTATAGTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr3L 21636450 5' - flea 220 2 65.35 TTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTCGCATTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAACACTTATTATATAA:1 - chr3R 4583048 5' - Doc2-element 4706 1 78.00 TAAATCCCTGTATTTGCAATAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCGAATTCCCAATTCAATACCAACTTG:1 - chr3L 21329353 5' + I-element 4990 1 76.24 GTACATATGTATTTGGCAGAACAGAAGCTGCTCCCCCGTGTATTTTTTTTGTATGCCCCAAGCTCTGTTCACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr2R 18356160 5' - P-element 2882 2 43.00 GGCTGGGGACTCCCGGTAATTGCTTCAATTTGGCGTACATATCCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3L 7968739 5' - hobo 2915 1 52.69 AATATAAATTTTTATATTTATTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTG:1 + chr3R 26434678 5' - Tabor 460 2 53.47 ACNCATTAGGTGTGCAGAGAGCGTCTGTGTGTGTGAGTGAGTATGGTGTAGATGGTTTTCCTGTAGGTGTGTGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGAGGTAAAA:1 - chrX 4699828 5' + frogger 2289 2 64.36 ACNAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTG:1 - chr3R 10030752 5' + BS 5059 1 74.26 GAATTAACAATTAACGCGTACACTAAAACAAAGAACACCATCAGAATTGGCCAATTGTTCGGTTATTAAACCACAGCGTGCATTTCGGAATCGCTTTAATT:1 - chrX 13812804 5' + mariner2 215 1 63.37 TGGCCCCAAACGCCGCTCCGCATCGGCACCACATCAGGCTGATACAGAGGGCTTTGCCGCGCAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGG:1 + chr3R 16611718 5' + Circe 7215 2 71.29 AACGAGAAGAATGTGACCCATTTAAAGCACCAGTAGCCATTCTCACCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr3L 1691006 5' + accord2 223 1 73.53 TATTTCTTTTGCTACAGTTTGCTGATAGTTTGTCAGTTTGTTTGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCCGTTAGTCGGTGATCCTTGCTGAAGGCG:1 - chr3R 5096604 5' - Chimpo 3829 1 57.43 AGACGAATCCCCAAGACGATCCCCAAGGAGTGAAACGCAAGGACTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCACCTCTCCT:1 - chr3L 420024 5' + Doc 425 1 57.43 TTGGCTGCATCCGGGGGCTTTCAAGGTGTGTTTGCTTCTAAAAGCTCCTGCAAAAAAGATAAGTAAGTTATTATTTTATTAGGATTAATATCGATTAATT:1 - chr3L 13830034 5' - HeT-A 5773 1 85.00 TATGCCATTCATATGAATGTTTGATTAGCTATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2L 7393667 5' + opus 155 4 68.32 GTGTCAAAGGACATGGAGAATCCTTCGCCTGGCGTTTGGCATCCAAATGCCCCAGTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCT:1 - chr2R 13312001 5' + jockey 4665 1 60.40 GCCGCCTTGCCCCCAAAACGCCATCCGCACATCATCTAGATTCTAGAACTTTGACTATTTATAAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2R 17077919 5' + Tirant 13 2 68.32 ATCGCTTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAG:1 + chrX 21636178 5' - Stalker2 374 2 53.47 CTACCCCTAACAATTGGGGGGATAAAAAAATATATGTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chr2R 4426873 5' + 1360 39 1 65.35 GCNCGCTCTCTCTATACGCACACGCACCTGGACAATGCGTAGCGAAGAAAGTGCGTTTGTATTGTCATAGGACAAATTGATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 + chr3R 7886083 5' + jockey 7 1 77.00 TTGCCCCCGAAGCTGGTTGGCTTGGTTAACGCAACAATTTAACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr2L 15013941 5' + jockey 4691 1 54.76 CGATTTTCCAGGTCTCTCAGGGGAGATGAATGGTGTTGGGCACGTTGTCGGCGGCTTCCTTTGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGCTTGACTTCCCTAGGC:1 + chrX 10704143 5' - G-element 447 1 63.37 GAAGAGCGCCGAGAGAGTTGGAAACGAAGCCGAAGCGAAACCCGAAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATACTAGCTTATAAGTAAGAGC:1 + chr2R 10541724 5' - invader3 5291 2 55.45 CTCACGCTGCGAACGGGGCTCTCGGGCACGGTCTGCGGTTGTTGTTGTTGCCGATGCGATTGCCATTGTAAGAGAGGCAACCGTGCTGGTGGTTACAGCAG:1 + chr2L 19566382 5' - Doc4-element 266 1 74.26 GTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTGCTTA:1 - chr2R 3341938 5' - Dm88 4123 2 67.33 TTTTCAAAGAAGATAAATGATTAAATTGCATTATATATGATATGTTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 - chr3L 1973513 5' + flea 31 2 62.38 TTGTTTACCAAATTTGTTTTCAATTTGTAAAATCAATTGAAACTACAATCCAAGCTGGCAGAACATTCATCAAGCACCAGCGCAAATATATTCTCTCTCTT:1 + chr3L 5045154 5' + G4 48 1 72.28 AGAGTTTTGGGCTGGAGCCTGGTTTCGAGTTTTGGGGTCTTTGGCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 - chr3R 26434753 5' + Tabor 32 2 55.00 AATTCAATGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCT:1 - chrX 20999760 5' + BS 55 1 52.48 AACAATACTAGGGGGTGCTTTTAGTGGCCAAAAAAAATTTTTCAAATTTTTTTCTTCGAATATAATTTTTTTAATTTTTTTT:1 - chrX 16528268 5' - HB 324 1 34.15 CTNATACAGATTTTATCTAAAATTGACTATTGGATACCCAAACTCAGTTAATTTGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGAATATCGATAGATA:1 - chr2R 4640899 5' - INE-1 499 1 75.25 TAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr2R 18723092 5' - opus 449 2 78.22 GGCTTTAAGGTCAACAACGGACCCAATGGACAGACCGGTTTCTGGGTAATTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGG:1 + chr2L 18833151 5' - F-element 4364 1 54.46 ATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGC:1 - chr2R 19727744 5' - R1A1-element 5159 1 59.41 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTG:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 126 1 59.41 TTTGTGACACTTTTTCGTCGAATTTATCTAAGCAACACTTATATACATGGTTTCAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTA:1 + chr3L 16163813 5' - invader2 4771 1 63.37 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCATACACTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACGCTG:1 - chrX 14317414 5' - 1360 3301 1 77.23 GGNGAGGGTAATTTTCTCCGTTTTCCACCCACTGCCACCAAGCCGACTTTTACCGCACCGACACTCACTAGTTATGGCCTGCACTTGTTTTTTTTTTATTT:1 - chr2L 16392265 5' - gypsy2 403 1 73.27 CATATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3R 14688331 5' + pogo 18 1 51.49 TTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATC:1 + chrX 21636199 5' - Stalker2 353 2 74.26 TGGGCTTCCGCTATGCGGGCCTCGCCAGGAAGTGGACAGTTAAGCAGCAGCTCAACTCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2R 13334897 5' + pogo 17 1 62.38 TCGATTTCATTTTTGTTATGGCTCCCCAAAATTTTTTGTTTTTCCCTTTTTTT:1 + chr2L 9844388 5' - Doc2-element 235 1 49.06 GGNCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAA:1 - chrX 4175117 5' + I-element 341 1 77.65 TTNGGCGTTTGCCTACTGTTTGTTAATGAATGGTTCCGTAAATTGCTAAAGGCTTGTTTGAGTAACCCAGATACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 - chr2R 8294308 5' - 412 491 2 75.25 TTNCGTTATTCAGCCTTTTTCAGTTCAGTTGCAGCTTAAGCTTAATATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 19952313 5' + roo 8693 2 55.45 ATGTTTGGCTAATGTTTCAATTAAGAAGACAGTGAAAAATTTAATTTTCTTTCATATGGATCAGACGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCTTTAAA:1 + chr2L 16410230 5' - Quasimodo 7094 2 54.46 AGAGTATCACAGCTTCGGCAGTTATCGTTTCCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 4022300 5' + roo 44 2 71.29 AAAATATGTTATACAATAGTACTCGTAATTATGTTTATAGTACTTACTCCATAATTTTATCTAACCTTAAATATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAAC:1 + chrX 17528863 5' + accord 7264 2 71.29 TCGCACTTCCGTTTCCAATTGGAGCAAAGAAGATCACCAGTACCTTCCCTTAGTTTTCCTTTTCCCCCTCCCCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTA:1 - chr3L 19070400 5' - rooA 7508 2 79.21 TACCAGAAATAAAAGTGCTCTTTCACTGCCTCTATTTTGACGCCCTCTAATTTTCAGCATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr2L 1913090 5' - pogo 2094 1 70.53 CGAACTGCTGGGGGCTGGTGTCGTGGTGCCCGTTTTTGTCCGCTGCGTCTGCCTCTAGAATTTGTATGCTAAATCTCCACCTTGCTTTTATAGTTCCTGAG:1 + chr3R 31681280 5' - INE-1 153 1 78.22 TTTGAAATTCTCCACAGCAAGAGCGAAAAATTACCTCCTTATTCCCGTAGACTTCTTTTAATTAATTTTCCTACCCTAGCTAATCGTAGAACGATGCTTGG:1 + chr3R 20792843 5' + Cr1a 4014 1 61.39 GTTGCGCGCATTCATTGTTAATCAAACAATTGATTTGCGGTCCGGGACGAGAGCAAACGGGGCTAAATTAAAGCGATTCCGAATTGCACGC:1 + chr4 646905 5' - mariner2 211 1 73.63 CTTGCTGGGAATCAGGATCATACGTACCCATTAGGGTCCAGAATGTCGCCGGGAAACACAAGCCGGAATTATTTCGCGCACCACTATAGGCGAAGGAACGC:1 + chr2L 10194124 5' - gypsy12 359 2 58.42 ACATTTTCCTCACATGAGCATACGTTCGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTG:1 - chrX 7660208 5' - accord 253 2 75.64 AGCCGACCCAAACGAATTTTATCAAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 22752005 5' - roo 393 1 66.34 AGTCTTGGATCAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 - chrX 21636277 5' + Stalker2 7253 2 70.30 CACACCCACTCGGCACAAAAATAGAACAACAGAGAAATTGCAAAAAAAAACGAAAACAAAACTCGAAAAAGTAACCAAACCAACAATTATGACAGGCCCAC:1 + chrX 12648274 5' + I-element 178 1 82.18 GTTGGCTTGGTTAACGCAACAATTTAACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2L 15013956 5' + jockey 4713 1 74.73 CAGGATCTCTGACCAACTGTATTCCAATAGCCAGACACTGCTCACACACACACTCACGTCACTTGGATATTGGCCACTTTTTCCTTTTTTTATTTTTTTTT:1 - chr3R 24895809 5' - Doc2-element 245 5 68.32 TAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - chrX 21564722 5' + diver 5937 2 77.23 TCAGTTGGCATAATTTCTTCCCAATCTCGAAAATTTTTGTGAAAGTGAGCAAGTGTTCACACATGAACATGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 9439763 5' + roo 8686 2 55.21 GATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCA:1 + chr3L 24213776 5' - invader2 219 2 53.47 TTATGTTTTTACCTTGTATAGTTTGCTGTAAGTGTAGTACTGTACCAGTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGCCAATTGCATTAAGGAAGA:1 + chr3L 17059974 5' + gypsy3 232 2 55.45 TATTGAGAATTCATGAACGATGATAATATAAATTAAACTTAGGGCAGATAGCTATTCCGATTGGGTCTGGCCACTTTTTATGCGCAACCAGCACCGTAACT:1 + chr2L 17304430 5' - R1A1-element 5059 1 80.20 TCTCTCTACTTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 22920375 5' + 1360 19 1 56.99 CTTTTCAGCGCAAACTTTATTTAAGCCACTATACAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 10453391 5' + hobo 42 1 74.26 ATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chr2R 9788948 5' - blood 7343 2 69.31 AGCAATTAAAAACTTATCCTATATATACATATATATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTT:1 + chr2R 987490 5' + Doc 335 1 66.34 AAATAACCAGGCAAGCACCAACAGAAAAAAAAAAAGGTCAAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr3R 24738958 5' - pogo 2072 1 63.00 GGCAATTAGCGGGCGTTTTGTAATCACAATACTACACCATGTGGCTCAAGTGGTTTCTTAACAGATGCCACTCGCTTGAAGACGTGCGTACAAGTTCTCAG:1 - chrX 3466975 5' - Chimpo 3941 1 56.44 TGNAATCGATGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr2R 18344552 5' - 1360 3359 1 60.40 TATGGGTTAAATAATAATTAGAAAGTAGCAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTCCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 + chr3R 17674332 5' - blood 7345 2 68.00 TTNTGACAATTTTTTTGCATCTGACTTTTTGAGCTTTATTTTGCACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr2R 8314118 5' + hobo 1 1 78.22 ATTTTCACTTTCCATCAAATCGAATGGAAACTTTTACGACGGTTGTATAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 - chr2L 8841136 5' + P-element 23 1 59.41 GTACCTCAAAGTTCCACGCTCTCCTCCTCCTAGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTAT:2 - chrX 1509619 5' - invader2 4880 2 68.32 AATATATCTAAAAGTAGAACATATTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 - chr3R 17412608 5' + 3S18 26 2 68.06 CACTGGACTCGGGGACAAGTTAAAGGACCCGAAATTATTCCACACGCGTTCGCATAATCACTAGCTGAGTTACGGGGATCTGATAGTCGGAAAACTCGAG:1 + chr3L 25808605 5' + INE-1 561 1 54.00 ATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGC:1 - chr2L 23295850 5' + micropia 5086 4 70.30 ACAACTTTCCCTTGGCTGAAAAATAATTGGATTAATACTCATATTAACTATCATGCACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 + chr3L 12352870 5' + Tirant 19 2 60.40 CACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr2R 5485086 5' + 1360 51 1 77.23 AATAGGTGCTGATTAAAAACGTATGCCATTCATATGAATGTTTGATTAGCTATCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2L 7393646 5' + opus 21 2 54.46 GANTGCTAAATGTGTGTTCACTGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTATCTCTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chr3R 20052113 5' + copia 4923 2 78.22 GANTTTTGTATTGGGATCAACTTTTGGGAGCTGACAACTCAACCTGAAATGTCAACAAGACGGCAGAGAAACAAAAGAAAGAAAAAAAAAATGTGAAAAAT:1 - chrX 14982414 5' + Tc3 138 1 73.27 TCTCTGTCGTGCAACAACTCCCCCGTGTATTTTTTTTGTATGCCCCAAGCTCTGTTCACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:2 - chr2R 18356271 5' - P-element 2868 1 59.41 ATTCCAGTTCGACCTGACCGCCTTAGACTCTTCTCGTATTCCAGTCGTCTTCGCTGTTGCTAGGCGGGGGAGTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCAC:1 + chr2R 2494300 5' - gypsy8 4651 1 63.27 TGTACCTTGGTTTACAGGTTGGATTGCCGAGAACACCGAAGATGAGGATACAACCGCTTCGACAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTC:1 - chr2R 22983523 5' + Quasimodo 6989 2 64.36 TTGTACTTTTACTTGCCTGCACTTGAAGAAATACTTGTTGTCTAAAGCAAAGAAAGTTTGCTAGAAGTTAAGAAAGTGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGC:1 - chr2R 18942106 5' - Ivk 247 1 83.17 AGATGCAGTTATAATTCTAGCTTATAAATTTAGCTTCATTTCTATTTAAGTGCAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATA:1 + chrX 12777583 5' - FB 269 1 55.45 TTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTG:1 + chr3L 24213801 5' - invader2 194 2 78.22 ACAGAGTTCATAAGTCGAGTTGTAAACCAAAAAAAGGTTGAGAGCCAGAGAATCCAGACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTC:1 - chr3L 25401156 5' + transib2 17 1 62.38 ATAATTTTAGTTTAAAATTAATGTATTTCCATATTAAACTTATCGCTATAATGCTTTTTCTTTAGCCTGTTCTTTCTTTTGATTTCATTTTATTTTATTTT:1 + chrX 3679739 5' + transib1 1898 1 55.45 TACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 20331822 5' - mdg1 7418 2 67.33 CACGCATACAAATACAAATCCAAGGATTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 19560898 5' + hobo 39 1 67.39 AGNCTCGTTCAGTGCATTCTTGTGAGCTAATTCAAGGGAAATATAAACTTTTACTTAAAACAATTGCCACGAAATAAATTAATATTTAGAACATTTTATTT:1 - chr2R 22673987 5' - jockey2 3231 1 41.58 GANTGACATATTCACAGTGAAACGTAGGTTAGAGGTGGCAGTCAGAGATCTTTACTATCGATATTTTTTTGACTTTACTTAATAATTTATAATATTTACAA:1 + chr2L 5010822 5' - BS 311 1 73.27 CGGGAGTGTCCTGATTGGTAAGTAATAAGGCATTCAAATAAAAACTAAATGTTGGGGTATTAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATG:1 - chr2R 11552683 5' + micropia 34 2 67.33 TATCCGAATTTGGACTCAATATTTAATTATTCATGTCCAATCCCCAAACTCACCCCACGCAATGTACTCTCAAAAATTCAAATTATTGTACCTACATATTG:1 + chr2R 17359037 5' + HeT-A 5975 2 68.32 AAGTTCTTCTATATGTGAACAAAGGAACAGTTTCTTGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 12398191 5' + roo 8704 2 66.34 ATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCAGTA:2 - chr2R 3824676 5' + 297 6617 2 67.33 CAAATAAAGCGACAAATTCCCAAAACCGCAATTCGGTGTACATAGATACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3L 6522360 5' - pogo 2077 1 53.47 TTCAGTTGCAGCTTAAGCTTAATATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 19952336 5' + roo 8716 2 78.22 ATACATACAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr2L 14242077 5' - HMS-Beagle2 489 1 90.00 TTTTGAATATATATTCCGCACTTGGTTAACTTTAAATCAGTTAACTATATATAACTTTCACTGTTGTCCAAGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAGGGTGGTT:1 - chr3R 5679046 5' - G-element 4111 1 63.37 ATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2L 12284002 5' + 297 49 2 75.25 AGTGCCATGAAGTACGTCGCATGTGCAACAATTAGCGGTGTTTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chr2L 21323251 5' - hobo 2906 1 55.45 CACATTGAGATATTTATTGGATAAATGCTGGGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2R 17346462 5' - hopper 149 103 72.22 AATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 - chr3L 6013732 5' + Max-element 8250 2 59.55 GGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGGAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAAT:1 + chr2L 12398132 5' - roo 375 1 60.40 AANCGTGTCCACGATCAGCGCTGTCCGTAGTGCGAGATGATGAAAAGCATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 - chr2L 21863424 5' - Burdock 230 2 53.47 ACTCTCAACCGATAAATATAAAACCGCCAACACTCTGGCTTAATTAAATCTCCACGAGCTCTTCAGTCCTTGCTTGCTCACCGGGACTG:1 - chr3R 17203081 5' - Rt1b 4997 1 53.93 CCGTTTTTTTCAGGTAGGAGCAACTCGTACTCAAAACCATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTT:1 - chr3R 30347130 5' - accord 150 2 62.38 AANGTCGCCACTGAAATACCCTTTTCAGGTCATTAGCCAAACGATCAGTTGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 26592577 5' - roo 386 2 52.48 AGTTTCCTGCACTTGCTTCTTCTTCTTCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCACCA:1 - chr3L 1064994 5' + gypsy5 7030 2 72.28 ACAACAAGAGTCTTCAACATGATCTGTATTTTCAAGTTTGGATAATATGTCTTGCGATTGCTTGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGA:1 + chr3R 460086 5' + F-element 102 1 63.37 TAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCAT:1 - chr3R 28959225 5' - HeT-A 6031 1 74.26 ATAGCTTAGCTTAGGCATATACATCTCATTCATTTCTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGAT:1 - chr3L 3232586 5' - I-element 4901 1 64.36 TTNGTTTCGCCTGCCAAGAGGAAAGCGACCTCAAATGCAAGAGTTCGTTGCGGTGGAGGTGGGTCATGGAGTACCTGCCTACGCTTGTGCGCCGAGAGAAT:1 + chr3L 4266480 5' + aurora-element 3785 1 53.47 GCGGTCAAAAAAAGTGAAGTCAAAAGTGTCAAACCTATTCAGTTGAGACAAAAAAAAAATGAATGAATTGAAAAACAAAAACAAAATGATATAAAAACAA:1 - chr3R 3589367 5' + Tc3 1573 1 49.00 ATAATCACAATTTCAGCTGTGATCTATTAAAGGTGCTTTCTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGTCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATAT:1 - chr2R 19057004 5' + 1360 3211 1 60.40 GACCCCGATCAGGGCAAACTGCTCCGAGGCCCGTATATTGCCACGCAACGCGCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAAATCTAACGG:1 - chr2R 14630121 5' - invader1 97 2 56.00 TGTATGTTATTGAACACTAAAACTTCTGGCGCTAACCCATTAAAATATTCAAATTAATACGTTAATTCATGGCGTCTTGTTCTTTCAAATTTTCTTTTTTT:1 - chr2R 15339579 5' + FB 174 1 76.24 AATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr3L 1259219 5' + Doc 45 1 63.37 GAATATTGCCCAGAAGGCTGCCCAGGAGGCCAAGAAGGCGTCGGACACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGT:1 + chr3R 25815755 5' - roo 156 2 55.45 CCAGGTATTTGGACACAGTTCGAAAGTGTTCTGCGCATTACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTAATTT:1 - chr2R 5202365 5' - roo 9037 1 56.44 TTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTAGCCAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGGGAAAA:1 - chr2R 4826124 5' + 1360 421 1 55.45 TTGGTCTAATGCAGTGGCATAAAATACGAAGTGAATGGGACTTGATTTGATTAAGATTTTCTGATGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:2 + chr3R 12514818 5' + opus 6 2 73.27 TGNGCATTCGCAAGTGAATGCTAAAACCAAACTATATCACATCGATGAATATCATCTCTGGGCGATCGAAGCGCAATGCAGCCGCATTTCTTCAGATAACA:1 - chrX 19291081 5' + Chimpo 417 1 68.32 GCACCAACGCTCCACAATGCTGCCTGTCGTGAGCAACTAGAAGCGGCTGCCAAAAATGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAA:1 + chr3L 8564775 5' - micropia 5175 1 63.37 TACAAATTATAGACATGTTTTTAAGCTTGGGTAACAAGAAGTGCAAAAAGGTAGAATTCGTGGGAATCTCACAGGAAATGAATAAAATGTAAAATAACTAT:1 + chr3L 7891253 5' - Cr1a 4319 1 85.15 ACACATTTGCCGCATTTATTGCGATTTCCCGTTAACTCGCGCACACTACACCCTCACACACACACACACACACACACACACATTCACACAT:1 + chr3R 22825126 5' + accord 7037 2 79.12 CAAATATATAAGGTAATATACATAAGGTAAAAAGTAACTGTCAGAAATAGAGTACCTTGTTCACACCAGCTGAGTAAAGGG:1 - chrX 15946740 5' + INE-1 537 1 80.25 GAACAGGTAAGACATTGTAGACCAAAGCCTCATTTCGCTGCCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATA:1 - chr2L 21641475 5' + F-element 4231 1 59.41 TAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCCA:1 + chr2R 5582183 5' + Cr1a 457 1 51.49 ATCAAATATGATTATTTGATGACCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr2R 17208489 5' + jockey 12 1 75.25 ATCGTCCATGGGCGAGTCTACGCATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGGTTTCACTGGCTTATCAACTTACTCTCTCCACTAAGTTTGGACTACAAGGTGCTGT:1 - chr2R 5534659 5' + Doc4-element 2551 1 81.19 CCTCTAAATATCAGAAATATGCGGGCTTGTGGCATCTTACTAGTTAACGCTGAGCTGGTTGGTCGGTACAGTCGGCTTTGGCTGCATACCCGAATAAGTTT:1 + chr2L 14154469 5' - Doc3-element 4546 1 57.43 GAGTCANAAAATAAATAGCTAGATACAGTTAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 16673588 5' + 1360 46 1 74.26 AGCGGATATTATCAGGCATTTCTCTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCT:1 + chr3L 5926590 5' + F-element 4515 1 75.76 TTGTTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr3R 29357096 5' - 412 7503 2 73.40 CTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAAC:1 - chr3L 17593059 5' - Copia1_DM 130 1 72.00 AGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAG:1 - chr2R 2527412 5' + roo 75 2 68.32 AACAGTGCTTCTTATTTAGAGTGGCATCTGATTGTTTTGTATTACAGTGCTTCTATGCAATATGCAATCCGCTCCTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACC:1 + chr3L 27390897 5' + invader4 358 1 75.25 CCTGCCGAAAGAAGTACAAATGCATATGCTTTTGATCGTATATGATTAGTTCATTAGCAATTTCAGCTTTTAACTGTCTCATATGGGGTATCGCAGCAAAA:1 + chrX 21493307 5' + BS 4686 1 74.26 TTGTCAGTTGGGTTTCGGGAGGGGTGGGAGGAAATGTGGGGATTGCGGGGCAAAAACGGAGGCTCCATCGCAGCGGCGCAGCGGAGAAGTGTTGATG:1 + chr2R 18329840 5' - HMS-Beagle 6884 2 75.26 AATGTATGCGAAGCACTCACGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:2 - chrX 13640684 5' - P-element 2832 1 22.77 TTTTGATTTAACAAGAGCAATTTACGTTTATTCCTTTAAAGCTTAAACTAATGTTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3L 15681623 5' - pogo 2085 1 63.37 CANCTCAACGTCGCGAAACGCGGCCCAAAGTTACCCACCTAGCACTACACTGTACTACACTACCTGTGCGACCTCCGCTATGACATCAACTAAATAAATGG:1 - chrX 13836311 5' - mariner2 40 1 79.21 GCCAACATTCCGTTCGACTAATAACCAACTTGTAGACGACAGCCAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCAGGAAA:1 - chr2L 608921 5' - TAHRE 10073 1 60.81 CAACTGCGAGTGCTACTGGCGACTATCTAGCGCATCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2R 18005643 5' - hopper 1376 1 64.36 TACCACACTTTTGATAAGTTTCGAATTACATCATTAATTATTATAATTTTTTCGCATTAGGCGCTTCATTTAAATAGTAAATATCCGATCAAAATACTCCC:1 + chrX 16237112 5' + ZAM 365 2 64.36 TTGTGGCATCTTAATTATTTCCATATATATTCAATTCAATAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTG:1 + chr2R 4657712 5' - Doc 4531 1 64.36 TTAGGAAGCTCAAAAACCACACTCGCACTCACACCAGCACGCATACAAATACAAATCCAAGGATTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr3R 19560861 5' + hobo 10 1 69.00 TTAAATAACATACGATAGATTGTCTAGTTTGTATGAGTGTACAAAAAGAACGATAAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTA:1 + chr2L 8638003 5' - rover 7054 2 59.41 GAGAGGTAAAGCTTATCGCAAAATAAAAAACCATTCCATTTGACTTGAACTGTGCTGCGGATGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCGTAAGGTT:1 + chr2L 3021550 5' - G-element 144 1 72.63 AATGCGGAATATTAATTTCATTTGAAACACGTTTACCTGCAGCCAGCGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCG:1 + chr3R 13152463 5' - Doc 310 1 52.53 GCATCTCCAACCGATAACGAATGTATATAACCCCAACAACCACCACCACCACCACCACCACCAACCACCAAACACCAACACACTCTGTCTACTATTTTTAC:1 + chrX 10227242 5' - Circe 182 2 81.19 CTCGCAAAAAATACAAACTGCACGATAAATTGATGGCAAAAACAATAGCAGGCCCACTCCACAGTTCACGATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCG:1 - chr2L 5627840 5' + flea 4705 1 75.25 CANATGCGAAAATCAAACAGGATAAGGCGGACAACTAAGCAACGCGAGGCGCGCCGGAAACTAACAATAAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACA:1 - chr3R 27565585 5' + I-element 5121 1 72.28 GGNACACGTAAAGTCGAGTGTGGGTATATAGCATATATATGAACATATATATCATATAGGTAGGTAGGTAGGTATGATTAAGTATGTTGAGTGAGGTCAAG:1 + chr3L 16427793 5' - G2 2937 1 72.28 AAAAAAAATCACAGACACATTTGGGAAAATGTAAATATATGTGTGTACATACATACAAATTGCCCATATTTTAAATTTCCATACTTAAATTTTCATTATAA:1 - chrX 14014219 5' + looper1 1648 1 46.53 GGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 20266005 5' - roo 9020 2 78.22 CAACCCTCGAGAGCAGCAATATTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACA:1 + chr3L 22209756 5' + F-element 4577 1 78.00 TTNTAGGTGAATAAATATTTTGAAATATATACTAGACTAAATTGAATATATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTAACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 20309322 5' - roo 9046 1 54.46 GACACGCAAACATTTCCCCAATGAAAGCAAATTACACACACACTCCGTTAACCATTAACTTCCAGCACAGCTGCCTCTCTCACAACTGCAATCTCATCGAC:1 + chr3R 19364274 5' + Doc4-element 296 1 84.16 TTAATTAGGTATTGCCAATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTA:1 - chr3R 9192598 5' - invader3 5445 2 61.39 AAAATCACTGTACATAATCATTTCAAACTCATAAATTAAGCAACGTCCGTTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:2 - chr3L 2392451 5' + Transpac 4943 2 51.49 TTNATTATTTCCCAAATAGTGATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chr3L 11891388 5' + Tabor 6868 2 51.00 ATGGTTTTGTGTGCCCTATTTTGGCTCTAATTATATTATTTATGTTTTGTGTTTTTTTTTATATT:1 - chr3L 12544391 5' - Tc1-2 489 1 78.46 AGGGTTGTCAGCCACACTTGAGAAACACGGTCCTCGACTTGTTCGACTCGCAGAGTCTAGTGTAATCTTTTTTTATAGCTTTTTTTTTCTTATTTTTTATT:1 - chrX 5640223 5' - BS 5095 10 49.50 CATTTATTAATTTTAATCATTTTTCTGACACAATTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 29423489 5' - roo 9053 2 60.40 ATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGG:1 - chr2R 18344612 5' + 1360 41 1 65.35 ACATTCTTACATATATCATAGTAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAATAGTATGAC:1 + chr2L 19817823 5' - G4 3823 1 69.31 AANGGGTTGGGAATATGAGAATCTGCATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTTCACCTCGTCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAAGAAC:1 + chrX 16168387 5' - G2 282 1 75.25 CCGGGCGAGCACATGGTGCGTATGGTAGGCTACACTTCTTTATTATTCCACTCGACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAAC:1 + chr3L 8469668 5' - R1A1-element 5015 1 58.42 GGCTGCTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTG:1 - chr2L 18885846 5' - TART-B 155 2 84.62 TGCCCGTTAAAGTTTAGAGCATACACGTAGCATAGCCCCTCTTGCATACAGGACTCTATGTGTGTGCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr3L 11450569 5' - Transpac 5222 2 72.28 GGTAACAACAGCAGTCGCACAGCTTGGCCTGCTCAGTCACCCGACTTGAATCCAATCGAAAACCTTTGGGCGGACGTGAAAAAAAAGGTTTCTGAAGCCAA:1 + chrX 12103768 5' + Tc1 1188 1 76.24 ACTCCTCTTCCCCTTGGTTGCGCTTATTTTCAGTAAGTTTCGCCTTTGTTTTGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTG:1 + chr3L 13367675 5' - Stalker 349 4 51.49 CGNCGCTTTACAGTTTATTGCGTCTTCTCTTCTTTTCAGCCAACTTTACGAAGCAACTGAGAAATGACTGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3R 14625987 5' + P-element 7 2 71.29 GATTTGTAATTATTCCATTCTAGCACGAAGCAATAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 27900414 5' + roo 39 2 67.33 TGTCAAACTTCTGCAGCACTGGCTTTGCGAACGCCAGTATGTAAATTAGAAAATCAGTCCGCGATCGTGACAATAAAAGATTAGGAGTTACTTTTAATGTT:1 - chr2R 3572821 5' - gypsy2 252 2 52.48 CGNAAAAACGTTGCATACATTCGGGCATTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 + chr3L 2485916 5' - jockey 4953 1 73.27 TACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr2R 18344633 5' + 1360 20 1 55.45 AACCCAGCCGAAGTGTCTTTTTGGGCCTCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 + chr3L 17971243 5' + P-element 48 1 31.00 TTAAATTGCAGTCGACTCTCGTCTGTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTGCGGGGCAGCACA:1 - chr3R 30349914 5' - X-element 391 1 75.25 TACTTTGTCCTTTCCACAGTAATATTCTTTTTAGTAGCATATAGGCACCTCTTACACCAGCACACACGATTCAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2R 20309427 5' + roo 8665 2 78.00 CACATAAGATTGTAGAATACTTTTCTTTTATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAA:1 + chr2L 7531370 5' + Porto1 4406 1 71.29 GAAAGGAGCTGGCGATAATCGATGGATGCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - chr2R 19149446 5' + diver 49 2 70.71 ATGTGCCAAGTGAACACGGTGAGCTCAAGTGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCT:1 - chr2L 13689944 5' + F-element 368 1 47.52 TTATACAATTGAAACAATATTATTATTGAATAGCATCTATATTTATTTATAGTTAGTTTCTTAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr3L 17447969 5' + hobo 13 1 35.64 TAGAGTGAAGGAGAGTCGAGTGCAAAAGTTGCCAAGAGCGGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACAGAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTATCTGTGGTG:1 + chr3L 24153204 5' - Chouto 442 1 62.00 AGCAAATGCCAAAACAGACCATCAATCAAGCGAAGTCCAGCCGGATAATTAGGGGAGGCCTCCAAAGACTTGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGTGT:1 - chr2L 7250612 5' + HeT-A 5736 1 57.73 ATNTTTAGGCCCGATCCCAGACAGATCTGCCAATGCACCCGCCAGCCTTGAACTTACAACACACACAGATATGCACACATACATACATATTACATACATAT:1 - 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aurora-element 4078 1 72.28 GTTATTTGAGTTGTGGTTGTGACTTTAGTTGTCGTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGGATTGTTGTTTTTGT:1 + chrX 1555774 5' - I-element 137 1 64.00 TATATTAGTAAATTAAACAAATTCATCATTATTGATTGCCATTTTATACTTTAATAACCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 18639518 5' - roo 9052 2 59.41 CTNCAGTTGCCATTACGCCGAAAGAGACGGGGATACTGGCGAGCGAGAGAGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTG:1 + chr3R 10615675 5' - hobo 2621 1 55.00 ACTCAGAGTTTCGTCGGTTCAATCAAATTGCAATTATCGTAAGCACGTGGTTGTGTCCTCCATTTGGTGGGGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAACAATA:1 + chr3R 19582218 5' + HeT-A 5763 1 70.30 ATCGCCAGCTGTAAATGTGAGCAATTGAAAATGTGTTTCAGGCAGAAGTCGTAATGTCCCTATCTACTCTCCTTTAGCCATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 20204963 5' - accord 191 2 56.44 TTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3R 6290969 5' + Doc 27 1 54.17 ATGTGGAGATTATCATGTAGAGGTACAAAGTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAA:1 - chr3R 4137727 5' - Ivk 293 1 70.30 TAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGA:2 - chrX 4175138 5' + I-element 336 1 60.40 GAGAAGCCACTTTCCAAGGATGTTCTGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCG:1 - chrX 1532626 5' - G4 85 1 74.26 TTTCGTATTTCGTAATTCGTATTATTCACATCCTTACATTTTTGCGACGCAACTTGAAGCAAAGGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTT:1 - chrX 13577863 5' - gtwin 7278 2 73.74 TATATTATCATATTCTTATCTTTCATTTTCCTTAGTATCATTACTTTTTCCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 19053053 5' - roo 9048 2 52.48 CGACGCTCATCGAGTCCAAGCGGTGGACCTGCGGAGACAGAGCGTTATAAAGATTACGTATGACCGGCGCTTCTAAACTCCCAAAATCGACTGACTTAA:1 + chr3R 24785560 5' - Burdock 6266 2 67.68 ACNACTCAACTGGCTACTTTGCTGTCTCCGTCGCTCGCTGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTACCAGCCTTGTGGTCTGGTAG:1 - chrX 20624675 5' - Gypsy6A_LTR 251 1 68.32 TTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAGGGCTGCAGTCGAAAATGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCG:1 - chr3R 7885599 5' - hobo 86 1 57.43 GTGTTTGTAAATGGCATCAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCC:3 - chrX 4175159 5' + I-element 315 1 70.30 ATTTCTGAGCTATTTCTCCTACATTCTCAGTAAAATTTGTATAAAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAA:1 - chr3R 15303263 5' + I-element 4890 1 56.44 CGAGGAGTTCCAAGTCTTGGGTACGAATCCGATAATCCTGAGACTGGTCCACTACCAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGATAACAG:1 - chr2R 3525148 5' - diver2 4643 2 65.35 TATAGGTGGGCTCGTGATAATGGTTGATCTTAATCGTGGTAATATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAA:1 - chr2L 18378701 5' - Doc 4374 1 57.43 TTTATGGACACCCGACTCTTTCGTTCCAACTTTTCACATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTAC:1 + chrX 8150415 5' + rover 6982 2 63.37 TAAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3L 18816125 5' - roo 9031 1 65.35 CGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCA:1 + chr3R 26434702 5' - Tabor 7275 2 74.26 TCAGACGCACTTTTTGAAAGGTGTTTGACCGGCAATAAGTCAATTTTGTGTACATTTTATTCACGCGCGAGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGT:1 + chr3R 13503615 5' - accord 7375 2 66.34 GTNGAGCAGCAAGTCGCATTTGAATTGTTAGTTTAGGTGGCATATTTCAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTA:1 - chr2L 6240950 5' - 412 309 2 56.44 CACTTACGATGACAATCAACGGTCAGCTATAGTTTTTGGCAAAACTCCCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTTGACCCGAAAATCG:1 - chr2L 11445426 5' + 1360 3185 1 65.35 TTTTAAGCAAACCACGAGAAGGTGAATACAGGTATGCCCTTCGTGAAGCTAACACCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCACCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3L 17503227 5' + pogo 18 1 59.00 TGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1 - chr3R 24430596 5' - Transpac 301 2 65.06 ACAACATCGGCAACTTTCTCTCTTCGAAAGTTCCCAGCTTAGTTACTAGGAAATGTTCATTATGTTCGGTAATCCAATTGGAAATAAGTCTCTCCCATAGT:1 + chr2L 17332774 5' - Helena 219 1 75.25 TGACATGAAGAAGGCCTCATAAATTGTTGCCTTGGTTGTCGGCTTTTATGAAAACATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAAT:1 - chrX 12428242 5' + I-element 4912 1 57.43 ATGAATCAACGTCGTCTCCCATGGATGCACCCAAACCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAACTGCTAACACA:1 - chr2L 19733860 5' + Quasimodo 342 2 72.28 TGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2L 13250380 5' + pogo 46 1 75.25 ACCTCGCCTGAATTCCAATAGCGGTGGCACACCAGCTACAACGCCGGGATCGGTTACACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCATTCC:1 + chr3L 21180019 5' - R1A1-element 5145 1 59.41 ACNACTTTTCACATGTCGCATCGGCGAAGGAACTTGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chr2L 810314 5' - hobo 2899 1 65.35 AAAGCGAGACGCCTGCTGTGGAATGATAAATTCATATACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 - chr2L 13840461 5' + FB 40 1 67.33 TTTTTGGCCACCTGCCTGCTGCCTTTCACCGTTCTACAAAATGTTGCGGCACAAGGAAGTAAGTACCGAGCTATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGG:1 + chr3R 7761217 5' + flea 4759 1 77.23 TGNTTTAACCATCTCGGGATTTTTTTTACTTGTCCCATGATTATTGACATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAA:1 + chr2R 4236025 5' - Doc3-element 4660 1 63.37 AAACACTTTTTTTACGATTCCGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 - chr3L 13345545 5' - Transpac 306 2 74.26 GAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCA:1 - chrX 21667945 5' + gypsy2 6494 2 78.02 AAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCC:1 - chr3L 18476541 5' + accord 24 2 52.48 TGGCGAAGATAAACTCAAATATTGTCTGCGCGAAAAAATAACAAATTTTTAATCAAAACAAGAACAGAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGT:1 + chr3L 18369160 5' + flea 4634 1 69.70 TGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr3R 19450198 5' + roo 8754 2 72.28 GAGAAGGAGAGCGTGTCCTTAGCCATAGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAG:1 + chr3R 25970494 5' + jockey 4662 1 73.27 TAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGG:1 - chrX 23108306 5' + BS3 1442 1 62.38 ATAGAATAGATAAGTTCCTATGTACGAAATGGGGGCGAATACCCTATATAGGCCGCAGGAATCCCCTTATTTCCCCTTTTGCGCACGGCCCGCTCGGGTAC:1 - chr2R 20593621 5' - gypsy8 293 1 53.47 TGNGGTCCCGTGTCCCAAAAAGCGATCTATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:1 - chrX 12813763 5' + BS 17 1 54.46 TCCAGCGCAACAGTCAGGATTTGGCACTATGCACAGATGGCAAGGACAGTAAAGTCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAGGATCAACTCCGAAATAAAT:1 - chrX 11961403 5' - McClintock 364 2 50.50 CACCACCTAAATCACTGACACACAAAAAGGACGAAAACGATTGCGTATCACATCACTAGTTTGGCTATATGAAATGAGAATAATAATGAATTCTTTATTAC:1 - chr2R 7739262 5' + accord2 78 2 73.27 TAGCCATCTCGCTCTGTCATTCATGCTAATCGGGCACATGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 - chrX 9579389 5' - Tirant 372 2 57.45 ACTAAAGTTTCCAAGAGCGATTCTGCTTTGCTAATCCGCCTCGTTCCCATGCCCGTGCTTATCAATATATATTTTTTGTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTA:1 + chr2R 13745969 5' - G6 2020 1 69.31 TAGAGTATCACAGCTTCGGCAGTTATCGTTTCCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 4022299 5' + roo 8707 2 70.30 CTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGAACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr2R 18723106 5' - opus 463 2 62.38 TTTATTTTCCGCCGTTACCGGTCTTTCGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTACTAAAAACTA:1 - chr3R 28063648 5' + Doc 53 1 72.28 CGTTGTTCATTTAACAATCACACAGGACAAGCGATAATCCCGACCCTCCCAAACGAATTCCATAGCGGGCTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGT:1 + chr2R 20907545 5' - F-element 257 1 72.28 TTGCACAAAATAACTTATATTTTTTAAAGAAAATTGTGCGATTTATACTCATTTTGAAGGGAAATTTGTTGGAAAGTAAAATATTTTAGAATTAAGTTCTT:1 + chr3R 23104184 5' + P-element 2612 1 54.46 CTNCGCTGTCATAAAAACGACAGCAACGCAAAAGCGAAAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr2L 18214161 5' + hopper 4 2 74.26 ATACATGTATGTATATCTGCTCAGGGACGCGCGTATGTTTTTCAAGTCCCGGATCGGTATTGAAGTATTGGAATCGTGTTCGCGCATTGCCCTACCCTACC:1 + chr3L 8616862 5' - Gypsy12A_LTR 1960 3 66.34 AAGCAGGCAACTTATAAAAGTTTTAAATATTCGTGAAATATATCTAAAAGTAGAACATATTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCAC:1 - chr3R 17412644 5' + 3S18 5784 2 61.39 AGGGAGCTACGTGTAAATGTCAAAGATATGCTGAGGGATGTGGACTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:2 - chr2L 21323320 5' + hobo 28 1 51.49 AGACAGTGAGGCCATCGAACGGCAATTCGGTGATCATTGAATCACAAGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTGCGGG:1 - chr3L 18798193 5' + rover 6876 1 60.49 TCTATTTACCGTACCAAATTTAGTATATTTACTCTGCACTGTAATTTAAACTAATTTTTTTATAGGGCATAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2R 8420780 5' - 1360 3382 2 64.36 ATTACATTAGCTGCCAGAACAATTTGTCTCTCTACTTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGA:1 + chr3L 22920349 5' - 1360 3388 2 78.22 TAAAGTTGCAATGCAATATTATCATGTTCACCACTTACCACCAGCAGCAGTGATATATGCCATCTCTTACCATTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 + chr3L 4859285 5' + jockey 4761 1 75.25 AGCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:2 + chr3R 24461834 5' + F-element 59 1 74.26 ATTTGACTGCAGATTCGCTAGGCGAAGTGCATGTTGTTGTTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3R 29357132 5' - 412 7532 2 62.38 CGNAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTATTTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 + chr2L 12283965 5' - 297 6927 2 76.24 AGAACATGACCTTATCTTAATTTCATGACCGCTTTCTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCG:1 - chr2R 13713495 5' - F-element 445 1 64.36 CATTTATTTGATTTTCATTTGCATATACCGACTGGGATACGTGCAAATTTGCGGCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chrX 14505761 5' - pogo 2082 1 52.48 TTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAA:2 + chrX 21564657 5' - diver 206 1 55.45 AAATCATATATGTGTTTGCAACGGGTCTAGAAATCCTCCTATTTGCGTGTGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr3L 13704732 5' - hobo 2917 1 58.42 ATNCAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 27900458 5' - roo 9028 1 75.53 AAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTAT:1 + chr3L 27356071 5' - Tc3 1691 1 75.25 AGCTCCACCCTTTACTTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 - chr3R 8191538 5' - mdg1 7425 2 60.40 GAAGTGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAG:1 - chr3L 25186377 5' - Max-element 8344 2 51.58 TTTTTGTGCTCAGCATTTTATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3R 20373238 5' + I-element 27 1 51.00 TTTTTGGTCCACCTATTCCGTGGTATTCACATCTTTGCGGTTTCAATTTCATAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chr2L 21559222 5' + FB 21 1 55.79 TTTCGCCTGCCTGATAAACTACCATTGCCACCAACTTCTAATTACGAATGCAAAATAATTGGTCTGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2R 20804655 5' + hobo 9 1 71.72 TTGCTCGATTTAACTTTGATTTGATTTAATTTCGGGCATTCTGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGATCGCAATCAAAAATGCTCAG:1 + chr3R 32031325 5' + Porto1 4330 1 58.42 TAACTTTAAATCAGTTAACTATATATAACTTTCACGTTGCTGTTTTTGTTGCTGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCA:1 - chr3R 5679020 5' - Doc2-element 4442 1 54.46 GACTTAGGTTCACCCAAATGGCCACATCTCAGTGGCTGGCGGTGACAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTC:1 - chr2L 6872467 5' + F-element 445 1 59.34 TGGAATGCACACAAACCGCAGATATCTATAAAGAACGCACTTTTGAATAATATAGATCTATAATATAGATAGATAATATCTATGAACTTCTAAGGTGAAGG:1 - chr2R 5299292 5' - 1360 225 1 55.45 AATGCATTTTGCATATTTATTGCAGTAAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAG:1 - chr2L 10018223 5' - 17.6 359 2 73.27 TTTAAACAAGTTGAAGAACTTTAATTATTCTGCGTGCACAGTTGCTTGTTGCCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 19947344 5' + roo 8688 2 54.46 GATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACT:1 - chr3L 11891368 5' + Tabor 6889 2 71.29 AANTCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTC:1 + chr3R 19450119 5' + F-element 378 1 53.42 ACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATA:1 - chrX 21636243 5' + Stalker2 24 2 56.98 TATATACATATATTGGGTGTATATAGAGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGT:1 + chrX 1349852 5' - F-element 4398 1 73.27 ATNTGGAACCCGTTATCACTAGGATCCAAAAATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3R 12375160 5' - pogo 2060 1 72.28 ATATTCGACTGCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr3R 7885572 5' - hobo 2935 1 73.00 TATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTG:1 - chr2L 23295851 5' + micropia 130 4 69.31 GCATCTGACTTTTTGAGCTTTATTTTGCACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2R 8314134 5' + hobo 17 1 63.37 AGTGGAGGCCGAGAGAGCGAGAGAGCGACCCGAAGCAACACAACACCAACACGAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCT:1 - chr3L 17971302 5' + P-element 22 1 59.41 CCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 - chrX 678824 5' + Tirant 8155 2 73.47 ACNTGGCAACATGAAACATTTCGGCGTGCAGCCAAGGCAATTACGTCTGCCGATATTTAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3L 7781170 5' + 297 11 2 68.32 TTAATGGACCTTGGACCCCGACAAAGCGGTGAGACCGTGAATTAACGGTAACGCACTGGGCCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAGGAGGTCGGACGG:1 + chr2R 3107346 5' + gypsy8 125 2 79.00 AGCGTCTAAAGAGTCGCTTCTGCGTGTCCTTGTTTTTTTTTGTTATTTCGAGTATCTGTGTGTGTCCCTCTGAGCATGTGAATGTGTGTGTGCGTGTGTGT:1 + chr2L 9020909 5' - accord 7031 2 56.44 GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTC:1 + chr3L 11115124 5' - R1A1-element 137 1 68.32 AATGGGCCACATCATCTGCTCTCCACAATATTTAAAGCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 11808895 5' + roo 38 2 66.34 TGTGCGTTATTTGGAAGGATTATTGCAAATTTTCCATTGCTCACTGGCCCAGATTTGTTGGCCTTTTTTTGGCATAAAGTCACATAATAAAGCTA:1 + chr2R 5469099 5' - transib3 2832 1 70.53 CGGCACGGAGACACAACTGGGTCACCAAGTCGTGAAGTTATTGAATGTCCGTCGATCGACAATTGCACAGGGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTA:1 + chr3L 1259498 5' + Doc 4429 1 72.28 CATCCAAAATAAAAAACTGGAGGGACAATAAAAAGGAAAGAAGATAGTTTCGGAAAACGTGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 + chr3L 22775888 5' - flea 4997 2 61.39 ATGACTTTTACGGGCAACAGCGTTCGGACCAAATTTAGACATTATCCGGGAATCCGAGGGAGAGACAACAATAATAATAATAATAACAATAACAATAATA:1 - chr2R 8638422 5' + mdg1 28 3 65.00 GTTATTTGGCTAGAACTCTATTTAAGGCGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 5925565 5' + roo 8714 2 75.25 TATTGTATCACATTTTGAAACGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:2 - chr3R 19947399 5' - roo 9018 2 78.22 TTGCTGCGAGTTTAAAGGCCTGCCCTGCAACGACGCTTTTTAATGATGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 + chr3L 963013 5' - jockey 4958 1 56.44 ATCAACAATTCAATGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCA:1 - chrX 20999766 5' + BS 49 1 49.50 GCGGCATTCAGCCTTTATCCACGGCAGCACTGGCTTGGAAAAAGGGGGAAATCTGATGCTGGCCCAGAAAACGCGTCAAACTTGATATGCAAGAATATTTA:1 + chr2L 11493712 5' + Helitron 108 1 80.20 GAATGTGAATGTGAATATGTCATCTATTGCCCATTTGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTT:1 + chr3L 23603311 5' - Bica 156 1 64.36 GCGCCCGAAAGTATGCAACTTGTCCAGCATGGCCTGTATGTGTGTGATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3R 22310839 5' - hobo 2908 1 57.43 AANCCACAACAAAAGCGGCAATGAGTCAATGGCAATCAACGCTATCAGGCAATCCTAATCGGAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAAC:1 + chr3R 15339212 5' + I-element 5152 1 62.38 TTACGCCAACTGATATGGCCAGCGGTTTTTCCATTTTCCATTTCAATATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAA:1 + chrX 20042917 5' - Bica 4562 1 59.41 AGGAAATCAGTTTTAAAGCGATGACTTCATAAAAGTATTTCGCGTGGCATTTTAGGTGAGGCAAAAAACCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 - chr3R 12554970 5' - mdg1 7452 2 71.29 TTTACCTGTAAATCTATACATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr2L 13250344 5' + pogo 10 1 67.33 GGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTA:1 - chr2R 9500044 5' + G5 4725 1 54.46 GATTGCTAGCAGCTCCCCCCTTTACTTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr3R 8191548 5' - mdg1 7436 2 55.00 ATNTGTAAACTATAATGAATTAATTAAAAACAGAAAGTTTATGTTAAAGCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACTCGTTACACA:1 + chr2R 2248352 5' - INE-1 548 1 77.23 AATTTTATCGATCTGTATCTACCACAAAGTTTTTCTGGCCATGTCCGTCAGTCCGTATAAATGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAAC:1 + chr2L 14243665 5' + INE-1 149 1 60.23 GCTCGTGTTGTTTCTATTTTATTCATAAATGTTTTGTTGCCTGTCTCACCATTACATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAAC:1 + chr3R 23569250 5' - accord 7003 2 71.29 TANCAATTGCATTAAGCCACCGATAAGTGCAGGGCATATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTTGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 - chrX 5933923 5' + Burdock 32 2 61.39 ACGCGCCGATCTCGAGGAAGATGTCGTCTTAATGACTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 6442686 5' - roo 9053 2 60.40 ACAAGTTGCTGTAACGGCGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAAT:1 + chr3R 25512025 5' - hopper 376 1 82.18 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACGAACTTGCGTTGCGTCTTTGTCTCTAGAATATGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTT:1 - chrX 14317415 5' - INE-1 155 1 79.21 CGGAAAAGTTTCCGGAAACTGACTGACTGCCCACACAATCGTTCCGAAGATACCATGAAGCTCCAGTAATTATTCGTAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGT:1 - chr3R 13807264 5' - Doc3-element 4377 1 62.38 AACGGGCTATGGGACTAAAGGATGACAGTACTAAGGACAAACAAGGACATAGCAAAGACCCTATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGG:1 + chr3R 17615091 5' + Tc3 311 1 47.52 AAGCCGGTATAAAGAACGCCTCCACAGCTCACATCAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTA:1 - chr4 776601 5' + Juan 374 1 67.33 TAAAAAATTTTCTCCGCGTAGTGCAATTAACTAAAATATGGCTTCTGTATTATAACTATTATTGTTATT:1 + chr2L 588693 5' - mdg1 31 2 68.12 AAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr2L 19644930 5' + blood 39 2 64.36 GTNATATAATTTTTCTTAGGTATATTAATTAAGTACACCATCAACCAATCGATAAAAGAAGCTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 - chr3R 4600514 5' - Tabor 7309 2 63.37 TTTTATGGAACTTGCGAATTCCCCTTAGTCTAGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGCGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGA:1 - chr2R 2557182 5' + Doc2-element 4368 1 79.21 TGACATCATCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAA:1 - chr3L 18337723 5' + Juan 4040 1 63.00 AAAAGTATACTACCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACGATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 31458412 5' + jockey 28 1 58.42 GGNAATTGCTTCAATTTGGCGTACATATCCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3L 7968725 5' - hobo 2893 1 70.30 AAGTGCTTAGCTTAGCTTAGCTAAGCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chrX 6518783 5' - pogo 2053 1 77.23 TATCGCTTGTCCGGCACAATTAGCCGGAAAGTGTGGCTAACATAAACAGCAGTCATAACAGCGGATTAACATTCTATGTGTCGATGCTAATTGAACTCAAC:1 - chr3R 9157338 5' + diver 5955 2 53.47 TTGATCAGGACCAATAGCCGAGTCAATCTGGACGTGTCCGTCCGCATGAAAGTCGAGATCTCAAGAACTGTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACA:1 - chr3L 11819269 5' + INE-1 173 1 79.21 AATACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCAC:1 - chr3L 19339450 5' + Tc1 5 1 78.22 GTTTGGCCAAAACGATTTGTAGCAATTTCGCTATTAGTATACTCCACTCCACTTCACTCCATTCTTGAGCAAAATCACAACTTTTAGGCTGTTCATAAGAA:1 + chr3R 31886839 5' + HB 199 1 63.37 TCGTTCAGGACCATCTTGCCGATCACGTTGTTGCTGGAGGAGATCACGTACCAGAAGAGGCACATCACAGGCACATTACAGTATTGGTGTATGCGGACTAG:1 - chrX 22445072 5' + invader1 202 2 66.34 AGAGTACGTTCGAAATATGGGAAATAAAATGGGCTAAGGGTGCGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 + chrX 6883253 5' - Burdock 223 2 60.40 TCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr3L 9909763 5' + Transpac 4955 2 56.44 AATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTAGACCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAA:1 + chr2R 3262650 5' + mdg1 7347 2 61.39 TTTATTCCCAAATATTTATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAATTTAGGCTTCACACTTGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAG:1 - chr2L 23075321 5' + INE-1 566 1 92.08 GGACACTAATAGAAAATCTATATTGTTTCTGGACTGTGCCAGGCCCTTTCTTTCTCCAACAAACCGCCCAAAACTTCAACGACGACACTTTTGAAAAATGT:1 + chr3L 22958803 5' + INE-1 255 1 64.36 AAAACATGCTTAATTTTGGTTTTAAAAATAACACGATGCGATGAGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr3R 7382609 5' - copia 244 1 47.56 CCGAGATAAGCAAAATAATTCGTTCTTCGGCGTTGATAAGTCTGTCTCCGTTGTGGGTACAGTGAGCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCA:1 + chr3L 1300521 5' - Stalker4 7150 4 72.28 AAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2R 18723111 5' - opus 468 2 59.41 ATAAATATCTAAACAATTTTCCTGCTATATTTCCATTTACTAGTGGCACTGACCGTAGCAGCATCATGTTGCCTCCTATTATGTGTTGCCATTGTGGGCTG:1 + chr3L 14309713 5' + gypsy2 6373 1 59.41 GCGGGAGCTGCGTAATTGTTTCAAATGGCAGTGTCGACTGATTGGACCGAGAGGAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATG:1 + chr2R 24328822 5' + 1360 3351 1 50.50 AAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr2L 19644929 5' + blood 40 2 65.35 TGTGAGTCGAGGTGAGCCAAATACGAACCATCCGGACCGAGCCGAGCCAAAACGAGCCCGACTACGCCAGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2R 9658432 5' + P-element 4 2 75.25 ACAAATATCGATGACGTAGCAATACCAAGTTCAGTGAAAACTGAATCCAATCAAATGATCCTAAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTG:1 + chr3L 27421602 5' + transib2 2722 1 61.00 TTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAATTTTTAACTTTGTTTTTTATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGA:1 - chr3R 28959227 5' - HeT-A 6053 2 48.51 TTTGAAAATTAAGAAAACGTGCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 + chr2R 9788926 5' - blood 7365 2 52.48 TCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTT:1 - chr3R 1868213 5' + G-element 41 1 60.40 AANATTGTGTTCAAGTGGATTTAAGGATTTTTGCAAGTAAAAAATTATTCATATTTATACATTTTTTTTGTATAAATAATATATACATACATACATTACAT:1 + chr3L 14284495 5' - 1731 94 1 78.22 CTACGACTGTTTGAATTTCCAGAATTTCCAACTGGGCGCCTTGAATTTCCACTAGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTATAT:1 + chr4 168612 5' - Stalker4 7055 4 58.42 GTNGCAGGAAGATGAGGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chrX 10644878 5' + hobo 35 1 57.43 TTNATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chr3R 19446212 5' - 297 351 2 71.29 ACCAGAAAAGTTCTTAACTTTTACAGGACGCGCTAATACTCTCCGGGACGACAGATATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATG:1 + chr2L 17118005 5' - Bica 123 1 51.52 AANGTTTTCGGGTTGCACATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr2L 12284051 5' + 297 6581 1 79.21 ACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 - chr3R 17666030 5' + Transpac 4965 2 71.29 CGGGTGATGCGTGGCTTCATCAACGCAGACAAACTCCTGCCATCCTTGAAATGCGCACTAACACATTCAACGAGCAGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGT:1 + chr2R 8377932 5' + gypsy7 22 2 64.29 TACTATTTGCATAGTTAAGATGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAAT:2 - chrX 22782080 5' + I-element 4881 1 53.47 CTTATCTAGTAAATTAAGTGGATTTGCTTATATAAATATGATTGTATGATTGTAAAATAACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTC:1 - chrX 6883342 5' + Burdock 14 2 63.37 ACNAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAA:1 - chr3L 24916686 5' + Porto1 153 1 60.40 CTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 20266032 5' - roo 9047 1 52.48 TTTGGCGAGGTGGGCGTGGTGCTAGGTGCTTAATTTAAGCAGTGTGTGGAATAACTTGGCTGCTTCTATTAAAATTCTGGTTTTTACTAAATTACTAATGA:1 - chr3R 30355418 5' - HMS-Beagle 6568 1 61.39 TAGGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGC:1 + chr3R 19450108 5' + F-element 393 1 51.52 ACTGGAAGAGAATTGTGTAGCTGACGTTATGAATTTTCATGCAGAAAGACAATCTTACCAATGAGTAAAAAAAATTCGTCCTCACACAACCTTTCCTCTCA:1 - chr3R 12511935 5' - P-element 84 1 68.32 ACACGAGCTACAAAAGGCTAAAGGAGCTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 12832181 5' - hopper 149 103 92.16 GAAAGAGATACGAAGAGAGCAAGAATGATGTGCAAAGAAAGCATATTCCTGCGATTGTATTTCCGCTTGGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAAC:1 + chr3L 7934992 5' + gypsy4 486 1 72.28 CATTTGTGGGTGATAAAAAGCGAACGATATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATC:1 + chr3R 9127382 5' + invader3 51 2 73.27 ATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chrX 20331813 5' - mdg1 7427 2 58.42 GGNTGGTTGGTTGATATTTGTTGGCTGTAGCGAGCTCGATAGTTATAGATAGTTATATAACTATCTATAACTATCTCACTCGCCTGTTTCGGCATTTTTTA:1 - chr3R 9441824 5' + gypsy9 4899 1 57.43 TGTAAAAGGTAATTAGTTCGCTACTACTTCAACTTCAAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chrX 22738545 5' + 297 6580 1 69.31 ACNACACCATTTCTCAGTTTTGTTGCGAAAGTAAAGTGGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chrX 17729040 5' - hobo 2905 1 63.37 CCGCGCTGGAAAAGCCGCATGCGCTCTCGTCGCTCTTCTGGCGGGGAAATTAAACAATATTAGTCCTAAATTTCAATGTTTTTTGTAAAATAATTTAAATT:1 - chrX 9030244 5' + HeT-A 5805 1 52.48 CATGGGCTCCCATGGCAGGCAACAAAAAAATATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 - chr3L 12172878 5' + 17.6 6963 2 71.00 CATTCGTTTCAAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:2 - chr2L 8297400 5' + Tirant 29 2 52.48 TAAGGTTTTTTTTCTCACTGGAATAGGCGACGTCGTGCAAGGCAACGCTGGTACTATTTTCATACAGTGGTTGACAGGATTTTATCTTTATAAATCACAGA:1 + chr2R 9207564 5' - looper1 1687 1 61.39 GAACTCCACTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGCGTTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr2R 544906 5' - HMS-Beagle 7029 2 69.31 GCCGCGTCCACGGAACAATGATGCCCTGGGTATCTGAGTGCTGTCTTTCTGATGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGG:1 - chr3R 28997123 5' - Idefix 111 2 57.43 ATACAGTCTGGCGCCTCTTTTTATGGGCACCCATCATAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3R 28698786 5' + 1360 38 1 63.37 TGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTT:1 - chrX 23182903 5' + Idefix 35 2 65.00 TGCAAAAACTAACAAACCATAAAAATCCGCACATAAATTACAATACAGTGGTGGGCGAGGGGGGGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGGAATCGC:1 - chrX 10106024 5' - G2 2720 1 60.40 ATGCGACGACAAGCAAACAGAGACGGTGAGATACAAAAAAAAATCAACGTGCAAAAAATGAAAGGAGCATTAAAATATCAATCACAAAAAAAAT:1 - chr3R 21931747 5' - transib4 40 1 65.96 TGCGAGTTTAAAGGCCTGCCCTGCAACGATGCTTTTTAATGATGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr3L 963017 5' - jockey 4954 1 60.40 AAGGATTGATATAGAGCTACGATAACTACGTTTATGTATCAATTTCACAGTAATTTTAGGAAAATTTCTTCTCTTCTTGTGTTTACTTAAACTTTAACTTA:1 + chr2R 21995466 5' + Transib5 401 1 34.65 GTTTGTAAATGGCATCAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTG:1 - chrX 4175157 5' + I-element 317 1 68.32 ACAAAGTCCATCCAATAGTACAATTCATTGGCTTTCCCAGCGCTGTCAGCAATTTTTGGCTTCGACTATTTTTTGTTTGGTTTTTTTCTTTACTTTTTTTT:1 + chrX 7600577 5' + Tc3 76 1 59.41 CCTTACAACACGCCAGATCCTTCTCCTCACTCCCAGGCTCTCTCCTCGCTGGAGTGATCCTCCTTCTGTGTCCTTCGGGCT:1 + chr3R 3380110 5' - gypsy8 497 1 77.78 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCG:1 + chr2R 5260087 5' - 1360 3222 1 60.40 TGGGGATATCGAGTGGGAATGAGAGGGCATGATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTATGCAGTTTTGACCCTC:1 - chrX 20686517 5' - Quasimodo 7070 2 73.27 AAAATAGTCACTTTGAATGGGAACAGAAAGGAAAAGCGATACTGATGGGGAGCTGTCTGGAAAATGAAAAACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTGG:1 - chr2L 20249307 5' + 1360 26 1 70.30 TGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 22920394 5' + 1360 46 1 71.29 CCNAGGCCATATAAAAAGCAAACGTTTATTTAATAGTATGTACAATATTATATATAATAATATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 9437285 5' - roo 395 1 67.33 ACAGAATATAATCATATATATATTCTTATTGATGAATTGTTTTTTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAA:1 - chr2L 7800440 5' - BS 5059 1 60.00 CCNTCCCTGCGAGATTCTGACTCTCTGCTGTGCGACAATATTTGGTTCGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chrX 17699164 5' - P-element 2859 1 50.50 CTGCATTCGTTTCAAAACACATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr2L 8297403 5' + Tirant 26 2 49.50 CTTGCGTAACATCTATTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAG:1 - chrX 9878731 5' - Tirant 458 1 80.33 CGCCTCGGAGGCCCGGTCCCCCATTACATGAGCGGATCCTTTGGCAGGCTTTGTTTGTCTACTACTTTGTGCTGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTA:1 + chr3R 4687826 5' - F-element 4453 1 77.23 TTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGA:1 + chr3L 24213785 5' - invader2 210 2 62.38 GCAAGTTTTTGTATCTAAAAACTTTTTTTATAATTATCTACTGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAAT:1 + chrX 12756123 5' - HMS-Beagle 7003 2 58.42 ATATTAGTTTAAGATTCAACTTCAAAGTTACTGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chrX 16699060 5' - roo 9028 1 68.32 GTGTTTCCTCAGGAGCTTCTTCAGCCACTTCTATTGGCTTTTCTTCAATAGATTGCGTCTCTGAAATTTTGAACTCGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCA:1 + chr3L 2049807 5' - Stalker2 7647 2 79.21 ACCTCCACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTT:1 - chr3L 22046510 5' - roo 9053 2 63.37 TCNCGTGTCCCAAAAAGCGATCTATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAA:1 - chrX 12813758 5' + BS 22 1 49.50 CANAAAAAACAAAAACACGACAGCATTGTAAAGCAATTGATGTTTATATGTCGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chrX 11808968 5' - roo 9050 2 56.44 GTCAGTCCGGATGTGTACATTCAACTGGCCCTGCAACTGGCTCACTACCAGCTAAATGGACTACAGGCCGAGTCGTCGAACTGCACCCTGGATCGGACTC:1 + chr3R 18729909 5' + diver 5711 1 54.00 AGTTTTGCCATTCTGTTTAAGTATAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCATCCTCTTCACAATCAGCAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATT:1 - chr2R 4132278 5' + hopper 256 1 72.28 TTTTGGGGCGTACGTATGTGGCCATGTCTGAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTC:1 + chrX 6728930 5' - F-element 32 1 70.30 TAGCTGTTGCAATCTATCTCAATGGTTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2L 8841077 5' - P-element 2839 1 31.68 AAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 22751982 5' - roo 9033 1 72.28 TTNATGTAAGTGCTTTGGAGATACACTCCGTAATAGGTTTGTAATAGGGTTCAATCTAAGCAAATTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACA:1 - chr3R 15502569 5' - Ivk 5364 1 69.31 GANTCAGGACAGGTGTGTGGCATGCGGCATTTGCAGGCAGGTGAAAGTGTGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGC:1 - chr2L 17034342 5' - Doc 239 1 55.45 GAATCCAATGCTTAATTATGAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTC:1 + chrX 12657177 5' + I-element 146 1 80.20 TAATAACATAATTGCGTCCCCCAATACGCTGGTTTAAATCCACGCATGTGAAATTACTTTGGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 10824034 5' - 412 7531 2 63.37 ACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACTG:1 - chr2R 9789007 5' + blood 27 2 54.00 ATGGCACTTTCTACTATGATTATTCTGCACATAATTGTAAAGCTAAATATCTTTGTTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:2 - chr2L 261052 5' - Juan 4187 1 55.45 TCTGAGGTCCTTTCACAAGGATCCTACAGCTACAGCTTATGGCCCACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACAC:1 - chr2L 13466379 5' + I-element 4942 1 56.44 ACACGTCTATGAATTTGCTTTTCACCCGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACT:1 + chr2R 22456201 5' - diver 6062 2 72.28 AGCTCATCGGCAACATTTCGTCAGCTTCCGCTAGTGGGCGGTTGGGTGGTCTGGTTGCTCCTCGGCGGTTCTTGGCGGCTCCTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 - chr3R 28059025 5' - Quasimodo 7052 2 80.00 AATGACCCACATCCTACGAGACGCAACTACTTAACCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGGCAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGA:1 + chrX 19821260 5' + Porto1 4518 1 80.20 GCCGAAGCTTTTAGCCTCGCCGGCGGCCAAGTTGAAGCCGGGCCATGTAAATGCATTCATGAGTGAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - chr2R 15578333 5' - mdg1 7450 2 69.31 CCCCCCAAACTAAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2R 18723122 5' - opus 479 2 60.40 TTACCATATTATTTACATTACTTCTCTTTGCGCGCCATTCAACTTTATCTACCATACAAACTAAAATTAATTGTACAAGATTCAATAATAAACATAGTATT:1 + chr3R 21823569 5' - Chouto 5849 1 61.39 GGCCGCGTTGACAGGCCTCGAACGAACATGGGGCGTTGATGCACATATGTCACATGATAACAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCACGTG:1 - chr3R 22187411 5' - G2 134 1 65.35 TGGCATAATTTCTTCCCAATCTCGAAAATTTTTGTGAAAGTGAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chrX 9439768 5' + roo 31 2 62.00 CACACACCGCGAGAGATGCCAGGTGAAAGAGAGACGGGGAGAGACGTGCTCCCCCAACGAGGAAGAGTGCTAGAAAGGGAGAGAGACGCTATTGGCAATGT:1 + chrX 13234578 5' + Doc3-element 109 1 76.24 CANGAACAAAGGGGTATTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chrX 8302837 5' + 297 43 2 82.18 AGNATTGAAATAGTTTAACTAGTCTTGTGAATAGTGCTAAAACAATAAGATACCATCAGGATATATTGATATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chrX 19030175 5' + Doc 14 1 67.33 CGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chrX 10644837 5' - hobo 2901 1 72.94 AAATCAAGTACTGCCAGCGATGTTGTCAACAAACGGGATCGAGCTCAATGAAATTAATGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 - chr2L 20914250 5' + P-element 15 1 44.55 CANTGGAAAAACAATACAATATCTGCATATTTATTTTTAAACCAATGCAAACCAAGGAAACATATTCAATCACTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACG:1 + chr2R 24208825 5' + Juan 7 1 73.27 ATACTATCATCTCTAATAAATAAATAAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGTGCGCTGGGACAAACGCTGGGACAAACACATAATGTGCTTATGGTGCTAT:2 - chr3L 21576902 5' + Tc1 1626 1 54.46 TANCTGCCAGGACTACAGCGATGACACTCATACGCCGCGTTGTCCGGCTCTATACACATACATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAC:1 - chr3R 24408339 5' + Quasimodo 9 2 70.30 GTTTTTGGTTTTTGGTTTTGTGAAAAATCTGGCTTTGTTTGCGCATTGAAATAAATAAATGCATGTGTGCCTTCTTTTTTCTTTTTATTATTTCTT:1 - chr2L 20600193 5' - BS 5095 2 79.17 AGGCAACCCCTTTGGTTTACCTTGTGGAACATAGTTGCTGGCTAGTCGGCCCTACAAGTGATTGTCTTACATCTTGTGTTTCAACATTGTTTCTGGGTAAA:1 + chr3L 20613349 5' + HMS-Beagle2 6922 2 59.41 TTCTTCATCCCGCGCATTCCCGCCTTTTACGCCGATTGCTGCCCGACGCTTCCACTGCTTATTTCTTTCCGACTTGTCCGCACGTTCTCACTCCCGAACTC:1 - chr2L 17061883 5' - gypsy8 438 1 65.35 GATGTGTTTAGATGATTTGTGCACATTCTTAAATGGTTTACCGTCCTTTACGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAA:1 + chr3L 24131083 5' - HMS-Beagle2 289 2 55.00 TTNAATTTCAATAAAGAACGAAGAATAGCACCATGGCAGCCCAACCAAAAGAAAATGCGAAAAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATC:1 - chrX 8421100 5' - jockey 4889 1 66.34 GGAAATTCGCTGGAAAGGCACAGGGACCTGCTGTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 - chr2R 23411938 5' - mdg1 7418 2 69.31 CTTTTCGTCTATTTTTCTACCACTTTTTTACAGCCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr3L 5276643 5' + blood 7043 2 57.43 TGCAGGATCTAAGATCCTTTTCCCTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 18223791 5' - roo 9020 2 76.24 TTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 20266007 5' - roo 9022 2 76.24 CAAACGAATATAATTAGCTGGCAATTGTCTCCACCCTGTGGCTCTCTCTGCTTTGGCCAGGCTGCAGCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTG:1 - chr3R 17754382 5' - invader3 481 1 75.00 ATTTTTACACTCTCAATTTAACGGTTCTTTTTGTTTTTAGGCACTTGCTGTAAAAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTC:1 + chr3L 27364877 5' - accord 7364 2 51.49 TGCGATGAGGATTTTCCGGAAAATAGCCTAAAATCTCATATGTACGCATGAGTTGATGGATGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chr3L 12352973 5' - Tirant 8492 2 65.35 TAATTGATTTCAAGATATGCGGAGGGGTTCAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 6156846 5' - Tc3 91 1 91.49 TTTGAAGCATTTTCCGACCCGTGTTCATCCGCCTGTGTTTTCTGTCCAATGTTTTTTTTGCGACCCCGATTTTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGG:1 - chr2L 13316543 5' + Cr1a 52 1 58.42 GGGGGAGCGAGCATGTGGCATGCATATTCATAAAATTGCACTGGAACAGCTCGCAGGACAACAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGA:1 + chr3R 17326316 5' + Quasimodo 237 2 67.37 TAAAACAAAATCTGGAAAGAGTATTTGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGG:1 + chr2R 17483730 5' + roo 8955 2 74.26 ATCGGCGGATTTTCTATGATTTTTTTTTATT:1 - chr3R 12585158 5' + Tc3 80 1 64.52 CCTCCGACTTACGTGTGTGTTTGAGTGTTCGATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTACACGTCTCAAGTTTAAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGAAT:1 - chr3R 23026627 5' - Porto1 4459 1 69.31 TGNATTGTGCGCCGATTATTTTGCCGTTTATTTCGCTCTCGCCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAATTTTCAAAAATGAAAAATTTCACTTTTTTC:1 - chr2R 13351820 5' + FB 159 1 58.42 ATTATTATAAAGCACAAACAAGCTGGTGGCGAATTTGAATTTAAAATAAAGCTTCACCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCG:1 + chr3R 21343081 5' + I-element 4994 1 43.56 CATTTAAAATACCTTTTCTCAAGATTTTCAAGACTCCAGCCACCAGCCCAAAAAAAATCGTGTGTAAGAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATCCT:1 - chr3R 10437066 5' - 1360 11 1 63.37 AGTAATACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACG:1 - chr3L 23155723 5' + gypsy 7030 2 65.35 GGATCATAGTTAAAGTTACTCTCCAGGTATTCTCTACAAATATTCGCATTCAATTAGGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr3R 4971242 5' + 1360 17 1 61.62 TGATGCGGTGAAACCAGGGGAAATCGACATTAGTCCTTCGCTTAGTTCCCAAGAAAAAAGCACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTT:1 + chrX 17488440 5' + invader2 204 2 73.40 TGCATTTTTATGTAAAATGATCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr3L 13652783 5' + hobo 30 1 51.49 ATATCAGAGGACAATTATCTGAGGAATGAATCGCTTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAG:1 + chrX 21636149 5' - Stalker2 7651 2 74.26 ATTGTGGCCCGGTGAGAGGAACGGGGTTGAGGAAAAAACCATTACAGAAGTTAATATTCGAATACGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTG:1 - chr3R 17550260 5' - mdg3 5426 2 58.16 TGAAAGAAAGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 12398120 5' - roo 387 2 57.43 AACGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATC:1 - chr3L 18476514 5' + accord 51 2 78.22 AGTAACGAAACATGAAATAATGGGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCG:1 + chr3R 6611175 5' - HMS-Beagle 246 1 79.00 CCCCCACACACTAATGGGTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 27452397 5' - roo 9045 1 57.00 ACACACATGCGAGTTGGTCAGCGCATCTATCTCCCGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTAT:1 - chrX 8313264 5' + jockey 4555 1 60.40 GANCTTTTTCTGAATTGCAGAATATTTTTAAGCTTAACTCCAAAAAGGATCTCATCCCGCCCCCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 + chr3L 9064281 5' - jockey 4976 1 60.40 AAGAGAATTGTGGTATCGATAGTTCCCTTGAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATATATTTAAACATGAAAAGTGTATCGAAGGGATGG:1 + chr2R 4956512 5' + Dm88 4253 1 66.34 ACTCCATTTGGCTGCTCTTCCCCATACCAGATATATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTA:1 + chrX 5887594 5' + S-element 34 2 66.33 TCNTATCCAAAAAGGATACATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 + chr3R 779366 5' + F-element 35 1 49.50 TTCCCACCTTTCGGCTGGATTTCCTTTACTTCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 + chr2L 11391861 5' + accord2 223 1 71.67 TGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 + chrX 21087578 5' + mdg3 22 2 57.00 CATTGGATTATTTGACGATTTCATCTGGACAACCATAAAATAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGAG:1 + chr3R 21621786 5' - blood 164 2 76.54 TANTCTTGGTATTGATTAATTGTGAAATTTGTCTGCATAAATAAAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCA:1 + chr3R 18584786 5' + Stalker 130 4 72.28 ATTTCCGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGC:2 - chr3R 1868238 5' + G-element 16 1 64.36 TCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3R 19446126 5' + 297 6586 2 73.27 TCGCCTTGGCATTTGCATTGAAATGCATAATTTATGAGTGCAGAAGACAGAAGAAAGGCAATTATTATCCACCCCAAACCCAAAAAAAAAGACATAACAAA:1 - chr2R 18602175 5' + transib1 2138 2 78.22 GTCCATTGTGTTTGTAAATGGCATCAAATAATAATTAATTAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGA:2 - chrX 4175166 5' + I-element 308 1 77.23 GCCAAGTATGCAAAAATTACAACTTTCCCTTGGCTGAAAAATAATTGGATTAATACTCATATTAACTATCATGCACGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chr3L 12352852 5' + Tirant 8108 2 78.22 CANGCAATAAAACAAGGAATAATCACGGGAATGAGAATCAGAAAAGACTATGAAATACTCAGCCACCGATTATTTAGCTTATTGCAAAAAAAAATTACAGT:1 - chrX 4941562 5' + pogo 1863 1 73.27 CACAATCAAGCGACTGGTTTACGGAGATCCTTTCTCCCTCTTTCTCACTTACGCGCTTACTCGCTCTCTCTCTCATATACACATATATATATACGCTGCTC:1 + chrX 10620378 5' + blood 189 2 71.29 ACTCCTAGTCATTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCA:1 + chr2R 1571529 5' - 1731 312 1 76.24 CATTTAATGCACATATTTGGCTTTTTGTGTGCCACTCGATTGCTCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 + chr3L 20669069 5' - Transpac 5203 2 53.47 CATAGAGAGTCGGGCAAAGTGTTGCATACTTTTGGGGCGGCCGATCGCATGGGTGTATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:1 - chr3R 22341229 5' - hopper 1395 1 59.41 AACCCGTCATCATCAGCATGCGACTGCTGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chrX 17729092 5' + hobo 42 1 64.65 ACNTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr3R 8191525 5' - mdg1 7439 2 64.38 CTCATCGCATCGGCTATTGAGCATAAATGTTTAATCAAATGAAGCATGCACAAATTGGGGTCCAGTCCGAAGCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATA:1 - chr2R 20383400 5' + Ivk 313 1 73.27 AATTGCGGTTACCGTTTTTATTTTCCGCCGTTACCGGTCTTTCGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr3R 28063664 5' + Doc 37 1 58.42 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCG:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 175 2 51.49 GTTGTTGTGGTGGTTTGGAGGTTTGGCCGCATCAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATC:1 - chr3L 5668424 5' - I-element 5085 1 67.33 GGAAATCTTTATACAAAGTTATTCGATTTAAGCCCCGCCAATTTGTTTCTTCGTTTTTCGGAAAAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGG:1 - chr2L 23068968 5' + diver2 254 2 67.33 GAAATCCTCCTATTTGCGTGTGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3L 13704703 5' - hobo 2893 1 78.12 GTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTC:1 + chrX 21636189 5' - Stalker2 363 2 64.36 GTNTAAGATTCAACTTCAAAGTTACTGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 16699054 5' - roo 9022 2 74.26 TGGCAAACCTAACATCTGTTTTCCGGCCAACCTGCAATCTCTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTC:1 - chr3L 5662721 5' + jockey 342 1 70.30 TATTAATTTTAATCATTTTTCTGACACAATTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 29423493 5' - roo 9049 2 56.44 AGATTTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAG:1 + chr2R 13319015 5' - TAHRE 10419 2 64.00 TATAAGTTTAAAGTTAAAACTTTCTTTTTATCGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCA:1 - chr2R 14036564 5' - pogo 292 1 69.31 TACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr3L 22349288 5' + jockey 24 1 62.38 ATACAAAAGCATAATATCATAATATAGATATTTACAATTGGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 16699005 5' + roo 8699 2 62.38 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGG:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 16 2 72.45 GTGAGCGAGGGAATTTCACATTTATTTGATTTTCATTTGCATATACCGACTGGGATACGTGCAAATTTGCGGCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chrX 14505743 5' - pogo 2100 1 68.32 GTTGTGGCATATTGTATCACATTTTGAAACGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 19947408 5' - roo 9027 1 69.31 CTCTCAAACGAAAAAAAAAAGGGGAAGGGCCCAAAAAATCATTTTGTGAAATAAAAAAAGAATGAATGGAATACAGGGAATGAAAAAAAAAAATGGAAAA:1 + chr3L 8036816 5' + Bica 337 2 83.00 GAGGAGCAAAATGACGGACGATTGTTCGGCGAACAATGCGACATTGTTGTGCTCACACTTCCCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr3R 12566796 5' + Doc 21 1 66.34 CTGCATTCGTTTCAAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr2L 8297403 5' + Tirant 26 2 51.49 ATTTAATTTTTAATCCATTTTCACTGGCGACACTCAACACCTTCTCCAGCTTTACAAATCCTTCCACATTCGGACTTCTCAAAAATACTAACTAGAGCCTA:1 + chr2R 4214761 5' - aurora-element 4072 1 64.36 AGGACACTTCGTGATGTAAGCTATTCAAGGCAATATACGAGAAATTGAGATACAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 27900507 5' - roo 407 1 73.27 GCATACTTAAAAATAACAAAACCAAAAGAATACCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr3L 11156199 5' + 297 7 2 71.29 GATGGCTGTGTGAATTCTCCAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGTCAA:1 + chrX 17321638 5' + Circe 7204 1 80.00 CGACTGCACAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 4806682 5' - roo 9031 1 63.37 ATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2R 9868917 5' + roo 8710 2 74.26 TGGTGGCATTTCCCTTTTATTATGCAGCATAATCAGCCATCCGGTGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTG:1 - chr3R 8482687 5' + Burdock 381 1 60.40 ACCCTAAAGCAATAAACAAAGCATGTATGTGAAGATTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 + chr3R 7009934 5' - copia 249 1 62.38 AGGAGGGGTTTAAGGGGTTGTTGGAACCCCCTGAAACACCCCTCCCACACATACACACACCCACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTG:1 - chrX 12258367 5' + accord 202 2 74.26 TTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGC:3 - chr3R 15021690 5' + invader4 2747 1 45.54 TGTAAAAAAACGTAAAACGAACAAAATGACTATATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr2L 21951236 5' + opus 7157 4 70.00 TTNTCTTCTGCTCGTTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chrX 10644791 5' - hobo 2931 1 71.29 AAAGCACGGAATCCCAGTGGGTCTACAGAATGACAAATTGTCAACTGAACAGTGAGCAAATACTGCAAGCCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 + chr2L 6645622 5' - mdg1 415 2 72.28 GAGGAAACACAATCTTTTTGACTGAGATTTGAACGGACAGTGGCCGCTCTTTGGTGGGTTCATGTATAGTTTTTTTTGTTTGTTTTTTTT:1 + chr2L 637014 5' - HMS-Beagle2 488 4 72.22 CACGATCTATTAAAATTCCTTAAACGTATTTTTATTTCTTTTCTTGCCGCCAGTCGAACAAATAATCTTTAAAACCGATTTTTTTTTTGTTTTTAATAAAA:1 - chr3L 10808150 5' + hopper 156 2 59.41 TCGTGTACTATTGACACGTTTTGTTGTAAACTTGGCAAAACGGACAAGCTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCT:1 + chr3R 26375375 5' - I-element 4955 1 70.30 ACTTTCCAGCCGGAGACTGGATTGAACGGTGGTACATATACGTTCCAAGCCGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 + chr2L 8297317 5' - Tirant 376 2 56.00 AACACTGATTTATCGGTGGTCGATAACTATGAAGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGC:1 - chr3L 10631068 5' - F-element 4305 1 67.33 ACAATGATATAGGATAAAATCGATAGAGTACAAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGATGC:1 - chr3R 5027281 5' + Chouto 48 1 96.04 CGAACTAACCCACAAAATCAAGGTGATTTCGCTTGGCCGAAAGCAGCAGAATAAAATGGGCGTAAAATAAAAAAAAAGGGAAAAGAGGAATAGTAAACGAT:1 - chrX 10094925 5' + Bica 354 1 72.28 CTATGTCCAGATGCTGTTGGTAAATATTGAAATCAAATACTGCACTTTTACTCGCATAAACTTCAATTAAGAACACTTCAAATGAAACCGCTGCGGCTGAT:1 - chr2R 17025350 5' + X-element 333 1 74.26 ACGTTCTGATACTGTATAAACAAAGATTGCCAAGTTTGAATCATTTATGGAAAACAGCCCGGCTACAGTGCGCGAGTATCGTTCTGACTCATAGTTTTATT:1 + chr3L 16048193 5' - F-element 183 1 74.26 CGATTGTTTTGCCATTAAGTCTGATAAACTGCAGTCCAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCG:1 - chr2L 10220949 5' - I-element 4886 1 68.32 TCNGGCTGATTGCTAGCAGCTCCCCCCTTTACTTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 - chr3R 8191555 5' - mdg1 417 2 69.32 TGGGCTAAGCAAAGTGGGGGCAAAAAACACGGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 - chr3R 13998089 5' - accord 182 2 74.58 GGCGGATGAACGTTTTGTGTTGCCTACTTTTCGGCTGGGTAGTGTTAATGTTGAATTGTAGTTTGGGGGCGGGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 9064387 5' + jockey 12 1 69.00 AATTTCACTTTTATTTGATTTTCATTTGCATATACCGACTGGGATACGTGCAAATTTGCGGCTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chrX 14505754 5' - pogo 2090 1 58.00 AACTTGCTTTATTTTTTATGATATGCTGCCAACGCACACGCACGCATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTT:1 + chr3R 30110931 5' + 1360 3263 1 64.36 TTTGTTGCAAGCATGAGCATTCATTTCAGGACTATTAAGAAGGTAACACCAAAGACCCTTGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3L 11217332 5' + 1360 31 1 54.46 TTATTGTTAAAATAAATAGAAATTAAAAACAAATACACACTGCGGCAGTAAGAAGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGT:1 + chr3R 1173655 5' + 1360 454 1 58.70 CCAAATGGTTTCCTTAAGTAGTACGATTGACATATGCTTTGAAATTGATTACCGTTGTACTCTATCCAACACAATACGACATAAAAATAATTTGATAACAT:1 - chr3R 19642946 5' + transib4 103 1 91.09 GGCGGTAAATTTTAGTAACCCATTCAGGATTGTGATTATTCAGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATAT:1 - chr3L 25484813 5' - Porto1 4266 1 67.33 ACTACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTT:1 - chr3R 2533957 5' - gypsy8 4817 2 57.43 ACAATAAACCACTTTATGGGCTATCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGT:1 - chr3R 25634937 5' - P-element 2834 1 26.00 TTTTATATTTCAATCAATTCAAATAAATGCGCTAGTTTAAGTGAGTACTCACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 14255611 5' + pogo 18 1 55.21 CGNATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr3R 13349552 5' + Ivk 50 1 70.30 CAAAAGAGGTAGGTTCCGAGTGGCGTCTTGGTGATCCCGTTCCATTAGTTTTACGTCTAGTAGAAGGGTGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 6814249 5' + roo 8668 2 73.27 CAACCAACACCAGTGCACCGCACCGCATCCCTCGTTGCATACGGACGTTCGCGATTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACATCAACTACTCTTCCAATCTTA:1 - chrX 8325423 5' + jockey2 52 1 69.31 CGAAACACACAAAACACAAACACAAACAGAACGAAATTATTTATGACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGC:1 - chr3L 979518 5' + accord 472 2 55.45 GTAGGCATATAAGGAGTCCACCGCAGCCAACTACATAAATTGTGGAAAAAAAAAACAATCCACCTCCGTTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTT:1 + chrX 19296098 5' - Doc 277 1 71.29 GNAGCTGTCATCGAAAATGACAACAAGCCCACAAGGAAAAAAAAGGGAGGAATCCGGAAATTATGCAAAAAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chrX 3547583 5' - roo 406 1 77.00 TGCAGCCCTTTCACTTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 7885581 5' - hobo 2925 1 65.35 GAAGTCATAAATCATATATGTGTTTGCAACGGGTCTAGAAATCCTCCTATTTGCGTGTGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr3L 13704740 5' - hobo 2925 1 66.34 TACACTTTGGCTGGCTTAGTTCAAATATTTTTACATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 9410857 5' + roo 40 2 67.00 CTTTACTGGAAATCAAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGA:1 - chr3L 25350827 5' - baggins 5420 1 38.61 GCTATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 - chr3L 1259221 5' + Doc 42 1 61.00 ACAAAAACATGTTCTCTTAACACATAAATAATTGTTTCTTAATGTATACGCACGGGCGAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCT:1 + chrX 4921704 5' - accord 300 2 63.37 TGTGGTGGTAACATTCAGTCCAGAGTCCAGAGTCGTTCGTCCATTTTGTGGGTCAAAAGCAAATACAGTATAATTCGCTAAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3R 24739099 5' - pogo 2086 1 64.36 TCGAATGATGGATGGTGAGAGTCCATTCATTCTGCACACGGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 8337904 5' - hobo 2907 1 57.43 GGNCAAAACTATAGTTGAGACATGAACCTAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAG:1 + chr3L 10557573 5' - 412 463 2 53.47 CACACAGCTTGTTAATCAATGTTGTTTGAGGCCTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCCCTGCAATC:1 - chr3R 31117219 5' - rooA 113 2 78.22 TATTAGGCACTTCAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chr2L 20315739 5' + FB 39 1 81.82 TACAATTTGTTAGCAAATAATTTAAATAACCTAATTTGCTTTTATTAAGTTTTTGTTGTTGGATTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTAT:1 + chrX 16565392 5' - I-element 94 1 57.43 GCCAAGAGAGCTCGGTATTTGCCATTTGCCATTCGCTTTTTTGTTTTGTTTGTTCTGTCGATTTTTTGCAGCTTTGTTTTGTTTTATTTTTTCTTTTTTTT:1 - chr2L 2096272 5' - gypsy7 5008 1 71.29 TTCGCTTCTAGTTGGCGGCAAAAAGAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 7908932 5' - hopper 149 107 82.93 TTCCACAGTAATATTCTTTTTAGTAGCATATAGGCACCTCTTACACCAGCACACACGATTCAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 20309416 5' + roo 8677 2 66.34 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCT:1 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 79.21 GAAACGAAAATATGTTAAACGCGTGACTAATGTGAGAACGTTCCACGAGATACATTTGGTTCGTTAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACC:1 + chr2L 1410116 5' + accord 6989 2 69.31 TAAAAACATTTAAAATTACAATTGCACATCTCGCGTACAATACATATTGGAACGTCACAGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACG:1 + chr2R 2056631 5' + flea 4846 1 63.37 TTTAACTTATGTATTTGGAAGACAAAACCAATAACACTAGAATATCAAGATGCGTAAAGCCATACGTTTTT:1 + chr3L 24764803 5' + 1360 22 1 83.10 AGTTTTTAAGCGAAGCGAGCAACTAGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1 - chrX 12756177 5' + HMS-Beagle 45 2 72.92 TTTTTAAATACCAAAAAAAAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGG:1 - chr3L 17061718 5' - diver2 4738 2 61.36 AAAACACAACAATCCTTTCAGAGCACTCCCGTCAATTTATCCTTTTCATCACCCCCTTGTCGCATTTTCCTGTCATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGA:1 - chr2L 18547583 5' - F-element 498 1 82.00 TANACCACGGCCCATCCATATATAGACAGTACACAAAAAATGGTCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAAC:1 - chr3R 9336640 5' + Quasimodo 162 2 57.43 TGTTTGCAACGGGTCTAGAAATCCTCCTATTTGCGTGTGTGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr3L 13704720 5' - hobo 2905 1 62.38 AACCGAGTGCACACGTTTGACCCAGGAGCGACACAACGAGGACATGTGGGAATTGCACACGGTTGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTG:1 + chr3R 7373376 5' + Quasimodo 253 2 73.27 TCTTGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATACATTTGAGAAAA:1 - chr3L 5662682 5' + jockey 381 1 64.36 GTCTTACACCCAGCCCGCAGGCTTCCTACCCGGCCACGCCCACACTTTTAAAAAAGTCTTGATATTTTTTTACATTTCATTTTTTATCAATTTGCAAAAAA:1 + chrX 2103622 5' + S2 124 2 68.32 CCATGGAGGAAACGATGCCCACGCCACCGGCTGCGCATCAAATGAATCAAGTTAGCACACGCAATAAGCACAGGCAGCAAGAACAACAACAGCAG:1 + chr3L 15109736 5' + TART-A 124 2 61.05 GTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGC:1 - chr3R 1977614 5' - micropia 419 2 60.00 AANAATTATAAACTCTTATTTATCGAATACTAAATTATTATTGGGCACCCGTCGTTTTTAAGTGCCTTAAAGTTCGAACTTAACTTTTGTTTTTAAGGAAA:2 + chr2L 5348955 5' - pogo 2026 1 87.13 ACNGTCTCAATCGACATGTGCGTTTCGAGTGGAGTGAACTGGATTGGAGTGTGTTTGTGTGTGATGTGTAGATGTCAGTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 10497285 5' - accord 7032 2 74.00 ACCGAATAAAACGTAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACTGCAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2L 20265916 5' + roo 8666 2 43.00 TTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAA:1 + chr4 941837 5' - TAHRE 10394 1 82.18 ATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCAAATCCTTCTGTTGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chrX 20331813 5' - mdg1 389 2 50.50 AANATAATTTAAAGTCTGTAAAAGATACTGGTTACAGTCCAGGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr4 119387 5' - 1360 3359 1 59.41 ACATGAACCTAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3L 10557592 5' - 412 7497 2 72.28 CTCGCGGAACTCTAGCCAAAGTACCGTCTACAACACATCAACCACTTTAATACGAATGCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTC:1 - chr2L 36426 5' + F-element 4494 1 66.34 TAGAACCAAAGGGTTGCACCAAGCAACAAGACTATTGAATTTATAGACATTCCATAACAGATCATAAAGAATCAATCGTAAAGCGAACGAATCTTTAATAA:1 - chr2R 4522115 5' - Cr1a 116 1 61.39 TTATATAAATTAATAGCTTTCAAGGTGCAAAAGAAACTGTAGCTTGTATATTGGATGCACTTCATTTTTCCGGATGGCTTTAGTGTCAGGTTCCAGCTCAA:1 - chr3R 13553335 5' - Fw3 332 1 77.23 TAACCTCCCGATTCCAGGCTGCCTCAATATATTTCTGGGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATCAAAATT:1 + chr2L 19392668 5' - hopper 257 1 60.40 GANAATTAAAGGCAATTATTAGTGCGAGTGCGGACGGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3L 447282 5' + Tabor 6846 2 71.29 CANTGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGG:2 - chrX 20999756 5' + BS 59 1 56.44 AACAATTCCGTCTATCCGTCCAGCTGGATGTGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACG:1 - chr2R 9066963 5' + Ivk 4994 1 70.00 ACACAGAAATGGCAACCAGTTTGACGTATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3L 14209075 5' + Quasimodo 43 2 74.26 AATTTAAGTTAGTAAACCAAAAGGATTAGACAGTCAGATATCTGATATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3R 19206096 5' - mdg1 7429 2 55.45 CAATGGGCCAAACAGCAGCCCAAACAAGCGGCAGTCGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2L 6184192 5' + roo 8704 2 64.36 ATGCGACATTGTTGTGCTCACACTTCCCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr3R 12566761 5' + Doc 56 1 71.29 ATCGAAAAAGAGATTGAGATTTGTTTAGCCAAAATAGTGAAATTATGCCCAAGTCCAAGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAAAGTTTAC:1 - chrX 21251048 5' - baggins 5195 1 61.39 AAGATACCGACTTTGGATTGACGACGCTCGGTCGCTTGGTAATTGTGCAGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr2L 20914027 5' - P-element 2859 1 51.49 AAATGTAAGTGCTCAGTGTGTTTTGTTGCGATTTGTGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAGGATCCCC:1 - chr3R 9589452 5' - baggins 5374 1 67.33 GTCTGGTTCATCTCCTGGATGCGGCAATAGCTCCACTGGTTCTCCTGGCCTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGT:1 + chr3L 4029630 5' - I-element 367 1 51.49 GCGACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 + chr3L 21144047 5' + jockey 4710 1 53.47 CGGCAGGTGGCTAACATCACGGCGAACCACTGAACGACAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTA:1 + chr3L 16545210 5' + F-element 4549 1 63.37 CAATTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTG:1 + chrX 21564654 5' - diver 209 1 58.42 TCGTGCTTAAATTTGATACGCAATAATAATGTTGTATATATAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGG:1 - chrX 12836098 5' + mdg1 7126 2 69.79 ATTAGAGGCCAGAAATAGCTAAACATTTTATATTAGTGTTAAGAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3R 7009993 5' + copia 33 2 60.40 ATTTATGTTCTTAAGCAATAAATGATAAATACTTTGGAAATATAGTAGAAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCC:1 - chr3L 18815101 5' - roo 8963 2 60.40 TTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGT:1 + chr3L 24213802 5' - invader2 193 2 79.21 CGCAGCCACTCGAAGTCCCATCTCTAATCTCGAGTCCCTTTCGCACTTGCCCGCTACTCACATGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 - chr2R 8951090 5' + P-element 14 1 65.35 CATCGGTTGCTCTTGCTTTTCGGTTTTCGGTATCTTGGTCTTGAAAAATTCACATTTATTGACATTTAATTTAAGTCCTGTAGCATATTGGACTAATCTAC:1 - chr3L 25995866 5' + Stalker4 2 4 71.29 TTNAAAACAATAACAAGTTTATTATTCTGCGTTCTCAGCATGAACTTGTCCAACCGATTGCGATATAATGTATTTATATTTATTCATAAACGGGATAAGTG:1 + chr3L 7760725 5' - diver2 433 1 57.43 CTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 + chr3L 11920060 5' + Tabor 6890 2 78.22 TAGCTGGCGTTGTTGAGTGAAGCCCTTTGATGACCACCCGGAAAGCACGATTTTCTTTTAGCTGGATGATCTGAGAAGTTCGTAAATGCTGTTGATTCTCC:1 - chr2R 3998861 5' - Burdock 5941 1 65.35 GTGTTTACTCTCGCCACGCGTTCGATATTTTTCTGGTTTTGTTATTTTGTTTGGCGTGACAGCCGTGGTTTTTAATAATCATCTTTAATTATCATATATTG:1 - chr3R 11023367 5' + Cr1a 85 1 60.40 TGGACTTGGGTCAAAACTATAGTTGAGACATGAACCTAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGT:1 + chr3L 10557565 5' - 412 472 2 58.00 GTCCCATGGGCGAATCGTCGCGCTTTTTCTTGCGCTTCTTTTCCTTCTGCGTATCTGAAGAGCCGCTGCTGAGCTGAATTAGTCCTCGCGCTAGGTG:1 + chr3L 21631754 5' - F-element 4478 1 65.98 CAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTAGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 + chr3R 24461836 5' + F-element 38 1 66.67 AGTAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr4 1156884 5' + F-element 59 1 70.30 CGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 + chrX 6509792 5' - jockey 4943 1 74.26 AAGATTCATCGAATAAAGTGGAATTACTGTTTTTGCTGGTGGTGAACTCTTTTCTGGGGGGTATACATCTCCATCTTTATAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 10609941 5' - hopper 150 11 79.21 GTTAATTTTTTAATTCAATAACGTCTATTATTGTCGTACGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 - chr2R 5178653 5' + mdg3 5280 2 51.25 TAATTTATTCCAAACAATAAACCACTTTATGGGCTATCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 25634950 5' - P-element 2846 1 38.61 TCCTGGTATGACTTTGGGGCAAATGAAAAAGAAAAAGTTTCCGAAACGACAGAGCACTGATGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATG:1 - chr2L 13623643 5' - Rt1b 4769 1 61.39 TAGCAGTAGGCAATTTCAGTTACGACGACAGTCAGCAAAATTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAA:1 - chr2L 19285916 5' - F-element 4639 1 62.38 TTAAAAATATTCTAATCTAAATATTTAAGTGTTAAAAATCATCAAAAAATAGTAACAAAATTCA:1 + chr2R 5517793 5' - HB 1401 1 76.56 GTTATTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGAC:1 + chr3R 19445581 5' - F-element 317 1 69.31 AGNAGGCATCTATCCGCCGCACACTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 + chr3R 20984203 5' + hopper 54 1 77.23 ATAATAAATAAATCACAAAATCAGTGAAATTCGTGAGCAACGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTT:1 + chr3R 3188738 5' + Doc 279 1 53.47 ATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAA:1 + chr3L 27356088 5' - Tc3 1674 1 63.37 AAACAAACGTTTGGGGTTCGCCTGCGGGTTTTGCGGTTGTTAAGCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 6184252 5' - roo 9039 1 58.42 GATATCTCACAAGTTGACAATGGATTCCTCATCGATATTGAACAGGATTCGTTCGGAAGGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:2 + chrX 7768897 5' + hobo 13 1 63.37 AAATACCTAAATCGGTTCTAATATGAACTGTTTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr2L 7558726 5' + FB 44 1 69.00 TTATTTGAAAATATATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3R 18066415 5' + pogo 38 1 68.32 TGNGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAA:1 + chr2R 544820 5' + HMS-Beagle 6849 2 79.21 CTAAGCTTTTGCCTGCTCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTCAAAAGTTTCCAACGCGAAGAAGTGAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 + chrX 20381382 5' - INE-1 575 1 77.23 TAATTAGTTCGCTACTACTTCAACTTCAAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCGGC:1 + chrX 22738554 5' + 297 8 2 69.31 CTTGTGCGCAAGAACTTTAAACACGAACAGCACGAAATAACACAAAACGGAATGCAACAAGCAGTGGCGATGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3L 11789942 5' + P-element 7 2 70.30 GAATTCACTAATTTCACAACACCAATAGTTATAGTTTCTCTATATCAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr3R 12514922 5' - opus 7477 2 56.44 CTTCGAATATGGCTTTAAGGCTTTTGGGAACCTGTCCCGCTCCAAACGCTGTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACG:1 - chr3L 11099626 5' - F-element 281 1 60.64 GACTGCTTTGCATACTTTTAGGGGCACTCAAAGTCGGCGGCTTTACAAATTGAAATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 - chrX 10974225 5' + jockey 4690 1 51.49 GTGCTCTGGATTTTCAAAGCTATTATTTAAAGATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chrX 9983697 5' + pogo 40 1 70.30 GCGTGGGGCGTAGGGGCGGGGGGGGTTGGGTGGCCCTTATGGACTGCGGCCGATTAACGGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTTT:1 - chr3R 29773124 5' - Doc3-element 435 1 77.38 CGNCGCCGTTCTATGAACTATATTACTGAAATATATATGATGTTGTATTAAATTCTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr2L 21612887 5' + 297 15 2 62.38 TTNTATAGATGCAGTTCGCCGCTTTATCTGGCTTTAGAGGCTGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGC:1 - chr3R 19449367 5' - invader1 4011 2 70.30 ATATTCAACAAAAAAATATAAAAAGAAAAAAAAAAACAA:1 - chr2R 24392144 5' + gypsy7 5009 1 84.62 ACGTATTGCACGACGTGAACTTGTGAAACTTTTGAAGTAAGAATGTCACAAGCAAAAGCTTCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGA:1 + chrX 12000976 5' + Porto1 333 1 57.73 GCAGGAATGTGTATTTTTTTAATTATTTCCCAAATAGTGATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 - chr3L 11891406 5' + Tabor 6851 2 65.35 TTTTGGTATATATGAAAAAAAAAAACTTTAAAA:1 - chr3R 18221479 5' - FB 880 1 81.82 AAGTTGAAGAACTTTAATTATTCTGCGTGCACAGTTGCTTGTTGCCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 19947351 5' + roo 31 2 55.45 TGTATAGTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAAGTTTGTATTTTAGTTTTAGTTTTAAATGATCAGTTACAATAAACGGTCGCTTGCGATATGCAAAA:1 + chr3R 2424355 5' + HMS-Beagle 218 4 46.53 TTNGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 - chr3L 14854765 5' + Quasimodo 30 2 62.38 GGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGAC:1 - chr3R 1868230 5' + G-element 24 1 56.44 ATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 22046473 5' - roo 9016 2 77.23 ACGTCAACAGGTTAAGATGAAGCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr2R 3036910 5' + F-element 69 1 77.23 AACGTAATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACTGCAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 20265925 5' + roo 8675 2 39.00 AACAAAAACACGACAGCATTGTAAAGCAATTGATGTTTATATGTCGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 11808961 5' - roo 9043 1 60.40 CCTGACAATTTTTTAAGCCCCACCAAAAAAAAAGGTGATGCTTTTTTCTTATCAGGGAAAAAAAAACACATGAGCGAGACGAAATTTAAATGTTTTTTTTT:1 - chrX 9009997 5' - transib2 2647 1 49.50 TGGTTGACATAACCGTGGTATACATCAACACGACGATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 26002660 5' + 1360 14 1 64.36 AAGATATCGTATCCGAAATAATGTTAGTACATTTGTATCTTAAGAAATATTTAATTCAGTCTCCACCACGAAAATAATTCTTATTCTAATTAATTAAGCTA:1 - chr2R 16642714 5' - GATE 110 2 54.46 TTAAAAAACTGAACAATAGAACTTGCTCTATTGTAACGGATATATACCATTGTTTTATGTTGTTAATTTAGTCTAATTATTTAGTCTATATTATTTGG:1 - chr2L 15090523 5' - F-element 87 1 21.43 CTGGCTCTGTGTTGGTGCCTCTCCCTCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTT:1 + chrX 19546082 5' + jockey 272 1 80.20 CTGTATTTATTAATTCTTATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGG:1 - chr3R 28799122 5' - I-element 5299 1 78.22 AATCACGGGTTAGTTCGGCTAAAAAATAATTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAATCCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGG:1 - chr3L 20698959 5' + S-element 1401 1 70.30 GAAATAGAAACAATTGGTTTTCGCAACATTAACGTATTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:2 - chr2L 1590826 5' + opus 150 4 64.36 GAAGGCGTTGTCAACGGGCCACGGCTTTGACTTTGGCATTTTCCTTCCAATCTCACCCAAATTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACA:1 - chrX 5009897 5' + I-element 4941 1 52.48 AATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chrX 9437205 5' + roo 8746 2 43.56 CTAACAAAGTGCTTTCACACCGGAAGCAATTGCAATGCGTTTGCCGTCGTCCTTGCCACCGCACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTC:1 + chrX 17326186 5' + Porto1 455 1 65.35 TTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAG:1 - chr3R 13349566 5' + Ivk 36 1 56.44 CTTACTTAGCAGCTGGTTATCAATATTAGCCCCGAAAAATAGGCAACACTTTTGTTTTTTTTTTAGCATAATATATTGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCA:1 - chrX 6509858 5' + jockey 6 1 71.29 ACGCTGTATTTGCATCTATGAATGGCTTTCGCGAGTAAAAATTTGAAAATGTTTTTAATTAAGTTAATGTAATGTTAATAAAGTAATTGTTGAAATTTATG:1 + chr2L 6123637 5' - 1360 373 1 70.30 ACNCTTCCCGCAAGCCAGGAGTTATTTTCGTGTCACTGGCATATTGGGAAATGACCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTC:1 - chrX 1832150 5' - invader3 5451 2 63.37 ATACATATATAAATGTATATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 14935088 5' - accord 7032 4 77.14 TCNGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 + chr3R 14049355 5' + transib2 40 1 65.35 TTGCAATTGGATTTATAAATAAGCTTTCTAGCGAGTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTC:1 + chr2R 9284494 5' - Doc 4445 1 65.35 CCCACTCTTTTGCTCGTTCTCTTAGCCTATCTAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGAATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGC:1 - chr2R 20920081 5' + 17.6 7026 2 66.34 GCTGGTTGGGATAGAAAAGTTTATATGTATGTACATGTACATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGT:1 + chr3L 10764030 5' - accord 209 2 60.40 CGGCGTCTCCTCCTCGCTCTCGGAGCCCAGTTTGTTTCCATTCTGGGCACCGGCGCCAAAGTAGTCCTCCTCCTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGGCGGTG:1 - chr2R 11456674 5' - invader3 463 1 77.23 TCGGGCCTTTGTCTGTATGCCTCAGATGGAAACTCCACATTAACATATAAATTAGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGA:1 - chr2R 7851633 5' - Stalker 419 1 73.27 ATAAGAGGAAATGTGTGTTTCATGTGAACGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:2 + chrX 6509764 5' - jockey 4971 1 53.47 TCCCAATAAAAGAGTTTAGATACTTCATCGAATTACTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr2L 16889530 5' + FB 39 1 65.31 CACTAATGGGTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 27452389 5' - roo 9036 1 65.35 TGGCAGTAGGAAAAGCAATGGGAAAAGCAGCCTGAGCGGCGACTCTGGATCCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr3L 19275666 5' - mdg1 7434 2 53.47 TGATGAGAGGGGATATTGGGGCGATGTTGTGGGTATGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr2L 17269838 5' - hopper 1375 1 63.37 TTNATATTTCGCTTCATAAATATGTAAATAAATGCCGACACGAGGGAAAGACAAAAGAAATCTTGGCCTGCTCCTACCCTCGATCAGACTACGTTCGGCAG:1 - chr3L 6661532 5' - invader1 109 2 69.31 GCGGTGAATCAAGATTTTCCAGCATTTAAGCTAATTAAACTGAAAATGCTAAATTATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAAT:1 - chrX 18952129 5' + mdg1 21 2 54.46 GCTTTTTTGCTTAATGCAACAAAATGATTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGCGCAGATGAATTTGACGCGCATTCTGCGCTTTTGTGCT:1 - chrX 21020811 5' - Porto1 395 1 72.28 TAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTT:1 - chr2L 23034062 5' - FB 411 1 43.56 CAATTAATTTAAGTTGGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 - chr3L 14854778 5' + Quasimodo 17 2 63.37 GGTTATTGTGGCGTGATAACGGCAATTTTTGTACTTGCTCTTGTTTCTCCAGCATTCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr2R 13304425 5' + hobo 18 1 61.00 AGAATGGCAAAAAGGAAGTTGAACGCAAACGAAGAAATGGCATTTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAA:1 + chrX 12869675 5' - diver2 4688 2 75.25 TTAAGTAAAGCAAAATCACTTTCCGGGCTTACGAGATAAGAATCGTGTAAAGAACGCACATTAATACATACATATGTATGTATGTACATATGTATACATG:1 - chr2L 6644197 5' + invader3 5087 1 70.00 CANGAGTCTGTTATTTCGCACGGTTCGTCGGCAGGTTCCACCAGCCATCAGGCACCCAATCCCAATCCCATCATTTTTTGGTCCTTCGAGTCGGATCACCT:1 + chr3R 18050866 5' + GATE 277 1 66.34 CCTAAGGATTTAGACTAATTTAAATACAAATATCTTCCTGTAGGTATTTCTTACAAACAAACTTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCACGTTACTGTCT:1 - chr2L 20952846 5' + HeT-A 5861 1 58.42 TGNCGTGCCAAATAGCGGACGTACTTCTTTCGTAATACAGGGATTCATAGCTAATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACT:1 + chrX 22982630 5' + Q-element 316 2 76.24 CTTAAATGCCGCTCGGCTTTTTAATGAGTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2R 9658351 5' + P-element 45 1 34.65 TTNCACAGTAATATTCTTTTTAGTAGCATATAGGCACCTCTTACACCAGCACACACGATTCAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 20309416 5' + roo 13 2 65.35 AAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCG:1 - chr3R 1868211 5' + G-element 43 1 62.38 TCNTGAAACTGGTTGCTCGCCAACTTGAGTTCTTTTCCATTTACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 - chr2L 10174176 5' - mdg1 7432 2 55.79 ATGAACTTAATACTAACGCTGTAAAAGGTACTGCTTACAGTACTCTGTTGAAGTTTTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAACATGTACAATGTAAAT:1 - chr2R 1921829 5' + 1360 3146 1 58.42 AANTTAAATAATAGAGAATAGTTATACACTAAATAAACAACCAGAGANNCAAGGCGATAATAAANCCAATATGGA:1 - chr3L 5161169 5' + Porto1 4251 1 65.33 AACGACTGTGAAAAGCGTGTACCATTTAATTGATATCTCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2L 5291673 5' - roo 9035 1 62.38 TCAACACTTTTGGCCGGGGGAAATTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chrX 4448558 5' - 412 440 2 73.27 AAAGAAAAAATGAAAAATCAATGCGCACCTATGATCGAATGAGTTGGCTATTTGGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 6082649 5' - roo 390 2 57.58 TCAGTGCTTTCGATTTTAACGATAGTTCCGATAACTCCGACACTCCCCTCGTGCCACGCCCACCTATAATAGGCTGCTTGCAGCGCTGGCCGGA:1 - chrX 10618351 5' + TAHRE 9973 1 68.09 GAATACTGAGGAGTAGCTTGGAAGCACTGATTGCCTCGTCTTCTGTAGTTATTGCCAGGCCTACTATTTCAACGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGA:1 - chrX 19820786 5' - Rt1b 4976 1 77.23 AAGGATACATTTGTAAGAGTAGTACACGGGATGTCCTTAAGCACACACACATGCATCGCTTGCAACAAACACATGCCCACTCACACACACACACATATGCA:1 + chr2L 16943839 5' + accord 7032 2 55.45 TTTACCGCCATTAATGGGAAATTACGGAGCAAATTGTAGGCGTTGACAATGAGAATATAAAATCAAACTGAACTTAGGGCTAACAAAATATGAAACTCATA:1 + chr3L 5189504 5' - gypsy6 7549 2 60.40 CTGCGACTAGATTCAAGTGCTGAAAATATAAGATTTGTTGAATAAAATGAATAGGAGTGATTGCTTTGGGATTTTTTTCGACTAATTTTGAAAAAAGGAGT:1 - chr3R 5166640 5' + Tc1 281 1 68.32 AATTGTATTCGTAGGAAAATAAATAAAATATAAGCCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAA:1 + chr2R 21818176 5' + flea 4580 1 66.34 CCAACCACACGTGCCACCTGCCCCCAATCCCAATCCTTATCCACATCCACATTCCCACGTTCAATGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGA:1 - chr2L 5731208 5' + Idefix 276 2 53.47 TGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTTAATCAATTATTTAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTG:1 + chrX 14771724 5' + BS 4800 1 64.36 GCGAGTATTGGGAAACATTTAGGCTGATAAATACATATCCGGCTAATTGGTAACTGGGCTAAAAGATGGGCGTGGATTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTG:1 + chr2R 9310874 5' - Circe 7340 2 69.31 ATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 20266001 5' - roo 9016 2 82.18 CATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTC:1 - chr3L 20224204 5' + Chimpo 46 1 74.75 TGATCTTTAAGCCGCGTGCTTTTCCTTCATTGATTACTTCTCGGGGTGAGCCTATCATTGTCCCTATAATAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAG:1 - chr2L 22685497 5' + Tirant 8293 2 69.31 ATTAATGGTTAATTAAGGTTAATAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCG:1 + chrX 8202077 5' + I-element 141 1 77.23 TGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 + chr3R 4600452 5' + Tabor 6895 2 79.21 AAGTGCAAATGTTGCTGGCTGGTTGAATAGTACAAAGTTCGGGATAATTGATGAGTATTTTCAATTGTTTACTAACTAACGTTCTAGTGTTCTGTGGAATA:1 - chr2L 9270358 5' + transib4 394 1 55.45 AAAGCCAAGACAATGGAGGGACTGGAGTAGGCATTGCTGGTCACCCACGAATAAGCTTACAATTAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGG:1 + chr3R 25067931 5' - Cr1a 4009 1 57.43 TANAAGTTCTTTGCCAATTAAGCCCAAAGTTTATACGATATGGAAAGCTGTCTAGCATAATTTTTGGTTTCGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chrX 6731887 5' + hobo 6 1 70.30 CTTTGCAAAAGTAGAACACAATTTTAAATTACTTAGCAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACA:1 + chr2R 10397956 5' + I-element 5125 1 64.36 AGCGTCCACCAGCAATACAAAACGACCCAGAGCAACACGAGCTGAACCCAGCCGAAGTGTCTTTTTGGGCCTCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:2 + chr3L 17971199 5' + P-element 5 2 74.26 CACCTGGTCCACACACCCACACACCCACACACCCATACATCCATCGTTGTTGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTC:1 - chr3R 28115141 5' + Quasimodo 124 2 50.50 TGACGCATAAAATGCGTAATGAATTTTAGATTTCATTTCAATGGCCTTTGAAAATTGCACAAAAATCCGCCCTTTCCCCATGTATATGTATGTATATATAT:1 - chrX 20884484 5' + 1731 4409 1 57.43 TGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - 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invader2 231 2 60.40 GTGCCGTGATGAATATCGGGATCGGACATCTTGCGCCGCATAGCCGGGATTTGAGTCGGCGTTAGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCTTGTTGGATGATT:1 + chr3L 1532073 5' - Fw2 3598 1 68.32 TAAACAAAACCGGTCGGCAGTCGGCCGAGTGTGCGGAGTTGGTAATTTAGAGTTGGAGGTGGGTGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCG:1 - chr3L 11595343 5' - Doc 4523 1 62.38 GANGGAATATCGGAGGAATAGCAGGGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 - chrX 19810586 5' + INE-1 561 1 64.36 ATAAAACCGAACAAACCAAAGGCCAAAAAAAAAACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAACGCCTTAGGATATAAGTC:1 - chrX 17333135 5' + Quasimodo 91 2 65.35 TTTAACTGTATAAATAAACAAATGAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr3L 18938892 5' - blood 7337 1 77.23 AGNTTTTCTTAACATTCTCCACTTAGCTCAGCTATAAATTATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGCCCC:1 - chr2L 22045124 5' + jockey 4707 1 60.40 GGCCTCAACGATTCTGTGTATTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 28288635 5' + 412 7107 2 82.18 GACCAAGTCCAACTAGCGCCTGCAACACCAATAACATCAGCAGCAATAGTAACAACAATAACAGCAACAACAACAATAATAATAATAATAATAGTAATAA:1 + chrX 21372221 5' + mdg1 38 2 56.00 TGCCTGCCTTCGCGTCCTTTGTTCGCCCCAATGTGGGTGTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACGCC:1 + chr3R 24461203 5' - 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chr3L 16464353 5' - Quasimodo 7020 2 64.36 ACAACGGCTCTGCAAACACCAGCGCACTTGTCTTAACCATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTA:1 - chrX 20655102 5' + I-element 5031 1 62.38 AAGTCGAATTGCTTTTTATGGATGCTGCTTTCCCGATTTCCACTTTCGAACGGGCAGAAAGGTATCCAGTTATACCAAAGACACTAGAATAACTAGA:1 - chr2L 14798907 5' + 1360 1 2 70.10 GGAGCCTGGTTTCGAGTTTTGGGGTCTTTGGCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 - chr3R 26434740 5' + Tabor 46 2 68.32 CTNAATAAGCCATGTAGCTCGTTTGTCGCAAAGCTCTCACTCTGCCAACTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCTCCGGGGAGTCTTGCGGAGGTATTATCACTC:1 + chr3R 3753068 5' - ZAM 436 2 61.39 TGGGGCTGATATAAAAAGTGTACTGTTACCGCATTATCAATTGCATTAAGCCACCGATAAGTGCAGGGCATATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAA:1 - chrX 5933957 5' + Burdock 6134 1 73.27 CGAATTACCCTAAACAACCCAGACCTCACACACAGTCTGAAATACATTAACGTGGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chr3L 7061216 5' + I-element 23 1 55.45 CGATATGCAAGTCTCTTTCCTAACCTTTCGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATAAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAA:1 + chr3L 26710520 5' - Tc1-2 30 1 74.26 TGGAGGCTGGAGGGATAGGAATGTCGGACAATTGGAAAATCGGAAAAGCGCTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCA:1 + chrX 7907691 5' + R1A1-element 157 1 66.29 CCTTGGCTTGCTTGGCATTGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCG:1 + chr3R 6001590 5' - opus 7164 4 75.68 GCATGGGCTCCCATGGCAGGCAACAAAAAAATATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 - chr3L 12172879 5' + 17.6 36 2 70.30 GCGAGCCACATATAGATGCAATGCCATTAGACACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chrX 9983645 5' - pogo 2057 1 74.26 CANGTTGGTTCCTTTTTTGTCGGGACACAAGAAACTTGTTTGCAGAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 - chr3R 25514882 5' - hopper 1382 1 55.45 AGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGATCGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCG:1 - chr2R 5924411 5' - jockey 4730 1 39.60 AAAATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGTGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGT:1 + chr3L 6620555 5' - accord 7035 2 64.36 ACGGGGTTGCAAAGTGATCTTGCCGTTTTTGACTGTCTGTCCGACTGCCCACGCATCCGTGCTCGCGCCTACCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATT:1 + chr3L 21865561 5' - gypsy8 323 1 69.31 ACTTGGGTCAAAACTATAGTTGAGACATGAACCTAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAA:1 + chr3L 10557568 5' - 412 7521 2 54.46 CAGCTGTTCGTTAGTCGGTTTTTTTTTCCTTTTTGTTTTTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATC:1 + chrX 13934047 5' - 412 127 2 61.39 ACTTTTATGCTCCTTTCTTGGGCACAATTGGAGAGGAGTTTTCCCCACCATAAGCCCCATACGTTTTTCTATAGCATTTTCAGTGCATGCTCAGCATTCCC:1 + chr2R 10981641 5' + gypsy11 4147 8 80.20 ACGTGTCCGACGTCGCCGTTCTATGAACTATATTACTGAAATATATATGATGTTGTATTAAATTCTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr2L 21612877 5' + 297 6586 2 73.27 ACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAAATAAACTACCTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCCGCAACATGCTC:1 - chr4 1294992 5' + HeT-A 5655 1 71.72 TGTGCTTTTAATTAGGAATTGCCAAAGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGA:1 - chr3R 9192605 5' - invader3 280 1 74.71 CTNCAAATAGCAATTCAAGGGCCGTCAATGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAA:1 - chr3L 23821850 5' + HMS-Beagle2 6921 2 68.32 TATAGACTGCGCACTACCCACTAAAAATAGAAATAAACTTGCACTGCGCCTATGTCTCTAGAATCTTTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1 + chr2R 16354172 5' - INE-1 159 1 71.29 ATAGACAACAAATTTAGTATACGCCTCGTTAAAATTGTTCTGTGGGGTTCAAAAGTGATAGCCTAGTTTGTAAATGATACTTTTTAATTTAATTTTAATTT:1 - chrX 6077967 5' + Rt1b 124 1 76.24 CAATCTTAAAAGACAAAATTATTCATGATGTTTTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr2L 20152988 5' - opus 7485 2 63.37 AANTCCATTATGCAATCGCTCCAATAACCAAGTTAATGCTATATAGTTAACCTAGTCGATCAGTCTGCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 10522122 5' + roo 8673 2 65.35 TATTCATAATGATTTTTCTCTTTTGTTGTTTTAAATTTAACGCCAACAAGCTGACGTGCCCAAAGTTTTGAAAATTTTAAAAATATTTTTTTTTTGGTAAT:1 - chr3R 4524872 5' + transib1 1963 1 68.32 TCCAATAACCAAGTTAATGCTATATAGTTAACCTAGTCGATCAGTCTGCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 10522103 5' + roo 28 2 59.41 CTTTTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTTTTTAACTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 + chr3R 31132980 5' - TAHRE 10417 1 69.31 GGGTCTAGATTAGCTATTGAGTGGATCGATTGGCCAGCCGATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 + chrX 12781011 5' + FB 38 1 61.39 ATCAGGCCAATCGCCCAGCATGTTAATTAAATGCTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3R 31026043 5' - mdg1 378 2 70.30 TTTCGAAAGCAAACTAACTATTACAAATGGAAAGAGAGCAATTTTAGCCGTCACAAAAAAGTGTATGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCAT:1 + chrX 6652918 5' + 1360 3367 1 75.25 ATGAGCAATGATCGCTGGTCGCTGCGCTTGTTTATCTCTTCTCCGACCCTAGGGAATCCAAGGTGACGTTGTCATTCAGCAGGTGAGCGCCGGTGGCTGTG:1 + chrX 20612187 5' - G7 879 1 78.22 GCAACAACTATGGCTCAAGAATAACATCAAACACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 18223830 5' + roo 42 2 74.26 TGGGCATCTTGGGATTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTACTGAATAAAATTAATAAATTAATAGGAATGATTGCTTTGG:1 + chr2R 6022171 5' + Tc1 249 1 74.26 TGTCTTGTCGCCCCCTGGCAAGTGCTCCTCTAGTGCCAACACAACACAGTTGGCTATGATTGTTGTAAATTGTCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCTTATC:1 + chrX 11979857 5' + accord2 7183 1 62.38 AGNGCAGTTAATAGATGCGCAGATTTTTCTCGGGGTTGGTGGCGCTCAGGGGATGAAACCATTTTTTTCATTGCAAACCGATAGAAATTTACAAGACTAA:1 - chr2R 6195586 5' - INE-1 298 1 58.00 CCGTCTCCAGCGGTACAACAACAATAGCGACAACTACACCATCGCACACACACATAAGCAATTCTTTAAACAACACAAAAAGAAAAAAAAATAAAAGAAAA:1 + chrX 15497901 5' + Doc2-element 226 2 46.53 TGGAATGTAATCGATGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 18344547 5' - 1360 3365 1 55.00 CGGGTCTAGAAATCCTCCTATTTGCGTGTGTGATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 13704711 5' - hobo 2894 1 70.30 AAACCTGAGTAGGGAGCACATTTCCCAGCTGATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATAT:1 + chr3L 12172822 5' - 17.6 451 2 67.33 CTNATTGCTAGCAGCTCCCCCCTTTACTTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr3R 8191550 5' - mdg1 399 2 55.45 TCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGC:1 + chrX 10119564 5' - FB 2 1 46.53 ATNAGAAATACGTGATATTTGAATCCAAGAATGGGCAGATGACTAGTAAATCATGATCCATTATTAATTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1 + chrX 6654423 5' + jockey 4734 1 69.31 TATCATAAGCCAGTTTAAAATTGGCATTTCTTTAATCATATGTTTATATGAGTGTTTGCTATACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr3R 23724174 5' + Doc 50 1 50.50 CAATATCGGCTTTGCAATTGAAATTCGGTATTTATTGTTTGTTATTTTCTTTTGCCTTTTTTTT:1 - chrX 7527535 5' - Doc2-element 235 1 84.38 GACAAGAGTGGAATATTTTATTATTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTCCAAACTTAGACTAACTTAGATATTATAGCATTAGCTACG:1 + chr3R 21343062 5' - I-element 5302 1 71.72 AAAAAAGTGATCTTTTTGTGTGTGCAAAGGTTTTTTCCGCAGCCAACAGCCATGAAACAGAATCGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chrX 6731774 5' - hobo 2938 1 78.02 CANGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCG:1 - chr3R 1868197 5' + G-element 57 1 76.24 TTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr2L 20153020 5' - opus 7453 2 80.20 TTNTGGTGCACGCTCATTTCAGTTACTTTTGAGGAGATCGTGACTGATTTCTAAAGGTGGGAAAAAAGGATAAGTCAGCGGGGTAATAATTATTATCATAT:1 + chr2L 20086079 5' + Transib5 2561 1 60.40 TGGGTTGGATGGGTTGAATGGGTGGCGCAAGGTGGCAGGCGGTGATTAGGTTGCTTGGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCTCCATGCGAA:1 - chr2L 10103515 5' + 1360 268 1 56.44 ATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chrX 4806732 5' + roo 8707 2 75.25 CCGATGAATGCCCGCATTGAAATCGCTTGGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTC:1 - chr3L 10815274 5' - F-element 306 1 71.29 GAGCAATGAAGATAACTTGCCAAATGGCAGAAATGGTTGTTTTCATAGGAAATTGGATTATGAAGATTGACGTTTAATATTGTGGACGCCGAAAAATGA:1 + chr3R 4617095 5' - invader3 280 1 70.71 TAAGGTGGGCAACTTTGATTAAAATTATACATATGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTTG:1 + chrX 7655246 5' - G5A 2648 1 72.28 TTCTGCTTTGCTAATCCGCCTCGTTCCCATGCCCGTGCTTATCAATATATATTTTTTGTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGG:1 + chr2R 13745989 5' - G2 3040 2 49.50 TGCAACTGCAACTATTTGAGGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGACACCTGTTGTCATGCCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 - chr3L 1259247 5' + Doc 20 1 44.55 AGAGAGTACTGACCTGTGGATAAAAATATAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 + chr3L 1834516 5' - 297 6961 2 46.32 CCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCACCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr2L 17205174 5' - hopper 1392 1 54.46 AACTACAAAGTGTACGACAAATGGGAATTACACGACAACCGACAATCGAAAAACAGCGCAGCGCAACAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGT:1 - chr3L 12693603 5' - 1360 3219 1 73.27 TAACTTATTTATTTAATTTGTTTTATTGTTTGGTTGGAACTTTAACTTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAAT:1 - chr2L 22685589 5' - TAHRE 10412 1 64.44 GGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:2 + chrX 6509793 5' - jockey 4943 1 75.00 TCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr2R 18723039 5' + opus 7148 4 63.37 GCTGCACCACCAAATTGTAGAAGTGGGGTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTG:1 + chr3R 7126978 5' - BS 4876 1 72.00 AAGGACACGTGCCGGTCGGCGATGGATGGCAATGGCTGGCTGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 30904182 5' - roo 402 1 75.00 CCAGTGGACAATCCTCCTATTCATAGCAGCCCTTTTTGTTTTGTCTGAGGCCGTGGATCAGTTGGGATTTTTTGTCTTTGTGTCTTGTTTACTCTCCCTTT:1 + chr2L 22016804 5' + Cr1a 208 1 73.27 CCGCATCGTCCATTCCCCCGTCCACTTTCCATCCGCAGGGGCGACTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGT:1 - chr3L 12340519 5' + Doc 493 1 56.44 TGNTGCTATATCCATTGTTGTTGGATCTTTGGCTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAA:1 + chr2R 20411879 5' - Quasimodo 7331 2 67.33 TGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:2 - chr3R 12115327 5' - 1360 3337 1 77.23 ATTAGCAAAAAAGCGCAAACTATGTGAAGAAAAAGGTGGAGAGAGTAATACAATCACGAGCGGCACGACATGCATTTGGGCTACCCTGGTATGTG:1 + chr2R 2950841 5' + G5A 2517 1 58.95 AATCGCACTCTTACACTCGCACTTACAGCGTGTACATAAATCTTGGCGATATATTTGCAGTATAATTTTTAGTCATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAA:1 + chr3L 13878018 5' + flea 4757 1 75.25 ATAATTATCAAACGTGTGTACAGTTGGCACAAATTTAAATATAACGTATGCCGATAGCTTTTACTTATTAACTTGGGCTTGTATATACATATGTACATACA:1 + chr2R 8338511 5' - invader3 5087 1 74.26 TCNATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 4806731 5' + roo 8708 2 76.24 TGTAAAGCTTAAGTACTTAACGGATTACAGGGCATTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 + chrX 14131771 5' - I-element 5317 1 67.33 TGAAGAGAAATTTATAAATTTTTCTTGAACATCTATAGAAATAAGGGTAATAAAAAAGTCGATTCAGAAAAGG:1 - chr4 924706 5' - HB 71 1 54.79 CATTATTGGGGACAGTTCCTGGTCGCGGCGCAAGTTCGGTTAACTCTTGACCGTTCCACTTTAAAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAA:1 + chr3R 15871464 5' + Rt1b 5136 1 47.52 AAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 - chr3L 9909789 5' + Transpac 4929 2 69.31 AACAGGAAAATCCATTATCTTGCGAGTAGACATAAAATCATCCAGACACGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGCAGTACCAGGTTGGCAGTATG:1 - chr2R 13271771 5' + Burdock 6015 1 64.36 ATTACGCGCCGATCTCGAGGAAGATGTCGTCTTAATGACTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 6442689 5' - roo 393 1 63.37 ACAATGCCAGGCAACTCTTCAGCGCATCCTTATACAGTCTGGCGCCTCTTTTTATGGGCACCCATCATAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 28698755 5' - 1360 3382 2 72.28 ATTCCTTTAAAAGTATGTATGTAGCATTTATACATTTATTCTTCATCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 4971135 5' + 1360 5 2 74.26 AGTCCACGAAACGCACCTGGTTGATACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAGCACGTGCGGAGTGGAAAA:1 + chr3R 25294118 5' - R1A1-element 165 1 74.26 ATCCAACTTGTCCAGCATGGCCTGTATGTGTGTGATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chr3R 22310827 5' - hobo 2896 1 69.31 GCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTT:1 - chr3R 6611286 5' + HMS-Beagle 6815 2 59.18 TACAGTCAGTTGGCAATTATTGGTTTATTATGACATGCACGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGAC:1 - chr2R 4032588 5' - micropia 176 2 59.49 CTNAGCCCCACCATTCATCGGCTCCCAAACCCACTCGCCGCCTCACCAAAAGCGCAAAAAAGACAGGCCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATT:1 - chr2L 8802031 5' + I-element 243 1 68.32 GATCAAGAATGATTAACTTACTTCGTTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGC:1 + chr3R 24354903 5' - F-element 4324 1 74.26 CTTTTATATGCCAATAAAAAAATTAAATATTAGTTTAAGATTCAACTTCAAAGTTACTGACCTGNAAAATCCCAAATAANAAGACTTTA:1 - chrX 16699086 5' - roo 403 1 67.42 TTTTCCAGCGCTGCTCTTCCATTTTCCGCATATCTTATGAAATTGTTTATTTTTCTCGCTGTGTTGCGGGGCGGGAGCCAACGGGGCTAAATTAAAGCGAT:1 - chr2L 20601528 5' - mariner2 225 1 76.24 CTTTTTATTATTTCTCCCAGCTCCGGCTGATCTTGCTGCCTTTTCTGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGG:1 - chr3L 3245121 5' - roo 469 1 63.37 GGAAAATGAAGAGATAAAAGTAAAAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAG:1 - chr2R 21632941 5' - 17.6 149 2 76.24 AACTTATCTGAGCTACCGCTTCCCTTCCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATC:1 + chrX 7356804 5' + F-element 378 1 70.30 AATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTA:1 - chr3R 9192577 5' - invader3 238 2 66.34 ATAGAAAGGCAACCGTCCTAGCCGAGGAGGGAGATGGGATTAGATAGGCTATTTGCTAGTCGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGC:1 - chr3R 31988987 5' - G5 4562 1 74.23 GTGAACAGGTGAAAACAAAGTAGGCAGCGGTGTTCTTGGCAAAACAGCGAGCGAAAATGCCGGCGATGCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr2R 8314240 5' - hobo 2932 1 70.30 CTGTAAGCAGTGTGGCAACATCATGTGGGCATGTATCAACAGAAATCCCAAAATAAATATCTTTATCGAATTCCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAGA:1 - chr4 261634 5' - 1360 3282 1 77.23 ATCGGGAGTGAAGAATTCCAGACGAAAGCCACCGCTCGATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3L 4118101 5' - hobo 2902 1 62.00 ACCTTCGTGTTCGTTGCAATGCTTCTTGTCCCCGCACTTCTCTCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATAATGCTG:1 + chr3R 1941330 5' - Rt1b 4760 1 53.49 GAATAGTGCTAAAACAATAAGATACCATCAGGATATATTGATATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:2 - chrX 19030147 5' + Doc 42 1 71.29 CCACTAAAAGATATAAACAATGATGACACTTATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAGCCTAAGTCTACAAA:1 + chr3R 17978202 5' + TAHRE 10244 1 69.31 CTACTGAGAGATATATATGCTATATCTGTACAAATGTAAAATATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 + chr3R 17412566 5' - 3S18 305 2 58.42 TTATTTAATGCTTAAATTTAAAAATTGCGTATTTATTTCGTATTACCAGATACATTTTGGACATTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3R 13349590 5' + Ivk 12 1 62.38 AAACGGGCTATGGGACTAAAGGATGACAGTACTAAGGACAAACAAGGACATAGCAAAGACCCTATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTG:1 + chr3R 17615090 5' + Tc3 310 1 48.51 AATATCTAGTACTTCATATCGCATTACCACTGTCCCCTCTAATGATAAGCAATTTTTATGTTTACTTTAAACTTAAACCGATACCTTAAACTATGGCGCGC:1 + chr2R 17999462 5' + TART-C 10813 1 72.28 GGTAATGCGGCAATTTGAGATCAGGATGCTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGTTT:1 + chr2R 15031634 5' - F-element 406 1 71.00 GGCGAGGTAAGCAGCCCACAGCCACGGCGGTTGTTGATCTATGTTGCCAAGCCCACTCGAACGCCCACAATCCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTT:1 - chr3R 20148486 5' + INE-1 245 1 65.66 GANGCACCGAAAAAAAAGCTCTAAATTTTGCCTTATGTGTATGTATGTATGTGTTACAATGTTAAAGTTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAG:1 - chrX 362241 5' - ZAM 8186 2 61.39 ACACCACAATTTCTCGTTTCAATTCATTGAAGGCTCTTAGATTTCTAGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATT:1 - chr3L 10000275 5' + copia 215 2 61.39 TGGGCGTGAAAACGTAATTATACACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 22751939 5' + roo 49 2 76.77 CAGATGAAAATTGCAAATGAAACTTAGCCGTGCTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCACCACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTAC:1 - chr3R 31032372 5' + Chouto 432 1 67.33 AGACGAAAAATTTCTCCAGAAGCAAAAGTTTTGTGCTGGCGATACAGAAAATATAAATTACATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAA:1 - chrX 1105403 5' + Juan 4083 1 64.36 AAAGAGGTGCTCTGGATTTTCAAAGCTATTATTTAAAGATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chrX 9983703 5' + pogo 34 1 64.36 AGTACTTGGCCAAAGTTATAGTATAAATAGTTCAGCTCGAGCCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 - chr3L 11920109 5' - Tabor 7291 2 56.44 AGNTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAC:1 + chr2L 12398128 5' - roo 379 1 63.37 CATGATCTATTAATAAGGTTTTCGGAATTGGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 15681546 5' + pogo 43 1 70.30 GANAAATCAATTATAGGCCCCAATGCGTTTTCTATTTTCTATCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCT:1 - chr3R 9127428 5' - invader3 241 2 60.40 CAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790062 5' + flea 4747 1 71.00 CTCAGCAAGCCAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3L 13704656 5' + hobo 32 1 58.42 ATTACGATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 31458447 5' + jockey 64 1 78.22 TCTCTGTGGTATCATTGTATCTCCCCCTCCATCATCTGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2R 13899200 5' - roo 9034 1 64.36 AACAATAAAAACCAACTAAGTGCAATGGCAGGGTAAAACAAAACTTCAATGTAATGAAGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chrX 22745633 5' + copia 4888 2 58.42 GAAAAAGCTGCCAAGCGAGAAACGACGGAGGACCATACCATATATAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTC:1 + chr3L 10364903 5' + F-element 327 1 55.45 TTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGA:1 - chrX 20678115 5' - Porto1 4560 1 80.20 GGNCCTGTCTGATATGTGGGTGTGTGTGTGTCGTCCTCCAACGGGTTCGAGTGGCCCCAGCCAACCCCCCAGCTCCGGGTAGTAGAATGTTGGAATGCAGG:1 - chrX 747786 5' - gypsy4 100 2 75.25 ACTGGATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCAC:1 - chr3L 5067859 5' + Quasimodo 43 2 71.13 AAATATCTGCATATATAAACTACAAGTGTATTCGTTGCTATCTTAACTTTCTTCCCAGTCTCGTTCTCCTTTCCGTTTCTTTTCGTTTTTTTTTTTCATTT:1 - chrX 20914094 5' - Doc2-element 246 1 54.46 ACGGCATTTTATTTTATATTATTTTTTCACTTCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAAC:1 + chr3R 20783815 5' + Doc 484 1 68.32 AGTGTAAACTTTGCCCTGTGCAACAGTTGCCGATGTCTGGCCACCCACTTTTCCCTTCAGCAATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 1204038 5' - roo 399 1 67.33 GTTTGCCTACTGTTTGTTAATGAATGGTTCCGTAAATTGCTAAAGGCTTGTTTGAGTAACCCAGATACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr2R 8294302 5' - 412 485 2 70.30 TCACATAAATATCCGTATGTAGTCTGTTGCATTCAAGACCCCATTACATAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3L 7629557 5' - opus 474 2 53.47 CACAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCA:1 + chrX 19820619 5' + Rt1b 4963 1 69.31 TAATACATATACATGTATGTATATATAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCAAAGGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACACATACAGT:1 - chr2R 21684959 5' - 1360 173 1 72.28 CANCATAAATTTTGTTGTAGCTATTTATTGCATTTTTATGTAAAATGATCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3L 13652755 5' + hobo 2 1 76.24 TATATTTCTTCCTCAGAAGGTTATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chrX 20331791 5' - mdg1 411 2 63.37 CAAAGTCTTGGATCAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTAT:1 - chrX 21636280 5' + Stalker2 7250 2 73.27 TATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTG:1 - chr2R 6801692 5' - McClintock 6391 2 68.32 ACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 + chr2R 981625 5' + 1360 64 1 71.29 TTCAGTGCTAGACTTTTATTACTCGTTATGATTGTGCCAGCATCTGGCAATAGGATACCGCATGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGT:1 + chr3R 26158473 5' - Cr1a 321 1 61.39 CACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chr3L 21144024 5' + jockey 4687 1 69.31 GAAGAATAGACATTTCAAATGTACCTCAGACTGTTCCACGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chrX 364831 5' - hopper 1379 1 61.39 TTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACA:1 - chrX 23182892 5' + Idefix 47 2 76.24 TTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 - chr3R 1868202 5' + G-element 51 1 71.00 ACATGTCGCATCGGCGAAGGAACTTGCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 810304 5' - hobo 2889 1 75.25 GAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGG:2 - chr3L 18476525 5' + accord 40 2 67.33 GACTGCACAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 4806683 5' - roo 9031 1 64.00 GGGGAGCATTAAAGTACAGAGCGAAATACAAAAAAATACAAAAAAAAA:1 - chrX 6452218 5' + G2 3075 1 70.83 GAAATGTAAAGCAAGTAAAAACCTGGGTCAAATTGCGGTTACCGTTTTTATTTTCCGCCGTTACCGGTCTTTCGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 - chr3R 28063694 5' + Doc 6 1 75.00 TGGCCACCCAGCTGCACATGAGACACATTGGCCACTACCAGCAGCAGCGACAACAGCAG:1 - chr2L 3605946 5' + TART-B 151 2 86.44 GGAAGCTGCTCGCACGCATTTATTAATTTTAATCATTTTTCTGACACAATTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr3R 29423473 5' - roo 406 1 76.24 TTAAGCCGCAAACGGAGACACTTGCAGATAGTTATGGAGATGCCGATGCAGATGCAGATCCCAAGTGAAGGGGGCAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAC:1 - chrX 17218247 5' + Doc2-element 247 6 54.00 TATGTTATATTATCATATTCTTATCTTTCATTTTCCTTAGTATCATTACTTTTTCCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 19053058 5' - roo 9053 2 56.44 AAATCAAATATGATTATTTGATGACCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr2R 17208487 5' + jockey 10 1 77.23 AGAGAATGCTATAGTCTCCGACAATCTTAAAAATATTTTTCATAAGTGTGGGATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCATTT:1 + chr3R 4093092 5' - ZAM 145 2 51.49 GTNACCCCTTTACGACAGCCCCCTCACCCTTGGCTTTTTCCAACTCCCCTTCCCCCATCGCCGCCGCCACTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTA:1 + chr2L 10760053 5' + jockey 468 1 74.26 CTACTAGTTCACACGTAAGTCCGTTCATTCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCC:1 + chr3R 20067961 5' + F-element 458 1 67.05 AGCAGAAAACACTTAAAAATTTGATTTTCTTAGCTTAAGAAAGAAAAATGTGAAAAAACTAAAGGTTTAATATGGAATATGTACGCATGTAATATGTATAT:1 + chr2R 18511665 5' - 412 217 2 78.22 TTTATGGCAGAGGTCAAGCAACTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 26592632 5' + roo 38 2 79.76 ACCAACAAGATAAGAGCCACATGCCTTTCGCAAAATCTTAAAAGGTTTTTGTTCATAAATTAGATTAAAAGTGGTGTGTAATGATGAACTCCTATTAAGAA:1 - chr3R 26140842 5' - 412 7543 2 75.25 AATAAAGCCACTTCGATGGCATCGGCGGCGGTACTAGTTGGATATATAAAAGCATAATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACATATATTCATTTTTCG:1 - chr2L 7398460 5' + invader3 268 2 59.41 GTAGCAAAACCCAGTGAAATGTCATCAGTTGAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTACACTACCTAAATCACAATTCAA:1 + chr2L 2740972 5' + I-element 4980 1 67.33 TTNCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTT:1 + chr3L 24213790 5' - invader2 5063 2 67.33 AAGTACAAATGCATATGCTTTTGATCGTATATGATTAGTTCATTAGCAATTTCAGCTTTTAACTGTCTCATATGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAA:1 + chrX 21493318 5' + BS 4697 1 63.37 TAGATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGG:1 + chr2L 21951180 5' - opus 7494 2 58.33 CTTGAATTTGTGAAAATTCAGCTTGCAAAATTATCTCACATTTCTGAATCTTTCTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTG:1 + chrX 12303914 5' + Max-element 449 1 59.41 TGCGAATGGCAAAAACGAAACCATTCTCCAGCCCAAAAAAAAGTGAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTATGCTAGAAGACGATTTTC:1 + chr3L 15983117 5' - 1360 3199 1 55.45 ATTGGCCATTTCTTTGCGGCTTTGAGCATAAACAATAATTTACGACCATCTGCATTGTTTGCATGGAAATTTTTCATTTTCCTTTTTTTTTTGCTTTT:1 - chr2R 13773974 5' - Doc2-element 246 1 52.04 ATGAGGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chrX 10644867 5' + hobo 18 1 56.16 TTNTAGATAAACGATAACGGAAGTATAAAACAAAAAAACAAAAACAACAAAAAAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACA:1 - chr2R 24698976 5' + Porto1 286 1 56.44 CCCCAAAGAAACGACTCCCTTTTTTACAGTACATAATGTATATATACATAAAGCGTATATAGTCTTTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGAGTTCGTG:1 + chrX 8640851 5' - accord 180 2 78.00 TGATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 24766009 5' + 1360 3 2 76.24 TGCATTAATTATGATAATTGCAACGTTTATGCTTCAATTCGTTGTGTGTGTGGGTCTCTTTGTCTTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTG:1 + chr3L 14216120 5' - I-element 4961 1 73.27 CTCCGGTTGCCCAACAACAGTTGTCTACTTTTAGGCGCTCATGTTCCGAAGTACAATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 19560958 5' - hobo 2923 1 60.00 CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTTCTTTCTCTTCTCTTCTTATCAACTCTTCGCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATG:1 - chr3L 22908066 5' - INE-1 535 1 78.22 CCCATGTCGACCAGGTCGACTCCACCCCACTGGCCAATGTCATAGCAATGCGACCAAAGTTAACAAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAAAATTGCA:1 - chr2L 5710768 5' + I-element 423 1 74.26 TCTACATTTTCTTCTGCGGCTGAAATGTTTCTGTCACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 3547493 5' + roo 39 2 69.31 CATTGCAATTAACATCGAACGCTTTGAACACATAATGAGCGTATAAACTTGAATCTGTATAAATAGAACATAAGCAAGCAAATTCTATTTTCAGATTTCTT:1 - chr3R 25868485 5' + 1360 3272 1 76.24 GGAAAGGGAGTGATAGAGAAGCAAAAGGCAAAGAACAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTGAAGTGTTCATATTGAA:1 - chr3R 20138161 5' - X-element 316 1 64.00 AGNGGCAGTAGGAAAAGCAATGGGAAAAGCAGCCTGAGCGGCGACTCTGGATCCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chr3L 19275664 5' - mdg1 398 2 54.46 AGTTGGTTTTTATTGTTTTCGTTTTTTTTAGGTATATTCCTGTCGTTTTTGCCTTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAA:1 - chrX 22745628 5' + copia 418 1 65.35 TAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTACAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chr2L 19644931 5' + blood 38 2 61.39 CACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - 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chr3L 8331287 5' - roo 9040 1 61.39 ACGCAGACCATATAAACGCCCACAATTATGATATAAACAAAAACAGGAGCAAAACCAACAGACGGACATGGCCATATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCA:1 - chr3R 8188318 5' - INE-1 91 1 61.39 AAGAAGAATGTGCTTTAAATTGATAATCTGCGAGAGAAAGAAGAATTTTTTGTATTTATTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3L 12160124 5' + pogo 12 1 67.33 ATACTAATAAAATAAATACACGTACATAGACACAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chrX 2172246 5' - I-element 5311 1 70.30 AGCCACACAGTAAGAACCCATAAAGAAGACACAACGAACAAGATGCGTAACGGCCATTCATGGGTTTGGCACTAGGCATTTGAACTTCAACCCCGACGG:1 + chr2R 14254773 5' + Porto1 2 1 68.69 AAGCGAATGTGCCAAACACAAATAAATAGTAAATATATAAATGTCTATGACTAACACGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAG:1 + chr2L 20807276 5' + invader1 372 2 61.39 CCCCAGCACTTAACGGAAATTGCATGCATATTAAGTTAGCCAGGCAGTAGTAAAGATGTAATCTCTGGCCATTTTGGATTACATGTGAACGTGATAAATAA:1 + chr3L 4646578 5' - Helitron 172 1 62.38 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCA:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5411 2 55.00 ATAATTCAGCTATCACTTTATTTTGCCTTTCGACTATCGCGCGTAAACTTTGTTCCGAATTGTTTTGTAGGTGTGGTGATCCCACTTCTGATGTCGGAGA:1 - chr2R 3021384 5' - invader1 415 2 29.00 GGAGCGTACGTTGGACTTTGCCACTTGGCATTCCTTCAGTGAGCGGTGACAACTCCCACTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr2R 13382032 5' - jockey 4973 1 41.58 TAAAGACATTTGGAAATTCTTCGCAAAAGGCCAACAGCATGAAAGGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3L 10557643 5' + 412 7085 2 56.00 CAAACACGCTTTCATATGCAAATTTCTTTCATTTCACAGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 22046433 5' + roo 38 2 66.34 CCTTTTCCGGCGCCCACACACCACAAATTGAATTACTTACAACGTTTTGACTTCGACCGATTTTCTGGGCTATTACACAGTGTTTTAAGCCAGATTCAATA:1 + chr3R 8354500 5' - Tc3 491 1 68.32 ACGAAACTGGCCGAAAATGGGAAATGATGCTCAAGGATAACCGAATCGATCTCGAATCGAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTG:1 + chr2L 9314356 5' - hopper2 1311 1 63.37 AAACGCAAAAATAGTGCAAAAAAATACGCACTCACACAACAAATACAATACAAAATTAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTA:1 + chr3L 24870994 5' + Quasimodo 154 2 66.34 TCTCAGTTGGCATAATTTCTTCCCAATCTCGAAAATTTTTGTGAAAGTGAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chrX 9439761 5' + roo 25 2 55.45 AATTAGTTTATTCCGTGGCGAAACATTTAGCATTGAAAGCCTTAACAGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGT:1 + chr2R 6192892 5' + accord2 177 2 53.00 TGNGTTGCTTCAACTCCGTCTATCGCCGACCAACCCACGAACTTAACTTTCAGCTGCCTCCAAAGTTTGAATTCTTGTATTTTGTATTCAGTTCTGATTTT:1 + chrX 11270474 5' + gypsy2 191 2 61.39 CGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAA:1 + chr2L 20360643 5' - R1A1-element 144 1 71.29 CGNGGTCAATGAGGAAGTCAGCCATCGAATTCTATTGTTTCATCTAACGATGCAGCAGCTGCATATATATGCATATGCATAACCCACCAACACTACCTAAA:1 - chr3L 10382750 5' + I-element 4969 1 75.25 GGGCTTGCAGGATGAGCAGTAGAAGCAGATTGCGATGGAAATAATGGAAAAGAAGGACACAAAGGCGGTCCAAGATTTCCCCGAATGCCTTAATAAATAAA:1 + chrX 11019451 5' + X-element 4704 1 63.37 GCCAGTGAGCAACTCAATTCGATGGTAAATTAGAAGGCCAACATTTCAGGCATTGGAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCG:1 - chrX 8918885 5' - jockey 169 1 63.37 ATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTAAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACG:1 - chr3L 20224237 5' + Chimpo 15 1 65.35 CTCATCGTTCAACTTTCGGCTTATGATCTAGAGATTTCGCTTGTGTCCAAGTTTCTGAGTTATTGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTT:1 - chrX 4704917 5' - Porto1 4440 1 66.34 GAAAACAAAAAAACCGTTACGGTTCGGGCCAAGAAACGATCCCAAATTCGACTTGAATCTCAAGAAGAGGAGGAAATGCTTGAGAATTTGTTGCCTGCGA:1 - chr2R 17427307 5' - Gypsy12A_LTR 2001 1 74.00 GGTAAATTGTAACTATCGATTGCCATTTGCATTAGATGATTGTGTTTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACGCCCTTAGAGAAATTTAAT:1 - chr3R 16016652 5' - I-element 477 1 62.38 TAAATTAACCGATATTACATATGGGTTCGTATTAAGCTTTTCTTAACATTCTCCACTTAGCTCAGCTATAAATTATCTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 - chr2L 22045158 5' + jockey 4669 1 80.41 GTTATCAATATTAGCCCCGAAAAATAGGCAACACTTTTGTTTTTTTTTTAGCATAATATATTGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chrX 6509843 5' + jockey 21 1 56.44 GATTGCAACTCCCTCTCGCCCACCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 + chr2L 17205178 5' - hopper 1388 1 52.48 ATNACCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2R 17208507 5' + jockey 30 1 56.44 CCGTTCAATCGATTTAACGATAAACGCTTTTGGCTTTCCTCTTTTTATAATTATTTTTTTTTTGTAAACTTAGCTTTTAGACAGTAACATGGTCTGGTAAC:1 + chrX 13569337 5' - HeT-A 5860 1 58.42 ATGCAGGAATGTGTATTTTTTTAATTATTTCCCAAATAGTGATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:2 - chr3L 11891408 5' + Tabor 10 2 67.33 AATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 19450179 5' + roo 8712 2 56.44 CAAGCAATAATAATTTTAATTAAATGCACCAAGTCCTGGCATCGTTATTGAGTAGTTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGTTAT:1 - chr3R 4834070 5' - Tc1 1218 1 74.00 TGGTTTCTGTTTCCCTTTCATTCTGGCTAATTAAGCGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCA:1 + chrX 20849685 5' - ZAM 8049 2 61.29 AAGAGCGGGGTAAATGTTGGGCTGCGGCCGCGGTTGTATTGAAAATCTGGGAGTCAAGAATAAAAACAAACGATTTTGTCCGCCATCATAGCAGCAACCAA:1 + chrX 2180716 5' - Rt1a 4672 1 73.27 TGTAAACCCCTTGGGTAGCGTGGAGACCACTGCTAATCTAACAATTGAAGGTAAGTTCTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAACATGGAA:1 - chr3L 2045224 5' + Cr1a 419 1 62.38 TCNTTCACTACCTTATGGTGTGATTGTTTCGGCACTAGGTAAACCTACATATATGAACATACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCG:1 + chr3R 22494083 5' - 297 6967 2 61.39 ATGGCGGGGTCAATGAGGAAGTCAGCCATCGAATTCTATTGTTTCATCTAACGATGCAGCAGCTGCATATATATGCATATGCATAACCCACCAACACTACC:1 - chr3L 10382754 5' + I-element 4965 1 78.22 GTNGCATTTATGCATTAATTTTGACTGATACTCGAATGATGGATGGTGAGAGTCCATTCATTCTGCACACGGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chrX 8337873 5' - hobo 2938 1 77.23 CTACTGTTATTTTCTGTTTTTTTGCAATGTTTTTTATATATGTATGTAAGTTATTATCTTGGTGGGTTATATTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATT:1 - chrX 23064283 5' - I-element 4937 1 61.39 TTTTTAACTCTCCAGCACGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATA:1 + chr3L 398682 5' + 1360 3098 1 81.19 AGCGCCAATTCAACTTCAACTTTGAGCGGCAATTGTCCGCCTTCAAAACAAATGTCGCCAAGTTATAAAGCCTGAGGAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTG:1 + chr3L 3254426 5' + Cr1a 497 1 69.00 GAATAGCATCTATATTTATTTATAGTTAGTTTCTTAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 5645016 5' + hobo 40 1 62.38 TGACTTTGCACGAAAAACACTTGAAATATTTATACTTCAATTTCGATTTCAATTAACGCGGCCATTGGCCATCGCCAAACAAAACCCCAAAAAAGCCCCAG:1 + chr2R 12789060 5' + BS3 239 1 82.18 ACGCATGTGACATTACTTTGGGTTGTAATGATGCACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 10824075 5' - 412 7515 2 71.05 AAAACTTCTTTTATTTTACTCCCGATACTGATATCTTTTCGATGAAGATGAAGTGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 + chr3R 6776504 5' + copia 4873 2 75.25 AATGCTTTGTTATTCGAGATGAGTGGTTTGTTTCAGATGATGCAAGGGAATTCAATAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 5912993 5' + flea 4773 2 63.37 CCAAGATTCAATTCGAAAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTC:1 - 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diver 6007 2 52.17 TTTGACCCTTTCGCTGTCTAATAAACTAAAATAAACAAAGAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr2R 4559060 5' + pogo 32 1 66.00 ACNTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr2R 5485146 5' - 1360 3369 1 56.44 GCCGGGGAAGGCAAACAAACAAGCTTAAAACTACCTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCCGCAACATGCTCCAGCC:1 + chr2R 15799978 5' + HeT-A 5660 1 73.27 AGNTGCCTTAGGCAAATACGCTATGGATGTGGATAATGTGGCTTTGGCCGTTTCTGTGGTTGTGCTGTGAGTGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGA:1 + chrX 23452192 5' - Quasimodo 203 2 74.26 CGACTAATTGCAATTAAGGGTAATCTTATTTTCCTGTATGCCACAACTAGTTTTCTACACGTCGGGGAAAATTAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 - chr3L 7629669 5' + opus 111 3 79.21 TATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACAT:1 - chr3R 14049396 5' - transib2 2772 1 77.23 GTAGTGTCGACAGATAAAAAGATATATGCTTTTCATATACAATAAAAAAAGCTAATAACTGCGTTATTGTTAGAGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGT:1 + chrX 20858689 5' - Copia1_DM 170 1 65.35 GGAATATCCGGGCTCACACATGCACACCGGTGCATGCAGGCTGACATGGCAGAGTGCGTTATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAG:1 + chr2L 4524728 5' + roo 9044 1 65.00 TTTTTTTTTTGAATCTCTAAAATATCTGATTTATATTAATGCCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chrX 14131822 5' + I-element 27 1 53.76 AANAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 - chrX 21564737 5' + diver 34 2 62.38 GTGAGTTTCTGTTCTGGTCTGTTTTGTGGCCAAGGGCTTTAATTGTGCCTGCACCCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAAT:1 - chrX 2440668 5' + F-element 301 1 53.47 GATATTTTAACGTGTTTTGCTTTCGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chrX 22745696 5' - copia 205 2 77.23 GCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr3R 23601768 5' + jockey 10 1 66.28 CGCACTTCTGCGCGAAAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 9439849 5' - roo 389 2 58.42 TCCGTTAAGACTTATCATATTCGAATGTATTCCCCATTTTTAACAAACAATTATACAAATCGTAGAAGTTACAAGAAAATGCTTTTATTTTTACCGCAACT:1 + chr2R 15313141 5' + Tc1 1642 1 48.51 TAAAACGATACTGACATCTGAAGCTCATCTCCACCACGTTAATGTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 + chr3L 7061150 5' - I-element 5320 1 56.44 GATATTACATATGGGTTCGTATTAAGCTTTTCTTAACATTCTCCACTTAGCTCAGCTATAAATTATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2L 22045148 5' + jockey 4683 1 67.33 TATATAAACAAAACACACGAAAAATATTCATGAAAACGAACTACAACGAACGAAACCAATACCAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATA:1 - chrX 11944198 5' + F-element 309 1 69.31 TGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGG:1 - chr3R 433138 5' - 1731 4597 1 51.49 GGGAACGTATCTGTATCTGGAGCTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:1 - chr3L 447357 5' - Tabor 434 2 74.26 CANAACGAGTTAACTCTTTACACAGAAATGGCAACCAGTTTGACGTATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACA:1 - chr3L 14209094 5' + Quasimodo 24 2 55.45 GACCGGAAAATAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr2L 19644941 5' + blood 27 2 53.00 AAGAAACGAAAAGTGATTACATAAAAACGACCACCGCTGCCTCTTCACTTCACTGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr2R 5262284 5' - 1360 3370 1 47.52 CAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAG:1 - chr3L 27415283 5' + transib2 48 1 72.28 ACTAGGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGC:2 + chr3R 19450106 5' + F-element 393 1 52.48 CCGTGTGCGTGGAGTGAACGGGCGGTGTGATGCCCACCGAGAACGGTGGCCAGAGGTTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGG:1 - chrX 2691254 5' - I-element 4928 1 64.36 AAAGATAACCGCAGAAAAAGGTGAGCATACAAAGCGGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGG:1 - chrX 17059008 5' + flea 4745 1 64.36 AANAGTCGTAAAGGTCATAAAAATTGTCTTAAACGAAATGAGCCATCCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTG:1 - chr3L 18451371 5' + accord 69 2 53.54 TGCGATTTTTTTACCGCCTCCTCTTTTTCATAATATTTGTTGTTTGTTTTTTTTTCTATATCGCGTCTATCTTCTTGCGAATCGAGCCGTACGATGTACGG:1 + chr2R 9633364 5' + Cr1a 4391 1 56.44 CAACTCTTCGTGGCCGGGAAGATACACGTGAACTGAAACTTTAAGCGCAAGTCGAAAATTATGCACAAAAAAAAAAGGAAAAACAAAAGGAAAATAAAAA:1 - chr3L 13688491 5' + Doc2-element 252 1 69.00 TATATCATTTTCCTGGATATTTATAGCTGGTGGATACCAGAAAAGGAAACTTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 - chr2L 20153087 5' + opus 16 2 62.24 GTNAGGCAAGCGTACGCTTCTCAGTTTTGTGTGCTCTAATAATAATTATAAAATTTGATTATTTCGATTGGAAAAACAAGAGAGAATACTGTAGTCGAGTT:1 + chrX 15409672 5' - INE-1 575 1 73.27 TTAAGAAAACGTGCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr2R 9788934 5' - blood 7357 2 55.45 TANTCCATTTCGTTATTCAGCCTTTTTCAGTTCAGTTGCAGCTTAAGCTTAATATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 19952306 5' + roo 8686 2 56.44 ACACGACAGTATGACAACCCTGGCCCGAGCATAATTGATAACAACTTGTGTGCTCATGTGGCTGTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 4805034 5' + 1360 5 2 70.97 GGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGTATAGTATACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2R 10444294 5' - P-element 2880 2 64.10 GTTTGCTGCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 + chr3R 17665974 5' - Transpac 5197 2 58.42 ATATATAATATAGCACACCAAAAATACCCAAAAGAACTTTAGTACAAAATGACAAACACTACAGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTCTT:1 - chrX 16147328 5' + 1360 450 1 71.29 TCAATTACCCAAAGAGCAATTCCTATAAGACGTTTCCACGATCAGCACGTAAAACAAGAGAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 - chr3R 25106833 5' - INE-1 561 1 55.43 TTCCACTTTCCATTTTGGCTCTTTTCTTTGCAGGGATATTTTAACGTGTTTTGCTTTCGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1 - chrX 22745730 5' - copia 239 1 62.38 TCCAAATGATTAAACCGCTCTCACAGTTTTTTTATATGGTTAATTTGGGATGTCTTAATGCATAGCATTATACTTGCTAATGCTTTTTCGTCCTTCGCGTC:1 - chr3R 6404117 5' - Dm88 479 1 80.20 TTTTCGGTCGAAATTTCTTTCGCACAATGAGCCAAAAGGTATTTGTACAAGCAAGACCACACCCAACGCCATGAGCTAGAGCCGTATTCTAAAGCGTGCAC:1 - chr2R 23803985 5' + Gypsy12A_LTR 2206 1 67.33 AGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 - chrX 21636256 5' + Stalker2 26 2 51.49 GANCCAGAAAAAAAGTGAAAGATTAAAGTCGCGTAATAGTATCACCAGTGAATGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGA:1 - chr2R 5422302 5' - 1360 3168 1 53.47 GTTTAGTGCGCATGTTTAAGGACGAAATCCCCGCCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGG:1 - chr2L 8747752 5' + I-element 224 1 67.33 TTCTTTGGCCCTGCTGGTTTCTATTTTTTTTTCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTAC:1 - chr2L 10809309 5' - Ivk 4966 1 68.00 TCTACTATAAATTTTCATCTTCTCTATCAACATATACACCCCAATGCAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTT:1 + chr3R 29476231 5' + Idefix 110 2 71.29 ATGGACGTGTCCGACGTCGCCGTTCTATGAACTATATTACTGAAATATATATGATGTTGTATTAAATTCTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr2L 21612873 5' + 297 1 2 77.23 TGGCCAGGCACATTCTACTCCACTTGATCGTGGATTGGCCGCCGGAGGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTA:1 - chr3R 7164572 5' - Doc 4437 1 56.84 ATNCCTTGGGGCAACCTTGTCATTTACATTTATTTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACTCACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107930 5' + accord 7104 2 64.36 TGAGAGATATATATGCTATATCTGTACAAATGTAAAATATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACA:1 + chr3R 17412570 5' - 3S18 301 2 62.38 CGCTTTGGAGGGTAATTTATCTTAAATATCTAAATCCTTTTGTGAAAATGATATTACATAAAAATTTTAACATTATTTTTTATTTTACTTTCTTTTTATTT:1 + chr3R 19294760 5' - F-element 4671 1 29.70 TACTAACGAATAACACATGTAATTGGTCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr3L 4091581 5' - flea 213 2 72.28 TGTACTATGTAAAACCAAAGAAGAGTTACCGAAGAATAGACATTTCAAATGTACCTCAGACTGTTCCACGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chrX 364861 5' - hopper 1409 2 73.27 TAGTTTAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 13229220 5' + roo 24 2 51.49 GTATATAAATAGGATGCAAAGGCGATATAAATACGTATGAGGGCAATGGGGATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCA:1 + chrX 18314258 5' - HeT-A 6032 1 56.44 AAAAAAGCAAAGATGGCGGCGGAGAGGAAACGGAAGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATA:1 - chr2L 1620133 5' + Juan 3878 1 65.00 ATAGTGTGACCGCTATATGTGCCAAAAATCCCGTATTCAGTATTTGGTATTATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATG:1 - chr2L 12546663 5' - 1360 3230 1 57.00 TGGACATAGCCAAGACCGAGGATCAGTCGATGGCTAACACAATGTATTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGAT:1 + chrX 6649446 5' - rover 7283 2 62.38 CTCAACGATTCTGTGTATTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:2 - chr3R 28288632 5' + 412 7110 2 85.15 GTCCTGAATTCTCCACCCCACACATTTTTCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAA:1 - chr3L 1982299 5' - flea 39 2 72.28 GACAACGACGACTGACTCTTCATTTGTTCAGCACGTGTGTATATACTCTTTACATTGCATTGGGGGGGAAATTACAGGATATGTACCAGAGGTAGGGTGCT:1 + chr3R 1875599 5' + G5A 461 1 64.36 CCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGA:1 + chr3L 25272532 5' + 1360 18 1 64.95 TAAAATCCAGCGTGTGGCAGTCACTCACTCACTCGTTCAATTTAATTCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGT:1 + chr3R 22207794 5' - I-element 303 1 54.46 AAAGATATAAAGGGTTTATAGTTTATAAAGTTATTTTTTTCCCTGTTCTATATACAGAGAAGAGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTA:1 - chr3L 10599635 5' + I-element 4967 1 68.32 CGNCACTGCCAGCGAGTGCCAAGTGTACAAGCAAATCGAAACCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCACCACCTGGTCCTGATCCGC:1 + chr3R 19758382 5' + Chouto 409 1 62.63 AANTAGGAATGGTTAACAATGCTTCAAACAAAAGTGTTGAATGTATTTGAGTTTTATAAATTTTACATACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTG:1 - chr3L 7333474 5' + Juan 13 1 66.34 GACCTTCATGTTTGGCTTTGAATTGGCTCTAACTTCACTATGTCGGCAGTTAGAGCCAATTCCATATTGAAACTGAAAAAGCTAGACTGGCTTTTCCACTC:1 - chr3R 31935513 5' + G5A 2348 1 71.29 TAAATTTGGAAGAATTATCATGTGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCAGAGAGTTATATGAAAAGAGATAAATTTTAACTTCGATTACTAATTTGATT:1 + chrX 23431605 5' - Doc 4429 1 77.23 AATTAACATTGCACACGGACGCTGCTGGGTAACTGAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAACTAAT:1 + chr3R 13729531 5' + Porto1 4448 1 58.33 ATATATTATAAAACTAAAAGTAATCTCATATTTTCCTTAAATGTTTTTAAAACGAGATTGTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 - chr3R 29923637 5' + blood 7028 2 62.38 CCATTTACCGTTTTAATTTTTTTTTTTAAAAAAA:1 + chr2L 21315421 5' - pogo 2026 1 88.24 TACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACAC:1 - chr3L 27450448 5' + Quasimodo 35 2 67.33 TANGGAAGTACACATTCCATTTTCGGTAGACTCAAATGCTTAATTGGAAATATAGAAAACATGTAAAAGTTTAAAATGCCAACTAGAGAGAATGCTATAGT:1 + chrX 19191643 5' - INE-1 581 1 93.07 ATTATGACAACAGATTATAAAATCAGTGAGCAAAGTAAAGTGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 - chr3L 11156293 5' - 297 6943 2 65.00 CCGGATGGAATCAGAGTCAAGCGAACCGAGATAGGCAGTGGAACAGTTATTATAGTAACAACATAATACTCTGTACGTTAGATGTACAATGATTTAAGATA:1 - chr3R 1849882 5' - Cr1a 4144 1 58.42 CAAGATGGCACGATGTGCAGATGGCTGGAGGAGGCAGAAGGAGCTGGCCGGAGATGGAGAGCCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAT:1 - chr3R 19290467 5' - Max-element 302 1 69.31 CATCAAACTGCGTAAAGCGATTATTAAATACAATGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGAGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTC:1 - chr3L 25297502 5' - 1731 269 2 76.24 TTTATTAACTGGGGCAGATTGCTATATGTATGGGTTGGATAACTTGCAGGCGGCGTATCTAGACGGCTGATCTCAGGAACTATACAAGCTAGAAGGTTGAG:1 - chr3L 26015349 5' + INE-1 161 1 69.31 TTCGGGTTGCACATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2L 12284045 5' + 297 6587 2 74.26 AGCCAAGCGTATTTGCCTTTGTGGTCGCCCCGTTCCCAGCTGACATACAGGCAAAGATCCAACTCGACCCCATATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTT:1 - chr3R 28443802 5' - Burdock 255 1 77.23 GTTGCGAAAGTAAAGGGGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACCCTACGCCCACCCGATAAACACTCGGTACCC:1 + chrX 17729061 5' - hobo 2902 1 67.47 TATTAGTTTTGTAAATTTCTATCGAATTTCTTCTATTCACGCCCACACTTTTAAACAATTATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATACCAGAAAAATTAT:1 - chrY 9414 5' + INE-1 504 1 56.44 TTNTGTTTACGTTTTCCGCTTTTGTCGGCACTTCAAGAAGTTGCCCCAATTAACTGGTTAATAAAGTGTTTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTCAGTA:1 + chrX 8475993 5' - F-element 491 1 71.29 CATACAAATATATTGCATTTTTGTACTGTATTGTTTTTTGTTTTTTTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 - chr2R 8547816 5' + I-element 30 1 53.47 ATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chrX 9437206 5' + roo 83 2 43.56 CGTTCAGGACCATCTTGCCGATCACGTTGTTGCTGGAGGAGATCACGTACCAGAAGAGGCACATCACAGGCACATTACAGTATTGGTGTATGCGGACTAGA:2 - chrX 22445071 5' + invader1 203 2 65.35 AGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCT:1 - chr3R 1868195 5' + G-element 47 1 75.28 GAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTGTGC:1 - chr3R 2533949 5' - gypsy8 4809 4 49.50 GGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAG:1 + chr3L 24213773 5' - invader2 222 2 51.49 AGNCCATTGTGGCAATCTTCGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 6814343 5' - 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P-element 2855 1 45.00 CAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr2L 20266012 5' - roo 9035 1 68.82 GTNTAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGG:1 - chr2L 21403539 5' + G5 4416 1 60.40 CAGATAAAAAGATATATGCTTTTCATATACAATAAAAAAAGCTAATAACTGCGTTATTGTTAGAGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTC:1 + chrX 20858699 5' - Copia1_DM 160 1 55.45 TGAATGGTTCCGTAAATTGCTAAAGGCTTGTTTGAGTAACCCAGATACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 - chr2R 8294282 5' - 412 465 2 52.48 TCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCC:1 - chrX 23108319 5' + BS3 1429 1 51.49 AAGGTTGACTTTCAAAGCTTGGGCTCGAAAATTGTTAGAAAGTTGAGAGAGCCTATCGTCGTCTATAATTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGA:1 + chr3R 22154100 5' + INE-1 89 1 70.30 CCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 11156231 5' + 297 39 2 68.32 ATTTTCCGCGCTATTTTCCACTGCCTCCTCCCTCCATATTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chrX 7376002 5' + hopper 141 1 90.91 GTNGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 + chr3R 13225504 5' + hobo 38 1 62.38 AGCAATTTGATATCGTAAGGCAAAAAAACACTGAGAACTACAACCGAGTGAGATCATGATTGCAGTCGCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCT:1 - chr3L 13924168 5' + Bica 15 1 68.32 TGNCAGTAGGAAAAGCAATGGGAAAAGCAGCCTGAGCGGCGACTCTGGATCCTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr3L 19275666 5' - mdg1 396 2 52.48 TTCCTTTAAAAATATAAAAGCTTTGGAGGGGGAAAAAAACAAACATAATCCTGTATATTACATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGCTCAGACAGCCAACATA:1 - chr3L 14585926 5' - Tc1 114 1 53.47 TGNACATTTAATGCACATATTTGGCTTTTTGTGTGCCACTCGATTGCTCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 + chr3L 20669065 5' - Transpac 288 2 56.44 AATTTGAAAGGGTTTCATCAACAATTCAATGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATT:1 - chrX 20999782 5' + BS 33 1 65.35 ATTATAGGCCCCAATGCGTTTTCTATTTTCTATCTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTT:1 - chr3R 9127419 5' - invader3 5425 2 67.02 ATTCCAATATTGTAAGGGATCTATATTTTCATCCGAAGTCTTCAAAGTAATACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGT:1 - chr3L 23155768 5' + gypsy 6985 1 79.21 CCCATTCGATAGACCTACTATGGCGACTACTACTGGCCTTTTTTTTTTTATTTTTTCAAAAACCC:1 + chr3R 22196011 5' - Tc3 1560 1 89.23 CGAGGAAATTTACAAGTTTAAGTGACAAAGCAACAAAAGAAAATAGCCAATTTAGCATAAAGTAAAACACAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTT:1 + chr2R 13749136 5' + I-element 57 1 74.26 AANAGGAATGGTTAACAATGCTTCAAACAAAAGTGTTGAATGTATTTGAGTTTTATCAATTTTACATACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGT:1 - chr3L 7333473 5' + Juan 14 1 67.33 ACAATCCCAGCTGAATCCATATGCCATTGAAAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAATCAACTAGCAAACATCCTAGCTAATCCCATCTCCC:1 - chrX 15967010 5' + G5 4609 1 69.31 CCCCCTCTCCATTTGCACCAGATCAGAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 19109336 5' - roo 392 2 60.61 GCATACTTTTAGGGGCACTCAAAGTCGGCGGCTTTACAAATTGAAATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chrX 10974216 5' + jockey 4698 1 54.00 CAAGGCACCTCTTAAAAGGGCATACAAATTGCAGATGTGAATGTTACAGAAAGTGAACATAAAACATTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGA:1 - 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chr2L 18177989 5' - 412 473 2 57.43 GGGGAATGGCATGAACAAGGTAAGAACGAGGGCAAGATTTATGACTGACTGTACAGAGGTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGATAAACGG:1 - chr3L 13469774 5' - rover 185 2 54.84 AAGCCAAGAGAGCTCGGTATTTGCCATTTGCCATTCGCTTTTTTGTTTTGTTTGTTCTGTCGATTTTTTGCAGCTTTGTTTTGTTTTATTTTTTCTTTTTT:1 - chr2L 2096274 5' - gypsy7 5010 2 73.27 CTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr3L 9076588 5' - mdg1 7405 2 76.24 TTAGTCGACACACTTTTCTCAATTAATTTGCGTCTGCTTAATTAATGAATCCTCAAAATAAAATTTAGCTATACTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chrX 19959784 5' - roo 407 1 71.29 AAGCCAGAAGCTTTTGACCGGACCACAATTGTGGCACTGGGTTTTTGAAAGGGCGCGGCAAGGGAACCAAGATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAA:1 - chr3R 12529400 5' - Stalker 79 4 76.24 AATAATAATTAGAAAGTAGCAGCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTCCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 + chr3R 17674341 5' - blood 7335 1 77.23 ATTATTATATATATAATGACGTATCATATCCGATTATATCAAAAACTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr4 1269540 5' - Transpac 5198 2 53.47 CTGTGGGTGGTGCTTGGGTGGTGGTCGGGTTGTCTGTGGCGGCGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTT:1 + chr3L 10670129 5' - F-element 353 1 58.42 CACTGCAAAACACAAGAACAAAGTTCAAAAACGTTAAGACACTGTGCTCCGGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCTTGTGGGA:1 + chr2L 8506705 5' - Fw2 3603 1 48.86 GCAGAGGATCAACAGACCTCCAAAGCGGAGCCATTCCAGCCTTCGAACCTCGCCAGTCCCCAGGATTTTGACGCGACTCACGACCAGCTGTCCCAAGCGC:1 + chr2L 5201629 5' + BS3 155 1 76.00 AAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr2L 12284004 5' + 297 6628 2 73.27 TCNTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 13652803 5' + hobo 40 1 65.93 ATNTTTTCTAAAAGAGAATCTAAATCTCTTTATAACCGTCATAAATGTTGCCATTTGCTTCAATGTCCAATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTA:1 + chr3R 13349486 5' - Ivk 5368 1 68.32 TAAGTGAATTATGAGGAAGGCATAATTACATAATTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAACCTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCT:1 - chrY 502467 5' - Doc 4453 1 61.39 ATTCAACATCACGATACATAAACATTTTTTATTTCTTTATATTGGAAATGCTAAAACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACT:1 + chr2L 21740160 5' - micropia 118 1 71.00 ATATGTATCTCGTCCATCTGTAGCGCTAGTCTACCAAAGTCAAATTATATCTGACACACTATTTATGAACCCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTG:1 + chr3R 23661732 5' - invader4 111 2 58.42 CTCTACGCTGTCATCAAAGTATGTAATTTAAATTTTAATTTTTTT:1 + chr3R 8383238 5' - 1360 3038 1 68.89 ACGGGTAGGAGATCAGTGTGGGTCCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAAAAGAACTGATCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGA:1 - chr3L 27323517 5' + 1360 444 1 56.57 CGGGGTTTAAGCAAAAAGTGTAGCATGCTTTTCAGCGCAAACTTTATTTAAGCCACTATACAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chrX 10453364 5' + hobo 15 1 62.38 ATCTGGAAGGTCTGATAAATAGTTTTGAAAATTTAAAATTAACAATGGCAACCGGAGGTTCAGTACCCATGCGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCA:1 + chr3R 3472184 5' + Quasimodo 7007 2 64.36 GCAGGATTTGTATTATTTCTTGCTTTCATCGACCAGCCTGGACATTAAAACGGAGAAATTCGACTATTTGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGTGCCCCCG:1 - chr3R 25319035 5' - jockey 4560 1 71.29 TTTAACGGAGAGCCACCACGGCTAATTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chrX 4448589 5' + 412 45 2 72.16 TTGGCGCCCCCCTTTCCCAATCCTTTGCCACCCTTTCCACGACCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - 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chr3L 16673663 5' + 1360 10 2 69.31 ATNTTGAGCGGATTCGGGCGAAGTGTAGAGGTGAGGAGTGGCAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGC:1 - chr2L 7101258 5' - Cr1a 247 1 63.37 CATATAGTAAGTACGATAAGCTATGTGGACTTGGTTCGGTATGGTTATGTTTTCATGGATGCATGTCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATT:1 + chr2R 15521174 5' - Porto1 4355 1 66.34 TTAATGTATTAAACTATATTTTACTTAACTAAGATGTCATAAATGGGGTCAGTCATGTAAAATAGTCTCGAATATTCATAGAAAAAGAAAAAAAAAACCAA:1 + chrX 20548182 5' + Doc2-element 221 3 48.51 ATNCTTTAACAGTCAAAGCCACAATGCCACTATTCACCGTCGTCCTGACACGCGTTTTTTTTGGTGAGACTTTTGGAGACTTATTCTAGTCCGCATACACC:1 + chrX 22445763 5' - invader1 208 2 67.33 ATCACAGATACCGTGTTAGCTAAGTTGTTCGAAATAATTTATTCCAAACAATAAACCACTTTATGGGCTATCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3R 25634984 5' - P-element 2880 2 72.28 GAGTGATCCTTTGTAGATGTAAGGATGGGGGTGGGGTTAGTATCAATGTCTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGT:1 + chr4 982094 5' - Stalker 7168 4 51.00 GAAAAAAAAAATTTCAGCCCCCAAAAGGGGTGACAGCCCTTAATTGCCAAAAATCAAGGTATTAGAAGGATAAAAAAGAAACCTACGAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 14333323 5' + gypsy2 392 1 81.19 GCATTCGTTTCAAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2L 8297401 5' + Tirant 8135 2 51.49 GACAACGAATGCAACAATTTCGATTGGGTGAATTTATGATTCGATTGTAGAAACTAACTATTCCGGTTGGCTTACAGTTTAACAATATTTATTATTTATG:1 + chrX 14949745 5' - Juan 4060 1 56.00 ATNGGTGGTTCGGTGGGTGTAAGTGGTTCGATGATGATGACGACGAAGTCGGGTTCGGCTAGATAGCCGTGTTAAGTCTCTCGCAAACCTGTTCGGATGGG:1 - chrX 17954247 5' - Fw2 3750 1 61.39 TATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chr3R 20373256 5' + I-element 46 1 69.31 CCNAGCAGCGCTGGCTCCACCTGCTTGCCCTCCTGGATGCCTTGGATGCGCGAACAGGTGCTTAGCCACCCGGATTACAAGTAAGTTATATCTATATCTAG:1 + chrX 8103626 5' - transib3 295 1 58.42 GTTGTCTGTGCCATTTGTGTTATATGTGTTTTGTCCATTAGCAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAAAATAAAAAAATAATTCAAC:1 - chr3R 4833182 5' - Tc1 1392 1 58.42 AANTGCTTTATTCAGTCTACGATAATATTATTTATTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1 + chr3R 11735257 5' - Juan 4165 1 80.20 TATACTTCTCAAGACTTACGGGGAAATGTTCAAAGCCAGCTGTCTTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 + chr3L 9076540 5' - mdg1 415 2 72.28 TTGTTACAATTTCCCACGTAAATACTTCCTGCCAAGAAACGCTCTCCCACACACACGCACACACAGACACACACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCC:1 + chrX 4807743 5' + Tirant 8241 2 76.24 TCTCCAATGTGTATAATGAACTACAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCA:1 + chr3R 3188713 5' + F-element 235 1 72.28 GTATATGTATTTTATATGTATTTATATATATATAATTGCAAATGAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGCATA:1 - chrX 1787715 5' - 17.6 452 2 81.91 CANGTGTCAAGTGCGCAAAATTCGGTGGAGATCGGTTGCCAAAACAGTTTTGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3L 2392362 5' - Transpac 5218 2 60.44 CGATGTCATCATTTAAATCGAATTCTTGCGCAACGTTAGCTCTCACATCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTA:1 + chr3R 32015810 5' - BS 4883 1 53.47 GGTTAAAAAAACAAAAAAAAAAGGGGG:1 - chr2R 3491297 5' - hopper 139 1 85.19 AGTGCTCAGGAAGCCGCAAATAAAGCGACAAATTCCCAAAACCGCAATTCGGTGTACATAGATACGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr3L 6522376 5' - pogo 2095 1 67.68 AANGCCGGACTGTGTTTGCATTGTATTTTTGTTTCTACTTTGTCGCTTATTGTTGTATTTTGGCCTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGAC:1 + chr2L 7836534 5' - Porto1 4419 1 70.71 GTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr2R 544870 5' - HMS-Beagle 215 2 55.45 TTGTCGTCCTTGCCTTTAAAACACCCGATACCTCAATTTGTTGACATTTTCGCAATTTGTATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chrX 5521050 5' - 412 7530 2 61.39 ATNAACCACTTTATGGGCTATCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr3R 25634934 5' - P-element 2832 1 22.22 AATTAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGAC:1 - chr3R 1868226 5' + G-element 28 1 50.50 CGAAAATGGGAATTTATGGCCGAATTCTTATCGCTATACTAGTTTCGCATTTTGCCATTTCCCCTCCACCTAGTCGTCTGGAATGCGAACGGCCTGCAGAA:1 + chrX 18396636 5' + G6 1633 1 65.35 AGCAGCTGGTTATCAATATTAGCCCCGAAAAATAGGCAACACTTTTGTTTTTTTTTTAGCATAATATATTGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 - chrX 6509851 5' + jockey 13 1 64.36 CTGTCTGCTGTGTCCTGGCGCTGATTCCGATTTTGGTACTGAATTGGATTTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCTCCGAAATTAAAAA:1 - chrX 11424023 5' - Max-element 245 2 52.69 CAAGGACAAATTCAGGGTAGACCTCGAGATACAGAATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chr3L 6522296 5' + pogo 49 1 76.24 CACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2R 3824667 5' + 297 6626 2 76.24 GGGGCTTCCACATTTGTGTGGAAGCTATAGAACATTTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCAGATTAGTTTT:1 - chr2R 17101425 5' - Doc 4513 1 64.36 CTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 - chrX 21564752 5' + diver 19 2 61.39 GGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 1259228 5' + Doc 36 1 54.46 AAGTTGCTTGACCTGGAAGTTGCTCACCTTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTA:1 + chr2L 488877 5' - invader2 4805 1 71.29 TGGACACATTGAGGATTAAAGCCACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 9141584 5' - roo 9019 2 78.22 TATTGGGGGGCACCGGGGGAGTGGAGGCCGAGAGAGCGAGAGAGCGACCCGAAGCAACACAACACCAACACGAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3L 17971321 5' - P-element 2885 2 77.00 CAGGAAAAAAAATGTATCTTCTGTTTGAAATCTATAAGGATTACCTTTATTTCGATCGGTAAGTAGAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr2L 4790934 5' + pogo 6 1 69.31 AATTAGCAATAAAACACATGAACTCCAATTGCAATAAATCGATAATTGCAGCTCTTTTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTAGA:1 - chr3L 22544769 5' - rooA 7437 2 55.45 ACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr3L 9076587 5' - mdg1 368 2 75.25 TCCATAGCTCAACATTCCAGTTGCCAATGTCCTGAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCTACAAACCTTCTTAGCAAACCCAATCC:1 - chr2L 16975961 5' + I-element 5113 1 62.38 ACATTATATTTTAGAAGCATCATATTTCGTTATTTTTATTTCTTACAAATTATCAATTTCAGTCGAGAAGTTGTACAAGGAGTTTCTTTGGCACTCATTTA:1 + chr2L 3962295 5' - HMS-Beagle2 427 1 62.38 GCNAATAATCCAGCAATTTGCAGTTTTCGATTCCCACTCGAACATTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCTTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGA:1 - chr3L 27091866 5' - 1360 3290 1 56.44 CAAAAACACTGTTTGCCCGGGCTTAGTTGGCCGTTGGCTCGGTTCAGTTTGGTTCAGTTGAGTTCAGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCT:1 + chr2R 17229403 5' - Doc 431 1 69.31 CATGGGCTCCCATGGCAGGCAACAAAAAAATATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:1 - chr3L 12172878 5' + 17.6 37 2 71.29 GANGTCAAGGAACCTTGTATTTATGTTTCAAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr2L 13250461 5' - pogo 2092 1 68.32 TAAAGCGATGACTTCATAAAAGTATTTCGCGTGGCATTTTAGGTGAGGCAAAAAACCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr3R 12554957 5' - mdg1 7439 2 58.42 TTATTGCTGGCGAAGCAGATTTGTTCGCAATACTCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCAACTACGTCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTA:1 + chr2R 17986973 5' + Doc3-element 4586 1 66.34 TGTTCAAACCACCGAATTTCCGGCGGCTTAACTCCGAGTGCATCGCCATTGGTTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr2R 20804753 5' - hobo 2918 1 58.42 CTTGCTTGTGACAGAGCTCCTCCTCTTTCCATTATGGCCGTCCATTTTGTTGTTGCGTTTCGTGTTTTTCACTTTAAATAGCTGCTGCACAGGCGCCACTG:1 - chr3L 20497843 5' - TART-C 150 2 73.27 ATGGGTAGTTTGTAATATGTAACTCGAAGTTTGAAGGGGCAATGGGGGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAG:1 - chr2L 108660 5' - 17.6 224 2 56.44 TCACTTGTGCCAAGCACTCGTACTCCGCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 678856 5' + Tirant 8115 2 70.00 ATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAAC:1 - chrX 8027466 5' + Juan 39 1 61.39 TAAGTGACAACAATTATGTACGTGTCGCCCATCCCAAACTTGCCCCTTAAAAAGCCCACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAG:1 - chrX 6185943 5' + accord 280 2 68.32 GGNACCCCACATTAAAAACGGAACGGAGAAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAA:1 + chr2L 18958193 5' + Porto1 365 1 69.79 ATTTCGCAGCCAGGAAATGTGGAAATTCGCTGGAAAGGCACAGGGACCTGCTGTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr2R 23411958 5' - mdg1 400 2 58.42 TGGAGTTGAACTTGCTCGACCGGATATTGCAGTATCAATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 9322901 5' - 412 477 2 62.38 AGAAAGAGCGTTGTTGATAGCCTCAAAACGTGAACTTTCAAGTAACTTCATGATTTATAAATTAAATTTAAATGATACAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 + chr2R 1516570 5' + Transpac 4921 2 78.22 TCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 + chr2R 9788952 5' - blood 7339 1 73.27 TTATCCCTTTGCCTCCTTCTCTGGGGTGGCAAAAATGTTATAAACAATGGAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGTGCACCACTTCCACGGAACA:1 + chr2L 11214066 5' - R1A1-element 85 1 56.44 ATGTTTNAAATGCATGTTTATACCATAACTTAATAGCTAGAAAATGAAGCTAAAAACTGCATTTTTGAAACTATAAGGTATAACCAAAGACCCTAGAATAT:1 + chr2L 14798777 5' - Tc3 315 1 68.32 TTTCACTCTCGCACTTCACAGCCATTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTA:1 + chr3L 7300295 5' - G2 2994 1 79.21 TATATTTTTTAAATTTTAATTTCCGTAAACATATTTTGTT:1 - chr2L 7111882 5' + copia 4690 1 82.50 CCTTCCACCAGCCGGCTGGCAAATGCAACACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGAC:1 - chrX 8422330 5' + jockey 4753 1 71.29 ATACTTGCAATAATTTGCATGCGACTCTCGAATGGCATGCAATGGATCCTACTCACGCAAGGCTTCATCATATTAATGATTAGGCTGT:1 + chr2R 21805482 5' - Rt1b 4759 1 77.27 TTTGAAAGGCTTTCGAAAGAAACCTTTGTGATTTGGCCAGGTGAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr2R 18649401 5' + opus 143 4 56.44 TTTATTATTTCTGAATATTTTATATTATTGGCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTTTGGTGTTATTTTTTGCATGCACATAAACTGCACCTTTCGC:1 - chr3R 21824171 5' + Cr1a 271 1 69.31 AAAACCCTGAAACCTGAGAGTTGGCCAGTTGGTGTGAGTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTG:1 - chrX 12427328 5' - I-element 232 1 62.38 TACCAAAAACACTGGTCACGCCTCTCCCCCCACATTTTCCGAATTTTATTCCCCAATATCATTTTTGCGTTTGCAATCACACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 + chr2R 5794752 5' + INE-1 541 1 65.35 AGTTTCTTGGCACTTGATTTTTAGATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chrX 14040763 5' + roo 8709 2 76.53 CAGTTTAAAGAGAACGTTTTCGAATTGAAACAAACCGGCTACCGAGGTTCACGGCCCCTTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCC:1 - chr3R 19495213 5' + micropia 103 1 62.00 CTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3L 22349284 5' + jockey 28 1 58.42 ATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTA:1 + chr3R 4160056 5' - invader2 5100 2 71.29 TCNTATCTCATTCATTCATTCAACTTTGTAAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 18816097 5' - roo 396 1 65.35 AGNGCTACGTGCGGACAAGCATGCATAATGAGGACCACGATCCTTTCACCTGGATGCGGGTTACCCCTACAAATTAACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTT:1 + chr2L 19602814 5' + hobo 3 1 75.25 ATNATTTTTCTTAGGTATATTAATTAAGTACACCATCAACCAATCGATAAAAGAAGCTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3R 4600509 5' - Tabor 7304 2 58.42 GAGCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr3L 13652801 5' + hobo 48 1 69.31 AAAAGGATTTTTTTTTTAAATTATAAAAAAAAACAGGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGT:1 - chr3L 12110736 5' - INE-1 542 1 69.23 CAACTTGTCCAGCATGGCCTGTATGTGTGTGATTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 22310824 5' - hobo 2893 1 72.28 AGCGCTTTTCATAACCAATTTACTGATATTGCGTGAAATACAAATCAAACTCTTAAGCTTAATTTGAAAATTAAGAGAAACAAACAAAATCAAGTACAAAT:1 + chr3R 28779100 5' - accord2 7243 1 80.20 AATAAAAACCTTTAAAAACCCAAACGGATAGCACTTTTCCATCAATAAAGACAGAAATATATCTTGGTTACCGAAAACTGTGAACTAACGGTACCGCGCTG:1 + chr3R 24840468 5' + gypsy8 4827 2 65.35 AAACAAAACAAAAGTTCTTTAAAATTTGTTTTCCTGTCGCAATTTGTTTATTAACATTTCCTTAAGCAAAGGATATACACTGGTTTATAAACGTTCGCTCT:1 + chr2L 11926205 5' + Doc3-element 4245 1 65.35 CAATTTTTGTACTTGCTCTTGTTTCTCCAGCATTCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2R 13304447 5' + hobo 41 1 65.35 AATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACTAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTTATAC:1 + chr2R 545172 5' + Stalker4 7109 4 71.29 GAGCACACAAACGTGTGCGTGAGAGAGCGAAATCGGAGAGAGGGCGATTACACACTGGGAGAAAAGGTTTGAACGGAAGCAAGTTAAACAAAAAAAATAAA:1 - chr3R 21582050 5' + Porto1 159 1 50.50 TTTCCCCCTTTCTGATGTTTGACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 9410820 5' - roo 352 2 81.19 TAATTTCCCCGGCTGATAGTGTGAAGGCAAACGGGCTGGGGTGTCTATTGAATTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTA:1 - chr2L 17332580 5' - accord 7264 2 55.45 CTTTCGACTTATCGAAATACAACATTTAAATATATTATTTTTGATCAATTGGCATCATACGAAAAATTCTTGTTTTGCAATGCCTTAACGTTATTATTATT:1 + chr3R 26646126 5' + 1360 305 1 73.27 ACCATGGGCGAGAGCTTAATATTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCG:1 - chr3L 19275063 5' - I-element 4886 1 79.21 GTATAAGAGATTGCTGCGCAGGCGCATCCTTAAATGCCGCTCGGCTTTTTAATGAGTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr2R 9658323 5' + P-element 17 1 62.38 AGNTGACTTTGGCACTTTGCGTTGCACGTTGCGTATGCGTGATTTTAATTTTAAGTGGAGCCACTAAGAAAGACGATTGACCATTGATGAGATTTATTTAT:1 - chr2L 3409129 5' - G3 353 1 63.37 TGTCATAGTTGAGCGTTAACATGTTTGGGAAAACGACATTTTTAATTAAGATTTGGTCGCCCACCCTAACGCCCTACAACCGCCCAAAACTGCTACACCCA:1 - 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Stalker2 354 2 73.27 GCCCAACTGCAATATGATTTACTGCCACATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCA:1 + chrX 10173632 5' + jockey 407 1 74.26 TAAAACGGATTTTGCACGAGGACAGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGAGGGGTTTCAGCACG:1 + chr2R 4558387 5' - Doc2-element 4347 1 76.24 CATACGAAAGCCGCAAATTCTAGAGAGAAGAGGAAGAGAAGTTCAGTGCATGGAAAGTTTAATTTTTCACCAAGCACTGGGAACTCTGGTTGTCGCTATAA:1 + chr2L 6561617 5' - Dm88 4063 1 53.47 ATTAGGATTAGGCCTCGTTTTGACATTGACATTAAACAAAGAGGAAAGCCAAAAGCAAACATAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATG:1 - chr3R 23238870 5' + mdg1 423 1 56.44 TTTTACATACCCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:2 - chr2R 18344636 5' + 1360 17 1 58.42 CAGCCAATGCTGCTCGTCGTCCTTACACTTTGGCTGGCTTAGTTCAAATATTTTTACATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 9410880 5' + roo 18 2 61.39 CACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 23601735 5' + jockey 57 1 73.74 AGACACAAGGACCTCCGCATATCAAAGTACAATTGGGCTTTCCTTTGGTATCACACGTTTCTTTTGTTTTATTTGCAGTTGCACGTCATTATATTTCAATA:1 - chr3L 15408011 5' + accord2 7286 1 61.39 GAAAAGCGTGTACCATTTAATTGATATCTCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 5291664 5' - roo 9026 1 71.29 ATACCATAACTCTCACAATCAGTCCCATATCCATCACCGCAGGACATCATCGTTAAGGACACTGACCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTATTGA:1 - chr2L 1235225 5' + Doc 4575 1 70.30 TTTTGAATCTCTAAAATATCTGATTTATATTAATGCCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chrX 14131816 5' + I-element 41 1 63.37 TAATTCCTGCGACAGAGCACTACTTGGACCGCACCATTAACAATTGGAAACCCTCAGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGT:1 - chr2R 20592770 5' - F-element 4479 1 59.41 TTAAGTTAATTTCAAAGCGTTTTATGTTTTTGTTTTTTCTTCTTATAGAGTATCACAGCTTCGGCAGTTATCGTTTCCTAAGTGTTCACACATGAACACGA:1 + chrX 4022255 5' + roo 8662 1 79.21 GTATGAGAGAAACCAACCGTGGAATCAACCCACAGCTGTGCGCATTCAACGAGTCCACTTGCGTCCGTCATGGAGAAGAAGTAAATAGCGACTACACGCAT:1 - chr2L 3984880 5' - micropia 23 2 70.30 TCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 - chr3R 20878169 5' + Doc 6 1 70.59 AAGGTTATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chrX 20331807 5' - mdg1 395 2 52.48 ATGGAGCAGTAGCTACAGTGGTATATATATTCTTGATCAGGATCATTAAGGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTG:1 + chrX 20002992 5' + INE-1 151 1 74.26 ATACGTTCACAATAGCAGCCACCGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3R 20584309 5' + 1360 50 1 76.24 ATTATAACAATTATGCGAAATGCAAATGAAAACATTGAAAAAGATCTTCGCGGAAGTGTGGCACATACAAAAAAAAAAAGGAATAAAAAAAA:1 - chrX 20805130 5' + Doc2-element 253 3 70.65 TTTGACGTACTTCAAAAGAACCAAAAAATACAATACCGCGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACTTTG:1 + chrX 584754 5' + Doc2-element 4390 1 70.30 AAAAATTGCGCAGATAAATAAATCTTAATATACTAAATTATTTATATGAATAGTGTTTTACTAATTCATTTATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2L 13229082 5' - roo 407 1 75.25 TATGTTTGTCTATTGGTTGGATGGCTCCGTTGCTGGTCGCTAGCTCGGCCGAGAACTTGAACTTTAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAG:1 - chr2L 14965298 5' - Quasimodo 173 2 51.49 TANGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACC:1 - chr3L 24208217 5' + Quasimodo 7 2 68.32 TTTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAAAGACAAAGAAAAACACACGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAAT:1 + chr2L 2436615 5' + 1360 3014 1 68.32 CGNGTTAACTCTTTACACAGAAATGGCAACCAGTTTGACGTATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAC:1 - chr3L 14209089 5' + Quasimodo 29 2 60.40 GGTAGAACACACTGACGGCAGCCACAACAATTTTAAGCTTGTTCTCTCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTG:1 - chr2L 19142351 5' - mdg1 36 4 73.27 AAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 - chr3L 13345507 5' - Transpac 5187 2 68.32 CCCACAGTATGTGAATCTCTTTTGGCTCTACAAAAACACGATCTTTCACTCTCTCTCGTACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr2R 21497561 5' - P-element 2870 1 63.00 CGGCGTCTTGACTGATGTCCTGGATGGTCTCCAGCTGTTCGCCATACTTTGCCTCCCCGAAATGCACCGAAAGTAGGTAAATTTAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 5026641 5' + TART-C 11095 2 74.49 AAACTGACCAGCCACAACAGCACTTCACTTGGCCAAGGCGAAAATCCAACAGACCAGCTCACAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGC:1 + chr2L 7339560 5' - Doc 366 1 65.35 GAAGTTGATAACAGCACGAAAACAAAAACACAGTAAACCGTAATCCGTAAAAATTGAAGAAGATGAGTTTATTGAAGTAGAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr3R 445982 5' + pogo 1 1 75.25 AGGGCAACAAAAAAACAAGCGGTGATCTTCAAAAGGTATCGATCACACCTGAAACGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACA:1 - chr2L 19164581 5' - Stalker 7106 4 64.36 TGTATTTCGAATAAGTTGGTTAATTAAAAAGACCTTATATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2R 18344561 5' - 1360 3350 1 66.34 CACGAAAGACGCGAGCCGAGTGCATCAGTATACAGGTGGAACACATGATTCTTATTCATTCGCAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAA:1 + chr2R 17522983 5' + I-element 4916 1 65.35 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATGCATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATC:1 + chrX 15019096 5' - Stalker 7031 4 76.53 TGCCAGGAGGATACAAAGGACGAGGTTACACACCCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 + chr3R 12115289 5' + 1360 40 1 68.00 CATGGGCTGCCCAAGACGCAGAGTGCAGCCGGCGCATCTTGTTATTTGTAGCAATTAATATCCAATATCTGGGTGCGGCAGCATAATTTTATTTTTTCAGA:1 - chr2L 8615519 5' - mariner2 880 1 83.17 AGCCACTGAAATACCCTTTTCAGGTCATTAGCCAAACGATCAGTTGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 26592582 5' - roo 9045 1 53.00 GACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACA:1 + chr2R 5532368 5' + Doc4-element 14 1 56.44 GTNGTCCTTGCCTTTAAAACACCCGATACCTCAATTTGTTGACATTTTCGCAATTTGTATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chrX 5521052 5' - 412 7528 2 58.42 AACCACGATTACCATCGGCTCATCTCGCCAGCAACTCCAGCACCTCCAGCATTTCCTTCACTAAGACCCAGCATTAAACACAATGTTTTTACATTTATTTT:1 + chr3L 3390460 5' - looper1 1812 1 78.22 AGGAATATGTTTGCTTAGAAAATGAAATGCATTCGAGGCCCCGGGGCAGCTGCCATGGTAAAAATGCATTCCCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr3R 29357018 5' + 412 6 2 69.31 AATATCATCTTTGTGCTTTTAATTAGGTATTGCCAATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATA:2 - chr3R 9192616 5' - invader3 5463 2 79.21 GGTCGTGTCGCCGCCTTGCCCCCAAAACGCCATCCGCACATCATCTAGATTCTAGAACTTTGACTATTTATAAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chr2R 17077928 5' + Tirant 4 2 77.23 CAGTTCATTTTACCTCGGCCCAATTCAAAAGTACGTGCCATATAAACATATTAAGATACACCAATTTTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACG:1 + chr4 137303 5' - 1360 433 1 67.00 ATTGGTAGAAGTTAGCAGAAACGGGAACACGGCCAGGACCAAAACCGAAAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACC:1 + chr2L 19602681 5' - hobo 293 1 57.43 TTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTT:1 + chr2R 5582165 5' + Cr1a 439 1 69.31 TCTAAAATAATGTTATAATATAATAAACTTGCAAAAATGTCACGTACTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chr3R 26255106 5' - opus 7476 2 60.40 TAAGTATGATTTGGGTTAATAGGCTTTGAGATATATTTATTTATTATATTCTTAATGTTTTATTTTTGATTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 + chr3R 25971159 5' + F-element 17 1 63.37 AACACACTTGGCATATACTGGCAGCCCAGATGCACATTTCACGAGTTTCACAATCGGAATGATTATCCTGGGTAGGAACAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr3L 23243092 5' + 1360 2 2 59.41 ATNTTTTAAACATTTCCTGCAAACGAATATTTTTATCTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGAGGAGTTGCTTGCGAGATGTCAGGGAGGGCGG:1 - chr2L 17118073 5' + Bica 37 1 60.64 AGTCGTGGATCTGCCCTTTACAATTAATTTTTAATGGAATTTTGTAAACTCAAAAATGAAATTCGGAGAATACATGTTCAATTATTTTCAAGCGAAATAA:1 + chr3R 19736433 5' - Tc1 1536 1 91.00 ATCTCGTCCCCGTACATCTCCGCTTTCTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCACTAAGTCTGTCGGCATATTGGCTGCTGTGGAATTTATTTGGTCTCCCAATG:1 + chr3R 2831902 5' - G5A 2576 1 73.27 AAATAAATTAAATAAGAAAACTACCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTG:1 + chr2L 21017751 5' - 17.6 113 2 77.23 AANCCTGATAAGAAACTAAAGCGGACCACCTAAATAGTTGGTGACAAGAATGGTTAGTTCGAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr2R 18434441 5' + 412 13 2 65.35 GTNTGCTTCTGTGTTCCGGACAAAAGTGTAACGAATACAGCATTACACCCGATCCCAACACTCTTAGCAGAGATATGACCTAACTGAGAGCCTGTTTCCAG:1 - chr2R 21825345 5' - baggins 113 1 60.40 TCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGTCGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAA:1 + chr3R 3528053 5' + F-element 168 1 76.24 AGTGCAACAGTATACTTGTGTTCTTTGTATTATCTATAAGTTGTTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCT:1 + chr3R 27539162 5' + Burdock 30 2 56.44 AGNAGTTTCGGAGTGCGGAGTGCGGAGTATGTAGGTACGCAGATTGCATCGCGTCACTTGTGAGCGAGAGAGTTGAGAGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAA:1 + chr2L 19192058 5' - Porto1 450 1 61.39 TTTAGCCAACGAGCTTTTTCAATGGCAATTGAATAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr2R 4559128 5' - pogo 2066 1 66.34 AAAAAAAAAACGATTTAACTGTATAAATAAACAAATGAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr3L 18938879 5' - blood 345 2 61.70 ATNGGGTGGAAGTTGGTCAAACGCAACATTTGTAAACTCTAAAATGGAAGCTAAGTCCATTTACAGCATTATCAAAAAAAAAATTAAAACAAATGTAA:1 - chr2L 2554662 5' - 1731 4267 1 87.76 AATACGTTTTATCAAGAACAAAGGGGTATTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chrX 8302849 5' + 297 6612 2 70.30 GGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGA:1 + chr3L 25889016 5' + gypsy8 311 1 72.28 CCTCCACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTT:1 - chr3L 22046509 5' - roo 389 2 62.38 AAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATT:1 + chr2R 5582176 5' + Cr1a 450 1 58.42 CCTGACGCGCGAGTTACCAAATTGCCTTAGGTCGACACGGTGTGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACA:1 + chr2L 23372502 5' + gtwin 6917 2 78.22 AGGCGAAGGTAACGATGTCGAGTAAAGTAAAGTTCCTAGGTAGCTAATGCCATTTCTAGTTCTAGTTTTCTTAATAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCATA:1 - chrX 16513180 5' - Q-element 331 2 53.47 TGNTGCAATTTAAGAGAGTAGAGAGAAAGAGACCTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAACAAGAGTGAATGCTATAGACGAGTTCCCCGACTA:1 + chr3R 18346620 5' - INE-1 566 1 52.48 ATATTGTATCACATTTTGAAACGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 19947400 5' - roo 355 2 77.23 GGAAACGAGGTTTTTCGTCTTCTGCTAGCTGCTGCATGGCTCTGGCAGATAGAAATGAAGCTTGGGCGCTGCATTTTCGGCTGCCTGTCCCGCCAATTGAC:1 + chr3L 24862573 5' + diver2 197 2 61.39 TAGACATGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGA:1 + chr2R 4368646 5' + invader1 3670 2 65.35 CTTATAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2R 4900367 5' + Doc 34 1 55.45 AAGTGTGACTCAAAAGACGGGTGGGTTTACCAAATCGGGGGGTTTTTGGGCGGGCTTTAACTGATTGTGTGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGATT:1 + chr3L 9119429 5' - accord 7099 2 79.21 TAAATCGCTTACAATGCCTCAAAAACTGTTTTTTTGTTTTTTTTTGGGTACAGAAAAAAAAAGAAGTACACATCCCGAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 + chr3R 9319134 5' - accord 7029 2 70.00 ACTTGCGCAAGATTGGAAAACTCTGCTAATATACCAACAATCAATGTGCTTTTCAAAATCAAGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr2L 5902376 5' + 1360 82 1 65.35 CGNAGCCAGGAAATGTGGAAATTCGCTGGAAAGGCACAGGGACCTGCTGTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr2R 23411954 5' - mdg1 396 2 53.47 GAGATGTTTTATCCCAAGAGTTGGGGCATACATATACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCA:1 + chr2L 21951146 5' - opus 496 2 77.23 TTGTTTGCCTGGTGGCAAACAACCCACTTTGGGGTGTTAATTAGCCGCACATGTGAAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATT:1 + chr2R 21494281 5' - P-element 2649 1 65.35 CACCAATAGTTATAGTTTCTCTATATCAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr3R 12514903 5' - opus 455 2 75.25 TTGAATCTCTAAAATATCTGATTTATATTAATGCCCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:2 - chrX 14131814 5' + I-element 43 1 65.35 CATATTCTCCTCAATTGCCAGAATCTTTTCAAAGAAGATAAATGATTAAATTGCATTATATATGATATGTTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 - chr3L 1973538 5' + flea 4763 1 71.29 CATTTGCCTAATTAATGGAAAACAAGTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 20451539 5' - HMS-Beagle2 498 1 84.62 