Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score CGCATCGAGTCCAGAGATGGTGTCGGTGAGGACGCCATCTTTGTGTTGTAAGTTTCTCCGGGGCTCCACAGTTTTCCTTATTTTGTTTTTTTTTTGTTTA:1 - chr2L 19168162 5' - gypsy11 3932 1 51.00 AACTTATCATACTTTCAGAGAATTTGTGGGTTCACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2R 21266437 5' + roo 8705 2 71.29 TATAAGTTTATGGCTGTACACATTATCATATGCTAGAGCTCGTTAAGTTTTCGTTTTCCACTTTTTTTGTGTTCGTGGCTAATGACTAACGCACTGTCAAA:1 - chr2L 4941950 5' - gypsy2 372 1 52.48 GGAGAAGTCAGCTCTAAATCAACAGCAGCCGTAAGTTGAGATGAGCGAATGTGACACCAGCGACCAAGAGACGGTTAGATAGAAAAAAAAAAGAAAGGAAA:1 - chr2R 11060598 5' + Doc2-element 226 1 68.32 ATGGTCGAGTCGTCGTACAGCACCACCCATTCCTCCGCCCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGG:1 - chr3R 5807037 5' + Circe 7200 1 61.39 GAGAAACTGCTCGGTGATTGCTATATGTTAGCAGTGAAATCCGCACTAAATAGGGAAAATTTGGTTTCTCCCACAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2R 23343847 5' + roo 8668 2 71.29 AAAAAGACTATAGAATGCCATTATCCAACACTGGCGCTGAGCGGATGAAGTTTTGCCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCA:1 - 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Quasimodo 241 2 58.59 AGAAAGCACAAGTTAATCACTGGAACATACATGTGAGGATGTCACAAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chrX 19561810 5' + 412 7080 2 52.48 TTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 + chr3L 27415227 5' - transib2 2795 1 55.45 TACGGTGAACGGTCCCCAAGGATGGGAAAAAAGAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr3L 776084 5' - 1360 3373 1 59.79 TTAACGTTGCCGCGGCGACGAGCAGGAGTCGAAGGAGTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCG:1 + chr3R 7281748 5' - F-element 4467 1 63.37 GTGTTCAAATCTAATTTACCAGTGATGCAAGTATAAGTTATTATATAATTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAG:1 + chr2R 23686398 5' + Chouto 33 1 72.28 AAATTTCCATTTTCAATTGCATGAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCT:1 - chrX 7087528 5' + F-element 4228 1 77.23 TTGTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGAAAGATATCT:1 - chr2L 16252345 5' + pogo 31 1 57.00 AGACCNCATGACCGCCGCATCCGCCTCCGCATACAAAATGTAAATATTTAATTTTGGCGGCTGCATGACCCAACATCCTCCCCCC:1 - 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Fw2 3764 1 66.34 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGA:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 6 1 60.40 ATAATTGCGTTAATTCGGATAACTCTTAGGTTTGTGATATGAGCAGGTCCATAGCTGCCATAGGTTCATATGGGTTTCAAAACGGAGTTATATAAGAGGAC:1 + chr3R 19865795 5' - Doc3-element 4288 1 62.38 TATACGCAATATCGCTACAAATCAGATGTTTAGGAAACAATTTCACGTATAATCTGACGTCTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTT:1 - chr2R 8144503 5' - Rt1b 4734 1 67.33 CTCCCCCTCATCCGTTTTGAAATAGATGTGCGAGAAGTCCGTCTTGCAATCGTTGTCGTCAGGAATCCTCCAGAGGTAAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCT:1 + chr3R 9470507 5' - Gypsy6A_LTR 334 1 56.44 CGCCAGCTTCCGATGCGGCGGCTGCGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTT:1 - chr2R 11096656 5' - gypsy4 482 1 71.91 CGAGAGATGGAGGAGAAAAGTTCATAAACTGTATATGTTGATGTAATATATGTAATATATATAATTACAACTTAGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAG:1 - chrX 5152127 5' - Quasimodo 7350 2 70.00 ATTTTTTACAGTTGTTAGGGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGATGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAA:1 - chr3R 23886969 5' + R1A1-element 469 1 79.21 CCAAAAACGACTCAGGTTCCGACACCGTAGAAGTTGAGCTGGAAGTACTGTGCAAGCCAAGTAAACCGAAAGGGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATA:1 + chr4 755406 5' + Stalker 241 6 76.24 TTACGCACGACTGAATTAATTACAATAATCAAGAGTCGCCACCAACGCGCTATCCCTCACACATACAAACACATAGCAGGGAACAGATCGGAAGAGCGT:1 - 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chrX 5003892 5' + gypsy5 7066 2 79.38 ACTTTTTCCTACTTTTCAACTGGCTCAACTCTACAAGAAGTAAATCTTCTTTTCCCTTGTTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATA:1 - chr3L 3541221 5' + invader2 248 1 67.33 GGTGGCCCACAATGCGGCTAGTGCCATGAGGGGAATATTCGTGTGTGTCTAAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGT:1 - chr3L 20692866 5' - BS 4816 1 55.45 CTTATGCAAATAACTCGGGAACCTTTCCATAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTAC:1 + chrX 2106349 5' + R2-element 329 1 70.30 CGCAGGAAGAAGAAGCTGCCGACCAGGTCGAGCGCAGCAATTGTGATGATGATGACCAGCCAGCGTTAGCGGAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCC:1 + chr3R 21212325 5' - 17.6 7116 2 82.18 AATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr2R 18891029 5' - opus 7491 2 60.20 AAATCCGAACCAAATTACATATTCATGTGCGGGAGAGACTCTCTCAAATGGGTCTCAAGGGCTCGTTTCAATTAGAAGAAAATTTCACTAAATGAAATTAA:1 - chr3R 12260553 5' + Tc3 1350 1 73.27 TCCTAGTTTCGAATCAAAATATACAAATAAGGGAGAGGCGATACCAAATGGTGGGAAGATGTGCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACT:1 - chr3L 16744853 5' - Gypsy6A_LTR 272 1 67.33 CAACGNAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr3R 9833035 5' + Tabor 6864 2 51.49 ATTCATCATCGGCAAAGGCCACTTTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACA:1 - chrX 10553316 5' + Tirant 8421 2 81.19 AAACGNGAACCACAAATTCTACGGCGGCAACCATAACTGCAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTT:1 - chrX 11059381 5' + I-element 187 1 61.39 CACACTCGCTCAGATGCAAGTACAGTGCAACCGGTAGCCGGCAATGTTATCGTCACCACACATAAACCTTCTCAAGAAGTCTGTGGACAGCCTTCTTCTTA:1 + chr3R 17014386 5' + Burdock 6105 1 68.32 CTTATTTTCAGCTGATGTCTTAGACTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTATTCATTCTTACATCGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTT:1 + chrX 11020025 5' - rooA 247 2 54.55 AACCTTTTCAAAGTTTTTCGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 + chr2R 13696033 5' + Doc2-element 246 4 64.58 CACAATTATCCGACCGATTGTTGTTTATTGTCTGTTATACCGCCAGAGGCATCCCATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAGA:1 - chr3L 22052533 5' + Doc3-element 4550 1 58.42 CACAATGGTGCGCACTGCGCCGCGCTCCTTGTGCTTCTGCTTCTTGCGGATGGTCTTCACAGTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTG:1 + chr2R 23905695 5' - roo 171 2 66.34 TCGGTTCGTAGATCGAACGATGCGGTGGCATATCGTCTTCGTCCTTAAAGGAGCCGCTTAAATTCGGCTTGTGTAAGAAAAAGCAACAGAATTTTACTAA:1 - chr3R 6387160 5' + Copia1_DM 4248 1 67.00 CTGCCGGCATGGACTTTTCGCAAAAGACCCTGCAGGATTACGAGGTTTTGGTTAGAAAGGGAAAATTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAG:1 - chrX 7891462 5' + micropia 5260 2 51.49 GAAGGNGTTGCGACTGAGGCTAGCGGCGCAGGACGCGATTGCGAATCAAGCGGAGAACCTGTCTGTTGGATTGGGGGCCTTCTTGAGGGGATCACTCATGG:1 + chr2L 16682786 5' - Quasimodo 6994 2 62.38 GCCATAAATCTAGCTGCGGCCGCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAA:1 + chr2R 8558130 5' - hobo 2632 1 78.00 GGAAGTTGTATGGCAAAATGCATGGACTTCAACAGGGCATCGTTCTTTTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAA:1 - chr2L 3707245 5' + Doc 4406 1 53.47 CTCCTGTTTTTCATTGCTCTTTTAGGGAAAGTAGAAGATTGCATCTGGACCTATCCATACTACTCTCTATATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTT:1 - chr3L 15665847 5' - Transpac 327 1 74.26 CTTTCAGTGCATATCAAGATACACGAAAAAATCCATCCGTGGAGAACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 5726782 5' - roo 9041 1 55.45 GTGCACACACTTGTACCTCCGACTCCTGGAGTCCTGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAA:1 - chr2L 3242990 5' - roo 52 2 66.34 ATTTCGTTTGTTCGATTCAATGTAAGCGGATTTGTTCTTAAAATAATGATTTCGGTGGCATTTCTTTCAGTGTACCAAAGTATATATAGATGGCGCCACA:1 + chr3L 3495329 5' - Transib-N1_DM 374 1 58.00 CATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCC:1 + chrX 21772491 5' - gypsy3 6549 1 65.35 CGAGTATATGGTCAGCTGGGGAAGTCTTCGTTGGATTCAGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTA:1 + chr3L 24212720 5' + Quasimodo 188 2 65.35 CTTGAGTCCTCGTTCATGCAATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2L 6177220 5' + pogo 51 1 78.22 TTTGGATGGGCTGAACTAGGAAGCTTCACGAAAACAATTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCG:1 - chr2R 17113510 5' - Circe 180 2 73.27 TTGTATTATTTTCTTCAATATTAGCCAGATCCGTTGCTTGTTTTCTTTTGAGCCGTCATCCGCACACCATCGGTAAGAAGGTCGTCGCGAACAAGAAGTTT:2 + chrX 8382753 5' + R1-2 170 1 58.42 TACATATACATATGTATAGGTACTACATATGCGTATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAAT:1 + chr3L 19246333 5' + Idefix 29 2 67.33 CATGTTTGCAGGGATGGAAATTAGTTGTTAGACAAGACAAATAAAAAAAAATCAAAACATTTTCAACTTTCAATTTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 + chr4 831743 5' - INE-1 156 1 70.30 GCCCCTGCACTCACAACCTCCAATGCCACCCACAAGCTTGGAACAAAACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCGAGGGAAG:1 + chr2L 256906 5' + G6 398 1 72.28 CGATACAAGTCATTAAGCCACAAAACCTAATCCTAACCTAGCTAAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGACCTTA:1 - chr4 993883 5' - Circe 7217 2 58.42 CACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 19450166 5' + roo 35 2 69.31 GAAGAATATTTAAATAGTCTTAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1 - chr2R 15002453 5' + 3S18 6 2 66.34 GTATGCGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 + chr3L 17858165 5' + HMS-Beagle2 32 2 63.37 GAAGCNGCAAGTTAAATGGGCAAAAAGGTTCGGATTTAAGGGGATCAAGTGGGCGAAGGAGATGTGGGTGTTAATATGTATGTGGTTCAACCGGTGGATCC:1 - chr2L 1932716 5' - transib4 2383 1 53.47 TAACGCCTCACAAGTGCCATTAATGTGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chrX 3306610 5' + hobo 48 1 81.19 CCTGGTGTCCTCCTTTAGAGTATACATCCGGTGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTA:1 - chr3R 3859299 5' - Idefix 21 2 77.23 CCAATNGCAGCTGCCTTTTTGCTAGGATTTCGGGTAGGGGCAAATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAA:1 + chrX 7093672 5' + Bari1 224 1 62.38 TACACGATTAAGAGTGTGTATCGTGGTTTTAACGATGCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTAT:1 + chr2L 15270849 5' - BS 4859 1 67.33 GCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 + chr3R 9833039 5' + Tabor 6868 2 53.47 TATCTTCCCCACCCCGTCATTATAGCACACCTTACTAGCTGATTCACCGAACTTGATCGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAA:1 + chr2L 7401190 5' + Porto1 365 1 62.38 TAGTGNCGCAAAGTATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 7654058 5' + jockey 15 1 71.29 CCGAGTTTTCGGGGTTTTGGCTGTCGTTTTCCGTAGGTCTTTGTGCTTTCGGTGCCTCTGTGCGAAGGTATATACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGAT:1 - chr2L 9856332 5' + HMS-Beagle 6796 1 77.23 ACCAGGCCATACTAATATTTCATTTGGACAATTGCACCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGA:1 + chr3L 24158475 5' - baggins 5210 1 64.36 TGGGCAATTGAAATACGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 + chrX 10555399 5' + Tirant 19 2 62.38 CAAGAGCATTTCGAGTCGAAATACGAACTATTTTTTTTTTAAGTCAACTGAAAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGTTTAC:1 - chr2L 9364398 5' - Idefix 7349 2 57.43 AATGCCGCAAGCAATGCGTGACGTTGAATCAAATTTGCTGCCACTGCACTTGTTCTTTAACTGGCAGGTTCAGGCTCAGAAAAAAAAAATGAAAATAAAAA:1 + chr3R 21842493 5' + Doc2-element 252 1 58.42 AGAAATATCGATCTAAGTTTAGCTGTCTCCAGCTTCGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACAT:1 - chrX 22413501 5' - invader2 493 1 79.21 AACTCTTTTTTCAAAAAGGCAGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 + chrX 17692584 5' + 3S18 27 2 50.52 CCACAAAAGCCTTCGAGAAAAGACAAGAAAAAGCAAAAGTTATTGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGC:1 + chr2L 5162577 5' + Bari1 1678 1 56.00 CATCTGCTATCAGCGAATACCACTGCAAACGTAAGAACGGGGATAAGCAATGGGGTGGAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTT:1 - chr3L 10897986 5' + I-element 477 1 62.38 CGTCTGTCGGGGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 + chr2L 19845899 5' + F-element 38 1 49.50 ATTTTNTTGCAAAAGGAGGTATGCATATGTTGGTCACAAAAACATTATTTAGCTGTGTTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATA:1 - chr2L 13370000 5' - 1360 404 1 62.38 GGACAGGACAATATCAACTGGACTACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTC:1 + chr3R 6171384 5' + HMS-Beagle2 6847 1 76.24 GCAAACGAAACTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chr3R 19495291 5' + blood 7177 2 89.66 GGCTAATGGGCGTGGCAAAAGGGACATGACAACTCATAGTTAGATCTACGATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGAAACCGA:1 - chr2R 22031976 5' - Cr1a 4106 1 78.22 CGGAGGGCTTTGAAAAACCTTCGTTGAATGTGGTGGTTTTGCAAACAACTACATTCAACGAAGGTTTAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCT:1 - chrX 1556962 5' + F-element 325 1 51.49 CAAAAGTCGGAGCTGGCAAAAAGACCGTGTTGTATGAAAGCAATGGGCCTCTTTTCTTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTT:1 - chr3R 25900965 5' - X-element 4442 1 55.45 TTGGAAAATGCGCCGCACTTCTCTTATCCCGGCTTGAACACAAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCAC:1 - chr2R 21501371 5' - R1A1-element 23 1 63.37 ATATGTAAGTATTCCGGATAGTCCACTTCCGCTGTGTACTTAATCTCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTCCTAAGACCTCGACGTTCATTCGGACTGACGGA:1 - chr4 621784 5' - INE-1 126 1 76.24 CGTCTGAAATAAATGAAAATGCAGAGCAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCAAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCT:1 - chr3R 13489898 5' + Doc3-element 4409 1 73.27 GGGACNAGCGATTTTGGGTTTAGCTTCTCGATTATTACATGGGCCAATATTTGCCGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGG:1 + chr2R 13243301 5' - hobo 70 1 59.00 GGTTCTGAAAAATGAGAAATATGCGAAATGTTCTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chrX 15384801 5' - 412 451 2 65.35 GAAGCTGTTTCCGCACCTCCCCCTGTAAACACAAGAAAGGTTAGTTATCGATCAAATGTATTGTTTACATTAAAACGACCAAAACAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 4846195 5' + R2-element 3585 8 75.25 CTTTGGCACTGGAGATCATGGCCGTGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTGACCGTTC:1 - chrX 22866720 5' - HMS-Beagle 72 2 70.33 ATAGCATGTATGTACTAACTACGTATCGGCGCATGGTCGGATACCTTTGCCTACGCAAGGGGGGGGAGAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 - chrX 1656048 5' + Max-element 8244 2 62.00 TGCCTGCTGTTTATGATTGTTTTTTCATTTTCTCAAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTTCCGAATGTATTAATTTGCATCCTCCGATTTTGTA:1 + chr3L 6457538 5' + Gypsy12A_LTR 2065 1 73.27 ACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGT:1 - chr2R 5173185 5' - Stalker 358 4 75.25 TTGTCGCCAAAAATCAAAACGATGTCTTTGCTTAGCTTGGCTCTTTCAGGCAAATCAAACATTGCCAAAATCGCTGTACTGCCTCTCTGCTGAAC:1 - chrX 18823228 5' + 3S18 5723 1 71.58 GTTCCAGGGAAAGTTGATTATTCGGTCCGATAGGTACTCCGCAGCCTGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCT:1 + chr2R 5102667 5' + jockey 489 1 61.39 AATATCGTCGACGTCGTCGTCATAATGCAATATTCAGTTCTTAATTTCCATACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCG:1 + chr2R 20947384 5' + 1360 2974 1 57.43 CGAGAGTGTAAGGACTACACTGTCAGAAAACACTGGGCTGAGAAGTTATTTAGCACTCCCAATTTTAGTAATAAAGCAATTTGTAAGTCCTCACATGATTA:1 + chr3R 12780262 5' + BS 4991 1 64.36 CAATATGCAATTTTCACACCAACGAGCAGGGCACCGCCCTTTTGGAGATGGGGAAGATGCAGCATTCCCCC:1 + chr3R 25823820 5' + aurora-element 463 1 63.38 CTAGTGGCCACAGTCGGAACGGCTATGGTAGGTGGACCGGGCACAAATGTCACGGGTTGGCGGGTTGGAGGTCTTGTTGTTTTTGTTGTTGTGTTTTTTAT:1 - chr2L 16814493 5' - I-element 122 1 54.46 TGAACNGAAGCGGGGAATTCAATTTATATGCAAATGATATGCGAGGCGGGCTGAAGACAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTGCTGAATAA:1 + chrX 4241748 5' + Tc1 225 1 64.36 TGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2L 9823655 5' + hobo 32 1 69.23 GGCTAGTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGAACCCGCAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr3L 22564795 5' + blood 7012 2 70.21 TTTTCNCACGCTCATCTGCGAATGTTCCAATTAGACACCACACTATATATAGTACTATATAGCCGGCAGTCATCCCACACCTGCACACACACACACACACA:1 + chr3L 15707510 5' + accord 180 2 77.23 GATAGCTTCGTATTGCTTCCTCATAGTGACCATCGTTCTCTTTTGCCTTGGCATACGCGGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACT:1 + chr2R 19488564 5' + 412 7169 2 61.39 CAAGTAGAGAATTGCTCAAACAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAGTAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGT:1 + chr2R 13747698 5' - F-element 340 1 79.21 GCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGA:1 + chr2R 5284583 5' - Doc4-element 2593 1 73.27 CAGAGCAGGGTGTCGAGGCACTCGGAGCACTTAATGTACGGCTCTGTGAGACTGCAGCGACATGTGGCACATCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTT:1 + chr3R 18254945 5' + accord2 7265 1 70.30 TCCGCACCTGTTCTGAAGCATTTTCTGCTCTCTCCCTCGCTTCCCTTCTTCTTCTCACCTGCCAAGGCACGCTCGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 - chrX 17561926 5' - accord 183 3 62.00 TCGTTCGCAACTTACGCTCAAGCACTCCATCGCCGTGCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTGCTTCCACAACTTCATGTTGTCACA:1 + chr3L 652696 5' - flea 4669 1 63.37 CCTTCTAAATTTCATAATTTGTTCAGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGA:1 + chr3R 12534716 5' - 1360 3168 1 75.00 CGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr2L 23372627 5' - 1360 3351 1 68.32 TCGAAGCGCCGGTTGAGCTTCTGAAGTCCAAGGTTAAGCCTTTATTTCGGGTGATTGCAATAGTGGTAGTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTT:1 - chr3L 5183124 5' - I-element 5052 1 77.23 GCACACCTTTGCCACCAAAGGGTGGTGGTGATGCGGTGGCGAGTTGAAGGGCATGGGGTTGTGGCTTTTGTCGTTTCATAAAACCGTGCTGACACGGTGAT:1 - chrX 17991586 5' - Q-element 198 2 74.26 CAAGACAAAAATGTAATACACGATTCGGTATTCGAACATTTCTGCGCAACAATAGAATAAGAACCTTTAATGATCAAAAAAGATTTACTCTCTGATTAGAC:1 - chr2R 1076557 5' - FB 293 1 77.23 ATCATTTTCTTTTCTTTACCCGAAGTAAGCAAATTTTCATATAATTGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr3L 5469031 5' - 1360 3325 1 55.45 AGAGTAGGTGGAAATTTGGCCAGGAGGTGGCTATATCTTTAGACAAACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCTATCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCT:1 - chrX 18122166 5' - R1A1-element 271 1 57.43 TTCTCTTTTGAACCAAACTGCATTTGGTATATGTATATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 - chrX 19885238 5' + HMS-Beagle 6833 2 67.33 TAATGAGGTTCGCTGGTTTTGACCATAAATCGCAGTGGGGCCAAACCGCCTTCAAAACTATTCGCGGCATTTGTGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATAT:1 + chr3R 13590521 5' - 17.6 451 2 67.33 AGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATA:1 + chr3R 1047953 5' - Stalker2 391 2 66.34 ATACATTACATACAGGTGTTTTTACTTTTAGCTAGTTATCTAGCTATTTGAAACCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATT:1 + chr3L 3199207 5' - Ivk 4979 1 57.43 AGACCAAGGAGAGCGAGAAGGGCGATATTGAGCAAAAGAATCGATTGCTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAA:1 - chr2R 18685055 5' + HB 1304 1 52.48 GTTAAGAGTCTATCCCGAGCCTCCTCCACCGCCAGCCCTCGAGTGGTCACACCGACTCCAAACCACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCA:1 - chr2L 5318895 5' + I-element 147 1 74.75 CAAAAACCAATCTGAAATCTGCGTCCCAGCAATTTGTCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAA:1 - chrX 3086716 5' - hopper 64 1 63.37 TACGAGAAAAAACACACGAGGCAGAAGAGGCAGCTGGAGAAGAGAAAAGCTTGCCAACTAGGCGGGGACGAGCATTTGAATAATTTAACAAAT:1 + chr3L 22371835 5' + invader2 401 1 58.06 AGTTCAAGAACATTAAATTCGCAATAATATAAATGTTTGATATTGCGCAACGTTTTTACCTTTATTTTACAATGCACGAGCATACGTATGCACACATACAG:1 - chr2L 22579319 5' - 1360 174 1 77.23 ATCAGGGACACAAACAACACTCAAATTGTTGGCCAGTTTCAGATTCAAATGGCAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTAGAGTCGAGTGG:1 + chr2L 17049542 5' + flea 115 1 58.42 GACGTCTTCGCTGGACGCATTCCTCTCGATGCCCAGAATCTGGTTCGAAAATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCC:1 + chr3L 22075575 5' - baggins 5001 1 62.38 AGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3L 5827890 5' + blood 43 2 64.36 TCACGCCTCTCCCCCCACATTTTCATAATTTTATTCCCCAATATCATTTTTGCGTTTGCAATCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 + chr2R 5794767 5' + INE-1 556 1 80.20 TGACCAAGGAGACAAACAGTGGCGTGCGATCCCAACCGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCAGAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACA:1 + chr2R 17433703 5' - micropia 181 2 66.34 ACCAGCATCGAGGCATCGAAGTGCCAGCCTTGGGATGGTGGTCTCCGCGGACGCCCAGCTTCCCCCCCCCTCCTCACTCCTTATCAACTTTGGAGAAGATG:1 - chr3L 5854972 5' + G6 303 1 53.47 CACCTGTTGGCCAGGTGGATTGTGTCAACTTTGCCGCTGCGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTG:1 + chr2L 2198279 5' - R2-element 279 1 68.32 AACTGAAAAGGTGAAAGACAAAGGCAACCATATGGACGGATATGCGTTCACATGCATTGATCGACTGGCTCAATTCTGCCTGTAACATTCTTTTCAACGA:1 - chr3R 7393678 5' - INE-1 18 1 72.00 ACAAAAAAATGGTAGCGGTGAGGGGAAAATATAAATCATAAATATCGCAATTAATCTAATGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATT:1 - chr3L 23662449 5' - 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F-element 303 1 65.35 TCGCTCAAGCGCCCGTTGAACGAATAAAACGGCCCAAAGACTTGGCCTCACATCCTGCTCACAGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTATG:1 - chr3L 3258159 5' + Rt1b 4988 1 54.74 CTACTCGTTTTAAGACACCAATTAGAAACTTTGATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAATACCGCTAACACGGGCTCAAGCCCTTA:1 + chr3L 11367196 5' + I-element 155 1 64.36 CTTTTGTAGGTTCTAATGAAAGGAGATCAACGATCGAGTTAGTTCTGGTTAAGTCTTATACATATTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGG:1 + chr3R 7349203 5' - Stalker2 244 6 57.43 TGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCA:1 + chr3R 26331643 5' + G-element 32 1 52.00 AAATACCACACGCATACACACACACACACGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAATATCCCATCAGTTTCCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAA:1 - chr3L 9548004 5' + F-element 4423 1 43.56 TAGAAAAACACACGAACGGGATTCTAAAGAAATGTCAACTGTTATTTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGA:1 + chrX 3387220 5' - F-element 4514 1 72.86 AGGAAATGGAACAATAAGTTTTATAAGATTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCT:1 + chr3R 27572983 5' + gypsy2 6697 2 72.28 TAGCTCAGCGTACACAATAGTATTATCCAATGATCCAGTAACACGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACACACAACCAAAAAC:1 - 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chr3R 18516154 5' - BS 4801 1 53.47 GACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 12578165 5' + jockey 57 1 74.26 AGCTCTTGAGATTTGCATACCAGATGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTGGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 + chr3R 10490331 5' + transib2 24 1 52.48 CAGGACGAGGGCAACCACAGTCTGGAGGGCAGCAACAAGTCCCCCATGGAGGCGCCCGCCTCAATACGCATGTGCAGTAATTATAAATATACAAATATATA:1 + chr3R 30929924 5' + Stalker 90 4 56.44 TCCCCTTTGCTATCAGGACATCTTACTTTCTAAGTAAGATGTTAGAGGACAAAAATTTGCCTGTCTCTAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAAA:1 + chr2R 7936738 5' - invader2 4631 1 80.20 TAGACAGAGACGGACCGAATGATAAGTGTGGCATATGTGTGCGTGTGTTTGTGTTCGTCGGACTAAATCACACACTGCTATTCTAATGAACAGCCTAAAAG:1 + chr3R 21966809 5' - HB 200 1 69.31 ACTTGAATGCCACCACATGTTCCATGGCCATCTTATCAAAGTGGGGCTAAAACCAAGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCA:1 + chr3R 31995899 5' + P-element 2778 1 60.40 CCACAGATCGAGACGAGAAACTAGAAACCCAGACACTAGGCAGGCATATACATAGCCACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGCACAAAAGCA:1 - 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BS 4709 1 68.32 ATTACATGATAGAAAGTACCGCCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCT:1 - chr3R 16291874 5' - invader4 2965 2 78.22 TGAGAGATTAGCACAGCTAAAGCAAAAGTAAATGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACA:1 + chr2R 9328873 5' - 1360 3161 1 67.33 TAAAATATTTGCTTGCCGATAAGTTCCTAATTAAATTAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr2L 20128976 5' - 412 460 2 58.33 GCAAAAATGCAATATACGCCAGTTTCTTTCAGTGCATATCAAGATACACGAAAAAATCCATCCGTGGAGAACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chrX 5726807 5' - roo 403 1 73.27 GGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 2090305 5' - roo 9049 2 57.43 ACGTCCTGTAACGGTCGCCATATAATATTTAAAGGATACCAAAGAAGGTTCGGTGTATCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTC:1 - chr3R 1252390 5' - Stalker2 334 2 66.34 AAGCAGCAAAAACAGCAAACAGAGTGACGTCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGAGCGTAAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAG:1 + chr2R 12991809 5' - Doc 488 1 61.39 ATACTCTAACTTTAGGTTGACAAACAATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGCATGCAGAAGGCATTGA:1 - 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chr2R 2306505 5' + invader3 5252 2 66.34 ATGACAAAATATACAAAATAATTGTTTTTATCGCGAATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chrX 3485630 5' + P-element 22 1 57.43 TGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 2090279 5' - roo 360 2 70.00 ATGCAAATCTTGTAATGAGGTGGTAAAATACAAGTTCTCTCGCTTTGTCTCCCTCTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAAT:2 + chr2R 12536292 5' + micropia 86 2 56.44 GTGTGCATTTTATTGTTGCAATTATCGCCCGACGACCCTTGTTGCCGCAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTT:1 + chr2R 22780967 5' - roo 9048 2 55.45 AGCATGACTGTGCTGCTTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr2L 20840409 5' - Transpac 296 2 63.37 CTGATTCGGTTTTCTTGCCGAACCATCATTTTGCTGGTAGTGACTCGTGGGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTG:1 + chr2L 16349085 5' - jockey 4717 1 54.46 TTACGGATTGAATAAACAAGGCCAAGAGCGAATGGAATGTGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2L 18275548 5' + 412 14 2 40.59 TGAGTCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3L 2182736 5' + blood 29 2 53.00 AGCGACGGATGTGTAAAGATGAATAAGAATAACACGCGTCCGGTTGAAACTCGAAATAAATAAAAAACTAATTTGCGGAATTCGACAAAATGAGTGTGTCA:1 + chr2L 22215373 5' + Copia1_DM 319 1 71.29 TGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTAAACAAGTGCA:1 - chr2R 4879042 5' + G-element 9 1 71.88 CACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCATGCTTTAGAG:1 - chr3R 19446512 5' - gypsy12 10151 2 69.31 GGGGCATTTGGCAAATAAAAAGCCACACAAATAGCAACAAATCAAAATGGTGCCGAGACGACTAACACAGCGATAGGTTCCTCTAACCATGCTTGTCGGAG:1 + chr2R 18229450 5' + R1A1-element 4886 1 62.38 ATCAATTAAGCAACAAGGTGCTCCACACACACACACAAATACACACACACACACTCAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAA:1 - chr3R 29469805 5' + Quasimodo 96 2 69.31 ATTTATAGTTATATTCAATTTCCAATTCCACACCTTTGCCGTTTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCAT:1 + chr2L 17108449 5' + diver 212 1 57.43 CAATCACAATTATTATGAGACATGTTAAATGGACCAAAAGTCCTGACAACCAACAACAATGATGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGA:1 + chrX 7260169 5' - F-element 209 1 68.32 CGCTTACGTGCACATCTGTTTCCTGAAGCAATTCCTCGAGCAGTATCTCCACGAGCTGAGCTACGATGGGGTGAGACTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTA:1 + chr2L 19523659 5' - Idefix 7022 2 68.32 TTCTCNCGCGGAGAAGTCGTCGTCGTTGTCATTGAAGATGCTACATTGATGCGCGCGTGTGAAAAATTAATAAGGGAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCG:1 + chrX 6216625 5' + 1360 457 1 59.41 CAACCATGTGCAGCTAACTCTCACCTGTCCTTCACCGACCGCGTCTGGAGTTATAATGCGGGCAGTGAACAAACTGTGTCTGCTTCCCCTTAAGGACTCTG:1 - chr4 739984 5' + diver2 4481 1 62.38 TGCAAACGTCAAAACAGTTGCAGGCATTAGATATGTGATATTTGATATATTGCAAATATACCTTATATATTTAATCGTTGTCAACCCTAGAGCCGAGTGTC:1 + chr2R 22822549 5' - rooA 7130 1 74.26 CAATGTTGGAAATTAATTTTTAAAATGAAATGTTTTCGTAAATTATGAGGGAGCACCTAAAGTCTCTGGCAGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTT:1 - chr2R 17198563 5' + Rt1b 4693 1 52.58 CACAGCACAGCTGCCGTCCAAATAGAACCAAAGATTGTTTCTTGATAGGCTCCTGAATCATAATAGTATTATAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTG:1 - chr3R 4641073 5' + transib2 2698 1 58.42 AAACTGCTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr2L 17862281 5' + F-element 10 1 72.83 AATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCC:2 - chr3R 934254 5' - Rt1b 4755 1 51.49 AACTGACTGTCAATTTCATTTACGTTTTCAATCCATTTAGTGTAAGCCCAACCACACAACACGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chr3R 31996775 5' - mdg1 406 2 64.36 GCACCCCTTTTAAGCCCACAAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAG:1 + chr3R 31293640 5' - hopper 395 1 80.20 GATTTGCATACCAGATGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 + chr3R 10490340 5' - transib2 2791 1 60.40 TGTGGTCTGTGTGGCTCACCTTTGACCCCCATTCCGATTCCCATTTCCCAAACAGCGCCTTTCAATAAGCCGTTCCCCATAGTTGGATGCCATACGTCCAG:1 + chr2L 15917953 5' - G7 854 1 71.29 CCGATATGCTGGGTCTGGCGGCCAAATATTTCGCGGCCCAAAAGGAGCTGGAACTGAAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAG:1 - chr2R 12467089 5' + Bica 10 1 61.39 AACTCAGTTGGCCAAATTAGATGCGGGATTAAGCTACATTTAAAGTGAATATTAGTTTAGTTGGGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAA:1 + chr3R 9830628 5' - Tabor 424 2 66.34 AAATTGAATTCGAATTTGAATCCGATTCGGTGTCGAATGTGCACGTTTGGCCCGTAATAAGTGGCTACACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 - chrX 16619703 5' + opus 5 2 74.26 AAGCTAAGAGATCCCTGCTCCTACTTCCATGACCACTGACGTCACAATTGTCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTATGCTCTCCGCTCCCTTTTACGCTCTCCC:1 - chr3L 8442445 5' + GATE 8281 2 55.00 ATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTT:1 - chr2L 23069854 5' - Stalker4 6871 2 71.29 TCTCAGCTATTTCTGCAAAAGCACACATACTTCGCTATGTTATATATATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 8299749 5' - roo 9044 1 57.43 GGCGCGATCCACTCCCAGTCCCGCGTTATCGAACTTCAAGGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTC:1 + chr3R 31215744 5' + 17.6 225 2 60.00 GCCCACTAAAGAATTTATATGCCAAATAATACAGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACAT:1 + chr3R 19826926 5' - Rt1b 4819 1 67.33 TCATAATAAAAAGACCAAAGATGATAAGAGTGGGGTCCCAGTGCACACACACACACACACACTCGCAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2L 12807874 5' + hopper 7 2 59.41 ATGGCCTTCTTGAACTTCTGGTGGCAAATGTGGCAGTCGATGATGCGGTGCAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGT:1 + chr3L 6188108 5' + invader4 2917 2 54.46 CTGCAAGCTCGTTAAATAACCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTC:1 + chr2R 5616578 5' - 3S18 6048 2 79.21 TTTGTTTTACCCATCTCTGTCTTAATCCACCTTGTTGGTGTTGTGTGTGTGTGCGATTGTCTCTTTGCGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAA:1 - chrX 10366047 5' - accord 239 2 78.22 AACGCNATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 + chr3R 9833036 5' + Tabor 26 2 50.50 CGGTGGGTGGTGCATTGCAGTGACACGAAGTGGAGCATAGATAATGGCAATTGGCTGGGCATTTTAGATTAGCACGGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAG:1 + chr2L 2797107 5' - F-element 4520 1 68.32 TTCTTTTGCACAATGTAAATCGGTCAAACCAATCAAAAGCGAAAAAAGAGCAACAATGCCCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 9653262 5' - roo 392 2 63.37 ACGGGGTCTACTAGGCTGAGACTGCCGGGCTGAGATCAAGGAGTCGCGAATGCGGCTGC:1 + chr3R 2451632 5' - Quasimodo 7045 2 72.88 CCGGCTTTCTTTCGCCATTTGCCGGTAGTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAAT:1 + chr2L 15168812 5' - mdg3 5033 1 72.28 TTTTANCTAAAAATATCTGAAACTTTGTTCAGTCCATTGCTGTCGAGGAACTTTTGTCGTTTACCCTTTTGCCACGACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAG:1 + chr2R 22853886 5' + invader2 186 2 77.23 AATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATAT:1 - chr3R 23499196 5' - Juan 3765 1 66.34 AGACTNGGAGGATGAATATTCATTTCACGAGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3R 22675786 5' - 412 482 2 64.36 AAGCCGCATTTGGTTGATGATACAACAGAATATGTAAGCTTTCTCATAGTGATTCCCAGTTCAACATTACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCA:1 + chr2L 19331078 5' + I-element 5109 1 64.36 GGAGCTGATGCACGACCTCATCGATTCAATCAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAACTAAAAA:1 + chr2L 9921920 5' + Idefix 7323 2 75.25 TTCATNCGGCACTTTTTAAAGACTCAAACGCAACACCAGCTGCTGGCCATTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAA:1 + chrX 16393248 5' + I-element 5146 1 52.48 GTAGGTGAATCCATAACGGCGACGATGTTGCCAACGTCCAAACAAAGCCAACTGCACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACA:1 - chr3R 19687204 5' + Copia1_DM 146 1 52.48 AATGATTTTGGCTTCAAGCATATCTTTGATATCTTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr2R 8125088 5' + Doc 46 1 69.31 TGGAGGTGGCCGATTCGCCTCTGCTCCATGTCTTTCCCTCAGCCACTGCCACTCTTTCACTGGATTCCTGCTCCTGACGTTTTTTGTTTTATCAATTATAT:1 + chrX 13624230 5' + Tc1 1481 1 66.34 ATGACCACTCGGTGTGCGATCCATAAAAACACAAGATTAAAGACAATGAGAATTGCTGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTC:1 + chrX 10957712 5' - Quasimodo 7013 2 59.41 TTCCCCCTCGTTGCCACCTCGGCACAAAAAAAAAAACACAAATAAAATAAAAAACGCAAAAAACAATTAAAAAAGCTGTGTGTAAATAATTTTGATGCATA:1 + chrX 7156924 5' - Bari2 99 1 55.45 GGTGTCTGTGAAGAAAGAAAGAAAGAGAAACATTTGTAAGTTTATCTAAAGCGACCTTGCACACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:1 - chr3L 16266115 5' - Burdock 6382 2 66.34 GGTGTNTCTACAACCTCCCGAAACGCGTATTCACTTCGATTTCCGGGTTCTAGCGCTGCAGCATTGTTTATCTACCATACAAACTAAAATTAATTGTACAA:1 + chr2R 22122394 5' - Chouto 5872 1 75.25 ATTTACTCGGACTTATGTGTGATGATTGTGGGTTAATGGAGTGACAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGG:1 + chr2R 11487645 5' - Doc 475 1 59.41 CCTTCTGTATAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chrX 17947365 5' + hobo 10 1 55.07 CACGCNCACACGTAGGCGACGGCTCACCAACACTCATGCAGCGCGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCC:1 + chr2L 8735695 5' + 1360 3342 1 62.38 TTAGAGGCTACACATGGTGATTGGTTTGATGCTATATCGTGAGACGATATGGAAATGTCCGTCTGTCGGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 - chrX 659481 5' + INE-1 148 1 58.42 TTAAAAAGTCCACAGAATTATTATATCTGTGTAAGTCCAATTGGAATCGAGGACGAAGATATTTGGGAGATACATTTATTATACATATTTGTAATAAAGAA:1 - chr3L 2806421 5' - accord2 7520 1 57.43 GTAGCGTAAACATGCTGGGAGATCTGTGATAGAACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGG:1 - chr2L 15271186 5' - BS 4790 1 67.33 CACTCATTTTTCTGCGGTTGCCCAGAGACTTTTACATTCAGGAAAATGTGTTGCAAAATCAGGAGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2R 9653249 5' + blood 7023 2 67.33 GTTGCTAGTCCGATGCTGTTACCGCTGCTGCCGTTGACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGC:1 - chr2R 5894919 5' - Doc2-element 4478 1 68.32 CATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chr3L 776137 5' + 1360 57 1 78.22 GTGAAGGTGGTGTCGTTAAAGTTTTAGGTGGAGGCAAGACAATAATTAGAGATGCTAGTCATCTCAAGAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAA:1 + chr2R 3031901 5' + F-element 4455 1 75.25 AGAATGTACAACTCAAGCTCACAAGCCTCACTCCAGAACACGAGCCTCCATCTACAAGTTCCGCCTGACCAACATGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTT:1 - chr3R 4660849 5' - accord 465 2 77.23 AGCGANAATGATTGATTTTTCGTCGTGCGTCTTCGGGCGAGTGGCAGCTTGTGTGAAGAAATAATTGAAATGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAG:1 - chr3L 8953296 5' - baggins 5132 1 60.40 AAGCAGCGCAAACGGCAATGGCAACAAGTTGCTGTCTGTCTGCCTTTGCACTTTAAGGTATTGGCGGCGAAAGCACCGAAAAATAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 15153022 5' + gypsy7 5006 2 67.35 TAGATTTCAAGAAGAAGTGAGGAATACAACATGTGTTTGCCCAGTTTTTGATAAGACACGACATATAATCGAAAAATCTGAATTCTTTAAATTAGAAACAG:1 + chr2L 7315411 5' + TLD2_LTR 159 1 58.42 AACTCCGGTCCAATAACCATAACCATTTCCTTCTCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAAC:1 - chrX 20897594 5' + F-element 334 1 66.34 GCTATTTGTTGTTTTAGTTGTTATCGCCTTTGTAGTTATTGTGCCAGCTGATTTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACC:1 - chr3R 19701247 5' - F-element 316 1 62.11 TCACAAATCAGTGCGAATGTTTATGCATGAAACCAAAAACGAATTACACGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAACAGCAA:1 + chr3L 6686566 5' + I-element 442 1 71.29 ATATGTGACCCCTGACCCCACCAAACCACCAAACCACCACCCACCAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCAT:1 - chrX 17607127 5' + R1A1-element 5005 1 52.13 CCATTCGGACCAAACCGCAGACTCGCAGAAACATATGGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 - chr3R 23618224 5' + hopper 18 1 60.40 CTCATGTTTCCTTGGAATGTTTTGGTTTTCATCTCATTTCGATTTTCCCTGTTTGGTTTTCTGCGGCGGCTGATGTGATGGGAGGCAATAATGACTTTATT:1 + chrX 13866313 5' - accord 7307 2 69.31 ATAATGTTTAACTGATTTGTAGTACTCTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTCTATTACGAACTAACTACAAATCGAATTTATTAAGGCCGCCA:1 + chr2L 6209641 5' - gypsy10 255 2 75.25 CGCTCCCCAACTCCTCCCCCCCGACCACCCAAACTCTTTTGGCCGTCCTGGCCCAGACTCTGACTCAGCCTAAGCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAAC:1 - chr3R 10738598 5' - invader4 2693 1 75.25 GCTTGATATTATTTCTAGCTGTGCATTTGGAACGGCTCACATGCGTGTGGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 - chr2L 1629654 5' - hopper 1391 1 51.49 ATTGAAATCCAAAGTCGGACTCGAACTCGTGACATGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAG:1 - chr3L 18151516 5' - Quasimodo 6896 2 65.35 ATAAAACACTTAAAAAGCATAGCACTCAAAGCGGGGCTCCAATAGTTTCCATTCTCACGTTATAAAGAGTGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGC:1 - chr3R 16830369 5' - G6 268 1 71.29 CACACCAGTGCTCAATACAAAATCCACGCCCACTTACCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTAGGGTTCAGGGCTG:1 - chr2R 14428223 5' - baggins 5321 1 63.37 TATGAATACCAATGAAAGAGTGGAAAAAACACTCACTGGACAGCATAAGTGGCAAACTGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGA:1 - chr2R 7024631 5' + rooA 7360 2 71.29 CGCTCGAATTAAACCTCTCGGATTGAGATACAAATCCAGATCCGAATCTGAATTCGAACTGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTT:1 + chrX 3158918 5' + R1A1-element 5096 1 66.34 ATTCCAATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTC:1 - chr3L 10464683 5' - invader3 5415 2 77.23 AAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 - chr3R 5775731 5' - invader4 3043 2 69.31 AGAATTAAAACACCTAAATGTCTCTTTCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 62975 5' - roo 356 2 74.26 GACGCTCACTTTTCGGTAATGCAAATCGTAAATTGAGCTTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTG:1 - chr3R 6769461 5' + micropia 202 2 61.39 GCAAANCACGAGTCCTCGTCTATTGTCTAAAGCATGGCCAAGTGTTTGTTAGCAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACT:1 + chr3R 21998064 5' + hopper 1292 1 56.44 GGAAACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTGATAGGGCCCGAAATGATGCCGCACGCCTTCGCATATCAGGACGACATTTCGAAATCGTACTGTTGCAGCT:1 + chr3L 25232768 5' - Osvaldo 183 2 74.26 TAACCNTTTCATCCATTACGGTGAACGGTCCCCAAGGATGGGAAAAAAGAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 776068 5' - 1360 3385 2 72.28 ATAAGGGAACCACCGCACTTGACCAGATCTGCGCAATGTATGTCGTTACGATATGTAATGTATATGGAGATGTATATGTATATGTATGTATATGGAAATGT:1 - chr3L 6037421 5' - ZAM 8151 2 74.26 CCTTCTCACAGCGCGAGTTCACCTTTCCCCGCGAGACACTAATAAACGAACTGAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGT:1 - chr2R 13504719 5' + flea 4775 2 49.50 AAATTTCCAGGCTTCGGACTCACTCCGTCATTATGTTTTATTTAATTTTTTATTTCACCACTCACTACTAAAATCCCCACATCCACTGCCGTCACATGTTC:1 + chr3R 26665372 5' + accord2 7357 1 66.34 GTATGCGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTAT:1 + chr3L 17858165 5' + HMS-Beagle2 32 2 61.39 AGTCTGCAATTTAATTAGACATTAAATATTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 9552182 5' - roo 9025 2 73.27 AAGCGAAGCATTTGTTTTTAGCCGCTCGTAAATTATTTTTGCTTTGTTTGCACTTCTCTGCACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCC:1 + chr3L 15643743 5' + Ivk 384 1 64.36 CATTTTGCGTTGCATATCTATTGATTGGCTTTGGATTTGCTGACGGCATTTCGCCTTGCTTTTGTTGTTTAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAG:1 - chr3R 21612800 5' + Doc 4491 1 71.29 CCCGCNTCATAGTGAACAAATGAGAGTGTAAAACCACATAAATTTTGCATAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 3947406 5' - roo 385 2 53.47 ATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chrX 21668884 5' - mdg1 381 2 65.35 GCCAAAACGTGATTCAGAATTCAAAATTACAGCCCACAGGCTCTCTGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGC:1 - chr3R 22673960 5' - 412 315 2 60.40 CATTCCTGCAGCGAATCACCTTCGGATTTCAGAAATGGGGAGCTGTGGAGCTAAGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTA:1 + chr2R 12773570 5' - G2 2975 1 55.45 TATATGCCGGCTTTCATGCACTAATATCCAATTTCTGAGAGCACTGCAGGCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATACATTATACATATT:1 - chrX 13059611 5' - accord2 101 1 56.44 CCCGCCCATATTTTTCAGGGTAAGTTTTTGTTATTTCTAGCGCATATCTCAGCCACGTTCTCATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr2R 11257834 5' - pogo 2090 1 65.35 CTTTTATCCGAGAAAATTCTCCTGCTCCTCCGAATGCGACTATCCTAGAAGTGATTAAGCGCATTTGTGCTATCCATACAAACACACACACACACACAGAT:1 + chr3R 12805370 5' + accord 183 3 75.25 ATATGGGATGTATGCTAAAGTAAACAGATCTAGTTAAGTAACATGGCATACTAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGA:1 + chr3R 29713995 5' + mdg3 5394 2 56.44 ATTGTTTTGACCAACCAACCACTTTCGCTTAAATGGGGCAGCAGATCGCTTAGATTTGCCCCTCTTTGTTTATTCTCCCTTATGTGCGTTGTTCGCAGTGC:1 + chrX 10575218 5' + Cr1a 227 1 75.25 GCCAGGAAACAGGCAGTGAAAATTCTGACTGACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCA:1 + chr2R 18061023 5' + F-element 401 1 69.00 GGCGACGCTTAGGGTTTAGAAATGAACTTTTATTAATGTGTTACAATAGTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCAAGCACACG:1 + chr2R 4622209 5' - Bica 60 1 74.00 CGATACGCAATCCCAGCAGGAACCCCACTAGAACTAGACCCACCCTGGAGACGCAGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAA:1 + chr3L 6948429 5' + G2 240 1 63.37 TGCCACCCACCGTCATTCCCTACCACGCCCACTCGCCCACTTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATAT:1 - chrX 16849386 5' + accord 6924 2 62.38 TTACGTTTTCAATCCATTTAGTGTAAGCCCAACCACACAACACGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 - chr3R 31996756 5' - mdg1 7425 2 57.43 GGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3R 19535763 5' + hobo 23 1 54.64 CTTTCTGTCTGCTTGGCCCCCTTTCCTTCTTATACCCTTCCAGAGGGTATTATACAAATTCAGGAAGAATTCACACCAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAAG:1 - chr2L 20907196 5' + INE-1 547 1 74.26 AGGAAAAGCAGAAGAAGCGGGGGAGAAGAACGCAAAGACCGGGCGAAAAAAAAGTTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAA:1 - chrX 20575231 5' + pogo 459 1 58.42 TTTGGTGTCTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACG:1 - chr3R 18860378 5' - R1A1-element 5286 1 74.26 TGAAGTCTTGCGTCGGCTCAACTGCAAAATGCTTTTAAGTTGTTTTTGTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTTACACATATATATA:1 + chr2R 12909834 5' + blood 179 2 82.56 CTTTGGCACTGCTCTGTTACAAGGTTTATGGATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 + chrX 2253820 5' + Tirant 24 2 57.43 CAACATGACACGCACACAGGCCCAAATAAATGGCAACAACCATGTGACCCGCCTATTAATTAAAATTTTTGTTGATTCTGGCTACTGGGAGCGCACAAGTC:1 - chr3R 11035460 5' + Rt1b 153 1 70.30 AATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTC:2 + chr2R 4577095 5' - Chouto 471 1 72.00 TGCCACAAAACGCAACTCATTAAAAAGATCACCGCACCGGGCGGGCAACCAACGCAACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCT:1 + chr3L 15374295 5' - Cr1a 4022 1 58.42 TCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACA:1 - chr2L 3244989 5' + rover 46 2 80.20 ATTGAAGCCGGCAGCACAACGAAATACACAGTGCTCGAAGCAGCGGTATATTTGCAAAGCAGCAGCCACGTGCTGCCTGGCTCACCGGCTTACGGTGCCCA:1 - chr3L 10481664 5' + G6 260 1 72.28 AAATACGGCAGCTAGACGCAACATACCAGACAGCAGGTGGCTTTAACGACCGCAATCATGAATATGGTGAAACGTGTCCGATCAGATGAGATGGCCAACAG:1 + chr3L 10341158 5' + Rt1b 4792 1 59.41 TATTATTGTTTTCATAAGTTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 3947351 5' + roo 8717 2 81.00 GGGCCTTTAACGACGTCTCCCAGGAGCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 20791801 5' - roo 358 2 75.25 GACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACG:1 - chr3R 19446520 5' - gypsy12 10159 2 63.37 AAAACTAACAATAAACCAATAACGAATTCCAATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAA:1 - chr3L 10464708 5' - invader3 254 2 56.44 ATCTGTGCAACGTCGTTTATTTGTTGGCCCGGCCGAAAGAAAATGCCTTGCAATATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGT:1 + chr3R 18628291 5' - I-element 401 1 63.37 GCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACTCTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3L 11696455 5' + blood 29 2 51.49 AGTCCTTCAAACAAATGTACAAAGAGTTCTGCGCGTTTTCACTGATTTTCACTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 5263538 5' - gypsy2 406 2 87.88 CCATGCCCATGCCGTGTTCGTGCGCCGCCGCTCCCCATCCGCCCAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTTGTGGCTTGAACATGATGC:1 - chr3R 17544516 5' - Ivk 4989 1 55.79 AAAAGACAGCTAATCTGCATTGTGGAAGTGAAGAGGGGCACTTACGCTGAAACTACTGGACATCTAAGGCTCAGCTTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGG:1 - chr3R 8518415 5' + HB 1230 1 61.39 ATTTCTTTATTTTCGTTATTGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAA:1 + chr3L 18125005 5' + 17.6 86 2 80.20 CATAAAATATTTGTCAGCTCTAAATGCTAAATGTATTCCACACACTTAAAAAGAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTT:1 + chr3L 20721887 5' - hopper2 1348 1 57.43 ATTGGGCTCACCGCGCTTCAACGTGCCATACACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2R 24940326 5' + 1360 48 1 78.22 CCTCGNTCTCCCCACCTTCTCACCACCCCACTGCATTTGGTTCACCCGCTACTTTTGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chrX 13747433 5' - P-element 2871 1 62.38 TCGACATGTTGGCGAATAGGTAATGGGCTTATGCCTCTCCAGAGCTTTTAGCCTAAGCTAAAGGCCCGATAATAAATCTTAAGTCAATTGCAAACGTTGTT:1 - chr3R 7790712 5' + NOF 3936 1 55.45 TACCATCGCCGCACTGCTGCTCCCCGTCGCACTTGTGCTCCTTGGGAATGCACCGATGGTTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATT:1 - chr2R 8218403 5' - 1360 3326 1 65.35 ATCAGGGACAGGCAAACGGGGACCGACAATGGAACAACTATGGCTATAATAACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACT:1 - chr3L 27413243 5' - invader4 2618 1 57.43 CCATTGTTCAGTACTGTGATAGTTACAGAGAACTCATACCCCTGTCCTTCGTCCTGTGTTTCGTATTCGAGTATAACTTATTTTCTGACAATTTCTGACAA:1 - chr3R 10165743 5' + transib2 420 1 51.49 TCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3R 27619252 5' + hobo 46 1 74.23 AATAGAATATAATTGTAGTTCCCAAGATTAAGAGCATACATATATATGTACTTTAAAGAATCGCGAAAATTTGTGCACCACTTCCACGGAACAGAAAATTA:1 - chr2L 3701120 5' - R1A1-element 77 1 65.35 TGTTGTTTTTTGTTTTTTTGTAAGAATATCTTGTATGTATGATCGGTTCTACATTCCCGCTCCATCTATTGTTGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCT:1 + chr2L 9524982 5' - baggins 5190 1 66.34 GTCCGTAGTAAAGATTTTTGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2L 6605534 5' + blood 7019 2 67.33 CCTTGATCAGTGCGTTCTTATCATCAAACTTTTGGGAAGCTTTGGCTTGAACTTGAGGGAGTCGAAAATGGGAGCCATCTTGGTCCGCTTCTTTTTACCTT:1 + chr3R 6107597 5' + Q-element 506 2 69.31 GTTTTGCCTCCCACTGCCAACTTTCTCGCACACAAATCAACATAAATCAGCTAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTA:1 + chr3L 9182545 5' + I-element 112 1 57.00 CACACACACTCAACTTCTCCCCCCGGCAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAG:1 - chr2R 18337275 5' + F-element 342 1 73.47 TAACCAACTGGGCGCATAAGTAATATGTAAATATTCATTATAATAGCATCTAGTCCTTATATCATAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAAT:1 + chrX 14546442 5' + accord 7288 2 67.33 CAGTGCAGTGAAAGGCTAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3R 29088668 5' + G2 3069 1 78.12 CGGCAGTGTGAGTGGCAAGAGCTCTCTTCGTCATCTCGCTCTCCCTCCTTTTAGAGTCAAAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAATTGTACG:1 + chr3R 934629 5' + rooA 7579 2 72.28 AAAAAAAATGAAACGAATAACTGAAAATTGTAGAACGGCCACCCTGCGAACTGTATCAGGCATCTAATAGTCCGGGAAATCGACTATAGCATTCTCTATTG:1 + chr3R 16951197 5' + INE-1 578 1 61.39 AACCAGGTGTGCTCGCTGTATATTGAGAATTTATTTTGTTGCCTACTTATGTGGGTTTTTCAAAAGGACAAACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAA:1 - chr2L 16542902 5' - baggins 4984 1 61.39 GAATTGAGATTAAAGATATGTTTATAGATTGGAACCATAAGTACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCG:1 - chr3L 1711360 5' + Doc 329 1 59.41 CATCCATGCAGTCGGGCAACTAGGCAACTAGGCAGTCGAGCCGTAACCGCAACAACTTCAATGCAGTTTTGGGAGGTTGGTGGACGTTAGAGTGGGCATGG:1 - chr3R 28482777 5' - INE-1 214 1 70.30 CCGACCGATATTGGCAAGACAAGTGGGGGTGTGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGGCGTATTATTTTTATT:1 + chr4 343797 5' - I-element 4931 1 61.36 GTACGTATCCCCGTATACGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTC:1 + chr3L 26446429 5' + Circe 41 2 78.22 AAAATGTCTAACTAAATTGCTAATTCTTCAGCTATCGATTGTGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCA:1 - chr2L 2504101 5' + invader4 182 2 58.42 GTCCCAGAGTCCGAACCAAACACCGCGATCCGCGGCGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTT:1 + chr2R 22983691 5' + P-element 2879 2 42.00 ATTACTGATTTCTTTACAAACCAGTCCTGGCAAAAGTACATACATACATAAATATGTACGTATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr3R 23723195 5' - Transpac 5218 2 69.31 GACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2R 21266491 5' - roo 9034 1 66.34 GAATAACAAAATCGTTTGGTGTTCGGGAGGTCCCACGCAGCAGTGATTGGTGGGCCTGGCAATTATGCGGGACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTG:1 - chr3L 26852123 5' - diver 218 1 72.28 GCGATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTT:1 - chr3L 14603157 5' - jockey 4999 1 42.57 AGCCAAATATCCAGTATGTAAACCTGAATTCCAGGGCCTTTAACGACGTCTCCCAGGAGCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2R 20791834 5' - roo 9055 2 61.39 TAAAATCTCTTAGATTTCCATTCAAAATCTATCCTCGTTATGTGCGGTATGTGGGGGTTATAGTGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATG:1 - chr2L 7449020 5' - rooA 353 2 60.40 TTTGGCTAAAAGCGCGCTTTTATGGCTTTGTTGACGCTCCCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 + chr3R 31293210 5' + hopper 34 1 56.44 GTTGTTTGTGTTATGTGGCTCGTTCTTGTGTTCTGTAACAATTTCAGTTTTTACAACTGGTCTTGGTGGATGTTCGCGTTCCGGATGTACCAAGGTGCACC:1 + chrX 1350002 5' - Doc4-element 2692 1 62.38 CCATCGGCTGGAAAAAGAGCACAGCTGTTTACAAAAACAAAACCAAGCGAAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTG:1 + chr3R 18021584 5' - GATE 8271 2 56.44 TGTGCTGCTTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr2L 20840417 5' - Transpac 290 2 58.59 GTGCATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCGCCGAATGTTTGGTCGACGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGAT:1 - chr2R 16395114 5' - flea 4868 1 56.44 TGCATATTTCTATTCCTTTATTGTACGACTCATCCCTTGACTAACAACCAACTAATTATTACGTCTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATCA:1 - chr3L 1659625 5' - baggins 5387 1 71.29 AAAGTAGCCAAAAATCAAACAAGCGAGTGTGTAAAACAAATATTATTCAAAGCTTTCATAGACTCTTTTCGCTCAGACAGAACAACGCATACAATTCCATA:1 + chrX 9993416 5' + ZAM 178 2 69.31 GTTTTGTGGCACATGAACGAACACACACACACACACACCGACAAATTGGCACAAATCATTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATTTTGCT:1 - chrX 7211509 5' - transib3 377 1 60.40 CTAAGTATACAGTTCATACATACACGAATAATTCATGCACACACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr2R 19079176 5' + 297 6611 2 62.38 GGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 15072589 5' + pogo 46 1 75.25 CATAATGACAATTATATTTTAAATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 87186 5' + jockey 33 1 51.52 CGGCCGATAAATGGGAAATTTGTAAAACAGAAGCCAGAGGGACGGACGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCTGT:1 + chr3R 6947732 5' + micropia 472 1 58.42 ATGCATGCCCCTAGCAATTGGTCAACTTTATTGATTGCTGTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:1 + chr3L 4681236 5' - transib2 2759 1 60.40 GCAATGAGCGGAAGTAAAAACTAAGTAAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGT:1 - chrX 9977893 5' - I-element 5044 1 77.23 CATCCNCGTCTCCATCCCAATCTCCATTCCCATGTCCATGCCACAGCGACCCATGGAAAACGGTGAGGAAAAGCGAAGGAAAAAAGGAAAAACAAACAAAA:1 - chr2L 11307904 5' + Doc2-element 237 1 57.43 GGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTTTGCAACG:1 - chr3L 23678116 5' + Osvaldo 36 1 73.27 TATTATCGATAACCACGTTCCCTTTCCCACTCCACGGCTGGTGATACAGCCCCAAACCAATGACCCTAGAATAGCAAGATGTGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 21840101 5' + 1360 23 1 60.40 CAGCAATTTATTTAGGTTTCGATTCTTGTTAGGTTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 - 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Doc3-element 108 1 57.43 TTATGCAATAAGTGCGTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTCGAATAAAGTTGCTCGACTTTTAGATACCCATTACTCAGCCAGT:1 - chr3L 21427056 5' - INE-1 542 1 59.41 TCCCAGTGTAAATACGGCGGACCGGGCAAAAGTGTATGCGTTCGGGAAAAACAGACCTGATCCCCAATAAAATTCTAGCATTTATACAGTGCATTGGACTT:1 + chr2L 16843555 5' + baggins 5349 1 57.43 TATTTCCGGACGTCGTCTATGTAGCAGGGCTGTCGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTCTACCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTT:1 + chr2R 3161929 5' + diver2 228 2 66.34 TTTGTTTTCACGTTAATTTTTCGAGCGTCGGTCAGGAGGTGAAATCACCATAATGGGAAAATAATTGTTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCT:1 - chr2L 8581537 5' - hopper 939 1 71.29 CAGCATAATTAGTGGAAGAGAGAAACAAACTATTAAAAGTGTAAATCAAATTTAATTACAGTTTTAAGTAAACACATCAGTTATTAGTTTTTGGCACAAAT:1 + chr3L 10875389 5' - transib3 432 1 53.47 GAACTCCAAGCAGAGATGGGTTCTCACTTCCAGTACTGTAAGAGTGCAATATATTTAGTAATAATGTAAA:1 + chr2R 11589906 5' - TAHRE 10278 1 91.43 CGTGCGTTTTCCGAATACTACATCTACTACTACTATTTGCTTATACTATTTCAAACACAGAATATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGCGTCTCT:1 + chr3L 20829319 5' - Doc2-element 117 1 69.31 ACTTTTCAAGTGCCTTTATTATTAAGGGGTGTTAAAAAATCGCAAAGGTCAATTGTATTGGTACATATAGAATTATTCTTCAAATTAAGCATAGTTTAAAG:1 - 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I-element 5022 1 60.40 GTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGCATGTAAGTATGTAACAGACAGAATGAAGCGTTTTCGACTGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCG:1 - chr3R 2473817 5' + INE-1 88 1 80.20 TGCATGAGTACGTTGTGTCAAATTATGTATACACCAATTTAGAAAACAAATGTAGTAAGCTAGAGGTACACAGACATAAGTTCAGTATAGCAACATAGTAT:1 - chr2L 23281068 5' + invader2 4893 2 79.21 CGCATGTGGGTGTAGCTAGTAAAATCCGAAGGGGTAACTTTAAAACTCCACAGCACCTGCTGCTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGG:1 - chr3L 10914870 5' - I-element 5061 1 64.00 CCCGCGCCCCCTCACTTTTCCCACCATTTTTCAGTTCGTGTGCCATTTCAAACGCCTGCGAAATGCAGCACAAAAATTGTTTATTAGGCATGGACTGGGCC:1 - chr3R 10611195 5' - copia 284 1 81.19 ATGTGGTTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:2 - chr3L 22324097 5' + hobo 32 1 51.49 GAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCCGATCCGGACACTGACTAAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr3R 23618126 5' - hopper 1398 1 62.38 GACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 + chr3R 17495768 5' + opus 43 4 80.20 GCATGAAATGTTTGTTTTGCTTTGTTTCTGTTTTGCGCCTGTACATAAGATAAGAACAACAAAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCG:1 + chrX 22714397 5' - 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chr2L 12896993 5' - Rt1b 4961 1 69.31 GAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 + chr3L 15056317 5' + BS 5032 1 77.23 ACAATGCAAACTGAAGAAAGAAATAAAAACAGCAACATCTTAAAGCGCAACGCCAACGCCAAACTCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTG:1 - chrX 8976796 5' - Dm88 380 1 66.34 CTAAACAAATGCCAGACATTGTACTATAAAGTAACCCCCCGCCGCATCGAATCGTATCAGATCGGTTTGGATCAGACCAGTATATACATATATGTATAGT:1 - chr2R 12664616 5' + INE-1 67 1 75.00 TGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACATTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 19450063 5' - roo 8994 2 61.39 CTCGTNTCGTTTGAACCTCTTAGTTGTCCGCAGCGCGCATGGAAGGATGAGCAAGCAGCAGTCGATCTGGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAA:1 + chr2R 21630964 5' + INE-1 122 1 65.59 ATAATGCTTAGTACCACACAATCCAAAAGTCACACAGCGCTGAAAAATGGTCAGCGGCATACAAATAGCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCA:1 - chr3L 18770477 5' + F-element 4400 1 75.00 CTAATCCTTCGTCCTCCGACTGGTGGCCATATGTGTGTGAGTCAGTGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGAAGTGTTCAAAGAGAGCAGTCAAATCT:1 + chr2L 18110766 5' - 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HB 1515 1 59.41 TAAATCACCGTTACCATTGCCGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3R 12578261 5' + jockey 37 1 55.45 GAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 25360937 5' + jockey 25 1 61.39 TATGTAGAAGTACATTTTCTCTTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTTTTTGTTAGGGAGAGCGTATACTAAGAAGCCC:1 - chr3R 19449983 5' - Fw2 3473 1 71.76 GGGTGNTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr3L 3254969 5' + 1360 30 1 55.45 AATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chrX 10555420 5' + Tirant 8147 2 62.38 AGGCACTCCTGCCAGCACCTAAGCGGCGAGAATAGGTTATATACACGTAGTCGGCTACTAATATTACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAAT:1 - chr3L 16106954 5' + I-element 4912 1 69.31 CAAAGGGAATTGTTTAAGCGTACTTTAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGAC:1 - chrX 19605012 5' + I-element 5093 1 77.23 ATGTCAGTCCAGTGCCAAGGCTGAGTCCAGTCCTTTTCCTTCTCCCTTCAGCGAAAGGAGCTGCCATCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGG:1 - 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chrX 21667936 5' + gypsy2 25 2 61.39 TATTATAGGGCTGCGATTAAGAAATGTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCGAACGAAAAAATTATTCATTTTTCTGGAATATCTATAGATA:1 - chr3L 19467995 5' - INE-1 499 1 72.28 AGGCGGGGGTTAACTAAACAGTTGTAAAATAATATTTTATTATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTAC:2 - chrX 14625544 5' - invader4 292 2 68.32 CACATACTTCCCTCTCGAAAAACAAATGTTACACATGTCAGCTGCTCCAAACAAGATAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGA:1 + chr3L 474957 5' + G2 2797 1 61.39 AATACTTAAGTCGTTGGCTTTTGAATAATAAAACTCTAGAACAACTCTGGCTCTGCATCCCAAATCATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCC:1 + chr2R 21505769 5' + Ivk 384 1 68.32 AAGTGACAGGTGACCTGGTCAACAAAGTGGTGCGGAATTTGTTCACAAAAATGGTTTGCAAATCGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAATAAAAA:1 + chr3L 6445940 5' - 1731 4526 1 71.29 TGGCATAACGGTTGGGTCGTAAACAAAACATGAAACCATCGCCAGGTGGCGAACATTTGTATCCCTTACATTTACTTTAGCTAAGTAACGGGCATCTGATA:1 + chrX 19397615 5' + INE-1 546 1 79.21 TACACCCCATCCCCCATGTGAACAGCAAAAAAAGCCCTGAAAAAATGCAAACAAAAAAGGCGCAATTACCAGCCGAGACACTCGACAAAAGACACAAGAAC:1 - 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chr2L 221882 5' + P-element 396 1 33.73 GTTTTGCGTTTATTGAACTTTAGCCGTAAGGTGCCGCGCATTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTC:1 + chr2R 8999179 5' - F-element 306 1 63.37 GTGGTCGCTGGGAGGCATAGAGTTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAG:1 - chr3R 11846778 5' - jockey 4631 1 77.23 AAGCGTTTTGGCAGCCTGCCCGTCTTGTTGCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3L 8763195 5' + jockey 9 1 75.25 GCCAGGATTAAGAAGCAGCTCCAGCCGACCGCAACCACTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACA:1 - chr2L 16969089 5' - P-element 473 1 40.59 AATCCACTGTTAGGTGTACAGTGCAAAGGGAATGTCATTTCTAGTTAATATGATCGGAACTATCAACTTAACATCATTTTACGAAATGGTTCGTGCTGTGT:1 + chr2R 5339483 5' - Doc3-element 4621 1 72.28 GCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACA:1 - chr2L 3245013 5' + rover 6972 2 59.00 AAGGGATGAAAGCAAAATGCTGGTTTCGGTTGTAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGA:1 + chr3L 12122232 5' + copia 312 1 68.32 GAATGATGAGGATTAGGCCATCACTACTGCCATGGATGTGTGTCAGTGGAATACACTCATCTCTGTTTACTTTGGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAA:1 - chr3R 30855602 5' - invader2 4922 2 59.41 CAAAACCTAGTTATACAAATCAACTTTTATTTTTAGCCGACTCCGTAATCTACCGATGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGA:1 + chr2L 14358209 5' - diver2 142 2 62.38 GACAGAAAATATTCCCTCTATATAACCACACTCTTTCATTTCAATACATCGCCATTACTAATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTT:1 + chr3R 4695870 5' + hopper 1172 1 59.41 TGGGAAGTGAAAGAGATGGCACACACACCAAATGCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATG:1 - chr2L 4049170 5' + 17.6 69 2 66.34 AAGTCCGCTGGCTAATTGCTTGAAACGCAGTCAAAACGTTGGTACTCTATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGC:2 + chrX 5570758 5' + Stalker 6973 4 54.46 GATGCTGCCAGGCATGCCTCCCATCTCCATCTACTTACCCCGGAATTTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTC:1 - chr3L 2865156 5' + accord2 161 2 52.58 CGACTTTTATGTGCTCCTTGCTTACTTTCCTTGTTTTGTTGGCTTTTATTGTCCTCTTTTCCTGACCATGAATATTTATGCAAAAACACACACACACACAC:1 + chr3L 3587558 5' + accord 179 2 69.31 AGCATTGTGACCTGTTTCTCTACCGCTCCTGCCTGCCACCCAGCCCTCCTCGCTCCTCGCATGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 21493942 5' - accord 7029 4 65.12 GCGAGNCATAAGCGCCACATGTGTGTGTCGCCTTCACTTCTGTTGATTCATTTAGGCGGCTGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGA:1 - chr2L 10601189 5' + 1360 452 1 63.37 GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGT:1 + chr3L 25232774 5' - accord2 7593 2 58.42 TGGATGGATGGATTCGCCTGCAGTTCGGGCCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGTCCAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAG:1 - chr3L 4548141 5' - G2 2856 1 68.75 CTACTACAGTAGCATAACTGTTTCAGCATTCTTTTCGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGCTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGC:1 + chr4 405113 5' - F-element 480 1 69.31 GATTCAGTACCAATCGAAGAAGAACCAGAAAACAAAGTTAATCAGATTGAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGG:1 - chr3L 2054248 5' + pogo 1694 1 56.00 TACGACTCTTAATTGCCCTATTCACATAATTACATTGGGAATGTATCTCAAATATACGGCCGAAACGATGCCCTTGCGCCACTCTCGTCGGGCTAAGGCAG:1 + chr2L 2854561 5' - aurora-element 3862 1 65.35 GCCAGTGGACATTCAATTAGAATGCGTTTTGCATTCCAGAAATAGCGTTTCGTTACGACTGAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTT:1 + chr3L 8901850 5' + accord2 72 2 64.36 CGTTCTCAGCACGGCCTCCCTGATTCGATGGGGTTCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGCCATAGGTCGAGGTC:1 + chrX 18259537 5' - Fw2 3544 1 79.21 ACCATTGCCGTCGCCTTACTTTGCTGCGCAATCGCTTCTACTTTGGCTTATCCGATGCCCGACGACATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2R 18865818 5' + roo 9 2 70.30 TGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 22052772 5' - mdg1 391 2 59.57 AGTGTGTCCTTGTGGGTGTAACAATAATCGTTTAAATGGTTAATGGCTATATTCAATGACTGAGGGGCTATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTG:1 + chr2R 16621217 5' - G-element 4229 1 73.27 ATGGATGTGGCAACGTTCTGAAACAATCTGGCTCACCTTTAGCGTTACTGAAATACTCAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTC:1 - chr4 718757 5' + Doc 4540 1 63.37 CTAACAAATGAATCAGCGTAAAAGACTATTCCAAATTCGTTGTTGTGTCTGGCCATTGACCTTAAATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGCAGAATCTTA:1 - chr2L 14028185 5' - baggins 5052 1 68.00 GAACGGATGTGTTGAAATTCATTCGACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 5104595 5' - roo 391 2 61.39 ACTTGCTAGTTCTTATTCCGGTTAATCTCATAAGCAGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGTTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2R 5880489 5' + roo 8705 2 68.32 AGCAAACAGCTACTGATATCGCCTATACAAACTCGACTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3L 17624171 5' - roo 9032 1 61.39 CACAAATTGAGAGGAAATACTGCGATTTCATAAATCTTTTTAATGGCAGGGCCAAGGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAA:1 - chr3R 16959182 5' + micropia 330 2 60.40 CTGCTCAGTTTTATAAATAAGTTCTGTGTTTTCGGTCTTCGGTTGGAGGCAGCGGTCCCAGCAGAGCGCTTAGTCAGCGCCTCGTGCCGTCTGGAGTTCCG:1 - chrX 3258308 5' - gypsy10 187 2 66.34 AGTTCCGCCCACGAGGAACCGTCTCGGTTCTGTCTCCAGACTCCTATTTAACTACAATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCATA:1 + chr3L 4042907 5' + R1A1-element 5225 1 62.38 CTGAAATGCAACTAAGCCTCGAATAATTGGAAAATTCTATTCCATTTCCAGTATCGACAATAGAATTTTAATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2R 8557810 5' + hobo 2 1 76.04 TCTCTTGCTTACTTGTTTATTTCGCTCAGTGCAGCCAGCGAGTACAATAGCCGGCTTTTGGCGTTGGAATAACACTGGCAAATGCAGTTGGGATTTGGGGA:1 - chrX 6904484 5' - gypsy3 464 1 62.38 ACAGAATTTGGGCCGCCATAGCTCTGCATATTCTGGCCATTTTCACGGACCGACCTGCACTCCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2R 5910839 5' - hobo 2926 1 66.34 GTTGGTATGTTCGCTCGGAACTGACTCTGCGCCACGAACGGTCAGCAACAGCAATCGGACACCCCTTATCCGGGGTACCGAGCTATGTTGCATAAATGCTG:1 - chr3L 16914392 5' + gtwin 148 2 76.24 AAAGTGCCTGAAGAATATTTCGAAAGTCAAATTGTACATGACCTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAACAATACCATA:1 + chr2L 6799261 5' + F-element 4433 1 55.10 AGTCAAGAATAGTACAACTATTTAAAGAATAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGC:1 + chr2L 71075 5' - Doc3-element 4618 1 79.21 CTACCCAAGCGGGGTATCATAAAATCATAACTATATTTGACACATAAAATTGTACATACATCTCGTGGCCAAGCAACATCCCCTCACGAAGTCGCTTACGC:1 + chr3L 21723383 5' + Doc2-element 4576 1 78.22 AGAAGAGCAGCTCCAGCGGCATGTTTGGTGACCGACTCCGTCGCGGATCCGCGGATGCCAATGTGAAGCGGGCGGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAA:1 + chr3L 3365195 5' + 1360 3325 1 76.24 TGTTTNATTCATATCCGTTCTTTTAGTGCTCAAACATTTCACTTCCTCGTGTTTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCAC:1 - chr3L 21925888 5' - X-element 434 1 53.47 CTTTTCTTTCCAACAGCTTGCCTCTTGGCTCGTCGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCC:1 - chr3L 10287706 5' - 17.6 7116 2 66.00 AACTAAAGCGGACCACCTAAATAGTTGGTGATAAGAATGGTTAGTTTGAGATATGGTTTAAATCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr2R 18434454 5' + pogo 10 1 63.37 TCTTCGTTTTTGGCTCTTTTGTTCAAAGGGGATATTCACTGTGGCCATGTGTGTATGTGGATGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCC:1 - chr3L 5281791 5' - I-element 162 1 65.35 TAATTACAAATAATTCGCCCACTGGGTCCCAGGGCAAACCCCATCGTGTGTTGTTTGTTGTTGCGGCTGACCGGACTCGTAAATGTCGAAATTCGCGCAGC:1 - 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chr3L 18420398 5' + F-element 4410 1 58.42 CGGAANTTTTTAAAAGAATACACAGTTGCCTGGGTCATATGAAGAAAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1 - chr3R 7002631 5' + jockey 4680 1 54.46 GGGTCAGTGGGGTCAGTGGCCAGCCGAGGTGGTCCCAGGCCGAACATTGCCTCGCCCGTGGACGATAACTGAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCA:1 - chr3L 26023469 5' + gypsy8 443 1 66.34 TTGCTTTCTGGTTGAGATGCGCCCCGTATTTACTCACCAAATAAATAAGACAGAAACAGAAACAGAATGATACAAACACAAAAAACAATAAAAAAAAAAAC:1 - chr2R 16376975 5' + Rt1a 5087 9 71.29 AAATCGACACTATACCCCACTATTCCCCACTATCCACTATCCACCACCCACTGCCCACTCGACCCTTCTCTACTCGCTTCTGTGTCCTTCGGGCTTCTTGC:1 - chr2R 20972024 5' - gypsy8 491 1 64.36 CATATTTCATTGAATGCATTTCATTGCCATTTAAATTTGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr3R 29019028 5' + Doc 49 1 72.28 GCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 - chr2L 14536288 5' - blood 7332 1 79.21 CCGCGGCGGATTGGCCTGGACCCCGCCCGCTTCAGGTGAGGGCTCCACTCCCACATGGACAGAGGGCATCACCAAGATTACGGGCATCAACACCAATAG:1 + chr2R 22879936 5' + rover 6891 1 78.79 TGGTGGGCAGAGAGGAGGACGAGTGGTTAGTTGCGTGTTCATCCTGGAACATGGGAAACAATTGTAGTCGTGAACCCCAATAAAATATTGGCATTTATACA:1 - 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I-element 13 1 75.25 GTTATGAACGGAGGAAAAAGAAAGGCAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGC:1 + chr3R 1267253 5' + Tirant 8225 2 74.26 CGAAATAAATGCAAACAGAAAAAAAAGGGGGAAATGAGGGAAAGGGAATGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCC:1 - chr3L 18977057 5' + G6 1668 1 58.42 AATACTCACCAATCACATATTCATCAACCGAAAGACGCCCACTAGCTACCCCCCTCGTGATCACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTA:1 - chr3R 2658269 5' + G2 347 1 69.00 CTGCACGTCAATTGAGCCTGGCCAAATCGTTGAGGTTGTTTTGGCCAGATGGGCGTGGCCGGAGGTCGAGCGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGACTGAT:1 + chr2L 21962436 5' - Helena 1276 1 66.34 ATTCTGAGGAATTTTTTCTATCAAAAATTCTGCACCCAATTAATTGAAGACGTACAAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2 + chr3R 25931300 5' - roo 392 2 62.38 ACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3R 14832392 5' + blood 7030 2 56.70 CGACATGGCCACCACTCCGTGAACATCGCCAGCACTACGCGACGTTGGACTCCAACGGGCAAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGGGCGTGCACAAAG:1 - chr2L 1240829 5' + gypsy8 144 2 56.44 AAACCTATAACGAGTATCTACGACGTACTCAGCATATGTGTGGCACATGTAGTCCTTAGTCCATACAACCAAACATATATGTGTGCATCTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 21071704 5' - accord 190 2 77.23 TGTGGACGTGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAAGGATAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCT:1 - chrX 14770554 5' - Tc1-2 130 1 66.34 CAGTTATCAGATCTTCTCCACACCTTATCAAATGTCGAATTCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAGAGAAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAA:1 + chr3R 12297427 5' + S-element 1336 1 47.52 AAGCCGAATCACTGACAGCCGCCACAGTGAAAATCGGCTAAAATACATGGCGAATTAGAAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCG:1 - chr3R 7478551 5' + gypsy4 6720 2 67.06 GTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr2L 5932131 5' + jockey 62 1 74.26 ATTTTTGGTCCACCTATTCCGTGGTATTCACATCTTTGCGGTTTCAATTTCATAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr2L 21559223 5' + FB 26 1 53.47 AGTGACAATTCAGGAAGCCAGGGTCCTGGAACCAGGCAGCTCAAATGTGCAACCATGCCGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTC:1 - chr2R 22434701 5' + McClintock 5978 2 62.00 CGTGTGTGCAAATAATGTGAATAAGAATAAGAAAAGCCTGGAAAAACAAGGAGTTGGTCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCT:1 - chr2R 7698478 5' + 1360 3385 2 65.35 ATATGTGGCCCTCTCGACCGGCAACACAAATTAGCTGGCTAGCATGACCCTCTCTCTGTCTATCTGCCCAACTTAAGGAAGTACTCGCCAAAATAGGG:1 + chrX 6082475 5' + gypsy3 6519 1 40.82 CGCGTACTTTGGGCCGCGTTTTTTTGGTAGAAAATTCTGGTTTCTGTAAGTCGAAAAGGGAGGGAGATAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATA:1 - 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Tom1 186 1 62.38 TTCAATATAAATAATTTGTCTTCCATCCGTGACTTTCCCTTTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTTGTCGTGAGTCTTGTTAGCATTGCAGGT:1 - chr3L 2542420 5' - mariner2 697 1 57.43 TGAGGGTGTCTCTGTAGTGGTTGGTCGCTGCTGCGTCGCTGCCGCCCAAAAGGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGC:1 + chr3L 14108232 5' + blood 427 1 58.16 CGGCCACACCGCCCTTAAGGTCTGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCT:1 + chr3R 15259027 5' - 1360 4 2 77.23 GAAAACTTGAAACATAAAGCATAAATAAAACAATGTCGACTGAATGTGATGTATGCATGTATTTGGCTTACAAATCAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTGC:1 + chrX 12420397 5' - Cr1a 4020 1 76.24 CCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr2L 15997874 5' + 412 32 2 65.35 GACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr3L 15276658 5' - hopper 1371 1 69.31 TATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACAT:1 - chr2R 1000398 5' + HMS-Beagle2 25 2 58.42 CGAAGAAGGAGGAATGGAAAGGAATGGTTAGCAGTTGGGCGGTTTTAATGCGTTAGAGTGGGCGTTGCAAACATTTTTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTT:1 - 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F-element 4490 1 70.65 ATGAAAAGTTGGACACAAAAAGGTGCTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2R 11730917 5' - blood 7339 1 74.26 GAGCTGCTCGTTTAGCTAAAAACTTTTCAGCACTGAAAAAGTTCTTTACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 25931411 5' + roo 8669 2 75.25 GAAACGAAGTTTATGGCGTCTGTGCTGCATCCGTGTAAGCGCTCTGTCGCTGCTCTCTCACTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTTTCTCACACA:1 + chr2L 21776182 5' + Cr1a 304 1 71.28 ATAAAACTTGTAGCTACCATAAAAGTTATATGCCACTTGATAACGTTTTTGAATACGAAATCTTCTGCATTGCCACTCGCGATCTTGCTGTCCAACTGACT:1 - chr2R 8656989 5' - gypsy8 377 1 76.24 TGCTGGTGGCTGGGGATTACTCATCATTGCAACTCATATTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGA:1 + chr2L 5539670 5' - Cr1a 4106 1 76.24 ACGATNTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3L 5827876 5' + blood 29 2 50.50 TTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAAT:1 + chrX 22398536 5' - Gypsy6A_LTR 154 1 57.43 GGGCGGATCAAAAAGTTAGTCAATTTCAGCGTGTACAGCATGCAGCTGATAACACGTCTGTCCATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTA:1 + chr3R 6143780 5' + rover 5 2 71.29 TGTTTGCAGCGACAAAAAAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 + chr3R 23346524 5' + P-element 22 1 57.43 TCATTAGGCGCTTTAAAATAGGGAAACCCAAGCGCACAAGAGGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGG:1 + chr2R 6130137 5' - gypsy7 20 2 54.44 GCACAACAAACGCTTCGTATTGTTAAAATAAAAGAAAAATTATGAAAATTGAGCGACACCGTGGTGTCCAAGTTCCGGGACATCATGCTGGCTGATGACC:1 + chrX 10848778 5' + GATE 8019 1 53.00 CTGCAAAGACAATTCAATCAGTCAGGAATATGGAACTTTATGCGAAACCATGGGATGAGAGAGGGTTATGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrX 2874894 5' + 1360 9 2 74.26 AGTAGATTAACAAAAGGTCAAATCGATAATCAGGAGTGTTTGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCT:1 - chr2L 20332013 5' - Circe 7213 2 59.41 TGCACACTTCAGCCAGGGCACATCATCTCGCCTGCACATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr3R 32014577 5' + jockey 4693 1 63.37 CCAAGTGCAAATATATATTCTATCTATTAGTATCGATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGT:1 - chr3R 27548410 5' + R1A1-element 5068 1 65.00 TTCGCCTACCACTTGCCACTCTAACCCTATAACTAGTCACCTTATGCTTTCGTGGTTTCCGATATATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCT:1 - chrX 20512532 5' + micropia 187 2 66.34 TGTGGTCGCTGACGAAGCCGTTCTGCTGTTTTGACCGCTACTGTTATCCATTTGCTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCA:1 + chr3L 20401205 5' - R2-element 486 1 55.45 TTGATTCCACCCAGTATGAAATTTATAAGCCGAAACACACTTCTAAATTGTTATTCGAGTTTCTTAGAGAAATGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCC:1 - chr3L 11871342 5' - Stalker4 303 4 74.26 AAACCAACAAGCGTCGACCATTTGAAGGGCAGAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCA:2 - chr2R 21914997 5' + F-element 4431 1 68.32 TATGGGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGGGGAACT:1 - chr3L 23678120 5' + Osvaldo 25 1 65.96 AATGCGAGTAAATTATTCTTGATTAAAACTTATCAGAGCACATTTCATATCACCTTTTCAAAAACGCAACAACAGCAAAGATTTAAGAATGAAACTCAGC:1 - chr3R 15986115 5' + rooA 193 2 78.00 GCAGGCCAAGGTGCAAGGTTTAAACGTGAACTGTAAAGCCTTCTTTGTGGGCGAGCTCTGGAGAGCGCCTTGGCTAGGCGATTTCTGTGGCGCTCTAGCCT:1 - chr3R 30827176 5' - BS3 1496 1 70.30 ATGGGGATTTGAATTTGGGCGGTTGGGTGGCGCACGGACCCTTTGAGGTGAAAAACAAAGGGCTATTGTTGCATTGGCCACCTCAAATTCCAGCCCTCAAC:1 - chr2R 5839401 5' + Tc1-2 1162 1 79.21 GCTCACACCGCAGGATTAAGTACTCAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATC:1 + chr3L 4958216 5' - HMS-Beagle2 7053 2 75.51 CTATGGCATAAATAAGACATTGAGCAAAACAACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTG:1 - chr3L 3713936 5' - 17.6 7081 2 69.31 GCGCGGGCATTTTCGATTATCAACCACCTTTTTTAACGTGCATGCGCACTGCGATGCACGTTAAAAAAGGGGCAAAAAACATTAATACCATTTGATTCCAC:1 - chr3L 12748931 5' - transib4 477 1 53.47 ACCGANCTGTTGGCCCTGCCGTTTTGCCCGCTGATGTCCTGCGCACGTTTTATTCTGAACCAATGGCAGCGACTCTGCGCATCCAAAATGGCGTCTCTGAC:1 + chr3L 25442227 5' - aurora-element 414 1 73.27 ATATACAAAATAATTGTATTTAACTCGTTTTGTACATCACTTGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chrX 3485638 5' - P-element 2853 1 30.69 AGTTAAAAGGCTATCATCATGTCCCACCTTTGGAAGGGAGGCCTTCGGTGCGACCACCCACCCCTTTTTCTGATTGAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCT:1 - chr2L 20762717 5' + invader4 2822 2 76.24 GGAGCACGCTTGCTTCTAGATCTAGAGGTGGCTCAGACTCTCTCGAATTTATGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCCA:1 - chr3R 19448525 5' + 1360 130 1 73.27 GTTATGTTGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chrX 11060490 5' + I-element 27 1 56.18 GCTTATCATTAGGTTTAAGTCTTGAAGATCTTTCGATATCTACAAGGATAGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2R 10029407 5' + roo 25 2 58.42 ATGCTGATGAATGAGTCATAAAGATAGCCAAATAGATGGCATGAAACCGGAAACTACCGAGAAAATATTTGGTACAACATTCAAGGGTTTTTTGAATGCCC:1 + chr2L 18863839 5' - HB 428 1 72.28 GTTTTTGATGGCTCTTAGCTTCTTGGCCATCAGCTGAGCTCTGTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTT:1 + chr2L 7332230 5' - X-element 414 1 57.43 CCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr3R 9996394 5' + blood 7051 2 61.39 ATTGGCCGCGGGCCCTGACACGGTTTGTGGCCAAAACGAGTGAAGACAAAGCAATAACAACTCGAAAAGGCCGAAAAAATCGTGTACCAAAAAATCGTATA:1 + chrX 15148711 5' - 1360 33 1 74.26 TGCACCCAATTAATTGAAGACGTACAAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 25931330 5' - roo 361 2 71.29 ATATATTTTCGAAATCCGCGCTATTAAGTAAGCCAGTAAGCCAGACCAGAAATAAACCTGTGTTTGCGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGC:1 - chr3R 11542388 5' - Doc2-element 463 1 73.27 GTGCTGCCCTTCAATAACCATATTTAGCAGGTCATCAAAACGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCC:1 - chr2L 18806520 5' - 1360 3350 1 62.38 ATTCCATTCCACTGTCCAGTTTCCCAGGCCAGAGATCACTTTTTACCCTTTTTGCGCACGGCCCGCCCGGGTACCAGGTCCACTTATTGTGCCGTTAATTC:1 + chr3L 9030806 5' - gypsy8 266 2 55.45 TAAGTAAGTGGCTATAAATCAACATTGCCCAAGGGTAATTACTAATTTCTCCAAACTTTTTTTATAGTTCGGGAGATCTCCACGTTCATACGGACAGACGA:1 + chr2R 17792138 5' - INE-1 127 1 61.39 GTGTGGATTCCAGAGCCACGTCGGGAAAGTTAATTGGATCTCAGAGCATACATAAGGTCGTACAGGTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTC:1 + chr2L 17990755 5' - hopper 399 1 69.31 ATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 - chr3R 1048032 5' + Stalker2 7290 2 65.35 GCAGCTCGTTGAATGGTTTTCGCTTTATGGTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGT:1 + chr2L 9824384 5' - hobo 457 1 80.20 AATCCTGTCAAGCCTCGAAGATGAAAACTAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTC:1 - chr3R 23548882 5' - Rt1b 4978 1 73.40 TAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 11240895 5' - roo 9031 1 72.28 CATGCTCAGTCACTGCTTACTTACAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTG:1 - chr3L 2464961 5' + R1A1-element 161 1 77.23 CCCATCCCTGCGTGCGTTTCCCATGTTGCCACCAGCAACTAGCTAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTG:1 + chr3R 18374972 5' - I-element 282 1 56.00 AACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 28623912 5' + roo 47 2 77.00 GTGCTTCTTTTTCTTCAAGCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCT:1 + chrY 2414802 5' - G6 1792 1 80.81 CCGTTGGCTTTTTGTGGCCATTCGACCTGTCACAGGTGGCTGCAGGGGCAACTTGCGCTGGAATGACGGTTTAGACGGCCAGCTAGAGAGTTGCCGGAGCT:1 + chr2L 19949316 5' + aurora-element 179 1 61.39 CAAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr2L 14536314 5' - blood 346 2 53.47 GTATGCAAAACGCACTCAACTAATTAATGGGTATTTTTTCATGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTG:1 + chrX 10554748 5' - Tirant 8307 2 55.67 GGGCGAGATCTGATGCAGCTGCTGGTGATAAGTACTATGGGTTATTGACCGATCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATAGGAGAAGTACGCGT:1 + chr3L 15523123 5' - F-element 265 1 62.38 GACTTGGGTGCGCATCAATGGGTTTTTAATAAATGGCCAACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCC:1 + chr3R 23207236 5' - roo 8912 2 69.31 TGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTGCATGTAT:1 + chr3L 6620563 5' - Quasimodo 33 2 59.41 TGTATTTATAGCAAACATACAATTTTAAAAAGAAACCCACAATTACCATTCTTCTGTGGTATCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTC:1 + chr2L 3835075 5' - roo 176 2 60.40 CTCAGTCACCACAAGACCCAAAACGAGATGCAGGGCTCCTCCAAGGACGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTA:1 + chr3L 7121500 5' + F-element 4397 1 53.47 TTAGTTCATGGCAATAAATACATAGTCTGTACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCATGTGAACACCGAGATC:1 - chrX 142610 5' - R2-element 403 1 63.33 TACTTTCACACTTCAGCTAAGTTTCATTTGTTCGGCTTTAAATTCCTTTCGCTTTGCCGCTTCTGACCGTTCTTAGCGCTGAACTCAGTTGGGGCGCATCA:1 - chr3L 14386457 5' - gtwin 6984 2 61.39 TGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCTCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 9193602 5' - roo 9047 1 64.10 TACATAAACTATTGGCCAGACTTTATTACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr3L 25798538 5' + blood 7021 2 70.30 GGTGGGAAATGTCGGGGGACACGCCGGAGTCAAGACAAGGACTCGCATGGGAAAAACTTTGGCGGCAAGTGAAAAAAAAAATAAAAAA:1 - chrX 18043686 5' + TAHRE 10442 2 65.91 ATATTCAAAAAGAAAGGAAGAGTGTTGCTATCGCTTTCGATTTTCAAGCTATAAAAAAGCAGTATTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 - chr3R 12789942 5' + flea 4765 1 71.29 CCAGTGAGCGATCAGCTTCAAGATGGCCGCTCCTGCGGAGAAGAACCCTGCGAGGCTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAG:1 - chr2R 20116110 5' + 1360 3327 1 60.61 TGTCTTAAAATATTTATGCCCACATCATACCAATGTATTGCAACATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACC:1 + chr3R 4579215 5' + Quasimodo 7 2 53.47 TCACATTTTTTTACAAATTTACAAATAACAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGG:1 - chr2L 12242035 5' + invader3 5246 2 75.25 CAGCCCCCGTGCATCCCAAGAAGAAGGCGTATGATGGCTCTTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCA:1 - chr3L 11475040 5' - Quasimodo 404 2 63.37 ATAAGCAAATTCCACAGGTAAATACCAAACTGAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACACACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTG:1 - chr3R 9002860 5' + TAHRE 10377 1 65.59 TTTACACTAACAGTTGTGAAAGTTTGCCAACATGTTGAGCATATTGCGTTCTGTACACAACGCGCACAGACAGCCTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chr2L 14831375 5' - Tc3 312 1 66.34 GTTTTCCCCCGGAAAAACACCGCACGCCCTCTGCAGCTTTCCACTTTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTTCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTCGTGCC:1 - chr2L 975049 5' - G5A 397 2 55.45 ATGTTTGCATCTATCTTCTCTCTCTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGC:1 - chr3R 4387793 5' - I-element 154 1 76.24 AAATTACATAGTTTTTCAAGTGGAAAAACTCAAGAAATTAAGTTTAGGCTGCCTGTAGCTGTTGATGTTGCTGGCAATGGTTAATAAATTTATGGATATTG:1 - chr2L 8882029 5' - Ivk 169 1 70.30 AGTTAAGCGCACAATTATCCCATGGAGTCGAGTGATCTTAGACTTTTAACGATGCAAAGACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTAGCCACCACATCCTGC:1 + chrX 16777330 5' + Rt1a 4880 1 68.32 ATAGTNTTGGACTCGTGGAGCGGAGCAAGATATGTGCGGCTTTGGAGAATATGGCTATATGTATATATATGGATTGAGCTCACTGGAGCTCAATTCATACG:1 - chr3R 13553013 5' + G3 4538 1 60.40 CCGACAAAACGATTTTCCGACTGCCCGACTGACTCGAACGATTTGGTAAATGATGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGACCCCACCTATCATTCTGTCTGA:1 + chr2L 12616638 5' + G4 165 1 61.39 CTGAAGCAAAGTGGTGGTAAGGAGACTACTTTATATAGCATAGTCCAAAAGTTTTGGGATAGAGATTCCTTTATTTAGAGATTCCTCTGTCATTGCTTGCA:1 + chr3R 6048315 5' - Q-element 99 2 54.46 TGTTGCAGTGTCTTTTCTTGGCCTGGCTTAATTTCCTGCTGCTCGACTTCAACTTGTTTTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAG:1 - chrX 2963792 5' + R1A1-element 5197 1 62.38 ATTCAACCGGTGAAAAGGAGAAGTGTGTCTAGATATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGAAAATGTAAGAAGATTCCTTCAGTAAAATTCTGTCGAGCGCT:1 - chr2R 5711834 5' + invader4 73 2 76.77 AGTAACCAATATAACACATATAAAACAAAAACTGAGTAATTGGGGCAAAAAAAATATGAAACTCATACCGGCCACTCCAATGGGTAGTGTTTGCCGGCTAT:1 - chrX 16197197 5' - gypsy6 7515 2 50.50 GTGTGTACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3R 27619273 5' + hobo 29 1 56.44 TGATCATCTTCGTGCACACACTGCAAATCCAGTTCCAGCCCAACTGCAACTTCCCCAAGTCCATAGAGCCCATAAGTATATCAGCAAAGACACAACATCCA:1 - 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Chouto 38 1 70.30 GCCACTGTCTTCAAAAGAAGAGTGAAAAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 12958904 5' + roo 8711 2 73.27 TTTTATGTATGTTTGGCTGCCAAAGCAGTTGTATTTGAAGTCTTTTATTATCATATATTGTAAACATAATTATTGAAGATCCGTTCGCTTTGCGAGTGATT:1 - chr2R 5752411 5' + Cr1a 126 1 60.40 GTCGATGGTGTGCTACAAGTAAATGGAATGCATGTGGGAAATGCGCTGCTCTTAGAGAAGGGAACGTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAG:1 + chr3L 15758212 5' + flea 490 1 66.34 GCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 - chr2R 8198516 5' + F-element 51 1 66.33 GTCGGNCGGCTCCAATTCCGGCTCGGGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTG:1 + chr2L 2377294 5' - invader2 212 2 79.21 CAGGATCAATAAACATAATTGCGCCCACACACACGGCCGGATGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCG:1 - chr2L 16469748 5' + F-element 248 1 58.42 GTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATC:2 - chr2R 1000412 5' + HMS-Beagle2 6894 2 72.28 CGGACAAGCGTAGGTAGCTTAGTTATGGCAAAACAGTATCTCTTTAAATATGTACTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTA:1 - chr2L 10487604 5' - baggins 5354 1 51.49 AACTGGCCTAATTCGCTGCAGAACTATATTAAAAATAAAGAAAGTAGAGAAATCATAGAGTAATCATTGGCTATCAGCAAAAAAACCAACATATTCTTTAA:1 + chr3R 13471189 5' + 17.6 7210 2 51.49 ATCCGTATCCGTCTGTTTGTGTATCTGTGAGTGTTATTGTGACTGTGGCCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTG:1 - chr3L 2570426 5' - I-element 4876 1 51.00 CAACACCCACTTTAGCTTCAACTCCAGTGAAAGTTTGTTGTCGCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 22454935 5' - hobo 2907 1 55.00 GCTGCATGGACGACGAGACGTCGATATCATCCAAGAAGCACTCAATGTTCAACGGCAGCTTGGTGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTT:1 - chr3L 14039817 5' - jockey 4648 1 71.29 TGACTAGTAAAAGTCATCTGATTTCTATGGGGTCATAGCTGTCCTGACAAACAATTTCCTGCAAGCTCGTTAAATAACCTTGTTTATAAATAAAACCGCCA:1 + chr2R 5616520 5' - 3S18 341 1 80.20 AACGAACTCTGGGGTGAGGTAACGAACAGGGGGAGTGGCAGCAAAGTTTCGGAGCAATCGGACGGACAGGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCA:1 + chrX 14400660 5' - INE-1 91 1 58.42 GGCAATTGGACCACTTAACGATTACCAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCT:1 + chr3R 10692668 5' + Transpac 274 2 74.26 TTGGTGAGCACTGATTGGTGATCCCTACCGATAAGGGGTATCTTTTGTTGCCCAGCGGGCGGTGTGTTTTTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTC:2 - chr2R 9610027 5' - F-element 290 1 68.32 CTATTGCTCCCATTTCGTATCGTTCGGTTTTAGTTCCAGTTCGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATT:1 - chr3L 9243303 5' - 1731 4488 2 58.00 AAGCGCTCTCCAGTTTCCGCTACCCGTTTTATTTTGTGCCTTTTGTTTTGTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGAATGTTTCTATGCTTAAATCATTATGTAT:1 + chr3R 18462715 5' - Porto1 4392 1 56.00 ATTTCGAGATCTTCGCTTGGCCACACACAAGCATTAGCATTTGTAATTGCACATCGTCTCGACTCATTTAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATG:1 + chrX 19295444 5' + 1360 3275 1 72.28 GAAGAGCATCAGCCACATAACTTCGTACTAAGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCAT:1 - chr2R 16014622 5' + hobo 2663 1 69.00 CAAGACTACACCGGAAGTGTAATTGAAACACACAATGATCTCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTT:1 + chr2R 23984846 5' + F-element 4215 1 59.41 ACTCTCGTAGTAGGGCGAGGACTCGGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGA:1 + chr2R 6634397 5' - Doc 316 1 74.75 TACACGAAAATGCCAATTGAAAGCCCATTTTTCAACTCGCACATTATGTACATAGCGGAATTTGGTTAGCGTGGGATTGCTGACCATGCACTTATGCAGTG:1 - chrX 10411797 5' - gypsy11 164 2 63.37 CCAAAAGAGAAAAAGCAATTCGTTGGTCAGGATCAATAGAATTTCTAGCCATGCCCTTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACCATAAAAGCTAG:1 + chr2L 21742014 5' + INE-1 152 1 74.26 AAGAAGAAACAACAAAAAAAATTCTTACAAATGGCATTCAAACCATTAATGCGGTGCCCAAACCTCCACGAATCACCCCACCAACGATGCGTCTCAACAAC:1 + chr2L 22974990 5' + HMS-Beagle2 6810 2 65.35 GGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAACAATGCTGA:1 - chrX 21638082 5' + gtwin 49 2 74.26 CATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:3 + chr3L 22564836 5' + blood 49 2 78.22 AGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACC:2 + chrX 21772501 5' - gypsy3 6539 1 75.25 TAGTCCTTTGGCTTGAAACACATTTCAAACTACACTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTC:1 + chr4 740101 5' + 1360 463 1 65.35 ACAAAACGCTCAAGCAGCGGGGACACAGACACTGGCTAAAGTGACTTCCGCTCGAACAGGACACACACCCTGCCACACACACACACACACAAATCCACAC:1 + chrX 16634828 5' + accord 7035 2 81.00 AGTGTGCGTGCGCATCAAAAGCTAAGAACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chr2L 306449 5' + Tirant 8109 2 79.00 TGCTCCTTTCGATGTTTTGGCCGGCAATAACTTAGAAAACGACAGGCTGAGACCAGAAGCATGCAGGACAAGGAGCGGAGAAGTTGGAAGGAG:1 - chr3L 25793374 5' + gypsy8 4563 1 60.22 ACCTGAGGTGTTCCAGCGTATTACGCACCGTGCGGAAGTTGACAATGGTGCCGAACTTTCTCAGTTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTT:1 - chr2L 4795519 5' - Bari1 159 1 66.34 AAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr2R 8157259 5' - Transpac 5204 2 55.45 GTCAAGGCACATGTATGGTCAAATGGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAGAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCC:1 + chr2R 5653863 5' + 1360 3358 1 71.28 GGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 13824357 5' + roo 8703 2 73.27 GTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATACGAATATTAGAATTCAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTTTGCACACA:1 + chr3R 4577503 5' - 1360 179 1 78.22 GAATTCCAGGGCCTTTAACGACGTCTCCCAGGAGCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2R 20791809 5' - roo 9030 1 67.33 CGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr3L 22052769 5' - mdg1 388 2 59.00 TTCCCGCTTCCTGATCCCTTGTGTGTATTTTTTTGATGGGTAAACATGGGCAAAAAGTGGGCAAAAGATTCCAGTTTTCAAATTTAAAAAATTAGATTTTT:1 - chr2R 19627898 5' - FB 23 1 58.42 CGCATCGAAATACATGAGTAATTAAAATGTATTATATTCAATTAGTTATAACCTGTTTATTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACC:1 + chr3L 11801976 5' + Ivk 4986 1 59.41 TACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 25931365 5' + roo 8715 2 78.22 AGGGCAATGGTGGTTATCGGATTGTGCTCCAAGTTCAGCACCTGTAGGTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCAT:1 + chr2L 16404770 5' - F-element 136 1 52.48 AGATGTAAGCCAGCTGAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr3R 19535785 5' + hobo 5 1 74.26 GGTTGCGCCTCTGCCTGAGACTTTGGGGATGCACTGGGAAAAATACACCAAAGTTATATATAGAGGGATATATGTTACTGGGTTGCGGAGCTTCAGGTGGG:1 - chr3R 15643145 5' - G2 132 1 44.55 TCTCGTTTTAGTGGTTTAAAAAACGTTTTTAATGTTAAAAACTCAGCGTTGTCATACACTTTTAGCTACCACCACACTATATTGTATGTACATATGTAGAT:1 - chr2L 11179101 5' + invader3 5084 1 52.48 TATAGTCGCAGGCCACGCCTGATTTATAATGCAGCGCTTGTTAGACGCCGCTGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGA:1 + chr2R 9628432 5' - rooA 185 2 76.24 TAATAGCCATACAGATGCATATATAGTACAAATATACCGATTAATACCGATACTAGTGGTAGTTTTTCTGAAAGCGTATAAAAAGTGTGTATATTGTTGAT:1 + chr2R 9792380 5' - transib2 2616 1 70.30 CAAAAGGTGAGACAAAGGCCAACAAAGAAGCCAAAGTAACATTCGATCGGGAAGTGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTG:1 + chr3R 30546336 5' + P-element 405 1 59.41 TTCTAATGAGCAAATTCTTTTGGGCAACAAAAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTGGGCCAGTGGGCGAGCGAAAGAGCGAGAGGG:1 + chrX 982859 5' - Cr1a 298 1 58.89 AAGCGATGTATAGAAGCTCAGTGGAAAGACAGCCATAATGTCCGGTGTATACGTTGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTA:1 + chr2R 1707630 5' - Idefix 13 2 57.43 ACCTACACAATTTTCCCATTTCCCCCATGCTTCGCTCTCGCTCTCCCACACAAAATCTAACTTTCTGAGCTGCAGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACA:1 + chr3R 18000124 5' + Cr1a 354 1 63.37 CACACGACTGATGGATGACCCTTCGCACATGGAAGTGTTTTGGCCAACAAAAAATAGGCGAAACAATAAAACCAAAGACACTAAAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3L 13139165 5' + 1360 8 2 72.28 CTTGGCGTAAAACAATAAACTTAAAACAAGCGAACGGCCACGAATTTAATTTGGATGGGATACTTAAACAATTCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGA:1 + chr2L 12545675 5' - Ivk 5185 1 61.39 TTCATTGGCCCTGTCTATTTTTGGAGATTTTTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 27448544 5' + roo 44 2 73.00 TCTGTCTTGCCGACTTTTTTGTGAATGAAACAGGATAGTGACTCTCGAGATCAGCTTTGGTTTACTCAGCCAGCCCCGATCGACTCGACTAGTGATCCTGA:1 - chrX 16238082 5' - INE-1 94 1 74.26 CTTTAGGTCAGGGCAGGATCTGGGATCCGGGTGTGGGATAGCCGGTTAAGGCCAGCCGCTTCGCCAGAGGACCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTT:1 + chr2L 4273889 5' - Bari1 385 1 77.23 TGTCCTGGCTATTGGGTGCCGATCCGTGCGGTTTCTTGGGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGTTTCGA:1 - chrX 17279225 5' - X-element 4343 1 61.39 AGGCCATAACTAACCGCTTATCTATCCCGTATGACCATTAATCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAAC:1 + chr3R 28603757 5' - F-element 68 1 59.41 CATTTNTTGTTGCACCGCTGCACACTCCCACCCACATACCCACACCCACAGCCACAATCGCAATCACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAG:1 - chr2L 15805234 5' - HB 1282 1 78.26 CTTAATTGCCTGAAAATGAAGCCGAGCTCACGGTGGCAACAGGACTAACGACCCGCCGAAATGTCATCCAAGACCGGATGTGCCAACAACAACATCGACGA:1 + chr3R 12789069 5' + gypsy10 5704 2 52.48 GCAGTAGCATTACTGCTGGCCCTCAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCT:1 + chr2R 5519434 5' + I-element 4873 1 77.00 TTACTCTTTGCCTTTTGTGTTGCAGAACTCGCACTTGCACACATGCATTCGCATGTGCATACACACACACACACACACTGGGTGAGTTTTACCGGACTCTG:1 - chr3R 28287846 5' - invader5 158 2 74.26 GAGGCGACGACTCCAACAACTCCAACAACTCTAACAACTCCCATCAAAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCC:1 + chr2L 6604929 5' - blood 7291 2 53.47 AACATTTATTGAAATATTTGTTTAAGCACTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTG:1 - chr2L 9960135 5' - Porto1 4317 1 72.28 AAACGAAAAATGGGTTTCAACTACAGTTATAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTC:1 - chr3R 2474336 5' + Juan 4020 1 70.30 GGAGGATGGGGAACTGGGACTCACAGATCCGGAACCCCAAGTACCACTCGCGCTTCGCACTTTTTCGTTTATTTGTTACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATA:1 + chr2L 18500892 5' - gypsy4 314 2 54.46 ATTATGCGAGTAGACTCTTCCTCTGTCTCCAAATAAATATAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATA:1 + chrX 22605687 5' - diver2 162 2 60.40 TCGAGAGTGGGACCATGGCGTCAGCGCTTATGTGGCTCTTTTGCCAGTAGCCGACCTCTTTGGTTTATTTGGTACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTC:1 + chr2R 20143770 5' - invader2 166 2 57.58 AAATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 6620556 5' - accord 188 2 66.34 TGTTANCTGCTTTAAAAGAGAGAGCCAACAAAAAGATAGTGTCTTTGTGTGATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3R 22667118 5' - 412 7519 2 50.50 AAATTCATCTAAAGTCTCACATCTTATGCCCATTATGCGGTTGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGC:1 - chr2L 12690460 5' - gypsy4 180 2 65.35 TGACANCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr2L 14536254 5' + blood 7053 2 62.38 GATGATGAATGGTTGAAATGAGTGCACTGCAAGAAAAAAAGATGGTTACTATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCA:1 - chr3R 5682561 5' - 17.6 7010 2 58.42 ACTACGTGCACACTACGCTTATAGATCTAAATACATAATTGCGTGCTTGCGACAAAAGAGTAGAGGAGCTAGAATACAAAAACGGAGGAAGCAAATTAATA:1 + chr3L 25236977 5' - Gypsy12A_LTR 2060 1 64.36 ATAATAGCGCCAAAACACAAAAATTGATTTCTGGGTAAACACAAGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGGTCTGTATAGTCTCCGCTGCCATTAACGCCAACGA:1 - chr3R 4945976 5' + HMS-Beagle 52 2 74.26 GATTGNGAGGAGTGCTCCTCGAACTCAACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTAGTAGCTAAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCG:1 + chr2L 14424582 5' - Chouto 465 1 76.24 TTAACGTTCTTCAACTAATTGACTAATTTATGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr2L 15997953 5' - 412 7524 2 54.46 CCTATNAGACCGTTGAGGAAAACTCCACCGCCTTCCATCTACATTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAAC:1 - chr3R 5180460 5' + blood 472 1 56.00 CGTATGTAAGTTGGTTCGTAGTTAGTGTGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATT:1 + chr2L 18117985 5' - HMS-Beagle 6665 1 72.00 TTCCATACCAGACGATAAATGGATAAAAAGATCTACTTGCACAGCTTTCTGCGACTGCAAAACAACACATCAGAGGCGCTCCAACCTGTCATGGTATCTGC:1 + chr2R 12095827 5' - X-element 4411 1 77.23 CTATATTCTTTCTCATAAATAAAAAACCGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 - chr2R 11257914 5' + pogo 45 1 74.26 CGGTTCAACTGCTCCATGGGTCGAAAGTTCTATGACCCATTGCAGTTGCTAGAGTAACATTTATCATAGGAGCGGATACTCAAATGCCATTAAATAAAAAT:1 + chr2R 17920020 5' + HB 468 1 57.43 TTTAAATTGCAAATCCGGAATATTTAGATCGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAG:1 + chrX 15555995 5' - Doc 4276 1 70.30 ATGTTGGAACCCCTCAAACATTATTGAAAGATTGATGAAAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATA:1 - chr2L 10942505 5' - accord 445 2 61.39 AAATGCCTCGTTTATAGCGCAAAAGTGCCATATAGTTTTAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGA:1 - chr3R 9783252 5' - Stalker4 340 4 62.38 CCTATTTTGCATATGGTCTTTTAGGCTGCCAGTTTTCAAGTGTCGAGTCTGTTGGGCATTCAAATGGAACATTTAGATTTTTCTTTTTTCTTTTCTTTTTT:1 + chr3R 18200594 5' - Doc2-element 232 3 85.15 ACTTCTGCTTTGCGATTTGTTTGTCAACTGACTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGC:1 + chr3R 17394568 5' - F-element 267 1 69.31 CCAGAATCTCAATCGCATTGGCACCCAGTTCCAGAACTACGTCAAGGACATTATCAACAACTTACACTGGCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTA:1 + chr2R 15142677 5' + F-element 4229 1 59.41 CCACATATCCCCAACGCCAGGGGCACTGGACAGGCACTATTTATCTGTGTTTTTGTGAGGATTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr3R 22831100 5' - mdg1 7446 2 63.37 ATTGGNCGTGAAATTAATATTCGCATGTAAGAGTTTCTCTGTGTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr2R 23776058 5' + 1360 81 1 57.43 CGTGAAGAAGAAAGAGTCGGAAAAGCCGCTGCGAACATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTA:1 + chr3R 7458452 5' + invader1 52 2 64.36 AATGCTTTTCTATGCTATGTTGTCTTAAACATGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - 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copia 4657 1 78.22 CTCTTCCCCAGTGACGATGGCTGCCACAACTAATGCATGTCTTGGTGTGTGTGTGTGTGAGAGTCCTGGATGCGCCATCATGTGTGTGTGTATGTTTATGT:1 - chrX 7618160 5' - accord 248 2 78.22 TATATACTTGGCATGCATTATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 15814715 5' - roo 9037 1 54.46 CCCATACAACACCAGCAATACAACACAGCGGCCATAACGCCCACATACCAACAACAACAGCTGGAGACAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCT:1 - chr3L 16679687 5' + F-element 452 1 59.41 GTCCATATAAACGCTGTGATCTCGTTGTCCTTGGATAGTTTTACACACTCCATATAGACTATTTAGGCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2L 3394687 5' + 1360 6 2 72.28 CAATGATGTGAAACTATTGGGCATATCTGTTTTCATATGCTTCTCTCATGCCCAATAGTTTCACATCATTGCTCGCACAACACGCACACTTATACGCGTTC:1 + chr2R 23448889 5' + 1360 3219 1 60.40 AAACGACAATATTATTACTTTTTACTTCAAGCATCATAATGTTTTTGGGCCACTCTGTTTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGAT:1 - chr3L 7740781 5' + opus 116 2 58.42 CGTTATTACATTGTTTTACATATCCTATATGCCCGCCATTTAGACTGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATG:1 + chr2R 4008923 5' + 412 495 1 54.46 ATACCCCACCGAGAAGTCCAATCCGTGGCCCACCAGAAGTGCCAGCCCACTTTGACAATAGATCATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCA:1 + chrX 12356923 5' - Stalker4 300 4 67.33 ACAGCGAAATTAAATATATTAACATACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr2L 20465640 5' + blood 7062 2 79.21 TGACGGACGGACAGCCGAACCGAAGTGGTTGGGGGACACACCATGTGTAGATATACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3L 7231109 5' + 297 11 2 58.59 CTGTTCGTCTTGTTGTTGTCGGCTATGTGCCACATGCATAGTGCTTATCGCTTAGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACG:1 + chr4 601350 5' - Bari1 1568 1 61.39 TACGCAGGTAAGGTACACGCAGTAAAAGAAGGTCGACAGCAAGGCAAAGGAATATGAATACCTCTCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAG:1 + chr3L 15371421 5' - Max-element 8347 2 67.82 CCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCTG:1 - chr2R 5424273 5' + 1360 3359 1 77.23 AAAAGACCTTTAAGCATACCGGGCACTCGACAGTGGAATTGCTATTGCTCTAACGTGGAGTTATGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGC:1 - chr3R 9628080 5' + G5 4408 1 56.44 GCTGCCCAACAGCAGCAATCCCATCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATT:1 - chr3L 16679252 5' + F-element 4226 1 77.23 TCGCGGCCTCAGCTGTTTTTGATGATGGCCCCTTTTGTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCC:1 + chr3R 8789757 5' + roo 8831 2 62.24 ACCTGATCAAGCCGCAGCGCCTCTTCTTCCTTTCAGTTGACGGGGTGGCTCCACGGGCCAAGATGAACCAATATTTTGTGGACTGTCGCTGTCATGGGAAG:1 - 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chr3L 18957711 5' + copia 4 2 75.25 ACAATATTTTGCCCCATTCGAAAACAATTTCAAAGAGCATCGTTATATGGCATCTCAAGAGCACTTTGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAA:1 + chr3R 3745701 5' - 1360 249 1 65.35 AAATANCATTGCCACATTGTTGACAATCGATATAGCCAAGTCTTAACAATCGATTTTAAGCACTGATTCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3L 9864556 5' + P-element 8 2 70.30 TCCAGGTTGATGCCGTGCTCCAGCAGGTACAGCTCCCAGCCCAGCAACAAACTTACGAGGGCATTAATCACAAACACTATCACCAAGTGAAAGTTAACTAA:1 - chr3L 9681976 5' + Doc 4610 1 68.32 AGATACAGATGCAAACGCACACAAATGGATAGCAACATGTGGCTCTTGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATA:1 - chr2R 22270791 5' + blood 169 2 61.39 CTGATGGTGGTCATCCTCAAGCATTTCAAGATCCTGCCTGTTATCGATCCCAAGTCCATTGTCTTCCTAGTGGGCATAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTT:1 + chr2R 9239523 5' + McClintock 6142 2 79.21 TTTAGCACCAGAAGGAGGAAAATGAGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:2 + chrX 12290616 5' - HMS-Beagle 226 2 59.41 TAGTAATTTTCAAAATTTTCACTGCCCACCCCCAAAACAAAATATTCTTATTAATTGTAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAA:1 - 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F-element 379 1 67.01 CTAATNATGAAAGGGAGATGAAAATATGATGAAAAGCTAATTTTATCGCAGATCAAAATTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAATCACGCCATAAGATC:1 + chrX 18154296 5' - 3S18 5971 2 53.47 AGTGAAAAGTGTGGTATTCTTGCAAAACTGAGCAATTCCATTACTTTTTTGAGATATCGATAAATATTGGAGAACAAATTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGA:1 - chr2L 3431516 5' - INE-1 341 1 69.31 TTTGCATAAGAACGCTTTTTGTTGTTTCGTCAAATTGGAAAAACACCGTGCGCATTATAACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTG:1 + chr3L 272510 5' + baggins 5151 1 64.36 CTCATATCTCAACACGGCGGAATGAGGACCCCTTTCTTATTCTCTTTCATACACCACTACCCATACACACTGTGGTG:1 + chr3R 5013748 5' - invader5 175 2 59.74 AAGTTCAGTGACCAAAATTTGTGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3L 11696480 5' + blood 3 2 76.00 CATTGGATGAGGCGCGTTGCCGGAAATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGG:1 - chr3R 14080270 5' - GATE 265 1 64.81 ATAAACAATGTTCTTGCGGCGAAAGAAATCGAATCGCTTATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:2 + chrX 15384748 5' + 412 7090 2 61.39 AATATNTGCACAGCCTCCGACTGAATGGGCGGGTCGTGAATGTGGTGCATGTGGCACTCGCGACGTCTGACACGACTGTGAAGTATACATTGTTCCGCTG:1 + chr3R 11140505 5' - Doc3-element 284 1 53.00 GACAACATATTTGTCATCGAAATGAATTATTCAAACCGAAAACTTAGCTTACTGAAGGCCCATAACCAACTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAAC:1 - chr2L 13668462 5' - Copia1_DM 173 1 78.22 GACTGTGGTATGCATTTCTCATCTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr3L 14005649 5' + F-element 24 1 52.48 ACCATAATGACAATTATATTTTAAATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 87188 5' + jockey 33 1 52.48 AAAGGTGAAAGGAAAATTTCTAGGACCTTACAAAATTGTTAAGCTAAACAAGTTCGGAAGGATGCGAAAAGCATACATTGTCCGTATGAACGCCGAGATCT:1 - chr3L 25398360 5' + INE-1 133 1 56.44 CAGCCACAAAGTATGCTACAAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 947927 5' + hobo 34 1 57.00 TTTTAGCACCAGAAGGAGGAAAATGAGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 + chrX 12290615 5' - HMS-Beagle 227 2 60.40 TCTTCNGCGTCTCTTTTGGGTTTAGTTTTGGTCCGAAAAGGATGATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3L 63048 5' + roo 8 2 70.30 ATAACACCTACAGCCGGCAACGATAGCGATAGACCCATAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATAATG:1 + chr3R 29113196 5' + accord2 7496 2 60.42 ACTGCAGGCGGTGGAAAAACGCAGGGGGGGAAGCGCATAAATAACCATGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATA:1 - chr2L 921517 5' - 412 81 2 53.47 GTTTGACAATTGTCAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chrX 697512 5' - roo 9038 1 59.41 CTTGGTGCAGTCATGAACATGCATTCGCAGCTACAGCTCCGTATACACATCTTAGTATGTGTGTACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATAT:1 + chr3L 14690354 5' + 1360 201 1 59.41 CAGCTAATATTATACGGGTTAAAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAA:1 - chr3R 5086324 5' - HMS-Beagle2 99 2 78.22 CATAAGTGTTATGCTACACGGAACCAACCCAGATGAGCTATCTCATGAAGAATCTGATCTCATTGATTACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTT:1 - chr2L 4611972 5' - 1360 441 1 76.24 AAACACTTCCTTTGCGATAACTTTTGTAATGATGTTAGATAGATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3L 2539226 5' + roo 1 2 79.21 AGGGGGGAGATATGTATACTAACTTCTAATCGCGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 19743123 5' + roo 8702 2 69.47 AATTGAGTTTTCAGCCTTCTCTGCTTCCGCCTACAGTCGAGCCTTAAATTGACTCTGCAGTTTCCCCCTATATGGTAAGGGACTCAGAGAAAGGCCAACTC:1 - chrX 20129423 5' + roo 484 1 60.40 TTAATCAAGGTGCATTGCAACAGGACTGTCTTTCTTCATTACGGGACACACCTACTATAATATATTTACAAAATAACTTGCTTAACTGACCACAAAACAGA:1 - chr3R 6400668 5' - BS 281 1 66.34 GCTTTNCGCGACCCGAATCCTAGTGTTTCGTTCGTGTGCGTGTGCCCGTGTGTGTCTACACCATGATGAAATAACAAAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAA:1 + chr3L 5691223 5' + P-element 176 1 59.41 CCCAACTCAAAAACGCCCCACTAAAAGCGACGGCTACAGGTAACAACAACAAAATCCAAACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGT:1 - chr2R 12553747 5' - 1360 8 2 52.48 AAGAAGTCCTCGAACAAGCAGAACACGAAAAAGGCGTCGGGCCTGAAATCAGGAAACTACAATCAGCCAGCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGT:1 - chr3L 10191036 5' + flea 4867 1 71.29 GAACCNCCGTACCTAAACGAGAATCCGCTTAAAGCCTTGTACCTTTTATAGTTCCCAAGATCACAGCGTTCACACGGACAGATCTAAGGAACTATAAAAGA:1 + chr3R 6359140 5' + INE-1 149 1 49.50 GAAATCTGTATTATTTAAAATTCTCCATATTAATATTGCTTTCGAACTGAAACTCACGCACACTTATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAG:1 - chr3R 25206094 5' + 1360 3245 1 62.38 CCTCGTTTGCTGTTTGACAATTTATTCTGGTAGCACACACCACCCACCGAACAGGCTGATCCTGCCGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGT:1 - chr3L 19579132 5' - flea 4846 1 69.31 TTTTGGTGGCGCTCCGTACGACATTGCGTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGA:1 - chrX 4441484 5' - 1360 3192 1 76.24 ATTAAACTATTTAAAAATCTTTATTTTGCCAATGGGATAAATAAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTC:1 - chr2L 8298537 5' + accord2 7577 2 57.43 GTTCAGGTGGTCTTGGCCATGGTTTCGCCAGATCAAACAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAA:1 + chrX 8199789 5' - hobo 53 1 63.37 TGTTCTCCGTAGCCATGTATATATGTCGCAGCTCAATTTATTTGCGACAGTTGTTAGTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTC:1 + chr2L 4302876 5' - invader2 153 2 59.41 ACCCACGTTTCATGTCTAGCCAGCCGATTGTCTATATATTTTTTAATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATCAGGGATTCCTAAGTCTTTGTGGATACT:1 - chr3L 2356105 5' - G4 3549 1 70.30 AAAGTTTCCTTTCCTGTTTTCCGTTCTATCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGC:1 + chrX 2835633 5' + blood 211 2 66.34 TGTTCTAGCAATTCGAACGTTATGTTGACCATCGTTTTCGTGAACTATCTGCCCAACTTGAGATTCTGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAA:1 + chrX 17691257 5' - R1A1-element 197 1 71.29 AAATCACGAAAAGAACACGTGGGTTCCTTGCATCTGGAGAATGCCACTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAAC:1 - chrX 21445477 5' + I-element 206 1 54.46 AGTCTCCTTTGTCTTTAATCTTGTTTCCGAGTGGAGGTACGGATTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAAT:1 + chr3L 5584780 5' - TAHRE 10393 1 64.36 ATTTCCAAGGCCGTCGAACTGGACACGTCGAGACACGATTGCAGTTGTTGTTTTCGCCCCGAATGGGATTGGAGCTTAATTTTTGTTAAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 9613377 5' - I-element 119 1 78.22 AATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 9823629 5' + hobo 29 1 52.48 AAAGGCAGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 + chrX 17692598 5' + 3S18 5810 2 65.35 AAATGCCAGTCTGTATTCCCCGGGAAAACAAAATAATAATAGTAGGGTAATAAAATTAAAAACAAAAACTGGCACAGTCGGTAGGATAATACATTGTTGAT:1 - chr2R 21638271 5' + rover 377 1 78.22 AACATGAAATGCAATCCGTCGGATGCATTTCATTTACTGAGCGCCATTCTGGGCTCATCTTCATCTGCTGTGCCGCTCTGCTAAGTCCGTTGCCTCCAACC:1 - chr2L 14090492 5' + gypsy10 226 2 77.23 CTTGAATTGATTCAAAACTTTCATTGTTCGCTTAGCGCATAATAGGGGCGGATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1 + chr3L 12246099 5' + HMS-Beagle 6816 2 59.41 CAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGGTAATACCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACA:1 + chrX 21667955 5' + gypsy5 51 2 62.38 GGTCGNCATCGATTATAGTGTTCGATTTGTTATTAGATTTGTGTTTTTTTTTTCGTTGGCTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTT:1 + chr3L 23436389 5' - Porto1 4382 1 51.55 ACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGCGGAA:1 - chr3L 23678150 5' + Osvaldo 23 1 68.32 ACCGAAAAAGAGATAATACCTGAGAGCTTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 - chr3L 3485043 5' + diver 5913 2 54.46 GTACCCGTCTCACTCCTTCATCGCGCCGTCTCGCTTTATCTCCATATTCATATGTGCATTTTGTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTAT:2 + chr3R 19523448 5' - invader4 2956 2 68.32 CACGGCGCTATCATTCCCGTGGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGAG:1 - chr3L 7657675 5' + F-element 284 1 75.25 GATTCNGATTGTTTAGGTTCAATCCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATG:1 + chr3R 9506825 5' - F-element 4451 1 77.23 GTTGGTGAGGAAGCGGAGATTGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCT:1 + chr3L 20125024 5' - F-element 404 1 78.35 TGTGTGAAATTGCACAAATTTTGCAGTCAAATGAACTTTAAGACGCATAGACACAGCCTCACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTC:1 - chr3R 22946999 5' - HMS-Beagle2 112 2 63.37 GCACTTTGATTTGGCTTTGATTTTTGCTTAATTACAGAGGCCGAGGTGGTCAAAAGTACTGTTTATGGGCCAAAAATAGAAGCATTTAACTGATCCTTGCC:1 - chr2R 19861504 5' - Bari2 996 2 56.44 AGAATGTAAAGCAATAAAATCGGTAACAATTACCTTAATCTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTTATTGGTAGC:1 - chr2L 7873144 5' - G4 3490 1 61.00 AAGAAGATGGCAGAATCCAAGTTGAAAGAACTCTTAGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 9653339 5' + roo 8703 2 65.35 CGCAAATAATTAAACTATATATGTACATATATATGGATACATAGTGGTGCATTGTTAGTACACTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chr3R 11731259 5' - hopper 1402 1 65.66 CCCGCTACACAGATTCGGATGGACAACCACAAAATATCACTTATCAAATACCTGAAATACCTTCAAAACCGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 23580297 5' + 1360 3 2 79.21 TTGCGCTGCCCACAAAATCGTGATTCCGCCAGTTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCA:1 - chr3L 17498038 5' - F-element 394 1 64.04 ATTTTGCATTAAAAAACTGTTAAATGAATTTAAAAAGCAAGAATGAACGAGTTCCTTGACTATCAGGTATCCGTTACCCAGCTAATGTGAATGCGAA:1 - chr2L 21347276 5' - INE-1 531 1 57.73 GTGGGCAGCTCTGGTGGGGATTGGTGAATACCAAATCAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACAC:1 + chr2R 17071066 5' - 1360 180 1 65.35 TAACAAGCGAAAGAGGAGAAAACTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCAGTGCAGTCGACTTTGGCTGCATACTCGAATAA:1 + chr2L 1599705 5' - Doc3-element 4550 1 77.78 TAACGAGCGTGGTTAATTGTAGCGATATACATGACTATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGG:1 + chr3R 5105477 5' - accord 35 2 65.35 TCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3R 19535759 5' + hobo 31 1 54.46 CATGCAAAATCATCGGAAAATGGCTGGAAAATCTATGCTGAAGATGTGTATGCTCTAGGGAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACT:1 - chr2L 7118065 5' + roo 8817 2 68.48 TATATGTTTACCGTTGTAGTACTACCAGTGATGCATTCTAAAACTAAACACCCCAAAACAATGAAGCGAAAATAATGGACAGCCCTATTGGAGTTATGCCT:1 - chr2R 18556982 5' - Rt1b 5055 1 60.40 ACAGAAAATGTGGAAAGGAAATATGTTTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGC:1 + chr2R 9946637 5' + jockey 170 1 73.27 TCTGGGGGTGTTTGGTCAGTTTGGGAGGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGATCGTCAG:1 - chr3L 15458174 5' - Porto1 221 1 73.27 TGAACNACCAAAATGCAGTGCAAGTGGCTCAAAACCGATTAGTTTAGCCAAGAAAACCGGCTTAACATACTAAATAAGTGATTATATACGGAGCTCGATGA:1 + chr3L 343784 5' - Doc2-element 34 2 74.26 AAATAGCGCAAAAAGAGCGGAAATGTCTGTAGGGAAAAGGTATTTGTACAAGCAAGACCACACCCAACGCCATGAGCTAGAGCCGTATTCTAAAGCGTGCA:1 + chr3L 10615711 5' + Gypsy12A_LTR 2205 1 79.21 ACAAGAAGGGCGAAAAGCACGAGGGCGGCAAAAAGAAGGGTCACAAGAAGCACCACGGACACTACAAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGG:1 - chr2L 6915873 5' - Bari1 1567 1 71.29 CTCCCGCTTCCCTCGAAGGCCGTCACCCCATCCACCTACCACCTACAGTCGCAACATGTTCGATGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCGCCCGCCG:1 - chr2L 20399517 5' - Rt1b 4850 1 60.40 GTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCC:1 - chr2R 4879039 5' + G-element 17 1 65.35 TTATTTAACATACTATGCAAATTGTTAAAGTTATTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACT:1 - chrX 19898736 5' - Bica 222 1 66.34 ACACCTTACAACCATAAACAGTTGCGTTGGATATCGAGAAGAACACGCACTTGGCGAAATACAGCCATCGTCCCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCC:1 + chr3L 26852003 5' + diver 5893 2 74.26 CCATGGTTGCTGGCAAACATTCTTGACTCATTGCCGATAAAGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACA:1 + chr3R 23320596 5' - Bica 1 1 59.41 CATTTGAAGAGAACCGAAAAAGAGATAATACCTGAGAGCTTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTC:1 - chr3L 3485055 5' + diver 13 2 66.34 TGGAAAGCTGGGAAAATCGAGAATATAGGATATGGGATGGCGGCCTATGAACACTGAATTAGGAAGATTACGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTG:1 + chrX 4073328 5' - gypsy 7335 2 60.40 CATTGCGTATATGCATAATATCTCGCAATATATTCCCACTTACCCTTCGCCTATTTTACATAAAATCCTTCCATATGCGGCATATATATGTATATGTATAT:1 + chrX 14649267 5' + Stalker2 7498 2 62.38 TACCGAGAGCTGAAGAGTGTCCTGGTAGCACGTGGTGATGAGTACACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGAC:1 - chr3R 30165497 5' - R1A1-element 351 1 55.56 CTTTGCTTATTTTCCTTTGAGGTAGGAAAAACAGCTCAAGTTTAAAAAAGAAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGA:1 + chrX 10457602 5' + R2-element 3323 1 57.43 CGATGCATCCTCATTCACATCCAGCACAACCGAATCCACAACCTCTCACCGAAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAATCTTTGTTTGAGGCCTATGACCGC:1 + chr2R 8043350 5' - rooA 7407 2 58.42 GACTTGCATTCATACCGCTCACCGCAACCGCAAAGTATGCAATTATTATATGAAAAGAAACACTCGAAGTAAAGCGAACACTAGACTTTTCGTAATTGCGC:1 + chr2L 20271219 5' - GATE 180 2 57.43 CGTTTAGGTACTGTGGACTTCCACTCGTCAATCTTTTCCTATCAGGCTGTTCATACCTAGCAAAATTCTCAACTTATTCCAGTAGATTACTTTTAATTAAT:1 - chr4 245503 5' + Cr1a 3979 1 74.26 TACTCATACGACACGTGCCACGTGAAAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCG:1 - chr2R 11759145 5' - mdg3 237 2 37.62 CTGTTNCATCTGCTGCTGCTGGACGTTCACGTAGTCCAACTCGTTTTCCGGAGAGGGTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGA:1 + chr2R 6685038 5' - G2 85 1 60.40 AGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGA:1 - chr2L 3964500 5' - INE-1 501 1 84.16 AGTGTTTACTCGTTGGTCGCATAAAAAGGATAACAGGACAAGAGCAGGCCATGTCAGGCACAAATTATGACGATAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAAT:1 + chr3R 14179038 5' + R1A1-element 359 1 78.22 CAGGTAACTGATACTCCTTTTTTGTTTGGTCTGTCGGGCTAATTTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACT:1 + chr2L 16119919 5' - F-element 4414 1 56.44 CGTAACCGAGTAGGTCAAGTCCCCAACTGTCGGCCAGTTCGAACAGCCCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTT:1 - chr2L 18209276 5' - F-element 264 1 53.47 CTCTACGATATGGGTGAGTTGTCCCCAGAGCTGCTACAAAAACTGGATGATGCCGTTCAGCAGCAGACAACTGTATGTTTGCACACGTATGCTCATGCATT:1 + chrX 2236149 5' + 1360 183 1 69.31 CTGTGCTAAAAACACAGCTGCAGCACCAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAA:1 - chr3R 24319639 5' - gypsy12 9988 2 78.22 AACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:1 + chrX 17049545 5' + Stalker2 7278 2 51.49 AGGAAATGCGGCATAATTGTTTAACAATGCAATAGAACACAAAAATCAACACCAAACAGCACCGCGAACAAGCACAAAAGGGAGAGTAAACTAAACACAAG:1 + chr3R 18995083 5' - Cr1a 205 1 61.39 ATTGATTTACGTTCATATTTAGTGCGGTTTATTTATGTCGTTTGTTGCATGTTCCAATATGAATAAATTTCCTCTGGGGAACCAGCCCATCGGAAAAGTTT:1 + chr3R 8145848 5' - R2-element 192 1 55.45 GATTTCTTTGGGCAGGAAACTACGCAGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCT:1 - chr3R 17824920 5' + accord 236 2 74.26 AATTGGATTACATTACAAAAACGCCAAAATGAGAAAGATGAATGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGA:1 - chr2L 4300700 5' + P-element 225 1 46.53 TTCTCCTTGTTGGAGGCCTCGGCCAAGAGCATTTGGATCTCCAGGAACAACTCCGCTATCCAGTTGCTGGAGTGCTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACG:1 + chr2R 23397329 5' - Bica 60 1 77.00 CATGGTTACTGAGTTCTCAGGCTGGTTCTGTGCATACCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTG:1 - chr2R 16019190 5' + I-element 4990 1 62.63 TGGTTTATGCAAGTGCCGCCTGCGAGCGATATAAAAACGCAGGAAGGGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 - chr2R 10671463 5' + flea 4796 2 59.00 AGGTATCTGATAGTCGCACTGCTGCTTGTTACCTTCTTGCATTTTTTCAACTCTTTGGTGCTTTCTTTAGATAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCT:1 + chr2L 12547551 5' - INE-1 172 1 59.41 CGTCAATACAATAGATCGAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTGTGGTTCTCTGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTTTACAATTCT:1 - chrX 5042645 5' + F-element 4228 1 76.24 GTGGCGAATCGCACTCACATACCCGTAATAGTTGCTATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTG:1 + chr2L 14214815 5' - R1A1-element 245 1 72.28 ATGGCCCTACAGCCTTTTAGAGTGTGTACACAAAAAACGAATGACAAACGAAATATATTAAGATTGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr2L 18568133 5' + I-element 12 1 67.33 TATATATTGGGATTATGGCCGAACTGAGTTTTTTCCCTGTGCAGTCGCGGTTTTGTGTGCTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGA:1 - chr3R 28600045 5' + blood 454 1 63.37 CTCAAATACGAACTAAACTGAAATGAATTCAATGAATTTGAAGAGCCTATCGATAACAATATTCGATCCGCGACATCCCCGACCCCGTGAAGAACCGCTTC:1 + chr3R 8864335 5' - aurora-element 4020 1 59.41 GACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGC:1 + chr2R 4577071 5' - Chouto 494 1 55.45 CCCTTGCCCGGGGTCACTTGGCAATGGGATGCATTTTAAATGGGCTTATCTCCCTACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCATGCATACTTCTACGG:1 + chr2L 3202516 5' - Cr1a 4018 1 57.43 TGGCCTCACACTAAATACATGACGGAGTAACTTTTAAGAACTCTTTATTGAGCCAAGCGAAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAAT:1 - chr2R 4133491 5' - gypsy2 190 2 62.38 ACGTATTAACTAAGAGAGTAAAGGTGAAGTTATCTAATTATCTTACCTATCGTTTTGAAGACCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCC:1 + chr4 653824 5' - F-element 4524 1 63.37 CTGCAATCTCTACCAGTTCCCTTGGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:2 - chrX 2090328 5' - roo 409 1 80.20 GGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATA:1 + chr3R 5775688 5' + invader4 2807 2 75.00 AATTTGAGGCAGTTTTATACAGAGTGAAAATATTCGAAATTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCG:1 - chr2L 747819 5' - Doc2-element 4474 1 61.39 AAGGGTTCGTTAAACTTTCAACGCCAGCTATTCCAATCGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTT:1 + chr3L 69291 5' + Rt1b 5112 1 74.26 AGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 13824356 5' + roo 38 2 72.28 TGCATTATTTGCATTAAATTATGCATACGGCGTAGGTAAACGAAGGTAAAGGGTTGAGAGGAAAGAAAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCG:1 + chr3L 12251155 5' - HMS-Beagle 65 2 73.27 ACAGCTTTTAATAAAGGCTGTTCGTTCCATTTGGGTTTCTTTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATGTGTTTA:1 + chr4 1074051 5' - Idefix 304 2 69.31 AGCTATTTTTGCACTCACACGGCAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTA:1 + chr3L 3412491 5' - R1A1-element 5294 1 75.00 ATATTNACAAGCATAGATATAAAATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 15343872 5' - roo 356 2 80.20 AGGGATACGACGAGGATAAGCTGAATGATAGGTGGGGGCTTAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCAATTACCATTTCCAGATCTTCGTTTTTGTTATATTAGAT:1 + chr3L 17451481 5' - G4 98 1 72.28 CCGTCTCTTAAGAATGTTTCTACCTCTTCGGGAAAAATTACCAATTTTTTAACATTTGTTGTTTTTTAACTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCG:1 - chr2R 658453 5' - Bica 495 1 79.21 GACTGNTTTCACATTATTTTGTAAGACCCCTACTAGTGAATTGAAGAATTTAATTGATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTC:1 - chr2R 18175944 5' - G5A 2649 1 45.54 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATGTGCATATAT:1 - chrX 12649915 5' - blood 7165 2 78.38 AAGAAGTTGCCATATAATTGCCAGGAAAAAAAAACCAAGACAAAGGCAGTGCAGAATGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCA:1 + chr3R 30861848 5' - invader2 169 2 55.45 AAGGTGCCTACGGCGAGTGAGTGTCTCCGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2L 16691177 5' + pogo 46 1 73.27 ACTGTGAACAAACTTCAACACGCTATTGAAACGCTGTTGCTAACACGACACTATCCTGCACAAAGACCTAAAGATAGCCACTGTCTCCGAGGCAATAAACA:1 + chrX 22826893 5' + BS3 1451 1 60.40 CTTCANTGCCCAATGGAGCGTACATTTTGAAAATAGTCAGCCCGGCCAATTGGCAATGGTCTCTCTCCTTGCGAGTGTGTATGTATGTGTGTTTGTGTGTG:1 - chrX 15425645 5' - Quasimodo 38 2 71.29 GGCACTGCTCTGTTACAAGGTTTATGGATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:2 + chrX 2253824 5' + Tirant 8135 2 53.47 CAATTCGCCGGTGACACAGTTAACATTTCGGTGACCCCAGCCTCAGCCTCTGTTTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACT:1 - chr3R 22564050 5' - R2-element 3552 1 64.95 ATATGTAATTTTGTGTAATATGTTTAATTTTAGGTAGTATATTATATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACT:1 + chr3L 24241616 5' - flea 150 1 56.44 CTCATCCCCATTAGCTATATATATATGTGTATACTTACGATTTGAAGGCAATTCTCGATGAATGTAATTTCTTGTTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAACGG:1 + chr2L 10413285 5' + INE-1 536 1 70.30 CGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTTTCAGTTTTATTCAGAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATC:1 - chrX 22689425 5' - HMS-Beagle 247 1 80.20 GGCCATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr2L 19845909 5' + F-element 48 1 59.41 GGAGTATGCGCACAGTCTGGCAGCCCCATATTACAGCACTTCCAAATACGGTAGTACCACTATCTTAGGATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATA:1 + chrX 6225516 5' - blood 157 2 74.49 ATTTTNAAAACACCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGTCAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr2R 4536704 5' - mdg1 7453 2 69.31 CATGTAGTAGTGCCGCAAAGTATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2L 7654065 5' + jockey 7 1 78.00 ATATACTCATTATAAACTACACAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTC:1 + chr2R 987522 5' + I-element 55 1 75.25 CCTGCTGGGTAATGAAAGGCAGCTGACGAAAAAGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATA:1 + chr3R 19993503 5' - F-element 4405 1 67.33 GACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 9868617 5' + roo 8707 2 73.27 CTCTTGCGCATCTGCTCCATGTTGTGCTTAGAATCGGCCAGAGTGAAAAGAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAA:1 - chr2L 7389482 5' - Bari1 367 1 56.44 GTGCTAGATTGCACTTGCTTATCTATGCGCCGTCTATTTTCTTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCA:1 - chr3R 20132532 5' - 1360 388 1 60.40 TTATCACGAATTATGTACTTTTAATCGGCTACCTTCGGCCTACAGTATTAAATATTATATGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCT:1 + chr3L 9067027 5' - jockey 4738 1 51.49 CTAAATCAGAGAAATAATTCTCATGCGATTGCACTACCGGACATCGTTGTCGCCTGACGCTCACTCTGCAGCAGGCGTCGGCAGCGATTCAGTGGTCGTCA:1 + chr3L 15903350 5' - HMS-Beagle2 159 2 71.29 TGTATATACATAAGAATTCCCCCCAAATTCAGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chrX 19561872 5' - 412 7502 2 68.32 AACTAATTTAAACGAAAAACTAATTTTAATAACATTTTAATGAGCCGCAAAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTTATGAAAT:1 + chr3L 10324157 5' - Doc3-element 4635 1 53.47 CATTCGACGCTGGCAGTGGCATATGGCATATGTTGCGTCAATCCAGCCATGAGCAGCGCAACAAAAACGGCTAAGAAGTTTTCCTTTTTCCCTTTTTTTTT:1 + chr3L 13580191 5' - Doc2-element 233 1 64.36 GCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTG:1 - chr3L 19339411 5' - Tc1 1597 1 43.56 GGAACTGGTCGGTGCAGATTGTGACTGGCATGGCCTATCTGGAACAGAAGCGCTTTGCTTTCAAAGTTTGCTTTGAGAGTGATTCTTTGTGA:1 + chr3L 4111183 5' + Cr1a 134 1 60.87 GGAGGNTTTAAGTCATTATTCATATCTTAAAAATATTTTTTTAAAAAAAA:1 - chrX 11527911 5' - hopper 163 1 72.00 CTTATTCATGATTTTATTTGCGCGTAACTTGTGCTTGATGTACTCAAAAAAATAAGTAATTTTATCATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAA:1 + chr3L 16069443 5' - Tc1 1481 1 66.34 CTCTCAATCTCACTATACCGATAAGAGTGTCGTGGGCCGCGGGGAAATAATAAAGAAAAAACACTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCC:1 + chrX 22680881 5' - Cr1a 4064 1 63.37 AAATGTTTGATATTTTTTCATATATTTATGAAAAGTCCGCCACGGACCGTAATTGTGACACATTACTGGAAGTGCAACTACACTCTCCACGAGAGGGCAGC:1 - chr3R 19397167 5' + baggins 92 1 54.46 CAGTGAGTCGTCGTTCGACTTTCATGCAAATTAAGGCAATGATTGTTGAATGCTTGTGTCCG:1 - chr3R 9182002 5' + 1360 457 1 56.45 TGACAAAAGTAAAATTATCTAGAATCTGCGTTTCAACACCTTATAAAAATTAAAATACCCCAGCACCAAAGACACTAAAATAACCAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 22794202 5' - 1360 3375 1 76.24 AGAAGCTCAACTCACCCAAAGAACTTTGGGGCCCAGGCGCATTCACGAGCTTTTAGAGATTGCGAGTTAACATACAGGTGCGGTTAAAATAATAACACTAC:1 - chr2R 14555191 5' + Tc1 8 1 61.39 ACATAATTAAAAAGGCGTCGTCCACGCCGACATTTGCTGCAATTGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGT:1 - chr3R 14974309 5' + Rt1a 4724 1 61.39 TCATTTTGCATTCTTTCAATTCCTACCAAATATTGTGTGCCTTTTTTATATTTTGTTAGGGAGAATTCGCCCGCCATGCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTC:1 - chr2R 14644630 5' - F-element 290 1 78.22 CTCTTCTTGCTTTCCGATGCGGCAATGTTCACGGACTTGCGGTCAAACCACTTAATGTAAACACGTTGAATAGTTGTGAAGCCTCACTGCTTTGGCATCAT:1 + chr3R 10854102 5' - diver 211 1 56.44 TCGGCAGCAAAAACAATATCACCGATACACGATAAAAAGTCTGAACAATCAACCAACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGC:1 - chr2R 9996504 5' + F-element 311 1 60.40 AAACCCAGCGAAATGTTTCAAGTGCACAGAAACAAAGAGAACAAAATTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAAC:1 - chr2L 9034186 5' - R1A1-element 8 1 54.46 CACGTCCCTTGTATAGTTCATGTGCCAAGCGGAGCCGAATATATTCATGGACTTTGAGAACTGGCTGGAGCTGCAGCTGGCGGTAAACACAAGTG:1 - chr2L 11742996 5' + Osvaldo 1045 2 64.21 AGTCGNCATGTTTGCTCGTTTCGCTCCCTGCGTTCGTTTTCTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGC:1 + chr2L 5636349 5' - F-element 471 1 58.33 ACCGTGAAAACACGGCGTAAAGCCCGCTAAGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGAAAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr2L 10635213 5' - roo 411 1 77.00 GCTCACCGAGAATCGCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAA:1 - chr3R 8782955 5' + mdg3 5428 2 75.81 CGCCACCTGTCGTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTT:1 + chr3R 30770909 5' + BS 46 1 71.29 CAGCACTGAAAAAGTTCTTTACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 25931384 5' + roo 32 2 59.41 AGTTAAAGGGATGTGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAGCAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 - chr2R 4639930 5' + 1360 41 1 69.31 CAAAAATTACTTTCTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATGTTATAAATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGA:1 - chr3L 24975217 5' + Tc1-2 256 1 70.30 TGCATTGTTCGGTCCATTGATGTCGTCGTCGTGCAGCAGCGAGGACAAGCAAACAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTAT:1 - chrX 8984971 5' + Juan 3893 1 58.42 GATGGCCAGCCGAGCTTTTCCCATAATGGTAAACAAAGATATGAAGAGTCCGAGTGGAGTGTTAAATGGAAAGTTATATATATATACACATACATATAGTT:1 + chr3R 25712455 5' - 1731 4409 1 70.30 GTTTGCACAGAGGCGCCTTTGTCGTTGCATGTTTTTGCGGTTTTTCGTTTATGTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTAACTTCTATAAGAGTG:1 - chr3L 11656250 5' - gypsy4 294 1 60.40 AGCAGCCAGGCTGAACGGAAGCAACATTACTCAATGTCAACATCAAAATTGCTTTGGAATTCATGCATTCATAAAGCGAGACGGAAATAGTTTCTGTCAAC:1 + chr3L 15664200 5' + invader5 3792 2 69.31 TTTCCACTGGATGCAGAGCCAACTCAGTTTTCACTAAGTGAAGAGGAGTTGGATCTAGACAAAGATACAGAAAAAGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATC:1 - chr3R 17800220 5' - Idefix 6930 2 70.30 CACTGGCCCTTTAAATGTGCTCTCATCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTG:1 - 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gypsy7 5011 3 62.38 AATTTAAATGGAAATAGGCGGGGGTTAACTAAACAGTTGTAAAATAATATTTTATTATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCAC:1 - chrX 14625559 5' - invader4 307 2 61.39 GTTTAAAAATATATTTCTTAGCATTACGGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACAGAT:1 + chr2R 13471622 5' + Doc2-element 4601 1 60.49 CTTATTTGAAAAAGTGTCCCACACTTATTATGGTTCTTCCTGCCATGGCTTTCAATTAACCTCCGGTACTTTTTCTTTATTATTAGAATGATAACTTAATT:1 - chr3R 28122814 5' - transib4 2175 1 69.31 TCCGGATAACTGGATAACTGGGATAACAAGGATCTTTTGTCACTAGATTGATATTTTTAAACAACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCCGGC:1 - chr2R 2144596 5' - Gypsy6A_LTR 96 1 69.31 ATTCATTTGGCACGGTCAAACAGATTTCTCAAATTTTCGAAGAGAACATTACTAGTTCCAGTGCTTCCAGTGCCCAAGTAATACGACCTAACGCTTATACA:1 - chr2L 10318259 5' + Stalker4 154 6 72.28 AGCTGTTTTCAGCAGGTACCTCGGATGCGGTGGGGTGTATGTGACGCATATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCGGGCGTATCCAGAC:1 + chr3R 17394655 5' + R1A1-element 5226 1 52.48 CCGTGTGTCCTTCCTTCACCATTTTTACGGCCACAATGGCATTATTGACCTCCGCCATGACCACCCATACAAATCCCCTCAGA:1 + chr3R 18046570 5' + Doc 4489 1 72.29 AAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTG:1 + chrX 17049559 5' + Stalker2 44 2 65.35 ACCCCCCGCAGTGCAATTTGTGAGGTCGAATGCTCTCCACTCACCCTTGAAGATGTGATCCAGTGTGGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCT:1 - chr3L 10660277 5' - HMS-Beagle2 