TTAAATGCAACCACACTCACACATATGCGCGTATAAAATACAGTCTTCAAAATGTAACCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGG:1 + chr2L 7596599 5' + 297 6559 2 56.44 GAACACCAATCACACTGGGAGCAACAGCAGCAGTAACAGTGGAAGTAACAACCACATAGCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATC:1 + chr2R 18096746 5' + Quasimodo 6911 2 64.36 TTNTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAG:1 - 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accord 6985 2 63.37 TGCACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2R 8314159 5' + hobo 42 1 72.28 GTTTGTCGAAAAACGCAACGTTCTATTTTGTTTGCGAATCCCATAATTTTTTTTAAAGGTATACTAGATTAGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 - chrX 13736773 5' + INE-1 28 1 62.38 CTAATGCATTTAAGGAAATATTAAAATAAGGACCTTACTATAATCAATATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGA:1 - chr3R 23099681 5' + Doc 4466 1 57.43 AGCCACTGCCGCATGATGGGCGGCCGCTGCGTGGGCGTGGTGGTGATGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCC:1 - chr2L 5936291 5' - F-element 4360 1 57.43 GANGGGGGAGGTCAGCTGGGCGTTAAGGCAAAAGGAGGAGTGGCGTCGTGGAAGATGTGTGTACCGATCGAGCATAGGCAGCGCGTCATGGCCAAAAACCA:1 - chr2L 4290456 5' + Osvaldo 485 1 65.35 ACATAAATATGTTTATAACTAATAACAAGTAAAATGTCACTGACGACATAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr4 119465 5' + 1360 23 1 57.43 CTAACCTTTGATATTTAATTCCATATACTAGCTCAAATCATTTCTCTCAGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3R 28117753 5' + I-element 27 1 53.47 GGAAGCAGTGGGAGTGGTAAGTCTTAAAAATAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:1 + chr3L 1973454 5' - flea 4971 2 71.29 TTNCACACATATTTGCATGCTATAAATGCGGCAATACACGCAAATACTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTA:1 + chr3L 13343153 5' + accord 7083 2 53.47 ACATGCCCATCTACACTCGCATCCGCTGATCCATGTTCCACATCAGTACCAGCATCAGCGTCGTCGATGTCGTCTTTGGCCCATCCGGTCTTGGATGGCAT:1 + chr3R 24715349 5' - gypsy10 5685 2 56.44 TTNGATATCGCAACAGATGGGTAAATAAAATCTTTATTGTGGGCTCACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr2R 7454085 5' + 1360 30 1 54.46 ACTCTGTTGTGGTTGTCGTGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTG:1 - chr3R 6308227 5' - F-element 304 1 79.21 TCAAAAATTGTGGGAAAAAATTGCTCAGCCGAGAACTTGATCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCAGATATTAATGT:1 - chrX 11223102 5' - Quasimodo 6910 2 76.24 AAATACATTTTGTAATCGAATTCAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 + chrX 7583180 5' + I-element 9 1 70.30 CAATGGCAGAATATTAACATGCAGATTGATGATGTGCTGACTGTGGCCAACCAAGGCAATATTTCCTTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCC:1 - chr3R 26763707 5' + Doc 4484 1 72.28 TANATATTTTTTTTATCCGGTTTTCGCCCTTTTCACTTGCTGCGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGA:1 + chr2L 9494656 5' - Max-element 403 1 68.32 TATATGATGAGTGAGGCAGAGGGGGAGAGAAAGATATAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACT:1 - chrX 13506454 5' - blood 125 2 62.38 CCAGATGATAAATGTGCCGGGTTGTTTTCATCTTCGTTTTGTTACACGCCCTGCTGGCTTTTCTTCGATTTGCCTCTGGATTTTGGATTTTCTCTATTTTT:1 - chrX 14711712 5' - transib4 2540 1 72.28 GGAGAAGCGGTGACCGACACTGACTGCGTCGACTTTTTGTGCTGAGCTGAATTGGTCCAGGACATGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGC:1 - chr3L 888903 5' - F-element 303 1 67.01 ATTCCATGATGTTTAGCGATCTGTTTAGGGATTTATGTAGTTTGTTTGTGTGAACTTTATACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:2 - chrX 19820126 5' - mdg1 7444 2 48.51 GGAGCAGGATTCGGTGGAGGTAAGTGTCGTTATCCAGTTCTTTGTGGGGTTTTTGTCAGCTTGTTTTCGGTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATA:1 + chr3R 29557827 5' - 412 152 2 75.25 ATNTTTTCCTAGTCGTGTTTGAATTCATATGCCTTTAGTTTATTTTGTTGTTTCAGTTCAGACGCTTCAAATGATTATGACGCCACCGATGCGTACGTTTT:1 - chr3L 26695548 5' - 3S18 263 2 67.33 GCCGCCGCGCCCGCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1 - chr2L 18987306 5' + P-element 61 1 18.81 TTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTG:1 + chr3R 25277639 5' + 3S18 51 2 71.29 CCAGCTTATACCCTTTCATCTGGTTACACATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTACTTATGTACGCAGACGTTGTTAAATTAT:1 + chr3R 8049981 5' + Q-element 577 2 71.00 CCTTTTTTACTTCGTTTTATTTTCCTTTTTTTT:1 - chr2L 1371433 5' - Doc2-element 254 1 75.76 GCCGGGAAGTCGACAGTTGGGAAATTATGTCTGATGTGTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTG:1 + chr3L 5381112 5' + accord2 7251 1 62.38 AAAGCTCTCCAAAACTCACCTGAACTATACACTGGACAACCACCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCCTGGATAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGA:1 - chr3R 11434969 5' + G-element 4153 1 70.30 CGAGTGGACTGTATCTCCACACGTCCCTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAG:1 + chr3L 27384379 5' + invader1 3575 1 72.45 ACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chrX 4806745 5' + roo 30 2 62.38 CGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCCAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1 - chr3R 1868228 5' + G-element 26 1 54.46 AAGCGTATTTGCCTTTGTGGTCGCCCCGTTCCCAGCTGACATACAGGCAAAGATCCAACTCGACCCCATATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCA:2 - chr3R 28443798 5' - Burdock 251 2 73.27 GCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:2 + chr2L 23372626 5' - 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chr3L 16222571 5' + transib3 382 1 57.43 GTAGCTGGTGCAGCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 + chr3R 24461823 5' + F-element 40 1 60.22 ATNAAAACTATCGAAAGTGAGGGAAGTTGAAGCCATTAAAAGAGAGGGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTAT:1 - chr3L 492743 5' + F-element 154 1 53.47 TTGATGCTGCCTGCAATGCAGCTGCAAAACAGCAATTGCACTCGGCGATCGCAGCCTGATGTTGCTGTTGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3R 26085643 5' - roo 404 1 75.00 AAGCTTCATCGGAAATGCCTTTTGATGGTCGGTAATGGGTCATTGTCTATAATTAAACCGGAAGCGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTA:1 - chr3R 31196208 5' - invader3 238 2 66.34 TGNTTGGCCCAAAGCTATCGACTGCACAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 4806664 5' - roo 9049 2 55.45 ACAACCGCTCCGTTAAGCTGATGCCCCACAGAACACCCCTCAAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCAGCCGCTGCCAGCAACATATCTAGGTATCA:1 - chr2R 4005769 5' + Helena 892 1 70.30 AACAATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATC:1 - 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invader2 5090 2 76.84 GGNAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 - chr3L 6013735 5' + Max-element 8259 2 54.46 CACAGGAAATGTAGTCCGCTTCGTATCGTGTCGGGTCAGAAAACTTTTTAATAACTCATTATAAACTACACAATCAGTGCCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chr2R 5497305 5' + I-element 6 1 57.43 AATTTTAATTAGTTTTGGGAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGCAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr3L 6013751 5' + Max-element 8242 2 72.00 ATAAGAAAGTTAAAAAATTAAAAAAAAA:1 + chr3L 11180105 5' + TAHRE 10442 1 82.14 GATGACTATCGCGTACGTAATTTTTTTTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCTATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3R 12375209 5' + pogo 36 1 74.73 AAGTTTATTCGGTTAACTTTGGCCGCTAAACTACATAGTGACAAACACAAAATAAAAAATCGGGGCGCAAAAAAAAAATACGACCGTTCGCTTTAAAAGCT:1 + chrX 4847849 5' - Cr1a 3 1 57.43 ATGCTGCGCTTCCCATGTTATTCGCTGCTGCGCTTTGGCATATTAGGGCCAATCGTCTAATCGCCAGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCT:1 - chr2L 12816802 5' + F-element 258 1 65.35 AAATTTTCATTAAGCGAAGGCAAGGCAAGAAAAGCAATTCCGTTTCAAAAACGTATCAATGGGTAACCGAACATCCGTTTGAAAAGTATGCCTCAACGGCA:1 - chrX 17514121 5' - mariner2 163 1 66.34 AACTAAGAAGAATGTGCTTTAAATTGATAATCTGCGAGAGAAAGAAGAATTTTTTGTATTTATTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chr3L 12160120 5' + pogo 8 1 71.29 TGCACACTTCATTGTCCCAGATTTGATCAGTCAAACCAAGAATTCCTGTTGTTTGCAGTTGATCTGTGGGCAAATCCAAGGCACCTATGGCAAGCATAGGT:1 - chr3L 12887992 5' - R1-2 489 1 74.26 AGAGGCGGCGAACGGACAACCTCCCACACTGATAATGGAAAATAAACAATACACGACAGCGCCACTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACC:1 + chr3L 12434211 5' + Cr1a 4435 1 59.00 CAGAACGCTAATTAAAAAGATACTTGATGGGAGCCACCGGAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAGGAATCTAAGAGCGCTTGTATCCAAGA:1 + chrX 12622553 5' + Idefix 322 2 60.40 CTAGCCATCTCGCTCTGTCATTCATGCTAATCGGGCACATGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chrX 9579390 5' - Tirant 366 2 59.41 ACGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 + chrX 6509791 5' - jockey 4944 1 73.27 GAACTATTATGGTTAGTGCTTGGAAATATTTTTAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGA:1 + chr3R 6535123 5' + Doc 4504 1 66.67 TGAATTGTGAATTGCGAATTGTGAACGCTATTGGCGTGCGGTTATTGTGAATTTATGTGCACATTTAGCACAATTAAAAATTAACACACACACACACATAC:1 - chr3L 16873748 5' + Quasimodo 35 2 63.37 GGCAAACGAAATAGAAACAATTGGTTTTCGCAACATTAACGTATTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2L 1590833 5' + opus 30 4 57.43 GCGGTTGCCCACCCACTGCAAGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 14354335 5' + 1360 56 1 83.17 AAAATTAAAATCAATCAAATAAGCGTAGATAAACATAACACATTTTATTTTTTTTTTACATTATTACGAAATAATTATTTAATTTTTTATTTTTTTTGTTA:1 + chr2R 8273424 5' + Tc1 1399 1 84.16 ATGCGAGGATGTGTGCGGCCAGCAGCGACGACGATGAGCACGAGAATGAACGCGAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chrX 18356177 5' - P-element 2870 1 62.38 GTCGCCAGCGTCGCAGTCGCCAGCGACAGAGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGG:1 + chrX 15502900 5' - HMS-Beagle 67 2 70.30 CGTTGTTGGTTTTAAATTTCAAATGGCTTGGCTTTCGTTTCTTTGTCACAGCTTTGGGTGGTTAACGAACATTGTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTAGGCGC:1 - chr3R 15573418 5' - gypsy4 284 1 69.31 AAATGGCAAATCAAAAAGCCATAAAAACCGACAAACGACCAAAAACAACACAAAAAGGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAG:1 + chrX 7550627 5' - Cr1a 220 1 62.79 CGGCAATTGTTAAAAATCCAATAAATAAAAATTCGTTCACTTTAGATCACGATCGGAAACACTCACTTAAAGATTTTGGCGTTCATACGGACAGACAGACA:1 + chr2L 21755381 5' - INE-1 124 1 53.47 AGTTTTACAGAAAATATAATATATAATAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATTATTTCTGGGTAAACACAAG:1 - chr3L 24131148 5' + HMS-Beagle2 45 2 69.31 CCAGAAGCAAAAGTTTTGTGCTGGCGATACAGAAAATATAAATTACATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAAT:1 - chrX 1105388 5' + Juan 4098 1 54.46 AGAAGAAGGATGCCAGTTGGATTGAGACAGTTGAAGCTGCCTATGGCAAATCGATTAACCTGATTGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACG:1 - chr3R 15543456 5' - Quasimodo 387 2 66.00 TAAGATTCAAAGCGTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGTAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 + chr2R 5178571 5' - mdg3 244 2 71.29 AAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCAT:1 - chrX 21667925 5' + gypsy2 6524 2 57.43 AACAATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAA:1 + chrX 21452473 5' + INE-1 533 1 73.27 CAACAGGCCAACCAACTCAAGTCGAATTCCGCCAGCGTGAGCAGCCAGTACAACACTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCACAA:1 + chrX 6535674 5' + Doc3-element 476 1 61.39 ACTCACGAGTAAATTGAAAAATGGAGCCCTTCTAAGTAGGCAGCAGTGGTACCAGTGCTTTGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3R 9297021 5' - hobo 2922 1 60.40 GAATTCAGTGGTTGGAGCTGCTTGTGTGCGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAG:1 - chr2R 14295640 5' - jockey 4604 1 71.29 AACGCAAAAGCGAAAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr2L 18214137 5' - hopper 1398 1 57.78 AGNCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 19450162 5' + roo 8695 2 72.28 TTCCCTGGCCCAAAACATCTTCATCTGGCTCACAGTTGACCTTGTGCCACTTGAAGTGGCCGGCTGGCGACCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAAT:1 + chr3R 16122297 5' + Chouto 5932 1 72.73 TGGAAATAGGTCAGCTGCCTGGCACGCACGTGTCCTTGGGGTTCAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACT:1 - chr3R 15380964 5' - Quasimodo 1 2 62.38 AGACTAGCCTTACCCAATAAAATGGGCAAAACCATAAAAAAAAAACAAGGCGTGAGTTGCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 13804376 5' + roo 18 2 57.43 GTAGAGCTGCAGAAATGAATAGTCAGATATATTAACCATCCAGAGTTTACTTAATTAACAAAAAAATCTATATAAAATAAAAAAAAAACATAAA:1 - chrX 6152130 5' + F-element 4685 1 86.17 CCCCAATTGTAAATTGATTTGTAAAATGAAATCAACGACCAATCAAGTTTGTTCAGTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAA:1 - chr3R 16340522 5' + Quasimodo 6994 2 63.37 CACTGAAACTTTAACAGTTTCACAGTCTATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTG:1 - chr2R 3526386 5' - F-element 222 1 65.00 GCTTTCTTCTTCTCGCCACCCGAGATTTCGATCTTAGCATCAATGCGGCCTGCATCTTGGTGTTGTTTTTTTTATATTATTATTATTATTATTATTTTTAT:1 - chr2L 13485139 5' - mdg1 29 15 71.29 TANCAAGTCATTGACAAACTGCCAGCCAAAGTCGAAGTTGTGGACACATTGAGGATTAAAGCCACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 9141544 5' - roo 396 1 63.37 TGNAATAAATTTTACGTTGTCCGTGTCTTGCCCCGTATCCCCCGGAGATCCAACCGTAGACCCCGTAGACCCCGTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAAC:1 - chr3R 11538552 5' - 412 7542 2 71.29 CAAATAAACGCAAGCGAGCCACATATAGATGCAATGCCATTAGACACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chrX 9983632 5' - pogo 2070 1 61.39 TGCAGCCAGTATTTGCTTTGCTTTCAGTATTCAGTTTCATAATTTCGATTTTTAGATTTTAACATTGCATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAAT:1 + chr3L 19341507 5' - TAHRE 10289 1 62.38 TTGCTGCATATTTTTAGGCGCCCACATTTACATTTACCAGCGCTTTGGCGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr3L 13988874 5' - hopper 1390 1 54.46 ACATGCTTCTTAAAGCGGCAACAACAACGAACTGGAAGGATCCAAATAGCACGCAAACAAACAGACAATCTAAATAGAATAATTATATATTTTATTGATAG:1 + chr2L 10809109 5' - transib1 1929 1 66.34 CTGGTGTGTTGGTGGTGAGGTGCGATCGTCACTAGTTTTTTGGGTCGTTGATATGTGTTTTTCTTCAATGTTTTTAATGTTTAATGTTTTATTTTAAATAA:1 - chrX 15520788 5' - P-element 2689 1 76.24 TATGAGTAAGCCCGAAAGTCAGATACTGCATACTACAGATGAGTTATCCTTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 27539244 5' - Burdock 233 2 57.43 AAATATAAATTTTTATATTTATTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGGGGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 + chr3R 26434677 5' - Tabor 7301 2 51.49 CTNGTCCTTGTTTTTGCGGCCGCCTTGTTTGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCC:1 + chr2L 16630745 5' - Bica 462 1 73.27 ACAGCGGAGTGAGAGAGAGGGCAGATAACTGAAAGTGAGAAGGAAGAAAAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3R 18700080 5' - blood 169 2 53.47 CCTAATGAAGAGTGTCAACAGCAAAGTGAGTAATTCGAATACATTCATAAGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTC:1 - chrX 7062902 5' - Ivk 4933 1 54.46 TTTGGGCCCAATGCAGGTTACACAAAAAAATTACAAAAATATTAT:1 + chr2R 10527966 5' + HB 325 1 91.11 AATGAACCTCAACGCATCTATATAGCTCTATACCTATAAATATGTAGAACCGAACAAAAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 11175836 5' - roo 401 1 66.67 GTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGCAGAAGGCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTG:1 + chrX 22651469 5' + INE-1 112 1 84.16 TTTTTCTGACACAATTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 29423508 5' - roo 9034 1 65.35 GAGTGCGAATATGCCATTGGTAGCAAGCCGAAGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGA:1 + chr3R 5776203 5' - accord2 120 2 68.32 TTATCAGGCAGTACTTGTCCGCGAGAGCACTGAGAGAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:1 - chr3R 28117810 5' - I-element 5319 1 63.37 CCGCTATGCGGGCCTCGCCAGGAAGTGGACAGTTAAGCAGCAGCTCAACTCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 - chr2R 13334890 5' + pogo 24 1 55.45 CTTCCCATTTCACGCTTTATGTGTCGAAACTTTGGCTGCTATTTATTTCTTTTCGCTGCTTTGTCTCAATGACACGTTTTATTTGTAAGTCTTTGTGTATA:1 - chr2L 174500 5' - Doc3-element 4443 1 57.43 CAGTGATAACAGTGATAACACGGCCCAATACCAAGGAAAAGGGCCGGACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGAGAGAACAGCGG:1 + chr3R 10596789 5' - diver2 108 2 55.45 TTCTCATTTATTTATATGCGCGTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAA:1 - chr2L 8828916 5' - accord 7229 2 78.22 TATGCCCCGAACTAAGACTTTTGTAGAGCTCTTAACCAAGTTCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr3R 20878210 5' + Doc 15 1 76.24 TCTTCCACTTCCGGCCTTTTCCAACACACACACACACATACACACTCCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAA:1 + chr3L 2828811 5' + accord 7156 2 73.27 GCCGCAAACCAGTTGATCTCTCAATATCGCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTA:1 - chr3R 13794854 5' + blood 7181 2 53.45 TTTTGAAAAGAAAAAAGAGTTTTTCAATGAAAATTATTACTGGTTGATTTACAATTTTTATAAAAGCAGACAGCATTTACGGTTTCCATATTTATCTGAAA:1 + chr3L 25304280 5' - Cr1a 423 1 50.50 TAAAATATATACTTGTACTTACTAACGAATAACACATGTAATTGGTCTATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr3L 4091562 5' - flea 4991 2 57.43 GTCTACTTCTCTGTGGTATCATTGTATCTCCCCCTCCATCATCTGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2R 13899207 5' - roo 9041 1 57.43 GGAAGACCGGCGGATGGGCCAGCAAGGTGGCCGCCATCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCC:1 - chr3L 2924599 5' + Doc 374 1 66.67 TTCGCGAGCCGACCCAAACGAATTTTATCAAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 22752011 5' - roo 400 1 71.00 ACNGGAAATAAAATGAAATGCAAATTATATTAACGATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr3R 25634900 5' + P-element 38 1 43.00 ACTCGCCACTTTGTGCCTTCTGTCTGCCAACTTGCTTATGTAGTTGTTGGCGGTCTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAA:1 + chrX 14295137 5' - Stalker 6918 4 70.30 TAATTTATTTATTGTTTAAAGTTTAAATTTTAACATTTTTTTCTCATTTAATTTCCCAATATATTGTATATCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 + chr2R 5212133 5' + INE-1 547 1 66.34 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTG:1 + chr2L 19479165 5' + micropia 130 4 57.43 ATTGAAATGACATCGAATGAAAATTCCCGTACGTGTCCCAAACAATATAAAAGCCAAGACCGAAAACCCAATCCCAATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCA:1 - chr3R 22219061 5' + G2 2902 1 81.19 GTTGGCACGATCGCTTGTCGTATCGCTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chrX 13640657 5' - P-element 2839 1 29.70 AAAAGTTCATTTTAAGGCCTTCCTTAGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGCTTGACTTCCCCAGGCTCTGTCTCCGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGCTGCTG:1 + chr3L 13149442 5' - G-element 411 1 73.27 GTATGGATTTTAAGCAGACCCGAAAAGAAAACAATTGTATACACAGAAACAACACCCATGAAGCCCCTGAGTACGGAGAGCCAGGAGACTTCGAGGAATAA:1 - chr3L 1630661 5' + Osvaldo 1506 2 79.21 AATTCTATACGTCGATTTTTTTCAAGTGATGATTTTCGCCATTTTTCCGCTTTTTCCTTTTTTTTT:1 + chrX 5167834 5' - Bica 343 1 65.15 AATGGCGCCTGGGTGCGGCACACAAAAATAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTT:1 - chr2L 307241 5' - I-element 145 1 72.28 ATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr2R 6947359 5' - 1360 3345 1 83.17 AGCAAAGTAAGGACAAGTCCTTGCTTAAGTGCGAGGAGTTTTTCTTCACTTTTTTTTTGTTGGCTTTTTTTTATTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 6199655 5' - Doc2-element 252 3 79.78 TCCTGGGCAGCGCCAGTGGTCCGCAGCAGCATCCGCCCGTTCAACGGGGTCTGCACTCGTACGGCCAGAAGCCAAAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAACAT:1 - 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chrX 6082653 5' - roo 392 2 60.40 AACGTTTCATGAATGGCGACAACCAATAAAATGGGGGCAAATAACCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 29423573 5' + roo 8694 2 58.42 TGNCTCCAATTTGAATTACGTTTTCGTATCGTATGTGCGTCCATACACTTATTTATGTACAAGTTAACACGAGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTG:1 - chr3R 7020555 5' + Gypsy6A_LTR 19 1 52.48 ATCCGAAGTCTTCAAAGTAATACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTA:3 - chr3L 23155738 5' + gypsy 28 2 50.50 TTTATAAACAAAACAGCACACAGCCAAACAAATCAAAAAGGACTAAACGAACGTATAATATAAATACAAAAAAAAAAAGGAAAA:1 + chrX 7608727 5' + Doc2-element 246 3 75.00 CGGCGAACTGCGGGCCGCTGTGGAGTATGTGTGGCTTCATCTGGACGATGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGG:1 - chrX 1174401 5' - BS 4791 1 52.48 GCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chrX 678830 5' + Tirant 8152 2 68.32 GAGGTGGTCCCTTGTACTTCCCAGACCGGCCACCCCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAAAGATGCGCTCA:1 - chr2R 19597059 5' + G2 61 1 81.19 AAGGGACTTTCAAGGATATCCCAAGAAAATAAATATAAAAACTGGATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr3L 5067899 5' + Quasimodo 6 2 65.31 CGCCTTGCCCCCAAAACGCCATCCGCACATCATCTAGATTCTAGAACTTTGACTATTTATAAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr2R 17077917 5' + Tirant 15 2 66.34 TTAAAAAAAAAATTAAAAAGCAAAGTTAAAAAACCAGCAAAGTTAAAATAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAATAAATTAAACTA:1 - chr3L 19634060 5' + HeT-A 4 1 76.24 AATGTAAAAAATTACCCACAGCGACGACAGAAACAATGGCAAACGATTTGATAAACAAAGATTGTCAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 - chr3L 13878145 5' - flea 250 2 76.00 AATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr3L 11257425 5' - 1360 3383 2 73.27 CCACCCTCTATTTTATAGAACCCTACATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1 - chr2R 16908781 5' + diver 5941 2 75.25 TAAGACTTTTGTAGAGCTCTTAACCAAGTTCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 - chr3R 20878198 5' + Doc 27 1 64.36 AAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTC:1 - chr3L 27415310 5' + transib2 17 1 60.82 CGTGGCTGCGTGATTGTTATTTTTCTACGTACATAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGT:1 - chr3R 23846883 5' - Bari1 1667 1 70.30 GCCAGGAAATGTGGAAATTCGCTGGAAAGGCACAGGGACCTGCTGTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr2R 23411950 5' - mdg1 392 2 57.43 TTTTATTTTGTTTTAAGTTTTTATTCAAAAAGCTTCAGTTCCAAATAATATGAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chr3R 15752015 5' + FB 22 1 57.00 ATTCAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGG:1 + chrY 2346866 5' - micropia 454 2 70.59 GANTGCAGATATTATATACCCCGTCCTTCGTCTAAACACTTACTTTAACATTAAAATTTATTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 + chr3L 11920022 5' + Tabor 6852 2 65.35 AATTAAAATTCAATATTAACGACTCACACCAGCAAAAAAAAGGGAAATATACAAATGAAATGAAAATAATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTA:1 + chr3L 1057976 5' - 1731 4288 1 65.35 TGCACCTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAA:1 - chr3L 5662679 5' + jockey 380 1 68.04 ATTAAATTTAAGCTACAAATTTAACAAGCGAAAGTGAGCAAGCATTAAAAAAAAATAATTGCAAAATTAAACCGAAAAAAAGAAAAAAATTATAAAAAAAA:1 + chrX 5254681 5' - Tc3 78 2 54.46 AAAAAAAAAAACTATTTCAACGACTATCCAAACACTTTTTAGTTAAAAAAAAAAAGAAGAAAACTT:1 - chrX 19905926 5' + HMS-Beagle2 490 1 75.76 GGGTATAGGGTACTTTCATATCATAAGCCAGTTTAAAATTGGCATTTCTTTAATCATATGTTTATATGAGTGTTTGCTATACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3R 23724192 5' + Doc 32 1 68.32 CCGAGGAGACGGCCTAGGGTTCTCGCAAAAGCGCCTGAATCGTCAAACTTCAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAA:1 - chr2R 4879835 5' - F-element 4568 1 56.00 CGNGGCAGATGCGTCAATTAAAAACCGCGCCGTAAAATTAATTTTAATCACATAATAACAAATACACACACACACGCACATACACACACACACACACACAT:1 + chrX 7659628 5' + accord 181 6 73.27 ACGCATCAGATGTAGCTATCGGATTAGTTTTATAACAGGATAATAAAAACTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 + chrY 3572594 5' + Doc 35 1 48.51 AAAGTTTTTAAGCGAAGCGAGCAACTAGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 - chrX 12756179 5' + HMS-Beagle 48 2 72.28 CTTTGCTGGAGGAGCTTTAACTCCCACATTATTGTATAATAACTATGAGAGTATTTGTATTTGGCTTAAATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 11764861 5' - roo 402 1 65.35 ATATGACTATGTTTGTGTGCACTCTCGCGTTTTGATAGCCCCATTTGCAACTTTTAGGATTCCCGGATTAGTCTTGGAACTTCCTTATTAAATAATAAATA:1 - chr3R 20928592 5' + Juan 4053 1 74.26 ATTGAAGACTATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 + chr2R 10552690 5' + INE-1 559 1 89.47 CCACAGGGCTCCGAGTTTCTCGAGGGCTACAGCATAAATGTGACCAAAACGTACAAGAAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGA:1 + chr3L 22242342 5' - R1A1-element 5028 1 65.35 GCCAGACACATTGATGGCTTGTTGGCCCTTGCTCACCTTCAGTCTTGCAAACCGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCT:1 - chr3R 31153247 5' + diver2 149 2 59.41 GACAATAAAGAATTATAATCATTCAAAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 - chr3R 7382660 5' + copia 51 2 78.22 TGCGCTGCCTTCTACATCTTTGAGAGTGAAAACAAGAGACGATAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGGCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCT:1 - chr3L 25625957 5' - 1360 3182 1 74.26 CAAAAAGCAGCGGTGACTTAAATACCTTGGCTACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGG:1 - chr2L 10711524 5' + I-element 224 1 68.32 AGTGTTTTGGGCGGTACCTTAAATGGGCAGTTGCGGTAACAATAATATCACCATAAGCACATTTTGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTGTGTTTTCTGACACTT:1 - chr2R 1278737 5' - Tc1 1591 1 73.27 TGGGCATGCCCAAAATCCGCATGTGACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCATGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGTAACTAA:1 - chr3R 19846401 5' + gypsy4 6632 2 73.27 GTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 11156235 5' + 297 6622 2 71.72 GCCAAATTTGCATTTAAAACTGTTGACGGCATTTTATTAAGTTGAAGAGTTTTCACGAATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTA:1 - chr2L 19278571 5' - 297 476 1 62.38 CTTTATAAAGTCAACGACTGTGAAAAGCGTGTACCATTTAATTGATATCTCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 5291685 5' - roo 9047 1 54.46 CAATGAAGAGTTTTTAATATAAACCAATCAGTAATATAAATTGAACGTGACAGGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATT:1 - chrX 14368518 5' - F-element 4446 1 61.39 GAGAAATACATTTTGTAATCGAATTCAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chrX 7583177 5' + I-element 6 1 73.27 ATTTTTGCGGTCTACGTTCGCGGGTTTGATTGTGTTTCTTTTTTCGAGAATTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTC:1 + chr3R 25434627 5' + rover 7135 2 57.43 AATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTT:2 - chr2L 23034061 5' - FB 410 1 42.57 TTTGCATACTTTTAGGGGCACTCAAAGTCGGCGGCTTTACAAATTGAAATATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 - chrX 10974219 5' + jockey 4696 1 51.49 GCTGAAATGTTTCTGTCACAACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 3547511 5' + roo 44 2 85.23 GCTTGGACATGTACTTGGCCACATCCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATG:1 - chr2R 12520081 5' - Doc3-element 4352 1 75.51 GCAATAAATTTGAAGTTTGGCACAGTTTGCCAACCAGCCACACACACATCAAAGGGGAAATTGCTCCCAAAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACTAAAAG:1 + chr2R 6535830 5' + TAHRE 266 1 49.00 TTTGAAACTCTGTAAGTTCCTGTCAAGGAATATGTTGCACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATAT:1 + chr3R 8380575 5' + 412 426 2 62.38 GGAATTATCAGCAGCTGTGGGCTTATGTAAGGCAAGGAAAAAAGGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATACGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTG:1 - chrX 4396349 5' - ZAM 8143 2 56.44 ATGGATCATCGTCATTATGAGGGGTATGATCATCATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGA:1 - chr3L 16974365 5' + F-element 4358 1 66.33 GCCAGCACTGGTAGGATAAGAGTGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCAT:1 + chr3R 24006916 5' - P-element 153 1 27.72 TTTCGATATTCCGTATACGTGCTATTTCAGTCTTTAGTTGGCCTACTCATAGAATTGACATCAAAACAAGAGAGAATTCCATAGTCGAGTTCCCCGACTAT:1 + chr4 510384 5' - INE-1 565 1 77.23 ATNGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGC:1 - chr3L 18476529 5' + accord 36 2 63.37 CCATGGAAACCGCGGACGGACAGCTGGCGACGCCAACAACACCTACAATGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3L 733884 5' + hobo 43 1 56.00 CCATCTTCGGTTACGCTAATTTGATGTTATATATTGTTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTG:1 - chr2R 6824954 5' - Rt1b 5066 1 65.35 AGGAGAGACCTAAAATTATCAAAGACCATATCGTAATTATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCT:1 - chr3L 27413305 5' - invader4 2754 1 62.38 AAAAGGGGGCATTGTAAAATTAAAAAAAAAATAGTAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGT:1 + chr4 1156853 5' + F-element 27 1 57.43 GATCGCTGTATACCCTTTCATAGGGCGTTATGATTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTT:1 - chr3L 19199423 5' - F-element 299 1 67.33 GGGGCCTTTGTTGCAATGCCACTCAGCGGGAAATCAGCACCAGGATTCGCATGGAGGTCGGTGGACCAGGAGTCAGTTGTGCCGTGCGCAAAAAGGGAAAT:1 - chrX 5590392 5' + gypsy8 304 1 63.37 CATTTCAGTGGATGCACTTTGTATAAACACCCAGATTTACTAACTTGATCGATACGACATATTATCTTATAGAGCTTAAATAAGCTGGGTTCGGAAAAATC:1 + chr2R 9682657 5' + FB 8 1 90.10 TGCCAATTAAGCCCAAAGTTTATACGATATGGAAAGCTGTCTAGCATAATTTTTGGTTTCGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chrX 6731876 5' + hobo 17 1 60.40 TGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGA:1 - chrX 22782060 5' + I-element 4901 1 68.32 GCCGAGAAATACATTTTGTAATCGAATTCAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 + chrX 7583174 5' + I-element 3 1 75.25 GCAGGCTCTCGACAAAGTTGAGCTGCGCTTATGATCTCTTTTGCTTGTTTATGCAAATGTACAGGAACATATATCGTATTTGGTGTGTTTTTTTTTCTTTT:1 + chrX 4402009 5' - gypsy7 5012 1 51.49 CATCTTGTTATTCTAGGGTATTTGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGGTCT:1 - chrX 14317416 5' + 1360 70 1 91.49 CACACATTTATCCTAACAAATGTATCACACTGTCTGGATCGCTAAAAATTCTCATGCACTGAACAAAGTTGAAAGCTTAAAAACAATTACCAAAACAAAAA:1 + chr2L 92571 5' + Porto1 188 1 53.47 GTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTA:1 - chr2L 23295872 5' + micropia 21 2 54.00 TTTGCTTGTGGTTTCCTCGGAATCGTTGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3R 5329388 5' + blood 7060 2 73.27 CGTGGAGAGAAGAGAAGAGTTGAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 - chr3L 12991066 5' - hobo 2885 1 80.20 GATGAGCCACCGGCGAACAGCTGCGCCGCTTGGTTTTTGAGTTGAAAGAGATTTCGGCAAATCTAACGGAATCGAAGGGCAACGGGACTTAGCTCTGTCGT:1 + chr3L 3649512 5' - diver 428 1 70.30 TGGGTGGTGGTGGGATGGATGTGTGGGATGTTTGGGCTACGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTG:1 - chrX 13543697 5' - F-element 4425 1 61.39 AACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACG:1 - chrX 21667916 5' + gypsy2 6533 2 66.34 TGGAGTGCGAACGGACGTGTGGTGCTAGTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTC:1 - chr2R 6715849 5' - Doc 473 1 72.28 ATAGTTTTATTTGTCTAAGGTTTGCCGGAGCGGCATTAAAATTTGCTCCCGCTTTCTACTTATCTACATCTCGCGTATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGAC:1 + chr3R 18962334 5' - 1360 3206 1 77.23 AGCGAGAGTGCCTGAAGGGTCTGCTGGTAAAGTAGTTAATTTCTATTTTGGAGTATTAGAAGATATTTTAACTTTGAAATTCTTTTTATCCTTTTTTCATT:1 + chr2R 8879243 5' + HB 155 1 78.22 GTTTAACTTGGCTCGCCTCGACTGAAATGTACTCAATTAATTGTAATTTATATAAACGCATATTTGTGTGTGCATTAAGCACACACACACACACACATAC:1 + chrX 6937435 5' + accord 7029 2 70.00 TAACAGGTTTTCCACATTGTCGTTGTAGTGCAGTTGCCAAAGAAACGGTATCTGTAGCTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 10522020 5' - roo 9052 2 54.55 TATTTTTTTTTTTATAGTTAGGAAAAAAAATATGCATCGTAGTGCATTCAAAACAATTTTGCCACGCATTTAATTTTTAATTTTAATTTT:1 - chr2R 11428400 5' - P-element 2641 2 52.22 ATNCGACCGTCTGTTATTTTTATTCCATATTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 30106858 5' - roo 9023 2 75.25 TACGGACCCGACATCGGTGACGATGACCTGGGAATCGACGATCCGGAGACCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACC:1 - chr3R 6011343 5' + I-element 5085 1 56.44 TAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr2R 4900363 5' + Doc 36 1 58.59 GACAAGACCACCATAACGGAGGCGCATCACATTTGGCCCACTCTGACCGACGAGGAAGTATGCATTGTTCCGCTGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGG:1 - chr2R 12155498 5' - Doc3-element 259 1 57.00 TAGGTTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2L 12322978 5' + hobo 32 1 56.44 GANAAAATCCAAATAGCCTGCGCCGAAAAAAACTAAACACGAAAACCGGCAAAGTACGCGTGAAAAATCTAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAA:1 - chr3L 7050794 5' + F-element 4401 1 75.25 CTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACG:1 - chrX 21667937 5' + gypsy2 6511 2 63.00 CGTGTTACTTGGCTCAATCATTTAATTGAATTACCACTTTTTTTCGTCCACCCGCTTGAGTTTTCGTTTTATTTCTTTTCTAATCAAATCGACGTGAAGTC:1 + chr3L 16282273 5' + Gypsy12A_LTR 267 1 56.44 AAAACCAAAAGAATACCTCGTTGTTATTGACTTCTTTTGATTGCTACAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 11156216 5' + 297 24 2 54.46 AGGATCGTGCGGAATGGTCAATGCCAAGACCACCAAATGACAGCGGCGCGGGATACACCCACCACGAATAGGCTTTCTGCAGCGCTGGCCGGACATGCATG:1 + chrX 19050589 5' + TAHRE 9981 1 72.28 CCTTTTACAATTAGGGATGCGACTCCTCGGACTCGGACTCGACTCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGAAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGA:1 - chr3L 11244496 5' + Idefix 276 2 57.43 ACTCCGGTGCCCATTTTGGGCAACGCCAATCGGATTGGCAAAAATCCGGCAGGTCAGTTCCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCT:1 - chr2L 9749891 5' - F-element 34 1 67.00 CATAGTTTTGAATCACCATCGGGTTCGGTTTGGCTGCGGCCACGGATGCTTGGCGCTCCTTGCGCCTTCTGACCGCTGGCTGCGGTCTCCACAAATGACGC:1 + chr2R 7330643 5' - aurora-element 357 1 70.30 ACGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr2R 2053923 5' + 1360 68 1 74.26 TTNTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 - chr3L 24208202 5' + Quasimodo 22 2 56.44 ATNCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGA:1 + chr2L 23299991 5' + invader4 354 1 69.07 ATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGTTTCCAGGCT:1 - chr2R 6947359 5' + 1360 68 1 71.29 TCAATTGTTTCCCATGTTACTGCCTGGGTTGCTTCCTTGGGCTATATATGTTTTTACACACTAATTTAGGGTCATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2R 2457429 5' - 1360 3386 2 58.42 CCNTATTAAAACCTCTTTATTATCCAAAAAAAAAAACTTAAAAAA:1 - chrX 10985349 5' + transib1 2138 2 73.33 TTNCTTAACATTCTCCACTTAGCTCAGCTATAAATTATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr2L 22045120 5' + jockey 4710 1 66.00 AATTATGTATATTTATATATGAATCGGCTCTTCGGAACGAATATGTTATGTAACAATTGCATTAAGTCGTTCCATATATTTTTCGGGGATGTTCTGGAGCT:1 - chr4 714594 5' - jockey 4629 1 65.35 TAATGGACCGATTGCATATCGAAACGAGGGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr2R 10468585 5' + P-element 44 1 35.64 GTGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chrX 4806749 5' + roo 8690 2 58.42 TTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGCGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2L 12284014 5' + 297 6618 2 61.39 TTGATAACAGCACGAAAACAAAAACACAGTAAACCGTAATCCGTAAAAATTGAAGAAGATGAGTTTATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr3R 445986 5' + pogo 5 1 74.26 AGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2L 13250367 5' + pogo 33 1 62.38 TCNTCGACTCGAAATGCCAAGAGTACGCCCAGTGAAAGTGCCTCTCCGGCGCGTAGCAATGCAAGCACAAGCAGCGTAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 - chr2R 12580544 5' + I-element 5141 1 77.23 AGCTATTCAAGGCAATATACAAGAAATTGAGATACAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3R 27900489 5' - roo 9052 2 59.41 GGNCCACCTTTGTTCTGCCATACATACATACATATCTGTACATATAGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACTATAT:1 + chrX 4452985 5' - Quasimodo 31 2 73.26 ATGGGCATTCGCTGAAAGGGCCCGAAAAAAGCAAAAGTCTTGAGTGCTGCAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAG:1 + chr3L 13183198 5' + I-element 439 1 53.47 CAACTATTTCGTATTTGGGCAGTGATTTGGCAGAAATAATTGCCTGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr3R 24430517 5' + Transpac 29 2 59.41 AAAAAGTAACTGTCAGAAATAGAGTACCTTGTTCACACCAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGACTCCCCGAGTTCCCCACTCGACTATAGCATTCTCTCT:1 - chrX 15946712 5' + INE-1 576 1 68.32 CTCCACTTTGTGGATAACTATATATACGGGCCTGGTAGTTTGCCTAGAATAATCCATAGTAAAGCCTTGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCC:1 + chr3R 31431261 5' - invader2 4847 1 70.30 CTACTGTCTCTTTGCGTCTCGCTTTTGAACTCAACTATCGGGCGATAAATCATTTGAAGTCTCCAACACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr2L 2685830 5' + hopper 6 2 71.29 CGTTTTTCACATCCTAGAAACGCTGGTTGGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGG:1 + chrX 19426774 5' - G2 56 1 76.24 GCATATATAACATTTATATTTGGGAATATGTATTTTAACAGTGTATCTCCCCATCCAAATAATTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTCGAG:1 - chrX 587240 5' - Ivk 5150 1 59.41 TAGGAATATAAAAACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTCGGCAGTAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACTGGAAATAATTGCA:1 - chr3R 6915198 5' + baggins 5301 1 52.00 TGATCAACTCGAGCCAAAAAGTCCACCTGGTTCAAGGGTGGATTTCGCCAAGCTCTCCCCATTCCAAACTGTGTCAATTTCTTTAGCTACCAGTACAGCA:1 - chrX 460524 5' + Doc3-element 478 1 55.00 TAACTTTTAGCACCTTCGCAGTTTCGCATTTCACCGATGCAAAGACAAACACACACACACTCGCACACACTGTTAGCTTATTCAAGACCAAGAATAAAGAC:1 + chr3R 19098276 5' + ZAM 8262 2 67.33 ATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCAATCTG:1 - chrX 158239 5' + INE-1 98 1 75.25 CACCCAGGCCATTAAAGCCGGGCTGATCTCTGTAGTAGCCATTGCCGCCGCCGTAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chrX 4558911 5' - 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invader2 5056 2 71.29 CGATGGAAAAAAAACAAAAAAAAAACGG:1 + chr2L 20045174 5' - hopper 141 1 92.86 GACCCAAACGAATTTTATCAAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 22752001 5' - roo 9052 2 62.38 ACNATTGAAACAATATTATTATTGAATAGCATCTATATTTATTTATAGTTAGTTTCTTAGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3L 17447973 5' + hobo 17 1 39.60 ACCAGCACACAGCAACACAATCATACAGTACCACACGTGCAGTCGAGTTTGTGCCTTAAGTCTTTCGTTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTG:1 - chrX 3019043 5' + copia 5002 2 82.18 CAAACTTCAACATTGCAGCCAAGAACGCCATATTCCTATATATGTACATATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGACGTAAGCCT:1 + chr3R 28443690 5' + Burdock 6158 2 61.39 AGNCCACCGGTCTGGCAGCACTAAACTGTCCCAAGACACAGACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCG:1 + chrY 2468610 5' + hobo 339 1 62.38 GATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr3R 779389 5' + F-element 51 1 70.21 CTTTTGGCCAAGAGCCTGCGCAAAGACCCATTAAAAGTGGCCAAAAGCGGCTTATAAACTAATCCACCACGCCCAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGT:1 - chrX 14611818 5' + HeT-A 5938 1 57.43 AGCCCACCGCCCAGCCAATGCGGCCAAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCT:1 - chr3R 7009428 5' + copia 4871 2 74.26 ATGCTATATAGTTAACCTAGTCGATCAGTCTGCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 10522087 5' + roo 8708 2 75.25 AAAAATGTATCTTCTGTTTGAAATCTATAAGGATTACCTTTATTTCGATCGGTAAGTAGAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr2L 4790927 5' + pogo 13 1 62.38 GAACGTTTTGTGTTGCCTACTTTTCGGCTGGGTAGTGTTAATGTTGAATTGTAGTTTGGGGGCGGGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 9064380 5' + jockey 12 1 66.67 TCCTTCGGGTTTCCCGTAAGATGAATGCGCTCTGCTTATCTGGTGGTCACTTTTCCTCTGTCTCGATTTATGTAGATTACGTTGGAGGGCTTAACTTCGCC:1 - chr2R 21948551 5' - gypsy 357 2 66.34 GTGGCAATCTTCGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chrX 6814335 5' - roo 9029 1 64.36 CCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCA:1 - chrX 21667947 5' + gypsy2 14 2 72.28 AGCTTTCAACTGAAAAGTTTCAAAAATTGTAATTTTCGTATCTTTTAGCGATCTTTTCTTTTTAGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGAA:1 + chrX 9745259 5' - Porto1 4419 1 73.27 ATTAGGGCTGCCGTTTAGCATTAAAATAACTTTATTTTAAGTTAAGTTAGGTAACTGTTGATTAGTCCATAGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 18754474 5' + roo 8668 2 75.25 GAAAGGCTTTCGAAAGAAACCTTTGTGATTTGGCCAGGTGAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2R 18649404 5' + opus 7036 4 59.41 TAACACCGGAGCTTAGGGAAATCCTCGAACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCAT:1 + chr2L 9436132 5' + 1360 182 1 72.28 TCNAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr2L 8297392 5' + Tirant 37 2 60.40 ATTTGCACCAGATCAGAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:2 - chrX 19109326 5' - roo 9043 1 51.49 TGTCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCA:1 - chr3L 19339442 5' + Tc1 12 1 69.00 AAGTATGCTAAGCATTTTGTCAAAACAATCGTTTTTATGTCATAAGATCAGATCATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 - chr3L 7868778 5' + jockey 4691 1 51.52 TAAACCACACGTGTAAACGCGCGCGGAGTCCTCCCCTCTCTTTTCGTGCCACCTCCTTCACCGTAACTTTGTTGTTTTTTTTTTGCT:1 + chr3R 24104712 5' - gypsy7 5015 1 60.92 TTCAATTTGTTTGCCCAACTTTTCTGCCGATCGTGCCGTTTCCCTTCTTTATTATGTGGTCATGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAA:1 + chr3R 9433164 5' - F-element 393 1 72.28 CAACTGACCTCAACAATGGCAATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 24739011 5' + pogo 33 1 58.42 AAATAGTGCTGTTTTCGATTTCTGTTATCGTTAATGGACCGATTGCATATCGAAACGAGGGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAA:1 + chr2R 10468554 5' + P-element 13 1 66.34 ATATAAACGAATAAGTTCGATTTTAATAAACTGCAATTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 20265931 5' + roo 18 2 45.54 CGNCCGGCAGACAAAACAAACGCATTATAACGAAATGTTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGG:1 - chr3L 11388294 5' + 1360 3174 1 68.32 ATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAG:1 + chr3R 7963095 5' - HeT-A 6048 1 77.32 AANGGTTTCATCAACAATTCAATGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTT:1 - chrX 20999775 5' + BS 40 1 57.43 GCNAAGTGTCTGGTATATCGTACGAAAATTGACTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 18177918 5' + 412 42 2 66.34 TTNGAGTATGATTTTGCTTTCCAAGACCCTTCTTATACGACTTTTTGGTTTCATTTATTTTCATTTTCCAAACACTTTTTTATAAAAAAAAAAACAAAAA:1 + chr3R 19457480 5' + HMS-Beagle2 480 1 87.00 TTGAAAGGGTTTCATCAACAATTCAATGGCAATTCAATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTG:1 - chrX 20999779 5' + BS 36 1 62.38 TATACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr2L 21951178 5' - opus 464 2 64.36 ATCGTTTTAGCTATTTTGATTATGCACAAGTTGAACGATATGAAAGTTGGTTTCATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 - chrX 8430949 5' - jockey 4958 1 61.39 CGAACAAGTGAGTACCCCTCCAATTTTATCCCCCCTCCATCGACGCCGTCGCCATCATCATCACCATCATCATCAACCATTAGTCCCGTTTTAATTGCCGC:1 + chrX 18199816 5' + Bari2 495 1 79.21 CTTTGCCCAACAGCACCCCTCCCTTTGATTGCCTACCCCCTAAAAAAAAGTCCAGTCCCTCCCAAAAAGTAAAGTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACA:1 - chr3L 17667308 5' + I-element 5184 1 75.25 TGGAGTCAAAACACGAGGGGGAAACTAAAGAGCTAGACAGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTA:1 + chr3L 11919684 5' - 17.6 7093 2 61.39 TANACATCCGTAACGCGATCAATACGACTGAATGGGCAAGGACGCTGCAGGTGTGGTCTACAGGCAGATCGCTCGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAA:1 - chr3R 3702796 5' - mdg1 257 2 55.45 CTTTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAA:1 - 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chr3R 6776586 5' - copia 5078 2 74.26 CACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:1 - chr3L 15104855 5' - hopper 1368 1 71.29 TACGTGTAAATGTCAAAGATATGCTGAGGGATGTGGACTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr2L 21323313 5' + hobo 35 1 58.42 CTTGTAGTTGCTTTTAACTATTTTATTTTTTTTTTGCTAGCTGTTGTTGCATTAAATTATCGTTATTTTTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATT:1 - chr2L 1927852 5' - invader2 486 1 75.53 ATNTTTATAGCTGGTGGATACCAGAAAAGGAAACTTTATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr2L 20153071 5' + opus 148 4 65.35 ACTGTGGACTCCATCGACCAGCGACCGCGCTGCGTCTATGTTTCTAGTTTCTGAGATTTCAACGTTCATTCGGACAGAAGGACAGACGGACATGGCAAGAT:1 - chr3L 7512136 5' - INE-1 115 1 74.26 TGTTATTAACAACGGGGAAGTATACAATACATGAGCCATTGAGAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 - chr4 1269608 5' + Transpac 35 2 56.44 AANAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 - chr3L 18337695 5' + Juan 4069 1 68.32 TGGATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCACATAGGA:1 - chr3L 5067857 5' + Quasimodo 49 2 74.26 CCATCTCGTTCTTCATACATCTGCAGTCCCATAATCTCTACTATTTGCATCGCAGACTTTGCTTTGGAATTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCAC:1 - chr3R 28967843 5' - F-element 80 1 70.30 TCNACAGGAACATATATTTAGAAAATAAGATAACACTCATTTGGCAAACGCTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTGGGGATT:1 - chr3R 20209758 5' + blood 456 1 65.93 GGNAGATGTCGTCTTAATGACTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 6442671 5' - roo 9038 1 58.42 CGGCGACCGGCTGCATTCGTTTCAAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr2L 8297413 5' + Tirant 16 2 61.39 TTGAGGTTATTGTGGCGTGATAACGGCAATTTTTGTACTTGCTCTTGTTTCTCCAGCATTCCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2R 13304421 5' + hobo 15 1 64.36 CGTTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chrX 10644803 5' - hobo 2920 1 61.00 AATGGCAGGCCCATAATTTTCTATGCCTTTGGCTAAACCCTTCATGGAATTAAGCGTATTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr3L 18938955 5' + blood 18 2 56.44 GCGGTGACTTGTTGTTGTTGTCGTTTTCGTTATTTCCTTGTCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTT:1 - chr2L 8089572 5' - I-element 5253 1 59.41 TGTTTAATTCACTTTGTATATTTGTATAACCTAAATTGTCAGGTTGATCTTTATGTTTATTCTTTTCTTTTATAAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTC:1 + chr3R 4658098 5' - Bica 100 1 73.27 ACCGAAAAAAGTGAAGGTAGTCCACCGACCGATGGCCCACCTGCCGGAACTTTAAACCCAAAAAAAATAAAACAAAATCAAAAAAAAGAAAAAGAAAA:1 - chr3R 15589420 5' + R2-element 3583 1 67.35 AGNACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790061 5' + flea 4747 1 71.72 TAAGCAAGCAGCAACACTTTAACGAAAGCATACACACCACATACATACATATATACCCCAATACCACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATTCCAG:1 - chr2R 16024856 5' + Idefix 93 2 59.41 CATAGTGGGTGACAAGACCACAAAGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTG:1 + chr2R 16942094 5' - flea 56 2 76.24 GANCTAGAGCGACGATTCGAGTTTTTATCAGGTTTTGTGGTCTGAGTGTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGT:1 - chr2R 7414883 5' - Doc 493 1 52.48 GANTCTGCCGATGAGTTGCGTTGAGTTGAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAA:1 + chr3R 30346797 5' - Juan 414 1 75.25 TTCCGCAGCCAACAGCCATGAAACAGAATCGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chrX 6731808 5' - hobo 2894 1 70.30 TGTTTAATTTGCCGCCTGTGGCACGTGACAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 30904262 5' + roo 46 2 72.28 CANATGCATATGCTTTTGATCGTATATGATTAGTTCATTAGCAATTTCAGCTTTTAACTGTCTCATATGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCA:1 + chrX 21493323 5' + BS 4702 1 57.43 GGGTGAGGGGGGTGAGGGGAACCATATTTTAGCGCATCGATGGCGAAATATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTC:1 - chrX 1000717 5' - F-element 4397 1 55.45 CCAATCAGCACTTCAGTCGCATCGTATCATCCCAGACTCTGACCGCAAAAGAAGAGTCCACACCCTTAGAACCTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCTAGAGAG:1 - chrX 20062620 5' - Cr1a 306 1 59.41 CGTACCCTGTTGAAAATCGAAGCAATTTCTTAGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCA:1 - chrX 13659069 5' + I-element 201 1 68.32 CCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:2 + chr3L 13652804 5' + hobo 51 1 72.28 CTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 23456281 5' + 1360 3 2 71.72 TTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr3L 22349246 5' + jockey 67 1 77.23 TGAGAAGGGTCGTGCCCCATATTCCTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTA:1 - chr2L 7285626 5' + roo 9046 1 75.25 TTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAA:1 + chrX 22398535 5' - Gypsy6A_LTR 155 1 58.42 TTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 20419100 5' - roo 360 2 75.25 GACCCCATTTCTACATGCTAAGAGCACTGCGAGAGAGGAAGAGAATGTGAGTTGCGAGCAAAGCGTTTAGGCTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chr3R 21206652 5' + P-element 3 2 76.24 TGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATAACCTTTTATTTATCAACTCGGCAGTTGATAAATAAAAGGTTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 - chrX 124082 5' + INE-1 17 1 59.41 CCNAACTTCCACATTCCTTCTCTCGATGGCTGTCACACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGTGTTGCAGACAGTGAACTCTGTCG:1 - chrX 2925999 5' + baggins 5186 1 64.36 TTTTTTTAAGTGTAAAAAAATGTCGATCTCACGAAGAGACCAAATAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAGTC:1 + chrX 22518988 5' - INE-1 549 1 70.30 TTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACAC:2 - chr3L 24208197 5' + Quasimodo 27 2 61.39 GAGTTTAAAGTTTTTCGAGTTTGTTTGAATTTTGTTGCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 27452330 5' + roo 22 2 58.82 GTATTGCCAATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTT:1 - chr3R 9192590 5' - invader3 251 2 53.47 ACCTTTTATTGATTGATTTCCTTGACTACTCATGGCGGACACACATAGAGGCCAAGACGACGCACCTCAGATACAACTCCTCTTATATAACTGCGTTTTGA:1 + chr2L 7837495 5' + Doc3-element 4291 1 66.34 GAGACATGTGGGAGAAAAAAAACATGATATAAAGGTCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3L 25079460 5' + 1360 3378 1 64.36 AATTTTCACTTAAGTCGAAAAGTAGGGAAACTAGCATTTAATAATGAGAAACTATTGGGTCATAAGGTATATGTGATCAGCTATGAAAAGATAATAACAAA:1 + chr3R 27379026 5' - HB 1406 1 90.10 GGNATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTT:1 + chr3R 23020818 5' - INE-1 575 1 53.00 TCAAATAATGATTCGTCTTTTCTCTGCTGACGCTGGTCCAATCTTCTATGAACCTCAAGTTCAGTTTGATTTTGTATTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTT:1 + chr3R 1227536 5' + springer 170 4 56.44 TACTTATTGCATAGACCACTGGCAATCTTGACGCCTGTTATGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGC:1 + chr3R 24774585 5' + hopper 1220 1 56.00 TTGTTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAAGATTTTAACTTTTTTTAACTTTTTAACTTGTCTTTGCTGGTGGAGGTACGGA:1 - chr3R 21622397 5' - HeT-A 6055 2 61.39 CTGGTTTTTATTTCCATCCTAGAAATCGGCCCCTCGGTCATAGAGCTTTCCCCATCGGTCTCACTTGTCGAACCGATTGCAATTTAATGTATTTATATTTG:1 - chr3L 20024252 5' - diver2 452 1 66.34 TTTATTTTATTAGCATAAAGTTAGTTTAAAATTGAGATATAGACTTTAAGAACTTACCACTTCCGCCAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGG:1 + chr2R 16762131 5' - Quasimodo 335 2 71.29 ATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:2 + chr2L 21951194 5' - opus 7451 2 77.23 ATCCCCGTACCCTTTATTATTATCAGTCTTATGGTTAATCTTTGTTTTGATTTATTTTGTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTATTTTAA:1 + chr2L 23389723 5' - HeT-A 307 1 54.46 TATTTCTGGATTGCCGCCTTTATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chr2L 21612961 5' - 297 349 2 77.23 ATTTCATGTGCATTATATTTGCAAATTTGCGTTGTTTATTTATGCGCGGCAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACATACTCCGTTAACCATTGTAGG:1 - chr2R 14692180 5' + Doc4-element 221 1 54.46 TGAGGACCACGATCCTTTCACCTGGATGCGGGTTACCCCTACAAATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2L 19602842 5' + hobo 31 1 52.48 CAAAGCATGTATGTGAAGATTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr3R 7009950 5' - copia 233 1 78.22 ATAACGAATCCACGGTAGATTAGATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTTAAGTA:1 + chr3L 25519856 5' - Quasimodo 7284 2 75.25 ATNAAAATATTGTACAAATGTGCGATCGTCACGAGTTCAATACGAATTAAAGAAGGGGTCTGATCTCTTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACT:1 + chr3R 19419722 5' - 17.6 350 2 66.34 GACCGGAAAATAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr2L 19644941 5' + blood 28 2 53.47 AATGTCAATGATATGGGAGTTTCAGTTTAAAGCTGCGATTGAGTTAATTTTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGT:1 + chrX 17729428 5' + hobo 464 1 54.46 CCAATCCCACACCATATAGATTGTGTTTACACGTCCATATCGTTACATTTATCTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3L 7781275 5' - 297 6957 2 62.38 TGAATAAATACATTTATATTCATTAAGTTGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTGGG:1 + chr3L 6506581 5' - I-element 4985 1 72.28 GGAGAGAATGGGTGTGGATCTCGGCATGCCTAGTGTGTTCATAAAATATTTGCTTAGCAGATTAGTAAAATGGACAATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTG:1 - chr3R 14935967 5' - F-element 4597 1 75.25 CCNAGTAATCCCACGGCGGGCAGAATGAACAGTCCAGAGAAGAGGTTGGAGAATTTTGTCGCCGGCGAAACACAGGTGGAATCGTGTTCGCGTATTGCCCT:1 - chr3L 14366976 5' - Gypsy12A_LTR 1968 1 65.35 AATTTGATTATGATTCTTTTTTTTTTCCTGCCCAGAAAGCATACATTTTTCATGGCACAAGGTCGTCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCA:1 - chr3R 26439307 5' - Doc 287 1 66.34 AGCAACTAAATTTAGACGCCACCGAGTGCAACCCCAACTCACAGTAATCCCAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAA:1 - chr3L 2853504 5' + Idefix 134 2 62.38 CANTTATCTGAGGAATGAATCGCTTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 + chrX 21636160 5' - Stalker2 392 2 62.38 GATCGGTATCCTATGCCCTGGCTTATGGCCCCGTCGGACCCGCTCTGCCTGCCATGAACTACAATAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATT:1 - chr2L 16006051 5' + R1A1-element 138 1 63.37 GCGACCTTGTTAGCAATTTGCCACTAGTTCAAGGTTCTTGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTC:1 - chr2L 2091410 5' + Doc 319 1 61.00 CCNGATATTGCTTTGGTTTTTGACAGTAACATGGACTGGTAACATTATCACATTGTGTGTTATGTTTACATTAGTTAATTTGAATTATTTTACAAGAAACA:1 - chr2L 16442101 5' - HeT-A 5802 1 80.20 GACCAGTTCTGCCTATTGCCACGCTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACCTTCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGG:1 + chr3L 23665701 5' - invader1 3706 2 78.22 AAATATATTTCTTCCTCAGAAGGTTATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chrX 20331788 5' - mdg1 414 2 66.34 ATATAGTTGATTAGCTTGTATAAATAATGGAAATATGTATATAAATGGAT:1 - chrX 5936991 5' + G3 4511 1 42.00 AAGGGTTAAATTATCTGACTAATTGGCTATTTATTAAGGAGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 13804453 5' - roo 394 1 54.43 TTTTTGGTAACAAGCTTGTAGGCGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr2L 1294802 5' + Doc 60 1 77.23 AATAGAGAAAGTGGAATAGTTTTGCCCAGTGGATCTCTCCCGACTTACTCTCTTTCTTTCTCACTCTCTGTCATACAC:1 - chrX 15023979 5' - invader5 198 2 80.77 CAAATTTCTAGTAAATAGCATGGCAAAGTCAGAAATGAATAAATTTTTCACTTTTTTTTCTT:1 - chrX 3064337 5' - HB 1497 1 87.10 TCCTAGACAGATAGTTTAGTCTCTGGCTTACAGAACACCCAAATGGAAATGAAACACGCGCTTTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGG:1 - chr3R 7473020 5' - jockey 4603 1 73.33 CCTTTGATATGGATTTTGTCGCCGTTAGAGAAGTCTTTTTATGACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTG:2 - chr3L 5020397 5' - Doc 59 1 57.43 GCNGCAAAAAGGAGAGCATATGCAATAAACACTCAATTCCACACACACACACACACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATCCGCGAGACGCGGC:1 - chrX 11370811 5' + invader3 182 2 59.00 TTGGTTATCGTTTTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGTCTACAGTATTGAAACTG:1 - chrX 23383971 5' + Circe 7315 1 81.82 GAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCAAATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCT:1 + chr3R 19450118 5' + F-element 377 1 56.16 TGNTTGAAATGATCTAATTTATTTATTTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chr2L 8649204 5' + F-element 37 1 50.50 AAATGCAAAACACTCAAATTTAGGACTTTAATGCACTGCATTGCCTATACAGTGCCAACTATAGTAAGCTGTAAATTGTTTTTTTTTTAATATATTTTTTT:1 - chr3R 29440978 5' - BS4 728 1 40.59 TGACAGTTTTGTATTCACAAATGATACATACTTCTATTCCTGATTCATAACTGAACTTCGTGTGGTCTACAGGTAGATCGCTCGTGACAGCCAAGTGCTGA:1 - chr2R 10487715 5' - mdg1 266 2 68.32 TGTGGGTTCATGCGTTGTCTTCTTGGTTGCTGGTTCTGCTGTTGTCTCATGGGTTGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGC:1 + chr2L 9902351 5' - F-element 213 1 58.42 TTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCAGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 + chr2L 20153021 5' - opus 7452 2 79.21 CAGAGCAACACGAGCTGAACCCAGCCGAAGTGTCTTTTTGGGCCTCGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr3L 17971226 5' - P-element 2855 1 47.52 GANTTGTGGGCCAGATTGCCGAGCTTTAGAGCTGAAGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 22920444 5' - 1360 3354 1 63.37 ATTCAGCTTTCCGTTGTATATTAACCCAAAAACCGAAATAGATGAAAATTTATTTGAATTGCACTTGCAGTTGTCGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAGAT:1 - chrX 7986622 5' - accord 181 2 75.00 TANTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGATCGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAG:1 - chr2R 5924415 5' - jockey 4734 1 35.64 TTTATCAATATTCTTTCTATTTTCTTTTACCCTCTTCAATTTCTCTTTATTTTGTATTTTTCTTGTCGCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCG:1 + chr3R 19741283 5' + blood 7179 2 66.34 CGNTGTCATAAAAACGACAGCAACGCAAAAGCGAAAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2L 18214158 5' + hopper 7 2 71.29 ATCCCTCTCCACCTTGATCTTGATCTTGTTTCCGTCTGTCTGTCCGTCCATATGAAGGTCGAATTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAG:1 - chrX 1194518 5' + INE-1 167 1 72.28 CAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 + chr3R 6290989 5' + Doc 52 1 76.24 TACGATATGGAAAGCTGTCTAGCATAATTTTTGGTTTCGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chrX 6731854 5' + hobo 39 1 65.35 GAAACCTTTGTGATTTGGCCAGGTGAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr2R 18649419 5' + opus 7164 4 74.26 AATAATGCGGAATAATGATGATTTTATCAAAGACACCAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTTTGACAAACGATTTTTTCGCCGTAGCTCTAG:1 - chr2R 949542 5' + 1360 53 1 73.27 AATGAACAGATAGAAAGGTTTCACTCTACCTTTTATACGATTTTTTTTTCGCACGGGTCCTACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCGCTGCC:1 + chr2R 2902056 5' - Cr1a 4411 1 68.32 TTGCAACCTTTTTTTGGAGCTCAGCAAGCCAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3L 13704637 5' + hobo 12 1 67.00 GTGCTTGGGCTGCCTTTGATGGCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTG:1 + chr3L 20586661 5' - gypsy4 440 1 78.22 GACACGCTTTCCATTAGAGTAATTTATGTGCAGTGTGGTTTTGATTTGCGTTACAGCCCGTTTTAGAGTTCTGGCTTAGAAAGGAAGGAAAAACATATAGG:1 - chr3L 15352532 5' + HB 407 1 76.24 GTGCTTTAGATGGAACTTTTTTTTATCACCTCATGCATAGAGTTGTTGTATCTGTCGACAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAAT:1 - chr2R 5473660 5' + gypsy2 6650 2 68.00 TGAAAACACCGAGCAATGACTTGTGGTATAGTAATTTTATATAATTTATAAGAACACAATTTCAAACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 8331310 5' - roo 400 1 69.31 TTTCATAACAAACAAAATAAAAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 + chr2R 24791014 5' - 1360 3369 1 58.59 TTAGAGGTCTTGTGGCACAACAGTTTTGTAAGCATTGGGGATTGCTGACCATGCACTTATGCAGTGTGCTACACTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCT:1 + chr3R 19958743 5' - gypsy11 4084 2 56.44 TTACGGATGGAAGCAACCGCAGTGTCAAATGCACATGAATAATTGAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTA:1 + chr3R 12753362 5' + Doc 4571 1 55.45 ATNATGGATGGTGAGAGTCCATTCATTCTGCACACGGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chrX 8337908 5' - hobo 2903 1 61.39 TANTGGGTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 27452386 5' - roo 9033 1 68.32 CCAACCAATTGGCGTATGCCACCAAATGTCAACCAGCTGACGTGTGTGTGTGTGTAGCTAGCTGTAAGTGTGTGAGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr3L 21884134 5' - hobo 2938 1 50.50 ACACACATGCAACTATTTGATGGCCAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAA:1 + chr3L 7061809 5' + I-element 277 1 75.25 TTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAAACTAAACAAATAGACAAACCTAT:1 - 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gypsy4 6579 2 63.89 TTTTCGTTTACGTAGGCGATAGTGACTCCACCTGTAGTTTATAACATTTATTTTTTTTTATCTCAAATAGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTA:1 + chr3R 20539570 5' + G-element 60 1 75.25 CACCAGGAAACAATCTCCTTAACTCTTTCGCTTGGGGCTGCGATTCGAGGGGGTTGGTGCGGGGGAGTGGCCCCACGAAGGGGGTCAGATCGGGAGAGCGT:1 - chr3L 11555807 5' - mariner2 568 1 60.40 TAATTTTCCATTTCCATCGGCAGTTTGTTTGCTTTCATTCCGTCGCTCGCCAAACTCCTCGACTTTCCCGATATCTATGTAAATATGTATATATATTGTTT:1 - chr2L 3753233 5' + G3 4512 1 55.45 GGTTCGTTTTTATTGTTTTCCTCTATTGTTTCGGGGATTTCCATTGTGTGCGTCCCTTACTTACTGTTTTTCCCTTCAGTTTTTTCCTGCTTTTTTTCAA:1 + chr2L 1411236 5' - Porto1 4432 1 74.00 CCTGATTTTAATTGAAACGACACACAGCGACATTTACAAACGCATACTGCGGCGTCTAACAAGCGCTGCATTATATAATTGGATGATAAGAACCTATGTAA:1 + chr3R 20218579 5' + rooA 7501 2 78.22 GGCTGAGCAAACTTTTGTTTACCTTCTTGGTAGCGAAATCAAATTTGAATCCGCTTTGGGGTTCCGCTTCCTCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAAC:1 - chrX 14713019 5' + I-element 5021 1 69.31 GAACAGTGAGCAAATACTGCAAGCCCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2L 6645668 5' - 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chr3R 8566770 5' - 412 7142 2 80.00 CTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATACAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr3R 22494173 5' + 297 36 2 62.38 TTTTTCTGATAGTTAAGGCGTGGCTGCGGGTTTGTTTTTTTTCTACGTACATAATATACAGAGGTGGTCAAAAGAATTTTAACAACGCACAATATTTGCAA:1 - chr3R 23846901 5' - Bari1 1685 1 49.50 GTNCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGG:1 + chr3L 24213784 5' - invader2 5069 2 61.39 CTTAGGTAAGGATTGTAGGGGTACTATATATACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 + chr3L 25598271 5' + 1360 48 1 75.25 AATGTTTGTCAACTACACGACAGTAAGCCAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3R 4805020 5' - 1360 3343 1 78.22 CAGAGGACTGTTGAGGCCAAAACAAAACCTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGC:1 - chr3R 31915857 5' - accord 130 2 71.29 ATATATATTTTTTTTTTTCGCACTGGTCCCCCGGCCACACCTGCCGCC:1 + chr2L 23244243 5' - Cr1a 4433 1 85.42 ATATATGCGAACAATTTAGCAATGTGTGTGAGTAATATAATCGTAATAGATATGTATATATATAGGAAACAAACAAAATCAAGTACAAACTGCTTCACAGG:1 + chr2L 9802085 5' - 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chr3R 19560968 5' - hobo 2929 1 67.68 AATTTTTCGCACGTTTCATTGCTGAAAACTCTCTTATTATCTATTTGTATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTTCATTAAGT:1 + chr2L 9448283 5' - Transpac 4873 1 52.48 TCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGC:1 - chr3L 27391397 5' + 1360 4 2 75.25 CTGGGCATGCCCAAGCCGTATGACATTAACCGGCAGTCATGGTTTTAGCAGTACGCCAAATGCCGACACCGCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAG:1 - chr3L 6730497 5' - BS 95 1 60.40 CCNGACGGGGTAAGCAAGGAGCCATCATCCAATCAGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTTCAACTTATAACTATTACATTGT:1 + chr3L 19974283 5' - invader2 4790 1 65.00 CGGTATACAAAAAACACTGTGGTATCTGATAGTCGTGGTACTGACTTAAGTTTGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGG:1 + chr2R 3398097 5' - I-element 4881 1 61.39 AAGGTCCTGATAGGCTGATTGAGTAGGAACATCCAAAAATTGTACTTGCCACAAACTAATTCTAACACAATGTAAATCCTAAATCGTAAAATCATGGCGAG:1 + chr3L 24120560 5' + TART-B 10305 1 58.42 TTAAAAGCTACAGTAGAGGACGTATGTAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGA:1 + chr3L 23155684 5' - 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gypsy11 4261 2 80.20 ATTGAATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 4727316 5' + Doc 44 1 35.64 CCGACGGCCAAACACGCGCTGGTAATTGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATCCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCT:1 - chr3R 6955789 5' + invader1 3712 2 73.27 CAAAATAGGGGAGCCGAAGTTAAAGTCACTACCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chrX 393027 5' + 1360 39 1 71.74 AGTGACAGTTTTCGAAAGAGTACGTTCGAAATATGGGAAATAAAATGGGCTAAGGGTGCGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:1 + chrX 6883237 5' - Burdock 6375 2 60.40 ATGTATTTCCCGTGTTATTTGTTTTAAAACTTAATGATCTTAAATTCAAATAAATTTTTATATTAAAATTACTTGATTTTATCCTTTTTTTATTTACTTTA:1 + chr3L 17278283 5' + HB 162 1 80.20 TGTTAGCTTTTAGTACCCTTTGCTTGGGGCGTTCAAAGCGATCGAAGCTTCATCTTCCGCTGCGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGG:1 + chr3L 6816526 5' - R2-element 302 1 62.38 AATTAAATAATTTCTTTTTATGGTGTATGAAGTGAGGAATTGAGGTCTGCAAAAGGCCCTATATCATATTAATGATAATGCTGTATCCCAGCTCCCAAGCC:1 + chr3L 21462189 5' - Rt1b 4742 1 78.22 GCACGTTACGTATACGCCCCCAAATGACATGTACATAAATTTAATGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTA:1 + chr3L 7295161 5' + G2 2955 1 56.44 CGACTAATTCATTTACACTGCAATAGTTCATTTATATATGAAAACCAAACACTGGCTCACCTGACACACACACACACACACACACACACACACTTACATAT:1 - chr2R 8299639 5' + Quasimodo 39 2 55.45 TCCATTGCTGTTCTATTCCCACATCACTCAAAAATATGCATACCCTTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATAT:1 - chr3L 16239889 5' - transib2 494 1 54.46 GCTCAAGAATAACATCAAACACCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2L 18223818 5' + roo 8718 2 86.14 CGAACTAAGACTTTTGTAGAGCTCTTAACCAAGTTCTCAGCATCTTTCTTCACATTGTCAGGAACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 - chr3R 20878203 5' + Doc 22 1 69.31 CAAAGGCGTCTTAGCACTCAATGTAATTGAGCAATAGCAATAAGCGCAAAAACAAGACGATTGTGCCCCCAGACAGAATAAGGGGATAGATCGGAAGAGCG:1 - chr2L 10945304 5' - mariner2 569 1 58.42 GACCCGGTGTACCTCTACACTGGTATTTGGTGGAAGATCTGCCAGACCACAATGTTACTCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAG:1 + chr2L 23331945 5' + Bica 4832 1 77.00 GTGTACAAAAAATACAGACAAATACAGCGTAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAA:1 + chrX 17164645 5' + 17.6 78 2 71.29 CTAATGACAATAACATACTCAAATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTA:1 + chr3L 26719135 5' + Tc1-2 11 1 49.50 GACGAAAAAATTAAAAAAAAAATCACAAGAACTGGAAAGTAGTTGACAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGAGAGAGTAAACAA:1 + chr3R 14462893 5' - Cr1a 213 1 54.46 AAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCC:1 - chr3R 6611261 5' + HMS-Beagle 6843 2 72.28 GATTGATTTATTACATGGCGACCGTGACAGGACAGGAGCCTGAGTTACCACCCCACCCCCCAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3R 991867 5' + Tirant 40 2 58.42 TCTTCCTATTAAACTCCATGGTCTACGACCATTAGTTTGGGCTCCTCCTCTTTGTTGGTTACCGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 19861721 5' + 1360 10 2 69.31 CTCTAAACTGAAACTTAGCTTGCATAGCGAATATATTATATTATATTACCCTCTAATTAATCGTAAATCTAAATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTT:1 - chr3R 11735295 5' + Juan 3765 1 52.48 TGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGC:1 + chr3L 18511087 5' + Ivk 63 1 82.18 TTGTCTTTTATATTTCAATCAATTCAAATAAATGCGCTAGTTTAAGTGAGTACTCACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr2L 14255606 5' + pogo 18 1 55.45 ATCAATTTACAACAAGCAAGCGTCAAATATTATCAACCACAAACAGCAAGTAATTAATAACGTAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAA:1 - chr3L 2872329 5' + HeT-A 5991 1 68.32 CTCCCTAAGTGCGATTTAACCCACTTCTTTTTGTAGTCTTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCAT:1 - chr3R 18616844 5' - 1360 22 1 45.54 GCAACACGGCAAACATCATAGAGCGAGCATTCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCATAGACAAGGGCTTGGAGCGCTTGGGACAGCTGGTCGTGTGTCGCGTC:1 - chr3R 18548664 5' - BS3 146 1 75.25 ATAATAAAAGGAATATTAGAATAGTAATAACTGTCTATCAGATTCCACGTAGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAG:1 + chr3L 12982493 5' - hobo 410 1 55.00 TGCAAAATAAATTGCCGGTGCCGGTCTTCAATTCCTGTGGGCCGTATTCACCGTCTGCTATGATGGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATC:1 - chr3R 2157200 5' + Rt1a 4703 1 58.42 GACCTCGACCATCGAAATCCATCAACAATTCGAGCGCATAAAAAGTGGTTATGACCCAGCGTTCGCATCCACCATCCGAGTAACAGGTATCTGATAG:1 - chrX 3235754 5' + INE-1 547 1 69.07 GCCAGTTGCAGCCAGAGTTTGCCAGCCGAGCGGCTTACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATG:1 + chr3R 29332089 5' - jockey 355 1 64.36 TTGGCATTAAGTAAAAAGTTAAACGATGTTGAAGCAGGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGT:1 - chr3L 13870008 5' + Doc 470 1 63.00 CCTGATTACGCGCGGCATTCACTCCTATTTCCCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGAT:1 + chr3R 25409709 5' + Idefix 6933 2 69.31 AGATCCCGCAGATTACGTGAAGTTTCTCCAGACATCTGCTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCACAAACTCTAACGGTTCTCTGCCG:1 - chrX 13444362 5' - invader1 87 2 73.27 AATGTTCAAAGCCAGCTGTCTTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 9076564 5' - mdg1 7429 2 52.48 AATGAAATTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCT:1 - chr3R 9192582 5' - invader3 5429 2 61.39 AGGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCC:1 + chr3R 19450109 5' + F-element 390 1 52.63 ACATCGACCTCAAAATTTCGAGTTTAGCCATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGG:1 + chr3R 5402307 5' - roo 8849 2 71.72 GTTTGTTTTGCAGGACGATGCTATTGTAGCGACTTGAATGGTGATTAATCTGTTCTCTAACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr3L 4554684 5' + 1360 19 1 77.23 CTTGAAAGCATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAAATTGGTTTGTAGAGAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGGCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 - chrX 21452828 5' - INE-1 561 1 49.45 ACGTGTCCCTGTATGGGTGAGTGGGCCAACAAGAAGCAGAACGAATGAGGAGTGTTTCGAGTGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGA:1 - chr2R 10172157 5' - HMS-Beagle 6610 1 65.35 ATTAAATTGTCCACTTTGGCAACCTGTGTGCCGGCACATATATATACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3L 1830844 5' + 297 21 2 60.40 AGACTGTGGTGTCTTTATAGAGCCAGCATCTACACAATATAAAGTGACCTTTTAAAGAGTTCATATCAAACAATAATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATC:1 - chr2R 17820819 5' + F-element 4392 1 74.26 ATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 9322864 5' - 412 7493 2 75.25 CGAGCACCTGGATACCAATTCTTCCACATGGCCTTTATAAATATTTAAGAAAAACCAAAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCG:1 - chr2R 13437988 5' + HMS-Beagle 456 1 66.67 CANTTCCGTAATTGTGGCCCACCTTTGTTCTGCCATACATACATACATATCTGTACATATAGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACTATA:1 + chrX 4452970 5' - Quasimodo 32 2 77.00 GCACAGTTCGAAAGTGTTCTGCGCATTACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2R 5202353 5' - roo 9025 2 68.32 AGNGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATCTAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGCA:1 - chrX 22576483 5' + Burdock 157 2 71.29 CCCGAACACTGGTCAATAAAGAGCAGGTAGCTAAACACCAACAAAGGTCGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACACCATACGATTTTTTGGC:1 - chr3R 29074559 5' + 1360 27 1 60.40 GGAGCGGCGTAAGAGTCTCATACAGTCGTTGTCCAGCTTCTTCCAAAAGGGATCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTT:1 - chr3R 10004878 5' - Doc 4279 1 58.42 AAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACT:1 - chr3R 9192569 5' - invader3 231 2 74.00 GTNTGCATATATTTCGTGGCGTACAGTGCGTATGATTGACATTAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCC:1 + chr2L 18224210 5' + roo 170 2 58.42 TGATATACTGATACAGACCGCGAGAGAGAGCCATGCCCAGGCCCAGGCCAAAGTTGCTCTCAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTTCTTGCTTGTGTG:1 + chr3R 16008205 5' - 1360 3259 1 48.51 GCAGCTATGCTAATTAAATCGATTTGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTCTTGGGTGCAGCCACCCGCAC:1 + chrX 15301996 5' - Stalker3T 251 1 73.27 CAAAGCCATGCGAACATTTCGCGACATTATCTGGCACGCATGTGTCAACTGCCGACGACTCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGAC:1 - chr3R 14945051 5' + I-element 4938 1 64.36 ATAAAAGCCAATGCACAAGTCAAAAGTATTTCACTTTTTAATAAGACATCAAAAACAACTCCAAACAGCACTGCGAATCACCCGCGAAACGAACGGATCTT:1 + chr2R 15376211 5' - Cr1a 122 1 57.43 ATNAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTC:1 - chr3R 9192566 5' - invader3 227 2 72.28 TCCATAAATTATGCACTATACAACACTGCATAGCACACACACGCACGCAAATATGTAGAGTGCGAAACGTGATACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTT:1 + chr3L 21026622 5' + accord2 7225 1 78.22 TCACATCCGAAGGGGTTTTCCTGGCCAGCATTTGTGAAAATCGAATTAGCACAGTCATTAGAACTCGGTGATTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATA:1 + chr2L 10690933 5' - Stalker 6947 4 78.22 TTTAATTTAAAAACTAAAATTTTGTGGAAATATTTGAAAAATTCCATAAATAAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 19952393 5' - roo 9048 2 58.00 TTNTCACCGTCACCCTCTCTATATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 + chr3R 19716852 5' - accord 183 2 92.00 GCGCCTTCTGCTATGCTAAACTTTTTACAAGGATTGCTCCCGAAGATGGTTGGCTTGGTTAACGCAACAATTTAACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 + chr2L 15013908 5' + jockey 4675 1 74.26 GATTCTGCTTTGCTAATCCGCCTCGTTCCCATGCCCGTGCTTATCAATATATATTTTTTGTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGT:1 + chr2R 13745987 5' - G6 2002 1 50.50 AACTCGAATTCTGGCAGCAAAATGGTGGTGACCTAGGAAAATGACCGAAAACATACGAATTGTGCATACATTCCAATTTAAACTAAAAAATTTTAAAACTT:1 + chrX 11579436 5' + 1360 3032 1 69.31 AAGAAGTGGATTTTCGTAGCTGGTGCAGCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCGG:1 + chr3R 24461808 5' + F-element 33 1 51.49 TGTACGCATTTCTCCTTCCTCTTCCTCCCCTCTTCTCTCCACTCTGCCAGACTTTTTCCTGTTTCTTTTTTTT:1 + chr2R 11372782 5' - Doc2-element 229 1 89.04 AAACGCAGTTTTCGCCTTCTGCCCAAGGTGGAATTACGGTTCTAAGGCCCCTTGTCCTTAGGCCTTAGATCCGACGTCCTGTCACGGTCGCAATGTAATAT:1 - chr2L 14308626 5' - Tabor 499 2 62.38 AAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr2L 12284028 5' + 297 6594 2 63.74 TCGCCGGCCGAGAAAGGTGAGCAATAGAGAGATGTACAGTGTCACCAAAGGCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACACTGGTTTTGCACTATGC:1 + chr3L 11217267 5' - 1360 3354 1 58.42 TCATCTTAAAAATTGTGCAAAAATATAATATCAACTGTATGTTGTTTGATAAGATATTAAATATGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATG:1 + chr3R 11990820 5' - I-element 4882 1 66.34 TTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTT:1 + chr3L 24213800 5' - invader2 5053 2 77.23 TGTAATTCACCAAATCAGCAACCATAAATGGAAGCTGGCCGAAACTGTTGGCGGTTTATTATTGTTATTATTGTTAT:1 + chr2L 12569812 5' - mdg1 7070 7 70.13 TTNAATGGAAAAGTACGAAGTTATCGTACTACAAAGTTGATTATTCAAACCACTTTATTCATTAGGCACCATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 + chr3L 20209529 5' + Burdock 6137 2 77.23 TTTCTTTCACACTGAACACAAACTTACGCCCACACTCGCACACCCACTCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGT:1 - chr3R 29334386 5' + copia 4832 1 59.41 CAATCGTCTTTGTTCGCGATTTGATGGACAACGCGCGTTTGAAAAGCTTCTTGCAACACTGACTAACCATTATGCCATTTCAACAAAAAAACAAAAACAAG:1 + chrX 11963180 5' + Porto1 164 1 54.46 CAGGTTCGCCCATACATGGAAAACCGGGCATGGGTTTGCAGCTGGCTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTTAAGTT:1 + chr2R 18702774 5' - Porto1 4486 1 56.00 CGCTCCGACGGATTTCATCGCGTTGTTGCAATTACCTGTCTGCGGACATCCTCGTCGACCAATTTGGATTTGAGTGAAGCGGTTCTTCACGGGGTGGCGGA:1 + chr3R 1681414 5' + aurora-element 4024 1 67.33 AAATGGCTTTAAATAATTATACTGTAGTATGTGCCTCTGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chrX 5521108 5' + 412 7073 2 68.25 AACGGGAATTGGCATCCGCCAGTAGTTGGAATGCCTGGCTTTAGTCGCCTGCCCCTTACATGTTGTATGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCC:1 + chrX 678746 5' - Tirant 8499 2 71.29 TTTATCGCGAATATAAAGCGGTCAGCTAGGTCACACCAATGTATGGTCATACCAGATGCAGTATGATGTAGCTAGGATATACCAGACGGGATGCAACCCTT:1 + chr2R 15301877 5' + gypsy12 117 2 81.19 GAGTAGCTCATCTCTCTTTGCTCGCAGGTGTTGCTTTTGTTGTAGCCGCCGCTCTCTCCCACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3R 24006977 5' + P-element 17 1 63.37 TGTCTAACTAAAACCATAAAAGACGGCATACGAGCACCTCTTTTAATTCGTAAATCAACTTATCCTGATGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTA:1 - chrX 8698886 5' - Tc1 1 1 69.31 TTAAGCGTCCCCCACATAAAACGAGGCTAATATGCGTATTTATGATACACACACACTCCACACTTTCACACAACAGCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 - chr2R 18926022 5' + Tirant 31 2 80.20 GATTTGACAAAAAATATACCCAAAAATATGTACTGCAATTAAATCACTAAAAAAAAGCTAAATCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 5959737 5' + roo 13 2 70.30 TTCTAGAACAGTGATTCTTATAAAACATGCTTAATTTTGGATTTAAAAGTACCACGATGCGATGAGTTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr3R 7382588 5' - copia 246 1 69.31 CTAAAGCGGACCACCTAAATAGTTGGTGACAAGAATGGTTAGTTCGAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2R 18434456 5' + 412 28 2 52.48 ACGCAACACTAACGAAAACACAAACTCAAGTAAAATGATTAAATTTCGAGTTCGCAATCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACT:1 - chrX 16838105 5' + INE-1 562 1 94.06 ACTTACACACACACACACACATATACCACATAGCAAGAGCCATACACCAAATCATAGAAT:1 - chr2L 12374990 5' + Quasimodo 74 2 93.33 GCTGGATGGAAGGGACGTGGGGTCGAGACGTTCATACGGACGGACTTCGCTATTAATCCTGATGAAGAATATGTATATGTCGCAGATCATTTAATTGTA:1 - chrX 13443650 5' + invader1 3610 2 73.74 ATAAGCAACATAGTACTTCCAAATAATAAAGAACACAAATAACGATCAGCATTTATGTAAACGACAACGCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAG:1 + chrX 11796506 5' - micropia 386 2 73.27 TGNATGTGCAACAAAAAGAAGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 4864133 5' + Doc2-element 220 2 90.32 GGNTAAGGATGCCCGACAGTTGCAGGAAGATGAGGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chrX 10644896 5' + hobo 17 1 61.39 ATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCACGAAGTGCGGACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAA:1 - chr2R 23934179 5' - 1360 427 1 70.30 GTGCAAAATTAAAATAAATTTGCACGCAATTTCCAATTGAAAATTGCCAATTAGTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTA:1 + chr3L 2798187 5' + rover 7072 2 67.33 GTCATAAAAAATATGTGGAGTTATTAATTTTGACCATGTTTAAGGCCTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACAATTCGGCAAT:1 + chr3L 24351134 5' - rooA 127 2 65.35 GTTATTATAAGAAGTTAAATATTTAGATTTTCCGTGACCAGAATTGGTGTTTAGAATTGGGTAAGCACTTCTGCTAATCGAGTAACGGGTATCTGATAGTT:1 + chrX 17816601 5' + INE-1 549 1 72.28 AGNACGATCGCAACTACAACGAAAACATGCCACTGGTGCAAGTGCTTACAATCAGATGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTACGTAATGT:1 + chrX 6878569 5' + Chouto 6203 1 58.42 AGTTTCTGGACATCTGCATCATGGGTGGGTTTCAGGCAGGTTTATGAATCATGAAGATAATACTGTGGAGGGAAGTATAGCAGCCTCACCATAGCGTTGAA:1 - chr2R 22653222 5' - BS3 332 1 74.26 TCGCTTGAAACCCTATGTTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCAGCCACTCGCAC:1 - chr3R 13225579 5' - hobo 2933 1 70.00 AGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:2 + chr3L 13345457 5' + Transpac 42 2 73.27 AGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3R 13225500 5' + hobo 34 1 58.42 TAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCC:1 + chr3L 23797688 5' + Helena 1148 1 45.54 CCCCAGCAAATAATCCTCCAGGATTCCAAAGCCGGTAACCAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCATTTAGTGATAGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 19714660 5' - Doc 4597 1 59.41 GAAAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2L 18214126 5' - hopper 1376 1 64.36 ACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATAT:1 + chr3R 19450000 5' - roo 20 2 71.29 AGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1 - chr2R 4181295 5' - accord 499 2 64.36 AAATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGTGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 6620556 5' - accord 7034 2 63.37 TATTTTTTATTCATTTTATTTTAAAAAAACATATAACCAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2L 14679195 5' + gypsy7 5004 2 55.36 GAATGAAAAGAATTTTAATTAGTTTTGGGAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCG:1 - chr3L 6013761 5' + Max-element 8233 1 81.19 TGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3R 22494178 5' + 297 6612 2 59.41 TTNGTGCATATCGAATGACAGAAATTGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 - chr3R 24430621 5' - Transpac 308 2 77.23 AANATGAAGTGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chr3R 6776548 5' + copia 48 2 76.24 CATGTGCAACAATTAGCGGTGTTTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chr2L 21323270 5' - hobo 2887 1 74.26 CTCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr2R 5311510 5' - 1360 3374 1 43.56 TGACTTTTTGAGCTTTATTTTGCACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr2R 8314139 5' + hobo 22 1 58.42 AANTATATACATACCTAGCGAAAGTTTACTCAGATCGTTGTAAATACTATTGGGATTCGTTCTTGATTTATCTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCG:1 - chr3L 10148683 5' - hobo 77 1 78.22 CGAAACGTTGTGCCATCCTGGAATTACCGAAAGATCCGCACCAATGTATACGCAGAGTCAGTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCAT:1 - chr3L 19594220 5' - R1A1-element 385 1 63.37 CCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGGC:1 - chr3L 24566085 5' - gypsy8 4862 2 76.24 ATNTCGACTAAAGTCATAAAAATAACTCAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 20266039 5' - roo 391 2 58.42 GGTTCGAGTCCCGGCTGAAGTCTAAGATCAGCAACCACTAACTTTTTTGAGCTTACTTACTTCATAATACACAGATTTAAAAATAATCTTCAAACAGATGT:1 + chr2L 9731436 5' + Q-element 284 2 74.26 AGTCGTTGTGGTAGTTGTAGTCGTGGTGGTGGTTGTGGTTGTGGTAGTCGTGATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGAAATTGACACAGTTTGGAATGGGG:1 + chr3R 25399105 5' - Doc3-element 456 1 52.04 CCGCGTGCATCTGGCCGGGATTCACTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTG:1 - chrX 10702765 5' - Quasimodo 6953 2 75.25 TGACAGGGAAAATTTCCATATACAAGCTGCTAAATGTTATTGGGGTTATAGTATGTGGGTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAG:1 + chrX 14040699 5' - roo 8619 1 59.41 TACGACCATTAGTTTGGGCTCCTCCTCTTTGTTGGTTACCGTTATGACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3L 19861698 5' - 1360 3363 1 57.45 CCATTTAACAATGGCGCAAATAAATAAAAAAGCAAGCTGGAAACGAAAGCGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAA:1 + chr3L 14393687 5' + Doc 4413 1 50.00 TTNTTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCAT:1 - chrX 21667909 5' + gypsy2 52 2 73.27 GANTAATTAATATTTAGCATTTTTACAAATTACTCCTGTGCAGGCTATATTTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2L 7393740 5' - opus 7482 2 59.41 CANAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 4806688 5' - roo 361 2 69.31 CTGCGGCTGAAATGTTTCTGTCACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chrX 3547506 5' + roo 8716 2 82.18 GGNGGAATAGCAGGGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCT:1 - chrX 19810575 5' + INE-1 572 1 53.47 AATGTAATATTGCAACCAATTTAAGTTAGTAAACCAAAAGGATTAGACAGTCAGATATCTGATATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr3R 19206079 5' - mdg1 7447 2 60.00 TAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAA:1 + chr2L 23299986 5' + invader4 352 1 65.00 AGNTATTCCGAATGTCTCCACATTTTCACATAAATATCCGTATGTAGTCTGTTGCATTCAAGACCCCATTACATAAATATGAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 + chr3L 7629532 5' - opus 499 1 74.26 GCCGAGGAATGAGTTAGACTTAATTAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCGCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACC:1 - chr4 862604 5' + Doc3-element 4561 1 75.25 GTCTTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr3L 9076581 5' - mdg1 375 2 69.00 TGNTATTGTTATAAAATAATATATTACTTCCGACTAAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAG:1 + chr2L 14094197 5' + Stalker4 6934 2 64.36 AAATATGTGTTATCAACATGGAGCGTATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1 + chr2L 6157196 5' + jockey 4720 1 73.27 ACCACCTATTCACGGATGATGACGTCGTCGGTCTTCGCGTTTCGCGTCGCTTTCGTTGTTCATCGTGCCTCACTTGGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:1 + chrX 4602184 5' + accord 46 2 81.19 TTATTTGGGGATTGTCACCCTGCACGGAGAATAATGCGATTATTTAGTTCATGAAGGGGCCTAGAATATATAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 8657057 5' + pogo 4 1 73.27 TCTGGCCATTCAATTGACCTTGAAAACCAACCCAGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 + chr3L 7154241 5' + FB 43 1 76.24 GTACAATTAACCAAATTGTAAATAAATTGATTATCAGTTTGTGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 + chr2R 6670026 5' + Tabor 6873 2 58.42 TTATAATCGCATTGCCCTTTCTACTCACTCAATTTACTTTATGCTGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTAT:1 - chr3L 1017311 5' - 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chr3R 20878165 5' + Doc 59 1 80.00 AGCAAAAGACGCCACTGAAATACCCTTTTCAGGTCATTAGCCAAACGATCAGTTGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 26592573 5' - roo 395 1 58.33 CCCATTCCATAAAGATTCAATAATCAATGATATGCCTCAGATCAAATAGGTAGACTTCGAGGCTCTTTTTTTTCGCACGGGTTCCACGGCCACACCTCCCG:1 + chrX 17942147 5' - Cr1a 4435 1 61.39 TTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 20419095 5' - roo 9019 2 80.20 CGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGG:1 + chr3L 25889015 5' + gypsy8 310 1 77.23 CANACACAAATTAGAGAAAAGCGAAATGTGTGTGTAAGATATAACGAATATTATTATTTTTATATTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGT:1 + chr2L 16689352 5' - S-element 1707 1 71.29 TAGTGCNAAAACAATAAGATACCATCAGGATATATTGATATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chrX 19030144 5' + Doc 44 1 74.00 ATATTTCATTTTCTTAATTATAATACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 + chr2L 9488159 5' - 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gypsy7 5350 2 63.37 CGGTGCAGGGAGCAACCGCTGTCACTGAATGCCGCCCGATATCCGGCTATTATGCCAGAGGTGAAGACGTCTTAGGAAGATTAGGATGGAGGGCGTGACTT:1 + chrX 4036745 5' - gypsy 7348 2 59.41 AATGCAAACGTAAAACTGAAAAATTTCCCCCTTTCTGATGTTTGACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2L 9410797 5' - roo 9039 1 58.42 ATACTAGATTCGTTGAGAAGTATGTAGCAGGCAGGAGGAAGCGGTTCCGACTATATAAAGTAAATATATTCTTGATCAGAATCCATAGCCGAGTCGATCT:1 + chr4 541017 5' + INE-1 97 1 84.00 CACCCATTTTTACATCCATGTTGCTTGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTTTGCAAAGCCTAAAAATAGCTATTTG:1 + chr2R 10567725 5' + G2 268 1 71.00 CTTTGGCCCGGGCATGGGTAGATTTGATTTCACTTTTTTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 5524742 5' + 412 7090 2 62.38 CCGACCGTCTGGACAATTAATCAAAAACACATTAACGATTTTCGAGTTGCTGGTACACCCTGAACTTGGGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGA:1 - chr3L 14853565 5' - Quasimodo 211 2 68.32 GAAGGGGTTGACAATCCACGGCACATCTGCTTTTCATTTCGAACTTTTATCTAACAACAAAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 + chr2L 10712100 5' + I-element 16 1 65.35 CCAAACGCATAAAATGCTTAACAAGCTCCTGCTGCCCGACCGCAGGACATACATACACTACTAGCGATGTACCCAACATATACCAGATAAGAATAAGATTG:1 - 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chr3L 27084878 5' - P-element 87 1 24.75 TAAATCTATTTGTCCAACAGACACTTCATCATCATCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTA:1 + chr3R 18782310 5' - 412 51 2 67.33 CGCGCGTTCTCACTCCCGATCTCCTTCCTTTAACGCTTCGACTCCTATCTTCTTCCATCTGTGCTTGCGCCGACGCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTT:1 - chr2R 2016659 5' - gypsy8 325 1 49.50 AAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 - chr3L 22751981 5' - roo 9032 1 73.27 TTTAATTTATGACTAATGATTGTATTTTGAGCAATGTAGATCGCCGAATAATGTGGTAAACTTCTAATAATAGTTGTGCTGTTTTTTTTTATGTTTAAATA:1 + chrX 18249179 5' - transib2 2636 1 68.32 AGTTCATTACGCATTTTCTGGTTTGGTTTCCTTTTTCGGGTATTTTTTTTTTTCCTTTTTTT:1 - chrX 3543013 5' - Doc2-element 236 6 79.03 TGCTCATTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chrX 10644799 5' - hobo 2923 1 58.42 TGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 + chr3R 779388 5' + F-element 57 1 71.29 TATTCATTAAAACGGTGATAACTGTTTCAACCAAACACGCTTTCATATGCAAATTTCTTTCATTTCACAGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 22046402 5' + roo 8671 2 72.28 AGTGCGCAAAATTCGGTGGAGATCGGTTGCCAAAACAGTTTTGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 + chr3L 2392371 5' - Transpac 5204 2 56.25 ATAACTGAGCGAGCTACTACTGATAGCAGGCCGCCATCTTGGAGCGGCCCGCCATTACCCACATCTAACGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGA:1 - chr2R 3111169 5' - Doc 363 1 74.26 AANATTTACTAAGCCCGGCGCGTGCTTTGCGCGGGGTGAGGGGAATAAGTTGCCCGAAGGGCAGGTATCGTAGCTACACCGCACTTCGATTAACGCTTTTT:1 + chr3R 29291813 5' - BS 149 1 77.23 GGNTCTACCAAAGGTAACATACACATATTTTTTGTCGAGGTGACGGCCCTGCTCTCTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGG:1 - chrX 13479992 5' - 1360 3196 1 76.00 CAATTTGGTTTACTTAAGCAATAAGGATGATTTGTACAACGTGGAGGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGAG:1 + chr2L 12707745 5' + 1360 98 1 72.28 ACGACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATG:1 - chr2R 3341944 5' - Copia1_DM 4132 1 61.39 GATTCCGATGAAAAAGAAATATACGCCTGAATACAAATACAAAGCAGGTGATCTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAA:1 - chrX 7615057 5' + flea 4543 1 76.24 TCGCGAACAGAGATTGTAGCTCTATTTTATGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTC:1 + chr3L 4173236 5' - F-element 234 1 71.29 GACATTATGCCCTGGAGCTGCCGCGAGTCCACCCACACTTTAGAAGGATTTGTAAATTTTTTCTTATTTCATTCCCCAATATCTATCGATATCCCATAAAA:1 + chr2R 20436322 5' + INE-1 499 1 69.31 TGGCTATGATTCACAATACAAAAGATGCAGCGGCGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGT:1 - chrX 10632867 5' - 412 401 2 66.34 CCCCTTTTTAAGCAATCAAATCTATCCGTTTGAATGAAGCTAAAACCACTGTAACCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:1 + chr2L 1089541 5' - hopper 1395 1 60.40 ACATTCGGATGGGGAAAGGCCACAGATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 8331237 5' + roo 8715 2 79.21 ACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGAC:1 + chr3L 24996088 5' - 1360 474 1 76.24 CGGGGGTAATTGGTAATAATTTAATCTAAAACGATAAAAACTAATAACAATGGCTGGGCAAACGTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGTCAA:1 - chrX 19398309 5' - FB 315 1 71.29 GCAGTGAGAAGTAGTTGAAAAAATATCTTTTGAGGGGGCAGGGTAGCGAGGGTAAGTCTGTCTGGACGGTCGCCGTATTTCCATGTTGTAATTGTTGTTGT:1 + chrX 17949733 5' + transib3 334 1 70.30 TGNTGCGCCTTGTTTAATTTGCCGCCTGTGGCACGTGACAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 30904272 5' + roo 8697 2 61.22 GAGGGAGGGGATCTGAAGATGGAGTATGTTAACTTGCCGAATGTAACTGTTGATACCGATAACACGCACGCACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCG:1 - chr2L 1516198 5' - G-element 151 1 70.30 AGATTTCACTTTGCCAAAATAAAGCCAATAACTTGGCAAGTCACAGTATCCTGCATCCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAAC:1 - chr2R 18055171 5' + Ivk 5060 1 59.41 CAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13704666 5' + hobo 42 1 68.32 ATNATTACTATTTATAGATGCTATTGGCTTACGTCTAAATAGAAATACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 - chr3L 13988954 5' + hopper 28 1 54.46 CGGGGTGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGTGAATCAAAAGAAACAACAATGAGTTGGCCTTTTGTTGCTGCGCGGTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGT:1 + chr3L 10111864 5' + F-element 4624 1 72.28 AGCATCTGGAATTAGTGTTTCATTGAGAAAGCAAACAGCAAATACATTCAGATTCCCAACCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCACGACTCCCA:1 - chr2L 8164861 5' + Quasimodo 317 2 58.42 CAATGGTATTCTTTTAAAATCATTTATTTTGGCATGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chr2L 21863325 5' + Burdock 10 2 67.33 GTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAG:1 + chrX 10119563 5' - FB 3 1 46.53 TGAAGTGGTTTTTCTTGTCGCTTGTGGTGCTCTGTTGCAGTTGTTGTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTATATATCGTGATTGTTGTGCTGGTAGCTAAAGAA:1 - chr2R 17462103 5' - Doc3-element 478 1 68.32 CATGCACGACTTGGGCGCACCACCCCCTTGAACCACCACCCACTCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGG:1 + chr3L 7860042 5' + F-element 4421 1 63.51 TCAATGTAGCTGGCCCAAAATCCGTAGCAGGTCGTCTGAACCGTCGCATTCCGGGAGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGAC:1 - chr2L 12050613 5' + micropia 347 2 65.66 CTATATACATGTCTCTGATAATCGCTCTTCAACTCTGGGTACTCCACAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCC:1 - chr3R 13030182 5' + Quasimodo 7006 2 53.47 ATGCAGGTGTAGCTCTATCTGGCCATCTAGCTATCTAACTACCCAGCTATATGTACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2R 18723026 5' + opus 7022 2 60.40 CGGTGGTGGTAGCGTAAATAACGGTATAACAAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACA:1 + chr3L 27364129 5' + accord 7026 2 62.65 TGAAAATTCCTAAGATCTTCCAAGAGCGAGAATAAAACTCATAATATTTGCATTTACCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCGTCAACTCCGACTAAGCGTCGTA:1 - chrX 5005055 5' + Gypsy6A_LTR 207 1 55.45 CCNGAAAAATAGGCAACACTTTTGTTTTTTTTTTAGCATAATATATTGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chrX 6509828 5' + jockey 36 1 53.47 TTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2L 12284006 5' + 297 44 2 71.00 CAGTGGCACTTGGCGGGTTTTCGGCTGAGAAACTGCAAGTACAGTGGAGCTAGGCTTGCCGACTTGTGGCGGCGC:1 + chrX 9759699 5' + gypsy 7155 2 77.33 GGATAAGCATAAAAAGCGGAAATTGTGTGCCGCCGCCATCGTCGACAACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTGTATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTG:1 + chr2L 14397087 5' - Tc1-2 465 1 55.45 GAGCTTGCGGTTTTTTTGGCCCGGACGCGGCACTCGATTTTTGTTTATCTTGTTCACAGAGATAAATAAGGTTTTTAACACATATACATATGTGTTAGTGT:1 + chr2L 2827688 5' - Porto1 110 1 63.37 GCCATCGATCAAAAATCCGTATGCAGGAGCAGCTGGGTCGGATTCCTATCTGCGGCTCATATTTTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCC:1 + chrX 4171067 5' - I-element 327 1 66.34 AAGAGGCAGCGACAACGACGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACT:1 + chr3R 1916757 5' + accord 7129 2 81.19 TAGGGCAATTGTGCGAAAATTGGGAAAAGTCACAGGAGACATGAGCGAGTTGCGAAAATGTCAAAAGGGGGTAGATCGGGAGAGCGTGCGGGCCATTCCAA:1 + chr3R 29271429 5' - mariner2 554 1 67.33 TTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCACTTTGTGGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAGTTTAAAGTAACTTTACTACATTAACATAACAATCAC:1 + chr3L 19457486 5' - X-element 4582 1 56.44 GAAAAGTAACGATGAAATAATAAAAAGGAATCAATTCAAATTTAAATATTTGAGCGCGCGTACCATCAGCTACAGACTCAATACGACACTCAGAATACTAT:1 - chr2R 6499298 5' + P-element 2805 1 42.57 TGATCCACCACCATCCACACGTGTAAGAGTACGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2R 21497494 5' + P-element 45 1 34.65 GAACCATTCCGCCAAATAAAGAATTTCAGGTGGGATTAAGTTTCTTATCATTCAATTTTTTATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCA:1 + chr3L 10757153 5' - Doc 248 1 61.39 GCTCGATCACGACTCTTTCTTCGTAGACCGGAAAATAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr2L 19644966 5' + blood 7014 2 72.28 GGAGGAAGAGTTGGAAACCCAAGACGCTACAGATTGCTTAGTGGAGGAAGTGGATGGCATGTTTATCTAAAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGAAAATTCAA:1 - chr3R 10160484 5' + Tc1-2 1249 1 53.47 AACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chrX 20331816 5' - mdg1 386 2 61.39 ATAGGGTACTTTCATATCATAAGCCAGTTTAAAATTGGCATTTCTTTAATCATATGTTTATATGAGTGTTTGCTATACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3R 23724188 5' + Doc 36 1 64.36 TCTTGGATCAACTGATAAAAGTAGTATTGCCTACTTTTTAGCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 - chrX 21636275 5' + Stalker2 7 2 68.32 CTTGCTTTAACTTTTCCGATTTGTAATTGAAATAATATCACTTTCATTATTAGTTATTAATTTCCAAAAGTTATTCGATTTCTTGTATATTTGATTTCTTG:1 + chrX 16519827 5' - S-element 154 2 67.33 CGTTACACATTTAAAAAATGTTTAGATTTTTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATT:1 - chrX 2624693 5' + 17.6 7418 2 70.30 TAAACTCTAAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTC:1 + chrX 21097035 5' - INE-1 157 1 72.28 TCAGAAGTAGTCTATCTCGACTACTAGATACCCAAGGAAGAATGCATACCCACTGTATGATTTGCGATCTGACAGGTCGTTTGCCCAGTCTGCGTCGGCGA:1 - chr2L 17953550 5' - Copia1_DM 3837 1 69.31 GGTTTATCGTTGTCCTTAGAACAACACATCGATGTACATGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTT:1 - chrX 5612059 5' - G-element 4120 1 62.00 CAAAGGAGCGTCGGACATCAGGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGAGGACGAG:1 + chr2R 13017183 5' - F-element 461 1 77.23 CATTAAAACGAATTGCTGCGAGTTTAAAGGCCTGCCCTGCAACGATGCTTTTTAATGATGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 + chr3L 963001 5' - jockey 4970 1 47.52 TACATCACCTCTGCAGGAAAAACAACAAAAATATGGGAGCCTTGTTTTTCATACACATACTGACCAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGG:1 + chr3R 11096917 5' + I-element 356 1 54.46 AGTGCTAGTTTTTGAGTACTAAAAGGTTGTTACAAGGTTGATTAGCCAATTCACGTTGTCTGGTAGTCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTG:1 + chr2L 4555101 5' - Doc 4509 1 69.31 TTGGCTTTTTGTGTGCCACTCGATTGCTCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:1 + chr3L 20669085 5' - Transpac 5187 2 67.33 GATGGGCGTGTTTCTGGGCCGCCAGGATTTATGTGCCATCATGTGGTGGTCAATGGCACAAAGCATACATCACATATATGTATTGCGAACGGCCTGCAGAA:1 - chr2R 9199996 5' + G6 1633 1 80.20 TANTTAAATTCACGCGGCAATAGGAAGGAAATCGGAAACCAGCACGGGCCAAGGAAAATACTTATGGCTTTACTATTAAACACATGGGTTTTTGCAAAAAT:1 + chr2R 21411361 5' + hobo 243 1 58.42 TTTATAAAAAAATCTACATAATTATTTATACAAGAATCAAAAAAATATGAAAACATTTTCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGC:1 + chr3L 25842941 5' - Quasimodo 364 2 61.39 AATCTATTTAATTTTGCTTCATTATATATATTATATAAAACACAATTCACGACAATTTAATTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 + chrX 13954726 5' - Juan 4197 1 52.48 CATATTTGTTAAATAAAACTTTTCTGTCTGATCGTCGAATAACGCATTCGGCAGACTCGGCTTACTTCCCTGCGCGATGAATGCCGGCGAGTATCCAGTGG:1 + chr3L 10802062 5' - Osvaldo 1076 1 76.24 TTGTGGTAGTCAATTAAATGTGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2L 20265978 5' + roo 8717 2 81.00 ATGCTANGCTTAAGTTTAGTTCATATTGAAGTTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGATACCATGGT:1 + chr2R 8435140 5' - Doc2-element 4461 1 68.32 TAGCGTGACTGATCTGATAAGATAATAAGCTCTATTTTCAACTTATTACATCCTTTTCAACGAATTTGGTAAACACTTTTACTATATATACATACATATAA:1 - chr3L 18416496 5' - 1731 4411 3 69.31 AATGAAGCGTTCCCATTTGGAGGTAATAAGTGTTTTTGGGCTTTTGTTTCTGACATGCCCATGATGAAGTGGTTCAACATTATTTAAAAAAATTAAAAAAA:1 + chr3L 17192337 5' + HB 319 1 69.31 TAGTTATGAAACCAGCACTTCCAATCGTTTTGAAACTAGAAAAACAGGACTTGGTTATATTGTGTCTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chrX 2172318 5' + I-element 11 1 68.32 CAAGTCGAGGTAAAATGGGCGTGAAAACGTAATTAAACACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAAA:1 + chr3L 22751924 5' + roo 36 2 64.36 GATTACCTTTATTTCGATCGGTAAGTAGAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2L 4790896 5' + pogo 44 1 73.27 CTAAGTCCTCTGCATTAATTACCAACCATAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 + chr2L 4152795 5' + FB 48 1 73.27 AGCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 9325607 5' - roo 9043 1 54.46 CAATTCTTATCGAGGCGCTGGATTCGGAAGGAAGGGTAAGCGAGTGCCAAATCACCCGGTCAATAACATAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCACGGTCTT:1 - chr3R 758701 5' + Doc3-element 368 1 59.41 TTACACCCAGAGCGCACAGATTCAGATTCGCAATCTGATTCAGAACCGTATGTATATGTATATGTATATGTATATGCATATGCATATGTATATGTATATGT:1 - chr3R 27870573 5' + Stalker 7093 4 71.29 CTACAAATAGTCTAGATTTACACATTTTCCGTGTCGCATTAACAACAATTTATAGCTCAATTTCATATTCATGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTT:1 - chr3L 18663868 5' + F-element 4212 1 75.25 TGTGTGTGTGTGTTTGTCAGTGTGTGGGTGGGCCACACATTAATGCGTTCGAGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr3R 8482029 5' + hobo 20 1 60.40 AAATTGAAAAATGGAGCCCTTCTAAGTAGGCAGCAGTGGTACCAGTGCTTTGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr3R 9297031 5' - 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roo 9051 2 56.44 TTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:3 - chr3R 15021689 5' + invader4 2748 1 45.54 TGCTGCTGGCTAGGAATTCTTGGAGAGTGCGGAGAGTGTGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAG:1 - chr2L 199000 5' - F-element 390 1 59.41 ATATGAATTTAATATATTTCGATTCAAAATATGTTCAATTAGGCGTACCAATGCGATAAAAACAAATAGTCTTCTTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAA:1 + chr3L 4553740 5' + G2 2801 1 71.29 TTGTTAATTAGTAAATTTAATGCGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 29357093 5' - 412 440 2 78.22 GCATTTATGCATTAATTTTGACTGATACTCGAATGATGGATGGTGAGAGTCCATTCATTCTGCACACGGTAGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 8337876 5' - hobo 2935 1 75.25 AGNCTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTTGCC:1 + chr2R 5582184 5' + Cr1a 456 1 50.51 GGNCACAAGTCGAGCATAAAGCCAAATAGCCTACACTTTTGAACATTTTTTTCTCATTTTATTTCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAAT:1 - chrX 14990904 5' + INE-1 509 1 66.34 ACGGAATGCAACAAGCAGTGGCGATGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr3L 11789988 5' + P-element 53 1 24.75 AGTAAAAACCTGGGTCAAATTGCGGTTACCGTTTTTATTTTCCGCCGTTACCGGTCTTTCGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACATGTTTC:1 - chr3R 28063681 5' + Doc 20 1 61.39 CATCAGCTATGCATGGCGTGTTTGTTCTTACAAGGGTCCTTTACGACTGTCGGGCATTTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGG:1 - chr2L 14484907 5' - F-element 325 1 71.43 CCTTACTTACTTTGCAATCATAAATATTTAATCATGAAAAGAGTTGGAATGTTTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chrX 10453457 5' - hobo 2918 1 56.00 AAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAAC:1 + chr3L 27182018 5' + F-element 281 1 79.21 AANCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 9325606 5' - roo 9044 1 53.47 GAGTATCACAGCTTCGGCAGTTATCGTTTCCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chrX 4022301 5' + roo 8709 2 72.28 AGATTGTTCACCCAACAAAATGATACATAAAAGGCCCACTGTACCATGTTTAAGGTAGAAGTACGAATATTGTCATTTCGGTCTTACTTTTAAGCTAGCAT:1 + chr3L 27361519 5' + invader3 105 2 79.21 TCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAG:1 + chrX 10119567 5' - FB 3 1 47.42 AAAAGATGAACGATTACACTTTCAAAACATGTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTAAGGACTCACC:1 - chr3R 26255175 5' + opus 7023 2 61.73 TANGGGGCGGATTTTCTTGACTATTGAATTGAAAAGTTTATTTACTTTACTTTGTCTACCCAACTGGCCATCCCACTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGT:1 - chrX 14527269 5' + Doc 457 1 77.23 GTAGGTACAATAATTCCTAATTAGGTATTCCACTTTCAACTTTCGTTTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAA:1 + chr2R 10904877 5' + Doc 201 1 54.46 CTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr3L 1259211 5' + Doc 53 1 71.29 GTTTCTCCACAAAAGAAGTGGATTTTCGTAGCTGGTGCAGCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 + chr3R 24461796 5' + F-element 21 1 63.37 AAGTGGCCTGAGTAAATTCGACTTTATTTCCATTCATGAAAGTATCGATTTAAGCTTATGTAAATTCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTG:1 + chr3L 11891294 5' - Tabor 7320 2 75.00 CTNAACTGACCTCAACAATGGCAATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chr3R 24739009 5' + pogo 31 1 56.44 TTAAACACACTGGTTTAAAGTTAATTAAATAAACGAATTTGCTATTACATAAGTCATTTCATTTTAAATATGAACATACCAAAAAATAAACACAAACCAAA:1 - chr2L 6832768 5' + transib4 2538 1 45.54 TCATTTGGGATTACATTGTGTTCTGTACAATTTGACACCTGTTGAAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 18816186 5' + roo 8695 2 57.43 CCCAGAACGAAAGGGAGAACAGTGACACAGCTGGTGGCCACCAGTCTCAACAGCAAGTCATGCAATTAAAGCTCCACCTCGTCGTCTGG:1 - chrX 19297758 5' + G6 1613 1 70.79 AGACAACAAATTTAGTATACGCCTCGTTAAAATTGTTCTGTGGGGTTCAAAAGTGATAGCCTAGTTTGTAAATGATACTTTTTAATTTAATTTTAATTTAA:1 - chrX 6077965 5' + Rt1b 126 1 74.26 GCTCGCATCGCCACAGAAAGCACTGTGCGAAAATTTGCGCACCACTCCTACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTGCTTCCAAATACGGAAAACTAAGTT:1 - chr3R 7668121 5' - R1A1-element 40 1 68.32 TGCATATCGAATGACAGAAATTGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 - chr3R 24430617 5' - Transpac 306 2 75.76 CTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAAGAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1 + chr3R 6611199 5' - HMS-Beagle 223 2 55.56 AANGAAAATAACTTGAATTTTTAGCGAGTACAAACTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAG:1 + chr2R 9213650 5' - Burdock 216 2 65.35 GCNATTGTTCCTGAATTAGAGATTCCAGGACAGAATGCGCCTGTGGAAATTGTTTCGCAGACAATAACGAGAATAGTGAAGAGGAAGAAGGGCGTCCTGAT:1 + chr2R 7641320 5' + invader1 3999 2 59.41 GCTCAGAGCTCATCTTACTTCTCTGTATCGCGCTTAGAACTTACATACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTT:1 + chrX 5384805 5' + 17.6 160 2 54.46 AATTCACATTAAGCTGAAAGAAAAGCAACAACTGGTCAGGGAAAATTGAAGAGAGAGCTTGAGAGATACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTAATTTCGTGCAG:1 - chr2L 3950796 5' - Doc3-element 408 1 56.44 GAAAGTATCTTGGTTTATCTATAAAAATGTATTTCTTTAAGTTGCAATAATTTTTTTTTTGGTTTTTCCTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chrX 9484328 5' - Doc2-element 232 1 51.16 TAGAAACAGAAGGAGTCTGTCACTTTTTCCATTCTTTTTTTTTT:1 + chr3L 9952508 5' - Doc2-element 229 1 86.36 ATCTTGTCATATAATTTTTCTTAGGTATATTAATTAAGTACACCATCAACCAATCGATAAAAGAAGCTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 - chr3R 4600519 5' - Tabor 7314 2 69.31 AACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCA:1 - chrX 23108322 5' + BS3 1421 1 52.08 ATTTAAAAATAATAATTTTATGATTTATAATACAATTGCGTCAAATGTAAAGAAATTATTCTTTAAAGCTGTCAAAAAACATGAAAATGATTTGGCATAAT:1 + chr3L 4481665 5' - Transib5 2697 1 85.15 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 - chr2L 4034960 5' - HeT-A 6061 2 80.20 GAGTGCGTAAGCGAGATGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAA:1 + chrX 9443816 5' + Doc 4583 1 78.75 TGAGGCGATATGATAAATGTGCGCAAATAGATATATGTTCGAACGCACGCATACGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAG:1 + chr2R 24614526 5' - Quasimodo 7350 2 63.00 AATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAAT:1 + chr3R 4160058 5' - invader2 240 2 69.31 AAATTTCCATCGAATCGCCAATTAAATCACACTAGCTGATTGACGTTCGAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTGATATGGACTTTAGACTTTAGGGTTTTGAT:1 - chr2R 2789671 5' - Idefix 7209 2 63.37 TTAAGCTTAACTCCAAAAAGGATCTCATCCCGCCCCCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 + chr3L 9064308 5' - jockey 4949 1 62.38 ATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTAGACCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTA:1 - chr3R 9485830 5' + mdg1 7336 2 72.28 GGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 + chr3L 447321 5' + Tabor 6863 2 63.29 AAATTGATAGAAATGAAAACATATTAAGTTTAAGTCAATCACAAGTCAATCGTCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr3R 778478 5' + F-element 50 1 57.43 AGNCGACTCTTAAGTCGTCCGTTTTAAACTATTTTGTTCCTTGAAAAAAAATAAATTTTTAAAAAAAAA:1 + chr3R 24677821 5' - hopper 162 1 62.32 AAACAATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2R 3824681 5' + 297 30 2 62.00 AATCGTTAGCCATTTGATATATCCTTTCTATTGCTATTTACCTATTAAGCCTTAAAACATGGAGGACAGTAGTATAACTGTTGAAATTACGTTATAATTTA:1 - chrX 20858808 5' + Copia1_DM 2 1 77.23 GGTCTCATTCTTCTGCGAAGCAATCCATCCCAAAGCATCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 + chr2R 19149405 5' - diver 184 2 63.37 GTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCA:1 - chr2L 21403539 5' + G5 4411 1 58.33 TTTAAAAATGTTAACCCCTATTAAATTAATTTAATACTTTATCGATTCGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGG:1 - chr2R 11269194 5' - G6 1821 1 53.47 GCTGAAAGTTTAAAAATCTGAGCAAGCCTCAAATTTGTATACTCGTTACTCGTAGAGGAAGAGGGTATACTACAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 - chr2L 20026413 5' + INE-1 17 1 82.18 ATTAGTTTTGGGAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 - 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chr3R 8513550 5' - gypsy 7367 2 57.43 ATCGCCGGCCGAGAAAGGTGAGCATTCATTTCAGGACTATTAAGAAGGTAACACCAAAGACCCTTGAATAACAAGA:1 + chr3L 11217266 5' + 1360 1 2 47.37 CAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 19446164 5' + 297 6624 2 74.26 ATTCCACCCTACCCAAAGGAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACACAACAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGGGATCAAGCCCTTAACCAACAATTAT:1 - chr2R 22563449 5' + I-element 167 1 79.21 CTTGCCCCGTATCCCCCGGAGATCCAACCGTAGACCCCGTAGACCCCGTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr3R 11538526 5' - 412 468 2 48.96 GGCAAATTTGCGAATTGCTTGGTATTGGGAAATTGTCACGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGT:1 - chr3L 25443449 5' - Doc3-element 4505 1 62.38 TTNTAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGAAGGATG:1 + chr2L 23286585 5' + Tirant 416 1 58.00 GCCAATGCACATTTAATGCACATATTTGGCTTTTTGTGTGCCACTCGATTGCTCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 20669060 5' - Transpac 5215 2 64.29 TTCCTTGCTTTAATGTATTGTTTTAATTTTAATTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 - chr3L 12572657 5' - Juan 4166 1 76.24 CATTGCTGATACTTTTATTGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGTATCGCTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACC:1 + chrX 13640635 5' + P-element 26 1 49.50 CTACGCGGATGTGGGTTAACCAGGTGGCGTGGGCTAGTGGTCTTTTTTTTCAGCAAACTTGAAAAATCCAGGATATCCGGCTCGAAGGACCAAAATG:1 + chr3R 20579494 5' - GATE 271 1 45.36 ACATATAATCGCCTTTAAAATTAATATAATAAATAATAGTTTCTTGGCACTTGATTTTTAGATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chrX 14040800 5' + roo 8674 2 69.00 GCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2L 12322996 5' + hobo 50 1 74.26 AATGGCAAATAGGAATGGTTAACAATGCTTCAAACAAAAGTGTTGAATGTATTTGAGTTTTATCAATTTTACATACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACG:1 - chr3L 7333480 5' + Juan 7 1 75.25 AANCAAGGTCAGCATAAAGCATTGTTGCCAGAGGGGGAGGTAGGGCACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3R 4805757 5' + 1360 29 1 55.45 CAAACAGATGGAAAACGTTGATGCGTCACGTTGTTGCAATCATTAGGAATAGGGACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTAGTGGCCACGATCGGTGACTATA:1 + chr3R 27843710 5' - Chouto 391 1 63.37 TAATAAGAAAGTTCAGCAGCTGCCTGCTGGTAATAAGCAAATTGAGCTGCTAGGTGCATGCTCGGCACTCTCACGCTCCGCTATCGGCTTATGTTTAAGCG:1 - chr3R 27718391 5' - Stalker3T 137 1 59.41 TGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:2 - chr3L 1259222 5' + Doc 42 1 60.40 ATTTCGCAATAGTCCGTAATGCAAAAAGCGGCAGTAGCAACAACTGTAAAATCAAAAAAAAAAATAACAACTATTTTACTGGCGCAGTGGGTAG:1 - chr3L 7818999 5' + 297 407 1 68.09 TGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTAAAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATATAATTACTAAGTACAATATCT:1 + chr3L 20224148 5' - Chimpo 157 1 54.46 GAAAGGGGCTCGCAGGACGAAAGGCCGCTGTGTGGTATATGTCGGCGAGACCGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCAATTTTGTGCGTCAGCG:1 + chrX 17025739 5' - invader4 285 2 66.34 AGNGGACACTTGTAAAGAGAGCGAGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCACGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 13640724 5' - P-element 2874 1 62.63 ACCATCAGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCTTCTTTTTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr3L 13345451 5' + Transpac 34 2 62.63 AAGGCAATATACAAGAAATTGAGATACAATATTTGCATTATTTTTTTTGTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 27900481 5' - roo 9044 1 58.42 TAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chr2L 19644931 5' + blood 38 2 63.37 ATTTTTTTTTCTTTTGAAACGATCACTTGGGTAAGTCCGACGCATCCTATTTGGAGTGTCGCGCTGTGCCGCAAGAAATGCTGAGTCGGCTTGCCGCTCAT:1 + chr3R 1707510 5' + gtwin 7082 2 68.32 AAGAGCTAAGCTTTGCTGAAGAACGTAGGGTTATCTTAAGAGATCTAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGC:1 - chrX 22576484 5' + Burdock 156 2 73.27 TATATATTCCGTGTTGTTTCGTATGAAAATTTATTGGCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCCCTCCTTCACTACTCCGACACAACATGGACTGGCAAGCC:1 + chrX 8988083 5' + G-element 315 1 42.57 TATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 4806724 5' + roo 8715 2 81.19 AATTCATATACATATGTATAATTCCTAATCTTAGTGTATCAAATATGGTATAAAACTCGTCGTTTGATAATATTAAGGTTTTTTTTTTATTTTTTAAATTT:1 - chr2R 11134889 5' - TART-C 11097 1 73.27 CGGGCTAATTCAGGAAGTTTATACCAAACTACGCATAGCTAGACCTTTAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAG:1 - chr2R 1338244 5' + 1360 3162 1 55.45 TGNATGCTGCGCACATTCGATGGGCTTTGTTTATGCTGGCGATGCGTTTTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTA:1 + chrX 10340989 5' + diver2 4755 2 61.39 ATATTTTTTAATGTGCACTTTATCATCATCATGTCAGGCTAAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAG:1 + chrX 20813030 5' + I-element 497 1 59.41 AANAAAAAAGACACCGAAAAGAAAGAGTAAAGTAATAAGTAATAAGTCTTTTGGTCTTTACAGTCTAATTATAATAACCTGATCCATCAGACAAAATATTG:1 - chrX 8507299 5' + transib2 2510 1 73.27 AAGAAGTTGAGGTCCCGTGTCCCAAAAAGCGATCTATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTG:1 - chrX 12813770 5' + BS 7 1 62.24 CCGAATTAAATGTTATTGAATACTCGCTGGGCGTACTGGTTATTACAAATAGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGGAACACAT:1 + chrX 11436599 5' + hopper2 1320 1 56.12 ATNGGGCCCAGGGCCCCCAGCCGCTTTTTCTACCATGGCTATTAACAAGTGGCGCTCGAAGGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAA:1 + chr3R 12930606 5' + jockey 4617 1 64.36 ATGGATTTGACAAAAAATATACCCAAAAATATGTACTGCAATTAAATCACTAAAAAAAAGCTAAATCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 5959740 5' + roo 8671 2 75.51 CTCATAATGAATCAAAACATTATATTCTTAGATTAAACTGAAGAGGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTA:1 - chr2R 4272313 5' + F-element 4381 1 56.44 CATCATGATTGTTGGTTTTTTTTCTGATAGTTAAGGCGTGGCTGCGTGATTGTTATTTTTCTACGTACATAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCAC:1 - chr3R 23846925 5' - Bari1 1703 1 72.28 GTGAGTTGGTGTGCGTGCCTATGTGTGTATGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACA:1 - chrX 11257454 5' - gypsy4 318 2 71.29 GAATAATGCCCCTGGCTGATGATTTGCCCCTTTCCTCTTGCACGAAAACTTATTCTAATATGGAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCC:1 + chr2L 2020903 5' + Doc3-element 4578 1 61.62 GCAAGACGAAAGGGAAGCACCGAGGCCGACAAAAAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTTTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGA:1 - chrX 4354175 5' - diver2 201 2 77.00 TGACATCAACTCGGCCACAACAACAACAACAACAACTGCAGCAGCAACTGCAACGATAGTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3L 11900105 5' + roo 8680 2 42.00 CANCTGCTCTCCACAATATTTAAAGCTTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 11808907 5' + roo 50 2 78.22 GAGGAAGTTTAAGGCTAAGACTTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:1 + chr2R 544792 5' + HMS-Beagle 6821 2 54.46 ACCAATCAAAATACATTGCCAGAATAGAGTTCACACGTGTTTGCCTTCTTTAGCAGTTTAAAAACACAGTTTGCTTCCTCCAATTTTGTATACTAGCTCCT:1 - chr2R 1771012 5' + Gypsy12A_LTR 2076 1 76.24 CATTGTATCTGATTATCGAGTCCATGAATTTGCAGTATATATTTTTGTTGACTCATTTCTGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAAT:1 + chr3R 12554862 5' + mdg1 18 2 62.38 TTATTTGCTGATTTTTTTATAACCTTTTTGGGGACCATTCGAAATGAGTTTCGTAGTTGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGG:1 - chr3R 8925136 5' - Stalker 414 1 60.00 AATTCTACAGCGTCCGAGGCATGTCGAGCGTACTTCATTTCGTATTTTATGATATTTTTCCCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAA:1 - chr2L 14480268 5' - invader2 241 2 69.31 TGTGTGTGGGAGCTGCACTAGTGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTT:1 - chr3R 20984225 5' + hopper 56 1 74.26 AAGTTGAGGTCCCGTGTCCCAAAAAGCGATCTATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 - chrX 12813767 5' + BS 4 1 65.22 TGAGAACCAAGCGATAGCTTGTAGGGTAAACAAAATACCAATTGGATTGCAAATCCAAAACCCCCCGCTGTATGGCCGTGAAGCATTGCTTTGCGAGGAGG:1 + chr2L 23017047 5' - Rt1c 5320 1 75.25 AGCGGGAGGAGGCGGGGGATCGTGATCCACCACCATCCACACGTGTAAGAGTACGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chr2R 21497472 5' + P-element 17 1 60.00 AAAAAGGTAAACATGACAAACATTTGTGGGTGATAAAAAGCGAACGATAAGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGA:1 + chr3R 9127362 5' + invader3 5197 2 60.49 CGGCGGCCAGCTGCAAAGTGCCGGCAACACTTCCCAGAGCAACGGAACCACCAATAAGCTTACAAATAAAGACTTATCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCT:1 - chrX 274202 5' - Cr1a 4012 1 54.46 ACTCATCATTTAGTTGTTCTCTAAAATAATGTTATAATATAATAAACTTGCAAAAATGTCACGTACTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr3R 26255087 5' - opus 492 2 73.27 GTGGAGCGCGAGCGGACGTAATTGCGGGGGGACGCCGTGTTGTTGCCGTTTCTTGTGGCTGCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTG:1 + chr2R 13933965 5' - accord 72 2 66.34 CCTGTCAACAGAGTGTAGAGAGGTCGCGAAATAATGGGCAATCAAAGAAAAACCATCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAGCCA:1 - chr2R 1343814 5' + I-element 5058 1 59.41 CCCCCCTACCCCCTTCCCCCACCTTTTTTCCCCCGTTTCCCCCCTTTTCCCCGTGCTTTCCGCTTTTCCGTTATTTCTTTTTTCTTTTT:1 + chr3L 8007235 5' - invader2 499 1 62.92 CAATGCGTCAGCTACGTCATATGCTGTCCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACT:1 + chr3R 2380336 5' - micropia 5387 2 76.24 AAACCAGCCATGCCAGTCAGAACTTCGACTTGTTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3R 12115337 5' - 1360 3347 1 67.33 AGAAGTACAAATGCATATGCTTTTGATCGTATATGATTAGTTCATTAGCAATTTCAGCTTTTAACTGTCTCATATGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTA:1 + chrX 21493316 5' + BS 4694 1 66.00 TCNGGGGAATCCTAAAGAGGCCAGTCTCTACAATTTAGGCGCTCTAATTAGATCACGAGAGCTGGAGAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGAC:1 + chr2L 956140 5' - accord2 7563 2 72.28 TCAGTGGACGGTACAGATGGTCCCAGGCCGAGCGTTGCCCCGCCCGTGGACGATACACCATGCTCCATAACACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCT:1 - chr3R 3379927 5' - gypsy8 4654 2 72.28 TGCCTTGAGCTTTTTCTCATTATTGTTACTATTAACTATCAGTCGACAGTGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTT:1 - chr3L 14703019 5' + Doc 276 1 58.42 ATTAAAATAACTTTATTTTAAGTTAAGTTAGGTAACTGTTGATTAGTCCATAGCTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 18754455 5' + roo 8687 2 56.44 GTNCCCAAAATGGAGCGATCCAATAGCTTAACGTAGGTAAATAACAAAAAAGAACAAGGAATAAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTT:1 - chr3L 20191860 5' - diver2 105 2 70.30 CTNGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 - chr2R 2949108 5' + 17.6 6963 2 64.36 GCNATGAAAGAAGGGGTTGACAATCCACGGCACATCTGCTTTTCATTTCGAACTTTTATCTAACAACAAAGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr2L 10712091 5' + I-element 7 1 73.27 TANGCCAAAGTATGGAGAATTTCGAATACCAAATATCCGAGAATAATAATTGTTTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCCTTGATTGTGGTTGCTGCG:1 + chr3L 6013650 5' - Max-element 8512 2 52.48 CATAAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCC:1 - chr3L 3924264 5' + G6 54 1 73.27 TGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACCACA:1 - chrX 21667935 5' + gypsy2 26 2 60.40 TGAGGGAATATCGGAGGAATAGCAGGGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 - chrX 19810587 5' + INE-1 542 1 80.72 CGNCACTTGTCCACGAATCTTTATGGATTCCGCCGCAGGAATGGGGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTC:1 - chr3R 16918440 5' - I-element 247 1 67.33 AAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACAACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chrX 9579318 5' + Tirant 8138 2 59.41 TCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 9325625 5' - roo 9025 2 72.28 CTGGCCCATATTTATACCTAGATTTTGTATTTTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGT:1 + chr2R 23699783 5' - I-element 4922 1 63.00 CAAAGCGTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGGAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATGC:1 + chr2R 5178578 5' - mdg3 238 2 63.00 CTGATCAAGACAAACTACAACGATGTAAAGTCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAA:1 - chr2L 3124430 5' + F-element 4383 1 70.30 AGTTTTATCAATTTTACATACGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATT:1 - chr3L 7333425 5' + Juan 42 1 60.40 TCTGTAGCTTGAAGAATACCGTTAATTTGTTCCAGAATTTAAACAAAATATATGTTTAGACAAACTATAAATATGTTATATTTATGGGCAGCAATAAACAT:1 + chr2R 5018794 5' + rooA 7288 2 54.46 AGTGCTCCGCACACACAAACACATATACTTACACGCACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATA:1 + chr3R 9325169 5' + Quasimodo 87 2 79.00 TATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGGAGCAACTTTTTTGGTG:1 - chr3L 22400319 5' - 1360 3338 1 77.08 GTCTAAATACTTTGTGAGTGGCTGGTTGGGCGTTCCGGTGCAGGCGGCTTTGGCTGCATA:1 + chr3L 8757562 5' - Doc3-element 4559 1 61.67 CCGATCCGTATGATTACCTTCTTATAGGAAGCTGCAATCAGAACAGCCAGAAATGACTTAACGACCTGAACTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTA:1 - chr3L 8378790 5' - invader2 4796 1 73.00 CAATGTTGCTGTCCATGTCCACTTACCTGGCAGTTTTGCGTAGTTTGTGGGCTTTAGAGTGGGCATAGCAACATGCTAAATCTCAACCTTCTATCTTTTAT:1 + chr2R 18582504 5' - INE-1 163 1 73.27 GCATATTTAAAGCCCGATATCAATCTTTCGCCGGCATGATACAAACACAAAAAACAATAAAAAA:1 + chr3R 16117042 5' + Bari2 917 1 57.81 TGNTTGACCAGCACTTGTGCTTCATATGCCTTTGTTGGTCGAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 14780048 5' + R2-element 3584 3 71.67 AANATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 9439835 5' - roo 9045 1 59.57 TGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:1 - chr3R 2689427 5' - diver2 4475 1 64.29 ACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCA:1 - chrX 21667919 5' + gypsy2 6530 2 63.37 AAAAGACAAAATTATTCATGATGTTTTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2L 20152995 5' - opus 475 2 56.44 GAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 4900357 5' + Doc 44 1 65.35 ATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGTTGATGCCAACATGTTTACAAAAATT:1 + chr2R 20670580 5' - 1731 4280 1 79.21 AACCAATTTTTACCTTAGTTTTGGCAATCTGTCTCCTTCTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTT:1 + chr3R 3120375 5' - HeT-A 6017 1 71.29 TGGTAAGTCTTAAAAATAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTA:1 + chr3L 1973468 5' - flea 4957 2 85.15 ATACGTACCCATACTTACATATACTCGAATATATGTATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 - chr2L 16954896 5' + Quasimodo 30 2 69.70 GACGACGATGAGCACGAGAATGAACGCGAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chrX 18356203 5' - P-element 2844 1 36.63 AATAACAAGATGCGTAACGGCCATACACTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAA:1 - chrX 20783463 5' - accord 372 2 53.00 CCAGCCGGCAAACTCACTTCAATCATATATAGAAATCTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATAAATTACA:1 + chr2L 470219 5' - Burdock 220 2 65.35 CAACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGG:3 + chr2L 23286581 5' + Tirant 413 1 56.44 GAGCAAATGAAAAACAAGAAAACTAAACGATCTAGAACTCATGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr2R 8951009 5' - P-element 2852 1 42.57 TGAGGCAATTTAAGTGCTTAAGCACATTACAAGCGGAGAAGCGACGGGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGG:1 - chrX 5713661 5' - accord 7009 2 59.74 TTTTTGTACATTAATGTCATCATTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 22137013 5' + roo 8715 2 82.18 GCATGCAACGATATAATTTGAAAATTAAGAAAACGTGCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGA:1 + chr2R 9788910 5' - blood 7381 2 66.34 TGCCATTAGCTTGGGCGTAAAGTTTACCAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCA:1 + chr3L 11901160 5' + Cr1a 223 1 76.24 AATATCCGTATGTAGTCTGTTTCATTCAAGACCCCATTACATAGATATAAGTTAACGCATGTTCCACTTGCATC:1 + chr3L 7629564 5' - opus 494 2 55.41 GACTCGTTTCGATGCGAGGATGTGTGCGGCCAGCAGCGACGACGATGAGCACGAGAATGAACGCGAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 18356166 5' + P-element 5 2 74.00 GTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTTATCATTTTCCTGGAATATTGATCCTGATCAAGAATATA:1 - chr3L 23747153 5' - INE-1 83 1 70.30 TATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 14688329 5' + pogo 20 1 49.50 AAAAATAAAAACATTTTTTAAAACAAACTTGCCATGCGTCCATGTCTCTGGAATATTCTTAACATTCTTGCTTTTATAGTTC:1 + chr3L 22707432 5' - INE-1 158 1 69.51 CANTTAGAAAAACGAGCAAATCAGTATGCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTT:1 - chr3L 26057840 5' + Cr1a 4023 1 74.26 GGTGGACGGTCGGAAACATATCTACTACGATATTTTACTTATAATATGATAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAA:1 - chr4 630462 5' + I-element 93 1 52.48 ATAAAGTCAACGACTGTGAAAAGCGTGTACCATTTAATTGATATCTCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 5291681 5' - roo 9043 1 54.46 GACAACCGAATCGAATCAGTGCGCACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGG:1 - chr2R 19593537 5' - copia 5000 2 65.22 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGA:1 - chr3L 6630130 5' + 1360 3158 1 65.35 CAACGCAAAAGCGAAAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr2L 18214138 5' - hopper 1388 1 52.48 GTGCGAGTGTAGCCCTTTATGTTGGCTAAAGTATTTTACATTTTTTCCATTTTCCATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTT:1 - chr3R 18843357 5' - GATE 191 2 59.41 AGGAAGAGCTAAGGAATCAAGATAAAATATCTGATGCGTTAAAAAAAATAAGATAAAGCGGTTTTGAAACATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAA:1 - chr3L 14700963 5' - accord2 7269 1 60.00 ATACATGCTCCTTTAGGCTTTGTGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 4806770 5' + roo 8669 2 74.26 GTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGATCAATAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCTCAGGAAGTATAAAAGCTT:2 + chr2R 4618504 5' + INE-1 151 1 48.51 TCNTTAAAACGGTGATAACTGTTTCAACCAAACACGCTTTCATATGCAAATTTCTTTCATTTCACAGAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 22046405 5' + roo 8674 2 68.32 CTAGTGAATCCATCAGCTTTGAAGACTCATATTCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCT:1 + chr3L 12233152 5' + jockey 177 1 68.32 GCAGGTGTTTCTTGTTGCAGAGAGGACAAAAGCCCAGATTTGAAGATTCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTG:1 + chr3L 21088283 5' + 17.6 7089 2 53.47 TTTTTGCCACGACCACTCTAACGCCCCAAAGCAGCCAAACTGTTCACGGCCACACTTGTATCTTATTTTATTCCCAAATATCTATCGATATCCCAGAAATG:1 - chr3L 26710196 5' + INE-1 500 1 62.38 TTNAGCTCAACGTTTCTGCTGATGGGTCTGTTTAGGTACGTGCCTGCAAATGTGGTAATGTATGTGTGTATGTGTGTAAGTATATGTAGTCTTATACTATG:1 - chr2R 6185920 5' - Quasimodo 15 2 53.47 ATTTTTTCGCAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 9196586 5' + G-element 4324 2 93.10 ACATGTTAGCGTTATAGCGCCAATTATGGCTTTCGACAGTCAAATTCGTCGCCTTCAGGCTGCCCCAA:1 - chr2L 21591729 5' + BS3 1352 1 88.24 GAGTCCTGTTCGGCTGCCCCCTCCCGTGACCTCTGACCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCTCTCGAATTGTTT:1 + chr2R 9974275 5' + Ivk 5199 1 63.37 TTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:2 + chr3L 9076584 5' - mdg1 7409 2 72.28 ATATATTTGCAGTATAATTTTTAGTCATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 + chr3L 13878066 5' + flea 4805 2 73.27 CAAAAGTTGGTCAAAAGTGTAACAGGTTTTCCACATTGTCGTTGTAGTGCAGTTGCCAAAGTAACGGTATCTGTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr3L 10522001 5' - roo 406 1 74.26 TTAATGCTCTTTGAAAGGCGCGCTCTCGCTCTGTGATTTTCTCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTGGCTTTGTTTTTCTATAATTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7698775 5' - gypsy11 3933 1 73.27 TTGATATTGATATCCTATAAAAAAAAAACATAAAAAA:1 + chrX 14967421 5' - Circe 425 4 81.08 TAATAAAATAAATACACGTACATAGACACAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 + chrX 2172250 5' - I-element 5307 1 74.26 AATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 + chr2R 9788959 5' - blood 7332 1 80.20 CCNTAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGA:1 - chrX 4175123 5' + I-element 351 1 75.25 CCTTTTTGACGGGCATGATTACACGGATTGGAAATTATGATACACACATATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chr2R 18344626 5' + 1360 27 1 53.47 TTTCATTTTCCTTAGTATCATTACTTTTTCCATAAATGTATAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chrX 19053033 5' - roo 9028 1 70.30 GGGAAATGTTCAAAGCCAGCTGTCTTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATTAAGTCTC:1 + chr3L 9076560 5' - mdg1 7433 2 52.48 ACCCCTAGCCCTAGTTGCACATACATACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chr3R 17666056 5' + Transpac 4939 2 60.40 GTGTAAGTGGAGTTGATGAGAGGGGATATTGGGGCGATGTTGTGGGTATGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr2L 17269851 5' - hopper 1388 1 56.44 CTGACCGATGTTTTGCTACGGCTTCACTTGCGTAAATGTTTCTTTAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAAC:1 + chr2R 17271713 5' - Doc 62 1 55.45 AGATCGCGAAGGTCTTGTAATCGAACAGCGATGTCAGATTCTGGAGAGTGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATA:1 - chr2R 15768749 5' + Doc 4432 1 53.47 TAGGACCCCTCATCCATTTTCTGGCGCATTAATCTCTCTGTTGTTTGCCTGGTTATGTCGGGGCGAAAATAATTCGCTATTTACTTTTTCTCCATGTTCCT:1 + chr3L 10401880 5' + micropia 4995 4 55.45 AAATGTATGTATTTTAAGAAGGAAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chrX 9579296 5' + Tirant 8 2 73.00 AATATTGTTATTTCCGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTG:1 - chr3R 1868247 5' + G-element 7 1 73.27 AAGACAAATCTCTCAATTTATCCCAAGTTTAACAGTAAGTACAGGTGTACTTATCCTCTTTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGT:1 + chr3R 28439987 5' - Burdock 285 1 57.43 AANTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAA:1 - chrX 23108334 5' + BS3 1414 1 60.40 AGACGTTCACCGAAATTGTTCGTGTTTCGATTGAAAATTGTTTATTTTCATCATATTCCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAAT:1 - chr2R 3146449 5' + 1360 3146 1 66.34 GAAACACAAACAGCTAATAAAACATTCGCGTGTACTTATTGTAGGGGTATTATATATCCTCCTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTT:1 + chr3R 2476447 5' - invader2 5063 2 77.23 CCGGTGGATCAATGATCACAATTCGGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAG:1 - chr3R 18059693 5' - Quasimodo 353 2 75.25 AAACAATGGTATTCTTTTAAAATCATTTATTTTGGCATGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAA:1 + chr2L 21863322 5' + Burdock 7 2 70.30 ACAATCGATGCTGAATGGTGCAGAAAATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATGGTATTTAATTACAAAATTAAGGGCTCTTTGT:1 - chr2L 21396596 5' + S2 58 1 77.23 TATCTCATTCATTCATTCAACTTTGTAAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 18816100 5' - roo 393 1 63.37 GANGTTCGAGATCGCATTGAAATGTTTACTGCGAACCATCTGCCTCAAAACAAAAATGAACTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGA:1 + chr2L 22293402 5' + I-element 425 1 59.41 ATTTACCTATTAAGCCTTAAAACATGGAGGACAGTAGTATAACTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCA:1 - chrX 20858773 5' + Copia1_DM 37 1 60.40 AATTTTTATGAATGCACTGGAAGTATGTAACCTGAAGGAGGACCCCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr3R 21311262 5' + 1360 31 1 63.37 ACGAGATCAAGTTGCTTATCTCCAAGAAGTTTGACGTGGTCGACGGCGGCGATCTTAAACATTGTAGTTAATTTGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 + chr2R 912940 5' - mdg1 404 2 62.38 ATATTAATCGGATAAATCTTAAATATTCGTTCTGAATCTTAACCTTCTAGCTTGTATAGTTACTGAGATCTCAACGTTCATACGGACAGAC:1 + chr2R 5441457 5' - INE-1 129 1 68.13 AGATGGCAAGAGGATGGGGGCGTTAGTTGGAGCAGAAAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATAT:1 + chrX 6624356 5' + I-element 5247 1 63.37 TCCCCGAAGGTCTCGAGGTTTACATTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCG:1 + chrX 17120820 5' + jockey 151 1 76.24 TCAGTCACTACTAGGAAACCATTCTTTGCGTAACTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATT:1 - chr3R 10827467 5' + HMS-Beagle2 152 2 75.25 AACAGCACAGCACGCACAATGCATAACGAACAGGGGAAATTAAGAAGGCTTTCAAAGGGGGAGGTAGGGCACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3R 4805147 5' + 1360 5 2 74.26 ACTTGTGCCAAGCACTCGTACTCCGCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chrX 678854 5' + Tirant 21 2 60.40 CAGTTTTTCATATTTTTTATATATACGAATTTATATGCGAATATGTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr2L 1907598 5' + 297 22 2 66.34 TTTAACAAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 - chr3L 9909795 5' + Transpac 4922 2 76.00 TATAAATACGTAGAACGTTAAATACTAGGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAA:1 - chr3R 25277670 5' - 3S18 290 2 71.29 TTCTGTTGCCAACAAATCCCACCGGCTCAAGTACAAGCGATTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATC:1 + chr2R 12808726 5' - invader2 248 1 55.06 TCNCATCTCTTTGTCAGGAGTGTCTTATGTTTATACTCGTGAATCTTCAAATATGTTCTTTAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chrX 13790072 5' + FB 16 1 63.37 AGATGGTGGTGGCAGGGGGGATCCCTCGCTGTAGTCCCAGATATTATGTTGAGAGGCACTTTCCTCTTTTAA:1 - chr2R 1393141 5' - Gypsy6A_LTR 274 1 91.67 GTCATGTTTCACCTGCCAGATGAATGCATTTGATTTGATATTTTCTGTCATCTGTGCGTCTACTACTAACTATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCCACAT:1 - chrX 4711346 5' - hopper2 1264 1 57.43 TGTATAAACTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCTATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGA:1 + chr2L 13154261 5' + INE-1 138 1 73.27 TTGTCGCCCGCAAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 7885595 5' - hobo 2911 1 53.47 GTGGGTTAAGCCATGGAAATGGCCGGGGGCCCCTTTGGCCAACCCCTTTTCTAAACCTAAAACCCATCGGAGTGTACAGCCACCCGCACATGACGTGCTGA:1 - chr3R 13732221 5' - Stalker3T 239 1 76.24 GTNTACGTAACGTTTGGCATGGTTACGCAAAGTTTGGGTTTGGGTGTATGAAAAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 - chr2R 17938953 5' + copia 24 2 52.48 TCAAAATCAGCTGTCAAGTGCACTGCATTTCCGTAATTATAATGAGCAAACTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGAC:1 - chr3R 25791438 5' - F-element 317 1 52.48 AANCCCAAACGCTTTCAACATTTCCGCTGCAGCTTCAATTACTTTCGAGCCGGTGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTC:1 - chr3L 8364405 5' + F-element 361 1 57.43 TGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:1 - chr2R 544879 5' - HMS-Beagle 224 2 57.43 TAAGCCATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTAC:1 - chrX 4175127 5' + I-element 347 1 71.29 CCGCACACATACACGTGTACATGCATAGCAAGAGAGGCGGTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chr2R 18356195 5' + P-element 35 1 44.55 GCCGTCAATGAAAGTTTGACAGCCACTGAGTGGCACTTTCTTGTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCG:1 - chr3R 25354732 5' - Bica 454 1 63.37 TTATACTTCTCAAGACTTACGGGGAAATGTTCAAAGCCAGCTGTCTTCACTTAGATCGTGTCCACCCAATGTCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 + chr3L 9076539 5' - mdg1 7454 2 73.27 AAAGATACATATATAAAAGTAAGTGATGCTAAGAACCACAATATATTAAAGAAGTAGATGTCTGCACGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGAGGTGTG:1 + chr2R 12006191 5' + invader1 176 2 63.00 TCACAGCATAAATTCAGACATCTTTTTCGAGATATTTTGTTATTTTGGTAATTTTCATGTAATTAGTATCACATGGCCCTATTATTTTGACCGCAGCTGTA:1 - chrX 17695005 5' - Tc1 1 1 89.11 ATGTCATTCAAAAACAAATTATTTATAACATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr2R 13122066 5' - pogo 2057 1 74.26 TATCAATATTAGCCCCGAAAAATAGGCAACACTTTTGTTTTTTTTTTAGCATAATATATTGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chrX 6509841 5' + jockey 23 1 54.46 TCATTTTTATGTAAAATGATCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3L 13652784 5' + hobo 31 1 52.48 ATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACGTTTGAGACTGTCACACTATAACCTTGTGCGTACACTTAATGAGTTC:1 - chr3L 23583103 5' - rooA 348 2 92.08 TTTGGCAACTTTTGCGGCCAAAATGGAATTTTGCGTTTGCCTAACTGGCAAAAAATTGCCCAAATAGTTGGGTGGGCGATAAGTCTGTCGGCATATCGGCT:1 - chr3R 17649230 5' - G5A 2605 1 74.26 AAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chr3L 9909692 5' - Transpac 283 2 52.48 CTTTTGTCGTAGGTTAAAAGTGTTTACTTGATCTTTTAAATAGTAATTAAAGGAAGAGAATGATTTTCCTGTCGTATTCCAGGATCATTAGCCGAGCCGAT:1 - chr2L 19121372 5' + INE-1 95 1 91.09 CCNCCGAGAAGCAGACATTGAGAATGCCGATCCTCAGCGTGCGATCCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGTCAGGGCAACCAGTTTC:1 + chrX 14759285 5' - R1A1-element 498 1 54.46 ATTTTATTTTTTCCGCAATTGTTGCAGTTATTTTAAATTGGAATGTTCAGTTCAGTTTCAGTTCAGTTCAGTTAGGTTTTGTATTTTTTTTTTCTTTTTCT:1 + chr3L 24934264 5' - Doc2-element 221 1 45.54 TTAAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAAAAACTTCCCCATCAAGTGGGTCCAATAAAAGTTTTATGAGTCAGCCGCAATTATGCAAAATATTTATTTATTTTTG:1 + chr3L 27200568 5' - mariner2 832 1 75.25 CGNGTTATGTTTATAAAAAGTATTTAAAAGGCAGAACAAAGCGTTAACGACCAATATTCTTTGTCACCATCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCAC:1 - chr3L 24241902 5' + Idefix 310 2 73.27 TCNATTAAGTCTACTCTAATTAGTTTCTCTTTCATCGCAAAAAATACGAAAAATAAATAAACAAAACGAAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAA:1 - chr3L 10978043 5' + Doc 4413 1 74.26 TATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAG:1 - chr3R 545849 5' - HeT-A 6050 2 82.18 TCAGGCGACTATGATTGGTGTGTTTCCCCATTGAAAAATGCAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr2R 8547783 5' - I-element 5322 1 59.41 AAACAACATACACAAATTTTTGACCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGA:1 - chr3L 7777915 5' + I-element 252 1 77.23 GCNGCGCAGTTCAACATACCCCATCATACTCTTTTTTCTGTATGCGTCCATATTGCTATTTTATTATGTAATTATAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCA:1 - chr2R 982417 5' - Porto1 4194 1 56.44 GGTATGCGTCCGATCATGCGCGATGTGAATGTGGCATTAAGTGGCGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATAT:1 + chrX 11955587 5' - accord 201 2 55.45 AAGTAAGTGCAAGTGTTAAGAGAACGAACCAACAAACAAATAAACAAACAAACAAACATTGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGCACAAATC:1 - chr3R 18640893 5' - Cr1a 154 1 63.37 CTAATAAAATATCTTAGTATCACAATATCTAATGTAATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2L 1590766 5' - opus 7464 2 64.36 CGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAAC:1 + chr3L 11115123 5' - R1A1-element 140 1 68.69 AANACAACACCAAAATCTAGGACCCGAACAGGAGCCACTTTTAACCCTTTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATAC:1 - chr3L 14257849 5' + 297 6787 2 56.44 GGCAATTCGATTAAAGCAGCTCGCAACTTCTTTATCTTTATTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCT:1 - 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chr3R 10030749 5' + BS 5062 1 77.23 AANTGCCACTAAACCGAGAACAGAGAAGCAAACAAAAAACATAGGGCACCTCGAGCAATGCATGTATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAA:1 + chr3R 5364394 5' - S2 1705 2 59.41 ACCGTTTACATAAATATGTTTATAACTAATAACAAGTAAAATGTCACTGACGACATAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr4 119472 5' + 1360 16 1 64.36 GATTCCGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3L 13345530 5' - Transpac 5211 2 60.00 ATACATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCAGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCG:1 - chrX 10253235 5' - gypsy4 6625 2 73.40 GAACCTTTAAAAGGATTTCAGTGTTTTTCATTTATGAAATTATTGATAAGAGCCGAGGAGCACTGGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGAT:1 - chr2L 1403589 5' + INE-1 131 1 68.37 TGGGTTCGTATTAAGCTTTTCTTAACATTCTCCACTTAGCTCAGCTATAAATTATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr2L 22045137 5' + jockey 4694 1 56.44 CTTGACAGGTGGCTGAAACTGAGACTTTGAACCACTTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGC:1 - chr3L 7200610 5' + F-element 353 1 64.36 CAGCACGAGAACTCGGTGAAAGAAAAACAAGAGAGAATACTGTAGTCGAGTTTCCCGGCTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGCGAAATTTC:1 + chrX 15409015 5' - INE-1 526 1 74.26 GAAACAGCAGGTGCAACAGTGAGATAAACAGCGTGGACAGCAGCACACCAACGGGTTCAACCAGTTTCGCCGGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGA:1 - chr3L 5101778 5' - R1A1-element 465 1 41.58 GTACTGTATTGTTTTTTGTTTTTTTTTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGGGCCTCTCA:1 - chrX 19185103 5' + I-element 21 1 61.43 GTATGTTAGAACCACTCCTGAAACAGGACACCAGATTCCACGATCCCTTCTACCACTCTCCTGATTTTCTCCCATCCCCCTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 27141013 5' - Doc2-element 251 1 54.46 TGGATGGCAATGGCTGGCTGCTGGTTGGGTGGTGCACTTGCCAACGCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 30904204 5' - roo 9042 1 56.44 TTNCTTAAATTTGGCAAAAACTTTAATGGAAATCGTTAAAAAAAAAAACCAAAAAAA:1 - chrX 18562173 5' - hopper 151 5 78.95 CATTGTAAAGCAATTGATGTTTATATGTCGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 11808945 5' - roo 9027 1 74.26 TGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATT:1 + chrX 21564692 5' - diver 171 2 80.20 GTGTGGCCATATTTCAGCATTTATGAAAATGATTTTGAAGTGGATTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGG:1 - chr2R 21984904 5' - Idefix 7067 2 56.44 ACGACTACAACTTTGTTGCAAGCGATGGGTTAAGATAAAGCGGAATTGAAAAAGCGTCAAAGCTAAACAAAACAAAAGCAACTCCTACCTCTCATTCACCG:1 + chr3R 8926791 5' + Porto1 271 1 62.38 ATAATGGAGCAGGCGATGGGCGCTGATTGCCCATCGCGACGTGATAGCATTTAAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAG:1 + chr3R 13211944 5' - Doc 343 1 52.48 GANTGCCATTTTATACTTTAATAACCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 18639551 5' - roo 9019 2 78.22 TGTGATTTGAGTAATTAGCTGTCCCGGAACAGCACTTGAAAATTAGTTGAGTTAAGCTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCG:1 + chr3L 9603765 5' - flea 130 1 63.00 GAATTAACATAAATGTGGTGCGGCTCAGGATGTCCAGGACATCCCCAGCTGCCTGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCA:1 - chr2R 21974604 5' + 1360 3348 1 59.00 TGGTATTTTGTGTTTTATTGTGTCGTGTTTGCTGCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 + chr3R 17665948 5' - Transpac 305 2 74.00 CCCAAATGACATGTACATAAATTTAATGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATG:1 + chr3L 7295179 5' + G2 2972 1 74.00 ATNTGGCAAGATAGTTATATTTAACATCAATTTATGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3L 10891489 5' + pogo 38 1 66.34 TTTTTCATATTTTTTATATATACGAATTTATATGCGAATATGTATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 12285874 5' + 297 25 2 69.31 TTTATTGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGTATCGCTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 + chrX 13640648 5' + P-element 31 1 35.48 AAAATTAAATTAAATTAAATTGCCGTAGCAATTTAAGGCGCCTTGTGGCAACTTGCGCTGCGTCTGTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTC:1 - chrX 16482591 5' - INE-1 173 1 53.47 TCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3L 14638610 5' + 1360 28 1 55.45 ATTGACAGCGCTGAGGGACTGGAATGGGAATAGGGATGTGGGGTGAGGGTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTTTTCTACCAGTGGG:1 - chr3R 26486696 5' - Idefix 6993 2 62.38 GGCCGAGAAAAAGGGAAAATTTTTGGGTAGCAGGAGGGAGCTAAGTGGGCCTGCACTTATAATTTGTTTGTCACAGTTCACTTCGCACTTTTTCGTTTATT:1 + chr2L 16436106 5' - gypsy4 342 1 55.45 ATNCTTGCTCTGGACCCCCAGCAACAATAATACCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGTTGGCTGTGGGAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 22331207 5' - hopper 145 109 62.24 ATGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 + chr2L 21863358 5' + Burdock 6179 2 72.28 ATTTAACATGACAGCCACATTAAATTGTCCACTTTGGCAACCTGTGTGCCGGCACATATATATACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3L 1830826 5' + 297 6583 2 78.00 AATAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACG:1 + chr2L 20840152 5' - INE-1 128 1 69.00 AANGAAGCTCGCAGCGGGCGTGAAAGTTGCGAGAATTTATAAAATCAATAAACATAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chrX 4808271 5' - blood 355 2 44.55 ATTTTATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCTACACCTTTAATGGATTTTCCATTTGCTCGCTATACCTTTTGTTTCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 + chr3L 21144015 5' + jockey 4678 1 78.22 TTNCTACTGGCTCAACGAGATGTACATGGATATTCGCATCCCTTTGCCGATCAACTCGAATCCGGGCATGGTGTGCTTAAGACTATGTGTTTGTTATATTA:1 + chr3R 18728788 5' - Stalker3T 217 1 72.28 GAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:2 - chrX 19109311 5' - roo 9028 1 66.34 AGTCTGGTAGCAACATAACAAAAAACCATTGCATATTTCACGGAGTCACGTCACCCAAGTGGGCATCCTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2L 10759997 5' + jockey 12 1 74.26 CAAGACTGAGCTGAGTCAGTACCATTTTCTAGCCACAGTTTTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGGTTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTT:1 - chr3L 6339995 5' - Doc2-element 4481 1 59.41 CAATATCGATTCGTTTACCATCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr3L 11790010 5' - P-element 2832 1 23.76 CCAAAGTCAACCTCTGAAGCCGCCGACGCCGCCAATGCCCACTGAGGTTCAATTTGAGGTATTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTT:1 + chr3L 21779374 5' - Stalker3T 307 1 62.38 CGAAAGGACACGAGCGCCGCCGAACTTTTCAAGGGAGAGCAGCCTCGGCAGTGGTCGGCGAGGCTGTGTGCCAGCATCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGG:1 - chrX 8178092 5' + TART-B 154 2 63.37 CTTGGTTAACGCAACAATTTAACACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAG:1 + chr2L 15013961 5' + jockey 4728 1 82.18 ACATATTCAATAGTTTAACATTGGTTTTATATTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 - chr3R 16593878 5' + Max-element 13 2 63.24 TCTAACATACACATACACACTTGCACATGAATCCCATTCTCGAGGGGCTGAATGAAGTGGGTGGCTGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTC:1 + chr3R 9957956 5' - Doc 4459 1 73.27 ATAAAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAA:2 - chr4 156607 5' + INE-1 146 1 80.20 CATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chrX 7583212 5' + I-element 40 1 67.00 TTNAGATGACGTTAGTCTCAATGCAATATTAGCAATTTCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGG:1 - chrX 22782066 5' + I-element 4895 1 62.38 GAAATAAACGTTTATCACGGCAATATTCTTGCTGAGATAGGACTTGTTGAAGCTCTCCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCT:1 - chr2R 22429101 5' + F-element 4500 1 65.35 TTGCATACTTTTACGCGTCTCTTTAGTATTAATTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chr2L 19602897 5' - hobo 2895 1 69.31 TGCCACCGACAAACTTACAGGCCACTGCCTCAACCCACACACATGTACACAGATTGAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATA:1 + chr3R 17066232 5' + Tirant 8354 2 65.31 CTATCATGGGTGGGTACTGCGTCCATGGACCAAAGGTGGCAATGGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGT:1 - chrX 12345140 5' - I-element 4952 1 60.40 GAAGATGTACAAGCGGTGCAAGTGTTCTGGGGTGCACGTGTCCTCCTTCTCCTCGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTC:1 + chr3R 9660715 5' - jockey 4749 1 54.46 CGTCAGCGTCAACGTCTCTCAACTCATCTTTGAGCCCCCTTCTCTGCGCAGAGCTGCGCTGGTGTTGGGCACGTTGTCGGCGGCTTCCTAAGCGTCTCTGC:1 - chrX 20978585 5' - G-element 476 1 58.42 CTTAAGCGGTGATACGAGCGGCAAGAGCGTTGCAAATGGAGAAAAATGGGGGTTACTAACATCAATTTAATTACAGTTTTAAGTAAACACATCAGTTAT:1 - chrX 10316315 5' - transib3 449 1 57.58 ATGTACTAGATGTAAGCTACACTGATCCACAGAAAAAAAAAAATCAAAAAAAAAA:1 + chr2L 16774295 5' - hopper 146 111 76.36 AGATATATGCTTTTCATATACAATAAAAAAAGCTAATAACTGCGTTATTGTTAGAGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGAC:1 + chrX 20858708 5' - Copia1_DM 151 1 53.47 TTTCTAAGTGTTAAATTATCTGACTAATTGGCTATTTATTAAGGAGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:1 - chr2L 13804458 5' - roo 377 1 55.45 TTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 9907347 5' + jockey 21 1 58.42 AAAAAAGTGATCTTTTTGTGTGTGCAAAGGTTTTTTCCGCAGCCAACAGCCATGAAATAGAATCGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chrX 6731774 5' - hobo 2928 1 68.32 GTGGTGGTGGTTATCCTGAAACTGGTTGCTCGCCAACTTGAGTTCTTTTCCATTTACATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr2L 10174189 5' - mdg1 401 2 54.46 TATAATAATTGCACGTACCAAACTAAAAGATCGAACAAACCCATAGATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATA:1 - chr3R 6598117 5' + Tc1 1251 1 63.37 CTGGATATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCACATA:1 - chr3L 5067858 5' + Quasimodo 46 2 72.73 TGNCACGATCGCTTGTCGTATCGCTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chrX 13640659 5' + P-element 50 1 26.73 TTACCATGTTCAGTGTTTAAATGCATATCCGTTCCGTGTTGTTGAGGTTGCTGCTAATGTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTT:1 - chr3L 5631464 5' - G2 185 1 64.00 GTATAAAATCAGCAACATATTTTATTACTTATTGAGTGCAACTACTTCTGCGGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATG:1 + chr2R 17484543 5' - micropia 5316 2 54.46 CAAAAGTCGCCACTGAAATACCCTTTTCAGGTCATTAGCCAAACGATCAGTTGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 26592575 5' - roo 9051 2 55.45 AGCAGCAGCGACTCCTTCACACATCGTTTGTCACATTGTTCTCTGCAGGATCTAAGATCCTTTTCCCATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 18223748 5' - roo 400 1 73.27 CCNGAACAATTTGTCTCTCTACTTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 22920362 5' + 1360 14 1 64.36 ATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAAC:1 + chrX 22398529 5' - Gypsy6A_LTR 161 1 64.36 TTTGTTGCAAGCATGAGCATTCATTTCAGGACTATTAAGAAGGTAACACCAAAGACCCTTGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3L 11217332 5' + 1360 30 1 54.00 TTAATTTAATCGCTGGAATTGACTCTCCAGAGGCAACTTCCTCTCTGGCTTAGCGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGG:1 + chr2L 2250098 5' - Doc 4522 1 61.00 CACTAGCATATATGCTGTAGTAATTTGTTGTTGTTGCTGTGCTGTTGGTGGTGGATTTGCCGGTCGAGAAGACGAAGCGCAAGCGCTGGCCGCTTACACTG:1 - chr2L 2886440 5' - Max-element 8270 2 53.47 CTAATATACTAATGTACANCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCANAATGTNNACACATGAACACGAATANNNNNNNNGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 19450186 5' + roo 8699 2 88.12 TCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCACCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chr2L 17205160 5' + hopper 6 2 70.41 ATTGCTGCACTTCGGGCTTGTGAAGGTGGTTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTG:1 + chr3L 21913821 5' - Quasimodo 50 2 60.81 AGCCGCAAATACCGAAGTCAAAATGCGTGGCCTCAACGATTCTGTGTATTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3R 28288663 5' + 412 7079 2 54.46 GATTTTATTAAATTGTTTGTGTCGCTTTTAGCATTACGAGAATTTTATTTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTAC:1 - chr2R 8550186 5' - diver2 70 2 52.48 GCCTCTGTATTAGGGGAAAGTTTGAAGTACTTGGCCAAAGTTATAGTATAAATAGTTCAGCTCGAGCCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCT:1 - chr3L 11920134 5' - Tabor 477 2 75.25 CTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAA:1 - chrX 21087677 5' - mdg3 235 2 59.41 TGGATCTTCTCCGCCAGCTGCTGATGGTGTGCCTCGTAGTGCTCCAGCAGCCGAAAGATCTGCTGCACAAGGTCGCGCGCCTCCGATTTTGTATACTAGCT:1 + chrX 21113544 5' + Gypsy12A_LTR 2073 1 80.20 TGGCGAAATCAAACAACGAAATCAACGAAATATGTAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCAC:1 - chrX 14127717 5' + I-element 4955 1 65.35 ATGCGGCACTATTTAAAATGCAATAGTTTTGATATCAGCTTTTGTGACTGTTGGGATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTA:1 + chr3R 4679254 5' + copia 4901 2 57.43 CCGAAACATCAATGAATTGGCCAAGAGGGGGATTGGTGGGAGGCTTCTATTTCTTGCATGACCAACAACCAAGGAAAGGAGCAAAAAAAAAAGGAAAAAAA:1 + chr3L 4497921 5' + Doc2-element 249 1 60.40 CTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAG:1 - chr3L 5266705 5' - HeT-A 6048 1 83.17 GCNATTGTAGCTACATCCACAAAGTCCACACAATGAAAAACGAAACTTGGCTAAATAGACGGCAAAAAATACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTC:1 + chr3R 12565983 5' + Porto1 4463 1 68.32 AGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chrX 9579334 5' + Tirant 8153 2 77.00 TGNGGGGTGAGTGGGGGCGTGGCAGAAAGGTGAATCAAAAGCAACAACAATGAGTTGGCCTTTTGTTGCTGCGCGGTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATT:1 + chr3L 10111862 5' + F-element 4622 1 75.25 TTTTTTTTAATTTGTTCCAAAAGAAGACCACAAATTCTCTAGTCATGGGTCGCGGAGAGCATTATGCCGTCGAAAAAAGAAACTTGATTAAAAACATGATC:1 - chr2R 4608375 5' + Tc1 394 1 78.22 TTTGAAATGTAATATTGCAACCAATTTAAGTTAGTAAACCAAAAGGATTAGACAGTCAGATATCTGATATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chr3R 19206074 5' - mdg1 413 2 64.36 CCCCAAAGCCTTTCCCACAGCTGCATTTGGGATTATGACAAAATGCAATTTGCATTTGCAAAGACGTTTGTCGGGGATCTTTGAGTCATAAAAGGGTAGTA:1 - chr2L 11678489 5' + baggins 5381 1 80.20 TGTCCAATTATCCTTGGATATTGCTTTAATGCCGCGCCAAGATTAAAGCCAAATTGCAAATTGTTTTTATAATTTTCTATTGCGCTAGGTGGTTGGGGTGC:1 + chr2L 12812488 5' - F-element 4468 1 78.22 AAAATGCTGAAGGATTAGGACGACCCACCACTGAAAGTTGGAACCTGGACAAGAACTTATTATTTGATGTTGGTGAAGGTGGCATCTGATTGTAAGCATTT:1 - chr3R 26455727 5' - Chouto 6163 1 66.34 GCTGAAGAATTCCCGCCGAGAGAATCAATAAACGCTGGCCATATACCAAATACAAAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACT:1 - chr3L 20699266 5' + F-element 473 1 60.40 GANCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGTGACTCAGGCACTTGTTCTGGAAGCGCTGTATGCGGTTGCGGTT:1 + chrY 652809 5' - G-element 3953 1 60.40 TTTCATCTCGATTCATGTTTTTATATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAA:1 - chr3L 5662672 5' + jockey 388 1 75.51 ATTGGCTGCATCCGGGGGCTTTCAAGGTGTGTTTGCTTCTAAAAGCTCCTGCAAAAAAGATAAGTAAGTTATTATTTTATTAGGATTAATATCGATTAATT:1 - chr3L 13830035 5' - HeT-A 5773 1 85.15 AACAAGTAAAATGTCACTGACGACATAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 - chr4 119442 5' + 1360 46 1 75.25 ACCCTTCGGGCACGTTACGTATACGCCCCCAAATGACATGTACATAAATTTAATGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACT:1 + chr3L 7295152 5' + G2 2946 1 55.45 TTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTA:2 - chr3L 19339394 5' + Tc1 63 1 79.21 GCATGAAGTTGATAACAGCACGAAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATT:1 + chr3R 445978 5' - pogo 243 1 76.53 GTAGCCGCCGCTCTCTCCCACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chr3R 24006936 5' + P-element 58 1 22.77 ATNTTGCATTCCAATGTTATCATAACATTTTATTTTATTAAAAATAAATAATAAAACAATAAA:1 + chr3L 17238608 5' + BS 5094 1 52.38 TCTGGGTGTACGAAGGACACGTCTATGAATTTGCTTTTCACCCGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAA:1 + chr2R 22456185 5' - diver 190 2 56.44 GTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1 + chr3L 25782375 5' + F-element 45 1 62.38 GAGTGCTGTTTCATCTAATAAAATATCTTAGTATCACAATATCTAATGTAATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2L 1590752 5' - opus 7478 2 54.46 TGAAAGCTATGTAGATACTTTTCGATAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAC:1 + chr2L 16507840 5' + BS 5047 1 73.00 CTTTTAGGCGAAACTATCAATTTACAAAGAAGTAAAGAAAGCTTATAAGACGTAAAGAGCGCAATTTAGCCATTGAATTTTATGCCGCAACCAACAACAAA:1 - chr2L 12568530 5' + Doc4-element 191 1 78.22 CCACACATTAATGCGTTCGAGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chrX 8337950 5' + hobo 52 1 78.22 GTNGCTCTGTTACCAGTGAGTGCGTGCGTCTGTACGAAATTGCAGCGCCATAAATATAACATATTTATAGTTTGCCTACTTATTATGTCTAAACACATATT:1 - chrX 19476404 5' - rooA 7 2 60.40 CTTAAAAAGTCTCAATAAATCCCCTAAACGGTGGCCAGCCAATCTGCCGGTCAAGTCCCCTCACCATGGGTGGCTGTTAATATATGTAGTATATATATATT:1 + chr2L 15605407 5' - accord 428 2 79.21 GANAACGTGCATATTCATAGGAATTTATATTAGTGGATCATATTGTAATAAACCAATATCTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr2R 9788938 5' - blood 341 2 59.41 GTTTCCCACCTTTCGGCTGGATTTCCTTTACTTCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 + chr2L 11391859 5' + accord2 223 1 72.58 AGNACTTATGTGCTGGAAGCCACTTATGCTGTCACTAGACTTGTTTATTGCAGCCCATAATTAGAACATATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAAC:1 + chr4 384158 5' - rooA 14 2 72.28 AAACAAGGAAAGACAAGCTCTCAGAATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTAGAATTAAGGCACACATTGGCC:1 - chr2R 4626637 5' - Bica 4853 1 64.00 CCCGAAAATGTATGAAAATTCACTGGCCTGTTAGCTTAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGG:1 - chr2L 17559353 5' - F-element 376 1 61.46 CANAATTTCTTCCCAATCTCGAAAATTTTTGTGAAAGTGAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 9439771 5' + roo 8699 2 65.35 ATGGCTAACAAGTCATTGACAAACTGCCAGCCAAAGTCGAAGTTGTGGACACATTGAGGATTAAAGCCACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 9141539 5' - roo 401 1 69.31 TGGTGTGCCTCGCCTGAAAGTATGCCACATTGCCCGTGACGAGGAGATTATTGCTATTGTCGTATCGGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 8922312 5' + jockey 18 1 65.35 CTGCCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 9909679 5' - Transpac 5215 2 65.35 AAGAAGTGGATTTTCGTAGCTGGTGCAGCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:2 + chr3R 24461808 5' + F-element 33 1 51.49 TGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACTAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAA:1 + chr3R 23020814 5' - INE-1 578 1 57.43 TACAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTT:1 + chr2R 5582166 5' + Cr1a 440 1 66.34 AAAAACGCTTTGGGTTCCTCGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 7642225 5' - 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chr3R 4971225 5' + 1360 36 1 61.39 GGGGAGCGGGACAAATGGGGTCCAAGGGGCAGGAGTTGGACTCTTTGGTTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCG:1 + chrX 1580220 5' - invader2 149 2 73.27 TGGGTTTTTCGTTTTTTTGGTCCAGTACGGCCATTTTTAATTGCGCGGCATTGTTGCTGGTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATG:1 + chr2L 19265765 5' - F-element 466 1 65.35 TACTTTTAGGCGCTCATGTTCCGAAGTACAATCCAGAGAACTGCCGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr3R 19560933 5' - hobo 2925 1 66.18 TACGCCCCCCCTAAAGTTAGGTTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2L 12322961 5' + hobo 15 1 63.37 ATGGGGGAAAAAATCGAAGAAACTATTTAAAAGCCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chrX 6082579 5' + roo 42 2 69.31 TACAAAAAAGAAAACATTTTCACAAGCCATTAGCTCGTATCCATCATCAGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGAACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTT:1 + chr2L 3131652 5' - 1360 440 1 55.45 ATNCTCCTTTAGGCTTTGTGCACTTTAGTTATTTATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 4806766 5' + roo 9 2 69.31 ATTTTGTGGAAATATTTGAAAAATTCCATAAATAAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - 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1360 3369 1 60.40 ATATGAAAAAATATAAAAACATTTTTTAAAAGTGTGAGCGTACGATTTTTGGGTCACTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 22902343 5' + roo 8683 2 60.40 TCCGGAAAATAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2L 19644940 5' + blood 7040 2 54.46 AATATTGTGCCATAAATTAAAAAAAAAAACCTTTTTAGAAATAACTTAAAAA:1 - chr3L 10551605 5' - pogo 1888 1 51.92 AANTCGTCCTCCTTGGGGGCAGTAAATTCTGTTTACCCACTGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTT:1 - chr3L 11884140 5' + 297 6971 2 59.41 CGAAAACTATTTCGTTGTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 3455870 5' - transib2 2643 1 70.00 AAGATCCACGAACAGGGCACCCAGTCCTCAATCAGATTCACACAATGCATTGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 + chr3R 16807059 5' - I-element 5340 1 67.33 ATAAGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGA:1 - chrX 4175121 5' + I-element 353 1 77.23 AAGGGGAAATTGGTAAAAACACAAGATACTCGAACTTGGGGGTGCACAGATACACAGATACAAAAAGACCACCAAAAACTACG:1 - chr2R 19266063 5' + Stalker4 7067 4 67.47 AATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 6290984 5' + Doc 39 1 68.82 TTNTTTTCCAAATACGATGGTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 + chr2L 6806050 5' - I-element 5305 1 76.24 TATATATAGCCAGCCATTAAATACATTTCCGTTTGGGGCCCGACCTCATGCATGCTATACACACAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTA:1 + chr3L 9183351 5' - I-element 252 1 69.31 TCCGTCCGGCAGAGATTGTCTCCAACACCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 + chr2L 2685751 5' - hopper 1369 1 73.27 TTTTACCGGCTCAGGCTACGGCTACACAGTTCACAGTTCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCCATTGTAAAAAGTCTGTG:1 - chr3R 4403140 5' + Burdock 6089 1 60.40 TGGTAATGAACGAAATATGCCACATCCATGCATATATATGGATGCATATACATATATATATATATATATGTCTGCTGTTCACACATGAACACAAATATATT:1 - chr3R 11183738 5' + roo 5 2 72.28 GTTCTCTGAGGCGATGCTGACGATCTAGATTGCGCTCCAAAATTAAAAATCTAGGGTCAACCTGAGCGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr2R 5262676 5' + 1360 4 2 74.75 CAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 19450161 5' + roo 23 2 79.79 TGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAAC:1 - chr3L 25232856 5' + accord2 27 2 53.47 CCTGGGTCCAAAAATTGTGGCCAACTTGTATGGCTAAAAAGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAAGAGTACTTTGTATTCCGACTAAGGGGAGAGTTGTAAT:1 - chr3R 21990665 5' - Doc2-element 4298 1 59.41 ATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCA:1 - chr3L 23702257 5' + G4 16 1 59.41 ATTACATTGGCAAACACAGAACACAAGATCAACAGCTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTC:1 + chrX 4749400 5' + F-element 4227 1 69.31 CANTGTTTTATTTTTTATTATCTTTATTCTTTCAACTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGAC:1 - chrX 3724603 5' - I-element 43 1 64.36 CGGTGTCGATGTGGCGTCTGTCGGGGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTAT:1 + chr2L 19845885 5' + F-element 24 1 57.43 GGCAAACTCAGCCAGACGACGGCTTAATTTTCACAGACTTACAAAAAAAACTTGTCATTGCGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTA:1 + chrX 8356512 5' + Doc3-element 4497 1 69.31 ATTCGATGTGTTTAGATGATTTGTGCACATTCTTAAATGGTTTACCGTCCTTTACGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCG:1 + chr3L 24131079 5' - HMS-Beagle2 7175 2 57.43 CGAACTGGGTACCGAATCTCCCAGAGGCTGCATAGGCAAACCTAAAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTG:1 + chr2R 14956836 5' + I-element 421 1 55.45 TTNGGATCCACTTTGATGGAGCTAGCTGCTAAATCCAATTAATGGAAAACTACACACGACGTGAGAAATGTGCGCTGCGCAGCAAAAAGTCGTGCGTAATA:1 + chrX 20635418 5' - Rt1a 18 1 73.27 TACGGCAAACATTAACGAATTTTTCTGTTTCTGTCCAAATCCAAATCCAAATCCCCCGGGTTTCCCCAGAAGTAAATACAAATATATGTATATATATATAT:1 - chr3R 27407577 5' + 1731 4409 1 45.54 GCGAAGATTATATCAGCGCCAGGGGGCAGAGATACGATAGGTGAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAG:1 + chr2L 23007125 5' - Circe 7243 2 68.75 AANTCTTCGCAAAAGGCCAACAGCATGAAAGGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chr3L 10557629 5' + 412 7100 2 70.30 TAATAAAAAACTGCGTCACGCAAAAAGAACATTTGATGGCATGTTGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1 + chr3R 4600408 5' + Tabor 12 2 68.32 TTCAAGCATTCGTGAGAGGCTCGGAAAATATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTA:1 + chr3L 20081776 5' - Juan 372 1 74.26 AGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATA:1 - chrX 21667924 5' + gypsy2 6525 2 58.42 AGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCAATCTGGC:1 - chrX 158237 5' + INE-1 100 1 75.25 GTTTTCTACAAGGTCAACATCGATATGGTGGAGCAGGCCAAGGTCTAAGATCGCCCGTCGCCCCCAACCTTTTTGCCTCCTGTAAGCGATCTTGAGGCGAC:1 - chr2R 16325992 5' - G3 116 1 65.35 GGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTT:1 + chrX 21636188 5' - Stalker2 7612 2 63.37 GATTCAATTCGAAAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACA:1 - chr3L 18476553 5' + accord 12 2 64.36 GCNCCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGT:1 - chr2R 6801687 5' - McClintock 434 2 73.27 CGGTTTTAAAAAGGGGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATG:1 + chr2R 17077854 5' - Tirant 8484 2 75.38 TATCCCCAGAAGGATGTTTTCAATGCAGCTTAGAAAAATTCCTGTTGCCGATGCAATTGTAACCTGTTGACCTTAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTG:1 - chr2R 4550659 5' - hobo 2833 1 75.25 CTTGTGGCTTTGCTCTTCGGGGGGTTTTGTGGGGTTCTGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGT:1 + chr2R 8333991 5' - F-element 265 1 65.35 TTTCGGTATCACAAAATTAATAACATGATAATTTTTACATATATAAAAACATGGCATACATACATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3R 27156735 5' - pogo 2090 1 69.31 GCNGCCATGAGATTTAGTTGTTGGGCCGCTTGATGGGCAGCTGTTGTGGGTTTCTTGGTCTTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCTAAATCGGCTAAAATGG:1 + chr2L 18960131 5' - Fw2 147 1 60.40 CAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAAT:1 + chr3R 10030706 5' - BS 5072 1 54.00 TGGCGAGTGCCAGGAATCGAAACTGAAACTGAAAACTGAAACTGTTTTTCGTTCGTCGTTACGGAAGCGCTTAATCCTTCCCAAGACCAGAGAGCGCGCTC:1 - chr2R 15430487 5' + Doc4-element 110 1 56.44 GTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAA:1 - chr2L 21403539 5' + G5 4412 1 58.76 GGCTAATGAATAAGAATGTGTCTGGCCCTGTGAAGGCGATAAACGTTTGCTGTGATTATTTGCCGCCATATACAAACGAATGTACACACACACACACACAG:1 + chr2R 20714171 5' + accord 181 2 61.39 CGGTTACGATGCCGTCTGTCCTGACAGCACTTCATCCCTGCCCCTATCTCTTTCCCCATGGAGAGCAGCCCCTTTTCAAACGTGTGGGCGTGGTAGTTTTG:1 - chr2L 14874799 5' - INE-1 244 1 74.26 GGGGGTCATGGGCTCCCATGGCAGGCAACAAAAAAATATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 - chr3L 12172884 5' + 17.6 6958 1 65.35 AACCAGCGATTATATACATTTGCACAATATATTAAGTGTAGCTAGAGCAATTATCTCTTCCAATTTGCATGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTTCT:1 - chr2R 13540194 5' - frogger 2352 2 69.31 TAACGTTTCTATTGTGAGCTTTTGGCCTTAGCGAAATAAATAAAATTCGACAGTTGCGATGGACATCTCGTCTTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGA:1 + chr3L 22253036 5' - Rt1a 4726 1 67.33 ATATAATTTATAAGAACACAATTTCAAACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 8331272 5' - roo 361 2 76.24 GCTGCGAAAGCTGCCCGTCTGCCTACCTAAGCTTTCTTCGATCAGAATCACAACATGCACACATACGCGTTCTCGTCTCTCTCACACAAGCAAGCAAATTC:1 + chrX 10819945 5' + 1360 3256 1 68.32 AAACCATTGGAGTGCGAAAAAGAATGGAAAAAATATTCCCCAGCAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 681699 5' - Quasimodo 44 2 55.45 ATTGATCGATTTGCGAAAGGAGCTGGCGATAATCGATGGATGCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACA:1 - chr2R 19149460 5' + diver 37 2 57.43 GTGATAGATTAAATTTTCAGCAGTTTGTGGGTGTTGTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTGGCTTTTAGCTTATGCAGCGATAAACACAAAAATCCCAATCAAA:1 - chr2L 521964 5' - pogo 290 1 79.00 TCTGCATTTTCGAGTTTATTACGGCTTCTAGCATTTCGTACTCTGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGC:1 - chr2R 9213716 5' + Burdock 6165 2 55.45 TTTTACAAATTACTCCTGTGCAGGCTATATTTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr2L 7393720 5' - opus 7464 2 70.71 AAAGCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 9325605 5' - roo 9045 1 52.48 TGTTTCTGTATTGTTGGTGTGTTGAAGTTGGTTTTTCGAAGTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAG:1 + chr3L 25507558 5' - I-element 56 1 72.00 TTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACT:1 - chrX 23182913 5' + Idefix 26 2 55.45 CGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - 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chr2L 11764937 5' + roo 44 2 70.30 CAGTTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAA:1 - chr3R 1960323 5' - gypsy9 217 2 87.13 AGNGTAAAACAAAACTTCAATGTAATGAAGCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chrX 22745662 5' + copia 48 2 75.25 TATGTTAATGGAGGCTCAGCTACAAATTGCAATGTCTCTGTTTCGCCCTTTGTCTTTCGTCGACGCCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGT:1 + chr2L 2471910 5' - accord 7039 2 72.34 ATNATTCAGGCCTAAATACAGAAAAATAAATTAATTTAATAAAACATTTAAATCAAGAGAAGTTGCTAAATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTA:1 - chrX 11678712 5' - INE-1 552 1 52.48 GTGGATGTTGTTGTCGTTGAAGATGTAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGTAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCA:1 - chr3R 12311783 5' + R1A1-element 468 1 74.26 TGGCCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2R 17208508 5' + jockey 31 1 54.46 AATTTAAGATGAGTGAGCATAAGGTACGTCTATACTTTTGTAGTTTGTAACTTTTCGAAGCCACTTTGTCATTATCTATATCTTCGTTTCTAATGTACCAT:1 + chr3R 29596549 5' - Porto1 4370 1 73.27 TANCTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr2R 18723092 5' - opus 7452 2 78.22 AAGTAGCTGTGCGCCATAAGCTCCAGATGCAGTGTCTCGTTCGCCAGCGGCACCAGCAGATGCAGATCCACCGCCTGGAGACCGCAGGACACATCCCGAAG:1 - chrX 5703435 5' + gtwin 7374 2 71.29 GACAGATAAAAAGATATATGCTTTTCATATACAATAAAAAAAGCTAATAACTGCGTTATTGTTAGAGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCT:2 + chrX 20858697 5' - Copia1_DM 162 1 57.43 GCTTTTCCGATTGTGCCTGGTACGTGGCCATATCAGTGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3R 20584354 5' - 1360 3354 1 64.00 ACTATCTGCGTTGGGGCACGATCTGCAGTTGGCGGTCGGCGCTTCGGGTGGGGATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGA:1 + chr3R 31766168 5' - Doc2-element 366 1 55.45 TATGTGGTTTGTCATAGCCAAGTTTTACTGCGTATGCGTGTATGTAAAAATAGGAGTCGAAGCGTTAAAGGAAGGAGATCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCA:1 + chr3L 17653079 5' + gypsy8 443 1 54.46 TTTCACTTTACCAAAAGCCCCCTTTGCTCGCTTTGCTCGCTTGCTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGG:1 + chr3L 4751367 5' + R1A1-element 79 1 57.43 CTTAAAACAAAACCAAACTAGTGTGAATGCCAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACAT:1 - chrX 6620438 5' + I-element 457 1 77.00 TTTGTTGTTATGGTTTGAAGCTTGATTTTCTTTTCTTACAAAATTTTGTTTTATTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAA:1 + chrX 11821762 5' + copia 5037 2 61.00 ATATTCAATAGTTTAACATTGGTTTTATATTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGTCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 - chr3R 16593876 5' + Max-element 8283 2 73.27 TAAATGTCTGCACAGAACAGGGAATGAAACATAATAAAAAATAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGG:1 + chr3R 17204477 5' + HMS-Beagle 259 1 54.79 TTGAATACCGTTATGAACCCGTCATCATCAGCATCCGACTGCTGTTTGACCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 17729107 5' + hobo 13 1 55.29 AANAACAAATGAGTTGTCATACGCGGTGTCATCAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTG:1 + chr3R 21656031 5' - baggins 5029 1 75.25 GCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTT:1 + chrX 21564693 5' - diver 6058 2 81.19 GTTATGAACCCGTCATCATCAGCATGCGACTGCTGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chrX 17729098 5' + hobo 38 1 59.41 CAAACTTGGATATATTTTTTTCGACTTAAAACCACTATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTGTTTGGAAA:1 - chr2L 20266012 5' - roo 9027 1 69.31 TCATACGGTAAAATCTCAAAAAAGTTATTGGATTGCAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chrX 21388625 5' - 1360 3378 1 45.54 TCTCTGTCGCTCGCTAAAAACCCAATTAAACGCGTCATTAAATTATTTCGCAATTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCAT:1 + chrX 4813696 5' + I-element 5043 1 60.40 ATGAGGAGGACGACGAGAACGAGTCAGTCCTTGCGGGGATTACGTGTTGACGTTGAATGCGCCGCTGATCCACAATGTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTA:1 + chr2R 9657940 5' - P-element 419 1 68.32 TATGGTGTAGGTCTTGAAGCGATCCTTTGTGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTG:1 + chr3R 28834471 5' + invader4 2642 1 70.30 AAACATTTCGGCGTGCAGCCAAGGCAATTACGTCTGCCGATATTTAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3L 7781183 5' + 297 24 2 60.40 TCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGA:1 - chr3R 15790076 5' + flea 4734 1 57.43 GATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGC:1 - chr3R 10030761 5' + BS 5050 1 65.35 TGTAAAGCAATTGATGTTTATATGTCGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 11808942 5' - roo 9027 1 76.53 GAAAGCATTAGCATACAATCAGCACTCCAATCAGGCCAATCGCCCAGCATGTTAATTAAATGCTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr3R 31026014 5' - mdg1 7445 2 65.35 GANTTCCAGCATGACATAATTGTGAACCGAATGGTACTAAAAATATTAAAATACCGCAGGCCTTCACTGCGGGAAATGTCGCAAGACAATTTGAGTAC:1 + chr3R 10067397 5' + baggins 451 1 63.27 GGCAATTGAACAATTACACTCGCACACAGTTGCAGGCCAATTTTGGTTTAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3R 21206752 5' + P-element 27 1 50.50 ATAGAACGTGTACATAACTACACACCTATATGGATGGTACATTATATATCGAGCTATGTACATATGTATGTACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTT:1 + chrX 5933813 5' - Burdock 255 1 77.23 TTTGGCCCGAGGACGATTTAGCATGGCTTTACCCATCGCCCCTCCTACCCGCGACCAGACTACGATCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCG:1 - chrX 8016348 5' - invader1 85 2 55.21 ACGCTTCCCATTTCGGCGCCGGCCGCCGAGTTGCGCGACATCAAGCGAACAATTGATTGGTTTAATACTTGTGCAAATTTGACAAGCTGCCGCCATAACAA:1 + chrX 11093774 5' + HeT-A 236 1 58.42 TGNAGAAAAAAAAAACCTCAGCGAATGCAGCCAGCAGTGACACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCATAAGGTCTTGCTCTACAA:1 - chr3R 9887955 5' + F-element 4224 1 57.43 AGTTTTGTTGCGAAAGTAAAGTGGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 17729055 5' - hobo 2915 1 71.05 ATNGATTTATTACATGGCGACCGTGACAGGACAGGAGCCTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3R 991868 5' + Tirant 41 2 61.39 TAAAGGCAATTATTAGTGCGAGTGCGGACGGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 + chr3L 447288 5' + Tabor 13 2 66.34 GGCGGAAAAGTGGGCGTGGCCATATGGGTGAACAGACTTGCGCTGCGTTTAGAATCTGTATGCTACTCGGCTATTGAAACGGAAACGCTCAAGCCCTTTCA:1 - chrX 2774744 5' + Doc4-element 92 1 76.24 TTATAGCCCCCTTACTCTCATTTCCGTTTATTACTCTTATAAATTTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTC:1 - chr3R 25869404 5' + 17.6 7139 2 56.44 ACATATAGGCAACGAAGAAGCTCAAGTAGCCTAAGACTTCAAAATTTTGCTTTTTGGCATAGCTAATCTACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAA:1 + chr3L 11259301 5' + S-element 381 1 77.23 AGTTACACTCTGGCCATGTCTCCTGCGGGAATTTCGGGGTCCTGACCCACGAAAGTTTTGGCTTTTTAAAGCCGGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 - chr2R 22456279 5' + diver 5892 2 77.23 TTATTTTATTATATTGATTTAATTTTTCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCA:1 - chr4 929082 5' - HeT-A 6028 1 71.29 ATGAACCTAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3L 10557594 5' - 412 7495 2 74.26 TCAGAAGGTTATTAACCCTTACCCCAACTCTAATTATATTTTAATCTTTCAAAGTGGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chrX 20331803 5' - mdg1 399 2 51.49 CAATTGTTCATAAAACATTTGACTACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCT:1 + chrX 9448417 5' + I-element 5015 1 79.21 GAAAACAAAAACACAGTAAACCGTAATCCGTAAAAATTGAAGAAGATGAGTTTATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr3R 445999 5' + pogo 18 1 61.39 AGCAATTCAAGGGCCGTCAATGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1 - chr3L 23821842 5' + HMS-Beagle2 44 2 75.76 ATATTATCATATTCTTATCTTTCATTTTCCTTAGTATCATTACTTTTTCCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 19053052 5' - roo 9047 1 53.47 GTTGAAGTTGTATACGAATCCGACTCCGAATGGGAACGTATCTGTATCTGGAGCTGTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3L 447388 5' - Tabor 465 2 58.42 AANTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 29423520 5' - roo 358 2 77.23 GCACGTTGTTTGGCCGAGGACTATGGCTCCTGGGAGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 + chr3R 17665981 5' - Transpac 271 2 65.35 TTTAATCATTGGGAAAACATTTAATTTTGCTGTTTTTTTTAAGTGAATTGATAGAATAGTGCATTACCTATACAAAAACTATTTAAAATGCATTTTAAAGT:1 + chr2L 10061418 5' + Transib5 265 1 78.22 ACGATTCCGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 - chr3L 13345532 5' - Transpac 5212 2 61.39 ACGAAAATAAGACAGACACAGACACACAGGTGGAATCGTGTTCGCGCATTGCCCTACCCTACCTTAGACCACTTTCCTTAAGAGCATAGCTCTAGCGGCCC:1 - chr3L 7295245 5' - gypsy12 9876 2 77.23 GTTAACCCCAACTGCAGCTAGTTAGTTAGTTTCTGGCGACCTGCATGCATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 + chr3L 19413932 5' + Burdock 6162 2 53.00 CAATTGATTGGAGTTGAACTTGCTCGACCGGATATTGCAGTATCAATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr3R 9322909 5' - 412 7538 2 70.30 CGAGTAAGATTCAAAGCGTGTTCGCATAAAAATGCCAAAGCCAACTGCAGGGTAAGCTGAAAAATAAATAGAACATGATAATTTAGCCGCCGTTTACAGAA:1 + chr2R 5178567 5' - mdg3 248 1 75.25 TATCGGAGGAATAGCAGGGGCATCAATTACGAGGGGATCTAAGCCAAGTCTTGAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCA:1 - chrX 19810579 5' + INE-1 568 1 58.42 CAGCAAGCTCAACAGGAGCAACTGCAAGAGGAAGATGTTGAACAGGTGCAGCAGGCAGTCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAG:1 - chr3R 15272431 5' + R1A1-element 474 1 57.43 TTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAG:1 + chr3L 24213780 5' - invader2 215 2 57.43 GGACATGGGCACGACTGTTCGCCGCTAAAAAAAAAATTAAATTAAAAAAAAAAACAGATCAGCGGGACGGCGGACAAAAAAGAGTACCTATTGAAGA:1 + chr3L 8860867 5' - Circe 7242 2 63.92 CCTGCTTCCTCTTGTAAGTTTATGCTCTCTCTTAGGCTTTCCTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACACCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGT:1 - chr2R 2047642 5' - Bica 4913 1 59.41 GCCGAAATATATTTTTGCCCACAGACAAGCTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:1 - chrX 21636235 5' + Stalker2 47 2 71.29 TTATTGTATAATAACTATGAGAGTATTTGTATTTGGCTTAAATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 11764889 5' - roo 9037 1 60.40 CTATCTTAAACATAAATATAAAAATATAAAAATTTATTTACTTTTATTCTTAAGTAGATTGTTTGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCG:1 - chr3R 28108737 5' + R1A1-element 5030 1 67.33 AAGGTCTAGTTCAGAGTAGTTATCGATTTTTCTCCGCTAGCTAAGGTTAAAGGCCAAAATGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGAC:1 + chr3R 23494062 5' + G2 2921 1 66.34 TGAGAACTTCGAGAAGTGCTAAGTTATAGTTATCTCTCTGCTGTGCGACAATATTTGGTTCGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr2R 3287464 5' - P-element 2872 1 42.57 ATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGG:1 - chr3R 1868224 5' + G-element 30 1 50.50 AATAATAATAATAATAATTATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCC:1 - chr2R 11721487 5' + invader4 2773 2 56.44 ATCTGTGATTGTTGTACTCGTGGGTTCCCCTGCTGGTATTGGAAATTTTCGGTTTGGTGAACTTGTTGATTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCA:1 - chr2R 2949140 5' + 17.6 4 2 76.24 AGACCGGAAAATAAAGGGGATTCAGTTAGATGGGTAATGCCAACTTTGCTCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr2L 19644942 5' + blood 27 2 52.48 GCCCTGAAGATTGCCCAAGGACCCAGATCCCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGG:1 + chr2L 9161418 5' + R1A1-element 4975 1 71.29 AGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAG:1 - chr3R 15790061 5' + flea 4747 1 71.72 CAATTCCTGCATTGCGGGGGTAATAACTTCCCGCCCTCCCAACTTTGGGGAATAGACGGCGGAACAAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr2L 18178001 5' - 412 485 2 68.32 TTNAATTCGAAAGAACTCGGCGATAGGAGACGTTAACAAAGCCGTCCACACGAGCCAATTTGCGGGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAAC:1 - chr3L 18476551 5' + accord 14 2 61.39 GGNTAGTAGAGTCATGCTTAATTATACTTAACCCCTACCCAAGTACATCGAGAGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAA:1 - chr2R 8550014 5' - G2 2938 1 57.43 GCTTGCTTTGCCAAGCTTGGAATTTCCCTACGAACACGTTCATTATTTAAATAAACTAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTT:1 + chrX 13086176 5' - Tc1 1244 1 61.39 TCACCCAGCATGTTAATTAAATGCTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr3R 31026053 5' - mdg1 7406 2 80.20 TTGGCGACGAGGTCTACAGAACTTCTCCGCCTCTAGCGAAGAGCTCGGCATTTGACTTTATTTCGATTTTAACAAGGGGAGCACCTGTGATTGTTCTTAGC:1 + chr3R 893154 5' - G3 4273 1 56.44 GANAAAGAGAGGCTAGGGAGAGTGGGAGAAAGTGGGTGAGGGGAGGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTC:1 + chrX 16456902 5' - F-element 228 1 53.12 ATATCCGTATGTAGTCTGTTGCATTCAAGACCCCATTACATAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr3L 7629565 5' - opus 466 2 61.39 ATGGCAGTGCGACGTGGCTTTAATTGCACTACTGACTGCGAATCCCGCATTCGTTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGC:1 - chrX 11480536 5' - Quasimodo 317 2 58.42 GACTCCGCGTCCTCCAGATTTCGTCACCTTGCCTATGCTCCTGATCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAG:1 + chr2L 22323620 5' + F-element 411 1 58.33 AATTTTTAATGTGAAAATATAATTTTTCACCATCAGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 + chr3L 13345423 5' + Transpac 4927 2 70.30 TTATACATTTATTCTTCATCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 + chr3R 4971162 5' - 1360 3357 1 57.43 TTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 29423523 5' - roo 9019 2 80.20 GCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 - chr3L 27415327 5' + transib2 3 1 76.00 ACTTGGTGGGACACATGGCGTCCAAGGAATAGAACGCAGAAAAACAGAAACTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGATCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 + chr3L 7936742 5' + 1360 84 1 59.41 TGTTGCAACCTTTTTTTGGAGCTCAGCAAGCCAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3L 13704635 5' + hobo 11 1 68.32 AGCAGCAGTGATATATGCCATCTCTTACCATTATTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAATCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:1 + chr3L 4859327 5' + jockey 4803 1 65.35 GCAAAGAAATTTCGTTAATGGGGAAGCGAACAAAAAGTCAAGAAATGCTTCTCAACGTTCAAACGGACGGACAGACAGACGGACATGGCCAGATCG:1 - chr3L 3728580 5' - INE-1 113 1 52.08 ATTGGGAGTTGGGGTATATTAGCTGTTGCAATCTATCTCAATGGTTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr2L 8841058 5' - P-element 2858 1 48.51 CTTGATCAGGATAAAGCGCAAGTCCAACTGGCCATGTCAGTCTGTCCGTATAAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCA:1 + chr3L 25304772 5' + INE-1 169 1 91.09 ACAGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 - chrX 21087682 5' - mdg3 5492 2 64.36 ATGTTAAGCCATAGATTTGCACCTCCACCCGCTCTTGAAAGTACAATACCACCATCTGGCTATAAACCTCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCC:1 - chr2R 16085992 5' + G-element 4150 1 54.46 TCTCATTTATTTGTGGATAGTTTGTTCTTGGGGCTTCACGGGTGCATTCGGTTTCATTTCCAAATATATCTCCATGCCGTCACCAAAAAAGTGTCTGCATA:1 + chr2R 17188413 5' + 1360 3337 1 81.19 CGATATCCGAGGTGGAAGTACAATCTGGTTATTTGGCTAGAACTCTATTTAAGGCGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 5925538 5' + roo 8678 2 60.87 CACTGAACTATGGTAATAGTGCGGCTGCGGTGCCTGTGCCTGCTGCACGGTTGCTTTCGCAGCTATCTGAAGCGCTTTGGACATGTGGAGGCGGATGTTTG:1 + chr3R 4797111 5' + Rt1c 5051 1 56.44 AGNGACAACAGTGCAGCACAAAAGACACCCCCAAATCCACCCAACGGCCCACCATCCGCTCCTGTGGAGCTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCAT:1 + chr2R 6096723 5' + diver 363 1 40.59 AATGGGTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 - chr3R 27452385 5' - roo 9032 1 69.31 AANTATCTATATATATACTTTAAAAGTGAAAGCATAATCTAAACACACATATAAACACAATATTATATTTATTAATGGCTTAGGATATAATTCATAAATTC:1 + chr4 1271445 5' + Quasimodo 99 2 71.29 CAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3R 22494161 5' + 297 47 2 76.00 AATTGTAGACAAAAAACGATCAAGGTAATGGCATGTAATTTCTATAGCAACAAAAAAATAACAAAAAAATGTTTAAATATGTTTATGTCTGTTGGATTGGG:1 - chr3L 14210232 5' - Quasimodo 292 2 72.28 CCTGGCTCCTGATTAATTTTGCTTTATCATCCGAGTCCCCTACCTGTTAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATATAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGT:1 - chr3R 9973423 5' - Circe 7142 1 61.39 ATNGCCTCAAAACGTGAACTTTCAAGTAACTTCATGATTTATAAATTAAATTTAAATGATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr2R 1516586 5' + Transpac 4937 2 61.39 CACACAAGCATAAACACAGACGACCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAA:1 + chrX 522147 5' + transib2 51 1 77.23 CACTTTAATCGGCGCATAGTACACGCGTTTTATTTATTTATTTAGAAATTACAAACATTACAGACTAGTATAATTGGATATAATATAAATATATTAATGAA:1 + chrX 3217029 5' - gypsy7 5060 1 71.29 TTATTATAAACTGAATACGCCCACCGACGAACAAGAAGAGGCGCCCGGCCGCTCGGTTTTTTATTAGCATGCATACTGCGCAGATGGCATACAG:1 - chr3L 11684095 5' - 17.6 138 2 73.40 CACATTTTTACGAAATTTTTAAAGTAATCAATTTCTTCAGCATACTTACTTACACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr2L 9488240 5' + 297 6600 2 49.50 AATGATTTTTTAGCGATGAGGCCTTCCAAGCGGCAATTTGAAGTTGACTAAGTTAAGTCGATTGGTATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACT:1 + chr2L 2831901 5' - BS 4818 1 71.29 CATAAAATACGAAGTGAATGGGACTTGATTTGATTAAGATTTTCTGATGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr3R 12514835 5' + opus 7026 2 56.44 GGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chrX 10644863 5' + hobo 50 1 72.28 GTGTGTGCCTTTCAAATTGTATGCAAGCAGGTCAAATAATGGCAACAAACGAACATTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chr2R 17938865 5' - copia 235 1 59.41 ATNTTATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr3R 20373252 5' + I-element 42 1 65.35 GGCCATATAAAAAGCAAACGTTTATTTAATAGTATGTACAATATTATATATAATAATATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 9437281 5' - roo 391 2 64.36 TGTTTATATTTTTTAAAATCAGATTGCATGAATAATATGTACAATATGTTGACTCTCAATGTAACGGTTCTTTTATTTTTTGGGCACTTGTTGCAAAAGTG:1 - chr3L 17655767 5' + Tc1 173 1 50.50 CGCAGTGCTATAATTATTTATAATTAATCAGTTCTTGTAGAATTCGCCGTCTCTTGTTCGCTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCG:1 - chrX 9657198 5' - I-element 323 1 53.47 CAATAACATAAGTTATCTTGTTATGACACCTCATAGACATATGTACATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1 - chr3L 20209635 5' - Burdock 6364 2 57.43 GGAGCCGCCGCCGCGCACGCGCAAAAATGAAAAGCCCATCCGAAAAAGGGGGGGGAAAAAAAAATGGAAAAGAAAAA:1 + chr2R 16840294 5' + Doc2-element 234 2 59.74 TTNGGTAATTGCATACATATGTACGTACATATATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACG:1 + chrX 1904009 5' + gypsy 43 2 70.30 ATTTAAAATATTAAGCAATCTTTAATTCTTAAATAAGGTCACCGTACTCTTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTC:1 + chr3L 18511029 5' + Ivk 1 1 74.26 TGATTTGATTTGGTTTGGTTTTTTTTTGTGGTGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 + chrX 20803565 5' - F-element 4413 1 68.32 CTGGTTCGCAACGACAACAACAAAAGGACAAAGCGCGCTCTCCGGTCCACGGAAATCAACAACACCAAACAGCACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAG:1 + chrX 18155439 5' - Cr1a 220 1 62.00 TANTAAACTTGCAAAAATGTCACGTACTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chr3R 26255126 5' - opus 7457 2 78.00 TCTGATAGACCTTGTCCAGTTCCTTGACAAACAGAGCTTTGACCTCAGCCTCGTCCCAGTAGCCGTTGCTCGTCGCACTCTCCAGTGAGCTCAATCCATGT:1 + chr3L 17798976 5' - G3 4525 1 72.28 ATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 + chr3L 9909710 5' - Transpac 5184 2 65.35 AACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACTG:1 - chr2R 9789008 5' + blood 27 2 53.47 GAGCTATTGCCGCATCCCAAGTACAAGAAGGGCAAGTCGCAGAAGTACGACATAGCTCTTTGTCGGACCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCAAAATAAACAG:1 - chrX 1709660 5' + diver2 4821 2 54.46 CATTTTGGCTCTTTTCTTTGCAGGGATATTTTAACGTGTTTTGCTTTCGGCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 - chrX 22745720 5' - copia 229 1 53.47 ATGATGCGTTTCGCCCGCCTTTAATTTGATTTCTCCAGTTCAGTACGGTTTGGTTCGAGTTGGGATTTGCATAAGAACAAGCTGTGTCTGCTTCCCCTTGA:1 - chrX 7622696 5' + diver2 4473 1 78.22 