153 2 39.60 GCTGTGGCCATTCCCGAAAGACAATAAATTAAGCGAGTTGCGAAACAAGATAGGTCAATCAAATTAAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACT:1 + chr2L 5684997 5' + I-element 4933 1 75.25 TTTCATTTACACAATGTAATAAAACTAAACAAACTGAAAGTCAATTAGAAATTTTATCAAAACATAAAAGCAGCGCTGGCCGGACATGCATATTGCAAGTG:1 + chr3L 11273545 5' + TAHRE 9990 1 75.25 GTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:2 + chr2L 20840441 5' - Transpac 5183 2 73.27 TACAATATACATAATTATATTATCTGATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr3R 24840010 5' + I-element 51 1 73.27 CAATTGCATATTTATACATATTTGTATTATTCATTTTATTATACTCGTTTCACTCAGAATTGATTGGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3L 1715580 5' + Doc 21 1 61.39 GTGCGTGAGTCATAAATTGATTTTCCCGCTGCGCCCGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTACCAAAGTTTGTGCAAATTCTAATGTCAATTTGGACCAAATC:1 + chr3R 13200125 5' - Bari1 1293 1 64.36 TACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCC:1 + chrX 21772489 5' - gypsy3 6565 1 59.30 AGTAAAAAAAATCAAAATAAAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGACACTGCTAATTTGTAAGAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTT:1 - chr4 805499 5' + Tc1-2 1479 1 80.20 GCTTTCATTTTATTGGATCTACCCTGCCAAACAGCGACATTAGTTTTGGTAAGCAATCTGTGATACATATATATATCTATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGT:1 - chrX 3003749 5' + Juan 1 1 71.29 ATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 15814696 5' - roo 354 2 75.25 GGACGGGCTCGTTAGCAGCGCTTGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTT:1 - chr3L 337256 5' - I-element 211 1 77.00 GTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3R 19535692 5' - hobo 2907 1 54.46 TTGTTGTTGTTGTTGGGGTCTGTGTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAAGTCCCTTAGAGAAGTT:1 - chr3R 9933631 5' - I-element 481 1 76.24 CGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr4 490295 5' - pogo 2051 1 76.24 GATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAT:1 - chr3L 24208211 5' + Quasimodo 13 2 63.37 TATTTATCCAATTTATAAATAAATATCGCCAAAATTAACTAGTTGGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAA:1 - chrX 22867424 5' + HMS-Beagle 6803 2 72.28 AAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAAC:1 - chrX 21638090 5' + gtwin 6957 2 66.34 GTGCTGAGATTGGAGTTTGAAGTTTGTTTATCAACTGGGGCAGAGTGCTATATTTATGGGTTGGATAACTTGCGCACATACAGTTGTCTGCTATCACTG:1 - chrX 21932988 5' - 1360 158 1 71.72 CCACCCCCCACCTTCCGAAAGGAACTCACCGCCACTGACTCCGCTTTCTGCTGTCATGTTCATTGTTGTAGACAATGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACA:1 - chr3L 16693107 5' - invader3 5461 2 77.23 TTTTAGCTAAAGCGTAAAAACCATTAATGAAGGCTTAAGTCGGTTATCAAGAGGTCGAAAGGTAACTGGAAAGGAAACGGTGCGGGCGCAAAGAGGA:1 - chr3L 7542558 5' + gypsy8 236 2 76.29 AACAAAAAAAAAACTTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATACCACTGTTTCTCTACTAACCAAAAAAATAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTT:1 + chrX 17565060 5' - Tc1 1376 1 58.42 CTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3R 12578163 5' + jockey 59 1 76.24 AAAAAAGCGGCAAGTAATATCTTTAATCACCTTTAATCATTTACTTCGTACTCTTTGGAAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAG:1 + chr3R 21046014 5' + FB 218 1 59.41 AAACACGCTGATTTACGAAGGAAAAATGAGTACAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 + chr3L 947873 5' - hobo 2896 1 67.33 GGAGCCGCAACATCCGGATCCCGATCGCCAGATACGCATCATCCGCAATCCGCAGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1 - chr2R 7728003 5' - jockey 4936 1 57.43 ACAAAGGCAAAGGCAGAGCAAGCCACCAAATCCAGACCGGCCACCTCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCCAGCTTCCAACAAATGTTTGCTCGCTTTGAAG:1 + chr2R 5893686 5' + G2 166 1 64.36 TCACATATTTATTAGTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTTTATGGTCGAGTTGCGTATATGTATACCAGGGACAGTTGTTTATTTGTCG:1 + chr2L 22063442 5' - Helena 1150 1 68.69 GTGTGCTATAAAGAGCTCGAGGGGCAGGACCAGGTGTGTGCGGCAAAATGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGTTCTCTCGCTCTCTAACATAAATTCG:1 - chrX 1427112 5' - 1360 94 1 58.00 ATTATAAATCTTTAGTAACTAGTCAAAAATAGTGCCGTAGTGCCTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chrX 13259303 5' + pogo 28 1 55.45 TCCTGCGGATCAGCTGCCGTCAATTAACATATTGTCCTGAGATCTCGACGTTCATACAGACAGACGGATATTGCTAGATCGACTCGACTATTGATCCTGAT:1 + chr3R 19344289 5' - INE-1 93 1 70.30 CTCTGCTTCATTTCCCATTCACCCCCGGTTATCCCTTCGCCTGTCATCTTCGCTATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCT:1 - chrX 6609602 5' - R2-element 435 1 57.43 TAATTCCGATTTTTGTGGGCTAAGAAGGCCAGCCGGTTGTTGTCGGCTTAAGACTGACTGTACAGAGGTTTTGATCGGCTCG:1 + chr2L 2727651 5' - rover 7156 2 54.88 CTTCTTGATTTTGCTTTCTTTTTTTTTTTAACACAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTT:1 + chr3R 10613270 5' - Quasimodo 115 2 61.80 TATTTTTGCACCTTTTATGGCTTCCGCCATAATCGACAGAGCTACAACTTTGTTACAACTAACTTTTGTTAGCCGGCGCGCCTTGAAGGGCTGAATTAAT:1 + chr3R 13129742 5' + BS3 1702 1 60.00 GAACAACACAGCGGCTAGCAGCTGACCTCGCTTAGCTCATATTACACGCCAGTCTCATCCAAGCTGGCCCAAAAACAAAAACAAAAAATAACAAAAAAAAA:1 - chr2L 16210956 5' + gypsy7 5004 2 76.24 GAGATTTCATAATTCACGAAAAACTAGTTTACCTCCCTCCCACTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGC:1 - chr2R 11920320 5' - invader1 3695 2 63.54 ATCGGTTTTGCTGCCTGCTCTACTTATTGCTTTTGGCGTTTACCCTTTTCAATGGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAAACACAACGAACGTCTTTTGGT:1 - chr2L 7927994 5' - hopper 493 1 60.40 TGCTCATCGACGCTGCTCGAAATCTTTGTGATCAAGAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr3R 16256206 5' + mdg3 5292 2 60.40 CCATACTTTCTTTTGCTATTTTTGCGTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGA:1 - chr2R 11052706 5' + micropia 5176 1 74.26 GCTAATTTGTACCACACCTTAAGCGCCCGTTCCCTTGGCTGTGGTTTCGCTAGATAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATT:1 - chr2R 16685471 5' - R1A1-element 5325 1 74.26 GACGGTCTCCAGTGGCTTCTGTGCGTGTTTGCGTATGTGAGGGTGGCTCCAGGCCCTCTCGAATTTTTGTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAA:1 + chrX 14444049 5' + 1360 152 1 57.73 ACATATTTCATTAATTCTGATAAAATCACAAATCGATACACTTAAAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTA:1 + chr3R 31735416 5' + HeT-A 5968 1 55.45 CATAAAGTAATTTTTTAAAAATTGTCAACAAATCATTTATGCTTCATAATAACACATTTTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGT:1 + chr3R 11684720 5' + mdg1 7315 2 64.36 CCCTTGGCGATTGTAGATGCAGTGCTCTCCCACTTTTCAAGCCTTTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTGCGCTTGGGATAGCCTAACTA:1 - chr2R 9275124 5' + GATE 8334 2 59.60 GTGTCNGTGCGCTAGTGTGTGTCTCTGTGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTG:1 - chrX 20879732 5' - R2-element 3114 1 72.00 CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTGGTGCTAAAGGTGCGGTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTAAGAGAGACGCTCTCAGTGCTTTCG:1 - chr2L 3013672 5' - Doc3-element 424 1 76.24 CTTGGNAATTTTCTTGCATTTACGAAGATCGGTGAAGAGAACTCGATGGCGGTAAGGACAATCTTCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCA:1 + chr2L 16331943 5' - 1360 268 1 75.25 TCACCCTTTCCACCTCTCTCTCTCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1 - chr3R 9226950 5' + jockey 4764 1 71.26 TGTGTGTCCGTCGGACTGTCTGTTTGTCATTGTGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATC:1 + chr3R 15670558 5' - invader2 4848 1 68.32 ATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689429 5' - diver2 4474 1 64.36 CTTTAAATAGTTCAAAGACATGATCAAGTTGGTCAATATCAAGAGAATAGGTTTCATTAGTTTCGTTAACGATTGTTCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAA:1 - chr3R 2208377 5' - 1360 3191 1 80.20 AACTGCCCCAATAGTGTAACGTGGACCTCTAGCATTGTAGGCTAATTAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr2R 8557904 5' - hobo 2910 1 52.48 GGAGCCGGACCAGAGTTTAACATGAGCTACTTTACTGAGATCAGCAGCACGCCAAGATCGCGCGTGGAAGGAGATAGTGCGTCGGAGCGTTACCAGAAGGA:1 - chr3R 16312342 5' + gypsy8 418 1 58.42 CACGTTGAAAAGTCCGTTGGGGGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAA:1 + chr2R 24977715 5' + accord2 7512 2 76.24 CCCCTCAAGCTCCATCCCCCCGCTGGGAACAGGATGAGCCGCATTCCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGC:1 + chr3L 1683854 5' + F-element 4543 1 54.46 GCACGGCTCCCTATTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chr3R 26794615 5' + hopper 139 1 76.67 ATACTTGTACGCAAAGTGTTACAGATACTTAACGCTAGTGTGTTCTGTGGCGAGGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAT:1 - chr3R 15390190 5' - accord 180 2 75.25 TTTGTTCGCTCTCAATCTCAATCCAGAAAGACGGCACATTCACATAGACACTGCTGGTGCCACTCGACTTAGCAGTCTGGTTATTATTATTATTATTATTA:1 - chr2L 18962796 5' - mdg1 39 8 74.26 TCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 2182732 5' + blood 34 2 57.43 AAAAACTCATAATTGGAGGGGTTCCTACAAAAGGTCAGCCCGACAATTGGAGAACCACTCGAACAAAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACA:1 - chr2L 18630677 5' - Quasimodo 6905 2 72.28 GTATCAGCCACAAAGTATGCTACAAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3L 947931 5' + hobo 31 1 53.47 GAGCAAAAGAAGAACAATATAAGCCACCACAACTACAAATTGAAAAACAATAAAGAGAACAATCACCATCGGCAAAATGTATTTTATTTTGTAATTTATTT:1 + chrX 10188232 5' - HeT-A 310 1 72.28 TGATGCTGATGAGTAGTTGGCGGCGTAAGGCGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGA:1 - chr3L 22202042 5' - Tirant 88 2 69.00 CGGGCCTGACGATTATGCGGGAATGATGGCTGGATATCAAAAATAAACTGACTTAAAAGCTAAAATATAAAAAGCTTCATAGCGGCCTCTGCAAATGTGCA:1 + chr3L 24564709 5' - gypsy3 77 4 71.29 AGCTCAGACTCCCTGGTCAGAGCCAGGACTCCCATAGAACAGGATTGAGATACTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAGCTGCACTTTTCTCTCTCAC:1 + chr2R 7327541 5' + Cr1a 277 1 60.40 AACGAGTCGGCAGGACGAAGGACTTGCTGGCCATAAATATCGCAGCCATTACACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGA:1 - chr2R 15618060 5' - hobo 344 1 57.43 CAACAAAGCCCATAAAGTAGTCCTGGCCAAAAGCCGTACGGACACACACAGAGACAGATAAAGTTGGCCGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCATCGCAAAAGAA:1 + chr3L 14860882 5' + Rt1a 4851 1 67.33 CTAAAAGAACCCCCGATCCGGACCAGAATCGGCGCTGGGCCTGAAGAAGACGTCTCATTAATGACAACAAGGAGCCCTATGTCCGGAGAAACATCAGCCGA:1 - chr2L 14483455 5' - Gypsy12A_LTR 1887 1 74.26 GAAAGATCAAAGCTGTGGCTTCTTAGACAACTTTTTTATTTCGATAGATGATTATTATTGAGAGGATTTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGG:1 - chr2R 14705206 5' - Gypsy6A_LTR 254 1 55.45 AGCGTTCGGCAATTATATAATCGGCCAGCCGCCAAACGAAAGTCGCCACACATAAACCTTCTCAAGAAGTCTAAGGACAGCCTTCGTCTTAGAAAGGGAGG:1 + chr3L 3280926 5' + Burdock 6115 1 55.45 GCGCGGAAAATTGGTGTGGGAGGCGTACAGATGCATACGTAGGTACTACTAAATGACAGCGGCGCGGGATACACTCACCTATAATAGGCTGCTTGCAGCGC:1 + chr3L 3599579 5' + TAHRE 9965 1 55.45 TTCTGTATCCGTAAAGAAATTCAAAAGGAAAAATTTGTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGTTAGGGAGATCGGTGGG:1 - chrX 14354338 5' - G5 4654 1 78.22 GTGTTTATGGAGTTGATGTCATTTGACTTCGCATGAAATCATAAAGCTCAACTGACAAAGAAATTGTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr2L 20230085 5' + pogo 6 1 73.00 CACCCNCTGCGCTGCACCACTCGCCTGCACCACCATCTCCACTTTTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAG:1 + chr3R 29382338 5' + 297 6557 2 60.40 TACATAAACTCGCACTCGTATGGTAGTAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTATCCAGTCTGCTAGCATATCT:1 - chr2L 1445417 5' - G2 2841 1 62.34 TTTAATGAACTTTTAACAAGCAACCAGCCATCCGCCCCTTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 + chr3L 7225897 5' - 297 6972 2 63.37 GGAAGCCAGCGAAACTCGGAACAATCGAAAGAGCAATCAGTTGGCGAACTGATATAAACTGGAGGACACATTACAATCAAAAGCCAGGGTATTTATACCTT:1 - chr2L 553318 5' + TAHRE 399 2 59.41 CCGATCCCTCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTGGTCCCATTAGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTT:1 + chrX 650670 5' + G5A 2604 1 77.23 CAGTTGTGTGGGTGGTTGGGCGGAAAACACCAGTCGAGTGGGTGACCTCCGGCGTGGGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACATTGAA:1 - chr3L 10817044 5' + aurora-element 4239 1 58.42 GTGACGCGCATGAATGGATTACCGAGATTCCTACTGTCCCTATCCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGT:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 4929 1 65.35 GCATTGAAGATTTTTAACTTTACAAAACTTTTAACGGATTTAAAATAGATTTTAGAAATTGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 8640796 5' + roo 8679 2 63.37 CTTAAAATGCAGTCTGTAATGTAAAATTCAGTGTTTATGTTAGTCTAAATTTGCTTATGGTACCACGGTTTTCAGGCTTCCATTTTGGCAGAACATTCAAG:1 + chr2R 5515516 5' - HB 444 1 55.45 TGCAGCAGGCGGATGGCGTATGGCGGCTGCGGATGTTTATGTCT:1 - chr3L 21594459 5' - Quasimodo 303 2 75.00 TGACTGTCAATTTCATTTACGTTTTCAATCCATTTAGTGTAAGCCCAACCACACAACACGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr3R 31996772 5' - mdg1 403 2 61.39 TAGTTGAAGGCAGCCAGTTGACGACGCTCGCTGAAACCGCGAAGCCCTACTGGTTCCGTTTAAGAGGGGCTACTGAAAAGTTTTGTCCCGACACGGTTCAG:1 + chr2R 9892407 5' + mariner2 104 1 62.38 TGTCAATGTTGTACAATGTTTTTCGGATTTTAAGTACATCGCGTTTATGTTTTTTTTTTCTATATCGCGTCTATCTTTTCGCGAATCGAGCCGTACGACAC:1 - chrX 18865855 5' + Cr1a 4387 1 75.25 GAGCGAGGCGGCAGCGTGGTGACGTCAATCCCAATGTCAATCCTGCTCTAATGGAACATCTCCCGGAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCC:1 + chr2L 11114991 5' - transib2 2449 1 69.31 GATCGAAATTCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 17788923 5' + roo 8713 2 75.25 ACAAGGGACCGATTTTTGAATACTATTTGAGATGAGGATTTTTGACACTTGTTTTGGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTG:1 + chr3L 21637324 5' - Bari1 1688 1 50.50 CTTGCAGCAACAGAGCAGCATCTACACATCAGAATCGAGTCCGGTCAGCCATAATTAATAATCCACACTGGGGTTTGTGCCGCGGTTCTGAGCGTCACGGT:1 - chr2R 12404494 5' + Rt1a 120 1 65.35 CTAAANTGGCGGAAGGGGACCGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTT:1 + chr2R 24892722 5' - roo 29 2 79.21 ACATTTTATTATATTATTAGTAATTGTATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTC:1 + chr2L 12241998 5' - invader3 5415 2 78.22 CCTCATGCGATTTGTGTGTTAATTTTTCATGAGTCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr3L 2182765 5' + blood 7012 2 76.24 TGCTGCTCTTCTCAACAATACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGA:1 - chr2R 6029120 5' + Doc 4271 1 81.00 AAATGCTTTAAAAAATACATAAATGTTAGTGCCTGGAAAATATATACATATATGCCACCACCTGATTCCCGATCCGCACTCTGCACCACACCGCCGCTGCA:1 + chr3R 18171082 5' + Chouto 291 1 69.31 TTATACCAGTTTTTACTGTGGGGGAGTAGATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCC:1 - chr2R 7793845 5' + Chimpo 47 1 80.61 GAGTAGCGTATTGATTCGGGTGCCAAGCACCCGGTTGTGCGCACCTTTGCATTTGCAGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGG:1 + chr3R 27609903 5' - hobo 71 1 56.44 GCTCAAGGGAACGGCGGTCTCAAGGTGCCCACTACGCTTAGCGTTCTAATTCTAAAGAGGTGATGAACATGTGACGGCAGTGGATGTGGGGATTTTAGTAG:1 + chr3L 18323067 5' - accord2 7342 1 73.27 AATTTTGAAATTGAGTGAAGGGTGTTTGACAAGAAATGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACT:1 + chr2L 16821053 5' + invader4 2753 1 68.00 GGCTATCATTCTATAATAAGTATAATTTTCACTCTACAAATAACAGCCATACACTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCGAAAATTGCT:1 - chr4 424043 5' - 1360 3323 1 60.40 ATACGGCCCTCTCGAGCCGGCGTCGTTGTCAATTATCGGTTTAACCCATGTCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGC:1 - chr2L 6791994 5' + blood 430 1 56.44 ATCCTCTGTCGCTCGGTGTCCAGGAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAG:1 + chr2L 1017153 5' - mdg1 116 2 76.24 ATTCTTGTTAGGTTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr3L 22564881 5' - blood 7350 2 63.37 TTTCTATCCAGGCTGTGAATCTGTCTGCAGAACAATCCTNAAGCATATTTTTCATTCTGCTGCTCTTACTTCATAGGGTAGCAAGACTCATCACCGGCGGC:1 - chr2L 1289141 5' + X-element 4310 1 68.32 CCTTCGCCAGGAGCTGCGGTTTTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGAT:1 + chr3R 27619678 5' + hobo 403 1 78.22 CTGGGGTCCAATACGGGAATTCCTATCGCCGGGTGCAATCCGCCCTTAGCCCATAACTGGCCAAACACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAA:1 + chrX 17390595 5' + F-element 489 1 70.30 CTTGAAATCATTTTTTTAATAGTCGATCCTAGCGTTGATAGCAGCGGAGACTATGACCAGACCTCTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGCGTTTACCCAGAAC:1 + chrX 4221342 5' - HMS-Beagle2 6932 2 69.31 AAATCGATCGATATTTGTATGAGAAGCAAGCTGAACACACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCTGGTTTCCTTATTT:1 - chr2R 11540341 5' - Transpac 354 1 62.38 ATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCATTTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCT:1 + chrX 21472692 5' - P-element 86 1 23.76 TCAGAACGACTGTAGACCGTAGATATTAGGTGGGAGAGCAAATACTCGGCAGCCGATACGCCGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATAAT:1 - chr2L 6958104 5' + G5A 2634 1 53.47 GACAACCCAGCGGATCCCCACTTTCCCCTTCAACCCATCAGGCGGGTTAACCACACGGCGCTAACCTGCAATGTCTCCAGAGGCTCCCAGCGACTCGGTGC:1 - chr2R 24683798 5' + HeT-A 5715 1 66.34 GAGCGAGTGGTATGGAGTGTGCCGGTAGGTGGGAACGAAGGGTACCGCCACCTCGTACTCAACCGAACAAGACATATTTAACAAAACTAACCCTCTAGACC:1 - chr3R 5783492 5' + I-element 5094 1 63.37 CCCAGTTCGAATTTCCGGTTTGCCAAATAAGGACGAGCATTTCACTGTTGTACTTGCCATCGCGCATCAGCATCACCGCCCAGACCCCAAGGTTCGACTGG:1 + chr3L 9543741 5' + Gypsy12A_LTR 415 1 56.44 AAAGAAGCACGGAAACAACAACTCGGAAAAAGGAGAGAGGCGAGCGGGCGTGGAAAAGTGTCGAACGAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTT:1 - chrX 6422412 5' - Dm88 442 1 65.66 TATGATGATGTCCCACCTCATGATCTGCGCCTGAGTACGCTCCACAAAGGTGATGGCCCAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATG:1 - chrX 16955265 5' + jockey 4649 1 66.34 TAGTTTGGTTACATGTGTACCTACACTGGGCGCAAAAAGGGGTAAATAACTATTTCTAAATGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chrX 13354237 5' - pogo 2090 1 69.31 GTGCTGACTTGCTTGCTCAGTTTGGATAGAACCACAGGCAACGTACCCGAAAGAAAGCGCAATGCCTCTGGAAGCAGCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2R 5640309 5' + roo 8665 2 78.00 ATGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689428 5' - diver2 4474 1 63.00 CGTTGCACACTTGAACATACCCTCAGCAAATAAATGCAAATTTCGCCATGGCAAACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGT:1 + chr3R 28773350 5' - Stalker 413 1 69.31 TAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1 - chr3R 1048043 5' + Stalker2 7279 2 54.46 TTGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 5932103 5' + jockey 33 1 50.50 GGCAACTTTGGTGGTCCTGCGGAGGAGGAAAGTAAGCCCACTCCCGTGGAGAGCGAGGAGCAGGCCGATGGAACTGGTCATCAGCCAGCATGATGTCCCGG:1 + chr3L 3296450 5' - GATE 8015 1 60.40 CTTTGGCAAGAGCGTCATTGACTCGGGCTGAAACCAAACGGGGGCTCCACAATAAGAACAAAAATTCTGGCATTTAAACAGTGGATTGGACTTCAGGGGGA:1 + chrX 720488 5' + baggins 5357 1 68.32 TTTCGGTGTCCGCCTTCATTTTCAGTTTTATCGTGAAGCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGA:1 - chr2L 13789972 5' - Rt1a 4902 1 62.38 TCCTTGTTGCCCAACGTGTCCAGGTAAGAAAGGTCCGACATTATTTTCCGCCGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr3R 9590889 5' + 1360 18 1 61.39 CTTCAGTACATCGTTGTTTGTTCTGTTGCAAACACAAACAGACCCCAAACAGCAGATTCCGGCAGAAAGCACGTTCAATTTCTTGGTCTTATTCATTATTG:1 + chr2R 9017867 5' + Gypsy12A_LTR 2125 1 76.24 TAAATGAAGCCAAATAATGACAAAGTAAATAAATATTATATATAGAAGTATCACCCGCTGCCTTTTGCTATTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATGC:1 + chr3R 22536166 5' - accord 179 2 61.39 TTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3L 22324091 5' + hobo 38 1 57.43 TTTGATTGATGTGCAATAGAGTTGAGTTAAATTTCTAAATTGAAATGGATGGGTTTGAGCGAAGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGG:1 - chr3L 18539734 5' - transib4 2390 1 61.00 TGGCAACGCTGACACGCAGCATAAATGCAATTAATTTAATACAGCACTAAGTGCATATTGAAAATACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAA:1 - chr3R 14036172 5' - invader4 2664 1 68.32 GAAATAAAATTATCAGCTGTGAACTATATATTATAATTTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACT:1 - chr3L 21222872 5' + Stalker 7149 4 67.33 CGAGAATATATGAACACTTCATTTTCCATTATTCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chrX 23283819 5' - 297 352 2 70.30 GCGGCAAGGAAAGCAACGTGGAAATAATGCCGAAACAAGATGGGGAATTATTTGAAAGCTATATTTTCCAAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGAT:1 + chrX 9961715 5' - F-element 353 1 56.44 AAAGCTATCGGTGTTTTGGTTCTTATTGGGATCCTTGATGGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCAATTCTTCGTTTGTCGGAAG:1 + chrX 4799520 5' + diver2 4749 2 60.40 ATACCGACACACATTATGGCATTTTTAAGTTTTGCCCTACAAGTGATTGTTCCACATTTTGTTTTCCAACATTGTTTCTGAGTAAACACAAGTGCCCGAAA:1 + chr2L 22497728 5' + HMS-Beagle2 6937 2 73.27 TTAGGTCACTTAGTTATTAATGCGTTTTGCTTTAATTGGACTTGTGTTTAAATCTAAGCTAAAAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 7375412 5' - roo 396 1 66.34 CTTGGCGTGCTCGTCGTTACGGCTCGTGTTATAGTTGCGGCTTTTGCCTCGCCGATTATATTTGCACGCATGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 10635343 5' + roo 4 2 76.24 CCCCATCATCAGGCCAAACATCGTGTACACATGCACAAACTCAAAGCCATTCGCCGTCATGCAGGCTGCACAAACACAGCCACCACGATACTCCCACCAGT:1 - chr3R 28075119 5' - R1A1-element 4988 1 75.25 TGGGCCGAACTAAGTGGGATTCAGTCCATCTTCTTTTGTTTGCCCGGGGCTTTGCTTCTGACTTTAATTGTTTTTCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTC:1 - chr2L 16037856 5' - Idefix 346 2 58.42 AAATCAACTAAACCTTAGATAAACCGTTGTTGCCGAGTCTTCATCCATCTCATATGAGTGTACTGCGAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATG:1 + chr2L 2177298 5' + I-element 168 1 71.00 TTCCATTTCCAATTTTATGCCCCTCATTGTTTTTCCTGCTGATTGGTGTCTTTTGTGTTTTTTGTCCTATTCTGAATTTTCTCATTGACAAGATT:1 - chr2L 15640326 5' - Doc2-element 4507 1 81.05 AATAATAATCAGGCAGGATCCTGAAGGGGGAGCTAAGGCGAAATGATGGGGGTGGGATGGGAGCTTCAAGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTT:1 - chr2R 22795110 5' - G2 105 1 60.40 GGCTGCATTGCAGTCAAAAACTGGCACATGACATATGAACTCAGTTCCGACATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCT:1 - chr3R 8185521 5' - Doc 238 1 58.42 ATGCAAGATTCACTTAGCCTTTCATGAAGGTTAAGAGATGCATGCCTAGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCG:1 - chrX 545166 5' - I-element 54 1 56.44 GATTTCAGATCAGAAAGTTCAGATCTTCACACATGGCTGTTTTGACTCCGTTGTTGAAATTATAAAGAACTGTTGTTTTAAATAATAACAAAAAATAAAAA:1 - chr2R 9493853 5' + BS 5098 2 75.25 GGGGGTGTTTGTGTTTTGGTTCTTTGGCGGTGTACGTTTGAATGTATAGGTGTGTCGATTTGAATGTATAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATT:1 - chr2R 999944 5' + HMS-Beagle2 6747 1 54.46 TTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2L 22775584 5' - pogo 2091 1 67.33 GCGGAGATAACGGAAAAGTGGTTTATCTGTTACGTATAAAATAAAGAAAAACTTCCTTTGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTCAGGTAGATC:1 - chr2R 11496393 5' + R1A1-element 5106 1 65.35 CGCTGATCAGTACGCCACCACAAAACCAGTCGGCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCT:1 - chr3R 29054982 5' - Doc 4325 1 67.33 ACGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chrX 10555413 5' + Tirant 8140 2 55.45 AGGACACTGGTGAGAAAGGCAGATGGATGTGGCTAGATCAATTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATAT:1 - chr2L 17853505 5' - INE-1 82 1 59.15 TAAGTGGCTCGATGCCCCCCACCCCCCTGACTTTTAGCCGCACTAGCTAAACTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chrX 1571445 5' - 1360 3362 1 80.23 TATGATTCCCCCACCACAGCTTACCCTCACCCAGGTACAGAAAGAGAATTAAAACACCTAAATGTCTCTTTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 62931 5' - roo 9064 1 68.32 CACCCACGAGACGGAATTGATGAAGGACCGCCACCTCGATCAAAATATTATGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCA:1 - chrX 798332 5' - HeT-A 5952 1 64.36 TTTGCATTTCAGCAAACAGATGGTTGAATGGTTGGATGGTAGGATGGTGCAGGATGGCAGGATGTGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGC:1 + chrX 1004753 5' - Porto1 396 1 64.36 AAGAAGATGGCGGTGTCTGTTGACCGACTTAAGACACCGTTTGTATTAGATGATAATAACAAAAGCCCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 22545055 5' + roo 8674 2 69.31 TGCCAAATAGCAACATGTGTAGCGACACGCACACACGGACACAACACGCACACATTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 + chr2L 13482122 5' - hopper 1397 1 58.42 TAATTTTTTCGTATCTCTGTTTATCTGAGTTCTCATTAGTACCAGTTATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGG:1 + chrX 15502538 5' + F-element 4340 1 59.41 GCTGATTTCGCCTCCGATGTCGATGTTGATTTTCATGCAAGAGTGCACGAGGCGATTCTTGCCAAAATGTTTTTGTATTAGATAATTTTGTTTGTTTGTTG:1 - 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HMS-Beagle2 273 2 64.36 ATGGCCACAAGAAGAGCACCAAACAGGAAGTGTCCGTCTTCGTGTTCGAGAAAAAGTCGTTGAATTTTAAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAC:1 + chr3R 29027558 5' + S-element 1687 1 61.39 AATTGGTATTGCCCAACTGTATAGATCAATATCCTAATATGCAGCTTATTACCTCTAATTAATTATTCTTTTGTTAGAGAGCGAAGAGCGATGCAGCGAAC:1 - chr3R 29380150 5' + 1360 118 1 70.30 ATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAA:1 + chr2L 22315587 5' + frogger 41 2 75.25 TATCCTTTCCTTCTTTTCTTACAAGTTTCCGGTGAGTGCTCCGCGTTTTTTTGCCCACGTCCAGCTTTAGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCAAAAATT:1 + chr2R 19442347 5' + FB 131 1 51.49 TGGAGAACTCCAAGACCCTCAGCGACACCGTTTCCCATGTGATTGAGCGCCTGCTTATGGTGGCCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGG:1 + chr2L 13007250 5' - 297 25 2 70.00 TCAGAAGAGAGGGAGCGCGGGAGAGTAGGAAACCAAACAATCGTGAGATTAAGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2L 222081 5' + P-element 21 1 58.42 CAAAAGATATATTATGAATATTTGCCACGCTGTTGTTTTATGTTGTGTTAGAGTCTGATGGCAAACATATTTTATGAGTTTTATTGTTGCCGCCGCTTTTC:1 + chrX 21045104 5' - HeT-A 160 1 57.43 GTTAGGGTTAAGCGCACCGTAACACACGCACACGCACACACCTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTATCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTTTGTG:1 + chrX 1644730 5' - Doc3-element 4447 1 58.42 TGGCGCTGACAGTGGTCACAATTGAGTTTTCGGCCGCCGCCGAAGAATCAGCAAACACAGCGGTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr2R 5322092 5' - 1360 3377 1 67.33 GCACTCATCTCGCCGACATGGTTGTTGTTGCTCTCGTTCTGCCCGCAATCCACAGCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAAT:1 + chr2R 7983554 5' + HeT-A 5960 1 59.41 TATGGTTGCATTGATTGAATGCTGTGGCAGTGTGGGTAAAAAGCGCTTCATATAAAAATAAGAGAGAATGCTATAATCGAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1 + chr2L 13936171 5' - INE-1 557 1 70.30 CCTGCAGAGGGAAAATCCCGAGAGCAGCATCGGTATCACTTTGGCCGGCGGTTCTGATTATGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTGTGTTTTGTTTATTGTT:1 - chr3L 14414824 5' - Porto1 190 1 63.37 CGGTCAATAGTGCCGCAAAGCCGAATTCAGACTTGTTATGGCCCGGTTGATGTTTTGACTCCTATTTAACTACAATAGCTATAGCTTCTAGTCCG:1 - chr3L 14657021 5' + R1A1-element 5201 1 67.37 TTGTATATTGACGTTAAAATTAGATGCCAACTTGTCGTCGTCTCGCTCGCTATGAGTGCTGGCTAATTGTAGTTGGGCTGGAGCTGGTAACTCTCAAAAAT:1 + chr3L 10165497 5' + baggins 177 1 52.48 ACAATTTAAATGGGGAATTTTCGAATTGAAAACTCAGCTGTCAGTTAACAATGCCAGCGAAGTTGTGAATCATATAAATTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 9725358 5' + roo 1 2 52.48 ATGCAGTGCAATAAATATTCAACAGGAATTGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3L 2804882 5' + hobo 40 1 65.62 AACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chr3L 2182710 5' + blood 7067 2 79.21 GCCTCCTGCGGGTGAGTTTTAAGTCCAAATTGCAATCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACAAAATCGATCCCGAA:1 + chr3L 16062233 5' + 17.6 375 2 65.35 TTAGTTAGTAGATGTAGATATATACTTGCGTTGACAGCAAAGTTTGCCGGGACCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3R 20101572 5' + Transpac 37 2 58.16 TGATGATGTTATCGTTAATGGTGCATGGTCGCAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTA:1 + chr3R 28653164 5' - Doc 4240 1 69.31 ATCCATTGACTTGTATGTCTTAATTTCAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGG:1 + chr3L 5828743 5' - blood 105 2 72.73 AAAGGGGCAGTCCGTAGTAAAGAAGAAAGGAGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGC:1 + chr3L 20310272 5' + accord 7005 2 69.31 ATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACCAACAC:1 - chr2R 2745201 5' + Stalker3T 79 1 68.32 AACGGTACGAACAAAATTGTAAGCTAAAACGTGAGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACAC:1 + chr3R 14913137 5' + blood 8 2 69.23 AATGCAATATACGCCAGTTTCTTTCAGTGCATATCAAGATACACGAAAAAATCCATCCGTGGAGAACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 5726802 5' - roo 398 1 68.32 TTAACAAACATTTTTCCCTCTCCCACAGTTCCCTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCC:1 + chr3L 8276799 5' + 1360 468 1 67.33 TTGTGACAAAAGCGGTATCAGGCTGTAATTTGTGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 9193570 5' - roo 393 1 65.35 TATTGCGAAAAAATCCTTTTGCAATGTCCTTGCTTTTCCACACTTTTTAGTAACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTTAGAACGTAAGAA:1 - chr3R 10978897 5' - 1360 3289 1 57.43 AGCGCAGACTGTAAAACAAAACACAGAAAAATATTCATTGAAGAAAAAAGCCAGCCAACAGACAGACAGACAGACTAAGAACACATGAAAATAACTTAGCG:1 - chr3R 23450764 5' + G4 3629 1 74.26 TATTATACTGATTTCTTAACAATTTCACAATTTATCACAATAGGAAGATATAATATTAAAGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGACAGA:1 + chr2L 13689119 5' - Cr1a 4246 1 64.36 GCCTAGGAAGCGCCCGACGCCGTAGCCAGTGATTCGTTATTTCAATTATTTGAGTGTCCCGGAGGCAGTGCGTTTATGGTGTACTGGATTCTTCGCAATAT:1 - chrX 11491353 5' - Copia1_DM 4092 1 61.39 CAAAGCACACGTCATTAAGGCACACAACAATATGATCTTAAAAAGTTATTTTTTCAATGAAAAAACGAATACAAAGTGTTATTAATGCTAACGGTATGCAT:1 + chr3L 5238425 5' + S2 1407 1 78.22 ATCTGGATTTAGAAAAAGATCGCAGCGCAAGTATATTATACCCACACCCAACGGCTTGAGCCAGAGCCGGATTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAG:1 - chr2R 17674404 5' + gypsy12 10156 2 77.55 TGGGGTATGAGTCTGTGGACGGTCCGGAGATGGAGAGCAAGATCGCGGTCTGTCATTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTC:1 + chr2R 9750607 5' - Doc 325 1 68.32 TGGCCAATGGAATCCGGAGCAGAAGCTACGTAATTGATGAAGCCGCCACTCTGCGGACAGTGGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3R 23618117 5' + hopper 11 2 46.53 ATTTTCTTCCCTAGACGCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3L 14364934 5' + blood 11 2 66.34 TGGCCGTTCAGTGCCCATTATTAAATTTTAGCAATGCCCTTTTTAGGGCAGAACTCTTTCTTCTCTTTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGT:1 + chr3L 21479417 5' + 297 6871 2 68.32 CCTCCAGACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 - chr2L 22227347 5' + F-element 53 1 68.32 AGGTGGTGAAGGATGAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3R 25360951 5' + jockey 11 1 75.25 ATCGGGAACACGCATCATTGACTTGAAGGCTTTTCCACACACACACACACATACAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGAT:1 - chrX 17049632 5' - Stalker2 388 2 63.00 AACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr2R 8198526 5' + F-element 44 1 57.43 GTGTGGGTGGTCAGCTCGGCGCCGCCGGCGGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCTCTCTTACAGGGGAAGAGGGTGATAAATCCACTTGGA:1 + chrX 19691163 5' - gypsy3 6861 2 70.30 AAAATGAAAAGTTGGACACAAAAAGGTGCTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr2R 11730920 5' - blood 7343 2 71.00 ATTTATAAAATAAATAAAATATGATAACTTCTAGGGTGAAGGGCTTTTTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATTCGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGC:1 + chr2L 4629866 5' - 1360 166 1 75.25 TGAAAAGTATGCAATATTTTTCTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGCTTGTCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGATAT:1 + chrX 17262313 5' - X-element 4469 1 93.07 CCTTAATAAAGTGGTTTTCTATATTACTTTGAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2L 5611391 5' + pogo 43 1 69.31 TGGAAAATAATTTTACGAGACGTTCAATTACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGC:1 + chr2L 16763450 5' - HMS-Beagle2 184 2 68.89 ACTGACACCACGAAGGCGTTCATTAAATTAATTTTGCAGCTTTTGATCGATGGGGGCACTTGTCACCCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTG:1 - chr2L 20042132 5' - Bari1 253 1 60.40 CTTTTCCACTGCTGTTGTCATGCATTTTATTTTCACTTAAAACTGCAATTGTTGGGGGGCCTTTGTTGCTGCTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAA:1 - chr2L 11219003 5' - I-element 45 1 78.22 ATCTGTTCATCATACGCATCGTAATCAAAGAGCGAGTTGTGCTTATACTCCGACTGATTGCAGCTCAGGAAGTGACGAAAATGTTCGCACTATAAACTTG:1 + chr3L 1532313 5' - rooA 368 1 77.00 ATGCACTTAATGGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr2L 9823608 5' + hobo 8 1 73.27 AAATTGAATGTGTGCGAAAATTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCG:1 - chr2L 21790538 5' - P-element 2755 1 28.71 TCTGCTGGAAAAGTATCTAAACCCAATTATTCGCCGAAGAGCATTCGTTTTAATTCGATTGACACAGCGTGCATTTTGGAATCGCTTTTATTTAGCCCAGT:1 - chr3R 21349177 5' + mariner2 224 1 68.32 AACTTAAGTAAAATTATTAAATTTCGAGTTCGCAATCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAATTCGACTATAGCATTCTCTCTT:1 + chr2R 15555280 5' + INE-1 577 1 87.23 GTAAANGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3R 14832388 5' + blood 7030 2 57.43 TGATCAAATGATACCGAATCATATGGAAAAGGAGAAAATAGTTTTGGTGAGTAATTTTAAGGTATAGTTGAGCGATGACTTGGTATCCAGCGATGAGACT:1 - chrX 9589366 5' - TART-A 13029 2 75.00 CTGCACTTCGTTTTGCACTCGCCAATGTGTGTGGGTTTTTTGCGCCCTGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCCTTA:1 + chrX 15313686 5' + Cr1a 71 1 63.37 AATGTCAAAAGTGCCATTGACATGGCACATTTGGTATCTGGCTGCCATTTTCCTATAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTG:1 - chr3R 19489352 5' - copia 4797 1 65.35 TGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3R 17495759 5' + opus 19 2 66.28 CGAAAATTCATTTGGGTTTCTATGTACATTTAAATCAGATGATTCTCTGCAACGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - chr2R 11540277 5' - Transpac 289 2 56.44 GATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGACACCCAATACAGTCTTTATGAGAAGAATATTATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTT:1 - chr3R 10736132 5' + invader4 2775 2 54.46 ACCGGGAACAACGGATCCGGATGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAG:1 - chrX 6534439 5' - Max-element 312 1 78.22 CTCTCGTTTTCCTGTGACCCCCCACTCCAATCATCAACTAAAAGCGAAAAGACACTAACACATATGTATATGTGTTAAAAACCTTATTTATCTCTGTGAAC:1 - chr2R 12901453 5' + Porto1 138 1 69.31 CAATCCCGAGAACACGGTCTTCGATGCCAAGCGTCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCA:1 - chrX 11804302 5' + copia 4765 1 67.33 ATCATGCATTCTCCCCCAGGCAGTGGCCCACAGTGAGGCAGCAATCGCAGCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCT:1 + chrX 17600754 5' - invader4 2982 2 58.70 ATCGAGGTGAGAGCATTCAGGTGTCTGGGAAATGGCGCGTGGGTGCAACGACCACCGCGCTGACCTCGAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGAT:1 - chr2L 11178560 5' - Max-element 396 1 72.28 GGTGTTATCATTGAACACGAGGCCGGAAGTGTCGCGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAG:1 - chr2L 6303490 5' - HMS-Beagle 23 2 72.28 TGTGATGCTGGTTGTGGTTCTGATGCAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGAAGGAGGTGCTGCTGCTGCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCTCAT:1 - chr3R 6356971 5' - Quasimodo 268 2 70.30 ACCTTNTCACCACCCCACTGCATTTGGTTCACCCGCTACTTTTGCACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chrX 13747420 5' + P-element 29 1 49.50 CTAATTTTACGATCGCGATAAATGTAATTTTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACGCGT:1 + chr3L 21123606 5' - Stalker4 449 1 71.29 GTAAGCCAGCTGAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr3R 19535781 5' + hobo 9 1 70.30 ATTTGAACAAGGGAAAACGTGGAAAGCTGGGCGCAAAAGTTAAGAGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chrX 13560782 5' - roo 9039 1 53.47 AGATATTGTGTAAGCATGATTAGCTCAACGGATGAGGAATGCAAGCCAAATGGGGAAGTAGGAGGTGGGATCAGTTGGATGGTGTATCTTTTACAGGGG:1 - chr2L 4521030 5' - gypsy3 310 2 58.59 TCATCGATCGAAACACACACACCCCACCCACATAAATATGTACACTGAAACACCTATAATCATATAATCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACG:1 + chr2R 14912609 5' + accord 7063 2 73.27 CCACATTTATCAGCAGTCGAAGCAAATCGTCGCTCTCCCGTAATAAGCTTATCAGTCGAGTGAAGAATATACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAC:1 + chrX 756960 5' - 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INE-1 136 1 56.44 AAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr3L 2182711 5' + blood 7065 2 76.00 GAAGGGTTCGCTCTGGAACGATTTAAGAAATGTAAGTCAAAGTACGTTTATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 + chr3R 14807923 5' + roo 87 2 60.40 AACAGATGGTCGGCGACCCACTTCCAAGCTTGGAGGCTGTCCAGTCCATCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCA:1 - chr2R 14073743 5' - F-element 193 1 52.48 GCAGGAGAAACACTGCTTCACGGATCTGGCACAGCAGGTGGGGATCATACAATATTTATATATATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAG:1 + chrX 21370838 5' - Stalker2 20 2 57.43 CGATGCAGCTGACAGCACTAATCACATCGATCTGATTAAAGGCTTAAGTTTTCAGCTCTCGATTGAAAATCGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 11240983 5' + roo 8668 2 72.28 TTAAANGAATGGCTAACAAGTCAATCATCTGAGGAATCTGCTGGAGATAATGCGGTCAGTGAACAAACTGTGTCTGCTTCCCCTTGAGGACTCTGTTGGAA:1 - chrX 1828753 5' + diver2 4487 1 59.41 CGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGC:1 - chrX 22386801 5' + hobo 46 1 70.30 AGTGCAAGCTGGCCAAATGGGCGTGGCAGTGGGAATGTGAAGGTGTAGGGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCC:1 + chrX 20864928 5' - 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chr2R 7173858 5' - I-element 4994 1 71.29 CTACANCTTGTTCCTTCTCCCTGGAAGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGAT:1 + chr2R 23173077 5' - R2-element 3202 1 79.21 GTGCAACTTAAACATTGTCATTCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACTTACACGAACATGTTACT:1 - chr3L 9720710 5' - opus 97 2 72.28 TTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 + chr2L 306490 5' + Tirant 8151 2 68.32 TGCCAAATTATGGGTTTGGTCTGCCATTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAG:1 - chr2L 10823352 5' - R2-element 263 1 74.26 TGAGGGGCGTTGAGTTTCCAGTAATATCGTGCAAATAACGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAAACATAAATGTGGTCTGCTTTTATAAAAATTGCTG:1 + chr2R 14363075 5' + Cr1a 454 1 67.33 AATTCACCTCGAAGGACTACTATGTAAACATCCGAAAGGCCCTCGTGCAAGGCTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATT:1 + chr2R 7390394 5' - Quasimodo 443 2 58.42 GGGCACTGTCCTTGGGTCCTTTTGTTCGTCCTGCGATGGACAGCAGCGCCTTTTTACGGCCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACAT:1 - 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BS3 208 1 58.42 CCAGGAGCTTTTGGCCCCGCCTAATAATGGGTCGCATTATTAGTTTTGCTGCCACTTTCCACAGATCCCTCAGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGG:1 + chr2R 15785600 5' - I-element 4908 1 75.53 GTGCAAATGCATATGTCGTAGCAGTTCTCGAATGCAATTTTGAACTTAGTTCGATTTAAAATAATATACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 - chrX 3697204 5' + jockey 4685 1 66.34 CGAAATAAGATTTATGTGTGACGTCGAATTACCAATTAGTTCATCAAGGCATAATTCTAGCCCAGTTGCCCAGTCATTTATTGTATTGGTAGGGTAGATTA:1 + chr2R 22902716 5' - Stalker 16 4 64.36 TGAATAAATATTTTGCTGACTTTGGCTGCCAGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGG:1 - chr3R 16940473 5' - accord 54 2 69.31 CGCGCGCATAATGATTTGTCCAAGAGAAGATGGAAGAGGGCAGTAGGCGGAGGGTGGAGGGCAGAGACGAGAACACGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGA:1 + chr3R 5066667 5' - 1360 3210 1 70.30 TAAGTGTTTGATCTGGGGCTGCACCCGCGGCGCTTCCTCCTTCCATATCCTTTACTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGA:1 + chr3R 5100233 5' + I-element 4925 1 56.44 ATTCAAATTCCCGCATACCCCGACCAAAAAAAAAAGAGGAGCAAAGCCGCAAAAAAGCGGAGCCAGCGTTAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGA:1 + chr2L 3957344 5' + R1A1-element 415 1 69.31 GCTTCGATGACGTCTGCAAAACTTTCAAGTCGAAAAGTGTTCAAGAATGAAATGACCCGAAAGACCCCAGCGAGTGGCACTGACCGTAGCAGCATCATGTT:1 - 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chr2L 7938875 5' - BS 5004 1 73.20 AAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr2R 18891051 5' - opus 463 2 67.33 TAAATATGAATAAAATATTTATTTCTGTAATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCATTGCCTCATAGTTGACATCCATATCTCCATA:1 - chr3R 12844669 5' - Doc4-element 2597 1 71.29 TCAGACCAAGGGATGGGCTCATACATTGTCTATTCTTATTTCCTTGGAGCTGCGAGGGCGGCCACTTGGATTGTAGGCTTGCCTACAATGGTTAACGGAG:1 + chr3L 22886950 5' - Doc4-element 224 1 59.00 ATAGAAGCATCTACAGTAATTTATAAAGCTTACTCACCTATAAAGAAAACAGAAATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAAT:1 + chr3L 7838823 5' + Porto1 366 1 55.45 ATTTTTTAGCACACTCCACAAGGCCTCAAATTACCTAGTGGCCCCGATGTGTGCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGC:1 + chr2L 9872527 5' - R1A1-element 5227 1 62.63 TATTTTACATTGGTCTTCTTTGCGCTGCTTAGCTCCATGGGATCGTGCTACCAATGGCAAAATAGATGTAATAAACCAATATAGGCCACCAATTGAGAACA:1 - chr3R 9996474 5' - blood 7376 2 65.35 CAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACAT:1 - 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chr3R 14360235 5' - ZAM 8094 2 54.46 TTAAGTGTGAAAACAATACCCTCGTTAAGCATCAATACCATTTAATCGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCACGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTA:1 + chr2R 21462335 5' + Doc 465 1 53.00 GATACATAGTGGTGCATTGTTAGTACACTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTT:1 - chr3R 11731224 5' - hopper 1365 1 74.26 AGGACTTAACAGTCGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAA:1 - chr2R 21421091 5' + springer 7165 2 57.43 TTATATGATGATAGAGCAGAATCATTTTTCGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTT:1 + chr2L 22348232 5' + 1360 3232 1 71.29 TGTGGGGTCAATGCACCAGCCGAGTGCCTTGTGGCCGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCG:1 + chr2R 10214172 5' + 1360 3359 1 67.33 CTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3R 19535746 5' + hobo 43 1 67.00 GTTGCAAGTCAGTTGGCGGCGCTAATGAAAAACGACAGGATGCGAGGGGGAAAAATAGTTTAAGGAGTGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCCG:1 + chr3R 30077561 5' - 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chr2R 12317275 5' + roo 8688 2 55.45 AGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGGGTGTTG:1 + chr2R 4577077 5' - Chouto 498 1 54.95 CATAAACAGTTGCGTTGGATATCGAGAAGAACACGCACTTGGCGAAATACAGCCATCGTCCCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:1 + chr3L 26852015 5' + diver 5905 2 62.38 GTAGATATCGGAAATGGGTCTTGGGATGATGACTCTTCCTGGACAATCCATGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chrX 4581215 5' + blood 7050 2 55.45 GTGGAGTCCATAGAGGCAACTGTTCCAGTATGCTTGTCGCCAAACCGGAGCAGTTGCCTCTATGGACTCCACTTCATCCTACCACCACTCGGCCATCCTG:1 + chr3R 31319841 5' - invader3 5173 1 58.00 CATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:3 - chr3R 1048033 5' + Stalker2 41 2 64.36 GACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chrX 5104619 5' - roo 9031 1 70.00 CGCCCAGGGGGCGTGGCATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2R 21937549 5' + 412 28 2 51.00 TCTGAGCAGACAAACTAGTGAAGGAGGGCGAATCAGAGACGCCTTGCTCCAACGTGGAGTTGTGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCT:1 - chrX 11976812 5' + G5 4409 1 56.44 AACTACTTGCAGTTTATAACGCCTCACAAGTGCCATTAATGTGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chrX 3306594 5' + hobo 32 1 65.35 TACAAAATCAGCACGGTTTTGGTGAGTTGATTGATAAGCTTACACACAAAGACTGTTCCAAGAAAAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAA:1 - chr3L 9627895 5' - Cr1a 3992 1 67.33 ACAAGTACATCACCCAGCTGACGACCTTGGTAAAGGCCACCACACTCGGAATCATTACGGTGCCATATGAACAGCGATCAAAAAGAAACGAAGACAAGAAC:1 - chr3R 10055786 5' - invader6 4582 2 71.29 ACAATGGAAACTCACAGAGACTGCCTTACATCTGAAATTACGTATTTGTATACAAAAAGCAGTCCTATCAAATTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr2R 21239349 5' + jockey 9 1 68.32 AAAAAGAAAAGTATTTATTTAAGAAGTGCAAGAAAATGGGTTCGAACAAGCAAACGATCGGAGGAAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr2R 1320401 5' + Transpac 4928 2 68.32 GATACCAATAACTGTTTTCTGAACACTCCCCCCCCTCCCATACATTTCAATTGTGTCGCAGTGATTGCAATTTTGAACTTATAATCATTTTTTTTTTCTCT:1 - chrX 4694724 5' - invader2 296 1 79.21 ATTTGCCACAGAGGCAAACAGAAAACGGCGCTAAAGTTGCAAAAGAAAGTGAACAAACTGAAAGCGGCAGGTTAAGAAAATAATAATAAAAATATAAAAAA:1 - chr3L 15797341 5' + Rt1a 5073 2 55.45 TGAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3R 19535771 5' + hobo 19 1 60.40 GGATTTAGTAGCAATTTTGTCTGGCGAAACGGGTAATAAAATGTAGAAAAAACTCAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGG:1 - chr3L 15459241 5' + copia 4716 1 74.68 GTGCTGAATCTCTTTTTTACGCCTGCCCCAAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGA:1 - chr3R 15465735 5' + jockey 4603 1 69.31 TGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAA:1 + chr3R 26331643 5' + G-element 33 1 52.48 GAGGGAATGGCAAAAAGTTTATTAGTTGCCTTGCCAGCCAGCCAGCCAAGCTATTCTTCTGTCTAGATGACCTCCGAGGTGAATGGCTGAATCACTTCTTG:2 + chr3R 30331357 5' - Doc4-element 2411 1 56.44 TGTGCGATTGCAACACTTCATTTGTGTTGACGAAGGATTTTCACCTTTTTTGACGATATTGGATTTCGATTTCTTCCTGTCAGTCTCTGGAGAAACACGAG:1 - chr3L 17903159 5' - X-element 431 1 77.23 GGGGATCTGCCTGAGACTAGGCGAATGACCATGTCAAGTGTACCGAGTGCTCTTTCGTTCGCTTGCTCCTTTTCCTTTTTCTTTTTGTTTTTGGGTTCTTG:1 - chr2L 4305873 5' + Tc1 162 1 51.49 TCATGACTGACAAGTCGGAGTAATAGCATACACACACATCATATTTGAACTATCGAGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACA:1 + chr3R 6724851 5' + accord 241 2 52.48 AGCTAATTTAAATTTAATTTTGTTTTCACCAACTAGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTA:1 + chr3L 6396659 5' + rover 7107 2 65.35 GGTCCTTAATTAGCCGCACAAGAGAGCAGCCTGTCACGAATATATCCCATATCCCTTTATGGCAAATGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTT:1 - chr3R 19011422 5' + Quasimodo 7306 2 70.30 AAAGAGAGAGCAATTTTCGTGTGCAAAGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGCTTAAGTATTTTGAGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGG:1 - chr3R 12128037 5' - 17.6 248 2 73.27 CTCACNCGAACACATCCTCGATATGCTTTGTGACAAACAACCAACTGTGTCTGGTATGTACGTAACTCTACACTCCATAAAGACCTCAATCTTCACACAGT:1 + chr2L 19800446 5' + Helena 1199 1 63.37 AGCAGCCGTGGCCCCATTTCGCGTTCTCTCTCAGAGGCTCTATTTTACTCGCTCAGCTGGATCATGATGCAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3R 4807850 5' - P-element 2869 1 61.39 TACAACTTCTGTTGGGCACTGAGGCGAAAGAATATCTCTCGAACCGAGAATCATAAAATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCA:1 + chr3L 13377585 5' - Doc 248 1 60.40 GCTTGGGTGGCATTTGGTAGGAACTGGTGGCTTGGAGGGGATAATGGATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGA:1 - chr3L 8256049 5' + copia 4855 1 57.43 TTTGCNATGGGGGACTTTCGGGTTGTTGCGTTTAAAATTTCACTTTTCGACGGTACAATGCTTTCCGCGACCCGTGACTAGAGAATTTTTGGTCTTCGTTT:1 - chr3R 14749983 5' - Tc1 333 1 64.36 ACACCNTGCAGCCATCCTCTTCAGAGACTCAAAGATCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGACAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTT:1 + chr3R 21202549 5' - baggins 5312 1 80.20 GCATGTATTTCTTTTCATTGCTGCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAA:1 - chr3R 24685548 5' - R1A1-element 144 1 77.23 GGCAGCCAACTCAACACACTTAACCACAAAAAGCACCGCCCATTTTTCCTGAGCATGCCGGTCAAAAAAGTAGACAGAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTC:1 - chr3L 3490308 5' + Circe 201 2 69.31 TCATTGGAAACGATGCCAGATCGCAAACTCAGCTAAGAATCGTTAAGAAATTATCACCGTTTCCCGCTGGCTGCAATCGTACTTGTCTGTAGTTGCCACTT:1 - chr2L 8398585 5' - rooA 90 2 74.26 CTGCGCTTTGTTAACACCCTGCGGATCTTGGGGTGGCAAAGTCCTCGAAAATGCAGAGGCAATGAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1 - chr2L 19090146 5' + opus 8 2 71.29 TCACATTGGCAGCGAACAATTTGCGACCACCCAAAACCCAAATACACCCTACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTAT:1 - chr2R 20933453 5' + Idefix 112 2 65.35 CCACAAGTCGCAGCTTCCATTCATGCTTCTTTTTGGCCTTTTCATTGACGCTAACGAACATTTTTGTCCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAG:1 + chr3R 29538741 5' - R2-element 3389 1 69.31 AAAGTCTTAACCTCACTGGGTGAGCAATCATAAATCACATGCCACTGCGCCGTGCTACCTTTTGTTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTCCTCTGGG:1 - chr2L 2527822 5' - R2-element 215 1 70.30 GGTGGGGAAACATCAGTAATTATTTGTCAAACAGATCAACGAAATGAACGACGGATGGATTGAAATCGCCAGCTCGACACGGCTATTGATCCGGATCAAGA:1 - chr3R 26960402 5' - INE-1 88 1 60.40 TTACCCCTCCCACGCTGAGTCGCTGGCCTGACAGAAACTGTGATCCACCAATGGGCAATGCTATGCCGATAAGTATTTTCCTCTTC:1 - chr3R 6889109 5' - HMS-Beagle 458 1 75.58 CCGACCTCTCTCTCTCTTTGAGATTCCACCCCAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAAAGCGGACACAAGC:1 + chr2R 2529603 5' - 1360 468 1 63.37 CTACAAGACGAATCTCAAGGCAAATTTTCAACTACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCC:1 + chr4 525958 5' + Quasimodo 7133 2 68.32 ACGAACCATTATCATATCTTCATGCGATATGGCAAAGTGTTCCGTTGATTTCTTTCTGTTTTCGCAGATTGAAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGA:1 - chr2R 20833556 5' + R2-element 247 1 70.30 ACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 - chr2R 15002427 5' + 3S18 32 2 53.47 ACTTGGTCATGTAGGTGAGGCCATTCAGATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:1 - chrX 9260673 5' + 3S18 28 2 50.50 CCGAGACAACTGCTCAAAACAAAAGTATTCAATCTATAGACAGTAAAAAAGGATTAACTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGGTTACTTTATAAAAT:1 + chrX 15027031 5' + gypsy7 407 1 56.44 AGCGACGCGTCGCCTGCTTAATGTTGCTTTTGTTATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGCATTT:1 + chr2L 19223365 5' - G3 4366 1 68.32 GGAGTGGGAAATGGTTTTATAATTACGAGGGTCGTTGCTCAGGTTGTCCGTAAATTATCGGTTGCCCACTTCTCCCCCAGATCCCACTCATAGGGAACTTG:1 + chr3L 19166829 5' + G6 1735 1 67.33 ACGAAAATAGAAGCCGAAAACTGAAAACGACATTTATAAACATTTAAGTTGCAACACTGCATTTTTTATGCGATATCAAATTCATATGTTTGATCAGCTGT:1 + chr3R 11062977 5' + transib3 162 1 78.22 TTTTACAACACTTTTGGGGGTGTGTGCAGAGTGCTTCTTCTTATCCAGGGAAGTCAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAA:1 + chr3R 5791619 5' - FB 36 1 70.30 ACTGTGCATTGCAAATAGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 - chrX 9839858 5' - P-element 2818 1 24.75 GTGTAGCCGACATATATATTGTACATGTGTACATACTTGATTTGGTCGCTTCTGCTTCTCAGTTGTCTTTGTGTTTTGTTAGCTCTCCCTTTTG:1 - chrX 23064776 5' + Cr1a 210 1 70.21 TACCCACCCGACCGAATAGATCCCGCATCCCAAAAACAGCCACCCAGTCAAACAGTCAAAAAAAAAATACAAAAAAA:1 + chrX 20731714 5' + R2-element 3584 1 77.92 ATGGAGTACTTTGCGGGCGATCCCCGTGTGTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCA:1 - chr2R 5758641 5' - R1A1-element 5017 1 71.28 TATCTATATATATAAATCATTGACTCGTGCCTTCTGATTTATTGGCTTTGCGCTCTGCTTTTCTCTGAGTGTGTTCATTGTTATATGTCTTCAGTATACAT:1 - chr2L 11407817 5' - Bica 91 1 79.21 TTAGCCTGAGTTCGGGAAGAATTTGTATATACATAAGAATTCCCCCCAAATTCAGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chrX 19561895 5' - 412 7525 2 57.43 TACCGCCAAATTCAAAATCCCGCATCATAGTGAACAAATGAGAGTGTAAAACCACATAAATTTTGCATAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3L 3947424 5' - roo 403 1 72.28 CGGACGGCGAAGCGGTTCACGTGCACGGGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCT:1 - chr2R 9199520 5' - BS 4701 1 70.30 AACAATGGCTAAATAAATAGACAAAAATGCGGTTCGTGTCAATGGCAAATAAATCTATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAG:1 - chrX 9742757 5' - copia 4780 1 70.10 TGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chrX 21087574 5' + mdg3 5271 2 58.42 TGGTCAGGTTAAGTGGTGATAAGGTAAGAGGCTTTCTTATGTATTTATATGAATTGGGCGCTCTCATGAATGGATCGCGCATGGATACTGATCAACCGAGA:1 + chr3L 24213555 5' - Quasimodo 249 2 75.25 ATGCTTAATTTGGGAAGTGAATGGGGTTAATGGTTTGCTTCGTTTGGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACA:1 - chr3R 6007341 5' - pogo 73 1 54.46 GCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTT:1 - chr2R 15002429 5' + 3S18 30 2 51.49 GACTGAGTATCATGAAGTTGAAGTAGCAGGGAGCTCCGTGTACTGGATACCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCACCGCTTGCTCTGCCAGATGGATGGT:1 + chr2L 17971216 5' - G2 433 1 73.27 GATGTACGGCAGGGTGACGAATCTTCGCCAGTTGGCCAGACCGCCACCGGAGAAGGTCAGACCACGGAACTCGTTGATAAATTTGTCACTTAATTCCCTGG:1 - chr2L 5746801 5' - Ivk 478 1 75.25 TGGGTGATTTGGTGGGAGAAGTGGGAAGGCACTGAACCTTCATCTTGTGGCTGCGTCTATGTTTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - chrX 22693647 5' - INE-1 166 1 55.45 AAGATTGGGGCTAATGGACAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGCAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTC:1 + chr3R 14882070 5' - gypsy5 397 2 54.46 CCCCAGCTAGGAGCATGTATTTTGCATGCCTCACCACCCAGCTCTGGGAAAGACGGATCCTTTGAAGACGCCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGAG:1 - chr3R 2724434 5' + Rt1a 4741 1 73.27 ATTCTCCGTCCTCCATCCTCGGTTCCCAGTTTCCAGTCCGCCAGCTTATGTACCAATCTCTTGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAA:1 - chrX 7556809 5' + mdg1 461 1 66.34 CGGCTGAGGTGGGCGCGACATGTGTTGCTGCTAACTGGCTGACCAGTTAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAA:1 - chr3R 2211556 5' - roo 8763 2 59.26 CCCAGTCTCTGTCGAATTTGCGTCTTTCGTTAATCAATGCGTTTAACGTTTTCAATCAAGCAACTGACAAAAAAATTCACGCCCGCAGGTTATAATTTTAC:1 - chr3R 12860210 5' - Gypsy12A_LTR 313 1 70.30 AAGCCATCCCAAAGTCGGCTATCTTAATGTTATTCTTCTCGTCCAGCAGCACCTTTGTAGATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTATGAAACGCAGATCAAC:1 + chr3L 15908782 5' + Q-element 215 2 63.37 TAAACTTGTGTAGTTGTTCGGTTTCGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTG:1 - chr3R 30934850 5' - F-element 222 1 78.22 CAGTTNCCAAATAACTAATATAAATTACTTTCCAGCAATTTACAAAAATTATGCCACAGCAAGAAGCAATACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTC:1 + chr3L 14409324 5' - Doc3-element 4584 1 64.36 AATGCTCTGGGAGCGCAACAAGTTCAGTGTGGGGCAGTCCCCTGATCGCAACGACCCATTCAGGAGGAGCTCCAGACTCTCGAGATCCCCCACTAGA:1 - chr3R 20759761 5' + Rt1b 445 1 79.38 ATAAAAGTGTTACGGTTCGATTTGATTTCGTTTCGTATATATTACTGCTGGACCGTCTTTCAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATC:1 - chrX 17341894 5' + Idefix 317 2 69.23 CCTGCGCACACTCATTACCGTTTGTTGTTGATTTCGGCAATAGTCTTTTAGCACAACACGCACACATATACCCGTTTTCGTCTATTGCTTTTACTCACACA:1 + chrX 22514794 5' + 1360 3243 1 73.27 AGAAGGGTTCCTTGAAAACGCCTCTGAAGTGGCAACATACGGAGAGCCAGGAGGGTCCACGAGTGAGCAAATCCTTATCGCCCTCGCGAAGCAATGCTTC:1 - chr3R 1849137 5' + Rt1c 5320 1 59.00 TGCACCTTACTCACACATACGGACAGTTAGTACACACACATAGACACACACACTCAACCTCCCCCGATGTGCCCGCTGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 10918468 5' - accord 7029 4 58.42 TATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGG:1 + chr2L 23022018 5' + Quasimodo 48 2 69.31 TATTAATGAGTGGGAAATGAGGTATTCTGTCTGCGGGGGAGCAGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCG:1 - chr3R 28003880 5' - F-element 315 1 59.41 ACAATAAGACAAAGAACCGTAATGATTTACCCTTATACTGCGAATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACCTA:1 - chr2L 21852458 5' + Tirant 8502 2 53.61 GAAAAACATGGAAGATACACCCCACACCCACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCTTCAGGATGGCCTTGTACAGGAGGAGTTTTAGGTTTTCCCTAT:1 + chr2R 5953584 5' - G-element 3861 1 73.27 GAACCAATAAATATTATTTAAGCTAAGGGTAATAATACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 5095368 5' + roo 39 2 65.35 TATTGATTTTTTACTGCGTCGACGTCGGAATCACTCCATGGGGTGGTTTGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTT:1 - chrX 276308 5' - roo 66 2 52.48 TTTCAACTAATCACAAATATTCAGTGCATGGCAACATGGGCCAACAAACTTACGCTGCGTCTTTGTTTTTAGGATTGGTATGCTGAATCTCAACCTTTTAG:1 - chr3R 29187021 5' - INE-1 170 1 74.26 ATGACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCG:1 + chr2R 4577069 5' - Chouto 496 1 57.43 TTGGCTCTGTGCGATTGGTCACAGCTGCAGCAGAAGAGAAGGAATCCCTTCGAAAAGGTTTCTTTTTTCGTGGCTTTATGGCCGAAACAAATAAAATGAAT:1 - chr3L 5591774 5' + Stalker4 496 1 54.46 CATGTAACCACTATTGAAGTTGGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCA:1 + chr2R 18582334 5' - Transpac 5126 2 81.19 AGTAAGAACGTTTAACGCACTAGTTATTCCTAGGCAGGCATATACATAGCCACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGCACAAAAGCATAAGCA:1 - chrX 11606766 5' + Tom1 186 1 69.31 AATTACATTTTTTGTTCGAGTTCGCTTTTTACATTCTAAATCACATTTTTTTACAAATTTACAAATAACAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCA:1 - chr2L 12242075 5' + invader3 8 2 71.29 TGGGCCGCCGATAGGGCGTGCATCCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGA:1 - chr3L 21664967 5' + flea 4934 1 76.24 GTTTAATCAATATTTATCAAAGTACCGCAACAGCAATTATTGCGTTGGTCTTGATTTTGGGTTTATTAAAGATTGCCAATGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3L 21908857 5' + roo 1 2 78.22 TGGCAGGCTGCCATATTCGAGTACCTGACTCTCGAATTTGACTAGAAAAAGACTATACTTGTGCATTCGATATGGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCAGTAA:1 - chr3R 22826357 5' + diver2 269 2 59.41 GAACGAGTACATCTCCAGGAGTCGTCGCTTCGAGCTGGCCGAAACGCTGCGCCTGACCGAAACGCAAATCAAGATCTGGTCATATTTAAAAAGAAAAAGGA:1 - chr3R 26877661 5' + Tc1-2 1202 1 79.21 CGACTTGAATAGATTTTGCCGAGCGTTAGCATAAAGTCGACAGTTGATGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTAATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGA:1 - chr2L 1454603 5' - Doc3-element 479 1 58.42 ATATATCTCAAGTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 11240882 5' - roo 9045 1 61.00 AAAACGCAGAACGCATAGACCCTCGCCGACTTCCTACTGCCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCCAACGATCGCGGTCTTGCT:1 + chr3L 3985689 5' + Doc3-element 371 1 63.37 CATACGATTCAATTTGAAGCTGCCTTTAAATTGGGGAACTTCTGCTTCCGTTTTTCACTATTTTGTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2R 11744581 5' - gypsy11 3934 1 50.00 CGAATCCTAGTGTTTCGTTCGTGTGCGTGTGCCCGTGTGTGTCTACACCATGATGAAATAACAAAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGC:1 + chr3L 5691236 5' + P-element 189 1 47.52 CGATCACATCTCATACTTCGATTCCTCACGAACCACTCGCCTCTCTTGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTAC:1 - chr2R 7322298 5' - accord 61 2 60.40 TTCATGCATTTCCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3L 5827850 5' + blood 7014 2 75.25 CGCCCTCGTTGCGTATCCTGTTCGGTATAATCGTGTAGTGGGATGGTCTGTTTTGGTTGGTGTGTATGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAG:1 - chr2R 9526924 5' - Doc 4484 1 68.32 GAGATTTTAAGCGCTTTTTAGAGTAAAGAAATCGAAAATTCTTCGAAAATCCATTTCCATATATGAGCAAACCTCTTAAAGTAAAATAAAATGAAAAAAAA:1 + chrX 6576131 5' + F-element 4683 1 81.19 GTAAATAATTATTATAACAAACACACAAGTAAAAAAACATTCAAAAACAGATCTCCCGCTCTAGAAAACAAACAACAATAATAATAATAATAATAACAACA:1 - chr3R 10613446 5' + mdg1 19 2 74.26 GGCCTCAGATTTTCTATAAAGCACTCGATATATTAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 17004741 5' - roo 9031 1 64.36 TGCGAGATGCTGCTAGATGCGGCGAGATACATTCATGTGCGTTCATATTTTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTC:1 + chr3R 12579581 5' - jockey 23 1 54.46 TATTTAATTACCTTTATTTATATTTAATGTTAACATGGAATTGTTTTTGTAGGTGTTTCCCAACTATAATTCTCAATATATTTTCGTTTTTTTTTCTCTTT:1 - chr3R 18978117 5' - Doc2-element 247 1 59.41 GGGGTTGTGGAATCCGAGGAAGTCACATTGCTCGGCACGGGGCACAAAACCCTAACAAAAACGTGCAAAAAGGCTCCAGGGCATGATACTATCTGCAGCTC:1 + chr3R 14004069 5' + BS3 261 1 69.31 GTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr2L 15997878 5' + 412 36 2 69.31 GCAAAAAGTTATTAAATTTTTATGCACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3L 776171 5' + 1360 23 1 56.44 GCACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 - chr3L 776148 5' + 1360 43 1 66.33 TAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGC:1 + chrX 21772496 5' - gypsy3 6544 1 70.30 GTTGGGATTTCCTCCAAATCGTATATTTCCGGACCCAGCACAACAAATAGAAATGGAAGACGTTCCATTACCCCTACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAG:1 + chr3L 4424471 5' + 297 6534 2 65.35 TATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGCTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGG:1 + chr3R 778390 5' - F-element 23 1 53.00 TTTACCAGCTACCAGAAAGTTAAGCACATCTCTTCTGCTCGCTCGGCGAATGTGAAACCAAAGTTAAATAAACAAACATTTCTTGATATTGCGCATCCAG:1 + chrX 16991734 5' + Tom1 93 1 72.00 ACCCTTTGCAAGGCATACGTCTCTGCCTTTGGCCTGCGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAAT:1 - chr2L 16369697 5' - Tc1-2 474 1 62.07 AAGGCGATTGCCCCGATTGGGTCCTAGCTGAGATCATATCAACACTCTCGAACTTAAGCATTGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACC:1 + chr3L 14561878 5' + Doc 4529 1 59.41 CATTTACCACCCAACATACGGGCTATTCTCTTATATATTACGAGAATATATGAACACTTCATTTTCCATTATTCATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chrX 23283779 5' + 297 6583 2 76.24 AGGAAGGGAATGGCGCCTTTTACGACAAAAGGCAGCCATTCATCTCGTCACTCTCGAACCGTTTTTCCTTGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTT:1 + chr3R 29627710 5' + McClintock 133 2 39.60 GCGTTAGTTCTTTAAACACAAAATTGGGAGAAAATTGCAGTCAAAGCTTTGACAGCTCCATGGGTCACGCAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACA:1 - chr3R 4708371 5' - invader4 2665 1 70.30 GGACTTGTGCAGCGAATTGCTGCTCATCGACATGGATTGTGGAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTCCTCTG:1 + chr3R 12690455 5' - R2-element 217 1 64.36 GATGCTTAGCAGGAACTACGGTAAAGCAGTATGCCAAAACTAGGAAAGCTAAGGAATATTTTGTAAATGCAGCTGACTTTTATTCTTAAATCTATTTTTGA:1 - chr2L 15285081 5' - rooA 185 2 70.30 AGGCGAGTGAAATCACTGTTTGGAGCGATAACAACTTTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACC:1 + chr2L 5148123 5' + I-element 4956 1 64.36 TTCACTTCATTCACCTTTAAATGGGGTTACATTTCCATTCGTGTAATTTTTCCGCAATAATTTAGCGTTTTGTTTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGC:1 - chr3L 20059783 5' - roo 8853 2 80.20 CCTGCGATTGCAAAATCTAACGCATTTTTCCTTAATGGCTTGCTGTGCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTAC:1 - chr3L 23064583 5' + 1360 3274 1 53.47 CGCACCAAATAATCAAGTTTTGTTTAGCCGCTCGATCTATAAATAGGAAAAACACTTGAGGATTACGACTATATTTCGTCTGTTTGGTGATTGTGTTAACT:1 + chr2L 15136828 5' - Burdock 1 2 71.29 TCTCATGCATATTTCATGGCCCGCTCAAATACGGCAAGGCTTCGCCAAGACAATTGGGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGG:1 + chr2L 1345829 5' - Cr1a 319 1 74.26 GATCGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3R 13824353 5' + roo 8697 2 68.69 AAAGCGCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:1 - chr2L 3245016 5' + rover 19 2 59.41 ATTTCCTTCACTAGTGTTATAAATAATATTAAATAATGATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAG:1 - chr2R 22774064 5' - BS 4792 1 62.38 TCATTTAACTGAAAAGGTTGGCAATATATGCATCTTTTATAATTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACATGGCTAGATCGACTCGG:1 - chr3R 7421419 5' - INE-1 107 1 64.77 ACAACCAACCGGCGGCGTTTACAAAAAATCAAAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAA:1 + chr3L 12948519 5' + mdg3 322 1 78.22 GTCCATGGTTACGTTGCAAGCACAGACAATAGGAATGGTTATGGCCTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTA:1 + chr3L 15077872 5' - jockey 4806 1 54.46 GGATGCTGGACAAGCCGGTTTTTTGGTTTTTTGGGTACGTGTGCTATATGCGTAGCAAGTTCGTAGGCCCCTCTAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGC:1 - chr3R 19844635 5' + Cr1a 437 1 79.21 CACATTTTACGAGCTAGAAGAACCATTAAAAACTGTTGCACTTTCCTCACCCACGTTGGACATTGAGGGCTTTCTTCGCCGTGTTTCGTTCTTTTCGACAA:1 + chr3L 13096693 5' - Tc1 492 1 55.45 CTCTTTAATGTTACGTTTGAATTTACAGAGAGTCTGCAATTTAATTAGACATTAAATATTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 9552212 5' - roo 9054 2 56.44 ATTTANAGATCCACTCAAGTCACATATAATAGAGAAAAAACCACATGAATTCCTGACCTAATGCCCACAATCCGCCCTTTTTTTTTTATTTTTTTACCTT:1 - chr2L 8172146 5' - TAHRE 10442 2 67.00 ATGGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2L 9823617 5' + hobo 17 1 64.36 CAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACG:1 - chrX 22386790 5' + hobo 57 1 59.41 TTTATTTTGTAATTTCGCACTTCATTTAAAATTTAAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 8468544 5' + TART-C 11096 1 57.14 CAAAAACTCGAGAAAATGATACTTGATGCATAGCTGTAAAATCAGAGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCA:1 + chr3L 10654804 5' + 412 404 2 67.33 GTTTTAGCATTATTTGGTATTTGGGTGGCCATACCAAATACCAAATAATGCTAAAACATTGCCTTATATTATGATTCCTTACCAAACCGTATGTTTGAAGT:1 - chr3L 27358523 5' + Tc3 1389 1 42.57 GTAGATGGAATTATTGATGGATTCCATTGACTTTAAACCGAGTTGCGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTT:1 - chr2R 18541577 5' + 297 6797 2 55.45 TATTAAATTAAAAGTTAGTAAACAACTCTTTAGCAGCAAGGTGTGGCCTTAAAAAACGATAACAACCCATTTTTCGAAATCATATGTTTTATGGCATAAAA:1 + chr2R 17913042 5' - copia 4946 2 82.18 TTAGATAAATTGCGAATGCGAACAAAAAACAAAGCCCTGGCTCGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2R 24614504 5' + hobo 32 1 56.44 CAATAAGCCTTCGGGCGAAAAAAGCCGCAATTGCTACCACTGACTAATTCGGCTTACCATATTAAAAAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGG:1 + chr3R 15053326 5' - diver2 4548 2 75.25 GCGAAGTTTCTATAATTGCCTATTATCATAATCAAAGGCACTGCGTTATGATACCCTATTCCTACCAATACTAATGCAAACTGCATTTTTCTGTACGCTTC:1 + chr2L 6216463 5' - invader1 173 2 67.33 ATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTAT:1 + chrX 21472692 5' - P-element 143 1 21.78 CCGAACCGCTGCGAAATGGGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACTTATTTACTGAATAAAATTAATAGGAGTGATTGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAAC:1 - chr3R 18969668 5' + Tc1 484 1 66.34 ATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 12843400 5' + roo 31 2 56.44 TTCAACCCTTGTTTCCAAGGACTTAACCCCCCCATAGATCCATCAACTTCCCCGCCCTCCGCCACTCGATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAA:1 - chr2L 10350396 5' - 1360 3248 1 69.31 CCGGCGAAGGGGCGTGTCGAAAGTGTGTATGTGCTAAAAGGGCAATAAACATAGAGAAAAAAAATGTATTTTGAGTTATCTACAAATTGTAAACTCAAGTG:1 + chr3R 20240636 5' + invader5 3640 1 54.46 TAATGTGCAATCTGTATTGTGAGAACCCACCCTCATGACCTCCATAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1 + chr3R 18390238 5' + jockey 4815 1 72.28 GTGTGAGAAAAAACCGCGTCAAAACCCACGCCCATTTTCCCTCAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTTAGGTGGACAACGCTCCATGAGTT:1 - chr3L 10249554 5' + Circe 7420 2 81.19 ACGGTATTGCTCTTCGTTTGCTACTCAGCCACAAAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTGCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGC:1 + chr2L 15079960 5' - R1A1-element 102 1 65.35 CCTCATCGTCGCCGTGATGTCCGTGCACATCCTCCCGTTACAAGGATCTTGTTATTCGTGTCTTTGATCGTGGCATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTAC:1 + chr3R 15036548 5' + Rt1b 5118 1 61.39 CTGCTGGGAATGGGAGTAGTTATCTTTTGAGAAACAGAGAGACACGAAAGACATTGAGACAGGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTG:1 - 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chr3R 5336339 5' - Stalker4 414 1 63.37 GTAGACTGCAGAAACTATGAGTATCTTTAGGATGGTGGCGGCTGGCTATAGTCCAGGGGTTGCTCGCCGTGGTAAAATGATTGAGACAATGAC:1 - chr3R 20788483 5' + frogger 2305 2 77.42 CGCCCCAAGAATACAAGAGAGAGATGTATGACAATGGATATATATTCTTTTGGGCCAACGGCTGCTAATCGGAATTTTTTTTATTTTTTTTTATTATGATA:1 + chr2L 5151917 5' - Rt1a 5072 1 76.24 CGGAGTGGCAAAATTTGGCAAAATAGAAAATAAAACTGAAATGGCTGGAGAAGTGATAAAAAGAAGTGGGATCGCAACTCTTTTCAAATTATTTTTTTTTT:1 + chr2R 11801466 5' + FB 175 1 72.28 TTAACTTGTATCTTTAAGATACGCGCGACTCAAGTCGCAGCATTGCTTAATAGACCAGAACTCACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCC:1 + chrX 7600343 5' + F-element 356 1 70.30 CCTGGCTGGTGCAACCATATTGGGTTGCCTGGCCGGCAAATTGGCGTTTCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAAT:1 + chr3R 24611719 5' + invader4 41 2 51.49 GGTGCCCAGATGAAACGAGGCCATGGGCAACTAAACGAATATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATA:1 - chr2L 4926516 5' + transib2 2427 1 61.39 CACTACCCTTACCAAACACCACGCACTATTTCCTGGTGAGGTCCATTTTTTGACTCGACTAAAAATCTACAGACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAG:1 - chr2R 5076346 5' - P-element 416 1 76.24 ACAGCCAAAATGGATCTATTGGAGGAGGAGGTCATGCAGTCGATAACTGTGATTGATGACGATGACGAGGAGAAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTT:1 + chrX 8427522 5' + R1A1-element 4915 1 78.22 GAAATGGAAGTGCAGGAAACCAACCAGAAACACACCACTAAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGA:1 - chr3R 16461067 5' - 1360 196 1 56.18 TTTTAATTTGATATAAATGTAGGCCATTCTCACTTAATGCTATCCCCCATTCCACTGCCTTTTCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACT:1 - chr3L 13235374 5' - flea 81 2 56.44 TCCAGGTGGAAAAGCAGAATGAAAAGCGGGCTGCGCCAGCGTCATCAGGGGAGCAGAAGGTTGCCGTCGTGTCGGGACAAAACTTTGCAGTAGCCCCTCTT:1 - chrX 5658386 5' - mariner2 86 1 73.27 GAAAATAGCCTAATTTGCCAGCCGTATTTTGACTCATTGCCAGAAGAAGTTATCGATATTCTTCAAAATCCGGAAGCAGAACTTTAAAAATCAAGTTATTA:1 + chr2R 5463121 5' + transib4 2166 1 59.41 TACCAGACTAAACCTTTATTTCCTCATAGTCTGGGGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGT:1 + chr2R 14921639 5' + Cr1a 397 1 49.00 TTTGGGTTTAGTAATGCATTTTTATGACCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAC:1 + chr2R 13418634 5' + 1360 3205 1 73.27 CCGTCTTGTTGCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 8763214 5' + jockey 28 1 56.44 GATGTTTCTCTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGGC:1 + chrX 13264691 5' - G-element 4325 4 81.25 TTATCAAAACAGAAACTTAAATAAAGCAAACAAATTGATGTGACCCATACCTCTCATTTACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATAC:1 + chr2L 17859111 5' + Porto1 309 1 53.47 TAAATTAACATTTGAAGGTTGTTTTGAGACATACTGGCTTCATTTTAAGATTTTCTGTTATCGTGTTAAGTGAAGTTTTTTTGTTTCTTTTTTTTTA:1 + chr3L 9738766 5' - gypsy7 5006 16 84.54 GCAAAATGTTATGGGCCAAGAACAAGTATGTATGTATGTTAAGACCGTGCGTTGCTCGATTTCCCCCCTTTTGAGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTT:1 + chr2L 8873501 5' + S-element 1560 2 63.37 AAGAAGGGTCCAAAGTAACGATGGGCTCCAAAGGATTTAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAG:1 + chr2R 13396287 5' - roo 288 2 62.00 ACACACACACAGGCCGAACCTCACTACCTCACAGCCACCGCACCACACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCG:1 + chr3R 6592983 5' - R1A1-element 491 1 55.45 CAGCGCTGGCCCAGAGTTTATAAACAAACATTAAACGCATACACATCACGTACGGATTTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATC:1 - chrX 1380474 5' + G2 2696 1 55.45 ATTGGNGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCAC:1 + chr2R 4577096 5' - Chouto 469 1 73.27 GCTAATGTTGCTAATATTGTTTTTCGCACTACGTCTAGTAAAACATTGTCTCTGAAGGAAATTGGTCGAATTTTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCGCAA:1 + chr4 685414 5' + Tc1 459 1 59.41 TTTCTGTCCTGACTCAGGCGCAGGCGAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2R 11115809 5' + hobo 50 1 72.28 TCAAGCCAGTTGCATATAAATGCTCATTCACAGCAGGTGTGTGCTAACCATGTTTGATATGGTTGGTTTTTGACTAACATGTTTTAAGTGTTTTTTTTTGG:1 + chr2L 17634856 5' + transib1 9 2 77.23 ATCAGTTTCTCTAGCCTGATTTTTGTGCCTGGTGTTTGATGTTCACTGTTGTTGTGCAGCGTGCGAGACCGAAGCGTTTTCAATGAAAAC:1 - chr2R 14866282 5' - gypsy10 443 1 67.78 TAAAGTCAGCCAGGGAAAAGTAGGCATAATAAATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 17607843 5' + roo 8687 2 57.43 AATAACGAATTCCAATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTAT:1 - chr3L 10464691 5' - invader3 5423 2 69.31 ACACGTAAGCTGCCGCAACACGCATTCACTTATTTCGCCATCAAAATGCTGGCACTTGAAATCAAATAATGTTAGTCTTAAATTCCAATGTTTCTTGTAAA:1 + chr3L 2033175 5' + HeT-A 5793 1 66.34 GTTTGGTATTGTAAGTGTATTTTCCCTTTGGGTGGCCATTGTGAGGGCAGTGGAGCATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAA:1 - chr3R 9852295 5' - X-element 16 1 59.41 AACAATTAAATAGTGCCAAATTGAGGTTAAGTTTGCATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chrY 1618887 5' + F-element 43 1 59.38 GCTTTAGAAAAGGGCAGCTATCGCGGCTTCTACATATCTCATCGTATTGGCAAGCGGGGATTTAGGTCCATACGAAGTCACA:1 + chr3R 23720651 5' + flea 4572 1 65.85 GAACCATGCCACCAAATCGACGCAGTGGGATCGACCAAGACAGCCAGGAGTAGTTGGATCCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGC:1 + chr2R 17600368 5' + Doc 4550 1 65.35 CCGATCGTCTAAGGAACGAACACCCAACGGTCACTACCAATGACTAATATCTGCGGAGTACTATCTTACTATTACAAGTTGCTTTCCCAGACCTCCCTGAA:1 + chrX 6798972 5' + Ivk 290 1 68.32 TTTGTGTACTTTTGTCATAACTTTGCGTTCTGTCGAACAGCCATAACACACAAAACATAACATAACAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAA:1 - chr3L 4323950 5' + F-element 318 1 68.32 ACAAACGTAGCAGGGCATACGGGCTTAGACAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTGA:1 - chrX 393211 5' - springer 168 4 71.29 ACCATTCCACAACCTCAACACACTTTGGCCAGATTAAGGATGATTTTATTTTGGTTTCGTTTTACTGCCTCCGTTCGCACACATACACACACATTCACACA:1 - chr3R 13605345 5' + accord 7036 2 60.40 ACAGTCGTTTAAGATGAAACACGATTTGCAAACGCAGGCAATGTGGGCAACTCTTGACGGACCAACTTATATATTATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr2L 15324850 5' + invader4 2759 1 67.33 TCAAGCAAGCGGATTTAGCCACCGCAGGACGCCCTCGACACGTCGCCAGACCCATCATTACCCCTTGACAGTCGATCAAGATCGCGCTCTTCTATCACTTT:1 + chr2R 14453974 5' - Porto1 335 1 82.18 GGTGCACGAAGATATAACTACCTAACTAAATATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAAAGCTGAGCTGGTTGGTCGTTCCGGT:1 + chrX 10625685 5' - Doc3-element 4580 1 79.21 GAACGCGCTCTATTATTCTTCTCTTGGTACTCTGTCGTTGTTGGCTCTCACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATA:1 - chr2R 1373099 5' + pogo 2097 1 55.00 CTTAATCACTAGAGATTTCAGTGGCAGCCGGAATTCCAATATACTGTTTTTAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAG:1 + chrX 20084749 5' - mdg1 7310 2 50.00 CTTGGGAATGATATATATTCGACTATTTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTTCTTTTTAGTTGTTTCTGTCATTTGTCTTGATCTATTATTATTATTATTAT:1 + chrX 14585869 5' - invader3 5060 1 68.32 AATTGAATGGGAATGAAATAAGCTCTAAAAGTGTTGTTAAAACGTAATGGCTTTTGTGTTAATTTGAACAATTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTT:1 - chr3L 9802761 5' + roo 8993 2 72.28 ACAAATAAAATTTTCTTTATTTCAGCATATTGATTCTAATATTAAAAATTTAGTACCTAAATTTGTATGTGTGCACGCGTATGCTCATGCATTGTAAATTT:1 - chr3L 24291413 5' + 1360 191 1 71.29 CAAGCNGTTAATAAAAGTGAAGATTTTTTACTTCTTTTTTTTTTGTTCTGTGTAGGAATGGATGAGGGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAA:1 + chrX 4394253 5' - mdg1 124 2 71.29 TCATTAAAGCGAAAAAGAGAGCTTCAAGAATTGTGGTGAAAGGTGTCTAGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCC:1 + chr3R 26212632 5' + R1A1-element 5265 1 55.45 AGACTCACTCACACTAACACTGACACATTCAGCTGTCGTATAAGCTGACTTTCACATTGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGA:1 - chr2R 16032221 5' - R1A1-element 5049 1 61.39 CTCACCCGAGGGCATTCCGATTCGGATAACCTATCTGGCGGACGAGAATGGCTTCCAGCCGCAGGGCGACCACCGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACA:1 + chr2R 12377115 5' - opus 7226 2 73.27 AAGAGAAATGAAAAGCTTTACTTGAAAAGCAAAAAAATCTCCCCCGAAATTGCAATACTCAATTATTTATATTGAATGATCGAAATGGGAAATGAAGACAA:1 + chr3R 9451405 5' + G4 123 1 55.45 CATTCCGCTAAGTGTTTTTGATGTGAAAATCTGGATTTCCGTAAATTATTTGAAGATTGATCGCACCGTTTTGCGATGCTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCA:1 + chr3R 4393179 5' - Gypsy6A_LTR 363 1 60.40 ACGCAGCTATATTCACACGCTCGTGTGTGTGCGTTCGTTCATAAATGATGTATGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:2 + chr3L 22324022 5' - hobo 2916 1 56.44 TCTATTTAAAGCAAAAGAACTACCATGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGATAGGGTGGGTATAG:1 - chrX 20495036 5' + Circe 7193 1 74.26 TGAAGTGTCACGTGCAGTTTCGGCCACCAGTCACCGAGTCGAGTCCCTTACAAATGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGC:1 - chr3L 3717704 5' - Quasimodo 317 2 59.41 TACAAATGCGAACCCATTTCAAAAATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2L 14536226 5' + blood 7025 2 65.35 CAAGTTCATGCTCAACAACGATTTTGTGAAGTGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 26294485 5' - roo 9029 1 67.33 TCTTACATAATCGATATAAGACGCACCACTTGCATGAAAGAGGATCATCAAGTCCTTAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAAC:1 + chr3R 29285463 5' + Quasimodo 137 2 63.37 ATTTCCATTGCACTTTTGTGTTTGTTCAGTGGGAGGTTGGTATGTGTGTATGGATTAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCATGTGAACACCGAGTCCTCTC:1 + chr2R 8958582 5' - R2-element 399 1 65.35 CATGACAGTGCCCAAGGGTTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAG:3 + chr3R 26331620 5' + G-element 10 1 70.30 GATGTCAAAAGCTCACGCGATCAGTCAGTTAAGTTAGTAAGTCTGCAAGTTGGGGCGATTAACTCTTGAAGTTCTGGGAATAAATATACATATGTACATAT:1 - chrX 12715616 5' - G3 4507 1 61.39 ATTTTTACTTGTGGTAAACACACACTTTTTTCATTCTCACATATGAACCAAGGATTTGGAGCCCATCGGTTGTTTTTTTTTTTACTGAAGTGAATTGTTAT:1 - chr3L 8060379 5' + Doc2-element 62 1 39.60 TTTGTGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr3L 11696463 5' + blood 7032 2 58.42 CGCTCACTTTAAATTGAGCCAAAACCGCCAGACTCAGTGCCAAACTGAGCCAAAGAGAGCCAGTCATCTTTGCAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCA:1 - chr2L 16451235 5' + F-element 4400 1 74.26 TAACTGCCCCAATAGTGTAACGTGGACCTCTAGCATTGTAGGCTAATTAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr2R 8557905 5' - hobo 2911 1 51.49 ATTGTGCGGTTTTTAAAATGTGTGCGTGGCAGTTTCGGGCGGTTTTGGGGCGTTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTACCTTTTATAGTTCCTGA:1 - chrX 18057003 5' - INE-1 154 1 49.50 TATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2L 22719577 5' + 1360 23 1 56.44 AGACCGACAGAAACCAACCACCGCGATGATGAAGATCATCATCATATGGGGCAACTCGTGGCGCTCGCTGGGTCACCTCTCAGCCCGAGAGGCTTGG:1 - chr3R 9347879 5' + Rt1a 4654 1 56.70 GCCGGCGTCTTTTGGGTTTACCCATTCAATTAGGGCCAAAAGTGGTGTGTGCTCGGCAAAAGTGCAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGA:1 + chr3R 22566953 5' + R1A1-element 4932 1 67.33 ATACATGTGAGGATGTCACAAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chrX 19561836 5' + 412 7106 2 75.25 CCAGCAATCCGAGCACCAGACATCGGCTGCTCGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGG:1 + chrX 15569157 5' + accord 7004 2 69.31 GGCTAAGGTGATGCCAGCCAGCTACACGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAG:1 - chr2R 11654167 5' + flea 4612 1 73.27 TTCAGCTCAAGATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGT:2 + chr3R 14882062 5' - gypsy5 7344 2 64.36 CAGCTTTTCGCTCCTGCTGCCTGGGTGAATGTCCTTATTGCCCTTCAAGTGATTGCCCCACATCTAGTGTTTCAGCATTGTTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr3L 4890183 5' + HMS-Beagle2 48 2 66.34 GTAACACGCCACTCGAGTTCCCGGGAAAACTGTTAGCACTCACACACCCATGGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAA:1 - chrX 14403725 5' + Quasimodo 7059 2 53.47 ATCCCCGCACCACCCTACGCGCACTATCTTTCCTTGCTAGCTGTCCGACGATCCCGGTTGCCATTTGTCTGCTCTTTCAGCTTTTTTCAAATTCTTTTGTT:1 - chr3L 17204817 5' + FB 172 1 73.27 TTTTTCGAACTAACGCTGTATTGTATCTGTGTACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGAC:1 - chr3L 13228683 5' + F-element 4513 1 68.32 CAGAAGTGCATAAATATGTATGTACACAGAGAGAAAATAACGTAACTAACGTAAGGTATTAACAAAGACACTAGAATAATATTCTAGGGTCTTTGGTATTA:1 + chr3R 28842008 5' + Tc3 316 1 56.44 GAGTTNTCTGCCAACAACAGGCTAGCAAACACTCCATAAAAAACCTTGAAGATCATCCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAA:1 - chrX 7545133 5' + Bica 181 1 58.42 TGAAAATTAACAATAATTATAAATAATTGATATGCCAAACAGGTTTTCTTTTGGCTGCGCTACGGAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTG:1 - chr2R 24210477 5' + flea 4649 1 65.35 GCCAGGCAGATGCACCTCATCCAACTGTTCAAGCAAACAGCTACTGATATCGCCTATACAAACTCGACTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 17624140 5' - roo 400 1 70.30 AGGACTTGAGCGGATCCTGCGGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACT:1 + chrX 18408553 5' - 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chr2L 20465671 5' + blood 7031 2 57.43 AGAGCTGTCATCTTGGCTACTTTCCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATA:1 - chr2L 17049821 5' - flea 4570 1 76.24 ATGTTTATAGGCTGATTATTTAAACCCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 9463392 5' - roo 358 2 76.24 ATTCCAGGGCCTTTAACGACGTCTCCCAGGAGCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 20791807 5' - roo 9028 1 69.31 ACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:2 + chr2L 306476 5' + Tirant 30 2 54.46 ACGAAGCAAACTCGCATGAATGCTCACGCTCTTGACGGGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr2L 7461206 5' + pogo 36 1 65.35 CTTTGGGTTAATTTCGTTTTAATTAAAACACCAAATGTGCAGTGGCAATGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCT:1 - chr2R 18895669 5' - Tc1 1281 1 63.54 AGCCANCTCATAAGGGAAGTGGAAAGCACCGAGGAACTAGGGTTCAAGACAACTGGCTCCAACAACAACAACAACAACAACAACAATAACAATAATAATAA:1 - chr2R 13004854 5' + mdg1 7064 2 60.40 TGCTGCAAATTGTTGAGAGCAGCAATTGCTGCCTTGATTGACCGCGCAAGTGTTTGTTATTGCTGTGCTGGTTGATGAAAAACTTGACACCGTTTGAAATG:1 + chrX 4173146 5' - 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chr3L 22849194 5' - flea 4860 1 48.51 CTTGACAACATTAATATTTCAAAAATTTCAAAAATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chrY 3647465 5' + F-element 54 1 71.29 CTTTGCGGACATGTAAAAGCGTAGTTACATGAGTTGGCTCTTTAAAACTACCCTAATATGTATAATTTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGC:1 - chr2L 19907332 5' + 1360 3175 1 57.43 CAGCCTTAAGGTAAATAATAGCAGCACTATACTTACACACACACACATGCATAACCACATAAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATAT:1 - chr2R 4236687 5' + Quasimodo 86 2 73.27 TACATATCTTAGAGCTAAATAAATAGTATCCATGGATATAAGAATTATGTAATAGTAAATACGAACTAGCTCACATATATATATACACACACACATACATA:1 - chr2R 7651645 5' + Quasimodo 38 2 65.35 GTAAATAAGAAAAATAATTATTATTTTAAAGCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAAAACGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATT:1 + chr3L 15864328 5' + F-element 373 1 67.00 ACCCTCGCAATTGGAAGTACGGCAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATC:1 - chr3L 3850487 5' + HMS-Beagle 225 2 77.00 CAGGTGAGTGCGCATACCTCCGCGTGGGTTGATAACAAAGTGGAAAGTAACAATGACATAGAATGACGCCATTTTAAAAAAGAAGTTATGCTCCCGCACCC:1 - chr2L 13900613 5' - mariner2 3 1 67.33 GAATTAGGTTTTATTATATTGTATATTCGATCAAACTGGTTTTCATTTATTCATTTTTTTCGGTTGGCATTTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGGTGAATGA:1 + chr3R 13333237 5' - Porto1 283 1 55.45 CTGGGGAAAAACGAGGGGAAAAAATATAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 19954799 5' - roo 352 2 77.23 TTCGCCCACTTCCGCTTCCTCCGGTGGCGACTTCACTACTGAGTGGATTCCACAAGTCCGTACCAACTGCCAGGCGGTCAGGGGCCAGATCGGAAGAGCGT:1 - chr2L 15949591 5' - mariner2 568 1 62.38 CGCTGNGGGCTTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTATGGTTGTTAGTGGGGCGCCAATTATTAAATGTGGGGGTGCTGCAGGGGGTCCCAC:1 + chrX 21269111 5' - gypsy3 363 2 52.22 CAGGGTCAAGGACAGAGTGCCAGTGGCGCACCGGAAAACGGTGGACCGAAGTGTTTTTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGA:1 + chr3L 25514007 5' - X-element 4694 1 50.50 ACAAGACGACCATATCGGCCATTTGGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr3L 27390340 5' + 1360 38 1 67.00 AAACATTTTAGCCCGGAATTTAATTTGATTGCCCGGCTCATGAGCGTGCCAATGAATATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2L 796744 5' + jockey 25 1 59.41 GCATAGTTTAAAGTCTACCAAAGCCGGCAAAAATGCAGCTACAGTTTTGGGATTTGTTGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGC:1 + chr3R 10207310 5' - Doc 4565 1 65.35 CGGCCACCCCTCGCCCCAGCGACAATTGTCCAAGATGAGTGAGGAAGCAAAAAGAGGACGCGCCGTCAATTAACGGCACAATATGTGGACCTTGTAC:1 + chrX 17527143 5' + gypsy8 275 2 59.79 ATGCACCCTTTTTGCTCCCACACTCTTTAAACATTTTCCATTTAGCATTCTGTTTATTTTGCTTAAAAATATATAGTGACAATTTGTGGCAAATTACATTT:1 - chr3L 3538624 5' - TART-A 13321 1 59.41 CTGGTNAGTTTGACATTGAGCGCGTGCCAAGCAGAAAACGCCGGTAAGAACGGGTCGCAGCCAGTGACAAGGAGACGCAAGAAGCGTCATTTGTGGTGACC:1 + chr3L 2760670 5' + aurora-element 353 1 58.42 TAAAAGGTATCTGCGTCGATTGCGACACATTGAATTTGCATTTACCCATAAATGCTCCATGTATATATGGAATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 - chr2L 10749212 5' - 412 7544 2 70.30 CTCCTCACCTTCGGCAGACACTTGCCAAATCTCTGGAATTGTGAAAAATGCCGCCTGGGTGCTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTATGCGTTGTTCGCA:1 - chr3R 14679823 5' + Cr1a 223 1 69.31 TATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCT:1 - chr2R 545173 5' + F-element 441 1 58.42 TAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCG:1 + chr2R 16928872 5' + blood 7010 1 63.46 CCAGCTGAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 19535776 5' + hobo 14 1 65.35 CCAGTTTATACTGTCTTTGCATGTGTGCAGCCTGATTTATGTACAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3R 22675879 5' + 412 7082 2 51.49 TGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATGTTACTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chrX 22252765 5' + 297 32 2 67.33 AAGCATGCGAAATTATAGAATTCTCTATACGAAAATTACTTAATTAAATATGTAGAGCCAAACAATATACTTACTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATA:1 + chr3L 23277227 5' + Copia1_DM 6 1 50.50 TAATCCAAGCATTTCTTTGCAAAAACAAAACTATGTCAGCATTGTTTGCTTGAAGGGAAGCCCATAGTGGCAGAGAGAAGCAAACGATCATATCCCCGTT:1 + chr3L 24291235 5' + invader3 5243 2 63.00 TAATANGTGCATATGCATATGTCGTAGCAGTTCTCGAATGCAATTTTGAACTTAGTTCGATTTAAAATAATATACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chrX 3697210 5' + jockey 4679 1 73.27 GAAAAACAGCCTCATATATATCCTTTTTGAAGGATCTCAAAGATTTAGATCAAGTACGTGGGTAGCTGATATAAATGTACATATGTACATATTTTT:1 + chrX 6729677 5' - G3 4503 1 75.00 TTTCATTAATCTCTGGCCCCTCAGCGAATTTGAAGTTTAATCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGAGCGCTCCTGC:1 + chr2L 19839071 5' + F-element 359 1 52.22 CCCATTGACTCCGGCTCAGTTATAACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATATAATATCATAACGTTAAAGTGCTGACCCAGCATCGGACCGGAAACCCGTGCG:1 + chr2R 18723092 5' + Gypsy6A_LTR 72 1 76.24 TTGCTAAATGTTTATAATATAATAAACAATTGTAATAATACAACGTCGTCGCAGGAGTTTTTGCAGGGCCCCTTAGTTGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCG:1 - chr2R 4938063 5' + Cr1a 4428 1 63.00 AACCCCAATAGAACTAGTCAAAATTAATGGTAGACTATACATCCGTTCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCAC:1 + chr3R 12661298 5' + Idefix 233 2 73.27 AGGCGCAGCTGGGTGGCTAAAATGGCTACGAGAGTGCTAAGGTTCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 15133908 5' - 1360 3362 1 79.17 ATGCGTGGCAACATTTTTTGCGCTTGGCTTCAGTTTCGCACAGGCCAGTGCTCGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGG:1 + chr2L 772763 5' - I-element 171 1 58.42 TTTATGCGGCTTTGTGTCATAATTCCTAGCGCTCTTCTCGTTGTATTTCCTCCTTTTTTTTACTCACACAGGCAAGCAAATTAT:1 + chr2L 2928903 5' + 1360 3257 1 69.05 TTCTACTCGTGCTATCCAAGAGTCTATGTCCAAGAGATGGGGGAGCTGGGTCACAGCCTTATAATTAAGATTATGGAGCGAGTCCGATCAGACGAGATGGC:1 - chrX 6614326 5' + Rt1b 4786 1 60.40 AAAACCAAAAATAGCGATAAGCAGCTGAAAATACTTCACGTTTACTAGGCCGAGTTATAAGTGAGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGA:1 + chr3R 5064853 5' - F-element 4277 1 71.28 CAAGTACAACTGAATTCTAAATATAAATGCTCGCAACGAACTAACAAATTCACAACAAATTTCAGTTGAACTCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGG:1 + chr2L 11816089 5' + 1731 4558 1 80.00 ATGGACTCAAAAATTCCACCCAAAAGTTGAATTTTATATGTCAAATTTTGGGCTAGCGTACAAGGAAAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3R 11097488 5' - mdg1 7452 2 67.33 AGACGGGAAAACGATGGAGTCGTTGGCGGTAAGCAGACTGGTCAAGACGGGACTCTCAACATCACCACGGATAAGCTTACAAATAAATACTGTTCCAAGCA:1 + chr3R 31030649 5' - Cr1a 4029 1 71.29 ACCGGCCAAAGGACAGCCATGTAAATTAAGTTTTAAATATGCCACATGAAATTCGTCATGAGACAGAAATCAAGAAAACATTTATATATTATGAAAGGAAA:1 + chr2R 14111661 5' + copia 234 1 66.34 GCCTTNAGCTGCTTCCTCACCTTCTCACGATCGTTAAAGGCTCTGAAGAATCGTTATCAGGTTCGAAAGCTAACATTTGAATGACTTCTGGGGAAAGAGGC:1 - chr3R 11607688 5' + hopper2 126 1 59.41 CCTTAGTGCTCTTAGGCCTTCCAGTTGGACCAGGTGCGGATCTCGTTCCAGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAG:1 - chr2R 8717511 5' - accord 7286 2 54.46 TGTTGCACCGTAAACCCTTTTTCCAGCTTGTAAGCACTCTGCCTGTCTCACTCTAATCGCGTCCAGGAGCGCCGGCTAACAAAAGTTAGCTGTAACAAAAC:1 - chr3R 11763723 5' - BS3 1670 1 69.31 GCTGGCATCCCGAACCCGTTCAACGTCAGCGAAGGGATGGAGAGGTGACATCTGATGAGGAAATTGTTTTTACCATCGGATTGTGGGTCCGAGCTTTGAAC:1 - chr2R 16172934 5' - Idefix 7072 2 80.20 ACCATACTCCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 21266515 5' - roo 395 1 67.33 GAGGCCTACCACCGAATGTGGAAATAATATGGGAGGTAAAAAGTTTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTT:1 + chr3L 4098955 5' + G4 3377 1 63.37 GCGTTTTTTAAGAATTCCGCGCTTGGCGCGCTTTTTCGTATCCTTGATTTCTGGCTGTTCCTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATT:1 - chr3L 18852146 5' - gypsy4 442 1 61.39 AAAATAGCTAGATTAATTCAGTTTTTTAGCTAGCTTTTTTGCCAATACCACTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCC:1 + chr3R 22666535 5' + 412 446 2 50.50 CCTAAGGTTATTTTCTTTCTTTTCTTCCCTCGCCCCCACTTGAGAAGTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr2L 14062954 5' + jockey 20 1 53.12 CAAAAGTTCGCCTTGAATTCTTTTAATTGAAATAGGGAAATAAAAGAAATCTAGATTCGGCAATCCGATCTTATTTACCATATAATTCATATGTTTGATCA:1 - chr3L 15869760 5' + transib3 157 1 80.20 GACTTACTGGAAGGGCACTTAGCTCCACTTCAGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGC:1 + chrX 6860174 5' + blood 489 1 68.32 GATGGAGCCGCAGCGGCCACCACAAGTGCCTCGCCCGTAGCTATGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCG:1 + chrX 1875456 5' - R1A1-element 337 1 56.44 CTGGAACAGCTAGAGATCGTTTGCGTGGTGAGGCCTATAACCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCAAATCTCTTGACACTTCGGCAATAAGCCGCTGCAA:1 + chr3L 8993876 5' - rooA 115 2 72.28 TATTGGATCTACCCTGCCAAACAGCGACATTAGTTTTGGTAAGCAATCTGTGATACATATATATATCTATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGG:1 - chrX 3003739 5' + Juan 10 1 62.00 TGGGCATAGACAGAGCTTTGACGTCAGATATCGGGCAGTTTTTGTTTAAATATTTTCAACGTCTAATGACGCTGGCATTTATTGTCCTCTGATTTTTGCTT:1 - chr3L 11714461 5' - TART-A 13358 1 58.42 GAGCTAGAAAACGCCATCCTCTAGAACACCTGACCGTTTACAATTTGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGG:1 - chrX 21593449 5' - Idefix 436 2 74.26 AGCAAGCTCCCGCAGCGCTAATTTGATTCCAGATTTATTTGAATGGACAAGTCCGCAGTTGGTTGGCAGTGCATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGC:1 + chr2R 19214138 5' - Doc 4385 1 75.25 GTGGGTCAAATTTAACCGGTAAGCGATGGCCACGTTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCA:1 + chr3L 17328414 5' + 1360 487 1 65.00 GGCTTGAAAGACATTTTATTATGTTTTTAAAGTGTATTCCTATTATTCTTAGGGATGTGAAGTTCTGTATTTGCATGTAGATAAACTGGACTTTTCGCTCT:1 - chr2R 5582047 5' + Cr1a 274 1 74.26 ATATTATGACTTATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCAC:1 - chrX 21638117 5' + gtwin 14 2 65.35 GTGGAGCTGCGATCCTCGGCCAGTTCGCATTATCGGGCATATACCACCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAAT:1 - chr2L 8734642 5' + 17.6 7006 2 53.47 CTAAGAGTAAGCGACGTTTTCGTGACCTCAGGTGGCAAATATACGTTGGCGCACCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3L 7316387 5' + jockey 23 1 63.37 CTCAATAATAATTACCTATCTATTCGTGTAGCTTGTGTATTTAAGTTAAAATGTTAATCTGGCTATATGGGTCTTTTATGTGTCTACTCTAAATATGAAAA:1 + chr3R 13164103 5' + looper1 114 1 75.25 TATGTNTGTCACGGGTGGTTTGGTGTCTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACT:1 - chr3R 18860396 5' - R1A1-element 5304 1 56.44 GACGAGAAACAAAAATAGGGGCCCTATGCATTTATTTACATGCCAGCAAAAAGGGAAATAACGGGATTCCTGCGGCCTATAAAGGGTAGGCGCGAGCACGG:1 - chr2R 4023812 5' + gypsy8 346 1 56.44 TATCTGAAGCATATAAAAGACTTGTTATTTTGGAGGTAAAGCCACTGCAACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGCACATA:1 + chr2L 2253002 5' + flea 4677 1 54.46 TGTCTAACTGCGCGGCCCCGACTATTCTCGCGCACGGCCCGCTCGGTTACAAGATCCAACTATTGTACCGTTAATTCACGGTGCATCCTCTTTGTGCACGC:1 + chr3L 24290867 5' - gypsy8 242 2 71.29 GGTCTCAGTACTCCCCGTCTCCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chrX 12756730 5' + jockey 57 1 74.26 CGTCACGTAGACGGCCGACTGATCGATATTCAATACAGGCGTAGGGCAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTC:1 - chr2L 18839472 5' + accord 213 2 64.29 CAAAACTCTGTAGTTTCAGCTCAAGATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTG:1 + chr3R 14882048 5' - gypsy5 419 1 78.22 AATAGGTTACAGCAATGCCGAAATAAAGAATATAACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 + chr3L 46935 5' + FB 42 1 68.32 AAAGAAGGAAAAACGCTGCCAGCCGCCCGCAAACAAATTTCAAATGAGGCAGGTCACTTATTTTATTTCGTCGACGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCT:1 + chr3L 18771105 5' - HB 7 1 80.20 CGCACGTTGGCCGTGTTGGTCCTTGAGTGGCTAACCAGGAAAAGGGGTAGTGGGTGGTGGGTGTTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAAA:1 + chrX 7505515 5' + Bari1 438 1 67.33 GAGAAATACGTAGCAAAGGATCGAAGATTTTGGGGTTTTTGGCCATGACGCGCTGCCTATGCTCGATCGGTACACACATCTTCCACGACGCCACATCCTCG:1 - chr3R 10580171 5' - Osvaldo 438 2 67.33 CCCCCCACCGCAAACGCCCACTTTTTTGGGGTGCTGCAGCTAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2R 16928832 5' + blood 8 2 70.30 AGTTTGAATCACTCAAACGTAACGGACGAGAAATGAAAAAGGAAGCTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGC:1 - chr3R 13569457 5' + Tirant 8282 2 55.45 ACTGCGCATATATATGTTACCACTTCCGACTTGTGCCAACTTTGCCTGCTTTCAAAAAAATTGGCGCCTGGTTACAAAACCTGAGCAGCCAAAAATAACTT:1 - chr3R 10280286 5' + Cr1a 489 1 60.40 TTTATTGTAATGTGTCTTGCAGTGTTTACATGTAGTTGTTTGAAAATTTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTG:1 + chr3R 26364997 5' - hopper2 1194 2 75.25 TTTCCGTACAGTTCTTTTCTCTTTTGAACCAAACTGCATTTGGTATATGTATATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 - chrX 19885254 5' + HMS-Beagle 21 2 56.44 ATCCAAGTTGAAAGAACTCTTAGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 9653325 5' + roo 52 2 79.00 GTGGCGGTGGCGTAGCAAAAGTCGAGTTGTGGAAAACTCGGGCTGTGGAAAGGCAACAGCTGGCTTCACAGCCATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGT:1 - chr3L 5978987 5' + baggins 5184 1 65.00 TGCCATGCCGTCAAGTACCTACACGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTT:1 + chr2L 20063141 5' - flea 4831 1 64.06 TGTTGGCCGAAAAGCTTGGGCTTTTAATGATTCTTCGCGGTGCCTCTTTCTTTTGTCGAACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACGCTGTACCTAT:1 + chr2R 11730851 5' + blood 7028 2 62.38 GGAAAACGAATGTATAATTTTTAAAATGTTTATTGTTAAAAAATGTGATATATATATTTTTGTCCTTAAAATTGTTTACTTAATAAAATCTCTAACTTTCA:1 - chr2L 18698611 5' + gypsy7 419 1 77.23 CAAATNAGTTACAATTCAGATGCTCTTGGGCCAATTCGTGCAGTAGATAGGCCCGTTCAATGTACGCAACTGGCTACTCTATAACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3R 7422600 5' - Tc3 316 1 61.39 TTCTTGGCCCGCTGATCGCTCCACACATTGACAGTGTTTGTTTACTTTGACATGTTGCTCAAATTGCAGATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 23061017 5' - accord 7032 2 68.60 ATCTAGAAGATACTTGTACGCAAAGTGTTACAGATACTTAACGCTAGTGTGTTCTGTGGCGAGGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 15390199 5' - Quasimodo 39 2 81.19 TTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGACCACAACA:1 + chr2R 4577092 5' - Chouto 476 1 66.33 AGCGCAAAAAGTTATTAAATTTTTATGCACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr3L 776174 5' + 1360 20 1 59.41 CAAACAAGTCGTACACTCGATGACGGGTCCAATGCAAATGTTTGCATTACCAACAGTCACTGCCCACCACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAA:1 - chr3L 19967010 5' + I-element 4890 1 72.28 CAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGA:1 - chrX 1018157 5' + 1360 196 1 74.26 ACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGCCAGTCCCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 - chr2L 1353769 5' + I-element 8 1 55.22 TAATCAACGCCGTCTGAATAAATATAGCGCTAACAATCACCGCAGCGGATGCACAAACAGACGGACGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAG:1 + chrX 16569578 5' + R2-element 3133 1 66.34 AAATATAGTCAATATATGTAACAACAAAACTCTCAGAATAATCACAAAAGCCTAATGGTACATTAGGAACGAAGATATACGTAATGATTTAAACATAGAAA:1 + chrX 18663580 5' + Porto1 4395 1 69.31 TTAAGCAGCATGTAGCACCCTTTTAAACATGAAACAAAACATAACGTAATATAATATAAAAAACATAAAAAAAAAA:1 + chr3R 20806865 5' + HMS-Beagle2 482 3 71.05 ATTTCTAGTAGACCGAAGGGCTTGACCATTAATATAATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTATTTTTTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTT:1 + chr3R 13222075 5' - F-element 78 1 59.41 GAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGC:1 + chrX 21772500 5' - gypsy3 6544 1 73.20 AACTTTTCTCCTGTTTTTGTTGGCATCACTGGAATAGTGATCTCCCTTTGATTTGTTTTTTTTTGTTTTACTTTATTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTG:1 - chrX 9007142 5' - Doc3-element 144 1 59.41 CCACAGAAGCAGGCTGACATATTGCCAAGAAAATGGGGTGAAAAAGTGTGACAGAGGGTAAGCAGGCCAAATGCGATTAGCCAGCACTCTTAGCAGAGACA:1 + chr2R 16563127 5' - baggins 139 1 76.24 ATTCTTGATTTCGCCTCGTTTGGTTTTGTTTTCACATTCGAACTTGAAATTCCTCTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCTAAATCGGCTAAAATGGCAAATC:1 + chr3L 13523523 5' - Fw2 141 1 60.40 CACTTTTCTTTAAAATCAGATTTAACTGCACTCTTTAAATGATTTTTCCAACCTCAGCGTGTTGACTGTTCCTATGTTTAAATCATTATGTATATCTTCGT:1 + chr3L 5964116 5' - Porto1 4384 1 67.33 TCAAACAGAAATTGATTAGGCAAACCTTATCAAAATACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1 - chr2R 8715212 5' + copia 4932 2 64.36 GAGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGTGTGTGTATTAGTTAAGTTAGTACGACTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr2R 22269238 5' - hobo 2918 1 58.42 GTAGCGATATTATATATTATGTAACTTATATGAGAAAGTAAACATCATACTGACTCGCTACTGCGAGGGCTTCGGCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCT:1 - chr3L 4884917 5' - rooA 275 2 53.47 ACTTACATTACGAGGTAAGAAATAATTGGTAGATAACGTGAAAGTTACATTCTATAATATCCTGTACTGTATATGCTGTTAATATTGCCGATTTGATTTGG:1 - chr3R 7780485 5' + blood 452 1 82.18 ATCATTGTTTAAATCATAGCAAAGAATTGCAAATTGGAAAGTCCTTTAATGATTGAAGAAGTCATAAGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCA:1 - chr3L 3423240 5' - I-element 188 1 69.31 ACTTCGGCACTCGGGCAAGTTCGCATATATCGTTCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr2R 20698412 5' + P-element 41 1 35.64 ATCATACATTTCCACCAACATGCCAACTATGCGGGTACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGC:1 - chr3L 7087846 5' + Ivk 5140 1 78.87 CGACCCAACATTTGCCTGATCAATGGCGGAGACTGTTAAGGTATAACTTGACTTCTTTTCGGCATCCAGTTGCACGTGGACACACACACACACACATAACA:1 - chr3L 20010259 5' + Quasimodo 41 2 72.28 CCTTCTATACACACATGTGGTGTATATATTTTAGCATTTTGAACGGATGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTC:1 - chrX 21599599 5' - micropia 5166 2 54.46 GAACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAG:2 - chr2R 4879046 5' + G-element 10 1 72.28 TATTTACCCAGTCAACTGTTCAGGCATTCACTCTTGCCCGTGGCAAGGGGGCTTTTTACGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGC:1 - chr2L 3246563 5' - roo 152 2 62.38 GATTTGCTTTAGTATCTAGTAGAAGAGTCTTGTAGTCCGTGCAACATCTAGTCCCTCATCAATAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAA:1 + chrX 13282296 5' + I-element 137 1 64.36 TTATCCAAAGCTGTGTTTCTTTTGATTTCCCTATGATTTTTCTTTACATTTTGGGGTCCTTTAATGATCAAAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGG:1 + chr3R 30114015 5' - FB 288 1 61.00 CGCCTTTTCAATTGAGCTGCAAACTGGTCCACGCTTTGATTTATGCCAGCTCCTCAGCGGCGGTCAGATAAAATTCTGACAAAGACATTAAGAAGACCCCT:1 + chr3L 662611 5' + Fw2 184 1 77.23 TCCGTNGAGCCGCCCAAGTCCTACACGCCGCTCAGCGCTCTCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTG:1 + chrX 19871509 5' - R1A1-element 493 1 59.41 TAATCCACAACCCAACTAATCATCGTTCTATAGACCAACAGTTAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGT:1 - chr2L 14848989 5' + Idefix 6969 2 66.34 ACTTAATCTTTTGTCCAGACACAGACGTTTTAAATTCGGCCAAAAGGGCAGACACTGCTTTTCTTATGAACAGAAAAATTGCTCAAGAATGTAAATAAAAA:1 - chr2R 12042971 5' - HB 169 1 54.46 GTTAAAATAAGCCAAAATTTAAGACATCATAACCAATTCCACTTACCAATCTTCGAAACCATTTCCACTTAATATTAATTAATTCGACACCGATGCGTACG:1 + chr3L 18072583 5' - 3S18 267 2 71.29 GGATATGACTGCTAGCTCCTCCGCCTATTCCCTCCTTCCCCCAATCGCGTTTACACTAGCTGAGTAACGGGTTACCTGATAGTCGGGAAACTCG:1 - chr2R 14826956 5' + INE-1 559 1 53.19 GAATGGAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3R 25814705 5' + 412 7087 2 61.39 TTATCGTACGTCACATGCAAATCAAGTCGGACGCGGTGCAGTCGTGCGATATGTTTACCTTTGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAA:1 + chr2L 14555984 5' + G5 4585 1 63.64 CAACTGCCCGTTACATGCGAATAATCCTACTCATAATTATTATATATAATATTACATATAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATC:1 + chr2L 8430344 5' - 17.6 7020 2 66.34 TTCTTGCTTTCGACATTTTTGTTATTGAATTCGATGGTTAAATATTCGTAACAAAAGAGAACGCTACAGTCAAGTTTCTCGACTATCAATTACCCGTTACT:1 + chrX 20772490 5' - INE-1 550 1 60.40 CCACAGCCACTAAATCACTTTGAATGAGCCCGTTTCTCTGTGTGTTGGCCAGGCCCAAGCCACTTATCAGATATGTATTGTGAGGAGTCTTAAAACTCCCC:1 - chr2L 11883503 5' + gypsy8 4651 1 66.34 AACTTCTTTCTTCAACGAGCAAACAACAACTCTCCTGCCGTCGTGCAAAAAACCTCTCCCGTTGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCCACTTCTGCAGACAG:1 + chr2R 4023416 5' + Doc2-element 373 1 66.34 TATAANATATGCGAGTGCTGGGCTCCGTGGAAGTCGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAATTGACAATAAATTATTGGAAAT:1 + chr2L 8920613 5' + R1A1-element 144 1 75.25 GTTTGGAAAATGTTTAGCTCATTGCCTGTTTACCTTTCTCCGTGCAGTGGCGTTGATGGACACGGAGACTATGCAGACCTCTGGTCAGCATTTCGGGCACT:1 + chr2L 12472458 5' - HMS-Beagle2 6948 2 53.47 AAATATTATTACTTAAAATAAATGTAATTCTCACTTATACATACATATATACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 8299668 5' + roo 24 2 53.47 GGTTATATACAAAAATTTGTGTAATATGCAACTGTATAAAAGCGAATTTAACTTATTAACTTATACAAAAATATGTGCACCCCTCTAACTTGCTCGTGTTA:1 + chr2R 15295313 5' - gypsy10 5646 2 74.26 ATCAATTCCATTCGCCAGCGACTCCCCGTTTCTCTGGGCAATTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGAT:1 + chr2R 12983440 5' - Rt1b 4767 1 63.37 GGTAAGCGATGAAACTCGAACGCGTGTCAGCATTTTGCATGGCCCAGAGCTTAATAGTCAGCACAGAGCGCTGAACTCTATTATGGCGCGTCAGCATTGTT:1 - chrX 8769388 5' - gypsy 7039 2 66.34 CAAAATGCGGGGCTTTGCGGCAATTAACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAGGAAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTC:1 + chrX 17298256 5' - Cr1a 183 1 75.25 GGCGTTGGGCGCTTTTAAGAACCGAAATCGAGGTTCGTCTTTTACACCGAATGACAAATGATATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAG:1 + chr3L 9499894 5' + S-element 1584 2 63.64 AATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:1 - chr3R 2689430 5' - diver2 4475 1 65.35 AGTTAGATCATTTATTTCGATTGGAAATAGGTTTCACGTCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGTAAATTGGATTGAGGCGAAGC:1 + chr3L 20622715 5' - 297 6830 2 71.29 CGTTTTAACTACATAAAAATATAAAAGGATAGACACTCAATAGGCCGACGATCTGGCCATATCCGTCTGTTCGACTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAG:1 - chr2R 21940747 5' + INE-1 136 1 59.41 TATAACCCTACAAGAACTGAAGGTTGCTATAATTTTGGCCACACCTGTGACCCTGAATGTGTTATGAAACTGAAAAAGCTGGACTGGCTTCT:1 - chr2L 3164190 5' + G5A 2342 1 80.43 GATTTTGTTGACTTAGCTCTAAAGTTTTAAAGTGATTTTGATTTGATCAGTAAACTTAAATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAC:1 + chr3L 10464616 5' + invader3 18 2 61.39 TCTACGCTTGTTGCGTAAAATTGAATTTGACTCGCAATAAACAAATCAACGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGC:1 + chr3R 11813981 5' + Tirant 8186 2 61.39 GAGTGGGCGGGCAGATGGGCGTGGTGTAAGCAAAAACCGTTGACAAAGGTAAACGTAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAA:1 - chr2L 12844831 5' - roo 145 2 60.42 TGCGAGTGTATTGGCGGGCATTTCCTTGAAAAAGGGACATGGGGGGGTGCATCCTGTGCGCATGCTGCCACATCTTGTCGTTGTTGTTGTTTTTGTTGTT:1 - chr2R 18670618 5' - I-element 133 1 60.00 CCATTTACCATCAAAGGGAGCTGAACATTTTCAGCTTCCAAATAACAAAGAAACACAAACAGCTAATCAAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATT:1 + chr3R 2476398 5' - invader2 321 1 68.32 GGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chrX 23155230 5' + blood 7061 2 72.73 TAGTTCTCGAGTTTTTAATTTTTATTTCCCCGTAATTTGTGGATTAAAATGGAATTATGAAAATGAACTAATCTTATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGG:1 + chr2L 12857371 5' + Circe 7129 1 67.35 TCTTTTGTCCGCTGCCCGGGCTGATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCT:1 - chr3R 13956921 5' - R2-element 3353 1 77.23 TCACCATTTCGCTCATGCATACTATAGTACTTTCAACATTGAATCAATTAATAACAATGTGCTGACCCAGCATTGGGCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAA:1 + chr3R 18661056 5' + Gypsy6A_LTR 82 1 53.47 TATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 19450175 5' + roo 8708 2 60.40 CAACTAATTGACTAATTTATGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr2L 15997942 5' - 412 460 2 60.40 TTTAAAGACAATTATTTTCAAGATGTCAAAAACACAAGCTCTTAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGGCGTCAACAAAAAAGTGGCTGCATAG:1 + chr3L 19516517 5' + 1360 3338 1 61.39 GAGTAATTCAGATAATGGCATAATAGCAACTTGAGTAATACACTTTTTTCTGGGCTAAGATACAAAGATTCCAAATTGGTTTTATTTTGCAAAATGTTATT:1 + chr2L 1619324 5' - HMS-Beagle2 396 1 77.23 ATCAACCCAGCGACCAAAGTGTCCCTCGCACCAATATTCCCCACAACCCACTGACACTTCGAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACA:1 + chr2R 14680587 5' + F-element 4577 1 61.00 CAGAGACCTCAAAAACCAGAACCAGAATCATAGAGCTCCGGCTGCGGTGGAATATATGTTGAGAGGAACTTTCCTATTTTAACTGCCAGCCTTGTGATCTG:1 - chr2L 9508285 5' - Gypsy6A_LTR 255 1 53.47 GAATGACTCCCTGTGTGTGTGTGGGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGCA:1 - chrX 10555481 5' - Tirant 8471 2 60.40 TTTCGGCACTTGACAAAAAATATATATAATTTGGCACGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATT:1 + chr3L 6511549 5' - Doc 4441 1 63.00 TGAATGACAGAAGGACATGGTCGTACATTATTGTTCGCCACCCTCACTATATCCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTC:1 - chr3L 3498688 5' - Circe 7117 1 55.45 GCAAATCATAAGGATCTACCTGATCTATATGAAATATTGCAATAGTACGCTCTTCTTAGGCAACCCAATCTTATCGGTATCAATTTAAACTATTCTTAATA:1 - chr2L 20862380 5' - jockey2 3314 1 62.38 GCCAGGCTTACAGTCCGTAGCGCGTCCCATTATGCGCATACACACACATGTACATATAGATAGAGGGGACACAAAAATAAAACAAATTTAAAAGATCGGAA:1 + chr3L 14059417 5' + Tc3 1589 1 82.18 CACGCCTTGGCTTTCATTTGGTAGTCTGGGCTTTGATTTCGCAACACCTGGTTACTGCTCAATAGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCT:1 - chrX 4144550 5' - gypsy4 6584 2 67.00 TTGCGTTGATTTTTTTATCATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr2L 12728420 5' - opus 442 2 81.19 CATGGCTGTAAACCGCCAGCAGGGGGCGCGGGATCCAACCACCACGAATAAACTACCTGCAATGCTGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCA:1 - chr2L 18063320 5' + HeT-A 5638 1 76.24 CACGCACTCCACATTCAAATTGCGGAGAAACCTATAAACAGGCCTCAGATTTTCTATAAAGCACTCGATATATTAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 17004701 5' - roo 408 1 72.28 GGTAATAACAGTTCTAGAGAGAAATGTCATCTACTATTTAGCAGGCCGATCCTTGATATGCGTGCTAGGTCGATGAGATGAGCCGACCAACAGGCTGCAAA:1 - chr2R 4581207 5' - Chouto 6014 1 57.43 TTGCTACGTGCAGCACCAAGTTGAATTTTCTGATTGTACTCGGCATTAAAGATTGTTCGACTTAAAAAAAAAA:1 + chr3L 18723988 5' + McClintock 6354 2 76.71 CTTTGCGATAACTTTTGTAATGATGTTAGATAGATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 2539235 5' + roo 8674 2 70.30 CTGCAAAAGCACACATACTTCGCTATGTTATATATATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chrX 8299737 5' - roo 9032 1 67.33 TTGGTTTCCCCATCTCCATCCTCCTGCCAGATGTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCTCTCTTTGAACCTTTTCCTAATCTTAAGAACCCAAGAGC:1 + chr3R 28285372 5' + 297 188 2 65.35 AATCTGAGGTATTTTTTAAAAAGTTAAATATTCCTTAAAATCTTAAAACCTCACTATATATAAAATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr3L 12596656 5' + flea 10 2 67.33 CTCAAAGCGGGGGTTTTTCACGCAGGGTTGGCATGTGTTTAATTGAAAAATCATATGCAGCGCGCATAATTATGTTAACGCTGCGACATCAGAAGTGGGAT:1 + chrX 7379537 5' + invader1 415 1 73.27 AGAACGATGAAAATTGCTGACCAATATAGAAATGCCATTAAACACAAAGTGGAAAGTGCAGCTTGCACCACTAACAATTATT:1 + chr3L 20445746 5' + Doc 115 1 50.00 TCCGGTGGTCACAAGCAAAGTGGAAACTCGTCTGCTAGCTGCTAGTTGCTACAAATTTGTCAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 16372385 5' + roo 8675 2 65.35 AATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 - chr2L 22690036 5' + Tabor 21 2 59.41 CCAGCACATGCTTAATTTATGGTTACACACTGACACTCAACTCCACTCCAACGAGATGTGCTGCTGCAGGCGAGAATTTCTTAATCTTATTAATTGTTGTT:1 + chr3R 23005186 5' + gypsy12 10085 2 75.25 ATACCTTGTGGAATTGTGGTATAAGCTGGTGGCTCATGCTCTTTATGACTCTTCGTCTCCGTTTTGTTATGGCGG:1 + chr2R 4546621 5' - HeT-A 246 1 64.00 TTGGTCATTTGGAATAACCAGAATGCCGAATGTGGGAGAGAGGATCGCGCATGGATACTGATAAGACGAGAATTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTT:1 - chr3L 12481293 5' - Quasimodo 219 2 59.41 TTCCGTGTGAGCGCACAAGGCAACGGCGGAAAGAGCCGGAAAAGAATGCCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCA:1 + chr3R 20716260 5' + INE-1 568 1 61.46 CTCCGAATAAATATACGTAATTGTACGGAATTTCCAGGTTGCCTTTTTATGGGATTAAATTGTACACCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:1 + chr3R 19201069 5' + I-element 63 1 72.28 ATACGCCGCGTGTACCAGACCGCTGCAACTCAATACCGATCAGGAAGTGTTGGCGTTTCGGGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACC:1 + chr3R 17437977 5' - Ivk 4965 1 64.36 GGTGTNTGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr3R 19535708 5' - hobo 2891 1 70.30 CGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 - chr2L 14536292 5' - blood 7336 1 75.25 CGTAATTTCACACAGAGAAACTCTTACATGCGAATATTAATTTCACGGCCAAATAACGGATCAGCAGCAGAAGAGGTGGAGGAATTGGAGGGAGCTGCAGC:1 - chr2R 23776089 5' + invader3 499 1 57.43 TCGACGCCGCCCCTGCTTACCCACAGCCAGGATCCTCATCCACATCATCCTCGGCGGCAGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACG:1 + chr2L 15990752 5' - Idefix 7058 2 65.98 TGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr3L 5827880 5' + blood 33 2 54.46 TAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATC:1 - chrX 22386784 5' + hobo 63 1 53.47 TGGTGAATTAAGTTGCTGGCCAAGTCACTTTCGATTCGTTTGGTAATTCTTAACCAAAATTGCCAAAATTCAATTAATAAAATAAAGAATAGGAAAAAAAA:1 - chr2L 675776 5' - McClintock 206 2 48.51 GAAATTGAAAAAGCAGTTTTCGTCCGTATGAGCGCTGTGATCTTCGGAACTATGTATGTATGTGTCGGCGAAACAGGAGTTTTATCCATATTATTTATTCA:1 - chr3R 6388794 5' - invader4 308 2 77.23 TAGTTTATGGATAAGTCGATGTTCATATTCATTCAGATAAGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGG:1 - chr2L 17778883 5' + Bica 4596 1 63.37 AGTAAACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 14832387 5' + blood 18 2 59.41 TTACCCGGCCAGTTGACAGGGGCGTGTCCGTGGGCGTTTCTACTGCCAGCCGCACAACACGCACACTTATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACAC:1 + chr3R 16188999 5' + 1360 3242 1 57.43 TGGTGTTAATTTCACTGGTGTCGAGCGGCAAGTGGAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - 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roo 397 1 67.33 AAAAAAAGAGCATAGCATCCCAGCTCTGCCATGAGGCATCTGGTGTCCTGCCA:1 - chr2R 14415179 5' + R1-2 3120 1 66.04 ACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr3R 22238691 5' + hobo 50 1 74.26 AACGGCTTCGGACGCGCTCAACTAAAGTGGAAAGTCGATAAATGAGAAATCAAGGCGAACGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAA:1 + chr3R 11097736 5' + mdg1 472 1 62.38 TAATTAAATCTGCGCAAATAACTTTAATAGATCAGCAATCCCACAAAGTACCTTGGCTTAACTCCTTAGCAAAAACTTCATTGTCAGAAAGTGGCTACTCG:1 + chr2R 5282299 5' - Tirant 246 2 58.42 GACCCTATCTAAATTATTTCGTTATTTAAATACACAACACAATAAAAACGCAGCACGAAAATTATGAGCAGTTTTCGAAAAATTCCGAGAAGGAAATAATG:1 + chr3R 14064512 5' - copia 401 1 79.21 AGTTATATTAGCACAAATCAAATCTCTTACAGCTATCATATGGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTCCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1 + chrX 20385028 5' + Bari1 41 1 58.42 TTTTCATGTGTGCGGTTGCCAAATGGGGAAACTTTAAGTTTTTGTAAACATCGATTTAAGTCAATTTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr3R 22167379 5' + P-element 56 1 68.32 AAATCATTTAAGGGACACTCACTCACGCACTTTTGAAAGCGAGGCTAAGACTAAGGCGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGC:1 - 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opus 289 2 66.34 TTAGTCCCATCAATTTACAGCGTCGAAAGCATTTGAAAACATGTTTCGAAACACACCTCCCACCCAACCGATCGAGGGGCGCTGCCGCGTATCGTAAGGCT:1 - chr2L 15093111 5' - Cr1a 4396 1 53.47 ATTGCGTACCGCTATCGTATCGTAAATGGATTAGGCCACTCCCCTATATCCGCTTAGCTGTAGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACATCCCAAT:1 + chr2L 16771592 5' + Idefix 54 2 69.31 ACATGCGTTGTAGACCAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGCAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAAAATTAACCCTTA:1 + chrX 1400351 5' + P-element 115 1 24.18 TTGCGTAACGCACACTTTTGTCGTCAACCTCCTGGTTTGCATTTGGGGCCGCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGC:1 + chr3R 19489924 5' + Rt1b 4951 1 55.00 ATTTATACTTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr2L 22319380 5' - Transpac 307 2 76.24 GAGGGAAAGCGTGAAAATCGTGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTATAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAAT:1 - chr2R 9668801 5' - rover 119 2 77.23 CTTCTGAAGAACTCAAGGCGACACACAGACTGTGTCCAGATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTT:1 + chr4 1084410 5' + Bica 4607 1 61.39 AATTAACTAAATTATTTCTACAACTTACGTAGCACATCATCCGCTTGAGCCTCAATGAATCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTAT:1 + chr2L 17965921 5' + F-element 4230 1 63.37 TTTTATGAGGGGAATACATATACGTTGTTTCCAGCCGCCTTCGCGTAGAGAAGGTAGTTGCACTTCCAGTAGTGTGTCACAATTACGGCGCGTACCACCAT:1 - chr2L 10496299 5' - baggins 46 1 75.25 CCAAANTAATTTGAGGGTTGGTCCTTGATTTTTCTTCTCCATCTCTCTTCGTACTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATT:1 - chr3L 15021279 5' - Doc 4372 1 57.43 CCACAAATTGTAAATATTTTTTTTTTTATTTTACCAAATATT:1 - chr3R 25866792 5' + Tc1 1480 1 71.43 AGCATTGCAGCTACCTGGTGGCGGACTAGAGTCGTTTAACCCAGCTGGAGAAACTAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTA:1 + chr3R 7933832 5' + F-element 134 1 63.37 ATATATATACATACATATATAAAATGTAAAAGGATTTCGTTGGCTGAGGCTGCCATCAACACTCGCTAGCTTTTGCCCTCAGCGAACGGCAGACCGCGTTC:1 + chr3R 25607727 5' + Doc 364 1 72.28 CGTGACTTTAAATGATATGAAATAAGGTGATGAGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3R 26404487 5' + 412 7096 2 67.33 AAGATCACAATCATTTAATTAACTGACCATTTTTAAAGACACGCGCTTGTGTAATCAGCTTTATTTTCTCTATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGT:1 + chr3L 15721886 5' + gtwin 6981 2 72.28 AATCACTTGAAAGGACCAACAGAGTTTTGCCAAATAGTTTGTCACTGTTTTTTTTTCCAAGTACATAACTATGTGTGTTTGCAAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 3927327 5' - accord 7032 2 53.47 AGAGTTGGAACATCCACATCCAGAAGGTTATTTTTTATTAAAATATCTAGCTATATTTGCTTCCTTAGTGTTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCT:1 - chr3R 21339113 5' - jockey 4621 1 74.26 TGCGGNTTCCGTTTGGGTTTTTGGTTTTGGTTATCGTAAATAGATTGACTTTCAGCTGATCGTGATTT:1 - chrX 6494039 5' + Gypsy12A_LTR 198 1 72.06 CTGTAAAAATCAAAACATGTTTAAAAGTCATTTAAAGTTAACATGTACATATATTCTTCTTTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGT:1 + chr2L 22196756 5' + INE-1 113 1 66.34 AGCTGCAATATTTGGTATATAACGCTTAGTTTTTGGCAATCCTGAGAACCATCACAGGCGCACCATGCACTATAGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTAGAAT:1 - chr2R 11129364 5' - hopper 1402 1 63.37 TTGCATGCCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 19510740 5' + roo 31 2 57.58 CAACGATCATTGGAGGAAATGCTGAAGAAGCTGGAAAAGTCACTCCCAGCCAAGATGTGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTT:1 + chr3R 24830727 5' - baggins 5080 1 57.43 ATGTAACATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3L 22564830 5' + blood 7054 2 72.28 CTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTA:1 - chr3L 11474691 5' - 1360 3284 1 73.27 AAAGCGGCATGTCGCCCAGGGGGCGTGGCATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:2 - chr2R 21937561 5' + 412 7070 2 62.38 CGGGAAGCTACATGGCGGGATTTTTGCAGTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATT:1 + chr2R 387980 5' - Ivk 219 1 79.27 TGGCTCTTTCTTTTTATTGCTTCTTGGTTGCGGGGTTGCTGAGATCAAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTAAAGTCAGAACAAAATACTCTGTA:1 - chr3L 4418060 5' - Cr1a 4187 1 51.49 CCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 9193604 5' - roo 358 2 74.26 GTGTCGCAGGGATTGCATGCAACGTCTGCGCTACTGAAGTCGCTTTTAACGATGCTTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:2 - chr2L 3621164 5' - 297 6957 2 67.33 CCATGTTGGCTCTTGGCTGGCGACCAAGTTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCT:1 - chr3R 7881438 5' + HMS-Beagle 7000 2 72.28 AATTTCCGCATTCCCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 15997861 5' + 412 19 2 60.40 CTAATTTGCAAAATGGAGACGAGCGAAAAAGAAAAAACGCTTGTTAACCAAAGCAGATGAGCGTTACATAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCAT:1 + chr2L 16654524 5' - invader4 2988 2 69.31 AACTCAATTCATTTACTCTCTCATCTGTCGGGCATCACAGATCTTTGTAAATCTTTTGTAATGTAAAAACAAAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCTCCGAC:1 + chr2L 21335332 5' - INE-1 568 1 52.48 CGAGAATCATCTGAAGCAGGCTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 23696614 5' + 1360 51 1 78.57 GCCAAATGCCGCCATTTGGGGTTGTGCCAATAAAAAAATGATATTTATGGTTGTAACGGCCGTTCTGTGTGTACGCCCTCCCCTTCTAAGAAGAAGGCTGT:1 + chr3R 16854691 5' - Burdock 6112 1 80.20 GCTCTCTCAATCTCAATCGGTCTGGCTAAAACTGTTATACCAAAACCAGTTTACATGCGCCGACGCGTATAACAAAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chrX 9599982 5' - P-element 2866 1 77.23 TTGGCCAGCTTGTAGGCGCTCTCCAGGTGCTCCACCTTAAAATTGTAGTCCTTCTGAAGGGCGTTGACGAAGGTCTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAG:1 + chr3L 16786339 5' - Chimpo 463 1 80.20 GATTCGCCATCCTTTTCAACAATCTCCCACGAGCCCGAAGTCGTTTGTCGATTTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCC:1 - chr2R 17037007 5' - Bica 405 1 58.59 GGACGGCAGTCCACAATAATATGGTTTAATTTTCTGACCTGGCTTAAATGTGGAGTACTCTTATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTA:1 - chr3L 9924943 5' - 1360 375 1 56.44 CGACCTGGACAACGATCTGCTCAAGCGGAAACTGGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGAC:1 + chr3R 18364114 5' + Bica 4896 1 68.32 ATTCATGGCTTTAATATTACTTTAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:2 - chr3R 9193637 5' + roo 8715 2 78.22 GTTTCGATTTCTTTTCATTTATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGC:1 - chr2L 12249664 5' - invader3 199 2 80.20 TCAGAAAATAAATTGAAATATTCTTGTTGACAAAACCGTACCGAATTCGGACAGAGAACTTTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGG:1 - chr2R 23214146 5' - Burdock 6062 1 63.37 TCGGAAATTCAGCTGCGTACATTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAC:1 - chrX 23004377 5' - invader2 5084 2 79.21 AGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 16252340 5' + pogo 37 1 64.36 TAATTGCTAAGATCGCTTTTAACCATTAATTGCGCCGTCGATGCATTGTTTATATTCATTTTTTTTTTCTTTTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATA:1 - chrX 11659680 5' - invader2 268 1 75.25 TAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 9193613 5' - roo 9013 2 82.18 GAAGTCAAGTTGAACAAGCGGATTCCACGCCAGCTTCCGGCAAGGATGGTCGAAAAACAAGTACAGATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTG:1 - chr2R 20731582 5' + hobo 329 1 73.27 TGCCGCCCAAATGCGAAAAGGGTTCATAACCGCACTTAGCTTCATTGGCCCTCCGTGTTGGCTCTTTGGCACATACTGTGTCCCCCACCTTGGGTTTCCAC:1 + chr3L 18316895 5' - Osvaldo 1287 1 66.34 GAGCTGTGTGAAGTGTGACCAGCCAAGTGAGTTGTTAGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACAC:1 - chr2L 1579082 5' - micropia 161 2 63.37 AAGTTAAGATCAAAGAATTTGATTTAGATTGCTAGAACTTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr3R 13494966 5' + F-element 53 1 68.32 GGTTTTCCAGATCGACGAGTTGCCTATAAAGTTAGATTGTTGCTTATTATGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr2L 6656268 5' + P-element 26 1 51.49 GTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3R 15072552 5' + pogo 9 1 67.33 AAAGTGACATACCCGCTGGAAGAGTTCGATGAAAGGAAATGAAGAAACTGAATGAACTGAAACTGAAATGAAGCTGGGACAAACACATAATGTGCTTATGG:1 + chr2L 7318197 5' + Tc1 1620 1 43.56 TATAATAATCATTCGAATTTCGTAGCATTAAATACGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 + chrX 12801454 5' - Burdock 217 2 62.38 AAAATGGCTGCAAATATGTAGCAGCTTGTATTTTTCTGAGCGAAAGTTTAGCATTTGCATATGTACATAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:1 - chr2L 9346255 5' + Transpac 4924 2 71.29 CAGGGAGTGGGTCCTGTCGTGAGGAGGTTGGTTGACGGAGGGGGGGGAGGGGAGAGTGTCCGACCATATAAAGTTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAG:1 - chrX 14398801 5' + INE-1 85 1 54.46 GCTAGCTGCTAGTTGCTACAAATTTGTCAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 16372419 5' + roo 8708 2 70.30 AAAATTTGAATACTAGATTTTCTCCTGCAAATATAGCTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr3R 17468409 5' - Transpac 264 2 72.28 GGGGTGGCAAAGTCCTCGAAAATGCAGAGGCAATGAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2L 19090117 5' + opus 37 4 65.35 AAAACAGCTTACCAAACTATAAATAATTAAGCTCACAAAATGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGGTGGACAAACTTGAAAATCCAGGTG:1 - chr3R 5079871 5' - GATE 294 1 62.38 ACGACATGGTTTGGATTTGGAGCCTAATTGCACTCGGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 - chr3L 3484604 5' - diver 180 2 67.33 CTATGTGTATATGTACATGTATGCGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTA:1 + chr3L 17858147 5' + HMS-Beagle2 6897 2 64.36 ATACTGGGAACAGTTTCAACAGCTCTCCCCCTATGGGAACACTGGATCGTTCCCCTGTCAGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTT:1 - chr2R 7147122 5' + Max-element 108 2 62.38 TCTTCGCCGCTCTTCGATTATTATCGTCTTCGTCAGCGTCCCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGAG:1 + chr4 527592 5' + Rt1b 4909 1 63.04 TACTTAAAATAAATGTAATTCTCACTTATACATACATATATACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTC:1 + chrX 8299677 5' + roo 33 2 58.42 AAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAAT:1 + chr3L 20224144 5' - Chimpo 161 1 54.46 CGCTTCCCCTCCAGCAGCCGTCTCTTTCTCTTGGCCTGGTCTACTGCATCGCGGCTGTTGCTAGGCCACTTCCCTACACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAAG:1 - chr2R 11182761 5' - gypsy8 9 2 57.43 GCTTAAGATATCGTTTTATCTATTTTTTTACGCATTAATGTTTAGCTTCATCCAAGCGAACTGTGGCCGAGGCAGATTCACACGTCGGCGATCGAA:1 + chr3R 30787023 5' - F-element 15 1 48.96 ATTCCCAATTACTTGGGTTCTTGGGCCCCAACCGCAACTCACCTGTGAACTTGGCCACGCCCTTGAAATTGATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTA:1 - chr3R 13461186 5' - Ivk 398 1 75.25 AACATCTGCAGTGGCAGGCAAGTTGGTGATGGAAAGAAGGAAGCGGGAAAGGGGGCAACTAAGTGGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTT:1 + chr2R 18257573 5' - F-element 356 1 77.78 AAAGAGCCCAAGGTCATTGGGGTCTCTTCCGAATACTTCCAAGATCGATCCATAGCACCTACTTTGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTC:1 - chr2L 9728099 5' + invader1 467 1 64.36 ATAGCTCGCCTGAAATCCTTATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCACGCAGCA:1 + chr2R 13964301 5' - accord 7182 2 78.22 GCCTCAGCTGTATCAGTTAACTCAAACTCAAAGATACACAGCGCAGATTACGTAAATATATTATCCAATTGGGTAAGAGCAGATTAATATTGCATGTGCAT:1 - chr2L 21025480 5' + invader3 5076 1 58.42 CTTGGCGCAGCTGGATTAAAGCTGGATATACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTC:1 - chr3L 27392170 5' - invader4 2771 2 70.21 CATCAGCGGCAAATCTAGTCCCGGTGCCCTCACCTCGGAGAGCCAGTCAATTCCCACTGGTAGACTAAACATCCATTCCCTGATTTAAACAATTCCTTGCT:1 + chrX 1447133 5' + Idefix 7021 2 55.45 GCTCGTCGCTCGGCCTCGCCGTTCCGCCCTGCCAGGACGACCCGTGCCGGCAGCGAGCCGTACGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCG:1 - chr3R 15174323 5' - HeT-A 5731 1 70.65 GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr2R 981624 5' + 1360 2 2 62.38 ATCGGAGTTTGTGCTTGTGTTTGATAATCATGTTAATCAATGGTTTGGAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTA:1 + chr3R 4656789 5' - I-element 156 1 55.45 CAACTTCTGGGGGCTTTAAATTAAGCCTGGATTTATAATTCATTGCCAGCTGCCGCTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTGACTGTTGTTGTTGTGTCTGCTGC:1 + chr3R 30358994 5' - TART-A 121 2 64.36 TGCTANATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3R 20140583 5' + jockey 59 1 76.24 ATGTTGCCAGTGTTGGGTGGGCATGGCCCAAGGGTTGGGGGGCTGATTCCTGCGGGTTATATAAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTG:1 + chrX 13559551 5' - F-element 352 1 66.34 ACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 697493 5' - roo 355 2 78.22 CAACCGATAAAAACAGAGCTAGAGAACATTGCAGGCGAGATGCAGATTCAAGGAAAATGGGCTTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTA:1 + chr2L 21254171 5' - Circe 120 1 51.49 AGCAGCAGCGACAAGTGGCCAAGAGGATTTGGATGTGAGGGTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACACGTTTTATTTG:1 + chr3R 31936213 5' - Doc3-element 4459 1 81.19 CGCATGACTTGACAATTTCTGTGACAACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATC:1 + chr2L 3621088 5' + 297 39 2 71.00 GTGCTGCAAACGTTTATGATGAGTGGGAGTAGGAGTTGGATGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTTTCA:1 - chr2L 6299117 5' + F-element 266 1 59.41 CTGCACGGCTATGGAATCCGGTGCACGCCAAAACAAATGTAAAACAAGAGAGAATGCTTAAGTCGAGTTGCACGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chr2R 15493878 5' - INE-1 543 1 70.30 CAAAAATAATAGTAATGCTCTTCGTTAAATCATTGATTTTATTTTTTGAGGAGATAAGATACATCAAACGAACATTCTGCCAAAGGGCCAACAAAGCTGAG:1 - chrX 20723526 5' - roo 8638 1 77.23 TGCCGCCTGTACAACTCCGTCGGTTGCTTTTATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 4455546 5' + pogo 2022 1 69.77 GGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 25360929 5' + jockey 33 1 53.47 TCCTAGTGTTTCGTTCGTGTGCGTGTGCCCGTGTGTGTCTACACCATGATGAAATAACAAAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAA:1 + chr3L 5691240 5' + P-element 193 1 43.56 GTGGTATGCATTTCTCATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr3L 14005645 5' + F-element 28 1 50.50 GATTAATTTTATTAAGTTAGTTTTCTTGTATTAATTCATTCTTTTAACCCATTCCTGCTGACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTG:1 + chr2L 1632327 5' + I-element 317 1 40.59 ATTTTTGATTTAACTGAAAAATTCTGTTATATGCATTGTATTTTTTTTGCAGGAATGTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 6247327 5' - roo 390 2 61.39 TGCAGTCGATTAACTACCCAACCGTCGCCCGGTCCAACTTCAGGGTCAATGGCTTTACCCTACATACTGCCAACCATCCGGGTGACAGCCAACACGGAAGC:1 + chr2R 23966380 5' + G5A 192 1 69.31 GCCTGCTACGCTGAACGTTTTGTCAAAAAGTTTTTGTTTTCTGTATTCCGGGGTGTAGTTGTTTTAATTAGGCTGAGTCTATGTTGCAGGCGCTGGATGCG:1 - chrX 16452868 5' - HeT-A 5652 1 44.55 TTATTGCGATAGACATTGGGGAAACACAACATTGCAAAGCAACGCAGCAATGGCAACCAAAAATATTAAAATACCGCAGGAATTGACTGCGGGAAATGTCG:1 + chrX 13730934 5' + baggins 434 1 62.38 TTTATATTGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTT:1 + chrX 23291015 5' - Stalker4 387 1 55.45 AATTTATTTGTCTGCGTTTAAGTTCAATAAACGCACCAAAACGGCTAGAAAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTT:1 - 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mdg1 7450 2 70.30 AGCCATTTCGGACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTG:1 - chr3R 19446530 5' - gypsy12 10169 2 53.47 TGATTTAGAAAGAAATCCGATTTATTTACAAAATTCTAAGTGGTAATCGAAACTAATTTCAGTGCTATGAACCGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCG:1 - chr2L 21728619 5' - R1A1-element 5333 1 77.23 GTCAATTCAAAACTCTTCAATCGCATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr3R 24661915 5' + jockey 59 1 76.24 TGTGCCGCCTCCTTTTCGGATGGTTTTCCTTATCCCATCGCTTATTTGGTGGCTCCACCTCCTCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAG:1 + chr2R 15850534 5' + F-element 476 1 66.34 TTGAGTATCTTCAGTGGATTGAGGAGCTGCAGCAGGCTGGGTAACATCAGTTGGTGACTCCACTTTTTGGGGACCTTGTGTGAATAAAAACAAGAGACGAG:1 + chrX 1159938 5' - 1360 3240 1 81.19 TCGGAATCGCATTGGCAGACTGGGATTATTAGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCG:1 + chr3L 8210239 5' - F-element 258 1 69.31 TAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATATGAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAA:1 + chrX 14625484 5' + invader4 2798 2 67.00 TTCCCCTGTCCAACCCTTTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTACTTAAGGGGTCACTAGAGCCATGATCTTAAGGATGGTCATAGGTACGGTAGGGC:1 - chrX 820463 5' + Gypsy12A_LTR 1951 1 81.19 GCAGTTGTTGTGCTGTTCGCCAGTTTGTTTATTTAATGCTAGTTTGGGCCAAGTTTTTTGTGGCCCCCGTGCGTGCAGAAAAGGCTGAAAAAGTGTCAGAA:1 + chr2L 10586170 5' + Tc1 1580 1 60.40 GATTCTCGGACAGTATATGCACATGATAGGGATCTTCTTCGCGTTCGTTCGGGACTGCCAATCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTC:1 - chr3R 7174650 5' - Rt1b 4953 1 56.44 CATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 13824370 5' + roo 52 2 76.24 TTCTATTTTATGTTTGAACCTAACAACCAACCAACCGCCAAATCGAACTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAG:1 - chr3R 5761494 5' - Stalker 310 4 55.45 CCAATCAAATACAAATTGCTCTAGTGCCAACGGAGTTCAGCGCTCTGCGCTACGAACGGTCAGCAACAGCAATTGGACACCCCTTATCCGGGGTACCAAGC:1 - chr3L 12349484 5' + gtwin 7046 2 74.26 AAGTCTTAACAATCGATTTTAAGCACTGATTCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr3L 9864593 5' + P-element 45 1 34.65 CGCCTTGGCACCCCGAAAGCTTCATTAAAACGAAAATAATGCAGAAGAGGGGAACTTGGGGGAGGGGGGAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAG:1 - chrX 13475381 5' - G6 253 1 60.40 ACAGGCGCCAAAAGACGACGAGATTAAGTCATCGAAGCGGCAATGTGAACAAGACGATCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCG:1 - chrX 14636149 5' + Doc 282 1 63.37 ATCGGACTTCAGTGCCATTTGCCGTCCTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2L 1517724 5' - roo 8991 2 74.26 CAATCCGTGGGGGTAGATGTCCACGTGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAAGTTTGTTTACGTTTAACAAATTAAGTTATATTACAAAAAACATTGAAA:1 - chr3L 79231 5' - HeT-A 5796 1 78.22 CTGTGGTATGCGTTTCTCATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr3L 14005647 5' + F-element 26 1 50.50 CTTCATGCTTAAAATCATGCTTCAAATCTTAATTAAAAGCCTATCTAAAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCT:1 + chr3R 21809251 5' + F-element 4323 1 52.48 CTCAAGCAAATGTCTCATTTCCTGCAACAATTGACTCCATGTTGCCACGCCTACTGTAACGCCCACAAGCCGCACAAAACTCCCACGCCCACACTTTTGAA:1 - chr2R 25216721 5' + INE-1 249 1 59.41 TTTCTTGCTCTGATCCCCACCACTCTTTCACCCAACGATCAACAGTTTTTATACCTGTTTGCTCTGCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATG:1 + chr2L 2175546 5' - I-element 312 1 73.27 CACACAGATACTGCGGCACGCACACAATCACCTCACATCATCGTGGCATATCCTGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTT:1 + chr3L 6367517 5' - X-element 4496 1 59.41 CTCGCCACGTCAGTCACGTGCCCCACATAAATAATTCAGTAATTATTTCTGCACACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGC:1 + chr3R 27384036 5' + Quasimodo 54 2 70.30 GTCAAAGCCAAAGTGCAATGTCCGTGATGTATGCGGACTGGAGTGGGTTTCCAAAATGTGTTGGTAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCATAATTCTAA:1 - chr3L 13133295 5' + invader1 262 2 76.24 CTGATTAAAGGCTTAAGTTTTCAGCTCTCGATTGAAAATCGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 11240952 5' + roo 35 2 63.37 TTTCGGACTGAATGTTATGGTGGGCAACTAGAATTTTATCGTCGGTTCTTGCCGTACAATATGGCGCAAGCAATTACAAAAGAATCTCTAAATTGTCGGCT:1 - chr3R 19449583 5' + Q-element 114 2 68.32 TCGACGTCAGCCGGACTCTCGCCCACATACCCGAAATATCCCTGGAACAACTTCCACATGTCGCCCTCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCA:1 - chr3L 4981050 5' - invader4 2686 1 50.50 GGTCTTGATTTTGGGTTTATTAAAGATTGCCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 21908903 5' + roo 8710 2 71.00 ACTAATGTGATGTTGTTGGTGTCGGAGTTAGAGTTGGGGTTTTGCCGTTTCATTATTTTTTTAACTTACGGTAGAAAAATTAAAATCTTTTAAAGATACCA:1 - chr2R 15202620 5' - Rt1b 5109 1 66.34 TAGAGGTATACTAAGATAGCATTTAAGCACGTGTAGTTCTGAGTCGATTTAATTTATATTATGTGCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 21293026 5' - roo 398 1 72.28 GGATTTCAAAGGAATAGCTTTTAGATTATTAATTCTGTTAAATATTTTCATACATACATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 + chr3R 20595783 5' - S-element 1702 1 59.41 TAACGCTTTTAACGACTTTAAGGGACCCAGTCTGCAGTTTGAATAAATGTTATAACTAAATAAAATAAAACAGATTAAAT:1 - chr2L 13731341 5' + TAHRE 35 1 80.00 GTAAAGTGAAGCGAAGTTATGCCTTCTACGTGGCCGCTGGCAACATGGTTTCCATTTTTTTTTGTTTTTTATTAACTCACGGGAATTTCTTGGGCACAATT:1 + chrX 6422779 5' - HMS-Beagle 365 1 65.35 GATCTTGCCATCGGCGATGGCCGGATCGTTGAAGTTACGCAGCTGCTCCGTTGTTTGGTGACCTTTTTGCCACTTTTTCTTCAAATGAACCCACAAATTTT:1 + chrX 17287012 5' - S2 1250 1 59.41 TTTATCAAATTTATAAATAAATATCGCCAAAATTAACTAGTTGGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTC:1 - chrX 22867422 5' + HMS-Beagle 2 2 73.40 ACATTTCACTATTTATCTTTTTATTGCGGTGCAGCTTGTAGTGGCGCCGATCCACCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGA:1 - chrX 5646025 5' - roo 8637 1 59.41 TTAAGGTATGTTAAGATTTCATGTTAAAAAATCTTACACATTTTCTTATGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGT:1 - chr3R 25924668 5' - mdg1 7339 2 51.49 CAATTTTTTTTTTTGTTTTCTTTTTTGCTCCTTTTCC:1 - chr2L 15813967 5' + S2 245 1 89.19 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAACCAACTACCGCGCGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAG:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 7600 2 55.45 TTATTTTCTACAATTACCGAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAA:1 + chr2L 17426199 5' + Idefix 7159 2 81.19 AAGGAACTGGTCCGTTGTTACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr2L 1353788 5' + I-element 22 1 57.00 AAACCAATTATGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAT:1 - chrX 21247599 5' + blood 7179 2 71.29 TTACCTTACATGCTACTAGAAAGTATGCAGTGGAATTTTAACACCTCATTGCTCAGCCAAAAATAAGCCAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2L 13842267 5' + jockey 4711 1 64.00 ATGCGAAATTACATGTGATGGGAGGATGTGCTTTGTGTTACAGAAAGGCATTGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCAT:1 + chr3L 14591571 5' + F-element 4332 1 56.44 GGGGCGCTGACAACTGCGAACAGGTGGCTGGCAAACATTTACGTAAAGTGTTCGTACCATTACTGCCTTTGGGATGGTCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 - chr3R 17458873 5' + blood 164 2 82.18 TCGAATGTGCAGCAATATTTACACATTCAAAGATAGCATAATAACCGCATGAACAACTCATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAATATTGCTCTCTTTC:1 + chr2L 18373234 5' - 1360 3316 1 69.31 GCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3L 5827872 5' + blood 18 2 59.57 GACGACCCATCTGCCTCTAATTGTAGCCCTAAGTAATCGAAGGCACTTTGCAATCGCACATTTGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCT:1 + chr3R 14309582 5' - Circe 7147 1 55.45 GATTAACTCGTTTAATAGATTGTCTAATACAAATGATTGGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGT:1 + chrX 12885961 5' - F-element 4242 1 61.39 ACCCAAAAACCTATTGAAGGTAGCGTTATGGCATTGCCAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTGCGTGATTTCGTTGGTAACTGATGGGATATTTA:1 - chr3L 22925106 5' - F-element 4401 1 60.40 CGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678155 5' + Osvaldo 18 1 68.32 GATCTTGTGCAGGCCGTACAACACTTCAACAGAACGGGGAAAAAATGATTAAAACGATAAAAAAATATCCAAAAGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGT:1 - chr2L 3391415 5' - INE-1 248 1 51.49 AATGAGTTTCTAAGCCAACCAAGCTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chrX 11449096 5' + FB 51 1 78.00 ATAAGCGCATTACAATAAATTTAAGGATGACTCATTACGGGTTTCCAAATTTCAACTCAACTTCCTGACGGCCCATACTATTGCTAAACATTCCTTTTCCG:1 + chr3L 22505169 5' - Osvaldo 56 2 61.39 TTAATGGCTTAATTCTGTAGATTTGCATAATCTGTCGCACGTTTTATCGATGCTTACACACTAAATTGAAGTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGA:1 - chrX 12948976 5' - Doc 4399 1 73.27 GCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2L 6605570 5' + blood 7055 2 75.25 GGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTAGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr4 868701 5' - roo 360 2 75.26 ACAAAAACTGACAAAATGAAATTGAGAAGAGGAACTAAGCACACAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAA:1 - chr3L 13374612 5' - Cr1a 197 1 59.41 CATAAAAATAATGAAAAGAAGGCAAACCAAACTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAA:1 - chrX 17031877 5' + F-element 4312 1 75.25 AATGATGCCAACTCCTCAACCGTAGCATTTATTGCGCCGGGACCTCCACAACATACGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGT:1 - chr4 1022907 5' + Idefix 222 2 53.47 CGCCTCCGAAACCGGACGGACAAACAGCCGTAAGCCCTTCCGGCCGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGA:1 + chr2R 16060020 5' - Circe 7239 2 54.17 CCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 + chrX 17049556 5' + Stalker2 7289 2 62.38 CAAAATGAACTCCTTTGGCTTTGAGCAGTGATGGGGAGCAATTTGTACTCCGCTTTTTCCACTCGGCTCGGTTCATAGTAGATTCACTAGAAACTATATAC:1 - chr3L 8217997 5' + Cr1a 4118 1 74.26 TTCCCCGAGTTTTTCTGCTGTCGCCTTTTAATTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2L 7843135 5' + 412 27 2 60.71 AAGTGGCAGTTGGCCTTGCCGGGCGGACGCAACAGCTGCGTAGGTGAAAGCCTTTGGTGGCTGGCAGATGCTATCCAACCAAGTATTAGACCCTAATTAAC:1 - chr2L 3938838 5' + HB 1341 1 63.37 AATTATTTATCCAATTTATAAATAAATATCGCCAAAATTAACTAGTTGGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTC:1 - chrX 22867427 5' + HMS-Beagle 6800 2 75.25 GTTCCGCCCGCTTTTCTCTAATCCAGTGCCTTCATGACCGCCATTAGCTGGCAGGAAAAGTCTCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGA:1 - chr2L 2017086 5' - R1A1-element 4888 1 71.88 AATATGTTTGGAACAAGTCTAAAAATATTATTTATTATTATACTCAACTAAACTGTAACGTGTAACGAATTAAACG:1 + chrX 20349306 5' - gypsy12 10196 2 64.47 AAGAATTCCTCTAACAAGGATCTCGAAAACCTAACAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGATTGATCGTCCGCTCACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCA:1 + chr2L 19020962 5' + springer 39 2 72.28 ATAGACACATACACACAAGCGCGAGCGCGAGGGGATCATCATGCTGGCGGATGACGGGTTCCATCGGCCTGCTACCGTATCCATGGTCTTAGGAGCAGACA:1 + chr3R 28451370 5' + GATE 8064 1 67.33 TGTTTTTTGCTCTGTGCTCGTAAAGCAGCTGCAGCAGCGCCACCTTCCGGCCGTTTTGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGAG:1 - chr3R 10539027 5' - Bica 489 1 53.47 GAAGGCACAGAATAGTCGGCCAAAGTCAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCTGCATAGTGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chrX 184016 5' + 1360 6 2 50.00 AGTTTTCTCGAATTTGTTTACGAATCGAAGATGCCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 + chr2L 6929365 5' - 297 6939 2 67.33 GGTATTAAAATATAGAGACCAACGAAAAAAAGAGCGAGCAGCAGACACATAAATCTCGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATAC:1 + chr3R 18741887 5' - 17.6 156 2 62.38 ACCCACCTCCAAAGAGGCGAATTAACTTGCCATCCGCTCTCTGTTTATAGATACGGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCAT:1 + chr2L 19035910 5' - I-element 5057 1 60.40 GAAGTATGCAATAAATGACCGCTATCTATGGTAGCATACTTTTTGACACCACTTAAATCCAAAAGTCAGTTGACATACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 31270924 5' + jockey 9 1 39.60 TGCTTTACACGAATTTCGCACGGCGCCGGCGCACTTTACATCCATGCTCGCCATCTCTCTCGCACTCCTTCGCTCTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGG:1 - chr3R 21821866 5' - invader3 468 1 74.26 ACTATTTTAAAACCAGAAACAATTTGTTTTAATCTCTTTGTTATTGTAACCATTTTTGTAGATTGAAAGAGTATACTAGATTTGTTGAAATGTATGTAACA:1 - chr3L 11653658 5' + INE-1 16 1 78.22 TACTTGTGCACGACCAAAGAAGATGGCGCCCACACACATGCTTACACACTCTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 + chrX 11042513 5' + jockey 4701 1 55.45 AATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATT:1 + chr2L 22315560 5' + frogger 2294 2 48.51 GAAATGTTTATTCTACGGCGTGGAATTCTTTACCCACTGCCATGATTTGTGCATTTAGAAAGTATTCTGCCACTGTATCGACTTGTATGTCTCCCAATTTG:1 - chr2R 22153117 5' - Helena 1228 1 70.30 AATTAAAACAATATTAGTATAAAGCACATTTAAAAAGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr3R 26404538 5' - 412 7507 2 63.37 GGTGTTAATTTCACTGGTGTCGAGCGGCAAGTGGAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 19510829 5' - roo 397 1 67.33 CTTTTNCCCTCGCCTGACTCGTCGTCACCAGCTGCAAGGATATCTGTGTGTCAGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 24545644 5' - roo 9051 2 56.00 TCCAANCGTCTGTGTGTGTCTTGGCTGCATATTGACAATTTGATACCAGCTTGCGATAGATGCGGCACAACGCATCCAGCTCGTCCCTGTTCGGGCGCCAA:1 + chrX 20589263 5' - HMS-Beagle2 331 2 79.21 GATTTAACTCGCTAATTTATATTTCAGTTTGAATTGTAGATTATGCTTGCTCGCCCCGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAA:1 + chrX 15987166 5' + Cr1a 62 1 57.43 GTATACGCATAAATAAAAATAACAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAACAA:1 - chr3L 5608806 5' + I-element 415 1 77.23 TAAAGCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTT:1 - chr2L 3245017 5' + rover 6969 2 62.38 CATCTTGTCAATATTGGAAAGGAGCATCATACATATGCATATATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACC:1 + chrX 19885168 5' - HMS-Beagle 7015 2 54.46 AAAAGTAATCACACAAAAAAAAACTCACAAATTAAGTCCATTTTTTCCTATCTATTGATGTGCCAAATGAACTAGTTGAGTAACGGGTATCAGATAGTCGA:1 - chr2L 10682732 5' + INE-1 551 1 67.33 AGTATGCTAGGAAAAATCCAGCACCTTTATTATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 13280156 5' + jockey 36 1 54.46 AAAGTATGCTAAAATATATTACAAAGTTGCAGGATATCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:2 + chrX 13401483 5' + jockey 22 1 56.44 TAGCAGTCAGCGGCAGTTTCTTGGCCATGTTTAGTCGGGCCAAGACAGTCTCTCTGTTTTTTTCTCAAACAATTTTATTTTATAGCCGACCGTGAATTTTG:1 + chrX 3521022 5' - HMS-Beagle 402 1 62.38 AGAACATCGTCAATAACGTTAAGGAAATTATGGAAGAATACAGTTTGAATTCAAATATCGATAAATATATTTCTGTTCCGCTTGTATGGAGCAGCGGCCAT:1 - chr2L 22983849 5' - Transib5 2968 1 66.34 TAACTTCGGCACTCGGGCAAGTTCGCATATATCGTTCACATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr2R 20698414 5' + P-element 39 1 37.62 AGTACAGTACACTCACACATACACTCGCTTACATGCAACCGAGTCGATCTACTCATGTCCGTCTGCCTGTCCTTAGCCCACGATTTTCTCGCCGTGGCTCT:1 + chr2R 8668925 5' + 1360 51 1 64.36 TGCAGCTCAACAGCTAATCGCGGCTTGAAACAGATCTCCGCGTGACGCAGTTGCCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGAG:1 + chr2R 8949266 5' - R1A1-element 4960 1 59.00 GTATATACTTGATATAAGCAAGTACTGGGGGCTCTCGTATTTTCGGTATAACTTAGTCTTAGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTCTTTTCTTCTTGTTTGT:1 + chrX 17949308 5' - mdg3 5095 1 71.29 CAGGCGCCACAGAAGGCGCAGCTCTTGACTCACACTTCGAAATGCACGCGAACAGCAGCCACATCCACAGCAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTC:1 - chr3L 1905199 5' + 1360 3221 1 79.21 TATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATA:1 - chrX 1018111 5' + 1360 239 1 73.27 TGCTAATGAAATCAGCACGCGTTTTGAAAGTCAAATTGTTGGAGGTTTAAGTGAATTTTAATCGTTAAGCTTTGTTTCGCAGGGCTGTATGGTGTTGTTTT:1 - chr2R 14268464 5' + Cr1a 243 1 76.24 ATTAGGAGTTGCAAGCTTTTCATTCCATTTCCATTTTCACTTGCAACTCCCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTT:1 - chr3R 24453798 5' - P-element 195 1 52.48 AAGGCCACTCGGTTGCCCTTTTCATCCTCCACCACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGA:1 - chr3R 30463111 5' - invader2 5018 2 68.32 TCGGATACACCTAAACACCAACCTATTCGGATACACATATGAGCATGTTGCCTCCTATTATGTGTTGCCATTGTGGGCTGGCGCGCATGGAAGGCCAAGAG:1 + chr3L 11356643 5' + gypsy2 6394 1 57.43 CCCTCCATACTTCAAGCTCACTCAAAGATGGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCC:1 + chr2L 15511250 5' + accord 7319 2 70.30 GTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAA:1 + chr3R 4160061 5' - invader2 5095 2 66.34 CAAGGGGAGGAACCCTGGACAAGGATCTGGGCACACTCACTCTAGCGGAGGGAGTGCAACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTAATTGG:2 - chrX 3892722 5' + Rt1b 4975 1 52.48 GGTATGGCCACCCTTTTTTTTTATTACTTCAAACATACGGTTTGGTAAGGAATCATAATATAAGGCAATGTTTTAGCATTATTTGGTATTTGGTATGGCCA:1 - chr3L 27358501 5' - Tc3 1426 1 58.42 TATATAATGACAAATGTATCAGTCAGTATGTTGCAGGAGTTTTGTATTTTTTTATTTATACTTTATACGTGGTAGCTGAAAACTCCTTTGTCACCTTGGTA:1 - chr4 719800 5' - BS3 1727 1 74.26 CGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:2 - chr3R 12578166 5' + jockey 56 1 73.27 CTCGCCGAGATGTTCGGCAAACAAAAAACGAGGAGCAGTCCGCTCAGCTGTGGTACCGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr4 907656 5' - 1360 3373 1 56.44 AAACAAGTTTGTTGTAGCGCCATAAAGTGTTTTGGCACACGATTTTTTCGCAGTGGCTCTAGAGGTGGCTCTAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCG:1 + chr3R 7794429 5' + 1360 92 1 74.26 GTGCTAAGAGCGAGAAATCTAATCAGACTAAATCAAGTATAAGTTCGATTAACAAAACAAAAAACAACTCCTACCTCTCACCCACATATCAAACCACACAA:1 + chr3R 4935782 5' + Porto1 289 1 55.45 CTACAGCCGCATGCACATCCATCAGATACTTTATATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATC:1 + chrX 10539845 5' - blood 254 2 70.30 GGCCATAACCATTAGCCAGCTTCATTCACAGATTCCAAAGGCACACACGAACATACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTA:1 - chrX 9460600 5' + 3S18 6056 2 60.40 AAAAAATGAAATTAAATTAAGCTACTTAATATCGTTCTGAACCAGAACGTATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:2 - chrX 2766851 5' - mdg1 416 2 71.29 CCGTTCCCAGTAAATAACCTCGATTCGAGGCGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr2L 6644332 5' + hobo 2 1 61.67 ATTGGGTAAACTTTTATATCTTTATCTAGGACTTTCGCCAGGCATTGGTTCAGGGAAATGGGTCTGCAGGATTAAGGCTGCAGGTACAAGTTGACGAAGGG:1 - chr2R 4581465 5' - Chouto 6077 1 71.29 TAAATCACATATTGTGCAATTTTATAGAACTAGCTCAGTAATCCCTATCCATAAGCAAGGAGCAGACAAAAAACGAATGGGGAGAGCTTGAGAG:1 - chr3R 852253 5' - Doc3-element 444 1 78.72 ACATTTGGCACACATGACAAGCGACATGTGTTTCTGATATGCCAATAGCGAATGGACATGTCCGCCCCACATTTTGTTCTCTTTCTTTGGTCCAATTGCGT:1 - chr2L 1568511 5' + Tc3 56 1 72.28 TAGGGCATTAGTCTCAGGCCCTTAACCCGAGCGAAAAGAGACGATAATTTGCCATTGTGGGCTGGCGCGCATGGAAGGCCAAGAGGTCCGCAAGACAACTG:1 + chr2R 23781991 5' + gypsy2 6410 1 57.43 GAAAAATGTTAGCTGTGTGCAGTTTTTTTTTTTCGCCAGCTTTCTTCTATATTTTTATACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGA:1 + chrX 3113682 5' - invader2 4697 1 64.52 GAGGAAACAGGAGGCAGTTTTGTTTTGTTTTCGGATTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chr2R 9916392 5' + Tirant 4 2 39.60 AAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTT:1 + chr3L 24213796 5' - invader2 5057 2 73.27 ACAAAAGTATGCTAAAATATATTACAAAGTTGCAGGATATCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 13401480 5' + jockey 18 1 60.00 TTTATTACCACTACGAAAAATGTTGGGAATGTTTCGGGCGCCTGGCGGTATGCACCATTTTTTCTCCGCCGACTTTCGCAAAAGTGTGGGCGTGGAAGTTT:1 + chr2L 2317635 5' - INE-1 246 1 73.27 AAATAATATGGAAGTTCCTCTCGAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAA:1 - chrX 16417503 5' + invader4 352 1 77.23 TTTACACAAAACGTAGGGCATTTCGCCATAAACATTGATGGTGTCAGAGTTCAAGCTTATTCACTTTATTTATTGTCTTTCATACACCACTATACATACAC:1 - chr3R 15894102 5' - invader5 184 2 77.23 TCTCATTTATCAAAAGCGTAGCATGTCGCTACAATAATAATGTGAATTCAAGCAGCCAATACGAAGCACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGA:1 - chrX 22679389 5' - Dm88 400 1 73.27 TCACTGGCACCAAAAATTATCGATGTAATTCATGGCATTCGGGAATGCAGCTAGCAGTTGTTCCAACCGGAGCTGAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATG:1 + chr3L 25729447 5' - Cr1a 4340 1 79.21 CCATCGCGTAATTGCAAAGTTGCAACTTGCAACTTGTTGCCATCGCTCTTTTTTCAGACAAATGCAATTCAAACTGCAGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACG:1 + chr3L 10284792 5' - Gypsy6A_LTR 88 1 57.43 GAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 25360921 5' + jockey 36 1 54.17 TGTGGCGTATCACGAAACGGTTCAAAGCTCAGCCCACCCCAAAATCAGCAATCAAAAATCCGTCTGGTGGCTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTA:1 + chr2L 13842434 5' - jockey 4735 1 79.21 ACAAACGCACCTTCTCCGGACGCACGGTGACCTTGCGACCGCGCCAGTCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGTCTCGATCTCAGTAACTATAAATGCTA:1 - chr3L 8976121 5' + INE-1 151 1 53.00 AAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr3L 5827902 5' + blood 55 2 76.24 GGCCAGCCAGGAGTTTCCACCACCACATCTAGCAGCGAACAGCGCTTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 + chr3R 13878210 5' + opus 177 4 67.95 AGCCAGCAATTAAAGCCACGAGTGCTCGCATGTGGTTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3L 22324126 5' + hobo 3 1 74.26 GAGCATTACTTGATTACCCGCAATTATTGTTACTGCTCCCAGACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTC:1 - chr3R 28449951 5' + 1360 3256 1 59.41 CGACTTGTTAAACTTTCGGTAAGACAAATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCC:1 + chr2R 21094533 5' - 297 6594 2 69.15 GTCTCCAGAAGCCCAGCCACGGATATAGTAGTGATGAACTAACAGTACAACTATTGAACCTGGACCCGAACGGGCCGTGCGCAAAAGGGGAAATAACGGGA:1 - chr3R 7802095 5' + gypsy8 311 1 66.34 GGGGGGCCTTTATTTACACGTAGTTTGCGGTATAAACTTAATTTTACTTCTTTTTGTTCGTTTCTTTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTCATTATGTTTCG:1 - chr3R 22580867 5' + accord2 7283 1 57.43 GGAAAAACGCTTGCAATAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATT:1 - chr3R 24437719 5' + gypsy6 43 2 67.35 TTGTGCTGCCTGTGCCAGTGTGACCAGGTAGCGCGGTGGCTAAAAATAGTCGCTAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGA:1 + chrX 10212375 5' + F-element 108 1 60.40 GAGCGGAGCAGTGGAGATCAATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAAT:1 - chr3L 9388986 5' - accord 6948 2 80.20 GGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTGGCCTCGGTTTTGGGTTTCGTTTCCGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1 - chr3R 14832474 5' - blood 349 2 53.47 ACTAATAAAAATGTCAAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTTGGCAGTTTTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGA:2 - chr2L 22063436 5' - INE-1 146 1 47.52 CCAACGCCAGGGGCACTGGACAGGCACTATTTATCTGTGTTTTTGTGAGGATTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr3R 22831090 5' - mdg1 398 2 53.47 TATCTAGAGCATGAAATCCGACTGACCGCCTCACTGGAAACCAACTGGACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3L 3255045 5' - 1360 3364 1 54.46 GGGAACCACACCAGTTCCAGCTCGAGTTTCACCCAGCTGCACTCCAGTGCCAGGCCCTCGACAGCCAAAGATCACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACC:1 + chrX 22874240 5' + blood 268 2 74.26 GAACCGATTGTACCAGCGGGACTATCGGGACCGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCG:1 + chr3R 5661538 5' - F-element 445 1 68.32 TATTACATATACATATCTCTTTCGTATTAATACCGAGAATCCTTATGTTTCTAACAACATGACCTTTTGACTCTTCATCACTTTTAATTTCATCTAAATTT:1 - chr2L 10388426 5' - G4 415 1 59.41 GTGCGGTGTCCATTGTGGGCGCCACAAGTGGAGGGTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGATCCCCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 - chrX 18718559 5' - INE-1 87 1 65.00 AAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCGC:1 - chr2L 23390134 5' - rooA 7470 2 51.49 TAGGTTCCTAAAACTAAACGCAAAAATGATACAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGT:1 + chr3L 894063 5' + G2 196 1 69.31 GTTGTNATTGTTATATTTTAAATTGTCATTAAAACCAATTGATTCATGGCTTTAATATTACTTTAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 9193678 5' + roo 8674 2 68.32 GTTGTTTGGCTGGCTGGCTGATCGGTTTCAAAAACCAGATTGCAGTTGTGAGAGAGGCAGCTGTGCCTGAAGTTAATGGTTAACGGAGGGTGTGTGTAATT:1 - chr3L 19902000 5' - Doc4-element 211 1 58.42 GGTATGGTTGGGCTCCCGGTGCGTCGGTGGATGATTGCCCATGGTGCGGAAGTGGACGGAGCGAAACAGCTGAGCACGTTCTCTTCTCGTGCGATAAATAC:1 - chr3L 1690172 5' + Rt1c 5115 1 70.30 AGACCACTAATGCCATATTGGAGTGCCCATAGTGGTTGCTTGAACTCCACCCTCTAACCACTCTATATAATTATCTTCGCATTCGCACTAGCTGAGTAACG:1 - chr3R 8393662 5' + INE-1 535 1 78.22 TTCCGATTGCTCTAATTGTTATGGGAATTTGGATTCTTCGGAGGATGCTGGATTGGCGGCCGAGCATACACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATA:1 + chr3R 30917592 5' + Stalker3T 192 1 64.00 CAATTATTAGAACCCCAACTTCATGGTGACAATAACAAATTCGTCCGATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAA:1 - chrX 22000014 5' + Quasimodo 206 2 79.80 TACCGTTACCGCTTATGTACACATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATAT:1 - chr3R 16568238 5' - X-element 4578 1 79.21 ACACACACAAATTTCCCTTCTAATACGCCTTGATTTCCCGACAGGACTGCCAGTTGAATCAACAAAATCTAATAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAAC:1 - chr3L 20713634 5' + I-element 229 1 75.25 CAGGTCGTTGCGCATGCGCCTTTTCGCTCGGTCTGCCTGAGGTTTCAGATAAACATGGAGACAGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGCTGCCAGGT:1 - chr3R 10658637 5' + Cr1a 460 1 55.45 AATGGAAAAGCAATTACCGCAGAAATAGATTCCATGGGTGTCTTGTCTGCCATGGCTGAAGTGAATGCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTT:1 - chrX 8818745 5' + jockey 4964 1 77.00 TTCCGNTTCGGTTTTTGTTGCTTTATTTGGAAGGACCCTCGAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTATCCAGCATTGGAGAGACCCAACCATTACTCTCA:1 - chr3L 18965763 5' + Porto1 374 1 66.34 ATACTACTCAGCAGATACGTGACTAGAAGTAACAATAGAGTCGATCTAGCAATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTA:1 - chr2L 6821081 5' + INE-1 151 1 67.33 GTGGCCAAGCCGTGGCCCGTGGTGGCTGCCCGTCGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACCAGCAAGCAAATTCTAT:1 + chr2R 16228499 5' + 1360 3259 1 64.36 TAGGCCATCCGAGCACCGCTCCGAACACATTCACTGCCGTCACATGTTCATCACCACTTTAGAATTTGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTT:1 + chr2L 3172021 5' + accord2 7395 1 69.31 CACTTGGCCACCCGGCAGATTCGGATCCGCAGAGAATTCCCCAGGGCACTTGGATTAAATTAGAGGAATGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAA:1 + chr3L 3345053 5' + gypsy4 465 1 77.23 CAAAGCCGTGGTTATCAGAGGAGCTTCCCCCGACCCTCATGCTTGTCGTCATTAGATAGAGCTCTACCACCATAGAAACTAGCCCGTGTCAGTG:1 + chr2L 15998517 5' + R1A1-element 309 1 59.57 GAAATTGGCCGAAAATAAAATTCTGTCGCAGGCCAAGTGAAATCGGAAATGGAACACCCATTACCAAATATTTCTGTACGCTTGTGATTAATTGGATTCTT:1 - chr2R 9564703 5' + frogger 404 1 75.25 GATGGCGTCGTCAATATCTCTGGGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGTGCCAAATTGTGTGATAACCTGCCTAACAATAGCATCTGT:1 + chrY 198023 5' - G5A 361 1 77.23 GACATCTTTTAATTATTTAACGTGCTACGTTTGGCACACACAATGCCATCTTCGAGTTTGGCTGCAATGACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACA:1 - chr3L 7194317 5' + Stalker2 7340 2 64.36 ATTGGGGCTACCAACAGCAAAAGGGAGCGTGAGAGGGACGAGATGGCCAATCAGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCGGGGCAAGAACTCT:1 - chr2L 9522865 5' + Rt1a 4797 1 69.31 GTTTATATTAGATAAAGAAGTTTAAAATATCCATTGTTAGAGCTAAAGTACAGATCGAAATAAAAGAGACACTTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCT:1 + chr2L 19434258 5' + mdg3 5482 2 60.00 GACAGAACGCTTATGGTAAACAACATTTCGCATTTGCTGTCAGCTGGTTTTCACCTGAGAAGGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACA:1 - chr2L 12158628 5' - jockey 467 1 62.38 CCGAGAGCGTGAGGGCTGACTTAAAAAAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGG:1 + chr2L 21031312 5' - 297 201 2 78.22 GAGATTTCCGGTACAAGTACAAACTGCTCTAGTTTAATATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCC:1 + chr3L 10982312 5' - Bica 86 1 62.38 CCTTCTCTCACTTTGATTAGGCGTCGGCAGCATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGAT:1 + chrX 17139667 5' - X-element 4510 1 69.31 CCGGGTGGCGGCTGCTGCTGTGCACTCCGCTGCTCCCGGCAAGAGCTGGTGACCAGACCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGCGGCACAA:1 + chr3R 10738376 5' + invader4 394 1 57.78 CGTGACCAATTAGTGATCAAGTCGAGCGGTCGCAGGGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTT:1 + chr3L 6275154 5' - Doc 470 1 67.00 ACGCAGGATGCCTTCAAATGCTGCAGATACTTTGCCACAGATGCAGATACAGATACAGTGAATGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTG:1 + chr3R 12790906 5' - flea 153 1 65.00 TTAAGCAACACCCTGTATACAGTATTCACTCGTTTTTTTCCTTTTTTTGTGTAGGTTAAAATTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 - chr2L 19178227 5' - copia 5015 2 65.35 CCTAGAAAACCGAGATTTCCACAATCTTAATCCACTTTGATTGTGGCTTCGCTTTTCCAACATTTGTCGTAAAAAAAACCAAAGCAATCACTCCCATTAAT:1 + chr2R 23089530 5' - Tc1 248 1 65.35 AATTCGCGGGCATCCATGAATCTGCGCGCATACCGCATCCCAAAGTCCACGTCCGCCGAGCAGCCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGT:1 - chr2R 9502180 5' - R1A1-element 68 1 74.26 GTAGTTTAAATACATTTAAATCATGTATAGTTGAATATGTGGTTTCGCTAGATAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTT:1 - chr2L 18473049 5' - R1A1-element 5323 1 61.39 TAAAAACACAGCAAAAAGTGTATGGGGAAAACAAAAGGAAGTACAACAACAACTTACCTGCAACGTCTCCAGAGGCTTCCAGCGAATCGGTGCTTCCGTC:1 + chr3L 17157048 5' + HeT-A 5722 1 62.00 ATTTCACTGGTGTCGAGCGGCAAGTGGAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 19510822 5' - roo 9053 2 60.40 CATCAATTAAAGCCACGAGGGCTCGCATGTGGTTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3L 22324123 5' + hobo 6 1 71.29 AATTTAAATGAATGGTCCAGGGTAGACAATGGTGTGCAGCATGCACTTCATAATTTGCTAAGTGATTTTCAAACAGCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 - chr3L 10379008 5' - mdg1 7458 2 71.29 AACGGCCACGACGACTTCAATGGCAATAGCTACGTCCATAAAGCAGGCGCGAAATTTCTTCGCGCACCGTGATTGGCTCAGCCGGCGAACATTACGGTATC:1 - chr3R 26328564 5' + G-element 136 1 51.49 TTTTTGACACTTCTTAAGCAGCACACTCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 22667174 5' + 412 7103 2 83.17 CGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCT:1 - chr2R 4879037 5' + G-element 18 1 64.00 TGTTCCTTGCAGTAAATCCGTCTCTGAATCTAAGTTAAGATAATGCTGTGCAATGAGCGAGTAAAAGCTCTTCAGGGGAAAATCAAAAATAGTTTTTAAGA:1 + chr2L 13473886 5' - 297 6907 2 65.35 ATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 63004 5' + roo 52 2 79.21 TGATATTGATTTTCCATACATTTCCCGAAACACTCGATTACATTTAACATTATGAAAGTTAGAGATTTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTACTTACAGA:1 - chr3L 13264863 5' - gypsy7 392 1 51.49 GAAAGGTGCTACTAACGGCGAGGGTGAAGAAAAGAGAAAAAAAAAATACAGCTAAGGGTGAGGTCAAAGGTGAGGGGAAACGTGGAGCATCCAGATGCGT:1 + chr2L 5418352 5' + 1731 478 1 82.00 CATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3L 2539306 5' - roo 356 2 76.24 TCAACACGGTACCACGTAATTATAGAGTTGCAGGGCTTATAGAACACACCACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAA:1 - chr2L 12210849 5' + accord 222 2 59.41 TATTACTGTAAACAATCCAATATCGCAAAACCCAACCGTCCTGGAAATTGTAATACTTTAAATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAAT:1 + chr2L 21373522 5' + copia 4664 1 70.30 TTTTGGCCAAATCAGATCGCTGGGGTGCCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAACTTTAACTGATTCGGCAGCGGATGTT:1 - chrX 12507659 5' - Quasimodo 187 2 74.26 AATTTGTTTCGAATGTTTGAGATTTTTATCTGCGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chrX 14505512 5' + hobo 10 1 68.32 AATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACT:1 + chrX 22398531 5' - Gypsy6A_LTR 160 1 63.00 CTGCANGTAAACGATCCATTTGCGCACCAGCAGCAGCCACACTATGCCGTACAGAACGCAAATGCCCGACTCCAGAATTTATACCGTTACCTTTATCACCT:1 - chr3L 16784982 5' + Chimpo 4219 1 72.28 ATAGGGATAGAAAGAGAGATACATATACATACATATATGGACAATTACACGCTACGGTTTACTGTGCCCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTT:1 + chr3R 8072549 5' - Stalker 114 4 72.28 GTTTGTGTGTTGACAAAAGTTGTGCTCGTTAAATAATAGTTAACCCGAAATCTGGAAAAAGGAAGGTTAACTATTATTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGA:1 + chr3R 7333219 5' - Cr1a 4237 1 58.00 ACCACGGGGCGTATGCGTGATGTGGTCAAACAAATGGAGAAATTCTAATTAAAACTCCGTCAAAGATACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:2 - chr2L 6605653 5' - blood 7383 2 72.28 TTCAGATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTG:1 - chrX 9260650 5' + 3S18 51 2 71.29 AGCCAGACCGCTGCGGGCAAAGTTCAGGCCCAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGAGAGACGAAAGAAAAGTATGCATT:1 - chrX 2937415 5' - Doc 285 1 63.74 AATTTGTCGAATTCAAGCTCTGCTTTTGAAACAAACTTGCAGTTAGTTATTTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAA:1 + chrX 13268929 5' - McClintock 10 2 63.37 GTCGATGGTAAGCTTTGTTAAAACAGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTTGCCGTCTGACCCGTGCGAAAAAAAA:1 - chr3R 2557655 5' + Cr1a 4449 1 75.25 ACATTGGCTTGCAGAAAATAGCAAAAACAAAAAAAAAATTATAATTTTTTAAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAA:1 + chrX 9650193 5' + Stalker 6822 2 80.46 CCCAAGGGTTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGCTATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCCACGAGTGCAGACGTGCCTAC:1 + chr3R 26331630 5' + G-element 20 1 58.42 ACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACAT:1 - chr3R 1048034 5' + Stalker2 40 2 63.37 ACGGGACTTGAACGGCGTGTCGCGTGCAGAGTGCGGGTCGGGATCAGGTGGTGTCCACGATCG:1 + chr2R 20424376 5' - Chouto 253 1 60.32 TAAATACCCGAAGGACTTAACAGTCGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCA:2 - chr2R 21421102 5' + springer 7154 2 58.42 GCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 9996385 5' + blood 7042 2 52.48 CAAAGAAGGGTCCTGGCACCCTGAGCGAAGAAAGGTATACGAAATATACGAGCAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGC:1 + chr3L 13897122 5' + G6 488 1 55.45 TTTGGGAGGTTGTTTTTGCGTTTTATAAGGGGGAAATTACATCTATTTTCCAGAGGAGTGTTCTCATGAATTGGTAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 + chr2R 5786581 5' + INE-1 30 1 72.28 CAGGAGATAATGCTTTTCTATGCTATGTTGTCTTAAACATGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr2R 4901620 5' - Transpac 297 2 67.33 GCAAGTGCGCAGCATATGTTGTTTGATTGCAAGCGAAAAATGAGGCCCAAGTAAAACGTGCACAGATGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr3L 5511439 5' + F-element 54 1 71.28 TCACGNCCCGAATCGAGGAAAGAAGCAGAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAAC:1 + chr3R 13909209 5' + I-element 413 1 68.32 CGGCAAATTATCAAAAGAAAGGTAAATTGAGGAAGGTGGAAAGGTGGAAGGAAGCGATTCTGACTGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATCG:1 + chr3L 6899203 5' + INE-1 85 1 54.46 GTCACGGGTGGTTTGGTGTCTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGA:1 - chr3R 18860389 5' - R1A1-element 5297 1 63.37 TCAGCTCAAGATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTC:1 + chr3R 14882063 5' - gypsy5 7343 2 63.37 ACAGTTGCTTGGATTCCCATTGAAATTAACGATGAATGCTAAATTTTAGTTATCCAGCTGGTAAGAATACAATAGTGCCCGAGATCTCGTCGTTCATACGG:2 - chr3L 12067548 5' - INE-1 135 1 77.23 TTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 11240894 5' - roo 9036 1 70.10 GCGGCGTTTTCAGGCTGGCAGAAAGCGCCGGGGGAAAACTTTGTCTTGATAACACACACACACATGCATACACACAACATGTCATTATTGTTATTATTATT:1 - chr2L 10070938 5' - mdg1 25 2 80.20 AAATTTCCGCATTCCCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:2 + chr2L 15997860 5' + 412 7071 2 61.39 ACTATACACACATAAACATTTGAAAGCCGTACATAGACTTAAAGGTAATGTAATTAAAGGGCTGCACATTACTTTTATTTTATTTTTCCTTAAGTTCCTTG:1 - chr3R 8147848 5' - F-element 4429 1 53.47 ACGTCTGCGGGTCAAATCGGCGGTGGGACATTGGGTCCTTCGACGTCTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTA:1 + chr2L 15061046 5' - flea 4582 1 72.28 ACGACTTGGCACCCTGCACCCTTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTGCTATGTTGTAATGTATATGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 17439714 5' - Quasimodo 39 2 73.27 CTCAAAGAAAATTTCTTGAATTTTTGAAATGAAAAAAACATTATTTTAAAA:1 - chr3R 28285913 5' + hopper 1389 1 82.35 CGCGTATAATAAGGTTCTCAATCAATATGAACGGTTTTGGGGGTTGGTCAATGCGTGCTCATTTAAGATATGGAGGTATCCTGTTTGATTTACTGTACCCT:1 + chr2L 21589376 5' - Bari2 831 1 55.45 AAATAGGCAGATATCAAATCAGAAGGCACAAAGAAAAGATGCAAGAATCAATGAAGCTGCCGATGCGAGGAGACGCCAGAGTGGAGGACCGCCGGGATCAT:1 - chrX 10543586 5' + gypsy8 4595 1 56.44 GTCCACCAGTCGATCCTGGAACAGGCGCAGAGCTTCATGGGCCCAGAGTCGCACCAAACCTTCAACGGGAAGGGAATCCCTTAAGTTAATGCCCCGCCCAC:1 + chr3L 4814694 5' + G-element 4250 1 78.22 TCATTGCAGTTTGCTCTATAGAGACCTCAAACCGGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAAC:1 - chr3R 30694819 5' - 1360 3237 1 65.66 CATGATGTTTGTGAAAAAAAAAACTTGTCCATATGTTCCTTTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 + chr2L 20209144 5' + mdg3 59 2 60.44 CATCGGTGGCAGCTCCACGCTCTAACGTTCCACTGAGATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCAGCT:1 + chr3L 7932379 5' - flea 4545 1 63.37 TGACATAAACTGCCTCCCATTTGCACATCGTATTTCGCCTTTTTAAGTAGGGAGTTAGTTGTTTTAAAAATGCCTTTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATT:1 - chr3R 30110556 5' - Bica 140 1 71.29 AAAGGCAAATTGCAAAGGCAAAAAGGCAAACGAAGCCTCTCGTTTTGCTTGTTTCCCTACGACCTTGATCGCCTGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACC:1 - chr3R 5592120 5' + F-element 4514 1 81.19 AGAAATTGGCTTCTGTATTGCACGTTTTATTCTCATTGGAATTTATAAATTAAATGCTTTACATACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAAC:1 + chr4 65933 5' - Circe 7165 1 71.29 CTGGGAGTCAATAGCTGAGATTACGGCATCTCAAAGCTTGGAGACGATCCGTTCATTTGAAGAGAGAGAAAGAGCGCGGGAGTTAGGTCCGTGATCGAGGG:1 - chr2L 306582 5' - Tirant 399 1 77.23 CATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATG:1 - chrY 2720354 5' + Stalker2 120 2 57.43 GCATGAGTTTGGCCAAGTCTGTGGGTTAAGCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGG:1 + chr2L 1487827 5' - F-element 4269 1 70.30 ACTCATTCTTATTTTCTTCTACACGTATATCTCTCTCAAACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCTTCATGT:1 - chr2L 1559656 5' - Bica 145 1 61.39 ACTCCATGGCCACCACTGTGCCGGTTTCATACCGCCTGGGCACGTCGCTCTGGAAGGCCACCTTGTCCTGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAG:1 - chr2L 861200 5' + Chouto 434 1 67.33 GACGGTAAGAGACCTTGTTAAAAAATATTATTTATACACTAGTGGGCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGA:1 - chr4 222523 5' + invader4 2939 2 57.43 CCCGTAAATATAGCACTCTAAACAAATTTTAAGCTCCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTA:1 + chr4 1155840 5' - blood 395 1 64.36 GCTATNGGGACGACAGTTGACAGGTGATGTCAGTCTACGTTTTTATCGAAGAGCTATCGATGTGTTCGCAGCTGTGTATATATATGTGTGTGTGTGTGTTT:1 + chrX 13791119 5' - accord 183 2 64.36 TGCCGCAATACGCCGCAATATGTCCACAAGCTGCGCTCCATCATCCGGGCCATTGACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGA:1 + chr2L 6376946 5' + R2-element 416 1 55.45 TACACGATCCGGGCGGCCATTTCGGTTGTTTCCCTCCCATTAGACTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTC:1 + chr3L 10911331 5' - Bica 4552 1 56.44 ACCACACAGACAGGAATTTTTAAAACTATTGTGATTAAATGAAATTTGTGGTTCGAAATGAAGAATACTGACTGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGT:1 + chrX 9260572 5' - 3S18 337 2 75.25 ACTTCGAAATATATTTAGACTTCAATTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAAT:1 + chr3R 18246536 5' - roo 98 2 77.23 CCTAAAAGATTGCTACATTTTCGCAATTAAACACAGACACAGCACACACACACACACACACTCGCAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2L 13482229 5' + hopper 8 2 69.31 GAGTAGTAAAAGAGTCCGAGGAGGGCCATGAACATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTCA:1 + chr2R 9497745 5' + copia 340 1 68.32 TGGAAGTCTCATCGAAATCCTTCTAGCCTGTTTTACTCAGCGTATTGTAGCCTTTTGTCCTTCACACTTCTGAGGTGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCT:1 + chr3L 6005999 5' + 1360 124 1 65.35 AAGGCGGGCCAAGCGTTGTGAGAAGGTCGTGGGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACATTCCGTCCCCCTTGCAATCACTGGGGTTGCAACACA:1 + chrX 2696112 5' - GATE 8200 1 68.32 ACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr3L 25798511 5' + blood 37 2 60.40 TCTATAAAAAATTCTGCACCCAATTAATTGAAGACGTACAAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 25931316 5' - roo 9039 1 57.43 TAAAAAGGAGAAGCATTTGCCTTGCGCACCGCAAACATATAATCAAATTCAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr2R 23468992 5' + I-element 26 1 50.50 GCTCGATTCACATATATTCTAATGTTCGCGTTCTCACTTCCACACTAGCTTATACCAAAGACAATAGAATAACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTAT:1 - chr3L 3951620 5' + Tc3 315 1 77.23 GTAATTACCACTCTTGTGTTTTTGTTGATTTTTTTTTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAGA:1 - chr3L 21926763 5' - F-element 40 1 72.28 CGAATGGGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATCTTATTTATTC:1 - chr3R 5775755 5' - invader4 309 2 61.00 GAGCTGCACTGCAACAAAAAGCTAGAACTTCGTTGTGCGGTATCACACATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chr2R 18891129 5' + opus 21 2 52.48 GCGATTCCGATGAGCTGCGTTTACAAAACAAACACCAAAGGCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGAC:1 + chr2L 2694754 5' - roo 202 2 59.41 AATTATAAAAGCTACTGCGCAGGGGCGGAGCAATGTGGTAGGAGAGGCAGTCTCTTCACTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAG:1 + chr2L 11380665 5' - Doc 385 1 60.40 CAATAGTCAATTTAAGCAGTCTCACTTTTTCTCTTGATTGAACAAACAATCACAAAGCGACAGGAAAAAGGACATCCACACACACACACACACA:1 + chr2R 18309074 5' + accord 7026 2 56.38 ATTTTAATTTTCCGTTTTTAATAGTTATGAACACATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTATTTTAACTA:1 + chr2L 9877825 5' - HeT-A 304 1 49.50 TGCATAATCACTTGCTGAAGTTCGACTGTAAAGTTCCTATACAAAACGCCTTTGAAGCGCAAGAGCGGTTCGGATTTCGTATAAATATTTTAATAACTTTT:1 - chr3R 29984752 5' - Transib-N1_DM 291 1 72.28 GCACGCTCGACACGAAGTGGCAGATGTGTGGCAACAACACCCATTTCATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATATCACCTTGGCAAAAAGGA:1 - chr2L 15331867 5' - I-element 5012 1 42.57 ACGACCGAAAACGTGCCGATAACACGGTGTCGCACACTCCCCTCACTCACACTCCCCATCAGAGAGAGAGAGATAGCTGGGTTTAAAAGAAAGAGAAAGAA:1 + chr3R 16819445 5' + transib2 2421 1 77.23 GTAGGTTGGCTCGTCTTCTTCCTCTTTGGTTTTCTTGTAGGGTTCTTGGACGGTGCAC:1 + chr3L 16434583 5' - mariner2 632 1 67.24 TGCTGATGGCCTGTCGGTCAAGATGAAAAGATGAGTGGCAAATGCGATTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCT:1 + chr3R 19998065 5' - baggins 5037 1 53.47 GTCGGTCATAATCAGCTGCACCCGGTCAAGATTTACATCTCCCGAGTCGGTGAGATAGCCCCTTGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCGAGTCCGATC:1 - chr2L 6909335 5' - diver 5723 1 68.32 CAGTAACTTTTTAGTACTTATTTGAGTTCTTGGAAATGTTGTCGAATTTGTGCTCGTCCTTGCTTGACTCCGGCTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGT:1 + chr2R 12209557 5' + G3 484 1 61.39 AGGCAATCAATTGGCAATCACCACTTGAGCGTATCGACAAGCCATTAAACAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 14582825 5' - roo 9045 1 53.47 CTGCTCAACCTCCGCTCATGTACGTCCATACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACT:1 - chr3R 30873304 5' + Doc 273 1 71.29 GGGTTTAATCTTCTTGCGCTTGGTAAATGTTCTGATTGCGTCACTAAATTGAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACC:1 - chr3L 8123561 5' + G-element 25 1 63.27 CTGATCGCTGGATGAGCATGATTCAGATAGCTATGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTT:1 + chr3L 4129568 5' - F-element 353 1 61.70 CGAAACCCACTGATGAACCCCAAATATGAAGACACATTCTGCCAAAAACCCCCTAAAACTCGTTGGCCCTTCAACTTCCGCTGAGTATCGGGTACCTGATA:1 + chr3R 13280887 5' + INE-1 546 1 62.38 ATAGCGGTCTTCGGCTGCTTCCTGCGGCCTTGTCACACGGCTCCATGAGTTTGCAGTTAAATTTATGTTTCATCCCACACTAACACACACACACACACACA:1 + chrX 1239228 5' + Quasimodo 36 2 80.20 TTTGAATTGTTTGAATCAATTAAATTGCTGGCCACGCATCGGCGACCTATTTTGATTTATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTA:1 - 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chr3R 12559681 5' - Burdock 6117 2 62.38 ATTATAAGAGGTTTGTTCAATGGGGTAATCCAATTGAGTTGGATGCGTTCCAAGTCGCTTTAGGTATATAGCCTTCTGCTGGGCAATTTCAGTTTTTACA:1 + chr2L 22100699 5' - Doc4-element 2748 1 71.00 CTTTCCTGACCCGATACATCTCAAAATCGAACGCGGACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 - chrX 21302984 5' + Quasimodo 22 2 59.55 GGGAATTACAATGCATTTAGCCACGGATAGCTGCCATTGAACAAGAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTA:2 + chr3L 15492427 5' + Quasimodo 7065 2 55.45 GTCTGATTAAGGCTGTCGTCTTAAAAAAAGTTTAGGGAGACTATAGTATGTTATATGTATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCT:1 - chr3L 15328895 5' - Stalker2 7442 2 57.43 GCCGGCGTCGCAGTCGCCGCTCTTGTTCACTTTCAGTTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACA:1 - chrX 16216778 5' - Doc 179 1 71.29 ATACACGAGCTTTAGCTCCACCATTGGCACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGGCCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACA:1 - chr3R 27649291 5' + G6 345 1 67.06 CCCATTGTTCTAGGGAGATCGCAGGGTATGCATACCCTTAGCATTAATAAAATATTGTAGAAGTTTTTCCATTGAAAAAATAACTTTTCAAGATCATATTG:1 - chrX 4771738 5' - S2 1354 1 67.33 TGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2R 21266478 5' - roo 9021 2 79.21 CATTTTGTTCACTCACTACTCAGGCTTCATTTCAAACAAATTGATGGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTG:1 - chr2L 7490929 5' - invader2 271 1 54.46 TAAAATATTTGCTTGCCGATAAGTTCCTAATTAAATTAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr2L 20128976 5' - 412 7508 2 60.40 GTCACNGGTGGTTTGGTGTCTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGA:1 - chr3R 18860389 5' - R1A1-element 5297 1 63.37 ACTTATAGAAACGGTAAGTAAATAAGGAAACCATGTGCTAATCCATAACTTATCCAAAATTTGCCTTAGGTATAACGGCTGCTATGAAAATTAAT:1 + chr3R 24162671 5' - G5 4546 1 71.58 AGTTAGATTATTATAGCTTAATTCAATTGTAATTATACAAACAAGATTATGATGCAAGGGTCTCCTGTTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGT:1 - chrX 21424598 5' - mariner2 726 1 69.31 AAACTGTTGAGCGTTGGCGGTTTGATTGATGGTTCGCAGGCGCAGAGTCCTAAAACGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGG:1 + chr2L 13033785 5' - gypsy4 488 1 62.38 CGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:2 + chr3R 28623914 5' + roo 8714 2 79.21 GATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAGGCTGCTTTATCAATGATACGAACCTGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCAT:1 - chr2L 21683411 5' + roo 494 1 78.22 AGGAACAGGCTGGGATGCGCCAGAGGAATTAGAGCAACCCCGAGCACAGCCCCGCCAACGCCAAGCCACTCAGCCACCACCCTACTCCCACCAGGGGGCCT:1 + chr2L 5942253 5' - R1A1-element 4982 1 76.24 ACCTCAAAAAAAAACGCATATTAAATTAAATTAAAACCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCCTGGC:1 + chr2R 8106984 5' - Tc1 1278 1 61.70 CAAATGCTAGATGACCTTGAACTCACAAACACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCAC:1 + chr3R 13240423 5' - R1A1-element 5003 1 70.30 CTAATAAAAATGTCAAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTTGGCAGTTTTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGAC:1 - chr2L 22063435 5' - INE-1 145 1 47.52 GAATGNCGAGTGCGCTCGTGTTTGCAGGATACCAAAGGCAAAAGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCGACTTTGTATCGCAACGCTTCCCAGTT:1 + chrX 4899629 5' - ZAM 74 2 55.45 AATATCATCAGGATGAGTTCGACTGGGTTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTTTCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCG:1 + chr3L 9353621 5' + 1360 92 1 73.27 TATTGGATCTACCCTGCCAAACAGCGACATTAGTTTTGGTAAGCAATCTGTGATACATATATATATCTATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGA:1 - chrX 3003739 5' + Juan 11 1 61.39 CATCCGAATGTGACGACTGTCCCCACACATTATAGTTTCGTTGCGGCGGACCGCAAAATACACAATTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAA:1 - chrX 4326955 5' + FB 11 1 68.32 AATTGGCCGTCGAGAATTTGATCGCAGCAATTTTAAATTTAAATATTTAAATTGCCCATCGGCGGACCGCAAGTAATTTTCTGTACGCCTAAAATTTGTAC:1 + chr3L 25850930 5' - hobo 2683 1 72.28 GCATGTGTGGGAAAACCCAGCACAGTTTTCTGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGACTTTACGTATTAGGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAAT:1 - chr3R 7724724 5' - 1360 3119 1 74.26 AATGCGGCATTCAAGTGATTGTGGGTGGAGTGACGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGAATTTTGTCCTGACTCTTGTTAGCATAGC:1 + chrX 1150156 5' - mariner2 701 1 71.29 CTTAGCAATAATTTATAATCAACAAGTAATTTGCGCGATATGGTCGTGGGCTATTTAAAGATGCCTCAAAGGCCGTTTGTTTGTTAAATCTAAAATGAAGT:1 - chr3L 18916855 5' + Tc1-2 1478 1 74.26 GGGATATAGCTTTGCAATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2L 12843416 5' + roo 15 2 62.38 TGGGGGATATAGCTTTGCAATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2L 12843419 5' + roo 11 2 66.00 CTATCNGATGTACAAGTGCTTCCAACAGATTGCCATCATCAAGCCAAACAGCAGCCGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCAT:1 - chrX 4099467 5' + F-element 4554 1 55.45 TTTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 2090231 5' + roo 36 2 62.38 GGCCATGTTCGAGGCGTAACGAAATTATCAATCAAATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTT:1 + chr3L 21642952 5' - Tirant 8240 2 60.23 AAAATTACTGAAAGAAACGTTTAAAATTGAATGGAAACTATGAAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGC:1 + chr3L 26305905 5' - HMS-Beagle2 7040 2 57.43 TTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 2090283 5' - roo 9027 1 66.34 CTTATTTTTTTGCTTCTTTTTTTTCTTTTT:1 - chr2L 16606593 5' - Doc2-element 245 1 80.00 CCAAGTTTTGTATCATACACGAATGTTGAAGCAACCGAGAACAGATCGAAATAAAAGAGACACTTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCG:1 + chr3R 18714763 5' + mdg3 5492 2 60.40 TTATANTTTTATGATATTTGATTCCCCATCGCGATTATAGATTCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGT:1 + chr2R 13802569 5' + Cr1a 4302 1 58.42 ATCTGGACGGATCTGGGGGTTCGGGTTGGTTAGGTTTTCCATTTGGCATGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGC:1 - chr3L 10823965 5' - G6 1638 1 52.48 TCACATTTGTGTAACGCATACTCGTCGAACACGTAATATATTTAGAAATTTTTGTGGAAATTTTAGTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAA:1 - chr3R 18742551 5' + hobo 2517 1 75.25 GCATTGATTGTAGTGTTATATTATACCTAACTAACGTTTGGAGCCACGGTTTTCGGGCTTCCTTTCATATTTAATGGCATTGAATACCATTTTGGCAGAAC:1 - chrX 14736333 5' - HB 451 1 67.33 TCCACCAGCAAAGTTAAATAAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTAACTTTGCTGG:1 - chr4 1294989 5' - TAHRE 10436 1 49.50 CAGGGTCACTCTAATCGGTGCAACGCAAAAACGGCTGGCTGTTTTGAGGGAACACTTTCCGGAGCGCCTTATCCCAATTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGG:1 + chr2R 8928196 5' + mariner2 545 1 65.35 ATTGCGTTGTAATATTTGATTTCCGAAATTAGATAAAAAATATTGGTCACTCTCCCCTTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCG:1 + chrX 22689303 5' - HMS-Beagle2 7063 2 59.41 TATGAATGCTGTTTTATTTGTCGAGTGCCTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 + chr3L 21840289 5' + 1360 45 1 71.29 TACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTA:1 - chr2R 2875210 5' - TLD2_LTR 121 1 67.33 CATGCATTAACTAACAATAAATAGAGTTTTTGCCATCGAATGTCAATCTAATGAAATGGAAGCCAAACTACGATTAGCCAGCACTCTTAGCAGAGACATGA:1 + chr2L 16199747 5' - baggins 136 1 70.30 AACAGCAAATCAGCAATTTCAGCAGCCTTAACAGCATGTCCGACACCCTTTTATGTCGTGTCCCCGGGTAACCAGCCTGCCACACACACACACACATACTC:1 + chr2R 13044312 5' + accord 7031 2 63.37 AACATCGTCCATTAGCTCGAATCAAAGACGAAATGAAGATCTAACATATCAGGGCAGCCCGACCTACTCCTGCAGCGCATCTGCTAAACCACCTGTTTTCA:1 - chr2R 11258807 5' + Chimpo 3908 1 57.43 GTCAAACGATTTGCAAAACCAACTGTCGGCTGCCGTTAACAATTGCATTTGCCATTTTCTGTTCTGTCTTTTTGTTACCATTTTTTTTTTCTTTGTTTTTT:1 - chr2L 14821195 5' + hopper 143 7 58.42 ACTGTATGGGTGCCCACCCATACATATGTATGTACGCGCGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 + chr3R 11731177 5' + hopper 36 1 59.41 CATTAAAGCAGAGGGATCTGCACGTGGTACGTGGGTGGTCCTCGCCCAGCTTTAAGCTGACAATATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTT:1 + chr3L 21848711 5' - 17.6 7289 2 70.30 GCGAGACACAGACAAACAAACAAATAGAGACGCGCACATAGATACACACTAATACATGGATGAAGGCACTCAGTGTTCCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGACT:1 + chr3L 3437682 5' + Rt1b 4881 1 73.27 GATATGGAGATAACCCGATCATAAGAGATCAGCATAAGCCTCTTCGACACAGAGAAACCCGATGAGGTCCCGTGTAAGGCGGCTCGAGTGGTTTCTTAACA:1 + chr2R 22914355 5' - Chimpo 3979 1 60.40 GAGGGGGCTGAGTGTAGCAAGGGGATGGGTATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTTGAATTT:1 - chr2L 19027292 5' - I-element 4988 1 79.21 AGGTGCGAGCTGGGGTGTTCTTTGAAATAGGACTGCCCATCTTTGTGAAGGTAAGACTTCCGCAAAAGTTTAAAAAAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTC:1 + chr3R 22990343 5' - Tirant 319 2 75.00 TTAATAGGGTGCAGCGTGTGAGTGGGGAGAGCGCACTAGATATGTTTGATCTGTTAGTGGTTTTGTGGGTGAAGAACTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATT:1 - chr2L 13486404 5' + diver2 172 2 77.23 TGGTGGCCTTCAAAATCTACGGAAACCATTATAAATCTTTAGTAACTAGTCAAAAATAGTGCCGTAGTGCCTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chrX 13259330 5' + pogo 1 1 78.22 CCTTCTGTCCCAAGAGACCCATTGGCGCACATGGTCCCGTTGCTCGTTGTTTTTGTTGGCACATTATGTCCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGCAC:1 + chrX 14591019 5' - Stalker 490 1 80.20 GTACCACCACAGTATAAACTATGTCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCG:1 + chr4 305392 5' - 1360 52 1 76.24 ACTAATTGACTAATTTATGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTAAAGGCAGCCGTC:1 - chr2L 15997940 5' - 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chr2L 15792463 5' + Doc 358 1 66.34 ATCCAGCAGATTTAGCATCCAGGGGAGTGGATTCTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTG:1 + chr3R 19446470 5' + gypsy12 44 2 66.00 TAAATAGTCTTAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGC:1 - chr2R 15002443 5' + 3S18 16 2 56.44 TTGTGTTATGTTAAAAGTTAAGTAAAATATATTTAAAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chrX 3050717 5' + I-element 45 1 66.67 GGTGGGAAATTGCAGTCAACATTTATTTCCGCAGTATGATGGAAAAATTCGAAAATAATTTGCGAGCCATATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr2L 7843054 5' - 412 486 2 71.00 TCGAACTTCGGACTCCCAACCAGATAGTCGGCATTCTTGCCGTCTGGTCTGCTGATGTTAGTGTCGGCATTTGGCCGGAATGGTAACTGGCGCAGCCGGTA:1 + chr3L 17840495 5' - accord2 7424 1 51.49 AAGAATTTGCGTTTAGTCAGACGTTTTTGGTTAATTTTGCTCGAGTGTGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAA:1 + chr2R 15522695 5' - 412 80 2 63.37 CAAGAAAATTCTACCACATATCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chrX 5178435 5' + hobo 53 1 77.00 ATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGCTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGG:1 + chr3R 778389 5' - F-element 23 1 52.48 GGTTGTGGTTCCGGGATAAGTTCGTCCTCTTCATTGGGTTCCCTGCACAGTATATGACCGGTCCTTTAACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGAT:1 - chr3L 8388174 5' + R2-element 403 1 61.39 CGAGANGGTACAAGACGATGGAGCCAGGAGCGAGACGAATAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 27448494 5' - roo 9034 1 60.40 ATAGANATCAAATTAAATCACATTTAAATGGGTCAGTAAAGTGGTGCCAATCTATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCAC:1 - chr2R 8415601 5' + I-element 4886 1 57.43 TCTCTCTCTCTCACACACACTCTGGCACCTGCCTAATTCGATTAGCCGCACCGCTCGAACGCTCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 + chr3R 29572294 5' + P-element 12 1 64.36 CTTTTGGATGCCGTAACTCTGAAATAGGGTGGCTCAAAAATGTAGCTTGTCAAGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAA:1 - chr2L 12384230 5' + pogo 1652 1 51.49 AATATCCATTGAAATGGGGGGAATGCTGGCTAAGTAATTTAATACCATTACGTTAAAGTGCTGACCCCAGCATCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCA:1 + chrX 6978902 5' + Gypsy6A_LTR 81 1 65.35 CTGTCCACGCACCTGTCGCTCACCGGCCTATCGCTAGCTCTCCCGAAATAGAAATATTGTTCAAATACTGAGACTTCTCCTCAATCCGATTTACATTTGAT:1 - chr3L 14126039 5' + 297 6837 2 64.36 CAGGGACGCATGACCATTACAGAACGAAGTAAACAAGAAAATGACATTACTCATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 - chr3R 908381 5' - copia 230 1 53.47 TGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr4 868644 5' + roo 24 2 55.45 CCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 15072585 5' + pogo 42 1 71.29 GGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGGCATTTCGGTGCGGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGA:1 - chr3R 7808970 5' - jockey 82 1 62.38 CCAACACACGTGCCACACACCCAAGGGCAGGCGATTAGCAGCAACAGTCTTTAAGAAAGGGAAAAAGGCGCAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCA:1 + chrX 9207953 5' + Rt1b 201 1 53.61 ATAATTAAAATAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATAT:1 + chr3R 5775669 5' + invader4 30 2 56.44 TTCCACTTGTTGTTTGTGGTCTCTCCCTATGCCGTCACAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 697449 5' + roo 8700 2 62.38 ACTATTTTTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr2R 13314188 5' + jockey 27 1 59.41 TAATTTGCTGCAAAGACAATTCAATCAGTCAGGAATATGGAACTTTATGCGAAACCATGGGATGAGAGAGGGTTATGCCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chrX 2874901 5' - 1360 3387 2 81.19 ATTACCAGACCAGATCGAGAATTGCATCAATATGCAAATAAGTGTAACCTAAATTGAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 - chr3L 6478576 5' + G-element 23 1 52.48 ATAAATCACACAACGTTAATGGTTTGGTGGTTTGGGAAGGCTAACATGTGAGCTGTAGATATTTAAAATCATTTAAATT:1 - chrX 978569 5' + transib3 111 1 92.41 AAAAACGGGCGGAACTTTGTGTACTGGGTGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAA:1 - chr2R 19486188 5' + Bica 136 1 71.29 ACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 11576430 5' - roo 9019 2 77.00 AAGATGGGAAGTGGGGAAAGGACTCTGGAATTATCGAAGAATGACCAGGAGTCCAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTG:1 - chr2L 3273942 5' - gypsy5 406 2 71.29 CAGCACTAAGCTACCCAATAAGATAAATATCCAAACTTAAAGTAAACACAGCTACCGCTTGGAGACCAAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCT:1 + chr2R 4017977 5' + F-element 4228 1 67.33 CTTTCCTGGGGTTAATTTGGGCTTACCATCGGCAGAGATTCCTCATAAATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 + chr2L 2025735 5' - 1360 3323 1 59.41 GTCAAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATA:1 - chrX 130115 5' - INE-1 83 1 70.30 CTCGTAGAGTAAAATGGTATACTAGATTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAA:1 - chr3L 25245594 5' - Porto1 4314 1 70.30 TTGCAACTTGGGATAAACAAAGCCATAATTCAAGAAACGTTTTGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGG:1 - chr2L 6404326 5' - HMS-Beagle 6854 2 57.43 TTTTTCCATACAGTTCTTTTCTCTTTTGAACCAAACTGCATTTGGTATATGTATATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTT:1 - chrX 19885256 5' + HMS-Beagle 6815 2 60.40 GACCTGACAATTGCCTCCCTTCTATTTACCTTCTTGGTCCGATTATTGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTATTCCCA:1 + chrX 10025709 5' - baggins 5023 1 58.42 GTGTCAACTCGATCAGTGGCGGCCTCATTTGCATGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTT:1 + chrX 10493842 5' - invader4 2682 1 67.33 TTTGCTGCATTGAAAGCGAATTGATGTTGGGACGAACGCAATGTCTAGTGCCACGTACATAGAATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGC:1 + chr2R 8311553 5' - BS 4734 1 53.47 GAAATGCCCAAGAAAATAAAACAAAACAAATTAATTCGTAGAAAAAGGTGTGAGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCT:1 + chr2R 8640680 5' + 1360 3225 1 62.38 GTACCCACATGCACCGTCACACGTAAATGTGTATGGTGCTTTCTCGCAGAGAAAAACGAAGTTGCTGAACAAATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 - chr3L 10035789 5' - jockey 4979 1 52.48 TTTGCCGGTTCAAAAATGTGAAATTCCTAAGTGTGTAGGCCCGACAAGCCAAAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAACAGCAAGT:1 - chr2L 9722032 5' + I-element 444 1 57.43 CCGAAAAGGATGATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 63016 5' + roo 8704 2 67.33 TACGTTTTATGAGGACACATGCCCTAGCCAAACACCCCGTGCAATTGTATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAA:1 + chrX 19055290 5' - mdg1 124 2 57.43 ATGTGGAGGTGCTGCACGCATCGAAACCGGACAAGTATCAACTGCATCTGCACGAGAGCTGCGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTT:1 + chr3R 26048269 5' - 412 7417 2 69.31 ACTGTTTTTAAAGACCAAAGAAAGGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCA:1 - chr2R 6501140 5' - Max-element 8263 2 80.20 AGAGTTAAGAATACGCCAAATGTAACCACAACTGTTCACCTAACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAA:1 + chr3R 15396508 5' + I-element 4914 1 62.38 TTGTGGTCGAGCGGATGAGCTCCCATGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGTTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGG:1 + chr3R 25912078 5' + R1A1-element 234 1 72.28 AAGTATGGAAAGTATCTCGCTGCAGTAGAGTTTGTTGGGATCGCACGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAAT:1 + chr3R 8944050 5' - HMS-Beagle2 48 2 62.38 CTCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAAAATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 - chr3R 1048046 5' + Stalker2 7263 2 56.82 GTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCC:1 - chr2R 1000374 5' + HMS-Beagle2 6932 2 75.25 ACGAGAGATCCTTCCCGAGTATCAGCCACAAAGTATGCTACAAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr3L 947949 5' + hobo 13 1 66.34 TATGAAACTAAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chrX 22517707 5' - 1360 3387 2 63.37 CATACTGTCCACCGAGGTTGCACGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCAAAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGT:1 + chr2R 10026853 5' + baggins 5175 1 78.22 GTCGAAGGCTGCAACACTCTGGGTTACTATTTCACTAAACGAAATTAAAAAATATTATGATTCCTTACCAAACCGAATGTTTGAAGTAATTAAAAACAAGG:1 + chr2R 10175645 5' + Tc3 1403 1 72.28 ATTGGTATCCAATTGTTTGATCATAACGTACTCAATCCCCATCAGCTCATTCTTCCAATCCGTCTGCGTGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGG:1 - chr2L 4393223 5' - F-element 4471 1 71.29 CGTACTCAGAAATTAATGTTGCATACTTTACGACACCATTGACGTGATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAG:1 + chr3L 3489108 5' - diver 5993 2 54.46 GGTATAAAAACAACGGTTATAGAAGCAATGGCAGGGGCAGCAAGCGATCGAACCACCAACAAACACAGAAGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAG:1 - chr2R 5037514 5' + gypsy11 4084 2 76.24 CACTCCTACAGAAGCTATCAACTATTAAATTATTAATGTATTAGCGTTGCACTGGGAAGGGCCGCTTCTTTTATTCTTAACATCTAGTCAACCAATTACTT:1 + chrX 2672928 5' + Porto1 4620 1 86.14 TTTTTGAATGCGTTTTGAAGTCTTTTCATAACCTAGGGTTTTTATTTTTTGCTTTGTGTTGGTTGGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAG:1 + chr3L 8439664 5' + Cr1a 224 1 75.25 AATTATTAGTATTATAATACGTTGGATAACTGAAAAGTATGCAACACTTTTGTTTTTTGAACGATTTTTTTTTGTTTTAAATAAAAGTGTGTACATTATTG:1 + chr3L 13900748 5' - transib2 2618 1 68.32 GAGGACATTGTGGAGCCAGGTGGAAGCGTTTCCGATCCTTCAAAGTACATACAATAATACAATAGTACATACATAATACAACGGTATATTTCCATGTCCCT:1 + chrX 15052341 5' + HB 52 1 31.68 AAAGCCTTTTAGCCGCGCCACCAATTCCAAGCAGCTCTTCTCTAATTAGCCTGCCAACTTGGCTGACTGCCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCT:1 + chr3R 18005314 5' - Bica 450 1 75.25 AACGGATGTGTTGAAATTCATTCGACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 5104596 5' - roo 390 2 60.40 TAACAGCTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2R 16928876 5' + blood 52 2 75.25 TCTAAAATAGTTCTCCTTACCTATCACATGCTTGTCATATATGTTTCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACG:1 + chrX 12342117 5' - accord 278 2 56.99 GAAAGATTCAGTGATATAGTGTTGGCGGCAAAGGCCACCAGATTGGTGAGGGCCTGTCGGCTGGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCA:1 - chr3R 26467314 5' + jockey 4595 1 63.37 GAAAATTAAAATGATTTAACAAAACTGTAGCGTATTGTTTAACAATGAGCAATAAATGAAATTATATAACCTACGCATACACACACACTTACACACACACA:1 - chr2L 4514194 5' + Quasimodo 28 2 72.28 GGGGTCCGGCTTGAACCAGGCAGATGGATCTTTACTGGTGGTGCTTTCTGCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGA:1 + chr3R 5230455 5' + accord2 188 1 54.00 ATTTCGTTCGACAGCTGGTCAGTTTTACACAGCAAAACGAAGTTTAAGCTTGGAGTAATCACTAAAAATTGAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 + chr2R 11540167 5' + Transpac 3 2 69.31 ACAACAACTGCGCACTGGGCAATTGAAATACGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 + chrX 10555384 5' + Tirant 8111 2 77.23 TTACTATATAAATAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAACGTTGCGCGTAGTGGACAACAACTCAAAAGGACTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 14002050 5' + roo 4 2 63.00 GGGAANCTCGGTGGGCTCCCATTTCCATTCCCACATCCGCTGCTACCGTCCAACGTTGGCCAAGTGCACACATCGTGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGA:1 + chr3R 24341266 5' + F-element 317 1 74.26 CTTTGGAGCACTTTTGAGAGGCGATAACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTTCAGTTTGCCCTCCGGGGGTTTTTTTGCCACTCGACTCACACCCAACA:1 - chrX 12572433 5' + hobo 29 1 71.72 GAGATGAAATAGTTGATCTCACCAAACCCCGTGCCATTCAGTTCTATTCCCTTTTCTATAACCCATCGTCTCATTCAAATATTTACTAATATATATACATA:1 - chr2L 2551452 5' - 1731 4418 1 68.32 ATGGTTGAAGGAGGCCCCAGCAGCAGACGAAGTGCAGGCTGGTGCCTGAAGTCTCTGCCTAGCCTTCGTTGCATACGGACGTTCGCGATTGCCTAGTCTTT:1 + chr2L 7645581 5' + jockey2 18 1 51.49 GGCACAGCCCTGATGTTATGTTGCTGGGATTTCGTCAATCCGAAGGCAAACACTGTGCAAAAAATGCGGCAGAGGGTCGCAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr2L 15352828 5' + G2 3077 4 64.36 GAAACCATATAAAATAAAGTAAAACTCGGAGGCCGAACAGTGGCAAAACATTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 28623971 5' - roo 9046 1 53.47 AGTACCGCAACAGCAATTATTGCGTTGGTCTTGATTTTGGGTTTATTAAAGATTGCCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 21908877 5' + roo 8685 2 58.42 TTCGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr3R 17495757 5' + opus 7148 4 69.31 TGAAAGGCCCTTATTCCGCCACCATGGCCTCGGGCCCACTACCACCCACTCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGA:1 - chr2R 10022376 5' + HMS-Beagle 6749 1 56.44 GGTTCACCATAAACTTTATTAACGTTCATCAACTAATTGACTAATTTATGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr2L 15997971 5' - 412 489 2 74.26 TTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr2R 8157239 5' - Transpac 265 2 70.30 CCGATGATCAACCCTCGACTTCAAAAGCGGCAATGAAAAAAATTCGCATATATGGTGGTGCGGAGCCCGAAGAAACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAA:1 - chr2R 19402136 5' + HMS-Beagle 385 1 76.24 AAGGAGGTAAAGACTAAATCTAGTAGCCCTTAAGCATTGGTTCCGAACACAAGCAGATAATTTTCGGCGTCACCAAGAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACC:1 + chrX 1478224 5' + 1360 3347 1 65.35 TTGGTGTCCGACGACAGGTAACCGGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATT:1 - chr2L 9981529 5' - flea 4705 1 76.24 AAGCAGTTAACTTGTGCAACGCAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCA:1 - chrX 11123626 5' + F-element 4405 1 77.23 AACAATCAGCAATAAAAACAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAG:1 - chr2L 19803831 5' + I-element 4915 1 81.19 CAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chrX 21844337 5' - mdg1 413 2 68.32 ATTGCGGATAATTTGATTAGAGATTTTTTTTGGCTCGGTACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACAT:1 + chr3L 3424499 5' - Rt1a 4797 1 61.39 ACTACGGCAAGAGCGTGGTGAACATCCTGCCCAGCGTAGAGATGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCAC:1 + chr3R 29995410 5' - hopper 482 1 57.43 AGAGGGTGGGATGGTTGTCAAGTGTTCTGTTTACTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTT:1 + chr2L 17901306 5' - FB 411 1 69.31 CAGGTATTGTATTCGATTGGACTTAATAGATAGATAGATAGATCGAGTGTAGCCTTGACACAGTTGCGTTGCACATAGTGCAAACCGCTGTTTTCGCACGC:1 + chr2L 22215294 5' + diver2 103 2 66.34 AAACCCTTCTGTTGGGCCAGTTTCGCCCTACGATGGTTTTTATTCCTTGGCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGA:1 - chrX 10153587 5' + I-element 425 1 55.45 AAAGGCTTAAAACTCACACCAAATAGTTTTGGCAGATCAAAAATGTGACTAACTTAAGCTTTGGCTGTACTCACGCCATACGATTAAACTAGCATAAGACG:1 + chrX 7644754 5' - 3S18 5955 2 69.31 TGAACAAACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAGTATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 28623906 5' + roo 20 2 60.76 TGTGCACGTTTGGCCCGTAATAAGTGGCTACACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:2 - chrX 16619666 5' + opus 7158 4 70.30 GAACAACAATAAAGTCGCGACGGTATGTATGTTTATTTTGTCTTTTACGTTACGTTTTCTTAGATATTTATGTATTTATTCGGTGAAATAAATGTAACAGG:1 - chr2R 12989018 5' + INE-1 18 1 51.49 TCTCCCCGTCGTTCATCTCCACCTCCAGTTTCTGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTC:1 - chr3R 24617920 5' - I-element 346 1 71.29 ATCAAAATCTTCTCATTAAAAACGAAAACGAACGAAACGTTACAGTTTTCCATTGTGTAACTAACCAACACATGAGCGAGGATCATTTTGTTTTAACAAGC:1 - chr3R 22731424 5' - Tc1 455 1 75.25 CGTCGCTCCAAAAACTGCTTTGCGAAATCCAAAGAATCTTTTCCATCGCCTAAAAGAATATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAA:1 + chr4 855792 5' - 1360 380 1 58.42 ACTCCCTAGTGCTTCTCTTTCACTATTTTTCCCCTGCTCAATTCCTTTTGAATCGCCTGTCACATAATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCC:1 + chr3L 13326216 5' - R1A1-element 4994 1 71.29 GTATATTTCAAATCCTTGTTATCCTTTGTGCTCCTTTAAATGCAATAAGCAACTTTCGGCACTTTCTGTGGTATAGTGTGTGTGTGTTGGATTGGGTGCCT:1 + chr2L 13442085 5' - Quasimodo 7015 2 80.20 TGAATTGGTTCTGGGATTGAAATTGGCCAAACACCAGTGTAATCGTGTTCGCGGATTGGCCTTCCTATGCTCCTTCAGAGCATGGCTCTAGTGGCCCCTTT:1 - chr3L 21766871 5' - gypsy12 9872 2 72.28 AGCTGCAGTAATTCAAGATCAGCTAAAGATTCCAAGACTTTCTGTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTTGGTCAGCTTGG:1 - chr2L 7303883 5' - G-element 350 1 56.44 TTTGGAGGCTGGAGGGCATAATAAAAGCCTTCCTGGTCAACTAGATACTTTGGGCCCGCCATTAGCTTGTATATATCTACATACATATTTACATGTTTTT:1 - chr3L 11560055 5' - G3 4503 1 57.00 GCGTTGTTCTAATTTTAAGCTGTTGCTGCTTAAATTATAGGGGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr2R 22740102 5' - Transpac 5198 2 62.38 CGATAACAAAGAAACAATTAACCAAAGAACTAATTTAGAATGTTAAAATAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2R 5267349 5' + pogo 25 1 57.43 TGTGAGGTGGAGCGACCAGAACCGGAGTAGTAGTACCGGCGAGTAGCATCACTTTCGTCCTTTTAATCTGAATTTCCTCATTGACAAGGTTTATGTGGAAG:1 - chr3R 27235396 5' - Doc2-element 4497 1 64.36 TGAAAGCGTTCTTTCAATTGCTAATCAGTCTGCCAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGG:1 + chr3R 22415131 5' + F-element 375 1 66.34 CATGTAGTAGTGCCGCAAAGTATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2L 7654065 5' + jockey 8 1 77.23 GATCCCTAAGAACTCCTGCCCCGCCAAAAAGGTGGCAAACGGGTACCCGTTTGGGATCCTTCGGGCGAAGCATAAATGCGCGCTTAATTGAATTAATTAAG:1 + chr2R 15728844 5' - HeT-A 385 1 77.23 ATTGAGGCGTTACTATTTCGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr3L 5827948 5' - blood 346 2 55.00 TCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACAGGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 17788932 5' + roo 30 2 75.34 ATCGCCGGCAACAGCAACACGATCGACAACAGCAGCAATGAGCAGCAGGCAGAAGGAAATGTTTCCGACCATATAAAATATATATATTCTTGATCAGGATC:1 + chr2R 11810551 5' + INE-1 80 1 57.43 AGTCCGTACTCCTGGCTCCTGGCGCGATGGTAGATCTTGGCTGGGGATTGACTGGGGGTGCTGCTGTTGGAGTTGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAG:1 + chrX 8172867 5' - G6 1617 1 75.25 CACCCTAATCGGTCAATCGGCGAGTGCAGGGGCTGACCGTACAGTAAGACGCCTCCCATACGAATTTGTCCGCCATCATAGCAGCAAGCAGGCCTCT:1 - chr3R 6273941 5' - Rt1a 4666 1 55.67 AAACAAACGCCTTGGCATCGCTTTTTGCTCAATGCGATTACCTCAAACAATCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGA:1 + chr3L 7864936 5' + I-element 4931 1 69.31 TACCCATGAACTATTCCTGTATTTATCTTTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGG:1 - chr2R 15959544 5' - Copia1_DM 133 1 75.25 TCACTCTGATACGTGAACCGTGATGATGAACAATTAGGCCACGCAGCACGAATCATTTCATAAAATGACATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACT:1 + chr2L 5158418 5' + Doc3-element 4660 1 67.33 AACGTTCGACATAATTAAAAGCGCGCGCCGTTTACGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAACTATAGCT:1 + chrX 2782236 5' + I-element 5272 1 63.37 CCTCGTCCGCCCAGCCTGCCACGCCCTCCCCGCCCACACAAACATGCTCGCACATAGAAAAACTGTTGGAAAAAAGAGCAGATTTTCCGGAAGAGGAAAA:1 + chr3L 4978590 5' + HMS-Beagle 447 1 66.00 GCCTGCGAAGTTGTGAATCATATAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 9552150 5' + roo 53 2 79.21 AGTTTAAAAAATTCCATGATGCTTTCTGCTCCTATAACCCGAGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCGACCAGGGGGACTACCTCAATGAC:1 - chr2R 5078411 5' - R1A1-element 4971 1 57.43 GTTTCCTCGGCTTGTTTGGGGTTTTCGTATTTCTCGGGGTTTTTCTTTATTTTTTTGGTTTGTTT:1 - chr2L 20295756 5' + Tc1 1403 1 93.85 ACTGCGACGAGAGCAACAAATACGAAAAGGTGGCGAAAATTGGCCAAGGCACCTTCGGGTAAGTCCCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAAT:1 - chr2R 22637442 5' + I-element 4921 1 72.28 TAGGAATCGATGTCGTTGCCGTTGTCTCTGGCATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGTGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCAC:1 - chrX 22787131 5' - F-element 4380 1 66.34 AGCGGTATCAGGCTGTAATTTGTGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 9193580 5' - roo 9049 2 57.14 TACAGGAATCGGACCCAAAGTGGGTGTGCCCAATTGGCCTATAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATG:1 - chrX 10163673 5' - 17.6 7047 2 58.42 TAGGAGAGACATTAATACCAAATGAAAATTGAAATTATGTCTATACACTCGACAAAGTTTTACGGCAGACAGAGAGAACTTGGGCTGCGTAAGCGGTTTTG:1 + chr2R 14698716 5' - Quasimodo 6953 2 83.17 GAAAAATTGTTACGAAAAATGGCGCGTTGTTGCTTGTAAAATGAATCCATTGTATATGTAAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAA:1 - chr3L 27253596 5' - roo 385 2 49.50 TTTAGTTTTAAGCCTAGCGTGGCATTAATGGGGATTTACGCATCAGAAAAGTAACCGATACAAACAAGCATATTCCGAATGAAAATGAAATAAAATAAAAT:1 - chr3R 7879882 5' - transib1 1900 1 53.47 AGATTGGTGCATGCCCATCGACCGCAGAAGTGTCCGCAAGTTGTCCCCAACAATTTCATATCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCG:1 - chr3L 19696500 5' + R1A1-element 193 1 63.37 TAGTATATTCTTGAACCTTAATCCCAGATCTCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATA:1 + chr3L 18228394 5' + I-element 4922 1 73.27 GCAGCGGCAACAAAGAAAATATAAATAATATGGATCCACTCCCGAACTCCTTCTGGTACCGCTCCGACGCACTATCTCCTTCCACTCGCGATCTTGCTGTC:1 - 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I-element 4950 1 72.28 GGACATACGGCTGTTGGACAAGGAGATGCGCCCGTGGGACACGTTCATCAACCTGGAGTCGACGGTCAAGAACATGAACCTACACACACACATACACACT:1 - chr3R 21037155 5' + accord 7101 2 76.00 GAAAGCGATTTCCTTTCTTTTTTAGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGAGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATA:1 - chr2L 3409152 5' - blood 36 2 46.53 GTTCCGATGGCCTATACGCGACAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAAT:1 + chr3L 27412536 5' - hopper2 1357 2 78.22 TTAAGAAAAGCTCACTTCTGGTTACCTAATATCCCTTTACCCCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAAT:1 - chrX 21337124 5' + hobo 2687 1 64.36 GCCTTGTGCCCGTATTATAATTGATACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTA:1 + chr2L 2310772 5' - invader4 304 2 48.51 GTCAGAGCTGTCAATTCCGCCAAAGTGGCTGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTAAATCTTTTATGGT:1 + chrX 2347773 5' - baggins 5075 1 67.95 AAACGNGTTTTCCACTCAAATTTGCATTCAGCCAAAGAAATACAAAGGTCTAAGGAAGGAGGAAGGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTA:1 - chr3R 17909411 5' + Doc 4420 1 66.34 CATTTTACTAAAATACTGTGATGCATATCTCTGAATAATAATAGGTTATTGTACTCTAATTCATGTACACCTACATTATTATTATTAATTAATATTATATT:1 + chr3R 14750458 5' - Burdock 412 1 42.57 ACGAAAACACACAATAATGGAAAAAATTCAATTATACTGGCGATGGTGACGCCGCTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAAT:1 - chr2R 19476451 5' - gypsy4 6374 1 62.38 AAGAGCTTATTTGATTCCTTCTTATTGTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATTGTTGAGCTGGTATTTGTGTAGGTGCAACACAGAGGCAGACTCGAG:1 + chrX 8947338 5' - Stalker2 443 1 72.28 GCAAAGCCCCCATCCACGGATGGGAAGCATCAGGTTACTACGGATACTGAAATTGTAACATTGGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAAT:1 - chr3L 241705 5' + I-element 419 1 67.33 GACTGGAGGCACCAGGCAACCAGAAAACACAGCAGGTGTTTCGCAGGCGACAAAATTCTCAAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTTCTGA:1 - chrX 3704472 5' + gypsy12 9988 2 64.95 GCCAAAATGCGCAAGAAAAAATTTAATTCAAACGGTCACAAAACGGGAAATGCAGTAGGGAAATAGACAAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 - chr4 1030015 5' + jockey 4669 1 77.23 GTGTTAAGCAGCTGTCCGTTTTTTTTGTTTTTTGCTATTGCGTCTGCGTGTTTGCCACATAGCTGTGCGCCATAGGTCCAGATGGGTTTCAATACAGAATT:1 + chrX 17963832 5' - F-element 4244 1 56.44 CGGTAGCCCGCAAGCCCAATAATTTTATGTAGAAGAAAATAAATATTCGAAAAGACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 9374900 5' - roo 9051 2 56.44 AATTAATCATGGGAAAGTGGGTGACTTTTATTTCTGTCATTACGTATCTACTCATCATAACTCAATAGTTTTATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCG:1 + chr2R 9306707 5' - Bica 79 1 75.25 CAAGGGAAAGTATGAAAATTGCAACGCTCACCAACAACAACTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTACGCTCTCAGC:1 + chr3L 24934401 5' + Porto1 488 1 72.28 TATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chrX 2766802 5' - mdg1 367 2 80.20 CTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 - chr2R 4024224 5' - Tirant 8429 2 55.45 TAGAATAAAGGATGAGGCATAAGTAGCATAACTGACAGACAATCGACAAACAAACAGATTGCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGC:1 - chr3L 22683756 5' + jockey 4663 1 69.31 GGATCAAAAAGTTAGTCAATTTCAGCGTGTACAGCATGCAGCTGATAACACGTCTGTCCATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTT:2 + chr3R 6143784 5' + rover 6960 2 69.31 TACACATATTATACTTACAAATCCATTAAAACTTCACATCTTATCAATGCGGGTGGTATGCTGCTCCGGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTT:1 + chr3R 13766769 5' - 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chr3L 14008797 5' - F-element 469 1 54.55 ACTTTGCGACTTTACTCTGAAGTTGATTCGCTGGATTTGCTTTCTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCT:1 - chr2R 10125880 5' + Cr1a 4365 1 70.27 GGTTTCCAGGTTTCTGCCAGCCCGCCTAGATTCGCATTTCGCGGAATTCGAATTCAAATTCAAATTTGAACTAATTAAGTTGAACTAAAATTTGAAATATA:1 + chr2R 9984304 5' + Rt1a 344 1 59.41 TTTGCCACTACTCTTAGATCAGAGAGCTTCGATCCAAAACGAACTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAAAGCATCATAGCGGCCTCTGCCAATGCGCAGA:1 - chr2R 18049916 5' - springer 99 2 66.67 ATAATTGGCAATAGATACATTTTTGAAGACTTCAGACTACGGAAATATTAAACTCCTTTAACGTGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATAC:1 - chrX 8988729 5' - Doc3-element 4558 1 68.32 CACAANCACACACAAAATTTTGGGTATTGTTTTGTCGAAACATTAACTAGAAATGACTTAGGATATAAGTCATAAGTTCAAGTATCCAATAAGAACCCCAA:1 + chr3L 8944857 5' + Quasimodo 121 2 58.42 TAGTACGTAATGGTAATAGGTAATGCCATGCACACAGCTATACTTACATACATATGTACATAGTTGGCCAATGTCAGAAATATATAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 23449590 5' + Rt1a 5069 7 50.50 TTGCGAAACGATAAAGGAGCAGAGAAAGAGGACGTGATAAAGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCA:1 - chrX 12206548 5' + F-element 178 1 59.41 CTTCGACAATTAGGCAATAGGCAGTAGGCTCCTCTAGTAACAATAGACGCTGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGACACACCCACTCTAACGCCCACAAAC:1 + chrX 6965780 5' + INE-1 218 1 58.42 CACCAAGGACATCAAGGAACTGTTCGGCACGAATGTGGTGGCCACCGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 + chr3R 22352756 5' - 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gypsy4 6601 2 73.74 GAGTAGGAAACCAAACAATCGTGAGATTAAGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr2L 222103 5' + P-element 43 1 36.63 GGTCANATAGATCGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 13824344 5' + roo 8690 2 60.40 TCCTTACCGGTATACCAAAAATGTTTGGAAAGAACTGCCGCGAAAGATAATACAAAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCT:1 - chr3R 14154817 5' - hopper 102 1 60.40 GTCTGAACTTAGCATGGGGATTTATTTTGCGGCATTACCTAAGGGGACCAATGAATATGATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTT:1 - chr3L 18844535 5' - Idefix 7242 2 68.00 GTCAAATCGCCCACGCTGCTTTTCGCTCTGCTTCTTCTTCCTGCCACTACGTTTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTATTGCTAGCTTATAA:1 + chrX 3685663 5' - invader3 113 2 56.44 ATGACCATTACAGAACGAAGTAAACAAGAAAATGACATTACTCATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3R 908372 5' - copia 221 1 59.41 CGACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chr2R 18891025 5' - opus 7492 2 62.38 GCTTTCTAAACGAAAACGGATAACGCCACAAAAGATTTCTTTGAAGTTGAAGGGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGG:1 - chrX 16582620 5' - F-element 417 1 63.00 GAGCAGGTAGTGACGACAATTGCATCGGTATGCCAGAAAATTATAGAATTTCGCCCTTCGCCCATCTTCCTGATAGTACCTGATAGTCGGGGAACTCGACT:1 + chr3R 4652187 5' + INE-1 562 1 77.23 TGAAGGACACGTGTGAGCGGGAGCGGGCAGAATTGTTTGTTGTTGGAAATAGCCGCAACAACAAACAATTCCGCCCACTACAATTCATGGTCCTTC:1 - chr3L 5502096 5' + Max-element 309 1 52.08 AAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chr2L 14536313 5' - blood 345 2 54.46 GTGAGTGGAAATTGGAATTACGTTTGCCATCTTCGCTGGGCATGGGTTCGACTGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCG:1 + chr3L 4644355 5' - Tirant 8197 2 52.48 ACGGGGGAGAGAGAAAGATCTAGGGAGCGTGGGGATGGGCAGCAAAAGGTTTGGTTTCGGATTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGAC:1 - chr2L 4874339 5' - Doc 303 1 66.34 CCAGAAGTTTTTCACACGTAGAACCATTTGAGTGCGTCGAGTGTAACTTTGCCTGCATTTTGTAAGTAGCTTGAACGGTGACACTAGAATAACAAGATGCA:1 - chr2R 20153278 5' - 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chr3L 9981236 5' + Cr1a 4030 1 61.39 ACCTTCGCCAACACTCTTTACGGGATTTCTGAAGTGAGACTGAAAGTGAGTAAGTCTGCTGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAA:1 + chrX 17437595 5' + Porto1 242 1 66.34 GGAGGCACAATTGGTGATTGCCGCCCAAATGAAGAGTCAAGAGCGGACTCTATTGGAAATTTGGAGCGTAGTGAAGGTCGCCCAACCGTCCGAGGGGCGCA:1 - chr3L 11792206 5' - Cr1a 4414 1 56.44 CAAAGGCCCTGAAGCGAGTGGTTGGAACGTCCTCTTCCCCTGTCAGAGCCTAGGGAAGTCAAGCGCAAAGC:1 - chrX 21386019 5' + G-element 449 1 73.24 GTTTGGGACTCTGCGGAACCACAAAGCGAACATTTTATGACTGTTGAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGGG:1 - chr2R 17339796 5' - I-element 5065 1 63.51 GAGCGAGACCAACACAGTGCTTGCTAGCATGCCATCCCTCTCTCGCTATTTTGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGATTGCTCTCGTG:1 - chr3R 8191061 5' + Cr1a 340 1 64.36 AGATCTAATCTGCGACGCTGAGAACAATGCAAATAAATCATCATAATTATTGATTATAGTTGCCCACACAAATCCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 + chr2L 1925659 5' - accord 7031 2 76.29 TTATCATGCTTTTATTGCTAGGATTCAGTATGATTTGAGGAATCAGTTTCAGATTTTCTAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCAAGACTTTT:1 - chr3L 11395642 5' + 1731 196 1 61.39 GGCAGCAGCAGCGAATCAAGAAGTCATCAGTATGGTACAATCAAAAACATTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCACACACACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 - chrX 4975482 5' + 1360 48 1 59.41 CTGCGAGCCACGTACGGTTGAAGAGGGCCCCAGAAGCCGAGAAGCAGGAGGCGGTGCTCCTTGGTAAATGAGAACCTGGGACATCGAAAGCGATCTCAAGG:1 + chrX 3886909 5' + jockey 4589 1 58.42 GCTCTGTTACAAGGTTTATGGATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chrX 2253830 5' + Tirant 8141 2 59.41 GCCAAATTTAAAACTGTTTACGGAACGTAATAGCATTTACAGAATATGATGCATTAATCACAAACACTATCACCAAGTGAAAGTTAACTAAGCTAGATTAA:1 + chr3R 10875255 5' + Doc 4620 1 54.46 TTGGTTCACGTGGAGTGTTTTTTTTACGGGTTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCT:1 - chr3L 2936988 5' - Quasimodo 4 2 68.32 AGTTGCGTTGGATATCGAGAAGAACACGCACTTGGCGAAATACAGCCATCGTCCCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 + chr3L 26852022 5' + diver 24 2 55.45 GAGAGGCAGTCATTTTATATTCAAGCATTTAACGGGGAAATAATTTTTTCTGATTAGCAGCAATTTGAATATGTCGCAGAACATTTAAATGAAACGAAATT:1 - chrX 22383365 5' + invader1 9 2 33.66 GTTTCAGCTCAAGATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGT:1 + chr3R 14882060 5' - gypsy5 7346 2 66.34 AAACATTTTTGATTTAACTGAAAAATTCTGTTATATGCATTGTATTTTTTTTGCAGGAATGTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAG:1 - chr2R 6247331 5' - roo 394 1 65.35 ATTCTAAACAACCCCGTGAAAATCAGCAAGAATCTAAAGAAATGGCTTATGTGAGTTTGAAATACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chrX 13259205 5' - pogo 2091 1 69.31 AAGCCGAACCGAACCGCAAATGTTATAAAGTGGTTTATCTCCTGGGATGCAAGTGAGAGTGTTTAAGAAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTA:1 + chrX 10425411 5' - Doc2-element 475 1 70.30 TATCTATATAGACGTGGTCCATTGTACAGTGGACGTCGTTTATTGTTTTCCTATGTCATGTCCGACAAGAGCTGCTCACTATGTGTGTGTGTGTGTGTTGT:1 - chrX 4567676 5' - accord 7028 6 72.28 TGTACAGAGAATTAGGAGAGTCATGGGATGCGATTGTCAGTTTAGATCGGAAGAACATCCTGCACAACTTGGCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGACTT:1 + chrX 6132328 5' - HB 1201 1 63.37 AAAATGGCGCGTTGTTGCTTGTAAAATGAATCCATTGTATATGTAAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 27253581 5' - roo 9033 1 63.37 AATGTAGCTAGTGGTCAAGGGCTATCAACTAAGAAGAGATTTATGGATATTGAATGTTTATGGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGATCAAGAAGATAAGA:1 - chr3R 26800508 5' - Ivk 117 1 62.38 GCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chrX 1399916 5' + P-element 43 1 36.63 TTACACGAAGAGCATTAATTTTGCAATTTTACTGGCGCTTCTTTGCCATACAGCGAAATTAAATATATTAACATACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr2L 20465689 5' + blood 7013 2 77.23 AACAGTAGATAATGCTTTTCTATGCTATGTTGTCTTAAACATGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr2R 4901622 5' - Transpac 303 2 70.10 ACGCGGGATTATTAGATTACCAAAAGGATTTCGAGATTTTTTAAAACCCTGTAATACGAAAGAAGTTAACTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGCG:1 - chr2R 4519011 5' - Q-element 224 2 59.41 AAAAGACTAACAAAATGCCAGCGAAGTTGTGAATCATATAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 9552134 5' + roo 37 2 63.37 GAAATCCGAGGCTAAATGGCTCCATCTAATAAAAAAAAAACGGCAAGTGCATTTCTGCGGTCGAAAGAGATGGCGTAAAGAGCGAGAGAGTGAGTGAGAAA:1 + chr2R 14789374 5' - Cr1a 287 1 61.39 TCCACCACAAGTCCACTCCCATTCCGATGCACTCCCTGTTCGTAGGGTTTGGTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTAC:1 - chr2L 395165 5' - Quasimodo 6906 2 56.44 GTTCTGTTATGTTAATTCTAGCTGGTAGTTCGCTTTTCCATTCCATGTACATCAAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGG:1 + chr2L 13084086 5' + jockey 224 1 64.36 GTTCATTAACGCCATGAATGATTAAATTAAAACCACAATTACGAGCGACTGCTAAAAAAAAAACACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 5625662 5' - hopper 147 108 79.22 TCGACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2R 18891024 5' - opus 7493 2 63.37 CCATATGTTATCTATTTACCCTGTTAAGTCTCATTTAAATTAGGGGAAAGAATAAACAGGGTAAATAGATAACATATGGTACAGCTGCGGTCAAAATATTA:1 + chrX 13127991 5' + Tc1 1 1 75.25 GCGCTTCTTTGCCATACAGCGAAATTAAATATATTAACATACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr2L 20465655 5' + blood 7047 2 64.36 GGCTATAGAATATTTGTTTCGATCAGTGGTGTAGTTTTCGATGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTC:1 - chrX 7593041 5' - G5 4598 1 63.37 AATGGAGTCTGCATGTGAGCATCCAGGCCAACATACGCCTAAAGCAACTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTC:1 + chr2L 11177792 5' + G2 2612 1 80.20 ACACTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTACGAAATCTAAAAATAGAATT:1 - chr2R 1982173 5' - 1360 3273 1 65.35 CTATTGTGGGCGAAGGCTGAGCACTAAACATAATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATATCAGTGCTTTGGACTCGAGAGTTTAAGATAAAAAATACCTATG:1 + chr3L 12072559 5' - HB 1586 1 64.00 CCTGGCTACACCTGTGGCTAATATGATGATGGAGATCGTGGCAATGAAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAG:1 - chrX 3812252 5' + transib2 2744 1 52.48 CTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr2L 9823627 5' + hobo 26 1 55.00 AACGCAAACAAACAAAACAAGCGCCGCAGTCGCAGCGACGTTGCCCGCTATTTGAATGCCTGTCACACACACATAGGACGCACACACACACACACACATAG:1 - chr3L 20771256 5' + accord 7029 2 56.44 TGCACCCACCACCACAGGCACACCCACTAACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGAC:1 + chr3L 8573236 5' + Ivk 5122 1 79.21 AGCTTCCGCAAATATACTTCAAAGTTTATAGTTTAGTAAATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATAAATTATCATTTTAGTGAATTTTCCAT:1 - chr2L 8967117 5' - Burdock 250 2 74.26 CAAGTCTGTCTTATCATCGTACAAGAATATGTCTAGCATTGAGATGCCATCGAGTAGCTCGCTGGGTCACCTCTCAGCCGGAGAGG:1 + chr3R 14270150 5' + Rt1a 4649 1 74.42 AAGAAGAGAGGGGAAAACAGGCACGAAGAGGCTCTGGTGTCCGAGTCGAGGCGGTACAAACCTCCATCCGTAAAAGCCAGGGGGAAATCCGTGGCCTACG:1 + chr2R 24090333 5' + Rt1b 301 1 74.00 TCCCGCCTACACAGGAAAGAAATAATCCCTTCAGACGAAGCGAATTTACACCATTTGGATAACGATATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGA:1 - 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flea 4974 2 65.35 ATGTGTGCCTTTTTATTTTTATTTTATCTCTTTCTAATCCAATGGTTTATATTATGAAATTGGTTGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAAATGATCAGCAA:1 - chr2R 3129235 5' + Tc1 459 1 59.60 TTCAACCAGAAATAATTTAAAAAGACAGTTCCGTTTAATTGCACCCACATGGACTCCCTCGCTCGCACACACACACACTCCTACACACACACACACATAGA:1 + chrX 8989033 5' + Quasimodo 36 2 77.23 AAAAATAAAATATTTGTAATGTGAAACGGGAAATTGGCGAAAAATGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:2 - chrX 10661009 5' + HMS-Beagle 30 2 57.43 GAGTCCAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTC:1 - chr2L 3273894 5' - gypsy5 7297 2 78.22 TTTTGTAACTTCGAGTTTTTTAATTTTATACCGCTACACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCT:1 - chrX 7847228 5' - hopper2 1564 1 72.28 GGTTTAAGTGCATTGAATCGGTTGGACGCACTCCGCGTATCACTATCTGGAAATACTGATTACGCCTATCGATTGCACCGTTCGATCCGCGACATCCCCGA:1 + chr3R 12688148 5' - aurora-element 4039 1 63.37 AGCGATGATTGTGAGATTGTAACACCTCCAAGTACTCCGCAAAATCGAACGCCATCATTAAATGAATCGCCAAGGACGAAAAAAAAAGGAAAAAGAGGAA:1 + chr3L 11066695 5' + Bica 343 1 82.00 CTAATTCCATTTTATTATGTTAAAAGTGAGGAAAAGTCCCAATCAGCCCGACCAAAATGTTAAATACTTCACCCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATC:1 - chr2R 18513768 5' - transib2 2562 1 67.33 TGTCACGCATTTTTTGTGAATGAAAAAAGCCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGC:1 + chr2L 7133703 5' + diver2 158 2 74.26 TTTCTTGCCCGAACAGCCACCGAGGAAATTGCGCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGACTTCTTCGACACATATTGTTTAATATCCCCCTACAGGTTTTC:1 - chr3L 18483252 5' - HB 1162 1 69.31 ATTCTCCATTTTGTGTTATTACTTATTTCTTAAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCAT:1 + chr2R 3600777 5' + accord 450 2 68.32 ATATTTTGTACTCGTTTGGTAAATCACAAATGTGGCATAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 - chr2L 9823692 5' - hobo 2901 1 70.30 AAAACTTATCATACTTTCAGAGAATTTGTGGGTTCACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 21266435 5' + roo 39 2 69.31 ACAATCGTAACAGCCAAACAACAAATGCGCACTAAATAAATATCCCAAGTCTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTA:1 - chrX 2530612 5' + 1360 85 1 60.40 AAAATAAATCACGCTCATCTAGAACGATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chrX 17479605 5' - I-element 5307 1 71.29 CCAAACGAAAAGCGAGCAACGACCAGCGGGAAAACTCTGCCGCCACAGTCACAGACGGTCCTCGAATTGTCTTGCGACATTTCCCGCAGTCAAGGCCTGCT:1 + chr3R 28141152 5' - baggins 429 1 57.43 CTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTT:1 + chr2R 4577073 5' - Chouto 499 1 57.45 AAAATTATTGTATTTCTGTTTTAGTGCTAAGTTCTATGTTCGTAGTACATCTCTGTTCTCTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTT:1 + chr3L 21075655 5' - G-element 14 1 63.37 CGTATGTGTATTTATTTTTAAAGCCAATTTTATGACGCTCCATACGATTTTTTTGCATACGCTTTTTTCGCCGTGGCTTTAGAGGTGGCTCCAGGATCTCT:1 - chr2L 1987163 5' + 1360 72 1 61.39 TCCCCTCCTTGACCCGATTAGATCTCACGTGAATCAGGGCAATCAATATGCATAAAATAGCAATCTCTCATTGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGA:1 - chr2L 10534213 5' - Doc 4377 1 76.24 GTCATCAACGCGGAAAATCAAGTGTAACTTGCTACAAGTGCGGTGAACAGGGTCACATCAGTTACCAACGCAATCAAGGAACTTAAGGAAAAATACCATAG:1 - chr3L 26057564 5' + F-element 4434 1 57.43 GAAGTCTCAAGGGTTAATATATCATTATTGACTCTATTGTATTTGAATAATTGTCGTTTAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAG:1 + chr3R 12801191 5' + invader2 4826 1 63.37 CATAACCAACGCGACTTGATTTCCGAGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCA:1 + chr2L 5302218 5' - Bari1 1530 1 74.00 AAACAAATTGCATGTGCAAAGGGTGTGGCTGCCCGATTCTTCCCTCCCGCCGTTGGCACACTCCGATTAGGAGCATTTTTTGGTGTTGCCACCGAAGTAGG:1 - chr2L 17832894 5' - baggins 494 1 79.21 AAGGGTTCACGGCCCTTTTGAGTGAGCATGTGCCATGGCTTGGGTCAAAAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTACAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTT:1 - chrX 7672252 5' - INE-1 174 1 60.40 ATGGAGAATGCTTAGCACAATTTAGCTGTTTGTTTGGCTAATGGAAATTCACCAGGCGCACAGTGCGTGAAGAAAGTAAGCACCACTTCCACGGAACACTA:1 + chr2R 13560751 5' - R1A1-element 82 1 80.20 AAAACCACTGGTTTGGGTAAATCTGAAAGGAAATCGTTGTTTGAAAAGTCATTTGTGTAGTTTTTATCTCGAGCCTTACCGTCCCTCTGGTGGGAGTCGCG:1 - chr2R 19429538 5' - Quasimodo 328 2 81.19 CTTTAATGTAGCTTTTTATAAAGTGAATTACTCTTAACATAAAAAAAGCACTCTCAATAATGCCACGCCCCACTATAACGCCCTAAAACCGCCCAAAGCTG:1 + chr2R 12992724 5' + INE-1 347 1 60.40 CCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3L 3254989 5' + 1360 49 1 75.00 TCGTTACCACCGCTGTTGATCGATATTTTAATTTTATTAAAATCTCGACGTTCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTGAT:1 + chr2R 25240190 5' - INE-1 93 1 54.46 CAGCAACAACAATTAGCTGCAACTTAAAAGCAATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAA:1 + chr3L 17109801 5' - roo 447 1 83.17 AACACGCCCCCAGAGATCCACCCCCTCCCTTATGAGACTCCTGTGGGTGTGTCTTGCGCTCGTGTGATTCTTTTAACAGCTCACTTGAATGTTTTGATCTT:1 - chr3R 18245279 5' + Cr1a 377 1 61.39 GCCGATAAAACGGTGCCACTGCCAAAGAACGGTCGAGGTCTGATTGCCATTGCCTCGAAATTGGCCACAATTACCGAGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTT:1 - chr3R 6223210 5' + jockey 4645 1 79.21 TGTATGAAATGTGCGTGCTATGAGAATAGCCGTGCATGTGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTACGTAATGTTAAATATCATGATTTAT:1 + chr2L 8852006 5' + Chouto 6220 1 62.00 TTTTGGCCGCAGTGTAGCTTGCGGCACACACACAGAAAAAAAGGCAAGCTAAAGTACACGTTAAATTAATTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGA:1 + chr2L 17635634 5' - 1360 410 1 46.53 ACCTGCTGTTCGGGTACAGCATGACACAGATGGAGCCATAGATCCGGAACAGGATACAGCATTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATA:1 + chr2L 12432120 5' - accord 46 2 65.35 GGGAGTTGGGAGTTAATGGTACGACGGATTTGTTTGGGGTATGGGCGTGGTGAGTTAGTTTGTAAATTAGTATTCTTTTTTTGTAATCTTGGCTTTTAGAC:1 - chr3L 21933555 5' - HeT-A 5879 1 67.33 CCTCANAAATGCTGTTAACATTGAAATGTCATAATTCAAATGGAATTGTTGTCTTTGGTGGGGAAAAGTATGGAGGGGGGGGGAGGAGTTAACATACCCCC:1 - chr2L 3150328 5' - accord2 210 1 81.19 CCTCATTAGGCAATCAATTGGCAATCACCACTTGAGCGTATCGACAAGCCATTAAACAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 14582818 5' - roo 389 2 59.41 CGAGTTTCCGTAATGAGGCGGACACACCCCACAGATCGAAAAACCAGATCATATCACCTGTCTGCCGCCAACTTCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTT:1 + chr3R 25755900 5' + 1731 4520 2 54.46 TGGAGGGGGGTGGAGGGGGTTTTGCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCG:1 + chrX 16677081 5' - accord 7011 2 76.24 GCATGAGAAAGAAATCACGTCGCACACGTGGCCGACACACAAATCTTTGAGCCGCTGCTACCTTTACACTCAGACACACAAGAACACACACACACACACA:1 + chr2R 19083974 5' + accord 180 2 33.00 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3370 1 56.44 TCGCACAACAACAACAAATTAATTATGCAGCAATGGTCTCGTGATTGGTTGTCACACTTGCAAACTCGTCCTAAGTGGTGCCAAATCAAAGAGAATCTTAA:1 + chr2R 14491709 5' + diver 5618 1 70.30 CGTCGNGTCGCTTTTTTCGGGACAAACAATTCGAAAACTTCTAAGGCATCGGAAAATATTTATTTATGACATTCCAAATCGCCTCTAATTGAGATAAGGCC:1 + chr3L 2606377 5' - mariner2 530 1 73.27 GGTGGAAAACGAGGGGCACACAGGCAAGCATGAGAGAGAGGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGC:1 - chrX 570255 5' + invader1 3786 2 60.40 TACATACTAAAACGGATGACGTGCAACGTCGGCAGAAGCAGCGGCAGTGAGAGACGTTGGAAATTTGTAGCTCAAGCTCGGCTGATCTGTATCCATGCGCA:1 + chr2L 160654 5' + Quasimodo 7129 2 70.30 AATTGTCAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 697505 5' - roo 9031 1 66.34 AATTTTTTTAAACAGTTTACTCGTCAATTTTCCTTTGTCAGAGTAAGAGTCTATGTCTCTAAAAAGGGCATGGCACAATCTTAACTTTCTAGCTTTTATA:1 - chr4 1054334 5' - INE-1 162 1 64.00 TAGGCCTTCGAACACGTCGATGCACGCTGAGTGAAGAAATCTGAAAACCCATTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGG:1 - chr3L 18403382 5' - diver2 206 2 68.67 GCACTCGGCAATTTTCGAATTGACATTCTAATATTTGTACGCAATTTACGCAGAGAAAAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTG:1 + chr2L 5395620 5' + blood 7379 2 68.32 TACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chr2R 21937522 5' + 412 56 2 78.22 TTGAATGGCGCATGTGAACTTGTGCGAAATGTTTCATCTCTGTTTCATATTTTTCGCAATGTGTTGCTTTGCGTTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAAT:1 + chr3R 5266293 5' + S-element 315 1 78.22 TTGTGGCGAACTGATCTTGGGGCCATCTTCGAGAGACATTCCCAGAGATGCGGAGAGCAAACCGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATGTTATACATA:1 + chr3R 30500324 5' - Tirant 8327 2 67.35 CTGCCCAGCAGCTACAGGAGTCCAAGGATGAACTTAAAAAACTCAAGGAGGACCTCGAACTCGGCAGCGCCCCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCG:1 - chr3R 27516548 5' + Cr1a 4428 1 62.38 GCGCGGTGTGCGAGGTCGTTTCACTTTGTCTCTCGATTGGCTCGGGCGTCCAATGAACCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 20084849 5' + 412 7072 2 58.42 ACTCCCCACAAATCTGGATGCAGGGGAGCGGCCTAGCAACAGCGAAGACAGCCGCGACGCAGGAAGAATCAAGGGCACAGGGGTCGAACGGGAACGGTGCG:1 + chrY 32441 5' + gypsy8 135 2 70.30 CAAATTAATCACAAATATTACTTGTGCTTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1 - chr3R 8480465 5' + transib2 45 1 69.31 ACAACAACCAGGAGCTGCCCCATGCCACCGTCCTGAGGCAACTGATCCTGGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAAGCT:1 - chr2L 879183 5' + Stalker2 7452 2 57.43 TATTTAATCCCGCAATAATTAATTCATTACTTGCACCACCCAGTTTTGTTGCTAGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAA:1 + chr3L 18689757 5' + Cr1a 426 1 60.40 TTGGAAGTGTTTTGCTGTGCGAATTTGTTATCGTTATCGTTACCGACTCTTAGTTCTGCTTGTGCAAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTG:1 - chr2R 11812918 5' - 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R1A1-element 139 1 69.70 TCCCATACTGAGTTGAAAATTACCCAAAAAGCCCTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTAGTCCGGCTGCGCCAGTTACAATCCTGTGGCCGAGGGAGGAA:1 + chr3R 10183656 5' + accord2 7443 2 66.34 ACCGAGGAGCTGCAGTCGTTGTCGTATAGGTGCTGAGGTAGTTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTA:1 - chr3L 15549828 5' + 1731 423 1 61.39 AGGCATATTGCGTGTGTGCTGCCTCATGAATAATACATGTGCTCGAAGTGGGCGTGGCACGTCTGGTTGTATGTCTAACTGGATATGCGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 20419871 5' - accord 7032 2 57.43 ATACATAGGATGGGATATTCAAAAGAGAGAGAGAAGATATGTATTACTCAAGGTACATATCTATATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTA:1 - chrX 9393235 5' - I-element 366 1 69.31 AAAAACGCCCACACCTCAGGGGGTCAACCTGTCGATCTCTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTC:1 + chr3R 18101121 5' - flea 126 1 61.39 AGAAAGTCCCTCATTTAAAAATTAAATGCGGCAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr2L 2645257 5' - mdg1 377 2 68.32 TGATAGAGGTATACTAAGATAGCATTTAAGCACGTGTAGTTCTGAGTCGATTTAATTTATATTATGTGCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2L 21293029 5' - roo 401 1 73.27 TAGAGGAAATACTCTTTATTTAACAAACGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3R 18170670 5' + pogo 25 1 67.50 TTTATGTACGAACAAATGAAGGAAAATCTCAAGCCTAATTCCGCATTAAGCTGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr2L 15020087 5' + jockey 4691 1 55.45 CCAGGAGAATGGACGACGCTCCTTCAAGGGTCCCACGTAGGCTATGGATTTCTCCCAAGCTCGCCTGATGGAGGTTAAATTCATCTGCACGTACACCAA:1 - chr3L 867540 5' + Porto1 421 1 73.74 ACCGAAATCCCACCGGAAACAACAACAAGAATAAGCTTACAAATAAAGATTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTGGGGACGGTAAATTAATTAAAAG:1 - chrX 159058 5' - Cr1a 3989 1 73.27 AGAGTGAAAAATCAAAAAACTAAACCCAAACTAAATCAGAGCGACAACTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTC:1 - chr3R 11597535 5' - 1360 113 1 57.43 GCAAGGATATCTGTGTGTCAGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 24545611 5' - roo 9017 2 80.20 GACACACATTGATTTCATATTAGAACTTTTTATTTTAAGCAAGGAAGGCAAGGGAAGGCTATACTATACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTAC:1 + chr2R 5884994 5' - R1A1-element 4980 1 71.29 CCGCTGTGGTCACCTGGCAATCGGAGTTGCGGTAAGGTAGGTAAGGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTT:1 + chr3L 18253110 5' - BS 4823 1 55.45 CAGCAATTTGCGTACGTGGCAGCCGCAGAGGGAGAAGACCAGGATGTTGGGATGTAGGGGGATGCTGTCCTGGAATTCAAATATGCTGAAAGAAAACACTC:1 - chr3L 22875424 5' - GATE 216 2 57.43 CCGGTNTTCCCGTCAGGCCGTTCAGGAAGGGCTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTTGGCGGACGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTT:1 + chr2R 12184129 5' - Ivk 5012 1 66.34 CACAGATCAACAAGCACTTCTACATCCACAGTGCTCCCGAGGATCACGATGAGCAGCTGATCGTGATTTCCGCTGATGGCCTTAACCCCGGCTTGAGTTTC:1 + chrX 16731671 5' + Gypsy12A_LTR 230 1 60.40 ATCTATTTGCATATTAAGAGAGTTCTATAATATCTCCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 7375332 5' + roo 8705 2 68.32 TAGGAGGATGAATATTCATTTCACGAGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3R 22675790 5' - 412 478 2 61.39 AGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAG:1 - chr4 829449 5' + INE-1 566 1 46.91 CCCAGTGCGCCTGCGCTGCCTAAAACTATCTCAAAAACGTGCAACAAAAATTGCTTTCCTGAGCAAAGAAGCTCCACCCTCGATCACGGACCTAACTGGCG:1 + chr2R 17187372 5' + Tirant 402 1 71.29 TTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr2R 19726911 5' - 1360 3346 1 68.32 TACTGGCTGTACAATTTTCCATAAGAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATA:1 + chr3R 7770877 5' + X-element 56 1 65.35 AGAACTGAAAAAGAGATAATACCTGAGAGCTTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 - chr3L 3485046 5' + diver 5910 2 55.45 ACAAAAGTTGACCCAATTCGGCTTTCTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACGTTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGAT:1 + chr3L 14199070 5' + Tirant 8492 2 73.27 GGGAATTTCAAATATGCATGAGCCAAAGAAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAA:1 - chrX 11268271 5' + P-element 392 1 37.62 CAGAAAACGGGTGAGTAACAATTGTTTAAACAGCAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr3R 6216809 5' + pogo 37 1 69.31 CCTCGCCAAATTAATGCAATTCAGCGTCGCGGGCGACGGTCAACTACACACAGAACCAGATACATATATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGC:1 + chr2L 1120769 5' + copia 276 1 74.26 TGACCCGACACACATTTACCGTTCTGCTACCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGT:1 + chr3R 5118611 5' - accord 356 2 74.26 TTCTTTATCTGCCTGTGAGTCCGACCGATATTGGCCGTAAATATGATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTT:1 + chr2L 21779480 5' - ZAM 8107 2 58.42 CGGAGTGGCTAGATGTTTGGATAGCTGTATGGCTGGATGGCTGTACGGCTATATGGCGACCAGAGAAATGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2R 22455012 5' + hobo 6 1 62.07 ATTTTTCCCAACCTTTTTCTCTGTTTGACAATTGTCAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 697534 5' - roo 398 1 71.00 ACTGCTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr2L 17862279 5' + F-element 21 1 64.36 GGGGGCGGTGGTTTCAGCGGTACATTCGGCTTGGCTATCTCTTTAAATGACAATCTCTTTTTTAGAAAATAACAATAAGTAATTGGTTGACTAGATGTGCA:1 - chr3R 6493100 5' - Porto1 4617 1 73.27 TCATTAACAACAGACTGGTTGGGATTGAATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:1 + chr2L 22689927 5' - Tabor 482 2 76.24 ATTTCCCAAGTTTCGTTACATTACAGGTAGATTATATGTATTTCGGAACGACCGACCCATTATATACATCTATCTATTTTGTTGATCAGGATCAAAAGCCG:1 + chr4 1001516 5' + INE-1 88 1 65.35 GTATCATCACTGGAAATCTGTTTACTCTTATATAATTGACAGCTAAAACATACCTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGTACTTGTCCGATG:1 + chr2L 6917288 5' - jockey2 3150 1 58.42 TTTGTTGCTTTGCTATTTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCATTTCCCCAGAGTGCTATTCCATACGTCCATATTGGTTT:1 + chrX 3688609 5' - Porto1 4260 1 78.22 GTGATGGAGAACGTAGGAAGTGAAGGGGCCTTTTTTTTATGGTGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCGG:1 - chr3L 14506690 5' + R2-element 101 1 58.51 CACCTCAATGGCGTTTCGGACTCGTCGTAGCAGCTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 - chr3R 21500412 5' - hobo 2885 1 67.33 CAAAAATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACAC:2 + chr2L 14536245 5' + blood 33 2 53.47 AAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATTACGCCAGCAGAGAACGTGAGATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAATT:1 + chr3R 19450152 5' + roo 66 2 53.47 GTGCTCTTGGATAAACAGACATGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTT:1 + chr3R 18860335 5' + R1A1-element 5036 1 58.42 TGCAGGCAATCGGTGGCTATGGAGGACGGGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATT:1 - chr2L 1730681 5' - F-element 4403 1 71.29 CCGTTTGGCATTCTGCGAAGAAGGAACCCCCAAATTTCCCATTCCAAGCTGCTGTTTTTGCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGGCACCACATCCTGCT:1 - chr2R 16078951 5' + Rt1a 4881 1 60.40 ACTGAATAGGCTTGCCTTTTTTCCGATTTTCAAAAGGGAACTCATAGGAATTTAAGTGTTAGTTTGGTTTTTGAATTATTTTTATTTTTTCAAAAACAACA:1 - chr2R 5757328 5' - Tc3 1558 1 55.45 ACTGACCGCCTCACTGGAAACCAACTGGACTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 - chr3L 3255025 5' + 1360 45 1 69.31 GCGAATATAACGACTGTCCGTGGCGCCGGGGAAAACACGAACCCGTGTCTTGAGGCCACTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTAT:1 - chr3R 23093118 5' + accord2 7519 1 63.37 AGCAATGTACTTTTAGTGTTCTTTCCTTTTTGTTATAACGGCAGCTTGTCAAATTTGCACAGGTATTAAACTAATCAATTGTTCGCTTTTCGCGTTTCACT:1 - chr2R 25240578 5' - HeT-A 187 1 82.18 CCTTCTGGGCCGTTCTATTTGGTATCTACCATATTTGAAGGACGATTTCGTCAGAATTGGCAGTTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2L 21295303 5' + 1360 15 1 66.34 TCCATTCGGCATCTCGGCGTTCGCGTTGTTTCGAGTGCATCCACATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGC:1 - chr2R 8065340 5' + Quasimodo 309 2 62.03 CTTCTGTCAAAAAACTCAGTTCGCATTAATTAAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTGTATTCCGGCCGCAAAGTTTGAACCG:1 - 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chr2L 949611 5' + gypsy10 99 2 54.46 TGTAAATATGCAAACAGATCAAGACGCTGAGCGCAAATAGTAAATAAATGGAAACTAAAGTAGTAAATCAAAAACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 + chr2L 773222 5' + I-element 3 1 76.24 CAAGCCACCGAAGCACCTGAAACCTCAGAAACCCCAGAAACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAA:1 - chr2L 18793243 5' + accord 233 2 60.61 CAAATTGCTAAATTTATTTTAGGCTCGGTATTCACTTGACACTCATATACGCCACTGTCTCTTGTTTTTACTTGCACAAGCAAGCAAGTTCTATTTTAAGA:1 + chr4 251329 5' + 1360 3266 1 55.45 TGGAACTGATGAAGACCCTTGCCGAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGCAGATTCATGTCAGTGTGTGGGAAGAGGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAG:1 - chrX 14525506 5' - hobo 2651 1 77.23 CAGTTTTCACTTCAACCAGGCGGTGTCCACCTCCTCCTCCGCCAGCAGTTCGCACTCCGATGAGGGAAAAGGTCCAAACTTAGGGAAAACCTAAAACTCCT:1 + chr3L 910431 5' + G-element 3861 1 64.36 TACTGGCGCTTCTTTGCCATACAGCGAAATTAAATATATTAACATACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 - chr2L 20465660 5' + blood 7042 2 59.41 GGACAGCCGAACCGAAGTGGTTGGGGGACACACCATGTGTAGATATACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3L 7231117 5' + 297 6602 2 57.43 TCTTGACTGCATATCACGTCCGGCTATTTGTTTGCTCTTACTGGGGGTATAATGATTCAGTCAAAACAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCC:1 + chr3R 8448176 5' - INE-1 572 1 68.32 ACAAGTGCTGCTCTTCATTTACGGATGAAATGCTTTTTTTTGTTGTATATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTCTGGACTTTGAGGTGGCTAAG:1 + chr2R 16683603 5' - Tc1-2 1155 1 65.35 GACTCTAAGGCCACGCCCACTTCCCATCGCCCCAGAAAATAAAGATAGATGGAGGAATATGTTCGTTACATAAGGATGAAAAAAATCTGAAAGCGACTGAG:1 - chrX 22740186 5' + F-element 107 1 61.39 GGAGGATATTGCTGTGGAGGAGGCGGTGGCTTCCGGCGCGGTGGTTTCGGTGGCGGTGGTTACGGTGGCGGTGGAAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTT:1 - chr2R 11241974 5' - F-element 4392 1 73.27 CCAAAAAAAAAACTTTCCCCAAAAGCTTAAAGTTTCCATCGCATTTCGCATTTCCTTTCGCTATTCACAATAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGG:1 - chr3R 19143034 5' + INE-1 553 1 61.39 CGGGAGAGTTTGCCCTCATCATGCCGAACACAGGTTCCGCTGCTCCGCCTCCGGGCAGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGC:1 - chr2R 8230042 5' - gypsy4 76 2 54.46 CATGTNCCTGCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3R 9996376 5' + blood 22 2 57.43 GAAATAGTTTCTCCAAATTGCTTTGCCCTAGCTCCAAGGATAAACTTTGCCCACAGCATGGACGCACTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTG:1 + chr3R 11306475 5' - BS3 179 1 71.29 TATCGCGACTACGTTGACATCTCTGTGGCCGTGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGAC:1 + chr3R 11246097 5' - HMS-Beagle2 88 2 69.31 ATAATAACGGATAGCTTCTGCCTTTTTGTTTTTTATTAACGTTTGACAGCAAAAATAAAATATTCACATGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGT:1 + chr3L 22061442 5' - S-element 318 1 73.27 GACAGAGAACATACTACAAATAAACTAACAGGGGGATGACGTCAGCTGGGGGAAAATTATAGAGGAAAGTGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGA:1 - chr3R 8937511 5' + INE-1 560 1 59.41 CATTTCCCCACCTTTCTGGCCCTCGTGACACTCGCGTTTTAAATAATTTAGCGCCATCCGGTGACTCAGCTACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTT:1 - chr3R 31271138 5' + jockey 4923 1 81.19 CAGTGGCGCCAGTTGGGTCTGATCCACCTGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATC:1 - chr3R 27465215 5' - F-element 4339 1 72.28 GTATACCAATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTTTACG:1 - chr2R 5395195 5' + Doc2-element 111 2 72.00 GGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2L 10635259 5' - roo 9027 1 72.28 ACCTCNACCAGCAAAGTTAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAA:1 - chr4 1294992 5' + TAHRE 10428 2 74.26 TCCTGGCCAGCTGCAACACTACGATTACCAACAACGTGACCTACATTGTGTCGCCGGCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAA:1 + chr2L 3019660 5' - I-element 483 1 56.44 CAGAAAAAGCTCCCCTTTCGAATGCCAAGTTGAAGCGCAACTTTTGAATTGCGTAAATTGATCGCAACGGATCCGAACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTT:1 - chrX 3405699 5' + rover 7090 2 79.21 GCCGAGCGTTGTTCTAATTTTAAGCTGTTGCTGCTTAAATTATAGGGGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1 - chr2R 22740107 5' - Transpac 285 2 57.00 TGCTTCTGATGGCAAATGCAAGCTATCGCCCCTCTCTTTACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAAGTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTAT:1 + chrX 3678408 5' + Cr1a 4178 1 62.38 AATCAGAGCTCATCAGGCTGCAACTGACTTTTGCTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGA:1 - chr2L 1274550 5' + F-element 4235 1 67.33 ACTTGAGCGTATCGACAAGCCATTAAACAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2R 14582847 5' - roo 9023 2 73.27 TACGCCATCCTGGACTTCCGCTTATTATTATTATTTTCACTTTTTTTTT:1 + chr2R 15922761 5' - Porto1 176 1 71.43 TCATANGCAGCGGGAGTGAGGAACTAGATCGATCAAATTGAAAGATGAGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGGACTTTTGGCCGCTGAGCGCGCAATTCGCG:1 - chr2R 16215678 5' - Doc3-element 230 1 52.48 ACTAAATAAATATTTCTACTACTACATTTAAAGCCGAGAAAGTATAAGCAAAAGACCACCAACACTTACATGAAATCTCCAGCTCTTGAAATACGATCGAG:1 + chr3L 2153431 5' + Stalker3T 115 1 56.44 ATAATATTAATTAAAGTCAGCCAGGGAAAAGTAGGCATAATAAATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 17607832 5' + roo 12 2 68.32 ACACCCCATCGCCAACTCACCAGCTCCACAATAACAATAACAACAACAACAGCTCGCTCTTCAACAACAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGA:1 + chr3R 16002749 5' + G6 366 1 75.00 ATTAGGCAGGAAAATGTAACAATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 1292531 5' - roo 9018 2 81.19 ATGTCAAACATGGCTCTCTTCCGCAGGAACATGCCGGCCATGTTGCCAAAGTAGAGCACTGTGCACTTAATGAGGCGAATTGTAAGTACGTGGCGATGACC:1 + chr3R 12405739 5' - Burdock 6300 2 58.42 CGTATATGCTAGTAAATGGTATTTCGTGTCTCAGGACTACACTGTTGTTTTCCTCGTCGTCGAACTCCTCTTCATACACAGGTACCAGTCTATAA:1 - 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chr3L 11260040 5' - R2-element 3489 1 75.25 TGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 + chrX 22898816 5' + 1360 69 1 75.25 CCGACTGAATGAACTGAACTGAACGCCGGTATTATTAGTGTGACCACCGATGCGATAGTTTATAATACCATGGTACACAAAAAAATTAAAATTGATTGCTT:1 + chrX 1026681 5' - Cr1a 4259 1 52.48 ACTTAAAGAAAACAGCCCTTATGTGCAGCGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCC:1 + chrX 19330551 5' - INE-1 556 1 54.46 CATGACGGATAGCTACCAGAGGCAACCTAGCCAATTAAGACTGTTTTATTAACAGATCCGCAGAGATCCGCAGTAACCGGTGAGGCTAACCAGACCGGGCG:1 + chr2R 5728927 5' - baggins 316 1 71.29 GAAAGTCAAATGCTTTTTATGTCCCCCTTGCTGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr2L 15019724 5' + jockey 4711 1 66.34 AAAAGTCAATTTGAGATCACACCTAAACTGCGATAGACATTTATGGGTAACAAAATATGCTGCAGACAGTAATTAACAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr3L 12646392 5' + jockey 4671 1 64.36 TGCTAAGTGATTTTCAAACAGCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 - chr3L 10378953 5' - mdg1 365 2 83.17 GCGCCCCTTTGAGTGCCACAGCGAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATC:1 - chrX 3051277 5' + I-element 195 1 77.23 GTAAAGAATGAAAGATTTTCATTCAATTAGGGTTTTTTTTAAAAACAAAAAAAA:1 + chr3L 5655606 5' + transib2 2633 1 57.41 AGTTTTGATTATGTGTCGCGCTTTGTTTCAATCAAAATCTCGCCAAACCGCAAAGAATTGAATAATTGCTACCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATC:1 - chr2L 9338969 5' - ZAM 90 2 76.24 GTTCCCTTGCGTTTTATTACTAGTTTTTCTACCCTTTTTGCCCTGACAAGCGTACAAAACACATTAATGTCAAATATCATTTTATAAGGGACAAAATTAAC:1 + chrX 5300706 5' - frogger 354 1 55.45 AACGCAGCAAATGATTTGTTTACATTCAAACGAATGGTTCTGAAAAATGAGAAATATGCGAAATGTACTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAA:2 - chrX 15384836 5' - 412 7538 2 70.30 ATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 9996400 5' + blood 7029 2 54.79 AATGATCGTGTTATATTATGTGCCGAATGATGGATGCAAAATAATAGCCCAATCTTATAAAGAATAAAACAATAAGATATTGTAATTAAATAAAGCGGTAA:1 - chr3R 22457610 5' + Chimpo 169 1 75.25 CACGTGCTATAGCCTAAGAACTCCTCTTCGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATA:1 + chrX 2226249 5' + Quasimodo 7016 2 72.28 TTTATTTTAAACACTCAAACAAATACAGCTTAAATAATTTACTTCTTTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGA:1 - 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hopper 1056 2 53.47 CACAAACACAAACACTAACACAGACCCACTCCGTCAGTCACAGGCACATGAGCTGTAGTCCTTGCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTA:1 - chr2L 16071771 5' + roo 9046 1 66.34 AGTTCAAGTACGTTCGAGCATTGGGAGCCTTCTACCTACGGCTCACAGGAGCTGCCCTGGTATGTGAGCAACCGAGTTATTGAAAGAGACTTAAAAGTTGT:1 + chr2R 9144411 5' + G5A 2552 1 57.43 ACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chrX 10555426 5' + Tirant 46 2 68.32 TTTACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:2 - chr3R 25931367 5' + roo 49 2 76.24 AGCTGATTCTGTTTCTGATTGACCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTC:1 + chr2L 18662336 5' - hopper 1363 1 74.26 AACCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATT:1 + chr3R 10736021 5' - invader4 317 2 71.29 TGGGGTGCTGCAGCTAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr2R 16928858 5' + blood 7045 2 57.43 TTTGTCTCCCTCAGTTTTTTATACACATTTTTTTTTGTTTTTGTATTTTGTATTTTCTAGCCCTTTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCT:1 - chrX 5921661 5' - Doc 4641 1 70.30 ACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3L 22324079 5' + hobo 41 1 66.30 CAAGACAACCAAGTGATATGAAAAGGTGCGGTAGAGTGATTTTTAAGATACTGGAATAAAGTGTTTTCCTCTTCTCTTTTTGTTTTTTTTTTTAACTT:1 - chrX 1108103 5' - TAHRE 10442 1 66.33 GGTTAAATTTAATTTCCAAAAAGTTCCACTTCTCCTTGTCGTTCTTGCCGCTAATTTACAATTTTTTTTGTTTTTTGTCTTATTCACATAAATAATATTTT:1 + chr2L 15220664 5' - NOF 351 1 61.39 AGTAGTCAAAGGAGCGGATGCCACGCGGTCGCCATGTAATAAGTATTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTC:1 + chr3R 9292528 5' - Stalker2 363 2 71.88 AAGCTATGGAATTTGTGTTATCCTGCGGCCCATATCGCTGGCCATAAAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAG:1 - chr2R 15156938 5' + rooA 122 2 53.47 ATGGATACAATACAATTTCTTTGAGTCCGCCGTTTGGATTTTTATTGTAAGTTCAGATTAAGCAAAAAATGGGATTAGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATT:1 - chr2L 21131628 5' + micropia 5298 1 72.28 CGTCTTTATTTTAATGGACAAGACAAATTCAATTTCTCCATCGGCACTTTACTTTGTCCATTTGCCCGACCTAAAAGTATGCAGCAAAATTTGTAATATAT:1 - chr3L 16147355 5' - P-element 156 1 69.31 ATAGGGCACAAGCCAGTAGAAATAATAGTTGGTCTGGTTTACCACCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCAG:1 - chr3L 20743529 5' - Bica 4880 1 54.46 CTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:2 - chr3R 27619253 5' + hobo 49 1 76.24 TCACTGGCTCTTCATGCAGACGTAAGTGGGGCAGGATGCTGGACGTCTGGACTGTCAAGGAATGGAAGGAAACTAATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGT:1 - chrX 15702508 5' - diver 208 1 42.57 CGAATTGCTGGGCAGACTGCTGGACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCTACTCTACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGA:1 - chr2L 3190727 5' - flea 4843 2 77.23 TGTATTCTGAGATAGCTGCAAGCGGCAGAAAATTAGTTTCCACTTTTGAAAATGCGTTTTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2R 5267252 5' - pogo 2087 1 65.35 TGTACATTTATATGGTTTATTGACTTTGGCCGGAGGTTTTTCGTTCTTAGCCAGTTTTTTTATACCATCATAAATCTTAATCGCAACCTTAAATGGAAATA:1 + chr3L 8834606 5' + gypsy5 7257 2 60.40 GCACAAACGATTCCGGAGGTGACCAAGGAAGTGCGCCTTATTGCAGCCTTAATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAG:1 + chr3L 8564343 5' + R1A1-element 413 1 59.41 AGCTANATAGCATTGCCACATTGTTGACAATCGATATAGCCAAGTCTTAACAATCGATTTTAAGCACTGATTCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3L 9864552 5' + P-element 4 2 74.26 AGCCAAGTTGTAGCTTCCTGTTGAATAAGTAATTAGATTTTATTACGCCAAGTTGTAGCTTCCTGTTGAATAAGTGATCGTTACATTATTATATTAAATAA:1 + chrX 14025866 5' + Rt1c 5383 1 69.31 TGTTTTTGTTGCTTTTTCGTTCGGGGCGAAAGTGCTACTACTGCGGTCGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 + chr3L 4627247 5' + FB 48 1 58.42 CAAAATGATGCATTTATCTCAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAA:1 + chr3R 9833016 5' + Tabor 1 2 75.00 TCTAAATAAAGTAAGCATTTTTAAGCACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 18076278 5' - roo 9022 2 79.21 TCCAAAGAGCAACAACAGGCAAACTCACTGCATCTGAAGGATGCGAACGACGAAAAAAGATTATACAGGCAACAACAAGAGAGAATGTTATAGGCGAGTTT:1 - chr3L 14123557 5' - INE-1 574 1 57.43 AAAAGGAAAACCAATTACGAATTCAAATGAAATTCATGAAATTCCAGCCACTTTGTGCCGACGGGACCACCTTAGGTTATTTCAT:1 - chr3R 22902664 5' - P-element 5 2 71.76 CGGCACATTTCTCACTGTCACTGTATGGGTGCCCACCCATACATATGTATGTACGCGCGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:2 + chr3R 11731158 5' + hopper 17 1 65.35 AAGCCTTAATTCTCCAAATTAAATTTACACGTGATGAAATTAACTGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACAC:1 + chr3R 13648632 5' - Dm88 4423 2 55.45 GGAGCCAGCAAAGTTGCGCAAGTCCAAGAAGTTTTGATGATGCAGATCCAAACTTCGTGGACTTGCGTTGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACC:1 + chr2L 14167220 5' - transib4 2322 1 52.48 TATGGTACTCCCACCTTGGCCCAATCAGGGGCACGCACTTTTGGGTTATTCACAACTTTCGGATATTTGCCACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGT:1 - chr3L 12628137 5' - R2-element 3184 1 72.28 CCAGACGCCAAGATCCAGGGAATGCAATCGATATATCGATATGTCACAATGATTTAAGATAAGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGGA:1 + chr2L 114570 5' - Cr1a 4103 1 55.45 AGCCACTTGAAACGACCGGAGATCGTTTACTCACGCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCATGGTACCGAAAAGAGA:1 + chr2L 9972726 5' - R1A1-element 4930 1 69.31 AATTATCAAAATTTTTGTTCATAAACATAAGTTTGTCCATAAGCTAGTAAAAAATGACTGATGAAATATAGTTCCTGATATCTCGAAGTTCATACGGACAG:1 + chr3R 18723039 5' - INE-1 131 1 72.28 ATAATTCCTATTGTAAAATCGAAAAAAGTCATTTGTTTATTTGTTCTTCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3R 14284676 5' + P-element 26 1 48.51 TGGGTGTTAGTTGCAGGTGTGCGTGCGATTTGATTTGCATTTATGTTAAATTTGTTTTAATTTTTGTAAACATGTTGGCATTGAGGAAGGCTGTTGAATAT:1 - chr3R 15131554 5' + 1731 4301 1 58.42 ATCGANCAACGCAAGGAAAGCGATAACATTGTCGCCGAGACCCTTTCACGATGCATAGAGGAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTA:1 - chr3L 24939432 5' + I-element 387 1 62.38 ACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGA:1 + chr3L 27415238 5' - transib2 2784 1 66.34 AAGTGCGGGAAAATTGCGTTAATGTGTCCCAAAGGTCGCAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCGGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATA:1 - chr3R 10193017 5' + Circe 7197 1 66.34 CCTGTAAGCAATCGTGTTCTGAGTTTTAAAATTCCTATGATTTACAGTTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTCATTTCTTGAATAGTTTCG:1 + chr3R 10732414 5' - HB 1486 1 77.23 GTGAAATAAAAATTATATTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGCATTTAATTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3L 19590776 5' - opus 7479 2 59.41 TCTTAAAACTCCACAAACCTGGTTGCGGGGAAGCGGCCTAGTAACAGCGAAGACGGCTGGAATGCAAGAAGAGTCAAGGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr3R 2446810 5' + 1360 32 1 77.23 CTTTGCCAACTTCTTTTCCATTCCATAACCATAATTAGTTGATAGTCCCAACTTGGTTAGTCGGCTAAACTTCTCTGTTCCGAGTAGATTCACTAGAAACA:1 + chr2R 18288560 5' + Cr1a 4112 1 64.36 TAATAAGTGAGATGGCCTTAAGTAAATTCCAGCCATGGCAAATTTGTCTCAATTTGAGAGTGACGCCAGGGTGATTCTCCAATCCGGCCATTTCCCCTTAC:1 - chr2R 17226213 5' - accord2 263 1 73.27 ACAGCCTGTAAGCATGTCCCGCGGGCGCAACTAATCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAG:1 - chr4 523437 5' + HMS-Beagle2 6856 1 65.35 TCTTACAACTATTATTGACTCTCTTTTGTCGCGCTTGATTATACTCTTTCCTCGTTCTCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGC:1 - chrX 12203046 5' + diver2 4701 2 55.45 GAACTGATAACTTTGATCAAAAATTCCATTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAAC:1 - chrX 3635635 5' - flea 417 1 72.28 ACTGGAGCGGGTCCTGCGGACTGCCCAGCATCCCAACGAAAAAGTCACTGCTCAAATGATCCAGCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGTACAGTTAG:1 + chrX 3855559 5' - Stalker 484 1 76.24 TAAATCAAGCAGTCGGAAGTGATAAACTGGAGCTTAACTGCAAAAAGTGAAATCAAAACAAAAAAAATTAAATTTTTTAAATTAATTTAATGTGATTTTTA:1 + chr2R 7227368 5' - NOF 3958 1 67.33 GGGGCAGGTCAGTGCTTGCTGTTGAGTAATTTTCAGGCCATAAGCTTCATATTTTATTTATTATTCATGCAATCTGACTTTAAAAAAAATAAACATTCAAT:1 - chr3R 26751375 5' - Tc1 64 1 61.39 GCAGCATCCTTCAAACCCAAGACAGATTTACCGAAGCGATGACTGTTTTGAGGAAACACTTTCCATAGGGCCTTATCTCAATTAGAGGCGATTTGGAATG:1 - chrX 11384444 5' + mariner2 540 1 64.00 CGTAGCAAGGATCCAAGGATCCGAGGACTCGGGAACGGGAATGTGGTGTCTTCTCTAGTTTAGTTCTTCTCCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTTTTTTATGT:1 - chrX 1591497 5' - gypsy7 5005 1 48.51 TAATTAAATATCAACAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr3R 24777977 5' + R2-element 3584 1 81.25 AAGCTGCTCGAATTAATGAGCCACTCGGTGACCTTGACTCTACCAACCTCCCTTGCATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 - chr3R 14492398 5' + I-element 5013 1 59.41 TTTAAAGCGAACTAAAAGTGCAATTACAATTTTAATGAGGTCCTATATTTACGTATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGC:1 - chr3L 18195862 5' + Bica 25 1 82.18 TACATCTAATGGTACAGTGAATTAAGGCTAGATTTCCATGGAGGAGTGTAGAAGGAAGCGTTTCGACCACATAAAGTATATATATTTTTGATCAGGATCAA:1 + chr3R 18687641 5' + INE-1 82 1 53.47 CGTTGGCTGCGAAACACCATTCATGCCAATTTGTTCCTCACCTACATCACATCCGCACTCCTCTGGATGTATTGTATATAACAGATACCAGATAAGAATAA:1 + chr2R 12484973 5' + Idefix 103 2 65.35 GCCCTGCGGACGCATAAATTATAAATAAAAGCCTCACACACGTGAAGAAAGAGAGGTGTATATAACCTCAAATCCATAACTGCAAGTTTAGAGACGGGTCG:1 - chr2R 14804645 5' - aurora-element 3984 1 65.35 TGTTGCTGGCTAGTGAGGAAAGTTTGGGTCATCTGCCAATTGTGGGTATTCGATTTTGGGATTATGCAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACAT:1 - chr3L 6444961 5' - 1360 178 1 71.29 CAACGGATCGCTAACGAAATTCACGTTTTGCGCAATACAATTGCTGAAGCGGTTCAATCGCTTTACCTACAATATATATGTATATACATACATATATACTC:1 - chrX 4528327 5' + INE-1 68 1 72.28 AATTAAGCGGAACTCGAACGCTTCGATGGCCATAAACCATACGAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATA:1 + chr3L 18658055 5' - McClintock 6124 2 57.43 GTTGACGCAGACATCCCGGTCCATGGCTGATTTGGCCAGTTGCGGTGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATC:1 + chr3R 5530540 5' + opus 7342 2 57.43 CACTTTGGCTTTCAGTAAATACGAAAAATACGGAAAACATTGGCAGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGT:1 + chr3L 11762751 5' - Idefix 180 1 55.45 CGCTGGAAGCACCACCCGATGACCAACCGCCACCAGATGCACCACCATCCGGAAAAGAATAAGCCGGAGCCTGGCATTTTTATTCTTTTATAAAAATATAT:1 - chr3L 10801668 5' - TART-C 11035 1 54.46 CGACTATCAGATACCCATTTGTCAATTGCAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGA:1 - chrX 20030808 5' - HMS-Beagle 6737 1 79.21 TACAAGTTATTTATTTACGTCATCCACTGATAAGGGAAACCAAAAACAATCGCGGACTGCAAGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAA:1 + chr2L 3713745 5' - P-element 168 1 68.32 GCCGCTTGGTGACTCCAACTTGGCTCTAACGGTAAGCGGATTTGACCCTTTGGTGGGAATAACT:1 + chr2R 20576191 5' - Quasimodo 6933 2 60.94 AAAAGGGTATACTAGATTCGTATGTAAGTATGTTACAGGTCGGACTCGTTTTCGACTGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTG:1 + chr3L 23746968 5' + INE-1 93 1 72.28 CAACAACATTCCTCGGCATCACCCCTTTTATCGCCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACTAGCAGA:1 - chr3L 18503840 5' + BS 4830 1 66.34 TCCTCGTCCGCTTTCCGAACCCACTCGCTTGTGTCTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAGTTT:1 + chr2R 20882119 5' - accord 201 2 61.39 GAATGGAATCATGTTAAGTCAGAGGATAATCCAGCAGATTTAGCATCCAGGGGAGTGGATTCTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCG:1 + chr3R 19446442 5' + gypsy12 17 2 62.38 GAAATGTAAATTGAAAATAATTTTCATTTTCTGGCTTTTTCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGC:1 + chr3L 13935312 5' + F-element 499 1 60.40 AACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 11576431 5' - roo 355 2 76.24 AGTGTGTAGTAAAAGTTTCTTTGTCCCGATCTTTGTTTTTTTGTTTTTATGAATGTCGTGGCTATGGCCAACGAATTATATTTAGATTATATTTGAGCTTG:1 - chr3L 7114544 5' - gypsy7 178 2 66.34 TCTGAATAAACATGTTTATTTTACTCGTGCAGCTTTATTTATTAACCCAGGAGTTTAGTCTTAGTCAGTAGGAATCGTTCAGTGCCTTCTAAACTTAACCT:1 + chr3L 21902532 5' - G5A 2795 1 73.27 CTCCGACTTTTGCCTTCCCGAGGGCTACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCTATTTCAATAAACAAATTATAAGA:1 + chr3R 17041513 5' + Idefix 298 2 74.26 GATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 2539267 5' + roo 8706 2 71.29 ATAATAACAAGGTGATGGTGATGGGGAACTTAGGAGTGAGCATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chr3R 8691849 5' + P-element 37 1 42.57 CCTTCCTCCTACGCCACTGCGGCCATTCATTCGTGCGGTCTGGCTGACCGATCCCTGATCTGTGCTTGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTT:1 + chr3L 6835038 5' - gypsy8 326 1 66.34 GTCTGATTAAATATTAGGGTAATATGAATAGAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAG:1 + chr3L 14114925 5' - hobo 366 1 69.31 CGAGTTCCCGAACCAAGCAGAATTTCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGG:1 - chr3L 6505839 5' - R1A1-element 5098 1 67.95 GAAAAGAAAATGAATGTAGAATGAATGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAA:1 + chrX 3306377 5' - hobo 481 1 77.23 ATGGGCAATTCATTATTTTATTTTTAAACGTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTC:1 + chr3R 5777854 5' - invader4 2994 2 70.30 AATTACCTACAATACCCATAAAGCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCA:1 - chr2L 3245035 5' + rover 6951 1 80.20 GCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTA:1 + chr3R 10736026 5' - invader4 312 2 66.34 ACCACTTTCCAGATGGCCGTCTTGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTGACTCAGGCACTTGTTCTGGAAGAGCTGTATG:1 - chr3R 29060673 5' - G-element 3964 1 70.93 TTAAGCACGTGTAGTTCTGAGTCGGTTTAATTTATATTATGTGCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 21293004 5' - roo 9039 1 56.44 TAGCTGGTAGGTTGTCTTGCCACTTTCTTTCCGTTTGTTTTGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chr3R 13767299 5' - Quasimodo 38 2 57.43 GCCCGCAGCGAATGCAAACATAATAAAAACCCGCACAGTATACTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr2L 15622710 5' - mdg1 7423 2 60.40 ATGAATTCAAAATTGTTTCGCTAGGCTAAGTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAG:1 + chr3R 25874600 5' - hopper 1072 2 70.00 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 4895 1 59.41 AGATTTCAGTTTCGTTTGCCATTAGTAAATTAAGACTCACTTAAAACTAACATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCAGGAAGGAA:1 - chr3L 10677900 5' - Max-element 8359 1 76.24 TAATTNATTGAATGCTGTGCTGCCAACTTCACTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAG:1 - chr2L 3338165 5' - 1360 90 1 71.29 TACCACATAACCAACGAATCCCACAACACATATGTGAGCGACGCTATAGCTATGAGGTACCACAAGTTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTG:1 - chrX 23044341 5' + F-element 4245 1 62.38 GACTTGATCTAAATTATAAACGGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGCATCGACTGTATTTTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCACG:1 + chr3L 1729889 5' + gypsy12 10055 2 69.00 AGGGCAAGGGAAATGCTGCTGAGATTGGAGTTTGAAATTGGTTTTTCAACTGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATTA:1 + chr3L 25325802 5' + F-element 4315 1 50.50 GATTTNTCTCTTATCAGCGCAGTGGTTGTGATGTAGCTAATTTAGATATTGCATCAGCCAGGATTACATGGGTGTCATGTTTTTTTTTCGAAGGTACCACG:1 + chrX 13395216 5' - Doc 4389 1 75.25 TTTAGTAAATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATAAATTATCATTTTAGTGAATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 - chr2L 8967086 5' - Burdock 219 2 61.39 TTTTTGCTGCGGCAACGCCAAGGAGCGCAAGGATACCGGTATCCATTTGCTGTGAGCTCGACCTCCTTTCTCGCCATCATGCACTTCTCTTCCTCACTCC:1 - chr2L 18903942 5' - R2-element 482 1 60.00 TGCGCAATTAGTCATAAGACTGATTAAGAAATTAAGAGGGAAGTAAAAAAAAACGACTACAACTACATGGTGACAACTTCACTTTATTCTGGTATATGCAA:1 - chr2L 19907077 5' - Gypsy6A_LTR 175 1 55.45 AAACCAAAATTGAAAAGCAATAAAGATTGCTAGATTACTGTTACCACTTACAAGGTCATTAAATGCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - 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F-element 13 1 69.32 CATCACAGACATGCGATGCCGCCGCAGCGGACGATGTAGATGTCTGCACGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTAGTATTGATGTATGC:1 - chrX 12041227 5' + invader1 195 2 72.28 ATGGGGTAATAAGCAGCCCCTCCGGTTCAACAGCCCCCCCACACCCGCACACTCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chr3L 8907003 5' + Tirant 55 2 54.46 TTTGAGTTTCCGATGCTGAGAAAGACGTGCGATAGCAAAACGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATGAAGCCGACCACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCTT:1 - chr3R 15210865 5' - diver 301 1 70.30 AATTAACCCATCACTTACGGAACTTCCTTGTAGCACACACCACTGGCCATGGCAGATCTGGTTTTGTTGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTT:1 + chr2L 13966488 5' - I-element 280 1 73.27 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTACACCGGTATTTCGCTAGCAAAAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTTTTTC:1 + chrX 20783463 5' + Gypsy12A_LTR 2032 1 66.34 ATCCGTTTGCCGTGTCCTTTGCCTTCGCCTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATAT:1 + chr3L 6878302 5' - F-element 4308 1 73.27 CTATANGTACTAACGGTACACTTACACTTCCGCCAAAACTCCCCAAATATGTAAAATCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTATTCT:1 + chr2R 20583120 5' + 1360 3191 1 69.31 CAGGTGGAAACGGTGGCAGTTCGGCAGTCCCCTAAATTGCAAAACTAATTTCCATTTTTCTATTTTCTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATG:1 - 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R1A1-element 5048 1 71.29 TTGACAATCGATATAGCCAAGTCTTAACAATCGATTTTAAGCACTGATTCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr3L 9864575 5' + P-element 27 1 52.48 TAACAAATTTAACAACTGGGGGGATTACATGATGGCCAGCTTTTACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTG:1 + chr2L 10727130 5' + R2-element 285 1 55.32 CTCGCGCCTGTTGTGTTTGAGTTCGAGTTGCTGCGCTTGTGAGTTTCTCAGCTTGTTGTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chrX 19848511 5' + P-element 17 1 62.38 GAATAGAGCCATGACGTTTCACAAAACCTTTGGTTACGGATGCAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGTCTATATATAGTGTATATATTCTTGATCAGGATC:1 - chr4 1121562 5' + INE-1 80 1 56.44 TAATGCCACAATAGCACCGTCAATTGCTTTGGGCCAGAACTAATTAGCTCGATCGCCGTTTTCTCTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCACCTAACCTGG:1 + chr3L 25148538 5' + jockey 462 1 70.30 ATACACACCAGAGAATTTTGTACTATCAGTGTTGAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3L 19051901 5' - roo 9031 1 64.36 TGTGGAATTTCCTAGTAGATGAGATGGTGTTATCCTCCGAAGATTTGTACCTTGCTAATGCATTCATGAAACCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr2R 10029511 5' - 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G4 3408 1 70.30 GATTATGGAAAGTTTGCCCTCTTTGATGTTGTTGTTTAAAGTTTGCCGCTCTAAGTTTTTAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGTGTAGGCG:1 - chr3L 5469635 5' - ZAM 8012 2 68.37 CCGCAAATTCTGCGAGTTTTTACTCATCTCCTGTGGAAAATCCCATCCACTTGCACATAAATTCCATGCTCAGCTTGCCATTTATATCTGTAGCGAAAAGG:1 - chr2R 17309260 5' + Gypsy12A_LTR 2140 1 80.20 GTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTAATTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 - chr2R 1000405 5' + HMS-Beagle2 18 2 63.37 CAGTTTGCGCGGCGGGAACTTGCTCCTGCCGATCTGGTAGCGCACGATAAGGGACCAGATCAAACCCAGGATCAGCTTTATGTTTCCTTATTTTTTCTGTG:1 + chr2R 22733906 5' - Transpac 346 1 79.21 AAGCCCATCAAATGGCAGTGTGACTTTTGATCTTCAGACCCTTAAAGCTTAATTGTGCTGATGGAAAATAACTCTTTCTTGTCTTAATAATAATATTTAA:1 - chr3R 6297683 5' - BS 320 1 26.00 ACTTACGTTTTTAGCTGTAAAACGGAGGGTGCTTTCTAAATAAAGTAAGCATTTTTAAGCACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 18076244 5' - roo 393 1 62.38 CAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 697499 5' - 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chr3R 1521228 5' - G6 1870 1 63.37 TATTTCCGTCAAAAGAGTAATTAAACGTACAAAGCAAACGACATTTCAACACACTCGGGGGGATGGCAAGCGGGAGGTGATTAGCGCTGTCATAG:1 - chr3L 1975138 5' + rooA 7395 2 75.79 TGGGCAATGATTTAATATCTAAGAATTTTAAAGACCATCTATGTTCTGATTTTACATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 21292925 5' + roo 21 2 58.42 CTCGCCTAATTGCATAATTTGTATGCGGGATTTTGGGGCTGATTGACTTTCTGTTGGCAGCAAGCCGAGCTGAAGGCACTTCTTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 23105774 5' - gypsy2 402 1 58.76 GTAGTGGATGGATGAGCTGTTGAAGGTCCAGCTGAGCAAGTTGAACGATTCTAATTTAGGGTCATATTAAATGCAGTATAATGCATCAGGAATATACTAGA:1 + chr3L 11836499 5' + Gypsy12A_LTR 109 1 54.46 AGGAAAATCTGAGGCATCAGCTCCCTATTAAATGGAGGGCGCGTCGCTAATGGATGGGGTTAATGGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCA:1 - chr3R 17343548 5' - baggins 5133 1 66.00 TTTTAAGTTCATGAAATCTCGCTAAATCTCTCATCTTAGCACCTTAACTTTTGCTTATATTTAAATGAATTTTACAATAATTGTACCTATATATTGCACCC:1 - chr2R 22997108 5' + HeT-A 5980 1 66.34 CCTCCCCTGCGGCCATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCT:1 - chr2L 17747561 5' - hopper 59 1 57.32 CGGATCAAAAAGTTAGTCAATTTCAGCGTGTACAGCATGCAGCTGATAACACGTCTGTCCATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGT:1 + chr3R 6143783 5' + rover 6959 2 70.30 AGAACCATAGCCAGAGGCAGAAACCTCCATGTGAAGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTG:1 - chr3L 7025197 5' - hopper2 1274 2 65.35 AATATTTGATTTCCGAAATTAGATAAAAAATATTGGTCACTCTCCCCTTAGCGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 + chrX 22689313 5' + HMS-Beagle 23 2 56.44 TAATTAGAAGCTGTCGCTTGTAGTTGAAAGTAATTTCGCAACTGTTGTTTGCCGGCACCCTTGTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1 - chr3L 15355091 5' - jockey 4969 1 71.29 TCTGTATCTGTGGTTCTGAATGGGGTGTGTATGTTGTATTGGTATTAGTGTACTAGTGTATTAGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTGTGGA:1 - chr3R 19465618 5' - Idefix 9 2 72.28 TCGAGGCTTCGCTCTCCCAGGTGCGCTACGACGATGTTTTCGCCACATATTTGCTGCTGGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTA:1 + chr2R 19472855 5' - Ivk 5000 1 66.33 AATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:2 + chrX 3485665 5' + P-element 57 1 22.77 AACAAATAGAAATAGAAGAAATTTCCATTTCCCATACTATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCG:1 + chr2L 7697943 5' + gypsy10 37 2 69.31 GTAATNATTTTGTGCCTCTGCAAGTAAGTGGCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCTCC:1 - 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invader3 4994 1 54.46 AGTGAATTTTTGGATTATTATGCAAAGTTTATGTGTGTATGCACCAGCTATTTTCGCATTAGCGGCCACGGGGCGTATGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTG:1 - chr2R 24146391 5' - Stalker4 119 4 78.22 AATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chrX 20783463 5' + 1360 84 1 77.23 AGCTAGATTAGATAAGTAAGGTCCGATAATTAAAAAAATACCAATTATTATAACAGTTTTTTGACGAAGTCTTAAACTTATTATTTGTATAAAGCAAAAGA:1 + chr2L 1361061 5' - P-element 2487 1 52.48 CAGGACCTGGGATGCCATATTTTGCTGCCTGTCCCTAGTCCTTTCGCCTTTGCCCCCGTGGTCTTTCGATGGCCTTTTGGCTCAACGAGAATGTTCAATTA:1 - chrX 9945581 5' - gtwin 7236 2 53.47 ATCCTTTTAAGAATCAACTCATCCATTTCCTGTATTCCCCGTATTTTATCTGCGCTAACAAAACCCATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCA:1 - chr3L 15389333 5' + F-element 4400 1 71.00 CATTTTCAATAATTTTTCAGCGGTAAGTGTGTGCAGCATTTTTGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTGCTTCT:1 + chr2R 20014866 5' - HMS-Beagle 6602 1 57.43 CATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3R 22675821 5' - 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chrX 21601146 5' - baggins 5003 1 52.48 TTTAATACACCGTCAATCGCAGTCGCTGCCGTCGTTTGTCAGCCGCGACCAACTAGCAAATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGATGG:1 + chr2R 6547027 5' + G5 4627 1 55.45 GTGAATCGGCGAACGTGAAAATCGCGCGCGAGTTTTCCCCTTTTACGGCTGATAGATTTTCCTGTTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCC:1 + chr2R 21379319 5' + McClintock 229 2 65.98 AAAATGTTGCGACACATCTGAGCTACTAATGGAGTTCGTGACGTTGTCCACTCCGGCATCCACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACT:1 + chr2L 654575 5' - invader1 3811 2 63.37 TCTCCAATTTTTTCTTTATTTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTGAATTAAGTAGGATTTATGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGAA:1 + chr2L 14516394 5' - jockey2 3181 1 83.17 TAATTNATTAATTACATCTAAGTGAACCATAATAAAACAGCTAAACTAAGTGAAAATTAAATAAAAGTAATTACAACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTA:1 - chrX 23362187 5' + 3S18 5768 2 76.24 AACTGTCGAAAACCCGAAAAATGTTGCATGGGAAAAGTCAAAAGTGCAAACACTCAAACGCCCACCTCCGCGCCACTCCCACGGAACACTAAATTAATTAT:1 + chrX 6496125 5' - R1A1-element 72 1 81.19 CCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTT:1 - chr2R 5173209 5' - Stalker4 382 4 51.49 CACAGCAGTGTGCGTGTGAGTGGCGATTGTCTTTTTTTTTCAGTGTACTTGCAGTTGCATTGCTCACACTCATTGTAGATTTGACAAAATATACCCTTCAC:1 + chr3L 5748316 5' + 1360 210 1 70.30 GATACNTCCGATTTCAGATGAAATTCCTTTGTATTTCTATATATATTCTCTATTACAATATATTAATCAAAATTTTCTACGTCCAAATGGATAGAAAATGG:1 - chr2R 10562294 5' - transib3 2575 1 55.45 GAAGGNCTGCAAAGGCATCACGATAAATTGTGTTGGTCAAGCCAAGGGCTACGCTTAAGAAAGAAGGGCAGAGCGAATTGGATCATCAAACGCGTCGGTCG:1 - chr2R 21004137 5' + gypsy7 122 2 52.48 AAGCCGCAGTTGCAGGCAGGCAGCATCTGCTGTGCTGCAGCCGTGGTTATTGTTGTATTCTGGCTGGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCCACTTCC:1 + chr3L 21221103 5' - TAHRE 10005 1 54.46 ATAAATAATAGTCCATTGGGCAGATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAAT:1 - chr3L 19959895 5' + I-element 242 1 77.00 GAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr2L 17862273 5' + F-element 27 1 58.42 CCACATTTTGCGCTCACCTCTGATTGTTGTGCTGTAAATTGCATTCGGTGGTCAACAAAAAGCATTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGT:1 + chr3R 18896354 5' - 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rover 7088 2 55.67 GCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCG:1 + chr3L 27586 5' - INE-1 570 1 65.35 GAAATAAATGGATTATGGTTTTAAACAACATTTAAGTTTGCAACCAAGAGATAATAAAACTAACTTTACTAATGCATAAGGAATCATAACTAAATAATTC:1 - chr3R 17177674 5' + G3 342 1 52.00 GTCTATAGCTATCTGCCAGCGGAATCTGCCGCCCATTTTTTACCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATT:1 + chr2L 20999635 5' + FB 111 1 68.32 TCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCAT:1 - chr2R 2529355 5' - 1360 3374 1 39.60 TTACCGTTTTAATTTTTTTTTTTAAAAAAA:1 + chr2L 21315425 5' - pogo 2026 1 73.33 GATTCNCCAGTAGATTATTGACCAGCTCCATGTGCCCTCGATGGCAAGCAATCAGCAGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAA:1 - chr2L 5357763 5' + Circe 7198 1 64.36 TATCGTGTACCGATTGTGTTAGCGTTTTGCTTGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAGTGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATA:1 + chrX 10788462 5' + Circe 7206 1 63.27 GGGCATCGGCCTCTGAAGTTGATTGAATGACTGGCAGTCCCGGCGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAA:1 - chr2R 20159037 5' + Rt1a 4969 1 73.00 TGTGTGTTTGTGTGCACCACTTGGTCTATTTGCATTTGATGTGAGTGTAAGCTGGCAGCCCGCTGTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGT:1 - chr2R 5910616 5' - hobo 2671 1 69.31 CTAATTTTTCCGCCCCTCTATTGCCAGTTTTTCCTCGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTT:1 - chr3R 19539311 5' - HMS-Beagle 6704 1 69.31 GATAGAAATCTAAAAGTTTTATTTATTCCGAAAAATAATTTGATATAATTGTCCACCAGGGAAGACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATT:1 - chr3L 15912325 5' + transib4 2390 1 50.50 CAAAGATTTTTATTCAAGGGTCGCTAACCTGGTGACGCGAAGTGTACTCCATCTCCGTTTAACAGACCTCGCCCACCAAGAAGGCTCAATAGAAGGCAACC:1 - chr3R 4732185 5' + X-element 4483 1 65.35 AGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2L 22319346 5' - Transpac 5206 2 56.32 ACAGTCTTAACTCGTGTGCGGGGCAAAACCACTGGACTCGCAAAGGACCGATATGGATTCCAGTATAGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2R 20791726 5' + roo 9 2 68.32 TGCGGGGGTTGGGGTGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 11832959 5' + roo 37 2 63.37 CTGCTAACTGCTGTCTAGGCTTTTAGACACGTTCTACCCCCGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 + chr3R 5946099 5' - HMS-Beagle 7011 2 58.00 AGCTGTGCCATTCAATTATTTACATATTCATTCCCGAGCTTACTGAACGACCTTCCCATCGCTGACGAACGCCAGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTA:1 - chrX 16221717 5' + F-element 250 1 63.37 GGTCGGATCCTTTGAGTTGGGAGGAAATGCTATCATTTGGTGCCTGTCATCGTTGTTTTCGTTGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGG:1 - chr3L 18562910 5' - HMS-Beagle 6673 1 62.00 GACTCATGGCAGTTGATTTACTGCTCTCACCGGTGCACGGGAATGGGTAATGGGTACCATTGGTTAACTCTTTTCCACTTAGCACGACGCGACTGCGTTAG:1 + chr3L 20073360 5' - rover 445 1 55.45 TATGTATGCTATGGAGATCAATAGAAATTGCTTAGTTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGAC:1 + chrX 10371827 5' - flea 128 1 64.36 GCTGGAGATGGCGCCACTTGTTTTGGCATTGCCAATTCTGGGCAAGCACACAGTAGGACAGAATGGCGCAGAATAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCC:1 - chrX 18420304 5' + I-element 4993 1 72.28 AAGTTGTTGAACTATTTTTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2R 13314198 5' + jockey 17 1 69.31 AGCTCGATTTTTCCACTTTTTCTGTTCACATTTCGCGCTGTTCCAGTGTGCCCAGCTCTTCTTGTTTGCGATCTCAGAGCTTTTCTATCCCAGGGTTCAAG:1 + chr3R 20070206 5' + X-element 261 1 74.26 GTTCTTGACCTTATTTGTCAGCAGAAACAAGTAAGTACGGTGTCCATTTGTCTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTAT:1 + chr3L 23593639 5' - Porto1 4254 1 49.50 GTACCAAAACATCCTTTGAGGTGTATGTCAATCGGCAGTTTATGACTGATTTTAAATATAAGGTTAGCCCTGAGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGAT:1 + chr2L 75902 5' - Quasimodo 190 2 77.23 GTATTCAACTTACTCCGAGTCTCGAAAATCCTCTAGTTCGTCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGA:1 + chr3R 29940623 5' + G2 270 1 59.41 GTTCGTCTTGCGACAATCGCTTGGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGAACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCA:1 + chr2R 6630960 5' + F-element 4479 1 72.83 CATGAGGCCAGGGGGCGTGGCATTGTAAGCACACCCACTTGTATATATGTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 + chr2L 9856223 5' - HMS-Beagle 221 2 52.48 AAAGTTAGTCAATTTCAGCGTGTACAGCATGCAGCTGATAACACGTCTGTCCATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATA:1 + chr3R 6143791 5' + rover 6966 2 63.00 TTTCGNCAGCATTGGGTGCCCCAGCCGACAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGTTCCAACG:1 - chr2R 19936801 5' + R1A1-element 471 1 67.33 TTGTANCGTTAGCAGCACTTTCGTTGGCAGCTCGAGCGCACTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGA:1 - chrX 13139004 5' + F-element 418 1 58.00 CTAAAGTAAATGTAATCGAGTTTGTGTAGTTAGAATAGAAAAGACACAACAGCCACACGAAACATTCTCGAGGATCATATAACTATCTTATTCTTATCTG:1 - 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chr2L 1667067 5' - flea 4844 1 66.34 TTTGGGCTCTTTCTGCTGGTCTTTTGCCGTCTTCGCTACAGTCTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCATATATTTAATTAA:1 - chr2R 17501574 5' + springer 7518 2 55.45 CGAAAATTCCAATCAATCATTCATTCTGCAACTAAACATACCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGA:1 - chr2R 17621063 5' - Tirant 8066 1 50.62 ATTTCAAGTACTCGTAGTTTCGATATTAAATTGATTTGAGTCTTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 + chr3R 12789844 5' - flea 4987 2 57.43 ACACGTCCATTGCCCAAATGCAACACTACCGGGAATCAGATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAA:1 - chrX 1174495 5' + Bica 4616 1 67.33 AAAGTGACAACTTACAGGTCTCAATATCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGT:1 - chr2L 16770968 5' - R1A1-element 5021 1 74.00 ATACATCTGAAATTGGCCACGGATCTCAGCACAGAAACTTTCTTAAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTA:1 + chr2R 4679131 5' - 1360 2959 1 55.45 GATGTTGAGTCTTAGTTATAAACAATATATACAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGG:1 - chrX 14628572 5' + invader4 2883 2 68.32 GGGTGGCGGGTTGAAAAGTTATTATTATTTTAACAATTTTCCAACTCTTTTGCGCTTGAACGGCGCCAGCGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATAT:1 - chrX 7779782 5' - I-element 5088 1 76.24 AGGAGAAGCATTTGCAGAATGAGGAGCAGCCATCCAAAGTAGTCAGCAGTGGAGGCGAAGAAACGAGTGCCAACATGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGG:1 + chr3L 21479362 5' - Quasimodo 315 2 56.44 GCACTGATCATGGTTCTATGACTAGGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACT:1 - chr3L 14803434 5' - Quasimodo 18 2 79.17 CTACAAAAAGAATTGACTGAACTCATCGAACTGCACTGCACTTCTACGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGA:1 + chr2L 8967286 5' - Burdock 6105 1 51.49 AACATCAACAAAAAAAAAACAACAATGGAACAACCACAACAACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTC:1 + chr2L 5546014 5' + G5A 2655 1 61.00 CCCGTTGCTGGGGCTCCCTCGATGGTGTGCTGGCCGCGTTGCAAATTAATTAATTGCCGCCATATGCTACTGCCATTTTGGAAGCAAAATGAGCGGTTATG:1 - chrX 4281680 5' + Chimpo 364 1 68.32 CCTTCTGCATGTCAATCTCTACGTCCTGGCGGTAGTTTTCAAACGGACTTCTCCGCTGCCTTTGACGCTGCTGGCTGCGGTCTCCACAAATGACGCTTCTT:1 + chr2R 6182917 5' - aurora-element 352 1 75.25 AGATAGCAATAAGTTTTACATTCGCTGGCAGTGCAACATAAACAATCTAAATGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACT:1 - chr2R 19035414 5' + Tirant 491 1 58.42 GCTTATGAACTATGGATATCGCAGATCTGCTCTCCATTGAGCCAACTTCGCTTCCCCAAACACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1 - chr2R 13751398 5' + 412 83 2 62.38 ATTGTCCTCGGGTTACACTGACCAATTTCGAAGAGCACAAATTGAGCTGCACACACACACACACACACA:1 + chr2R 18650300 5' + accord 7028 2 75.36 GTGCGAGAAACAAAAGCGTGGAGTTAGGAAAGTCCACTGGAAAAAATAGGCGGCGTAAAGAACGAACGGGGTTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCGTC:1 + chrX 3003777 5' + Juan 236 1 60.00 GGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATG:1 - chr3L 18592072 5' + Cr1a 485 1 49.50 GAATTCATTCGCACCCAATTTCAATCGAATACTCCCTCGACAGCCGGCTTGTAGACGTGTCCCACATGTCACCTATACCATCCAAATATGGGGAACAGCCT:1 + chr3L 24121823 5' + G5A 2440 1 64.36 CAATCAATGTATTCGAAACCATTATTTTTTGCAAGACAAAGCGGAAGTCAAATACCAAATACCTCAACGATGCCAAGAAAAACTTTTATACGTACCAGAGA:1 + chr2R 18226258 5' + Fw2 394 1 64.36 ACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 + chr2L 18112502 5' - transib2 2798 1 51.49 TGTCTGTGCCTGGGTGGGTCGCGTTATTTATGGCATCAAAGCTCGGAGCCGAAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTTAATAAACACATTATA:1 + chr2L 8641979 5' + Idefix 295 2 61.05 GACTTTTTTTGGGAAACGATCGTGTTGTCATCGTCATATTTCGGGCCACTTGTTTTGGCCGCATGAAAAAGTATCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAAC:1 - chr3L 15531061 5' - 1360 3296 1 75.25 CGCAGGGTGCGATGGAGCCACTCCAGATACGTGTCCGCCGCCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCT:1 + chrX 10624983 5' + HMS-Beagle 79 2 54.02 GTCTAACTAATTTAAGTTACACAAATGGCTTCGGTAACTATATACAATACAATATATAAATAGCACATTCACAAAAAATAAATATGTATGTAATATGTATG:1 + chr2L 9675302 5' + Dm88 7 2 83.17 TGCAAGATCTCCTGTCCCTTCTGCAAGTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAA:1 + chr2R 19578894 5' - hobo 395 1 73.27 ACCTCCACCTGGCCGTTTCCAACAATTACGGATTTGGACCACCTCTCCAGTAGTGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGT:1 - chr2L 23006688 5' - Stalker 22 4 60.00 CGGCGCCCCCAAAGTCGCCGCTGATGTGGCTGCTCCTGCTGCAGTTGCTCCACCTCCTCCTCCAGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGG:1 + chr3L 16456196 5' - Rt1b 4987 1 68.69 CGTTGNATATTATTTTTATCCCACCAATAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 + chr3L 21909395 5' + roo 8753 2 72.28 GCAGCGATGCTGGGATGCTGGGATGCAGGATGCAGGATGCATGATGTCAAATTGATATATTGTTAATTGTTGTATTTTTATTATTGTTATGTTGCAGCTAA:1 - chrX 8324927 5' + BS3 1664 1 61.39 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTG:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 4931 1 67.33 TCCCTGGAGGAGGTAAAGCTAAAGGAGGTGGAAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTAAGCGACGCTATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGTCC:1 - chr2L 8356452 5' + Bica 4835 1 70.30 TGCGTCAGCCGGAAGTTTGGAGATGGGTCTCATGTTTGATTGTTGGTGCCGCGAAATGGAGATGAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCA:1 - chr2R 8789074 5' - G-element 4152 1 66.34 GGTCATTATGCATTTAAAACACGCGGTCACGATCTCTCCCTCGCTGAGTTAGTAACTGCGACGACCCAAAACCGACCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAAT:1 + chr3R 12298585 5' - accord2 7575 2 79.21 ACACAGCGTTCAGTCGAGATGCGCCAAATTCAGTTAGTTGATGTCATAGAGAAGCGCTAGTGGTCCCGTTCAAGAGGGGCTACTGCATAGTTTTGTCCCG:1 + chrX 4353335 5' + mariner2 93 1 78.00 CCAAGTTTATTATGAAATTAGAACGCACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGC:1 - chr3R 8185664 5' - Doc 405 1 74.00 CGGTATCAGAAGAGCCACTCATGTCATAGAGCGGCCAATGGCCAATCTTCAGCCTCGAGAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCAT:1 - chr2L 18514834 5' + micropia 33 2 62.38 CTGGTGAACAATCAATTCAAATATACCTCTCAGTCTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGGTTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTT:1 - chr3L 2901144 5' - transib3 415 1 65.35 AGCATGCAGCTGATAACACGTCTGTCCATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTT:1 + chr3R 6143816 5' + rover 6992 2 73.27 CAGAAAACACTGGGCTGAGAAGTTATTTAGCACTCCCAATTTTAGTAATAAAGCAATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGGGAGGTTTGGTTTTATCTTT:1 + chr3R 12780285 5' + BS 5014 1 42.57 GTATGACAATTATCTGCACTTTCGAGTACCATCTTTTTCCAAGTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 - chr3L 20195572 5' - blood 7336 1 57.43 CCTCTCGCCGTCCGCTTGTCTTGGGAACTCACTACAACGATGGCAACGCGATTTTGTACTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTCAATCAGCTCCAGCTACT:1 + chr3L 10535444 5' + springer 7325 2 51.49 CGACCNACCAGGCGGAGAGCAGGGAGCCGGCACAGAAGTGGTTATCACCCCAATGGCGAATGTGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGT:1 - chr2R 17853512 5' - F-element 265 1 64.36 AAACAGGAGAGATCATTTGAAGAGAACCGAAAAAGAGATAATACCTGAGAGCTTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGT:1 - chr3L 3485068 5' + diver 5888 1 77.23 TAACGTTCAACAATTACACCGTTAGCAGTGTGAGCAACGCACAAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATGCTTTGTATATTTGTT:1 + chrX 258399 5' - Cr1a 172 1 64.36 GCATCTGCTTCTTGTGCGAGGCTCCTCCGTTTCGCTGGAAAATCACAATTCGCTATCCTGCTGCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAA:1 - chr2R 12705606 5' - P-element 202 1 63.37 TTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689420 5' - diver2 4466 1 56.00 AATCCCTGTACTTGTATGTCGCTATATATTTGTGTATGTTGTATTGGGGTGTAATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTTGGGAC:1 - chr3R 23185834 5' - Idefix 16 2 69.31 GAGCCGACTGATTATTGGGATGCAAGTTGGCAAGCTGCATGGGAAAGTTGTTCGTATTATGTGCCAACTCCGGCTAATTGCAGCGCAAACATTGTCTTCAT:1 - chrX 15479943 5' + transib4 222 1 51.49 ATATCGAGGACCTTATGTCCTTAACTAGTTCTACAAACAGGAAAACAACAATCTTCCGGGACCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAA:1 - chr3R 24162618 5' - R1A1-element 5301 1 66.00 TCCACGCTCTTTTTTCCCTTTTTCGTCCATTGTCTATTTGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAA:1 + chrX 14810846 5' - I-element 4889 1 61.39 GCCCGACTGTCGGCACATTTACACCAAGTAATTTAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 15524357 5' + TART-C 11098 1 78.43 TAAATCTGGATATATTCAGAGTTATACTCGTATATGTTTGAGGCCTATGGCCGCGCTAATCACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCA:1 + chr3R 18635823 5' - rooA 129 2 67.01 GTGTAAAAGTTTGCACAACGTGCAACGTGCGACGCAAACGACAACGTTGGCGACGTTTGCCTCCAATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCAT:1 + chr3L 22426275 5' + invader2 71 2 77.23 CGCCTGTCGATATGATAAAAGCGGTTTCTCTGGCAATCGAACCGTGCGATCCTGGCCCTATTTGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAAC:1 + chr3R 5555056 5' - R2-element 3362 1 67.33 CGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGC:1 + chr3R 26331657 5' + G-element 46 1 66.00 CTTAGAAATGCACTTCCCTTTCACTGAAATAGTTTAACGACTTTGTTCCACGATAATCCGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAAT:1 - chr3L 3579688 5' - roo 8755 2 64.36 ATTTTTTCTGTTGCTGCTAAGACAAAATGCCAAGAGTTGACATTAAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACTGACTAGCAAATGTCCT:1 + chr3R 28782588 5' + G5 4592 1 53.47 CTCACAACCGATCCTATTTCGGTAACCACACCTCAAGAGGTATTCAATTCCCTTCGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTT:1 + chr2R 991996 5' + hobo 255 1 60.40 CGGACGGACAGCCGAACCGAAGTGGTTGGGGGACACACCATGTGTAGATATACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr3L 7231112 5' + 297 6597 2 55.45 CTGCCATGAAAAATGACAGCTGTTCGCTGCGAATGGCTATTTATGTGTTAAGACATGATAAGTAGGCAAACTATAAATATGTTCTATTTATGGGCTGCAAT:1 + chr2R 12436078 5' + rooA 7282 2 59.41 GCGAAACAAAAGCAAAATCTAGTCTGGCTTTAGCCAGACACAGTGGGCAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCAGATC:1 + chr3R 7295371 5' + Stalker 7143 4 62.38 TTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCC:3 + chrX 21772474 5' - gypsy3 6565 1 50.50 CACGCGGTCATCCTGCCGGCGGCCAAGAGTCCCAACAAAGTCTCCGATTCGGCAGCCACACGCCACCCAATGCCGCGTCTCGCGGATTCCTCTTTTCTTAT:1 + chr2L 4336725 5' - invader3 5360 2 56.44 CCACGATTCTGTGTTTTTGTTTGCCCTGCTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCA:1 + chr2L 14034725 5' - jockey 395 1 71.72 GAAAGAAAGCATTCAAAAACGAAAAGAGAATCTGACTCGTGTGTATTATATGGTATTTGGGATGTCAAATCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTT:1 - chr2L 18860008 5' - jockey 4702 1 75.25 CCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2R 21266507 5' - roo 387 2 59.41 TCACCGCTTTCTAGCCTATTGATTTGCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTTT:1 - chr2L 14964646 5' + hopper 146 114 86.54 CTTCGCCTTAAATAGAGTTCTAGCCAAATAACCAGATTGTACTTCCACCTCGGATATCGCACGTTAAAATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTT:1 - chrX 5925575 5' - Cr1a 4114 1 67.33 CTCCATCGTCGGGTTAACAAGGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTAGTGGGC:1 + chr3L 11909325 5' - FB 83 1 77.23 TCGCTGCGAGTCCTCGAAAAATGCACTGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATAT:1 + chr2R 11516275 5' - R1A1-element 29 1 73.27 TCCAACAGTCCGACATATGCATATGTGCTATCTATACCACTTTAAAGTTTAAACATTCGTTTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTA:1 + chr2L 20880386 5' - hopper 1099 1 66.34 ACCGTCAGTTTCTTAAACTCAATGCTCTCGTACAGCTCCTGGCAGAAGTCCCAGTGCGTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCGAGGGAAGCACC:1 + chr3R 15238630 5' + G6 402 1 63.37 AGCCGGAGGCAGCTGACAATGACATTTTGCAGGAGATGAATGGCAAGGCAGCGGAGCCGCCAACGCTTGACTCGGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGT:1 + chr2L 8369322 5' - diver 386 1 78.22 TGTTGACACAAAGTTTTTATTATCACGAATTATGTACTTTTAATCGGCTACCTTCGGCCTACAGTATTAAATATTATATGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCG:1 + chr3L 9067008 5' - jockey 4757 1 68.32 CACACCGCGTGACAATTACGGTTTTCTTGGTCTTGCCATTTTTACTCACACAAGCAAATTCTATTTTAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGA:1 + chr3L 4666094 5' + 1360 3296 1 66.34 AAAGTCAGCCTTAAAAAAAAAATGTATGAGAACATCCAAGAAGAAATTGCCATCATAACACCTGCCATGCTAACAAGACTCACGACAAACGCCAGAAATCG:1 - chrX 16240757 5' + mariner2 717 1 70.30 AAACAGTACTATTCTAGTCAATATTCTTAGCAACATTTTAGGTGTGTACACCCCAAGCACAGAAAAGCAAGAGAGGATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTA:1 + chr2R 5246364 5' - INE-1 566 1 55.45 CGCTGTGTGCATTTTATTGTTGCAATTATCGCCCGACGACCCTTGTTGCCGCAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 22780963 5' - roo 389 2 59.41 ATGGCCAAAATGGAGTCTGCATGTGAGCATCCAGGCCAACATACGCCTAAAGCAACTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAA:1 + chr2L 11177784 5' + G2 2604 1 72.28 TACATTTCCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr3L 5827854 5' + blood 7 2 73.27 CATCCTTTTCGGCACAAAACTCCTCCATTTAGATGCCCAACTTCACACACATATCCCAGCCAACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAAC:1 - chr3L 1266385 5' + F-element 304 1 65.35 TAAAAATAAAAAATTAAAACAATATAGAATTTTAATAATACAATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCA:1 + chrX 16499435 5' - HMS-Beagle2 198 2 56.04 TGGGTTGCTCAGGATGTGGGCAATAAGAATCACGCTCTTTATAGCGTGATTCTTATTGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTC:1 + chr3L 22126842 5' + I-element 4978 1 43.56 AAAGGTAGGTATATTATGCCAGCGGCTGACAAGCCAGGGACTCCTTCGTTCGGACTCCCCAAGATTATTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACCGTT:1 + chr3L 13661832 5' - Bica 279 1 71.72 TAACACAATTCAAGATCTAAGCATCATAACAATCTTGCATAGCACAATAATGCGCACGCTGAATACTCTAATGACAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTT:1 + chrX 16215187 5' - 1360 383 1 51.49 CTTTTTATTCGCTCACCTTTCTTTTCGTTTCGCTTACGTAATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACGATGCCTTCAAAGCGAGCAAACACTT:1 - chr3L 8696188 5' - G2 167 1 62.38 TGTAGATTCACATCCCACACCTGGCCGAGGGACAAATCGGATAATACCCAATTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTG:1 + chr3L 4819274 5' - Doc3-element 4563 1 57.73 TAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGAACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chrX 17947352 5' + hobo 55 1 75.25 GGCATAATTACTCGCACAATTGCACTGCAGATACATATATTGCCGACTCGGGCCAACCCCAACAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCAC:1 + chr3R 16027922 5' + R1A1-element 4925 1 67.33 GCTTAAGTGCGAAACTCTTGCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTCCTTCGCCATATGTCCACGAGCGCAACG:1 + chr2L 17617579 5' - R1A1-element 13 1 76.24 CAAAATCACGTAACCAATGCACCAAATGTTACCTAATGTTTATAGGCTGATTATTTAAACCCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 9463357 5' - roo 394 1 64.36 GAATGAGCTCATGAATTGCAATTAATCAACTAAACCTTTAATAATCATACTATTCAATGCTCGCTCGAACTTTGCACAACTGGCAGCAACGCTGACTTCCA:1 - chr2R 13479166 5' - flea 4894 2 71.29 AGTCTGTGATTATTGGCGTAAATCGGGCGAACTATTCGAGCTTGAATTATATTTTTCACAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 16253351 5' - roo 391 2 47.52 TCTAGCAGAGTCCTCCAGCCAAGCCAAGTGGTGGTGGTGGTGCAGTCGTTTAGCGTATCTCTCGCTGAAGCGGGAGATCTCCTCTGCTACCCATGGCATTC:2 - chrX 17203804 5' - G-element 4049 1 62.38 TCGATAACACAAGTCTTTTTGGCTACAAGTTGGAGATTTTTTTTTATGGAATGGATAAGTTTTTGGAGGTCATATTCAAGCGGGATCTTTTCCCACTATTT:1 + chrX 21948939 5' - S-element 1331 1 74.26 TAAAAGAGGTTGCAAAACAGTCGCAAAAATGATATAGTTTGGGCGTATAAACGTCAATATCTCACGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATAT:1 + chr3L 10615767 5' + INE-1 172 1 64.36 AAAATTTTTAAAAAGTTTTATTCACCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - chr3R 7641686 5' + INE-1 556 1 81.00 GTTTGGATTAATTCAAGTTAATTTAATTTACAACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTAGTTAAGGGGCCACAAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTG:1 + chr3L 19128453 5' + Gypsy12A_LTR 1932 1 68.32 AGTGTCGAGGCAGCCGCCAAAATGAACGCCGATGGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAAT:1 + chr3L 5665986 5' - HMS-Beagle 5 2 66.34 CCACTTGTTTTTGTTTTCGCAGTACTCACTGTACCCGCTACACCCGCTACACCCGCTACAAAGCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGAT:1 - chr2L 3924082 5' + I-element 5009 1 60.40 TTAAGCAGACATTAAGTTAATAAAACTCCAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATACAGACC:1 + chrX 10696171 5' + flea 4693 1 69.31 AAACACTTCCTTTGCGATAACTTTTGTAATGGGGTTAGATAGATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3L 2539226 5' + roo 1 2 75.25 ACCCTGCGAAAATCATTGGAATTTCAATATGGTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACAC:1 + chr3L 12526383 5' - opus 7231 2 68.32 GCTCGCTTAAGTGCCTGCAAATTGCACTGACAAGAGCGGGCTGAGACCTGGAGAGGTCGAATGGATGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCG:1 + chrX 566421 5' - jockey 4600 1 67.33 TTCGACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2R 18891023 5' - opus 491 2 64.36 AGTACAATTCAATCAATGGCATACAGTTTTCTCATTTCATACTACTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTC:1 + chrX 11021966 5' - jockey 4693 1 56.44 CGGACCATAATGATTAGACAGCCATTCACAGGCACAATTACATTTATGGAGTGCAGTTCAACGACTTCCGTGTTGTTTATGGCTATTTGTCAATAATAAT:1 - chrX 12861287 5' + hopper2 402 1 69.00 GCACTCTCCTCGCAGACACACGCTCTTAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGAC:1 - chr3L 21916376 5' - R2-element 3212 1 74.26 GCAAGGCTGGTACAATCATACAGACACTTACCACACAAAATTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTG:1 - chr3R 1725844 5' + mdg1 196 2 59.41 TCGCACACAGCCCTGAGAAATTGGTAAGAGCCAGGTAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTTTCCATCAGGGTCAATAGCCGAGTTGA:1 + chr3R 31669658 5' + INE-1 94 1 69.31 AACCGAAAAATCGTGACGGGATAAACTTAAGGGGGGAAGAACTGAGATCTGAATATATGGCGTATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGT:1 - chrX 368715 5' + F-element 4212 1 68.32 CCATTCGCAGGAAGTTCAGAGATTGCACAGTTCTGACCATAGCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTA:1 - chr2L 20929867 5' - opus 7410 2 61.39 CAACATGACAGCGACCCAAGTCTAGCTGTCTGTCGTGTGTGTAAAATATTATTGAAGACCCGGCTGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGCGAATTAC:1 - chr2R 18078853 5' - R1A1-element 140 1 68.00 AGCTAACAATAGCAAAATGGAATTGCCGAAAGAGCTAATCCGACGCT:1 - chr3L 14433656 5' + R1-2 376 1 91.49 AGTTAAAAAGCTGAAATATTTTGAATACGGTTAGCTGGAGCAGGGCAACCCTTTAACTTTAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTAAATGAA:1 + chr2L 5611823 5' + pogo 162 1 57.43 ACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCAT:1 + chr2R 5284557 5' - Doc4-element 2619 1 47.52 GAAAACGCGTGGAAATATTTCCATAATTGCTCAGCGCACACTTCTCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTT:1 + chr3L 3283312 5' - R1A1-element 37 1 64.36 GGGGCGCCTAGAAAACTTCAAAAACTGGCTCCAACTCAAGATAGGGGGTAAGTGGCTTTGGATTGTTTTCGGATTTTTCTGTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 24570047 5' - Doc2-element 251 1 75.51 GCACGAAATTCTGAAAAACTCCAGGAACCAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACA:1 - chr2R 16155911 5' + I-element 190 1 73.27 GGACAAAAAACTGCAGCTCCAATGGGTGTAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAAAAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTC:1 + chr3L 14939770 5' - McClintock 113 2 69.31 TCTAATTAGTTACACTTAGGCAGACACGGCAGACCCAGAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACTATTGAAGAAATAAAAGTGAA:1 - chr3R 7138206 5' + HB 1491 1 66.34 CAAAATTCTGTACAAGCGGGAAGATGAGCGCAATGAAGAATGTTGAAAACTATGTATCAAGAAGGAAGCGAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGC:1 - chr2R 1248189 5' + gypsy4 374 1 69.31 AAACGTCGATAAGTAGAAAAACTCGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAAT:1 + chr3L 6752787 5' - McClintock 6033 2 76.24 TGTCAATTACTTTCAACAAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr2L 14536330 5' - blood 362 2 63.37 TTGCCGGTCGTGTGGGAGTGTGACGAATCATTTAATGCCAAAGATTTCTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTC:1 + chrX 1565221 5' - 1360 236 1 69.31 AAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAGAAGAGAATGTCAAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 + chr3R 18346631 5' - INE-1 551 1 51.49 CATAGNATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 13314179 5' + jockey 36 1 57.43 TGGATCCCAGCACGATTATAGCACGATGGTTTCAACTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATG:1 + chr2R 7270380 5' - R1A1-element 333 1 65.35 TCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 9868612 5' + roo 48 2 78.22 GTCCAGTTCTGGGTGTTCTTCTCTGATTGCTGGGTTGCTCGAGCCCCAAACAAACCAGACCTCGCCCCCTAGAACAGAAATTCAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 16509195 5' + Doc 4701 4 90.10 ATCCGCACACCGAAAATCATAAATCCCCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAACATAATACAAACAAATAAATAGAAA:1 - chr2L 2585120 5' + Doc2-element 90 1 68.32 GATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3L 2182717 5' + blood 49 2 72.28 TTATCTCCAAATAAGATTTCCAGTTACGTGAATGAATTAATGCACTTATCCCGTTTATAAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGACAAGTG:1 + chr3L 16106524 5' + diver2 470 1 66.34 GGGAAACCAGTCCCTCCTGCTCCTGGCTGCCCTATCCTATCCCAGTTATGAACAGATAGGTTTCAAGAACAATTTCCCATATACATAGATGTTTTTTTTTA:1 + chr2L 3582993 5' - Transib5 28 1 57.43 GCGACTCCATCTCATCCCCAAGTGAATCGTATTCTTTTTTCGGCCGGACATTGCCGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chrX 18569898 5' - opus 7494 2 69.31 ACCCTGTATCCCATGTGCCTGCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr3R 9996365 5' + blood 11 2 69.31 TTCATCGAATTGACGGACACAAATAAATGTCTTAGTCTACCCTTCTCGACAATGCATCGCGCCACCAAGACATGAGCGGCAAGCCGACTCAGAATTTCTGC:1 + chr2L 17121582 5' - gtwin 7074 2 70.30 GTTGGTGATCAACACTTTTAATCCAAGAGGACAAGCATCTGTATCTGTTGGACATTGTTGACCATCTCTTCCTTACGGAAACGCTTCATCATGGTGACGAT:1 - chr2R 4796663 5' - Rt1a 4725 1 59.41 TTCACTTATTGCGTATACAAAATGGAGATTTGAAACAAAAAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTT:1 - chr3R 10418545 5' + hopper 1170 1 63.37 GGCATTTGGACTCAGCCCGCAGGCTCGCTGTGTGTGAATGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTG:1 + chr3R 18797981 5' - I-element 360 1 61.39 ATACGCAAAAAGGCGAATGCAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 25814691 5' + 412 7073 2 59.41 TTCATGGCTATACTGGGTAAGCAGGATGTACCTCCCGAGGGAGCCAAGAACCGTGTGGAAGCCCCTCTTGACCCCGGGACCACTAGAGCTCCGCTATGACA:1 - chr3R 4504769 5' - mariner2 56 1 65.35 AATTTTAAAGTTAATTTGCTTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACA:1 - chrX 1524341 5' - jockey 77 1 80.20 AAATACGGCGAGGAAATCTGAGGAAGCCGGAGATCCTGTTGGTCTGTGTGATTTTTTCGCATCCAGACACATGCACTATATGCTCACTTGTGGGTGTATAG:1 - chr2R 22936682 5' + R1A1-element 5259 1 65.35 GATTTTGAACTTGTAGCCTCTGGAATGCCCATTCGTGCCGGAAACACGTGCGCAGCCGGCAAACACAGAATATTTGCGTGGCAGCTGCGAGTCTTTGTTAG:1 + chrX 15046994 5' + Gypsy6A_LTR 121 1 62.38 CCGATCGATCAACCCTCAACGGTCCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGT:1 - chrX 17328408 5' + Cr1a 235 1 45.54 AATGTGCCCACGAGCAAACCGAAAGTCAGCTGATACAAATTGGGTTTGCTGCAAGACGACCAATCGGATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAGA:1 + chrX 10485602 5' + copia 4663 1 62.38 GACAAAATTGGCTTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGA:1 + chr2L 16703707 5' - F-element 383 1 83.78 AATTCACTTAAAATTCACAGTTTACGAACTCAACCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCAC:1 - chrX 20942497 5' - Dm88 370 1 69.31 GGAAAAGCCAGGAATGGCAAACAGTGCTGTCGGTAAGCGACATTCAATAAAACGTTATTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAG:1 + chr2L 17013364 5' - Stalker3T 303 1 55.45 AAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 19535753 5' + hobo 37 1 60.40 GCTCGATCCGACAACGACAATGCGATGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAA:1 - chr3L 12714683 5' + 412 7373 2 74.26 AGGCACAAGCTTCGGGTCATTAAATAAAGCGACGGCCAATGTGCACAAACACACACACACACGCGTATTTACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGAC:1 - chr2L 2894493 5' + accord 216 2 69.31 AACTCGACCCTTCCAATTAAAACTTGCATAACTTTTAGTTTCGTTTTTTACTTCTTCGTTTCGTCAGTTTTCCATAGTAACATCTGGGCCTCATCTTCAAT:1 + chr3R 22096057 5' + Circe 7228 2 75.25 AAGGGGAATTTCAGATGGGAAAGGCATTAGATCTTGCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 + chr3R 17940253 5' + jockey 4746 1 64.00 ATGGGTTCTTGCTTGTCACCCGCAAAAGTTTCCGACCCTAAAGCCCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGT:1 - chrX 22747440 5' - Doc 4404 1 55.45 ACATTCTCTATTCTCTTATTGTCTATGAATATTTTCCAATAATTATACTACTCTTTATACATAATATTGATAGATATATGTACCTTGACATTTATTTTCCA:1 - chrX 9997924 5' - transib2 272 1 75.25 CATACCGTGTAGCCCCAAAATAATCCACCGTCAATTTTGGTTCTCACCGGAGCGCGACTCTTTGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATAT:1 + chr2L 1929692 5' + invader4 30 2 54.74 ACAGGTGTGACACAGCCAACGCAGCTCAAGTTGTGAGAGGGTGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAG:1 + chr3R 11118611 5' - jockey 4722 1 58.00 GAACACCCTCCTTAACTAAAAACACTTTCGATGGACTATGGCGGAACCAACTTCTTTCGTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGTCATCT:1 - chr2R 16775544 5' + Q-element 289 2 58.42 TTTACCAGAAAAGAAAAAATAAAGCACACCAACCCACCAAACCCAGACCGGCCACCCCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCAAGCTCCCACGTATCTCCA:1 + chr3R 4759451 5' + G2 37 1 74.75 CCGCANCACATCGAATCCGTTTCCCGTCAACTTCAGAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAAACTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCA:1 + chr3L 20132179 5' + springer 304 2 64.36 TTTAATAAAAATGAAGAGAACTTTTAAGGTAAGTAACTCGCACCTTTGGATATTCCACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACC:1 - chr2L 15029935 5' - invader4 2715 1 55.45 TCCAATTTTCCATTTTGCCACACCCAGAAAAAGTGCATTTTTCTACGACAGTTTTTGGCATTTTTGCACTGTTTTTATTTATTATGACAAAGTGTCACAAT:1 + chr3R 11303581 5' - Stalker 6917 4 79.21 CGCACCACCACACGCACATTCTCGATTTCGTCATCGAGAATGGAAAAACACGAACTCTAGATAAGTCACCCATTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATT:1 + chr3L 5359178 5' + Idefix 188 1 67.33 TGTTGGATCGATGCGAAATGCCGGTAAGTAGATGGGATCGATTACGTGCGTGATGGGAGGTGTTACACCTGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTC:1 - chr2L 14197658 5' - G2 290 1 49.50 ATTTGGATTTGGAACTGGATCTGGATTGGATTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTG:1 - chr3R 18912843 5' - F-element 4507 1 57.14 GTTTTGCTTTAATTGGACTTGTGTTTAAATCTAAGCTAAAAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 7375389 5' - roo 9036 1 65.35 GCAAAGACACATCGACAAACCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGG:1 + chr3R 27204134 5' + roo 247 2 81.19 GCTAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr2R 16928870 5' + blood 46 2 69.31 GGCGTTTCAATTAGTTTTATTAAAAATGCAGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTG:1 + chr3L 20857540 5' - flea 141 1 83.17 TCCTTAGCCAGACATTTCCTAACTGAAGTAAAGTAAAGAAATAGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAAC:1 + chr3R 11001068 5' + X-element 4611 1 57.43 TCAGAGGCCAAGATGCAAGTGTTGAAAGAATGCAAAGGCATCGATCTGCTGATGGGTCAGTTGGAAACATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATG:1 - chr3L 2428549 5' + pogo 1649 1 69.31 GGCCGCCTGTTTATCGAACTGTGTAATTTATGGCATTTGTTGTTAATTTGTCTTGCGAAGAGTCGCGCTCCAACACGGCCTTCCTGACCTTTCACAC:1 - chr3L 22012944 5' - invader4 2738 1 57.73 GCAGCAGATTACCTCTTCGAACCATTTGGCAATCCAGCGAAATATTCCGAACACTGTCCGCTCAAGGAGTAACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTC:1 - chr2R 20018785 5' + Q-element 246 2 72.28 TCACATCGCAGTTTTTGAAAGCAGCGCATTTATTTATATTTACACACCGTTTAGCTACCATAAAAGGTATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chr2L 20465565 5' - blood 370 2 69.31 GGTGGCGTTCAGACGGATTCTTCGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACG:1 - chr2R 4027307 5' + R1A1-element 5044 1 75.53 GCCACGCTCCACGATTCATTTCTAGCCCGGCGTTTTCCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTA:1 - chr3L 13771764 5' - opus 7212 2 64.36 TTGTCATTTACTCCCGTCCCGTTCAGCACTGCATTGAAACATTTTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTG:1 - chr3L 22980218 5' + invader4 2857 2 57.43 TTCCGCTTCAAACATATAGAACTCTGCTAAATGCAACGGAGACTTGGAGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAA:1 - chr2R 17002893 5' + F-element 4236 1 59.00 CATTTTACGTTTTGCCTAGGTGCACATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGGAAGTTTTTCATGTTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAGCAAAAT:1 + chr2R 25089830 5' + HB 173 1 53.47 TACCAAAGTGTACTCAATGCACAGAAAACAATTTGTAATTTGTCCTCCAGTTTAGATCGTCTTTTTAAATAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTC:1 - chr3L 10020025 5' - TAHRE 327 1 45.00 CTCATAGGGAAATACAAACTATTTCTTATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 9868572 5' - roo 9027 1 74.26 ATGTCAAAAGGCAAATTATGTGCTGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTACGGAAGGATATTTTAATGGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGT:1 + chr2R 19895048 5' + Tc1-2 1302 1 76.24 CGGCGCTCTTCACCGGTACCGGCGGCGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCG:1 - chr2R 10282572 5' - F-element 311 1 74.26 ATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 - chr3L 23871302 5' + Doc 53 1 70.30 GGCAGGCGGAAACTATTGATTCGCTGGATCTTTAAGATGTCCAGTTCAGTTTGGTTCAGTGTTAGTGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTC:1 - chr2L 3470461 5' - jockey 4732 1 70.30 GTTAATTTCACTGGTGTCGAGCGGCAAGTGGAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 19510826 5' - roo 394 1 64.36 GCGAGAACATGACGCTGCCTCGACTTGCCGGCTTATATAACCCACACCGATATGGAGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAA:1 + chr2R 19234709 5' + Stalker2 7521 2 62.38 CTTACTTAATGAGCTTCAATTCCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 + chr3L 2182687 5' - blood 7335 1 80.20 TAACTGAGATCAATTGTAATTGGGGAAATTGAACGAAATCATCGTACCAATTAAAAGGGGCCCCAAAACACGACAACAACTCATGGCTGCGATAGTCGAAG:1 + chr3L 16402400 5' + S-element 1313 1 56.44 AAATTAATCAAGAATTCTGGAGACAGCCGAGATACAGATAGGAAATCGATAGAAAGTGACAGTTCAAAATATTATAAAGAACAAGAGAGAATGCTGTAGTC:1 + chr3R 18845959 5' - INE-1 580 1 65.35 ACTAGCTGCCAAATAGCAACATGTGTAGCGACACGCACACACGGACACAACACGCACACATTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr2L 13482116 5' + hopper 12 2 64.36 AGCTGAGATTACGGCATCTCAAAGCTTGGAGACGATCCGTTCATTTGAAGAGAGAGAAAGAGCGCGGGAGTTAGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 - chr2L 306570 5' - Tirant 8494 2 65.35 CGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATG:2 - chrX 22824229 5' - Gypsy12A_LTR 2254 1 47.52 TGCCAAATGCAGTGGCACCCGCAACTGAGCCGCTTGTTGGCCAGGTTGGCTGGCAGCTTTTGCCCTCGTAAGTTTGTTGCTGGGCTGGGAGTTCGTT:1 - chr3L 14340377 5' - Doc 4553 1 65.98 GCAGTCCTAATAAAATTACGTCAAGCCTTGCAAAAACGAAAAAAAAAGAACAAGCAAAAAAAAAAACAAAAACAACCAAAAA:1 + chrX 11264106 5' + Tc1-2 495 2 62.20 TACCACCCTGCTCAAAATGCGGCAGACACAATTCCAACGAAAAGCTGACAACCCATACAAATCCACTCGCAAGAAAACTAATCAGAG:1 + chr3R 10742902 5' + Doc 4505 1 54.02 CTCTTCAAACACACGAACACACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3L 14882834 5' + jockey 22 1 73.33 GCTTGGAAAACCGCAGGAAAACATGTCACCAAAGGGCAGCTCCGCGCGCAGCAAGCTTACGGCATAAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAA:1 - chr3R 9114801 5' + Chimpo 161 1 64.36 AGGAGAAAAATCGAAGGACACTTTGGGGATGAGAGGATATTCATGCAATTTGTGGTAAGGAACTTAAGTGCATTACTGTTTTCTTTGAAATAATTGAAGTG:1 - chr3R 20504582 5' - 297 6611 2 63.37 ATGTACGTCTAAGTGGAACCATGTACCGTTCTTGTGCTGCTTCTTTGTCTCTAGAATCTATATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 - chr2L 4303545 5' - INE-1 156 1 70.10 TTGCGCTTTTTGTTCTCGGTTTCACTTTTTTTGCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATC:1 - chrX 1240234 5' - micropia 5172 1 67.33 CCGGACTTAGCTGGAATAAACCTCCGGTTGTGTCCACAAATAGAAGCTAATGAAGGAAGCTTTTCACATTTTTATTACTCTAACGCCCTAAAACCGTCCAA:1 + chr2R 23452161 5' + INE-1 342 1 65.35 AGATCCCAATTGGAATAATGATTCATCCTAATGGCTTCGTAATTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTAGGGTTCACTTCGTGCAGTCATAAGC:1 + chr2R 10672476 5' - Doc3-element 400 1 54.84 TTACAGTCTTCAGATTCGCTTTCTTCAATTTTTAGATCGTCATCATCTTTATTATCTCTTGAAGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACC:1 - chr4 232457 5' - hobo 2635 1 71.29 ATTTTCGTTGAGGTGTTGATTGACGGGTATGAGTTGTTATTGGTATTGATGAAGGATCGCGATCGCGGAGCGGGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCA:1 - chr2L 7311985 5' + Stalker4 198 4 39.80 CAAGAGCGTGGCGCAAGGATCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCC:1 + chr3L 10232901 5' + F-element 4502 1 72.22 CAGGCATTGAGGGCTTCTCTTTTTTTCTCCTTGCAGTGAACACAGAAGAAAAAACCAGTGCTTTAAAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTCGAGTGATTCTTTT:1 - chr3R 18933261 5' + rooA 477 1 62.38 AGAAACTTGTTAGATTGCCCCATAAGCTGAATCTGGATATGTGCCATGAGTCCCTTGAGCGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGAT:1 - chr3L 20580292 5' - Doc4-element 58 1 56.44 GACATTTAAATATTTTCCACAAAGCCACAAGCTGTCAGGGAATATAGAATAGTGGCAGTATGCCCAGGACTAAGGACAGATCGACTCGGCAATTGATTCTG:1 + chr3R 15519674 5' - INE-1 95 1 75.25 GTTGCGCACGCTTTCGCTCAGTGTAGGACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTG:1 + chr3R 13617278 5' + accord 7031 2 55.84 ACACACACGCACACACACACACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATG:1 + chrX 8185447 5' - accord 7046 2 80.20 ACAGTTTATATTGTAGTCTTTCTTGCAATTAATGATTTGTAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr2R 15856424 5' - mdg1 7417 2 65.35 AGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr3R 14913170 5' + blood 7062 2 73.27 CAATTACTTATATACTTGGCATGCATTATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 15814723 5' - roo 9045 1 50.50 ATTTGGGTGATAACTCTGCGGCAATCCAGGCGCAGATCGAAATTCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 17788889 5' + roo 15 2 62.38 ATAGTNCCAGATTAAGTTTTCTTCTTGAGCATTTACAGCTAGAAAGTCGAGAAGAATCTTTTGCAAAAAATCCGTCTGTTCGTATGAACGTCGAGATCTCG:1 + chr2R 4711938 5' + INE-1 135 1 68.32 TGGTCCAGGGCGGTGCGGAATGGGCCTGGTCAAGCCACGCGGCTGGGATAGACGACTTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGTTCGTTGGATGATTTCT:1 + chr3R 25153204 5' - Fw2 3595 1 65.35 GAAGGTTGGTAAAAAGAAAAGTATTTATTTAAGAAGTGCAAGAAAATGGGTTCGAACAAGCAAACGATCGGAGGTAGATATAGTCATGTATACCCTTACAT:1 + chr2R 1320391 5' + Transpac 4918 1 80.20 TTCGGTCTGTCTATGTTCTCAGTGTTGCTGTGTTTCAGTTCAAATCAATTGCGAATTCAAATGATCTGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGAGTCAG:1 - chrX 12641113 5' - Chimpo 274 1 67.33 AACATGCTGATTGTATTTATCGGAATGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGAAGCAACAATCATAGAGGCAGAT:1 + chr3L 17692662 5' + invader2 121 2 66.67 AGCTGGCTCTATTAATGGATAATCACTTTTTATGAAGTTTATGTCGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGATCGCTGGCCTTTTGGCTCAGCGAAGAT:1 + chrX 5014234 5' - gtwin 329 2 77.23 GCGGATTCGGACAATCCACAGACAGCTGGGGCTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGTAACATGGACT:1 + chrX 20777164 5' - HeT-A 5866 1 74.26 TATTTATTAGAATTAAATGTAATAAAATTTAAGTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 + chr3L 25798458 5' - blood 337 2 68.37 CGTCAAATTAAAGATTTGTGTAAGACAGTGTTGGCTGAACAGGGGGCGGCTGGGCGAGCACGGAAGCGGGGCAGTCAGTTAGACAGCAAGATCGCGCGTGG:1 + chr3L 22182677 5' + gypsy8 384 1 60.40 TTAAATGCTGGTATGTGCGGGCGAGGGGGTGGCACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGA:1 + chr3R 16661432 5' + HMS-Beagle 6709 1 67.33 CTCTTTATTTTAATGAAATTAAATTTTTTGAATTGCGTTGATTTTTTTATCATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:2 + chr2L 12728388 5' - opus 474 2 54.46 TTTTTTCTGTCCTGACTCAGGCGCAGGCGAGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2R 11115806 5' + hobo 46 1 69.00 GTGTGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATGTCACCCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chrX 22252764 5' + 297 6613 2 60.40 AACTAACTGGTCACACTAAAGCGGCAGATTTTAACTGCTACGTAGACACGGTCACTCCGACAATAATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAG:1 + chr3L 17465933 5' - blood 122 2 69.31 TTCGTGTGCGTGTGCCCGTGTGTGTCTACACCATGATGAAATAACAAAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAA:1 + chr3L 5691253 5' + P-element 205 1 31.00 CAAAGGCTAAACAAGGGCGCAATTGATGGGCTCTTCCGTGTCTACGCTTCCTAGGCTGCGGAAACTGCTTGTGTCGATGCTAATTGAACTCAACTGTATT:1 + chr3L 15403400 5' + diver 73 2 44.00 TGCGGATGGATGAGGATGGGGAATGGAGCAGTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCT:1 - chr3L 12058859 5' + G2 275 1 69.57 CGGCAGAGTCTGTCATTTTGTCCGTTTCCTGGTTGCTGTCTTCTTTCCTCTTTTCGTCTCTATGGGTTTTCTTTTCCTTTTGGTTATGGCAG:1 + chr3L 25691434 5' - TAHRE 272 1 65.22 GATACACCAAAGAATCCTTTGATAACACAGTGAATAAAAATTATGAACTCTGGATATACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACCGACGTTTTTAAC:1 - chr3R 11724929 5' - transib2 444 1 61.39 CTTAGTAGCCAATTTGCCGGAATTGCACATTGGAATTCAGTGTCTTCCTAAGTACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGC:1 + chrX 4323270 5' + opus 363 2 56.44 CAGCACACCCGAAATTGCGCAGAACTAGCAACTTGCCATAAAATCCGAGCACCTACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGAGA:1 + chr3R 30841896 5' - R1A1-element 5028 1 61.00 TTCCTTTAATTTCTAAACTACGACTTGTGGAAACTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTT:1 + chr2R 8725433 5' - Ivk 264 1 67.33 CTCCTNCAGCGAGGGAGGTGGTACGTGGGTGTGATGGCGGTTGTTCGCTTGCTGGTGTGAGAGAGGCAACGGTGCTGGTTGCCTACAATGGTTAACGGATT:1 + chr3R 12849199 5' - Doc4-element 223 1 57.43 TGGGGTCTTAGGTGCGAAACAATCAATACCCTCGTCGTCATTGCAAAGTCCAGGCCCCCCGATAACTAATGCCAATTTGAATTTTATTAGGGTTCAGGGC:1 + chrX 10484286 5' - baggins 5323 1 80.00 GTGAAAAGAGCGGCGCGAAATCATAATGGAAATCAAAAATAGCAACACACACACACGCACATATTCACACATACCGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTG:1 - chr2R 10545412 5' + accord 7066 2 60.40 CGAATATATTTTTAAATCTAACAGTTTTCTAGAGATGGCAAGCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAAT:1 + chr3L 12471409 5' + I-element 419 1 66.34 ATGGAGTTTAGTTGCGAGACGCGCTTTCAAATGGGGGAGTATGCCGGGTCACGCACGACTCCCACCAAAGGGCCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAATTCTC:1 - chr3L 24211364 5' + Quasimodo 231 2 69.31 CTCATTCCACTTGAATTATTGTCTAAACGTGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTAC:1 - chr2L 3641210 5' - opus 7114 2 70.00 CGCCAGTGGAAGTTCCGGTCGGTTGGCTTTTTTTTGCCCGTTGCACGCGCTTTCTTTATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACC:1 + chr2R 8634503 5' - F-element 316 1 60.40 TGAGTACCCAGTAATTCCATCCTAATTGTCACTTGCCAACGAAGGACAATGGAATGCGAGCGATGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGTC:1 - chrX 17047315 5' + Stalker2 199 2 65.35 AACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAG:1 - chr2R 4879003 5' + G-element 52 1 74.00 TATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATAC:1 - chr2L 7241330 5' - pogo 3 1 78.22 TAGCAGAGAGATGCAGAAAAAGAGAGAGCGAGCGTGGGCTAGAGTGGGATAGATAGCTGGATAGTCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chrX 1399838 5' + P-element 8 2 71.00 TCTGAAGAGACAACCACTGACTGACTGACTGACAGGCAATGCTGCAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTT:1 + chr3R 26488226 5' + I-element 154 1 55.45 GATGAAGCTTAGGAGCGGTGATCATCTCCAGAACCTTGTTGCGAACCCATGACATGGAGAATCAGCAGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACAA:1 + chr3R 4931615 5' + Burdock 5963 1 79.80 ATTAGCAATCAAATACTAATGCAAAATCTTTTTCTTTTATGTTTGTGACGTCTTGTTTTTGACCCACCATCAAACACATTAAACACACACACACACAGATA:1 - chrX 11220428 5' + accord 182 2 66.34 CTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGA:1 + chr2R 8158771 5' + Juan 37 1 48.51 CGTTTAAGCTAGTTTATAGTTAAATTTGGCAATATTGCTGTTGCTGTCCTTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGT:1 - chr3L 16005160 5' - F-element 4242 1 74.26 ACCAATAGATTTCCCATAGCTTTAGTAGCATTAAGTTGTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAA:1 + chr3R 21390369 5' + Burdock 6313 2 71.29 TGGGGCGGGCATTCGATACATATACATATGTATAGGTACTACATATGCGTATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAG:1 + chr3L 19246317 5' + Idefix 10 2 68.37 TACATCGATTTGGGTGATAACTCTGCGGCAATCCAGGCGCAGATCGAAATTCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 17788882 5' + roo 8 2 69.31 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTTGTGATTTTATTTCCCCCGTCTGTTTTTGCGGATGGTGTGGCCACAACTGAAATTAACTAGGCAATGATTGTTGA:1 - chrX 7978952 5' + 1360 444 1 67.33 CACCACTTTCCCATTTTCCCATTTCCCTAATGAAGTTTGACGTGCTGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGAGGAAATCGTGCGC:1 - chr3R 30415211 5' + pogo 1633 1 54.95 CAGATGGGTAATTGAAGGAGGTCATGTATGAGTCTCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTG:1 + chr3R 28007597 5' - F-element 421 1 65.35 TAGGTGCTCTATATATTTAACATTTATCTGCTTACAAATAAGTCAATAAAAATGTTTTAATCATATAACAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3L 18076356 5' + roo 8671 2 68.32 ACGGCGCCCCTGTCACTCAGCACTAGTGGCTGGCCAGTACTACGATTTCGTAGTCGCAGTTATTACTCTTGCATCTCGCAAGCAAATCCCTCTCTC:1 - chrX 16161396 5' - Bica 21 1 69.79 AGATAGCAATCTGTACAGGATCAGCGGTGAATTCGCATTCCTGTTGCTTTCTGCGCTCATAGTAGAGCGTAAAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGT:1 - chr2R 17106882 5' + roo 8766 2 74.26 AAGTTTTCCCCTCGGCTTATTTCCATGTATGCCGATCCGCGCCACCAAGAGAACGGGGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTAG:1 - chr2R 12962990 5' - roo 8668 2 60.40 CATCAACGGCAAGCTGACAATGTACAGTCAGCCACTCAAGGGGCACAATTAAAGCCGCTCTCTCTCGCTCTTGTTCTGTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chr2L 9814783 5' - gypsy7 5011 1 73.12 GTACCNCTCGACCGTACCGCCGCGCTAAATGGGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 + chrX 15378902 5' + blood 7069 2 66.34 CTATACACTGTAGTTTAAGCCATTTGCTTAGCATTCAGGCTGAAAACGAAAACATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGT:1 - chrX 13506995 5' + 1360 3352 1 60.00 GATTTTCATGAATGGCAGGGCAGGCTGATTTTTTTAGTTTTGCGACGCTGACTTATTGAAATTGACAGAAGGTTAATGGCGCGCCCTTGTTCAAGTGTAGA:1 + chr3R 29374362 5' - TART-A 13199 1 80.20 CCTGTTCATGACCACAATGTGTCCGCGAACCTTGACCGCAGCCATGTGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3R 22352855 5' + 412 29 2 54.46 GGTATGGTTGTTTGGTTTTGTGTATGTAATGATCACTAACTAAATCGCTGCTGGGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTTTTATCATCTAA:1 - chr2R 4736296 5' - rooA 7500 2 65.35 TTTTGCCTCGCCGATTATATTTGCACGCATGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 10635302 5' + roo 8709 2 69.31 CAATTCATATAATTTATAATAATCATTCGAATTTCGTAGCATTAAATACGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 + chrX 12801440 5' - Burdock 6367 2 50.50 GCATATGTCGTAGCAGTTCTCGAATGCAATTTTGAACTTAGTTCGATTTAAAATAATATACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chrX 3697196 5' + jockey 4693 1 60.40 ACTCCGCGCGACTCCGTTCGTTATTTATTGAGGCCAACTAAGCGTGGGTCATCGTCTGCTATAATTGGATTAATTACTCTACCAGACCACAAGGCTGGTAG:1 + chr3R 17426015 5' + Gypsy6A_LTR 252 1 66.34 TTTTTATGGTTTTTACTATACTTCATTATTAGTCCGAATTTGTTAATGCTAAGTCCCTTTCGCACAATCGTTACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTT:1 + chr3R 7570394 5' + 1360 3232 1 75.25 GCACTCGTATACGCGCCCGTAATATATACATTGTTCTGGTGCAAAGAGAGTCGGCGCTCATCTTG:1 + chr3R 12216239 5' - Doc3-element 260 1 63.08 TTGTTGTAATAACTGGTCAACCAGATAGTATATTTATAATCTCAAAATAGGCAACTAAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGC:1 + chrX 22748445 5' + Doc 307 1 59.41 ATTATTTAATGGTCGGTTTAAATGCTTACTCCATGACCAGCCACATACGCTGAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAA:1 - chrX 9819908 5' - hobo 2644 1 59.41 TCTAAACGACTCTTTCGATCTGCTTGCCACTAGCACCACTCCCGTTACCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAAT:1 - chr3L 13686428 5' - R2-element 3147 1 61.39 AAAACAAAACAAAGTTAAAAAAATAAATAAACTAAAAAGGAAAACATTTTCGTTCATTCATGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAATA:1 - chr2L 1512296 5' + Porto1 244 1 61.39 AACTCNATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTA:1 + chrX 17049529 5' + Stalker2 14 2 64.36 GCACTGAAATCAAAATGAATTAAGTGCGAGTGATAGAAAAGTTGTCGTGTTGCAACAGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAG:1 - chr3R 9906074 5' - accord 153 2 67.33 AAAATACAAAAATACAACTAGGAAGGTGGGAAAGGAGGTCGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACT:1 - chr3L 21666169 5' - F-element 4414 1 60.40 GCTTGGCAGATCGAAAAAACTAAAAAAAAAATAAAAA:1 - chr2L 3306145 5' + Doc 4698 3 91.89 TTTGTGCTCCTGGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTGGCCTCGGTTTTGGGTTTCGTTTCCGCTGTAATAAACCAATATATGCCA:1 - chr3R 14832485 5' - blood 7389 2 75.00 AGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGTGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 13314176 5' + jockey 22 1 57.14 TAAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCAG:1 + chr2R 13136829 5' + Doc4-element 339 1 56.44 CTTCGACCCTTTCTAGTCCCTGCCCGAGTGACCGAACCATCTCAACCCTGCCGCCCTTCACCGCGGCTGTTGCTAGGCCACTCCCCTACACGAGATTTGTG:1 - chr2L 4513371 5' - gypsy8 4672 2 61.39 TAATAGCTAAAAGAGTCCTTGAACAGAATTTGAGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCA:1 - chr3R 7628961 5' + baggins 5341 1 67.33 TTAATATTTATTATGTGTATAAGTGAAAAATTGGGGATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGGT:1 - chr2R 4312990 5' + R2-element 50 1 70.30 GTCCCTCTAGCGTTGGCGCGTTTGAAAAGTCTGAAAGCCATTTCAAGGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACG:1 - chr2R 6946526 5' - INE-1 128 1 59.41 AGTAGGCATAATAAATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 17607861 5' + roo 41 2 66.34 TCCAATAAAAATAACGACGACATCGCCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGG:1 + chr2R 17191494 5' + R2-element 301 1 74.00 GCAGCCCCGCTCTGGTATTTATAGGCAAGCTGACTGGAAATTCGCCGCCTGCTCTCTCGATCACTCGGACGGTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 6283599 5' + P-element 5 2 74.26 GCTGGAGTTCAATAAATATACCATCGCTCTTTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:2 - chr3L 21908944 5' - roo 9027 1 69.31 TTACCAACATGAAAATAGAAGACAGCAAACTATTGTTTCGGACTATGCCAGGTATGAATCAGATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAG:1 - chr3R 23555571 5' - G6 17 1 69.31 TAAATAACATATAATCGCATCCGACTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 17624217 5' + roo 47 2 76.24 ATTGAAGAAGAAACTTGAAGCTAGACGAGAAAAATGGTGGGCGAAGGTCCTGAGGAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTT:1 - chr2L 17423232 5' + pogo 145 1 58.42 ATTTATCTCAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1 + chr3R 9833027 5' + Tabor 6856 2 60.40 AATTGAAAGTTACTTGATTTCAAGTATGCTATAGCCATAAAGGGATTACTAGCACACGAGGACGTTTGATAGGTCAGGATGGCCGTGTCGCAGATCATTTA:1 - chr2L 1731855 5' + invader1 3604 1 62.38 GCCTAGGTTAACTTTGTGGGCTTGATAAATGTGGAAATTTGGCATATCGTTCAAAAGTTCTGAGCTTAACGTTGACGAAGGGTAGTTGGCCGACCCTTGAT:1 - chr2R 4581352 5' - Chouto 6058 1 71.29 AAAATAAGGTTAAGTAGCTATTACGCTCGCATATACATGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGC:1 - chr3L 6538028 5' + 17.6 7094 2 63.37 GCAGGTGTCCCTGGGGTTGTATCCTTTTCGTAAATCGACTGCGCCAGTTACATTCGGCCCCCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGC:1 - chr3R 2462522 5' - flea 4708 1 52.48 TAAATCAATTATTGATATGTCCCTTAAAGCAGCGATAACAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGAT:1 + chrX 3552224 5' - Quasimodo 125 2 61.39 TGTGGCAATTCTAGAGGAGCAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGA:1 + chr2L 15173366 5' + hobo 2882 1 79.38 GAAAGTAACAGGCAAAAGTAAACGTCTTCTAAATATCTGAAAGGTTGTGTTCAAGCCAAGTCTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATAACCTTGAACC:1 + chr3L 19014683 5' + Stalker3T 344 1 61.39 CGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACACCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chrX 10555414 5' + Tirant 34 2 54.46 CTGTCTGGGAAATTGATAGCTGCAAACACATTAAGTGCATTCTATTGAATAAAAAAGCGATAAAGGAGATAATAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTT:1 - chr3L 11702460 5' - X-element 4547 1 75.25 AGCTATTGAAATTGAACACCCAAGACTCCCGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr3R 1941517 5' + Transpac 4964 2 70.30 TCCGTTATAGTTAACCGTTTACATAAATGCATAAAATTTGCGCACGGCCCGCCCGGGTACAAGGTCCACATATTGTGCCGTTAATTCACGGTGCGTCCTCT:1 - chr3L 19354886 5' - gypsy8 4903 2 64.36 GATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTGCCTTCTG:1 + chr3R 14882072 5' - gypsy5 395 2 54.46 CTTAAATGCTTTTAATAACACTTTTTCTTTGGTCAAAAAGTTCGCTTAAATTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 17607928 5' - roo 9047 1 55.45 AATTAGGCAACTGATAAAGGCTAATAGATGGAAATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:1 - chrX 14521306 5' + jockey 4717 1 64.36 TGGACTCGAGAGCAGGACAAATGTGGCATCAAGACGGGACAAATGTTAAATGTTATGCCTTCCGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATT:1 - chr3R 24765747 5' + invader4 2771 2 67.33 TTGCGNAATAAATTTAAACGTAATGCAACTAGATGAGATTGGTTTTCTATGTGTATTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTGCCCCTTCATGACTCATAG:1 + chr2L 18208560 5' - baggins 5380 1 60.40 TACGCATGTAAACAAGCTTTGTAAACAGGAACCAAAAAAAAAGCCATAGAACGAACACACAGCGCTGAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 988981 5' - hopper 148 114 63.83 CAGGCCAGAAGCCATTTGTCAAATGCGAGGCGGAGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTT:1 + chr3R 10447443 5' + blood 7283 2 66.34 GGGGGAGAAACACCAATACACACCCACTATCGCTACAGCTGTCTCACTCGCTCATTGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAA:1 + chr3L 1478092 5' + accord 261 2 58.42 GAGTCNAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTC:1 - chr2L 3273894 5' - gypsy5 7297 2 78.22 AACGGNAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAC:1 + chrX 17049545 5' + Stalker2 30 2 51.49 CTTCTCCTGTTTCTACGTGTGCATCATTTCTCTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTC:1 - chr3L 22734761 5' - invader2 440 1 73.27 CGACACACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3R 14832393 5' + blood 7035 2 51.49 TAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGC:1 - chr2R 15002433 5' + 3S18 5773 2 56.63 GAATGAACAAATTCCCTGGCTGGCGGCAGATTTCCGTTGTCAGTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAG:1 + chr3R 20727506 5' - F-element 461 1 57.43 TTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 + chr2L 15234316 5' + micropia 6 2 73.00 CCTGCCTGTGCAAACCCTTTGCTCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - chr3R 15153081 5' + hopper 51 1 73.27 AATACGTACGTATATGTTGCAAGCCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCC:1 + chr3L 22918191 5' + Doc 4547 1 77.23 AACCTATAGCATAACATGTATCGGCATACCACATACGCCAAAGCAATTCGTAAAGTGCCATCACAGGCTTACTCACGCCCCCACACACACACACATACTCA:1 - chr3R 29657841 5' + accord 186 2 70.30 TCAACAGAAGTCAATTAATACGCTATAAACGCCACCAACACATGTCTTTCCAATTTTCGCTTGGTTTTTCCGCTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chr2L 7120381 5' + INE-1 550 1 70.30 AACCTTCCAGTCGCATTTGGAGCCCAAGCTTTCTATGTTTTCAGAGCTAACTGTAAGTGTGCCTTTTGTTTTTATCTGCTGATTCTTTATGATAACGGTGC:1 - 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pogo 2087 1 65.35 GTGTTTTGTAAGATTCCCATGGCGCTGTTGCTGTCGCTTGAGCTGTTTGCATTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCAC:1 + chr3R 31866294 5' - hobo 58 1 55.00 AACACAACAAATGGCTCTGGCATACGGTCGTGGATGGAAACGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAA:1 - chrX 20061464 5' - accord 6949 2 59.00 AGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3R 14832410 5' + blood 41 2 63.37 TGGGCTAGCGTACAAGGAAAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 11097538 5' - mdg1 7404 2 79.21 AATGCAGCTAAACGAATTCGAAGAGCTGCATGCCCTGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACAC:1 - chr3L 10627475 5' - R1A1-element 5305 1 62.38 CAAGGCGTATCTGCAAGATAAATAGCGGAAGGCAGATACATGTTCATACCAACGCTAACAGTTTGTGCAAATAAACAGCGCACCATTATAATAACAGCTGT:1 + chr3R 9918889 5' - hopper2 1470 1 76.24 TGATGTTTAGTCTACCAGTGTATGATCAAAGACACTAGAATACAAGCTGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3R 970738 5' - 1360 3354 1 71.60 AATAAAAAAGAACAGCAGCACACCCAGAAAAGGGCCACTGGAAAAGTGTAATACCTTATGTAACTTATAGTAACACGTAAAACTAAACTTAATTGTGCAAG:1 - chrX 4169119 5' - Chouto 5871 1 70.30 CGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGT:1 + chr2R 5617509 5' - invader1 3983 2 59.41 TGAACTGAAGATGTTATCGTCGACGTGGCCTTCTTCGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAT:1 + chrX 4802586 5' + roo 342 2 66.34 TGGCGTGAAAGTTTTATACGATTTGGAAAAAGGCGTGACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr3R 15153036 5' - hopper2 1572 1 56.44 TGGTTGGGAAGTTGTGGGTGTAGAATGGACATGTTACTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chrX 22252767 5' + 297 34 2 69.31 GGCTTTAATTGCATAATTAAATTTACTGGCTGTACAATTTTCCATAAGAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAG:1 + chr3R 7770854 5' + X-element 33 1 48.51 CCGCATCATAGTGAACAAATGAGAGTGTAAAACCACATAAATTTTGCATAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 3947405 5' - roo 9047 1 53.47 AATAGGATGTGCCAACACTCGCTATTTATGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATA:1 - chr3R 24476344 5' + F-element 4428 1 71.29 TGCAGCTGGCCAACTTGCTGCTGCTTTTAGCTGGTTTTCAGAACTTGGCTCGCTTACATTTTGGCCGTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 + chr3L 2836099 5' + micropia 4969 2 68.32 CGAATCCACAGATCCCGAACTGGACACTTTTGGGGTGGCCGCACACTCTGATATCGTTGCCTCCGCTTGCTCCTCCTCTTCTAGAACTCTCTTCTTCCGAA:1 + chr2R 17414810 5' + Gypsy12A_LTR 2036 1 78.22 TGTTACTCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2L 22724109 5' + pogo 38 1 68.32 GACCCCAATTCCTGCACTTTATGATGCATGTCCTGGCCGCAGACGCTTACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAA:1 + chrX 4014590 5' + I-element 5129 1 52.48 TCCGACTGACCGCCTCACTGGAAACCAACTGGACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr3L 3255029 5' - 1360 3348 1 67.33 CGTAGGCTTTGTCACTTCGAAGTTTTAGTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTTAACACAAAACCCACTCCC:1 - chr2R 9736336 5' + Circe 141 2 68.32 AAGCTAGCAGGCAACCTTGGCCGCCATAATTATGGTAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAG:2 - chr3R 13235905 5' + Doc 4518 1 65.35 GCCCCCTGTGCGTGTGTGTGCGTTTCGCTCGCTCTGAGTGTGAGTGTGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chrX 14505429 5' - hobo 2910 1 54.46 CACTTTATGACGTCCATTAGTCGACGACGATGGCTACACATGCTGATAAATAAGTAAACTATTGATAATAAAACAAAGAGTGCACTTACAGTTACACGCGA:1 + chrX 22926611 5' + Tc1-2 107 1 59.41 AAAAANATGGATATTGACAAGCATAGATATAAAATCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 15343862 5' - roo 9030 1 70.30 ACTTGAGTTTAATTCGTTAATTTCATCTCGATTGTCACTCGACTTCAATCAGCTTCAACAGAACCAGCATCTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGG:1 + chr2L 10041434 5' - gypsy12 10191 2 72.00 AAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 19510794 5' - roo 9029 1 69.07 AAAGTCAAACATTTATGAACTGAATTATACATATACATTTTTTTTTTCTTTCTAAGCAATGTGCTGAATATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1 - chr2L 20129019 5' + 412 4 2 42.57 ACTTGCAGTAAAACTAGTTTCGTTGTGGCTATTAAATAGTGGGCTAAAAATAAGGAATTTTCAACTCTTTCCCAACCATTTTTTTTTTTACTATTTGACTT:1 + chr3L 2031619 5' - Rt1b 5143 1 85.15 ATATGTTATTTATGGGAATGGATTATTGGTGGGCTAAGTGCGGATAATCTAGTCCCATTCATCCTGCGGG:1 - chr2R 14816659 5' + Rt1c 5194 1 52.86 ACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACG:1 + chr3L 25889014 5' + gypsy8 308 1 77.00 TATAGATTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3R 11685578 5' - mdg1 7417 2 65.35 CGAACTGGCTGTATGTAATCCGCTTAAGTTCCTCGGAATCGGCACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACAC:1 - chr2L 7503675 5' + Quasimodo 7069 2 57.43 TGGTGACTCAGCGAGGTCAACTGCTGATTGATGCTGCCAAGATTGCTGATCTGTTGGTTGATCGTGGCCAGATTGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAGGTTAT:1 - chr3L 9592824 5' - Doc3-element 351 1 76.24 GCATTTTCCCGCATCAAACAGCCGGTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCACTCACATTTGAAATCAGTCTTAAGTTGAAAGTTAG:1 - chrX 21261908 5' + McClintock 6226 2 44.55 TTACCGATTCGGACTTGAAAAGAAGATAATTCGGGATTTGGAACTGCGTTTGTTTTTTTTGGCTTTAGTCTGCCAATTTTTTCATTGACAAGATTTATGTG:1 - chrX 19316586 5' - Doc2-element 4501 1 72.28 TTGAAATCGCAACAATTAACCGTTTAAGAATATCCAATAAAAAAGAGTATTATTCCAACGTTTTGGTGACCCCAGCGTGAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAA:1 + chr2L 22319463 5' - Transpac 4887 1 77.23 AGTTAGAACGGACGTAAAAGTCGTAAGGCAACATTCTCAAAGTTATGCTGCGTCTTTGCCTATAGAATCTGTATGCTGAATTTCTGAGATCTCGACGTTCA:1 - chr3R 5259312 5' - INE-1 140 1 67.33 TCAACTTGGTTTCCCGACTAAGGTACTATATATACATATATATACATACATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 - chrX 12290708 5' + HMS-Beagle 6814 2 48.51 AGATGAAAACGAGGTCCAAGGAATAAAAGAATACAACAAGAAAATTCTACCACATATCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chrX 5178471 5' + hobo 18 1 61.39 ATAACCGTATATGTTTTTACTATCTACTAAAAAAATGCTTTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3L 19260780 5' + pogo 32 1 64.36 ATCGGCTGCGCCGTGCGTTGATGTGAGTGGACTATCATGTGTGCGTGCGTATCTGTGTGAAATTTGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTAT:1 - chr3L 17533007 5' - Stalker2 7304 2 65.35 ACGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGA:1 - chrX 1018160 5' + 1360 193 1 77.23 AAGCTGGGCGCAAAAGTTAAGAGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 13560759 5' - roo 352 2 76.24 CACAGTAAGAGTTCCGTGAATGGAAGTGGCTCCAAATAATTATCAAGAAATCATAATCAAGTTATTTGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 + chr2R 22113409 5' + mdg1 7046 2 71.00 TGTGAAAGGGGAAAAGAGAGGGGCAGAACGTGTGCAAGAGAGGGGAGAAGGGGCGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCATACAGAAAAATTCGGT:1 - chr2L 17735841 5' + invader1 3782 2 58.42 TAGTATTTGAAGCATATGTATTTGAGGCGTTTCGTTCGTCCTTCACACGCACACAGACAGACGGGCATGAGAACACACATACATAC:1 - chr3L 18742831 5' + 1731 4382 2 62.79 TTCTTGAGCTGCCACTCTCCGCATCTGCCACTACCTGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGG:1 - chr2R 18944830 5' - R1A1-element 4893 1 60.00 ATTTTTATCTCGTTGCCGCAGGAATAAAAGGAGGCAAGCCTCCTACTGACGCTCGATCTCTGGAGAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAACAGTGGCT:1 - chr2R 5735092 5' + 1360 3332 1 67.00 AACGAGAGTTAAGTGGAATTGCAATTAGTTTTTTTCTGTGGGTACATAATTAACTTCTATTATATTGTTCTTATACAGTTCTCTTATATAATGATATTTTA:1 + chr2R 4208600 5' - Dm88 4137 1 69.31 GTGGATTCATCCGGGAATCTGGGATAGGCGTGGACTATTGGCGGAGTGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGGGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGA:1 - chr3L 3852625 5' - Tirant 56 2 53.12 GCACAACTAACTCACTTGCGCCGGGATTAAATGGGTTTAGTTTGGATTCCTTTATGCAGAAGCACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCT:1 + chr3L 17744926 5' - F-element 4483 1 68.00 GCTGGGATTCCATATGTATAAGCACTGCCAGATAGGTTTCAATTAGACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACG:1 - chr3R 29811368 5' + gypsy4 328 2 57.43 CTGGCCAAGGCCTTCGATGTCAAGTCGGACTTCTCCATTAAGTACAAGGCCTTTGATCCGGCGGGCAACGAGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTG:1 - chr2R 15321783 5' - Bica 425 1 75.25 TCGGAAATAATTAAATAAATGAAGCAGCTGCAGGAACAATAGCCGAGTCGATCTAACCAAAGACACTAGGATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 14939340 5' + 1360 20 1 69.39 ACCCTCAGACCGCATGAACTTGGCTAATCACATAAACAAACAAATAAAACTGTGCAGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGC:1 - chr2R 14924575 5' + micropia 5201 1 64.36 ATTTTAGCCCGGAATTTAATTTGATTGCCCGGCTCATGAGCGTGCCAATGAATATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 796748 5' + jockey 18 1 62.22 CCAAATAAAAAGGTCGTTGAATGAGGTCAAGGTAGCACTAGCTCCCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGAC:1 - chrX 20496537 5' + Cr1a 330 1 60.40 GCAGAGTAATCGATGTGACTTTGCCCTTGCTATTGTTGTTGTATGCACTTAAACTGCGCTGTGCACCAGCTCTCACACACAAAATCTAAAGTTCTAAGCGT:1 - chr3L 5057257 5' + Cr1a 324 1 68.32 TTATTGCTTATGAGGAGGAAAAGCTTGGACCTCCTTGTTGGCCCTGGATAAAGCCCGAGTTTTGGCCATGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGC:1 + chr2L 12970576 5' + jockey 216 1 77.23 TCGAATAATTGGAAAATTCTATTCCATTTCCAGTATCGACAATAGAATTTTAATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2R 8557828 5' + hobo 24 1 56.00 CTAGAAATATGCTATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 22238742 5' - hobo 2930 1 64.20 TGTGAGCCATAAAAATAAAAATTTGTATGCACTCAATGGGCATCGGGCAGCGGTCAAAAATGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGG:1 - chr3R 14443975 5' + opus 7316 2 65.31 CTCGACATGGCTAAATAAAAATGAATGAATAGATAAGAACAATCTGGGATGTGTGTGTTAGAGTTCGATTTATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3R 31072384 5' - roo 408 1 77.23 CGAGGCAAATTAGGATTTTGCCGGGCAGGTTTCTCAATTTGGCAATTGAAATGTAGACAATCAGTGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCT:1 + chr2L 10236115 5' - opus 6 2 65.00 GTGCTGCCATACCGAGAACTTCGACGGGTTTCAACTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGGGGCCA:1 - chrX 12966315 5' - micropia 5212 1 66.34 CGAAGCCGACGACTTGCTGGAGAAGATCAAGGAGCACATCAAGTAGAGGATAGACAACTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTC:1 + chr2R 8124903 5' - gypsy2 6617 2 67.01 ATGTGGACCACAAGTATTTCGGATCATTGTTGACCATTGTCGAAGCACCAGCTCCAGCCTACTGCAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCT:1 + chr2L 18181949 5' - invader2 4824 1 54.46 AACCAATTGATTCATGGCTTTAATATTACTTTAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:2 - chr3R 9193646 5' + roo 42 2 69.31 GATCGTGGCGCTGACAGTGGTCACAATTGAGTTTTCGGCCGCCGCCGAAGAATCAGCAAACACAGCGGTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 5322097 5' + 1360 7 2 72.28 GAGTTTATGCGAATACAAATAATCGTTTATTGCGAAACAAACCCGAAAATAAACGCGGATGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chr2L 19157840 5' + HMS-Beagle 38 2 62.38 GATTGNTAACCAGTCAAGTGGCAGACGGAATTAATGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGA:1 - chrX 2253894 5' - Tirant 361 2 67.33 TACCAGTTCCCTTGGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 2090318 5' - roo 399 1 70.30 AATTAAACAAAGTTTGCTTAATATTTCGGGGGTTACGTTGACCCTGTTTGCATTTTGTGAACGGTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr2R 6715073 5' + pogo 6 1 71.29 GAATTGTCCCTGACGTCATTTTCACACAAAACGACGTTTAGAAGTATAAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGG:1 + chr4 176024 5' - accord2 16 2 77.46 GCTATCATCATAATAATACAGGTGTGCCAAGTTAAGATCAAAGAATTTGATTTAGATTGCTAGAACTTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 + chr3R 13494938 5' + F-element 25 1 54.46 GACCACCTCACTGCCACATTATTCTGTCCCCGTGAAGAGGGGTCGATCCTACCTGGATATGACCAACAAGAGTCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGG:1 - chr2L 21183362 5' + X-element 4518 1 77.23 CTGATTCGACACACAGCGATTCAACGACGACTCGAGCAATTTACACAATAATGAATAATCCCGAAAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAAGAAAATGAAGG:1 - chr2L 8470018 5' - gypsy12 10049 2 56.44 ATTAGTGTCATAAGGCGGCATGTCACCGAGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATAGAGTAGCCGCTGCGTTTG:1 + chr2R 13608504 5' - R2-element 335 1 82.18 AAGAGCACTAAAAACACCCATAGAAGCAACAACAATTGCTCAACGGGGCGTGTTGGATGGATTTTGAGCGTTAGAGTGTTACATACTTTTCAACGAATCTA:1 + chr3L 15912681 5' - INE-1 13 1 55.45 TAAACNTATGTTGTTGATGGCTTACTGGGTAAATTGCTTTAGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACG:1 - chr2R 24350114 5' - F-element 268 1 59.41 TAGAANGCGGTGTGACGACGACCGTCGAGTGTTTTTGGCGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGC:1 + chr3R 26845524 5' - Quasimodo 6969 2 64.36 CCTGCGCCAGAAACATTTTACATTCATTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGT:1 - chr3R 26127877 5' - Bica 162 1 73.27 AAAAGAAACTCATAGAATTGCATGTGTTTTCAAAACTGGTTATTGCTCTCGCCTTTTCCTTAGCTCGCTTACTCACTACCCATTTTTGTTTTTTGTTTTTT:1 + chr3R 29211790 5' + hopper 141 1 70.30 TTCAAAGGCTCCTCTGCAGGACTTGTTCCAAAGATTAAATACATTTTCGGCTTACCATATTAAAAAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGG:1 + chrX 546131 5' - diver2 4548 2 54.55 CACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACAACCACTGCCG:1 + chrX 23362219 5' + accord2 7347 1 52.58 AATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr2L 19090055 5' - opus 463 2 63.37 GGGAGTTCAAGGCTGCCAACGCACCCAGCCGTGATTTGTGGCCAGAATACGCAACCAGATGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGC:1 - chrX 18192660 5' - gypsy4 6468 1 63.37 ATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCTATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGA:1 + chr2R 8443974 5' + INE-1 138 1 74.00 GCCTACGACCGCGCCCACTTTTATTAGCTCAATTTTTTGCTGCCGCCCCACGCTGTGTGTTTGCCTCTTGCCTATTTGCTATTTAAATTTAATTTGCATTA:1 - chr3L 4778478 5' - TAHRE 42 1 63.37 ATATGTATGTAACATCATCCTTGCACAGTGCCATGACCAACCTACACTTTCACCAGTCTGTGGACCTGTTCAATAGTTCCGTGTCCCTTTCGAAATCCAAA:1 - chr2L 855647 5' - Helena 292 1 54.46 AGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTAT:1 - chr2L 20840507 5' + Transpac 4941 2 59.41 ACTTATATACTTGGCATGCATTATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 15814718 5' - roo 9040 1 53.47 CGGAGTCTCGTTTAGACGCTAAACGGGAAACGAGTGCGGTAAACTAACACAAAGATTGCTTTTTAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATG:1 - chr2L 19106221 5' + G2 141 1 68.69 ACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGAC:1 - chr2R 4879044 5' + G-element 12 1 70.30 GTCCAAGTGTCTAATACAAGAGAGAACGCTGATTCGTGTATTATAAGGCGATCAGCCGACATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCA:1 + chr3R 5167494 5' - Tc1 1639 1 64.84 TAAATAAAAGAGTGTAGAACCTTAGTACAATCGTTTTGCAAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAAT:1 - chr2L 13749187 5' + 17.6 6995 2 60.40 GAATTNTGTTTTACCAGTTGAATGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chrX 13401521 5' + jockey 61 1 73.27 TTGGGATAGTGCAGGTGCCAGGAGGTAGACAAACAAAAAGAGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chr3L 14065458 5' + blood 32 2 66.34 AGATCGAAATCCCTGCATTGTTCTCGCCCCGGGAACTGTTGTTGTTTCTGTTGCCGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATA:1 + chrX 997066 5' - Doc 4472 1 60.40 ACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGC:2 - chr3L 23678161 5' + Osvaldo 11 2 64.00 ACCTAATACTTTTCCTGAAAGTGATTAGTGTATAAATGACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCAGACT:1 + chr2R 19977814 5' + Tirant 8365 2 58.42 AACTATGAATTGGGCGGGAATTATATATTCAGATATGACACGACCCAAGTTGCAAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTT:1 - chr3R 14743011 5' - F-element 495 1 61.39 GCTCAGGAACAAGCTCGTGCGTCCGAAGAGGAAGTGGACGAAGATTACGACTTTGAGGAGTCCTTGGAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACAATAAGACCGG:1 + chr2L 9644381 5' + gypsy4 6596 2 64.36 TTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTAATGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTTGCGATCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTG:1 - chr3R 2552889 5' + INE-1 543 1 71.29 GGAACCTTTGAGTGACTTGAGGGTAATAACAGTTCTAGAGAGAAATGTCATCTACTATTTAGCAGGCTGCAGGTGCAAGTTGACGAAGAGTAGTTGG:1 - chr2R 4581228 5' - Chouto 6070 1 72.16 ATTGATCTTTATTTCATTGTGGTACACTTTCGGTTCAATTGCAACATTTACATTCGAACGCATAACAAAACTCGCAAACGCACACACACACACACACATAT:1 - chr3R 22075478 5' + accord 183 2 64.36 GAGATTGTGTATTCCTGGTGCTGACAGTGGGACAAGAAGAAGTGCGAGATGCTCAGTATAGAACGCTATAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTT:1 + chr2L 6019495 5' - INE-1 553 1 46.00 GTCCCAAAGCCATCGATCCTTGTATCGAGAATTGATCATCTCTAGAGCTCCATTTAGAGGGTAAACACAAGCGCCCAAAATGCTGACCAAACGTCTGCATT:1 - chrX 4418658 5' + HMS-Beagle2 6958 2 62.38 GCTTGGCTGGCTGCTTGGCTCAAGAAGAGCAAAACATCTGCCATCATGTTTTCTGTGGGTACATAATTAACTTCTATTATATTGTATAAGAACAATATAAT:1 + chr3L 3561034 5' + Dm88 4158 1 52.48 CAACCTTCTAGCTTTTATTGTTCCTGACATCTCGACTCGGGTATTGATCCTGATCAAGAACATACATACGGTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTACATA:1 + chr2R 1751259 5' - INE-1 29 1 66.34 CCGTTCGTTGACTCTTGCCGTTGCTGTGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr2L 19146854 5' - Transpac 292 2 76.24 TGAGTGGGAGCTTCATTCGAATGGGGATTCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGG:1 - chrX 19043819 5' - Tirant 8274 2 71.29 TTAAGTCTTGCGCGATTCTTTGGCTCACATAATTTATAAGAAATTATTTATTTTCAAACAATTTCCACTCGACTCTACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTC:1 - chrX 13493232 5' - flea 4859 1 67.33 CCGCTCCACCAAGCGAGTGGCAATCAACCATAATGCCAGTCCGTTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACC:1 + chrX 15236927 5' + Doc2-element 468 1 57.43 TTAGCTTAGATGATACCAAGAAATGCTGAGATAAAACGAAAATATTTCCTAGGAACTGTTGAGAAGAACACCGACCTGTTACAATTAGGTCTCAAACTGA:1 - 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S-element 1351 1 57.43 CGAAGNCTCGCCCTCAAGTTGAATGCGCTTTGGCTGCGGCATCTCGGAGGGTATATCCTCGTGGTGGTCTTCGCAAGCGTCAGCTAAGAAGGCAGGCTTG:1 - chr3L 19545743 5' - Chimpo 4099 1 58.00 GAAGGAGGAAAATGAGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTT:1 + chrX 12290626 5' - HMS-Beagle 7012 2 56.44 AAAGCCTCATTGCAATGGTAAACGTTATAGTCAGCGTGACTTTAAATGATATGAAATAAGGTGATGAGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr3R 26404453 5' + 412 9 2 61.39 CAACAATGTGTTGTAAATGAAACTGTTATCGAATTCATAGAAAATTTGTGAACCCTAAGCCGTACTGATAGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGAC:1 + chr2L 13020133 5' - F-element 497 1 76.24 TGCTGATGGAGCTTGGATTTGTTTTCTATGAGTTACGAGTACGATTATTGTATATATAGTAATTCATTCAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTAC:1 - chr3L 5650983 5' - F-element 4369 1 72.28 GGACGGTGTACTGTGGCACAAAAGATATGGACACCTGACGACGGCATATAGTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATC:1 + chr2R 1747112 5' + Transpac 413 1 49.50 CGGCAGTGCTTCCGCCATTAATTGCATTGGACTAATCTACCCTACCAATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCA:1 - 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HB 438 1 68.32 GCAGGAGCAGAAAGTGGAGGAGGGTGCCAAGTGGCCGGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTA:1 + chr2R 13388772 5' + 17.6 7125 2 63.37 TTGGCTCGTGTTCATTGTCGCTCCCTCCGCCCCATTGTTCCTCTCTCCCCCTCTTCACATCTACTTCCTCCAACGCGTATGCCTGCGTTGGCGACGAGCTC:1 - chr2L 18937161 5' - R1A1-element 477 1 60.40 TAAATAGTCAGCACAAAAGTATGCTAAAATATATTACAAAGTTGCAGGATATCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAA:1 + chrX 13401468 5' + jockey 7 1 71.29 CAGCTGACAACAGAACACAGCGAAAAAAAAGAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 + chr2L 9854113 5' + Transpac 44 2 75.25 CCCACGTTAAGGCATTTTCCAAATCGGTTTTGTTATGATGATTCTTGACCAGGAATGTCAGAATGATCGCATTGGCCTCTCTTTGCTGCTGGTTGAATGTG:1 + chr2L 10216228 5' - gypsy7 5242 2 76.24 CGGACACCGAGTTCCGTCAAATGTGGCAGGATGGGGTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACC:1 - chrX 18382205 5' - Rt1a 4837 1 70.33 GCTGCCAAATAGCAACATGTGTAGCGACACGCACACACGGACACAACACGCACACATTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 + chr2L 13482120 5' - hopper 1399 1 60.40 TCTTTTGAACACAGAATTGGATTAGGTCGATTATGGTGTCTGTCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACC:1 + chr2R 5978911 5' + Circe 7345 2 58.42 GGGGAATGATTCGGATTCAACGTCCATGTCGACGGATTCGGTCACCAGCCGGCAGTCCATGATGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCAATCTTT:1 - chr3L 7765838 5' + Gypsy6A_LTR 391 1 64.36 CAAGACAGTCTAAGTTTTGTGAATACTGGTTCATTTAAATGGATGAATAAGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAAGACTCAAAACTAGAATTACATAATA:1 - chr3L 23889301 5' + Porto1 4212 1 54.46 CGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCA:1 - chr2R 21421078 5' + springer 7176 2 69.70 TGAATATGATTTGTGTTGTTTGGTTGGACATGCTGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGG:1 + chrX 14602470 5' - Quasimodo 61 2 66.34 ATGTCGACCTGTGAATTATGCCTAAAGATTAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2R 20502511 5' + Doc 4699 1 55.32 ACACGGACTTTCGCATCTTTCGTGACTACGGAGGTGTTCCCGGCCTGGACATGGCTTATATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCA:1 + chr2R 19377923 5' - R2-element 3526 1 60.40 TTTAAGCCAGACAACACCACACCAATTATGCCAGCGGCACGAGGAGTCAGAGACGCCATTTCGGACGCGCAGAGGCGCCGCCATT:1 - 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BS 4675 1 79.21 TTTTGTAATAAAATTTTTGACATAGGCGTGAACTTTATAGAAGAACCGGCCGCCGCTTCCTTCCTTCCGCCCACACACACACACACACACACACTTATAC:1 - chr2R 22624384 5' + accord 7031 2 51.00 ATCGAACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTG:1 - chr2R 4879049 5' + G-element 7 1 75.25 TGGGATTCGTCGCATTCAGCGATTCGCAGCGCACAGGAGCAGTTGCACAGGGCGTATGCGTGATATTTGCCTGCCTGCATTATTATTTAGTATTTGGTATG:1 - chrX 2888301 5' - Tc3 1430 1 54.46 TAATTGCTGGTGGTGTGCCAAGGGGGGAGGGGGAGGGGGTCCACTTTTCTTCAGACACTTCAGACTTAAACAAAAGGAGACCAGAAGGATGCGGGACAA:1 + chrX 845564 5' + gypsy8 4541 1 66.67 CGTGTNCAAGGAGTGATGGCCAGCAGCTTACGCTTGCAGTTGTTCGTCTTCCCGGTTCGGTGTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGG:1 + chr3L 20234460 5' - gypsy5 24 2 64.36 TCAAATCGCTTGACTTACGAAAATGCAATAAATTGCAGACGTAGTAGGGATTTTTGCGCATAAATTTTATGAATTCTTCCAGAATAAAACGTGTTCTACTA:1 - chr3L 22166442 5' + aurora-element 10 1 67.33 CACATTTTATAACTATAGAGAAATAAGTTTATTATCTATTTTGGAGAAGAGGCAGCAGAATCTAGGAATAAAATTTACAAGTCGGACAGACTTCACCATTC:1 - chr2R 14828105 5' - hopper2 265 1 65.35 GAAGTTTTCGCCAGTTGCAGACCATTGTGCATCCCGATAAATATAGTAATAAGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGT:1 + chr3L 16233531 5' + Circe 7232 2 64.36 AAGAGTACAACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chrX 22517698 5' - 1360 3378 1 54.46 AACTTTAATAACACCAATCAATGAAGAGGGTGTCAGTGACCAAATGCCGACACCGCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACC:1 - chr2R 17055640 5' - BS 79 1 61.39 CTTGAATGCCAATTTGAAAATCAAAAGTTGCTCCATATAAAACCACAATCTTTTGCAATATATGGCATGTTGGATTGTTATGCAAGATAAATACCC:1 + chrX 6789233 5' + Helena 436 1 75.00 GCGACGACAAACAAGAGAAATGTGCTTTTGTGCTGGGGGAAATATCCCAGAAATCCTTTTCAATATCCTATTATTATTTGTTATATTTTTGAGTCGAACTA:1 - chrX 17433106 5' - 297 381 2 80.20 GGACGGGCGAACTGAATCCATCATAGAGATCTTGGTTGGGCTTTAGCTAATCATAACAAAATTGTGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTT:1 + chr2L 12658339 5' - S-element 1343 1 65.35 CCGGCGACTGTCCCCTAGTCAGCCTGGGCGAATCCACAGTCAGTTCTGCCATGTAAGCATTGTATAGCAGGGGCCAATTCCTTTATGATCAGAGCGCGCTT:1 + chr2R 4930647 5' - G7 474 1 66.34 TGCATACCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 19510741 5' + roo 8698 2 59.41 GCTGCAACAACAATGGCTACAGCCATTGTGTATTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACA:1 + chr2L 1325915 5' + Tirant 8351 2 66.34 GAAGCCAAAGAGATCGTAGTCTACTAAGATTTACGCATGACTTGACAATTTCTGTGACAACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr2L 3621055 5' + 297 7 2 72.28 CGCTGACCCATAAAAGCGGGGATCTCCATGGTCAGCGACATCAGTTCCATCGGCAACATGTTCCATCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAA:1 + chrX 12959225 5' + roo 9013 2 66.34 TTTCCCCCCACGCTGTGTGCATTTTATTGTTGCAATTATCGCCCGACGACCCTTGTTGCCGCAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2R 22780953 5' - roo 399 1 67.33 AAGTCTGAGCAGTCAGACAGGCAAGTTGAGAGCGTCGCCACCCCGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTT:1 - chr3R 18527961 5' - accord 173 2 67.42 GGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr3L 14364967 5' + blood 44 2 69.31 ATCGTGTTAGGAGGTAGTCTCTACATATATCTAATGGATGATGGATGGTTATGTTAATTGAATCCTCCTCCCTTACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCG:1 - 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chrX 17389914 5' - R2-element 3364 1 79.21 CGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTT:1 + chr3L 24213803 5' - invader2 5050 2 80.20 GAGAGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCT:1 + chr3R 1047943 5' - Stalker2 7649 2 76.24 ATCACAGACAAAGTGAAAAGAAAATATTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCC:1 - chr3L 21868839 5' - Tirant 8108 2 73.27 GATACTTTTTTTATGCGGTTTGCCGCCCACGTTCCGCACTTGGAGTGTCATTTTTGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCG:1 + chr3R 25814565 5' - 412 7262 2 57.43 TCGTCATTCGAGTTAATAATAAACAGACACAAGCAGAACCACACACACACGCACACACGTGCATGTCAAAGCCGGCTGCACCGCCACGACCTCCC:1 - chr2R 21230277 5' + Doc 4542 1 71.58 TGTTCCCAATGCTGCACTTCATCGATTGCGATTCGGGGGGTATTTGGCTGGGGCTGCTGATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATG:1 - chr2R 23036110 5' - 1731 87 1 61.62 GCAGCGTTGACCTGCAGGATTTGCGTGGCCGCTCTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGA:1 + chr3L 15099877 5' - Tirant 8468 2 65.35 TCATGTGTGCGCTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr3R 19535672 5' - hobo 2927 1 67.33 AACTAGTTTGGTTACATGTGTACCTACACTGGGCGCAAAAAGGGGTAAATAACTATTTCTAAATGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chrX 13354234 5' - pogo 2093 1 72.28 TTAAGAGAATCTAAAGAAATAAATTATTAATAAATTATTAGTGAGGTTTCAAAAAGATCAATTTGTCCAAGACTCCCTGCAGCAGGTGAGCTCCGGTGGCT:1 + chr2R 3466450 5' - G7 882 1 76.24 TCACTAGCTATCCAGTGCAAAGATATCTGGTAATGAGCAAAGAAGAGTACGTGCTCTGGGGTTTCGCACCGTCCACTTTCGCACCATGGGCATTCATCCGC:1 + chr2L 12131410 5' - Rt1c 5062 1 60.40 CAGCAGGCTGCTGGCTGTTGGTTAGGAATTTGAATATTTTTAGCAGGGTATTTAAAAGGAATGAGTTGCGGTTTGAGACGCTGGCAG:1 - chr3R 16509665 5' - G-element 3939 1 83.91 GGTGTCATGGGGTTGGTTTGGATCTTAAAGGGCGTCGAAACAAACCTTGTGTAATAATTTAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAG:1 - chr2L 3273162 5' + gypsy5 7322 2 73.74 GACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCACGACTAT:2 + chr2L 22699421 5' - INE-1 565 1 79.21 TGGGATACCAAGGCAGGGAGAGTGTTGCAAAGGGCATAGTGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAG:1 + chrX 4911198 5' - 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BS3 1362 1 59.41 ACGTCTGTGCGGAGGCTATCGATGGAGGAGGCTATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr3L 22071841 5' - mdg1 376 2 67.33 GGGCAACACCATCTCCATCTTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTC:1 + chrX 5194823 5' - G2 2772 1 76.19 AAAAAGATAGTGTCTTTGTGTGATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3R 22667147 5' - 412 437 2 79.21 CGCCGGCAGAGTTAATGAACATAGGAAATTCGTTTACATTTTTGCCATTTGTGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCT:1 + chrX 14136105 5' - invader1 3583 2 57.00 GAATATACCCCACTATGCAAGAGGTACGATGATTATCGATCATCGGTGAACACTATAAACAATATATTAATTACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGA:1 - chr2L 20086997 5' + hopper 1136 1 57.43 TTAAAGTACCCTCTCATATTCATGTATTGTGAGGGCATAAAAAAGGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGAAGAAATTGTTTTTTTGCAAATCTATAGAAA:1 - chrX 21586805 5' - INE-1 311 1 54.46 GCTATCTGTTAATTACATAACATTCAAAGTTATAATCTGCGCCCATCGTTGCTTGTGAGCAATTTCTATGTTTTCAGAGCTAACTGTAAGCGTGCCTTTTG:1 - chr3L 6657286 5' + looper1 53 1 62.38 CGTGANTCGGTGTTATCGCGTGGCTCCGCATGGAATCGCTGATTCCATGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGG:1 + chr2R 15829608 5' - mdg3 313 1 53.47 TTTTGATTGCTTTTTGTTGTCTGTCTCGCTTGGGTTGAAGTCAGACAGCCAGACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2R 16639342 5' - P-element 2865 1 55.45 TCATCCGTTTTCTCCTCCGCCACCCGCCACCCGCCACTCGCCATTCGACGCCGATCCACCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCC:1 - chrX 4375850 5' - Rt1b 4906 1 68.32 GGCGAGATTAAGAAGGTTATGCAGCAGCTTTTAAACGGTTTGTATTACATCCACAGCCTTTGGTGAACCATGTCACACGCCCACTCTAACACCCACAAACA:1 - chr2R 22636983 5' + INE-1 219 1 56.44 TGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 11832973 5' + roo 51 2 77.23 AGTTTCAACTTGTTTTCCCTTTTTTTTTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCAGTTTGCGATCTGCCTCTATGCT:1 - chr3L 21061956 5' - invader2 128 2 72.00 GCTGATAAATTTACAAACTTCGTCCGAAGAATACAGAGTGGCACGCTGTCGCGTTATCATAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr2L 6177146 5' + pogo 11 1 69.31 GACTGTCCCCGATAATCACGGCATTAAGGCATTATTCTGCAGGAGCTGCAGGTTTTTAATCAATCTCTGCTGTGGCACTTTTTTTTTCTTGTTTTTATTAT:1 - chr3L 12683222 5' - 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gypsy3 6542 1 72.28 TGTCAGCGTGCGCATTCATCGAAAGGAGAAACTAAAGTGCTGGGGATATGCTGTGGGCGGTGGATAACATTTATTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGAC:1 + chr3R 25976009 5' - INE-1 301 1 62.38 GATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 63005 5' + roo 8713 2 77.78 AAATTGAGGTTGGGCCCCTGGGCCCATAACCTGCTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCAC:1 + chrX 2990687 5' - 1731 4579 2 79.21 GGTTGGCCAGAGTCAAACGGGTTATGCGCTTGACCAGCTAACTCGCTATATTCACACGCCTTAATATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTACATAAAGT:1 + chr3L 7889612 5' - 1360 390 1 63.37 TGTGAAAAATCATAAACAAGGTCCAAGAATTAGGCTTAATGGTAATCGATTGGCATAAACAAGACTCAAATATGTTCGCTTTCAACTGAAAAGTAGCAAGG:1 + chr2R 10521518 5' + Fw3 170 1 81.19 AGCAACGACTTATTCGTAGCATCACCGACTGTCCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3L 1437439 5' + 297 2 2 67.33 TTCGCTCCACCCAATTCCAGAATCTGCCGCCTCTGTAGCCGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATG:1 - chr2L 3792891 5' + 412 7482 2 67.33 CCTCCTCTTCTCCTTCGACTGTCATCGTCCGGTTATTAATTTTGGTTGAAGGTTTACGATTAACGATACACGGCACATGAGATCTTTCCCCGCCTCCTAAA:1 + chrX 2499661 5' + roo 177 2 81.19 AAATGGTCTATGTAATGCCTAATGCTATGATTTAATTAATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATC:1 - chr2R 21092015 5' - 1731 4590 1 63.37 TCCACCACCAGTGAAACTCCGCAGGATAAAAGGCTAACACTTGTGTCCTCCGCCCAAACAAAATCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCC:1 - chr3L 14565306 5' + Quasimodo 77 2 64.36 ACGGACCGCAGACGCCGGCTGCCAGGAAGATCGCTCTGGGACGAGGAACGTTGCACCTGTGTGGTTTGGTAAAATAAGATATAATAATAATAATAATAG:1 + chr2L 5276676 5' + invader3 5057 3 78.79 AGGTACGCCTGCTGGCTGTACGACTTGCCGCATATGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATATATTTCATGTTCACAACACATAAACAGTACA:1 - chr2L 10739347 5' - transib2 330 1 65.35 AATGAGAAGTTTGCTATCATTGCTAATGGCGCAGACAAATGTTGACATTGCGTGAAAGTGCTTAAGCTATCTTAGACTTATAGTTTATAACAAATTATAAC:1 - chr3R 18211088 5' - S2 1455 1 62.38 AATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTG:1 - chr3L 27415324 5' + transib2 7 1 72.28 AAAGTGGCAGGTCGGAGGAAAAGCCATGCAAAGCATCTGGCCGCCTCTCTTTGTGCCTTAATTAATTTTGATTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 + chr2R 14121039 5' + I-element 4 1 74.26 AACTCCATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTA:2 + chrX 17049529 5' + Stalker2 14 2 65.35 GTTTTACAAGGACCATGCCCATTAGGTGTCCCTGCTGGGGTCGTGTGGAAGGTTTGAGCAAAGATACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chrX 7648250 5' - 1360 3367 1 77.23 CGCCGACAACTGTTGGCCAGAGAACATGACAACGAACTAATACCGAAAAACTTTGAAATTGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTACAGAACCTAGATA:1 + chr2R 18086680 5' + X-element 497 1 65.35 AAACCCCACCAGCCCCCTCCCGGTCACGTCATCCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTAC:1 - chr2R 8377037 5' + Tirant 8214 2 68.32 CAACAGGCAATACAGTGGCTACAACAACAATAGCAGACAGTGCTTTGCGGATCATTTTACTTGAACAACCGACAATACGACCAATTTCAGCGTATTTTTT:1 + chr3R 18157238 5' - Tc1 425 1 61.00 GGACAAAGAAATCACAAGTTAATCACTGGAACATACATGTGAGGATGTCACAAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chrX 19561804 5' + 412 7074 2 60.40 GCTTTCATTAACTCCCCCCGTTTTCGCCCAAATAACCCGAAAATGACACTGTGCACCTTCATTTGGCAGCGTCAAATCAACACACACACACACACA:1 - chr2L 16991807 5' + accord 180 2 54.17 CAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAG:2 - chr2R 4879004 5' + G-element 52 1 73.27 TTACCAAGTTATTTTAACGAATTCGGTTTTTTTTTGCACCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATC:1 - chr3L 8768131 5' + Cr1a 77 1 71.29 CAGTGAGAGCGAGGGGTCCACAAAGCTTGGCCCATTTTGGGGAGGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTG:1 - chr3L 20349638 5' - G-element 237 1 62.38 GAACTCGTAAGGCCCGCCCTTATAGCCAAACATTTAAAATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTAC:1 + chr2R 11879094 5' - G-element 4243 1 68.32 AATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3R 1048039 5' + Stalker2 7283 2 58.42 GAATGTTTGAGATTTTTATCTGCGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chrX 14505502 5' + hobo 20 1 58.42 TTTCAGCTCAAGATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTG:1 + chr3R 14882061 5' - gypsy5 406 2 65.35 CAGCATTTCCCCTCAACCGCGACCTGCGGTCAGCTGCAGTTTCAGGACAGCATCCCCTACAACCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTT:1 - chr2L 15575200 5' + GATE 283 1 61.39 ATATTGCAATAAATCCATTATTATCTTGCCCAAAATAGAAATACATCCCTGTCTATAGCCAAGTTCAAGCCCAAGTTCTGCTTGGGCGCTGCATTTCGGAT:1 - chr3L 15244625 5' + diver2 178 2 78.22 TTTATATTGTGTGGGGGTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACACTCCCAAAACGTAGCCCGCGCACCGTTTTCTGACGAGGAAAACTCACTCTAACAAT:1 + chrX 23439012 5' - Gypsy12A_LTR 362 1 59.41 TTCCAAGCGAACGAAAGACGCCTCCAGTGCCACAAATCATGTTCGGCCAGATGCATTTCCCAGAAGGAATCGTTTCCGACTTGATCATGATCAATAGCCG:1 + chr3L 20916047 5' + INE-1 88 1 66.00 TTTTATTAAATATATGTTTTACGCTCTCTCGCTAGCTGAGAACTGAGTTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGT:1 + chr2L 22037714 5' - Quasimodo 188 2 60.40 CAAAGAAAAAGTAAGAAAAAAGCGAAACAGCGCACATTGAGCAGGGTAACAAGAAGAATGATTTTTCCTTGTACTACCAAAGAGACTATAATAACAAGATG:1 - chr2L 7941781 5' - 1360 3386 2 58.42 TAGAATATTTACTGTGCATTTTTGACCGAATAAAAAGTAATTTCTTATTTAACATGCCTTCCGAGTCTTTCAAATTTAAGTATTGATGTATGCGGACTG:1 - chr3L 17791010 5' + invader1 3810 2 74.75 CCCCACACGGAATCCACTCCACACTTTCCACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGAC:1 - chr3R 24254739 5' - P-element 28 1 34.65 ATTAGCAGAGAGATGCAGAAAAAGAGAGAGCGAGCGTGGGCTAGAGTGGGATAGATAGCTGGATAGTCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chrX 1399836 5' + P-element 7 2 72.28 AGCTGAATGAATAATAAATAAGATCGAGTTAGAAGAAGGTTTTTTGGGCTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGC:1 + chr2R 6132652 5' + F-element 221 1 52.48 AATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACT:1 - chr3L 10464678 5' - invader3 5410 2 82.18 TTCGTCACGCTGTGAGGCAAACGGATCTCGTTGTTCGTGATCTAGATACTTCTCCAGATTGAAGAATATATACTTATTCGGTTCCTTCTGCCTGTTACAT:1 - chr3R 19898387 5' - INE-1 30 1 66.00 CTCCGATCAAGTATTGATAAATGAAGAGCAGGGCCTATACACAGAACCAGTTCTATTTGTGTCCTTATTGCTATGTAATAAACCAATATATGACACCAATT:1 - chr3L 14365050 5' - blood 7383 2 72.28 AGGCTCAGCTGGCCGCTTTGAGTAGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTG:1 + chr2R 19046389 5' - F-element 4507 1 60.00 TGCTGCGATGTGAGTTATCAGAAAATCACCAAACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTC:1 - chr2L 9167095 5' - flea 435 1 68.32 AGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCATACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr4 868640 5' + roo 20 2 59.41 TTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAG:1 + chr2R 4577092 5' - Chouto 473 1 69.31 GCATCGAATGGTTCGCAAAGTTCAAGGAACTTGCGGCGTGCCGTTTTCTAATCTTGCCCGAGTGGTGGTCCTCCATGCGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chr2R 24591379 5' - accord 253 4 56.44 GAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGGTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 - chr2L 20840498 5' + Transpac 4949 2 55.00 TTAATAAAGAAAAACTCAACGGAACTGATGTTGATTTCAACTCGAAAGTGACAACTTTTGGACACTAATGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACT:1 - chr3L 20257322 5' + HMS-Beagle 6686 1 74.26 AGCTGAGTGTTGATTGGTTGAGTGGTTTAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTT:1 - chr3L 10099175 5' - Quasimodo 309 2 72.28 AACGGNCCGGACCACTAAATCTTATATCTGCAGCGGGAATAATTTGAAATAAAAATTGAGTTAAAAATTACCTTTCATTAGAATATTTGACATAAGAGTAT:1 + chr2R 5774285 5' + 1360 400 1 68.32 CCGTACCATATAATCAGGAGCCCTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCGCCTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGACGGGGGTACCTGAAAAGAATAA:1 - chr3R 10705651 5' + TAHRE 10115 1 75.76 GTTTAACGACTTTGTTCCACGATAATCCGAGGAATGAACTGGCCTGCTGAGTCACCCGACTTGAATCCAATCGAAAACCTTTGGGCGGACGTGAAAA:1 - chr3L 3579657 5' + Tc1 1169 1 75.26 TTAAAAATAAATCTGAAATCACACGGTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGTAGCATGGACTGGTAAC:1 - chr3R 3508405 5' - HeT-A 5860 1 76.24 GCCTCAGATTTTCTATAAAGCACTCGATATATTAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 17004742 5' - roo 9030 1 65.35 GGCACACAGCCGATGACGAACGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATC:1 - chrX 6292933 5' + jockey 4621 1 79.21 GAATTTACAGAACCAGATAAATGCACAACAGGCTGTGTATGTAAAACAGCAAAATATGCACTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATAATATTT:1 - chr4 654682 5' + 1360 245 1 64.36 ATCCTGGAATCGATTTTAGTACATCAAAGTAGTCTCTTAAGGTTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:2 - chr2R 5616617 5' + 3S18 36 2 59.41 CAAGAGTGCGTGAGTGCGTCGTGAGTGTTGCAAAACGGCTGTTCGCCTAGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGG:1 + chr2L 1651653 5' - R1A1-element 5022 1 61.96 GAAACAAAACGGCGACTCGATTATATTAACACTCCTAAAAAATTACACATATTTTGGGTGTCAGAGGTTAATAATGTGGTATGAATTTGGAATTGAACACA:1 + chr2R 5446381 5' + hopper 950 1 60.40 TTTAACTTTAAATTTTTAACTTTAGTGATCAGATTAATTGCGTTTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCC:1 - chr3L 23393538 5' + 1731 4576 2 61.39 GCAACATGCTAAAGTTTTTTACATAATTAGAAATATGAAGCAGTCAGGGTGGTGCATGAAGGTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAA:1 + chr3R 9108209 5' + 1731 4473 2 51.49 GAAAGGATATTTCCTTGGATCCATTCAGTGATTTCTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACA:1 + chr3R 17632557 5' + 1360 340 1 67.33 CGGTTNCTTGGACGTTGTCGCGTTTTGATTATTGGCGTTACGCTGAAAAAACTTTAGCTGATGCACCGTTTTGTGACTAGGAAAACTCACTCTAACAAAAT:1 + chrX 8527704 5' - Gypsy12A_LTR 360 1 65.35 TTGGAATTGTTGTGCACAGGCTGTTTATTACACTAGATCAGTGTTATTGTAGTCCGTTCCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTA:1 + chrX 4100826 5' + 1360 496 1 64.36 AAGCGCCGATACCTAAGTTGATTACTTCTGGTTTTCCAGGCTTGTGGATCATCAAAATAACAGCCATTTTCCATTGTCTTGGAACACTTGAATCCTTAAAA:1 + chr2L 1155119 5' - Helena 92 1 74.26 CTTCATTCTATTTACGGCGACTCCAACTATGTATGTATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTAGTGTTTCTGCTT:1 + chr3R 14911842 5' + invader1 23 2 67.03 CATTGCTCAGTTGGTTGGTTGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCG:1 - chrX 8376975 5' - F-element 4431 1 81.19 CACAANTCTGGCCCCGAAACGCCAGCAACTGTGATTTAAGCCCACCACCCACCTCCTTCAGTTTTTCCTTTTCATTTTGTTGTTGTTTTTTTTTCTTTTTT:1 + chrX 8732425 5' - gypsy7 5012 4 54.46 AAATGCATTGACAAAGTAGATCAAAAAAGGTGAAAGGATGTGCCAAAAAAAAACACACACACAAAACTGGTTAAAATTGATTACTTTAAGAGCGGAAGAGA:1 + chr3L 7829247 5' - Cr1a 4244 1 73.27 AATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 - chr3R 1048024 5' + Stalker2 50 2 73.27 ATTTCATGTATGGATTTTCTCTTGAAGCAATTATAAATATTTTTAGTTGAATTTTAAGTAAACTTTAAGACTTATTTATCGATATCCCAGAAAAATTATGA:1 + chr4 1147454 5' + INE-1 506 1 75.25 CTATATAGTGGGTGTCCGGATTTCGGGGTGTCCTGGCAGATGTGTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTACATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGG:1 - chr3R 13530623 5' - accord 146 2 74.26 TGGCTAATCTCTTCCTCCCTCGGAATGGGAGCACAAAAGCAGAGCCTCTGCTTAGCCACCAGCACGGTGAGAGGATGATATTTGGTCTGTCCGCGACCTTT:1 - chr3L 4579713 5' - Rt1b 197 1 61.39 AATGGAGTTATCGCCGTTTGTAAAGGATATGTACATACATTCACAAACGGCGATAACTCCATTTGGCCATGGGTTTTTGTCTTTTTTTTTGTAGCCTTTTG:1 + chrX 12094621 5' - G2 3067 1 78.22 TCATTAGCATTCGAGTTTTGTTCTGGTCGATTCCATTCCACGCCCGTCGTCCACTCATCATCAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGC:1 + chrX 6508886 5' - Doc 4256 1 67.33 CGGATAAATGCGAACAGCAAGCTCTCCAACGAAAAACGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTG:1 + chr2R 9192046 5' + Stalker 6901 4 62.24 AAACTAAAAGCAACAGCATCAAAAGGAATATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chr2L 18286111 5' + 412 25 2 52.48 AGTCCGCGGATCACTACGATAGGTAAATGTTATCTATAAAGTTAGTTTGAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTT:1 + chr2L 8965348 5' - Burdock 6174 2 57.43 CATTCACTCCAAACATGCTCTCTCCCTTTCTTCCCCCTCTCACCCACTGAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chrX 18367578 5' + jockey 4699 1 73.24 ATTCCGGCAAAGCTTTATTCTACACAGAGAGAAAGCAGTTGTAACAAACTGTAAAAATGTTAATTTCTATATATGTAATATTATTATTTGTAAATTGCAAA:1 + chr3R 25767652 5' - 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chr2L 8339874 5' + Chouto 160 1 37.62 CTTACATCTGAAATTACGTATTTGTATACAAAAAGCAGTCCTATCAAATTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr2R 21239373 5' + jockey 32 1 48.00 AAAAGGCAGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTAT:1 + chrX 17692597 5' + 3S18 44 2 64.36 CCAACAAACGCCGCAACAAAAACCATAATGACAATTATATTTTAAATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 87209 5' + jockey 12 1 73.27 ATTGGATATGGAAAAACTTGATACTTACTTACCTGTACAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGACTCGCAAGCA:1 - chr3L 19545975 5' + Max-element 65 2 60.53 CCTCTGTTCTTTTTCCTTTTGCAGGTAAGCCTAAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTG:1 - chr3L 22468280 5' + F-element 4245 1 67.33 AATTTTTAATTAATATTTTATTTCATCATATTAATACGAAATTGGCCAAAACTCCAAATATATATTGTATATAAATTCTTGGATCAGAATTGATTTCGGCC:1 + chr3R 25956025 5' + 1360 3176 1 76.24 AAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chr2L 15997920 5' - 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chr2R 14052726 5' - Cr1a 4155 1 66.34 CAACATCTAGCTCTGATATGTCCGCGATCATGTCAGTCTGTCCATATGAACGTCGAATTCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACA:1 - chr4 187127 5' + INE-1 173 1 76.24 AAACGCAAAAATGATGAAAATGCATGTGAGTGGTGAGTGGCACCCGCACTCAAAATTGTTGAGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCACCCTTGCAGTTC:1 - chr3L 4367643 5' - hobo 5 1 77.23 AAAAAGAAGATTAGTGCAACTCGTTCAACTTGCGAGCAAAACCGATGCGCAGTGGTCTTAGTTGGTTTGGCTTTCAAACGGTAGATAAGAAAGATCATCAT:1 + chr3R 28965690 5' - gypsy10 5557 1 56.44 CTTCCGACTTAAGCCGCTGGCCAGGTTGTGAGAACTCGGCCAACAAACATGCGCTGCGTCTGAATCTCAACCTTCAAGATTTTATAGTTCTTGAGATCTCG:1 + chr3L 16024108 5' - INE-1 147 1 65.35 ATTCAAAAACTTTGGATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCATAGAAGCTTAAAATTATTCTTATAGCTTACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCA:1 + chr3R 19445971 5' - Gypsy6A_LTR 116 1 61.39 GTATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 - chrX 2766803 5' - mdg1 368 2 79.21 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCG:1 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 2 1 56.44 TACTCAGCATTAACACAATGTTCTCATATGATCGTCGAGGATGCATTCCGACCATATCAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGA:1 + chrX 22902388 5' + INE-1 89 1 80.68 TGTAGTTTTTGAGAGAAATGTGCCTTAATAAAGTGGTTTTCTATATTACTTTGAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr2L 5611369 5' + pogo 21 1 54.46 TCATCAACAGTCCGCTAAAAAACATTTCCCCAAAACTCGTGGCGCTCGCTGGGTCACCTCTCAGCCCGAGAGGCTT:1 - chr2L 2265742 5' + Rt1a 4652 1 56.58 TAAGCACGATTCTGGGCTTTTTGGAATCTTTTCGCAGGGCACACGCAGTCGAAACAGACAAAACAAAATCATTTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAA:1 + chr2R 20198533 5' + I-element 213 1 71.29 TACTTGAGGTGAAATACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr2R 1373198 5' - pogo 2087 1 63.54 CGGGTTCAAAACGGACTGGTTTGCTCTGCGAAGGCGTTTGCTGCTATTCCTCCCCTTTTTGGTTTATTCTTTTCTTTTATTA:1 - chr2L 19942945 5' - Bica 126 1 75.61 CCTCGAAACGACGCCGGCGAACTTGAGCAAATCACCTCAAGGGGCCATAAAAAGCGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGC:1 + chr3R 30748420 5' + 1360 3331 1 54.46 TATTTTTCATGTTTTAATGATGTTTTCATTTTCTAACCATGTTCTTTGAATAAATTCGTATATATGTATACGTTGGACTGTGAATAGTTGTGATGCCTCAC:1 + chr3L 3484935 5' - diver 225 1 79.21 TATATTCATGTTATAGGAAGTATTTTTGTGTCGATGTAATATATTTTATTCATATAAATGAAACAAGTTTTATTTATTTACTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 1559804 5' + hopper 143 12 77.23 GTGGACGGCAGGGCTGGGGGATGTTCTGTATTCTGGCAAAAGGTGGAGAGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTAC:1 + chr3L 15742874 5' - 17.6 62 1 51.49 TCTGTGCGAGCCGAGATTAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr2R 13793749 5' + P-element 69 1 23.76 AGTGAGCGGCGAAGAAACCCAATGCCGATGCACGTTCGATGGCTGCATCGAGCGAGAGTCACTCCAAGCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTC:1 - chrX 16690482 5' - R2-element 3169 1 70.30 TGAGACCATTAACGGAGTCGGGATTAATAGGCGGCAATTAAGCAAAAGAAAAATTCGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGTGTTTGAATAATTTAACAAACG:1 + chr2L 11958194 5' + invader2 402 1 63.37 GCATCGATGCATTGCCAATCTGGGACGACTTTACCATTTATCTCAGTCAGTCGACTCAGTCCGTCAGTCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCAC:1 - chr3R 4531278 5' + Quasimodo 271 2 71.29 GATCATTTTCTTCGATAAATATTTTTAAAATATTTGCTTGCCGATAAGTTCCTAATTAAATTAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr2L 20128951 5' - 412 7533 2 42.57 TTGCANTTTCCCCACTCCAATCGGAAGTAGCGTTGTTTATGTGCTTTCAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAAGAACGCACGAAAGAGAGAGTAAACA:1 - chrX 9657618 5' - Cr1a 214 1 65.00 GTGCTNCCTTTAAGGACCTCGTGCTGCAGCTGCTTTGATGATTTATCCGCTGCCCACCCGCCCACAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCT:1 + chr2R 22574392 5' - 1360 3265 1 68.32 TACAGCAAATTAAGCCTCAAGGTCTAAATTATTAAAATGCAAATTAGCCAGCGAGTAGGCGAACAACGCACAAAAGGTAGAGTAAACAAAACACAAAGAC:1 - chr2L 5411034 5' - Cr1a 202 1 62.00 TACGTTTTTGTAAAACGTAAACGGAGTCCGCAACGCACAACAGGTAATAGAGCAATTTACGTCAGTCAAAGAGCAATCCAAGTGGCCGCCCAAATTCGGTC:1 - chr3L 16730798 5' + Doc4-element 444 1 48.51 AATAGAGGCCAACATAAATCGGGATTTACACTAATTACAGGGCAAATGAAAAGAAATATTGCGGAATTTAGATATTTGAAAAAGAAGAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 13875420 5' + Doc2-element 218 1 56.44 ATTTCNGCTAGCTTCAAACAGATTGACACTAAATTAAGTGAAGTGCGCCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGT:1 + chr2R 23858698 5' - HMS-Beagle 87 2 61.00 CTCCACAAACTGACGATAATTATCGATAAGTCGGAGTGAAAATCGATCAAATCGATAAGACTATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATAGCCGC:1 - chr2L 11051368 5' - 1360 2997 1 65.35 CTTGCACGCCTTGGTAACTGACAGTTGAAAAATTTGTGTGACTTGACAAATGCTACGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCC:1 + chr2R 14603599 5' - roo 311 2 57.43 TTTCCTTCTTTTCCTCGATGATTTATTGGACAAAATGGTTTTTGTTTGCCAGTCAGTTCGTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATAC:1 + chr2L 18274807 5' - gypsy4 467 1 70.30 TGTAATTATAGGCAATTTCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGCATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCT:1 - chr3R 13236227 5' + Doc 4485 1 80.20 TGCCATTAACGCGGCGTTAATTTGTCGCTCAAAGTGTGAGCGCACCTTAAAGTATGCCATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 14582131 5' - roo 9044 1 59.41 AAGGACGTGGCGCAAACAAATGCAAATTGCTCATACGCCGTGGGAACCATGAACCATAGACCCAAAAATATTAACATACCGCAGGCCTTGACTGCGAGAA:1 - chr3R 24379069 5' + baggins 428 1 62.00 AATAATATTCTCTATAAATAAATAACCTTCTGTATAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chrX 17947390 5' + hobo 17 1 62.38 AGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTG:2 + chr2R 4577077 5' - Chouto 488 1 54.46 TTTCTACTCGAGCTGTTAAAATTTAACTTTATATTCACGAGTTATGGTTCTGCCGAAGTCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATT:1 + chrX 151674 5' + hopper 423 1 67.33 GGTGAACGGATTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 5545410 5' - Rt1a 5087 15 80.00 AATTTGTTGGTATACGTAAAGAAACAACGATTTTTTTAAAGCTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGATATGGCTT:1 + chr4 895988 5' - 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X-element 4525 1 65.35 AGTTTAAGGAACACGTTTGTATCGTCCAGAAAGTAGGCTTATTTCACTTGTTGCGCTTTTCGTTCCACTTTACTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3R 21852852 5' + 1360 7 2 71.29 AAAATCATAATGGATAGTTGTAATCGGTAGAGGATAACACAAAAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTT:1 - chr2L 8109328 5' - Dm88 50 2 72.28 AGGTTTCGATTCTTGTTAGGTTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 - chr3L 22564889 5' - blood 347 2 55.00 GTTTCTTTCAGTGCATATCAAGATACACGAAAAAATCCATCCGTGGAGAACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 - chrX 5726786 5' - roo 9045 1 52.48 CGACGACCCTTGTTGCCGCAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 22780996 5' - roo 355 2 76.24 CAATTGAGACTTGTAAACTCACGAAAGAATTTCCTCGAATTAACACTCTACACTCTACATTCTCGATTAAATTGGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTT:1 + chr2R 21094219 5' - G4 89 1 72.28 AGCCTTCTGCGCCCATGAAGACCATGCTAAGGATGGTCTCTATGGAGACGGGCGAGACGACGAGGTTCTAGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCGAATGTGAAA:1 - chr2R 6883742 5' + aurora-element 4090 1 68.32 TGCAGNATCCCTCGGATCCTCCTGCTCCTTCGGCACTCCTTTCACTCCTTGTGCACCCTTAACCCTTACCCTGTCTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGATG:1 + chr3R 28954241 5' - 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chr3R 17862427 5' - GATE 8447 2 54.46 GATCATGAAATTTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chrX 2090221 5' + roo 8665 2 65.79 CCACCGACAGCAGAGAGGTAGTAGCTATGTGGCAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr2R 21937489 5' - 412 7503 2 69.31 TTTCTCATCGTCGCGCACCTTCCTTCCAACCCTTGCCTTTCCCTTGCCGCAATTTAAATAAACTGTTATGAGGTCAAACTTAGTTAATAGTAAACAACAAG:1 + chr2R 10608698 5' + looper1 331 1 55.45 TATTTTAAATTGTCATTAAAACCAATTGATTCATGGCTTTAATATTACTTTAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 9193665 5' + roo 8687 2 56.44 AACTCCATATGAGTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chrX 22517690 5' - 1360 3370 1 46.53 ACATATGCATGTATAGTTAAAGAAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 17244139 5' + 412 54 2 84.16 AGAGTCCGCCAACCTTTTCAAAGTTTTTCGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 + chr2R 13696023 5' + Doc2-element 246 4 70.69 ACAGGGCGTAATAATCCTGGTGGGAGTGGATGAGAACATTGGGGAACACCACTTGAGCGTATCGACAAGCCATTAAACAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr3L 19807659 5' - roo 410 1 49.50 GGCAGAGGAGGAGTCGAAACCAAAGCCGAAAAAGCATAGGCAACGCAAGGGCACCGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGCAGCTCTGCGC:1 - chr3R 16268562 5' + G6 498 1 56.44 CCAAAAGTATGCAACATTAGTTTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAA:1 + chr3R 29653066 5' - jockey 4942 1 80.20 GGGTATAAAGAGGTCCTTGATGGCGCGGAAATACTATGTCCATGCAAGGGTTCGTTACTTACTCGCTTAAGCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTC:1 - chr2R 9525321 5' - baggins 5026 1 76.24 AGCTAAGAACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chr2L 306468 5' + Tirant 8129 2 59.41 GCCGTCGCCTTACTTTGCTGCGCAATCGCTTCTACTTTGGCTTATCCGATGCCCGACGACATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2R 18865824 5' + roo 8679 2 64.36 CCCACTGAACTGCACTGGTCTTCAAATTCAATCATCATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTG:1 - chr2R 17991022 5' - gypsy2 6633 2 64.36 TATGAATAATCAAGCTTGAAATGACTCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCT:1 + chr3L 10914565 5' - jockey 4588 1 74.26 GCCCCAAACTGACCCTTAAATTGTTGCGGCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 - chr3R 31293263 5' - hopper 1370 1 75.00 CACGGCAGCTCCTTGGTGGAACAACACCACTGCCAGTTGGAACACTACTACCGTGGCCAACAAAGTGATTGAAATTGGATAATGCTGATGGCTGGCAACAA:1 + chr2R 18022209 5' + flea 4769 2 58.42 CAATTTATAAACTGCTCGCACACACACACTGCTAAACAATTTTTAACTTTTTTCTCGTTTTATATCCCTAATATTTATCGAAATCCCAGAAAAATTATG:1 + chr2L 17058778 5' + INE-1 505 1 77.78 ATGCTTTTGTTTGTTTGGCTTACTTTACGTTAGAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGA:1 + chrX 2306861 5' - R1A1-element 5068 1 41.58 ACCAGGTAGTGCTGGCGACACAGGTGCATCCAAATTGTTGTTGCCTCCGTTGAGCTTTGCTTTTCGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGT:2 + chr2L 19472306 5' - HMS-Beagle 6743 1 68.32 AGAAATTTATTTGCGAACCATACACACTAACTTATTTGAAAACAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTAC:1 - chr2R 19637350 5' + 1360 370 1 69.31 CTTGTAATTTATTATTTATGTTCCAATCATGATTTAGTTTAATATTAGCTAAAATGTAAAAAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTC:1 - chr2R 23870149 5' - invader2 4650 1 66.34 TTTAGTTGAGTGTACATTTCTGTCATCCCTGAACAAACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 28623877 5' + roo 8677 2 62.38 TGACTTCTAATTGATAAGCTGCATTTTGAGGTTTTATAGGAAATATTACAAAACAATATAACTATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 + chr3R 19512287 5' - invader4 316 2 70.30 CAGCTCGAGAAAGTAAAGCGGATTTTGATGGCTACACGTCGCCAGTTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAA:1 - chr2L 4785235 5' + Tirant 185 2 54.46 GCGAAGTACCAGCCAAAAACTCGCAGAAGGGCTCTCAACAAATTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGAC:1 + chr2L 8360410 5' - invader4 2634 1 61.39 GAGTAAAAGTTAACAGATAATTAACTTCTTCTTTTTTCCATCCGCATCTCTAGGGTCAGAGGCGGCGGATCTCTGTTTTTTTTTATTTTATTTTATTTTTT:1 + chrX 8763761 5' + transib1 1900 2 55.45 GGCATNATCCGACGACTAAAGCCGTCTTTCAAGCCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCC:1 + chrX 21591881 5' + R1A1-element 4966 1 66.34 TTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACA:1 + chr2R 4577089 5' - Chouto 476 1 66.34 GACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:1 - chr2R 22774516 5' + BS 17 1 57.43 CGTCTGCGCTACTGAAGTCGCTTTTAACGATGCTTAATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr2L 3621142 5' - 297 6935 2 67.33 GTTGGCAGAATCCAAGTTGAAAGAACTCTTAGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 9653334 5' + roo 44 2 70.30 CGCCCAGTTATGATATTAAAGGTATTTCCGTTTATTGCACACAATCCATACAGCATCGTGGTTTGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr2R 9218800 5' + opus 135 2 69.31 CACCAGGATGGTGGTGTGGCTCCCGCTCAGTCGGTTGTTGGCCTTTTATACACCGAATATTGGTTCCTCCGCTTCTTACGATTTTTCTATAATTTTTTTTT:1 + chrX 16743964 5' + Tc3 77 1 62.38 CTGCGCTTGCCTTTTAAAATTGTTTGAAAACGCTAAGGGTTCTCAGGTGAGGGGAGATCTTCCGGTAAACTGATACCAGTGTTTTAATAACCGAACATCCG:1 - chr2L 22007274 5' - mariner2 187 1 82.18 ATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCGAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATAT:1 - chrY 1076850 5' - INE-1 80 1 63.37 GTTTTGCTTCAGCTAAACACAGTTGCTGCCTCGTTATGCAATGTGAAAATGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAG:1 + chr3R 14208326 5' - hobo 2631 1 55.45 ACCTTCCCGCTGAACCACATACACTCTGTCCACTATCCACTATTCGACACCAACACTGGAGACAAAGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chrX 12635987 5' + 1360 7 2 55.45 GAATAAACTGCGCTGTTTATTAAGTTTGTGCATCATGGGCGGCATGTGTGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGTATACA:1 - chr3R 26659288 5' - Quasimodo 122 2 52.48 CAACTTTTTATATTTGGCCAGCAGCAGCAGCAACCAGTATTTGTGTGTCTGTTTTATTTTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTAT:1 - chrX 9992469 5' - Stalker 6913 4 63.37 GTTCTGCGGCTAATAGCATTTAAATTTTAATGCCCAATTTCATAGAAACGCAACGCAAGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATT:1 - chr2L 3655609 5' - F-element 4426 1 62.00 ATATTTACAAGCGAGTTAAGATGGTACAAGCTTTATTTAATGCGTCACTTTAGATCTGTGTGCGGTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCAGC:1 - chr2R 9653361 5' - blood 375 2 74.47 GCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACAT:1 - chr2L 3244998 5' + rover 6984 2 70.10 TCAGGGGTTACATGAGTTTTTAGGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGAAATGTGGGCTTGCAGTTTTGGGCGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTT:1 - chr2L 12684327 5' - I-element 5039 1 27.72 TCCCAACTTCCAAACACACTCACACTCAAGCAGGACTCTGCAGGACCTACACATATGTATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chrX 14424113 5' + hobo 16 1 58.42 ACCACAAATTCTACGGCGGCAACCATAACTGCAAAACGGGCAAGTTGGGATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTC:1 - chrX 11059373 5' - I-element 4951 1 68.32 AATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr2R 18891029 5' - opus 7488 2 58.42 GATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 14582879 5' + roo 52 2 78.22 CTGCTTAGGTAATCAATCAGAGTGTGCTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGATCTAC:1 - chr3L 16727915 5' + F-element 4222 1 72.28 AGCTGCGTTTAATGGCTTTTCGGAATTTAAACAAGTCGCGTAATTTTGGTTATATATCTTATATCTTATCTTATATCTTATATATCTAGGCTTTTCGAGAG:1 + chr3L 11341098 5' - 412 7305 2 60.40 AAGTGTGTCAACAAGAGTGTGTATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCG:1 - chr2L 1331059 5' + Stalker4 7277 4 78.22 TATGCCCGACTGTCCCTGGGAATGTTTATATAATTTTAATTAATTTTCTGCGGCCAGCTTAAATCTTCATTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGAGTTA:1 + chr3L 2203119 5' + Doc3-element 4586 1 76.24 TGTCCTATGCGATATCCCTGGGAATTGTGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCCTATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATC:1 - chr3L 2141971 5' + blood 406 1 70.30 ATTTGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAG:1 + chr2R 18372632 5' + jockey 4725 1 76.24 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGA:3 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 19 1 69.31 AATGATGACGAAAAATAATCGTGGCCCACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCTG:1 - chr2R 631918 5' + 1360 101 1 78.35 CACCTTCTACAAATGAATGCGACGTGACGACAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGA:1 + chr2L 19610957 5' + Doc 330 1 70.30 TGGTTATGGCCCTACAGCCTTTTAGAGTGTGTACACAAAAAACGAATGACAAACGAAATATATTAAGATTGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 - chr2L 18568138 5' + I-element 7 1 72.28 ACATTGGAGGATGAGTTGGACAACCAGGAGAAAGAACTTTCAGAATGTGCAAATGAAGAAGCGGACCAAGATGGCTCCATTGTGGGACACCGGATGTGAC:1 - chr3L 14672154 5' - Q-element 475 2 60.00 CAACGAAATGCTGATACCTGTTGTCCATTTCCGATCATCTCCTCGAAACAATGCAAAAATTAACAAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCC:1 + chr3R 31729128 5' + hopper 1142 1 71.29 GCGTATTTGCTTTATGCAAACAGCATGAAATGCCAGAGGAAGTTAACTAAATTGTTTGAATTTATTCGTTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCT:1 - chr2R 9954520 5' - Stalker4 480 1 62.38 GTAAAGGTAACACAGAAATCTGGGCTTTATTTTTGTCTCAAATTACAATAAAAACGAACGCCATAAAGTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCA:1 - chr2R 16651138 5' + Doc 308 1 64.36 CTGCACACAAAAGCAACGCAATTTCTAGCCATGACTATGTGGAATATTGTTACGTCCGTCTGACGCAATGTATGATGAATGGGGGACGTCACCTATAAGAT:1 + chr3R 19360012 5' + mariner2 760 1 64.36 ACGAAAGCCTGGATTTTAGCTTGGTGTCCAACAGCGATGGCAAACTGGGCGATGAGGACTTGGAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGT:1 - chr2R 18658771 5' + McClintock 6385 2 66.34 AAGCATACGCGCATCGATGCCAAAATTCGCTGAAACCAATTAATTCTTTTCGTTCGAAATCAGAGACGATCTTTTCCTTATATTTAGGCTTGAAAGTAAAA:1 - chr3L 23688854 5' - transib3 2411 1 61.39 TTGAGCAGTCAAGACAGCCGAGAGCCCAGGGAAAATTCACGTGCAGACTCGTAGAGCTATCGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTTTCAAGCT:1 - chr3L 6790209 5' + Doc3-element 432 1 67.33 CCTCTCCGACGCCGCCCCTCTGCCACTTGACCTCCCTAATCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAA:1 + chr2R 22588073 5' + jockey 4823 1 71.29 GTGAAATAACACAAATGGAGGCGTATATGCATATGCACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAATACGATTTTCGGGCCGAAATCA:1 - chr3L 7785330 5' - 1360 3187 1 64.36 CAACAAACGGGTGCAAAAATTGAGCCCGGTTAAAATTGTATATTATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 + chrX 3697120 5' - jockey 4960 1 57.43 CATGAAAATCTTTAAGAAAGAATGCCAACATTCTGAGCCCGGCCGGAAAGCACTCTTGCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGC:1 + chr3L 6668281 5' - copia 480 1 58.76 ATGCAATCGTTTTTTCCTAAAACCTCGTTCCGGTGACTTTCCCGATCTTCGGCTAAATACTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACT:1 - chr2L 16609679 5' + R1A1-element 4948 1 65.31 GGGGCATCTTCAACTTCTGCTTGGCAAATTTTATGGACATTGTGTGTGTGCGAGGAGGTTTTTGGGTGGAAAAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAG:1 - chr2L 21031822 5' + 297 29 2 63.37 CCACCACAAGTTGCAAGTTGACTTTGGCAGTGCAAAGTTTTAAATAAACATTGCCATCGGTTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCT:1 + chr3L 12063269 5' - G2 70 1 68.32 ATCAGCATCATCGACGTCGTCGTCGACATCCTGATGAGCCTGGGATGTACGGGCGAGTAAATAACCTTAGGGCAGAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAA:1 - chr2L 3352604 5' + F-element 4406 1 73.27 ATCTCTTCTTCTTCCGACTCGAGCTGCTGGTCGGTTGGGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATA:1 + chr2R 6438333 5' - 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chrY 253851 5' - accord2 7231 1 59.78 CCCTAGACGCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 + chr3L 14364942 5' + blood 19 2 58.42 AGGCTGACAGTGCCACCCACGATCCGTTGCCCCAATAACCCAGAGGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCCAGACTAAGGGGAGAGT:1 - chr3L 8783102 5' - Doc2-element 4304 1 61.39 ACTGTAAGTGTTATTGCCGAATTGGCCTAACTGTCTTCTAGCACAACACGCACACTCATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAA:1 + chr3R 25682653 5' + 1360 3253 1 72.28 TTGCATATATAAAAAGCTAAGCCAACTTGAAAAGAAAGACTCAACGTCCAACGGATTCATATACACAAATAAAAAAAAACCAATGTATGGCCGTTACAGAT:1 + chr2L 14599095 5' + 1360 3367 1 80.20 GTGCGGAGCAGGCTCAAATGTCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCA:1 + chr2L 1358145 5' + I-element 4899 1 79.21 AGACTAACAAAATGCCAGCGAAGTTGTGAATCATATAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 9552137 5' + roo 8704 2 66.34 TTTAAGTTGGTTAACTTGCCATCGCTCATATGTCCTCGTGGTCTTAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCTTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCT:1 - 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chr3L 24486374 5' + Quasimodo 53 2 64.36 GACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGC:1 + chrX 22726191 5' - Helena 1277 1 51.49 TCAAAGCAACTGTCCCAGCTAGTCGATTGCACTGCTTGTTAGTAGTCTGCCCGCAGGTGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCT:1 - chrX 22867643 5' + copia 104 2 61.39 ACCACTGTGGCCTACAGCTGCCGTAGGAATAATCAAAAATAACTGGAAAATATATTTATATACAAATGAAAGCGGCTTTAAAGGGAGATGGATGGTGGGCG:1 - chr3R 4522735 5' - transib4 2429 1 54.46 AGCACGTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACC:1 + chrX 21772501 5' - gypsy3 6539 1 75.25 AGAGATAAGCCAAGCCTACTAAAATCAAGAGAGCAACGAACCTGTCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTC:1 + chr3R 10277753 5' + INE-1 549 1 71.01 CGTCAGTTTTGAGTCGGAAGTTTGCGTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCG:1 + chr3R 10273463 5' - F-element 4431 1 74.26 TTTACACATATGACGTAATTATGTATACCTTCGGATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGG:1 - chr4 1131965 5' - jockey 4603 1 66.34 ACCTTATCGAGCAAACGAGACAGGATTGTCGCATTCGCAGTCTCCTGCGTGGGTTCCACATAATCCTGCACGGTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 - chr3R 23701020 5' - mdg1 420 2 78.22 GATACAAATTTGTTACACGTACAGCTGTGGGGAGACAAGAGATACGGCCGGAGTCGAGTACGTGTGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCG:1 + chr3L 19397434 5' - opus 7369 2 67.33 CCGCGAATCCCCCTGCAATGGCGATATACAGGAAATTGTGGCCAATACTTTAGCGGAGGAAGCCGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATAT:1 + chr3R 2211420 5' + Chimpo 70 1 68.32 GCTTGGAATGATATTCGCTATATGGAAATTAGTATAATCTGGCAAAGGGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAA:1 + chr2R 19395421 5' - diver 193 2 52.00 TTGGTGTCGGTCAGTAATGAGTCCCAACCTACCAAAGGCCATCGAAAAAAATCAAGAAAATCGAGTAGCGGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 - chr4 167530 5' - P-element 2818 1 73.27 GTCCGGCACATCAACTGCTTTTTATTGTTGCTAATCGCTTCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCAC:1 - chr3R 14011433 5' + mdg1 251 2 60.40 TTGACAATTGTCAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chrX 697510 5' - 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chr3L 10102899 5' - roo 279 2 52.48 CCTTAAAGCAAATTTTTGGACATGCTACTTTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGCGCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATG:1 - chrX 7849380 5' - hopper 1398 2 75.25 TGTTAATTTGTGTGATTCCGAGGGATTGTGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTG:1 + chrX 14319119 5' - Quasimodo 348 2 76.24 TCCGCTCGATTCTGCCAAACAAAGGGACTGCAGCTGCATCAAGAGTTTGCTACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCT:1 + chrX 22746432 5' + Doc 4524 1 56.44 AGGAAAACTTTGCAGGTGAGTGAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAT:1 - chr2L 18970613 5' + roo 8788 2 79.21 CCACTAATGAAGGAGTCATTGGAATCCTTAGCCAATTCGGGAGAAGTTGAATGAATAATGTCGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr2L 11119061 5' + 1360 14 1 73.27 ATGGCNCCTCCAGGCGGTGTGATCCAACGCTGCTGGGGGCTGTTCCATTAAAAATATGACTGGCATTCTTGGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCATTGA:1 - chr2R 12925619 5' + 1360 437 1 46.53 GGCTTTCATCCTTTGGGCTCCCTTGGTTTTTATCTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTA:1 - chr2R 18312478 5' - Juan 4022 1 72.28 AGAAAAGAAAAAAATTTAACGGAGGTTACACAACATTTTGTGAGAGGTTGTATATATTAATCGCATTACACGCTACGGTTTTTGTTTTTTGTTTTCATTTA:1 - chr2R 16628562 5' - transib2 100 1 60.40 TTATATAAAGCTTGGATCGCTCGGTAATATCATATAATATTTGGTTACACATTTCCCCGCTACTTCTTTGTGATTCTATGATTTGGTGTATGGCTGTTGCT:1 - chrX 6232513 5' - Quasimodo 67 2 75.25 AAAGTATTACATTAAATTATGTTGAAAATTAGGGAAAAGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 15814654 5' + roo 8701 2 64.36 CACATGTGTTTAGTAGCAACATGTAGCTGATAATTAGCAATATCAATGGCATTAGTTGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTA:1 + chr3L 5843456 5' + invader2 100 2 61.39 GTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2L 9823636 5' + hobo 36 1 57.43 GCAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3R 25814709 5' + 412 7091 2 65.35 CATCGCTCAGTAGACTCTGCGAACTCCGCTGGCCTTGCTGCATTGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3R 16372477 5' - roo 9041 1 51.49 CTTCGATGGATGATGGCCTAGGATGATTGGATTGGAGCTGGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATT:1 + chr3L 716663 5' - F-element 4261 1 62.38 CTATGGCATGTGAATCCCTGGTGATCCTGCTCTAATCCTGGGCATCGCTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAAT:1 - chrX 5914442 5' - Ivk 109 1 57.43 