TGAGCCTCAACAGCATCGACACCCTGGTGGAACTCAACATGGCAGAAAAACAGCAAAGGATATGCAAAAATCAAAAGGAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 21076324 5' + Doc2-element 240 3 60.00 AAAAATAAAACAGGAAAATATATTCAGGCTTTTATATTAATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1 - chr2R 5953169 5' + 17.6 6960 2 70.10 AGTCCTGGATGGGGTTCGGCACCTGTCCGCGCACGGTGATCTCCTGCTCTTCGCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGT:1 + chr3R 6004714 5' + opus 7426 2 55.45 GCTTATCTAGTAAATTAAGTGGATTTGCTTATATAAATATGATTGTATGATTGTAAAATAACGTATAAGTTAACACAATCACAAAAAACCCGAAATATA:1 - chrX 6883343 5' + Burdock 6147 2 65.66 GTTTATTCCTTTAAAGCTTAAACTAATGTTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3L 15681598 5' - pogo 2060 1 68.32 GTGCGAGTGCGGACGGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 + chr3L 447303 5' + Tabor 28 2 53.47 CANCGGCAGTTAACCCCAACTGCAGCTAGTTAGTTAGTTTCTGGCGACCTGCATGCATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 + chr3L 19413924 5' + Burdock 11 2 64.52 TTNCTCGGGTTCTTTCGCTTTTAAGCCGTTTAGTACGTAGGCATAATCGCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTA:1 - chr2L 3346656 5' + Rt1a 5022 1 73.00 CTGGGGCACAGGGAGCTACGTGTAAATGTCAAAGATATGCTGAGGGATGTGGACTCGAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr2L 21323329 5' + hobo 19 1 60.40 AAATCAGCTGGGTTAACTATCGGTCTAAAAATTCTCAAGCTTTTACTCATGTTCTAGAAATGTCCCCTTCTGAAGGTATTAATTTGCTTCCTCAGATTTTG:1 - chr3L 23750879 5' + Gypsy12A_LTR 2063 1 73.27 AATCGAATGAGGATACCAAGGGTTAGCTAGTGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGG:1 - chrX 1636974 5' - Idefix 201 2 69.31 ACATTCATTAATTTTCATTTTCGCTATGTTGTTATCAAAAACCAATTTTTATTTTTCCATGTATCAAATGAAAAGTTGGTTTAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 24436587 5' + TART-C 11100 1 71.29 ATTACAATTTCATGAACTTGGCGGCATAAACTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTT:1 + chr2L 16546111 5' + Cr1a 238 1 69.31 GTAGTGTGAATAATGAGAAATTTGTGGCTACTTAGGCTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGG:1 - chr2R 3334251 5' - Quasimodo 6926 2 65.35 GGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:2 + chr3L 447317 5' + Tabor 6881 2 67.33 CATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTC:1 + chr2R 5582160 5' + Cr1a 434 1 74.26 AANCTAAGCACAAAGCAACTGCGGGCTGCTCTCAAAAACCGAAAAGCAATCAGCGACTAAGCTAACACACTCAGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCA:1 + chrX 6497195 5' + gypsy5 7072 2 76.24 ACAAAAGCATAATATCATAATATAGATATTTACAATTGGGGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 16699007 5' + roo 8701 2 64.36 TTTGGCCCGAAAGTTGGCCAAGTTGCCCTGGCCGCACAATTGTTGCACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAAG:1 + chr3R 11114071 5' + 1360 3254 1 59.41 TAATCTGCGAGAGAAAGAAGAATTTTTTGTATTTATTTGTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chr3L 12160147 5' + pogo 35 1 65.35 GCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2R 5485125 5' - 1360 3348 1 67.33 TTTTGTCGAGAAAAGTGAGATTGCTTGAAATGATCTAATTTATTTATTTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 + chr2L 8649183 5' + F-element 16 1 68.32 TTATTTCTGTGTCTTCCGCTTTTCCCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAG:1 + chrX 10119553 5' - FB 13 1 56.44 TCCATTTTTAGTTGCCAGCCGAAGGATGGGGGATAAAAGTCCTGGCGCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCGGATGTATACTG:1 - chr3R 28126823 5' + Bica 79 1 53.47 CTCATATGTACGCATGAGTTGATGGATGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 - chr3L 12352939 5' - Tirant 352 2 74.00 TTGCCATTGCCTTTTTGGCCTGCTTTTGGTTGCACTTTTCCCCTGCCACCTCTTTGCCCGCTGAATGCGCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 6442579 5' + roo 4 2 30.30 AGGCCGTAAGCCGATTTCGAAAATTAACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACG:1 - chrX 4175118 5' + I-element 355 1 80.00 TTTTAAAGAAAAATATTAAAATATTCAGCACAATTAAAGTGTTTCAGCTGCTTGGAAATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:2 - chr2L 11314111 5' + 297 6588 2 67.33 GCTGGCTTGGCAAATTCCAATTAATTTATGAGCCAAAATCTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTT:1 - chr2R 19506683 5' - I-element 47 1 57.89 AACTATAAGGAAACTAATAAAAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACG:1 + chr3L 27181998 5' + F-element 261 1 59.41 TGAGCGCCAGCAAAATGTGTCCCGGATCTTTTGACGTCATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAG:1 + chr3L 12472155 5' - gypsy12 9971 2 62.38 GANAAATGCCGCCGCGCCCGCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chr2L 18987313 5' + P-element 54 1 24.75 GGAACAGTGCTCTTTGCTCTGGAAGCAGTGGGAGTGGTAAGTCTTAAAAATAATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr3L 1973434 5' - flea 232 2 54.46 GATGTGGAAAGCGTAGGAAAAAAGGTAGTAGACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCGAGCAAATTATATTTTTA:1 + chr3L 11216646 5' + 1360 3264 1 69.31 AATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCA:1 + chr2R 4673580 5' - Quasimodo 7335 2 66.34 TTTAACCTTTCTGCCGGCAGGTGAATTTAAAGTGGAGCCCCATTGATTGAGCGGACATATTTTGTTGGCTGTCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCG:1 + chr3R 27383867 5' - 1360 135 1 66.00 CAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 + chr2L 20360646 5' + micropia 4975 2 58.42 GGCATAAATGTTTCAGCAGCATTTTATGCAAATGAGTTGCATCCACGCACACACACACACACACGCCACCCAAAATTGTCGCGCACACTCTTGAAAAATGT:1 + chrX 12254170 5' + INE-1 255 1 63.37 AAATTTTATGACATAACGTTTGACAGAAAACCTTGAAAAAGTTTATAGAAGAGGGAATGAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAG:1 - chr3R 1852068 5' - Cr1a 4298 1 58.42 CAGTGGAAATTTTTTTGTGCTCAGCATTTTATGCACGTCTTCCCAATTTATAAATCATTTTTCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 + chr3R 20373227 5' + I-element 17 1 61.39 AGNCTTGGCTTTATATAGAGTTTTCCGGCTGGGGACTCCCGGTAATTGCTTCAATTTGGCGTACATATCCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3L 7968765 5' - hobo 2933 1 73.27 GCCAAAAGCCAATAATGGAGGCAAACGCGACTAAAGAGTGAAAGGAGGAGCCCTCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACTTGGCCTCACATTCTG:1 - chr3R 17818681 5' + Rt1b 4950 1 78.22 CAACCCACAGCTGCCACATCGTTACCAATCTATCGTCACAATGGCGACAACGTGTCTATCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGC:1 + chr3L 1712264 5' + F-element 4489 1 60.40 AAACCAAAAAGGAAAACACCTTTAAATTGCCAGTTAAAGTTTTTTTTTTCTGATTTCCCACCTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGAC:1 - chr2R 13651469 5' + flea 4826 1 68.32 CCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCC:2 + chr3R 19450113 5' + F-element 400 1 57.43 GAGGAGAAAAATGATGGCACTCAAAGTACTCGAAATGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAG:1 + chr2R 21027523 5' - F-element 457 1 60.23 CTCATTATAATTTCTATAATATATATATATGTTTATCAAAAATATTTCAAATTTGGTCTTACATAGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3R 2161813 5' + 1360 8 2 69.31 TTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGT:1 - chr3L 6013727 5' + Max-element 8241 2 64.00 TAAAAGTATTTCGCGTGGCATTTTAGGTGAGGCAAAAAACCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chr3R 12554941 5' - mdg1 7423 2 59.41 ATAGCTGGTTTTAAACTTACTTTGACAATTTTGCACTTAATAATTGCTTGATCGCTATGTTTCCATATTTGCTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATTCAAAC:1 + chr3L 15585522 5' - Gypsy6A_LTR 167 1 73.27 GCNAACAAGTCATTGACAAACTGCCAGCCAAAGTCGAAGTTGTGGACACATTGAGGATTAAAGCCACCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 9141542 5' - roo 398 1 65.35 ATGCGGGCCTCGCCAGGAAGTGGACAGTTAAGCAGCAGCTCAACTCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2R 13334885 5' + pogo 29 1 55.45 CTATCAGATACCCCTTAGTCAGTTAGTGTTAATGCGAAATTCATCATTTGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACAT:2 + chr3L 23127714 5' - INE-1 30 1 88.12 GCTCTTTCTGGATCTGGGGTTGTAAATGTATCTGGGTTTTGTAGTTTGTTGTCTTCGTACATTCACCTCTCCTTCTATCTGAGTAACGGGTATTTGATAG:1 - chr3R 5205491 5' + INE-1 547 1 74.00 CGTGATACGGGTGCAATAAAAATTGCAAGTGAAAACAAAGTCTCATGCGATAATAGGAACATCGGGATACAGAAGGGAAAAGCGAAATAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 1586493 5' + Rt1b 5143 1 54.46 TTTTCTTATATGTATGTATATGGCATGTATTATTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATGAAAAAGCAATATACA:1 + chr2R 15324361 5' + Porto1 4227 1 68.32 GGGCGCACTGCAGGTGACCTTCGGTCGCAGCGCGTCAAAACCCCCCCAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCC:1 + chr3L 17223995 5' + accord 6908 2 60.20 TACAGTTGGCAATGGCCCATGCCATTAATGTGGACGTGGTCTGTATATTTTTGTTATATTGATAGAAATACAAAGACAAATAATAAAATAAAAA:1 + chrX 11410043 5' + Rt1b 5143 1 76.60 ATAAAACATTTGACTGCACAAACAGTGGGCCACAAAAGTCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGAGGCT:1 + chrX 9448426 5' + G-element 3975 1 60.61 GGNGGTAATGAGGAAAATTATACTAATTCGTAGCTGCTGTAGATTGGGGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTATTTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr2L 12283937 5' - 297 6955 2 55.45 AAAGCAAACCAACCCGGAAAAACCGCGAAAAATCCATTGCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAAAGCAACACTTAG:1 - chr3R 17674383 5' + blood 37 2 62.38 GAGATCAAGTTGCTTATCTCCAAGAAGTTTGACGTGGTCGACGGCGGCGATCTTAAACATTGTAGTTAATTTGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr2R 912942 5' - mdg1 402 2 60.40 AAGCTACTCTAATAACCGAAAAATCCAGGTGATTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGG:1 + chr2L 2454273 5' - F-element 4408 1 72.28 CGTGTGTGTTTGTGCATTTCCGTTTCCGTTGAATAGTCGTGTTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATG:1 + chrX 4884722 5' - I-element 4882 1 64.36 GGNCGCTGGCAATCGAAAACTGTTGCATACTTGGCAGCTGCACAGATATATATATGTACCTATATACGAGTATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 13403828 5' + jockey 12 1 72.73 TAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAA:1 + chr3R 19450177 5' + roo 8710 2 58.42 CGATTTCGCTAACCGAACAAATAGCGGTTTTAACAGTTTTTAGTTAATTGCGCAAATTACTTGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTA:1 + chr2L 17049232 5' + diver2 4687 2 64.36 GACCTCTTTAAACATTATCTTTATAGCTTACTGATGACTACATAAGCATTCCATCGTCCGAGTAATACGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAG:1 + chrX 13264319 5' + Stalker4 170 6 65.35 CTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTT:1 - chr3R 19449429 5' + roo 8624 1 59.41 ATGCGCAAACAGGAAGCCACATGTGTAATTAGGAGGCCAATGCTTGTCTCAAAGCTCCTCCACGGCACGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCC:1 + chr3L 21563754 5' + Max-element 8326 2 66.34 AANAGCGGAGAATCGTATCGAAGGAAATCAAAGTATTTACGATAGCTACAATCCATAGTCCATAATAGTCCATAATAGTCCATAATAATAATAATATTATT:1 + chrX 13366990 5' + mdg1 7074 2 58.42 ACCAAGGCTACCAAGGATCTCCGAGGTGGGCGGTGCGGCTGAAGTGGGCGTGGCGCAACTCGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACT:1 + chrX 20388617 5' - I-element 2 1 63.37 GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCA:3 + chr3L 11115124 5' + micropia 4988 2 54.46 AGGAAGATGTCGTCTTAATGACTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 - chr3L 6442672 5' - roo 9039 1 57.43 GATATATTACTCCACTGCTCCCACTCACCGTAAGTGTTTTACCAATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCT:2 + chr2R 16938763 5' - flea 4778 2 56.44 TTAACAAAATAAAATGATATATAAATCAAATCAAAGTGGATAACTGCACCAATCAAAATATTTATATAAGTTTAATACAACATTTAGCAAGTGGTGTCAAC:1 - chr3L 13989597 5' - hopper 1062 2 24.75 TACGCCCACGCCACTCATCCGTCCGGTGGGGCCCGTGTTCCCACTCCTCTTCTCCAACCTCCGTTCACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTT:1 - chr3R 23805132 5' + 1360 3234 1 73.27 AAAACACTGTGGCCACGCCCATCTTTCACCTACAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAAGTAACGGGTATCCAATAGTCGGGGAACTCCACTATAGCATTCT:1 - chr4 976480 5' + INE-1 572 1 69.31 TTTATTCCACAATATTTATCGATATCCGAAAAAAAAAATATTAAAGTTCGCGTTCGCATTCTCACCTGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACT:1 - chr2L 23075321 5' + INE-1 557 1 73.00 ACTTCTGCGCGAAAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 9439846 5' - roo 386 2 55.45 AAAGGAGATTGGTTGCTTTTATGAGAGAAGTGGGTAAAACTCCAACCAATGATGATATCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 17172744 5' - roo 396 1 63.92 ACTAACAAACAAATGAGAGCCAAAAACAACAATTAATAAGATTAAGAAATTGAGCGTGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATCA:1 + chrX 5254042 5' - gypsy12 10030 2 75.25 GCGGGTTAATTATGACTTGAAAGCATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAAATTGGTTTGTAGAGAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTC:1 - chrX 21452843 5' - INE-1 574 1 47.31 AGNACTATAGAACTTGAATACCGTTATGAACCCGTCATCATCAGCATGCGACTGCTGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chrX 17729120 5' + hobo 16 1 64.36 TAATGTTGTTTGGTAATAAAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGTTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGAGA:1 + chr2R 24812529 5' - Stalker4 7270 4 83.17 AANAAAAAGGAGAAATATATATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 7103191 5' + S2 1621 4 91.18 GCTAATTGTGTTTATGTCTCTTCCCACCACGCCGCGCCATGTGCCGCCCACGTACGGAACATGACATAAATCCTACTTAATTCAAACCTTCTAAATATTAC:1 + chr3R 26043426 5' + jockey2 3232 1 58.42 CACTGTTCTAGATTTTATAGATCAATGTTTATGGACACCCGACTCTTTCGTTCCAACTTTTCACATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATT:1 + chrX 8150381 5' + rover 4 2 75.25 AAAAGAAGTGGAATAAAACAAATTTGATTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr2L 18214124 5' - hopper 1374 2 66.34 CACTCTCGCACTTTTGCCCCGCTTCGATTTCGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCAAAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTG:1 + chr2R 17314327 5' + baggins 5183 1 71.29 ACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAGGAATGAGCTACAGTACTTGGGCAGCCTCGGCTCCCT:1 + chr3L 25232913 5' - Osvaldo 1111 1 79.45 ACNAGCGATTCTCCCTTTCGCACTTCTGCGCGAAAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGAC:1 - chrX 9439867 5' - roo 9070 1 75.25 ATTCTTAAATAAGGTCACCGTACTCTTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 + chr3L 18511053 5' + Ivk 25 1 52.48 CACACACACTCGTATAGTATATGCAAATGTGTGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 + chr2R 8314161 5' + hobo 44 1 74.26 TATCTTGTCATATAATTTTTCTTAGGTATATTAATTAAGTACACCATCAACCAATCGATAAAAGAAGCTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 - chr3R 4600520 5' - Tabor 476 2 70.30 GCNGCTGACGTCGTCACTTCGCCCCGCCCCCTTGCCACATCCACACACACACACACACACACACACACATATA:1 + chrX 18002144 5' + accord 184 2 73.97 AAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGC:1 - chr2L 23295877 5' + micropia 4971 2 59.60 TTNAATATTTTATTTTCGCCGTGCAGTTGATGTTGTCAACAAACGGGATCGAGCTCAATGAAATTAATGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr2L 20913930 5' + P-element 5 2 71.29 ATAGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 13225472 5' + hobo 6 1 73.27 CGAGTATTCTCTTCTGCTCGTTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chrX 10644785 5' - hobo 2937 1 78.22 TTAAGGCGCTATATATAAGGAGTGGAAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTT:1 - chr3R 27365243 5' - Quasimodo 7037 2 77.00 CGNGTGCCCGGGATGACTCCTGCCCGAGGGGTGGTGGTTCGTCTGGTGGTGAGACTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTG:1 + chr3L 19010817 5' - F-element 4463 1 48.51 ATTTCAATCAATTCAAATAAATGCGCTAGTTTAAGTGAGTACTCACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr2L 14255617 5' + pogo 29 1 55.45 CACCTATGATCGAATGAGTTGGCTATTTGGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 6082624 5' - roo 9026 1 73.27 CTTGGCTCACCTGGGCAGCCATACGAGAACAAAAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATG:1 + chr3R 30963090 5' + HMS-Beagle 6673 1 67.33 GTTGAAAAGGCTATAGACAGTAGCATGCGTCGCTGATCGGTGCGAACGGGTCGCAGCCAGCGACAAGGAGACGCAAGAAGCGTCATTTGTGGAGACCGCAG:1 + chrX 6316767 5' + aurora-element 357 1 61.39 ACNATTAAACAGCTAAAAGATTCCAAAGGGCCAACCAGAACTGAGAGCATTCCTACTAAGGTGCAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGAT:1 - chr3R 15790097 5' + flea 4713 1 73.27 CGTTTAAGCCAATATGCAGGCACTTCCTCTTAAGCTATATATATGTGATGTAAAACGAAAATTAATTTAATTCAAGCAACTTAGCAAAATTCTGTTGCTTT:1 + chr2L 9820684 5' - Copia1_DM 4249 1 78.22 CTTTCGTTACTTTTAGATATCAAATCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGT:1 - chr3L 3516251 5' - jockey 4583 1 76.24 GCGACAATCTGAAATCCCCAATTATCTTTTGTATCGATATGTATAAGCGTATAAATAAATTAAATGTGTGGGCTGCAGGGGGGTCCCTCGCTGCAGTCAC:1 + chr2L 11760897 5' - gypsy3 352 2 62.00 GATGGGACCTTACAAGATTGGGATATAAGGAAGAGATTTTTAGCAGGCGAGATGGAATTCTTGGTGGATCAATCAATATATAAATATATATATACAAATAT:1 + chr3L 5622444 5' + Stalker 6936 4 52.48 TTCCCTTTTGGTCCATGTGTCATTATGTGGTATACACATTGTTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCC:1 - chr3R 17352467 5' - micropia 5240 2 58.42 CTAAGTTATACATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTAA:1 + chrX 13328862 5' - Doc 4702 7 68.42 CAAGGTTTTTGTTACAAATTTCGGAAGATAAACATCAGGAAAATATATATATATAATTATATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAAATTTTAT:1 + chrX 23182832 5' - Idefix 7365 2 60.40 CCACTCGAAGTCCCATCTCTAATCTCGAGTCCCTTTCGCACTTGCCCGCTACTCACATGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2R 8951085 5' - P-element 2868 1 60.40 GCNGGAGGACCCGTCAAGGTTAGGCTCGATTTAGTAGAGATAAGTAAAATGGCATTGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTT:1 + chrX 1229215 5' - 1360 3012 1 62.89 TGCATGAAAACTGTTGTCAGTTGTGATATCAAAGAAAGAGCTTCATAGCGACCTCTGCCAAAGTGCAGAGCTTTGCCGGCTATGCTCGAGCTTCCGGCCAA:1 - chr2R 5609188 5' - gypsy3 6618 2 69.31 CAGGCAGTACTTGTCCGCGAGAGCACTGAGAGAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 - chr3R 28117806 5' - I-element 5315 1 68.32 AGNAACAGCTGTTATTAACAACGGGGAAGTATACAATACATGAGCCATTGAGAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 - chr4 1269617 5' + Transpac 26 2 52.48 CANTACGCTGGTTTAAATCCACGCATGTGAAATTACTTTGGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr3R 10824055 5' - 412 7510 2 60.40 AACTGAGGAATGGGTTTTGGGCATAGGATGTACTGTCATGATTGTTGGTTAAGTGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTT:1 + chr3L 7729365 5' - I-element 125 1 68.32 GTTACATTTTTGAACCAGAAAAGTTCTTAACTTTTACAGGACGCGCTAATACTCTCCGGGACGACAGATATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTT:1 + chr2L 17117992 5' - Bica 135 1 64.00 TTACGATTATGACTGCGTTCTATATAGACCATATACATACATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATAC:1 + chr3L 11450474 5' + Transpac 32 2 60.40 CACACATATTGCGCATACGGCACGTTGTCAACGTCAAGTGCCTGAGTGCGACAAGAAACTTAATGAAATGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCG:1 - chr3R 27896137 5' + accord 121 2 72.28 AATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAAC:1 + chr3R 4504049 5' - INE-1 557 1 69.31 CTTCGACTCGGCCCTCGGTCCGTTCCGCATTGGCGACGCAACGTAGCCGAGTCGGTCTGCGTCGAGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTC:1 - chrX 16158418 5' - Max-element 209 2 75.27 TGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTGAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTT:1 + chr3R 6776557 5' + copia 4926 2 83.17 GGNACTATTTAAAATGCAATAGTTTTGATATCAGCTTTTGTGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr3R 4679258 5' + copia 4905 2 63.37 TANATTATACAGGATACAAAAAATAATATACATATACATTTAAATTGTGAATTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTA:1 - chr3L 12171036 5' - 17.6 7183 2 53.47 AACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 22349255 5' + jockey 57 1 68.00 GCACTTAATGGCTAAGCACACACTTACAAGGACAAATTCAGGGTAGACCTCGAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 6522270 5' + pogo 23 1 54.46 TTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 - chr3R 8191523 5' - mdg1 7410 2 75.25 GCNCAATCGAAAAGTTGGGTAACCAGACTACCATTCCCGGAGATGTTGCTTGGCGGCTGTACGACGGTGAAGTATGCATTGTTCCGCTG:1 - chr2L 8380118 5' - Doc3-element 284 1 71.91 CCNAAAGCGAAATATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - chr3L 12160190 5' - hopper 1398 1 47.52 TGTCTCCTGCGGGAATTTCGGGGTCCTGACCCACGAAAGTTTTGGCTTTTTAAAGCCGGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAG:1 - chr2R 22456263 5' + diver 15 2 64.58 ACCGGATATTGCAGTATCAATTCTCGGCAAAAGTGCAGAAGGCTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3R 9322883 5' - 412 461 2 55.56 AGCCTTTTTCAGTTCAGTTGCAGCTTAAGCTTAATATTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 19952324 5' + roo 8704 2 66.34 GCNACCAAAGTCGAGCAACGTAATGGCCAAAATGAAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCCATACACTGGTTTTGCACTATGCAGCCA:1 - chr3R 26267410 5' - 1360 3349 1 53.47 AATATTAAATATTTTTTATTTTTTATTCGATTGCAATAATTTGAATAACACAACACACACTTCACATTAGCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTC:1 - chr2R 21498887 5' + P-element 283 1 71.29 GCAATCGTATTAGTTAATTTTCAGAATCATAGGGATTATATACGCACCAATCAGGTACCAGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAA:1 + chr2R 9019559 5' + hobo 2602 1 72.28 TATAGACAATACTATCATCTCTAATAAATAAATAAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGTGCGCTGGGACAAACGCTGGGACAAACACATAATGTGCTTA:1 - chrX 22641740 5' + Tc1 1617 1 58.00 GTTGGGGAAATTTATGTGCCGCTCGGGCAACAGAGGCACACACGCTTCTCCAGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCT:1 + chr2R 24348083 5' - Bica 12 1 56.44 CGGATANTTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2L 23372627 5' + 1360 8 2 56.44 GACGACACTTCAGGTGTCAAGTGCGCAAAATTCGGTGGAGATCGGTTGCCAAAACAGTTTTGATTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 + chr3L 2392352 5' - Transpac 299 2 65.35 GGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACT:1 + chr2L 20360641 5' + micropia 23 2 59.41 AAGAGAGTTCATAAAGGCAAGCAAATATTCTGAATTTGGTGCAAGAGAATTGTATGTATTATAATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2R 9868884 5' + roo 8677 2 64.36 TTAAAAGTATGCTAAGCATTTTGTCAAAACAATCGTTTTTATGTCATAAGATCAGATCATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr3L 7868782 5' + jockey 4689 1 53.47 GGGGCTACTACAAAAGATCTTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGT:1 - chr2R 14282024 5' - I-element 5041 1 78.22 GAATGGCGTAGTCTTAAAGCGGAAGTGCTTGGGGCAAAGTGCGAACAACCAAATCAAAATCCCACCAGGTGACGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATC:1 - chrX 4258043 5' - 1360 21 1 81.19 TCATAAGTCGAGTTGTAAACCAAAAAAAGGTTGAGAGCCAGAGAATCCAGACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 - chr3L 25401149 5' + transib2 24 1 55.45 AATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chrX 4806726 5' + roo 8713 2 81.19 ATNAACACGAATCAACAACGGCACAGATTAAATAGGCAAGCAACTGGGGGTTAAAAGAGTGGGATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACG:1 + chr2R 13490423 5' + invader3 253 2 69.31 CCCTTCTTTCAAACTACTAACGCATCCTTTTACCCATCCCCCACCCAATTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr2L 20951838 5' + 1360 16 1 58.89 ATATACATATGTATAAGATGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr2L 21951177 5' - opus 466 2 64.00 TTAATTTACCATTTTTATGAGTTAGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTT:3 - chr3R 22133279 5' + accord2 7231 1 90.10 CCAGGTGCGGTGTGCGGTTCTGGGGGCGGGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGAAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATAATGAATT:1 - chr3R 29441321 5' + accord2 69 2 69.00 ATAACAGCAACAACAACAACAACAACAACAAATTTATATTTTAAATATATGCAGTATATATATATAGATATACACGGACAACCACAACACAGAGACA:1 + chrX 10034271 5' - Stalker 434 1 63.92 GGCACGATTATTCACGAAGGTTCGTACTAATTATATATGCATATACATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2R 17483819 5' - roo 9046 1 63.37 ACGCTCCAAAAAGACACATATGGCATAAGTACTTTATTCAAGGGTATAATGATTTATTTATAACAGCAAAAAATTCTATTTTAATTTTGAAAAATATATAC:1 + chrX 13957960 5' - copia 4669 2 57.43 TTTTCAGGTCATTAGCCAAACGATCAGTTGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 26592598 5' - roo 9028 1 69.31 CGGCCACGATGCGAAGGTGTTATTGATGTACATCTCCATCTGCATCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGT:1 - chr2R 13089109 5' + opus 7088 2 55.45 CTAATTTACTGGCTGAGTGCCTTGTAATGATGAAATCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAA:1 + chr3L 10557600 5' - 412 7489 2 78.22 TANAGACATTTTTTAAACATTTCCTGCAAACGAATATTTTTATCTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGAGGAGTTGCTTGCGAGATGTCAGGGAGTGCGG:1 - chr2L 17118080 5' + Bica 37 1 58.42 AAAAATCACAAAATCATTGAAAGTTAAGGCTTTAAAAATATGATTTTCTAAAATTTTAGTTTGAAAGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr3R 6776621 5' - copia 244 1 68.32 GGATGGAAATGCGATGGATGATCCTATGTATATCTGCCACTGTTTGAACTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAA:1 + chrX 6439228 5' - HeT-A 5981 1 68.18 GCGAGGATGCACAAACGCAACAACCATGAGATTAGCTTCAATTAGCCGTTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTAC:1 - chr2R 24615287 5' + Quasimodo 216 2 52.48 TGNGGATTTTCCGGAAAATAGCCTAAAATCTCATATGTACGCATGAGTTGATGGATGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 - chr3L 12352968 5' - Tirant 8487 2 59.41 AAATATNAGAGGACAATTATCTGAGGAATGAATCGCTTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAAT:1 + chrX 21636147 5' - Stalker2 405 1 75.25 TTTCATTGCTGTTTTTTTTTTTCATACGCGCAAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGAC:1 + chr3R 1680703 5' + accord 48 2 75.25 GTACAGCTGGTTAGAATGTACTACTGCCTTATCGGGAGTGAAGAATTCCAGACGAAAGCCACCGCTCGATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr3L 4118071 5' - hobo 2931 1 67.33 TACAACTACAACAACTGTAACAGCCCCTCCCACAACACAAAAACTACAGCCACATCTTCGTCTGCCTATCTATCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATC:1 - chr2L 9696312 5' + Doc2-element 475 1 70.30 TTTTGAAATATATACTAGACTAAATTGAATATATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2R 20309339 5' - roo 9029 1 71.29 CCCCAACTGCAGCTAGTTAGTTAGTTTCTGGCGACCTGCATGCATGCAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 + chr3L 19413937 5' + Burdock 1 2 68.57 GTGAACTTTTTCACATTCCGCATTTGCAGCACACGGAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACC:1 + chrX 14373732 5' + HMS-Beagle 6689 1 68.32 GCCTAAAAGTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTTAATCAATTATTTAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCT:1 + chrX 14771708 5' + BS 4784 1 54.46 GTTTTTGCCACACACATTTTAACGGAGAGCCACCACGGCTAATTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chrX 4448606 5' + 412 32 2 56.44 ATTTCTTTTCACACACTCGCGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGGCCACGTCCAGATTTTGAGATATGAATTTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTC:1 - chrX 14129872 5' + FB 150 1 74.75 AGTAATTAATTAATATTAAATTTCCAAATTAGTACTCTTTGGATTCGATCGCCGAGGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr3L 22736185 5' + F-element 51 1 61.39 ATGTCGCGGTCGCCGTCAATTGTTTACGATTATGACTGCGTTCTATATAGACCATATACATACATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3L 11450451 5' + Transpac 4928 2 70.30 AAAGTGCGGCGGAGTGAAGACGATCCTTTGACCCCCTGGCTACATAAAATTTAATTATGCCATAGACACCCCCTTACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCA:1 + chr2L 18205422 5' + 17.6 141 2 67.33 CATTCAAGTTGGACTTTTACTTTAATTTGCGTCGAGCCTCGTAACAAGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATT:2 + chr3L 14209001 5' - Quasimodo 7340 2 53.47 AAGATGACTTTGAAGATAACACAGTAACGATTAAAACAAAGTTCCGAAAAATGGAAAATGTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCAGCCCA:1 + chr3R 2471366 5' - Cr1a 4431 1 88.12 GTACACTTTAAAAAGGGTCCAATCTATTTTCAACATAACTCTGGACCTATTGGAATTTATATAATTGGCGCCCAACCAACAATCTGAACCCACCAATCTAA:1 - chr2R 11690185 5' + gypsy 496 1 67.33 GTGCATATCGAATGACAGAAATTGGCAAGGGGTCTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 - chr3R 24430618 5' - Transpac 5227 2 77.55 GGGGAGAGAGTGCAACAACTTTTCAACGATTTTGAGGAAGAGTTTGAGCATGCTCGAAAAAAATCGGATTTTAAAATGCAAATATGTATATATGTATATAC:1 + chr2L 16496291 5' + G3 4505 1 64.36 AATCAGCTGATGAAAATGCCAAGAAAAATGGGAAATCAAAATGATTCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTACACAGCT:1 + chr2L 21929513 5' - INE-1 545 1 55.45 TGAAATGATCTAATTTATTTATTTAATAATTAAGGACCATTCTCTCACACGGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 + chr2L 8649208 5' + F-element 41 1 54.46 ATAAGCAAACAAGATCCTTCTCTATGATGCCAATAACGACGGAGGTCCTGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCTAATTTAC:1 - chr3R 23574679 5' - 1360 205 1 56.44 AACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr2R 5485065 5' + 1360 30 1 61.39 TTCTTGGTTAAATGTTGCGTAAAATGAAAGCGATTTAATCAATGTAAATATACATAATATTTGCAGCGTGTTCGCACAGCTACGGTCAAAATAATAG:1 + chrX 3624394 5' + Tc1 2 1 55.67 ATTTCAGCTTTCAAGCCATGGTCCTCCGTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGGGCCAAATTGTGTGATGAACTGCCTAACAATAGCATCTG:1 - chr2R 10358585 5' - G5A 362 1 72.28 TANTCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAACAGTCAGTCGCGAACGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAG:1 - chr3R 1868216 5' + G-element 34 1 53.61 AAAAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCC:1 + chr2L 4177208 5' + GATE 31 2 44.00 GGNATGGTGTGGTATCTCTATGGGTCGGGGGCTTGACTGCCGACTACCGCTATAAATATCTGAATGTGAAATTGTACTTTAGTTCTTAACAGAACTCAAAA:1 + chr3L 3855796 5' + gypsy9 238 2 54.46 AAATGCAAATTATATTAACGATAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr3R 25634915 5' + P-element 54 1 28.71 AAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAAGAATTCCCTGGA:1 - chr3L 23702263 5' + G4 9 1 65.35 AAAGAAGAGTTACCGAAGAATAGACATTTCAAATGTACCTCAGACTGTTCCACGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chrX 364845 5' - hopper 1393 1 57.43 TTTTGCACAATTACTATTAAGCGACAGCTTTTCCGATTGTGCCTGGTACGTGGCCATATCAGTGCCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 20584380 5' + 1360 10 2 69.31 GTCAAATTTTCCTGTTGTCCGGTGTCCGTCCGCTTGTCCGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCAAATTTGGGTGGGATTGT:1 + chr3L 5815735 5' - I-element 4898 1 61.39 CATTCTTTGGGCTTAATAAAATATTAAATGCGAAAATCTAACACATCGTCCACATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTT:1 + chr2L 8297043 5' + Tirant 8054 1 60.61 TATGTGTACTCATTCTATATAGTATAATAATATATCTGTGCGTTGGTAAAAGCAAGAGGCGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATT:1 + chr2R 18694302 5' - 1360 3202 1 55.45 TGTATCAGCAACTTTTGTTGGCAGCAACATGACGGTGCACAGTACATACTTTAAGAGCATCGATGGCTGTTTTGAGGGAACACTTTCCAGAGCGATTT:1 - chr2R 625762 5' + mariner2 514 1 74.49 GCTAATTAAAGATAACAAGAAAAATAAGTAATATTAAAAGGAATATTTAAAGTGGAAAGCAAAAAAATCTTAAAAACAAAAGAATGCTATAGTCGAGTTCC:1 - chr3R 8939601 5' - INE-1 573 1 80.20 GCAGCAACATCGCCCAGCAAACTGTTTGTTTTCATAATTTCCCTTCTGGAAGAGGCTGTGCACGCAAAAAACAACACCAAACAGCCCTGCAAACAACGCAC:1 - chrX 3686756 5' - Cr1a 231 1 59.41 TAACTGGCCTCCATTTTGGTCAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAA:1 + chrX 13610113 5' + micropia 5045 1 79.21 CGATATGTATGCGATTTTTATGTGTGAACGTAGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAA:1 - chrX 7564798 5' + Doc2-element 466 1 68.32 CGGACGGCCGGCCAGCCAATTAAGCCCAAAACTGGAAAGCCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1 + chr3L 447312 5' + Tabor 37 2 62.38 GTGCTGGCGATACAGAAAATATAAATTACATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAA:1 - chrX 1105371 5' + Juan 4115 1 71.29 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATC:1 + chr3R 19450169 5' + roo 38 2 66.34 AACTTTTCCTTGCCGCAAACGTAGCAAGGAATATTTGAAATAGCCTTCCCCCGGCTTTCCCCTTCAAAACTTAAGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGT:1 - chr3R 11291943 5' - F-element 426 1 79.21 TTCTCTCTCCACTTGTTTTCGAACTTCCTCAGTAGCCTTATCTGTTGACTCCGTTGACTCCTGTGCTTTCTGATAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTAC:1 + chr3L 27413502 5' - hopper2 1302 1 72.28 CAAGCGTATTTGCCTTTGTGGTCGCCCCGTTCCCAGCTGTCATACAGGCAAAGATCCAACTCGACCCCATATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTC:1 - chr3R 28443799 5' - Burdock 6389 2 73.00 ATAAAAAAAACAGTCAGCTTCGCGATGGAAACAGAAAAAGAATATATATAATTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTTACATACATTTCAACGAATCT:1 + chrX 22841744 5' - INE-1 14 1 59.41 GGTAAAACTCCAACCAATGATGATATCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3L 17172712 5' - roo 9023 2 71.29 ATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGT:1 - chr3R 1868214 5' + G-element 35 1 57.29 GTGCTGATTTGCGCTTAGGCTTTTAGTACATAATTTATAGGAGAGGTTGGGCATAAACAGCTTAAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAAC:1 + chr3R 12799716 5' - I-element 5015 1 68.32 CAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 22046481 5' - roo 9024 2 69.31 GTGCACTTGGGCCTGGCTTATGTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTT:1 - chr3R 24464923 5' - F-element 4348 1 79.21 CAAGAAAAATTCGTATATATACTTTATATATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chrX 13263085 5' + 297 6620 2 81.19 GCGCAACATCACATTGTTCACCCAGTAGTCACCGTGCACCAATGTATTAAAATCTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACCCCCCTCCCTCATGCTCTTCCTCTT:1 + chr3R 25276379 5' - Bica 5 1 57.43 CATTAAACGCCGGTATTATTAGTGTGACCACCGATGCAGTTTTTGAGAATTATGCTCGCATTCTAGTCGCACACGGGACTAGACACCGTGCGCATTTTGAC:1 + chrX 1026708 5' + baggins 5111 1 68.32 CCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 - chr3R 14049398 5' - transib2 2774 1 75.25 CTGGTGACGCCGATAGAAGATTCGATGATTGGGGAGATCCAAATGCTAGCTGTCTGGCATTCACTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTA:1 - chrX 16869859 5' - I-element 4895 1 63.37 ATACCAGAAATAAAAGTGCTCTTTCACTGCCTCTAATTTGACGCCCTCTAATTTTCAGCATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2L 1913091 5' - pogo 2089 1 67.33 CACTTTGGCCAGCAAAAGCAACGCCAAATAACAAAAAGAAATATTAGAAATAATAGAAATAAAAAAAAA:1 + chrX 18177780 5' + BS 5098 3 63.77 AAAGTAAGCTGAGATACCAAAATATTTGTAAACCAGGGGCGTGCCAACTTTAAATGGAGGGGGCTAGATATTCAGATGACAAAGTTAAAAAAATAAAAAAT:1 - chr3L 10548908 5' + TAHRE 10440 1 62.38 TTNAAGATTCAACTTCAAAGTTACTGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 16699053 5' - roo 9021 2 75.25 CTCGGGGTTTAAGCAAAAAGTGTAGCATGCTTTTCAGCGCAAACTTTATTTAAGCCACTATACAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chrX 10453362 5' + hobo 13 1 64.36 CACCGANGGCTTGTCGTCATATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 14688348 5' + pogo 1 1 67.33 ATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAAC:1 + chr2R 4673585 5' - Quasimodo 7330 2 71.29 TATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAA:1 + chr2R 5582172 5' + Cr1a 446 1 62.38 TGTGTGGATTTATGTGAAATTATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2L 21951195 5' - opus 461 2 74.71 AGTAAACATGACTTCGCTGTTAGACGTATTTAGTGCTTCTGTCTTTTGAGTAACGGAACTGCAACACTTCTACAAAGTAAATATTATACAGATGTTAGTTA:1 + chr2R 19890307 5' - transib1 464 1 55.45 GTCTGTCGGGGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 + chr2L 19845900 5' + F-element 39 1 50.50 ACTGCAATCGAAATAAAACTTCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACT:1 + chr3R 21343318 5' + I-element 5034 1 79.21 AGGTGAGCCAAATACGAACCATCCGGACCGAGCCGAGCCAAAACGAGCCCGACTACGCCAGCCGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2R 9658423 5' - P-element 2874 1 66.34 AGTTGGCAGCAGATCGCTGGTGAACAGGAGAGCAAAATGTTTGAAGTCGCCTGCCTGATGTTCATCTGCCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCT:1 + chr2L 12508081 5' - Quasimodo 7069 2 67.33 TGTCAACATCAACAGTTTCAACATTTTGCCGCTATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 17104911 5' - accord 7030 2 92.59 GCTCTTGTTCTTAATGGTTCCGATCCCTTTTCACATAATGGCCATTCCATTCTATTCCAAGCATCGTTTTACAGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAA:1 + chr2L 18272179 5' - Cr1a 3991 1 59.41 TGAGAGAAGTGGGTAAAACTCCAACCAATGATGATATCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 17172723 5' - roo 9034 1 60.40 ATTTTTCACCATCAGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 + chr3L 13345444 5' + Transpac 4948 2 60.40 TACTAGCTCAAATCATTTCTCTCAGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 + chr3R 28117778 5' + I-element 52 1 78.22 CTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGC:1 - chr3R 1977620 5' - micropia 5409 2 54.46 CTGGTATACTGCAAAAAATAGGTTTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTTTTGCGAATCGAGCCGTAC:1 - chr2R 4955468 5' + Cr1a 4382 1 77.23 TTTTGTCACAGCTGATATCATCTAAATCAAAAAGGGGAATAAATAGTGGTGTTTTGTTGGATATCGGCGTAGGAGTCCAGCGATGAGGCTATAATTGACGG:1 + chr3R 905867 5' - TART-C 293 2 61.39 TCNTGTTTTCGGATCAAGTTTATTGACCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCCCTTTGTT:1 - chr3R 10824101 5' + 412 51 2 72.28 TCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:2 - chr3R 2425639 5' - 1360 3359 1 72.28 ATGGCCGTCCGCCGGCTAACATCTCGTGGTACATCGACAACATGCCGGCCAACAAGCGCACCACTCCCCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACC:1 + chr2L 18383938 5' + I-element 211 1 68.32 ACCAATTTAAGTTAGTAAACCAAAAGGATTAGACAGTCAGATATCTGATATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr3R 19206093 5' - mdg1 7432 2 52.48 AAAGGCACTCCGGACAGCAGTTCGTTCTTGATCGTGTCTGTTCTGTGAGTTTTAAAATATCTTTCGTCTTAGGCTAAGCTGCGTAGCTGCGCTGCCGGAT:1 - chrX 9107694 5' - 412 310 2 79.00 CTCTGAATCCTGGCTCGTTCCTTCTTTGAGTTCTTCTGGGCTTCTGTGTGTATGTGTGTGTTCGTGTGTTGCATTAAGTATGATTTATGTCAAGTTCCGGT:1 + chr3R 25699438 5' - jockey2 3205 1 71.29 CANTTGACTTCGAAAGTTTCTGCACTCACTTGGACAAACAAAATAACTAAATATTTCGTGCCCTTTACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTAT:1 - chr4 1233703 5' + 1360 243 1 67.33 GTAAAATTTATTGAACAGCAATTAGGCGCAAATAAATATCAATTGAGCGAGCCGTGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGG:1 - chr2L 20004004 5' + 17.6 221 2 60.40 TTATTATAGTTCGGTTTCTGCTTGTGATTTGTAATTATTCCATTCTAGCACGAAGCAATAATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 27900389 5' + roo 8678 2 63.37 TTGTCCGCATATGTAAAGTCAAAGTGTGGCATCAAAGTTTAATACCAAAGACACTAGAATATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr3L 27613482 5' + 1360 58 1 59.41 CTGTATTCTTCTTGCTGCGTAAAAAAACGAAAAAAAAATTACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTG:1 + chr2R 25128199 5' - F-element 4507 1 60.40 CTATCAGATGCCTGTTACTTACCTAATGTAAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGAGATATGGTTAGATACTGGGAAGCAAAATGAGAAAAAATTTTAAAA:1 - chr3R 4465102 5' - INE-1 471 1 72.28 AGAGCTTTCGCGCGAGTATAAGAGATTGCTGCGCAGGCGCATCCTTAAATGCCGCTCGGCTTTTTAATGAGTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr2R 9658308 5' + P-element 2 2 77.23 ATCCCGCATTATTTCTGGATTGCCGCCTTTATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chr2L 21612970 5' - 297 358 2 68.32 AAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACA:1 - chrX 21564734 5' + diver 5925 2 65.35 TTAAATCGTGTTAAACGCCTATCTGATGGCGATTTCGATGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCG:1 + chr3L 9250349 5' + P-element 2857 1 42.00 TTACTCCTGTGCAGGCTATATTTAATGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chr2L 7393711 5' - opus 7453 2 80.20 TGTTAATAACATAAATCAACATGAAAGAAAGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 12398099 5' - roo 408 1 78.22 GCNCATGGACCAAGGTATTTTTTATATAAAAATATATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTT:1 + chr2R 17483756 5' + roo 297 2 65.35 GTGTCCTTCTACAAGATCCTAACCTTCGACGTCCTCAACTATGATCCGCAGAACAAGAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTC:1 + chr2R 23233747 5' + Doc 393 1 62.89 CCAAACTAAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr2R 18723118 5' - opus 7478 2 56.44 CGNGCGGCTCTCGCCGGTCTTAGTTAAAGACACGCGGCCGACTCGATCATGCTCTCACAAGTCGCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chr2R 18232739 5' + blood 7179 2 63.37 AAAGCTATCGACTGCACAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chrX 4806674 5' - roo 9039 1 55.45 AGTGTGACAAGTTTTCAGTGCACAAATATGGAAAAATACTATCTCAGCGTTCCCGGCTTGACGTAAAAGTCGACTAAAGGGTGGATGGAGGAGCCCTCATG:1 - chrX 10187983 5' + Rt1b 4907 1 70.30 TAGGATATAAAAATAAGTTAAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr3R 29923577 5' - blood 7364 2 74.29 TATATACGAACTCTTATACCCAGTGGGCTTAGCCTCAAAAAGCTCTCGCTCTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 11764956 5' + roo 8685 2 49.48 ATNCCACCTCCACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGA:1 - chr3L 22046515 5' - roo 9058 1 67.33 AACAATTGGCCCAGGACACCGGCCTAACGATATTGCAAGTGAATATGACCTACATAAATTTATCCATTCCATGAAAAAACGTGCTTAAAGCGAATGATTAA:1 - chr3R 10514295 5' + S-element 372 1 61.39 ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTAACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACG:3 - chr2R 17373248 5' + gypsy6 7423 2 75.25 CTGGGTTCCTCTTCCTAAATGATCACAATTAAATCAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chrX 20933753 5' - mdg1 7418 2 65.35 CAAACCCAAGCACTACTCCAAGACCCTGCGAACCAAATCCAAAGTTTTTTTTTTTAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTA:1 + chr2R 2144977 5' - Doc2-element 4735 1 79.00 GCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 19446160 5' + 297 6620 2 70.30 ACTGAAATATATATGATGTTGTATTAAATTCTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr2L 21612911 5' + 297 39 2 74.26 GTNTGGTGCACTTCCGGTTCCGTTTGTGTGTTTTGCCCGTTTTTGTTACAGCTTACGATCCGTTTTTGGTGTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTA:1 - chr2R 13711980 5' - 412 325 2 74.26 CAAAGAGTATACGAACAGAGTTCAAATATTGGCAGATAACTATGAGGCAAAGGACTCAAGCCAAGCTAAGGTCCATGTAAAAACCAAAGAGAGCTTTAGGA:1 - chr4 368149 5' + Fw3 113 1 57.43 TAGTTAGTTAGTTTCTGGCGACCTGCATGCATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 + chr3L 19413950 5' + Burdock 6181 2 67.33 TGNCCTGCGGGTCACTCCACATTATGTCAAAGATCTGCAATGGCACGTGCTAGATGTATGTACGCGTTGATAAGATCAAGAAGATAAGATTATAAAGATCA:1 - chr3L 20262668 5' - Ivk 105 1 60.40 CCCTAAAGTTAGGTTTTTCCTCAGGGGGCAGGCGAGGCAACCAAAGCGTATCCAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 12322969 5' + hobo 23 1 57.43 ATTGATGACATGGCATGCCAAGCAAACAGCACACACACACACACACACATATTCACCCACTGAAATGTCCTCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3L 20867529 5' + hobo 6 1 71.29 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCT:1 + chr3R 19450170 5' + roo 39 2 65.35 CCAAGCTCCTCCATCATCATTCGTCTTTGCTGGCCATGTGGAAAGGGTCGAATAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATAATGACAGACCCACCAAAC:1 - chrX 5820524 5' + I-element 183 1 59.41 ATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGC:1 - chr2L 9730908 5' - TAHRE 10384 1 86.14 TATCATCTCTTATTTTACCCATCTGACAATCAACACGCTGCATATTCCGGTTTATCAAAAACTTAGTAAGAACTCAGCGACAAAAAGACCAAGACGAGCGC:1 - chr3L 13895986 5' + Doc3-element 250 1 75.25 TAAGCGGAAAAGGGAATGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTT:1 + chr3R 9174683 5' - 297 6603 2 76.39 TATTTTAAGAAGGAAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chrX 9579305 5' + Tirant 8125 2 63.37 TTNTTTGGAGCTCAGCAAGCCAACACCTGCGGTTGTGGAGCTTCGGAAGGGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3L 13704646 5' + hobo 22 1 56.44 AGCAGCTCCCCCCTTTACTTAACCCTTTATAAAGCCCCCTCTTTACCGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr3R 8191541 5' - mdg1 390 2 57.43 CGTTTTGTGGACCGCTTACAGATATATTCTTTGTTCGTTTATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 - chr2R 6670090 5' - Tabor 7289 2 56.44 AATGTTCTTGTTTATTGACACAAAAGTTATGCGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAG:1 - chr3R 27256432 5' + gypsy4 334 2 67.71 TAAGATGCTATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2R 5485054 5' + 1360 19 1 60.40 GCCATCCTATCCTAGCTAGCACGGCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATGGGTTGTT:1 + chr2L 19845910 5' + F-element 49 1 58.42 GCATACTGCTGATGCCACTTAAATATTGACATAAACAAGATTATCTACTCTAAACTGTGCAGTAGCCTAATCTCCTACTCTTTAATATTGTAAGCCGAAGT:1 + chr3R 11536734 5' + diver2 4582 2 54.46 ACNTACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 - chr3R 17666034 5' + Transpac 42 2 67.33 CCCAGGTATCGGGTTTTCTAGGGTATGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 - chrX 11894740 5' - Transpac 298 2 77.78 GACATGCAAATTTATGAAAGCCGCTTGTGTTCCTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTT:1 - chr3L 6442929 5' - F-element 495 1 67.33 TGCGTAGCATAGTTTTTGGCATAGCGAAGAATGAGATAATTATATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTAACCCATGCGGCAAC:1 - chr2R 23601883 5' - jockey 4961 1 52.48 CATCTCTTTGTCAGGAGTGTCTTATGTTTATACTCGTGAATCTTCAAATATGTTCTTTAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAA:1 + chrX 13790075 5' + FB 19 1 61.39 TGGGCGGCGGCACGATTATTCACGAAGGTTCGTACTAATTATATATGCATATACATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 17483827 5' - roo 391 2 60.40 GGCACCCGGAACAGGGCGGCGAGTTGAAAAACAAACGTTTGGGGTTCGCCTGCGGGTTTTGCGGTTGTTAAGCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2L 6184280 5' - roo 404 1 72.28 AGATGACACGTTGACTTTGGGAGCCGTGATGATAATGATGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGAC:1 - 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Tirant 380 2 60.00 TGTTGTGTCTGTGGGTACAGCGATTGTTGCTATATCCATTGTTGTTGGATCTTTGGCTATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAA:1 + chr2R 20411855 5' - Quasimodo 7355 2 68.32 TGCCTAGGTACACGGGAAAAAATGCAAATTTCAATAATGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTC:1 + chrX 13320691 5' + hopper 251 1 74.26 CGAAAATATTTGGTTATCATTGGGTAAATATGTGAGGAGCAACAAGGAGAATGGATAATAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCG:1 - chr2L 3818714 5' - GATE 438 1 58.42 ATGCTAGCTATTTAACCCACACATATCTAATATTATTATACGCAAATATATAAGCTGAAAGCACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTGAATCCAAGAAAA:1 + chr3L 24803164 5' + Idefix 347 2 56.44 AGTCACCGAAGTACTTTCGCAATCGATTTCTAAACTTGGCCAATGGAAAACTATAGATATTGACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAA:1 + chr2R 8550710 5' + I-element 5202 1 67.33 AAAAATAGTAAATAAATGAGTATTCAAGTTTTGAATACAATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr4 1156878 5' + F-element 53 1 66.34 GCNATATTTAGGCCCGATCCCAGACAGATCTGCCAATGCACCCGCCAGCCTTGAACTTACAACACACACAGATATGCACACATACATACATATTACATACA:1 - chr2R 11657604 5' - 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chr3R 31650151 5' + Rt1b 4942 1 54.46 CTTGTAAGGGCAGATATCCGCCACATTGCGTTGATGACTGGTAGAATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTGGTTCCGAACGTACCACGGTGCCCCACTGAT:1 - chr3L 24757757 5' - F-element 4352 1 76.24 AAAATGGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAACAAGAGAGAATGCTATCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAAAGCGA:1 - chrX 14770750 5' - INE-1 532 1 89.11 GTTAGTTATGCGGCAGTGGTGTCTGCGATTGGTGGATTAGGTTGTGGTCGAAATTATTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCT:1 - chr3L 16902268 5' - gypsy4 67 2 59.41 CTCGTCGTTAACTTTTTATTTGTTGCCTCTGCTCCTTTTGTTTGTTTGCTAGTCGCATTATTGCCCAGCTTCCCCCCCCTCCTCACTCCTTATCAACTTTG:1 + chr3R 12827649 5' + G6 294 1 72.28 AGTGGATAGGGGATGCGTAGGACCTATACCATAATCGATGGGTGTTTAAATGCGTGTGTGCGTGGCTGTGTATGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGA:1 + chrX 2496204 5' - accord 179 2 51.52 TATAAAAACATTTTTTAAAAGTGTGAGCGTACGATTTTTGGGTCACTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 24163231 5' + roo 8694 2 59.41 CGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACG:1 - chr3R 1868208 5' + G-element 29 1 58.33 TTTTCATCCATTGCCTTAACATTGTATATTCAATTTAATCCGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chr3R 22208553 5' + I-element 36 1 58.42 GATACTGACATCTGAAGCTCATCTCCACCACGTTAATGTTTTTATTAATGTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 + chr3L 7061156 5' - I-element 5314 1 59.41 ATTGAAATGGCTTTGTCGGTTCCGAAGGGCTAGAGGACCCTTTCCGCCCGAACTCCTTTCACTGTTGTTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTG:1 - chr3L 22704906 5' - Doc 468 1 70.30 CANCAACACACTCACTTGTGCCAAGCACTCGTACTCCGCATAGCCGCACTCAATGAGAAATGTGTGGCGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 678867 5' + Tirant 8115 2 72.28 AAAGAGGTCACTCCTCATCGGTGGCCATTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 - chr2R 9340132 5' + Doc 94 1 53.47 GGCGGCGACCACATGGCATATAATATATACAATATTTGGCATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATAACACAAAATCTAAA:1 + chr3L 4953215 5' + I-element 5175 1 56.84 TCNCCTGCGGGTTTTGCGGTTGTTAAGCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 6184235 5' - roo 358 2 75.25 AGCAACACAACACCAACACGAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr3L 17971269 5' + P-element 55 1 26.73 CCATGTCCTTGGCAACCTTGAGGTACATGGTCTTGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTC:1 + chr2R 15376992 5' + X-element 4498 1 65.31 TCNTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTT:1 + chr3L 24213791 5' - 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chr2L 19817600 5' - G4 3452 1 69.31 CGCAGGCAGATATATAAAAAATAATTGTGACTTACAGTTTTGTGGAAAAGAACTCAAGTAATTCTATATGACTTTGTTTAAAAAAACAATAAAATAATTTT:1 + chr2L 14575417 5' + gypsy11 3937 1 42.57 CTCGAATGATTTCGGTCTCGAATTCTTGGACAACCTGCCCGTGGACAGTAACTTCTCCACGCAGGATCTGATCAAACCTTATACCCTCAAAGTGATAGAAG:1 + chr2R 14057791 5' + Porto1 326 1 74.26 GGNTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3R 27452382 5' - roo 9029 1 72.28 TTCAGTGCGCAACAAGCGGACAAAAAGCGCACTTGTGGCACCACCGAAACACCATTGGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAA:1 - chr3R 20374109 5' + I-element 4890 1 61.39 AATTATTTATTATGTTTTATACGTTTTGTGTTCGTATCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3L 4118154 5' + hobo 39 1 61.39 TAACGAAAACAGAACATTACACGTCGCAGAGGACACCGTCGCTGCTGAACTCCTGAGGTTCCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGGACCT:1 + chr3L 24258849 5' + HeT-A 5740 1 60.40 TTGCTTCATTATATATATTATATAAAACACAATTCACGACAATTTAATTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 + chrX 13954739 5' - Juan 4184 1 63.37 CATCCAGTTGTCCAGCAACGAGCTCCAGTGAAATCGGAATACTCGTCGGGCAGTAGTGATGTGTAAGCATTGTTTTTTTTTTATAAATCACAGAATATGAA:1 - chr3L 16344394 5' - looper1 1680 1 57.43 ACNGTAAAGGTAACGCCGGGCTCCTTGGCATAATCGCTCAACAGCTACAGCCACAACAACAGTTGTTGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAG:1 - chr3L 15450744 5' + Doc3-element 4373 1 71.29 AAAACCCCCACACAGAATTAGGCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATAC:1 - chr3L 19425390 5' + X-element 80 1 78.22 TAGCTTAGAGTTCAATTGCAGGAACACGAAACAAGATGGATTATTTATCTATATGGATTATGAATTATGAATCTATTTGGACTTGTCCGTAAGTTTGTTAA:1 + chr3L 16757607 5' - G5 60 1 76.24 TCTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCTTGGGCCTACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chr2L 9313987 5' - hopper 1379 1 58.59 TTAAGCTATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 + chr3R 25277622 5' + 3S18 34 2 55.45 GGTTGTAAGAAATAGTCCAAGAACTCTCGACGAGGACGGACAGGCGGACAGACAGACGGACGTGGCGAGATCGACTAGGCTATTGATCCTGATCAAGAATA:1 + chr3L 23230712 5' - INE-1 85 1 67.33 TTGGCAGTCCATCATTAAATTGTGGCTAAGATTCCAATCAAACATACATAAAAATGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACCGCTTACGC:1 - chr3R 26093076 5' + Quasimodo 6946 2 64.36 ATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGA:1 + chr2L 23299991 5' + invader4 356 1 69.70 AGGAAATGTTAAGCACGGAAATCATGCGCGCCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 - chr2R 10763700 5' + FB 47 1 69.31 GCCCCAAGCTCTGTTCACCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr2R 18356230 5' - P-element 2838 1 23.33 GTATGTATGTAGCATTTATACATTTATTCTTCATCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:2 + chr3R 4971147 5' - 1360 3372 1 62.38 CGTTTGGGCCCGCCATTGCCGACGGCCAAACACGCGCTGGTAATTGCGGCAATTGGCGTTGGCTCATTTTAGAACGATCGATTTGCTCGTTGTCTATTTGT:1 - chr3R 6955807 5' - Doc3-element 187 1 63.37 CCAAGAGCTCAAAGAATCGCAGTTCTCTTTGCACTTTGCCATCATCACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTC:1 - chr3L 12231032 5' - jockey 4749 1 54.46 CAATGGCCAAAAACCATGAAAACAAAATGGCCGACAGCCAGGTGGATATGTGTGTGTGTGAGTGAGTCAATGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGAC:1 - chr2L 10621695 5' - GATE 8269 2 76.24 AGTTAATGGTTTTGCACATTTTTACGAAATTTTTAAAGTAATCAATTTCTTCAGCATACTTACTTACACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr2L 9488254 5' + 297 6586 2 41.58 AGAGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1 + chr3L 25272556 5' + 1360 71 1 60.40 AATAATTTCAGCAAAAAGTTTACAATGCAGTGAAAGAGAATGCTCTAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGT:1 + chr4 452227 5' - INE-1 542 1 63.64 AATCTAAAGCGCCTCCTAAGAAACAGCTTCCAACCAAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCC:1 + chr2R 3194515 5' - 1360 79 1 64.36 GCCAACGCCACCAAGTTTCGTTTAATGTAGAAAGTTGTTTGGCAAATCATAAAAATCGATAAGATATCACCATTCAACACATTTTTCTAAAGTGTGG:1 - chr2R 4326129 5' - INE-1 258 1 57.73 ACAATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr2R 3824679 5' + 297 6614 2 64.36 TTGTTTCTCCACAAAAGAAGTGGATTTTCGTAGCTGGTGCAGCAGAAATAATGTTAAGTGCGGCCGGAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr3R 24461794 5' + F-element 19 1 65.35 CGGAACGTAAATTAGGAATGCGCTTTTAATGGTGTGCATTTTCTTACCATAATTTATTTCTTTAAGAGCGACAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATA:1 - chr2L 4234089 5' - Cr1a 4220 1 46.53 TTAGCAATGCGCCATACCTAACCATAATCACAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAA:1 + chr2R 7398833 5' + G2 177 1 69.31 TTAATATGAAAACACCGAGCAATGACTTGTGGTATAGTAATTTTATATAATTTATAAGAACACAATTTCAAACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 8331316 5' - roo 406 1 75.25 AACGCGCGGCACGTTTGCACGGTTAAAAGAAACCCAAATTAGGCCGCGACTTCAATGAACTATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCC:1 + chr2L 11829240 5' + blood 494 1 60.40 TTTTATATTTATTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1 + chr3R 26434687 5' - Tabor 7290 2 59.41 AGGCGCCACTTGCTGGTGGTCTCTTCTCCTCGTCCTTCTTGATTTGGGGTACTTTGCTAGGTATACTGATCGTGAAGGGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTG:1 - chr3R 7180097 5' - Idefix 7178 2 67.33 TTACAATTATCGATCCGCGACATTAGTTAAAAACAAGAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTGCT:1 - chr3L 24402217 5' - INE-1 550 1 60.98 AACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 - chr3L 13345491 5' - Transpac 5205 2 76.12 TTGGTCTTTTAGTAGTAGTGGTCTTAGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAA:1 + chrX 1556411 5' + Bica 107 1 74.00 AGTCCTGGGCCACGAGTTTAACCCCACTGGTGTTTCCAGCAATTCGCCGTTAGTTGGGAGCCCTAAGCTGAGAACGTGCATTTGTACATATACATATACAT:1 - chrX 13970338 5' - Stalker4 7200 4 68.32 CGAAAATCTTTGAGAATCAAAAGCTTTTTGAGATGCATTGAAACGAAACCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAA:1 + chr2R 21512623 5' + I-element 99 1 53.47 TGACAACAAGCCCACAAGGAAAAAAAAGGGAGGAATCCGGAAATTATGCAAAAAAGTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 3547566 5' - roo 9051 2 60.40 TTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTTTGCCCTCCGATTTTTATTTTGTTATTCGACTTACTGTAGGAAAATTAAGATCTTCTAAAGATACCACCTA:1 + chr2R 3341947 5' - Rt1b 5105 1 63.64 ATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGT:1 + chrX 21087593 5' + mdg3 35 2 59.18 GTNGAAAAGTTCTAAATGGTCGGATAAAACAATGTAATAGTTATAAGTTGAAAATTTCGACAAGATTAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTA:1 + chrX 10255946 5' + invader2 4841 1 73.27 CGTTTTTAAGTAATGTATGGGATAACAGACTATCTTGGTGCCGCGCAAAACGTATGGGCTGGAAAACTATTGATGGGTTTAGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 + chrX 18353508 5' + jockey 4668 1 73.27 AATTAAAAGCAGAACATTAACATCAGCTCGTGTGTTCCTATTTATGGCAGAGGGCAAGCAACTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 26592672 5' + roo 8678 2 64.00 CGCAGACCAATACAGATTAATTACAGTATAAACAAAACGAGACGTATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGG:1 + chr2R 2949037 5' - 17.6 465 2 62.38 ATAAATGGTAACGAATCCCGCATTATTTCTGGATTGCCGCCTTTATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chr2L 21612984 5' - 297 6955 2 55.56 AANCTTGCTTGTTTCAGTTTGATTCCGATTGTTGGTGTTGTGTGCCGGACTGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chrX 6518849 5' + pogo 22 1 62.38 GTNGTAGATATATCTTATGTGGTTGAGCTTACATATTTCACTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1 + chr2R 3065327 5' + Quasimodo 32 2 64.36 CCGTCGTCAAAAAAGAATTACATATGTATGTCAAATGATGAATATTAATACTATTAACTGGCGCCCAACATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAGACA:1 - chr2L 16534621 5' + gypsy7 263 1 50.50 TTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chrX 9439830 5' - roo 9033 1 65.35 AATATATATAACAAATATATAGCTGAATCATGTTTTCTGTGATGTATGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3L 12990581 5' + hobo 29 1 56.44 TATTGGTGGGGAGAATAAAAAGTCAGGGGAGGGATGTCTCAAAGTCCTGCTGCTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGC:1 + chr3L 10121173 5' - Quasimodo 7045 2 62.50 CGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTGCTT:1 - chr2R 3341939 5' - Copia1_DM 4127 2 66.34 TGCAGTGAAACAAAAGTCGAAACAGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGCTTCAGGTGGGGTTGGACGGGGTTGGTTGGG:1 - chrX 7622988 5' - G2 112 1 72.92 TGTCTTGGTAACCTTGTGACGAAAGTTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 20419125 5' - roo 386 2 55.45 GTGTGTGTGTGTGTTTGTCAGTGTGTGGGTGGGCCACACATTAATGCGTTCGAGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2R 14055123 5' + hobo 19 1 61.39 GGCGTGGCGCAGGATCTGCGGTCGAGGTCGTCCTTGGGGGTTGAACCTGACTGTCAAAGTTATAATGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAG:1 + chr3R 12022245 5' - hobo 70 1 68.32 AGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACC:1 + chrX 21772501 5' - gypsy3 6539 1 75.25 CTGTTCTGTACTGGAGGCGATAGGCCTTGGATGGGAGGTTGGGGGGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAA:1 + chr2L 35952 5' - F-element 4416 1 61.62 AAAGTGATCTTTTTGTGTGTGCAAAGGTTTTTTCCGCAGCCAACAGCCATGAAACAGAATCGAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chrX 6731777 5' - hobo 2925 1 67.33 ACNAGATCAGAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 19109320 5' - roo 9037 1 57.43 CTGTCATTCATGCTAATCGGGCACATGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTATATGTATGAAGGTTTTTA:1 - chrX 9579376 5' - Tirant 352 2 71.29 GACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:2 + chr3L 9907387 5' + jockey 62 1 75.25 GACTGAAAGGCGACAAAAGCCAAAATCAATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGC:1 + chr3R 13438121 5' - hopper 1280 1 72.28 AACAGGAAACTGTAGAGCCAAATAACAAAAACAATAGCATAATTCTAGGAGCATGCCGATACTGTAGCTGTGCAAACAATTTCTATTTTTAGATTTATTAC:1 - chr2R 14275562 5' + 1360 3274 1 82.18 AANTGTTAATTTTTTAATTCAATAACGTCTATTATTGTAGTACGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 - chr2R 5178657 5' + mdg3 5297 2 66.34 TTAACGAGAGGGTATGTTAAGTAAGCAGCTTGACGCAAAGAATATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGA:1 - chr3L 23869150 5' - gypsy 428 2 59.41 TAATTTAAGTTGGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chr3L 14854774 5' + Quasimodo 21 2 59.41 CACAAAACGCAAACAAAAAATTTAATTAAATTTATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGC:1 + chr2R 15032542 5' + F-element 367 1 67.33 AGATCTCATATTTTTCTAGGTCGTAGAAACCTCAGGAGAGAATGCCAGAGACGAGTTCCCCGACTACCAGATACCCGGTACTCAGCTAGTGGGAACGCGAA:1 - chr2L 21786464 5' - INE-1 531 1 57.43 GCTATACTGTAAAAGTCGAGTTGTCTAAAAGCTATTCATCTACTTCCCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGT:1 - chrX 6651662 5' - invader1 93 2 62.38 CTGCACTTCACATCCAATATGACCGTTCGTGCTTCCTTAACAGCTTATTCCTGAGAACCTTGTCGCACGAATGTGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATT:1 - chr2R 544898 5' - HMS-Beagle 7039 2 76.24 ATGTCAAAAGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTT:1 - chr2R 2527420 5' + roo 67 2 60.40 CCNACTAATTGCAATTAAGGGTAATCTTATTTTCCTGTATGCCACAACTAGTTTTCTACACGTCGGGGAAAATTAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCT:1 - chr3L 7629670 5' + opus 7113 2 79.21 GTNGGCATTTGTTGAAACCATTTAGATAGTGCGGTGCGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTC:1 + chr3R 5690249 5' - Doc2-element 4495 1 68.32 AGTATCACAGCTTCGGCAGTTATCGTTTCCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 4022302 5' + roo 46 2 73.27 TAAAATCATTTATTTTGGCATGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 + chr2L 21863339 5' + Burdock 6160 2 53.47 ATTATGTGGTATCACAGAGAACAGTAAGGTTTTTTTTCTTTATTCTTTTTATTTTTTTAATTT:1 - chr2L 14728751 5' - HB 320 1 84.13 ATGTCCACCAGCGGATTGTCGAGTAGACAGCGCCGGAAACGCTGCTGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGTTT:1 - chr3R 11729364 5' - Juan 3790 1 54.46 TTNAAAGGCTTTGCTTATCTAGTAAATTAAGTGGATTTGCTTATATAAATATGATTGTATGATTGTAAAATAACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 - chrX 6883355 5' + Burdock 1 2 75.25 GTTGAAAGTGATGAAGATTTATTGTTTTCATTAAAGCTGTCTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTT:1 + chrX 15649889 5' - Quasimodo 7028 2 68.32 AAATGCACATTTAAACCGTGACTTACCAGGGGGTTTGTGTGTGTGTTGTGTGCGGGAGAGGGGTTAGTGCTTGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTA:1 - chrX 15696233 5' - Quasimodo 38 2 66.67 GCAGCACCACCCACTTAGAAACCACCCGGCACCACAATCATAAAGAATCATGGAGAGAAATTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATA:1 - chr2L 17867361 5' + I-element 369 1 62.38 ATCTTAAAAGACAAAATTATTCATGATGTTTTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr2L 20152990 5' - opus 7483 2 61.39 GCTGCATTCGTTTCAAAACAAATGTGGTTTTCGGTTGAAAAAAGTCTCCAGTGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 - chr2L 8297404 5' + Tirant 25 2 52.48 GCTTATTGGTGGTGGCTATATCGCTCCACGACTACAAAATGCTCATTCACAAAACGCCGACAAGACGCTGCCCACGTTTGCCCACCTTTTAGAATTTCGAA:1 - chr2R 6941388 5' + FB 227 1 75.25 ATTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTTGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAA:1 + chr2R 9499997 5' - G5 4793 1 48.51 GATTTTCATTTAATTTGTGAAAGTGTCTTAAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACAT:1 - chr2R 13737211 5' - 1360 3160 1 70.30 TTNATATAGAAAAGAGAAAAAAAAAAACAAAA:1 + chr3R 13953835 5' + gypsy7 5011 1 90.62 GAAATAACACGCTGGCCAAAAGCGAAATATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3L 12160205 5' + hopper 2 2 47.52 CGTTTACTTTGCTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACATTT:1 + chr2R 15655571 5' - HeT-A 6001 1 85.15 TGTAGATGAAGTGTAAGTGTAATTGAAAAACTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr3R 6776546 5' + copia 45 2 74.00 AGGCATCAAGGAAACAACGGCCACATCGAGCACAGAAGCAACAGCTCCAACTCCAGCTGCAGCAGCACCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAA:1 + chrX 16604520 5' - R1A1-element 5061 1 72.28 TATATATATATATATATGTCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chrX 18070629 5' + roo 8721 2 84.16 AATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 - chrX 21564737 5' + diver 34 2 62.38 GACATTTCTGACTGCAGGCTGCCCGTGTCACTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGC:1 + chr3L 17685821 5' + R1A1-element 372 1 77.08 TGACTTGAGTTGAATGACTAACTGACTGAGTGCAATTGTGTGTGCGTGTTGGTGTTGCTGTAGGCATGCGTGTATTAGATAATATGTGTGTGTGTGTGTGG:1 - chr3R 21694183 5' - accord 7031 2 48.51 GTTGTGGCATATTGTATCACATTTTGAAACGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 19947408 5' - roo 9028 1 68.00 GAGTATTCTCTTCTGCTCGTTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chrX 10644786 5' - hobo 2937 1 78.00 CAGCAACGACAAAAATATTAAGTGCATATCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTACTCCCCATTTTTAATGTGATGGGGAGTAGTTAACAAGTAACAT:1 - chr3L 25551331 5' + gypsy 6982 1 39.60 CTATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chrX 12813737 5' + BS 43 1 69.31 AGNTAAGCTATTTACAGACTTACAATGGTTTCGTTTTTTATTTCCTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 + chr3R 25277620 5' + 3S18 5797 2 53.47 CTACTGTTTGTTAATGAATGGTTCCGTAAATTGCTAAAGGCTTGTTTGAGTAACCCAGATACCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr2R 8294296 5' - 412 479 2 64.36 ATNGTGTAGAAGAAATAAAAGAAAAGTGGAAAATGCAGACAGACTCTGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCT:1 + chrX 4888655 5' - 17.6 7167 2 54.46 ACTCAACTCGGGTTAGTTGAGCTCACTTTCACTTCGGTAGCACTATAGACTGGCGAAGTTCCGACCGTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 + chr2L 21876936 5' - INE-1 137 1 67.68 GGATATGACACAATCTATATAAACAAAACAAAGTTTGTTGGCCCATTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGTAAAAACTGTCACGCCCACACTT:1 + chr4 120277 5' + INE-1 244 1 71.29 TAGAGGATAAATGGTAACGAATCCCGCATTATTTCTGGATTGCCGCCTTTATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 - chr2L 21612990 5' - 297 6973 2 70.11 TCACCGAAAACCCCAACACACACGCACACACATTCGTGTTGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTG:1 - chrX 4810114 5' - jockey 4760 1 61.00 GTTTGTTGCAACTAACCCCTAGCCCTAGTTGCACATACATACCTATATACCCAGTCGCTGCAAGGAGGCTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 - chr3R 17666070 5' + Transpac 6 2 74.26 TGNGATGCAGCCCCAGGCAACCAGCAGAGTTCTCACAGCTACACAGAAAGAAAAAAAACAGAAATCAAAAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAA:1 + chrX 11246292 5' + F-element 345 1 77.23 CGTCCACGTTTTATTTTTGTTGTGTATCATTTTGCTGCTGTTGCGGTGCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAG:1 - chr2L 3239643 5' - HMS-Beagle2 7001 2 52.48 ACAATGCGACATTGTTGTGCTCACACTTCCCCTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr3R 12566764 5' + Doc 53 1 68.32 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAG:1 + chr3R 17660025 5' - micropia 5410 2 55.45 TTAAATGCCGCTCGGCTTTTTAATGAGTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 9658352 5' + P-element 46 1 33.66 TTATTCCAATAAAACATTACATTACATTTTTGTATGTACATATGTATAAATAAGGTAAAAGAATTCATCATACAACTAAGCAATCAATGTAAACCATGATC:1 - chr2R 25206923 5' + invader3 5136 1 71.29 AGTGATATTTGAATCCAAGAATGGGCAGATGACTAGTAAATCATGATCCATTATTAATTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1 + chrX 6654433 5' + jockey 4744 1 59.41 CAGTGGGCTTAGCCTCAAAAAGCTCTCGCTCTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 11764936 5' + roo 8709 2 71.29 CTGCAGCAAAGTGGGCTACAATAATTTGCATGGAAAGCGTGGAGAGAAGAGAAGAGTTGAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3L 12991103 5' - hobo 2922 1 63.37 GATTTATAGCCAAATATAGATGCCAAGGTGCCTAATTGACGGCATGAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chr2R 12726861 5' - copia 225 1 55.45 ATAAAACAAAATCAACAACAATGGCATATGTGTAAAGGATGGCGTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGAAGGTTTTCGGGCCGAAATCAATT:1 + chr3R 27376674 5' - 1360 3184 1 63.37 TANCAAAATAGTTTGCATAATACAGCGATTTAGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGATGGAAAGTTGATTTGCTAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTT:1 - chr2L 6838743 5' + Tc1 59 1 75.25 AAAATTCCATGGCATACGTCGCGTTTTGGTCGGCCAAGTCTGAGATTTACCAGCTAACTCACACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTT:1 - chrX 4045599 5' + I-element 4996 1 49.50 CAACAACACGACTCGCATTATTCCCTTGGCGTATTTTTGGTATTTATGTAATTTTTTTTGTGATTGATATTTTAATGCTGCTTTCATTTTTTGATTGCTAA:1 + chr2R 19793391 5' + transib4 69 1 66.34 CAGGAGGCGCGCATGGCCAAGGAAGCCGCCGAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGA:1 + chr3R 11375205 5' + F-element 4325 1 61.22 GCNCTATTTGCGTCCCTTATTTTTCCTTCTTCATTCTTCATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 - chrX 5256753 5' + INE-1 21 1 78.22 ATNAATATCCGTATGTAGTCTGTTGCATTCAAGACCCCATTACATAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr3L 7629561 5' - opus 7473 2 57.43 AGCCAAACGAAACCAGCTGACAACTGAGTAAATGTTTTGGCCCTATTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGG:1 + chr2R 22320195 5' + springer 7489 4 54.46 CGCCATTGCTGATACTTTTATTGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGTATCGCTTCGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTT:1 + chrX 13640632 5' + P-element 23 1 52.48 AANCTGTGCGTCAAGATAGCATCACTCGGTTAGCGGCAATTGAGAGACGGTGGACAAAGAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAA:1 + chr2L 23313654 5' - S-element 1700 1 64.36 TANATAATAAGCAGCTGAAATGATTGAGTTAAACTTGTGTTGTCTATTGATAATTACCCCTGGCTGACTATACTTATTTTTGCTCTTAAATGGCTGAATAA:1 - chr2L 1380005 5' + Osvaldo 124 1 91.09 TTAAAAAAGGTTGTGAGCCAATAATGGAGGCACTGCCGCTGTGATAAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTTGAATTTTTGA:1 - chrX 19669188 5' - S-element 1687 1 54.46 GCAAAAAGAACATTTGATGGCATGTTGTTGTGATGTTGAAATAGACAGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 + chr3R 4600427 5' + Tabor 6870 2 54.46 GGAGCAGATACGTACCCATACTTACATATACTCGAATATATGTATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:1 - chr2L 16954903 5' + Quasimodo 25 2 65.35 AAGCTGCTCGCACGCATTTATTAATTTTAATCATTTTTCTGACACAATTTCCGCTGGCCGCACTTTTTTCGGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 29423475 5' - roo 404 1 74.26 TGGATTCTATTTTAAACAAGTTGAAGAACTTTAATTATTCTGCGTGCACAGTTGCTTGTTGCCTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 19947334 5' + roo 8678 2 64.36 AATTTCGAGGGACAGGAAAAGCGCGAGACCAGTGAGGACGAAGAAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGC:1 + chr3L 22905085 5' + R1A1-element 459 1 59.41 GTGTCTTGGCAACCTTGTGACGAAAGTTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 20419126 5' - roo 388 2 59.00 TATATATATATATACTTTTCAACGAATCTAGCATACAATCTTACTTACTTTCTTGTTAATTATTAGTGGAATATTATTAATTTGTAATAATTTTAT:1 - chr2L 11466842 5' + Tc1-2 1373 1 73.96 AAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGGGCAGACGTGCCTGC:1 - chr2L 13151043 5' + G6 19 1 58.73 AACATTGAAACGCGTCTTGTGATAATATATTCCTGTGCTACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATAGA:1 - chr2L 3706320 5' - Quasimodo 293 2 55.32 TGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3R 14688327 5' + pogo 22 1 50.50 GAGCATAAACTTCAATTGGAGCACAAGTATCAAGTGAGTAGTCGATGCGATGCAGCTCAGTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCAGA:1 - chrX 13271493 5' - invader2 270 1 66.33 AGACCCAAAAACCGAAGCCCCCGAAGCCAGTTGCCACGACCCATGCCGCTGGTGAGAGAGCCCCAAAGCCCGAAGACCCACGACGTATGGAGCATTTTAAT:1 + chr2L 15200596 5' + Copia1_DM 372 1 78.22 GGGCAGGTTTGGCGGTTCGTAATTACAGTGATTTACCGGATCGATTTGTGTGTGTTCGTTACAGTTACAATTGGCGCCCAACGTGGGGCAGCCCGATGCC:1 - chr2R 17907554 5' + Circe 258 1 59.00 CCNAGTCCGTTTTGCTGGTCCCATTATCCCTGCAGCGGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 21767199 5' - F-element 469 1 76.24 ATACCGACCACTACAAATGCACCCTCAACGACAAAAGAAATAACAACTACGACTTCTGCTCCTACGACCACTCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAA:1 - chr2L 14162233 5' + F-element 341 1 34.65 TAGTTTTGGGAATGTTTTTCGGTGCAATTAAAGCCAAATGCCAGCCAATGCAATAAACAAAACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 - chr3L 6013742 5' + Max-element 16 2 63.00 GANTCAGATCAAGCAGGAGTTCGAGCAGGTGCGTTCCGCATGTGGGTGTGTGATGAGTCAAGTGTGCTCGCTGCATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCA:1 + chr3R 22487365 5' - F-element 4294 1 69.31 AGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr3R 13225474 5' + hobo 8 1 71.29 TTNAGCCAACGAGCTTTTTCAATGGCAATTGAATAAAAAAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr2R 4559128 5' - pogo 2066 1 66.34 TTTTGTTTGTTGCGTTTGAAAGCTAAGAAACCAAACCGACACCAAAAGGTAATAAAAACAAAATTGAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 16286686 5' + gypsy2 425 1 77.92 GGCCAAAAGTCTGAATAAGGGAAAATATTTTTTATTGGCCATTTCAATTATCTTAATGCTTTTACCAAGACGCCCAGTGAATATGTGTCTGTGTGTGTGTT:1 - chr3L 6279663 5' - accord 184 2 58.42 TTGAGAATTTACCATTGGCAAATGCAATGTCTTAACAAGAAGGTTGGTTAGTATGGCCATGTACACAGGGCGTATGCGTAATATTTTAAGAACATAACTAA:2 + chr2L 6870826 5' - Transib5 416 1 69.31 GANGAGCACGAGAATGAACGCGAGTCCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chrX 18356209 5' - P-element 2838 1 29.70 GCCTGGTTTCGAGTTTTGGGGTCTTTGGCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1 - chr3R 26434737 5' + Tabor 6876 2 67.42 TANTGCCCCAGAGGAGGTCATAACTATAAGCGAGAAACATTTGGGCTAACTGGAACTAAAGGTAGTTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGACA:1 - chr3L 20646274 5' - Circe 292 1 70.30 CGAACGGCTGCCACGCGAGTTCGCTGCTTGAGTCTTTCGTAATGCCGCATAAAAGCGCTATGCAAATACATTGTGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTG:1 + chr2R 18960373 5' - Porto1 306 1 77.23 TTNGTGTTGCCTACTTTTCGGCTGGGTAGTGTTAATGTTGAATTGTAGTTTGGGGGCGGGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3L 9064374 5' + jockey 21 1 57.29 GAAGATGAGGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chrX 10644871 5' + hobo 42 1 64.36 GANGGCAAAAGTGGGTGGGATCCTGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGC:1 - 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chrX 687914 5' + BS 5104 12 96.30 CTCCTGCGGGAATTTCGGGGTCCTGACCCACGAAAGTTTTGGCTTTTTAAAGCCGGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 - chr2R 22456260 5' + diver 5911 2 58.42 ATGGGACCTGTTCAAACCACCGAATTTCCGGCGGCTTAACTCCGAGTGCATCGCCATTGGTTCAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr2R 20804761 5' - hobo 2927 1 65.00 CGTTGACGCTCCTTGGGAGCCAAACAGGATGGTTGGAGGTGGCGTCTGGATGGGGTGCTTGAGTGGATTGTGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCT:1 - chr3L 18664934 5' - Quasimodo 7118 2 63.37 TGAATCGCTTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCT:1 + chrX 21636175 5' - Stalker2 377 2 50.50 TTTTTGAGTGCCTCCTTTTGCTGCTCCTCGGTTTCCTTGTTACCTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAA:1 - chr3R 9505476 5' + diver2 4724 2 64.36 GAACAGGTTCTTCACCTCTGGTTGGAGGTGCTGTGCGCTTGCCAGGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCG:1 + chr3R 15221698 5' - Doc 465 1 61.39 TACGCGCCACCGCCTAGCAAGCAACTAATTGCATTTTCCCAGATGCAAGATTCAACGACACCTTACCACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 + chr3R 23545632 5' + Quasimodo 59 2 71.29 ATCAGTCGACGTGCTCTCTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chr3R 24739032 5' + pogo 54 1 79.21 TGTCGGTTCTGCTTAATGCTCCTATATCGCCAGCTCTTTCTTGTGTTCTTGTATTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAG:1 - chr3L 16485277 5' - F-element 382 1 61.39 TATCCTGTGTCATTGTCCTGTTCGCTCGTGTCCTCGGCTCGGATTCGAACGGGCAGCAGCTTGCTATGGTATTTTT:1 - chr2L 1296471 5' - F-element 4443 1 84.21 CCTTTGCCACCCTTTCCACGACCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr3R 14626057 5' + P-element 53 1 24.75 TGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 23146506 5' + 1360 51 1 74.26 ATTCATCGCTCCATCTCAAAAGGAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 2527432 5' + roo 8717 2 52.53 AAAATATAATTTTTCACCATCAGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr3L 13345436 5' + Transpac 4940 2 57.43 ACGAATCATTTTCTGGGTTCCTCTTCCTAAATGATCACAATTAAATCAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chrX 20933741 5' - mdg1 392 2 53.47 TGAGACAGGCATATACATATACATATAGACAGCACCAGCGCCCAAAACAGCAAGGAACTGAGAACTACTACTGAGAACTACTTCGAACTGAGAAGTTAAGC:1 - chr2R 6511555 5' - Cr1a 4096 1 56.44 GTAAGGGATCTATATTTTCATCCGAAGTCTTCAAAGTAATACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTA:1 - chr3L 23155757 5' + gypsy 6996 2 68.32 AANATGTGAGTCGTTTTTAATGGCGCAAAGCTTTTACCTAGATGACTCAGATGGTGGGCTATAATGATCTAATGAGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3R 9325579 5' - roo 408 1 77.23 AAGCCTTAAAACATGGAGGACAGTAGTATAACTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCAATTATAGCTTA:1 - chrX 20858762 5' + Copia1_DM 48 1 71.29 TCGACGATTAATGCCAATGCACATTTAATGCACATATTTGGCTTTTTGTGTGCCACTCGATTGCTCTTTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 + chr3L 20669048 5' - Transpac 305 2 74.26 CTCTTTATCGTTCTCCTTTGACTCTATTTCGCAGTCAAACAAGGGGAAGTTCTATGCCTTTGTGGATGTTATGATTAGTCATATACCATGGAGCACCTGTG:1 - chrX 17929716 5' - G3 4285 1 74.26 GTTAATGTTGAATTGTAGTTTGGGGGCGGGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 9064344 5' + jockey 57 1 68.32 AGATTTCCATGCTGCGTTTTAAACCCTACTGTTGGTATTTATATTTGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTT:1 - chr2L 366735 5' - I-element 4988 1 55.45 TGCAAGGGAACGGCGCTGCAAATGCCTTTCCCCCCCTTCCCGTGCACATCGGCATGCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3R 28288573 5' - 412 7529 2 61.39 TGNATATGAATGCAAAAAGAGGTGCTCTGGATTTTCAAAGCTATTATTTAAAGATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chrX 9983718 5' + pogo 19 1 59.41 CAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACC:1 + chr2L 1432060 5' - Stalker 47 4 71.29 TTCACCGGATTCTATATGCGCAGCGATCGATTTACGATTTACGTGGGTGTGGTGGTTGGGATGGTAATTGGTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAG:1 + chr3R 17892776 5' - invader2 177 2 78.22 AANTTAAAAAAGAACATTTGCGGCCTTAGATTGGAAAATGTCTAATACTATTTACAGATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCC:1 - chrX 8150501 5' - rover 7281 2 62.38 CANAAAGCCGCAGCAACCGTCTAAGAAAGTAACCAAATGAAATGCCTTTTGTGGCTGCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTA:1 + chrX 4173421 5' + I-element 4875 1 58.42 GCTGCATCTGCCAGCACAAAGGATTAAATTAAATATTCTGCTAATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACTCGAGTCTA:1 + chr2L 3243311 5' + Doc2-element 4583 1 57.43 GACACTAGAATAACAAAATGCGGAAAGCCATACCATTTTTTTGCACACAATTTTTT:1 + chr2R 9843317 5' + 1360 39 1 85.71 CCATAAAACAAATTAAGAAAAGCGAAGAAAAATTAAAATAAAGAAGCTTAACAAGCGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAATAAAAAACAACAAA:1 + chrX 12754521 5' + gypsy7 5013 1 83.17 GCTGCTCTTGTGTGCGTCCGGGTGTGTTTGTGTAAGCCAAACCGCAGCGTAGAAAAATTCTTTGGGAAAAAGACAATAAAAAAAAGAAAAACAACAAAATA:1 - chrX 2269840 5' + gypsy11 3932 1 70.30 TTNTCATCGCCACAAAATGAGGGGGAAAAAATATAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 6443176 5' + G3 4583 1 36.63 TTCTCTCTTCATATGTATATGGTTAATAAATTATGGCGAGATTTGTGGAGTTGTTTGATTTAATGCAAAGCTTAATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATG:1 - chr3L 25332850 5' - 17.6 57 1 54.46 GTGGGTGGATCGGATTGGGATTGGCTGGCTGACCCGCTGACCGTCTTGAATGGGGAGAGCTT:1 - chr3R 10481241 5' - Doc3-element 449 1 75.81 AAATCGCACTCTTACACTCGCACTTACAGCGTGTACATAAATCTTGGCGATATATTTGCAGTATAATTTTTAGTCATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGA:1 + chr3L 13878017 5' + flea 4756 1 76.24 TACAACCAAGATACAGCGGCTGCCATTCACCAGCACGAATAAACTACCTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCCGCA:1 + chr2R 11210468 5' + HeT-A 5647 1 76.24 GGGCGGGGGATCGTGATCCACCACCATCCACACGTGTAAGAGTACGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr2R 21497481 5' + P-element 32 1 46.53 TTTTTCCTATCTGGGACCCTTTGTATGCGACTGAGTGAGCGGGTAAGATGATGAACTCCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chr3L 21999122 5' - 412 7512 2 50.00 AANCGAAAACTGTTGCATACTTGGCAGCTGCACAGATATATATATGTACCTATATACGAGTATATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2R 13403818 5' + jockey 24 1 61.39 CGGGGAATTGCTGGCGCAGCTAAAAGTGGCCCCGCCAATTGAACCACCGAATCCGACTACCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGGTAG:1 + chr3L 1347352 5' - Doc3-element 4516 1 59.41 GCNCAACAACACACGCGGCTCGCTTAATCCATAAAGATTTATTTGTCGGGCTGCAGAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCA:1 - chr2R 8414944 5' + I-element 5103 1 59.41 CCGAATCCAGCGCCTCCAGCGTGAGCACAACCAGCGGATCAGGTCCCTGCTTCGCCGCCAGAGACTTGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGTGTACCTGAAA:1 + chrX 2940160 5' + HeT-A 5744 1 62.38 TTTGCAAATGAGCATAAATAAATAATTCAATTCAATTTGGAATTTCGCTCGTGCTGTGGACAAACATTCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCTAAGTCC:1 + chr3R 8492689 5' + diver 423 1 64.36 GAAGGCCATTGTGGCAATCTTCGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chrX 6814345 5' - roo 9039 1 54.46 GGCACCTCTTACACCAGCACACACGATTCAAGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 20309384 5' + roo 8709 2 73.27 CTNCTCTGTGGTATCATTGTATCTCCCCCTCCATCATCTGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2R 13899202 5' - roo 9036 1 62.38 GGNATATGCCGAAAATACCAATTGGCTTGGAAGTGCTGGCAACGGTGCATTTCTTGCTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCG:1 - chr3R 15287990 5' - accord 6912 2 61.39 GGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATA:2 + chr3L 25889010 5' + gypsy8 305 1 77.23 GCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGG:1 + chr3R 19450209 5' + roo 101 2 59.41 TATCTTAAGTAAAAATTATTTTACCTCGGAAATAGACTTAACACCCTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3R 2425641 5' - 1360 3361 1 70.30 CATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 - chr3L 18337714 5' + Juan 4050 1 53.47 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGC:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 14 1 65.35 TAGTATAAATAGTTCAGCTCGAGCCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:1 - chr3L 11920091 5' - Tabor 7274 2 74.00 ATATAATATGATACAAGGAACCCATAAATTCGAAAGGAGCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATA:1 - chr3R 19448560 5' + F-element 4575 1 68.32 GANGATGCAGTTGGCCCCAAAAGTCGCCAGATCGCTCGCCTGCTACGAGACCGTTTCTGGAGGAGGTGGGTCATGGAGTACCTGCCTACGCTTGTGCGCCG:1 - chrX 2533569 5' + aurora-element 3778 1 67.33 AAACAAAGGGCCAGGGAGAAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAGTAAACCAGGAGAATTTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTATTTAAAAAGACGATCT:1 + chr2L 18932953 5' + TAHRE 352 1 50.50 AGTGCATTTCCCAATTGCCAATTGTTGGCCAACTTTTGTTGGTTTGGTAGTAGCTCGTCTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTT:1 + chr2R 22904884 5' - Doc 486 1 64.36 CTGAAAGTAGGCTACACATTCCAATCTCAAAGCTCACTTTACGTGTGTGTGGGAGCTGCACTAGTGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chr3R 20984268 5' - hopper 1402 1 61.39 AAATTATATATGTAAAAATATTAATGATAAGGTGCGATAAAAGATAATAAAACTGACACGGTGCCCCAGTTCTCAGAACCTTTGATTGTGCTCGTTGTATG:1 + chr3L 1997093 5' - F-element 4318 2 55.45 AAATAAGGTCACCGTACTCTTCATAAAATGTCCCAATATATTTAGATATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGA:1 + chr3L 18511059 5' + Ivk 31 1 56.44 TTAGCAATAATTTGTGTATAAGTAATTTGAATTGAAATATTTTTGTTTGCTGTTGCTAGATAAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 + chrX 19872616 5' - INE-1 556 1 89.11 TATATGAAAATTTATTCTTTAAAATTGAAAACTAGAGGGTTAGGGATATTAATATATAATTCGTCTTAAAGTGATTTGCTCGGAAACCAAATCTATTACAT:1 + chrX 21218816 5' + Stalker 7227 4 78.22 ACAAATTATATTTTAAAAAGTAATTCAAAATTCGAATTTAATGATGAAGATGACGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 9868984 5' + roo 21 2 59.41 ACATGGACTGGTTCTACCAGACGACCGTGAGTTGGGATATATATTTCAGATAGATATTTGGTTTATCTATTTTTCCTAACTAAGGCTCTTTTACTAAAAGC:1 + chr3R 30516328 5' + G5A 2390 1 79.21 TGAAGCAAACAATGCCGGAACGGCAATTGTTGAAAGTAGTTAAGAAAGGCTTGAGGGACGGGCGCTATTTCGGAGTTTCGGTCCTTTAGCAATTATTTTCT:1 + chr2R 4511925 5' + transib2 60 1 66.34 CAGCGTAGCGAAGCGAAAGCAGACACGAGGGAGAAGGGCGGGGAAAGAAGAACTAACAATAAAACAAATTAAATAAATAAATTAAACTAATTAAATAAAC:1 - chrX 17068947 5' + HeT-A 355 1 59.00 GGAAATTCCCAACCCAATTCTAATCCCAAACTAAAAAAAAGGGACAAACAGAACAAATCGATCGTTCTAAAATGAGCCAACTCGAATTGCGTGCTCAGCG:1 + chrX 11884554 5' + Doc3-element 228 1 51.00 TGNATACTCACGAATGAATATTGATATTGGAGTGCCGGCGTTTTTTGTGGCCATGTTATTATTGTTAAGGTTTTGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAGC:1 + chr2L 19549383 5' + gypsy6 167 2 78.00 TTTGGTTTTCGGGGAAAAATTCGCATTTTATTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTT:1 - chr3L 19030680 5' + hopper 149 111 60.53 AATGCAAAGGCGAAATTTTATCATTTTTCCTCAATATCTATTGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGT:1 + chr3L 2273675 5' + INE-1 538 1 76.24 CTCCGGCCCAGCTATCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTAATCCTTA:1 + chr3R 2914320 5' - Circe 7050 1 65.35 CTTGTGACGAAAGTTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 20419113 5' - roo 9037 1 62.38 TTTCAAAAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAAAGACAAAGAAAAACACACGAGCGGCGATTTCAACAAACAAATTTAAAAAGCT:1 + chr2L 2436615 5' + 1360 3007 1 50.00 TATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTTTATTTAACTTTGAGTTTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTATTAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 - chrX 12671043 5' - TAHRE 10428 2 74.26 TGTGGCTGTGTTTGTGGCTTTATCAACTATATTTGGTTTATTTTATGATTTGTTTGAACTTTTAAATTTTTACTTTGCAGGTGGGTTTAACTTTTGTTCTT:1 + chr3L 5816268 5' - HeT-A 278 1 71.29 AANGGTAACGTTATTATTATTCTAACGTTAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGC:1 - chrX 7583252 5' - I-element 5312 1 68.32 TCCAACTTGGCGCTCAGTGAAGCAAACGGACAAAGCCTGCCAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTC:1 - chr2L 20300145 5' + invader2 5054 2 66.34 TACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTG:2 + chr2R 5582162 5' + Cr1a 436 1 72.28 ATAATAGAGAGAGAGAGAGAACAAATTGTGTGAAGAGAATACGAATTATGAGATTTCTGAGGGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAG:1 - chrX 5380716 5' + R2-element 3214 1 66.34 TGACATATGGGGGACATTTCGGTGACCCAGAATGCCAAACAGCCATCATACAACAAACACATACCTGTGACTACTCCTGAGGTTCCCAGCGACTCGGTGCT:1 - chr2R 17357128 5' + HeT-A 5716 1 62.38 TTCTTGTATATTTTGTGCTGCTGCTTTTGTGGCTTTTTTGATAATGACGCTGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATA:1 + chrX 18152185 5' - Stalker 6820 2 58.42 TTCAAATGATAATTCAAAAATAAGCCTTAACTTTTCATTTAATTCAAATGATATAGGCTAATCGAAGGGTCAAAATAACACATAATGTTCACACATGAACA:1 + chr3L 20986981 5' + roo 8659 1 78.22 ACCTTTAGTTTTCAGTTATCATTAATATAGGTAATACAAGTGATTTTTTTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chrX 19052973 5' + roo 8691 2 55.45 TANTGTAATCTGGTTTTTTGGCTTGCTACAATTGCGGTTCGTGCTGGCTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGG:1 + chrX 2520555 5' - Transpac 317 1 55.56 CGCTACCCATACAACACCATTTCTCAGTTTTGTTGCGAAAGTAAAGTGGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 17729030 5' - hobo 2915 1 55.45 GGGTTATGGGCACTGGAGTCTGAGATTTTAGGTAGATCTCTCAGCAAGGAGGGGGGACTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGC:1 - chr3R 22344488 5' + R1A1-element 5158 1 69.77 TACTTTTCCCCCAGAACTGTTCAGGTGGACGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTG:1 - chr3L 7060733 5' - I-element 4999 1 70.30 CGATTTAGATGCACAAACTGGCGCCTTTTCGGAATCGGCTGCACCCGCTCACGCT:1 - chr3R 26876446 5' + F-element 467 1 63.64 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCA:1 - chr3L 23730763 5' + Stalker4 7259 4 73.27 CGCGTTTGGGCTGCCAGCTAAATGAGCAACACGGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGG:1 + chrX 18264046 5' - TART-B 151 2 71.88 ACNCCAACCGTGGGCCTTTCTCCTAGCTCTTTATCCCGGCACCACTACACAGACACACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCTGTCCGTCCCATTCATGCCC:1 + chr2L 14120822 5' - invader5 140 2 61.00 AACGAACGAGATAAAGACATTTGGAAATTCTTCGCAAAAGGCCAACAGCATGAAAGGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr3L 10557654 5' + 412 7075 2 57.43 CATCCGCACATCATCTAGATTCTAGAACTTTGACTATTTATAAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr2R 17077898 5' + Tirant 13 2 60.00 CACGACAGTATGACAACCCTGGCCCGAGCATAATTGATAACAACTTGTGTGCTCATGTGGCTGTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3R 4805035 5' - 1360 3375 1 64.36 TTTTGACTGTTTTCACCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCA:1 + chrX 10774879 5' - 1360 3121 1 85.00 GTTCGCTGGTAAATAGAGCAGTTGATCAGACCATGTATTTACCTCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 + chr2L 57457 5' + Transpac 4967 2 61.39 AGAGGAGGAAGAAGCTATGGAGCAAAAAAAAATGTGAAAAAAAATATACGGGAGGACTGGGAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAA:1 - chr3R 14069312 5' - FB 33 1 65.35 TAATCAAATATAAAAGTAGAACATTTTAAATATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCC:1 + chr3R 16593839 5' - Max-element 256 2 70.41 ATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr2R 6947359 5' - 1360 3351 1 82.11 ATTAATTTCCGTTTTGCAAACCAATTGAAAAACAAAAAAAAGAAAACAAAAAAAAACAAAAAGAAAAAAATGAGTTAACGCGAATGGCGCGCTCAGCGGCG:1 - chr2R 17344898 5' + Doc3-element 231 1 53.47 GGAGCATCTGACCGCTCCCGTTGATGAGCTGGGTTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTATGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTG:1 - chr3R 22490611 5' - F-element 4429 1 72.28 ATGATCCTAACGGTAAACCTATCTATATACGTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3L 13652799 5' + hobo 34 1 62.92 AGAACAGCGTAAAAAGGTTGCCTGCTTATAGGATGAAATACGTATACATTATTACATACGCTATTATTACATATTTCGATATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 - chr2R 4900391 5' + Doc 10 1 60.40 TGCCATCTGTCATGAGCGTTGCATAATTAGATGAACTTTGCAATGCATTTAATTTGCTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTGA:1 - chr2R 15452180 5' + Circe 70 1 62.38 AAATTAAAATAATATGTTCCCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTTTCGGAAAAGTCTTAACGTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGC:1 + chr3R 1288864 5' + diver2 4793 2 78.22 GTTTTACCACCTTGCGCTACATTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTCTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTGA:1 - chr2L 22216580 5' + diver2 4556 2 94.95 TTTTAAGTATTCCCCACTTGAGTCAAGTGCATAAATTCGTATCGAGTGCTTGCGAACGCGAAATTTTATCATTTTCCTGGAATATTGATCCTGATCAAGAA:1 - chr3R 18347640 5' - INE-1 87 1 45.54 TTCTCAGATCTTTTGCGGTCCAACAATATTTATACGTGATAAGTATTCAGTGGGTCATTACGTTCGGTTGGATTTCCATGAACAAAATGATACTTAATATC:1 - chr2L 17302471 5' - Copia1_DM 4136 1 79.21 GAAATATTTGAAAAATTCCATAAATAAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 19952367 5' - roo 9021 2 85.15 AAGGACTTCAAGGCATGCCTGGCCTTTGAACTGCGCTCCGACGACGAGGTGGAGGCCTCCCTGCGCGTGCTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTC:1 + chrX 3889359 5' - gypsy4 6545 1 67.33 CANGTGTATGTGGGTGTGTGTGCCTTTCAAATTGTATGCAAGCAGGTCAAATAATGACAACAAACGAACATTTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chr2R 17938850 5' - copia 250 1 71.29 TAGCAAGCTGCGAGGTCAAGGGATCGGTTCTTAAATGTATTTTCAAATTGTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 27156630 5' + pogo 20 1 57.43 TTGACATTCCGCCTCGGATTCCAGTTCTTTGCCCCTGGCCATCAAAGGAGCTCCTCAAATGAACTTCACCCAACTGGACGCGGCAGTTATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 4072351 5' + HMS-Beagle2 474 1 77.23 GTNGTAGGAGGTTTCGCCCCAAAAGTGGCGCAAAGGGGCGCACCATGCGGGTGCTGAGACCCAAAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAG:1 - chr3L 11772721 5' + R1A1-element 5117 1 51.49 GCAAGTTGAAATTTATTAATTTCGTGATAAGGTAAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTG:1 + chr3R 13502893 5' + invader1 269 2 66.34 CCAGACTGCAAAGCGCAAGATAATATCAGGCGCTTCTCCATATCTTGAGAGGAAAAAACTAAACCCTGGCCAACAAGGGGAGAACCCTTCGTCTACAGAAC:1 + chr3L 23220410 5' + X-element 490 1 65.35 AAAAGGGGAACCACCACATTTCGCAGCCAGGAAATGTGGAAATTCGCTGGAAAGGCACAGGGACCTGCTGTTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 - chr2R 23411975 5' - mdg1 7455 2 73.27 AATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTC:1 - chrX 23108310 5' + BS3 1438 1 58.42 CTGTTGAGAGTATAATATCATAGCAGCCCCTTTTAGCCCAACACCTGCTTTCAGCCCCATTAGCTCGGTGAGTTACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAA:1 - chr3L 13195374 5' - roo 8690 2 80.20 TTNAAAGTAATACTGTATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGC:1 - chr3L 23155728 5' + gypsy 7025 2 60.40 GTCCGACTTGAACCACGTTTTGCGCTTTACAACTGCTCCGGGCAGTGACCATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGT:1 - chr3L 14495580 5' - gypsy4 6643 2 72.28 CGGGGTCGATCTCGTTCGCATCTTTCAGCTAGGAAGTCCACTTGTTTATACAGAAAGAGAAGGTCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTA:1 - chrX 12408069 5' + accord2 277 1 60.40 TCTACTCTCCAAAAAGATATACATGTATTGTATATATCTGGTGTGAATGCAGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAA:1 - chr3L 10348099 5' + 17.6 7081 2 52.48 TTGCTTTTCCCACAGTATTCAATTAAGATTGACAGCGGGAATATTTAACTCGTTTGTGGGGGACAGTACGTGTAGTGATTTTTATAAAAATACTGATTTTA:1 + chr3R 21340756 5' - roo 371 1 59.41 TCGATTTCTGTTATCGTTAATGGACCGATTGCATATCGAAACGAGGGCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2R 10468568 5' + P-element 27 1 52.48 ATTTACATAATCCTTGAGCTTTTGATTTGCTTTAAATGTATCTTTTTATACTGAGACGCAAAAAATAGTAGCCATAACGAGTTTTGTTTTGTTTATCGTTT:1 - chr2R 21504606 5' - Porto1 189 1 53.47 AACGACTGCTATGTACAGTTTATTGTTATGGTTGTCGTCTTATGTTCGCTTAGAAACCGTATACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCA:1 - chr2R 12751279 5' + Quasimodo 8 2 70.30 TATTTGTCGAAATATGCAGCAAATAAGAGGAAATGTGTGTTTCATGTGAACGGGTGCGTATACGTTATATTATGCTTATTTTTATGATGATGTTTTTATTA:1 + chrX 6509742 5' - jockey 4993 1 73.27 CTTATACTTTGGCTCAAAAGAGCACACAAAAAGACAAATTTCATCTACACTGACTTCAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAATAAGAAA:1 + chr2L 16337931 5' + Q-element 344 2 69.31 ACAAAACTCTGACAATGGCAAATAGTAATGGCATTGCCTTCGGCAACAACTATGGCTCAAGAATAACATCAAACACCATGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2L 18223872 5' + roo 8664 1 77.23 CTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGAAATACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 6417815 5' - Quasimodo 37 2 68.57 TATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGC:1 - chr2L 1654716 5' + micropia 5 2 74.26 GATTGTGTAGTGTAGTGTGGCAAGTGGCATGTGTGGGACGCTTTTGTGGGTGCGAGTGTGTGTGTGTATGTATATG:1 - chrX 3297752 5' - Quasimodo 30 2 69.74 ATCTATTAATAAGGTTTTCGGAATTGGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3L 15681550 5' + pogo 47 1 74.26 CCTGGTTGCCCTAAGATGCCTACCCAAAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCT:1 + chr3L 19002892 5' - flea 4612 1 73.27 TTTGAGGTAGTACACTTTGAAACTACATTTATTCAATTTGTGTAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGT:1 + chrX 21636183 5' - Stalker2 7617 2 58.42 TTNGTTCAGTTAGTTGTATCAAACCCCACATCACTTACACATGTTTTGAGCTGCTCAGAGGAGTGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 + chrX 18952028 5' - mdg1 7448 2 73.27 ATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTTTATTTAACTTTGAGTTTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTATTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 - chrX 12671042 5' - HeT-A 6058 2 74.26 TTTGTCCGCATATGTAAAGTCAAAGTGTGGCATCAAAGTTTAATACCAAAGACACTAGAATATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 27613481 5' + 1360 56 1 61.00 AAAACTATCAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACAGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTAGCTCCGGCCAAA:1 - chr2L 12232834 5' + gypsy6 7460 2 65.93 GGGGAGTGGAGGCCGAGAGAGCGAGAGAGCGACCCGAAGCAACACAACACCAACACGAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGA:1 - chr3L 17971306 5' + P-element 18 1 63.37 AAAGAGGAAAGTCTTAGGGCGAAAAACCAAAAAAATCTATAAAATGTTAGATTTTAATAAATGCTTTAATTAAGATGTATTAATATTATTAATTTAAGCT:1 + chr2L 2633771 5' - transib3 2663 1 82.00 AAACAACTAAATAAATTATGCACAAATTACACAGACATATTCGGACATATATTCGGGAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr3R 22852825 5' + F-element 29 1 45.54 ATTTACTAAGCGATTATATATACACATATATATTTCATAAGGGTCCATATGAAATAGAGAAGGTATTGAAAACCTTCAACATCTTTA:1 + chrX 9181077 5' - invader2 4640 1 44.83 TCCTCGACGCCTTTCTCCATGTTGTCTCGGAGTAGTGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAAGTACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCAC:1 - chr3R 24048898 5' - G-element 250 1 79.35 GTTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:2 + chrX 10644804 5' - hobo 2918 1 59.41 GANAAGTTGTTATAAATTAAAAGCAGAACATTAACATCAGCTCGTGTGTTCCTATTTATGGCAGAGGTCAAGCAACTGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3R 26592686 5' + roo 8665 2 78.22 ATCCAATAAAATTAAAAGCCATGAACACTAGGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCT:1 + chr3R 19450080 5' + F-element 368 1 73.27 ATCCATTTAATAGCTTAAGGCGTAATGTTTTATTTATTCATATGTGTATGGTTTATATTGCTGATTTTATTTAAGTTTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 12883051 5' + roo 8666 2 78.22 GGGACATTGCATAGGGTTAAGGATGCCCGACAGTTGCAGGAAGATGAGGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTT:1 - chrX 10644910 5' + hobo 3 1 76.24 TTGTATGCCTGTGCCTGCAATTTGTTCGATGCTTTCAATGATTTTAACAAATTACAATTTGGCTAAAGCATTCGTTGTGAATAAAGAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 21892208 5' + Osvaldo 1522 2 68.00 AACATATACTAAATCTATTATTGGACTGTTTACTAAATTAATTCTAATTGTTAGAACTGTATTTATTAATTCTTATATTTATTTATTTATTTATTATGATA:1 - chr3R 28799184 5' + copia 229 2 80.20 GCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCCGTTTT:1 - chr2R 5485121 5' - 1360 3344 1 65.35 TGAATAAATATTTTGAAATATATACTAGACTAAATTGAATATATACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2R 20309329 5' - roo 9039 1 61.39 ATGCGCTGGGCTTTTGCAATCTTTGGGTTGCAATTTGAACTTCACTTCAAAGACCACCCCTTGGGACCGGTTTTCATTTTTATTTTCATTTTCCTTTT:1 - chr2L 21038398 5' - Doc2-element 239 1 86.73 TTNTGCATATCGAATGACAGAAATTGGCAAGGGGTGTACACAAACCCACTCACTGGCCAATGCCCCAGCTCACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr3R 24430620 5' - Transpac 5226 2 74.26 GAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAA:2 + chr3R 19450118 5' + F-element 405 1 62.38 CACACAGGGCTGTATGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGAAGCGTAACGCCATACG:1 - chr3L 25271546 5' + 1360 17 1 93.44 TCCGAATGTGTGTTTGTTTTGTTGTTTACTTATTATCACCAAAATAGGGGTTCTTATGGAATAATTGAATTTATGACTAAGGCATTCTATGATTTGGTGTA:1 + chr3L 18420844 5' - Quasimodo 78 2 71.29 TGATTAAAACAATGGTATTCTTTTAAAATCATTTATTTTGGCATGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 + chr2L 21863316 5' + Burdock 1 2 76.24 AGTGAACTTCATCTCCGTCTTTTTCGTCTCATGCCATTTTGGCCAGTGAGACAAAGGACGAGCACACAATCACACACACACACACACACATACTCACACAC:1 + chr3L 15454358 5' + accord 191 2 55.45 CGAGAAATACATTTTGTAATCGAATTCAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 + chrX 7583176 5' + I-element 5 1 74.26 AGTCCATAGAATCAGATCAGTTATGGAAATAAAACTTTGATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAA:1 + chr2L 9720290 5' + invader2 4744 1 61.39 GCAGGAGGCAGTTGCCATTGCTGCTTTTTCCACTGCAATTATGAGCTGCAGGTACGTACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr3R 22494196 5' + 297 13 2 65.35 CATTTAACATGACAGCCACATTAAATTGTCCACTTTGGCAACCTGTGTGCCGGCACATATATATACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3L 1830825 5' + 297 6583 2 78.22 GAGTATTCTCTTCTGCTCGTTGCCCCCAAAGTATGCTTTAAAATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chrX 10644786 5' - hobo 2936 1 77.23 GTTTTCGTATCTCATTCATTCATTCAACTTTGTAAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 18816093 5' - roo 400 1 70.30 TTACGATTCCGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr3L 13345534 5' - Transpac 295 2 63.37 GATGACAACTTAAGTGAAAATTCTGCAATTATTATTTAAAAATTCCTAGGAAAAGGAATGAATCATTCGCTTCCATATATTTTGGAGATATTTTCACAGTA:1 - chr3R 30314169 5' - Ivk 5231 1 89.11 TGAAGTGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGCGGCTAATTCCTCCAGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAG:1 - chr3L 25186378 5' - Max-element 8339 2 53.47 CCATACAACATAAATAAGAACTAAGCTACATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCATTTATATGTTAAT:1 - chr3R 23244305 5' + BS 5025 1 67.01 GCGTGTCCGTGTTCTTACCATTTTTACGTTTTTGCCAAGTGCTCGTTTAGTTGTTTTTGAGTTTTAGCCATGCTTTTTGCAGTTTTTTTTCCGTTCTTTTT:1 + chrX 21593664 5' + rover 137 2 62.38 TGACGACATTTTTCAATTAAGAAAGGATCACAAGGCGCTTAGTAAGGCGTTTGGCTCCGGCTCCTGGATATTTGGATTATTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGT:1 - chr2L 5442188 5' - G2 3076 2 54.46 CCACAAACACATTTGACCAAAAAAAACAAAAACACGACAGCATTGTAAAGCAATTGATGTTTATATGTCGTTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chrX 11808985 5' - roo 404 1 74.26 GATAGAGAGAACTCAGCAGCCAGCAGACAGATCAGAAAATCACAACCCACGGCCATAGAAAATCTGACCACCCATCCAAATCCCCTAGCAAGAAAACTAAT:1 + chr2R 14298942 5' + Doc 4500 1 69.31 TCTTAGCCTTCATCTGATTTTCAGCTTAACATATCAAAATGCACTCTGTGTTTTAATAACCAATATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAATGGTACG:1 + chr2L 20632475 5' - mariner2 155 1 64.36 GAATGATAGTGGATTTATTGATCATACCAGGAGTGCCATTCCTCGGTCATCCATTCCAGCAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 + chr2L 6805219 5' + I-element 4919 1 66.34 GCAATGGTCAGTACACTGATTTTATGGTGACCAGCGTCACCCAGCTGAGGGTAATCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTT:1 + chrX 4593990 5' - Doc 4433 1 63.37 GAAAATGATATCACTTGGGTTGCCTAAGGTTCTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATTTATATTTAGGA:1 - chr2R 2527410 5' + roo 8741 2 70.30 TACAGACAAAGCGTTTTCATTTTTCTCTGGCTCTCTGTTCGTCTGTCCATCTGTCCGTATGAACGTTTGGATCTGAGGAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGA:1 + chr3L 22943441 5' + INE-1 160 1 64.36 AGGTGGTCAAGGTGTGTGCGTGTGTGGGTGCGAGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTT:1 + chr2L 18046717 5' - Quasimodo 6955 2 67.33 AATTCCATATACTAGCTCAAATCATTTCTCTCAGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:2 + chr3R 28117769 5' + I-element 43 1 69.31 GAAGCACTGTCGGAGGAAGCTCTTCCCCATACCAGATATATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTT:1 - chrX 5887744 5' + S-element 32 2 62.38 AATTATTCATGATGTTTTTGAAAAAAAACTTGTCCATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr2L 20153004 5' - opus 7475 2 62.11 ATCCATAAACTTGGACCCATAACTGGTTCGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAA:1 + chr3L 25729805 5' - Cr1a 4277 1 72.28 TATCAATAATATTCAGATTAAATCTACATACATATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 4806733 5' + roo 42 2 74.26 GATATCCGAGGTGGAAGTACAATCTGGTTATTTGGCTAGAACTCTATTTAAGGCGATGTTCAAACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 5925539 5' + roo 18 2 58.95 AGTTTTGGCCCGGACTTTATTCAGGCCCGATGCGCAGAAAAGTTTCCATTAAGCGGTCTAGGGTTTGGTAAGTTGGTTGGTTGGTTGGCT:1 - chr2R 12825293 5' + gypsy6 7649 2 81.11 ATTTGTATTTAGCCTACCGTGATTAATATCAATCAACAGGCTTATAATGCCTGCTTGAATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 - chr3R 19448913 5' + 1360 75 1 68.32 TTNAAGTGCTGTGAAAATTTTTCGGCTCCTTGTTTGATTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCGTTTTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGC:1 - chr2R 17313156 5' + diver2 196 2 76.24 CTTCGTAGATAATCTCACTGGAACCATCGAGCCTTAGCTTTTTCGCGGCACTGTGACCATTGATGATCGTTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGG:1 + chr2R 18971829 5' - F-element 4515 1 77.23 AAAGGGCGCCACTTGCAGGTGCTCCACATTCTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGC:1 - chr2R 14627974 5' + TAHRE 10419 2 74.26 CTGGCCGAAACTTTTCCACCTTAAAGTTTATACCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3L 1698566 5' - roo 9031 1 70.41 TCTACTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCGTTTTAATTTT:1 + chr2R 15479244 5' - Doc 4698 1 90.91 ATGCACTTATGCTGTGCCAGCAACTTTTAAATTAAAAGCCGTTGTCGCGTTTTCCATCGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTAT:1 + chr3L 12111242 5' - rooA 7413 2 70.00 CAGGATAACTGCCAGGACTACAGCGATGACACTCATACGCCGCGTTGTCCGGCTCTATACACATACATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAG:2 - chr3R 24408344 5' + Quasimodo 4 2 76.24 TTTCCCAATCCTTTGCCACCCTTTCCACGACCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr3R 14626066 5' + P-element 41 1 34.69 TCGGATTAAGAATGCCATCAAGCTGGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 6814325 5' - roo 9019 2 74.26 TACTGCTATATTAATGATTATGCATAATCCTTACCTACTTATACGAATTACCATTTATTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTG:1 + chr2L 19057564 5' - invader2 4845 1 66.00 AATTCTCAGTTCAGACAGACAGATGAGCGTCGATAAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 4528259 5' + HMS-Beagle2 484 10 76.36 CAATACAATATCTGCATATTTATTTTTAAACCAATGCAAACCAAGGAAACATATTCAATCACTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAA:1 + chr2R 24208836 5' + Juan 18 1 63.37 CCNACTTGGCCCCCCAAACTAAAACCTCCCAACTGGTTATAACTGAGCCGGAGTCAATGGGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2R 18723131 5' - opus 489 2 69.00 TGAACAAATATTGTGGTAGTCGTGTGCTCTGTAACTAAACTTATAACGAAATACAAAATACAAAATGCGAAACACTGAATACAAAATAAAATAAAATAAAA:1 - chrX 11982626 5' - transib1 1901 1 55.45 TGCTTGGTTTGGTTTGATATAAATTGGCTTTAGCAGCTAATTTTGTTTTCTGACAGGATACATTTGGGCATTATGCTGAAGGGGCATTTTGCCCAGAGTAG:1 + chr3L 24164896 5' + R1-2 2829 1 73.27 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTGCGGGTGTGATGCTATGTATGATGGTGAGAGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACACACATTCACACA:1 - chrX 17971835 5' + accord 7036 2 67.01 CCTGACCCACGAAAGTTTTGGCTTTTTAAAGCCGGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 - chr2R 22456239 5' + diver 44 2 72.28 TCTTAAGTGACAGTTTTCGAAAGAGTACGTTCGAAATATGGGAAATAAAATGGGCTAAGGGTGCGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATT:1 + chrX 6883232 5' - Burdock 245 2 66.00 CAACGGCTAAATGCCAATGGCAACAACCCATCTCTTTTGTGTGCGTGATCGGCCAGAGGACAAAAACAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chrX 5371770 5' - 1360 3361 1 71.29 AGCATGCGACTGCTGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGTCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chrX 17729078 5' + hobo 27 1 67.14 TTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGTTTTTTTTAACTTTTTTTTGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACA:1 - chr3R 18052449 5' - TAHRE 10420 2 75.25 AACGAGTCCAAGTCCTGGCCTCCTCGTTCACCTATTTCGTATTTGGGCAGTGATTTGGCAGAAATAATTGCCTGTATATAGTCATGTATACCCTTACATAC:1 + chr3R 24430489 5' + Transpac 1 2 77.23 CAATTAACTAATTAGAATTGCGTACAAATTAGAGAAGATGCAAAAAGGGATGTCACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 26140735 5' + 412 23 2 56.44 ATGACTTCATTAATATTGAGTAAAACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 6442655 5' - roo 9022 2 74.26 CANACTTTGACATGCCGGACAAAACCGAACTGATTCGAATAGGTCACTAAAGCGCAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGCTGCCAGGTTATAAAACCTG:1 + chr3R 1825280 5' + Cr1a 471 1 57.43 TGCTGCAACTGGACGCAGCAACTGTCCAGCTGCAACAACATCAGCGACGCAGTCTCCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCGGCGCTAGCGACAGCAGCAGCAG:1 + chr2L 16559819 5' + TART-B 175 2 45.54 ATTTCTCCTATATTATAATTATATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 - chr2L 14365443 5' - blood 332 2 76.84 AGNTTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTA:1 + chr3L 24213797 5' - invader2 5056 2 74.26 TATGTATGTGTATAAACCATGGTCCATGGTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTG:1 - chrX 12813736 5' + BS 44 1 70.30 GCNGACTGAGCTCCGCTCGATTCTGCCAAACAAAGGGACTGCAGCTGCATCAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCA:1 + chrX 22746421 5' - copia 4936 2 55.45 AAACCACACTCGCACTCACACCAGCACGCATACAAATACAAATCCAAGGATTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3R 19560874 5' + hobo 24 1 55.45 AAAAACTGACTAAAGGAAAACGCAGAGCAAAAATAAAGGACAAACAAAGGAGTAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCA:1 + chr3L 5665272 5' + F-element 4409 1 55.45 GCTGCCGGCCAAGGCGAAAAGTGCCGAGGCCGAAAATGGAGAGACGCCGTCGAAGGCGCCAAAACGCAGGAAAGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGT:1 + chr3R 4906812 5' - F-element 4537 1 81.19 GACAGGGAAAATTTCCATATACAAGCTGCTAAATGTTATTGGGGTTATAGTATGTGGGTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGT:1 + chrX 14040700 5' - roo 8618 1 58.42 ATNAGGGTTAAGCTGTCGGATGGGGGGTTCCTAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chrX 10644867 5' + hobo 42 1 64.95 TTNCGCGTCTCTTTAGTATTAATTTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 - chr2L 19602887 5' - hobo 2885 1 79.21 TTACGGGTTAATTATGACTTGAAAGCATAAAATCAAGTATGTTCCTCTAAATTGGTTTGTAGAGAAACGGAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCCCGA:1 - chrX 21452845 5' - INE-1 569 1 46.00 ACNATCTTTCACCCTTTCCGTTTGGGGCCCATTCCATTTCTGACCCCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGATTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACG:1 - chr2L 20524625 5' - Doc2-element 456 1 54.46 CAAACGAGAACGAAAGTAGTCGAAGTTCGCTTTGTTTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTTTCGTTTCTTTGTCACAGCTTTGGG:1 + chr2L 2419963 5' - gypsy4 427 2 75.25 TGNTTTGATTACAAGGCTACATCGAAAATGTTGTTTAAATATTTCTTCCATTGTATTAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr2L 14365380 5' + blood 19 2 59.41 AAGTAAATGCGATATTCAATCGAATTTACGCTAAACCAAATTGGAAATCGCTGGCTTTAAGCCAAGAGAGAATGTTACTCAGCTAGTGTGAGTGCA:1 + chrX 20579256 5' - INE-1 533 1 69.79 TAATAACATAAATCAACATGAAAGAAAGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 12398102 5' - roo 405 1 75.25 ACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTGC:1 - chr2R 3341941 5' - Dm88 4126 2 64.36 GCATCTCGGCGATCTTTCGTTTTTATGTTTAAATTCATCGATTTACCAAACTAACCTATAGATATTAAAAGCGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTC:2 + chr2R 15816437 5' + Bari1 3 1 74.26 GCTAGCCAGTCACATAGCCAGTCAGTATCTCCAGCTTCGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAAC:1 + chr3R 26075584 5' - invader2 495 1 75.25 GATCGCGTTCATTGCCTTTGCCTTGCATTATTGTATGTGGCTTGAACATGATGCAATTTTGGTTAATAATCTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCG:1 + chr3L 7994265 5' - Ivk 4942 1 67.33 CTGTTTTGGGCATTCACGAATTCCTCGGTTTCCGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATC:1 + chr2L 10413051 5' + Circe 12 2 67.33 ATCCATTTTCGGGCACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGC:1 - chr3L 5067852 5' + Quasimodo 54 2 79.21 GTATGCGAAGCACTCACGAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chrX 13640681 5' - P-element 2829 1 19.80 TANAGTCAACGACTGTGAAAAGCGTGTACCATTTAATTGATATCTCATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 5291680 5' - roo 9042 1 55.45 ATTTGCGAAAGGAGCTGGCGATAATCGATGGATGCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 - chr2R 19149452 5' + diver 5933 2 65.35 TTATTTACCATGAGTTGGCAGGAAAATTGCTGGCAAAAACTGGAGCCCCAATGATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAATTACTTAGCCAC:1 - chrX 12160189 5' + Porto1 4455 1 61.39 TCAACTTTGTAAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3L 18816116 5' - roo 9040 1 56.44 ACACAAGGATATTTGCGCTTAGGCTGCAATATTTTAGAGGGCGACTCGAAACAGGCTCTTAGTTAGGTCATGTCTCTGCTAAGAGTGCTGGATAATCGTAA:1 - chr3R 8064628 5' + baggins 148 1 64.36 CGAGCGAAGAAGGCGAGGCAGCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGC:1 + chr3R 6423907 5' + Tirant 98 2 75.00 GCGGGGAATTGCAATCAACATTATATTTTTCACTTCAAAGTATGGGCTATAGATTCATTTGAGTTCTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTG:1 - chrX 13848213 5' + F-element 28 1 68.32 TTAGCTCATTGCCTTATGCGTTATCAAAATTATTGCGTTGCATTTGCATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 + chr3L 10382655 5' - I-element 5328 1 56.44 GCGATTGCTGCAGTTCGAAAACCGCTTGAATATGCTAAGGAAGGCATGCATGTATGCAACCGCATACACTACATCTCCCTTCTTTTGAAAAATAACGTAAT:1 + chrX 16386543 5' - mdg1 7011 1 75.25 TCGAGAGCTCTGGCGAAACCAGCCAGCATAAGCCTTATCAAGGCTAAGAGAGCGCTACCGGCTTCGAGTGACTTAAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTC:1 - chr2R 10163938 5' - rooA 303 2 72.28 CAAAGATAGATAATGCGTTCATAGTAACAATTTCCTTCGCATCGCTAAAGAATTTCCAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 + chr3R 2556351 5' + I-element 4919 1 61.39 GGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3R 19446138 5' + 297 6598 2 61.39 CATGACGTTGGCCACCCGGCGGGTTGGAGTGAGTGGTTGACTCGGATTAGCAGCATTGACTAACGAATGAGTGAGCATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTG:1 + chrX 8385347 5' - F-element 4429 1 77.23 GGNACTAAAAGCCAACAATGGCATAAAAAAAACATGTCATAAAAAGACACCACGCCAAGCCTCTTCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATT:1 + chr2R 20931971 5' + G4 14 1 60.40 TATTATTGAATAAGATATTGTTACTTGGTATTTTGCGATCTAAATTTATTGTATGTAAAATTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 + chr3L 7333376 5' - Juan 4199 1 61.39 TTTGTTTTTGGTTGACAGGGGATTGGAGAGCATGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAATTAAACTATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGC:1 + chr3L 998088 5' + Porto1 4569 1 71.29 CTGAAAATAAAGAAAAAATGAAAAATCAATGCGCACCTATGATCGAATGAGTTGGCTATTTGGCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 6082657 5' - roo 396 1 64.36 TTTCAGCGCCCGTCTTTCGAATCGTGTGCAAACGTGGGACTCTATGCCGCTTATCTTAAATCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATA:1 + chr2L 7877594 5' - Cr1a 4133 1 55.45 AANTAATTTAAGTTGGTAGGTGTTTTGTAGTCTAAACTTTTGCCTCGATTTTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1 - chr3L 14854777 5' + Quasimodo 18 2 61.39 ATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2L 12398157 5' - roo 9014 2 90.10 TGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 + chr4 1294988 5' - TAHRE 10425 2 84.69 TCAACGTTATAAATCGCCTATAAAAGCAACAACAACCACACCTCACACCCAGGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAA:1 - chr3L 11324610 5' + I-element 4910 1 60.61 CAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 + chr3L 9909715 5' - Transpac 260 2 70.30 AGGCACTTTGCCTCTTCACTTCACTGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2R 5262599 5' + 1360 48 1 73.27 GCAATTTGGGTTAAAAACCATTTTGGCAAAGAAAAAAACAAAATAACAAAAATAGCATAGTAAAAAATATATTGACAGACTAAGAACATATGAAAATAACT:1 - chrX 10695295 5' + G4 3624 1 73.27 TTGAGGTTGAGGCCCATAAGGTAAGGCTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 + chr2R 544813 5' + HMS-Beagle 46 2 72.28 TGTCCACCGGATTTCGATTCGAATTGGATTTGTATGTGTATATTGTACTAACCCTTCGTGACTCAAAGATGCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATAC:1 + chr3L 8294817 5' - baggins 5347 1 76.24 ATCAAATTTTTCTTATAGAACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTG:1 - chr3L 23155712 5' + gypsy 54 2 76.24 GAATGCGAGCTGATGAGTCCTGGCCCCCAAAAGGAACCGAGTGCACATCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGC:1 + chr2L 19319343 5' - Quasimodo 437 2 55.00 TAGAATCTAATCGAGGTGAAGGCCAGTCAAGAAAATAAGTACACCCGAATGTTTTATTACTAAGGGGAGGTCGTTAATAAATAAGGCAAAAAGAAGC:1 + chrX 1609197 5' - Q-element 513 1 64.95 CAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGT:1 + chr3R 14049356 5' + transib2 41 1 66.34 CGACGATTCTTATTCCTAAAGGGCTTGTAGGACTTGCCCTTGTGCTTGGCACCCAGATGAAGCTTCTTCATGGCTCACAAATCTAATTCTGGACCACACTG:1 + chr2L 11170369 5' + transib2 2823 1 79.21 AGNATATTCCCTTGCGTGTGTATGTGTGTGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTTCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCT:1 + chr2R 20808869 5' - F-element 4396 1 69.31 TTTCCTGTGTGGGAGGACATTTAGTTAGCGACGACTGTCTCGCTTCGCTTCTGCAATCCCATTTCTTATACAATTTTCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTATG:1 - chr3R 8432141 5' + invader6 117 2 80.20 GTGCCCGAAAGTATGCAATGCCCCCATTAAAGAGCCACTTTTCACTCTCACCCCCAAAAGCGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 23601770 5' + jockey 23 1 58.42 GCGTAAGGAAAAAGCCATGGCAAAGACACAGGTGAAAGAGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTC:1 - chr3L 10209717 5' - Cr1a 4205 1 61.39 GATTGAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 - 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chr4 717323 5' - F-element 4385 1 73.27 GAGAGAAATTCCTGAACTGCTGACGACAATCGAAGCGAATTCCTGAAGGTATGATGCCTTTGAAGGTTGCTTTTGGAATGCAGAAATTACAATGCATGCAA:1 - chr3R 17916669 5' - Transib5 186 1 59.41 CGTCAATCGCTTTTGCACTCTTCTTTCAGCTCAATAACTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACAC:1 + chrX 7097391 5' + hopper 949 1 62.00 ATGCACACAAGCCCGCCGAGCGAGGCAAACAATCAAACAAACACATGACATTGGATAGCAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAAGGTAAAATAA:1 + chr3R 17713266 5' - Cr1a 4323 1 60.00 AAAACACTTGTCAACTGCTTTTGGATTTTGTTGATATAAGCTATTCTCTGGGCAATAATGAAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACA:1 + chr2R 17490846 5' - Gypsy6A_LTR 137 1 65.35 TTTAATCAACTTTATTTTGCTCTTGTCTTTTCTGTCACTGGAAAGTTCGTGACTTCGAACAATGCCGCGTCTCGCGGATTCCTCTTTTCTTATGCTCTC:1 - chr3L 15874122 5' - invader3 168 2 64.65 TGTCGCCACTCGAAGGGGACGGAAAACTCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCG:1 - chr2L 7621996 5' - F-element 386 1 72.28 CAGGTGACTAACCAGAGGATTCGTTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTC:1 - 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mdg1 7412 2 71.29 TATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGAATTCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAAGCACGAAGTACGGACACAAGCACTCAACAA:1 + chr2R 6085997 5' - 1360 459 1 92.08 TAAAACCAAAGCCAAAACCGCATCCATGCTCGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGGCCCGC:1 - chr3L 3440572 5' - gypsy8 301 1 82.22 GCCACACTGTACGACAAATTTGTTGTTTTCATTCATCTAAATCAACTTATAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAG:1 + chr3L 16842505 5' - Cr1a 226 1 52.48 TTGCAACTGCAACTATTTGAGGGCCGTGCAATTGCCGCTTGGCTGAAAAGAGGTCAATTAGCTGCGCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3L 1259248 5' + Doc 16 1 63.37 AGGACCATCTTGCCGATCACGTTGTTGCTGGAGGAGATCACGTACCAGAAGAGGCACATCACAGGCACATTACAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAATAAG:1 - chrX 22445066 5' + invader1 3817 2 60.40 GGCGAAGTGGGAGCGCAATTAATACAAACCAAACCCAACGAACCTTCTTGTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCA:1 - chr2R 13487470 5' + ZAM 5 2 69.31 CACAACAATTTTAAGCTTGTTCTCTCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTG:1 - chr2L 19142329 5' - mdg1 21 11 65.85 CTTTCTTTCTATTTTATTTTTACCAATAATAATCAAAAACTAGAGAGAATGCTATAGTCTAGTTACCTGACTATCAGCTACCCGTTACTCAGCTAGTGTTA:1 - 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transib2 2646 1 53.47 TACAATACCCGTGAGAATCGAATCGAAAAAAAAAAACAAGGAAAA:1 + chr2L 16232018 5' + Doc2-element 227 1 93.33 CANCCGCACATCATCTAGATTCTAGAACTTTGACTATTTATAAGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chr2R 17077898 5' + Tirant 34 2 59.41 ATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACC:1 + chr2L 23299991 5' + invader4 358 1 70.30 CATTAATGCGTTCGAGTGCCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chrX 8337945 5' + hobo 40 1 79.76 ACTTGGTATATTTCACATGGATTTATTAAATTGGTCTTCGAGGAGGCCTTATTTGAATTTCATGCTGCTATCTTAAGAGGACCCATTTTTAAATGCAGAGG:2 - chr3R 31285940 5' - G5A 1 1 71.29 AATCTTCTTATCGGCAAAGCCTAAAAAAAAATTAAACAAAACTTCACGCACGCAGGTTGTGATTCCTCAACGACACTAACTTTTCACGACTAGACTC:1 + chr2R 14792306 5' - Gypsy12A_LTR 284 1 62.89 TTGAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATAAATTGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294993 5' - HeT-A 6060 2 80.20 CTTCTAATTATTTATTATGTTTTATACGTTTTGTGTTCGTATCGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 4118159 5' + hobo 34 1 56.44 GTGTCTACTGTGGATGTCGGCTTGGTTTATCTGTACACCCCAACAGCCAAGAAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chrX 17300378 5' + jockey 4683 1 52.24 ACCTTCGGAGTCGTCCTTGTTGTAGATGTAGGCGTAGTACTTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTA:1 + chrX 1554928 5' - jockey 4686 1 59.41 ACNATGAATATTATAAAAAAAATAGATGCACTACTCGCGTTTCATTTATAAACATAAAATTTTTGGTCCTTTATTGCTGTCTTTGCCTTTTCCTTTTCCTC:1 + chr2L 22697582 5' - Bica 465 1 81.19 ACCCAAACGAATTTTATCAAAAATAATTTGACGCAATTTTAATTTTTGCTTACAATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 22752000 5' - roo 9051 2 61.39 TCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAAATAAACTACCTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCCGCAACATGCTCCAGCC:1 - chr4 1294989 5' + HeT-A 5660 1 75.25 ATAAATATTTAATCATGAAAAGAGCTGGAATGTTCGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 - chrX 10453438 5' - hobo 2898 1 67.33 AANAATAAAGTAACACATAATAGAAACTTGCTACATGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCAATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr2R 3824680 5' + 297 6613 2 63.37 ATAAAAATGCATAAAGCAGCCACCAAACCGTCGCCAGTCAGTCACTCGGTCTGCCTGATCCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGATTGG:1 - chr3L 18129599 5' + Rt1b 4975 1 70.30 TATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 + chrX 21564679 5' - diver 184 2 67.33 CGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 - chr3L 13345525 5' - Transpac 286 2 54.46 CGAAAAAAGACTGTGCCTTGTCTACAAATACGAATTCAAGGGACGTCAATGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCT:1 - chr3L 23821871 5' + HMS-Beagle2 6895 2 59.38 ACNATGCACCTTTCTTTCATCTCTCATTTGATGTTTGGGTTATTTTTTGTTTATTCCTCGAAGTCTCCTGGCCCGCCGGCGCCCGCGCTTCCCGGCTTCAG:1 + chr3L 10108624 5' - Osvaldo 1477 1 65.35 TGNTTTGTCTCATTTCAATTGTTTGCTCTGTCGAAATTAACATCATTCTGAGTGGCTAAAAAGCAGAAGAAAATCTGAAAAATTAATAAAATTAAAAAAAA:1 - chr3L 20922306 5' + HB 320 1 80.20 TTACCGAGAAATACATTTTGTAATCGAATTCAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chrX 7583172 5' + I-element 1 1 78.22 TAATCACGGTAGTTAATTAGTTAGTAGTTAATATTCGAATACTATTTCAATTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 + chrX 21087917 5' - mdg3 5424 2 75.25 CATGAAACATTTCGGCGTGCAGCCAAGGCAATTACGTCTGCCGATATTTAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3L 7781179 5' + 297 6601 2 60.40 TAAAGGTTCCCACCACCGCCATTTATCTGTTATCGTGGTTACTCAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGAT:1 + chr3L 25608069 5' + F-element 128 1 56.44 AAGTATGCAATAAAAATCTATTATGTGTCCTGCACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 7885606 5' - hobo 2909 1 60.87 TTTACGATTCCGGGCGAAAGAGTACCACAAAGGGTCGGTCCTTTAACTTTGTTATTGCTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 - chr3L 13345535 5' - Transpac 296 2 64.36 GTGTGTGTTTTTTTATATTTAATTTTTTAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr3L 26740885 5' - pogo 2051 1 50.50 GGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATAAGATTCTACCCATGTTGTCACAAATCGCAAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTATTG:1 - chrX 392288 5' + INE-1 259 1 66.34 CATCAGCAGGTTTTCCGTGGAATATATCTTGGGAATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr3L 13345453 5' + Transpac 4957 2 69.31 AAGAAGGAAGAGCTCAGATCATAAGCCCCCCTTTGGATGCGCGCCTGGAGATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 + chrX 9579311 5' + Tirant 8130 2 58.00 ACCCACAAACTCCCCACCACCCCAAAAACAACGCGTATTTCTCGTTCGTTTCTACGGAAACGCTAAAGCCCTCCCAAGACCAGAGAGCGCACTCTTGCTCT:1 + chr3R 16252267 5' + Doc4-element 117 1 78.22 GCCATCGGTTACGGTCACCACTGCTCCGCCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAG:1 + chr3L 4390991 5' + accord 58 2 61.64 TTCTGGTCGAGATTAAGTGGATTAGGATTAAGAAGAAAGCAGCGATCGGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACAC:1 - chr3L 25841491 5' - hobo 2911 1 71.29 ACTATCATCGTCTAGGATTTGGGGATCCATAATGTATCGACTTTATGAGAGAATCGCACTCATCCGAATTCCCTTGAAATTTTTTTTTTATTTTGTTTAAA:1 - chr2R 21095735 5' - TART-C 11100 1 78.22 AAACAGCAGGTGCAACAGTGAGATAAACAGCGTGGACAGCAGCACACCAACGGGTTCAACCAGTTTCGCCGGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAG:1 - chr3L 5101777 5' - R1A1-element 466 1 41.41 GATGCTTAAAATCTAAACCAATGGAAGTTGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 + chr3L 22789734 5' - accord 6985 2 72.28 TACAAATGTTTGCTGCCAAGCATAATCATTTACAATTAACATAAATAATAAATCAAATTTCGCGTTCGCATTTCCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATA:1 + chr3L 7892890 5' + INE-1 546 1 54.46 ATTGAAAGCTTGATTTTTTAAGTGTGTTAAGATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATCGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chr2L 19644883 5' - blood 330 2 67.33 CTGCTTCGTCGGCAAGTGCGAAAGCTCCTGATGTACATTTGCGGCAGCAAGGAAACAAACAAAATCAAGTACAAACTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTG:1 - chr2L 8060682 5' - accord2 7218 1 54.46 TAGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr3R 13225473 5' + hobo 7 1 72.28 CCNTATACAGTCTGGCGCCTCTTTTTATGGGCACCCATCATAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr3R 28698782 5' + 1360 34 1 61.39 AAGTAATGTATGGGATAACAGACTATCTTGGTGCCGCGCAAAACGTATGGGCTGGAAAACTATTGATGGGTTTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chrX 18353515 5' + jockey 4674 1 67.00 CTAATTATATAATTTACGACAATAAAACTCAAAATTCACTTAAAACAACACGGCACATGCGAAGCTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGC:1 - chr2L 22312002 5' - Idefix 376 2 73.27 CTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2L 12284017 5' + 297 6615 2 60.40 TCTCTTTGGGCCAAGAGTGTATATATGTATATGCCACCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATG:1 + chr2R 12833992 5' - F-element 4315 1 64.00 CTATAAGGATTACCTTTATTTCGATCGGTAAGTAGAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 4790903 5' + pogo 37 1 66.34 TTGTTTTTCTGTCTATTCAAGTATATGAGGCATTCCCCTGTAGGGTTCTGATCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTA:1 - chr3L 24387122 5' + Cr1a 4282 1 49.50 AAGTGGCGCTGGTTGGGGCCAGGAAGTTCGGTTTGAAAACTTTGGCTTAATGTTTGCGCATTTTATGAACCTGCTCATTGAGGTAGGCTCCCTGGTGGGAG:1 - chr3R 22797474 5' + R1A1-element 4977 1 74.26 AAAAGCAAACCAACCCGGAAAAACCGCGAAAAATCCATTGCTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr3R 17674384 5' + blood 7046 2 63.00 ATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr3R 19450197 5' + roo 8753 2 73.27 CCTGATTTTTAGAAATTTAAAGAAAAACTTACCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAA:1 + chr3R 27830888 5' + I-element 192 1 58.11 AAAGCATGAAAAACAAATATAAATTTTTATATTTATTTTCGTTGTACTTTTGTGGGGGTGGCGCCAAGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 + chr3R 26434663 5' - Tabor 7314 2 68.32 CGTATCTCATTCATTCATTCAACTTTGTAAACCGAGTTTTGTAACTTTGAAATTCGCTTCACACTTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 18816098 5' - roo 396 1 66.00 CCNTGCATGTTTTTTGTAGTTTTTCTTCTATATATGTATATGTGCTCGAGTATTTGCCGAAGGAGTATCTTTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTT:1 + chr2R 13318855 5' + Juan 4032 1 70.30 ACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATT:1 - chr3R 10030758 5' + BS 5053 1 68.32 TTGCGCACTTCATTTCAACACCGATCGTCATCGCGTGGAAGTGAGGAAAGCAACTCCGTCATGCTGCCTATCCGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGGA:1 - chr2R 24546013 5' + INE-1 138 1 73.00 ATAACACAAAACGGAATGCAACAAGCAGTGGCGATGGCATGATGAAAAACATAAGGTGGGCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chr3L 11789978 5' + P-element 29 1 40.70 AGTTCGAAAGTGTTCTGCGCATTACTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2R 5202349 5' - roo 9021 2 72.28 ACAAAGTTTGTTTCTTGTTATTTGATATGCTGCGCGGTTATTTGATAATAACAGCTGTCTGCGAATTCTTCTGCGTGGGCTGTGGAAATTGCCTATAATCA:1 + chr2L 17224992 5' - 1731 32 2 62.38 AAGAGTTATTCCACCTCCACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 - 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chrX 22782074 5' + I-element 4887 1 54.46 GATGGACGGGTTAGCGATACGAAAGAGGAGTATGATGATTAACAAGTGCAACAAAATAGCAATAGCCAAAATGCTGTGTATGCAGTTTTGACCCTCTGGTG:1 - chrX 9668407 5' - Quasimodo 7065 2 80.20 ATAATGCCACGAAAGGGGAAAAGGACAGGCTTAGATGCAACTACGGCTGCAGATACAAATACATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCG:1 - chr3L 14135625 5' + Bica 469 1 64.36 TTTTCTATGCCTTTGGCTAAACCCTTCATGGAATTAAGCGTATTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 18938939 5' + blood 7045 2 55.45 ATCTACATTTTCTTCTGCGGCTGAAATGTTTCTGTCACTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 3547492 5' + roo 37 2 68.00 TTGAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAATTGGAAATAT:1 - chr3R 20419100 5' - roo 360 2 73.27 GGTGGAAGCTGCACAGGTGCTAATGGCCATTAAAAACGCTAATGACCACAAGCACTGAGCAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATA:1 - chrX 11150563 5' - McClintock 6124 2 70.30 GAGGGAGGATAAAGGCGAATAGGTTGAATACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 4022344 5' - roo 9027 1 71.29 TCTAAACGCAAACCGAGTGTTATTGCTTCTGGGGACTCAACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGA:1 + chr3L 13878607 5' - flea 4854 1 64.36 TANGATTATTTGATGACCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2R 17208495 5' + jockey 18 1 68.32 GGGCAGTAAACATTTAAAGTAACTCCGTTGGGATTGCATATTCATGAAGAGTTATATTTGTAATCGAACGTGCAAACCGCACAATTGTGGAAATGGCCAAA:1 + chr2L 22319630 5' - frogger 2047 1 70.30 TAATTAGGTTATACGGATGGCAGGCGCACATTTGCCAGCTTAATTTTTTTTTTATTTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 + chr3R 23561961 5' - I-element 5331 1 52.48 AGAGCCAGCCAACGGACGAGGCGCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAAT:1 - chrX 10602387 5' + jockey 4818 1 77.23 TCTTCTTCAGAGGGCCAAATAAAAAATTCAAGACGAAGATATGGCCCTTCAAGTGATTGCCCCACATCTAGTGTTTCAGCATTGTTTCTGGGTAAACACAA:1 + chr3R 11920919 5' + HMS-Beagle2 6927 2 57.43 AGCCACCCATCCAAAAAATGCTGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAG:1 - 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jockey 4977 1 59.41 TTTCACCTCGATCCACTCCGCCGGACTGAGGTTCCGCGGTATGACCTCGCGGTAGCTCATGTTGACTTGCGGTCTGGGACGGGAGCCAACGGGGCTAAATT:1 - chr2L 11123944 5' - mariner2 233 1 67.33 CTAGCATTCCACGCCTAAGATTGGCCAAACAAAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGACACTACATATGGTATTTATTATTCATGCAATCTGACTTAAAAAAAA:1 - chr2L 12103194 5' - Tc1 77 1 67.33 TTAGTATATTTACTCTGCACTGTAATTTAAACTAATTTTTTTATAGGGCATAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr2R 8420799 5' + 1360 26 1 50.50 ATAGTTNTAGTTTCTCTATATCAATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chr3R 12514898 5' - opus 450 2 80.20 TGACTGCATCTGAGCCTTTAAAGGCAGTAGCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCAGTGG:1 - chr2R 3172243 5' + 1360 47 1 73.27 CTTTGGGTAACTTTTCCACCTTGGAAGCCGTAGCTCTCAGGAACTGCATGCTGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGT:1 - chrX 15773771 5' - Rt1b 4920 1 57.43 TGNAAAGAATTTCACATGAAAATTTGTTCACTTTGTTTTTGTATATCGCCTTAGTTTTATTATGCTCGTTGTATTATTTAAATGTTGCTGTTGCATGCATT:1 + chrX 2838524 5' - 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I-element 209 1 72.28 TAATTTGAAAAAAATTCTGTTTGTTACTAAGTTGATTTCTCTTTGTTATTTCTGCCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAAGCCGAAT:1 + chr3L 25485667 5' + Porto1 4350 1 53.47 TTTCAAAGAAAATAACTTGAATTTTTAGCGAGTACAAACTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2R 9213646 5' - Burdock 6356 2 61.39 GTCTTTCGAGCGATGGGTTGGTTAGACGCACACACACACACACACTCAAAACCACTCACACACACAAAAAACCACACATATGCACACACACACACACACAA:1 - chrX 13076533 5' + accord 7027 2 61.39 CCAACAACAGTTGTCTACTTTTAGGCGCTCATGTTCCGAAGTACAATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 - chr3R 19560948 5' - hobo 2907 1 64.36 CGAGGACCATCCCAGCATGAAGGGTGTGGTTCTGCGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGAT:1 + chr3L 1299428 5' + Ivk 5075 1 65.35 AANATTGCATTTCGCATGTTGTAGGTAGTACTAGGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chrX 10644825 5' - hobo 2897 1 65.35 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCT:1 + chr2L 20360644 5' + micropia 4982 2 58.42 TAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTT:1 - 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chr3L 21636535 5' + flea 13 2 69.31 TCNTTCACCCACACATGTCCATCATCGTCATTTTTTCACCACATCCTGCAGCTTCATATTGCTTTTGATTTCTAATTTGGTTCATTTTATATTTGCTAGAA:1 + chrX 2840288 5' + invader5 35 2 79.21 GCNAAGTCAACCCGCCCACGCCACCAAAACTTAAACTTGAGACGTGTACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAA:1 - chr3L 11894598 5' + Porto1 4519 1 78.41 ACTCCACGGGAATGTTCATATTGACTTAACGGAAACTAGAGATAACTAGAGATATGCAAAAATGGACACACAATGTTTTTTTTATTAAACGAAATTATTTA:1 + chr2R 8436834 5' - jockey2 3390 1 77.23 AGCAGCAGTGGCAACTGCAGCAAAGTGGGCTACAATAATTTGCATGGAAAGCGTGGAGAGAAGAGAAGAGTTGAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr3L 12991117 5' - hobo 2937 1 78.00 GTGGCCTCAACGATTCTGTGTATTGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr3R 28288637 5' + 412 52 2 80.20 TATCGATCTTAAAGGAGATTGGTTGCTTTTATGAGAGAAGTGGGTAAAACTCCAACCAATGATGATATCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 17172754 5' - roo 402 1 71.29 TCAATATTAGCCCCGAAAAATAGGCAACACTTTTGTTTTTTTTTTAGCATAATATATTGATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 6509839 5' + jockey 22 1 54.08 TGTGGTTGGCCCAAAGCTATCGACTGCACAAAAGTGCCACCAACTATAGCTTATGGTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTG:1 + chrX 4806662 5' - roo 388 2 58.42 AAGTTATTCCACCTCCACTGGAAACGTCGGCCCATTTCGCAGTGCACATGGATACAAGGGAGGTTTTGCTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 22046520 5' - roo 9063 1 73.27 TTTTGACCAGAGCACCCAGCGTCGTTGTTTGTTTTTGCCACACACATTTTAACGGAGAGCCACCACGGCTAATTCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 - chrX 4448636 5' + 412 2 2 78.22 GGCGAGCAAAAAATGTCAAATTATTTTGGTGTATCAATAGAAACTGGCCAAAAAAAAGCAACATTAAACCTATCAAAACTTTTTTAAAAGTTTGGGCGTGA:1 - chrX 12550092 5' - INE-1 252 1 81.19 TAAATATGAGCCGATGAAAAATGTTCAACGTTTCATGAATGGCGACAACCAATAAAATGGGGGCAAATAACCCACCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 29423599 5' + roo 8668 2 71.29 TCCAGCAGCCTCGACGAGAATCTATTCAGATCTCATCGCTCAGAGCTGAAATATTCATACATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr2R 18649494 5' - opus 487 2 66.34 CAGAAAAAACCCTTTTCCTGCTTCGCCGCCTTCTTGGCCAAAGGACCTTTCACCACCCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAAAAC:1 + chr2L 6156715 5' + Doc 475 1 61.39 TGCAGTGTAAACTTTGCCCTGTGCAACAGTTGCCGATGTCTGGCCACCCACTTTTCCCTTCAGCAATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 1204035 5' - roo 402 1 70.30 TATAGATAGTATACGCGTCTTGCATCAAAAGAAATTGATAATCTCTTAATAAGCCGAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAA:1 + chrX 7485902 5' + G-element 4195 1 62.38 ACCGCAGGCCCGGAGACCGAACCCCAGATCCAGGCCCCCATACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGCGTC:1 - chr3L 13181013 5' + springer 466 1 66.34 ACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAA:1 - chr3L 24916690 5' + Porto1 149 1 55.45 TAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGATCGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTG:1 - chr2R 5924421 5' - jockey 4741 1 41.00 GTTTTACCACCTTGCGCTACATTTTATTTCCAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTCTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTGATA:1 - chr2L 22216580 5' + diver2 26 2 95.05 TAAGTTAATTAAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATAAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCT:1 + chr3R 19450026 5' + F-element 377 1 60.40 GACTTCCGAATCTTCTGAACGCTGAGAGACGAATGAGAGTGCGACCGTGACACGAGCGTTCAAATATACCAGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr2L 18987243 5' + P-element 5 2 70.00 ACTTTAATTGCTTTTAATTGAATTGCAAAACAGATTATGGAACTATGAGTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 + chrX 4174890 5' - I-element 5332 1 58.16 AAACCCAGGGCGGTGAAAGGAATTAAAAGGGGCACAAAGCTCTTGAGTACTCTTGACAACAAAGCATTTAAAGGCGGCAATTGAGCACGCGGAGGTTTTTG:1 + chr2L 7636615 5' + Rt1b 5022 1 81.19 TTGTTTTGTTTTGTTTTGTGTTTAGTTCGGCTCTTGTAATGTAGTTTCGCTTCCAACTCCTATTGGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGACTTCAC:1 + chrX 13872441 5' + Doc3-element 392 1 71.13 ACCGCCACACACGTGGCGAGCTGCGACGCCAGCTGGCTGCTTCACTTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGA:1 - chr2R 9642826 5' - roo 8830 2 55.45 TATTTCCCAAATAGTGATGATGTATTTATTATTCAATTAAGGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chr3L 11891383 5' + Tabor 6874 2 56.44 TCTCGGAATGGAGATCTCTAATGACCCAGTGTTTAGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAGTGGCGGG:1 + chr2L 17561744 5' + hobo 2925 1 65.62 ATAGCTGAAAATTTATTTAACTAACTCTTTCGACGTACGGGTATTTCTACTGAATGTAATCCCATATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:2 - chr2R 9789026 5' + blood 9 2 70.30 CANTTCCCTCGCTCTATTTGCGTCCCTTATTTTTCCTTCTTCATTCTTCATACCCGTTACTCGAAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chrX 5256763 5' + INE-1 10 1 76.00 TCNAGTGCCGCTGTGTGTGTGTGTGTGGACGATGACGCTGGTAAAAAAAATAATGAATAAAAGAAAACAATGTTAGTTTTAAATCTCAATGTTTTTTGTAA:1 - chr3L 3389346 5' + HeT-A 5792 1 66.34 GTCGAAGAATTGCCGATTCTTCTTGTTTGACTTTGATTTCTTTTTTGAATATGTACGTCTTCTAGCACAATACGTACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTG:1 + chrX 14923173 5' + 1360 3229 1 57.43 TTTGAATTTGCTTCCGAATCCGGATATTCTGAGCTTTGCGAATGTTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCG:1 + chr2R 24049335 5' - Stalker 302 4 55.45 CACTGAAAAAACGGAAAACTTTTCCTTTCGGAAATAGAAAAGTTTTCGTTTTTACCGAAAACGTGTAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATC:1 + chr2R 16908713 5' - diver 213 1 65.35 TCGAAAGTTGTTTCCCTCATGGTCTTGACTGCTTTTTTTTTAATAGTTTCCTTGACTGTTTGTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTA:1 + chrX 10572169 5' - Porto1 4374 1 70.30 ATCAAGCTTATTCTGCAAATCGGTATAGATTACAGTAATTATACTGTCTAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGA:1 + chr3L 18075815 5' - F-element 4233 1 52.48 CACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 - chr4 311579 5' + 1360 39 1 64.36 TTTATCTGCAACAAAACGCTGGAGCAAAAAAAAAAACAACAAAATTAG:1 - chr3L 7410798 5' + gypsy11 3934 2 64.58 GTGTCGCTATCGCACTCTTTTCAAGTTTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGGCCGATATTATGTTCTGCCTATAATAGACTTTATCCTATTATGTA:1 - chr2L 14975320 5' + Cr1a 4212 1 72.28 ACAAAATTTGAATAAAAAATCAATTTAGATGCTTTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTG:1 + chr3L 14306397 5' + invader2 320 1 65.31 GTGTGGTGTATCTTTCGTGTACTTGTGTTTGTTTGCCCACTTCGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGAGACGGCAGTGGTTGTGGGGAT:1 - chr3R 9490879 5' - accord2 7350 1 65.35 CCGTGTCTTGCCCCGTATCCCCCGGAGATCCAACCGTAGACCCCGTAGACCCCGTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAA:1 - chr3R 11538532 5' - 412 490 2 66.25 CATGGCAAGAATGCAGTCTATTTACTTGTTAAATAGCATAAGCCAAAATGGAAAAGGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2L 12284034 5' + 297 17 2 63.37 TTTTTACTCCCACGGAAAGTGCCATATAAATCGCGCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAAGGCTGCATAGTGCCA:1 + chr4 508485 5' + 1360 3343 1 65.35 ATCTCATCTGCATGTGGAACAAATAAACGATGAATGGATATGAACAATAAGAAGAATTAATACCACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chrX 19959904 5' + roo 8674 2 70.00 ATTGAACTGTCTTTTTATGGCTGGGAAAAACGGTTTGTTTTTTTTTGTTTATTT:1 - chr3R 9128656 5' - Porto1 161 1 55.56 AAGAATGTCAACCATCCCACGATTTTTCAATTGCGTGCTTGCACTTGATTTTATTTTATTTCCTTTTCCTTTCCTTTTATTTTATTTTCCTTTTTTTCATT:1 + chr3L 9398344 5' - Doc2-element 251 1 76.24 TACATATACACATAAATAACTATTAATAATAATGGTAAATATTAGTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTC:1 - chr3L 17660354 5' + I-element 465 1 55.45 GAACCGGGAACCGACGAGGATAGCAATAACAATAAGAACAACGAGGAGCTGAATTAAAACGAAGGAATTCTGCGGATTGTTGTTATTATTGTTATTATAAT:1 - chr3L 18803422 5' - mdg1 26 4 58.42 AGTGTACTCGTCCGATAAACAATTACCCGGACATTCGAATCAAGCCGAATCAACTGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCG:1 - chr3R 11599262 5' - mdg3 5223 1 65.35 AAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAA:1 - chr3L 23702241 5' + G4 32 1 54.46 GTGGCGTCTGTCGGGGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGC:1 + chr2L 19845895 5' + F-element 34 1 47.52 GGTGGTCAATGGCACAAAGCATACATCACATATATGTATTGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCG:1 - chr2R 9199952 5' + G6 1677 1 61.39 ATTTGACCTCTTTTATTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:1 + chr3R 19734083 5' - I-element 5296 1 82.18 TCAGGATTAGTGCTGTTACTTAAGTACCTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3R 4971180 5' - 1360 3339 1 75.25 TTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAAT:1 - chr3R 23429887 5' - HeT-A 6043 1 86.14 CTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGATGGACAGGCGGACATTTCCAGGTCGCCTCGGATCTTGATCCTGATCAAGAA:1 + chr2R 1751257 5' - 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F-element 4419 1 63.64 TGNTGACCTTTCTGCCCCAAATGCTGACGTTGCCACACTCATATCTGCAGCAAATTAGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:2 + chr2R 17208505 5' + jockey 28 1 58.42 GAAGGCATTTATGCAAGCGCATAAAAACTGCAACTGCTGGTTGGCCGAAAAGGATGGCCATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAA:1 - chr3L 17936319 5' + F-element 125 1 66.34 CTGCTTCTGATTTTAAGGACTTGATGATCCTCTTTCATGCAAGTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGT:1 - chr3R 29285512 5' - F-element 4418 1 57.43 AAATTTGATTTTAATTAGTTTAGCGCCTGAGAGTCTTTGGCAAGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAAT:1 - chr3R 14957724 5' - TAHRE 10393 1 69.31 GGAAATCACTTCATTTTTTCACAACTGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGG:1 - chr3R 21365629 5' - G-element 4195 1 74.26 AGCTGGTTGTGGAAAGCCGAAGTTTATGGATGCAGTAATTATATACAACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAC:1 + chr2L 12398128 5' - roo 379 1 63.37 TCCACAGTGGTTAATATTTTGGAATTGTTGGAAATCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCTAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAACCTATC:1 - 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roo 395 1 64.36 GTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGT:1 + chr3L 24796711 5' + Cr1a 397 1 69.31 TGGCAAACGCAATCATTTTCTTAGGCCTCCCTTTCCCATTCCCAAGCACTTAATCTAACTTTCTGAGCTGCAGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGC:1 - chr3R 23420657 5' + Cr1a 356 1 56.44 GTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 + chrY 104334 5' + INE-1 153 1 78.22 GATACGTTTTATCAAGAACAAAGGGGTATTAAAAAATATTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chrX 8302849 5' + 297 6612 2 70.30 TAAAGAGCTGGAATCGTTCTGTGTGTCTATACCATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTC:1 - chr2R 22644920 5' - Ivk 4928 1 68.32 CACTACATTATCACAAATTATCAAGATAAATAGCAACGTGTTTAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTTTCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAC:1 - chr2R 12281786 5' + F-element 181 1 57.00 AANACAGAATAAGCAGAATAAAAATAAATGTGTGCTGCAAAACTGTCACGTTAATTTATTACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 9437179 5' + roo 13 2 65.35 TTTCCACAGTGTGTGTGTGTTTTTTTGGGGGGAAGCGTGTGTGTGCAAGGAGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCT:1 - 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chr2L 17755152 5' - Doc 4694 1 79.21 CACTGTTATTTTTGCTAGTTAACTTAATTGCTGTTACTGTGCTGGTTGTTGTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAA:1 - chr3L 16222573 5' - gypsy4 473 1 60.42 GANAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 27452376 5' - roo 9023 2 75.25 AAACTTGCTTGTTTCAGTTTGATTCCGATTGTTGGTGTTGTGTGCCGGACTGGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chrX 6518849 5' + pogo 22 1 63.37 GGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCG:1 - chr3R 9192572 5' - invader3 5420 2 71.00 CTTCTGCGCGAAAATTTTTAATTAAGCCAAAAAAAAAAGGGAAAGGCAATCCTTGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 9439845 5' - roo 386 2 55.00 AGNTCTAGCCCGGCATGCCCCGATTGCAACTCCCTCTCGCCCACCGTCCATGTCATGCATGCATAAGTGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chr2L 17205157 5' - hopper 1409 2 70.30 GTNAACGGAGAGCAACACGCCCGTGGATCCGAGGGTCCAGGTAGGTACCACCTACACACATATATACATACACCTACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAA:1 - chrX 14831759 5' + Porto1 315 1 74.26 AACGAGCAGCAATAGAATGTAATAAATATATGAGGCACACTAGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCT:1 + chr3L 18027239 5' + Doc 317 1 58.42 TGACGAAAGTTTAATTTATTTAAAAAAAAGAGGACATACATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - 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Q-element 77 2 68.32 CAGACGGTTCTCGAGACAAGGAAATAGTAAAGGAATGGAGGAGGAGGAGTAGCCCTCATGGCCTACACTGAAGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCAT:1 + chrX 19820621 5' + Rt1b 4964 1 68.00 GCCAAATCGATCTGGCCATGTCCAACTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAG:1 - chr2L 21256472 5' + INE-1 566 1 54.46 TGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGA:1 + chr3R 19450129 5' + F-element 416 1 73.27 TTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAA:1 - chr2L 22224559 5' - Rt1c 5396 1 60.40 CANGAAATGTAAAGCAAGTAAAAACCTGGGTCAAATTGCGGTTACCGTTTTTATTTTCCGCCGTTACCGGTCTTTCGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 - chr3R 28063697 5' + Doc 4 1 76.24 AACTCCAACCAATGATGATATCTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 17172707 5' - roo 9019 2 76.00 CGAATTAAATGTTTTTCATGATTTATGCATTTTTTCCCTAATAATATTTAACGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chrX 7583196 5' + I-element 25 1 52.48 TTAACGCTTCTAATGTATGCGCATACACGAGGATTTCGTGCCTCCACCTAGTCGTCTGGAATGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCAC:1 + chr3R 28138401 5' + G6 1655 1 59.41 AAAAAAGTCGCGCTCTAGTGTGCGCTCTTTATTTTTGTTTTTAGTTTCGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAA:1 + chrX 19496641 5' - transib2 2664 1 53.47 GCAAGGTACACATAGAAAATACATTAAAACAGCCATAGATGCTCTTGAAGTTTGTGCTGTTCACTATTTCAACGACTGAACCGTGTCGGGACAAAACTT:1 - chrX 22785364 5' - mariner2 102 1 72.73 ATTTTGGCATGTTAAAAGAAAATTGTTTGCTCTTACATATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCC:1 + chr2L 21863350 5' + Burdock 6171 2 64.36 TATTCAATTTGTTTTGGTAACAGCTTGGCGCAATATCGAGAAATGTTTGTTTATTTTACGAGGAATCGATGCGGCGGTACACCGCGGTCGATCTTTTGTA:1 + chr3R 31149474 5' - Tom1 36 1 67.00 GATATACAACTCTTAGCAATCTATTGCATCTTTATTGAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATAC:1 - chr2R 9042309 5' + I-element 210 1 63.00 AATGTGACAGAAGGGGATACCATATACCCCCCACACACTAATGGGTATGAAAATCTCACTGACTTTCGCAATTAATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3R 27452424 5' - roo 408 1 76.24 GGGCTCTATGGCTGTACGGCTCTCTGGTTCTGGGGTCAGTTGGACTGGCTCTTTATGTACATGCATTTTTCCATTCCCACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGC:1 - chr2L 17918716 5' - Idefix 428 2 77.23 TGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3L 22349252 5' + jockey 59 1 70.71 TTACTCGCCTCTCGAAATTAACCATTTCGGATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTA:1 - chrX 5556986 5' - hopper 973 2 70.30 GTTTCGTTCTTTCTGGCTTCTCTGCTGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCG:1 - chrX 4438825 5' - Doc 4444 1 74.00 GGTCTTTGTGCCCAGCTCCACGGAGGGCTCCCGCCAGGATCAATCACTCGATCCGCCGCTCTCCAAGTCTAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATA:1 - chrX 16847308 5' + F-element 302 1 72.28 ATTATAATTGAAAACATGTCGAATTTCCGTTTGATTTTCAAATATATGTAATTAAGTGTTTTGTTTTAGAACTATATCAATCGCGAATGCGGCTGCGGAT:1 - chrX 6931036 5' - Quasimodo 313 2 74.00 ATTTAGGATCGGTTTTTATTTTCTTTTGCACAGCTGACCATCTATAACCGCAGTGTGCCTGTGTGTGTCTATATATGTATGTGCGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 15515176 5' - Quasimodo 38 2 54.74 TTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGG:1 + chr3L 24213788 5' - invader2 5079 2 59.77 TCTGAATCGGTTTTCCCGCTGCACGTACAGGCATATAATTTTTCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chrX 19110556 5' - roo 9028 1 56.44 AANCAGCAATTAACTAATTAGAATTGCGTACAAATTAGAGAAGATGCAAAAAGGGATGTCACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 26140729 5' + 412 7069 2 62.00 CACACTAACTTCGGTCCCTGAAAGAGCTTGGAAATCAAGGCGGAATAAGAAGCCCCGATTTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTT:1 - chr2R 14664515 5' + Cr1a 57 1 55.21 ACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr2R 23872664 5' - hopper2 1566 2 66.34 TTATATATAAGCACGAATGTAAATTAGTTTATTTTTTTTTCGTGTGCAAAGTGCAAGGTGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGCCTTAAAT:1 - chr3L 15012524 5' + F-element 4384 1 50.51 CCATTGCCTTAACATTGTATATTCAATTTAATCCGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr3R 22208560 5' + I-element 43 1 65.35 GTATCAACGTCGAGATCTCAGCAACTATAAAATTGTCTGGCATTGCATGGTTTTATTTCTCATTTCCCTCTTTTTGGCCCCTCGTCAGCCTCTTGGCTTCA:1 + chrX 1130963 3' + INE-1 137 1 70.30 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAAGTGAGTGTGTTG:1 + chrX 678864 3' - Tirant 8118 2 70.30 TTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACT:1 - chr3L 12572639 3' - Juan 4075 1 71.29 GGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTGAGTTACCAATCCAATCAATCAAACAAACAAAAGAAGCACAAAAACAAAATGCATTTAACTCTTT:1 - chr3R 14037297 3' - F-element 4453 1 63.37 ACATGGACATGTACGAGGACGCTGGCAATGGATTGACCACATTGGCCGCAGACGGAACTCAAACAAACCAAGGCACAGAATCGTGGACAGATATCGA:1 - chr3L 12829768 3' + Chouto 6289 1 74.23 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCGATACGAACACAAAACGTATAAAACATAATAAA:1 + chr3L 4118149 3' - hobo 44 1 66.34 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGGTCGAGC:1 + chr3R 9322888 3' + 412 7517 2 51.49 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGAC:1 - chr3R 13225507 3' - hobo 41 1 65.35 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAATTTTGC:1 - chr3L 2392376 3' + Transpac 5194 2 63.37 CANTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCTTTTTGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTGTCACTAGTGTCTCTTTTTTTCAAACTCAATCGCAGCACCG:1 - chrX 1646011 3' + Cr1a 194 1 58.42 ACGAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAGCAGCAATGGATACCCGTAAAACCCTCAAAACTAGACACAATGA:1 - chrX 9292226 3' + Porto1 4384 1 63.37 CCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCAACATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGCCTGCAATGCTCCACTATTGTAATCGGCTGTTA:1 + chr3L 6211463 3' - baggins 5239 1 77.23 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTCTCTATGCGCATCTTTA:1 + chr3R 22341239 3' + hopper 1405 2 69.31 GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAA:1 - chrX 21636199 3' + Stalker2 353 2 74.26 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCAAATGCAACGCAATAATTTTG:1 - chr3L 10382679 3' + I-element 5304 1 74.26 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATTAATATAAAAGCCTGAATATATTTTCCTGTTTTATT:1 + chr2R 5953166 3' - 17.6 40 2 73.27 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGA:1 - chr3R 14049326 3' - transib2 11 1 68.32 TGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGCAGTGAAGCCAAAGCTGAGTACTAAATTACAACGAAAAACAAGAATTACACACTTCAGT:1 + chr3L 18387177 3' + Stalker4 1 4 65.35 GTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGTATGTTTAATTTTTTTTTTTGCTGCTGATGTTGTGTTTCACTATTCACCATTCCATTGCCGTGAAGCTAGAACA:1 + chr2R 10556664 3' - diver 3 2 73.27 GAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCACAGTTGGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATAAGCATAGCTACATTTTAAGCGATAAATAA:1 + chrX 20451342 3' - Cr1a 4182 1 70.41 CGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAA:1 + chr2L 15488476 3' - Doc 456 1 74.19 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACATACACGTATACAGACACACATGTACCTACTTAAAAGCGCACAAGCAGCACTTAACCC:1 + chr3R 20215023 3' - hopper 14 1 65.35 ATNTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGAAGACGCAATAA:1 - chr3R 14626001 3' + P-element 2866 1 58.42 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAATTTGGCCTATGACAATACAAACGCACTTTCTTCGCTACGCATTGTCCAGGTGCGTGTG:1 - chr3R 7886101 3' - jockey 20 1 65.26 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCGTACTACAATAATAGACGTTATTGAATTAAAAAATTAACATTTAAAAAATGTATATT:2 + chr2R 5178671 3' - mdg3 31 2 52.48 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTAACAAGAC:1 + chrX 19030154 3' - Doc 35 1 64.36 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGAAGACGC:1 - chr3R 14626006 3' + P-element 2861 1 53.47 TTTTCTTTTTTTTTGTAACTTTACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATGCATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATACAATTTA:1 - chrX 13590499 3' - TAHRE 10441 1 81.19 TATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTA:1 - chr3R 7382631 3' + copia 256 1 68.29 TTNAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTATACAACCGTCGTAAAAGTTTCCATTCGA:1 + chr2L 8841117 3' - P-element 42 1 40.59 GTNGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAACGAAAAATGTCAGCTTTCGAGAGCATTCAAA:1 + chr2L 12323054 3' + hobo 2922 1 60.42 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAAAAGATGTTTTCGAGAGAGATAAGCTCTCCATCGCACATT:1 + chr2L 1136544 3' - jockey 4710 1 63.37 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTT:1 + chr2L 6184253 3' + roo 9040 1 57.43 GTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTACTAATCAGGTGTCAGGCGGAGCCGTGACAATGAAAGATTAGGAGTTTGCTTTTTATGCTTTAT:1 + chr3R 10589364 3' - gypsy2 342 1 61.39 TANAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTATAATTGATTTGTCGGCTCTATCGCCCGAGTA:1 + chr3R 9127446 3' + invader3 259 2 60.40 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGAGCAATCGAGTGGCACACAAAAAGCCAAATATGTGCATTAAATGTGCATTGG:1 - chr3L 20669061 3' + Transpac 5213 2 62.63 GTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGCAGATGTCTGGAGGAATAACGGAAGCATTCGATAAAACGCATTGAAATTGCATTGTGGAAATTGTGAGCAGTTGAA:1 + chr2L 10039548 3' + invader1 126 2 55.00 AANATGAGAAGCATATTATGTTACTATATGTATATTTGATTTAATTTAGTTGAATTTGTATTACTGAGATTGTTTGTAAGAAGTCGTATTGCTATTAATAA:1 - chr3L 23024184 3' - rover 4 2 62.38 TCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTT:1 - chrX 21564646 3' + diver 217 1 66.34 ATTATGAAAAGTCTAGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACATCACTACTCACACTTTCTGGTAGTTCCATGT:1 + chr3R 2542477 3' + GATE 8420 2 72.28 TACATACATATTCACTGTTAGCTTATTTAAGACTAAGAATAAAGACGACGAGTCAGGAGATTATCAAGCAGCGTGCGGAGATCT:1 - chr3L 6757093 3' + ZAM 276 2 73.81 AACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTGAGTTAGTGTTTGCAGGGGATGGCGTGTTTGGGGTTTCGGTATCGGTATTTTTGGTGCCATTTTTGGAGCAG:1 + chr3L 14291516 3' - Porto1 4562 1 74.26 TCCCTTATATATATATGTACATTTCAGTCTCAGTTTTTCAGTGCTAAATACAGTATGTTCTATTCTTATTGGTTTGGATTACAATGGTGGTTTAGGTTTTG:1 + chr3R 30248225 3' - Juan 4187 1 66.34 TACTTACGATAACCAAATTATCCCAAAACTTTCCGGGTGTAGCTGATAAAGGCTGAGTATAAACATCAATTTTAAGGACACTTTTGAATTGTACTGATCCG:1 - chr3R 4816903 3' - Gypsy12A_LTR 172 1 59.41 CCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACCGTCAATCAGCCAAGTGAATGCCAGACAGCTAGCA:1 + chrX 16869816 3' + Stalker4 7104 4 65.35 AAATAAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATGTATA:1 + chr4 1128518 3' - transib1 1897 1 72.28 TTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGGATCTGTTTCGGGTTCGTCGTCCAGCTTCACGA:1 - chr3L 3404314 3' + F-element 4311 1 67.33 AATGGCAAAAACAAAGGAGCTATCAGTTGAGCATCGAGCCGAGATTGTCACTAAAATTAAGGCTGGTACTTCTGCATTTGGGGCAGAAAGGTCATCAAATA:1 - chr2R 17208501 3' + Bari2 254 1 76.24 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGT:1 - chr3R 8191473 3' - mdg1 34 2 57.43 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGC:1 - chrX 4806677 3' + roo 9036 1 57.43 AAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAACAAAATACATTACAAACAATAAATATAAGAACCTATTTTATATAAAG:1 - chr3R 11061815 3' + jockey 4893 1 57.95 GTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCCGCGATGCAAGGCGGGAAGTTAAAGGGCGGTCAGTGTAAACGGTGACTTATGGACCTCGGACTTATGGACATCC:1 - chr2L 21645331 3' + gypsy8 33 2 67.35 ATNCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAAAAAAAATATGCAGAAACCAAAGGCATCGGCAACTGAT:1 - chr3R 1167806 3' + Rt1a 5023 1 68.32 ACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTAGTGCGCAATGTTCTGGGTCCAGGGCCAAT:1 - chr2L 18355355 3' - I-element 5193 1 71.29 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATGCCGTCAATTAGGCACCTTG:1 + chr2R 12726838 3' + copia 5071 2 78.22 GAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCGTCGAGATGGCTAACGCCAAAGCTGAGACCAGAAGGATGTAGGACACCAGCCAGCGGCTCTGCGAGCACG:1 - chr2L 12161346 3' + gypsy8 4485 1 76.24 TATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTT:1 + chr2L 21570263 3' - Dm88 4378 2 63.37 TGGCTCCCTTGTGGGATACCGGATGTGACTCGGAGAATACAAGATAAAGAATTTTCTAGCTTCTGCTGCGAATCAGTCCAGTCAAGCTTTTGTCGGGTACG:1 + chr2L 22737493 3' - Q-element 482 2 54.46 ATNTATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAATTGCAGTACATATTTTTGGGTATATTTTTTGTCAAATCCATCAAAGC:1 + chr2L 5959746 3' - roo 8668 2 79.21 AGNTCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATCGCTTTTTGGG:1 + chrX 12813750 3' - BS 30 1 55.45 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGCTGGGGTGTACTAAACCCATCAACATTTATGTTCAATTTTTATGCGCCACCTGCCAAGCC:1 + chrX 18350291 3' - jockey 4699 1 50.00 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGCATGCCGATGTGCACGGGAAGGGGGGGAAAGGCATTTGCAGCGCCGTTCC:1 - chr3R 28288579 3' + 412 7523 2 55.45 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCA:1 - chr2R 3919671 3' - 1360 39 1 62.38 TGTTCCGCATCCACGATTTATTTCACCATGACCTGCATGACCTCGGTAAGTTTTTGTGTGGCTATGGATGATACTTTGTAATCATTGCTTCCAACTAAATA:1 + chrX 14996545 3' - HeT-A 6019 1 80.20 TTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACCCGCCCCTCCACCAACGTCTAAGCAATGAAATATT:1 + chr2L 12144216 3' + F-element 4400 1 65.35 TAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGCCCCCCTTTACACAATCTACATTTTGTTTGCATTCTTTACCATATGTGCAGCATGTATCCTGA:1 - chr3R 1832037 3' - Cr1a 462 1 68.48 AAAGGTAAACAAAGAGCCCTTAATTTTGTAATTAAATACCATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATTTTCTGCACCATTCAGCA:1 + chr2L 21396588 3' - S2 66 1 79.21 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTAATGCCCTGTAATCCGTTAAGTACTTAAGCTTTACAAACATGATAACGATT:2 - chrX 14131756 3' + I-element 5332 1 55.45 CGNTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGGATAACCTCAGAGAACTTCCACTGCATCCAAGCATTGGTTCATCAGA:1 + chr3L 26644807 3' + HMS-Beagle 7018 2 53.00 TGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATAAAAAGTA:1 + chr2L 23075092 3' + Cr1a 4232 1 45.54 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAAGACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAA:1 - chr2L 11764876 3' + roo 387 2 50.50 ATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGAGCTGAACAGCTTGAGTTGCGCC:1 - chr2R 6801526 3' + McClintock 5975 2 55.10 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATTAATAATGATATTTTGATTACGGTTGTCATAGTTTTTGTGTGATAACAGAAATGAAAACTT:1 + chr3R 8353914 3' - 297 5 2 75.25 TGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTA:1 - chr3L 27182015 3' - F-element 278 1 76.24 GAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATAGGCCCTCCAAACTAGAAACACAAGCTTAAAGATGCAG:1 - chr3L 21591831 3' + gypsy 419 2 62.38 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACTTTACTTTGCTCACTGATTTTATAATCTGTTGTCATAATTTCATTCAAGG:1 + chr3L 11156304 3' + 297 6953 2 58.42 TATATACATATTGACATATATTGATTGTATTTCTCAACATTCTTTTAAGCCAATTAAGGACGATTTTAGTTTATAAATCTACACTTCAGGATATTATGCAA:1 - chr2L 17785574 3' - G3 4504 1 71.29 AAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTTATTTGCCTAAAGTCAAAACGGCCCCC:1 + chr3R 31753302 3' + hobo 2518 1 73.27 TAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAAT:1 + chrX 21667907 3' - gypsy2 6542 2 75.25 CAAAAACAAAAAGAAAAAAAAATATACCCTAAAAAAAAGCATAGAATGATTTAAGAAGCATTCGGCCACATTTTCCACCAATCGCATTTGCCCAAATGCT:1 + chr2R 20377705 3' + G2 3077 6 56.00 TCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTGCCTCCAACAACAAAAAGCAGCATCAGAAGAAACCGGAACGGGAACAACAACAAACACTTCAATTACC:1 - chr3L 18392493 3' + F-element 383 1 62.38 GCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAAAACGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAATCAAACAAGGAGCCGAAAAATTTTCACAGCACTTTAA:1 + chr2R 17313156 3' - diver2 4728 2 76.24 TTTGCTTTCTTTGTGTTACAATTTTCTGTTTAACATATGACTACTAAAAGATGGTCGATTCTTGTGATTGAAGATATATTCTTGCAGAAAAATGAACTTTA:1 + chrX 12131831 3' - mdg3 5078 1 44.55 ATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCTAACTCCAAG:1 + chr3R 6611308 3' - HMS-Beagle 6796 1 79.21 CACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCACGCGCCACGCTCCGCAATCGGCTTATGTATAAGCGTTTGCTCATTGAAGGTGCGGTGGGTGGTGGATGATGGGTG:1 + chr3R 23667906 3' - Stalker 7056 4 56.44 GTTCCTGAGATCTCGACCTTCATACGGACGGTCAGGATCAGACTCTATCAGTTGAGTGGAATGTTTTGTTTTGACAGAAAGCGGAATGCATAAGCCAAGGG:1 + chr3R 2468727 3' - INE-1 140 1 61.39 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGGTAAACGAATCGATATTGTTTGGCAACTATCGATGAAAGA:1 + chr3L 11790032 3' + P-element 2856 1 46.46 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGCAACTAACACTCAATAACTGCACTTTTCAGTTTCCCCGAAAGTTGTGCTTTCACTGCAGTTTGCCACATCGG:1 - chr2L 810228 3' - hobo 4 1 75.25 TANTACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGTGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGCTCACTGTACCCACAACGGAGACAG:1 - chr3L 1300562 3' + Stalker4 7109 4 74.26 TAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAAAATTATAAAATCCAAACAATTGGACCAACTATATAA:1 - chr2R 645020 3' + Bica 126 1 94.81 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTCGAGGTCTACCCTGAATTTGTCCTTGTAAGTGTGTGCTTAGC:1 - chr3L 6522280 3' - pogo 33 1 62.38 TAATGTCCCGTCAGTTGACTATACTATAGTATAGTCAAGTTCCCTGACTTTCAGATACCCGATACTCAATTAATGCTCCACGAAACGCAGAAACTTGAG:1 + chr2R 12233788 3' - 297 361 2 68.69 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATATCGAAATATGTAATAATAGCGTATGTAATAATGTATACG:1 + chr2R 4900351 3' - Doc 50 1 71.29 TATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATATTGCAAAGGCGTCTGTATCTATTTGATCCTGTTTGTCTGTGT:1 - chr3R 17243136 3' - hopper 42 1 63.37 GTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTGTTATAAA:1 - chrX 21504669 3' + Cr1a 208 1 61.62 TGNCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACGGTGGCTGCTATTGTGAACGAATTTGCATGCAGAGTGGCTTAAAAGTGATACCAAATAAC:1 - chr3R 20584272 3' - 1360 13 1 66.34 CTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTATATTTTTCACCCACAGTAAAATCTGTCATGCCCTTTCCTGCAGTTCCACAAGTGCCGACTCCTACTCTGCC:1 - chr3L 23716557 3' - flea 201 2 75.25 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGAGCAATCGAGTGGCACACAAAAAGCCAAATATGTGCAT:1 - chr3L 20669075 3' + Transpac 278 2 57.43 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATAGCTAATCAAACATTCATATGAATGGCATACGTTTTTAATCAGCACCT:1 - chr2L 7393649 3' - opus 7140 4 51.49 ACTCTGTGGTGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCCAATTAGAGGGTTCTCTACCCTTTCCAGGCCAGCTCTTGAGCAAGGCTGCTGGTGTGCAGATGG:1 - chrX 21115305 3' - baggins 4955 1 60.40 GCCCACACTTTTGCAAAATGTTTTATTACTCTTGTAAATTTCCATCGGAATCAGTGCATCAGATATATATGATAGCATCGGCCGCACAACTCATTATGAAG:1 - chr3L 22649245 3' + INE-1 256 1 57.43 CAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCATAAAGACAGAACCAAATGTGCAGCACTGGGTCTGGCCTCTGGCTGTGCAAAATGTGATGGGATGGG:1 - chrX 4351090 3' - Doc2-element 4422 1 72.00 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTGTTGGGCTTAATTGGCTGGCCG:1 - chr3L 447320 3' - Tabor 6884 2 70.30 CATTTTACCTCGGCGGCACTCTTACAGCAACGGACAGACAGACAGAAAAACACACAGGCAAACACAATCGTTGCTCTCAGTGCATGTGCACTGTCTTCACA:1 - chrX 9466515 3' - frogger 2291 2 79.21 CGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGAAAACTTAAAGCAGTTAAGAGCTCGTCGTGCTTAAAATATTCCATCGGTGTCTGACAGTCAAGTTT:1 + chr3R 12189493 3' - Porto1 394 1 70.30 TGAGTAATACCAGTTGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCATGGTCGCACAGACTCCAAATTTTGTGTACTGAATACGACGCTCAGACCAGTAAGATGGAG:1 - chr3L 4036932 3' + transib2 2677 1 67.33 CAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAGGTTGGCCGGAAAACAGATGTTAGGGTTGCCACGC:2 + chr3L 5662724 3' - jockey 339 1 75.25 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTCTTTGTTTATTTTAGTTTATTAGACAGC:1 - chr2R 4559072 3' - pogo 45 1 78.22 ATNTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGGTGAATGAGAGGTACGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGAGACGCTTGAACGAATATGGGAGAACAATAC:1 - chr3L 23666174 3' - Porto1 294 1 68.00 AAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTAGCTAGACATTTTACGGGTAATTATCGAATGTGCTATCCAGGGGGAGAGCGGATGGCCGATGATTGAG:1 - chr3R 15740105 3' - HMS-Beagle2 6820 1 74.00 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTTACTGATGATAATGATAGATAAGTGTGCGCCAAGTGCACTACGTAACTTACTC:1 - chr3R 22158785 3' + P-element 2882 2 68.32 GCTACAATTACCGATTTACGTGAGTCAAAGAGCAATCCAAGTGGCCGTCCGAATTCGGTCATGCAGACTGGTATGGATCGTACGTTTTTGTAAGACGTAAA:1 - chr3L 14209359 3' + Doc4-element 406 1 83.17 ATTAAAAAAAAACATAAAAAAAAATTATGTTATGTGTGTGCGGGTGATTATGACGGTTTGTCGATCTCAAAATCACTCGCACGCACTTAAATATTTAATGG:1 + chrX 6119813 3' - hopper 152 3 87.13 GTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAAAAATGAAAATCCCAGCCAAGAACATAAAGTACCTTATTGGCAAAATAAGGGTATCTGGGATATTT:1 + chrX 12388094 3' + opus 266 2 74.26 TTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTGTTCATATGTAGGTACGATTGTGGAT:1 - chr3L 15593377 3' - accord2 12 2 74.26 TTNTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTTACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATGCATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATACA:1 - chrX 13590504 3' - G2 3075 3 80.20 AATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACAT:1 - chr3R 4160059 3' + invader2 239 2 68.32 GGGAATATAAATTATAAATTACAACACTGATATAAATTATTAGGATGTTGTTGTTAAAGCTTGACATGAAAAGAAATCCGTATAGCTCTTGAAATATAAG:1 - chr3R 20052041 3' + copia 251 1 76.00 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATTT:1 - chr2L 19644869 3' + blood 344 2 53.47 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCA:1 - chr3L 13652800 3' - hobo 47 1 68.32 AANGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAA:1 + chrX 4448590 3' - 412 48 2 71.29 TTNTAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACAACGATTCCGAGGAAACCACAAGCAAATTGAAATTGTGAAATCTTTTCCCCTGTGCA:1 + chr3R 5329418 3' - blood 7030 2 61.39 TGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCTGGAAAAAGCAGCTTCATTTGTTTTACTCAAATTTTAAATTGCAA:1 - chrX 22895687 3' - R1A1-element 4924 1 54.02 AGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGGTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATATTTTTTTGTTGCCTGCCATGGGAGCCCATG:1 + chr3L 12172878 3' - 17.6 6964 2 68.32 AAAAGTTTTTTTTTTTATTTCTGAGCCTCATTTTAAAATTAAAACTGGACATTTTATATGTTTTTCAAGTATATAAGAATGTATGTTTTAAGTAAACTCAC:1 - chr2L 13923969 3' - HMS-Beagle2 492 1 73.27 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAA:1 + chr3L 18337709 3' - Juan 4055 1 54.46 CTAAAGGGTGGATGGAGGAGCCCTCATGGACTACAATGAGTAATTAAAAGTAAACATGTGATTAATCACTCTGCTCAAAGTACACTCGTTTCTTTGTTAAT:1 + chr3L 11632442 3' + Rt1b 4901 1 68.32 TTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGGAGTTCATCATTACAGCCCCCTTCCCGAGTCGTTGGCTTAATGCGATTTCGCCCACCGGGTCAAGGTC:1 - chr3R 5524672 3' + 412 7521 2 52.48 TAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAA:1 + chr3L 19339394 3' - Tc1 63 1 79.21 CGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACAACTGCAGCGCCACTCACACAGATACTCGCCCCCGTCCCTTCCCAAGCACGAAAAACTACACGAA:1 + chr3L 17990192 3' + 1360 3193 1 73.27 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAA:1 - chr3R 14049335 3' - transib2 20 1 59.41 GAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAAGCCAGATTTTTATATTTTGTACGCCATCATATCATTCGGAAACGACGGCACCGCGAGTCCTGCGAC:1 + chrX 7270102 3' - Cr1a 56 1 60.42 ATTTTTCGTTTATTGTATATATTTTACATGACATATATACAATAAACAAATTAATGTTAACCGATCCCAATAAGATTATATCCAATAATTGGTTTCTGGGT:1 - chr3R 25879570 3' - Transpac 4760 1 47.52 GCGTGAGCAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAGTGTATGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 14317416 3' + 1360 3303 1 75.25 ATAAAACCAAACCTCTCACCAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGAC:1 + chr3R 10030801 3' - BS 5010 1 72.28 ATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTG:1 - chr4 829446 3' + INE-1 80 1 80.20 CTNAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATGTCGACTGAGTTGCCACTTATTGGATTCCCTACGATCGGATTGGATTC:1 + chr3R 14352744 3' - pogo 1741 1 57.43 GCCTGAGTATTATGGCGAGCCTGCTGATCATTGTTTCTCCGACTCCTTACTTGACCACTGGACAATCATACAATTCCCGGCTTTCACATCTCGCTGTTTTT:1 + chrX 10441646 3' + TART-B 305 2 27.72 AATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTATTCCCGAAGTAACAGTGCTGCC:1 - chr3R 31669480 3' - 297 6827 2 78.22 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGACACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATG:1 - chr3L 13652785 3' - hobo 28 1 49.48 GAATTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGCTAAGTAATTTAAAATTGTGTTCTACTTT:1 - chr2R 10397963 3' - I-element 5132 1 71.29 TTAGCCATTCTTGTAAACAACAACAACAGAAACCAGGGAACTCAAAGCCACAGAAAGAGAGAGGAAAATTAAGTTATATAAGTGATCCGA:1 - chr3R 21603248 3' + 17.6 194 2 81.11 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTCATAGCTAGAGCTGCATCTGATTTGGGGGATGTCCCGCACTTCTTTCCC:1 - chr3L 14088031 3' - hopper 3 2 74.26 TAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCAGACATGGAAAACCGGCAGACAGACGGAGGCAACCAAAACATTTGACAAAACCAAATGACATTTTG:1 + chr2R 21855173 3' + G6 1952 1 80.43 GACGGCCTCAATCTTGGGGGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGATGCTCTTTATTATGT:1 - chrX 21772490 3' + gypsy3 6550 1 64.36 TTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTACTCAATTGCGATTACGATTGCCACTGACGATTGAAACTGAAACCGCGATTAAGGACATTATCTACGC:1 + chrX 17233949 3' + R1A1-element 80 1 70.30 GGAGTGACGTATTTGGGAGGTCGAAACCGGCACCTTCAATTATTTCTAAGAAAACAGTAATGATTAATAGAATGGTTGTTCCTAATAGGATACAATGCTG:1 - chr3R 16835799 3' + 297 6580 1 62.00 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGTTGCTTGACCTCTGCCATAAATAGGA:1 + chr3R 26592637 3' - roo 8714 2 78.22 AAACAGGCCGAATGCCCCATAGTGCATTGTTTCTTAACCATCCATATGTGAAATAAATATGATGTGTAGGCATATTTCCCTATAACTCCAATCCATTCATT:1 + chr3L 1140377 3' - hopper 3 2 68.32 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATT:1 + chrX 19030132 3' - Doc 57 1 86.14 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTGCCCTACCTCCCCCTTTGAAAGCCTTCTTAATTTCCCCTGTTCGTTATGCATTGTGCGTGCTGTGC:1 + chr3R 4805143 3' + 1360 3380 2 70.30 ATTGTTGATCAGGATCAACAGCCGACTCGATCTTGCCAAGTCCGTCATTCAGTCCGTTTGAACGTCGAGATCTTGGGCACTATAAAAGCTAAAAAATTGAG:1 - chr3L 22753880 3' + INE-1 86 1 67.33 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGAGCTTCGGGCGATAAAGAAGGAGAAATATATA:2 - chr3R 25514827 3' - hopper 45 1 66.34 TATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTAC:1 - chr3L 25889011 3' - gypsy8 305 1 77.00 CACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGCTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCGCTTTTGCCCCCACCACCTTGCAACGCCGATGCACTAGCATTTGGCA:1 - chrX 12355252 3' - invader1 176 2 53.47 CCTGAAACGCAGTGCAAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTGTGTGAGGAAAAGAGAAGAGTTGATTGCATTATATCGAG:1 + chrX 11524003 3' + Ivk 306 1 54.55 ATNGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCT:1 - chr3L 17971238 3' + P-element 2844 1 36.00 TTCTTGATCAGGATCACTAGCCATTCCGGACATGTCGGGATCTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATA:1 + chr2R 13259686 3' + INE-1 87 1 56.44 GGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGCATATGCATATATATGCAGCTGC:1 + chr3L 10382696 3' - I-element 5022 1 77.00 CTTAAATCTCAATGTTTTTTGTAAAAATTTTTCAATTGTTAAATAATTAATTCTCTTTAATGCGCAATATTAACGACTTTGTATGATCATTCAACTGGACA:1 - chr2L 1317311 3' + HeT-A 5790 1 65.35 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTCTCTTTCGGCCTCTATCTGGCTATTCGCAACGCCCCCACGTGCTTTT:1 + chr3L 10522610 3' + roo 390 2 50.50 AAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTATAATTGATTTGTCGGCTCTATCG:1 + chr3R 9127438 3' + invader3 251 2 52.48 ATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACC:1 + chrX 1018116 3' - 1360 234 1 68.32 GTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTAAGATGACTCAAACATCCATGCATCTGGCCATTTTAGCGATTTTGAAACCCTATTCCTATTT:1 - chr2L 4093874 3' - I-element 409 1 68.32 CCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTTCTATAAGAAAAATTTGA:1 + chr3L 23155711 3' - gypsy 55 2 77.23 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCATTAATTTCATTGAGCTCGATCCCGTTTGTTGACAACATCAACTGCACGGCGAAAATAAAAT:1 - chr2L 20913936 3' + P-element 2876 1 66.34 GCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTGTCTGTTGTTTATGCGTTAATTTGTGCGCAACGCTTCACAGTTTTCC:1 + chr2R 6656323 3' - HMS-Beagle 6640 1 54.46 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGC:1 + chr3R 13437226 3' + hopper 1379 1 63.37 AATCGATCGTTCTAAAATAAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCACTGCATGCAAATAAGCCCAAGGCAAACTTATCCTTCACTCCAACTTCAACCCACTACCA:1 - chr3L 9758927 3' + Doc3-element 205 1 59.41 GGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTCGTCATATGATCATATTTCTATTAGAAAATAATTGCTAAAGGACCGAAACTCCGAAATAGCGCCCGTCCCTCAAGCCTT:1 - chr2R 4511970 3' - transib2 106 1 78.22 CCCAAAAAAAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTAGTGCCAAGGACCAAACGCGTCAAGTCCAAGTCCCTGCAAT:1 + chr3L 10827819 3' + Idefix 7095 2 57.58 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAGTACGAATAAATCCGAATAGTAAGGCATAAACCAAAAGTCCAAGAACTAATAAACATTGACAAATAACACTACAGA:1 - chrX 17939616 3' + mdg1 7390 2 76.00 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCTGTGGCCTTTCCCCATCCGAATGTGATTTTATTTCTTAGCCATTTCAGTCAAGCAT:1 - chr3L 8331205 3' - roo 8683 2 59.41 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCGAAACCAAAAATTATGCTAGACAGCTTTCCATATCGTATAAACTTTGGGCTTAATTGGCAAAGAA:1 + chrX 6731881 3' - hobo 12 1 65.35 CCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCCCCCCACCTCCCCGCATAAAAATGGGCACCCCTCTCTGCCGCGTTGCCATGTTCCAAATTCTTCTGCG:1 - chrX 17724400 3' + Idefix 202 2 63.37 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCGACGTTTCCAGTGGAGGTGGAATAACTT:1 + chr3L 22046520 3' + roo 9063 1 73.27 AAGTAAAATAAAATAAAAAGAACAAGAAGCAATACCCACAACACTTACACTTCATTAACTTTTGGGTAATAAAAGTGGGAGCTAGGGAAAAGACACTGATA:1 - chrX 14958207 3' + F-element 4682 1 65.35 TGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGCTACGCCGGCAGCGCTGCTCCTCGACTTTG:1 + chr2R 2308851 3' - McClintock 5957 2 61.39 TTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTTCGCTCCACACTATGACA:1 - chr3R 19969497 3' - F-element 4302 1 80.00 CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAA:1 - chrX 1600195 3' - BS 5037 1 70.30 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAGTGTAGTAGCCAAATGTGTGTTGGCTGGCAGGACACTAAAGAG:1 + chr3L 6900716 3' + pogo 2098 1 77.55 TTATACAAAATCGGAGGATGCAAATTAATACATTCGGAAGGGGACAGTTCTAGAACAGGAGGAAAGCCGAACGAACGAAAATTTTAATTGCACCAAATATG:1 - chr2R 8291991 3' - Gypsy12A_LTR 2068 1 64.36 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTTTCAACT:1 + chr2L 6184259 3' + roo 393 1 59.34 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATCATCATTAAAAAGCATCGTTGCAGGGCAGGCCTTTAAACTCGCAGCAATTCGT:1 - chr3L 963008 3' + jockey 4963 1 51.49 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGGACATTTCAGTGGGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTTTGCTTGGCATGCCATGTCATCAATTTCGC:1 + chr3L 20867534 3' - hobo 1 1 76.24 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACAAGACTAGTTAAACTATTTCAATACTATATTAG:1 + chrX 19030182 3' - Doc 7 1 75.25 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAAATAAACAACAATTTTACTATATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTAC:2 - chr2L 12283966 3' + 297 6926 2 77.23 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAACACAAAATAC:1 - chr3R 17665950 3' + Transpac 5222 2 72.00 GATACAGTGCGCATACACAGCTCTTTTGCACCTCAGCGAAAGAGTGCTCCATGTACCATGAGTGCGGAAAGTATCCAAGCTCTGAGGGTTCCGCCCGAAGA:1 - chr3L 23210966 3' - Helena 1038 1 56.44 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGTCATGTGTCTGACCCTCCTGCGCCCTTTTTGGCCA:1 - chr2L 9313917 3' - hopper 13 1 62.11 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACCTTAATTGAATAATAAATACATCATCAC:1 + chr3L 11891370 3' - Tabor 48 2 69.31 ACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTCTTAGAAATAGGCGCACAGCCACAAATAATAAAGCAAACGGAAATGAAATACAATACCCGAGGAATCC:1 - chr3L 14087676 3' + hopper 1058 2 55.45 TTNCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCAACTGATCGTTTGGCTAATGACCTGAAAAGGGTATTTCAGTGGCGACTT:1 - chr3R 26592578 3' + roo 9048 2 52.48 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCAACCAGTTTCAGGATAACCACCACCACTACTTCC:1 + chr2L 10174196 3' + mdg1 7446 2 61.39 ATNAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAA:1 + chr2L 261066 3' + Juan 4201 1 69.31 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTCATAGCTAGAGCTGCATCTGATTTGGGGGAT:1 - chr3L 14088049 3' - hopper 3 2 68.67 TGNAATAATCGATACCCAGGGAACACCACGGGGAGACCATTACAAATGTAATGAGTCCTATATATACATACATAAAGAAAGGAGCGCCTCAGGCACATTCA:1 - chr2R 19582795 3' - 1360 2915 1 65.35 TTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACACCCACTTTTGAAATTTTATACAATTTTTTTTTCGTTTTGTTTTGCCTTGCCAATTTTT:1 + chr3R 4052808 3' - Stalker4 7047 4 68.32 TTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTAATTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 + chr4 1294988 3' - HeT-A 8 1 73.27 GACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCC:1 + chr3L 25350820 3' + baggins 5413 1 42.57 TCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTATTCGGTAGTCTTGTTCGGCTTGTTGCCCCATTACCTTGG:1 - chr2L 965331 3' - 1360 54 1 60.00 CTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTTCACCTTGCCTCGCATTTTGTTTGTTGGCTGAAAGGAAA:1 + chrX 3277605 3' - Bica 398 1 65.48 CACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTAGTCCCTTTCAAACAGCCGTGTGATTCACTTCGCTTGAAATAAAATAAACTGAAAGCAGATAAAAGCTTCTGCAA:1 - chr2L 16887888 3' + P-element 2886 2 73.27 TGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCGTTTTCCGTTTCCCTATGCTTGTGTGCTTAGGACAGTTTTTCATTTTGATTGGCATTTCAATAAGAAATTC:1 + chr2R 21493291 3' - P-element 2617 1 77.23 TATAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACACATTTAATTGACTACCACAATTGCAGTTTATTAAAATCGAACTTATTCGTTTATATT:1 - chr2L 20265930 3' - roo 8681 2 42.57 TATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTCTCAATGGCTCATGTATTGTATACTTCCCCGTTGTTAATAACAGCTG:1 + chr4 1269612 3' - Transpac 4950 2 52.48 GGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAATCGGCATGAAACGTTGACAATGACGATGTGGCTGACATTGTGGCTTTATATGTCGTGGTTACACCTA:1 - chr3R 22730752 3' - Quasimodo 246 2 72.28 GAGCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATAGAGAGCAGCATAAAAGCCTGGCCACAAACCAAAAGCGGGCCAACAAC:1 - chr3R 8709878 3' + 1360 3178 1 51.49 TTAATTTTGTCCCTTATAAAATGATATTTGACATTAATGTGTTTTGTACGCTTGTGATTAACGCTAAAGGTTGTTTACAGCCATTATTGGTGTTGGAGTTT:1 - chr3L 12091311 3' + frogger 355 1 60.40 GTAAGTACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTGAGTTGTTCGCAGTACAATAAACTGCCAGCTTCAAATGAGCTTTGAATTCTGC:1 + chr2L 8559884 3' - G-element 263 1 60.00 GTNTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTATCACAGCGGCAGTGGGTCTTATCGATGCTGTCTCGCTCGCACTCGCACACTTCCTGCCGTTTACCTG:1 - chr3R 23886745 3' + S-element 1710 2 73.27 GGNATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTTGCGCTGACCATCCCTACTAAAAGACATTCCATCTCCGCTGTTTTGGTTGTTTTTGGCTTTTGT:1 + chr3R 21896252 3' - gypsy4 88 2 63.37 AATTCAAATTCAAATTCAAATTCAAAGAATCGCTTGCCTACTTTTAGGCCAATTAACATTTAGATACTTATTGATGATTGATTTCATTCGTTTTTTTAAAG:1 + chr3R 21917771 3' + Rt1a 310 2 78.22 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTAGTCCCTTTCAAACAGCCGTG:1 - chr2L 16887942 3' + P-element 2833 1 26.00 AACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTCCT:1 - chr2R 17077847 3' + Tirant 348 2 77.23 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTCGAGGTCTACCCTGAATTTGTCCTTGTAAGTGTGTGCTTAGCCATTAAGTGCATAT:1 - chr3L 6522266 3' - pogo 19 1 58.42 TGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGGCAACCGCACAAGGATGCAGCCAGCTGGTGTTGCCGCCTCTGGTTGGCAACCCCCTGACC:1 + chrX 6143001 3' + accord 9 2 62.38 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATCAAACTTATGCAATTATCGCTGCTGGCTATTCAGTTTAATGAGCGCTTATCTGCTGGG:1 - chrX 20043567 3' + 297 6936 2 60.40 TTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACAAGTACATCACCCTGATGAAGGTAACAGAGGAGGATGGTGATCCCAAGCTGATGAAGT:1 - chr2L 13028203 3' + accord2 7330 1 59.41 ACACACACACACACACATAGACGGGGCTTGCACTGCGAGAAAAGGGGGGAAAGACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' + accord 7031 2 55.68 TGAATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTAAACCAAAATTGGCCTGCAACTGTGTGCGAGTGTAATTGT:1 + chr3R 21206743 3' - P-element 36 1 41.58 TGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAATACGTACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTTTATGATCGCATACGGATTCTATTATAATTTTATCTTC:1 + chr3R 18301623 3' + 1360 3187 1 62.38 GTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAGGTTGGAGAAGCTCGCACCGAACGTGCGAGCAAGGAAATGTGGAAGAAAAGCAAGGGAGAAAACGTC:1 - chrX 549819 3' - F-element 403 1 68.37 AGATTTAGAGTCAAAGAACTTCTAAGGTTAAGGGCATATTTTGTCAAATTCAAACTGGGAATGCGAGCAGCCTACGTGAGTTTGCATCAAAAA:1 - chr3L 14626436 3' - 1360 236 1 51.61 GAGTTANGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCGTGTAGCATTCGGTTTCTAGTTGTAGTTGGGCCTGGGACTTATGGGTGATGCTGGGGGTCTGCT:1 - chrX 1638736 3' + G-element 3913 1 68.32 GTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATTGGACATTGAAGCAAATGGCAACATTTATGACGGTTATAAAGAGATTTAGATTCTCTTTTAGAAAA:1 - chr3R 13349489 3' + Ivk 5365 1 66.34 ACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTGAAAAAAGGGGAATAGGAAAACGGTGAGGGACAACAGCAAAAGAAATGCATCATAAATTTTCATGT:1 + chrX 20887378 3' - jockey 4959 1 64.36 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTATGTCGTCAGTGACATTTTACTTG:1 + chr4 119440 3' - 1360 48 1 77.23 ACTACAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAGCCTCAATGATGAAACAATCCCAATCCCAATCCCAATCCCCCAGCCAA:1 + chr2R 20578005 3' + G2 3073 1 85.33 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATGTAAAAATATTTGAACTAAGCCAGCCAAAGGGTAAGGACGACGAG:1 + chr2L 9410868 3' - roo 8693 2 56.00 AACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCAATGTAGTAGCAGCGGAAGGCCTTGAAGG:1 - chr3L 8976645 3' - Max-element 406 1 71.00 CCAAGCCCTCAGACGCCTGCAGATTTCACATTAAAATCCCCCCACCCCTCATCAAAAAAAGAAA:1 + chrX 16449246 3' + G2 2903 1 71.88 ATCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCAGCATAATAATGGGTTACCATTTCTGTACA:1 - chr3L 6157913 3' + F-element 397 1 70.00 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACACCAATGTCGCATTG:1 + chr3R 12566763 3' - Doc 30 1 59.74 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTAAATATCGGCAGACGTAAAATGCCAGCTCCTCT:1 - chr2L 16231437 3' - 297 35 2 72.00 TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTTTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTCTGCCAAAACTTTTAATTCAGTTGGGGGTCAGATAACTAGG:1 + chr3R 14475247 3' - 1360 89 1 66.34 AACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACGAGTTCAAAATTTCAGAGACGCAATCTATTGAAGAAAAGCC:1 - chr3L 2049842 3' + Stalker2 364 2 64.36 AANTATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCCAATTGTAAATATCTATATTATGATATTATGCTTTTGTATCATTTTTGTGCGATTTAAATCCATATGGT:1 - chrX 16698976 3' - roo 6 2 73.27 GACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTATAGACGACGATAGGCTCTCTCAACTTTCTAACAATTTTCGAGCCCAAGCTTTGAAAGTCAAC:1 - chr3R 22154103 3' - INE-1 92 1 67.33 CTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTA:1 - chr3R 4504044 3' + INE-1 562 1 74.26 CTNTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATT:1 - chr2L 8841087 3' + P-element 2829 1 21.78 TTNTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAA:1 + chrX 20999747 3' - BS 68 1 64.36 TAATTACGCGATAAGCAAAGCTCAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATCTAAATATATTGGGACATTTTATG:1 - chr3L 18511080 3' - Ivk 56 1 77.23 TTCATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATGCTGGATGCGGGGCTACCGACTGGCAAGCCACTGGCCTAGTC:1 - chrX 20088579 3' - F-element 4533 1 58.42 GCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGTAATTTTATAAAATTTGTTACCTT:1 - chr3L 22915226 3' + Doc2-element 320 1 76.24 GCNTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGGAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTGCTACTTTCTAATTATTATTTAACCC:1 - chr3R 17674335 3' + blood 329 2 70.30 GTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCAATAGGAACCTTTCCATTATAGTTCCGATGGGATGGAGGTTTCTCAGGCT:1 - chr2R 4155865 3' - gypsy4 6484 1 54.46 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCTGAACCAATGGCGATGCACTCGGAGTTAAGCCGCCGGAAATTCGGTGGTTTGAACAGGTCCGATTTCC:1 + chr2R 20804765 3' + hobo 2930 1 70.30 AATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTGTCCAAATACCTGG:1 + chr2R 5202365 3' + roo 9038 1 56.00 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTA:1 - chr2R 5485081 3' - 1360 46 1 72.28 CAAATAAATTAAATTAAAAAAATTAAATTGGCGTGAATTGTGTTTTATATAATATATATAATGAAGCAAAATTAAATAGATTTTGCTGATCGACGAAACC:1 - chrX 13954708 3' + X-element 4718 1 67.00 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTGGACCAACTTTTTTCTAACTTCCCCC:1 + chr3L 1698606 3' - roo 8713 2 76.24 ATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCCAGTATGGAGCTTTAGAGATCATATGCTG:1 + chr3L 9076667 3' - mdg1 7038 1 75.25 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAATAGCTACAACAA:1 - chr3L 13652766 3' - hobo 11 1 67.68 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGCGGATAGATGCCTGCTGGTCTGTCAATTATGCACTTCCATATCT:1 - chr3R 20984175 3' - hopper 26 1 53.47 AANAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCTTTCGGGCCACACACTCCTGTCGCTGTCGTTGTCGTTGTCACT:1 - chr2R 18005555 3' - hopper 6 2 71.29 GAATATTCTAGGGTCTTTGGTTATACCTTATAGTTTCAAAAATGCAGTTTTTAGCTTCATTTTCTAGCTATTAAGTTATGGTATAAACATGCATTTTAAAC:1 - chr2L 14798779 3' + Tc3 313 1 67.33 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTTG:1 - chr3R 178120 3' - BS 40 1 67.33 CGNCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTAT:1 + chr3R 17666036 3' - Transpac 40 2 64.36 AGTGACCCATGTAACAATTGATTTGCGGCAAAGGCACGTTCCTCACTATTCCAACCAAGATGCAGGTGAACCTTCAAGGAAGGGGGCCGGGATAAAGAGCT:1 - chr2L 14120846 3' - mariner2 268 1 54.46 ACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACCATGGCCATCCAGGAGTAGTAGATTACCAGGGTCAGTATCAGAATCAGTGCCGCGGCGCAGCTATA:1 - chr3L 17264665 3' + Tabor 11 2 76.24 GCNCCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAAAATCAAAAATGACTAGGAG:1 - chr2R 1571530 3' + 1731 316 1 77.08 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACATCTATTGAAATTGAATATATAAATTTACGTTGTGGAGAACTTGCCAAGACTCAAA:1 + chrX 20933825 3' - mdg1 20 2 59.41 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCAGCCCGTTGTTACGTTTTTTGGCCT:1 + chr3L 10485655 3' + I-element 5344 1 50.50 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCTTTTGA:1 + chr3L 23090536 3' + 1360 3343 1 82.18 GCTGATAAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATTTACAACAATTATACCAACAAGTTACTGTGGTGTTTATGATCGGTTGCGATCGCAGTTCCATTGT:1 + chrX 9572396 3' - accord2 7186 1 65.35 TAAATAAAAGGCTACAAAAAAAAAAAGGGGAAATGGAAAAA:1 + chr3L 10030609 3' + G2 3063 1 63.41 TGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCGAGGGAACACCACGGGGAACGTGGAGACCGAACGTTAAATTCAAAAATTGCGCCTGTCTGTGTCTCGGCACATGCG:1 - chr3R 10350674 3' - 1360 2924 1 72.28 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAACAAATCGTGTGCCAAAATGGGGGTAAAAAACTACCAAAGCAACTAAAATATTTTCCA:1 + chr3L 15725622 3' - 1360 79 1 57.58 GCNTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGTTGTGGAGTATATGCCGTCGTCAGGTGTCCATATCTTTTGTGCCACAGT:1 - chr2R 4265283 3' - I-element 5204 1 52.48 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGTGAAAAGTTGGAACGAAAGAGTCGGGTGTCCATAAA:1 - chrX 8150415 3' - rover 6982 2 63.37 CAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGCCCAACGAAACCCCAGAACCCAGAACACCCACCCCCTGGCGGGTGTGAAATCAT:1 - chr3R 9208588 3' + G-element 318 1 55.45 CCAATATGGACGTATGGAATAGCACTCTGGGGAAATGCCAGTAAATCCCACTCCTATATAGCGAAACAGCCAATCCCTCTGGTCGAGCACAGAAACCACCC:1 + chr2L 2129003 3' + Porto1 4263 1 56.44 TTCCATGTTTATCTGAAATCAGATCACTGTGCACGGAAACACAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGCAGGTGGAATGCCCAACTTTAATTGTTTTAAT:1 - chr2L 3335243 3' - Cr1a 419 1 62.38 GCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGCGTATTTCCTATGAATGGGAAATATGTTTGGATTTCTGGTTTCATCGGAGCCATGCATAATTTGTCATG:1 - chr3R 16601177 3' - 17.6 36 2 71.29 GTNCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGAACAGGAACTGTACTTTTCGCTTTCACTCTCCCGATCAGGGTCTGGACCACGCCCCACATGTGATTAAGCATTT:1 + chr2L 17237506 3' + Cr1a 245 1 56.44 GACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGGGGTGGGCTGAGCTTTGAACCGTTTCGTGATACGCCACAG:1 - chr2L 13842433 3' + jockey 4732 1 60.40 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAACTCATTAAAAAGCCGAGCGGCATTTAAGGATGCGCCTGCGCAGCAAT:1 - chr2R 9658332 3' - P-element 26 1 53.47 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACCTAATTGAATGCGAATATTTGTAGAGAATACC:1 + chr3R 4971217 3' - 1360 44 1 69.31 AGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCGAGGAGAAGGAGGACACGTGCACCCCAGAACACTTGCACCG:1 - chr3R 9660728 3' + jockey 4736 1 62.38 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCTCACTTTCACAAAAATTTTCGAGATTGGGAAGAAATTATGCCAACT:1 - chrX 9439765 3' - roo 29 2 59.41 CAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCGGCTGTTGTTGTTGGAGGTGATCCAGTTGCTGCTGCTGCCGAAGGAAAACGGAGGTTGAAGGTGGGATGTTGGAAG:1 + chrX 2035221 3' - F-element 436 1 67.68 AAATTCAAAATGAAACTTATAAAGACTAGGGCAAAAAAAAATTAGTTTCGAAGTAATCACATATATGCAAAGTCTGAAATCTTTGCAAATTTTAATAATGT:1 - chr3L 18104225 3' - Gypsy6A_LTR 155 2 77.23 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATACGTTCCCATTCGGAGTCGGATTCGTATACAACTTCAACTCCTTGGCGGCAGTG:1 + chr3L 447403 3' + Tabor 7319 2 73.27 GCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTA:1 - chr2R 3919674 3' - 1360 42 1 64.36 ATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTTGCATACCTGAAGCCGTCTGCGTCCATTTCAGCGATTGTTG:1 - chr3L 1391850 3' - F-element 161 1 57.43 CANCGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGAATCAAACGTTCTTCAATAGTTTCTTGATCTATATACAGAGTGAATGGCCCGTCTCGAGATATAGAT:1 - chr2L 492452 3' + HMS-Beagle 6858 2 75.51 AANATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAAAAAAATCACTTGTATTACCTATATTAATGATAACTGAAAACTAAAGGTATACGAGCTGCTATTAAGAAAT:1 - chrX 19052951 3' - roo 8669 2 62.38 GGTGCAAGATCGTATGTACAATGCTTATGTAAGCGTAATATGTGAAGCATCTCATTCATTTTACGATGTCGTTATAGGGG:1 + chrX 22382679 3' - rover 46 2 61.25 AGTGGTTCAGTTACCGTTGCCGGTCGGTAGTCCACACCTATGCTTGCCATAGGTGCCTTGGATTTGCCCACAGATCAACTGCAAACAACAGGAATTCTTGG:1 + chr3L 12887957 3' + R1-2 454 1 69.31 CACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGCCTAATTCTGTGTGGGGGTTTTCCATTCTCGCCGCCCCTTCGTAGCTGCTTCCTTCGGAAAACGACATCGGCAGCA:1 + chr3L 19425444 3' - X-element 26 1 75.25 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTAT:1 + chr3L 22349282 3' - jockey 29 1 57.00 CCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAGCCTTGCAGAATTTATATACTAAAGAAACGGTTTGCATGCAGGAGAGGATTCTGATC:1 + chr3L 22775990 3' - flea 4759 1 73.03 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGG:1 - chr3L 22400252 3' - 1360 8 2 71.29 GGGTTTCGATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGCGACAAGTTGACTGAAGGTTAGACCCGATCCGATCCGATCGGATTGGAATGTTGGCC:1 + chrX 17699250 3' - P-element 16 1 65.35 CCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACACACCACTTTTAATCTAATTTATGAACAAAAACCTTTTAAGAT:1 + chr3R 26140808 3' + 412 7509 2 58.42 TCAACCCCGACGGACGTGTTTTTAACAGAGCTACAGTTAATATCGAAGTTTAAGTGAAAAATTCAACCCCACAAGGCTAACATAAAAACATAATAAGCATT:1 - chr3L 4182099 3' + Porto1 11 1 68.32 GATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGGTTAGAGACATCACGTATTTTCAGCTAAGTCCCACATAAAGTACCAGAAATTCACTTCACATACCTA:1 + chrX 2888936 3' - Ivk 5076 1 74.26 GTTCATACGGAGAGACGGACATGACCAAATTGACTCGGCTATTATCTAAATGTGGTATTGGGAAAGTAATTTATATCTAAAAAAAATATTTTCCAATCAGA:1 - chr2R 25166715 3' - INE-1 123 1 57.43 GCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGAGAAAGTATGTTTTCAGGAACTAATCTATCTATA:1 - chrX 19130003 3' - Ivk 221 1 71.29 GAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCCATTGAATTG:1 + chrX 20999761 3' - BS 54 1 51.49 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATA:1 - chr3L 20209570 3' - Burdock 6175 2 72.45 AAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAATTGAATAGCGGTCGTTGGAACAGTACCGAGTACGATAGTAATTATATCATTTAATTTCGGT:1 + chrX 8859496 3' - hopper 145 103 74.23 AGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTAAATAATTGATTAAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGG:1 - chrX 14771703 3' - BS 4778 1 60.00 GCGGCAATAATAAACATTTAGTGAAACGCGAAATTGCCAAAATACCCCAAGCAAACGCAAAAAATCGACACACAGTTTGTTTTTAATTTAGTTTCTTTGTT:1 - chrX 13865253 3' + HeT-A 168 1 61.39 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACAACAGCAACA:2 - chr2R 20411849 3' + Quasimodo 7361 2 74.26 TGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGGGAGTGGTGCGCTTGTTGGCCGGCATGTTGTCGATGTACCACGAGATGTTAGCCGGC:1 - chr2L 18383948 3' - I-element 218 1 60.20 TATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCAGCAGCATTAGCTTGGCTCCTTGGCTCAGCTGCTAGCTGCTTCTTCTTGCGCAGCTCCTTGCACTTCCGTTTCC:1 - chr2L 10717167 3' + I-element 5030 1 74.26 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTCACCTGGCCAAATCACAAAGGTTTCTTTCGAAAGCCTTTCAAAACGAAA:1 - chr2R 18649395 3' - opus 7027 4 55.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGCGCAGAAGTGCGAA:1 + chrX 9439851 3' + roo 391 2 60.40 ATNACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAAATATTCTAAGTAGCGCAGTCCCCAAAACACACTGATGATGTT:1 + chr3R 21345013 3' + HMS-Beagle 248 1 72.28 AGGAGTACAGAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCAACTGAGCCTTAATGCGTATGACTTTATTGACGCCGCTTGCTT:1 + chrX 16525390 3' - Transpac 4833 1 65.35 GCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGACCACTGTAATACACTACCGATTATTCAGATAATGCTGCATA:1 + chrX 6679202 3' + Doc 4348 1 59.41 AACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCCTTAAATCGAATCAGGAACTACGTTAAATTTAACTTGCATGTCTATACCAT:1 - chr2R 6422142 3' + invader6 52 2 55.45 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTAAAGAACATATTTGAAGATTCACGAGTATAAACATAAGACACTCC:1 - chrX 13790088 3' - FB 32 1 59.41 TGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAGTAGATATATCCTTGATATGGATCAATAAAAAATATAAAAGATGGAAGATCCAGCATACGGATT:1 + chr2R 18487323 3' + INE-1 31 1 54.46 AAAATCAAAATCAAAAGCTAATCAAAAGCGTTGGAGGTAAAAAAAAATGTATTCGCAATATTTACAATCAATGAGGGAAGGTGTAGTCATGGTAACCAG:1 + chr3L 5737343 3' + P-element 2654 1 83.84 TCNACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATTATTTGATGCCATTTACAAACACAATGGAC:1 + chrX 4175166 3' - I-element 308 1 77.23 TTNGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGCGACAAGTTGACTGAAGGTTAGACCCGATCCGATCCGATCGGATTGGAATGTTG:1 + chrX 17699247 3' - P-element 19 1 62.38 AANTATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGGAGTTCATCATTACAGCCCCCTTCCCGAGTCGTTGGCTTAAT:1 - chr3R 5524698 3' + 412 7495 2 73.27 CATCCACACACACACACACACACACACACATGCTCACTCGCAGGAGCAGGAGCAGCTGTTTAAAGTGCGAGGCTGAAAGCGAAAGGGCGAAACAAAAGCC:1 + chrX 16579624 3' + accord 180 2 61.00 TANTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGTTAGA:1 - chr3R 12554854 3' - mdg1 10 2 70.30 AGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAATAATATTCAATCACTCTTATGCTCTGACACAACGGAATCACCACATTTTTGACTTTGTGCATTGTTTTTT:1 + chr2R 24208932 3' + Juan 4204 1 65.35 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTAGTGAAAGACT:1 - chr3R 22494081 3' + 297 6969 2 64.36 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATAAACGAACAAAGAATATATCTGTAAGCGG:1 + chr2R 6670079 3' + Tabor 439 2 67.33 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATCTAAAAATCAAGTGCCAAGAAACTATTATTT:1 + chrX 14040770 3' - roo 41 2 70.30 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTTCATATGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCTCGATTGAATTATCTTTTGGC:1 + chrX 5442090 3' + hopper 1404 2 40.59 ATAAAAAAATATATAAATAAATCCTAATTATTATATTGCTAGAGTAACGGCATTCTACATATTGTACCAGCAAGAATTCGCTTATTTATTCGCTTTCATAC:1 + chrX 10560459 3' + S2 1603 1 51.49 GACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTTCGGTTCCTCGGTTCTGTGTTTGCTATTCGCTCCTCTCATCTTGGGCTTATCTCTGGCCATTGCCA:1 + chrX 6704589 3' + Doc 32 1 66.34 TCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGTCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCA:1 - chr3L 6630130 3' - Ivk 10 1 69.31 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGATAGCCCATAAAGTGGTTTATTGTTTGGAATAAATTATTTCGAACAACTTAGC:1 + chr3R 25634966 3' + P-element 2862 1 54.46 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGAGCAATCGAGTGGCACACAAAAAGCCAAATATGTGCATTAAATGTGCATTGGCATTAATCGT:1 - chr3L 20669051 3' + Transpac 5221 2 71.29 ATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTT:1 + chr2R 9500073 3' - G5 4701 1 54.46 GAGCACACGTCCGCACTCCCTGACATCTCGCAAGCAACTCCTCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACAGATAAAAATATTCGTTTGCAGGAAATGTTTAAAA:1 + chr2L 17118070 3' - Bica 47 1 68.32 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATAAAAATAATAATATTCGTTATATCTTACACACACATTTCGCTTTTCTCTAATTTG:1 - chr2L 16689358 3' + S-element 1701 1 66.34 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGA:1 - chr3R 11538466 3' - 412 7096 2 70.30 CTNATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTAAGAGATGGCATATATCACTGCTGC:1 - chr3L 4859328 3' - jockey 4803 1 65.00 TCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGT:1 + chr3R 15790064 3' - flea 4746 1 69.31 GAGCAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTGCATATAATGTATAAGCTATGATTCATATTCGCGAATAAAAATACTGCTTTTT:1 - chr3L 23839868 3' + 1360 3307 1 57.43 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCAACCAGTTTCAGGATAACCACCA:1 + chr2L 10174185 3' + mdg1 397 2 50.50 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATACTATACGTGGGCGGCACCAGAATACGAGAGAGAGAGCACTTCCAGCGCATCCAGGCACATAGTTCCGT:1 + chr2R 10444319 3' + P-element 2882 2 74.26 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACACAAACTGATAATCAATTTATTTACAATTTGGTTAATTGTACTAGCT:1 - chr2R 6670021 3' - Tabor 29 2 53.47 ACNACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATG:1 - chr2R 5582160 3' - Cr1a 433 1 75.00 GCATTGCTTTTTACAACGCATCTATTGAAATTTGATTATACAAATCTATAAAAAGCTTCTCGTCTATTCTTCTTTCCGGGTTGATAAGATCTGTGATTTAC:1 - chr4 825617 3' + S-element 306 1 76.24 CTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCTCCCTTCCTTGGGAAGTTTTGAAAAAGCTTGATGATCCCGGCGGTCTAAAAAGGGTTAGATCAAAAATCAGTCCGTGCG:1 - chr2R 1009310 3' - gypsy8 4656 2 68.32 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAACGGGGTCTACGGGGTCTACGGTTGGATCTCCGGGGGATACGGGGCAAGACACGGACAAC:1 + chr3R 11538537 3' + 412 7527 2 57.43 GCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCAGGACGACTGGCCGGATCGGGATCA:1 + chr3L 9983362 3' + 412 320 2 72.28 ATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTCATAAAATT:1 + chr2L 5460030 3' - Tc3 283 3 20.79 TATAAATACAGAATAAATACCCAAACAAAACAATATACCCAGCTTCTAGCAAATATAAAATGAACCAAATTAGAAATCAAAAGCAATATGAAGCTGCAGG:1 - chrX 2840332 3' - invader5 3764 2 62.00 ATNCGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATCGCTTTTTGGGACACGGGACCTCA:1 + chrX 12813763 3' - BS 17 1 55.45 AATTTAATTTAATTTTAATTTGCACTAACTAACAAATTTTGAAACTAATATTTTTATGTGCACGATTTTTGATTTGGCTATTGATCTACGTGTTTCAT:1 - chr3L 22962729 3' + Rt1b 125 1 73.47 CGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCACCGAAAAACATTCCCAAAACTAATTAA:1 + chr3L 6013747 3' - Max-element 12 2 67.33 TATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTGGTTGTTGGGGTCGAACTTCTTGATTGTCTTTGTCCAATCTAGGGCATCATTTGTTTTGCAGATTTCTTCCG:1 - chr3R 12034877 3' - I-element 209 1 79.21 CTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCAGACAAAAGAAATAATCGAACAACACAATCAGACGAATAATATCTTTCATATAATAACATT:1 - chrX 22218725 3' + 1360 256 1 64.36 GTNGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTGCAAATTTTGTGTGCAAACAAACATTGTTGTAATTGCTGAAAGTGTGTCAAAATGACAGGGAATCCGA:1 + chr3L 9303214 3' + transib2 2689 1 58.42 TCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCGACGTTTCCAGTGGAGGGGGA:1 + chr3L 22046513 3' + roo 9058 1 65.66 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTACGAGAGAGAGTGAAA:1 + chr2R 21497518 3' + P-element 2827 1 20.00 ATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCTGAGTGGCCAAAGCGAATCGAAACGAGAGAACATAACAACTATAACTAA:1 + chr2L 16416596 3' - micropia 268 2 57.43 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGCCATCT:1 + chrX 19109310 3' + roo 9027 1 67.33 TTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCTTTATGCACACCTTGGGTAAGACCGTAATACCGCCTAGTGAGACCATGCGAGGACTTAAGAATAACA:1 - chr2R 13942173 3' - Porto1 427 1 71.29 AGNTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCAAGCAGGTTCTAGTGCATCTAATTTGACTTTCACTTTTTGCTGCCACTGATTGCTGTACG:1 + chr3L 16298898 3' + INE-1 149 1 58.42 TTCGTTGAGGAAACAGAGGAAGACTCTTGAAAATCATGTCATACGTTAATTGCCAAACATTGGCACTGCAAATGCAAATAAACAGATCGAAATAGAAGTTC:1 + chr3R 18276382 3' + invader5 3979 2 74.26 TACAATTTAAAATTAAAAAGGAACAGCACCACCTTATAGCGCAAGAAAACCTAGCCTGTAGCTAAATATGCCTGCATCCACACGGACTCGATCCCAGCAAT:1 - chr2R 577008 3' - invader5 3697 2 82.18 TAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTC:1 - chr3L 24213804 3' + invader2 5049 2 81.19 TTNACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATACAACATGTAAGGGGCAGGCGACTAAAGCCAGGCATTCCAAC:1 - chrX 678770 3' + Tirant 368 2 58.42 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGATTACAAAA:1 - chrX 7583187 3' - I-element 16 1 63.37 TTAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGATTGTGCTAAGATCCGAAACCAGCTCCAAGTGGCAGGCCTTGGTAAAAAAGCACACAAATACATGCAA:1 + chr3L 26290400 3' - INE-1 544 1 75.25 ACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGCGTATTGCGTTCTCTCTTTTTGTTTTTTGTTTCTAACTGGAAAAAGTAAATCTGGAAATCTATTCAATTGTGAC:1 - chr3R 19114411 3' + INE-1 554 1 55.45 CAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCATCCTGGAATTGCTGGCGGGGCGCAGCAATGGCAGA:1 - chrX 12375629 3' + accord 7272 2 75.25 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACGAAAAGGGTTTATCATAACTTATTTATTGCTTATTCCAGGTTGTCATGTTCTTCGGTCTGACGGTGGCCTC:1 + chrX 13152839 3' + pogo 2098 1 76.24 TCATAATAATAATAATAATAATAATTTCTCTCAGTGCTCTCGCGGACAAGTACTGCCTGATAAAGAGGTGAAATCTGTACAGTTTACTTTTGGCCGAGGCT:1 + chr3R 28117848 3' + mdg1 7068 8 77.23 AAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGGAGTTCATCATTACAGCCCCCTTCCCGAGTCGTTGGCTTAATGCGATTTCGCCCACCGGGTCAAGGTCGTCAGTGCG:1 - chr3R 5524663 3' + 412 477 2 61.39 GTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATATTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTT:1 - chr3R 17243104 3' + hopper 1406 2 74.26 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCG:2 - chr3R 27156640 3' - pogo 30 1 60.40 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAGTCCGGCACACAACACCAACAATCGGAATCAAACTG:2 + chrX 6518835 3' - pogo 36 1 62.38 GGCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGT:2 - chr4 158192 3' - gypsy 153 2 60.40 TGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCTTTCTAACCGAAAAGCAGCGAAAAGCAACCGAAAAAGCGATC:1 + chr3L 562906 3' - micropia 292 2 73.27 GGNCAGCTAGAGAGTTGCCGGAGCTGGAGTAGGAGCGGGAGCGGGACCAGGTGCAGGAGCGGGAGCACCCCGGTGGTAAGGTCCCAAGGCAA:1 + chr3R 19597962 3' + aurora-element 176 1 72.83 GTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGCTCATCCGGACCAGCTTGAGCATGGAGCACCCCTATTTCCCCTTCTGTTATTGAGTCCT:1 - chr3L 20005112 3' - Quasimodo 7156 2 60.40 GCNCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTATCTGGGTTACTCAAACAAGCCTTTAGCAATTTAC:1 + chr2R 8294271 3' + 412 7507 2 62.38 CTTCGATGAGCAGGATGTGAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGTGTAG:1 - chrX 19820616 3' - Rt1b 4960 1 71.29 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAAC:1 - chrX 19820031 3' - mdg1 7049 2 64.36 CAAACTAACCCAAAAAATAAAAAAGCATAATATGGCGCAGAGCGCCGAGTTA:1 + chr3R 13892110 3' - Tc1 1404 1 90.38 TTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTCGCTTGGGAAAAGGCTCTCGCGTGGTTCTTGTTGTTGGCCCTGTGGCT:1 + chr3L 14611868 3' - gypsy7 313 1 52.53 AAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAGGTGAAAAACGATAACTTAGAAATGATCAAACAAGAAATAACCTTACATTGGTGATATAC:1 - chr3R 3920923 3' - Circe 114 1 52.48 GTCATAATAAATATAAATAAACAAATATACAAAAAAAAA:1 + chr3L 6565066 3' + Stalker4 81 4 87.18 ACATCATACAGCGAGCACAATCAAATCTCACGCCACCATCCCGAGAATATCCCTCTTCGGTGCTACTTGCATGGGGATAAGGAATTTT:1 + chr2L 1445352 3' + F-element 4314 1 73.86 AAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAATCAAGGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAAAACAATTATTATTCTCGGATATTTGGTATTCGAAATTC:1 - chr3L 6013666 3' + Max-element 261 2 58.42 GTAAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGTTTAAATAACAATAGTCATCGCTTATTGTTGTTGCCCCAACTAATTTGAACTGTGCATGTGTGT:1 - chr3L 12266134 3' - 1360 3274 1 66.34 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCCAATTGTAAATATCTATATTATGATATTATGCTTTTGTATCATTTTTGTGCGATTTAA:1 - chrX 16698987 3' - roo 8681 2 62.38 TCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCACGAACGGTCATATTGGATGTGAAGTG:1 + chr2R 544895 3' + HMS-Beagle 7036 2 73.27 AAATCTACTAAAATGATAATTTATACGCACCCTTAGCCCATTTTATTTCCCATATTTCGAACGTACTCTTTCGAAAACTGTCACTTAAGAAAACTTTAAGT:1 - chrX 6883221 3' + Burdock 255 1 76.24 GTTGGANGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTTTTTCGGCAAGTTTT:1 + chr3L 23821880 3' - HMS-Beagle2 6891 2 71.29 AAGAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATATGGGGTCGAGTTGGATCTTTGCCTGTATGTCAGCTGGGAACGGG:1 + chr3R 28443774 3' + Burdock 227 2 53.47 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGAGCTGCTAGCAATCAGCCA:1 + chr3R 8191553 3' + mdg1 7440 2 59.41 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCA:1 - chr3R 9325633 3' + roo 9017 2 80.20 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACGCACCCTTAGCCCATTTTATTTCCCATATTTCGAACGTACTCTTTCGAAAACTGTCAC:1 - chrX 6883238 3' + Burdock 6374 2 59.41 AAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATT:1 + chr2L 23034061 3' + FB 410 1 42.57 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGA:1 + chr3R 22494168 3' - 297 6621 2 67.00 CTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCTCCTTAATAAATAGCCAATTAGTCAGATAATTTAACACTTAGAAATCATTAGTCGTTCATGA:1 + chr2L 13804475 3' + roo 394 1 64.36 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTAGTCCCTTTCAAACAGCCGTGTGATTCACTTCGCTTGAAAT:1 - chr2L 16887922 3' + P-element 2852 1 45.54 CTNGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCTGTGCTTTCTTTGCCGGTTTTCGCTTTATCTCGTCCTATCCTTTCAAAGCTCCTTTTCTGTGCTTGTT:1 - chr2L 21545566 3' - G6 485 1 67.33 CGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACCCGCGGCCTATTAAGGGACTTGGACAGTGGCGCACATAAGTGTAAGGCTGTGCGCAGAATGTGTTTTTATAGATGT:1 - chr3R 6569167 3' + gypsy8 311 1 62.38 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCCTACATAAATATTGACAATCTTTGTTTATCAAATCGTTTGCCATTGTTTCTGTCGTCGCTGTGGGTAATTTTTT:1 + chr3L 13878140 3' + flea 244 2 70.30 TCCATGCGCGCCAGCCCACAATGGCAACACATAATAGGAGGCAACATGATGCTGCTACGGTCAGTGCCACTAGTAAATGGAAATATAGCAGGAAAATTGTT:1 - chr3L 14309724 3' - gypsy2 6384 1 70.30 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTGTCCAAATACCTGGAGGAAACTAAA:1 + chr2R 5202376 3' + roo 9048 2 56.44 CACCGCACTTCGATTAACGCTTTTTGTTGTTGGCCAATCGCCGCATGATTTTCGATTTCTCCGAGAAGAACAACGATATCTACTTGGAGTAAGTGCTAGTG:1 + chr2L 12271339 3' - BS 152 1 71.29 CGAGGATGTGGCGTCGTGGAAGATGTGTGTACCGATCGAGCATAGGCAGCGCAGACTGCATTGTTATTTAGTTTAGACAAATGAAATCGAATGCTAAACGC:1 - chrX 18564361 3' + Osvaldo 438 2 56.44 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTT:1 + chr2L 18214132 3' + hopper 1395 1 53.41 AACCCACTTTTGTCCCAGATCCCATTTGCAATTAGCTTCGTTCGGTGTGTGCGTGTTAATGCAACCATTAGCTTCACTGTA:1 - chr2R 13750462 3' + G2 374 1 77.78 TCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATCAGCTGGGAAATGTGCTCCCTACTCAGGT:1 - chr3L 12172824 3' + 17.6 7376 2 69.31 AAAAATAAAAAAAATGTAAAAAAAAACAATCGGAAAACGAAAAGAGTTTCCACTGGCACTTGTTTATTGCCGTAGA:1 + chr2L 17256136 3' + invader2 4755 2 80.26 AATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCT:1 - chr2R 544768 3' - HMS-Beagle 6797 2 78.22 CGTGTGAAAAATTAATAAGGCATTGATTGTTGAGTGCCATGATTTATTTGTTGATACAACCGAGTTATTTACACTTAATTTGACAATGCGTGTAATGGTTT:1 + chr3R 18625105 3' + 1360 433 1 73.27 GATATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTCTTCGCCAAGAGTTATGCACCGGGAGTTACGTATACTGCAGAAATTCCTTCGAGTACGTA:1 - chr2R 8469875 3' - Porto1 4481 1 66.34 GCNATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGGATGAGTCCCAGTTGGATGTGGTTACTGCTTTGAGCGGAAGTGGACCGGCCTAT:1 + chr3R 17536472 3' - F-element 311 1 56.44 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGGTTATTTGCCCCCATTTTATTGGTTGTCGCCATTCATGAA:1 + chr3R 29423568 3' - roo 35 2 63.37 ATTGGCAAGGAATGCTCTTTATAGGCAGCAATAAGCGACTGCGGCAGAACCATTCCCTGCTGCTGCTGTCGCTAGCGCCGCTGCTGTTGCTGCTGATGGGG:1 + chr2L 1382481 3' - TART-B 231 2 32.67 GAATTTGATAAAATATGCCCTTCATCTTAGAAGTTCATAGACTTTAAATCTATATTTCGATCAATTCAAAATCTAACTTTACCTTAATATCTTCCTACATA:1 - chr2L 22254803 3' + 1360 207 1 63.37 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACTGTCGGGCATCCTTAACCCTATGCAATGTCCCTG:1 + chrX 10644912 3' - hobo 1 1 78.22 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCACCCTTCTACTAGACGTAAAACTAATGGAACGGGATCACCAAGACGCCACTCGGA:1 - chrX 6814263 3' - roo 18 2 59.41 CAATAATATAATAATAATAAAATTTTGGTAAGTTATAAGAGAGTAAATACAATTTTGAAAGTTTATACCCCACCAAATACGCGACAACCACAGCGGCAACA:1 + chrX 12960084 3' + invader3 5053 4 70.30 AAGCACATTATGTGTTTGTCCCAGCGTTTGTCCCAGCGCACTTCCCATTCCAACATTATTTATTTTATTTATTTATTAGAGATGATAGTATTGTCTATAAA:1 + chrX 22641742 3' - Tc1 1616 1 62.38 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAAACGAATCACGTCCACTTCAACGAAAAATGTCAGCTTTCGAGAGCATTCAAATCTTT:1 + chr2L 12323059 3' + hobo 2932 1 67.03 CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATACTCGTATATAGGTACATATATATATCTGTGCAGCTGCCAAGTATGCAACAGTTTTCGATTGCCAGCGTC:1 + chr2R 13403827 3' - jockey 15 1 71.29 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTGGAACTCAAAGTTTGACTCAGGAGTTCA:1 + chr2L 14418399 3' - jockey 4746 1 72.28 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAGTCCGGCACACAACACCAACAATCGGAATCAAACTGAAACAA:1 + chrX 6518841 3' - pogo 30 1 56.44 TTTTGTTTTCTTTTTATTATTTTTTTTTTTGCAGAATTGGACTGAGTTGGCAGGTTGGTGCGCATGTATTTGTATTGGCAG:1 - chr3R 10301376 3' - Rt1b 5148 2 51.85 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACTTACTTGAGAAGCTGTTCAGGTCGCTGGAGTTGCATGCACAATTTAATGCCGCTGTAGAAGTC:1 + chr2L 20919488 3' - P-element 90 1 69.31 GTTAAATATCAAAGTTTCTGATCTCTTCTCTTCAGAATTTGCCTTTGGCAGTGTCAGACAGTGAAATATTTGTCGATAACTATTAGCAAGTGGTGCATGAA:1 - chrX 869836 3' - Tc3 1604 1 63.37 GATTTATTTATTTATTCTATGGTAACGAAGCCATGCTAAAAGTTCTTTTTTAAATTCAGGTCAGTTACTAATTCATATGCTAGTACAGTATTCCTACTAAG:1 + chr2L 16948468 3' - Doc3-element 80 1 69.31 TTNAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCCAAAGCACT:1 + chr3R 15502561 3' + Ivk 5356 1 62.38 GCACACACACACACACACACATGGGTTCAAGTTGGCAAGTACAGGAGGTACCATTTGGGTTAGAACAAGCAACTCTTTCAGATAAGAATTATTTAAGA:1 - chr2L 4140449 3' + accord 183 2 77.55 TATATAAATATACACATATACATATATGTGAATGTGTCAGAGAGAGCAGCTTAGACCACAGACAGAAGCCTGCAGGACATTCCCACATTACTCCATCCGTC:1 - chr3L 12919306 3' + Stalker4 7046 4 69.31 CAAATCTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACG:1 + chrX 10119637 3' - FB 24 1 53.47 AAGAGATGGCCGTAATGGGAAAAATGGCTGGGAGTTTCTTCTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTGCTTTAAATGCACATAAATTATGCAGTTCTGGTCAAA:1 - chrX 8377363 3' + accord2 252 1 77.55 CTAATATCTATACACACTGGCGTTCACTACATTGTCATCTCCCTCTAACACACAATCTTCGATATATCAGTTCGAAAAATCCTACTTTATTTTTCTCTTTA:1 + chrX 17995514 3' - invader4 2945 2 52.48 TGGTATATGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCAATTACAGGAGACATTTGTAAAATGTCAAATGTGTCAGGGTTTCGCCTGAGGATTGC:1 + chr3L 25144839 3' - X-element 4399 1 61.39 ATATATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATA:1 + chr3L 23456267 3' + 1360 3370 1 56.44 CTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCC:1 - chr3L 24213773 3' + invader2 5080 2 51.49 TGCACTAAGATTACATGTTTTTGGGCACTGCATCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTCAATAGTGTTTATATTAATCTGTATTCTGACCTGTTCTTGA:1 + chrX 11382303 3' - roo 8797 2 62.38 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCACCGAAAAACATTCCCAAAACTAATT:1 + chr3L 6013745 3' - Max-element 8249 2 65.35 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATATATTCTAGGCCCCTTCATGAACTAAATAA:1 + chr3L 8657018 3' - pogo 43 1 72.28 AACCCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGTGGGACGAGAGCTACAGGCAACGCATGTGCAATATTGTTGGTTTCTACATATCCTGCGAACTCTGTTCCGCTC:1 - chr3L 15135778 3' - invader4 123 2 77.23 CCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAAATCGATCAAT:1 + chr2R 19149460 3' - diver 30 2 54.26 AATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAAGCTGGCAACCCTATTTTTGGGAGCTCAAAAGTTTTGCTAGGATCTCATGTGTCTGGCTATTAACTTGG:1 - chrX 18188207 3' - Tirant 8455 2 76.24 TTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTATGCTTAAATGATTTAAGTACAAACAATTGTTTCGGGATCGTATTTTTCTGTATGTTACGTATATAATTTAA:1 + chr4 545383 3' - Tirant 277 2 73.27 AACGCGTATTTCTCATACGTCTCACCGACAATCCCAACCACAGAACCAACAACAACCACAGAGTCTACTACAACCACAGAACGTGTTACAAATACAGATCT:1 + chrX 12969153 3' + F-element 264 2 66.34 TGNACCCAACTGCAAGGGAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTGCTACTTTCTAATTATTATTTAACCCATACTTTGCA:1 - chr3R 17674325 3' + blood 7351 2 60.40 CAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTGACGAGGCCGAGTTCACCATCTGCAAGGGTCACAAACTGAACCAGGACTTCCATCATATAGTCGAAG:1 + chr3R 11704484 3' + Stalker4 386 1 71.29 TTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGG:1 + chr3R 1977610 3' + micropia 5400 2 64.00 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATCGTAATTAATCTGTTTACTTCAATA:1 - chr3R 31458428 3' - jockey 9 1 65.15 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAGAGCGCCCACA:1 - chr2R 18528765 3' + jockey 4963 1 56.44 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGTCGTCTGTGTTTATGCTTGTGTGGAAAAGAGCTCG:1 - chrX 522135 3' - transib2 39 1 65.35 ATCATAGGAATTTTGTATCTTATCTTATCTTTGGGACCTGCGGGTCTCAAGCTCTTCTTATTTTATGAACACAGCTCGTCAAGATGCTGGTGCTGGCCACA:1 - chr2L 16306745 3' + HB 1584 1 73.27 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTACTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTACTTTTTTGCATAATTTCC:1 + chrX 3547528 3' + roo 9019 2 83.16 AATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAA:2 + chr3R 9192574 3' + invader3 5422 2 69.00 GTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - rover 6963 2 64.79 TTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTT:1 - chr2R 5410958 3' + Tc1 1404 1 52.48 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCG:1 + chr2L 18214144 3' + hopper 1400 1 58.95 AAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTT:2 + chr3R 4604452 3' - gypsy 150 2 57.43 ATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGTCTGCACGCTGAAAAATTTAGATTTTGTGTGGGAAAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chr2R 18351810 3' + micropia 5248 2 60.40 TCNTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGCAATAACAAAGTTAAAGGACCGACCCTTTG:1 + chr3L 13345508 3' + Transpac 276 2 63.83 CTACGTACTAAAACAAAAACCTCCCCTCCCCTCCCTCTCCGCCGCAGCCGATAATAAATACAATGTATAATTTTTGCTTTTCTTCGCTTCGCTCTACGTTT:1 - chrX 5849166 3' - Rt1b 5035 1 80.20 TATGTTTCATACACTGAGCCAATTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTAACTACTCCCCCTTCAAGATTACGGCCAGATCGGCAAGTACTTAAAATTCT:1 - chrX 4576387 3' - Gypsy6A_LTR 30 1 75.51 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGGGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACA:1 + chrX 4448607 3' - 412 31 2 55.45 CGCAACACACATTCAGCAACTACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTTGACATCCCTTTGGAACTTGAGGGTTTGTTCAAACGTCATTTTACCACCGTGGAGTT:1 + chr3R 24689360 3' + Chouto 354 1 56.44 CGNAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATTGTATTCAAAACTTGAATACTCATTTATTTACTATTTTTTTTTTAATTTTACAATGCCC:1 - chr4 1156859 3' - F-element 33 1 51.49 TTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGGGCGCTGCTTCGTGGGTGCAATACTGGAATACCTCATGATACTGATACAGTTTGATAAAGTCCTAAACAAATA:1 - chr3L 20737616 3' + BS 76 1 60.00 CTCCGACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCGTGCCCGCATCCAAAGGATCCAGCTCAACGGTCACCGTATCGATCCAGGAGCCACCCACG:1 + chr2R 14683744 3' + gtwin 7297 2 66.34 AGAGCGCACTCTTGCTCTTCGTCGTTGACAAGCTCCAAAATCTTAGAGCGAAGAGTGCGCTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACAACATT:1 + chr2R 18885050 3' + Doc4-element 121 1 83.17 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACC:1 - chr3R 13225515 3' - hobo 49 1 73.27 TATTAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGAGTGCGATTCGTAAGGATCCTCGCTGAAGTCGCCAAGAGGACGTGAGGGAATCAACCACGTGGCAGGAAAGT:1 + chr3R 15713537 3' - INE-1 546 1 74.26 TTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGAGCCACCAAGCCGGATGAGTAAGAACGGTGGAGCGGAGGGCGCA:1 - chr2L 9274212 3' - springer 446 1 56.44 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGCTACAGATACGTTCCCATTCGGAGTCGGATTCGT:1 + chr3L 447375 3' + Tabor 7300 2 52.17 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTAACTGTATCTAGCTATTTATTTTGTGACTCGAGTTGGCAGT:1 - chr3L 16673577 3' - 1360 34 1 63.00 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTAGGCCCAAGAGCACACACACACACACACACATACATAGA:1 + chr2L 9313987 3' + hopper 1377 1 59.41 CTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTTGACCCAAGTCCAAG:1 - chr3L 10557563 3' + 412 7526 2 58.42 AGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTTCCGGACTCGAACGTGTTTGAAACAAACTCACACTCGATAA:1 - chr3L 23295743 3' + X-element 4310 1 59.41 GTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAG:1 - chr2L 23372503 3' - gtwin 2 2 77.23 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGAGCTGCTAGCA:1 + chr3R 8191545 3' + mdg1 7444 2 58.43 AANTCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGGCAAAGGATCATGTGCTGAGTTGTTTGTTGAATTCAAAAGTATGTGCATGTTGGGTGTGGAGCAGGCTGATA:1 - chr3L 25401042 3' + transib2 2822 1 77.23 TGGGAAAAGCGCTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTG:1 - chr3R 28443705 3' - Burdock 6173 2 76.24 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCC:1 + chr2L 6184227 3' + roo 350 2 83.17 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGT:1 - chrX 18353557 3' - jockey 4717 1 69.31 ACNGTGCGTGCGCAAAGAGGACGCACCGTCAATTAACGGCACAGTTATTAATGCAAATGACAGTCTTTTTGCCAGCTGCTTTGATCACAAAAAAGGCAAGA:1 - chr3L 14197908 3' + gypsy8 237 2 63.37 GGATTGCCCTACCCTACCTATGACCGCTTACCTTAAGAGCATGGCTGTTGTTAAACAAGCGAAACTTTGTGCCCGATAATGATCTACATGGGATTGCGAAG:1 + chr3L 16490569 3' - Gypsy12A_LTR 1956 1 59.41 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCAGCGGAAATTGTGTCAGA:1 - chr3R 29423512 3' + roo 9030 1 69.31 TTNTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGTCATGTGTCTGAACCTCCTGCGCCCTTTTT:1 - chr2L 9313922 3' + hopper 1400 2 58.70 GGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATTTTACATACAATAAATTTAGATCGCAAAATACCAAGTAACAATATCTTATTCAATAATACAATATA:1 - chr3L 7333369 3' + Juan 4206 1 68.32 TATATATTTTTTTAAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCACACACACACACGTACACAAAACAGATAAATGGTAGCAAGTTTTTAACAACACCAACGG:1 - chr2L 12212757 3' - mariner2 782 1 58.42 AGGCGTCAGAGACGCCATTTCGGACGCGCAGATGCATCCGAAAGTTTGCCAGCCAGCCAGACATTCGGTGCGATTTATGTGCGAGTTTTGTTTGCTCTGTC:1 + chr3L 10318250 3' + aurora-element 410 1 73.27 GANGTAGGCCGCTCTCCGTCAAGGAGAAAGTCATCGGCAGCTCGATGGGCGTTGTGATCATTCTTCATTATTTACTAAAACGTAGAATGATTTCTACTGGA:1 - chr3R 6701279 3' - baggins 480 1 70.30 CTCAGGATCTATAAAAGCTAGTGTATGGTAATAAAGATATGCATCGAACTAAACTAGACAATTGAAGAGTGTCTCGACTACCAGCTACCCC:1 + chrX 19679412 3' + INE-1 153 1 73.63 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGACAAAAACCAA:1 - chr2L 17269774 3' - hopper 29 1 53.47 CAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTTGACATCCCCAAACAACAAAAGGAAAAGATGCGGCGGCCGAGTAATAA:1 - chrX 5110862 3' + Chouto 488 1 65.66 GGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTACGATATTCCCATAACAGAAACAATTATATAACCAATAACTATATCGAGCTAGTCAAACAACTGAT:1 + chr2L 14093907 3' - F-element 312 1 66.34 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAGTTTTAAATGGAGTT:1 - chr2L 23313643 3' + S-element 1712 2 77.00 GCNTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATCATCATTAAAAAGCATCGTTGCAGGGCAGGCCTTTAAACTCGCAGCAATTCGTTTTA:1 - chr3L 963004 3' + jockey 4967 1 46.53 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAGGATCGTGGTCCTCATTATGCATGCT:1 - chr2L 19602831 3' - hobo 14 1 63.16 ATNTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAAGGAAAAT:1 + chrX 19053029 3' + roo 9024 2 75.25 GGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAATAATATTCAATCACTCTTATGCTCTGACACAACGGAATCACCACATTTTTGACTTTGTGCATTGTTTTTTTC:1 + chr2R 24208934 3' + Juan 4206 1 67.33 AGNCAGCTAAGCGAGTTATACTGTATTGCATTTTTGGATCCTAGTGATAACGGGTTCCATATATTTTCTAATATTTCTCCGCTAAATAGACAGGAATAGCA:1 - chr3R 12375121 3' + pogo 2099 1 79.21 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTGCTACTTTCTAATTATTATTTAACCCATACTTTGCATGCGATTATTATTTTTGTGTTACACTTGC:1 - chr3R 17674296 3' + blood 7380 2 67.33 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGGCATACAAAAAAAATACACGGGGG:1 + chr2R 18356252 3' + P-element 2849 1 40.59 TTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTTATATATTTTTCATTAGCTTGGTTTAC:1 + chr3L 27392418 3' - invader4 396 1 71.88 GTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATA:1 + chr2L 8691297 3' + Cr1a 215 1 56.44 TTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGGCTTCTTTTTCATTGAATTGACTTTGGCCTGGCTGAAT:1 + chrX 13898472 3' - I-element 416 1 62.38 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATA:1 + chr3R 13437249 3' + hopper 1402 1 66.34 TTNTTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAATGGAAAGTGGAAA:1 + chrX 22745731 3' + copia 240 1 63.37 TTNTGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTACTGCTTATCGACATCTCCGGCTGCTG:1 + chr2R 20411938 3' - Quasimodo 39 2 71.29 TAAATATTTTTGCCACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATAAGCAGAATGTTAAAGAAGAACCACTGGCAATAACCCAGTTTAATTACTCGAG:1 + chr2R 5827080 3' - Tc1-2 198 1 61.39 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAAATAAACAACAATTTTACTATATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGA:1 - chr2L 12283964 3' + 297 6928 2 75.25 CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCT:1 + chr3R 6611291 3' - HMS-Beagle 17 2 62.38 TTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGCTTAGAAATTTAGATGTCTGAATCTATTATGCCATAATTGCGATGAATTTTTGTTTTGCGCAT:1 - chr3R 3179234 3' + 1360 298 1 56.44 TTTAGAAACGAAAAATTTTTTTGTAGTTTTTGAATTGACACTTTATAAAGTGATCTACATCAACTTTTAATGAGTATACCAAATCGAACCAAATCGTTTCT:1 - chr3R 26262990 3' - Stalker4 6872 2 78.22 GTGCGATACACGGCAACGCCCCCCGGTCGTTTGGGAGGAAGGCGTGGCCGTGGGACCAGTGCGAAGCCAGACAGACTGAGGGCTGCATAA:1 + chr2L 9031925 3' + Cr1a 4400 1 70.00 AAAAAAAAAAGAAAACAATGATTAAGATCGGTTCTCTATCTATACATTCGACAGAAATTCGAAGTCCAATTGATTCGTGGGAAAGATTCCTTGCTAAAAAC:1 + chrX 4398864 3' + transib2 2641 1 92.08 TGNATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATGGGGGCCAAAGGGGCTAAAGGGAGCAAAAGGGGCTGTGGTGCCATAGTAATTAAAAATCTTCAACTCTCGT:1 + chr3L 14363627 3' + invader2 310 1 75.25 ATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGATACGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTGGTGTTGTGTGGATATGTTCG:1 + chr2R 10523100 3' + invader1 3664 2 79.21 AGCTAGAAGCCTAAGATTTAGTTTTAGGCATCTAATAGAGTTCATAAAAACATGTGAAAACGTGCTATGTTATGCGTGCTATCAGATACCCGTTACTTAGC:1 + chr3R 29588498 3' - Transib5 2931 1 49.50 GTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGATTTAATTTCAGTTGATTTCATGTGTGCATTGCCGGATGGTTATCAGAAAACGAATTT:1 - chrX 1642669 3' - I-element 455 1 65.35 GTTTTGCCAAGGTGATAGTTCAATAAGCCACATATTAAAGTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAACTGCTCTAATTTACAACTACCATAGTCTCTGGTAT:1 - chr3R 1546661 3' + I-element 5015 1 65.35 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCTTTCGGGCCACACACTCCTGTCGCTGTCGTTGTCGTTGTCACTGTCA:1 - chr2R 18005551 3' + hopper 1413 2 71.29 CCNCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACACGTTTTCGGTAAAAACGAAAACTTTTCTATTTCCGAAAGGAAAAGTTTT:1 - chr2R 16908727 3' + diver 201 2 52.53 TTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGT:1 + chr2L 22243413 3' + 1360 3330 1 76.00 AAGAACACACACACACACACACTGATAGCTAGCCAGGTGTGTGGACTGACTGGTCTGTCTT:1 - chr3R 30357842 3' + accord 181 3 80.33 TCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAAGCTCCTCCAGCAAAGCTGCAAGGA:1 - chr2L 11764852 3' + roo 411 1 74.26 AGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTCTTCCGTCCATTTGCCATCTCTCTCACAATTCCCATGTAC:1 + chrX 7368588 3' - accord 7214 2 60.40 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCATCGAAAAGATATCAGTATCGGGAGTAAAATAAAAGAAG:1 - chr3R 6776508 3' - copia 4875 2 72.73 TGGTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGT:1 + chr3L 24916690 3' - Porto1 148 1 56.00 CTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATTCTTTTGCTTGAGGGAGGAGCGTATCCCGTACTCGTTGGCCTGTTCCTGGGCCTGC:1 - chr3L 13464844 3' + invader2 4956 2 62.38 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAGGATCGTGGTCCTCATTATGCATGC:1 - chr2L 19602832 3' - hobo 21 1 58.42 TTTTTTTTTTTATTTTTTGTATCCCATTTTTTATCCAAAATTTTCTTGGCCAGCAGCACCT:1 - chr3R 22232916 3' - G2 3074 11 90.16 TAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATCATTGTTTAAAACGTAAGACAACCCATTGAATTCCTTTATCGTTTGGCATATCGAATTCACCTGCAAT:1 + chr3L 24947354 3' - Chimpo 172 1 72.28 ATNTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTT:1 - chr3R 10030721 3' + BS 5056 1 59.41 AGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTCAGAATTAGAAGATACGGTGGGAGAACGTCTCAAGAAAGGCAAGTTAAGGGAGAGCAGGACTGTCCGC:1 - chr2R 3463305 3' - springer 7437 4 62.00 TATATACATACATACATTACATACATACATACATACATTTGGGTAATTTAATTATTTTTTGACATATATTAGGGTATTTAAAACTGGCCATCTGTT:1 + chr3L 14284652 3' - 1731 94 1 67.71 TCNACGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTTTATTTATGGAATTTTTCAAATATTTCCACAAAATTTTAGTTTTTAAATTAAAGACACTTGGAC:1 + chr3R 19952404 3' + roo 9058 1 66.34 ATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTGTTTATATTATTATTTCAATAAGTTGCATTGTTCTTATCACA:1 + chrX 15117801 3' - Doc 4672 1 58.42 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAG:1 + chr2L 6184231 3' + roo 357 2 78.57 TTTCAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCTGGTCATGATTTTTTAATAATTATTTTATTTTACCATAATTCCTGTTTAGAAGCGACAATGAAAACTACCCAA:1 + chr3L 12941919 3' + 1360 3018 1 63.37 ATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCAGTGCATAAAACTGAATGCATCGCATT:1 + chrX 12426621 3' - I-element 245 1 73.27 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTATACAACCGTCGTAAAAGTTTCCATTCGATTTGATGGAAAGTGAAAATGCGCCCAGAACAGTTAGT:1 + chr2L 8841154 3' - P-element 5 2 75.25 CTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGGGCGGGTGGTGAGTGGGTGTTGTGGGTTCACGGGGGCATATATCATGTTGTGGATGGGTTTG:1 + chr2R 22335902 3' - accord 258 2 70.30 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACTTTACTTTGCTCACTGATTTTATAATCTGTTGTCATCAT:1 + chr3L 11156293 3' + 297 6942 2 65.35 TTNTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTATAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - X-element 4719 1 73.27 CANCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAAT:1 + chr3R 9322876 3' + 412 7505 2 62.38 AGAGACCCGAGGACGGCCCTCGCTTATTTTGTATTTTGAACCCCTTCTGTAATGGTTTATAGAAAAAAGCGTGCCAATCAAATGCAATATCTTATGTTTTG:1 - chr2L 8254840 3' + gypsy9 4977 1 69.31 AGAACATAAATCTCTGTAAGGGTCACACTGCGGAAATACTAAGATCATCGAGTGGCAACGCCGCACAAAAAAAACAATATCGGAAGGTGAACACAAAGG:1 + chr3L 25479190 3' - Cr1a 4183 1 79.80 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTC:1 - chr2R 17077849 3' + Tirant 363 2 75.00 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCTATGGACTAATCAACAGTTACCTAACTTAACTTAAAATAAAGTTATTTTAATGCTAAACGGCAGCCCT:1 + chr2L 18754471 3' - roo 7 2 72.28 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATA:1 + chr3R 9322877 3' + 412 453 2 62.38 CTNTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAAATCGATCAATTAGATCTTTC:1 + chr2R 19149470 3' - diver 27 2 53.47 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAATTAATACTAAAGAGACGCGTAAAAGTATGCAACGCCAAGTGGCAGGG:1 + chr2L 19602912 3' + hobo 2925 1 59.30 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAAT:1 - chr2R 17938880 3' + copia 220 1 62.38 CTGGATATAGATGAGCCGATATATGAAGAGAACGACGACGCATAGAGCACAGGATATTCCGAAGGTCATTGATTTCGCCACAAATATTCTGAGAGCTTGTC:1 + chr2R 4626626 3' + Bica 4879 1 63.37 AANGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGGATCCAGAGTCGCCGCTCAGGCTGCTTTTCCC:1 - chr3L 19275685 3' + mdg1 7415 2 66.34 TANGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATCCTAGCTAATCCCATCATATCCATTTACATTTATCGCATTTCCCGAAATAACCGAGCAGCTTTGATGTTTCCA:1 + chr3R 29299503 3' + G5 4581 1 69.31 CAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGGGAAAAATATCATAAAATACGAAATGAAGTAC:1 + chr2L 14480239 3' + invader2 212 2 68.32 ATGCGATGCAAGATCGCTCAAATATATACTGTAATTCTTTATTTTACAAAAAAAATAAAAAAAAACGATTATTCCAACGAAAAAACTCAGAGCAAAA:1 - chr3L 14324050 3' + F-element 136 1 64.95 AAATACGGATCATTTGTTCGACTTGAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGAAAGTTGCTCTCTAAATTGGTACAGAAAATGCATTTGAAAAGGTGTACTC:1 + chr2R 14553991 3' + McClintock 6342 2 55.45 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGGGTTTCCTGTGCTAAATCAAGTGTAAAAATTGAGCCTATGGACGTGCCCTTGCCTTTTGTTCG:1 + chrX 8303631 3' - accord 183 2 76.14 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATACGTCAAACTGGTTGCCATTTCTGTGTAAAGAGTTAACTCGT:2 + chr3L 14209090 3' - Quasimodo 28 2 59.41 CCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACTTGTACCCCAACAACTACGACAACCACGTCCACCACAACCACCACAACGACTACAACC:1 - chr3R 25399366 3' + Idefix 19 2 62.38 TTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCTTTACGGACACGCTTCATCATGGTGTCGATGATCGAGACCTGTTCCTGTCCCAAAGTGCGGTGGTCGAAC:1 + chr2L 13527961 3' - Rt1a 4762 1 62.00 GGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACGTGCCCGA:1 - chr3L 7295157 3' - G2 2951 1 52.48 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCGGCGCGTA:1 + chr3L 6442687 3' + roo 391 2 61.39 ACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCTACGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCTGCTGGGGTCTGTCAT:1 + chr3R 14012386 3' + Doc 223 1 80.20 ATTAAAAATAAAACTATAGAAAATTGTAATTAAATAACTAAAAACAAAATACACATAAAGTAAAACAAAAACATGTACACAAAACCGAAACAACACAGAAA:1 - chr3R 6484619 3' + P-element 2691 1 61.39 CGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCTAACCCCTACCCAGTGACACCGCCTGCACCACCTTAACTTCGCAGACCATTCGC:1 - chr2R 7331064 3' + G2 2916 1 58.42 TTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCCGATCTTCATTGTTTTTAATTTGCCAGACATTTTTGCTAA:1 - chr3L 22801932 3' - Bica 490 1 68.32 CANCAATCATTACCTTATTAATTTTTCACATGCCGCAAATACCCTATACCTGGACAAGCAAGCACAGCACAGCATTAAAAACTCAAACTATGTTTAGATTA:1 + chr2R 3877507 3' - 1360 443 1 75.25 TGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCTTCATTGATCAGGGATTTGTTTCAAGCGTATTATTAACGCTGAGT:1 - chr2L 13250962 3' + pogo 341 1 55.45 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTGGCTTTAATCCTCAATGTGTCCACAACTTCGACTTTGGCTGGCAGTTTGTCAATGACTTG:1 - chr2L 9141547 3' + roo 393 1 61.39 TANAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGAGCCACTTTACTTTCGCAACAAAACTGAGAAATGG:1 - chrX 17729046 3' + hobo 2900 1 68.00 ACTCACTTCGAGCCGATCAAAGCTCTGTACATAAGCATGGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAATCCAATGTTAAGTATTTTCGAGCAAG:1 - chr3R 26575072 3' + rover 7148 2 47.52 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTGAGTACTCACTTAAACTAGCGCATTTATTTGAATTGATTGAAATATAAAAGAGAAAAATA:1 - chr2L 14255601 3' - pogo 13 1 62.38 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACTTCCACACACATCCGCACCCCTGCAATCCGGACTCAAACAGTCGCACTCAGATACAAAT:1 + chr2R 10871464 3' + 1360 3182 1 63.00 AGNGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTTTAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCAT:1 - chr3L 20224122 3' + Chimpo 183 1 74.26 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGAC:1 + chrX 21564743 3' - diver 5916 2 56.44 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAATCCTTGGATTTGTATTTGTATGCGTGCTGGTGTGAGTGCGAGTGTGGTT:1 - chr3R 19560875 3' - hobo 25 1 54.46 AATTTACTTGGCTTTACTTTACTTTTCTTCTCTTTAATGAAGAAAAGAGTTTACTTATGCCAATGCCTGCAGAGCCTTGCTGTATCATCAGTTTCTGGATG:1 + chr3L 12805436 3' - TART-A 13130 1 57.43 ATTGTTGCAGCTCCAGCGCCCATTATGCGATCCGGCAGGACGGACTCTCAATGCTATTCAGCCATATCCATGCTCCTTCCTTCCTTCCTTGTCTGCTGCAG:1 + chr3R 19579675 3' - Osvaldo 173 1 72.28 AAAATTCGATTTTTTCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCGCGCCCGACTATGACAACGACATCGAAATGCTTTCCTTCAGCTCCTCTGCCTTTGTGCATTT:1 - chr2R 10763633 3' - FB 15 1 64.36 TAGCCTTAAGGGCAGTCAACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCCCCCAATCTAGGAATAGATTTCACCATAACGAAAATGTTGCATCAGCCCCTAAT:1 + chr2R 973819 3' + springer 234 2 57.43 TCNATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTCTCTCAGTGCTCTCGCGGACAAGTACTGCCTGATAAAGAGGTGAAATCTGTACAGTTTACTTTTG:1 + chr3R 28117839 3' + I-element 5349 1 69.00 TTTTTTTTTTGTTTTGCTTATTTGTGTTCTTCATTGTTTTATAAACATTGATTTAATAAATTTCCGCTTGCAGAAGGAGGAAAAGATTCGAGTCC:1 + chr2L 15032003 3' - Doc3-element 4719 1 74.74 ATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGA:1 - chr3R 19450206 3' - roo 98 2 63.37 ACNTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTTTCAG:1 - chrX 8922325 3' - jockey 31 1 52.48 CTCGTGGGTTAAATATGCAAGGGAACGGAGCTCTCTTAATATCTTTCCGACTCTTTCGCTCCTTCATCTCTGCTTGTGTGCATCCTACATTTGCATGACTG:1 - chrX 20231780 3' + Rt1c 5121 1 70.30 CANAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAAAGTGCGAGAGGCAAACGAAAGACTCAAGCGCGC:1 + chr3L 5571172 3' + Quasimodo 15 2 62.37 TCAGCGTGGAGGTTTAGGGGGGTGGGGAAGTAGTGACGTGTGCCCTCAGCTGGAACTATTTTCGAAAAAAAGTGGCTCCGATGTTGCCAATGATTGAAG:1 - chr3L 7883657 3' - gypsy5 110 2 38.38 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTCGAGGTCTACCCTGAATTTGTCCTTGTAAGTGTGTGCTTAG:1 - chr3L 6522281 3' - pogo 33 1 63.00 CCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAGTGCTAACCAACGTGACCATAACCGACAGCTAGGA:1 - chr3R 777635 3' + rover 409 1 78.22 TGCAGCAGAAAAGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGAAAACGGTGTTTTTGCCGTGTGTATATCCGATCCTTGGGGCACCAGGGACTTGGG:1 + chr2R 17898866 3' - baggins 5197 1 66.34 AATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTGACTTGGCAGTGTTGCACGGGAGCGCTTTCGCAATCAGTTGGAGCTTTGGAAGC:1 - chr3L 913831 3' + invader4 2969 2 53.47 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCT:1 + chrX 4022343 3' + roo 9026 1 72.28 TGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 4988 2 54.46 TGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCA:1 + chr3R 9192586 3' + invader3 249 2 56.57 ATNACGCAATAAGTTTAAAAAAAAGAAAAACCTGG:1 - chr3R 23743981 3' + Doc2-element 4764 1 91.43 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTAAGCATATAGTTGATGTTGATGCTGTTGCAGTTGTTGTTGCAGGATATCCAGCGTGTACGCG:1 + chrX 12633178 3' - Doc 20 1 45.54 AGNGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCATCGCCGGCATTTTCGCTCGCTGTTTTGCCAAGAACACCGCTGCCTACTTTGTTTTCACCTGTTT:1 + chr2R 8314238 3' + hobo 2930 1 70.30 GCNAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACTGAGAGAAATGATTTGAGCTAGTATATGGAATTAAATATCA:1 - chr3R 28117761 3' - I-element 35 1 60.40 TTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCGACGATTGACTTGTGATTGACTTAAACTTAATATGTTTT:1 + chr3R 778463 3' - F-element 168 1 61.39 AACATGTTCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCAAGGAGCCAGATCCTTACTTTGAGACGTTCGGTAAAGGGAAAGGGATATCGCGT:1 - chr2R 554067 3' + 412 122 2 60.40 ATGCTTTTATTTTAGTTTATTTAATATTGAAAAGCATTATCTCTAATTTCTCTTAAATTTCAGGCACATAGCGGTAATAGAAACATAGCACTACACACAAA:1 + chr3L 18520965 3' + transib1 1897 1 79.21 CAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATAC:1 - chr3R 4504065 3' + INE-1 541 1 53.47 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATTGCATCTATATGTGGCTC:1 - chrX 9983647 3' + pogo 2073 1 71.08 TCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTAAATAACATTATTTAAAATCAACGCTTTTGGCCATCCTTTAA:1 - chr2R 5701503 3' + S-element 1687 1 59.18 TTTAGATGTTTTTCTGGAGCATAGCTCCGTTGATTTTTAACGTGAAGTTCGTCTCAGTTGTAAAGCTTTCCCGTTCTTTACAATCGTTATTATTAATTTGT:1 + chr3L 20994459 3' - gypsy11 4390 2 63.37 CTCGGATCATCCAGATATGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATTGTTCAAGCAGCGCCAGTATGCTGTCTCGGCAGCAACAGAGAAGCTTATGTATGTCGAGCT:1 - chr3L 25264118 3' + Burdock 5967 1 65.35 GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAA:1 + chr3L 14854754 3' - Quasimodo 40 2 72.00 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTT:1 + chr3R 24430578 3' + Transpac 265 2 70.30 CGNCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCCGATATTCCCTCAAACCAAATTG:2 + chrX 19810597 3' - INE-1 550 1 76.24 TTCTAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGACAAAATCACGGATTGCTGGAAATTGAATTT:1 + chrX 17997103 3' + HMS-Beagle2 481 1 45.61 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGCATGCCGATGTGCACGGGAAGGGGGGGAA:1 - chr3R 28288600 3' + 412 449 2 68.32 AATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTGTTGCTGTGTGGGCGGTGGGGCGGAAAGGGATGGGCGTGGCTGATGAGAATGGCCCGAGTTGTTTACCCGG:1 - chr2L 11632236 3' - accord 7030 2 59.00 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGCCTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTCCCCCGGCCAAAAGTGTTGAAGGCAGT:1 - chrX 4448551 3' + 412 7506 2 69.47 ATTGAGAGACTAAAAATTTCTTGCTCAGACAGCCAACATATGATACATTATGTACAAATTATGTACATTATTATGTATTTACTTTCCTCCTTAGTTTTTAC:1 - chr3L 14585810 3' - Tc1 132 1 39.60 TTTCTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGCAGACTGGTGTAAGCGCCTGTGTAAAATGTGGTTCACATTTATTGGTAGGAGGTATGGGGGTTATGGAACGGCT:1 + chr2L 3984407 3' - Doc2-element 245 5 85.15 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGTAAAATAATTTTTACTTAAGATAATGTTTTC:1 + chr3R 2425649 3' + 1360 3369 1 62.38 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGC:1 + chrX 9439838 3' + roo 9064 1 61.54 ATNAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCTTGGATTCAAAT:1 - chrX 6654439 3' - jockey 4750 1 54.46 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGAT:1 - chrX 13640666 3' - P-element 56 1 21.00 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCCATTGAATTGTTGATGAAACCCTTTCAAAT:1 + chrX 20999781 3' - BS 34 1 64.36 GCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCCATAAGCTTCTCTGTCTGCTGCTCTGCCTGGCGCTC:1 + chr3R 11510917 3' - R1A1-element 279 1 74.26 GTCGCGNGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCTTTGCGGCCCATTAGCCAAAT:1 + chr3R 9297078 3' - hobo 56 1 75.25 TTATTATTATTGTTATTATTATTTCATTCCACATTCAGTGGATTTTTTTTATTTAACACTAGAGACAAAGGAACACGAACGCGGCAATTAAAAAATAATTA:1 + chr2R 9263890 3' - mdg1 26 2 75.25 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAAAATAGTTCCTATGTTAATATATAAATACAAAAAAAGTAATGAAATCAA:1 + chr2R 969218 3' + mdg1 392 2 55.45 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAACGGTAACCAACAAAGAGGAGGAGCCCAAACTAATGGTCGTAGACCATGGAGTT:1 + chr3L 19861710 3' + 1360 3368 1 58.42 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTTGCAGTT:1 + chr3L 1259244 3' - Doc 19 1 60.00 AANGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTCTCCGGCTGGAAAGTAAGCACTGTGGGGGT:1 - chr2L 8297302 3' + Tirant 8497 2 70.30 TGNCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGCTGGCGTAGTCGGGCTCGTTTT:1 + chr2R 9658384 3' + P-element 2867 1 40.58 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCA:1 + chr3R 9322874 3' + 412 450 2 65.35 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATATAATTATAATATAGGAGAAATCAAAAAAAACTAGATGATATATGATTTTTTACTAATGCGAGTGTT:1 + chr2L 14365487 3' + blood 371 2 67.33 CCGAAGNTATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGATATCATCATTGGTTGGAGTT:1 + chr3L 17172707 3' + roo 9018 2 75.25 GCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGCCTAGCCTTGAATGGACGAAATTCCTCGTTAACAG:1 + chr2R 1265482 3' - F-element 4341 1 65.35 ATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCC:1 + chrX 19810562 3' - INE-1 569 1 55.29 CTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCAATTTTGGCCATCACTAAAAAATTGGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - 1360 90 1 79.21 CANATTGCGGGTACTTACAAACACACCGCATAAATCTGCAAATGCAGATCAATACGGTACTCTGCGTCTCGAGCGCCGATAACACTCGGCACTCATAACGG:1 + chr3R 1465946 3' + hobo 79 1 51.49 TACACACGAGGACGTGTGCTGGTCTGAAAGGCGGGACAGACGCTTCATTCATGCCACGCGCATCTTGCGCTGTCGACATTTAAAATAGACGCGAAACACG:1 + chrX 10820885 3' + invader6 4459 1 79.00 TANATAAATAAACGCACGCTACAACAACAAAAAATATATATTGATAAGCACGGGCATGGGAACGAGGCGGATTAGCAAAGCAGAATCGCTCTTGGAAACTT:1 - chr2R 13745973 3' + G6 2016 1 65.35 ACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGTAT:2 - chrX 14040718 3' + roo 8600 1 60.40 CGACTATCAGATATCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGATATCGATAGATACTGGGGAATAAAATGGTCGTGACCGTTTTGGGCGTATTGTAG:1 + chr3R 23891338 3' - INE-1 550 1 55.00 CTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGACAGAAAAACATGTTCTAACACCTAGGCCGTATGCAATGATGAACTTAAAGAAACAGAAGCATATTTCTACAA:1 - chr2L 11013307 3' + 1360 3297 1 81.19 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACA:1 - chr3R 17665968 3' + Transpac 294 2 59.34 TTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAAGTTTAACCGATAGCCTACCGCC:1 + chrX 4332967 3' - I-element 263 1 81.19 TCAATAGGTTATGGGCCCAGTCACATTTTCGACCAGGTGGTGAAATATTTTAATTGTGCAAAGAATATAATAAATAAATAAATTATTGAATACAAATACAT:1 + chrY 357863 3' + copia 271 1 73.27 CGAGGCTCCACTTTGCAGCTTGATAAATCATGATATTTAACATTACGTAGAATGCAAAGCGGATTGATGTTGTCTCCGTGCCATTTGATTTCTTTTTGAT:1 - chr2R 19541616 3' - Chouto 6242 1 75.00 TTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCACAACTGTCTCTTTCCGTCTCTTTCCCGCCCGCT:1 + chrX 13516771 3' + Doc 300 1 64.58 CTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCATTGATTTTTCATTTTTTCTTTATTTTCAGCTTAAACAAATTG:1 + chrX 6082670 3' + roo 409 1 77.23 CTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAAAACCCACCGCGTTCGGAACCAAGCCTGCGTGCTTAACCGCGATACCGTACAGTCTATGTGAGCGAGTGCCAG:1 + chr3L 23452263 3' + rooA 7544 2 74.26 ACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATGTGATTCACTCAGAGCTGACTCATTAATTGAGACCGGTACTTATCCGTGTTAAGCGCAATAGCTTAACAG:1 + chr3R 7761345 3' + flea 252 2 77.23 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCG:1 - chr2R 544791 3' - HMS-Beagle 24 2 55.45 GAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTCTTGTTCTGCGGATCATAGTTGAGGACGTCG:1 - chr2R 23233773 3' - Doc 423 1 69.31 TCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAAAAAGAACAAGACTAAACGGAGCACATGCAAAAACAAAAACACAAGCACAAACAGAAG:1 - chr3L 18376466 3' + F-element 389 1 67.33 GAACTAATGTCCCGTCAGATGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATTATCGGAGAAATAGTTTTCATGACTTTTTGTAAACAACGCTCTTTAATTCA:1 - chr3L 25626524 3' - 297 6946 2 76.24 TTNCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTG:1 + chr2R 9500039 3' - G5 4730 1 58.42 AGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTA:1 - chr2R 544772 3' - HMS-Beagle 6801 2 74.26 TCATAATAAATAAATAAATAATAATAAAATATTCCACTCTTGTCTCCGTCCCCACAGGACACGCAGCAGCATCAGCAGCAGCATCAGCA:1 - chr3L 14125816 3' - copia 227 1 79.78 TCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGAGTTCCCAGCACATGGAAATCGAAGCTCTGGACTCAGAGGAAGACAATATCGGCGGTGAAGATC:1 + chr2R 13509902 3' - F-element 286 1 74.00 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAG:1 - chrX 7768924 3' - hobo 40 1 67.33 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACACTTTACTTTGCTCACTGATTTTATAATCTGTTGTCATAATTTCATTCAAGGGTATAATTATTTTATGAA:1 + chr3L 11156322 3' + 297 6971 2 76.24 CTTGTACGTTCGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTGATTGATGGCCTGGATAGTTGGAATGTACAAATGCTGTGTTGTCACT:1 - chr3R 24682980 3' - I-element 350 1 52.48 TTTCGATCCGTCCACTTCCGCACCATGGGCAATCATCCTCCTCCTCCATGACCCGTCCTGTTCCGCTCTTCCATCATCATCGATTTCGATTTGGCCCGTTT:1 - chr2R 15239842 3' - Rt1c 5080 1 64.36 TTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACTTTCTTTTTCGAGAAAACTTTTTGCTTTCCTGCCGGATTGTGCGTGCCCCTTTGCTTCCCGTTGCC:1 - chrX 1603052 3' + Doc 296 1 68.32 CGGCAGGAAGCCCGAAGGACACAGAAGGAGGATCACTATAGCGAGGAGAGATCCTGGGAGTGAGGAGAAGGATCTGGCGTGTTGTAAGGGTCAGCGGAGTC:1 - chr3R 3380098 3' + gypsy8 489 1 83.17 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATACTCTATAAGAAGAA:1 - chrX 4022290 3' - roo 8698 2 61.39 GCNGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGGGCGCAGAAAAAAACACAACCGTTCGCTTTAAAAGGGCCACGCTCACACTTTACTCTTGCCAATTACTAT:1 - chr2L 22534391 3' - Cr1a 47 1 64.36 ATNATTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATGGCGGCAGCTTGTCGATTTGCACAAGTATTACACTAATAAATTGTTCGCTTTTCGCCGCCGCCTTTCAGTTCAGT:1 - chr2R 18031756 3' - HeT-A 255 1 76.24 GATAGACGCGATATAAAACAGAGAACAGAAACAAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTGTAAAGCATTACGTACTTTCCATAAAATTAATAAATGGAAA:1 - chr3R 19496152 3' - Cr1a 4359 1 62.38 AAATAAAATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTGTCCAAATA:1 + chr2R 5202360 3' + roo 9032 1 61.39 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAATTAATACTAAAGAGACGCGGAAAAGTATGCAAC:1 + chr2L 19602898 3' + hobo 2897 1 68.00 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAATGGGTTCTTCAAAATATTGTGTTCAATTCACAATGTACGGATATGAA:1 - chr3L 8656949 3' + pogo 2077 1 55.45 CTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATAATAAAATATTCCACTCTTGTCTCCGTCCCCACAGGACACGCAGCAGCATCAGCAGCAGCATCAGCA:1 - chr3L 14125816 3' + I-element 5345 1 70.30 CGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAAC:1 + chrX 22782056 3' - I-element 4905 1 72.28 ATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAATGTTTGTCATGTT:1 - chr3R 9127371 3' - invader3 5226 2 62.38 GCTTGCTATGGAATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTTTCTTTGAATGTTTTCCCTGAGTCCTGCACAGCTGCGC:1 + chr3R 30355063 3' - F-element 4439 1 76.24 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTTTTTCGGCAAGTTTTT:1 + chr3L 23821881 3' - HMS-Beagle2 7 2 72.28 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCAT:2 - chr3R 6776545 3' - copia 45 2 73.27 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATAAATATTTGATCGAATATCAGGTCTATGTAACATTTTCGTTTCTTGTTGCCAGCAAAAGGCTGAGTAAAAA:1 + chr3R 15744628 3' + pogo 2100 1 78.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAAGGAAAATGAAAGATAAGAATATGATAATATAACATACCCA:1 + chrX 19053062 3' + roo 396 1 61.62 AANAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTCCACTTACACATTTGCGCCGCAAAATGTTGC:1 + chr2L 17269872 3' + hopper 1409 2 77.23 AGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGGGGGGGGAGGGGATCGAAACGCTGCTGCTGCCTCTGCCTATGCCGCTGCCGGCGTCGCAGTCGGCGCAGG:1 - chr3L 18795856 3' - Cr1a 290 1 60.87 AANATTGATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTCGAAAAATCATTCCATGTTA:1 - chr3L 12572619 3' - Juan 4055 1 48.51 AGAAGATTTAAAAGATTTCACGTGCTAGATCTCCCCGACAGGTTTGCTCCTGTCGGTAGTTGATTTTACACAAGTTCACTACGGTACTCACATCGGCTTTT:1 - chr3R 6684416 3' + G4 3681 1 61.39 ATNTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTGACACGGGGCGAGTGTGCCACCAA:1 + chrX 5649443 3' + S-element 1702 1 65.35 TTACCGGCAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCA:1 - chr3L 13878073 3' - flea 4812 2 75.25 CCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGGTTGGCATGGCTTTGGTTATGAAATTTCACATTTTCTTGACATTTACTGGCTACAATTT:1 + chr3L 7964180 3' - G2 142 1 63.04 TCCCTGACATCTCGCAAGCAACTCCTCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACAGATAAAAATATTCGTTTGCAGGAAATGTTTAAAAAATGTCTTTATTCAGT:1 + chr2L 17118086 3' - Bica 31 1 52.48 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTC:1 - chr3R 26140749 3' - 412 7084 2 61.05 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGAGCTTCGGGCGATAAAGAAGGAGAAATATATAAAAATAACAACAGCAACAACAGTGACTGAGG:1 - chr3R 25514796 3' - hopper 14 1 63.37 GTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAG:1 - chr3L 23933562 3' + Cr1a 238 1 70.30 GAAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGGGTGAACACACAGCGCATTCAGCGGGCAAAG:1 - chr3L 6442629 3' - roo 16 2 63.33 AACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATTATTTGAT:1 + chrX 4175144 3' - I-element 330 1 57.43 TAAATTAATGATAATGAAAAATATGATAATAATTATTACCCCGCTGACTTATCCTTTTTTCCCACCTTTAGAAATCAGTCACGATCTCCTCAAAAGTAACT:1 - chr2L 20086099 3' - Transib5 2581 1 41.58 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATATATAAAGTATATATACGAATTTTTCTTGGTCATTAGAATAGACTGTTATAAAAAAATAATAT:1 - chr3L 20324666 3' - 297 5 2 73.27 CTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTTTTAACAGATACTACGCCATTGTGCGTCCACTGGAGTATCCATTGAATATGACACACAA:1 - chr3R 12519391 3' + opus 91 2 68.32 TCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGAATTATAATCGTGTTTCGTGTGGTATTGCGATTTAAATTATGTGGCCAAGGAAGAAAGAAA:1 - chr3L 21918215 3' - Quasimodo 49 2 65.35 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGTTTTAAATATATTTATATGTAATC:1 + chr2R 18434511 3' + 412 443 2 74.26 CGNAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTT:1 + chr3R 10030782 3' - BS 5029 1 53.47 ACNAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTTCCACAACCAGCTTTCTTTCATGTTGATTTAT:1 - chr2L 12398109 3' + roo 398 1 68.32 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATAT:1 - chrX 12657098 3' - blood 27 2 54.46 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATTACATTAGATATTGTGATACTAAGATATTTTATTAGATGAAACAGCACTCGAAGA:1 - chr2L 1590747 3' + opus 7483 2 59.41 TATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGT:1 - chr3L 23933642 3' + Cr1a 178 1 72.28 GTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGCATTGGCTGGTGGCAAAATTCCCGAAGGCGCCGAGGTGATCCTAAGCTGTCAGGCCGACGCCAATCC:1 + chrX 3130224 3' - ZAM 7991 2 76.34 ATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGTGTTATTTTGACCCTTCGATTAGCCTATATCATTTGAATTAAATGAAAAGTTAAGGCTTATTTTTGAATTATCAT:1 - chr3L 20986986 3' - roo 8664 1 75.25 ACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAAACACACACACGCACACAACAACAAAACACTCAGATACATGGGAAAAAAAAGAAAGAAAAC:1 - chr3R 14177265 3' + F-element 484 1 67.68 AGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGCCATTATTGTTAGAGTTGCTTTGTTGCTACTGCTCGCTTTTCACGCTCCCGC:1 + chr3L 22196051 3' + invader4 2618 1 56.44 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTAGGCCCAAGAGCACACACACACACACACACATACATAGAAAGA:1 + chr2L 9313991 3' + hopper 1381 1 55.45 GGATTAGTCTGCCCTTTTTTTTCGGGAACCAATCAAGACTGCACATCGGCTC:1 + chrX 418811 3' + aurora-element 36 1 59.62 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGA:1 - chr2L 19644879 3' + blood 334 2 63.37 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAG:1 - chr2R 18723052 3' - opus 45 4 76.24 GACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCTAAACTACACTACAAATTATATTGGTATAAGTTCTACGCAAGCTAAGCTGCCTTGCACCAAAGGCAGTGGC:1 + chr3R 30365031 3' + F-element 4397 1 73.00 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTA:1 + chrX 8027464 3' - Juan 41 1 63.37 CACCAACGGTGGCACGCGCCGCAGTTGTGACACACTACTGGAAGTGCAACTACACTCTCCACGCGAGGGCGGCCGAAAACAGACGGAGCAGCGAGAGCATT:1 - chrX 21019096 3' + baggins 41 1 77.23 CTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATTGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTT:1 - chr3R 460085 3' - F-element 99 1 63.64 GAACGATTCCTTTTAAATCCAAAACAAATAGAATGAAGCGAATAGGAAAACTAAAGGGTTTAGCTTAGAAATTTAGCAACTAAATATGTGATTTTCATTGT:1 - chr2R 9499981 3' + G5 4809 1 55.45 ATGTACTATATATATGTATATACATATACATAATACATAATTAATTAATTTCCAAAAAAGAATACAAATGTTATGGAGAGCGAGAGCATATATTCTTTTAG:1 - chrX 7256825 3' + 1731 4406 1 40.59 GTNCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTCCAGCCCAAAACTCT:1 + chr3R 26434753 3' - Tabor 6872 2 54.46 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTTTGAAAGATTAAAATATAATTAGAGTTGGGGTAAGGGTTAATAACC:1 - chrX 20331809 3' + mdg1 7431 2 54.46 CTNGATATATGCACATACTACAATATATATGGGATTACATTCAGTAGAAATACCCGTACGTCGAAAGAGTTAGTTAAATAAATTTTCAGCTATCAATGATA:1 + chr2R 9789034 3' - blood 7012 2 78.22 TGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAACAGCAACATATTGGCTGGAC:1 + chr3R 24245891 3' + roo 9019 2 76.24 TCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGT:1 + chr3R 15790089 3' - flea 4721 1 66.34 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAAGAGAGCACGTCGACTGATTGCCATTGTTGAGGACAGTTGAGTGCGCTTTCTTT:1 - chr3R 24738997 3' - pogo 19 1 58.42 TANAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCTTCTCTTCTTCTCGCACTCCTCGGGCACGGCTTTGCCGGAGGTGACGCCGCCGTCCGACGCGGGTCC:1 - chr2L 10357702 3' + accord 312 2 74.26 GTNTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATGTGCAA:1 + chr3R 17666042 3' - Transpac 34 2 58.42 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAAGACAGCTGA:1 + chrX 10119657 3' - FB 4 1 73.27 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGTTGGAGACTTCAAATGATTTATAGCCCGATAGTTGAGTT:1 + chr2L 2685803 3' + hopper 1407 2 59.21 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCAGGACATCGGTGGTGCTGCGACTCATCAAGACTCGAGGCCC:1 - chr2R 15084927 3' + hobo 2907 1 57.73 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGATTACAAAATGTATT:1 - chrX 7583181 3' - I-element 10 1 69.31 TTACAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTACAA:1 - chr3L 10522042 3' + roo 9028 1 69.31 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTTCCACAACCAGCTTTCTTTCATGTT:1 - chr2L 12398116 3' + roo 9054 2 61.39 TGTTCATAAGAATAGCATTGTCTGGTTTTGACCAACGTAAACTCCCGAAATGATCAATATTTTCTAAAAAGTGAGTTTGATTAAGTTATATGCCTAGATGA:1 - chr3L 13541441 3' + HB 209 1 77.23 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATT:1 - chr3R 26140750 3' - 412 7091 2 64.36 ACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTATGTACATAGCTGTGTATATAAGCCACTTGTGT:1 - chr3L 12096669 3' - Quasimodo 90 2 69.39 GCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGAGCACTTGACGAGATTCATGGAAAACCTTT:1 - chr3R 19560341 3' + hobo 60 1 71.29 TATTTTGCCTTCGATTACATAGTATGCAATATGTAGGTACATAATTGAATCCCTTGAATTATTTACTCGTTGAGGGTTTTGGGGTTGTCGACGAAGGCAGC:1 + chr2L 12145660 3' - TAHRE 10370 1 62.38 GTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGTTTTACCTGACTCACCTGTAATACGTATTCCCCTATCTACTCCAACAATCCCCCCTGCGTCCGACGAACAAGAG:1 + chr3R 18006537 3' - Quasimodo 37 2 55.45 TGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGTTTAACTATTTATAAAATATATCATAAAGGGCTTTTCAAATAGTCAGATTTGGCTAGAAAATAG:1 + chr2L 3234473 3' + invader2 4713 1 67.33 TTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGTCCCTTAAGCACCCTACGTCCGGAGATACATCAGCTAAACCAAAGCACTTTACAAAAAAAAAACTCTCCGCAATA:1 - chr2L 11044234 3' - gypsy12 9882 2 58.00 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACCCGTTCACATGAAACACACATTTC:1 - chrX 6509771 3' + jockey 4966 1 52.53 AAGAAGGGAAATTTTTGATTTTCATATATTTTCGAATTTCAAAAACTGGACGTGGTTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTT:1 + chr2R 5676625 3' - FB 157 1 62.38 CGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGATTTCAAGTTGAATGTCGTGGC:1 - chr2R 19171516 3' + F-element 281 1 61.11 ATTACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGCAATGAATTGAGATTTAGGTAGTGTTGGTTTTGTGTTTTTATTTATTCTACTTACGCTGCTTTCACATTACATG:1 - chr2R 9720032 3' - I-element 5009 1 56.44 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTATTCAATTGCCATTGAAAAAGCTCGTTGGCT:1 + chr2R 4559125 3' + pogo 2063 1 69.31 CCNTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGA:1 + chr3R 19446220 3' + 297 359 2 62.38 TTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATACATGCATTGCTTGTGTTCATTCTCTGTGAATTTTTTACCCATATTTGCTGTCTCTGTT:1 - chrX 13489496 3' - S2 16 2 58.42 AAGCTTCATACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAACCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCATCGCCTCCCACTGCCAACCCACATCTCACCACCCCACCA:1 + chr3L 10120491 3' + F-element 4457 1 56.44 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTAACTGTATCTAGCTATTTATTTTGTGACTCGAGTTGGCAGTACTG:1 - chr3L 16673573 3' - 1360 31 1 61.39 TCCCAGCTATGGGGGAACGCCAGTAACAGCAGCGTAAAAATCATCCAACTGCCCCCCCACTCTGCGCTCTCTCGATGATTATGATGTTGTTGTTGCTGTTG:1 - chrX 13920048 3' + Fw2 3560 1 52.48 GCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTTGGGATGTCGGGTCCAAATTGGCAGAGTTTTTACATTTGATTTA:1 + chrX 20796525 3' - I-element 225 1 57.43 AGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCAGCGGAAATTGTGTCAGAAAAATGATTAAAATTAATAAATGCGTGCGAGCAG:1 - chr3R 29423478 3' + roo 401 1 71.29 AANAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAGTCCGGCACACAACACCAACAATCGGAAT:1 + chrX 6518828 3' - pogo 42 1 68.00 GTTTTGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTATCTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCTTTGAACAT:1 - chr3L 9076565 3' + mdg1 390 2 51.49 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGT:1 - chr3L 10557592 3' + 412 7497 2 72.28 AATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTCTCCA:1 - chrX 22726189 3' + Helena 1279 1 51.49 TGTTTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTT:1 + chrX 8422109 3' - jockey 4811 1 74.26 CAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr2L 20360641 3' - micropia 17 2 63.16 TTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACACAGCATGTTGTGAAGTTGCGGCGCAAAAAGAAAGCACGCGAATAAAACATAAGAAAATTT:1 - chr3R 21618871 3' + S-element 1704 1 67.33 GCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAAAAAAAAGATACTTTTCGATTAATGTAGAGTGGTAACT:1 + chr2L 16507862 3' + BS 5050 1 69.31 ATACTCTTTGATATTGTAAGCAGAAGTAGTCAGTGGTAGCAATTGCGATGCCCATAGTGCAGGAGTACCCCATTTTGTATTTGCCCCAGCAGGAACAACAG:1 + chrX 19992397 3' + diver2 45 2 60.40 TAACTCCTCCCTCAGCTAAGTGAAGAGCGTCCGTGGTTTTCCTAGCGTTTGCTTGTAGGTTTCGCACGTAAGTTTTTCGCACCAGTACCAGGCA:1 - chr3L 23323262 3' - gypsy9 4997 1 62.77 CAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGGGCGGGCTGTCGGTCTATTTCGGCCCCCAGCCGCCGTTGACTAGCGACTGCAGTTAAGTCATAAGC:1 - chr3L 18337433 3' - F-element 470 1 55.45 AAAGAAAAAAAAAAAGTAAAACCGAACAGCGAGTGGCACAGTGGAGAGATGAGCTCGAAAGGTAACTGGATTTTGGCGATGGCATTTCCTGATCCTGACAG:1 - chrX 17218123 3' + Doc2-element 247 1 36.63 GAGCAGGCTTTATTTGTAAGCTTACTCGTGGAAGAAACAATTTTTTA:1 - chr2R 2564609 3' + Cr1a 4035 1 57.45 GTAACCAAAAAAAAGAAAAAAAAAGTAAAAAAAATATTTCCCAAATTCTCCACTGCACTGCAGGCTGTATGCTAAGCAGAGCGACCATGTCACTTTGGGGG:1 - chr2R 18005075 3' + gypsy7 5002 1 61.39 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGCGCCTGCACCAGTTGAATGTGAGTGTAACGAGTGCCTTCCTCCTTTTTTCACAGTGTGGCGAAACCCT:1 + chr2R 9207906 3' - Doc 316 1 73.27 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAA:1 + chr2R 19149450 3' - diver 46 2 67.00 CCACCCCTCCCCCTAAGCCACCACGCTCATACACATTGTTAACATGTTTTGACCACGGCGATGGGGACAACGCATGACTGAAACCGAATATGTAATAAAA:1 - chrX 5270327 3' + ZAM 27 2 60.00 AATAAAAATAAGAATATTAATATATATGTGAATGAATGTATATAATATTACATTCATTTCCTTAGTCACCCCAATAAAGACACGTGATTGAATACCTGAGG:1 + chr3R 30517049 3' + mdg1 7075 2 70.30 GTNTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACTGGAGACTTTTTTCAACCGAAAACCACATTTGTTTTGAAACGAATGCAGCCGGT:1 + chr2L 8297408 3' - Tirant 8127 2 57.00 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTACGCAAATGGTCAAAGAGAACTAGTAATTCGG:1 + chr2R 5701564 3' + S-element 1673 1 72.28 CAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAA:1 - chr3R 19589934 3' - BS 5032 1 57.43 TGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGTGCCGGCAGCAGTGCGAGAGCATGGGAGCCAGTAGCTATCGATGGTTCCACGACGGATGCTGCGAG:1 - chrX 11988352 3' + roo 211 2 70.00 CANGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACAGTTCAAGCTTAATCCCT:1 - chr3R 14627672 3' - P-element 485 1 22.77 ATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCATAAATCTCATTCCCGCGAATCCCGCCCACTAGATATGGGCAAAGTCA:1 + chrX 12184962 3' + R1A1-element 5114 1 53.54 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCATTAATTTCATTGATCTCGATCCCGT:1 - chr2L 20913972 3' - P-element 47 1 30.69 TTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTT:1 - chr3R 28240017 3' + Cr1a 149 1 72.28 TGNGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCAGACTGATCTGTAATTGAGCTTCCATCTAAGAGTGGTAACTGTTTTTTTCCATTGACACAATTCACATAATT:1 + chr3L 11619820 3' + R2-element 3450 1 72.28 TTNAGGAAAAGAATGAGTTTTTGTATATTATCTGGATTGGGTTTTCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTAAATGTCAACAATAAGCTCGAGTGCGGCTG:1 + chr3L 14709939 3' - I-element 5146 1 69.31 TTNAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTGCGTAGCCCCTCCCACAACTAACCCCCCTTCGAGCA:1 - chrX 4323789 3' + S-element 1681 2 63.37 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGAGATC:1 - chrX 13640665 3' - P-element 56 1 19.80 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGGGAGGGCGGGA:1 + chr2L 18177973 3' + 412 7511 2 60.00 ACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTTCCTTCTTGTTATGCAAATGCGTGCAAAATGTGCGAGGTTTTCT:1 + chr3L 20608589 3' + copia 4943 2 64.36 AANTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAACAATGTGACAAACGATGTGTGAAGGAGTCGCTGCTGCTGCTCA:1 - chr2L 18223743 3' + roo 405 1 78.22 TAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGACATTTGTTAACTAAGTGCGCAGT:1 - chr3L 14330024 3' - hobo 377 1 80.20 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGGGCCTCGAATGCATTTCATTTTCT:2 - chr3R 29357034 3' - 412 7075 2 54.46 TGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACTATTAACCGTTTGCATAAACGACCCATCCTTATGACTTT:1 - chr2L 4786646 3' + Chouto 5943 1 76.24 TGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCAACATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTG:1 + chr2L 21403544 3' - G5 4411 1 53.47 ATNTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGT:1 + chr2L 18177960 3' + 412 444 2 72.28 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTATCTCAATTTCTTGTATATTGCCTTGAATAGCTTACATCACGAA:1 + chr3R 27900500 3' + roo 400 1 70.30 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGCTCGCTCTCTTTACAAGTGTCCGC:1 + chrX 13640723 3' + P-element 2871 1 61.39 TTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCA:1 + chr2L 23034059 3' + FB 408 1 40.59 AANGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCTTGGATTCAAA:1 - chrX 6654440 3' - jockey 4751 1 53.47 AAATCGTCTTCTAGCACAACACCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTTAGTTAAAAATATGCTTAACAATTATACAAACTATTAAAAACT:1 + chr3L 23840224 3' + 1360 3201 1 60.40 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAAAGATACATATTTCTGGGCCATCATT:1 - chr2L 9410683 3' + roo 9022 2 72.28 TTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTA:1 - chr3R 4504048 3' + INE-1 558 1 70.30 ATAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGTAATCTCAAAATTGTTGCCAACCGCAAAACTTTTGTCGCTCGTCACTGGCTTTTGTTG:1 + chr2L 2938687 3' + Q-element 77 2 64.95 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAGTCAATTTTCGTACGATATACCAGACACTTTGCAAAGAATAGCGCCCAATTGGGGG:1 - chr2L 18177895 3' - 412 7072 2 61.39 TTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCT:1 - chr3L 24213771 3' + invader2 224 2 53.47 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGTGAGGTCTGGGT:1 + chr3L 7061200 3' - I-element 39 1 61.39 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCGTTTTTATGACAGCGCAGCA:1 + chr2L 18214163 3' + hopper 1413 2 77.23 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATTTTCATACCCATTAGTGTGTGGGGGGTATATGGTATCCCC:1 + chr3R 27452412 3' + roo 396 1 64.36 ACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACAACACACGAAGCGCCCATCCCTAAACCA:1 - chr2R 10032883 3' + accord 195 2 78.22 TANCTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATGTGCAACTAGGGCTAGGGG:1 + chr3R 17666055 3' - Transpac 21 2 59.41 TTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGAATTTCTTTTCGTGTTACTTATCG:1 - chr2L 2082268 3' - Doc 4552 1 76.24 GCNGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTATCAATTTAAACTAAAATCACCATGTTGCATCACTTTGTTTCCAATTCGAAATCAATCATTTTCGA:1 + chrX 5439937 3' + micropia 5338 2 68.32 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAG:1 - chr3L 13878059 3' - flea 41 2 68.32 GCNTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAATTCAGTGTGTCCGCCGCCGGAAATCGAACCGAAAGGCAGTGTTGGAAGGCAGACTGGACTTAGACT:1 - chr3R 4292090 3' - 1360 3215 1 67.00 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCGTGTTGGTGTTGTGTTGCTTCGGGTCGC:1 + chr3L 17971278 3' - P-element 46 1 35.64 TTTATTTTATTTTATTTATTTAGGAATTAGTTTGAAAAATAATTAATTGGCATACAATAACCAGATTCATTAATTCGCATCGGTTGCATTTGCCTGAGAGC:1 + chr3L 14334954 3' - HeT-A 1 1 81.19 CATTCTCATTCATACACCACTACACAGATACACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCATTCATGCCCTGTTTCAGTCAAACTGGATTGATGAGGAGAAACGAT:1 - chr2R 5791743 3' - invader5 3879 2 73.27 AACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGATTTTGAAACTGCTAAGGACTGAATAATTTCATTTAGTCCTTTTTATTGTGACGCGGAA:1 - chr3L 793270 3' - I-element 4996 1 62.38 TTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATTCCTTTTCAAATCGGTTTTGGTCTAATGCAGTTTTCCTTGTG:1 + chrX 7798721 3' - X-element 4422 1 58.42 CTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGTTTTCGGTTGTTTCGAGATTATTTGAGATTATCC:1 - chr2L 4828221 3' - Idefix 323 2 70.30 AANCAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACAATCCA:1 + chr3L 18337731 3' - Juan 4033 1 70.30 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTAAATATCGGCAGACGTAATTGCCTTGGCTGCACGCC:1 - chr3L 7781192 3' - 297 6613 2 69.00 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTTGTGCTTCTGGTCGTGATGGGCGCGCTTATCACGCGTGCTAATCACGATAGAAGTGCGTTGTCCATATTCCCCT:1 - chr3R 30106775 3' - roo 8665 2 76.24 TTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAACTGCA:1 - chr3L 14854671 3' + Quasimodo 7357 2 68.32 CGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTATATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTC:1 + chrX 19810574 3' - INE-1 550 1 66.67 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCGCTTTTTAAAACCGATTTCCTG:1 - chr2R 17077846 3' + Tirant 8490 2 64.18 GCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCTCTAACAATAACGCAGTTATTAGCTTTTTTTATTGTATATGAAAAGCAT:1 - chrX 20858714 3' + Copia1_DM 146 1 59.00 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGACAAAA:1 - chr2L 17269779 3' - hopper 34 1 58.42 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAA:1 - chr3L 13878040 3' - flea 4779 2 53.47 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACAACGAC:1 + chrX 4448616 3' - 412 7075 2 58.42 GCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGAAGCGTATGTCAACTGCATAAAGCACTCGGCGTCGGGGCACAGGTGCATTATGTCCGGAACAGTGGCCGGCTCCGCC:1 - chr3L 21673630 3' + Doc 438 1 75.25 AGNCAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAATATGTTCTACTTTTAGATATATTTCACG:1 + chr3R 17412613 3' - 3S18 50 2 71.29 CAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTACTATGACATGGTGATCGAGTTCATGTGGTCCAATTCGTTTCTGAAAAGTCTTGTCTATGAGAG:1 - chr2L 6805477 3' - I-element 4999 1 68.32 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACATGCAGATGAGATTATTTT:1 + chrX 19959910 3' - roo 5 2 75.25 AANTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTATAATTGATTTGTCGGCTCTATCG:1 + chr3R 9127438 3' + invader3 251 2 52.48 ATGTATACTGTAGACATATAACTATTGTAACACATTAAAAAAAAATGATGATACTGGTCTGCTCATGATTCCCTGGAGG:1 + chr2L 22225085 3' + Bica 91 1 50.63 ATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTACGTAAGCTTTAATAGCTGCTAAAACAGATCTGTCGACCCTATCTGGTGCGTAAATAGCGGTATAAAAAGCACC:1 - chr2L 23041141 3' - Doc2-element 4497 1 70.30 GTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACACAAGACCGTTGTCCTTAACGTGCCCACA:1 - chr3R 18961674 3' + F-element 4232 1 72.28 TCNTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACGGTGGCTGCTATTGTGAACGAATTTGCATGCAGAGTGGCTTAAAAGTGATACCAAATAACACTAAACACTTC:1 - chr3R 20584260 3' + 1360 3388 2 78.22 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTACCGTGTGCAGAATGAATGGACTCTCACCATCCATCATTCGAGTATCAGTCAAAA:1 - chrX 8337891 3' + hobo 2920 1 60.40 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTCGCGTTCATTCTCGTGCTCATCGTC:1 - chrX 18356206 3' + P-element 2845 1 35.05 CGGGAGGCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATAATACGTTAATGTTGCGAAAACCAATTGTTTCTATTTCGT:1 + chr2L 1590828 3' - opus 35 4 55.45 TANTATTGCATAGGCACATACTACAATATCTCGAACTAACCATTCTTGTCACCAACTATTTAGGTGGTCCGCTTTAGTTTCTTATCAGGATTAGAAAGTAT:1 - chr2R 18434432 3' - 412 4 2 75.25 TCAGCTAGTGTGAATGCGAATGAGAGGCAAGACAAGGACTTACGTACACATTACATGAGAA:1 - chr2L 21768687 3' - INE-1 529 1 63.93 CTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCTAATGAACTAATCATATACGATCAAAAGCATATG:1 - chrX 21493329 3' - BS 4707 1 53.00 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTGACACGGGGCGAGTGTGCCACCAAAGATGC:1 + chrX 5649449 3' + S-element 1708 2 71.29 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTT:1 + chrX 10644870 3' - hobo 43 1 65.35 GTGGTTGGGGTGCGTGTAAAACTTGCTATGGTATTTGCCTTTGAGTTCGTGTGCGGCCTTTATTGGTTTACTTCATCAACTCGAACGACTGAGTGGTTGGG:1 + chrX 5535285 3' - F-element 4459 1 68.32 TANGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTCCCAATG:1 - chr2L 8841057 3' + P-element 2859 1 49.50 AAATCAAGTGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTGTTCTGAATTCGTTGTATAAATTTCTATTCTGATCAAATTGGTGTTGTCTGGTCGGAGGA:1 + chr3L 25337161 3' - Doc3-element 37 1 63.37 TCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCATCCAGGTCTCCGGGATGCGGGC:1 + chr3R 9653626 3' - jockey 4605 1 80.81 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTC:1 - chr2R 544792 3' - HMS-Beagle 25 2 54.46 AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATAC:1 + chr3L 447351 3' + Tabor 7267 2 80.20 TTNTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCT:1 - chr3L 24213771 3' + invader2 224 2 53.47 AGNTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCT:1 + chr3R 4604457 3' - INE-1 150 1 57.14 CCNAAAATCGGCTTCTAGCACAACACGCACACATATACACATGGTGCACGCAACTGCCAACGAAAATATCATTTGGCCACGTTAAAGTTTTCGACTCCCTC:1 + chr3R 13546923 3' + 1360 3197 1 71.29 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTGTCACGTGCCACAGGCGGCAAATTAAACAAGGCGCAACATGGGAAGCAAA:1 + chr3R 30904283 3' - roo 8689 2 54.46 AATTTTAAGTATGGTTGCAAGATCCCGCAGTCCGCGCTTCCGAGCTTGAATTGAAAAAATTGAAAATTTTAAAAATTCATATATTTTTCGATTGCATTTTC:1 - chrX 7701030 3' + hopper 441 1 49.50 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACAGGCAATTATTTCTGCCAAATCACTGCCCAAATACGAAATAGGTGAACGAGGAGGCCAGGACTTG:1 - chr3R 24430497 3' - Transpac 4928 2 69.31 CTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGACCAACGCGGAACAGCACAACCCACGCACCG:1 - chrX 1093183 3' + F-element 4220 1 69.31 TANGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATATTAAGCTTAAGCTGCAACTGAACTGAAAAAGGCTGAATAACGAAATGGAATATATTGTT:1 - chr3R 19952299 3' - roo 15 2 64.36 GGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGCCGCACCCTGCATTAGAAGATCAAACATATTTGATGGGTTTGACTTTGATAAGGGTGCGCCAAC:1 + chr3L 6020392 3' + R1A1-element 5189 1 57.00 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATCG:1 - chrX 13640664 3' - P-element 55 1 22.77 CATCGAGATCTCAGGAACTATAAAGGCTAGAAAGGAAACATAAACGGCTTAGACGTTCAGCAAGAGTGCGAAAGTTGGCTGTTTATTTGGTGTAGGGCTCG:1 - chr3R 18695601 3' + INE-1 144 1 72.28 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTCCCAAGATATATTCCACGGAAAACCTGCTG:1 - chr3L 13345456 3' - Transpac 41 2 72.28 TTTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - TAHRE 10438 1 88.12 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTAGGTACTTAAGTAACAGCACTAATCCTGATGAAGAATAA:1 - chr3R 4971170 3' + 1360 3349 1 65.35 TACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCACGAAAGACCGGTAACGGCGGAAAATAAAAACGGTAAC:1 + chr3R 28063657 3' - Doc 43 1 64.00 AATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTATTACGATCCAAAGGTAGATATTTATTGAATAAATTAACTAAA:1 + chr2R 19572237 3' - 17.6 308 2 57.43 GGNCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCTCTAACAATAACGCAGTTATTAGCTTTTTTTTATTGTATATGAAAAGCATATAT:1 - chrX 20858710 3' + Copia1_DM 150 1 53.47 ACGACTTGAAGGCCCTTCCTACTTTTCAGTTGTAGGTGTAGTAGTTTTTGTTGTTTCTGTTTTATATTCTTTCTTTTTCTTCATTTTTTATACTTTAGGTT:1 + chr4 402172 3' - Fw3 183 1 61.39 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGAACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGTATATG:1 - chrX 14040715 3' + roo 8603 1 55.45 GCNCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chrX 706056 3' + Juan 15 1 76.00 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAGTGCACA:1 + chrX 4806750 3' - roo 25 2 57.43 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGCA:1 + chr3R 22494197 3' - 297 12 2 66.34 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCATCGCCACTGCTTGTTGCATTCCGTTTTGTGT:1 - chr3L 11789981 3' - P-element 46 1 31.68 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATTTCTATATATGATTGAAGTGAGTTTGCCGGCTGGCAGTTGAA:1 - chr2L 470211 3' + Burdock 231 2 58.16 AATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGATATTGGGGAATAACAAAAGTTTTACGGACATGGCGAACATGGAGCAAGGATTGCTGCGGGGCA:1 + chrX 5208459 3' - INE-1 517 1 56.44 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATC:1 - chrX 6654460 3' - jockey 4750 1 61.25 CCAATACTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGTATGC:1 - chr2R 12446047 3' - hopper 37 1 59.41 AGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAA:1 - chr2L 9778711 3' + F-element 4627 1 64.65 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTAGCCTAAACGCTTTGCTCGCAACTCACATTCTCTTCCTCTCTCGCAGTGCTCTTAGCATGTAGAAATG:1 - chr3R 21206657 3' - P-element 8 2 71.29 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTATAATTAAGAAAATGAAATATTTG:1 - chr2L 9488156 3' + 297 351 2 83.17 AGGGTTCACTGTCTGCAACGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAATAATACGGGTAGGAGATCAGTGTGGGTCCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAAAAGA:1 - chr3L 27323489 3' - baggins 5182 1 58.00 GATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAACTATCGATGTTTTCTTAGAAAACCATCGATATTTGGCACTATCGATAGTTTTTCAGC:1 + chr2R 6494362 3' - opus 393 2 64.00 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACAACGACG:1 + chrX 4448617 3' - 412 21 2 59.41 ATNCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGA:1 + chr2L 19644921 3' - blood 48 2 72.28 ATCTGAAACCGGATCAAAAGAACTCGCGACGTAAAATATTTTATAAAAGAACACCAAACAAAATAACAGCAAGTAATTAATAACGTAAATAAAACAACAAC:1 - chr3L 2872273 3' + gypsy9 360 1 69.31 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCGGATTAAATTGAATATACAATGTTAAGGCAATGGA:2 - chr3R 22208559 3' - I-element 42 1 64.36 GATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAGTCATAATTAACCC:1 + chrX 21452841 3' + INE-1 564 1 43.56 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATGTATGTATATGGTCTATATAGAACGCAGTCATAATCGTAAACAATTGACGGCGACCGCGACATTTT:2 - chr3L 11450448 3' - Transpac 6 2 73.27 CACGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGAATAGCTGCAAATATTCGGTGGACTCGTTGACTTGGCAGCCAAAGTAGCCATTCTCGAGGTTCAGGTAGAAGACC:1 + chr2L 4570990 3' - G2 118 1 79.21 TGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCCGAGTACTTTAAGATGAAATCTGTTACTAGATTACGATTAAACGAGTTGATATGAA:1 - chr2L 19390422 3' + hopper 351 1 58.42 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTCTCAATGGCTCATGTATTGTATACTTCCCCGTTGTTAATAACAGCT:1 + chr4 1269611 3' - Transpac 4951 2 53.47 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATTGTATTCAAAACTTGAATACTCATTTATTTA:1 - chr4 1156886 3' - F-element 60 1 72.00 TTNCAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGTGATTGAATATGTTTCCTTGGTTTGCATTGGTTTAAAAATAAATATGCAGATATTGTATTGTT:1 - chr2R 24208834 3' - Juan 16 1 65.35 TTNTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAAT:1 + chr2R 2949096 3' - 17.6 48 1 74.26 TTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAA:1 + chr2L 8691298 3' + Cr1a 216 1 55.45 GATTAGAAACGAGTGCCGATCAGCAATTCAACGCTTTACAAGCGGCAAACTGCAACTGCAAATGCTGCACATTATCCATTAATTGGGCAGATAAGAAGCGT:1 + chr3R 30460705 3' + BS 433 1 63.37 ACNTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGGCCTTAATATAGTATATATTTT:1 - chr3L 12539387 3' - R1A1-element 5101 1 77.23 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGT:1 - chrX 19820043 3' - mdg1 23 2 52.48 TCCACGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAAAGGAATAAATTAACGGCAAGATTCACTCAACAAATAGTTCACGCTGACGCAGGCCGAACGTTGCTAACT:1 - chr3R 2520480 3' + Tc1-2 457 1 76.77 CCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGG:1 + chrX 21667952 3' - gypsy2 6497 2 77.23 CGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAAGAAGACTATTTGTTTTTATCGCATTGGTACGCCTAATTGAACATATTTTGAATCGAAATATATTAAATTCATATGG:1 - chr3L 4553738 3' - G2 2799 1 73.27 TATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTATAATTGATTTGTCGGCTCTATCGCCCGAGTAGATATCGCCTGACAATGG:1 + chr3R 9127464 3' + invader3 277 2 78.22 CTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTAGAGTGACGGATGCGCTTGTTTAATTTTTGTTAAAATGTATTTCGTTCGGCGGTTCTTGTATTCTATTTTTTGTAGAC:1 + chr3L 18302995 3' - Porto1 232 1 57.43 TANGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTATCTGGGTTACTCAAACAAGCCTTTAGC:1 + chr2R 8294264 3' + 412 7500 2 69.31 AGNGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGC:1 - chr2L 10712120 3' - I-element 36 1 57.43 GCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAATTGGCACCTAAGAGGTAAGCATTTAAGGCACTTAAAAGCCGAAGAATATTTAATAT:1 + chr2R 10920276 3' + Doc 58 1 58.42 CGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAAACACCTACC:1 + chr3L 14854763 3' - Quasimodo 32 2 62.38 AAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACAGACTGCGAATAAAAAGAATGCCACGCCAAGCAACAGAG:1 - chrX 16457821 3' + accord 7088 2 61.39 TTNATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGATGTCAGCAACG:2 - chr3R 11538455 3' - 412 7085 2 58.42 TTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTTAAAATAGTTTAGCTAATAATTATGTAAATTTGACAATCCCT:1 - chr3R 6725701 3' + invader2 4639 1 63.37 AAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTATTTTTTCGCTCTTTTTCGTAACTATTCCATAGGCCTGCCCTCCGCCGGCCGAG:1 + chr3R 17787173 3' + F-element 4439 1 60.20 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATACGTCAAACTGGTTGCCATTTCTGTGTAAAGAGTTAACTCGTTATGA:1 + chr3L 14209095 3' - Quasimodo 23 2 54.46 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCACAAAAAAATTTCCACTGCATACGTAATG:1 - chr3R 20373216 3' - I-element 6 1 72.28 TTNTGCAGCCGTGGATAAAGCAACGTACTCTGCGCAGGCAACAACTGTTGCTTTTGGCGGGAAGTCTTAGCAACATGTTGCTCCGGCCTCTTCCCTCTAAG:1 - chr3R 26996763 3' - Copia1_DM 3979 1 69.31 ACTTTCTACCTTTTATAGTTCCCAATATCACAGCGTTCATACGGACAGACA:1 - chr3L 25304796 3' - INE-1 157 1 80.39 AAAACCTGCGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGGGAGGGGCGTCGTACTCAGACTATGTATAGTCTACTCGTATAT:1 + chr3L 2813259 3' + Burdock 294 1 59.79 CGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAGCATTCCCGATATATTCTTCCAATCCAATCATATGAATGTTTTACCCTTAT:1 + chr3R 24559586 3' + micropia 420 2 53.47 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCAACAAAATTCAAACAAACTCGAAAAACTTTAAACTCGCTACGAGCGC:1 - chr3R 27452319 3' - roo 8691 2 54.46 GCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGGCCTCGGCTGCACCCGCTCCCTTAGCCAATAAACGCGGAGCAATAAA:1 + chr3R 9176246 3' + F-element 432 1 60.00 AGNCAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATA:1 - chr2R 5582166 3' - Cr1a 435 1 71.88 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGG:1 - chr2L 17205176 3' + hopper 1390 1 52.48 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTGGCTTTAATCCTCAATGTGTCCACAACTTCGACTTTGGCT:1 - chr2L 9141567 3' + roo 9036 1 61.39 AAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCACTCTACCTCCAACAACAACAGCGGGCCGAAGGCTGTCCACATGCT:1 - chr3R 14190927 3' + F-element 356 1 73.27 AATGGAGTTGGAGTTTGGAGATGGCCACGATGGTGATGGCAATAGCGATGGCGATGGTGTACTTCTTAAGGTTTCCCACCACAAACGATTCTGCAGAGGCA:1 + chr2R 22696861 3' - gypsy3 463 1 58.42 GTNTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACACAGCATGTTGTGAAGTTGCGGCGCAAAAAGAAAGCACGCGAATAAAACATAAGAAAATTTAATTACGC:1 - chr3R 21618863 3' + S-element 1712 2 75.25 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCAT:1 + chrX 10644867 3' - hobo 44 1 67.68 TGNCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGGTATATTTGAACGCTCGTGTCACGGTCGCACTCTCATTCGTCTCTCAGCGTTCAGAAGATTC:1 - chr2L 18987250 3' + P-element 2874 1 64.36 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTCCACTTACACATTTGCGCCGCAAAAT:1 + chr2L 17269867 3' + hopper 1404 2 72.28 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTCTTAAAATACATACATTTGTATATG:1 - chrX 9579289 3' - Tirant 2 2 79.21 AAACTGGAATGGAAAATACCTTATTAAACCTTCTATTAGTTCTATTGTAAGTAGTTGTGGGCGGTGGGCGGTGGGCTGAGTGTAAACCGAGCTGCAGGAAC:1 - chr2R 22772606 3' + ZAM 486 1 57.43 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAAC:1 - chr3L 16973373 3' - S-element 1546 2 48.51 GGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCTAATGAACTAATCATATACGATCAAAAGCATATGCATTTGTACTTCTTTCGGC:1 - chrX 21493310 3' - BS 4689 1 71.29 TGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCGCTCATTCCCTCTCCCAACTTCACGTACAGCGCTCAAATTGTGTACATCCATTTGAATACTTCT:1 + chr3L 9144781 3' + Cr1a 266 1 57.43 CCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATCAATACTAAAACGCCAGCGTGTTTGCCA:1 - chrX 20726853 3' - 17.6 169 2 72.28 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTCGCGTTCATTCTCGTGCTCATCGTC:1 - chrX 18356206 3' + P-element 2841 1 33.66 CATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACCCACCTGAGTTATATCCCTGAACTCTTCCTTGGCCACCACCCTA:1 - chr3R 19404710 3' - invader4 2953 2 56.44 GTNTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTGTTTGGAATTACACTATAGTTTATGTCTAGAGCCATTCATTTTTTG:1 + chrX 9251854 3' - HMS-Beagle 6723 1 53.00 CCTTAAGTTAATGTTTCCCTGAGTTTGGGTTTTCCACCTCCACCTCGCTCTCTCTCTCTTTTTCTCTCATGGATTTTACACAATTTTTATCTTATTTAACT:1 - chr3R 19514970 3' + G2 3000 1 69.31 AAAAAGTGGCTGCTTAGTGCCAAACTAATGTATGGGCGTTACGCATCTTGTTATTTAGTGTCTGCTCTGCCAACAGTTGCAGCTGACGGCGGCTTCAAAAG:1 - chr3L 1279735 3' + 1360 3343 1 68.32 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAAGTGTGAAGCGAATTTCAAAGT:1 - chr3L 18816141 3' + roo 9015 2 81.19 CTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGAT:1 - chrX 21087593 3' - mdg3 5286 2 59.79 ACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTAGTAAGTACAAGTATATATTTTATAAATGTTGCTTTTGCGTTT:1 - chr3L 4091542 3' + flea 252 2 77.23 TAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAACA:1 - chr3L 14944561 3' - G5 4769 1 51.49 GTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGCTTAGTGGGCGTATTGGACTTGGACTGGGGCTTTGGCTTGGTTTCG:1 + chrX 8203380 3' - accord 65 2 54.46 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCTCCTTAATAAATAGCCAATTAGTCAGATAATTTAACACTTAGAAATCATTAGTCGTT:1 + chr2L 13804470 3' + roo 389 2 59.41 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTCTTAAAATACA:1 - chrX 9579303 3' - Tirant 16 2 65.35 ACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTCCGATAAGGCCCCTGAAGGGCGAGGCTAATTTCCACGGATTGCAGTACATGACATGATAAT:1 - chr3R 31171940 3' - Quasimodo 7199 2 62.38 GTATATTTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAAGGCTATATTTGATAAACTTCTAATTGATTTATTTG:1 - chr2L 3836992 3' - I-element 5162 1 62.38 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGGTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTCATGTGAGAGCAGCAGCTGTG:1 - chr3R 22341130 3' - hopper 14 1 68.32 TTAAAAATACTCTTTCGGCAGCAAGCTTTAAAACACCATCTAGAGCAGCGGTCCCAGGACAGAGCCTTGTGGGACTCCGTCCACATCCTCGAACTTTCTGA:1 + chr2R 4932234 3' - G7 300 1 79.21 CAGAGACGCTAAGGAAGCCGCCGACAACGTGCCCAGCACCAGCGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTGGAAAATAACAACAACAACAACAATGTTGCACACAAGA:1 - chr2R 20702864 3' + G-element 477 1 70.30 GCTTACGGCATAAAAACAACAAGATATTGATCTTTAGTTTATATTTATGTGTTAAATTAATACAGTCACTTACTAAGTTACCACTCTCAGTTCTTATGTGT:1 + chr2R 6254332 3' + Chimpo 136 1 75.25 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAAT:1 - chr3L 13652777 3' - hobo 24 1 55.45 ATGGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATACCTTCAGAAGGGGACAGTTCTAGAACGCTAAGACGCCAGAGACAACCAACGATGAACGT:1 + chr2R 5653802 3' - Gypsy12A_LTR 2080 1 67.33 GACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGAATATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTT:1 + chr3L 15099647 3' - G4 3804 1 44.55 AATTAATAAAAATTGCAACAATTTAACATTTCCTCACTTTGTTTATATTTGTTTCTGGTCCTCTGAACAGCGCGGATGGATATCCAGATGGCGGATTGGA:1 - chrX 16234659 3' + Transib5 2603 1 59.00 TCTGGTCCTCATGTACCAAGGAGTACATGTAGTCAGCCGTTAGAGAAGCAACCTCGAACAACCAGTTAGTGTGCACCTGGAACC:1 + chr3L 27975508 3' - jockey2 2999 1 80.95 TTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCCGAGTTTGCTTGTTGATATTGTCAAAGTAAACAGTCAACACAGTGAAACGGTGCACTGGGAACTGAGAGC:1 - 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TAHRE 10442 1 71.29 TCATCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTA:1 + chrX 19820783 3' + Rt1b 4973 1 74.26 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAACTTAAATAAAATCAGCAATATAAACCATACACATATGAATAAATAAAACATTACGCCTTAAGCTATTAAATGGA:1 + chrX 12883050 3' - roo 8667 2 77.23 GTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCCGATATTCCCTCAAACC:2 + chrX 19810591 3' - INE-1 556 1 70.30 TTAACTGGCCTTCTTACGGGGCACTGCCGACTTCGCATTTGCATAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTCAAGAGAAATATAAAACTTCAGAAATGAT:1 - chr3R 15389249 3' + baggins 5128 1 71.29 TTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAAAAAACCTGGCCGGAGACCAAA:1 - chr2L 19980721 3' + HeT-A 6003 2 80.20 AANCCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGTTTTTTTTTTTCTTCCTAGTGCCTCACTTTTGAATTGGATTCGATGTGTGCTCTAT:1 - chr3R 18958362 3' - Rt1a 4948 1 62.38 TANAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGAC:1 - chr2R 17938895 3' + copia 206 2 76.00 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGC:1 - 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chr2L 7287833 3' - 1360 3247 1 61.00 AAGTATTTACACACAATTTTTACGCTTTTCAACAAAGTTCTTTAAAATAGAAACAGTTTATCGCGTTTTGCCTTTTTGTTTCGCACCGCCGTCGGTCTTCT:1 + chr3L 14420537 3' + Bari2 79 2 82.18 CGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCCGATATTCCCTCAA:1 + chrX 19810588 3' - INE-1 559 1 67.33 TATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAA:1 + chrX 21564727 3' - diver 44 2 72.28 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAG:1 + chr2R 2527424 3' - roo 63 2 56.44 GCGTAGNGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCCTAGTACTACCTACAACATGCGAAATGCAATTTT:1 - chrX 10644825 3' + hobo 2897 1 62.38 CGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGTGCAAGGTTTCTTTCTGGGATTCAGATTCACTCGCATGC:1 + chr2L 9731519 3' - 297 6567 1 66.34 TANTTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGTTTTTTTTAACTTTTTTTTGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 7 1 76.24 GTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACATTGTTCCACTTTTCTTTCGATTTTTTTTTTCCCTACCAACATTTTGCCCTCAAGAGCTGCACA:1 + chr2L 18423417 3' + R1A1-element 6 1 60.40 CCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCAAGTAACTCCTTTGGTGCCCCAGCGTCCGTCGACAAATGGAAGGGC:1 - chr3R 11693958 3' - F-element 4357 1 58.42 TCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTTTCTTTCGTCTTCTCGGCTTTTGGGCGCAATTAATTTGCAGACAGCGAATCAGCCTT:1 + chr3R 10531422 3' - G2 397 1 58.42 TANACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATAATAAAATATTCCACTCTTGTCTCCGTCCCCACAGG:1 - chr3R 21343048 3' + I-element 5314 1 65.35 TTGCTGCTCCCAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTTTGCGGCTCGTGTTGTTTTCTATTTTACATTTTT:1 - chr3R 24438533 3' - Chouto 327 1 52.11 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCG:2 - chr2L 19644880 3' + blood 333 2 64.36 TGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCACACTGCCTATTTTGGTGAGATCTGGATCCGGTCAG:1 - chr3L 10564160 3' + invader4 429 1 72.28 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACGTATGCGTGCGTTCGAACATATATCTATTTGCGCACATTTATCATATCGCCTCATTAGATAAATTGCGA:1 - chr2R 24614511 3' + Quasimodo 7364 2 77.23 ATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAGTCATAATTAACCCG:1 + chrX 21452842 3' + INE-1 565 1 43.56 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTGACAATCTTTGTTTATCAAATCGTTTGCCATTAGGTTTCTCGTCGGAAAAGGGGTATTCGTATTTAT:1 - chr3L 13879703 3' + flea 250 2 49.50 CGCCAAGTCTTCGGTTGGAGGCAGCGGACTTACCAGTCGCTGGAGTGGCGACTCTTTATGTGCCTGTGAAGCAGCAGCGAAAGCGCAAGGCTAACACGAAT:1 - chr3R 14646337 3' - gypsy10 238 2 69.31 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCA:2 - chr3R 24461828 3' - F-element 53 1 68.32 ATNTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTC:1 - chr3L 20209536 3' - Burdock 6144 2 71.29 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCC:1 + chr2L 6184240 3' + roo 9027 1 70.30 CGTTTAATTGAATTAATTAAAAGCAATAATACCTTGAAATAATTGCGCCTAATAGAAAAACTTTGCCTGCCCGAACAATTGCCTTCGGACATTG:1 + chr2L 4297547 3' - HeT-A 384 1 71.28 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGCTCGC:1 + chrX 13640704 3' + P-element 2852 1 42.57 CAGAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGAGAAACTGTATATACATGCATTGCTCGAGGTGCCCTATGTTTTTTGTTTGCTTCTCTGTT:1 - chr3R 5364412 3' - S2 28 1 63.37 CTNAGTGCACTCTACCAAGAGGTGGAGCTCTAACACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGCCTTCCTTCCGAGAATACCATGAAA:1 - chr3L 21995616 3' + R1A1-element 273 1 70.00 GTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAA:1 + chr3L 9909798 3' - Transpac 1 2 78.22 AAGCAAGTTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAGGGGGGAAAACTGTCCATATAAATTATGATTATTTTTATGAGCTGCCAAGCCAAGTTGGTCGAC:1 - chr2L 2002988 3' + Doc 4429 1 70.30 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGGTAAACGAATCGATATTGTTTGGCAACTAT:1 + chr3L 11790022 3' + P-element 2844 1 35.64 TTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATGCGATTGGATCGGGTGTAGACCTCGCCGCAGCCTGGGAATAGAAATATATATAAAGTAAGTAAGCGTAACTTC:1 + chr2R 9008515 3' + Stalker 6859 4 78.22 GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAATATATGTTTGAAAACCCTCGATTTGAA:1 + chrX 1600220 3' + BS 5041 1 74.26 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAG:1 - chrX 4806685 3' + roo 9028 1 66.34 AANTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATACAAATTGCGAAAATGTCAACAAATTGAGGTATCGGGTGTTTTAAAGGCAAGGA:1 - chrX 5521056 3' + 412 7524 2 55.45 CTNGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACG:1 - chr2R 5532370 3' - Doc4-element 16 1 57.43 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGGTATATTTGAACGCTCGTGTCACGGTCGCACTCTC:1 - chr2L 18987277 3' - P-element 40 1 37.62 TTNTTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAACTTGGCATG:1 - chrX 19820023 3' - mdg1 2 2 73.00 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGTGCGAGCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGG:1 - chrX 9579339 3' - Tirant 8145 2 68.97 TTTTAACTTTGCTGGTGGAAGATTTTAACTTTTTTTAACTTTTTAACTTGTCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGATTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTG:2 + chr4 1294987 3' - HeT-A 6060 2 75.25 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCTCACTTTCACAAAAATTTTCGAGATTGGGAAGAAATTATGCCAACTGAG:1 - chrX 9439762 3' - roo 8689 2 56.00 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTCCTAGTACTACCTACAACA:1 - chrX 10644841 3' + hobo 2912 1 70.00 GAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTACAGCGGTTGTTAAGTCACTTAAATCACTTTACCTTACTTGGCAATTTTAAAAGTTTGTGTTTGTTT:1 - chr3R 14794139 3' - TAHRE 10293 1 70.30 ACTACAACACACACACACACACACACACGCAAGCACTCTCGAGTTTGAAAAACAA:1 + chr3L 10736292 3' + gypsy3 420 1 87.27 TATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAAACATCAATACTTATCTCAAACTATTGATAACGCTGAAC:1 + chr2L 12649775 3' + 297 439 1 65.35 CCAACTGCGTTTTGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCT:1 - chr3L 9076573 3' + mdg1 7420 2 61.39 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTATTTCTATTTAGACGTAAGCCAATAGCATCTATAAATA:1 + chr3L 13988946 3' - hopper 36 1 62.38 TCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTCACTCATGAATGCATTTACATGGCCCGGCTTCAACTTGGCCGCCGGCGAGGCTAAAAGCTTCGGCA:1 + chr2R 15578334 3' + mdg1 413 2 70.30 CAGCCGGAAAACTGGAATGGAAAATACTTTATTAAACCTTCTATTAGTTCTATTGTAAGTAGTTGCGATTTAACTTTGTTGCGATCTCGTGTATAC:1 - chr2R 9643908 3' + ZAM 478 1 67.71 TTTTTTTTCACATTTTAGTGAAACTAGGAGGTCTAAGAATGTAAAAAAGTTTAAGTGTAGATGTCTAATTAAAAGGCTAAATTTTCTTGCAGTGTAGTGGA:1 + chrX 10508794 3' + copia 380 1 73.27 TGTAAAATGCCATAAATTGTAACTATATATTTTATAAAAAATCAGAGTACAATAAAATGACAGCGCCGAAGGGCACTGAAAATATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 3701147 3' + TART-B 10427 2 75.26 TTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTGTTATAAA:1 - chrX 21504669 3' + Cr1a 206 1 60.40 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAG:1 - chr3R 12554870 3' - mdg1 7052 2 61.80 TCAATGACCAGTCCTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGTTGGTGATCCATTTGTCGCGATCCTCCCTAGAGGGGAACTGTGAAC:1 + chrX 16591851 3' - R1A1-element 4957 1 51.52 TAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTGTTGTAGTTTTTTCCATATAATTAAGCACCTTCTAAAAAACGTTTATCTAAATATCGAAGGCAATTA:1 - chr2L 3402940 3' + invader2 3 2 70.30 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCC:1 + chr2L 6184239 3' + roo 9026 1 71.29 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGAGTAC:1 + chr2R 2949127 3' - 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chrX 16902426 3' + Doc2-element 316 1 60.40 CGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACATATAAATTATAATTTAATAAGAAAACA:1 + chr3R 27469620 3' - micropia 78 2 72.28 AAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGCCATTTGATTAAACGCCTCGTTTTATTCAATATTT:1 + chr3L 3691695 3' + jockey 4649 1 63.37 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATACTCTATAAGAAGA:1 - chrX 4022291 3' - roo 35 2 62.38 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACA:1 - chr3R 19589935 3' - BS 5033 1 58.42 AGNGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCGAGCTTGTCGCTGCAAGCGTTGCGTATACGCAGCGTGTTCTCACCGCAGTTTTTTTCTTTATGGC:1 - chrX 9734278 3' - accord 7101 2 68.32 AAGTTCCGGTCAGGCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTCAGTGTTCTCGTTCTCGTCCTTTGCATGGGTCTCTGAATGCTGAATGTTTGCCGCTGCTGCTG:1 - chr3R 19320333 3' - jockey2 3193 1 61.39 ACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGCACTGGCTGGATGTGGATTGATGGTGGTGGTGGCGGG:1 + chr2R 23285450 3' - Quasimodo 452 2 56.47 TATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTT:1 + chr3L 27415319 3' - transib2 12 1 67.33 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGTCGTGGAAAGGGTGGCAAAGGATTGGGAAAGGGGGGCGCCAAGCGTCATCGTAAGGTGCTTCGTGA:1 + chr3R 14626102 3' + P-element 2879 2 69.31 GATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGCGTCTCTCCTCTGGATCTTCGTTGTTGTTGCTCTGCAGCGGCGTTGGCTGCTGTTCGTGATCG:1 - chr3R 7178930 3' + INE-1 92 1 59.60 GGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGATTTGGTGTTCTTGTGCTGCTTTCTCTGTTCGTTTAGCATTTTGGCC:1 + chrX 14312262 3' - I-element 4908 1 60.40 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGCAGACTGATCGACTAGGTTAACTATATAGCATTAACTTGGTTATTGGAGCGATTGCATAATGGAGTTCTCTA:1 + chr3L 10522127 3' - roo 8668 2 71.29 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATGTATGTATATGGTCTATATAGAACGCAGTCATAATCGTAAACAATTGACGGCGACCGC:1 - chr3L 11450456 3' - Transpac 12 2 66.67 ATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTATACGATGAGTGGATGTGGATTGTGTGGTTTTTGCAACTCAG:1 + chrX 22926278 3' - 17.6 101 2 60.61 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGCAATAACAAAGTTAAAGGAC:1 + chr3L 13345498 3' + Transpac 5178 2 77.23 CAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAATT:1 - chr2R 4673550 3' + Quasimodo 7365 2 76.24 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAACATGCAGG:1 - chr2R 13318856 3' - Juan 4033 1 72.28 CAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCACACTTTCACCTGCCTGCAAATGCCGCATGCCACACACCTGTCCTGAC:1 + chr2L 17034340 3' + Doc 237 1 57.43 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATTGCATCTATATGTGGCTC:1 - chrX 9983647 3' + pogo 2061 1 74.74 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGA:1 - chr3R 24461821 3' - F-element 46 1 61.39 TAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACTTGAACTCGATGAAAAAGTCGGGGCGGAAAACTCTCAATCTCGAAGCAGTAACTACAATTTTT:1 + chrX 5253363 3' - R1A1-element 24 1 66.34 AGATTATTATTATTATTGCTATAATAATTTATAGTATTGGTTTATCTTGGCTCTTGCAGCGATTAATTTCGTGAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTTTCAC:1 - chr3R 19255385 3' - mdg1 7070 2 33.66 ACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAAATTTCATTTTCCCCGTTTGTTTGCACATAAT:1 + chr3R 22322394 3' + INE-1 534 1 61.39 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACCAATTCCGAAAACCTTATTAATAGATCATGAACTTCAGATACTTT:1 - chr3L 15681531 3' - pogo 28 1 55.45 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGTCGTGGAAAGGGTGGCAAAGGATTGGGAAAGGGGGGCGCCAAGCGTCATCGTAAGGTGCTTCGTGATA:1 + chr3R 14626104 3' + P-element 2881 2 71.29 CGNTTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCAACAAAATTCAAACAAACTC:1 - chr3R 27452346 3' - roo 54 2 80.20 TTTAATTAATTTAAAGATTTTTTTATCCTATATAAAATATATGAGTTTTATGAATGACTTAAAAACTTGGAGTATTAAGTATTAAGTTCGCTGGGTGTTGC:1 + chr3L 15420468 3' - Stalker2 7189 1 53.47 CCGACGAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCACCGCAAATAAGCTTACACACAAAGACTGTTCCAAGAAAAGAAATCCAAGCGGAAGTCCGAATAAAACTT:1 + chr3R 20804871 3' - Cr1a 4075 1 71.00 ATGCAGNAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATGAAAGATAAACATATGAATACTATGAGTACCAACATCACAGCTTATTCGTATTCAGCTGTACAC:1 - chr2L 11844106 3' - BS 5052 1 50.50 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTT:1 + chrX 9439835 3' + roo 9038 1 60.40 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATGTAAAAATATTTGAACTAAGCCAGCCAAAGTGTAAGGACGACGAGCA:1 + chr2L 9410870 3' - roo 8692 2 54.46 TTTTACTATATATACATACATATAAGGTTCGAGGCATTATAAAATTCAACGCCCCAACTCCCAAAGAATCGACCTAATTTCCGCAGATTTAATTATAGAAA:1 - chr3L 18416367 3' - Dm88 21 2 76.24 GAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTAACTCCTGAAAGAAAAAGTTTTGGGATCTATCAAATCTTAAGTAAACTCTAACTTCCATGATTTGAAT:1 - chr2L 9871656 3' - copia 4971 2 75.25 AAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCTGGTGACC:1 + chr3L 9907454 3' + jockey 4990 1 65.35 TCNTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTA:1 + chr3R 19446208 3' + 297 6928 2 74.26 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAAC:1 - chr2L 260996 3' - Juan 4039 1 56.34 CCNGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATT:1 + chrX 21564764 3' - diver 5895 2 73.27 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTATAAAAGCTAAGCAGAAATACAAGCGCTTCCATATCAGCCAACCTTTGCTAAACCATAAAAACTTTATAT:1 - chr3L 17172632 3' - roo 5 2 67.33 CTAAGCACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAA:1 + chr2R 3341937 3' + Copia1_DM 4125 1 68.32 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCAACCAGTTTCAGGATAACCACCACC:1 + chr2L 10174187 3' + mdg1 7437 2 52.48 AAGAGTACCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAGGATCGTGGTCCTCATTATGCATGCTTGTCCGCACGTAGCC:1 - chr2L 19602816 3' - hobo 5 1 74.26 CTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACATGTAGCAAGTTTCTATTATGTGTTACTTT:1 + chr2R 3824674 3' - 297 6615 2 63.92 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCAT:1 - chr2L 17205171 3' + hopper 1395 1 57.43 TTGTGGNCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATG:1 - chrX 7583223 3' - I-element 52 1 75.25 AATACATGTACAATAGTATCCCTTAGACAATTCTTGGCCCCTGACATTTCCGCTGTGGTGTTACCTTTTGAGAAATTACCACAAAAACCACAATAAACGAC:1 + chr3L 9850818 3' + G6 1939 1 74.26 AATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATATCGGCCCGAAAATCGTCTTCTNNNNNCACACGGACCACATCACTACTGTCGAATGGAGTCC:1 + chr2R 5755706 3' + 1360 3159 1 57.45 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAAAAATAAAAAAATAGTGAGAACTCAAACCCTA:1 - chr3R 3374390 3' + I-element 5299 1 78.22 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACA:1 + chrX 4448611 3' - 412 27 2 53.47 ATTACTAGGGCGTTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGTTCGGTGGTCGCCCCAGTCATCAATTTGGTAAAAGGTGTTGTTTGGCTATGTTTTATGTTTTT:1 - chr2R 4330135 3' - Stalker 135 4 72.28 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTA:1 - chr3L 13878041 3' - flea 4780 2 52.48 TATAGATTTAAAGACTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGGCGACAGAATGAAAGTCAGTACGCAGATAATAAAATATAGA:1 + chr3R 6769003 3' - 1360 239 1 57.43 TGAATAGTATATTCCAACAGGCTTCATTACATTGAAGTTTTGTTTTACCCTGCCATTGCACTTAGTTGGTTTTTATTGTTTTCGTTTTTTTTAGGTATATT:1 - chrX 22745612 3' - copia 4867 1 79.21 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATGATAGCACATCCTGTGTGATATCTTGCGCAAAAGGACCGATGAAAGTT:1 - chr3R 6002935 3' - opus 7140 4 55.45 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGGGTGTGTAACCTCGTCCTTTGTATCC:1 - chr3R 12115297 3' - 1360 49 1 75.25 GAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGGGAGGCGGTGGGAGGCGGTGGGAGGCGGTGGGAGGCGGTGGGGCCTACGCCACTGACACGTACTAACGAGCGACGCCTGA:1 - chr2L 6511187 3' + copia 154 2 57.43 TGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAATCGTATAAAAGGTAGAGTGAAACCTTTCTATCTGTTCATTGAGGGTGTCCTCTGGTAATTCTGGAATTTCCTC:1 + chr3R 24128957 3' + Cr1a 4444 1 76.24 GTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGCAAACTAGTTTTTTGGTATCCGAGCATCCGTTGGCTCAGGTT:1 + chr3L 16478848 3' - Idefix 214 2 58.42 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGTATGCAACAAGA:1 - chr2R 12446040 3' - hopper 30 1 54.46 AGACGAAGTTTTTGGCGACTTAGAGTCGAGTTTGAATAGGTGGCGCCAGCTCTTTACTCGGCGATCGCAAAGTTGTCGGAGGATCGCTGAAGAGCGTAATA:1 - chr2L 5912568 3' + gypsy7 496 1 60.40 TCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCATCGACAAACGACCGTCCCGCCCCCAGCGATTCGCTTTCCACTTGAGCCATCGATTTTCGATTTTCCAGCTGCTGGGCC:1 + chrX 3263917 3' + Doc 441 1 62.38 GANTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCCGTTCTCTGGTAGGCACTCGAACGCATTAATGTGTGGCCCACCCACACACTGACAAACACACACACACACA:1 - chr2R 14055122 3' - hobo 14 1 64.95 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAATTGCAGTACATA:1 + chr2L 5959711 3' - roo 39 2 69.31 CAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTC:1 - chrY 1428630 3' - Doc 380 1 71.29 ATNAACAATAATAATAAACAATCTTTCATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTAGTAAGTACAAGTATATATTTTATAAATGTTGCTTTTG:1 - chr3L 4091547 3' + flea 248 2 73.00 CATTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATACTTATTATATACACTTGATCAGTCACTCGAACGGAAACGGAGGCGATTACGAATGCCGCTC:1 - chrX 5887649 3' - S2 8 4 71.00 GTGAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAACTCCCCCGCCTAGCAACAGCGAAGACGACTGGAATACGAGAAGAGTCTAAGGCGGTCAGGTCGAACTGGAATTAA:1 - chr2R 2494297 3' + gypsy8 4651 1 64.36 AGNTTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAATGCGAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGGT:1 + chr2R 3550649 3' + Doc2-element 4716 1 70.30 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATTAACCCCAAACTAAAGTTTTCTAAAGACATCCATTCAATTCGAAAGATTGTACCAGCATAA:1 - chr2R 11363949 3' - transib2 12 1 65.35 TANGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCTGTTAAAAAATACGGTTCGCTATTTGCACGAGGCATTTGAATTTTACGAGGAG:1 - chr3L 9887590 3' - Transpac 5210 2 59.00 CTNTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTTTTGGTTTACAACTCGACTTATGAACTCTGTGC:1 + chr3L 25401158 3' - transib2 15 1 64.36 AATGTGTTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTTTACATCTGCCTTCTTATTAACGTAATCAAACATAATGTTATTTAACCAGGGATCACCATGAATAACTGCA:1 - chr3L 18115210 3' - Bica 105 1 61.39 ATGTACATATGTATATATATGTACATACATATGTAACTATAAATTGATCCGTGTATTTCGAGCAGATGAACTGATAATAGCATTAAATTACAAGTTGGCGC:1 - chrX 19455069 3' + G3 4509 1 76.24 TTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGT:1 - chr2R 5532369 3' - Doc4-element 15 1 57.43 TCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTGGTGGCCTGTCTGGTGGTCTTCATCATTTTTGGCATAATCGCTATCTTCATCCCGGGCAAGGTGATCGGACTGGTCT:1 - chr2R 12875458 3' - Stalker3T 110 1 80.20 ATAAGCAATGTATTTGCGGGTTAGCTGAGCCCAACATCAGCACACATTGACCATTCAAATAAAGAACAGCAATGACACAGAATTGCTCCATTGATAAGGTA:1 + chr2R 3293741 3' + Stalker4 7242 4 66.34 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGC:1 + chrX 13640700 3' + P-element 2848 1 38.61 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCACTAGTGCAGCTCCCACACACACGTAAAGTGAGCTTTGAGATTGGAATGTGTAGCCTACTTTC:1 + chr3R 20984266 3' + hopper 1400 1 59.41 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGAACAACCAGCTATCCGAGACTAGGCAGAAGTTGCTGTATCAGCGCGTGCATTCTGAGGGACACTTAC:1 + chr3R 446112 3' + pogo 2096 1 74.26 TGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAATTTAAAAATATGACATAGTTTTGATTATTTAAAAGGATATCATTTAAAATTACTGTATTATTTAA:1 + chr3R 6411365 3' + Juan 4204 1 66.34 ACTAATAAAATTATGAAAAAAAATATCAAAATATTTTTCAAAAGTGTGTGCGTGTCAAGTTTTGGGCGATTTTGTAAAATTTATAAAAATTTATAAAATTT:1 - chr3R 16595424 3' - INE-1 401 1 54.46 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTT:1 + chrX 21564738 3' - diver 5921 2 61.39 TTNTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGGAGAGGGAACCCCGTGACAGGCAATCGGGATAACTATTAAAGCGAGTGGTGGA:1 - chr2L 16954805 3' + Quasimodo 7354 2 67.33 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACAATACACAGAATCGTTGAGGCCACGCATTTTGACTTCGGTATTTG:1 + chr3R 28288658 3' - 412 30 2 59.00 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGACTGACGAAGCTACTTAAAATTAAAAAATAATATTTTAG:1 + chrX 7583136 3' - Doc 61 1 62.38 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTA:1 - chr3R 446029 3' - pogo 48 1 74.26 GTNCGATGCACCATCGGTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCTTCAAAAAAAGGCTTGAGAGCTTCTATGGCT:1 - chr2L 20910482 3' + Doc2-element 128 1 75.51 ACTTTTTTCACTTTAATTTCAAACAATGAGAGTATTGTTCATATAAATCATTTGTACAATCTTATGTGCTAGAAGCGTATCAGTTGTTAAAATTAATGTC:1 + chr2L 9712664 3' + transib4 2477 1 67.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGCGCAGAAG:1 + chrX 9439845 3' + roo 385 2 54.46 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTGCCCTACCTCCCCCTTTGAAAGCCTTCTTAATTTCCCCTGTTCGTTATGCATTGTGCGTGCTGTG:1 + chr3R 4805142 3' + 1360 3379 2 69.31 ACNTATAGTTTATAACAAATTATAACACCTTGAGGTAATTTTAAGCTTTCAGTGCTGCTCGGTTGTTTGCTGAATATAACAAACCATATGATATACAAAGC:1 + chr3L 9055785 3' - S2 1459 1 71.29 CTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACCAGTCCTTTTTATTCCCCTTATTTATGTTTTTTCCAGTATGCCCCTTATTTTAGGCACGCCCTCAATGT:1 + chr2R 25216611 3' + Cr1a 4255 1 82.18 AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAACCAAATGCACGGCGAAAGAAAATCAATGAAGTTCTATAATCTAGCAAATTAGCC:1 - chr3L 21383882 3' + 1360 3319 1 59.41 CTNCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAATATCCTCAGGATCAAGAAAGACTTGGTAATCAACGTATTCCAGAGATGGG:1 - chr3L 19305656 3' + I-element 299 1 57.00 AGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGATCGCCGCATCTCAGGAAGCAGCACGACGGGCGGGTGGTGGCAAGCAGGGCGACAAGAGCGCCG:1 + chr3R 15934275 3' - Doc 468 1 75.25 TTTCAATTAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATTTTGCGACCTGATTACTTATTAGTTTCCATAATATAAAGCTATTATAATAG:1 - chr2R 2286495 3' - 1360 310 1 50.50 GAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGATTTGAGTGTGTGTGTTTGAGTGTGTGTGAGTGTGCAAGTGCTTGTGTCATTGCCATTAATTAAACACGTTTATGGC:1 + chrX 15437659 3' - Porto1 483 1 72.28 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGAA:1 + chr2L 19644922 3' - blood 7058 2 72.28 CATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCGAAAGATTGAAAACATGAAAGAAAA:1 + chr3L 21636504 3' - flea 4801 2 71.29 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAG:1 + chr3R 14049442 3' + transib2 2818 1 71.29 AGNTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCATACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGGCGTTACTCCATTGGCAAG:1 + chr3L 9682247 3' + F-element 4414 1 77.32 TATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGGCTTCTGGCTCGCACACACAGACACACACAGACACACACTTGCACGCAATTAGGCATAATCACCTACACACA:1 + chr2L 14542995 3' + Doc 4263 1 59.41 AAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGTGGGTGTGGGTGTAGTTACTGATATTGGTATGGGTTATATTTCTACAGCTATAAG:1 - chrX 1652663 3' + 1360 384 1 57.43 GGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATATAAAAATTAAATAAAACGTTATTGAAAGATAATGTTGCTCTATTAAGTTTGCATTATCATCTGTATAAGAAATA:1 + chr3R 26469050 3' - accord2 7333 1 77.23 GTGGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGCACCCATCTTTGTGGACTATCCGGGAATTCAGCATTTGCTAAGACAGCAACAGGAATA:1 + chrX 7768997 3' + hobo 2928 1 67.37 CCGAAACCCACTTCTCCCCCAGAGTGATATACACAAGATTCTTCTCCTCTTAGGAGAATAGTTATATAGGTCTTGATATTTTTAGACTGTCATTTACAAGC:1 - chr2L 23002666 3' + G6 1714 1 77.23 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGG:1 + chr3R 8191534 3' + mdg1 7434 2 59.09 GAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCT:1 - chr3R 25277612 3' - 3S18 24 2 56.44 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGT:1 + chr3L 7061189 3' - I-element 43 1 70.21 GTAATGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGATTATATCGTTTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAAAGGGAAACGGA:1 - chr3R 17733243 3' + INE-1 551 1 72.28 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTACGAGAGAGAGTGAAAGATCGTGTTTTTGTAGAGCCAAAAGAGATTCACATACTGTGGGAACGCG:1 + chr2R 21497567 3' - P-element 7 2 71.88 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTT:1 - chrX 8922329 3' - jockey 35 1 48.51 AAAAAAAGCGAAAATAAAAAAAAAGCGGCAAACAAGTTGGCTCAATGGCTCGGGCCC:1 + chr2L 16397782 3' + Doc2-element 254 1 71.93 ACATGAAGATCAACCTGACATATCTGTCGTCCCGGAGAGTATTAGCGCGTCCTGTAAAAGTTAAGAACTTTTCTGGTTCAAAAATGTAACCGAAACCAACA:1 - 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jockey 61 1 71.29 TCNAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATCTAAATATATTGGGACATTTTATGAAGAGTACGGTGACCTTATTTAAGAATTAAAGATTGCTTAATATTTTAA:1 - chr3L 18511031 3' - Ivk 3 1 72.28 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCAGACCAATTATTTTGCATTCGTAATTAGAAGTTGG:1 - chr2R 20804685 3' - hobo 41 1 65.35 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCAC:1 + chr3R 23601770 3' - jockey 23 1 58.42 CGCTTGAATATGACCTACAAATACTTATCCATTTCATGAAAAAAGAGTAGTTTGAAAGGCGGAGGAACAAGAACGTTGTGAAAGGGTTGCCAACTGCCAAG:1 - chr3L 6333850 3' + S-element 1350 1 61.39 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAATTTGAAAGGCACACACACCCACATA:1 - chr2R 17938856 3' + copia 244 1 68.32 AAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATATAATTATCTCATTCTTCGCTATGCCAAAAACTATGCTACGCATTCTTGCTGTCCCATAGGTGGCGCGTTGG:2 + chr2R 23601912 3' + jockey 4990 1 70.30 TANCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTTGCGCGTATGAAAAAAAAAAACAGCAATGAAAAAAA:1 - chr3R 1680699 3' - 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chr2R 21818962 3' + flea 238 2 61.39 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTTTTGCCTCACCTAAAATGCCACGCGAAATACTTTTATGAAGTCATCGCTTTAAAAC:1 + chr3R 12554961 3' + mdg1 7443 2 62.38 TCCAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCGCCTAATTTAAACATTCATTGTCTGCCTAGCGAGACTTCTTATAGCATTGCTCTCAACGTAGC:1 - chrX 6515967 3' + Idefix 6980 2 54.46 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTTGACCCACAAAATGGACGAAC:1 + chr3R 24739065 3' + pogo 2052 1 75.25 CCNATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGGGTAATGGAGGGTAGGGGTTGGGGGCATAGTGGCCATGGGTAACAGACGGTAACT:1 + chr3L 11033338 3' - F-element 44 1 62.38 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCAT:1 - chr3R 19589928 3' - BS 5026 1 51.49 GGGTGGNTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCC:1 - chr3R 19446130 3' - 297 9 2 69.31 CACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAAACTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGTTGGAAGACTGGAAGTTTTCGAAAAACAATGTCCATCTGG:1 + chr3L 19497620 3' - 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chr3L 18938881 3' + blood 7348 2 66.34 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATATACGTTCTTTTTACAAATAAAAATGAAAGTGAATTTTCATGTTCAACTAAA:1 + chr2L 21090981 3' - flea 14 2 65.35 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAACAATGTGACAAACG:1 - chr2L 18223772 3' + roo 9039 1 56.44 TAAAATATAATATAAATTTCTAACAAATACTATTTTTATGTGCTAACAAAATTCTCAAAAACAAAACATAAGCTGTTTTCCAAGTGCTTACTATAATTAAC:1 - chr3L 18215037 3' + Burdock 409 1 88.12 TGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAAGAAGACTATTTGTTTTTATCGCATTGGTACGCCTAATTGAACATATTTTGAATCGAAATATATTAAA:1 - chr3L 4553747 3' - G2 2808 1 64.36 GTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGACAGCAAATGAGAGAATTAGCCAGCCGGGAGATCAGTCCTCGTACTCCGACTGAGAATGAAACTG:1 - chr3R 21429016 3' + blood 273 2 65.35 GTTTTACTTTTTTTTTTTCTTTTTTGCCCCCTTCACTTGGGATCTGCATCTGCATCGGCATCTCCATAACTATCTGCAAGTGTCTCCGTTTGCGGCTTAAG:1 + chrX 17218248 3' - Doc2-element 247 1 53.47 AGACATCGAGCGGTCAATAACCCATATCTCATCACTGCCGACAACCATACAGAACAACTCTAGATACTCTATACGCTATTTACAAACTAGACATACAGCTA:1 - chr3R 7847143 3' + F-element 305 1 79.21 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTGCATTTTTCAATGGGGAAACACACCAATCATAG:1 - chr2R 8547791 3' + I-element 5314 1 67.33 AAAATAAATAAAATAAAATAAAAGAAAAACGTTTTAATCAAAGATAGTAGCCAGCTTAATAAAATGGTCTACTAATTGAACGGATACTGGCGTGCAATTTC:1 - chr2R 22997258 3' + HeT-A 1 1 75.25 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGAGATATCAATTAAATGGTACACGCTTTTCACAGTCGTTGACTT:1 + chr2L 5291678 3' + roo 9040 1 57.43 TCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACAATCCAACAAATTAAGACAAAATAATAATACAAGAATATATTTTTCTTCTCTCTC:1 - chrX 21832482 3' - FB 101 1 60.61 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATTTTCATACCCATTAGTGTGTGGGGGGTATATGGTATCCCCT:1 + chr3R 27452413 3' + roo 397 1 65.35 ACNCGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTTTCAGGCGAGGCAC:1 - chrX 8922316 3' - jockey 21 1 62.00 GTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGAGTGTGTGTGTGTGGGAGTG:1 + chrX 5113084 3' - 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accord 4 2 72.28 AAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGAGCTTCGGGCGATAAAGAAGGAGAAATATATAACAATAACAACAGCAACAACAGTGACTGAGGCAGACAGGTCA:1 - chr3R 25514785 3' + hopper 1412 2 76.24 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACTGAGAGAAATGATTTGAGCTAGTATATGG:1 - chr3R 28117773 3' - I-element 47 1 73.27 AGNCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCATACATCACAGAAAACATGATTCAGCTATATATTTGTTATATATATTTTTTACTTCA:1 - chr3L 12990571 3' - hobo 18 1 55.00 AGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGGAGCTGTTCTGTGGGTGGGGTCTCTAGAATTATTTGCAGTGTACGTGTCTGACGCTCTACAAATCGCAG:1 - chr3R 24694451 3' - Juan 319 1 74.26 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAAAAAAATTACGTACGCGATAGTCATCACCTCACAGTCACCTCGAT:1 + chr3R 12375228 3' - pogo 27 1 60.40 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCATACATCACAGAAAACATGATTCAGCTATATATTT:1 - chr3L 12990593 3' - hobo 41 1 68.32 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGATGTCAGCAACGCT:1 - chr3R 11538453 3' - 412 7083 2 57.43 AANAATAATAATATAATAATATCTTCATCTAAACATTCGCATAACTGCCAAATTACCGCCTTCAAGAGTATTTCCAACTTCCCAACCCGATTATATCCTTT:1 + chrX 13977273 3' + invader3 5048 4 60.40 AGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGCTTAACTCAACTAATTTTCAAGTGCTGTTCCGGGACAGCTAATTACTCA:1 - chr3L 9603772 3' + flea 122 1 55.45 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCA:1 + chr3R 6776604 3' + copia 227 1 56.44 TATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATTCCAGAAAATTAATGAAATTTC:1 - chr3R 7585233 3' + F-element 4640 1 50.50 TACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGCCAGCTACTTGCCTTGCTCCGATTTGCAGCTGGGCGCTCACAAATCTTGTCACAGCGATGCAAATATCT:1 + chr2R 19999254 3' + F-element 415 1 69.31 CANACATTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAAC:1 - chr2L 8841065 3' + P-element 2852 1 44.00 TATCGGTATCAACAGTTACATTCGGCTAAAGTTGCGCAATGCCGTCTGGACCACGGATCACATCGTGGACAAACTGGTCTTCAAGGACATTCAGTTGACGG:1 - chr2L 5213242 3' + G-element 191 1 65.35 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATCGGCCAGTGAGTGGGTTTGTGTAGACCCCTTGCCAATTTCTGT:1 + chr3R 24430604 3' + Transpac 291 2 59.41 AAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACACGTTTTCGGTAAAAACGAAAACTTTTCTATTTCCGAAAGGAAAAG:1 - chr2R 16908731 3' + diver 220 1 61.84 GCNAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGACTGCCTGCTGCACCTGTTCAACATCTTCCTCTTGCAGT:1 + chr3R 15272411 3' - R1A1-element 494 1 65.35 ATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACGTGCCCGAAGGGTATCACGGTATTTT:1 - chr3L 7295139 3' - G2 2933 1 68.32 ATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACATACTCCCACTTCCCTTCATATTCTCATATTAATAATTAATTAAACCTCAATTTAAACT:1 - chr2R 13748244 3' + 1360 3185 1 64.36 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGCCACGTCTCTGGTGTCTGTGTGCGTGTGCGATTGTGTGGGTGTCACAATTAAATTCTCATCTACACTCGCT:1 + chr2L 1089650 3' - hopper 4 2 73.27 CCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTT:1 + chr2L 23034057 3' + FB 406 1 38.61 GTNTAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTCACGACAATTTATATCATAAAAATGTAACCCAATAACTT:1 + chrX 13954790 3' - Juan 4062 1 57.00 GGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTCACGACAATTTATATCATAAAAATGTAACCCAATAACTTTAAACTTTTAACAAAAGTGTACTTTCTTATCGCCAGG:1 + chrX 13954827 3' - Juan 4026 1 71.29 AGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTCGTACTGCCTCTGTCGATGCTCGGCCAGCTCTGCCTCTGTCGACGCAAACACCAACTGTGCCTCTGAAGTT:1 - chr3L 25625583 3' + Tc1 421 1 72.92 ACACACACACACATATTCACTGGGCGTCTTGGTAAAAGCATTAAGATAATTGAAATGGCCAATAAAAAATATTTTCCCTTATTCAGACTTTTGGCC:1 + chr3L 6279663 3' + ZAM 271 4 61.46 AANAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGG:1 - chr2L 17205175 3' + hopper 1408 2 64.29 ACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTGTAAATAGTATTAGACATTTTCCAATCTAAGGCCGCAAATGTTCTTTTTT:1 + chrX 8150496 3' + rover 7276 2 58.42 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATGT:1 + chr3R 17666038 3' - Transpac 37 2 63.00 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAATTGCAGTACATATTTTTGGGTATATTTTTTG:2 + chr2L 5959730 3' - roo 8684 2 63.37 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATTGTACTTCGGAACATGAGCGCCTAAAAGTAGACAACT:1 + chr3R 19560940 3' + hobo 2899 1 72.28 TCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATGCCCAGATCACAGTTGGAATGCTTATTTCTATACTGGCGCTGCATAAACTCCTGCT:1 - chr2R 8622401 3' + F-element 285 1 60.40 GATTTTTCCGTTATTTTTGTCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTTTTTGTGAAATTTCGTTGTTGCTATTATGTGTGTG:1 - chr3L 17210619 3' + S-element 281 1 74.26 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATGTAAAAATATTTGAACTAAGCCAGCCAAAGTGTAAGGACG:1 + chr2L 9410863 3' - roo 35 2 61.39 GTNCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGTGAAAAGTTGGAACGAAAGAG:1 - chrX 8150430 3' - rover 6996 2 77.00 ACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAAACACTTTATTAACCAGTTAATTGGGGCAACTTCTTGAAGTGCCGACAAAAGCGGAAAACGTAAACAGAAA:1 - chrX 8475992 3' + F-element 492 1 73.27 TGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTTGACCC:1 - chr3L 10557572 3' + 412 7517 2 52.48 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGAGCGAGAGCTTTTTGAGGCTAAGCCCA:1 + chr2L 11764933 3' - roo 48 2 74.26 TTTTAATTTAATTATTATTTTAAATTATTAAATAGCTCTCATTGACGCTTTAATAATTCATTTTAAACCTTACCAAGGACAATAAGGAGACAGTCTTTAGT:1 + chr3R 21618179 3' - flea 4985 2 60.40 GTTCCCCGACTATCAGATATCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGATATCGATAGATACTGGGG:1 - chrX 23078696 3' - INE-1 556 1 75.71 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCTCAATCGTTAGCCGCGATTTTGTTTTCGTTTTGTAATTCAG:1 + chrX 4022383 3' + roo 403 1 73.27 TAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGT:1 + chr3R 13349546 3' - Ivk 56 1 76.24 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATTGCATTTTAAATAGTGCCGCATTTA:1 - chr3R 4679251 3' - copia 29 2 56.44 TCAGCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCGATGTTAGGTTTAAGTTAGTCTTAATTTACAAGTGCGAGAATAAAGTTCAACGAATTTCTCAATTTCTACAT:1 - chrX 5169937 3' + Max-element 8377 2 81.19 CGTTCTCCCACCGTATCTTCCAATTTAGGAAAAGAGGTCTGCGGCAACCGTCCTGCCTCCCGGATACCTCTAAGAGCATTTAATCCAGTGCTCTACCCAG:1 + chr3L 13825805 3' + gypsy6 7700 4 69.00 AATATTGCATAGGCACATACTACAGTATAATTATTTAAAGCCATTTAAAAAATTGACAATCGATTGGATCGATTCCTTGCTGTAAGAGCAAGGAAGCCATT:1 + chrX 5521163 3' - 412 3 2 76.24 TGGCGGCGGTTATGCTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTGTGTTAGAATTAGTTTGTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTTTTG:1 + chr3R 28536939 3' - TART-B 10319 1 85.87 CTTATACTATGGCACATATGCTCCAATTGGTTGGATTTGGTGGTTGATTTCGTTATTGATAAATATCAAACAAGATTTTTTTTCCTGCAATTAAGAGATGG:1 - chrX 5193525 3' - Quasimodo 4 2 63.37 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGTCTATTCTTCGGTAACTCTT:1 + chrX 364841 3' + hopper 1389 1 53.47 AAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCAAAGGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTATCTCGCACTGCGCATCCTAAACTGTATCTCAACTGCTCGCCGCAGCC:1 + chr3L 10336725 3' - 1360 223 1 57.43 GACTATCACATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAAGGAAAGAACGAGAAATTTCAACATATATGGTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 - chr3L 19471445 3' - INE-1 549 1 58.95 TGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGCTTTTCATCATCTCGCACTACGGACAGCGCTGATCGTGGACACGATTTGTGTCGCACCTGTTTGCCAA:1 + chr2L 21863445 3' + Burdock 6387 2 75.25 TATTTTAAAATTTTTTAATTTCTTTGCAGCGCCCAAGGTACTGTGCTTAAATATTGCATATATAGTTTGATTGCTCATCGATCATTGATCTTTGGACTCTC:1 - chrX 7691074 3' - 1360 3031 1 71.29 ACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAATAAACAACTACGCTCACAGATACACACGCCACATACTCGGGGGCAAAACGCACTTAATGAATAAGGTGTAGAAAGA:1 + chr3L 5241246 3' + 297 6953 2 80.20 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCCAGTATGGAGC:1 + chr3L 9076649 3' - mdg1 7056 2 59.41 AAAAAGCAGAATGTAAATAATTCTTATCATTTTTGGACTGTTAAATATCACACCGGCAGACCAACAATCAGATGGCACAATTATCCGGCGGAGGAAG:1 + chr3R 7952777 3' + Bari2 935 1 62.89 GAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGACTGTGCGCACACTGAGCGAAAAAGTGCAGACAATGGTTAAATTTATAGTTAATTTCTTAGAGCTATA:1 + chr2R 16490355 3' - roo 8828 2 73.27 AGATGTTATTGACCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTATAGTCTCGTGGGCTGCTCAGCTTACTAAATTTTCGG:1 + chr3R 7144327 3' - Circe 7212 2 64.36 AATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAAACTACGTTCTTGACCTTTTAGATT:1 + chr3L 1121480 3' + 1731 4488 2 76.24 GGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTAATTTGGTTCGAAGTGGCGATGATTTTTTAACAAAATTGTTGCAGTTTTTCGAGATGATTTTGTGGTGGTGG:1 + chrX 11969779 3' - Porto1 4456 1 69.39 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACA:1 - chr2L 8841081 3' + P-element 2835 1 27.72 CAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACG:1 - chr3L 24213783 3' + invader2 212 2 60.40 TGNTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGAC:1 + chrX 22782052 3' - I-element 4909 1 75.25 TCNACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCTAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAGCCTTGCAGAATTTATATACTAAAGAAACGG:1 + chr3L 22775964 3' - flea 4790 2 68.09 ATCTTTACTCTTTGCCGCTCTTAAAACAATCAATATCACTCCATGTTAACAGATAACAAATTTTAAACGCATAGAATATAGATTTTTTAATGTAAGTGAAG:1 - chr2L 6076790 3' + Cr1a 4236 1 70.30 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCGCCTTAAATAGAGTTCTAGCCAAATAACCAGATTGTACTTCCACCTCGGATATCGCACGTTAAA:1 - chrX 5925529 3' - roo 14 2 63.37 CCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCAT:1 + chr3L 27415323 3' - transib2 8 1 71.29 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAA:1 + chr3L 22400346 3' + 1360 3360 1 57.43 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCT:1 - chr2R 544793 3' - HMS-Beagle 26 2 53.47 CATAAACATCGCTAAATAATTGTTATAATAAAATGGCTATGACGATGGCCAGAAAGGCAAGAAAGAAGACGCACATCATCATCATCACATCGTCCACGGGC:1 - chrX 18626115 3' + R2-element 3411 1 72.28 GATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAATTTGTTACAACGGATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGTAACACGAGGTCGCAAATTGGGTGCCACTTACAA:1 - chr3R 22314623 3' - Q-element 99 2 76.77 CGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTTCTATAAGAAAAATTTGATACAGTATTA:1 + chr3L 23155721 3' - gypsy 45 2 67.33 ATNTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTATCTC:1 + chr3R 27900461 3' + roo 9024 2 73.27 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTTGATAAAATTCGTTTGGGTCGGCT:1 + chr3L 22752005 3' + roo 395 1 67.68 TGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTATTGATTAGTATTACTTTTGTTATTGTTCGTTCTGTTATGTTATTTTATTAT:1 - chr3R 24515224 3' + F-element 4601 1 63.37 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTATCGAAAAGTATCTACATAGCTTTCACATACATTTTACATGAAGCCCAAAAGCAGGCAA:1 - chr2L 16507807 3' - BS 5015 1 58.42 TTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGGAGAGGGAGCAGAACTTCGGCAGCGGGGCGACGGTGACAGGACAACGCTAACGGGATCCTTGTTGAGAGTT:1 - chr2R 9059930 3' + 1360 99 1 74.26 GTNTTCTTACTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTTGATAAAATT:1 + chr3L 22751991 3' + roo 407 1 72.60 GGGGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATATCCTCCGTTAAATCCTCTCCATCTGTTCACTAACAGAATTTGACCACGTATCATTTATAAAT:1 - chr3L 21534234 3' - 1360 12 1 65.35 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCAATGATTTTGTGATTTTTAGA:1 + chr3R 6776624 3' + copia 247 1 71.29 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTC:1 - chr3R 26140768 3' - 412 56 2 82.18 TCNCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTCCAGCCCAAAACTCTGG:1 + chr3R 26434755 3' - Tabor 31 2 52.48 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGTTGGCAAGTGCACCACCCAACCA:1 - chr3R 30904225 3' + roo 9023 2 75.76 TTNTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGATGTCAGCAACGCTCGTTCGCCCGCCCAACTT:1 - chr3R 11538435 3' - 412 11 2 68.00 CCTTCCGTGTCCTTCGGGTTTCTTGGCGCCCGACGTTTCCACTGTTTATTATTTCCGACTTGACCTCCTCGTCTCCTCCCTGCCTTTCCTTTTTTTCCAGC:1 - chr3L 16019115 3' - gypsy8 495 1 64.36 AATATTAATAATAATATATTAATAAATTATTATTATTAGTATGCTCAATATAATATTAAGAACAAGTTATTGTGATCAATTGAAATCGCAAATGAAATATT:1 + chrX 7427956 3' - Tc3 298 2 71.29 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTGTGTCTATGTACGTGTATTTATTTTATTAGTATTTTATTGCCTTGCACGTTCCCAACTT:1 - chrX 2172220 3' + I-element 5337 1 63.37 GCAATCTTATATTTCCAACACTTACAATTAGACGTGCCCACGTGCCACAAATCGCT:1 + chr3R 20953053 3' + frogger 186 1 62.50 TTTTTTAACATAGACTTAGCAGGTCAATATATATACAGGTATTCCGTGCACACATTGTATACAAGCTTATAGAGGCTCAACTAAAGCTTGATAACAGCAAT:1 - chr3L 19486468 3' - G7 1101 1 64.36 GGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTTCCAGCATAGTGCATATGTAAATTGGCCATTTGTCTGCAGTAGCAGTAAGTTGTTATGGTATTTCT:1 - chr3L 17230846 3' - I-element 4973 1 71.29 GACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTAGTAGTGAGTGGTGGATCATCATCATAATCATCATCATCACCCACATCCATGGGTTCTACAAGTTCAACTCGTAAAG:1 - chr3R 14088595 3' - accord2 7349 1 62.38 CCNCGGCTCTGCTCCTCTGCAGACCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGTGCGCCGACCAAAAACTTCACACCTGAATGCA:1 + chr3L 18947274 3' - G2 303 1 67.00 TTGATTNTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAGTCAATTTTCGTACGATATACCAGACACTTTGCAAAGAATAGCGCCCAATTGGGGGAAAA:1 - chr2L 18177891 3' - 412 15 2 65.35 GCTGCCAACCAGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCT:1 - chr3L 13878044 3' - flea 25 2 52.00 CAACTCAAACGATTCAGTCAACGACCTCACTGACTTTTGCATTACACGCAAAACAATTAACAGCTACAATTACCGATTTACGTGAGTCAAAGAGCAATCCA:1 - chr3L 21604603 3' + Doc4-element 344 1 77.23 TANAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTTCAGTAAAAGTGTGTTAAGAGCAACTAGCCAATAGGCAATAAACGAGAA:1 + chr3R 8823151 3' - mdg1 7084 2 64.36 AGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGGTATTTCGCCTTATGAGCTTAGTGCCTCCTTAGA:1 + chr3L 26645576 3' - HMS-Beagle 6932 2 66.34 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAATGGAAAGTGGCAAACATGGCA:1 + chrX 22745739 3' + copia 248 1 69.31 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGTTGCTGCTGCAGGCGAGGGTTGCTGGTGGG:1 - chr3R 8192386 3' + mdg1 412 2 43.56 AANCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCAT:1 + chr3L 22046473 3' + roo 9016 2 76.24 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACTGAGAGAAATGATTTGAGCTAGTATA:1 - chr3R 28117776 3' - I-element 50 1 76.24 CACCGGTGTTTCGCTGGCAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTCGTCCGAATATATTAATGGTGACAAGTTGCAGCCACACCAGC:1 + chr3R 21241373 3' + Gypsy12A_LTR 1991 1 75.25 CCGAATGGACACTCTTCATACACAGGTACCAGTTAATCCGTATTGCACCATGTTCAAGCCACCAACTGTAAACAAACTGTGGTTAAACCCCGTCGAACTTC:1 - chr3R 22335548 3' + Ivk 4941 1 56.44 ATTGGATAACCTTTGGATAAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGAAGAGCAGCAGCGTCTTGCTGAAGTGGCCCAGGATTCCAACCACGGCGAATGTCATG:1 - chr2L 13182955 3' - GATE 8085 1 56.44 AGGACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCCGA:1 + chr3R 12566771 3' - Doc 45 1 59.00 GATCAGTCATTTGTTAAATAGCAAAGTTTCTGATTTTTTTTAAACAACAAAAAATCTTCATTTTTTTGGCTCAACTGAATATGTGCTACACTTTTGACTTG:1 + chr3L 27357479 3' - Tc3 1616 1 69.31 ATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACCCGAGTGGAAATTTGCTTGGCTTCTTCTTTTTGCCGTCTCCT:1 + chr3L 14300599 3' - Transpac 412 1 58.42 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATTTTAAACTGGCTT:1 + chr3R 23724168 3' - Doc 56 1 44.55 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGAACATTTTGATTAAGAAGA:1 - chr3L 22920379 3' - 1360 31 1 56.44 CTNTGTGCCTTTTCCCCTTTCTTAAAGACTTGTGCGCTCCCAGTTACCCCCTCTTTTCCCACTTGCCCACTCCCTTGAGTGGAGTGCTGCTCCACTGGTTT:1 + chr3L 11319919 3' - Rt1b 179 1 55.45 TCCTCGTTCCTGTTCTCTATCTATATATCTCTCTATCTCTCTCTGTCTGTCTCTGTGTGTGTGCGTGTGTTAACCCTTGGCCGAATTTGCATAATGCATA:1 - chr3L 15863258 3' + Cr1a 4344 1 84.00 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTAAGTATCTTTGCAACAGTTGCCAATCAATGGGCATAAGTATC:1 - chrX 5912907 3' + flea 4983 2 56.44 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGACGCACGCCCCTTTTTTAGGGTAATCGACTTCCATTTCCGCTTAAAAATTCTAACTTATTTACTTATTCAAAG:1 - chr2L 19397007 3' + hopper 1413 2 75.25 ATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCT:1 - chr2R 5582184 3' - Cr1a 443 1 59.30 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTG:1 + chr2L 6184249 3' + roo 9036 1 61.39 TTNTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAATAGTTAAGCTTTAAAGCATATTTCTCTGAATTTTGCTGACAATCCCATAAATTGCTGAATTTTCTC:1 - chr3R 13248639 3' - 1360 3118 1 72.28 TGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTTCACCTTCCATCTGCTGCTGCTGTCTGCTCTGCTTCATCAGTTCTTATGTGAAGTGCACTCTTTATGTTAATAGTT:1 + chrX 14667638 3' - gypsy8 4540 1 46.53 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGGAAAAAAAAACTAATTGTTGTCGTTTTTTGAGAAAAAACTCCTTTGCAATGGAATTAAATACATTTAT:1 + chr3L 19882052 3' + transib2 2818 1 51.49 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTATATTGCCTCATGGGAGTTTAACGATCAAGTTAGGGCATAAA:1 - chr3L 20688404 3' - roo 35 2 62.38 CCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACGCCAAATTTCAATTTGCAGCATATGCAGATTAGCATCCATTTACTTGGCTACA:1 + chr3L 4778285 3' + Doc 263 1 63.00 TCATAGCTAGATCCACAATGATTTAATATTAGGGGTGGGGCAACAATTTATGCGTTTTTGACTTGGTTTCTTGTTTGGTTTTGTTTTGTTTTCCCTCCATA:1 - chr3R 29351528 3' - Cr1a 4152 1 67.33 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGA:1 - chrX 19820059 3' - mdg1 39 2 63.37 TATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATATTTTTTTGTTGCCTGCCATGGGAGCCCATGACCCCCCTTGGGT:1 + chr3L 12172891 3' - 17.6 6951 1 58.42 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTTCAGTGGGCTCAATTGGCCATTAGAG:1 + chr2L 20315754 3' - FB 51 1 76.24 CAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTGTTACGAGGCTCGACGCAAATTAAAGTAAAAGTCCAACTTGAATGATCTCAAGTTTGAGGGCCTTCCGAA:1 - chr3L 14208976 3' + Quasimodo 7365 2 76.24 AACTGCNGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTGTTTTTAAAAATACTTTAGCAGAGGTGGGTGTTGACCACCCTTTTTATTTTCGAAAACG:1 + chr3R 27659078 3' - 1360 462 1 71.29 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTGACAATCTTTGTTTATCAAATCGTTTGCCATTGTTTCTGTCGTCGCTGTGGGTAATTTTTTACATT:1 + chr3L 13878145 3' + flea 5008 2 75.25 CATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAA:1 - chr3R 1135322 3' + Cr1a 4340 1 72.28 TATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGCTTTGGCGGGCGCTTTGGGGCGTACGTGTCGTATGCGTAATTTGGGGGCTTTCGTCGGCTT:1 - chr3R 28948743 3' - F-element 309 1 68.75 TGTTATAGCGGCAGCTTGTCGATTTTGCGGGGGTGCAGTTTAAGGTCGGTCGTTTGTTGGCTCTTAGAAAGCGTTGAGATATAGGGAAACTGTGTTCGGTC:1 - chr3L 3639043 3' - HeT-A 235 1 54.46 CCTTCCCTACTCCGGGACAACATGGACCGGATACCATCCCATCCCATCCCATCCCATGCCATCCCATCCACCGCCTATCGTCCAGCAGAAGGAAAAAACGA:1 - chrX 14693696 3' + G-element 301 1 75.25 ATNGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTCGATTCTGTTTCATGGCTGTTGGCTGCGGAAAAAACCTTTGCACACACAAAAA:1 - chrX 6731786 3' + hobo 2917 1 59.00 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGCTCGCTC:1 + chrX 13640706 3' + P-element 2854 1 44.55 TAGTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATT:1 + chr3R 22494160 3' - 297 6630 2 75.25 ATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTTAAGGCAATGCAAAGTCGAAGCCAGGCCAAAACGGGGATTAGCCAAA:1 - chr3R 6887792 3' + 1360 198 1 68.32 AGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGGTGGCCACATGTCGGATACTTAATATCCCTCTGAC:1 + chr3L 15873497 3' - Doc 323 1 65.35 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAG:1 - chr2L 19845916 3' - F-element 53 1 65.66 GCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAACCAACAAAGGGGCAATCCTTTTTCTCGTGATGAGGTATCTGTCTTTTCTCTCAATCCCAACCCACCTTTCAA:1 - chr2R 10525075 3' + INE-1 218 1 73.00 AAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAAGTATGCTACGGCTTCCTTTGCGTGCGGACTGCGATAATCCCATCAAAA:1 + chr2L 6876096 3' + hobo 2574 1 53.47 TGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 416 2 63.00 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGG:1 + chr2L 18177963 3' + 412 449 2 69.70 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCCCTCGTTTCGATATGCAATCGGTCCATTAACGAT:1 - chr2R 10468580 3' - P-element 39 1 40.59 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACACTTAGTATGTACTACATACATACAAACATTCATATGTATATCGGGCATTCGAACGTTAACATGCACACTC:1 + chr2L 470314 3' - Burdock 4 2 75.25 GAGCAACCGAGTCATCGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGGGAGACCAAAAAAACTTCCACAGCAGCCGAAATGATGAGACAAATGAATGAGAATTTA:1 - chr2L 11905984 3' + G5A 2538 1 72.28 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGT:1 + chr3L 9909766 3' - Transpac 33 2 53.47 CTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCAGCAACGGCATCATCGGGATCAGCAC:1 - chr2L 2624796 3' + Doc 391 1 74.26 GCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATGTAACCCAAAATGCCGATCGAATTCCCCTGTAATGCTATTTAATGATATTCAATG:1 - chr3L 16839557 3' - R1A1-element 5232 1 52.48 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGA:1 + chr2R 5202346 3' + roo 9018 2 75.25 TTATTATAAATTTAAGTTAATCTGCAGTCAGAGTAGATACAGAATGGTCCGAAATGAAAATGGTCATGGCATAATTTTTTTCAAAAGCTGCTGTTCGTTAT:1 - chr3L 21902369 3' + INE-1 430 1 78.22 TTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACTGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTTCCATTCGAGTCGTTTTGGCCTCTGGCAATTCTAATTGCAT:1 + chr2R 21983510 3' - rooA 7414 2 59.41 ATATTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTCAATTGTTTTTATTTTTTTTATTTTTAGCTATCCAAGCCACTTTTTTTAGCACACCGGAAATAGATCAGGGG:1 + chr2L 10676434 3' + INE-1 565 1 77.23 GANTGGATATTTTTGTTATTTGATTCACATTAGCATTCGCAGATTCCAAAAGAGCAGCTATTCCAGCGTTAAGCTGGACGAGAATACCTTGAAGAGTTTCA:1 + chr3R 25914758 3' - 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Quasimodo 33 2 64.36 ACTCCAGACGGCACGAGGCGCCGACTAAGCGCTCTGCTAAGTCCGTTGCCTCCATTCCGAACTTCACATGCGCCTAGGAGGCATATGTTTTCCTTTCCGTC:1 - chr3R 9853868 3' + gypsy10 5833 2 56.44 CACAAGAACACACACACACACACACACTGATAGCTAGCCAGGTGTGTGGACTGACTGG:1 - chr3R 30357850 3' + gypsy3 419 1 74.14 CANCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATTGGTTGTTTCCAAGTCAGTGGATAT:1 + chr3L 18680259 3' - hopper 50 1 76.24 TCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAAGAACAATGACTTATCAAAAACAACAACAATAAAACTATAACTTAACTTT:1 - chrX 7709831 3' + 297 496 1 56.44 CANACATACATATTCACTGTTAGCTTATTTAAGACTAAGAATAAAGACGACGAGTCAGTCGATTTCAAGCAGCAAACACATGGCCAACGATGAGCAGGGT:1 - chr3L 8214308 3' + ZAM 8236 2 74.00 AACAATCTCACCCAAATCGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACATAAACATAACCCATCCAACTTATTCAAATTGTGTG:1 + chr3R 10461558 3' + I-element 4897 1 82.18 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAATCCATT:1 - chrX 7768915 3' - hobo 31 1 58.42 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTATAATTTTGGAGCGCAATCTAGATCGTCAGCATCGCCTCAGAGAAC:1 + chr2R 5262676 3' + 1360 3383 2 71.29 ACNGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGC:1 + chr3R 17243229 3' + hopper 1414 2 75.25 ATGAAACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATCACTTGGGTGCGTTCAGGAGGAAAGGGGG:1 - 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chr3L 17152151 3' + F-element 284 1 78.22 TAAATAAAATTATTTGTTTTTTTTTTACAAAATGTGTGATTGTTAATAGATTCACGACGGGAAGAGGCCTACCTTCTCAAAGATGCGTCGTTTTAGGG:1 + chrX 8488608 3' - TAHRE 64 1 78.57 GGTTTGGGCGGTTTTAGTGCGTAAGAGTGGGGGCACAAACATTTTTTTTCAAATCGATAAAAATGTACAAGACTCATAGAAATGTCAAAAAATATCAACAC:1 + chr2R 2245001 3' - INE-1 345 1 77.23 TCTCGAATTTTTGTTTGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACATTGGGACTTAGGATTTATCATGTATGTATCTAAA:1 - chr2L 11163120 3' + 1360 91 1 66.34 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTCAATAAACTTGATCCGAAAACACGACAAGGCTGTCTGTCAGAAGAGCGAAAAATCGGCCACATGG:1 + chr3R 10824141 3' - 412 11 2 68.32 GAAGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTATTCCGTGTTGAATGCAAACGTAACACTGAAAAATTT:1 + chr2L 9410801 3' + roo 400 1 43.56 ATAACCTACATATAACATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCGTGCAGCTGAACGATCATGACGAACTGCCTCGAACTGGCGC:1 - chrX 18293021 3' + accord 435 2 57.43 TTCCGAACGTACCACGGTGCCCCACTGATGGTTTTCATTGGCCCTGTTGCATTATGTTCGACATCGACATGTAATTGATATATTGGCTGCAGGCGCTCCAC:1 + chr3L 21456935 3' - F-element 4359 1 71.29 TGTCCATCACCTTGGGTTACCACGGCCTTCTTCGGAGATTAAAGAGGTGCCTGATCCTGCTTCCTTCTCTCCATATTTGCAATAAAGCGATCGATCGGTTT:1 + chr3R 1013211 3' - Osvaldo 1288 1 76.24 CGCGGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAATTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGTCCATATCATACATAATAAACAAAATAATTACAGA:1 - chr3L 27396714 3' + gypsy6 7789 4 56.44 GTGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCACCGGCTCCAAAGTAATTGAAGCTGCAGCGG:1 + chr3L 8364382 3' - F-element 367 1 60.71 TTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTT:1 - chr3L 14854695 3' + Quasimodo 7334 2 72.28 TTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAAATTCAACTTGCATGTCTATAACATCTA:1 - chr2R 2002906 3' + Doc 178 1 73.27 CATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACCAGTCGTAGAGTTCTTTAAATCACCAGACCAGGAACAGGCCATGGATCA:1 + chr3L 16723241 3' - Rt1a 4855 1 67.33 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATATGCAAATTTATTTCAAATACTTGAGTAAGCTAAATGCCAGCCTAT:1 + chr2R 8949559 3' - P-element 36 1 55.56 AGNCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATG:1 + chr3R 17666033 3' + Transpac 367 1 42.00 GTCCACGTCCGACCACCTATTTTCTGACGATGAGGTTCACTCAATCTCCTCAAGCCCAGAACAGCGAAATTCACCCCACCCCCTGCCACCCCTTCGGAAAA:1 + chrX 10548815 3' + TAHRE 455 1 54.46 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGGGCCTCGAATGCATTTCATTTTCTAAGC:1 - chr3R 29357030 3' - 412 18 2 58.42 TTGGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCTAATGAACTAATCATATACGATCAAAAGCATATGCATTTGTACTTCTTTCG:1 - chrX 21493312 3' - BS 4691 1 69.31 ATGAAAATACTCACAAAAAAAAAAACAGAAAACAGAAAAAAAAGAAAAAAAACAATGAACAGAATGAATCCTTAATCTGTGAAAGAATGCCACGCGGTCTC:1 + chrX 3451201 3' - Transib5 380 1 67.33 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATAGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCC:1 + chr2L 20266005 3' + roo 356 2 78.22 AATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAACCTTCTTCTAGCACAACACACACACACACACTCACAACGCCATCCTTTACACATATGCCATT:1 - chr3R 27376693 3' + 1360 3165 1 64.36 TANCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAATA:1 - chrX 7768932 3' - hobo 48 1 74.26 AACGGTAGCTAATTCGAGGGGCGATTTTAACAAACAAATCTACAAAAGTCCCAGACATGTGCCGGCCACCACCACCACCCATAC:1 + chr2L 14024463 3' + 1360 2980 1 63.10 GGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTAC:1 - chr2R 5582182 3' - Cr1a 456 1 52.48 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCA:1 + chr2R 8547818 3' - I-element 28 1 51.49 GTNAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCAATATATTATGCTAAAAAAAAAACAAAAGTGTTGCCTATTTTTCGGGGCTAATATTGA:1 + chrX 6509839 3' - jockey 25 1 52.48 GTACATCCGGAGTAGTGTATGGGATTGGGCTGCGGACTGATATAGGGATTGGGTTGTTGTTGGGGCTATGAATGTGGATGGGGTAGGGCTATTAGGGTAAG:1 - chr3R 8145755 3' - Idefix 79 2 79.21 ATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAAT:1 + chr3R 9192595 3' + invader3 256 2 58.42 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAACATTAACGTGGTGGAGATGAGCTTCAGAT:1 - chr3L 7061165 3' + I-element 5305 1 71.29 TAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTCAAACATACATACTAGGCAATTGCAGACACAACCTACCCCAACTTGAGCACATAATCCAAT:1 + chr3L 2532856 3' + invader4 2671 1 70.30 CAATACTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGT:1 - chr2R 12446051 3' - hopper 36 1 61.46 CGNGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGCCCTAGTGTTCATGGCTTTTAATTTTATTGGATT:1 - chr3R 19450079 3' - F-element 366 1 79.21 TTNCTAGTATGAACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACAAAACTGATTGCAAATTGCATTCTGGGTATGTGCAAAAAGTCTTAAAGAACGAA:1 + chr3R 2216806 3' - invader2 27 2 41.58 CTTATTCGATTATGCAGCCGAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTATGATGGTCATAAATTTGTTTGCTCGCCCAGCTCATTGTGCTG:1 + chrX 14354514 3' + Doc3-element 4549 1 65.35 CACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAAC:1 - chr3R 19589896 3' - BS 4994 1 75.25 AACAGAAAAAAAAACAGGAAAAACGGAAAAATACACAAATTGAAATCAACGTGCACTGAATGTCCTCATTGAAGTGAAGGTAAAACAAAATCGCAAAAATA:1 - chrX 8822971 3' + Doc2-element 246 1 56.44 CGNCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTAAATATAGCCTGCACAGGAGTAATTTGTAAAAATGCTAAATATT:1 + chr2L 7393732 3' + opus 7474 2 58.42 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAA:1 - chrX 1600184 3' - BS 5026 1 59.41 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCATGGCCACGTCTCTGGTGTCTGTGTGCGTGTGCGATTGTGTGGGTGTCACAATTAAATTCTC:1 + chr2L 1089637 3' - hopper 13 1 62.89 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCG:1 - chr2L 10712118 3' - I-element 33 1 56.00 AAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCACTCCTGGGACCAAAAATTACAACCCAAAAACAAATT:1 - chr3R 22207981 3' + I-element 319 1 71.29 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGCCATCTCTGATCT:1 + chrX 19109317 3' + roo 9034 1 60.40 ATNAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTCAACAGGTGTCAAATTGTACAGAACACAATGTAATCCCAA:1 + chr3L 18816182 3' - roo 35 2 62.38 TATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTAT:1 - chr3R 4504047 3' + INE-1 559 1 71.29 GTNGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACGCGATCGCGTCCAGAGACAGCTTTCCGTGTCCTCCGACAGCAAGTTGCTCGACGAGGACATTCGCGAGGAGATGA:1 + chr3L 3593412 3' + X-element 202 1 73.27 CCNTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATTAT:1 + chrX 4175139 3' - I-element 335 1 58.42 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGC:1 + chrX 678825 3' - Tirant 50 2 73.27 TCNTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTC:2 + chr3L 23678151 3' - Osvaldo 22 1 70.30 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCGGCATTTGACTTGACTCCTTGTTTTGTTTCCCGTTCGCCAGAGTGTCTCTTGTTTTGTCAACAATT:1 - chr2L 14189316 3' - mdg3 5273 2 75.25 GTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGTCGCAAGATAAATGATGGCTCTACATAACAGCCGTCTATTTAGTTTCGATCTCAGACGTCTT:1 - chr2L 16096155 3' - F-element 260 1 65.35 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGCACAAGCACTTTTAAAATGGTAAACAAAAGTTGGAATATCTGATTT:1 + chr2R 10468642 3' + P-element 2858 1 49.50 TTATATTTAAAAAACAAAAAAATGAGAAACCAACCCTGCCATGGTGAGCTTTCCACGCTGCCACT:1 + chr3R 23401483 3' + transib2 2633 1 81.54 TAAAAGCCGCGCGCGTTAATCGCCGGCCAACCCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTGGACAGAGGAATCGATAGTCCTGCACCTGTTGGACAA:1 + chr3R 24900476 3' + gypsy2 310 2 65.35 TGGCGTGCATCCAGCGCCTGCAACATAGCCCCAGCCAAGACAGCGCGCAAAAACATTGTGGATTTCCGGAGAGCAAAGATTACCGAGAAGAAGACATTGCA:1 - chrX 3139423 3' + HeT-A 5647 1 67.33 TGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATACATACACCGGTCCATGACAACATAAGCCT:1 - chr3R 8617618 3' - flea 42 2 71.29 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGGGGAAAAAATAATCATATAATATATATGAATAA:1 - chrX 23283847 3' + Burdock 215 2 71.29 TATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGGTGCTCGACGTGGTGCTGCTGCTGTCGCTTTCGCTGTCCTCGCTGGTGGAGTCCATGGG:1 - chr3R 14660533 3' + R1A1-element 142 1 64.00 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGTGGGAGTTGTCACCGCTCACTGAAGGAATGCCAAGTGGCAAAGTCCAAC:1 + chr2R 13382023 3' + jockey 4964 1 50.50 CTTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTTGATAAAACACCTAATGATATAAAGTTTAATTACTGATAAAAGCAAGAACTAAGT:1 - chr3L 6353584 3' - flea 348 1 61.39 ACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAACTTGTTCACGCTTTAATGAATGTAAAAAGGAACATAG:1 + chr3R 25424237 3' - Doc 4513 1 62.38 TATACCACAAAATCTGAAAAGAAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCATCAAATAGTTAGCAAATTATATAAATTCATATATTAAGATAGCCAACATATG:1 + chr3R 18922353 3' + I-element 5179 1 71.29 GGCATATATTGGTTTATTACAAAACATATAATTATAATATAGGAGAAATCAAAAAAAACTAGATGATATATGATTTTTTACTAATGCGAGTGTTCATACAC:1 + chr2L 14365494 3' + blood 378 1 74.26 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCA:1 - chr3L 10522048 3' + roo 9022 2 75.25 AACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGAGCTTCGGGCGATAAAGAAGGAGAAATATATAACAATAACAACAGCAACAACAGTGACTGAGGCAGACAGGTCAA:1 - chr3R 25514784 3' + hopper 1413 2 77.23 AGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGCGGAGTCGAGTGGAGTGGGTCAGTATTTCTGTGGGAAGTGGGTGAGCTGTGTTCTG:1 + chr3R 11593116 3' + flea 4838 2 57.43 TCTCTTCGGTTTTTACTTGGACCTTAATTCCGTGGAAGCTTGACCCATGCGTTCGGACTCTACAACAGTTTTCCTATTTCCCCGGACTCAAGCCTCGCATA:1 + chr3L 26294733 3' - Fw3 104 1 72.28 GCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACAACAACAAACAACCACACACATATAAGC:1 - chr3L 20995167 3' + Doc 466 1 76.24 TTNATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTTGTGCCTGTTTTTAGCGAATTTCGATTTCGATTTCGATTCATTGATGCAATGATTTGGAGGCA:1 + chrX 4431918 3' - F-element 74 1 65.35 TTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGTGGGTGTGTGTGTTGGCAAAAGTAAATCGAAATTAAGGCTG:1 - chr2R 13046114 3' - I-element 4914 1 62.38 AGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACGAAGAATAGTTCCCTTTTAGCCCCGTTTACCCCTTTTTTTTCTGGC:1 + chrX 12205886 3' - Max-element 8324 2 54.46 TCAAAAACAAAAAGAAAAAAAAATATACCCTAAAAAAAAGCATAGAATGATTTAAGAAGCATTCGGCCACATTTTCCACCAATCGCATTTGCCCAAATGCT:1 + chr2R 20377705 3' + R2-element 3584 1 55.45 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGT:1 + chr2L 6184246 3' + roo 9033 1 64.36 GAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATTACTCTTTTTCCGCTCACTCCTGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAAT:1 + chr2R 22475977 3' + 1360 328 1 54.46 CGGACTTGTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACACACCACTTTTAATCTAATTTATGAACAAAAACCTTTTAAGATTTTGCGAAAGGCATGTGGCTCTTA:1 + chr3R 26140832 3' + 412 7533 2 65.35 CCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATATATTTTTATATAAAAAATACCTTGGTCCATGAGCAAATAC:1 - chr2R 17483750 3' - roo 291 2 59.41 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACTACATATACTTACACACACACACACATACAT:1 + chr3L 13306248 3' + Quasimodo 7359 2 72.16 TTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAATGCTGAGGCTGGCAAAGGTTGGTGGGCCCTGGTTGACAATATTCCTTGGGTGGGTAGCAGCTTTAAGGCTTCAACGAT:1 - chrX 7629280 3' - Ivk 245 1 57.43 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGAGTTGAGCTGCTGCTTAACTGTCCACTTCCTGGCGA:1 + chr2R 13334876 3' - pogo 38 1 64.36 GGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTATTAATAATGCGAACGCGAAATTTCATTAAATGGATAGGTTCGAAAAATTTTTTCAGATAAAATTGTTCAGGAA:1 - chr2L 21856494 3' - INE-1 550 1 62.38 GTATGCACACACACACACACACACACTTACTCACCTAGAGAGCAAGCCAGAAAGC:1 - chr2R 16376448 3' + accord 179 2 76.36 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCGATGAAACCAAATAGCAAGCCCATTACTTTTACAGTTGTATAGTATGAAAT:1 - chr2R 17222055 3' + 1360 3334 1 65.43 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACAT:1 + chrX 19959893 3' - roo 8686 2 58.42 TTGTTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTAACTCACCGAGCTAATGGGGCTGAAAGC:1 + chr3L 13195328 3' + roo 8645 1 72.00 GCGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATGTATGTATATGGTCTATATAGAACGCAGTCATAATCGTAAACAATTGACGGCGACCGCGACATTTTA:1 - chr3L 11450447 3' - Transpac 5 2 74.26 ACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAA:1 + chr3L 5662672 3' - jockey 391 1 76.24 GCNTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGATGGTGATGCCACTGCTTAAAATGGGTGTGAAGGATTGGTAAAGCTGGAGAAGGTGTTTAGTGT:1 + chr2R 2815810 3' - gypsy4 6448 1 62.38 CAGCCAAGGCAAAAACTATTAGTAGCTTGGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATTATATATGCAAGGATCTATTGGCGGATCTGTTGAC:1 + chr3R 5725071 3' - hopper 406 1 61.00 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACTGGAGACTTTTTTCAACCGAAAACCACATTTGTTTTGAAACGAATGCAGCCGGTCGCCGGAGCAG:1 + chr2L 8297419 3' - Tirant 10 2 67.33 TACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCCCAACCAGGTATCGAGTTTCCCTTGGGCAATGCAG:1 + chr3R 29951129 3' + Tabor 348 2 65.35 TTTTTGTATTTTCCTTTTTTTTTTGCCTTTTTGGCCATGCGTGCTAGGAGTCCTGGAAAGATCAAAAAATAATAGGCTGTCGATAACTGGGTAAAAAGGGT:1 - chr3R 28131533 3' - Doc2-element 254 1 55.45 TTAGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACATTTGTGGCCATGGCCAAGAAAATCTGTTTCTATATGCATATGCGAACAAAAAGAGCAACAAA:1 + chrX 9208320 3' + 1360 3119 1 70.30 CATACTTAAATTTTCATTATAAATGACTAATCATCGTAACAAAAAAATATTCCATTTAATGGCAACCATATCTAAGTTTATTTTCGCCTAAAATGCTTTCG:1 - chrX 14014038 3' + looper1 1648 1 58.42 TANACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACAACAGCAAC:1 - chr2R 20411850 3' + Quasimodo 7360 2 73.27 AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAATTAAAAGCACA:1 + chr3R 9192605 3' + invader3 5452 2 68.32 TGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCA:1 + chrX 21907814 3' - accord 123 2 56.44 GATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGAGAGAGACGGCAATGAGGGAGAAAGAGAGGGGACTAGCGAGCTT:1 - chr2L 18887038 3' - accord 7109 2 56.44 CAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAACAACTGGCCAACTTGGGTGCAAATGGAACACACACAGCT:1 + chrX 9595309 3' + 17.6 6945 1 61.39 TTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACA:1 - chr2L 260999 3' - Juan 4072 1 69.31 CTGGAGNGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGC:1 + chr3R 22494162 3' - 297 47 2 72.28 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCCTAGTACTACCTACAACATGCGAAATGCAATTTTAAAGCATACT:1 - chrX 10644815 3' + hobo 2907 1 55.45 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGGATCCAGAGTCGCCGCTCAGGCTGCTTTTCCCATTGCT:1 - chr3L 19275679 3' + mdg1 7421 2 61.39 ACTGGCCTTCTTAAGGGGCATTGCCGGCTACACAGCCATTTGCAGCCGGGGGAGAAAAAATAATCCGTCAGTGGCCAAAAGTGACGACCGTCATTAACCAC:1 - chr3L 22126715 3' + baggins 5131 1 66.34 CAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAGACGAGCTACTACCAAACCAACAAAAGTTGGCCAA:1 - chr2R 22904908 3' + Doc 462 1 65.35 GAGCCTGGTGCCACCTCTAGAGCCACGACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTT:1 - chrX 14317415 3' - 1360 69 1 72.16 TTGTTATTATTATTATTATTATTTCTGTACTCGACATTCTTAAAAACACTTATCTCGAGTGTTTTTAGAGCTTTCCAAAAAATTTACAAATTTCCTTTGAA:1 - chr3L 9550695 3' - mdg1 7055 2 47.52 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATA:1 - chr3R 20373256 3' - I-element 46 1 69.31 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTAAGCACTTCCTCTTCTCGGGCTGATTTA:1 - chrX 6518763 3' + pogo 2073 1 57.43 AAACAAAACAAAAAAAAATATACAAAGACTGTGTACAGTAGCAAAAAAGACACAAAGAAATGTTTGTGGCCTGTACTCCGAGGAGAAGGAGATCGAG:1 - chr3R 22635645 3' - Tc3 85 2 63.92 TGNAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTGTATATATATGTGCCGGCACACAGGTTGCCAAA:1 - chr3L 1830858 3' - 297 6605 2 70.00 AAATAGTTAAAAAAAAATAAAAAGAAACACAATTAGAGAAGAACTTGAAGTACTTATAGCTCAAATGGCCAAACAGCTTTGTTGATCCACCTTAAGCGATC:1 + chrX 6389543 3' + TART-B 10629 3 75.25 GTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTTTCGAGCTTCCAAGGATATGAAAAGGATTTAAGTGTGCATGATTACTAACTTTGTTGCCCC:1 - chr3L 17151780 3' - 1360 34 1 65.35 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCA:1 + chr3L 6442654 3' + roo 357 2 75.25 GTTAACCAGCAAGAGAAGGTTACCATCCCGAAGATTAGAGAAGGAATTTATATGGCTATTTGTTTTCGGTCGGCCAAGAGAATGTATGCCAAAATGGCCA:1 + chr2R 20557843 3' - Ivk 455 1 62.00 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTCCTAGCCAAC:1 + chr3R 31026129 3' - mdg1 7042 2 73.27 ATAAATAAATAAATAAATTAAAACAAAAGCAATTGTGTACAATATGTTCGGCATGTTTGGCATTTGTTCGGGATTTGATTGTTTTAAAGCACTAAGCACCT:1 + chr3R 16169195 3' + Juan 4215 1 64.36 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAAT:1 - chrX 7768920 3' - hobo 33 1 62.24 ATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCTAGATAGGGTTTCCTTTGATAGCCGGGTGTCGTTGCTGTTCGTGGGATAATGGCCGTCAAGTGGCAAGA:1 + chr2R 18812387 3' - G2 149 1 72.28 AAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTGTAAATAGTATTAGACATTTTCCAATCTAA:1 + chrX 8150476 3' + rover 7256 2 69.31 TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATAAAAGAGGTCAAATAACTCTTAATTACATAATTAAGTTTGCATTGTTCAAG:1 - chr3R 19734046 3' + I-element 5333 1 57.43 ACTTTATATCCTAATATGGGCGGTATGGATGGATGCGTGCGTGCGATGCCGACACCAAATTTAATAATAATTCTGCAGTTGGGAAATTGTTTGATAATTTA:1 + chr2R 15609484 3' + transib3 2722 1 75.25 ATGTACNTAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTGTTTGATGTTATTCTTGAGCCATAGT:1 + chr2L 18223824 3' - roo 48 2 77.23 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTGGCTTTAATCCTCAATGTGTCCACAACTTCGACTTTGGCTGGCAGTTTGTCAATGACTTGTTAGCCATG:1 - chr2L 9141538 3' + roo 402 1 70.30 ACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCTTGCCGGAGCTGTGGAAAAATTTCGACA:1 - chr2R 8936469 3' + F-element 189 1 68.00 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAAAGTGCCCAGAGATT:1 - chrX 1600170 3' - BS 5012 1 59.41 ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTA:1 - chr3R 14049367 3' - transib2 52 1 77.23 CANCTCCTTGTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCTATTATTCAGCAAATACGTGGTCAGTGCTAAAGCAGATCTCGGGATAAGAAAG:1 + chr3L 21999428 3' - Tc1 283 1 74.26 ATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGCGTCATAAATAAAATTGAAAAACATTCATAATGTCAATGGCGGCGAACGCAGTGAACGAGGGAAA:1 - chr3L 6014639 3' - 1360 3169 1 62.38 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGG:1 + chr3R 26434736 3' - Tabor 6888 2 72.00 CACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGTTTTTCCGGCGCCACTGGACCGGACAACCAGCGAGCGAGT:1 + chr2R 12840636 3' - diver2 58 2 61.39 TGNGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGATTA:1 - chrX 7583192 3' - I-element 21 1 58.42 GGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCCTGACCTAGCAGTTTCGTCTGCTCTCTCTGAGGCTCACCTCAAACGTGTTTAGCATAATTTTTTCGTTTCGT:1 + chr3L 18007868 3' + McClintock 6014 2 69.31 GCNTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGAGGACGAATTTTTTTTACTCATTGGTAAGATTGTCTTTC:1 + chr3R 12511892 3' + P-element 41 1 27.72 CCTCTGCAGCTGCGTGAGGTCCGATCGGGTTGTCAAGAATAGCGTGTTGGGCAGGTCCACTCTGTTGATTTGATAACAAGATTCGCTTCCAAAAGTTACAC:1 + chr2R 12782809 3' + invader4 2873 2 64.36 GCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACGGTCGAGATTTCCTGTGGTTTCTAGA:1 + chr2L 4217157 3' + rover 128 2 77.23 TTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATTAATATAAAAGCCTGAATATATTTTCCTGTTTTATTTTTTTTTTT:1 + chr2R 5953175 3' - 17.6 6958 1 65.35 AGTGAGGCATCACAACTATTCAGATGCTTTGGGATGGATTGCTTCGCAGAAGAATGAGACCTATAGTTTTGGGATGAGGAAACAACTGTGTCTTCCCGTTG:1 - chr2R 19149372 3' + diver 224 1 70.30 GAATCGAGAGCTATAATTTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGCGCAGATTTTCCACCAGACGATCCGCATCATTCATTGCCTCGGGGCACA:1 + chr3L 11821398 3' + roo 70 2 54.46 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGT:1 - chr2L 8297332 3' + Tirant 388 2 57.53 AGNAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGAACAATTATTAACAGTTTTTGATTTTACAACTTTAAAAT:1 + chr3R 15920717 3' - BS 5072 1 61.39 TTNTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAAGTGCGAGTGT:1 - chr3L 13878030 3' - flea 4769 2 63.37 TTTGTTGAATAAAATTAATAGGGGTGATTGCTTTGGTTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAATTAGTTTCATTAAAGGTTTTTTTTAATTTGTTCCAAAA:1 - chr2R 4608375 3' + Tc1 235 1 82.18 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAA:1 + chr3R 22494172 3' - 297 6618 2 65.35 ATNTGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGCGCCAGGACTTTTATCCCCCATCCTTCGGCTGGCAACT:1 + chr3R 28126814 3' - Bica 88 1 61.39 GCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCATCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGGATAGTATGGAGCTCATACGAAAACACAA:1 - chr3R 24700155 3' - Doc 339 1 71.29 ACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGATGCACAGCTGGCGTCGTCGCAGCTCTGCCGCGCTTAGTACATTGCTTAATTTCTCTGATTAACTGCTGGCA:1 + chr3R 28745220 3' + Doc 4516 1 55.00 ATGACAAAAAAACAGTTTTTATTGTTATTGCAGCACAGATGGACTTTGCATGTAAGGGCAAGCCGGGCACCTACGCCACCATCCAGCCCACTTCCGCCCAC:1 + chr3L 7212594 3' - looper1 1624 1 56.44 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTAATCCGCTTCCTTGTTTACTGAAATCTA:1 + chr3R 22208595 3' + I-element 5308 1 73.27 CCATGGTCTTAGGAGCAGATGTTTATCCAATCGAATCCAATCCAGTTCAGTCCCGCTCTGAGGCTGAGCATATGCACTTCTGGTGTATCTTCCCAGG:1 - chrX 18232452 3' + GATE 8065 1 75.26 ATNTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCAACTGATCGTTTGGCTAATGACCTG:1 - chr3R 26592602 3' + roo 9024 2 72.28 TANGTTACCTGCATCGAGGAATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTATTCAATTGCCATTGAAAAAGCTCGTTGGC:1 + chr2R 4559124 3' + pogo 2062 1 67.33 CACAATTAAACAATAATAATAATATAATAACAGATTAATATAGCCGTACTAAATGTTAAATGTAACGCACTC:1 + chr2L 20782941 3' + invader3 5037 1 59.72 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAACGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTATATGGTCG:1 + chr3R 13437255 3' + hopper 1409 2 71.00 TANATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATACTCTATAAGAAGAAAAAACAAAAACATAAAACGCTTTGAAA:1 - chrX 4022264 3' - roo 7 2 70.30 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCGGCGCGTAATGCGAGCG:1 + chr3L 6442696 3' + roo 400 1 70.30 GACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGAAAACATGTACTAACAACACATAGGAACTATGGTCTTTTATTAGAAAATTTTGAACTGGTTTTTAAGA:1 + chr2R 16343678 3' + gypsy8 4471 1 69.31 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCATCCATCAACTCATGCGTACATATGAGATTTTAGGCTATTTTCCGGAAAATCCTCATCGCAACT:1 + chr3L 12352976 3' + Tirant 8495 2 68.32 CAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' - micropia 17 2 58.42 CGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAAAACCAAAACCAGCTATAAGAAACTACTGTAGAAATATACATACA:1 - chr2L 12247502 3' + F-element 302 1 56.44 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCACGAAAGACCGGTAACGGCGGAAAATAAAAACGGTAACCGCAATTTGACCCAGGTTTTTACTTGCT:1 + chr3R 28063685 3' - Doc 16 1 65.35 TCNGAGTCAGAGCCTGGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCTTAGGAAGCCGCCGACAGTAAGTTTCAGCATCTCGAAATCGACATTAGCGG:1 - chr3R 6014539 3' + G-element 436 1 63.37 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAGCTTCTTTTATCGATTGGTTGATGGTGTACTTAATTAATATACCTAAGAAAAATTATA:1 + chr3R 4600510 3' + Tabor 7305 2 60.40 ACNGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTAAAAATATTTCCAAGCACTAACCATA:1 - chr3R 6535130 3' - Doc 4513 1 73.27 CGNCTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCCCGCCCCCAAACTACAATTCAACATTAACACTACCCAGCCGAAAAGTAGGCA:1 + chr3L 9064367 3' - jockey 33 1 48.51 CTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCTTCATTGTGAATTTCGGTTAAACGCTCTCTTAATTCCGTTAAAAAATTCTTTCTCAGTTTTTGGTTTTTCTA:1 + chr3L 24820550 3' - F-element 310 1 75.25 ATTAGTTCGACTCATAAAATAAACAACAATTTTACTATATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAATTAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGA:1 - chr2L 12283932 3' + 297 6960 2 61.39 TTGTGAAGTAGTTTAAACAAATGAACTAACTCTTTTGCATTTTTTGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCTCTTTCTTGCCTGTCACGATTTTAATTA:1 + chr2R 8179008 3' + Cr1a 157 1 76.04 GTATAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTATTTCTATTTAGACGTAAGCCAATAGCATCTATAAATAGTAATTATGCCCTCATACATGTAGAC:1 + chr3L 13988972 3' + hopper 1405 2 66.34 TGCTTATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGTTATCGTGTCTTATGTTTCGTTTTGTGGGGTTTTTTCAAAGAAGCTCAGAGTTACGCAGTTTT:1 + chr3L 7268466 3' - Tom1 180 1 60.40 AAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTACATACATATGTACATAGCTCGATATATAATGTACCATCCATATAGGTGTGTAGTTATGT:1 - chrX 5933824 3' + Burdock 6380 2 66.34 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAA:1 + chr3R 31026111 3' - mdg1 21 2 56.00 TANTTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGATGCCCAGAGCAAAACCAGCGTGGTCACCGA:1 + chr3R 30533353 3' + Idefix 7022 2 67.68 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCACAACATCGGCTTACAGTGAAAGAA:1 + chr3R 9605177 3' + opus 7464 2 75.25 CTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATAGGGGAAAAAATAATCATATAATATATATGAATAAT:1 - chrX 23283846 3' + Burdock 6352 2 70.30 TTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTA:1 - chr3R 4160057 3' + invader2 5099 2 70.30 CAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGGAAAACACATAAAACTTGATTATCTTGATTAAATTGCAAATC:1 - chr3R 6143562 3' - pogo 139 1 57.43 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGG:1 + chr3L 22349286 3' - jockey 26 1 60.40 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGACGGCGGCCGACAGCAG:1 + chrX 18356253 3' - P-element 37 1 42.57 AACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAAAATACACTTTCTGTGTGTGAGGGTCTGTGTTAAATCCGCAGAGAGATCTTCTGAAATGCATTTCCATTTTTCA:1 - chr3R 27402508 3' - opus 7431 2 76.24 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATTTTAAACTGGCTTATGATATGAAAGTACCCTA:1 + chr3R 23724187 3' - Doc 37 1 63.37 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGGTCTCTGTTTTCAACTCTTCTCTTCTCT:1 + chr3L 12991061 3' + hobo 2892 1 78.65 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCCAAAGTAATTTCACATGCGTGGATT:2 - chr3R 10824070 3' + 412 442 2 75.25 ATTTGCTTTTATTTATTGAATCTTTTTGAATAAGAACTAACAATAAGTTTTAAAATCTTAACTTGAAAAACTTGTTGAAATTTTTTCACATTTTTATTAGT:1 + chr2L 22063436 3' - F-element 4663 1 75.25 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATA:2 + chr3L 23456279 3' + 1360 3382 2 68.32 AGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGCCAAGTGTAAAGGCCTTTAGCGAGGACAAAACAATATCATTTGGCCCTATGCAATTGGATGTATGTCTA:1 - chrX 18003671 3' - I-element 5137 1 71.29 TTNGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTAAGAGATGGCATATATCACTGCTGCTGGTGGTAAGTGGTGAACATGATAATATTGCATTGCAACTTTAT:1 - chr3L 4859284 3' - jockey 4760 1 76.24 CANAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCATTGATTTTTCATTTTTTCTTT:1 + chrX 6082649 3' + roo 388 2 56.44 CAGTGATGTTTGGAGTTGTTTTTGTATGGTCAGCATTCTTACGTTGCCCAGCTACACCCACATAGTTGAATGGCATAAGCATATGCATCCTTAGCATATCC:1 + chr3R 1862126 3' + Cr1a 243 1 75.25 ACTGTTTATGGAGATTATGTTGGAGGGCGTGGGTGTGATATTTCCATTGGCAGCTGGCGGTGTCGGAGAACCCATCTTCACGAACTCGTACATGTTCTCAT:1 - chr3R 19129460 3' - gypsy 7361 2 78.22 GANGTAAGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTATGAATATTTCAGCTCTGAGCGATGAGATCTGAA:1 + chr2R 18649470 3' + opus 7466 2 64.36 CGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACGTGGAAACCGTAAATGTTGAGCTAAACCATTTATCTTCCGCTCGGTGGCTAAAGTTAGGAGCAAGCTAGTTT:1 + chr2L 14219311 3' + Cr1a 406 1 59.41 TCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTAATTAGAGGGTAATATAATATAATATATTCGCTATGCAAGCTAAGTTTCAGTTTAGAGACTTTAAAT:1 + chr3R 11735304 3' - Juan 3756 1 47.52 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACACCCTTCCGAAGCTCCATATGTATGCATCGCAGCTCCCTTCGCAAAGCCAAGAAGTGA:1 - chr2L 17660273 3' - hobo 15 1 46.00 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGACGGCGGCCG:1 + chrX 18356246 3' - P-element 44 1 35.64 CGNCTATCAGATACGCGTTACTCAGCTAGTGGGAGTGGAAGAAATATAAAGGACATAAGAAGAATCTACTCTTTTCGAGATTGTCAAATTACAATTATTGT:1 + chr3R 19718861 3' - INE-1 550 1 89.11 GCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCT:1 - chr3L 24213775 3' + invader2 5078 2 52.48 CACCAANAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTAAACTATTATCTTCGCCGAGGCCGAT:1 - chr2R 4508587 3' + 1360 3338 1 77.23 AACACACACACACACATACTCATGCTTGTATGTATGATTCAATTTGGCTGTACAGACGTGAGCATTTGCAGAACAGCGATAGCAATGCCAATAGCCAACAG:1 + chrX 6230297 3' + accord 186 2 54.46 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACTGTCGGGCATCCTTAACCCT:1 + chrX 10644898 3' - hobo 15 1 64.36 TTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCTTAGAGGCAGATCGCGAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAACAATCCCAAAAATTAAATCAACAGCT:1 - chr2R 4909352 3' + invader2 101 2 74.26 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTT:1 - chr3R 19446149 3' - 297 6582 2 68.92 TGNCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAA:1 - chr3L 10557587 3' + 412 449 2 66.34 AATATATGATAATTAGAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTCGGCAACAACAAAAGGCGAACGGGGGAAA:1 - chrX 5082841 3' - Cr1a 84 1 73.97 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTCTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCGTTTT:1 + chr2L 18214148 3' + hopper 1398 1 60.40 CGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTCAATGCCTTCTTCGCCGTTGCTTTTTTGGTCGATTTATT:1 + chr2R 21044374 3' - Tirant 8262 2 59.55 TCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCTTTGAACATTTCCCCGTAAGTCTTGAGAAGTA:1 - chr3L 9076542 3' + mdg1 7451 2 70.30 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATATCTGGTATGGGGAAGAGCTTCCTCCGACAGTGCTTCGAACTTATGGAGAACTTATAGCCTAAGGTC:1 + chrX 5887774 3' + S-element 1714 2 73.27 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCGTATCTATGTACACCGAATTGCGGTTTTGGGAATTTGTCGCTTTATTTGCGGCT:1 + chr3L 6522365 3' + pogo 2082 1 57.43 AAAATTAAAATTAAAATTAAAAAGATTACATTTTAGACTTATTCAAGAACAAATAAACTTTAATGAAAAATTACGTTATGTTCAACGATGGATTTATCAAT:1 + chr2L 5619740 3' + Rt1b 97 1 76.24 ACTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACATCACTCTTTGTTAGGAATGTTTTGCGCACAC:1 + chr3L 9722301 3' - F-element 127 1 70.30 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCAATGATT:1 + chr3R 6776610 3' + copia 233 1 57.43 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTT:1 + chr2L 21951229 3' - opus 49 4 77.23 TGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCATACCGAGCAGTTGATTAATATAAATGCTTGCCAAATTGATGA:1 - chrX 12773350 3' + accord 7185 2 72.28 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTCTCCGGCTGGAAAGTAAGCACTGTGGGGG:1 - chr2L 8297303 3' + Tirant 398 2 76.09 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACA:1 - chr2L 19644874 3' + blood 7351 2 58.42 GTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTATTAGTTTCCTTATAGTTA:1 - chr3L 27181997 3' - F-element 260 1 58.42 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTTTACG:1 - chr2L 9410805 3' + roo 9038 1 63.83 AAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAAGCTAAAAGTAGCCCCACGGAAAATGGCCAACGGGCTGACTGGGTGGGGCGGA:1 - chr2R 10925192 3' + G2 3024 1 50.50 TAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCCAGCATGTGTGCATGTGCATGT:1 + chr3L 17966999 3' + P-element 2770 1 23.76 AAGCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATC:1 - chr2L 12398156 3' + roo 9015 2 87.13 TTNGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGAGCAATCGAGTGGCACACAAAAAGCCAAATATGTGCAT:1 - chr3L 20669075 3' + Transpac 279 2 56.00 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGAAAGGGACTCGAGATTAGAGATGGGACTTCGAGTGGCTG:1 + chr2R 8951088 3' + P-element 2871 1 63.37 GGNTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGTGCCGAGTGGGTGTGGTTGTGTA:1 - chrX 12648266 3' - I-element 140 1 76.24 ATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTGAAACCTTATAAATAGGATCTCCGAAAGAAGAAGCTATAAGTCAGCTTAAACGTATTTTTAAAGAAATTGTCGATT:1 - chrX 21388476 3' - 1360 2 2 76.24 GCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCA:1 + chr3L 24916692 3' - Porto1 147 1 55.45 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACACAAACTGATAATCAATTTATTTACAATTTGGTTAATTGTACTAGCTAA:1 - chr2R 6670019 3' - Tabor 6866 2 52.48 GTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGACGCGGGTGTGTGTGATTGTGATTGTGTGGTATC:1 + chrX 11270107 3' - F-element 260 1 76.24 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATGCATGCAGGTCGCCAGAAACTAACTAACTAGC:1 - chr3L 19413948 3' - Burdock 6177 2 64.65 AATAAAAAAATGTAAGTTTTCTTTGACCCTATTCAACACATTAAAAAGAAAAGTACATCTTATAAGAGTAGCTTATAAAACTTATTTCATTTAAAATCGTA:1 + chr2R 13449794 3' + transib1 60 1 52.48 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCACACATTTGCATATACTATACGAGTGTGTGTGCAAAATAAAGCTCAAA:1 - chr2R 8314145 3' - hobo 28 1 58.42 GCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGTTTGGCCATTAACTACACACAAAACACCCAAAGAGGCCGATGGATTCGGAGGTGACCCAACCACTCCTGGG:1 - chr3R 22208009 3' + I-element 377 1 75.51 GTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTC:1 - chrX 21087613 3' - mdg3 44 2 78.22 TTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTCAGCATTCCTCGGGTATCAATAATTTCGTGCACCTGCCAGCA:1 + chr2R 14429334 3' - hobo 487 1 57.58 TTTTTCCTGATTTTTTTTAATAGTCAAAAATATAGTGCAATTTCCCGTTCGACAGTACAAATATTTTACAGATTCAGGTCGAATCGAAAGAAAAGGACTG:1 + chr2L 14239889 3' - Porto1 4430 1 77.00 AANAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTGTTACGAGGCTCGACGCAAATTAAAGTAAAAGTCCAACTTGAATG:1 - chr3L 14209001 3' + Quasimodo 7340 2 53.47 GCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAATATATAACAAGAATGCAACCTATCCAAGCAATCCAACCTAAAAAACTGCAACAATGTAATA:1 + chr3L 24209062 3' + Quasimodo 5 2 66.34 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGAACTATAA:1 + chr3R 1977619 3' + micropia 426 2 54.08 AANAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGCGTGTGTTCGCTGGAGCATTTTAAGCGCATTTCATTTGGCCAGCTGCAGCGCTGGGGGAATGAAACCTTTTTG:1 - chrX 11291707 3' - diver2 342 2 72.28 GTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAACGTCATCTTAACTATG:2 + chrX 22782071 3' - I-element 4890 1 56.44 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTTCATATGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTG:1 - chrX 17971837 3' + hopper 1386 1 54.46 ATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTATTTTTTCTTTTCTTTTTTTT:1 + chrX 10544344 3' - Doc 4623 1 73.91 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTAAGTATCCTGCGTCGTGCCACTGA:1 + chrX 20331899 3' - mdg1 15 2 65.35 GCNACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGTATATGGAAATTTTCCCT:1 - chrX 14040703 3' + roo 8615 1 55.45 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCC:2 - chr2R 544794 3' - HMS-Beagle 27 2 53.47 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATGTATGTGGGGGCAAGTAAAAAAATTGTATGCCCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAAGCA:1 + chr2R 16940419 3' + flea 5004 2 64.36 AAGTAATTATTATTATTAATTTATTAATTATAGTTATAGGCATGATTAACTATTTCATAAAACTAAGAGTTATGTTTAACAAAATTTCCGTTGATCTATGG:1 - chr2L 3992045 3' - invader6 4389 1 62.38 AACAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATCGTTGGACAAATGAAATAGCCGAGTTTTT:1 - chr3R 9149978 3' + gypsy7 5004 1 90.91 AACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGACCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGATCGCACGCTGAGGATCGGCATTCTCAATGTCTGCT:1 - chrX 14759294 3' + R1A1-element 489 1 63.37 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACCTTAATTGAATAATAAATACATCATCA:1 + chr3L 11891369 3' - Tabor 49 2 70.30 CCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGGCAGCGATCGCTCGGATTTGCCTTTTGCTCTGCAGAAGGGAAAGCGCGT:1 - chrX 7312443 3' + 17.6 7060 2 59.00 TACTGTGAAAATATCTCCAAAATATATGGAAGCGAATGATTCATTCCTTTTCCTAGGAATTTTTAAATAATAATTGCAGAATTTTCACTTAAGTTGTCATC:1 + chr3R 30314169 3' + Ivk 5231 1 89.11 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAATCTTTTAAGGAGAAAAGTGTTGCATAAACAAG:1 - chr2R 18528775 3' + jockey 4961 1 63.44 AGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGGGAGGCGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAACGT:1 + chrX 22782058 3' - I-element 4903 1 66.34 TTAATCGTAGTTTAAATACGGATCCTTTCTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATACAATATTTTAGTGGGTAGAGGACAGCAC:1 + chr2L 21252403 3' + McClintock 377 4 62.38 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATAAATTCCGTAAACTTTTCGCCCCCCCACTCGCCTCA:1 - chr2R 16940332 3' - flea 4773 2 61.45 AACCAACATCCAAGAAGAAATTTCCAACATACACACTTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGCCAGAAATCGAGTCTAACCAAGTCCTTGCATAACT:1 + chr3L 15335902 3' + mariner2 664 1 75.25 AAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAAGAACGGAAAAATAGGACAGGCTGCAAACAGTTTACCAGATAATAAACAAATCATAAGATAGGT:1 - chr2R 9787334 3' - rover 169 2 53.47 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACCCCAATTGTAAATATCTATATTATG:1 - chrX 16699022 3' - roo 8716 2 79.21 GCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:3 - chr3L 25232768 3' + accord2 172 2 54.46 TTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGT:1 + chr2L 21570251 3' - Dm88 4390 2 55.45 AAAAAAATATCTATATATATTTCAATACAATTTAGCAAGCATATACACAACATGTGGCAAGAGAATTGCCATAATAATTGCCACTTCTTTTTAACTGCTTT:1 - chrX 14325083 3' + Transib5 31 1 74.26 CAGCAATAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTTGAGTTACAACGGCAAAAAGAACCGAAACCG:1 - chr2L 6269806 3' + invader2 482 1 69.31 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCA:1 - chr3R 19589942 3' - BS 5040 1 65.35 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTAAGTAAGTATGCTGAAGAAATTGATTACTTTAAAAATTTCGTAAAAATGTGCAAAACCATTAAC:1 + chr2L 9488253 3' - 297 6587 2 40.59 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACT:1 + chrX 10644879 3' - hobo 11 1 58.97 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCTCAATCGTTAGCCGCGATTTTGTTTTCGTTTTGTAATTCAGTTTT:1 + chrX 4022387 3' + roo 407 1 77.23 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGC:1 + chr3L 1259226 3' - Doc 38 1 56.44 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATAGCTAATCAAACATTCATATGAATGGCATACGTT:1 - chr2L 7393663 3' - opus 7041 4 64.36 GTACAATAAAAAAAAAAATAAACAAAAAAAAAACTCGGAAAAAAACACTCTCCATCTCTGACTGCAAATGCCCCTTTCTCCACTCCGAATTTTTTGGG:1 - chr3R 15872419 3' + F-element 4684 1 89.80 CTGTAATCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTCTAACTTTTTATACCCGTTACAGGGTAAAAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGATAAAAAGT:1 + chr2L 23075091 3' + Cr1a 4231 1 46.53 GANTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATACTCGTATATAGGTACATATATATATCTGTGCAGCTGCCAAGTATGCAACAGT:1 + chr2R 13403810 3' - jockey 32 1 54.46 GTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGGTGGTGTCAAGAAGAATTGCGATTCAATTGCAGGGGCTGTGTGAAAGAACTACGCTATGCTGGAGCCATCGACCATC:1 + chr3R 27885831 3' - I-element 5106 1 74.00 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATTTTTGGATCCTAGTGATAACGGGTTCCATATATTTTCTA:2 - chr3R 12375152 3' + pogo 2068 1 64.36 CCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAGCCTCGAAAATGTCGACAGCCGAAAGTCTAGCCATAGAAGCGACTTACACTTCATTTTCTACATATTAA:1 - chrX 3751822 3' + Stalker3T 267 1 70.30 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGT:1 - chr2R 5485087 3' - 1360 51 1 78.00 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCATCGCCACTGCTTGTTGCATTCCGTTTTGTGTTATTTCGTGCTGTTCGTGTTTAAAGTTCTT:1 - chr3L 11789951 3' - P-element 16 1 61.39 GCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGAAGTATATGAATAAGGGAATCAGAGCGTGAGCGAAATACATGATCATGAAGAG:1 - chr3L 9530359 3' - 297 6744 2 56.00 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTT:1 + chr3L 22751982 3' + roo 9033 1 72.28 ACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCTATTGCTGGTGTTTGTTGATTGCTGCTGCCGTCGTCATCCGTATATCTTGCCC:1 - chrX 9170884 3' - Tirant 8273 2 58.16 GAGAACCTAAATTTATTATTATTAAAGGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACATCACCATATATTTTCTCGGTGCATTTTCAACTATGAAGAGAGAGT:1 + chr3L 3843191 3' + I-element 245 1 66.34 AANAAAAAAAACAACAAAAAAAGAAAACACAACAGGCACCACCATCGACACCGTCGACACCTTGACACGGCAGCCAAACATTCGCTGGAAGCGAGCCACGA:1 - chr2L 3925247 3' + gypsy11 3933 2 65.35 CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTATTGAATTCCCTTGCATCATCTGAAACAAACCACTCATCTCGA:1 + chrX 5912980 3' - flea 29 2 58.42 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATTTGTGCAG:1 + chr2R 8547827 3' - I-element 19 1 43.56 AAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGTGGCAAACGTATTGACAGCGATTTCCTTTCTTTTTCAGCTGACTTTGGCACTTTGCGTTGCACGTTG:1 - chr2L 3409120 3' + invader1 257 2 73.27 AACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCTGCTCGAGAGGCAACTATGAGATATGAGAATG:1 - chrX 523289 3' + transib2 115 1 69.39 ATNACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCC:1 + chrX 19820110 3' + mdg1 7416 2 66.34 AATTAATCGATATTAATCCTAATAAAATAATAACTTACTTATCTTTTTTGCAGGAGCTTTTAGAAGCAAACACACCTTGAAAGCCCCTGGATGCAGCCAAT:1 + chr3L 13830035 3' + HeT-A 5773 1 83.17 ATNTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGAGAAATTCAAAGTTGCGGCAGTGATGCTTTGAAACAGATTTCCAATATAAG:1 + chr3L 12569584 3' - 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invader2 5090 2 80.20 ACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAATGACCGACCTACTCAAGCGCGTTATAACCAAAGCGCGCACACACACACACACATGCATACA:1 + chrX 6820852 3' + Ivk 4962 1 66.34 GTGAGAAATAAACGAAAAAGCGGACAAAAAAAACCCACTTACCGTCAGGGCGGGAATGCAGGAGGCAAATGCGTAGACCCAGATGTAGAAAAAGGCGCAGA:1 - chr3R 13261712 3' + gypsy4 436 2 75.25 GCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGCTACCTCAGTTCAATAACATTCCCTACATAAATTAGAAAGTTAAAG:1 - chr2R 2968877 3' + F-element 4361 1 57.43 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACACGTTTTCCGAACCTATCTTCTTTCCTTTTTATTGTCCCTCCAGTTTT:1 - chr3L 22775900 3' + flea 226 2 53.47 TGNGTAACGGGTATGTGATAGTCGGGGAACAAGATAAAGTATCTTGTTTTTTTACTTCACTCCTGAAAATGTTGCAGGAAAAGCAGCTGCCAAACCGGCGG:1 + chr2L 3994301 3' + INE-1 548 1 52.48 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCCCTCGTTTCGATATGCAATCGGTCCATTAACGATAACAGA:1 - chr2R 10468574 3' - P-element 33 1 46.53 CTTAATGGGAGTTCATCATTACAACGGGGTCTACGGGGTCTACGGTTGGATCTCCGGGGGATACGGGGCAAGACACGGACAACGTAAAATTTATTACACCG:1 + chr3R 11538555 3' + 412 492 2 75.25 CGAAAATCAAAAATTTCACTTTTTTCAATTAACTAACTGCTTAACTATCAGACAGTATGAGCAATCTCGCAGGCCCGCGAAGTAA:1 + chr3L 14010087 3' + FB 155 1 74.12 TTTGGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGATATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTTTCTATTGTTTTTAAATTCTGGAAAAGCAGCCAAGGGGC:1 + chr3R 23886870 3' + INE-1 530 1 78.22 GAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATACAAAACATAAAGATGTCGCTAAATTTTTGCAAAAAACTGACTGATCTTTGCGTTTCAAAATTTAAAGAG:1 + chr4 274429 3' - 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Tirant 317 2 67.33 TTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAAATGGTTTATAGCCGCATTTTTGACAGTGAAATGTGCCTGCGTGCGTTTTCTGCAGCGGTAAA:1 + chr3R 25652087 3' - Juan 16 1 64.36 TCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTATCACAGCGGCAGTGGGTCTTATCGATGCTGTCTCGCTCGCACTCGCACACTT:1 - chr3R 23886760 3' + S-element 1695 1 58.42 GTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCTGCTCCAGACACAATCCCTTGATGGCAT:1 + chr2R 6213277 3' + 17.6 7083 2 76.00 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGCACTCGAACGCATTAATGTGTGG:1 + chrX 8337950 3' - hobo 45 1 76.60 GTCTTCCTCTTCACAATCAGCAGAGTCTGAATCTTAAGGCTGAGGGTAAGCAACTCGTTATGCCAGCT:1 - chr3L 21948485 3' + hopper2 63 1 64.71 GAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCTAACCGGCAAGCTGGCCCCCAGTAATTAGAGGCTCTAATAAAGCTAACGTTTCTCCAG:1 + chr3R 20119486 3' + HMS-Beagle 6636 1 62.38 AAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCATATAGCAAAAGCTATT:1 + chr3L 14638658 3' + 1360 19 1 59.41 TTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGTCATCAGAGAGTTTGAGGCTTCTAAAAATCAAATA:1 - chr3R 24191732 3' - TAHRE 10427 2 64.65 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTTCATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAGGTAAA:1 - chr3R 9325611 3' + roo 9039 1 54.46 AGAATAAATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACATAAGCAAACACTGGGTGATGGAACCACGCCCACCGAGCGATAACGATAACTTCAT:1 - chrX 17944309 3' + 1360 3182 1 60.40 GCNTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAGTTATACTACTGTCCTCCATGTTTTAAGGCTTAATAGGTAAATAGCAATAGAAAGGATATATCAAATGGC:1 + chrX 20858800 3' - Copia1_DM 9 1 70.00 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGG:1 + chr3L 9076635 3' - mdg1 7057 2 54.55 TATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCTCCGTTTTTGGGGCGCCCTCGCCACTCCCACCACACGGATCTGCGGTGGGCGGGAC:1 - chr3L 7060513 3' - I-element 4949 1 61.39 TTNTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTCCAGCCCAAAACTCTGGTGGCCTCC:1 + chr3R 26434763 3' - Tabor 23 2 56.44 TAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAAGTATATGTGGTTAATTGAGTACAGGGTAT:1 + chr3L 16268572 3' - 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Juan 4190 1 63.37 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTG:1 + chrX 5649420 3' + S-element 1679 2 63.37 AGNTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATA:1 + chr3L 1259235 3' - Doc 29 1 50.50 GGNATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATTGCATA:1 + chr2L 17205260 3' - hopper 23 1 59.41 ATNTTTATAAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCCGCGCCGAACACCGCCCACCTCCAAGCCATCCCCTCCTCCTCCTGGCTATTTCCGGA:1 + chr2R 8029846 3' - ZAM 8157 2 69.00 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAAATACTTGCGACACTCACAATGGCTTCTTTCATATTAAATTAGTTTTT:1 - chrX 22781999 3' + I-element 5331 1 53.47 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAAAAAAATCACTTGTATTACCTATATTAATGATAACTGAAAACTAAAGGTAT:1 - chrX 19052971 3' - roo 25 2 53.47 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTTTGAAATTGTGTTCTTATAAATTATATAAAATTACTATACCACAAGTCATTGCTCGGTGTTT:2 + chr3L 8331307 3' + roo 397 1 66.34 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACCACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAACATGTGTAA:1 - 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chr2R 18691149 3' + gypsy 7362 2 74.26 GGGCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAATTTTGCGCACTTGACACCTGAAGTGTCGTCACCTGTC:1 - chr3L 2392345 3' + Transpac 306 2 72.28 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCC:1 + chr3R 17674368 3' - blood 52 2 79.21 GTNTTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTT:1 + chrX 21087674 3' + mdg3 232 2 56.44 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGCAATAACAAAGTTAAAGGACCGACCCTTTGTGGTACTCTTTCGCCCGGAATC:1 + chr3L 13345530 3' + Transpac 5210 2 59.41 GTCCATGGGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTCGAGATGAGATGTGGGATGCGATCAAATTGCGGCTGAAATTGCTGTT:1 - chr2R 23055923 3' - G-element 4279 1 54.46 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCT:2 + chrX 678844 3' - Tirant 31 2 54.46 ACAGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATTTCTT:1 - chr2L 19644866 3' + blood 347 2 48.51 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAGTGTAGTAGCCAAATGTGTGTTGGCTGGCAGG:1 + chr3L 6900705 3' + pogo 2084 1 64.36 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAAAGATACAAATAGTTCATTCCATTCCATTGCATTCCAATATT:2 - chr2L 18754378 3' + roo 9038 1 56.44 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTATATTTAT:1 + chr3R 13437248 3' + hopper 1401 1 65.35 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTTTTGGTTTACAACTCGACTTATGAA:1 + chr3L 25401150 3' - transib2 23 1 56.44 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTTGAAAAATCGAGAAAAGCCAGGTTTTTAGTTCGATAAATATGATTATG:1 + chrX 14505851 3' - pogo 27 1 57.43 TANAAGTAAACGCGCTTCGTCGGCAAAAAACTCTCACGCGCAAATTTTATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGCAAAATTAAAAGTTAAAATCGTCT:1 + chr3L 17482323 3' + TAHRE 87 1 43.62 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAACGCGTAGCTGTGAGTTCCCCGCTAGCGATGGCAGCGTGAGTGCTTTTGGCG:2 + chr2L 16887994 3' - P-element 23 1 57.43 CTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACAGTTTGTACTCGCTAAAAATTCAAGTTATTTTCTTTGAAATTTCTCTGGATTGTACATA:1 - chr2R 9213627 3' + Burdock 6375 2 63.37 TATATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCATATATTTATTTCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCCAAGTGATATCCCAAGAAAACA:1 + chr2L 17152048 3' - Stalker 247 4 73.27 ACGCGGCATTGGGTGGCGTGTGCTTAAAGGGAAAAGGATGCTAAAGAGCATCAGCAGGCAAATGCGGAAAATACATTTTTCCCTCTTCGAGAGTGCAGATG:1 - chr3R 4608946 3' + invader3 5383 2 71.29 GCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCCATTGAATTGTTGATGAAACCCTTTCA:1 + chrX 20999778 3' - BS 37 1 61.39 GANTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCATCAGAAAATCTTAATCAAATCAAGTCCCATTCACTTCGTATTTTATGCCACTG:1 - chr3R 12514829 3' - opus 17 2 62.38 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTAT:1 - chr2L 21951179 3' + opus 463 2 65.35 CTTCTAAATAAATAAATAAATATAAAAAAAAGATACTTTTCGATTAATGTAGAGTGGTAACTATCGATAAGTATGGCGCGTTTTTCAAAATATTTGCATTT:1 + chr2L 16507901 3' - copia 229 1 70.30 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATT:1 - chr2L 19644870 3' + blood 343 2 54.46 TTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGCTTTGTATGGGCATTAATTTGGTTCAGATGGGATTTCGGTTAGATTGATTGATTGATTCGGACTCG:1 - chrX 10712323 3' - 17.6 6956 1 74.47 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCG:1 - chr3L 2485916 3' + jockey 4953 1 73.27 GGCTGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAATATACAGGATTATGTTTGTTTTTTTCCCCCTCCAAAGCTTTTATATTTTTAAAGGAAAGTGAG:1 + chr3L 14585932 3' + Tc1 120 1 57.43 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTATCTGGGTTACTCAAACAAGCCTTTAGCAATT:1 + chr2R 8294268 3' + 412 451 2 66.34 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATGGACAAGTTTTTTTTCAAAAACATCATGAATAATTTTGTCTTTTAAGATTGAA:1 - chr2L 20152986 3' + opus 7487 2 65.35 AACGGGTATCTGATAGTCGGGTTACTGGACTATAGCATTCTTTCTTTTGTTGCTTATAATAACTACGATTTACATGTAGTAAAATATATTATCGGCTGTTG:1 - chr3L 18756635 3' + INE-1 553 1 51.49 TTTGGGAACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGATTCGAAGAAGGCTGGTGGTT:1 + chrX 11733800 3' - jockey 4597 1 77.23 AAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAGCATAAACATCAACATACCACATCAAACTCCTTTCAAC:1 - chr2R 5981319 3' + ZAM 41 2 77.23 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTAACTGTATCTAGCTATTTATTTTGTGACTCGAGTTGGCAGTACTGTTTAGTTGGTATAA:1 - chr3L 16673559 3' - 1360 17 1 63.37 AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGCGCAGAAGTGCGAAAGGGAGAATC:1 + chrX 9439861 3' + roo 9067 1 72.45 TANGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTAAGCACTTCCTCTTCTC:1 - chrX 6518774 3' + pogo 2062 1 67.33 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8269 2 51.49 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAAC:1 - chr3R 17665974 3' + Transpac 5197 2 58.42 CAGTCCNACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAACTCCAAGACAGTGTCAACGTCGAGATGTTTAAGGCATCCCCGGAATCTTTTAATGGTTGCCA:1 + chrX 9757914 3' + Idefix 7063 2 71.29 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTCGCCTCAAATGCGGGCACAGGCAGAAA:1 - chr2R 16940312 3' - flea 4771 2 61.39 GCNTAAAGTCTAAAAATTGAGCTACACACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAAGCGGAAGCGTAATAAAAGCGT:1 - chrX 15176618 3' - transib2 2795 1 78.22 GATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTCATGCTTATGTGCAAGTTATCCAACCCATAAACATAGCACCCTTCTACAGTTCGTCATTTTCTTGTTTACTTCGTT:1 + chr3R 908359 3' - Tom1 207 1 76.24 AATATCCCATCAGCTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACACACCAGCACTTGTGCGTGTGAAGCAACAACACACA:1 - chr3L 6743786 3' + F-element 4403 1 65.35 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCAATGATTTTGTGAT:1 + chr3R 6776617 3' + copia 240 1 64.36 AACTAATTTCACTTTTTCCACTTTTTCAGCTGCGTATTGTTAGACACGAACCTCCTTTTTAACTGGAAGTCCATGTAGGATTGCGACTTGAGAACTTCGA:1 - chr2R 3287474 3' - X-element 44 1 52.00 CTTCTTATTGGGGATTTTACAAAGTGGGAAGCGAATTTCAAAGTTACAAAACTCGGTTTACAAAGTTGAATGAATGAATGAGATACGAAAACAAAAACAAG:1 - chr3L 18816084 3' + roo 409 1 75.25 CCNAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAAG:2 + chrX 19053023 3' + roo 354 2 81.19 GGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACG:1 - chr3L 7295164 3' - G2 2958 1 59.41 ATAAACTTCGAGATCTCAGGAACTACATAAGCTAGAAAGATTAGACATGCAGATTTCAGAGACGTAGACGAAGTAAATTTCTATCGAACTTTTTTTTCAAA:1 - chr3R 24826083 3' + INE-1 139 1 82.18 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACCCGTTCACATGAAACACACATTTCC:1 - chrX 6509770 3' + jockey 4965 1 52.48 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTGCCCTACCTCCCCCTTTGAAAGCCTTCTTAATTTCCCCTGTTCGTTATGCATTGTGCGT:1 + chr3R 4805136 3' - 1360 16 1 63.37 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAAATTAAAACAATACATTAAAGCAAGGAAACAAATATATACTTTTCGCACTTTA:1 + chr3L 12572682 3' + Juan 4191 1 51.49 CATTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTGCATTCTCATGGTTCTTTTGATGTGAATATAATTTTTATTTTTTTTTTCTCAGTGCATTGATGTCTCGATGATGT:1 - chr3L 9684437 3' + hopper 142 2 60.40 CAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCCTGGAATTGCAAATGTACAAAAACAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2R 13470739 3' + F-element 4504 1 63.37 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTG:1 - chr2L 18223793 3' + roo 354 2 77.23 TTNCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCTCAATCGTTAGCCGCGATTTTGT:1 + chrX 4022365 3' + roo 385 2 55.45 TTNTTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATAAGGAAAAAGGAAATATGAGGCTACGCAGAATATTTCGGCAAATATTATCAATCAAAATTG:1 + chrX 4372355 3' - Dm88 4389 2 77.23 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTTTGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCGTATCGACCGAAAATAAAATCCGTTGCAATCCA:1 + chrX 21388566 3' + 1360 3350 1 65.35 TACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATTTGAATAACATTTTAAACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr2R 2146570 3' + I-element 5071 1 66.34 GCNGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTTATAAATAGTCAAAGTTCTAGAATC:1 + chr2R 17077881 3' - Tirant 51 2 75.25 GGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTGGTTGGTCCGAGGGCTGTGCAGTGGGCGGATGGGTGTTTATTTCGAGCCGTATCTCGTGCGTGTGTGTGTG:1 - chrX 20646476 3' - Doc 455 1 73.27 GTNCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGATCTTGTAAATTTCTATAGATTTGCCAAAAAACTTTTTGCCACGCCACT:1 + chr3R 8485838 3' + INE-1 125 1 97.03 GTCGCGCGTTTTGATTGGCCCAGCCAAGCATAACAACGACACAAGCTTCAACAACAACGCAACTGCCCACCACTAGTACTTCCATAACCATAACAACAACC:1 - chrX 4245151 3' + G6 113 1 80.20 ATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACACGCAAATGTACGTAACAAGCTCTAAAAATTGTATTTGCCAGTAGTGAGAGAGCAAAAAACACGCTTTATTTA:1 - chrX 16463087 3' + I-element 5177 1 56.44 GTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAGTGAAATATGTAAGCTCAACCACATAAGATATATCTAC:1 - chr2R 3065330 3' - Quasimodo 35 2 67.33 TTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATACATACATAGATGACTCCGATGCATATAAGCAGAACTGCTCTCTGAAAGCCAATTTGGTTTTCTATTCTGTTTGCCA:1 + chr2L 22253844 3' - 1360 499 1 80.20 TCNACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGACAGCAGAAATTATACTGTGGCCCAATCGCGAGGGA:1 - chr3L 15221288 3' + roo 8597 1 64.36 GCGTGCGACAGTCAAATTCGTCGCATTCAGGCAGCAGCTCCCGTAAAAGTAGGCATTACTATACTGCATTGTCCGGGTTTTTATGATAAATACCCTCTTC:1 + chr2R 16997759 3' + BS3 1334 1 73.00 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCCGGGTTGGTTTG:1 + chr3R 17674379 3' - blood 41 2 68.32 TGAGGCATCACAACTATTCAGATGCTTTGGGATGGATTGCTTCGCAGAAGAATGAGACCTATAGTTTTGGGATGAGGAAACAACTGTGTCTTCCCGTTG:1 - chr2R 19149372 3' + diver 226 1 71.72 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTTTGGCTGTTCGGCTAATTGGCGGTTAGCACGCCCGTGTG:1 + chr3L 3781294 3' - FB 38 1 62.38 TTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGCCCACTGTTAGTCATTTTAGGCCTACTCCCTGGACATCGCGATTGGCTCCGCTTTGTGTAGCACTTAAGTGCTTA:1 + chr3L 22507680 3' - F-element 4424 1 75.25 CACTTTGACGTTGCTCACGAATTTCGTTTTGCATTTTAATTTTGCTGAATTTGTGATTTATTTATTAGTTGATTAATTGGTATTATTTGTATGCTTCGTTT:1 - chr3R 14087069 3' - Doc4-element 10 1 72.28 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACT:1 + chr3R 9322871 3' + 412 7500 2 68.32 CCCAGCGGCAAAAAGACCAAGACGAGCGCCGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTTCCTCGTCGGTCAGAGTGGGCCAAATGTGATGCGCCTCCGT:1 + chr2R 12155483 3' + Doc3-element 243 1 61.39 TCNGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCGCCAAGGTCTTAGTGTCAAGGAGCCCACTAACTTCTCCTCAAACTCTA:1 + chr3R 16612687 3' + Circe 104 1 58.42 TTNTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTATTGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCC:1 - chr3L 21144061 3' - jockey 4724 1 62.38 GAAAAAGTTAAACAAATTGCAGCGCAAACATTGTCTTCATAGCAAACTTTTAGCTTATTTTTTTTGTTCGGACAAATTTACGGTAGTAGCCGGTGAGGCCT:1 - chr2R 2879985 3' + transib4 204 1 57.43 CCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATTATTTGATGCCATTTACAAACACAATGGACC:2 + chrX 4175167 3' - I-element 307 1 78.22 TATATGTATGTATATATAGTAAAAGTGTTTACCAAATTCGTTGAAAAGGATGTAATAAGTTGAAAATAGAGCTTATTATCTTATCAGATCAGTCACGCTAA:1 + chr3L 18416497 3' + 1731 4412 3 70.30 GGGCGTTAGAGTGGGCATGGCAAAAAGTTTTGTGTCTAATCGATAAGAATTAACAAGACTAATAAAATTATAAACAAATTTCAAAAAATGGTTCAAAAGTG:1 + chr2R 5722308 3' - INE-1 212 1 80.20 ATGGTCCAAAACGCTTCCTTCTTTTCAAAGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTATTCTGGTCACAAGTTATAATTTTAATCTTTCGAAGTGTAGATTTAGG:1 + chr3L 18568078 3' - INE-1 41 1 77.23 CCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGT:1 + chr3R 15790058 3' - flea 4752 1 75.25 ATATATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCAT:1 + chr2L 19644913 3' - blood 7067 2 79.21 AGNTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATGCTGAAAATTAGAGGGCGTCA:1 + chr2L 1913051 3' + pogo 2051 1 76.24 TTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCAGTACACAAGTCCTGAACGAAGGGAGGAGTCAAGCCAAGGGAAGCTTGAAAAGA:1 + chr3L 10241719 3' - Bica 111 1 58.42 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGT:1 + chrX 5649419 3' + S-element 1678 2 64.36 ACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCTTTATTCTTTTGCCCATTGTTGTTGCCCGTGAGCATGT:1 - chrX 8707972 3' - 1360 3352 1 63.37 GGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTATG:1 - chr3L 26719148 3' - Tc1-2 24 1 61.39 ATTGGTTTTTTATGTGTATTTTAAGTTTAACTTTAATTGGTTTCTTTTATATATGCACTAACAATGCATTTAAATAAATTGGCATTGCTTGCATAAATCAG:1 - chr2R 14123863 3' + transib1 4 2 71.29 ATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAAATACAAGACAATGGCAACAATCTACAGCTGATAAAGAAA:1 + chrX 8373006 3' - S-element 398 1 63.37 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAAGTG:1 - chr3L 13878037 3' - flea 19 2 56.44 TGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTTGCAGCAATTGTTGCTGCTTGGAGGCTT:1 - chr3R 9178112 3' - I-element 162 1 72.28 GTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGTAGGGTTCTATAAAATAGAGGGTGGTACGTGATTGAATTTTT:1 + chr2R 16908798 3' - diver 5924 2 58.42 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATACGTTCCCATTCGGAGTCGGATTCGTATACAACTTCAACTCCT:1 + chr3L 447392 3' + Tabor 7308 2 62.38 AAATTATAACCTGCGGGCGTTGAATTTTTTTGGTGCTGAAGGATATTATTAGAGCGGTGCATCCAGCTCCCTGTAAAATCCCATCTCGCAAAACTCGCACT:1 - chr2L 14286659 3' + Gypsy12A_LTR 316 1 56.44 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTTGACCCACAAAATGGACGAACGACTCTGGACTCTGGACTGAATGTT:1 + chr3R 24739090 3' + pogo 2077 1 55.45 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGAT:1 - chr3R 12554868 3' - mdg1 24 2 56.44 AACGAACACACTCATAGAGCGTTGTTCACCTCAACACACTCTGTCTCCAACCCGTTTTGGTCTGCGTGGATTAACCCTTTTCTCGGCATAATGTGTGCACC:1 + chr3R 11311628 3' - Circe 217 2 64.36 TTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAACATTTTCAAATTTTGTACGCTCTGCGCTTGAATAGCTTAGTTGGTAAAGCGTTGA:1 - chr3R 6819309 3' - I-element 5181 1 55.10 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACGCTCCATGTTGATAACACATATTTAAAGAACAATACCCACAATTAGCAGCAATACAAAGTCTT:1 - chr2L 6157157 3' - jockey 4680 1 66.00 TTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGTTAGAAAGTAAAG:2 - chr3R 12554846 3' - mdg1 7040 2 78.22 ATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAACTTGTTCACGCTTTAATGAATGTAAAAAGGAACATAGTTTGGGTCAAAACAAATTTCCAACTAAATTCCT:1 + chr3R 25424270 3' - Doc 4480 1 72.28 CTNGGGCTGGGATTGATGGATATAGTAGGGGTAATGGAACGTCTTCCATTTCTATTTGTTGTGCTGTGTTTTGCATTGAACTATTTCCTTATCTGCGATCC:1 - chr3R 17545863 3' - 297 6534 2 71.29 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATCCAAAATTA:1 - 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chr3L 20178345 3' + McClintock 83 2 63.37 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGGTGCAGTTCTCTGGATTGTACTTCGGAACATGAGCGCCTAAAA:1 + chr3R 19560930 3' + hobo 2904 1 70.93 AAATAAAATTATTTGTTTTTTTTTTACAAAATGTGTGATTGTTAATAGATTCACGACGGGAAGAGGCCTACCTTCTCAAAGATGCGTCGTTTTAGGGTCAT:1 + chrX 8488612 3' - TAHRE 63 1 79.21 TGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTTCTGTTTTTGTTCGGTCTCCTTGCAATTCTGAGATCGAGTCAGTTGCTTGTAGACG:1 - chr3R 447076 3' + pogo 1944 1 60.40 ATNGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAGGTTGGCCGGAAAACAGATGTTAGGGTTG:1 + chr3L 5662718 3' - jockey 345 1 69.31 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGAACAACCAGCTATCCGAGACTAGGCAGAAGTTGCTGTATCAGCGCGTGCATTC:1 + chr3R 446098 3' + pogo 2082 1 60.40 CAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCTAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAGCCTTGCAGAATTTATATACTAA:1 + chr3L 22775956 3' - flea 4805 2 79.21 AATAATAAACAATCTTACATATATGTATATGTATGTGGGGGCAAGTAAAAAAATTGTATGCCCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAAGCAACGCGCTTAAAA:1 + chr2R 16940431 3' + flea 257 1 76.24 TTTTGCACGTAGTACGATCGTTAATACGCATCCATATGTACCTATATCTATTTTTTTGCTAGTGGGTGTGTGATGTGTGTAAGTTGTATACATTCAAACGA:1 - 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Juan 4059 1 55.45 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTTTTGTTCGGTTCTACATATTTATAGGTATAGAGCTATATAGATGCGTT:1 - chr3R 11175846 3' + roo 9046 1 56.44 TACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGGGGCGGCCGCTGCCGCCTCCCAGCGAACCGTCAATGGGAGCTTCTTGCA:1 - chr3R 29660153 3' - accord 260 2 72.37 TTNATAATAGCAACATAGTGTATAAACATTAAGTAATTGTTCGCTTTCGGGTGGCAATTAAAGTGTTGAATTGAAGCCCGGCT:1 - chr3R 17944525 3' + invader2 4894 2 66.27 TTATTTTCCTTTTTCTTTTTCCCCACAGGCTTGCCACATACACACACACTAGCACTGGCCCACACACACACGCACACAGTCTACATTTTTACAGGTTTTC:1 + chr3R 22720714 3' - Doc2-element 249 1 59.00 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTAATTTGCTGCAGATATGAGTGTGGCAACGTCAGCATTTGGGGCAGAAAGG:1 - chr2R 17208511 3' - jockey 31 1 55.10 CACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGATTGTCCTCGTCCTCCTCGACATTCGTGATCTCCGAATCCAAGTCGGAAAGAT:1 + chr2R 11585563 3' - accord 329 2 57.58 TTTTCACTTGTTTTTTTTTTAGGGTAATTGAGGCGGGGTAATACCAACTCTCTAACGGCCAGCTTTTGCTAATTTAAATAATTG:1 + chr3R 17113726 3' - Porto1 170 1 88.10 CACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTATCGGAAGCGGTGGCCCAACATATGCAGACTGTTTCTACTTTATCTATAGCTATACCCGTTACTCGTAGAGT:1 + chrX 23087700 3' - 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Doc 27 1 56.44 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCAACAGACAAGCGAAAATTTGATGAGAAATCAATCAAATG:1 - chr3R 779384 3' - F-element 52 1 67.00 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCCAGTATGGAG:1 + chr3L 9076648 3' - mdg1 18 2 59.00 CTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCACACACGCATACACACTCAGACGCGGAGACATCCAGTCGCACACATGTGTGCGACTGGATGTCTCCA:1 + chr3R 31871818 3' + jockey 4734 1 56.44 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTCGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAAT:1 + chrX 21564728 3' - diver 43 2 71.29 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTCTCTATGC:1 + chr3R 22341230 3' + hopper 1399 1 62.24 TGTTACTGTTAATTTTCATTTATTTGTTGCTAGTCAGAAATTACACATAGAAAAACTCAAGCTGCTGGGGCAAAGCCAATTCGCCGTTGGCCGGCATCGA:1 - chr3R 17412319 3' - 3S18 6083 2 70.00 GTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGATAATCAAGCTAAAGAAGGAATTGGGTTAAGTTGAAAGTTTAAAAGGACTGTTTGAAATGTCTTTTCTACACC:1 - chr3L 15387556 3' - Juan 4062 1 71.29 TGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGAATGGTATCTACCTACCTTGCCATCTGACTATGGTAAGTATTTACATAATAAGGTCTACTGGAGTGCAGTT:1 + chr2L 22997145 3' - I-element 4941 1 73.27 ACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGATCTCGCTTATGGCATTCTATGTTGCTTTTAACAACCAACTTTCTATCCTTGCGCCTTTCACGTGCCG:1 - chr2L 21227714 3' + INE-1 542 1 75.25 TANTATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATC:1 + chr3L 10557645 3' - 412 31 2 53.47 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGCAGATAGAAATCTGCACACATTTCGGCCTATCC:1 - chr3L 6900625 3' - pogo 39 1 69.31 CANAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAATTTTGCGCACTTGACA:1 - chr3L 2392366 3' + Transpac 5204 2 52.48 TCAAGGGTTTTTTGAATGTCCCTATATGTTTTTCCTTCCTTTCTAAGCCAGAACTCTAAAACGGGCTGTAACGCAAATCAAAACCACACTGCACATAAATT:1 + chr3L 15352512 3' - HB 427 1 56.44 GGNATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTAT:1 - chr3L 27182014 3' - F-element 277 1 74.26 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTT:2 + chr3R 20878177 3' - Doc 48 1 68.32 TAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTTCTATAAGAAAAATTTGATACAGTATTACTTTGAAGACTTCGGATGAAAATATAGAT:1 + chr3L 23155750 3' - gypsy 16 2 61.39 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAGTGTAGTAGCCAAATGTGTGTTGGCTGGCAGGACACTAAAGAGACA:1 + chr3L 6900719 3' + pogo 2098 1 78.22 CCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTTCCTTTAACGCTTTGCCTTTCCCCAGTTCTCAATTAGTGGACATTAATCTGAAAT:1 - chr2R 8594075 3' + Quasimodo 198 2 59.41 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGACGGCGG:1 + chrX 18356243 3' - P-element 40 1 35.11 CTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTACAGCCCAAAACTCTGGTGGCCTCCAA:1 + chr3R 26434765 3' - Tabor 6860 2 56.44 CATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACGAGCGATCTGCCTGTAGACCACACCTGCAGCGTCCTTGCCCATTCAGTCGTATTGATCGCG:1 + chr3R 3702783 3' + mdg1 244 2 68.32 AANTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATTGGAATTACGGTGGCTAAGCATATATTTTCCTTGCAGGATGGCGATG:1 + chrX 4349641 3' + 1360 291 1 58.42 ACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTATAGCGTTTTCTCTTGTTTTTTTATAATGAGTTATCGATTTTGTTAGAAAAAGATAGAGTAAGTAACTTAT:1 + chr3L 17915818 3' + INE-1 554 1 62.38 CGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGGTTCAAAAGCACTTTGTAACAGATTATTTGATTTATTCAGCCCTATTTTAACGGACAAAT:1 - chrX 9085830 3' - Doc 351 1 66.67 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGAATTTACATAAGCTTAAATCGATACTTTCATGAATGGAAA:1 - chr3L 11891320 3' + Tabor 450 2 56.44 GGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTACCAAGTACTAAACTAAAATGTTGAAACCACAAATGATTGAACTCATCATTGTGCCCATCAATAA:1 + chrX 5397019 3' - hopper 1089 1 46.94 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAAAGATACAAATAGAGCAAAAAATTGAGGGGAAGACATGAAAGGCATAAATGGCTGGAAGTGGGAATACC:1 + chr2L 18751374 3' + roo 403 1 63.00 CGAAGTTATGTACACATTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACCTCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGACGGCACCTGCATGGAATAGGCTA:1 - chrX 955372 3' - frogger 2356 2 77.23 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAATTTTCATAAAAAATGAATGCGCTGAATTTTTGCTCTGGTCGCTTTTAAGTGCTTGTAAGTGAAT:1 - chr2L 14007702 3' - pogo 8 1 71.29 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTTTGATTAAAGCAACTATTAATATCGAT:1 - chr2L 1912971 3' - pogo 6 1 69.31 AAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTAAAGAACTCATTTCGTCGAGGCAACGCACCTGAGACCACATTGACGGCTCAGGAGGAGGCTAGC:1 + chr3R 24535441 3' + invader4 2818 2 76.67 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCAACCAGT:1 + chr2L 10174169 3' + mdg1 7419 2 65.35 AGNCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATATACGTTCTTTTTACAAATAAAAATGAAAGTGAATTTTCATGTTCAACTAAACAGTTATTTA:1 + chr2L 21090991 3' - flea 4761 1 75.25 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAAATCGATCAATTAGATCTTTCAGCGGGCAAGAT:1 + chr2R 19149482 3' - diver 5903 2 65.35 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAACGAAAA:1 + chr2L 12323029 3' + hobo 2892 1 72.28 TGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGTCGCCCGATTGTTGTTCTCACTGTCACTATTCACCAGCCAATTGATAATTG:1 - chr3L 16980835 3' - F-element 4393 1 54.46 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGGGAGAGAGCGGCGGCTACAACAAAA:1 + chr3R 24006943 3' - P-element 45 1 31.58 TAGGAAGATGGCCGTTATGTTGGGATGCCTATGAAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATGAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTACTG:1 + chr3R 19449392 3' - G7 992 1 64.36 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGGTTGGAGACTTCAAATGATTTATCGCCCGATAGTTGAGTTCAAAAGC:1 + chr2L 2685810 3' + hopper 1407 2 62.65 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATTATTGCTTCGTGCTAGAATGGAATAATTACAAATCACAAGCAGAAACCGAACTATAATAAAATCCGA:1 - chr3R 27900382 3' - roo 8671 2 68.32 TGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGAACAACCAGCTATCCGAGACTA:1 + chr3R 446067 3' + pogo 2051 1 77.23 ATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCACCATCGATGCATTCGCGGGGCAATACCGCCTTTTCCTGAGGGTATT:1 + chr3L 25515259 3' + diver2 4873 2 53.47 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAACGA:1 + chr2L 12323026 3' + hobo 2889 1 75.25 GAATTGCGTGCTCAGCGGCAAAAATACCAATCCTCGAGCCCCCCATTCCCACCTACCCACCTACCCACCTAACCCCCTTCCTCGCATCCACAACGGTCGAC:1 - chr2L 6751258 3' + Doc3-element 233 1 41.58 GCTACTGAAAAGTTTTGCCCCGACACGGTTCTGTCGCCATCATGCGTTGTATGGAGGGAGGGTGAGGAGGGTTCCTTCTCTGTCCGCGTTTAATACAAGTA:1 + chrX 1808520 3' + mariner2 93 1 76.24 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGACGGCGGCCG:1 + chrX 18356246 3' - P-element 38 1 37.89 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACAAGACTAGTTAAACTATTTCA:1 + chrX 19030170 3' - Doc 19 1 63.37 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACGGTTTCTAAGCGAACATAAGACGACAACCATAACAATAAACTGTACATAGCAGTC:1 + chr2R 12751276 3' - Quasimodo 11 2 67.33 TTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAA:1 + chr2R 2949093 3' - 17.6 51 1 78.22 TATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGAATGTTGAAGGCTCCACTCATCGGCACACGAATAGTCCTCGGAATCGGTGTGAATCATATCCTTCAGATGGTTGTA:1 + chr3L 7664635 3' - accord 6921 2 78.22 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCACAAAAAAATT:1 - chr3R 20373234 3' - I-element 24 1 54.46 TTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCCGATATTCCCTCAAACCA:1 + chrX 19810592 3' - INE-1 555 1 71.29 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATAGCTCGGTACTTACTTCCTTGTGCCGCAACATTTTGTAGA:1 - chr3R 7761249 3' - flea 34 2 60.40 ATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATTGCATACTT:1 + chr2L 17205263 3' - hopper 20 1 62.38 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCG:1 + chr3R 19449376 3' - roo 29 2 62.38 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGCGGATAGATGCCTGC:1 - chr3R 20984204 3' - hopper 55 1 76.24 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGACCCACTTTTATGCATTGGACGGGGGC:1 + chr3L 12230771 3' - jockey 60 1 75.25 TTCATTATCATTAGTTTTAATTTTGTTAAATACAAGTACTTTGTAATATAATGAGATAAGAATCTCCATACTGCAGTAGTTTTGAAATATACTTTCGGTTT:1 + chr2L 11154816 3' + Transib5 2585 1 70.30 AAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCATTTATTGCGTTTCACATATTAAGGTTGGTTCTTAACCTTCCATTACTTTTGCTACAAATAGTT:1 - chr2R 7508148 3' - HMS-Beagle 6966 2 66.34 TAAAAGTTTTTTTTTTTGGTTTGGTTTGGTTTC:1 + chr2L 4087932 3' + FB 882 1 90.91 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATTGTACTTCGGAACATGAGCGCCTAAAA:1 + chr3R 19560930 3' + hobo 2918 1 68.06 CTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGGGCAAATGAATGGCTGTATAATGTGCATGTGATGTCCATTTGACTTATGTACATATGTACATTACTCAGATATG:1 + chrX 6334440 3' - Ivk 5271 1 80.20 ATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGAAAAATAAAGTATGGCAAAAGGTGCCATAAAATAAATAACACGAGG:1 - chr3L 9247556 3' + invader2 433 1 53.06 ACCAATCAAAAATATTAAGACAAATTGTTAGTGCTCCATTTTATATTTCAAATATTTATTCACTTATGTTTGTATCGTTTAAATGT:1 - chr3R 558125 3' + G4 3493 1 61.63 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCCGTGTGAGAGAATGGTCCTTAATTATTAAATAAATAAATTAGATCATTTCA:1 - chr2L 8649208 3' - F-element 41 1 54.46 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTCAATAAACTTGATCCGAAAACACGACAAGGCTGTCTGTCAGAAGAGCGAAAAATCGGCCA:1 + chr3R 10824136 3' - 412 7069 2 63.37 TCGCACACACACGCACACACACAGTGAGCACGCAGGATACAATACTATTCAAATTGACACTAATGCAACAAAATTGAAGCAGATGCAAGTGGAAATGTCCT:1 + chrX 17973830 3' - Stalker 446 1 55.45 TCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGT:1 - chr3R 4504045 3' + INE-1 561 1 73.27 CTAGAAGCCTAAGATTTAGTTTTAGGCATCTAATAGAGTTCATAAAAACATGTGAAAACGTGCTATGTTATGCGTGCTATCAGATACCCGTTACTTAGCTT:1 + chr3R 29588500 3' - Transib5 2929 1 47.52 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATAATTGCGTTTCAATATTATTATTTGAGGGTATGATA:1 - chr2L 5291616 3' - roo 8703 2 68.32 TCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACAAACACACACATACACACACACAAAATCCAAGAGAGAAAAAAGGGAA:1 + chr3L 10760920 3' + accord 133 2 68.32 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTA:1 + chr3R 31026110 3' - mdg1 7061 2 54.46 GGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTGCGAGTTCCAGATAAGCAACGTGACGCCGCCTCACGCGAGATAAATAACTATGTCCCCCCCCCC:1 + chr3R 21584765 3' + R1A1-element 4983 1 76.53 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAA:1 + chr3R 13349555 3' - Ivk 47 1 67.33 AANAAAAAGAAAACAAAAAAAAAACCAAACCAAAACC:1 - chr3L 2656807 3' + Doc2-element 220 1 75.68 AGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACATATATGTACGTACATATGTATGCAATTACCAAATCAT:1 - chrX 1904005 3' - gypsy 7026 2 66.34 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTAATAAATTTTAATGTTAAAGTAAGTGTTTAGACGAAGGACGGGGTATATAATATC:1 - chr3L 11920029 3' - Tabor 6859 2 59.41 TCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTACGCAAATGGTCAAAGAGAACTAGTAATTCGGAAGAACCGCAATTA:1 + chr2R 5701578 3' + S-element 1687 1 62.38 CTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGCCAGACATCGGCAACTGTTGCACAGGGCAAAGTTTACACTGCACTGAAAG:2 - chr2L 1204028 3' + roo 409 1 77.23 ACTATTCAACAACAACCACACGACAATTCAACAACAAATCAACAATATCCCTGTCGTCGGCCTTTCATTCGATTTGCTTGTTAAAAAGCTCAAATTTTATG:1 - chr2L 1262912 3' - transib4 329 1 63.37 ATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGA:1 + chr2L 23295847 3' - micropia 5089 4 73.27 AAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTGCTCAGTGCTTGTGGTCATTAGCGT:1 + chrX 11150528 3' + McClintock 137 2 75.25 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCTTG:2 - chrX 6654448 3' - jockey 4759 1 57.43 GTGCGTGTTGTGCTAGAAGATGATTTCCGTTCCTGGAAATTGATAATCAAATCAAGTAATAATGCAGAAGGAACTATATTGTGTTCTTCATTTACTTCGAA:1 + chr2L 19599078 3' - 1360 3205 1 75.25 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCCAGCTTGATGGCATTCTTAATCC:1 + chrX 6814323 3' + roo 353 2 76.24 TTNTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTACGTTTGCTGGTCGGTGGTCAACT:1 + chr3L 14257631 3' + 297 346 2 79.21 GAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATAACGCACTCTGCCATGTCAGCCTGCATGCACCGGTGTGCATGTGTGAGCC:1 - chr2L 4524738 3' - roo 9054 2 55.00 TAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATAGTTCGTGTCGCAGCCGCAGACGCAACACTTGACGGAAATGGCCAAGAAATGAGCCCCCGTTTGCCA:1 + chr3R 15502061 3' - Ivk 5264 1 76.24 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGGATACGCTTTGGTTACCTCGCCTGCCCCCTGAGGAA:1 - chr2L 12322985 3' - hobo 36 1 62.24 GTNTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTTTCA:1 + chr2L 6184256 3' + roo 9043 1 55.45 TAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGT:1 - 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chrX 8150382 3' - rover 5 2 74.26 GGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCTAAGAAAGCTGATCTTCCGGCTGAAAGGCCGAAATACTTACAT:1 + chr3L 12848350 3' - Doc 424 1 61.39 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGATGCGCTAGATAGTCGCCAGTAGCACTCGCAGTTGCTGCGGTGTGTGTGCGT:1 + chr2R 18005660 3' + hopper 1394 1 58.00 GACCTTCGGGCAACTTATTCCCCTCACCCGGCGGGGGAAAAAAATCTAAACTTATCAGCACAACCCATTCAATACATCCTATATCTTTATATTTTTCTGTC:1 - chr3R 30385623 3' + BS 188 1 59.41 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTGAAAAATTGGAGGCTGTGGACCTAGCTCATGAGGA:1 + chr3L 8386206 3' - jockey 4794 1 56.44 GATCTCGACGTTCATACGGGCGTGGCTGGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTTAC:1 + chrX 21575378 3' - INE-1 132 1 59.60 GACAGCATATGTGCCAACTACAGCGGCCTATGATATATGAAATGAACGAGATGAGGCGGCTATTGTTAACATCTGAGGGAATACAAGGGTAATAGCTATG:1 - chr2R 18740623 3' + rooA 7317 2 63.00 GAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGATTATATCGTTTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAAAGGGAAACG:1 - chr3R 17733245 3' + INE-1 549 1 70.30 TTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTCCTGTCATCGAGCTTGTTGTGTACAAATTTTTAGTGCCTTGTTCGTCGCGATGC:1 + chrX 9951901 3' + 1360 55 1 59.41 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGTTGGCAAGTGCACCACCCAACCAGCAGCCAGCCATTGC:1 - chr3R 30904210 3' + roo 9038 1 60.61 TTGGGATCAAAGGCGAGCTTAAGACAGAAGGGCAGAACGAATTGGGAAAACAAGGACTGTGAAAGTTGCAGAGGGAAATTAAATTTGGGTAAAATATTCTC:1 - chrX 8786792 3' + gypsy7 5314 2 58.42 AGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTCTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGACGAATGCTGCGTTCGGTACGCGACAGGACCGCCAGAT:1 + chr3R 19828004 3' - Quasimodo 378 2 67.33 TCAATACCAACTTATCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCGAGCATTATTTCCAGGACCCCCTAGCCACCCAAGGACCTACCCTTCGAGCCTCCT:1 + chr3L 4935852 3' + I-element 4998 1 57.43 ATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTACGACAACTGGCTATTGACTGATCAACAGTTTTACAATAATTAGCTTAAAA:1 + chrX 20778950 3' - diver 72 2 53.47 ATNTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGG:1 + chr3R 1977609 3' + micropia 413 2 64.36 GCNATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGAAT:1 + chr2L 19644923 3' - blood 46 2 70.30 TCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGAAAAGGGGCGTGGTTGTGGGCTGAAAGCAGCT:1 - chr3R 10129984 3' - Idefix 7115 2 68.32 AGACGCACAGTGAACTAACGGTACCGCAGAAAGGGAAATAATTAATTGTGAACAAATAGGCAGTGTAATTCGGATGCAATAAAATAACAAAACAAATTGGC:1 + chr3R 21373520 3' + gypsy8 4818 2 65.35 ATNTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCTATGAGGATGGGTTTATGTTTAACACGGAATTCAATCTTGTGAGGCAGCCTTTGAAATTTTTAGC:1 + chr3L 13386659 3' + G6 1780 1 75.25 TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTAATCCGCTTCCTTGTTTACTGAAATCTAGCTCGCATAAT:1 + chr3R 22208606 3' + I-element 5319 1 62.38 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCATTAATTTCATTGAGCTCG:1 - chr2L 20913979 3' - P-element 48 1 27.37 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAGAATTTAATACAACATCATATATATTTCAGTAATATAGTTCATAGAACGGCGACGTCGGACACGTCC:1 - chr2L 21612875 3' - 297 2 2 76.00 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAACATGCAGGGA:1 - chr2R 13318854 3' - Juan 4031 1 74.26 ATATCTATCGATCTCCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCGTTGGCTTTGACATCTCTTGTTTCTCAACGCATGTATGAACGCGCAGACAGTGAATAAGGAG:1 - chr2R 5188900 3' + INE-1 498 1 65.00 ATTATATCATCCATGTAAACATAACAAGTTTATCCAACTTGTTCTCTTAATAGATCCATCCATTGCCATATGTATGCAAAATGGTATAAGTAAGATTAAAG:1 + chr2L 6392709 3' - TLD2_LTR 38 1 65.35 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCTCAATCGTTAGCCGCGATTTTGT:1 + chrX 4022365 3' + roo 9048 2 55.45 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAACGAAAGCCCCACTTTGCGTGCAACTACAGCTGTGTTTAGTCGTTTAGTTGGAAAACTAATTGTCAATAT:1 + chr3L 16709418 3' - FB 7 1 72.28 GTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGACTTTATACAGCGTTAAAAGCGTTTGTAAAT:1 - chrX 14998295 3' - 1731 298 1 70.30 ACAATAATAATAATAATAATAATAATAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGAGAGAACAAGCTTAAAATTGTTGTGG:1 + chr2L 19142330 3' + mdg1 23 4 67.90 AATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTCTGGTGCCGCACAACAAGACGCGTTACGAATGCCTCTGCGATCCGCACCGAACGACGGCCGGAAACTGACTG:1 + chr2L 6632384 3' - accord 6929 2 77.23 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAACGGTAACCAACAAAGAGGAGGAGCCCAAACTAATGGTCGTAGACCATGGAGTTTAATAGGAAGAG:1 + chr3L 19861722 3' + 1360 3380 2 70.30 GTNTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTTTCTGTTATTCCATTCGTGTTGACCCCAACAAACACAGAAAAAAG:1 - chr3L 4576423 3' - I-element 4961 1 54.46 ACACACACACACACACACATTCTGGTTGATTTCGGAAGCAATTTTGGCACCAAAGTGAACAACCATGAAAGCGGGAAAAAGCAGTAGTACTCCATAG:1 + chr3R 28571280 3' + accord 7031 2 61.86 TGTGATCCGCCTCGAAGGACCAAAGCCTTTCGAAGAAGCTCTAGCCAAGATCGGAGGAGCATTTTTAACCAAGCACCAAGATTTATACACCAATTTGCCAA:1 + chrX 9788934 3' - GATE 276 1 67.33 GATCTGACCACGCCTTTATCTACGCCCACACACACACACTCGAACACACACCAACACCACGAGGGCAACATGGAATGTCTTTAATGTTAATGACTCGAGTG:1 + chr3L 13346605 3' - transib4 2517 1 74.26 TCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACTCTATTGAACGGCAACGGAACTCTATTGGATGCCAAT:1 - chr2L 8262333 3' + G2 85 1 61.43 AGNTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTATAATTAAGAAAATGAAATATTTGCGCAAGTTGCCCACTTTACTTTTACTTTCAG:1 - chr2L 9488125 3' + 297 6963 2 63.37 TAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTGTACTATGACGTTCTCTCGTTTTTTTAGTTAATATGCGATCGGCTTTAATAAAACATTAGTTTTAG:1 - chr3L 19468169 3' + INE-1 544 1 59.41 CCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCACACAGATACAACGCCCCCCAACACACACTCACAATATATGGAACAAAATGGCTAAAATTAGCGCACGAC:1 - chr3L 8743447 3' + Burdock 6308 2 71.29 TAATAAATAAAACAAAAAAAAAATAGATAAAACGTTATCGGCCATGGGGGTCTCTGACACCCGAATAAAGTTACCACGATGGAGAAGTCTGGGGAATGGAA:1 + chrX 12890083 3' + Rt1a 5077 4 75.25 TTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCACATCACCTTTCGTATCCCAAGCGTGTGGTACTCCTGAAATATGGATGAGTGGATG:1 + chr2R 14435212 3' + I-element 207 1 58.42 CGTTACTCAGCTAGTGGAAATGTGATCGCGAAATATTTTTGTATGTATCATGCAAAGCACCCAGAGTCTGCTTTGGGAACAAAGGTAAGTTATTAAAAGCT:1 - chr3L 25843708 3' - INE-1 535 1 71.29 TGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTATTAGTT:2 - chr3L 27182009 3' - F-element 272 1 70.30 GAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACAAATACAACAACAACAATGTTTCCTGTTGCCTTAGCGCTCTTCACCGTAATCAAGCCACAAATATGTTGCTGTCA:1 + chr2R 22292616 3' + micropia 5435 2 57.43 TGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTTCCGACTCAACGCTGATTATT:1 + chr2R 4235444 3' + Doc 4485 1 78.35 CAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTTGAGAAAAAGTATGAATTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTCCGGATTTTCATTACTCAGTGTACATTTAGA:1 - chr3R 11400635 3' - I-element 5173 1 69.31 TAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGATAATCAAGCTAAAGAAGGAATTGGGTTAAGTTGAAAGTTTAAAAGGAC:1 - chr3L 15387580 3' - Juan 4086 1 52.48 GTATTTTAGTATTAATACATTGGGATTTTCCTATTCTAGGTCTGGGATCCGCGTGTCAATGCCTCGGATCGGTATCATCTGATGCCCATTATTACGCCCGC:1 - chr2R 19667148 3' - hopper 1349 1 77.23 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGAAAGGGACTC:1 + chr2R 8951059 3' + P-element 2848 1 36.84 TACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAATTAAAAAGCAAAGTTAAACTCTGAAACCAACGATGCCATTCTACTAAATTCCCCCGCAAAACATAAAATTCA:1 - chrX 16473887 3' + TAHRE 10428 2 56.44 TTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATAAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTATTTTATTTCAAGCGAAGTGAATCACACGGCTGTTTGA:1 + chr2L 16887933 3' - FB 987 4 60.40 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCATCGAAAAGATATCAGTATCGGG:1 - chr3R 6776524 3' - copia 4893 2 55.45 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAAGCCCATTCTAATGATGTAGAGGCGCAACCAGG:1 + chr2L 6645734 3' - mdg1 15 2 64.36 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACGGATTACGG:1 - chr3R 446019 3' - pogo 38 1 64.36 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGAGCTTCGGGCGATAAAGAAGGAGAAATATATAA:1 - chr3R 25514826 3' - hopper 44 1 65.35 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTAGGTACTTAAGTAACAGCACTAATCCTGATGAAGAA:1 - chr3R 4971173 3' + 1360 3346 1 68.32 TATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATGAAATCGAGGGGACTGTGCTTGGGCATTTTGGTTTTTGGGGGCTTGTGAGATTACGATTTGG:1 + chrX 4502718 3' - I-element 5010 1 68.37 TGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATTAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGGTTCTGGTTCGGGATCTTTCTCTAAAGAATCGTTGGTCTCGT:1 + chrX 7867388 3' + Ivk 4988 1 58.42 GTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTAT:1 - chr3L 7295172 3' - G2 2931 1 54.55 TTTTCAATTAGCGCGAAATCCATATCAAGGTGCCGGAGGATTATATGAAACTGGCCAGGGACGATTGTTCGATATTAGTTCGCTGGCTAATCGCGATCGTT:1 + chrX 12628075 3' + invader2 4655 1 71.29 ACATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAAAAAAAAAACAAACAAAATCAAGTACAAACTGGTTGACTAAATGCCCTCCGGG:1 + chr2R 25222086 3' - accord2 7279 1 73.81 TTTTATTTATTTTATTTCATTTCTTTCCGCCGTCGCAGGAACTTTGACCTTTCCCCGTCCAAAATAGC:1 - chr3R 19799550 3' - F-element 89 1 91.18 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGGGCCTCGAATGCATTTCATTTTCTAAGCAAACATAT:1 - chr3R 29357022 3' - 412 10 2 66.34 TGATAGTCGGGGAACTCGACTACAGCATTCTCTTTTGCTTCGTATTAATATTTTTCAGCATGAACTATAGCAACGTATGTCTTTCACTTTCCACCTTTCAG:1 - chr2R 6087596 3' + INE-1 563 1 53.47 AATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTCAATTTTTATATACTTTTTTTAGTCTTTACACTTATTTCGTTGGCATCGACAA:1 + chr4 253250 3' + Tc1 1347 1 59.41 AAGCAAGGAATTGTTTAAATCAGGGATTGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAGTTGGAGTTTTTCCAATGGTTAAGAAACTAATAACGAT:1 + chr2R 2770068 3' - Idefix 7022 2 77.23 AGNAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACAGCAGTCGCATGCTGATGATGA:1 + chrX 17729086 3' - hobo 50 1 70.30 CAGGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGCGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGGCAATTGTTGTTTGTGGTGATTTATTTAGT:1 + chr3R 7178139 3' + INE-1 95 1 64.36 TCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAA:1 - chr3R 19589897 3' - BS 4995 1 74.26 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCACAAAAAAATTTCCACTGCATACG:1 - chr3R 20373221 3' - I-element 11 1 67.33 GGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGAGGCTTCAGTACTTGTTGTAGTTGTAAATGCCGCATTTGTTGATGTTGATGGTTCAATTGTAGTCGTC:1 - chrX 12968647 3' - Stalker2 7397 6 64.36 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCGTTACGCATCTTTCTTTGGCCCAACCAATATCCCCACAATATCAGGCACCGTCGAAATCCTATGCCTCACAATCT:1 - chr2R 5529178 3' + 1360 3343 1 53.47 CANTAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTAAGCACCTAAAATTTCGCTTTCACTTCTATCCGCAAGT:1 - chrX 364770 3' - hopper 36 1 56.44 TAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCATATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCAGCCAAAAACCAGAGCATCAAGTAATTTGGTTTATGGATTT:1 + chr2L 12813727 3' + Quasimodo 451 2 71.28 GACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTGCCACAGCCGACAAATCCCCTGAAGAGCTTCAACTGGTCGAAACTGCCGGACGC:1 - chrX 1292164 3' + jockey 4625 1 58.42 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTATCTCAATTTC:1 + chr3R 27900467 3' + roo 9030 1 68.32 ATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTCCTTTGACCCTATTACCTTCTCATTTTTCTCATTTGTCAATTTATAGACAGTTGTCGTCTGGCT:1 - chrX 12945898 3' - Stalker4 6878 2 76.14 CATTGCCAGTTATGGACGAAGCTGGCCTGATTCCCGATCACACGCTTGCTTTCTAGTGAATCGACTAGATGGCGGCGTACAGCGCAGCATCTGCCTACGCG:1 - chr2R 4933059 3' + G7 328 1 59.41 CTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAAAAGCATCATCGGATCCTTTTCGCCTTCGGACCTGTCGTAGAAC:1 - chr3R 7487638 3' + Ivk 4937 1 59.14 CTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATGAAGTTGAAGTGCGGTCACAGTTGCGGTTAGTTAAAATGGCCAAGTCGA:1 + chrX 6502135 3' + micropia 65 4 53.47 TTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAG:1 + chr3L 24916689 3' - Porto1 149 1 56.00 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGCCAGACATCGGC:1 - chr2L 1204066 3' + roo 9034 1 66.34 GAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGAGAGAAACGGAGATCGAAAAGAACTGTGTGCCCAGGCATTATACCTTTTTCGTTT:1 + chr3R 20958409 3' + G6 1640 1 63.37 CGCGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCATGCACATAGACACCTCCACTTCCACCTGGCACTCTGGTCATCCACACGGTTCGGGCTT:1 + chr3R 28942040 3' + Q-element 563 2 62.38 GCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTATCAACCGGCGGACATCTGTTTATCTGTCCAAGTGGCTTACTCCACTGCGGCATT:1 - chrX 19247651 3' + Quasimodo 323 2 58.00 TTNTTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGCTGGCCGGCCGTCCGCACTCGCACTAATAATTGCCTTTAATTATCGCG:1 - chr3L 447279 3' - Tabor 4 2 75.25 TATTTTATTGATATTTTAAATATATCTTACAAGCTTATTTTATTTCTTTAATAACTTTAACTTTAACTTCCTTCCTTAGCCATCTTTTTCGTGCTCTTTAC:1 - chr4 175715 3' - transib1 1921 1 57.43 AGNTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGCTTGTACGGCAGACAGTGAAAAGCCCACTGGTTCTACGAGCTGAATTAGGAAAGC:1 - chr3R 25322795 3' - Doc 317 1 61.39 ACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAAAAATATTCCCCAGCAAGGCATTTTCATTGAAAGCT:1 - chrX 681656 3' + Tirant 8377 2 60.23 ATAAGTGTTTGTAGGATCTAATTATGTACCAAAAATGATTTAAGATAAGGGATATATAGTTTCTAGTGAATCCTCGAAAGAAGATTACACGGAAAACTAAT:1 + chr2L 7765858 3' - Cr1a 4290 1 71.29 CANAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATCGCTTTTTGGGACACGGGACCTCAACTTCTTGCC:1 + chrX 12813773 3' - BS 7 1 63.37 AAATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCGAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAAATGGTTTTGAAGAACACATCATTCATCATCA:1 - chrX 16340120 3' + I-element 212 1 70.30 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGCTTTTAAATAGTTTCTTCGATTTTTTCC:1 - chrX 6082584 3' - roo 8711 2 74.26 TAAATAAGATAAGATAAGATAAGAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTT:1 - chr3R 15768203 3' + Stalker3T 203 2 65.35 AGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGCTCGCTCTCTTTACAAGTGTCCGCTACGCT:1 + chrX 13640729 3' + P-element 2877 2 67.33 CATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGCAGATGAACATCAGGCAGGCGACTTCAAACATTTTGCTC:1 - chr2L 12508110 3' + Quasimodo 7040 2 61.39 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTTTTTTATTCAATTGCCATTGAAAAAGCTCGTTGGCTAAACAACTATC:1 + chr2R 4559136 3' + pogo 2074 1 58.42 GTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGAGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAACGTCATCTTAACTATGCAA:1 + chrX 22782074 3' - I-element 4886 1 52.00 CACTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATG:1 + chr3L 26007750 3' + G5 4753 1 53.47 ATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGTCAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTATTATCTCAAACGGCAAGCAAACTACGTAAGATACCT:1 + chr2R 11694355 3' + invader2 4798 1 64.36 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTTGATAA:1 + chr3L 22751987 3' + roo 9038 1 63.37 CTCTCGCTTCTGATTTTAAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTGGTTTTGTTTATTGTTTGTTTTTTTTTCTTCATATTTGCAAGGCCTATTGAATAACTGTT:1 - chrX 18321619 3' - Porto1 225 1 64.36 ACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACCTTTTTTCTATTCTTTTTAACTTTCTGCTGCTTGGCATAAAGTTTGAGTTGTCACGTTAC:1 - chr3R 12849802 3' - accord 7044 2 68.32 AATATAACATATTTATAGTTTGTCTAAACATATATTTTGTTTAAATTCTGGAACAAATTAACGGTATTCTTCAAGCTACAGATTTGTCGTTACTATCGTC:1 - chr2R 5018776 3' - rooA 7269 2 73.00 ACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCTTTGGCCATGATTCGGTTTTGGTAGCTTGTTGTCC:1 + chr3R 12770090 3' + Cr1a 63 1 68.32 GACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACACTCACACACTATCTGCTGTAACTAAATACCCAACAAAGCGAATATGAATATTTT:1 + chr3L 7433814 3' + accord 7081 2 72.92 CAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTAAGAGATGGCATATATCACTGCTGCTGGTGGTAAGTGGTGAACATGATAATATTGCATTGCAAC:1 - chr3L 4859289 3' - jockey 4765 1 71.29 AAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATATTCTTTGCGTCAAGCTGCTTACTTAACATACCCT:1 + chr3L 23869142 3' + gypsy 7407 2 67.33 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGTTAGAA:1 - chr3R 12554853 3' - mdg1 9 2 71.29 ATTCCAAGCTCCTTGTGGATATCGGAGTTTTCATGGTATTGACAGGCATTTCCGGCGCCATTTGCATGGCCATTGAAGCGTCCATTCCTAAGTCTGCACCG:1 - chr3R 6655387 3' - G-element 4031 1 71.29 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTATGAATATTTCAGCTCTGAGCGATGAGATCTGAATAGATTCTCG:1 + chr2R 18649480 3' + opus 7476 2 61.39 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAA:1 + chr2R 11164501 3' - roo 20 2 59.41 AAAAAAAAAATAGGGAAAATAGTTGACAAATT:1 - chrX 3671851 3' + Bica 340 1 87.50 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACGCACCCTTAGCCCATTTTATTTCCCATATTTCGAACGTACTCTTTCGAAAACTGTCA:1 - chrX 6883239 3' + Burdock 237 2 58.42 CTCAACTGTGTGTATATTGAGGTCTTTATGGAGCTTGGATTAACACATTTGAATTATCAAGAAACAGGACTAGAAAAACATGTGAAATTGGCACAGAAGTA:1 + chrX 8047760 3' - Helena 1203 1 73.27 AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTT:1 - chrX 4806675 3' + roo 391 2 54.12 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATTGCATTTTAAATAGTGCCGCATTTAAGGGTGCTTTCTT:1 - chr3R 4679238 3' - copia 4885 2 63.37 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGAAAATCCACTTCTTT:1 - chr3R 24461807 3' - F-element 32 1 52.48 CTNATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAGCTTCTTTTATCGATTGGTTGATGGTG:1 + chr3R 4600479 3' + Tabor 435 2 77.23 TNACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTGACACGGGGCGAGTGTGCCACCAAAG:1 + chrX 5649445 3' + S-element 1705 1 68.00 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGATGTCAGCAACGCTCGTTCGCCCGCCCAACTTTCAGCA:1 - chr3R 11538429 3' - 412 6 2 73.27 TAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCC:1 + chr3R 15502553 3' + Ivk 5348 1 57.43 TANCAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTTAGTTTAGTGTGCTGCACGTGACTTGATTGTCAGTTGCAATTTAA:1 - chr2L 17280454 3' + 1360 15 1 54.46 CTNAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTCATTGAACACAGCTATATATACTCGTACTTCATAGGCTAATAAACGCGTTCTTCTGCCTGTTGCATCATTTTTATC:1 + chr2R 5740017 3' - HB 24 1 40.59 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAAGCCCATTCTAATGATGTAGAGGCGCAACCAGGTGTTTCTA:1 + chr2L 6645742 3' - mdg1 7 2 72.28 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAGATAAATGTAACGATATGGACGTGTAAACACAATCTATATGGTGTGG:1 + chr3L 7781269 3' + 297 370 2 58.42 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAG:1 + chrX 8422115 3' - jockey 4805 1 70.30 AANTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGG:1 + chr3R 8191534 3' + mdg1 7422 2 63.00 GGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGTCCTCCGTTTTCCTTCCTTCCAGAAGTTCCACAATCTGCACAGAAAATCCCAGAATGCCAGAGA:1 - chrX 7533072 3' - Doc 4538 1 67.33 TCNGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATAATTTATAGCTGAGCTAAGTGGAGAATGTTAAGAA:1 + chr2L 22045119 3' - jockey 4712 1 66.34 AGNCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAGTGTAGTAGCCAAATGTGTGTTGGC:1 + chr3L 6900698 3' + pogo 2078 1 58.00 TTGTTAATATATATTTTCAAAACTAGCCCCCCTAGAACTGTGAATTCTATAAACAAAGTAAGTTTATTTTTACAAATGTAGGAAATATTCTTGCAGTGTA:1 - chr3R 25817466 3' + TART-C 11027 1 76.00 TTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTTAGCCCTTCGCCTTCTTATTGCTTTTGGCCTTACCTTTTTACCACTCCAGTTTGCCTTTAT:1 - chr2L 9848499 3' - I-element 379 1 65.35 AGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAAATTA:1 - chr2L 23299976 3' - invader1 420 3 55.45 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATAATTTAGCATTTTCAGTTTAATTAGCTTAAATGCTGGAAAAT:1 + chrX 18952116 3' - mdg1 7072 2 60.40 AANATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGATGCAGAAACAGATTAAAGATCCAAATGCAGTTGCACACTTGGAAAAATAATTTATTTTT:1 - chr2L 7270527 3' + G2 276 1 68.32 TTNCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTGGCTTTAATCCTCAATGTGTCCACAACTTCGACTTTGGCTGGCAGTTT:1 - chr2L 9141559 3' + roo 9044 1 52.48 CCTAAATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCC:1 + chr2R 2527411 3' - roo 76 2 69.31 AAAATAAATGTAAAAACATTGTGTTTAATGCTGGGTCTTAGTGAAGGAAATGCTGGAGGTGCTGGAGGTGCTGGCGAGATGAGCCGATGGTAATCGTGGTT:1 - chr3L 3390460 3' + looper1 1812 1 78.22 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTTCAACTCTTCTCTTCTCTCCACGCTTTCCATGCAAATTATTGTAGCCCACTTTGCTGCAGTTGCCACTGC:1 + chr3L 12991113 3' + hobo 2932 1 73.27 TGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGGAGTGTGCGCGAGTTAACGGGAAATCGCAATAAATGCGGCAAATGTGTTGCTTTGTG:1 - chr3R 22825117 3' - accord 7034 2 81.44 TTATGCCTACGAACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCAGAGAGTTTGTGCGTTCATCCCACCAAATTAATAATTTGTGTGAT:1 - chr2R 1119892 3' - Rt1a 4969 1 54.46 ACACATGTATATGTATATAATATAACAAACACATAGTCTTAAGCACACCATGCCCGGATTCGAGTTGATCGGCAAAGGGATGCGAATATCCATGTACATCT:1 - chr3R 18728805 3' + Stalker2 254 2 56.44 TGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTAATAAATTTTAATGTTAAAGTAAGTGTTTAGACGAAGGACG:1 - chr3L 11920043 3' - Tabor 6873 2 61.39 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATTATTACAAGGCACTCAGCCAGCGAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTTG:1 - chr3L 10557576 3' + 412 7537 2 55.84 AGATACCTGTTACTCAGCAAGTGTGAATGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTTTAGTGTGCACATTTGCTGGATTTTCCCATGCAAATGTGCAAGTTTTC:1 + chr2R 15426816 3' - INE-1 542 1 57.43 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCACGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTTTTCTTGTTTTTCA:1 - chr2R 8951016 3' - P-element 36 1 37.89 CCGCTTCCTTTCTTTTTCGCATCTAGTCAAAGAAGATTTAAAAGGTCTCTATAATATTACTAGAGTGGGGTGCTTAAATCTTAAGAAGAATACGTTGCGAT:1 + chr2R 5549035 3' + Porto1 4602 1 76.24 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTCCTAG:1 + chr3R 31026124 3' - mdg1 9 2 68.32 TCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTACTCCATCGAGGCACTGTGAGTTTCGAAGAAAGGTTCTGT:1 - chr3R 7762106 3' + flea 4655 1 61.39 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAGGTAAAAGCTTTGCGCCATTAAAAACGACTCA:1 - chr3R 9325585 3' + roo 402 1 72.28 AATATACGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATGTACATATGTCTATGAGGTGTCATAACAAGATAACTTATGTTATTGAGTTTTTCGGAATTTGT:1 + chr3L 20209652 3' + Burdock 6381 2 67.33 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTTGAATCGTGTGTGCTGGTGTAAGAGGTGCCTATATGCTACTAAAAAGAATAT:1 + chr2R 20309406 3' - roo 21 2 57.58 GGNTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATTTCCAAGCAGCTGAAACACTTTAATTGTGCTGAATATTTTAATATTTTTCTTTAAAA:1 + chr2L 11314111 3' - 297 6586 2 68.32 GTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGGAAAAGAAAAAAATTATATATCAGCTTAGATGAACTTGT:1 - chr2R 13392461 3' - hobo 2659 1 61.39 TTTCTTTGAAATAATGTAAGTGGTTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAGAATTTAATACAACATCATATATATTTCAGTAATATAGTT:1 - chr2L 21612902 3' - 297 6611 2 65.35 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATCCAAAATTAAGCATGTTTTATAAGAATCACTGTTCTAG:1 - chr3R 7382590 3' + copia 244 1 67.33 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTT:1 - chr3L 22920399 3' - 1360 50 1 76.00 TGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAATGTTTG:1 - chr3R 9127378 3' - invader3 47 2 69.31 GTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTC:1 - chr3R 17665996 3' + Transpac 5175 2 80.20 TTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGAATATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTC:1 + chr3L 15099634 3' - G4 3817 1 38.61 TTCAAAGTTTTTTTTTTTGTTTGTCATTTTCACAATAATATGAAATGAAATAACTGCTTTTAACCCA:1 - chr3R 26537848 3' + Tc1 1469 1 58.21 ACCAATATGGACGTATGGAACTCTGGGAACTGCTACAGATGGGTCCAAAACGTATTTGGAGCGGCCAGAAAGACCCGATCCGCCGGAGGATGATGCGCCGC:1 - chr2R 8897221 3' + Porto1 4262 1 71.29 ATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCCGCAGTCTCGGCAGCATCAACATCAACATAAAGCATAAACAG:1 - chr2R 20443615 3' + Quasimodo 184 2 64.36 TTTTATACATATACATATACATACATACATACATATACATACATACATACATATTTACACATATACTTATTTTAACAATTTCAGCTATATTATTTAATAT:1 + chr2L 14948265 3' - Stalker4 7200 4 54.00 GGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTTCGACCAATCCTTTTGACACGCTAACCAAAAAGTTCGATAACGATA:1 + chr2R 13931500 3' + roo 8944 2 55.45 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAGACACAATATAACCGAGTCCTGTTTTTCTAGTTTCAAAACGATT:1 + chrX 2172296 3' - I-element 33 1 57.43 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAG:1 + chr2R 544867 3' + HMS-Beagle 7015 2 55.32 GTGTAAAGAGTTTCTTGACACTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTTTCTCGACCATGACAAGAATTTGTTTAAACAAAAAGACCCAGC:1 + chr3R 6944208 3' + S-element 1504 1 62.38 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATTATTGCTTCGTGCTAGAATGGAATAATTACAAATCACAAGCAGAAACCGAACTATAATAA:1 - chr3R 27900389 3' - roo 8678 2 63.37 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTT:1 - chrX 14040730 3' + roo 8602 1 67.82 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATTGCATACTTT:1 + chr2L 17205264 3' + hopper 1407 2 71.91 CGNTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGATTGACAAACCCCCCAAAGGGGGGGTGGGGTAGGGTCTTCCTGAGGGGGTTCCTGC:1 - chr2L 7142776 3' + GATE 67 2 57.43 ATTTAAAGGATGGTAGAGTGAATTATCTCATCTTTTGAGCTTTGTTATCCAAAAATCTAAGATATCGCCTCTTCGAAACCTTTCTCCGCATATTTGCCCCC:1 - chr2L 15354720 3' + invader2 338 1 64.36 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTA:1 - chr2R 5485054 3' - 1360 19 1 60.40 AAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATATTCTTTGCGTCAAGCTGCTTACTTAACATAC:1 + chr3L 23869139 3' + gypsy 417 2 70.30 TTTTTCTCAAACAATTTTCATTGATGCTATGTTTTTTATTTGGTTACAAAATATTCCGCCTGCCGTCTGCTAACAATCAACGCCATTGTCCGGACCTCTCG:1 + chr3R 16693260 3' - HMS-Beagle 423 1 76.24 TTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTTGCAGTGTTTAATTATAGTTACTCGCGTCTTATTTAATTCAGTTTTTAGG:1 - chr2L 1697689 3' + Cr1a 191 1 59.00 ATNTGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATGCTTTGGGATGGATTGCTTCGCAGAAGAATGAG:1 - chr2R 19149408 3' + diver 6069 2 65.35 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGGATCCAGAGTCGCCGCTCAGGCTGCTTTTCCCAT:1 - chr3L 19275683 3' + mdg1 7417 2 65.35 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAAGAGGAGTTCATCATTACAGAAGAGATAAATGCGGCTGGGCAAACTCATTGCGAAATTGG:1 + chr3R 29979312 3' + 412 456 2 57.43 GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACGGTTTCTAAGCGAACATAAGACGACAACCATAACAATAAACTGTACATAGC:1 + chr2R 12751272 3' - Quasimodo 15 2 63.37 CCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAATGAACACAACAAAAAGCAAACCGCAGATTATGCGAC:1 - chr3L 13673329 3' + Porto1 4300 1 64.36 CTTACATAGGGATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGAAAAATATCGCAACAAAAAAAAAATAGGCCACGCAACTCTTTAAA:1 + chrX 3995069 3' + Fw2 3670 1 72.28 TTTTTCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGCGCGCCCGACTATGACAACGACATCGAAATGCTTTCCTTCAGCTCCTCTGCCTTTGTGCATTTTGCCAGGCTA:1 - chr2R 10763623 3' - FB 5 1 74.26 TTGTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTTTTGCTCACCCGCATTTCTAGCTCCGACACAAGCCCTGCAGCTATCCGTTCACATAATTCGATGGCGCCAT:1 + chr3R 8559335 3' + F-element 346 1 69.31 TATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGTTAATCTGCATGAGCTGCACGCTTTGTCGGCCAA:1 - chr3R 8191440 3' - mdg1 1 2 76.24 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAAT:1 - chr3R 7382628 3' + copia 240 1 71.29 TAGATTTTGTGGTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGT:1 + chr3L 27458172 3' - I-element 5173 1 37.62 CGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAGTTTCTTCAACAATTGCCCTGATTTATGCCACTTTAGTTAAGGGTGAATACTTTGTAATTAAG:1 - chrX 8997733 3' + Tc1 433 1 71.00 GTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTATCATGTATGCGCTATATGTATACGCATATGCCGGTGGTTCCCAGTTGGAATTGTAAACATGTC:1 - chr2L 14950395 3' - I-element 5066 1 67.33 AATTAAAAAAATCAAATAAATTATAAACTCAATTAAAGAAACTAAAAACAGCTACAAAAAATTCAAGATGTCAACTATCTTGCATATATTTTTTACACAAA:1 + chrX 16867894 3' + HB 321 1 75.25 CCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACTCAATTTGTAAAACGGAATTTTATTAGGTCGCAGTCGAG:1 + chr2L 14074942 3' + I-element 5066 1 64.36 TATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCCGTCATTATGTGATAGGAATCTATCTCAAAATTATAAATTAAATATTCGGACGTTGTATGCACCATTATTA:1 - chr3R 19449176 3' + roo 8685 2 76.24 ATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCCAGACCCCCCGTCCCACCACCACACACACT:1 - chrX 16518434 3' + Quasimodo 190 2 70.30 TACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTATGCAAAGAGGAGTTCACAAAGAGAATCTGCAAATCAATGAGCTCAATTA:1 + chr3L 11679616 3' + F-element 279 1 67.78 AGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGCCTTCTGCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGACTACTACTACAATTAA:1 - chrX 22651454 3' - INE-1 97 1 73.27 AAGTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTAATGCCCTGTAATCCGTTAAGTACTTAAGCTTTACAAACATGATAACGATTAATTGAAACTC:1 - chrX 14131745 3' + I-element 5343 1 66.34 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTTCAGTGGGCTCAATTGGCCATTAGAGTGGGGCATTTTCAGATGAAGGAGTTTTGAAATGGCTTCAATTTACGATG:1 + chr2L 20315803 3' - FB 2 1 71.29 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACAGAGTACGAAATGCTAGAAGCCGTAATAA:1 + chr2R 9213701 3' - Burdock 44 2 70.30 TTTACATTGTGTTAGAATTAGTTTGTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTTTTGACTGTTAACTACTACTAAATGCATGCTTACCAAATATACTTATGTAAC:1 - chr2L 6679528 3' - TART-B 10280 1 52.48 GTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCATCGTTTTGCCAGCGCTGCGAAGAAAGATGACTTCGCTGGCGAAATCATTTACCTCGTT:1 + chr3L 10907736 3' - Porto1 4513 1 65.35 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCT:1 + chrX 678844 3' - Tirant 8137 2 54.00 AAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGTCATTTAAGTTATTATAATTATATTGCCCAACCACCTCTTGAACAATTTTTTGTACACAGAATCTCTTTCCAT:1 + chrX 9427816 3' + FB 247 1 66.34 GGCTAAATTAAAGCGATTCCGAAATGCACGCTGTGGTTTAATAACCGAACAATTGGCCAATTCTGATGGTGTTCTTTGTTTTAGTGTACGCGTTAATTGTT:1 + chrX 13812799 3' - mariner2 220 1 58.42 TGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAA:1 - chr3L 7295166 3' - G2 2959 1 61.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCCAGCTTGATGGCATTCTTAATCCGAA:1 + chrX 6814326 3' + roo 356 2 73.27 GGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGAGTTGACAGCCCAGGGGGCAGGGGGCTCTGT:1 - chrX 19792664 3' - accord 185 2 83.87 AAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGATTTATGGGTTAAGCTCGGTGATTGTTGTGCCAGAGGCTTTTGTTGGTTTGTTTTTCTTAAATGTGTTTTTC:1 + chr2L 11961124 3' - I-element 4989 1 73.27 AGAAAAAAAAAAACAACCAACTCAAAAGCAGGAGCCAAAGAATACCGAGCGAGAGTTTGGGGATGGGCTACAAAGATACCTCTGAAAATGGAGGG:1 + chrX 7403484 3' + gypsy7 5015 1 68.42 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAACGGTAACCAACAAAGAGGAGGAGCCCAAACTAATGGTCGTAGACCATGGAGTTTAATAGGAAGAGGTG:1 + chr3L 19861725 3' - 1360 6 2 73.27 GCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGTGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGTGCAGTGTGAGGAACGCTGCCAGCCCAT:1 + chr3L 23678119 3' - Stalker 6887 4 93.26 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAACACA:1 - chr3R 17665956 3' + Transpac 5215 2 65.35 AANTGGCAAGGAATGCTCTTTATAGGCAGCAATAAGCGACTGCGGCAGAACCATTCCCTGCTGCTGCTGTCGCTAGCGCCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGG:1 - chr3R 29098473 3' - TART-B 232 2 37.00 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGCGCATTCAGCGGGCAAAGAGGTGGCAGGGGAAAAGTGCAACCAAAAGCAGGCCAAAAAGGCAATG:1 - chr3L 6442583 3' - roo 8673 2 61.00 GANATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAA:1 - chr3R 14049354 3' - transib2 39 1 63.37 TTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCATAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAAT:1 + chrX 20999748 3' - BS 67 1 62.38 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAACTCATTAAAAAGCCGAGCGG:1 - chr2R 9658359 3' - P-element 52 1 27.00 ACNGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGTTGGCAAGTGCACCA:1 - chr3R 30904233 3' + roo 353 2 82.47 TANATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGT:1 + chr2L 18177960 3' + 412 7498 2 72.00 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCATAAATTGTGCCCTTTTTTTGACCAAATGCCTGACTTATC:1 + chr3R 29422829 3' + roo 389 2 47.52 GGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTATTGTAGTTTGAGTTCGAGTTCAAGTTCGAGCTTATGGG:1 - chrX 1652846 3' - I-element 179 1 68.32 TGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACATGGAAGGACGACCACCACAATCAACATCATCACCCGCCGCTCGTCGTCTCGCATAGAAAGGTGAGTTCAACTTCGAT:1 + chr2L 20322076 3' + gypsy8 486 1 64.36 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAAGAGAGCACGTCGACTGATTG:1 - chr3R 24739030 3' - pogo 48 1 76.29 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATA:1 + chr3R 14049404 3' + transib2 2780 1 69.31 GCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATTAATATAAAAGCCTGAATATATTTTCCTGTTTTATTTTTT:1 + chr2R 5953170 3' - 17.6 36 2 70.30 ACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTT:1 - chr3L 10557577 3' + 412 459 2 57.43 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGACGCACCCATCTTTGTGGACTATCCGGGAATTCAGCATT:1 + chrX 7768975 3' + hobo 2901 1 60.00 TTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' + R1A1-element 144 1 71.00 GTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAAGAAGACTATTTGTTTTTATCGCATTGGTACGCCTAATTGA:1 - chr3L 4553774 3' - G2 2835 1 59.41 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAA:1 - chrX 7583210 3' - I-element 39 1 65.35 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGTCGTGGAAAGGGTGGCAAAGGATTGGGAAAGGGGGGGCGCCAAGCGTCATCGTA:1 + chr3R 14626089 3' - P-element 19 1 56.00 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCT:1 + chrX 10644873 3' - hobo 40 1 62.38 CTCATCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGT:1 + chrX 19820782 3' + Rt1b 4972 1 73.27 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATAAGGTAGCCAACTGAAATATCGAACTTATTTTTGGA:1 + chr2R 21819040 3' - flea 4795 2 65.35 AAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCAC:1 - chr3L 23933649 3' + Cr1a 171 1 79.21 TTATAATAGAGAGAGAGAGAGAACAAATTGTGTGAAGTGAATATACAAAAAATATTCCGTATATCATGTTAGAAACGTTTCTTTCCAATCGGCTTGC:1 + chrX 5381686 3' - blood 170 2 69.07 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTACTTTGTCTTGTCACCG:1 - chrX 17300358 3' - jockey 4697 1 52.48 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGGTAAACGAATCGATATTGTTTGGCAA:1 + chr3L 11790018 3' + P-element 2840 1 31.68 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCACAAAAAA:2 - chr3R 20373237 3' - I-element 27 1 51.49 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATAATTGCGTTTCAATATTATTATTTGAGGGTA:1 - chr2L 5291621 3' - roo 44 2 73.27 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGAAAAGAGCAATCGAGTGGCACACAAAAAG:1 - chr3L 20669089 3' + Transpac 264 2 71.29 CATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGAAATATCCATTGCACAGAGCACGTAGCAATCGCTTTGGAGC:1 - chrX 991772 3' + G4 36 1 64.36 GGNCAAATTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGCATATGCATATATATGCAGCTGCTGCATCGTTAGATGAAACAATAGAATTCGA:1 + chr3L 10382726 3' - I-element 4993 1 52.48 CTAAACATCCGTCCATTAATTTACTAAATTCTTCAAGTAAGGCAGGAATTGTTTTAAGCCATTTCTAAGTGAATTTACTTAGTTAACAAAGTTTTG:1 - chrX 16510343 3' + Idefix 189 1 78.12 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGCGGATCGATGCCTGCTGGTCTGTCAATTATGCACTTCCATATCTG:1 - chr3R 20984174 3' - hopper 25 1 52.48 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGTGTTTAATTACGTTTTCACGCCCATTTTACCTCG:1 - chr3L 22751929 3' - roo 8705 2 71.29 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGCAAATGCAACGCAATAATTTTGATAAC:1 - chr3L 10382674 3' + I-element 5309 1 70.30 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATTATTTTTAAGACTTACCACTCCCACTGCTTCCAGAGCAAAGAGCACTGTTCCAAAGAAGGTGGGCAAC:1 - chr3L 1973418 3' + flea 5007 2 70.30 TGNGCACGGTTGCTTTCGCAGCTATCTGAAGCGCTTTGGACACGAGGAGGCGGATAAATGACTATCCTATTGCAGTTTTATAATAGAATTTAAGTATATTA:1 + chr3L 8610390 3' + Rt1c 5013 1 58.42 CTATTGGAACTTATATAATTTGTACATAGCTTACAATTTAAACAAAAATCTAAGTCCAGTTTTAAAACGATAGAAAAGTACAGCACTGCAAATATCATGAT:1 + chrX 1904083 3' + gypsy 463 1 57.43 TCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCT:1 - chr2L 12398142 3' + roo 365 1 75.25 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGTGCATGATAGTTAATATGAGTATTAATCCAATTATTTTTCAGCCAAGGGAAAGTTGTAATTTTTGCATACTTGGC:1 - chr3L 12352852 3' - Tirant 1 2 78.22 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACAGGACGTCAATGC:1 - chrX 4806650 3' + roo 400 1 70.30 TTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATGCAGCAGCCTTTACGAGAGGAGTAAGTCGGCAAGTTAGTTGGTGGAAGC:1 - chr3L 20659120 3' + hobo 434 1 72.73 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAAGTGAGTGTGTTGCT:1 + chrX 678866 3' - Tirant 9 2 72.28 CTTTCTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAATTTTAACATATGTAAATTGTACTCAAAGTGCACACACACACACATACATACACACACATGTACACTA:1 - chr3R 24445724 3' + ZAM 8186 2 58.42 TATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTCACATCTTAGGTCAGGTTAATGCTTATATC:1 + chr3R 15137332 3' - Stalker 6937 4 70.30 GGNACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATCAGCTGGGAAATGTGCTCCCTACTCAGGTTTAGCGAC:1 - chr3L 12172816 3' + 17.6 457 2 60.40 TGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTTACGAATTCCTGCAATTTGTACCATTTAACCCCCTATAAACTGTGAAAAAAA:1 - chrX 21231195 3' - I-element 4954 1 58.42 AGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATTACTATATTAAATATTAGTGTTACTAGTGTAGTAGGCTGCTCCATTGCGCCATTGTGCCTTTCCA:1 + chr3R 29335973 3' - Cr1a 4338 1 78.00 ATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATAATAACTTGTTGCACGTTGAAGACTTTAATGCCGAAGCTAGTGA:1 + chr2R 1727024 3' + Stalker4 280 4 61.39 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAACAGCAACATCAGGCTGCGATCGCCGAGTGCAATTGCTGTTTTGCAGCTGCATTGCAGGCAGCATCAAGA:1 + chr3R 26085645 3' + roo 405 1 76.24 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTAATCCGCTTCCTTGTTTACTGAAATCTAGCTCGCATAATTAAAAGTGAAA:1 + chr3R 22208617 3' + I-element 5330 1 54.46 AANATTTAAAAAAAAAACAAAATTTCTATTGGTACATTGATACAAAAATACCAAAATACTAACGGAATCTGTATTGAGCAGCAAGAGATATTCAACAACAA:1 - chrX 12565737 3' + TART-B 10630 2 52.48 TANAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAAAGTGCCCAGA:1 - chrX 1600174 3' - BS 5016 1 55.45 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTCCACTTACACATTTGCGCCGCAAAATGTTGCCACTG:1 + chr2L 17269877 3' + hopper 1414 2 82.18 TTGTGTACATATTATATATGTATAAGCGTGCCAGAGTGCTTGGCATTGTGTGCCATGCGAGAGATATTATTATTATTGGCAGAAAAGGTGGCGCCCAGCGA:1 + chrX 13671804 3' - accord 7287 2 61.39 GTNATACTATTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAATAATAATAAAAAAAGTTTATACGTAAGCGTTACTATGATATATGTAAGAATG:1 - chr2L 19817824 3' + G4 3823 1 69.00 AAAATTATCTTAATATCTCTCTATTTGTAAAATTAGTTATACATTCTCAGCTACGATCACGATCATACTATTCATTCTTGATGGATTGTACATAGATCAAG:1 + chr2L 22108224 3' - Transib-N1_DM 55 1 77.23 TTGTAAATCATCTTGGGGGAACTCAAATGCAGACTGGGCAACACAGGTGTACATTTTTTTGAAATAAA:1 - chr3L 24735921 3' + transib1 2061 1 69.12 CAATAAAAAATTTAATAAAATAAGCCCCCAAATTATTAGATAATTGATAACTTACCCATAAATCCAAGTGGACCAAAGGGCAGCAGGGGAAATTTGGCGTG:1 - chr2L 11368963 3' + transib1 1933 1 50.50 ACNTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCATTAATTTCATTGAGCTCGATCCCGTTTGTTGACAACATCAA:1 - chr2L 20913956 3' - P-element 31 1 46.53 AANGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGAGAAAGACATTTTTATTATCCAACAACAGCCGCCCTTAAAGTCTTAGGCCTCGAAATCAACCATAAA:1 - chr2R 5075855 3' + Tc1 84 1 54.46 TGCGCAAATGTTTGTGATGGGTCACAATTACGTCTTTGTTTCGCCATCGCTGAATTTATGCTTCCATGGCAAGTGCTCGTACTATTGTGA:1 - chr3R 23611981 3' - jockey 81 1 64.44 ATAATAAATATTATTAATATTAAATTTATGCTTACCTTTTCAATTTCTAATATTTCATTATTAATTCAGACATTCACAAACATTAATTTCCTGACAAAAAT:1 - chr2L 15807008 3' - mdg1 7086 2 59.41 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTCTTAAAATACATACATTTGTATATGC:1 - chrX 9579288 3' - Tirant 8108 2 80.20 CANTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACTATTCCCAAACTCGA:1 + chr3R 19446239 3' + 297 378 2 61.39 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGC:1 - chr2L 1204077 3' + roo 9024 2 77.00 GCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATTACAAAATTACTTCAAAAACCATTCAACTGGCAACTGGGCAAACAAAATAAAACGCATTCGTATAT:1 + chrX 5173887 3' + I-element 154 1 54.46 ACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTGCTGGCAGGCATTTTTTTTCAGTCCTGTTTGTGTT:1 + chr2R 16913877 3' + 1360 17 1 65.35 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGGGGGCGGGATGAGATCCTTTTTGGAGTTAAGCTTAAAAATATTCTG:1 - chr3L 9064298 3' + jockey 4959 1 52.48 ACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATATCTAGAATAGATTATTTAAAAAAAAAATGTCTAATTTGAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGATTATTCAT:1 + chr3L 14944627 3' + G5 4811 1 45.54 TACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTTAGG:2 - chr2R 912935 3' + mdg1 409 2 67.33 ATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTAATTAGAGGGTAATATAATATAATATATTCGC:1 + chr2L 6868358 3' - Juan 3782 1 76.09 ACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGCTTGTCCTTGCGTGCCTGGAATTTCAGAAAAAATAAACGCTTTGCGTGTTGCTCTTCTGA:1 + chr3R 6599684 3' - F-element 467 1 63.37 ATAAAAAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAA:1 - chr2L 4025424 3' - copia 5090 1 40.21 CATTCAGCAACCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCTCCGCTCGCGCTGCTCAAAATCAAACGTCAAAGTGCCGAGAAATTTATTCAATTAACATAATTT:1 - chr2R 23647930 3' + Chouto 363 1 63.64 GTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTTTATATTGTTA:1 + chr2R 6801725 3' + McClintock 6424 2 73.27 ATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCTTTGTAGCCCCTAAAACATTTGCAAATTGAATAACC:1 + chr3R 12824524 3' + accord 7275 2 64.36 CANCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTGATAGGGAGTCCAGAATTTTCAGCAGCCATGGCAACATCAAT:1 + chr3L 25332052 3' + F-element 216 1 57.43 AAGTATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACACACCACTTTTAATCTAATTTATGAACAA:1 + chr3R 26140794 3' + 412 442 2 70.30 TTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGAATGGAAATTTCGTACTTATCTTTTAATTTTTATGAATTTCTCTGATTACGAAAATTGCTTCTGG:1 - chr3L 6390541 3' - GATE 371 1 63.37 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATC:1 + chrX 12813740 3' - BS 40 1 66.34 CTGCTCATCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTC:1 + chrX 19820779 3' + Rt1b 4969 1 70.30 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAAATTAAAACAATACATTAAAGCAAGGAAACAAATATATACTTTTCGCACTTTAAATTAC:1 + chr3L 12572688 3' + Juan 4197 1 52.48 ACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGCGGTTAGTTAAACAAAAGTGCGGTACCATGAAAACTGGGTCAAAAT:1 - chr2R 13660254 3' + I-element 394 1 54.46 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTC:1 + chr2L 17269842 3' + hopper 1380 1 59.00 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCGGGGTTGGTTTG:1 + chr3R 17674379 3' - blood 41 2 68.32 TAATATGGACTTTAGACTTTAGGGTTCTGATGAAATGAAGAGAGGGCTTTTGAGTTGCTGACTTTAATTGACTTTGCGTTCTGGAATCAGCATATATCATT:1 - chr2R 15199696 3' - Idefix 401 2 74.26 CTAGGACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACTTCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATCTTGTACTGCTGAATGCCATGCCAACCGAAAGA:1 + chr3L 5745252 3' - 1360 451 1 67.33 TTTAGCTTGAAGGTCTCGCTTCTGATTGTTTGCCTCAAAAATGTACGTTGAAATACGTTTTCTTTCGCTGAATAGCTATAAAAATGGTGCGAACAGTGCG:1 + chrX 10303335 3' - Porto1 237 1 75.00 AAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTAC:1 + chr3R 846264 3' + Stalker4 95 4 70.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATCGTGCCAACAACAATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTATTG:1 - chrX 13640618 3' + P-element 2878 2 66.34 TACAATAGTTATATGTCTTCAGTCATCCGCCTTCAATGGTAAAATAAATACGTTTTAACCAACCAGATTGATCCATTTCTATCCTCTAAAATCCAAAATTC:1 + chrX 3192056 3' - Bica 98 1 73.27 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTACAACGACAA:1 - chr3L 10522036 3' + roo 9034 1 65.35 AANCCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAAAGTGCCCAGAGATTTTAAA:1 - chrX 1600165 3' - BS 5007 1 64.36 GANAATGCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATCCCTATCGTTTATTCGGCGAAATTGTTATTATTAATAATAGTGGCATTATGACTAGAAATAATTAAAAC:1 + chrX 3031004 3' + G2 2772 1 72.28 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAATATGGAATAAAAATAACAGACGGTCGAATGGTTGGATTGGATTCTCTGCTGCTAATCACCCG:1 + chr3R 30106891 3' + roo 400 1 67.02 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTGTTTGATGTTATTCTTGAGCCATAGTTGTTGCCGAAGGCAATGCCATTACTATTTG:1 + chr2L 18223854 3' - roo 8682 2 59.41 AAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATATGTCGGATTCTCTTCCTACTTCCGTTC:1 - chr3R 11619483 3' - Dm88 81 2 80.20 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGCCATCTCTGATCTGGTGCAAATGGAGAG:1 + chrX 19109332 3' + roo 9049 2 55.45 GTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGAATTTGGGTCTTGAAATTTCTTGAGAGGGTCTGGCTGA:1 + chr3L 16626476 3' - HMS-Beagle2 6829 1 62.38 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTA:1 - chr3R 14626033 3' + P-element 2834 1 26.73 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGGTCGAGCAAGTTCAACT:1 + chr3R 9322898 3' + 412 474 2 59.41 CAAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCCAAAGTCACGTGACAATGAAG:1 - chr3L 3781259 3' - FB 32 1 72.73 CTGAGCTGTTTCCGCCTACACATATTCAGGCATTCGGAGCATCAGACATCTAACATCTCAGCTCAGCTCATCTCGCAGCCTAAGGGAGTTTTCCTGTTTTT:1 - chrX 2320103 3' - gypsy5 7103 2 74.26 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCGACTGCCGCTTGTTTGGGCTGCTGTTTGGCCCATTGACGGAAAAGCTTTATTGGCCTGGTCCCAAGCATAT:1 - chr2L 6184157 3' - roo 5 2 72.28 TTCAAATTCAAATTCAAATTTCTTAGACAACAATTTTTATTATGTGAACAAATGGCACACTTGTATTATTCAAATTTACTGTAATTCATATATTTTGTTCT:1 + chr3L 14920471 3' + Rt1a 312 1 80.20 ATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGCGTGTTAAGTGCTCAGCACAAACAAACACATGCTCCACATATTGTGCGATGGTCAACAAT:1 - chr2L 7772190 3' - I-element 214 1 67.33 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAA:1 - chr2R 544799 3' - HMS-Beagle 32 2 58.42 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCAGCTATTATAATTATGCTCGAATTATGCAAATAATTATATGAAATACTAAGCTGCTTGATTTATAAATCAATT:1 - chr2R 23508840 3' - hobo 6 1 73.27 TCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGATATCCAACAATACCACTGCGACTATGGCAACTTTGGCATGTAAAAAGCGTCAAACAAAGCTGATTTCTATTGGCA:1 + chr2R 8336952 3' + F-element 381 1 78.22 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGGGTACAGTCTTATATTTATTGATAAA:2 + chrX 22218663 3' + roo 9021 2 76.24 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCCGTGTGAGAGAATGGTCCTTAATTATTAAATAAATAA:1 - chr2L 8649222 3' - F-element 55 1 68.32 TTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCATGGAAAATCGTTGAGGCGTAAATTGGCAGACAAAATGCTTTAGGAAATTCAGTCGAAGAAAG:1 - chrX 8303081 3' - 297 431 1 65.35 TTGGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTTATTTTACAATCATACAATCATATTTATATAAGCAAATCCACTTAATTTACTAGATAAGCAAAGCCT:1 + chrX 6883350 3' - Burdock 6 2 71.29 TTNTTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTACACGTTTTCGGTAAAAACGAAAACTTTTCTATTTCCGAAAGG:1 - chr2R 16908736 3' + diver 6078 2 57.43 GAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGACTGCAGTTGCCGCTGCCTCTGGTTGGATCTCTTGGTGGATTCCTTGGAG:1 + chrX 2425667 3' - F-element 4501 1 53.47 CGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTCATCCGGCTTCAGATGTTTTTAACAACAATTTAAAAATCCCGTCGGTG:1 - chrX 3927631 3' - jockey 4751 1 68.24 ATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATATGTATATGATAATCCTATGTGCCTACTTCGTCTTTCCCGAGATTTGCCGGCATCGCAGAGTCGCCTGTTCCACCGC:1 - chr3R 17536794 3' + Tc3 312 1 80.20 CCCCCCCCCACAGTCCGAAGAGATGGCCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTGTTGTTGTTCTTACTTCTGGCCAGAGCGC:1 + chr3R 10554379 3' + accord2 235 1 76.24 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCATTGATTTTTCATTTTTT:1 + chrX 6082645 3' + roo 9047 1 52.48 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAATAGC:1 - chr3L 13652774 3' - hobo 21 1 58.42 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTAT:1 - chr3R 19589923 3' - BS 5021 1 50.50 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGATATTACAAGCCAGAACACTGCTTAATAGCTCACATGTC:1 + chrX 5515178 3' - 1360 21 1 73.27 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTGCATTTTTCAATGGGGAAACACACCAATCATAGTCG:1 - chr2R 8547788 3' + I-element 5317 1 64.36 TGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGTCCAATCCAGACGGCGGCGCCGGAAGT:1 - chr2L 13669594 3' + micropia 5349 2 73.27 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAACAGCAACATCAGGCTGCGATCGCCGAGTGCAATTGCTGTTTTGCAGCTGCATTGCAGGCAGCATCAA:1 + chr3R 26085643 3' + roo 403 1 74.26 TGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCACACACACACACACGCAGGTTATTGAATGTCCTCCGGGG:1 - chr2R 20176848 3' - ZAM 7998 2 58.42 CCNTTTGAATCCAAAATAAATATCTAGAATAGATTATTTAAAAAAAAAATGTCTAATTTGAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGATTATTCATATTTTG:1 + chr3L 14944633 3' + G5 4817 1 46.53 GATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCTTCTCCATCCTTTGCGAGTTACTTTTTTCATCTTTTTTCTTTTTTGCTCGGCAT:1 + chr3R 24462052 3' - F-element 4314 1 54.46 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCTCTCATTTC:1 + chr3L 10557666 3' - 412 10 2 69.31 CAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATTTATAGCCATGTGTGGCCAATGTTCAAGTTCGCGAGCAACT:1 - chr2R 13419247 3' + Quasimodo 348 2 66.34 ATCCTACTAGCACTAATATTTAATACAGTAATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCGTCAAAGCCAGCGGCGCAACCGGTGGCGCACAGTGGG:1 - chr3L 11293515 3' + Cr1a 4295 1 63.37 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAATCCTTGGATTTGTATTTGTATGCGTGC:1 - chr3R 19560897 3' - hobo 47 1 69.31 CCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGGCTAATTGAATCAAAGCAATGTCCTGGCACACGCGTCGGCTTAATTGCAAAATTGGAA:1 + chr3R 15562889 3' - invader3 490 1 61.39 AGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATA:1 - chr2R 10552699 3' - INE-1 574 1 86.14 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTT:1 + chrX 9439816 3' + roo 355 2 78.22 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTATGATGGGTGCCCATAAAAAGA:1 - chr3R 28698801 3' - 1360 53 1 80.20 AANTAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAAGTGTGAAGCGAATTTCAAAGTTACAAAACTCGGTTTAC:1 - chr3L 18816124 3' + roo 9032 1 63.37 CGNGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGC:1 - chr2L 10712128 3' - I-element 41 1 64.29 TGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 32 2 54.00 ATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGATGCAGGATACTGTGACTTGCCAAGTTATTGGCTTTATTTTGGCAA:1 + chr2R 18055161 3' - Ivk 5070 1 54.46 AACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACAGCAACAGCAAAGTGTGCAAAGAGCTGATAAAAAATAATAACAAAATATATACATGT:1 + chr3R 24576050 3' + F-element 4434 1 53.47 ATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGCTTCAACACTCTGCTGAAGGCAACAA:1 - chr2L 19624374 3' + Quasimodo 268 2 74.26 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCAGTGTTCACTTTGTTGTCCTCGTTTTATCCGCTCCTTTTGCAGTTCCTTCGTGCTCGTCCT:1 + chrX 9442621 3' - roo 8700 2 64.36 AGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATCGC:1 + chrX 12813742 3' - BS 38 1 64.36 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGAGATATCAATTAAATGGTACACGCTTTTC:1 + chr2L 5291664 3' + roo 9026 1 71.29 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAACACAAAATACCAGGC:1 - chr3R 17665945 3' + Transpac 307 2 76.24 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCC:1 + chr3L 6442671 3' + roo 9038 1 58.42 GTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACATATATTCGAGTATATGTAAGTATGGGTACGTATCTGCTCCTTGGG:1 + chr2L 16954908 3' - Quasimodo 6 2 67.82 TGNACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGAGCTGGTGAAGCTGAGTTGGCCGATGCAATTGACTGTGATTTCAGTAGAGCTCACTGAT:1 + chr3L 22481274 3' + copia 137 2 64.04 CCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCAAATTATATTTTACACCATAAGCTTATTTCTAACTAACTT:1 - chr3R 8680056 3' + accord 146 2 61.39 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATTTCTTCAA:1 - chr2L 19644863 3' + blood 7362 2 49.50 AGNTCTCGACGTTCATACGGGCGTGGCTGGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTTACA:1 + chrX 21575379 3' - INE-1 133 1 58.42 CTNCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAATCGCCAACGAAATTTTCAGATTTGTTTTTATTTTTTAGCAGGGGAGTTA:1 - chrX 14497988 3' - F-element 420 1 60.40 TTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAAGAAGACTATTTGTTTTTATCGCATTGGTACGCCTAATTGAACATATTTTGAATCGAAATATATTAAATTCATA:1 - chr3L 4553741 3' - G2 2802 1 70.30 ATNTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr4 1294990 3' - TAHRE 30 1 61.62 AGAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAACAAAAAACAAAAATGGAAGGCCTGCTGGTGGGATGGATTTGGTTTGGTTAGGATGCGATGGTAAGAAAGATACCCCGA:1 - chrX 14333617 3' + Doc2-element 227 4 55.45 GTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAGAGACTCTAGCAACTCAGCGCTCCACATCGGACAGATAGACGCATC:1 - chrX 7189302 3' + 1731 4433 1 55.45 AGCCGATAACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCCTTTAGCAATTATTAATTATGATTCCTATGAGCAAGCTCCCCACATGGGCAACCAATGAATAGTTGTGA:1 + chr2L 23135987 3' - diver 313 1 90.10 GANTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGATTGTCTCTCTTTCTTGCTGCGTG:1 - chrX 2494716 3' - hobo 51 1 75.25 AANTCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGGCGAAGATCTCCATCTCCTCTCACAGCGGAGCAGACAGATAAATAAAAACAGA:1 - chr2R 9308152 3' + pogo 1644 1 57.43 GTCAACTATACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTTATTGCTCATCCTTGCAGCCGAATCAGACATTTAAGCCTCACATTTGGTAATCAATGCTTTCAATACC:1 - chr2L 13567341 3' + Copia1_DM 113 1 55.45 CGNAGAGGAGAAAGTAAACCAGGAGAATTTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTATTTAAAAAGACGATCTAAACTGGAGGACTAATTACAAATTAAAAGCCA:1 - chr3L 17273126 3' + TAHRE 305 1 70.30 TTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGCCTAATTCTGTGTGGGGGTTTTCCATTCTCGCCGCCCCTTCGTAG:1 + chr3L 19425413 3' - X-element 57 1 55.45 GAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTTATATTGAGTAAACTTTTTTTCTTT:1 + chr3L 23010087 3' - hobo 247 1 75.25 AGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGTAGGGTTCTATAAAATAGAGGGTG:1 + chr2R 16908780 3' - diver 5942 2 76.24 AAATTTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCAGGGAAATTGCAAAAACAAAAAAGCCAGCGATTGCGAAATTCGAGCAGGAGGCTGCATCTTAAAAATGCATTT:1 - chr3R 21927772 3' - hopper 127 1 73.27 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTC:1 + chr3R 9192571 3' + invader3 232 2 72.28 TTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTTTGTTTAAACTGACCTTCCTGGGCAGACATATTTTCCTGTACTGCTTTAAGAC:1 - chr2L 11275714 3' + I-element 45 1 69.31 GTTTTTCTTTTTATTGTGTTAATTATGGCTTGTTTTATGACTCAATTACCGATTAATAGT:1 + chr3R 7638813 3' - HB 1358 1 63.33 TAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTAATGTCAATCATACGCACTGTACGCCACGAAATATATG:1 - chr2L 18224215 3' - roo 8839 2 63.37 ATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTTAACACATAAAAAGTCTTTGTTAGGTAATGTTTGTAAATCTTGTCATTTACTTTTCGTAACACA:1 + chr3L 5615507 3' - Porto1 275 1 60.40 GTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTACATCAGGCCCCGCTGTAAGCTCCTCCGTCGACGTTGTACCCGCCACCTCG:1 - chr3R 4801454 3' - I-element 5324 1 55.00 CGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCACACTGTGAGAAAAGAGGACATCCTTTAG:1 + chr3R 31636641 3' + Max-element 8323 2 71.29 ACAACAATAATAATAACAACAACAATAATGGAGAGCACAAGCAGTCAAGCTA:1 + chr2L 5937136 3' + mdg1 7058 5 82.69 GCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTTAAAGAGAACTCAGTTTGAAGAACGAAGAAAGAAAAGCGATTGTGAGTTGTGTGAAAAGCAGAA:1 - chrX 10793105 3' + invader3 192 2 67.74 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACAACGATTCCGAGGAAACCACAAGCAAATTGAAATT:1 + chr3R 5329396 3' - blood 7052 2 65.35 TTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATGTAATTTATATTTTCTGTATCGCCAGCAC:2 + chrX 1105371 3' - Juan 4115 1 71.29 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTGCAATGTT:1 - chr3R 28443698 3' - Burdock 6165 2 71.00 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGATCCACTAATATAAATTCCT:1 - chr2R 9788956 3' + blood 7335 1 77.23 TACCCCTTCATGACTCAAGGATCCCCCTCGGTCGTTTGGGTGGGAGATGTTACCGTAGGACTTGTCTGCACGTCATTATGAACGCCGGGATAGATCACGC:1 + chr2R 4329969 3' - baggins 5378 1 77.00 ATNGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATCTTTAAATAATAGCTTTGAAAATCCA:1 + chrX 9983691 3' - pogo 46 1 75.25 AATCTACACACACACACACACACAAAAACACACACAATCAGTTAAAGCCCGCCCAAAAACCCCCCGATTTGGTAAACCCACCCGTCTTTTGAGTCACACTT:1 - chr3L 9119429 3' + accord 253 2 79.21 TANGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAAGGA:1 + chrX 19053025 3' + roo 356 2 78.22 ATTATTATTGACAAATAGCCATAAACAACACGGAAGCGGCTGAAAAACTGTGGGAAATTTTTTTAAATATTTCTGTTTTCCATTGCTGCTGGGTTGGCTGC:1 - chr2R 22365872 3' - hopper2 402 1 79.21 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTTTTCTTGTTTTTCATTTGCTCGCCAAATTTTAGCAACGTTGCTGGTTTAA:1 - chr2R 8950980 3' + P-element 2881 2 71.29 TAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAG:1 + chrX 21452828 3' + INE-1 552 1 56.00 CANATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACCCGTTCACATGAA:1 - chrX 6509782 3' + jockey 4953 1 63.37 ATACCATAGCAAGCTCTACACGCACCCCAACCACCTAGTCTCCGGCGAATGGCCAACAGAGAGACAAAAGCGAACTGACTGACTGATCGGACGGCGATCGT:1 + chrX 7618720 3' + F-element 4447 1 58.42 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCC:1 + chr3L 1259227 3' - Doc 37 1 55.45 ATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAATAATCAACTTTGTAGTACGATAACTTCGTACTTTTC:1 - chr3L 20209536 3' - Burdock 6144 2 71.29 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACCTAATTGAATGCGAATATTTGTAGAGAATACCTGGAGAGTAACTTTAACTATGATCCTAAGAGTTACA:1 + chr3R 4971253 3' + 1360 3381 2 71.29 AGCACAGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACATCCGCTATGCCCTAATGAATGGCGATGGCTCTGGAAGGCTCTTCG:1 + chr2R 17973107 3' + Porto1 395 1 67.33 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGTTGGAGACTTCAAA:1 + chr2L 2685778 3' + hopper 1394 1 75.00 CCNCCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACAAGACTAGTTAAACTATTTCAATACTATATT:1 + chrX 19030180 3' - Doc 9 1 73.27 AATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAGCAGCAGTAACGACAACTGACACCAGCCGTTGGCTGCAAGAATTCTCAAGTCCTGCCAC:1 - chr3L 20862349 3' + Bica 4540 1 63.00 GCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTATTGAATTCCCTTGCATCATCTGAAACAAACCACTCATCTCGAAT:1 + chrX 5912982 3' - flea 27 2 56.44 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTGTCACGTGCCACAGGCGGCAAATTAAACAAGGCGCAACATGGGAAGCAAAAGTTTACCAATGCAGAAAATTGAAA:1 + chr3R 30904308 3' - roo 8664 1 77.23 GCNGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTAAGCACT:1 - chrX 6518784 3' + pogo 2052 1 77.23 CTTCGTAAAAAATGTTCATTATTAATATGTTTTACAATTGGTGCATCTAAAAGATTGATGACCACTTCGGGTAATGGAAAAAATGGAAAATCGACTTAAGA:1 - chr3L 10520818 3' - transib3 2519 1 59.41 CCATCCAAATATGGGGAACAGCCTCCAAACACCAACTGGAGAGGCTGAAAACTATTCAAACAAGTGCTGCTCGACGTGCGTTAGGGCTTCCTTGG:1 - chr3L 24120309 3' + G5A 2438 1 75.79 GANTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTTATCATTTTCCTGGAATATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTGATAT:1 - chr2R 8443974 3' - INE-1 549 1 66.34 CATCCAAATCCGCTTGCAAGAAACTTATTCGAGTATGCAGCCACAAGAAAGAGACAGACATAAGTGGGAGTGAAAGAGAGGGAGTTCTGGGTGAGTGCGCT:1 + chr3L 19218737 3' + Doc3-element 4525 1 65.35 TANAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTCGAAAAATCATTCC:1 - chr3L 12572625 3' - Juan 4061 1 56.44 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCA:1 - chrX 21564658 3' + diver 205 1 54.46 TATTTATTATATTATTATTATTGTTATTTAAATATCTAATCTACAGAACTTAAATCATATCACATTAAATATCATATCATATATTATCATATCATATTATA:1 + chr2L 22001244 3' - invader3 5048 4 49.50 GGNCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAAT:1 + chr3L 11257418 3' + 1360 3376 1 66.34 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAAGTGAGTGTGTTGCTGTGC:1 + chrX 678870 3' - Tirant 5 2 76.24 GTNATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGTATATGGAA:1 - chrX 14040712 3' + roo 8606 1 53.47 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTG:1 + chrX 4448594 3' - 412 7097 2 68.32 AAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTTATTAGTAAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATCGCGGGAACTAGCAGCTGAAATGGA:1 - chrX 18728172 3' - accord2 7368 1 71.29 ATAAAAAAATATTCATTCAAATTTAATATATACCTTTAGTATTAAATTATTTGTAAACATTTTTTTTTTCAGTGAGCATCGCCTGGCCGAACGGCCACACA:1 - chr3R 13845209 3' - hopper 63 1 75.25 CACACACACACACATACAGAAAACATCCAATCTCGTAAAGTTTATGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTT:1 - chrX 17049550 3' + Quasimodo 40 2 92.54 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGCCGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTAC:1 - chr2L 17269791 3' - hopper 45 1 68.00 GTAACGGGTATCTGATATTCGAGCTCTGTTGCATTGATTTTTCAATACAAATTCTTGGCAAAAATTGCAGAATTACGACGTGACAGAAGGATGGCTTCGG:1 + chr2L 16936496 3' + INE-1 551 1 75.00 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAGATATCAA:1 - chr3L 18337631 3' + Juan 4202 1 68.32 ACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGATAGTCCAAGTCGTCAGCGTTTCGATTAGCCAAATTACTGAACTTTTCC:1 - chr2R 15513331 3' + 3S18 147 2 54.46 AGAAGACGATTTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACCCACGCAGCGGTAAGGACACAGAAAGACACACACACACACACGCGCGCGCAG:1 - chr2R 20814703 3' - 1360 3191 1 58.42 GCNTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTCCAAACAGTGTCAAACTAACAAAGAAAATGCATGTGAGAAAAAATG:1 - chrX 11828581 3' - F-element 66 1 53.00 GCATTGCTTTGCGAGGAGGATCAAGATATGGTCACTCGTAAACACCCCTGACTTTCTCAGCTCTCCTGTGCTCCGTAGCTCCACCAGCTTCACCAGATCCA:1 - chrX 21502182 3' - Rt1c 5317 1 68.32 ATAAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGGGCGTCCTCTTTGCCACAGGTAAACGGG:1 - chr3L 18476481 3' + accord 488 2 73.27 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTGCCCTACCTCCCCCTTTGAAAGCCTTCTTAATTTCCCCTGT:1 + chr3R 4805118 3' - 1360 34 1 58.42 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGGATACGCTTTGGTTGCCTCGCCTGCCCCCTGAGGAAAAACCTAACTTTAGGGGGGGCGTAGAAACTTT:1 - chr2L 12322953 3' - hobo 7 1 71.29 TTNCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATTAATATGAGGGCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTT:1 - chr3R 19446151 3' - 297 6611 2 56.44 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACAGCAGTCGCATGCTGATGATGACGGGTTCATAACGGTATTCAAGTTCTATAG:1 + chrX 17729116 3' - hobo 20 1 61.39 GCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTG:1 + chrX 21667920 3' - gypsy2 6529 2 62.38 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGCACCCATCTTTGTGGACTATCCGGGAATTC:1 + chrX 7768969 3' + hobo 2894 1 71.29 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTAAGC:2 - chrX 6518787 3' + pogo 2049 1 81.19 GTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTTTTGACGGCCGTTTTACGAGCCATAGTTTAAGTACTTTTAGCTTTAAAGTAACATTGTATAATTATTATTTTTTTT:1 - chrX 14220429 3' - TART-B 10256 1 65.35 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTCCCAATGGATTTATGAGCATTAGGTTTC:1 - chr2L 8841036 3' + P-element 2880 2 70.30 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCCCTAAAC:1 + chrX 19820116 3' + mdg1 384 2 61.39 ACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTATTTGATTGGAACTGTTTGCATTTGGCGCTGTTTACATTTCT:1 - chr3L 12301130 3' - I-element 4995 1 61.39 AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAATTAAA:1 + chr3R 9192599 3' + invader3 5446 2 62.38 AAATCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATATGCCACAACAATGAAGCGAGTCGTGCAGCAAGCCG:1 + chr3R 19947434 3' + roo 390 2 60.40 TGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAAATCGATCAATTAGATCTTTCAGCGGGCAAGATCACAAGTACCGA:1 + chr2R 19149494 3' - diver 5890 2 78.00 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATTTGTGCAGCA:1 + chr2R 8547829 3' - 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roo 8682 2 63.92 TTNTAAAAATATATAAATATTTTTGAACGATTTAATTAATATTTTGCTTTTACAATATTACACCTACGGTTAAAGTTTATTCATTCGGTACATGAAGTATA:1 - chr2L 15934837 3' + mariner2 829 1 44.55 TATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCTAAATGTCTGTCCATTGGCAATTGATTATCCTTTGACTGATTGATCGACACCCTTGTGTGTGCGTTTCG:1 + chr2R 11447469 3' + Tc1-2 1295 1 75.25 AGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTTTTAAATGGGTTTTCTCGTTGGTCTGTTTTTATGTTAGGTTATATTGGTTTAGATGTTATTTTTCGGATTGGT:1 + chr4 395098 3' - I-element 410 1 78.22 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGAGTTGAGCTGCTGCTTAACTATCCACTTCCTGGCGAGGCCCGCATAG:1 + chr2R 13334887 3' - pogo 27 1 54.46 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAATACGCTTAATTCCATGAAGGGTTTAGCCAAAGGCATAGAAA:1 + chr3L 18938938 3' - blood 35 2 56.44 CTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCT:1 - chr3R 23020817 3' + INE-1 577 1 56.57 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGGGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCG:1 - chr3R 7885603 3' + hobo 2903 1 61.39 GAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTTGTGC:1 + chr2R 9199941 3' - 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Tom1 277 1 79.21 ATCCTCACACATTGACAATAAATAGGACCAAGGACCAAGGACGCACCAGGACTAACGGCAATGGGAAGAAAGGAGAAGGACAACGGGGAGGGGATCAGGAG:1 - chrX 6436614 3' - micropia 5125 2 73.27 TACGCTCCCCACTATTCCAACGCATTATGGCGACTGAACCGTGTCGAGACAAAATTTTGCAGTAGCCCCTCGACCATTACAACAACTTCACATCAATAATG:1 - chr2R 5211067 3' - mariner2 137 1 70.30 TTAATTTGTTTTTATTTTATTTTTTCAGGTGCATTTGGTGAGAGGTAGTTTTGAAGTTCCGTTCTTGTTTTTTTGTTTTACATACATATCTCAATTTGGTT:1 + chr2L 9131630 3' - HeT-A 322 3 53.47 AAGTTGCCGCATGGGTTACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATATAATTATCTCATTCTTCGCTATGCCAAAAACTATGCTACG:1 + chr2R 23601881 3' + jockey 4959 1 54.46 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGT:1 - chrX 9437182 3' - roo 8680 2 63.37 AAAATTGAAAAAAAAAAGACAAAGTTAGCTTAAAAAGTATCTACGCCAATTAAGCATAGCCTGCATATTGAATATAAATGTTTTTAATCTGGACAAAATGG:1 - chr2L 10966818 3' - Tc1-2 1397 1 76.24 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATATCAGATATCTGACTGTCTAATCCTTTTGGTTTACTA:1 - chr3R 19206105 3' + mdg1 7420 2 64.36 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTACAAATAAATACAAAAAATTCTTCTTTCTCTCGCAGATTATCAATTTAAAGCACATTCTTCTTAGTTA:1 - chr3L 12160119 3' - pogo 7 1 72.28 CGNCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGCAAACGTCGCCGTCATCGTGTCGCCGTCGTTGTCGCTGCCTCTTGCT:1 - chr3R 1916754 3' - accord 217 2 52.00 TATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAAAATTACATATGTACATGTGGGCATGCTGAAAATGCTAGAAGGTCGCAATGATGG:1 + chr3L 12088849 3' - 1731 92 1 70.00 ACTATTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATTTTAAACTG:1 + chr3R 23724164 3' - Doc 60 1 46.53 ACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCGAAAATGAGGGCTTGATCTGGTTTGGGCTTAAAGATTGCGGTGGCTCGCTGGCCATT:1 - chr2L 16146546 3' + Porto1 4296 1 57.43 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACAATTTGTCATTCTGTAGACCCACTGGGATTCCGTGCTTT:1 - chr2L 6645622 3' + mdg1 7453 2 72.28 CTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATTTGTGCAGCAAGCTCATTTATTTGT:1 + chr2R 8547844 3' - I-element 2 1 49.50 AAAAAAAAAACAAAAAATTATAAAAAATGGTGGTAAACATTTTGTCGCCTTCGGATTTGATGCCTTCATTAGGAGCCAGAATAGAATAGACAGAAACTTTG:1 + chr3L 13234897 3' - Tc3 85 3 79.21 TTTTTTTCACATTTTAGTGAAACTAGGAGGTCTAAGAATGTAAAAAAGTTTAAGTGTAGATCTTAAGCTGCATGTAAATGCGTTAAATTAAATTTTAAACG:1 + chr2R 22862317 3' + copia 381 1 43.56 GTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCATGCAAGTCGCAACATCCTTTAGCTATTCATCAACAGCTGCCCGTCTAATCATGGCCAGAATGTTTTCAT:1 - chr3L 9521116 3' + Dm88 4473 2 72.28 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAATGCTGGAGAAACAAGAGCAAGTACAAAAATTGCCGTTATCACGCCACAATAA:1 - chr2R 13304427 3' - hobo 21 1 58.42 GGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGTGTTGGCTGGGGAGCAGACTTGTAATATCATAACTCAGCATTGTTTCCACTCATTCTTTCTTTTTGGTCT:1 - chrX 18220837 3' - F-element 4430 1 75.26 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTTCCACAACCAGCTTTCTTTCATGTTGATTTATGT:1 - chr2L 12398107 3' + roo 400 1 70.30 TCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGTTGCAAGATCCCGCAGTCCGCGCTTCCGTGCAGCTCGACCCAAAAGCGATTTGTATCCCACCCAAGTGCGTGGGTAT:1 - chrX 5494719 3' + hopper 431 1 69.31 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATATGTATATGTATGCCCCAACTCTTG:1 - chr2L 21951160 3' + opus 482 2 63.37 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGATCTGATCTTATGACATAAAAACGATTGTTT:1 + chr3L 7868757 3' - jockey 4715 1 74.26 GAGAGCCTGGAGCCACGTCTAGAATAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAGAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACT:1 - chr3L 25272556 3' - 1360 71 1 56.44 GGACTTATTAAGCCGTCCGAAAAATTTCAAGAGAAGTTGGCAGTGCTGAAATTTAATTTCATTTTTAATGGATTCGCGTCGCACCCACCAGGTGGCAGCTG:1 - chr3L 11669702 3' + P-element 2431 1 65.35 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTGTCAGTCGAATAAATGATCCGTCAATAACGAAGACAAAGAT:1 + chr2R 3146374 3' + flea 5004 2 77.00 GCTGGAGCATGTTGCGGGCGCTGGATGCGCGCCACTTGCAGCGTGTATATGCAGCCAGCATTGCAGGTAGTTTATTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr4 1294990 3' - HeT-A 5659 1 72.28 TCTCCCTTTTATGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTAGATTCCCCCCGCCTTGCTCCACTGCCATAAATAACGCATTAAAATTATAACGAA:1 - chr2R 8659848 3' + Cr1a 221 1 60.40 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTAGGTACTTAAGTAACAGCACTAATCCTGATGAAGAATAAATGTATAAATGCTACATACATACT:1 - chr3R 4971146 3' + 1360 3373 1 63.37 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACTGCATTCTTGCCATGTGCAACCCGAAAA:1 + chr2L 12284047 3' - 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mdg1 7047 2 71.29 TTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTCGAAAAAT:1 - chr3L 12572631 3' - Juan 4067 1 63.37 AANGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCTAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGCAAATATGCCAATTGGCTG:1 + chr2R 11364017 3' + transib2 2771 1 77.23 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATATATATCCATTAAGCTCCGTGCTTAACCGAATCGTAGAGTATATTGCACACTTGCAAATTCTTG:1 + chr3L 15646986 3' + Juan 4201 1 63.37 ATNAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTC:1 + chr3L 10557639 3' - 412 37 2 59.41 AATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAGGTTCTTTGGAAGTTGCGGAGGGTCGTCGAGTTTGGATTTTGTTTAGGGAAATTAAACGTCTGCTCGTTTTGCT:1 + chr3L 27391778 3' - 1360 3260 1 77.23 ATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGGCTGGCAAACTTTGTGGGTGGTGGCTGGTTTTGCTTTCCCAGTGGGTGGTGCATC:1 - chr3R 23084276 3' - FB 236 1 63.74 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATACAAATTGCGAAAATGTCAACAAA:1 - chrX 5521086 3' + 412 7494 2 76.24 AAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGAATGCTATTTCAGCTTGGGGTAATGTCGACCAGTCTTTTTAGCCAAAGTTCACTGTGCTAGC:1 + chr3R 6112631 3' - I-element 4997 1 73.27 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGTCGTCTGTGTTTATGCTTGTGTGGAAAAGAGCTCGAA:1 - chrX 522133 3' - transib2 31 1 61.05 CTGGTCATATTTAATAAAAAAAAATCGC:1 - chr3L 8036295 3' + Tc1-2 1198 1 71.43 ACNTCATGGAAATAATAAGAACCATGTACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCCTAAGATTGTCAACAACTTGGTGATCCCTTTCGATATG:1 + chr3L 5666393 3' + invader4 423 1 59.00 ACGACTAATGTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATTTGTGCAGCAAGCT:1 + chr2R 8547833 3' - I-element 13 1 38.61 GATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAATCTTTATGTGTGTTGTTTGCCCATGCTGCCTTCGATCCTTTTGGGGGCATTTCATAAATGCAGCC:1 + chr2R 13318965 3' + Juan 4207 1 61.39 TANCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCGTTCTTTCTTTTTTTTTACATTACTGACAAATGCCTTACAAAAGATTTACAAAGA:1 - chr2L 21335373 3' + INE-1 544 1 66.00 TTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAGTACCCCTACACGTTACTGGTGTATTCTCCTACTTTGTACTGCGTACTTTCTTTTTTCTTATTATTATAT:1 + chr2L 20851869 3' + invader2 5083 2 57.43 CGTCGAGATCTCATGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAGATTAAGCATACAGTTTGGTATTATTCTAGTGTTGCTTTACCGTAAGTTGGCTATATTTAGAC:1 - chr2L 22127123 3' + INE-1 144 1 55.45 GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATCCCATAG:1 - chrX 8027433 3' + Juan 4184 1 55.45 AACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATACACCAAAAACGGATCGTAAGCTGTAACAAAAACG:1 + chr2R 13711943 3' + 412 7341 2 71.29 TATGAACGTCTCGATCTCAGGAACCAGTAACGGGTACAGACGGACAGATATGACATTTATATAACCACTTTTTGGTATTTTCTGAACCTTATTTAATCCAA:1 - chr3R 20738501 3' + INE-1 138 1 58.42 CACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTCAACATTAGGACGAACCAACACACCTAC:1 + chr3L 22144284 3' - 1731 4321 2 77.23 TGNAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGGTAGTAGCTACCAGCGGTTGACTTTGTAATTGGTT:1 + chr2L 10711688 3' + I-element 5339 1 51.95 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGGCATGTGTCTGACCCTCCTGCGCCCTTTTTGG:1 - chr2L 9313920 3' + hopper 1410 2 65.48 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTCAATAAACTTGATCCGAAAACACGACAAGGCTGTCTGT:1 + chr3R 10824114 3' - 412 7091 2 61.39 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTGTTACGAGGCTCGACGCAAATTAAAGTAAAAGTCCAACTTGAATGATCTC:1 - chr3L 14208996 3' + Quasimodo 7345 2 58.42 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATC:1 - chr3L 13878065 3' - flea 4804 2 74.26 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAAC:1 - chr2L 18223785 3' + roo 9026 1 69.31 AAAACTAGACGTGGGCAAAACAGACTAATTGGTGGGCAAACGATTCCAGCTTTAAAACGCACCAGCTCCCGAAAGATGTGCTGCTCAAAAACTTTAAATAA:1 + chrX 1019234 3' - FB 98 1 51.49 ATTAAAAAAAAAAACACTTTTAGGAAATACATAAAAAATCTAGAATATTTTCTTTCTTTGTAAATACAATGATTGTATTTCTGAAATAAAAC:1 - chr3L 10551519 3' - accord2 348 1 85.87 GANTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAGGTTGGGAGGGCGGGAAGTTATTACCCC:1 + chr2L 18177985 3' + 412 482 2 60.23 TCNGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAA:1 - chr3L 13878071 3' - flea 4810 2 79.21 CCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAAAATGAATCGCATAACTTATACTCGGGCTCAGTGCCACCAGATTCACAATTTGCAA:1 + chr2R 6611632 3' + mdg1 115 2 47.52 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGTCGTGGAAAGGGTGGCAAAGGATTGGGAAAGGGGGGCGCCAAGCGTCATCGTAAGGTGCTTCGTG:1 + chr3R 14626101 3' + P-element 2878 2 68.32 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACAGCAGTCGCATGCTGATGATGACG:1 + chrX 17729088 3' - hobo 38 1 65.93 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGTCTATTCTTCGGTAACT:1 + chrX 364838 3' + hopper 1386 1 54.46 TTCGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATAATTTCTTTGAGCTGAATTACTGTTTTTTTCAGACGGGATTTATAAATAACAATTGATGTCGACTATCTTAAA:1 - chr2L 16889464 3' + FB 712 2 58.42 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAATACA:1 - chr2R 18344561 3' + 1360 3350 1 66.34 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCAC:1 + chr3L 23821859 3' - HMS-Beagle2 6912 2 59.41 TANACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGT:1 - chr3L 23933642 3' + Cr1a 178 1 71.29 CATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTT:1 + chr3R 15790090 3' - flea 4720 1 67.33 CAACTCGTGGGAACTGTGAACAATAGACCTAAAAATATTAAAATGCCGCTGAACTTGTCCGAAATTCGTATAAAGTTTGGTTTAACTTAACTTATCGCACT:1 + chrX 3892229 3' + baggins 383 1 61.39 AGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAATTTGCGCAAATACTATGCGAATCAGCACCAGCACCCGCCCGCCCACTCGGTCAACTCGTCCTCG:1 - 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chr2L 9410781 3' + roo 392 2 69.31 TTNTTGTGTATGTTATATGTTTTTGTGTAGTTGTGTCGTGTTTTGCTCCCGCTTCAGTTTATGCTACCGCGGAACTTAAGCCTCTATGAGATCTTGTTGAA:1 - chr2R 12801265 3' + transib1 315 1 60.40 TTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTAAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGATAACATTATAATTAGAGATAAAAAACAAAAACCGACGAAAAAATAACTAAAA:1 + chr3R 14718011 3' + 1360 3275 1 49.50 TGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGGTAAATGCGTTAGTAGAACTCCGC:1 - chr2R 17904713 3' + invader2 169 2 76.24 AATAATAAAAAATAAATAAAAATAATACTTCTTAACTGCTTTTTGTGAGCTGTAAAACAATAGACTTCTTTATTTTGTCAAATATCGTAAGTAACGTAACA:1 - chr2L 1554565 3' + Rt1a 5075 5 58.42 AACCACAATCAAGGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAAAACAATTATTATTCTCGGATATTTGGTATTCGAAATTCTCCATACTTTGGCTTATGA:1 - chr3L 6013647 3' + Max-element 283 2 58.16 ACNTCGATGAGCAGGATGTGAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGTGTA:1 - chrX 19820617 3' - Rt1b 4961 1 71.29 TGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACTGCGTTCGAAGGCAGGAGCTCTCTTTGTATGGTGCACCACTTATAGTTTGGTGGGCACGGTGCT:1 + chr2R 16957053 3' - invader2 245 2 72.28 GGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTATGTGTTTGTCCCAGCGTTTGTCCCAGCGCACTTCCCATTCCAACATTATTTATTTTATTTATTTATTAGAG:1 + chr3L 21576892 3' - Tc1 1636 1 46.53 CAAATAAAATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTGTCCAAAT:2 + chr2R 5202359 3' + roo 9031 1 62.38 TTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAGTGAAATATGTAAGCTCAACCACATAAGATATAT:1 - chr2R 3065334 3' - Quasimodo 39 2 71.29 AAACTCTCAGGTCCAAAGCACTGCTATTTTTATGAACACACAGCTGTAAATCAGAGCCTAAATTCTAAGGGGATAAGGAAAATTGGTATGCTTCTGTGGAG:1 + chr3R 4516768 3' + HB 1605 1 76.24 TANGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGACGGCGGCCGACAGCAGCCGATGCGACCCG:1 + chrX 18356266 3' - P-element 24 1 55.45 TTNAAATTAAATTAAAATTCAACGGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - Rt1b 121 1 25.74 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCAAGTTCCTTCGCCGATGCGACATGTGAAAAGTTGTGTAATTCAGTTCGAGAAATACACTCTGAATTTGGCGTA:1 + chr2L 810352 3' + hobo 2937 1 75.25 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTAAATATCGGCAGACGTAATTGCCTTGGCTGCACGCCGAAATGTTTCATGTTGCCAAGTTTTGA:1 - chr3L 7781165 3' - 297 6 2 72.28 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATAT:1 + chr3R 19947400 3' + roo 9019 2 77.23 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATATATATCCATTAAGCTCCGTGCTTAACCGAATCGTAGAGTATATTGCACACTTGCACATTCTTGGA:1 + chr3L 15646988 3' + Juan 4203 1 63.37 TCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGCATTTAATGCAAGCTGAATCTCTCACCACCTCTCCCCTTTCCCACCGATTTGC:1 + chr2L 21815278 3' - R1A1-element 5075 1 62.00 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTCTTAACCATCCATATGTGAAATAAATATGATGTGTAGGCATATTTCCCTATAACTCCAATCCATTCATTT:1 + chr3L 1140378 3' + hopper 1413 2 69.31 AGNCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCTATGGACTAATCAACAGTTACCTAACTTAACTTAAAATAAAGTTATTTTAATGCTAAACGGC:1 + chr2L 18754465 3' - roo 8677 2 66.34 TGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATTTCATTTGGCTTTGTTTCAGTTCGCCTCGTTTGATTCGCAATATTTTCATTTTCATTT:1 - chr3R 8442230 3' - Quasimodo 328 2 62.38 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGCGCCCCTCAGTCGGTTGTCCACTTGGTTACAGCACGGAACTTCTTATGGCGCTCCAAGCTGGGAATTGCTTTTT:1 - chr2L 13076450 3' - 1360 2 2 58.42 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCA:1 + chr2R 544869 3' + HMS-Beagle 214 2 56.44 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCCGGGTTGGTTTGC:1 + chr3R 17674380 3' - blood 7051 2 67.33 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTACAACGACAATGTGGAAAACCTGTTACACTTTTGAC:1 - chr3L 10522010 3' + roo 397 1 65.35 AAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAGCGACGACAACTGTCCGACAAAACAGCTTAATTATATTTCAAGTTTTTTTTTTACCAATTCTGTTTGCCAAAGGAAGGG:1 - chrX 6156714 3' + Doc2-element 223 3 62.00 CTACAATACTGTGCTGAAACCCATCATGCCATCATGCCATCATGCCATCATACAATCGGACCTCCCAGACACCACACATCATCCAC:1 + chrX 16123913 3' + Doc2-element 4338 1 74.42 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGC:1 - chr2L 17205169 3' + hopper 1397 1 59.41 CCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCATCAATCTTTATATAATTGGTGCCCAAATGCTGATCCAACTGGTGCTTGCGGGA:1 - chr3R 11624743 3' + Gypsy6A_LTR 359 1 66.34 AACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAACAACAACAATAGTAATCTAATAGTCCGTTACAACAAACTAAGCTCGGGCAGCTCC:1 + chr2L 12373894 3' + I-element 97 1 63.37 CGAACACACACACACACACACACACACACACACTTACAATCCAAAAACCACATTTATGTGCTACGTTCTACTGTCGTA:1 + chrX 8672453 3' + accord 182 2 92.31 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAAGACAGC:1 + chrX 10119654 3' - FB 7 1 70.30 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATTTTAAACTGGCTTATGATATGAAAGT:1 + chr3R 23724181 3' - Doc 43 1 57.43 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAAGGATAACTCATCTGTAGTATGCAGTATCTGACTTTCGGGCTTACTCAT:1 + chr3R 27539243 3' + Burdock 6368 2 56.44 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATT:1 + chr3R 12566762 3' - Doc 55 1 70.30 GANGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAACATTAGTTTAAGCTTTAAAGGAATAAACGTAAATTGCTCTTGTTAAATCAAAATTAGTGTTACTAA:1 + chr3L 15681636 3' - pogo 3 2 76.24 TTNAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTTTAGGTTGGGGGCTGCAGCGTGGGGGCC:1 - chr3R 11058724 3' - G2 2949 1 71.29 ATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGCTTTTTTTTATTATGATCGTTAAATAACGAATTTATGTTTGCCTTACTCCAGTGAAAA:1 + chr2L 13586194 3' - Doc 4453 1 54.46 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATTGCATTTTAAATAGTGCCGC:1 - chr3R 4679256 3' - copia 34 2 61.39 AGNGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTATAC:1 - chr3R 4160054 3' + invader2 244 2 73.27 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACAAGAAACTGTTCCTTTGTTCACATATAGAAGAACTTTGTCGT:1 + chr2L 12398197 3' - roo 8698 2 60.40 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATA:1 + chr2R 2949104 3' - 17.6 6967 2 66.34 GTTTGCTAAGAAGGTCTAGGGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCACGAGGAGGCGATGGGCAAAGCCGGCCGCATC:1 - chrX 14130847 3' - I-element 5106 1 67.33 ACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTTCTATAAGAAAAATTTGATACAGTATTACTTTGAAGACTTCGGAT:1 + chr3L 23155738 3' - gypsy 27 2 50.00 CAATATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAATGGTACGCTCCCCACTATTCCGACGCGGCCGATCTCGCTCCAGAAATAATCTAAACAAAAGGCC:1 - chr3R 2472683 3' - mariner2 174 1 59.18 GAAAAAATAGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACTGTAAAGGTCCTTGCTAAAAACTTAAAAAATTT:1 + chr4 935646 3' - 1360 40 1 80.20 CTNGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACCAATTCCGAAAACCTTATTAATAGATCATGAACTTCAGATACTT:1 - chr3L 15681532 3' - pogo 25 1 53.61 CTATTCATCCTCACACATTGACAATAAAGTGGAAAACGCAGCAGGGAATCATATGGAGTATGAGTCATTTTATGAGAAAAGCGGACAGTATTTATATTGTA:1 - chr3L 3929753 3' - micropia 176 2 76.24 TTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTTGTTGTTTTCCTTTTTGCTTACTTGCTAGGATACAAAAGTTGCTAAG:1 - chr3R 19755724 3' - hopper 1090 1 59.41 ATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATAATCTACATGTATTTATATTTCGTATTCTTCATCATATTTGGATCATTTTTCACACTCAATCTGTT:1 - chrX 16473733 3' + INE-1 30 1 64.36 GACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGT:1 + chr2R 2879459 3' + Stalker 6965 4 53.47 TTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTTTTCGTTTTTGTTTTTCGAGTGGTTTTCTGATGTCTGAATGCTTATATATGAGAGCGTAGCGCCTAGC:1 + chr3L 16404963 3' - I-element 233 1 75.25 CAAGACGTCAAAGAAGAACACCGATAACATACGGACACACGAGCAGACGTCGGTAAAACTACAAAAAAGAATCGAGTCGAGTCGCGTTCAGCTTGCTTT:1 - chr3L 14642146 3' + diver 498 1 69.70 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGAATCCCCT:1 + chr2L 19644928 3' - blood 7052 2 66.34 GTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTACGCTAGCTTCTCTGTGGACTCTTTGATTCCAATTTGTACGTTC:1 - chr2R 8161815 3' + micropia 5 2 56.44 CTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATT:1 + chr3R 2689430 3' + diver2 4475 1 65.35 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTAAACCAAAATTGGCCTGCAACTGTGTGCGAGTGTAATTGTTCAATTGCCGTATCTGATATG:1 + chr3R 21206764 3' - P-element 15 1 62.38 CGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTGTGGGTATTTTCATTTGAGTAATTGCTGAAAATATTTTCACTATTTATTTATTTT:1 + chr3R 31016573 3' - Porto1 4482 1 57.43 ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATGTATGTCCTCTTTTTTTTAAATAAATTAAACTTTCGTCACAAGGTTGCCAAGACACAAACGAATATG:1 + chr3R 20419137 3' + roo 9061 1 69.31 CACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCCCTTTTCAATGATTCAATAACACGTGTTA:1 - chr3R 20229199 3' - invader4 288 2 71.29 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACAACGACGCTGGGTGCTCTG:1 + chrX 4448629 3' - 412 8 2 72.00 ATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTACCCTCACACCAAAATGTGGTTTCTGGGGGCCATTGCTCGACCGGCTGACGCCTGATGTGATTGC:1 - chr3L 5831813 3' + Doc3-element 4483 1 61.00 TCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCTGCACTTGTGGCCAGTTGTGTATGGGGCTAAACTTTTAACCGAAATAAGGCAGCCAAGCCAAATTCATC:1 - chr3L 963439 3' - jockey 4605 1 72.28 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACACCCTTCCGAAGCTCCACAACCGCAGGTGTTGGCTTGC:1 - chr3L 13704660 3' - hobo 23 1 56.82 TATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATAT:1 - chr2R 13318884 3' - Juan 4061 1 56.44 CGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGACTCTCGTGGACTCCGGGTTGCATAAAGGCTGGCGCAGACGAAAGGGATCTGCGAGTGTTTCACTTTG:1 - chr2R 15578217 3' - mdg1 4 2 73.20 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAATGCCCGAATGTATGCAACGTTTTTGCGTATACGGCATGTAGTCTACACGACG:1 - chr3L 2485891 3' + jockey 4978 1 50.50 GCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTTAGTACACATCACAATGGCAAC:1 + chr2R 15524956 3' - G2 2916 1 76.60 GGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTCACGACAATTTATATCATAAAAATGTAACCCAATAACTTTAAACTTTTAACAAAAGTGTACTTTCTTATCGCCAG:1 + chrX 13954826 3' - Juan 4027 1 70.30 AAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTTGACAAATGTATGTGACACTTACAATTAGTATAAAT:1 - chr3R 11519244 3' + jockey 4754 1 64.36 AANTTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGATGCGCTAGATAGTCGCCAGTAGCACTCGCAGT:1 + chr2R 18005641 3' + hopper 1374 2 65.35 GTNGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACAAACATTCCAACTCTTTTCATGATTAAATATTTATGATTGCAAAGTAAGTAAGGTAAGTAACATT:1 + chrX 10453468 3' + hobo 2928 1 66.34 ACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATACGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGTTCTGTCTGAGCGAAGAGTATATGTTGCCATCACTGCCGCACACG:1 + chr3L 8416880 3' - ZAM 8177 2 70.30 AANGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAATAATATTCAATCACTCTTATGCTCTGACACAACGGAATCACCACATTTTTGACTTTGTGCATTGTTTTT:1 + chr2R 24208931 3' + Juan 4203 1 64.36 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCGCCTTAAATAGAGTTCTAGCCAAATAACCAGATTGTACTTCC:1 - chrX 5925551 3' - roo 8699 2 61.00 TGTCAATGTGTGTGTGTGTGTGTCTAAGTGTAAGTGTGTGTGTATGCATTGGGTTTTGTGTATTCGCCTGTGTTCATGTCTATCATTCGGTTTTCCCCTT:1 - chr2R 22778116 3' - accord 188 2 63.00 TCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACATGTGCCCGATTAGCATGAATGACAGAGCGAGATGGCTAGCGGGAAGCGGGTGAAAC:1 + chrX 9579407 3' + Tirant 384 2 62.00 AATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGATCCGGTGCTGTGAACACAACTTTCGCTTCAATTATCCAAATGACACATTGAACAAAT:1 - chrX 5231792 3' - Idefix 292 2 60.40 CCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGCACAAAACAAACTCAAAAGCAAGAAGAACGTGAAACCGCG:1 - chr3R 14051536 3' + transib2 2378 1 60.40 ATTCTCCAAACGATTTAGTCTTCAACTTTAACCCAAGTGACGCCGCGACAACTCAGAACGAAACCGAAAATTAAAAACGGAAGAGATTGTTGTTCCTGGTG:1 + chr3L 21286199 3' + Bica 4463 1 66.34 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAACAGCAACACCAGACTGGGGAACTCTTAACTCTCGACTCGCATCTCAGTG:1 - chr3R 26087120 3' + roo 385 2 48.51 ATATATTTGTATATATATATTTTGCTGCTTAATTTTGTTAAGACCGCCTGAAAATATGCAATCCTTGCTCTCTTTGGGTTTTTAAACAAACATTTATTTGA:1 + chr2L 2288507 3' - Stalker4 7045 4 40.59 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCTTCATTACATTGAAGTTTTGTTTTACCCTGCCATTGCACTTAGTTGGTTTTTATTGT:1 - chrX 22745634 3' - copia 4889 2 57.43 CAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATTATCGCACCATATGCAACTAATTTCCTTACGATTACGATTCCCTGCGAGGCATTAACAACTTTTGATTGCCG:1 - chr2L 14070950 3' - F-element 4581 1 65.35 AAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAGCTGTCGTTCCTTTTCTCATGAGAGCATTTGTCGGCTTTTTCAGCT:1 + chrX 2652723 3' - Doc2-element 495 1 56.44 GCATCCAGCGCCCGCAACATGCTCCAGCCAAAGTACAACACTTACTTACCTGCAGCGTCCCCCTGATTGAAATAACCTGACCTGAGTGAGTTACCCATCAC:1 + chr2R 4947843 3' + HeT-A 5653 1 53.47 TTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGATGAGGGTTTTCGGGGGTAAAGACCGCACGGCAAATAGCCCAAAATGGTGACATTGTTGTTTAAGA:1 + chr3L 5253309 3' - Doc 349 1 69.31 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACAT:1 - chr3R 19450197 3' - roo 89 2 73.27 ATNAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGTTGGCAAGTGCACCACCCAACCAGCAGCCAGCCATT:1 - chr3R 30904212 3' + roo 9034 1 62.38 CACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTTTTCTTGTTTTTCATTTGCTCGCCAAATTTTAGCAACGTTGCTGGTTTAATCGGC:1 - chr2R 8950975 3' + P-element 2886 2 76.24 GAAGAAGGGCGTCCTGATGACGCTTCGACATATATATATTATTGATCAGGATCAACAGGCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' + invader1 4003 2 58.42 GCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGCTGGCAAGGACTAGAAAGGATGTTAGTGAAAGAGAAA:1 - chr2L 17632892 3' - roo 169 2 68.48 ACTGTTAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATGTATAACTTAGCCTAGGAATTGGGGATTA:1 - chrX 13328844 3' - Circe 430 1 86.67 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTGTCAGTCGAATAAATGATCCGTCAATAACGAAGACA:1 + chr2R 3146369 3' + flea 239 2 71.29 GATTTCGAAATCTCGTACAGAAAGGGCCAGCTGAACATCGTTGCCGACGCACTTTCAAGACAACTGCACGTTGTTGTCTGTGATCATCACTTTGGGCACTC:1 - chr3R 3906812 3' + Osvaldo 197 2 63.37 TTNACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATTTTAAGAATGGTACAATATTTTGTAGAA:1 - chr3R 20419062 3' - roo 8711 2 73.27 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATGTATGTCCTCTTTTTTTTAAATAAATTAAACTTTCGTCACAAGGTTGCCAAGACACAAACGA:1 + chr3R 20419132 3' + roo 9056 1 64.36 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTG:1 + chr4 311605 3' - 1360 12 1 67.00 CGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCGAAGCAGCCACTTTGGTGTCGTCTGCCAGGCATCCGGTTGGTGGCCAC:1 - chr3L 11757248 3' + Doc2-element 293 1 58.33 AANGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTTCTATAAGAAAAATTTGATACAGTATTACTTTGAAGACTTCGGATGAA:1 + chr3L 23155741 3' - gypsy 25 2 52.48 TACACCTCCTTTTTTAAAGAAATGACGTAATACATCTAGCCATTGTTTTTTGTGTTGTTATTGCGTTGAGTTTTTTTTCCTCTCTAAGACAAATTTTTTG:1 - chr3L 2003848 3' - Stalker 6832 2 52.00 GAGGGTAGAAGGAGCAGCGTACTACAATAATAGACGTTATTGAATTAAAAAATTAACATTTAAAAAATGTATATTCTGCACAAAGACGCGGTTAGTTAAAA:1 + chr2R 5178697 3' - mdg3 5257 1 73.27 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTT:1 - chr2R 8951029 3' - P-element 55 1 24.75 GACGGTTTTCAAATCTTGTAGGTTTATCGGACGGTTCATATAAACACGGTATTTTAAAAAACCCAATAAATAAAATTAGCTCATAACCACTTAGCCTACCG:1 - chrX 22786531 3' - mariner2 649 1 61.39 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAA:1 + chr4 311569 3' - 1360 25 1 67.53 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAA:1 + chr3R 19446214 3' + 297 6934 2 69.31 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCACAAATC:2 + chr3R 23601775 3' - jockey 18 1 61.39 GANTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACAGATGATGGAGGGGGAGATACAATGATACCACAGAGAAGTAGACGTACGTATTTGCATTGGAAAAC:1 + chr2R 13899229 3' + roo 400 1 71.29 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACC:1 - chrX 6509794 3' + jockey 4941 1 76.24 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGT:1 - chr2L 6645670 3' + mdg1 7405 2 76.24 AANCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTCCTGAGGGCAT:1 - chr2R 17077839 3' + Tirant 8463 2 68.32 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGAGCCACTTTACTTTCGCAACAAAACTGAGAAATGGTGTTGTATG:1 - chrX 17729037 3' + hobo 2908 1 60.40 GATGAATCAATACAATACAATAACAGCAACAGCTTTCACCTTGTCACTTTCAGCCACTTTCGCCCACTTTTTGCCTACTTTCCCGGAACTCGATGACAATC:1 + chrX 6442354 3' - BS 5066 1 56.44 CTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCTCCAGAACGGGTATTTTGCTCGCCAGAGGCTCATTTGTCCCGCCACCAAAACTGCTGATGCTGCCCTCCAGTAT:1 - chr3R 22509840 3' + F-element 374 1 77.23 ATTTGAAAAATATATATAAAAAAAATATATATTTAATATAAAGTGGATGTTTTTGAAGAGCACATTCGAAAAGCT:1 + chrX 17447103 3' - copia 4664 1 66.67 CTNACACACACACACACACACACACACACACAAGCGCATTCACGCCGAAAAATGTTGAGCTTGAGAAAGGAGTTTCGCTCGTGGCCATTCTGAAATG:1 + chr2L 9626531 3' + Quasimodo 36 2 75.26 AAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCCCCGCATCGATCGCTCTTCGATCCCCGATCACTG:1 + chrX 6800436 3' + Doc 4481 1 70.30 AGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCC:1 - chrX 4806669 3' + roo 406 1 69.74 TTTGTACGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGCGACTTGGTAGCAGCGGTAGCTGGGAAAAGCTTTTCATTCCTCCAGCCTACTC:1 - chr3R 21344004 3' - I-element 5127 1 53.47 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTCTTCAGCTCTAAAGCTCGGCAATCT:1 + chr3L 22920432 3' + 1360 3342 1 75.25 CCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGACCAGTCCTGGAAAGCGAGATGGCAACTCTGAAAGGCAAC:1 + chrX 6303760 3' - R1A1-element 5012 1 68.32 CTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCCCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAGAGTCATGTGGGTGGGGTTCAAGGGGGTTTTTCCAAGGGGTGAAGGTCCATCAGTG:1 + chrX 5589496 3' + Doc2-element 4602 1 65.35 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCATCGA:1 - chr3R 6776542 3' - copia 42 2 70.30 CANCTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTTCAATGGGAACCTATGCTTCTGGAGCACGCCAACACACGAAAGTCAAACCCAGTGACCA:1 + chrX 17711871 3' + 1360 171 1 58.42 TTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTTTTCGGATCAAAAAGAGTAGAACAAAAACGCAATTTTGCTCGAAA:1 - chrX 22900575 3' + Tc1 1536 1 68.00 TGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGCGATTTTCCACTGCCGATTACCGATAGCTTACGTGGCAAGGCAAAAAGAGCAAAAAAGATCGAATAAGG:1 - chr2L 2236818 3' - Stalker4 34 4 67.00 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTGAAACCTTATAAATAGGATCTCCGAAAGAAGAAGCTATAAGTCAGCTTA:1 - chrX 21388503 3' - 1360 29 1 58.42 AGCAATCAGTGTAAACCATGATCAGGGGATCAGCCAGCCGGAAGCCCGGTTGTGGGTATAGTGCTCGAGGTCTTCAGAGTAATCATCTGGTCCCCCACCAC:1 - chr3R 21244493 3' + invader3 5135 1 67.33 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGCAAAGTGGGTGGCCAGACATCGGCAACTGT:1 - chr2L 1204060 3' + roo 9045 1 60.42 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTCTCTATGCGC:1 + chr3R 22341232 3' + hopper 1398 1 62.38 TGNTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTTATGCAGAGGCCCAAACACACACACACACACACAC:1 + chrX 7978950 3' + accord 219 2 61.29 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGCAATAACAAAGTTAAAGGACCGACCCTTTGTGGTACTCTTTCGCCCGGAATCGTAAAAA:1 + chr3L 13345537 3' + Transpac 5221 2 69.07 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGTGTTTAATTACGTTTTCACGCCCATTTTACCTCGACTTGAGGTACTGCTAATTG:1 - chr3L 22751909 3' - roo 19 2 62.63 TTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTTACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATGCATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATA:1 - chrX 13590506 3' - gypsy7 5001 1 80.21 ATAATTGTTGAGTGCTAGTGTCCGCGATTCGTGCCTCAAGATATGACTTGCAATAAACAGTTTTCATATATTTATTTATTTTCCTCGGTGTGTCACAAACG:1 + chr3L 27656385 3' + 1360 455 1 81.19 GCGAGAGAGCGAGAGAGAGAGACAGACACAGATAGAGACAGGTATAGGCTGCGAGTGAGACGGCTAACGAGAAA:1 + chr3L 10811413 3' - Cr1a 293 1 72.97 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGTTAATCTGCATGCGCTGCACGCTTTGT:1 - chr3R 8191447 3' - mdg1 7046 2 71.29 TGNATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGCGTCTATCCACATTATCCGCTTTAAAGGGCAGCAGCCGGCTTACACCACACTCACTCTAAAAA:1 + chrX 10823050 3' - accord 7032 2 73.20 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCT:1 - chr3R 27156648 3' - pogo 38 1 68.32 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGACAAAAACCAAAGCA:1 - chr2L 17269770 3' - hopper 18 1 54.26 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGG:1 - chr2L 9313952 3' - hopper 54 1 76.24 TTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAG:1 - chr3L 13878059 3' - flea 40 2 68.00 AGNGGGTAGAAGGAGCAGCGTACTACAATAATAGACGTTATTGAATTAAAAAATTAACATTTAAAAAATGTATATTCTGCACAAAGACGCGGTTAGTTAAA:1 + chr2R 5178696 3' - mdg3 5258 1 72.28 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATT:1 + chr3L 6013706 3' - Max-element 8288 2 76.24 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGT:1 + chr2R 5202351 3' + roo 361 2 69.70 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTTCCTTTCCTATGGCAACATCAGATCGCTTAAAGCGTGTGTGCCCTTTGAAGTATGC:1 + chr3L 16662462 3' - jockey 25 1 56.12 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGGTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGTGTTAGCTTCACGAAGGGCATACCTGTATTCAC:1 + chr3L 17503206 3' - pogo 40 1 63.37 AATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTT:1 + chr3R 846259 3' + Stalker 6939 4 75.25 ATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATT:1 + chr3R 1960322 3' + gypsy9 5229 2 89.11 TCGAACATTATTGTAAAAAAAATCATATGCTCTAGCCATCCTTAAGGAAATTTGATGTAAAATTGAAATGCATAGCATACATAAAATTTCAATTAATGATT:1 + chr2L 9841792 3' + Circe 462 1 75.25 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGAATGGTTTGGGGCCGTTTGCCTTACAGACAGCGC:1 - chr3R 15744533 3' - pogo 39 1 65.00 GGGCGGTTTGTGGACGTTAGAGTGACCGTGACTATTCGCTGGTTAAATGCGCTAAAACATAAAAAGTGACATAGTAAAAAACAACCAAAGAGTGAAACTAA:1 + chr4 502002 3' - INE-1 223 1 77.23 CTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTTGACCCAAG:1 - chr3L 10557569 3' + 412 467 2 53.47 GTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTG:1 + chr2R 2879475 3' + Stalker 132 4 60.40 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAATAGCTACAACAAAATTTATGGT:1 - chr3L 13652756 3' - hobo 3 1 76.24 ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGCTTTTCATCATCTCGCACTACGGACAGCGCTGATCGTGGACACGATTTGTGTCGCACCTGT:1 + chr2L 21863438 3' + Burdock 248 2 71.13 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTAT:2 - chr2L 11764896 3' + roo 9030 1 67.33 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTT:1 + chrX 364815 3' + hopper 1363 1 77.23 GANAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTTTTTTACACAACTACA:1 + chr2L 21951244 3' - opus 7037 4 61.39 ATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAGTTATACTACTGTCCTCCATGTTTTAAGGCTTAATAGGTAAATAGCAATAGAAAGGATATATCA:2 + chrX 20858794 3' - Copia1_DM 16 1 63.37 CAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCATTTACTTGCTTTATTTTCGACATCTGTCTACGTAATTCTCGATGTATATGTTTA:1 - chrX 6132594 3' + 17.6 6994 2 59.41 TANCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATC:1 - chr3L 13652801 3' - hobo 48 1 68.32 AANAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAATGAAACTGATTGCAGGCAAGGCCAACTTAAAAAGGAGGA:1 + chr3L 22425772 3' - 1360 81 1 60.40 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACA:1 - chr3R 13225517 3' - hobo 48 1 72.45 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAACATTAACGTGGTGGAGATGAGCTTCAGATGTCAGTATCGTTTTATATAGTGTCTGGAAAATTGCGAG:1 - chr3L 7061127 3' + I-element 5343 1 64.36 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTTAAATTGTTGCGTTAACCAAGCCAACCAGCTTCGGG:1 - chr2L 15013946 3' - jockey 4713 1 67.33 CTTGTGGATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCAAAATAAACAGTATCGAAACTGACGAGCTCAGAAACATTTTATTCATT:1 + chr3R 20959402 3' + diver2 4779 2 66.34 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAGATCTTTTTGGCATTAA:1 + chrX 8422131 3' - jockey 4789 1 54.46 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAACATGCAGGG:1 - chr2R 13318855 3' - Juan 4030 1 74.75 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATTTGTG:1 + chr2R 8547824 3' - I-element 21 1 46.00 GCACAAAAGCGCAGAATGCGCGTCAAATTCATCTGCGCGTACACCAATCTCAATGATGCAGCCGGCTAAAAACCGAAAGCTCCGGAAATTGTCAACCAAAT:1 - chrX 7774797 3' + Porto1 396 1 57.43 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCTC:1 + chr3L 10557659 3' - 412 7070 2 62.38 ATTTCTCAAAAGTGTGGGCGCGGGGGGAAGTAAGGACCTGCCTGGGTTACATGCGTGTGTTTGTATGTGTGTACACTTCCTTTTCCTGCTTACCCTTTTTT:1 - chr2L 18440951 3' - INE-1 253 1 76.24 GTATGCACACACACACACACACACACACATACACACACAAAGAGAGAG:1 - chr2R 22271097 3' + accord 179 2 81.25 GCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGAGGCTCCAAGAACTCGAAGGACACCGGGATGTGGCCAATCGGAGGCTT:1 - chrX 12518929 3' + 1360 24 1 61.39 CGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTTAACTTGTTTTTATTTGTTGTTTTCCAAAGAGCGTAGTTTCTTGTAGC:1 + chr2R 5131816 3' - Porto1 221 1 67.33 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGAGCTGCTAGCAATCAGCCAGAGTTGTCATTG:1 + chr3R 8191565 3' + mdg1 7452 2 71.29 CTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCCATCTGCCCCTTGCGTTGCCGTGCCGTGCCGTTGA:1 - chr3R 9549532 3' - invader2 188 2 71.29 ACACCATAGAAAAAAATCACAAGAGCACAAAGTCAGCGGAGATCAATGGACAGCGAAGACGGCGGCGGGCGGGAAAGTCT:1 + chrX 22541566 3' - mariner2 589 1 77.50 CGTACCATACACGGTAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGTAGGAGATGTTGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAACAAAAGGGGCTCTGCTGAAAATGCAATTG:1 + chrX 16870743 3' + Cr1a 4399 1 73.47 AATAATTATTTTAATTTTAATTAAAACAATAATGAGATCATTTAATAAA:1 - chrX 10967743 3' - NOF 3961 1 46.94 TGNCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATTTCTTCAAATTTTAATTGGTAAAGGAGTAGTTGGG:1 - chr2L 19644836 3' + blood 377 2 76.24 AAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAG:1 - chr3R 19450171 3' - roo 40 2 64.36 AACGTGTAACGAAATAAAGAGATGGAAGACGAGAGTACCTGTACTTGCGTAGTGCCCGAGCGCTGCAATAGGTCTCCAAATTATTACAATGCATTCATTGG:1 - chr3L 21702816 3' - Gypsy12A_LTR 2256 1 56.44 TAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATTAGCAGACTTCGGAATTAAAAATT:1 - chr3L 22014058 3' + Ivk 5020 1 76.24 CAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTTAGCTGTGAAATATAAGTTTCTGGTCATAAACGATATAAAGCTG:1 + chr2R 18230332 3' - R1A1-element 492 1 56.44 GTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGAGCTAGCTGCAATGTTGTTGTTGTACATTATGTTGCATTTGCAATGCAAAT:1 - chr3L 13359979 3' - 1360 3236 1 63.37 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGCTCGAGCTGAACTATTTATACTA:1 + chr3L 11920091 3' + Tabor 434 2 74.26 CCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGAAATTATCGTTTCGTTTTAGCCG:1 + chr3L 17766835 3' - R1A1-element 276 1 77.23 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACCTTCCTTATTTGCAATAACTAATAC:1 + chr3L 18639579 3' - roo 52 2 78.22 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGCAAGTTCCTTCGCCGATGCGACATGTGAAAAGTTGTG:1 + chr2L 810315 3' + hobo 2903 1 63.27 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAAATCGATCAATTAGATCTTTCAGCGGGCAAGATCACAAGTACC:1 + chr2R 19149492 3' - diver 5893 2 75.25 GGNAACGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAATTATCCAACGAGCCCAATGGAAAATGCCCACACACGCCTGCAATCAGACAGCCACACATACATATACGCATTC:1 + chr2R 5843756 3' + Fw2 3572 1 56.44 CTTACTTTTCGCTTTATTTATATTAATACACATCGCATTGGTATCAATGAGTGTGTTTTGGGCTGGGGACAACTATTATTCACACTGAAGAAAGGACTAAT:1 + chr2L 20403140 3' - Fw2 33 1 62.38 CANTTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAATTTGGCCTATGACAATACAAACGCACTT:2 - chr3R 7886131 3' - jockey 57 1 69.31 CTNTAGATGTCTCAGAACGTTTACTTGGGCCATGGCTGAAACTGTGGCTTTCTTCTTTGATGTTTCGATATTGTTGACGTTTGTTACTCTCTATATTTTAT:1 - chr3L 23524196 3' - gypsy10 5509 1 78.22 AAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGGCCTTATAAGTTGGTGGGTAGAACGTACCCATAAGATATGT:1 + chr3R 13844500 3' - Doc2-element 441 1 59.41 CANCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTATCTGGGTTACTCAAACAAGCCTTTAGCAATTT:1 + chr2R 8294269 3' + 412 452 2 64.36 AATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTGGCTAATATTCAGCGGGCAATTATTGCGCAGTACGAAAGAATTGGCGGCACCACT:1 - chr3R 4242898 3' - I-element 236 1 59.41 CTTCATATAACCGATTTAGGACTGTTGAATTTATATTGGGCTTCTCGGCGGTCTCGAACTTTCCAGCTTCCGGGTTGCTCTTGCAGCGCTGAAAGGACGAC:1 + chrX 20159738 3' - flea 290 1 81.19 ACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCAC:1 - chrX 4806663 3' + roo 9050 2 57.43 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAAGACAGCTGAG:1 + chrX 10119658 3' - FB 3 1 74.26 CCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCACTCCAGACACTCCACTATCTCATCCACTTGTTTTCCAACAGTTTAACAACATC:1 + chr3R 10115125 3' + F-element 351 1 58.42 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAATATCGATGAGGAATCCATTGTCAACT:1 - chrX 7768908 3' - hobo 24 1 54.46 TATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACAACCGGTGAAAAACTATGAAAGTCTTTCGCCCAAGAGAAAATGACTCATGCATGCAACACGCA:1 + chr2R 19450961 3' - accord2 83 2 68.32 TCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCG:1 + chrX 678831 3' - Tirant 44 2 67.33 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGCTTTTAAATAGTTTCTTCGATTTTTTCCCCCATTGTTTT:1 - chrX 6082573 3' - roo 8700 2 63.37 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTTTTGTTCGGTTCTACATATTTATAGGTCACACAGCTAATACAAATAATTGTTTAAGGGTCTACAA:1 + chr4 531423 3' + roo 400 1 41.58 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATGTATATGCATATATAATTAGTACGAACCTTCGTGAATAATCGTGCCGCCGCACAACAAATGTGTTGTAT:1 + chr2R 17483842 3' + roo 406 1 77.23 AAGTCTTCTTAATTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATTTTCATACCCATTAGTGTGTGGGGGGTATATGGTATCCCCTTCTGTCA:1 + chr3R 27452420 3' + roo 405 1 73.00 GAAGTCGTTTCTGGAGGAAACGATCTTTTGGACACAAAGGTCTCTGCTAGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGCAATAACAAAGTTA:1 + chr3L 13345492 3' + Transpac 5172 2 77.23 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATGGCCATCTGTTGCAGAGATATACATATTTAAAAATCTTCAAGTCACTCAAAA:2 + chrX 9982456 3' + pogo 2089 1 58.42 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCTCGTGTTGCTCTGGGTCGTTTTGTATTGCTGGTG:1 - chr3L 17971205 3' + P-element 2876 1 68.32 GCTGAAGAGGGTACACCCAACCGAACTCCCTACCCCGCTGCTAATTGAGTCATTTCGTTCGTCTTCACCCCTTCTCTTTTTCTATAACTATTTAATTCACC:1 - chr2L 14639819 3' + G5 4638 1 68.32 AAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATATAAGGATCAATAAAAACAATATGATCAATACTTCGTTCACATTGAATATACCGATTTATTCAAGAAAAG:1 - chr2L 15022454 3' + Porto1 4215 1 62.38 GCAATCCCGAAAAACAAAAGTTTATCAATAAACAAATTATAATAATCTATATATATAGTAGCCCATGGGCGATTTTGACACCTGTCGTGGGGCAAACAACA:1 - chrX 16206545 3' + Idefix 7089 2 61.39 TTTTATGTATATTAAATGGATATAATGCATTTATTTAATTAATTATTTATTTCATCATTTCATATCAATGTCTAAAATCAGGAAATTTAGTATAAGTAAGA:1 - chr2L 13332540 3' + transib3 2627 1 50.50 CTNCACGCGAGGGCGGCTGGAAACAGGCTCTTAGTTAGGTCATGTCTCTGCTAAGAGTGCTGGATAATCGTAGTAAAAAAACGGTCCAGCAATAGACTCAT:1 - chr2R 15030324 3' + baggins 97 1 72.28 CCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAGGATCCCCGCCGCTTCGCCATCCTTGTGGCAATCAG:1 - chr2L 13538030 3' + G2 56 1 64.36 AACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTTGACCCAAGTCCA:1 - chr3L 10557565 3' + 412 471 2 57.43 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTCGAGGTCTACCCTGAATTTGTCCT:1 - chr3L 6522298 3' - pogo 51 1 80.20 TTNGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGTATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTT:1 - chr3L 14854696 3' + Quasimodo 7333 2 72.28 GACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACAGCCAACACCCTGAGCCCAATCCCATATGTAGATGTACTATATC:1 + chr3R 19989824 3' + Doc 473 1 59.41 CANCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAAGCGGGAAGAGCTGAAAGGGATCAG:1 + chr3R 24533935 3' + P-element 319 1 32.67 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGCAGATAGAAATCTGCACACATTTCGGCC:1 - chr3L 6900630 3' - pogo 44 1 74.26 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACACCAA:1 + chr2L 6184242 3' + roo 9029 1 68.32 TTAAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATTAACTTTTATTGAATTGAAATTT:1 + chrX 1582156 3' + HMS-Beagle 6680 1 75.25 CCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATACATACATATATGATATATCGATATGAACACAAACAAAA:1 - chr3R 4602478 3' + Tabor 7219 2 65.35 TAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAGTCCAGGAATGGAAGGAA:1 + chr3L 10776335 3' + Quasimodo 3 2 79.31 GAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCATTCCTGAACTTGATCATCCACAATCTTTTGTTCACAGTCTGCCAAACGTCTT:1 + chr3L 25400869 3' + Doc 4445 1 57.43 TANGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATT:2 + chr2L 17205255 3' - hopper 28 1 54.46 TANCAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACT:1 - chrX 1600193 3' - BS 5035 1 67.33 GTTGAGTTGAAGAGACTGTTTCGGTTGTTGTCCTTGCCAGAGAATAGATGCGGATT:1 + chrX 17673592 3' - Doc4-element 331 1 53.57 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGGGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTG:1 - chr3R 7885605 3' + hobo 2901 1 63.37 ACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAACGGGGTCTACGGGGTCTACGGTTGGATCTCCGGGGGATACGGGGCAAGACACGGACAACGTAAA:1 + chr3R 11538542 3' + 412 7532 2 62.38 AAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCCTCCGTATTCCTCGCCTCTCCTCGCATCGACTCATC:1 + chr3L 14139465 3' + F-element 4443 1 64.36 CTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCT:1 - chr2R 5582184 3' - Cr1a 458 1 50.50 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTTTCAGGCGAGGCACACC:1 - chrX 8922313 3' - jockey 19 1 64.36 TGNTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGTTAGAAAGTAA:1 - chr3R 12554848 3' - mdg1 7042 2 76.24 GATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAAT:1 - chr3R 23020828 3' + INE-1 564 1 46.53 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGATTACAAAATGTATTTCTCGG:1 - chrX 7583175 3' - I-element 4 1 75.25 GAATAGTGAAGAGGAAGAAGGGCGTCCTGATGACGCTTCGACATATATATATTATTGATCAGGATCAACAGGCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAAT:1 - chr3R 4604461 3' + invader1 381 2 51.49 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACT:1 + chr3R 6776600 3' + copia 223 1 60.40 GTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATATATATTAAATGTGCATATATATATCCATAATCAATGGCTTACGTGTGTGGCCGTCTGTCGATGGCTGGAGGAG:1 + chr3R 13545134 3' + invader2 4860 2 78.00 ATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGA:1 + chr3L 19339422 3' - Tc1 26 1 54.26 GGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTCTCACTTGGCAACTGACACATTGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAA:1 + chrX 10521754 3' - invader2 353 1 73.27 GTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCGTGGCTACGGCCATGTTTTGGTCTTGGGCCTTTATGTCAGCAACAATTTGCTGGCATGACGTTTTTCATCA:1 - chr2L 6173397 3' - HMS-Beagle 6707 1 75.25 ACNGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTATGACTGAATTAACATCGGTGCACTCCGAGAATAAA:1 - chr2L 10368227 3' + Ivk 382 1 63.37 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGA:1 + chr3L 22400350 3' + 1360 3364 1 55.45 ACGAAAGAGCATACAATAGGGATACCAAAACGATATTTAAAAACATTTCAATTAATTTTAGTTGTTAAAACGATATTTTGTGAACTTTGAATAATTGTAGA:1 - chrX 7210936 3' + transib3 80 1 54.46 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGGGCAGAGAGCAGAGTCGT:1 + chr2R 635679 3' - 1360 53 1 75.76 ATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCCCGCCCCCAAACTACAATTCAACATTAACACTACCCAGCCGAAAAGTAGGCAACACAAAACGTTCATCCGCCCTGTG:1 + chr3L 9064392 3' - jockey 8 1 73.27 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCGGATTAAATTGAATATACAATGTTAAGGCAATGGATGAAAAAAAAAACAC:1 - chr3R 22208544 3' - I-element 24 1 53.06 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCGGATATGTACGCCAAATTGAAGCAATTACCGGGAGTCCCCAGCCGGAAAACTCTATATAAA:1 + chr3L 7968756 3' + hobo 2928 1 68.04 TTNATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTTGAATCGTGTGTGCTGGTGTAAGA:1 + chr2R 20309378 3' - roo 51 2 78.22 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCC:1 - chr3R 13225496 3' - hobo 30 1 54.46 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACATATATTCGAGTATATGTAAGTATGGGTACGTATCTGCTCCTTGGGCGT:1 + chr2L 16954911 3' - Quasimodo 16 2 62.00 ATATTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGGAGACACAAAATCGAAATCTGAAGCACTGAAATTACACCACGAATATGTACAATTCGATTTGTGTGTTGA:1 + chrX 9890878 3' - Cr1a 415 1 60.40 GCNGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 424 2 53.47 GTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCAATCAAATCGAGGAGCACACAAAATGCATATGAAAACATTTTATTGTATTTGCATACAATTTTCTCATA:1 + chr3L 10836777 3' - mdg1 7324 2 65.35 TANATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTACATACATATGTACATAGCTCGATATATAATGTACCATCCATATAGGTGTGTAGTTATG:1 - chrX 5933825 3' + Burdock 243 2 65.35 ATTTTCGAAAAAGTGGGAAAATGAAATGTCTTCGTCAAAGTGAGGGGAGAACTTTTAAAAGTATTAAGACTGAAAAGAAGGCTGGCCTAATCTGTCAAAT:1 - chr3R 11085474 3' + FB 130 1 58.00 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGGTAAACGAATCGATATTGTTTGGCAACTATCGATGAAAGATACATCGAACAGATGTTTGAGTATTGGCT:2 + chr3L 11790061 3' + P-element 2883 2 74.26 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTCCTGAGGGCATGCGGCTGTACCGTGAAAAT:1 - chr2R 17077820 3' + Tirant 375 2 53.47 GACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAACAAAAAATATATATTGATAAGCACGGGCATGGGAACGAGGCGGATTAGCAAAGCAGAATCGCTCT:2 - chr2R 13745982 3' + G6 2007 1 56.44 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGC:1 - chr3L 9076578 3' + mdg1 377 2 66.34 ATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGAGGACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGTCCCTAACCGAATTTCAACTTCCTCGACTCATTGTAATTGCA:1 + chr2L 14033927 3' + Tc1 1262 1 60.00 CGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCA:1 + chr3R 9192573 3' + invader3 5420 2 70.30 TTTTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGT:1 + chr3L 24916686 3' - Porto1 153 1 60.40 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGTCATGTGTCTGACCC:1 - chr2L 9313937 3' - hopper 39 1 61.39 GTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTTACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATGCATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATA:1 - chrX 13590506 3' - gypsy7 5006 1 81.19 ACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGCGCCCACCACGCACTGCCATCAAATAGCGACTC:1 + chrX 10256137 3' + Idefix 6992 2 67.33 ACGTGCGTACAAGTTCTCAGGTCCTTACAAATAAAAACAGGTTAGCACAAAGGCAGCCTATGTGCCACACTCCCGGTGGCGGAGCTCTTGGCCCA:1 + chr3L 13892635 3' - Chimpo 3939 1 66.32 TTCTTGATCAGGATCTATAGCCGAGTCCATCTAACTCTGTTCTTCCGTCTGATCGTAAAAGCGCCGAGATAATACTATAACTAGAAATATGATTTTAAGCA:1 - chr3L 27331683 3' + INE-1 87 1 55.45 CAAGAAAATAAATATAAAAAAAATAAAGCTTACAACAAAACAAGAGAGCAAGTCAATAAGCCTCCACTAACTGAAATGTATATGGAAAGCAGGAAAAAAAA:1 + chrX 6792229 3' + Tc1-2 479 1 73.27 ATCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCCCCCACGCTAAACTCTTCTGCTCTCAGCAACTTCAGCCAAACGAGACGCTCTATTCGCATGTCTC:1 - chr3L 9971928 3' + Porto1 479 1 70.41 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGGGGGCGGGATGAGATCCTTTTTGGAGTTAAGCTTAAAAATATTC:1 - chr3L 9064300 3' + jockey 4957 1 54.46 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGAAGACTTCTGTGTAC:1 - chr3L 21636430 3' + flea 241 2 72.00 GTNTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTTGAGATGTGGATTATTTTTTCAGCATTCATTTTTTATTTTAACCAACATACTACC:1 - chr3R 16581118 3' - hopper 1095 1 61.39 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATTACAAATTATTCAATTTGTTGTAATTAATATTTGATTAATGGCTTACACGATATTTTTTTAAGCC:1 + chr3R 19206187 3' - mdg1 12 2 68.32 ATAATAATAATAATAATAATAAAATAACAAAATAAGTACGACAGTTCAGATGCGTTTACTTTTACTAGACTAAAGCTGTATAATTTCCCATTTGTTTAAAA:1 - chr2R 19058756 3' + mdg1 38 8 39.60 TGGTAAAGACGAAATAAAGTCAAATGCTGAGCGATACATAAGTAAACTACACAACCATGATAATGCAAGGCTAGGCTTACACAGTGGCTGGCGGCTTA:1 + chr3L 27351228 3' + G3 4345 1 64.29 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGATCTGATCTTATGACATAAAAACGATTGT:1 + chr3L 7868755 3' - jockey 4717 1 76.24 GTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTCTCGCTCAGGTTCCCTTTTTTGTGCTGTGTGTGTTTTATTAAGTTTTTAATTA:1 + chr3R 7465241 3' - accord 7375 2 58.42 TTNCGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACTGAGAGAAATGATTTGAGCTAGTATATGGAAT:1 - chr3R 28117770 3' - I-element 44 1 69.31 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTTCCTTTCCTATGGCAACATCAGATCGCTTAAAGCGTGTGTGCCCTTTGAAGTATGC:1 + chr3L 16662462 3' - jockey 28 1 54.46 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATGTATATGCATATATAATTAGTACGAACCTTCGTGAATAATCGTGCCGCCGCACAACAAATGT:1 + chr2R 17483835 3' + roo 400 1 71.00 TTGTAGTTTTTAGTACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCACGAAAGACCGGTAACGGCGG:1 + chr3R 28063640 3' - Doc 56 1 79.17 GAGGATCGTGCCTTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAAGTGGTTGTTCGGTTATTAAAACACAGCTTGAATTTCGGAATTCAAGTGTTATATGATCCTCGAT:1 - chr2R 1778090 3' + mariner2 149 1 77.23 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATAGCCAGCTCCTTTCGCAAATCG:1 + chr2R 19149454 3' - diver 43 2 63.37 TGGTATTATGTTCGTATATACTACACCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAAGCCCATTCTAATGATGTAGAGGCGCAACCAGGTGTTTCTATAT:1 + chr2L 6645745 3' - mdg1 7042 2 75.25 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATC:1 + chr3L 10557645 3' - 412 31 2 54.46 TAATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTAGGTGGGCAGCCAACGTGGCGTATGCGTAATGTTTAGTTGGCAGCCGCTCTTAACCC:1 - chrX 3119269 3' - accord 7031 4 64.84 AATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCTCAGGAGTCTGTTCCTTCCTGCAATGCCATCGTTGTTGTGCGCCGTCTAAAGTCCATAAGTCCGTCTTGGCC:1 - chr2L 4783777 3' - baggins 5298 1 57.43 AGGGGCTGGTTGGCTTGGCGTATATGTTTTCATTTAGCAGATACAAGCGGCATGTACACGGGATGCTACTGGGCCTTCTTTATCAATATTTTTTGCGATGG:1 - chr3R 27835682 3' - G7 748 1 77.23 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCACCGAAAAACCTTC:1 + chr3L 6013733 3' - Max-element 26 2 51.49 TTNAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATTGCGATATAAAAATTGGTTGCTCATTTGCTGCTCTT:1 - chr2R 13317842 3' + jockey 4943 1 71.29 TTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACATACCCATTTGAAATCCACCGGCTGG:1 + chr3R 2694627 3' - diver2 4535 2 72.55 AANCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATC:1 - chr3L 13878065 3' - flea 47 2 73.27 CCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAAGATACATTTATGTAGAAAGTATCTGATTGAAAACTAG:1 + chr3R 18845362 3' - I-element 473 1 59.78 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCACACACGCAAATAGGAGGATTTCTAGACCCGTTGCAAACACATATATGATTTATGACTTCCTGTT:1 + chr3L 13704745 3' + hobo 2930 1 71.29 AATTTGACAAAATATGCTCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTATTGATCAATTGACACCATGCAAAAAATAGAAATAAAATAGAA:1 + chr2R 7897617 3' + 1360 208 1 77.23 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTGCCCTACCTCCCCCTTTGAAAGCCTT:1 + chr3R 4805103 3' - 1360 49 1 73.27 GCGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAATA:1 - chr3L 13652776 3' - hobo 23 1 56.44 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACAGATGATGGAGGGGGAGATACAATGATA:1 + chr2R 13899191 3' + roo 9025 2 73.27 ACNCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAAGGGGCCGTGAACCTCGGTAGC:1 + chr3R 19495176 3' - micropia 5096 4 78.22 TTAATATAAGTTTTTAAATTAACAATAAAGAGGAATATGCACTTCAATTACAAATTATAAATCATTACAGTTCCAAATATAGGAATAAACAATCTTTTTCT:1 - chrX 4762347 3' - invader6 4440 1 81.19 GCGCGACCTTCATCCGTCTACGCACACCCACCCACACATGTGAGCCATAAAAGTCCTCGAAGAACCCATGACTCAGCCTGAACCACAAATATCGATTGATG:1 + chr2R 13092661 3' + Ivk 5031 1 71.29 CGAGAAATACGCGTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTT:1 - chr3L 16995277 3' - Doc4-element 60 1 81.19 CAATACTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGTATGCA:1 - chr2R 12446046 3' - hopper 36 1 58.42 TGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATCTCCAGT:1 + chr3L 25350823 3' + baggins 5416 1 41.58 CTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCGTATAATCAAAATCTTGATAAACAAATATCATATTTCTGTAGCTTGCAAACTTTTCAATGAGT:1 - chr2L 18036251 3' + I-element 39 1 67.33 CAATTGTGTATGGTTGTTGTTGCTCGGTGTGTTGTTGCATGTTAAAAGTTAAACAGAAATCAATTGGGGACAGCATTGATCCAAGAGACAAGACTAGGAAA:1 - chr3L 7602168 3' + transib4 323 1 67.33 TACATACATATGTACATACAATACATACATACATATGTATGTACATACATTTATACATATATTCCGATCGGAAAAGCCTAATTGACCTCTTGGACAT:1 + chrX 6863858 3' - invader3 5085 1 68.04 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGCCCTCGTTTCGATATGCAATCGGTCCATTAACGATAACAGAAATCGAAAACAGCACTATTTGGTATTC:1 - chr2R 10468547 3' - P-element 6 2 73.27 AGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAATTCTGCACCTGTGGAAATGTAT:1 + chr2L 23084407 3' + accord 7363 2 58.42 TCNCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAAG:1 + chr3L 26007756 3' + G5 4760 1 52.00 AACTAATTGGTGGGTAAACATGGGTAAGGTAAATTAGGTAAGGCTGTGCTGGCTTTTATATATAATACATTTGGACAAATTTTACAAATCATCTTGCATAT:1 - chr3R 8415501 3' - FB 76 1 50.50 GTGTTTGTGTGTGTTGGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTATGCCACAACCATGGGCTGAATAAAATTGAATTCGACTGTGATTTTG:1 - chr3R 13546570 3' - gypsy3 418 1 64.36 GAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAATATACAGGATTATGTTTGTTTTTTTCCCCCTCCAAAGCTTTTATATTTTTAAAGGAAAGTGAGGTTGTTGC:1 + chr3L 14585940 3' + Tc1 128 1 65.35 TGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCCATGGCCCGCCACTGTCACTGCATTTTAATTTACTGCATACCTTGAGGCGCCATTCGCCTG:1 + chr2R 13381994 3' - jockey 4661 1 69.31 TATAAAATGGGGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGTTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAATTGCTGGCTGATGCCCCGTCATTCCTTTTT:1 + chr3R 12078078 3' - G4 3516 1 82.18 TGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAAC:1 + chrX 21667910 3' - gypsy2 51 2 72.28 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATATTAAGCTTAAGCTGCAACTGAACTGAAAAAGGCTGAATAACGAAATGG:1 - chr3R 19952310 3' - roo 26 2 53.47 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATTTTTGGATCCTAGTGATAACGG:1 - chr3R 12375169 3' + pogo 2051 1 81.19 GACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAA:1 + chr2L 23295881 3' - micropia 4969 2 62.38 TTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAAATTGTATGTACAATGCTTGTTACCCCTTTGTGAATCATTTATGGAGCGCGGCAAAGAAAATGTAGCATTAAAAGAG:1 + chr2R 14723597 3' - rover 63 2 66.34 CACGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGGATGCGCGCACTTGAGCCCGCAAATTGAAGGCAATTGCCGGCGATTATGCGACTTTC:1 + chr3L 20932217 3' - Quasimodo 102 2 61.39 CTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATTCTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTA:1 + chr2R 9500042 3' - G5 4727 1 56.44 TGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAACAAAAAAAACTGGGTCGCAGTCCATAAGTTCAAAGCGAAGGAATATTTTCA:1 + chr3R 28473356 3' - accord2 7297 1 55.45 CGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAACAAACGCACGCTACAAAAAAAATACACAAGTTTACAAAGGAAATACGTAAATG:1 + chr3L 7208852 3' + G6 1978 1 68.69 GCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATCTGTAGGGGTACT:1 + chr3R 1977615 3' + micropia 419 2 59.41 TAACTATAGTTAGCCGACGCGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGAAAAGAAGGACACAAAGGGGCTGCGACTTTAACCCACCCGGTTAATGGTGATGACGAT:1 + chr3R 6288280 3' + X-element 4629 1 64.36 CACACACACTTACACACACACATGTACATGTACATACATATAAACTTTTCTATCCCAACCAGCCAGTCTCGAATGTTGGTGGATTGAGAGGGTTCATTGCA:1 - chr3L 10763992 3' + Quasimodo 28 2 71.29 AAAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAACCCCAAAGAAACAGCCGATTTTCAGTGTTTTACATTGCCGCGTTCCGGAAACTGGAGTCCCAATAT:1 + chr2R 21431470 3' + F-element 4659 1 71.29 TTTCTTTAGCTACCAGTACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTGCACTTTTAGCAACAACAACGGCAGACAGCAAAAAATTAATAAAAGCCAAGTAAAAA:1 + chr3R 29531076 3' + Doc3-element 477 1 63.37 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTT:1 - chr3R 178121 3' - BS 41 1 68.32 AAGCAGCAAAAAACACACAATTCAACTACTTAGCCACCAAAACTTAAACTTGAGACGTGTACCGATGACACATAAATTCAGCGTTTGGAGAAAAGTAAAAG:1 - chr2L 19203486 3' + Porto1 4440 1 69.31 GANGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATTCTC:1 + chrX 19820788 3' + Rt1b 4978 1 79.21 TTGTTANAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAGGTAAAAGCTTT:1 - chr3R 9325605 3' + roo 382 2 52.48 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACATCTATTGAAATTGAATATATAAATTTACGTTGTGGAGAACTTGCCATGACTCAAATATAAAAT:1 + chrX 20933833 3' - mdg1 7050 2 65.35 TACGATAACCAAATTATCCCCAAACTTACCGTGTTAGCCACAAATGCTTCAGCAATTAATGCGCTTGGTTTATCAGGAACAATTTCATTAGCGATATTAGT:1 - chr2L 5165328 3' - Gypsy12A_LTR 168 1 72.28 CTTTCTTATATATATCTTATATATTTAGGCTTATCGATAGGGCGAACTATGCACCACACATACATATCTATCTATACCCTGTATATTCAGCCATGTAAAGT:1 - chrX 12913148 3' - 412 7323 2 56.44 TTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCCCGAAGAGATGATTTCTTCTTAAGGTATGAGTTCTCTGTTTTCCAACCTATGAACG:1 + chr2L 22731967 3' - Cr1a 163 1 58.42 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATG:1 + chr3L 6442648 3' + roo 355 2 80.41 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGGTATATTTGAACGCTCGTGTCACGGTCGCACTCTCATTCGTCTCTCAGCGTTCAGAAG:1 - chr2L 18987254 3' + P-element 2870 1 60.40 CCNGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCA:1 + chr3L 23702265 3' - G4 8 1 67.33 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGATATCATCATTGGTTGGAGTTTTACCCACTT:1 + chr3L 17172717 3' + roo 9028 1 66.34 GGNCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAA:1 + chr3L 26007755 3' + G5 4758 1 50.50 CTNGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATACGCTCCATGTTGATAACACATATTTAAAGAACAATACCCACAATTAGCAGCAATACAAAGTCTTTA:1 - chr2L 6157155 3' - jockey 4679 1 67.33 ATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCCCCATTCCTGCGGCGGAATCCATAAAGATTCG:1 + chr3R 16918427 3' + I-element 234 1 80.20 TTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCAACTGATCGTTTGGATAATGACCTGAAAAGGGTATTTCAGTGGCGACTTGTGCTGACGCTTGGCGGTTGCGC:1 - chr3R 26592555 3' + roo 410 1 75.76 GTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAGATATTCTGTGCAGATTGCCTTTACCAA:1 + chr3L 15393304 3' - P-element 116 1 31.68 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGGGCCTCGAATGCATTTCATTTTCTAAGCAAACATATTCCG:1 - chr3R 29357018 3' - 412 6 2 70.30 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAAT:1 - chr3L 2392381 3' + Transpac 270 2 68.32 GTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGAACATTTTGATTAAGTAGAGAGACAAATTGTTCTGGCAGCT:1 - chr3L 22920357 3' + 1360 3380 2 70.30 ATGTTTGGTGGGCCTGTCATAATTGTTGGTTAAGGGCTTGATCCCGGGTTGGAGGTCTTGTTGTTTGTGTTGTTGTGTTGGCTGTTGTATGACCTT:1 + chrX 22678374 3' - I-element 185 1 77.08 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGATTTAATTGTGATCATTTAGGAAGAGGAACCCAGAAAATGA:1 - chrX 20933746 3' + mdg1 7425 2 58.42 GCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACACCACTTACGTCTCTGAACTCAAAGGCTCCTCCTACTATTCCTAATCCTAATTTTAAATTGCC:1 + chrX 1641913 3' + Porto1 454 1 65.35 CAGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCTCGTGGAGCCTATGGATCCCAAGGACCTTATGGATCACAAGGACCTTATGGATCTCAAGGACCCTATGGGCCG:1 + chrX 12971741 3' + HMS-Beagle 475 1 78.22 TTGTGCGTTGTTCGCAGTGCACATAAACTTCACTGTGCACCTATTCTCTACTCTCGCTCTTATCGAGGTGCGTGTCTGCAACGTAAATGTTTAATTGATAA:1 + chr2L 14222359 3' + Cr1a 229 1 60.40 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGATTTAATTGTGATCATTTAGGAAGAGGAACCCAGAAAATGATTCG:1 - chrX 20933742 3' + mdg1 7434 2 52.08 TCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATTAGTTTATTTTGATTACTCGGTTCTCTGCTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 17975457 3' + invader2 5068 2 67.33 ATNTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTAC:1 - chr3L 10522044 3' + roo 9026 1 72.28 GGAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCGCTCGCAATTCAATATCACGTCACAAATCAGCC:1 - chrX 8508456 3' + Idefix 184 1 52.70 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGAC:1 - chr3R 19446169 3' - 297 6629 2 79.21 GANTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Tabor 6858 2 47.83 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGGACATTTCAGTGGGTGAATATGTGAGTGTGTGTGTGTGTGCTGT:1 + chr2R 13018366 3' - hobo 31 1 58.42 ATGCTANCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:1 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 55.45 ATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAACTCACCTGCAGATGTACCTGAAAAATAAAAACAAAAATCAAAGCAAT:1 + chr2R 9278230 3' + TAHRE 10400 1 55.00 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTTTTG:1 + chr3L 25401129 3' - transib2 44 1 70.30 AAGAGGGGATGAGTTATTGCCCTACAAGTGATTATCCCACATCTTGTGTTCTAACATTGCTTCTCATTACTCACTGACTGCCTGACCAAGCCAACTTCCTG:1 + chr3L 25255064 3' + HMS-Beagle 6786 2 47.52 TTNAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAATT:1 + chr3R 9192596 3' + invader3 257 2 59.41 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGTGGGAATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTA:1 + chr3R 17666031 3' - Transpac 4964 2 66.34 CGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTGAAAATAGAATTTGCTTGCTTATGTTCTATTTATACAGATTCAAGTTTATACGCTCATTATGTGTTCAAAGCGT:1 + chr3R 25868467 3' - 1360 3290 1 58.42 ACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAAT:1 + chrX 20999743 3' - BS 45 1 58.11 CGAACACTTTGGTTAGATTTTGCCTAAACTAAGACGTTAGCAAATACAACATGGAAACAGCACATTCTAAATAAACGAAATGAAATAAAAAACAAATTTCG:1 + chrX 17080214 3' - transib3 379 1 62.38 TTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGG:1 + chr3L 22349285 3' - jockey 27 1 59.41 TCNAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTATTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGTTGGCAAGTGCACCACCCAACCAGCAGCCAG:1 - chr3R 30904217 3' + roo 9029 1 65.35 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACACGTTTTCCGAAACTATCTTCTTTCCTTTTTATTGTCCCTCCAGTTTTTTATTTTG:1 - chr3L 22775892 3' + flea 234 2 57.43 TTGCAGCCTGTTGGTCGGCTCATCTCATCGAACTAGCACGCATATCAAGGATCGGCCAACTAGTCTTCGCTCACCTGGCACCCTTCTTTGTGTGTCATGTT:1 - chr3L 13897111 3' + Chouto 6015 1 64.36 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTTAAGAGCTCTACAAAAGTCTTAGTTCGG:1 + chr3R 20878204 3' - Doc 21 1 70.30 TCATATGGCGACCGTGACAGGACGATTGCAGGGCGAATGCAGGACGTATAAACGGGATAGGGAATGGATGGCTTTGCTAAATTACTAGC:1 - chr2R 5892860 3' + gypsy11 448 3 56.18 TTATAAAAAAAAAAACAATAAAGCTGCTATTTAGATATATG:1 + chr3L 3662499 3' + gypsy11 3929 2 92.68 AGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTCGCCAACAACGCCTTCGCTCCTACTCCGGGGGTGAGTCACTTCCCC:1 - chr3R 16661903 3' + G6 473 1 76.24 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATA:2 + chr3R 17666025 3' - Transpac 4970 2 76.24 TTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTCAGTCACTGTGGAATCGGTAGTTT:1 + chr3L 3189172 3' + roo 8689 2 76.24 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGATCCACTAATATAAATTCCTATGAATATGCACGTTTTCT:1 - chr2R 9788937 3' + blood 7354 2 58.42 TTGGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTATTTATACAAAAAATGTAATAGATTAAGTTGGCATAAGTTCAGGAACCCAAATATTTAGC:1 - chrX 8302756 3' + 297 384 2 68.32 ACCCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCTCCTCGGTGCTCCAGCAGCAGCAACAGCAGTCAACTCCCA:1 - chr3R 16932776 3' - R1A1-element 236 1 56.70 TAAGTCNCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAGGTTGGCCGGAAAACAGATG:1 + chr3L 5662709 3' - jockey 354 1 60.40 GTTTCCCAACTATCACATACCCATCTTTCAATCATAAAAGCACAAGTGCTGAGTAGTTTACCTTACTGGGTCGAAGACGTAGTAAAATTGGCTGCAGAGGA:1 + chr2R 15677208 3' - INE-1 556 1 90.10 AAGTAAAGTTTGAAATTTATTTAACAAATTTACCGACGCTGTGGAGAATCGTTGGGAATCTTTGTTATATATTTACTATGCTTACGAATGTATTTAATGTA:1 - chrX 17220874 3' - 1360 372 1 82.18 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGTCGTGGAAAGGGTGGCAAAGGATTGGGAAAGGGGGGCGCCAAGCGTCATCGTAAGGTG:1 + chr3R 14626094 3' - P-element 15 1 62.00 AACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAAAAAAACGAGGGAAGTATAAGGACAAGAAATGGTGAATTTAT:1 + chrX 9942834 3' + I-element 5139 1 63.37 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGAAAATCTACTAAAATGATGATTTGCATACTCGTACATATTTCAGAAAAGTTGCGACATTTTCGCAGGGGTTA:1 + chr3L 19414009 3' + Burdock 6361 2 55.00 TANAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTCCAGCCCAAAACTCTGGTGGCCTCCAAAAGCAC:1 + chr3R 26434771 3' - Tabor 6851 2 66.33 GCACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTC:1 + chr3R 2533949 3' + gypsy8 158 4 49.50 AGNTATGTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTC:1 - chr2L 9410814 3' + roo 9022 2 68.32 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTAGTAAGTACAAGT:1 - chr3L 4091572 3' + flea 4981 2 63.37 CGCATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACC:1 - chr3R 4504073 3' + INE-1 533 1 54.46 GTAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGGATCCGCTTTGCACCCTCCCTCGGCGTTTTTCACTGCTCTTTTTCCGACTTCCT:1 - chr3L 7968662 3' - hobo 20 1 53.00 TTTTCAAACACCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTGGAACTGGGCGCACTCAATGGTGCGACAGAAGCCAACATTCGGTTAGTGTAT:1 - chr3L 24149843 3' + hopper2 1249 2 63.37 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATAAATATTTGATCGAATATCAGGTCTATGTAACATTT:1 + chr3R 15744593 3' + pogo 2066 1 64.00 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAAGTGCGAGTGTAAGAGTGCGAT:1 - chr3L 13878019 3' - flea 4758 1 74.26 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGTTTTAAATATATTTATATGTAATCCAGA:1 + chr2R 18434515 3' + 412 447 2 70.30 TAAAAACTAGAAGGTTGAGATTCAACATGCAGCTTCTAGCGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGCTGACCCATGCTGCCAAGCCCACTCTAACGCCCACA:1 + chr3L 22511715 3' + INE-1 164 1 91.92 AANATAGGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTCAACAGGTGTCAAATTGTACAGAACACAAT:1 + chr3L 18816172 3' - roo 40 2 64.58 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGA:1 + chr3R 8191535 3' + mdg1 385 2 63.00 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAGACACAATATAACCAAGTCCTGTTTTTCTAGTTTCAAAACGATTGGAAGTGCTGGTTTCATAACTA:1 + chrX 2172318 3' - I-element 11 1 68.32 AGGGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGCCAGGGTTTAAAGTTGATGTCGCATCGGCTTAATTGGCACGCCTGCTCAGAAGGATTGTGCATATATAGT:1 - chr2L 4672866 3' - Stalker 148 4 75.25 AANGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAACATGCAGGGAGC:1 - chr2R 13318852 3' - Juan 4029 1 76.24 ATNTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTTCGAACTGAGTGTAGAGAATATTAAATAATTTTATGAATAATTTTGACCAA:1 + chr3R 17244004 3' - hopper 1078 1 62.38 AAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACACACTGTTGACATCATTTCCGTTTGCATGACAGCATCTACA:1 + chrX 17429597 3' + HeT-A 5940 1 66.34 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATT:2 + chr2R 8547820 3' - I-element 26 1 49.50 TAAATAAAATTATTTGTTTTTTTTTTACAAAATGTGTGATTGTTAATAGATTCACGACGGGAAGAGGCCTACCTTCTCAAAGATGCGTCGTTTTA:1 + chrX 8488605 3' - TAHRE 64 1 77.89 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCTGGGTTGGTTTTCAAGGTCAATTGAATGGCCAGATTCGCCTCGTTTGTGATTT:1 - chr3L 7154222 3' - FB 24 1 57.43 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTAATACAATGGAAGAAATATTTAAACAACATTTTCGATGTAGCCTTGTAATCAAATCAGGGGAA:1 - chr2L 14365374 3' - blood 13 2 64.36 ATTGGCGCCCCACTAAGGAAACACACAACAACACACACAAACACACAGATTATGTAAGTGGCGTCATTGTGCCCGGCGGTAGTGGTGGCACCCCTAGTAAT:1 + chrX 1647411 3' + gypsy3 396 1 59.41 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTATACAACCGTCGTAAAAGTTTCCATTCGATTTGATGGAAAGTGAAAATGCGCCCAGA:1 + chr2L 8841145 3' + P-element 2873 1 66.34 ACAAAAAAAAAGAAAAAAAGTAGGCAGCTTAACCCGCCGATGGGTGGAG:1 - chr2R 21235730 3' + gypsy7 5005 1 71.43 CTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATAGACGCCGTGGCCCGAGTGTGCGAAATGTGTGAAATATTGGAGACAAACGGGCAGTTTTTATGTTAGCTGCGAAAAA:1 - chr3L 16217637 3' - 1360 3249 1 78.22 TATTTGTTTTTTTTTTTCTTTTCTC:1 - chr3R 22175172 3' - gypsy7 5012 6 96.00 GCNCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCC:1 + chrX 19959889 3' - roo 8690 2 58.42 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCTAACTGGTGAGTGTGACGTTTTGGCCATCAAATAGTT:1 - chr3L 7061819 3' - I-element 24 1 46.53 CGNCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGACACAGGCGTGATGTCGCTTACGAATCAAAT:1 + chr3L 1491027 3' - 1360 44 1 76.24 TTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTATTATTTGTTTAGGCAAGCAATTAAAAGTGGATGGCCACAATATGAGTTGCTGAAGTGCCCGA:1 + chr3R 15033513 3' - Tc1 1363 1 67.37 CANGTCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTAATAAATATTGACGTTTACTAGGATCAATAAGATCACTTGGGCGATAGCCCCTTTTTTTCTCTACT:1 - chr4 239973 3' + 17.6 211 2 74.26 AAAAAAAAAAACAAAAAATGGGGGAAAAAAATAGCAGAAGAGCAGCAACAACGCAGCCCCAAAAAACACCCCCCCCCC:1 + chr3L 5287036 3' - hopper 140 1 51.28 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAACAATGTGACAAACGATGTGTGAAGGAGTCGCTGCTGCTGCTCA:1 - chr2L 18223743 3' + roo 405 1 78.22 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATCGGCTGGCCAATCGATCCACT:1 - chrX 12781030 3' - FB 53 1 79.38 GTTTTAAGAGTGGGAAAACGAAAAAAACAAAATTTAAAGGGTGGGTGGTGGGCAGTGGAAAGGTCGTGTCAAGGGGCGGCTTTTACTATACCAGGAAAACA:1 - chr4 401948 3' - FB 897 3 58.42 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATT:1 - chr3L 13878056 3' - flea 38 2 65.35 CGTCGGTCGTCGCCACGCAGACATTGATTATTATTCAATAAACACAGCTACATTTTTAGGGAAATAGATATAACTAAGTTCGTTGAAGCAAAAGATCCAAC:1 + chr3R 6037276 3' + gypsy7 135 2 70.30 AAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGAGACCTAATTTTTTGGCTGTGCAATTCCATTCCACCTCGG:1 + chrX 3779171 3' + I-element 294 1 60.40 GCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGATTAATTTGTATATGTATAAGGTTTATGAAATTTGCTCTGAAATTTGCTTTGTTTAGCATTTTGAAACTTTTCG:1 - chrX 9007167 3' + gypsy6 374 2 46.53 GTGGACCCTCCTGGCTCTCTCGGCTCTTCTGAGCTCGGTTGTTCTCGCTGCCTCACTGCCCTTCCATTGGCACTCCTGCCCTGACCTGGTCTGCATCCTCG:1 + chrX 1424625 3' - Rt1c 5280 1 60.40 GGCCAATTGGCAAGGAATGCTCTTTATAGGCAGCAATAAGCGACTGCGGCAGAACCATTCCCTGCTGCTGCTGTCGCTAGCGCCGCTGCTGTTGCTGCTGC:2 + chr3R 14390413 3' - TART-B 236 2 31.68 CCTTTATATTTTTGCATCGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATACATGCATTGCTTGTGTGCTCCG:1 - chr3R 2474634 3' + S2 1664 1 76.00 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATGATAGCACATCCTGTGTGATATCTTGCGCAAAAGGACCGATGAAAGTTCTCAGATTCAGACGGTCGAGAGA:2 - chr3R 6002912 3' - opus 1 2 78.22 CACACTAGCCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTTGACTATAGCATTTTCTATCTAGTTAATTGACCAGATCACTGTAATTTCACTTTTTATGCT:1 - chr3R 3579152 3' + INE-1 539 1 55.45 GTGGCTGGGTTTTGATTACCGCTTGTGGATGCGAGCAGCCAAGTGGACAGGCGCAGGAGCAGGAGGAGCTACTGCCCCTCCTCCAATTTCGCTGCGAAGGA:1 + chr3R 13092065 3' - Tom1 119 1 70.30 ACNGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTTGCGCGTATGAAAAAAAAAAACAGCAATGAAAAAAA:1 - chr3R 1680699 3' - accord 41 2 69.39 AAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAACGTCATCTTAACTATGCAAATAGTACCCGAGA:1 + chrX 22782087 3' - I-element 4874 1 60.40 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGAACA:1 - chr3L 22920394 3' - 1360 46 1 71.29 GAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCAAAAGTAGCTGTTGGCTGTTAGAAGCACGAAGGAAGCTGGCCAGAGATACTAT:1 - chr3R 20372779 3' + I-element 118 1 58.42 TTATCGTAAGATACCTGCCGTGAATATCAAAGTAATGAGAGCTACAGACCTAAGATCCTTGAAAATCGTGACTTACCCAAAGAACTTCCGCCATTTCCTGC:1 - chr2R 10358701 3' + Chouto 165 1 77.23 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATAAATATTTGATCGAATATCAGGTC:1 + chr3R 15744581 3' + pogo 2053 1 76.24 GTTTTTTTTTTTAAATAAAAGGCCTAAAAAATTCGCGCGTGTAGTTGCTTGGCGGCGCCTTCGATGAACAAGATGATGAATTGAGTGATTTTAGTAATTC:1 - chrX 20263996 3' - transib2 2631 1 72.00 TAGAATAACAAGATGCGTAACGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTCTACCTCTTATAGTACATACATGCCTATGAATCTAGTATAACAT:1 + chr2R 5143500 3' - 1360 3379 2 76.24 CGNTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACTGTACATCTCTCTATTGCTCACCTTTCTCGGCCGGCGATGGTGGCGGC:1 - chr3L 11217257 3' - 1360 10 2 65.12 TGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCTTGATCTTGCCCTGACGGATATTGCTGGCCAGATTGGTCTCGGCCAGAGATTCGGCA:1 - chrX 8479757 3' + jockey 4723 1 67.33 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATAT:1 + chr3R 14049405 3' + transib2 2782 1 66.34 CCTAAAGCTCTCTTTGGTTTTTACATGGACCTTAGCTTGGCTTGAGTCCTTTGCCTCATAGTTATCTGCCAATATTTGAACTCTGTTCGTATACTCTTTGC:1 + chr4 368150 3' - Fw3 112 1 58.42 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATGTGCAAC:1 + chr3R 17666043 3' - Transpac 4951 2 58.00 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGG:1 + chr3L 22349286 3' - jockey 25 1 61.00 TATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGTGTGTGTGTCCGTTTCAGGGGTGTTTCAGGGGGCTGAGGGTTCCGTTTCAGGGCC:1 - chr3L 17104832 3' + flea 303 1 61.00 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTT:1 + chrX 10644858 3' - hobo 51 1 76.