ATATTTTTCCTGAATTTTAAAATTTAAGTTACAACACCTTGCACTGCGTCTATGTCTAGAATCTGTATGCTTTATCTCAACCTTCTAGCTCTTATAGTTCT:1 + chr2L 3940846 5' - INE-1 157 1 63.37 GGCCATAGCTTTTATTTTACCAGTTGGATGCAACTTATCAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 4692787 5' + HMS-Beagle2 481 2 57.14 TATGACCACCCATCCATCATCAGCATCAATACTAATGCACACCGTTATTTCTGCAGACATCTCCTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGG:1 - chr3L 19251612 5' - invader1 112 2 77.23 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATGC:1 + chr2R 5250069 5' + INE-1 165 1 96.77 CTTGGTAATGAGGTGCAAAAAAACAAGAAATCAAACGAAGCCAGCAGAAGAGAGGATGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAATGCCAAGCCCTCGCA:1 - chr2L 9838955 5' + rooA 7528 2 61.39 AAAATAGAAAGAATCGAAGGGGAGAAGAAATGTAAATTCCGATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 - chr2L 5152005 5' + I-element 34 1 58.42 CACGGGTGGTTTGGTGTCTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATT:1 - chr3R 18860387 5' - R1A1-element 5295 1 65.35 AAAAAGAAGAACCCAAATTGTATGTATCAACTCTGGACTAGACTGTTTGTGGAGTATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCACCAAGTCCTGGCACCGTTATT:1 + chr3R 4604143 5' - Tc1 1269 1 52.48 GCCGCAATTGATCAGGTTCTTCAAGGTGGCGGGACCCTTCATCAGAGTCCTTCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAG:1 - chr2L 20726142 5' - G-element 4141 1 55.45 CTAGCCCCCAAGCCGATATTGGCATTAGTGTTTCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGGTGGTG:1 - chr3L 3231996 5' - TART-B 149 5 62.96 TTTCGTTTTCCCCACCACCGAGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCGGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCC:1 - chr3R 5225322 5' - F-element 441 1 77.23 CAGATACACAAACTATATATATACAGACATGGTCACACATTTTCACTGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTG:1 - chr2L 4302736 5' - invader4 2636 1 59.41 GCTGCGATGTCACGTCTCCTGCGCGCGTCGGTCGAAACCCAAATGGCGACAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chrX 19848426 5' - P-element 2859 1 52.48 TTTGTGTGTTTTTGCCAGCTTGTAATTGTTGTTGATGTTTATGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGG:1 - chrX 17791686 5' - ZAM 47 2 73.27 CTTTTCAGCAATTTTTGGTGACCTGTCTGCTGTGTGTGCGTCGCAATTCGCTTATCAATTGTTTGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGG:1 + chr3R 22066600 5' - Chimpo 21 1 72.34 TTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr4 490238 5' + pogo 29 1 56.44 AAACCACATGTAGGCGCACAACTAGACTGTGAAAAAGAGCTTATCACTTTTATCTGAAATTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGAG:1 - chr2L 6723628 5' + R1A1-element 74 1 49.50 CTTTAAGCCAACATAATCAACCGCAATCAACACCAAAGAGCCAAAAGCAATAAGAGCAAAAAAAGAAAGCATAATCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTC:1 + chr3R 22204053 5' + Doc2-element 4408 1 78.22 CTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCT:1 + chr2L 9823654 5' + hobo 54 1 74.26 TTTTTTCTTATATTAAATTCAATAAATTGTGAAATCATTGCTTAATCGTAGTAGTATGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCG:1 + chr2L 11175083 5' - G2 2789 1 58.42 ATATGCTTTTTAAAATAACTTGAAATAATATGTTTGGGGTACTCCATACGAATTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr2L 14252769 5' + jockey 19 1 70.30 CCCCATCGCCTCCGCTCAACCCAGTAACATGGAACAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTC:1 - chrX 18125477 5' + G2 162 1 66.00 ACCCCGGTGACCCGTAAAAAATTACCTATTGCCGCTTAGAGTCGGAAAAAAGGAACCCCATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCG:1 + chr3L 13348363 5' + Ivk 205 1 67.33 GCCCCAACTTCTGTGCGTTATTATTTGCCTTTCGAATCCAATGTGTGTAATGCCTTCGAGTGTGATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGGTCGCAGG:1 - chrX 13443324 5' - blood 419 1 73.27 TCTGCTGCCCCTGACCCTGTCACTGAATAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATT:1 + chr3R 30285681 5' + roo 403 1 73.27 CCACTAATGGTGATGTTGATGGCGGTCGGATTGGGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTT:1 - chr2L 5402228 5' - Quasimodo 226 2 73.27 CCACGGACCAGGGGCCAAGTACTTGCAGCGAGCGGGTAATCTAGTCCCATTTATGCTGCAGGGTGAGGCGGAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTTGTCGCAG:1 + chr3R 5535299 5' + Rt1c 5233 1 67.33 GGTTGATCTTTGAATTAAGAGTCATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 2539328 5' - roo 9042 1 54.46 TCCATGTCCGTTTTGATTCATGTCTCGCTTAGTTTGTTGCTGGGCTGGGAGTTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTAGGATTAGTTTT:1 - chr3L 6063721 5' - Doc 4513 1 69.07 AACTCAATAATCACATCAAATGTCGCCACTGGACTTGCAGTGCCGTGCTCCCTACGCCTTCCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAA:1 + chr3R 22135584 5' - invader1 3716 2 64.36 TCTGAAAGGATTTCAGGATGCCACTCGGTATGCTACATGTAGAGGTCGTGCACTTCTAACAAAACTACGCACATATACACGCAAATTCTATTTTTATATTT:1 + chr3R 1439303 5' + 1360 3269 1 57.43 CATGAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCA:1 - chrX 23108346 5' + BS3 1402 1 71.29 GGGGCTCTGCTTTTGCTTTTCTTTGTTCGGTTGTTGCGGTCGTTGTTTTAGCTTGGATTTTTGTTGTTTTTTATTTGGATTTTTGTTTTTTCTTTTTCCTT:1 + chr3R 24457071 5' - Doc2-element 219 3 59.41 ATAATTTTTTGTGCGTGGCAGGTTCACTGCAAGTGTATGTGTGTGTCGGTGGGTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGG:1 + chr3L 19228606 5' - Quasimodo 6994 2 55.45 CCAGAAACTACAATGTTGAAAATCCATTTAAATACTATTTATTTGCTTTTGGATATTTTAAAAACCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATT:1 + chr2L 1255960 5' - F-element 4593 1 42.57 AGACAGTGTGACCGTGGAGCAATCCGATAAATATACTTTCTGTGCCAACTCTAAAACTCCACATAAAATACCAACGTATAATGGCGACTGAACCGTGTCGG:1 + chr2R 14769414 5' - mariner2 112 1 77.23 TTTATGCGATACTCATAACCAACATCGAGGCGAATGTTCAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATG:1 + chrX 20951810 5' + G2 207 1 61.00 ATTTAAATAGAACGCCTTAAAAATGGTTAATAGGAAATACACTTAGGGTTTTGAGAAAGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr3L 16528996 5' + copia 4886 2 56.44 GTTAAGTTCGACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chr2R 18891017 5' - opus 497 2 70.30 ATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chrX 17607875 5' + roo 55 2 80.20 TAGGAGTCAAATAAGTTGACAACCCAGAGACCCCAAGACTCAGAAACTGTGAGACTTCAAGACCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGA:1 - chr3R 10934920 5' + Rt1b 4895 1 66.00 AGCGGGGCTTATTTGCTTATAAGGCCGCAAACCAATCAATTGAAAATCCCTTTCGAGACACGGCGTAAAAATTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGAGGTTAC:1 + chrX 9636463 5' - 1360 26 1 66.34 ACAGCNGCAACAAGCGGCCAAAAACAAGCTGCAGCTGCGCTGGTGTTGGGCACGTTGTCGGCGGCTACATTAGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGCTTCCC:1 + chrX 9468337 5' - G-element 457 1 63.37 AAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCGAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCATGATCAAGAAT:1 - chrY 1076856 5' - INE-1 86 1 69.31 GACCCGAATCCTAGTGTTTCGTTCGTGTGCGTGTGCCCGTGTGTGTCTACACCATGATGAAATAACAAAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCA:1 + chr3L 5691232 5' + P-element 184 1 52.00 GTATGATCTGCAAGATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 14582905 5' + roo 22 2 54.64 AGCAGNTAATTTTGTTGTACTGGTTTTCTTTAAGCGACATATCTAACTCTTTCACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAA:1 - chrX 2442777 5' - Bari1 1631 1 59.41 AACACAAAACTGATGTCATATTCGATTTTCAGTATCCTATCTGTGAGTTTAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAG:1 - chr3R 20139553 5' + jockey 4940 1 58.42 TGTCGGAATAAATAAAAGCAAAAACATTCGACGGCTTTTGTTTGCGCTGATAAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGT:1 - chr3L 4025945 5' + accord 6905 2 58.00 CCAATTTCGGTTTTCGGCCATGTTTCGCTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTG:1 - chr2R 13379734 5' + R1A1-element 72 1 73.20 GAGCCGGCCATTGTGTCCTTTGTGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCCGCTTGCGTCGAAATCTTCTTCCGCGC:1 - chr3R 18844195 5' - invader2 457 1 81.19 TAGCAGAGAGATGCAGAAAAAGAGAGAGCGAGCGTGGGCTAGAGTGGGATAGATAGCTGGATAGTCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGAG:1 + chrX 1399838 5' + P-element 9 2 70.30 TATGGATTACCAGGGTAAAACCAAAGACACGAGAATAACATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCG:1 - chr2R 5952581 5' - 1360 3314 1 77.23 GCAATTAAAATTTGAATACTAGATTTTCTCCTGCAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr3R 17468415 5' - Transpac 270 2 68.32 GGGATATGTGTGAAGAAGAGAGGAAAACTCCCTTTTGTTATTAAGTGGATTTGTATGTGTATATTGTACTAACCCTTCGTGACTCAAAGATGCCCCTGAAG:1 + chr2R 3339871 5' - baggins 5368 1 68.32 AAAGANAGAGCGAGCGTGGGCTAGAGTGGGATAGATAGCTGGATAGTCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chrX 1399856 5' - P-element 2860 1 51.49 TTTCAAATTATCAGATTGAAAAATCTACACAGTCGTCTAGGACTTTTGCCAACTTGCCCGCATTTTTGCTGCAGCGCATAATAAAAAATTTTAAAATTT:1 + chr3R 13648793 5' + 1360 3032 1 55.56 CTGGTTTTCCAAGATTTCGAGACTCAGTTCGTCATATACTCAGAGGGTGTCACCCGCGCTAGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTT:1 + chr3L 25354521 5' - flea 309 1 64.36 GTGCGGAGTCCCGAGTCCGTGGAAGTCGACGTGCCTCACTGCAAAATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGGTATACCCAATCATTTATTGT:1 + chr3L 19414905 5' - Stalker 33 4 57.43 AAATATGTCCAGGAGATGTTCATTTCTAGACCACGTTCCTCCAATTCTAATTGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTT:1 - chr2L 1569641 5' - GATE 8351 2 59.41 CTGTCNGTGTGGTTGAGTCCTGAGTCCTTGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATTACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGGAATTGTGAAGATTCCA:1 - chr3L 3967711 5' - Q-element 23 2 71.29 GCCCANTGGCGATGTGACCCGGTTGCTGACTTTAACCGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATAT:1 - chr3L 2666314 5' + hopper 1306 1 65.88 TGAGGATGGAACCGCTCACTAAATATTTAATTAGAGTGAAAAAAAATCATGACCTTATCTTTAAAATTGTAATTAATTCCAAAATTTCCGCCTTTTTACCA:1 - chr3R 17162241 5' + transib4 2629 2 68.32 GGCTTTAATCAAATGCCGTACAAATTGGGGCTTGATTCCGTATTTGGATAATGTTATTGCTGGAATGCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr3R 6551271 5' + F-element 29 1 69.31 AAAGATTCAGGGAAAGCCCTTCAATGGATTGAAGCAATTGAACGATCTGTTGCTTTCCTACAATCGAATCAAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACAC:1 - chr2L 13986164 5' - R1A1-element 401 1 77.23 ATATCGTTAAAGATAAAGATATCTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTAGTGATCC:1 - chrX 20996665 5' - INE-1 97 1 50.50 GAAGTTTGACCAAGTTCATGCTCAACAACGATTTTGTGAAGTGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 26294475 5' - roo 9039 1 57.43 TATTTCGGGGGTTACGTTGACCCTGTTTGCATTTTGTGAACGGTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2R 6715052 5' + pogo 27 1 55.45 CGAGTCAAGCTTAAAAGCGCAGCTTGCAAATGGACGGAGCATCATTTATTGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGGTCTTAATTGG:1 - chrX 3868345 5' + 412 7532 2 59.41 CCATCGACGCCCCCATCCGCCGCATCCACGGCTCCAACAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCA:1 - chr3L 20782113 5' + Quasimodo 100 2 62.38 ATCAAAAGGAATATGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 18286128 5' + 412 7093 2 65.35 TTTATTGATCATTTGACTTCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAGTCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACT:1 + chr2R 9236991 5' - INE-1 550 1 67.33 CCAGAAGTTAACCAAAACTCAAACATGTACAAAAAACGAGACCTGAGTGCGGCGCATAATTGTCGTTATGATATTATATTTCGTGCACTGAGCCAACTGGT:1 - chr3R 6926396 5' - Gypsy6A_LTR 25 1 66.34 ATGGGCAGATGGGCCGATGGGCCGTTGATCCGGATCCAACCAACAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTAC:1 + chr3L 13637675 5' - Quasimodo 6906 2 56.44 TATAAGTGTTTGTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2L 16252354 5' + pogo 23 1 52.48 AACGCATTTGGCACACATGGCGTATGATTCATATTTGCTATTCGTGACTCTCCCTTTTAATGCTATTACTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chr3R 15703769 5' + copia 4876 2 69.31 AAAACACTTGCTTACGCACCTACAAACTCACCAAAATGTTACTGAGAGAGATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTCCGTGT:1 - chr4 785504 5' - Tc1 1623 1 69.31 CACGTCAACATTTTCCCAAAACACCGAAAAAAGTCATACATATATGAACGTTGAGATCTCAGAAACTATTAAAGCTTGAAGGTTGATATTCAGCATACAGA:1 + chr3L 2737855 5' + INE-1 175 1 71.29 GAATATGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2L 18286136 5' + 412 48 2 73.27 AAGAACGGATGTGTTGAAATTCATTCGACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 5104593 5' - roo 393 1 63.37 TATCCCAAAAACGCAAGATAACCAAGCATATTACATTTTATACCCGTTTTATTCGTAGAGTACTACGAGGTCCATCCGTATGAATGTCGAGATCTCAGAA:1 - chr2L 16363037 5' + INE-1 138 1 66.00 TCTGCAGATTACTGAAGCGACAGATGTAAGCTTGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 + chr3R 28012524 5' - diver 6068 2 67.33 TAGGCATTGAACCTTTATTGACTTGTATTTGCGTGTAGCCGGTTTTAAATTTGAATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGGTTTTATG:1 - chr2L 13324431 5' - Porto1 4256 2 57.43 TTTTCCTGTTATTATAATTTGGTTTTTTTTTCTGGTCTACGCACTTATTTAATTTTAAGCCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGT:1 - chr3L 13061807 5' - INE-1 576 1 63.10 AATTGCTATAAATAACAAGAATTGCTTTTAAAGAAAAGACATTGCTTTGCAAATTTCAACTCTCTCCATTCCATCCACACACACACACATATACACACGTA:1 - chrX 11982258 5' + accord 7038 2 66.34 TCTAAAGTTTTAAAGTGATTTTGATTTGATCAGTAAACTTAAATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGA:1 + chr3L 10464633 5' + invader3 20 2 58.14 ATACACACATCCACCCATACCCATGAATTGATTTTGCGTTTGAATGATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGA:1 - chrX 7305079 5' + invader2 445 1 76.24 AGTAGTGATCACCATCTCGGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAAACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGG:1 - chr3R 11639639 5' - F-element 460 1 79.00 GCTGGGTAATCTTGTACCCGTTTCCGTCGTGGTTTCCCGCGGGCAACGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACG:1 - chr3L 8761554 5' + jockey 138 1 54.00 GCCCCGGGGCATTAGAAGTGTTAATAGAAAAGTGCCTCCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACAT:1 + chrX 369234 5' + Quasimodo 293 2 62.38 AACCTGATCGGGGAAGGAGCTGCAGCGCTTTGGGGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATT:1 - chr3R 11357583 5' - G2 58 1 66.34 ACACCAGAAGCACAAATACTCGCAGCACCGCAGTTTCCCAACTTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATG:1 + chr2L 1283685 5' + micropia 5134 2 50.50 GCCCAGAAGGCAGCAAAGTAGCACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGA:1 - chr3R 26776123 5' + Quasimodo 83 2 78.22 AGCATTCGTAATACTCATCGAGAATCTTAGGGATGGAACGCTGGCATGATCGCGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGAC:1 - chrX 22959976 5' + R1A1-element 5032 1 63.37 ACATTAAATGAAGTATAATGCAAACCATTTATGAAGTCGATCATCTTTAGTTGGACTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTG:1 + chr2L 19867218 5' - invader2 4828 1 53.47 TCTTACCCTAACTGGGCAATAGGTATATTATCAATTTTGAAATTTAAATATCTATTGTTACTATCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 1270763 5' - roo 9057 1 41.58 TTTGTAGTATTGCCACTAATTTTCATTTTTAGTTTTATGGTTGTATGTGTTTTTATTACTTTTTCCCTGTTTTCTCTATTATTGTTCACACATGAACACGA:1 + chr3L 7997623 5' + roo 8662 1 73.27 GAGCTTTCACTGTGGTTTGCCGTCGGTGGATTAGTTTATAATTGGTATTTTTGCTAAGACTAGAAAAAATACCAATTATAAACTAATCCACCACGCCC:1 - chrX 11296398 5' + HeT-A 5911 1 46.94 ACCAAAATCCAAAATTGGTCAAAATGATAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAAGCCAGCCACGGCAAAAACTATTA:1 - chr2L 18662988 5' - hopper 407 1 72.28 AGAAAGTTTAATTTTGCCAATAGCTCTTGAGATTTGCATACCAGATGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 + chr3R 10490310 5' - transib2 2821 1 76.24 CGTGGNAATTATGTTGTTCAACTCTTTGTTCCACTTGTTGTTTGTGGTCTCTCCCTATGCCGTCACAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 697421 5' + roo 8 2 70.30 GGAAAAGGCAGCTGTAAAGTACTACTACTACATCTAGTTTCTAGTTTCAAGTTTCGCTTACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCG:1 + chrX 18763707 5' - Doc3-element 4573 1 46.53 TATAATCAAAGATTTCGACCGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGTTTATTATGAAGTAGACCGTCTT:1 - chr2L 8069004 5' - gypsy4 173 2 76.60 TTCGTTACACAAATTAAACCTATAATACATTTTACAAACGGATTATTTATTAGAATTAAATGTAATAAAATTTAAGTAATGTAATAAACCAATATATGCCA:1 + chr3L 25798415 5' - blood 377 2 79.21 CATGGCTTTTAGCATAATGCCGCGTATCCAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCGTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATATAATTATAT:1 + chr2L 11200097 5' - rooA 7494 2 74.75 CATCTCCTGGTGCTTGGAACTTGCTTTTCCATTTCCTTTTCATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACT:1 + chr3L 3476156 5' + Idefix 26 2 61.39 TGGACGCCACCACCTCGAGGCAATTGCTTGTTACCTCCTTTGGCACTTGACTGCCAGTTCAGCCAGGTGGTGAAGGTAACGGTATAAATTCTGAAGCTGCA:1 + chr2R 21449149 5' - Chimpo 4204 1 64.36 CGCGTACTACGAGTATGTTGGTGGCTTGTTAGGATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTATGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAATTTAATGTTTT:1 + chr3L 13405894 5' - I-element 472 1 67.33 GAATTCGAGAGTACGAGAGTACGTGGAACCACAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGT:1 - chr3R 5090556 5' + McClintock 150 2 68.32 GAATTATCGAAGAATGACCAGGAGTCCAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTC:1 - 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chr3R 9919481 5' - mdg1 7352 2 79.21 CACTGGATGGAGCTGATGCAGCTAACAAAGGTGAGCACTTTGACCATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAG:1 - chr3R 27313208 5' + Stalker 447 1 60.00 GAATGGGGCATATTGCCACATGGCCAATTACCGCTTATGAGGGTGGATCAGCAGTATCTCAGCCGGGATACCACAGATAATAGTCTTTAATATTTGTAATT:1 - chr3L 1320907 5' + gypsy7 5093 1 70.30 GCCATGGAGGTAGTTCAAGTTAGTTTCTTAGTTATTGATTTTATCAATATTACACTTTTTAAGTCATATCAAAGATATCAAAGATTTAAAAATGAAAAGTG:1 - chr2L 9982794 5' + Dm88 4239 1 89.11 CAGTCAAGTGGCAGACGGAATTAATGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAA:1 - chrX 2253884 5' - Tirant 8458 2 77.23 TCGAGCCCCCGACACATACACACAACACACATTGGCAGCAGAAGGAGCAAATTTATTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGT:1 - chrX 14543319 5' + Rt1b 5064 1 58.42 CATAAAAGCAGGCACAAAAAGCGTTGCCTACTTAGGGGCGCCTCTACGGAAGTCGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr3R 31159625 5' - hobo 2918 1 58.42 GTGACTTCTTCTTACATTGAGCACTGCTATCGCGACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCCTCTGCTGACCCTTGTCA:1 - chr2R 12924703 5' - X-element 4531 1 61.80 GGGCTTTGTTGCCTCGAAGCTTATCATTTATTGCTGCTGATTGCTTTGCCTGTCCATACAACCACCCAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCT:1 + chrX 19055956 5' - R1A1-element 4978 1 73.27 TGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr2L 15997923 5' - 412 7494 2 79.21 AAAAAAGTAGTAATAGGCGTAATAAGAATAATTGGCGATAGCTCGGATGGGGCTTAGAGTTAGGCGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTG:1 - chr2L 11223629 5' - Idefix 6982 2 65.35 TTTCAGGTAAATAAGTAATTTATTATCTTGGGATTGTTGCAGCGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCC:1 - chr3L 25525522 5' - Rt1b 4995 1 62.38 GGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATAC:1 + chr3R 3590972 5' - Gypsy6A_LTR 385 1 83.17 ATGTGAGTCGAAGTATTTTAGTTAGTTTTAAGAAGATTCTGTTTATTTTTTGATCTGACCATGCCTATATCTCCGCCCACAAAAACAATCCTTGAAAATAA:1 - chr3R 7916912 5' - transib4 2489 1 66.34 CTACTCACCATTTTGTAGCACTTTTCCGCGCTTAGATGTTTTTTCACTCCTTTCTCTTCCTTCGATTTTGTAAATTCGTCTTCTAGCACAACACGCACACA:1 - chr2L 16870984 5' + 1360 3208 1 76.24 GTATTAAACATTAAGTTATTTACGTGGTATTAATCAATATGTGTACGTTGGGCATTTCTCCAAAACTTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGAT:1 + chr3L 19068474 5' + Bica 432 1 73.27 AAGGTTGTACCCGGCTCGCTGAGTGCTTCGCCGAATGTCTGATTCTGAATGCTGACCCCAGCATCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGCA:1 - chr2L 10821238 5' + Gypsy6A_LTR 90 1 54.46 GCCAACTTATATTTGTAAAAACCAATGGTTGGGGTATTCATCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGAGTAAGCGG:1 - chr3L 11473237 5' - Quasimodo 230 2 53.61 CACTTTGGCAATATATTGGTACATATGTACATACACAGATAGTGCAAGAAATTAACCTATGGTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAA:1 - chr3L 852542 5' + Doc 4311 1 65.35 TGAATGTTTGTGTGCCATAGTACATTCAACCCAAATAATAATTTTACACCGTTTCAGCGTACTTAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTC:1 - chr2R 4853939 5' - Quasimodo 7161 2 58.42 CTTTTGAACCAAACTGCATTTGGTATATGTATATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:4 - chrX 19885234 5' + HMS-Beagle 6837 2 71.29 TTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:2 + chr2L 9823644 5' + hobo 43 1 65.00 GCAATGGACGAGATGGCAAGTCGCGGGGTGCGGATAGCTGGGGAGGTGGTTGGTACCCATATTGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGT:1 + chr3L 22223335 5' + R1A1-element 5046 1 53.47 CATACTGTGATATAAACAATAAGAAAACTGAAGAAGACGCGATTGCACGTTTCTATTTCACACTAAATTGTATTTATTTGAAAATATTTTAAAAAAAAAAC:1 + chr3R 22597727 5' + TART-B 10506 2 69.31 GCAAACAAACAATTTGTAATTTAAGTGTAATGTCCGAGATTTTTATTTCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAA:1 - chr3R 9789403 5' + Burdock 392 1 52.48 TATGCTTTTTAAAATAACTTGAAATAATATGTTTGGGGTACTCCATACGAATTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 14252768 5' + jockey 20 1 69.31 AACATGTATATGTAAGTACTCGTAGTTTCGATATTAAATTGATTTGAGTCTTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 - chr3R 12787929 5' - flea 4970 2 48.51 AGAAAGGCGGCGCAAATTAGAATTTTAATGATGAAACCCAATTAAAGTTCCTTAAAATGTGAAAATGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAA:1 - chr2L 19845345 5' + F-element 135 1 69.31 AATTAACTAACTCGGCCGTGTTTGTTTGCGTTTGTTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTC:1 - chrX 14333013 5' - S-element 1240 1 65.35 GGAAATGGCAATCTATCCGATTTATTGGACTCGACGTGGTTCTCAGCGGTTTTCTGTGGGTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCA:1 + chrX 6996550 5' - Quasimodo 7001 2 64.36 GGCCACTGGATACGCAAGGATACGAGATGCACATTGATCAGTTGCATGGAATGGGGAGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTG:1 - chr3L 10088046 5' - Doc3-element 411 1 59.41 GGTCCACTAAGAAATCCAGTTCCGAAAAGTCCATGGAGCTACAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTTGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCG:1 + chr2R 25175730 5' - Doc3-element 4355 1 75.25 ATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2L 17862257 5' + F-element 43 1 57.43 TATGTATGCTCCTCCATTTGTTTACCCTTTGCGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGGGAGGAGGGCACGGTAGGAACCGTT:1 + chr3L 2133594 5' - G-element 273 1 70.30 CCCCCATCCGTGGGCGTCGCTGGCAAATTACCTAGGCAAAAGTTGTGAGCCCCAGAATCAACAAAGGCCGTTTGTCGAGCTCAAAGCAGCTGGGGTCGGAA:1 - chr3R 31411417 5' + FB 3 1 76.24 GAATGGACACATTCATTTCAATTTGTCAATCTCGCTCTGGGCCCCCTCCCCCATAGCTGGATAGCTGGATAGGTCCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTA:1 + chr3R 21463889 5' - Fw2 3524 1 54.46 GAATCTGGGACTGCCCAGGGAGCGAGTGATAAGCATCTGTAACATGGACAAGCATGAGCTGGATGACTACTTTCTACCAGCTCCAGCCCAACTACGATTA:1 - chr3R 6453514 5' - baggins 161 1 80.00 CGACATTGTTGACAATCGATATAGCCAAGTCTTAACAATCGATTTTAAGCACTGATTCCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 + chr3L 9864567 5' + P-element 19 1 58.42 TATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCTCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCC:2 - chr3L 20988181 5' + blood 114 2 66.34 GTTTGCTTGCGTTTGAAATGAAAGTTGAGGGAGATATTTGTTTATTTGACGGGAAATCAATACGGCGGACCACCGCGGTCGGTCTTTTG:1 - 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chr3L 9871835 5' + roo 121 2 73.27 AAGTATCGTCTGACCAACTAAAGTGGGAGTCCAATTTGATTTATGTATAGCTGACCATGTGAAGAGATGCGCTCATGCCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACC:1 + chr2R 16693618 5' + G2 87 1 64.36 CTCGCCTTGCCTTGCGGAAAGCAGACGCTTTTCTTTTGTCGATTTAATTGAAATAATTGCAAAAATGCAATATGCACATGTATGTACGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 7861916 5' - Quasimodo 39 2 69.31 CGAAACCAATTACCTTTGTCACCGGCAACGCCAAGAAGCTGGAAGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGG:1 - chr2L 4979243 5' - jockey 442 1 56.44 CAGTAGGTCCAGGTTGCCATCAAGACACACCCAACACACCTAACAAACACACACACCCAACACACACACACACACACACACACATATAAAAACATATATTA:1 + chrX 8440755 5' - BS4 665 1 44.55 TTAAGAGAAGAGTGAAGCTTTGTCTTTAAACAAAATCAAACTGAACTTAAGGCTCAGAAAATATGA:1 - chr3L 27334550 5' - gypsy6 138 2 57.58 ATCGGCACAGTTATCTTCAACTTTTTATACCCCTGCCCTATTTTCGTAGAGTAAAAGGTGCAAGATTCGTTGTAAGTATGTATGTAACAGGCAGAAGGAAG:1 - chr2L 22132743 5' + INE-1 28 1 80.20 ATTAAAGTATTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAA:1 - chrX 21638105 5' + gtwin 26 2 53.47 GCGATGACGCCAGCAGCCCGGCCAGTGGGGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCAGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAAT:1 + chr3R 13691207 5' + Rt1b 5061 1 72.28 GTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2L 16252343 5' + pogo 34 1 61.39 TTAGCGGTTCTCTTGCGCTCTTTTGGGCCATCTCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - chr2R 11115846 5' - hobo 2897 1 64.00 CTCATATAAAATAGACGTAACTGCTTACAAAATTTAAAAACTTATCATACTTTCAGAGAATTTGTGGGTTCACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2R 21266399 5' + roo 8667 2 74.26 ATATTCGTTGAAACCACAAGCAGAAAAGTTATCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAC:1 + chr2L 12574648 5' + 1360 3201 1 68.32 AGCATATCGAATATCACCAATATCACACATATGCTCTACTTGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGATATATGATCCTCGAGAATGGAA:1 - chr3L 16267187 5' + Idefix 131 2 66.34 AGCCAAAATAAACAGAATTTGGGCCGCCATAGCTCTGCATATTCTGGCCATTTTCACGGACCGACCTGCACTCCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2R 5910828 5' - hobo 2937 1 77.23 GGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 2090299 5' - roo 9043 1 52.48 GGGTGCGAAGCTACATTGTGGCATTGGTTTTGATGTGGCCGACACGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGT:1 + chr3R 18680929 5' - Doc2-element 4340 1 61.00 CGGAACATAACGTAACGAAACTTGAAACCTGCAACAAAGTAAAACACATGATCATTGTATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTC:1 + chr2R 6271505 5' + blood 7108 2 61.39 AATGCGAAGGATTCAAGGCAACATGCAGCAGCGAGTCAGTTGGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAATGTGAACATT:1 + chr3L 14256215 5' + rooA 367 1 76.24 GTTAAAATATCCGTCAAAAACTTAAGTAAACAGACATAACTACGTGCATTTTAAATTGAATTAGATTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATA:1 - chr3R 28563558 5' + Ivk 5370 1 61.39 ATGATGCATGGGCGCCGAATCTAACGGTATGCCAAAGCATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAA:1 + chr3R 19361123 5' + G2 321 1 60.42 TCACAATATTTGACTTTGCATTTTTGTTAATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTATTATAAATTATATTTAATTTATTTTTTGATTTATAAGTAAAATAA:1 - chrX 14299941 5' - S-element 124 2 84.16 CTCCTGCTGCTACCCGCAAGACATTGGCATTGCCACAGTTGTAACCGGAAACTGTCGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATAT:1 - chr3L 17122867 5' + accord 183 2 59.41 AGAAAATCCCGAAAAGCAGATAGAATAAATATTCCGTAAAGACAATACGTTTTGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGTACGTAGTGGTGTA:1 - chrX 18339731 5' - Copia1_DM 119 1 55.45 AATTGTTGAACTTAATCTGTAATTATGCACCCGCAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCC:1 + chr3R 14333738 5' + Quasimodo 6906 2 66.34 AAAGTGAGTTTACTTTTGATACCGTTTTTCGTGCAGGATTCCTTTAGTATTTAGCGTTATGCAATAGTTTGCTTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTA:1 - chr3L 1266290 5' - F-element 92 1 75.25 TATTGTATTTACACCTTAGCTCCGAGAGTCTCTATATAACTGCTCCGCTCTGCATCGCGGCTGTTGCTAGGCCACTCCCCTACACGAGATTTTTGGGGAGT:1 - chr3R 3526538 5' - gypsy8 4666 2 53.47 TCGTCAGTTCAATTGGTTTGTAAACATTATTTAAATAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACT:1 - chr3L 4017988 5' - flea 452 1 65.35 AGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTCTT:1 + chr2R 10552702 5' + INE-1 577 1 86.14 GTGAGCAGTGAATCCGTACATATTGAAAGGCGGCGGTGGAGAATAATTTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGAT:1 - chr4 1016128 5' - jockey 4897 1 52.48 TTTGTGGGGTGTTTTCCATCTTGGTGTTGTGGGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr3R 31763415 5' - Tirant 8479 2 54.46 AGAATTTCCCGGAAGAAAAGCTTAGATTCAACAATGCATAAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCGGGTGTCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCAGATC:1 + chr3L 11326640 5' - 1360 136 1 65.35 GATCGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 13824353 5' + roo 35 2 69.31 AAAAGCGGCAGATGAACTAGAGCGAAAGCAAGAAAATATTATTTCAGGTGTATATGATTAATTAACTGCTGTAAAATCCCGAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 8640903 5' - roo 398 1 70.30 CTTTAACCCACACCATCCAAACAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 14324100 5' - hopper 148 107 90.00 ATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3R 22238675 5' + hobo 34 1 58.42 CGCATATATGTACTATTTGAATAGAGTGTTTATATTGAAATGGGGTCTCCTGTCTTCCTTTGGCAGTCAAAGATTCTCCTCCGTGAATGTAACCATAAAAG:1 - chr3R 11077299 5' + baggins 5063 1 62.38 AGCAAAGTGCGAGCCCCCAAAAACGAGGCCCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:2 - chr2R 21379600 5' - P-element 2842 1 35.64 CATTAAACGTTATATAAAAAAGATTTATAAAATACATTTATAGACGCATAAACCCATAAATAATAAATTTAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAG:1 + chrX 16859759 5' + F-element 126 1 73.27 GGATTGGTGCCCGATCATTGGTGCTATCACGAACAGCTGGATGATCATTTCCGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGG:1 + chr3R 14799201 5' + Stalker 6875 4 48.51 TTCGCAATGGGGGACAGTAGATAATAGATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAATTTTGGCGGCTGCATGACCCAACATCCTCCCCCCGTTGGAAG:1 + chr2L 22744841 5' - diver2 4515 1 71.29 CATCATAAAATGTGCGAATGAGAACTGAACCCGCCATTTCCTTGGATGTGAATGCGAGTGTGGAGCGGTACGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 16135724 5' - accord 7032 2 71.88 CTCGGCGAGTTCATGCTCACCCAGTACACCGGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTT:1 - chrX 15298614 5' + F-element 4632 1 69.00 CTCTGTCTGGCTTTATAAGTTTTGTGCATTGCTGTTCTTATGTGGTTATGCATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTA:1 - chrX 17519134 5' - Quasimodo 3 2 76.24 GAGAAGCATTGCAACAAGCCAAATAATATGTACAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTC:1 - chrX 12177932 5' - baggins 5191 1 71.79 CAACAGCAGCCACATCGAGGATAACGAGAGCCACTACCCTGAGCACGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGC:1 + chr2L 13498136 5' + accord 93 2 55.45 GCCGCGTAATTATTTCCGACCTTTTTTCCGCAACTCGCTCTTTCAACATCCGCTTTTCTTTTACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGC:1 - chrX 870461 5' + hopper 451 1 62.38 CTTGCTTTTGATTGCCTACTCAGCGGAAAAGGAAAAAATCAAGCTCAAAACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAGTAATTATGAAAGTTCAGTTTGA:1 - chrX 11381083 5' + Idefix 7282 2 60.40 CCCATCGTTATATTTTAACTGCTGCCCATTGTATTTACCAAGTTAGCAGGGCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTT:1 - chr2R 8268447 5' + Idefix 7096 2 55.45 GCGCCACTGGTTTTTGTGAATTTCAAAAGCATAGTTTTGGTCCGTCGTCGTACTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAC:1 - chrX 13625467 5' + Rt1b 5047 1 77.23 ACAAAGTAACTTCATATGCGTTGAAACGCCTTTTCGGGTGGAGGGCGTGACTTTGCCCCCGTGGTCTTTCGATGGCCTTTTGGCTCAACGAGAATGTTCAA:1 + chr2R 7952718 5' - gtwin 323 2 62.38 CACAGCCGGGTTGGGGTAGTGTCTCAAGTAGGACTCTGTCGTGGGCGCATCCTTCTTCACTTTGGCGCCGGGCAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTC:1 - chr3L 8634660 5' + opus 7219 2 74.26 GGTCAACATCCCTTTCGCTCTGCACAAACCACTCCTTTTCACTCCCCCTGTCAAACACACAACGGCGAACAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAA:1 - chr3R 31855688 5' + micropia 5310 2 78.22 GAAAATGAGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chrX 12290633 5' - HMS-Beagle 209 2 63.37 ATTGATGAGGACAAGTGAACAGAAAAGTAAAAAAACGATTTCAATGAATCTAATCAATCAACCTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 21282539 5' + 1360 9 2 71.72 CTTTACGAGATGCCAACACGGCGTATGCGTAATAAACTGAAACGTTATTGAGCAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGA:1 - chrX 13697689 5' - invader6 45 2 57.43 AATCCAAGGCGGGACAAGAGACGACACGTGCAAAAGGAAACAAAAAAAAAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGTTTCTGT:1 + chrX 20077614 5' + HMS-Beagle 492 1 54.46 AGTTACAGAAGAGAGTTGCAACAAAAGAGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTT:1 - chr3R 17815761 5' - accord 6997 2 71.29 AAGGCAGCCACTTTTTTTGTTTTCTTTGTTATTTAAGCGTAATTAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chrX 14204601 5' + 1360 27 1 57.43 AACATAGTCGATGAAGAGCTGCACTGCAACAAAAAGCTAGAACTTCGTTGTGCGGTATCACACATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:1 - chr2R 18891144 5' + opus 6 2 65.35 AAAAGAAGTGATGTACATTCTACGAGTAGATGTAAAGTGCTAGTGTTTACCCTTTGTTCGCCTTACTCATTAATTTAGTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTT:1 + chr3R 13715527 5' - Doc2-element 248 1 60.40 ACGCGTCGGATCTCGCAAGGAGTGCGAAGTCATTTTACTGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGCGCCTAGAAAGAAGGCGCTCA:1 - chr2R 18636469 5' + G-element 364 1 60.40 GAATGNGTAAAATTGTTGTATTTATTAACTGCTTTTTTGAAGTAGTTGCCTTGAATGTCTGTTTATCTGTCTCTGTATGTTTTCACTCCGAACGTACCACG:1 - chrX 6700106 5' - F-element 4365 1 79.21 AAGAACTGACTGTCAATTTCATTTACGTTTTCAATCCATTTAGTGTAAGCCCAACCACACAACACGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chr3R 31996778 5' - mdg1 7447 2 67.33 CCTAGGCTTTTGTTGGCGCTGGGCAAGTGTGTTTTGGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATC:1 - chr3L 17950637 5' + accord 263 2 55.00 AGTTACTATGTTGCATGCTATTTTGTTTATCTTTGTAAGGTAAAGGATGATCTCTCGATCCACACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAG:2 + chr2R 4576387 5' + Chouto 447 1 66.34 GTGACTGTTGTCGTCCAAGAGTTTTTCCATCACCAAATCGAATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCG:1 - chrX 7555063 5' - GATE 101 2 59.41 ACTGGNCACGGCCCCAGCGATAAGCAGGAATCCCAAAAGGCCACACAATCCATGTTTGGAATTAAAGTGCGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTG:1 - chrX 2935607 5' - copia 41 2 71.29 TAAAACATGGGGTTCAGCTAAGCCGGAGGGCAGAGAACCCTCTAATTGGGCCCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAG:1 + chr3R 29959688 5' + baggins 4971 1 74.26 TCTAGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAA:1 - chr3R 1048045 5' + Stalker2 7277 2 52.48 CCCACGATGCGTTTGTTGTTTATATATGTATATATTCGGATATATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGCCAATTGCATTAAGGAAGACAG:1 + chrX 19536727 5' + gypsy3 235 2 57.43 AATCAATCAATTTGTGGCATATTTTTACAGCCCGTGTTGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGG:1 - chrX 9739239 5' + micropia 5032 2 62.38 CTCCAACACAGATCTTCTGTTGGTTTTACCGAACCACGGCACCCTACACACCCACAAGTGAGCATATGGGGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCC:1 + chr2L 7158372 5' - R1A1-element 5223 1 65.35 TCTATAAGAATAAATAAGTATTGATAGAAAGTAATGAAAAAGTATACTAGTAGAAATCCTGAATGTAGTCATTGCCTCGTTATTTTTTTTTTGAAATATT:1 + chr3L 12289240 5' - TART-B 10509 1 80.00 GTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 - chrX 1399925 5' + P-element 32 1 46.46 AAATATGGGGAAAAATAAACCAACAATAAGGAAAACCAAATTAATCACAAATATTACTTGTGCTTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGC:1 - chr3R 8480501 5' + transib2 9 1 70.30 TAATGCGCTAACCATGGAAATGGATTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAAAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGA:1 + chr2R 15407477 5' - roo 8967 2 73.27 ACAACACTCTATAAAGGTCTGATTGGCATGGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATAC:1 + chr3L 13609717 5' - Quasimodo 123 2 70.30 GTCTGCATGTATGCCACTTTACTTGCCCCTTTTTGTGCTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGC:1 - 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chr3L 2804913 5' + hobo 14 1 63.37 CTCGGGGGGATGTGGCTCCCGTCCAACCAAGCAGAAAGGACATCCGCATCCTTATGGACACTAACCAGTCGGAAGGAAGGCCTACACACACACACACACAC:1 + chr3R 27391170 5' + accord 254 2 76.24 TCGCACGTGCTCTTGTCATTTTACTTTTAAAACTTTTGCGTTCTACTGTCGTTGTCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTA:1 - chr3R 18526059 5' - gypsy2 6496 2 61.39 ACGAAACGCGTAAGCTATTGTGTAACGAAACCAAAGTCAAAGATCCATAAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGC:1 - chr2L 9135622 5' + Bica 470 1 56.44 GATTAATGCACTTAATGGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr2L 9823603 5' + hobo 3 1 78.22 AAGGTAAGCTGAATTCAAAGAATGTAGTTGAAGTTTAATATATCAGTGGTTATTACAAATGGAACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGT:1 + chrX 19084253 5' - Ivk 4960 1 56.44 GTACANGTTGTTGCGCCTGATGTGGCTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCA:1 - chr3L 3313022 5' - BS 4800 1 78.22 ATATAACATTAACATATGATTAAAAACTTTACAGAACCTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCACTCTCTCTTGTTG:1 - chr4 843077 5' + INE-1 581 1 61.39 AACCTGACAAGCGACCACAATAAGAAGCCAGCTATGACACAGAGTAGGGTCACTAAGCTGTCCCAAGATACAAACCTTAGCAGTAACTACCACCAATAAGC:1 - chr3R 16622567 5' - R1A1-element 229 1 56.44 CCTCCTTACAGTATATACCCCATTCATTTAGCCATCTAAGCTGGACAATTTCAGTTTTTACAACTGGAATCCGTAGGTTCTGGTTGATG:1 + chr2L 17288690 5' - Doc4-element 2721 1 66.29 GAACTTGTACAATGTGACACTTGTTGAACGCCGATCGACGGGCCATAATTTTTACCAACGTCTACATGTCAAAACCAGGATAGGGAGGTCATGAG:1 - chr3L 9762902 5' - jockey 4767 1 73.68 ATTGGGAGAGCTGTTCAATGTACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTATCATAGACAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCGAG:1 + chr3R 907875 5' - Cr1a 489 1 64.36 TTTATGATTTTCATTTTCAATTTAATTTGATTTGCTTTCTAAACTTTGTACGTCTACTGTTCAATGTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 13153254 5' - transib2 2641 1 79.01 TAGGTCTTTGTGCTTTCGGTGCCTCTGTGCGAAGGTATATACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 - chr2L 9856299 5' + HMS-Beagle 33 2 62.38 CCCCGCACCCCTGCCCAATGCCCAATGCCACGCCCCTACTCCGAGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGTGCCTAGA:1 + chrX 2513415 5' + G-element 351 1 67.33 ATTCAGCAATGGTTTCTGTCTACCAAAATTTGCCCACCAGTTCCTCCAGACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 - chr2L 22227389 5' + F-element 11 1 77.23 TTTCACCGAAAAAACTCTATATCATAGACAAAACTGGAAGCTTAGACATAGAAGGCACTAAGTTGTGCTTGAGAAAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTA:1 - chr3L 3288288 5' - roo 8973 2 76.24 TTGCTTGCCATTAAATTTAGCAGTTGGCAAGACGGAAAGAAGGGAAAAGTCAGCAGGATGTGCGGAATCAACTCTCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACAC:1 + chr2R 6559731 5' + Quasimodo 7069 2 76.24 GTTCACTTTTGTTTGCTTATCTCACACAAAGCCCTTTATCTGGCCACCTTGTTTCGCTCTCTGAGCAAGAAATTTATGGTCTCTCAATGTAAAGGTTCTTT:1 - chr2L 18115362 5' + Tc1 145 1 61.39 AATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTT:1 + chr4 868642 5' + roo 8685 2 58.00 GAGCTCACTCAATGCTAGCAAATTAGTTAAAAACCAATTAAAATCGCTCATCCGCCACGTTGACCGAGCCGAGCGGAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCA:1 - chr2L 11232203 5' - gypsy2 6694 2 69.31 CTTCTGATAAGTTCAAGAACAGTCTAGCCATTGTTTACCGTTAGACCAGAACCACATGTTGCTCGGGATCCGCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTC:1 - chr2R 9185925 5' + Doc 458 1 73.27 AACCGAAAACCGCACAAAAAAAGCAAAAAAAAAAATAGCAACAGCAATGTGTGGGGCTTCATCGTTGTCTCTTTAACGCTTATTTTGTTGTTGTTGTTTTT:1 - chr2L 9347230 5' - gypsy11 3933 1 68.32 AGCTGTAAGGATTAAACCTTTAGAGTTTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTT:1 - chr2L 20882717 5' + invader3 265 2 65.67 CCTACACCCAGCTAACACTTACACTTACATTCCGATATATGTATGTTTACGAACGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCT:1 + chrX 18200333 5' + F-element 255 1 62.38 AATTAAGCATAAATTATGATGAATTGCATTTGAACCATTAGATAATTTTGCGGGCTTAGTTTTCGCTTTATTTGTATGTATCGATCTATACCAGTCTGTAT:1 - chr3L 22095303 5' - Fw2 8 1 51.49 CGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGG:1 + chr3L 25889015 5' + gypsy8 310 1 77.23 GAGTCCCTTATATGGCATTAGCGAATGCGCTTGCTATGATGCATCGCACTTCAAAGAAATGTGGTCTTGGCCGGAATTCTCTCCGACCCGGCCTTCCTGAC:1 + chr3L 26415381 5' - invader4 2747 2 75.25 AATTGAGATTGGCAACAATAAGGAGGTCCCAATTCATGCTTCTTAATATATTCGGACGAAGACAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCATGAGAATTTGTTGC:1 + chr2L 21648180 5' - Gypsy12A_LTR 2007 1 58.42 ATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr2L 7654011 5' + jockey 62 1 80.00 CAGAAATACTTCATGCACTTTTAAAAGATCCACAGCGCTTACCCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTAAAGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAAATCACC:1 - chr4 832279 5' - X-element 299 1 57.00 AGTTTATATTGTAGTCTTTCTTGCAATTAATGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr2R 15856422 5' - mdg1 7415 2 69.31 GGTTCTTAAAATTCAGGCAGCAGGGCGCACTTCAAGCCTAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAA:1 - chr3L 23949033 5' + gypsy11 380 2 43.56 TGTAAGCTAAAACGTGAGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 14913154 5' + blood 35 2 57.43 GTTGCTGCCAGTTTACAGCAACCCCAAGCCTAAAAGCACACACACACACACACACACACACACACATTCAA:1 - chr3R 21552552 5' + accord 7033 2 70.42 AAATCTACGGAGTTCGTTGCCAATCCCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTC:1 - chr2R 8449771 5' - X-element 39 1 74.26 TAAATAAATATGTAAATATAAATACATCATAATAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2R 19105068 5' + Rt1a 5074 1 62.50 TTATGACGTCTGGCCTCCTCTGTTGACGCAAATGCGTGGGCGAAGCGGTCGGCGGATGGCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTG:1 - chr3R 27275388 5' - Doc2-element 345 2 65.26 CATTTTCCCCCACCGCCCATCAAGTGTTGCCCTCCCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATAT:1 - chrX 14681216 5' - 1360 403 1 65.35 TCTGCACTTTCGATTGTTTGTTCTTGGCTCTGAAAACTGTAATTTAATGTGCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 27619196 5' - hobo 2915 1 55.45 TTTTTCGGCTGTAACCTAATGAAATTGTCTCTAGAGGAGAGCACTTTATCTTCAGGCAGTTGATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCA:1 - chr2R 21092999 5' + 1731 4454 1 67.33 ACTCCGATGTGACGGGCTGAAAACTGTCGAAAGTTTTCAAAACAATGCGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTA:1 - chrX 7836219 5' - Quasimodo 100 2 53.47 TCCCTCCCAGTGAGATTTCGAGAGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTAC:1 - chr2L 15733908 5' - jockey 4928 1 82.18 GCTATTTGCCTGATAAAGTTTTTAATTATCACATGGCGCTCATTTCTCAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATT:1 + chr2R 18763297 5' - micropia 5148 2 53.47 CAACTGCTGCAAGTTGAAATGAAATCATGATACATAATTAACTTATAAACGAAAAATGAAAATTTCTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGC:1 + chrX 5349348 5' + 1360 114 1 72.28 CATTAGATATTATATTAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCT:1 + chr2L 12240117 5' + micropia 26 2 53.00 ACACAGAGATATACTACAATTCTAGGTATATGTATTTGAATATTTTTAAATTATATACACCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACA:1 - chrX 11878353 5' + G6 1923 1 62.38 CGATTGGATTGTGCAAAAGAATAGCTCCCTCAACTATACCATCTATCATAATGGAGGAGTGCGACTTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTG:1 + chrX 5949986 5' + Rt1b 4970 1 60.40 AAAGCTTGGAGACGATCCGTTCATTTGAAGAGAGAGAAAGAGCGCGGGAGTTAGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAT:1 - chr2L 306550 5' - Tirant 367 2 60.40 CAATCGATTGCCAGTAAATAATCACCCGTGGGCAGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAAAAGGAGAGCGCGAGCAGCGG:1 + chr3L 16169522 5' - Max-element 8322 2 64.36 TAGAAATGAAACTAAAAAAAATGCTTCTCAGCCGCGAAAGATGCCACCGCAGTTGATACACAAATAATTGTCCTCGTGCATAGCGTAGAGCCAGTTGCGTG:1 - chr3L 24974799 5' - jockey2 406 1 57.43 TTGCCGTTGGTCCTGCGGATAATTGCACTCAGTATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr2R 13124460 5' - mdg1 7417 2 68.32 AATCGATGCTCGGTCTCGCTTTCCCCCACCTCAAGGTTTTCCTTCCTTTTTTCGGTTGGTGTCGTTTTTTGGGGTTTGTTTTTCATTTTCCTGTTTTTTTT:1 + chrX 6149124 5' - Doc2-element 233 2 81.19 CTGCATTCGCTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTAGAGTAGCGTCAGTGTGGATCTACCCTGGCTCCAATGCATCACGCCATAAACCCATGGTCGGCAAGCCG:1 + chr4 1301722 5' - gtwin 7089 2 57.43 AGTCAAGAGATCCAAATATTAGAGCTATGATAATAATACTAAGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTC:1 + chrX 4837661 5' - invader2 273 1 58.42 GCTCCTCCTTCTCTTCATGCGCTGCGCTCGCTGTGGAAAACAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACC:1 + chr3L 8570156 5' + I-element 4872 1 64.00 CTGCTGCCGCATTGCGAGTGTGCGTGTGTGTGTGAGATACTTTTGCAACTGTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGG:1 + chr3L 21460682 5' - Quasimodo 293 2 54.00 GCCCTGCCCACGTCCACGTCGTCACCTAGTGACCCCACTCGCCTACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCT:1 + chr2L 19040880 5' + R2-element 332 1 56.44 GAAATTGTTTTATGCGTATCCGTAAATTTCCCCTCGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTTATAG:1 + chr3R 29769530 5' - F-element 190 1 65.35 ATTAGGAAATTTCCGCATTCCCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr2L 15997854 5' + 412 12 2 67.33 ACTTTCGGGCCGCGGCCACTAAGAGAGGGCACTGAGGCCTATATACATACAGCTGTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAAGTAATACAAAG:1 + chr3R 4515190 5' + HB 34 1 73.27 AAGGTTTATAATACTAAATTTTACTAATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAG:1 - chr3R 27118389 5' - mdg1 430 1 74.26 ACGCGGATAAAACCGACTGTTGCCACATAGTGTTTGTGAGCGGAATGGCTGGGAGTTTGTGGGGGAGTGTGTGCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACT:1 - chr3R 7668909 5' - 17.6 36 2 74.26 ATAACTACATAGATGGCTGAAGGAACGAAGGCTTAGGTTTGGCACTAGATTGGCACATGGTGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3L 13888707 5' + copia 4885 2 61.39 TGCGCATCAAAAGCTAAGAACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACG:1 + chr2L 306457 5' + Tirant 8118 2 70.30 CAGCTTTAGCTGCAAAAGCGATTGAAACAGCTGGAGAGCCTGCGTCCATTCTGGAGGAACCAGAAATGGAACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACT:1 + chr2L 194194 5' - R1A1-element 5059 1 75.25 CGCGCGTTCTCACTCCCGATCTCCTTCCTTTAACGCTTCGACTCCTATCTTCTTCCATCTGTGCTTGCGCCGACGCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTT:1 - chr2R 2016659 5' - gypsy8 325 1 49.50 ATTTGTTCTCGGTGTGGTAATCAATATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCTCACGAGA:1 - chr2R 19184715 5' - Cr1a 355 1 76.24 AAATGCACCGAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 7808933 5' + jockey 28 1 58.42 GTCGTNTCTCATCTAATTCCGAATTGCTTCCAACTGTTGTTGTTCTCAAAAATATCTTATAATTTAGGTTCACCTCATTGGGATTGGTATTTTTTTTA:1 - chr2R 14812796 5' - I-element 220 1 66.33 AGTTTGGAGTTCAAAGCAACGTGATCGGATAGATTTCCCAGATTTCCCCTGCCAGCATCTTGTGCGTTATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCAT:1 - chr2L 10253504 5' - jockey 489 1 83.00 AGGGTCCTTCATCTCATAATGGTGCCACTAAAAGTCTGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTT:1 - chr3R 19535572 5' - Tirant 471 1 75.82 CCCGATACTCATCTAACAATAGATAAATATATACAAGCAGAACAGCTACAAAACAGCTACTTACAAGAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTAT:1 + chr4 166096 5' - INE-1 565 1 64.36 TTCCGAAATTAGATAAAAAATATTGGTCACTCTCCCCTTAGCGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 + chrX 22689323 5' + HMS-Beagle 6829 2 58.42 TTTATATTTAAAAACATGCTCATTTCAATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTA:1 - chrX 1598315 5' - Quasimodo 34 2 73.27 TCAATATAATATTAATAGTAATACACTACAAAACTTAGAACCAACAACGAAAGCGAAAGAGACTCTCTGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCTG:1 + chr3R 31989160 5' + Doc2-element 139 1 51.49 TTGACAGTTTCCCAAGAACGGATCGACAAAGTTTTGGGTGAGCGGAGTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr2R 10697011 5' + 297 4 2 63.37 AAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCACTTTGTGGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAGTTTAAAGTAACTTTACTACATTAACATAACAATCACAT:1 + chr3L 19457488 5' - X-element 4580 1 58.42 GACCGATTTTTGAATACTATTTGAGATGAGGATTTTTGACACTTGTTTTGGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACT:1 + chr3L 21637330 5' - Bari1 1682 1 50.50 TTCAAATTCTGCTGCTAACTGCTGTCTAGGCTTTTAGACACGTTCTACCCCCGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAA:1 + chr3R 5946088 5' - HMS-Beagle 7021 2 58.42 AATATTCGAGCAGTAATTGCACAAATATGGCTCGTATAAACAAAATGCGAAAAACAAGAGTTTTTTTCACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTT:1 + chr2R 17216089 5' - invader2 4728 1 72.28 TTTTTTTGTTTTTTTTGTGCAACCAATCCTAACAGAAAGGAATATCGTTGAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2R 14515741 5' - roo 385 2 50.50 AAACATGGAATTAATTTTTAAGATCAATAGCTCTACGTACCAATATCTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATG:1 - chr3L 381615 5' - Quasimodo 6 2 53.47 CCTACGGGCCACACCCCCCAAGCCCCCGATCAGATAGTCCCCCCCCCTTTGGACCATATGTAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chrX 16619590 5' - opus 7483 2 60.40 CCAACTGTTCAAGCAAACAGCTACTGATATCGCCTATACAAACTCGACTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 17624160 5' - roo 400 1 62.96 CCTATCCCGTGCAACAGTCGAAGGACTTGAAGAAAATCATCAAAATCATCAAGAAGAACCTGATCAAGGAGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTT:1 + chr2L 6091717 5' - invader2 4789 1 73.27 TTTTCCATTGCCTGATTGCACGTCGGCTTGTGGGCGCTGCGTCGTGGTCTCTATCATTAACCTCAATATCAACCCTTTAGCGTTTATAGTTCCTGAGATCT:1 + chr3L 9441885 5' - INE-1 149 1 75.25 CGTTAAAATTAAAGCATATGCAATTGGAATGGCCAGCTGACGTAAACATTACTCATACACGCATTACTCGCACAGGCATTACTCACACACACACACACACA:2 + chr2L 13731358 5' + Quasimodo 34 2 78.22 ATAATCTGTGTATTCTCGCGTTGGCGTCGAAATTGCTAATGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr3R 12408392 5' + P-element 36 1 43.56 GAGGCAAGAGGCGGTGGCTCAGTGTTGGTGGACTTGGAGTTACATGCCTTCGATGGTCACCCAGCGCGCACATGCCCGCCTCGCACATCCGGTCTTGGATG:1 - chr2L 829432 5' - gypsy10 5689 2 66.34 CTCCACATGTGTGACATTCGCGGGCTTGCAAAACTCGCAATTAACGGAGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCG:1 + chr3L 18376785 5' - F-element 289 1 55.32 CCATTGGATGGGGACAAAAATCATATTAAGACGGGCACATTATAAAAGACATCGAGCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAA:1 - chr2L 11454639 5' + copia 315 1 65.00 TGAAAATGCTCATGTTCTGCAATGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - chr2R 18358266 5' + jockey 4706 1 58.42 AGGAATAAAAGAATACAACAAGAAAATTCTACCACATATCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chrX 5178453 5' + hobo 36 1 59.41 TGCGAATCTGATTGGAAGCCACGAGGAGTGAGTTCGTGTGTGTGTGTGGGAGTGTGTCGGATAACTTGTTCATCTTGTGGACGCCGAAAAATGAATATATG:1 + chr3L 6364765 5' - invader3 273 2 54.46 AGCGCATACCCTGCGGGTTGCTGTTGTTGATATTGTTGCTGTAAGTTTGGAAGAGTAGTTGAAGTTTCACTACAAAAAGACTAGGCAATC:1 - chr3R 31677370 5' - jockey2 25 1 55.56 ACCACGTACTTGATAATCCTGATTCAGTTTCACATGAGCGAATCCACCATCGGCAGTGATTCCAACGGACAGTAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCT:1 + chrX 1454030 5' - R1A1-element 317 1 77.23 CAAGCAGTCCTCAAGCTGCCAGGCATTCGAAGAACCATCATAAAAAAAAAACCCAGACCGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACA:1 + chr2L 5786454 5' + jockey 4619 1 62.38 TAAGTCACGTGAGCATTTAAAGGGTTAACAAGAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGA:2 - chr3R 27222741 5' + P-element 391 1 40.59 GAAAAACTAAGCTTAAGTGCAGTGGATGGAGAATAGGAGCAGGAGCAGGAGCATCGGAACAGAGCAGAGTCAACCAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGT:1 - chr2R 12064139 5' + INE-1 113 1 79.21 TTAATATGTTACACATCAATTAACAAGCAAAAAGAAAAACATATTATTAACACCACACACAAACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCTG:1 + chrX 16437329 5' + G6 17 1 69.31 GGGAGCGCTAATATGTGATGATGCAAAGTAAAATCAAAAAAAAA:1 - chrX 18708577 5' + F-element 4679 1 65.91 TTTTGGTTCGGGCTTAGGAGGCAGATACTTCTCGACGGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTC:1 + chr3L 4459439 5' - I-element 273 1 68.32 TTTTAGAATAATATAATCTTTGAGCATTTTGATAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGA:1 + chrX 17209381 5' - Doc 4358 1 72.28 AAGGATCCACAGCCACGCATCCTTGGAGCTTCTACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 - chr2L 13335611 5' + accord 7029 4 77.61 CAGTCAACCAAAAGGTCATAAACAAAGATAAGATTGTAAGTCCTCCCGCGGGCGACTGGAATACATCCCCCTGGATTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGACGT:1 - chr2L 21360218 5' - BS3 225 1 77.23 AAACTCGTCTGCTAGCTGCTAGGTGCTACAAATTTGTCAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3R 16372409 5' + roo 8673 2 55.26 CAAACCAATTCACTGACCAATTCGCCATGACAATATTTCTCGACCAATAATTATGTCATTTTTCATATAATTATTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3R 17216896 5' + blood 7014 2 34.00 AGTTGGCACCCATTTAAGAGTTAGTTTTTCGCAGTGCAGAAGTTTTTGCTGCAAACGCATCTGCCAGATACTCAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTT:1 - chrX 8317826 5' + hobo 2476 1 79.21 TTAGAAAGTGATCTGGTGCCTGGAGTTGGAACCTTTGTGGCCTGCCTTGTCTTGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGG:1 + chr3R 24849727 5' + flea 4576 1 57.43 CTTCTCTCCGTTGCCTGTGCATTATTAAAGTATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTC:1 + chr3R 9271993 5' + invader2 4933 2 72.28 ACATAAAAAACAGCACAGCAGCGACGAACAGCAACAAAATTACGAGTCAGCCCCACAAGCAATGGCAACTACAATACAAACAAGAGAGAATGCAATAGTCG:1 - chr3R 17056598 5' - INE-1 579 1 60.40 AATTAGCTAAAATGACTCTCAGATGTCTGTCAAATTAATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr2R 19232852 5' + Burdock 36 2 63.37 AGCATCTGGCAAATTAAAGTGCAGGCAAGCAGAAATTCAATCTCTCGTTTGATTCTCGCCCTCTCTTTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCC:1 - chr3R 13622484 5' + blood 196 2 67.33 TAAGCCAGTTTCTAAAAAGAATTGGAAGAATGTGATTGGTTATAATTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3L 25341904 5' + 297 6608 2 57.43 TATTATTTTGAAAAGAATTTCTACTTAGTTATTGTTATTGGATTGCTTGAGTTACGTATACTTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAAC:1 + chr3R 18514330 5' - Stalker4 7261 4 65.35 AATGTGGCAAGTTAAATATTTATAGCATAATTCTAGGAGCTGCTACATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 20140543 5' + jockey 18 1 71.29 ACTCTCGAAGAGGGAAAAATGTATTTTCCGCATTTGCCTTTATTCGACTTTTCCCTTTAAGCACACGCCACCCAATGCCGCGTCTCG:1 + chr3R 4608953 5' - invader3 5379 2 60.92 TCAACAGCGATTTATTTCCCAGGCAACTTAAGTACGCCGCTTCTCTGCCCGGAACAATGCCCATTCATATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTG:1 + chrX 7383904 5' + copia 77 2 75.25 TGTAATACGATTGCGATCAGATGGAAAATTCGCATCTGTTTTAAAACGTAAAAGAGTGTGCAAAATTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGT:1 + chr3R 26535375 5' - hopper 1340 1 54.46 AAGTGCCGGTTGTACTACGCGAGTTCAAAGGGTAAGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCA:1 - chr2R 11115716 5' + hobo 384 1 65.35 ACCAGGATATTGTGAGTACTTTCCTGCTTTCATTTTTGTTATTTTCGGTTTTTTTCTTTTTTTTTGTCAATTACTTTTGCACCTCCCCCTTTTGCTCCGAC:1 + chr3R 25425605 5' - R1A1-element 4901 1 81.19 TTGGCACTGCAATCAGTCGATTAGCAGACCGCGTGTCAAAGTATTTAGCTTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCTTCTGTAATTG:1 - chr3L 24937493 5' - Q-element 105 2 54.00 CGGCATCAGATTATTTATCTTTCGGCTTCATCGATCGCTGAAAGATCCACAACGGCTTGCATCAGGAGCACCCACCGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCG:1 - chr3R 16679657 5' + accord2 3 2 77.00 CTTTTGTGCGGCATACCCGGCGTATACGCAATGTTTAACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGT:1 - chr2R 8198562 5' + F-element 8 1 80.20 TGAATGAGTTTCTAAGCCAACCAAGCTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chrX 11449098 5' + FB 50 1 76.24 CAATCAGTCAGGAATATGGAACTTTATGCGAAACCATGGGATGAGAGAGGGTTATGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:2 - chrX 2874880 5' - 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flea 4821 1 62.38 GCCCGAAAGAGTATCGCAAACAGGACAGATGCTGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCC:1 - chr3L 19184688 5' + jockey 422 1 67.33 GTTGGCTAGTTAGTGCCATAAAATTACGATGTACCACTTAAGAATCCAATAACAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAA:1 - chr3R 17871573 5' + 17.6 263 2 65.35 GCAAGTTTAACAAGACAACAGGAAAAACTGGTAAAAGTAGGTAATAACACGTTATCAAGAACAAATGCTCAAATGATCTAAAAAAGTCAAAAATTTGATAT:1 + chr2R 10652586 5' - Tc1-2 263 1 65.35 AGCTGACAGCACTAATCACATCGATCTGATTAAAGGCTTAAGTTTTCAGCTCTCGATTGAAAATCGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 11240977 5' + roo 10 2 66.34 TTCAATAATAGCTTCGACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 9868632 5' + roo 28 2 58.42 TGCTCCACATCCACATCCACATCTTTCACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCTAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTC:1 + chrX 3337005 5' + Quasimodo 7091 2 71.29 CATTGCAATATTTTTGTTTATTATTCCCAACGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCAT:1 + chr3R 12789653 5' + flea 4702 1 73.27 CCACGGGTGCTCGCATGTGGTTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 22324111 5' + hobo 18 1 59.41 CTTAAGCTCATTAAGGCTCATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTTTAAGAATCT:1 - chrX 7771613 5' + Idefix 302 2 79.17 TGTGTTTATACTAATTCCGTCTATCATTTAGCAGCTGTCCGATGCTAATGATGGAACGCATTCGCCTAAATAGCCTTGCTCCGATCCGGCCATTTCCCATT:1 + chr3R 25077118 5' - accord2 265 1 75.25 AATGGCGGCACAACGAGCAAACGCAGCACAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCC:1 - chrX 19493670 5' + Gypsy6A_LTR 352 1 59.09 GCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 - chr2L 14536288 5' - blood 7333 1 79.00 GCAATGATTTAATATCTAAGAATTTTAAAGACCATCTATGTTCTGATTTTACATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2L 21292928 5' + roo 8688 2 55.45 CAACAATGCCGGCGAAACGAAAAGCAACAATTGCAGGAGCAATATTTGCATCTTTAGCAGTCCGTTTAACTTCCCTACACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAA:1 + chr3L 8646441 5' - gypsy8 10 2 69.31 CAAGAAAGCAACAACAATTGACGAAAGTACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 + chr2L 4835311 5' + F-element 107 1 72.28 AGACACATTTGCTTTCGTTTCGTTTTCTATATGTGTTTTAAGTTTTATTTTCAATCGATTCGGTTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTA:1 - 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Bari1 378 1 66.34 TACTTAAGACAAACGAAAAGAGAAATTGAAATAGCATTTAGCAAACCTAACGGAAAATCAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGG:1 + chrX 9028881 5' + I-element 142 1 71.72 AGGGATATATGTAGCTTGGGATGTAGAGGAGGAATGGCTGGGCTGGAGGGCATTTTCGATGTACTGCGATCGGGCTGCTGCTCCTCCGCGCGCTGTTCCAG:1 - chr2L 590047 5' - G2 442 1 54.46 TATCACGTATACGTAAGAAGAAATGGTCGTTACGTTTATACAATTTGGCACAAAGTTCCTTGTGGCAGG:1 - chr2L 13332889 5' + G5A 398 2 57.97 ATGAAGTGGAGAGGGCGGATAATGCCAAATAATAACGCGTTCGGCAGCCTTGGCTCCCTCCTGTGTGATGAATGCCGGCGAGTATCCAGTGGTCTCCGCC:1 - chr3L 25419816 5' - Osvaldo 1068 1 70.00 TTAAAGATTGACCCTCAATGTGCTTCATGATGTTGGTGTCAAAATAATACGGTTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTA:1 + chr3L 13921201 5' - 1360 206 1 59.41 TATCTGCGGTTATCTCGGCACCAGCGAATTTCTTTTGCACTTGCAATAAAAATAATCCCAGCATAGATAGAATAAGAACACATGAAAATAACTTAGCCTTT:1 + chr3R 11722965 5' + G4 3632 1 68.32 ATCCACCAGCAGATGAACCACTAGAATTACAACGAGATCTCCAACCAGATCTCCAACTAAATCTCCAACCAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACC:1 - chrX 18612002 5' - R1A1-element 5087 1 76.24 ATGTGAACATTTCGTGGCTACAAACATCGTCTTCTTAGTCGATTGATTTCGGTTTTTGCTTTTGTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTA:1 + chr2L 9683313 5' + Tc1 1551 1 63.37 TCAACGTTAAACTGGGAATAAAGAACGTCCTGAATTTTGAGATTTTTGAGCCTTGAGTGATTGAGAGAATCCAATTCCCGCCAAATTATTTGCTTACTTTT:1 + chr2R 2118769 5' + transib2 203 1 62.38 ACTTGCTGATGTTGGGAATTAAAATGTTGGCTGATATTAGCAAGGTCTTTGTGCAGGGTGGTGATTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCATGC:1 - 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Helitron 31 1 63.33 GTAAGTTCAACGCAGGCAGCCTTCACTGTGCTCGTAAAGATTTTAATTGATAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATCTTTT:1 - chr3L 16128073 5' - copia 88 2 56.44 GTCCTGCTCCCGCTGTTTGAGCCCCAAATGGATCCCGGCTTTTGTGTTTTCAATTGAGGAACAGAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3R 25395686 5' + roo 12 2 67.33 ATTGCAAGGGTGTATAATGTATGTTATCATGTTCCGATGGTAGCAGACGGAGCCGACCTGCGTAATCAACTAGAACTTCACTTACTCAATGCAAATCA:1 - chr4 897061 5' - Bari2 144 1 73.47 GGTTCTGAAAAATGAGAAATATGCGAAATGTACTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chrX 15384801 5' - 412 451 2 64.36 AACTCAACTCCAGTGGCGAACTTGGCTGAAAACTTTGGCCAACAAAGCAAAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTG:1 + chr2R 18346179 5' - 17.6 7118 2 58.43 GGGCGAGGCCCAGGCCAATCCGCCTCTTCCAGCCGACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTG:1 - chr3R 4622725 5' - Quasimodo 7230 2 65.35 ACAGCCAACAGATATCCAACCAGATACATAGATACAGATACAAGTGCAATTAACAAGTAAATGATAAAACCAAAACTCGCACTAAGCATGTGAGGACTTAC:1 + chr2R 19603437 5' - BS 4994 1 58.42 TTCGTCGAGTGAAATATTTATGGGTGGCATTTTTAATGGACTAAGAGCAGTAGTTGCTCCATCGACTTACGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTAT:1 + chr3R 30355864 5' - ZAM 106 2 74.00 TAAAATAAAATATTTGTAGCTTACCCAAGTTTCTTGGCATGGCTTATAATATAGTTTGCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 23343735 5' - roo 9055 2 60.40 TTTATGACAGTTCAGCCAGATGATGTTGCTCCTGTTACAGTTGCCGTCGCTACCTTTCCACTCACTTTCCATTCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTG:1 - chr2R 17893240 5' - Copia1_DM 453 1 76.24 ATGCGTTTTGCTTTAATTGGACTTGTGTTTAAATCTAAGCTAAAAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:2 - chr3R 7375393 5' - roo 9040 1 61.39 GCGGGCACAAAAAGGAGCAACAAGAAGCCACGCAGCCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCT:1 + chr2L 16050432 5' + F-element 4214 1 64.36 ACAATATGGCATCGCCGCCTTACTTGCTCAGTAAGGGGTATCTGATAGACTATAGCATTCTCTCCTGTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTTTT:1 + chr3R 5601433 5' - Doc2-element 218 1 62.38 GAATATTTGAATATTCGTCGGTGTTGAATTTGCATGGGTGGATATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTG:1 + chr3R 914104 5' + hobo 370 1 57.43 GAAAGTGTTTGAATTGCTGGGGTGTGTGGATTTGTAATCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTCTGGATGTTTTCACTCCGAACGT:1 - chr2L 1605601 5' - F-element 4371 1 61.39 AGCGAAAAGGAGCGGGAACTGCTAAGACTGATCAGGTGAGTGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCA:1 + chr3L 18143669 5' - F-element 394 1 61.39 GTCTACTCTGTTTGGGACTAGATCTGCTGCTATCCGGTTCATGTTTTGCATGCGGTAATCATTTTTGCATGTTATCATTCATTAATTTAAGCAGATCAAAT:1 - chr2R 21224783 5' + jockey 4936 1 49.50 ATCTGTGTAGTACATATGTATATGTGTGTGATTCCTGGATGGGTCCTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAAT:1 - chr2L 9848650 5' + Transpac 363 1 55.45 TCTATGTGCTCTGTTATGAGTGGGGAGTGTGGTCGGCTCCCGCGACGCAGCGCGCCGTATTGATTCGGGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3L 23123907 5' + Tirant 8114 2 74.26 CGCAGCTCCAGTTCCAATTCGTGCAGACGACGGTTCAGTTCGTTGATGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCA:1 + chr3L 8739422 5' + Quasimodo 7048 2 53.47 CTTCCGCGCACTTTCTTTCCCTCCTCCTTCGGCCATCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGA:1 + chr2R 16738521 5' - Rt1b 4865 1 65.35 TTAATGCACTTAATGGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:2 + chr2L 9823605 5' + hobo 5 1 76.24 AAAAGTTAAATATATAAATAAATATGGAAAGTAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATATGAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAA:1 + chrX 14625453 5' + invader4 9 2 71.29 ACTAATCACATCGATCTGATTAAAGGCTTAAGTTTTCAGCTCTCGATTGAAAATCGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2L 11240967 5' + roo 20 2 56.44 AAACATAATAAAAACCCGCACAGTATACTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:2 + chr2L 15622725 5' - mdg1 7408 2 75.25 ACTTTCATTCGAATTGTGCCGACGCTGCAAGAGGACTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:1 + chr3L 15276641 5' - hopper 1393 1 45.54 ATAGTTATGCGAGTGTATATCCCACTCATGATGTATCATGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 - chrX 12818017 5' + HMS-Beagle2 6915 2 61.39 ACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAA:2 + chr4 1301730 5' + 1731 23 2 44.55 TGCTTTAAATAGTGTTGTACGTACAACTTTTTCATTTATCACCGGTCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATA:1 - chr2R 14963110 5' - 1360 3278 1 57.43 CTTTTAGTTTTTTGTTTTTTTCTTCACTTTTGGTTCGGGGAGCTGAGCTAAAGTTGCTGGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCA:1 + chr3R 13434564 5' - jockey 4656 1 58.42 TACGCAATGTTTAACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 - chr2R 8198538 5' + F-element 32 1 56.44 TCACACGTCTGGCCAAATAATTGGAGCCCAACAACCTTTGGCAGCCAAAATCCTTTGTATGCCCTTCTGCTTTTGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAG:1 - chrX 2502889 5' - hopper 1208 1 72.28 TCCGCAAATATACTTCAAAGTTTATAGTTTAGTAAATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATAAATTATCATTTTAGTGAATTTTCCATATAT:1 - chr2L 8967113 5' - Burdock 6382 2 70.30 ATAGGTTCAGGATTTGAGCACTGTTGCGAAATGATGCGGCGACACTCGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACG:1 + chr3R 16082953 5' - Doc 4273 1 57.89 GGTTGTGCTGGGTTTTCAATGTGTGTGTTGTGTTTTTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCT:1 + chrX 5847610 5' - 17.6 308 2 73.27 CGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAATCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 22238689 5' + hobo 43 1 68.75 GTATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCT:1 + chr3R 4160054 5' - invader2 5102 2 73.27 AGCGGCAGTGAGAGTGAGCGAGAGCTGGCGAGGTAGGCAGAGAGAAAAGGAGAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTCATTCTA:1 + chr2R 15813821 5' - 1360 10 2 53.00 ATACATTCATCGTCTTTACGAATGTAGCTGGTCTGCTCCCTTGGATTGACTACCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATTTTTT:1 - chr2L 2128403 5' - transib2 2653 1 58.42 ACCAGGATAACAGACGGCGCACAAACAGAGAAAAATCAGAGGGGTGCAACGACCAGCCGAAATGCCATCCAACACCGGATGTGCCAACAACAACATCGACG:1 - chrX 18974218 5' + gypsy10 61 2 63.37 AACAAAAGCCAAGCACAGACAATGGCTTCATCTCAGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGGGT:1 - chr2R 12536239 5' + 1731 247 1 64.65 GGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGATGCCCACAACACAGTC:1 + chr2R 4577099 5' - Chouto 471 1 72.92 CTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 - chr3L 15099934 5' + Tirant 8144 2 63.37 AAACCAGGCGGCTTCTTCAGCGGCTCAATGGTTAGCGTACAGTTGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGC:1 - chr3R 30461873 5' + F-element 349 1 56.44 CTACTGAGCGTGGTGCTCATGTTTCTCACAAGATCTTCGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTA:1 + chr2R 8462415 5' + Circe 7374 1 62.38 CCGGCAAAGCGAATCACGTGTACACTAAAAATAAAAGAGAGTGTGCGTGCCGCGTCTGTTATGTATAACAGATTCGTATTTTATTTTGTAGATCGGAAGAG:1 + chr3R 15548233 5' - HMS-Beagle2 7169 2 48.51 ATATTCATTTCACGAGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3R 22675801 5' - 412 472 2 53.12 TTATTTAAAATTATAAAACAAACAAAAAAAACACGAAGAAACTAAAATAGAAGTCATTGCCACCCATTAAAGTTCGATTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGT:1 + chr3R 24634487 5' + blood 7179 2 68.32 GGTGATCCCCAGTCCAGACTATCCCGCCTGCCGCCCTCCGATGCCGTCCTGGAATTCAAATATGCTGAAAGAAAACACTCGAAGGAAAGCGAACACTAGAC:1 + chr2L 14604206 5' - GATE 195 2 59.41 GGGTACTCCATACGAATTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr2L 14252733 5' + jockey 32 1 60.26 ACCTCTGGTCTCCAGATCACCCCCTTTGCGCCCTTCCTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTGGAACTGGGCGCACACAATAAACAATA:1 - chr2L 15388791 5' + hopper 1099 1 64.36 GGGGCTTCCCCGAGATGTCGTGGTTAATTTCCCGGAGTTGCAACATTTTACTGTGGCAGGTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGT:1 - chr3R 25561271 5' - Doc 487 1 61.39 ACCAACCCCACCGGTTACAGCTACAGCAAAGGACTCGCCAAGCAAGAGAACAAGCGTCAGCGGTAGTAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTT:1 - chr3L 191222 5' + F-element 4441 1 76.04 ACTAAAGCAAGGATATGTGCAGGAAGCCAGAGGTGTGAGATGCCAGCCAAGCTTCAGCCAGAATGCCACAATTACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTC:1 + chr2R 22277658 5' + TAHRE 10065 1 50.50 CCATTGTGGATAGTTCCTGGATGGATCCGTTCAGTTTGTCCCGCCGATTCTTTTCCGCTCGGTTTCGCGCCTAAGAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCAT:1 - chrX 15315145 5' + G3 4463 1 71.29 GAAGGGCACCCGCAGCTTTGTCGTCACGTCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTCCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr3R 14139442 5' - hopper 1369 1 69.31 CAATCCCAAGCGAACCTCATGACGCACACTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACC:1 + chr2R 5953635 5' + I-element 4952 1 71.72 TGCCANACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 - chr2R 22774508 5' + BS 25 1 50.50 GCGCTTGGCCATACCTTCAGCAGCAGATTGGCTTCGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATAT:1 + chrX 18136428 5' - F-element 4250 1 65.35 AATAGTTTTTTATTGTTATCACCATAAATCACAAACATTTTATTATATTATTAGTAATTGTATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTC:1 + chr2L 12241964 5' - invader3 264 2 56.00 GATCAGCAACTTGAGGGGAACTGGTTTCTGGTCACCAGATGCCACTTTTCGACAGCTGAGAGAAGCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGC:1 - chr2R 19232412 5' - R1A1-element 219 1 54.46 ACGAAGGGCCCCAACTGGGACCACCATGGAAACTCAACTGAAGGATCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACT:1 + chr3R 16657415 5' + Quasimodo 7136 2 58.42 GATAACCGTAACTCAAAAGTACTGAAATAAAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGA:1 - chr3L 22973578 5' - invader4 3027 2 70.30 TAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr2R 16928872 5' + blood 7059 2 71.29 TTTATTACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:2 - chr3L 25798517 5' + blood 7042 2 56.44 TAAGCGGGGAGGAACAGACAAACGACCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATAT:1 - chr2R 4026804 5' - roo 89 2 74.26 AGTCTATATACAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACA:1 + chr2R 6218923 5' + gypsy7 5008 1 77.78 GATGGAGGCACATTAAAAAATAAATAAAAAATACTGATAAAAATACTTATTAGCTCAAGAGGGGCTACTGCAAAATTTTGTCTCGACACGGTTCAGTCGCC:1 - chr3L 25846038 5' + mariner2 109 1 56.44 GGAAAGTATCAGGCACCTTACTATTCAAACGGAGGATACCCAACGCCTTCTCAAAATAATGGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCAC:1 + chr3L 9086199 5' - P-element 254 1 66.34 CTGCCAATCTGCCGCTGCCTGCCTCGAAGATCCTGCCTGCTCCCAACTAGCTCCATTTTGGCAGCACATTCAAGAGTTTTTTTAATGTCCTTATATGTTTT:1 - chr3L 15761901 5' - HB 417 1 57.43 CATATTTTTTGGTGGCCATCCATTTAAGCATTATAACTATCATATTTAACCGCCAATATTTCGCTGTTGTTCTCTATGCCTGACACACACACACACACACA:1 - chr3L 5718261 5' + Quasimodo 36 2 69.31 GTAACAAATGAGTCTGGGGCCCCAGTCAGCTTTTTATAATTACCTCAGACGAAAGACGCTGCATGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCG:1 + chrX 3009008 5' - Max-element 97 2 73.00 TGGTAAATCCGGCTTTTTCTTAAAGGTGCCAAATGATGTATTGTAGATAGCCATCCCACAATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAAT:1 + chr3L 270511 5' + hobo 139 1 63.37 TGTGAAAAGGTATATGGAAATGACTTCGTTTTAACGTTTAAATATGTAGATTACATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCA:1 - chr3L 23008113 5' + blood 133 2 57.43 GGTGGGGAGTTGAACCTGAGCGATACGCACTGACAAAAATGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr2L 15478792 5' + jockey 4703 1 61.22 TCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chrX 22517663 5' - 1360 3343 1 73.27 CCCACTGAAAGAGCCCACCAGTAACCATAAACCATACCAGCTAACACAACGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATA:1 + chr3R 18468617 5' - blood 7106 2 57.43 TAATATCTTAATATCTGGAAATGAATCTTTTCCGGTGTAAAAGCCTGAAGCTGAGTGAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATAT:1 - chr2R 10000253 5' - Tirant 495 1 67.68 CGGGCCCACCTGTGTGCACGCTTTTCAGACAACAAAAAACTTTTCTTTTTTTTTTCCTCTGGCCCCCTTGCCCCCCACGAATACAATAAAAAATATTCATT:1 + chrX 12241736 5' + gypsy7 346 1 73.27 TTCGGGCGACAGGGCAGGCCGCCCAACTACTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCAT:1 + chr3R 28436278 5' + hobo 2710 1 70.30 GAGCGGAAAGAGGCCTTCGAAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAGTATG:1 + chr2R 13018287 5' - I-element 5153 1 80.20 AAACAGATCAAGACGCTGAGCGCAAATAGTAAATAAATGGAAACTAAAGTAGTAAATCAAAAACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 + chr2L 773233 5' + I-element 14 1 65.35 TGTCGTCACACGTCGCAAGCTGCAGGAAGCCACAAGGACACTGGGAGAAAACAGCACTCGAGTAGATACCATGACAGGTTGGAGCGCCACAGAAAT:1 - chr2L 4361735 5' + X-element 4424 1 57.29 AAGCCGAAGTCGATGCTCTCTCTGTCGCTCTCCCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr2L 222242 5' - P-element 2842 1 34.65 ATAAAATAAACGTAACTGCTTACAAAATTTAAAAACTTATCATACTTTCAGAGAATTTGTGGGTTCACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2R 21266404 5' + roo 8672 2 71.29 GGACATGGGTTCCCCCCTATCATCTACATACTTGGCGTTTGATTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTA:1 + chr2R 18190321 5' - Stalker2 7550 2 58.42 AGCTCGGCCAGCTTTTCTAAGATTTAATATTTGCTAACCATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAAATCTACAATGATTTAAGATAAGGGTA:2 - chr2L 18220129 5' - Cr1a 4138 1 62.38 GAATTNTGAGCTATATAAGGCAATTATGTCTGTCTGATAAGGCTTAACCGCTTACGCAACTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGGGATCCACT:1 + chrX 15078386 5' + Quasimodo 260 2 51.52 GCCCCTGTGGAGAGCGAGATGCTGGTGGTCATTGAGGGCGTCAACGTCACTCACTTCGCCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAAT:1 - chr3R 5794007 5' - Stalker3T 289 1 76.67 GGTACGAATCTATAAAACTTTTTATGGGTGGGAGAAATCGTTTGAGCCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTG:1 - chr3R 5117670 5' - rover 6842 1 54.46 TTTTTCTACAATCAAACTACACACAACAGCGACGCGCATTCAGCGTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATACAACAAACACTCACCTGCAATGTTTCCTGAG:1 + chrX 14798131 5' + TAHRE 10060 1 73.27 ACCCTGCGCAAGCTGGTCGAAAAGAAGCGAAAGCAGAAGGAGGAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3R 21117343 5' + opus 148 4 61.62 TAGCCGTTTATTCTACTTTCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 22407510 5' + roo 8720 2 80.20 TTGATGCAAACTCAACTAAAACCATTTCTGCTTGCTTTTTGTAGCACAGCACAGCGATGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACT:1 - chrX 4355646 5' + F-element 4416 1 65.35 AGAGANAACAATGTTCGCATACATATCCTTTCGCAGATCCATGTCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 - chr2R 16775301 5' - mdg1 7372 2 56.44 CCCGACTGGTGGCTCATCCTTGCTCTGATGCGACACTGCATCGAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATAACCTTGAAC:1 - chrX 18873821 5' + Stalker3T 343 1 57.43 GAAAGGAGGGGGCGCCAAAGGAACTGTGTTGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAA:1 + chrX 9342234 5' - FB 711 2 70.30 GTAAATCTGCCGATGGAGTGAAAACTTAAAGGCTTTAGGAGTAAGATAAATGGAATCACAATCATATATAAGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGCCTCAG:1 + chr2L 18289607 5' + Tabor 275 2 66.34 TAGCTGTGGAAAGGTCTTCCATCCTGGCCTCTCCTCCAAAACACCCCTCCAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCAACCGCTGCAAGCAACATATCT:1 + chr3L 3378703 5' + Helena 884 1 66.34 TTGAATGGGCCAAGTCCCCAATTTAATCAGCGAAAATGCGAAACGACTGGCAGCTGGTCAAAATATCAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chrX 12155497 5' + 297 2 2 76.24 ACTGCTTACAAGCAGTGGAGAGGAAAAAAATAAAATAAAATACAAAAAAGATGCAGCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGT:1 + chrX 5935336 5' - 1360 17 1 62.38 CGCGGGGACCTAACCACCATTCTACCACCTGGCCGTCAACCTTCTGGACAATAGCCAATCCCTTAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACT:1 - chr2R 4879467 5' + G2 2927 1 82.00 TGTGTAGTATATGAACTTACGTTTGCATGCCGTAAGCTTGCTGCGCGCGGAGCTGAAGTTCCAGTGTGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTC:1 + chrX 2333300 5' - Chimpo 71 1 74.26 AATCTTTTGACATTCCACTGTGCATTTCGAAGCGTTTGTATTGTAATCACCCATCTCTGTTGATGCTGTTGTTGCCGATGTGACTCTGTTTTTTCCCCCAC:2 + chrX 10234062 5' + rooA 488 1 67.33 GTTAAGTTTATTTATTTTTCGCTTAGGTTAACTGTTGTTATTGTAGTTCACTTAGTTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATT:1 + chrY 3649263 5' - 3S18 6085 2 58.42 TCGCCGAACCGCTATGAAAACTACTCCGCAAAAATATCAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTTATTCCTGTCGTCGAGTCGGTTGCCACCATCA:1 + chr2R 4877815 5' + Chimpo 327 1 62.38 GTCGTGGAAAACGCGTGCGGAAAACTGTTTGTCAAATAATTTTTCACAGGACAACTGCACTGCTTGCATTGACAAGTGCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 + chrX 2910168 5' - accord 7029 2 49.50 CTTTGTCCGTTCTCGCCTGTTCTGCGGCAGATAGGCAGAAGGCGTTGGCTCCCAGCTCCTACTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACG:1 - chr2R 24803036 5' - Rt1b 4889 1 68.97 TCTTCAATCTCTTATACGAAAAACACAACCCAGCCCTCCCAAAAAGGACCTGCCACCCAACACCACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCAACG:2 + chr3R 13240864 5' - Tc1 1274 1 67.33 GGACAAACCAGAGGGAACGGACGGTGGAACCGACAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCT:1 + chr3L 18243140 5' - R1A1-element 4956 1 65.62 GGTTGAAGTCAGACAGCCAGACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chr3L 16150750 5' + P-element 54 1 25.74 CATTATTTTAAGCTCACCTCAAACGACATACGTTCTCAGCGACAACGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTT:1 + chr3L 23874231 5' + Doc 280 1 79.21 AAGAGGAGCAGTAACGTCATCGGAGTGGTTCAGTGGGTCGTCATAAATAACGCTTCGGGTTTCCCGCGCATTTTCCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGAT:1 + chr3R 9952976 5' + INE-1 545 1 78.22 ATCCATCCTCCTAGAGACTCTCAAGAAGATTGGCTGCCCAAGGCGTTGTTCGACGAAAAGACGTCCGGGACCGGGAAGTGCACCCAGACACCGGTGGAGAA:1 + chr3R 25301948 5' + Osvaldo 1169 1 63.37 TGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCG:1 + chr3R 1047985 5' - Stalker2 7609 2 61.62 TAAAGGTCTACTGGTCTGTGATGGAATTTGTAATTTTATATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2L 16691235 5' - pogo 2069 1 61.39 CGAGGCCGAACAGTGGCAAAACATTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 28623944 5' - roo 355 2 78.22 CTGAATCAAGAAGCTGTCTCTAATAGTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTT:1 + chr3L 25332744 5' - I-element 5023 1 74.26 TAAATGCGACGAATGGGTTTCTTTTGTTGCATTTTGCATTTGCCACGCGACAGGCCCAGCCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAA:1 + chr2R 8098957 5' + I-element 219 1 59.41 GACACGACACAACTTCGTATGCTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGT:1 - chr3R 10531101 5' + R2-element 3448 1 78.22 AGCGGCATGGAGGCCACACCGCCATTGCCAAGTCGCCGTAAGCCCGGTATAGCTGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTT:1 - chrX 8528414 5' - R1A1-element 4964 1 58.42 ATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2L 14536265 5' + blood 7064 2 73.27 TTCATTTGGCAATCCTTTTGTGAGCGAGGAGAAGTTTACGAGTAGAGGGAGAAATTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTG:1 - chrX 7638808 5' - Doc2-element 345 2 63.37 GGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTC:1 + chr2R 4577099 5' - Chouto 466 1 76.24 TAAATTGATCATTAGTGCAAAAGTGCCTCTGTTTAGCAGGCATCCATCCAAATTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGG:1 + chr3R 19449081 5' + R1A1-element 111 1 57.43 CAAGGATATCAAAATGAAGTGGACGGCCATTGGTTGAATTTCAATGCATTTTCGGAATATATATTTCTAGAGACAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAA:1 - chr3R 20495833 5' + Juan 4072 1 77.23 AGGCGTCGACTTGCCGCCACTTCCGCATGCAGCCGATGCAGCCAATGCAGCCGATGCACCAATTGCAGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAG:1 - chr3R 27914851 5' - hopper 403 1 76.00 TTTCGTCCTATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGTTTGATAGTGCC:1 - chr2R 8157270 5' - Transpac 5225 2 73.63 TTTGAGCTTTGGCCCCGAGCTACGTTTTGCACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTTCGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTGC:1 + chr2L 9230884 5' - Idefix 344 2 70.30 TTAACTCGACGTTTTTCACTCAACGAGCTTTTTACACAACAGGCAACAAAAGAGGAAAGTGCCTCTCAACATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGACTCC:1 + chr3L 5072082 5' + Gypsy6A_LTR 308 1 53.47 ATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGAAGGCAAATATTTTTTACCGCACCAGGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACAC:1 + chr3R 19445155 5' - jockey 107 1 66.34 GAGGGAAAGAGGTAGGAGCAGGGAGTTGGCCATTTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAGGTCACTTTGATAAATTTGTCACTTACTTCCCTGGAGTTAA:1 + chr3L 3639792 5' - Ivk 472 1 67.33 TGTTCGCTTAGCGCATAATAGGGGCGGATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1 + chr3L 12246123 5' + HMS-Beagle 6816 2 61.04 AGTTAAAAATCTTGACGCGAAATTAAAAGAAACAAAAGAGAACGTGTACATTTGTTCGTGCACATTTGTGGTAGAACACGATTTTCGGGACGAAATTAATT:1 + chr2R 6217506 5' - 1360 3184 1 67.33 ACACTATCCTCCGAGAAAGTCACATTATGCCACAGATATTGATTATTATTCAATAAACTTACAAGCTCAAATATAATCCAAATATAATTC:1 - chrX 2873575 5' + gypsy7 5420 2 64.44 GCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:2 + chr2L 5932106 5' + jockey 36 1 49.50 GTGCCCCGAAAAGTTTCGCCAACATTTCTCCGCCGACTTAACCACTTTGGCATGTGTCTCAGACTCTTATTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAAT:1 - chr3L 11318212 5' - diver 5820 1 72.28 AAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3L 5827870 5' + blood 23 2 57.43 GCTGTAAAGTGCAGTTCGCAATAACACTACAAAATGTAATTTAAATTCTCTTTATATTTCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 11576367 5' + roo 8680 2 63.37 ATTATTTAAATATCGCTAATTTTTTTATTTATGAGATAGAATGCTGAGCTTAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCTTTATTTAAATGATCAAAGTGTGCTGA:1 - chr2R 4402675 5' - Stalker 7171 4 55.45 CCAAAATATTTAAGTTCTAAATAAAGAAGAAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTA:1 + chr2L 8776849 5' + G4 3686 1 88.89 CCATTGTGGTGCAAAACACCTACTGAGATCGTCCGATGAAATGGTGGGCGTGGAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATACAGCTGTGTTCATAAAA:1 + chrX 13837829 5' + HB 1 1 56.44 TCTCATTTCGAACAAATGTAATGGGGGTTAATTCTCAAACTAATGCTTGGATTTTGCATGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATC:1 - chr3L 2714657 5' - HMS-Beagle2 170 2 61.00 CTCTAACCATCGTGGTTGTGGTGGCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATT:1 - chr2L 11106482 5' - R1A1-element 163 1 76.00 AGTACTCACTGTATTAGGAAACCAATATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAAT:1 - chr3R 26773414 5' + 1360 272 1 74.26 CGCTTCGCTTTGCTCCCTTTCTTGTATTCTTATTCGTTCTTCCGCCGTCCCTCGGTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGCA:1 + chr2L 19163650 5' - invader2 323 1 59.41 ATAAGTGATCTATGTGTAGTAGAGCAGTTCTATTTAAGTAATTTAAACAAAAGACTTAAGCAACAAAAACAACAATACCNCTAATCCGGGCTCANGCCCTT:1 - chr3R 21678732 5' + I-element 154 1 66.34 ACAACTCAATGCACTCAATCAATGCACACAAACAGCAACAGTCGCCGCCTTTTGTGGCACAAGCACTCGACTCATTAGCAAGAATCGCTCTCGCGCAGATC:1 - chr2L 17207906 5' + Tom1 207 1 75.25 AGCAACAACAACAACAGCAACAACAACAAAATTATGTAGCCAGCAAACATAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAA:1 - chr2L 7967998 5' + gypsy7 5009 1 66.22 GTTCCAGGCAGATTATCGATGACAAAATATACAAAATAATTGTTTTTATCGCGAATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:3 + chrX 3485612 5' + P-element 4 2 75.25 CAAATTTTCGGGCTTCCAAAAAAGGACTCCCCGGGGAAGAGCTGGCCTTATCGCGATGATGTGCCAAAAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAA:1 + chr3R 16629988 5' + X-element 4373 1 78.22 CTCATCGTCAAAGGACTTTGAGTCCTCGCGCTCGAGCGCCCGTCAACGCTGAAAGCGATAAGGCAATTAGAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACATAA:1 - chr3R 28122421 5' + I-element 4944 1 75.25 TTGCTGTGGCTTTGCTGCGTTTGGGTGCTGGTGTGGCCAGCTGTTTGGCAACTCCGCTGGAGGCCAGGGTAGATCCACACTTTGCATATTCTTTTGTATTC:1 + chrX 12586697 5' + gtwin 228 2 67.33 GGGAGNTAACACAATAATCCTTTTACCTTTTTTTTTTTAAATCCCAAAAA:1 - chr2L 1531824 5' + FB 187 1 66.00 ATCGTTGACATTCTGGACCCATTTTTCGGATGTAACCCAATCCTCCAGCCAAGTCATTGTGCTCCTATTCTCTACTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACACGA:1 + chrX 4377313 5' + Cr1a 305 1 60.40 CGAAANTAAACCATAAAGCCCACTGAACATCAGAGCGCATATTAAACAATATTGTTTTTCTATTCCTGCAGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTCATAGTCCA:1 + chr2R 15308610 5' + 297 470 1 70.30 TATATTCTTTCTCATAAATAAAAAACCGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr2R 11257913 5' + pogo 46 1 75.25 AAAACTACCCAGTGCGTTTCGAAAATAGTTGCAACTTGCGAAAAATATGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGC:1 - chr2R 13621574 5' + 1360 467 1 56.44 TCTCTTTTTTTTCGTTGCATACTCAGCGGGGCATGGCAAAAGGGGCGGCCAACGGATCGAAAATAGGGGAAATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGAC:1 + chrX 16501383 5' - R1A1-element 5231 1 72.28 ATATGGCATTTGTTAAGCTTTTCATTGGCCCTGTCTATTTTTGGAGATTTTTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 27448564 5' + roo 8689 2 53.47 GTGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAAAATGTTGATGTTATGCTTGATTTTTCAGCGATTTATGTGTCATTGTTTTGCCGCTCAAATTAGCTGCTAAACG:1 - chr2L 5897627 5' - R2-element 167 1 80.20 GAGGTGTGCAGGAATTGCAGGGGCTTGAAGGTAGGTGGATCTATAAAGCGTACGCCGTAGCCGGGGAACAGGTTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATAT:1 + chr3L 16778478 5' + Juan 3835 1 76.24 AGGATGTCGATGCGGCAGATCTCGTAAAAGAAACCAGAACTGCCGACACAGCACTTTCGGAGATACATGGTTGCCTCTCTCACAACCGCAATCGCATCGAC:1 - chr3R 3187495 5' + Doc4-element 296 1 73.27 CTTTAAGATATCAGCAACTTTCTAATGTGTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTAC:1 - chr3L 17856101 5' + HMS-Beagle2 7161 2 71.29 TGTATGTGTGGCTGGGCTGAGAAAGGTAATGCATATAATTGAATTTTTACGCAACTAAAGAAGAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTG:1 - chr3R 7565612 5' - Quasimodo 62 2 62.38 TGAAGTGCAGGGCCTATACACAGAACCAGTTCTATTTGTGTCCTTATTGCTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 - chr3L 14365029 5' - blood 350 2 51.49 AACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 + chr3R 9833036 5' + Tabor 6865 2 51.49 AGGAACTCCAATTAAGTGCAACTTTTGTTTTCTTTACATCATTTATATGTATAAGATATACTTTCTGTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr3R 25876227 5' + flea 4762 1 74.26 AAGCGCAGAGAAAAATCATCGGAAATAAAATGAAGAATGCTTACACAAAACACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATG:1 + chrX 17338631 5' - I-element 4967 1 60.40 GTCGACTCGAGTCGAAGTGCAAAAATGAAAAGGTCTAAATTGCAAATGAAATGCAACCGAATCAGATAAAATACAAAAAAAAAACAATAAAAA:1 + chr3R 30099762 5' + G2 3075 1 54.84 GGTAGCTCTGCTCTTCAATCTCCCGTTGCAAATCCCGCAGAGAAGCCCCAGGTCAGGACCAAAAACTATAACAATATCGGCACCATGCGAAAAATTCTTGT:1 + chr3R 28776965 5' + 1360 278 1 75.25 TAGTGTAGTGTTTGCATACCGTTTTCTGTCCTGACGTTCATACGGACAGACAGA:1 + chr3L 21613579 5' - INE-1 126 1 94.44 AAAATTCAAAGTTCTTAGATTTGAACATCCCAAATTATTTACAGGATTTGCAAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACA:1 + chr4 232033 5' + diver 5914 2 49.50 ATATCAAACACGCTTGTGTTTTTGATTAGTTGGTTAAAATTTAACTAAACTGTCATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACG:1 - chr3L 23087666 5' - 1360 3242 1 61.39 CTCAATGATCCGTGTAAGCACGGAAAACTCAAACCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCT:1 - chr2R 21424730 5' + F-element 4220 1 75.00 ACAATCTAATACTACAGAGCCAACAACAACCGCAGAACCAACAACAACCACAGAGAACACAACAACGACAGAACCAACAACAACCACCTAGCGCGAGG:1 + chrX 12968902 5' + F-element 4470 1 55.10 CATTCCCCTGTCGCAGGTGGACGAGCAGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCA:1 - chrX 18639276 5' + Doc 314 1 79.21 TTGCAATATTTATGCTTTTTGCTCTTTTTACCCGCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCCTTATTTATTAACGACCTCCCCTTAGTAATAAAACATTCGGGTGTAC:1 - chr3R 7672028 5' + Q-element 550 2 66.34 AGGCGTACGTGTGATCCTGCATGATGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAG:1 - chr3L 14010389 5' - 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Q-element 494 2 67.33 CCTGTGCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:1 - chr2L 3245008 5' + rover 27 2 61.39 GATGTGCGGAACATGCTGCTGCCCAACTGTCGTTGGCTGCACTTGTTATCAAAAGAGGTTGCTTGTGTCAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATG:1 - chr3L 2875873 5' - 1360 3228 1 61.00 TACATNCAAGTACGTGGAGCTCGTGACTCGCCAACTGGGTGACAGATAGTTGCCAGATCAGCGGTGCGATCGTCATTCGGCCGCGCGCTCGTTGGGCGCG:1 - chr3R 15446581 5' + Rt1a 287 1 55.00 GAGGGTTTCATTGGCCCCAAGATCGGTCACCCCACGTATCTGTATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCC:1 - chrX 6084887 5' + GATE 337 1 57.43 CGAGCACTTCCAATAACCATTCAATCCGGTCCTCCTCCTGGATCTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGTTGATGCC:1 + chr3R 6144041 5' - rover 6896 1 57.43 TAACCGGTTAAGGTTTGGCGATGTCAGAAAAAATATGAATTCATGGCAGCCTAGAATCTCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAA:1 + chr3R 23595241 5' + jockey2 3125 1 63.37 GTAAAAGGGTATACTAGACTCGTGGAAAAGTATGTAACAGGCAGATGGAATCGTTTCCGACTATCAACGAAAGTATATCTATTCTTGATTAGGTTCAATAG:1 + chr2R 4618504 5' + INE-1 85 1 83.17 CTATTTCTTTTGCAAGCTGGTTTTTGTCTATCGAAAACTATTTCGTTGAAAAGTATGTATGTAAGTCGCATTTAAACTTGCTGAGTAACGGGTATCTGATA:2 + chrX 16255006 5' + INE-1 546 1 91.09 ACACGAGGAATTCATATCAAACATTTAGAACACAGTTAAAATGCTGTTGACACCTAAATGTTTATTACTTTTTGATTTATTAGGTTCGTGTCTAACAATAC:1 - 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F-element 4521 1 69.31 GCTGCTTCTGTGTGTCGAATCAAAACATTTGTGTATGCATGAGGTCTTTTTTGTATCTTTAATTTTTTCCCTGACCTTTTTTTTGTATAATTTCTTTTTT:1 - chr2R 17896558 5' + Tc3 78 1 77.00 ACAATGGATCCACCTGGGCACCTGGTCCCACCGAAGTGTGCACCTAGAAAAAAGATTGTATCAGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGGGT:1 + chr2L 5496775 5' - Stalker2 7563 2 71.29 AGCCGCTAGACTTGGACATTAATCGATAACACTTGAGTATTTTTTCATGTTCCGCAGGCGAGCCATTAAGCAACATCAGTCCTAAATTTCAATGTTTTTCT:1 - chrX 4471674 5' + HeT-A 5789 1 70.30 ACCGGAAGGCTCTCAAGGAACTGGTCCGTTGTTACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr2L 1353802 5' + I-element 9 1 70.30 CATATTTTGAATGGAACGTATAGATCGTAATGTTTTCTCATAAAAGTGCCATCACTGAAAATCGGATCTGCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAA:1 + chrX 7526328 5' + 297 375 2 75.25 CTCCCCAACCATCGCACTTCTTGTTTTCCATCGCAGCCAGCGCTTGTATTGCACAATGGCACTTTTTTCTCTGATGTAGATTGGAGGCGGCTTAGGGGTCT:1 - chr3R 22893892 5' - Fw2 198 1 66.34 CAACAATGGTATGTCCAACTCACCCAGACCTCCGTTCTTCCTGGAATTCAAATATGCTGAAAGAAAACACTCGAAGGAAAGCCAACACTAGACTTTTCGTA:1 - chr3L 15208210 5' - 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Tc1-2 1171 1 56.44 GTCGGAGACACGGCTTTGAAGTGAATACAATTAGTGGAGCTTTGACAGCTAGCGCTTATCTAAGGTTATGATATTTCGCTTAAGATGGCTGTTCCAATGTC:1 + chr3L 7786904 5' - BS4 378 1 63.37 TGGCTGGACCAAAAAGAAAGCTCTTCAGTGGCGCAGCAGCGTCATCATCATCATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGT:1 - chr3L 18274779 5' + 1360 3230 1 55.45 TCGCACTGTCTCCACGCTCCAAGCCCAAAAAAGTCAAAAATTTGATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGCCTAAATACTTT:1 - chrX 11280626 5' - Tc1-2 210 1 72.28 TTGCAATTGAGCCACAAAAACACTTTGGGATTGTGACAAAATAAAAAAAGCCAGCAATTATCGACGACTGCAGTCGATTGCACTCAGTTAGATCTCAATTA:1 + chr3R 25460046 5' + Ivk 5170 1 65.35 GTTGACAATTGATGGCTGGCAATGGAAATGGCACGGAAAAATATTTGCCGGATTTCATTAAGCGTTTGCAGCCTGTTGGTCGGCTCATCTCATCGACCTAG:1 + chr2R 19990649 5' + Chouto 6029 1 62.38 GGGGAGTTTGCAAACTTTGCCGCAAGCTCCAAAGAAACGGCTCCGATTGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAG:1 + chrX 22747870 5' + Doc 492 1 53.47 TGCACGGTTCGAAACTAACTACAGCCAACAGCTAAGCAACAAAACTACATATTACAGGCTTTTGACGACTACGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATAT:1 + chr2L 226833 5' + Helena 380 1 57.43 CGCTTGAATTTCAATACACTCCACTGCTTTTCTCTCAGTGTGTCGGCCATCGGGGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCG:1 - chrX 5564700 5' - F-element 372 1 57.43 CAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2L 6605571 5' + blood 7056 2 76.24 TTTTTNCGGTTGATGAGTGCCAAACTCTGCATTTTTAAAGCTTTTCTCCACTATATCTGAGCGGCCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCATGTAAGATTGT:1 + chr4 116917 5' - flea 265 1 69.31 TACACACGCACACAAGCAGGCAGCCCTGCAAGCACACACACACAAACACACACACACACACATTCAA:1 - chrX 1509758 5' + accord 187 2 65.67 TAGCTGTCAAATCATATTTTAATCTGTTTTGATTGCTGACTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTT:1 + chr3R 30939207 5' - Tirant 335 2 59.79 CGGGCACAGGATGCTTGGAAAATGTCCGTCCTTTCTCTCTTTTGCCAGCGGCAAGGTCCCAGGGAATTGAAAACTCTGAGAAAGCAGACGCGTGAATATGT:1 - chr2L 13690394 5' + invader6 4790 2 70.30 GTGGGGGTCTCTTATCTATGGAAATTATTTTGGCCCGAAAATTATCTTCTTACGCAAGTACGCACACGTATACACGTTATCTTGTTTTCACTCACAGAAGC:1 - chr2L 3777925 5' + 1360 3246 1 77.23 GTTATCTTTTAGGATTTGTGATTTTATAGTCAGCTTAAATATGTGGCCACTGTTAGGCTCCGGGAGGGTGTGATAGGAAGGTCTGCTACCCATGGCATTCC:1 + chrX 14581468 5' - G-element 4048 1 48.51 GCCACTAGTAGACTCACTATATACGAGTACATATATCCTGTGGCTCCAGGCTCTTTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGGGCTACAGCGAA:1 - chr3R 22660433 5' + 1360 117 1 59.41 CGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAG:1 - chr2R 21421078 5' + springer 41 2 70.30 GCGAGGTGACAGCGAAGTACACCAGCGCCATGGCTGACATATTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGA:1 + chr3R 9749686 5' + HMS-Beagle 182 2 59.41 AGTGANGCGCAACGAATTTCTTAATGGTGCAATTTGGCGTTTTATGTTTGAAGTTTAGGCGAATGGCGATTTTCAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATAT:1 - chr2R 19891889 5' - 412 270 2 79.21 AGTGGACATTCAGCAGCTAAATAAATGTGTTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTA:1 + chrX 601071 5' - Juan 289 1 71.29 TGGGTGGTGGGCGTGGCGCAGCTGCGAGAGAGCGAAGGCATGTCTCTCTGTCGCGGCTGCGCAACCTTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGAGTCAGGC:1 - chr2R 11450851 5' - Chimpo 272 1 68.69 ATTTAAAGGCGTGCGAGATTCAGAGATCCCGCTCCTTGCGGAAAAATCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGCGGTCGCCATTTTCGTTTT:1 - chr2L 21206448 5' + Max-element 408 1 75.25 GTAAATATTTCACAAGTGACCGATTTTTGAATACTATTTGAGATGAGGATTTTTGACACTTGTTTTGGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1 + chr3L 21637313 5' - Bari1 1699 1 67.33 AGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr3L 11696456 5' + blood 7037 2 52.53 TAACTTAACGATGCCGCCCGGTTTTATCACCTGCCCACTCACCGTGCTTCTCTTGGTTGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGG:1 - chr2L 1602678 5' - accord 44 2 59.41 TCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1 + chr3R 26331639 5' + G-element 26 1 53.06 GGTGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 11832971 5' + roo 49 2 75.25 CGCAGCCGACGATTAATAGAAAATTATTTCACGTTTGCCTGTTTGTTTAATTTTATTTTTATGTGTATCTGTGCGTTTTCTGAGCATTTTTGATTGCGATC:1 + chrX 11421814 5' - Porto1 4330 1 79.21 ATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCC:1 - chr2R 5173207 5' - Stalker4 7336 4 53.47 ATAGGTGGAAAATAAGCAGCACAGGGTCACCCTGTGACTTCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATC:1 + chrX 2087782 5' - roo 8916 2 60.40 CATAACGAGAGCTTTCTCCATTTATTTCCATTTTGTGGGCTGATACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAG:1 + chr3R 19546548 5' + F-element 375 1 58.42 ATATCGTTCTGAACCAGAACGTATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 - chrX 2766823 5' - mdg1 7426 2 60.40 CATTGCAATTAGAGTTGGAAAATTAGTTGAGAGAGAGAGAGAAAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATTATAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAAC:1 - chr3L 4298095 5' - Cr1a 238 1 69.39 AAACAGACGACCAAAATAGTCACCGCAGTTAAATATCAGGTAGTTCACGACGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGGGGCTTCT:1 + chr2L 356245 5' - F-element 404 1 54.46 CACATAAGATAAACAATTATTAGAACCCCAACTTCTTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCGCTAT:1 - chrX 22000027 5' + Quasimodo 6917 2 72.28 TACAGCCGTAGTGGGGGATATAGCTTTGCAATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2L 12843430 5' + roo 1 2 74.26 AAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 11240909 5' - roo 9017 2 80.20 AGGGGGAAAAACGCTGCAGGTCTCCCGTACTGGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTA:1 - chrX 22484089 5' - 1360 3149 1 68.32 CAGACTCTGAGTCTGATGCGGCGCCTAAGAAGCCAGCGACAGCTCCTGCACTAACAAACGGCACAGAAATCGACTAGTTAAGGCACTGTCCAGAGCTC:1 + chr3L 21833301 5' + BS3 1523 1 64.29 TTTAACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 - chr2R 8198529 5' + F-element 40 1 54.00 TCATGTGGGCTATGCCACCCGGAGAACCCGTGTTGATTTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTAT:1 + chr2L 20832675 5' + Quasimodo 7178 2 70.30 ATTGTTTTATTATTGTTTTTATTTTAGTAGTAGTTTTACCACAATTTATTTTGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAA:1 + chr3L 3947344 5' - Doc4-element 492 1 69.31 ACCGAGTGGAATGATGTGCTCCGAGCCAAGGGAATAATTGGGCCCAAGGCGAAGGAGGCGGAGATGATGATATTCTCATAATTGTTATAATGTTAATTGTT:1 - chr3L 11992833 5' + BS3 1634 1 64.36 TACCGACTAATGTTAGGCATAAATAATGCAGCAAGGGACAAAGAAGCAACCGAGGCAAATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGT:1 + chr2L 7566621 5' + Bari1 209 1 57.43 AGATAATAAGTGCATATGCATATGTCGTAGCAGTTCTCGAATGCAATTTTGAACTTAGTTCGATTTAAAATAATATACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chrX 3697213 5' + jockey 4676 1 77.23 GTTGCACCTTGTTTTTGCTGGCTCGCAAGTGGTTTGATTTCTTGTATGCTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAA:1 + chr3L 13262768 5' + Burdock 192 2 53.47 CATAAACATAGAGTCTGTGCCACGAATCTGTATCTGTATCTGTGCCCCTTTCCACGATCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTTCGCTCGT:1 + chr3L 14595030 5' + R1A1-element 3 1 65.35 TAACCAAAGAACTAATTTAGAATGTTAAAATAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2R 5267331 5' + pogo 43 1 75.25 GCTCGTAACTAGCTAAATATCTTTAATACACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTAT:1 - chr2L 1329967 5' + roo 270 2 72.28 ATATTCTAGGGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTTGAAGTATGTAACAGACAGAAGGAAGCGTTTCCGACCAGAAAAATTATGAAATTTCGCA:1 + chrX 22707480 5' + INE-1 515 1 67.33 CTCCTGTTTGCTGGAGTTGAAATCAATCAGAAAAAAGGGTTTCCGACTATATAATGTATATACATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGAACTG:1 - chr4 1121498 5' + INE-1 98 1 77.23 AGCAACAAAAATCAGCCACCGCAGGGATTTTATTCGGTTCGTTTCGGTGCCCAAAACAAAATCCCCAGGATGATTACCGGCTGCGAATGGTACGTAAGGA:1 - chr3L 18416733 5' + BS3 1397 1 55.00 ATTCCACGGGAATTTCGTGCGGGCCAGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACAC:1 + chr3R 29337368 5' + opus 317 2 61.82 CCTTGAATGTGTGTGTGCGTAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGAC:1 + chrX 1897988 5' - Tirant 8285 2 78.22 CAATAAATATTCAACAGGAATTGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr3L 2804874 5' + hobo 53 1 73.27 AGTCCTTGGTGGCGCATTTCAGGTGCTTCAACTCCCTGTCACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGC:1 - chr3R 6095593 5' - accord2 7240 1 60.40 TCAGCAATGGTTTCTGTCTACCAAAATTTGCCCACCAGTTCCTCCAGACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAA:1 - chr2L 22227387 5' + F-element 13 1 75.25 TGTCGCTCCGTCTTTTTACACAACTTAGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 + chr2L 6607339 5' - blood 7320 1 73.00 ATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCG:1 - chr3L 20224250 5' + Chimpo 2 1 76.24 ATTAAGCTACTTAATATCGTTCTGAACCAGAACGTATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chrX 2766836 5' - mdg1 401 2 56.44 CCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chr3R 7808966 5' + jockey 62 1 75.25 ACCCATCAGCTACTGGGTCGAGGCTATACCCACACACTGCCACTGACACACACACACACAAAC:1 + chr3R 18954443 5' + Quasimodo 35 2 90.48 AAAGATTTTTGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr2L 6605543 5' + blood 7022 2 62.11 TTTACAATTAGCAAACAAAAATAATATTCTCCGGCGTTTCACTCACACGGGGAGATAGAGCTACCTCTAGAGCAACCCCAAAAAAACCGTGTGCAAAAAAA:1 - chr2L 18826848 5' - 1360 40 1 62.38 ACTATATATACATATATATACATACATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:1 + chrX 12811908 5' + HMS-Beagle 6838 2 69.31 GGAGAGTGTTTCGTCTGGAATAGACACTTCTGATGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCG:1 - chr3L 10460197 5' - invader3 5420 2 76.24 TGGTTCCCACTTACATGATTTTTTTTCGGTGTGTGTGATATTTCGTCACTTATTCCCTTCACTTTTCCCACGCCGAAACAACAATTAATAAGATTAAGAAA:2 - chr2R 3769162 5' - gypsy12 10082 2 72.28 AGCCTCCGCCGGGCCTTAAGGCCATCATAGACCACCTCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTAC:1 - chr3R 12691380 5' - R1A1-element 5121 1 69.31 ACGAGCAGATGAACTGGTGCGTCATGCTGCCGGTGGAGGCCGATGTGCCACCATTTGAGTATTACACTAGGGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACG:1 + chr3R 23406435 5' - 1360 484 1 68.32 ATAAAAAACAAGAGAGAATGCGTTCCTCCACCTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGGCGGTGAATCGCCACGCGTTTCTGGGGAAATGGCCTGCAGACGC:1 - chr2L 21820790 5' - invader3 425 1 78.22 TTTGATTAAACGTTTGCAATGACGATCTTTACATATACCTTTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACCGTTTTGCT:1 - chr3R 14028233 5' - Bica 274 1 60.40 AGCGCGCAATAATTTTGGAAAATGTTTGTATATTTTCTTTAATTGTCGCGGGCCAAGCCCAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGC:1 + chr2L 21963859 5' + BS 4724 1 69.31 TGAGGGTCAGCAGAAGGTAATCGTCATTGGTGACCCCGCAATAAGCAAAATGCAGAACACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACTCTG:1 + chrX 3876227 5' + Chimpo 261 1 75.25 TGGGCGGGTAATAAAAATGAGTAAAGGAAAACACAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCG:1 + chr2R 22525747 5' + jockey 144 1 48.51 CTTTGGGGTCACTATATTGCTTTTGTATGGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACT:1 + chr3L 11461580 5' + Tirant 393 2 69.31 CCGAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 7808940 5' + jockey 35 1 51.49 TTATCGCCCAGCATCATCTTATTCTCTATTTGTATTCCCTCCATCTTTCAGATACGGATGTAGCCTTGGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAA:1 - chrX 15608063 5' + G2 84 1 71.29 ATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGC:1 - chr2L 9778708 5' + INE-1 567 1 78.41 ATTGAACGCATGTTTTCGAGACAAATTTTCGAAAAGATCTAACGGAAACCGAGACACAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCG:1 - chrX 6600134 5' + F-element 4497 1 66.34 CATGCATGTGTGTCGGACAAAGGAAATATTTCAAAACCAATTATTGTGATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAAT:1 + chr3R 26234314 5' - 1360 3170 1 53.47 GGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 - chr3R 5775749 5' - invader4 3061 2 55.45 CGAATTCATTCTGGTCTTCTTCACCTTTGCTTCACTTTTATTTTTGTTATTTAACCTTGCCAATACCACCTCTTTCGCTTTTCGATTTATTTATTTATTTA:1 - chrX 15024690 5' - Doc3-element 84 1 62.38 AGTTCACATCTAAAATCTAAAATACACCATACATAAAAAATCAACGCACATATAAAATTTAAAATTCAATATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTT:1 + chr2R 1000294 5' - HMS-Beagle2 7190 2 74.26 CAGCAACAGGACAACAAAAGCAATCAACTGGATGCTGGGCTGTCGAGAGCAACAGGACAACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCCG:1 - chr2L 4262326 5' - Gypsy6A_LTR 98 1 59.41 GCGTTCTTCTCTTTATTTTCCCCAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACTAATACCGATGACAGAGTTAGAACCAAGAAGATTAAAAAG:1 + chr2R 16624916 5' + Porto1 4514 1 78.22 AATGGGATCTCATAAATAACTATATATCTCAAGTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 11240861 5' - roo 402 1 68.32 CCAATTAGTTTTTTTTTTTGCGCACGTCCAAATTTTGAGATATGAATTTTCAAATAAAGTTTAAAAATGTTCGAAAATCAAAAATTTTACTTTTTTCAAAT:1 + chr2L 7470796 5' + FB 163 1 77.23 TGTACTTTTAATCGGCTACCTTCGGCCTACAGTATTAAATATTATATGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGT:1 + chr3L 9067040 5' - jockey 4725 1 53.47 CAGTTATGGAAATCGGACTACAGTTCTTAAGTTTCCTTAGCATTTTAGGCATTACAATTCTTAACTAATCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAA:1 - chrX 10644064 5' - F-element 42 1 72.28 AAATTACTCACCGAGACGGGACCCGGCTCTTGACTGCCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAAC:1 - chr3R 19072311 5' - Stalker 7154 4 64.36 CTAATCACAACCCACCCACGCGTTCTAGCAAGTGCTGTTGTGAACAAATGTCCTAGTTCTTAGTTCTAATTTGAATTTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCT:1 + chr2R 6619539 5' + Gypsy6A_LTR 183 1 73.27 AAAAAAACCGAGGGAGGGACAAAAAAAAAGGGAAAAGAAAAA:1 - chrX 10656177 5' + Doc2-element 234 1 59.52 TTCCTTTGCTGATTCAAATACACTAGGGTATTCTTTGTATCCATATGCCTAAGGCCTAAAGTAAGAATTAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGT:1 - chr2L 21301785 5' - diver2 4556 2 75.51 TTGGCTTAATAGGTGGCTCCATTTCGCATGCCTCTGCCTTATCCCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAA:1 - chr2R 16901197 5' + I-element 4876 1 56.44 CTACGCTATTCGATTTTCGGTTTTTTTTTTCGGCTTTTCCTTCGCCTTCGTTTGCTTTGGCCGTCACCGAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATTTAT:1 - chr3R 10867686 5' + 1360 3354 1 57.43 ACTAGTTCAACTAACACACACGCTAAACATATTTATACCCGTTACTCGTAGAATAAGAGGTTGTACTTGACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAAT:1 + chr3L 11194898 5' + INE-1 253 1 73.27 GGTGCAGGATGCGAAACCAATGCAGAAGTTCCAGGACGGCACAGGAGCTATGCTCTCAACTGCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCT:1 - chr3R 17058671 5' - accord 7372 2 47.52 AATATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr3R 13375934 5' + Tc3 240 1 79.21 GTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTACGTGCACAGTGGT:1 + chr3L 24796711 5' + Cr1a 397 1 69.31 TTTGGAAAGCAAGCATTTATGATTTGTTGCTGGCTGCTGGCTTGTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTAGCCTTTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTTTTTT:1 + chr3L 15952029 5' - gypsy7 5007 3 52.63 ATGGTAAAGGGATATGTTTTATTTGAATGGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAA:1 + chr2L 21811514 5' - Dm88 4435 2 71.29 TGTGTGGGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGCATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 - chrX 10555464 5' - Tirant 347 2 77.23 ATGACTTTGCATGCAAAATCCTCACATTGTTTATGCAGTTTGTCAAAATATCACATGTGGCTGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTG:1 - chr3R 7825495 5' - gypsy4 6583 2 67.33 CTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chr2R 21937523 5' + 412 7108 2 77.23 AGGCCATCCTTGTCCCATGTCGCCCACGGTGTAGGATGTCCGGAGATGGCGCACTGGAAGCGCACACTGTGTTGTCTGTCATCCGGATGGTTGGCAGTATG:1 + chr2R 15954162 5' - G5A 175 1 67.33 TAAATTTCGAAAATAAACTCTACTACAATTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2L 16252282 5' + pogo 41 1 77.23 AAATANAATATTTGTAATGTGAAACGGGAAATTGGCGAAAAATGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 - chrX 10661007 5' + HMS-Beagle 32 2 59.41 TTTCAAGTCAATTAGGCAAGTCGCCCACGTCATAAGTGTGTGAAAAAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAAT:1 + chrX 3100958 5' + invader2 4795 1 58.42 AGCCATCAGCAGACTGAGCGTCTGCCAAAAGGCCTTGAAGAGCAGGCGCAGTTTGGGCGTTAGGTTTGTCACTGGGACGGCAGTTTTTGGCGGTTTTAGGG:1 + chr3R 17810764 5' - INE-1 348 1 80.20 AATGTTTGTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr2L 16252350 5' + pogo 27 1 54.46 TTTCATACATTTCCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGG:2 + chr3L 5827849 5' + blood 7013 2 78.22 CAATAGCTAGCTATCCCTCATTTTCCCTATCTCCGGGATCTGTATTTACTTGTTGGCGTTGCCCCATAGCTGTGCGCCAATAGGTCCAGATGGGTTTCAAT:1 + chr3R 31903834 5' - F-element 4252 1 62.38 GGTGGCAGTTGTAGTTGGTAATGGGAGAGTTGAGTGCGTGTTTATGGGCATAGCGGATGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTG:1 - chr3R 8425123 5' - Porto1 407 1 78.22 AATCCTCAGAAATGAAGGGTTTTCCAGATCGACGAGTTGCCTATAAAGTTAGATTGTTGCTTATTATGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2L 6656251 5' + P-element 9 2 68.32 AATAAACAATGTTCTTGCGGCGAAAGAAATCGAATCGCTTATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chrX 15384747 5' + 412 7089 2 60.40 ATAACTTTTACTTAAAATGCGATTTAGTAATAAATGGGCATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 19198124 5' - pogo 2069 1 68.32 ATGCAGCATTTGCAGACAGCCATCGAAGTGCAAGTGTGTGTGCGTGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:2 - chr3R 14614903 5' - 1360 3363 1 53.47 GATATTTTATTTGGGGTTTTATTAGATAGACACTACAAGCTAGGGAACCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGAACTTG:1 + chr3R 24229331 5' - jockey2 3157 1 52.48 TTCGCTTAGCGCATAATAGGGGCGGATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 + chr3L 12246125 5' + HMS-Beagle 46 2 72.28 ATTGCCTCATCACCAGTCATACCCGATCACGCCATTCCTTCGTTATGGCCGTCACTTTATTCAAGGGGGGGAGGAGTTAACACATCTACATCTACTTCCCC:1 - chr3L 27382895 5' + gypsy5 6 2 67.33 GTTGGNTGAAGCACGTGAATGTTCTTTTTGTGGACAGTCCGGTGGGCAAGCAAGGACTAAAGAGCACGCAGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATC:1 - chr2L 15899958 5' + Rt1b 5043 1 63.37 CGGTCATTAGATTCGTTTCTATTTTAAAAATGTTGTTATTCGCAACGGTATCTGAGAGGAGAGAAGCGGATGCAGCTGCACACCAACACACACACACACAC:1 + chr3R 17861316 5' + gypsy3 420 1 63.37 GATGCGCCACTCCACTCCGCGGCTCAACGATTCTTCTATACAATTCTTCGAGCCTCCTCCCCTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCCCTTTTTTTAA:1 + chrX 13304404 5' - blood 6994 1 64.36 AAAACTGCGTTTAAACTCGCCAAACTCACGCACACCGCAAAACGGAAGAAGCGAAAGAGTGAGCGTGGAGGACGACGAACAATCGAGAGAGCAGCAAGA:1 - chrX 9408726 5' + Osvaldo 302 1 59.60 TGTATAAATAACACAGCATTCTAATGCTTTTATGAGTCCATAAAATCTCAGCTAACCAATAAATGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTAC:1 - chr2L 6506168 5' + Ivk 5030 1 73.27 GGTGANGCGCAATGGGGGGCGATCGTTCTCGACAAGCTGGTGATGCGTCTATGTCTCTGGAAACTATATGTCTTATCTCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTA:1 - chr3R 4823362 5' - INE-1 158 1 71.29 GGTTTNTTAGAGCTTAACAAAAGCCCATTTAGCCCTTTGACCTTATCCCTTCAAGAAAATTTTTTTTAAGTGGTTTGCCATACAAAAGTTATATTCCACGA:1 + chr2R 3142645 5' - transib1 405 1 53.47 TTTGAATCCTACTTAGTTACGCATCGTTTGCCTGCACCATTAAGTAAAATGCCACATCGTGGGGCCAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACA:1 - chr2L 20553315 5' + Circe 282 1 57.43 CGGCTGTTTTTAGCCCTCGATACGCGAAAAATGCCATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATT:1 + chrX 2642475 5' - Stalker4 96 4 65.35 GGTGGGCGGGGTGTTAGCTCCATGAGCTGCCAAGCAATCGCCCTTGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCAGCG:1 + chr3L 13153106 5' - gypsy4 6354 1 56.44 CTTTGATCCCCTACTTTCTGCAATTTGAAATGTATTGTATTAAATCCAAACTTATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGT:1 - chr3R 10171791 5' + diver2 4598 2 53.47 GTTGTATACCGACATTTTTTTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3L 15099964 5' + Tirant 8115 2 65.35 GTCGCGAAAGCGGTGGAAAAGCGGAAAAACCGGGGGAAAATCGGCGGGCGGTGGAAGGACGAGGGGGGAAGGACGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGA:1 + chr3R 28931374 5' + Rt1b 4958 1 69.31 GACTCTTAACGCTCATTAGTTCTCTAACTCCGCCAGCCCCAACTCTCAACTTGTTTTCTCACACACCACACGCCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCA:1 + chr2R 14318920 5' + Quasimodo 68 2 79.21 ATAAATAAGCCATAAAGCCGCCAGCCAAGTGCACGACTGCTCGATCGGATCTAGTTCAAATTAATTAATTCAAATTTGAATTTGAATTCGAATTTCGAGCC:1 - chrX 1404035 5' - Rt1a 303 1 58.42 CATGTAATTAATTATCAACACGCGCGAGTTATCAACGTGGTCCTGAGCGTGGAGCGGGCGTGGCAACATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACAGACAG:1 - chr2R 1890482 5' - INE-1 131 1 57.43 TCGGGNACACGCATCATTGACTTGAAGGCTTTTCCACACACACACACACATACAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAT:1 - chrX 17049631 5' - Stalker2 386 2 60.40 GTAAGCAATGGTTTTTTATTTGTGTGCTCGCTAGCTAGAGGGTAGTGCGTGTGTGTGTGGCAGGACGATTAATCCCTACTACATACTCTATGCATAACAT:1 - chr3L 22642627 5' - G4 3739 1 63.00 TTCTTTTCTAAGGCAAAAATGTGTAATAATTATGATTGAAGGGGCTCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 + chr2R 20053934 5' - blood 7333 1 54.46 ACGCAAAAAGGCGAATGCAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3R 25814693 5' + 412 7075 2 57.43 TCCCATTTTGCCGACGGCAAATAGTAAAAATGTAGCGAGATGTTTTTGTAAAGATTTTTCTGTATGCTTCTCGCTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCG:1 - chr2L 8829739 5' - invader1 142 2 60.40 CATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGCGTTGTTTTTGCC:1 + chr2R 22529301 5' + jockey 196 1 68.32 ATATTATTTCAGGTGTATATGATTAATTAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 8640868 5' - roo 9026 1 80.20 CAATAAGCGAGAAAATTGAAGAACAAAAAAAAAAGGTCAGGCTGTGCTGAAGAGGAAAACCTAACAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTC:1 - chrX 12502717 5' + springer 8 4 58.00 GCCGGCAGGCTAAGATTCAAGTATCTGATTCACTTTCGGTTTATATTTTTTGGGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGG:1 + chrX 10198757 5' - G6 1931 1 55.45 GGGCTCTGCAATCCGGTGTCGATGCGAATGCCGATACTAATACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACA:1 + chr3R 28665020 5' + I-element 5079 1 59.41 AAAGATTGCATTAATTTTTTAGCATGTTAGGATTCAGTATGATTTCGAAGCCGAAGGAAGGGGTCGCAATAATGGCAGAAACGACTGATTTCGTTAAAAAT:1 + chr3L 18663924 5' + hobo 471 1 77.23 TTCCATCGAGGAGAAGATCCTGCAGCGACAGACGCACAAAAAATCCCTGTCGAGCACCATCATTGACCGACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAA:1 - chr2L 2990573 5' - flea 146 1 66.34 GCATCCGGTGGTCACAAGCAAAGTGGAAACTCGTCTGCTAGCTGCTAGTTGCTACAAATTTGTCAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 16372382 5' + roo 8672 2 68.32 CCAGTAACTTTCAGTAGCCCCCTCTCCTAAGCAACCCTCACGCCCTACCATCCTCTTATGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTAGATC:1 + chr2L 14125541 5' - Tabor 7180 2 67.39 CCAGGAAAGTGACATTGATGGCTTGCCGACGAGCGAGAGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAG:1 - chr3L 22584406 5' - Idefix 189 1 62.38 CTCGCCGATTATATTTGCACGCATGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2L 10635296 5' + roo 50 2 75.00 AATGTTGAAATTTTACGCCTCAACAGAATATCGATTAGAATTGTTCAATTTCAATTATCATCCAGGCGACCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACA:1 + chr3R 26806929 5' + Porto1 4375 1 72.00 AGAAATTGGGATATACACAAGATCTTACCTGGGAACGACCTGCAATCGATGCGAATCTTAAATGCCCTGCACAGCTAGGATTTGGCGGCCAGGCGGCCG:1 + chr2R 21545685 5' - gypsy12 455 2 76.77 CGGAAAGCGGAAGCCCAGGAGAAGCCCGCAGAGAATAACAAGATGCGTAACGGCATTGGCTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr3L 14195271 5' - 1360 3333 1 66.67 CAGCCACTAAGAGTAAGCGACGTTTTCGTGACCTCAGGTGGCAAATATACGTTGGCGCACCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr3L 7316393 5' + jockey 17 1 69.31 CCCACAGGATAAAGGAGGTTTTGGGGGTAACACTGCCATTCAAGTAAGTTTCAACACAATTATAATGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACA:1 + chrX 18044698 5' - R2-element 3386 1 70.30 GTTGCAAACTGTTGGGGGAATGGCAATTCAAGGAAACCAATTTAAATTGAGTTTGATCATCGTCCCAGCTGCCATAACGATAGGGCAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr3L 2822296 5' + Transib5 16 1 81.19 ACGATGAACCCGGTGGTATAGGAAGGCTTAAACTCAAAACTGGCGCTTGGCATTACAGACTGTGAGCTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTC:1 + chr3L 14641143 5' + baggins 5213 1 54.46 GTTGCAGCTGAGATTTCGAACTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCC:1 - chr2L 17797734 5' + R1A1-element 4874 1 79.21 GGAAAATCTCAACAGCACTACAAGAAAATTCTTCAAAGGCAGCCTTCTTTCTTCTTTGCGTCTTTATGGATTTTCTTCTCCTTTTAGTTATGGCGGCAGCT:1 + chr2L 5636033 5' - TAHRE 267 1 57.43 GCCGTTCCGTCCGCCGGAATCTCTCACAGTAGAATGCTGCAAAAAGTCCTTGCAACCGGATGTTGTGCAATAAAAATGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAG:1 + chr3R 7470857 5' + X-element 4313 1 76.24 AAACTTCCTAAACGGTTTCCACAAAAACACAAGCCTATCCACACGCCCTAAAATCCACGCACACAAACGCAGCTCAAGTTCTGGGCTGATCAGTACCCATG:1 - chrX 12787451 5' + Quasimodo 249 2 73.27 ACAACAAACGCATGGTTTTGTTGTGGATAAAGAAGTCATAAAAACAATAAAAGTTTTATATTGACGGTGTTTAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr3R 8185282 5' + Doc 14 1 68.00 TGTATNTGAACAGCAGTCGAGCATGGCCGATTTGGCCGACGTGCCTAAGACTTCGAACCATATGTATGTACATGGATATGTAGGTTATATATATTTGCCAC:1 + chrX 14900320 5' - accord 7268 2 83.17 ATAAAATAATACTTATTGCACCATGAAATCACAAAACAGCTAAGGCCAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGC:1 - chr3R 14654177 5' + HeT-A 6050 2 57.43 AACAACGAACAACGAGGCAAAGTAAAACTGGCCTGGCCAATTCGAAATTCGAATGCATCGTCATCATCATCATCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3R 14282719 5' + P-element 4 2 76.24 CGTTGNTACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 - chr2L 1353776 5' + I-element 35 1 61.39 AGGTCACTAAATACCAGCCCATCAGCGAGAACATAAAGGTCACGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGG:1 - chr3L 21838868 5' + R1A1-element 73 1 58.42 GAACGTGATCATCATCGCTCAGTAGACTCTGCGAACTCCGCTGGCCTTGCTGCATTGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 16372489 5' - roo 9053 2 59.41 GCCCTTCAACCTGCCTGTCGTCGTTGCGATAAGCGACGGTAAATGATTTTTCGATTTCGTATTAATTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTA:1 - chr2L 1321351 5' - R1A1-element 5322 1 77.17 CTATGCTAGGATGCTTTGCAAAGGTATTTTGACTTTAATTCCTGACATGTATACTATATACTATGTATACTAACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCA:1 + chr3L 23072220 5' - 17.6 492 1 78.22 CAGAGGAGATAAGGGCCGAAGCTGTGAAGAAAATTGATTTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTG:1 - chr3L 20662114 5' + X-element 4409 1 61.39 ATACTGCCACGTGGCACAAATGATGTGAAGGTCGTTCATTACGGTGGCGATGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGC:1 + chrX 22690129 5' - HMS-Beagle 6809 2 54.46 TGTCGTCGTTGTCATGTCTACATGTCCTGCGTCCTGTATTCTGCATGTGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATTTCA:1 - chr3R 29373427 5' - Doc2-element 4410 3 52.48 ACGAAAGAAGCGTTATATTTCGGGGGCTGTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGAATGTTGGGCGCCAGTTAATAGATTTGTGTTTTTATGGATG:1 - chrX 10775189 5' - gypsy7 5459 2 69.15 TCGTTGTCCTGCTCTCTTTCCTTGTGCGACTCCAACTCGGCATTGGAGCAACGCAGGGTGAGTTCTGTCAGGCAGCAGTACAGAGGCAGTACAGCGATTTT:1 - chrX 9257293 5' - 3S18 5716 1 75.25 AACTGTCTCAGCTGTACGATTTTCTCGACCTAACAATAATCGTTGCAATCTCCTCTCTAACACACTATTCTTGACAACCCGATCGGACCTCACTTAGCTGC:1 + chr3L 14358810 5' - invader4 2878 2 57.43 ATGGTTGTCTTGCCTACCGGCAGATAGTTAGAGGTGCTATATCCCACGGTAGCCCTCCTTTGGCGTCAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2R 5640433 5' - roo 401 1 71.29 GGAGCAACAACTGCACTTGGAATCGAATATATGTAAGTGAGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCTGTGCCAC:1 + chr3L 15305614 5' + micropia 477 1 60.00 GGAATATTAGGGCCTCTGATTTCGTTTATCCACAAGAGACCAGACCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAGATAATA:1 + chr2L 13404293 5' + invader4 418 1 71.29 TGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAACAGTGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTG:1 - chr2L 13702396 5' + Stalker4 313 4 79.21 ATTTCATCAACTTGGTCCAATGCACAGAGCCAACATACGGGAGTACTCCTTATCTATAGTTCTGATTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATG:1 - chr3R 12174981 5' - Rt1a 4733 1 72.28 AGGGTAAGCTACATGGATCTGGAGCTCTTGACAACTGATAAGCGCAGTGTAATTGTAGATTATACAGCACGCAAACATTGAGAGCGAGCGCGAATGTTTGC:1 - chr3L 3485161 5' - diver 403 1 79.21 AACTTAGTGCCATACAGGAAGTCAGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCT:1 + chr3L 16266038 5' + Burdock 6184 2 74.26 CCCACATAACAGGCTGTTGTTGCAACAGCTGCTGTTCCTGCGTATCATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTAA:1 + chr3L 2085718 5' + hobo 2481 1 55.00 GTGCCATCCCGGAACAGTACAAACCATTAGAAAAAACTGTCTTTTTTTAACCCGTAACTCGTAGAGTAACAGGGTTCACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 - chr3L 22908781 5' + INE-1 13 1 68.32 TTTGTTTTTCGAATATAGATATCATAATTTCAAATGTTATTTTATTTTGTGTACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAAC:1 + chrX 21668531 5' - Bari1 1683 1 55.45 TTTGATAAAATTCGCAAAATAAAAATTGAATCTTCTGAAGGAGCTGTAACGAAATCGAGTCTACTTAGAGTATGACAATAAGTAAATTTAATAATAAATCT:1 - chr2R 5607834 5' - G4 3798 1 70.30 TCCGTCTGCATGGGATTCATTATGTACATGCATACATATGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 + chr2R 6146982 5' - Burdock 221 2 71.29 TTGCTAAAATAATGCAAGAACAGCAACGAAAAATTTGACAAAATTTGATGCGCTCATATCCCCGAAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACC:1 - chrX 14157420 5' + F-element 275 1 66.34 GTAAACTGAAAATAAATCAGTCATCCGCTCGGTTGACCAACTGCCCAAGTTAGTTTGCTTTTCTGTCTTTGTATTTCGTTTACTCTCGCTTTCGTGCGTTG:1 - chr3L 21840077 5' + Cr1a 217 1 53.47 ATTCGCGAATTAACCTCTTAATGTATAGTACGTTACAAAAAATGCATTTATCCCGGGAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGC:1 + chrX 10280802 5' - rover 114 2 59.41 CAATTTCCCAATAAGTTCGCCAGTGGATTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTC:1 - chrX 17432534 5' + hobo 405 1 73.27 GATTGGGCAAGCTGCTTCTGTTGCTGATTGGCAAAGTCGAGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCA:1 - chr3L 14069120 5' + Doc 4358 1 60.40 TTTGCAAATTTGTTTCGAATGTTTGAGATTTTTATCTGCGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chrX 14505518 5' + hobo 4 1 74.26 TACATACATACTGTATGTTCATATAAGTACGTCACTTTAAACATCTGCCTTCGTTTCCTTTAACCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTTAAC:1 + chr3L 21821414 5' + Tc3 317 1 61.39 CCCACAGAAGGACTCACACCCACACCCGCAGTGGCAGCCACAGCCGCACAACCATGAACCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAA:1 - chr3R 31630954 5' + Quasimodo 7084 2 61.39 CGCCCGACCGGCAATCCAATATCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 16554826 5' - roo 9016 2 78.22 GTGGANAGCTGGTGGAAAACTGGTGGGAATGTGCAGCAGCTGGTCGTTGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTGGCCTCTGACGACCAC:1 - chr2R 9333220 5' + HMS-Beagle2 7030 2 63.00 AGCGCACCGGGAAGGGGAAGGTGCTGGAGGATGCGGTGGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACATTCCGCCCCCCTTGCAATCACTG:1 - chr3R 28339356 5' - GATE 8213 1 62.38 TGCAGGCTTTAACGGAATTAATAATGCCCATACCATATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCT:1 - chrX 5142961 5' - Quasimodo 6948 2 63.37 CGCATCCGGTGGTCACAAGCAAAGTGGAAACTCGTCTGCTAGCTGCTAGTTGCTACAAATTTGTCAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:2 + chr3R 16372381 5' + roo 8671 2 69.31 AGTGTCTACGGCTCCTGGCCATATATGGCGAATCCTGAGGCTGGGGCCGCTGTCAAAGGATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATAGA:1 - chr3L 21802436 5' - 17.6 7071 2 54.84 CCATGGGATCCCTGGAAATGTTGCACAAAATATATACGCCTGCCTTTTTACACCCCGTCAGAGGATTCTGTCTTTTTTTTTTATTTTTATTTTTA:1 - chr2L 5415343 5' + hopper 150 13 77.89 CCGTTGAGCTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 + chr2L 19090031 5' - opus 487 2 67.33 GTTCTATTTTCTGCTGATGCTGACTTTGTGCCGATTTCATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGAAAACATTCAAGGGTTTTTTGAATGTCCCTTT:1 - chr3L 22543417 5' - HB 424 1 64.65 CGAAAGTTTAGCATTTGCATATGTACATAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr2L 9346215 5' + Transpac 4964 2 73.27 GTGGGACAAAACCGGCATTACAGGAGGGTGCGCAACGAGTGGTCACTGCCTAAGGATTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCT:1 + chr2R 10270507 5' + R1A1-element 280 1 55.45 TCGAGCAAACGAGACAGGATTGTCGCATTCGCAGTCTCCTGCGTGGGTTCCACATAATCCTGCACGGTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 - chr3R 23701014 5' - mdg1 7452 2 72.28 ATCCCGGCGTGAATTGAACTGAATCATCGGTTCGACCGCTCTTGGCATCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATTTTTTTTT:1 + chr3R 16128076 5' - transib2 2650 1 58.42 GTGTGTGTGAGAGTGTGTGTATTAGTTAAGTTAGTACGACTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chrX 5796730 5' - hobo 2902 1 67.33 CAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1 + chr2L 22319264 5' + Transpac 15 2 60.40 ATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr2R 1000403 5' + HMS-Beagle2 20 2 63.37 CATAAGCGCACTCTGGCAAGCGGTCGGATGACTTATGGTTGTCCTGCCCGAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTA:1 + chrX 20813266 5' + Stalker2 7212 3 55.45 TGAGTCCACCCAAAACAAGCAGATTATGTTTCGAGCATTCCATGCCTTCTGCATGAAGGGCAGCCTAAGTACGACGGATTTGGCTGTCGTAGGCCAAGCCC:1 + chr2R 9197625 5' - BS3 1327 1 65.35 GGCTTCACTGTGCTCCTTTTGTGGGCGGTATATTAAGCACACACAATGCCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGG:1 + chrX 15532313 5' + Doc 4522 1 56.44 TGTCCGGATATCAAAAAGGTTGTTGTAGCTTCTAAGTCTGTAATTAAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGTTATTATTG:1 - chr2R 8113707 5' - Tc1 1213 1 58.42 GCAGAACAAAACGCCACCGGAGTGGCTAGATGTTTGGATAGCTGTATGGCTGGATGGCTGTACGGCTATATGGCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr2R 22455029 5' + hobo 3 1 70.30 GGGTATCAGCACAGTTGAAGCTCTACAACGAAGACACTAAGATGCTGAAATATTCTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTTAAT:1 + chrX 7768736 5' + Circe 72 1 58.16 AATTTNATGTTAGCTGGAGACCCAGTAAGTACTTCCGTTTATTAATAGCCGAGTCAATTTGCCCATGTCCGTCTGAAAGTATGAACGTCGAGATCTCAGGA:1 + chr3L 13094742 5' + INE-1 138 1 72.28 CATGCTTGAAAACGTCCACATTTTCGGCATTAACCGCCGGCTGTTCAGCGGTATTATGCGTGCTAACAGTATCCCACTTCTGATGTCGGGTTAAGAATATC:1 + chr3L 4426204 5' - micropia 459 1 70.30 TCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTA:1 - chr2R 4879018 5' + G-element 37 1 59.00 AGTAGAGTGGTTTGCTTGGTGATTTGTTTTGTGGTTGCTGTTGTGGTTTAGTCTCATCTTACAAATTGGTATTTTTTTTTGTAATCTTGGCTTTTAGACAG:1 + chr2R 22935380 5' - HeT-A 5877 1 64.36 GTGTCTTAGTAGTTAAATATTGCCGGGTATAATCAGCTTAAGGGCTTTTTTCCTTACAAGCAAGTTGACCCACAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTG:1 + chr2R 7639510 5' + Stalker3T 102 1 76.24 GGGTGCAGTGGAGGATGGGGAGTGTTAACCCGTTGACTCGACAATTTTGCGAAATGAACCTCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACACGGCGA:1 + chr3L 22663855 5' + Tc1 496 1 60.40 TGATTATATTAAACAGATAATTACGTCGATCTGGCTAGGTCCATTTGTTTGTCCCTCTGTACGTCCGAATGAACGTCAAGATCTCAGGAACTATAAATGCT:1 + chrX 11949852 5' + INE-1 150 1 76.24 GAGTCAATTGTTTTTTAGTCCCTTGGGTTAGAATGTGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGG:1 - chr3R 31031111 5' + Circe 53 2 72.28 CGCTTACAAACGTCGGCAGAGACCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATAGT:1 - chr3R 5086765 5' + Chimpo 188 1 78.22 GAAACTAATCGATTTGGATGGCGACTAGCTGTAAGTTATACTGGGTAGTGGTCCTGACCGGATATACAGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATAT:1 - chr3L 20929125 5' - Bica 4847 1 78.12 ATCTGCACAAATGAAGCCGATTATGGTGCAAATACAATTTCTTTTTTCGCCGGTACAATGCTTTCCCCGACCCATGACTAGAGAATTTTTGGTCTTCGTTT:1 - chr2L 3419862 5' - Tc1 333 1 70.30 AATCCATTAATCTACGCTACACACTAATCGATAGTGGGTGAATGTTAGAGTGTGGTTACACCGGGGAAACAAAATCCAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATT:1 - chr2L 13799552 5' + 1360 3166 1 72.28 GCCCAGTGACCAGAATCCATCGACGGCCTACCAGGAGCATAATGATATTGAGCTGTACATTTCATCGATGAAAAGCAGAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 17602151 5' + Doc2-element 240 1 65.59 GATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTC:1 + chrX 21087585 5' + mdg3 30 2 54.46 AACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAAAACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAA:1 - chr2R 4879003 5' + G-element 50 1 71.43 AGCATGTTCATGCTCAACGCTGAGTTTGATTAACAGAAATTCCAAGTCAGCCAAGTGTGCGTATTTTGGAGGGAGAAGTCGAATAAAGAAATTGTGAAGTT:1 - chr2L 13313075 5' + invader3 5420 2 73.27 GAAGCGCCCGTATTCTGATGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 - chr3L 1857643 5' + GATE 8265 2 45.54 TGCGATTGTATGGAGCGTTTACATTATGGCGTAGGTCAGTGTTGGACCTAATATGGCTTTTATTAAAAGAGCCTTAGTTGCCATATGGAGTTTGATTGAGT:1 - chr2R 12115865 5' - G5A 2366 1 75.25 ACTGTAGGGATAATGCCTTTCGTGGCTGAAGTGGGAAAACTGCAAAATGACGTGTTCAGCTTCAACACGTCGGAGTACAACATAAAAGGGGAAATTAACA:1 + chr2R 25169892 5' - hobo 372 1 93.00 AGCAGGTGGATGTAGTACTCTGAGCAGCCATCGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGC:1 + chr2R 16401748 5' - 412 7371 2 69.31 TTGGTCCTTATTGTCCTTGTCCAAGAGACGGCAACCTACTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGAT:1 - chr2L 770427 5' + I-element 426 1 77.23 GTAAAGTATACCCCGCCTGTCGTCGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAG:1 + chr3R 15667393 5' - Quasimodo 7093 2 76.24 TGCTCCAATCTCAGCGCATCCACGCATTCGCGAAATATGACCCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAACATTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCA:1 - chr3R 14938418 5' + gypsy4 126 2 75.25 AGTTTAACCCTCTACTCCAAGGTACAAGTACCGTTTTCCTAAACTTGGTTAAAGTTCTTTGAAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACC:1 - chrX 10996550 5' - Quasimodo 345 2 67.33 TTCTCTTTGTAAGGTTTTCCTCTCACCCTATTTGGGATTTTCCAGCGATTTCACTTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAG:1 - chrX 11652205 5' + roo 9022 2 68.32 CTGCACCTTTTCTTTTAGCCGGTGACTTTCTTTTCGCTCTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTG:1 + chr2L 12666532 5' - HMS-Beagle 6607 1 61.39 AGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 + chrX 17049565 5' + Stalker2 50 2 71.29 GTTGCAATTTTCGCCGTCTAGGAGCGGCAGAGAGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCATCTTCTGAAGCAGCG:1 - chr2R 10959687 5' - gypsy4 162 2 66.34 GCACGGCATTCTGTGGCCCAAAGTCAGATATATCCCATGCAAATACTAGACAAAAACCAACAAATAGCCAAACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 21268628 5' - roo 9055 2 82.18 GGACGAAGCTGAGCTGAAGCTGAGCGTGAATACGTTTCGGTTGCTCGTTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAA:1 + chr2R 5808581 5' + Stalker 298 4 58.42 GAGTTTGAGTGATCTGCTGAATTCTGGTGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCTCTCTTACGCTCTCTCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCT:1 - chr2L 17031707 5' + GATE 76 2 72.28 GGGACATTAAACAATTAGTTTTTGATTTTGATTTTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTCGC:1 + chr2R 6624671 5' + invader1 3933 2 67.33 GTAAACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATA:1 + chr3R 14832388 5' + blood 7029 2 59.00 AAGTTATTAAATTTTTATGCACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr3L 776166 5' + 1360 28 1 56.44 GAACGAGCCGAGGAAAAGCTAAAATGTAATAACTCTTCTTGGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr2L 12991400 5' + hobo 35 1 60.40 TCAATGCCACTCCACGCTGGCTGTGCCAACTTCCTGTTGCAGCAACCACTACTACCCTATATGGACACGCCACATACACATATACATATATACATATTTAT:1 - chr3R 31278293 5' - G3 4503 1 86.14 ATATGATGTAGTAGATAATCACTGGACTTCTGCCAGAGCAACGCCTTCCTCCAAAATCGATTGTTAAAAATGGCGTCTCTGGCGCCTCGTGCCGCTGGCTG:1 - chr2R 23208726 5' - aurora-element 396 1 67.33 TTTCAAGTCCGCTCCTGGCGAGCCTCCCCTTAAAACATTGGCGTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATTCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGC:1 - chr2L 11806094 5' + Q-element 603 1 73.27 AGTCAATAAAAATGTTTTAATCATATAACAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3L 18076314 5' + roo 47 2 73.27 ATCGACTATAAGGGGACAGGCTGTATAAACTCAGCGTCGACGAGAACGACCTACAACCATGGAAGCTGTGCAGAAGAGGAGCCCTCATGGACTACACTGAT:1 + chr2R 5205496 5' + Rt1b 4919 1 78.22 AAATCGTTAATAACACATACCAAATGGCACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATTTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATGTATATAT:1 + chr3L 13166482 5' - gypsy11 32 2 74.26 TTTGTTTTTGGTTTTTTTTTTAGTCTGAGCCTAACCATGGAGAGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAG:1 + chr3R 26093270 5' + G2 441 1 56.70 ACCCAACTCCATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAC:3 + chrX 17049525 5' + Stalker2 7258 2 69.31 GCATTTGAATCATATAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAA:1 - chr2L 988904 5' + gypsy7 5013 2 73.17 CCGAAATTTGTGTGTCTCTGCCCATTTTCATTCTCACTTTTTTTTTTGACTGCGTGATTGTAAAGAGTTAAATTCTTTTGTATTCTAAAATTTAAATCAT:1 + chr2L 13120984 5' + Tc3 395 1 65.00 GAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGT:3 + chrX 17049558 5' + Stalker2 7291 2 64.36 TATATGATTTTCTTCCCTAGACGCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3L 14364928 5' + blood 7013 2 74.49 AAATCCAGCACCTTTATTATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2R 13280143 5' + jockey 33 1 61.18 GACTCAGACCAGTCAAGAACCCAATGCACTGAGCCAGAATTTTATTGGGGTTCATGGTTCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAGGAGTCTGT:1 - chr2R 22100440 5' - baggins 5279 1 77.23 TTATCACAGAAAGGTCCGTTCCCAGTAAATAACCTCGATTCGAGGCGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2L 6644347 5' + hobo 28 1 51.49 TGCACGTGCGGATTATTGAGCATCGGATTGTTAGCCATCGGTGGCCGCGGTGGCTTATGTTGCTGCTGTCACTGTATGCGTAGAAAAGA:1 - chr3L 14797961 5' - 1360 143 1 74.16 CGCTTATACAAAGTATGAGGAAAGTTTGCGAAAGACTTCATAGCTTTGAAGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTAT:1 + chr3R 19448390 5' - roo 82 2 64.36 ATGCAAAACTACTTTGTTGTTGTTTCTACTTTGTTTTCTCGATTTGGTTATCATGTTCACAGAGAGACATAAGGTTTTTAACACATACAAATATGTGTTAG:1 + chrX 13860813 5' - Porto1 113 1 63.37 CAAGCACACTGCAAAGTTCTCATTATGGAAGTCCCCTTTAGGGCGAATAATTTTAATCTGCTAATTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCG:1 + chr3L 15676016 5' - 1360 430 1 74.26 GATTTTATTTGGGTCAGGGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCACTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGATAAATTTCAAGCTTTTATAGTTCCTGAG:1 - chr2L 12480776 5' - INE-1 153 1 78.00 ACTGTACCCTGGTGCACTTGTTGTGCCTGCTGTTTTTGCTTCACACGCTCCGGGCAGTAGAATGT:1 + chr3R 24226072 5' - gypsy4 111 2 58.46 GTCGTCTGCTCTCCCCTATCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGT:1 + chr2L 21051116 5' - F-element 291 1 81.00 TTTCGGCTGTTTTGCTTGGCTCCCTTCGACTGGTCTTAACCAATTTTGGGCAAACTTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTATCACTCTC:1 - chr3R 18112778 5' + Cr1a 281 1 59.41 GGCAAGATCAAAGCGGTACTGACTGCCTGAAAAGAATTCACTTTCTTTTAGTCTTGTATTCATTGGCATAATTGTTCCCCATTATCTATCGATATCCCAGA:1 - chrX 7544354 5' + INE-1 496 1 59.41 AGCCCGCAAATTGAAGTTGAGCGTCGAACGTGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCA:1 - chr2L 796718 5' + jockey 290 1 69.31 GAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr2L 22719630 5' - 1360 3349 1 74.42 TTTCGTGACTGCGTCAGACATTCCTTGTAGTTCCGTCGGTCAATTTTCTCGCCGATCGCCGACGATGGTGCAGCTTTAATTGCATGACTTGCTGTTGAGAA:1 - chr2R 5999401 5' - G6 1589 1 75.25 CGTAGAAAGAATATAAGCAAATTAAGTCAATTAGTGTGCAACTTTGACGACTTCTGACATTCTGAGTAGTGGGTATCTAATAGTCGAGAAACTCGATTATA:1 + chr2L 19688019 5' + INE-1 565 1 77.23 ACCAAATGGTTTAATATTTATCTTTCTCTTATCCAATTTTCTTATTAATCAATACACACAATTTGAATTTGTATTTATCATTATTTTACTTTGGTTTTATT:1 + chr2R 4287682 5' - F-element 4672 1 65.35 GAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chrX 10555434 5' + Tirant 8147 2 72.41 ACCATGAAGAGCCCAAAAAAAAGGCATGTGAAACATTGAACTCTTCCAGAATAAAACGTGTTCTACTACCACGGATTAGTCTGCCCTTTCTTTCGGGAACC:1 + chr3L 18867213 5' + aurora-element 43 1 72.28 GAGTGGTCATTATGAAGAAAGCCCCTAAGGCGGTTCAGATAGATTTGAGGCATGACACCCGTCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGT:1 + chr3L 9060928 5' + roo 209 2 68.69 GAAAGTTTAATTTTGCCAATAGCTCTTGAGATTTGCATACCAGATGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:1 + chr3R 10490311 5' - transib2 2820 1 75.25 GATAGTGACTGTGGTATGCATTTCTCATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 - chr3L 14005655 5' + F-element 18 1 60.40 AACCCCCAGGCAAACTTGGCTAAAACGCAAACTGCACAGCCCAACCTAATTATGCAATTTCAACTCTCTCCATTCCATCCACACACACACACATATACACA:1 + chr3R 16029494 5' + accord 7034 2 63.37 TCGAANCACCATTTATTCCTAATCCGCAACAGCTCACCGTTCTCCCTAACCGGAGGATAGTATAAAATATTACACATTAAGTAATTAATAACTAGACAAAT:1 - chr3L 6634323 5' + G5 4701 1 64.36 TAATAGTAATTAGCAAATAAATAAGCAAAAGTTCAGTTCGACGCTAAAAAGCGCCCAATCACCGCAGTAAAATAAAGGAAAAATAATCAAGATAGGAATGC:1 - chr2R 24411163 5' - Circe 6953 1 70.30 CATTTAGATTGACCCATCCAAAATCATACGAAGCATACGCTGACGTCTGCTTGTTTAGCTATTGTCTAACAGGGTGGTGGCGAGG:1 + chr2L 2736722 5' - G6 1833 1 55.29 CAGGCTGTAATTTGTGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATT:2 + chr3R 9193588 5' - roo 9038 1 58.42 ATGTGGGCATGATTATGATGCAGACGGGCATGGTCAACCAAGGCATCACGTCGGTGATGAATACAATGGAGGGTACTGTAAGATTGGAAGAGTAGTTGATG:1 + chr3R 24698198 5' - jockey2 51 1 75.25 AAAGACGGGGTGGAAACTGTGTCACTTCCGTAAATGAAATCAAAATTTTTTTAATTACCCATCTGGCGACATGGGTGCATTGCTCAGAAACATGTAATTTA:1 + chr3L 5743221 5' + roo 8791 2 72.28 ATCTCCGTTAGATGATGATGGTAGTTGTGATTAGGCATTAAGTCCACACACTCAAACTTGCCACCACACGAACACACACACACACACACACTGTG:1 + chrX 9399702 5' + accord 258 2 67.37 TCATACCGGGATTCGCACCATTGGTCACTTGCAAGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAG:1 + chr3L 6531708 5' + Doc2-element 4520 1 66.34 ACGCCGCGGATTGAGCTGAAGACAAATGATGATGCATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTAT:1 + chr3R 12903358 5' - 1360 332 1 75.25 AGAAAGGCGGCGCAAATTAGAATTTTAATGATGAAACCCAATTAAAGTTCCTTAAAATGTGAAAATGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTT:1 - chr2L 19845345 5' + F-element 133 1 70.71 GAGGGCGATGGAGGTTTGAGTGGGAAATAGAAATAGAATTTCTGCACAATTTGCCATTGAGATATGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCCGAATCAATACGGC:1 + chr3L 11746987 5' + hobo 144 1 69.31 CGCGAGGCACTTAAACTTAATACAAAAATGCGAGCGGAATTGGAATTGAAATTGAAATGGGAATGCAGCTGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 + chr3L 22039892 5' + diver 27 2 74.26 ACTTTATTAACGTTCATCAACTAATTGACTAATTTATGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr2L 15997959 5' - 412 477 2 62.38 TGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 5932104 5' + jockey 33 1 50.00 TTAAAGTCAAAGTGATTAGTACAAGTACACAGTACTTTGGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTCCTTTCTTTGTA:1 - chrX 10323448 5' + Chouto 105 1 66.34 TATTTAATTTATTCAATGACTTCATGTCATATCTGAAAAAATCTTTGGCATGAAATCGTCTTCGGCTCGTCTTCTGGCACGTCTCTTGTTTTTACTCACCC:1 + chrX 1016855 5' + 1360 3242 1 60.40 TTCATGCTCAACAACGATTTTGTGAAGTGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 26294489 5' - roo 361 2 71.29 GCTAGTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3L 22564796 5' + blood 9 2 68.32 TAATATTTCGGGGGTTACGTTGACCCTGTTTGCATTTTGTGAACGGTATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2R 6715055 5' + pogo 20 1 55.67 GGGCAGCTGGATACGGTGCGTACATGTTGGAGAGATTAAGCTCCAGGGCGGCCAGATACTCATCCTTGGTTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAAT:1 + chr3L 8906546 5' + G6 1836 1 69.31 TTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCT:1 - chr3R 2689428 5' - diver2 4473 1 63.37 AATTTTTAACAACTGTAAAGGTTTTTTATAATAATAATACCAGCAGTAATCATATTCGAGTTCAATTAGCAGGCGGCTACTTTATTTTTTCTTTTTTTTTG:1 - chrX 10276496 5' - gypsy7 5006 1 55.45 GAGGACAAATACGAAACTGATACTTCATTTACAGGTTCTTACTGACTGCATGCACAGCTGAAGTGCAAATAATTGACTACACCTCCCTTTTTATAGAAATG:1 + chr3R 3636404 5' - Stalker4 6937 3 79.21 GATACACCGTATACCTTTGAATAAGGATACAAATTAAATAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACAGGGGGTTC:1 + chr2R 5779507 5' - springer 7472 2 74.26 AAAATTGAGCGTGGACGGACAGAAGTGCATAAATATGTATGTACACAGAGAGAAAATAACGTAACTAACGTAAGGTATTAACAAAGACACTAGAATAATAT:1 + chr3R 28841989 5' + Tc3 241 2 75.25 AATCCCAGGAGGAGCAGGAGCATTCCATAGCCCGTGCAGAAGTTGATGCCGCACAATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAG:1 - chr2R 9080543 5' - F-element 284 1 61.39 CCTAATTTATACAGTTTACGCTACGAAGTTGTCAATATGTAGGAAATATTCTTAAGTGCAGCTTATTACAAGTTGCCCAAAGTTCTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 16008038 5' - HMS-Beagle2 490 2 82.18 GAGCGACAGCTACGGCGAGGAGAGCAGAAGATTGTTATTTATGTTGAGAGGCACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTAGTCTGGCAGAATAAGTA:1 - chr3L 16306736 5' - Gypsy6A_LTR 243 1 78.57 AGATTATTTTAGAGTTTTGGAGTTAATAAAGAGTAATATTGTGTATAGCCCATTAACTACCTCAATATTTAAACAAGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAT:1 - chr2R 4905068 5' + R1A1-element 11 1 78.22 AACAAATTACTTTGACAGCACAAAGTTCTCAAGTGAACAACCTGAACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAA:1 + chr3R 14027491 5' - pogo 1658 1 55.45 ACGGGTTACATTACATTTCCCAAGCCATAAGATATTTTGTATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTT:1 - chr2R 5954255 5' - I-element 4970 1 61.39 TAACTAAGTCTTTTGCGGAACTGCTACGCCAGCCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTTTGCAAAAATGGAAATAATAAATGTTGTCTGCTTTTTTAAA:1 - chr2L 16069102 5' + Cr1a 446 1 66.34 TATATTCTTGATCGCTCTTATATCTTAGAGGGATTCTTACACATTGGGTTAAATTTCTTGTTTTCAGCTACTCGTATACTAGCTGAGTGACGGGTATCTAA:1 - chr3R 2558701 5' + INE-1 544 1 59.41 ACAAAAATGAAGTGAGCAGTGGGAAAAATGTGTATTGATTCGGCGTCAATTTGGAGTTAGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGA:1 + chr2L 1945137 5' - blood 121 2 63.00 CATTAAAATGCAACAACGCAGATCTCAGCGTTTTTTGCTATTACAGACGAAAATTTATTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTA:1 - chr3L 95042 5' - hobo 2693 1 63.37 GGGGTNAAATTGGAGGAAGGCAGCAGTGGTAACCACTTTGCACCAAAACCAGCCAACTCGCGCCAACGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCG:1 + chr3L 14498943 5' + F-element 4503 1 65.35 ACGCAGCAAATGATTTGTTTACATTCAAACGAATGGTTCTGAAAAATGAGAAATATGCGAAATGTACTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAG:1 - chrX 15384835 5' - 412 7537 2 69.31 AGTTTGTTTTATTCAATTGATTATTTTTGTATGCAAAGAACTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 - chr3R 14913217 5' - blood 7354 2 59.41 TCACGAGGCGCTGATAAAGAATCCCAAATCGGGGGATCGTAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr3R 17123543 5' + opus 158 4 60.40 ACATANACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGG:1 + chr3R 31996560 5' + mdg1 7356 2 71.29 GTCCGACTTCCTAACCTTATATTGAATACCAACCCCAAAAACCCGGTTTCACATAGCTGGTGTTCACGCAAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 - chr3R 3843152 5' + Max-element 8255 2 59.41 GGGAGGCGGTGCGTCAAGTAGGCGTGGCTGGGTGGGTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGT:1 - chrX 5814081 5' + rover 167 2 64.36 ATATTTGTAGCTTACCCAAGTTTCTTGGCATGGCTTATAATATAGTTTGCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 23343744 5' - roo 9046 1 55.45 GATGTGTATCTATGAAATACGTTTTATTGAGATTTAATTCTTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAA:1 - chr3R 10775727 5' - mdg3 5308 2 60.40 TAATTAGCAGCATTTAGACGTCGATACTGGCCAAATTGGGAGACCAAAGAAACTTCCACAGCAGACGATATGCCGACAGACTTAGGGCCCACCCGAACACG:1 - chrX 1314205 5' + G5A 2622 1 66.34 CATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chrX 2090286 5' - roo 9030 1 63.37 TGGCTTTTTCGGGTTTGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr3R 17495744 5' + opus 7022 2 60.40 TTAGACTGCTCCAGTTTCGAGCTGCATCTCCCCATCACATTAAAAATGGGCGTCCTCGTCCATGTCTATGTTATCAAGGATTTGCGTT:1 + chr3L 10911370 5' - Chouto 6272 1 69.32 CCAAAGGATATCCGCTTTAACTTTTGCCGCAATTGAACAGAGAATTCGCAATGTGAAATTCGCTAGCATATCTGTGTATTTGTGTATGTGTGTGTGTCTGT:1 + chr3R 28939853 5' - Quasimodo 39 2 42.57 CGAGCTTCCTGCTCGAGACTAGAGGCAACTCCACGCCGGCCACAGCTAGGAATGCTTCGACAGCCTTGACCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATCCGTAAC:1 + chr2R 5321974 5' + 1360 9 2 67.33 CGATTCAGTTCTCAGTCGGTCAGTGCGTGGGCCTGATGCATCGACTTGTGTGTCTTCCCATTTGTGCCTCAACTGTGTAAAGATTGAGGTCCTTATGGAGT:1 - chr3L 16273603 5' - Helena 1191 1 62.38 GACGTAGCTGGTAATAATACATGTTCGCACAAACTGGTTGAGACAACCGTCAGAACAACCCCATCGTCTGCTCTCTCTGAGGCTCTCCTCAACGTAAACA:1 - chr2L 23049028 5' + McClintock 6038 2 68.00 CCCTGGCCACAAACTATATTCGGAATATATGTGCCAGTATGTCGGGTTCGCCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATG:1 - chr2R 23333425 5' + 1360 3275 1 58.42 CGAAANGAAGGAGAAGGATGGCGTGACCTTCAGCCGAATGTAACTGTTGATACCGATAACACGCACGCACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCGTAA:1 - chr3L 7698871 5' - G-element 148 1 69.31 GTGGCGTAACTAAGTATTTAAACAAAATGAATGCTTTCTTATTCAGAACTGAGTGACTTACACTTGAGATCGCGTTCGAGAAATTCTTCTTAGGGTCTTCG:1 - chr4 712713 5' - jockey 4539 1 65.35 GACTTCGTCTCTTTGCCGGAACCGGTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGTTCCCCTAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGCGAGGC:1 - chr3R 15323563 5' + R1A1-element 4900 1 71.29 TCCTTGTTCTGTTCATCCAAATGGTGACCATTAGGATGAACAGAACAAGGAGGAGAATTTAATGCTAATTGAAATTATTTTGTTTCAAATATTTTATTTT:1 + chr3L 17237529 5' - G7 1157 1 52.00 AGAAGCCATAAAAGAAAAACTCCAGCCATTTACCCCAAATACACTCAAACGCGGAAATGTGGGCAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAG:1 + chr2L 18368279 5' + 1360 148 1 69.31 CATGCCCAGCAAAAGGTGCGAATCCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACACAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAA:1 - chrX 10805097 5' - hopper 276 1 74.26 GCGATTGTCCTGGTACTATGCACCCTCCTTTCTGCTCCTCTGGCTGGCGCTCTTATGCAAACATTTGGGTATGGGCCCAGGCCCTACGCGTAAAGAAATGT:1 + chr2R 12359649 5' - frogger 2243 1 51.49 AGGCGGGCGATAAAAAATAGGGAACGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTC:1 - chr2L 17050690 5' + flea 474 1 63.24 AATGCACTTAATGGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr2L 9823607 5' + hobo 7 1 74.26 TGATAACACAACGCGCTTATTTATATTTTTTGATTCATTACAATTTACGCTGAATTTTTACTGAATCTCAGCCTTCTACCTTTTATGGTTCCTGAGATCTC:1 - 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jockey 4599 1 68.32 TTGACAGCGTTTTTGGGCCGACGCGTCAGATCCTTCGGCCTGTTTACTCCGTTTGTTTGTTTGATTATTTGTTCACAGAGATAAATAAGGTTTTTAACACA:1 - chrX 13533696 5' - Porto1 129 1 72.28 ATAGTACAACAGCACATCTAGTTAAAGAACCAGCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATACATACATACATTTTCCTAAACCTAATCTTTAAACTAAAAAT:1 - chrX 15099078 5' - Circe 7040 1 67.33 TATTAGTGTGGCGATTGGCTGCGTGGCTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCACTGTATGATGTCAATATTG:1 + chr2L 6001227 5' - F-element 4306 1 62.38 CAGAGAAGGTTCCTCTGATGCTGTGGGGGAAAGTAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1 - chr2L 3333638 5' - blood 7338 1 67.33 GTTTGTAAACAGCGTGAGCATTTCCCATACTATCAGAATGTTCGATATATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 + chr2L 17473407 5' - INE-1 156 1 53.47 ATTACATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAATCAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATA:1 + chr3R 23020833 5' - INE-1 559 1 47.52 AGAATTTTGTACTATCAGTGTTGAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3L 19051890 5' - roo 356 2 75.25 GTTTGGTGTTCGGGAGGTCCCACGCAGCAGTGATTGGTGGGCCTGGCAATTATGCGGGACTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 - chr3L 26852110 5' - diver 205 1 59.41 TCATAAGTGGAATAATAAGAAAACCAATATACTGCATACAGTTGCGGTAACAATAATAAGCGGATTTCGTGTTTGTCCCAGTGTTTCTGTATTTTCTGACA:1 + chr3R 7641001 5' - Tc1 1594 1 78.22 GACAAATGGTTTTCTAATTGTACTTTTAATACAAAATATACACATATGTATATATTCTAGCTTAAATAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACGGATAGAC:1 - chr2L 21378558 5' - INE-1 129 1 61.39 CGATTCTTGTTAGGTTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr3L 22564883 5' - blood 340 2 61.39 CAGGATGTCTTCGTTGTCAAGTCCGACGGCAACAAAGCCGTTAAGCATGTGGTCTCCACTCCCATGGCGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGG:1 - chr3L 21556623 5' + Circe 7118 1 71.29 CGCTCTGTGTGTGTATTTGTGTGTTTGCGTGCCCCCAAAGTCCCCGCACTATTAATTAAAAGTCGAAACCAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 - chr2R 16928950 5' - blood 7382 2 71.29 AGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chrX 2090275 5' - roo 355 2 74.26 AAGCCATGCAAAGCATCTGGCCGCCTCTCTTTGTGCCTTAATTAATTTTGATTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr2R 14121059 5' + I-element 24 1 55.45 TAAGCTAACGCCCCTTTTTTAATTGGTTTGTATAAATATATAGTCCTTTATGTATATATAGATATAATCTGTATTTGCTGTAAAAGTGCGCGAAATGAGGC:1 + chr2L 18961208 5' + Tc1 186 1 78.22 CGATCTGGCCGCACCCATATGGCCACGGATGCGTGAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTTGACTTAGGCTAAT:1 + chrX 15647150 5' - 412 332 2 58.33 TGGATTGGATTGGGTTACTCCAACTGGAGTGGGTGGCACAGTGGCAGTGGGGTTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTA:1 + chrX 8206995 5' - Ivk 5020 1 55.45 CTGTTNTTTTATCTTTTGATTCGTGAATGCTCGCAGAGGTTTTTTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGT:1 - chr3R 7055466 5' - Doc 4516 1 60.40 GTGCCGTTTCTCACTCGCTTTCATTGTATTCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:1 + chr3R 21799529 5' + jockey 4806 1 70.30 AAATTGTTTTTTTTTTTCATGACTAGAGGTGCAATCTGATTATTTGGTTGGTTGCTGTTTAGGTTGTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATT:1 - chrX 12649351 5' - I-element 4931 1 68.32 GTGCAATATATATTATGTTTATTCATGGCCCATATACGCCTAAAGCAACTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCCAAGCTGCGTGAGAAACTAAAGATTCT:1 - 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BS3 1337 1 66.34 TATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGCTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCG:1 + chr3R 778390 5' - F-element 24 1 52.53 TCCCTAACTTTTGTTTCGAAAATTGAAGCTTAAAGCAGACAATCTTCACTGGCTTATTAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTGGAGTACAAAGTACTCCTCT:1 - chr3L 28005624 5' + Doc2-element 4318 1 73.27 TAAGGTAAACTATCAATTGTTGTTTATCAAAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGA:1 - chr3R 14327953 5' + I-element 173 1 70.30 CAGGGGCGTTCATTTCGGCACGGATAGATGGACGGGCTGGTCCACACGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 23171436 5' + 1360 10 2 77.89 AGTCCCAAAGACTCAGACCACCAGACCGTCCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGG:1 - chr2L 8086945 5' - Idefix 415 2 71.29 TATGTNTGGGACGAAAAGGTGGCATAAGTAATGCCCACGGAGTGGGTTTCCAAAATGTGTTGGTAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCATAATTCTAAT:1 - chr3L 13743924 5' + invader1 3872 2 62.38 TCTTCGGCGCCGGTGAGTACCAGAATCCCCACCAGTACCTCAAACGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGG:1 + chr3R 21380354 5' + R1A1-element 5067 1 55.00 CATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGC:1 + chr3R 26331641 5' + G-element 31 1 50.50 GTGCACCAAAAAGCGTTGTTAAAAAAACAAAACAAAGTGATTTTAAAAGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - 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Cr1a 4149 1 73.27 TTATGTTGTTCAACTCTTTGTTCCACTTGTTGTTTGTGGTCTCTCCCTATGCCGTCACAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 697429 5' + roo 16 2 63.37 CTGAATTATACATATACATTTTTTTTTTCTTTCTAAGCAATGTGCTGAATATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2L 20129000 5' + 412 7076 2 47.52 GAGTCTGCGTGTGTGATTTGTCATCATTGGCGAGATTGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr2R 19196525 5' + invader4 2759 1 75.25 GGTTAACTCTACACTTAACTGTAATTAACTACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATACACCCAT:1 - chrX 21087950 5' + mdg3 81 2 58.42 TATACTAGATTCGTTGAAAAAAGCACACAGACATAGACCCAGCGCCAGTTTGTTGACCCATGTTGTCAAGCCCACTATAACGCCCTAAAATCGCCCAAAAC:2 - chr2L 21794173 5' + INE-1 345 1 56.44 CATCAACATCGATGAGCATCTGAAGCTGGACTTTATCCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGG:1 - chr3L 4135056 5' - F-element 420 1 64.00 TTTCCAATATTTTCCGATTTTGCTTTAAACAGCAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 6216870 5' + pogo 38 1 70.30 GGATTAAACCATCAGAGAGCCGGAAAAGCCCGGGCGCCTTTCCGACCGCTTTTCCGCCGTCAGCCTATGGCCATAACTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTA:1 - 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chr2L 18769555 5' + 1360 73 1 55.45 CAATCGCAAATGCGCTCTTAGCGGTTCTCTTGCGCTCTTTTGGGCCATCTCGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2R 11115863 5' - hobo 2921 1 51.61 ATTAAATTATAAAATAGCGAGCCATAAAAAACTCTTGATTCAACTTTTATTCTTCTTTATATGTTGGGAGAACCTTCTCCGTTATTCACTGCCCTTAAGG:1 + chr2R 14557010 5' - springer 237 2 61.00 AAGGAGCAGTAGGCAGGGGGAGAGGTGAGCGGTACATGCACACAATGGATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGC:1 + chr3L 12326024 5' - Doc 239 1 55.45 ATGGAGAGTCGGAACAGAAAAGGGGTAAAAAGGGCAATAACTTATACGCTGTTTCAAGTGACTTACGGATATTTTAGCAAAATTTTTATTTTGCTCCACGA:1 - chrX 13064368 5' - HMS-Beagle 320 1 46.53 GAGGGCGTGGCAAGGAGGGACAACAAACTTGCGCTGCGACTTTGTGTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCT:1 + chr3L 410139 5' - INE-1 172 1 87.18 AACAAATGGAGAAATTCTAATTAAAACTCCGTCAAAGATACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 - chr2L 6605625 5' - blood 7355 2 59.41 TCTGGTCTATCCGTCGGCCTATATGTCCAAGTGTATTATAAGGCGATCAGCCGACATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTG:1 + chr3R 5167470 5' - Tc1 1624 1 70.30 CGGAGTCCTTTTTCCCAGCCCGAAACGGAAGTAGAAAAAATTTAATTAAAGCTGACTACGCTGTAGGCGCCCCACAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGC:1 - chr2L 19241511 5' + gypsy6 332 2 72.28 TTACCAAAGTCGTCCCCTGGCGCAAAAGTCCGTATTTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3R 25814770 5' - 412 7512 2 56.44 GGCTTCTTTAGGAACGGCTGCAACAGCTTCGCCCTTTTCTTTTCCGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTT:1 + chr3L 257135 5' - Bica 477 1 67.33 AATGCGTCCGCCCCAGTTGTTGTTTCCGCCAATCTGAATCTGTGGTCTTGATGTCTCTCATTGCAGTACTGGGTAGACCGTGAGAGGGGGTATGTTAACTC:1 - chr3L 7514167 5' + accord2 204 1 54.46 GGCGAAATGTATCGATATGTACTTACACTTGCTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGC:1 + chr3R 28323623 5' - HMS-Beagle 103 2 68.32 CTTATGAAGAACTGTTAGTAATTTCTTTGCCGATATGTTAATTAGGGCCTAATACTTGGCTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCG:1 - chr2L 17971498 5' - HB 1298 1 74.26 TGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr2L 22319370 5' - Transpac 297 2 66.34 AGGACTTCCCAAGCATCCAAGAACGAACAAAATTATACATTATGAATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGAATTTTTGGAAACACC:1 - chr2R 5910071 5' - hobo 270 1 59.41 AGCGGCATGGATCTCAAAAAGAATCATTTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 19051853 5' + roo 8708 2 71.29 ACATATTTGTGTATTCCTGTTCTATTCCATTATCTCCTCGTCTTTTGCTAGGCTGGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGTGTAAG:1 + chr2R 7742431 5' - Doc2-element 4591 1 57.43 TGCTGTAAGTGATGACTAGCTTTCGGGAAATGCGTTTCGATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACA:1 - chr2L 13259625 5' + rover 7096 2 61.39 ATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCG:1 - chr2R 21421068 5' + springer 51 2 80.20 GAATTTAAAAAGTCAAACAACACAAAGCAAAAATGGGGAGGGGAAAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCC:1 + chr2L 7629159 5' - hopper 57 1 55.45 ATAAAGCTTTCGCAAGAGTTACGCCATGCCATGCGGAACTCGATCTGTTCATTTTGAAATTTTCACAGGATGGGTTACTTAAACAATTCGAAAGACTATGT:1 - chr2R 4900753 5' - Ivk 5200 1 71.29 TTCCAGCCTGCACGATCTCATCCGGTGGCAGTTCCACTTCTGTGGCGCTCTATCCTGTCGTGGTACCG:1 - chr2R 22392586 5' - BS3 1484 1 63.24 TAAGCTCCAAACTACAATTTGGAAGGGTGTCCATCGCTTCGTTGTTCCACTAATAAGCCAGTCTCCTTGTCATTCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGT:1 + chr3R 23147849 5' - Tirant 24 2 73.27 AATGTCGTTTATTTTTGGTTTTGGCATTTTGTTTTTTGTTTTGCAGTGTGTTTGTTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTA:1 + chr3L 17940230 5' - F-element 494 1 63.37 TAACCTTAAAAAGATTATTTTTCTCAGTGCAACAGTACAATACACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 - chr3L 8041796 5' + Tirant 60 2 57.43 TTATAATGAGCAACATATGCTGCGGGTACGCCAGCCAGCAAACTGCAACTGCAAATGCAATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCG:1 - chr3L 18176780 5' - Bica 461 1 64.36 GATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 2539302 5' - roo 352 2 80.20 TCATGTTTTATTTTTCGTTTCCCTATTTCTGCTCTTTGATTTAGTTAATGCATTAAGTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAAT:1 + chr2R 3169877 5' - 1360 209 1 63.37 TAATTNAAATTCTTGTGACAAAAGCGGTATCAGGCTGTAATTTGTGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 9193558 5' - roo 405 1 76.24 GAAGTAAGGCAGCTAAAAACGTACAAGGAAAACCCTGGAAAACTCAACCTTCTAGCTGTAGCAGTTACTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACA:1 + chr2R 2748533 5' - INE-1 124 1 61.39 GGCAGATGCACCTCATCCAACTGTTCAAGCAAACAGCTACTGATATCGCCTATACAAACTCGACTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 17624144 5' - roo 396 1 66.34 CAGGATGGCAAGACGCCCACGCCGAGGCAATCAGGCAGCATGGTTACGCACCAGGACGACGTGGTCACCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGGA:1 - chrX 4116014 5' - TAHRE 10085 1 71.29 AATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTTTCAGTTTTATTCAGAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 - chrX 22689399 5' - HMS-Beagle 221 2 56.44 CCTGCCGGGCATGGCCAGCTCCACCTTGATGTTGGCCGTGGCCGTCACCTTGGTGGGTCGCGGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGAG:1 - chr2R 8664285 5' - G-element 310 1 59.57 AAAACATTTTAGCCCGGAATTTAATTTGATTGCCCGGCTCATGAGCGTGCCAATGAATATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr2L 796743 5' + jockey 24 1 60.40 CTTCCTTTGCGATAACTTTTGTAATGATGTTAGATAGATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3L 2539231 5' + roo 8670 2 74.26 GTGCATAGTGCCATTTGGCACACAAGCTGTTGCCATTTGGCCCTAAACGATCATAGGCAAATGGATAGTTAACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGG:1 + chrX 19218598 5' - Doc2-element 4403 1 79.21 GCCCGCTAAGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 10635234 5' - roo 389 2 57.43 TTTTGTTACGCTTGTTAAATTGCCTCAAATGCTTAGGAAAAAATAAAATATAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAA:1 + chr2L 7547435 5' - blood 165 2 74.70 ATTATTTATCCAATTTATAAATAAATATCGCCAAAATTAACTAGTTGGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 - chrX 22867426 5' + HMS-Beagle 5 2 74.26 ACAGGCACTTGAATACGCAAAAAGGCGAATGCAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 + chr3R 25814679 5' + 412 8 2 71.29 TTGGCNGCCAGCCAAATATCCAGTATGTAAACCTGAATTCCAGGGCCTTTAACGACGTCTCCCAGGAGCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 20791843 5' - roo 403 1 70.71 TAATAACTGATCTTTCCGCCTCAGCTTGCCGTGTGAAAAAATAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAA:1 + chr2L 1749718 5' + 1360 483 1 79.21 AAATTTTGATCAAAAAATCCCAGAGTTATTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGAC:1 - chr2L 2264188 5' + Doc 454 1 71.29 TCCGAATTTCCGTAATGGACTTCGCGGCGTTCCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAGGAGGAGCCCTCATGGACTACACTTAAGGGAGGGAG:1 + chr3R 6960823 5' + Rt1b 4928 1 74.26 GGCTCTACTCTGATATTCTGTGTTTTTCCCGATTGGTTAGGTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGG:1 - chr3L 140117 5' - invader2 4974 2 59.41 CTTTAATTTTAAATAATGTAGGGAACCATTACAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCC:1 + chr3L 8272419 5' + HeT-A 6044 1 73.00 ATTGAGATTGGGATTGGGCAGTGGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTAACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCAT:1 - chr3R 19982186 5' - Idefix 6963 2 77.23 GCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGG:1 + chr2L 22719601 5' + 1360 47 1 74.26 CTTAGTGTTAGAGGCACGCAGCATCTCGTGCGCCAAACGAATTACCCCTGCTGCAGACACACACACATACAAACTGCGTAATCG:1 + chr3R 5414803 5' + accord 7110 2 80.95 GCCAATGTGCAGCGTGAGAGTAACGAAAAAAAAAAACAAAACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGC:1 + chr2L 306106 5' - Tirant 8199 2 60.40 TTCATACATTTCCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3L 5827850 5' + blood 7014 2 77.23 GAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chr2L 17862248 5' + F-element 52 1 66.34 CGGATCCCGGGGGGATGCAAATTATTGCATCAGCAAGGCAGTGGAAAATGAAATTGTTTGTGCGGCAACGAGGAAAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTC:1 + chr3L 460844 5' + F-element 4499 1 74.26 TGTACTCTAAAAATTCGCGGGCAATCCATTCTCAGAATGATTGCATAGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATAT:1 + chr3L 20656375 5' - roo 8686 2 54.46 AAGACGTGAGTATTATTACTCTTGTCATTAAATGGCATTAAATTAACAATTATATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3L 23099719 5' + F-element 43 1 59.41 GGGCAAAACTTCTGCCAGTCGAAGAAAAAAAAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACAT:1 - chr3R 13272919 5' + Ivk 411 1 74.26 GACATTTTAAAAATTCGTCAGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGAA:1 + chr3L 21253214 5' - 1360 2914 1 80.20 CTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chr3L 25798510 5' + blood 38 2 63.37 CACCAAATGTTACCTAATGTTTATAGGCTGATTATTTAAACCCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2L 9463376 5' - roo 9038 1 61.39 GCAACTGAAGACAGTCAATGGATTCTCGGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCCCCTTCCACTA:1 - chr2L 9032061 5' + Doc 324 1 65.96 TAACATAGCGTAGAGATGGGCGGGCGTATTATTTTCATACTAGGTTAATGAATTTGCATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAAC:1 + chr3L 20690799 5' - G5 4565 1 63.37 AATGTAGTATACTTTTGGGCGGCGGAAGGATTGTGACAAATGTCTGGTGGGAGCTTGAAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTG:1 + chrX 2679589 5' + Cr1a 451 1 50.00 CGGACNGGCTTGGACAACTCAACTATAAAGCTGCCGTGGGAGTAATTGAAATATGAGTGCAAGAAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGAGAG:1 + chr3L 20894027 5' - Cr1a 302 1 75.00 CGAAAAATGTCCAACAGAAGCAAACAATTCCATTACCCGGGCGAAGAAAAGAGAAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCT:1 + chr3L 8456281 5' - 412 391 2 58.42 CCGACATGTTACAGCCGCGGCGCAGGACAAAGCTGTGCCGTTTGTACGTCTTTGCCTTTTGCATTAAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGAC:1 + chr4 888764 5' - INE-1 145 1 65.35 TTGTAATCAAGCCGTCGTTATTGTGCGCTACGGCAGGTAAGTAGTTGTGTACTTGGGCTGAGGCCATGTTGCAGGCGCTGGATGCGCGCTACTTGCAACAT:1 - chr2L 12720796 5' - HeT-A 5637 1 63.37 TAGTAAGTGAATATGTCGTCCCGCTCATTCCAGTTCATTCATCCTATTCATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATC:1 + chrX 19016147 5' - Doc 4642 1 54.46 CACCGTGGGCGTGAGTCGGGCTAGGGGGCGTGGCACGTCTGGCATGTGTGGCCAAGTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGT:1 - chr3R 11097088 5' - mdg1 7320 2 61.39 TTGCTCAGCTATTTGTATCGCCATTCGTTTTACACTTGACAACATAGACTTACACACACACACATACTTTACTACATAGCAACAGCCATACACCAAATCAT:1 + chr3L 16800039 5' + Quasimodo 69 2 69.31 TGTTGCATAAATTGCCAGCACGCAGGCGAAACTTTGCATCATGCTAAATAGGATGTCTGGGTGCCAGCTTGTGTGGTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTA:1 - chr3R 23108782 5' - accord 7103 2 29.29 TTTGCTTCGCTTTCTCCATTTCTTTTCTCTCACCTATTTCTGCAAAAGCACACATACTTCGCTATGTTATATATATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chrX 8299776 5' - roo 408 1 77.23 ACTAAACAGCTGCAGTAAACATTACTCCGTCGGAAAATAACAAAATAAAGGTGGAGAAACATCGACTGCTGCCCGCTCCCTTAGCTCCGACAGAAGCCCCG:1 - chr2R 21282358 5' + F-element 392 1 75.25 TTAACATTTAGATTGTTATTTCAGCTAAAAGTGCCATAAAAAGTGCTCGGCAAGGCGGTCTACTGAAACTGTTTACCTTATCTCTGGAATCTTCACAATTC:1 + chr3R 22995115 5' + Q-element 18 2 62.38 TTGGGAAACAGCTGAAGAAGGAAAAACAATTTGTTGCGTCTTTTTCTCAAGAGTCTGTATGCTGAATCGCAACCCTCTACGTTTTATAGTTCCTGAGATC:1 - chr3R 4549996 5' - INE-1 150 1 64.00 GTGTGGCTACCTTTGCGGTGGAGCGCTCATGCTATTGAAAAAAAAAGGTTACAATAGGCGTTGAAGAAATCCTAAGGCATTCTATGATTTGGTGTATGGCT:1 + chrX 4646553 5' - Quasimodo 73 2 69.31 ACCCGTCTGGCCATCATTTTTCGCGCATCATCCCAGCAATAGGGGATCACAACTTGAACCCGGATAGTTTGCAGCCCAGTTGTGATTATTATTATTATTAT:1 - chrX 12358441 5' - mdg1 7055 3 82.18 TAGACTTCTTCTTTTTCTTTTTCTTAGACTTTTTCTTATTCTTTTGCTTACAATCAAATGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTACGTAAT:1 + chrX 22995714 5' + Chouto 6201 1 56.44 ATGACCCTTGATTCCCCGAAACTTCTATATAAATATCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCC:1 + chr2R 9265415 5' + I-element 5113 1 64.36 TATCCCAGATTAAAATCCTTTTGATTAAATATTGTCTCATTAAAAATTATGTAATTTTTTAATCCATAAAACATATTGTGAGGGAATACCACTCTTTTTAT:1 + chr3L 10075305 5' + copia 100 2 70.30 TGGGGACACACTGACGCCGGACAGGAAGCTATAGCTATTGTAGTTAAATAGGAGTCAAAACGCAATCGGTCATATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTC:1 + chr2R 23876189 5' - mdg1 354 2 79.59 TACGAAATATTTAAATTGAAGCTCAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAATTTTTAACACTTTGAAAGTT:1 + chrX 13577878 5' + hopper 1197 2 76.24 TAAAGGAATACAAAATCACGTAACCAATGCACCAAATGTTACCTAATGTTTATAGGCTGATTATTTAAACCCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 9463347 5' - roo 404 1 74.26 GCGAGNCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGAACTAGAGAGAGCGTGAGAAAGGGCAGCTTAGATAACGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 + chr2L 22319257 5' + Transpac 8 2 66.34 ATAATTGAGTTTAAAAGTCACTCCTTCACCATTTCTTAACTAGTGCAACGCATAACAATTCCTTGCTTAAGGCCTCACCCCTTCGTCACGTTCCCACGTTC:1 - chr3R 31010768 5' + Idefix 7054 2 63.37 CTGGAATCGATTTTAGTACATCAAAGTAGTCTCTTAAGGTTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 - chr2R 5616614 5' + 3S18 5804 2 62.38 AACTTCACGTACAACGTTTAAGTTTTCTAAGCCTACATCTTAAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAA:1 - chr2L 16758243 5' + Doc 4455 1 58.42 GATACCAAAACGAAAACATACAATAATAGAAATAAAGTTACAAGCTGGCGAAACTAAGGGATTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACG:1 + chr2R 12578727 5' + F-element 4411 1 72.63 TTTGAGCCTGATTTATGTCGTCGAGTGTCGCGGGTGTTGTGCTAGAAGCCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTAC:1 - chr2L 7581136 5' - 1360 3155 1 67.33 TGGTAGGCAGCTGGCGCGTCATGGGAGAATTATCAGCCGCGTGTGCCCAAAGGAACGAGTTATCTATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 9027889 5' - roo 9062 1 55.45 TATTATTTGCTGCATTCTACTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTAT:1 - chr2L 12760057 5' - accord 6973 2 76.24 AAGATGCGGTGGTTGTATCCTGCCAGTGGGAAGGCATGTGTGTGTCCTCAATGAGGATGTAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCG:1 - chrX 1128962 5' + R1A1-element 110 1 72.09 TATAAATGCAATTAATATACTAATGTACATCTTAGCTTTGCTGGCCCTTTGGAAGAATGTTTACACATGAAC:1 + chr3R 19450175 5' + roo 8658 1 91.67 AGTTTCTCATGCTCATGATATATGTAACATAGATTTAGTATTAATATTAAAAGTAAGTATTTTTGTAAACATTGGGTTTTCGACAGTAACATGGACTGGTA:1 + chr2R 7452545 5' - HeT-A 5862 1 74.26 GCTAAAAGTAAAACCATATTATAGTTCACGACGTATGTTGACAACTCTGGGATATAACAACATTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACT:1 + chr2R 10805727 5' + diver2 4549 2 59.41 GACAAAAGGCAAAACAAATTGAGAGCAATGCATATGCTCTGCCCGACGCTCTTTTGCATTTTTTGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCTCTTTCGTGCGTTG:1 + chrX 3534221 5' + Cr1a 217 1 52.48 AAAAAAAGTAAAATCAACGGCAAAAGAACAATAACAATATGACCAGCCAAACAGCTTGTTTAATAACAACACCAAACAGCACTGCGAAGAACGCACAAAAT:1 - chrX 4614704 5' - Cr1a 226 1 70.30 CCGTTGACCGCCTTCGATGTTGTGCGGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCT:1 + chr3R 14849799 5' + pogo 1744 1 74.26 TGGATTTGGGTTTTGGTTTGGGTTTTTCGTTTCTGGTTTCGTTTTCGGTTTGAGACGGTTTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAA:1 + chrX 4528925 5' - I-element 332 1 64.36 TTTTCTCCCTATGCACTTGTTTAAACTGAGAAACTATAACTATAACTATAACTAAATTGACTTTAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCAC:1 + chr2L 19176742 5' + Stalker2 181 2 70.30 TGCTATGTTGTCTTAAACATGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 - chr2R 4901600 5' - Transpac 277 2 62.38 TACTTTAATTTCAATACTTCTTGCATCATATTTATATCATACCAACTACATTGTTTATTAATAGTCCCTGTAGTACTTTTTTTTATTTTATTTTTATTTTA:1 - chr3R 18373772 5' - F-element 4685 1 75.25 CATGGATTAGGCCAGTTTATACTGTCTTTGCATGTGTGCAGCCTGATTTATGTACAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 22675890 5' + 412 18 2 61.39 CAAAAGAGCTCAGGCCGCCAAACCGAACCCAATCCTTGTTCCCAACCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAA:1 - chr2L 5249366 5' + 1360 330 1 47.52 GAAGCCGGTTGCAAGATACACCCACATTGTTCCGTTCTTTACATTACACTCAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCT:1 - chr3L 158949 5' + 412 7445 2 55.45 AAAATGAGCTAGTCCCTCGAGTCCGTGCCCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCATACTAAAGTCACTGGAGGAAGAAAAACGTCT:1 + chr2R 24431790 5' + baggins 4994 1 74.26 ACTGACCCTTTAAGGCACGCCAGATCCTTCTCCTTCTCCTCTCCAGGATCACTCTTCACTTGTGGTGATCGTCCTTCGGTGTCCTTCGGGCCTCTTGCCGC:1 + chr4 145870 5' - gypsy8 488 1 80.20 AAGCAAAAGAGACTTGTTATGGCGGAGCTCGTATGCGTAGAAAAGAGCTATTTGCCGTAGCGCTCTCCGCTCTTTTGCTCTCGAACAAAAATTCGAG:1 - chr2R 2311467 5' - 1360 92 1 69.07 CCTGGGACACCCTTATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATA:1 + chr3R 31996542 5' + mdg1 7338 2 53.47 ACACTTGATTGATGTCTGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATTTTATGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAATATGGAAACCGTAA:1 + chr3L 4393326 5' + Cr1a 426 1 77.23 AATTAAGATGTTCATTTGATTTACTCAAATCTATTTTATCGTTATCGTTGGAAATGCGTAACGGCCATACATACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr2L 18569544 5' - 1360 3337 1 57.29 CATTTGGCAACTCAGATGCATTACCACATACTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGG:1 + chr2R 5969828 5' + flea 331 1 70.30 TACTATACTACATCATGTCAGTGTCCTAGCTCCTTTGTCCTTCGATGTGGCACCTTGACCACCGGCGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTC:1 + chr3R 14531357 5' - flea 4754 1 74.26 TTCACAAGTCGATAGTCGTGATTGGAAGAAAAATATTAAACTAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATCGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTT:1 - chrX 5570183 5' + Cr1a 4166 1 58.42 GTAAGGTGCTACAACTATCAATTACTTATATACTTGGCATGCATTATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTTTACTC:1 - chr3R 15814741 5' - roo 400 1 65.35 AGGAAAAGCCTAACTCTTTCAGTGCCAGTGAATAAAATTTGTCGGCCATGTTAATGAGTCACTTTGAACAGAATTGATTTCGGCCCGAAAAACGTCTTCTA:1 + chr3R 7927606 5' + 1360 3192 1 64.36 CCATTTATCTTTCCTTATCGCCTGTGCAACCCCTCAGCAGCACCCGGAAAGTTTTGAAATAATTTATTTATCGTAAATAGAGTGACTTTTAGCTGATCG:1 + chr3R 15024527 5' + Gypsy12A_LTR 192 1 76.77 CCGATCGAATCGAAAAGCTAAATGGGGCACTCAAATGAGGGACAGAAAGAGCAAATCGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAA:1 - chr3R 31718635 5' + Bica 485 1 61.39 GTAGATGCTGCAGGTCCCTTCTTTCTCCACCGTACGAAATCCCCCCCAAATTGCATGCATAAGGAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAA:1 - chr3R 8131933 5' + invader1 154 2 68.32 AAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACAC:2 + chr3L 24213769 5' - invader2 226 2 55.45 TATATATAACTTTTTTCTTTTTGTTGTTTAGCTCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTG:1 - chrX 8502441 5' - HMS-Beagle2 108 2 67.33 GAAAATGTAATAATAAAACGACAAATTCGGTGGGTAACATTTTCCATTTCTTGGCTGTGTACAAACTTGTGTGTGTGTCCTTCTTTTTTTTTGTTTGTTTA:1 - chrX 2811699 5' - Porto1 164 1 79.21 CTGCATGTATCAACCATTTTAGAAAATTCTATAATTTTTTTTTACCGTTGCCTCTATAATGTTGTGCAAAATATGCCCTTCACCATAGAAGTTCTTTGACT:1 - chr3R 3746166 5' + 1360 228 1 70.30 CAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCAGACGGACAGACGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACACGGCTATTGATCCTGATCAAAA:1 + chr2R 1751259 5' - INE-1 88 1 90.10 AGGAAACGCTGAAATGCAAACGAAGTTGGCCAAAAACGAAACACAACTACGTGACGAACGGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAAG:1 - chr2L 3621761 5' + 297 6523 1 62.38 GCAAGGGTGTTGCGATCAACTTCATTACAGATGATGATCGACGAATCCTTAAGGATATTGAACAGTTCTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTAC:1 + chr2L 5985052 5' + G4 3465 1 69.07 GTGGATAGTGGGTAGTGGGTAGCCGGGGCCAAAGGACAACCCTTTGTCACATTCTGCAATTTATGTTATTGTGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 + chr2R 16376783 5' + hobo 2710 1 78.57 CATCTAGTTGTTGTTGCCAAGGGGTCTTTCGATATTCAGCCCATTTGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACA:1 + chrX 3411478 5' - X-element 4598 1 67.33 CATTTNCCCGCCCTCACCACACTGACGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAG:1 + chr3R 14407017 5' - P-element 416 1 29.70 ACAAAACGCAACAAAGCTGAACTCAAAAAAGAATTCAAAAAAAGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCG:1 + chr2L 9069245 5' + Porto1 221 1 65.35 AGTTGNACACGCCTCCAGTTTCCTTTCTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTATCCAATTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCA:1 - chrX 567675 5' + accord2 7335 1 78.22 GGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr2R 19726926 5' - 1360 3361 1 53.47 TTTGCACCTTGATTCTAGGTAGGATTACTTGTGTATTTAAATATCAGTTTATATTATACGATTTCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAG:1 + chr2L 4840087 5' - HMS-Beagle2 90 2 67.33 TGCCTGCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr3R 9996380 5' + blood 26 2 54.46 TGAGAACGATTTCTTTTCGCAGATACATATTTTACTGATTACGTACGTTCCTTGCATAGCCGGAAAAAGCTCTGCACATTTGCAGAGGCCGCTATGAAGCT:1 + chr3R 4379393 5' + gypsy3 6659 2 55.45 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTT:1 + chr2L 20360644 5' - R1A1-element 146 1 72.45 GATTAATAGACCTTTTAGTCCGCCCGCTATAAAGTAAATTCCCAACCCATAAAATGCCACATACCCCAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTTGATCAG:1 + chr3L 18649613 5' + 1360 3162 1 64.36 TTTATGTACCCTCGTCTTCAGTAGCTCGAGTTTTCATTGTAGTGCATCAAAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAA:1 + chr2L 7330438 5' - 412 7256 2 50.50 CCTGTCATCAATGTATTTGCGGTTGGACGCGACTCCTTTTGCTCTGTGTTGTCAGCTGTCATGTACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCAT:1 + chrX 12965752 5' + HMS-Beagle2 74 2 76.00 GTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTCCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGC:1 + chr3R 22844256 5' - F-element 54 1 62.38 ATAGTACTTACGTTTTTAGCTGTAAAACGGAGGGTGCTTTCTAAATAAAGTAAGCATTTTTAAGCACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2 + chr3L 18076239 5' - roo 398 1 67.33 AAGCAGCGCATTTATTTATATTTACACACCGTTTAGCTACCATAAAAGGTATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr2L 20465583 5' - blood 7364 2 55.45 ATATAAAATCAAAATCTTTGGGTGGTGATACATATGTAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACAT:1 + chr3R 19408680 5' + I-element 457 1 63.37 TTCTCCATCCATTTGATTCATTTTCAGCAGATATTTTTCATCCCCCGCATATGGCAAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCAT:1 - chr3R 25527588 5' + Doc3-element 4615 1 54.46 AGGAAATGCAAAGGAAAATCCGGCAATATCTTGAAGCACAGATATTTCGTGTTTACCAAATACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCA:1 + chr3R 23633062 5' + F-element 4436 1 66.34 GAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTT:2 + chr4 1301733 5' + 1731 4338 2 47.52 GTAAACGTTTTTCCAATATGAGTTTCGGCCGGGGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCAT:1 - chr3L 15211915 5' - G6 1775 1 67.33 AATATATAAGCTGTGGGAAACGGCCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAA:1 + chr3R 17670067 5' + gypsy4 153 2 77.23 GGCACCTGGATGGCCATCGATTTGAGTGTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTTTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAG:1 - chr2L 988808 5' - 1360 3240 1 72.28 CATGTTCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTATTTTTATTATATACGGCAGGAAAATTAAATCCTCTAAAGATACCATCTAAAGTCCTTGGATGGCATGCACG:1 + chr2L 4352076 5' - Rt1a 5013 1 73.74 TGGCAGGCACAGCGATGTTCAGGGATTAAGATCAAGGTTATTTTAATATTTTTGGGTCTATGGTTCATAGTTCCCACGAGTTGCACAGAAATAAACGGTCC:1 - chr2L 12331993 5' - baggins 365 1 62.38 AATTGAATAGAATTTAATGAATTATTATTTCAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTGTAT:1 + chr3R 11103004 5' + 1360 377 1 76.24 GTTTTGTGTTGTATTGTGCACTCTTCGCCGCCGGTGAAAAGGAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTG:1 - chr3R 16290412 5' + invader1 176 2 61.39 CCTCCTCCTCTATATGTAAATAAAAAAAATCCAGTTCCCAGCTGGCCCAGCATACCGATGTATTCCTGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 + chr2L 5664866 5' + jockey 4799 1 71.29 TTGCAGCTGTTCTCATTAAAGAAGCAAATGGAACAACCTCAACAACCAAACGAAGCGGCTACTCTATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTT:1 - chr4 204079 5' + R2-element 368 1 55.45 TATGANATTGAAATTCCCGCCATATCCCTACAACTTTGCCCAGCTTGGACTGCTTTCTTTCACTCCCAGCTGGAGAGCGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 13565074 5' - accord 186 2 65.35 TTACCCTCACCCAGGTACAGAAAGAGAATTAAAACACCTAAATGTCTCTTTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 62951 5' - roo 9044 1 54.46 GGGCANAAGGGTTCAGGTGGGGTCAGCTGCGGTTAAATAATTGGAATGGTCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGG:1 - chr2L 17693702 5' + Dm88 398 1 54.46 AAGGGAATGGTGAGAAAAGTGTAGTTTTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGT:1 + chrX 7525232 5' - gypsy4 6618 2 74.26 ATAGATTGACCGCAAATTTTTAATCTTATCGGCGCGATTTTGGCCCCTGAGTTACCCCGTCAATTGTATGTATTATTATTTTGACTACTCCAGGCACCTTG:1 - chrX 4604615 5' - invader2 4680 1 77.23 CGCCCGAAACCGCAAGGATCCAACTGAATTCGGTTAGCCTGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 22455076 5' + hobo 25 1 53.00 TTTAATTTATATGCTTGGCCAACTCCTTTTGACGTGGCAACGCGGCGTGAAAAAAAAACGTACAAAAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTC:1 + chr3L 18511696 5' - copia 100 2 56.44 TTACATATAGTAAAATAAAATATTTGTAGCTTACCCAAGTTTCTTGGCATGGCTTATAATATAGTTTGCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 23343725 5' - roo 402 1 70.30 ATTTGGGTTTCTATGTACATTTAAATCAGATGATTCTCTGCAACGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCCGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - chr2R 11540268 5' - Transpac 5199 2 54.46 TTCTGGAGGTGGGCGTGTCTGACAGGGAGGAGATGAATGTTTCTGTGGTAAGCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTA:1 - chr2L 11856733 5' + jockey 4846 1 48.51 CATACGCCCGAACCAAACCGAATGCAGTGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGAC:1 + chr3R 11940255 5' - F-element 464 1 52.48 GAAAAGTCCCACAGGCGAGAAAACCACGAGCTTCATAGCGGCCTCTGCCAAAGTGCAGAGCTTTGCCGGCTATGCTCGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTC:1 - chrX 16532843 5' - springer 7193 2 78.22 CTTTATCGGGAACACGCATCATTGACTTGAAGGCTTTTCCACACACACACACACATACAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATA:1 - chrX 17049636 5' - Stalker2 391 2 64.36 CGCTTGACAATCAAATCTTGGCCTTAAATAGACGCAGTCCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAG:1 - chr2L 11388048 5' + Quasimodo 7098 2 61.39 ACGCTGTGTGCATTTTATTGTTGCAATTATCGCCCGACGACCCTTGTTGCCGCAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 22780962 5' - roo 9053 2 60.40 CATCATTGGGAAATATTTTGCACCAATCGCAGGGTACACTGAATGGATTGGATTGGCTTTGACATGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTAT:1 - chr3R 24493223 5' - Ivk 4958 1 67.33 ACACCAAGCGAAGTGTGGGTCGTGCCCCAGGCAGTACACGGACACTTAAAGCAAACTAACAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCC:1 + chr3R 20719608 5' + F-element 458 1 65.35 CATCTCATTTGATTCCCTCAGCTGTTGATTTTCCCAGACTTCAAACACACAAAGGCAGGAATTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCT:1 + chr2L 21088825 5' - invader2 175 2 59.41 GATACAAATGCGAACCCATTTCAAAAATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr2L 14536224 5' + blood 7014 2 73.91 AGCTTTGTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATG:1 - chr2R 4339493 5' - G5A 2770 1 77.78 CATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr3L 5827862 5' + blood 15 2 65.35 TATTGGGAAAGCTAACAAAGATTTTTATGTCTGGTTTAAATGATTTTCCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 - chr3R 10490414 5' - transib2 2798 1 56.44 ATTCGGGTTCGGCTCAACACTTCGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3R 22899223 5' - P-element 2835 1 26.00 CTGTGATTGTTATCGCAAACATGTGTAACTCCTTACGTTTTTGCAGCCGAGTCGCGCTGGTTCGCCTTACGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 + chr2R 11209873 5' - Transpac 271 2 72.28 ACACAACGGACTCGATCCTCACCCAAAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCC:1 - chr3L 13974411 5' + I-element 5041 1 74.26 TTATCAAACTCCTGCGAGATGCCGGCGCCACCGAGGTGCACATTCGCATTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAGAT:1 - chr3L 6912386 5' + Ivk 260 1 56.44 TGGTGTGGTCGAAAATAGTTTTGCAGCTCAACGCCTCCCGGAGAACCGAGAAGACGAGAATTTATTCCACCGATCTCTGATAAAAACCTAAATGCTGACTC:1 - chr3L 18330592 5' + gypsy12 9821 2 83.17 GCCGCGCATAAAGTGGATGCTTGGCAACATGGGTCAATAAACTTGCTCTGCGTCATATATATCTAAAGTCTGATCCTTCTAGCTTTTATAGATCCTTAGAT:1 + chrX 12806802 5' - INE-1 151 1 64.36 TGAAAGAAAGTCCCTCATTTAAAAATTAAATGCGGCAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 - chr2L 2645261 5' - mdg1 382 2 64.00 GATGAGTGCGCAAAAATGGCAGCGGAACGGCAAAGAGCAGTCGGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGTAGAGTGAAAGAGCGAGAAAGTGAGAGCG:1 + chr3L 14863007 5' - Cr1a 290 1 67.33 GATTGCTAAGCTTCTTAGCCACTCGAGGCACTCAGTCATTTCGGGGACTCCACCTTGTTAAAATCGAAATAAAGTCAAATGCAGAGCGATACATAAGTAAG:1 + chrX 16517629 5' + G3 4369 1 56.44 GTTTCCCAAGAACGGATCGACAAAGTTTTGGGTGAGCGGAGTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr2R 10697017 5' + 297 9 2 58.00 TATTGTTGCATCTGGGTCACCCGTTGCTACCTGGTTCACCCTTGCTAGGCGGCCACGCAAATAAACAGTTTTTGCCGGCTACGTAACGTCATCCGGCATAA:1 - chr2R 4816650 5' - gypsy2 73 2 59.41 CAAGTTCTCGGGGAGGCAGTATACTGATCCTGGATCCCCGAAACTCGCCGAATCCCCCCCGAATCCTCCACAAACTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 + chrX 6920161 5' + jockey 4789 1 74.26 TGATGCCAAGAAGGCACTAAGGAGAGAGATTGAGCGGCGCCTAGATTGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAG:1 + chr2R 16957794 5' - micropia 5102 4 53.47 TATAGATATGCACGTTGAAAACCTCAAAAATTACAATGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCG:1 + chrX 3264812 5' - Ivk 22 1 63.37 CTTCTCGGCTTCTCTCTCTTTTGCATACGCTTCGCCTGAAAATGGCGTCACAGTCACTGCATTCTGCACATATTCTCTCGTTCTCACTCTCTCGCTCTTTC:1 - chr3R 10532501 5' + Cr1a 291 1 60.40 CAACAACAAAACAAAAAAAACGAAACAAAAAAA:1 - chr2R 17932740 5' + gypsy7 5006 1 81.82 CATCATTTGCTATAAATTTACTTCATATTATTACGATGATGTATTTATTATTTGATCACCGCA:1 - chr2L 12237074 5' - jockey 4980 1 52.38 GGTGTTAAAAGTGTGGGCGGCGTTTGAGTGGGCCTTTTGGGGTGGCAAAGTAGGTGGTGTGTTGGATTTTCAGCTCTTTTAGCGTTCTTGGACGGTTCACA:1 - chr3R 6414267 5' - mariner2 631 1 74.26 ACCTGNCTCAGGCAACACAAATTCAAGCAAAAATAATAATAAACTATTTATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3R 26294549 5' + roo 8690 2 55.45 GTTGGCAGGCCACCTTTTCCTAACTAAGACAAGTGTGCAATGTCTTCGGTTTTCTCGACAGAAGAGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr3R 31968437 5' + FB 12 1 67.33 TTCACTCCAGACTTGATGTGTCGAAGTTGCCAGTGCCGATGGAGAGCGTCAGCAGCGT:1 - chr3L 16759033 5' + R1A1-element 383 1 60.34 CGGGTGGCGATGCTGCGGGAAGAAATTAGGCGGGCCAAGAAAAGAAGAAATCACGAAGATGGCAACAGACTGCTGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTT:1 + chr3L 3530586 5' - invader2 192 2 81.19 TTTTGCTTATTTTTATTCCCATGACTTAAATACTTATTTACTGTTTTGAGTAAACACATCAGTTATTACAATAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCAT:1 - chr2L 7005346 5' - transib3 419 1 65.35 TTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCCGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3L 22564869 5' - blood 329 2 72.45 AGATCTTAGTATTTTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAG:1 + chr3R 1047946 5' - Stalker2 398 2 73.27 TATTCGAGCTACACACTAGAGAAACACTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAATGTCGAGCA:1 + chr2L 1568301 5' - R1A1-element 5046 1 72.28 TTGTGGATAAACAGTAAACAACCAGTTGATAAGGTCCTTCAGCTGTCTTCTGTGGAGCCTTCTTGGTGGGCGAGGTCCAAATCTGACAAACATACCTCCAT:1 + chrX 16990026 5' - BS3 1303 1 74.26 CCGGTGGGCACTTGAATCGCATGCATCGATTTGGAACCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGG:1 - chr3L 11425186 5' - roo 8868 2 64.36 ACAGGATTGTCGCATTCGCAGTCTCCTGCGTGGGTTCCACATAATCCTGCACGGTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chr3R 23701001 5' - mdg1 406 2 62.50 GGAACTATAAAAACTAGAAGGTTGAGATTCAGCTTACAGATTCAAGGGACAAGGACGCAGCCCATCTCTCCGTCTTCGGATCTCAGGAACTATAAAAACTA:1 - chrX 392288 5' + INE-1 151 1 63.37 AAAGCGCAAGTGCCACTATTTTTGTAAAGAGCGTGCTGGTCTCCAGACAGAAAAGTCTGTGTATCTGTGGTGTACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACAT:1 - chr3L 10750529 5' - accord 7027 2 56.44 CACGCCCCCAATCTGCCTTATCTCCAGGACTTCCGCCCACTCACCTGCCCATTAAAAGCATAATCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTT:1 - chr3R 12882289 5' - roo 8748 2 71.29 GAGGAGCACCTATACAACATAATTCTATTGCTTTTTTAAACCCCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTT:1 - chr3L 25751341 5' + Max-element 8269 2 63.00 ACGAACCCGAGAGCACGCGAATTCTTCAGACTGGGAGTTCTCTGAATTTTACATAATAACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATA:1 - chr2L 5783543 5' + Tirant 476 1 60.00 CGCAAGTGTTCACTGTACCTGGGACGCAGCACTATAGATAGCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCAAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 - chr2R 10697107 5' - 297 6942 2 63.37 GACGGGCGAAAAAAAACTAAATGAAATTTCATTTAGGTGGTCGCCAACGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTC:1 - chr3L 12470452 5' - Quasimodo 6998 2 56.44 TCAACAAGGAGTTGAGGCAAATTGCAGACACTTTTTGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCCTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAAC:1 + chr2L 21926802 5' + Copia1_DM 97 1 64.36 ACAGAGTATTTGAAGAACGACTCAACGCCACTTGACAAATGAAAGCAGCTGCCCCAACATCCGCAGAATATTCTTCACAAAAAAAAAGAAACAAAAAAAAA:1 + chr2R 18950356 5' + gypsy7 5008 108 55.45 TGGAAAGCAGATTCCAGGAAAAGTATCAACTCCAGCATTACCACCGACTGCTTCACGAATCTCGGCCGCTGTTACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCG:1 - chr3R 23814551 5' + F-element 482 1 76.24 AATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:2 - chrX 19192434 5' + INE-1 13 1 73.27 CTGTCGATTTGCTGAAAATAAACTTGGCTGTTTTCTTTTCTCCGCTGTCGTTTCCAATTGTGTTTTAATTATGTGTGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 + chr2R 12524060 5' - accord 7029 2 72.28 ACACCTAGATAGTCTGGCTTCTTGAGATAATATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAA:1 + chr2R 13296954 5' + P-element 2829 1 42.00 CAAAGAGGAGGGACAGCAGCCAGAATTGGAGCCACTGCAGGCCAAAAAAACAAGCAACCAGGCGTTTCACTGAGGCAAGAAAATCCGCAGGCCAAGTTAGG:1 + chr3L 15621186 5' + gypsy6 7344 1 61.39 AGATTCCTGGAAAAACTGGAGATGCCACAAACCCATTTGGCAACCAAAAACGTAACGGCTATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACG:1 + chr3R 15015460 5' - 1360 3335 1 54.46 ACGGTCAGCAAAATGTTTGTTTAAACTGCGCTTTGCCATTTCGTTGTTAACAAAGTTGTTTGTTTATGAGGCGCTTGGCTTGCTGATAGGGGTGGCCGGT:1 + chrX 16862415 5' - G2 6 1 48.00 TCTTGGTTCGTGGATAATATGATCTGGATGAAGGCATTTCTTGCGTGAGTATGTATATATGTAATGCTAGCTCGCTTAAACACAGCCACTATCACCGAAAT:1 + chrX 16555917 5' - diver2 499 1 53.47 ACAATGGTAAACAAATCTGGTAATGGATCACATTATTAATATGTGTACAAAATATAAACTTATCTCATTAACCATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 + chr4 806630 5' + BS 5012 1 73.27 GGGTCCAGAAGCAGCTGTCAACGGGACCGGGGAGCAAGCCAGGTGGAGAAGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chr2L 19520859 5' - 1360 3367 1 50.50 TTCGGTGGGTTTTTATCGGCGGCGGTGGTGCGTGAGTCTTGGGCAGTGGGTCGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAG:1 - chr3L 7600938 5' - I-element 5054 1 52.48 GTATGGGTGCCCACCCATACATATGTATGTACGCGCGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAG:1 + chr3R 11731180 5' + hopper 39 1 62.38 CTACGCCACATCTCCGACGCATATGTAAAGCTCCTTCGCCTACAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCTAAACAAAA:1 - chr3R 6131085 5' + rover 7202 2 56.44 AATTAGAATTGGCTTCCCTGGGTGCGTCCCCGAAGCAATGGGGTAATACATTGATCTTGGGGGTTGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCC:1 + chr3R 6882372 5' - Doc2-element 4372 1 72.28 CGACGCAGGATGCTGTGATGTCTGGTAACTTTGGCCTAAAGGATCAGAACTTGGCACTGCGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 + chr2R 16121192 5' - blood 7320 1 71.29 ACACTGGCCATTCCCGTGCTACGCACCACATAGGCATAGCAGAAGGTCTCGTTCAGGATCTTACGCAGTTGGCTGCCCATGTTGCCATGCCCACTCTAACG:1 + chr3R 25347925 5' + INE-1 209 1 77.23 GGGAGAGCAGTTAAATAACATATAATCGCATCCGACTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 17624228 5' + roo 8700 2 63.37 AGGTAAAGAGACGCTCCAAAACAAATGCTATCAAAGAAAACGCTACTACACCACCACAACAACAACAGCCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATT:1 - chr3R 28322779 5' - R1A1-element 71 1 72.28 CTATTTATAGGATGCTGACAACAGGCACTTCAAAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGA:1 - chr2L 19847786 5' + F-element 4377 1 67.00 AGAGGAGCAGTGCTTCCCCCCAACTGGAGAGACACAGGCACAGAGACAGCCACAGACACAGAGACACCGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATT:1 - chr3L 6535129 5' + 297 6838 2 70.30 TATTTTGTCTGTCATGACAGAGGTCGGGTTGAACCTTAACCTTTCCTCTCCTTTCCCATCCTTTCCTTTTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGG:1 + chr2L 1212095 5' - I-element 199 1 68.32 GGTAATAAAAATGAGTAAAGGAAAACACAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGC:1 + chr2R 22525753 5' + jockey 150 1 43.56 TGTTGTTCTTCCTCCGCTCGTTGCCACTGGTTGGCTTCCTCTAATTTCGTTAAGTTTCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGA:1 - chr3R 31627609 5' - F-element 4389 1 59.41 TCTCCACGTGAAGTAGAGATAGGGACAATCAAAAATTGTAGAAGTAGATAAGAATAAGTCATTGTTTGCTTTTTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAA:1 + chr4 1098329 5' + Tc1 170 1 57.43 GCAGCTTTGTCGTCACGTCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTCCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 - chr3R 14139431 5' - hopper 1358 1 80.20 TCGCTCTCTCTTGCTCTGTATTTTTGTCGTTTTGTTTCATTACGTCAAAAAATTCGAGCTTTTGTGTATGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGACTTTAA:1 - chrX 2141981 5' + Stalker 456 1 76.24 GGAATTGGTTTGTCTTCCTTAAAACTTGTTATTCTGTACAAAGGGCACCCACTTAAAGTGTAAGTCGTGCGTATTGGGTTGACACGACAAAAGGTCACAAC:1 + chr3R 18643387 5' - Q-element 680 2 74.26 CCCCACACACACACACACCTGTACACCTACAACCGCATACAGGTTTTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGTCCATACTATGTACGTGGCAC:1 - chrX 9377571 5' + BS 4766 1 73.27 AAATAGTTTTCAGTGTGGCGTTCGTCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGAT:1 - chr3R 5522696 5' - Ivk 5095 1 75.25 AGAACGAGTCCAATCCCATTCGGCGATGATTTATGCAGATTTTATTAGGGTTCAGGGCTGCAATTGACTTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACA:1 + chrX 6029056 5' - baggins 4959 1 62.38 CTTTTGCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3R 12578193 5' + jockey 28 1 53.47 AATGCATGCGATCAAATAAACAATGTTCTTGCGGCGAAAGAAATCGAATCGCTTATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chrX 15384733 5' + 412 22 2 58.42 ACGTGCTGTTGGGTCAGAGGGAAAATTATGGAAATATTGCATCATGTGCCGTATGCCTGGAAAATTGTGCGGCTTTTCTATTACTCAGTTTCAATTAAACC:1 + chr2L 17315067 5' + Copia1_DM 91 1 81.19 TCCATAAAAACATATATTTGTTTTTTATTGTATCTAAAACGATGAACATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATGATTCAAATA:1 - chr3R 7805978 5' + Stalker4 7281 4 60.40 AAGCCCTGGGCTTGGAACTACAGAAACTCAATGACATGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCG:1 + chr3R 25474662 5' - HMS-Beagle 6861 2 63.37 ATGTTAAGGCCTTCCGCTCGCTCCTGAAGCTGCGTGGGTGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 + chr2L 17278054 5' + copia 4907 2 60.40 GATTCCCCTAATGTGTCTGACCTCTCGTCAAATCTGTGTAATTGGAAATACAAAAAAAAA:1 + chr3L 20033421 5' - Tc1 1478 1 35.00 GTGTGGATTGTAATGGATATATACAATATTTTGTGTCTGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGG:1 + chr2R 11383652 5' - Quasimodo 14 2 71.29 CGGCATAGTCACCAATACTTGTGCACGACCAAAGAAGATGGCGCCCACACACATGCTTACACACTCTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chrX 11042498 5' + jockey 4686 1 70.30 AACTGAATTATACATATACATTTTTTTTTTCTTTCTAAGCAATGTGCTGAATATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr2L 20129002 5' + 412 7074 2 45.54 CATAGCTTAAAGTAAAGTACCATATTTCATTGTAAGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGT:1 - chr3L 15206443 5' - Stalker2 68 2 72.28 AATAANCACTAAATGTGTAGTTGGCTGCCTTCGCTTTTCCGCCCTGCTCCTTTTTCCTCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAC:1 + chr3L 11477444 5' + Quasimodo 9 2 68.32 CATGAACGGAGCCAACCCGCCTCCGATCCCCCTACACGGAATAGAGGAGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCC:1 + chr2L 9273103 5' + 1731 406 1 57.43 CACAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAACTTAACAGACTATCAGATACCCGTTACTCAACTAGTGCAATAATAATAATTTTTCTGGGATATCGATAGAC:1 - chr2R 19947145 5' - INE-1 500 1 69.00 GGCGATGACATGGCCATGGAAATAAATTAATTTGATTATTAAATA:1 + chr2L 4965805 5' - HeT-A 365 1 86.67 AGTTGATGAGCCGGATTCATTTCGGTTGCGTGCCAAAGTCAACGGAAGGTGCGAATTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATAT:1 - chr3R 5431531 5' - blood 7105 2 63.37 TGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATG:1 + chr3L 27356085 5' - Tc3 1677 1 61.39 CTGATGATAAATTGAGGACAGCCAACCAGGAGACCGCCGAGATCAAGCGGATTATGGACCTCGCGCTAAGTGGTTGGTGTGCGTGTAAAGCTTGCTATG:1 + chr3R 22617055 5' - F-element 4451 1 64.65 TTGGCTTTCCTAATTGGGAAAGACTGAACACTTAATTAGACATAATTATTGCTGACAGAAGTTTAAACAAGTCCGTGGTAGAATGAACACTCATAAGGCCC:1 - chr2L 12857828 5' + invader3 5193 2 67.33 TAAATGACAACACATTTATTGAGAATTCTTTTAATATTCCAAAGCACACTATGTTTTGCTATTTCTTTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATA:1 - chr3R 20925042 5' - G4 3551 1 55.45 CTGTGAAAACCCTAGGGAAAACACCGCCACCAAAGTTGAAAATGAAATGCGAAAGATGGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTA:1 - chrX 14713938 5' + roo 8933 2 59.41 CAGGAGCGGGAGAGAGAGAGAGTTACCGTTGTTTTGCTATTGCCACTATTATTATTTGAAAACAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACA:1 - chrX 2354389 5' + 1360 350 1 65.35 TCTGACAACTTCCCATGCCAACGAAAGTCAAAGTCACAAATAATGAGCACAAATTCCGCTGTTTATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCTGA:1 - chr3L 9252708 5' - P-element 2515 1 69.31 TTCCGCATTCCCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:2 + chr2L 15997864 5' + 412 7075 2 57.43 AATTGACAAACTTATGGCAACGCCTTAACCCTTTTTAGCCCTTCTTAGCCCTTTTTAGCCAGCGTGTGCGGCACTCTCGTCGGGCCAAGGCAG:1 - chr3L 5858178 5' - aurora-element 3862 1 79.57 ACGCAAAAATCCTTATAAATTTCTCTGAACTTCTCCTCCTGTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGC:1 - chr3R 13460932 5' + 1360 3289 1 69.31 ACCTTGGCTTCTTCAGCGTCTCTTTTGGGTTTAGTTTTGGTCCGAAAAGGATGATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr3L 63057 5' + roo 8663 1 80.20 TCCCANCCTTTTTCTCTGTTTGACAATTGTCAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 697529 5' - roo 9055 2 64.36 GGTATGTGCTCCTGTAATGACTCCATCCGAACAAAGTCCGCACAGTTGCGGTAACAATAATATCACCATAAGCACATTTTGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTG:1 - chr3R 6552607 5' - Tc1 1606 1 62.38 AGAGTCCACTAAACAAAAGTGTAAAACATTAAGAAGAACAACAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGT:1 - chrX 10572277 5' - Transpac 5031 2 62.38 GGCGGCGGCGGAGGCGGCGGCGAGGGGGGGCGTGCCTTGACTATTAGTATCTCGATGGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATG:1 - chrX 17226148 5' + hobo 312 1 68.00 CCGCTCCCGCTTATCACTCTTCACTACGGCGCCCAAAAACCCTCACACCAGAGCAGCTAGTTCGTCGCACTCTCATGTTGCAACATTGTCGGCGGAAACAG:1 + chrX 10802282 5' + gypsy5 7098 2 69.31 ATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3L 22564814 5' + blood 27 2 56.44 CAATATGTTAGCTAAGAAGTTATGTTGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 + chrX 11060472 5' + I-element 21 1 52.48 TTTAAAACACGGTCATTTTCTTTCAGTGCAAGTCAAAACGGAAGTCAAATACCAAATACCTCAACGATGCCAAGAAAAACTTTTATACGTACCAGCTAAAA:1 - chr3R 12800187 5' + Fw2 397 1 76.24 TGAGCTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr2L 19090035 5' - opus 483 2 64.36 GGGGTTAATTTTAAGGGTGTTTTTTTGGTGGTGCAGCATAAGCAAGTTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGCAGTCATTGAGTTCTCAA:1 - chr2L 13557411 5' - Stalker 6800 2 53.47 CAAATGCATTTTTGCATTTGTGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAA:1 + chr3L 22488573 5' + roo 9034 1 79.21 TCCGCTTTTCCATAACACCTTGTCAGCTTATTGCTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATA:1 - chr2R 9408494 5' - flea 385 1 66.34 CACGATTGTGTGTTTTGCGCACAAGAGTTTAGCAGCCTTTGAACTGAAAACGAATTAGTATTTGGTCGAGTCTGGTCGAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGG:1 - chrX 15196594 5' - I-element 4892 1 59.41 GTGAAAACATTTGTATACTCGGCTGGCAAATAAAAAAGCATGCGAAGATTGAGAAGCTAGCCAAACGTAGACAGCCCTTGAAAACAGAAAAGAAGAAAAGA:1 + chrX 22926757 5' + mdg3 5091 1 56.44 AGTGGGCTCATCTATACCGAAACGAGAAGATAGAGGGAAACTGCAACAGCAACCACAGCCACCACGATACTCCGACCAGGGGGCCTACCTCAATGACCAC:1 - chr2R 11208234 5' - R1A1-element 4968 1 45.00 AATCCGCCAATCCGGCGATCGAGCTCGAACGCAAGCCCAAGTCATTAAAAACTACAATACACAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAGTTATCA:1 + chr3R 26002419 5' + Cr1a 78 1 63.37 GCAACTAAAAGTGGCAATTAATTTGACACGTTCTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTCTGCCACAATTATGTTTACATTAGGGCAGGCTGG:1 - chrX 4190282 5' - Quasimodo 6891 2 80.81 GCGATACCTGTTTGACATAGTTAGCGCGCTGTTTCTTAAGCTCGTCCTTTTGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACTTTCATACGGACAGACGTACATGG:1 + chr3R 4332403 5' - INE-1 121 1 50.50 TTTGGGCGTGGAAAACCTGAAGACAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTG:1 - chr2R 12184657 5' - 1360 3267 1 75.00 GTTTCTTATGTCTAACAAACTTTTCATAATGTAAAACATATGAATTTGATATCGCATAAAAAATGCAGTGTTGCAACTTAAGTGTTTTTAAATATCTTTTT:1 + chr3R 11201778 5' - transib3 106 1 67.33 AATAATTAACAAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 - chr3L 11887837 5' + Burdock 20 2 50.50 TAATGACAATGCCAAGCGCTTCGATTCGAATCGATGTTGGAGTAATGATGCGGGCTGTGAACAAGCTGTGTCTGCTTCCCCTTGAGGACTCTGTTGGATTC:1 + chrX 3514669 5' + diver2 4489 1 61.39 ATTTATATTGTAATGCAATGTTTATAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTAACACTAC:1 - chr3R 10445167 5' + I-element 4964 1 75.25 GAATAGTTTTGCCCAAACATAAACAAGCTTCAAGAGCAGATAGTGCGGCGGTTTTGGGCGCTGGGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGAG:1 - chr3R 20249795 5' - G2 2874 1 68.32 CCTTATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAAT:1 + chr3R 31996552 5' + mdg1 310 2 63.37 ATTAAGAAGACCACTGTACTTGAGGAAGACGACGACTTTGATCCGCGTGCGGAGGAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCGTTCTCTCTT:1 - chrX 22993845 5' + INE-1 577 1 57.43 GTTGGTGATTGTGCGCAACGCTCGGGTTTGGACCCTTTGAACTCTCAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCACGCCATACGATTTGTTGGCACACGATTTT:1 + chr2R 1880664 5' + 1360 37 1 54.46 TTTTTGTGTTTAACGTAAACTTTTTCAAATTTATTAAGGTTACGTTTATACTAATACACTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCC:1 - chr3R 556531 5' + Tc1-2 24 1 51.49 AGCCTTGGTGGCCCACTAACGAAGCTGGCTACGATGCGCGGCTGTTATTGCCAACAAAAGGTCACGCAACTAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTT:1 - chr2R 11237519 5' + Tc1 1354 1 70.30 ATGACAAGTGAAGTGACCGAAAAAAAACAAATTTTAAAGG:1 + chr3L 22359028 5' - FB 725 3 60.00 CTAGGCTTTTAGACACGTTCTACCCCCGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:3 + chr3R 5946113 5' - HMS-Beagle 200 2 72.28 ATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3R 7808963 5' + jockey 59 1 72.28 AGTCCTTTTTTGACAACCAAACCAAACAAAAAGCGAACAATAAATCAGTGAATTATTTGTGCAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGA:1 + chrX 9178992 5' + TAHRE 283 2 59.41 GGTCTCTTTGTTCGTCTCTTTAATGTTACGTTTGAATTTACAGAGAGTCTGCAATTTAATTAGACATTAAATATTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 9552227 5' - roo 406 1 71.29 CAGGTTTCTATTAGCAGCACATACAGCGCACGGCTGATTACCTTTAAGGACTTTAAAACGCAAACACGAAATTTCAACATTTTTCTGAGATATCGATAGAA:1 + chr2R 5932372 5' - INE-1 500 1 65.35 CAATGCCACAGCCGCAGAACACGTCATCGAGACCGAAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCA:1 + chr2L 12458608 5' + HMS-Beagle 6705 1 64.36 AGGGGAGTGTGAGACATTTGGATTGCGGATGGCAAAGAGCTCGTGTGCTGTCTGATAGTTAAGCAGTTAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGATTTTC:1 + chr3L 19092071 5' - FB 156 1 53.47 AGATCATTTCAAGTGTTAATCGATCCCACTCTATAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGAT:1 - chrX 389443 5' + hopper2 1167 2 66.34 TTTTTGAAAGCACCAAAACACTTTGGTCACACTTAGGTAGATACCTTTCATACAATTTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCTAT:1 + chrX 15269754 5' + HMS-Beagle 40 2 60.40 TGCGTGCCACAGTGGGCAGAGGCCGGCCGGAGGAGGCGACATTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACATGGCGACCGT:1 - chr2L 720083 5' + mdg1 431 1 57.43 CATTGCCACACTGTAATTGGCAATCGGAGCAAATTCTATAACTGATTTTCAGTGTTTGGTTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCACAATGCACTGCTGTT:1 + chrX 5158147 5' + Tc1 471 1 59.00 ATATAACTCTAATTAGCTAAAATGACTCTCAGATGTCTGTCAAATTAATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 + chr2R 19232842 5' + Burdock 26 2 53.47 ATCCGNACTCGTGTGCGTCCCTTGCCGTCTGCATGCGGGAGAGAGAGGGATAGAGAAGGCAAACAATCAGAAAAAGGCCAGTGCCTAAAATGGGATGAGTG:1 - chrX 1622117 5' + hobo 193 1 53.47 AAGCACAAACCCAAGCGCCGGGTGAAACAAATTAAAAGTAACACTTAAAATTACACCACGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAAT:1 + chr3R 26491177 5' + 1360 2997 1 61.39 AATTTGAGTCAAATTCAATTAAATTACCTAATTAATAGCTTATTTAAGCTAACGAAAAGTTAAGTACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCT:1 + chr3R 27088961 5' + mdg1 7162 2 69.31 CTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTCCGAGCTCAGAACCTCT:1 + chr2R 6438359 5' - Stalker4 7321 2 67.33 CTTACACTTGAATTGATGATGCCAATAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGG:1 - chr2L 21941534 5' - F-element 4510 1 74.26 CGCACTTTATTCTGAGGAGAATAATGAAATTAGCTCACGGCAGAATGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCAGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCA:1 + chr3R 30020516 5' - gypsy4 6665 2 68.32 GTAATAAAAATGAGTAAAGGAAAACACAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCG:1 + chr2R 22525754 5' + jockey 151 1 42.57 TTAGCTAAGAAGTTATGTTGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chrX 11060479 5' + I-element 27 1 50.00 AAAACAACAAGGACAACACAATAAACAAAACAACAACAACAAGGACAACACAGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGA:1 - chrX 12572003 5' - Cr1a 146 1 62.38 GCAACCACAAATTCGCCGGGAAACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATA:1 + chr3L 13082943 5' + Quasimodo 106 2 77.23 GAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGG:1 + chr3L 24213774 5' - invader2 5079 2 51.49 CGTTCGAAGGGGCCAATAGATAGTAATTATGCGCGTAATGAAAACATCAATTGGTGCGCCAACGCAATGACCTACACCAAGCGTTTCCCTTTCTTATTCTC:1 + chr2R 7271187 5' - invader5 3894 2 78.22 GCAAACCAACATATACTCGTACTTCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGG:1 + chr2L 19098530 5' + opus 7291 2 76.24 CATTCCCATCAAGAAATGCTTGCAAAAAGTTTTTCTTTTTTCCATTTCTGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCGCGACTC:1 - chr3L 13826333 5' + rover 179 2 59.41 TGCAGTCCGCAATTAAGGCACTTGCTCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 - chr3R 11115484 5' + jockey 4695 1 77.23 TGCAGTAACGCATACGGCCCGCATCAGCGCCTGAAACCAACCACCATATACCGATCGTTGTTGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCGTTTATAAACAGC:1 - 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chr3R 31944226 5' + F-element 328 1 57.00 CCTCTGGAAGAGGGGAGAGCAACCGCAACCAGTTTCGAGTATATTATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAA:1 + chr3L 16782186 5' - Max-element 8432 2 55.45 GTTTATTAAAACTACAGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr3R 13135700 5' + Tirant 8121 2 50.51 CGGATTGAGTTTGCGTGGTAACGTGTCGAGCATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGAATACTACAATAGGTTCGTTGAAAAGTATGTAACAGG:1 - chr4 214475 5' + INE-1 18 1 68.32 CGCCTTCGACCGCCGTCGAACTCGAAGTGCAAACGGAACCAGACTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTCC:1 + chr2L 13939520 5' - R2-element 482 1 50.57 GCAAACACTGGCAGCCAAACCAACACACACACGCATGCCATAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAA:1 - chr3L 10124620 5' + Quasimodo 6953 2 60.40 AAAAAATAAGTAGTCTGTGGGCGTGGCACATTTCTGGGCCCATTCCTCCTGAAACGCAGGTAGCTCCGTGTACTGGATACCACTCCTGATGAGCATGGCTG:1 + chr3L 1998513 5' - G2 463 1 72.28 GATAACAGAGGCACACTCGATAGTTGGATTTGATGAGACGTGTACATAGAAAGCATATTCATTAAGTACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAG:1 - chr3R 20380865 5' + Idefix 6913 2 71.29 CGATCAAGTTCTACTCTAAAATGTGGGTATGGTTGTTTGGTTTTGTGTATGTAATGATCACTAACTAAATCGCTGCTGGGAGGGCTTCGCCTTTTATTCAT:1 - chr2R 4736321 5' - rooA 290 2 59.41 GCTTTAATAAGTATCCTATTCGCGACCAATTCATGTTTGTGTGGCCTAGTTTGCGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 6644269 5' - hobo 2915 1 54.46 AACAAAATGTATCATTTCAACTGATAAGGGAAATCGATAGATACACACCAGAGAATTTTGTACTATCAGTGTTGAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3L 19051941 5' - roo 408 1 78.22 GAGCGGAGGAGGAGAGTTCAAGCAGAGACAGAGAAACAGAAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAA:1 - chrX 15185287 5' - Cr1a 4291 1 69.31 GAAATTAGTGGGTGGCGGGTAACGAAATCAAGCTGAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTC:1 + chr3L 6109107 5' - hobo 289 1 65.35 CGTAATATTAAAAATAGGCTAACGCCCGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACGC:1 + chr3R 14880475 5' + gypsy5 107 2 70.00 CACAAAATCAGTAAACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3R 14832378 5' + blood 7020 2 68.32 ACCGCTTTGATCTCTGCCAGCATTAAACGCGCTCAATCAAACCCTTTGACTTTGACGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAG:1 - chr3L 14182874 5' + Transpac 181 2 61.39 CGATGCACTCTCTATGATATTTGGTATTTTTCACCCCGCCTACGGTCACACTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAAC:1 + chr3R 9039743 5' + Doc 4262 1 55.45 CTAAAATATATTTAATATAATTCTAAATTTTATCCTGGAATCGATTTTAGTACATCAAAGTAGTCTCTTAAGGTTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATA:1 - chr2R 5616648 5' + 3S18 5 2 74.26 ATCTACAAGAAAGGCGATCTGAAAAGTTGGCGCTTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGTATACCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAA:1 - chr3R 1447239 5' + Bica 421 1 65.35 AGTACGTGAAAATCAAATACAACTAAATTCAAAAACTGAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr3R 9428564 5' - blood 7342 2 62.38 CATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3R 27619258 5' + hobo 43 1 71.00 TACGTGTATATAAATATTGTATATGTTTTTTGTAAATTAACTTAAATTGTTAAATGTAAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGTTACTG:1 + chr2R 7481376 5' + HeT-A 5858 1 78.22 ATCGTATTAATATTATAGGTTAATTTCGTATTTTCCATCGTTTTCTCTCATTCAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 + chr3R 24066685 5' + hobo 76 1 55.45 GATTATGCCGTGTTTTTCGCTTTGTTTTTGCCCTTATCCCAGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chr3L 14580148 5' - blood 7315 2 59.41 GTTTGAGAGCCACTGATGCCTCTAACTCCCACTCAAAAGGTATCGAATGACCAAAGTTCTCAGCCGACTGAGTTGAAAAATACATATGTAAAATTCAGCTT:1 + chr2R 14074289 5' + transib3 2646 1 79.21 TTTACCTTTCAATAAAATTGTTGAATAATCAACGGCACAGCAGAAACATCACAAGCAGCAGTAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACA:1 + chr3R 6119775 5' - BS 5052 1 65.35 TCAATTATTTGATCAGAAACATATAATTAAATGTGCTTTATTATCAGATGTCTTATATTATTTCTTGACAGTCTTAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTT:1 + chr2R 17659981 5' + S-element 1533 1 64.36 TGGTGTGACAATCGCTGCGTATTTTCTCATTTTTCACTCCTTTGCAGGCCAATCTAATCGCGTTTTGCTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTC:1 + chr3R 29307351 5' - X-element 425 1 71.29 AACGTGACTTCCGATTTTGGTTAGCAGAATACCAAGTACCGAGTACCGAAATCGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCG:1 - chr2R 12523627 5' - 1360 3177 1 66.34 GGCAAAAACGATCAGGGATGGCGTGCTTCGAAGTATTTAAAACATTCCGTGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTATATTTTTAGA:1 + chrX 6849524 5' + 1360 3266 1 54.46 AGGTTCTTCATCACACGACCCACGCATCTTTTCCTATTGTTCCTCGACTCCATGTCCAGGCCCACAAAGTTCCTCGTTATTAATGGGTTTGGCTTTAGAAA:1 + chr2L 20654961 5' - Tc1 1197 1 69.31 AACGAGTTCCCAGCGCCACGATCGCATAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 + chr3R 22494556 5' + jockey 4699 1 73.27 CTCAGNCACCTGGCGTGACCGAAAGCAAATAAAATAATTATGCGTTTTGCAGACCTCAATGGGTTGCGCAAAACGAAATCGCCAGGACGATTACCGGCTGC:1 + chr3L 21094586 5' + BS3 1381 1 46.53 GATCCCCAACCGACAATCAAGAATAATCATGTAAACGAAAAGCGTAATGCTGGTCCCACGAAACCCACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTT:1 - chr3R 26006837 5' - pogo 328 1 68.32 CTCCCTCGGCGACGGAGTCCTTGGCATCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAAC:1 + chr3R 6657213 5' - F-element 4415 1 74.26 TTTAGNGGTTTCGGTGGAAAAAAACAGTGAAAAATATATAGTTGAACGAACAAGAACAGACAGCAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACT:1 + chr2R 12168791 5' + 297 6511 1 65.35 TTTAGCAAAATAAGATGTGTCTGGTTTCCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACA:1 - chr3R 9729947 5' - R1A1-element 5092 1 72.00 ATAAACATTTATTTTCCCCCTTCCCACTTATACCTAAAAATCCTTGTTGAATCACTTCGTGGAATTTGGACATTGTTTAGAGTTAATGGGGGACAGCTACG:1 + chr3L 10099324 5' - Doc4-element 2371 1 53.47 TATTGTTTAATGGGATCTCATAAATAACTATATATCTCAAGTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAA:1 + chr2L 11240853 5' - roo 410 1 74.26 CTGTTAGTGCCACTAGCTACGAACACTATATGGTACAGCAGCAGCAGCAACTCCAGCAACAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTAC:1 + chr3R 6442113 5' + Doc2-element 456 1 68.32 CAGCCACAAAGTATGCTACAAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:2 - chr3L 947927 5' + hobo 35 1 57.43 ACTTCAGCTGCTGAATTAAATTTTGCCACTATACTCTTTTGTGACTTGTACCAAATATTTAATTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 + chr3R 13088396 5' - Juan 4196 1 58.42 ATTTATGAATTATAATATGCTGTTTTTTGACGTAACTAGAATAACAAGATGCGTAACCGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCATCCACTTTTTTGGTGAC:1 + chr3L 6461492 5' - 1360 3336 1 66.34 GACTAGCTGCCAAATAGCAACATGTGTAGCGACACGCACACACGGACACAACACGCACACATTCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:2 + chr2L 13482115 5' + hopper 11 2 65.35 ACGAAACAAACCAAAAAATAAATGGGATACAAAATTATAAAGGGTCGAGATAGAAAAGTATTTAGACGAATTATTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATG:1 - chr3L 17647743 5' + G4 3525 1 59.00 TTTTATAGCCGCCTTTGGAGCAACTAGCTTAATTTATGTTCGACTCATTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGTAGAGATCAGTAGAGATTTTA:1 - chr3R 25930181 5' + R1A1-element 5098 1 51.49 GATTGCGACACATTGAATTTGCATTTACCCATAAATGCTCCATGTATATATGGAATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chr2L 10749195 5' - 412 474 2 59.41 AGATTCTGAATACGATTCAGGCTACTGCTCGGACTCTTCTTTAGCTGCGTTTCTAGGGTCAAAAAACCCCTGAATATTCTGCCAAAATGGTATCCAATGCC:1 - chr3L 15309110 5' + HB 455 1 61.39 GGGAAAGAGAAGAGGTCAGTTTGGCAGAATTATGGTTGAGAATCTCCCGCCCAGCAGCACCACATAATTAGTTTAATTGGCGCTGAACTAGCGGGAAATAC:1 - chrX 19065374 5' + gypsy6 409 1 70.30 ATGCGTGGGGGTGACCAAGGCGATGGGCAAGTAATCTTTGTGAGTATCAGTGTTTAGTACTGTTGTCCTTCTCCTAAACATTTTTGTTGTTTTTTTTTTTC:1 + chr3R 12417299 5' - gypsy7 5016 1 79.21 TATGCATGTTGTACAGACGTCACGAATCAGCAGCATTTGCTCGTACAAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGT:1 + chr2R 15378935 5' + gypsy4 44 2 53.76 TTGGGAGGAGGAGGTTGCTCTGCTGCCATAGGACCCAAATCGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGT:1 - chr3R 6218475 5' - HMS-Beagle2 60 2 59.00 TTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATAGCAAAAAAAAATAGAATGACAGACTAGAATCTCATCCTAATAGTCAAG:1 - chr2R 20596466 5' + jockey2 3099 1 51.49 CCTGCGCCTGCGGAACTAACGAGCCCGGCGGTATAATAGAAGTCATTTTATTCTTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTAT:1 - chr3L 21565544 5' - P-element 418 1 60.40 TTGTGTTAGCCACAATCGACTAGATGCCTCATAAGCACCAAGTTCCGTAAGCTGGCGGTGCGTGGGTTGTGCAGATCGAAGCGCAATTTCAATGCAGCCGC:1 + chrX 1093100 5' + Chimpo 401 1 55.45 CAATANACAACCAGGCAACAAAACTCTTTTTTCAAAAAGGCAGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 + chrX 17692563 5' + 3S18 10 2 68.32 GAAAGTTTAGCATTTGCATATGTACATAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 - chr2L 9346214 5' + Transpac 46 2 74.26 TGTTAATTCCCCTGCCCTTTCCCGTTTCACTCGATATCCCAGGAAAATAATGAAATTTTGCGTTCCCATTCATACTAGCTGATAGTCGAGGAACTCGACTA:1 + chr2R 18009446 5' + INE-1 563 1 70.30 GGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr2L 20840478 5' + Transpac 4970 2 75.25 GGCTATAAAATAAAAATGTTATTCTCGCACAGCCAACGTGCTGAAACCCCTCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATT:1 + chr2L 13470360 5' + Doc2-element 4389 1 64.00 CTCCTGCGAACCATTGGCACACGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTGATAT:1 + chr2R 13458510 5' - Q-element 196 2 78.22 TTTACTTTGCAAGTTCACACCCGCCAGTCTCTAGGTTAGGAGATCTCTAATTGGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTGTTTTTTAGTTTTAAGTAAATA:1 + chr3L 10972014 5' - rover 6821 1 64.36 CGGCGCGACAGCAGCGCACAAAAGTAGGCCAAACACTCACAGACAGAGCAGCACGGATACACACACACACACACACACACACACACATGTGC:1 - chr2R 16073421 5' + accord 185 2 79.35 TCAGGCCTCCTCCGAAGGTAAGGACATGCTAAAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTTCCGAATGTATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATAC:1 + chr2L 8243007 5' + Gypsy12A_LTR 2068 1 69.31 AAGAAGAAAAGAATTAATTTCTGACTGGAATGCCTAACCCAATTACACAACATACGTCTCTCTCTTTGCTGCTGCTTCGGCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chr2R 13153370 5' + blood 7176 2 56.12 TGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2L 16252334 5' + pogo 43 1 70.30 AACATTCACCAACACACGCGCGCGCTCGAAAGAGAAGAAAAGGGGCAGAAAACTTCTGTGGTGTTGGTCCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTG:1 + chrX 1134599 5' + baggins 5132 1 65.35 ACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGAC:1 + chr2L 3813589 5' - 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Gypsy6A_LTR 234 1 63.37 ATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGT:1 - chr2R 4879012 5' + G-element 44 1 65.35 AACCAAAACGCCCCATCCCTCCACTTTGGCCACATCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:1 + chr2R 11607766 5' + jockey 4821 1 66.34 ACTACTTTGACTGCAGCGAATAAGTCAGTGGAATAAAGAGGCTGGAGTTCAATAAATATACCATCGCTCTTTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3L 21908984 5' - roo 404 1 74.26 AATAAAGTTGTTGAACTATTTTTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 13314202 5' + jockey 12 1 74.00 TTTACTTTTGTAAATCGCCAAAAGAGGTACTCCCTTCGAGGAGCCCAATATGATTATGAGCATCCATAGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:2 - chr2L 11165419 5' - transib2 2813 1 66.34 GCTGGGCTTCTCCTCGTCCTGGTTGATGTTGAGCATGGCGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTG:1 + chr3L 1716447 5' - Doc 4497 1 61.39 CTTAAATGTAGCCCAACTTAAGTACCGATTAGATAAAGAACTCAATGGCCAGCAATTTATGAAAGTGATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 17788997 5' - roo 9061 1 69.31 CAACCGATGACCTTTCTACCTGTTCGATAAGCACTCAATTTGCAGCTGTCCTGGCCATTGTAAATCAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGA:1 + chr3L 18138383 5' - micropia 5006 4 65.35 AAGATATAATTAAAATAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTT:1 + chr3R 5775664 5' + invader4 2784 2 54.46 GGTTTCACAATATGAAGTGGCTAAAGAGTATATCTAGATGTTTCCAAGATGCGGAGGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGC:1 + chr2R 22968141 5' + flea 4590 1 61.39 AAAATCGTCGGGCCGTGGGCGTGTCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAA:1 - chr2R 11907571 5' + F-element 4590 1 77.23 GTCTANCTAAGTAATTACAGTTGAATGGTGGCTACAAACAAAGGGATCGGCCGGGGGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGA:1 + chr3R 31635522 5' + R1A1-element 5017 1 61.39 CAATAATTGCATTATCAATCGATAATCGTATCGTATCTTCGAGCGGTAGGTTTCGATAAAGGGTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chrX 22517548 5' - 1360 3378 1 38.61 CTAGCAAAGACCAGAGTCGCTGTCATCGACCAAGTGGTTAATAAGTTCGTTGTTGGGTTTGCTGGTGGAGGTACGGATTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 + chr3L 22898982 5' - HeT-A 6059 2 59.00 AGCCGCCTTTGTGGAATATACACATAAAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAAC:1 + chrX 10445565 5' - INE-1 530 1 75.25 CCATTACTGGAGTTTCATTTCATTCACGGGATTATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGTACCACGGTGCTCCGGTGATGGTTCTCAGGAT:1 - chr3R 23872834 5' - Fw2 3623 1 70.30 TAAAAACAAATAAGACAAAGTACACAGACATAAACCACGCCCCCGACGCCCCCAAGATGATCAGCACTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCG:1 - chr3L 13090445 5' + S-element 363 1 74.26 AATACATTTTACAAACGGATTATTTATTAGAATTAAATGTAATAAAATTTAAGTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 + chr3L 25798438 5' - blood 7366 2 56.44 GTTGAAGAAGTCCGATTAAGCTTTAATGCTGCCTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTAT:1 - chr2L 1170979 5' + diver2 4675 2 52.86 GCGATGAATTGTGCATGTGGCGGATTTATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGTAC:1 - chr2L 12193672 5' + Ivk 4997 1 69.32 GTTCAGTCAAGAGCCAAACCTGGAAAAATCCGCGACTTCATATCAGCGCTAACTTAACTTAATTAATTTAAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTT:1 + chr2L 20253041 5' - Doc 4407 1 78.22 TTCCTGTTGATTACAATATCGCCTTACAAAACGGATCCCATCTTTTTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCTTCTTTATTTTGTTGTTGTTGTAAGCAC:1 + chrX 22791924 5' + gypsy12 10054 2 55.45 TTGTCCATCTCCCCTTTAAGGTTAACTCTCTTTTCTCGAAGGAAAGGCACAGCAAGCCCCCAAACCCAGACCGGCCACACCTTTCAGCAAACCCTGCACCA:1 - chr2R 5996944 5' + G2 16 1 59.41 ATAATNAATTCTTCTATGATAACTCCAGAAATAAATCATTTCGAATACAAGATATTTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 + chr3L 4987390 5' + I-element 22 1 54.46 CAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chrX 10555432 5' + Tirant 52 2 74.26 GAACAGTATCTTCCAGTAGGATGAAATGGATGTCTTAATCGTGGGTTTAGCATTCGGCAGCGGCTTATCCTGCATACTAGGATTAGTTTTCTTGCTAGGGG:1 + chr3R 19247566 5' - Doc 4502 1 66.34 TTGGANCACGATTACTAGGCACACCGCTTTATTCATTTCACTCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGAT:1 - chr3R 4965598 5' + McClintock 147 2 58.42 TGTGCTGGTTCTGGAGGCTGAGTGGCTGGAGGAAAGCCTGCTCGATGAGGGGCTTTATGTTGGGGGGAATGTAGTTGGCCGATCCTTGATA:1 + chr2R 24037463 5' - Chouto 6057 1 79.12 TCAACNAGCGTAACCCAAGCGCCGTTTCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACG:1 + chr2R 16050140 5' - Ivk 5014 1 81.19 CAACGTCAGTTTTATCACATTAAGTAGACAGCCTCAGCTGAATGTGGAAAACGGAGACCCCAAATCTGATCCGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTA:1 - chr3L 17905015 5' + Gypsy6A_LTR 156 1 76.24 TAACTGACAGCTCAAGTTAAAAATGTCTGCTTATCGAATTGAAAATTATTTTCGATTCGTTCCAAGTCAAATGGTAGGCAAGTTTTATTTTTTTTTTGTTT:1 - chr3R 10482245 5' - HMS-Beagle2 490 1 54.46 GAAATNGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCT:1 + chr2L 22719605 5' + 1360 51 1 78.22 TTATTGCTGTTATTTTTTTTACTAGAACGCTTTTAGCGATATCAATTCTGTATTTATTTTTATGAACCTTTGAAATTGCTATTTTATTGTGTAATTCTAGT:1 + chrX 10309599 5' - Porto1 4217 1 75.25 CCCAGAGACTTTTACATTCAGGAAAATGTGTTGCAAAATCAGGAGCATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr2R 9653269 5' + blood 32 2 55.45 TATTCCAATAATAATTAACAAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 - chr3L 11887846 5' + Burdock 6147 2 56.44 CTTATGCATATTCTGCTGGAAATTACTAACAGGAAGTTGCATTCGAAAAGCCATTTTCAGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCAC:1 + chr3L 18655597 5' - flea 312 1 68.75 CCAAGTTCGCTTGGGCTTGGCTCTTCTGCTTATCCTTTCTTGCATTTGCAGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTAGCCGCGATGTGCGTGGCGG:1 + chrX 8977728 5' - hobo 71 1 56.38 CGGAGCAAACGAAATAATCGAAAAGTATTTTCAACTGAAGAGAACGGCGCTACCAACATGCTAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCG:1 - chr3R 25711824 5' + Ivk 5132 1 64.36 AAGATTGAAAAGAACTCTTTTAAGGATATTTACCAGGCTATCATAAACGTATCGCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTAT:1 + chr2R 14272473 5' + Doc 4244 1 56.44 ACAGGCAATGAACAAGAGTTAAGCTGGCCATTTTGGATTACATGTGAACGTGATAAATAAACATGGTCGTCCATATTCGCGCACGAAAGTCAGAGCATCCT:1 + chr3L 13320777 5' - Helitron 131 1 77.23 GACTAGTAAAAGTCATCTGATTTCTATGGGGTCATAGCTGTCCTGACAAACAATTTCCTGCAAGCTCGTTAAATAACCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAG:1 + chr2R 5616521 5' - 3S18 6105 2 79.21 GTGCAGGCAAGCGCGACCAGGAGATCCATGGCCACATCGTTCTGCATCATCATTATCGTTTGGTAAGAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATG:1 - chr3R 13937587 5' - Ivk 5201 1 71.29 TGGCTACGGCTATGGGTCTTCTTCTAGTGCTTCTTACATGCCTAACTACTATCGCTATGCTCCGTACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCA:1 - chr3L 21189553 5' + G2 2929 1 70.30 ACAGCCGCCTACATGCCTTCCATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAA:1 + chr3L 3298298 5' + ZAM 8089 2 80.00 GAACCCAACACCCGCTTCGAATATTTCCCTTTTGCCAGTACCCATGCAGCATAAAATTAGCTGCGACATATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATA:1 + chr2L 7505670 5' + Quasimodo 135 2 67.33 TTAATTCGACGCCAAAAGATGCTGACATATTTGCCAATACCGGTAAAAATTTACAAGACTAATACAAGTTCTTGAGATCTCGAAGTTCATACGGACAGATG:1 - chr4 652748 5' - INE-1 128 1 57.43 AGCTATCAAAGGGAAAATGCCGACAACGACGTATGGAGCATTTTAATGCGTAGTGTGCTTATAACAGCAGATCTATGGAAAGTCGTTTGTGGTCAATATGT:1 + chr3L 19226025 5' + Copia1_DM 426 1 79.21 ATTCTTACATATATCATAGGAACGCTTACGTATAAACTTTTTTAATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAA:1 + chr2L 19817825 5' - G4 3821 1 65.35 TTTTTGTTTGGCTTTGTCGCCGTCGGTTTGTGTTTGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAA:1 - chr3R 22265808 5' + 412 167 2 66.34 CCACACAATACACTACAAAGGACTCCTCCAATAACCTAACCAGATATAATCAAAACGGACAAACAAAATGGAATAATAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGA:1 + chr2L 5641422 5' + Tc1 108 1 73.27 ATAAATGTACGAGTATATACAGCACTCTTGTGAAAAGAGTGCTGTATATGTCGGGGCGAAAATAATTCGCTATTTACTTTTTCTCCATGTTCCTTTTGCTA:1 - chr2L 12254076 5' + micropia 5002 4 75.25 TAATAGGGTACAATTAAAACAAATTAAGTCTCTAGAAGATTCGCTTCATAATTTCTTCTTAATGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGA:1 + chr2L 3355787 5' + opus 263 2 64.36 CAATGGCGAACAAAGTGAAGTGTGACCGTGCTCTGTGGAATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3L 9864640 5' - P-element 2849 1 41.58 TTGCAACACTAATATCTTATATCATATTACAGTAACTGGCGGGTTCTATAATTGATTTTAAAACTTTAAGGACGTAATGTCCTGATCATTAATTTAAATTA:1 - chr3R 13237409 5' + Transib5 2586 1 81.19 AACCAAAAATCAGTGGCTGCAAAAAAGATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAA:1 + chrX 691631 5' - 1360 211 1 81.19 CCTATTTTTTTTCTTTTTCTCCGCACGTTGAAAGAAAATATACGGGGGAAATGTAGATGGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCA:1 - chr3R 9151532 5' + Doc 4532 1 64.36 AGCGGGTGGGTGGTTAGTTGTTCGGTGGGGCCACATTTTTGCATGCAAGCACTTTCCTTCTTGTACGTTTGTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGT:1 + chr3L 14905320 5' + copia 154 2 56.00 CGCCCTGCAATTAAGTCTCCCTTGTCATTCATTTCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACATTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTT:1 - chr3L 27269467 5' + F-element 4380 1 66.34 ACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTT:1 + chr3R 14882092 5' - gypsy5 7314 2 66.34 AGCGACATACGGTGAGTTTGCAATACCACCCCTTTTGGTAAAGTGCACTAAGCTGTATGCACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACG:1 - chr2R 1779568 5' - R1A1-element 5320 1 41.00 ACTCGGTGGTTCACTCACTCAGCCACTCACACCCACACGGCCCGAAATCGTCTCGTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTAC:1 + chr3R 16099764 5' + 1360 3236 1 62.38 ATTGCCACATGGGAGCGAAATTACACAAAAACACGCAAGCACCCGCACCGCGCACACATAAACACACACACACACAC:1 - chrX 2589951 5' + accord 7025 2 58.44 ACGAGCGGAACGGGACAGGATCCACAACAACGACATCGACAAACACCCAGTAAAAAACCTGCATGTGCAGGCAAGCACCCGGTTGTGCGCGCACCCGAATC:1 + chr3L 20235740 5' + hobo 136 1 62.38 CATTCCCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:2 + chr2L 15997869 5' + 412 27 2 60.40 GTTATCCATGCTTGCTTGTGTTTACCACTTCACTTAACTTTATCACAGTTCTTGCTCTCGCTACGTTTTCTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTT:1 + chr3L 20401247 5' + Cr1a 208 1 77.23 GATCAAAATTTATGTGTGGTAAATATTATTATTTTATATTATAATTATTATTATTATTATTTGTGAGTCATGGTTTTTATGTCAAAATAATTAAAAACTTT:1 - chr2R 11190510 5' + S-element 1456 1 63.37 AGGTCCCGAAGACCGAGCTAGAAGAGCTGCAAATTAATGCGCAAGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCG:1 + chr3L 24079500 5' + gypsy4 51 2 62.38 TTAAGTCTTGAAGATCTTTCGATATCTACAAGGATAGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr2R 10029421 5' + roo 8703 2 64.36 GAGATTCTCGATCCGGAGGACGGAAATCTTGGCATGCACGCTGGGATTATGCATATTTTGCCAGTTCCTCGGCTATTTCATCTCTGACCGGAATTATGAA:1 + chr3R 6506174 5' - Fw2 3686 1 73.00 CGTAGTTCGGTAGTTGGTTGGTAGAGAGTTATTATAGATATAGTTTTGGGTTGAATGGGACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAAAACCTATATT:1 - chr3L 8047925 5' - Cr1a 4316 1 67.00 TCTGGACATCCTGAAGGATAAATGGAGTCCTGCTTTGCAAATTCGTACCGTTCCTCTTCCGATCCCAGGGGAAACATACGGTTCATACTATAAACTTGTGC:1 - chr2L 14563298 5' - rooA 365 2 60.40 TAATCCCCCAAATTAGTCCCTATATTGTCGAATCTGTACAACTGTTGGAACAACTTATTCGTGGAGAAGTTGACAGTCTCGACTTGATTAGTCGGCTTAAC:1 + chr3L 22939893 5' + Cr1a 4081 1 66.34 TAAAGCGGCATGTCGCCCAGGGGGCGTGGCATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr2R 21937562 5' + 412 7069 2 63.37 CGTCTTTTGGCCCAGGCAAAACTTTTTGCAAAATGAAATTGTTTTCGTATTAACAATTTCATTAAAATTAAATTACTTTTTTTCTTGTTGCCTATCCAATG:1 + chr2L 3658493 5' - invader3 5004 1 77.23 ATTAACTGTTATTAATTGATATAATTAAGTGTTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGG:1 - chr2L 9024332 5' - Idefix 7052 2 74.00 CTCCTTGAGCTCAACTGCTATGCTAATTACGCGTGTGGCCCATTGTCCTTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTC:1 + chrX 2394358 5' - invader4 172 2 57.43 CTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr2L 19090039 5' - opus 7482 2 60.40 CAATAACGAATTCCAATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTA:1 - chr3L 10464692 5' - invader3 238 2 68.32 TCCCATTTAAATTATAAAAATTTCAAATGCTCTATTTACCGTAAATATTTTCACAGTAATTTACGCAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGA:1 - chr3L 13334052 5' + G2 2834 1 71.29 GACTTGCCCGCCCTGCCCGACGAACCCTCGTTGTCGTAGTCGTTCTCATAGTCGTAGTCGCCCTCTTTGCGCACGCACCGTTACCGTTCAACCTATATGCC:1 - 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HMS-Beagle 7038 2 73.27 TTGATATATTCGATAAACAAGGTGTACGAGCGATTACGAGCGAACTGCTCCAAATCCGCCCACCTTATACGAGTCTATATACAAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 + chr3R 29902769 5' + G2 3075 1 50.50 TTATGGATATATGGCCCCCCATGGACATGGGTTTCTCGGTTTCTTGGTTTCACTGTTATCCAGGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAGGGTGGTTGTCCAGTC:1 + chr3L 15187597 5' - G-element 4103 1 56.44 TCAGAAGGCGCTTGGTGAACATCACACTACACTCCAGTTGGCTTACATTGCCGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTC:1 - chr3R 24658436 5' - jockey 432 1 55.45 GGAGGAGGGAGAGGAAAGGGGGAATGGGAAAGGGGAAATGCACACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACA:1 + chr3L 18239266 5' + I-element 4941 1 58.00 CTCACATTTAACCTTACCAAAGGTTACAATGCGTCGCAGGAGCGCAGAGAGAGACAGTGCGTTCGGGTTCATTTCGTGCAGTCATAAGGATTGGTGAGCAA:1 - chrX 9118888 5' - Doc3-element 388 1 54.46 TGTTTAAATTTTAAAGCATTTTATTCGTTCTGGTATAGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr2L 16252088 5' + pogo 2 1 39.60 GCGAGCGTGGGCTAGAGTGGGATAGATAGCTGGATAGTCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chrX 1399865 5' - P-element 2851 1 43.56 GAAGAGATCTCTCAAAAATTATAAAACTTCGATTCTTCCAGCCAATCAATAGATACGACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCC:1 + chrX 19821175 5' + R2-element 3135 1 57.43 GGTTGNTAAGCTAACAGCAGCGGTCAAAACGAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGT:1 - chr2L 19528592 5' + Dm88 4500 2 69.31 GTAGCNCCGAAAAACGGGTAAAAATCAATGCAACTCCAGCTCCACTCCCTATGCGCACACCGACCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAG:1 + chr3R 28325874 5' + Chouto 5941 1 55.45 AGCTGGACACGCACAACAACTTCAACACCGAGCACTTTGCACCCATTTACACGGTACCCGCACCGAACCTGGCCGACAAACACATATAACAAATAGGTTT:1 + chr3R 24715716 5' - X-element 4565 1 79.00 ACATATCGATGAGATTGTCGTCCCGCAGAAAGACCAGGGCCACCGATTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTG:1 - chrX 7940914 5' + 1360 3388 2 57.43 CCAACCAGTCCTGTTATCCTTCCCAACCAGATTGCTCTAAATGAGCAACTTTTTGCCCTCAGAGAATGACAGACCGCGATCTTGCTC:1 - chr3L 1704584 5' + Doc 370 1 64.37 TTCCAATATGCAGATGTGATGGTGCCACAAAATGGCGCTGCAAGCCGCTGATTAGAGAGAGGGAGCGGAAGAGATGAGAGCGGGAGAGTTGAGGGTGTTTT:1 + chr3R 4823527 5' - Porto1 466 1 64.36 AAATTTGATTTTAGGTTGTTTGCATTAAATATTTAATTTATTTATTTGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTACCTATTAATTCAGC:1 + chr2L 19721251 5' - X-element 4659 1 66.34 AATGGGGAAAAGGGTGAATCCGGGAGTCAACAGCAGAAGAAGATTGCTGAAAGAGATGAGAGCGATGTTGAAATGTACACGGGGCACTTATGTTTGAAAAC:1 + chrX 7513341 5' + invader6 4763 2 66.34 CAGCTATCCGTCCGCCCTGCGATATTGTGTCCAGGAAGCGATCCACTCAGGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGACGCATTCGCGACTT:1 - chrX 11484257 5' + Quasimodo 314 2 64.36 CCATCCACTACTTGGTCAGAAAAGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTC:1 + chr3R 10359856 5' - Doc2-element 4519 1 77.00 GAGTGGCGCAACGAGTGCCGACGGAGGTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCAAAAACCGCACGAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATG:1 + chr2L 21762783 5' + INE-1 254 1 73.27 AGCTTTTTCAACTTTTTGCGGCTTTGTAATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAG:1 - chr3R 13124313 5' + F-element 4303 1 72.28 TGGTGCGGGGGTTGGGGTGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 11832956 5' + roo 34 2 60.40 AAATAAATAAACGTGAACTGAAATCCAGGGACCAACTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAAG:1 + chr2R 11177911 5' + hobo 2687 1 63.00 CAAAGCTTGGAGACGATCCGTTCATTTGAAGAGAGAGAAAGAGCGCGGGAGTTAGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 - chr2L 306551 5' - Tirant 8476 2 59.00 TAGATTTAAAAAGAAATTAACAAATTCACTTTAAAAGAAAAAATGTGGTATATCAAGAGAAAAACTTTTTTTTTTATTAACGAAATTATTTTATTTAATTG:1 - chrX 16727169 5' - jockey2 3381 1 87.13 TCAGAAGTTGGTGGTAAGGAAAATACGGAACTGCTGCTGAGAAAGGCAGCTAACAAGAGTGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGA:1 + chr2R 16916176 5' + I-element 4906 1 61.39 CCGCCTGCCATACATACGTACATAATAATAAAAAAAAA:1 - chrX 12243834 5' + Rt1a 5068 1 68.42 GTAGTTCTTTCCGCATGTCCCATTTATGGAAGTCAGCCTGTATAGGCTATGCGGCACGTGGATGAAAGGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTA:1 - chr2R 14008806 5' - HMS-Beagle 6690 1 71.29 GTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3R 15072558 5' + pogo 15 1 61.39 AATCATCAAGGCAGTCACAAGAGGTGTGGCAAGGGCGGCTTTGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGG:1 - chrX 3518979 5' - copia 4745 1 59.41 AGCAGATTGCCAAATTTAGAAGCGAAATGGATCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAA:1 - chrX 10738799 5' + R2-element 3417 1 69.31 CCCACTCTCACGCCTACTGAAGCAACCATCTCCCCAAACTCGGTGGGACTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGG:1 + chr2L 22020824 5' - invader1 3706 2 53.47 TTATGATAAACGGTTGCTATGTAGCCGTCGCACACAGATACTCTACACTACCTAAATCCCAATTCATTGCCAACTTGTCCGGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 + chr2R 23716075 5' + I-element 5013 1 56.44 GTTGCCGGCGACAAGTGCGTATCTGTGGCTCTGAATCTGTATGCTGAATCTCGACCTTGTATCGAGAATATATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCT:1 + chr2R 22725985 5' - invader1 4008 2 69.31 AAGTATCTTCTACTCCCCAACTTCGTATGGTCCCTTCTCCTTAAGAAGTACATTAAGATGTACAGATGCTGATATAATGACTGAAGTATCTGATGTTCTGG:1 + chrX 21022401 5' + Chimpo 483 1 64.36 GCCACNGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chr3R 22352796 5' - 412 7513 2 62.92 TTATACTATATTTTGCTATATATGTAGGAATTTCTACATATAAATCCGCATCTCGAGAAACACCAGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACT:1 - chrX 15182600 5' - R2-element 3295 1 63.37 CAGTGGAATAAAGAGGCTGGAGTTCAATAAATATACCATCGCTCTTTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 21908959 5' - roo 9042 1 55.45 TCGAGACTAGAGGCAACTCCACGCCGGCCACAGCTAGGAATGCTTCGACAGCCTTGACCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATCCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr2R 5321986 5' + 1360 21 1 54.46 GCAGCTCCCGGGGCAGACTCTCCCTGAGCTCTTTCAACTTGGCCTCCCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGCTCAC:1 + chr2L 6068417 5' + HMS-Beagle2 6785 1 51.49 GAGCAAATTAAAACGCTTCGCAATGCACAAAAGGGTTAAATGGCTTAAGCGCTGGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAA:1 - chr3L 3537793 5' - roo 146 2 59.00 AGAGCTCAGTTAGACGGACGGACAGCCGAACCGAAGTGGTTGGGGGACACACCATGTGTAGATATACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3L 7231098 5' + 297 2 2 67.33 ATTGTCTTGTAACGCACACGCCCTCAACAGGAGACAAAGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGATAAAT:2 - chrX 14670753 5' - Cr1a 3999 1 62.38 AATACAAATTTATAGTAAAACTGCTAGCACCTTTAAATTGCTTTCTACACTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATT:1 - chr3R 14945883 5' - Porto1 4459 1 59.41 AACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3R 15072560 5' + pogo 17 1 59.41 CGCCCCCATTTGGGATACTGATTGGATTTCAGTATTGTTCCTAATCTCCGCCCCACGCGGTATGCGCACGAGTTAATCTTTTTCTTTTTAGAACATCAACA:1 + chr2L 6360665 5' - invader5 3582 1 73.27 TCCGACCGTCTCGCTCTCCTATCCCCTATCTCTTTTCCGACCGTTCGTCTTGTGTGCTGTCTTTTCTTTCTTGCTTGTTTTGTGTTCCAGGACGCATATTA:1 + chr3L 18005768 5' - Osvaldo 1418 1 59.41 GAGAAATAATTTTTTCAACCAATATATAGACGCCCTTTATCCTCCAGTTGGTTCATCGTGATTTGGCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGG:1 - chr2L 21184248 5' - jockey 4916 1 70.30 TCCGCGAACCTTGACCGCAGCCATGTGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 22352834 5' + 412 50 2 75.25 CATCTTTATTGTAGCCGTTGACGTGACGCTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAG:1 - chr2R 1683133 5' - F-element 4343 1 72.28 GGTGTCTGCTAATTGAAATGGTCCGAATTGGGAACTGGGGCCGAGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCA:1 - chr2R 6791725 5' - accord 7068 2 57.43 GCAGCACGTGTCGTTTGGCCATGTACACAAGGATATGTGAGTGCTTGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCACGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAA:1 - chr2L 11758912 5' - mdg1 7286 2 52.48 CACATGTTACTCACACGTAAGAAGAGCGCAAACAAAACAGAGAGACGAAAA:1 - chr2R 23573428 5' - Cr1a 197 1 92.16 TGCATTTGGCTTTTGGAGGCGCGATTGAGTGGTAGGGAGGGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGT:1 - chr2L 21857820 5' - I-element 4984 1 60.00 AAAATCTGTTAAAACCAGAAATAGATTTGACACCACTATACACACCACTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chr2R 3111997 5' - pogo 2075 1 53.47 GGGGAGAAGCAGGTGGGGCAGTGGGTGGCAAGTGGGCGCTAAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAACTGGT:1 + chr2R 7767156 5' + R1A1-element 485 1 59.41 TTTGCAATAGCTCTTTGTCTGTGTGCGCCCGTCTAAGTGCAAAAGTGTGTGTGTGAAGGGTAGTGTCACGTACATAGTATGGGCAGTTTGTAATTCCACGC:1 + chr3L 17578339 5' - BS 4749 1 56.44 AGAAGGGAGCGGCACAATTAGAATAAAGAAGCCATCATGGATCCAACACCGCCGCTTCGTGCCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chrX 8240734 5' - 1360 3374 1 67.33 GCTTGGGCTCCGACGATGACGACGAGGATCTAATCAGCAGTGATGGCAGTTTATACAAGGGAGATCTGGGGCACTGCCAGTAAATCCCACT:1 - chrX 274116 5' + Porto1 4293 1 80.22 AGAGGGGGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACC:1 - chrX 21667998 5' + ZAM 7962 1 77.14 CTGTGGTGTTTCTTTTCTGTTATTATTTTTTTCGCTTGCACCTCGGCGCCGTCTCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAAT:1 + chrX 18641063 5' + Cr1a 63 1 66.34 GTTTATGGAGTCTACAACCCGGCAGCTCTGCAGCTCTCGGCAATGTGGCAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTC:1 + chr3R 10206302 5' - invader4 2624 1 54.46 AAAGGAAGTGGGTGAAAGCAGTCGGTGTGGATGATATCTGCTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAATGATGTTGGCTCCAAGAGGTTAGTGGT:1 + chr3R 27453113 5' - Q-element 238 2 80.20 GAGGTGTGCGAAAAAAGCAAGTTTGCATCATGAATATGCAATCGAGAAGTTGGAACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGA:1 - chr3L 5557109 5' + flea 4682 1 55.45 AATTCTGACAGCCGATCACGACGACCGTGTAAGTCCTTTGCACTCCTATAATTTTATGCAGCTGTGCCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTT:1 - chr2L 21990897 5' - micropia 5330 2 53.47 TTGTGCCCATGAATGAAAAGAAGCCAGAGTGTTTCTGTTTTTGTATTTTTCTCCTGTATTTTTTTATTTTTTTGGTTAGTTTTAGCAAACTACGAGGAACA:1 - chrX 7214769 5' + Tc1 1422 1 70.30 GTTGCGTTTTCTGTTGTTGTTGATGTGTAAATGCATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACT:1 - chrX 575638 5' - Tirant 298 2 78.22 TCAATGCGTTTCGAAACTCACTTGTTATTAACCATAAAATTTTGCTTGCCCTTGGCATAAGAAAGCCGTCGAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGC:1 + chr3L 2009799 5' - micropia 5190 1 73.27 TCTGTTACAAGGTTTATGGATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 + chrX 2253832 5' + Tirant 8142 2 61.00 TATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTG:1 - chrX 22824232 5' - Gypsy12A_LTR 2257 1 50.50 TATTTCCTTAAATAAAAGTCAACGAAAACTAATTGATCCACCCGAACCGACTAGCAGATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTA:1 + chr2R 21631821 5' + G5 4629 1 66.34 ACCAATCTAAGCATTAAGAAAACCTACATCTATCCCCTTCCGTAATCTTGAAGGGGGAATAGTTAACAGCAGCCAATGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGC:1 - chr3R 8379408 5' + Gypsy6A_LTR 20 1 61.39 AAGAGTAAGCGACGTTTTCGTGACCTCAGGTGGCAAATATACGTTGGCGCACCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3L 7316385 5' + jockey 25 1 61.39 GGAAATGTAGTGTCGAGGATTAGAAGTGTGGAGCAGTTATAATCAGTATCGAAAGGAGTCAGTCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAA:1 - chrX 10454824 5' + Idefix 195 1 60.40 GAATTGATGGGCAACGACTGGCGGTATTCATATGTATACCAACAGGCACTGGATTGTACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:2 - chr2R 5910939 5' + hobo 17 1 62.38 TTGCGCGCACTGTTGCCGGCAAAGACCTTGTCCATTTTTGAGTCCAGCAGCACCTCGTCGGGAAACAAGTGCAGCCCTGAACCTCAATAAAATTCTGGCAT:1 - chr3L 9779501 5' + baggins 5329 1 58.42 GATGCATTCCCACCTCAATCCTTTGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTT:1 - chr3L 15100647 5' - Tirant 268 2 74.26 GATGATGATGATGATGATGATGATGGGACAAGTTCCGCGGTAGGAGCGATGAATCCATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAA:1 + chr3R 24263643 5' - BS 5034 1 56.44 ACCCACTAACCGACTCACTTTCCGGCTTTTGTATCTTGTATGTTGTGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCT:1 - chr3L 8896438 5' - Porto1 236 1 56.44 AGCGGCTTTGGAGTGTGTTGGCGGAGTGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGCTGCTTTGCAAATATACC:1 - chr2L 735652 5' - G6 225 1 78.22 TATTTCATACGAGCTGAAACTGAAAGGAAAAAGTGCAATCGTTGAGAATAAACATTACGTTCCAGGTGTCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACA:1 + chr2R 5803239 5' + F-element 410 1 76.24 TGTGCAAGAAAGTAAAATGAATGCAGCCAAAGGGAGTTGTTGAGTTGAATTAATGTTAATTATGATGATCAGTGATGTGGGTTATAGGTGGTGGAGATCAA:1 + chrX 17538874 5' - G-element 4187 1 80.20 CCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 25931363 5' + roo 53 2 80.20 CGGTGCTAATCCCAATCCCAAAATGCCTCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGC:1 + chr2L 3532320 5' + G2 293 1 72.28 GCGACCTCGTTAATTTTCAATATAATTTCCAGTCGTCTTCCTCTTCACAATCAGCACAGTCTGCAGAATCGTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACAAT:1 + chr3L 15856747 5' + hopper 270 1 78.22 AGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTT:1 - chr2R 22774498 5' + BS 35 1 60.40 AGTCTAAGTCCTAGTGGGGTGCCCAGTCACGCGGCCGGTCCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTA:1 + chr2L 14684481 5' + I-element 435 1 61.39 AGCCTGCCCGTCTTGTTGCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 8763207 5' + jockey 21 1 63.37 GTGGAGGTACATCAGAATCTACGTACTTCTGAAAACGTTTGGGCTCTGGTTCTGTGTTCGGTGAGCTCGACTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAG:1 + chr2L 32600 5' + Stalker3T 58 1 74.26 TGAACTTTGAAAAATAAAAAAACAATTTTAGATACAAGCATTTAAATAACAAAATGTGTGCTAGTGAATCTCAAATGTTCCCTTTAAAAATAAATTATTTC:1 + chr2L 12640752 5' + FB 846 2 75.25 GTTAACAGTGGCGTCGCAAATGATGTTGACTCCTCTCCCGTGTGTCTTGCCACTCAACTATTTCGCTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCAGAA:1 - chr3L 10518218 5' - 1360 3191 1 72.28 CACTTGTCCGTTCCATTCTGTGCACTAGCCTCTTGAGTTGAGACGCTTCTTGATTAGTTCTTAAGTTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATG:1 - chr3L 4326846 5' - HMS-Beagle 59 2 72.28 TGCTATTTACGTTTTGACACCGAGCAGCAATACAGATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTAC:1 - chr3R 14451843 5' + roo 9070 1 65.35 GACCATCTTGGTTGCTTACACGGAAGAGAAAAAAATACAGTTGATGCAAAAACTTGGCTTCCGCGAAAACGATCACGCAGGCAAAAAATTCTCAAGCTTTT:1 - chr2R 5175870 5' + Gypsy12A_LTR 2006 1 61.39 GCTTATTATTGGCAGGCAAAACACCTCTTAGCCATTTCCATACAAGTCGCTGCAAACTCCAGGTCTCCAGCCAGTGCATAAATCAAACAACAATTTGA:1 - chr3R 28687241 5' + 297 391 2 55.10 CGGCTGCACTCCCATGTCCTGTGCTGAATTATCCTAGTCATTTTAAACCCCGACCTCACACGGGACACTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCC:1 - chr3R 23998653 5' + jockey 452 1 75.25 CGTATAGGACTGGGAGAAGGCGGAGCTGTTTCAGTTCGATCCCGACGATGAGCTATTGTTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCA:1 + chr3R 26841141 5' + Idefix 7055 2 61.39 ACTGCGGCGATGGATAACTAAGGCCAACACATATAATAACTTGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTC:1 - chr2R 545260 5' - Stalker4 7029 4 58.42 ACGCATTTGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCA:1 + chr2R 18372628 5' + jockey 4721 1 72.28 TTCTATCGAGTTGCCACGCTCACTCTATTTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAGTTTCGCGTTCGCATTTCCACTAACTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 + chr3R 31957630 5' + INE-1 547 1 67.33 CTGGANTAGTCGCAACGCCGCTTGAAGGGTGAAGCTTCACCCTCCGAGCGGCAAGTTTTGATATATTGTCTGCCAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTT:1 + chr2R 5736691 5' + R2-element 3315 1 44.55 TCAATCAGCTGTTGCGGCGAATTGAAGCTCTGTTAATAACAGCGCCTGTTAGCAGCGTCGCTGCACCACTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCA:1 + chr2R 12705081 5' - P-element 2880 2 66.34 TTTCATACAGTTTCCAAAGCTAAACCGCATTTAGCGCGCGTTTAGTGGTCGCCATTCTGTTTCGCAACATCGGCCTTGTAGCAACAAGCATATAGGCAGAT:1 - chr2R 15605735 5' + invader2 4979 2 61.39 GACTGTCCATATTCTACTATTATCGAGATTGTGACCCTTTGCTAAAGGGACGCATCGAAATAAAAGAGACAATTGTAATAGTATTCGAATATTAACTTCTG:1 - chr2R 20273337 5' + mdg3 5483 2 57.43 CTCGAATTAATTTAATGAATTGGCCATTACTTTGTTGATTGAATGTGCCGTGGAAACAATTTCGTTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTT:1 + chr3R 16383399 5' - Stalker4 477 1 70.00 TTCACCACTAAGTTACTAAGCCAGACCTCGTGAAAATTTCCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTA:1 + chr2L 12619676 5' - R1A1-element 44 1 67.00 TTCTGCCACCTGTTGTTGTCAGGAAGACTGCCTTTTTTATTTAGACTGGGACTCAAAACTCGCAGTCGTCAAAAGCGATAATCTATATAGCACTAATCTTC:1 - chr3R 2723868 5' + Helena 63 1 73.27 GAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCCGCCGCATACC:1 + chr2R 18891050 5' - opus 7468 2 64.00 GGGTTAATGGCTAATCATCGAAAATGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGT:1 + chr3R 17794134 5' + accord 115 2 75.25 AGTAAGAATAGAGTGGGTGCTACTAAGAAAGTGGTTGTTGGTGCACGTGCAGATGGATTTGGCGCACATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGG:1 + chr3R 28238367 5' - Porto1 379 1 72.28 CACCACTTCAATGCCGCAATTCGGTGGCAGTCAGCCGCAAATACAGCTGCAGTTGATGCCAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGC:1 + chr3R 16343395 5' - F-element 379 1 68.32 GCCTTCTCTGCCACCCAAATCCCCGTGGCTAGGATACGAACTTGGGAGTAGTCCTGCTCGGGTGGCAAACTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGA:1 - chr3R 16537685 5' + Cr1a 4370 1 72.28 CCTCTTTGTGCGTCTGCAGCTGCATGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTTGTTTTGAGTGTGTTCCAAGCAAACGCACAACACGCACACTTATACGCGTTA:1 + chrX 16591552 5' + 1360 3219 1 50.50 TTTCACTTCTTTGCCAATTTTTTGTCTTCGCCTTTATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGG:1 - chr3L 7572144 5' + pogo 344 1 65.35 GCAGTGAGTGGCCGCGCGGCCAGGCGACAAGTGCCCACACAGGGCACAATACAACACACAGAGCTGGAAACACGGACACACACAACACAGAGACAGAATCG:1 - chr3R 28429483 5' - Stalker 428 1 75.25 TTTTTGCAGAGCAGATGCTGAGCGAATGGGGGCTTGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATATACGTTCG:1 - chr2L 14051200 5' - Ivk 5010 1 64.36 CAATCAATATCAGTGCACTATATTTACTAATAAAATTGATTGGCTTGACTTTCTCTCCTTATCGATAACCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAA:1 - chr2L 14029521 5' + accord 6910 2 68.32 CCGGGGGAGTGGCAAATAAATCAAAGCGCGTTGCGAAAGCGAGTGCAAGAGGTGCGGGCGTGTTAAGTGGGCTCAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACA:1 - chr3R 15050309 5' - G6 56 1 75.25 ACGTTAATTTGTTGAGTAAATCTCCGGCTTTTGGGTAAACACGAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAA:1 + chr2R 16918183 5' + HMS-Beagle2 6984 2 69.31 TTCGGCGGAAAAAGGTCCTTTGAGGTGCATCTCCGCACTTTGGCTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGGGTGGGCGGGAGTCAGTGTGTCTGTGTGTGTGTAC:1 + chr2R 16331292 5' - accord 256 2 54.46 AAAAAATTGTTTTCGTGGTAGTAGTTTAACTAAACTAAGTATTTTGCATTATTCGTCCTTGGGCTTTGTTTACTTTCCCTTTCGTGCGTTGCTCGCAGTGC:1 + chr2L 3681192 5' + Cr1a 227 1 80.20 GAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAAGAAGCGTATATGAACCGTATAAACCGAGATCTCAACGTTCATACGGACAGAC:1 + chr3L 23746964 5' - INE-1 129 1 74.26 CCCGTTTCCGCCCCTCCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGG:1 + chr3L 5975217 5' - F-element 4477 1 76.12 GAGAAAGAAAATCACAAAGATAAACTCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 5104661 5' + roo 8714 2 82.18 GTAATGTCCCATGCCCACTGCACCACGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGATACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGC:1 + chrX 18192729 5' + BS 4891 1 72.28 CGCCACTTGAACTTGGTGCGGCATTGGCTCGGGTTGTTTCTCTTTTATTGTGTACAAAAAGAACGATATGGTTGCGCAACAAATCATGCGCTTAGGTGTAA:1 + chr3R 12263660 5' - rover 7053 2 55.45 GGGCTAAATTCCGAATTAAATTGCTCAATTATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 22781031 5' + roo 35 2 70.33 CGAACAAAATTGTAAGCTAAAACGTGAGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 14913144 5' + blood 25 2 55.45 AATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr3R 7808962 5' + jockey 58 1 71.29 CTTCCTCTCCGTCGTAATCATCATCATCGCCGTTTGCCCCACCGTCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGGTGAGTGTGTCGCCGCCTAGTGCAGTTTAA:1 - chrX 10039822 5' - TART-A 89 2 57.43 ACCGATTCAAGGTCACAGAAAACGGGTGAGTAACAATTGTTTAAACAGCAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 6216794 5' + pogo 22 1 57.43 TGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 5104623 5' - roo 9026 1 74.26 ATTGTGAATGGAAGCTCGTCGAGTTCGCACCATCATCACGTCCCCGTCGCCCATGCCCAGCCCCCAGTGGCAAAGGCAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAATGG:1 + chr3L 572080 5' - hopper 141 1 62.38 AGGGGTGTAATTGAGCTCGATGATTTTACTTGTGGACTGGCAGATCTTCAACGATTGGGATATGGTGGAAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTCA:1 - chr2L 22228657 5' + Bica 4793 1 47.92 TGCTGCTTTTTCAGTTTCCTAGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCG:1 - chr2L 18416660 5' - F-element 4431 1 79.21 TACAAGACGACCGCCATACCAGTATCTACGAGAAGGCACTCTCAACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCCAGACGCT:1 - chr2R 24924496 5' + BS 4876 1 54.46 GCCACACACACAAACACCCAATGCACACGTTTACATTGCCATATAGGTACAGCCAAAGACACTAGAATACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3R 14478615 5' - 1360 3361 1 61.39 CTGGGACTTGCGCAGATCCTCGTCGCCATCCCAGCCGTCGGCCTTGATGGCCGTAAGGATTTGCTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAA:1 - chr3L 1237010 5' - FB 215 1 75.00 AAGTCTACGCGATGTGTAAGATAAGTTAAGCAGTGCCTTAATAAAGTGGTTTTCTATATTACTTTGAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr2L 5611445 5' + pogo 8 1 36.63 AAAGTTCTGGACCACCACCTGCGACTTCTTCGGATCCTTGCGTGCCACCACCTCGCCGCCCACAATCTGACTACGTGGGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT:1 + chr2L 7015734 5' + blood 7179 2 61.39 CTCCTCTTTTTTTGGCATGAGGGAAAAAGCAAAAGTTGCCATAAGATCGCCTAATTATATAATCATCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAAC:1 + chr2L 4377109 5' + gypsy10 48 2 70.30 CTCCTAATTTGCTTAACTTTTTAGCACCAGAAGGAGGAAAATGAGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCG:1 + chrX 12290597 5' - HMS-Beagle 246 1 79.00 GCTAGCCATTTCGGACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTAC:1 - chr3R 19446533 5' - gypsy12 10172 2 54.46 ATGTGCAGTACAAGATTTAATTCAACAGAAAATTTTAAAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAG:1 + chr2L 14892851 5' - springer 432 1 69.31 CGGTTTGTTCGCTGAACTCACGGATTGACTCAGGCACTTGTTCTGGAAGCGCTGTATGCGGTTGCGGTTTGAGACGCTGGCAGTGCCCCACAGCTGAA:1 - chrX 8548452 5' - G-element 3924 1 75.51 TGGGTGCGGAAAATTTTCGGAGATTTAATGTAAAGTGATAAAGGTCTGGCTGCTCTCTTCTTCTAGTTCTACATTATAAATTTCTGAATCTGAACTCGAAT:1 + chrX 2661489 5' - transib2 2551 1 61.39 CAAAAAAAAATATTTTATTTTTCAGCTCCTATTTGCTTCACTCTGACCCTCCTTGCGTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTT:1 + chr3L 15495479 5' + mdg1 199 2 61.39 GAACACCCAACTCCATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACT:1 + chrX 17049521 5' + Stalker2 6 2 73.27 AATAACTATATATCTCAAGTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTCCTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 11240875 5' - roo 391 2 56.12 TATAATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTTCTATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATCTTGTAGATCGCAAG:1 - chr3L 27269888 5' - HMS-Beagle2 7171 2 55.45 CATGCAGAATATCCTTTGTTACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCT:1 - chr3L 7170534 5' - Quasimodo 432 2 80.20 TTATATTAATGGGTTTGGACGCACCTGACTGAGAACAAGATTAAAATAAAGGAGACCGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGGT:1 + chr4 823477 5' - INE-1 545 1 72.28 ATAGATAAAGGTCAAAAATGAAATATTGTATGTAAATTCAATTCACAGTTGCTAAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTC:2 + chr2R 10552700 5' + INE-1 575 1 86.14 TAATATCTGATCTGGACATTGTGGCACCTTCTTTTGCCTATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTGCCCACGTCCAGCTTTAGAGATATGAATTTTCGAAA:1 + chrX 19268357 5' + FB 118 1 63.37 AGAGGAGGGGGGTCGTAATGATGTGGGTGGCTTGAATGACACGTTGCGGAAGTTGTGGCTTAGTTTGCAGCGTGTTCGCACAGCTACGGTCAAAATAATAG:1 - chr3R 6552977 5' + Tc1 2 1 66.34 TACAAAAGTATATTGAATATGGAAATATTTACCTACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTGATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTC:2 - chr3R 8587117 5' + mdg3 157 2 67.33 CTAAGNGGACCGAGATAACGATAAAAGGCCGTAGATAAGTCACCCAATGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCAC:1 - chrX 1190278 5' + Idefix 7031 2 69.31 TATAAATATACAAATACCCAAAAAAAACCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATTCAATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCAT:1 + chr2R 545201 5' + Stalker 7037 4 72.28 GTGCAAGTGGTAAAATTTAAACCGAATTTAATTGAATTTACCCAAAACTGACTGACATTCGCATTTATATTATTAGGATAGTGTTTGCATAAGAGTGCCGC:1 + chr2R 15010243 5' + frogger 2279 1 71.29 GTAATTCAGATAATGGCATAATAGCAACTTGAGTAATACACTTTTTTCTGGGCTAAGATACAAAGATTCCAAATTGGTTTTATTTTGCAAAATGTTATTTT:1 + chr2L 1619326 5' - HMS-Beagle2 394 1 75.25 CGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3R 19535758 5' + hobo 32 1 53.47 GCAACTCTTTTCAACTATTAGTCTTGTTTTGATCACCTTTATCTACGCAATTCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATT:1 + chr2R 24916194 5' + F-element 4291 1 49.50 GTCCTTTTAAGTGTCTGCAGTGTGGGTGGCATGTTTGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCTTGATTGCGTTGGTAACTGATGTGATATT:1 - chr2L 10810021 5' - F-element 4403 1 64.36 AAAATGCTTATGAACAAATTTATATTTACGGCAGTTATTTTACAATAACGTTTCTTTATTTCGGCTATCAGTTCAGAACTAAGTAATACAAAGAGAGAGAG:1 - chr3L 24773735 5' - Chouto 112 1 82.18 ATGGATTGTGGTTCCTGTCACGGAACTTAGTTCTTACTTCTTCGGGTTCTGATATTTATAAACAGCGCCCAATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCCAA:1 + chr3L 19140491 5' + 1360 3117 1 55.45 ATATTTATATGGCATTTGTTAAGCTTTTCATTGGCCCTGTCTATTTTTGGAGATTTTTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 27448570 5' + roo 19 2 58.42 TTCCGTTTTCTGACTGTTTGCCTTCTCTATCCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chrX 22413356 5' + Tirant 8120 2 64.95 TGGGGGCTTACACACCTGCGCTTACCCCCAGGATTTCGGAATGGTCCCCCTTTGCATGTACCATTCGGCTTTTGTGAGTATTCAGAGCATTTTTGATTGCG:1 - chr3R 26531402 5' - Porto1 4333 1 58.42 TGTTTGACAATTGTCAACTTACAATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:2 - chrX 697513 5' - roo 9039 1 58.42 ATCTATTTTAAGTGGCTGTAAAGCATTCAAGGATGTGGGAATACGTTTGTGTGAGTCTTTCTTTAATGAAATGTTGATAAATGTTCAAAAGTGTGGGCGTG:1 + chr3R 19944338 5' - INE-1 253 1 71.29 GTTTCGGGAGTTAGTGTTTTTTATGTCCATGAAAATGGAGAAGCAAGCAGTTCCGAACTAACTGTAAATATGTATGTATGTATTATCTTTATCTTCAATTA:1 - chrX 11798975 5' + Circe 7080 1 74.26 CGCAGTTCGTTCTCCTTGTTACGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGG:1 + chr3R 14035505 5' - F-element 4480 1 76.67 CGGCCCGAGAATTCGAGAGTACGAGAGTACGTGGAACCACAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTG:1 - chr3R 5090564 5' + McClintock 6094 2 60.40 TGGCCAGATATGAATGCCGATTCGATTTGCGTGTGGTTTTCGTTTAGTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGA:1 - chr2L 12992850 5' - F-element 498 1 63.37 ACTATAAACACACTTTTATTTACAGCAGAGCATTTCGAAGTCGCTTCAAGGACCTAGTTGACAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTTGAATCTACCGTAT:1 + chrX 4816806 5' + Circe 7292 1 68.32 CCGAAAAACGAACCCAATCCACATACCAATCTCGAACCAAAGTGGCGGCAAAAGTCACGTTTTTCGAGTGGCAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAA:1 - chrX 18224768 5' + I-element 5104 1 76.24 GACCCTTCGTCTAATTAACTTAGACGACACCACAGTATACTTACTAAACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTATGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCACCGA:1 + chr2L 4907921 5' + BS 4925 1 79.21 TTGTTTTAGTTTTTGATACTGCTTATAACTACATTGTATTTACTTACGTTTTTGCTGCAGCGTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATG:1 + chr3R 21667093 5' + pogo 302 1 68.32 TTTTGGGTCTTTTGCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 12578201 5' + jockey 18 1 56.57 ACAACGAACTACAAAAAACAACGACAATAGTTGAACAACTTTAATTTTTTCAAATAATTGACTTCTTACTCTCCCTCAATCACCGGATGAATTAAGCTCCA:1 + chrX 293774 5' - G3 4542 1 77.23 GAGTAGGGTGCTTACCAATTATACGATATGCTATAAAACTACCAATCATTTATTGTTTTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAA:1 - chr3L 23447521 5' - Stalker4 6944 2 59.41 GATCGATGCCAATGTGTTCTTGGCCCTTTCATGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTT:1 + chrX 422483 5' - TAHRE 10387 1 66.34 AGTCCTATACACACGCCGTTTCGATTCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATG:1 + chr2R 17191273 5' - opus 7218 2 75.25 AACGANTGGCGGTATTCATATGTATACCAACAGGCACTGGATTGTACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2R 5910927 5' + hobo 29 1 56.44 AAAGANAATCCAGCAAAAAAAAGGGCATTAAAGATGCTGTGGGAAAATAGTGGGGGGGAAAACTGTTGGAAAAAAGGGAAAATAACGGGATCCCTGCGGCC:1 + chrX 17375213 5' + gypsy8 322 1 79.21 CGAGTGCAGGCGAAATTCAACCGCCTGGCTCAAAGGGCGGTCGCAACACTTTAATACTTAATACCTGTCAGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTC:1 + chr2L 21321199 5' - G4 3685 1 53.47 CATCGAAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 + chrX 17049568 5' + Stalker2 7301 2 74.26 CTTGACTTTTTATATTTATACACATTTCAAAGGAGATGAAAGCAAGAATGGGACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr2R 11089258 5' + hobo 48 1 59.41 CTTATGTTGACTTTTGCATGGCAACATTAAAATGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTCATATTTGATATG:1 - chrX 10123292 5' + copia 4912 2 66.34 ACAGAGTGGCACGCTGTCGCGTTATCATAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr2L 6177178 5' + pogo 43 1 73.27 CTCACAGAGCATCTATGCACAGTAATTGCCCACAACGAGGACCGTAAAGCGCAAAAGCTTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACA:1 - chr3L 17427704 5' - baggins 4957 1 64.36 ATAATCTAATCTGAATTTATTCTTTCAGAATCTCTCAAGATGCGTATTACTACCGTCTGAAAGCCAAACGTCAACAACCATCTAAGACCATTGAATC:1 - chr3R 4720111 5' + gypsy10 5591 1 56.70 CCACANTCACAACCAAAATTCTAACAAACCCAACCCAAATTGCAATGTGCAACCTGGAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCA:1 - chr2L 7845057 5' + I-element 4957 1 60.40 ATGTTTGTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2L 16252349 5' + pogo 28 1 55.45 ACTGGGAGAGCGAATTTGGGGAGGCGCAATCTTTATAAATAGGAAAAAATAATAATCAACAAACTACGTGCCCATCCGAACAGGTTTGCGAGAGACTTAAC:1 - chr3L 14221352 5' + Fw2 3759 1 63.37 CCTAACTGTAGCAACAATTACAAAGTGAAGAAATAAAGATGGAAAAGGAGGCGAACGAAGGTTGCTTTTGGACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATT:1 + chr3L 2487539 5' + Bica 105 1 74.26 AATATGCTATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3R 22238737 5' - hobo 2908 1 59.18 GCATTCAATTTTCAACCATTTATTTTGCCACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATTGCACTCTTTGTTTTATTATCAATAGTTTACTTATTTA:1 + chrX 17982092 5' - Tc1-2 74 1 78.22 ATAACCAGTCAAGTGGCAGACGGAATTAATGGGCGCGAGTTCAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 - chrX 2253889 5' - Tirant 8465 2 69.70 GTTTCGTTACCAATCGTAATTCCCTTTCCTCCGAAAATCCACCCAATCTCTAAACTTTGGCAGCGAGAGCGCCGCTGTCTAAGAGAGTCATGTGGACATAA:1 - chr3R 9830036 5' - Tabor 7045 2 48.51 ATGACAATAGCCAGTGTGTTCATGTGTGTTTTTTCCATGCACATAAACTCCACGTTTCGCTCTCACTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCA:1 - chr3L 4941220 5' + Cr1a 320 1 74.26 ATATATTTAAGTTATATTTGAGAGAAAAATATGATGATGTTTACCAAACCGAATTTAATTGTATTTCTTTGCACATTACAAATAAGTTTACTTTATAATGT:1 + chr2L 16583444 5' - HeT-A 348 1 71.29 GGGTAAAGATGATTTGCAGACATTGTTTAAATTTGTGAACCGTGGAAAAACTAGATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGT:1 + chr2R 19516422 5' + invader4 2932 2 52.48 AATGGTGATGAATACAGGGAAAAACTAGTCCCTGTGCCAAGCCCATAACCACGCGAATTCCGCAGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGATGTGGT:1 - chr2R 22835426 5' + R1A1-element 4995 1 70.30 GGCCTTCGTTTGGGCCAACCCACCGCACCCACGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTA:1 - chr3R 7671979 5' - hobo 94 1 69.31 ATGATTGAAATGATTATGCACATCACAAACACAACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATAC:1 - chr2R 19316004 5' + copia 4861 1 67.33 ATTTGTGCTCAGACTTCCATTTTTTTTTCTATTATAATTTTTAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGATTTAGCTACCGTTTAC:1 - chrX 159816 5' - 1360 2977 1 68.42 GTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr2L 14536298 5' - blood 7342 2 69.31 GTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGGGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3L 22564832 5' + blood 30 2 67.44 CTCGTGGGCGTAGCCGAAGTGCACCGAAGCAGCACGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr3R 22899187 5' + P-element 38 1 37.76 CTGGGCAAAAGTAATGGAGAACAGATATCCCAGCATGCAGAGTTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATG:1 - chr2R 11251318 5' - F-element 4451 1 57.43 CTGTTAAGTTCGACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 + chr2R 18891015 5' - opus 499 1 72.28 TCGAAAGCGACGGAATAGACACGAGATAATGCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGG:1 - chrX 13949706 5' + F-element 375 1 69.31 GTATATAGCCAACCACGAAGCATATGCATACCACCCTCTATACCCTCTAACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 + chrX 20443626 5' + Quasimodo 59 2 56.44 CTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGA:1 - chrX 21667937 5' + gypsy2 24 2 62.38 AGCTAAGCCTACACCCACTTAATCCACACTGGAAAAACACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAA:1 + chr2R 8851585 5' + F-element 484 1 66.34 TGTCGAATGTGCACGTTTGGCCCGTAATAAGTGGCTACACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chrX 16619673 5' + opus 7038 4 63.37 AGTGGGTGAGGTGCACGGGTTCGGGCCTGGGTCGCTGATCGCATTGGTCATGTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTT:1 - chr2L 3543147 5' - Quasimodo 300 2 65.62 TATGAAATCGAAATCACATCAAAACAAAAAGTTGGCGATACGCAAGAAAGTGTCAGACCAAAGACACTAGAATAACTAGATGCGTAACGACATACGATTTT:1 + chr2L 9633468 5' + 1360 22 1 68.32 CACCCAACCACCAGCATAGCCACCGAAAATGCTCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGTCGACTGCACTGGAAC:1 - chr2R 22095203 5' + Doc3-element 4566 1 67.33 TTTTCTAGGATTTACAAGGAAAACTTTCAATAAGCAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGA:1 + chr2R 10336017 5' + Doc 4504 1 65.35 CGAACACTTTTTTTTAATAAACATAAAAATAAGACAACTTCCACATAATACCTCAAAAAAAGGGCACCATCCACGAAACTAAGGCCCAAGTAAAAACCGA:1 - chr2R 2591008 5' + Fw3 99 1 60.00 AAAATCAGTTGGGTTTGTTTGCTTTTCTGGTGTTTGCAGAAAAAAGGAGGCAGCAGAATGGTAGGGATATTGGGTTTCCATTCATATTTAATGGCATTGCA:1 - chr3R 16378884 5' - HB 468 1 65.35 GGGGAGGGGAGTTACCGGTGTGGCAGAACGTTTTGTGGACACCTAATCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTT:1 + chr3L 21925095 5' - Transpac 4778 1 54.46 CTCTGCAGTTTAGCTCGAGGTAAGGACCATGTGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCA:1 - chr2L 17862644 5' + F-element 314 1 68.32 CTTTCCTCGATTTCTTTCACTTACTTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGT:1 + chrX 11054799 5' - invader4 110 2 75.25 TCCGCTCTTTGATCAAAAGAAACGGTTTTTACAACGAATATTTGGTTTTTTATTTCGATTGAAAATCATTTTAGTATTTAAGTT:1 + chr3L 21136637 5' + Tc1 1549 1 53.57 CTTACNACAAGGACCTTGCTTATGCGCACATAATTACAGACAGCTGGCACCGAAAAGAAGCCACATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr3R 22830995 5' - mdg1 7445 2 63.37 