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATT:1 + chr3R 27452373 3' + roo 9020 2 78.22 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCTCAA:1 + chrX 4022346 3' + roo 9029 1 69.31 CGNGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGC:1 - chr3L 21144047 3' - jockey 4710 1 52.48 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATTCCCAAGATATATTCCACGGAAAACCTGCTGATGGTGAAAAATTATATTTTCAC:1 - chr3L 13345433 3' - Transpac 4937 2 60.40 TTCTTTGTTTTTTAATTTTTATCTGCCCATTGCCCGTCTTCAAAACACAACAAGATAGCAATAAATAGCAATAAAAATCAAAAACAAATTAGGACTCGTAA:1 + chr2R 1597415 3' - Doc 4695 2 69.31 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTTTTGTTCGGTTCTACATATTTATAGGTATAGAGCTATATAGATGCGTTGAGGTTCA:1 - chr3R 11175838 3' + roo 9054 2 59.41 ACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAA:1 + chrX 19053022 3' + roo 9017 2 81.19 CATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGAATAAAATTAAAAATTGTTAAAAATATTATTGGCCATCTAGCTTTAACAGTTTTCTAAA:1 + chrX 21030155 3' - INE-1 502 1 72.28 CATAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTTTTAGAGTATTCAGCTAGCGACGTGTGCACATTAAAATGGGCGTTGAGGGGCGCATCTC:1 + chr3R 8071028 3' + 1360 370 1 66.34 ATCATAGATAAGCTCAACCGAAACGACGCTTATACGCCCCTCGTCTACGCCTTGGGCAAGGTGTCGACACGCGCAGGCATTGAACTGGAAATGCTGGGGAA:1 - chr3R 23568037 3' + jockey2 141 1 60.40 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAG:1 + chr3R 19446250 3' + 297 6970 2 74.26 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCCTTCCTTTCCTATGGCAACATCAGATCGCTTAAAGCGTGTGTGCCCTTTGAAGTATGCTACACT:1 + chr3L 16662468 3' - jockey 22 1 60.40 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAACTCATTAAAAAGCCGAGCGGCATTTAAGGATGCGCCTGCGCAGCAATCTCT:1 - chr2R 9658328 3' - P-element 22 1 57.43 TTTATTTATCACGTTCACATGTAATCCAAAATGGCCAGAGATTACATCTTTACTACTGCCTGGCTAACTTAATATGCATGCAATTTCCGTTAAGTGCTGGG:1 - chr3L 4646579 3' + Helitron 171 1 63.37 ATTCTCGAGGATCATGTAACAATCATATTCTTATCTGGCCCATGGCAGTTTGCTATCGATTTAATAATTGGCTGATAAAAGTAAAAATACACCGCAATCGA:1 + chr3R 17824851 3' - Idefix 127 2 66.34 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACCTAATTGAATGCGAATATTTGTAGAGAATACCTGGAGAGTAACTTTAACTAT:1 + chr3R 4971237 3' - 1360 23 1 56.00 GTNTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTGGTACATAAAATTGTATATAATCAGAGCAGTTTTT:1 - chr2L 7932659 3' - accord 7019 2 64.36 GTGTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTTGCGGTGGTTCTGTAGGTGGTGGATCAATGGGTTGTGTGTTAG:1 - chrX 281869 3' + I-element 5015 1 57.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTCCACTTACACATTTGCGCCGCAAAATGTTGCC:1 + chr2L 17269873 3' + hopper 1411 2 79.00 TAACTATAAATATAAAAATATAATATAAATCCGGAAATATGAAAATCAACCGCTTAAGATAGATCCTTGCAAAAACTTCTGTACTTTACAGTCAACCCTCG:2 + chrX 8734588 3' + Stalker4 7044 4 78.22 CTCTAGAGCCACAGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTAT:1 - chr3L 22920403 3' - 1360 55 1 78.22 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCA:1 - chrX 7583214 3' - I-element 16 1 58.11 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCATCGAAAAGATATCAGTATCGGGA:1 - chr3R 6776523 3' - copia 4892 2 56.44 AANAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGT:1 - chr3R 178127 3' - BS 46 1 73.00 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAATTTGAA:1 - chr2R 17938875 3' + copia 225 1 57.43 AAATGTGTGGGCGTGACAGTTTTAAAAGGTTTGAGGGCATTAGAGTGGGAGAGGCATTCTTTTACAAGAAACTTGTACAAAATTTGTGTTGATTACATATT:1 + chrX 22663920 3' - INE-1 246 1 61.39 GTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTCCTCGATGGTGGCATCCACCTCGACCTCGCTGATCTG:1 - chr3L 16911548 3' - F-element 4402 1 45.54 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATACGTTCCCATTCGGAGTCGGATTCGTATACAACTTCAACTCCTTGGCGGCAG:1 + chr3L 447401 3' + Tabor 7318 2 72.00 GTNCCCCCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGCATATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCACGAGCGCATATCCCTGCAGGACCAGCTGCCA:1 - chr2L 7905368 3' - G5 4630 1 68.00 TAGCGGATTGCCCTACCCTACCTTTGACCACTTTCCTTAAGAGCCTGGCTCTAGTGGTCCCTTTAATCACCACTCCCCTTTGATCAACACTCCTCAGA:1 + chr3L 14210132 3' - Gypsy12A_LTR 1960 1 66.33 TTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATG:1 + chrX 4175122 3' - I-element 349 1 75.51 TTCTTATAATGTGTTTATTAAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGAATTCCACTCTGGGCATTAAGCTAATGAAATAAATTCCGAATAAAAAAATTCCAGCC:1 + chr3R 18830733 3' - Idefix 7116 2 58.42 CGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTT:1 + chr3R 6611257 3' - HMS-Beagle 6847 2 76.24 TATACATATGTATATACAAAATAAATGTACATATAACCATGTGCGCATGAACGGGTAAAAAAAAAACAAGGTCGAAATTAGTTGCCAACGTGGCCCTCAAG:1 - chrX 5043466 3' - invader3 5083 1 67.33 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCCAGTATGGAGCTTTAGAGATCATATG:2 + chr3L 9076664 3' - mdg1 7041 2 72.28 TCTGTTGGATTCCAAGCTTCCAACGGGGGAAGGGCAGTCGCATTTGAAAGCCGTTGACAGCTGCAGTTGGTTAATGGCCAGCCAGATGGTAGAC:1 + chr2R 13383095 3' + diver2 4499 1 67.02 AAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGCCCCATGAGGAAATTATCCGTCAGGCGTAATTCCATTAATTTGGATTTT:1 + chrX 18955360 3' + Doc2-element 4327 1 51.49 GTTGAACATTATTGTTTATGCTAGCACTTTTATTTTTATTGTTTGATATTGTTATGATGTTTCTTTCTAGAATTTTAGTGCAAATTGATTTTTCTCCATTA:1 + chrY 808594 3' - gypsy11 4084 2 46.53 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGCC:1 + chrX 19109306 3' + roo 359 2 71.29 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTAAGAAGTGCAATTACCGAAAGACTTGCCACATATTCTACAGGAAAATTCGGACGAATGTACTCGAA:1 - chr3R 5329312 3' + blood 7382 2 71.00 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACATATATTCGAGTATATGTAAGTATGGGTACGTATCTGCTCCTTGGGCGTGTGCTTGT:1 + chr2L 16954919 3' - Quasimodo 9 2 69.31 ACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTAACTATACCTATTTGCACTAACCATAAGACGGGGTGCCCAAGGTGATGATAACGGACAACG:1 + chrX 14703506 3' + gypsy 435 2 70.30 AAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCTGGTACCTGATTGGTGCGTATATAATCCCTATGATT:1 - chr2R 9019583 3' - hobo 2626 1 64.36 CTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAACTTACAGAGAACGCAATGTACGAAAACGTAACTAAC:1 + chr3L 4286205 3' + Doc 4300 1 64.36 ATNGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATATATAAAGTATATATACGAATTTTTCTTGGTCATTAGAATAGACTGTTATA:1 - chr3L 20324678 3' - 297 17 2 63.37 ACTTAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACTTTGCAGTAGTAGTTTCACCGGCATACCTTTTGAGTTGTCTGCCACTCTTGCGTAAATAGCCGCCGCAAAGGC:1 + chr3L 26345277 3' + R1A1-element 5200 1 77.00 ATATATGTACATACATATAGCTAGCATTTTTTACACCTGCATTC:1 - chrX 6444854 3' - 1731 4409 1 56.82 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACAAGACTAGTTAAACTATTTCAATACTATAT:1 + chrX 19030179 3' - Doc 10 1 72.28 TAGGTAAGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACGTGCCCGAAGGGTATCACGG:1 - chr3L 7295145 3' - G2 2938 1 63.00 AGNATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCC:1 + chrX 19810575 3' - INE-1 572 1 54.46 AGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATATATACT:1 + chr4 156603 3' - INE-1 150 1 81.19 AGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCATTACATAATGGTAGGCAACTGGAACTAGCGAT:1 - chr3L 3269649 3' + Stalker4 7280 4 73.27 AGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAATTTCTTTAGCTACCAGTACAACAACAACAATAAATTCGGTAGAACAGAAAATGACTAACAGCAGTAGTTGCAAT:1 - chr3L 5249399 3' + Doc3-element 450 1 56.44 CTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGCTGCTGAGGTTGCTGCAACTACTGCTGCTGCTCATATTTATTTGCGCTTTTTATT:1 - chr3R 13521845 3' - F-element 4326 1 60.00 GAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAATTTGAAAGGCACACACACCCACATACACTTGGC:1 - chr2R 17938848 3' + copia 252 1 76.24 AGNACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCA:1 + chr3L 6013720 3' - Max-element 39 2 61.39 GATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATTTCTTCAAATTTTAATTGGTAAAGGAGTA:1 - chr2L 19644842 3' + blood 7383 2 70.30 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATGTAAGAGCAAACAATTTTCTTTTAACATGCCAAAATAAATGATTTTAAAAGAATACCATTGTTTTAA:1 - chr2L 21863319 3' - Burdock 6140 2 73.27 CGTTAAGCGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGA:1 - chr3R 14626012 3' + P-element 2856 1 48.00 TAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCTGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGCCAGAACTCCAATGCTCCACCATATGGCCAGAAAGCCAGAAATGGCACGA:1 + chr3R 13573152 3' + R1A1-element 456 1 60.00 TCGATGGAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACGGATTACGGTTTACTGTGTTTTTGTTTTCGTGCTGTTATC:1 - 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chr2R 14260563 3' - Rt1b 189 1 61.39 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGTGTGAGTGTGGGAGGGGGCGGCCTACGGCTTGCCACTCGCCTTTCTTCGTCCCTTTCATGTGTGCTTGAAATT:1 + chrX 19817289 3' - Quasimodo 37 2 70.00 AAAAAAAAAAGTAAAATAATAAAAAATTGATTTTGTGGTTGGTTTATTCCGTTTCTCAGCCAGTGAAAAGTGCGAACGAGAATTGATTTTAAATGACCGTT:1 - chr2L 17182370 3' + Doc2-element 252 2 84.16 TTATAATAATAAAAAAATATTTGAAAACCAATTATGCAATGCAATTAGAGCATATTTATTTAGCTTAAGTTCCTTTCCCCGGACTTTAAATTGTTTATTT:1 - chr2L 14918778 3' + mariner2 829 1 69.00 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTT:1 + chr3L 23678153 3' - Osvaldo 20 1 72.28 TGNGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 5401 2 62.00 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATACTCTATAAGAA:1 - chrX 4022293 3' - roo 8701 2 64.36 TTTTTTCTTTCTTTTTTTATTCAAAACCCCCGACTTTTTGCCGCACACTCGTCCATTGAGTTCTGTAATTTCACCAGTGACCAGTGGGCGTGGCAGGCAGG:1 - chr3R 17991145 3' - Osvaldo 1522 1 73.27 CANATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTCCTGAGGGCATGCGGCTGTACCGTGAAAATTG:1 - chr2R 17077818 3' + Tirant 8484 2 55.45 GAATCTTCTTGTATAATAACTAACCATAAGTTTAAAAATCTTAACTATACCGCGCAGCAACAAACGGCCAACTCATTGTTGTTG:1 - chr3L 10111903 3' - F-element 4646 1 53.57 GAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAACATTTTCCATTTTTCGGAACTTTGTTTTAATCGTTACTGTGTTATCTTCAAAGTCATCTTCGGTCCT:1 - chr3R 2471359 3' + Cr1a 4438 1 90.10 ACNGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCGTGGATTGTCAA:1 - chr2L 10712107 3' - I-element 23 1 58.42 TANAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCCCCTTTCATTATCCATC:1 - chr3R 2474281 3' + Juan 4200 1 58.42 ATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAAAAAAAAGATACTTTTCGATTAATGTAGAGTGGTAACTATCGATAAGTATGGCGCGTTTT:1 + chr2L 16507884 3' + BS 5072 1 53.47 TAAAAAAAAGAAAAAAAAAAATTGTTCACATATATGTGGTTGGCCAGTCGAGATGTTAACAGGATACGATAAACATAAAATTATCGAAAGACAGAGAAAG:1 + chr3R 16835261 3' - hopper 150 20 75.00 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACC:1 + chrX 10644862 3' - hobo 51 1 73.27 TGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCTTCTTCACTATTCTTGTCGTCTGCCGGAGCTGCATATCTGGCGTCGAATTGTGGATTTTCACAAGAACCGG:1 - chr3L 20179954 3' - invader1 4011 2 56.44 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATCCGTGGCGGGTAGTGGGTACCAAATGCGCTAGCCACGCCCATTAGT:1 + chr2L 4260196 3' - Transpac 52 2 55.45 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACTGAGAGAAATGATTTGAGCTAGTATATGGAATT:1 - chr3R 28117769 3' - I-element 43 1 69.31 CCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCACCCACTACCACGCACACACACACACACACACACACACACACACTCAACCAA:1 - chr2R 13018361 3' + accord 7339 2 43.48 TCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTTAATTCGCTTATGTGTGACCATACCTTCGACATCGCTATCTTCTTCTTGCCAGGCAAGAA:1 - chr2R 1069326 3' - 1360 226 1 59.41 TTATTATATTATTATTATTGTTTTCGGAATATAGATGATCTGATTTCCCAGAGCGCTCCTCCTTTGTGCTCTGCACTTTCTTTTTTGCCTCTTTAAGGTTC:1 + chrX 16592180 3' - invader3 5045 1 54.46 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACA:1 + chrX 19030150 3' - Doc 32 1 65.96 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACATCTATTGAAATTGAATATATAAATTTACGTTGTGGAGAACTTGCCAAGACTCAAATATAAAATAGT:1 + chrX 20933836 3' - mdg1 7047 2 70.30 TTNAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGATGGAGGCAAGGTTACATTGTATTAATGTGTTGATCCG:1 + chr3L 27389119 3' + Idefix 256 2 62.38 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCAAAGCACTGGGACCACTGATGCCTACTTAGAAGGGCTCCCTTTTTC:1 - chr3R 9297036 3' + hobo 2907 1 62.38 TAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATATCTCAGTTGAAAATTTAAGGTCGCAGTTTTAGGCTAAATATTTCAATTTGTCGGTCAGCCTGC:1 - chrX 9951380 3' + I-element 5341 1 63.37 GATCGACTTAGCTATTGATCCTGATTCATAATGAATATTCTCTTTATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTCCAACGAATCTAGTATAC:1 + chr3R 17534858 3' - INE-1 96 1 76.24 CTTTATTTTACTTTACTTTACCATACTATAACTATACTATACTATACCATACTATGCTTCAACTCACTTATCCCCTTGGCTGCCTTTCTTC:1 - chr3R 23878825 3' - TART-A 13134 1 72.53 ACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCTCCGTTAGGTTGAAGTACTTGTGGTCTCCACTGGCATCGGCGCCTTTGAGGGCGGCCGTAGAACGTGGATAGGCCT:1 + chr3R 16492898 3' - micropia 5368 2 78.22 ATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAAAAAAACACTTCTCTTCTTCGACTTCTTTTGCTATTGTTTTCACCCTTCTACTTTAGTTTTT:1 - chr3L 7815748 3' - pogo 301 1 65.35 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGATTTAATTGTGATCATTTAGGAAGAGGAACCCAGAAA:1 - chrX 20933750 3' + mdg1 7421 2 62.38 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTTATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGATCATGTCTCA:1 - chr3L 10557588 3' + 412 7501 2 68.32 TGTTGTTTTTGTTGTTGATTTTTTAGTGGTGATTAATGCAATGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGAGCATTTTTATGCACTTGCTGCTGGAATTTT:1 + chrX 11289889 3' - I-element 127 1 46.53 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTATGTCGTCAGTGACATTTTACTTGTTATTAGTTATAA:1 + chr4 119453 3' - 1360 35 1 64.36 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACTAATTTACTTGATAAATTCGCTTAATAGTTTGGAGAGGTTATGAAATGAATCACAACTAAAATTCATAG:1 - chr2L 10956574 3' - blood 12 2 65.35 TANGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACT:1 + chr3R 9322871 3' + 412 447 2 67.33 GGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCTAATGAACTAATCATA:1 - chrX 21493347 3' - BS 4725 1 57.00 ACGGTGNGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTATCACAGCGGCAGTGGGTCTTATCGATGCTGTCTCGCTCGCACTCGCACACTTCCTGCCGTTTAC:1 - chr3R 23886748 3' + S-element 1707 1 70.30 ACGCAGGAATGTCAGGAGATGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGACAATGCACACATGCTGTGCAAAGG:1 + chrX 4457307 3' + Bica 4916 1 75.25 GCNAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCAAAAATAAAAATGCCTGAGCCAACGAAAATCGC:1 + chr3R 31043893 3' + Doc 466 1 67.33 TGNTTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTCCAGCCCAAAACTCTGGTGGCCTCCAAA:1 + chr3R 26434766 3' - Tabor 20 2 59.41 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATATGGGGTCGAGTTGGATCTTTGCCTGTATGTCAGCT:1 + chr3R 28443765 3' + Burdock 6354 2 64.36 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGG:1 + chr2R 18356229 3' + P-element 2829 1 20.41 CAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCAC:1 - chr3R 24461830 3' + F-element 304 1 44.55 TTTTTTTTGTTTTCTATTTTGCTCCTTTTCCGAGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAG:1 - chr2R 3899231 3' + S2 236 1 41.58 TTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGCCAAAGATCCAACAACAATGGA:2 - chr2R 20411889 3' + Quasimodo 7321 2 77.23 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCATTGATTTTTCATTTTTTCTTTATTTTCAGCTTAA:1 + chrX 6082662 3' + roo 401 1 69.31 AATTTCGGAATCGCTTTAATTTAGCCACCAGTCACCATCTACCATTTACCATCCCCTCGCCCAATCCCAGAAATTGCTTTCGAATTGGATTAGCTGCATAA:1 - chr2R 16724724 3' + mariner2 216 1 74.26 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTGTATATATATGTGCCGGCACACAGGTTGCCAAAGTGGACAATTTAATGTG:1 - chr3L 1830841 3' - 297 18 2 62.38 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAAGC:1 - chr2L 11764874 3' + roo 9052 2 52.48 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGAAAGGGACTCGAGATTAGAGATG:1 + chr2R 8951072 3' + P-element 2857 1 48.48 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGATATAAATTATTAGGATGTTGTTGTTAAAGCTTGACATGAAAAGAAATCCGTAT:1 - chr3R 20052058 3' + copia 233 1 56.44 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAGCATTTAATTAACATGCTGGGCGATTGGCCTGATTGGAGTGCTGATTGT:1 - chr3R 31026028 3' + mdg1 7431 2 55.45 TTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTCATTCG:1 + chr2R 4339515 3' + G5A 2792 1 78.00 TTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAATGGGGCTTCCCCATTTATAGGGGTTACCCCTTGTAAGCCTAAAAATACGTATCGACTTTG:1 + chr3R 17880557 3' - I-element 5182 1 64.36 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTAATAAATTTTAATGTTAAAGTAAGTGT:1 - chr3L 11920057 3' - Tabor 48 2 75.25 CATAGTATAAGACCACATATACTTACAAACACACTAGCACACGAAGACAGTCCAGTCACTTAGCAAATCCTTTTTTAACTTTATGGCTCTGCGTT:1 - chr3L 6803139 3' + Quasimodo 15 2 72.63 AANAGAAAAAAAAAAAGTAAAACCGAACAGCGAGTGGCACAGTGGAGAGATGAGCTCGAAAGGTAACTGGATTTTGGCGATGGCATTTCCTGATCC:1 - chrX 17218129 3' + Doc2-element 246 1 32.29 TTNGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAACTTTTACGACGCGACCTGCAAGGCTAGCAGAAAAACCCGTCGCGTCTGCTGCATTTGGAGTTG:1 - chr3R 24762441 3' + 1360 413 1 68.32 AACAAANGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGA:1 - chr3R 6611208 3' + HMS-Beagle 212 4 57.43 TTNCTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTGGTGGTGGCTGCGCGTGACGTGAGAGAGCCCCAAAATCTAGCGCTCTCTTTTG:1 + chr3R 29087510 3' + Cr1a 217 1 59.41 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGAACAACCAGCTATCCGAGACTAGGCAGAAGTTG:1 + chr3R 446078 3' + pogo 2067 1 65.62 TTCTGGCTGGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCTAAACAGAGGCACTTTTGCACTAATGATCAATTTATCGTCGATGAATAAACCCCTGGCTGTTAA:1 - chr3R 19449052 3' - TAHRE 10027 1 72.28 AGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTCACCAGTGCCTAGCTCTAAGGCGCTTGAACATAAGATTGGAGGGCACTACGCGACCCAATAACA:1 - chr3L 23446579 3' + HMS-Beagle2 116 2 65.35 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTCCTGAGGG:1 - chr2R 17077842 3' + Tirant 362 2 69.57 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTC:1 + chr2L 13250428 3' + pogo 2059 1 70.30 AACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCA:1 - chr3R 6611204 3' + HMS-Beagle 7012 2 56.44 TTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGACCCCATATACC:1 - chr2R 10602206 3' - I-element 4917 1 70.00 ACNCACATTGCGGGTACTTACAAACACACCGCATAAATCTGCAAATGCAGATCAATACGGTACTCTGCGTCTCGAGCGCCGATAACACTCGGCACTCATAA:1 + chr3R 1465943 3' + hobo 76 1 48.51 ACACACACACACACACAAATACGCAGGAAGATTTCTGGAACTCACGAACACGAACGACCTTTTGGAGGTCAAACTTGTATCTTGTATCCCCAGAGTGCCTT:1 - chr2L 1143518 3' + accord 185 2 74.26 GTNATTATGTTCGTATATACTACATTATTTAGGAAATGTATGAGTATGTGAAAGATCCAGACCCCAGACAAGATATGGCGCACACACACACACACACAC:1 - chrX 12173677 3' - mdg1 7041 2 70.71 CATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCTCTAACAATAACGCAGTTATTAGCTTTTTTTATTGTATATGAAAAGCATATATCTTTTTATCTGTCGACA:1 - chrX 20858693 3' + Copia1_DM 166 1 61.39 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCCC:2 + chrX 19820111 3' + mdg1 7417 2 66.34 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAGACACAATATAACCAAGTCCTGTTTTTCTAGTTTCAAAACGAT:1 + chrX 2172295 3' - I-element 34 1 58.42 CTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGA:1 + chr3L 5662670 3' - jockey 393 1 78.22 CCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAACAAATGGAAAAATATACGAAACCAAAAATGACTTCATGATCCTGTGTCTTTCGAAAAGCTGT:1 + chr2R 3097585 3' + Fw2 3695 1 60.47 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTT:1 + chr3R 10030780 3' - BS 5031 1 51.49 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACAATATATATAGATAAATGTAACGATATGGACGTGTAAACACAATCTATATGGTG:1 + chr3L 7781266 3' + 297 6948 2 59.41 AGCATTCATGGACAAGAGAAGGCCATATCAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGAAGCTGACGACTCGAGTCGCCCGTTTAAAAAGCCCAGGGA:1 + chrX 4583990 3' + Chimpo 4058 1 69.31 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGGGGGCGGGATGAGATCCTTTTTGGAGTTAAGCTTAAAA:1 - chr3L 9064306 3' + jockey 4951 1 60.40 AATGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGATTATATCGTTTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAAAGGGAAACGGAAA:1 - chr3R 17733241 3' + INE-1 553 1 74.26 TGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTCTCGCCTGGGGCCTCCATTTTCCTGAATTTTGATGTGTTTTCCGGGTGTTGTGAGTTGATGTTTCCTAACGCATA:2 - chr3L 19986107 3' - G4 3475 1 77.23 GAGGCATCACAACTATTCACTACACGTTTTCGGTAAAAACGAAAACTTTTCTATTTCCGAAAGGAAAAGTTTTCCGTTTTTTCAGTGAAAGGTCGTCGTTG:2 - chr2R 16908699 3' + diver 227 1 79.21 ATNGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTATGATGGGTGCCCATAAAAAGAGGCGCCAGACTGTATAAGG:1 - chr3R 28698782 3' - 1360 34 1 60.40 TTNGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATTAGATAGACTAAGCTTACTTTTTGGTTGTATGTGAGTTTGTTTT:1 + chr3L 19896802 3' - 1360 3322 1 55.45 CAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATCCCATAGCCACTTGGCTTTTCCACTTT:1 + chr2L 12774076 3' - invader4 263 2 73.27 ATTCTGACATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTGATGAAGGGGTAGAGCATGAAGAGCGAAGCGCGCAAACAATTTTCGAATAGAAA:1 - chr2R 5422179 3' + baggins 5341 1 57.43 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGGAGCGCAATCTAGATCGTCAGCATCGCC:1 + chr2R 5262667 3' - 1360 15 1 64.36 TGNCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATCCGATATAGCTCTTTGTCGGCCGCTGTCTTAGTTTGCTTGGCTGAGTTTCCCGGGTGGAGTTTTTCGCTGCGAAA:1 + chr2L 7931615 3' + diver2 230 2 59.41 TTATCATTAAAATTATTATTATTACAATGACAGAGCCATTATAAGCATATCTTAATAGCTAAGATGAAGATCGAAAAATATTGGCATGAAACATCCTT:1 + chr3R 29310161 3' - mdg1 7079 2 47.96 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATCCGA:1 + chr3R 14688323 3' - pogo 16 1 49.45 GATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTTGTGCCATTGACCACCACATGATGGCACATAAAT:1 + chr2R 9199970 3' - G6 1659 1 54.46 TCCGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCATTAAACATTGCTCCACGTGAAAACGAAACCCGACTCGAGTAGAATCCCCGTATCTGCCTTTCTTCCCCCAATTA:1 - chr3R 10039958 3' + aurora-element 4099 1 67.33 AAAAAAAAAACAAAAAATGTGGCACAGAGCAGAGCAGAGAAGTTCGGGTCGTTCGCATGTATTAGGCAGGGCACTGTAACCCACAGCATTCACATGTACC:1 - chr3R 1850931 3' - hopper 139 1 58.00 TGCTATAGTCGAGTTCGCCGACTATCAAATACCCTACATCAGTGTAGAGCAGCATGCGCAATTATCAGCATATGAAAAGGAGTGGGCGCAGGTGAGCTCAT:1 - chr4 528260 3' - INE-1 568 1 66.34 TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGAAAAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTT:1 - chr2R 18618487 3' + jockey 4944 1 78.22 AGATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGG:1 + chr3R 433124 3' + 1731 271 2 65.35 ATGTTGCGGGCGCTGGATGCGCGCCACTTGCAGCATGTATATGCAGCCAGCATTGCACGCGTCGTTGGATGGTAACTATCGCCTCCCCTCAAGCTGTAATT:1 + chr3R 11350766 3' - HeT-A 5651 1 56.44 ACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTTAAAATACATAAAAACAGGGAGCCATTTAATTCCACGATCTTCGTGACATTTGAACTGCAGACTTTAT:1 - chr2R 21818948 3' + flea 5011 2 75.25 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTCTAATTAGTTAATTGCTGTTT:1 - chr3R 26140729 3' - 412 17 2 62.38 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGACCCACTTTTATGCATTGGACGGG:1 + chr3L 12230768 3' - jockey 63 1 78.22 TACAGCTGCGGTTAAAATATTAGCACTACTGCAGGTGGATAGTTGATTTCCTAAAAAACATTTAAAACATGAGGAAAATGAATATGTTTGTAGTGAACAAG:1 + chr2R 1089869 3' + Tc1 1 1 57.43 CCNGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGG:1 + chrX 678832 3' - Tirant 8150 2 65.35 CAGCTACATGTGGACACCACTTGCTAAATGTACATATAAATAAACAATTTATTAACTGGAATATCAGAATGCGTTGAGTACTGCATAGAAGTGATCTAAC:1 + chrX 8672591 3' + hopper2 1257 1 73.00 GGNGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAGTG:1 + chrX 4806746 3' - roo 8693 2 60.40 AANAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTAAAGAACATATTTGAAGATTCACGAG:1 - chrX 13790107 3' - FB 50 1 77.00 AGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTG:1 - chr3L 16973371 3' - S-element 1544 1 50.50 TCCAGCCTTTGAACCTCGCCAGTCCCCAGGATGTTGACGTTTCATTTATCGTAATCAAGTGCGCAATCAATGCGAAGAGTATTGCACTTAACTACCCCCGT:1 - chrX 12252486 3' + BS3 111 1 69.31 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATGTTTTAAATATATTTATATGTAATCCAGATATCAATTCTAATCAATCCATTATGTATCTGAGTTTGT:1 + chr2R 18434553 3' + 412 485 2 62.38 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGTGTTTAATTACGTTTTCACGCCCATTTTACCTCGACTTGAGGTACTGC:1 - chr3L 22751915 3' - roo 8691 2 57.43 GGTGGAGTTGCAGATAGTATAATGACCTGGGGCTTTTTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGGCCAATGGCCGCGTTAATTGAAATCGAAATTGAAGTATAAATA:1 - chr2R 12789086 3' - BS3 265 1 56.44 AAGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGACGAGGACGTGCGCAAGTTGATCCATCAAACTGCTCAAATCCGCTGCCTGT:1 - chr2L 21969746 3' - I-element 4995 1 61.39 CAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGTTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAA:1 - chr2L 23299998 3' - invader4 365 1 77.23 CANGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTTGCAAATATGCCAATTGGCTGGGTCAACACAAAAT:1 + chr2R 11364031 3' + transib2 2785 1 65.35 TGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTAACTAAAACTGCAAAATTCCATCACTCACACACACATAATCAAAA:1 - chr3R 10970573 3' + accord 6935 2 56.44 TATTGTTTTCACTTGTTTATTTTTATTTTTAACACATGTAAATATGTGTTACCGTCTTTTCGCTTCTGACTGCTTTATGTCTGCTGTTGGTCTGTTTGTTT:1 - chr2R 20473357 3' - Porto1 175 1 64.36 AAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTTTGTCTTTTATCTGTTTCTTTT:1 - chr2L 9728449 3' + P-element 231 1 20.79 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCATCGCCACTGCTTGTTGCATTCCGTTT:1 - chr3L 11789986 3' - P-element 51 1 26.73 ACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGTGATTGAATATGTTTCCTTGGTTTGCATTGGTTTAAAAATAAATATGCAGATATTGTATTGTT:1 - chr2R 24208834 3' - Juan 14 1 66.67 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCGAAACCAAAAATTATGCTAGACAGCTTTCCATATCGTATAAACTTTGGGCTTAATTGGCAAA:1 + chrX 6731878 3' - hobo 15 1 62.38 TTCTGTTCCGCATCCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATCAGATTGTTTTCTGACTAATATTTGGCTGGAAAGCGG:1 - chr3R 28133200 3' - TAHRE 10391 2 61.39 AAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTCGTCGGCCCCAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATAAACACGACTACGTAAACCTAAACCTTCGATCCGAGCCAA:2 - chrX 535263 3' + diver2 4776 2 65.35 GANGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCGGGATCTATTGGCTCATTATTGGATGGTTCTCATCTGGGTTGTTATTCTC:1 - chr3L 3120491 3' - I-element 5088 1 52.48 TANGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAATATATGTTTGAAAACCCTCGATTTGAAACGACTGATGAGTG:1 + chrX 1600234 3' + BS 5055 1 59.41 TGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCAAATTGAGTGGTTAATATTGGAAAGTAGGCACGATAAATTGTATCTAAA:1 + chr2R 15438157 3' - Ivk 231 1 58.42 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAGGATCGTGGTCCTCAT:1 - chr2L 19602841 3' - hobo 30 1 51.49 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCAAGGGTCTTTGGTGTTACCTTCTTAATAGTCCTGAAATGA:1 + chr3L 11217312 3' - 1360 51 1 74.26 TTCACTATACTATTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATT:1 + chr3R 23724156 3' - Doc 68 1 54.46 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGAGCTGCTAGCAATCAGCCAGAGTTGTCATTGAGTT:1 + chr3R 8191569 3' + mdg1 7456 2 75.25 TCAAAAGCCTAAATGTACAAAAAATACTAGCTACTTTAACATTAACATTAACTATGTCCAACACAAATAACATACACAAATTATTAAAGGAAAAATAGTA:1 - chr2L 12540142 3' + TAHRE 10245 1 62.00 ATATATACATATGTATATATATATCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCA:1 + chr2R 10594164 3' + G3 4507 1 49.50 TGAACACTCATAAGGCCCACTGTACCATGTAGTGGCATAGTTGAATGCAATGAGAAAATCGACGTCGTGAGCTACAAAATAGGTGTTTGTAAGGTTTCACC:1 + chr2L 10482090 3' + invader3 11 2 72.28 ATCCGTTCGCTTTGCGGGTGATTCTTTGTGATTTGCTCCATAAACCTGCTTTCTCGCGTGCTTGAGAATTTCCCACAACAATTACCATCGGACTTTTTGGC:1 + chr3L 3140360 3' + Cr1a 125 1 71.29 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAATGGGTTCTTCAAAATATTGTGTTCAATTCACAATGTACGGATATGAACTAGATTTGTTA:1 - chr3L 8656937 3' + pogo 2089 1 67.33 TACCTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCT:1 + chr2L 17269831 3' + hopper 1368 1 68.32 AAATATAAAGTAAAGTAAAGTAAAGAGTTTTAGGTGTCCAGAAGGTATCTTTTTGACAGAATTGTAATTGGAATAAATACTGTATGTATTTCAAATATTTA:1 + chr3R 13543960 3' + TART-A 13106 2 81.19 CACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCACAGTTCCCATACCAAATAATACCTGCATGCACGGTGAAAGCGTGAAAACGAA:1 + chr2R 19940965 3' + F-element 4329 1 55.45 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCGGCGCGTAATGCGA:1 + chr3L 6442693 3' + roo 398 1 68.00 GTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAATGGGCGTCCCCGGAATTTCGGGTTTGTCACATACCAAC:1 + chr2L 143711 3' - diver2 199 2 62.38 CCAGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAGCAGATTCCACCAGCCAAAAAAATAAACACCTGGAACGACGCCAGATGT:1 - chr2L 20965962 3' + McClintock 5977 2 60.40 AAAGGTTGTCTTCGTGCGTCCAGGGAGTTGCCTTAAACGGCTACCCCACTCGTCCTGCCATTCTGCGTCCTTTCTCTGTGTTTGCCTGGCC:1 - chr3R 21810321 3' - aurora-element 97 1 57.14 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGC:1 - chr3R 19589920 3' - BS 5018 1 53.47 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCCAGCTTGATGGCATTCTTAATCCGAAGATTGCCACAATGGCCTTCTTTTTAGTAAATGGTAAA:1 + chrX 6814363 3' + roo 9057 1 61.39 GCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCTTTGCGGCCCATTAGCCAAATAAT:1 + chr3R 9297081 3' - hobo 53 1 75.25 AAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGAAAAAAAAGGGAAACAGTGAAAGTTATTTACTATTTTTAATGGAAAGTTATTTGTAATTACCTACTCAAACTA:1 + chr3R 22497990 3' + 297 394 1 76.24 TTNTTATGTTCGTATATACTACACCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAAGCCCATTCTAATGATGTAGAGGCGCAACCAGGTGTTTCTATATTT:1 + chr2L 6645747 3' - mdg1 7040 2 77.23 CGNTGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTT:1 + chrX 22386782 3' - hobo 64 1 52.00 AGATACGCGTTACTCAGCTAGTGGGAGTGGAAGAAATATAAAGGACATAAGAAGAATCTACTCTTTTCGAGATTGTCAAATTACAATTATTGTAATTCTAA:1 + chr3R 19718869 3' - INE-1 542 1 90.10 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAACTTGGCAT:1 - chrX 19820024 3' - mdg1 4 2 71.29 AAAAAACAAAAAAAAAAATCGGAGGAAAAAGGTGGAACAAAAAAATGAAGGCAATGGAAAACCCAAGCCAA:1 + chrX 9480354 3' - hopper 140 1 88.73 ACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTTATGTGCATTTAGTGTGTATTTTGGTAAGCGGGTGGGTTCGGTGACAAAGTAGTCAGGCCT:1 + chr3L 14259719 3' - HeT-A 5985 1 66.34 CTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTCGGGATCTTCGAGCAAGGTGGCAATCTGTTTGTAAAGCTGTTT:1 + chr2L 17981014 3' - F-element 4510 1 60.00 AAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAATTAAAA:1 + chr3R 9192600 3' + invader3 261 2 63.37 AGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTC:1 + chrX 23108323 3' - BS3 1425 1 50.50 CTGTAACGGTCATGTAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTTTCCTTGGTCGGGCAATCACACAAATCATAAATTTGGTGGGACGAACGCAGAAACTCTCT:1 + chr2R 4877103 3' - Cr1a 4170 1 64.36 ACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCACACCTTGCCTCCACAATGTGTCTCTCCTGGCCCAAAAGTCAAACTACAAGTTCGTCA:1 - chr3R 23196513 3' - invader2 4710 1 62.00 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCAATGATTTTGTG:1 + chr3R 6776615 3' + copia 238 1 62.38 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGCATTAAATTTACTAATTAACAACAACA:1 + chr3R 29357098 3' + 412 7498 2 73.27 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGCTG:2 - chr3L 447324 3' - Tabor 49 2 74.26 ATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTAGATTGGGATAACTAGACGAGGAGTGGATCAAGGTGGAGACACGCTTGCAACGGATGCG:1 + chr2L 16737836 3' - invader3 5403 2 60.40 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGAGAATCATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTA:1 - chrX 6518790 3' + pogo 2078 1 71.01 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCATCGAAAAGATAT:1 - chr3R 6776534 3' - copia 34 2 62.38 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGCGACAAGTTGACTGAAGGTTAG:1 + chrX 17699215 3' - P-element 50 1 31.00 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAA:1 + chr3R 22494172 3' - 297 34 2 62.24 CTCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAACAAACAAATTTTAAGAATCTAAGAGTACTTGTATCCCATTAACGTTATCCATACGCCCCCCTGGC:1 - chr3R 24460668 3' + Idefix 269 2 73.00 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACCTAATTGAATGCGAATATTTGTAGAGAATACCTGGAGAGTAACTTTA:1 + chr3R 4971232 3' - 1360 28 1 55.00 CACTGTGGACGAAAACACAAGATCAAAACTAACTCTCATTGTTAAGGAAAATTAAATGTAGCAAGTATCGTTAGAAAGAAAACTATATATATATATATGTA:1 - chrX 4915286 3' - Cr1a 395 1 76.24 TCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGATCCCATTTATCACATTAACCGGGCACTGTGCTACCTAAAACAGGAGAGGTAG:1 + chr2R 24159940 3' + Quasimodo 243 2 67.90 AANTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAGGCTTTTAAATAGTTTCTTCGATTTTTTCCCCCATTGTTTTTATTTTTATGGGTGCA:1 - chrX 6082557 3' - roo 20 2 59.41 GTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATATTTTACATTTGTACAGATATAGCATATATATCTCTCAGTAGGGGATTCCCGTAGCTAATCAAATAATATA:1 - chr3R 17412537 3' + 3S18 334 2 70.30 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTTAGTCCCTTTCAAACAGCCGTGTGATTCACTTCGCTTGAAATAAAATAAA:1 - chr2L 16887914 3' + P-element 2860 1 53.47 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTGCAATGTT:1 - chr3R 28443698 3' - Burdock 30 2 71.29 AACTAAGTGTTGCAGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATGGGATTACATTCAGTAGAAATACCCGTACGTCG:2 + chr2R 9788996 3' - blood 39 2 65.35 TTTTGTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTCTTTTTTAATGTGCCAATGTCTTTTGGGCATATGCCATGTGTGTGCCCTATATCTTAATATCAGGGAAGTAGT:1 + chrX 19379433 3' - gypsy7 5011 1 33.66 TCTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACACACCACTTTTAATCTAATTTATGAACAAAAACCTTTTAAGATTTTGCGAAAGGCATGT:1 + chr3R 26140824 3' + 412 7525 2 57.43 TGNTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGCACTCGAACGCATTAATGTGTGGCCCACCCACACACTGACAAACACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978951 3' - hobo 11 1 68.00 TTNAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTTCGGTGTATAGTAAATTTGGTGATATACGTATGTGTGGGGTGGGAGTACTACCCTCTTTTATGCCTGCA:1 - chr2L 17815919 3' + FB 51 1 70.30 TATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATATGGTGCCTAATGAATAAAGTGGTTTGAAT:1 - chr3L 20209571 3' - Burdock 43 2 74.26 CCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTGATTTGCGCGCTGCAATTAAGGCGCT:1 - chr2L 22195409 3' - invader1 3721 2 80.20 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTCTCAATGGCTCATGTATTGTATACTTCCCCGTTGTTAATAACAGCTGTTCCTGAAACTGATTTAACG:1 + chr4 1269632 3' - Transpac 4930 2 68.32 ATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTTAAAATACATAAAAACAGGGAGCCATTTAATTCCACGATCTTCGTGACATTTGAACTGCAGACTTTATGTA:1 - chr2R 21818945 3' + flea 255 1 78.22 CTNAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAGCACGCGAAGTGGATTTAACCACTTGTATGAAAATACACATTTAATAAAGA:1 - chr2L 20239716 3' + Tc1 1573 1 53.47 ATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATGCTTTGGGATGGATTGCTTCGCAGAAGAATGAGACCTA:1 - chr2R 19149403 3' + diver 186 2 61.39 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTCCTAGC:1 + chr3R 31026125 3' - mdg1 8 2 69.31 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCTCACTTTCACAAAAATTTTCGAGATTGGGAAGAAATTATGCCAACTGAGATTTAATAGGAAAGCA:1 - chrX 9439746 3' - roo 9 2 70.00 GCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGTTTATGTTTTTCTCTCATCTTTGCGATTAAAAA:1 - chr2R 14032066 3' - I-element 225 1 67.33 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTTAAGAGCTCTA:1 + chr3R 20878187 3' - Doc 38 1 58.42 TGCTGAGCTGTTTCCGCCGACAATGTTGCAACATGAGAGTGCGACGAACTAGCAGCTCTGGTGTGAGGGTTTTTCGGCCCAGGGTCAGAGGAGGAAAAGCT:1 - chr2L 12285450 3' - gypsy5 7105 2 73.27 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGCACAAGCACTTTTAAAATGGTAAAC:1 + chr2R 10468621 3' + P-element 2837 1 28.71 AGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCTGAAGCTTACTGTATGCTCGTGTATGTGTGTGTGTGTGCCAGTGTGTGTG:1 + chr2R 6829828 3' - Quasimodo 6903 2 52.00 CTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAACCTCTTATTTGGTGACGGCGGCGACGGCACCTCATCGGAGGTGGTCACTGGGCTGA:1 + chr2L 10270599 3' - 1360 3375 1 63.37 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATGTATGTATATGGTCTATATAGAACGCAGTCATAATCGTAAACAAT:1 - chr3L 11450469 3' - Transpac 27 2 55.45 TCNGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTTTGTGTAGACCCCTTGCCAATTTCTGTCATTCGATA:1 + chr3R 24430613 3' + Transpac 300 2 70.30 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGATCTGATCTTATGACATAAAAACGATTGTTTTGACAAAATGCTTAGCATACTTTTAAGCATATTTTTTACTGT:2 + chrX 6302724 3' - jockey 4673 1 68.32 ATTTTTTCTTACACTTCAGCGCATGATTTGTTTTGCATCCATACCGTTCTTTTTTTTTCGTTCTTTTT:1 + chr3L 1872019 3' + rover 94 2 86.76 AGNTAAGGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATGCATGCAGGTCGCCAGA:1 - chr3L 19413963 3' - Burdock 58 2 73.27 GTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATTAACAATTATTTCGCCACGG:2 + chr3R 1868234 3' - G-element 20 1 60.40 ACNATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATACTCGTATATAGGTACATATATATATCT:1 + chr2R 13403783 3' - jockey 58 1 78.22 TTCATTTAAAGAAAAAAGTGGCAAAAAGGTCAGCAAACAACCGAGCAGCACTGAAAGCTTAAAATTACCTCAATCCTGATATATTAACTTATTACTCCCAT:1 - chr2R 2963796 3' + S2 1262 1 72.28 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGAAAGGGACTCGAGATTAGAGATGGGAC:1 + chr2R 8951076 3' + P-element 2859 1 51.49 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATT:1 + chrX 9439833 3' + roo 9036 1 62.38 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGGTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTCATGTGAGAGCAGCAGCTGTGTCAGTTA:1 - chr3R 22341123 3' + hopper 1408 2 75.25 AAAAATTTAAATTCATTAAATTGAAAATACTTATTGTATTTTAAATCAAAATAACAATAAACTTTAACACATGCCTAATAAAAAGCTAATATAAAAATTTA:1 + chr2L 9595078 3' + TLD2_LTR 151 1 91.09 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATCCAAAATTAAGCATGTTTTATAAGAATCACTGTTCTAGA:1 - chr3R 7382589 3' + copia 245 1 68.32 GGTGGCCGTGGGACCCGTGCGCAAAAAAAAACAATAAAGAAATCGCTAGAAATTGCAGAGGCAGCGGCTACAAGAAAACAAAAGAAGATGAAATAAGCCCG:1 - chr3R 23084731 3' + Cr1a 4442 1 81.19 CGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATT:1 - chr3L 27182019 3' - F-element 282 1 80.20 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGC:1 + chrX 18356235 3' - P-element 43 1 28.09 CCTATTATTTTGACCGCAGCTGTGTGACTGCTGGAGCATAAATATGGCAGAATGTGGGTGCTTGACGACCCTTCTGACTTTCGATGTGA:1 - chr3R 4761229 3' - Tc1 3 1 67.42 ACNTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTAGTGACGCATGCAATGGCGTTGATAAGTCGTCATCAATGTGGCTGATCGGCAG:1 - chr3L 8336109 3' + roo 270 2 50.50 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCC:1 + chrY 311346 3' + 1360 3380 2 61.39 AATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGGAAAAAAAAACTAATTGTTGTCGTTTTTTGAGAAAAAACTCCTTTGCTGTGAATCGCGAATCCTCTATGTTTA:1 + chrX 522229 3' + transib2 2823 1 77.23 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGGATCCAGAGTCGCCGCTCAGGCTGCTTTT:1 - chr3L 19275688 3' + mdg1 377 2 69.39 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATGTATGTGTATAGAGCCGGACAACGCGGCGTATGAGTGTCATC:1 + chr3R 24408320 3' - Quasimodo 28 2 59.41 AGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGGTCGCTACTTGGTGATGGCGAAAAATTTACTAAAAGACACCTCTATTTTTTGATCAAATTTAAACG:1 - chr3R 5616397 3' - Porto1 260 1 69.31 CGTGAGAAGTCGACTAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGG:1 + chr3R 9127410 3' + invader3 5410 2 73.00 AGACGATTTTCGGCCCGAAATGGCGTTACGCATCTTGGTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' - 1360 3188 1 91.67 TCNACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAGAATGTGCACAAATCATCTAAACACATCGAATGAG:1 - chr3L 24131076 3' + HMS-Beagle2 295 2 60.40 TTAAAAGTGAGTAATGGGAATTGGTTATGGTTAAAAAGGTTATGTATTGTATTTTAAGAAATCCACTCATTTAATGAGCGATTTCTAACTTGCAGCAATTT:1 - chr2R 21982988 3' - Copia1_DM 84 1 62.38 AAAACTTGATGGTGAAAACTACAGTGCTTTGGAACTTCTTTTGTTTACTTGTTAAATGGGAGAAGGTAGGAATAATTGCAGGGGTTTCTTCAAGATTGAAT:1 - chr2R 17503510 3' + Dm88 343 1 79.21 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAG:1 + chr3R 19446240 3' + 297 6960 2 64.36 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATATGCCACAAC:1 + chr3R 19947408 3' + roo 9027 1 69.31 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAA:1 - chr2L 11764876 3' + roo 387 2 50.50 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCATTGATTTTTCATTTTTTCTTTATTTT:1 + chrX 6082654 3' + roo 393 1 61.39 ATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGAAAGCATTGAGGGTAAAGGCATTTTTAGATTGC:1 - chr2R 8562146 3' - 17.6 7017 2 63.74 TGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTTTATTTGCTTTGAACTTTTGCTTTCCGAAACTTTTTTCGCATTCCGAAATTTCTCGGTT:1 + chr3R 25740359 3' + Cr1a 4240 1 67.33 TTAGTGCGTTTAGGGTGTACTGGATTCTTCGCAATATGGTGAGAACTTATGTTGTCGCCACATATGTACATGGATGATGTTGATGTTGATTGCGGAAAAAT:1 + chr3R 32012980 3' - Copia1_DM 4107 1 61.39 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAA:1 - chr3R 17665989 3' + Transpac 263 2 73.27 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTAA:2 + chrX 20331877 3' - mdg1 7075 2 60.40 CAAAAAGAAGAAAAAAAAAAACACAAATGCGAAGAGGGAACAAAAAAAGTAAAAATAATTAATAATAATTA:1 + chr3L 9338843 3' + gypsy7 5007 3 88.73 AAAAAGAAAACAAAAAAAAACTATAGAGATGGTATCAGATGGTTGAAAGAAAAAGTGGAAGCTATCATTTTCAAGGTAATCTTAACCTAAAACACGAAAT:1 - chrX 12669601 3' + HMS-Beagle2 489 1 78.00 AANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCGGCGCGTAATGCGA:1 + chr3L 6442693 3' + roo 397 1 67.33 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACACTGAGAGAAATGATTTGAGCTAGTATATGGAATTAAATATCAAA:1 - chr3R 28117759 3' - I-element 33 1 59.41 TCAACGAAACTATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACTAAAAAGAAAAGATCGCTAAAAGATACGAAAATTACAATTTTTGAAACTTTTCAGTTGAAAGCTA:1 - chrX 9745258 3' + Porto1 4420 1 73.27 TAAATATGTACATATGTATATATATGTACATACATATGTAACTATAAATTGATCCGTGTATTTCGAGCAGATGAACTGATAATAGCATTAAATTACAAGTT:1 - chrX 19455074 3' + G3 4504 1 76.24 GTGTGCNCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCACCGAAAAACATTCCCAAAACTAATTAAAATTCTTTT:1 + chr3L 6013756 3' - Max-element 3 2 76.24 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGAGCTGCTAG:1 + chr3R 8191543 3' + mdg1 392 2 55.45 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCC:1 + chr3L 9076639 3' - mdg1 18 2 57.14 TTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACGAGTTCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTCCGACATGGACTTTTGTACGGGCGACTGCA:1 + chr2R 16329567 3' - Ivk 5368 1 73.27 AAGCGTNTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGAGGGGTTTCAGCACGGTAAATAATGTTATCCAAAGTTGTTGTTTTCCACGCTAATTGTAAGGCTAG:1 + chr2R 4561717 3' - Doc2-element 4375 1 52.48 ATTCTGAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCTGAGCCAAGAGCAAACAAATGCGAGGGAAAATGGGCGCTT:1 - chrX 13023747 3' + gypsy6 303 2 60.40 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAAGTGTGAAGCGAATTTCAAAGTTACAAAACTCGGTTTACAAAG:1 - chr3L 18816120 3' + roo 9036 1 60.40 TANATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTTAAAATACATAAAAACAGGGAGCCATTTAATTCCACGATCTTCGTGACATTTGA:2 - chr2R 21818962 3' + flea 4997 2 61.39 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCACCGCCTCTCTTGCTATGCATGTACACGT:1 - chr2R 18356207 3' - P-element 47 1 32.67 ATNCTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTT:1 + chr2L 18214132 3' + hopper 1382 1 57.43 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCACAAAAAAATTTCCAC:1 - chr3R 20373229 3' - I-element 19 1 59.41 AAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGCCTAATTCTGTGTGGGGGTTTTCCATTCTCGCCGCCCCTTCGTAGCTGCTTCCTTCG:1 + chr3L 19425425 3' - X-element 45 1 56.44 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAAC:1 - chr2R 13318863 3' - Juan 4040 1 65.35 ACAACATCAGAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTAAATGGAACCCATTATCATTCCCAAGGCGCAGCCTGTTAAAATAGAAGTAGAAGCAAAGGA:1 - chr3R 21062842 3' + invader3 296 1 54.46 TACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAAAATACTTGCGACACTCACAATGGCTTCTT:1 - chrX 22782018 3' + I-element 5316 1 71.13 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCGACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTTGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCC:1 + chr2L 18177955 3' + 412 7493 2 74.00 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGGCA:1 + chr2R 18356231 3' + P-element 2828 1 21.78 TTNCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTTTTGTTCGGTTCTACATATTTATAGGTAT:1 - chr3R 11175865 3' + roo 9027 1 72.28 AAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATAAAGATACTCCTTCGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAACATGCAG:1 - chr2R 13318857 3' - Juan 4034 1 71.29 GATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCCAGAGAACAGAACACTATAAAACTAAAACACTCCTTGCTGCCAAGGGGCAACAAGTTTGTAATGACTTTGAGGAAC:1 - chr3L 15023333 3' + 1360 3286 1 76.24 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGCAAACAAGTTTCTTGTGTCCCGACAAAAAAGGAACCAACATGAAAAAATG:1 + chr3R 25514890 3' + hopper 1390 1 55.45 GTGTATATAAACGATATATCTAATGCTAAAGCTACATTTTGCTTGCTTATTATCTATCTTAGAATTTGACTTCAGCGTGGAATGTGACTGGCGCCAAAATA:1 - chr2R 2308163 3' + accord2 398 1 60.40 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAAC:1 + chr3R 26434732 3' - Tabor 54 2 76.24 CAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGAATGTGTTTCTGTGGTCAGAAAGGATTGCAGCGGTCGGCCCAA:1 - chr3L 12232087 3' - Ivk 5068 1 57.43 AGATACCCGTTACTCAGCAAGTTTAAATGCGACTTACATACATACTTTTCAACGAAATAATTTTCGATAGACAAAAACCAGCTTGCAAAAGAAATAGAAT:1 - chrX 16255003 3' - INE-1 542 1 93.00 GTATTTCGGGAGAGCATTGCTCTTTGGTGCTTAAGCTTTAGGATTTGATTACTAGAACGGCTAAGTGCCGTTGCCAAATAGATTTACGAGAGTACAAGGAG:1 - chrX 19790648 3' - 297 206 2 77.23 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGGATACGCTTTGGTTGCCTCGCCTGCCCCCTGAGGAAAAACCTAACTTTAGGGGG:1 - chr2L 12322967 3' - hobo 21 1 59.41 AGTCTTAAAACTCCCCACAAATCTGGATGCAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCGAAAGAAATCAAAGCGATGCGATGTCTCGAGTGGAAGTCCAAGCAAAGG:1 - chr2L 18243639 3' + gypsy8 4657 2 55.45 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATATGGGGTCGAGTTGGATCTTTGCCTGTATGTCAGCTGGGAACGGG:1 + chr3R 28443774 3' + Burdock 6368 2 53.12 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTAAGAGATGGCATATATCACTGCTGCT:1 - chr3L 4859327 3' - jockey 4803 1 65.35 TCGATGAGCAGGATGTGAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCGTCTGTGTAGAG:1 - chrX 19820614 3' - Rt1b 4958 1 74.26 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACAATACACAGAATCGTTGAGGCCA:1 + chr3R 28288636 3' - 412 7106 2 81.19 TANGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAGTGTTGATGGTTGATGGTTGAGAGTCCGCAGCCTTCGATGTACAGCAGCAGCCTAAGTAGATATATGTATATATAGG:1 - chrX 19181599 3' - I-element 209 1 75.25 TACATACACACACACACACACACACGTATGAATGTACGTACGTATTTTGTAGCACAAACTTGTGTTGACTTATGCAATAAAAGCAGGGCACGTGCATGTCG:1 + chr3L 10574945 3' + Quasimodo 34 2 74.26 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTAT:1 + chr3L 10557644 3' - 412 32 2 55.45 CCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATATATATCCATTAAGCTCCGTGCTTAACCGAATC:1 + chr3L 15646955 3' + Juan 4170 1 69.31 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTCCACTTACACATTTGCGCCG:2 + chr2L 17269861 3' + hopper 1398 1 66.34 CCNCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCA:1 + chr3R 23601757 3' - jockey 36 1 51.49 ATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTT:1 + chr3L 25350812 3' + baggins 5405 1 53.47 TTNTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTGTTATAAA:1 - chrX 21504669 3' + Cr1a 206 1 60.40 GANGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGTAGCA:1 - chr3L 21144046 3' - jockey 4709 1 51.49 AATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTGGTTGGTGGTCGCCCAGTTGTCTACACATGTAGCTATCAATCGGACATTGCCCCGCGGTAATCTGTTTGCTCTGAA:1 + chr3L 14278381 3' - G2 378 1 69.31 GTNTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGCAGGGGAACCCACGA:1 + chr2R 2949123 3' - 17.6 6948 1 59.41 TCACGCTTCCACCCATACAAATTGTTTACGTGAAACTTTTCTGCGACAGTTTATAAGTGAGAAAATAGCTTCGTTCGTTCGTGTTGAAAAGACATTAAAAC:1 - chr3L 20887967 3' + hobo 2669 1 80.20 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCCCGGTGACAATCTCTGCCGGACGGACGTACTCCCTC:1 - chr2L 2685740 3' - hopper 31 1 61.05 TGCAACCACTCTGGAAAATAACCACTTATGGTATACATGGGGATATATCCAGCTGCTGCTGTGGGCCAGCGGAAAGCTCAAAGTGTGTGCACGACATAAGC:1 + chrX 6892127 3' + G4 3374 1 69.31 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCACAAAAAAATTTC:1 - chr3R 20373232 3' - I-element 22 1 56.44 GGNAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGCGGTGGCAAGGACGACGGCAAACGCATTGCAATTGCTTCCGGTGTGAAAGCA:1 - chrX 17326195 3' - Porto1 464 1 56.44 AANTTGTAAAATGCCATAAATTGTAACTATATATTTTATAAAAAATCAGAGTACAATAAAATGACAGCGCCGAAGGGCACTGAAAATATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 3701147 3' + TART-B 10544 2 75.25 TACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGATGGACGTGGAGCGGGAGGTGCTCGCTGGATAGTTGGCGTGTTAAATGGAATAAA:1 + chr3R 31857101 3' - F-element 4547 1 56.44 GATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCCCGCCCCCAAACTACAATTCAACATTAACACTACCCAGCCGAAAAGTAGGCAACACAAAACGTTCATCCGCCCTGT:1 + chr3L 9064391 3' - jockey 9 1 72.28 ATTATGTTCGTATATACTACAACATAAGCGCTTTCGCTGAATAATCATGTGAGATTTTAATAGCTCGCCTTGCAAAATGGTGCATTCGAATAAAGTTTTTA:1 - chr2L 10174076 3' - mdg1 7038 1 74.26 GGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTATGGCCAACTTTTGTGAGCTGCAAAATTAAAATCGCATCAAATCAGCAAATCAGCC:1 - chr3L 9172101 3' + 1360 3305 1 63.37 CACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATACGTTCCCATTCGGAGTCGGATTCGTATACAACTTCAACTCCTTGGCGGCAGTGG:1 + chr3L 447404 3' + Tabor 7320 2 74.26 GACCATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTTCTTCTTGCGGTTTGCTTATTGCTGTTCGGCAATACATCATCGACTGGCTGTCACTATTACTACACCAGCGTTC:1 - chrX 12102112 3' - accord 185 2 77.23 CCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTTTAGCATACCTTCGGACCACCAAACA:1 - chr3R 15034246 3' + hopper 46 1 74.26 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTACATTAGGTTCATGTCTC:1 - chr3L 10557589 3' + 412 7500 2 69.31 CGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACATATATTCGAGTATATGTAAGTATGGGTAC:1 + chr2L 16954892 3' - Quasimodo 36 2 72.28 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAAAAAAGTGAAATCAAATCTACCCATGCCCGGGCCAAAGA:1 + chr3R 5524743 3' - 412 28 2 58.06 ACTAGCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAAGAAAAAACTGTGAAGGAACAAAAATTAAAGAGATCATCCCCTTCCCACA:1 - chrX 22778778 3' - mariner2 54 1 54.46 GTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACCAAAAACCACCCACTGGAATGCGTACTGCCACTGCCACTC:1 + chrX 1994557 3' + Stalker 60 4 60.40 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGC:1 + chr3L 22046477 3' + roo 356 2 73.27 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAG:1 + chr3L 22349289 3' - jockey 13 1 70.33 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAATGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCAT:1 - chr2R 5674660 3' + S-element 1677 1 66.34 CATTTGTTTTCATCGAGGTGTGATATCCGGTCGCCAGCCGGCCACTTCAAGTGGCACAAGGTCAACTGTGAGCCAGATGAAGATGTTTTGGGCCAGGGAAA:1 - chr3R 16122296 3' - Chouto 5933 1 71.29 ACCAAAGTTTGTGCAAATTCTAATGTCAATTTGGACCAAATCTCCGCCATTTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTTTTGGACATTGTCAAGCGTTGATGCATGA:2 + chr2R 13638173 3' - Bari1 1313 1 56.44 AGNAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGATTGACTTCTGATCTAATTGAATTTCGCACGCCTGGGAACTGCTCCTGGGTAAAGTAAAATCAATGGG:1 - chr2L 6517163 3' + copia 5024 2 77.32 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGTTAATCTGCATGCGCTGCACGC:1 - chr3R 8191452 3' - mdg1 13 2 66.34 AATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTAAGAATAACCGGATTGGTATGTAGAGGTAGTACCACGGGAGCCGCATTATGATGC:1 + chr3R 20987090 3' - hopper 423 1 60.40 GCNAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGCCTAATTCTGTGTGGGGGTTTTCCATTCTCGCCGCCCCTTCGTAGCTGCTTCC:1 + chr3L 19425421 3' - X-element 49 1 52.48 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACTGTACATCTCTCTATTGCTCACCTTTCTCGGCCGGCGATGGTGGCGGCTT:1 - chr3L 11217255 3' + 1360 3366 1 57.43 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATAATGATAAAACATTTAATTAAATTCGTTATAACATTTTTATTAATTCTTGTATGCAAAGTTTTTATTTA:1 + chrX 23280087 3' - Transpac 4924 2 75.25 CACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGATAAATCAAGAACGAATCCCAATAGTATTTACAACGATCTGAGTAAAATTTCGCTAGGTATGTATATAC:1 + chr3L 10148681 3' + hobo 75 1 75.25 TCNAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGA:1 - chr2L 19845914 3' - F-element 53 1 63.37 AATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATATCACATATAATTTGTGCAAGTATGTAGGCGCAGATCGCGGGTACA:1 + chr3R 29479642 3' + X-element 58 1 58.00 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCACACCCTTCCGAAGCTCCACAACCGCAGGTGTTGGCTTGCTGAGCTCCAAAAAAAG:1 - chr3L 13704644 3' - hobo 20 1 59.41 GANGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTT:1 - chrX 4806693 3' + roo 9020 2 72.28 TACCCTCACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCAAGCGCTCTCAGCGGGCGGTAGCGGAGGGACCTCCAACTCCGGAAGGTCGCCAGACCATTCTGT:1 - chr2L 1169671 3' + 1360 3255 1 55.45 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGT:1 + chr3R 10030793 3' - BS 5018 1 64.36 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGAGTTGAGCTGCTGCTTAACTGTCCACTTCCTGGCGAGGCCCGCATAGC:1 + chr2R 13334888 3' - pogo 26 1 53.47 CAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTG:1 - chr2R 5582158 3' - Cr1a 432 1 76.24 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCAACCA:1 + chr2L 10174167 3' + mdg1 384 2 65.62 TANAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCCGA:1 + chr3R 12566771 3' - Doc 46 1 60.40 GANGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTACGAGACGATTTCGGGCATTTGAAGTTGGTTTGATTTAACTTCCGGTCATTTCATTTCCTCTCCTATT:1 + chrX 20751021 3' - 1360 3224 1 59.41 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACA:1 - chr3L 27415229 3' + transib2 2793 1 57.43 AGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATTAGTATATTGTATGTACATCTGTATATATAGCACATTCTTCACCTCGATATAAAATTGTA:1 + chr4 628945 3' - diver2 182 2 69.31 CTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAGCAGCCCCACCCCCTGCCGCCCTCCTTTCGACTCCAATTTAGCCTG:1 - chr3R 26068869 3' + F-element 246 1 54.46 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATTAATATGAAAACACCGAGCAATGACTTGTGGTATAGTAATTTTATATAATTTATAAGAACACAATTTCAA:1 - chr3L 8331267 3' + Burdock 213 2 71.29 TTTTGTTTGGCGATGACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCA:1 - chr3R 1418285 3' - BS3 222 1 62.38 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTAGGCCCAAGAGCACACACACACACACACACATACATAGAAAGAACGATGGAGAAGGACAT:1 + chr2L 9314008 3' - hopper 17 2 55.45 TGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGTGTTGTAATGGCTGGCATCCAAGGGGATCCCCCGTCCAACGCTTGACTTTTGACCCAA:1 - chr2L 9072548 3' + Transpac 5091 2 72.09 AAGTAAGTAATATGTAAAGTAAAGTAATGTTGACTTGTATGTTCGGTACATTTGGTGATTTAAACGGTGACTTAAACTGCGCTTGAAAGTAGGCAACGATT:1 - chr3R 16041116 3' + Stalker3T 44 1 82.18 TCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTGGGCAAGCGAGAAATCAGTGCGGTGTACAACATTGCGTATGCTTGATACGTTATGAATGCGCTGGCTTA:1 - chr3L 16979930 3' + F-element 4407 1 73.27 TTTGCATGTGTACTGCGACCCAGTCGGGTGTTCATGGAGAATTATGAAAATCGTTGCGCAATTAATTTAAGAATTTTTTCCCCAGCTTAGTAGGAAGCAAA:1 - chr2L 12665005 3' - baggins 5416 1 71.29 ATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTTGTGCCATTGACCACCAC:1 + chr2R 9199954 3' - G6 1675 1 59.41 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGGTGTATTTGAACGCTCGTGTCACGGTCGCACTCTCATTCGTCTCTCAGCGTTCAGAAGATTCGGAAG:1 - chr2L 18987245 3' + P-element 2879 2 65.35 CCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAGTTTACCAAGTTCCGAGTTGGTGTTTTGTATGTTTTCCACGACCCAC:1 - chrX 12128186 3' - Doc 4226 1 58.42 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCTCGTGTTGCTCTGGGTCGTTTTGTATTGCTGGTGGA:1 - chr3L 17971203 3' + P-element 2882 2 73.20 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTT:1 - chr2R 5485082 3' - 1360 47 1 73.27 TGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAGTTCCTCAGTATGCCAAATAATTATAGTTCTTATTTTCTAAGTGCCTTCAATTAAACTAAAACTTTT:1 - chr2L 11988963 3' + Idefix 182 1 71.29 ATTTGAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAACTCAAAATATAGTGTTGTACTTACACCTCATGCGCTGAATTTATGCTCACCAATAAAACAAAACGAGTACAG:1 - chrX 8966247 3' + transib2 2637 3 64.36 TTGAAATAGTGAGGAGCGTGCCTCTGCCGTTGAGGCATACTTTTCAAACGGATGTTCGGTTACCCATTGATACGTTTTTGAAACGGAATTGCTTTTCTTGC:1 + chrX 17514097 3' + mariner2 139 1 61.39 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACG:1 - chr2R 5485067 3' - 1360 28 1 61.86 ATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGAACGTAGAACACGAGCTGACAATGGCCAGAAAA:1 - chr2R 11556394 3' + Stalker 284 4 73.27 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGCATGCCGATGTGCACGGGAAGGGGGGGAAAGGCATTTGCAGCGCCGTTCCC:1 - chr3R 28288578 3' + 412 7524 2 56.44 CTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGATTGCGCCCTTCTGGCGCGAACAAAGGTGTTCTATATGTAATTGTTTAAAA:1 - chr2R 3824022 3' - Max-element 8279 2 93.55 AATAATAAAAATAAAAACAAAATAACTTTGTAGTTTCTTACCAGGAAAGCGAAACGCTGGACAT:1 - chr2R 19361317 3' + Doc 4691 4 68.75 CAATCATTGCCTTATTAATTTTTCTCACGCCGCAAGATGAATACTCTGTTCCGCCGAGAGGCGTTTTCTCGGTTTCTTGTCAAATCATTTTTTTCATTTCA:1 + chrX 14387148 3' - 1360 440 1 58.42 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCAGCGGAAATT:1 - chr3R 29423520 3' + roo 360 2 76.77 CGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCG:1 - chr3L 7295175 3' - G2 2969 1 70.30 ATGGTCNGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGATTGAGATTGAGATTGAGATTGAGATTGAGATTGAGATTGAGATTGATATT:1 + chr2L 7622393 3' - F-element 274 1 54.55 CGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGACGGCGGCCGACAGCAGCCGATGCGACCCGAAC:1 + chrX 18356269 3' - P-element 17 1 60.82 GGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTTATCACAGCGGCAGTGGGTCTTATCGATGCTGTCTCGCTCGCACTCGCACACTTCCTGCCGTTTACCT:1 - chr3R 23886746 3' + S-element 1709 2 72.28 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCA:1 + chr3L 18337723 3' - Juan 4040 1 63.00 CTACATGAGTCAGTCACTTGAGATGAATTGAATTTATTAGCTAGCTGAAAAGTGCAAATTTGCTACTCGTTGCCACCCGTTTTGGTGGAAAATTGTGCACA:1 + chr3L 10523961 3' + roo 8821 2 79.21 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCAAATTAATACTAAAGAGACGCGTAAAAGTATGCAACGCCAAGTGGCAGGG:1 + chr2L 19602912 3' + hobo 2931 1 63.75 CTNCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTACTTAAATATTCGAGATCGCTGTCCTTTGGATATG:1 - chr4 533995 3' + accord2 7430 1 56.00 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGG:2 + chr3R 9322882 3' + 412 458 2 57.43 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAGACACAATATAACCAAGTCCTGTTTTTCTAGTTTCAAAACGATTGGAAGTGCTGGT:1 + chrX 2172308 3' - I-element 21 1 58.42 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAAATTAAATTGTCGTGAATTGTGTTTTATATAATATATATAATGAAGCAAAATTAAATAGATTTT:1 - chrX 13954724 3' + Juan 4202 1 56.12 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTCATCAACTCCACTTACACATTTGCGC:1 + chr2L 17269859 3' + hopper 1399 1 60.20 CGTCTAAGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTGCGGGTTGCATGGGCGTAATCGGCCGGGGTTTTAAATACTCTATGGCAACAGGACCCCAGCCATTTGGTGGGG:1 - chr2L 18873753 3' + HB 1211 1 57.43 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCTGTGAAATGAAAGAAATTTGCATATGAAAGCGTGTTTGGTTG:1 - chr3L 22046429 3' - roo 8698 2 62.38 GAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCACCCGTGTTCGATGCCTTGAATTGAAATATGATAATGTGGGTACCTTGGATAGG:1 + chr2R 4850490 3' - HMS-Beagle2 240 2 59.41 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATTTTAAACTGGCTTATGATATGA:1 + chr3R 23724177 3' - Doc 47 1 53.47 GTNATTTGGTGCACACTTCAATATGAACACTTCAAATGAAACCGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATACTGCGTTTCTCTGTTCTTTGCCTTTTGCTTCTC:1 + chr3R 20138146 3' + X-element 300 1 78.22 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCA:1 + chrY 3648870 3' + S-element 1674 1 82.18 TTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTATGTGTAGCCACAGAAAGCCATTTCCAAGAGCATTACGTTAGGA:1 + chrX 15633749 3' - accord 299 2 62.38 TTTTGTTATTATCTTTTCATAGCTGATCACATATACCTTATGACCCAATAGTTTCTCATTATTAAATGCTAGTTTCCCTACTTTTCGACTTAAGTGAAAAT:1 - chr3R 27379027 3' + HB 1405 1 90.10 TTNGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAGAATTTAATACAACATCATATATATTTCAGTAATATAGTTCATA:1 - chr2L 21612898 3' - 297 26 2 64.36 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACTGCATTCTTGCCATGTGCAACCCGAAAAC:1 + chr2L 12284048 3' - 297 6584 2 77.23 TTGCTGTGAGTAGGTTGTGGTGGTGGTTGTTTGTGGACTGGGCAGGGTTAGGGCTTGGCTTAGGGTTCGCCACC:1 + chr2R 8974375 3' + copia 147 2 78.38 CATGTACACACACACACACACATAAAGAAACAACACAAACAAAAAAACACTAAAAACACCAAAACGTATAAGA:1 + chr3R 15416081 3' + accord 180 2 57.53 TTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACACGCACACAACATCGGCTC:1 - chrX 4203727 3' + 1360 3191 1 77.08 AAAAAAAAGAAAAAAAAATTGGGAGAAGCCAGTGTGCTGCTCTTCGCTTGATGATGACGTTCTTGAACCATTTCCATGTCACTCACCCACATCACCAGTCC:1 - chr2R 19648321 3' - hopper 141 2 54.46 GCAACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATA:1 + chr3R 23601759 3' - jockey 34 1 48.51 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCTGTGAAATGAAAGAAATTTGCATATGAAAGCGTGTTTGGTTGAAACAGTTATCACCGTTTTAATGAATAAAT:1 - chr3L 22046399 3' - roo 4 2 75.25 GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCCGCAGAAGTTTTTCTTAAAATTTTCGCACTTTTCGCAGATTGCATTTAACGAAGGATAAAGTTTT:1 - chr2L 3688021 3' - I-element 5136 1 68.32 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAA:1 + chr3L 18337724 3' - Juan 4040 1 63.37 TGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAACCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAAAACTGTGGCTAGAAAATGGTACTG:1 + chr3L 6339979 3' + Doc2-element 4465 1 75.25 AANCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTTCATATGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCTCGATTGAATTATCTTTTGGCCTTCAG:1 + chrX 5442096 3' + hopper 1412 2 43.56 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGCGAGGACTTACTGTCTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAAAGT:1 - chrX 1600181 3' - BS 5023 1 54.46 CACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACAAGACTAGTTAAACTATTTCAATACTATATTA:1 + chrX 19030181 3' - Doc 8 1 74.26 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCAGCGGAAATTGTGTCA:1 - chr3R 29423514 3' + roo 9029 1 71.00 TTTTTTCTTATTTTTTTAACTTCAGATACTTTTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTTTCGCCAGATGCTAAAGTCGTTAGTAGAATCTATATAACA:1 - chr3L 11559925 3' - TAHRE 10442 1 67.33 TTTTTTTTATTTTTTTTATATACATGCACATAAATTCCTTGGCCCTTTTGCGGCACGAGCCTTCAGTTTGCAACGATGAGAAGGATGAGGAGGAGGAAGTG:1 - chrX 9289664 3' - TART-B 10632 6 66.34 GGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAACTAGTGTGAATGCCAAGCCATGTCAAATGGCCCAAAACAAATGGCCAAGACCAGA:1 - chrX 6620388 3' + I-element 354 1 63.37 TCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATACAATTGTTGTAGAAATATGTCAGTAAAATTCACA:1 - chr3R 13581406 3' + copia 134 2 66.34 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGTTTTTCAATTACACTTACACTTCATCTTCATCGAAAAGATATCAGTATCGGGAGTAAAATAAAAGAAGTTTT:1 - chr3R 6776504 3' - copia 4873 2 75.25 AGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCATATGCATCGCTCCACAATCGCATCATTTTGAGCAATTAAGTGTGTATT:1 - chr2L 18806057 3' - accord 7040 2 59.79 TAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAGCTACGTAAGCACAAAAAAGAACGAACAAATGGAAGAGCTAAGGCGAAAGATTTCCCACTGA:1 - chrX 16469858 3' + Stalker 88 4 56.44 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTCCCAA:1 - chr2L 8841059 3' + P-element 2857 1 48.51 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAATAG:1 - chr3L 13652775 3' - hobo 22 1 57.43 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTACGTTTGCTGGTCGGTGGTCAACTCTCTAGTT:1 + chr3L 14257639 3' + 297 354 2 72.28 CGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTATTTTAAAGAGGGGCATGATAGTTTGCAGTTTC:1 - chrX 20344075 3' + INE-1 570 1 90.91 TTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATACCGCGCAGCAACAAAAGGCCAACTCATTGTTGTTGCTTTTGAT:1 - chr3L 10111895 3' - F-element 4655 1 57.43 CGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTTGGGTGGCTTTGCAACGCGGCTTTTGGACTAATAAAAACAAGAGA:1 - chrX 19057683 3' + Dm88 369 1 56.00 TGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTCGATGTGGTGCGTCCGTCGTCGCCGTTCTCGTGCGTCTGCTGGGCTCCAGCCTGACAAAGGACCTTCT:1 - chr3R 19590480 3' + BS 5023 1 74.26 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGG:1 + chr3R 26434736 3' - Tabor 50 2 72.28 CAAGCATTTGGCCGGAAGCCCTCGCATAGCCGGAAAAAGCTCTGCACATTTGCAGAGGCCGCTATGAAGCTTGTGCAGTGGGAAAGTAATTGGAATCTGAA:1 - chr3R 5821959 3' + springer 7196 2 71.29 ACTGTCCAACGTTGCTCACAAGCAACTTTCGCATCTTTCGGTTTTGAATTTTTCTCCCACCCGAGGCTTTTATTATTGAAATATGAAGTAAATAGAGAAAC:1 - chr3R 21065522 3' + looper1 1727 1 67.33 TTNCTGATTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACATGTAGCAAGTTTCTATTATGTGTTACTTTA:1 + chr2R 3824675 3' - 297 6618 2 67.33 CAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAAATGGTTTATAGCCGCATTTTTGACAGTGAAATGTGCCTGCGTGCGTTTTCTGCAGCGGTAAA:1 + chr3R 25652087 3' - Juan 13 1 66.33 ATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCGGAACTAAACTACGCGACAAAGAGCATCTAACAAAA:1 + chr2L 21243820 3' + I-element 477 1 70.30 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGTACTCTTACACGTGTGGATGGTGGTGGATCACGATCCCCCGCCTCCTCCCGCTC:1 - chr2R 21497471 3' - P-element 22 1 57.43 CCAAGTAGATTCACTAGAGACTATATAGTAAAATATCCTTTAGCCACCCATTTTTGCTCCCCTTCATTTTTGGTGGCATGTGTGTGCCGGGCAAAAGGTTA:1 - chr2L 11697566 3' + Cr1a 4112 1 69.31 AGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGCTGCTGGTGAGGGCTGCAAACTGGGGTGGTGGAGGTCCGTAATTACCAC:1 + chrX 14474282 3' - G6 273 1 56.44 AATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTAAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTT:1 - chr2R 14970682 3' - I-element 186 1 78.22 ACNGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATA:1 - chr3R 17665963 3' + Transpac 289 2 58.42 CTCCACCAGCAAAGTTAAAAACAAAGTTAAAGTTCCAACCAAACAATAAAACAAAATAGGAAAACTGCCCAAGAACAAACAGCAGGAGCATTACTTTAATG:1 - chr2R 18067265 3' + HeT-A 6062 2 58.42 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCACTTGCACGGCC:1 + chr3L 1259227 3' - Doc 37 1 55.45 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAACGCGTAGCTGTGAGTTCCCCGCTAGCGATGGCAGCGTGAGTGCTTTTGGCGAAGG:1 + chr2L 16887998 3' - P-element 19 1 61.39 GTGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGATGAGTGTACCAGTTTACGTGTGTATTTGTGTTCTCTGCGTGTCAAAGAGTTTGCAGTCGAATCGAGTCGAGTCGAGT:1 + chrX 12698292 3' - gypsy3 420 1 75.25 GACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCCCTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCGTCAATAAAGCCGCAAGTTGCTCTTCGCAGCGC:1 - chr3R 22830299 3' + HMS-Beagle2 6995 2 65.35 ATGAAACTTTCCATGCACATAGTAAGCATATAGATATAAAATATCATTACATAAGCGAACAGAAAACAATAATGTTAAGGTCCCAGCCCTGAGATGATTAA:1 - chr3R 14420041 3' + Dm88 4101 1 58.42 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATTAACCCCAAACTAAAGTTTTCTAAA:1 - chr2R 11363985 3' - transib2 48 1 74.26 TCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACCAATGTACAATGCTAAAAAAAAAAATACACAAAACAACAGCTTGA:1 + chr2L 13738557 3' + I-element 44 1 55.45 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAATCCTTGGATTTGTATTTGTATGCGTGCTGGTGTGAGTGCGAGTGTG:1 - chr3R 19560878 3' - hobo 28 1 51.49 ACTGCGTTTTGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTACTTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCTT:1 - chr3L 9076572 3' + mdg1 7423 2 57.58 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACTGTCGGGCATCCTTAACCCTATGCAATGTCC:1 + chrX 10644909 3' - hobo 4 1 75.25 TTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATCAGCTGGGAAATGTGCTCCCTACTCAGGTTTAGCGACTTGTATTTCATGTTCCCAAATCAGCTGGTGTT:1 - chr3L 12172784 3' + 17.6 7418 2 78.79 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAAC:1 - chrX 18952070 3' + mdg1 7406 2 77.23 GATCGTATTACCGGGGCGTTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTGTGGGTCATGTGAGTGCATCAGGTCGCAAGAAGAAGAGTCAGCCGAATGA:1 + chr3L 11133798 3' - Stalker4 7097 4 58.00 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCAACAAAATTCAAACAAACTCGAAAAACTTTAAACT:1 - chr3R 27452331 3' - roo 33 2 64.21 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTATCTCAATTTCT:1 + chr3R 27900468 3' + roo 9031 1 67.33 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGC:1 + chr3R 22494162 3' - 297 47 2 75.25 TTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAG:1 + chr3L 17307313 3' - Stalker4 486 1 72.28 TGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGCGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTCGCGGTTCAAATGCTTGAAGAACATTTGTTTT:1 + chr3R 11586589 3' - I-element 5145 1 68.32 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAGCAC:1 + chr2R 544870 3' + HMS-Beagle 215 2 55.45 GGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACAAAAATAGCAACAAAGGGCGCGCAAACAAAACGCACGCCTCAATGCTCCA:1 - chr3L 2419166 3' + Bica 175 1 57.29 CTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACGGTGGAAAGTGGAAGTGATATTAAAGTGGGCAAAAAGATTTTTGGCAAATCGA:1 - chr3R 30704699 3' + mdg1 157 2 47.52 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAACGAAAAATGT:1 + chr2L 12323033 3' + hobo 2902 1 66.32 TTNCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACGTTTTAATTAGATTTTAATTTAAAAAAAA:1 - chr3R 9192533 3' - invader3 5248 2 74.26 AAATTTGAAAAATATATTAAAAAAGCTAACTCTACACGCTGTCTAAACTAAGATCAGGCGATATCTCTAAGTTATCCCGCTGAGCAACTCGTTTACTTGTT:1 - chr3L 3258984 3' - copia 4666 1 34.65 TTTGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAAGATCTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCAAAGCGGGGCTAATCACTTGGTTTAATCTCAGTTTGTGTAGAT:1 + chr2L 479564 3' + I-element 57 1 48.51 GCACTCCCTTCCTGCAGTGTAGTATATGAGGGCTCCGCCTTCCACCCTTTAGTCGCCATTTAAGATAAGTTGGGAACGCTGCGAATATCGATTCTTACTA:1 + chr2R 25127240 3' - Rt1b 4931 1 79.00 TTNATACGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAGTCAATTTTCGTACGATATACCAGACACTTTGCAAAGAATAGC:1 - chr2L 18177908 3' - 412 7085 2 49.50 CTGATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATACATTTAGTTTAGCAAAAGAGTTAGCATATAGAAGAGCTACT:1 - chrX 4174045 3' - I-element 5214 1 62.38 CTTACTCTCTCACTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGTCTTGAGGTTATCGATTATTCCTTCTCAGTTATGACGAA:1 + chr3L 13905501 3' + Cr1a 294 1 69.00 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATACTATACGTGGGCGGCACCAGAATACGAGAGAGAGAGCACTTCCAGCG:1 + chr2R 10444298 3' - P-element 26 1 53.47 GTTCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGGTGCGCTTGTGTTGAAAACC:1 - chr3R 22204006 3' - gypsy8 4774 2 48.51 AANAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGACAAA:1 - chr2L 17269780 3' - hopper 35 1 58.42 AAGCAGNGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGCT:1 - chr2L 20360647 3' - micropia 20 2 58.42 GTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGGAGTGTGCGCGAGATAACGGGAAAGCGCAATAAATGCGGCAAATGTGTTGCTTTGTGTGC:1 - chr3R 22825114 3' - accord 189 2 77.23 CTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATTGGCGTGCAAACATGGCTGGCTGCATCGCTCAAGTGCATTACTTACCATAAATTTCATCAACTCCACC:1 - chrX 17220400 3' + Stalker 202 4 73.27 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAA:1 + chrX 9439828 3' + roo 9031 1 67.33 ACNGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTCACGACAATTTATATCATAAAAATGTAACCCAATAACTTTAAACTTTTAACAAAAGTGTACTTTCTTATCGC:1 + chrX 13954823 3' - Juan 4029 1 68.00 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTCTCCGGCTGGAAAGTAAGCACTGTGGG:1 - chr2L 8297305 3' + Tirant 387 2 67.33 AGNGAGAAGAAAAACCTTAATTGAACTAACTTTCATGAAGTATTGTTCTTGTTAACAAAATATATACACAAAAGTCAAATAAAAACAATTCGAACTTGCGA:1 - chr2R 19725986 3' - Juan 4028 1 77.23 AANGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAAT:1 + chrX 8027462 3' - Juan 42 1 64.00 TAATAATAATAAATTTAGGTTCTCCTAATTGGGATTGGGATTTTGGGGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATTATTGTTGCGGCTGTGGCGGAT:1 - chrX 21562710 3' - I-element 247 1 85.15 AAAATTGTAAGTCTTTGAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATTATTGCTTCGTGCTAGAATGGAATAATTACAAATTACAAGCAGAAACCGAAC:1 - chr3R 27900397 3' - roo 22 2 53.47 ATAGTGCAAAACCAATGTATAGCCGTTACGCATCTTGTTATTTAGGGTCTTAGCTCTGTCAAATGCCTGCGCGACGTCTGGTTTACGTTTTCAAATGACCC:1 - chr2R 3503913 3' + 1360 3356 1 78.22 GATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGTCGATCGACGTATTCGCGCAGCTCCTCGATCTCCTCCTTCACCTGCTGCACGG:1 - chr3L 980094 3' - Gypsy6A_LTR 388 1 60.40 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGT:1 - chr3R 12554858 3' - mdg1 14 2 66.34 AAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACAAATGTAAGCAGACGCGGCGAAGAAATAAGAGCTCACATAGCGGAATGGGGGAAAATATAA:1 - chr3R 15516350 3' - G5A 2759 1 65.00 TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTTATTACTATTATCTTTATCTGGCGACTTGCGGGAGATGTTCTTGGAGGCGGAATGGGTTGG:1 + chr3L 11284017 3' - mdg1 7067 8 77.23 GCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTGTGGTAATTCCAGTAATCACATAAGCACACCTATAGAATGCTAGTTAGCAATTACCAGCTAACTCGA:1 - chr3L 566981 3' + rover 114 2 69.31 AANTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAGGTAAAAGCTTTGCGCCATTAAAAACGACTCACAT:1 - chr3R 9325582 3' + roo 405 1 75.25 TTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCGGCGCGTATGCTGCGCTTCCTCTT:1 + chr2R 7012592 3' - accord 399 2 76.24 CAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCC:1 - chr3R 19589905 3' - BS 5003 1 66.34 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGCGACAAGTTGACTGAAGGTT:1 + chrX 17699213 3' - P-element 53 1 28.71 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGCAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTT:1 + chr3R 10030780 3' - BS 5016 1 58.14 TGTAATAGGAAAATAATTAAGTCCGCTAATTGAAAATTTTTGAATCGCTCATCAAACACACTTCTCAACTCCCTTCAATTTAGTATGATAAATGATATCGC:1 + chrX 17495798 3' - Bari1 344 1 60.40 TTAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGGAAACGAAGGCAGATGTTTAAAGTGACGTACTTATATGAACATACAGTATGTATGTAT:1 - chr3L 21821413 3' - Tc3 316 1 62.38 GCNCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGGTAACTGAAG:1 - chrX 1600189 3' - BS 5030 1 63.00 GACGGCAGTGGTTGTGGGTTTTTTTTTTTGGAGTGCGGGGTGTGCAAAAAGAATTCAACTTAATTGAACAGAAC:1 - chrY 1076850 3' - accord2 7349 1 71.62 TCATAAAATAAACAACAATTTTACTATATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAATTAGTATAATTTTCCTCATTACCGCCATTGAATGTACTTATC:1 - chr2L 12283921 3' + 297 390 2 72.28 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCACAAACACACAGTTGTTGGAAAGAGACGGACAA:1 - chrX 2877279 3' - hopper 16 1 49.50 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAG:1 - chr3L 17971240 3' + P-element 2849 1 36.56 CTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAACGAACCTGCGAGCTGAATGAAGCACCTGTTGACTCCTTT:1 + chrX 16770839 3' + I-element 5070 1 61.39 AAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGAATATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGA:1 + chr3L 15099639 3' - G4 3812 1 36.63 AGCTGTCATTTTATTGTACTCTGATTTTTTATAAAATATATAGTTACAATTTATGGCATTTTACAATTTCGGATCAGCGGCAGTTGTTGCTTCTTTTCTGC:1 - chrX 11251978 3' - TART-B 10472 2 74.26 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTGTTTGGGTGTGTTTTGGTAGGTAATTTGGCTAATTCGAATATGTGATT:1 - chr2L 7558671 3' - FB 15 1 58.62 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGAAAGGGACTCGAGATTAGAGATGGGACTTCGAGTGGCTGCGATAGTATCG:1 + chr2R 8951099 3' + P-element 2883 2 75.00 GAGTCAATTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCGACTGCCGCTTGTTTGGGCTGCT:1 - chr2L 6184205 3' - roo 53 2 70.30 TGTCTATTACCTATAGACCTTGAAAAATATGAGCAGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGCCAGTAGCGCCAGTTACCAGTTACCAGTTACCAG:1 - chr3L 5087947 3' - hopper2 459 1 66.34 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTAAGAGATGGCATATATCACTGCTGCTGGTGGTAAGTG:1 - chr3L 4859316 3' - jockey 4792 1 54.46 ATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATACCGCGCAGCAACAAAAGGCCAACTCATTG:1 - chr3L 10111909 3' - F-element 4669 1 71.29 AGNGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACACGTCTTACTATTAGCTAACCAAGTAAACAACCAAATAAATGATTGAAATTT:1 + chr2L 5290521 3' - roo 8832 2 48.51 CTNGCCGATGCAGCTAACTATCGGTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGTGTTAGCTTCACGAAGGGCATACCTGTATTCACCTTTTCGTGGTTTGC:1 + chr3L 17503221 3' - pogo 25 1 54.46 TTATTCAGTAAATAAGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTGGCCAACTTCAATGCCTTTGCGGGGCATAATTATTACTTTAATTATGCTTAAT:1 - chr2R 8330646 3' - Tc1 225 1 62.38 TATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTACTTAAACCCTAGACCCGGTTGCACATAAATACAGGGTATCTTATGGTCTCATAACCCAACTAG:1 + chr2L 13615497 3' - accord2 7523 1 60.40 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGCACAATTACCAAGCGACCGAGCGTCGTCAATCCAAAGTCGGTATCTTGTA:1 + chr2L 20914030 3' + P-element 2862 1 54.46 CGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGCATATGCATATATATGCAGCTGCTGCATCGTTAGATGAAACAATAGAATTC:1 + chr3L 10382724 3' - I-element 4994 1 51.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATATTATTATATATAATATTGTACATACTATTAAATAAACGTTTGCTTTTTATATGGCCTTGGTCACA:1 + chrX 9437290 3' + roo 400 1 73.27 CCAAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGCACGAAGTTAAGAGGGCCAGCAAAG:1 - chr2L 17159607 3' + F-element 4472 1 75.25 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCTGTGGCCTTTCCCCATCCGAATGTGATTTTATTT:1 - chr3L 8331227 3' - roo 41 2 69.31 TTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATGAATGCCCGCTTACTCCTCTGTGTTAGATTCCTGAGTCTGTGTGTGCTTTTGTTTCTTCGCCGCCTT:1 + chrX 12176930 3' - F-element 333 1 68.32 TTNACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGATTTCCTTTG:1 - chr2L 19845875 3' - F-element 13 1 68.00 TTNAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACTACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTG:1 - chr3L 27415220 3' + transib2 2803 2 58.00 AGATTGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAACAATTGAGTTGAGGGCTTCCTCGGAAAGCCAACGAATTATTGTATAGAAA:1 + chr3L 3000668 3' - mariner2 283 1 53.16 CTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCACCCGAGCGTATGAGATTGTTTTCGATAAAGATTATGCACAA:1 + chr2L 16923764 3' + accord 7184 2 63.37 GTGCGGACGATCAGTCCAGTTAACTTAGTTAACTATTCCCGCCTCAATATTATTGCCAGCGGGTCCATTGGCCAGGCGCACACTGTACTTGCCGCTGGCCA:1 + chrX 14652424 3' - springer 13 2 59.41 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTG:1 + chr2R 5202352 3' + roo 360 2 69.31 TCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCGGCAACATTCGACATTATTTACACACAGGATCACTTCAACTTGGGCGGAAAGCAAAGCCGAATACC:1 - chrX 354540 3' + Bica 4812 1 70.30 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTTAAGAGCTCTAC:1 + chr3R 20878188 3' - Doc 37 1 57.43 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTACT:1 - chrX 17300372 3' - jockey 4709 1 63.64 GCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGTATGCTTGATTGCTGCGAATAGGAATTGATCTGGAAATGCAACTAGCATCTTACCAGC:1 - chr2R 16119911 3' - gypsy4 6448 1 68.42 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGGGGATAGATGCCTGCTGGTCTGTCAATTATGCACTTCCAT:1 - chr3R 20984179 3' - hopper 15 1 55.81 TTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACAAAGCCACTGCCCACGGAAACGATCCACATCATGACGTAGGGCAGCGAGGAGTAAAGACCGTTGGCCTTGAT:1 - chr2L 12032889 3' - accord2 25 2 79.21 TTCTTTTTTTGTTTTTTTTTTGCTCTTTTGACCAGTTTCGCAGTCGCAGAGTACGATTCAAAATCCGCTCGTCACTAAGGTTTTCCAGATCGACCACATCT:1 - chr3R 11933043 3' - G2 3077 6 60.40 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTTTGTG:1 + chr3R 24430582 3' + Transpac 271 2 65.66 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTTTGTGTAGAC:1 + chr3R 24430587 3' + Transpac 5193 2 61.39 CTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGCGCAGAAGTGCGAAAGGGAGAATC:1 + chrX 9439861 3' + roo 409 1 76.34 GGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAATCCTTTGTAACACTTGGCACTTCCTTCAACTCC:1 + chr3R 29481439 3' - G2 282 1 67.33 AGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATA:1 - chr3L 27356075 3' + Tc3 1687 1 63.37 GAAAAGAAAAACAAATGTAACAATTGATGGTCTACACACATTAATTAGCATTTTTAATCACCCGAACCGAAGGGCAGCAAGGTTAGCAGGTAATATGTACT:1 + chr2L 12500265 3' + invader2 4754 1 55.45 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTTTTCCATTTTTGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACT:1 + chr2L 12284020 3' - 297 6609 2 54.08 CTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACTTAAACAACGTACACAACTTAACTATCAACCAAGTCACACAGTTGCAGATAAATAAAAACAAATGGG:1 - chr2L 9413783 3' + Transpac 213 2 68.32 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGACCCACTTTTATGCATTGGACGGGGGCCAA:1 + chr3L 12230774 3' - jockey 57 1 72.28 ATTTAATTGTGTTTTTTTTTTTCGTGTTTGAAGGAGATGACCGTTTACGCATATTTCTATTTTCCACGGATACATTATTTTCAGCTATAATCTTCGTGGGT:1 - chr3L 14204110 3' - transib2 2643 1 78.22 GANAACTAACATGCCCAACAATGATAACCGAATTGCCATTTTGGCCGATGATTTAGACGATCTGCCAAATTCAAAGTATTTCAACGTTTTATACAAGGAGA:1 - chrX 5627182 3' + Fw2 112 1 64.36 CANACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATCGCTTTTTGGGACACGGGACCTC:1 + chrX 12813762 3' - BS 18 1 54.46 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATCATCATTAAAAAGCATCGTTGCAGGGCAGGCCTTTAAACT:1 - chr3L 963021 3' + jockey 4961 1 60.00 CGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAAAAAGAGAGAGCAGAACACAGGGATTAGCATTAATCGTAGCACTAAAAAAAA:1 + chrX 14591164 3' + F-element 463 1 57.43 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTCCT:1 + chr3R 31026122 3' - mdg1 7049 2 66.34 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGT:2 - chrX 8922350 3' - jockey 57 1 69.31 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAACATGTGTAAGTGATGTGGGGTTTGATACAACTAACTGAACAAACTAA:1 - chrX 18952024 3' + mdg1 414 2 78.22 TTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGCGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGTCAATTGTTGTTTGTGGTGATTTAT:1 + chr3R 7178134 3' + INE-1 90 1 69.31 CAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAAAGGGTTAAAAGTGGCTCCTGTTCGGGTCC:1 + chr3L 14257830 3' - 297 6806 2 75.25 TTNTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAGTGTAG:1 + chr3L 6900679 3' + pogo 2059 1 71.00 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATACTCTATAAGAAGAA:1 - chrX 4022290 3' - roo 8694 2 59.79 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTG:1 - chr3R 19450161 3' - roo 8694 2 74.26 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCATCCATCAACTCATGCGTACATATGAGATTTTAGGCTATTTTCCGGAAAATCCTCATCG:1 + chr3L 12352971 3' + Tirant 8490 2 63.37 ATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGAAGGTTCTATTGCGCCGCTTCCTTGCTCAACGATCAATTCCTGTTGACCGCATCGCATTGCGTCTAT:1 - chr2R 21800322 3' + R1A1-element 5000 1 71.29 TTNACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGGCTATAAGTATGTGTGTATGTATGTACTGTGGGTCGCCCAGGGGAGTTCCCCTT:1 - chrX 5649335 3' + S-element 1704 1 65.26 TTNTGTCTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGGGGGCGAGCGATCGGCAGGAATGTTGCAGATGCAGGAGAGCC:1 - chr3L 10712018 3' + Cr1a 206 1 54.26 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCGATACGAAGAAATACGTACGGCGCCACGCGTGTTGAGACTGACTGC:1 - chr3R 1027407 3' + jockey 4964 1 52.53 AAAATAAAAACCAAAAGTTAATATCTGTTATATATGTATCCTTGAGAGCTTTTCACTGTTACTGTTCAACAGAAAC:1 - chr2L 5106736 3' + P-element 2654 1 76.32 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTTTGTGTAGACCCCTTGCCAATTTCTGTCATT:1 + chr3R 24430608 3' + Transpac 295 2 65.35 AGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' - micropia 4982 2 58.42 GTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAACGGGGTCTACGGGGTCTACGGTTGGATCTCCGGGGGATACGGGGCAAGACACGGACAACGTAAAATTTATTA:1 + chr3R 11538550 3' + 412 489 2 71.72 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAACATGTGTAAGTGAT:1 - chrX 18952057 3' + mdg1 7419 2 64.36 TTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTTACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATGCATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATACAATTT:1 - chrX 13590500 3' - TAHRE 10442 1 81.19 GTNCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCGTTTTTTAAGAATTCCGCGTTTGGCGCGCTTTTTCGTATCCTTGATTTCTGGCTGTTCCTGGCTTCCCT:1 - chr3L 18852097 3' - 1360 3205 1 75.25 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGGTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGTGTTAGCTTCACGAAGGGCA:1 + chr3L 17503193 3' - pogo 53 1 76.24 CAACAATAATAATAATAATAATAATAATAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGAGAGAACAAGCTTAAAATTGTTGTGGCTGCCGTCAGTGTGTTC:1 + chr2L 19142347 3' + mdg1 33 11 70.00 GGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGGGAGAGGGGGGGATGTGAGGCGCCGTTCCGGATTTTAATAACAAGTG:1 - chrX 16193673 3' - Doc 4520 1 53.47 GATTCTGACAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGATATATGCCCAGATACTCAACAGAAACACAAAGGCCACTGTTCC:1 + chr3L 10126454 3' + F-element 4339 1 54.46 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAATTGCAGTACATATTTTTGG:1 + chr2L 5959718 3' - roo 30 2 61.62 AAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACAAAAAATGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAACTACGTGTACATCGAAAACCAATTTTTTATCACTATGC:1 + chr2R 6253063 3' - Cr1a 209 1 66.34 ATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGA:1 - chr3L 16973378 3' + S-element 165 2 49.50 TTTCTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGCAGACTGGTGTAAGCGCCTGTGTAAAATGTGGTTCACATTTATTGGTAGGAGGTATGGGTGTTATGGAACGGCT:1 + chr2L 3984407 3' - Doc2-element 245 5 87.13 TTGCACGCATCGTAACTTCTGCATTCCAAAGGCAAACTTTAAAGTCAATATAGTTTCAAGCTATCGCACCGAATATTGGTGTGAAGGTCACAGCATTTTCG:1 + chr3L 23785582 3' + Transib5 186 1 62.38 GAGGGGTGGTGAATTGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTCTTTCATGATTTGTTGGTACAATGACGTTCGACGACTAGGATGCATTTGTCCGCGAAGTC:1 - chr3R 3610686 3' - ZAM 7976 2 62.38 AGCGCCGTGGTACCTTCGAAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATGAAATTAAGGTCGAAAACAGAAAACAAAACACACAGCACAAGCGTTTGAGAAG:1 - chr3R 22236252 3' + Doc 4384 1 55.45 ATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAGAGCAAACAAAAAATTGTGGATCAACAATTGAAACATCGCGTTTTTATATGTACG:1 - chrX 8927130 3' - accord2 7294 1 60.40 GTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAAGTAGAAGAAGACGAAGTTTTAGGTCAGTAAAGCAGAATGCAAAACTAGTGTGGGAGAATG:1 - chr3L 19089018 3' + gypsy7 450 1 67.68 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTGTATTTTAATATT:2 - chrX 9437171 3' - roo 5 2 74.26 CANAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGACAAAAAGAAAACGGGCAAATGATTTACCAAGTCATCCACTAAAAAAAAGCG:1 - chr2L 22942682 3' - I-element 4999 1 56.44 CTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTC:1 + chr2L 17269834 3' + hopper 1371 1 66.34 AACTAACAGTCACTATTGCAACTGATATGAGTTTGTGTGGCCTGTAATTACAAACTTTTGCCTAAGCTCGTCCAGCTGCGACTGCAGCACGTTTTCGATCC:1 - 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chr3L 13878064 3' - flea 4803 2 73.27 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTGCA:1 - chr3R 28443703 3' - Burdock 34 2 76.00 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATAATTATTTAAAGCCATTTAAAAAATTGACA:1 + chrX 5521120 3' - 412 7089 2 67.03 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGTATAAACTTTAAGGTGGAAAAGTTTCGGCCAGGTGGGAAAAAGGACCAGGATCCAGT:1 - chr3L 1698541 3' + roo 9053 2 60.40 AGNAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTATAATTGATTTGTCGGCTCTATCGCCCGAGTAGAT:1 + chr3R 9127449 3' + invader3 262 2 63.37 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCATACATCACAGAAAACATGATTCAGCTATATATTTGTTATATATATTTTTTACTTC:1 - chr3L 12990572 3' - hobo 20 1 53.47 ATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTTTGATTAAAGCAAC:1 - chr2L 1912984 3' + pogo 2082 1 58.42 ATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGTGAACGTATTTACTTGTGTGTTTGTGTGTTTGTGAGTCGGCGATGAAGATACACTTTGAAATAA:1 + chr3R 8705822 3' - I-element 4918 1 70.30 TGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCTAATGAACTAATCATATACGATCAAAAGCATATGC:1 - chrX 21493328 3' - BS 4706 1 54.00 CCGTCAAAGCGAGCAAACATTTGTTGGAAGCTGGGTGGTGCAGGGCTTGCTGATAGAGGTGGCCGGTCTGGATTTGGTGGCTTGCTCTGCCTTTGCCTTTG:1 - chr2R 5893687 3' - G2 167 1 64.36 TAAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAACCGACACCGAGAC:1 + chr2R 5627653 3' + HB 319 1 80.20 TANTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGA:1 - chr3R 12554869 3' - mdg1 7063 2 55.45 TTTATGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAATATGGAAACCAGAATCTCTGGCGACTCACTTACTTTTCCCTAATGTGGAAGGTTTGAAGTAAC:1 - chrX 9618153 3' + Cr1a 396 1 58.42 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCATACCCACAACATCGCCCCAATATCCCCTCTGCATTTCCTCCCAGGAGGAATA:1 + chrX 18589121 3' + hopper 1398 1 43.16 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTACAACGACAATGTGGAAAACCTGTTACACTTTTGACCAA:1 - chr3L 10522007 3' + roo 400 1 68.32 TTNACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGATAAGGATGAAACAGAAACGCACAGGCGAAGAAGGATGAAAAAATAAAAATAAAA:1 + chrX 9747909 3' + transib2 2669 1 61.22 TCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAAAATTTTGGCACGCCCACTCTTAAACCTAAAACCACCCAAAACTACGACGCCCTCATTTTTGAAAAATTGT:1 + chr2R 1652240 3' + INE-1 302 1 73.27 AGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTTGATAAAATTCGTTTGGGTCGGCTC:1 + chr3L 22752006 3' + roo 401 1 71.28 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACATTTATTTTTATTCTGCTTATTCTG:1 - chrX 9437183 3' - roo 17 2 62.38 TGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGTAGATGACTCTGGGATATATCACAGATTTGATTAGTGTGAAAATTACTAAGGATA:1 - chr3L 9953721 3' + F-element 29 1 58.00 ATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTATTGCATATCCTTAAGGTAATCACATTCACAATATAATAAAACCATGTGCTGGCACGGAAACTGTGGCACTTT:1 + chr3R 29371436 3' - Quasimodo 39 2 73.27 AAGGAGCTTGGAATGCCATGGGTAGCAGAGAAAGTATTAGATTAAGAAGCTAAAATTGGTTTGAATTGCTTTAATCTCTTACTGCCCTTAGATGCTTGATC:1 - chr2L 2535036 3' + G-element 4039 1 63.37 CTNCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCCGTGTGGGAGAATGGTCCTTAATTATTAAATAA:1 - chr2L 8649226 3' - F-element 59 1 71.29 GCTTGGAAAAGCCTAACTAATTAGAATAAGCGGCAGGTAATGGCTCCGCCGACATATGCTATTATTCGGGTTATTACTTTATTTCAACGTATTATTCCCGT:1 - chr2R 15796888 3' + GATE 8337 2 70.30 GAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTCGAAAAATCATTCCATGTTATGAGTTACACGCCAACCAGCCTTCTGTCAGC:1 - chr3L 12572588 3' - Juan 4023 1 80.00 GCTAAAGCGAAATGCGTTCCTGGGCTGACTCAGCGTCGTCGATGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCAGTTGCGCTGAGAAGATGTCCGAGTTGACAGTGCTGAA:1 + chrX 6819602 3' - gypsy10 97 2 53.47 AGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGAT:1 + chr3L 23112566 3' + R2-element 3239 1 62.38 TTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGC:1 - chrX 4806670 3' + roo 9044 1 53.00 GTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACGCCGAGTGTACTTGGGTAGGGGGGACTGCCAAAAGACCGGAAAA:1 - chr3R 22879064 3' - G6 1988 2 78.22 TGNTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAACTTGGCAT:1 - chrX 19820024 3' - mdg1 7042 2 71.29 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTCCTA:1 + chr3R 31026123 3' - mdg1 7048 2 67.33 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCT:2 + chr3L 25401122 3' - transib2 51 1 77.23 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGGTTATTTGCCCCCATTTTATTGGTTGTCGCCATTCATGAAACGTTGAACATTTTTCATCGGCTC:1 + chr3R 29423592 3' - roo 8675 2 64.36 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACAATACACAGAATCGTTGAGGC:1 + chr3R 28288634 3' - 412 7108 2 83.17 GCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGAACTGAACTTAAGTAAATGCCTTGCAAGCAAAGCCCTCGTCATCATG:1 - chr3L 11406137 3' - invader2 4960 2 63.37 GTTTACTTCCGTTTTGACTTCCGCTTTTGTTTCATGAATGAATACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGAAGGCAAATATTTTTTACC:1 + chr3R 19445186 3' - Fw2 334 1 69.39 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAATTTGGCCTATGACAATACAAACGCACTTTCTTCGCTACGCATTGTCCAGGTGCGTGTGCGTATAGAG:1 - chr3R 7886092 3' - jockey 17 1 70.30 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGTGCATGATAGTTAATATGAGTATTAATCCAATTATTTTTCAGCCAAGGGA:1 - chr3L 12352877 3' - Tirant 8133 2 53.47 ATGGTTTTAATGTAATTTTTTTAAAATATTCTAATACTAATATTCATTAAAGTGGCATCGTTAAGCTTTCTTGTTTTGGCCAACTTTTCACAATTCATTTG:1 + chr3L 17206847 3' + transib4 26 1 79.21 CANGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAGTGG:1 + chr3L 22349292 3' - jockey 20 1 66.34 GCNCGAGCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATCAGCTGTAACGATTTTCTTC:1 + chr2L 20435610 3' - Burdock 51 2 70.10 ATTCGTAGCTTGAAAGAAGCACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAGTTTTTATTATCCTGTTATAAAACTAATCCGATAGCTACATCTGATGCGT:1 - chrY 3572594 3' - Doc 35 1 48.51 AGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAGCAAAAATCAGAACAACAACCAGAACACCATCCAAAGCAG:1 - chrX 18607162 3' + I-element 372 1 68.32 GCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCTACACAATCGTAAATGCAAATGTTTTACCTATGAACTGAGAACTTGAGAAGTGATTCATT:1 + chr3R 18505515 3' + F-element 4459 1 66.34 CCTCGCGAATCAATGCTTCACGGCGTTCTTTGGAAACTTTTCTGGCATTTTCTTTATTACTTGGGGCCCCTTGGATTAATACATCACCGAGTTTGAGTGCT:1 - chr3L 1283841 3' + Rt1c 5323 1 66.34 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGAGCGAGAGCTTTTTGAGGCTAAGCCCACTGGGTATAAGAGTTCGTATATAT:1 + chr2L 11764957 3' - roo 24 2 52.48 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTACGAGAGAGAGTGAAAGATCGTGTTTTTGTAGAGCCAA:1 + chr2R 21497540 3' + P-element 2884 2 64.62 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTCCCCCGGCCAAAAGTGTTGAAGGCAGTTGGCAACGCAAAACGCCAACGAGAAGGAGCCCATGAGCCCA:1 - chrX 4448510 3' + 412 7541 2 73.27 CCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTTTTGGTTTACAACTCGACTTATGAACTCTGTGCCACCTTT:1 + chr3L 25401165 3' - transib2 8 1 71.29 CTCACAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTCCCACTCTGAACTCTTCCGCAACTGCAGCAACTATAGCAACAACAACTACAGACTTTCCTGGCCAACAAAC:1 - chrX 18814728 3' + Porto1 487 1 80.41 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACAACGA:1 + chrX 4448615 3' - 412 23 2 57.43 AATATTAACTATTAGTTAATATACATCGCTATAGAAATCTGAGAGTTTTAATCTTTAAATTATATCAGTTTATCCTTTCCTA:1 + chrX 6939799 3' + Tc3 265 1 28.05 TACCTACCAGTACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTGCACCTTATGCAACAACAACTGCAATCAATTCGAGCTTATAAAGGCGATACAATTTCCTGGGC:1 + chr2L 22942603 3' + Doc3-element 483 1 60.40 CATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTCTAATCTCAAAATTGCTTTCAAAAGACCATG:1 + chrX 21214391 3' - F-element 173 1 71.29 TTTACGATGCTGTTTATTTTGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGTCCGACAAAGAGCTATGTCGTACTTCTGCGACTTGCCCTTCTTGTACTTGGGATGCGG:1 + chrX 1709651 3' - diver2 298 2 58.42 CCGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTAACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGCTCATATTGATAATCTTGCCCTCGAACGACCAGAGTATATGCTCCGC:1 - chrX 3130956 3' + Quasimodo 204 2 53.47 AATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGAAAAAAAAAACAAAAACCCCACACACGCCACCCCAAATGTTTAACATTTAGCTTCAGCCAGGCATCGT:1 + chr3R 16649855 3' + F-element 4307 1 64.36 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTCTAATTAGTTAATTGCTGTTTTTTAGGATT:1 - chr3R 26140720 3' - 412 8 2 71.29 AANATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTGTCACGTGCCACAGGCGGCAAATTAAACAAGGCGCAACATGGGAAGCAAAAGTTTAACAATGCAGAAAAT:1 + chr3R 30904303 3' - roo 8669 2 74.26 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTA:1 + chr3R 8191522 3' + mdg1 372 2 76.00 GAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCCTTTGGCTTTAATTGC:1 + chr3L 6013719 3' - Max-element 8275 2 63.37 CTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAATTGCCACGCCCCCCGTTGTGGAAGGAGGGCAACAGCACGCTTGTGTGCACACCCACCGTTTTCGGTTTGGGAAGA:1 - chrX 8300809 3' + Idefix 204 2 81.00 TTTTAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCATCGCTTACCAGACGCCTCCCCACTCCACCGCCAAGGATGTTTGCAACGTGCTGCCAGTG:1 + chr3R 8484080 3' + FB 194 1 68.32 CTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACGTTTTAATTAGATTTTAATTTAAAAAAAAATAGTCGATTAGACACAGATACATT:1 - chr3R 9192509 3' - invader3 5211 2 52.48 AATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGAATAGGAATAGGAATACGAATAGGAATAGGATGGAGCCTGGCTACATGTAGTTTTT:1 - chr2R 13782354 3' + invader2 4671 1 48.51 CGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGCCGGTGGAGGAGGAGGATGCACTTGGCCTAATGAAGTTCTGGGCTCGGTGGATAGGGTTGGGGAAACCATAA:1 - chr3L 19439637 3' - accord 258 2 67.33 GAACAACCTCTGCAGCTGCGTGAGGTCCGATCGGGTTGTCAAGAATAGTGTGTTAGAGGGAGATGAAAAATATGTTTTGACTATAGTGATGAGATATGACG:1 + chr3L 22760268 3' + invader4 108 2 68.32 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGCATTCTCGGAATAATTGTTCATAAAGGCTGGGAAATTATCGAGGAATCATCTTCGTGCGTT:1 - chr3L 19467903 3' - INE-1 557 1 61.39 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTA:1 - chrX 17300383 3' - jockey 4718 1 76.29 CATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATTGGCTGTGATGCTGGAATTGTAATCGTTTTAAATCTATATAGGGTTAGGAT:1 + chr3R 22096395 3' + 17.6 7047 2 49.50 TTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGCGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGGCAATTGTTGTTTGTGGTGATTTAT:1 + chr3R 7178134 3' + INE-1 90 1 69.31 TANATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGATGCTTTGGGATGGATTGCTTCGCAGAAGAAT:1 - chr2R 19149411 3' + diver 178 2 68.32 CCAAATTCATCTTCACGTGCACTAAGAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACTCTCAACTCTCTCGCTCACAAGTGACGCGATGCAATCTGCGTACCT:1 - chr2L 19192090 3' + Porto1 418 1 72.28 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAAAAAAATCACTTGTATTACCTATATTAATGATAACTGAAAACTAAAGGTATACGAGCTGCTATTAAG:1 - chrX 19052955 3' - roo 9 2 58.42 AAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCACTAATAACCGTTTCACTGCCAAATTGGTGTGAAATGCCTTTTTGTG:1 + chr2L 752486 3' + Ivk 321 1 59.41 GAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTATTCTC:1 + chrX 19820788 3' + Rt1b 4978 1 79.21 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAATTGCAGAACATATTTTTGGGTATATTTTTTGTCAAATCC:1 + chr2L 5959738 3' - roo 8671 2 72.92 GCCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAGTGGGGGGCCGGCACACGATGGCAATGGATCTTAATAAAAGGAAGGCAAAAGCT:1 + chrX 16141231 3' + G-element 4325 4 89.16 AATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - HeT-A 6 1 79.21 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCGTTTTTATGACAGCGCA:1 + chr2L 18214160 3' - hopper 5 2 74.26 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTTAACTGTATCTAGCTATTTATTTTGTGACTCGAGTTGGCAGTACTGTTTAGTTGGTATAATTTAGCG:1 - chr3L 16673552 3' + 1360 3379 2 70.30 TTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGACAGGAGTGTGGAAAGTGCAAAAACTAAGCAGCAAATCGTGTGTGAAATTAACCGGCTTGCCGCAGCCAG:1 - chrX 6918960 3' + accord 380 2 75.25 TATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGGTTGCCACGCCCTCTCTAATGCCTACAAACTGCACAAAACTGCCACGCCCACTCT:1 + chr3L 19271028 3' + INE-1 85 1 64.71 CTNGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTAGCCC:1 - chr3R 6611196 3' + HMS-Beagle 224 2 57.43 TTNAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTCACGACAATTTATATCATAAAAATGTAAC:1 + chrX 13954780 3' - Juan 4073 1 67.33 CCCGTATGTTGGCGGCGCAAGAACTCTACGACTGTACGCTCAGTTGGCCGTAAAAAGGCGCTGCTGAGTGAGCTGCTTATTATTGGATTTGGCCTGGCCGG:1 + chr3R 5877858 3' + Rt1a 4792 1 65.35 TGNAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGTGTTGAAAAAAGTGGGGGGTTCGTATCATATCGATAGTGAAGTTGACC:1 + chr3L 4343136 3' + accord 171 2 68.32 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATTACATTAGATATTGTGATACTAAGATATTTTATTAGATGAAACAGCACTCGAAGATTA:1 - chr2L 1590744 3' + opus 483 2 62.38 CCGATTTGCGGTGAGACGTAAGAAAACCAATAAGCATAGTGTGCACATTAAATTGACAATTCGAACTGTCCGCCATTAAGTTTTGATAAACCCATTGCTTT:1 - chr3R 18947166 3' - Doc 298 1 77.23 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAGGTAAAAGCTTTGCG:1 - chr3R 9325602 3' + roo 385 2 55.45 ATTAGGCCTCAAACTGAACTCTTATAATTACTATGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGTTTTCCAGCTTTTCTTGTTTGACTTTCTTTTGTTTTTGGAAAA:1 + chr3R 10041066 3' - Idefix 473 2 72.28 GTNATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAGACTGCCAACAACTACATAAGCAAGCATTCCAGCGCCAGCCGTAACCGCTCCTCCGGAGCCAACAGC:1 + chrX 6284642 3' + Stalker4 81 4 67.33 AAAAAAAAGAAAAAATAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAAATCGACAGAACAAACAAAACAAAAAAGCGAATGGCAAATGGCAAATACCGAGCTCTCTTG:1 + chr2L 2096270 3' + gypsy7 5008 1 70.71 GCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTAGAGGGGGACTCGGGAAAGGGA:1 + chr2R 5856360 3' - Porto1 389 1 82.29 AAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAAACAAGCCCCGAGAATTTCATCATTT:1 - chr2L 14226764 3' - hopper 145 103 82.46 GCAATTTCGCTGCACAAATGAACACGTGTGCATAACATTAATTCTATTTTTTTCAAGAACTGAGATACTTTGGATAGTTCAAAATTTTGTAAGTCCATTGC:1 - chr3L 23784721 3' - Transib5 168 1 58.42 GTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGT:1 + chr3L 19339447 3' - Tc1 8 1 75.25 TTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTTACAAATTGATTTCGCTTGTGCCAAAAATACTAGGTGACAATAGCACCA:1 - chr2L 3739938 3' + hopper 956 1 57.43 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTCACCTGGCCAAATCACAAAGGTTTCTTTCGAA:1 - chr2R 18649412 3' - opus 40 4 67.00 ACGACCNTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGCTCGCTCTCTTTACAAGTGTCCGCTACGCTTAAGCTC:1 + chrX 13640736 3' + P-element 2884 2 74.26 ATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTTAGGT:1 - chr2R 912934 3' + mdg1 7450 2 69.70 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGGAGC:1 + chr2R 5262643 3' - 1360 39 1 65.35 TAATCTCCATAAACAGTGTCTTAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCAGACAGTTTTAGTTAACTACTCCTAAAAAAATATCAGAGGACAATTATCT:1 + chrX 21636147 3' + gypsy 7366 2 56.44 GAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGAAGTGCGTGAGAAAGGCAAGAGAAGGAGAAAGGCAAACGAGAAGAGAAAGAGGGAGCCGCATGAAAACG:1 - chr3R 20791282 3' + Bica 19 1 68.32 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGGATACGCTTTGGTTGCCTCGCCTGCCCCCTGAGGAAAAACCTAACTTTAGGGGGG:1 - chr2L 12322966 3' - hobo 20 1 60.40 TCGTAGCTCCGACTTGATATTTACGGCAGTTTTTTTTACAATTTCAACCATTTTCGGCCATAAGCGCCAAATGAAATATCCCACTGTGGAGAGCCATCAAA:1 + chr3L 11188166 3' - Chouto 186 1 60.40 TGTGTGAGTAAAAACAAGAGACTAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTAAGTATTTTTATGATTATTTTTTGTTACTCTGCTCCTCTGTTTTGCTCGTGAAA:1 + chr2R 10604035 3' - 1360 3243 1 63.37 CGAATCAGTTAACTTCCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTCAGCCCCAAGCCATCACTGATGATCGCCTGTCCACAATTTTTGTTGGCTGGTTCGCTGCAA:1 + chr3R 17883130 3' + invader6 4864 2 80.20 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTAAGTATCTTTGCAACAGTTGCCAATCAATGGGCATAAGTATCCTT:1 - chrX 5912904 3' + flea 227 2 53.47 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTTGACCCACAAAATGGACGAA:1 + chr3R 24739064 3' + pogo 2051 1 76.24 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTT:1 + chr3L 25401126 3' + transib2 2777 1 71.29 GCGTGGAGAGGGTAGTTGCACTTCCAGTAGTGTGTCATAATTCGCGGCGAGATCTGGATGAACGTCAACAAGCGCACCAAAATACGC:1 + chr3R 10886065 3' - baggins 83 1 59.77 CTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAGTCATAATTAAC:1 + chrX 21452839 3' + INE-1 562 1 45.54 TCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGCCGTTTACGTTTATTGCCATTGGAAGTCGCGGCTGT:1 + chr2L 15737666 3' - F-element 4608 1 64.36 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCA:2 - chrX 21564692 3' + diver 6059 2 80.20 CACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGAGCACTTGACGAGATTCATGGAAAACCTTTTTGTGGTCCCCTTAA:1 - chr3R 19560326 3' + hobo 75 1 56.44 AGAGTTCTGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCAGTTCGAAGTAGTTCTCAGTAGTAGTTCTCAGTTCCTTGCTGTTTTGGGCGCTGGTGCTGTCTATAT:1 + chr2R 6511533 3' + Cr1a 4074 1 71.29 CANCAGAAGCGACAGAGTTCACTTTCTGCAATGTCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAGTGCCCCGTGTCGAATGGAAAGGTTCTTCGTCTAAG:1 + chr2L 21374882 3' - baggins 5195 1 66.34 CATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAGCTTCTTTTATCGATTGGTTGATGGTGTACTTAA:1 + chr3R 4600486 3' + Tabor 442 2 71.29 CGAATAATTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTCTTCATAACGCTCACGTTCGTATTTGGTGAATCCCCACTTCTTTGAAACATAGATCTA:1 + chr3L 23093860 3' - Doc3-element 4535 1 61.39 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACAATACACAGAATCGTTGAGGCCACGCATTTTGACTTCG:1 + chr3R 28288651 3' - 412 7091 2 66.34 TACAGCTCCGCTTAGCTCTTTATAATAAAACATTAAAAGCAACTCCAAGGAAAAGCCGAGTTAACCACACATCAGGCCAATATATTCAGTGTAGAGCCTAC:1 + chr2L 6218259 3' + gypsy2 224 2 62.38 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTATAATTAAGAAAATGAAATATT:1 - chr2L 9488158 3' + 297 6931 2 85.00 TACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTT:1 - chrX 4806674 3' + roo 9049 2 52.75 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTAGAAGGCTTATATGGCTTATATAAAATGTTATCCTTTCTTTTAATTTTATGCATATTT:1 + chr3L 17448055 3' + hobo 2920 1 54.46 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGCACCCATCTTTGTGGACTATCCGGGAATTCAGCATTTGCTAAGACAGCAACAGGAA:1 + chrX 7768995 3' + hobo 2920 1 61.39 AATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAG:1 + chr3L 5662690 3' - jockey 373 1 58.42 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAGACACAATATAACCAAGTCCTGTTT:1 + chrX 2172277 3' - I-element 52 1 76.24 CGTATAACCTTGAACCTATTATTCCTATACTAACCTACATAGTATTCTCGCCCGCTAACCACACGGCAAAGATGTTGAGCTAATCGTCCTCCTAACTAAAT:1 + chr2R 5799055 3' + Stalker3T 350 1 50.50 AAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCACCAAGTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGTGATTGTTGGATTGGAAACTTCTGAACCCATT:1 - chr3L 23008199 3' - Tc1 1340 1 69.31 CCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGGGGAACACATTAATTTACATAACCACAAACTTCCGAACTTCATATAGAGTGG:1 + chr2L 11043541 3' + gtwin 432 2 62.38 GCTTGGATCGTGGTTATGGTGTTGGTAACATCTGCGTGCGTTGTGTCTTGCGAGCCTTATGCCTCCTTAAAAGGGCTGCGGTGCTACGTTGGTCT:1 + chr2R 5725978 3' - jockey2 279 1 63.16 ACTATCAGATACCCGTCACTTAACTAGTTTGAATGCGAACGAGAAAGTTTATTATTTCCTGATATTGATAATAAGCTGGAATGTATGAAAGTCCAATTAGA:1 + chr2R 1726979 3' - INE-1 548 1 60.40 ACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAAATGGAAACTATGCTGCCGCAACCTGTAGATTTGGCTCGCCCAAGTCAGAGGTTTTGGTATTCAGTTTAAAT:1 + chr2L 22005908 3' + mariner2 861 1 69.00 TGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATGACTCTCGTCAAGTTTCAGCCGCATGAAACGATAACAAATTATTA:1 - chrX 13429449 3' + BS 5069 1 51.49 GCCTATGTACGCTCAATATGAAATGAAGTATGCATATATCTCGAATGACTTTGACTTCACAAGTGGCTTTGGCTTACGGGGATGTTTG:1 - chr2L 4172739 3' + Quasimodo 7194 2 77.27 GCNCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTG:1 + chrX 21667950 3' - gypsy2 11 2 75.25 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGTAGGGTTCTATAAAATAGAGGGTGGTACGTGATTGAATTTTTCACGAAATA:1 + chr2R 16908807 3' - diver 5915 2 49.50 AAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCGCTTACTATTTTTGAAATGGATCTCGCTATTGCAATTGAATATGGCTTTTTAGTAGGGCATTGTAT:1 - chr3R 19676831 3' + 1360 3140 1 71.29 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTCGAAAAATCATTCCATGTTATGAGTTACACGCCAACCAGCCTTC:1 - chr3L 12572595 3' - Juan 4031 1 72.28 TTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGGAGAGGGAACCCCGTGACAGGCAAT:1 - chr2L 16954833 3' + Quasimodo 7326 2 72.28 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACTGGAGACTTTTTTCAACCGAAAACCACATTTGTTTTGAAACGAATGCAGCCGGTCGCCGGAGCA:1 + chr2L 8297418 3' - Tirant 11 2 66.34 TTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCT:1 + chr3L 19339419 3' - Tc1 36 1 55.45 TACACACACACACACACAAATTTGCATACATAAGGAAACAAATGGACTCGCAGCACAATTTGAATGCCAAATCATTCAAGTTGATCACATATATAGAAATT:1 + chr2L 936684 3' + accord 184 2 51.49 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTT:2 + chr2L 18214130 3' + hopper 1380 1 60.40 AGAAAAGTAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTT:1 - chr3R 178121 3' - BS 38 1 63.27 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTA:2 + chrX 10119634 3' - FB 27 1 53.47 CTCTCATGCTCTTCCTCTTGACAGATAAAAATATTCGTTTGCAGGAAATGTTTAAAAAATGTCTTTATTCAGTGCAGAAATCTTTTAGTTGGCTATTACAA:1 + chr2L 17118114 3' - Bica 2 1 77.23 CTCCTGTTCTAGAACTGTCCTCTTCCGAAGGTATTAATTTGCTTCCTCCAATTTTGTATACTAGCTCCTTTTTTATTGCCTTTAATGAGCCAGTTCAATTT:1 + chr2L 9452817 3' + Gypsy12A_LTR 2029 1 69.31 ATCATGTTGCCTTCTGTTGTGTGTTGCCATTGTGGGTTGGCGTGCCCAGAAGGCCAGGAAATACACGAGACGATTTTACGAGCATATTCAGACTGGTTA:1 + chr3R 25584843 3' + gypsy2 6356 1 78.79 CGAGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTTATGGGGCTGGGAAAAATAAATATAAATTGCCTGCTGGCTGTCGATTTGATTTCATAA:1 - chr2R 16444521 3' - 1360 3178 1 62.38 ATNCAGTTATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGT:1 + chr3R 14688314 3' - pogo 35 1 56.44 CGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCTAATTTATATGTTAATGTGGAGTTTCCATCTGAGGCATACAGACAAAGGCCCGAAGA:1 + chr2R 7851636 3' + Stalker 422 1 74.26 GGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGGGCGTCCTCTTTGCCACAGGTAAACGGGGCACCACTG:1 - chr3L 18476472 3' + accord 497 2 66.34 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAATACGCTTAATTCCATGAAGGGTTTAGCCAAAGGCATAGAA:1 + chr3L 18938937 3' - blood 36 2 57.43 ACCCATTACTCAGCTAGTGGGAATGCAAATACGAAATAACATAATTATTTATTTGTAGCACATGGGAAATGGGACAGCTCAAAAAAATTTAAGATATATGG:1 + chr2L 21924915 3' - INE-1 538 1 57.43 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGCTCGAGCTGAACTATTTATACTATAACTTTGGCCA:1 + chr3L 11920103 3' + Tabor 7288 2 61.22 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAACAACTTATAGATAATACAAAGAA:1 - chr3R 27539182 3' - Burdock 6186 2 76.24 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGCAATCAAAAGAAGTCAATAACAACGAGGGATTCTTTTGGTTTTGTTATTTTTAAG:1 - chr3L 11156204 3' - 297 6593 2 64.36 TTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATAGCTCGGTACTTACTTCCTTGTGCCGCAACATTT:1 - chr3R 7761255 3' - flea 40 2 66.34 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTT:1 - chr2R 5485082 3' - 1360 46 1 73.00 CAAAAAAAAACAAAAAAAAACTCAAAATATAGTGTTGTACTTACACCTCATGCGCTGAATTTATGCTCACCAATAAAACAAAACGAGTACAGAAAATACAT:1 - chrX 8966238 3' + HMS-Beagle2 489 1 68.32 CGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTAATGAACGAGATTCGGCTTAATTGTCCCGATGCACATGACAATCGACACTAATGCCAGGCTGCCTTATT:1 + chr2L 11504172 3' - I-element 5282 1 74.26 TGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTTTTTCAGCTCGTAGGCACATTTGGCCTGCAGAAAGC:1 + chr3L 7248302 3' - I-element 4947 1 64.62 TTATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCTAAAGCACTCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTAAGGCCACCGCGGCAGATTCGAACTG:1 - chr3R 18100037 3' - frogger 71 2 77.08 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATAATACGTTAATGTTGCGAAAACCAATTGTTT:1 + chr2L 1590819 3' - opus 157 4 71.29 ACNGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATTATTTGATGCCATTTACAAA:1 + chrX 4175156 3' - I-element 318 1 67.33 TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCGTACTACAATAATAGACGTTATTGAATTAAAAAATTAACATTTAAAAAATGTATATTCTGCACAAAGAC:1 + chr2R 5178683 3' - mdg3 5271 2 59.41 GAAAATTATCTTAATATCTCTCTATTTGTAAAATTAGTTATACATTCTCAGCTACGATCACGATCATACTATTCATTCTTGATGGATTGTACATAGATCAA:1 + chr2L 22108223 3' - Transib-N1_DM 56 1 76.24 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTAATACAATGGAAGAAATATTTAAACAACATTTTCGATGTAGCCTTGTAATCAAATCAGGGGAATATGGT:1 - chr2L 14365368 3' - blood 7017 2 71.00 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTCTCCGGCTGGAAAGTAAG:1 - chr2L 8297314 3' + Tirant 378 2 58.42 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCACTAGTGCAGCTCCCACAAACACGTAA:1 + chr3R 20984230 3' - hopper 8 2 58.62 TCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGAACCTCGGTAGCCGGTTTGTTTCAATTCGAAAACGTTCTCTTTAAACTGGCTGACTCAAAACAATGTCAA:1 + chr3R 19495234 3' + Doc 4366 1 78.35 ATNCAAGATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATTGTCGAAGCCAGTGGAAATATTTTTATCTGTCACCGTTTAA:1 - chr2R 8464593 3' + Idefix 74 2 52.48 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCT:1 - chrX 8922353 3' - jockey 60 1 72.28 TTTTTTCTTTCTTTTTTTTTGAACCAATTGTACCGATTTGCCGACGCGAGATATTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATAAGTTTAATATCGC:1 + chrX 23362226 3' - gypsy7 5005 2 49.49 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGAAGACGCAATAAA:1 - chr3R 14626000 3' - P-element 20 1 59.41 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGTCTATCTGTATCTGTATTATTGTATCTGTTACCGCTCCGAATGCCCGGCAGT:1 - chr2R 13899124 3' - roo 19 2 60.40 GTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCGTTGGGCATGGAAAGGGGAAGGGGAAGAAGCCTAGGCCTCGGTTGTCATACGACTTGACTTGGAA:1 - chr3L 10375665 3' - Quasimodo 312 2 68.42 GAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATTCCATCCGCTCTCGCCTCGTCGTCCTCTTCGTTCTGGCGACTTTTCACTCTCTCCCTGCCACTTTCCGCGTTTGGTG:1 + chr3L 20598782 3' + Gypsy6A_LTR 280 1 79.21 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCCCGAAAATGGATATCCAGTTTTTATATTTATTTTCTTGGGATATCCTTGAAAG:1 + chr3L 5067893 3' - Quasimodo 13 2 59.60 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAA:1 + chr3R 19446234 3' + 297 6954 2 58.42 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGTGTCGCGTCTGGCATTATTCGTCGCATGCCCCATGCTCGGTTTCC:1 + chr3L 10258950 3' - I-element 73 1 55.45 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCG:1 + chr3L 22046493 3' + roo 9036 1 57.43 CTNTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACTTGATTTTGAAAAGCACATTGATTGTTGGTATATTAGCAGAGTTTTCCAATCTT:1 - chr2L 5902384 3' - 1360 90 1 57.43 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCCTAGTACTACCTACAACATGCGAAATGCAATTTTAAAGCATACTTTGGGGGCAA:1 - chrX 10644805 3' + hobo 2933 1 69.41 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTAAGTATCCTGCGTCGTGCCAC:1 + chrX 20331896 3' - mdg1 7056 2 62.38 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACACATTCGTGCGACAAGGTTCTCAGGAATAAGCTGTTAAGGAAG:1 + chr2R 544867 3' + HMS-Beagle2 7159 4 58.42 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACATAAAGGCGGCAATCCAGAAAT:1 + chr2L 21612960 3' + 297 348 2 78.22 CGTCCGTCTTGGGAGAATTTTGATCGGAGATTATGTACGTCCACAAGTGTTTGCTGCTTGAACTTGTCGAAAGGGGGCTGGTGGTGGCGGTTTAAGCCAAA:1 + chr2L 7750873 3' - ZAM 8337 2 59.41 CTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACAGGACG:1 - chrX 4806657 3' + roo 394 1 64.00 AANTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTTTACGTTTGCA:1 - chr2L 9410799 3' + roo 9037 1 57.43 TTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGATTTCCTTTGG:1 - chr2L 19845874 3' - F-element 13 1 68.32 GATCAACTCCGAAATAAATTAAACACTGTATTCTATATCATTTTCAGTATTAAGTTTTGGGTTTAGCTCAATATATACTTTTTATGGCGCCATCGAGGGCT:1 + chr3R 11272208 3' - McClintock 6313 2 61.39 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTCGCGTTCATTCTCGTGCTCATCGTCGTCGCTGCTGGCCGCACACATCCTCGC:1 - chrX 18356179 3' + P-element 2868 1 60.40 TTNTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAATCATAAGAAACCCCCATTTCGAA:1 - chr3L 12089684 3' + P-element 168 1 18.81 CAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTTTGTGTAGACCCCTTGCCAATTT:1 + chr3R 24430600 3' + Transpac 5206 2 57.43 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACGGTTTCTAAGCGAACATAAGACGACAACCATAACAATAAACTGTACATAGCAG:1 + chr2R 12751274 3' - Quasimodo 13 2 65.35 CCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGCATCCATCGATTATCGCCAGCTCCTTTCGCAAATTGATCAATTAGATCT:1 + chr2R 19149467 3' - diver 5918 2 50.50 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTC:1 - chr3L 10557591 3' + 412 445 2 71.29 GTTGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGAGAGAGGTGTGTCCCTGTAAGATTATTGAGGTATTACAATGTTGAATGTACACATTTGGAAAAGGTCT:1 + chr3L 18353641 3' - accord 207 2 72.28 GTGTGAATGCGGACCATGCACTTATACTTTGTGGACTTCGAGATGACCGCCTCCTTCTGGCGTCACAATATCTGCTACGATCCAAGTATCGAGAAGCACCA:1 - chr3L 10558508 3' - 412 188 2 71.29 GAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACATGCTACTTTGGAGAAGTTACCGATCCAGGAGCTTGGCTTATAAGGCTA:1 + chrX 23452665 3' + R1A1-element 4917 1 54.46 CANACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACATGTGCCCGATTAGCATGAATGACAGAGCGAGATGG:1 + chrX 9579386 3' + Tirant 8469 2 62.38 TTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATGCAGCGAGCACACTTGACTCATCACACACCCACATGCGGAACGCACCTGCTCGAACTCCTGCT:1 - chr3R 22487376 3' + F-element 4283 1 59.41 GTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAATAAATGGTAATTCGTATAAGTAGGTAAGGATTATGCATAATCAT:1 - chr2L 19057577 3' + invader2 4831 1 56.44 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTTTGACCCACAAAATGGACGAAC:1 + chr3R 24739065 3' + pogo 2053 1 75.00 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATTTTTGGATCCTAGTGATAACGGGTTCCATATATTTTCTAATATTTCTCC:1 - chr3R 12375142 3' + pogo 2082 1 60.82 TTNGTGTTCATGTGTGAACATCGCCTTAAATAGAGTTCTAGCCAAATAACCAGATTGTACTTCCACCTCGGATATCGCACGTTAAAATTACACTTTCCAGT:1 - chrX 5925514 3' - roo 8663 1 78.22 CTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCAATGTTTTTGGCCCAAAAATACAACCGCTTTTCGATTTATCACAGACAACATAGCAGCCACGCCCATCGGCA:1 - chr3R 10273544 3' + I-element 218 1 74.26 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTGTTTGATGTTATTCTTGAGCCATA:1 + chr2L 18223822 3' - roo 8714 2 82.18 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTCTCTCAGTGCTCTCGCGGACAA:1 + chr3R 28117796 3' + I-element 5305 1 78.22 TGTTGTAGTTTTTAGTACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCACGAAAGACCGGTAACGGCGGAAA:1 + chr3R 28063643 3' - Doc 58 1 77.23 ATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCT:1 + chr3R 1977624 3' + micropia 428 2 50.50 AATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGATCCACTAATATAAATTCCTATGAATATGCACGTTTTCTTAATTTTCAAATTATATCGTTGCATGCTT:1 - chr2R 9788908 3' + blood 7383 2 68.32 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCGAAACCAAAAATTATGCTAGACAGCTTTC:1 + chrX 6731845 3' - hobo 48 1 74.26 CGCTGGAAGCTTGGCTTCCAACAGAGTCCTCAAGGGGCTCCACATCTTCAAGTTCTTCGTCCTCCTGGTGATCTCCCTCGCTCTCTAAAGTCTTCTCCTCC:1 + chrX 17450240 3' - diver2 4502 1 68.32 GTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGGTTTTGTGGCTTTGCGTACCACACGGCGTATGCGCGTCGTCTATTTGTTATG:1 - chr3L 12916681 3' - HMS-Beagle 6863 2 58.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTATTTCTATTTAGACGTAAGCCAATAGCATCTATAAATAGTAATTATGCCCTCATACATGTAGACATAAAT:1 + chr3L 13988978 3' + hopper 1411 2 72.28 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGATGTCAGCAACGCTCGTTCGCCCGCCC:1 - chr3R 11538440 3' - 412 17 2 62.38 GGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCAATGTATCTCCCGAAAATTCATTTACTGCATCGGTTGGCATACGCAATAATAAATCCATATTTTGCACAGC:1 - chr2L 18300678 3' - accord 4 2 74.26 GAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTAGTTTGGCTTGTAGGAGGGCTGAGTCTATGAATTTGTCTTTTTACTATTACTTGCCCTCGCTCGTGTGGACTT:1 - chr2R 3640288 3' - I-element 5088 1 58.59 AGGCCGTTAGCATTCCAAAGAACTGTTTTTATGACTTTTGCTTTCCTTTTGCTTGGCGTTTTCTTGCGTTGCGGCCCTTGAGAAAATTACATTTTTCACCC:1 + chr2L 17161477 3' - G2 283 2 73.27 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGTGCATGATAGTTAATATGAGTATTAA:1 - chr3L 12352901 3' - Tirant 8156 2 73.00 TCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCTGGTCAAACAAAAGTCATTAAATTGCGGAAATCGGGTCACCAAACCGACA:1 - chr2L 21039368 3' + Quasimodo 276 2 60.22 CTTTTCCTTTTGGTTATGGCGGCAGCTTGTCAATTTGCACAAAAATTACACGAATAACGGTGATGTCTTTGAAGTGCCATTTCCCGACACAACAACACAAG:1 - chr3L 16474033 3' - TAHRE 272 1 55.45 TGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCT:1 + chr3R 6611299 3' - HMS-Beagle 9 2 70.30 TCNTCTTATTGGGGATTTTACAAAGTGTGAAGCGAATTTCAAAGTTACAAAACTCGGTTTACAAAGTTGAATGAATGAATGAGATACGAAAACAAACACAA:1 - chr3L 18816085 3' + roo 408 1 78.22 ATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTAAGTATCTTTGCAACAGTTGC:1 - chrX 5912928 3' + flea 4965 2 76.53 AAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAACAGTTAGCCGACCCAAACTTAAAAAAAAAGAGGCGAAAACCCGAGAAACGAAGAAAAAAGG:1 - chr2R 21879374 3' + G6 2021 1 41.30 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACTGGAGACTTTTTTCAACCGAAAACCACATTTGTTTTGAAACGAATGCAGCCGGTCGCCGGAGCAGAGTAAGC:1 + chr2L 8297426 3' - Tirant 8110 2 74.26 GTTGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGTGTTGAGTGTGTATTTGCGAGTGTGTGCGCTTTGGCCAATGGTTTATGGGTTCCTGTTTTTGGC:1 - chrX 7832822 3' - Porto1 496 1 51.49 TGNTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAA:1 + chr3L 18337687 3' - Juan 4077 1 75.25 CTNTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTTCCCCTGAGTTGAGTTATCGCTTTTCCACCTGCC:1 - chrX 17931307 3' - micropia 389 2 65.00 GGCGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACACTGCCAAAATGCACAAAAGGAGATGGAAACTCTAGACTCG:1 + chrX 5227397 3' - 1360 211 1 57.45 ATACATAAGTACACGCGGATGTTTTTTTACTGAGGGGAGGGCCTCAGGGGATTAATGCAAAATCAAATTTGGTCCAAAAACCGTGAGGATAGCACTT:1 - chr3L 6478271 3' - Q-element 558 2 53.61 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTAAGCACCTAAAATTTCGCTTTCACTTCT:1 - chrX 364780 3' - hopper 40 1 65.26 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGAGCGAGAGCTTTTTGAGGCTAAGCCCACTGGG:1 + chr2L 11764938 3' - roo 43 2 69.31 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGA:1 - chr3L 9076582 3' + mdg1 373 2 70.30 TGNTATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 426 2 53.47 TTATTATTATTATTGTTGTTGTTGCTGTTATTGTTGTTACTATTGCTGTTGTTATCATATCGTGGTACATGACGAGTGTTGTTGCCATTATTATAGTTCTG:1 - chr3R 15141276 3' - mdg1 29 3 64.36 AAAAACTACCCTAATATGTACAATTTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCGCTGACATCATTAGGCTCATGCACAAACACACACATATACA:1 + chr2R 15620586 3' + 1360 3138 1 59.41 ATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATATAAAAAAGAAATTGCTGGAAAAAGA:1 - chr3R 2914289 3' + Circe 7082 1 65.35 TCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTA:1 + chr3L 26007754 3' + G5 4762 1 52.08 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATTTTTGGATCCTAGTGATAACGGGTTCCATATATTTTCTAATATTTCTCCGCTAAATAGACAG:1 - chr3R 12375129 3' + pogo 2095 1 74.23 TGAGGAACACAACCCTGCACAAAGATCTCAAACTAGCCACTGTCTTCGAGACAATAAATAAACACATCAACACAAAAGGCAAAAGTTTTACAGCCTGCCG:1 - chrX 7366459 3' + BS3 1413 1 60.00 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGTGTTGGAGACTTCAAATGATTTATCGCCCGATAGTTGAGTT:1 + chr2L 2685803 3' + hopper 1382 1 59.41 CAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATATAATTATCTCATTCTTCGCTATGCCAAAAACTATGCTACGCATTCTTGCTGTCCCATAGGTGGCGCGTTG:1 + chr2R 23601911 3' + jockey 4989 1 69.31 GTNCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGG:1 - chr3R 29357058 3' - 412 7098 2 65.35 ACAATTTAAATTATTTTAAAAAAAATTGTA:1 + chr2L 7714838 3' - HeT-A 5807 1 83.33 CACAATTAAACACTGATAATAAAAACAAACAAATAGATATACTATCTAAATATCTTACATTTTTTTTTAAACTAACTGAAAGCTAGTTTAACATTTTTCAT:1 - chr3L 10596592 3' + invader3 5037 1 47.52 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGAGCTCGCTCTCTTTACAAG:1 + chrX 13640716 3' + P-element 2864 1 52.48 TANTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCC:1 + chr3R 22341217 3' + hopper 1383 1 55.45 AAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGATATCATCATTGGTTGGAGCTTTACCCACTTCTCTCATAAAAGCAACCAATCTCCT:1 + chr3L 17172742 3' + roo 390 2 57.43 CCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGG:1 + chr3L 24566085 3' + gypsy8 4863 2 77.00 TATTAATTACTAAGACCATCTACCTTAAAATTGTTTGTTAATCACTATTATTAATTTCAAAATTCCCGAACCAAAAAACCAAATGGCCAGCGAACAAAA:1 - chrX 6126069 3' + Burdock 419 1 53.54 AANATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATG:1 - chr2L 13250383 3' - pogo 49 1 77.23 AAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGAT:1 - chr2L 19845883 3' - F-element 22 1 59.41 GTTTATAAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCAAGCCCATTTCATTTCGGACCAAATTGTTGGCAACATTTTTTAACTTTTATTGTTGCTGTCACT:1 + chr3L 9297322 3' - ZAM 8155 2 71.29 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATAGCATTTAATTAACATGCTGGGCGATT:1 - chr3R 31026051 3' + mdg1 7412 2 77.32 ACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTCTAGTTGTCTAGTGTTTTTTTGTTCTCATAAAGCAAGACAATCGGTCAAAATAAAATATTAACAACATTGAAAA:1 - chr3L 14396956 3' - BS 5000 1 65.35 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGAC:1 - chr2L 17269783 3' - hopper 38 1 62.38 GANAGGGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCAAATTACATTATTGGTATTTTGAACTTTCAATAA:1 + chr3L 15044397 3' - accord 7059 2 59.41 AACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCCCAAGTTCCCTGGCCAGAATACCCACGAACTCACCATCCACATAA:1 - chr3R 12002760 3' + Quasimodo 187 2 63.37 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTAATTTTCCCCGACGTGTAGAAAACTAGTTGTGGCAT:1 + chr3L 7629632 3' - opus 7151 4 65.35 TTACTCTGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCAGGCGACGATGACATTGAAAGGGAAATTACATTTCATGTTTATTGTCTTAATAAAAATAAT:1 - chr2L 8092990 3' + Bica 4808 1 63.00 ATGAAGATCAACCTGAGAATTCAGAGGATGGGAGCGGCTCATCAGTAAAGTGACTTCCACAAGAGTTAAATACCAAAAAAGGGGATTACGTTGAAGAGACA:1 + chr2L 14493195 3' + Bica 147 1 78.22 GANTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTTCCACAACCAGCTTTCTTTCATGTTGATTTATGT:1 - chr2L 12398107 3' + roo 400 1 70.30 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTAACGGACGTTGCTTAATTTATGAGTTTGAAATGATTATGTACAGTGATTTTTTCGAGTGAAAACTTTTA:1 + chr3L 2392469 3' - Transpac 6 2 68.32 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAAGAGAGCACGTCGACTGATTGCCATTGTTGAGGTCAGTTGAGTGCGC:1 - chr3R 24739004 3' - pogo 26 1 53.47 TAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCATTTCCATCTCTGCCTGTCATCGCAGGCGGTTGGACGAC:1 + chr2R 8826134 3' + F-element 4438 1 62.38 GCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCACTCACAGCACAACCACAGAAACGGCCAAAGCCACATTATCCACATCCATAGCGTATTTGCCTAAG:1 - chrX 23452198 3' + Quasimodo 197 2 69.31 CTNTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGTATATGG:1 - chrX 14040714 3' + roo 8604 1 55.45 TAAATAAATTATAAATTACAATTACTTTTGTTGGAATGTTATAGCCGCCGTCGAATTCTAAATTATATTTTATTAAGGCTGCATTTCGAATACAAAACGGG:2 - chr2R 8518580 3' + copia 5121 1 74.26 CCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTCCAATTATAATTTCAACAAACAATAAATCGAAAAGAAAACTTAAATGCCAAGTGGAGCGTGTTT:1 + chr3L 4685885 3' + I-element 172 1 64.36 TCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACAGCACAAAAAATTAGTTTTACGCCCATATTTTTGAATAACAGCTATT:1 - chr3L 23232759 3' + 1360 91 1 59.41 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATT:1 + chr2L 17205255 3' - hopper 28 1 54.46 GTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGTGTGACAACGCCAGCGACAAGAGTCGCAGGGTAAGGTGCCGCCTGCGGTCTTCACATAGGCATGCG:1 + chr3R 24467337 3' - blood 242 2 68.32 AAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTAT:1 + chrX 1018146 3' - 1360 207 1 63.37 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCACCGAAAAACATTCCCAAAACTAATTAAAATT:1 + chr3L 6013751 3' - Max-element 8243 2 71.29 CGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTACACATGC:1 - chr2R 18723028 3' - opus 7024 2 56.44 GAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCTATGCTAAAGTAGGACCTCATGTTAATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGA:1 + chr3R 19446219 3' + invader2 134 2 72.28 AGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCAGCCTCTTTCATAGTTTTTCTTTTCCCAAACTCCTTCTGCTTCTTTGAGACACTTTCACTTGCCACACAA:1 - chrX 18942236 3' - 297 475 1 66.34 CTNTACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTCCCACTCTCTCTTGCTCCCTTTCCCATGCAGATTCTTATCAGA:1 + chrX 12632116 3' + Porto1 455 1 68.32 TGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATA:1 + chr3R 19446217 3' + 297 356 2 66.34 TTNGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTAAGTAAGTATGCTGAAGAAATTGATTACTTTAAAAATTTCGTAAAAATGTGCAAAACCATTAACTTTG:1 + chr2L 9488257 3' - 297 2 2 44.55 AGTCGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGGTTGAGCATCGACTCGGCTTAATAAGAATATATTTTATCGGATGAATTGTAACAGGTATAATAAACG:1 - chr2L 21236194 3' + INE-1 144 1 63.37 TTGAACAGATTTATTTATTTATTTGTTATGATTTAATGAAAGAGTTTTTATTTCATTTTTCCTATGATGCAGAAAAAGAATGAATTTGATTCTTAAATTGG:1 + chr2L 16187118 3' - G3 349 1 73.27 TGNTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAGAAGGGTCGTTTTCGGTGCGATTG:1 + chr2L 10168264 3' + micropia 5203 1 75.25 ACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCATTAAGTATATATCTCATTCGTGAAAATTTCTAAGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATATTAATCCAG:1 - chr3R 20005368 3' + GATE 450 1 57.00 AATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATGAGCCCCAATTGGGATGTCCTGAAAATTTATGGTGGCCTGAT:1 + chrX 8787442 3' + TAHRE 10388 1 56.44 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGTGAGGTCTGGGTTGTTTAGGGAAATT:1 + chr3L 7061214 3' - I-element 25 1 48.51 TATGTACATAGATTTGACTATTTCTAGTCAATAGTATAGTATATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAAT:1 - chr3R 4571525 3' - 1360 342 1 60.00 CCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTACATCTCGAAATCATGTGGAGTCTTCAGCATGTAGCTCACATTTTCGATGGTGTGATCTGA:1 + chr3R 25315841 3' - Doc 4566 1 53.47 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACATAAAGGCGGCAATCCAGAAATAATGCGGGATTCGTTACCATTTA:1 + chr2L 21612983 3' + 297 6952 2 55.45 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTTTTTCGGCAAGTTTTTCA:1 + chr3L 23821883 3' - HMS-Beagle2 5 2 74.26 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAACAAGTCGAAGTTCTGACTGGCATGGCTGGGTTTTATTTTGTTTGTT:1 + chr3R 12115351 3' + 1360 3367 1 52.63 TTNTAACACAGATAAATATGTGTTAGTGCCTTTTCGCTATTATATGATGGTTGGGCTTGGGCTCACAGCACTCACACAGAGACACAAAGGTTAATGCTCT:1 - chr3L 17989411 3' - Porto1 117 1 62.00 TGTTGTTGCGTTTCGTGTTTTTCACTTTAAATAGCTGCTGCACAGGCGCCCGCCCGGCCGTCAGTTTGTGCAGCCATTTCGACTTCGCATTTGGTTGCCAC:1 - chr2R 5691205 3' - TART-C 182 2 54.46 GGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATAAGTACACACCCACACGCTCACCACGCTCTTTTATATCCCCATCCACAATGTCTGCACAGGAG:1 + chr2R 19214713 3' + 412 195 2 63.00 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTCATTTGTTTATTTATACAGTTAAATCGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 18938878 3' + blood 7351 2 63.37 GAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACAGCTACACAGTCATACACACATTGCCACAAGTACACTGGAAATGTAAATGTATGCCTTGCTCGTATCCTA:1 - chr3R 24001799 3' - micropia 4986 2 75.25 ANTTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTG:1 - chr3R 13225499 3' - hobo 32 1 56.00 ACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAA:1 + chr3L 5662671 3' - jockey 363 1 68.06 TTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGGCTTTCTGCAGCTCCTTTGTGAAGCTGTGCAAATACATCATAAATAAATAACTGGCTCGGCTATACA:1 + chr2L 16581605 3' - Stalker3T 322 1 75.25 AATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTCCA:1 + chr3R 15502554 3' + Ivk 5349 1 56.44 TGNGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAGGATCGTGGTCCTCATTATGCATG:1 - chr2L 19602833 3' - hobo 22 1 57.43 CGCACGCGTTTATCTGTAAGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGGGGAAAGCTTTTCGGCTCGATCAGCAACTAGCCA:1 - chr3L 4577839 3' + diver2 118 2 72.28 AGTATGAGATTAGTCTACTTCACAGTTTTGGCCACAAGCCCACCCATTCACTCAAATATTCCAGGCGCCTGCACTGCGAGAAAAACATTTGCTTCAGAAAA:1 + chr3R 9204566 3' - diver2 4560 2 76.24 TTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGCGGTCTGGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTC:1 - chr3L 25411053 3' + Doc 338 1 58.42 CTTCGATAAGTTGTTCGTATTAAATCCCTGAATCACAATATTTAAAGATGCCTCAGCTTTCACCTTTCGCCACGTGACAGCGTTCTTCCGTCTCGTTTCTT:1 + chrX 3273226 3' - Dm88 290 1 52.48 CANGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTATTCTTTGTTTCAATGAGGTTTGCTTTGGTTAGTTTTAGTGGTAGT:1 + chr2R 4739056 3' - P-element 467 1 52.48 GAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACAATACTAACTCACAGCCACACACGTGCTGCCAAAGCAAGCAAAATAAAAGCGTTA:1 - chr2L 5342383 3' + accord 6995 2 63.37 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCCCTAAACAGATCGCTAAACATCATGGAATG:2 + chrX 19820127 3' + mdg1 7446 2 50.00 AGATCGCGCTCTTCCACCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAACATTGGCTATTGAGTAAGTTTGTTGATCTGAAATTTTTTGATTCACAATACAGCACGT:1 - chr3L 23452008 3' - Porto1 336 1 65.35 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAATA:1 - chr2R 18344563 3' + 1360 3348 1 68.32 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATCGATAAAAGGGGCAAGCAGGTAGTGTAGTTGGAAAAAGGCCTGAAAATTCTGGAAA:1 + chr3R 23886856 3' + S-element 1711 2 70.11 TTATAATAATTATTTTTTGTATTTAGGTGATGAGCATCTTTGTAAAAAGCTATTTACATTTGAAAAACTCAGTTATTTCTCAGACTGTACTGCACGCTGGA:1 + chr3L 14978439 3' - HeT-A 5894 1 63.37 TGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGATTGCGAACTCGAAATTTAATCATTTTACTTGAGTTTGTGTTTTCGTTAGTG:1 + chrX 16838099 3' - INE-1 568 1 96.04 CCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAGAGCCGGCTGCACACACAATATGTTTCCAATGTAGCACATTTAATATTAACTTTTCGAATTTATTTTT:1 - chrX 12348294 3' + Doc 4504 1 58.42 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCTTGGCGCCACCCCCACAAAAGTACAACGAAAATAAATATAAAAATTTATATTTGTT:1 - chr3R 26434674 3' + Tabor 7303 2 57.43 TAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTTGCAATTTTAA:1 - chr2R 5410945 3' + Tc1 1419 1 66.67 TGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTTCCCTTTCCGAGAGCATGACCTTCGACTCCTGTAGCCTGAACGAGATCTCCGAGTTGCCCACAACCCC:1 - chr3R 23116612 3' - F-element 272 1 71.29 CTTGCACTGTGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTGGTAATTTCTGAAAGGGTCTTTTTTCTTAGCTTTGTTGGAATACACTGAGAGAAACTCGCACAG:1 - chr2L 9224856 3' - Ivk 302 1 71.29 GTTGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGCTCCAGCCATGTGCTTGTTGGAGGACATCGCCGCTGCAAATT:1 - chr2L 11134514 3' - G-element 4244 1 58.42 GAAATAAATTGATGGAAGGAATTCGGTTCTAGCTCGTTGGCATTGAGTGTGTTGGTTTACATCGTCTTATTTCCCTCGTTCCCAGTGTTTAGTGTTTA:1 - chr2R 12008877 3' - Gypsy12A_LTR 2246 1 60.20 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACA:1 - chr2L 6645660 3' + mdg1 7416 2 66.00 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTG:1 + chr3L 9909742 3' - Transpac 57 2 77.23 TGAATTATTTTTTTAATATTTTTTTTTATATAAATATGCAGTGGTCCGACATTTAACTTTCTTTAGGCACTGGCTCTCGAATCCAGAGAAGCACATTCAGA:1 + chr2L 9623638 3' + Tc1 1394 1 91.09 AANATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCC:1 + chrX 4022338 3' + roo 9021 2 76.24 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAA:1 - chrX 19820032 3' - mdg1 7050 2 63.37 TGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTTATAGGTTCAAGCACATATCCTTACAGATACACGTATTTGGTAACTGTCTGAAGAGCGGAAATGCAGTGAATCCCCTT:1 + chr3R 15153190 3' - gypsy11 451 3 71.29 GGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGATGCCTCTCGACGTGCAATTTATGCATTTCGTGTTTACAGTTTTATGATTATGTTTTGCCTAACACC:1 - chr3R 14487405 3' - F-element 457 1 70.30 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATGCGTGTTCATGTGTGAACATACATTTTAAGAATGGTACACTAT:1 - chr3R 20419071 3' - roo 8699 2 76.25 CGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAACCCTTTGGAAAACTACACACACAACTGACAATGAATATCAAAT:1 - chr2R 21950196 3' + hobo 483 1 57.43 TCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTGAGTGCTGGGTATCTCATAGTCGCGACTCTTGACTAAAGTGATCTTTACTCCTAAACATCTTCCTATA:1 - chr3R 4640619 3' - X-element 4421 1 70.30 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATCTAAATATATTGGGACATTTTATGAAGAGTACGGTGACCTTATTTAA:1 - chr3L 18511057 3' - Ivk 29 1 55.45 TCTATCGATCTCCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCGTTGGCTTTGACATCTCTTGTTTCTCAACGCATGTATGAACGCGCAGACAGTGAATAAGGAGTA:1 - chr2R 5188898 3' + INE-1 501 1 62.63 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTC:1 + chr3R 1977622 3' + micropia 5411 2 52.48 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTGAAACCTTATAAATAGGATCTCCGAAAGAAGAAGCTATA:1 - 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Q-element 254 2 59.41 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGTCTATTCTTCGGTAACTCTTC:1 + chrX 364842 3' + hopper 1390 1 54.46 AATAATAATAAACAATCTTACATAGTATATATCTCCCAAAATTCCCAAATTTCTTAAATATATATTTTTTTGACTATAGAGTATTATTCCACTAATCCAAG:1 + chr3R 25510424 3' + flea 254 2 34.65 TGTGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTCAATAGGTACAGTGGTTGTTAGCTCTGAACATTTTATGCATTCGGTTGATGTATATCC:1 - chrX 16011083 3' - I-element 5145 1 62.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGAAGACGCAATAAACTGTAAAGCGA:1 - chr3R 14625989 3' + P-element 2878 2 70.30 CGCGGGTACTTACAAACACACACTATAAATCAACACTACTCTCACATATGAATTTCTCATGTGTGGTAACCCCTAAATCAAGTCCATTATTGCTTGTCACT:1 + chr3L 22759328 3' + hobo 84 1 81.19 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCCCGCCCCCAAACTACAATTCAACATTA:1 + chr3L 9064342 3' - jockey 56 1 69.39 AGAAGTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCCCAACCTAAAAGCCCTTACCACGCGACCACTCGCCAATGCCATTAATCATCTGTGCAAATGGTACA:1 - chr2L 21691529 3' + 1360 3182 1 68.00 CTAAAGTAAAGTAAAGTAACATTACTTCGTATGATCTGAGTTTAATACCTTGAACCACTTTCACTGCGATTGATCACTGTGTTCTTTAAGGGTTCAACTTA:1 - 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chr3R 460070 3' - F-element 86 1 77.23 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCTCGTGTTGCTCTGGGTCGTTTTGTATTGCTGG:1 - chr3L 17971207 3' + P-element 2874 1 66.34 GCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTGTTCCATTCGTCCATATTGCTATTTTTGTCAACTTGTGCGGTCATACCTTTGGT:1 - chr3L 20207265 3' - Porto1 4308 1 72.28 CTGAGCCTTAGACGTCGGGGAGTTCTTCGACACATATTTTTTAATGTCCCCACAGATTTTCAAGTGGGACTCGTGCGTGGGCGTGGCACTCATTAATAGAC:1 - chrX 17000616 3' - HB 1203 1 65.35 CGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACGAAAACCACAGCTGAAGACTGAGCGTG:1 - chr2R 15883764 3' + F-element 485 1 79.00 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAA:1 - chr2R 4673573 3' + Quasimodo 7345 2 58.16 AGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCAATCTTGTTTTAGCGAAGCTCCACTGTACATAGTAGCAGAA:1 - chr3L 10683916 3' + 297 211 2 60.40 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAGACACAATATAACCAAGTCCTGTTTTTCTAGTTTCAAAACGATTGGAAGTGCTGGTTTCATAACTAACTAAAT:1 + chrX 2172325 3' - I-element 4 1 75.25 CAACAACGGGTCAGACGCCGACATCCAGAAGCACCAAGCCCAGCATGTACATAGCCAAATGCCCTCCCAAATCAAGCACGACGTCATGTACCATCATCACT:1 - chrX 15371544 3' + ZAM 8076 2 80.20 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTTTTGGTTTACAACTCGACTTATGAACTC:1 + chr3L 25401153 3' - transib2 20 1 59.41 AGNAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTG:1 + chr2L 18214141 3' + hopper 1391 1 55.45 GCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGATATCGTACTTGGAAAGGCCAAGCACAGCCTCCAAACAAAAGTAGAAAAGAAAATGTTTCCAATTAAATAGTTCT:1 + chr2L 12187589 3' + frogger 19 2 66.34 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCATCCATCAACTCATGCGTACATATGAGATTTTAGGCTATTTTCCGGAAAATCCTCATC:1 + chr3L 12352970 3' + Tirant 382 2 62.38 CCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGACGAAAGGCAATCTGGTTGTCACTC:1 + chr2R 5851245 3' + F-element 4450 1 81.00 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATGCCGTCAATTAGGCACCTTGGCATCTATATTTGGCTATAAATCAAACATAAATACTTTGC:2 + chr2R 12726878 3' + copia 242 1 63.37 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAAATTAAATTGGCGTGAATTGTGTTTTATATAATATATATAATGAAGCAAAATTAAATAGATTTTGCTGA:1 - chrX 13954719 3' + Juan 4204 1 57.43 GTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACACGGGTTGACACTCGCCGGCATCAAAGTTCATGGTTGTCCTGGGCGGCTGGGTTG:1 + chr2R 13386910 3' - copia 5059 2 63.37 GTTTTAAATTTGCGGGAGACATTTTTGAATTACATTGCGGCAGTTTTGCGCGCCATTGTTCAAATATTATGTTACTTTACGTTACTTTACTTTACTTTAAT:1 + chrX 20787038 3' - TART-A 13247 1 62.38 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAA:1 - chr3L 13652789 3' - hobo 36 1 57.43 AAGTTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGCCACGTCTCTGGTGTCTGTG:1 + chr2L 1089599 3' - hopper 55 1 76.24 GCTGCAGTAACTACCAGCATGGTTGCCTCTCTCACAACCGCAATCGCATCAAACAACAGCACAACAGCAAATGACAGCAGCAACACAGAGACAACATTCAC:1 - chr3L 15947324 3' + Doc4-element 265 1 59.41 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGCTTTTCATCATCTCGCACTACGGACAGCGCTGATCGTGGACACGATT:1 + chr2L 21863424 3' + Burdock 6366 2 54.46 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACT:1 - chrX 4806694 3' + roo 9019 2 74.26 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGAGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCGGGCTA:1 - chr2L 17205162 3' + hopper 1413 2 70.65 CCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCGGAGGCTAATGAAGACCGCCTCAGGATGCAACGCCGCCGCCG:1 - chr2L 16342869 3' - HMS-Beagle2 203 2 56.70 GAGGATCATATAACAATCTTATTGTTATCTGATATCTGTTGTTAAAATCTCTCGTTAACTGAGTATTTATTGTGGCCATTCCAAGTCTACAGATTGTGCCC:1 - chr2R 577116 3' - Idefix 6937 2 65.35 TAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTAGCGGAGTGAGTGGAAAATGGGCGCGATTGGGGGGGCCGGCGACTATAAATAT:1 + chr2R 16915199 3' - McClintock 6213 2 69.88 TTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGTAGGGTTCTATAAAATAGAGGG:1 + chr2R 16908778 3' - diver 5944 2 78.22 AANAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTA:1 - chr3R 13225473 3' - hobo 7 1 72.28 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGGTCGAGCAAGTTCAACTCC:1 + chr3R 9322900 3' + 412 7529 2 61.39 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTT:1 - chr3L 13652796 3' - hobo 43 1 64.36 TCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTTGCAGTTGCAA:1 + chr3L 1259248 3' - Doc 10 1 67.37 CAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTT:1 - chr2L 12398140 3' + roo 367 1 73.27 TATTTGTTTAGACATGATAAGTAGTAAAAAGAGCAAGATGGTGTAATCCAGCGACTTCATTCCATAAGTACGGAGATGAGCATTGCCTCGCAGATCTGTG:1 - chr3R 3610620 3' + rooA 7244 2 67.00 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATTAACCCCAAACTAAAGTTTTCTAAAGACATCCATTCAATTCGAAAGATTGTACCAGCATAAGTCGCTT:1 - chr2R 11363942 3' - transib2 3 1 73.74 TGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTAATGGCTTTGATCTTGAATCGTTATTAATCAATTAAGATTAATGCAAATGTCAGGCTTCAA:1 + chr2L 4885832 3' - F-element 4458 1 68.32 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATACAACATGTAAGGGGCAGGCGACTAAAGCCAGGCATTCCAACTACTGGCGGATGCCAATTCCC:1 - chrX 678749 3' + Tirant 389 2 69.31 CGGAGCTGTGCTCCAGAAAAAGCAAAACATTCTTGTGTCTTCACCATTGAAATAATTCTGGCGGTCACTACCGAATCCAATTAGAACGACATTGCAGC:1 + chr2R 1340146 3' + gypsy11 407 2 38.78 CACTTGTTTTTTTTTTTATCTTGTTCAAAGACCACAATATTTAAGGAGACCAGAGTGTTTTGAATGGATTGGACATTCAAAACACTCTGGTCTCCTTAAAT:1 + chr3R 26080641 3' - Porto1 166 1 39.60 CTTGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAGTTTTAAAGAGTAATAGGTATAGATGTAGTAGATGTAATAGATTTAGTTGTTAATTTAAAAGGAGAGAAT:1 + chr3L 27411781 3' - Stalker 410 1 73.27 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCCCTAAACAGATCGCTAAACATCATGGAATGCT:1 + chrX 19820129 3' + mdg1 409 2 51.49 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTTTTCTTGTTTTTCATTTGCTCGCCAAATTTTAGCAACGTTGCTGGT:1 - chr2R 8950984 3' + P-element 2877 2 67.33 TTNAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAATTTGAAAGGCACACACACCCACAT:1 - chr2R 17938857 3' + copia 243 1 67.33 CTNGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGC:1 + chrX 4175124 3' - I-element 350 1 73.27 CAGAAAATTAGTTATACTCTACGAAACACAGGGACACTGAAACAACAATCGAAGAAAATGACAGAAAGCCAAGAGGTTGAAGCAATATTGATGAATTATAC:1 - chr3L 14195848 3' - transib2 406 1 67.33 CGCTCCTACCCGCGACCAGACTCGTCATCGCAGAAGAAGCCCCGCTTGTACGGCTCGCCC:1 + chr2R 9404406 3' - invader1 3729 2 70.00 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCCAGCTTGATGGCATTCTTAATCCGAAGATTG:1 + chrX 6814331 3' + roo 9025 2 68.32 TANCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTCAGCACGTCATGTGCGGGTGGCTGTACACTCCGATGGGTTTTAGGTT:1 + chr3R 13732168 3' + Stalker3T 186 1 77.23 CGCGCTCAATTCTTGATCTTATCCACTAACAGTTTGATTATATATGATTTGGTGGTATATATCTTGATTTATTTAGATTACTTCATTTTTTCATTTCACTT:1 - chr2R 9124338 3' + Gypsy12A_LTR 2116 1 70.30 TATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:2 - chr2L 20360645 3' + R1A1-element 142 1 69.31 AATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTTTTTCGCAATTTTTTATATTTTCATTTTTCATTTGGTGTGCTTGGGATTTGCCAAAGAAGCGCAATTTATTCG:1 + chr2L 16628753 3' + 17.6 7198 2 71.29 TTTTTGATTTCAATATTGTATAAAAGTTCTTCTCGTTTTGTCGACTTTTTCTTTGGACTTTAAAGTTTTGCATGTGCCATAAAACACCTGCTCCCCCGCCT:1 - chrX 9420955 3' + hopper 193 1 82.18 GGTAAATTAATTAAAAGAAGTCTACTGGAAACGTCGGGCGCCAAGAAACCCGAAGGACACGGAAGGACGATCACTACAAGCGAGTAGAGATCCCG:1 + chr2R 4876652 3' - Cr1a 3984 1 73.68 TTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACA:1 - chr2R 20411879 3' + Quasimodo 7331 2 67.33 TAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTGTTACGAGGCTCGACGCAAATTAAAGTAAAAGTCCAACTTGAATGATCTCAAGTTTGAGGGCCTT:1 - chr3L 14208981 3' + Quasimodo 7360 2 71.29 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTAC:1 - chr2R 18723034 3' - opus 7143 4 58.42 GCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGATGAAGGCAAACATAATAAACACAAAAAAATCGACATTAATTATGCAATAAA:1 - chr2R 21462001 3' + Bica 45 1 56.44 CACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCTCACCGTACTTACTTGTGATACTAACTACGGCATGCTGTGCACTGTAATCTCCTAAGGCAAAAGCGATCTC:1 - chr4 1070763 3' - 1360 46 1 70.30 CCATACAAATATTTTAATATAAATCTTCAAAAACTCATTAATGCTTAATGTACTTAAAAAACATCGTATTTTTCTCAGTGTGCATTAAGAACCATCACAAA:1 + chr3R 8969118 3' - Transib-N1_DM 294 1 61.39 TTNTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACATATCATATTGCAATGCGACGGGGTAATAAGATAACTTTAAAGATTAAAATTCGGGGAACTCA:1 - chr2L 3272628 3' - Tirant 8422 2 53.47 TTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTGCTGTAGTGTTTTGTTTCTGTTGCTGTAGTGATCTTCCCTTTTAAGGCATATAACCAGAGAATTAGT:1 - chr2L 15504070 3' - Porto1 4420 1 72.28 TTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCGAGATGCATTTATTCAAGT:1 - chr2L 260974 3' - Juan 4047 1 61.39 ACCGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTATGTGTCGGAAATGGTAATTCATCAAA:1 + chr3R 4825802 3' + 1360 138 1 73.27 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTAGTAAGTACAAG:1 - chr3L 4091573 3' + flea 221 2 64.36 GCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTGATATAGAGAAACTATAACTATTGGTGTTGTGAAATTAGTGAATTCTGGGTGTGAAATGTATTATA:1 + chr3R 12514942 3' + opus 7500 2 75.51 AAAAAAAAAGAGGAAAAAAAAATGATATATACGTAAGTGCACAAAGCTCCCGACGGATTCTCGTCAC:1 - chr3L 3584438 3' + Doc2-element 251 4 85.07 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCACCCGACGTCCTCACCACTTTTGTTGTACCACCATCAGAGATCCATTGAATTCAGATCGTTTTTGAGTTCCTGCGAT:1 - chr3L 13876524 3' - flea 43 2 75.25 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATC:2 - chr3R 7382627 3' + copia 241 1 70.30 GTNTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATGTATGTGTATAGAGCCGGACAACGCGGCGTATGAGTGTCATCGCTGTAGTCCTGGCAGTTATCC:1 + chr3R 24408342 3' - Quasimodo 6 2 74.26 ATCACTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCAACGGGATGCCACATTTTTATCACACTAAAATGTGACAAG:1 - chr2R 17651882 3' + Doc2-element 4450 1 60.40 TCNTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAAT:1 + chr2L 5959700 3' - roo 8714 2 79.21 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCAGCGGGCGCGGCGGCATTTTTCGAGTGACCGTGTGCT:1 + chr2L 18987328 3' - P-element 39 1 40.59 AGTCCTGGATTTGCCCTCCTTAATGGTATAATGTTATTTTATAAATAACTAAAAAGTTAATCCTAATGGTTCAATAAACGAATTTAAAAAAAAAA:1 + chr3R 20332735 3' + Rt1c 5359 1 80.00 AGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATGGGAAAAAATATGGAAAAAAGCATACGAAAAAATGGAAACAAACTAACGAAATGGCTAAGAAAAGAACAC:1 + chr3R 18919900 3' + I-element 61 1 72.73 TACTTGAACTAATAAAATATATCAGTTTGCAGCTTGTCAGCTCAAGAGAGTTGTGTCACTTTGAAAAATGTGTCGACGTGAGGTACCCTCGCCAACTTTTA:1 - chr3R 30255559 3' + G7 1166 1 46.53 ACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTACTGCACAGTTTTAGCGGCTGCATGACCCAATACACAACGTCTTAAGCTATTTCCGTAAATTGGAG:1 + chr2R 24279214 3' - diver2 60 2 73.27 ATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCATACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGAGAGTTGTCGTGTGACAGGAAAAGGATGCTAAAGAGCA:1 - chr3R 4608997 3' + invader3 133 2 62.38 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGGGCCCTGGGAAAAAAAAACTAATTGTTGTCGTTTTT:1 + chrX 522184 3' + transib2 2781 1 63.27 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTCATTTGTTTATTTATACAGTTAAATCGTTTTT:1 - chr3L 18938884 3' + blood 7345 2 69.31 GTNTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGAT:1 - chr3L 2392392 3' + Transpac 259 2 78.22 CANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTTTATTTATGGAATTTTTCAAATATTTCCACAAAATTTTAGTTTTTAA:1 + chr3R 19952387 3' + roo 9041 1 63.37 CCGGCTACGTAACGACATCCGGTTTAATGCTTACTGGCGATGTTGCTGTTGTTGTGTATAAAAGCTAAAGCTAAAGCAGTTATTCAATTTGATCTACTGGC:1 + chr2L 13122146 3' - gypsy2 78 2 66.34 ATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCG:2 - chr3L 25889009 3' - gypsy8 304 1 77.23 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGCCAAAGACCCCAAAACTCGAAACCAGGCTCCAGCCCAAAACTCTGGTGGCCTCCAAAAGCACA:1 + chr3R 26434772 3' - Tabor 6853 2 65.35 AANAAATGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTTTGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCGTATCGACCGAAAATAAAATCCGTTG:1 + chrX 21388559 3' + 1360 3343 1 66.34 AACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTGACACGGGGCGAGTGTGCC:1 + chrX 5649438 3' + S-element 1697 1 60.40 ACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGCTAGTGGGTTGCTGCTTAGTGGGTGGCATGTTGTGTGGCATGGCCGTGCAACATGTTCTTGCGGGGTCATTCGGTG:1 - chr3L 9809734 3' - Max-element 304 1 40.59 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGAGTTGAGCTGCTGCTTAACTGTCCACTTCCTGGCGAGGCCCGCATAGCGGAAGCC:1 + chr2R 13334895 3' - pogo 19 1 60.40 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCAACAAAATTCAAACAAACTCGAAAAACTTTAAACTCGCTACGAGCGCGTTG:1 - chr3R 27452315 3' - roo 23 2 53.47 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTCTGCTGGGTCCCCGTCCTAGTCGTCAT:1 - chr2R 21433456 3' - jockey 4834 1 73.27 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTTGAAAAATCGAGAAAAGCCAGGTTTTTAGTTCGATAAA:1 + chrX 14505841 3' - pogo 37 1 67.33 ACGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTATAACGCTCTTCGATCTCACGCTCTCTAACAAAAATTCGA:1 - chrX 12176318 3' - 1360 170 1 88.06 CGNGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAACATGTTTTGAAAGTGTAATCGTTCATCTTTTTTTTT:1 + chr3R 26255180 3' - opus 148 4 65.35 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTAAGCACCTAAAATTTCGCTTTCACTTCTATCCGCAAGTAATGCAAGTCGTCAATTCCCAATTAT:1 - chrX 364744 3' + hopper 1405 2 69.31 CGATACGCGGCAGCGCCCCTCGATCGGTTGGGTGGGAGGTGTGGTACCAGTCCGAAAAAAAAATAAATAAAACCGACTGGCGACTGACTCATTTGCCCAAA:1 - chr3R 21688252 3' + Cr1a 4403 1 70.30 AGNATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGCATTGCGTATGCGCTATATAGACGGTCGCCCCTGAAATTATGCA:1 + chr2R 6914580 3' - jockey 4702 1 54.46 ATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTAAGGCATCCGAGCTTGCAATTTGGGTTTAAAATCCGAAA:1 - chr3L 14290412 3' - accord 409 2 61.39 GACTAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGACAAAATGGTGCACACTGAGTGTTTTAGCGGCCGAACCAGTTTTTAAATGGACAGTGCAAAAAAAAAACT:1 + chr3L 18822450 3' + Cr1a 492 1 71.29 ATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACGTGCCCGAAGGGTATCACG:1 - chr3L 7295146 3' - G2 2940 1 61.39 GTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTTTCATGTTCGTTACTTATTTCAGTATTTGTTACATTTTGTTTGGTTTTCTTTCTTACATTTACTTTAG:1 - chr2R 2868553 3' - Porto1 4467 1 73.27 GTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCGCTCAGTTGGATTTAACAAACAATTGGCATGTTTTTGGCTTTTTGCTGCTCGGTGACATGTTTGTTGTTAATTT:1 - chrX 12048516 3' - I-element 360 1 70.00 GAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCTGCTCTATTGGCTCCTTCAGATGCCCCACACCCCGCACACTCCTGGAGCGGCCAGTCATCCGATGACACCTGGCGGAC:1 + chr3L 10873914 3' + F-element 363 1 66.34 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAG:1 + chr3L 23456281 3' + 1360 3384 2 70.30 CTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTCCGTCTCCTCAACCTCTAGCTCCTCGGCCATGGTGTGAAATTACGAATTTTTTTTCTTTTTCAAAATACAACACT:1 - chr3L 357987 3' - Rt1a 5032 1 77.23 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATAATTACACAATTTCCCCCGGCCAAAAGTGTTGAAGG:1 - chrX 4448555 3' + 412 7496 2 68.32 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAAT:1 + chr3L 24208203 3' - Quasimodo 21 2 55.45 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAAATAAACAACAATTTTACTATATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACG:1 - chr2L 12283965 3' + 297 346 2 76.24 CAATAATTGATAAAAATTAAAACTGCCCGTTTTAAAACAAATAAAAAATAGTGTAGCACAAATACGGTTATTAACCTTGAGCAACTCAATGTAATAAGAGC:1 - chr2R 22855023 3' + Doc 4686 1 79.21 GTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATGTAAGAGCAAACAATTTTCTTTTAACATGCCAAAATAAATGATTTTAAAAGAATACCATTGTTTTAATCA:1 - chr2L 21863316 3' - Burdock 1 2 76.24 CAACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGGCCTTTATGGGTAACAGAAATAAAGAATATTCTGTAACTCCGATCGGAATAGAATCTA:1 - chr3R 29043284 3' - McClintock 266 2 68.00 ATNAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAATTTGCAGGCTGTGACAAAGTTTAACTGATTCGTGATTTTGTTTATTAATTTCGCGTG:1 - chrX 8338538 3' + hobo 491 1 58.42 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTGGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGCCACGTCTCTGGTGTCTGTGTG:1 + chr2L 1089601 3' - hopper 53 1 74.26 TTNTTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGT:1 - chr3R 12554858 3' - mdg1 7052 2 66.34 CGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGTTGGGATTCAGTCGCGAAGAGAGGCACTGTAATTATATATATGTATATGATATGTGTATCTAGTTT:1 + chr3L 22272928 3' - F-element 494 1 72.28 TTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTTGTGCCATTGACCACCACATGATGGCACATAAATCCTGGCGGCCCAGAAACACGCCCACC:1 + chr2R 9199996 3' - G6 1633 1 78.22 TAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATATTTTACATTTGTACAGATATAGCATAT:1 - chr3R 17412580 3' + 3S18 291 2 72.28 TTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCA:1 + chr2R 5531185 3' - 1360 76 1 51.49 ATAACAATAATAATAATATTAAGTGATTTGTATCCATAACTGTTATCCTTAAGGATAATATCCATCACCTATATATATTTCTCAAACCCTTTCGGCTGCAA:1 - chrX 4284415 3' + mdg1 7070 8 56.44 AAGAGCGCGCTCATTCTTGATTTGTTGGTACAAGCACAACCACAACAACACCAGTACCAAGCACTTCAAAAAGAACAACGCTAATATGACACTTTAACAGT:1 + chrX 7604466 3' - F-element 357 1 51.49 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTTTTCTTGTTTTTC:1 - chr2R 8951017 3' - P-element 43 1 30.69 TCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACATGGGTTCCCGGGATCTGAGCGCCA:1 - chr3R 12044199 3' + Doc 398 1 80.00 CAAATTGGATCATCGAACGCGTCGGTCGTCGCCACGCAGCCGAAGCATACATAATTGTACAGCCAATTAGGAATGGATATAATTCAAACTTAAAGCTCAAA:1 + chr2R 11093250 3' + gypsy7 5351 2 65.35 AAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTATGTACGTAGAAAAATAACAATCACGCAGCCACGCCTTAACT:1 + chr3R 23846891 3' + Bari1 1675 1 62.38 GATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGAACGTCTGTCCGTTATTTCCATTACCGTTATTGCCCATTATTTCCAATTACCATTAGAACAACGAACTGCTTC:1 - chr3R 4247063 3' + INE-1 98 1 79.21 ATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAATCATTCAAGACAGTTTCAAATTTGATGTGATGTGATA:1 + chrX 8420369 3' + jockey 4870 1 63.37 TCNCAAGTATGCAAATTTTCAGTTTTTTAGTAATAATACATTGTAGATTTAATACACTACTGCACCAAGTTAAAAATGATTGCAGGTAAATAGTTTACATT:1 - chr2L 754047 3' - hopper2 1563 1 59.41 CGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAGAACGGGGTCGAATCCTCGTGACTGCCGAAAGTCTTACTGTTAAATTTTCTTCTTGACTTGACCAGTC:1 + chr2L 9745845 3' + X-element 4434 1 74.75 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAAGCTCCT:1 - chr2L 11764870 3' + roo 395 1 57.58 GTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTTGCGCGTATGAAAAAAAAAAACAGCAATGAAA:1 - chr3R 1680703 3' - accord 48 2 75.25 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGC:1 + chr3L 23821857 3' - HMS-Beagle2 6914 2 61.39 TTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTCTCCACCCT:1 - chrX 22726185 3' + Helena 1283 1 55.45 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTTTCATACACCCAAACCCAAACTTTGCGTAACCATGCCAAACGTTAC:1 + chr2R 17938947 3' - copia 4899 2 56.44 GAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGAAGCTCTACGAGAGTGGAAGGGTTTCAGAAAACCAATATCCGACAGA:1 + chr3L 15925188 3' + Ivk 278 1 54.46 TAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGGGGGTTTGTCCATTTTATGAGCCGCCGCCCCATGCATGTTGACACTGTATCA:1 + chrX 7395986 3' - jockey 4666 1 56.44 ACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACCTTTGAAGATATGGATCTGCGGGCTAGCACGCCGGTAACCAAGGTCTATAATCG:1 - chrX 15855849 3' + Tabor 6933 2 61.39 AATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAATTATGCACAACGTCACTTTCCTGACTCTCAGGATGCCAGGTTCCCACTCCCAAAAA:1 + chr3R 27822001 3' + TAHRE 10411 1 42.57 TTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGATGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTCCGCAACTTGCTCAACTTCTTGGCCAGCACAAGCCATATCT:1 - chr3L 11879577 3' - Circe 7102 1 59.41 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTTGATAA:1 + chr3L 22751987 3' + roo 9038 1 67.33 CCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCGATCCAGTAGGTGAGCGTCATGTCGTCGTCG:1 + chr3L 5364976 3' + I-element 4992 1 72.28 TCGGTCTCGAGGCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCATGTTTGTGTCCTGCAAGCGGTACATGCGATTCGGTTACCAGTGCTATCCGGCCAAGGAGCGCG:1 + chrX 18068909 3' + Stalker 421 1 66.67 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATAGCTAATCAAACATTCATATGAATGGCATACGTTTTTAATCAGCACC:1 - chr2L 7393650 3' - opus 7028 4 51.49 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATGTATATGCATATATAATTAGTACGAACCTTCGTGAATAATCGTGCCGCCGCACAACAAATG:1 + chr2R 17483834 3' + roo 402 1 72.16 ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGGAGAGGGAACCCCGTGACAGGCAATCGGGATAACTATTAAAGCGAG:1 - chr2L 16954812 3' + Quasimodo 7347 2 60.40 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATA:1 - chrX 4022304 3' - roo 48 2 75.25 AGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGTTTGAATGCATTGTATAATAGCGGAAATATGATCGAGCAGACATTTTTATCAACGGATAATCTCCGTCAAACATC:1 - chrX 16222336 3' + 1360 159 1 76.24 GTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCATTTAGTTATTGTAATTTGCGTTGA:1 + chr3R 9091066 3' - I-element 4878 1 75.25 TCTTAAATGTCAGGATGGTGGAATTGTAGTAGGCTAGAGTACTAAAGAGATCGCGAAAAAGTTGAGTTAGATGACAGTGATATTGTTTCACAGCTG:1 - chr2R 4901210 3' + invader2 4835 1 59.38 TTTTCGTTTGTTAAATCATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACCACACCCCATAACCATTTCTCTGGCTTT:1 - chrX 12246916 3' - invader2 406 1 75.25 TTTATTCAATTTATTTCTATTGCCGCCGCACTCATATCGCCAGTTTGCTGTCATGTTTCATATCGGCGCAGTAGATGCTGCAATGATTGAATAAATGTGC:1 - chrX 1924828 3' - Stalker4 499 1 46.00 AGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGCACTAATCTTCTGTAGAAAGTCCGTCC:1 - chr2L 4004097 3' - G2 2917 1 73.27 ACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCTCTTGTTTTCATCTATGTATGTTCGTATTATTTTTATGAAATTTTTT:1 + chr2R 3939665 3' - rooA 351 2 71.29 CTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATATTTATTTATTATATATTAATTAGGCTTTGTGCCAATAAGTTAGGAGGCAGCTTAAA:1 - chr2L 21732142 3' + 17.6 7404 2 69.31 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTCAACAGGTGTCAAATTGTACAGAACACAATGTAATCCCAAATGAAATGAGAACAACAA:1 + chr3L 18816200 3' - roo 8681 2 62.38 TTTTTAATTTTTTTTTTAAATTGGTATCAGTATAGTAACGAGTAACGGCTATCTGATAGTCTCTTGTCTGGATTATATAAATAGATTTCCAAACAGTTTG:1 - chr2L 12156936 3' - TART-C 11098 1 40.00 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGGTCG:1 + chr3R 9322885 3' + 412 461 2 54.46 TATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTACAAGATCCATTCATTTTGTCACCTCCTTATTCCCATATCGCATTTCTCTTGCCTA:1 + chr2R 13737296 3' - G6 1781 1 59.41 AATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCATACGCATCCACATCCCCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACATCCAAACACAAAAACGCCCAACACGAA:1 - chr3L 13872439 3' + flea 4606 1 72.73 GTCCTTCGGGCTTCTTGCCGCCCGACGCTTCCGCCGTTTGTTATTTCCGACTTGACCGCGCGTTCTCCCTCCCTCGCGATCTGCGTCTTTATCTTAGCCAG:1 + chrX 1625035 3' - gypsy8 487 1 70.30 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGAT:1 - chr3L 13878057 3' - flea 39 2 66.34 AGNGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGTGAGGTCTGGGTTGTTTAGGGTAATTCGGAT:1 + chr3L 7061219 3' - I-element 19 1 58.00 AAAAAAAAAAACAAAGAAATTCGAAAAAATTAATAGAAGAAGATGGCAGTACTGAGACAGAGTACAGAAAAAAAGGGGACAAAACTAGCCAAAGCGAAAAT:1 + chr3R 28436829 3' + transib2 2645 1 62.38 CANTGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGTTCGTTAAATTTGATTCATGAGGCGCTCTCGCTGCGAGAGTCCCAACCTCAAC:1 + chrX 4449601 3' + Doc 211 1 63.37 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTA:1 - chrX 17300374 3' - jockey 4713 1 68.32 CCAAAAAGAAAAAAAAAACGAACAGGGGACAAACTAAACGAAACAGAATCAACTACAGATGCGACAGATGAATCTTCTTCAACAGAATCTCAACCAGATAG:1 - chr3L 11770979 3' + invader2 292 1 60.40 TTNTTTAAATTATAACGTAATTTCAACAGTTATACTACTGTCCTCCATGTTTTAAGGCTTAATAGGTAAATAGCAATAGAAAGGATATATCAAATGGC:1 + chrX 20858800 3' - Copia1_DM 7 1 71.43 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCC:1 - chr2L 19845907 3' - F-element 46 1 57.43 TCNGCCGAACGTAGTCTGATCGAGGGTAGGAGCGGGGGACGCGGAGTCCTGGTGGCCAAGGATGTGGCCAATGCCGCTGGCCAGTTAAATGCACCCAGTGT:1 - chr2L 19649183 3' + invader1 3717 2 68.32 AGATTTCCCCGAATGCCTTAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAAATCCTTAATTGATCGGTTGTTGTTTTTGTTGATGCTAATTTCATCAATCTGCTCCAC:1 - chr3L 18836341 3' + X-element 4697 1 68.32 AANATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAGGT:1 - chr3R 9325614 3' + roo 9036 1 60.40 AAATCGCCATTTTTCCGAACTTTTGAAACATGATAGATCCTTTCCCACGCTTCCTGCGCAGTTGAATAAACACCTAATTCATCCACGAGCAGGTTAACGCA:1 + chr3R 23203127 3' + invader1 492 1 75.25 AAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACGATTGAAACGTAAATCCTTTTTTAAA:1 - chr2L 19227283 3' + Quasimodo 218 2 74.26 CAAACGATTCCAGCTTGCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCTTTAATATATACGAGAAAGTCAAGATAGCTATTTTA:1 + chrX 13790144 3' - FB 41 1 70.30 AAGACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGCCAGACATCGGCAACTGTTGCACAGGGCAAA:1 - chr2L 1204047 3' + roo 9053 2 58.42 ACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATG:1 + chr3R 3320507 3' - 1360 45 1 76.24 CCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTTGCAGTTGCAACTGTAGC:1 + chr3L 1259255 3' - Doc 9 1 68.32 GGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGACAATCCGAAGACGACGACATTTATCAAG:1 + chr2L 3133041 3' - Burdock 6033 1 67.78 TTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGGAGAGGGAACCCCGTGACAGG:1 - chr2L 16954837 3' + Quasimodo 7326 2 75.26 AGNATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGTCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAAAATTGGTGTATCTTAATATGTTTATATGGCACGT:1 - chr4 137335 3' + 1360 400 1 67.33 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTA:1 - chr3R 19450192 3' - roo 8725 2 55.45 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTGCGTAGCCCCTCCCACAACTAACCCCCCTTCG:1 - chrX 4323793 3' + S-element 1677 1 68.32 CTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTT:1 - chrX 4806674 3' + roo 9047 1 53.76 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGGATCCGCTTTGCACCCTCCCTCGGC:1 - chr3L 7968691 3' - hobo 13 1 56.25 TTTTATTTTATTTTATTTTATCCCTAAAGTCATAGAAGTCGGCACGTTGAGTTGGTAAGTGGAATGGGCGATTCAAAACCTTTATATATAGCATATACTA:1 - chr2L 2330611 3' + transib1 1901 1 72.00 TCATAANACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATC:1 + chr3R 6776580 3' + copia 5072 2 79.21 AGTACAATAGCTCCGACTGGGCCAGTACGCCTACAAACAGTTTACCTTCAAGAACATCTTAATAATAAT:1 + chrX 5755465 3' + baggins 5399 1 79.71 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGT:1 + chr3R 14688314 3' - pogo 35 1 63.37 TCCACTCAAGAGAGCGCCCAATTCATATGAATACATAAGAGATCCTTTTTACGCTCTTTTCAAATTTGGTGCTCTTTTTCTTTGCGTTTACGAATATTTTC:1 - chr2R 2832478 3' + Quasimodo 424 2 56.44 ATAAGAAGTGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAATTGCTATTATAATTTTTATACTTACACAAATAA:1 - chrX 22576335 3' + Burdock 6288 2 55.00 TCGCTGTTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAAC:1 - chr3R 17665959 3' + Transpac 293 2 62.38 CATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAACTTGTTCACGCTTTAATGAATGTAAAAAGGAACATAGTTTG:1 + chr3R 25424241 3' - Doc 4509 1 58.42 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTATTCAACCTATTCGCCTTTATCCTCCCTCAATCGTTA:1 + chrX 4022352 3' + roo 9035 1 63.37 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGGCGGAGATGAATTCCAAAATTAGCAAAAACAAAAAAAAAAGAAAAATTGTGAAAATATACCTTTGCACAGATAGAA:1 + chr2R 12271764 3' - blood 170 2 55.45 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGG:1 + chr3R 17666029 3' - Transpac 4966 2 72.28 ATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTGATTTAATTTTTCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - TAHRE 52 1 43.56 CTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGGAGTGGTGGGAGCGGTAGACCAGTTTCCGGTTGCTGTCCTCGGGCGACAGGTGCCACTGGATTTCCTGC:1 - chr2L 18384056 3' - I-element 22 1 64.36 TAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCAGGGAACTTGTTTATAGCACTCTCTCTTTTTTTTGAGTGTACCGATTGAGACGGATCACAGTGTGGCTC:1 + chr3R 6949611 3' + INE-1 544 1 63.54 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGTGAGGTCTGGGTTGTTTAGGGTAATTCGGAT:1 + chr3L 7061219 3' - I-element 20 1 57.43 GTAGTANTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAA:1 - chr3R 6290999 3' - Doc 57 1 75.00 TGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTGGGCATATACATATGTATATACCGTATAATATACATATGTATCTATATATG:1 - chr3R 12563965 3' - accord 7316 2 56.44 TTACCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTGTCTCTGTGAGGGGAGGAGGGGAGGAGGGGGGCTGAAGCCCTTGGCAGTCGAGTGC:1 - chr2L 9844872 3' - G4 113 1 52.48 CACCATGGTATCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAACTTCAATATGAACTAAACTTAAGCATAGCA:1 - chr2R 8435141 3' + Doc2-element 4460 1 69.31 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTAAAAAATTAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAAAAAAA:1 - chr3L 8369518 3' - pogo 29 1 60.61 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATA:1 + chrX 4806733 3' - roo 42 2 74.26 TTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTA:1 + chr3L 19339420 3' - Tc1 35 1 54.46 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTAAGGCACATATGCTACTATATAAATGTGCCCGAAAAAGGATATCCAGTTTTTATATTTATTTTCTTGGGATA:1 + chr3L 5067883 3' - Quasimodo 25 2 49.50 GGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGAACTGCTTATCGACATCTCCGGCTGCTGGCAG:1 + chr2R 20411942 3' - Quasimodo 7 2 60.27 CTGGCAACAATTTTTATAAAATCAAAAACATTACTCGCAAGTGCTTGGCAATCTGTTACCACTTGAAAACTGCCAAAAAAAAAAACCGAATCACATG:1 - chr3L 7853039 3' - Cr1a 458 1 80.41 AAGCAGNTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTT:1 + chrX 9439835 3' + roo 9038 1 57.43 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATTGCATACTTTTGTGC:1 + chr2L 17205269 3' + hopper 1413 2 78.41 CCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACAACTGAACCAGCCAAAACAACCTTACTATCCAACCAACCACACCAACACCACCACCACCAC:1 - chr3L 5271747 3' + I-element 5066 1 68.32 CATCATATTCTCTAATGTCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACCTTCGCCTCGCTTTGCCTCACCTG:1 - chr2L 14112198 3' - invader4 2956 2 77.23 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAACTATCTAGAAAAACTGTTAAAATTTTTGAATTTTAGCTAAGCCGTTATCGTTGTTTT:1 + chr3L 16673657 3' + 1360 3374 1 64.00 GTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTAGCTAGATAAGAACATTTGAAAGAAATGCCATAAATAGGTGATAAGTGATATTGTTTTGGTA:1 + chr2L 5307232 3' - accord 7062 2 67.33 AAGAACACACACACACACACAGAGAGTGGAAAACAATTTTATCCACAAAG:1 - chr2R 19215513 3' + accord 7027 3 78.00 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTTAAATTGTTGCGTTAACCAAGCCAACCAGCTTCGGGGGCAATCCTTG:1 - chr2L 15013935 3' - jockey 4702 1 56.44 GCNAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTATACAACCGTCGT:1 + chr2L 8841101 3' - P-element 58 1 24.75 TTNCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATC:1 - chr3L 27415240 3' + transib2 2782 1 67.33 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCGGCGCGTAATGCGAGCGAATTATTA:1 + chr3L 6442704 3' + roo 408 1 78.22 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGCTGGCCGGCCGTCCGCACT:1 - chr3L 447308 3' - Tabor 32 2 58.00 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCTCTCATTTCCTTTG:1 + chr3L 10557671 3' - 412 5 2 74.26 GGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTAAATATCTTTGTATATTGCATTACTACCACAAACTTCGAGATGCATTTATTCAAGTGTAAAAGCAACACCTTCCTTG:1 - chr2L 260953 3' - Juan 4026 1 82.18 CTACATCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCACAAGCAAAAAAAGAAGAGTTAACAAAAGAAAACCCAAACATA:1 + chrX 12728887 3' + F-element 457 1 63.37 TTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATATGAAAAATTAAAAACTATAATTCGCACGATTGCAAGAACAATACTTGCCGATTACCTTTAAACGTAT:1 + chr3R 6819851 3' + I-element 5244 1 72.28 AACATTCTCCCCCCCCTTGCGTAGGCAAAGGTATCCCTGGCCGGCTAGACATCAGGATCGTCCTCCTCCCCTCGAAAGCAATAAATGTTCAAATCAATTGA:1 - chr3L 6013271 3' - Max-element 8218 1 64.36 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTCGTGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAA:1 + chrX 13640690 3' + P-element 2838 1 28.71 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTAATTTGCTGCAGATAAGAGAGTGGCAACAGCAAGAACCTGAAGTTATCCGCAGGTGAGAACA:1 + chr2L 12392194 3' - jockey 22 1 41.58 CAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTGGCTGCCACACCCTAAAAGGGAAAACACCAACGCATATTAAACAGAC:1 - chr2R 13316592 3' + jockey 4646 1 56.00 CANCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATA:1 + chr2R 5531203 3' - 1360 58 1 69.31 ATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGATTGCAGATTCCTTTGCCTGCCCAATAAACCCTTATTAAGGACCTTGCAGGACCTTAATT:1 - chr3R 27786334 3' - R2-element 3535 1 63.37 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGGCATACAAAAAAAATACACGGGGGAGTTGTTGCACGACA:1 + chr2R 18356267 3' - P-element 22 1 56.00 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGTCTATTCTTCGGTAACTCTTCTTTGGTTTTACATAGTACAA:1 + chrX 364862 3' + hopper 1410 2 74.26 GCNTACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATATTTACATAGATACATACATAGATATCTCCATGATACTCAGTAAAAAAGGCAAGT:1 - chr2R 4182431 3' + Stalker4 7198 4 53.47 CAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAATGTCGAAAATCCATGGCGGCAAAAAGGGCAAATCATCGATGGGCAAGGGTTCCCATCCCACT:1 + chr3R 13047270 3' + roo 241 2 65.35 AGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGATACCCGAGCGTCGCTTCGGATTGTAGCGCGGCGGTCCGCGGAAGGGAACTGTGTGGTGATCAAGGA:1 + chr2R 14067681 3' - invader2 4953 2 73.27 TATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAAGGAAGGGAAGTGACATATTCATTAACAAAACCATGGCAACAACAGTAGAAAAGCAGG:1 - chr3R 5088503 3' + 297 6534 2 67.01 GGGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCATTTTTTGATATTTTTACTATCTTTTTCTATAATTTTTTAAAAATTTATATCTTTAC:1 + chr2R 5237152 3' - Doc 4490 1 59.41 GATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTAATTAGAATGGCTAATGAGTTGTACATCTAATGTCTCAAAGCTAAAGCTAAAATTGTTTAAGAAATATAA:1 - chr2L 6292974 3' - F-element 339 1 65.35 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGTATAGTGGCTTAAATAAAGTTTGCGCTGAAAAGCATGCTACACTTTTTGCTTA:1 - chrX 10453371 3' - hobo 22 1 55.45 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTT:1 - chr3L 21484241 3' + 1360 3345 1 85.71 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGAAACAACCGAAGGGGAAAGCGCTGCGGCTGGGTAATTTTGCCAAAAATGTATTGCCAAAAATGCTCC:1 - chrX 1565952 3' - blood 168 2 51.65 TATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAATGTTTGTCATGTTTACCTTTTTCC:1 - chr3R 9127360 3' - invader3 5215 2 52.48 ATNAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTATTAAAGTAGTAAGTATTAAATTAAAGTAACCCCGATTTGTTTCAATAAAGATGAGACTTGGCTAATTTAGTCAAGA:1 + chr2L 6296797 3' + TART-A 13149 1 52.00 AATATAAATATACAAATACACAGTATACAAATACAAAAATACGAATAGAAATATAATGCTGTATAAAGTAATCACAACTTAAAATAAATTAAATCTTAAAT:1 + chr3L 15382380 3' + Stalker 6939 4 56.44 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCG:1 + chr3L 10557648 3' - 412 7081 2 51.49 TCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTTCGTTTCTCATGTTCAATGTGCCCATGGGCTTATTGGTTTACGCCTAATCCAG:1 - chr3L 16709321 3' - FB 25 1 54.46 ACNCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTAAGAAGTGCAATTACCGAAAGACTTGCCACATATTCTAC:1 - chr3R 5329339 3' + blood 7354 2 59.41 TATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAACAGTGTTGTCCTTTTAGCTGTGGCATATTATTTAAAAAATGTTTATTTTAATCACACAGAAGTTAGATC:1 + chr2L 10043008 3' + roo 8769 2 68.32 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCCAAAGTAATTTCACATGCGTGGATTTAAACCAGCGTATTGGGGGACGC:1 - chr3R 10824047 3' + 412 7518 2 52.48 TATCAGATACTCGTTACTCAGTTAATGGGAATGCAAGGAAAAAAGTTTTGGAGCAATTGTGAGAGTTAGAGTGGGCTCCGTTGGCCTAACATCTTCTGGTA:1 + chr2R 11410320 3' - INE-1 546 1 72.28 AAAAATCATCCAAATATCTCCAATACTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACA:1 - chr2R 12446066 3' - hopper 56 1 73.27 ACTGGCTAATAGGACAACACTCAAAACTAGAATTTATTAAAATTGCTGGGCAAAAAGAGCACCAAATGGCAAATTAAGCAGTTTAGGAGCAGATTTATGTG:1 - chrX 20901786 3' + Porto1 4192 1 71.29 CTAAATATAAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCT:1 + chr2R 2527412 3' - roo 75 2 68.32 TTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGAAAAGTTTTCTGTGCGCTGAAGATGGAATGTATGTATGTATGGAT:1 - chr2L 3545844 3' - I-element 5210 1 53.76 TTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCCCGAAAATGGATATCC:1 + chr3L 5067856 3' - Quasimodo 50 2 75.25 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCA:1 + chr2L 10174163 3' + mdg1 375 2 71.29 AANTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATGTAATTTATATTTTCTGTATCGCCAGCACAAAACTTTTGCTTCTGGAGA:1 + chrX 1105391 3' - Juan 4095 1 52.48 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGCGACAAGTTGACTGAAGGTTAGACCCGATCC:1 + chrX 17699224 3' - P-element 42 1 39.60 TCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTAT:1 + chrX 22824227 3' + Gypsy12A_LTR 2252 1 45.54 CGCCACCACGCAGTATGTGTGTATAGGTGTGTTTGTGTCTGTTCACTGGATATTTGGTTGAGTGTCTATTCGCCCTACGAAGTGTTGTGGCTTTTTACAGG:1 + chrX 15403101 3' - accord 205 2 64.36 AGNATATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCCCTTAACAGATACGAATCTGTACAGAGTTTGCTGGTGGGACTCCCCC:1 + chr3L 25326208 3' + X-element 4410 1 59.79 CTGGAATGCGAAGAGTCGCGTTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCGTAATCCACACGCTCGCACACAAACACACACACATGCAC:1 + chr2R 14917088 3' - invader4 2766 2 66.34 TANTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGACTCTCGTGGACTCCGGGTTGCATAAAGGCTGGCGCAGACGAAAGGGATCTGCGAGTGTTTCAATT:1 - chr2R 15578219 3' - mdg1 10 2 70.30 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAA:2 - chr2L 18223786 3' + roo 9025 2 70.30 TGNAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTTCAACAGGTGTCAAATTGTACAGAACACAATGTAATCCCAAATGAAATGAGAACAACAA:1 + chr3L 18816200 3' - roo 17 2 62.38 CCTGATCGTACGGTAAATCTCTAACAATAACGCAGTTATTAGCTTTTTTTATTGTATATGAAAAGCATATATCTTTTTATCTGTCGACACTACTGAGTTTT:1 - chrX 20858681 3' + Copia1_DM 178 1 73.27 AGNGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAGCTGGAGTGAGGGCATTTAATTATCACATATGTACATATGAGTATGTTGAGCACTGCGTTTTGTGCTCGCAC:1 - chr3R 27604051 3' + micropia 5275 2 60.00 GCCGTTGAGGCCTACTTTTCAAGTGGTTGTTCGGTTATTAAAACACAGCTTGAATTTCGGAATCGCTTTAATTTAGCTCTATGGTCTCCCGGAAAGAGTAC:1 + chr2R 1779016 3' + mariner2 164 1 76.24 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAA:1 + chrX 678852 3' - Tirant 23 2 58.42 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCG:2 + chr3L 24208212 3' - Quasimodo 12 2 64.36 TANTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGACGGAATGAAAATGATTTAATACTTAAC:1 + chr3R 4679306 3' + copia 241 1 69.31 GAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTTCGGCTGATTACTTTTCGACGTGATGGCCAAATATGCAAAAT:1 - chr3L 20289181 3' + Doc 350 1 62.38 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGCCACGTCTCTGGTGTCTGTGTGCGTGTGCGATTGTGTGGGTGTCACAATTAAATTCTCATCTAC:1 + chr2L 1089643 3' + hopper 1406 2 67.68 TGGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGGCACTGATATGGCCACGTACCAGGCACAATCGGAAAAGC:1 + chr3R 20584354 3' + 1360 3353 1 62.38 TCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCTCCGTAGCCTATTGTATACTACAATATATTTAATTTTGTTAAGTA:1 - chr2L 3813588 3' + Ivk 5265 1 57.43 AGNGCAGTTTATGTGAATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAATGAACGCGTGCGCGTAAGAAGTGAA:1 - chrX 3289222 3' - Cr1a 265 1 74.26 CGCCGGTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTAGGTTCGTTGGTTTTCCAGACTTTCCCCGCTCTCGTTCCTGTGTTGGTGTCGCGTTCTTTCGACGTTCGTT:1 + chr2L 18845260 3' - Fw2 3623 1 69.31 CTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAGGTTGGCCGGAAAACAGAT:1 + chr3L 5662708 3' - jockey 355 1 59.41 CCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAACTTCTGCCCACACAATCCTCTGGATTCTTCAAAT:1 - chr3R 641317 3' + I-element 36 1 66.34 CTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACCATGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCCGTTCGAGATCATCGCTGCAAGTGCAAGTAAATTGACTG:1 + chr3R 29527371 3' + Idefix 189 1 65.35 TAAATAATAACAAAAAATAAAAATGCACTTGTGTATTTCTACTCGCTTTGAATTAAATTTCAGATGCCATCTCTCTTTCCATGGTTATTGCTGCGACAGAC:1 - chr2R 9493694 3' + BS 5097 1 73.27 GAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCCCGCAAATTGGCTCGTGTGGACGGCTTTGTTAACGTCTCCTATCGCCGAGGTCTTTCGA:1 + chr3L 18476545 3' - accord 20 2 54.46 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACATCTATTGAAATTGAATATATAAATTTACGTTGTGGAGAACTTGCCAAGACTCA:1 + chrX 20933823 3' - mdg1 7060 2 57.43 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCTCGTGT:2 - chr3L 17971233 3' + P-element 2848 1 40.59 GTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCTCTATGCTTTTTCTGCAGCAACTTTAGTTTGACTTGTTATTATTTTGTTT:1 - chr2R 8503786 3' - Doc 309 1 53.47 CGTCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGAAGACGCAATAAACTGTAAAGCG:1 - chr3R 14625990 3' - P-element 10 2 69.31 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGAGCGACAAGTTGACTGAAGGTTAGACCCGATCCGATCCGATCGGA:1 + chrX 17699236 3' - P-element 30 1 51.49 GCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATAATTGATTTTTCAGCTAGAAAGTTGAAAAAAGGAAAACCAC:1 + chr3R 6114720 3' + 297 6794 2 67.33 AANAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCAGAGCTTCGGGCGATAAAGAAGGAGAAATATATAACAATAACAA:1 - chr3R 25514817 3' - hopper 35 1 55.45 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCATCGCCGGCATTTTCGCTCGCTGTTTTGCCAAGAACACCGCTGCCTACTTTGTTTTCACCTGTTTACTGCATTAAT:1 + chr2R 8314249 3' - hobo 2709 1 81.19 ACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGACTTCTTTACCTGGCTTATGCGATATCGAAATATTTTTCAAGCTATGGGCTTGGCAACATTTGGAA:1 + chr2L 21608383 3' + Ivk 475 1 63.37 ATNGCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTTAAGCCCAAAAGCGAGAGTACAAGAGAAGGAGCTCGCGAGAGAGGGAATGAAAGATAAT:1 + chr3L 23228895 3' + invader1 3764 2 67.33 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGCAACTAACACTCAATAACTGCACTTTTCAGTTTCCCCGAAAGTTGTGCTTTCACTGCAGTTTGCCACATCG:1 - chr2L 810229 3' - hobo 5 1 74.26 TTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTTAACGAGCAGGGTTGCCACGCACACCAAATGTTGCCAAGTGTACCCCGAAAATGTTC:1 + chrX 6511704 3' + invader1 37 2 59.41 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCTTTCGGGCCACACACTCCTGTCGCTGTCGTTGTCGT:1 - chr2R 18005562 3' - hopper 13 1 60.40 AACAAGAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTACTTGTGTAAAGAGACGATTTTCTGGATTTTAGCTGCGACGTTGTGCTCAAGCTGGGAAACAGGAAAAC:1 + chr2R 949942 3' - 1360 3231 1 58.42 TATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTGTCTGCGTTTGTGACTTGCACCAGAACCCATTGAACACCACGTCCATTAGCCAGAAGTTGAGGATCTACAGCGG:1 + chrX 20268733 3' - accord 7030 4 56.44 AGAACATGTTCAGTGGCGATGTCTTCAATTACCATTTCGAGATCTCGATTATGACTCAATTCAGACTCCATTCAGACTGATCTTCTAATTCTTAATCCCGA:1 - chr3R 4064039 3' - G4 497 1 60.40 GCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCCGTTCTTGTTTGATTTGTGGTTAACAC:1 + chr3L 18094967 3' - hobo 455 1 73.27 ACNGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACCTTAATTGAATAATAAATACATCATCACTATTTGGGAAATAATTAAAAAAATACACATTCCTGCA:1 + chr3L 11891407 3' - Tabor 6850 2 66.34 ATAATTTTTTTTTTATAAATCAAGCACGTTCCTTTATTGGAGTTGCTTGTGTAAACGGTCATTTCATTTACGCACAATCAGGATTCTACTTCCACTGCTTG:1 - chr2R 10387188 3' - looper1 1691 1 82.18 AACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAAATGAATCAGAAACAAGTTCAAGTTCTACTCCGATTACAAGTTCCTTCGGAA:1 - chr3R 16287845 3' - 1360 3231 1 56.44 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTG:1 - chrX 4022307 3' - roo 8714 2 78.00 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTT:2 + chr2L 18177961 3' + 412 7498 2 72.28 ATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCACAAATCATAATCCACATAAAAAAAACCACTGAACTTTCTATCTTGCTTTTATGAT:1 + chr2L 11901403 3' - micropia 5244 2 62.38 GTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTGCTGGCAGGACCTAAGTTGTGGGGCATTTGTAGCCGAGATCAGAACGGTCAGCTACCTGTGGATGGGTCCCG:1 - chr2R 5735147 3' - G4 3468 1 74.23 GTNGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTT:1 - chr2L 19644887 3' + blood 7338 1 70.30 AAAACTGTAAATCAAAGGATTTTTTCTTAAACTCACAGGACCCAAGCACTGCTATTTCATTGAACACAGCTGTACATACATATAAAGATGAGCTTTATCAC:1 - chr2R 5739071 3' + HB 1574 1 60.40 ATNCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTCAT:1 - chr3L 14088077 3' - hopper 49 1 73.27 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGCATATCGACATATTTGCCACTTTTTCTTTTTTTAGGTCAGCCCAGATG:1 - chr2L 10958774 3' - F-element 48 1 71.29 ACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTAGAAGATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGAACAGGAGCAAAATGTTTGCAAAAGAAA:1 + chr3R 28126133 3' - Cr1a 4421 1 70.83 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACCAATTCCGAAAACCTTATTAATAGATCATGAACTTCAGATACTTTAGAGCCTACGGAGCT:1 - chr3L 15681516 3' - pogo 3 1 73.63 TAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTGTAAATAGTATTAGACATTTTCCAATCTAAGGCCGCAAATGTT:1 + chrX 8150489 3' + rover 7269 2 56.44 TTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCACGCCGTCGTACCCTCTCGACTCCAACC:1 - chr3L 25514755 3' + Cr1a 227 1 72.28 AAGCAGNTGTTTGTGCGATCGCGTTTCTACTACTTCTATATATATTATATATAAATTCACTCTTTTAAGAAAATTAAACTTTTTTTTGAATAATAAAAGTA:1 - chr3R 20194716 3' - X-element 228 1 74.26 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATTTTCATACC:1 + chr3R 27452381 3' + roo 9028 1 73.