CCTCTNAATTTCGAAGGAAGGAAGGTTCAATCATCAAGGTGGGGGTCACCATTTGGCTGCTTGCTTTGAAAACAAATAATACAAAGAGAGAGAGCTTAAGA:1 + chr3L 378671 5' - Chouto 105 1 76.24 TGCTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 - chr2L 17862277 5' + F-element 23 1 62.38 CTTGGTAGCCAGGCAGCGCGGAGGCGTCAAGGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGT:1 - chr3L 22325322 5' - hobo 398 1 69.31 TATTTGGTCACACTTAGTCCAGGCGCTATTATCATCTGGTAACACTGGTTTTACATGTACGCTCTCTCTGAGGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACA:1 + chr2L 568317 5' + McClintock 96 2 65.35 TTGACGGCGACGGTGAGGCAGTTTGGCTTCCAGATACTAGTACCGTTTCAAAACTGTTGACGTTAACCGTGGTGGTGAACGCCTTTTGCCTAAATTTGCAT:1 + chr4 901029 5' + transib3 496 1 81.19 GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCCCTGCTTGTCGGAGCAAAATGCCATATGCTCACTTGTGGGCGTATAGGGTGCCGTGGTT:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 5271 1 41.58 CAACTTTGTTTAAGCAAAAAGGTAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTG:1 - chr2L 11549992 5' - hobo 278 1 77.23 TAAGCCCCTCTTTATGGCCATAGCCCTGTCTCACTCCCTCTTCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCAC:1 - chrX 18035956 5' - R1A1-element 403 1 58.42 CTTGCATTACACTCCCATCAATGCTATCAATAGAATCTCAGTTCAATTTTATTGATAGCATTGATGGGAGTGTAATGCAAGCAAAGGCCAAATGAGTAAA:1 + chr3L 3430981 5' - 1731 4539 1 72.00 CAATCGGTTTGCTGAATGCTCTTATGAAGGAGGGCGAACGCATTTTAACCTTTTGGTGTGTTAACTTAGTAGTATTAACATATAAGCAATGCTGACGCGCC:1 - chr3R 10782690 5' + gtwin 55 2 42.57 TCATGTTTCCCGGCGTCCCAGTTTTTTCCGTTTGCATTGCACTTAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACC:1 + chr2R 22113595 5' - mdg1 217 2 56.44 CGACACACATCAGCACACCGATACTGGTACACCATCACCATCACATTAACTAGCACAAACACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTT:1 - chr2R 18540158 5' - hopper 281 1 69.77 AAACAATCAACTCGAGCTAATGTGACTTCGCATTGAACAAAAACCTCATTTACGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGT:1 + chr3R 23045986 5' - R1A1-element 5314 1 62.38 CCGCTTCCCGTTGTCTGCACAGAGAAAAAAGAGTTACGATTTGTAATAAGGCAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACC:1 - chr3L 7173908 5' + gypsy5 7244 2 59.41 CTCTCTTTTTGTTTTCCTTCGGCTACATTAGACATCTGCTCGTAAAGGAACAAGCGCCACGAAGGAGCAGCAAATCAACTACGACTAAGCGTCGTAAAATA:1 + chr3R 29972317 5' + Gypsy6A_LTR 212 1 80.20 CTCCACTACACTGCAAGAAAATTTAGCCTTTTAATTAGACATCTACACTTAAACTTTTTTACATTTTTAGACCTCCTAGTTTCACTAAAATGTGAAAAAAA:1 - chrX 10508795 5' - copia 381 1 74.26 TGGGTGATTCATCATTTAAGATAAATAAACATTTTCATTTTTAATCAATGTTTTTTTTTTTAAATAAAA:1 - chr2R 19211122 5' - transib2 2633 1 50.72 TCCTTGGGCGCCGTGATCTCAGGGCCGTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGGAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCG:1 + chrX 21602077 5' + micropia 5009 4 76.24 CTTGGGGGCACTTTTGAGACCAGGAGAGCGCAAGCCTCTTAACAACAGCATGCATATATATTAGCAGCGGTATTATTATTATTATTATTATTATTTTCATT:1 + chr2R 20467052 5' - mdg1 7069 2 82.18 GACACATCACATACATTTGAATGCTTCTAGAACAAAAACAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 9749154 5' + gypsy7 5005 2 43.40 CCGTCGATCCTACTGCGGACTGTTGGGTGGTGTTATCTCGTCGCCTTCGCCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTA:1 + chr3R 6898279 5' - Rt1b 4706 1 56.25 TGCCGTTACACGAGCGCCACTCGTAATCGTAATCGCATGTTGGTGCACAGAAATAAAAATGACGATCCAAGTGCGATAAATACTAACAATAATAATAATA:1 - chr3R 15993928 5' + mdg1 28 2 67.00 GGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 10635246 5' - roo 9043 1 58.16 GCCTCATTAAATTCAGATCACTTTTCAATCAGCTTCTGGTGGAATAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCATTAAATTTATTGATGATATTATGGGATTCG:1 + chr3R 21663818 5' + hopper 346 1 75.25 GGCATTTAAATAAAAATAAACAAGGCAAAGGAATACTTCGAAACACAGCATAGCAAATCATAACCAAAAACAACAAAAAAAAAAATAGGAAAATAAAAACA:1 + chr2R 19694640 5' + Doc2-element 254 1 56.44 CCGCCCTTGATGGAGATACCCAGGCCGTTGTTGTCCACCTTTTTCCTGCTGCTTAGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGCCTACGTACTAAAACAAAA:1 + chr3L 21760213 5' - Rt1b 5039 1 35.64 TAGTCAGCACAAAAGTATGCTAAAATATATTACAAAGTTGCAGGATATCGAATTATGTTTTACCAGTTGAATGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chrX 13401472 5' + jockey 11 1 67.33 GAATTTTTTCTATCAAAAATTCTGCACCCAATTAATTGAAGACGTACAAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 25931308 5' - roo 9047 1 54.46 TGGCCTGGACGGGCCGGAAATGCTTTTAGTCACTGCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTATCTA:1 + chr3L 1686532 5' + Cr1a 4149 1 72.28 GGTGGTGGGTGGCAGCTGTTGTGGGAGGTCGAAAAGGAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATA:1 + chr3R 27357832 5' + I-element 4982 1 63.37 ATTAGAGTTATAAGCTTAGTCCTCAGAGAGTTGAAGGATGGCAGAAGTAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATATCCG:1 + chr2L 17748140 5' + INE-1 88 1 61.39 GCACGNAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGG:1 + chr2L 22719601 5' + 1360 47 1 74.26 CAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCAACCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1 + chr2L 306483 5' + Tirant 8144 2 59.41 GCTCAAATTGATAATGAAAATGAAAATAAGCAAAGCCCATGAAGCGTGTCCGTGAGGACGAGATGGCCAATCAGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTAT:1 + chr3R 31344432 5' + Rt1a 4777 1 62.38 TATCGAAATTAAGCTTACGTTTTTTTGTATACGATGTCTTTTGTAAACTCTTGCACTTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGTGGTTTTGTATGTGAATA:2 - 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chr3L 10363719 5' + gypsy10 426 1 71.29 GGCGATACATTGTGTCAATTCGGTTCAACTATGATTATTTAATACAAAAAAAAAACA:1 + chr3R 19445006 5' + transib2 2636 1 73.68 CGTTTGAAGAAGTACTTGTAGAATTGCATAATGTGCCCATCTACAATTTATTTCCATGATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGC:1 - chr3R 9475449 5' - Stalker2 7491 6 61.39 CCACAGAAGACAAGATGAGCGAAGGGGTACCAGCGTCGCCCGTGGCCATTGGCGAACTCAAGTACGAGGATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGA:1 - chr2L 9966878 5' - roo 8795 2 72.28 GTCTGCGCTATAAAACGATTTAGAAAATTACACTGATGAAATTAATGATGCAAGTAAAATCGTTTAGCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 + chr3L 10378892 5' + mdg1 11 2 61.39 CCAGAGATTCGCCTAGACGAAGGACAGAAGTTTGGAGCCACTACAGTGCCTTGGCTAGACGATTTCTGTAGCGCTCTAGCCTGTCGTGGTACCGGCTGGAG:1 + chrX 17079571 5' - BS3 1477 1 58.42 GAAGTACGTTAGTTGATTCGCGTTGCTCCTTGAGCTCCTTCAACTTTCCCACACAGATTATGTCAGGTGCATCATCTTCAAAAACAACAACAACAAAATAA:1 - chr2L 15027668 5' + gypsy11 3933 1 56.44 CGGCCAAAAACCTCAAAAACGAGAACGTCAAGCACCAGAAACTGAAGAATGGCGTGGTGAAATCAGAACAGGAGACGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGC:1 - chr3R 19904307 5' + Rt1a 4965 1 80.20 AAAATATACAAAAATATCTATACTGAAATGGTGGGGGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCAC:1 - chr3R 14055011 5' - Circe 7205 1 63.37 CGAAAGAAGGACTCTGCTGAGATGGCGGTGGAAGGAAAAACTGAAAAATATCAATTATATTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 17663299 5' + pogo 12 1 47.52 GGCGTCTTGCATGGCTGATGCTAAAAATGCATCATACCAGATGCCACAGTGACGAGACACTCCTTCCATCACTTTAAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTT:1 - chrX 19425356 5' - Porto1 309 1 69.31 CTTTCAACAAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chr2L 14536321 5' - blood 7365 2 54.46 ACAATTACATCGCTGCACGCAAAGCTAAATAAAATTACGCGTTCGCAAAGTGGGAAATAACAAACAGTGGAAACGTCTGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACA:1 + chr2R 15004410 5' + gypsy8 488 1 54.46 CCAAAAAAAAAGCTCAATTAACAGCTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGA:1 - chr2R 5850948 5' - pogo 1820 1 78.00 TACGAGTGCCAAGGGAGGCAAGGCCGTGGTTAGCAGCAGTTTGATTGCGGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAAT:1 - chr3L 16529654 5' + copia 5051 2 54.46 CAACANTGCATCGTAAAAATATGCGCATATCAAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3R 31683959 5' + hobo 51 1 74.26 TCATTTGACAAGCGTTTCAAAACAAATTTGATTTTAGGATTTGTTTTTTTTTGTTTTTATACAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCG:1 + chr3L 17040729 5' - Quasimodo 316 2 67.33 GAGAAATGTGCCTTAATAAAGTGGTTTTCTATATTACTTTGAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2L 5611381 5' + pogo 33 1 59.41 GCAGGATCGGCCTGAGCCTCAGCCCCCACAGGCTCAGCGTTCAGGAGGACAGCCTCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCA:1 - chr3L 16557267 5' - ZAM 87 2 57.58 AACGGTACGAACAAAATTGTAAGCTAAAACGTGAGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 14913137 5' + blood 7029 2 62.38 GGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAA:1 - chrX 22386756 5' + hobo 91 1 68.32 GTATTTCATAGACTCGCACACGACGGACTTTACGGGTTTTATCGACGCTTTTGGTTTGCCTTAAAGTATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCGAGTC:1 + chr3L 7952704 5' + INE-1 92 1 68.32 GTATGCAGTTATGGTCGCAGCACAGACACAAGTGTTAGCGATTGACACAGATACTCAGATACTCGCACCCTGAGATCTCGACTTTCATACGGACAGACGGA:1 - chr3R 14758947 5' - INE-1 126 1 73.27 CGCGGCTCATCCTACTGGCCAGAGCGTTGTCAAATCTAACAGCAAATTGAACGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGAAT:1 - chr2L 5910151 5' - GATE 354 1 67.33 AAGATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - 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chr3L 15459992 5' - G7 846 1 73.27 TGATGAGATGGTGTTATCCTCCGAAGATTTGTACCTTGCTAATGCATTCATGAAACCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2R 10029495 5' - roo 389 2 59.41 TCATTCTGGCATTCGCTCATTACACTCATTTCGCATAGTTTGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAGTTAAGTTAATATCTAAT:1 + chr2R 8272481 5' - I-element 5243 1 64.36 ATGGCACTGGCTCCTAAATAGGGATTCCTCTTTACTGGATTGCATTCCACATTGCATTGCTTATATCCATTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCAACCCACTTC:1 + chrX 18029891 5' - invader2 273 1 60.40 TGGTGTGTGGAACGTTTCTATTTGCTGTTGCTGTGGCAGCTGCGAGGCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTTCATTAACCAG:1 - chr2R 11454241 5' + Gypsy6A_LTR 166 1 69.31 AAATTTCACGACTAACCTAATCTAAGGCCTAACTCACCGAACGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACAT:1 + chr2R 10294421 5' - accord2 115 2 55.45 ATTATTATTTTAATATTTTGTGCGGCAATCATTTAATATTCAGTATCCGCCATGGTTGTCTCACCCGCCCACATCCAAATCCTCTTTTAAGAAAACTTATT:1 - chr3R 20385043 5' + Doc3-element 4533 1 78.22 TCACAAAATCAGTAAACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr3R 14832377 5' + blood 8 2 69.31 TATGGCCATGGCTACGAAATCTTTGCACTAGCTGCCACTGCAGATGGTTCCCTCTTGGCCTCCACTTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAA:1 + chr2R 10647680 5' + P-element 175 1 71.29 AACCCTTTTCAAAAATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACA:1 + chr2L 14536236 5' + blood 24 2 53.47 AAGCAATCTGTGATACATATATATATCTATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 - chrX 3003699 5' + Juan 51 1 71.29 ATAGGTGTTAAAGTTCTGCTTATCGCGAGTTAATAACAAATAAAA:1 - chr2L 7302703 5' + HMS-Beagle 385 1 82.22 AGTATTGCAGCCCCATGGTCTACACCCAAAATTTGGGTCACTGCGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAA:1 + chrX 5153936 5' - Quasimodo 6938 2 57.43 CGTCTATATCAAAACGTATTTCATGCACATTAGTTGCGCTTTTATGAACTTCAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAA:1 - chrX 12152928 5' + flea 468 1 55.45 AATAATAAAATGAAAACCATTACTGCAGCGCACCGACTATAATACATGCATTAAAAAATTAAAAGCATGCCAATCATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGA:1 - chr2L 5652291 5' + 1360 267 1 81.19 GCTGTTGGTTTCCCAGGGTTTTCCCGGCTGACTCTGCTTGTTGCGAACCCATGACATGGAGAATCAACAGCATTTACGAACTTCTC:1 + chr2R 16914011 5' + Burdock 5948 1 58.14 GCTGCCGCCAACTAAGATGATGCTTTGCAATCTTAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chr2L 18568062 5' - I-element 5315 1 68.32 TGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chrX 21087569 5' + mdg3 5265 1 62.00 TCCCATACCGCCATCCAGCCACTGTCGCCCGCCAAGGGAGCTCAGTCCTCCGCCAACTTCCTTCCACAAACATGCGTGCACCAACACTGAACGCATCTGGA:1 - 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chr4 829452 5' + INE-1 547 1 62.38 GCGCGCTTGCACGAACGCCACGCTGACTTCCACTCTACTCTACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACA:1 + chr2R 23562376 5' - flea 4825 1 77.00 TGTGTGACCAAGGCATTAGGAACTTATTATTGAGTTATAAATTACAAATCTAGCAATTAAAACAATATTTGTTAATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTA:1 - chr2R 10928137 5' + INE-1 98 1 72.28 ATCCGGCAAACGTTCGCGTATGATCTGCAAGATACGGATGGAACATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2R 14582922 5' + roo 7 2 68.69 CACTGCCGTAATCGCTCCTCCTATCCGTGTACGGAAATCCATGTGACAATTGGGTCTTAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAG:1 - chr3L 21611176 5' - Idefix 7259 2 56.44 TTTGCCGCAAGCTCCAAAGAAACGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCA:1 + chrX 22747885 5' + Doc 320 1 78.00 ATTTCNCGGGTGTCTCAGTTTGTCCGGAGGCCTGTCCTTAGCCCACGATTTTCTCGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 + chr3R 16787524 5' + 1360 84 1 73.74 CATCTGCTTGCCATTTGATTCGATTCCGAGAGTGGAGGAGTCCCCCCAACACCCGACACAAGTCTCGACACTGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACT:1 + chr3R 27149001 5' - Ivk 316 1 75.25 CCCATCATTTCTCTTGAGTCGTCGTCGTATCTCTATGTGTTTTTTTTATATTTATTTATTTGGAAATACACCGTTGCCCCTGGAATTTTGTATAAATCAAT:1 - chr2L 14391105 5' - Tc1-2 440 1 60.40 ACCGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3R 22352799 5' - 412 446 2 70.00 TTGACATTTCGCACAAAAAACAAAAAAAAAATCGAGATGAAAAAATCGAAAAAAAGCAACACCAATAGAAGGAGTGGAAGCATAAGCTTCCCTTTTAAAGG:1 - chr2R 17618849 5' + rover 6924 1 44.55 AAACAAATAGCCAATCAAGGATCAGTAAACACATCACAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTT:1 + chr2R 4745663 5' + R2-element 3464 1 68.00 GCCGAATAGGATGCCCGGCATGCTAGCCCATTGGCAGCAATCGCAACAAGAAGGAGGAGTTTAGCAAGCACCGTGCGCATTATAACTGGCCTTCTTACGGG:1 + chr2R 1246721 5' + baggins 5126 1 72.28 AAATTAAAACTAACAATAAACCAATAACGAATTCCAATGCTCAGTTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTA:1 - chr3L 10464713 5' - invader3 5445 2 59.41 GAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr3R 19535770 5' + hobo 20 1 59.41 AACAANCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAAGGGAAAA:1 + chrX 7480771 5' + Doc2-element 227 1 59.09 CGATCTTACCCTAACTGGGCAATAGGTATATTATCAATTTTGAAATTTAAATATCTATTGTTACTATCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 1270760 5' - roo 9060 1 38.61 TGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3R 15072557 5' + pogo 14 1 62.38 GCCCTATAGCCCCCACTCATTTGCCAACTACAACACCCCGCCCTCCATGGAAGGGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCA:1 + chr3R 8185556 5' + Doc 491 1 56.44 TTGATCGGGTTTCATATTAAATTTAAAGAGTTACTCTACTTTACTCTGCTTCTTTAATCCGATCAATCTGCTTCGTTACATAATGAATAAGATCAAGAAAT:1 + chr3R 7004304 5' - gypsy12 10081 3 76.24 CATAATAATGTGCGACCGAACACAAGCCGCATGTTTTGACTTTGGATGGCAGTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATATAGGCAG:1 + chr3L 21449584 5' + invader2 4977 2 54.00 ACGTTAAATAGTAATCTAGGTGTGGTGACAAGAGCTGGGAAACAGCGCAATGACTAGAAGGGGAAGAGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGGAGGA:1 - chr2R 12930602 5' + R1A1-element 342 1 69.31 GTACANGTATGCGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 + chr3L 17858159 5' + HMS-Beagle2 26 2 57.43 GTTTGATTATGCCCAGCACACTTCGGCTCGTCTTACATGAGCATTTCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAAC:1 - chr2L 6536813 5' - invader4 253 2 56.25 GTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAG:1 + chr3R 26331644 5' + G-element 34 1 53.47 CAAACCCGTCAATCAACCATTGATCCAACCAATCTCAATCTAAGAACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCA:1 + chr2R 24912987 5' - copia 99 2 55.45 CCATGGATTAAATGGACAGGACATTATCTGGCGCACTTAGTATGCACCATTCTATCACATAGCCAACAAGTAATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTG:1 + chr2L 18283476 5' - Cr1a 477 1 71.29 TCAAGAGCTAAGACATTTTATCAGCCTTTGCCGGCGCTTGGCATCTCGCATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGC:1 - chr3L 15450201 5' + Doc 4550 1 51.49 GATTCGGATCGCGGGTGGCTATAAATTCGAAATGAATTACAATGCACAGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chrX 8714573 5' + P-element 29 1 50.50 GCAATTATAATTAATTATGTGGGTCTAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCC:1 + chr3L 14353359 5' - hopper 9 2 75.25 GGACGAGGAGACGAGACGGTACAAGACGATGGAGCCAGGAGCGAGACGAATAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 27448483 5' - roo 9045 1 52.48 AGAGTGTGAACACAAAAAACGAATGACAAACGAAAAATATTAAGATTGCACAGAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGACGTGCCACTCAGTCTAAAGC:1 - chr2L 18568115 5' + I-element 30 1 46.53 CAAAGGGCAAGGGAACTATGTGATGATGGCTTCTTTTCCTGCACTTCCGCTGTCTAAGAGAGTCATGTGGACA:1 + chr2L 2021793 5' - Tabor 7048 2 75.34 AAACATTTACTTTGTAATTTCAAGTACTCGTAGTTTCGATATTAAATTGATTTGAGTCTTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 + chr3R 12789828 5' - flea 244 2 69.31 GGAGGTGGTGGTGGCAAGGAAACTAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGAAACTTATATAATTGGCGCCCAACC:1 + chr2R 21027846 5' + gypsy 472 1 74.26 TTGGACGTGGACGTGAATGTGAGTAGGCACTGCGAACGTAGGCACTGCGAAGAAAACAAGCCGACTTTAATTGTTTTTCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCA:1 + chr3R 19715130 5' - Idefix 7166 2 59.41 GTAATGACTGTGAAAATTAATGTCGTCATATTACTCATGCACCCAAATACAGGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTC:1 - chr3L 85532 5' - jockey 4772 1 61.00 TAGAAGAGCAATTAGTATAGTTTTACGTTATTATTCCACACACAGTTCTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTTGCC:1 - chr3L 4182983 5' - mariner2 754 1 71.29 AGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 - chr2R 15002430 5' + 3S18 29 2 50.50 AACACGCTGATTTACGAAGGAAAAATGAGAACAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr3L 947874 5' - hobo 2901 1 66.32 ATTGTACCCGTAGTTGATATATTAAATGCGCAATAAATATTTGGTAGAAACACTGGCGTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 9376247 5' + roo 8710 2 53.47 TTTAAAATGCAAATCGTGTTTTATTGTAGAATTTAATTGAGCGCAGTTCGTGCGAGATCAAAGGGGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATT:1 + chr3R 13905086 5' - Quasimodo 295 2 65.35 CGACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 9868618 5' + roo 8706 2 72.28 AAAACTAACACCCAAATGGGAGCTGAAAAGCTGATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr2L 9774284 5' - 412 7519 2 61.90 CCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:3 + chr3L 22052788 5' - mdg1 7406 2 78.22 TCAGTTTCAGTTTTAGTCTCAACTTCATCCCCATTTCCCAATCAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAG:1 + chrX 4117913 5' + baggins 5352 1 61.39 GGTAGCCCTCCTTTGGCGTCAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTCATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 5640386 5' - roo 9017 2 80.20 CTGAACATTTTCCGACGCTTTTCCAATTTTACGACTCGAATTGTTCGACTGCTTGGTGTTCGGTTGCCTAGTCAAGATTAAAGATAATAAGATAAA:1 + chr2L 18285627 5' - Cr1a 4218 1 70.83 GGCTGCAGCAGGTGGCGACTAAACAAAGCGAAATAGGCGGTTAATAATAGGTTGGCTGATTGATGACATAACCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCAT:1 + chrX 12595314 5' - HMS-Beagle2 75 2 75.25 AATTGTGGCTTTTTCGGTCAGTTTGTGTGCGGTCAGAGGATGGCAACCATGTGAGCAGCCGTTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCC:1 - chr3L 7449020 5' + invader4 2981 2 57.43 GACGCCCACGTGACTGCCAGTTGATCCTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTG:1 - chr2R 10689520 5' - flea 43 2 73.27 CCCCTTTTTCCAGCCAACAAAGAAATTCCCTAATAATAAAAAAGGAAAAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAATGGGCAAACGATTCCAG:1 - chr3L 10543033 5' - FB 50 1 53.47 TTTGGTGCTGCCATATGAATCTGTCTCCTTTTTCGACGTTTTTGTTTGGCTTACTTTACGTTAGAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2L 3834452 5' - opus 7494 2 37.62 ATAAATATCGCAGAGATATTTTGATTTTATTTTCTAATATTCTACCGATTGACTTTGCCATGGCCGTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCG:1 + chrX 19806383 5' + micropia 14 2 56.44 TCCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2R 21266508 5' - roo 9052 2 61.00 TGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chrX 11060497 5' + I-element 46 1 68.32 TAAGCTATAGTGGATCTAATTGCAATTTTTCATGGTAATTACTTTGATTTCCCTCTGTTTTTGCAGCTCTGGAGCGTGTGCAGCTAAACGGACGCATTCCC:1 - chr2R 22415096 5' + gypsy5 182 2 72.28 TAGGCTTTTAGACACGTTCTACCCCCGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 + chr3R 5946114 5' - HMS-Beagle 199 2 73.27 TTACGCGTGGAAGGTAGAAAACCTATGAGTGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCAC:1 - chr3R 31253745 5' + G6 1982 1 70.30 TATGCAGCGCAATTTTGAAGCTGACATTTTGTTTGTTCGCTCCTACGAGTATTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:3 - chr3R 17505020 5' + jockey 30 1 53.47 TGTAAAAGAGCACAACTGCTCTCAAACCAATATTGATATAGGTAGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr3R 4806559 5' - P-element 2855 1 45.54 TATCAACACATTTTTCAAAAGTTGGCAGTTTTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAT:1 - chr2R 5212082 5' - INE-1 125 1 67.33 TCTTGACCTTGCCAGCGACTTTGATGGGCTTTTTTGTTACCAACCCCGGGAGTTCTCTTACCAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGAT:1 - chr3R 24837257 5' + I-element 337 1 58.42 GCGCAGAATTTATGCTAATATCCATTATGTCGAACATGTTATAGTTTCTTCCCTCGTTCCATATGTATGCGCCAATTATTTAAATATGGATCGCACCGTCT:1 - chr3L 21785521 5' - Gypsy6A_LTR 393 1 70.30 CGATCATAAGCATTATGATAATGATCGCAATGATGATGCTGTGCTTTCTAGGCACTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTG:1 - chr2L 2167209 5' - G-element 318 1 57.43 CATAATTCTATTGCTTTTTTAAACCCCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCG:1 - chr3L 25751324 5' + Max-element 8287 2 73.27 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 19450169 5' + roo 8702 2 66.34 TGTACAAATTGATTAACAATTCTACGTATTTCCAAATAAATACAAAAATTATTTAAATAATCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCATGCCT:1 + chr3L 19960042 5' + I-element 17 1 62.38 TGATGATAAAGGAAAATATCGCCTCCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACTGTAGAGGGTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAAC:1 + chr3L 22423273 5' + I-element 5120 1 75.25 GAGTCNGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACG:1 - chr2R 4879041 5' + G-element 13 1 67.68 AGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 22675815 5' - 412 7506 2 66.34 TTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chrX 5104622 5' - roo 9028 1 73.00 ACACTCACACACACTCGCAGACAGATGGAGAGACTGCGACTGTTGTAATATTTGTTGCCATCTTACAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAC:1 + chr3L 13677117 5' - Tirant 1 2 70.30 ATTGGNCTGGATGTCCAGCACGGCGTTCTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGGCGGTAGGTGGTA:1 - chrX 11824356 5' + Rt1b 5092 1 70.30 GCATGCTGCATGTAAATCGAAAAGGGCAGGATGTGAGTACCTAAAATAAATAAAAAACAAGGAAGGAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 + chr3L 23027551 5' - INE-1 556 1 46.53 CAATGCACCAAATGTTACCTAATGTTTATAGGCTGATTATTTAAACCCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 9463371 5' - roo 9043 1 58.42 AGCCGNACGCCGCTACTCGGCCATCTTATAAACACAGGCCACATCCTTCCCCGCCCACAAGCCCACAAAAAAAGAGAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTC:1 - 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chr3L 23123909 5' + Tirant 8112 2 76.24 TTGTAAAGAAGACTCTTTTTCCGGCATAGTGGTCTTACTCTGAGGCTAATCGCTGACGCTCACCCATACCATGAAAACTCCGTTATCCACAAGGAGCTTGG:1 + chr2L 4511895 5' + G-element 4028 1 61.39 CTTCTATTCTTAGATATATCTAACAAAGCTAACATGGCTCTTTGTTAATGTTTTTTTTATTGTTAACAGGGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGT:1 - chrX 14597504 5' + BS 5000 1 72.28 GATTCCACATTATATAACGTGTGAGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAC:1 - chr3L 5712153 5' - Stalker4 7208 4 76.24 TGAGAATAAGGGGGAGCGAAGCGCAGAGTAGCCGCTGTCGGCGTCGCATCAAGCAATCTTTGAGTTATCCTACCGGCTGGGCCAGTTAAATAGTTTTTAAT:1 + chr3L 14755647 5' - McClintock 482 1 55.45 AATGTGCAAAATTCATGTTTTGTCAAACTTAATTGGAAAATTGAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTG:1 + chr3R 15120668 5' - gypsy2 6597 2 64.36 CTCTTATGTATATAGAAATGTTCGAAAGCTATTTGTTATATTTGTCAAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTG:1 + chr2L 8877998 5' + 1360 447 1 62.38 GCCGAAAAGGATATACATACGTATGTGAGTACGATTGTATTCATTGAACAATTCTGATGACACCCAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATAGAACAATGT:1 - chr3L 10246304 5' + BS 383 1 55.45 AAGTAACGATTAGATAAAGAACTCAATGGCCAGCAATTTATGAAAGTGATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 17788978 5' - roo 9042 1 56.44 CGCCGCGCTCATAATTTATATCAGTTTTGTTAACTCAACGTGACTGCGTCGCGGGATCTCGCCGGAATAGGCTGAATTAATAGAGACCAAGATGACAAAGG:1 + chr3R 17292338 5' + BS3 1722 1 73.27 GAGCTTTTGGCAAATTTGAATCTTCTTCACACGCCTACACCTACACACGCATTATCGCTTTAATCGCTTTGTTTTTATTTGTTTTTAATCAATTTTATTTT:1 + chr2R 16135686 5' - Tc1 389 1 70.30 CCGGCGAAGAGAATAAGAATTCAATTATGCAGCAAAATGTCACATGGGACGGCTGGCGAAGGGAACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGAT:1 + chr2L 14681334 5' - diver 5763 1 65.35 TTTCGTTTGCCATAGAGTGTGGTAATCAGTTTTCATGAGGCAGCAGAGGCAGCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAAC:1 + chr3L 18200526 5' - invader4 2918 2 52.48 TGAGCGTTGGGCTTGGCATGACTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAAC:1 - chr2L 11821897 5' - 412 7156 2 78.22 CAGTGTGGGTGTAGGTATTTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACAT:1 - chr3L 9072434 5' + accord 230 2 38.78 AGGAAAGGACAGGCTAGTATTTTTGCTTTTGGTTGCGGCGTTGGGGAAGCGCACTCTTCACTTAAAGATTTTGGAACTGTGCTTGGCAACGACGGAAAGCA:1 + chr3R 4918413 5' - Doc4-element 133 1 79.21 AAAGCCAGGCGAGCCCAGGCGAATTAAAGCGAGAAAAGCATGTGCAAATATAAATCAAAATCAACGAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr3L 6624159 5' + jockey 78 1 71.00 AGCACTTTATACCTTGGTAGGAACTGCTGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTAGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAACGT:1 - chr2R 6829655 5' - I-element 329 1 68.42 TTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGAC:1 + chr3R 26331638 5' + G-element 28 1 52.48 TTATTGATTTAATTGAAGAAACAGCAGAACCTAAAACGGAAGTTATTACGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACG:1 - chr3L 11001383 5' + I-element 490 1 53.47 GCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTCTGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGAAAATTCTATTTTTAGAT:2 - chrX 3464218 5' + 1360 3267 1 55.45 TCTAATATAAAGAATTAGTAAGTAATGCGAGTTATTGTGTACAGCCACTTCGCGTCGCGTGATCTTGTCGCGCGTTTTGATTGGCCCAGCCAACGTACCTA:1 + chr3L 6930444 5' + G6 126 1 59.41 TAAAATCAACAAAAGCATTTAACGCGACGGTCGTCAGTCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGC:1 - chr2R 8812030 5' - F-element 408 1 62.38 GCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3L 8763224 5' + jockey 37 1 59.00 TGTAGAAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2L 22719635 5' - 1360 3340 1 73.00 ATCAACCACCACCCACTTCTCAAAATGTAAGGTCGTTGTCGTCGCTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chrX 6157892 5' - Doc2-element 222 4 54.55 TACCAACATTATTCACATTGTTCGCTCGGAATTCCTTAGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCT:1 - chr3L 22911137 5' - jockey 4580 1 62.38 GGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3R 19535707 5' - hobo 2895 1 68.37 TACGGGAGATGCGATGAGGCAAAGCAAACACCAAGCTAGTGAAAATATGCGAACAGCGTAATGAAATTGTTGCAATAAATATAACAGGTATAGATGTAAAA:1 + chr2L 18169701 5' - Stalker4 392 1 79.21 CAAAGTCGAGTAGATCGGTCATATAGATCGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 13824328 5' + roo 8674 2 68.32 CCATCTGAAAACACCATCAATAGTCGATTTCAATTTCGTTACTGATGGATTTTTGGTCGACAGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 - chr2R 4536692 5' - mdg1 7441 2 61.39 GAGAGTGAAGAAACGACTGAAGAATCTCCCTTTGGGGGGGCCTATAAAAATCTCTGCAACTCGTGGGAACAACTAGCCCAGTCGCTTACGGACAGTCCGGG:1 - chrX 8795644 5' + baggins 283 1 60.40 CGAACCTGCTGCTGACACACGGCAAATTGTCGAGTCCAGTCGCAACACTTTGGCAAACACAAAAGCCACGCCCATTTTCCCTGAGCAAGTCGGTAAAAATA:1 + chr3R 20983106 5' + Circe 7380 1 59.41 TCATTTTCCTAATATTCCCATTCGACTTGCAAGCTACCTACTCATTACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTCTC:1 - chrX 21131925 5' + INE-1 573 1 66.34 TACTATAGCTGATAGTGTTAATCCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCC:1 + chr3L 8165208 5' + 297 182 2 78.22 ATATCTCAGTTTGTATGTTGACAAGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTT:1 + chr4 497914 5' - F-element 4443 1 75.76 AAAATCTACATTTGAGCTGGAAAAAACACACGTAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAA:1 + chr2L 9244780 5' + hopper 983 2 76.24 TTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGCATTTCACGACTTTATTCTTTGGATATCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGAT:1 + chrX 124083 5' - 297 260 2 60.64 AATGAAATCCTTTGGGTTTTCTTTAAATAAGTACAGATCATCTTCTGAATACAAAACCACAAGAGTTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTC:1 + chr2L 4699603 5' + Copia1_DM 157 1 67.33 GGTATTACTATGTGATAGATTCTGGGGTGCTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3L 3254945 5' + 1360 5 2 75.00 ATATTAATATCTAGCTAATAACTGTTTACTTTGTTGTATTTTATTACAACATATCAGTAATTCATTCCCATATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAA:1 - chr3R 7512644 5' + copia 8 2 71.29 AATCATTATGTTTTTTAAACGTTTTAATTTGTTAATACACAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr2R 4784808 5' - 1360 3369 1 56.18 TTTTTTTGTGCAACCAATCCTAACAGAAAGGAATATCGTTGAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3R 31143425 5' - roo 9039 1 57.43 CCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAAA:1 - chr3L 24916685 5' + Porto1 154 1 61.39 TTTTCAGCACTGAAAAAGTTCTTTACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3R 25931388 5' + roo 28 2 55.45 GATTGGACTTAATTAGGCTCATTTTGATCGTATTACTCGGACGCTGGAATGCTTATGTGGTCAATGGTGGTTTTTTGTGTATTTGTATATTTACGTTTATT:1 + chr3R 27270011 5' - Stalker 86 4 69.31 AGCGCGTGTGTCGGCTTTAAGTGCTGTCGAGGGGTAGGGTATTGACGGGAATGTGATGTTATAATCGACTTTCCCTACTATCAGATACCCGTTACTCAGCT:1 - chr3L 23255390 5' - INE-1 545 1 55.45 AACATAATAAAAACCCGCACAGTATACTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2L 15622726 5' - mdg1 7407 2 76.24 GGAGGCCTATAATCGCACTCTCCGCTGGCAATCCAAGCCAAGATCAATCCTTGAGAACTTCTCCTCGTTCACCAACGCAATCACGGAACTTAAAGAAAAAT:1 + chr3L 16860133 5' + F-element 4427 1 75.25 AAAAATAAGTGAAATACAAATGGGACCGTATGGTGAGGTCCCTCGGCTGTCTCCTGTGGGGCCTTCATGGTGGGCGAGCTCTGGACAGTGCCTTGGCTAGG:1 - chr3L 20710937 5' - BS3 1519 1 79.21 ATGGTTTACCTGGCTTCGGGTTTTTGGAGTCGCTCGATGTGGAGTTCGAGGTTCCTGGAAAGGCTTACACTGGGGGCCTTCAGAGTATCCAAGGATTCCTC:1 - chrX 20968507 5' + GATE 8313 2 61.39 AAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTG:1 + chr2R 22525786 5' + jockey 183 1 57.43 TAACAAAATGCCAGCGAAGTTGTGAATCATATAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3L 9552141 5' + roo 44 2 70.30 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAACAGCGTGGTCTTGTTTACTTGTTTACTTCCAAATACGGAAA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 48 1 69.31 ATGATTTATTTGCTTACGCCCCAAACTAGATACTGAATCATAAGCATGGTACTTTGACCAAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 5469888 5' - roo 391 2 53.47 CCACTGATGATGGTACTTAAAATAATAGTAAAGCAAATGCTCGCATAAACAACAATTAAACTTAAACGCAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTC:1 + chr3R 9174793 5' - Tabor 6881 2 75.25 TCCATTCATGCGCGTCACTGAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGTATCCATCCGTACTTATTTTACG:1 - chr3L 23112565 5' - R1A1-element 5320 1 76.06 CCGCAGGAGTGTTCACTGTGCTGCCTTTCCAGCACTCAGTGCCCACCGATTTAGCACTGAAATGTCGCGCAGGCGCAACACCATCAGCCAACCGGCAAATC:1 + chr3R 15463153 5' + gypsy3 6901 2 80.20 AAAAACGCGTCTGTCTAACCATTGCAGACTAATCCGGCTGTGAAGCCGGCAATGCTCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGTGCACGGTGTTTTTCCCGTGTG:1 - chr2R 9126219 5' - baggins 5102 1 65.35 AAAACNCGAAACAAATGTAGGCCTTTTTCTGCTGGGGTGTTTGGCACGTGACTGTGAGGAGGGGCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGC:1 - chr3R 7825382 5' - F-element 4324 1 66.34 CGAAGGACTTAACAGTCGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATC:1 - chr2R 21421094 5' + springer 7142 4 62.96 ACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAA:1 + chr3L 25232772 5' - accord2 7595 2 56.44 TTCTGNGGTGGATTTGGTCTTAGCCCCGGCATGTAAATGTATCGTTTAATCCTTGCGATGGCAACAGTTGCCGTTGAGAGCGCAATTCGCGTTGGCTCTTT:1 + chr3R 16865464 5' - Doc3-element 220 1 72.28 TGGACATCATTGAATTCAACATTTCTAGTTAGTCGATACTTCCACACAAAACTTACATTTTACTTTACAGAAGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACG:1 - chr3L 1971326 5' - accord 7193 2 77.23 TTAGATGGAGTGGGATAGGCTCCTGGCCCATCCACTTGGGGGGTGACCAACCAGGAACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGTGCGATTTTGTATCACCTGGAT:1 - chr3L 14971640 5' - Helena 1123 1 55.45 AATATGTATTCCATGCGCCTTTCAATTTTGTTTTTTACTGGGCAAGTTATGTTAGTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr2L 9346157 5' - Transpac 5210 2 45.54 ACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr2L 5932127 5' + jockey 58 1 70.30 GGGCGNGTGGCTCTTGGAGCGCTTTAGAAATCAACCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGG:1 - chr2R 19465379 5' - Quasimodo 7064 2 73.27 ATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGAGAAGACGTTTTTATAGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3L 14005629 5' + F-element 44 1 52.48 AAAAACGAGAGCTGTGCGGCGCAGAGAAAATGTTGCTGGCCAAATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGGTTTTAGAACTGTGTTGTATAAC:1 - chr3R 13935610 5' - Doc4-element 2571 1 66.34 CAAAATCCCGCATCATAGTGAACAAATGAGAGTGTAAAACCACATAAATTTTGCATAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3L 3947412 5' - roo 9054 2 60.40 GACAACGAGCGCAGGGAAAATGAAAATCAGCCACTGCAGCTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTC:1 - chr2R 8669487 5' - jockey 404 1 61.39 ATATGCGTGACTATGCCGAAAAGCTGGAGGAGAAGATCGACCTCATAAACAAGTGCGTCTGAAATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGAC:1 + chr3R 30602316 5' - baggins 5049 1 61.39 CCGAATTAAACGTTACTTAAACATTTTTGATTTAACTGAAAAATTCTGTTATATGCATTGTATTTTTTTTGTAGGAATGTTAATGTAAAATCCCAAATAAG:1 - chr2R 6247349 5' - roo 412 1 79.21 CAAAGAAGATTGAAGATTTGAAGATTGAAATGGGAGAAGAAAGCAGAAGATAGAGTTTTCGACTATATAACGTAAATATATTCTTGATCAGGAACAATAG:1 + chr3R 30368448 5' + INE-1 85 1 56.00 GGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACG:1 - chrX 22867380 5' + HMS-Beagle 51 2 78.22 CAAAANAGGTACTCCCTTCGAGGAGCCCAATATGATTATGAGCATCCATAGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 - chr2L 11165401 5' - transib2 2795 1 52.48 TGCTATGCAGAACGTGATAACCGACAGAGATTCAGTGAAAACCAGACGAGTAACCGACGAACATAGCTTTTAGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCT:1 - chr2L 13921596 5' + 297 173 2 74.26 GGCCAAGGATCTGGAATCTAGAGCAAATGTTTGGACCCGTCATGAACCCCTCGAATAAATATAAAAAACTCTCAGCTTCACCACGAATAAGCTTAGAAATA:1 + chr3L 10129785 5' - Cr1a 4045 1 61.39 TAGCTATATATACCTATATTCAAAGTCTACGCGATGTGTAAGATAAGTTAAGCAGTGCCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2L 5611467 5' + pogo 17 1 63.37 CCTGAAGATTGAGTGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2R 18865911 5' - roo 9041 1 57.43 CGCCGATCCCTTCATGGTCTTCTTCCTGGCGCTAATAATCTTGATCAACGGCAGGGAGCAGATCCTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAAC:1 + chr2L 1130434 5' + I-element 455 1 76.24 AATTTGTTGATTGAAGAATAATTTTAGAAAGAATACTTAGAAAGAATATAATTCAAACAAATATAGAATACAATATAATATCACAAAATAAATTTCAAAA:1 - chr3L 16363864 5' + 1360 365 1 60.00 GTTGTCTTTAGATCTGCCTTTTGGGTGTTGTCACTGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGT:1 - chr3L 8643885 5' - F-element 265 1 65.31 CTTCAACAAATATAATAAATCGCGCTTCAGATAGCTGCGAAAGCAACCGTGTCCACTGATCAGCTGCGTTAGATAGAACGTTATTTCGCCATACTTCCGT:1 - chr2R 6766424 5' - Rt1c 4968 1 79.00 TTCGCTCAATCGAAGGTGGGGGACTCGATTAAATGAAGATGCAAAAGAGGAGTAAAAGCCGTAAAGTCATGGGACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 - chr2L 14179576 5' - 1360 20 1 76.24 TTATGTTTTTAGACGGCGCTGACGTCGACAGTTGGCAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGG:1 - chr3L 13784606 5' - Doc 455 1 66.34 GATTTCGTATTTGATTTTTATTTAATAGCGAGAAATTGAGTTTTTGGATGGCTGAGCTTGTCCACAAAAAATGATATTTCTTTTATTATTTTTCTTTTTTT:1 - chr3R 9198043 5' - Doc2-element 255 1 56.44 TCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTA:1 + chr3R 26331655 5' + G-element 37 1 61.29 AATATATTTTGGGCTGGAAATAGAAAACGTTTGATTTCGCTGGCTATTTAAATCTATGAACAAAGGAGAGAAAATGTTCGAGTTCTCCGACTATCAGATAC:1 - 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rooA 23 2 63.37 CAGAACAATCAAAAAGCCACAAAAAGCCATGGTTCGGGCAAAAAAAAAGAGGAGATATCAAAAGTAGCGAGTACAGATACTATATGTATGTATGTATATG:1 - chr2L 9605862 5' + 1731 4410 1 78.00 CATCGATTGAGGTGGGAGTTTCGTTTTCGTTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTA:1 + chr2L 4026353 5' - accord2 7408 1 72.28 AAACGAAGTCTTGCGGTTAAGAGGGGAAAACCAATTAAAATTTAACACAAGAATCGATGAAGCTAACCGCAAATCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATT:1 - chr3L 1996562 5' - 17.6 368 2 81.19 AAGCATGACGACATTTTTTTAATGCCACTGTCTTCAAAAGAAGAGTGAAAAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 12958882 5' + roo 24 2 56.44 GCTTAACCCGAGACAAGCGGCAGGCAACACGTGCGGAATGGAAAATTTCCAAAAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAA:1 + chr3R 10747696 5' - R1A1-element 109 1 73.27 TTCCAGGAGACCTTTGCTTTTAGCTAATCTAAATTATTATTGAAAATTCTAATAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGT:1 - chr2R 15373287 5' + Tc3 312 1 55.45 TCCGTTGAGCTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2L 19090030 5' - 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gypsy12 111 2 58.42 TTTCAACAAAAAATAGAAGTTAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr4 131963 5' - hopper 151 5 73.17 CCCAGACGGATTGCCTGCTGCTGCTGGTGTACGAACAACTTATCGAAGTGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAATTAGAAAAACTTGATGGTGAAAACTA:1 - chr2L 1713536 5' + Dm88 342 1 69.00 ACGTATGTATTATTCTGGGGGAACCAAATGAACCAAGTTTCTTCTATGTATGTCTGTGTAGCGTAATCTAACCCCAACAATCATGACAGACCCACCA:1 + chr3R 18011712 5' + I-element 180 1 81.44 CTCTACTTTCTGCTTTTACCCTGACGCCTTTTATTATTTTATAAAATAGTACTTTTAATAATTTCGAATTTTAGATTTTAACATTGCATGTGGTGAGTTTG:1 - chr3R 7976472 5' - TAHRE 10308 2 60.40 TGAAGGGAGTGCTGACGTGAGAAGAGGGGTAGGTCAAATTTTATGACATAACGTTTGACAGAAAACCTTGAAAAAGTTAAAGTCGATTGATTTAAGAGCGG:1 - chr3R 1852103 5' - Cr1a 4250 1 77.23 GTTGGGGCGGTTTGATGGAGGGCCTTGGTGCGGGGGTTGGGGTGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 11832931 5' + roo 8 2 69.00 GGCATCGGAAGTTTGCTCCAGTATAGGGCTATTATTTATATTTATGTGTGTTTGTGTGTGTGAGAAATAGCGTTTCGGCATGTAGGAGGGATGGGCATGAG:1 - chrX 9024080 5' - I-element 5054 1 74.26 AAAGCNAATAATGGATACGGAGGCGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTCAGAATTAGAAGATACGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGAGTGCCCTT:1 - chr2R 18710586 5' - gypsy6 7677 2 79.21 GGAGGAGTCGCTATCTGCAATCCCTGCCGCCGCTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCCTTTCAGACAGTGAACTCTGTCACTTCTGCTGCATGTAGGAG:1 + chr3L 1290962 5' + baggins 5205 1 69.31 CTCGGGCGCAAATTATGTAAGATTTCGCGATGCGGGAGGAGCAACTGCCCCAGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAG:1 + chr3R 27151986 5' - 1360 3257 1 54.00 TATCACTTAAATATGAAACAACAGGCTATTGGTTTATTTAAATATTTTACAGTTGACATCGAGGAAATGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACT:1 + chr2L 6623629 5' - HMS-Beagle2 6948 2 71.29 AAATGCAGTCGACGTCGCAAACAAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCAT:1 - chrX 3694777 5' - jockey 4719 1 77.23 ACAAGAAGCAACATAAATAAAAACGGAAACGGAAACGAGCCCAGTGCGCCTAGTACGCCCACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGC:1 + chrX 7712094 5' + TART-B 155 2 58.70 AGAAGAAAAACGCTTAAAAACACGACAAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATC:1 - chr2L 13806697 5' + F-element 155 1 73.27 TGGCACGAACACGGCGACCAGAGGAGGCCCAAAAAACACAAAACCAAAAAAAAAACAAGTGAAAACAATAAACAAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGC:1 + chrX 17991088 5' + Porto1 206 1 54.46 TTATTCAGTACTTATTTCATTAACCGCGACGAGCTCTTGATTTGCGTAATTGATTGCCTCATGCACGTCACACAACCACACACACACACATTCACGCATA:1 + chr3R 17563671 5' + accord 7038 2 51.00 TGTCTCATCCTAACGAACTAACTCATTTGTGATTGTCATTGTACTGGATTTCATGTTTTCTGTCCAGGCTGTTTGATGTCAATATTGCTGATGCT:1 + chr3R 8941247 5' - F-element 4298 1 73.68 ATGGCCACAAGATGGCGCTGCATCAAGATGGAAAACCGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGA:1 - chrX 9394537 5' + rooA 123 2 66.34 CGGGGTGGTTCGGCACCAAAACAATCGAACTCATCACATTCCTGGCCGTTCCCGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCC:1 - chr3L 21880435 5' + roo 446 1 61.39 GGAATCAGTTCGTCCTCGTACATGTCCTTGGGTATCTTGCCGCAGAAAACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACT:1 - chr3R 20792407 5' + I-element 4903 1 52.48 GCTATTCAAAATAATTTAAATCTAAAGTAAAGTCCGTGTTTTAATGTGCAAGACTCATTACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGCACAGA:1 - chr2L 16674630 5' + X-element 4343 1 63.37 ATTAANAATAATATTAATTAAAGTCAGCCAGGGAAAAGTAGGCATAATAAATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 17607825 5' + roo 5 2 74.26 CGGTATCAAATGTCATTGAGTAGGATCTCTCTTATATAATTATCGATAGGCTCTAGTTAGTATTTTTGAGATGTCCGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCA:1 + chr3R 15179957 5' + aurora-element 4105 1 61.39 TGGGGCTGTGTCTGTGCTGCACCCAAATGTATCCGTATCCGTAGCTAAATGGGTATGGGGTATCTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTCAT:1 - chr2R 20964691 5' - accord 181 2 58.42 CGGATCTCTGCTTCATCATTCTCATCATGCTGAGAACACACATCAGCTTGAGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTTAG:2 - chr2R 13208894 5' - G-element 359 1 53.47 AAGCCCACTTACTTACAATTTAGCTGAAAAATAAAGCGAACGAGAGACAGACAGGAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTTTTATAGTCA:1 + chr3R 19749504 5' - Cr1a 4204 1 59.41 AGGGGCTTCTGCCTGATCATCTCGCCCAGGATGCAGCCCAGGCCCCACATATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1 + chrX 9264260 5' + 3S18 6 2 56.44 CGTCAAAAAATCAGTAAACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 14832375 5' + blood 6 2 69.31 AATGATGTGGGGTGGTTCAATTTCTTTTATGATTTCTTGTTGACCTACGTCTTTTAAATCGCAATCGGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTG:1 - chr2L 23052919 5' + diver2 492 1 55.45 TTTGAAGGCATCTGGGGAAATATGTCAGCGTTGTTTAAGTTTTTAACATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGG:1 - chr3L 22178578 5' - I-element 74 1 61.86 GCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTC:1 - chr3L 27415284 5' + transib2 47 1 70.30 TATGTTAGCAGTGAAATCCGCACTAAATAGGGAAAATTTGGTTTCTCCCACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:2 - chr2R 23343824 5' + roo 27 2 54.46 ACAGCAATAGTTCCCTAACTCCTCTGCTCTGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTATAAGCCGAAGTAGTCA:1 - chr3R 18273480 5' + diver2 4587 2 70.30 TACACGGCAAACCAACTCACAAATCCCAGCAACTAACTAACTAACTAACTAATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGA:1 - chr3L 18705639 5' + accord 382 2 52.48 CACCACTTAAGGACGTTTTCATCCCCTGTTTTCGCATAGTGCCATTTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAAGGCATAT:1 + chr2L 18364111 5' - 1360 219 1 70.30 TTAAGNGTATTATTGGGAAAGCTAACAAAGATTTTTATGTCTGGTTTAAATGATTTTCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTGGTTTTTTTTGGCATAAAGT:1 - chr3R 10490424 5' + transib2 16 1 62.38 GGCAAACATGTTATGAAATACGTCTCTAGTCTGTTCAATATAGATTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 + chr3R 11685540 5' - mdg1 417 2 72.28 CAGAGGAGGAGCCTCAAAAATAGGGTGACATTTTTGTCAGCGGTAAAGTTTCCGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAA:1 + chr3L 24349286 5' + GATE 371 1 59.41 ATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCA:1 - chr2R 4879023 5' + G-element 32 1 54.00 CATTTTCGATTGTAAAAGCATAAATAAGTCCCTGCTATCGAAGCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGACTGCAGC:1 + chr3R 8938664 5' + gypsy3 6916 2 57.43 CTCCCAACCGAAGAAGCCGCATTGATCTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTTAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAAT:1 + chr2R 14206387 5' + F-element 4242 1 72.28 GCGCTTCGTGTTGATTTTGTAGTCTAGATTAGCAATTTATTCCCATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAAC:1 - chr3L 18688836 5' - roo 8666 2 61.39 GATGAGCGTGCCCCAGGGCAATCCAAACTTAGCCACAATCAACTGCGAGTCCGCCGTTAGAACGGAAGCATGGCGAAATAACGTTCCATCTAACGCAGCTG:1 - chrX 2231804 5' + Rt1c 4986 1 60.40 TCAAAAACTAACGATACCAAAATGAAAAAAACAAAACCGACGGATGTTTCTTTCGAAATTTATGAATGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAA:1 + chr3L 5671559 5' + I-element 105 1 73.27 CTACGCACCACGCACCTCTCTTCCTCTTCTTCCTGCTGCTGCACCGCCGTTGATTCTAGTGTTTTGTGGCTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGC:1 + chr3L 17529619 5' - 1360 223 1 75.25 TCAAACTACAACAGATGAAATATAAGACAATGCAATGAGGGTAAAACAAACTAAAAACCTAACTGCAAGTTAATCAGACTCAGCCGCATTAACAGGGCTGT:1 + chr2R 17523759 5' + gypsy2 499 1 56.44 GAACCTATTGAGGCGTTACTATTTCGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr3L 5827954 5' - blood 351 2 52.48 TGTACAACTTTAAGATAGATAGAGAACAACAAACATACAAACACACTCGAAAATGCCTCGCCAGCTTAACGTAGATAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGA:1 - chr3R 10605926 5' - diver2 4674 2 65.35 ACAAAATCTACTGAAAGCCTAAACTATTTTCTCCTTTTCCATAAGACAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAG:1 + chrX 9020243 5' + TART-A 13154 1 53.47 ATAACAATAACGCGTTTCGGTGGGGCTCAGTTTCGGTTTCAGTTGAAGAATCCCCTCCAACATAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAA:1 - chr3L 19700720 5' + gypsy 7383 2 55.45 ACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGC:1 + chr4 1301730 5' + 1731 4333 2 43.43 CCACCGCCCCTGTGCGCCATCACCCCCCGCTCCCACATTCAAACGCCCCTGTGGAAAGCGACGTCACCAGGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATA:1 - chr3L 4139335 5' - Ivk 5041 1 79.21 CGTGAAAGTTTTATACGATTTGGAAAAAGGCGTGACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr3R 15153039 5' - hopper 1375 1 61.39 GGTGTGTGAGTGAGTGCGGGCCGCAAATGGTGTATGTGTGTAAGTAGGGCAACAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTAGGATTTATGCCAAGTCCCGTTC:1 - chr3R 21188713 5' - jockey2 3204 1 54.46 ATCATGCCCACAAAAAGGCGTGGCTGCTGGGCAGTGCCTCGCACTCCGGCATCACCCACAATCCCAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTA:1 - chr3L 11473790 5' + Quasimodo 6894 2 75.00 TCGAATTAATCATCTCAGGGCTGGGACCTTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATA:1 + chr3R 14420036 5' + 412 7257 2 71.29 CAGAAGCGCAAAACTTAACGAAATTGAAATAGAAAATAAAAGGAAAAATGGGTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGC:1 - chr2L 4269073 5' + Doc 4328 1 51.49 TTATCGAATGCCATAATGGGTACTGATTACTTGGGGTTATGTTACAGCCTTGTCATCACCGCCGTTTCACCGAATGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGA:1 - chr3R 22986511 5' - HMS-Beagle2 7026 2 78.22 CTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTATACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTA:1 - chr3R 18860370 5' - R1A1-element 5278 1 80.20 TGAGAGAGAGTATGCAAAGGAGTGTTTGATGATCTACGACAAGGAGACGGGCGCCATCATCCATCCGCCTGTGCGTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr2R 7399954 5' + hopper 145 109 60.61 CCAAAGATCGATAGGCCATCGATGGCTCGATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTTCGG:1 + chr2R 19126383 5' + G-element 3958 1 70.30 ATCGATAGATACACACCAGAGAATTTTGTACTATCAGTGTTGAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 - chr3L 19051909 5' - roo 9039 1 56.44 CGTTGTGCGGTATCACACATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chr2R 18891099 5' + opus 7045 4 78.26 TGTTTAAATTTTAAAGCATTTTATTCGTTCTGGTATAGTAGTGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr2L 16252088 5' + pogo 2 1 46.53 TCCGAGGATTTGTCTGCCAGACGACCAACTTATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAAATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACG:1 - chr3R 19249755 5' + Bica 4897 1 75.25 TTATTAACTCACGGGAGTTTTTCCGCTACTTAGAATATTTGTCGTTCGCGATTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGG:1 - chr2L 22468210 5' - HMS-Beagle2 337 2 94.59 AATTTTAGGAAATTAACATAGTCTCAACTATTATAAATATAATTTTAAACAAGAGAGAATGCCATACTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACTCGTTACTCA:1 + chr4 512186 5' - INE-1 548 1 71.29 AATTTNCAGCTGTGTGGATGTGGCGGTACCACGGGGCGGATGGTTGATGGCCGCTCGGCAGGACGCACGTGTTTTTTTTTAATTGGCGCCCAACATGCAAT:1 - chrX 16569901 5' + gtwin 491 1 74.26 CGATGATGGGATTGCTGTTGTGATGGGATTTTCAATTGTTTACTAACTAACGTTCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGCACAACGAATCACCA:1 - chr2L 21014600 5' + transib4 423 1 82.18 CATGAGTCTGCGTGTGTGATTTGTCATCATTGGCGAGATTGTGGAAAAGGGACGTGGAAACTCAAATCCATTGGCGGAAATCACGATCAGTTGAAAGTCAC:1 + chr2R 19196522 5' - Gypsy12A_LTR 196 1 56.44 GGAAGCTGTGCCGGAGAAAATTCTTCAAGCAACCGAGGCGTTGATTATAATCAAGAACATATATATTTTATGTGATAGAAAACGCTTCCTTGTGCCTGTTA:1 + chr3L 12745859 5' - INE-1 33 1 60.40 TAGTCNCCGGCCTTTCACCATATGCGAATTACCTATACTTGTTGGGGCGCCATCTATATTTACCTCTGGTATGCAGAACTAAGCATTGGTCAATTATGAAT:1 + chr2R 18046882 5' + Transib-N1_DM 411 1 48.51 CGTGCCGAAGCGCCTGGGAGTATGCTACGTTTTCCGTGTCCCCCATTTTGTGTTTGTCAAACCAGTGGTAGCTTTTAATAATTTTCTTTTATTATCATATA:1 + chrX 10978041 5' + Cr1a 82 1 56.44 TTTTGTAATTGTTGGTTAACGGCACTAATTTGATCCGCAAACTCGGCTTGAACTAACATTTCAATTTGGGACAGCTACGCCTATTAAGCGTAATTGTGGCA:1 + chr3L 27180034 5' - Doc4-element 2349 1 72.28 TTAGATTCTCCCGCAGTTTCTCTGCACAGATAAGAAAGATAATGCTGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGCAGTACCAAGTTGGCAGTATGGGA:1 - chr2R 1772447 5' + Burdock 6018 1 55.45 GACCTGGTTGCAGAGCGGACAGCACACCGCGAGGCCAAAGGTGTAGGTGTAAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGT:1 + chr2L 22319229 5' - Transpac 248 2 53.47 CGTTTGGATTAGAGTGGCTCAGCAAGAAGCGCACGGAGTGGGGGGTTGGGGGTGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGC:1 + chr3R 21340263 5' - G6 242 1 58.42 GTTTTTGTTTTATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTAACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTG:1 + chr3L 15954956 5' + copia 147 2 60.40 CAGGGGACAATAAGGTTCTCAATATTCTCTAACAATGTTGGGTTGTAGGGGGATGCTGTCCTGGAATTTTCCAAATATGCTGAAAAAAAACACTCGAAGAA:1 + chr3R 19445759 5' - GATE 8445 2 78.22 GAGCCCTCGAGGTGGAGGCCTCGCCTCTGGTCGCGCATGTTGTGTCAGCTTCCATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTT:1 - chr2R 14466038 5' + Cr1a 489 1 59.41 ATAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chrX 17947357 5' + hobo 50 1 72.28 GTTCGCGTATGATCTGCAAGATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 14582911 5' + roo 9 2 65.56 CCCTCGGCACCTTGTCCCCGTCCACCTTGTAGTATTCCCACAGTAAATGGGTATGTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGTAGTAGACTAATCTCAT:1 + chrX 19564503 5' + diver2 4557 2 54.46 GTGTCATGTGTGCGCTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3R 19535669 5' - hobo 2930 1 70.30 TTAGCTGCACTGATCTGGGATACTCAGATGATTCTCGGAGACTATTGGCACTTGTTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTT:1 - chr3L 25414421 5' - S-element 1270 1 67.71 CTTGGTCATGTAGGTGAGGCCATTCAGATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 - chrX 9260672 5' + 3S18 29 2 49.50 AATTAGCCTTTACTTTGATGTTAATTTATATACTGATATTTATGTTAAATAAATGCATACATTTTGCCAAGAAAATGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTA:1 - chr3L 7432808 5' + S2 21 2 67.33 TCATGAGTCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr3L 2182739 5' + blood 27 2 50.50 AATGTCACGGCGGCTAGCGGTGAAAGTGTTTTCCTACAGCCCCGGCAATCTATTCAAAAATGCATGATTTTGCTCTGCGACTTTTGTCTGTCGTTCGCGTT:1 - chr3L 9690853 5' - HMS-Beagle 293 2 69.31 AGAATCGTAAAGCTAAAATAAACAACGCTAATTACGGTTAAACCCGAAATAATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTT:1 + chr3L 20414411 5' + Cr1a 4345 1 51.49 TAGGGGGCGATAGGGGAGCCAGCGCACACACACACACACACACACACACACACACAGAAACACACACACACACACA:1 - chrX 8091391 5' + accord 7026 2 63.16 CCTGACCAATTCCATCTGGTTTTTATGACCCTCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAA:1 - chr2L 17749113 5' + Doc 4552 1 68.32 CCTGCGGTCAGGCAGTCAGTGGCAATCCTTTACGCTGAATTCCACTGTTTCTGGGCACCACCAATCCCTCTCTCTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACA:1 + chr2L 14945611 5' + jockey 4740 1 75.25 CACGTGCATCGTTGCATCCCTTGGATTCTACAAAAGGAGTAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGG:1 - chr3L 9125456 5' + R1A1-element 367 1 62.12 CGCAAAATGCAATTTATACATTTCCGTTAAGCAAGCGAAATTAGGTGGTAACAAAAATAACACTGACCAGGTATTTGCTGAATAAAATTATTAGGAGTGAT:1 - chr2L 16019065 5' + Tc1 241 1 62.38 TTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTTACAAAGACATCTCCAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTT:1 - chr2L 23232652 5' - invader4 2606 1 53.47 CGTTGGGGGTTTTGCATTGGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAG:1 + chrX 21657127 5' - I-element 5070 1 81.19 TTTTTCGACACGCGACAAGTGAGTGCCGCCCCAGGATGCGAAGCCCAACAAAAAATAGAAACACACACAAAAAAAAAAGAAAAAACGAAACA:1 - chr2L 11421436 5' + gypsy7 5008 1 64.13 TTAAGGACGGGAATAACACACTAACCGCATGGGAGAGGGGGAGATGCTTGCGAGATGACAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCG:1 + chr2L 8463462 5' + Bica 68 1 68.32 CATTGCTATCGCTTTGTATACCGTTTGTTTCCACTTGCGTGTCAACTTCATCTTTGACTGCCCCTTCCGACGGGGCATTGCCACCTTCACA:1 - chr2L 16558366 5' + baggins 5143 1 65.93 TAGTCGTGTTTGAATTCATATGCCTTTAGTTTATTTTGTTGTTTCAGTTCAGACGCTTCAAATGATTATGACGCCACCGATGCGTACGTTTTT:1 - chr3L 26695539 5' - 3S18 6027 2 74.19 TTTATCTCAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chr3R 9833028 5' + Tabor 18 2 59.41 CCAGGGAAACGGGCACACGTCAATCAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAA:1 - chrX 3260939 5' - 1360 100 1 76.24 GTTGTGATTGTTATATTTTAAAGCCATGAATCAATTGGTTTTAATGACAATTTAAAATATAACAATCACAACAGATGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATA:1 - chr3R 9193678 5' - roo 8687 2 64.36 CATTAGAAATTTATCGCACTCGAGGTTCATAGAAACTTACCCCAGCAGAATAATACCGATGCTAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGTAGAGACAGCCGAA:1 + chr2R 9162807 5' - diver2 4725 2 61.39 AAATATCCTTTATCCTTAGTCTACGAATTTTTTTTGTAGATCTTTAACATATTTGCCCTTGTGCACCGTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACG:1 - chrX 7400114 5' + mdg3 5199 1 79.00 ATAGTAGAAGGTAATTTTGACGGTTTTGGGGTTAAGGAGAGGTAGCAAGGAATAGCGAATACTTTTTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAA:1 + chr3R 18279328 5' + invader1 3616 2 70.30 GATAATGCCGACAAGTTGACCGAATTCGAGCGAGTTCAGTTGGAAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAT:1 + chr2R 13452673 5' + jockey 4859 1 56.00 AAACGTTGCGTTGCACAGCAATTTCAGCAACCCCTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chrX 13560725 5' + roo 8707 2 70.30 CATCTTAATTTTCCATCCAAAGCAAACAACACGCACGCCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTA:1 - chrX 4012297 5' + Doc 4258 1 62.38 CACTTCGTCGGCTTCGTCTTTCCCTTGCGGTTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCA:1 + chr3L 3191939 5' - I-element 276 1 69.31 TGGAGTGAACAGACCATAACTCGGAGCTGGCGAATACTCAAATTTAATCAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGT:1 + chr2R 9377813 5' + F-element 4211 1 54.46 ATTTGGTTTAGTTAGTAACTATGAATATGTTGTGTGTGGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATG:1 + chr2R 18811368 5' - Stalker4 7235 4 62.38 TAAATATGACGAGTTTTGACCGCAGCTTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTT:1 - chr3R 4198789 5' + gypsy4 182 2 73.27 CTTTAGGTCCTATGACTTAAGGACAAGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATGGCAGAGAAGAAAGTAAAAAAAA:1 + chr3R 16210956 5' + Doc3-element 4486 1 74.26 CAATGCAAACGTAATATTTCGTAAAAGGGATTATTGGCTATACTTATACAACCTTGTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGT:1 - chr3R 29070346 5' - Bica 120 1 74.26 CCCTCTATTTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAGTTTCGCGTTCGCATTTCCACTAACTGAGTAACGGGGATC:1 + chr3R 31957650 5' + INE-1 541 1 80.00 GAACTTCGTTGTGCGGTATCACACATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - chr2R 18891105 5' + opus 7161 4 74.26 AGGTGCTACAACTATCAATTACTTATATACTTGGCATGCATTATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTT:1 - chr3R 15814738 5' - roo 405 1 67.74 TATTTATATTTACACACCGTTTAGCTACCATAAAAGGTATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr2L 20465595 5' - blood 7352 2 67.33 GGTTTCTTGTTTATTTCAACTTTGGGTTTTTTTTCCTGTTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTTTTACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 - chrX 11906333 5' + INE-1 17 1 59.41 TGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:2 + chr3R 19535704 5' - hobo 2895 1 66.34 GTTACGTCCTTGAAAGCTTTCTACAGCTTGTCCGTCCTTGCCGTCCTCCTCCAAATAGTCCGGAAATTTCTGCGGCTGCTGCTTCACTTTTCTTCGCATCT:1 + chr2R 10794133 5' - Osvaldo 341 1 62.38 CTTGTTGTCAGAAGCTTGATTTTGGCTAGAATTGTTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTGT:1 - chr3L 27361417 5' - X-element 4348 1 65.35 CATGCCCAGTGGTTCATTTAGCTGTCAGGTCCAGTCCGGACCAGTAATTTCCTCTCCCTCAAGCGACAGAGCTCACAGTCTGTAATGCCAATCTTATGCAA:1 - chr3L 10809641 5' - baggins 5170 1 65.35 TAACGAAGCTTATAACGCTATACTTATTTTTATTGCTAATGGGAAACATTATCTGCTGTTTGGTGTTCTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCT:1 - chr3L 13288971 5' + Cr1a 272 1 60.40 AAAAACATTAAAAATGCTATCCCATTACTCAAGGATCGGACGGACTAGCGAAATGAATAAGGTTTTGGTTGTGTAGATCTCGAGATCTCAGGAACTATAGA:1 + chr2L 19272419 5' + INE-1 146 1 75.25 CCGCCGCCTCTTTGGTTTGAATCAGTGTCCGCTTGGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGC:1 + chr2R 11827563 5' + 3S18 5877 2 65.35 ATAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAA:1 + chr3R 5775678 5' + invader4 2798 2 65.35 GTAGGGCCAATAAGTTGTCAGATAGTCCTGCCAACAGGATGAGCCGTTTTTCCTGAGCCCAGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTG:1 + chr3L 15891737 5' - Rt1b 4700 1 60.40 CACCGAGATCGTGGCGCTGACAGTGGTCACAATTGAGTTTTCGGCCGCCGCCGAAGAATCAGCAAACACAGCGGTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr2R 5322103 5' + 1360 1 2 78.22 CTTCTGTATAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chrX 17947364 5' + hobo 43 1 65.35 GGTTGCTTCTCGCTTTTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGT:1 + chr3R 7221953 5' + opus 73 4 70.37 ATCCTACATGTGCAGGCAAGCACCCGGCTGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 + chr2R 4549808 5' + Tirant 45 2 74.00 ACACACATTTTGCTGATTGCCATGTGCGTTGTCTTTCCCAGCGAATAAATTATTAGAGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCA:1 + chr2R 16452316 5' + F-element 4585 1 64.36 ATGATCTGCAAGATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 14582903 5' + roo 8692 2 54.46 AAGCTCCTTTCCAAATCGTTATTACTCTCAACTGCCTTAGCGGCATGGATCTCAAAAAGAATCATTTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3L 19051815 5' + roo 8670 2 71.29 GGTGTCGAAGCGGTTTTAAAACGTAAATCCAAAACAAGATAGAATGCTATATTCTAGTTCCCCGACTATCAGATACGCGTTACTCAGCTAGTGTGAATACG:1 - chr3L 23006865 5' - INE-1 533 1 77.23 AGCAAATGCGATTCGCAGAACCATAATCCCCACGCCCCCGTCAAACCCCACTTGAAGCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTAGAT:1 - chr3L 3830409 5' + G2 165 1 60.40 TAGGGATGACAGTGTGTATTTGTCATCGGTATTCCTTTGAATGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGAG:1 - chr2L 12909896 5' - Tc1 122 1 58.42 CAGTATAATTCCACACTTTTCTTTACAATTTAACACACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1 + chr3L 87873 5' + jockey 89 1 65.35 CATCAAAAGCTAAGAACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2L 306461 5' + Tirant 15 2 66.34 GCGTGTGTGTGTTTTTTTTATTTTTATTATATACGGCAGGAAAATTAAATCCTCTAAAGATACCATCTAAAGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACC:1 - chrX 14626684 5' - Rt1a 5003 1 82.18 GTGGGCTGTGGGAGAACAGAGAGGCTTTTTTAGAACTAAAGTACAGACAATATTCTTAGCTTAGTCTACCCTTCTCGACAATGCAGCGCCCAAGCTTAACG:1 + chr2R 7289776 5' - diver2 172 2 65.35 GGCAGTATACATATACAAGGGTATTTACCCGATTGGTATATATACATATACATATGTATAAACGAAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGC:1 - chr3L 123079 5' + 1360 99 1 72.28 GCTCATATTGCAGCGACACATTCGAGAAGGCCCAGCAGCATGAAGGCTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGAAATCGGAAGTG:1 - chr3R 8991288 5' - diver 5801 1 65.35 CTTGAAATTATTTCTAGCTGTGCATTTGGAACGGCTCACATGCGTGTGGGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 - chr2L 1629653 5' - hopper 1390 1 51.49 ATTGAAAATTAGGTGATTAGTTTTTAATTTAATAGATGGGAGGTTATTCAGCTGACCTTTGCTGAGAGCGGAAGAGTTGAGGGTGGGAGAGCTGAGAGCGA:1 + chr3L 15197170 5' - Porto1 499 1 61.39 CTTGAAGATCTTTCGATATCTACAAGGATAGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2R 10029427 5' + roo 45 2 70.30 ATTTTTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 13314185 5' + jockey 30 1 56.44 TGCTAAACGGTATCGTAATTCGTAATTAATCTATTTCATTTATATGAGCACTAATTGCTGGCTTTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGT:1 + chrX 3459952 5' - I-element 5185 1 56.44 TTCGCNCTTCGGTGGAAGAGAAGCTGTCCAAAGACAGAGTATCTAAAATCAGAAACGAATATGAAGTAGCCCGTTTCCTGAAGCAGCGCTCACG:1 + chrX 2941011 5' - gypsy4 156 2 68.09 TCCACGTGTAAAATCTAGAAGAAGATGGCAGAATCCAAGTTGAAAGAACTCTTAGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 9653357 5' + roo 8685 2 58.42 GAATAAACATCAAAACAAGAAGAAAAATGGCAAAAACCCGACTGGCTAATGAACACAACAAACCAACAAACAAAGCGAAAATAAAAATTAAAATTAAAATA:1 + chr2L 1479813 5' - Rt1b 129 1 58.42 ATACCTGAGAGCTTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 - chr3L 3485028 5' + diver 5928 2 65.35 CAAGCATTGACTACCACGATTGCCCGACAGCTACATACGAGCCTGCTCAGTCACCCGACTTGAATCCAATCGAAAACCTTTGGGCGGACGTGAAAAAAAAG:1 - chrX 22903680 5' + Tc1 1174 1 60.40 TAACCNATGATCATCACACGCCAGTAAAATTAAAGAACATTTAAGTATAATAGTATACCAACATATAACAGCACTTTGTTGCTATGTTTATATTTATGTTT:1 - chr2R 2053227 5' + 412 72 2 75.25 GGGTAATAAAAATGAGTAAAGGAAAACACAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCG:1 + chr2R 22525752 5' + jockey 149 1 44.55 TTGACTCCCAATTCTTCTTAGGAACAATGAATGGTTTTTTTTCTTCTAGTTGATACTATCTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 9463458 5' + roo 8680 2 55.45 AACGACGCTAGAGAAGATGAAATGGAAGAAAATATGGGCCAGGTAAACACTATGATAGGCAATCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAGAGGTTC:1 + chr3L 24258499 5' + baggins 5067 1 61.39 AAATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATAAATTATCATTTTAGTGAATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 - chr2L 8967080 5' - Burdock 215 2 66.67 GTGTGCCTGCTCCGAGCATGCCGCAAGTGAGCCTCGCCGCATTATTACATATTAATGCCTCCTTCATTATGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTA:1 + chr2R 8825787 5' - 1360 2958 1 71.29 GTTCCAATTTGGGTCCACCCTGCAACCAAAGGTTTATTTCGTGTGATAATAGTTTCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTT:1 + chr2L 22123614 5' - F-element 4540 1 58.42 GTTTGGAATGAGACAGATGACAACAGCAGAAAGCTCTATCGCCCAAAGCTTTTTCTGACAGCTGTTTTCGTCATAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2L 6656368 5' + P-element 4 2 71.29 TAGTCGCGGCTAGTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr3L 22564788 5' + blood 7012 2 76.24 TCACACGTTCTAACAACGCAGTCGCCGCCGGGTTTTTTCGGTTTCGGTTCATGTATATATATGTATGTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCA:1 + chr3R 21968121 5' + 1360 3305 1 72.28 GGCAACGTCTTATGAGTGAAAAAATCTACTAAATTGAAATTGAAAATAAGTTGACGACGCTGTTTGCTGCGAGGGCTTCTGTCGGAGCCAGTAGAGCGGGA:1 + chrX 19534677 5' - F-element 383 1 74.26 GCAACGAGCTGCTCCGGGTGTAATATTCCGGACGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTT:1 - chr2L 2688097 5' + roo 487 1 68.32 CTCTGGAATGGGATTGGGTCCAGACTTTTCCGCCTTGAGCTTCTTCAGCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCGCTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCG:1 + chr3R 5568075 5' - G-element 341 1 56.44 AAGATAGCATTTAAGCACGTGTAGTTCTGAGTCGATTTAATTTATATTATGTGCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 21293014 5' - roo 9049 2 60.40 GAAAGGTACTTGCATTTAAACATTAAAATCAACAGCAGATAGAAAACGTAGGCACGGTGATTTATCTGGATGAAGCCGACCACGAAGATAAAAT:1 - chr3R 16153288 5' - diver 314 1 60.64 GAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTA:1 - chrX 21087672 5' - mdg3 5482 2 54.46 TGATAAGTGAAAAAGCCACAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTA:1 + chr2R 8207118 5' - 17.6 270 2 80.20 GAAAACGGTAAAACTTTGGACCTTTGATCTTGAGACATCAAGGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr2R 1763604 5' - 1360 3340 1 63.37 TTTCGCATTCGTACACACCTTTTCTCGAATAGATCACCGTGGCAATGGTAATATTACAACATTTCTCACTGTCCGTCCTTCCGTGTCCTTCGGGCTTCTTG:1 + chr2L 19791746 5' - gypsy8 492 1 75.25 ATTTATATATATTTAAAATTCTTATTTATGTTGAGAGGAACTTTCTTCTTTTTACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTA:1 - chr2L 22018403 5' - Gypsy6A_LTR 227 1 83.17 TTTCGNGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCG:1 + chr2R 5206895 5' + Doc4-element 19 1 61.00 ACTTAAAGGATGCCACCACGGCAGACGAACAGATCTGACAACAACAACCCGATATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGC:1 - chr2L 13782707 5' + Stalker 200 4 58.00 CGTCCTGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTAGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 - chr2L 22690050 5' + Tabor 7 2 71.29 CTCTTTCGAAGCCGGCAATTTGGCTTTCTTGTTTTCCCAGACAATTTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCAACTT:1 - chr2L 5201269 5' - micropia 5346 2 63.75 GGTGCAGACCCTTAGCACTGCACTTAACGCATACAGCTGCGCACAATGTCCTATTTGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGC:1 + chr2R 16537812 5' + F-element 353 1 59.00 TAATAATTGTAGCTCATTTAGTTTGAGCACTTTACAGAGCTCTGTTAGTCAGCTAGTGGGAATGCCAAAGGGAACATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGA:1 - chr3R 23890189 5' - INE-1 505 1 53.47 CACTTTAATTCTTAATCGGTTCGGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGC:1 - chr2R 3785235 5' + diver2 189 2 77.23 CGAAACTGTTGTTTGCTTACTATTATTTTCAATTATTATACCCGATAGCCGAAGGAAGCTTTTTCGACTATATAAATTATATATATTCCTGATCAGGATCA:1 + chr2R 7396255 5' + INE-1 81 1 49.50 AATTGCTCCATGGACTTGGGACTGCACCTAGACTTGCCCACGCCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGCAGTCCCACGGGAAACAAT:1 + chrX 5671576 5' + baggins 5297 1 55.45 CCCTAGTCTCATGGCGGCGGAGTCTCCTCTCGAGGTTTCCCAGGCACTCCAGACCGTTTCCGACCATATAAACCATTTACATTCTTGATCAGGACCAATA:1 + chrX 15297867 5' + INE-1 84 1 59.00 ACATGACAGTGCCCAAGGGTTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGC:1 + chr3R 26331619 5' + G-element 8 1 72.00 CATTAAATCGTATAATTAATTATAATACATTTGGTATTAACGAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGG:1 + chr3L 21924876 5' + hopper2 1165 2 58.42 GAATACACACTAGACTACGGTCTAAGTACATTTTTTTTTTGGTTTTTTTT:1 - chrX 12639626 5' + hopper 142 3 50.00 TATATATATATTTTTTTATCTGTGTATCAGTTATCATGAGTAAGGTCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAATCTACTATGATAA:1 - chr3L 10782303 5' + gypsy9 52 2 70.30 TTATGCTTTAAATTAAATTGTTGTTCTCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTATTCC:1 + chr2L 7559188 5' + Idefix 71 2 73.27 CATTTATTATATTCAGTTTCTCTGGTCACACGTTCGGGATTTTGTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCA:1 + chrX 7082954 5' - 412 7354 2 61.39 TTGGTNGGACAGATCGAGACGATAATAAGTACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCGCACTGCCAAAATTCTGCGC:1 - chr3R 22364897 5' + invader4 492 1 78.22 ACGCTCGGATGTACATATGTGTGTGTATATTCCTTTATGGAATGCATTCTCTTGGTGTGAAATTTTGTTGATCTAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATT:1 + chr3R 12950563 5' + S-element 375 1 58.42 TTTTTGACATATCGATAGAACATTTTTGTTTCCGTCAATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATTGTTCCTGACATCTCGAC:1 - chr4 1187066 5' - INE-1 145 1 80.20 GCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 - 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chr2R 13674484 5' - Tom1 224 1 72.28 AAATAGTCTTAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGGGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGT:1 - chr2R 15002442 5' + 3S18 5767 2 62.79 TTAAGACACATAATCTTTTATTTGAATAGTTTCTTGCTCTTTTTGTGGTTTGGTATGTTTTGGTTGTGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGT:1 - chr3R 26234723 5' - Doc 4379 1 74.00 ACTTCGATTTTAGCTTTTTCTTTGCATTTCCAATTAGCCGTGCAGCATTTACAGTTGTACATTGGCCCAAAACGAAGAAAAAAAAAAACA:1 + chr3R 11168590 5' + gypsy7 5008 1 62.22 TTTCCAGACGAACTTGCTTCCTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTGCGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCAT:1 + chr2R 20124168 5' - Porto1 4344 1 75.25 TTTTGTCAGCCTGCCCGTCTTGTTGCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3L 8763200 5' + jockey 14 1 64.36 GTGCCTCTTAATTTAGCCACGTTTATCTGGGAGCTTGGAAACTATATTATGGTTCCTGCAGTTTCTCCCTGGAACTTTCACTAGCTGAGTAAAGAGTATCT:1 - chr3L 13373830 5' + INE-1 542 1 70.30 TCCGCCGGACGCCTAATGGATCTCTTCAAGCGCACCTCAACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGTG:1 - chr2R 12941303 5' + F-element 4506 1 59.41 ACCTTAATTTAAATGTTTTAGTTTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:2 + chr3L 11610382 5' + 412 7107 2 79.21 ATCGTTATTACTCTCAACTGCCTTAGCGGCATGGATCTCAAAAAGAATCATTTCTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3L 19051829 5' + roo 20 2 57.43 GATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCAAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTAT:1 + chrY 1539196 5' + hopper 1324 1 62.38 TTGACTCAAATCGATACAAATGCCAGCGGCAACAACTAGATAATGCACAAAAGTGATTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 - 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Q-element 198 2 59.41 CGCAACTAATTTAGTCGTTTTAAAGGCCTGCGCTGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACG:1 + chr2L 22951718 5' + 1360 3275 1 64.58 AGACCCAGTTTAGACCGGCAATTGGCAGACAGGCTGGGATGTCCGTCCTCTGGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGG:1 - chr2L 7239351 5' + INE-1 156 1 59.79 TAATATGCGAAGGTGGGTTACTATTCTGGCAAGCATCATGAACATTGGTAATGCGATGAACATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATAACTGTAT:1 + chr2L 183408 5' - 1360 155 1 65.00 ATGCAACGGAAGCAACTCATCGTGGCACAATGGGGGGAGCGTGAGTCGTTGAAAGCGAAACCAGTCAACAAAGCAGTCAAAAAGCAAAAAGTAAAAAAAAA:1 - chr2R 13035207 5' + Doc2-element 239 1 69.31 GCATTGACATTGAACAGTCAGCTGTTGGGAAGACTGGCGTTGCCAGATCAGCGGTGCGATCGTCATTCGGCCGCGCGCTCGTTGGGCGCGAAATTCGAATT:1 - chrX 22488133 5' + Rt1a 298 1 71.29 ACTGTGCTGGCGGGATTAAGGGAGGTTACCCGTTTATTACTCGCCGGCATTTATAACGCAGGGAAGGGAGCCGAGGCTGCCCAACGCGTTGTTCGACGAAA:1 - chr2L 12830919 5' + Osvaldo 1126 1 59.41 AATCGCCCGACTGCACATATGACAACGTACATTATTCTCAATATCTGCACCTTTTCTTTTGAGCTTTTGGCATCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCA:1 + chr3L 7945877 5' - 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chr3L 7766306 5' - R1A1-element 483 1 54.46 TACAGNACAACCATAACCACAAGAATTTCGGCCAATTTTCGGTGGATTTTAAGTTTTAATGGTTTAAGTTTTTTTATATCATTAGGTATTTAATTTCAAAC:1 + chrX 6481069 5' - HB 1527 1 56.44 AAATATTCAGTTAATTATAACTATTTAGATTACTGCAGATTACTGAAGCGACAGATGTAAGCTTGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCAT:1 + chr3R 28012493 5' - diver 211 1 63.37 ACGCTAGAAAGTATGCTAGGAAAAATCCAGCACCTTTATTATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:2 - chr2R 13280165 5' + jockey 27 1 60.40 AAAACGAACAAACCTACAGTGATTAGAAGTTAGGCGAACATTTTCTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAA:1 - chrX 12546870 5' + 297 448 1 60.40 ATTGTACCATTGTAACATAAAGAAGAGGCCCCTGAAGAAAATAAGGAAAAACCTGCGGGAATGCCAGTAGTCGAGTTCACCGACTATCAGATACCTGTTCC:1 + chrX 4563849 5' - INE-1 551 1 63.37 GAACAAAAAGTTTACATATCCTTACTTACTGGGAAGTCCCTATTCTCTAGCCCTACTCAACTAACAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 + chr3R 1137119 5' + I-element 4883 1 74.26 TTTTGCCCTAACTCGCTCCATTGGCCATGTCATTTGCAATTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTT:1 + chr2L 15561175 5' - 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chr3L 3442092 5' - Doc 4274 1 61.29 GGAAGTTGTAGTATAGTGTCCCTAGAATTTTAATAAGAGGTCTTTATATTTTTGCATTGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACATTTTC:1 + chr3L 9241102 5' - S2 12 2 68.32 GGTGGCCTGCTGGAGAAGGCAGTCGAGGGTGGTGTAGTGGGAGTGACCTTTGCACTTATGTATTATGCATTTGGTCGGCGTGGTAATGCTGACCATGCACT:1 + chr3R 17722402 5' - gypsy11 173 2 50.50 TACTATTATTAGTACGAAAGGCCTAACAGCTTTTTCTCTATTTCAGCTTGGAATAAAATCTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTACCTTTAATAGTTCCTGA:1 + chr2R 9945304 5' - INE-1 154 1 58.42 GCGTTTTCTTCGGATCTTCTTGGGCTTTTTTTCTTTCTTTCTCGTTCGGAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACA:1 + chr3L 4396457 5' - Bica 62 1 52.48 GATGAATATTCATTTCACGAGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3R 22675796 5' - 412 7525 2 55.45 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCT:1 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 77.23 TTATTTAAACTTGAGTGCCAGAATTGCCTCGAGCTGTAAATTAAAAAAAAATTCAACAACACCTTATGACTGCGAAAGATCCCGCTTGAATATGACCTACA:1 - chr3R 10730918 5' + S-element 1347 1 56.44 CAACTACATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTC:1 + chrX 17049528 5' + Stalker2 12 2 65.00 CCACTTTGGACACTCGGGAGAGCACGTCCAATTTGTCATGAGCCTGGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCTAATGTAGCCGCCGACAACGT:1 - 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chr2R 16709925 5' - transib2 491 1 73.27 CCCATCATCGCTCCGTCTCACTCGTTGCTTTTCGCACGCTGACTAACTGTACTTCATCCCATTTTTCTTCTACTTTGTGAAGTTTTTTTTTATATTTTTCT:1 + chrX 6862559 5' - mariner2 791 1 62.38 GAATGCAAACATAATAAAAACCCGCACAGTATACTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr2L 15622719 5' - mdg1 376 2 69.31 GTTTTTGCCACGCCTCGTAAGCCGTTACAATTTTATGTGTATCAACTGTGATAGTTGAAAAGCGCACACCGACCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAAT:1 - chr3R 1346346 5' + Chouto 5932 1 51.49 AGAATAGTGCGCGCCTTCTCCAGGTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAAC:1 - chr3R 22677623 5' - 412 7143 2 76.24 TCGCTTAGCACACACATTCGAGGACCCGAATCCGAATCCATGGGCAAAACCTTAACCTAAAGCATAAGAAGCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCC:1 - chr3L 6661282 5' + rooA 7522 2 71.00 AGCGCGTTGCATGCCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 19510734 5' + roo 22 2 59.38 TCACATATAATTTCCTGAACAATTAACACATTCTCCAAGTCAAAAAACTTCTTTTTTATCCTTACATTTCGGGGGGCACAATAGTTGACATTCATATGTCC:1 - chr3L 4775423 5' - Doc4-element 2600 1 78.22 TCGGGGCAATTAAATGATTGGCAGTGATCATGAAATTTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chrX 2090196 5' + roo 1 2 74.26 TAATCAAAGCAGGTCAGTGAGTTTTCAAATAAAAGCACACAATCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr2L 5086678 5' + FB 35 1 59.41 TTACCTGTGTCCCCGTGCAAAGCGTGTCAAACTAAACATCGATGCCGAGTACCTTATCCCCAAGTTGCCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCG:1 + chr2R 17791028 5' + roo 8904 2 73.74 GCACATTTTTCTCCTTGTTAGACAGTGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCG:1 + chr3R 25279619 5' + Doc 297 1 77.55 AGTAAGAGGTATCCGATAGTCGCAGCACTCGGCAACGGCATTCTCTTGTTTAAACAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACCAGTT:1 + chr3L 11801872 5' - INE-1 553 1 54.46 TGGCTAGGCCTGCTTCTGGTCCCACGAACCACGAAACCTCCACTTAACATCCTTTTTTTATTTATACTTTATACGTGGTAGCTGAAAACTCCTTTGTCACC:1 - chr2L 22210031 5' - BS3 1733 1 48.51 GCGAAGGGGCGTGGCCGCGGTCAGTCAAGAGCGCAGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGACACTCACCCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTT:1 + chr2R 22622733 5' + hobo 6 1 55.00 CATCGCAGAGCCAAAAAACCAATTATACTATTTTACAAAATAATACAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAA:1 + chr2R 15002357 5' - 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chrX 5020840 5' - F-element 233 1 61.64 TGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr2L 6605552 5' + blood 25 2 57.00 GCACACATTTACCGACCCCCTTCCACACTATCTGTCCCTTTTATCACTCCTCGCTCCGCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAAT:1 + chr2L 17918423 5' + Idefix 7117 2 56.44 AATTCGTTTAAGCCAAAGTCAACACTTTCTTAATCAATTTGCTCCTATTGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCAC:1 - chr2L 2125096 5' - Ivk 317 1 53.47 GAAGGCCGTATAAATGTTATCTATTTGCATATTAAGAGAGTTCTATAATATCTCCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 7375314 5' + roo 23 2 57.43 ATACCAAGCTCCCAGCCTGACCTTAAACGCATTCAGTCGGGCTTGGGACGAGCTGTTGCTATGTGGTAATGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTAAGTA:1 + chr3R 2626462 5' - Quasimodo 34 2 50.50 ACCAGCTGTAATCGGGAGCCATGAGGATCATCGGTCGTGAGGGAAAAGAGTTGGCGACTCCGTACTGCACCCCACGGATATATACTATATGTATGTATATA:1 - chr2R 16796258 5' + 1731 4406 1 74.26 TATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 23456277 5' + 1360 9 2 66.34 GTCCGCCCTTGGGCATGCTCTTTAATGCCGAGTGTCAAATGCTGAATGCTGATGCTGAGTCCGAAATACCGAAAAATACATTAATTTGATTTAATAAAATC:1 + chr3L 17756363 5' + TAHRE 72 1 77.23 TAAGTCAACTAAGTGGGTGGACTTTGGAAAAGCATTCAGCTGTTTCGAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAAC:1 + chr3L 22687220 5' + Doc 4496 1 53.47 AAGCTACTCCAGGTAGATCCAACTTGAGCGATTGCACTATGGGGCATTTGGCTTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:2 - chr3R 16531259 5' - hopper 1369 1 68.32 CCGTCCGGGCAGTCGACTACCCTTTTTGTTCACGAGATCCAAGGCGTTTTCCTTTCTCATTCTCTTTCATACACCACCACACAGACACACTATGGTGAGTT:1 + chr4 402072 5' - invader5 171 2 62.38 ATTTTATCCTGGAATCGATTTTAGTACATCAAAGTAGTCTCTTAAGGTTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTA:1 - chr2R 5616622 5' + 3S18 5796 2 54.46 CTCGTNGGTGGTGTGGTGATGGGCGGTGCTGCTACCGCTGCTGAAGTGACCAACTGGAATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTTACGG:1 + chr2R 8997522 5' - Chouto 182 1 61.39 ATCTTCAGCTGTTGTGCTAATAACAATTTAGTGATCTAGACTCTGCTTAATGGCTAGTTAATTTCACACGTCGCACGCTGAATACTCTAATGACAAATATT:1 + chr2L 17499342 5' - 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chrX 9568692 5' - G5A 431 1 75.25 CGTCATGTACGCTGCCAATCAAAGCGAAATCAAAATGGTGGGCGATGCGTTGCCAGTTAGCAGAGACTGCTGGTGCCGTAGGAAAAAGAAAAAAGAAAAAA:1 + chr3R 12751357 5' + Doc2-element 220 1 55.45 CACGAAGCCGTCTCAAGTGAGAGAGTCCCTGCGACCCGTCTCAAGTGGATCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCA:1 - chr2R 13190720 5' + accord 55 2 54.46 ATTTAGGTACAGTCACGTCCCAAGTCCGGTGGTACAGTTGTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGCTGAGCAGCTA:1 - chr2R 11447405 5' + R1A1-element 4939 1 58.42 TTTTAAGTAGGCAATTTGTAAAAATTAAGCAGCAAGCAACACAATACAACCAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAACCTCAACAACAAAAACAACAA:1 - chr3R 13225821 5' + I-element 128 1 52.48 CTATGGGCTGGCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTTTG:1 - chr3L 23678121 5' + Osvaldo 31 1 70.30 AAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATA:1 + chr3R 19449954 5' - roo 61 2 63.37 AAGATTAAAGAAGAATTGATGTGCATAAAACGGCGGCTAAAATCTCAGAAGTGGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTC:1 + chrX 12243730 5' + mdg3 306 1 73.27 AAGGTTGGAGCACCATATTGATATCTGGTCGGGAAAACTCCTATACATCCCCCAATTCAACCCAACAACCTTGCGAGAACCTACCAACCCAGCGAAGAAAT:1 + chr3R 9180962 5' + F-element 4534 1 64.36 AACTTACTGCCAAAAAAAACCCCCCTAGCCACGCACAGCAACAAAGCGAAAAAGTTTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGG:1 - chrX 5095949 5' + G4 3366 1 58.42 TCATACATTTCCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr3L 5827851 5' + blood 7014 2 77.00 GGGAGGCGAAGGAAATTTGCATTTGGCCTGTTGGCCAGGTTCGCGACTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGTTTTGGAAGT:1 - chr3L 3712544 5' + R1A1-element 120 1 55.45 CTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 19535683 5' - hobo 2916 1 56.44 CCAACCTGATAATATTGTTGTGTTTTTCCAAATGGATAGCCTTCGTGGAAAAGCACACAAACACACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATA:1 - chrX 15975476 5' + 412 7304 2 47.52 GATGCGAGCACCAACGGAAGAAATGGAAAGCACAAGCACAACCAGGCCAAGTAAGCCCCTACAATATAGTCTTCAAAGTGGATATAATAGACTTGGCTCTG:1 - chr2L 32550 5' - Stalker3T 315 1 81.19 CGTTGTGGCATTTTTCCTCAATTACAAAAGATAAAAACAAAAGAGTTAACAGTTAAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGC:1 - chrX 14987375 5' + Bari1 431 1 65.35 GATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGT:1 + chr3R 26331663 5' + G-element 53 1 72.28 GATCTACAGTGATCCTATGAAAACGTCAAGACGACTGCTTTCTCCGAGTAGCGTTCCTGCAGGCCCATGAAGTGGCCGTGGGCAAAA:1 - chrX 21113171 5' + Stalker4 482 1 71.26 GCGGCGGAATCCGCTGTCTCGGGTCGCCTAACTGGCAGTTAATGCTGCGGAGACTATACAGACCTCTGGTCAGCATTTTGAGCACTTGTGTTTACCCAGAA:1 - chr3L 2322659 5' - HMS-Beagle2 6933 2 61.39 CAGTGACCAAAATTTGTGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr3L 11696475 5' + blood 7020 2 70.30 TTTGTAGTTTTATTAAATATTGCTGACGATAGTTGTTCTTGTTGTTGTTGCTGTTGTTCCTGTTGTGTGTTTTCCGTTCGGGTTCATATCGTGCAGTCTTA:1 + chr3R 18355572 5' - Doc3-element 403 1 79.21 GGGGGAGTTGTTGGATTTGAGTGTCACCCGAGTGCACCGCAACATCATTTATGGCCGTGGCTACCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr2L 18662406 5' - hopper 1404 2 66.34 CACCCTGCCACCCATTAGTATTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGA:1 + chr2L 21892839 5' - F-element 482 1 80.20 GGTGCCCGACATTTCCATCTTCTTCATGCGCTCCGCCTTGCGTTTAAACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chr3L 5790764 5' - 297 369 2 56.44 ACATTTCAACTTGCAACTTGACTTTTGCCCGCTCCTGGCTGCCTGCCGTGTGATATTTGTCGGGACTTGGCGAATTCATTTATTTAAAAAAAAAAAGAAA:1 - chrX 17960161 5' + transib2 2634 1 60.00 TGCTTTTCCTTACTGCCAATATTTTTTACGGCGTTAATATTTTTTGGTCATTCCTTTGGCGGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGC:1 + chr3L 14592470 5' - F-element 4484 1 62.38 GCATACTTTCCGGGGCTTTTAAAACGACTATTCGCAAGAAACAACACTAAAAGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATG:1 + chr3R 13339032 5' + BS 5020 1 50.50 AGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chrX 12290640 5' - HMS-Beagle 202 2 70.30 CCCCAGCAAGGACATCAAGGAACTGTTCGGCACGAATGTGGTGGCCACCGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 + chr3R 22352753 5' - 412 7544 2 72.28 GCTCGTCTGGTTTGGTTTGTTTTCACCAAGCAAACGTGATCGTGGAAGTGGACGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGCTGCTGCTTGCTGTCT:1 - chr3L 17417564 5' - Bica 4573 1 56.44 TAGATCCCCAACTAAATAAATTTCAAAATTGTTTATTTTCTTCCAAACAAATCAGCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCC:1 - chr2L 308563 5' + Tirant 8180 2 56.44 GACGAACATGAATAAAATTTGCGTAAGAGTGGACAACAAGCGGATTTCGCTCTGGACCTTGGACTCCAGCGGGCCAAGGGCATATAGGTTGAACGGTAACG:1 - chr3R 6923439 5' + gypsy8 4869 2 60.40 TTAAAATTTGCCTGTATTTTCTTGTAACGATTTTGTATGTTTTTAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAG:1 + chr2R 451006 5' - I-element 385 1 56.44 GCTCTGGCCGCCTACCACCTGTTTGGCTTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGGGGGCCTCCCCCTTT:1 + chr2R 18500633 5' - R1A1-element 4910 1 70.30 GCGTGCGCTTTTCCTTTTCCGTGTCTAGCATTGGACTTGGACTTGTGGCCATGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 + chr2L 11385126 5' + transib2 25 1 54.00 AATTTTGAGGCTACATTCTAAAATATCTTTATTTTAATACCACAAGCAGGTAATGAACAAACGAAATTTTCAAGACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCG:1 + chr2L 14969249 5' - G2 146 1 40.59 GCCATCGGATAATGGAGAGGGTGGATGCGATGTTAACATTGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 - chrX 1859951 5' + flea 48 2 69.31 AAGGATGAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr3R 25360943 5' + jockey 19 1 67.33 CCCAGCAAGCAAACAACGGCAAGAAGTTAAGGAGCAAGACCAATGCTAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGA:1 - chr3R 10099114 5' - accord2 7369 1 55.45 GAAGAAGCTCTCAACTTTATACATTTTTCATGGCTGGCAGCAAAACGAAAAAAAACACAAAAAAAAGTAAAGGAACCGAAAAAAAAAAACAAAAAACA:1 - chrX 5209958 5' + Bari2 909 1 53.06 AACTAGAGTGCAGTCTCAGTCGACTACGTCATCAAGGCAACTGCTTGTTGTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAAGATCGG:1 + chr3L 10534030 5' + invader2 252 1 58.42 TTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 + chr2L 20840425 5' - Transpac 280 2 57.43 ATTTTGAGTGCTTTCGTGCCTGGCTCCTTTTGCCAGCTGTCTAACTGTTGTTGTATTCATAACTACTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAA:1 - chr3L 935254 5' - R2-element 3382 1 71.29 ACATGTGCGTCTGCGACTCACAAGTTATGGGCCACAAATCTGTGCCTCTGATAAAGGTTCATGCCCCTCACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTT:1 + chr3R 20062219 5' + Cr1a 4198 1 67.33 TAGAAATTAAAGGAAGGTTTAGGGTAAACGGCGGGAGGAACTATGACTCTCTTGGGGATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGGGGGGTATTCTTCTG:1 - chr2R 8725426 5' + R2-element 25 1 68.04 GAAAGCTTTCGCCTTGTTTCGCATAAATTGCCCCAAAATAATCCCAACTATCAACAAAATGCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCA:1 - chrX 9845423 5' - R1A1-element 5270 1 65.35 TCATTCTCCTTCAGCTGCAGCTTCGTCTCCAGTTTGACCTTTTCCGCATGAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTT:1 + chr3L 12512084 5' - P-element 483 1 57.43 AAAAAACGGGAGAGGGATAAGGACAATGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTTTTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTAAATACTCTAATGACA:1 - chr3R 30712738 5' - 1360 408 1 73.27 CATTGATTGCAAATGGTACAGAAGATTTGCTGGAATGATACAAATTGCCATTTAATGGGAAACAAATTTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2R 19637237 5' + 1360 8 2 73.27 CACTGCATTCTGCGCTATCGATGCAAGGCTATCGAATACAAGTGGACTTAGGGCTGGCGAATAGAGTATTGCCAAGAATCCAATTAATCACAAGCGTACAA:1 + chrX 13387395 5' - frogger 398 1 71.29 GCTCCTCGAGATCTTTCTTCACTCCTACCAACCACATCCACTGACGCCTCCTGGCGACATTTACTGGCCTGCCGCTGCTGCTGTTGCTGCTGC:1 - chr3R 14789386 5' - TART-B 154 3 68.82 GTAGGGCTTTGTGCTTTCGGTGCCTCTGTGCGAAGGTATATACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 - chr2L 9856300 5' + HMS-Beagle 6828 2 61.39 ATGCCGCTGTGACGGCCATTGCAACGGGCACGAATAAAATAATGCAGTTTACTTAATCTAACAACCCCGAAATGTAAATTGGACTGAGGAGAAGCCTCAGT:1 + chr4 1242884 5' - 297 6824 2 68.32 CTGTCTGCCCAGCCACTTAAGACTATGTGTTTGTTATATTATATACATATACATGTGTATGCAGAGGGCATACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGT:1 + chrX 15297526 5' - gtwin 469 2 58.42 AGGGCATCAAGTATTCGCACTGTGGGCAGCGATTCCTGTTCGTATTTTGTACTTTTTGTGGACTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGT:1 + chr3L 7405215 5' - Stalker 6915 4 63.37 TTTGCNGTTGTTGTCGCTTGTTGTTATGCTGCTTTCCTTCTCAAACCATTCTCTACTTTTTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGCAACG:1 + chr3L 6539570 5' - Idefix 246 2 65.00 CCTACTATTTTGTCAACGCTATTTATTTTTATCAAATTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATT:1 - chr2L 3013614 5' - R2-element 3215 1 59.41 TTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCATTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTC:1 + chr2R 1949358 5' + INE-1 573 1 56.44 CTTACTGTTTCGCTCGTTGTAGGAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr2L 22719652 5' - 1360 3356 1 59.41 ACATCTATAAAGAAACCACAAAGAATCTACAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAG:1 + chr3L 5192409 5' + 1360 397 1 72.28 CTTCCCATTGCCCAGTGCCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCGACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAG:1 - chr3R 6599343 5' + F-element 387 1 81.19 ACAAACACACAACTACCCACCCACCCGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCG:1 + chr2R 5910627 5' + hobo 2647 1 78.22 TCCTGCGAGTTGCGAGTGTTGGTCCTGCATGTCGCCATGTGAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGAACTTGTC:1 - chr3R 30413414 5' - jockey2 3155 1 60.47 AAATTCGAGTAACTCAAGGCAGATGTTTTGATTTGTTTTGTTTGGCTTTAGAGTATTCAGCTAGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAG:1 + chr2R 18764763 5' + 1360 445 1 59.41 AATTTGGGCCGCCATAGCTCTGCATATTCTGGCCATTTTCACGGACCGACCTGCACTCCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2R 5910843 5' - hobo 2922 1 62.38 AGCCAGAGTTCTTACACCGAGCAAGCAGCAGCCAAACAAAGTGAAGCAAAATAAGCAGCAGCAAATAATAAATAATATCAAAAGACCACCAACACTTACAT:1 - chr3L 16164110 5' + Stalker3T 85 1 72.28 CTCCGTCAGTTCCTGTTCCGTTTCGAAATCCGCAAAGAGCTCGCCGTTGCTGTTGGACAATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGT:1 - chr3L 9622329 5' - opus 331 2 71.00 AAGGTTGATCTTTGAATTAAGAGTCATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 - chr3L 2539330 5' - roo 9044 1 56.44 TGGATGAAATTGAAGATCATCATGCAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTACAGCTGAGTTTGGTCCGATCGGGTGGTCATAAA:1 - chr2R 7394618 5' + invader4 2890 2 71.29 ATGTGTCATGTGTGCGCTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr3R 19535667 5' - hobo 2932 1 72.28 TGAGAGCTTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATAT:1 - chr3L 3485023 5' + diver 45 2 70.30 CCAGAGGAAATCGGACAGGAACTAAGATCAACGTCAACTCGAATGCAGATTGAACGTCGTCAGTTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGA:1 - chr2R 11488397 5' + Burdock 290 1 72.28 TATTTGTCTTGCCCATTTGTATCGCACTGCCACGCCCACAATGAAAATGGACAATAGCGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGG:1 - chr4 1133129 5' - hobo 2677 1 63.37 TTGTTTTTCCATACAGTTCTTTTCTCTTTTGAACCAAACTGCATTTGGTATATGTATATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 - chrX 19885259 5' + HMS-Beagle 16 2 63.37 TCAACCAATCCACATCGAATCATCATCACAGCAACCGCAGCAGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTT:1 - chrX 272893 5' - gypsy4 61 2 61.39 CCTTCCGGAATACCACCACTTACGCGACTAGGCAGCTCTTTTCTACGCATACAGTAATAGCAGACAACTGCATGTGTGCACACTTATGCTCATGCATTGTA:1 + chr2R 4615475 5' + 1360 186 1 81.19 CTGTTATTGTACATACAATTACCTAGATGTATGTGAGTGTGTCTGTGTCATGTAACTTTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGG:1 + chr2L 9796567 5' - Tirant 8124 2 67.33 CTTATTCGTACGATCTCGATTAAGGCTGCCTCTTTGATCACTTGAGGTTTATCTTATGACCATCGCATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGC:1 - chr3L 12054950 5' - invader3 5398 2 71.29 TGGAANATGCAATCGCATGGCGATAATAACGCGTGGCCAGGATATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACT:1 - chr2R 14826995 5' + invader4 2998 2 62.38 AAAACACATCAAAGAATAAAACACACACTGTATCGAATTGTGGCTGGCAAAAGCAGAGAGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr2L 8501445 5' - P-element 2792 1 58.42 AGCGANTGAAAAATGAAACGTATTTATAACTTTTACTTAAAATGCGATTTAGTAATAAATGGGCATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr3R 19198099 5' - pogo 2094 1 69.31 GATTGATCTTGTTTCCCCCAGACTGAAAGTGTCACCGCCAAGACGTACGTGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATA:1 - chr3L 6173472 5' + 1360 313 1 63.37 ACTTACCTTTTTTTGTCTGGCTAGGTGTGTGTCCCCAGTCTCTGTGGTAATTGTAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCG:1 + chr3R 32014354 5' - jockey 4730 1 55.45 GAAGTACGAGTACGAGTATCTGTGCAGATAGAGCTCAACGCCTACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATC:1 - chrX 11514435 5' + F-element 275 1 57.43 CAAAAATAATTTTTCATTTGTGTATGGTTGTAGTATTTCATTTCATTTTGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAG:1 + chr3L 18168380 5' - flea 163 1 53.47 AACCCTTATCAATGAAATTTCACATTTTCCCACAACATCTTACTTTGTTGACCCCTTTTCATCTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAG:1 - chr3L 7876821 5' + blood 7179 2 75.25 AATCTGTCCATTCTGTTCCACTAAACATTTTCCATTTTCCATTCCCCATTTTCCATTTCTGGAACCCCCATGGTAGCTGGTGCAGAACCGAGAAGCAGAAA:1 - chr3L 10149715 5' + G7 10 1 56.44 ATAAACTATTGGCCAGACTTTATTACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3L 25798535 5' + blood 7014 2 74.73 AACATGGCATTGAATCTATTATTGGCTCTAGCCAACGACACCAGTTTACGGAACTTGTTATCAGGATTTTCGAAGCTATCCCATCAGTTACCAACGCAATC:1 - chr3R 22699036 5' + F-element 4408 1 76.24 TTGAGCCGCACGTACAGCGTTGGATATCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCTAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTG:1 - chr3R 17544111 5' - Transpac 454 1 72.28 TCAAGAGCAACATGCACTCAGCGCTAAACTTCATTGCAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATT:1 - chr3L 14856095 5' + 17.6 7070 2 63.37 TCTCGTGTTCGAAATATAAAAATCGTTAAACAAAGACTGGCGTTGTTTCTGGATTTGGATCGACTGCGACTAAGTCGCGAAATATGACTCCT:1 + chr3L 12690669 5' + gypsy4 6651 2 79.35 TGTCATTGCCCACGGCAATGGGTCGAAGCATTACTAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTATTAATTTTATTCAGTATATACGTGGTCAGTGCTAT:1 + chr3R 26475377 5' - Tc1 218 1 54.46 GTAATTCGATTTCGAAATCTGGAACTCCAATATTTGACGTCCGTCCAAACAAAGTCAAACTTTTTGGCAATGGATTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAT:1 + chr3L 6119792 5' - accord 7100 2 61.39 ATACAGCTCTAGAAGCACTTTGGGTCGGGACTGTAGGCCATCGAGGAGCCCATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAG:1 - chr3R 29594511 5' + R2-element 495 1 58.42 ACTCTGATGATTATGAGGCTGTCGCGGAAAAAGGCAAAGGCAAAAAAGTAAAACCAATTTATCTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGA:1 + chr2L 3142675 5' - Bica 4676 1 54.46 ATGCTTTGACATCATTTGTCCCTCGGGTTACACAACGCAGCAGCTCCGGAAAAAGAGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCG:1 - chr3L 567863 5' + F-element 4465 1 61.39 CCCCGGCCAAAAGAAACTAATTAAGTAATAGCCAACTTAGCTTCGTATTTTATGACTTTACTGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATT:1 - chr3R 10931635 5' - invader4 2630 1 53.47 GATATCTAATTTTGAACAACGTTCTTTGCCCTCACAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAG:1 - chr2R 4924454 5' + Doc 411 1 74.26 AACACGAGCGGGATCAGGATGCTATGGGGCAAAGTGTATCGACCACGGGCTGAGGCAACGCTCGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCTATAATTAGAACA:1 + chr2L 19129581 5' - rooA 7282 2 54.46 CGAGACGGCCGCGTCGTCATCGAATTTTTTCTCATTTTATTCCCCAACATCTTTTGGTATCGCAGAAAAATATCTGGGTTAACGGGTATCTGATATTCAGG:1 - chr3L 3433972 5' + INE-1 552 1 78.22 ATTGGCGGTTTATGGGGTCGCAGTCCTTTCCTGACCCGATACATCTCAAAATCGAACGCGGACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACC:1 - chrX 21303009 5' + Quasimodo 7 2 66.67 ACCCGTGCAGTTGTATCTGCATCGAGCAAAGCAGCAGCAACATTGGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr3R 19751096 5' + 1360 26 1 53.47 CATTAAAATTCCGGGGAAATGGCCCCATATGGGTACACCACTCTATATCTGCACGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACG:1 - chr2L 432171 5' - BS 4798 1 57.43 TATCCCCAAAACCAAGTAGAATTATCGACACCGAACTCCTTTTCGGATACAGAGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAG:1 - chr2L 18218307 5' + micropia 5292 1 60.40 CAAGACATTTTTGCAAGACAATTCTCTATTTTTTTTCTTTCTGTTATTTTGTTATTTTTAAGAGCACGATTTAATTTCAACTAATTATTAATTTATATTAT:1 - chr3L 18855370 5' + Tc3 268 1 79.21 AAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3L 5827889 5' + blood 7053 2 63.37 CCTTCCGTATCTGTGCACCACTGCGTGCTCCTGTGTGTTCGTGTGCGTTTGGTGTGTGTATGTTGTATTGGGATGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGT:1 - chr2L 15158582 5' - Idefix 41 2 57.43 CAATGTAGCGGGCGAGCGGAAGTGTAAATTGCACACTTGAAACCTGCCAACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAAT:1 + chrX 10756483 5' + I-element 4921 1 51.49 AAACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 11576432 5' - roo 356 2 75.25 GTTCTATCACCTTGATCGTCTTGGACTCCTGTTCAGTTGTCTCCTTCAAGGGTTCGCTCTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGG:1 + chrX 9262261 5' - Tirant 11 2 62.38 ATTGTAAAGCGGCATGTCGCCCAGGGGGCGTGGCATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr2R 21937566 5' + 412 12 2 67.33 CTAATCTAACGCTCTGGGTAGCATATCTCTTCCAGCTGCTGTTGGCATTGGAGGTAAATGGCTGTACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCA:1 + chr3L 17072482 5' - P-element 299 1 67.68 CAAAANAAATTGACAAAAGCCGGCAAAAGCTTGACAGGCGTCAGGAAAATTAATAAGGCAATTAATGTTGAATGCTTATGTCCGCACTTTGTGCCTCAAAA:1 + chr3L 20104978 5' + 1360 474 1 55.45 AGGGGCGGCATCTCGGTCTTAATGCTCGTCATGGACCGCTACATAAGTCGATGCTTTGTGGCTGTGGTTGGTACCCATGTCGCGGGTAGAGCCTTCATGC:1 + chrX 19782255 5' + R1A1-element 5027 1 62.00 GGGAAAGTGGAGTTTATACACAGGTCAATTGCGACTATCCCAAAAAAATTATGAAATTTCGCGTTTCCATTTCCACCTGCTGTGTAACGGGTATCTGATAG:1 - chr3R 13194751 5' + INE-1 547 1 65.35 GCTTCGCAAGTACCACAAATGGTAGTCGATCCTCTAGTATCCAACCAATATTTCGAAACTCACTAACCTGCAATTTGACCCAG:1 + chr2R 9896935 5' - gypsy12 486 2 57.83 AATGAATGTGGTAAAATATTTTCCGCGATGTCAATCGAAAATACCTACGTAAATTGTTTACCACAATGCTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTG:1 + chr3L 8628077 5' - I-element 179 1 79.00 GAGCGAAGGAAGCGCAAATTAAAGGAAATTTAATCAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATC:2 + chr3R 5452835 5' + jockey 110 1 66.34 ACGCATATAAACAGTGCAAAGTGTGCGTAACGAACTATGCATCGATCCTCTATAACTGTGGTTTTACATTTTCTACCACGGTTTTCGGGCTTCCATTCATA:1 - chr2L 16121597 5' - HB 483 1 69.31 ACAAAACACACTGTAAACGAGCTGTAGATGTGCAACAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chr2R 19205672 5' - hopper 147 116 60.00 ACACCATTGCCAAAAGACGCCGTTCCTGCTGGTGGGCACACAGATTGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTT:1 + chrX 19698324 5' - Q-element 141 2 55.45 TGGCGAAGGAAACGCGCCTGGGCATCGGTGGCAGGCATTTCACTCGCAGGTCACTAAATAAAACTCACACGACACCCGCACACATAAAGTTGCCGGCTA:1 + chrX 2238931 5' - 1360 164 1 70.71 GATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:3 - chr3R 1048027 5' + Stalker2 7295 2 70.30 AAAGGAAAGCGGCGGCAGGCGGAAAATGGTGTCAGTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGA:1 + chr2L 7755967 5' - copia 4692 1 65.35 CAGCTTTTTCACTTACAAACGCGCAATTTGTGGATTGCGCAGAATATTCAGATATATTAAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTT:1 - chr3R 5946188 5' + HMS-Beagle 13 2 64.36 CGGCGCCCGCGGACCACAGCTCCTTGGTCAGCAGGTAGGTGGAGATGGAGGTCAGGCCATTTTGGAGCTGGGGAAGATGCAGCATTCCCCC:1 + chr3R 25069122 5' + aurora-element 463 1 64.84 TGCTAACTAGTACAAGTTCCACCTCTATAAAACAAACAGGATCAGAAACTAATCCTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGA:1 - chr4 900179 5' + 1360 3168 1 65.35 ATAGATTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3R 11685579 5' - mdg1 378 2 66.34 TTTATTACTAGCTTATATTTGATTCGAAGCTGTTCACGATCTCGTCCCAATTCAGACTGATCTCTGATAATTACTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCG:1 + chr3R 1207380 5' - Idefix 7254 2 62.38 GTGGGACTGCAAGCTAGTGCTGATGGAATAGCTCAGCCATGGCGTTGGGGTCTGAGTTGGAGTCGCCACAACGCCAAAGAGCTAGAGCCGGATTCTGAAGC:1 + chr3L 13217284 5' + Gypsy12A_LTR 2200 1 68.32 TAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGC:1 + chr2R 5284547 5' - Doc4-element 2629 1 57.43 ACACAGTGTAGTCCAACCGCCCAAAGTGTGGCAGTAGCTGCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAG:1 + chr3R 11880970 5' + invader4 2945 2 60.40 AAAGTTAAGGGACAAAAAGTGCGAATAACAGCTTAAAACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTAAAGAGAAGCCTCAGTAATTTAACAATATTTGTATTTC:1 + chr2R 23004154 5' - 297 221 2 76.24 GGGCAGGATCGAGAGTGAGAGGGCAAGTACAGAGCAGAGCAGCAAGTCGTGGATGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCAC:1 - chr2L 685131 5' - blood 7102 2 59.41 CGAAACAACGCACACTGAACAAAATTTGCACACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTT:1 + chrX 9113502 5' - P-element 2700 1 36.63 CTTTCACTCTACCTGCTCGTCCAGGGACAGGTCTATGAAAACCGGATGCGAGAGGTATGTTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTTATAAGAA:1 + chr2R 14164475 5' + Tc1-2 157 1 53.47 CTCCTTCGGTTGTGTGACAATGTTTTTCTATTTGAATTGGCACACTCATTTTGTCGAATTCCGCAAATTAGTTTTTATTTATTTCGAGTTTCAACCGGACG:1 + chr3R 16476884 5' - Copia1_DM 275 1 76.24 AATAGCAGGCCCATCCTTCAATTCCGGTTGCATGGATACAAAAATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 - chr3L 12246185 5' - HMS-Beagle 7014 2 56.44 CATCCGGGGGCGTGGCAGCAACGGAGGGCTCTCCAGGATCAGGAGCGATTGCAGGATCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATT:1 + chr2L 3691378 5' - R2-element 253 1 61.39 AAACGCAGCTATATTCACACGCTCGTGTGTGTGCGTTCGTTCATAAATGATGTATGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr3L 22324020 5' - hobo 2928 1 64.84 CGAGTGCTTTTGAGTGATTTACCTGATTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCC:1 + chr2L 12348182 5' + Cr1a 205 1 82.18 AGCCATAAGAACTCTGGAGCTAAATGCCATATATATATTCATCTACTTACTTATTCGTTTTAATTGGTAAAAATATGAAAAGAAAAAATAAAACAACAAC:1 - chr3L 922805 5' + gypsy7 5013 1 60.00 AATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 - chrX 19192430 5' + INE-1 17 1 73.27 TAAATNCTGTGAAAGTTGCATTGAAGGCATTGAATACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGC:1 + chr3R 11520437 5' + Idefix 7168 2 65.35 AATAAATTCACTAAGAACCCAATGCTAGCTAGACCAGAAAGCAGAAGTCAAAGAGATGAGGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTG:1 - chr3R 10127324 5' + flea 4651 1 67.00 GCCGCGGATGATAATATACAAATACAAATAAATACAAAAACCTCCGCGTGCTCTTCAGTCCTTGTTCGCTCACAGGGACTGCCAATCAAGGTATGACTTCG:1 - chr2L 1010677 5' - Rt1b 4977 1 70.30 CTCAGCCAGAACAAGGAACACGGATGTGACACAGCTGGTGGCCACCATTCTCAACAGCAAGTCATGCAATTAAAGCTCCACCTAGTCGTCTGGAATGCGAA:1 - chr2R 22209584 5' + G6 1621 1 74.26 TCAGCAAAAGCGCACCGTCTGCACGCGACCAACTCCGCAGCGAAACTGAAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATAAAGTAGCCCGTCTTCTGAAACAGCGC:1 - chrX 20449370 5' - gypsy4 161 2 58.00 TACGCAGAGCCTTCAGCACTTAGTTCAGGTCAAAATACAAATAACAACTTTTACCCAAACAGAATGTGTAACACACGTGCGATTACCTCAAACAATCCCAC:1 - chr2R 25138810 5' + I-element 4886 1 70.30 GATGTGGGCGTGATTCGTGTACTTTTCCCTACCTATCTCCACTTTCCTTAAGAGCACGGCTCTAGTAGCCTCTTAGGTGCCCTATTTCCGGAGAAACATTA:1 - chr3R 23394382 5' - Gypsy12A_LTR 1892 1 72.28 TTCTGGTCCCAGGAAGTAATGTATTCAAGCAGATATTCCCCGACATCTCCAGAGAGCCTGGTCCAATTAACACAGACTCAATACGACACTCAGAATACTAT:1 - chr2L 14108638 5' + P-element 2805 1 78.22 TTTGACACTAGTTTTCGACTAAAGAGATGTTCGCCCTGCCTTTCTCTTTGCCACTGCCTTTGCCCACTCGCTTGTGTGTTTTATATATATTTTGCAATTTT:1 - chr2R 18419601 5' + copia 4666 1 71.29 AGGGGTTTATCTTGCGGTTTTGACTGTGCCGGCTTATCATTTTGCCTTTCTCTCACTCATTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGT:1 - chr3L 10773512 5' - Bari1 1667 1 66.34 ATGGATGGTGCGGTCTGCAAGGCCTTGCCCATGACAACCCGAAAAAAAGTACAATAAAATCAAAGTCGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCTCGACACAGTTC:1 - chr2L 7343290 5' + mariner2 102 1 69.31 CGCATTATATTTGCTTTTACGACCCTTTTGGTGTGTGGTAAAACACTTCTGGGCATTAAAGGGATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGA:1 - chrX 17866341 5' + 17.6 7000 2 71.29 AACTTCGTTGTGCGGTATCACACATACATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chr2R 18891104 5' + opus 46 4 75.25 TTTTATTCATATCTGTAATATATTATGTTATTGTGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 11477196 5' - hobo 2899 1 74.26 ACATAATTCCGATGCTTTTTACACAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGA:1 + chr3R 20167945 5' + HMS-Beagle 6738 1 77.23 TCAAAAATCATTGAAGCGGTTTGTGTCATAAAAAAGAGGATCTCATTTTGTTAGTCAGCATATACATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGGG:1 - chrX 14870221 5' + Stalker 185 4 71.29 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACA:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 5334 1 59.41 AATATCGCAACTAAAACAATCTTAGACCAAATATACAACATTCTTATTCCCGTTGCGCGTAGAGTAAAAGCGTATAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:1 - chrX 21005280 5' + INE-1 15 1 78.22 ACACTTATGCATGGAAGTGCATTTGTTGAAAGTGACAGTCGCCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACA:1 - chr2R 16018607 5' + I-element 190 1 59.41 CCTTCCGGGGCCCGGAATAAAAAAACTTTCCCAAATTCGCCGTGTCATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAA:1 - chr3R 29611835 5' + I-element 191 1 54.46 TGTTAACTTTTTTGCTTTTACACATTATTAATCGTACTATGTTCGTGATTTTTTGTTGTAATTTATTGATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGAT:1 - chr2L 6003519 5' - HMS-Beagle 239 2 57.43 GCCCTTTCTATGGTTTTTAGCCATGCCAATGCGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCA:1 + chr2L 12503207 5' - FB 779 3 68.32 GTATCAATAATTTTTTAAACAATCAACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTAT:1 + chr3L 3798375 5' - hobo 283 1 75.25 TTCCGTAAACATTTTCCCGGCCGCAACCCCGACAGCAAGACGACAATTTGTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAAT:1 + chr3L 7265790 5' - hopper 1344 1 55.45 GTTGACACCATTTTGAAACAGTTGAAAAGCACTCGTTGAATCTTGAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCA:1 - chr2R 14684788 5' + F-element 4454 1 55.00 ATCAAAGTAGGTAACACGCGCAAATAAAACACTTGACACATTAAAACAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAAGAGTTAACCAATGGTACTC:1 - chr3L 14248379 5' + rover 472 1 50.50 CATTTAAATGCCGACATCGTTGACGTCAACAGCAGTTTATATTTTTGGTTCACTCTTGTTATTATTTGATACGAAGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAA:1 + chr3R 10724635 5' - 1360 3238 1 76.24 ATAAGTTGACATTTTTCTTGCATCTTTCGTTCTTTGTTCTCATTTTACGTAAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTT:1 - chrX 22746155 5' - Doc 4407 1 57.43 ATGAATATTTAGATTTATGTTGGCTAAAGGTTTTTGTTGCAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCT:1 - chr2R 14814163 5' - Tirant 66 2 65.35 CAGCCATTTGCGATGGCCGATTTGCAGTTGTTGTTGCAGGTGTTGTTGCTAAAGGTGGAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTGGCTAAAGA:1 + chr2L 7146406 5' - Doc3-element 479 1 79.00 CAGCAATACACACACATACACACAAGCATACACATCACGAAACTTGTTTGTTTGCGAGCGGGCTATTTCAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCA:1 + chrX 14598670 5' - I-element 5019 1 52.48 GGCAAAGAGACAGGGCGGAGAGGAAAAGAGAACAAGGAGAGGCAGAAAAGTGCGCGCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACACACTCAACTGTTC:1 + chrX 7691804 5' + Porto1 463 1 60.40 CCTCCCACTTTTTTCCGCCCCTCAGCTTCTTGCGCAGAGCTGCGCTGGTGCTGGGCACGTTGTCGGCGGCTACATTAGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGC:1 - chr3L 3943433 5' - G-element 462 1 78.22 GGTGCTTTCTAAATAAAGTAAGCATTTTTAAGCACTGTGTAAAATCCCAAATAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 18076271 5' - roo 9030 1 70.30 AACGAAAATACCGCGGAAGCGCAAAAGTACCAGAATTTCCCTGGTATCGCGCTCTCTCTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCG:1 + chr3L 21879466 5' - invader3 191 2 65.31 GGATATGGCCTCGGATATTGAAAAGTTGTCCTGCATGCTTCTGGTCTCAGCCTGTCGTTAGGCATCTCGACGGGGCATCTTGACCCTTCACATATCCTTCT:1 + chr3L 5993320 5' - gypsy8 4486 1 73.27 CGTGTNTTACCAACTGGCGGGCATAGAAAGTGCAGTTGGTTGAATGGAGCTGAAAGTTGGTTGAGCAGTTGATGTGGTGGGAGTCAATAATGACTTTATTG:1 + chrX 10996229 5' - accord 460 2 71.29 CCCAACTTCCAAACACACTCACACTCAAGCAGGACTCTGCAGGACCTACACATATGTATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chrX 14424112 5' + hobo 17 1 57.43 TCGAACCGCGTGACATCCTGCAGAACAAGCTCATCCATACCATGAAAACTCCGTTATCCACAAGGAGCTTGGAATGCCATGGGTAGCAGAGGAGATCTCCC:1 + chr2R 4878612 5' + G-element 4057 1 70.30 TAGCGAGCCATTGAGTGGAGGGGCATGAAAGGGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCATAAAATAAATGATAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTA:1 - chrX 11282367 5' - Cr1a 78 1 68.32 AACTATAAAAGATAGAAGGTTGAGATTTAGCATGTTGCTATGCCCACACAAACATAGCCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTACG:1 - chr2R 1751259 5' + I-element 4994 1 56.44 CAATCTCAAGCTGAGATACTTTATAAGTAATTACAAATTTAGCTCGATCAAAATGCTATTGAGTTATGCATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTT:1 + chrX 19536949 5' - Quasimodo 23 2 38.61 AATACATGGGATTTTGTGTTATACTTCGCTTGTAGATTGTTGTGATGTTGGTCGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTTTCGTTTCTTTGTCACAGCTTTGG:1 - chr2R 6620217 5' - gypsy4 428 2 74.26 ATAACCATTACATTGAAGCTTGTGAGCAAAGTCGGGCTTTACCCTCGCACCCCGCCACTCTGTGTTTTAATAACCAATATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCA:1 - chr2R 24962242 5' - mariner2 169 1 55.45 TGTTGGCCACTTTTGTTGCCAACTCGACATATTTCAATCACGTAAATTTATTACGTAAACATTTGCTTTGCTTTTGGCACACGATTTTTTCTCCGTGGCTC:1 - chr3L 22631372 5' + 1360 50 1 79.21 ATGTTCACACAAGCATATGTATAAATATATACATATACCCCGAAACGAGTGTAGCATTTACGCACTGGAAGGTGAAAGAAGACCGCTAGGACAGAGGAGCA:1 - chr2L 11168037 5' + gypsy8 4461 1 69.31 GCAGTTTAGGAACAGTAATGGTCTTAATGGAGCAGTACGAGATTTCGAGCGAAGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGA:1 - chr3L 26130937 5' - Quasimodo 6919 2 59.00 TATGTCAGTCCAGCCGTGTAAACTTTGAGATTTCAGTAACTAACTATCAAGGCCAGAAAATGTTAACGCTGCGACAGATACATGATTTTATGACTTATATC:1 - chr4 700069 5' - Quasimodo 103 2 58.42 GAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 + chr2R 19726858 5' + 1360 35 1 61.39 AATATTTAGTTAACGATATATTGATATAGATGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTT:1 + chrX 17947881 5' + hobo 395 1 70.00 CCCGATGAGAAAGTGGAAGGACTCCAGCCAGCCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCGCCAGAATTTGGGTTCTT:1 + chr2L 1853916 5' - Quasimodo 132 2 66.34 CCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1 + chrX 3485670 5' + P-element 62 1 17.82 CTGATAAAACTGCTTTGGCTAAAGCTTACATGAAGTGGACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAAC:1 - chr3R 32047765 5' + Tirant 8357 2 62.38 AATACACAATATGTATAAAACATAACAATAAGTGTGTGAATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTAT:1 - chr3L 3096482 5' - HeT-A 6020 1 62.38 TGGCCGAAAAGCTTGGGCTTTTAATGATTCTTCGCGGTGCCTCTTTCTTTTGTCGAACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr2R 11730854 5' + blood 20 2 59.41 TATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCC:3 + chr2R 4577083 5' - Chouto 482 1 60.40 ACTGCTAACTGAAATCCAATGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCAT:1 - chr2R 22530804 5' - I-element 4883 1 81.19 GTTGAGCTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr2L 19090033 5' - opus 488 2 68.37 GAGGCGGTTATTTGAATTATTTTTTTTTTTCTGGTTTATCTTGTTTACAGAGATATATATGGTTTTTAACACAGATAAATATGTGTTAGTGCCTTTTCGCT:1 + chrX 20881921 5' - Porto1 101 1 73.27 ACATTTGGTGTTTGTTCCACCAGCTTTTGTAACACTCCCAAAGCAATCAATTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATT:1 - chr2L 14696786 5' - I-element 4911 1 57.43 AGGATGATCACGATGAAGTAGACACTGGCGCACACCGACCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGTCGAACTAGAAGCGTTGCTGTCAG:1 - chr3R 26231507 5' + Chouto 5966 1 71.29 TTACTTAAAATCGAATCTTGCCCGTTCTTAAAGGTTGGCAATGCTATCAGCTGTATTGTCTGATGCAGCTGATCTGATTTATTACCAGTTTACTGGATCAC:1 + chr2L 10330341 5' - Rt1a 160 1 71.29 TTTACGCTGTGATAGTATCCATGAATCGAACTGATAAGTTCCTTGAGTCCTCGTTCATGCAATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2L 6177261 5' - pogo 2091 1 69.31 CTGCCGTAGGGAACAAATCCGTTCTTTCCCGCCGTATAGAACACCTCCACCTCCTGGCCGTCTTCGTTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTA:1 + chr2R 11259405 5' - F-element 4370 1 69.31 TAAAGTCAAAAATATTACCAAATTAACTGTAACAGGTAAAGGAACCGACCCAATAAAGTGTACATATATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAG:1 + chrX 22589838 5' + INE-1 90 1 61.39 AATAAAGTGCAAAACAATTTAGAGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr3R 23630091 5' + pogo 27 1 56.44 GCAGATCGCTGGGAGTGGCCTACACCAATGTCCCGACGATTCCACCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTCAAACTTTCCTCCCATTCTAGAACTGTCCGC:1 + chr3L 15969216 5' + gypsy12 9982 2 65.35 TTTATTGCCAATCTGATGAGTAACTAGGGGCATGAAATGTGTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCA:1 + chr3R 15157065 5' - GATE 8334 2 59.41 AAAAATCAAAGCTTAGAAAAAACATTGAAAAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTT:1 + chr3L 18218429 5' + F-element 4441 1 76.24 GGTTGGGAGTGGGGGAGTGGTTCCTCCCAATTCCCAATTCGGCAGTTGACAATCGCCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACA:1 + chr3R 30142828 5' + F-element 4283 1 60.40 AACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGCGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTG:1 + chr2R 22529311 5' + jockey 206 1 78.22 TGGGGTGGCCAGTGCTATACTTAGCCACTATTTAGCAATGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACGCGACATCAGA:1 - chrX 6452602 5' + micropia 460 1 57.14 AAAATATTTATGCCCACATCATACCAATGTATTGCAACATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAT:2 + chr3R 4579221 5' + Quasimodo 13 2 53.47 CATAATATTTTCTCATTGCACGAAAATCTATCAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATT:1 + chrX 1014571 5' + 1360 241 1 61.39 CTGCCNACGGGTGGCAGTTTAACCTTTTGCTGCAGAGGCTTCACCAAGCCGGATCCAGCTCCGCTTGTATTGTTATTCGTATTAAATCCCTGAATCACAAT:1 - chr3R 10359237 5' - Dm88 273 1 77.23 AGAGGTGAGAAGGCGACATCGTTTTATTCCATTGGTAAATTACACAATGAAATATATTCGATTTGAAGATTAGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTC:1 + chr3R 6460708 5' + Quasimodo 261 2 74.26 GCACCATCACGAAACCCATTAAGCAACCCAGGGATTCCAGAAAAGAGGACCCGAAAGAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGC:1 + chr3L 20639465 5' + G2 127 1 70.30 GGCTCGTAACCAAAGTTTTTTACCGCCAACTGAAGCAAAGAAAACTCATATACAACATATATACAACATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAA:1 - chr2L 5827195 5' - roo 25 2 66.34 TCGGCTAATTGGGCGCTTCTAATCAATGCTTACCCATTCCCAGCTATTGTGTGCGTCACATTTGCATATGTTGCAAAAAAGAAAAAAAAAAACAA:1 + chrX 3423830 5' + gypsy7 5009 1 63.16 ATCTAAGCGGTTTGGCTGGGTCTATGTAAGTGTCTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGG:1 + chr3R 27854804 5' - Quasimodo 7043 2 65.31 GTTTGNGTGTTTTTAATTTCAACTTCCCTTTAGTAGGTATCAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGACACAATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCCATAA:1 - chr3L 10488602 5' + INE-1 85 1 67.33 GATTAAATTGAATAAACACTTTGTAAAAATACCTTTGAATGTTCTGTCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCACGAAAACCGTGGTAC:1 - chr2L 15378867 5' + HB 490 1 72.28 ATGGATGAGTTATGGCTCCCGTTTTTTTTTTATTTTTTTT:1 - chr2R 20901298 5' + hopper 141 1 72.50 AAGAANCGAAGGGGAGAAGAAATGTAAATTCCGATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr2L 5151997 5' + I-element 38 1 64.95 CTAATAAAAATATTTTTACGACAACTCGCGAAACTCACGCAAAACGTTGGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGC:1 + chr2R 13280293 5' + jockey 220 1 53.47 GTGTCCTGTGAGAATATTTACTATGGTCGATGGTTGTGAGAAACTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTATCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTAC:1 + chr3R 25966093 5' + R1A1-element 266 1 62.38 GGTCTTTTGCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 12578196 5' + jockey 25 1 56.44 CAGCGTATCACAAAAAGGCAGGCAACACAAATATAAAAAATAAGCAAGTAAGTTATGAGCATTGTCGAATACCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chrX 21215993 5' - INE-1 548 1 65.31 CATATAGAACCTGCCAGGATATTGGTGTAATGTAGCGCATTTCGTGTCGTCTACCCCGGAACGTAGATGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGAT:1 - chr3L 13626494 5' - accord2 7410 1 70.30 GTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCT:1 - chr3L 5797286 5' - jockey2 3171 1 72.28 CAATGGGGGACATGGCCAATACAATATGTAGCTGATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGG:1 - chr2L 17511847 5' - hobo 359 1 66.00 CTGCTAATTTGTGCAAACAAAACAAAAAATGCGAGATGAACAAGTAAAAGCAGGAAAATAAAAGTGATCACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATGCGTA:1 - chr3L 70234 5' - 1360 150 1 53.47 AATGGTTTGCCTGCTGTGCTGGGAGCTGCGGGCGAGAGGGACAAATGGAGAGTCTGCGAATAGTGTGACCAACGTTGCATGGGGTGAGTTTGGGGGTTGGG:1 - chrX 6049044 5' - HeT-A 5930 1 77.23 CGTCTAAGCAACGAATGTGTAAATTTCAGTTATACACTAACCGAGTTGAACAGCCCCGGATGCCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCAGCTCAGGTACATGA:1 + chr3L 5872689 5' - R2-element 3317 1 66.34 TTATGAGTTATGCTAGGCAAGGACATGGCCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCGCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGAGG:1 + chr2L 5479174 5' - R1A1-element 4886 1 69.31 CATTTGCTCTCTCACACACACACACAAACTTAATGAAGTGAAAACAAATATATACGCAAGTGTTGTCTGTGTGTGCGCGCACACACACACACACAGACTAT:1 + chr3L 12216133 5' + gypsy3 427 1 69.31 AAGATNTTTTAAACGAATGACTCCCTGTGTGTGTGTGGGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chrX 10555495 5' - Tirant 379 2 58.00 GGGAATAACAATACGTCGGAGTGTGAGAGTACAGCTCCTCTTTCATATTTTGATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGTAAGCGT:1 - chr2R 2552853 5' + INE-1 31 1 70.30 GCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 12578188 5' + jockey 33 1 51.49 AATGGGAATCACTGTTTGTCTCTTTTTGTGCAGTTGCCTCGCACTCACCTTCGCATTTTGAGCTCTTTTTCCATTTAACTATTACATACATACATACATAT:1 - chr2L 974232 5' + 412 7277 2 73.27 GATTTGTGTGTTAATTTTTCATGAGTCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:2 - chr3L 2182757 5' + blood 9 2 68.32 GTTTTATCAAATAAGAACCTGTTTTAGTAAGAACCACAACTTAATTCTGATAATTATTCTGATCTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTGA:1 - chrX 19876832 5' - Idefix 7237 2 61.39 TAATTAATTTGTTCTATTACGATTTAGATAAAGTCAGCAATAGTAAGCTAACAAAACTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACT:1 + chr2L 17008149 5' + roo 8817 2 62.38 TAGAACCAAGCCCACCTTGATATTTGTACATATGTTGGCATGTGTGCACACCAGTGGCACTTAATCAACGCCCACGCACGTATGCACACACACACACACAC:1 + chr3L 10552297 5' + accord 179 2 78.22 TTAATGAAATATTAAAAAGTTGATTGTACGCTCAATTTGACTGACCTTCAGTAATTTTAAAGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTCG:1 - chr3L 19903769 5' - Quasimodo 375 2 67.33 AAAATGATGCATTTATCTCAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3R 9833017 5' + Tabor 6846 2 70.30 AACTTTTACTTCCACCAGAGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATC:1 - chr3L 19651165 5' - accord 7015 2 81.00 CGAACTGACAACATTTTAATCATTTATAAAGCTGCCAAAAAGTAGACATTAGTCATACTCTTTCCCGACTCACACACACACACACACACACACATATCGA:1 - chr2L 2528310 5' + accord 7032 2 63.00 TCTGGAGCCAGAAATCTCAAATATGTCAGAAATTATAGTTAGATTGGTTTTGTCTGTGCGCAAAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTG:1 - chrX 19906255 5' - Ivk 320 1 71.29 GGGTGAGCATATCAGAGACAGAAAATCCTTTCCTTAAACTAAAGTTTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCA:1 + chr3L 11687558 5' - R1A1-element 5013 1 54.46 CAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCT:1 - chr3R 19450097 5' + roo 110 2 64.36 TTCATTTTTCTCGATTTCATTTTTGTTATGGCTCCCTAAAATTTTATGTTTTTACATTTTTTTT:1 + chr2L 9844378 5' - looper1 1812 1 84.38 GACTATGTGAATCTATCTGAATGTCGGTATGTCGGCTTGTGTGCGCTGAATGATGCCTAATGCACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGGTTA:1 - chr3L 5642088 5' - R1A1-element 5294 1 67.33 TTTTATTGCTGATGACTAATTAGAACTATTCCACGGTCTGTGCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATT:1 + chrX 9230100 5' - Doc 314 1 65.35 CGTAAGCTTACCATTAGTCCTCCGATTATTACGAATTTTGGACTTCCTGAAAGCCAAACCTTTTTTGCCATGTTTACAACAGATCCATGCGAACTAATTAA:1 + chr2R 4711803 5' - Tc1-2 230 1 70.30 TTTACTGTGCAGTTCTGTTATTATACTATCGTTATATCGTTATATGGTGAACGAACGCGAGTGTCCATATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGG:1 + chrX 6572122 5' - Tirant 16 2 77.55 GCCCAGTAGCGTACTCGATCCAAGGCCGGCGGACTACGTTCGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTG:1 - chr2L 16813563 5' - invader1 3615 2 72.28 CATTAACGTATACAAAATCAATTAGTTTTTGACCCTGAACGATCGGAACATTTGTGACAGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCT:1 - chr2R 5028631 5' - R1A1-element 5036 1 66.00 TGGGCAGTGGTTCAATGGGAACTGCTCAAAGGTTATCCATTATTACTATCTACTCAATTTGTTAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGAGATC:1 + chrX 21573802 5' - Idefix 432 2 64.36 ATCCAATTGAACAACAGAAAACACCTGTAGCAAAAAATCAACAGCATGACAAAGAACACAATGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCA:1 - chr2R 14615011 5' - Porto1 212 1 68.32 CAATTTAAGATAACAACAATGTCAACGACTGCCGCCCTCTCTTTCGCACCGCCCCCAGCCCCTCTCACTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATAT:1 + chr3L 18814362 5' + blood 7149 2 71.29 AATGACAATTCTCTAACAGCAGAACAGTAGATTGGCCGCGTCAATAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTT:2 + chr2R 4870385 5' + 1360 3234 1 55.45 AGAATTTACTGGCGAGCAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 - chr3R 28726918 5' + R2-element 3582 1 71.43 CCAGCAGTGGCCAACTGGGAAAGTGTGTTAGCCGCCCAATTGCCAAATTCGCTGTACTGCCTCTCTGCTCAACAACCGTTCAGGG:1 + chr2L 12020579 5' + 3S18 5735 1 62.35 TTTGTGCATGCGAAATTGGAAAAATCGAGAGGAGTTCCTAAAACATAATATTTCTCAAAAAACCGCAAACGCACATAGAGACTACATGATATGAGCTAAGA:1 + chr3L 10665279 5' + hopper2 1144 1 72.28 CTTCGNCTTCAGTTCGCTCTCGAAATCCGGAGGCGGTGGGCGATAGAAGTGCTCGAAATCGAGGGCGACATGTTCGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGC:1 - chr3R 9363622 5' - Idefix 7046 2 78.22 GAAAAATTAAACCTTAAACAACATTTCTGCGGAAATATTGTAGATCCATCCACTTCATTGCCTTGCATGGCTAATAGAAATGTACTAAAAATGTCCCAAAA:1 - chrX 23184328 5' + Helitron 478 1 76.24 TACAGTTCATACATACACGAATAATTCATGCACACACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr2R 19079183 5' + 297 6618 2 69.31 ACTTCTTTATTTTCAAATTGATCCGCTTTTAAAAGCCAAACAATTTGAAAATAAAGAAGTTGAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAAC:1 - chrX 10727169 5' - Ivk 98 1 52.48 TTTCCTTTGTTAAGTATGTACGTTTGTATATTTATTTGGTGTTTTGCTTATATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTC:1 + chr3L 13877444 5' - 1360 3183 1 54.46 TCCTGCTTGTTGTTCATCAAAAAGTTCCATTGGGCAAGGGGAGCGGAGGAGTAGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGA:1 - chr2L 17953713 5' - HMS-Beagle2 6983 2 59.41 TGGAGNCTGTGAAGAATAATGATGTGGAGGACTCGCCGCTGCTGAAGGGATTGCAATATGCAGCGGCCAAAGATGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATA:1 - chr2L 7995080 5' - blood 7122 2 74.26 ACCAACACACACACACACACACTCACACGCACACGCACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACATTTTATTCACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 + chrX 7978948 5' + jockey 4760 1 73.00 TAAGGCCTTAGCGGAACAAGCTGAAGAAGCTCTCAACGTTCATACGGATAGGCGGACACATGGACATGGCTAGATCGACTCGGC:1 - chrX 5209980 5' - INE-1 106 1 64.29 GTGTTGTCGATGAAGTGTCGCCGGCTGGAGAGTTCGCGGTTGTCGATCCGAAACTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCATATATG:1 - chr2R 11220985 5' - 1360 3228 1 59.00 GGCGTGAAAGTTTTATACGATTTGGAAAAAGGCGTGACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 + chr3R 15153037 5' - hopper 1377 1 59.41 GTATTTTACAAGTCCTGCCGCCCGCCTTCTTTCCTTTCGTTCCCTTCACCCAAATCCCGAAAAGCAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAAAATC:1 - chr3L 12311881 5' + Idefix 301 2 57.43 ACACTGCGAGAAATCGAAGGAGATGTGGGCAAGGGACGCTCACCGAACCAATACAAACATTTGGCGGCATTCGTAGTCGCTCTGTATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 9755159 5' - Quasimodo 39 2 57.43 TATACATAATATACTAATGCATATCATTAAATTGCGCCTTTCAAAACAAAAAGAAGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAA:1 + chr3R 18015980 5' - Cr1a 156 1 59.41 CGGGCGAATTGGTCCACCGGCATACATAAATCATGTAGCCCAAGGTTGGTGCAACATTAGATACATATATTCCTCTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr2R 6838455 5' + I-element 1 1 78.22 TAAAAACTGAATTAAATAAGACGCGAGTAACTATAATTAAACACTGCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTT:1 + chr2L 1697691 5' + I-element 199 1 54.00 GCATCCGGTCATGCATGAGCTTTTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCT:1 + chr3L 26481589 5' + gypsy3 170 2 79.21 TAGCCATAGACAAAGATGTTGTAAACGAGGAGCACCTATACAACATAATTCTATTGCTTTTTTAAACCCCTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTG:1 - chr3L 25751367 5' + Max-element 8 2 71.00 AAAGTTGTTGAACTATTTTTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2R 13314199 5' + jockey 16 1 70.30 TGGTTTGATCTGCTTCTGTTCTTTGTCCTGTATGCGATTCAATAGCTCGGGCAGTAGTTTCTCCAAATGCTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAAC:1 + chr3L 8055005 5' + accord2 7629 2 76.00 CCTTCACTGCAACTACTTGGGTGTATATACTACCAGTACTGCCAATACCACGACCACTATTGCCGCAGAGCCACCGACTGTTTGGGCTTAGACACCCACTC:1 + chrX 9414537 5' - Rt1b 4813 1 81.19 ACCGCCCAGCGAGCAGAAGGCAAACATCTGAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTC:1 - chr2R 6592719 5' + F-element 4442 1 75.25 GCATATAATATTGTATATTTTTTCAGAATCCGACCTCAAAACTCGAGGGAGCTAATAGATATGTGTCGTATCTGCACGAAGTGCGGACACACGCACTCAAC:1 + chr2L 10414755 5' - 1360 461 1 78.22 AAGAGATCGTAGTCTACTAAGATTTACGCATGACTTGACAATTTCTGTGACAACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:2 + chr2L 3621062 5' + 297 6595 2 65.35 TAGCCTGTTTTTGTGTAGATTAGTGGTGTCAACATTTTAGCCAGTGGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTC:1 + chr2L 11680972 5' - 17.6 7110 2 54.46 TGTTCGATGATGGCGAGGACTAGAGTCTCCAGTTGGGATGCGATGTATATGCCAATTTGATTCAACCGGGGTTCCTAAAAATTGAGGATGGGTTGCCCGT:1 - chrX 10901586 5' + Max-element 8100 1 67.00 ATATACATATATATATATATATATAGACGGACATATATATATATATGTATATATTCTTGACCCAGTCGAACTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCC:1 - chrX 12657092 5' + INE-1 126 1 43.56 GCAAAAAGCTGCGCCGTGCCAATTAAGCTGACTTTGAGGAACTTCGTGGTGTCCTTTTTTGTGACTTTTCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTG:1 - chr2R 11608355 5' - roo 221 2 78.22 ATTCAATCGAGTAAACAGCAATTTATTTAGGTTTCGATTCTTGTTAGGTTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 - chr3L 22564917 5' - blood 7386 2 75.25 CTCAAATAAAAGAATGGAAATTAATTTAATTAAAGGTTCTGAATAATTTTACTGTTGTTTTGAGCTGAAAGATTAGCTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGT:1 + chr3R 7168368 5' + hopper 409 1 77.23 ATATGTTTACATAAATATATAGGGTGCGTATGTATATAGTTTACTTCCGAGGGTTGCGCCAGAACATCAGATACTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAGC:1 - chr3L 12896716 5' - Chimpo 462 1 62.38 CAGAGATAAAGGATCATAATTAGTTTGATAATTGGGATTTAGCATGGCGAACGGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACA:1 - chr2R 10992721 5' + 1360 167 1 56.44 GCTACAATGATTTTGGCTTCAAGCATATCTTTGATATCTTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr2R 8125083 5' + Doc 41 1 64.36 TTGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chrX 11060496 5' + I-element 45 1 67.33 ATTACATGGTGACTTGAGGCGAAAAAGAATGAAACGATCACCAATGGAATTTAGTTAAGTTCTTGAGCTGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGAT:1 - chr3L 8571964 5' - Stalker2 7349 2 76.24 ATTGTTATTTTCCGCCTTTTTTCTGGCTCTAACTACTTGCAGTTTATAACGCCTCACAAGTGCCATTAATGTGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chrX 3306564 5' + hobo 2 1 71.29 CCGAACAAATAAAATGTGTGGAAAGCCAAAGGAAAAGCTGTACGTTTGTATGTATCAAAAACTATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTACGTATGT:1 + chr3R 14957893 5' - Quasimodo 31 2 53.47 GGGGCAGGTGGCAGGGCGGTCGGTCGGTCGGTCGGTCGGTCACAAACTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCG:1 + chr3L 12590974 5' - flea 157 1 53.47 AGTTGTTTATGAAAATAGCTGGGCTAATTTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTCACTCGCACATACATTGCTTAT:1 + chr2L 9844000 5' - Stalker4 7242 4 67.33 TTTTCCTCAGCCGCAGCTGCTGCTTCTTTCTCAGCTTGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGCGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCG:1 - chrX 848027 5' + Bica 4875 1 61.22 TTGTCTATTATTTGTTGCAATTCAAATGAGTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGGATCTTTGATTGTGCTC:1 + chr2R 9320948 5' - F-element 4326 1 68.32 CCCGCCGGGTGCAGCAGAAGTTGACGAACGTCATGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGG:1 - chr2L 334225 5' + invader1 3576 1 64.95 AGTGTAACAATCTCCCCCTTGACCTTCTGTTTTACATTCACAATGTTGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGG:1 + chr2L 6949457 5' - Rt1b 4878 1 62.38 ACACGCCTTAGTTGAAAGACATCTTCTCCCATTTGTCCATCTAATAGTCGGAGGGCAGTATACTGAGTCAACATTAAAGTTTACTCTGCTTGCAGTCAGCT:1 + chr2R 3399266 5' - G5A 296 1 67.33 TCAGGAGGATTTGACTCTCGAGCTCCTGCAACTCGGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAA:1 + chr2R 9267691 5' - invader4 2963 2 65.35 TTGCGNTTCACCTGTAAGCGTTTAAACGTTTTTATCGCTATCGATAGGAATGTGTGATTTTGAATTTCTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAG:1 - chr2L 12707671 5' + Circe 101 1 72.28 TTTGCATACCAGATGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGA:1 + chr3R 10490342 5' - transib2 2789 1 62.38 CATCATGTATATCACTAATGTTTTGTTTACGGTGTAAATAAGTATGTATATGGAATTTTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTT:1 - chrX 14691624 5' - ZAM 8109 2 63.37 TTAGCTAATGGGCATTATTATTGGTCTCATGTCAGGAATAGATCTTTAATCGCATTCAAATTGCATATCAAATTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGT:1 + chr2R 8158728 5' + Juan 11 1 75.51 ACAGGAGAGGAGTCCAAGTTTTTGGCAGTTCCATTCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCG:1 + chr3L 14655497 5' + Tirant 8177 2 64.29 GGGCTGACAGCGAAGAACGCACATATTTGCTTTGTAATCATTAGCTGATAAGGCGACAAAACCAGTGTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2R 24614414 5' - hobo 2931 1 72.28 CGCCCATTTAGACAAGCCACTATAATTTAGCCAAACCGAGGAGGGGTAATAATTATTGTCATATTGTTCATTATCATTAATTTAAATTAATAAAAATTGCA:1 + chr2L 1054544 5' + Transib5 2598 1 63.37 AACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr2L 22319341 5' - Transpac 5189 2 66.67 TAAAATATTTGAGTGAGTATCCAAGCAGTTAAGATCTATGGTACTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCAT:1 - chr3R 18544711 5' - Doc3-element 4508 1 57.43 TTTTATTATTGTTTTTATTTTAGTAGTAGTTTTACCACAATTTATTTTGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAAACGT:1 - chr3R 9759285 5' - Doc4-element 488 1 23.76 CAAGGCTCGCCATCGATCTCTTCGAAAGTTATTGTAGGCATTTAGGGTATTATCGATCTGGGGTGTTTATTGATTAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAA:1 + chr2R 7392248 5' - 1360 243 1 71.29 AGAGGTATTCGAGTGGCTCAACTATGAAATAGTCCGAGGAAGCGTTTCCAACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCTGGATCGATAGCCGAGTCGATC:1 - chrX 17211916 5' + INE-1 96 1 64.00 GATAAAAGGCGTCGCCGGCTGCCGATGTATCAGTATGGTGAATCTCAACCTTCTAGATTTAATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAC:1 - chr3R 14286168 5' - INE-1 125 1 76.24 TTCGTTTGTCATTTGCATTTCGGGTGACGCAAATCGACAGGAACAAAAAAAAAAACCTAACTACAAGTTAATTAGACTCAGCCGCATTAACAGGGCTGT:1 - chrX 5149687 5' + gypsy2 499 1 