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTC:1 + chr3L 6442653 3' + roo 356 2 76.24 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGGTCGAGCAAGTTCAACTC:1 + chr3R 9322899 3' + 412 7528 2 60.40 TTATATAATTATATGATAAGAACCTATGAGTTTAACAACGACGCCTCATCCAATCAAACCAACCAATCAGCACTCAATCAGAATCCGATCGCGAATAATGT:1 + chrX 11383027 3' + rooA 257 2 78.22 CCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCTGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATAGTTTTGACCCAA:1 - chr3L 10557570 3' + 412 466 2 50.50 TGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTCTTGCCTTCCTAAGTTTTTGGGATG:1 - chr2L 7722270 3' - I-element 5184 1 75.25 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCAT:1 + chr2L 19644913 3' - blood 7067 2 81.19 ATNGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCTGTTCGCAACGTACTACGATTGCGATCCGCTAACAACGAAGGTTGGG:1 + chr3R 25911638 3' - Q-element 87 2 57.43 ACGTTTTTGCAAAACGTCAACGGAGTCCGCAACATACAACAGGTAATAGAGCCAAAAGAAATTCTAATTTTCGCAACAAAAACAACTGCCACAATAGCCTG:1 - chr2L 4636161 3' + Doc4-element 488 1 62.38 CGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGTATTCATATTGTCGCTTTGTTACATTACATTTTACATTCATCTTAAACGGTAAGCGTTGAGAGACCATAGAA:1 - chr3R 17871658 3' - 1360 3284 1 75.25 CGCGTTAATCGACGGCCAACCCTTTTTCTAATTTACATACGGGCGATCGCAAAGACAGTGCTGCAGAAGT:1 + chr2R 3572815 3' + gypsy2 321 2 88.57 AGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAGTGTCAAGTGTCGACGGCTGACGG:1 - chrX 8830436 3' - Circe 316 1 62.50 CGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGA:1 + chrX 21564742 3' - diver 5917 2 57.43 AGTGGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTTACAAAATGCCCACCTTGCCGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGG:1 - chr3L 13652804 3' - hobo 50 1 51.00 CCGTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATAT:1 + chr3L 11257375 3' - 1360 3382 2 47.52 TGAGTTGCATGACCCTTACAGACTATTTTGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATGACTGTAACGTGCTGTTGAACATCTTCTCATTATTGTTGACTTT:1 + chr3L 149386 3' + Cr1a 4171 1 61.39 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTTATTTTACAATCATACAATCATATTTATA:1 + chrX 6883312 3' - Burdock 6180 2 73.27 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAGATCTTTTTGGCATTAAATGAGTGAAGCTCCTAAACATACATAT:1 + chrX 8422158 3' - jockey 4762 1 76.24 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGCAGTCAGCTATGTGGCAAAATTCTCGTTGCAACGACCGCAGCAAGGGTAACGATAAAAAAAAAG:1 + chrX 10119649 3' - FB 12 1 65.35 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCGTGGATTGTCAACCCCTTCTTTCA:1 - chr2L 10712095 3' - I-element 11 1 70.30 AAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGCCGTGCTCCACGAGCCTGGCCAGCGAATTGTTTGGT:1 - chr3R 17366016 3' + F-element 406 1 62.38 AAGGATNTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCAC:1 + chr3L 23821859 3' - HMS-Beagle2 6912 2 56.44 TTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGAACCTTTCCATTATAGTTCCGATGTGATGGAGGTTTCTCAGGCTCAGCTCAT:1 - chr2R 4155857 3' - gypsy4 6469 1 60.40 ATATACAAAGTCTTTTGCATTCTTCGTCTTTGTCGTTTTGATAAATTTATTTTCACAGATTTCAGACTCGATATCATCTTTTTCTTCTTCTTCCACTTCCC:1 - chr3R 19444919 3' + Cr1a 177 1 72.28 AGNGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACG:1 - chr3L 13878046 3' - flea 28 2 54.46 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCGTGTTGGTGTTGTGTTGCTTCGGGTCGCTCTCTCGCTCTCTCGGCCTCCACTCCCCCGGTGCCCCCC:1 + chr3L 17971317 3' + P-element 2883 2 76.53 ATNCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATT:1 + chrX 4175137 3' - I-element 337 1 60.40 AACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACA:1 - chr3L 23933648 3' + Cr1a 172 1 78.22 ACNACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTTAATGGCACCACCTATGACTGCCAGCACAATTCGGGGACTGTTGCCACGGTATG:1 - chrX 2372586 3' + Doc 4266 1 58.59 ACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTTGCGCGTATGAAAAAAAAAAACAGCAATGAAAAA:1 - chr3R 1680701 3' - accord 41 2 69.79 TATCCAATAAGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGAGCTGGCTTCGGTTGATCATCCGGGAACTCGT:1 + chrX 1821717 3' + Juan 3766 1 68.32 ACAAGCAAGGAAATTATATTTTTAGGTTTTAGGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGTTAAGTGCCTGCCATAATTATGAAATATTTTTTTTTCTTTT:1 + chrX 8345029 3' + 1360 3262 1 40.59 GGNAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATGCCGTCAATTAGGCACCTTGGCATCTATATTTGGCTATAAATCAAACATAAATACTTTGCTAAACGAT:1 + chr2R 12726886 3' + copia 250 1 71.29 GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCGAATCTAGTATACCCTTTTTACTCTAAGAGTAATGGGTATAATAAATTCCTTTACAACGGATCACGTTTT:1 - chr2R 18487178 3' - INE-1 29 1 71.29 ACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATCATGTTCTATTTATTTTTCAGCTTACCCTGCAGTTGGCTTTGGCATTTTTATGCGAACACGCTTTGAATCTTACT:1 - chr2R 5178569 3' + mdg3 246 2 73.27 TAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCATTATGCATATTTATGGAAGCTCTCCGGCTGCAGCTCCTCCCCCGGCA:1 - 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hopper 12 2 50.62 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCTTTCGGGCCACACACTCCTGTCG:1 - chr2R 18005575 3' - hopper 26 1 59.41 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCAACAAAATTCAAACAAACTCGAAAAACTTTAAACTCGCTACGAGCGCGTT:1 - chr3R 27452316 3' - roo 8688 2 52.48 TAATTAAATAATAATAAAAAAAGGAACAAGTTACCCCATTTGAGTGCCGAATAAACCTATAAAGCCCGAAATGGATAGGGTCCAAGCTGTCGGCACGCGAG:1 - chr2R 20468958 3' + BS 5093 1 88.12 CTNGATATTCACGGCAGGTATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCCGTATCTAAGCAAGCTAGTCATGAAGTTGTTAAGTTATCTGGATAA:1 + chr3R 6025658 3' - Chouto 174 1 55.10 CCNTCGATATATGCACATACTACAGTTTAATACAATGGAAGAAATATTTAAACAACATTTTCGATGTAGCCTTGTAATCAAATCAGGGGAATATGGTTTGT:1 - chr2L 14365364 3' - blood 3 2 74.26 AGCCACGGCGAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGTCTTTGCTCAGATGGTAGGGTATAAAAATAAAATTTGCAAAACCAAGCACAC:1 - chr2L 22551761 3' - 1360 49 1 65.35 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTAAGCACCTAAAATTTCGCTTTCACTTCTATCCGCAAG:1 - chrX 364771 3' - hopper 38 1 58.00 AGAGCAATTACTTATTACTTATTACATATTCCCTGAAGTCACAATGGCAAGTACCCCACCCCACCTCACTTTCGGGGCAGCCTCTAGGGTCATTAACATGC:1 - chr2R 14126070 3' + Stalker2 399 2 56.44 CTACGTACTAAAACAAAAATCTCCTTGTGCTCTATTCAGTACTTGCACGCTCATTGGTTTTGGCGGAGACAGATACTTCGGAATGCGGTTGAAGCTAGAAC:1 - chr3L 12125494 3' - Rt1b 5035 1 56.44 TTGGCCGTCACCAAAATAGTGGCTGCATTATGCCGCCGCAACGGTTGCTATCCCCAAACGCATCCTGCGAGATGGTTTTAGTCCCTGGCTGAAAGCTGGCA:1 + chr3R 18880447 3' + 1360 3330 1 73.27 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTT:1 + chr3R 17243214 3' + hopper 1399 1 60.40 CGGCAAAGGCACGATCCTCACTCTTCCAACGTATAGTGGATCAGAACCCGAATCAAAGGCTGCCGCAGCCCACTTAAACTTGTGAGGTGAACGACTGGCGA:1 - chr3R 18862398 3' - mariner2 146 1 68.32 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGCCAGAC:1 - chr2L 1204072 3' + roo 9028 1 72.28 TCNTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGAATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCATTGATTTTTCATTTTT:1 + chrX 6082644 3' + roo 9046 1 52.48 TCNTGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTGATACTCTTTAATATTGTAAGCTGAAGTGTCCGGGATTAAAGTGTTGCATCCCCATCCCGCTGCC:1 - chrX 18717670 3' + diver2 4540 2 62.38 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAACATTAGTTTAAGCTTTAAAGGAATAAACGTAAATTGCTCTTGTTAAATCAAAA:1 + chr3L 15681623 3' - pogo 16 1 63.37 AAAATGAATTGATTTATTAAATAGGGTGTGCTTTTTTATTGTATTTTTTATTATTTTCTTATGTAATTTCCTTGATTTATTAACCAATCATTTAAAGTATT:1 - chr3L 18091326 3' - HeT-A 366 1 63.37 TAAAGAATAATAAAAAAAAAAATTATAAGCATTTATTATTTTAGAAGCTATCCTGTAATTTAATATTGATAGTTTTATGAAGCTTAATGCATTTTCACCTT:1 + chr2L 16947655 3' + Rt1a 5070 2 65.35 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCACACCATTCTCAAAAGAATCTTATCATAATGTATGGAACAATTGTAAAGATA:1 + chr2R 7454161 3' + 1360 3364 1 55.45 TTTAGGCTGTTCGTAAGAACAGCAGTGTTTGGTTTTGTCCAACGCAAAGTCCCGAAATCATTAATATTTTTAAAAAGTTGAGTAATGGAGCCGCATTTTTA:1 + chr2L 16946514 3' + HB 202 1 77.23 AGATCGGATTGTAAGTCTAAATGGCACGAAGTGTCCTTGTACTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATA:1 + chr2R 1234689 3' - Q-element 626 1 76.00 AGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGTCACTAAAATTGCTCATATATTTGGAATTTTTAATATCAGAGAAAATTG:1 - chr2R 23663628 3' - blood 7201 2 71.29 GTGGGGCAATCCGCGAACACAACTACACCGGTGTTTCGCTAGCAACAAATTTCTCATGCTTTTACTTTTTTTTACTATTAAAACAAATATTTTTTTTTAAA:1 - chrX 7082216 3' + Gypsy12A_LTR 1966 1 50.50 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCAAATCTATATACAGTGTACATACATGGGAAGCCAGTCGAATGTGCATTAGCCCAC:1 + chrX 2025753 3' - 1360 22 1 68.32 AANTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGC:1 + chr3R 22494196 3' - 297 6594 2 65.35 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCA:2 - chr3R 17665977 3' + Transpac 275 2 61.39 TTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATCGTATCTTTATATATATATATATATATATATGCATCATA:1 + chrX 3003691 3' + Quasimodo 7338 2 74.26 AGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATT:1 - chr2R 544770 3' - HMS-Beagle 3 2 76.24 CATCGAACCGGGAAGCTTTACGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAACTAAAAGACTATAACCCTTTCTCT:1 - chr3R 5425301 3' + ZAM 69 2 76.24 TGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAGTCATAATT:1 + chrX 21452836 3' + INE-1 563 1 46.39 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATG:1 + chr3L 10557637 3' - 412 7092 2 62.38 CGGATCATTTATTCGACTCGAAATAGGAACTACGTAATTGGCGCAGTCGGTGTGATCAGTGTTAAAGTTCCAGATCGCGGATAAAGAAACCCTACATTCCT:1 + chr2L 16134874 3' + Tom1 372 3 68.32 TATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTCGGCTATAACTCAGTAGCTTTATCAAAAAACC:1 - chr3R 17275628 3' + Quasimodo 32 2 68.32 CAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAG:1 - chr3L 23933557 3' + Cr1a 243 1 65.35 ATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCCCCCCAATACGTCACTATATATATATTTGTATATATATGTGCCGGCACACAGGGTGCCAAAGTGGACAATTTAATGTGG:1 - chr3L 1830840 3' - 297 17 2 61.39 TTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACCGCACCGAACATGCCCATAATCAGTTCAAACAAATCAACTTTCCCGAAAC:1 - chr2R 21874902 3' - P-element 103 1 57.43 TGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGGCGGCAGGAAGCAGAAAGATCTGCCAGATCTACAACAACCATAATTTAAAGGCAACACAACAAGGA:1 + chr2L 12870443 3' + I-element 339 1 72.28 GTNTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATACTTATTATATACACTTGATCAGTCACTCGAACGGAAACGGAGGCGATTACGAATGCCGCTCACA:1 - chrX 5887646 3' + S-element 1710 2 73.27 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTCATAGTTCCATAATCTGTTTTGC:1 - chrX 4174914 3' + I-element 5305 1 73.27 ATNTGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGTGAAAAGTTGGAACGAAAGAGTCGGGTGTCCATAAACATTGATCTATAAAATCTAGAACAGTGA:1 - chrX 8150380 3' - rover 3 2 76.24 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTCTTAAAATACATACATT:1 - chrX 9579297 3' - Tirant 10 2 71.29 AAAGGGAGAAGAAAAACCTTAAATGGATATATATAAAATTCAAGAAAAGCATAATAAACATGCTTATGTACCAATTTGGAATATTAAGTTAAAATTACGAT:1 - chr3L 15646875 3' - Juan 4030 1 71.29 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTCTAATT:1 - chr3R 26140744 3' - 412 32 2 58.42 AATTCCTTGGTTAAGCCCCACCCCATCGTCCCACAGCCGGGTCCAAATCAGTTCAGACTCGGATTCAGATGCGAGAGCCGCAGCGAGAGAACGCGGTATTA:1 - chr3L 20317082 3' + Idefix 215 2 81.19 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGAC:1 - chr3R 20373263 3' - I-element 53 1 76.24 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACTGTCGGGC:1 + chrX 10644886 3' - hobo 26 1 53.00 GTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCACTTCATCTGCGGCTTTGGCCGGTGCTTAGTGCGCCCTTTGTTTTCGCCCACATTTTTTCCAAGGGGC:1 - chrX 8831148 3' + Quasimodo 223 2 72.28 AGCGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGCTTGGGAGCGGGAAAATCATCTTACTTTGTATGTATCGTGCATGCTAGATTTTCCAGTGCCTG:1 - chrX 12955331 3' - diver2 258 2 70.30 TTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTGTTGAAGTAATTTTGTAAATGCTTTGTGGGTCTGTCATCTTTTTAAGATCATTCTTTTGCTAT:1 + chr3R 15796999 3' - I-element 241 1 75.25 CAGGACCTGGTTGACTCCATGCCAAAGCGTTGCGCACCTATTATTGCTAATAAGGGTTTTAATAGGCAATTTAATATGCGTTTTTTTTTGAGGTAGTTATA:1 - chr2R 8106977 3' + Tc1 1280 1 55.45 ATNCTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAACTTGTTCACGCTTTAATGAATGTAAAAAGGAACATAGTTTGG:1 + chr3R 25424242 3' - Doc 4508 1 56.44 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTAAGCACTTCCTCT:1 - chrX 6518778 3' + pogo 2058 1 72.28 CTNATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCTGTCTATTTCAACATCACAACAACATGCCATCAAATGTTCTTTTTGCGTGACGCAGT:1 - chr3R 4600417 3' - Tabor 21 2 59.41 TTAATTTACTTTTTTTTTTAAACACGTCTGCCAGCAGGCGCGATAAGGACTAATAACAATATAGCTCAAAGTTCGCCTCGCAATTACGCAGTTGAGACGGC:1 + chr2L 3165181 3' - NOF 3956 1 91.09 TCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCAATATATTATGCTAAAAAAAAAACAAAAGTGTTGCCTATTTTTCGGGGCTAATATTGATAACCAGCTGCTAA:1 + chrX 6509853 3' - jockey 11 1 66.34 GACGGTTAAGTATGCATTGTTCCGGTGCGAAGGGAGTGTGAAGAACCACCTGAAGTGGCCCTGCCAGAAACCCAAGATCCGAAGAGGCCAGGCCACTGGAG:1 - chr3R 4672824 3' - Doc3-element 289 1 71.29 CTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACGTTTTAATTAGATTTTAATTTAAAAAAAAATAGTCGATTAGACACAGATACATTGAC:1 - chr3R 9192506 3' - invader3 22 2 55.45 TCNACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGGGAATGCAAATTGAAATGCTTAGCAGTCGACTCTGCAGCTGCAGGTGCGTTCAGATTGGGGTCAGT:1 - chr3L 18476815 3' - accord 7344 2 69.31 TCTGAGTGATAATACCTCCGCAAGACTCCCCGGAGGTAACTCGCGCGAGAAGCAAGTTGGCAGAGTGAGAGCTTTGCGACAAACGAGCTACATGGCTTATT:1 - chr3R 3753071 3' + ZAM 433 2 59.41 TTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACTCATTTAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTC:1 + chr3L 24916687 3' - Porto1 151 1 29.00 GCCGTGCGCAAAAGAGGAAATAACGGCGTAAGCACGGATCGTGGAGTTAGTCAACCAAACCGCGCGTGAATACGAGAGAGAGACAGAGAGAAAGGGGATAT:1 - chr3R 2559798 3' + gypsy8 305 1 67.33 TTATGATAAGTGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGATTCGTTTTCGGTTTTTTATGCGACATAAACAACGCTC:1 + chr2R 19265074 3' - X-element 4544 1 62.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTA:1 + chr3R 27900457 3' + roo 356 2 78.22 TGAATTGGGATTTAGGTAGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGAAAGTAGATTCGGGGTGGGGGAATAGATATAGGGGTTCTGTACCCA:1 - chr2L 12893240 3' - I-element 4979 1 63.37 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTTTGATTAAAGCAACTAT:1 - chr2L 1912981 3' - pogo 16 1 60.40 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAATAAAGCCGAGAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAA:1 + chrX 22745718 3' + copia 227 1 48.51 AATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAACAGAGCGCAAAATCATAAAGCGTACAAGGCAACAGCAAAATTTCCAACTTTTGTAATCGAG:1 - chr3R 26161091 3' + HeT-A 6042 1 64.00 TANCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAATTGCATGACCCTTACAGTGTATTAAATTTTCGCATTGGTTTGTATATTGTGATAGTCTAGAGT:1 - chr3L 7907531 3' + Cr1a 4137 1 60.40 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATAGATATCATCATTGGTTGGAGT:1 + chr3L 17172706 3' + roo 353 2 77.23 GACTATCAGATACCCGTTACATAGCTAGTTTAAGTGCGATGAAGATACAGATATGCAAAATATAAAGAAATAAATATTCTTACCAAGATTGCTTACTTATA:1 - chr3R 21628568 3' - INE-1 549 1 47.52 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATATCTCAGTTGAAAATTTAAGGTCGC:1 - chrX 9951419 3' + I-element 5302 1 74.26 CGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAATTTT:1 - chr3L 2392378 3' + Transpac 5192 2 65.35 ATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGTATGGGCGTGGTATCTGTGCTAACCGGCTTCACTTCTTTTGCTTACAAATGAAATTTTCAGAGAATTTTAAATAATTAA:1 - chr3L 3834004 3' - HeT-A 5936 1 83.17 GGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGTGCGACAGACCGGAAGTAACGTAAAACGTAACAAACGACACATTGGGGCACAATTTGCACACGTGTCGT:1 - chr3R 23247731 3' + gypsy4 15 2 72.28 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCCGGGTTGGTTTGCTTT:1 + chr3R 17674383 3' - blood 7048 2 64.36 TTCCTATTTGCCAGTTAAGTTTTCGAAATTTGTTTATTATTTCATTTCGTTTATTTAGAATGTGCTGCAAAGGCAGATGGGTAACAGCCCATTTCTGTCAT:1 - chr3L 11434139 3' - Porto1 4185 1 66.34 GTNTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAAAGCCCCTTTCTATTTGTTTGTGT:1 + chr2R 23336813 3' + 1360 3243 1 78.22 GANGAGTGATAGTCGGTGACTGATATCTAAATATATTGGGACATTTTATGAAGAGTACGGTGACCTTATTTAAGAATTAAAGATTGCTTAATATTTTAAAT:1 - chr3L 18511029 3' - Ivk 1 1 74.26 GCCACCACTAAATTTTCTCCAAACGATTTAGTCTTCAACTTTAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAACGTCTTTTAAGGCCAGAACCCTTCGAAA:1 - chr3L 13342195 3' + Bica 4450 1 72.28 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:1 + chr3L 25232906 3' - GATE 8272 2 50.50 GGGAATCGTTTAGTTCCTTCTGAACTCAACCTAATGTGTAGCTGGACAGATTGAAATGATTAGCCTGTAAAGTAGAGGTGGAGGCCAAATCCGCCCGCCCA:1 - chr2R 18154885 3' - G5A 2805 1 61.39 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAACTTG:1 - chrX 19820028 3' - mdg1 7046 2 67.33 AGACGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCTGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGTCCGCCGGGACCAGCGGGACCACCTGGTAAGTGCCAGCTGAAGGCGCGTG:1 + chr3R 16552469 3' + Cr1a 4396 1 52.00 GAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGTAATTTGTGAGTGTGAATGGATGGATATAAGTGCGATTGATGTTATGGCATCATTGGTGGG:1 - chrX 741565 3' - Porto1 498 1 68.37 ACACACACACACACACATACATGCGCACGCACACAGAGACACAGTCGCACTTGAAGTTTGCTCTCTGCCGGACAGTTTGGCCCGTTGGTGTTAATTCAATT:1 + chr2R 21373111 3' + Quasimodo 37 2 83.17 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTACGAGAGAGAGTGAAAG:1 + chr2R 21497519 3' + P-element 2827 1 20.79 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCATCGCCGGCATTTTCGCTCGCTGTTTTTCCAAGAACACCGCTGCCTACTTTGT:1 + chr2R 8314226 3' + hobo 2932 1 65.52 AAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGCCTACGGAGTTGCGGCAGTTGTGTTGGAATATTGGTGTACATGTCCGATTTA:1 - chr2L 23173371 3' + 1360 3140 1 51.49 TCGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTTTCATTCATAAAAAGATTTACTTCATTAAAATTACGAAATCATAGCACACTTTCAGGAGCTTCCATGGCATCCAC:1 - chr3R 11481811 3' - jockey 4760 1 77.23 TGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATAATGCGGAGTTCTTTGTTTCAATCTTTCCGCTATTACTTGCGGCAGTGCGTGCACATTCCGTTTGCCACTT:1 - chr2R 11273673 3' - invader1 3894 2 69.31 AATAATTTATTCGCTCGGTTGGTTGGCTGGATGGTTTGGTCCTGGCGGG:1 + chr2L 3738136 3' - F-element 4538 1 75.51 TTCTTATCTAACGATTGAAAGCCCAACACCTGTGACAACATCCAAGCCAAATTGTTATCCAGGCTCCACCGATAGTCGCTGTCCCCAGAAGCCACCTACTA:1 + chr3L 20420779 3' + gypsy10 5567 1 76.24 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATATCAGATATCTGACTGTCTAATCCTTTTGGTTTACTAACTTAAATTGG:1 - chr3R 19206094 3' + mdg1 394 2 53.00 AAATATAAAAATATTTTTTCTTTTTGCTATTTTACTATCATATTAGTATATCATCACAATTTGGCCACGAATATTAAATAAGTGACTAATGTTGTTAATAG:1 + chr3L 18653193 3' + transib1 1956 1 44.55 GGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTTTATAATTTTTTTTCACATTTTTCCGCATGCTTTTCCGGCATGTTTT:1 - chr3L 14709709 3' - I-element 4952 1 61.18 TTTTTTTTATTCTTTTTTTTTGTGTATTGTTTTCTTTTGCCTTAAGCGTGTATTAATATATTCGTCTATAAGGATATCACTTTGCACTGATAATTTTATTT:1 + chr2R 9642935 3' - gypsy7 5006 1 83.17 GCTCATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCAAGCTCAAAGCTCAAATTCCGAATGAAATCCAATTCAAACATTTACCAAACAACACAATACCATAACGA:1 + chr2L 20856890 3' + 1360 194 1 72.28 AANATTATTATTATTACTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAAGCCCATTCTAATGA:1 + chr2L 6645716 3' - mdg1 7071 2 52.48 AGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAATATACAGGATTATGTTTGTTTTTTTCCCCCTCCAAAGCTTTTATATTTTTAAAGGAAAGTGAGGTTGTTGCA:1 + chr3L 14585941 3' + Tc1 129 1 65.35 TGTACTCCAAGCTTAGGGGAGAGCGAACGTTTATAAGCCAGTGTAGATCCCTTGCTTATAGCCTTTGAAACTATTAAAGCCATCTTAAACTGGGATTTCTC:1 - chr4 993609 3' - Doc3-element 4264 1 56.44 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTGTTACGAGGCTCGACGCAAATTAAAGTA:1 - chr3L 14209018 3' + Quasimodo 7333 2 65.93 GGNGAAGAAAAACCTTAATTGACAAAAGCACCCTAATCAATCAGTCATCATAGTTCATTGTCCGTCGGATCGCAAGTACTATGCAAATTGATGCACTTGAT:1 - chr3R 7459791 3' - Juan 4026 1 76.24 GATATCCGTTACTCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGATATCGATAGATACTGGGGAATAAAATGGTCGTGACCGTTTTGGGCGTATTGTAG:1 + chr3R 23891338 3' - INE-1 541 1 60.44 AAAACCCCCAATTTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTCCGTTGTCTCGTTGTCATTGTCCGATGATCCCATATCGACTGCCTCAACACTTT:1 + chr2L 3352857 3' + Doc2-element 484 1 55.45 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGATTTTCGGCTTAGGTTGAATGCC:1 - chr2L 9523770 3' - FB 54 1 79.21 GAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCTTTGAACATTTCCC:1 - chr3L 9076560 3' + mdg1 7433 2 52.48 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGATTTAATTGTGATCATTTAGGAAGAGGAACCCAGAAAATGATTCGTGGCATATATGTACATAAGTGTA:1 - chrX 20933719 3' + mdg1 414 2 71.29 TTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCATTTTCCTGCTGTTTTTTCTTCAGCCACACCCACATT:1 + chr3L 5199563 3' - Ivk 361 1 64.36 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGTATTTGAATATACGTATGTACATGTATGTACATGTATGTAAATGTATATAT:1 - chr3R 10288079 3' + roo 9034 1 58.42 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGGGTACGTACCTGCAGCTCATAATTGCAGTGGAAAAAGCAGCAATGGCAACTGCCTCCTGCAAT:1 + chr3R 22494199 3' - 297 6591 2 68.32 GTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGCGTCAACAAAAGCAAAAACGAGGCTTAAGTCCGATCCGAAACCGGCTGCC:1 + chr2L 13247913 3' - pogo 352 1 60.82 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAACGAAAAA:1 + chr2L 12323030 3' + hobo 2896 1 70.41 AANATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAGAATGTGCACAAATCATCTAAACACATCGAATGAGAGATA:1 - chr3L 24131071 3' + HMS-Beagle2 300 2 65.35 AANAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCGGGCTAGAGC:1 - chr2L 17205158 3' - hopper 6 2 71.00 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCA:1 + chr3L 16973438 3' + S-element 1674 1 72.28 ACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTTTCCACCCCCAGCACTCATAATGACTTAATTA:1 - chr3L 13651692 3' + hobo 2523 1 68.32 ATATCCTTCTCCGTTCTCCTCTGTCCTCGCGGTCTTCTTTCACCTTCTATCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCTGCTA:1 - chr3L 14013175 3' - gypsy8 4474 1 69.31 GTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACATTCGGGCGCTGCTTCGTGCGGATGTTGCTGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC:1 - chr2L 18885844 3' + BS 65 1 63.00 TGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTAAATAATTGATTAAACTTATACTC:1 - chrX 14771740 3' - BS 4816 1 80.20 GCCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATTTGATTTGATCAGATACGATTGAGAGCGTCT:1 - chr3R 5435969 3' + Quasimodo 338 2 68.32 CATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATGGGGCCCTTCCAGGCGAGATTTTCCAAG:1 + chr2R 9558300 3' - X-element 4561 1 72.28 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCAATATATTATGCTAAAAAAAAAACAAAAGTGTTGCCTATTTTTCGGGGCTAATATTG:1 + chrX 6509838 3' - jockey 24 1 52.53 ACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTATCGCAACTGTACATGTCGGATGATCGCCTTATAATACACGAAGAAAA:1 + chr3R 5169225 3' + Tc1 1619 1 95.24 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAACATCTGTGACAACATGGCGTATGATTTATATATATGCGGGTCCCGCACTCTGCATTTTC:1 + chr2R 15634307 3' - roo 46 2 72.41 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAAGTTGAATGGTATTTTGAATATTGTAAACCTTTTATATAAAAGCTCT:1 - chr3R 14609201 3' + blood 348 2 53.47 TTACTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCGGAAGAAATCTAACTGCAATTACCCGGAAAGCCCATTCTAATGATGTAGAGGCGCAA:1 + chr2L 6645729 3' - mdg1 20 2 59.41 TAAGATCTTGACGTTCATACGGATAGACGCACTGTCGGACAGATGGATCAGATCTAGCATATCCAAACCAACCAACAGCCACAACCAGTAGAAAAGCAGCG:1 - chrX 11433214 3' - INE-1 135 1 62.38 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGCAATCAAATGAAGTCAATAACAACGAGGTATTCTTTTGGTTTTGTTATTTTTAAGTATGCTC:1 - chr3L 11156197 3' - 297 5 2 71.29 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTAGGTACTTAAGTAACAGCACTAATCCTGATGAA:1 - chr3R 4971176 3' + 1360 3343 1 71.29 AAACAAGAATTTTTCGTATGATGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTTCAGGGCACCAAGACGGATCAGTTCAAAT:1 + chrX 15644648 3' - 1360 280 1 75.25 TTAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACGTGCCCGAAGG:1 - chr3L 7295154 3' - G2 2948 1 53.47 GGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTT:1 + chr3L 23702268 3' - G4 5 1 70.30 GTNAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTTCATATGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCTCGATTGAATTATCTTTTG:1 + chrX 5442088 3' + hopper 1405 2 44.00 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGCATTAAATTTACTAATTAA:1 + chr3R 29357090 3' + 412 446 2 79.35 ACGGGGGGAGGATGTTGGGTCATTTGCCATCGTCATAATGCCGCAAAACAACTGCGCAGCTGAAGGCGAAGACACCTTAAGTGAGTTCTCCCCTGTCGGCG:1 - chrX 10668190 3' + diver2 4521 1 78.22 AGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTTCCAATCCAGTATCTTCCTGCT:1 - chr3L 13612570 3' - R1A1-element 280 1 65.45 AAGTTGGTATTGAATTTGGACTTAGGTAGTATTGGTATTGGTAGCACTTGCTGCGTTTCCCTCCGTATAATCTGTTTTTTGGTTGATTACGCTTTTAGTA:1 + chr2R 1344771 3' - I-element 4989 1 72.00 CTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCAAGCCATCATTAACACGCACAGAGCCCACTTCCATTCTTGGCCTACACTGGGAAAAAGTATGA:1 + chr3L 15775555 3' - R1A1-element 208 1 67.00 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGGGGGCGGGATGAGATCCTTTTTGGAGTTAAGCTTAAA:1 - chr3L 9064307 3' + jockey 4950 1 61.39 TATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGGTAGTTAAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGCAACAAAAACAATAACACCACCGATGACAATGGCAT:1 + chrX 1757941 3' + invader2 314 1 71.29 ATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACAACGACGCTGGGTGCTCTGGTCAAAA:1 + chrX 4448636 3' - 412 2 2 78.22 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTTATGAAATTCGCGTTTGG:1 - chrX 4969036 3' + 1360 3358 1 62.38 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCAGGCTCCTGTCCTGTCACGGTCGCCATGTA:2 + chrX 21555675 3' - Tirant 51 2 71.29 TCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCCGGCTTTAAAAAGCCAAAACTTTC:1 + chr2R 22456229 3' - diver 31 2 76.92 ATNCTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGGGAGAGAGCGGCGGCTACAACAAAAGCAACACCTGG:1 + chr3R 24006954 3' - P-element 33 1 42.55 CCCAACTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCATCCCCACCCTCCGATGAAGTCCAGCAGACCAGAGCACAGAAAGTTAAACATGGAGCTAC:1 - chr2L 22183390 3' + Idefix 158 2 58.42 AATTTAAAAAAAAAACGAAAAAACAGAAACTTATGTATCTTTAAAAAAAAATTTAAGAAAAGAGCCGCATGCTGCTATTGCAAGTCAGCGAAATTTTTCCC:1 - chr2R 13964159 3' + TART-C 11098 1 88.12 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAACTCATTAAAAAGCCGAGCGGCATTTAAGGATGCGCCTGCGCAGC:1 - chr2R 9658335 3' - P-element 29 1 50.50 AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAG:1 - chr3R 14049334 3' - transib2 18 1 61.00 TGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACACACACACACATGCAGTTGAAAAAGGATACAGAAGGAACTTTGGTCGAC:1 - chr3L 11000769 3' + 1360 3177 1 52.48 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTATGATGGGTGCCCATAAAAAGAGGCGCCAGACTGTATAAGGATGCGCTGAAGAGTTGCC:1 - chr3R 28698764 3' - 1360 15 1 64.00 CCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCAGTCAGCTCTTTTTTAACCGCCTCGTACTCGAAGTACAATACGTGCAGTGACTTTAAGCAAGCTTT:1 + chr3L 26740148 3' + invader1 3662 2 72.28 TTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCGACGTTTCCAGTG:1 + chr3L 22046505 3' + roo 385 2 58.42 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTCTGTGAAATGAAAGAAATTTGCATATGAAAGCGTGTTTGGTTGAAACAGTTATCACCGTTT:1 - chr3L 22046411 3' - roo 16 2 63.37 ATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCATATACAAAGACAGAAAATCAT:1 + chr2L 261072 3' + Juan 4208 1 76.00 TTTTTTTTATTTTTATGATTTGTAACAATTTATGGATTACAAAATATTACAAAATATATTACAATGATTTTTACATAATTATATTTTCACAATACATACTC:1 + chr2R 10927220 3' - Rt1b 5147 1 56.44 TTATTGTAATATATTAATATTATCTGTATATAGCATATTCATTTGATTTCGTCATCACACTCATAGCAAATTTCATAGCCCACTTTAATTCTTCCC:1 + chr2L 3664682 3' + Tc3 293 1 77.08 GCTTTTNGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGGTTTTTTGCCTCACCTAAAATGCCACGCGAAATACTTTTATGA:1 + chr3R 12554944 3' + mdg1 7426 2 53.47 CANTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATCAGCTGGGAAATGTGCTCCCTACTCAGGTTTAGCGACTTGTATTTC:1 - chr3L 12172807 3' + 17.6 7393 2 54.46 TTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGCACGGAGAGCAGCCATCGAGTGACGGCGATGCCCACGGCCCCGACCCTCAACTTAATGGCGCCCAACGACGAGA:1 - chrX 20268022 3' - I-element 4911 1 80.61 GTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCACCCTTGCAATTCTCTGGTCGAGTGGCTGTCTACTTGAAAACAATTCTTTTGCTGAGTGTGTGTAACGAGGCCAT:1 - chr3R 20100399 3' - hobo 23 1 71.29 ACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGACTACCCCCAGTACTTGGGGCCATTTGCATAACTGGTCGGAAAAGTGGTTTGGCC:1 - chrX 9852434 3' - I-element 4991 1 56.44 GANCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTAATTTTCCCCGACGTGTAGAAAACTAGTTGTGGCATACAGGAAA:1 + chr3L 7629640 3' - opus 7030 4 56.44 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTACCGTGTGCAGAATGAATGGACTCTCACCATCCATCATTCGAGTATCAGTCAAAATTAA:1 - chrX 8337887 3' + hobo 2929 1 67.71 GTNAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGCATGAAACAGAAATTATGAATGTGCTTAGTGTGGGGCATACATATAC:1 + chr2L 19397111 3' + hopper 1388 1 54.46 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCTCTCATT:1 + chr3L 10557664 3' - 412 12 2 67.33 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTAAGTATCCTGCGTCGTGCCACTGATTGAACTGC:1 + chrX 20331908 3' - mdg1 6 2 74.26 TACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAATATAAAACCAATGTTAAACTATTGAATATGTTAAAAGCTAGAGCTCAATCAGGAAA:1 + chr3R 16593903 3' - Max-element 20 2 59.00 CTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCATTGTTTAGACGATGAAATTTATTTGCACAAAAGCGAAACTCTATTGTTTCGCCCTCAGTTTTATCCT:1 - chrX 4187594 3' - I-element 471 1 73.27 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTC:1 + chr3R 17243215 3' + hopper 1400 1 61.39 CACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTCCGCTGGCATA:1 - chrX 22637961 3' + INE-1 533 1 65.35 TCCTTGTTCTCTTTGTTATCTACCTACGTTAAACTTGGGCGCTGCATTTTGGCTGTCTGTCCCGCCAATCGCCACTTTTTGCCATTGCCTGCAGAAAACTT:1 + chr3R 14255011 3' + diver2 4678 2 72.28 TAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAAACCAATTTAGAGGAACATACTTGATTTTATGCTTTCAAGTCATAATTAACCCGT:1 + chrX 21452843 3' + INE-1 566 1 44.55 ACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGTATATGGAAATTTTCCCTGTCACATTTTC:1 - 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micropia 128 4 74.00 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAATAATGGTAAGAGATGGCATATATCA:1 - chr3L 4859335 3' - jockey 4811 1 73.27 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGCACTCGAACGCATTAATGTGTGGCCCACCCACACACTGACAAACACACACACACACACACACACACACACGAAC:1 + chr3R 10446285 3' - hobo 1 1 67.33 TGTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACGGACGGACATGGAGTACATTTACATTTACCAGAAAGTACTAAATTCAATGCATTTTGCCGGAACAGAATATCTTT:1 - chr4 609033 3' - INE-1 141 1 67.33 GGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGCGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGGCAATTGTTGTTTGTGGTGATTTATTTAGTGG:1 + chr3R 7178141 3' + INE-1 97 1 62.38 AATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTTTTAGCTTAAGCTTAATTTAGATAGGGAATATGATCTAGACTGTTTGCTTGATTAACTATGCATAAATG:1 - chr2R 20924877 3' - Burdock 254 2 70.30 GAGCTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTATTGCTGCTAAGCATTGTTTTCCCTATATGTGTATTGTAATCCACTTGGCAAATAATCCAGGTTTACTGGTGGC:1 - chr2L 523979 3' - Doc4-element 2566 1 78.22 GGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCCATGGTAGAGCCCCAGGTGGTGGTGCGGATGG:1 - chr3R 24792856 3' - F-element 4495 1 71.28 CAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACAGATATTTACAGTGCTCAAGTGAATTCACAGTGCTTAAGAAACATTAAACATATCGCATATAAACACTT:1 + chr2L 12618948 3' + G-element 4149 1 73.27 CCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAATTTCCCCCGGCCAAAAGTGTTGAAGGCAGTTGGCAA:1 - chrX 4448545 3' + 412 455 2 66.67 AGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAACCGCACCTTTAGCACAACAACAAACAACAAACAACAACAACAACACTAATGAACGGCGAAGGTTTCGTAAATCG:1 + chr3L 11261323 3' + Doc3-element 450 1 57.43 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTGTTTGATGTTATTCTTGAGCCATAGTTGTTGCCGAAGGCAATGCCATTA:1 + chr2L 18223847 3' - roo 8689 2 57.43 GGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAAGACGAGATGTCCATCGCAACTGTCGAATTTTATTTATTTCGCTAAGGCCAAA:1 - chr3L 22253056 3' + Rt1a 4706 1 55.45 ATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGCTCTACAAATTTTCGGTTGAGCATTTTCTCTGTGAAGTTTGGTCAAAAAATTCTAAACTGGGTTGCGGAATTT:1 - chr2L 17038039 3' + R1A1-element 72 1 73.27 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCCACTTGCTTCTTCAGGGACCACACCTTGCGCAGAGTCTTAACAAAG:1 + chrX 17283983 3' - 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chr3R 30904204 3' + roo 9042 1 56.44 CTNGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAAATAAACAACAATTTTACTATATATATATACCCCAATCTACAGCAGCTACGAA:1 - chr2L 12283963 3' + 297 6929 2 73.27 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATGCTGAAAATTAGAGGGCGTCAAATTAGAGGCAGTGAAAGAGCA:1 + chr2L 1913075 3' + pogo 2074 1 55.00 GGAAAATACTCTATTAAACCTTTTTTTAGTTCTATCGTAAGTAGTTGTGGAAAAAGAGTGAGAATGAAGTGCCGAAACAAGTGCTCGACAAATACAGCCGC:1 + chr2R 21946550 3' + ZAM 496 1 74.26 TTNTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCCCGGTGACAATCTCTGCCGGACGGACGTACTCCCTCCATCTACCAGCTTCCGCCTTCCGCC:1 - chr2L 2685715 3' + hopper 1403 2 67.33 GCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAATTGCGGACGTGCCCGTTTCTGCGGTTAAGAGCGAGCGTGGAA:1 - chr4 54748 3' - INE-1 567 1 62.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAGCGGCGGCGG:1 + chrX 18356243 3' + P-element 2878 2 49.21 ATNAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACAGGCAATTATTTCTGCCAAATCACTGCCCAAATACGAAATAGGTGAACGAGGAGGCCAGGACTTG:1 - chr3R 24430497 3' - Transpac 9 2 69.31 GTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGTCTGGTCGGTCAAATAAGAACCCACATATTGGGGCAGACCGCGTG:1 - chr3R 30191767 3' - F-element 4398 1 55.00 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGT:1 - chrX 6654464 3' - jockey 4775 1 73.27 GAAAATTGTGTATAAATACTTTATTATTAGCTAACTGCAATTCATCACAATTAGTACGTTTTAGTACGATGGTTCAATGGATCAATATCAAATAGAAATTA:1 + chr2L 22355150 3' + Bari2 966 2 63.37 ATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCACGGTTTTAGCGAGTTATTTATTTAAAACATCCTTCTGAGAGGCTCTCATCATCCCCCAACCA:1 - chr3R 11337772 3' - X-element 55 1 70.30 AAGAAAAACAAAACAAAAAAAATTAATCAAAATTATTTGATATCCAACAAATTCAAAGAACATTAACTTCTCCCTAAACCTAAACATTCATTCG:1 - chr2R 12924925 3' + Doc2-element 220 2 71.28 GCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTT:1 + chr2R 9199936 3' - G6 1693 1 77.23 CGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCGGCTAGAGCGAGTTGAAATACACTGAGAAAAGCTA:1 - chr2L 19366619 3' + BS 4780 1 65.35 ATCCAATTTGGGTAGGATTGTTCTATATCGATCTGGAGTTATTTTTCTATTTCGGTTTGATATTGAATTACATTCAATTTGCTTATAAACATTTAAACACT:1 - chrX 14461456 3' - I-element 4897 1 58.42 TAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTAGCAATGTCCGTCTGTCCGTATGA:1 - chr3L 23871829 3' + mdg1 261 2 55.45 CCGTCTCTTGTTCGTTTGCATGCCTCGACTTCTCCTCCTACGGCTCCGTCGGCTCCTCGAGCGCTGGAGGC:1 - chr3L 4419957 3' - I-element 356 1 56.34 TTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGGGTGTCCATGTGTGTGCCGTTCGCTTGTGTCATTCATTTCCGCGACACCGCCCCTTTCGGCATTCCTCTCATAAG:1 - chrX 8202520 3' + F-element 4461 1 78.22 TTTAACTATAAAATGTACAAAGAAATCTCAATATTCCAATAATAACTGATACCCAAATAGAAACCCAATAGAAACCTTAATATTCCTGCATCCCTGAGCAT:1 + chr3L 6870011 3' + transib2 2760 1 67.33 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAGTG:1 + chrX 4806746 3' - roo 29 2 61.39 ATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCGGGAGATAGATGCGCTGACCAACTCGCATGTGTGT:1 + chrX 8313264 3' - jockey 4555 1 60.40 CTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTT:1 + chr2R 9199937 3' - G6 1692 1 76.24 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGGCACTCGAACGCATTAATGTGTGGCCCACCCACACACTGACAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' - hobo 14 1 66.34 GTATAATAAATGTATCTCCCAAATATCCTAGTTAATACTTGTTATTGCTCTGTTGTTCCACTGACCAAAGTCCCATCCAGTGGTCTGGTTCGCTTCCTGT:1 - chr2L 17761701 3' + accord2 106 1 76.00 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAACTCATTAAAAAGCCGAGCGGCATTTAAGGATGCGC:1 - chr2R 9658344 3' - P-element 38 1 41.58 ATNTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGAAAATGAATATTTATTATATGTATATGGAAAAATGTTG:1 - chrX 16243797 3' - 297 6612 2 64.36 GANAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAG:1 - chr3L 9076583 3' + mdg1 7410 2 70.30 TGNTTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTGTGTCTTTCTACATGTATACAATATAAATTTAAACTATATTTACCTTCTTC:1 - chr3L 9779901 3' - Quasimodo 6912 2 52.48 CTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAATTTTAAGCACTCTGAATTACTACTAAAAATTCATTGGCTTCATTCATTCTT:1 - chr3L 18463317 3' + 1360 149 1 71.29 AAATAGATTTTAATATAAAAAATGTAATCGAAAATAAGTTCAAAATTCTTCCCTACTTGAGTAGCAACATTATATAGTTTACTTAAGTTACTTCGAAAAGA:1 - 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Juan 4033 1 68.09 TAATAAAAATATCTAAAAATCAAGGTCTCGTAACCGGGTTTTCTTTGAAAACGCTTCATATGCTATTATATATACACCCTATATATATACACACATTAACT:1 - chr2L 16466741 3' + gypsy10 406 1 56.44 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCAACTGATCGTTTGGCTAATGACCTGAAAAGGGTATTTCAGTGGCGACTTTTGCTGACGCTT:1 - chr3R 26592566 3' + roo 397 1 64.36 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGCTGGCGTAGTCGGGCTCGTTTT:1 + chr2R 9658384 3' + P-element 2874 1 45.16 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCGTACTACAATAATAGACGTTATTGAATTAAAAAATTAACATTTAA:1 + chr2R 5178659 3' - mdg3 5295 2 64.36 AANAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAAGAGAGCACGTCGACTGATTGC:1 - chr3R 24739029 3' - pogo 50 1 75.00 AGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAACGTGCCCGAAGGGT:1 - chr3L 7295152 3' - G2 2946 1 55.45 GTACCATTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAAGCGGCTATCAGCTAAATTACAAAACACACTCTCATATTCGCTGTCTGATGCGCTACGTTGCTCCTTTGTCG:1 + chr3R 2473614 3' + mariner2 156 1 69.31 GTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGGTTGATCTTTCGGCTTGTGTTATTAGCCAAGTCAGTGGTCTAAGGTCTGACGATATTGAATGCT:1 + chr3L 27378581 3' + gypsy6 7541 2 68.32 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTCAATAAACTTGATCCGAAAACACGACAAGGCTGTCT:1 + chr3R 10824112 3' - 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chr3L 911592 3' - I-element 203 1 58.42 CAATATGTTGGCTATCTGAGCAAGAAATTTGTACTCTCTCAATGGAACGGTTCTTTTTGTTGATTAATTGTAAAGATTTTGAATTTTGAGGGGCAGTTAT:1 - chr3L 853181 3' + Tc1 111 1 61.00 CANCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCGTATCTATGTACACCGAATTGCGGTTTTGGGAATTTGTCGCTTTA:1 + chr3L 6522356 3' + pogo 2073 1 56.44 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATAATTATTTAAAGCCATTTAAAAAATTGACAATCGATTGGATCGA:1 + chrX 5521134 3' - 412 7085 2 56.44 CATAGTGCAAACCGCTGTTCTCTCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTAACCAAACAGCAAGCTTGGGCTAGGGCTTTAATGG:1 - chr2R 17445578 3' + diver2 4629 2 72.28 AGNTATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACAAGAAACTGTTCCTTTGTTCACATATAGAAGAACTTT:1 + chr2L 12398192 3' - roo 39 2 64.36 CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATAAGTTATATTAGCATTTTTCTCAATTGTTTTGAGCAATATGATC:1 + chr2R 3065401 3' + Quasimodo 7339 2 67.33 AANACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATG:1 - chr2L 19845912 3' - F-element 51 1 61.39 TGTGGGAGAGCGAAAGACCGAGATAGTGAGAGCGAGAGAATAGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCGAAAAACAACAACACCAAACAAA:1 - chr3R 23295169 3' - Cr1a 302 1 83.52 AGTCCATATTAGAAAAGCTCGATAGCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATCTACAACAACCACAACTGCAGATTCAGCTAGCACAATCACTGAACAA:1 + chrX 12968884 3' + Idefix 7229 2 51.49 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTCGCGTTCATTCTCG:1 - chrX 18356217 3' + P-element 2830 1 22.77 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGC:1 + chr3R 24430565 3' + Transpac 5184 2 80.68 CGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTAGCAGCGGCTGTGAGTGCCGCCCAAAACGGAGTGGTCGCAGTGGCC:1 - chr2L 7499551 3' - accord 66 2 54.00 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATAACAGATCTGATTCTGATGTTGGCAAAAGTCGCTCAAGTCACGAGTGTTCGCAGTGGTCGCCGCTCATTCAT:1 + chr3R 6003045 3' + opus 498 1 79.21 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCCGGCTTTAAAAAGCCAAAACTTTCGTGGGTCAGGACCCCGAAATTCCCGCAGGAGACATGGCC:1 + chr2R 22456268 3' - diver 15 2 66.34 AGNTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTATTATATATTATATTTTCTGTAAAACTGGTAACAAACTTATTTTTCATTTCAGTCCCTGG:1 + chr3L 24131181 3' - HMS-Beagle2 12 2 67.33 TTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGGACCCCGTGCCGGCTCCAATGGGTTTAGGATATTATGG:1 + chr3L 23933119 3' + Cr1a 251 1 57.43 AGNTAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAACATG:1 - chrX 18952067 3' + mdg1 371 2 73.27 AATAATAAACAATCTTACATATATTATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATAC:1 - chr2L 12374988 3' + flea 257 1 75.25 GAGATCTCGACGTTCATGAGGACAGATCCTGATTAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGCTTACTTTTCCCTGTTACATACATACTTTTCAACGAATCT:1 + chr2L 22211542 3' - INE-1 134 1 69.31 TGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGAAGCTAGAAGGAGGTCGTGTTATTTTC:1 + chr3R 20377654 3' - I-element 5179 1 73.27 ATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTCTCCCCGCACACACAAACACACACAAACACACA:1 + chrX 7978947 3' - micropia 62 4 67.33 AANGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAACTTCCATATGAGTTAGAAAAGAAAGTTGGCCAAGGACTCGAGGACGGCTAAGACTGGTCCAATCGAAAT:1 + chr3L 1405189 3' + pogo 1739 1 71.29 GTCATAACTGTACACTTGGAGCCATTTAAGTTTAGTACGTTATCACGGCACAATATTTGAAAGCTGTCTAGATCGATAAGAAGCCACCACACCTTGACTCT:1 + chr3R 2912646 3' - Q-element 666 2 74.26 GCGAAGTCGCTTACACGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAGCGAGTCGGGTCTGTTGCAGCGATGAAATCGCTGGATAGGGGGATTGCGGGAAAGCGACGG:1 + chr2R 21552855 3' + Doc2-element 4582 1 64.36 AAACGCTTCTTTCTGCCTGTTACATACTTTGGTTAACATTACAACGCTACACTGTGCTCCAATACTTTCTGCCCCGAGTTCTCAGTTATTGCATGCGTGTA:1 - chr3R 24591617 3' - INE-1 33 1 70.30 AGNAGCTGGAGTTGATTGAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAATACAAAATCAAACTGAACTTGAGGTTCATAGAAGATTGGACCAGCGTCAGCAGAGAAA:1 - chr3R 1227554 3' - springer 188 2 57.43 GACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGGAGTTCATCATTACAGCCCCCTTCCCGAGTCGTTGGCTTAATGCGATTTCGCCCAC:1 - chr3R 5524684 3' + 412 458 2 59.60 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGGAGCGCAATCTAGATCGTCAGCAT:1 + chr2R 5262663 3' - 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chr3L 25783551 3' + Doc 4502 1 65.35 ATNAAAGAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTCTCAAGTTGTTAAACATGGATGTTTATTACTGGCTTTGTTTGTTAATTAAAATAAATACTTA:1 + chr2L 20694352 3' + I-element 313 1 67.33 AANGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAACGTATACAGATGTTATTTTTATATACTAGTGGATTATATAGTAAAATACTTAAGTT:1 - chrX 16587575 3' + pogo 381 1 66.34 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATAATGTAGATATTTAAAATGTTTGATACAA:1 - chr3R 5264000 3' - FB 47 1 75.00 GANGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGTGAGGTCTGGGTT:1 + chr3L 7061201 3' - I-element 38 1 59.41 CGGAACTACAAAAGCTAGAAGGTTGCGAACTCAGCTTGGACACATTTATAAAATATGCTGCTTTTTGTCCTATGCCCCTATCTTCCCACTACTCTCTCCCT:1 + chr3L 16255946 3' + INE-1 156 1 78.22 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTTTCATACACCCAAACCCAAACTTTGCGTAACCATGCCAAACGT:1 + chr2R 17938944 3' - copia 4902 2 59.41 TACCACCAATAAGCTTCTCACTGCTGTTCGAATACGTCACCCGAGCGGACAAGGTTTCCCATGTAGGCTTACAAAAAACCCCCGAAAAATACATAAAT:1 - chr3R 29906926 3' - R1A1-element 221 1 69.39 ATNGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAGTCCGGCACACAACACCAACAATCGGAATCAAACTGAAACAAGCAAGTTTTCTAGCCCGCAGCCAG:1 + chrX 6518865 3' - pogo 6 1 79.21 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATCTAAAAATCAAGTGCCAAGAAACTATTATTTA:1 + chrX 14040771 3' - roo 40 2 69.31 TATAATCTCCGAAGACGGCCGTGGAAATCAAGGTGAGGGACACGGTATATAAGTATGGGCCAAAGAGCACCATAGCTGCTCGATGGGCGACCGCCATTTCC:1 - chr2R 16781034 3' + Osvaldo 1267 1 61.39 ATAACTGTGAGTTCTACACGTACGATACTAGATCAAACAAGCGGCAGCAAAGCGAACCGGGGCCCAAACTATGCTCCAAAACCGAACCGGAGACTC:1 + chrX 12040194 3' + Juan 495 1 63.54 GCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTGA:1 - chr3L 23933554 3' + Cr1a 247 1 62.00 ATATTTATATATTTATATATATACATATGTATGTCATACCAGATGCCCAGATAGGACCCCTGCCACGCCTCCTCATCCCGCCTATCTCTAAAGCCAGCCCC:1 + chrX 3287244 3' - Stalker 87 4 87.13 CAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAACACTACAGTAACTACGGGAACAGCAGCGACAACAGCTGCAAAATTGAGCTGACGGAAGCGAACGAC:1 + chr3R 7234997 3' + Doc 45 1 74.00 TGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCCCGAAAATGGATATCCAG:1 + chr3L 5067858 3' - Quasimodo 44 2 72.16 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTACTTTGTCTTGTCACCGCCTCGATAAAGT:1 - chrX 17300346 3' - jockey 4685 1 63.37 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTT:1 + chrX 9439813 3' + roo 9029 1 77.27 TTNGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATTAACCCCAAACTAAAGTTTTCTAAAGACATCCATTCAATTCGAAAGATTGTAC:1 - chr2R 11363957 3' + transib3 2843 3 57.43 TTATCTGATGCAGCTGATCTGATTAATTACCGACTTAGGTGTGTCAAAGCCAGCGATCAAAACAAAAACACTAGAACCAAACGCTACCGCTGCGCCAACAC:1 + chr3R 2399607 3' - Rt1a 184 1 76.24 CAGCAGTGTTGGCGGAAACAGCAGCAACTTGGAGGAAGAGCATCTGACACGCGATGAAAAATAATAGGTTAGTTAGTAGAGTACATTAATGGATCATCAGT:1 + chr3R 23189161 3' + gypsy5 7099 2 59.41 GGGGTGACCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTA:1 - chr3R 4679277 3' - copia 4924 2 73.27 GAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACCATAATTATGCTCACGCTTACAGCCTTCGCCTCCAGCGACTG:1 - chr3L 15712315 3' + micropia 5188 1 58.42 CCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGCCTCTTGCTAAATGCAGACAGGGTGCAGGAGTTTGACGTGGA:1 - 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mdg1 45 2 67.33 GATCCTATTAACACTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTGTTTTATGTCAGCTAATGAATAATAATATATAC:1 + chr3R 11869833 3' + Cr1a 4294 1 75.25 AAGTTANCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGAACAACCAGCTATCCGAGACTAGGCAGAAGTTGC:1 + chr3R 446079 3' + pogo 2063 1 65.35 CCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGGCAGAGAGAAAAGCGAGCTGAGAAAAGCGAAGAGAGAGCGAGAAGAGAGGAGAAGTGGCAGTAAAGCATTTGATGTAA:1 - chr3L 2828941 3' + springer 7225 2 74.00 CANACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCACACATTTGCATATACTATACGAGTGTGTGTGCAAAA:1 - chr2R 8314156 3' - hobo 39 1 68.32 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACCGAAGTGCACTTGACTTTGCTGACCTCAGCGTAGTTTGTTTA:1 - chr3L 11156542 3' + 297 6936 2 58.42 GANATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCA:1 + chr3L 27415292 3' - transib2 39 1 62.38 GTGACANTGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGC:1 + chr3L 23678115 3' - 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chr3L 21917073 3' - I-element 5125 1 57.43 CTTTATTCTTTTGATCTTAGCTTAAGACAAACAAATCGTATTTGTACTGCCCTTTTGTTTACATTATTTCGGGAACGAGATCTCCCGCTTGGGATATTGA:1 - chr4 970230 3' - 297 6870 2 48.00 GACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACACACACACACGCATAAAACACGCTCTGTCTGCCAACGCGTGATATACACTGCGACAAAA:1 - chrX 17941192 3' + accord 226 2 67.33 AAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATCTGTAAATAGTATTAGACATTTTCCAATCTAAGGCCGCAAATGATCTTT:1 + chrX 8150493 3' + rover 7274 2 54.00 AAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCC:1 + chr3L 23678117 3' - Osvaldo 30 1 79.17 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTCTCTCAGTGCTCTCGCGGACAAGTACTGCCTGATAAAGAGGTGAAATCTGTA:1 + chr3R 28117826 3' + I-element 5335 1 55.45 CTNCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAG:1 + chr3L 6900674 3' + pogo 2053 1 76.24 GTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCAACCAGTTTGCCAGCTCGTTGGTGAGAAGAGGGTTTTAGGGGCAGACTGACAGGCTTGGATTTATGCTGCA:1 - chr3L 2814396 3' + R1A1-element 86 1 72.28 AGACGAGCGCCGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTTCACCGTCGTACAGCCGCCAAGCAACATCTCCGGGAATGGTAGTCTGGTTACCCAAC:1 + chr2L 8380105 3' + Doc3-element 262 1 53.06 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAGTGCACAAAG:1 + chrX 4806753 3' - roo 22 2 57.43 ATNCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGCGGATAGATGCCTGC:1 - chr3R 20984204 3' - hopper 53 1 76.24 CCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCCGGGTTGGTTTGCTTTTTCTTGGGAGGGCTTGGGTGGAAATTGCCTGTTTC:1 + chr3R 17674418 3' - blood 7013 2 77.23 TTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGAAGGATGCGGCGATTCATGGGCTGATATACCTCCTG:1 + chr2R 8364872 3' + baggins 4961 1 78.22 ATNAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATGTATGTGGGGGCAAGTAAAAAAATTGTATGCCCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAAGCAACG:1 + chr2R 16940422 3' + flea 5007 2 67.33 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTACTTTGTCTTGTCACCGCCTCGATAAA:1 - chrX 17300348 3' - jockey 4687 1 61.39 TGTGAAGTTATTTTAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCA:1 + chr3R 9192586 3' + invader3 247 2 55.45 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAAAATCGAGGCAAAAGTTTAGACTACAAAACACCTACCAACTTAAATTA:1 + chr3L 14854774 3' - Quasimodo 21 2 59.41 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTTAAGAGCTCTACAAAAGTCTTAGTT:1 + chr3R 20878201 3' - Doc 24 1 67.33 GCGTATCCGGCAGCGCAGCTACGCAGCTTAGCCTAAGACGAAAGATATTTTAAAACTCACAGAACAGACACTTGACGTAATTGTTCTTGTTCGCCGGCCAC:1 - chr3R 18442747 3' + 412 306 2 70.30 TAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCAGTGAGTGGCAGGTTCTGGGGAGCCGGCAAAAGTTTCCAAG:1 + chr2R 19219286 3' - Doc 426 1 58.97 TGCATACTTTTTCGGGGGGAAGAACATTGAATTCCTGTAGCTAAGGGGGTAAAGTCTCACCGCCGCTGTTGCACCTG:1 - chrX 8350371 3' + Transib5 2818 1 66.23 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATACACCCATGCGATCGGCCGCCCCAAAAGTATGCAACACTTTGCCCGACTCTCTATGCG:1 + chr3R 22341231 3' + hopper 1397 1 61.39 CCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGGCAGATTATGGCTGCTGGCAGCCG:1 - chrX 4040803 3' + roo 467 1 76.00 TATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTTAGGTCATCTTTGTT:1 - chr2R 912924 3' + mdg1 7458 2 78.22 ACNGCAGATTTGCGTGGCCGCTACGAATATGAGATCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAAATGTTTACAATCCCTCAACGGA:1 - chrX 4571706 3' + gypsy2 6593 2 77.00 AGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTA:1 - chrX 21564640 3' + diver 224 1 73.00 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTATGTACGTAGAAAAATAACAATC:1 + chr3R 23846872 3' + Bari1 1657 1 81.00 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCC:1 - chrX 8922354 3' - jockey 60 1 73.00 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTTTCAGGCG:1 - chrX 8922322 3' - jockey 28 1 55.45 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGA:1 + chr3R 20878169 3' - Doc 56 1 76.24 GATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGTTTTCCCCATCCCGTTGACTTGGCCAGGAATTAGCACAACATTAAATAACACGATTTTGC:1 + chr3R 15502180 3' - Ivk 5076 1 66.33 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTTTACGTTTGCATTCAAC:1 - chr2L 9410793 3' + roo 9043 1 57.43 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAACATGTTTTGAAAGTGTAATCGTTCATC:1 + chr3R 26255171 3' - opus 157 4 75.25 TTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGGGCTGGGAATTATAAAACAGAATCAAAAGGCAAAAGTGCGAGTTTCGTACACAAAGCTTGGCCAACTTCT:1 + chr2R 22623036 3' + Stalker 444 1 56.44 ACGGTTCACATAAACACGGGATTTCAAAAAGTAAATAAAAGTATCTACAGGTAGGACCCGCTTATAAATCTAAAATCTAAATAAATAAATCTAAGAACAGG:1 - chrX 21149942 3' - mariner2 619 1 73.27 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACGTCATCTTCATCATTAAATTCGAATTTT:1 + chr2R 9868958 3' - roo 47 2 72.28 TGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCTTTGAACATTTCC:1 - chr3L 9076561 3' + mdg1 7432 2 51.49 CACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTCCCAATGGATTTATGAGCATTAGGTTTCCA:1 - chr2L 8841034 3' + P-element 2886 2 75.26 CGCATTCAGCGTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATACAACAAACACTCGCCCCACATTGTTGCCGTGGTTTTGGACAGTCTTTTCCCCGGACTCTGCCGCC:1 - chr3L 20891015 3' + TAHRE 10015 1 58.42 GTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAA:1 - chr3R 9127384 3' - invader3 42 2 72.22 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCCCTAAACAGATCGCTAAACATCATGGAATGCTTATCCAGCGG:2 + chrX 19820139 3' + mdg1 419 2 61.39 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATTTTTGGATCCTAGTGATAACGG:1 - chr3R 12375169 3' + pogo 2052 1 81.00 ATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGCTCATTTTGGACCGCTTACACAGTCGGGTTGGAGGTGTCATACTATGGGTCGCTATATCCTATAATG:1 + chr2L 21372886 3' - Circe 7132 1 68.32 TAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTACTTATTTTCATAAGTCGTGTAAATATCTATCGATTTGCGACAAAACTTTTTGCCACGCCCACTCTAACGC:1 - chr3L 26710194 3' + INE-1 171 1 54.46 GTAGATTAGTCCAATATGCTACATTATGAAATACTCCTGGATACTTTTTACAACTTCTTTCTAACTCTGTTACTGACTTTTTCTATCCTCATTCTTTGTAG:1 - chr2L 11832495 3' - Stalker4 6958 4 59.41 CAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGCTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACAGGACGTCA:1 - chrX 4806654 3' + roo 396 1 64.36 ACATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCAGTTCAGAAGTGGGAACGCTTGAAGTTCAAATAATATGAGAGAAGAGACGGGCTATGT:1 + chr2R 4326858 3' - Max-element 8389 2 59.41 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCTAACAGGCTTCATTACATTGAAGTTTTGTTTTACCCTGCCATTGCACTTAGTTGGTTTTTATTG:1 - chrX 22745635 3' - copia 21 2 56.44 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTC:1 + chr3L 10557631 3' - 412 7098 2 68.32 GTNTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGT:1 - chr2R 11164417 3' + roo 9043 1 56.44 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATCTAAATATATTGGGACATTTTATGAAGAGTACGGTGACCTTATTTAAGAATTAAAGATTGCTTAA:1 - chr3L 18511039 3' - Ivk 11 1 64.36 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCCAGCTTGATGGCATTCTTAATCCGAAGATTGCCACAA:1 + chrX 6814337 3' + roo 9031 1 62.38 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTCTTAACCATCCATATGTGAAATAAATATGATGTGT:1 + chr3L 1140343 3' - hopper 37 1 64.36 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCG:1 + chrX 9439837 3' + roo 9040 1 56.44 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGGCATTAATATAAATCAGATATTTTAGAGATTCAAAAAAAA:1 + chrX 14131820 3' - I-element 37 1 59.41 AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATT:1 + chr3R 9192582 3' + invader3 243 2 61.39 TTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATATATATCCATTAAGCTCCGTGCTTAACCGAATCGTAGAGTAT:1 + chr3L 15646964 3' + Juan 4179 1 60.40 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCCAAATAGCCAACTCATTCGATCATAGGTGCGCAT:1 + chrX 6082629 3' + roo 9031 1 68.32 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATACAAATTGCGAAAATGTCAACAAATTG:1 - chrX 5521083 3' + 412 7497 2 73.27 GGGGGCGGAATGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTCTGTCCTCTTCGCACTGACACTGTGCCT:1 - chrX 5374070 3' + GATE 8226 1 72.28 CTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATATTTTACATTTGTACAGATATAGCATATATATCTCTCAGTAGGGG:1 - chr3R 17412563 3' + 3S18 309 2 55.00 CAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCAAAGTTTGGTGGCTCCTTACACTTTTGCGTTTCTCTAAATT:1 - chr3R 4840385 3' + F-element 319 1 58.59 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCCTCCTTGCAGCTACTGGGTATATAGGTATGTATGTGCAACTAGGGCT:1 + chr3R 17666050 3' - Transpac 3 2 65.38 TGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTGTGTCTATGTACGTGTATTTATTTTATTAGTATTTTATTGCCTTGCACGTTCCCAACTTTT:1 - chrX 2172218 3' + I-element 5339 1 65.35 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGTTTTG:1 - chrX 18353553 3' - jockey 4713 1 65.35 TACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAAC:1 - chrX 10445556 3' + INE-1 539 1 73.27 TTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAGAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCCTCTCATTCTCT:1 + chrX 22383372 3' - invader1 2 2 31.68 TAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAATAAAAGGTCCAAACAATCTGGGTATCCAATGAAAATATTTGAAGTAGGAATCTTACATTCGAAGGGAATATTTTATTGT:1 + chrX 8971439 3' - hopper 150 12 59.41 CCNGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTCGCCTCAAATGCGGGCACAG:1 - chr2R 16940319 3' - flea 17 2 58.76 GGGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTGGGTGTATCCTGGGTGGCT:1 + chr3R 13503691 3' - F-element 371 1 63.79 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTTTTGTTCGGTTCTACATATTTATAGGTATAGAGCTATATAGATGCGTTGAGGTTCATTACTTTTCAT:1 - chr3R 11175827 3' + roo 404 1 71.72 GGTGTATGCGGACTAGAATAAGTCTCCAAAAGTCTCACCAAAAAAAACGCGTGTCAGGACGACGGTGAATAGTGGCATTGTGGCTTTGACTGTTAAAGAAT:1 - chrX 22445763 3' + invader1 208 2 68.32 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATATCAGATATCTGACTGTCTAATCCTTTTGGTTTACTAACTTAAATTGGTTGCAATATTACATTTCAAACTCGTA:1 - chr3R 19206068 3' + mdg1 419 2 70.30 TTNGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAG:1 + chr3R 19446222 3' + 297 6942 2 60.40 AAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGGCGTCTTGGCCGTGCAGACCAGTTTGTCCGGAGTGCCGCCCAGAAAGT:1 - chrX 7984150 3' + gypsy12 10116 2 52.48 GTNTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAACAAATACCTTGTATATCTGGGGAATTTGGTGGAAATAGGTTTCAACAGAAAT:1 - chr2R 10761694 3' + FB 283 1 60.00 GCACCCATTGAGTGCATCAAAAAGCAAAAACTTGTGCACGACCTTTTTTGGGTGTTCTCGTTCACCCTTCATTTCTTAGACCGTAAGATTCCACTCGCAAC:1 - chr3R 10514124 3' + hobo 2583 1 75.25 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTGATATAGAGAAACTATAACTATTGGTGT:1 + chr3R 12514904 3' + opus 457 2 74.00 TTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTTTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAAGATAAGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTTAAACTGAAACTTAAAATGATT:1 - chr3L 17340861 3' - Gypsy6A_LTR 265 1 47.52 TGTCGCACTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAAAAATCGATTTGCGGTCTGGGACAGGAGAGTATGCGGAAGGACATGCGTGCGTTTATTGCC:1 + chr2R 9975329 3' - mariner2 295 1 65.35 CATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAAC:1 - chr2L 21936092 3' - INE-1 11 1 49.50 GTNAAATGCCATAAATTGTAACTATATATTTTATAAAAAATCAGAGTACAATAAAATGACAGCGCCGAAGGGCACTGAAAATATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 3701147 3' + TART-B 10428 2 70.83 TACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTGAATGGGCCATGAATGGTTTCTATGTGCGTGCAATTTGCACAAATTGCAGACAGACCG:1 - chr3L 13294900 3' - Doc 4507 1 67.00 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAATGCTGGAGAAACAAGAGCAAGTACA:1 - chr2R 13304454 3' - hobo 48 1 72.28 TTNTGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGGAAAAAAAAACTAATTGTTGTCGTTTTTTGAGAAAAAACTCCTTTGCTGTGAATCGCGAAT:1 + chrX 522217 3' + transib2 2811 1 65.35 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATATGCCACAACAATGAAGCGAGTCGTGCA:1 + chr3R 19947426 3' + roo 9047 1 53.54 ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGCTGGCCGGCCG:1 - chr3L 447316 3' - Tabor 6880 2 66.34 GCNAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACGCACCCTTAGCCCATTTTATTTCCCATATTTCGAACGTACTCTTTCGAAAACTGTCAC:1 - chrX 6883238 3' + Burdock 238 2 59.41 GATCAGGATCAATAGCCGACTGGATATAGCCATTCTAGTCATTTTGTTCATCAATATCTATCGACATCAATTATTTTATCGTGTGGAAAATAAAACTCGGA:1 - chr3L 11887685 3' + INE-1 92 1 80.20 CCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACAATGACCAGCGCCCATTGAACTGCACTTGGGTGTAAAAATAAAACACC:1 - chr3L 13919322 3' + Gypsy12A_LTR 2231 1 63.33 AGNTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAGATCTTTTTGGCATTAAATGAGTGAAGCTCC:1 + chrX 8422145 3' - jockey 4775 1 63.37 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTATGACGGGTGCCCATAAAAAGGGGCGCCAGACTGTATAAGGATGCGCTGAAGAGTTGCCTGGCA:1 - chr3R 28698759 3' - 1360 11 1 64.36 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAAGTGTGAAGCGAATTTCAAAGTTACAAAACTCGGTTTACAAAGTTGAATG:1 - chr3L 18816113 3' + roo 9043 1 53.47 TTNCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATGTATA:1 - chr2L 13250358 3' - pogo 24 1 53.47 AAGGAAATAGGAATCTTTGCAACAGGTACTGTACGTAAAAATCGCATAAGAAATTTGTACTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAA:1 - chr3L 25912002 3' + looper1 1471 1 54.46 TANTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATCGATAAAAGGGGCAAGCAGGTAGTGTAGT:1 + chr3R 23886829 3' - TART-B 10199 1 72.28 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACT:1 - chr2R 544797 3' - HMS-Beagle 6823 2 55.10 GANTGGCCGGTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCCTAAGTTCAGTTTGATTTTATATTCTCATTGTCAACGCCTACAATTTGCTCCGTAATTTCCCATTAA:1 - chr3L 5189514 3' + gypsy6 120 2 57.43 AAAACAAAAATAAAAAAATTCTGGCATAGAGTGGCTT:1 - chrX 6626666 3' - Tc3 86 1 72.97 AATAATAACGTTAAGGCAATGCGAAAAACTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATAAAGCTCAAATAAATTGCAAACAAAGTGAAAGT:1 - chr3R 17900402 3' - 1360 302 1 55.45 CGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATACATAT:1 - chr2L 21951183 3' + opus 459 2 68.32 TTNCATTACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTATTTCCAGATGATATTACACTTTTG:1 + chr2R 21864608 3' - Porto1 325 1 74.26 GGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCTAATGAACTAATCATATACGATCAAAAGCATATGCATTTGTAC:1 - chrX 21493320 3' - BS 4699 1 61.39 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATTTTAAGAATGGTACAATATTTTGTAGAAAAGAACCA:1 - chr3R 20419054 3' - roo 8703 2 66.34 ATAAAAGAAAAAAAAAAACAAATTTCTTAGTGTTATTTTGATTAATTAATCACTATTTTTTTTTTT:1 + chrX 13307057 3' + gypsy7 5010 9 57.58 GCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:1 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 14 2 75.82 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAATTTGAAAGGCACACACACC:1 - chr2R 17938862 3' + copia 238 1 62.38 GTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGGAGTGTGCGCGAGTTAACGGGAAATCGCAATAAATGCGGCAAATGTGTTGCTTTGTG:1 - chr3R 22825117 3' - accord 189 2 80.61 TTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGCCGGAGATTTACTCAACAAATTAACGTAAAATAATTTTCATTTGGACTGGTAGA:1 - chr2R 16918156 3' - I-element 5182 1 62.38 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCAAGTGTCAGTCCCTTTTGGCCGGCGTTATAAGGTCTAAGTGCTG:1 - chr2R 16422207 3' - hopper 41 1 61.39 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTAATTTGCTGCAGATATGAGTGTGGCAA:1 - chr2R 17208534 3' - jockey 58 1 71.29 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCA:1 + chr3R 6776581 3' + copia 204 2 79.21 TCNTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGGTGTTTGATGTTATTCTTGAGCAATAGTTGTTGCCGAAGGCAATGCCATTACTATTT:1 + chr2L 18223853 3' - roo 8675 2 61.29 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGGTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 22341165 3' - hopper 49 1 75.25 ATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCACTCTTGTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGGTCTCTTTCTCTCTACTCTCTTAAATTGCACC:1 - chr3R 18346621 3' + INE-1 565 1 52.48 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTGAGTTGAGCTGCTGCTTAACTGTCCACTTCCTGGCGAGGCCCGCATA:1 + chr2R 13334886 3' - pogo 28 1 54.46 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGGAGCGCAATCTAGAT:1 + chr2R 5262654 3' - 1360 28 1 56.44 TTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCCCATTCCCGATTTTCCCCTTCACATTCACGATCCCGAATCGTCCATCGATCCTA:1 + chr3L 15258072 3' + Doc 407 1 61.39 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCGTACTACAATAATAGACGTTATTGAATTAAAAAATTAACATTTAAAAAATGTATATTCTGCACAAAGACGCGGTTAGTT:1 + chr2R 5178693 3' - mdg3 5261 1 69.31 TTNTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTC:1 - chr3L 12572638 3' - Juan 4074 1 69.31 GCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAGCCGAAAGATTGAAAACATGAAAGAAAAACCCGTTAACTGATTTTTTCTGTTAAATATTCTTAAATATA:1 + chr3L 21636545 3' - flea 4760 1 79.21 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATAATTTATAGCTGAGCTAAGTGGAGAATGTTAAGAAAAGCTTAATACGAACCCATATGTAATATCGGTTAATTTA:1 + chr2L 22045158 3' - jockey 4673 1 77.23 ATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGGAATCAATAAACTTGGCCAGTGGTTAGCAGAAATCTTGAATACAAATATTTTCCAATGCTTACAATGTTTGCAGTG:1 + chr2L 12877982 3' - FB 362 1 82.18 TGGTTANCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTACCGTGTGCAGAATGAATGGACTCTCACCATCCATCATTCGAGTATC:1 - chrX 8337899 3' + hobo 2912 1 52.48 GGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATACAAATTGCGAAAATGTCAACAAATTGAGGTATCGGGGGTTTTAAAGGCAAGGACGACAATTAC:1 - chrX 5521046 3' + 412 7534 2 63.37 CATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTG:1 + chr3R 15790096 3' - flea 4714 1 73.27 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAAGGATAACTCATCTGTAGTATGCAGTATCTGACTTTCGGGCTTACTCATACCCCATTGT:1 + chr3R 27539253 3' + Burdock 242 2 64.36 CTTCTGTAAACGGCGGCTAAATTATCATGTTCTATTTATTTTTCAGCTTACCCTGCAGTTGGCTTTGGCATTTTTATGCGAACACGCTTTGAATCTTACTC:1 - chr2R 5178568 3' + mdg3 247 1 74.26 ACATATACACACACACACACACACACACACACACACAAGCAAACAGAGCAGAGAGAAAGCAACAAATT:1 - chrX 6429993 3' + Quasimodo 29 2 73.53 AAAATCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAAGCAAAAAAAGGAGAATACAAAACCCAGTTAAAGTGACTAAGCCAACTACGTAAATATGGCCCAAACCCA:1 - chr3L 13943116 3' + Doc 4698 3 77.00 GCTATGGGGCAACGCATCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGGCATTCGTACTTCTCTTAACAAGTAATAAATTACGTGCTTTATGAAGGGCACTTTACA:1 + chr3R 26163187 3' + Doc3-element 4338 1 64.36 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTCT:1 - chr3R 26140748 3' - 412 36 2 62.38 TAAAAAAAAACAACAAATTAATGGGGTTTCTCTTACTTGAATCTCTGATTTCAAACAGTGCTTCTTTTCGCTACAGATCTTTCGACTGACCGGCTTAAGTT:1 + chr2L 10294517 3' + gypsy11 3934 1 72.28 TCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGTAGGGTTCTATAAAATAGAGGGTGGTACGTGATTGAATTTTTCACGA:1 + chr2R 16908803 3' - diver 5919 2 53.47 AATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATAAATAACATATCTCACTCAATATCTCCGTCTTTACAGCCCAAAAGCTCCTTAGTTATTTGAATGCCAG:1 + chr2R 14816716 3' + accord2 7508 2 59.41 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGCCAGACATCGGCAACTGTTGCACAGGGCAAAGTTTACAC:1 - chr2L 1204039 3' + roo 398 1 66.34 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGTCGAGGAGCGTTTGGGGGAAAATTAATGTCACACGAGCGAGCGAGTCGGAAAAACAGGGTAGAAATG:1 - chr2R 19541200 3' - opus 142 4 44.55 CCTCGGTTTCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTCCAAAGGTTCTGATAAACTGTCAGGAATTAGAGTCTAACAACCTTCGAGCCCAATTGGCAAA:1 + chr2R 3515027 3' - Idefix 7237 2 68.32 CAAAAAGTGAAGTCAAAAGTGTAAAACCAAAGACATAGAGTGATGAAAAACAATCTAAAAGTTAACTGGCCGGGATTGGCTGCGATTTAGGTCAGCAAGCG:1 + chr3R 4951125 3' - Tc3 337 1 66.34 GGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAA:1 - chr2R 18344565 3' + 1360 3350 1 67.01 GCCGTAACCAAAACCCAGACACTAGGCAGCCACCTACATGCAATGTCGAGCCAGCGACAATGAGTTCAGTATTCCGATATCGAGACATAATAGAG:1 + chr2L 14062306 3' + Tom1 119 1 70.53 ACAAATTTTAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTTTTGCATTTTTTTGAGCATATGTCGTTGCAAATTGAGGCACTAAC:1 + chr3L 7835796 3' + 1360 3013 1 61.39 GGTTAATCAACAATCATATCGCGGTCTCACTCGAATCATACGCTCACGCAGCCCCATTCAATACTTTCTCCCATA:1 + chr3R 24676700 3' + P-element 2767 1 64.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTGCGGCATTACGTATACACCGCGTGTGCAGTGGCTCCTGTTGCAGACAAAATGCACAGCCCACGC:1 - chrX 5441962 3' - hopper 4 2 68.04 ACTATCAGATGCCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCAAACTGCATGAATATTTTAGATGAAGTTAATGGGTCTTATGACTGCTTGAGTGTTGTAAAGGGTG:1 - chr2R 22618132 3' - INE-1 548 1 66.34 CATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCCGCCAGTTCTGCTGCAATTTGAAA:1 - chrX 10463136 3' + accord 180 2 76.24 AGNTGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAGGGGAAATGGCAAAATGCGAAACTAGTATAGCGATAA:1 - chrX 18396663 3' - G6 1660 1 63.37 TCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGATTTAATTGTGATCATTTAGGAAGAGGAACCCAGAAAATGATTCGTGGCATATATGTACATAAGTGT:1 - chrX 20933720 3' + mdg1 7451 2 70.30 TTTTTTATTTTCGCTTTTTTTTTGGCATGCAAACTTGGCCCAGCTGGAGTGGAAAAAAGTCTGGATGGATGGGGGGAAAACTGGCAGTATGCCTCTGCCCA:2 - chr2L 16397676 3' - Doc2-element 253 1 78.22 CAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAATATTTTTGTAAATCAAATTAAGTCTAATATGCGACATCAATCTATTAACAGATCGCTTT:1 - chr3R 13210322 3' + McClintock 17 2 71.29 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTTTCAACTCGCCG:1 + chr2L 6184264 3' + roo 9051 2 56.44 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTGTATATATATGTGCCGGCACACAGGTTGCCAAAGTGGACAATTTAATGTGGCTGTCATGTTA:2 - chr3L 1830829 3' - 297 6 2 74.26 AAAGACACTAGAATATTATTCTAGGGTCTTTGCATATACGTACATTGGGGTGGGTCAATTTTGTTATTAAAGTTATAGTAGTTAAAGGAAGTCGTTAAATT:1 + chr3R 17536915 3' - Tc3 309 1 68.32 TTNTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAATTTTTGTAATATATAGGTACAATTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr4 1294990 3' - TAHRE 10391 1 71.59 CATGATGCGCTGCAGGAATAGGTCGGGCTGCCATGATACCATTTCCGTACTTGACCAACTCGCTTTTGTTCTGATCGCTCCGCGATGTGGTTAATGCGCCG:1 + chr3L 16349124 3' - Chimpo 3890 1 75.25 TCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTTTTATCTAGCAACAGCAAACAAAAATATTTCAATTCAAATTACTTATACACAAATTATTGCTAAATGAC:1 - chrX 19872611 3' + INE-1 561 1 89.11 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTAAAAAAAAACAAAAAACAATACAGTACAAAAATGCAATATATTTGTATGCATTTG:1 + chr2R 8547822 3' - I-element 23 1 48.00 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTTCGGGTGTTAATGTGTTCGTGTGGATTATGTGACGTATTGCCTAGTGTAG:1 + chr2L 9809099 3' - Tirant 11 2 52.48 ACNGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTC:1 - chr3R 25277611 3' - 3S18 5788 2 57.43 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCG:1 - chr3R 19446129 3' - 297 8 2 70.30 CATAGATTTGTCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACGAAACAATTACGCGCCATGGGCTCTCAGGAACTGTCAGTA:1 - chr2L 4428858 3' - 1360 336 1 60.40 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAATATAAAACCAATGTTAAACTATTGAATATGTTAAAAGCTAGAGCTCAATCAGGAAATAAA:1 + chr3R 16593907 3' - Max-element 8252 2 62.38 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGTATAAACTTTAAGGTGGAAAAGTTTCGGCCAGGTGGGAAAAAGGACCA:1 - chr3L 1698550 3' + roo 9044 1 57.43 CANGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCTTTCGGGCCACACACTCCTG:1 - chr2R 18005578 3' - hopper 28 1 60.00 TANGCTAATAAATATATGAAAATCTACTAAAATGATGATTTGCATACTCGTACATATTTCAGAAAAGTTGCGACATTTTCGCAGGGGTTACTTTTTATTTT:1 + chr3L 19414020 3' + Burdock 6371 2 60.40 TCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTTGCAGTTGCAACTGTAG:1 + chr3L 1259254 3' - Doc 10 1 67.33 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACCCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTA:1 - chr3L 13878041 3' - flea 23 2 52.48 ATNTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACATACACGTATACAGACACACATGTACCTACTTAAAAGCGCACAAGCAGCACTTAAC:1 + chr3R 20215021 3' - hopper 16 1 63.37 TGAATTTATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGAGGGTGGGGGCGTTGGTGGAAGTTTTTCCTGGCTGCGCACTCATTTTCTAGCCGTTTGTCTGTTCTTTGG:1 + chrX 14502469 3' - HeT-A 5954 1 74.26 TTNGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAA:1 + chr3R 14049428 3' + transib2 2804 1 57.43 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACAT:1 + chr2L 17205252 3' - hopper 31 1 54.46 ACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCGAGTTACGGGGTTCGAGTTTGGACTGTCACCCCCACCACACCCAAATGCACACACCCCACCACCCGCAT:1 - chr3R 9542744 3' + GATE 8209 1 63.37 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAGTGGGT:1 + chr3L 22349294 3' - 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hopper 11 2 69.31 GCTTGAAAAGGACAGGAGAGAGAGCATAGGTTTTTGTATAGTCCATTAAAAAAAGAAGAGAAAAACATGAAAAAAGAAATGGAATCATAGGGATGCCCCCG:1 + chr3R 24319893 3' + Rt1a 4937 1 64.36 TGCACCCGCAAGTACAGGTACTCTCGTCTTCCATCCCTTTATTTCGTTAGGATTAGTTTTTGGTTTTTGTTTCCTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTGTACAAA:1 - chrX 18915359 3' + gypsy12 10161 2 62.38 GTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATATCTAAATATATTGGGACATTTTAT:1 - chr3L 18511081 3' - Ivk 57 1 78.22 TTGTTTTGTTTTTTTTTTGTAGTTTTGTGACTGTTTTAGCAAAACTTATTTAGCTACGCCCTAAGCCTAGGCAATATTATCAATACGATCGTTGAAAACC:1 + chr2R 13580849 3' - G2 3074 1 71.00 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAA:1 + chrX 4806722 3' - roo 8717 2 80.20 ACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACAAAAACCGAAAAAAACCCTGCTCAATCCGGGGGCCAAACTAAGCTTAGCTATACTCTCCGCTGCTACAA:1 - chr3L 3107265 3' - Bica 41 1 75.25 CAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCTGGTGAC:1 + chr3L 9907453 3' + jockey 4989 1 64.36 CCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGTAAATCTCTGTTGGTTTCGAAAAAAAATTCATTTC:1 + chr2L 5725731 3' + I-element 4880 1 65.35 GAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGGACTTGATGGGCGGATGGTGCCACATGGGTTCTTGGCTCAGTGGTCGGTCTGTACCCTGC:1 - 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chr2L 18787485 3' - Gypsy6A_LTR 215 1 68.32 AACAAATAAAATAAAATATATGCTCAATGTCGAAGGACGTATGGAAAATGGAATAAATTGCTGCACGCCATGCCAAAAATGTCCTCACTCACTATACGCAA:1 - chr3L 18933093 3' + G7 1150 1 51.49 GGGCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCAGCAATCCGAGCAGGATCCGCTGGCACCCAACTCACCAGCAACACCGAAACTTGCAGCAGCAGCCGCA:1 + chr3L 9471295 3' - R1A1-element 5077 1 74.75 ATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGTCTTAGCTATTCTC:2 - chr2R 544767 3' - HMS-Beagle 6796 1 79.21 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGAT:1 - chrX 7583194 3' - I-element 23 1 56.44 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAATGTTCGTTTGTTGCCATTATTTGACCTGCTTGCATACAATTTGA:1 - chr2R 17938876 3' + copia 224 1 58.42 CAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTATCATATCGTTAGTTTCCGCAGATCGGGAGTACGAGATTGGGCCACTTG:1 - chr3R 30459987 3' - Porto1 351 1 53.47 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGTTA:1 - 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chr2R 18099642 3' + diver2 494 1 66.34 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCGTGTTGGTGTTGTGTTGCTTCGGGTCGCTCTCTC:1 + chr3L 17971284 3' - P-element 37 1 42.86 CACAAAAGGGAGAGTAAACAAGACACAAAGACAAAAAATCCCAACTGATCCACGGCCTCAGACAAAACAAAAAGGGCTGCTATGAATAGGAGGATTGTCCA:1 - chr2L 22016808 3' - Cr1a 212 1 69.31 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCTTCATTACATTGAAGTTTTGTTTTACCCTGCCATTGCACTT:1 - chrX 22745650 3' - copia 36 2 63.37 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAAAGCAT:1 + chr2R 5485158 3' + 1360 3381 2 69.31 GTAATTGGTTGACTAGATGTGAAAAAAGAAAAAGCTAAGAGAGGGTTAAGTGGGCAGAGTGGGGAAGAACGAAAGTTTGAGTCTGGAAAACACAGAGCAAA:1 + chr2L 12269704 3' - Porto1 4618 1 73.27 ATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTTAAATGCTATCACGTCGCGATGGGCAATCAGC:1 - chr3R 13211965 3' + Doc 322 1 68.32 GGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAAAAGCACGCACAAAAAACCAC:1 + chrX 17791570 3' - Cr1a 298 1 61.11 TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTGACAATCTTTGTTTATCAAATCGTTTGCCATTGTTTCTGTCGTCGCTGTGGGTA:1 + chr3L 13878133 3' + flea 4996 2 63.37 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGTCATGTGTCTGACCCTCCTGCGCCCTTTTTGGCCAATGTCT:1 - 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BS 5053 1 68.69 AGNAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGTATGCAACAAGACCT:1 - chr2R 12446037 3' - hopper 27 1 53.47 TATGTATATATATGTACATACATATGTAACTATAAATTGATCCGTGTATTTCGAGCAGATGAACTGATAATAGCATTAAATTACAAGTTGGCGCATTGCAA:2 - chrX 19455062 3' - invader3 5087 1 76.24 TCAAGATCTCAGGAACTATAAATGCTTAAAAGCAGTGCCTCTATCAAACACTATACGGCGGGCAGCTTAACACTTCATCGACACCTGTGCTACGAGTTGCG:1 + chr2R 548369 3' + INE-1 146 1 74.26 TGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGCACCGCAACAGCAGCAAAATGATACACA:1 + chr2L 3239623 3' + HMS-Beagle2 6988 2 70.21 ACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATTGTCCATTTTACTAATCTGCTAAGCAAATATTTTATGAACACACTAGGCATGCCGAGATCCACACCCATTCTCCC:1 + chr3R 14935966 3' + F-element 4596 1 76.24 CTTATTCCATCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTGCCTAGTCCTGTTAATTAAGAACACATACGTATAAT:1 - chr2L 22982802 3' - Copia1_DM 469 1 64.36 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTAATTTTCCCCGACGTGTAGAAAACTAGTTGTGGCATACAGGAAAATAAGA:1 + chr3L 7629646 3' - opus 21 2 56.44 CCCTGCTACTTTTCAGTTGATAGGTGTAGTAGTTTTTGTTGTTTTCGTTTAAGTATTTTGCAAGGAGGAACCGGAGCAACAGGGGACAGCTTTAATTCCGC:1 + chr2L 12126442 3' - Fw3 170 1 64.36 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAA:1 - chr2L 13250369 3' - pogo 35 1 64.36 AAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGA:1 + chr2R 2879454 3' + Stalker 111 4 57.43 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTTTGAAATTGTGTTCTTATAAATTATATAAAATTAC:1 + chr3L 8331280 3' + roo 9033 1 68.32 CGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGCTTTAATTGCACCGAAAAACATTCCCAAAACTAATTAAAATTCTTTTCATTC:1 + chr3L 6013761 3' - Max-element 8233 1 81.19 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCGGATATGTACGCCAAATTGAAGCAATTACCGG:1 + chr3L 7968727 3' + hobo 2895 1 68.32 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAATATCGATG:1 - chrX 7768926 3' - hobo 42 1 69.31 AAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACCTAATTGAATGCGAATATTTGTAGAGAATACCTGGAGA:1 + chr3R 4971223 3' - 1360 38 1 63.37 AAATCCAACTGCATCACCAAGATTACGGGCATCAACACCAATAGAAGGACAAACTCTACTGAAACCGAAGATCTCCCGATGATTAAAGATACAACTTGATG:1 + chrX 13776939 3' + rover 6869 1 53.47 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTA:1 + chrX 9439823 3' + roo 9027 1 70.00 GCAGGCACACACACACACACACACATGCGCACACACGTGCACAAGCACCCGCACAACCGCCCAAACACTCACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTG:1 - chrX 9955489 3' + accord 179 2 62.38 TGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAA:1 + chrX 23108327 3' - BS3 1421 1 54.46 AANGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATCCAAAATTAAGCATGTTTTATAAGAATCACTGTTCTAGAAAC:2 - chr3R 7382586 3' + copia 248 1 71.29 TTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATG:1 + chr3L 23702237 3' - G4 36 1 58.42 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGTAAGTAAGTATGCTGAAGAAATTGATTACTTTAAAAATTTCGTAAAAATGTGCAATACCATTAACTT:1 + chr2L 9488255 3' - 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gypsy2 6510 2 64.36 TTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAATTTGCTTAGATTGAACCCTATTACAAACCTATTACGGAGTGTATCTC:1 + chr3R 15502552 3' + Ivk 5347 1 58.42 ATAAACATTTAATAATTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACAGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAAT:1 + chr3L 19339398 3' - Tc1 55 1 72.16 GAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTAT:1 + chr3R 9127416 3' + invader3 229 2 72.28 CACACACACACACATTCATAGCCAGTGAGACACACGCTGTTGTCAATTTCCTTCTTTTTTC:1 + chr3R 8687356 3' + Quasimodo 40 2 91.80 CACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTAATTTGCTGCAGATATGAGTGTGGCAACGTCAGCATTTGGGGCAGAAAGGTCATCAAATAATCATATTTG:1 - chr2R 17208491 3' - jockey 14 1 73.27 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAA:1 + chr3L 23456270 3' + 1360 3373 1 59.41 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATGTATGTGTATAGAGCCGGACAACGCGGCGTATGAGTGTCATCGC:1 + chr3R 24408322 3' - Quasimodo 26 2 57.43 CGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGGGGCCTTACATATTTGAAACTTGTCCCAACAATTTCCAGTGATGTTAGC:1 - chr2R 15501688 3' - F-element 4336 1 54.46 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTACGTTTGCTGGTCGGTGGTCAACTCTC:1 + chr3L 14257634 3' + 297 349 2 77.23 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCCAATACGTCACTATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAA:1 + chr2L 12284014 3' - 297 31 2 54.74 AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATACGTTCCCATTCGGAGTCGGATTCGTATACAACTT:1 + chr3L 447384 3' + Tabor 7300 2 54.46 TATCTTGTTACTTAGGAATAATTGGGAGAAAGCTCCATAAAATATTGTTGAGATGTAGCGACAGACTTCATTAAAGATTTCGAGGATCAGGAATTTCTTTC:1 - chr2L 20344202 3' - transib4 80 1 78.22 CTAATTAAAACAATTCCTTGCTATCTGGGGACCTGTCTACACGATCGGCGTTT:1 - chrX 5340730 3' + Idefix 204 2 67.92 ATACCCGTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAA:1 + chr3L 9814087 3' - INE-1 540 1 66.34 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATAGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTTTACATAAAAATGCAATAAATAGCTACAACAAAATTTATGG:2 - chr3L 13652757 3' - hobo 4 1 75.25 CTTACGCTAATAAATATATGAAAATCTACTAAAATGATGATTTGCATACTCGTACATATTTCAGAAAAGTTGCGACATTTTCGCAGGGGTTACTTTTTATT:1 + chr3L 19414018 3' + Burdock 6369 2 58.42 GATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCCATGAGTTAGTTCAGTACTGAGTACGCTATCAATTGCTATA:1 + chr2R 694015 3' - Bica 468 1 59.41 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATGAGAGAGAACTTGCGCCGGCGCCACTGGAAAGTG:1 - chr2R 10444201 3' - P-element 3 2 73.20 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACA:1 - chr3R 13225503 3' - hobo 37 1 61.39 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGGTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTC:1 - chr3R 22341150 3' - hopper 34 1 60.40 TACCGTGGGACTACATACGTGCCCAGGAGTGTGTTCCTCCTGATGGAAAACGCCATGCAGTCACATATTATATGTTCTGGGCCACGCCACCGTCTTGATCC:1 - chr2L 5914919 3' - baggins 5291 1 74.26 CGTGAGAGTTTTTTGCCGACGAAGCGCGTTTACTTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTGATTTA:1 - chr4 929083 3' - TAHRE 103 1 32.67 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATCTAG:1 - chr3R 9325616 3' + roo 9047 1 57.95 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAA:1 + chr3L 24208201 3' - Quasimodo 23 2 57.43 GGNGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATTGC:1 + chr2L 17205257 3' - hopper 26 1 56.44 AGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAACAAGAAGAAGCAGTAGAAGACTGGCGTCAAGAACAAGAGGCATTAAAAAATCAG:1 + chr2L 2111652 3' + accord 7312 2 64.36 AAGCTACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTG:1 + chr2R 4339503 3' + G5A 2783 1 77.32 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 6 1 80.20 GTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACAGATTCACCTAACGTACACAGGACTCCAGGAAGCAGTGGGACCTGCCAAAGGATTCCATCAGACCACAC:1 - chr2L 13471434 3' + Doc2-element 4376 1 72.28 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCTTGGCGCCACCCCCACAAAAGTACAAC:1 - chr3R 26434703 3' + Tabor 7274 2 75.25 GATAAGAATAATATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAAATCCCAATTTAAAGTCCCTGTTGTATTAAGCCACATCCCATTTGAGAAAATTTGTCGT:1 - chr3L 6582415 3' + Idefix 6930 2 54.46 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGATTACAAA:1 - chrX 7583188 3' - I-element 16 1 63.00 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAGT:1 + chrX 4806745 3' - roo 8694 2 62.38 TAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGTGCGATATGCAAATGCGCTGGTTGTCATTTGTGCTGGGGATTTGTTTTAAGCGCCT:1 - chr2R 15070615 3' - I-element 244 1 61.39 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTTAAATTGTTGCGTTAACCAAGCC:1 - chr2L 15013959 3' - jockey 4710 1 76.47 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTCTTTGTTTATTTTAGTTTATTAGAC:1 - chr2R 4559075 3' - pogo 48 1 81.19 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTATGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAG:1 + chrX 19030139 3' - Doc 48 1 76.77 CGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTACGGAAACGGAGGAGGCACCG:1 - chr2L 8206839 3' - FB 407 1 79.21 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAGCAAAACAAGCTTACAAAGCTAAACGTGTTCGTATGCAA:1 - chr2R 12726796 3' - copia 36 2 60.00 TACATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAAACCATTTTGGAGCCGCCAGGAGCTGCTGTCGCAAGCATTTATTTTTATTTTCATTT:1 - chr3R 25651996 3' + Juan 4198 1 58.42 TCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGGGTTGTTTACGATGTGTTAAGATGGAGCCAGAAGGTGTTTGTTTGGTCATTCCA:1 - chr3R 19293022 3' - G6 1861 1 57.43 GTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATATTGGGTAAACAAATGAGAAAAAATTAAAATCATAGAACATTATTTTCCACCGACAAGTAATT:1 + chr2R 5319966 3' - INE-1 520 1 73.27 AANGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCA:1 + chr2L 261051 3' + Juan 4186 1 54.46 TTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCCGATATTCCCTCAAACCA:1 + chrX 19810592 3' - INE-1 555 1 71.29 TTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTGATCGTCGAATGAGCCGTGTTCGCGTCCCAGCTTATGGAGCAAG:1 - chr3L 7440327 3' - Quasimodo 7215 2 56.44 TGTATGTACATATGTATATACAAGCCCAAGTTAATAAGTAAAAGCTATCGGCATACGTTATATTTAAATTTGTGCCAACTGTACACACGTTTGATAATTAT:1 - chr2R 8338511 3' + invader3 5087 1 74.26 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGT:1 + chrX 364822 3' + hopper 1371 1 70.00 GATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAGATATCAAGAGTT:1 - chr3L 18337626 3' + Juan 4207 1 73.27 CCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGAGCCGAGTGTCCGCTTGCCAAGGCATCGTTGTGAAGCCAGGAAAGATGACAAT:1 - chrX 1022729 3' - rooA 7167 1 66.34 AANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCGGCGCGTAA:1 + chr3L 6442688 3' + roo 392 2 62.38 CANAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACA:1 - chrX 4806662 3' + roo 388 2 58.42 TCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTTCCAGTTGGTTTTTGCGGTGTTGCGCCAACAATTGGGGACAGGTTCATATCTCCCCTTCCCTTTAG:1 - chr3L 13969682 3' - Idefix 6939 2 68.32 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACATACACGTATACAGACACACATGTACCTACTTAAAAGCGCACAAGCAGCACTTAACCCAAA:1 + chr3R 20215026 3' + hopper 1404 2 68.32 AATCCCTTATGTTAAAGTAGAAATAGCAAAACATATTAAAAAATGTACGACACAGATACACAAAATAATCCATAAGACACAAGAACACGCTACAACATAAT:1 + chrX 12455905 3' + G4 3569 1 61.39 AGGCTTCTCCTCCACTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGTGGGCGCACATTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGA:1 + chr3R 15598683 3' + 17.6 240 2 50.50 ATCCATCGATATCCCAGAAAAATGATAACACCGCGTTCAGATCCTTGATTTCCAGTAGGAGAATGTCACTCAAATAATGCAAATGATCCAGATGCTCGGCA:1 + chr3R 16440349 3' + INE-1 500 1 73.27 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGCACACACATAGAGTCCTGTATGCAAGAGGGGCTATGCTACGTG:1 + chr3L 11450546 3' + Transpac 5199 2 59.41 ACNAATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTCGGCATCACAGTAATGGGGTTCGCAAACACAAATCGAGCAGACATTGAGTGCGCCCAGGAAAGGGCGGCC:1 + chr3L 10824380 3' - diver 229 1 64.36 CCNGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACA:1 + chr3L 23821853 3' - HMS-Beagle2 6917 2 64.00 ATGCATAACATATTTTAATACTTAATACCTGTCAGGGATCCTTAGGTTTTCGTAGTTTTCTTTAAACTCTGAGTTGCCCTTTACGAAACCTGAAACTTTAT:1 + chr2R 4907450 3' - G4 3728 1 66.34 CGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGGGAGACCAATAAACAGCGCAAATTTAAAGTAATGTAAACAAATGCAAGGTAATTAGCA:1 - chr2R 23799922 3' + blood 487 1 54.46 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAACGTATATGGATAGGTTTACCGTTAGGATCATTT:1 - chr3L 13652797 3' - hobo 44 1 65.35 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTCCCAATGGATTTATGAGCATTAGGTTTCC:1 - chr2L 8841035 3' + P-element 2881 2 71.29 ATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGTTATCCGACGACATGCATGTGGGTTTTGTGGCTTTGCGTACCACACGGCG:1 - chr3L 12916705 3' - I-element 5157 1 53.47 AAACTTNTTTAAATTATAACGTAATTTCAACAGTTATACTACTGTCCTCCATGTTTTAAGGCTTAATAGGTAAATAGCAATAGAAAGGATATATCAAATGG:1 + chrX 20858799 3' - Copia1_DM 11 1 68.32 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTT:1 - chr2R 544796 3' - HMS-Beagle 6825 2 55.45 ACTACTCCCCCCTCAAGATTGCGCCCACCCTGGCCGACCTG:1 + chr3L 25810405 3' - gypsy3 6557 1 90.24 CGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTTTAGCTGTTTAATTGTGGT:1 + chr3R 15790100 3' - flea 4710 1 77.23 GAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGC:1 - chr3R 19450112 3' - F-element 399 1 56.44 ATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCGCAAAAATAAATTTCATGTCGGCGAATGCAAGTTCAATGCACTTGACTCTGA:1 - chr2R 14076487 3' + 1360 321 1 64.00 ACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATTATTATTTGATGCCATTTACAAA:1 + chrX 4175156 3' - I-element 318 1 67.33 CGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTGCCCTCTTCCTTTGCCAGCAATGCATTCAATTTCCAAGGATCGACCAGGCT:1 + chr3R 27299508 3' + mdg3 5223 1 62.38 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGGAGAGGGAACCCCGTGACAGGCAATCGGGATAACTATTAAAGCGAGTGGTGGACCCTTAAAG:1 - chr2L 16954796 3' + Quasimodo 7363 2 76.24 ACCTCTCATTCACCGACATATCAAACTACACAAACAAATAAAGCTAGCAAACATTGCCGGCCAACAACTCCACGTAAACTTCATTTACTGTCTGGCTGTGG:1 - chr3R 6411061 3' + Porto1 278 1 69.31 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAAATATGTTCTACTTTTAGATATATTTCACGAATATTTAAAACTTTTAT:1 + chr3R 17412631 3' - 3S18 32 2 54.46 TCGGCGGTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGCCAGTCGGTCGTTAGTTTTTGTTTTCGTTCATTTGT:1 + chr3L 15500989 3' - F-element 286 1 57.43 CACCAGGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAAAGCTTTAAGCTCGCAAACAGCTGTTTGTGCGATCGCGTTTCTACTACTTCTATATATATTAT:1 - chr3R 20194769 3' - X-element 281 1 76.24 CTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGATGTCTTTTCTCCCTTTTTTCCTCCAGC:1 - chrX 14133700 3' - I-element 333 1 81.19 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACCTAATTGAATGCGAATATTTGTAGAGAATACCTGGAGAGTAACTTTAACTATGATCCTAAGAGTTACAACACA:1 + chr3R 4971258 3' + 1360 3386 2 76.24 TATAAACACAATTTTCACTTTAACTGCGTCTTTTGCCAGCCTTTCATATCCTTTTCCTGCCCCCTTGAGTGTCAGTTGCGAGGCTCTGGGATGCTAGGATG:1 - chrX 4563599 3' + transib4 2470 1 62.38 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTCATAGTTCCATAATCTG:1 - chrX 4174920 3' + I-element 5299 1 79.21 TTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAATT:1 + chr3R 9192596 3' + invader3 257 2 59.41 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATACAATGACGTTAGAAAGTAA:1 - chr3R 12554848 3' - mdg1 4 2 76.24 AGNCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGGGCGTCCTCTTTGCCACAGGTAAACGGGG:1 - chr3L 18476480 3' + accord 7337 2 72.73 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAAC:1 + chr2L 6184237 3' + roo 360 2 73.27 GCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTTGTGCCATTGACCACCACATGATGGCACATAAATCCTGGC:1 + chr2R 9199976 3' - G6 1653 1 60.40 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAGGATCGTGGTCCTC:1 - chr2L 19602843 3' - hobo 32 1 53.47 CACGGTGAGAGGCTGATATTCGGTCTGACCGTGACCTTTGTGCCTTTTCCCCGCTTCAAGCTCCACGCCTGTTGGAATTCATTTATGTTGTTTGCCAAGCT:1 + chr3R 29046596 3' - Rt1b 214 1 58.42 CGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGATAATTGATTTTTCTGTTTTGTCTTTCAAGATTCAAGTGGGTTACTAAGTACGCTTGATTTGTCTTTTG:1 - chr2R 4431420 3' - G-element 4205 1 68.32 CTTATGTACTACGTGGCTATGTGACGGCGTAGTAGTGGCTGGGCTTTGGTACACAGTTCAGTAGCTTAGGCATGGGAGGCGCCGTTTTCTTCT:1 + chr2R 17055845 3' - Tom1 150 1 55.91 GCNTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACCCGTTCACATGAAACACACATTTCCTC:1 - chrX 6509768 3' + jockey 4967 1 49.50 TTATACAATTCTCTTATATAATGATATTTTATATCTATATGCTTACTACGTGCATGGAAAGTTTCATTTTTCACCATCTCACTGTTGTTTTTTCAGGCCTT:1 + chr3R 9700654 3' - Dm88 4146 1 75.25 TGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTGAACTTTCTACCGAAATCTCTCTCC:1 - chr2L 9313413 3' + Cr1a 256 1 64.71 CTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAACACAAAATACCAGGCAAA:1 - chr3R 17665942 3' + Transpac 310 1 79.21 AGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCTCATTGGCTGGCTTTAGTACAAGTTCAGCATAGACGA:1 - chr2L 18392258 3' - F-element 437 1 63.37 ACATATAACATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAAATAATAACAAGAAGGAGTAGGAAAAGCGCCTGCCTGAG:1 + chrX 3113934 3' + accord 7288 2 60.40 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTTTACGTTTGCATTCAACACGGA:1 - chr2L 9410788 3' + roo 385 2 62.38 TCGAATCAAGTCATACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCTTATGAATGTATTCGAATTACTC:1 + chrX 7062875 3' + Ivk 4906 1 75.25 TAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGAGCTACCATGATAAGAATAAGGATTTCGCACAGACGTTGCACGTTGCACGCTGGCCCGAGTATAAA:1 + chr3L 25463335 3' - Cr1a 4177 1 57.43 GCTCTCTTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACGAGAAGGAGCGGAAGCTGCCGGCACCCAGGAAATACTGTGATTCCTGCGAGGGTGAG:1 + chr2L 17409283 3' + F-element 387 1 68.32 TAATTGTTATATTGGCATTATTGTTTTGTACATCTAACTCTTGTTAGCCGGCGCGTCTGCAAGGGCTGAATTGGTTACGAAATCGGATACCAGATAGCACC:1 - chr3R 4662719 3' + BS3 1648 1 71.29 AAAAATAAAAAAAAAATTCTAAAGTATACCCGATAAAAACAGGCAACAAAAATCTGCTAACTTTATGGGTCGGAGTACATCATACTAACT:1 + chr2L 21722485 3' + Transib5 23 1 77.78 AGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGG:1 - chrX 4806671 3' + roo 9042 1 54.46 TTAAAGCTTATTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATGTATGTTTATTTTTTATCAATTCTTGGGTTGCCAA:1 + chr3R 3915855 3' - 1360 3011 1 74.26 TTTTTTTTTATTATTATTATTTTTTGTCGCTGTTGTTGTTGTTTTTGTCTCTGTTGTTGTTTGTTTTTGTTCACCCCTCGTAACGGTCACACTTTTTATAA:1 - chr3L 23696482 3' - Rt1a 5071 5 78.22 GANTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCGCTCGCAGCCCCAACTTTCTCAATGGAATGCCCCA:1 + chr3R 29416633 3' + Doc 202 1 64.36 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAA:1 - chr3R 17665961 3' + Transpac 291 2 60.40 AANAAGAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTACTTGTGTAAAGAGACGATTTTCTGGATTTTAGCTGCGACGTTGTGCTCAAGCTGGGAAACAGGAAAAC:1 + chr2R 949942 3' - 1360 3231 1 57.43 CTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACTGCGGCACCCGGCATCGACCAACTGCATCCCCAGTGCGAGGTACAATG:1 - chr3R 16666677 3' + F-element 214 1 55.45 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCGGATTAAATTGAATATACAATGTTAAGGCAATGGATGAA:1 - chr3R 22208555 3' - I-element 38 1 60.40 ACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGATAACACAGTAAACCACTGTGGGCACATGATTGAGGATGAACCGATGATTCGAGGAATCGTAGTGCAG:1 - chr2R 21976725 3' + G2 2827 1 69.31 TAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAATGTAAATGTGAAGACAGCAGACAAAAACAAAAACCAAAAACCAAAACAAACTAGTTAACGTTAAATGGAGCGGA:1 - chrX 15948016 3' + G2 3044 1 68.32 TGTGTTTAACTTTCACTATACTATTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAG:1 + chr3R 23724145 3' - Doc 79 1 65.35 AAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCGACATGCCGGAGCTTCTCTAGGTATTGGCAAATATTAAA:1 + chrX 15369506 3' - diver2 129 2 61.39 AGCCTTACTCCATGTTACATACATAAGGTAGCCAACTGAAATATCGAACTTATTTTTGGACTATGCTGATATTTGCCACACACCACGAAACAGGGCTGCAA:1 + chr2R 21819081 3' - flea 4754 1 76.24 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCCATTGAATTGTTGATGAAACCCTTTCAAATTA:2 + chrX 20999783 3' - BS 32 1 66.34 ATNAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATA:1 + chrX 19820105 3' + mdg1 7411 2 71.29 TTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTGTCCGGCCGTCTGGCCAAATGCAAAAAGAATA:1 + chr2R 7248473 3' - Gypsy6A_LTR 276 1 68.32 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGTTCAACTGATCGTTTGGCTAATGACCTGTAAAGGGTATTTCAGTGGCGACTTTTGCTGACG:1 - chr3R 26592569 3' + roo 395 1 58.00 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTCTCTTTGCATTGCCAATAATAAATTTCAAATTTCACATTTCACTTCCGCTGCA:1 - chr3R 5436679 3' + jockey 4927 1 56.44 TANGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTCTAATTAGTT:1 - chr3R 26140740 3' - 412 28 2 53.47 TAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATCAACCAACCAACCAACAAACCAAGTCAACACCCATAGCACCAACACCCAGTCAAGGCCACACATG:1 + chrX 4575405 3' + I-element 4933 1 68.00 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTCGAGATCG:1 + chr3L 6442680 3' + roo 394 1 60.44 CCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCCCCCCATTCCATCAACTGACCAAATTGTGCACTCAGGGTGAACTAATTGAGTAATTCAAAGTTTTTAGG:1 + chrX 5370809 3' + Doc3-element 423 1 69.31 AGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTAT:1 - chr3L 23456275 3' + gtwin 440 2 56.44 CCAGTACACCATAAACGCACTAAGCACATAGATATTAAGTATCATTTTGTTCGTGAAAAAGGTAAAATAAAAATGGGTATCACTTGATAGAAGGTCTCATA:1 + chrX 13475576 3' + Copia1_DM 4106 1 60.40 GGGGGGGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTACTGCAAAGAGAGACAACACCGACCCTCACACTTCTCAAAAAATATTTTGAATGCACTGGCAGAAATTCTA:1 + chrX 7475462 3' - accord2 208 1 55.00 AGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTATATGTGTGTATGTGTATGTGTATTGTGACTGTGATTGTGTTGGCCAAGTTGGTCGGATTGCGT:1 - chr3R 13546816 3' - accord 7133 2 67.33 CANACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAACGCGTAGCTGTGAGTTC:1 + chr2L 16887960 3' - P-element 57 1 23.76 ATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTCACTCATGAATGCATTTACATGGCCCGGCTTCAACTTGGCCGCCGGCGAGGCTAAAAGCTTCGGCACTAATAAA:1 + chr2R 15578342 3' + mdg1 7459 2 78.22 CTNGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCTGGCGATTAGACGATTGGCCCTAATATGCCA:1 + chr2L 12816767 3' - F-element 293 1 73.27 AAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTGATCACACTTAAATGGCCGCTCGCCCGTGTGACTCATGGTGTGGCGGTCCAGGTGGGTTTTCA:1 + chr2L 3171715 3' + flea 4897 2 65.35 TACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCTTTACATACCCTTTTGTTTTTCCAACGATTTTCAGCTATCCAGTTCTG:1 + chrX 9728990 3' - Circe 7190 1 66.34 CTCCCGCTTCAGCGAGAGATACGCTAAACGACTGGACAACCCCTCCTCCCCCTCACCAACACCAAGCAACCATCCAAGGCTGACACAGCAGCCGCAACACT:1 + chr3L 10714120 3' + G-element 4074 1 58.42 GAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATATTCTTTGCGTCAAGCTGCTTACTTAACAT:1 + chr3L 23869137 3' + gypsy 7402 2 72.28 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGCAATCAAAAGAAGTCAATAACAAC:1 - chr3L 11156235 3' - 297 41 2 71.72 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTT:1 + chr3R 6611257 3' - HMS-Beagle 50 2 76.00 ATCATTAAAATTATTATTATTACAATGACAGAGCCATTATAAGCATATCTTAATAGCTAAGATGAAGATCGAAAAATATTGGCATGAAACATCCTTAAACC:1 + chr3R 29310166 3' - mdg1 39 2 44.55 CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATATGGGGTCGAGTTGGATCTTTGCCTGTATGTCA:1 + chr3R 28443762 3' + Burdock 6351 2 67.33 CAAGATGAATACTCTAATGACAAATCTTTCCTCATTTTTTGGATAAGTCTCAACCTATCCAAATTTCCGATTTTTTCATCTTCCATTGGTTTGACTATTTC:1 - chr3R 19447780 3' - 1360 408 1 75.25 TACAAATAAGGACTGTTCCAAGCATAGTTCTAAGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGCAGTCTACTGGCAAAGTCGGGGTCTTATCGGTTAGAT:1 - chr2L 950380 3' - Cr1a 4031 1 74.26 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGC:1 - chr2L 19644877 3' + blood 336 2 61.39 TTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGTACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTATTCATCGATGTTTTGTATGAGCACGCTTTAAT:1 + chr3R 18776322 3' - 1360 488 1 70.30 GGTTTAACTTTTGTTCTTTATGTTTCTTCGTCTCCTTCTCATCAGCTCGCCTAATCTTAGTTACTTGTATTTTTGTTTATTTTTACTTGTATTTTTTCTCG:1 + chr3R 25351840 3' - HeT-A 274 1 66.34 GGGCGCGTAAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTATAAAAAAGGCAAACAAAACG:1 + chr3R 19755632 3' - gtwin 6972 2 75.25 ACTAATAAATAAATTAATAATAAATCAAAATTAAAAGGGTATCCAATGTTTTCATACCTAAATTGTTTTCTCTAGTTTGTTTGGCTAGTTTGTTCTAAAGT:1 + chr3R 21907262 3' + flea 4988 2 73.27 CTNTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACTTTGAGGTGGCCAATCTAATTTTTACTTTAATGAGCAGCGTTTTCTTTGAACCAT:1 - chr2L 16657401 3' - Tc1-2 1194 1 64.36 GANCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGATAGAGCTAC:1 - chr2R 18723034 3' - opus 27 4 57.43 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCT:1 + chr3L 10557658 3' - 412 18 2 61.39 TATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAAT:1 + chr3R 1960321 3' + gypsy9 5228 2 89.11 CATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACAATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATA:1 + chrX 23108295 3' - BS3 1453 1 71.29 AGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGCCCTAATAAAAAGCTAAAGCACAAAGCGCGCCCAGCAAACATTAGCTCCATAACAAGTGAAGAAGACAGCGGCTAAGTG:1 - chr3R 8072011 3' + invader1 140 2 79.21 GAACCGAGAAGCAGAAAGTCAACGCTAAACGCCTGCAACCAGGCCAAAGGGCCAAAATCCAATTTGTGGGCAACACGGGTGTCATACAGTTCCCGCG:1 - chr3L 19894462 3' + G7 15 1 80.41 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGGGATTGTGTTAACTTATACGTTATTTTACAATCATACAATCATATTTATATAAG:1 + chrX 6883316 3' - Burdock 6176 2 67.33 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAGCTATGGACTAATCAACAGTTACCTAACT:1 + chr2L 18754430 3' - roo 48 2 76.24 TGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATT:1 + chr3R 13349576 3' - Ivk 26 1 53.47 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAA:1 + chr2R 11164482 3' - roo 32 2 68.09 GANGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAATGTCGAACAGGCCACCAATCTTAGCGTACTGAG:1 - chr2R 9918012 3' - Doc 437 1 65.35 CCGTGANGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATA:1 + chr3L 20224236 3' - Chimpo 16 1 64.36 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCCTACTGAATTATTGAAAATAATCTACGCTTATCAAAACGGCAACAG:1 + chr3R 11175924 3' - roo 29 2 58.42 ACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAATCTGAAGAACTACCAGATACAAAAAGAGCTAAGATG:1 - chr3R 3523902 3' + F-element 492 1 64.36 TCACTAAAATCAAGTGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAGGACACAGACGCAAGTTACAGCTTGTGTCAGAATAATATATAC:1 + chr3R 20420131 3' - Doc3-element 43 1 64.36 TCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTGAAGTGTTCTTAATTGAAGTTTATGCGAGTAAAAGTGCAGTATTTGATTTCAATATTTACCAACAGCATCTGGACAT:1 + chr2R 17025348 3' - X-element 335 1 72.28 CTGGGCTGGGAGTTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTAGGATTAGTTTTCTTGCTAGGGGATTTGCCTTGTTTGGTCATGAGAATTTGCTTA:1 - chr3L 10927161 3' - Doc 4549 1 73.27 GCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCGCTTACGATGAGAGCGTAATAAATCTAAAAATAGAAATTGTTTGCACAGCTACAGTATCGGCATGCTCCTAGAATTA:1 + chr2R 14275523 3' - 1360 3313 1 66.34 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCAACTGATCGTTTGGCTAATGACCTGAAACGGGTATTTCAGTGGCGGCTTTTGCT:1 - chr3R 26592573 3' + roo 404 1 62.07 TATTATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGA:1 + chr3L 25232821 3' - accord2 62 2 81.19 TCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTGTCACATTCAGCACATTCCTTTCAGTTCGTTTAATTAAAGTGTCCAATAAATTAAC:1 - chrX 18719626 3' - Tirant 8329 2 61.39 TTTTTCGTTTTTTTTTTGTTTCGCTGTTGGTCGCAATGGCTTGGTTTTCGCTCTCTGATGTGGTTTTAT:1 + chr3R 28412822 3' - Doc2-element 228 1 88.41 TCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCAGGAGCCGAACATGATACCGTAGAAGGAGGAAA:1 + chr3L 13036090 3' + HMS-Beagle2 141 2 68.32 CAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTAGTAAGTACAAGTATATATTTTATAAATGTTGCTTTTGCGTTTA:1 - chr3L 4091541 3' + flea 253 2 78.22 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCA:1 - chr3L 10557588 3' + 412 448 2 68.32 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACA:1 - chr2L 6645660 3' + mdg1 7415 2 66.34 AATACTAACTACTTTAACATTAACATTAACATTAACTATGTCCAACTCACACACACACACACTCGCAGGTAAACTGAAGCAGACAGAGACAGCTGCACG:1 + chr3L 5577456 3' + TAHRE 10265 1 55.56 CCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTATTTCTATTTAGACGTAAGCCAATAG:1 + chr3L 13988934 3' - hopper 47 1 72.00 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCT:1 - chr2R 544809 3' - HMS-Beagle 36 2 66.32 CGGTTTAAATAGGTGACATGAGGATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGCGCTTTGTAGAGAAAGGCGTCCCTGACTCCAACAAGCTCGCCCACTTT:1 + chr3R 12709641 3' - roo 335 2 53.47 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAACAGTGCGCAGCGTAAAAAAGAAAGAGGCAAATTGTAAATGCTTAAAG:1 + chr3L 10604680 3' + jockey 4965 1 52.48 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACG:1 - chr3R 446027 3' - pogo 46 1 72.28 TGNCAGTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTT:1 - chr3R 5911853 3' + Stalker 72 4 47.87 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATAAATATTTGATCGAATATCAGGTCTATGTAACATTTTCGTT:1 + chr3R 15744598 3' + pogo 2070 1 59.41 CTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATCATTGGGGCTCCAGTTTTTGCCAGCAATTTTCCTGC:1 + chrX 12160172 3' - Porto1 4472 1 64.36 CCCAGACCCCAAGGTTCGACTAGAGCACCCACAGGTTAGTGAATATCGGGGGAAAAGTCATCTGTTAGTTGACCAACTGCAGGGGCTCCGCACTTTCCG:1 + chr3R 30504269 3' + Gypsy12A_LTR 414 1 73.74 TCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAAAGTTACTTTTAATGAAACAAAACTATCGCCCATCGCCACCTCTCGCAGTCTGGCCACTGTTCTCACTGTTCCC:1 + chrX 8906963 3' - 1360 216 1 74.26 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATC:1 + chrX 22745696 3' + copia 5076 2 76.77 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGTCTATCTGTATCTGTATTATTGTATCTG:1 - chr3L 8048376 3' - roo 8707 2 69.31 GGNTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAACGAAAAATGTCAGCTTTCGAGAGCATTCAAATCT:1 + chr2L 12323057 3' + hobo 2920 1 60.40 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGTGCATGATAGTTAATATGAGTATTAATCCAATTATTTTTCAGCCAAGG:1 - chr3L 12352879 3' - Tirant 8135 2 51.49 TTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTAC:1 - chr3L 25889011 3' - gypsy8 306 1 77.23 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACGGATTACGGTTTACTGTGTTTT:1 - chr3R 446006 3' - pogo 25 1 54.46 GAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTG:1 - chrX 21564636 3' + diver 227 1 76.24 CTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTATGTGACCTGCGAATGGCAAAAACGAAACCATTCTCCAGCCCAAAAAAAAGTGA:1 + chr3L 15983141 3' - INE-1 566 1 53.06 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGAATCCCC:1 + chr2L 19644927 3' - blood 7053 2 67.33 TGAAATGTACATATTTATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGT:1 + chr2L 261047 3' + Juan 4183 1 51.00 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATT:2 - chrX 7583198 3' - I-element 27 1 53.47 AAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTCTTCAGGCGTTTAGATTAGAGTACAATACATGGGTATTGGGGG:1 + chr3L 24234216 3' - Doc 318 1 57.00 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGAGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTG:1 + chr3R 9322866 3' + 412 7511 2 65.88 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGC:1 + chrX 9439838 3' + roo 9041 1 55.45 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGTATAAACTTTAAGGTGGAAAAGTTTCGGCCAGGTGGGAAAAAGGACCAGGATC:1 - chr3L 1698545 3' + roo 386 2 56.44 AATATTAAAATAAAAAAAAAAATAAACACATGCCACAGCTGTTTCTCCATGTTTTTCATATTCATTTGAGACA:1 + chr2R 11925687 3' - hopper 155 8 65.75 GGAATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGTCCCGCTGTGTTATGAACACAGCTGTATACTCGCCACATAGCCACATTCGCCACAAATAAACTAATAACTATTAA:1 - chr3R 23385918 3' + HB 1590 1 46.53 TCTATCGATATCCCAGAAAAATAATCATGTTTCGCGTTCGCATTCCCGCATCTGTTTCGCCACCTTTACATAATCCTGCGGTGCTGGCCTCGTGGTCTCCA:1 - chr2R 4929715 3' + INE-1 501 1 53.47 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCGCATGAAACAGAAATTATGAATGTGCTTAGTGTGGGGCATACATATACATATGTAAATCCAAACAAA:1 + chr2L 19397130 3' + hopper 1407 2 71.29 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGAATCCCCTTTATTTTCCGG:1 + chr2L 19644939 3' - blood 30 2 55.45 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGGGCTTGGCACAAG:1 + chrX 678853 3' - Tirant 8107 1 73.42 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACCCAGACATGTGTTCGCTTATGAGTCCGTTACTGATTATAAACAATGCAACATTTGAAC:1 + chr3L 7154308 3' - FB 19 1 60.40 TCAACGATCGGTATATGGTGGAAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTCAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAACCAACTATCAACTATCACAAACACC:1 - chr3L 9401215 3' + Bica 4766 1 74.00 TTNGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGTATGCAACAAGACCTGGCTGAATAATTTC:1 - chr2R 12446023 3' - hopper 13 1 67.33 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTTTGAAAGATTAAAATATAATTAGAGTTGGGGTAAGG:1 - chrX 20331819 3' + mdg1 7421 2 64.36 GCNCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAACGTAAATAGCCGGTATTGACTACCGGTGATTGGCGATTTTAATGGCCGTCG:1 - chr3L 12447510 3' + Doc2-element 463 1 59.41 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTC:1 + chr3L 13435601 3' - Doc 52 1 44.44 AAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGAATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATTCGAGCACACATTTCTTCAAAT:1 - chr2L 19644861 3' + blood 7364 2 51.49 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGA:1 + chr2R 5485132 3' + 1360 3355 1 60.40 CGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTTTTGGTAGTTTTACGTGTAGTTAGAGTATTGTATTCTACTTGAAATGTCTGTTGG:1 + chr3L 1976297 3' - Bica 4677 1 62.38 CTACGTCTCACCGACAACCCCACGGCCGACAGTGCTGTTAATATCCCATAGTTAGATAGCTGCATCTGCAGCACAACGTGAAAAAGGATCTACAAGA:1 - chrX 12100756 3' + F-element 278 1 81.44 TAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGTGGTGTGTTTGGTATATAACCTTCTAGCTCACACCACATAATGATGTTTTTAAACGCACTTTAATTTTTTTGA:1 - chr2L 16672957 3' - Tc3 314 1 79.21 ACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGATCGCGTTGACTGGCTTTAGCTGATGGCCAAATAATCGAACGATATTTCTGAGCTGCTCTGA:1 + chr3R 30316589 3' + micropia 5303 1 68.37 CAAGAAATCAAATATACAAGAAATCGAATAACTTTTGGAAATTAATAACTAATAATGAAAGTGATATTATTTCAATTACAAATCGGAAAAGTTAAAGCAAG:1 - chrX 16519827 3' - S-element 1562 2 67.33 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTTGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGTTTTCTTGTTTTTCATTTGCTC:1 - chr2R 8951009 3' - P-element 35 1 42.57 CCATAGCAGTCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCGCGCGACCTCAAAGACGACTCAAACGGCAAGGCACACAGAAGGGCCAAAGATGAACCCTTTTCTCAG:1 + chr3R 22158083 3' + Helena 1272 1 66.34 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGCTTTGCGGCCCATTAGCCAAATAATAAACATGTTCAATAATTACCCTGGGGTGTGCGGCATGGGAGTGTTATTC:1 + chr3R 9297130 3' - hobo 4 1 74.26 TTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTGATGCAGCTGCAGTCCCTTTGTTTGGCAGAATCGA:1 - chrX 22746437 3' + copia 51 2 65.35 TGNGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGGATCATAATTGACCAGTTTGAAGCGATGTAAGTAAGGTG:1 - chr2L 2560510 3' + X-element 4342 1 60.40 ATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGAACTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGCAGGAAAACGAGGTTTTGCGAAA:1 - chr3L 16060475 3' - F-element 4252 1 68.60 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACATCTATTGAAATTGAATATATAAATTTACGTTGTGGAGAACTTGCCAAGACTCAAATA:1 + chrX 20933827 3' - mdg1 7056 2 61.39 TTTCAGAATTCTTCAATACTTTTAACCATTACAACTTGCCGGTACCATCTGCAAGATTCATTACATTGAGAAGTGGACTTTGACTCTCAGAATGAATTAAA:1 + chr2R 6462697 3' - G4 291 1 72.28 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACTGTACATCTCTCTATTGCTCACCTTTCTCGGCCGGCGATG:1 - chr3L 11217265 3' + 1360 3356 1 61.39 CTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAAGTCATAAAAAACAGGGAAGAGGCAATAAAAAAG:1 + chr2R 17341703 3' - HB 1318 1 67.33 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGC:2 + chr3R 23601737 3' - jockey 57 1 72.28 TGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAG:1 - chr3L 23933568 3' + Cr1a 249 1 71.43 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAAAGTGCC:1 - chrX 1600178 3' - BS 5020 1 53.47 AATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCACTCTTATCCTACCAGTGCTGGCTGAA:1 - chr3R 24006912 3' + P-element 157 1 31.68 ACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATATCATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTTGAGTATGTCCACTTGATTTTTCCTACAACCTTG:1 + chr2L 3815377 3' + I-element 5113 1 64.36 CAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACATAACAACAAGACAAGGCTGGAGCCCAACTGAATAGTGTGCGTAGGAAGAGCATACTAATTTCATTAAA:1 - chr3R 31964277 3' + I-element 99 1 56.44 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTA:1 - chr2R 2949036 3' + 17.6 7393 2 61.39 ATNTGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATACGTCAAACTGGTTGCCATTTCTGTGTAAAGAGTTAACTCGTTATGAGACGAGTCCC:1 + chr3L 14209105 3' - Quasimodo 13 2 62.38 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGACCCACTTTTATGCATTGGACG:1 + chr3L 12230766 3' - jockey 60 1 79.17 AACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGGATACGTCGTCCACTCGCTCCATTCCATTACCACAGGGCGATGATGGCGACTTGACGAACTTCACCAGGCT:1 + chrX 2236081 3' + accord 84 2 75.25 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAGCCGCAAATTTGCACGTATCCCAGT:1 - chrX 14505791 3' + pogo 2052 1 76.24 GCNATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTG:1 + chrX 4448598 3' - 412 40 2 63.37 GCAAGCCGACTCAGCATTTCTTGCGGCACAGCGCGACACTCCAAATAGGATGCGTCGGACTTCTACCGCCGATCGGTCGGGCATGCGCGTCCGTATAACTC:1 - chr3L 12081762 3' - gypsy 7139 2 75.25 TTTTCTTTTTCTATTTTTTTTTTAAATGCATTATATATCTCAATTGTTAATTAAGCTCGTAACATTTGCAATGGAAATTTAGCTTGAGCCATTTTCCAAGC:1 + chrX 17011523 3' - Doc2-element 233 6 69.31 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTGGACCAACTTTTTTCTAACTTCCCCCCT:1 + chr3L 1698608 3' - roo 47 2 74.26 TCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATTTGTTTGTTTTAACGTGTCTGTTTCTGTAAAACTCTCTG:1 - chr2R 3009646 3' - 17.6 7000 2 61.39 CTNTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCATATGAGACAGTTAAAAGCTGAAATTGCT:1 - chrX 21493362 3' - BS 4741 1 71.29 AAGTATCAAATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAGGAGGATATATATTTACTTTTTTTGGGTATTAAAAATGATCAAATCA:1 + chr2R 4916071 3' + invader2 5046 2 63.37 CAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTGTTGTGTTGCTGGCATTATTGTACTGTGCTCACTGTTATTC:1 + chr3R 22605912 3' + Idefix 7272 2 59.00 TGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGGCGCTTCCATTGTGGGGCCTCTGCGTTTCTTTGTGTGCGTGCAGCTGCAGTGTTGAGAAACGC:1 - chr3R 20784129 3' - F-element 4487 1 69.31 ATCAAGTTACACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATAATTCAAAACTAACTCGG:1 + chr2L 15559453 3' + Ivk 4910 1 80.20 AANTGATTGCTTTGGGTTTTTTTTTCCACAAATTTTATAAAAAAAAAAACTTAAAAACCAAAAAAACATGAACTCACCATGAGCATAGACGGCCACACCGC:1 + chr3L 21442634 3' + Tc1 256 1 61.39 TAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAGGTCATATCCATATGAGGTCCATATATACGAATCGTTTTATGAACAGAAAGGCATTAAAACGA:1 + chr2R 5859223 3' - G3 4554 1 65.35 TTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCAGCCCTTCAAGTAGGCAAC:1 - chr3L 14944562 3' - G5 4770 1 52.48 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCGACGTTTCCAGTGGAGGTGGAATAACTTT:3 + chr3L 22046521 3' + roo 9064 1 74.26 TCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAGCCGAGCTTCCCGTTAATAAACAACTACCTTTAGTTCCAGTTAGCCCAAATGTTTCTCGCTTATAGTT:1 + chr3L 20646253 3' + Circe 271 1 67.33 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAGTGCACAA:1 + chrX 4806751 3' - roo 8687 2 56.00 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAG:1 - chr3L 18337647 3' + Juan 4186 1 54.46 GGATCAATAGCCTAGTCGATCTCGCCACGTCCGTCTGTCTGTCCGCCTGTCCGTCCTCGTCGAGAGTTCTTGGACTATTTCTTACAACCCAATTAACTCC:1 - chr3L 23230701 3' + INE-1 97 1 56.00 TGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACACTTACTGAACAAGTTTTTGTAGCAGACCTCTTTTACTTTTGCCAATATGGCGACTGTAAAATTGCAGTG:1 + chrX 11806098 3' + hopper 952 1 57.73 TGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTAATTAATT:1 + chrX 4175134 3' - 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P-element 8 2 69.31 TCTTAAAATAAAGTTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTAAGAGAACCCCGAGCCCAAGGAAGGGCGACTAAAAGCCTTG:1 - chr2R 18724967 3' + opus 371 2 60.82 ATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTTATGCCACAGCTGTTTGCACCGCCCACATTCCAT:1 + chr2R 16940864 3' - flea 4975 2 66.34 ATNTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGGAGTTCATCATTACAGCCCCCTTCCCGAGTCGTTGGCTTAATGC:1 - chr3R 5524696 3' + 412 7497 2 71.29 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTT:1 - chr2R 8951033 3' - P-element 59 1 20.79 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGACCCACTTTTATGCATTGGACGGGGG:1 + chr3L 12230770 3' - jockey 61 1 76.24 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGCAAAAAAGTGAAATCAAATCTACCCATGCCCGGGCCAAAGAGGCAAAACCCATGG:1 + chr3R 5524757 3' - 412 7075 2 57.43 TGNATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTAGGTACTTAAGTAACAGCACTAATCCTGATGAAGAATAAATGT:1 - chr3R 4971166 3' + 1360 3353 1 60.40 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATGGTAGTAGCTACCAGCGGTTGACTTTGTAATTGGTTGTGTGTG:1 + chr2L 10711695 3' + I-element 5323 1 57.00 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTGCAATGTTGAAGTTTGCACTGCATG:1 - chr3R 28443681 3' - Burdock 6149 2 64.36 TACACTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCG:1 + chrX 21907808 3' + accord 7201 2 68.69 TCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTTCATTGTAAACTGAATTAATTGAATATGAGCCGGTGGCTAGACAC:1 + chr3L 22779149 3' + flea 494 1 57.73 CGNCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAACGGAACGCGGAGAACCGGCGTCTACGAATCTT:1 + chr2L 483492 3' + Burdock 6324 2 67.33 ATCGGTGTCGAACTAATTAATATTAAGTGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTGACACGCATGTATATGGAATGCGATGGCTGACCAATTGC:1 - chr3L 230704 3' + 3S18 274 2 64.36 AACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTGACTGAATCATTATACCCCCAGTAAGAGCAGGCAAAAGCTTAG:1 - chrX 20381382 3' + INE-1 575 1 77.23 GATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACGGATTACGGTTTACTGTGTTT:1 - chr3R 446007 3' + pogo 1796 1 64.36 AATTTGGTTACCTTATGCGTAAATATATTTAGATGTTTTTTTTTGTTTTTGGCATCTGAGCGTAGACCAATGGCAGACTCTTGGGTATCTTAAGATCGTAC:1 - chr2R 8662955 3' - Transib5 51 1 56.44 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTACCATGGACCATGGTTTATACACATACATAGATCG:1 + chrX 12813741 3' - BS 39 1 65.35 AAGCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTATCTCAATTTCTTGTATATTGCCTTGAATAGCTTA:1 + chr3R 27900491 3' + roo 9054 2 61.39 TATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACACACACACCGTTTATTTGTATTTGAAAATGTCAA:1 + chrX 2679244 3' + 297 6532 2 66.33 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTGAGCCCACAATAAAGATTTTATTTACCCATCTGTTGCGATATCGAACATTGATAGATTCT:1 - chr2R 7454071 3' - 1360 15 1 64.00 CCNTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCACATAAACTTCACTGTGCACCTATTCTCTACTCTCGCTCTTTCGCACGCTTTTTTCATGGTCCACGGTATATCCTCC:1 + chrX 9023594 3' + Cr1a 225 1 67.33 GTTTGTCCGTATGAACATCGAGATCTGGGGAAATACAAAATGTTAAAACTTGGCTGTTGGTAACCATTACATGGTTAATGGTTATGACCCAGGCTTAGATT:1 + chr2R 19475143 3' + INE-1 129 1 59.41 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCTCT:1 + chr3L 10557660 3' - 412 7069 2 63.37 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGCTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGG:1 + chr2L 18177963 3' + 412 447 2 70.30 GTNCCACCCTTGCAGGTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACTGTCGGGCATCCTTAACCCTATGCAATGTCCCTG:1 + chrX 10644912 3' - hobo 1 1 78.22 AATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATCGTCTAATTTGCTTAAGTTTGTACCAATAATTGCCATTCAATCAATGAGCAACAATC:1 + chr2L 2851115 3' + P-element 2687 1 52.48 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGCACAATTACCAAGCGACCGAGCGTCGTCAATCCAAAGTCGGTATC:1 + chr2L 20914025 3' + P-element 2857 1 49.50 CANGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAG:1 - chr2R 18723044 3' - opus 7040 4 67.33 ACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTTGTAGATGAGGAACTTCTGTTGGTTGTCGTTGAAGGTTC:1 - chrX 12969251 3' - I-element 318 1 61.39 ACNGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGTGAAAG:1 - chr3R 7885588 3' + hobo 2918 1 56.44 ATTCAAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTCTGAGCTAGCCAAAGTCACGTGACAATGAAGGAGTAAGAGTGTTTCCCACTC:1 - chr3L 3781238 3' - FB 35 1 53.47 AAAAGTTTTTTTTTCTGTTTTTTTGGCATTCGGGTAAACAAAGAGTGTGTGTGTGTGGCATATGTTAAATGCAATTTGCGTAGTCTGTGCTGTATTAATCA:1 + chr2L 1692934 3' - HMS-Beagle2 492 1 86.14 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTTGAAAAATCGAGAAAAGCCAGGTTTTTAGTTCGATAAATATGATTATGTAGCCTTAAATACTAG:1 + chrX 14505867 3' - pogo 10 1 69.00 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGAATGGTTTGGGGCCGTTTGCCTTACAGACAGCGCATTCAAGC:1 - chr3R 15744525 3' - pogo 32 1 57.43 TTTTTCAAAAGTGTGGTCGTGGCAATTGTGTGTGGGAGAGAAGAGTGCGAGTGTTGGTTCTGATTGGACAGAGTGTGCACCAGCCACTCGCGTATCCTAGA:2 + chr3R 27910435 3' - INE-1 252 1 48.51 AGTTGACGCAAAGGCTCTAACCTATTAGGCGGTCAGCAAAAAAATGAACTCGAGTCATCCCATCTTGTACTTCTCTCTGAATCACTAGTTTGTAGTAGTTT:1 + chrX 19812750 3' + Gypsy12A_LTR 475 1 57.43 GTNGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTA:1 + chrX 22782054 3' - I-element 4907 1 73.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGCTCCTTAATAAATAGCCAATTAGTCAG:1 + chr2L 13804439 3' + roo 358 2 76.24 TGNAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACTATTAACCGTTTGCATAAACGACCCATCCTTATGACTTT:1 - chr2L 4786646 3' + Chouto 5943 1 75.25 GCGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACTGCACTTAACTCCGCTAGTTCACAATTTTCCCATGCATCAGC:1 - chr2L 19454461 3' - Max-element 477 1 58.42 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAATGCTGGAGAAACAAGAGCAAGTACAAAAATTGCCGTTATCACGCC:1 - chr2R 13304434 3' - hobo 28 1 52.48 GTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAGAAGAAGATGGCAAAAAGGGCTCTAAAACACGACAACAGCATTTAGAGTCGTCCGGTGGCCCATCATCG:1 + chr3R 7067942 3' + baggins 5425 1 71.29 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACAAAAAAAATAATGCAAATATTGTATCTCA:1 + chr3R 27900462 3' + roo 9025 2 73.27 TGAGCATACCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAAAACCCAATACAACTTGCGTCAGT:1 + chr3L 25768163 3' + Circe 7382 1 75.25 AACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGACAGCAACTTACTCACGCCATGTGCCCCTAGATCCCGTCC:1 - chrX 20351868 3' + accord 437 2 67.33 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGACTCTCGTGGACTCCGGGTTGCATAAAGGCTGGCGCAGACGAAAGGGATCTGCGAGGGTTT:1 - chr2R 15578224 3' - mdg1 15 2 59.41 ATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAA:1 + chrX 1018112 3' - 1360 238 1 72.28 ATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTATGTACGTAGAAAAATAACAATCACGCAGCC:1 + chr3R 23846880 3' + Bari1 1664 1 73.27 ATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCCTCAACACTCTTGTTTGTTTTTAGTATTCCTAACTTAAGAAAAACAAACAAGAGTGTTG:1 - chr3L 15731236 3' + 1360 3203 1 47.31 CTCTCTCTCTCTCTCTTTTACCTCCTCCTCTTTAGCTGGTGAGCGCTAACTA:1 + chrX 8479489 3' + blood 171 2 92.31 AAGCAAAAATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAATGAGAAAATTAACATTGGTAAAATCAGTCCAAGTAATGGATCGAAATGTAAAAAAAGGAATCCATTT:1 + chr3L 15862764 3' + I-element 96 1 77.23 ATNTTACCGCGAAAACTAATTTCACTTTTTCCCCCCGCTGCACTTGTTTGTTTGGTTGACTATCGAATTTCCGAGTAAAACCAGGCAATATGTTGGCTGTC:1 - chr3R 26492433 3' - X-element 57 1 75.25 CGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTAGCCCATTATTTCAT:1 - chr3R 6611186 3' + HMS-Beagle 246 1 76.40 AGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGCTTCTTTACTCTTTTCTAGGCGCACGCACACTGGCACGCCGGCAAAAACACACAC:1 + chr3L 5184300 3' - pogo 1702 1 57.43 CCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCGATCCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATA:1 + chr2R 5924407 3' + jockey 4727 1 43.00 CCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGGAAAACTCGGAAAAGACCGAACAAAGCCACCC:1 + chr3R 17838512 3' + P-element 2750 1 32.67 GCCCTTGAACTTGAGGATTTGGGGCACACTTGATTCCAATAAGACGGTCGTTAGGGGAAGACTGAAAAAATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGAGAG:1 - chr3L 23226674 3' + mariner2 425 1 63.37 TCNACTCCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACATACCCATTTGAGAATACAGCCTCGATGACTTGATTGTTGTGTTGCGACATGATTAGCTGATAA:1 + chr3R 2691134 3' - diver2 15 2 49.50 AAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTCGACTGGCGACAAGAAATATGTAGACCCACGCTAACAGCTGGAGCACCTCTGTTATCAGGCCGATATTTTTCGAATA:1 + chr2L 21107729 3' + Transib-N1_DM 490 1 54.46 ATGTGATTGTTATGTTAATGTAGTAAAGTTACTTTAAACTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCCACAAAGTGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTT:2 - chr3L 19457488 3' + X-element 4580 1 58.42 AATGATATAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAAACGGGTTAAAAAAATATCCCCTCTGCCCTGTTAGTCCTTTCGCAGTGCTTACAAATTTCTCAGAAG:1 + chrX 453779 3' + Tc3 1579 1 72.73 AANAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTTTCAACTCGCCGC:1 + chr2L 6184265 3' + roo 9052 2 57.43 ACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGATAGACACGTTGTCGCCATTGTGACGATAGATTGGTAACGATGTGGCAGC:1 - chr3L 1712273 3' - F-element 4498 1 51.49 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACT:1 + chr3L 9907441 3' + jockey 4984 1 56.38 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATCGATAAAAGGGGCAAGCAGGTAGTGTAGTTGGAA:1 + chr3R 23886834 3' + S-element 1675 1 69.31 AGNGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTATACATATATTCGAGTATATGTAAGTATGGGTACGTAT:1 + chr2L 16954896 3' - Quasimodo 32 2 68.32 CTATCTATCATAATAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAATTAAGCTGGCAAATGTGCGCCTGCCATCCGTATAACCTAATTATGAGAAAACCACTTAAGCT:1 - chr3R 23561942 3' + I-element 5350 1 61.39 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTGCGGCATTACGTATACACCGCGTGTGCAGTGGCTCCTGTTGCAGACAAAATGCACAGCCCACGCAT:1 - chrX 5441960 3' - hopper 6 2 67.33 TAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCCAGTTTTGAAACATTTACTTTATGTTGTT:1 + chrX 22779458 3' + I-element 5261 1 80.20 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCGTTTTT:1 + chr2L 18214149 3' + hopper 1413 2 73.56 GCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTT:1 - chr3R 460084 3' - F-element 100 1 65.35 TGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATGATGTTTGACAATATTTTGTTTTTTGAAAATTCCTGTATAATGTCAACCGTTGGCATCT:1 + chr2L 20464745 3' + R2-element 3386 1 59.41 AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGTCGTCTGTGTTTATGCTTGTGTGGAAAAGAGCTCGAAATAGGTAGATATATACACG:1 - chrX 522114 3' - transib2 18 1 59.41 TATCTGATAGTCGGGAAAGTCGCCTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTC:1 - chr3R 4504061 3' + INE-1 559 1 66.67 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATCATCATTAAAAAGCATCGTTGCAGGGCAGGCCTTTAAACTCGCAGCAATTCGTTTTAATGA:1 - chr3L 963000 3' + jockey 4971 1 48.51 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTTTGAAATTGTGTTCTTATAAATTATATAAAATTACTATACCACAAGTCATTGCT:1 + chr3L 8331299 3' + roo 9052 2 58.42 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTCACATATATATAAATGAATTAGTAAAACACTATTCATATAAATAATTTAGTATATTAAGATTT:1 - chr2L 13229101 3' + roo 388 2 56.44 GGNTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGCGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATATTTTTTTGTTGCCTGCCATGGGAGCCCATGACC:1 + chr3L 12172881 3' - 17.6 6961 2 65.35 GAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTCACCTGGCCAAATCACAAAGGTTTCTTTCGAAAGCCTTTCAAAACGAAATCAAG:1 - chr2R 18649390 3' - opus 17 2 61.62 AAAATATAATATAAATTTCTAACAAATACTATTTTTATGTGCTAACAAAATTCTCAAAAACAAAACATAAGCTGTTTTCCAAGTGCTTACTATAATTAACC:1 - chr3L 18215036 3' + Burdock 410 1 88.12 GTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAAATTGTTACAGTGTAATTTTTACATGGATGATATGTTCGGTGGAGCTGATTCCATACGCAAGCTATTAATGCTAA:1 - chr3L 26291047 3' - 1360 310 1 73.27 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGGAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGG:1 - chr2L 17205188 3' + hopper 1379 1 60.00 GGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTTAATGCAGGACAGGATGCGTGTGATGGGCGGTCCGAAGCATCTGAGCGAGGCCGATGCTATGGCCATAGCA:1 - chr3L 8943806 3' + Circe 7105 1 77.23 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAACATATCATATATAATGCAATTTAATCATTTATCTTCTTTGAAAAGATTCTGGCAAT:1 + chr3L 1973525 3' - flea 4776 2 58.42 CAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACGTGTTAATCAATTATTCAAAGATTTGCATGGCAA:1 + chr2L 18864940 3' + HeT-A 5932 1 71.29 GAAAAATATCATAGCAAGCTTTCCTCGCACCCACACAGAGCCACTCAAACAAAGAAGAAAGACAAAAAGGGAACAATGGGCAAATGGTGCACTGAAAGAAA:1 - chrX 21487400 3' + F-element 4442 1 71.29 GCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:2 - chrX 12649915 3' - rover 43 2 76.24 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGAAAATCCACTTCTTTTGTGGAGAA:1 - chr3R 24461798 3' - F-element 23 1 61.39 GGNCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGGGAACGTGAACGTGGGCGTATTGCAGCCCCATGCAACGGAGCTTTTGAGAAGATTACCTCACAAA:1 - chr3L 13877235 3' + flea 279 1 69.31 AAACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCCACTAAAATATCCAGAAGAGTCCGATGGTCTGGTCACAGGCCAAAAGAAGAACAAAAGAG:1 + chr2R 7584498 3' + HMS-Beagle 378 1 62.38 GGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGCCTTCTGCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGACT:1 - chrX 22651468 3' - INE-1 107 1 83.51 GGTCGCCATGTAATAGTTTTAAAGAGTAATAGGTATAGATGTAGTAGATGTAATAGATTTTGTTTTCTTAGACAGCGATTCTACAGCGACTTCATCTTCCA:1 - chrX 13152724 3' - Stalker4 417 1 63.37 CATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGTCAGTCGGTGGGCCATGGAAATGGTCGTGGCACTGATTCAGATTCTCGGGG:1 - chr3R 20094100 3' - gypsy4 208 2 54.00 AAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATGGAGGCGCTATTCGAGGAGGCATTGCCATTGCCGTTTGAGCCATTACCCGAGG:1 - chrX 6878126 3' + micropia 5330 2 58.00 CCATTTTAGCCGATTTAGACGATCTACCAAATTCTGACAAAGACCAAGAAACCCACAACAGCTGCCCATCAAGCGGCCCAACAACTAAATCTCATGGCTGC:1 - chr2L 18960131 3' + Fw2 147 1 61.39 CCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAAG:1 + chrX 19053023 3' + roo 9018 2 78.22 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGTATAGCTAAATTTTATTTTGAGGATTCA:1 - chrX 19959829 3' + roo 361 2 77.23 AATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAAT:1 - chr3L 24213799 3' + invader2 5054 2 76.24 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACG:1 - chr2L 17205201 3' + hopper 1367 1 72.73 AGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGTCCTTCTTAGCAAACCCAATCCCAATCCCCCGGTATACCCTGGCTAGCCCCGATATCTCCAACATAACCCCC:1 - chrX 7530604 3' + I-element 5084 1 52.48 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGGGCCTCGAATGCATTTCATT:1 - chr3R 29357038 3' - 412 26 2 50.50 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATTTGTAGGGGTAACCCGCATCCAGGTGAAAG:1 - chr2L 19602856 3' - hobo 45 1 66.34 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTCATAGCTA:1 - chr3L 14088072 3' - hopper 44 1 70.30 CGCAGATACACAGACACACACACACACACAGCGGCAGTGTTTTACGCATTCCAATAAGCCAATGTTGGGCAACCTGCAGCATGGCTTGCTCAAATATTTAC:2 + chr2R 20101483 3' - Stalker 445 1 55.45 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATGT:1 + chr3R 17666038 3' - Transpac 38 2 63.37 CTCAAGTGCATTCGCTCTTGGATACAAGTGCGTTTTATGGCACGTTGTGCTTGTTTGTTTTTCCATTGCGTATTTAGAAGTTTATTAATCATAGCTTTTAC:1 + chr3L 2310739 3' - Idefix 337 2 69.31 CAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAACGATAGTTCATTTCATTTCATGTTTATTTTTCCAAATTTCATTGGCAATACCTAATTAAA:1 + chr3R 9192599 3' + invader3 260 2 62.38 TGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTTGCACAAATTGCAGGCTCACACACACACACACACTGGCACACACA:1 + chr3R 22562289 3' + accord 6950 2 58.42 GACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAACTTGATATCTAATTTCTATGTTTACTTTACCTTTGGATATATTTTA:1 - chr3L 16654469 3' - I-element 5311 1 57.43 TTTAAAATATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTCCATTGAACATTTCATTGACACTTTGACAGCAGCATTGACATTTGCGTGACTCGGGTGATT:1 + chr2L 17117647 3' + Tc1 1502 1 68.32 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGG:1 - chr3L 18337664 3' + Juan 4169 1 71.29 GANAGGTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTGATTACATTTTATAAAAGAATTTAGTTGGGAAATAAATAAACTGAAGAAGACACTTGATTGGTTTCGT:1 - chr3R 11377431 3' + invader2 4626 1 75.25 TATTATATTAACTAATAAAAAACGTATATATTACAACTGAAATGAACGTGTTTTTATTGGGGTTTCATTTTGAATTCAATTGGGGCAATACATATA:1 + chr2R 19659694 3' + transib3 2673 1 87.50 ATNTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAATAATAGGAGCGCGCGCGTGTGTGTGTGTA:1 - chr3L 13991972 3' + S-element 1671 1 74.26 GAATGCTGAATGAAATCGTTATGAAGGGGACGAAGTACAGGAAATGCATTTGCATTTCGGTTAACGCACTAGAATATGCAATTCAAATGTGTGTCGCATAA:1 - chr3L 10476487 3' + copia 4649 1 73.27 ATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:1 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 58.42 CTTAAGCGCGTCATGTGCGGGTGGCTGCACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCCATGAGCCATGCGAAATGAAAT:1 + chr2L 15642619 3' + Stalker3T 237 1 80.20 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTCGCGTTCATTCTCGTGCTCATCGTCGTCGCTGCTGGCCGCACACATCCTCGCATCGAAACGAGTC:1 - chrX 18356166 3' - P-element 6 2 73.27 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCACGAAAGACCGGTAACGGCGGAAAATAAAAACGGTAACCGCAATTTGACCCAGGTTTTTACTTGCTTTA:1 + chr3R 28063688 3' - Doc 9 1 71.13 GCTGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAACCCATAGAGACGAAAATGTTGCATTGTAAGTTCACCCAACGCCATTTACATTTTAGAATATGCAGCAAATTAAA:1 - chr2L 17582034 3' + TAHRE 271 1 64.36 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCATGCCACACACCAACACAGGCCTTT:1 - chr2R 18005595 3' - hopper 46 1 79.21 CGNGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGATTGTACTTCGGAACATGAGCGCCTAAAA:1 + chr3R 19560930 3' + hobo 2891 1 75.76 AAATTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATCTCACGTTCTCTGCTGGCGTAATTAGAACCTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGAT:1 + chr2R 2527420 3' - roo 8731 2 60.40 CCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAAAATAAATATGCAAATGCAACGCAATAA:1 - chr3L 10382684 3' + I-element 5299 1 77.23 AACACACTTCAGCTACCACGTGAGCATTAACGTGCCACGTTGACATCCAACACCGTCATCTTACATTGATTTCTTTGGCGTTTATTATTATGAATTTCTT:1 - chr3L 17496956 3' + Chouto 499 1 58.00 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATATGTGTGTATCATAATTTCCAATCCGTGTAATCATGCCCGTCAAAAAGGGTATGTAAAAA:1 + chr2R 18344637 3' - 1360 16 1 59.41 TTNGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACATCTTCCTC:1 + chr3L 6442673 3' + roo 9040 1 55.45 TTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTTGCTGACTGTCGTCGTAACTGAAATTGCC:1 + chr2L 19285908 3' + F-element 4632 1 70.00 CAAACAAATTTAAAAAAAAAAACTTAAACTTAAACATAGCATATAGTGAATACTCGTTATATATCATTAGAAATAAATTTGTCTCCCTTATTTTTTTAG:1 + chrX 6381728 3' + gypsy2 424 1 45.45 GTNGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAAGTGCGAGTG:1 - chr3L 13878031 3' - flea 4770 2 62.38 CTTTTATAGTTCCTGAGATCTCAATATCCTGATATTCCTGATCAAGAATATATACACTTCATATTGTCGGAAACGTTTCCGCGAATCTAGTATACCCTTTT:1 - chr2R 4618506 3' - INE-1 148 1 53.47 GATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATATACTTTATATGTATTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTT:1 - chrX 15903172 3' - INE-1 96 1 45.54 CANTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTTTTTCTATACTTTATTACAATAATATTTTGTTTTGATATTAATCAA:1 + chr3L 17695348 3' + 1360 3236 1 58.42 GCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTAGTTGCTTTTTTCTTGCTTTTGCCTTTTGCTTGCTAGCCACGGGAAACCCAGGAGCCGG:1 + chr3L 1720273 3' + hopper 464 1 59.41 ATNTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATGTATGTGTATAGAGCCGGACAACGCGGCGTATGAGTG:1 + chr3R 24408315 3' - Quasimodo 33 2 62.38 TTTCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTTTCAACTCG:1 + chr2L 6184261 3' + roo 9048 2 53.47 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTCTTAACCATCCATATGTGAAATAAATATGATGTGTAGGCATATTTCCCTATAACTC:1 + chr3L 1140364 3' - hopper 16 1 55.45 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAGTCAATTTTCGTACGATATACCAGACACTTTGCAAAGAATAGCGCCCAAT:1 - chr2L 18177901 3' - 412 20 2 58.33 CCNAGCTATGGGGGAACGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAATCATCCAAAGCAAGAATGAGAACAACCAAAATAACATCCAAA:1 - chrX 18607646 3' + Fw2 3561 1 56.79 GTTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTATCTACAAGATGCGAGTATTCGCTACTCACCACTTTAATGGCCGAAATGGCAGCGTG:1 - chr2L 12298723 3' - 17.6 7161 2 58.42 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAAGCCACAGATGCTCGTGCCCGTGGACCTGGGCAAATGATTTGCATTAAA:1 + chrX 6944198 3' + roo 9042 1 53.47 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTGCGTAGCCCCTCCCACAACTAACCCCCCTTCGAG:1 - chrX 4323791 3' + S-element 1679 2 66.34 TGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAACAACTTATAGATAATACAAAGAACACAAGTATACTGTTGCACTTTGTAT:1 - chr3R 27539156 3' - Burdock 6160 2 55.45 TCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCTTTTATGCCCGCACATGTGTGTGCTTGCAACTCTTTCGTCTGGCATCTACCGCACTGCTCTTCT:1 - chr3R 27140512 3' - Doc 4492 1 54.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGGCATGCCGGGCTAGAGCTCG:1 - chr2L 17205155 3' + hopper 1411 2 73.27 GTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGCTAGGTATATTAAAATCACCTAGAACTA:1 - chr4 1266621 3' - Juan 51 1 72.28 ACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAATTGGAGTTAACATCTTCTGTTGTTCTCTTTAATAGATTA:1 - chr3R 19448703 3' + hopper2 1525 1 61.39 AATTAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGGGTTTAGTTTCGGTAGTTGGGTGCCAATTAAAT:1 - chr2R 4203211 3' - 1360 3261 1 66.34 TTTGTTTCTTTTCAGGTACCCACCGCCACCCACGGGTCCACCCACCATCACCGCCCACCACCATCGACCCTAGACCACCCACTCCGCAGCTGCTCCACTCT:1 - chr3R 6613902 3' - HeT-A 5753 1 79.21 TANGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTGATGTAC:1 + chr4 311611 3' + 1360 3382 2 72.28 TTNTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCA:1 + chr3L 24916688 3' - Porto1 151 1 55.45 CGATTCCTGCGTGCACTGCGGTGAGGCGGCCAAGAATCCATTTAGAGGTTGTTGGAGCAATTCACATTCCTCGTTGAAGTGTACGGCTCACTCAGAGACCC:1 + chrX 16396602 3' - 3S18 5632 1 55.45 AAACATTAAACTTCTCTAAGAAAGTTATTTATTGTAACGACCTTAAACAATGGAAGATGCCTGAGAAGTGGACGCTGCTCGTGTCCAAATGGATGGGG:1 + chr2L 2354781 3' + I-element 473 1 55.10 CTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATTTACCATAATTTGTTCTGCCGTAATTTGTCTGTATCTTGCAAATTTGAGACACTCTTTTTCGTATTGCTTCA:1 - chr2R 1646262 3' + I-element 5255 1 77.23 GCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTCTTAGAAACTTCGTCGCGAAA:1 - chr3L 14086976 3' - hopper 1055 1 64.00 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCCAAAGTAATTTCACATGCGTGGATTTAAACCAGCGTAT:1 - chr3R 10824057 3' + 412 7508 2 62.38 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGATTTCCTT:1 - chr2L 19845877 3' - F-element 16 1 65.35 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCTAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAGCCTTGCAGAATTTATATACTAAAGAAACGGTTTGCATGCAGGAGA:1 + chr3L 22775979 3' - flea 25 2 56.44 TTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAA:1 - chr3L 18337660 3' + Juan 4173 1 67.33 TCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACAGGACGTC:1 - chrX 4806655 3' + roo 395 1 65.35 CAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGATAATGAGGCAGCGAGTTTGGGGAATTGCTGTTCGTTTAAAGACAG:1 - chr2L 9751859 3' - F-element 358 1 54.46 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTTTGATAAAATTCG:1 + chr3L 22751993 3' + roo 9046 1 60.61 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAATATGGAATAAAAATAACAGACGGTCGAATGGTTGGA:1 + chr3R 30106865 3' + roo 9030 1 68.32 AAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGCTCGAGCTGAACTATTTATACTATAACTTTGGCCAAGTACTTCAAACTTTCCCCTAATACAGAGG:1 + chr3L 11920133 3' + Tabor 7315 2 74.26 TGNGATTTGGCGGCAGTTCCCCTCGCCTGGATGGCATAATTACACGTTGATGAATGCCTCAGCAATTGCAAACTCAACTATGTTGCAAAGCTCGGTAATAT:1 + chr3L 21452546 3' - G5 4406 1 54.46 ATAAATATTGTTTAATTACATTTTTAATTTGAGAGCGGAAACGGGCGGTCCGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 22100279 3' - S-element 106 2 76.19 GGTTGGTGTTGTTAAATGTATCTTGCTTGGTTTGAAATGAGCTAAGCAGATCAGCAGAGATGATGATATCGTAAATTTAAAGAACACATTATGCAAAGTGA:1 - chr2R 7376000 3' - I-element 5085 1 71.29 AGATGGTTAGGGTGGTTGTCCAGTCGTTTAGCGTATCTCTCGCTGAAGCGGGAGATCTCCTCTGCTACCCACATGCAGTTTGCTCCACATGGAGAGCCAAC:1 + chrX 12863087 3' - G-element 4106 1 70.30 AANAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTAGGCCCAAGAGCACACACACACACACACACATACATAGAAAGAACGATGGAGAAGGACATGGCAGT:1 + chr2L 9314014 3' - hopper 6 2 64.58 GACCTATGGCTCCGAGCTATGGGGCAACGCAACCTGGAGAACCTGCAACATGGAACTGGAGACGAGACCTACAGCCCAAGAAGTCCCAAAAGACAACCCGA:1 + chr2L 7354896 3' + Doc3-element 4323 1 70.30 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCCCTTCACCGCTCCCTCCTGAGTATTCAGTCTTAGTATTCGAGTATCTTAGTATCCGAGTATCTCAACTGG:1 + chr2L 9141658 3' - roo 6 2 69.31 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGCGGATAGATGCCTGCTGGTCTGTCAATTATGCACTTCCATATCTGCCTTGAAGGACTCACATCACTG:2 - chr3R 20984152 3' - hopper 3 2 74.26 CCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGGCACTCAGCCAGTAAATTAGGTTCATGTCTCAACTATA:1 - chr3L 10557582 3' + 412 455 2 62.00 ATNTTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCACTCTTATCCTACCAGTGCTGGCTGAA:1 - chr3R 24006912 3' + P-element 158 1 32.00 GGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGCGTCCTGAGGAATTGCAGTGCGGATTGTTCGAGGACATTCTCGTTGAGATT:1 + chr2L 6299047 3' + Rt1b 4814 1 48.00 ATAGTTACACACACACACACACACACACACATACACACTCATATCATTTGATGGAGAACAGGAAGCATTACGGAGATAAAAACGCCATAAATGGC:1 + chr3R 13822399 3' + Quasimodo 33 2 57.89 TGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCATTAAATTTATGTACATGTCATTTGGGGGCGTATACGTAAC:2 - chr3L 7295165 3' - G2 2959 1 60.40 CGGTCAGTCAGGTCTTGATGTTGGTGAGAAAATCTTAAACTCTGCCAAAACTTCTGTGTTAGTTTTAAAATGTTTTTAAGATGCAGTAACCTATTTACGTT:1 + chr3R 25087701 3' - jockey2 3187 1 77.23 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAAATGGTTTATAGCCGCATTTTTGACAGTGAAATGTGCCTGCGTGCGTTTTCTGCAGCGGTAAAAGACGAAA:1 + chr3R 25652095 3' - Juan 8 1 70.30 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTCGAGGTCTACCCTGAATTTGTCCTTGTAAGTGTGTGCTTAGCCATTAAGTGCATATG:1 - chr3L 6522265 3' - pogo 18 1 59.41 ATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAACAAAAAATATATATTGATAAGCACGGGCATGGGAACGAGGCGGAT:1 - chr2R 13746002 3' + G2 3027 2 55.45 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTA:1 + chr3R 6776597 3' + copia 220 1 63.37 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGTGAAAAGTTGGAACGAAA:1 - chrX 8150433 3' - rover 26 2 75.64 TATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAGAACGGAGGACATTCGGAAATTAAAAAATACTGAATGGCATCATGTTA:1 + chr3R 19446436 3' - 297 6958 2 59.41 TGGTGCCAATTGATCAATAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTAAAGGGCACGAAATATTTAGTTATTTTGTTTGTCCAAGTGAGTGCAG:1 + chr4 1233684 3' - 1360 262 1 66.34 AACAACAAAAACAACAATAAGGTGGTGCAAAATAGAAGACGGGATATATATGGGCAATGCACCA:1 + chr3L 8841655 3' + I-element 133 1 87.50 AATGTATGGCCGTTACGCATTTCGTTATTCTAGGGTCTTTGATTGTACCATATATTTTTATATATATTTTGAGAGAGTTTTCCAACGTATACATATGTATG:1 + chrX 16121222 3' + 1360 3369 1 69.31 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGAAA:1 - chr3R 24461819 3' - F-element 42 1 58.59 TGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACCCTTAACCCTATTAACCCCGTGTCCGCGCCCCATTGCAACCCCTTA:1 + chr2L 3964633 3' + I-element 92 1 54.46 TATTTTTTTTTTAGTTTTATTTGTTTTTTCTTTTTTGG:1 + chrX 18935413 3' - Doc3-element 172 3 86.84 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCA:2 + chr2L 6184241 3' + roo 9028 1 69.31 AGGGCAAACGATTCAAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCCAAAGTCACGTGACAATGAAGGAGTAAGAG:1 - chr3L 3781250 3' - FB 45 1 68.69 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCTTGGATTATAATATCACGTATTTCTAATTT:1 - chrX 6654421 3' - jockey 4732 1 68.32 CAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAACATTTCAACATTTTTGTGATAAAAACAACCGCAAAAAATAATTAACCCTATGACGCCCTAACATTGCCGCAATCT:1 - chrX 17866119 3' - INE-1 543 1 61.39 ACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTTA:1 - chr2R 912937 3' + mdg1 7445 2 65.35 AANATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAACATGTGTA:1 - chrX 18952063 3' + mdg1 375 2 69.31 AAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTAT:1 - chr2R 5582167 3' - Cr1a 441 1 67.33 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCCAGCTTGATGGCATTCTTAATCCGAAGATTGC:1 + chrX 6814332 3' + roo 9029 1 66.33 ATTAACGGCACAATAAGTGGACCTGGTACCCGGGCGGGCCGTGCGCAAAAAGGGAAATGGGGGTGGTGCACAAGTGAAGACAAGGAATTTGGAAAATCTCA:1 + chr2R 13619850 3' + gypsy8 4919 2 57.43 GCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTTATGTACTTCCATATAAGCACCGATCGCGATGATGATGCTATTTTGCGGATTTGTCTCGTCC:1 + chr2R 17392359 3' - Tc1 1638 1 67.33 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGGCATTAATATAAATCAGATATTTTAGAGATTCAAAAAAAA:1 + chrX 14131820 3' - I-element 9 1 58.90 TTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAG:1 + chr3L 19339436 3' - Tc1 19 1 64.36 CAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATCGTGAACTGTGGAGTGGGCC:1 + chr2L 5627790 3' - flea 4755 1 80.20 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGCCTTTTTCCACCTATGGAATTTGATTTATTTGTTGCACTTGAATCACTTAC:1 + chrX 15173413 3' - roo 8689 2 57.43 GTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTGCAATGTTGAAGTTTGCACTGCATGCCTGCGTGGGGGTT:1 - chr3R 28443667 3' - Burdock 6135 1 78.22 ACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACCCCAAAATAATACCAATCCCAATTAGGGTAGGTAAATAGGGATGTCTCCTATGATAAACGTGA:1 + chr2R 588037 3' + I-element 181 1 64.36 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATGTATGTATATGGTCTATATAGAACGCAGTCATAATCGTAAACAATTGACGGCGACCGCGACATTTTATAG:1 - chr3L 11450444 3' - Transpac 2 2 77.23 CACACACACACACACATACGCACACACAAACATTTATAGTTTGGAGAGAAGATCAAGCAACTAAAATCGATAATATGCAAATATTTTTTGCATCCCCCA:1 - chr2L 12549450 3' + accord 7032 2 73.74 CGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACAAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAAGACAACAAGGAGGTGACGGAGGAAACCTG:1 + chr3L 20225187 3' + Chimpo 76 1 77.23 GTNACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAAAAAAAAGATACTTTTCGATTAATGTAGAGTGGTAACTATCGATAA:1 + chr2L 16507870 3' + BS 5058 1 60.40 TCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGAAGTGCTCGGGGTGCTCATGGGCCATCCAAGGTGACTAAAGAGACAAAGAG:1 - chr3L 1447653 3' + Bica 3 1 52.53 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCAACTGATCGTTTGGCTAATGACCTGAAAAGGGTATTTCAGTGGCGACTTTTGC:1 - chr3R 26592574 3' + roo 389 2 56.44 ATATAGAATTGTAGAGCAAGAACTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGTCCATCACTTCAAAAATTGCATAA:1 + chr2R 21833647 3' - F-element 4232 1 72.28 CGGGGAGCAGGATGTGAGGCCAAGTCGCACCCTTCGCCTCTACTGCCAACCAACCCGCCACCCCACGGCGGAGGTCACCCACTCGACTGGTGTTTTCCGCC:1 + chr3L 10817026 3' - Rt1b 4957 1 56.44 TTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATT:1 + chr2L 22224564 3' + Rt1c 5401 1 55.45 ATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAATGTTTGTCATGTTTACCTTTTTCCGGAACAATTCCAT:2 - chr3R 9127347 3' - invader3 5202 2 63.37 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAAC:1 - chr3R 17665959 3' + Transpac 293 2 62.38 TTCGATTATTACCGAACTGATAGAAAAAAAAAAACATCAAGAGCACAGTTGTCATTTGTAATGCATTTATTCGGTTTCAGTGTCTTC:1 - chr3R 22743789 3' - Circe 445 1 57.47 TCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAATGTCTCCATGTGGCTAACGGCCATCACATTTCTGTGTGTCGGCTACGGCGACATTGTGCCAAACACGTACTGTGGAC:1 + chrX 5388327 3' + TAHRE 10432 1 73.27 CGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCT:1 + chr3L 23678137 3' - Osvaldo 15 2 72.28 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTAAAAAATTAAATATAAAAAACACACACAACCAAAAAAAA:1 + chr2L 7418313 3' - pogo 19 1 58.14 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAATGTTTGGATTCTATCTCTATGTTAAGTAATCTGTAGATATGCTCTTCTGAATTGATTGAGAAATTTTGAA:1 - chr2R 19257366 3' - Doc 7 1 69.31 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGCTTTTCATCATCTCGCACTACGGACAGCGCTGATCGTGGACACG:1 + chr2L 21863421 3' + Burdock 227 2 55.45 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGAGAAATAAATACAATAAATTAGTTTAA:1 - chr2R 16880921 3' - 1360 27 1 56.44 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATATAGTCATTTTGTTCGTTTTACGTTTTTTTACACAACTA:1 + chr2L 21951242 3' - opus 36 4 64.36 TANTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGA:1 - chr3R 9325625 3' + roo 361 2 71.29 TCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAATTTTGCGCACTTGACACCTGAAGTGTCGTCA:1 - chr3L 2392351 3' + Transpac 5219 2 66.34 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATTGCGTCAAATTATTTT:1 + chr3L 22751981 3' + roo 9032 1 73.27 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCGGGTGAAAAGCAAATTCATAGACGTGTCCTTCGTACA:1 - chr2R 22456191 3' + diver 184 2 62.38 CACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACCACACGATCCACCATACCGCCCAGCCCCACAATTTTATGCGCCCTTT:1 - chrX 7457094 3' + Doc 494 1 53.47 AATAATAATATTAATAATAATTATAATAGGAATGAAAAACCGCAGAGCTGCAGAAACCGGCGACGGGACATATTTTCTAAAGTTTGCTTTGAAATATGCAC:1 - chr2L 15129443 3' + mdg1 7081 2 70.30 CTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGAGTTTTTGATATAATCGGATATGATACGTCATTATATATATAATA:1 - chr4 1269542 3' + Transpac 277 2 55.45 CAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTCCCACTCTGAACTCTTCCGACTGTAGCAGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGACGTAGACGCTGGCGCTGTTTCGGC:1 - chrX 5939760 3' + Porto1 491 1 63.00 TCNAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTCCATTTTTTTATATTATTGAA:1 - chrX 23211096 3' + HMS-Beagle 6992 2 81.19 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCA:1 - chr3R 19589945 3' - BS 5043 1 68.32 TTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAACTTGG:1 - chrX 19820027 3' - mdg1 7037 1 74.19 CAACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGTAACTCACAACGGGAGAGCAGAAAAAGAAGTTCGAGCGGTAATAGAAGGG:1 - chr2R 4396834 3' + G6 308 1 52.48 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGTCTATTCTT:1 + chrX 364830 3' + hopper 1378 1 62.38 TANTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATATAAGGTCTTTTTAATTAACCAACTTATTCGAAATACATCGATTA:1 - chr2R 18344554 3' + 1360 3357 1 61.39 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGGATCCAGAGTCGCCGCTCAGGCTGCTTTTCCC:1 - chr3L 19275685 3' + mdg1 377 2 67.33 TTNCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACGGTGGCTGCTATTGTGAACGAATTTGCATGCAGAGTGGCTTAAAAGTGATACCAAATAACACTAA:1 - chr3R 20584267 3' + 1360 3381 2 71.29 TTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTA:1 - chr3L 4091584 3' + flea 210 2 75.25 TTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCGTAGACCAATGGATTCATACATGAGTTGGTCG:1 + chr2L 6712792 3' - I-element 5003 1 68.32 CCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACTTTATGGGTCCGAGTCCTTGGCTTCCTGAACTCTGCTGGTGCCGTGGCCT:1 - chr2L 16408642 3' - invader1 25 2 55.45 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGGAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATG:1 + chr3L 22046474 3' + roo 9032 1 69.77 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGGATACGCTTTGGTTGCCTCGCCTGCCCCCTGAGG:1 - chr2L 12322987 3' - hobo 41 1 65.35 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTTAAATTGTTGCGTTAACCAAGCCAACCAGCTTCGGGGGCAATCCTTGTA:1 - chr2L 15013933 3' - jockey 4700 1 54.46 TTNAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGCATTAAATTTACTAATTAACAACAACAACATGCACTTCGCCTAGCGAATC:1 + chr3R 29357121 3' + 412 468 2 51.49 ATTATTAATTATAATTATTATTATTAATTTGTAGTAGATCAACGGATACTGTATACAGCTCAATCCAATTTCATTTTAAATTTCAAAGAGTTTCAAGTTTA:1 - chr3R 31611875 3' - gypsy9 5308 2 66.34 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAATGCTGGAGAAACAAGAGCAAGTACAAAAATTGCCGTTAT:1 - chr2R 13304440 3' - hobo 32 1 57.58 AAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATTGGCGAATTCAGGGACAGACAGCCTATTGACGTTAGTTTGATAGAATTATTAGAAGTATCTA:1 + chr3L 25883660 3' + micropia 5378 2 66.34 AAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAATACTGGGGCGGCACAAAAAAATGATTATATTTACATTAAGAACCTATGTACACTTAA:1 + chr2R 5070970 3' + Tirant 8240 2 70.30 TTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATTGAAATTATCAAAAGAAAGGTAAATTGAGGAAGGTGGAAAGGTGGA:1 + chr3L 6899229 3' - pogo 212 1 61.39 TCNTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATGTAAAAATATTTGAACTAAGCCAGCCAAAGTGTAAGGACGACGAGCAGCATTGGCTGTCTGAGC:1 + chr2L 9410887 3' - roo 8675 2 68.32 AATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCG:1 - chr2L 23372507 3' - gtwin 6 2 73.27 GCTCCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATA:1 + chrX 21564761 3' - diver 10 2 70.30 TANATATTTATATTTATGTTGATTATTGAAACATTTCCATGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGA:1 - chr2L 22690005 3' - 1360 2958 1 65.35 GTGATGAACTGCGAAACAATAGCATCAGTCCATCTAAGAGTCGAAGGGCAGTACACTGAGTCAACATTAAAGGCATTTATGGGCTGTGCGTTTTCCATTTT:1 - chr3R 21081616 3' - G5A 368 1 71.29 CTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAAATTATAATAGGTTTAGGAAT:1 - chr2R 22878312 3' + F-element 4264 1 69.23 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTCGCCTCAAATGCGGGCACA:1 - chr2R 16940320 3' - flea 22 2 56.44 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGACGCACGCCCCTTTTTTAGGGTAATCGACTTCCATTTCCGCTTAAAAATTCTAACTTATTTACTTATT:1 - chr2L 19397012 3' + hopper 1408 2 70.30 TTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGAGCGAGAGCTTTTTGAGGCTAAGCCCACTGGGTATAAGAGTACGTATATATGGCACTTTGAACTAGCCGAGGGACT:1 + chr2L 11764982 3' - roo 8663 1 73.27 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCT:1 + chr3R 6611284 3' - HMS-Beagle 6815 2 58.33 AGNCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGGAGGACGAAGAACTTTCAGATTTAAGCTATGGGTGTGCTCCACTGATG:1 - chr2L 21669135 3' - HB 1293 1 53.47 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGGTACATTTGAAATGTCTATTCTTCG:1 + chrX 364832 3' + hopper 1380 1 60.40 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATTGCATTTTAAATAGTGCCGCATTTAAGGGTGCTT:1 - chr3R 4679242 3' - copia 4889 2 59.41 CTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAAATCAGGGACAACAGCTCTCCGCCCAGAGCGAACATTTATTTAAAATGTTTGATGTTTTCCTCGG:1 + chr2L 16551653 3' - 297 6766 2 78.12 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGGTGTTTTCATATATTCTTTTTACATATTTGTCACAATATGCTGTCAATACAACGTCG:1 - chr2L 19643850 3' - blood 7178 2 62.38 ATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAGGTTGGCCGGAAAACAGATGTTAGGGTTG:1 + chr3L 5662718 3' - jockey 345 1 69.31 TTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACT:1 + chrX 1018156 3' - 1360 197 1 73.27 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGTACTTGTGGAATGCATC:1 - chrX 8027439 3' + Juan 4177 1 63.37 GANAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGCGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTT:1 - chr3R 19589914 3' - BS 5011 1 60.00 TCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCGGCGCAGATGCTAAACAAGACGCCAGAAATTAAAGTGCAAAG:1 - chrX 19889085 3' - roo 8820 2 60.00 TTTGCCCATCCTTTAAAATTAATTTTTAACGTTTGTTTCCGACCCTATAAAGTATATAAAGTATACGTATACCACAAGCCGCCCAAAACTGTTACACTTTT:1 - chr2L 21710221 3' + FB 808 3 74.26 AAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTTTTGAGCCAAAGCACCAAGAACGGGAAA:1 - chr2L 20629095 3' + Ivk 265 1 72.28 ATTGCAGTGTTACAGTTACCCAGCACGGGCGGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGG:1 + chr2L 20360642 3' - Doc 481 1 69.49 AAACTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAACTTGTTTGTAGGAGCTTCTAGCAGTTACTTCACTTACATTGGCAAGTTTTGAAATGCAGCTGCTTT:1 + chr3L 959236 3' + jockey 4628 1 75.25 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACATACACGTATACAGACACACATGTACCTACTTAAAAGCGCACAAGCAGCACTTAACCCAAATCACA:1 + chr3R 20215031 3' + hopper 1409 2 73.27 CGGTTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTTGTTGGGCTTCTCGGCGCAGGAGTTAACGCTGAACTGAAACTGGCCAAAGAG:1 + chr3R 11987234 3' - Rt1b 5050 1 57.14 GTATGCAGCCAAAGCCAACTACGTCGGAACGACCAACCAGCCCACACATTTTGTCTGTCCATCCAGCTCATGGCCCGTTTCAATCTCTTTTGAATGAATCA:1 - chrX 12841828 3' + Doc3-element 4558 1 64.36 AGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAAAACCAAAAACCAAAAACCAAACTTCAACAATAGCAAAAACAAAACTCTGGGCCAGAAAACTCACAGAA:1 - chr3L 18419962 3' + F-element 305 1 58.42 TCNCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGGTTGACGTTTGTTCGCCACACGCGTGACATTCCTGGCCGA:1 - chrX 13654791 3' - G2 2906 1 59.41 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACCCGTTCACATGAAACACACATTT:1 - chrX 6509772 3' + jockey 4963 1 54.46 GCNGCCGAATCCGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAAGAATCAAGGAAACTACAGTCGTGAAAGTCAACCAGGACCAAGATAGCTAAG:1 - chr3L 24362840 3' + Quasimodo 6922 2 57.58 CTGGGTCACCTCTCAGCCCGAGAGGCTTGGTTGCTGCTATGATGGGGATGGGGGTGGAGCATTGGCCGTAGAACAGCTGCATTCTTGGAAGTCAAAA:1 - chr3L 7571106 3' + Rt1a 4646 1 56.70 CCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAATGTTCCATTTAATTCAATACGCTTCGTTTCCAGCGTATTGAATTAAATGGAAC:1 + chrX 10841831 3' + 412 312 2 47.52 TCNCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAA:1 - chr3L 27356102 3' + Tc3 1660 1 76.24 GTNCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCCTAGTACTACCTACAACATGCGAAATGCAATTTTAAAGCATACTTTGGGGGCAACGAGCAGAAGAGAATA:1 - chrX 10644789 3' + hobo 2933 1 74.26 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTGACAATCTTTGTTTATCAAATCGTTTGCCATTGTTTCTGTCGTCGCTGTGGG:1 + chr3L 13878131 3' + flea 4994 2 61.39 TAATAAAAACATCATCATAAAAATAAGCATAATATAACGTATACGCACACACACAAAACATCAAAGCCGGTGAAAGGCGCCGCCAAGGACGAGGGCGTGGC:1 + chrX 6512329 3' + jockey 4993 1 55.45 ATATACTCACACACACACTCACACTTAAACACATATATGCTGGCGAGGCCTGAGAGCTCTGGATTGTGGGTGTGG:1 - chr2R 16247481 3' + Quasimodo 31 2 80.00 GAGCACGGATGCGAGGCAGTCAGCTGGACAGCAAGATCGCGCGTGGAAGAAACGTCGGAGCGTTTCCAGAAGGAGTTCGGGAGTAATTCTCCCTTTGGGCA:1 - chr2L 17173713 3' + gypsy8 360 1 78.22 TTTATGTTTTTTTTTTTATAAATGTTAAAAGGGGGAGTCCACACTTTGAGATTTGCTTACGTACCCAGCTGGTTTTCGCCTAATTGTGACAGCTGGATC:1 - chr2L 7568350 3' - HMS-Beagle2 480 1 71.72 ACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCTAGCGTGCAGATGACGAATAGAAGAACGACGAGCCGAAAGTGCCCACTTGGCGACCATGCATGTGCACTGCGAGAA:1 - chr3L 21602586 3' - Cr1a 387 1 78.22 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAATATATGTTTGAAAACCCTCGATTTGAAACGACTGATGAG:1 + chrX 1600232 3' + BS 5053 1 62.38 GTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTTTGAAAGATTAAAATATAATTAGAGTTGGGGTAAGGGTTAATAACCTTCTAAGGAAGAAATATA:1 - chrX 20331791 3' + mdg1 419 2 66.67 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTTAAGAGCTCTACAAAAGTCTTAGTTCGGGGCA:1 + chr3R 20878208 3' - Doc 16 1 75.00 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATGCCCTGCACTTATCGGTGGCTTAATGCAATTG:1 + chrX 5933920 3' - Burdock 6171 2 64.36 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTCTGAACCAATGGCGATGCACTCGG:1 + chr2R 20804720 3' + hobo 2908 1 74.36 ACTAATAAAATTATGAAAAAATACCCATAATCTTTTCAAAAAAGTGATCGTGGCAGTTTTGTTCTGCTTAGTGGGCGGTGGTTGGCGGAGTGGGTTGGTTG:1 - chr3L 9760997 3' - INE-1 401 1 72.28 AGACCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATACAAATTGCGAAAATGTCAACAAATTGAGGTATCGG:1 - chrX 5521074 3' + 412 7506 2 62.38 CGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCTGCGCTCGCGTTGAGGATCGTGTGCATGTGGCAC:1 + chrX 3404802 3' + Ivk 5034 1 68.37 GANGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCGTTGGCAAGTGCACCACCCAACC:1 - chr3R 30904226 3' + roo 356 2 76.24 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCAACTGTCGGGCATCCTTAACCCTATGCAATGTC:1 + chrX 10644908 3' - hobo 5 1 74.26 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATTGTGGAGAGGCGCACACTGCGTCTT:1 - chr3L 26645887 3' + 1360 3369 1 55.45 CGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTCGTACTCTCTCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATA:3 + chr2L 22762326 3' - invader1 399 2 46.53 ATTCTGATTCAAATTCAGATTCCGATACCTGGATACCTGGCAACTGAGCTGGGAGTCCGACTGCAGTCGAAATGAAGTGCCAATCAGTGCCAAAACACCCC:1 + chrX 14440035 3' + transib2 2545 1 78.22 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACAGTTTGTACTCGCTAAAAATTCAAGTTATTTTCTTTGAAATTTCTCT:1 - chr2R 9213639 3' + Burdock 227 2 54.46 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCCGAACAATCGTCCGTCATTTTGCTCCTCAAACGCAATATTGC:1 + chr3R 12566810 3' - Doc 7 1 80.20 TAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGACTTAAATGCGAAAATGTTAAAGCAAATAAAAAAGAGTGTGAAAACGAGCAGCTTGCCATGTAA:1 - chr3L 17101988 3' - 1360 3273 1 56.00 CTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGAAAGGATCCTCCTGGTCCCCAATCCAGCTTTGTCTACC:1 + chr3L 2404883 3' - Quasimodo 321 2 62.38 AGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAAGTGCGAGTGTAAGAGTGCGATTTAC:1 - chr3L 13878015 3' - flea 4754 1 78.22 TTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGCGCTTTGTTTAACTGCTGGCTATACATAATTTGTCATAAGAGTGCAATACTATCTAAATTGGCTTTTGCCAATTTT:1 + chr3L 24721814 3' + INE-1 87 1 77.23 GTNGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGGAGACGGGTCCCGCAAACTAAAAACAAAATCGCCAACATTTGCGA:1 - chr2R 16583375 3' + TAHRE 10396 1 53.47 TTTTTTTAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAAC:1 - chr2R 961123 3' - transib2 2625 1 54.46 GATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGACTCAGGATTCGAATTTAAGCTTACAAGCCGCGTATGTTATGGTTTTGTAATTCCTCCTT:1 - chr2L 14572076 3' - G2 2941 1 64.36 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCA:1 + chr3L 10557633 3' - 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BS 4700 1 60.00 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCAGATATTGGTTTATTACAATATGATCCACTAATATAAATTCCTATGAAT:1 - chr2R 9788950 3' + blood 7341 2 71.29 TTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAACGATTGGCTGACGAACATGGGTGTCCACAAAATGTTTTTCACACCATTTTTCCTCTAT:1 + chr2L 22181226 3' - Idefix 7137 2 65.91 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAATCACACACATACAGGCCATGCTGGACAAGTTGCATACTTTCGGGCGCAACATGCAATTAAAATGCAAAAAAGGCAA:1 + chr3R 22310868 3' + hobo 2937 1 77.23 ATCTTCGAGCTGGTGCGGAGTATATGGAGCCGTGAGCTGGTGTCGTACCCCTAGCTCCTCCAGAAACTTCCTTAACGCCCTACTTGTGAACTGCACGCCGT:1 - chr3R 3906839 3' + Osvaldo 1210 1 73.27 TGGGCTTCTTAGTATACGCTCTCCCCTAAGACTAGAATATAAGGTCTTACTCTACAACTCCGCCTGCAAATTAGAGCGGGCTTTTAGTTGCCAGCTAATTA:1 - chr3L 15761480 3' + Fw2 3472 1 61.39 ATNGGCGAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTGTTTGGGTGTGTTTTGGTAGGTAATTTGGCT:1 - chr2L 7558688 3' - FB 46 1 66.34 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAAACGTTTGTTTTTCAACTCG:1 + chr2L 6184261 3' + roo 9049 2 54.00 AAAATGAAAATACATTTTTGTTGCACCTTCGGCTTTGAGATTTTCTTTACAA:1 + chr3R 24689005 3' - Dm88 4284 1 69.23 TGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATTTGTGCACATAACTTGGGAACGATAGTTGGCGACAAGAGCAGCGAAATCAACCA:1 - chr2R 5954575 3' - 17.6 7405 2 60.40 GGNATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATGCACACACATATGCGTCGCCATTTTGCCGGC:1 - chrX 13953372 3' - Quasimodo 77 2 61.62 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTAAGTATCCTGCGT:1 + chrX 20331888 3' - mdg1 7064 2 54.46 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTCATAGCTAGAGCTGCATCTGATTTGGGGGA:1 - chr3L 14088050 3' - hopper 21 1 56.00 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTATGCCCTATAAAAAAATTAGTTTAAATTACA:1 - chr2R 8420819 3' - 1360 46 1 70.30 CATAAACACACGCACACACACACTGACACGGGAAACAAAGGCATTAATCAATGGGGATGGCGGGGCTACCACCCACCACTTCACTGACTAATCATCTACG:1 - chrX 21424441 3' + accord 180 2 68.00 ATNTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAAATATTTTTTAATACCCCTTTGTTCTTGATAAAACGTATT:1 + chrX 8302849 3' - 297 31 2 69.31 GCNATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCCGAACAATCG:1 + chr3R 12566778 3' - Doc 38 1 53.00 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAATGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGATTTTACAGCAATGGTTAAGTGCTACCCAGATCAGAGTCGAATATA:1 + chr2R 2594227 3' + roo 9030 1 94.06 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTAAGCACCTAAAATTTCGCTTTCACTTCTATCCGCAAG:1 - chrX 364771 3' + hopper 1378 1 60.40 ATAATATTAATTAATAATAATTTTCATTATTCAATAAGCCCTACTTTGCTAACTTTTAATCGACTGTATTCGTCGCACATCATTGTTTGTATCGCCATTAA:1 - chr3L 14957604 3' - Tc3 268 1 88.12 GATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTAGTAAAACGAAAAAAAAAAACGAAACGAAACGAACAAGGATAGTGCGCTAAAAAGTGATAATTCGTATACCAAA:1 - chr3R 7995550 3' - Tc1 1500 1 70.30 CANGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCAAATCACTTTAAGACGAATTATATATTAATATCCCTAACCCTCT:1 - chrX 21218849 3' - Stalker4 411 1 55.45 CCNAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCAACAAAATTCAAACAAACTCGAAAAACTTTAAACTCGCTACGAGCGCGT:1 - chr3R 27452317 3' - roo 8689 2 51.49 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGCGGTTGAAGTGGTACTGAGGGCATTAATATAAATCAGATATTTTAGAGATTCAA:1 + chrX 14131814 3' - I-element 43 1 63.37 GTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTAAACAAACCATAAAATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCAT:1 + chr3R 2331729 3' + Cr1a 4376 1 72.28 GTNCGCGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGATACAGCATTATCATTAATATGATATAGGGCCTTTTGCAGACCTCAATTCCTCACTTCA:1 - 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chr2R 1265718 3' + Cr1a 4293 1 71.29 AGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGAACAGCTTTCAATCTTTTGCCAGCGCCGCCAAGTATGCAATATAAA:1 + chr2L 12392568 3' - TAHRE 10292 1 55.45 CTNGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCCGCCGCCACTGCCGTCGGCGTCGTCCACGTCGTCGATATCCT:1 - chrX 596695 3' - I-element 391 1 57.43 AACAAATAGAAATAGAAGAAATTTCCATTTGTAACTAAGAATTATATTTGAATATTAAACATGTAAAAAAAATTTACAAAATCGAAATGTACACTTTTAAA:1 - chr3L 19533426 3' + 297 6496 1 61.39 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGA:1 - chrX 1600191 3' - BS 5019 1 60.92 GAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCCCACATGGACTCCTACGTTGATGATCAACAAATGGAAGAACTCATTGATGATAAGGGTGAGCTTGTCG:1 + chr3R 11620817 3' - accord 7031 2 73.27 ACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCAAAAGATGAGACATTATGAGGCGTCTGACAAAAACACATTCGAGCCTCAATTTGC:1 + chrX 13536592 3' - accord 201 2 78.00 TTTCCTTTTTTTTTTTGTGTTGTTGTTCTCTGCTGGGGAACAACACAAAAAT:1 - chrX 3088775 3' - Transpac 343 1 75.00 TCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTG:1 - chrX 14040721 3' + roo 8597 1 63.37 TGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGAGATTGCAGGTTGGCCGGAAAACAGATGTTAGGGTTGC:1 + chr3L 5662719 3' - jockey 343 1 71.00 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTCATAACGGTAACCAACAAAGAGGAGGAGCCCAAACTAATGGTCGTAGACCATGGAGT:1 + chr3L 19861709 3' + 1360 3367 1 57.43 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGAAAAAAACTAGAGAAAGTCGCGGTTCTTTTTTTCAAAT:1 - chr2R 18618478 3' + jockey 4953 1 69.31 TTTTTATTTATTTATTTATTTGATTTGACCATACTACCACAATGAAGTGTGCGAGTCGACTGATATCGTTATTTAATTATATTTGTTTCTTTGTTTTTGAT:1 - chrX 14784723 3' - Tc1-2 479 3 49.50 TTGAAATTTGAAAGCTGGAACCACGTCCAGTTTTTGAAATTCGAAAATATATGAAAATCAAAAATTTCACTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTATCGCAATAA:1 - chr3R 9233434 3' + FB 36 1 60.40 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGCAGATAGACATCTGCACACATT:1 - chr3L 6900636 3' - pogo 50 1 83.17 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGT:1 - chr3R 25277641 3' - 3S18 5817 2 73.00 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTATATATTCAATTTAGTCTAGTATATATTTCAAAA:1 - chr2R 20309339 3' + roo 9029 1 71.29 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAG:1 - chr2R 544784 3' - HMS-Beagle 6810 2 64.29 GAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCCGCATCTACGTCCGCGTCCGCGTCCGAGTCCAATTTCCAATGCCCCAACTGGATTTTGATTTATGCCGAAAA:1 + chr2R 15824938 3' + F-element 228 1 76.00 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTT:1 - chr2L 8297341 3' + Tirant 351 2 78.22 GCNTATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGT:1 + chrX 1018150 3' - 1360 203 1 67.33 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGGGAGGGCGGGAAGTTATTACCCCCGCAATGCAGGAATTG:1 + chr2L 18178001 3' + 412 7538 2 68.32 CTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGATCCACCTCTATCTCTGCCTCTCCACTTTTCCGCTTCGATTTTTTGGCAAGTTGGAAAG:1 - chr2L 5451866 3' - 1360 103 1 53.47 TAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACCCCGATGAGGCGGGGATCTGCGAGGACGGCCTAAAAA:1 - chr3R 20276373 3' + roo 8872 2 79.21 CGTAAATGGAGCAGTCGGTAGGATAAATATAAAAAATTGTGCGAGATCTCGCAACCATTTTTTCAGACTTTCGCTGATTACACTGGAAACAGACGGAGGTT:1 - chr2R 10927912 3' + rover 361 1 59.41 CAGCAAAGTGCTGACACTAGCAGAAACAGATTTAAAACATAATTGGCACCCAACTAAATAAGAATTCACAACCCCCAAAAATGTAAGTGGGCTGATCAAA:1 + chr2R 2057809 3' - mdg1 258 2 78.00 AANGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAAT:1 - chr3R 17665964 3' + Transpac 288 2 57.43 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCCAGTATG:1 + chr3L 9076645 3' - mdg1 7060 2 52.48 TAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCGGCGAGTGACAAGGACTCGAGCTGCCTGCCGCTTGCACACTATTAATCAAGTAGATTGGGCTTCCCCGTG:1 + chr2L 19838797 3' - 17.6 7162 2 76.24 TAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACCGCCGCCAAGTATGGTTAGCATAGGATATAATCTGCCCAACTGCCAAG:1 - chr3R 5078370 3' - Chouto 112 1 57.00 AGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGGTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAA:1 + chrX 23108303 3' - BS3 1432 1 57.95 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGCTGGCC:1 - chr3L 447321 3' - Tabor 26 2 64.20 GANGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAGGAATATGGGGCACGAC:1 + chr2L 7285618 3' - roo 391 2 82.18 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATTGCTGAAGGGAAAAGTGGGTGGCCAGACATCGGCAACTGTTGCACAGGGCAAAGTTTACACTGC:1 - chr2L 1204036 3' + roo 401 1 69.31 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGCATTGCGTATGCGCTATATAGACGGTCGCCCC:1 + chr2R 6914568 3' - jockey 4714 1 67.33 CGATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGT:1 - chr3R 19450185 3' - roo 54 2 50.50 GANCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTA:1 + chr3R 1977613 3' + micropia 417 2 60.40 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGT:1 + chrX 21087682 3' + mdg3 240 2 64.36 TAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTAC:1 - chr2R 4673588 3' + Quasimodo 7327 2 74.26 AGNCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCG:2 - chrX 7583196 3' - I-element 25 1 54.46 GTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAGGTACCCATTCCAAGGATGGCAAGGATAACCCGAAAACAGCT:1 + chr3R 12567855 3' + Doc 37 1 58.42 CACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAA:1 - chr2R 3919678 3' - 1360 46 1 68.32 CTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGCATGCCGATGTGCACGGGAAGGGGGGGAAAGGCATTTGCAGCGCCGTTCCCTTGCAACATGCAAACGATTCA:1 - chr3R 28288557 3' + 412 7545 2 77.23 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAAACAACGACGCTGGG:1 + chrX 4448622 3' - 412 16 2 64.36 AANAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATAGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATGACTTTAGTCGAA:1 + chr2L 20266037 3' + roo 389 2 57.43 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGAATTTACATAAGCTTAAATCGATACTTTCATGAATGGAAATAAAGTC:1 - chr3L 11891313 3' + Tabor 458 2 55.00 GAAGTACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAATCAAATCCAAGCACGACCCCAAGACCCTGCGAGCCAAAGCCAAGGTTAGAAA:1 + chr3L 26800189 3' - 1360 463 1 55.45 TATGAGNTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTTTAATTATTGAACTAATCGACCGTGTACATTTAGTAGT:1 + chr3L 22788474 3' - I-element 5135 1 61.39 GGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTCCGCTCATTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTTATAATAAAATATTTTCTTCTTTATTCTTGGCAAAA:1 - chr2R 4822258 3' + Q-element 484 2 74.26 GAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTAGTTCAAAATAGATAGATACTCGAACGAAAACAGCGTACCATAAAGG:1 - chrX 22596366 3' + INE-1 549 1 75.00 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGGCATACAAAAAAAATACACG:1 + chr2R 18356248 3' + P-element 2845 1 36.63 GCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGAGTGGGTGTGCGAGTGTGGGCGTAAGTTTGTGT:1 + chr3R 29334371 3' - copia 4847 1 74.26 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACAATTTGTCATTCTGTAGACCCACTGGGATTCCGTG:1 - chr2L 6645626 3' + mdg1 411 2 68.32 GANGCAGCTAACTATCGGTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGGTGTTAGCTTCACGAAGGGCATACCTGTATTCACCTTTTCGTGGTTTGCTTAAAA:1 + chr3L 17503227 3' - pogo 19 1 60.40 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGACAAAAACCAAAGCACACACTCACGGACTTAAGTTCT:1 - chr2L 17269748 3' + hopper 1412 2 70.30 TANTATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACA:1 + chrX 4448607 3' - 412 31 2 54.46 ATNTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAA:1 + chrX 4806738 3' - roo 8701 2 68.32 CCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATTATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAG:1 - chr4 311199 3' + 1360 3367 1 54.46 GGGTTTTTTGAATGTCCTTATATGTTTTTCTTCTCCATTTTGTGCGAGAAAGTGCTAAGCAGGAAAGGAACTGATAGTTGTATTACTGATAGCACTCCA:1 + chr2R 5654382 3' - HB 423 1 75.76 TTATAGTCCAAATATTTTATTTCCATTTAATATATCATTTAGATTTAAATTATTTCAAGAACCATATGTGAAATGATTCATTATGTTGGGTATCCACTGTA:1 - chr2L 9069474 3' - G7 1158 1 83.17 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTCTTAACACTAATATAAAATGTTTAGCTATTTCTG:1 + chr3R 7009984 3' - copia 4911 2 69.31 TGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAATCTGAAACTGGCCAGGAAACACTTAAATTAACTGCTTCAAGTCGCTTCGTA:1 + chr3L 10200199 3' - Bari1 298 1 55.45 TTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTTCAGCAGGAAAAAGAAAAACAGGAAAAAACTTCGAGCGAGAAGAGAGTGCAAACGCGTTCATCACACA:1 + chr3R 20232787 3' + invader2 413 1 74.26 TCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAACGAAATCGCAGTTGATTGTTTTTGTTTGTGTTCTTTTTTCTCTCTGTTAGTACATACATAA:1 - chr2L 19626978 3' + Doc2-element 4608 1 65.35 ATNTATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACAGTTTGTACTCGCTAAAAATTCAAGTTATTTTCTTTGAAATTTCTCTGGATTGTACATAGGTCCCC:1 - chr2R 9213620 3' + Burdock 6382 2 69.31 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCCTACCGTGTGCAGAATGAATGGACTCTCACCATCCATCATTCG:1 - chrX 8337905 3' + hobo 2907 1 58.00 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTAATTTTCCCCGACGTGTAGAAAACTAGTT:1 + chr3L 7629625 3' - opus 42 4 72.28 TTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTGAAACTTGGCATGTGCA:1 - chrX 19820019 3' - mdg1 7037 1 76.24 GTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATACGCGCCACCCAAACTGGGCCGCAGTTGTTGTTGTTGCCCCGATCATATGGTGGATTTGTTG:1 - chr2R 10478624 3' + McClintock 5959 2 61.39 TTCTTCGATCAGTATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTATAGCTCAATACAAGTGACTTTTCATAAAAGTGGCCTAGTTTGGCCGTAATGCTCACCGCACTAA:1 - chr2R 16043163 3' + 1360 3172 1 68.32 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCAATGATTTTGTGATTTTTAGAA:1 + chr3R 6776625 3' + copia 248 1 72.28 CCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCAAGTTCCCGAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCTACTTTGCAGACCTCTTTTCGAGTGCCAT:1 + chr3L 17221032 3' + Idefix 7020 2 66.34 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTCAATAAACTTGATCCGAAAACACGACAAGGCTGTCTGTC:1 + chr3R 10824115 3' - 412 7090 2 60.40 AANAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCTAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAGCCTTGCAGAATTTATATACTAAAGAAACGGTTTGCATGC:1 + chr3L 22775973 3' - flea 31 2 61.39 TTNCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCTGGCCTACAATCACGGTTAGGCGCCAGATGTAACGAACTGTTTTCCTACGTCTGCTTGCTACGAGC:1 + chr3L 25493149 3' + Porto1 450 1 70.30 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTATGATGGGTGCCCATAAAAAGAGGCGCCAGACTGTATA:1 - chr3R 28698785 3' - 1360 35 1 63.64 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTTTGAAAGATTAAAATATAATTAGAGTTGGGGTAAGGGTTAATA:1 - chrX 20331812 3' + mdg1 7428 2 57.43 AGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGGACATTTCAGTGGGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTTTGCTTGG:1 - chr2R 14763358 3' - hobo 23 1 54.46 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAA:1 + chrX 20999561 3' - BS 41 1 73.00 TANTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAATGGAAA:2 + chrX 22745724 3' + copia 233 1 56.44 TAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGAAGCTTTCTGGTTATTACGGTTTCATAAGTAGAAAGTTATCCGGCTT:1 + chr2R 5969755 3' + invader4 2640 1 56.44 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGTAGACCCCGATTCGCCGCCAGGAAGCGACAACGATGT:1 - chr3R 11538463 3' - 412 7091 2 66.67 CTCTTGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACATGAACACAAACGCAAACACGGCGAAATGGACCGAACGTCGCCTCCAAGGATATACATGTGCTATATA:1 - chr2L 4714826 3' + Doc 456 1 71.29 AGATTTATTGTCAGATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGGAAATTACTATCTATTATCCATTCTCCTTGTTGCTCCTCACATATTTACCCA:1 + chr2L 3818694 3' + GATE 418 1 71.29 GTTTCTTTTCTTTGAGGTGTAACTTGATTCGACTTTTTAGGTCCTTGGAGTTAAACGGAGTGAACAGGATTGATGGTGTAATTTTAATTAGCCGCCAAATG:1 - 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Doc 58 1 44.55 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCATAACAAATAATATTTTTATAAAAACTGTAATTTGTTT:1 + chr2R 8420864 3' + 1360 3349 1 72.28 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCG:1 - chr3R 178124 3' - BS 44 1 71.29 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATTAACCCCAAACTAAAGTTTTCTAAAGACATCCATTCAATTCGAAAGATTGTAC:2 - chr2R 11363957 3' - transib2 20 1 57.43 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGTGGGAGTTGTCACCGCTCACTGAAG:1 - chr3R 18509084 3' + jockey 4941 1 74.00 CCNTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATAATAAAATATTCCACTCTTGTCT:1 - chr3R 21343061 3' + I-element 5301 1 78.22 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACAATTTGTCATTCTGT:1 - chr2L 6645646 3' + mdg1 7429 2 52.48 AGNAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTTTTGTTTATTGCATTGGCTGGCATTTGGC:1 + chr3L 6013710 3' - Max-element 8284 2 71.29 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCACAGCCACATGAGCACACAAGTTGTTATCAATTATGCTCGGGCCAGG:1 - chr3R 4805052 3' + 1360 3358 1 58.42 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTATTGAATTCCCTTGAATCATCTGAAACAAACCACTCATCTCGAATAACAAAGC:1 + chrX 5912990 3' - flea 4776 2 58.42 TCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGGTAGTATACTTTTGGGGAGTAGCGGGTTCT:1 - chr3R 31458395 3' - jockey 11 1 73.27 CGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTATTTTAAAGAGGGTCATGATAGT:1 - chrX 20344085 3' + INE-1 136 1 70.30 GTNGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGGATGTCTGGGTCGTCCATTCTG:1 - chr3R 16028718 3' + accord 157 2 77.23 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACAGTAGATAATTATAAAAAAAGTTTTTAGATACAAAAACTTGCCTAAAAA:1 - chrX 12756116 3' + HMS-Beagle 214 2 51.49 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCAAGGATTGCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGCTTAATTAAAAATTTTCGCGCAGAAGTGCGAA:1 + chrX 9439851 3' + roo 9055 2 61.00 CGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAAGCTCATACAGGCCCACTCGCACATAAATCAAAAA:1 + chrX 7480697 3' + Quasimodo 7056 2 68.37 ACTGAAAGCTGCTATACTAGAAGAGTGTCATAAGATCCCACAACAATATGATCTTAAAAAGTTATTTTTCGATTGCCCGGCGGCGCCAAGAAGCCACCGCT:1 - chrX 3280998 3' + S2 1311 1 68.32 CGNTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTT:1 + chrX 21667916 3' - gypsy2 6533 2 65.35 CGNACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTTCCTG:1 + chr3R 2993037 3' + R1A1-element 213 1 57.43 ATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTTCCA:1 - chr2L 12398137 3' + roo 370 1 70.30 GAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTAAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCCCACTCCGCAGCATTTGTGGTCGTGGCATG:1 + chr2R 24265086 3' + 1360 115 1 70.30 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAAACCGAATTCCACAGCGGCACCGGCCAGCTGGGCAAGGAAAATGTCCTTGAAAATGTCGCATTGTTGTTCT:1 - chr3R 29357379 3' + 412 7498 2 74.26 TAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAAT:2 + chr2L 22224561 3' + Rt1c 5398 1 58.42 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAAGCTCCTCCAGCAAAG:1 - chr2L 11764861 3' + roo 402 1 65.35 AGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGTTTGTGTTTAAATGCTTCTCTCGCGTGCTGTGCTCACCACACGCTTACACGG:1 - chr3R 17885061 3' + F-element 119 1 57.00 CGTCACCCGGTTAACTTAGTTAACTTATAGCCTGACAGTTTTGTTGTTAGTTTTTCCAAGCAGCGGTTTCCCGCCTCAGCTTGGGTTTAGTTTAAATCTAT:1 + chr2R 17373248 3' - gypsy6 7423 2 75.25 TGNACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTGGGTTATTTGCCCCCATTTTATTGGTTGTCGCCATTCATGAAA:1 + chr3R 29423569 3' - roo 8698 2 61.39 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCAGAAATGAGTCAACAAAAATATATACTGCAAATTCATGGACTCGATAATCAGATA:1 - chr3R 12554867 3' - mdg1 23 2 57.43 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACCTTAATTGAATAATAAATACATCATCACTATTTGGGAAATAATT:1 + chr3L 11891386 3' - Tabor 32 2 53.47 CANAATTACATACGCATTGGCAGTACTAGCATAAACAAGCAAGCGAGACGCTGCTGTTTCGACCTGGCCCAAAGCTGACGTCGACATCAGGTGGTGGCTGG:1 - chrX 15302661 3' + gypsy11 4057 2 58.42 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGGTATCGCACACATATGGAAATGAGTCCACATGTGTGGTAAGTATCCTGCGTCGTGCCACTGATTGAAC:1 + chrX 20331905 3' - mdg1 7041 2 75.79 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCAACAGACAAGCGAAAATTTGATGAGAAATCAATCAAATGTATCCTTTTTGGATATGAACAAAAAA:1 - chr3R 779358 3' - F-element 27 1 57.43 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGTCAATAAACTTGATCCGAAAACACGACAAGGCTGT:1 + chr3R 10824110 3' - 412 7095 2 65.35 CACTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGAAATTCAGATGAAAAAGAAACCATCGCAAAGCGGAGACC:1 + chr2L 11050861 3' + Doc2-element 4452 1 76.24 ATNCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTG:1 - chrX 4022309 3' - roo 52 2 79.00 GTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGC:1 + chrX 20999737 3' - BS 78 1 75.25 CTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCCGTAAATGTGTACAAAAATAAGCGGAAAATTGCCAAAGC:1 + chr3L 14704166 3' - rover 7138 2 78.67 CACAATAAAATAGAAAAATAATGTTTATAAAACCTTACTTAAATAACTTACAAATTTATAACCAAATTTCCATAACAAAATACACAATAGATTAAACTGTA:1 + chr3L 7810369 3' - pogo 55 1 66.34 ACNTTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGTGAAAAAAGTGGGGGAACATGACAAAAACAAGCCACTCGTGGCCAACAAAAAAAAGAGCGGGAGTTTCGAA:1 + chr3R 28062770 3' + Ivk 4936 1 74.26 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACTGGAGACTTTTTTCAACCGAAAACCACATTTGTTTTGAAACGAATGCAGCCGGTCGCCGGAGCAGAG:1 + chr2L 8297421 3' - Tirant 4 2 72.16 TGNATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGATGTTGAATATATCTTGTTTAAATTGCTAATTACTCCGTATATAGGTTTGATA:1 + chr3L 5288972 3' - I-element 5125 1 66.34 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCGAAACCAAAAATTATGCTAGACAGCTTTCCATATCGTATA:1 + chrX 6731856 3' - hobo 37 1 63.37 CAATTANCATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTATCGAAAAGTATCTACATAGCTTTCACATACATTTTACATGAAGCCC:1 - chr2L 16507819 3' - BS 5027 1 51.49 AGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACACAAACAAATAGTGAGAACTCAAACCCTATCCAAATCGC:1 - chr3R 3374380 3' + Quasimodo 246 2 64.00 TATACATATACATATGCATATACATATACATATACATATACATACGGTTCTGAATCAGATTGCGAATCTGAATCTGTGCGCTCTGGG:1 + chr3R 27870568 3' - Stalker4 241 4 77.01 TATCACCGTGTCAACACGGTTTTATAAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTTTCTCGTAATACACGCTGTCGGTTAAGGTTACGCT:1 - chr3R 13593799 3' + Q-element 197 2 76.24 GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATACATATGTACATATATAGGAATATGGCGTTCTTGGCTGCAATGTTGAAGTTTGCACTGCATGCCTGCGTGGGG:1 - chr3R 28443670 3' - Burdock 2 2 75.25 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGCCATCTCTG:1 + chrX 19109313 3' + roo 9030 1 64.36 CAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACCGCTGGCCAAACATAAATATGCACAAACCA:1 - chr2L 12759381 3' + F-element 360 1 74.26 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAA:1 + chrX 22745703 3' + copia 5081 2 70.30 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAGTATTCATATGTTCCCATAATGTCCAATCA:1 + chr2L 11844157 3' + BS 5045 1 70.00 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATC:1 + chr3L 16973441 3' + S-element 1677 1 69.31 AGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGATTTGTTATCTTAAAGAATAAAACTATGAGTCAGATTCGCCCGGGCTGAAAGAGAAAATTT:1 + chr3R 16114289 3' + F-element 127 1 74.26 CACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCG:1 + chr3R 2533950 3' + gypsy8 4898 4 50.50 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGAAAAAGTAATGATACTAAGGAAAATGAAAGA:1 + chrX 19053035 3' + roo 9030 1 70.30 AGCCGAGGTGTAGGCCATCGGCGGAAATCACGATAAACTGAAACCCATTTTTTTTTCTTTACTAAGCTTAAGTTATATTTAAAATTCTTTTCAGACT:1 - chr3R 7017691 3' - gypsy12 213 2 58.76 CTGACACACACACACACACACAAGTCGTTGAGGCAGG:1 - chr2L 3382729 3' + Quasimodo 36 2 78.38 TGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATAAATACCAAAAATACATGAGACAACTCAGATTAACCGTTAGA:1 + chr2L 21379331 3' + mdg3 5253 1 63.37 ACNGTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCATCGATTGCCGCCTGGACAGGACACATGTTGCATGTCGTCCTTGTCGAGGC:1 - chrX 6099209 3' + G2 2833 1 56.44 GTNGCGTGCGTTTGTTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chrX 10664377 3' - G6 2016 1 59.41 CAGTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTATTTTATAAATTAATAATAAATTGAAACA:1 - chr2L 11549700 3' + pogo 2056 1 73.27 CATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATGGGGCA:1 - chrX 18002176 3' - accord 7030 2 81.40 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGTACGTGACATTTTTGCAAGTTTATTATATTATAACATTATTTTAGAGAACAACTAAAT:1 - chr3R 26255094 3' + opus 485 2 66.34 TCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGCGTGCAGTGCAGTGTTTTGTTAAACGTGCGGTTGCCAATGACTGCACTTCCGCTTGTAG:1 + chr3R 21197003 3' - Doc 495 1 64.36 TGGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCCACTTGCAATATGCATGTCAGGCAAATGGAGCACTACGCCGACCGAGAGAAGATGG:1 - chrX 20763097 3' - TAHRE 10020 1 56.98 CGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCACGTTGGTGCCTCGAATCGGGAAATGCTATACCCTCGTTATGCGATTGCCTTGTTGGCGAGGGCGCAAA:1 + chr3L 12895036 3' + Cr1a 4389 1 71.29 AAAAATAAAGTCTGTTTATACAAAACTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTTGTGCGCAAACAGAAATCGCGGTTTATCAATTGATTCTAGAAAGGATAACAA:1 - chr3L 7269128 3' + G4 3387 1 55.45 CGTGCAGATGAATTTGGCGCGCATTATGCGCTCCTGTGCTGAGAGCAATTGTTGGGTCTCACCTTTCGTGCTGTTGGTCCTCGTCCTTGGC:1 - chr2L 6875509 3' - Porto1 413 1 65.93 TTATTCTTATATTGTTTATTGTTAGCATTATATCCTGAGCATCTCGCACTTCTTCTTGTCCCACTGTCAGCACCAGGAATACACAATCTCAGCGAGATTAA:1 - chr2L 6019484 3' - hopper 1108 1 76.24 CCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTAATTTGTATATACACACACGTATATATTATTTCAATTGCCATATCAAATTATGGCCACTC:1 - chr3R 8764360 3' + Cr1a 4004 1 62.38 ATNCTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATT:1 + chr2R 16660291 3' - gypsy9 29 2 49.50 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Tabor 470 2 36.63 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTCA:1 - chr3L 14088078 3' - hopper 50 1 76.24 CTNGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGATACTGCAATATCCGGTCGAGCAAGTTCAACTCCAATCAATT:1 + chr3R 9322908 3' + 412 7537 2 69.31 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATATCGAAATATGTAATAATAGCGTATGTAATAATGTATACGTATTTCA:1 + chr2R 4900358 3' - Doc 43 1 64.36 TGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTGTTTATGCCAAAATGATTTTAGTCAACTTGTGCTATACACCATATGAGCATTTATTTGATTTTGTAG:1 - chrX 3568197 3' - rover 6854 1 70.00 AATATATGTCAATATGTATATATATCAATGTTGTTTAAAAATAGAATGCTAACGAAAACGATGAACCTTTTTTTGTAGAACGTATGAAGATTCAAACGTTG:1 + chr2L 17785707 3' + G3 4504 1 71.29 GCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAGTCTTGGACTCACTTCCTCCACTCCCGCCGGCATTAGATGGTGTTTAATTAAAGGGT:1 - chr2R 17620654 3' + F-element 314 1 60.40 TATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCACGCCCCCTCCCACGAAACAGCACCCCTTGTGCTTAGCC:1 + chrX 3032858 3' - copia 199 2 61.39 TTTAAGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACGCACATTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTCTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTT:1 + chr3R 20683400 3' + Gypsy6A_LTR 156 1 65.35 GGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAA:1 - 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mdg3 5287 2 57.89 TTTACTTCTAATTTAAAAAACATAATATCAACTGAAAGGGCAAACAATAGAAGTAACATCCCCAAAACTGAAGAGCCCTAGATGAAGGGTTGTTATGCCGA:1 + chr2L 18863971 3' + S-element 128 2 73.27 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCAAGTTAAAGTTAAAGTTAATTGTAAAATTTAAAAATCAAACCCTAA:1 - chr3L 24234279 3' - roo 8694 2 55.45 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATCCCTA:1 + chrX 19820113 3' + mdg1 7419 2 64.36 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGCAAATACGGTCCAAAAAGGCTGTTTTCT:1 - chr4 302646 3' + 1360 3337 1 73.27 TTCACACCAGCTGAGTAACGGCTATCTAATAGTCGGTTGTTAGTTGCATTAGAAAACATATTCGAGGTGAAGAATACAAGGAATTCAATCTTAAATATATT:1 + chr2L 21614194 3' + INE-1 537 1 65.35 ATNGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAAC:1 - chrX 20999516 3' + BS 5067 1 53.47 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATGATAACCTTGATCATGATGAC:1 - chr3L 19861654 3' - 1360 47 1 79.79 AAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATAGGCGGAAAAAAAACACACGGCTGAATGCTCA:1 - chr3L 12432802 3' + 1360 3164 1 69.31 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATGTTCATATATGTAGGTTTACCTAGTGCCGAAACAATCACACCATAAGGTAGTGAAAGACTAGG:1 - chr3R 22494078 3' + 297 6973 2 68.00 AGTGTGCACTTAAATTACATGCTTTTTGAGCAATGCACCCTGGACCGCGGACAATGGTAATCAAGGGGGTGACCGGGGGCTCTAGGGTCTGACAGGCGGGA:1 - chr3R 6040056 3' - roo 8801 2 67.33 AGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAAAAGGATTTACATGCGTGTATCTGTGTGGGCGAGTGTGTCTGGGTGAGTTCCATTTGC:1 - chr3L 22568592 3' - Doc2-element 454 1 61.39 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATGTATGAATATTTCAGCTCTGAGCGATGAGATC:1 + chr2R 18649466 3' + opus 459 2 75.25 AAATTAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGA:1 + chrX 8958637 3' + Doc 4699 1 78.22 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATGGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCC:1 - chr3R 29357061 3' - 412 7101 2 67.33 CGNGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGCACCCATCTTTGTGGACTATCCGGGAA:1 + chrX 7768966 3' + hobo 2891 1 73.27 TAAATATATCCGTGTTCATGTGTGAACACATATAATTGCGTTTCAATATTATTATTTGAGGGTATGATACAACTTGGCTCTTGTTTTGGATATTTGGCTTT:1 - chr2L 5291584 3' - roo 8671 2 68.32 GANTACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTTAAAGGGAAAAACCTCAAACGTTCACGAACGAAAGAAAGAGGAAAAAGTGGGCGTGGGTCTGGTTA:1 - chrX 4457024 3' + invader3 5372 2 57.43 CGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTATAACCATGGAAGAGGTTCTGAAACTTTAAAAATCGTATTG:1 - chr3L 22111583 3' + R1A1-element 22 1 60.40 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTCTCCGGCTG:1 - chr2L 8297323 3' + Tirant 8476 2 60.40 CCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTAATCGAAACGATCTAACCGTCGACTACACAAAAGCCTTTTGTCTTTTTATA:1 - chr3R 19698226 3' - Rt1b 4824 1 53.47 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATCTATTCTAGTGTATTTGCCTTCACCATAATCGTCAGTCTGAGATTGCTATATACCCTC:1 + chrX 22559925 3' - roo 8681 2 61.39 CAATATGTAGGTACAATAATTTGAATTTTTGAGAGTACATTGCGTGTGTGTGTGTGTGAGATTGGTACATCTGCCTGTTCATCAGTTATAGTTTTATGATT:1 + chr3R 18418857 3' - TAHRE 10344 2 58.42 TTTTTTTTTCATTTTTATTTTTTATTTTAAAACTTTAGTATCTAGATCCTATTTCCAGTAGCTTCGATATACTTTTGAGCCCTGACCTAGCTTAAATCCG:1 + chrX 21012032 3' - Doc 4691 5 77.00 GAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACCCAAATATCTCGGAAACTTGACTACAATAAATCTTCTCATAACCCAAA:1 + chr3R 10529578 3' + F-element 4347 1 57.43 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGTTCCACCGTCCGTTCCCTCTGGTTTGTCCGGGTCTGCCAGGTTCGTGGGTTTCCTTGGCTCGGATCCG:1 - chr3L 18243101 3' + P-element 2855 1 67.71 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATA:1 + chr3R 17243221 3' - hopper 9 2 67.33 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATATGTATGTAGATTTAATCTGAATATTATTGATAAATAACTAAAG:1 + chrX 4806744 3' - roo 8690 2 61.46 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAACATCTATTGAAATTGAATATATAAATTTACGTTGTGGAGAACTTGCCAAGACTCAAATATAAAATAG:1 + chrX 20933835 3' - mdg1 9 2 70.00 GTNCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGCCTTATGGCTTA:1 + chrX 4175127 3' - I-element 347 1 70.30 GCGGGANTGTCAGGAGAGGCCGGGTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAAGTTTGTCTACACTGTGCAACAAAT:1 - chr2R 21475854 3' + Bica 4918 1 72.28 TTNTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTTTTTTCTTCGTTTTTGGGCCAACGTACAACTGTAAATGCTGCACGGCTAATTGGCCAAGAGG:1 + chrX 14982233 3' - Doc3-element 200 1 71.29 TCNTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTGGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGCGACTGCAATCATGATCTCACTC:1 + chr3L 13924123 3' - Bica 60 1 74.26 TGNTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTT:1 + chr3L 25401123 3' - transib2 50 1 75.25 AAAGACACTAGAATAACAAGACGCGTAACGCCGTACGATTTTCCTTTAACCCCAAAACATGTGAGCCACTGGAACAGCTGAGTAAAACGATCATCAGCTGA:1 + chr2L 16944212 3' - 1360 3387 2 62.38 CGNGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTACATATAGCTGGGTAGTTAGATAGCTAGATGGCCAGAT:1 - chr2R 18723042 3' - opus 148 4 65.35 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCA:1 + chrX 19030148 3' - Doc 41 1 70.30 CGAATGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCAGTGCGCCTTATTG:1 - chrX 20999461 3' - BS 89 1 57.43 AANCGTACACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACATGAGTTCTAGATCGTTTAGT:1 - chr2R 8951030 3' - P-element 56 1 23.76 ACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAATTGCACGGGGGGGCAACAATAAAAACAGAGGCAGAACAGAACACAGCAAGAAGAGCG:1 + chr3L 9698582 3' + P-element 2630 1 71.74 CGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGTCCATCTATTTCCCACCTCCCATTTTTCCCCTATTCTGGATTTTCGTGCGCCTTT:1 + chr3L 11890991 3' + GATE 8440 2 57.43 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCA:1 + chrX 21564745 3' - diver 5914 2 54.46 ATTTAATTTATTTATTTATGCAAGTTCAAATACTGCTTGCACTTTTATAAATAATTTCCTTTTCATATAAATCAATGGCTATAAATGCAATGCTACATTCG:1 - chr3R 18157558 3' - X-element 4710 1 75.25 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACAGATGATGGAGGGGGAGATACAATGATACCACAGAGAAG:1 + chr2R 13899202 3' + roo 9036 1 62.38 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGGCATACAAAAAAAATACACGGGGGAGTTGTTGCACGACAGAGATACAG:1 + chr2R 18356276 3' + P-element 2873 1 62.38 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTATGTAATGGGGTCTTGAATGCAACAGACTACATACGGATATTTATGTGAAAATGTGGAGACATTCGGAATAACT:1 - chr3L 7629532 3' + opus 499 1 76.24 GCTCTCTTAATAAAAGCCATATTAGGTCCAACACTGATCTACGCCATAAATTTCCAGCTAATAAAGCAAAGTGCAAAGGGGCAGGAAACTGCGAATCGGG:1 - chr2R 19201256 3' + G5A 2395 1 59.00 ACTCTTATGACAAATATTCTAATATCATTTTTGAAATTTTTTTTTGTGATGGTATGTACAAATTTGATTCCTTTTCGGACTACTTTAGAAAAATGTTATTA:1 - chr3R 16298561 3' - 1360 398 1 56.44 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTTATACAAACATTCCAACTCTTTTCATGATTAAATATTTATGATT:1 + chrX 10453442 3' + hobo 2913 1 56.67 GAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGCTGGTTTTTCTTATTTTAGCTCGAATTTGTGTGTTATAATTTATGCGCATTTTTT:1 + chr3R 19523632 3' - invader2 4798 1 58.42 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTCGAACTAACCATTCTTGTCACCAACTATTTAGGTGGTCCGCTTTAGTTTCTTATCAGG:1 - chr2R 18434444 3' - 412 7069 2 63.37 AAAAATATGAAAAAAAAAAACAAAATTCAACCCATTTTTGACCGTCGCAGTTTTGTGCAACAAACGGCGGTGCAAGTTGAATCTCTAGCTCTTATAGTTCC:1 - chrX 14317599 3' + gypsy7 5008 2 56.44 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTAAATATAGCCTGCACAGGAGTAAT:1 + chr2L 7393712 3' + opus 451 2 79.21 AGCTTGTAAGTTTATGGAATAATAATCAATGTCTGCGTGGCGACGACCGACGCGCCGTCAGTTGGCTCTTGACTCTCCCACGCTGCAGTCGGTGGCTCTG:1 - chrX 12784918 3' - gypsy7 5397 2 54.00 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTTGTATATAATTACTGCATCCATAAACTTCGGCTTTCCACAACCAGCTTTCTTTCAT:1 - chr2L 12398119 3' + roo 388 2 58.42 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGGATACGCTTTGGTTGCCTCGCCTGCCCCCTGAGGAAAAACCTAACTTTAGGGGGGGCGTAGAAACT:1 - chr2L 12322955 3' - hobo 9 1 69.31 TGGAATTAAGATAGAAATATTATCCGTAAGGGTCGACATATTGCATTGAGAGGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTTATTCCCAGAAAGTTCAACC:1 - chr3R 1166691 3' + Dm88 4305 1 80.20 AAAAAAAAATAAACTGTTAAATGTCTTGGAATTACAAGCGATTTAACCCGTTGCCAAAGGGCCAAACCGAACCTTTCTCCTTCTTTTTGTGGCTCCCTTTT:1 - chr2L 16923909 3' - accord2 345 1 71.29 ATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAGAAAAGGGGGCAGGCGGCG:1 + chr2R 18346936 3' + jockey 352 1 81.19 ACCCACTGCTTCAGTCGCCTCTAAAGTGTATGTTGCGTTATTAGCGATCGTATTCATAATCAAGATGTATGTTTCCTTTGTGGGCCGGAGTTAGGTAAGCT:1 + chr2R 8346007 3' - gypsy12 4 2 78.22 TTTAAGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAG:1 - chrX 22398534 3' + Gypsy6A_LTR 156 1 59.41 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCG:1 - chr3L 4091587 3' + flea 4966 2 78.22 AAAAAATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGCAAATCAACTTTCCATCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACTAAATCGCTGTATTATGCAAACTATTTTGAT:1 + chr2L 6838742 3' - Tc1 60 1 76.24 ATNTTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGT:1 + chrX 21087682 3' + mdg3 5492 2 64.36 CTAAGACTCAGCTCAATAGGCTTAGAGTAATACAATTCATCCGATAAAATATATTCTTATTAAGCCGAGTCGATGCTCAACCTTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 + chr4 829447 3' + G5A 2462 1 50.50 AAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGGGCACGCGATTATCAAATTTATGGCTGAGGTCAGCCGAGAGGGAAA:1 - chrX 2082598 3' + Transib-N1_DM 472 1 88.66 ATNATTAGATCCTACTAACAATAATATTTATTAGAGTTGTTTTCATTCTATGTTCCTAGCTATGTTAACCCGACTGTCATAATCCAGGCAAGTTGACCGAA:1 + chr3L 22938110 3' + Cr1a 4287 1 68.32 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACAGTAGATAATTATAAAAAAAGTTTTTAGATACAAAAACTTG:1 - chrX 12756124 3' + HMS-Beagle 206 2 59.41 TAGAGTATTCATCTTGCGGCGAGTGAAAATATTTATCTAGGCAAATATTGTGGAGCTTTCTTTGGAATTGAACGAAGCGGAAATGCTCTTCAAGAAAAGAT:1 - chr3L 13915495 3' + 1360 414 1 77.23 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCT:1 + chr3R 23601738 3' - jockey 56 1 71.29 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCATATGTCCCACTGTGTATATGTGTGTGTGTATCTGTGTGGGCGGTGTGCGTGTGTG:1 + chr2R 16805835 3' - accord 184 2 65.88 GTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGACGTAGAGCATGTTTATAATTATTTTCTATTT:1 + chrX 22898655 3' + micropia 5118 2 69.31 GCCAAAAATACATGTAAAATAGTCGCAGCGCGTGTGTTTTCAATTTAATAATTAGTGAGTGAGTGAGTGATTAAAGTCGGATACTAACAGAAAGGCCGGGC:1 + chr2L 13267014 3' + G6 1933 1 77.23 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATGCCCTGCACTTATCGGTGGCTTAA:1 + chrX 5933912 3' - Burdock 6178 2 74.00 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCAACAGACAAGCGAAAATTTGATGAGAAATCAATCAAATGTATCCTTTTTGGATATGA:1 - chr3R 779366 3' - F-element 33 1 50.51 TTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATAATGTCTGTTGGGTACATTTGCGA:1 + chrX 21741721 3' - HMS-Beagle 53 2 53.47 ACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTAATATACCGTATCTCCACTCCACGCCGCGCCACTTCGACACCTCAATGTCATTGTTTTGGCCCGATGCCATGGGCCCT:1 + chr3R 8499702 3' + Circe 66 2 65.35 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGTACTCTTACACGTGTGGATGGTGGTGGATCACGATCCCCCGCCTCCTCCC:1 - chr2R 21497475 3' - P-element 25 1 54.00 TTTAATAATACAAATTTAATTTTCTAGTGGCTTAAAACACCTTTTACCATGTTTTTTCTGGAGGGAACTTTTTCGGTCGATTCATTTTTCTTTATCGGTGG:1 - chr3R 23591541 3' - invader2 4727 1 70.30 TGNGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGGATAGGG:1 + chr3L 22349286 3' - jockey 26 1 58.42 ATCAAAGACTAGTATAATTGGATATAATATAAATATATTAATGACCTCTGCCAGCGGCCAAGTTATCTACGAAGCAACTACACTGAGAAAAACACGTTATT:1 - chr3L 14473705 3' - gypsy7 5083 1 60.40 GCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGTCCACCGATATGACCAATAATCAATGGCTAATA:1 + chrX 2841621 3' - accord 7318 2 70.30 GCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTAAAATTATGTAACACACTAAGAAGGAATGGACAACCCTATTGTTG:1 + chr2R 5149444 3' + X-element 4549 1 65.00 ATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGTGTGTTTTTCTTTGTCTTTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAAATATTTTTTTTGAAA:1 - chr2L 2436615 3' - 1360 3014 1 68.32 TAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTGGCGGTGGGTCATAAATACCATTTGGAGTGTATGCAGCGCCCATAGGTGGGTTATAAAAATT:1 + chr2L 18214025 3' - hopper 953 1 63.00 GTACACTCTCCTGTACAAAAGTCCCCAAATGTTTTCAATAATGTTAATGTCAAGGGATTCCCTGCTCCATTGCTCGCTTAAAACGTTCACATCGTTAAATC:1 + chrX 1715704 3' - Tc3 1264 1 56.44 TCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCGACGTTTCCAG:1 + chr3L 22046503 3' + roo 9046 1 56.44 AGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCTTAAGTCACAATCGCATTCTGGCTGTTTTGAGCGATAGGGAACGGAAACTCTTTCGTCCTCTGA:1 + chr2R 16285866 3' + invader2 246 1 67.33 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGA:1 - chrX 7583195 3' - I-element 24 1 55.45 TTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATAATTTCTTTGAGCTGAATTACTGTTTTTTTCAGACGGG:1 - chr2L 16889499 3' + FB 677 4 67.33 CGGCTGGATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGT:1 + chr3L 23730764 3' - invader1 3651 2 84.16 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTTTCATACACCCAAACCCAAACTTTGCGTAACCATGCCAAACGT:1 + chr2R 17938944 3' - copia 4901 2 59.00 AAGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTGTCTAGATTCCATTTGTAGGGCG:1 + chr2L 13030195 3' - jockey 4711 1 78.95 ATTAGATCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTTTGGTGTTTTTCGGTTCGTTATTTCTTTCTGATGTGACACAAATGTTGGTTTTATTG:1 - chr3R 29457953 3' - F-element 4476 1 55.45 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCCCGGTGACAATCTCTGCCGGACGGACGTACTCCCTCC:1 - chr2L 2685739 3' - hopper 36 1 62.38 AAACAAATATACAAAGTATTTACAACCGTTTCTGTTCAAAAACTACGTTCTAAAGGGTCTGGTCTAGCCTTCTGTGTGCGATAGAGAGGCACTATTGGGCA:1 + chr3R 29503768 3' + Cr1a 171 1 69.31 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCATCCATCAACTCATGCGTACATATGAGATTTTAGGCTATTTTC:1 + chr3L 12352955 3' + Tirant 8476 2 57.58 CTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACATGTAGCAAGTTTCTTTTATGTGTTACTTTATTGTT:1 + chr2R 3824680 3' - 297 6608 2 61.46 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAAAAAAATTACGTACGCGATAGTCATCACCTCACAGTCACCTCGATACACTCGATGGTCTCGAATTCGACA:1 + chr3R 12375253 3' - pogo 2 1 73.27 GGNGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAA:1 - chr2R 544799 3' - HMS-Beagle 6828 2 57.43 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCTGGTATATTTGAACGCTCGTGTCACGGTCGCACTCTCATTC:1 - chr2L 18987273 3' + P-element 2852 1 42.00 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGATAGCCCATAAAGTGGTTTATTGTTTGGAATAAATTATTTCGAACAACTTAGCTAACACGGTATCTGTGATTT:1 + chr3R 25634986 3' + P-element 2882 2 74.26 GGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATATTTTGCAGTCATAAAGTGTTGTCGTCTTTTATTGGCCTTTTTTCCACCTTTTTCTTTA:1 - chr3L 16027228 3' - Doc3-element 437 1 66.34 TTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTT:1 + chr3L 23821866 3' - HMS-Beagle2 22 2 57.43 TTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATACCGCGCAGCAACAAAAGGCCAACTCATTGTTGTTGCTTTTG:1 - chr3L 10111897 3' - F-element 4648 1 55.43 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAG:1 - chr2L 17205192 3' + hopper 1375 1 66.00 TGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGGAAACAGTAAAACACGAACCGGACAGCGAC:1 - chr3L 14302041 3' - I-element 4956 1 69.31 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCCAACCATATTAACCCTCAACATGGATAAACTACCAATTTTTGAATAAATT:1 + chr3R 21311334 3' + 1360 3363 1 53.00 CTNTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTCTGTAAGGAGTCGCGCCTGCGTTGCTCCGCCGCAATGGCCTCGA:1 + chr3R 10010982 3' + copia 114 2 55.45 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTTAAATTGTTGCGTTAACCAAGCCAACCAGCTTCGGGGGC:1 - chr2L 15013943 3' - jockey 4710 1 64.36 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGA:1 + chrX 678839 3' - Tirant 36 2 59.41 CANCTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTTTGTGGCCTGGCAATGGGTAGAACATTTCGA:1 - chr3L 10604904 3' + jockey 4859 1 68.32 ATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCATATATTTATTTCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCCAAGTGATATCCCAAGAAAACAAGA:1 + chr2L 17152051 3' - Stalker 244 4 76.24 GACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATGCTATTTAACAAGTAAATAGACTGCATTCTTGCCATGTGCAACCCGAAAACTTTT:1 + chr2L 12284052 3' - 297 6580 1 81.19 CTAATACAAACCTGAAGATTGATTATCCATTTCAAATAATACTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAATTAGTATAATGAATACCTACCTCCTCATAAAGCACT:1 + chr3R 19738586 3' + hopper2 1340 1 66.34 AATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGCCCTAGGGGGTGTGTGTGTGTGCGTGGTAGAAAATCTCTTTTAATTGCCAATCGTGTGGAAAAATGAATTT:1 - chrX 3549165 3' + 1360 3165 1 70.30 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAAGCTCCTCCAG:1 - chr2L 11764866 3' + roo 397 1 60.40 ACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTGCGGGCGGCAGCGCTACACTTTGTTGTTGT:1 - chrX 7300580 3' + jockey 4733 1 70.30 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTTTGAAATTGTGTTCTTATAAATTATATAAA:1 + chr3L 8331275 3' + roo 9030 1 72.73 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCAATTCTAATTAGTTAATTGCTG:1 - chr3R 26140732 3' - 412 20 2 59.41 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATACTCATAGTTCCATAATCTGTTTTGCAATTCAATTAAAAGCAAT:1 - chrX 4174896 3' + I-element 5323 1 57.43 TTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATATATACTTT:1 + chr4 156605 3' - INE-1 146 1 82.83 CCATGTTACTGTCTAAAAGCTAAGACTAGAAAATATACTAATTATAAACTAATCAACCGACACCAGACAAAAACATGTATTCTTCAGCGCAATTGAGATGC:1 + chr2R 4189851 3' + HeT-A 5869 1 49.50 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCAGACCAATTATTTTGCATTCGTAATTAGAAGTTGGTGGCAATGGTAGTTTATCAG:1 - chr2R 20804665 3' - hobo 21 1 60.40 GTTCTTAAGATATAATTCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTTTTTTTGGTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTGCTAATGGACAAAACACATA:1 + chr3R 4833160 3' + Tc1 1370 1 80.20 CCAACAAGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAACATTCGAGCTTTTCTCTCGAATGTATATAGGTGTGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTTCATCAGTGCT:1 - chr3L 25552477 3' - Fw3 27 1 84.16 CCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCTCGTCTGTCTCTCACGGGGGTTGATTTCTTATTGCCCATCAATGTGACTGTCT:1 - chr2R 3032174 3' - 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chr2L 4479478 3' + invader2 145 2 70.30 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATTTTCATACCCAT:1 + chr3R 27452384 3' + roo 9031 1 70.30 AGTTCAGATTCGGAAATTTATAATGTAGAACTAGAAAAAGAAGAACTATTATAATCTAATATAATTTATTCTTATATCTTTTATTTCTGAGGACAGTCGGG:1 + chr2R 4514915 3' + transib2 2556 1 43.56 GTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCAAGGCGATCAATGGCAAGTTAGAAGAGACGTCAGGTGCTTTCAAGGTGCTCGTCCTGGATTTCTCCATGC:1 - chr3L 17899478 3' - Doc 475 1 72.28 TCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATATTTTTTTGTTGCCTGCCATGGGAGCCCATGACCCCCCTTGGGTGTATTGATT:1 + chr3L 12172900 3' - 17.6 6942 1 65.35 AAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTTGCTGACTGTCGTCGTAACTGAAATTGCCTACTGCTAACTGCGGATGCTGATGCGGATGCGAATGCGAATGCGGA:1 + chr3L 2871516 3' + F-element 4677 1 78.22 ACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATAT:1 + chr2R 3760468 3' - accord 41 2 65.35 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCTTCCTTACATTGAAGTTTTGTTTTACCCTGCCATTGCACTTAGTTGGTTTTTATTGTTTTCGTTTTTTTT:1 - chrX 22745621 3' - copia 4875 2 69.00 ATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCA:1 - chr3R 6769710 3' - mdg1 42 2 58.42 TGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTATCTATAGTCTTC:1 - chr2R 10552693 3' - INE-1 568 1 88.12 AATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGATAATCAAGCTAAAGAAGGAATTGGGTTAAGTTGAAAGTT:1 - chr3L 15387589 3' - Juan 4095 1 61.39 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACA:1 + chr3L 24208199 3' - Quasimodo 25 2 59.41 CAGATANATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATACTTCTAAAATTGGAGTTAACATCTTC:1 - chr3R 19448725 3' + invader2 19 2 70.30 CCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTAATATCTATCTCCTTCGCCCCTCTCCTTTTATCTGCCACTA:1 - chr2R 3031785 3' - F-element 4267 1 59.41 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGCTGGCCGGCCGTCCGCACTCGCACTAATAA:1 - chr3L 447297 3' - Tabor 22 2 57.43 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCAATATATTATGCTAAAAAAAAAACAAAAGTGTTGCCTATTTTTCGGGG:1 + chrX 6509829 3' - jockey 35 1 57.43 TGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCA:1 - chr3R 19450117 3' - F-element 404 1 61.39 CTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATATAGGCTATTGTGGAGAGAATGTCTGAATGTG:1 - chr2R 3663829 3' - invader2 244 2 67.33 TTNGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGAACCCGTGCGAAAAAAAAGAGCCTCGAAGTCTACCTATTTGATCTGAGGCATATCATTGATTATTGAATCTTTATGGA:1 - chrX 17942152 3' + Cr1a 4430 1 65.35 CTTTGGGATTTGTGCAGTATTTTAAACAAATATATAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTATGGTTTAGACAGATTTGGCCTCTTTGATCAATTTTTTTTTTT:1 + chr2R 10607800 3' + Cr1a 148 1 55.45 AGGGCAGAGCAAATTGGATCATCGAACGCGTCGGTCGTCACCACACATACACACATGTAAATCAAAAATCTAAATCAGAGCTCATGGAAAAGCCG:1 + chrX 22906643 3' + gypsy7 107 2 60.00 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTATGAGTAACGGGTATGAAGAATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGCGAGGGAAATGT:1 + chrX 5256764 3' - INE-1 10 1 77.23 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTGCCCGAAAATGGATATCCAGTTTTTATATTTATTTTCTTGGGATATCCTTGAAAGTC:1 + chr3L 5067895 3' - Quasimodo 13 2 59.41 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTCACTCATGAATGCATTTACATGGCCCGGCTTCAACTT:1 + chr2R 15578305 3' + mdg1 7430 2 59.14 AAAATTTAAAATAAAATAAAAAAAAATGTAAAATATTCAAATACTTTCTTCATAATAAATGAATATTGGTATGAAATCCTTTCCTTTAAGTACATCACACT:1 - chr3L 14813054 3' + TART-C 11096 1 74.26 CCNTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATTGATATAGAGAAACTATAACTATTGGTGTTGTGAAATTAGTGAATTCTGAGTGTGAAATGTAT:1 + chr3R 12514938 3' + opus 490 2 71.29 AGNTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCA:1 - chr3R 19450117 3' - F-element 404 1 59.41 AGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATTAACCTCGTTGTTTTAGAAATGGTTCCCC:1 - chr2R 25253524 3' + TAHRE 10382 1 71.29 TGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCTTGTCATAAGTGCATGAAATGTTTTTG:1 + chr2R 19797737 3' - F-element 4519 1 73.00 GCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCTCGTTGGCGATCACCGTCGTGGTGGCCTCTCGCAATATTAACTGCTTGGCCAGGGCAATCTTCT:1 - chrX 6713796 3' + F-element 226 1 72.16 AGNTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGAAACAAAAGGTATAGCGAGCAAATGGAAAATCCATTAAAGGTGAAGCATACTTTTGAG:1 - chr3L 21144036 3' - jockey 4684 1 65.12 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATAACAGATCTGATTCTGATGTTGGCAAAAGTCGCTCAAGTCACGAGTGTTCGCAGTGGTCGCCGCTCATT:1 + chr3R 6003042 3' + opus 495 2 76.24 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTACTT:1 - chrX 17300371 3' - jockey 4708 1 62.63 ATATTAAATATTACTTTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAA:1 - chr4 1294994 3' - Cr1a 4299 1 51.52 TANTTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTATGTGTGGGGAGAGAAAACAAATAAAAAAGATATAATATATTTATAT:1 - chrX 11795342 3' - I-element 222 1 52.48 GTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTTCCCAGCTTGGCTCATGCATGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGCGGATGTCCTTCTTATTGGG:1 + chr3R 14956971 3' - G-element 4179 1 69.31 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCGAAACCAAAAATTATGCTAGACAGCTTTCCATATCGTATAAACTTTGGGCTTAATTGGCAAAGAACTTG:1 + chrX 6731885 3' - hobo 5 1 71.43 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCACTTATGCATGCATGACATGGACGGTGGGCGAGAGGGAGTTGCAATCGGGG:1 - chr2L 17205174 3' + hopper 1400 1 59.14 AANAATAAAACATTCGCGTGTACCCGTCTTCCGCGGCCACTCGGAACGGCTAGTCTTCCACCGGCACTTCCTTCCACCGCTGATCGTCCAGCG:1 + chr3R 2894744 3' + Q-element 549 2 43.01 CTGAGATCTCGACGTTCATACGGGCGTGGCTGGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTT:1 + chrX 21575376 3' - INE-1 136 1 62.38 ATNCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAA:1 + chr3R 19449410 3' - roo 8644 1 71.29 TCNCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCACATTGATTTTTTTTCTGCAGGCCAGCCAGCCGAAGGCTTTTCCTTCCATGATTTGACCAC:1 - chr2R 17344337 3' + Stalker 425 1 81.19 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCGCATCAATCCTTAGCACAGTGGGTAGCGTTGGCGTCAGCTGTTAA:1 + chrX 12346306 3' + hopper 1386 1 63.37 GAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAA:1 - chr3L 24213788 3' + invader2 207 2 65.35 TTACAATATTACAGAGTATAAGATTAGTCTACTGCACAATTTTAATTACACGCAAAATACTCGAATAACAAGGGCCCCAATCAACAATGCCAAATGCCAAA:1 - chr3R 31366362 3' - diver2 4574 2 69.31 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATTGCATCTATATGTGGCTC:1 - chrX 9983647 3' + pogo 2070 1 72.09 CCACTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAAT:1 + chr3L 26007749 3' + G5 4752 1 54.46 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCCCACTTTGAGCAAGTCATATCGATATCGAACGAATCGAACGAAAATCCTGTTC:1 - chrX 9439940 3' + roo 8621 1 55.45 CTGGAGNCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAA:1 - chr3R 17665989 3' + Transpac 263 2 72.28 CAAATCGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACACAATCAGGATGCAGTCATCGCCAGTTGGCACTCCATTCC:1 + chrX 14376811 3' + Doc 219 1 62.38 AAATGCACGTTGTGTCTTAATAACCGAACATCCGCTTAAAAAGTAGGCCTCAACGGACAAGGACAGGTCAAAGTGGAATCGAGGGAAGATTCCTTTCCATC:1 - chr3L 10833587 3' - mariner2 199 1 57.43 TTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGCTTGTTTAAAAATATGGTGTGTGTGTGCCCTTTTGGCAGGAGAAAGTCCCTAACCCTTTGAATTTCT:1 - chr2R 10380447 3' - I-element 4915 1 70.30 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACAATACACAGAATCGTTGAGGCCACGCATTTT:1 + chr3R 28288644 3' - 412 45 2 73.27 GCAAGCCGACTCAGCATTTCTTGCAGCGTGAAGCAACACTCCCGATTTCAAGGGTCTGGCTGTGGTGGACAACAGCTTCCAGGAGGTTAAGCTGGAAGACT:1 - chr3R 17545953 3' - gypsy 7139 2 66.34 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCAGTCATTTCTCAGTTGCTTCGTAAAGTTGGCTGAAAAGAAGAGAAG:1 - chr3R 14626010 3' + P-element 2857 1 49.50 ATGCTTATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTGGCTATGTGCCTGCAAGTGATATGGGTAGCACTATTGATTTACCGTTGCTCAAAGC:1 + chr2L 11665535 3' - Tom1 181 1 61.39 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACTCCCAGGAGCCATAGTCCTCGGCCAAACAACGTGCAGCAAACACGACACAATAAAACACAAAATACCAGG:1 - chr3R 17665946 3' + Transpac 306 2 75.25 CTGGACTCGTCAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGCAACGGGGAGCGGGGAGAGCGCGACTTTTCATTCG:1 + chrX 4058876 3' + R1A1-element 343 1 65.00 TCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAAAAGTTACTCTCAGCACCGGAGGAGGAGTTTTTTGGAGACAAAAAAGGCGGGAGGTTTAAAATTGGAGCTGG:1 + chr2R 979461 3' + Porto1 355 1 52.00 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAGTGGCTCTTTAATGGGGGCATTGCATACTTTCGGGCACAA:1 + chr3R 23601772 3' - jockey 21 1 60.40 ATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGCATCGGCTCATCCTCTTCAGACTCATCAC:1 - chr3L 11780090 3' + P-element 2504 1 33.66 CTCAGCTAGTGTGAATGCGAACTCGAAATCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATAATAGATTCAAATTCTATGCATTGCTGTCCACTACCT:1 + chr4 40036 3' - INE-1 530 1 65.93 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCTCGTGTTGCTCTGGGTCGTTTTGTATTGCTGGTGG:1 - chr3L 17971204 3' + P-element 2883 2 73.68 TGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCAAAAAATCACATATAGTTAGATAGCAAATACTGTCTAATTATAAACCTAAAAGTGCTTTATGCAGGT:1 + chr3L 8460198 3' + Doc 4391 1 53.47 AAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTGCCTTCTTTTTTGGTAAAACTGAATCATTTGATGG:1 + chr4 142005 3' + rover 82 2 71.29 AACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTAGATTCAGCTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTACTGCGAGGGCTTACCTCTTTATTCCTTCGATTTGTTGAGCCTT:1 + chrX 16112232 3' - rooA 352 2 73.27 CAGCCTTACTCCATGTTACATTTATGACTAAAAATTATACTGCAAATATATCGCCAAGATTTATGTACACGCTGTAAGTGCGAGTGTAAGAGTGCGATTTA:1 - chr3L 13878016 3' - flea 4755 1 77.23 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAATGTATTGTTTTTAAAATTATTAAAACTCGAAAAATCATTCCATGTTATGAGTTACACGCCAAC:1 - chr3L 12572603 3' - Juan 4039 1 64.36 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTTTTGTTCGGTTCTACATATTTATAGGTATAGAGCTATATAGATGCGTTGAGGTTCATTACTTTTCATCA:1 - chr3R 11175825 3' + roo 404 1 72.28 TTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCATTTCTAATATACCATTCGGCTTTTGTTTTACACAGTTCTTCGGTTTTTAAGTGCTTTTTCGCGTTTTATT:1 + chr2R 18134533 3' - Porto1 4394 1 56.44 ATTAAAGTGGGTATCACAAAATATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATGTATTAAAAACTAAA:1 + chr2L 22757426 3' - P-element 278 1 27.08 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTT:1 - chr2L 9410809 3' + roo 9027 1 70.30 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCCAAAGTAATTTCACATGCGTGGATTTAAACCAGCGTATTGGGGGACGCAATTATGTTATTAGGAAT:1 - chr3R 10824029 3' + 412 483 2 68.32 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGGAATGCTGGAGAAACAAGAGCAAGTACA:1 - chr2R 13304454 3' - hobo 46 1 71.72 ATNTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCAACGAGATTCTAGAGAATGGGAATGGATGGACTGCCTGATGGCAGGATGGCCCAATGAGCTG:1 - chrX 21500895 3' + INE-1 151 1 52.48 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCAGTAACTTTGAAGTTGAATCTTAAACTAATATTTA:1 + chrX 16699063 3' + roo 9032 1 65.00 CATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACAACAACTCAGCAAAACGAAGTGAAACCAGTGAAAAAAACCAACATG:1 - chr3L 12318697 3' + Ivk 4957 1 54.00 AAGTCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTCTATTCTCGGAGTCACACCGCGCACACTCCAAAAAGCTTATAATTTGAGATGATCTTTGCTCCGACAACGCCCC:1 - chrX 20801643 3' + Q-element 437 2 60.40 AAAAAAACAATAAAATAATTTTTTGGCACATATGAAATGTTGACTCATGGCGGTACCTTAGAATTCAGACCCCAAATTCAACGCCCCATTGAATGTCGCTG:1 + chr2L 14575577 3' + gypsy11 3937 1 84.16 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGTAGCAATCAAAAGAAGTCAATAACAACGAG:1 - chr3L 11156232 3' - 297 37 2 64.29 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACTTGAATCGTGTGTGCTGGTGTAAGAGGTGCCTATATGCTACTAAAAAGAATATTACTGTGGAA:1 + chr2R 20309416 3' - roo 8677 2 66.34 CTAAGCAAAATAAAAAAAAAAACAAGAACAATGGCCACAGAAAAGATGAACAAAATTGTAAAACGAAACCCGAAGATAATCTACACTGTAATACTAGTCGG:1 - chr2L 3932164 3' + F-element 4680 1 76.24 GAAGATCCTAATATTCACACAAACACAACCCAATCACAACAACAAAATCCGCACCACACACCCAAATCAGCAGCACTTTAAACATTTTGTGAACAATAAAA:1 + chr3R 19224079 3' - 1731 4575 2 69.31 AGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCAGTGAATGGCTTGGGTTTTTTTCGGCCAGGATTTGCCGGCCATTCTCGTGTTTTGTTTGCCTTTGAGATGG:1 - 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chr3R 24006923 3' + P-element 146 1 27.72 ATAATAAAACATTCGCGTGTAATTATGTACGCAGACGATGTTATATTATGCCTCCAGTACTTGGACAGTGAAGTATTTAGTCCTTTGTCTATCCAATTAAA:1 + chrX 6135141 3' + Q-element 550 2 63.37 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGC:1 - chr3R 20373245 3' - I-element 35 1 58.42 AANAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATGCAGCCAGCCGGCAGGATGCCATTGTCCTTGAACAGGCCAAGAGATAAACTCACGCCC:1 - chr2L 1453947 3' - accord2 7275 1 60.40 TCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCTCCCACTCTCAACTCGTCCGCTCTCAGCAACTTCAGAAACCATACACGCACACATGGGGGCAAAGTAATTT:1 - chr3R 29807681 3' + Porto1 482 1 71.29 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTAATAAATTTTAATGTTAAAGTAAGTGTTTAGACGAAGGACGGGGTATATAATATCTGCACT:1 - chr3L 11920023 3' - Tabor 6852 2 66.00 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTTATAAATAGTCAAAGTTCTAGAATCTAGATGATGTGCG:1 + chr2R 17077894 3' - Tirant 8145 2 63.37 ACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACCTCCGGCATAGGATACTCCATGCACCCTTTCTTCGACAG:1 - chr3L 22498941 3' + accord2 7277 1 61.39 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTAGGAACCCCCCATCCGACAGCTTAACCCTCATCTTCCTGCA:1 + chrX 10644876 3' - hobo 36 1 59.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACTCATTAGATCATTATAGCCCACCATCTGAGTCATGTAGGTAAAAGCTTTGCGCCATTA:1 - chr3R 9325596 3' + roo 9054 2 59.41 TGTTTTTTTTTTTAATATATTTTTTTCCCTATTCGAGGATTTTTGCTTGCCAAAGCCTGCAAATATGTTGTGCCACTCCCCGAAAGTGCGAAAACCTGAC:1 - chr3R 29440818 3' - BS4 732 2 81.00 CGAATTATTTTTTGCAAAAGTTTGAAATGCAATATGGAAGGAAATTCGAATATTCTTGTGTATTTTATATCTGCTGTTGTTTATGTGTGAAGCCATTTTGC:1 - chr3L 18856904 3' - HMS-Beagle2 400 1 61.39 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATAACAACTTATAGATAATACAAAGAACACAAGTATACTGTTGCAC:1 - chr3R 27539163 3' - Burdock 6167 2 57.43 AGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCGTGTGACTGCAAACTGGTCAAGATTAAC:1 + chr2R 17359972 3' + gypsy4 67 2 78.22 ATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCATGCGCACTCAGCTTCCACCAAAAAGTTAAGAAAAAACG:1 - 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chr2R 8311629 3' + hobo 2488 1 68.32 AATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACACACACACACACACACACTAACACACACACATGTATGTATGTATATCTAGCTATATGCATTGGGCGCAAGCAAA:1 + chrX 2677617 3' - 1360 3255 1 69.31 CACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCAGTGGCAGCACAAGCAAAAACTTATAA:1 - chrX 1623676 3' + F-element 475 1 61.82 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACCCAGACATGTGTTCGCTTATGAGTCCGTTACTGATTATAAACAATGCAACATTTGAACAAGG:1 + chr3L 7154312 3' - FB 15 1 64.36 GTGTTTCGTTCTTTTCGACAAACAGCAGTGCTTTGCGCATCATGTTGCGTGAAATTTGACACTTTTGGCCGGGATGACGACACAAATTTTCACCGCATCTT:1 + chr3R 8143364 3' - Tc1 491 1 66.34 AAAGGTTTAATAGAGTATTTTCTATTCCAGTTTTCCCGGACGCACATGACGTATACGCAATATGCAAAAAGCTTCGCGTGGCCTTCAGAATGGGTGGTGA:1 + chr3L 10835225 3' - ZAM 497 1 67.00 CANCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCGCATTAAATTTACTAATTAACAACAACAACATGCA:1 + chr3R 29357105 3' + 412 7505 2 65.35 TTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTGTCCAAATACCTGGAGGAAAC:1 + chr2R 5202372 3' + roo 381 1 52.48 ATCAACACACACACACACACACACACACGAACAGACAGGAACAAAAACTCGAAACCCCAGCAGAGA:1 + chr2R 8655837 3' + accord 7027 3 86.36 TCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGGAAACGATAACTGCCGAAGCTGTGATACTCTATAAGAAGAAAAAACAAAAACATAAAACGCTTTGAAATTAACTTAA:1 - chrX 4022255 3' - roo 8662 1 79.21 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACGGATTACGGTTTACTG:1 - chr3R 446012 3' - pogo 31 1 57.43 ATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTAATATTCACTTTTATGGCCCAATCACAAACATTCTGTTGCTTCTTT:1 - chrX 22776826 3' - I-element 4976 1 59.41 ACGCATCGGTGTCGACATAATCATTTCAAGCATAACGAATAATTAGTGAATTTCATCTTCTTTTTTTTAACATAACAACCGGAACTGATCTTTAAATCGAA:1 + chr2R 12923446 3' + 3S18 270 2 77.23 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAAAAAAATTACGTACGCGATAGTCATCACCTCACAGTCACCT:1 + chr3R 12375224 3' - pogo 31 1 64.36 CGNCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGAGTAT:1 - chr3L 26719149 3' - Tc1-2 25 1 61.39 GANTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCAAAGCACTGGTACCACTGCTGCCTACTTAGAAGGGCTCCATTTTTCAATTTACTCGTGAGTTTAAAAGGGGAGTTT:1 - chr3R 9297006 3' + hobo 2937 1 75.25 TAAAATAAAAAAAAAAACTTTTGAAATGAAAC:1 + chr3L 21331870 3' + HMS-Beagle2 492 1 84.38 TTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTATATATGGTATGGTCCTCCGTCGTTTCTCGCTTGG:1 - chr3L 10364913 3' - F-element 337 1 65.35 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGGATAACCTCAGAGAACTTCCACTGCATCCAAGCATTGGT:1 + chr3L 26644799 3' + HMS-Beagle 7009 2 59.41 GGNTCAGCACTTTGATATTATGTTTCATACACTGAGCCAACTGTTGTTGAATTAACATTAGTGCGCGCTAAGAAGCGACAACGGTTTAAGCCAACTAGCAG:1 + chrX 20894558 3' - Gypsy6A_LTR 48 1 54.46 TTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTAGTGAAGGCGCTAGATAGTTGTTGTTAGCATGAAGGTGATCGTTGATTTGAATGACAATTGATCTGTTGTCTAA:1 + chr3L 23854146 3' - I-element 5129 1 78.22 TGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGGTGTGCTGCTGCTGCTTTTCTTCTTGACTTT:1 + chrX 17301466 3' - accord 307 2 69.31 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGCTTCATTACATTGAAGTTTTGTTTTACCCTGCC:1 - chrX 22745659 3' - copia 44 2 72.00 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCATCCGCAAATCCGTGA:1 - chr3R 19446126 3' - 297 5 2 71.29 TAAAATAACTGTATTAAATATTAGTGCTAGAAGGATCTAATTCGTATCTACAGGTTAGGTTCAAGTGTATAAATAATAAATGGTTTCTTTTCTGCTTAAGG:1 - chr2L 16798669 3' - Cr1a 4309 1 67.33 TCNTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAACCACACATAGCGTTAGCTGTTTCTTAACAATTTGTCTATCCT:1 - chr3R 10326491 3' + invader2 4835 1 56.44 TTNGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCAGCAGAACTTATATATTAAAATAGTGGTTTACCGAAATAAGATCAATTTATGATAA:1 - chr3L 21484646 3' + Cr1a 228 1 62.38 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGCGCAGCGGTC:1 - chr3L 14088079 3' - hopper 51 1 77.23 TTNCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAACA:1 - chr2L 18223784 3' + roo 9027 1 67.33 TCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGAAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTTTCTGTTGCCACTCGCTGACAAATTGTTGATG:1 - chr3L 14919870 3' - Doc2-element 490 1 65.66 TCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAATCCCCTGCCACGCCCCCAGCCGCACACCCATACCCGATCTGCCCCATCC:1 + chrX 20285019 3' + F-element 389 1 51.49 CAGCGCCCCTCGATCGGTTGGGTGGGAGGTGTGGTACCAGTCAATTGGAAATATTCAACAAATAGGTCACAACAATTTAATAAAGTTTAAATCAAAGAAAA:1 - chrX 11521742 3' + Cr1a 4413 1 63.37 TCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGA:1 + chr2R 1621921 3' - INE-1 138 1 49.50 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTC:1 - chr3R 19446148 3' - 297 13 2 59.77 TTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATGAAAGATAGAATCATTCACTTACCAATCCCTTAAGTTGAATAATAGCTTA:1 - chr3L 20895245 3' - invader3 5210 2 93.88 AANGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACCTAGAACTAAGTTAGTTTTTCTTTTTATACCTGCCCAAATAAAAGATAATGGAGTCGAAGACAT:1 - chr3R 4510486 3' - HB 1409 1 72.28 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAGAACAACCAGCTATCCGAGACTAGGCAGAAGTTGCTGTATCAGCG:1 + chr3R 446089 3' + pogo 2077 1 54.64 TTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTGAATGGTTTTTTCGATAACCCGCCCCAATTTTCTGTCCAGTGTAGTCTTACCAGAATG:1 - chrX 5358715 3' - Idefix 7144 2 59.41 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTAAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATT:1 - chr3R 4679275 3' - copia 4893 2 66.67 ATAAACACACACACACACACACAAGGGCACTTGGGGAGAGAAATAAAAAAAAATAGCCATGATCTTTGGCTTTGGCAACCAGCTTTGCTGTTCGTTTTTTT:1 + chr3R 10593515 3' + accord 7027 2 76.24 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAGCCGCAAATTTGCACGTATCCCAGTC:1 - 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chr3R 19450183 3' - roo 52 2 52.48 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTATAGCAAACACTCATATAAACATATGATTAAAGAAATGCCAATTTTAAACTGGCTTATGA:1 + chr3R 23724172 3' - Doc 48 1 50.52 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:1 + chr3R 1977623 3' + micropia 5412 2 51.49 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATC:1 - chrX 13640665 3' - P-element 56 1 21.78 ACATAGATATAAGCAATGTATTTGCGGATTCTGACTACGAACCCAACTTTTTTCCCTGTGCACGCGATATCCGCTCATTTTTTGGCCGCCGAATCGGTGAG:1 - chr3L 5015544 3' + Stalker 278 4 77.23 GTTTGTAGTTTTTTTTTTTCCTGCTTCCCGTGAACTACATGTTTCACCAGCCCAAACCAAAGATGGCAACTACTCGTCAAAGGAACAGCAGCAACGCGACG:1 - chr2L 8337978 3' - gypsy7 5014 1 56.44 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATAATTTCACATAAATCCACACATCTTATA:1 - chr2L 21951188 3' + opus 454 2 71.29 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAATATATGTTTGAAAACCCTCGATTTGA:1 + chrX 1600219 3' + BS 5040 1 75.25 ATAGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAG:1 - 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Doc 310 1 64.36 CANTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCGTTTT:1 + chr2L 18214148 3' + hopper 1398 1 62.38 TTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGAAAATGAAATAGACAACTAAAAATGCA:1 + chrX 8675358 3' - F-element 4550 1 74.26 TTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTACGGACCTCCCCAGCAGGCGCCGGTG:1 - chr2L 7860440 3' + Stalker4 7035 4 75.25 TATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATAT:1 + chr2R 9500048 3' - G5 4721 1 50.50 AATAAATATAAAAAAAATAAAGCTTACAACAAAACAAGAGAGCAAGTCAATAAGCCTCCACTAACTGAAATGTATATGGAAAGCAGGAAAAAAAAAAACAA:1 + chr2R 15381676 3' + transib4 2579 1 73.27 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCCCGGTGACAATCTCTGCCGGACGGACGTACTCCCTCCATCT:1 - chr2L 2685735 3' - hopper 32 1 58.42 CTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTGCACCTTAGTAGGAATGCTCTCAGTTCTGGTTGGCCCTTTGGAATCTTT:1 + chr3R 15790082 3' - flea 4728 1 59.41 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATTGTAAGCAAAAATTAAAATT:1 + chr3L 22751966 3' + roo 353 2 88.12 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTTGAAAAATCGAGAAAAGCCAGGTTTTTAGTTCGATAAATATGATTATGTAG:1 + chrX 14505854 3' - pogo 24 1 56.44 GCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGCAATAAGTAGTCTTTGATTTGCTTTCATTCTTTTTTTTTTTGCATTTTATGCCGTTCTGTA:1 - chr3R 25553538 3' + Cr1a 35 1 68.00 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAATGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCC:1 - chr2R 5674657 3' - S-element 36 2 63.37 GAGGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGAAAGGGACTCGAGATTAGAGATGGGACTTCGAGTGGCTGCGATAG:1 + chr2R 8951094 3' - P-element 9 2 70.00 TGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAGTTATACTACTGTCCTCCATGTTTTAAGGCTTAATAGGTAAA:1 + chrX 20858772 3' - Copia1_DM 37 1 61.00 CTTGGTCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTC:1 + chr3L 26007752 3' + G5 4755 1 51.49 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTA:1 - chrX 6654466 3' - jockey 4777 1 73.27 AATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAACGTCATCTTAACT:1 + chrX 22782068 3' - I-element 4893 1 60.40 GTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGAGGCATGTGTAACGCATAACACAAGCGGACTGGAATTGGCCATGGGAAATTCGCTGAAAATGTGAC:1 - chr3L 12950834 3' - hopper 113 1 55.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTTGTTAG:1 - chr3R 27156629 3' - pogo 19 1 60.40 AGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - 1360 122 1 90.00 GAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAGATAGAAAATAGAAAACGCATTGGGGCCTATAATTGATTTGTCG:1 + chr3R 9127429 3' + invader3 242 2 59.41 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAG:1 - chr3R 29357068 3' - 412 55 2 76.24 ATTGATCCTGATCAAGAATATTGTAACGAGCTGTCCGGGGGCTCAAAACAGCGTGAAATGAGCAGATTTATAGGCCTTATTTTGGTATTTAACTGGTGCTG:2 + chr3L 10017779 3' - INE-1 83 1 73.27 ACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAATGACAACTAATTTGGCTAAATTGTGAAAGTCGTTAGGAGAATTAGAGACTTC:1 + chr3R 25974252 3' - F-element 4346 1 57.43 CAATAAATAGGCAAAACATGGAAAAAAAAACTGTTACGTTACTGTTTACGTTAATTGTTTTATGATACGCATTTTGGGCGAGATTGAGGATTGTCCGTGTA:1 + chr3R 829851 3' + Doc3-element 4714 1 74.26 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCATCCATCAACTCATGCGTACATATGAGATTTTAGGCTATTTTCCGGAAA:1 + chr3L 12352961 3' + Tirant 8480 2 53.47 ACNCACACACACACACACATTCTGGTTGATTTCGGAAGCAATTTTGGCACCAAAGTGAACAACCATGAAAGCGGGAAAAAGCAGTAGTACTCCATAGTAG:1 + chr3R 28571283 3' + accord 7031 2 59.00 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTT:1 + chr3L 1259238 3' - Doc 26 1 53.47 ACATCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAACAAATGAAGCGCTAAATCGGTCGAAAATATTTGCACTACAAAGTAGCAAGGGAAAAACAAACGGAAAGAG:1 + chr2L 1796360 3' + Fw2 3691 1 69.39 CTTATCGCCGTTACATTGATCTTTATAATCTTATCTTCTTGATCTTATCAACGCGTACATACATCTAGCACGTGCCATTGCAGATCTTTGACATAATGTGG:1 + chr3L 20262652 3' + Ivk 89 1 57.43 GAAAAACATATGAGAACATTCAATACATTCAATAATGCATCGGTAAGGCATTTTTCGAAGGAAATTGGCTAGCATTAG:1 - chr3R 16815578 3' + HB 415 1 89.74 CAGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATGCATCACTTCACTTCATCCGCTCAATTGTCGGTGTAACACTCGCGA:1 + chrX 20916413 3' + Doc2-element 288 1 54.46 CAGGGTACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCCAAATCCGATCCGACAACGGCCTCCCCCGCCAACTGAAAAAGACCAAGAGGAAAGACCAAACCGAGCTCAA:1 - chr3L 778882 3' - Rt1b 4676 1 67.33 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTAAGAAGTGCAATTACCGAAAGA:1 - chr3R 5329356 3' + blood 7337 1 77.23 TAGAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACATGCTCCTTAATAAATAGCCAATTAGTCAGATAATTTAACACTTAGAAATCATTAGTCGTTCATGATTTGCGTTA:1 + chr2L 13804484 3' + roo 403 1 73.27 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACG:1 + chr3R 31026098 3' - mdg1 35 2 57.43 TATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTT:1 + chr2R 9500074 3' - G5 4700 1 55.45 GTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGCAGGTTTTTATATCCGTTCGGTCACTCTATTATTATTGACTTCTGGAA:1 + chr3L 25256200 3' - Burdock 333 1 68.32 CTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAAACTAACCACAGCGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTAAGCCAATACCGTAACCAT:1 + chr3L 10814980 3' + GATE 8353 2 81.19 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCG:1 - chr2L 10712118 3' - I-element 34 1 56.44 ACTTTACTTTACTTTACTTTAATACAATATACTCTACCCACCTTGAGTCGT:1 - chr2L 6296732 3' - TART-A 13150 1 70.59 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTACGAGAGAGAGTGAAAGATCGTGTTTTTGTAGAGCCAAA:1 + chr2R 21497541 3' + P-element 2849 1 42.57 TATGTATGTATAATGTATGTATATTGAATGTTGTTTCCAATTTTTATTCAGGACTCAGATGATGAGATTTCCCATCTGGAGTGGGAGACTGTACGCGTGCG:1 - chr3L 13910166 3' + Dm88 10 2 60.40 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGGGCGGAAATAAAGAGCAGCGGTCATAGCTAGAGCTGCATCTG:1 - chr3L 14088060 3' - hopper 32 1 58.42 ATCTATTTATTCATATGTTTTTCATCAATATGTAAAAAATAATAACAAAACTATTAACAATGACCTCTATTCGACAAACCGGCGAAAAACGGTGCGTGCTT:1 + chr2R 2961880 3' - S2 1607 1 62.38 TGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGTCGCTTGTCTTTCAAATTGCTGCTGAAGCGGTGAGCTTGTTTGGTTTCATCAGGATGCGGCCGTGGC:1 + chr2R 21597585 3' - diver2 4723 2 73.27 CTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATCGTGCCAACAACAATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTA:2 - chrX 13640629 3' - P-element 20 1 55.45 ATAATTTCGTTTAATAAGATAAGAAAAGGTTCAATTTTCTCTTTATAAATGCATTTCCACTCAGCTCCAGAAATGTGAGGCATAATAATACTAGAAATCTT:1 - chr3L 15707114 3' + jockey2 3393 1 91.09 CAATTCCTGCCTTTGTTTGTTTTATTTAAATAAGAGGATATATAGTACCCCAACACTAGAGCTCACCGTAAGGCCCTCCCAGCAATCGAAACACCAATAAA:1 - chr2R 7718299 3' + invader2 5070 2 56.44 ACACACAAATATACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGTTCTCTGTTTGTTTCTGTTCTCGTTTTTGTTTGGCTCTCCTTTTAA:1 - chrX 18636907 3' + Porto1 4452 1 54.46 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAACAGCAGGTCCCTGTGCCTTTCCAGCGAATTTCCACATTTCCTGGCTGCGAAAT:1 + chr2R 23411958 3' + mdg1 7438 2 58.42 ATATAAAAATATTTTTTCTTTTTGCTATTTTACTATCATATTAGTATATCATCACAATTTGGCCACGAATATTAAATAAGTGACTAATGTTGTTAATAGC:1 + chr3L 18653194 3' + transib1 1958 1 46.00 GTGGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAGTCAGTTAGTGTTAATGCGCAATTCACAATTTTTTAAGGTATTCATAATTGGTTTGCGTTTCCCTAAACG:1 - chrX 22519684 3' - INE-1 561 1 51.49 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCA:1 - chr3R 21575930 3' - Doc 53 1 44.55 TTATCATTAAAATTATTATTATTACAATGACAGAGCCATTATAAGCATATCTTAATAGCTAAGATGAAGATCGAAAAATATTGGCATGAAACATCCTTAAA:1 + chr3R 29310164 3' - mdg1 7079 2 46.53 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTGATATAAATTATTAGGATGTTGTTGTTAAAGCTTGACATGAAAAGAAATCCGTATAGCTCTTGAAAT:1 - chr3R 20052046 3' + copia 245 1 68.32 GACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTC:1 + chrX 21907821 3' - accord 116 2 63.37 AGNTATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATTATAAAAGCTAAGCAGAAATACAAGCGCTTCCATATC:1 - chr3L 17172667 3' - roo 8703 2 64.36 AAGTTGAAGCCGTTTTTTCATGGAATGGATAAGTTTTTGTAGGTCATATTCAAGCGGCATCTTTCCCCATCCAGCTGGTCATGCATCTTC:1 - chrX 19988901 3' - S-element 1384 1 72.22 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGGGAGGGCGGGAAGTTATTACCCCCGCA:1 + chr2L 18177989 3' + 412 7526 2 58.42 TTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTTGTGCGTTGTTCTATGTGCCTATGTGCCTATTTTCGTTAATACCAAATGTATTATAATTAATTATACGATTTAATG:1 - chr3L 21924876 3' + Cr1a 190 1 68.32 TANCTGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCTGGCTCCTGTTTCTGTGCTACTTCCTTTTTTTCTG:1 - chr3R 16855265 3' + Cr1a 4015 1 64.36 CANTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGCACAAGCACTTTTAAAATGG:1 + chr2R 10468616 3' + P-element 2833 1 18.00 TGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTTAATTTTCGAAATCGGCTTACGGC:1 + chrX 4175116 3' - I-element 358 1 82.18 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTG:1 + chr3R 10030772 3' - BS 5039 1 54.46 TTTAAATAAAAAATAAAAGGATATTTTAAAGGCCACAAGAGCCCTGTAATAATAATAATAATATATCTTATGTGTGTACTAACCATCATGATAGTACAAGT:1 - chr2R 13283141 3' + G2 3054 1 76.24 ATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATTATTTGAATTTTTGAGGTGTACATTACGTGGGGCGAGGGGGCTAAGCGGTGGGTACAAA:1 - chrX 17349370 3' - TAHRE 10369 1 74.26 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGAAAATCTACTAAAATGATGATTTGCATACTCGTACATATTTCAGAAAAGTTGCGACATTTTCGCA:1 + chr3L 19414002 3' + Burdock 6353 2 62.38 AAAATTTAAAAAAAAAACAAAATTTCTATTGGTACATTGATACAAAAATACCAAAATACTAACGGAATCTGTATTGAGCAGCAAGAGATATTCAACAACAA:1 - chrX 12565737 3' + TART-C 11096 1 52.48 AANAAAATCCTAAATATAATTTATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTAATAAATTAACGTGACAGTTTTGCAGCACACA:1 - chrX 9437207 3' - roo 84 2 43.56 TTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGAGTGTGACGTTCGTTGAGTATTTTTGTTATATTTT:1 + chrX 17951723 3' - Quasimodo 88 2 69.31 TANCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACCTTCCGAACGAATCCTGTTCAAT:1 - chrX 7768933 3' - hobo 48 1 75.00 TGNGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTA:1 + chr3L 24208194 3' - Quasimodo 30 2 63.37 CCCGGTTGAGGGTCCGATGATTTGTTTCTAGTTCGGTTTAACAAGGGGGTGGGAGTACTGACCTTGATGCTGTCGTAGCAGG:1 - chr2R 17276044 3' - Tirant 8150 2 78.05 CAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCCCCTTCCCTGCCAACACCCTTTTCTCGTTTAGTTT:1 - chr3L 17220475 3' - invader1 3796 2 68.32 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTGCGGCATTACGTATACACCGCGTGTGCAGTGGCTCCTGTTGC:1 - chrX 5441984 3' - hopper 30 1 56.44 GAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCAACGTTCAAAGCCAATCAAAGATTTATACCCTCGGAAAATTCAAACGTTGAATGTCGGTCGGAC:1 - chr3R 26369522 3' + F-element 4433 1 65.35 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATAATTTAGCATTTTCAGTTTAATTAGCTTAAATGCTGGAA:1 + chrX 18952113 3' - mdg1 7075 2 63.37 CCGGGCAAGCACTACCACTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTTCTGCCACCACGATACTCCCACCATCTGGTCTATCGTCACGCGATTACAGC:1 + chr2L 22181306 3' - R1A1-element 5138 1 71.29 GGNACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGACCGCGACTAATGCTGTTTTCTGTTGTTTTTTTATG:1 + chr3L 3924264 3' - G6 54 1 70.30 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGACGGAATGAAAATGATTTAATACTTAACTAATTAAGCACAGAATCTTAAATTTACTTATTCGATTCGTG:1 + chr3R 4679347 3' + copia 248 1 71.29 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATATGCCACAACAATGAAGCGAGTC:1 + chr3R 19947421 3' + roo 9040 1 56.44 ATNTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAATATTAAGCTTAAGCTGCAACTGAACTGAAAAAGGCTGAA:1 - chr3R 19952321 3' - roo 8701 2 62.38 AAAGAAACTAGAATATTATTATTATTACAATATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCTGTTTGCAGATATGCTCTATAGTTATTATCACTATGTCATA:1 - chrX 21097427 3' - Tc3 309 1 74.26 TGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATG:1 + chrX 23108318 3' - BS3 1430 1 51.49 TATCTTGCCGGATCATCAATTTGGATTTTGAAAGGGACACGGAACTATTGAACAGGTCCAGACTTCAGAGCTCCACACTTCAGTTGCGCCCAGGTCTCGCG:1 - chr3L 13852265 3' + Helena 273 1 63.37 CTNCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCGACTCCGAAAGGCACTTGGCCACATGACCGCACTGGCACACCAGATTCTC:1 + chr2L 13029404 3' - Burdock 5997 1 65.31 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGT:1 + chr3R 17666030 3' - Transpac 4965 2 71.29 TTNTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATGATCTGATCTTATGACATAAAAA:1 + chr3L 7868748 3' - jockey 4724 1 77.23 TTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTTTTTTTTTTTGTTGCGAACTGCACTGACTGTGGGGCATACGTAATTAATCCGCAACTATCAACCAG:1 - chr2R 23725187 3' + F-element 4462 1 65.66 AGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTATAC:1 - chr3R 4160054 3' + invader2 5102 2 73.27 TAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCTCCATGGACTACACTGAAGGGAGGAGTGCGCGGGGTCAAGGAAAAAAATCACAAGGACGATGCTGGAATGGAAACAAGTT:1 - chr3R 12019456 3' + Rt1b 4902 1 59.41 TATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAAT:1 - chr2R 5582170 3' - Cr1a 444 1 64.36 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATACAAATTGCGAAAATGTCAACAAATTGAGGTATCGGGTGTTTTAAAGGCA:1 - chrX 5521060 3' + 412 467 2 51.49 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAAGTTGAATGGTATTTTGAATATTGTAAACCTTTTATATAAAAGCTCTACTCTTACAAAG:1 - chr3R 14609189 3' + blood 7372 2 55.45 ACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTTTGACTTTGCTTTTGGGCCAGATTGATGCTGGCCGGCTGGCTGATGATAGCCTGTGACTAAGACTCGC:1 - chr3L 20704418 3' + baggins 5355 1 72.28 TATATACGATATGTACAATATATAGGCGGATGCCTAAGCAAT:1 + chr2R 10686579 3' + Stalker2 267 2 97.62 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACGTCATCTTCATCATTAAATTCGAA:1 + chr2R 9868954 3' - roo 8715 2 76.24 ATAACGTTAAGGAAATGCAAAACAAAATTTTTCGCATTGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTATTTTATTTCTATTTT:1 + chr3R 1510317 3' - 1360 298 1 82.18 CCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGAAATTGCTAATATTGCATTGAGACTAACGTCATCTTAA:1 + chrX 22782066 3' - I-element 4895 1 62.38 TTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACACTATCACTTATTGGAATATAAGGTTTGTTTTCTAGAAATATTTCAGGCATCTAATACTGGAAATATTCAGT:1 + chr2L 19080879 3' + roo 8607 1 68.32 AGATGTTGAAGGTTTTCAATTAGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAAAACAAAAATTGGAAAGAAAAAACCAAACCGAATAGCAAAAA:1 - chrX 15300729 3' + invader2 4643 1 59.41 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGAAAATCCACTTCTTTTGTGGAGAAA:1 - chr3R 24461797 3' - F-element 21 1 63.00 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATGTATGTATATGGTCTATATAGAACGCAGTCATAATCGTAAACAATTGACG:1 - chr3L 11450464 3' - Transpac 22 2 57.43 CCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCAT:1 + chr3L 23678131 3' - Osvaldo 21 1 72.28 ATNCCAAAGACACTAGAATATTATTAGAATGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTATACCTATACTTTAAAGGGAGTGCTTATTTATCTGAATCATAAATAAAAA:1 - chr2R 12894918 3' - Tc3 314 1 50.50 CAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGACTTCTTCGACAGTTGTAGCGCTTTTAATGACGATCATCACGACAGCCACAGTTAAATTGACAAATTACTTACTTG:1 + chr3L 24253297 3' - HB 1208 1 72.28 CTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAACCAGCAACAATGCCGCGCAATTAAAAATGGCCGTACTGGACCAAAAAAACGAAAA:1 - chr2L 19265770 3' + F-element 461 1 60.40 TCNTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCTTGGATTCAA:1 - chrX 6654441 3' - jockey 4752 1 52.48 TTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGGCTTTTTAAGGGGCAAGTTTGG:1 + chrX 6185910 3' - accord 7155 2 75.26 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACA:1 + chr3L 23456269 3' + 1360 3372 1 58.42 GGNGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTAAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTTAAGTAAG:1 + chr3L 12035010 3' - I-element 179 1 70.30 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATAAAAAAAAGAAAATAATATCACAAAAAAGGATGCCGAAATAGAGGGAGATTTTCG:1 - chrX 19806625 3' + jockey 4977 1 60.40 TGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGCGGCGGTGCGCAGTTTGCGGCCATTTGACTGGACGATTATGTTGC:1 + chr3L 9859002 3' - gypsy5 6988 2 66.67 GTTGTCCGTCTCGTCTGATCGGACTCGCTTAATCATATAATGATTAGGCTGTGTCCCGTTGCTTCTGCCTCTGCTGTGGCAACTGCCTTTCCACTTCCA:1 + chrX 16553465 3' - Rt1b 4790 1 55.56 ACNCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATATACTCGTATATAGGTACATATATATATCTGTGCAGCTGCCAAGTATGCAACAGTTTTCGATTGCCAGCGTCCA:1 + chr2R 13403829 3' - jockey 13 1 73.27 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCG:1 + chr2R 8951049 3' + P-element 2832 1 24.75 AGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCC:1 + chrX 20999752 3' - BS 63 1 60.40 TCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCCGAACAATCGTCCGTCATTTTGCTCCTCAAACGCAATAT:1 + chr3R 12566807 3' - Doc 10 1 77.23 ATNATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGTTAATCTGCATGCGCTGCACGCTTTG:1 - chr3R 8191448 3' - mdg1 7047 2 70.30 AAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATCTCTAATGAAGCCTCCGACATTGTGGCATCGTCAG:1 - chr2L 12815664 3' - Doc 336 1 68.85 TATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCCCCAATTATGTAAATTCGTTTCTTCGATAAGAATTGATTTCGTCCCTTTTTTATTGGTTACTTTTACAGA:1 + chrX 18150961 3' + 1360 3118 1 75.00 GACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTCTATTTTCCC:1 + chrX 158245 3' - INE-1 92 1 75.25 TTNATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGGAGCAGGAGTGCAGGATACCC:1 + chrX 19024746 3' - micropia 181 2 78.22 GCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTGAAAAGGACTTGAGTTTGTGGTGACTAAGAAATAGGGGTTTCCTTGAAGACGATAATAGGCAGAGTAATGC:1 + chr2L 3425686 3' - 1360 3293 1 75.25 ACNATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTGGTGTGGGCATACTTTGAGTGGGCACTGTATTTCAAATATATATGTTTATTACTACTACGTTGGCC:1 + chr3L 15863646 3' + G5A 2748 1 70.30 AAAAAAAAAAGAAAAAAAATCGATGCTGTGAATGCTCTAAAAAAATTTACATTTTCTCTACAATTGCAGGTGAATAACGTTTAAGCATACCTTATAATTGT:1 + chr3R 11902411 3' - hopper 141 2 78.22 GCNACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGA:1 - chr2R 981622 3' - 1360 60 1 67.00 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTAATCCGCTTCCTTGTTTACTGAAATCTAGCTCGCATAATTAAAAGTGAAAAACGAG:1 + chr3R 22208623 3' + I-element 5336 1 60.40 TANGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATCCAA:1 - chr3R 7382624 3' + copia 244 1 66.34 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTGACAATCTTTGTTTATCAAATCGTTT:1 + chr3L 13878105 3' + flea 209 2 76.24 TTAAAGTCGGGTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCATTTACACGACTTCCTGCGACGGACGGGATTCATAATTG:1 + chr2R 8392367 3' - hopper 1256 1 57.14 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATTGCATTTTAAATAG:1 - chr3R 4679262 3' - copia 40 2 67.33 AGNCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGCAACGCCATCAGTGTAATCAACTTGGTGTCGGCAAG:1 + chr2L 21955241 3' + 412 453 2 63.37 AANGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCCTAGTACTACCTACAACATGCGAAAT:1 - chrX 10644833 3' + hobo 2889 1 72.28 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATACAAAACACAAATACGAAATACGAAATACAACATACAGATGTACATACACATACGACACGTGTA:1 + chr2R 9543838 3' + roo 326 2 68.00 TACATAGTATGGGCAGTCTAAATAATTGATTAAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGTGGTTTGTGTTTCCACACAAT:1 - chrX 14771682 3' - BS 4758 1 78.22 TTCCAAATAAAATTAGTTTTTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATAGTAATGCGCAGAACACTTTCGAACTGTGTCCA:1 + chr2R 5202356 3' + roo 364 1 65.35 AGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAA:1 + chrX 21667922 3' - gypsy2 6527 2 60.40 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTTAAAATACATAAAAACAGGGAGCCATTTAATTCCACGATCTTCGTGACATTTGAACTGCAGAC:1 - chr2R 21818953 3' + flea 247 2 70.30 TGNTTGGTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTCAATTTTTTTTCAAAGTGTGCCGAAAG:1 + chrX 18124281 3' - invader2 354 1 73.27 GANGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATTGCATCTATATGTGGCTCGCTTGCGTTTATTTGATTCCTGCATTAGCATTTAAGAATAACA:1 - chrX 9983604 3' + pogo 2098 2 76.24 TGCGAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGAAAAACAATTAAAGAGCTGGAACAGTGTAACAATATTTCACCCAATGGCTTAACCCTTGCCCTTTCATC:1 + chr2L 17635142 3' + Idefix 343 2 65.31 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGAAAATCCACTTCTTTTGTGGAGAAA:1 - chr3R 24461797 3' - F-element 22 1 62.38 CATCCAAATATCTCCAATACTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCG:1 - chr2R 12446060 3' - hopper 50 1 72.28 CGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAACAAAAAAGCCCAAGGAAAAATAAGGAATGAAAAACGTCAAGTACGCGACATGAAAACTA:1 - chrX 18561910 3' + gypsy4 477 1 61.39 ACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATGCGAACGTCGGCCGTTTTTTTTTTTAAAGCCACCACAGGCACCCCCACCAACACACAGGACTGGCAAGGATTCTAAG:1 + chr2L 12772354 3' - INE-1 538 1 83.17 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATAATACGTTAATGTTGCGAAAACCAATTGTTTCTATTTCGTTTGCCTTCTATTTAATTCCCATCGCT:1 + chr2L 1590854 3' - opus 8 2 59.00 AGNCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATCCTGCAGAGAACAATGTGACAAACGATGTGTGAAGGAGTCGCTGCTGCTGCTCAG:1 - chr2L 18223742 3' + roo 406 1 79.21 AATAACAAAAACAACAAAATAAAGAAAATAAAACAAATAATACAAGACTGAAAACAGTCATAACAAACTTGATGAAATTTTCCAAACCAAGCCATC:1 - chr2L 16542398 3' + gypsy11 3933 1 73.96 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATG:1 - chr3R 20373251 3' - I-element 41 1 64.36 CAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCACTTTTTGATTATTCTTGGTAAAACCCGCTTTTACCATCTTCTTCCGCTCATTTCCT:1 - chr2L 18150321 3' - accord 195 2 69.31 TAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGGCTTCGCTTGCATTTACGT:1 - chr2L 12653966 3' - Tc1-2 100 1 80.20 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCATGTGAGTAGCGGGCAAGTGCGTAAGGGACTCGAGATTAGAGATGGGACTT:1 + chr2R 8951078 3' + P-element 2880 2 63.41 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATTGCATCTATATGTGGCTC:1 - chrX 9983647 3' + pogo 2087 1 65.22 TGNAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTAAATAATTGATTAAACTTATACTCTTGTACTCTTTTTGCATTGCATACTTTTAGGCGGCGGTGGT:1 - chrX 14771699 3' - BS 4775 1 61.39 TAAACCTCCCCATAAATCTCGTGTAGCGGCCTAGCAACAGCCGTCTCGGCGTTCCTTTCCGATTTCTTGCCTTTCAGGCCTTTTACGCCGGTGACTTTCAC:1 - chr3R 3904139 3' + gypsy8 4662 2 61.39 ATGAACNTAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCAAGCGCAGGGGATTGTAAATTACCATAC:1 - chr3R 28296391 3' - 412 68 2 70.30 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATTAAATATAGCCTGCACAGGAGTAATTTGTAAAAATGC:1 + chr2L 7393724 3' + opus 463 2 67.33 CCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGCGCAGCTAATTGACCTCTTTTCAGCCAAGCGGCAATTGCACGGCCCTCAAATAGTTGCAGTTGCAACTGTAGCCGCT:1 + chr3L 1259259 3' - Doc 5 1 72.28 ATNAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAA:1 - chr3L 18337661 3' + Juan 4172 1 67.33 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAGTCAATTTTCGTACGATATACCAGACACTTTGCAAAGAATAGCGCCCAAT:1 - chr2L 18177901 3' - 412 21 2 57.73 TTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGA:1 + chr3L 19339422 3' - Tc1 33 1 52.48 GAGACGTACAACAAAACGGCACGGAAAAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAGAGGCACGCAGAAAAAACACACTGAGAGAAAATGATT:1 + chrX 20741600 3' + Bica 247 2 63.00 TCTCAGTGTTAGTCCCAAAGCTAAGAAAATAAGAGCCTTTCAGAAATCACAACAGTTGTTGCAACACCCGGCCAAGGCACCGATCGCGTACAAGAGGTCTC:1 + chrX 2669964 3' + Ivk 236 1 57.43 TTAAAATATTTTTTTTTAACTAATAAAATTCACAAGTATTAGCAGAACAAAATTTTGTTCCAATTATCTTATTACATTTTTAGAACGATACTTTATTGGCC:1 - chr3L 391899 3' - transib1 35 1 73.27 CTNTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTGGTGGCCACGATCGGTGACTATAGCTGAGCACGGCTAAGTTTCATTTGCAATTTTCA:1 + chr3R 31032368 3' - Chouto 436 1 70.30 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAACTCATCGCATCGTGGTACTTTTAAATCCAAAAT:1 - chr3R 7382621 3' + copia 247 1 64.36 CANCTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACACTCCTCTGAGCAGCTCAAAACATGTGTAAGTGATG:1 - chrX 18952056 3' + mdg1 7421 2 62.00 AGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCACACTACTCAAATGTGATAAATCAACCTCATCAAATATGTCAGCCTGCTTCACC:1 - chr2R 3603577 3' + Doc2-element 389 1 57.43 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGGTCGTGGAAAGGGTGGCAAAGGATTGGGAAAGGGGGGCGCCAAGCGTCATC:1 + chr3R 14626086 3' - P-element 24 1 53.47 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAACAGCAGGTCCCTGTGCCTTTCCAGCGAATTTCCACA:1 + chr2R 23411941 3' + mdg1 383 2 66.34 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATT:1 - chr3R 14049330 3' - transib2 15 1 64.36 AGGTATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGC:1 + chrX 19109305 3' + roo 9022 2 70.30 ATNTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAAC:1 + chr2L 6184237 3' + roo 360 2 72.28 TTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCCCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTTTCAGGTAATTTCCACTAATT:1 + chrX 3053715 3' + blood 7127 2 69.31 TGNCCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACAAT:1 - chr2L 6645658 3' + mdg1 379 2 63.37 CCNCTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCACCCACATACTATAACCCCAATAACATTTAGCAGCTTGT:1 - chrX 14040720 3' + roo 8598 1 61.39 TGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTCAAGACTTGGCTTAGATCCCCTCGTAATTGATGCCCCTGCTATTCCTCCGATA:1 + chrX 19810579 3' - INE-1 568 1 58.42 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCCAGTCCGGCACACAACACCAACAATCGGAATAAAACTGAAACAAGCAAGTTTTCTAGCCCG:1 + chrX 6518858 3' - pogo 8 1 73.96 CCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAGTTCAAACAGTGGCAGATATACATAGGAT:1 - chrX 6439248 3' + HeT-A 5948 1 71.29 TTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAAAGGGATTTACTGGCAGTTCCCTAGAGTTCTATTCCATACGCACTTGCTCGGGAATTTGCTGCGGTTTGG:1 + chr2R 15244501 3' - Porto1 4322 1 71.00 TANGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCTT:1 - chrX 6654449 3' - jockey 4760 1 57.43 TGNAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAACATTAACGTGGTGGAGATGAGCTTCAGATGTCAGTATCGTTTTATATAGTGTCTGGAAAAT:1 - chr3L 7061133 3' + I-element 5339 1 62.63 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATTTCTCTCAGTGCTCTCGCGGACAAGTACTGCC:1 + chr3R 28117804 3' + I-element 5314 1 70.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACACATTTAATTGACTACCACAATTGCAG:1 - chr2L 20265972 3' - roo 48 2 75.25 GTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTCCTTTACATTAGTGAAAAATACTTTGGAGAACTGCGAGCCTTACAAAT:1 + chr2R 11676163 3' - Quasimodo 7046 2 54.46 CTNGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAGGACACTAGAATAGTGTCTTTGTTATTACTTTTGCAATAAACAGTTTTATTATTTTTTTT:1 + chr3L 11036367 3' + 1360 469 1 89.11 TACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGATGCGCCAAAACTAAAGAAAATCAAAGTCCAAAACCGACGACAAATCAAATAACGGAACTCGAT:1 - chr3L 21356270 3' - accord 42 2 71.29 GATTATTAAAAAACACGGCAGGGGTGACAAACACAAAATAAAAAACAAACGGCAAAAAAAAAACACCACCGATCGCTTTGAAAAAAACAAAAAAGAAAACG:1 - chrX 5460973 3' - Cr1a 64 1 84.16 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGCACAAGCACTTTTAAAATGGTAAACAAAAGTTGGAATATCTGATTTCTTACAGTTTTAACCGGTTTTGTTG:1 + chr2R 10468667 3' + P-element 2883 2 72.28 GGCTGAGTAACGGGTGTCTGATAGTCGGGGCCAAGTGCGTATCTCCCAAATGTTTTTATTGTTGTTTGCTTTTTTCGTTCTTTTGTGGTTTTCATTTTTCG:1 + chr3L 547065 3' + INE-1 545 1 75.25 TTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTCGTATTAACAGATTGGTCTCATTAACTGACTTCTTTGATGATCTACTGTCTGTGTTTGTGTTGTTGGGAA:1 + chr3L 9990246 3' - I-element 4877 1 56.00 GAACAACGCACGAAACGGAGAGTAAACAAAAGGATTTATAATACCCCAGAAAGTTATATTTGCTTCAGCTTTGTTCCATTTAAAATAAAAATTGCAGTTTA:1 + chr2R 2769817 3' - Cr1a 220 1 58.42 GGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGAAAGTTAGATCGAGTAGCGGTTTTGTTTT:2 - chr2L 4308649 3' - Doc 4541 1 71.29 TANATTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATTAATGTTTTCATATGCCCTGGGGCAGTT:1 + chr3R 31855617 3' - I-element 238 1 71.29 ACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCAAAATGTATCTGGTAATACGAAATAAATACGCAATTTTTAAATTTAAGCAT:1 + chr3R 13349583 3' - Ivk 19 1 60.40 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACAGGACGTCAATGCA:1 - chrX 4806649 3' + roo 401 1 71.29 GCAAAGTTTCTGATTTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTGTTTTTGTTTTTCAATTCATTCATTTTTTTTT:1 - chr3L 2401764 3' - Tc3 1596 1 63.01 AGAATTTTGGCAGTGTGACGTGCAAGGACTTTTCATTTCGCTCCTCTCTCGTGTGTGTTATCTGCATTCATAATTTGTGTTTATTGTTATCAATATGCACT:1 + chrX 12684437 3' - invader4 488 1 73.27 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCGTGGATTGTCA:1 - chr2L 10712108 3' - I-element 24 1 57.43 TATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATCAAAGCAGTAGCAACAAAAATTTAATAAAATCTTACTCGCAAGAAA:1 - chr3R 10449877 3' + F-element 43 1 56.44 ACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACAGGAAAAATGTCAATGGGGCCATAAAAATGTCTGGGAAGCTGGCCAGCCGGATAACTTGGTTTTTCTTTCA:1 - chr2R 6553672 3' - roo 190 2 73.27 TGAATCCCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACCACAGCTCCAGATACAGATACGTTCCCATTCG:1 + chr3L 447362 3' + Tabor 7286 2 64.52 CATTTCCCCAGAAACGCGTGGAGATTCACCGCCAAATAACGGATCAGCAGCAGAAGAGCTGGATGATCTTCTCTGGATCTTCGGGCGCGGGATATAGCTTC:1 + chr2R 16590894 3' + invader3 437 1 60.40 CGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCTACGTGTTACTTGCGATGATTACCCCATTATGTGTCTCTATTGCTTCTAAATGTAGTCTTTACA:1 + chrX 21668023 3' - ZAM 3 2 55.56 GAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTAAAAATACGAGTCTAAGTGATGGGTTCCGTTTTTGTTTAGTAGTGCTCACTAGTGAACGGCCTT:1 - chr3L 12171810 3' - 17.6 7152 2 68.32 CACTTATTCTGGATTTCAAAGCTACAGCAAAGAATATTTTTTGCACAGCTCTTTAATCCTTAGAAAATCCTTTGATGACTGCCAACTTGCCTCTTCAACCC:1 + chr3L 7308277 3' + Doc 4236 1 66.34 AANCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGTGGCTTTAATCCTCAATGTGT:1 - chr2L 9141587 3' + roo 352 2 80.20 TATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATAAGCCGGTAGCAGGGTCATTAGCACACTTAAGATATTTTTTGGCCGCCCAAAACAATTTTTCGATCATATGATCCA:1 - chr2R 4576764 3' - Chouto 226 1 62.38 CCNTAGCTAACCGTAAAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGATATTGAGAAGGCTGTGAAATCCTATTATTCGCAAACGTGG:1 - chr3R 3757380 3' + Cr1a 4008 1 65.35 AAACGTGTACATTATGTTATTAAAAAAGTTATCATTGCAGTTTTATTTTGAAAATAATGTTATATTTTATTCACTACAGTTTTTGGTCTATTTTGGTGATA:1 - chr3L 18265187 3' + S2 1390 1 35.64 ACGAGTAAAAAAACCACCCGAGGCCTGCTGCGCAAGAGCCGTATGGGTGAGTGGACGCACACTCAAGCTGATCAGCTTTGTATGGGCTACAGTTCCGGCTG:1 + chr3R 20049848 3' - hobo 2801 1 63.37 AACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCATATAGCAAAAGCT:1 + chr3L 14638655 3' + 1360 16 1 62.38 TANGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGTGCGGCGGATAGATGCCTGCTGGTCTGTCAATTATGCACTTCCATAT:1 - chr3R 20984177 3' - hopper 28 1 51.49 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACTCGCGTTCATTCTCGTGCTCATCGTCGTCGCTGCTGGC:1 - chrX 18356194 3' + P-element 2853 1 45.54 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATGCCGTCAATTAGGCACCTTGGCATCTATATTTGGCTATAAA:1 + chr2R 12726859 3' + copia 223 1 57.43 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCAAAACACAGAAT:1 - chr2R 4673551 3' + Quasimodo 7364 2 75.25 AANTGCCACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAATAAAGATAAAGAAGTTGCGAGCTGCTTTAATTGAATTGCCATTGAATTGT:1 + chrX 20999762 3' - BS 52 1 46.00 ATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCTTAAATCTGACTTATGAAATGATTTTGTTTTAATCA:1 + chr3L 23883329 3' - invader2 229 2 64.36 TGTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAATATACAGGATTATGTTTGTTTTTTTCCCCCTCCAAAGCTTTTATATTTTTAAAGGAAAGTGAGGT:1 + chr3L 14585934 3' + Tc1 123 1 60.00 ATGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGAGACATACATAGAGAGACGAGAGC:1 + chrX 16478239 3' - Doc 4544 1 75.25 GTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGATAGATGCAAAACGAAACCCCCAACGCCAAAAGTGATGTGCAGCAAATGAG:1 - chr3L 8232405 3' - Circe 7337 2 67.33 AACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTT:1 - chr2R 912938 3' + mdg1 7444 2 64.36 CGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCAATACATATATGTGATGTATGCTTTGTGCCATTGACCACCACATGATGGCACATAAATCCTGGCGGC:1 + chr2R 9199979 3' - G6 1650 1 63.37 TCCACTACAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAACGGACACACTTGATGGGTTGTGGGCTAGAAAAAGTAATAGTTTCCAAACAATAA:1 + chr3L 7334478 3' + Juan 256 1 61.39 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAAT:1 + chr3L 22046487 3' + roo 9030 1 63.37 GCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTGTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGTTGTACGAGCCGAGCAACCGCCTCCT:1 - chr2L 20767743 3' - F-element 311 1 77.23 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTCCCAATGGATTTATGAGCATTAGGTTTCCAG:1 - chr2L 8841033 3' + P-element 2883 2 73.27 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAAATATGGAATAAAAATAACAGACGGTCGAATG:1 + chr3R 30106859 3' + roo 9025 2 74.00 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACTTGTTACGAGGCTCGACGCAAATTAAAGTAAAAGTCCAACTTGAATGATCTCAAGTTTGAGGGCCTTCCGA:1 - chr3L 14208977 3' + Quasimodo 7364 2 75.25 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAATCAAATTTGTTTTATTCCACTTCTTTTTCGCTTTTGCGTTGCTGTCGTTTTTATGACA:1 + chr2L 18214155 3' + hopper 1405 2 69.31 AAAAGGTATCTCTACGAGCAAGACCACCACACCCACTTCGCCAAGTTGGCAACGCTATCAGCTGTTCTACTAGCTCGCGTGATTGCTGCGCAAAGCTATGG:1 - chr2R 4981028 3' + Gypsy12A_LTR 2156 1 71.29 ATTTGAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAACTCAAAATATAGTGTTGTACTTACACCTCATGCGCTGAATTTATGCTCACCAATAAAACAAAACGAGTACA:1 - chrX 8966248 3' + transib2 2637 3 64.00 TTNCCTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGCGGGAAATGCAACCCTTGGGGAACTGGATCCTACAGCTGGGTCGGATCCAATGCACCCGGTTTCCATACTGAG:1 - chr2R 10548089 3' - Doc2-element 245 1 66.00 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTTCAATGTCCCAAATGTATCTGGTAATACGAAA:1 + chr3R 13349555 3' - Ivk 47 1 67.33 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGTCATGTGTCTGACCCTCCTGCGCCCTTTTT:1 - chr2L 9313922 3' + hopper 1405 2 64.37 GACCAGCGCTGCCAGACCGGGGTGCTTTAGCCGTTTACCAGCACCGCTTTCCCAGCTGCTACGCTGCAAAGAATGGGATGTTTTAGATCGTTTCTGTATCA:1 - chrX 22717187 3' - Rt1c 354 1 70.30 AATAAAGAAAAGACAGCACACATAAGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGGCGCCGAAAACCGAAAATACGTATGTACAAACAAAATCGACACCGTTCGTTG:1 - chr3L 19165119 3' + Osvaldo 1447 1 52.48 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCGATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATCTTAACACACTTAAAAAATCAAGCTTTCAATT:1 - chr2L 19644882 3' + blood 7343 2 66.34 GGGTTCAGGGCTGCAATTGACTTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGAGACCAACACACCAGAAGGGTCCGGGTCCGATAAATAATTGCGTACATTTGAACAA:1 + chr3L 6805780 3' - baggins 5312 1 66.34 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGCAACTAACACTCAATAACTGCACTTTTCAGTTTCCTCGAAAGTTGTGCT:1 - chr2L 810251 3' - hobo 27 1 53.47 CGGCAAAAACATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTAGTGACTTTAACTTCGGCTCCCCTATTTT:1 + chrX 393026 3' - 1360 44 1 69.79 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGCGAGGATGCCCACTTGGGTGACGTGA:1 + chr2L 10759952 3' - jockey 58 1 73.27 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGAAAAAATCTTTTAAGGAGAACAGTGT:1 - chr2R 18528787 3' + jockey 4941 1 78.22 TTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACAGTTGAGTTTATTTCGTATTGAGAATTTCGTACTGATAA:1 - chr3L 23869086 3' - gypsy 7022 2 65.00 CGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCGCGAAATTGTGAGCGAGAAATGATTTATGGCCATTGCCAATTGCAGCTGAGCGAGCGAG:1 + chr3R 6930563 3' + I-element 402 1 73.27 CTTTCAATAACTCGGTTCCTCACATACCAGGGTAGCCCAAATGCATGTCGTGCCGCTCGTGATTGTATTACTCTCTCCACCTTTTTCTTCACATAGTTTGC:1 - chr2R 2950855 3' - G5A 2537 1 73.27 AANAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTCTACTTACCGATCGAAATAAAGGTAATCCT:1 + chr2L 4790898 3' - pogo 42 1 70.30 GGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCCTTCCGATGTTTTGTGTGTGCGTTTCT:1 + chr3R 14999179 3' - 412 7244 2 73.27 ATTTCCATTTTTCGACAAATTTAAAGCCATTCCCTGGTCAGTTAATTATTATTTTTTGTGTTCATAGAGTTGCGGCGAAACACGAACACCACAACATAAAT:1 - chr2R 19807853 3' + G4 399 1 66.34 AAGAGGACTTGTTGTGTCCTGCCATTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAGGATCAATTGACAATATAATGGAGATCTA:1 + chr3R 19446314 3' - Q-element 425 2 78.22 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGCCACGTCTCTGGTGTCTGTGTGCGTGTGCGATTG:1 + chr2L 1089613 3' - hopper 41 1 66.34 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCCCGTCCACTTCAACGAAAAATGTCAGCTTTCGAGAGCATTCAAATCTTTC:1 + chr2L 12323060 3' + hobo 2926 1 63.27 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAGACCAATTACATGTGTTATTCGTTAGTAAGTACAAGTATATATTTTATAAATGTTGCTTTTGCGT:1 - chr3L 4091544 3' + flea 5009 2 75.25 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGTGGAACAGTCTGAGG:1 + chrX 364808 3' - hopper 56 1 78.57 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGGGAGGGCGGGAAGTTAT:1 + chr2L 18177979 3' + 412 7516 2 54.46 TTNAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGTAAAGAGGGGGCTTTATAAAGGGTTAAGTAAAGGGGGGAGCTGCTAG:1 + chr3R 8191543 3' + mdg1 393 2 54.00 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGTAAATGGAAAAGAACTCAAGTTGGCGAGCAACCAGTTT:1 + chr2L 10174171 3' + mdg1 383 2 63.37 ATAATAGTAATAATAATTAGAAAGACAGGCTTTTATGCTTGTTATGAACATTTTCAAGTTTCAAACTACAGTTCACCCTAATCTATCGTTGCACTTGTTGA:1 - chr2R 18796708 3' + mdg1 7085 2 53.47 ACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGCATGCTGACCTTGAAGTCGCGCACAGCGGATTAAAGGATTAGCCCCCACAGCGGCATATTCCCCAT:1 + chr2L 8299077 3' + Tirant 8187 2 61.39 AAAGTAATCACGGTGGCTGGGCGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTTCACGCTGGCGGTCGAGGGTTTTTCTTTTTCCGGGGAGACTGG:1 - chr3R 16594882 3' - Max-element 497 1 56.25 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAGATCT:1 + chrX 8422119 3' - jockey 4801 1 66.34 TGGGATTGTCGGTGAAACGTAGGAGAAGTACGCGTTGCTGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTGCTGCCGGTTGCCGTATGGGACTCACATTGGCTTGGGGTTTT:1 + chr3L 19005970 3' - F-element 278 1 69.31 GAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAATGGAAAGTGGAAAACATGGCAGCAT:1 + chrX 22745743 3' + copia 252 1 75.25 CTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 11 1 63.37 AATATACAAAGTATTTTGATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGAGGGGACGAGAGACAGCAATAAGTCTGTCGATCCAGTGCCAT:1 - chr3R 21921525 3' + Cr1a 176 1 58.42 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGGTGGAGGGACGGGGCAAGTGGGCGTGGCCTACCACACGACAAAAACCAAAGCACACACTCACGGACT:1 - chr2L 17269756 3' - hopper 11 2 62.38 TTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAACCGATTCCCGTAAATTCGCGCCCAAATACACACCCTCTTGGTCATGTGTGTTCGG:1 + chr3R 17708861 3' + 17.6 340 2 59.41 AAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCTTGCTGTTGCTGCTGCTGCGGAGATGGCGGCACATTCATTGGAAGACCTAGGAACTCGGCCGAT:1 - chr2R 21005405 3' + jockey 199 1 67.33 AACATAAATATAAATGTGTAAACGCCGTTGTTGTAAGTACTCGCCACAAATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAG:1 - chrX 23291031 3' + 1360 2960 1 74.26 CAAGCCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGAATAGGGAACACCAAGAGCCATAATAAACCAAATTGTGGCGTGTGCACG:1 + chr2R 9203451 3' + G6 1765 1 59.52 CAACATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAAGGAATCTGGCCAAGAGCGGAGCACCGAATGCAATATTAAGTAAATATACAAAACGTTGTCGGCACGGCGC:1 - chr3R 22176973 3' - transib3 28 1 62.38 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTC:1 - chrX 4806683 3' + roo 9030 1 64.36 TCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTCCGGCCGCACTTAACATTATTTCTGCTGCACCAGCTACGAAAATCCACTTCTTTTGTGGAGAAACAACAGAGGC:1 - chr3R 24461787 3' - F-element 12 1 72.28 TTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATAGTATTATTGTGTGTACATGATCCGGCAATAAACGAAAACGTGACCCTGTCAGCATTGTACAAATA:1 + chr2R 12721971 3' - ZAM 125 2 71.29 CTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGCACTATGGGAAGGTAATTATACTCCGCTGCTTGTTGCGCGGTGATTAGTC:1 + chr3L 23183656 3' - 1360 103 1 54.95 CGGTAACTACATAAGTTACCATATTGGTGGCTTGGCAAAACAGGCTGCAATCTGTTCGTAGTGCTGGTTTAGACAGTTCCGTTTGTACACAGTCCAGGCAT:1 + chr3L 7731092 3' + Chimpo 185 1 71.29 CAATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGGCGGTTGCGTGTTATTGTTGTGCGGCTCATTAATATAAGAGTGGATCGGGAAACCGACATTGGCGTACTTCAA:1 + chr2L 8223409 3' - accord 185 2 74.26 CTCTTTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCATCTATAGAGCCACGGCGAATCGCCCCGAAATAAATTCCGAACATATGTATAGGCTTCTGCTGCCCAA:1 - chr3R 30174891 3' - 1360 90 1 50.50 TGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCAATTTGGTAACTCGCGCGTCAGG:1 - chr2L 23372502 3' - gtwin 6917 2 78.22 AAAAGAAAAACAAATGTAACAATTGATGGTCTACACACATTAATTAGCATTTTTAATCACCCGAACCGAAGGGCAGCAAGGTTAGCAGGTAATATGTACTC:1 + chr2L 12500266 3' + invader2 4755 1 56.44 TCCCGCTCTTCACCTCAGAGACTCCTCAGAGACTCTGTGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGGGAAGTAGCCGGAGGATCGGGGG:1 + chr2R 12392475 3' + GATE 8299 2 55.79 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGT:1 + chr3L 10557638 3' - 412 38 2 61.39 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGCATGCCGATGTGCACGGGAAGGGGG:1 - chr3R 28288604 3' + 412 445 2 72.28 ATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCAGAGCCTAAGAGCGAACCACAACCAAAGCAATTAGCCGA:1 + chr2R 22911881 3' + accord 358 2 56.63 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGAACTTTAAGCATTTCCAAACGCCATGTGTGCGTAAGTATGGATTTTTGTTTTTC:1 + chr2L 1691621 3' + Tabor 7304 2 56.44 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGATAGCCCATAAAGAGGTTTATTGTTTGGAATAAAT:1 + chr3R 25634948 3' + P-element 2844 1 34.65 TGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAATGTTTGTCATGTTT:1 - chr3R 9127370 3' - invader3 39 2 61.39 GTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGCATTGGTTGCAATGCAATGTATGGCCGTTACACTTCTTGTATATTTCTGATTAACTTTCTCACTTCTGCCGCTTCG:1 + chr3L 23773452 3' + 1360 3348 1 63.37 TCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTC:1 + chr3L 23678154 3' - Osvaldo 19 1 71.29 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTAATACAATGGAAGAAATATTTAAACAACATTTTCGATGTAGCCTTGTAATCAAATCAGGGGAATATGGTT:1 - chr2L 14365367 3' - blood 7017 2 71.29 AATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGAGATGTTGAGAGCAGGAGCAGAAAAGGGCCCAC:1 + chr2L 9758687 3' + Cr1a 3998 1 79.21 AACTAAGTGTCACAAAGTATGTACCTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGCTTGTCTGTGGGCAAAAATATA:1 + chrX 21636228 3' - Stalker2 7302 2 72.28 AAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTATA:1 - chr3R 4160055 3' + invader2 5101 2 72.28 ANTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGAAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAATGGAAAGT:1 + chrX 22745726 3' + copia 242 1 62.77 AANGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCACAAATTAAAGCGCTTGGAAATTTGAATGAAGATGAAAATGCAACTCTTTTCCCG:1 + chr3R 12571839 3' + Doc 244 1 57.43 AATTCAACGCGGCAACCGCACATTTTGCTTCCAAAATGGCGGTAGCTTGATGGTGGAATCGACCCCACTTTGGGGGGCTGCATGCCCCGAATATCTTCCGG:1 - chr3R 8050943 3' + Chimpo 287 1 48.51 CTTGCCAGTCCATGTTGTCCCGGAGTTGGCTAGTTCGGCATATTGTATAACATCTGCGGAT:1 + chr2L 7790261 3' - G-element 313 1 62.30 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCT:1 - chr2R 544803 3' - HMS-Beagle 36 2 62.38 TGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGTGTATCGTGGTGGCAGGCTTGATAGTCTTATGGTGAAGTGTGTAACGTCCGTTGGTCAGTCCGACTCGCAGGAATACCAG:1 - chr3R 22691523 3' + R1A1-element 4976 1 70.30 ATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGATGGCTAGCGAGTGGAGAAAGAGAGAGCGGCGTGAGAGAGTCGCAATATCAAAAAAAATGAACTTTGAAACACAG:1 - chr3L 7856213 3' - blood 7179 2 69.00 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACGGGCTTGCAGTATTTGCTCACTGTTCAGTTGACAATTTGTCATTCTGTAGAC:1 - chr2L 6645642 3' + mdg1 7433 2 52.48 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAA:1 - chr3R 25277609 3' - 3S18 5786 2 59.41 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGGGGTCCTCCTTCAGGTTACATACTTCCAGTGCA:1 - chr3R 21311274 3' - 1360 43 1 69.31 TGTTAAAGTCGGCTGTTGCGGGCATATACCATGTGTCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAACAACACCTCGGGCGGTGGAAACAAAAAGCATTTCAACTGG:1 + chr3L 12162119 3' - hopper 1258 1 66.34 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATATAATTATAATATAGGAGAAATC:1 + chr2L 14365444 3' + blood 7339 1 77.23 TTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTCCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCAGCTCCAACGAGAGCAACTCCAACGCGAGCAGCT:1 + chrX 6579921 3' - Cr1a 420 1 69.00 AANATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACCATAACATATTCAGGTTGTTAAACCATA:1 - chr2L 4152908 3' - FB 49 1 72.28 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAAGTGAGTGTGTTG:1 + chrX 678864 3' - Tirant 11 2 70.30 CGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATACACACATGCTAGTTGGGTTGGTGGAATGGGGCAGAAAG:1 - chr2L 15173663 3' + accord 141 2 68.32 AATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAAC:1 - chr3L 23933644 3' + Cr1a 176 1 74.26 ACNGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACGAGGCCCAAAAAGACACTTCGGCTGGGTTCAGCTCGTGTTGCTCTGGGTCGTTTTGTATTGC:1 - chr3L 17971210 3' + P-element 2879 2 68.82 CGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGGAAGCACAGACACTCACTTCATACTCGTAGGCACTTTTTTT:1 - chr3L 7606953 3' + invader1 3722 2 65.35 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAGAGCGAGAGCTTTTTGAGGCTAAGCCCACTGGGTATAAGAGTTCGTATATATGGCACTTTGAACTAGCCGAG:1 + chr2L 11764977 3' - roo 8668 2 70.30 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGGCTTTCCAGTTTTGGGCTTAATTGGATGGCCGGCCGTCGGCACTCGCACTAATAATT:1 - chr3L 447295 3' - Tabor 20 2 55.45 AGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATGTAATTTATATTTTCTGTATCGCCA:1 + chrX 1105367 3' - Juan 4119 1 75.25 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTAGGTACTTAAGTAACAGCACTAATCC:2 - chr3R 4971183 3' + 1360 3336 1 78.22 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCCTTTCATGCTGTTGGCCTTTTGCGAAGAATTTCCAAATGTCTTTATCTCGTTCGTTGGCTCTCATTTCCTTT:1 + chr3L 10557670 3' - 412 6 2 73.27 CGNTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAA:1 - chr3R 10030730 3' + BS 5049 1 67.68 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCACTGGAGACTTTTTTCAACCGAAAACCACATTTGTTTTGAAACGAATGCAGCAGGTCGCCGGAGCAGAG:1 + chr2L 8297421 3' - Tirant 5 2 69.39 GTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATATCTATATATATATACTGCATATATTTAAAATATAAATTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG:1 + chr3R 25400123 3' + Stalker 424 1 66.00 CGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAAACACTCAGACCCATTTTTCCACAGCAGCTATTCCAACTTACGCCTTCCATTAATTTTACAG:1 + chr3R 11371291 3' + I-element 5014 1 66.34 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACACACAGTGGCACACATCCGACGAAATCTGCAAAACGCCTTTGGGCCCTCGTCAG:1 + chr2L 2720321 3' + 1360 3182 1 62.38 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGATATCAATATATCCTGATGGTATCTTATTGTTTTAGCACTATTCACAAGACTAGTTAAACTATT:1 + chrX 19030167 3' - Doc 21 1 61.00 AANATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATCTAAAAATCAAGTGCCAAGAAACTATTATTTA:1 + chrX 14040771 3' - roo 40 2 68.32 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCACCT:1 - chr2R 912949 3' + mdg1 395 2 51.49 CAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGAAAGGCAAATGAATCATAAAACTGAAAAGAGAGCGTGGGAGAGGAGGGTGGGGGTGGGGACAGGAAAAGCGTGAC:1 + chr2R 19468188 3' - Cr1a 4013 1 74.26 AGTCATGCGTATAGGGTTGGCACGACAAAAGGTCATAACTTTTCCGTAATTTACCATTTCATTATGTGAACAGTTTAGTAAGTGTAAAAAATGCACAAATT:1 + chr3R 25510739 3' - Q-element 697 1 67.33 AAAGTCCTTTCACATCACACTGAAAAATATTCAGGTTTTATAAACGGGACAATTGCAGTCAAATGCTCCTATGCTGTCCAGTTTTATTCAAATGTATTGTA:1 + chrX 7436887 3' + invader4 478 1 51.49 ATTACCTTAAACAATTCCACCCAAATTGGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGACAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAGACCAGATAG:1 - chr3R 6128881 3' + I-element 4888 1 70.30 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCCGTGTGAGAGAATGGTCCTTAATTAT:1 - chr2L 8649233 3' - F-element 66 1 77.23 CGNAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCTCACACACTTACAGCTAGCTACACACACACACACGTCAGCTGGTTGACATTGCCATCCTTATCG:1 - chr3L 20867417 3' + hobo 2927 1 65.35 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGTGCATGATAGTTAATATGAGTATTAATCCAATTATTTTTCAGCCAAGGGAAAGTTGTAATTTTT:1 - chr3L 12352863 3' - Tirant 8119 2 67.33 TTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGACCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATATATACTTT:1 + chr4 156605 3' - INE-1 145 1 80.61 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATAATTGCGTTTCAATATTATTATTTGAGGGTATGATACAACT:1 - chr2L 5291611 3' - roo 33 2 63.00 AGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTTTTACCTCTTTTACAACGAAAACATTCTATTATTGCTTATGATTCG:1 - chrX 8430606 3' - hopper 1171 1 54.46 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCGTGGATTGTCAACCCCTTCTTTCATCGCTC:1 - chr2L 10712089 3' - I-element 4 1 77.00 GTCTTCTCACTTGGGATTTTACAGCATTGGTTATGTGCTACCCAGAACAGAGTCGAATATAGTAAAAA:1 + chr2R 2594234 3' + roo 9070 1 91.18 TANGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGAAGCGAGAGAGCCGGATTCAAATGAAAA:1 + chr2R 19115577 3' + Circe 7102 1 71.29 ATTGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTAT:1 + chr2L 23295860 3' - micropia 4990 2 58.42 AGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCTACTGATGAAGTTTGTGGGCTAACTTG:1 + chr3L 8966419 3' - Max-element 8363 1 73.27 TCACATAAAATGTGTGCAGAGCTCTACTCAATATAGCAATGTCCTTGCCACGACAATTTCGCTTCAATTATTTGTCTATTGCCTCAGCTCAGCGCCTTAAA:1 + chr3L 13913563 3' - 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412 48 2 74.26 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAGATCTTTTTGGCATTAAATGAGTGAA:1 + chrX 8422140 3' - jockey 4780 1 58.42 ATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAGTGGGTAGTGCGCGTA:1 + chr3L 22349304 3' - jockey 8 1 78.22 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATGTAAAAATATTTGAACTAAGCCAGCCAAAGTGTAAGGACGACGAGCAGCATTGGCTGTCTG:1 + chr2L 9410884 3' - roo 8678 2 65.35 GGAGATTATGTACGTCCACAAGTGTTTGCTGCTTGAAATCGACTGTATCTGTATCTGTATCTGGATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTAAAAGTA:1 + chr3R 30474932 3' - ZAM 350 2 52.48 GTTATTATTATTATTATTACATACATATATATGAGACGAGTAATTAGATTATAAATAATTTAGTGCATTTTGCATGTTTATTTTTGCTATAATTATGAATT:1 - chrX 7675649 3' - mdg1 7053 2 60.40 AGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTA:1 - chrX 22398530 3' + Gypsy6A_LTR 160 1 63.37 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATAT:1 - chr3R 19450189 3' - roo 58 2 52.48 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTACAACGACAATGTGGAA:1 - chr3L 10522029 3' + roo 9041 1 58.42 CTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATTTAAGCCAAATACAAATACTCTCATAGTTATTATACAATAATGTGGGAGTTAAAGCTCCTC:1 - chr2L 11764869 3' + roo 394 1 57.43 ATNAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGTGGGAGTTGTCACCGCTCACTGAAGGAATGCCAAGTGGCAAAGTCCAACGTACGCTCCGTG:1 + chr2R 13382035 3' + jockey 4987 1 35.56 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACT:1 - chr2L 23295813 3' + micropia 418 2 70.11 TCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTCTCTCTTGTTTTTAATAAGTTTGGTGAACCTTTTCTTAAATCATCTTACCACAAAGTAGGCCTGTGTGTT:1 + chr4 184669 3' + INE-1 561 1 60.40 AGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACACTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACT:1 - chr3L 24272067 3' - gypsy11 35 2 74.26 TTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGACCTCACTGCTCATGCCAACACTACTCAGT:1 + chr3L 9159683 3' - I-element 295 1 70.30 CGNATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATAAACTCTGCCCGATAAGTATGCAACGGATACTTTT:1 - 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Idefix 83 2 73.27 TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGAACATATGCTACTATATACATATACGTCAAACTGGTTGCCATTTCTGTGTAAAGAGTTAACTCGTTATGAG:1 + chr3L 14209096 3' - Quasimodo 22 2 53.47 CCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGAGCCTTCAACTCAAGACTTATGGGTTATTACTTTATATGAAACGTGCATTTTTAATCAAATATTGCAAT:1 + chr3R 11104388 3' - Ivk 5334 1 71.29 AGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACA:1 - chrX 15019095 3' - Stalker 7159 4 76.24 CGNATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATATCGTTCGCTTTTTATCACCCACAAATGTTTGTCATGTTTACCTTTTTCCGGAACAATTC:1 - chr3R 9127350 3' - invader3 5205 2 60.40 CAATCACAGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCATCGCCCCTGTCGCCTTGGCCGCACCAGCTCCCATTGTGCGCTCCGCTCCA:1 - chr3R 6691127 3' + F-element 4425 1 54.46 ACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAAACGGAAACTGCGATATGCGAGCTGAGAAACAAACAGACACAAAAAGATAGACAGACGGGGCTGAGAC:1 + chr3R 10984018 3' - Doc 470 1 74.26 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTGCGGGTGTGATGCTATGTATGATGGTGAGAGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACACACATTCACACA:1 + chr3L 4233584 3' - accord 182 2 67.01 TGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCAGGGGGGTTAACATGTGAGCGCAAGCATTGAAGTGCCCTACT:1 - chr3L 5652405 3' - P-element 2792 1 47.52 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGGTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTCATTTGTTTATTTATACAGTT:1 - chr3L 18938895 3' + blood 332 2 75.82 AAATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTATCTTTGAGAACTGTTTTAAACCCCTTAACTACCC:1 - chr3L 23591512 3' - 1360 21 1 94.29 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATCGTGCCAACAACAATAAA:1 - chrX 13640648 3' - P-element 39 1 32.67 AGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGATGGTGATGACGATGATTTACTCTGTCCGTCTGCATGTCCGCCTACTGTGGGTGAGGGCGATTGCTGTGTC:1 + chr2L 21973590 3' - F-element 4323 1 79.21 TTNGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCC:1 + chr3R 12566769 3' - Doc 47 1 62.00 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTTGTTCCGCCGTCTATTCCCCAAAGTTGGGAGGGCGGGAAGTTATTAC:1 + chr2L 18177982 3' + 412 7519 2 51.49 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAACAAAGATATTTAGCTTTACAATTATGTGCAGAATAATCATAGTAGAAAGTGCCA:1 + chr2L 261051 3' + Juan 4186 1 54.46 CTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAGATCAAAATGATCGTTATAAATGTCATCTATATAGAGTATAAAACCATT:1 + chr3L 7299957 3' + Juan 339 1 51.49 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTTTTACTCAATATTAATGAAGTCATTAAGACGACA:2 + chr3L 6442665 3' + roo 9032 1 64.36 ATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGGCTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTGCTTTTGTGAAATTTTAAGCGCCAATTTGGAAACG:1 - 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Juan 4041 1 62.38 GTNGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTATGTACGTAGAAAAATAACAATCACGCAGCCACGCCTTAACTAT:1 + chr3R 23846893 3' + Bari1 1677 1 59.41 AAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTTGCATATGTTATGTGTGTGTGTTATCTAGTTACAAAACGATCTAAAACCGTTTTTGCAA:1 - chrX 22481804 3' - I-element 4998 1 62.38 GAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACGGTGCGGTCTGAGGGCTTTCGCAAAACAAACGAAACTTAA:1 - chrX 14086201 3' + F-element 367 1 60.40 CANTGAACGAGAAAAACAACTAAATCCGATCACAAAGCATGTAGTTCAATCCAATAGCCCCATGTCCCAGCAATATCTTGGGGCTTGGCCTTTTGCGTTAG:1 - chrX 16516662 3' + S2 165 2 73.27 TAATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTAGGTGGGCAGCCAACGTGGCGTATGCGTAATGTTTAGTTGGCAGCCGCTCTTAACCCCCTAAC:1 - chrX 3119263 3' - accord 185 4 80.41 AGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAATGCAACCACGTAACGTTTTGCCACTTTTTACACTTGTCTACAGTATTTTAAATATACT:1 + chrX 2763237 3' + X-element 4455 1 60.40 CGNTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATTAAAACATTTTATTTTTTATTTAAGGCACTCATCAACTAAATTTAAT:1 + chr2L 23181651 3' - 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chr2L 23506305 3' + Max-element 8336 2 56.44 GCNGCACCCCCACATTTAATAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACACACAACAACAACATTGCCATAATGATTCCGATCTTGGACATTCCCGATGTCGCTCT:1 - chr3R 19448161 3' + gypsy3 375 2 58.00 TACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATGTAAGAGCAAACAATTTTCTTTTAACATGCCAAAATAAATGATTTTAAAAGAA:1 - chr2L 21863333 3' - Burdock 17 2 60.00 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATATATAAAGTATATATACGAATTTTTCTTGGTCATTAGAATAGACTGTTATAAAAAAATAATATAAGA:1 - chr3L 20324662 3' - 297 1 2 77.23 GATCCACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGG:1 - chr3R 31045711 3' - INE-1 96 1 72.28 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAAACCACATCCTGGTTTTCCCCGTCACGCCTTAAGTTACCTTTTGCATGGAGCTTTGGGCAATTCCACTGCACTAT:1 + chrX 18353773 3' - jockey 4672 1 77.23 CTTCGGCGCTGTCATTTTATTGTACTTAAACTAATACGCAACAAATGGAGCAGGACGAATGCAATGTGTCACCTTTATGGCGACAGGAAAATGAAATCACG:1 + chr3R 27808839 3' - TART-B 10478 2 77.23 TTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCAGTCTCAGTTTTTCAGTGCTAAATACAGTATGTTCTATTCTTATTGGTTTGGATTACAATGGTGGTTTAGGT:1 + chr3R 30248221 3' - Juan 4191 1 62.38 GTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAAC:1 + chr2L 23295872 3' - micropia 22 2 53.47 AACATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGATAAATTTTTCCTTTGCTACATACATTCGTATATCCTTTTTGCCGCTTTGTTTGTTTGGAATTTCTCA:1 + chr3R 26534627 3' + G5 4685 1 63.00 ATATCCGTTACTAAGCTAGTGTGAATGCGAACGCTAAAAGTGGGCAGACAGATGGATACGGTTAGATCGACCCGACAAGTAATCCGGATCATGAATATATA:1 + chr3R 3322533 3' - INE-1 540 1 60.40 TANCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATG:1 - chr2L 13250362 3' - pogo 28 1 56.44 ACATTAGAATAACAAGATGCGTAATAGGGCATAACACCATTCAAACCATTCAATATAACAGTCGTGCTGAAATGAACTAAGTGAATTCGGCTC:1 + chr2R 4616616 3' + 1360 6 2 69.89 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATT:2 - chrX 19820036 3' - mdg1 7054 2 59.41 CAGATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTTTTTTATAGCAACTCGCAAC:1 - chr3R 772984 3' - 412 7482 2 82.18 GANGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGTTAAATTGTTGCGTTAACCAAGCCAACCAGCTTCGGGGGCA:1 - chr2L 15013942 3' - jockey 4709 1 62.38 ATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCCCACTCGCGTCGGTCTTACACCCACCCACCCCATTGGGAAGCACCTTGTGTGCGGCT:1 - chr3R 6041538 3' - R1A1-element 5331 1 59.41 CANCTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGGGGCCTTTATGGGTTATGGCCATATCAAATCCATAGGGCAAGACCAGCCGGCTGGATTCAA:1 + chr3R 16107760 3' - McClintock 266 2 59.41 GCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAGCCGCAAATTTGCACGTATCCCAGTCGGTATATGCAAATGAAAATCAAATAA:1 - chrX 14505764 3' - pogo 22 1 49.50 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCCTTTTCCATTTTGGCTTATG:1 + chr2L 12283998 3' - 297 53 2 79.21 CGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGAACTGAACATGAAAATGTAACTGTAACTGAAACTGAAGCCGAAATCTCAAGCGAAGCGTTATCCGT:1 - chr2R 14045000 3' - 1731 4487 2 74.26 TGNATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGACCCACTTTTATGCATTGGACGG:1 + chr3L 12230767 3' - jockey 64 1 78.22 TTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCACGTGTGAAAAGCATGGAAGTGATTGTATAAGAAAGATGATAGAT:1 - chr2L 1893085 3' - F-element 4209 1 55.45 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACCATTGAGATAGATTGCAACAGCTAATATACCCCAACTC:1 - chr2L 8841063 3' + P-element 2853 1 45.54 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTACGGCGGCTTTCTGTCTCACTTGGTCATGTGTCTGACCCTCCTGCGCCCTTTTTGGCCAATGTCTATGCTCCAT:1 - chr2L 9313902 3' + hopper 1411 2 73.27 ACNCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCAATATATTATGCTAAAAAAAAAACAAAAGTGTTGCCTATTTTTCGGGGCTAATATTGATAACCAGCTGCT:1 + chrX 6509851 3' - jockey 13 1 64.36 CTTGCGACAAAAGGATATAGGAGCCAGTATACAAAAATGGAGGAAACAAATTATATATAGAGTATACACAGTGTATTGAAGAAAACAGAGCAAGCTAAGGG:1 - chr2L 13866024 3' - Gypsy12A_LTR 2094 1 51.49 TGTGCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAATCGCTGTAAAACTGACTGACTTTCGAGCCACATTCACATGTATTTTTGCCCGACGGTGGTGGTGGTG:1 + chr2L 14034555 3' + X-element 4340 1 73.27 CTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAATGTATAGATTGCAAATAAAATTTGCCAATAAGTTGCAT:1 - chr2R 16529850 3' + F-element 493 1 62.38 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTGGTATTAATTCTTCTTATTGTTCATATCCATTCATCGTTTATTTGTTCCACATGCAG:1 + chrX 19959897 3' - roo 8681 2 63.00 ACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCTAAT:1 - chr2R 2949019 3' + 17.6 7410 2 72.28 AGCTGTTGCGAATAAAAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACGGCCCATTTTAGTGCATTCTGAGTGGC:1 + chrX 1751844 3' - diver2 4871 2 76.24 TATTATGTTCGTATATACTACAGTATAATTTAGCATTTTCAGTTTAATTAGCTTAAATGCTGGAAAATCTTGATTCACCGCTTTTTTTCCCCCTATTTTAA:2 + chrX 18952149 3' - mdg1 7039 2 74.26 TTTTTGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTTCCTTACATCTTCAACGAAAGTTGGTTTGGCCTCAGCTTGGAGGGGTCGAATGTGTTGAAC:1 - chr2L 5181255 3' - I-element 379 1 61.05 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTAT:1 + chr3L 11257424 3' + 1360 3382 2 72.28 TTTTGTTTTTTTTTTTATGTAGATCTGAATTACCAATCCTAAAATAAAGTGCACCTTAAATTTTCTCTTATATTCACATCCATCTGCTTTTGGTCCGCCC:1 + chr3L 13190712 3' - G2 3074 1 71.00 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCTTTGTTGTTAGATAAAAGTTCGAAATGAAAAGCAGATGTGCCGTGGATTGTCAACCCCTTCTTTCATCGCTC:1 - chr2L 10712089 3' - I-element 5 1 76.24 TTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTTGGGTAAGTCCGCCAGTTGTTTAATTTCGTTGGTAATTATTTATATAGGCAGCGATGGT:1 + chr2L 21968500 3' - I-element 4950 1 63.37 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATTAATTGCGAAAGTCAGTGAGATTTTCATAC:1 + chr3R 27452380 3' + roo 9027 1 74.26 TANGAACTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAATGTCATGTTAACAGAGCTACAGTCCAGTGTTTTATCTTTAATTTAAA:1 + chr3R 6031581 3' + hopper 957 2 60.40 TTCCGTTCACGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGACTTGTACTTTGGATTTCGTTAGGAAATATATGGAATTCCAAACTTTTT:1 + chr3R 25867923 3' - opus 7352 2 52.48 AGNTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTAATCCGCTTCCTTGTTTACTGAAATCTAGCTCGCATAATTAAAAGTGAAAAACG:1 + chr3R 22208621 3' + I-element 5334 1 58.42 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATAGTGGTTTTAAGTCGAAAAAAATATATCCAAGTTTGAGTTATTTTTATG:1 + chr2L 20266025 3' + roo 9040 1 58.42 CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTAGGCCCAAGAGCACACACACACAC:1 + chr2L 9313978 3' + hopper2 1555 1 74.26 AAGGTATGACTTCGATGAGCAGGATGTGAGGCCTTCAGTGTAGGCCATGAGGGCTACTCCTCCTCCTCCATTCCTTTACTATTTCCTTGTCTCGAGAACCG:1 - chrX 19820625 3' - 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Quasimodo 39 2 58.42 AGNGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTCAACTCTTCTCTTCTCTCCACGCTTTCCATGCAAATTATTGTAGCCCACTTT:1 + chr3L 12991096 3' + hobo 2938 1 70.51 TTATCACACACACACACACATACACACTCAAACACATACCGTCGCAGTACACACCCACAAGGGCACACAACAAGTGGCAGG:1 + chr3R 21968028 3' + accord 182 2 50.62 ATTCTTGATCAGGATCAATGGCCGAGTCGATCTGGCCCTTTTCGTCTGTCCATATGAAAGCCTCGATCTTAGAAACTATTACTGCTCTAGAGTTGAGATTA:1 - chrX 22511269 3' + INE-1 86 1 66.34 CGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGTTCAGGTCGTTAAGTCATTTCTGGCTGTTCTGATTGCAGCTTCCTATAAGAAGGTA:1 + chr3L 8378776 3' + invader2 4781 1 58.42 ATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATT:1 - chrX 2082625 3' + Transib-N1_DM 446 1 90.62 CAACAAGAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCAATCATTCTAATCGCTTACCATTCAAACTCAATTG:1 + chr3R 26031894 3' + F-element 424 1 63.37 AAGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGAGATCTGATTCTGCCTGGCACCCGGCTTGGATTAACAGTGGGCGACTTTGAAGGTC:1 + chrX 1336583 3' - Chimpo 249 1 64.00 ATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGAGTTGGAGCACATGAATTTGTACATGGCAT:1 - chr2R 13375104 3' + Ivk 4976 1 70.30 TGATCCTCCCTTTCTAAATTATGTGAGAGACTTATTGCCAATCAATCTAGCCAGATACAAAGATACACACTCACACTACCCCTGCTTCCTGGTTATGATCA:1 + chr2R 16617343 3' + Helena 202 1 61.39 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAATTTGGCCTATGACAATACAAACGCACTTTCTTCGCTACGCATTGTCCAGGTGCGTGTGCGTATAGAGAGAGCGAG:1 - chr3R 7886084 3' - jockey 9 1 78.22 TATATAGTTTCCAGTGAATCTATCAGGAATCGGGACTGTTAACTTCACCACGAATGAGCTTACAAACATAAATCGAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGG:1 - chr3L 2317259 3' - Cr1a 4117 1 65.35 TTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCAAATGTATCATCATTTTACCAAGAACTGTGCTCCTCGACTTTTGGATACCCATAGTGGGTGTGCGAACGAGA:1 + chr2R 4387362 3' + diver2 126 2 78.22 AATTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCGTTGATTTGCGGCGCCTTCTGTGACTCATATTTTGTTTTTCTTATCCTTGTTTTTTTTT:1 + chrX 3034052 3' - Tc1-2 214 1 58.42 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCTTATAAATAGTCAAAGTTCTAGAATCT:1 + chr2R 17077882 3' - Tirant 8157 2 75.25 TTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAGTGGCGAGCGGCAGCCATTTCCTCTACGGTGATTACACAGGGATGGGTGTCTAGACGAG:1 + chr2R 6634128 3' - 17.6 355 2 65.00 AGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAATTCTGCACCTGTGGAAATG:1 + chr2L 23084404 3' + accord 7360 2 55.45 CCCACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCCCTACCTCGTCTAAAAACCGGACCCACACACTTTACACGGAAGGACATTCTCAAC:1 - chr3L 22956531 3' + F-element 410 1 56.44 AANCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAATTTACCAGGTATGAAAATCGCAACGAATGCAGGAAGAATGCTCCAAATGTCTAGAGCCTGCA:1 - chrX 13789752 3' + FB 297 1 70.30 TTGAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATAAATTGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1 + chr4 1294992 3' - HeT-A 6059 2 80.20 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACCACGTTAATGTATTTCAGACTGTGTGTGAGGTCTGGGTT:1 + chr3L 7061201 3' - I-element 38 1 60.40 TCTTCTAGCAAAACACGCAAACACATACGAGTTCTCATCTATTGTTTGTACTCACACCAACAAGCAAATTTTATTTTTAAATTTCTT:1 + chr2R 17262783 3' + 1360 3207 1 81.61 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTGACACGGGGCGAGTGTGCCACCAAAGATGCACAAAAG:1 + chrX 5649456 3' + S-element 1715 2 78.22 ACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGTGTAATCGATTATGCCAAGTACAATTGGGATTCTTGTGAGGTAAGGAATCTTTTTAGG:1 - chr2L 7229635 3' + F-element 4258 1 69.00 TTTTTTAAATCAAACTGTGTATGTGGTTTTTAAAACAATATATATACATAAATGAGTCGGAACATGAATGAAATCTGAAGGACAACTGAGCAAGCAGTACA:1 - chr3L 11311695 3' - transib2 2625 1 82.18 GAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGCCATTGCTGTTTCTGCAGTTTCAATTGCTGTTTTTGTTTTGCCTAAC:1 - chr3R 8398196 3' - 412 7537 2 52.48 GCCTTCTTTACGATCTGAACAGTCAACGCATCAGTTGAAGCGGTTAAGTGACTAATTTATGGCCTTTTATGTAAGCCAAAGCAATAATACTGATTCCACAC:1 + chrX 5036532 3' + gypsy12 249 2 74.26 ATTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTT:1 + chr2R 16880920 3' - 1360 9 2 78.22 TTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGG:1 + chr3L 5662675 3' - jockey 388 1 73.27 AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATAATACGTTAATGTTGCGAAAACCAATTGTTTCTATTTCGTTTGCCTTCTATTTAATTCCCATCGCTGTTA:1 + chr2L 1590858 3' - opus 5 2 62.38 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATATGCCACAACAATGAAGCGA:2 + chr3R 19947418 3' + roo 9037 1 59.41 TCNTCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTAAGCACCTAAAATTTCGCTTTCA:1 - chrX 364785 3' - hopper 51 1 71.29 TGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCGCTGTTGCATGCAAATTTCATGCATAAATATGTGAAATTTT:1 - chr2L 7163739 3' + blood 86 2 62.38 TTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAACGCACCTCTTCCCCATCCTGCAGACTTCGCTATGTCCTTTGATGCACTCCAAGAAAATATT:1 + chr3R 10492589 3' + Quasimodo 6976 2 64.36 TTACTCCTCCCCCCTCCCCCCCTCCCCCCTTTCTCCTTCCTACAGACAGTTGTTGTTGCCGTTGGTCAGGAGGGAATTTTC:1 - chr2L 12306610 3' + accord2 220 1 80.25 TTNAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTATACAACCGTCGTAAAAGTTTCCATTCGAT:1 + chr2L 8841118 3' - P-element 41 1 41.58 TCAAAGCTTGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTTTATGCCATTATTGATGCTTCGCAAGGCAATTTAATTTCATCGAAGGGTAGGGTGCA:1 + chr3R 11259995 3' + Idefix 7074 2 60.40 ACACATACACACACACACACATGCAGCGAGTCCTTACGCTCATGTGTGTGGGTGTCAAAGTGACAATAATTTTGTCTTTCCCTGCCAAGCGAAGAGACAAG:1 + chr3L 6687505 3' + Quasimodo 33 2 63.37 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAATCGAATCACGTCCACTTCAA:1 + chr2L 12323023 3' + hobo 2890 1 77.32 CCTTTTCGCTATTATATGATGGTTGGGCTTGGGCTTGAAGACCGAACTGAATTGGGCGGGCTGGCAATTAAAATTACCAACGGCAGCACCGACTGGCGCAT:1 - chr2R 20420573 3' - Porto1 89 1 69.31 GANATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGAAGAGCAGTGCACAGCGGAGCGGACGGTAAACACAACTAGAAAAT:1 + chrX 15048976 3' + accord 7018 2 55.00 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAACTATTAT:1 + chr3R 13437242 3' + hopper 1395 1 59.41 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACT:1 - chr2L 19845923 3' - F-element 62 1 73.27 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGTGCATGATAGTTAATATGAGTATTAATCCAATTATTTTTCAGCCAAGGGAAAGTTGTAATTTTTGC:1 - chr3L 12352861 3' - Tirant 8117 2 69.31 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTACAGATACCGTTACTTTGGCAACTGCACTACAACGACAATGTGGAAA:1 - chr3L 10522028 3' + roo 9042 1 57.43 TTNACAGTGTCAAATCTGTGAAAGCTTGGAGTTGTTTTTCTCTTTCATTGTTAATAGTTTTGTTATTTATTGAAGCAATGTAAAAAGTTTTGTTTTCCCCG:1 - chr2L 2506634 3' + S2 1516 2 60.40 GTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTACGATCAAACTGCTGTGTCATGCACAATACTCATCGTATA:1 + chr3L 18401517 3' - I-element 400 1 60.40 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCG:1 + chr2R 11164489 3' - roo 32 2 63.37 AGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGTTCCTCAGATAACAGGTGGCACTTTTCGTCGCACCCGAGTTAAACTC:1 + chrX 17388275 3' + Quasimodo 240 2 55.67 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACCACTCACTCATGAATGCATTTACATGGCCCGGCTTCAACTTGGCCGCCGGCGAGGCTAAAAGCTTCGG:1 + chr2R 15578332 3' + mdg1 7449 2 68.32 TCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCAATCGCATCTGGAGGCGGAGCAGCAGAAACCGAGGCAG:1 + chrX 2677256 3' + opus 84 2 57.30 GAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGAGCAAGAGACTCGAAGACTGCGAGTCCGACTTACATATGCTCGTTATTCATAAACTTAATGCCAAA:1 + chrX 4822883 3' + micropia 5307 2 69.31 AGGAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCACAAAAGCTGATATCAAAACTATTGCATTTTAAATAGTGCCGCATTTA:1 - chr3R 4679251 3' - copia 29 2 54.46 ATATTCAAGCGGGATCTTTTCCCACTCTTCGACTATCGCAGCCATGAGTTGTGTGTGTGCCAACATGTGGGTGGGTGGCCCCAAAACTTTCTCACCGAGAC:1 + chrX 12053019 3' - S-element 1339 1 51.49 TTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCTAATATGTAAGCAAGCACTTTATATGGAATACATTTTTGGTAAACTACCCTTGCACCATTATTCTTATTT:1 + chr3L 20945726 3' + 1360 3105 1 76.24 TCGAAGGGAGGAGACTGATTCAGTGTAGGTCCAGTATTATGTATTGATTTTTAGCAAGCAAATTCCTTTTTAAATAACTTTGCTAAAATACTACATAAAAT:1 + chr2L 12286068 3' - BS3 440 1 31.68 ATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCTGGGCTCTTGGGGCTAAAACGCTCTCATCTCCAGATGGAATTT:1 + chr3L 6017692 3' + 3S18 5868 2 59.52 CTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGAGTTTTCCTTCTTTTTGATTGTTTCTCTGTGGGTTTTTGCTTTGTTTCGACTGTTGTTTATGGACA:1 + chr2L 9969800 3' - Porto1 225 1 71.00 TCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGCCGTGGCAGCTGTCAGGAGTTTGGAGCCGGTTCTTCAGGTTCATT:1 + chr3L 12352493 3' - Tirant 209 2 55.45 ATNAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAAGGATAACTCATCTGTAGTATGCAGTATCTGACTTTCGGGCTTAC:1 + chr3R 27539239 3' + Burdock 228 2 54.46 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCAGCAATGGATTTTTCGCGGTTTTTCCGGGTTG:2 + chr3R 17674374 3' - blood 46 2 73.27 GCTCAAGTTTTATAACCTGGCAGCAATTTTTATAAAAGCAATATTCCCTAGCCACATGCATCCTTACATATACATATGCACTAAACCTAACCCATATTCAT:1 + chr2R 14042295 3' - Cr1a 474 1 67.33 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCCCCTTTTTAAAACCGATTTC:1 - chr2R 17077849 3' + Tirant 369 2 73.08 CGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTATTAGTTTC:1 - chr3L 27182007 3' - F-element 269 1 68.00 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGAT:1 - chrX 7583194 3' - I-element 22 1 57.00 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGCTGCTACTTTCTAATTATTATTTAACCCATACTTTGCATGCGATTATTATTTTTGTGTTA:1 - chr3R 17674303 3' + blood 7373 2 60.40 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTCATGCCGTCAATTAGGCACCTTGGCATCTATATTTGGCTATAAATCA:1 + chr2R 12726862 3' + copia 226 1 54.46 GCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGA:1 - chr2R 5206897 3' - Doc4-element 22 1 62.38 ACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTACACAAATTGAATAAATGTAGTTTCAAAGTGTACTACCTCAAAGCGATTCATTCCTCAGATAATTGTCC:1 - chrX 21636157 3' + Stalker2 7643 2 66.34 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATAATTTAGCATTTTCAGTTTAATTAGCTTAAATGCTGGAAAATCTTGATTCACCGCTTTTTTTCCC:1 + chrX 18952139 3' - mdg1 11 2 64.36 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCGGATTAAATTGAATATACAATGTTAAGGCAATGGATGAAAAAAA:1 - chr3R 22208550 3' - I-element 33 1 55.45 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAAGTGAGTGTGTTGC:2 + chrX 678865 3' - Tirant 10 2 71.29 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTATTATATATTATATTTTCTGTAAAACT:1 + chr3L 24131148 3' - HMS-Beagle2 6928 2 71.29 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTT:1 + chr3L 22349255 3' - jockey 57 1 68.00 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCGCCACACATTTCTCATTGAGTGCGGCTATGCGGAGTACGAGTGCTTGGCACAAGTGAGTGTGTTGCTG:2 + chrX 678867 3' - Tirant 8115 2 73.27 AGCTTCAGTACTTGCATTGGCCTCTCTTTGCTGCTCGTTGAATGTGTTAGTGCGCATTTCAAGGATGGCAGGAGTTTGTCTGCGTTGATGAAGCCACGC:1 - chr2R 8377940 3' - gypsy7 5266 2 55.56 GAGCACNTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCCGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTTTCAGGCGAGGCA:1 - chrX 8922317 3' - jockey 23 1 60.40 CTCGCGGACAATTACAGCGGTGCGATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGATGAAGGAACAGACTTTCGCCGAATGTGAAATAGGGTAACTCAGCT:1 - chr3R 17410053 3' - 3S18 115 2 60.40 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGCGTTTCAAAATGTGATACAATATGCCACAACAATGAAGCGAGTCGTGCAGC:1 + chr3R 19947428 3' + roo 9047 1 54.46 ATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTTGGCCGTCGTTAGTTGTGTTTTGTGCTTCCTACTTTCAAGAGCTCAGCAAAAATGCTAGCTGCTT:1 - chr3L 5592206 3' - Idefix 6933 2 65.35 CCNTAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGG:1 + chrX 4448599 3' - 412 7092 2 62.38 CAAAAGGATGATGGAGAAAATGAACCGAACGATTTTAATTGGGTCAATTAATTGTTTTCCGCTCGCTCTAGGGACAATTTCTTTTGATTTTGAATTTTTCA:1 - chr2R 7944863 3' + G2 195 1 71.29 TTTAGTACATAATTAGATCCTACTAGCACTAATATTTAATACAGTAATTTTACATTATATTCATTTCCCCATTTCGCTGCCATCCTAATCCCCTTTACCAT:1 - chrX 13876403 3' + Cr1a 4279 1 67.33 ATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTATACACCTGTGTTTCGAGTTGATAAGAAAAACCACTCGTGCTGTTTATGACATTCACCCCTATTATTGTAGAAT:1 + chr3R 31131749 3' + Transpac 4820 1 74.26 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGAGCAGTGATGGGTTGATGTTCAAAGGGGGTCAGCAAAAACATATTGCATA:1 + chr2L 17205260 3' - hopper 23 1 59.41 CCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:2 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 21 1 73.27 GATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATCTGTGTATCTGTGCATCCACAAGTTCGAGTATCTTGTGTT:1 + chr2R 19266046 3' - Stalker4 7097 4 58.33 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTTCAATTTCGTTAACCATTATTGAAGTG:1 + chrX 6620700 3' + I-element 5307 1 75.25 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGGGTACAGTCTTATATTTATTGATAAAGTACAA:1 + chrX 22218669 3' + roo 9027 1 70.30 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATATCGAAATATGTAATAATAGCGTATGTAATAATGTATACGTATTTCATCCTATAAGCAGGCAACCTTT:2 + chr2R 4900379 3' - Doc 22 1 48.51 ATNGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAATCCTTGGATTTGTATTTGTATGCGTGCTGGTGTGAGTGCGAG:1 - chr3R 19560882 3' - hobo 31 1 53.00 AATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATTGGACATTGAAGCAAATGGCACCATTTATGACGGTTATAAAGAGATTTAG:1 - chr3R 13349505 3' + Ivk 5349 1 48.51 TTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTAACCTTCGCATTACTTCGAGTATTTTGTAATTCAGCTTATAAATTTGATGTCTAAATTAG:1 + chr3L 8654552 3' - I-element 452 1 58.42 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATT:1 - chr3L 22920402 3' - 1360 54 1 79.21 ATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTTAACTTTGCTGGTGGA:1 + chr4 1294989 3' - HeT-A 8 1 80.20 TGGGGGGTGGGGGGGGGGGTGGTTACTTGGACCAA:1 + chrX 19790902 3' - accord2 225 1 74.29 TCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGCCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCATGAAATCTTACACCAAGAAAAAA:1 + chrX 11794398 3' + R2-element 3264 1 76.24 TAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGCCAAAGATCCAACAACAATGGATA:1 - chr2R 20411887 3' + Quasimodo 7327 2 74.23 TTGGAANAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCAGGGTCCTGGACGGAGAGAGAAAATTCAGTTTGAGATAT:1 + chrX 21332377 3' + flea 405 1 66.34 CGNATATAATAATAAAAAAGAAACTAGAACAATTGGTGATGCACATTTTGACTCCCTTGCACGTATAATCCCGATAACTTTGAGATGATTTTGCTCACATT:1 + chr3L 22984983 3' + Rt1a 5068 1 67.33 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCGCCATTTCGCCACCCACCTGTGCAGATTGAACAGGTGAAATGTTAATCTGCATGC:1 - chr3R 8191461 3' - mdg1 22 2 57.43 ACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAATGGCCCGTGACCGTGCTTGTGGGCGGGAAAGTCGGCGGA:1 + chr2R 12973766 3' + mdg3 137 2 60.40 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCAGCCGAGCGGCGGCAG:1 + chrX 18356234 3' - P-element 56 1 23.76 GAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAACCCTTACGGCACCTCAGCTGTGAAACAATATCACTGTCATCTAACTCAACTTTTTCGC:1 + chr2R 4901232 3' + Doc 53 1 61.39 TTATTATGTTCGTATATACTACAGTCCAGAAGAATTACCCTTATCCATTCCATGCTGGCCACTATGTCAGGTGCCAGTATGGAGCTTTAGAGATCATATGC:1 + chr3L 9076665 3' - mdg1 2 2 73.27 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACCCGCAGTGAGCCGTTAGCAGCTTTTGGCCATCTCTGATCTGGTGCAAATGGA:1 + chrX 19109329 3' + roo 9046 1 52.48 CACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATTTAATGTATTTATATTTATTTGAATTCTCTTCACGTTGTTTTGGCAGTGTCCCGTTATAGTCTAGTATTTTGTTT:1 + chrX 11728927 3' - diver2 474 1 61.39 AAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGC:1 - chr3L 25497422 3' + gypsy8 126 4 76.00 GAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGACCTACGATAATATGCTGGCGGGACCGCAAAATGTGTCGTGCCTTCAATATTACCTAATGTCAGC:1 + chr2L 22737398 3' - Cr1a 4182 1 67.33 AGGAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAGCTTCCACTTCCTAGGTGGAAACTGTACAAATTAAATTTAACTCTTGCTCAAATGCCTTACGGAAATTGTCTCAA:1 - chrX 20464261 3' + INE-1 550 1 68.32 AGNCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTCTCCGGCTGGAAAGTAAGCACTGTGGGGGTT:1 - chr2L 8297301 3' + Tirant 391 2 71.29 ACNGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGCTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCGGTACAGATTGTAAGGCGAGTCCAGCTAAAAATGAA:1 + chr3R 19240894 3' + R1A1-element 5063 1 61.39 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTGAGCTGGGGCATTGGCCAGTGAGTGGGTTTGTGTAGACCCCTT:1 + chr3R 24430592 3' + Transpac 279 2 56.44 CGNCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATCAACAAGTTCACCAAACCGAAAATTTCCAATACCAGC:1 + chr2R 2949109 3' - 17.6 6962 2 62.38 CANACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAAGAAATAAGGCCAATGGGTGTAGTATCTGAACAAAACGATAATGTTTGGGACGTTGGAGTAGACACAAAAT:1 + chr2R 1727371 3' + Stalker 7204 4 77.00 ATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATTTCTCGTTCGTTCTGTTTGCCGTTCTTATTATTTATCCCCATTA:1 + chrX 1249789 3' + rover 12 2 56.44 AANATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAGCCTTACCTTATGGGCCTCAACCTCAAGTCTTAGCCTTAAACTTCCTCGTCGTTAGATGT:1 - chr2R 544780 3' - HMS-Beagle 13 2 66.34 AAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAAGTGAAAACAAGAATAAAAAAAAATGTTTAAGTACTTAAGTTGCGC:1 - chr2R 14641877 3' + gypsy4 451 1 77.23 CTNACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGTATAAACTTTAAGGTGGAAAAGTTTCGGCCAGGTGGGAAAAAGGACCAGGA:1 - chr3L 1698547 3' + roo 9047 1 54.46 ACCAACACACACACACACACATACACGCACGCAACACACACACACACACACGTACAGCTTGACATGCATGTAATTTGAGGATCTGTTTAAGAAAGCAGAAG:1 - chrX 10236935 3' + accord 7027 2 56.44 TCTGTGTATCGTTTCGTTTCGAATCGTTTCGTATCGTTTCGTATCGTATCCTTGGCACTGCTCACTGAAGCGCCTCCACTCAACTGAGCAAA:1 + chr2R 15640717 3' - Doc 4399 1 65.22 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTGGGAGAGAGCGGCGGCTACAACAAAAGCAACACCTGCGAGCAAA:1 + chr3R 24006961 3' - P-element 17 1 56.47 TTTTTTTTCTTTTTTTTTGTAACTTTACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATGCATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAATACA:1 - chrX 13590504 3' - gypsy7 5003 1 81.00 ATGACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATCAATATATTATGCTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 21928661 3' - jockey 61 1 77.23 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTGTCTAATGGCATTGCATCTATATGTGGC:1 - chrX 9983649 3' + pogo 2053 1 78.22 TAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGCTTGTCTGTGGGCAAAAATATATTTCGGCTAAAAAGTAGGCAATACTACTTTTATCAGTTGATCCAAGACTTTGG:1 + chrX 21636281 3' - Stalker2 1 2 74.26 ATTAAATTAAATTTATTTTTAATTACTCGCTGTCTCTGCTAATTGATAAATCTCCATTGGCCAAAAGGCAAAAGCTCAGCACTCGATGGGCGGCAGTTGC:1 + chr3R 23470879 3' - NOF 3957 1 74.00 TAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATATTCTAGTGTCTTTGGTATTAAACTTTGATGCCACACTTTGACTTTACATATGCGGACAAAACCCC:2 - chr3L 27613476 3' - 1360 52 1 65.35 TGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGTAATTGGACTGTGGTTTGTTGAAAGATGTGGGTTAT:1 - chr3L 23245601 3' - I-element 5042 1 69.31 GTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATAAAAGAGGTCAAATAACTCT:1 - chr3R 19734077 3' + I-element 5303 1 76.00 AANAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACATACACGTATACAGACACACATGTACCTACTTAAAAGCGCACAAGCAGCACTTAACCCAAATCA:1 + chr3R 20215029 3' + hopper 1407 2 71.29 AAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTGTTCTTCTGTCACCTGCTTTATTTTGTATCTATTCACATAATGCCACAAATTGGGATTACGCCTAGTTATTAGT:1 - chr2R 18076870 3' + Gypsy12A_LTR 2012 1 61.39 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATATATTCTAGGCCCCTTCATGAACTAAATAAT:1 + chr3L 8657019 3' - pogo 39 1 70.41 TTTCCCGACTACCAGATACCCATTAAGCAGCTAAAGGAAGTGCTGGGAGTATATTTTAAACTTCTTCGTCATTTCTAAACCAATTGGCAAGAGAAATAAAA:1 + chr2R 7316172 3' - INE-1 555 1 87.13 TCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAACAAAAAATATATATTGATAAGCACGGGCATG:1 - chr2R 13746016 3' + G6 1973 1 69.31 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATGTGCAACTAGGGCTAGGGGTTAGTTGCAACAAACA:1 + chr3R 17666071 3' - Transpac 4924 2 75.25 AANTCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCT:1 - chr2R 5485056 3' - 1360 21 1 58.42 ACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCTGAGGGTTTCCAATTGTTAATGGTGCGGTCCAAGTAGTGCTCTGTCGCAGGAATTA:1 + chr2R 20592770 3' + F-element 4479 1 59.41 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACACCATCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCGTGAGAATGAGTAACCA:1 - chr3L 14638603 3' - 1360 21 1 60.40 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATGTGATTCACTCAGAGCTGACTCATTAATTGAGACCGGTACTTATCCGTGTTAAGCG:1 + chr3R 7761331 3' + flea 4997 2 63.37 GAGAGCGAGAGGAGAGAAGTAGAGCGCGAGCAGCCGGTGCACCACCACAACCACCCACCAACGGCGAGCCAACTGAATAGAGCCACAGCACCGGCGCCACT:1 + chrX 8209614 3' - Max-element 101 2 72.28 TAAGAGAGGGCGTGGTCGGACAGAGAGTGAGTGACAGAGAGGGAGAGAGAGTGAGTAGTACAGATTTGCCTTCCTCGTGAAAATTATTGTGAGCAAT:1 - chr3R 19015528 3' + transib2 2706 1 78.35 GAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAA:1 + chr3L 25232904 3' - GATE 8265 2 51.09 ATGAACGCGCTAATAACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCAAGACGCCGCCGCAAAACTGAATGCGCAAACAAAACGTCAAGTGAAGCCGG:1 - chr2L 17192529 3' - rooA 7393 2 51.49 TAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCATTTCCCCAGAGTGACATCCTTTTCGTCCTTACTTTTTTACTCCTTTTTCGCTAAACGAAATTGTTGAAACAGATGT:1 + chr2R 21869666 3' - Porto1 4301 1 65.35 CTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCCTTTGTAAATGGCATTTGGCATTTTTTTTGGTTTTTGCTCCACTCACTTCGAATATTGCTGGG:1 - chr3L 9187655 3' + F-element 345 1 39.60 TGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTTTATACAAATTTTACTGAGAATGT:1 + chr3R 15303243 3' - I-element 4909 1 76.00 AAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGGTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGT:1 + chrX 22900308 3' + Tc1 1589 1 80.20 TTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTTGCCAAAAAGATTGCACTACGAAGGAGCAAATGAAAAAATAAAAATCAAAAACAA:1 - chr2L 12207033 3' + Porto1 4469 1 60.40 GTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGATTTTGTACAAGACAAATAGGTTGATATCTAATATATGTAAACATTGTATAGTGAAGAAAAA:1 + chr2L 19064713 3' - G-element 4218 1 70.30 TGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGAAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCATTGACTGATAAATCGCCAGCAATTTATTATTGATAACACATTGGTACA:1 - chr2L 17094449 3' + Bica 22 1 53.47 ATTGTATGGATTTATCGCTTCTAATTAATAAAGAAATAAAAAACACTTCTATTGCCCCACATTTAACAATTTAAGTTCATGTTGTCATTTGTTTTCAGCTT:1 - chrX 20266167 3' + BS 5072 1 66.34 CANAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACATATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCCAAGAATTAATTTGAGAATATTTTTTGCA:1 + chr2L 20484452 3' - diver2 139 2 68.32 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTACGTTTGCTGGTCGGTGGTCAACTC:1 + chr3L 14257632 3' + 297 347 2 79.21 ATACCGCGGGACCGCGGAGTGCTGAAGACCTTGCGGGAAGAGAGGGGCGATATGGAGTAGATAGAGACAGAAGCGTGGGAGTGGGGCCAAAGGCAAGCAAC:1 + chr3L 5251408 3' - Max-element 8380 2 61.39 AANCGTTTTATATAAACATATAAACCAAAACAACAACAAGGAAAAACAAAAAATAAAAAACCCTAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCA:1 + chr2R 18524581 3' + gypsy9 432 1 76.24 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 20 1 73.00 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACTTTCAAACTAAAATTTTAGAAAATCATATTTTTAAAGCCTTAACTTTCAATGATTT:1 + chr3R 6776611 3' + copia 234 1 58.42 CTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCCGATACACACACTTGCACACGTTCATA:1 - chrX 12860323 3' - roo 148 2 73.27 GTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTAGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAA:1 - chr3R 23020834 3' + INE-1 558 1 49.50 ATNGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATGCTGAAAATTAGAGGGCGTCAAATTAGAGGCAGTGAAAGAGCACTTTTATTT:1 + chr2L 1913084 3' + pogo 2082 1 60.40 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACAGCAGTCGCATGCTGATGATGACGGGTTCATAACGGTATTCAAGTTCTATA:1 + chrX 17729115 3' - hobo 21 1 60.40 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGCCTTCTGCACTTTTGCCGAGAATTGAT:1 + chr3R 9322868 3' + 412 7498 2 71.00 TGNTTTCTTTGAAATAATTGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATAAGTCACTATATATATATACATGTAGCAAGTTTCTATTATGTGTTACTTTATTGT:1 + chr2R 3824679 3' - 297 33 2 61.39 AGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATATACGTTCTTTTTACAAATAAAAATGAAAGTGAATTTTCATGTTCAACTAAACAGTTATTT:1 + chr2L 21090990 3' - flea 4761 1 75.00 CTNTCAACCTTCCACATAACTATATAATCAAAACTGTTTTGGCAACCGATCTCCACCGAATTTTGCGCACTTGACACCTGAAGTGTCGTCACCTGTCACAC:1 - chr3L 2392341 3' + Transpac 310 1 76.24 CTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCACATTAGGCCCTGTCAACCGCACTTTGTGGTTTCCCCATG:1 + chrX 18720563 3' - accord 280 2 61.39 CTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTACGTTGGGAATGGTGACGGGGTCAAAGGGCGAGGTCTTGTAGTAGCCGTCCTCGGGGCTGT:1 + chrX 14950415 3' - Doc 492 1 64.36 CGNCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCATACGTATAAAAACTTAGATGTAATTTCGT:1 - chr2R 4341588 3' - micropia 423 2 70.30 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAAGGTGTGATCGTATCGTGGTCCTGTTCTGGGGTGGTGAAAATCCGTCACCGCACTGATCCTCT:1 + chr2R 12210527 3' + roo 8996 2 74.26 CGAAGACACAATTAAACAATAATAATAATATAATAACAGATTAATATTGTATGTACATATTCCTAACTAAGCCAAGCAAAAGAAAAGCTACATACAGAATT:1 - chr3L 6166344 3' + invader3 5031 1 59.41 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATCGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGGTAGTATACTTTTGGGGAGTAGC:1 - chr3R 31458402 3' - jockey 18 1 68.32 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTTAAATATCGGCAGACGGAATTGCCTTGGCTGCACGCCGAAATGTTTC:1 - chr3L 7781182 3' - 297 22 2 59.00 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATT:1 - chr3R 7885614 3' + hobo 2900 1 69.89 TTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTTATTGTTAGTTTCCGGCGCGCCTCGCGTTGCTTAGTTGTCCGCCTTATCCTGTTTGATTTT:1 + chr3R 27565577 3' - I-element 5129 1 65.35 CGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATTTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGCAAATGGCTCATGTAAGTGGTTCTTGCCGCCAACATTTATAAAACAGGA:1 - chr3R 17368600 3' - F-element 4345 1 55.45 TTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAATAATAATCATAATGATAATGCTGATGTGTTGATGAGGTGCCGTTTGGTCTTCGATCTGTGG:1 - chr2L 3850806 3' + mdg1 7022 2 58.42 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCAGCGGAAATTGTGTCAGAAAAATGATTAAAAT:1 - chr3R 29423498 3' + roo 9044 1 55.45 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATGGGAAAAGGATCTTAGATC:1 - chr2L 18223796 3' + roo 351 2 80.20 TTNTTATTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTTCAATTGGCAAATATTTTAACGCTCATTCGAAATAAGTTCCGGCAATATTGTAATAAAATCTTTGATT:1 + chr3L 10528170 3' - F-element 90 1 73.27 AAAAAAAACGAATTCTAGACCATAGTGCAATGTCTGGATTCTCTGGCTCTCAACCTTTTTTTGGTTTACAACTCGACTTATGAACTCTGTGCCACCTTTGG:1 + chr3L 25401167 3' - transib2 6 1 73.27 TTNTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGAGTATATTTTCTTTTTTCGATGAAGTGTCGCCGTTTTTACGTTGGATGGCTGTCAA:1 - chr3L 14854676 3' + Quasimodo 7354 2 62.63 AAAACAACAATACCGCTAGCCCGGGCTCAAGACCTTAACCAACAATCATGGCAGACCCAGCAAATCACTTACAAAACTTATGCACGAATGCACAGGACAC:1 + chr2R 9774566 3' + I-element 140 1 72.00 GTAGCACCCGCACATAAAATTTTTGGGTGCGAGTAGAGTTAACTGATATTGAGCCAATGTTTGCCTAGGCCTACGATGACCACAACTGAATACCGTGACCA:1 - chr3L 19890445 3' - hobo 49 1 78.22 CTCTGCACATTGGCAGAGGACGCTATGAAGCTTTTTTGTTAGCGCTTTATGGATCATTGATTGGATCGTGGTAGTCGTGGGTTTCGTGGGACGAGCATTAC:1 + chr3R 26006794 3' + gypsy3 6649 4 71.29 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCGCATTGTTCGCCGAACAATCGTCCGTCATTTTGCT:1 + chr3R 12566792 3' - Doc 24 1 63.00 GCAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAATTGCTCTTCTGCTTGGGCTCCAACTCTTTGACGTTTCTCTTAGGTTTTTCTCACAGCCCAGCCCCCCACCCCCCTC:1 + chr2L 11221357 3' + Doc2-element 230 1 76.77 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATAAATATTTGATCGAATATCAGG:1 + chr3R 15744579 3' + pogo 2051 1 78.22 CTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACATAATACAACCGGACAGATACCAGCCACCATTCTACCAAAAACACTAGTGCCTTTGATTCTACATTACGCAGACAC:1 + chr2R 2953289 3' + 17.6 149 2 78.22 ACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACCCGATTATCTTGTTGAGGAAAATGTTACGAATTCATT:1 - chr3L 20425142 3' + INE-1 143 1 71.29 TATGATTAATATAGATATAACTTACTGATTTAAAATTACAATTTGTGTTCCGCGAGTTGTGGTTGTTGTCGTGGTTGTCGTTGACGTAGACGTGGTGGTG:1 - chr3R 19040120 3' + transib3 291 1 54.00 GCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAGGAAATAAAAAACGAAACCATTGTAAGTCTGTAAATAGCTTAACTATCCGGCTCAACTATGCAAATGGA:1 - chr3R 25277596 3' - 3S18 8 2 72.28 GTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTAGCTTTTATTTAACTTTTTTAACTTTTATTTCAACTTTTTTATTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 2 1 51.49 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTT:1 - chr2R 5485065 3' - 1360 29 1 61.00 CAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCACTTCACACCGACTTCAGACTAGAAAATGATACAGAAACATAA:1 + chr3R 25431984 3' + accord 123 2 58.42 CTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAACTTGTTCACGCTTTAATGAATGTAAAAAGGAACATAGTTTGGGT:1 + chr3R 25424244 3' - Doc 4505 1 55.00 GTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACAT:1 - chr2R 4260437 3' - micropia 5136 2 80.81 TANAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAAATCTCACGTACGGATACTCATACATACGGACAAACAGACGAACGGA:1 - chr3R 5333805 3' - blood 460 1 54.46 AACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTAAGTAAGCGCCCAAAAACTTGTTTGTCAATTTTCCGTAGCTGCAAGTCTCATGTGCGAGCTG:1 + chr3R 5952672 3' - hopper 1016 1 63.37 GACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGCTGCACTTAAAATGTTTTTGTACATTGTATTTTTGAAGTTATTGTTTATTCCTAGCCCGGTTAG:1 - chr3R 10983161 3' - F-element 4213 1 69.31 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAAAAATGATTTATAAATTGGGAAGACGTGCATAAAATGCTGAGCA:1 - chr3R 20373244 3' - I-element 23 1 54.44 TTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGGGAGAGGGAACCCCGTGACAGGCAATCGGGATAA:1 - chr2L 16954825 3' + Quasimodo 7334 2 64.36 TANACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATTATTTTTAAGACTTACCACTCCCACTGCTTCCAGAGCAAAGAGCACTGTTCCAAAGAAGGTGGGCAACT:1 - chr3L 1973417 3' + flea 249 2 71.29 CTGAGCCACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAG:1 - chrX 22726201 3' + Helena 1267 1 48.51 AGNGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTTTTCATACACCCAAACCCAAACTTTGCGTAACCATGCCAAACGTTACGTAT:1 + chr2R 17938951 3' - copia 4895 2 51.49 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTA:1 - chr3R 13225480 3' - hobo 14 1 65.35 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGCCTCCTTGCAGCGACTGGGTATATAGGTATGTATG:1 + chr3R 17666037 3' - Transpac 4958 2 64.36 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTGTATTTTGTGTCAAAAGATAAACCTAAAACTAAAAGAGTGTGATATTTGTTGTTGGTATTG:1 - chrX 19820035 3' - mdg1 15 2 60.40 GTGCTATTATTTTAACCGAAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATT:1 + chr3L 19339450 3' - Tc1 5 1 78.22 AGCCAACTGATCTTAATTCTGGTTCTGTTACGAACTGCCACTCAAATTCACATTTATTTCTGGGCCAACTAAAGACCAGCAAATCTCCATTACAAGGGGGC:1 - chr3L 16440317 3' - gypsy10 298 2 67.33 TCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTTTCTCGCAGCTTTGACAAATAACTGATCAGGCAAGCGAATC:1 - chr3R 26326298 3' - G2 2643 1 68.97 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTATTGAATTCCCTTGCATCATCTGAAACAAACCACTCATCTC:1 + chrX 5912978 3' - flea 31 2 60.40 CATTGTGAAATTCCCATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTGCACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTTTTTATGGAACTGAAAAGGAGACAGAC:1 - chr2L 6815658 3' + Copia1_DM 76 1 74.00 CGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTGCTATTGTTGGTTGTGGTTTGTGGCACTCTATTTGCATATTATGTCATCAGCAGTCCATCAGTTGTGTTG:1 - chr2L 6814167 3' - Quasimodo 7038 2 79.38 CCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCATACAACATGTAAGGGGCAGGCGACTAAAGCCAG:1 - chrX 678780 3' + Tirant 358 2 69.31 TTNCGACAAATTTTGAAAAAGGAGTTGCATTAAAGGTTTTTATTGAATTTTTTCCAAACGAAGACAAACAAAGCGGCAGGCACAACAATCGCATTCGTTCT:1 - chr3R 23238900 3' + Tc1 277 1 63.37 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCACTAGTGCAGCTCCCACACACACGTAAA:1 + chr3R 20984231 3' + hopper 1365 1 72.28 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTACTATACTTACGCACCCCACTCACTGTGCTTTTCGTCACTACGA:1 - chr3L 21636444 3' + flea 4985 2 59.41 CTNCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGCTTAGCTAAGCTAAGCTAAGCACTTCCTCTTCTCGGGCTGAT:1 - chrX 6518766 3' + pogo 2070 1 59.41 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTTGTGCGCAAAAGTAAACAAACGCAACTTTCATTCATAAATAGCAACAACGCAACCGGCGAAATCGAATCAAA:1 + chr3L 20186099 3' - FB 3 1 76.00 TTNGAGACTTAATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGACATTGGGTGGACACGATCTAAGTGAAGACAGCTGGCTTTGAACATTT:1 - chr3L 9076563 3' + mdg1 7430 2 50.50 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAATGCCCGAATGAATGCAACGTTTTTGCGTAT:1 - chr3L 2485913 3' + jockey 4961 1 68.75 ATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTT:1 - chr3R 178122 3' - BS 42 1 69.31 ATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCTGTGCTGACCCAGAATTCAAATCCCA:1 + chrX 13713900 3' + Quasimodo 125 2 74.00 CGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGCCCAAAAGCGAAAAGGAAAACCCAGGAAGAGATGGGAAAAACAAGAAA:1 - chr3R 29357643 3' + 412 293 2 55.10 CATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAAGTCAGAATTGGGATACTTAACTAATCTGCTACCCTCCCAAAACGGTCGTCCTTCGCAATGCC:1 + chrX 8069706 3' - 17.6 139 2 67.33 TTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGC:1 - chrX 21087603 3' - mdg3 34 2 69.31 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAAC:1 + chr3L 22349247 3' - jockey 66 1 76.24 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTCAAACATCAGAAAGGGGGAAATTTTTCAGTTTTACGTTTGCATTCAACACGG:1 - chr2L 9410789 3' + roo 9047 1 61.39 CCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATCTCGTTATGTTGTCCTTTGTTTGAAATGCCAGCTGCTGCAGCGCTGCC:1 - chrX 19827898 3' + Stalker 414 1 67.01 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTACGAGAGAGAGTGAAAGATCGTGTTTTTGTAGAGCCAAAAGAGATTCACATACTGTGGGA:1 + chr2R 21497562 3' + P-element 2870 1 63.37 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTACATAAATC:2 + chrX 19820109 3' + mdg1 7415 2 68.32 GTNGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTCTTAAAATACATACATT:1 - chrX 9579297 3' - Tirant 8117 2 71.29 GAGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGTGAACAGAGCTTGGGGCATACAAAAAAAATACACGGGGGAGTTGTTGCACGACAGAGATACAGCAA:1 + chr2R 18356279 3' - P-element 11 2 61.39 AACAACGCACAAAAAGGAGGGTAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATTCAAAATACTTTGAATATTTCTTTACAAACTATGGCACAAATGTTGAAGTGTACA:1 + chr3R 12115065 3' - Cr1a 219 1 68.32 GCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAGGTGCAAGA:1 + chr3L 5662682 3' - jockey 348 1 50.00 TGAACACACACACACACACATATATGAGCGTACATGTGCATGTCTCTTTTTCACTTTTTATTTAGCTTTGGCATAAAAAAGTATTTTATCGTTGGCCAGGA:1 + chr3R 9148528 3' + accord 182 2 62.38 GACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTCTCGATTTTATGTTTGAAGTGGTATTGAAATGAAGTATGGATATTCAAATATG:1 + chrX 19223347 3' - mdg3 153 2 53.47 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTATACTATACGTGGGCGGCACCAGAATACG:1 + chr2R 10444277 3' - P-element 47 1 32.67 AANAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCCCGGTGACAATCTCTGCCGGACGGACGTACTCCCTCCATCTACCAGCTTCCGCCTTCCGCCAGCTTCC:1 - chr2L 2685708 3' + hopper 1410 2 74.26 CTCCAATACTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAGAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACGGGGCGAATGCTCTGCAAACATTTGCGCTCGAAAGTAT:1 - chr2R 12446049 3' - hopper 39 1 61.39 ACNACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATCGTGCCAACAACAATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTAT:1 - chrX 13640620 3' + P-element 2884 2 69.89 GGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACGAAGTTCCCAGAGATTGGGCCTACGGTAGGCCACCCGTCTAATTTGAAATAACCAAAAGAAATCCGTCAC:1 + chr3L 16005351 3' + ZAM 8026 2 72.28 AAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAACAAGAAAGCTGTAACATGTAACTAACACACCGAGAGCTCTCTATAAAGCGCACTCTAGTTTTGGCCAAGTG:1 + chr3R 17898777 3' + rover 438 1 73.27 CGNTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGGATAACCTCAGAGAACTTCCACTGCATCCAAGCATTGGTTCATC:1 + chr3L 26644804 3' + HMS-Beagle 218 2 53.47 CACCAAGCACTGGGAACTCTGGTTGTCGCTATAAAACTTAGTTGCCTGTGTTTCACCAAAGCTCGACATTTCGTCAACGTTCGCGATTCGAGGATACCCCG:1 - chr2L 11174211 3' - Dm88 4075 1 63.37 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGATGGTAAACGAATCGATATTGTTTGGCAACTATCGATGAAAGATACAT:1 + chr3L 11790037 3' + P-element 2862 1 52.04 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTT:1 + chr2R 11164512 3' - roo 8673 2 70.30 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCATACATCACAGAAAACATGATTCAGCTATATATTTGTTATATATATTTTTTACTTCATATCC:1 - chr3L 12990566 3' - hobo 14 1 57.43 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTCGAGGTCTACCCTGAATTTGTCC:1 - chr3L 6522299 3' - pogo 42 1 79.12 TTTTACCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTATTCTTGCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATAATCATATATAATAAAATATGTCATCAAAGTTAGGCTTTA:1 - chr2R 5249846 3' + Tc3 237 1 67.33 ATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGTAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGAC:1 + chr3R 17615177 3' + mdg1 7067 8 59.41 CGCGAGAGGATTTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATGCCCATATTTGTCGCCTGACGAAATTTTACACTTTTGACATTTTCA:1 + chrX 14336639 3' - Doc2-element 4563 1 55.00 AACAACAAAAAAGAAAAAAAAACACATTCACATTTTAAATTGCGTGCACTTTTATGCGTACGCACACATAACATACACATGTACATATGAATTCGTAAGTA:1 + chrX 3080951 3' + gypsy7 5004 1 56.44 CCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAA:1 - chr2R 3919679 3' - 1360 47 1 69.31 AAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGAAATCAAAGCACTTTTACTGTCGCACTCTCCTTGGACAATTATGTGGCACGACATGAGCTCACGGCTCAGCAAG:1 - chr2L 18001412 3' - Tc1 1464 1 76.24 TANGTGTTGCAGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATATGGGATTACATTCAGTAGAAATACCCGTACGTCGAAA:1 + chr2R 9788999 3' - blood 7047 2 61.39 CCAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAATTAATAATGGATCATGATTTACTAGTCATCTGCCCATTCT:1 - chrX 6654450 3' - jockey 4761 1 57.43 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGCCGCAAGCAAAACACGTTAAAATATCCCTGCAAAGAAAAGAGCCAAAATGGAAAGTGGAAAA:1 + chrX 22745732 3' + copia 244 1 64.29 ATCTGATAGTCGGAAAACTCGACATTATCATTCTCTCTTGTATTTATTTGCACTTTACAAACAATTAACTTAATTCTGACTCACCTCACAGTTTGGGAAAT:1 + chr2R 17791285 3' + INE-1 560 1 78.22 TGNATTGCGCATGGATACAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGCGGGTGTGTTGACAAATTGACATATTGTGGCTACAGAAAGTTGCAGTTGTAAGTCGT:1 + chr2L 4692873 3' - Quasimodo 7134 2 61.39 CCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGTTTATATGGGCACCCAGCTCTTCGGTCTTCTTTTCTGCCAAGCTGCACGACTCGCAGGCGCTCTCG:1 + chr2R 21090035 3' - diver2 4649 2 70.30 AAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAGTGTATGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 14317416 3' + 1360 3311 1 73.12 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTATTATAATTAAGAAAATGAAATATTTGCG:1 - chr2L 9488154 3' + 297 353 2 81.19 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCTTCTGTATAGTAAACAGAGAATTTTCATAGATCTTTTTGGCATTAAATGAGTGAAGC:1 + chrX 8422142 3' - jockey 4778 1 60.40 CGCGTATATGTGTGCATGTTGTGTTAGAAGACGATTTAAATGATGACATCGTCATCGGCTAGGAACTTTTTTTACTATGGGCACTCTTACAATTATATATT:1 - chr3R 32015760 3' - 1360 3216 1 69.31 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATACGTCAAACTGGTTGCCATTTCTGTGTAAAGA:1 + chr3L 14209080 3' - Quasimodo 38 2 69.31 TGTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTATTTCACTCTCGTCTGGGAGAAACTGTATGCATTATGCATATCCTTAAATCGCTGGGGATATTGGTTAACGGAA:2 + chr3L 9184261 3' - Quasimodo 36 2 78.22 GCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGGGAAAAGGGGGTCGCGTTTGTATGTATGTATGTTTTTGAGGAGCAGCGACGAG:1 - chr2R 17793301 3' + accord 179 2 56.44 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCACTAGTGCAGCTCCCACACACACGTAAAGTGAGCTTTGAGATTGGAATGTGTAGCCTACT:1 + chr3R 20984263 3' + hopper 1397 1 56.44 CTNGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGTTACAGTGGTTTTAGCTTCATTCAAACGGA:1 - chr2L 1089565 3' + hopper 1385 1 62.07 ATACATTCTTGATCAGGATCAACAATCTGGCCATGGTCTGAACGCAGTGATCTAGGTAACTCTAATAGAAAGAAACGTTTGTACTAGTTTGAGGTTTATTA:1 - chr3L 21142801 3' + INE-1 82 1 76.24 GTTTCACATTGTTCTAAAGAAAATCCTTTAAATCCTGCAGCGAAATAAGCTTCTTCGATTTGGATTTCGGATTTTAAGGCAATTTATGACCCAACAATTGC:1 + chr2R 23516179 3' + pogo 1991 1 88.12 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCTAATTTGCTGCAGATATGAGTGTGGCAACGTCAGCATTTGGGGCAGAAAGGTCAT:1 - chr2R 17208507 3' - jockey 29 1 58.00 TCNAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGCTTAACAACCGCAAAACCCGCAGGCGAACCCCAA:1 + chr2L 6184242 3' + roo 9029 1 67.33 TAGTACCTATTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTTAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGC:1 + chr3L 20224221 3' - Chimpo 31 1 56.44 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGAATTAGCCGTGGTGGCTCTCCGTTAAAATGTGTGTGGCAAAAACAA:1 + chrX 4448608 3' - 412 7078 2 53.12 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCGAAACCAAAAATTATGCTAGACAGCTTTCCATATCGTA:1 + chrX 6731854 3' - hobo 39 1 65.35 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATTTAGCTTTTTTTTAGTGATTTAAT:2 + chr2L 5959700 3' - roo 8714 2 80.20 AAAAAAAATAACAAAATAAGTAAAACAGTATAAACAA:1 - chr3L 15893861 3' + gypsy11 3936 1 72.97 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCGCTTTTGGGGGTGAGAGTGAAAAG:1 + chr3R 23601733 3' - jockey 60 1 76.00 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTCGTGTTGGTGTTGTGTTGCTTCGGGTCGCTCT:1 + chr3L 17971281 3' - P-element 42 1 39.00 TTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTGTTGTCTTTCCTTTCAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGT:1 + chr3R 1546406 3' - I-element 5174 1 58.00 ATNTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTGCATAATGCAAAACCAATCTATGGCCGTTACGCACCCGCTAAGGGTACAGAGGCCATTTGATAATTGCAAG:1 - chr3R 21346199 3' + 1360 3327 1 63.64 CANCTAAAGCCGACTGCACCGGAACGACAAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGCCGTATTTTGTAACCATTAGGGCGGTGGAACCGAACGGAAGCTTTT:1 + chr2L 21714989 3' + Doc3-element 4563 1 58.42 TTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGCTTCGGACTGGACCCCAATTTGTGCATGCTTCATTTGATTAA:1 + chr2R 20383370 3' - Ivk 343 1 58.42 CTATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGCCAGTGAGTGTGTGTGTGTGGCGGGGCGCAGGACAGGTCGGGGGGCAGTTGGCATATCAACTGGTCGGACA:1 - chr2R 14995678 3' - Quasimodo 35 2 72.00 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATACGTCTCGTTTTGTTTATACTGTAATTAATCTGTATTGGTCTGCTATGTTTTTGTAATCT:1 - chr2R 2949022 3' + 17.6 7407 2 69.31 TTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATAGGAGTTCATCATTACACACCACTTTTAATCTAATTTATGAACAAAAACCTTTTAAGATTTTGCGAAAGGCATGTGG:1 + chr3R 26140826 3' + 412 7527 2 59.41 AATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTCTCTTGCACCGCACCCTAAACCTTAAGAGCAAATGCATAAATTCAATTTGCCGAAAGCAAAAAAATTGCATAAT:1 - chrX 7396326 3' - jockey 4937 1 75.25 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTCTTAAAATACATACAT:1 - chrX 9579298 3' - Tirant 8118 2 70.30 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTTAAGTATCTTTGCAACAGTTGCCAATCAATGGGCATAAGTATCCTTG:1 - chrX 5912903 3' + flea 228 2 52.48 GANCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGATAGCTAATCAAACATTCATATGAATGGCATACGTTTTTAATCAGCA:1 - chr2L 7393652 3' - opus 7030 4 52.48 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGCAGGACACATAATAGATTTTTATTGCATACTTGCGGGCGACAAGGGAAAGGG:1 - chr3R 7885586 3' + hobo 2920 1 58.42 TCTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGATATTAGTTCGACTCAATAAAATCAATTCACAACATTACAGTACGCCCTAGTAAAATAAAGAAATGAAAA:1 - chrX 8941621 3' + 297 6928 2 67.00 TNTGCCGGCGCAGACGGATTGCATTTGGCTAGCTTGGACTCTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGTTAAGTGGCGCACATAAAAGGCGGG:1 - chr3L 2371794 3' + Tabor 295 2 73.20 CTCCGTACCTCCACCAGCAAAGAATATTTACAGCGCAAAAGACGATCAACCACGTCGTCTCCGAGTCGTTCAGGACACCTTGCTGCTCTCAATAACCTCCA:1 + chrY 2971714 3' + HeT-A 6054 2 70.30 TATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTCTATTTATTTTGTTTTACGGGCGCGAAAATTGATTAACGTTAATTAAT:1 - chr2R 14002156 3' - Porto1 4373 1 64.36 AATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGGAGGGCTCAATTGATTTTAATAAGCCCCAATTAAGCCGAGCGAC:1 + chr2R 10132596 3' - accord 225 2 56.44 GANAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCGGATCCGCTTTGCACCCTCCCTCGGCGTTTTTCACTGCTCTTTTTCCGACTTCCTTCGCTGGTTGTTT:1 - chr3L 7968649 3' - hobo 8 1 65.35 AGNTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGATAAACCAAGCCGACATCCACAGTAGACACATTACTTTGTCTTGTCACCGCCTCGATAAAGT:1 - chrX 17300346 3' - jockey 4684 1 64.00 AACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTTCTTCCGCTAGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGT:1 - chrX 7978948 3' - Gypsy6A_LTR 268 1 61.39 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAACCATAAGCTATAGTTGGTGGCACTTTTGTGCAGTCGATAGCTTTGGGCCAACCACAGGACGTCA:1 - chrX 4806654 3' + roo 404 1 72.04 ATACTTGTGAGGTATAAATACCCTGGTTTTTAAATTGTGGCGTATCCTTAGTTTAGTGTTGGCTGAATTTATATAATGTTGTTAATTGTTTTTTGTATGAA:1 - chr2R 4544008 3' - TAHRE 407 1 56.44 TTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGAGCTTAAACTTCAGTCCTCCAACTTCGTAATTAAATGGCTGATAGATATTTGAATAATTTAG:1 + chr3L 17465324 3' - I-element 5059 1 42.57 AAGTTGACCAAATCACTTGAAACTTTGTGAATCACCTTGGGGGAAGTAAAGAGTAACACAAACCAAATTTAGTGAAGAAAGGTGCAAATGTGAAACGTGGC:1 - chr3R 25569412 3' + transib1 2037 1 78.22 TATCGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCT:1 - chr3R 4562143 3' + INE-1 503 1 82.18 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGGGGAAGTGTGAGCACAACAATGTCG:1 + chr3R 12566758 3' - Doc 45 1 70.11 TGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAAGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTTTGCTTTCTGTTTTTTTGTTTTTTTTTGGTTGTT:1 + chr2L 11867747 3' - F-element 4223 1 67.33 TCTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTTTGGTCTGGGCCTGTCCCTCAAAATGTCCACTTTCGTTTCCAGGAGATTCACCGCCACCTGGGAAATGCAT:1 + chr2R 8598999 3' - accord 7032 2 70.30 TTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGTTTTTAGAAAACGAAATTGCTCAATTGGTTGGTTTTTTTTTTTGA:1 - chrX 13968972 3' - I-element 101 1 55.45 CAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACTCTTGCTTAGGCTTTTGCTTTGGCTTTGATTAAACGTCAGGTTGCAAGTATCGTCGTGTG:1 - chr3L 2693797 3' - gypsy4 6459 1 64.36 TGTTCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGAATTCAAATTTGTCTCATTGTTAATGGTGCGTAAGTTTTGCTTCGAGTGCAAG:1 + chr2L 16273379 3' - Quasimodo 240 2 65.35 CTGTCACGCCCACACTTTTGGAACTGTTTAAAATTTGAATTTCGTGTTTGCCCGACCATAATTCACCGTGACAAGCCAAAAACCATTAGTAAAGGCAAT:1 + chr2L 14444152 3' + INE-1 249 1 56.57 TATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACCTTGTTAGCCTGGCCAATACGATGGGCTCGGGAGAAGGCCTGAATATCGTTGTGGGGATTCCA:1 + chr3L 19884994 3' + accord 7296 2 68.32 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATGCATGCAGGTCGCCAGAAACTAACTAACTAGCTGCAGTTGGGGTTAACTGCCGCTGGATCAGGTGCA:1 - chr3L 19413913 3' - Burdock 6139 2 75.00 TTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACACCATCTCTGCCATCCTGGTTGCCTTCATTGCCAAAAAACTCTAC:1 + chr3L 4022391 3' + I-element 91 1 56.44 GGATACAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGCAAAGTTTGATCATTATTGCCCGGGCAAAAGACAAGTTACTTGAGTTGATTTTGCCTAAG:1 + chrX 7623751 3' - Quasimodo 7122 2 68.13 ATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCTGG:1 + chr3L 9907449 3' + jockey 4987 1 61.62 AANTACACGACCATGATAATGTCTTAGCACTAGGCCTACTAGATAGGGTAACTCAGATCGAATATATGAAAAAGCTCCAGACGAAGTCCACGGTTCGAATT:1 - chrX 11966535 3' + G3 4389 1 71.29 AGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGGAAGCTTTTGTGCGCCCGCGGCCACTTTCACGCGTTTT:1 - chr2L 10897655 3' - Doc 317 1 62.38 TAAGAAGGGCAGAGAGTCAAGAAAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAAATAAATAGAGTTTTGATAAGATTTTCCATGACTGACTTTCAAA:1 - chrX 14430974 3' - Cr1a 4237 1 60.40 TCNTCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCTCAGTA:1 + chrX 19820783 3' + Rt1b 4973 1 74.26 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGGAATGCATTTTTACCATGGCAGCTGCCCCGGGGCCTCGAATGCATTTCATTTTCTAAGCAAACATATTCC:1 - chr3R 29357019 3' - 412 7 2 69.31 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGTATCTTAATCTATTTAATAACTAATAGGCTAATCAATTGTTATGCTTGTTATGTAAATTTGCCTTTTTGTTT:1 + chr2R 24068899 3' - blood 7015 2 75.25 ACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGAGCCTGGAGCCACGGCGAAAAAATCGTTTGCCAAATAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' + 1360 3294 1 68.32 ATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATAAACTCTGCCCGATAAGTATGCAACGGA:1 - chr2R 14296276 3' + jockey 4956 1 69.31 ACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTATTTTATTTTTTTCTTTTTTGTGGTCTCTGAACTTTTCTCACTCCAAATGCCACTCGAAAT:1 + chrX 17553153 3' - 297 472 1 65.35 GACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACAAAAGAACAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTCCCAAGCAGAACCACGCAATTGCTAGAAATGTTAAATGTAAATG:1 - chr3R 11290616 3' - invader1 102 2 74.26 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTGCCCTACCTCCCCCTTTGAAAGCCTTCTTAATTTCCCCTGTTCGTTATGCATTGTGC:1 + chr3R 4805134 3' - 1360 18 1 61.39 TGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTGTAAGTTTGGAGCCACAAAGCTTGACCGAGCATTTGATCCTGGAAAAGTTGGATGCT:1 - chr2R 5948629 3' - I-element 5133 1 57.43 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTC:1 + chr3R 31026120 3' - mdg1 7051 2 64.36 CCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCAAACAGTTCATATTAGAACCGATTT:1 + chr2L 7558718 3' - FB 53 1 73.27 TCACCAATGCTTATGACTGCACGAAATTAACCCGAACGCACTGAGAGCGTATCTCTCAAGCTCTCTCTTCAATTTTCCCTGACCAGTTGTTGCTTTTCTTT:1 + chr2L 3950780 3' + Doc3-element 392 1 64.36 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGTTCCTGACAATGTGAAGAAAGATGCTGAGAACTTGGTTAAGAGCTCTACAAAAGCCTTAG:1 + chr3R 20878199 3' - Doc 23 1 65.31 CTNTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGT:1 - chr3R 6290997 3' - Doc 59 1 82.00 CAAGGAGCGCCTGTAATCTTCCTCAGAGTTTTTGCAGCTGGCTGCATTCCACACCATTTAAGAAAGTGTATCTTTTAGAGCAGAGGTCAACCG:1 + chr3L 10730285 3' - jockey2 2983 1 69.89 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTGAGTACTCACTTAAACTAGCGCATTTATTTGAATTGATTGAAATATAAAAGAGA:1 - chr2L 14255607 3' - pogo 19 1 56.44 CAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAATGTGCCTGCAGGTCATAATATTAATTGTTTTTACCGTTCAGCACT:1 - chr3R 15563048 3' - diver2 4727 2 55.45 AAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGCGGTTACTTTGTGTGTGTCAGTGTTTCTGTATCTGTGTTCTTCGCC:1 - chr3L 22215446 3' - I-element 4928 1 54.46 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGCTGCGGCATTACGTATACACCGCGTGTGCAGTGGCTCCTGTTGCAGACAAAATGCACAG:1 - chrX 5441969 3' - hopper 15 1 58.42 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATCTCCAGGCGCGCATCCAAAGGGGGGCTTATGATCTGAGCTCTTCCTTC:1 - chrX 9579313 3' - Tirant 26 2 56.44 TAGGAGCAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCCGGATTGAAGGCCAAA:1 + chr2R 11836286 3' - F-element 259 1 66.04 CGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGGTTTACAGATTTTAATTTACAAACAGTTGTCAGATGCCCTCTTTTGCCAC:1 - chrX 21521003 3' - rooA 101 2 54.46 TTNCGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATGCTTTTCATCATCTCGCACTACGGACAGCGCTGATCGTGGACACGATTTGTG:1 + chr2L 21863428 3' + Burdock 6370 2 58.42 TAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATTATGTACGTAGAAAAATAACAATCA:1 + chr3R 23846873 3' + Bari1 1665 1 78.49 GTGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCG:1 + chr3L 16047628 3' - Gypsy6A_LTR 22 1 59.38 GTCTGGCGTTGCCAGATCAGCGGTGCGATCGTCATCCTCATCCTCATCGTTCTTGGCGGCATTGCGGGAGCTAAAGCTGTAATCCGGGCACCAGATTTGGT:1 + chr3L 11856741 3' + Rt1a 251 1 73.27 TATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAATATATGTTTGAAAACCCTCGATTTGAAACGACTGATGAGTG:1 + chrX 1600234 3' + BS 5055 1 60.40 GTNTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAGAGCAAAGTTGGCATTACCCATCTAACTGAATCCCCTTTATTTTCCGGTCTAC:1 + chr2L 19644944 3' - blood 25 2 52.48 GCTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGAGCTGCTGGCATCCTTGGCAGATCGTTTGATAATATGGATTCCGGTGCTCTCGTCCAGGTCCTGCAGTTCAC:1 - chr2R 13256813 3' - accord 7031 4 74.26 CTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTACTGCACTATCAGCAACTTTTAACGCAAACTTGTTGGCACCTAGTTCCCTTCACC:1 - chr2L 9045966 3' + F-element 489 1 55.00 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCTATTAATTAAAATTTAAATGGCTACGGCGCTGAAAGGTCCACGGAGATTTGTCTAAATTTAGCTCCTAGCCAA:1 + chr3R 31026128 3' - mdg1 7043 2 72.28 CTGAGTAACGGATATCTTATAGTCTTACCCACATTATGTCGTTCAAACTTTTGTTATTCGTAGTTTTTGCTGAAGCATCAAAAACTACTCTCAATTTGGTC:1 - chr3R 19445241 3' + INE-1 547 1 74.26 TATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGGGTGTGGGGG:1 + chr3L 21141453 3' - Quasimodo 38 4 76.19 TTNATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATC:1 - chr2R 912944 3' + mdg1 7438 2 58.42 GANGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGTATCTGGGTTACTCAAACAAGCCTTTAGCAATTTACGGA:1 + chr2R 8294274 3' + 412 458 2 59.00 TCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTCTCTTTCAATGAATGATTGCCGTGGCAAAATCGAGACTCAGGTCCCAACCATTATCAAGTGGTGCCACTTGATGTC:1 - chr2L 8251291 3' - micropia 5392 2 78.22 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATATTTTTTTGTTGCCTGCCATGGGAGCCCATGAC:1 + chr3L 12172880 3' - 17.6 35 2 69.31 AACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGAGCAAAACCTCCCTTGTATCCATGTGCACTGCGAAATGGGCCGACGTTTCCAGTGGAGG:2 + chr3L 22046509 3' + roo 392 2 64.29 AANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGCAACAGCAACATCAGGCTGCGATCGCCGAGTGCAATTGCTGTTTTGCAGCTGCATTGCAGGCAG:1 + chr3R 26085637 3' + roo 397 1 68.32 TAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCGCAAGTTGCCACAAGGCGCCTTAAATTGCTACGGCAATTTAATTTAATTTAATT:1 - chr3R 7739991 3' + INE-1 171 1 55.45 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATATGCAGTGTTGGCGTGTTGTGAG:1 + chr3L 6900674 3' + pogo 2053 1 77.23 ACGGTGNGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTATGTGCAGCAAAAGACGCTAATGGGCCAAAAAGGTGTGACACGGGGCGAGTGTGCCACCAAAGATG:1 + chrX 5649448 3' + S-element 1707 1 70.30 AACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATGTGCTGCTATTTAAATCAAAAATTGTAAATAGCAGAACATAAATCGATT:1 - chrX 11070621 3' - invader2 211 2 42.35 AGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGGGGATCACACGCAACTGCAGCTGTTAAGCAGCCCAGTAAACCTCATACGGAAGGATTC:1 - chr3R 18655682 3' + HMS-Beagle 460 1 54.74 TAACTTGATTTTTAAAGTTCTGCTTCCGGATTTATTCAGACTTTTCGTTTTCATCAAAGGAGCAGTTCGGTTTTTTCCAGCAGAATACGTCAAACATCCG:1 - chr2R 5459243 3' - transib4 2163 1 72.00 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAACGATTAGAAGAACAACAAAAGTTAAAAAATACTAGAGAATAAAACTAAAACTTAAAGTATATAAAATAT:1 - chrX 20269791 3' + mdg1 7077 8 73.27 CCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATACGGGTATCTGATTGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTATTTTAAAGAGGGTCATGATAG:1 - chrX 20344086 3' + INE-1 135 1 69.31 AGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCTGCAGCTCAGAAAGTTAGATTAAGTGCTTGGGAATGGGAAAGGGAGGCCTAAGAAAATGATTGCGTT:1 + chr3R 23420652 3' - Cr1a 361 1 54.46 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTATAAAGTTCACACAAACAAACTAC:1 + chrX 19820102 3' + mdg1 370 2 75.25 CTNACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACCGAAAAAAGTGCGGCCAGCGGAAATTGTGTCAGAAAAATGATTAAAATTAA:1 - chr3R 29423495 3' + roo 9047 1 54.46 TGGCACCCATTGAGTGCATCAAAAAGCAAAAACTTGTGCACGACCTTTTTTGGGTGTTCTCGTTCCTCGGCCTGACACATTTCTTACTTCTTTGCTGTGCA:1 - chr3L 22978655 3' + hobo 2581 1 61.39 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATA:1 - chrX 21087560 3' - mdg3 5257 1 72.28 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCA:1 - chr2R 981616 3' - 1360 55 1 68.32 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACGAAGCGATACGACAAGCGATCGTGCCAACAACAATAAAA:1 - chrX 13640647 3' - P-element 38 1 32.67 AANACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTAAGAAGTGCAATTACCGAAAGACTTGCCACATATTCTACAGGAAAATTCGGAC:1 - chr3R 5329325 3' + blood 7368 2 57.43 TATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTAAGTAAAGCTAGCAATTGCAGACAGGATTTTGCTGGATT:1 - chr3L 26023054 3' + Circe 7090 1 70.30 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGGATAGGCACATACTACAGGTGACATCCCTTTTTGCATCTTCTCTAATTTGTACGCA:1 - chr3R 26140753 3' - 412 41 2 65.35 CTNATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACGTTAAATATTATTAGGGAAAAAATGCATAAATCATGAAAAACATTGAATTCGATTACAAAATGTATTT:1 - chrX 7583180 3' - I-element 9 1 70.30 TTTCGATTGCCAACACTTAAAATATAACCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTGCAATTATAACATTTAGTCAAAATATGTAAATATATT:1 + chr3L 23003546 3' + FB 424 1 68.32 AGNTAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGTTTTCAAACAACATTCGATGTATTTAAATGATAACTGAAGTAAAAAGTGCCCAGAGATT:1 - chrX 1600170 3' - BS 5012 1 59.41 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCCAAAGTAATTTCACATGCGTGGATTTAAACCAGCGTATT:1 - chr3R 10824056 3' + 412 490 2 62.69 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTATTGGTTGCCGTGCACATGTGTGTGTGTGTACTCAATATTCATTCATGTGAGAG:1 - chr3R 22341141 3' - hopper 25 1 57.43 TTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATATAAAAACATGAATCGAGATGAAAAG:1 + chr3L 5662674 3' - jockey 389 1 74.26 AGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCCCTCCCCCCACTCCACTCCTTTTTTTTCACCCCTTTTAGCCAGCA:1 + chr3R 24461925 3' - F-element 4416 1 60.40 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCGGCTTGGAACGTATATGTACCACCGTTCAATCCAGTC:1 - chr2L 8297331 3' + Tirant 361 2 68.32 CGNCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCATAACAGATCTGATTCTGATGTTGGCAAAAGTCGCTCAAGT:1 + chr3R 6003012 3' + opus 7474 2 58.95 TGCACACACACACACACACACACACACACACACAAACATATG:1 - chr3R 15794459 3' + accord 7028 2 78.57 TATATACATACATACATTACATACATACATACATACATTTGGGTAATTTAATTATTTTTTGACATATATTAGGGTATTTAAAACTGGCCATCTGTTTGCAA:1 + chr3L 14284657 3' - 1731 94 1 69.31