58.59 CGCTGATCCGGGAGCTGAGACACAGATTCGCGATGCAGGGCGGCCAGATGAAGCGGAGAGACTGTGAACTAACGGTACCGCACTGGACCTTGGACTCCAGC:1 + chr3R 15136941 5' + gypsy8 99 2 72.28 TGGATGTAAAAAATCCAAAGGAAAAGAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 + chr3R 19444845 5' - blood 7330 1 74.26 CAGGCAGGGAAAATGGTGGGCGGGGTCAAGAGGGGCTACTGCAAAATTTTGTCTCGACACGGTTCAGTCGCCATAATGCGTTGGAATAGTGGGGAGCGTAC:1 + chr3L 5266103 5' + mariner2 138 1 80.20 TTTACAATTACAACGCAAACAACGAAATCCCCACAAGAGGAAAATGTCCTTTTTTGTGTCCTATTGATTTTGTTTACTAGCTCCTATATTCTTTTGTGGCA:1 + chr3L 14641841 5' + Gypsy12A_LTR 2092 1 71.29 AAGAAAATCACCAAAAACTTTGAAAAAGTTAAGCTTTCCGATCTGAATTTTTCCGAAGTCCGATCGACGAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACT:1 - chrX 18142775 5' + I-element 401 1 75.25 AAGATTTTTAACTTTACAAAACTTTTAACGGATTTAAAATAGATTTTAGAAATTGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 8640802 5' + roo 21 2 57.43 TGGAGACTTTTAAAATGTTTCGAAATGGGGTTTGTTGAATTCCCTTAAATGGGCGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGG:1 + chr3R 4532491 5' - Quasimodo 315 2 57.00 CATTTNTTATTTTTAGCCGATTCGGGGTCTGGTTTCGCCCATCAACTATAGCAGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:1 + chr3L 16821468 5' - Burdock 6375 2 55.45 CCAGCTACTTGGTCATGTAGGTGAGGCCATTCAGATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:2 - chrX 9260679 5' + 3S18 5787 2 56.44 ATCTGAAATTACGTATTTGTATACAAAAAGCAGTCCTATCAAATTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2R 21239378 5' + jockey 37 1 53.00 CTTTTGATTTTGCGACGAAGTAAACAAGTGCTTTATTAAAAAAAAAAACATATTTACATATTTTTATCTATTTGTAAATCTATATGGCAG:1 + chrX 10367568 5' - G3 4478 1 64.44 GCAATGGGGAATGGCATTCCCGAATTGTGACAGATTTGGTTAAATTGGCCTAATCAAAATCGGAATTGCAATTCCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 - chr2L 10081045 5' - mdg1 418 2 71.29 ATTGTGGCGGCGAATTTGTGGGGGTTAGAGGGGGCGAGGTGCCATCGGTCAAGAAACTTGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTT:1 - chr2R 20639686 5' - INE-1 166 1 73.49 TCGTCNTTAATCATTATACAAATCGGGCAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACC:1 - chr3R 24285912 5' + Bari1 1699 1 81.19 CGATTTTGGGCTGCCTGACACATTGACAGCACTGAAGGGATAACAACCACGGCACCCTATACATCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGC:1 + chr3L 10109943 5' - R1A1-element 5236 1 69.31 TTAAAAACACAAATTTGCCTTCTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTC:1 + chr2L 3274890 5' - gypsy5 7237 2 73.91 GACAACCACAAGGATACAAATGTGTCTGGTGCTCCTGGCAGAGCAGAGGAGCTGAATTAAAACGAAGGAATTCTGCGGATTGTTGTTATTATTGTTATTAT:1 - chr3L 15047797 5' - mdg1 7055 2 64.36 TGCGGCGACCGATGGGTCAAATAACTCCAAAAAAACGACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGA:1 + chr2R 21849052 5' - accord2 122 2 63.37 CTCTCGTCCTCATTAGGCAATCAATTGGCAATCACCACTTGAGCGTATCGACAAGCCATTAAACAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 14582811 5' - roo 396 1 64.36 TGTGTTTCCTGCCGCAGCTGACAAGCATTTACTTTCACAGAGGGTGAGCACCCGAGGACCCTGCCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCT:1 + chr2L 7296617 5' - mdg3 5192 1 74.26 CAATANGCCGACTGAAGAGAGCGGCTCTGCAGTTTTAGTTCTCTTTGCTCTTACATGTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 + chr2R 20698339 5' - P-element 2869 1 60.40 CGGGCGACAGCAGAAAATTTAATTAAAATGCTAATAGTGCCGGGCAGCAAACAATGTTGTGATATTTTTTCATATTATTATTAGTCTTGAACATTTCTATC:1 + chr2L 17162091 5' + INE-1 297 1 61.39 ATTTAAGGCGCTTCGGTTTGGGTAAAATTTATTATAGTCAGAGCATAAAACTCTGTAAGGGTCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGAAAAGGGG:1 - chr2L 10639515 5' - Cr1a 4139 1 78.22 CGTTCCTGTCGTGTGTCCAGTTGTAACTCCCTCCCTCCAACTCCTGTTGCAAACCGCTTAAGATCGAATAAGATACAAAAACTCATACTTTTCCACAAAAA:1 - chr2R 24858755 5' + I-element 5149 1 74.26 GCGGGGAAATATAGTTGTCGAGCGAGAAATCATGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 - chr2R 7338692 5' - Tirant 374 2 53.00 CTGATACCCTTCAAGGAGGAGCTTCCAGCAGGTGGAGGAGCCGCAGCAGACTGGAGAACCACCACAGCCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAA:1 - chr2L 20109834 5' + G2 2885 1 54.46 CGACGGGCTCCGTTGCCAGTGCATCCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCC:1 + chr2R 13510752 5' + F-element 312 1 75.25 TACCTGAACACAAAATTGCCTTCGTCAAAGCACCAAAGCCAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATA:1 - chr2L 12765979 5' + Idefix 7112 2 61.43 AATGAATGGGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATT:1 - chr3R 5775757 5' - invader4 3069 2 63.37 GGATCCTTGCAACGAAGCCACACGTGAGTCTTGTTCACATTGTCGCTG:1 - chrX 1164499 5' - Doc 237 1 62.50 AGCGGAGTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr2R 10697050 5' + 297 44 2 71.29 ACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAA:1 - 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R1A1-element 4982 1 68.00 CCCAGACTGGCTTCATTTTTGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2L 5932085 5' + jockey 15 1 66.34 AGGATAGCACCAACTGAAATCCAAAACGGAAGGATTGTTCTTAAATTACTGAATTAATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTG:1 + chr2R 6608913 5' + invader4 2679 1 60.40 TAACAAGTTAGCCGATTCAAGGCAAATTGAAATGCACAACTCTTAGGGAAAAACACGCTCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAA:1 - chr2L 15466835 5' - R1A1-element 158 1 73.56 AATTATGAGGCAATAATTCTTAGGCAAAGTGAAATATGAAGACATTATTCATTCATCAAATTATGTTAATCTTAAATTCCAATGTTTCTTGTTAAATAATT:1 + chrX 16748967 5' + HeT-A 5799 1 52.48 TTAGATAGCCCACGAAAGCAGCATCCACAATTGTTGGGGAAATGCTACGTGGGACCACTAAAAGATAATGAAACATGTAACGAAATAGATTGATGGAAGGC:1 - chr2R 11501161 5' - Gypsy12A_LTR 2248 1 44.55 TTTAANGTGTTTTGCATGTTTTTCTTGTCTAAGTTTATGGTTACGAAGTAACTCCCGCACACTGGAGCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAAT:1 - chr3L 16381925 5' - Bica 209 1 66.34 GCAACACAGCTTCTACAAGAGAAAGTGTTTTGAAAACCAAGAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGAC:1 - chr2L 3898388 5' + I-element 174 1 72.28 GGCGGCCATTTTGCGATAATGTCATGCCCATACACACACACACACACACACACACACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGC:1 - chrX 10296516 5' + invader3 5368 2 59.41 AAAACGTTTTCGAAAGCATCAGATTCATTTATTTGGAAAGAAAGAAATGTCTCGAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTT:1 - chrX 7841574 5' - hopper 999 2 61.39 CTTTCGGGCCGCGGCCACTAAGAGAGGGCACTGAGGCCTATATACATACAGCTGTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAAGTAATACAAAGG:1 + chr3R 4515191 5' + HB 35 1 73.27 ACTTCCAATACATTATGCAACTGCTTAGGACATCCTTAACATTAATATCCTTGCCTAGCATTATGAAAGGATTTTCATTAAATATTTATGAACATTAATAT:1 - chr2L 13542992 5' + 1360 2949 1 67.33 CCCCTCATCCGACAGACCTCCCCCCCCCCCTCCCCCC:1 + chr2R 18334984 5' + accord2 224 1 75.68 AACAATTATGTATGATTTTAACTGATTCCTCGGGGTATCGAAGTACCTAGATTTACCAAACGCGACACGTACTATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAA:1 - chr3R 10408073 5' + R1A1-element 4889 1 73.27 AGAGTGATCATATGCCAAAATATCGGATAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAA:1 - chr3R 25300266 5' + I-element 193 1 72.28 TTTTTTAGACTTTCTCATACTTTACAAAAACGTGCTGCATACGAAAATAATTCCTGACAAATGGATTATATCATAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATA:1 - chr3L 5694831 5' - Tc1 1349 1 59.41 AACATACTAGTGATTAGTTTGATCTCTGAAGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTCGTATTGTCGGTTGTTCAAGTAAAATGATCCGCA:1 + chr3L 19339568 5' + Tc1 458 1 81.82 TTAATAATAATATTAATTAAAGTCAGCCAGGGAAAAGTAGGCATAATAAATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 17607826 5' + roo 5 2 75.00 GACTTCATTACAAGCCCATTAAAAGCGGGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAG:1 - chr2R 14375428 5' + micropia 5317 2 73.27 AAGACGGAGGATGGCATCAAGGTGGAGCCGCCCAATGCCCAGGATTTGATCAATAGCCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCTTCAGGATGGCCTTGTAC:1 + chr2R 14039592 5' - G-element 3886 1 63.00 CCAAGGTCAGGCCAAAGGCGCAACAGCAACAACAGTTGCAGCTACTTGCCACGGCAGAAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAA:1 + chr2R 11810622 5' + invader2 4985 2 66.00 TGTATATGATAGATTTTCAGCCATAGATAGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTG:1 + chr2R 18240904 5' - 297 26 2 68.13 TAATTTTCTCACTGTGCTGAGTGCAACAAAAGGACGCACAAAGTACAAGTCGGGCTCTCCAGTGCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAA:1 + chr2R 18724556 5' + Cr1a 4094 1 50.50 CATCTCCATTTACCTATGCCATTGAGGAAAAACGTTTCTGTAAGTGTGCCATTTCTCACTCGCTTTCATTGTATTCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAA:1 + chr3R 21799484 5' + jockey 4761 1 76.24 AAGATAGCGCTTACTTAGTTTTTCCTCGGGATTCGGTGGCAACTCCCCCTCCCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCG:1 + chr2L 14450681 5' - Bica 4914 1 62.38 GCAAGACTTTGAGGCCAAGGTGATGCGGGCGGCCAAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCG:1 - chrX 6245048 5' + F-element 4465 1 65.35 TAAGCAAACGAATATGCCCTTCAAAGATTTAATATAACTTTCACTCGTTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCC:1 - chr3R 14926948 5' - R2-element 3453 1 53.47 GAATTTCATTTCTTTTTCCCCCTTACATATTTCTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:2 - chrX 22747476 5' + Doc 47 1 67.33 TAAAGAAAGCTTAAAGCGAAGGGCTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGATAGAAAA:1 - chr3L 23323644 5' - diver 362 1 75.25 GCACTGACGTTCGTTGATCCCTACGTGCCATAAATTATAGTAAAATATGGAAAAATAAAGGGCAAGGTACGTTGTTTTTAACGTATGTAGTTAATATATGT:1 + chr3R 10842892 5' + transib2 303 1 76.24 GGCAGTCACGCACGAGCTCAATAGCTTAGAACGGGATAAAAAGCGCGCAATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCC:1 + chr3R 6254902 5' + 1360 3115 1 53.25 TCAGCTTGTATGATACTTTTAACTGAATAAAACTATCCCTTATATAATTAACTCCCAGTCCATCTAACCCCTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 + chr2R 9004182 5' - jockey 4949 1 79.21 TTATATTAAACAGTCAGAATAGCTTTAAATGGAGACCTTAATAATATGCGCGACACACAAACTATAAATGTTTGTGTGTGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 21965787 5' - accord 7031 2 58.42 GGCCGCGGGCGCATAGTTTTCAAATTCATTGTTGATGATTAAATGTTCTTTTAGTAGCAAAATGGGTAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTT:1 - chr2R 24663568 5' - transib2 469 1 66.34 ATATAGTACTCATGACTGGCATAACTGAAAATATGTCCAGGTTCGATGACCACCCACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGA:1 + chr3L 19655049 5' - flea 4843 2 61.39 GGATACAAAACAACGTGGTAGATTTATTTTCCAACCTCTGAACTGCAGCATAATATAAAAGGGATTTCAATAGGATTGCAGGTACGCGTTGTTGCGCTGAA:1 - chr3L 14739169 5' - F-element 253 1 81.19 AAAATAAGAGTAATTGGAGAATCCTGAGACGATTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGT:1 + chr2R 3139246 5' - accord 199 2 67.33 CAAACAGTTGGCACGGCCAAAAACACACTCGCAGCGAAGGGAAGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGG:1 + chr2R 12493399 5' - Doc 336 1 60.40 TTGATAGAGGTATACTAAGATAGCATTTAAGCACGTGTAGTTCTGAGTCGATTTAATTTATATTATGTGCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2L 21293030 5' - roo 402 1 74.26 AAAATATAATATTCGAAATATTTCGCTTACAAACAATTAAAACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 11576471 5' - roo 396 1 66.34 GATCCGTTCATTTGAAGAGAGAGAAAGAGCGCGGGAGTTAGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 - chr2L 306537 5' - Tirant 8461 2 73.27 ACATAAAAGCAGTTCGCTCTTCGGGTCCCACAGCTCATGTTAGCATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAACGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGC:1 + chrX 1193053 5' - GATE 378 1 60.00 AATGGATAACGAGCCATCAATCATCGGTCGAAGTACCAGTCAAAGCAGACCATCTAACAAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGAT:1 + chr2L 7119791 5' - R2-element 3268 1 71.29 GTGAACTAAAACCAACGTGCGCCTAGAAATATGCTATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr3R 22238764 5' - hobo 2932 1 73.27 CACTCCACTCCAATCCGTAACGTACCCGATACCGATCCACCTTCGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGC:1 + chr3R 24615227 5' - R1A1-element 4954 1 56.44 TCAGGGTGATTTTCTTTGGGTGTATGCTATGAGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGA:1 + chr3R 11803313 5' - hobo 2599 1 68.32 TTAAAAGCTTAAATGGATATAATAATATAACTCTAATTAGATAAAATGACTCTCAGATGTCTGTCAAATTAATGTACAAGTTAACACAATCACAAAAC:1 + chr2R 19232818 5' + Burdock 6135 1 73.47 TACACACTAGCAACAAACAAAAGCTGAAGCTTTCAACTCAAACCACAACAAATTCAACAGAAATAGATATCATTGTGACCCACGAAACATTTACTAAATCA:1 - chr3R 6998453 5' + I-element 196 1 64.36 ATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCAC:1 + chr2R 4577096 5' - Chouto 469 1 73.27 CCAGTATGCTGTCCCACGACATCACCGACAAACCCAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATAC:1 + chrX 9052541 5' + I-element 5124 1 73.27 AGGTATTTGGTACTGGAATTGGAAGCACGCTCAATTTTTCGGGATTATTCATTATTGTATGTAAGGAAAATATATCTGCACAAGCAAGACCACCACAC:1 - chr3R 20509024 5' + Gypsy12A_LTR 2166 3 77.55 TATAGCTGGAACTGATCTTGTATGAATGCATAAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGATGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGC:1 - chr3R 8822984 5' - 1360 128 1 74.26 GGACATAACAAAAGAAAATTGCCAGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGG:1 + chr2R 14403256 5' - roo 231 2 76.24 GAGGCCAGGGGGCGTGGCATTGTAAGCACACCCACTTGTATATATGTATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 + chr2L 9856226 5' - HMS-Beagle 237 2 63.41 AAAAGCCCAGGATGCGTTTCAAAGGGTCGATAATGTACGTATTACCGAAGCAATAACACTCATCCAAATAACGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAG:1 - chr3R 23155452 5' - diver2 111 2 72.28 AAGCATAAAAAAAATGTTGAACATTTAAATTGAATTCCCGGGCCAACGGAATAAAATGAGAATAATAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chrX 11019038 5' + Rt1b 5149 3 63.41 GCTGCCATGAAATTTGAAGAGCAACATTCAGTTTCAGTTTCTGTTTCTGTTCAAACATGAACACGAAT:1 - chrX 11006907 5' + roo 8664 1 60.29 TGCATATGACCATATATGCGCTCACATATCTCAACATATATCAAAATATATACATACATATATCTATATAGGTATAGATATATGTACATATGTACATATAT:1 + chrX 13979965 5' + G3 4507 1 54.46 AAATGCCATAAATGGCGCTAAGGCAGATAGCCGCGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACT:1 + chr3R 28026218 5' - baggins 5048 1 64.52 CTTCACTTGCTCACTCACTGAGTCCACCCAACGACATCGAAAGCCTGGCCAGTCAGTGCAGAACTATCAGTGCTGCCCCTCGAACTAGAGTCAAAAGAAGA:1 + chr4 714405 5' + jockey 4729 1 63.37 TGGATCATGGAACAATCATCATGCCAAACTGATTACGCAGTTTCTGAAAGATATTTGCGTAAACACATTGTATTGACCACTGGGTCAGATTCCCTTATTTT:1 - chr3L 16966578 5' - transib3 2858 2 77.23 TTAGTCAATTTCAGCGTGTACAGCATGCAGCTGATAACACGTCTGTCCATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTAC:1 + chr3R 6143795 5' + rover 20 2 58.42 CATATGTAAGCATTACATTTTATAGATTATTTTGAATAATATTGAAGTTGTACAGTGGCTTGAATTTTGCTTTTAAACTTCGATATTAACTGGAGCTCTGA:1 + chr3L 13313891 5' - Porto1 35 1 61.39 ATGTGGCGACTGTAAACAACTCGCCCCGTGCCTTGGCAGCTGCGAAACATGAATTATGCCACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACG:1 - chr3L 1120993 5' + Doc 4535 1 65.35 AGGTAAGCACCTCTTGCTGTGCCCATTTTGGCCAAGAGAATAGCCACCTACTGTGGGCCATCGATTTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAA:1 + chr3L 7317190 5' + jockey 474 1 68.32 ACATGACGCCACTTATATACATGTCGGAGATGCATTCTTATTAGCGTCGTTAATATTTAATCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCA:1 + chr2L 23390379 5' - invader4 280 2 72.73 TACATTCTGTTTAAGTTGTAGTAGTGAGATTCTTAACTTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGAC:1 + chr3R 18869608 5' - hobo 350 1 62.38 GGCTGAAATTTTATTTTTCTCCTTCGATTTTTCTGTTTTCTGTTGTATTTGGAGAGGCAACAGAAAACAGAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGA:1 - chr3L 15227616 5' + I-element 326 1 62.38 TTCCACTTCCACTCCGTTTCACGATGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGATCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAA:1 + chr2R 18498648 5' + HMS-Beagle2 6983 2 71.60 ATCGATCTGAGACAGCCGCAGTCGCAGAAATCACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTG:1 - chr2R 5658059 5' - I-element 282 1 68.32 CAGTTGCTCCACTTGTTCGATTCTCTATTATTTTGTGTTTTCCTTTTTTGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGGC:1 - chr2L 12133059 5' - TAHRE 271 1 64.94 TAGAGAAAGAGCAGCGAGGAGATCTTCTAAAGGCACGTCAACCTCGTTAATGATTCTTCAAAATACCCAAAACACACTCACACAAGCAAGCAAATTATATT:1 + chr2L 5559996 5' + 1360 3260 1 81.19 ATTTAAGAGCCAGACTTACTCTCCCATTTTTCACACACGTTTGGAATGTGTGCTACTTATTTGAACTACCAAAGAGGAGGAGGGAAATAGGGTCGACAATA:1 - chr2R 12498727 5' - G5A 2655 1 73.27 GACAGCGAAGAACGCACATATTTGCTTTGTAATCATTAGCTGATAAGGCGACAAAACCAGTGTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 + chr2R 24614419 5' - hobo 2926 1 67.33 CATTTGTTTTTGTTGCTGCGAGGGAGTGGGAATGCTGAGCAGGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATA:1 - chr3R 11146946 5' + Stalker4 7197 6 72.63 GGCAGATGAACTAGAGCGAAAGCAAGAAAATATTATTTCAGGTGTATATGATTAATTAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2L 8640897 5' - roo 392 2 64.36 AAAACNCACCAGCCACCTGAACACACCTTTTTCAAAACACACCTATGCTGAAATATTTCTAAACTCGATGGGTTTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCAG:1 - chr3L 4129301 5' - 3S18 5677 1 42.57 CTGGGTTGGAAAGTTGGTCACAGCTTGGTTTGTTTATAGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCG:1 + chr3L 3350721 5' + R1A1-element 5056 1 62.38 TAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTACGGAAAGCGCTTCCCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAA:1 - chr3L 23773904 5' + INE-1 122 1 54.46 ACACAACCGTTCTCAAGCGCAACTTTCTTACGGACAGACGGACATGGCCAGAACGCCTCGGCTATTGATCCTGATCGCACACGCTTCCTTCTGCCTGTTAC:1 - chr2L 21363610 5' - INE-1 32 1 70.30 GCTTACAAACAATTAAAACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr2L 11576447 5' - roo 9035 1 68.32 CAAAATCGGAACTTATGCCAGGCATTTCGAGTTGCCAGAGTTTCCGCGGGCCGGATAGGGAAAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATG:1 - chr2L 1849943 5' + mdg3 5105 1 67.33 TTAAAGTAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 + chr3R 5775673 5' + invader4 34 2 60.40 ACTGAAACCGCCATAATCTTGACAGACAAGTGCTCGCGCTCTTTTCGCCGTGCTTTTAATGGTTTGTTTTTGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAA:1 + chr3R 10617164 5' + micropia 5163 2 67.33 CTTCTCATTAATGTGGCAAGTTAAATATTTATAGCATAATTCTAGGAGCTGCTACATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 20140534 5' + jockey 9 1 80.20 CATAATGCCTTAAGCCCGTTGCCTCCAACATGGGCGCCCTGAAAAAAAGTTACAATAAATTTTTACGACCCTAATGCTGACACCACATCCTTTTCGCTCAG:1 + chr2R 12803795 5' + ZAM 8115 2 76.24 GCCAGGCGCAATCCACCCAAAAGCCAGCCCACTGTATGTATAAACGAGAAAAACGGTTCGGACATTCATTGGACGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAA:1 + chr3L 16689475 5' - R1A1-element 9 1 72.28 CGGAACGCACCTTCTAGCACCATCAAACCTTATACCCTCAAAGTGATAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAG:1 + chrX 1901055 5' + Porto1 375 1 79.21 CGTCCTTGCTCCTTGCACCCAGGTCCCTTTTTTTTTTGTGGTTGCATTCGGCACTGTTTTTTTTCTGTGCTATTCACAATAATTATTAATAATAATAATT:1 + chrX 3588859 5' + gypsy9 299 2 69.00 GTGTGCGTGTTGCGGATCGCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCC:1 - chr2R 23818385 5' + F-element 276 1 81.19 GTACATAATAAGTGAAAAGTTTTTAAATTAAGTCATCATACAACTAAGCAATCAATGTAAACCATGATCAGAGGACCAGCTAGTCAGGATGGCCGAGTTGT:1 - chr3R 23721713 5' + invader3 5168 1 66.34 ATTGAAAATGCAAGCTCAAGAAGGCCATGGCAAAGATGGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACA:1 + chr3R 8504349 5' + roo 8817 2 61.39 GGTCGGAAAAGGACGAGGTCCTTTGCATATCGCCGCCTGATTGCTTCTTGTTCCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTA:1 - chr3R 27425928 5' + 17.6 7102 2 57.43 GATCATTATATATTCGAGAAATATTTGTTTCATAACTTTGAATTATATTTAGATGTAGATTAGATATAGATATGGTTTTGGAGCTCAGAGCCTCTGCTCTG:1 - chrX 12066254 5' - Stalker 359 4 71.29 GTAGCAATAAAGCGGGCACAGTATGCTTCGCGTCCAGCCCGATTCACACGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCA:1 + chr3R 7185359 5' - baggins 5364 1 53.47 AATTTTAGTCCGTAGTAAAGATTTTTGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr2L 6605527 5' + blood 1 2 72.28 GGGTGCGCTCCAGGGAGGGCGTGGGCAACCACATCGTCACGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCA:1 - chr3L 8191720 5' - F-element 4265 1 61.39 ATAGGGGTTGTCCTTCTTCTTGCTGGCCGCGGGTGTGCTCTTCCTTGCACAGATATCTTTTCGTTACATACATTAATGAATAAGATCAAGAATTGAGCGTG:1 + chrX 18006134 5' - Gypsy12A_LTR 2116 1 69.31 AGAATTATGAGCTCAGCCTCAGCTCAGCGGTTGCTGTGGGTGTTTTGGGTCGTTTGGGTGTTTTTTTGGGTGGTGCTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCA:1 - chr2L 10720028 5' - accord 168 2 78.00 CCTGGTTCCGACCAATCAGCTGTGAGGACTTGGCAATACAGCAAGCAGTCTCCAGCTTGTCGCCCGTTAGCATCCAAACGCACACACACACACACATATTC:1 - chr2L 13299880 5' + accord 185 2 80.20 TGCTCCTCGATGGGTGTGATATTGTGCTCGGAATCGATGGTCTGTGTGTGATTGGAACTGATTACCTTATCTCTGGAATCTTCAGAATTCCCTCATATATG:1 + chrX 15053607 5' + Q-element 29 2 61.39 AGCAACTGCAATAGAATCAGATTAAAATTGCTTATCTTCGTGACAAATCGGTGCTGCCGGAGAGGAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCAT:1 - chr3L 17858240 5' + HMS-Beagle2 6746 1 71.29 ATTTGTATTTACCACAAGAAATTTAACTTTTTACCTGATGACTTGTTGTCGCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGGATAAAGTCTAAAAA:1 + chr3L 15594719 5' - transib2 2801 1 64.36 ATGCAAGTATTGTTAAAATAAAGAGTTTGGATGATCGAAGAGGTATCTATAACATTTTTTTATTATACAAATTAATACTAATGAATTTTAAAACTAAAACA:1 - chr2L 14693469 5' - jockey 4801 1 70.30 AGGAAGAAAAGATACCACGAGGTAATCAAAACCAAGCCGCGCAACGCAAACATATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTT:1 - chr2R 6869938 5' + pogo 1967 1 56.44 ATACACAATTGGAATGCAGCAATCAAAAGGCGACACACCGACTCCAGCATCGAGATGACGATACCTCCCCGAAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACGCG:1 + chr3L 16936731 5' + gypsy4 6543 1 74.26 CGCCGCCCGCCTTGGTCACCGAACCCAATCCCGATCCCGACCCTATAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 - chr3R 15994301 5' + jockey 4813 1 55.00 TGAATCTGCATCGTTCGTCTAACACTCATTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTC:1 + chr2R 15901313 5' + Doc 388 1 73.27 ATTCATCAATATCATTTTATCAATTTTCACCGCTGTCCAACAGATTTCGCAGCCACCTAAACCGCCTGCAGCTCCAGAATTTATACCGTTACCTTCACCAC:1 - chr3L 13675963 5' + Chimpo 4217 1 64.36 AAACTTAACTGAATGCGGATGCTTGGTTCAGACTGGTTACGTGTAACGAAAAGAATTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGT:1 - chrX 19812185 5' - Gypsy12A_LTR 2236 1 77.22 TCTACACACTCCCAACTTCCAAACACACTCACACTCAAGCAGGACTCTGCAGGACCTACACATATGTATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chrX 14424122 5' + hobo 7 1 67.33 AAACCAAGTCAAGGTGAGCTATGACGAGGATAATGTGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTAT:1 + chr3L 2517291 5' - ZAM 8183 2 67.33 TGAAGTTTGGTTTGGCCCAAATGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr2R 21238183 5' + jockey 93 1 79.21 TCTAGCTGAGAACCAATTATAGAATTTGAAAGTGATAAAAGTCGGCCAAAGAAAGTGTCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATAC:1 + chr2L 7521513 5' - Idefix 334 2 63.37 TTGCTCGCTTATCATTGGGCATAACAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 18548710 5' + G2 3076 2 82.22 TTTTCCCGCTTTTGCACGCCTTTCCCCGCATTTCCCCCCTCTTCCGCCTACCGACTGACTGACAGACAGACAGATAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGAT:1 + chr2L 7949745 5' - INE-1 93 1 55.45 ATTACCATACTCCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2R 21266518 5' - roo 398 1 70.30 TTTGGACACCTTTACTCGCATTTCCGGGTCCGTATGAGAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCT:1 - chrX 19738074 5' - P-element 18 1 42.57 CGCAAGATTGGTTAGATATATAAAGAAATATGTATATTTTGGCGCTTAATCGAATTTCGAGTCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGG:1 - chr3L 25332138 5' - F-element 333 1 65.35 GATTAAAAACAGAAAAGAAAAGATGGCAAAAATAAAATAAGAATATGAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACCCAAAGCT:1 + chr3L 8037213 5' + Idefix 7174 2 69.31 CAGACAGGAGTTCAGCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCG:1 + chr3R 19010389 5' + F-element 449 1 77.94 ATAATAATAATAATATTGTTGTAATATTCGCTAAGAAGAGCATATCGGCTTTGAAGCATTGCAAACTGTATCACGCTCTTCCATCACTTTGAAGGTGTAAG:1 - chr3L 21253093 5' - Porto1 324 1 77.23 GTAGTGCCGCAAAGTATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 7654059 5' + jockey 14 1 73.27 CTGCCATTGTTGCTGGTCGTTGAAAATCTGCGTGCGCAAGTAACAACATTTTACAGCTGCAATTAAAGTTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTATGAACA:1 - chr2R 18731820 5' - HB 12 1 73.27 AAATAGCACTGACCACTTATTTACTGAATAAAATTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCAC:1 + chrX 20356833 5' - Tc1 1289 1 67.00 TCTGTGGTGACGGGCTGGGGATAGAATTCGGTGTCGGTGTCCGTATCCGGCGTGATGATGTTCTTCAGCCCAGCAAAGAAATCCTAGGGCCGTTTCCAACT:1 - chr3R 24232919 5' + Doc2-element 4651 1 66.34 GCTTGAAAATGCTTTTAATGCTGAAGTATAACTATCCAAATACCAAATTATTGTGATCTAATTGAGTGCAATTTAC:1 - chr2R 12721618 5' - Ivk 5163 1 39.47 CACACNCGCCCGATCAAAAACACCCAAGCCAATGATCACAACACCACTCGCAGAGCACGACCACCTATTTTCTGACGATGAGGTTCACTCAATCTCCTCAA:1 + chr2R 12388870 5' + TAHRE 486 1 63.37 ACAAAAACCAGTCAAATTGTGTTTCCGAGCTATTTTTCCAAAAGAAATTATAGCTTGTGCTGATGCGTGAACTCCTATTTTTAATAATTATTTTATTTTAT:1 + chr2R 5185635 5' + 1360 3094 1 70.30 GTTAGTTGTTGGCTGGATGGGTAGGTAGGTATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 + chr3R 17702094 5' - Quasimodo 6972 2 70.30 AGACAGTGATAACGGGTGGACCGTTGGTAAGTCAACGGACAGTGAGAACGCGCAGGACGTAGAAGGGAAACTGCAGAGTCGAGTAAAGGCTCGATTGACC:1 + chr3R 2534085 5' - roo 433 1 62.00 TAGGAGTATTTCGAGGAGCGGACAGCCTGCGATGACGACATGTTTGCTAGGTCAGATTTTCGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGT:1 + chr3L 8745045 5' - 412 396 2 67.78 AATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTG:1 + chrX 22726195 5' - Helena 1273 1 47.52 CCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2R 13314156 5' + jockey 60 1 80.20 ATTCTGCTTTTAGTACTTTGGACGGAAAATCTAAATTTCTCAGCTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCCTTTAACAGCTCGCTTGAATGTTTTGATCTTGTG:1 - chr3R 18880083 5' + Cr1a 380 1 75.25 GAGGTGGAGCTATAGAACGTACGGTCTTGGGGGTTACGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTGCTTCTATTAAAATTCTGGT:1 - chrX 17801132 5' - HMS-Beagle 6588 1 64.36 GCATATCAAGATACACGAAAAAATCCATCCGTGGAGAACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chrX 5726774 5' - roo 9033 1 63.37 GTATTGGCCTTGGGCGTACTGCAGGCCAGGATCCCTCGCTGCAGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCTCTCTTACAGGGGAAGAGGGTG:1 - chrX 1643305 5' - gypsy3 301 2 76.77 ACTATTTCGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 - chr3L 5827937 5' - blood 7346 2 66.34 AGTCATGAAACCCCTGTCTCATTAGTCATCTACCTCATTATCAGTAAAAACCATCATTCTCGACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCAATTAT:1 + chr2R 13258514 5' + Ivk 5171 1 54.46 TTAGTAGCATTTTGCCATTTAGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTTACATTAAT:1 - chr3R 19749484 5' + Ivk 87 1 77.23 TCCACATAATTCCCTCGAGGACCTGCTCCTCGCTGATGGTTTCTCTGCAACTCGTGGGAACCATGAACCATAGACCCAAAAATATTAACATACCGCAGGCC:1 + chr3L 17745675 5' + baggins 415 1 61.39 TCGCAAATTCATAGGTGTGTTATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAG:1 + chr3L 18483586 5' - TAHRE 10372 2 79.21 TTGCGATAACTTTTGTAATGATGTTAGATAGATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 2539237 5' + roo 8676 2 68.32 AGTTTATAACGCCTCACAAGTGCCATTAATGTGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 3306604 5' + hobo 42 1 75.25 TTTGTACTTCTTACTTTGAATTTTTTTGTTGTGTAAACTTTCCAGTGAGTACATCCCATCAAGCCGAGTCGATGCTCAACCTTTCTAGCTTTTATAGTTC:1 - chr2L 669303 5' - INE-1 158 1 65.00 CCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3L 5827861 5' + blood 7025 2 66.34 CTATCTATAGGTTCTATAAGCCCCACAGCATGTGGTAGCATATCCGCGGCGCCCCTAATGAGCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAA:1 + chr2L 891261 5' + F-element 167 1 58.42 GCGGCGACGTGGTGTCCAGTACGGAGGGTCGGGGCGTCATCAGATTGTGTAAA:1 + chr2R 15683010 5' - R2-element 273 1 58.49 GCACCAAAACAATCATCAAACGGATAATGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCAC:1 + chr2R 20490188 5' + jockey 100 1 72.28 TAAAATGAGAAGAAACTCTCACAACGTCGGCGTCACTAGAAGCTGCACTCCTAATCTATTGCTTTTATAGGGGATATCGACGTTCATGCGGACACACG:1 + chr2L 20840154 5' - INE-1 128 1 68.37 GTGAACGTCCTCAAGGCAGGACCTTGGGATTATTGACTCCCCTTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGA:1 + chr2R 11244366 5' - F-element 283 1 59.41 ATTTCCACGATTTCGATTTCCACGATACCCGTTACTCAATTAGTTCGAGTGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGG:1 + chr3L 20659426 5' + X-element 4287 1 51.49 CACAAGCCACTAAAATTTTTAAACATTATCAAGTCTGTTGCCTTTTTTTCATGGAATGGATGAGTTTTTTTAGGTCATATTCAAGCGGGATCTTTTCCCAC:1 - chr3L 9770887 5' - S-element 1336 1 61.39 CCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGA:1 - chr2R 22774506 5' + BS 27 1 52.48 TATGCACCCTTAACCAGGATCCTTCGATAATGGCTAGCATAAAGCCAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATG:1 - chr3R 30316886 5' + 1360 173 1 60.40 TTTGCTTTGGTCTACAGCATAATTGCGGGTTCTACTTCGACTGCGGGGTTGGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATT:1 + chr2L 16435450 5' + Quasimodo 7260 2 58.42 GCAAACTCAACGAGCAAACAACCCAAACATGACATCAACGAATAAGCAAAGTGAGAGACACATTTAATGTAATCAAAGACGAAAAATGGAAAATACTTTAT:1 + chr2R 6939681 5' - Cr1a 181 1 77.23 TCCATGACCGTCCTCCCCTGGATCAGCATAGCTTTCGTCGTCCGATTCGCCATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGTCC:1 - chr3R 13421760 5' - Idefix 7083 2 56.44 AAGATATCAAGTTAAGTATTATCGTTAGACTTACCAGCGTTCCGCATAAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGC:1 - chr2R 22784409 5' + I-element 392 1 53.47 TTGATGCAGATTGCTGGTGGTGCTGCTGCTATTCGGGGTGGTTGCCTCCGAACCACTTGGCTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATT:1 + chr3R 25355933 5' - HMS-Beagle 6665 1 68.32 AGTCAGCAAGCAATTGCAGGCTATGCACAGCATATGAATATTATATTCATTTAACACGCCACCAATTATACCGTTCACCTTTTTTTATTTTAATTTTTTTT:1 + chrX 5139736 5' - Doc2-element 254 3 71.29 AAAAAAAAATGGAGGCCCGAGGACAACATTTTCAGCTGCTGGTTTCTCTTTCTGTTCTTCGTTTTCCAGTTTTAAGCTTGGCATCCAAGGGCTCCCAACCA:1 - chr3L 3575163 5' - invader3 372 1 75.25 AATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chrX 22517669 5' - 1360 3349 1 67.33 TACCATCTGGTAAGCCTAATCTAATGCTATTGTTGGAAATTCAGGAAGTAATAAGGAGTAGGCACTGTTGTTGACTCTTAATTATATGTATGTATGTATAT:1 - chr3R 14802564 5' + 1731 4409 1 79.21 GCCCAGGCCGATCGTTGCCTCAACCTGGGACGACACACAAACAGAACCCACCAACACTACCCAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGG:1 - chr3R 2975563 5' + I-element 5005 1 69.31 GAACATTGCCCGCCTGATCAATAGGGTCTTGTTGGTAGCGCCGTTCTCTTCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGGCGGATGAA:1 - chrX 2216212 5' - Ivk 5039 1 67.33 GTCTAAAAGTTTAATATTTTTATGTTAATCTTTAAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATATAGTCATTGAGTTCTCAATATTAA:1 - chr3L 4273317 5' - Stalker 6794 2 64.36 TCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr2L 19845914 5' + F-element 53 1 64.36 CCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTACGAA:1 + chr3R 4199874 5' - INE-1 531 1 68.32 TCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGAACGTTGATATATTCTTGATCAGATTTAATAGCCGAGTGGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAG:1 - chr3L 23871824 5' + INE-1 129 1 68.32 GAGAAACAATTTCAGATTGCACTCAAAGTGATGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTCTGTAGTTTGATATGTG:1 - chr2L 20020598 5' - Porto1 292 1 68.32 TACTTTTCAACGAATCTACAATAGTATACAATAGTATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCC:2 - chr2R 5737684 5' + 1360 3314 1 78.22 CACAGAACCGATAAACAGCGGCTCTGGGGGAGTTTGCGCGCAGAACGCCGTGGATATCGCAATGATAACGATTTCACAGCTTCAATGTTCTGAGGTGATCT:1 + chrX 22747844 5' - mariner2 347 1 69.31 GAATGCCATCTTCCTGGGGGCGGGGGCAGAAAAAACCAGGACCAAGAAGAGCCCAAGCCTTTCGCCAGGCCGGCAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGA:1 - 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chr2R 18028385 5' - gypsy6 7341 1 74.26 ACATGTGTTTCTAAATAACACTTATTTCTAAACGAGAATTTTTAATCAAGAAAGCTTTGTTTTGTTACATTTTTTTACTATTCTTATCTTTAATTATACAA:1 + chrX 16437754 5' - invader2 4736 1 70.30 CGCACAAAAACACACAGACACAAGCGGCAGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAGGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 + chr3R 178124 5' + BS 43 1 69.00 AAAGCGTGTTGACTTTGTTAATAAGTTTTGTAATAAGTTGCTAGCCAAGTTAAGGGACTGTCCATGGATATTCACAAAAACAAAAAAATGATAAAATAATG:1 + chr3R 20102145 5' - pogo 54 1 77.23 AAGAGGAACTCTTCTTCCTCTAAGCACATGCTCCATCGCTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTA:1 + chr3R 29015573 5' - R2-element 3405 1 61.39 CGCCGCCTCCCTGAAGATTGAGTGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2R 18865920 5' - roo 9050 2 55.45 AATTGTATAAATTGCTAGAGACACATATGACGTATCAGCTACTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGTCATGGGTTCGCAACAA:1 - chr3L 2437923 5' - Burdock 5921 1 59.41 TTGGGTGATAACTCTGCGGCAATCCAGGCGCAGATCGAAATTCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 17788891 5' + roo 8681 2 60.40 CACAATATCTCTTGCATTTGGCACACGCACCCCAAGCACATGTGTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCAC:1 - chr3L 3960571 5' + 1360 210 1 56.44 CTGGCACACCCTTATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATCC:1 + chr3R 31996543 5' + mdg1 7339 2 52.48 ATTTATCTTAAGCCATCGTCAGTTGCATATTTTATGGCTATTTTAAACCACTCAATGTGGTAATCGGGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAG:1 - chrX 353706 5' - R2-element 3389 1 71.29 CTTAAGGAAATCTTGAAATTCCAGAGCACGCATTTCTGTAATCGGTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr4 1219242 5' + 1360 29 1 55.45 TGGGCATTAGGCAGCCGGCCACCACCAATCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTT:1 - chrX 8566099 5' - Ivk 5021 1 72.28 ACTTTTTCAGCTTGCTACCCTATTCGCACGACTCGCTTCAGTCCTGACCTGTTGCTGATTGTCTTTGGTAGTGCGAGGCAATTTTAATTTACTTTTAATTT:1 + chr3L 13883988 5' + Rt1b 124 1 66.34 TTTTTTGGCAAATCTATAGAAATTTACAAGACCTTCTAGCTTTTATTTTTTTCTCATTTTACTCCCCAATATCTGTCGATATCCCAGAAAAATAATGCAAT:1 + chr2R 5119461 5' + INE-1 509 1 59.41 ACAATTTTGCAACGTGCCTGGCATGCAACGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGAGGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAG:1 + chr3L 14099207 5' + R1A1-element 458 1 69.23 CGCAGCGCCAATCAGCCGCAGCTTGGGCTGGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAG:1 + chr3L 2495344 5' - mdg3 329 1 70.30 AACTGGCCGCCGCCGCAGCAAAGGCCACATGCCGTATACGTAAGCCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTCCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTAC:1 + chrX 1368972 5' - R1A1-element 76 1 55.45 TAAACACACTGGTTTAAAGTTAATTAAATAAACGAATTTGCTATTACATAAGTCATTTCATTTTAAATATGAACATACCAAAAAATAAACACAAACCAAAA:1 - chr2L 6832767 5' + transib4 2539 1 44.55 ACCGCCAACTCTATGGCCCTCTCTTTCCACCCACACAGCACAGCAACCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 + chr3L 11554860 5' + blood 168 2 70.67 ATTTATTTTTCAGTTGCCGCAGCTCAAGAGTATCGAATGCATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGC:1 + chr3R 19487555 5' + Tirant 406 1 61.39 GGAACTGTTTTGCTCAGTGCACGAATGGAATAGATCTGTGCCTGCCTTCCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGA:1 - chrX 7754814 5' - flea 414 1 56.44 TTTGAGCCAAGTCCATTGTCGTGGTCTGAAAGAGTGTCTGATTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGC:1 - chr2L 10676867 5' - X-element 423 1 59.41 CACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACA:1 + chrX 17049554 5' + Stalker2 7287 2 60.40 CCTATCAAAAGTTAATGCATTGCATGTTAAAACTGAACATTTGATGGATAAATCGCTGAGTTGACGCAAGTGTGCTCTCCCTACGCTCTCTCTCTCTCTCT:1 - chrX 1235183 5' + blood 7174 2 73.27 GCGCGTTGTTGCTTGTAAAATGAATCCATTGTATATGTAAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 27253575 5' - roo 9027 1 69.31 AAAAGTTGTGCTCGTTAAATAATAGTTAACCCGAAATCTGGAAAAAGGAAGGTTTTTTGACAACAATCGATAGTATTATTTCTGCGGAAATATTGTAGATC:1 - chr3R 1225585 5' + Helitron 423 1 71.29 GTTTCGTTGCTGGCAGCCAAGTTTATTATGAAATTAGAACGCACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACG:1 - chr3R 8185680 5' - Doc 421 1 58.00 GGCTGAGCAGTGGGCGGTAGAGACGCCAAAATGAACAGAACGGATATCATATTTTCAATTAGATTTCGATTAGATTAGATTAGATTTAGTGTTTTGTGTAG:1 + chr3R 14298356 5' + S-element 1488 1 75.25 TTGATCAGGATCAATAGCCGAGCCGATCTGGCCTTGCCAGTCTGTCCACACGGACAGACGGGCATGACTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTCAT:1 - chr2L 21737998 5' - INE-1 93 1 55.79 GGGTGGAATGAGTTGTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr2R 19726942 5' - 1360 3377 1 66.34 CAGATTGTTCTTAACGTGGCTAACTGGATTAATGTCGATAGAACCTGACCTAACTAATCTGAGAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 12958968 5' - roo 398 1 59.41 TGCGGTCGCTTGTGGTGGCTAATGCTCGGTGTCTTTTCTAATTGATGCACACAATAGCCAAATCGAAATTAACACTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAA:1 + chr2R 11136246 5' - invader2 5099 2 63.37 AATACAGTGTAGTCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chrX 22867334 5' - HMS-Beagle 209 2 64.36 GTCTTAAAACCTCATAGGAATCATTTAAAACACGCTGATTTACGAAGGAAAAATGAGTACAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr3L 947846 5' - hobo 2923 1 62.38 AAACATCAACTTTAACTAGAGATGGGTCCTATTCGTTTTTCGGATCTGCTAGTTAGGATCTGAGATTGGTGTTAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCT:1 + chr3R 27562985 5' - Ivk 330 1 76.24 ATAATGAGCGGGCTGGAGGCAGGAGGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTA:1 - chrX 13504541 5' + invader3 5254 2 75.25 CGCAANGATACACCTGGGAAAAGCAGAGTGATAAACTCTTTCAAACATTTAAACTATCCAGTGACTTGAAATTTTGATTTATACTAATAAATGTATACTTT:1 - chr3L 27369764 5' + Tc3 1504 1 54.46 CTGAATCCGAAATTACTACTGGTTCTTTGTTAAAATTTAAGTGTTGCCACTTCAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAG:1 - chrX 10620800 5' + hopper 1396 1 63.00 CCGCANTCCACTCTCAGCCACTGAATAATATATGGTCCATCCTTTTCTCTTTCTGTGCTTGTTATCGGGTTTCAGTTCTTTGCTTACATTCGTTTTTTTTT:1 - chr3R 19536744 5' - invader2 301 1 73.27 TCTTCTTAGGAACAATGAATGGTTTTTTTTCTTCTAGTTGATACTATCTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 9463446 5' + roo 28 2 53.47 GCCCGCCCACAACTGCCACGCCCACGCTCGCTCCAAGCAACAAAAGCAGAAACAATTGAAATTGAAGAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACA:1 - chr3L 9208277 5' + hopper 1376 1 69.31 ATTGAGTGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr2R 18865904 5' - roo 9034 1 64.36 AGCAAGGCTGGTTTAAATAGTACTTTCACCTACTTTCTTCCGAGTTAAAGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGG:1 - chr2L 17863310 5' - F-element 215 1 55.45 GGTATATATCATTGACTTCAAATACCCTAAGAGCGATTGAGACAACAATGCGCGATTCTTATAAATGGATAGATTCGAAATCAATAATAAGTATCATATGT:1 - chr3R 10443605 5' + Tc1 97 1 54.46 TCTTTNGGTAAACGAGAACTGTAACCTAGTTAGCAAATAGTAACTCAATAGCGATTACCCAAAACGATAAAGGCACCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 11953651 5' + Tirant 8139 2 77.23 AATGGAATGTGGACAACCCCGTTGATCTGTGCAACTGGAGAGGTAATTTTAATCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 15648145 5' - roo 394 1 58.42 CCCGTTTGGCAACACCTTTCCCGCCAACATACGGGAGTACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACG:1 + chr3L 11602734 5' - Rt1a 4727 1 81.19 AGGAAGATTACCATACTCCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 21266524 5' - roo 404 1 76.24 AAATTCATTCGACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chrX 5104609 5' - roo 9041 1 55.00 GAGATGCATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - chr2R 8157254 5' - Transpac 5199 2 55.45 ACCCAGGAAGGAACTTCAAACTACCAAAACAAACCAACAACGTTACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTTTTGTTGTCCGAT:1 - chr3L 8438838 5' - Bari1 1641 1 58.42 GAAAAAGGAAAGAACTACAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGC:1 - chrX 7771768 5' + R2-element 488 1 81.72 AAAATTGATTTTCTTTGTCTCGTCGGATATTTATGTAAGTCCATCCGAAAACTCAGCAAAGCCACAAAAAGACAAAAACAAAACGCGAAAAACAATGAAAA:1 + chrX 4596449 5' + Bari2 916 1 64.36 ACCTACTTGAACTCGTATCCATCGCGGGTTGGCGTATAGCTGAACTGCTCGAGGGCGTCTTTAACCGCTACGCTACGTGACACACTACTGGAAGTGCAATT:1 + chr3L 6157082 5' + baggins 70 1 56.44 GCTTTCCAGGGTCGGTGAAAAATGAAGGGACGCGAAGCGCCAAGACCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGATC:1 - chrX 1527737 5' + R1A1-element 5019 1 53.47 GCCTTAGATTTACGTTTTTTGATACGTGCCTAACCCCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGAC:1 + chr3L 18949453 5' + gypsy4 6476 1 64.36 TGATTAGCGACAAAGTAGAAGTTAAATCACACACAAAGGTACATTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGA:1 - chr3L 25414095 5' - accord 377 2 56.44 AAAATAGCCAGAGTAGGACCACAGTCTTCGATATATCGATAGGCAGTGCCCTGAAATCGAAATCTGTTTATTATAAATTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGA:1 - chr2L 13783505 5' - opus 274 2 81.19 AAGTGTTTCTCTTCTGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGG:1 - chr3R 2971849 5' + accord2 156 2 57.43 CACCTAAACAAGCCTATCAAAAAACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCC:1 - chr2L 23374317 5' + F-element 458 1 77.23 GTCGATGGCAGGCATTTACTGTGCTTTCAATTTTGGCCCAGGTGGTTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chrX 8223273 5' + jockey 4708 1 53.47 CTTTGGTTTCGTCTGTGTGGGCACCTCCACAGTCGGTGAAACAGGTGGTGGCGCCATTTCTGACCTATTTAATGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTC:1 + chr3R 23250687 5' - McClintock 5956 2 71.29 GTTTAGCAATTTTTCGTAGGTTAAGGGTGGACTATATTTGTATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATC:1 + chr3R 4474808 5' - Stalker4 6995 4 67.33 GGGCCATTCACACTCAAAAATTGGCACGGAAAGAAAAAATAACTTACTTTTTCTTTCGAAATATGCTGACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACG:1 - chr3L 17667775 5' - Cr1a 4019 1 70.30 GCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr2R 8198516 5' + F-element 54 1 67.33 ACACCCTGGGTGCATCAAGAATAGTTCATTAGCATTATTCATACTATTCTATTCAATAGTGACTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAA:1 - chr2L 6131731 5' + Doc 349 1 54.46 TTTCGATATCCAGTGGATATTATCCTTGCCCTTACTTTTGAAAAATGTATTGCTTCTTTATCGTTTTATTACTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAT:1 - chrX 22638723 5' + INE-1 95 1 73.27 GTACGCATCCTGGTGCTCCTTGAGGCAAAGGCGGCACAGGGTCTCTAGAATTTTTGTTAGAGAGCGAAAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTT:1 + chr3R 23126268 5' + 1360 127 1 62.38 GTCATGAGAAAGTCGGTGAGAGAGCCCGCCAAGAATGTGTGGGTGGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTT:1 - chr3R 16292094 5' - jockey 4702 1 55.45 GAAAAATGTGCGCGACTAAAAGGAAACAGCATAGAGAAAAAAGTCATCTGCGGCCAATTGAAATGGGGAAATTACAAACACAAAAAAAAAACAACAAGAGA:1 + chr3R 19549122 5' + Porto1 167 1 62.38 GCCCGTGATCTCTCCCAGTTCAATATCGATAATAGCATCGGGCGCAGTGCCCGTGAAAATGGATAATAGATAGTAATTTCCTTTAATTGCCTTTT:1 + chr2L 14929154 5' - GATE 452 1 54.74 ACACGACCTCCGCCAAAGGTCAAAGGGATTTGTGAACTAATTAATTACTCCTCCATCCAAATGGCTGCATCAGCAGGAGAGCAGCGGCAATAAGGGGTAA:1 + chr3R 25768335 5' - G7 66 1 69.00 AATAATAAACATATTAAAAACAAATGTCCAATTAAATATACATATATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2L 21032056 5' + 297 17 2 63.37 AGCAAATGTATTGTTAGTCATACATAGTGTAGAATTATTAATACTTCTTAGCTTTATTATTTACCATGGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTAT:1 + chrX 16554905 5' + Juan 26 1 74.26 TAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr4 868650 5' + roo 30 2 59.41 AGAGTTTTGCTCGTGTGTGTGGGTGAGCCAGAAGGCTAGATGATGAAATGCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTC:1 + chr2R 16870489 5' - transib2 2678 1 53.47 GATACGTTCAACGAGCGAATCGGATCATAATGTCAATGTTATTGCCGACTGTTGACAAGGCCATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGG:1 + chr2R 4878464 5' + G-element 3913 1 59.41 ATTTACGGAACTTTGCTTGCCCACGCGACCCGAATACCGTTCGACCCTGTTTGCCCTTGGCCCGCTGAAGTCCAAGGTCCAGAGCGATACCGTTAGTTCAC:1 + chrX 3805635 5' - 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chr2R 10282354 5' + Stalker 6 4 53.47 TCGAGGCGTTGGAGTTTATGCTACCTTTAAAATATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACCCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3L 2978968 5' + hobo 41 1 63.92 ACTTATTGAAAAGCATAGATAAAGCAGCATCCAACATTGTTGCTCCGCTCGTTGTTTGTTGTTCATTTGGTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTT:1 - chr2L 20046957 5' - F-element 323 1 72.28 AATTTACACAGCATTAAATATGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGG:1 + chr3R 18960302 5' - R2-element 3118 1 77.01 GTATTTCCGTTTACGGACAGCACATAGTTATCATCCACCGGTGACTTGGCTGCTGTGACTCCCGGTGGGACCCTAATGACAGACGGGAAAAACACCGTGC:1 - chr2R 12307412 5' + baggins 5101 1 78.00 AGTCCTTGACTGCGAGCGCTTTCAATTATTGAAAGGAGCAGACAGCCGAAACACACACACATACACATGCACACAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr3R 14614796 5' + Tc3 240 1 79.21 GAGGANGTGACGCTAGCTTTTATCACAATTTATGCAAACCGCTGACAAAAATGCTAATAATTACATTCTCTCCCCCCCGGAGTGGATCACTCATGGGTACT:1 + chr3R 7439297 5' - Quasimodo 6989 2 75.25 AGCAAAATGATTTTTTTCATTTTTTTGTTTTTTCATTAATTTTTATAACCGTGTTGGGTTCGCTTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATT:1 - 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gypsy11 391 2 75.25 AATAAACCAGCAAGTGCAATTACCGCAACAGCAACAAAGCGGGCGGCAATTTGCAACATTGTTTTTAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAG:1 - chr3R 29655923 5' - jockey 4734 1 69.31 CATAAAAGAGCCAGATAAACGCAGCTATATTCACACGCTCGTGTGTGTGCGTTCGTTCATAAATGATGTATGAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr3L 22324004 5' - hobo 2934 1 74.26 ATCCAGAAAACTGTTTGCACGCCAATTTAATTTATTAATTCAGCCAAGGAGCCTAGAAAACAGGCGCAACATAACACACACACACACACACACACATCCAC:1 + chr3R 24088849 5' + accord 187 2 69.31 TGTGTTCAAATTAGTTGGTGCGTAAAGTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 - chrX 8179084 5' - pogo 2055 1 74.26 CTCCGGCGGCCACTGTCATTGTTTGACGCAAAATCTCGTTAAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACC:1 + chr2R 19007008 5' - R1A1-element 5033 1 59.41 AACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGT:2 - chr2R 4879003 5' + G-element 53 1 74.26 ACCACCAACAAAACACTTTTAGCCATAAACTCCTCCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTC:1 + chr2R 13748842 5' + G-element 3928 1 74.26 CTAAATGCAAACATTTATAGTTTCGTTAACTTTGCTGATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCT:1 - 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INE-1 580 1 70.59 TCTGATTTGATATGTTCATTACAAAATATTAGAAAGAAATTGCTTTGCTTTGTTGCTGTATTTGCTGTATTTGTTTATTGAAATCGATGCTTTTGTTTTTT:1 + chr2L 3362858 5' - Idefix 7097 2 74.26 TATCAATTTCATTGTTTATCATGCATTTCCGCCTACCCTCGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTG:1 + chr2L 20927653 5' + blood 401 1 61.00 TACTCCCTGACGATGGAGTCCTTCGCCTGTACTCCATGAGGTTCTGTCCTCTTTACTATCTCGTCCATCTTCTCACGAATCGAGCCGTACGATATA:1 + chr3L 8519527 5' + Cr1a 4388 1 51.04 ATTATGAGCTGTTAAGGTGTCTCGGCTATCATAAAATGTCTTTTTCAGTAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAT:1 - chr3L 5487639 5' + Tc3 315 1 54.00 GGGTACGCACTTTCCCCGAACGGTAAACAAGTGAAAAACATTTGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACACGTCCACACACCACCCCCC:1 + chrX 3619994 5' - Dm88 414 1 57.43 AACTGCAATGCACGCATCATATACATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTAGTGATCGATATTAAGGGATTACTAGCACACGAGGACGTGTGATAGGT:1 - chr2R 4285202 5' + invader1 3577 1 74.00 GCACCTGAGACCGAACACCAGCACCTGGACCTGGGTGACTCGCATGGCTGCACCTACTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 + chr3R 4234815 5' - Transpac 5225 2 60.40 AATTGCTTTCTGACAAAATATCTCTGTTTGTGTGTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 - chr3R 26805998 5' + flea 23 2 58.62 ATAAATTAGACAACGCCAACGTCTAAGTGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCAC:1 + chrX 6034083 5' + HMS-Beagle 6923 2 81.19 ATCTGCAGGCGAGCATCTCGGCACGATTCATCTGCACCTGGGCAGAGGAAAAGGTTTCCTAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAGATAATAAGAACCATG:1 + chr3L 3610926 5' + invader4 427 1 62.38 ACATTATACCCGTTTCAAAAAGGGCTAAATTCCGAATTAAATTGCTCAATTATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 22781052 5' + roo 24 2 56.44 ATTGAAAAGTTTCGCGTAAAGTTCGCGTCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATAAGCAGAAGGATAATTGAAAAGGTAAACGGCAAAACATACCTCT:1 + chr2R 13657875 5' - Tc1-2 128 1 72.28 TGGCGTAATCTTTGATTACCAGCACGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGA:1 - chr3R 29020963 5' - F-element 482 1 76.24 TGCCAAAACGGCCAATTAAGGCGTTATTAGCCCCTGCAGATGTGCTGAGATTCCATTGGCGTTCCCGATGCAGACACACTGCGGTGAGCTAATAAGTTAAG:1 - chr2L 6015240 5' + aurora-element 4214 1 76.24 CATTCGATCTAGATGTGGACGAGGAGGTGACCAGGCTATTGGGCACCGATCAATGGTTGTGGCAAACCAATCTTAACGTTCATACGGACAGACGAACATGG:1 + chrX 15663045 5' - INE-1 121 1 75.25 CTTCTTTTTTTCGATTTTAACCTGGCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCTGAAATTAACAGCTGTTATTATAATGGTGCGCTGTTAAATTAACTTTTGCGG:1 - chr3R 9035786 5' + hopper2 1492 1 75.25 ATACGCGTGGATCTTCAGGTCCACGCTCACATGACAACGCCAACGCCAACGCCATCGCCATCGACATCGCCGTTCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTCTAGA:1 - chr2R 18109476 5' + GATE 8415 2 72.28 GTTAACACTTTTCCAAAATCAAAGTGTTTTGCATATAATGAGACGTGATAATACTCATATCCTATGATATAATCCATTTGTTGAATTCTGTTTTTATTTTT:1 + chr2L 7997846 5' + Tc1 1392 1 70.30 AAAGGCATCCAGCATCCAGCATCCAGTATCCAACACATATTTACATATTCTCCTTGCCCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACTA:1 + chr2L 11590565 5' - X-element 118 1 66.34 CAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTG:1 - chr2R 5173182 5' - Stalker4 7311 4 78.22 AGCCATAAAAGCAGGCACAAAAAGCGTTGCCTACTTAGGGGCGCCTCTACGGAAGTCGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 31159622 5' - hobo 2921 1 61.39 GACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 - chr2R 4879045 5' + G-element 11 1 70.30 CGTTAGTATTAATATGTCTTCGAAGAAAGTTACATTAAAAACAAGAGAAAATGCAATAGTCAAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTCT:1 - chr4 89462 5' - INE-1 540 1 75.25 TTTATCCATTGCGGACCCAGCGTGGTACCCATCAACTTTTAATTTTGTTTCATTTTTTCTTTTCGTTTTTCGATTTTTTCTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 17755218 5' + hopper 143 8 62.77 AATGTCGCCGAAGGATGCAGGCAGTTGTTTGGGTTCCCTTGTAGTTTGCATAAATAATTGAGCAGCAGTGCAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGT:1 - chr3L 10074569 5' + flea 4895 2 68.32 GTGCTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr3L 3254971 5' + 1360 32 1 57.43 CACTCTGGGTGAGGTCAGGCAATTTAAACTAAAGCCATTCGCAGGCTTGTCATAATGTGTAATGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGA:1 - chr3L 16897321 5' + P-element 225 1 68.32 TGTATGGCCGTTAGGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTTGTGTAAGCAATGATCACCGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCCTAACGGCCATA:1 + chr2R 2256420 5' - 1360 3373 1 59.41 CACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTG:1 - chr3R 2533952 5' - gypsy8 4812 4 52.48 AGCAGTCCCTTATTAGCCATTCAAACCACTGCGCGTTGTTGGCTTTCTTTCGCCCATGTCCGTCTGTCCGTCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAT:1 - chr2L 18145982 5' + INE-1 140 1 61.39 AACAAACAGCCGGCTAGTGTTAACCAAGCTGCCCCGCACCCTGAAGCCAATCCATCAGCTCAATAGTTACTGGATATGATTTTTCGATAGAGTGGAGAATG:1 - chr3L 25285683 5' - G5A 251 1 56.44 GAACGTATATAGTATTTGTGTGTGCGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTCGTGTGGTTCTGTCAGGATAAACGAACACACACACACACACAC:1 + chr2R 9928218 5' + accord 181 2 64.36 TAAAGCATTTTGGTCACAAGTAACTGCCCCAATAGTGTAACGTGGACCTCTAGCATTGTAGGCTAATTAAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2R 8557925 5' - hobo 2931 1 71.29 AGAACCTCGAGTATAAAGATTCCCGAGTTGAGATGGAGTTTCCATGGGCTGCAATAAACATGTCACCGGACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTAAGA:1 + chr2R 19831764 5' + rooA 7328 2 55.45 TTTTCTACAGCTTTAAAGGGGCAGGCACACTACGATTAGGAGTATTTTTTCGTGTTACCACCGAAGTAGGCCTCACCCCGTCAAGGAGACGGTCCTCGAAC:1 - chr2R 25038115 5' - baggins 463 1 77.23 AGCAGAGGCAGCAATTGAGCACTAGAGCACTTGGTCTACTCTTTCAAGAACTTTATCAACAATAAAATGTGACAAAAGTGCAAAATAAAGAAAACAAACAA:1 - chrX 3270448 5' + mdg3 5081 1 78.22 GTAGGCGGTGGGCGGCATAAATAATGCTGATGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTT:1 - chr2R 20442089 5' - Doc 4498 1 73.27 CTAAAAACTTTTCAGCACTGAAAAAGTTCTTTACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 25931396 5' + roo 20 2 60.40 GCGAACCTTGACCGCAGCCATGTGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr3R 22352831 5' + 412 7106 2 78.22 TGAAGTAGCAAAGTTGCAAGAAGTCTACGCAAAATCGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAA:1 + chr2L 14263410 5' + Doc 4426 1 64.36 CATTTTGCCGCGAAAAAGCACTGCTTAATTATTGTGAACGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATAT:1 + chr2L 17843142 5' + Rt1a 5053 1 65.35 AGTGTCAGGGAAATGTTGCTTTCTTTTTTCCTCCAACAGAGCCAAATGTAAAATAAAAGCAAAGTAAAGGAAACAAAAATCATAAAAACAATAACCAAAAG:1 - chr2L 17141343 5' + BS4 449 1 57.43 TGGAGTGATTTGATTAGCGACGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCAT:1 - chr3R 19917912 5' - F-element 232 1 80.20 CAGCAATACGCATGTTGCACTCAACGCAACGACGCACACAATAAACAATATATTAATTACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAA:1 + chr3L 15199607 5' + hopper 1150 2 68.32 CCCCTACGCCAACGGCAGCGTTGCCCTCTCCGGGATGCTCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTGTTTTTTAG:1 - chr3L 21435721 5' - rover 6834 1 65.35 GATGCCATGAAAAGTGTGCAAATCAATCCTATGAATTATGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAG:1 - chr2R 11575186 5' + INE-1 148 1 66.34 TTGGCATTTGCATAAATTTATGTTAACTTGGCCAGCTTTGGCAGACTATTTGCATCGCCACTCAGCCTCCAGCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACA:1 - chr2L 4297276 5' - Tirant 8321 2 80.20 GCAGAATGGATGGTTGCGCATGGCAAAGAGAGAAAGTCTATCGCTCTCTCTGTCGCACAAGGGGCATCTTTCGCCTTGGACCTACGGATTCCAGTTGTAAA:1 + chrX 16150815 5' + Doc4-element 2732 1 75.25 GATTATAATCATTGTAAAGTGGTAAGAAACTGCTGTAGTTGAAACACAACTCAAATCGATGTTAAATATGTTCTATGTTAAATATTTTCTTATTTTTATAA:1 - chr2L 3439759 5' - mariner2 829 1 48.51 GTATGNGCAAACGTCGCCGTCATCGTGTCGCCGTCGTTGTCGCTGCCTGGCTGACCGATCCCTGATCTGTGCTTGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGG:1 + chr3R 1268933 5' - gypsy8 335 1 53.54 ACGGTGTGCAATTTAAATTTTCATCCTACTTAGTCTAGATTTTGCCCATGCATCCTGCACAACTTGCCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGACTTCTTCG:1 + chr3R 28188062 5' - HB 1196 1 61.39 GTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr2R 1096877 5' + Tirant 8148 2 68.69 TGGCCNAACCAAAACAAACATAACTAACCAGACTCTCCATAACACATTTAATATACAACAAACACCCTGTTCACACATGAACATTAGTATATTAGTTGCAT:1 + chr2R 17111720 5' - roo 8613 1 69.31 CACACATTCTAATTAGCCAAAAGCCGAAAGCAATTTATGCTAAACCGAAGCATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATC:1 - chr2L 18872878 5' + Doc 4501 1 53.47 ATGGCAACATTTCTTTTCGGCCAGCCCAATTTCCTTCTGCGACTTCTGCAGACAGCTAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACA:1 + chr3R 21989757 5' + Doc2-element 419 1 64.36 CGATCATGAACTTCCGGCGTGGGGACAGCGGTGGCTAGACGTTTGCGTCTGTAGAGTCTTCTTCTGAAGATTACGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTT:1 + chr3L 290057 5' - gypsy 7339 2 74.00 CTTGCGAAATGAAGAAACCCTCCAAAAAAACAAAAGTACTAATGTTAACTTAAATACCAATATTTTCATTCCTATCTCAATTATTTTTCCTTTATTTTGTC:1 - chr2L 3011412 5' + Circe 6967 1 73.27 TAGAACTGCCCGCTGGGAACTCGCTGCTGGGTCATCGAGTCGCCCTACCCGCACCACCCACAACAATGAACCCCCGACCAATTTACAACTTTGTAATCCCT:1 - chr3R 13410042 5' + G-element 4230 1 63.37 TGTCTTAATAGTCATATTTCATATGTTTTGACCCCATTATGCTTTCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGTCTGCTATCATCTCATTCGTAGAAGTGAG:1 + chr3L 12679177 5' - 1731 4186 1 72.28 GAAACGTCGTCCATTCCGCTCAGTGCGTGTATCATCTGGCCCCTCTTTTCCTCCCACCACAGTCTTTCACTAAGAATTTCCCAGCAAATATGATAGTCATA:1 + chrX 15198720 5' + R2-element 3247 1 80.20 GTCGGCGTGCTCCTACATAGCTATAAACATCAATTTAGCAACGAAAATTGGTTTTCAGATAGCTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATAC:1 + chr3R 27504596 5' - R1A1-element 5275 1 68.32 GCGAAAGGAACAATAAAAGAAAAGTGTCTACGGTGGCCGTTAAGCAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTT:1 + chr3R 27386244 5' + Juan 391 1 59.41 GTCGAAGGTCAGGACTGCAAAGCGGCAACATCCCCTTTTTTACTCGTAGAGTGAAAAAGGCATTTCAGACCATATGAAGTATATACATGTATGTATATTCT:1 + chr3R 4195883 5' + INE-1 69 2 65.35 TTACTTAAAATAAATGTAATTCTCACTTATATATACATATATACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 8299676 5' + roo 8687 2 55.43 TCCCACTCTCGCCCAATTTCGCCCACATTCACCCACATTCATCCGCTTCAAGTGGCTCAAGTGGCCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTG:1 - chrX 20018847 5' - accord 7026 2 52.69 AAACAGAATGCTGGGAAAACAATGACCATGGGCCAAATTGTCTGATGAACTGCCTAACAATAGCATCTGTCCATCTAATAGTCGGAGGGCTGTATACTGAG:1 + chr3R 4833572 5' - G5A 330 1 72.28 TGGACGCGAAACACGCTGCACAAATGGCAATTGGCAAGCACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAA:1 - chr3L 22961143 5' - Copia1_DM 92 1 61.00 GTTCGGACGTAGGCTGCCCAGGGATAAAAGCTGGTGCCACTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACA:1 + chr3L 22839174 5' + 1731 4600 1 61.39 AAGTCCTGCGACCTGGCAGCGGAGTGTGTTGACCTCGGTGAGGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGA:1 - 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chr3R 22070240 5' - 1360 414 1 65.35 CAAACAATAGCTGCAATCGATCAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCGTCGTCCTGGCATGGAGTCCACCAAGTCC:1 - chr3R 14940718 5' - Tc1 1282 1 80.20 CACAGCCCCCGCTGTCCTGGAAAGTGGGACTACGTACTAATTTGCTTTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCT:1 + chrX 18197665 5' + BS 4790 1 54.46 TCTGTNGTCAACCACGGAATTCAAGCATTAGCATTAATAAACAATTCATTTGAAGTGACACCAGCGGCCACAGTTCGAGAAACTTAACTTTGTATTTTTGA:1 - chr2R 17594964 5' - X-element 174 1 71.29 ACGATTGCCGTCATGGGCGAATATATTGCGAATACGCCCCGGCATCCCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3R 31159705 5' + hobo 29 1 52.48 GCTTATCGAGAATGCCTGTGAACTTGTTGGACTTTGCGAAGAAAAAACAGATGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAAGGATTGTGTCTTGGGAC:1 + chr2R 14777775 5' + R1A1-element 249 1 57.43 ATATTNCCACATTTTGACACGTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 + chr3R 12578151 5' - jockey 4944 1 74.26 AACACCAGTGCCAAGGGACATTTAGCCGAGCCAGCGATGCATTATATAATTAGAGATAAGAATCCAAGTAAGAATGAATAGAAGGCGAAGCCCTCGCAGTA:1 - chr3R 4855966 5' + rooA 296 2 66.34 GCTCAGACAAACGGCCGGCAACAATTGCTGGCCATCCTGGCCATGTCCGTCTGCCCGTATAACCATCTCGATCGCAGGAACTAGAAAAGCTAG:1 - chr2R 9497284 5' + INE-1 152 1 59.14 GGCACAGTAAATTGCGCAAGTGTCCACGTGGGCAATCTATTTGCATTAGTCTGCGAATGAGAATGTACGGTATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCA:1 - chr2L 17934435 5' + blood 7337 1 72.00 GGTTTAAGTCTTGAAGATCTTTCGATATCTACAAGGATAGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr2R 10029418 5' + roo 36 2 61.39 GAACACTGGGGGAAATAAAAACCTGTAGGTGACAAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCA:1 - chr3R 16818063 5' + Doc2-element 4443 1 66.34 TCTGATTTATTTGTATTTTATGTCCTAGTTACCCAAGTGTCGGGTTTCTGCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGTTGCGTA:1 + chr2R 25219286 5' - Quasimodo 235 2 56.44 CGAGAAAATCGTAGTGAATCTGTAGTAAATTTGCTTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGA:1 + chr3R 21899193 5' + 1731 448 1 66.00 GCGGTCCATTCATGCAGTTTTGCGCTTCTATTACGCGAATATCGATAGGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTG:1 - chr3L 22057939 5' + micropia 5200 1 55.00 TTTCTGCAAAAGCACACATACTTCGCTATGTTATATATATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 8299740 5' - roo 9035 1 64.36 TGGCCTCCTTCTTCGTCTTGGCGTCCATCCAGTTGACCTCGTCCAGGATGTCGGTAGTTCCAGCCGCTTTCACTTTGTAACGTGTTACGAAATAAATTGAT:1 + chr3R 4721236 5' - Gypsy12A_LTR 2255 1 54.46 CTGTACTCCTTGGCCTTTCCGAACAGTGCCTTGATATCCTCCTGGCGCTCCCTCCTCTCATCCTCGCTCATGGCCACATATGCGCATAAGCCCTCT:1 + chr2L 13386906 5' + blood 7164 2 78.12 GCCGCGCCGAGTAACGGAGTTAGTCCATAAGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTAT:1 - chr2L 16705514 5' + X-element 4558 1 70.30 TAAACTAATACGAATTTATGGGATTACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCACGTTCTTGCTCTCCCTTACAACTGTCACAAAACC:1 - chrX 6867966 5' + Doc2-element 468 1 73.68 GGGGCAAGGGTCATCCGCATATATTGGTTCAATGATACGGAAATCTTTGAAGGTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAA:1 + chr2R 7732432 5' + hopper2 1404 1 57.43 CCGCCCGTCACATCCAATTGCTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTAAACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGCGATGGAAGAGCGCG:1 + chr3L 9430669 5' + Porto1 332 1 80.20 TTTCCTACTTGACAGGACAACGACAAATTTTACGTGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCC:1 - chr3R 12112338 5' - Bica 462 1 69.00 TGTGGAAGATAAAATGTTCGAATCGAAAGAAATTTTTCGCTTTATTGCTCTCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCT:1 + chr3L 10684381 5' - Dm88 387 1 58.42 CGGATCTCACATGTAATAGGATTTGAGGATCCGTTCTGTGTGGGTTTGGTCGGTCAGGAATAGCCTCTCAGTCGCGATCGAACACTCGA:1 + chr2R 7589585 5' + G-element 1 1 64.04 GCTTTATTTTGCGCCTAATAAATCTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 - chr2R 18358095 5' + jockey 4714 1 66.34 AGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr2L 19845923 5' + F-element 62 1 73.27 ATGGGTCCTATTCGTTTTTCGGATCTGCTAGTTAGGATCTGAGATTGGTGTTAGTTACTAGATGGGCATAACAAACAAGATATATTTAACAACACCAACCC:1 + chr3R 27563006 5' + I-element 5086 1 74.26 TATATTCGACGCCCACACACGTTGTCATTTGTGAGTGACACACACAGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATT:1 + chr3R 16410758 5' - McClintock 41 2 54.00 TGTATGATTTAAGTGCCCATTTTTCTGTGTGTACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 27619299 5' + hobo 3 1 74.26 AAGTTATCGTCGCTCTTGCGCTTGTTTTCTGCAGGGGGGGATTACAGAATTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGC:1 + chr2R 23861116 5' - F-element 474 1 51.49 TTTGGTGGCAAGCTGCCCGTGGAAAGTTTTTCAATCACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGC:1 + chrX 4167886 5' - accord 344 2 67.33 GCACGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGCGCACGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTGTGCATCTTGCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGT:1 + chr2L 17233110 5' - R1A1-element 5246 1 48.51 ATTCTGCTGCTAACTGCTGTCTAGGCTTTTAGACACGTTCTACCCCCGTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr3R 5946093 5' - HMS-Beagle 232 2 60.67 ATACACGCACACACACACACGCGCAAGTTGCCCTTGCAGTCTCCCTCGTACTGCGAATAAAAGATGTCGTCGCTCGAGTGGAGTTGCCTTCAACGGCTAC:1 + chr3R 10446283 5' - aurora-element 75 1 78.00 GAAACGCTGACGTCGAGCAGCTTGTTTTAACTTTTGTTTAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGA:1 - chr3L 13923769 5' + invader2 346 1 61.39 TCAGGCTGGCTGTGCTATAAAGTAATTAGACGGCCAACGAATTTGGTAGCGTTAAATAATTGTATCACCGGATGAATTGAGCTTCAGTGAGCTCAATCCAT:1 + chr3R 29199591 5' - G3 4527 1 61.39 TTTGTGAACCTGCCGGGCGACAACGACAAAAAAACCAAAGCCAATGCGAAGACGATGTGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGAC:1 - chrX 17918690 5' - Quasimodo 7101 2 66.34 ACAAACGTAAGTGATATGCGAATGCAACCTGTACAATAATTATCTCTTTTTTTTTTTGTTATATTCCT:1 + chr3R 19368164 5' - Osvaldo 1520 1 47.06 CAAGCAAACGCCTTGAATAGCAGCACTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAA:1 - chr2R 7729605 5' + F-element 300 1 75.25 AAAGTTTTAGGGTTTTTCCGTCTGCTTTTCCCTTTTTTTTGTTTTTTGGGCGCGCCATGGGAAGTATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATG:1 - chr3L 9911916 5' - McClintock 6073 2 65.35 AGTGGGCCGTGGCCATAAGCCACCTGCCAAACCAGGTCGACCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATG:1 + chr2R 20509463 5' + G2 141 1 59.41 TTCCTTAAGTTCAAGTCCTTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTA:1 - chrX 10564480 5' - Idefix 166 2 82.83 GTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr3L 22564800 5' + blood 13 2 66.34 CGAGCTTCCTGCTCGAGACTAGAGGCAACTCCACGCCGGCCACAGCTAGGAATGCTTCGACAGCCTTGACCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATCCGTA:1 + chr2R 5321974 5' + 1360 7 2 68.69 GCTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr2L 19090038 5' - opus 482 2 62.63 CATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 9823623 5' + hobo 23 1 58.42 TCAAATCCTACACCGAAAGTAAATCCAAATGGCAAAATATTGGTTGATCAGAACAGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTAC:1 - chr3L 20194994 5' - INE-1 551 1 59.41 CCAAGNATTGTAATTGGCCCATATAATGCCTTCGATCCAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGTTATGAACGGAGCCCAAAA:1 - chr3R 9321940 5' - roo 8704 2 66.34 ACTGAGCCAGCGATACAACGAGAAGCGCAGCGAACTGAGGCAGGCCGTCTTCATTCCGTGCACGCTCCAGAAACGGTCCATCCGAACACCGTGTTCTGCGA:1 + chrX 19858923 5' - Max-element 8123 1 55.45 AGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGGGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr3R 7808969 5' + jockey 65 1 76.24 TGTGGCACACTTGGTTTAATAGCAACAATTTGCACCACACCGGCACTAAATGTTCTTTTCTATTCTTTCGCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAG:1 - chr3R 20400071 5' - Cr1a 4421 1 71.29 AATGTTGGTAGAAATAAGACGCCGATGTATATCCGTGGTAAATATTAGACTAATATGAGATAGAATTATTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr2L 10985113 5' - INE-1 544 1 59.41 TAATTAACATATAAATGAAAAGGTTGTTTTAAAATTAAGTTGGTCAGTCGGTAGATCCTCGTGGTGGTCTTCGCAAGCGTCAGCTAAGAAGGCAGGC:1 + chr2R 17073242 5' - Chimpo 4102 1 59.79 ATGCGAATGAAGGAAGAATATTGATGTTGGCTGCCCCACTTCCCTTCCTCTGCTCAACCTTTTCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTACCGGTT:1 + chr3L 5281325 5' - invader1 95 2 60.40 GTGGAGAAACTTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCA:1 - chr3R 25796095 5' - BS 5079 1 59.41 TTATCATTGCACCAACAATTATAGACACAACCCCGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 - chr3L 20857866 5' + flea 4796 2 66.34 AAATCTTTTTGGCAAGCTTCGGCTTCAGTTGGAATCGCTTTTTATGCCCTGGCAGCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCC:1 - chr2R 14046445 5' - jockey 4657 1 55.00 GATTTTGTTTCGCTCTCTTCGGCGCGCGTCGATTGGTTTATTTGGTACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGC:1 - chr2R 12923594 5' - invader2 4995 2 69.31 CCAAGAAGAAGACTACGTCGTTACCAACGCGGCACATCATAAAGAGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTG:1 + chr3R 23955509 5' + F-element 150 1 55.45 GCCTTCGATATTTCTAAAGCTATGTTATCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAG:1 + chr2L 6775517 5' + I-element 223 1 72.28 CCAATCTCCGCTTCCTCACCAACCTCACGTCCAAATCCCCTTGCAAGAAAACTTATTCGATTATGCAGCCGAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGC:1 - chr3L 20125025 5' + Doc3-element 4577 1 80.20 CCCAGAACGCCCTAAGAATACTTCGATTATTGGAGAGGCGTGATGTAAGTTTCTAGCAAATAAAATTTTTAAATTAGGGCACACCCAATCCACACATCAAC:1 - chr2L 12453028 5' + Ivk 5060 1 77.23 GGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 10635260 5' - roo 9026 1 73.27 CGCATGTTTTAGTTTCTGGGTTGTGTAAAACAAATTGTTGCCAAATTTCGCGGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTAT:1 + chr3R 12564036 5' + P-element 202 1 54.46 TGCGGTACATAGTTAGCTGCAGCTTTAAGCCCCGTATGCGTAATATGAACACCGGTCAACGAGGCGTTACAGTTGTCGAGCGGTAAAATGTTTTTCCGCAT:1 - chr3R 7303316 5' + R1-2 2929 1 69.31 AAGGCNTACCGGAACAGAGAAATAAAATAAAATCAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTT:1 - chrX 4047950 5' - 17.6 64 1 66.34 AAAACAGTTCTTTTTGGCCAGTTAAGCAAAGACAGAATCAAACTGAACTTGAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGGCCACTCCAACGGGTAGTGTTT:1 - chr2L 10407701 5' - gypsy6 105 2 63.37 AAACAATCCTCCGTATAAAGCCTGCTGTATCTGAAACACACACAACTGGAGCACCATTATGCAAAAGGATTATGCAAAATTATGCTTAAAAAAAGGGAATC:1 + chr3R 12813606 5' + transib3 2850 2 62.38 TTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGT:1 + chr2R 5259038 5' - invader1 3969 2 67.33 GCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 - chr2R 4879005 5' + G-element 51 1 72.28 AACTGCACTGCACTTCTACGTGGTGTTTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGA:1 + chr2L 8967314 5' - Burdock 5976 1 73.27 AACCAACAGCAACATAAGCAATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGAGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCA:1 + chr3L 4417946 5' - R1A1-element 5046 1 78.22 TACTTACTTCTCGCCTACATCTGGTTCGCAATAGCATTCTGCTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAAC:1 + chr3R 16312166 5' + micropia 70 2 58.42 TTTTTTTGCCAGTGTATATATATATGTATGTGTGTGTGGGGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGG:1 - chr3R 29449935 5' - Doc 4491 1 60.00 GAGGATGAATATTCATTTCACGAGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3R 22675793 5' - 412 7528 2 58.42 GAGTCCCCACCACATCATTCCTTTCGCCCCCATTCTAGATCGCATAAACATACAAATAAAACTTTTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACA:1 - chr2L 1255278 5' + Doc3-element 4486 1 57.43 TCACCTCAGTGTGCGTTTGCATTCGTTGACGCTTGACATATTGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGATGATGT:1 + chrX 16278573 5' - mariner2 766 1 58.42 CTAATGTAACCACACCTTTCCAAGGTTTTTATACCCGTTACTCGTAAAGTAAAAGAGGACACTAGATTCATCGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGAG:1 + chr2L 22059729 5' + INE-1 30 1 72.28 TGCGGGACATGGAATTTAGTGTAAGTTGTACTAACAATTTTATCGAACCCGCTAAGATAAGTCCTTGTGATGTGTCTTAAAACTCCCCACAAATCTCGTGT:1 + chr3R 4702392 5' + gypsy8 4664 2 72.28 GAAATACTCTTAGGAGCAGGTTCATTCTCTACCTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGG:1 + chr2R 8126432 5' - Doc 4423 1 67.33 CACCACCGGTGGAGGCTCCTTCTTCCAAGGCGCCGTCCAGGTCGCCCCCGTGCAACCGCAGGCCGTCTACCAACCAAACCCGTCCAACCCCACCTGAAGC:1 + chr3R 4254940 5' + G2 122 1 74.00 GGAAAGTGCCATGGTACTTTATGTAAGTCTGTTGAATTCAGTTATATTAACTTGGGTAAGGAGTACAGGTCTTAAAAGGAAACAAAAAAACAAACAACAAA:1 + chr2L 7060698 5' + gypsy7 5013 3 83.17 ATGCAAAAAGAAAATAAGAGAAAAAAAAAAACAAAATAAGAAAATACAAAATAAAATACAGAGAAAAAATCAAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAA:1 - chr3R 10588916 5' - 17.6 7131 2 75.25 AAGAGCTCAAACTTGGCCAAGAAGGTGCTGGATTTAAGAAACTTGTTCCATAAACGTAGCACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACA:1 + chr3L 14881682 5' + I-element 162 1 64.36 GTGGAGTGGGATTTCAGACATTACTCAATCAGCGGGCCATAAATGCAAGCTGATTAATGCAGCTGCCTGTCTGACGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2R 19964634 5' - roo 406 1 74.26 CCATAATGACAATTATATTTTAAATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3L 87187 5' + jockey 30 1 53.61 TTCCACGCCACAACAATGAATGAGACAATTTCTTTTTCCTTTTTTTGTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr3R 20140607 5' - jockey 4962 1 66.34 GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCC:1 + chr3L 11115124 5' + micropia 31 2 55.00 AAGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chrX 6283680 5' - P-element 2843 1 36.63 GCGGCGATCATAAAAATAAATCTACAGAAAAAGCTTGTTATTTTCGATAATAAAAATAAAAACTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTA:1 - chr3R 7941770 5' + flea 401 1 67.33 ACTTACCCTTGTGAGCCATGTCTTCTAAAGACGGCATGGGTCGGTCCTTTTTTATATTTCTGTCTGCCTAAAAAGTTAGAGCCTTCGCGTCAACTAACAGA:1 - chr4 705258 5' - Gypsy12A_LTR 469 1 68.32 CATCCTATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:2 + chr2L 19845912 5' + F-element 51 1 62.38 CGCTTCGTTCGCCCCCCGCTGCACCACCCCCTGCGCCTGCAACGTCTCCAGAGTCTTCCAGCAAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGG:1 - chr3L 10986660 5' + HeT-A 5735 1 57.61 GTGGCGAGGAGGTAACTGCCTCATGTTTTTATACGCTCTCAGAGTAAGCGAGGGGAAAGAGGGAAATTTTGGCCTTCACCCAAAAAAGTGACTGCATAGTG:1 - chr2L 21088199 5' + 1360 3340 1 81.19 GTGTACTGAAATCTCATTGCTTATCATTAGGTTTAAGTCTTGAAGATCTTTCGATATCTACAAGGATAGTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 10029389 5' + roo 7 2 76.24 TATCAAACGATTAAGCTCGAAGTGGGTTCGCAGAGCTGACTCCAAGCCAGAACCCATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCACCGATGA:1 + chr2L 2833495 5' + G5 4643 1 64.36 TTAACCACTTACAACCAGGCCAACACACACACACACACACACACACTCATAACGTAAACAATAAGTGTCCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAAT:1 - chr2L 9369875 5' + 17.6 88 2 54.46 CCCGGAGTTGCCAATGGACACAGCGAAGGTCGCCCCCACGTCTCGGGTAAGTCTCTCCAATTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 + chrX 3693887 5' + jockey 4808 1 67.33 CGAAATTGCAGATTTCCTTTTTGTTTTTCGTTTT:1 + chrX 15597253 5' - 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G3 4503 1 50.68 GGAAAGATAATCAAAGAAGCAATTGGCCAGCAGGGACGTGTTTTACATATTATTTAGGTGACACTGTTTTTATCTATGTGTTGTGCTGGTAGCTAAAGAAC:1 - chrX 7371977 5' - Doc3-element 477 1 80.20 GTAGCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCAGATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr3L 22564832 5' + blood 28 2 66.67 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATAC:1 + chr4 1267786 5' + Stalker4 7093 4 72.00 TACAATACCCATAAAGCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTAC:1 - chr2L 3245028 5' + rover 6957 2 74.00 GAATGNTGACAGCCATTTTTATACGGCGAGTCCTTTTTGGGGAATGTGGAAAGGTGCCAGGGGTGGCATTTTTATTTTTTTATACTCCTTTTTTTTT:1 + chr3L 18974146 5' - Doc2-element 253 1 74.23 TTGTGCATGTAAACTGAGGTGTTGTGTTATGTTAAAAGTTAAGTAAAATATATTTAAAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chrX 3050738 5' + I-element 26 1 58.42 CGGGGATATTTATATTCTATGCCTAGCTTTAATTTTCTCTTTTCAAAACTCAATGAAAGCTAGGCATTGGAAAATATTTCTTTATTTTTATAATGAAGGTA:1 - chr2L 7043607 5' - mariner2 821 1 71.29 TTTTCGGCGATCCCAATAAAAAAAATGGCTGAAATTCAAAACCCGAAAGAGCAAAAGAAGCTCAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAACAATATTCGA:1 - 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chr2L 5062275 5' - gypsy7 5008 1 88.24 AAGGACGACACTCAGAGAAAACTAACACTCAAACAAGGATAAGAGAATTATTCAGCATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAATT:1 - chr2L 13476569 5' - rover 7038 2 63.37 TCTGCAATTTATGCCATATATAGGCTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGC:1 - chr2R 19146467 5' + 1360 3293 1 77.23 CACGTTATTGGAAGCCAATTTAGCAGACAACATTGGCTCAAATGGAGGCATCGCTCATGGGTACAGATCAGCCGAGAACTT:1 - chr2L 5841995 5' - Quasimodo 6973 2 64.20 ATCCAAACAAATAGAATATTTTTGGGAGGGAGGGATAAAGTGAATCTAAAAGTTGTCTCAGTGACCTATGCTGGTAATGACAGCTGGACATCGTCTTGGCA:1 + chrX 19695196 5' - Tc1 1299 1 64.36 AACTCTAGTGATTATGTTTATGCGACCTCTAATATAGGAAGCCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCT:1 - chr2R 9834917 5' + accord2 7587 2 58.42 TTAGAACATGTATTCTGAAAGTAACTTTTAAATTTGAATTTCTCGAAGGACCAAAATGTTCACACTATAAACTTAATGAGTTTAATTCGGGTGCTTGAATC:1 - chr2R 24269463 5' - rooA 330 2 68.32 TTTGATTTATTTTCATGTCAATACTCCAAGAATGTTAAACTTTCTTGTTCGCAAGAACAAGAACCACTTGCTGAGTAACGGGTAATTGATAG:1 + chr2R 6155610 5' + INE-1 547 1 41.30 ACTTATTTGGAAAGTGAGATCTTGGCGTGAACACACTTAGAAGGAACTCCTAGGAATTGGGCCAAATAAATGTGCGTTAAAGTTCCTGAGATTTCGACGTT:1 - 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INE-1 580 1 67.00 GACCGAGCTTTGAACAGGTGCATTTAGTGTGGCAGCTTGTGAAAGTCAACATGGCGTATTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACA:1 - chr2L 18461141 5' - Copia1_DM 175 1 67.05 TGGTGAGGCATGCAAAATACATGCTCCTAGCTGGGGCTAAATAATATATTCCTTAATAAATTTGATTTGTAGTTATTTCGTAACAGACCAGAATTCAGAGC:1 + chr3R 2724420 5' + gypsy10 290 2 66.34 TTTTATTATTGTTTTCATAAGTTAGTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 3947348 5' + roo 50 2 78.00 ATGCTAATTATTTGGATTAGGACTGTGCCTAGACAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAA:1 - chr3L 16681980 5' + flea 4608 1 67.33 TATATTTAAACGTATGCACGGCTGTGTGTATTTGTATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:2 + chrX 9950831 5' + hobo 39 1 67.33 TAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 17947356 5' + hobo 51 1 73.27 AGTTATTAAATTTTTATGCACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:2 - chr3L 776165 5' + 1360 29 1 54.46 AAGGTTAATTAAGCCAAGCGTTCCACTCCTCAGCCAACCCAGCCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAG:1 - chr3R 30307935 5' - copia 112 2 63.00 TGTGGTTCCCCAGGCTGGCTTCATTTTTGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAA:1 + chr2L 5932077 5' + jockey 7 1 76.24 CAAGCAAGTGGCGATGCCGTTCGCACCACATCGCTCTCCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAAC:1 + chr2R 11209138 5' + Quasimodo 428 2 60.42 TGGCGATGAACCCGACGAGGAGCAGGCGTCAGCGGTAGTCGCTGAAGGTGAGGATCAGGCGACTGAAGCAGTAGGCTATGAAGTCTCGATGAATAATCGAT:1 - chrX 1016205 5' + gypsy12 30 2 61.39 AATGGGCGTTGAGGGGCGCATCTCGCTGCTGTTCGTCTGATTGGCTGTATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCATTTTGCTATT:1 + chr3R 8071026 5' - Bica 271 1 51.49 CAACTCTGGCTGCAGTGCTGGAAAAGGTACTAAGTTCTTCTGCCGTAATTACGATGTAAAATGTATTTTATATATTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTA:1 - chr2R 24870022 5' - INE-1 33 1 70.30 ACACACACCGACACTTGTGTGAACAAGTTAACAAAACGATTTCGCTGTTGGAAAACTTTTATTGTGCGAGTGGGCACACACACACACACACACGCATATCC:2 + chr3R 20419766 5' + accord 7031 2 69.31 GAGATGCTCTGATTAGGGGCGCATGTGGAGCAGCCAACGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATC:1 - chrX 15701119 5' + Doc 303 1 63.37 GCTTATTGTTATGAAATCCCACGTTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCGGTATTGCTGTTGCTGGCGTTGCCCA:1 - chr3R 2465784 5' - F-element 4287 1 79.21 GGACATCGAGGCTTTCATCACGGGCGGTCTGCAAGTGAGTTATACTTTATAAAATGATAATAACAAAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCA:2 + chr2R 18444179 5' + 1731 4215 1 75.25 TGTCAATAGCGAAATACAGTGTAGTCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 + chrX 22867322 5' - HMS-Beagle 221 2 52.48 AACGTCGACAACTACGATGTTGCGGCTACTGCGCCCCAAGAGCACTGCATGCTTAATCTCCACTTTCTAGCTTTTATATTGTAGTTCCTGAGATCTCAACG:1 + chr3L 2118103 5' - INE-1 144 1 56.44 TGCTTGTATGTTTATTTTTCTTTAAGGAACATTATCACTTCATTCAATCATTTAACAATTACTTCGTACGATGAAATGCAGAGTACGTAATAAATATAT:1 - chr3R 21455845 5' - Gypsy6A_LTR 233 1 64.65 TAAAAGTCAAATCTCTGATAACTGTAATAAAATACGACAGACGGGAAGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACT:1 - chr3R 9462234 5' + baggins 5180 1 57.43 AACGATTCCCTCTTAGTGGATTACTACTGTAGCCATCTAGCAAAGGCATGTGCAGCTGGTGCTGTTTCGGATGCTGCATTTCTAAAATTGTGGACAGGCGA:1 + chr3L 18658516 5' - invader6 435 1 72.28 CTTAAGTAAAGTATAAAATGAAGTATTGAGGCATTAAATAAAATATAAAAAAGAAAGAATGCGATAGTCGAGTTTCCTGACAATCAGATACCCGTTACTGA:1 - chr2R 2777424 5' - INE-1 548 1 61.39 CATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGTCAGAAAAATTATGAAATTTCGC:1 + chrX 15408740 5' + INE-1 514 1 88.89 GCCGTNGGCGAATCCCCTGAACTTGGGATGCAAACCTCCAAAAACCAAAATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTATCGTCCCTAGCT:1 + chr3R 11560594 5' + Cr1a 3994 1 61.39 TCCACAATCCCGACAAGGAGCGCGTGCGCAAAAAGGGCAAACATTGGGAAATAACGGCACAATATGTGGACCTTGTACCCGGGCGGGCCGTGCGCAAAAAG:1 + chr3R 19230277 5' + gypsy8 298 1 56.44 TCGCGTTCTCGTTTTAGAGTCTCTATAGGTTTACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAAGATTTT:1 - chr3R 2415924 5' + 1360 22 1 61.18 CCCGACGACCCTTGTTGCCGCAAATGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 22780994 5' - roo 357 2 78.22 CCACATTACAACTGATTGAATTAATCAGGCTCATTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTCCTCTGGGGAACCAGCCCATCGGAAAAGTTTTG:1 + chr2L 15191793 5' - R2-element 190 1 72.28 TCTATTTGCGAGCAGCTATTCGTTGATTTTTTTTTACAATCCAGTGACCATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAGAT:1 - chr3L 21143299 5' - FB 100 1 56.44 AATGGGCATTAATCTCCAACTTTTATGTTCATCCAAAGGTGGTGCACAAGAACCACTGGCGACAGGTGAGCCTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGA:1 + chr2L 7754423 5' + accord 7189 2 71.29 CATCCAACCGGCGTAGACCCCAAAAAAGCTCAAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATC:1 - chr3L 5643095 5' + 1360 3184 1 70.30 CACCGAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3R 7808938 5' + jockey 33 1 53.47 GCACATGGTTTTGCAATTCGCTTTTAGATTTCTTACACGAGCGGAAAGAGGGCAATTCTGGCCGTTACCAACGCAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATG:1 + chr3R 19325689 5' + 1360 3351 1 79.00 GAGCGCTTACATTTGTGAGCTCAGCGTGTTTCGAGTGCGATGCGGAAGCAAATTAATATATTCGGAGGGAGACAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCTTGAG:1 - chr3R 4966439 5' - Gypsy12A_LTR 2017 1 57.43 TATATGCATATGCGCTTTGGTTGATTTGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGCCGG:2 + chr3L 15023110 5' - gypsy2 96 2 73.27 GCGATCGGTGGTCAGCACACTGCTCTGGAGATTACTCGCAAATGTTGTTGAAATATGAGATGTGGGACAATGACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTT:1 + chr3L 12545181 5' - HMS-Beagle 6786 2 61.39 CCGCGCCTTCCACGCCACAACAATGAATGAGACAATTTCTTTTTCCTTTTTTTGTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1 - chr3R 20140614 5' - jockey 4969 1 59.41 TAAGTGTGATTCAGTGTTGCGCTCGACAGCGCGGCAAAATGTGCACGTGCTGCACCAGCCGCAAGGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAAACTAATT:1 + chr2R 22374444 5' - gypsy6 395 1 73.27 TGGAAAAATGCGGCAATCCAAGGGCTTGGGCTGTGGTGGAAAACATTTGAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2L 12963269 5' - hobo 2911 1 53.47 TCTATCGCTTTCTAAATTGCATTCACTGAAAAGAATTAAAATTTAGAAGAACGCGTAGAGTAACGATTATCCTTATTAGCACGAAGTGCGGACACAAGCAC:1 - chr3L 3253018 5' - 1360 466 1 79.21 CAGCATAATGAATTCCATAAATTGTGGTCACAAACAGTTTCAATAGACCAAAAAACATTAAAAATGTCGCAAGACAATTCGAGGACCGTCTCCTTG:1 + chr3R 30214518 5' + baggins 461 1 54.17 TTCTTTTAAAAATGAGCGTAGACTTTTAGAAAATGATTTTTTGGCACTGCACAGATATTAGCGTATGCACCAGACGTTCAAAACGGGAAAAAGAAAAAAAA:1 - chr2R 18140427 5' + Doc2-element 237 1 67.33 TAAAATTCGCGCGTCAGTCGTAAAAACATATTGTAATACCAACAAAGTTGCGACAAGCCATATAAATATAATACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTC:1 - chr2R 10221570 5' + jockey 4854 1 78.22 ATAAAGCAGCAACTTAAATATATCATTTCTTTGGTTGTTGCTGTCGTTGTCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCA:1 - chrX 9714486 5' + Cr1a 263 1 55.45 AATCTACTGAAAACACTCAAATTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATT:1 + chr3R 26532013 5' - Quasimodo 141 2 79.21 GTTTGTTCAACAAATAACAAATTAAGTAATAGCTTAGACTGTGTAGTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGT:1 - chr2L 19566832 5' + diver2 4598 2 61.39 CTAAAAGCAACAGCATCAAAAGGAATATGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2L 18286114 5' + 412 7079 2 53.47 GGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCC:1 + chr3R 14882078 5' - gypsy5 389 2 52.48 AGGCTCAGTTATTAGAAGTCATTTTAAAAAACACACTCTTGTACCAATATGATTTTTGATTGCGTTCGCTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTC:1 + chrX 17330480 5' - Porto1 4271 1 60.40 GGTCGGAAAATGGGAAAAGTCGGGGAAGTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3L 924672 5' - roo 9039 1 54.46 ATGCACGGAGGACGATTGCACAAGTCGTTGCAAACTTTTTGCCAAGCCATGTTAACTTAGTTAACTACTCCCCCTCAGAATTAAGGCCGCCCTCGGCCGTC:1 - chr2L 15188236 5' - gypsy6 7386 1 56.44 CCCTGATAGAAGCCCAGGAGGGCAGGCGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTG:1 + chr2L 7411013 5' - X-element 41 1 73.27 AAAAGAAAAGCCGTCCACTTTCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3L 15276625 5' + hopper 11 2 67.33 AAGGGGGCGTGGGCCTTCGAGTCACTGCACAAAACAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTG:1 + chrX 13168783 5' + Doc 4525 1 65.35 GGCGGTCAGACATTGCAAATTAAGCCCGCGACCGCGACCGTCTCGGCACTTAAGGGTGGAAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGG:1 - chr3R 26004474 5' + Rt1b 4925 1 59.34 ATACAAGCATGACGACATTTTTTTAATGCCACTGTCTTCAAAAGAAGAGTGAAAAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2 + chrX 12958878 5' + roo 8684 2 52.48 GACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chrX 12290644 5' - HMS-Beagle 6994 2 74.26 CTTGTGACAAAAGCGGTATCAGGCTGTAATTTGTGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 + chr3R 9193569 5' - roo 394 1 66.34 CTACAGCCATGCAGGATGGTTTACCGCCCAGCGTTGGCGCCGGGGATCAAGCCCTTCCACAGCAGCCGATATGCCAACAG:1 - chrX 22828815 5' + G5A 2600 1 66.25 ATACATTTACAAATAGTTAAATCTCTCGATGGATATCGTTTCCTCGGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATT:1 - chr2R 22847828 5' - roo 71 2 54.46 CCAATTTTGTTGTTGTTTTTTTTTGAGTCGTGTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCT:1 - chr2R 19070114 5' - gypsy4 326 2 68.32 TACGTTTTTTTGTCCAGTTGTTTGATTAATTGTGCACACGCCGCGTGTCCTCGCGCTGGGAAAAAAACAAAAAAGGGGCAATAAACAGCCGAGACACTGGA:1 - chr2L 3268488 5' - hobo 358 1 62.38 ATAGCACTTTCCATTGTCATTTGCGCCTCAACGTATGCTATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTCAATCTAT:1 - chr2L 6594288 5' + 1360 238 1 69.31 TTAATTAGTTTGATCATTTTTATTTTTTAAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAAGATCGGA:1 + chrX 1135583 5' + invader2 94 2 68.32 GGAGTGCGGACAAAGAAGATGCCAAACCCAATCAGCCACGAACGATGTGAGCCAAAATATGTATGTTTACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAAT:1 + chr2L 11826432 5' + Bica 108 1 64.36 CATTGTTCGAACAGTTTTCCCGCCGTGCGCTTTCGATTTAAAGGGCATTTTCCATCAGCTTTTGGCTTGGGATCAAAGGCGAGCTTAAGAAAGAAGGGCA:1 + chr3L 11912802 5' + gypsy7 5326 2 66.00 TATATTTAGATGTCGCACACCACTTGGCTGATTTCGGCTGGTTGGTGGGTTGGTTGGTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGCTAGCCACTATCTTTAAGGCAATA:1 + chrX 2332836 5' + BS3 1447 1 76.24 CGACAGCGCAAAAAGTTATTAAATTTTTATGCACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 776178 5' + 1360 4 2 71.91 GCGGCGTTCGAAACTTCAACATGAAAATAGAAAGAATCGAAGGGGAGAAGAAATGTAAATTCCGATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr2L 5152028 5' + I-element 10 1 68.00 ACTGCNACTGGTTTTATTCGGGGCTGTCCCTGAGGTTGCGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAAT:1 + chr3R 20663323 5' - invader4 358 1 68.32 GCATGCTTTCGGTTTTCACCATATGAAAAATGAATACTTCAAGGTCTTAGTCTTTACCGAAAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGTATAGACAGCCGAAAT:1 + chr2R 5065199 5' - diver2 4723 2 54.46 TGATCCATGGCAATCATGTCAAATTGATTTCGTCACGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTCGTTTTTACTCACAC:1 + chr3L 19166246 5' + 1360 3242 1 77.23 AGTGTGTTTGTATTGCGGGTAGACTTGGGTTCTACGCATTATTACAACGTTTGTTCTGCACATTAAGTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTG:1 + chr3R 4565295 5' + Doc 367 1 71.29 TGGCACACAATCTGCCGAGTCTGTGGAAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTT:1 + chr3R 25387994 5' - Quasimodo 7037 2 84.16 CTACTCTCTTTTCACTCAACACCAAGCGTAAGGTTTGATCTAAACCTGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAA:1 + chr2L 7086003 5' - 1360 3238 1 76.24 ATGTGGTGGCCACCGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3R 22352788 5' - 412 7509 2 59.41 TTTCCTCTTTAATCCTCTTTTTTATTTCTTCCTCTACAGCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCT:1 + chr2L 21013128 5' - invader2 464 1 61.39 AACAGCGCGTCACGCATGTGAGTGCGGGTAGCATCTTCACGAGAAACTCGAGAACTTGTGGTGGTGGTTTTGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGAT:1 + chr3R 22831509 5' - mdg1 7361 2 73.27 CATATCATGGATCCTATATGCGCACAACCTAAATCGAATCTTTTCAGCCCCTATCGTCGCAACAAGTAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGC:1 - chrX 11908755 5' + hobo 452 1 68.32 GGGGTCTGTTGTGTTTATAGGTTGTGGGGTTTGTGGAGTTTGCTGGGCCTCTAAGCGCATGATGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAA:1 - chrX 14537205 5' - I-element 5017 1 63.37 AATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATA:1 + chr2L 22689954 5' - Tabor 7294 2 57.43 CACATCCATTAGCCAGTTTTTCTTGAAAATCAGTTAGGGAATGACAACTCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAA:1 - chr2L 2893200 5' - HMS-Beagle2 6840 1 53.47 GATCCCGATTGCAGCATGGACTTGTCTGTGAGTTCTGCAGGATCAGCTCCCGCTGGCGATCGGAGTTCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTC:1 + chr3L 10092158 5' - BS 4806 1 68.32 AATTGAGCGGAAGTTAAAATGTTGGAAAAACAGCACTCAAATATTAAATATGATCCTTGTTTTGGGGTCTTGTTTTCCCCTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 13521029 5' - accord 258 2 69.31 TTCTCCACCAGCTTATGCAAATTATTTTGAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATGGTTGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCAGCATTTGACTTTATT:1 + chr2L 14079180 5' - G3 4357 1 65.35 CCCCAAGGATGGATTTACACGGAATCCACAATTAGACTTCCGGTCGCTAAACACACACATCTAAATGCAAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 19510425 5' + roo 29 2 73.27 CGGCTCGCTGACTAATTGCTGATTGAGTTGCGCCTGGGAATGGATTTGGTGTGCCAAATGATTATTATTTTTATTATTGTTATTAATGTTATTGTTATTAT:1 - chr3R 17529287 5' - mdg1 7076 5 49.50 AACTTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:2 + chr3L 22052746 5' - mdg1 410 2 68.32 ACTGTACCTGGGACGCAGCACTATAGATAGCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chr2R 10697096 5' - 297 6931 2 76.24 AAAAACCCAAATAAAAATTGCATATTATGTAAAGAGCGGCGGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGG:1 + chr3R 11274845 5' - F-element 460 1 58.16 GAGCGGACCGGCGAGTCAAAAATAAACCAACAATAAGGAAAACCAAATTAATCACAAATATTACTTGTGCTTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 + chr3R 8482917 5' + transib2 2 1 60.40 ATACATATTACATACGTACATACATATCTCGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2R 18511741 5' + 412 7080 2 71.29 CTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3L 22564825 5' + blood 38 2 67.33 AGGCACTGGGCTGCCGTCCGTCCGATGATCGGGGCTATGGTGCGCCACTGCGTCGGCATCAGAAGCTAGCTGAGGTTGAGCAGGCTGGGAGCGAGATGACG:1 + chr3L 360770 5' - G3 267 1 61.39 GAACTTCAGTTTATGAGTACATTTGTATTTATGTATGTATGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTT:1 - chr2L 10377219 5' - 412 173 2 69.31 TTTTCGGGGTTTTGGCTGTCGTTTTCCGTAGGTCTTTGTGCTTTCGGTGCCTCTGTGCGAAGGTATATACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 - chr2L 9856327 5' + HMS-Beagle 6801 2 72.28 TGGGAAACTCAAATCCACTCCTACTAGGATGCTATCATTTCAAAACAAGCTAGCTCTCAAAGGTCTCTCTTCATTTCATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTC:1 - chr3R 14162715 5' + Idefix 394 2 50.50 GGTGCGCTGTCAATATAATTAACTAAATGAAAAGAGAGCCAAAGCGTGGTATTAAGTTGCAATTATGTCGCCAATTAAGTAACAATAATAATAACAACAAG:1 - chr2L 7869720 5' + mdg1 7059 2 76.24 CCAGCNAGCGGCGACCGAGAACCCCGAAACAAAGACCCCAGCCCAAAATGAGGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 6672941 5' - roo 9027 1 57.43 ATTTGTTATAAAAGTTAAATATATAAATAAATATGGAAAGTAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATATGAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chrX 14625444 5' + invader4 2759 1 80.20 TGACATATCAAATTTTGATCAAATGAACAAGTCGTCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAG:1 - chrX 22872469 5' + INE-1 167 1 74.26 TCAAAGAACAAACACTACAACTTACCAACAAAGCGTTGACTGTTTTCTAAATATTTAAGCAGGCCCAAGACAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCT:1 + chr2R 15074305 5' + I-element 5087 1 72.28 TATCAGGCACCTGCAATTCTCCCACTCGCACCTGGAGGCGCTCAAGGACAACAGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAG:1 + chrX 22867887 5' + HMS-Beagle2 210 4 52.48 ATGCACATTGTAAGCGGACATTTCGCGTGGCACTCGCGCAAATAAAGATACATTCTGTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGT:1 - 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Chouto 493 1 53.06 CAATGAAAAAGCCAATAACCTGGATTATCTGCGCGAAAACGGATTACAACATATCCAGCCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCA:1 - chr2R 5454000 5' + INE-1 568 1 52.48 ATTTCCAGTATCGACAATAGAATTTTAATTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2R 8557853 5' + hobo 50 1 81.19 GTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3R 14913171 5' + blood 39 2 70.45 ACAGGTCCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAATCTA:1 - chr3R 3586565 5' + INE-1 151 1 58.42 CCTACCCCATCTTCAGTTCTCAGTTCCGCCCACCAACCACCACCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCT:1 + chr2R 12540327 5' + F-element 322 1 57.43 CAATTTTGAAATTTAAATATCTATTGTTACTATCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 1270832 5' - roo 9026 1 71.29 TGCAGCGCCAAATCTGCAAACCAAATCCAACATATACATCCCAATACAACATACATTACTCCAGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTA:1 - chr2L 14963230 5' + Idefix 6926 2 72.28 AGCATGTAGTCCGGATCCTCACCCACCGCCACCTTAGGCATGCCACCGACTGCAATACCTCGTGTTGATTCTTTCAAATCCGAAACTTCTTTAAAGGCGTT:1 - 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chrX 4047950 5' - 17.6 64 1 66.34 TATTTATAACTTTTACTTAAAATGCGATTTAGTAATAAATGGGCATTAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chr3R 19198119 5' - pogo 2074 1 63.37 AGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3L 22052766 5' - mdg1 391 2 56.00 AGCTGTGACGATGAACAAGCCAGGAACCGTGTTATTGGAGCTGCCAGTCAGTGTGCCCTGGCTCCAATGCATCACGCCATAAACCCATGGTCGGCAAGCCG:1 + chr3L 8564679 5' - gtwin 7089 2 60.40 CCTACGCAATAGTGATGGTGCAGTTGGAGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAG:1 + chr2L 15476934 5' - jockey 4685 1 72.28 CGGAGGCCGAACAGTGGCAAAACATTGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 28623945 5' - roo 9020 2 77.23 CATCAGCTAAGGCTATGGCCGAACCAACTCCAACGGCAACCATGCCCATCTATGCGCAGGTGAAAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATGAAGATCAATGT:1 + chrX 21353374 5' - Ivk 101 1 59.41 TTTGTATAATTTCCTTGAAGGTCTTAAAGCTCTCAGTTATCAAAACTTAGTGCCATACAGGAAGTCAGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGA:1 + chr3L 16265995 5' + Burdock 6141 2 72.28 CAAGTCTGATAGGCAAATCAACATGCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTAG:1 - chr3R 24952080 5' + McClintock 6116 2 77.23 AACTTCCAAACACACTCACACTCAAGCAGGACTCTGCAGGACCTACACATATGTATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chrX 14424109 5' + hobo 8 1 61.80 ACAGCACACACACACACACACACTCGCAGCATTGCACTATGGGGCTTTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chrX 11441772 5' + hopper 20 1 58.67 TGGGCNGTGTGACCATGCCAGGCATCCGTATAGAACTGTTTAAAAGGCCTGCGGTGGCGACTTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATT:1 + chrX 855290 5' + blood 169 2 72.00 CAGCGGAAAAGAGTTAATATAGTGGAAAATGGTATGAATCCATTAGTCGTGCTATAGAAAGCTTAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGG:1 + chr2L 12125253 5' + flea 4706 1 66.34 GCCCACTGCACGCTGCGTGGCATCAAAATAAATCCAAAAATTAACAAAACATGGCCATTGACCGCGAAATCGGTGGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATG:1 - chr3R 32015459 5' + Tc1 451 1 73.27 TGTATAAAGTGTGTGCGTAATTTTTATTATGTGTTATGGCAAGAGAAAAAATTAAAAAACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2L 15119117 5' - 1360 6 2 64.36 CATCAACTAATTGACTAATTTATGCAAGTCAAATAAATGTCATGTCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 15997945 5' - 412 7516 2 57.43 GATTTGGGTGATAACTCTGCGGCAACCCAGGCGCAGATCGAAATTCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 17788888 5' + roo 8672 2 65.26 TCGCTTTTTACATTCTAAATCACATTTTTTTACAAATTTACAAATAACAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATA:1 - chr2L 12242054 5' + invader3 29 2 56.44 ATCTCTACCTATTGCAGCTGGTCTATCTGTATCTACTCAATCCACTTCATCTGTTCCATGTAGTAGCACATCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCA:1 - chrX 15164385 5' + Doc2-element 410 1 76.00 AGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 14582880 5' + roo 51 2 77.23 ATGAATATAAAGGGATCGTTGAGTCTCGTTCAACTTCGCGAAGGTGTCTTAATGTATCACAGAAACGTATATATATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGT:1 - chrX 22841494 5' + INE-1 91 1 74.26 AAAGGTCATTCAATTTTCGACTGCCGGCAATGGGGCAATGAGGCTTTTCCTGCGTTTTCACCCGTTCTCCCGCCAGGACACCAACACACACACACACACAC:1 + chr3L 10185806 5' + accord 254 3 63.37 CTTGTTTGCGCTGATGTTGCAACAATGACGCGACACAAATGTACTTGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCGAGTAACTGCTTGGCACGCGCCAT:1 - chr2L 5476616 5' + invader1 35 2 68.32 AAAATCTGGTTTTTGGTTTTGTAAGCCGGCCTAACTTCCATTACAGTGATTAAGAAGACTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGTC:1 - chr3L 2296666 5' + Burdock 6096 1 62.38 AGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 9996407 5' + blood 53 2 74.26 TGTATACGTATGTATATGTATGTACATGTATGTTTCTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATG:1 - chrX 17678734 5' - Rt1a 5022 1 68.32 TAAGACTGAAACAACGTAAAGTTTAAGTTAAAGTTTAAGTAGTCACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGACAATATTGAAACTAAGTTTACCCTCGAGCAATG:1 - chr2R 21995569 5' - gypsy 7181 2 59.41 TCTGCGAACCGGTTATCATTTTGTTGGCAATTAAACAAAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACAAGATAAACCAGCACTCGAGTAGATACCATGATAG:1 - chrX 22527440 5' + X-element 4405 1 64.36 CCACACCCACCGGCTGAAGGCCACGGGGCAGATATGGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTCGCT:1 + chr3L 8143326 5' - R2-element 3234 1 64.36 TTACATCTCTGCAAGGAGTTTCAATTACCAATCCATGTGCCTCCATTGGGCATCAATATCGGCTTACACACTTCGATATTAACTGGAGCTCTGATAAAAAC:1 + chr2L 10609653 5' - Porto1 28 1 74.26 GTGATTTTTATTAATGTATGAGCTGCATATACCTTTTTAGTATAACTTCTTACTTGATCTCTTCTTCAGTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATC:1 + chr2R 15299455 5' - I-element 356 1 74.26 CACCCAGCATTAACTAGCTAAATGGAAAATGAAAACAAGTTATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCACCGAACTCC:1 - chrX 12789282 5' + G5 4645 1 59.41 TTTATATGCACTTATATGAACACTTACATTATCATCGTAGTTGAGGCTATCCTTCCACTGCAGAAGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chrX 20475554 5' + 297 6613 2 72.28 GTTCATAGATGCCATGAAAAGTGTGCAAATCAATCCTATGAATTATGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACT:1 - chr2R 11575193 5' + INE-1 141 1 73.27 AAAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCGAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAAT:2 - chrY 1076856 5' - INE-1 86 1 69.31 GGCATNCCCGGCGTATACGCAATGTTTAACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chr2R 8198553 5' + F-element 17 1 70.30 CTCCGGGGTATATTGCTCCGTTTCTGTTGGTACTCCATTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCG:1 + chr3L 7958651 5' + F-element 4503 1 68.32 TGATGAGAGCCAAAGCCAAAGTCTTGGCAAAAAGTTCGTAATTAGGATGTTCTTCTTTGACGTCTTGTTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGGCAAATCTA:1 + chrX 1115541 5' - diver 464 1 53.00 CAACACTCTCTGATCTAATGTTATCTGTACTTGTTCCTTTCCAACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAA:1 + chr2R 9527199 5' + F-element 386 1 57.43 GCCAGGTGAAGCAGCCGTGTTGGAGCAACTAATTCCTAAATTGTAATGCCCAAAAACTACCCTAATATTTATAATTTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATT:1 + chr2R 14728138 5' + 1360 3166 1 66.34 TAATGCCTAATGCTATGATTTAATTAATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACC:1 - chr2R 21092003 5' - 1731 4578 2 75.25 GTACTCTCCTATGTACATATGTACACCTATGTACTTCTAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCC:1 + chr3R 17008736 5' + invader2 240 2 63.37 AAATAACTCCTTGCAGCAAAGTGAAAATGGGACAATTTTATACGAGTCAGCGTCATAGTCATAGTCTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATAACCTTG:1 + chr3R 11206505 5' + Stalker3T 340 1 69.31 TCGCGTATCATTGTATAACGTATATTCAGAATGTGCCGGCGTTTGAGCCAGGATACGTTTGAGTACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATA:1 + chr2R 21123416 5' - Transpac 431 1 37.00 CCAATNACGAATTCCAATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTT:1 - chr3L 10464693 5' - invader3 239 2 67.33 ATTTAAATTTCCTGGCCTAAAACAAGATTATGACACTATCTGAAACTCCACCCTAAAGGCACTACCGAGATCTGCGATACTCTACATTACGTTTTTATTCA:1 + chr2L 17826798 5' + BS3 314 1 68.32 ATGCGCCTTGGCTTTTGTGTCTGCCCCTTTGCTACATTGTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGTTTTTTCACTTGATTTTTTTTTTT:1 + chrX 9733891 5' - Porto1 170 1 57.45 GGCCAAAAGGGCACTTCACATCGGTTTACCCTGGCCACATATACATACACACACACAAACTTGCATTCGAAAAGATGACGAAAAATAAAGAGGAAAATAAA:1 + chr2R 19107151 5' + Doc2-element 250 1 52.48 GTGGGNTCACCGGGTGACAAGCACTCGTTATTGATGCGCCCCCAAGCTGCCGTCACTTGGCCGTAAAATACCAATTGTTTTAATTGAACATTCTCGTTGAG:1 + chr2R 23285485 5' + gtwin 319 2 59.41 GAAGCAAAGAGGCGGGCATAGCCGACCCAAAAGATTGGCCAACCATGCAAATTATATCCAATTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTT:1 - chrX 11680633 5' + I-element 237 1 68.32 GAATGGTTCTGAAAAATGAGAAATATGCGAAATGTACTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chrX 15384805 5' - 412 458 2 59.18 ACTTCTCGCTTTTCCCTCTTGACATTGACCTTGGGATGTGCCCTGCTCCACTTCGAAGCTCAACCGAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATT:1 + chr2R 6509736 5' + HeT-A 5952 1 73.00 GGAGGATGAGTCAGAGGGAATAAGACGATTAACAAGAACACGCAGTGCACGGTCCAAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATG:1 - chr2R 1687578 5' - 17.6 161 2 66.34 TAGGAGTGAACACTTACGTGATGATTTGGCGGTGAAGGTCAGGCCATCATCCCAATCGTCGCTCGGGCCAACAACATTATTACTACTATTATTGTTATTAT:1 - chr2L 21125435 5' - mdg1 29 2 75.25 AGGCTGTTGACCAAAATCACTTTAAGCGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chrX 6283703 5' - P-element 2866 1 59.41 CCCCAAGGATGGGAAAAAAGAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3L 776097 5' - 1360 3356 1 60.40 GTGTGTGTGGGTGCGGTTTGGCATCTGACGGCTGCCAGGATGGCAAACACTAATTTGCATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCA:1 - chr2R 19221304 5' - Quasimodo 12 2 66.34 GTATGGAAAATGATAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCCTGAGA:1 + chr3L 20762663 5' - INE-1 152 1 50.50 GTTTTCGTTACTCTGCGTATGCTTAATATCTTAGCAAAAGGCCCATTTTCTAAGAGAGAACGCTGGAGTTGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTC:1 + chrX 848797 5' - INE-1 549 1 90.10 AACGCTTTGATGGAGTACTAACATCGTCGATGGACGGCTCATCTTGCTCATTAGTGTTCTCGCCGTTGTCATCTTTCTTATCTACCGTCTGAAAGCCAAAC:1 + chrX 15686275 5' + gypsy10 5572 1 75.25 CGGCCACAAAAATGCTTATCGAACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTTTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCG:1 - chr2R 14802444 5' + gypsy6 416 1 76.24 CGCCAGAGAGCAGCCAAACGGCAGCTAAATAGAATAAAGTCCAAACCAAATAAGCAAATTTTATAATTAATCTTAAATTAACAGAGGTAGTAGTTATCCAT:1 + chrX 777018 5' - G4 3770 1 54.46 CTTTTCCAATCGTGAAATTTCCTTTACACTGCAGGACGATATGCTACACTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTC:1 + chr3L 8343204 5' + F-element 445 1 52.48 ATTTCAAAACAAGTCTATTAGTGAGTGTATTGCTGATTCGGCTTGCTCTCCAATGGAGCAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGG:1 - chrX 2254397 5' + Tirant 221 2 67.33 TTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGGATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTCAACAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTC:1 - chr3L 23909059 5' - INE-1 173 1 67.33 AATATAGAGCATATAGAGCCCGTTGGCCGCCATCCCCGTTGCTAGCTCCATTTTATGGTTTATTGAACCGCAAAAGGCGGCAGGAACACGCACACACACAC:1 - chr3R 14914782 5' + accord 7025 2 56.44 TAAACCGTTTATAATAAGACAGGCAATATGCCGAGCCATCGAGCCAGGATCTTTCTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATAGAGGAGGAGAGCTTTGCACAT:1 - chr2L 2320223 5' + baggins 5220 1 58.42 AAGGANCGAAAGTTTGTTTTATTCAATTGATTATTTTTGTATGCAAAGAACTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr3R 14913227 5' - blood 352 2 52.48 CGGTATCACACATACATATGTAGGTTAAGCACCCTCTTCTTGCGTTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chr2R 18891092 5' + opus 42 4 77.65 AGCAGCAGCAGCAGCTCCATCAGCAGCAACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTACGTTCGACGCAACACACGCACA:1 + chr3R 24241686 5' + Bica 4625 1 70.00 TCATAGGGATATAGGAACTCGTCGTCGCAGTCGGCATTCCTGTATCGGCGGTAAATGGCCTTCTCCACTATCCAGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTG:1 - chr3R 12410850 5' - roo 155 2 77.23 TTTGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:2 + chr2L 6605550 5' + blood 7035 2 55.45 CCCTTGATGCATTCAACAGCATCGTGGACGATGCAATATTCGAGGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAG:1 + chr2R 4656679 5' - HMS-Beagle2 139 2 56.44 CCTTGAAGGTCTTAAAGCTCTCAGTTATCAAAACTTAGTGCCATACAGGAAGTCAGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 + chr3L 16266007 5' + Burdock 17 2 60.40 ATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chr3L 27415293 5' + transib2 38 1 62.38 CTGAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGC:1 + chr3L 15056315 5' + BS 5030 1 77.23 AGTGANGTGTAGAGAGCGATGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTCTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGG:1 - chr3R 16295296 5' - Doc 4423 1 78.22 TAGATGAGAAATGGAATACGAGAAACCGAGCATTTAACAGCTCCATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3L 16138916 5' + P-element 34 1 27.72 GCAGAAATAAAACTGCTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr2L 17862290 5' + F-element 10 1 75.25 GCTCCCCACCCACCAGCCGTCGCATTTTGTCGTGTTTTTAAACTAGAGACAGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTTTCCTGAAGCAGCGCTCAC:1 - chrX 21456089 5' - gypsy4 157 2 67.33 CTTGTCCTGGAAGAATTAGAGAAACAGGCATGAATACACTTGCAAGTCAGCATTTATTATTATTCATTAGTCAGTAGGAATCGTTCACTTCCTTCTGAACT:1 - chr2R 25063218 5' - G5A 2801 1 54.46 GCAGCTGCAGCCACATTATTATTCACTTCATCCAGCTTGGGCTGGCGTAGGCAGTTCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCT:1 + chr2R 21320291 5' + R1A1-element 5071 1 66.34 CGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATAT:1 - chrX 9023561 5' - blood 7165 2 91.49 ATTTANACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCGATTATCA:1 + chr3L 27593 5' - INE-1 563 1 57.43 GAGCATACGCAGCGTTGTCCGTCCCCCAGTCAGCCGGTTAATTACCGCCAAGCGAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAAT:1 + chr3R 31322170 5' - flea 490 1 65.26 CAATGTTCGTTATGACCTCCGCGCATTGTTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 + chr3L 9250491 5' - mdg1 336 2 71.29 CCAAAGTCAAGCTAGAAGATACAACAAAAACAGTACGGGCACCGTAATTCAAACGTCGAACACGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCC:1 + chr3L 14440406 5' - R1A1-element 5008 1 62.00 ACTTCAAAATGGCGAAGCGAGTCAAAGGGAAAGTTAATTGAAACCAAAGGAGTGAGAGAGTGGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGAT:1 + chr3R 8685248 5' + I-element 432 1 67.00 TAAACGTAAGGAGAGCTGCTCTGCCAAGTGTTTTGTGTTAGTGCTTTTGTGTAACGGTCTGCTAACTGGAGCGGCGATTTTAACAATCAAATTTAAAAAGC:1 - chr3L 14536022 5' + 1360 3006 1 71.29 TCTTANTTTTTGGGTTTCATTGAGTTATTATATGCATGGAATGATACGGATAAGACAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGAC:1 - chrX 16760593 5' - R1A1-element 5190 1 58.42 CTTCTTGTTGTTTTGTGTCGCGGCGCACGTGTTTGAACGGTAGCATGTGTCAGGCAATGATAGGTTGCGGCATTGGGGAAGTGCACTCTTCGCTCCAAGAT:1 - chr2L 18724155 5' - Doc4-element 165 1 70.30 AACAANTTCCTGCAAGCTCGTTAAATAACCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATT:1 + chr2R 5616569 5' - 3S18 292 2 70.30 TAGCGATCTGTTTTGCTTGGCGCATTGTTTTGGGAAAGTTTGAAAGTGCGGTTACAGCATATGGGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTTGTGGCG:1 + chr3L 15233888 5' - invader4 366 1 70.30 ACTTTTTCGCGTCATGTTGTATAAGCTTGTGTGGGTGCATGCGTGAGTGTGTGTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGC:1 - chr3L 8031716 5' - accord 7006 2 73.27 GGGGCGGGATCAAGGAGCCTTTTCAATATTTTTGGTCAAGTTGTTTTGTATTGTTTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAA:1 - chr2R 14586441 5' - I-element 5160 1 65.35 TTATGTGTCATGTGTGCGCTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr3R 19535665 5' - hobo 2934 1 74.26 CTCCATTTTCATTGTACTTAAAAAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTT:1 + chr3R 25296843 5' - gypsy4 6610 2 77.23 GTTCGAAAGACAATCTACGTGTAACGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTT:1 + chr3L 1659036 5' - R1A1-element 37 1 76.24 GCAAANTTGATCAATTTCAGATTTCGACGAATCTCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGTGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCT:1 + chr2R 12451649 5' - R1A1-element 253 1 41.58 TCAGTNTAAAGTTTCACAGACGAGTGAAAAGCGGCCAGCGTGCCAAAGTGAATTTCAAAATGGTTGGACAAGCTGCAATTTTACTGATATCATACTGAATC:1 - chr3R 9832888 5' + Tabor 7270 2 76.24 TAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAAT:1 - chrX 1018154 5' + 1360 199 1 71.29 TGACCTCCAGTATTTGGACCAACTAATGATGTAATCTCTTTTAGCCCACTTTTCACACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAAGAGTAGACA:1 - chr3L 7889173 5' + Circe 176 2 61.39 GTCAACGCGCTAAACCCAAAATAACCAACAACAACGGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTA:1 - chr2R 20360828 5' + F-element 474 1 74.00 GCAGGTGAGGTAGATTGCTGGTTTAATGGTTGTCCAGTCGTTTAACGTATCTCTCGCTGAAGCGGGAGATCTCCTCTGCTACCCATGGCATTCCAAGCTCC:1 - chr2R 4585277 5' - G-element 4041 1 74.26 AGACCNGTTTGATCGTATTATGTCTAAAAGATTAGTAAAATATTGATCTAAAAGAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chrX 13854512 5' + pogo 19 1 59.41 GCATAAAGTACACAGAGAAAAATTATGTCAAGAGTAAAAGAAGAGTAGAAGAAAACTATGGAATACTTTCAATAACTAATAATACCAATAATAATAATAAT:1 - chr2L 19398871 5' + mdg1 30 2 79.21 TGTTACTTAAACATTTTTGATTTAACTGAAAAATTCTGTTATATGCATTGTATTTTTTTTGCAGGAATGTTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTAC:1 - chr2R 6247339 5' - roo 402 1 73.27 GCCTTACATCTGAAATTACGTATTTGTATACAAAAAGCAGTCCTATCAAATTCAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCAC:1 + chr2R 21239371 5' + jockey 25 1 51.58 GGGGGTGTGAAAACTTTTTAATTTCTTCCCCCGGCTTCTTCTTTCTCTCCATTACCCCACTCATTTATTTCCCTCGTTTTCTTTTTCTTTAATTTATTTAT:1 - chr3R 22096313 5' - X-element 4717 1 73.27 GCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 + chr3R 25796003 5' + BS 5012 1 58.42 ATACGGCTGGACTCAATAAATATGCCGGGGAAATGAAAATAAGAAATAAAATACAAAACAAGAGCAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCA:1 + chr2R 11804801 5' - INE-1 556 1 65.59 TTTAGCATGTTGTGCGTTGCACTTTGGATCTCCTTTTTGTTACTTAACCATGCGGGTGGCAAGGCGGGGTTGAAAGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCT:1 + chrX 15260268 5' - jockey 4755 1 62.38 CCCACCAAGGACATCAAGGAACTGTTCGGCACGAATGTGGTGGCCACCGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr3R 22352754 5' - 412 490 2 73.27 ATAGAAAAGCAATTGCATATTTATACATATTTGTATTATTCATTTTATTATACTCGTTTCACTCAGAATTGATTGGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr3L 1715571 5' + Doc 12 1 69.31 GCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3R 22352802 5' - 412 442 2 73.27 CCTTTGGAGCAAGGACAACGAGTTTAGTTTGCCTTTCGCCAGCGGCGCCATTTCGTGGGACCTTTTGTGCGTCGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTT:1 + chr3R 27809644 5' + Cr1a 244 1 70.30 GCGGATGCGGGTGGTGCGGATGTGGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGC:1 - chrX 15311158 5' - accord 142 2 76.92 AATTAGCCGATGACACAGAAGTTTCACATTGGGCGGCATATCATATATCCGTATACAGACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:2 + chrX 5151908 5' + Quasimodo 12 2 68.32 CAATTGCCCGGCTGACCACCACCGAACCACCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAG:1 - chrX 7563109 5' + F-element 429 1 56.67 AAGAGGCGTCAGACAAAGACAATCACGAAAAGGATGTCCAAAATCAAACAACAACCAACACGGCACTGCAAACAACGCACACGAGGGAGAGTAAACAAAAC:1 - chrX 14028793 5' - Cr1a 210 1 59.41 CTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 9193605 5' - roo 9021 2 75.25 CACGTGAGTATCAGCAGTAGCAGTTGAGGCGGAAAAACCCGGCAGAAAACCCCTCTGACCCTTGGGCTTTCCCACTTTCCGCAAGGTATTCACCACTCCGC:1 - chr2R 7245203 5' + Max-element 8367 1 79.21 AAGCGCTGGCAGTGGAATATTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGAG:1 + chr3R 26241529 5' + jockey 349 1 78.22 CCAATGCGTCCCGCTCCTCCCGATTTGATAAATGACCACCTCGGCACTTAGCACGTGCTCTCAGTCAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAA:1 + chr2L 13062188 5' - opus 7119 2 67.33 TAACAATGAAAGCAACGTTTTTGTCATCCCTCCCTTACCATTTTTGTAAAAAAAACAGGCAAAATGCCCC:1 + chr3R 32032784 5' + hopper 1408 2 58.57 ATGGGGCAGATCTAGATAGGGAAAAATCTGGACTAAAGCGTGATTAAAATTGAAAGGAAAATCAGATAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATT:1 - chr2L 2619419 5' + Porto1 4508 1 64.36 AGCGCACTCGCCTCTCATCAGCTTTTCGTCCTGGCCAAGTTCCGTAGCCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTT:1 + chr3L 7217798 5' + HMS-Beagle2 6822 1 56.12 CGACGCAGCGTGTGATTGCCACTTTCCCTCTGCACAAAATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCTCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACAT:1 - chrX 15364030 5' + baggins 5220 1 72.28 CTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2R 9870964 5' - roo 395 1 65.35 TGGTCGTCACTGCTCGTTGACGTACGTACGTCTCGCTCTGGCACACGGCCATGCAATGGCGCCACTCTCGACAGCTGTGAGAAACTTATTGGTGGTAGTCA:1 - chr2R 8030998 5' + R1A1-element 225 1 77.23 GATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr3L 22052782 5' - mdg1 374 2 72.28 ATTTATGCCCACATCATACCAATGTATTGCAAGATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1 + chr3R 4579226 5' + Quasimodo 18 2 60.40 CGTGGATGTCGACTTGGTGTCATCCGTTGAGGCAGTCGCCGATTGCTTTTGGTTCTTTTTCGTTTTTTTGTTTTT:1 - chr2L 2631738 5' - Doc2-element 230 2 66.67 AACTTGAATCGCATTTTACTGTCATGATGAACCCATAAAAATCTATTTAAATTTAATTTTAACACAAAAGAAGACTTAAAAGATTTCATGTGCTAGATCTC:1 + chr2R 20549144 5' + G4 3692 1 52.48 ACCAAGACGAATCACAATGGAAATCACATCCTGGGAAACTACCGTACATACGTATATGAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chr3R 24597251 5' + HMS-Beagle2 482 5 63.16 GGAAGTTTTTCGTTACCATGAATCCCGTTACCCATCGGCTTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGG:1 + chr2L 2975135 5' + R1A1-element 4896 1 79.03 CTGAAGGAAAGTGAATTCTACTGTGCATTTTAAATAATAAAATTGGATTATTTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr3L 7602013 5' - opus 7481 2 55.45 GGGAATAACATTTGGTTAAGCACAACGACGTTGGAAGTTCCCTTTATTTAGAAGATGAACATTTGGGCATAGCACAAGAATACAATAATTTAAATGCATTT:1 - chr3L 18342207 5' - Bari1 313 1 64.36 ATTTTATGCGACTGCAACTGCGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCC:1 - chr2R 18890744 5' - opus 65 4 79.21 CCTGCCATTTCGCGCAGTTCATTAGTGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 + chr2L 1380295 5' - transib2 2801 1 50.50 TGGAATCAAAGTCGTCGATCTCCTGGCTCCATACGCCAAAGGTGGTGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAG:1 + chr4 1033381 5' - G-element 4141 1 61.39 AGTTGAAAAAACAATTTTGTGAAAAATGCCTTTAATGGTGTTGTTCATTATTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 21792235 5' + roo 8690 2 56.44 TGCATNGGAATTAATTTGCCGAGAAGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAAT:1 - chr2R 16111190 5' - BS 4723 1 75.25 AGTGGCCGCCGGCCATGCGAGTGCCGATTTGGAGGAGTCCATCAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTC:1 - chrX 11708467 5' - jockey 4732 1 57.43 GTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2L 11240893 5' - roo 9033 1 70.30 AATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCA:1 + chr3R 26331659 5' + G-element 49 1 68.32 TTGGGGCGCATGAGCTCAGCCAGCTGAGAAGCGATTCAATTCGATGCGATGCGATGCGATCATAGCCAGTGGGGCGTAAGCATTTTTGACCCTCTGGTGGA:1 - chr2R 11188368 5' - Quasimodo 335 2 77.23 TCAGTGTGTTACATTCGGCCGTAATGGAAACGCCCACGTAAAGATCATCGTCACGATTCTTAAGGTAGCAAACTGGATGCGAGCAATTACAGAGGAATCTT:1 + chr3R 23762115 5' + Q-element 101 2 67.33 CGAGTACAATCTCATACAGAAAATCGACTCGAACAGCACACTCACTGCTCCGGCGCAATATCAACCGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGAT:1 - chr3R 8865077 5' - McClintock 117 2 71.29 TTTAATTTACAGAGAGAGAGGGAGCGAACTTTGATAACTAAGAGTAATATGTGCATCGCAGCAGTACCGCTGTGATCATCACATAAAGTTGTCTGCTATCA:1 - chrX 4759148 5' - 1360 161 1 55.45 ATAGATTTGTGCACTTCCGTTGTGCGTGTGCTGTATCTGCTCCACCGGACGGGGCGTGGCATGACTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTCATCAAGAATAT:1 + chrX 13829636 5' - INE-1 84 1 59.41 AACTTTTACGAGTGCGTGCGATATTTTACGACTTTATTAGATGTCATGGTAAATATGGGATAGGAAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAG:1 + chrX 7542951 5' - Cr1a 3972 1 62.38 CCCCTGTAAGCTTGTTCATTCATATACACACATACATACATACATACATAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAA:1 + chr2R 21712137 5' - McClintock 171 2 54.35 GTTTAGTATTTTGTGCCGGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr2L 18788837 5' + 1360 25 1 79.69 TTCCGTTCAATTTTATAGCATTTGACAACAATTTGCGAGGCTTTTGTTACTTGTGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCA:1 - chr3L 18661807 5' - Quasimodo 6924 2 56.44 CCAGATCGATCGATCGTTTGGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTTTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATT:1 - chr3R 21783697 5' + diver2 235 2 76.84 AATCCGATTCGGTGTCGAATGTGCACGTTTGGCCCGTAATAAGTGGCTACACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chrX 16619685 5' + opus 23 2 56.44 TGCGCGTGCTCTCTTTGCTCTGCCGAGAGCCTCTGCCGCTGGCGACTGCGACTGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGT:1 + chrX 13640292 5' - Cr1a 4206 1 55.45 AAGTTTAACTTACCTAATATTCCAAAGAAATCATTCAAAGATTCCAAAGCTAATGCTGAGCGACGTTGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTA:1 - chrX 4799251 5' + G6 1685 1 72.28 CGATAGCGCGTTATCGAACGATACAGTCGCGCTAAGTTCGACCAGCCCTAAAAGTTTTAAATCGCATTGCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCAT:1 - chr3R 7643722 5' - R2-element 3257 1 74.26 CTGTCCATTTGAGTGGTCATTATAGTAAATTTGCTTTGATATTTTTCCATAAGTTCTGTGATTGCGTTGATGACTGGTAGAATATTTAAGTCTCTTTGGAT:1 + chrX 14120252 5' - F-element 4388 1 70.30 TACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2R 18891043 5' - opus 7474 2 59.41 CGGTACAACCGATTTGGTAGCAATCGGGCCAAAGCCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCA:1 - chr2R 17609352 5' + G2 2902 1 63.83 TTTTTCCCCTCTTTTTGGCTGTCGCAGTCGCACTCTCTGTGTAATCCGAAATCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGTGAAAAAGACGCTCTATGTGATGCA:1 - chr2R 13336087 5' + F-element 124 1 55.45 GGGGTTAGCAGGGCAGTAGAGTCCTCTGCACATTTTCGTAGGTCGGGTCTTGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGG:1 + chr2L 16129166 5' - F-element 296 1 68.67 CAGATNGCGACAGGCTCATAAGCACATAAATCAGCAAACTTCATTAACACGACTGCCAAAATCTACGAATATAAATCAGCAAACTTCACCAACATCAATCC:1 - chr2R 22151561 5' + Chouto 6182 1 75.25 ATGCTTTGAAGTGGACTCGCATTGTGGCCAAGTTAATGAAGTGGACATATCAGTTAACAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACG:1 - chr2L 6241946 5' + Doc 259 1 59.41 GAACGAAACTGCCGTCCGAAGGACTCGTTGCCCCCACAATTTGGCTCAAATGTGCTGCACACAGTGGTCGGTGCTTCAGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 13312351 5' - accord 188 2 68.32 ATACGCAATGTTTAACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr2R 8198539 5' + F-element 31 1 57.43 TCCTATAAAAATTCAAAGTTCTTAGATTTGAACATCCCAAATTATTTACAGGATTTGCAAGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 - chr3R 28012594 5' + diver 19 2 53.47 ACTCGGATTGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 - chr2L 20840522 5' + Transpac 7 2 74.26 GTGTTTAGCACAAATTCCGCATGAAATTGTATGGATACATATATATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2R 22740025 5' + Transpac 4943 2 55.45 CTTCCTGCAGCGCTGTGTCTTTTAGACAGCTTTTATCCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATACACTATAAT:1 - chr3R 28723224 5' + G5A 2734 1 66.34 ATCCCACATGCCCAGCTGTTGGTACATCTGTTTGAAAATTATTTTTGAAGCCATGCATTTCGAAGGAAGTTAGTTCTAGAAGGTTAGTGGTTGTTGATCTG:1 - chr3L 2232127 5' - Q-element 228 2 77.23 CATTTCTCTGGAGGTTTGAATATTGCTTTTCGCCATGGTTTTCACCAACCTATATATCTCTTTTTCATTTTTTTATATTGCAGGTACATGTCTAAAGTTTT:1 + chr2L 8603872 5' - mariner2 806 1 71.29 CCCAAGCCATAATATCAAACCGAGCAGCCCTGCCTGCTGTTTGTGCCACCAAAGCGAAAAATATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAA:1 - chr3R 20224185 5' + HMS-Beagle 6648 1 61.00 TATACAACGATTTGATAATAGAACTGTAGTTTCATTCTGACTTTTACGTCGTTTTTAATATTATGTATTTCTTTATTGTTTATGTAAGTGTGTGTCTGTGT:1 + chr3L 10122423 5' - Quasimodo 39 2 65.35 GTATTATTGGGAAAGCTAACAAAGATTTTTATGTCTGGTTTAAATGATTTTCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTGGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAT:1 - chr3R 10490418 5' + transib2 22 1 57.43 GCTATGAACTTGACAAACGATTGCCAGGAGGTAGCATCCAGAGTGATCTAGTTCGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTT:1 + chr3R 13870476 5' - I-element 369 1 59.00 GCATTGCGAACTAACTAAATCGAAACGATTCTTGTGATCAGTATCTGCGGTCTTGCCAAAGATTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAG:1 - chrX 7099160 5' + Burdock 6094 1 60.40 GCTAGTCACAGTATACATTATATAAGCCAACCCTCTCTTTACTTCTTCTTTTTTTTTATAAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCC:1 - chr3L 14222782 5' - Bica 86 1 56.44 GTCGGACGGGGTCGTTCGTCGAGTCGTGGCTGTTGGCTGTTGGCTGTAGCGATGATGATGTCGCTAGTTTCTGTTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTT:1 - chr3L 699105 5' + invader1 80 2 46.53 CATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chr2R 8157248 5' - Transpac 275 2 61.00 ACTTGAGTCAGATCGGACAAGAAGTTGCTGTTGCACATGCAACACGCTGTTGATACCGATAACACGCACGAACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCG:1 - chr2R 21921213 5' - G-element 151 1 52.48 CAAACTCAATCGTCTATTCGCAGTAAAAAATTTCGAATTACGCAGGACGAATGTGGAGGGCAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCT:1 - chr2L 12876762 5' - F-element 305 1 64.36 CATTAATCGCGATCCAGAGTCCGCCAGTTGTGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1 - chr2R 8938559 5' - Transpac 5174 2 79.21 TCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTCTACCTGCCATTTGCACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAG:1 + chr2L 7255811 5' - copia 4996 2 49.50 AGAAATTAAAACTAACAATAAACCAATAACGAATTCCAATGCTCAATTAATGCTACAATAATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTT:1 - chr3L 10464715 5' - invader3 261 2 63.37 TAAACGTGAACGTTTTGTTAAGTGCTCTTGGATAAACAGACATGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTA:1 + chr3R 18860314 5' + R1A1-element 5015 1 64.36 TCCGANTGCGGCGAATACTCCAGGAGGTAAGTTGAGCTATGAATTAAATTGCTAAAAAAAAAGAAACAAAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTA:1 - chr3L 9738897 5' - hobo 2466 1 39.60 CATGCTTTGGGGTTTTAAGAGTGTTTAGGTGTTCGTGTCTACATGTGTGTGTGTGCGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGC:1 - chr2L 16778904 5' + R1A1-element 5296 1 56.44 AACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAA:1 + chr3L 25340835 5' + gypsy8 302 1 75.25 AAGCCGGCAATTTAGTTTGACTTTTCCGCGCGCCTTTTTCTGTTTGGTTTCTTGTGTTTCTTGGACGGTGCACATAAGCGCGGGATTTCAAAAAACCCCAT:1 + chr2R 7087258 5' - mariner2 604 1 62.38 TGGCGAGGTGAAAGTCATAAGAAGAAGAGGACAATCGGAGGAAAGGCAGAAAGTAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATG:1 + chr3L 12049156 5' + Bica 4595 1 60.40 GCCTTCTCGGATTCCGCTTAAATTGTAATTATTTGTTGGCTCCACTGCTTGCACACAGTTTTGGATTTAAGTGAATCGGTTATTCACGGGGTCGGGGATGT:1 + chr2L 11925578 5' + aurora-element 4027 1 63.37 CATTCAGCCGGAGTGAAAGAGACGGCCTGAGGGAGAGCGAGAGATCGAGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATACAAAAAACAACACAAAACAGCACTGCGA:1 - chr3L 21106101 5' - Cr1a 240 1 66.34 AGGGAGTACGACTCACCCAGTCCCGACGGCATGTCAAGGTGAGTAAAGAAATTTGGGATGAGTTATAAAAGTAAGAGTTGATTGATTTAAGAGCGACAGAG:1 + chr3L 7949248 5' - Cr1a 4245 1 59.41 TTTTTACACATTTTTATTAGTCTTGTAAATAGTCATCGATTTGCAAAAAAAAAATTCTTGCCACGTCCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTACCA:1 + chr2L 22063437 5' + INE-1 350 1 67.33 TAAATATAACCTCGCTCCTAAATCTCTTGCTATCCTACAAGTCCTGCAGCCTCTGGCCCAACTCCAGTCCAAACACATCAATACTAATGCACACCGCATTT:1 + chr3L 4182427 5' - invader1 186 2 61.39 GGTGGAGAAGCAGGATGCAGCAGCTGGCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCG:1 - chr3R 24491357 5' - Quasimodo 231 2 73.27 ATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGC:1 + chr3L 26719157 5' + Tc1-2 33 1 70.30 TTCGTTCTTTAAGACTTTTTGCACATACCCAGAATGCAATTTGCAATCAGTTTTGTAGTAGGCTAGAGGTACATATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAA:1 - chr3R 2216806 5' + invader2 27 2 48.51 TGAGTGGTTTTAATGGGTGTGTTAGAAATGGCGCGGACCAGGAAGGCACACTTTTGTTGTCCTTGCTGCTTTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chr3R 32041981 5' - hopper 1413 2 77.23 TGTATATTCATTACCTCATCCTGTGCAGATGGCCAGACTCTCATCCAGCTTTCGTTTCATGCATTTTTAAGATGTTAAGAGAAAGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chrX 19315277 5' - pogo 2040 1 49.50 TTTATTAAAAGGTAGGTAAAATTAAATGGGAAAAGGATATATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAAT:1 - chrX 21638096 5' + gtwin 6951 2 60.40 AGCAGCCATAAAAGCAGGCACAAAAAGCGTTGCCTACTTAGGGGCGCCTCTACGGAAGTCGGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 31159619 5' - hobo 2924 1 64.36 AACCACACCCAGAACGGGGAGTTCCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGT:1 + chr3R 16390577 5' - 1360 3233 1 76.24 GGGTGTACTAGATTCGTTAAAAAGTATTTAACAGGCAGAAGGAAGCTTTTCCGTCCATATAAAGTATATATATTCTCGATCAGGATCAATAGCCGAGACGA:1 + chr3R 14437796 5' + INE-1 94 1 84.16 GCTCTGCTGAGATTTAGTTGGTTTATTTATCAGTTAATATACGTATTTGAGTGAGTTGCGTGTGTATACATATGAGTTTTTAAAACTAAAGACAGAAAACT:1 + chr2R 21614758 5' - gypsy4 200 2 77.23 TATTTATTAAGTCCCCGAAAAGGGCCAGCCAACGACTGAAGACTCACCGCAGATATGCCAATCCATCCCCACGCACACACACACACACACACATACGCACA:1 - chr2L 943515 5' + accord 188 2 53.47 TAATTTTAATCCTTTCCGTATCCAATAAGAACCCCGCAAAATTTCACCGCAAATAATCATAATAAGTGTGGAGTTCAGCTGCGGAAACTTGAGAATGTGCT:1 + chr3L 6839787 5' + Transib5 481 1 69.31 CAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTAAGCTACAGACTTGAAAC:1 - chr2R 6493165 5' - transib2 2781 1 66.34 TGAAGCTCGTTTGCTTCATCAAAATGAAGTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGCGCTTTGAACGTGG:1 + chrX 544766 5' - Idefix 251 2 57.35 AACACGCACTTGGCGAAATACAGCCATCGTCCCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 + chr3L 26852044 5' + diver 5922 2 62.92 ATTGAAAAAAGGAAATGGCGAAAAAATACATGAAAATTAGCAATGCAACGGGCGAAAATATTGTTGACAAATATCCATGGCTTCCCATGACAGCGGCAGTC:1 + chr3R 9577514 5' - hopper2 379 1 57.43 TTCGCGATAATCGCATTCCATGAGATGTCTTCCATAAACATAACAATGCAAACAGACTCGGCCCACGCACACACACACACACACACACACACATTG:1 + chr3L 21343419 5' + accord 7031 2 52.08 TCAAGACGAGCTCCCTCCTCGCCCTCGCTGGCTAGATTTTCCTTCCATGTAATGTGCTAATTGGAACTCACCTGTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTG:1 - chr2L 13126496 5' - Tirant 53 2 80.20 CTCATTTGGTCTCCACTTTCTGCAAGATACCATTGAAATCTATTACAAACTTGATACCTTATCTTTCGAAGATTTCCGTACCTCCGCGATCAAAAAAAAAA:1 + chr3R 18043333 5' + R2-element 3574 1 64.36 GCTCTTTTCGCTGTGTTTGTGCTCCTGGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTGGCCTCGGTTTTGGGTTTCGTTTCCGCTGTAATAAACCAATATATGCCACC:1 - chr3R 14832500 5' - blood 375 2 77.23 ATGAAAAGTATACAAGATACTAGCAATAAATATTCAACAGGAATTGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2L 12107234 5' + hobo 30 1 52.48 TCATCTGTACCAGCGGTTCGGCAGCAATATCTCACTGGAGGCCGAGGATTAATACACAATTGATCAATTGTTAATTTGAGATCATCATCATCTCCTGGCTC:1 - chr3L 5367433 5' - BS3 1608 1 74.26 CTTCGCTAATGAAAGGACATTCAGTTAGGCGGACAGTTTAGGGGGAAGCAACAGAATAGTGGAGATAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATTTT:1 + chr3R 9085016 5' - Gypsy12A_LTR 2056 1 57.43 CTGTCNTCGCGATTTCTGCTAGACTAGCCACACACACACACTCTTACACTCTCAATTGACTGTGAACCGATTGAAATCTCTTTAATCTCAAACCGATACCT:1 - chr2L 20255728 5' + TART-C 10798 1 72.28 AGATAGGGAACCCAGCTAATTACACGGGGGCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGA:1 + chr3L 9040719 5' + 1360 193 1 73.27 TCCATTTCTCCCCACTGATTTTTGACTATCGACCTCTGTATGGAAACATTTTGCACCTTTAGCTGCCACCTGGACTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCA:1 + chr3R 26404704 5' + 412 7148 2 79.21 TTGTTNCTTTCGTGCCAGAGTGCTTGTGTGCTTTTCTGCTTTTGGTGCTCGGACTCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCA:1 - chrX 16768775 5' + Tabor 228 2 58.42 GATCTCATAAATAACTATATATCTCAAGTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACAAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 11240866 5' - roo 397 1 59.41 ATTCAGCCCGCAAAGCTCGGGCAGAAAGCCAAGGCAAGGCGCCACACAAAAACAAAAACTCTAGCCAGTCCTTTCGTCTGATCGGACTCGCTTCATCATAT:1 + chrX 19549116 5' - Rt1b 4774 1 75.25 TGCGGCCAATTTATCTTAGTGTAGGCATAAAGGAACCTAAAACGCAACTAGAAAACCCCGTCAACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATCACGTTAC:1 - chr3R 6885730 5' - Bica 4826 1 68.32 CTCGTCCCTACTATTACCGCCTTATTGTGCCGCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1 + chrX 22445198 5' - hopper 1401 1 68.32 TTTGGTCATCTCGTAGCTTTCCAACTAAATATTGCAACTCTTTTTCAGCACGTTCGTGAAGTCGTACGCGGCGCCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACC:1 - chr2R 10298324 5' + diver2 4680 2 78.22 AATTGATTGATTTCCATTCGAACAGCCTCTACAGCTGAGTTTGGTCCGATCGGGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCC:1 - chr3L 7014872 5' + invader4 2927 2 78.22 TACCGTTCTCCCCAGCATCCTTGGCTGACTCGGCTGTCGTTATTATTTATGTTTTGTTATCCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTT:1 - chr3L 17153589 5' - HMS-Beagle 6823 2 66.34 TCATGTATTAAGAATTGCCAGTTTCTAATTTGTTTATTTTTATTAACTTTTAATTTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 + chr3R 11214748 5' - TAHRE 10417 1 71.29 CGTGAAAGCAAAAGATCAAGATCCAGGACTTGGTTTACTCCATGCCGCCTAGGTGTAAGGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTG:1 + chr3L 16133453 5' - 1731 298 1 77.78 AAATCGTTTACGACTTTTTGTCAACCTGATTTTTTGGTGTCGCCTGTCAGTTCGTCGCGTTTGTTATGCGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGG:1 - chrX 10046180 5' - G2 2888 1 70.30 AAAAANCGCAGCAAAGTGCGAGCCCCCAAAAACGAGGCCCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2R 21379609 5' - P-element 2851 1 43.56 CTCCCCAGCTAACTCTTCACCATGATAGCCGAGTTTAATGTCTATGTTATCAAGGATTTGCGTTGTCGACATCGAGGCTCCACTTTGCAGCTTGATAAATC:1 - chr3R 19090270 5' - Chouto 6235 1 63.37 AATTGTCTGAATATGGAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTGGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCC:1 + chrX 13057303 5' + Max-element 51 2 76.34 TCCGTTTCGTCGAGTTCCTGTGTGTTTCATTGTGCTGACGATTCTAGATATAGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTG:1 + chrX 692392 5' - Q-element 140 2 65.91 CTTTTCAACATGTCAACTGTCTCACATAAATCTAACCTTTATAAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATA:1 + chr2L 14434326 5' - blood 392 1 57.43 GGGAAGGAGTAAAAGTGCGACGCGCCCACCGCAATGCGAAAGACAATGGCCCCGAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCA:1 - chr2L 3610962 5' + G2 294 1 58.42 TATTACTCTGACCCCATTGGATCAGTTGGCAGTGTTAGACTATAATATTGATGGCGACTCATTACATTGGTCCAACACTGACATACGCCATCCAAGTGTGG:1 + chr3R 19669151 5' + G5A 2430 1 64.36 CAGCTTACTACTAATGTTTGTTAAATATTTGGATAGCAAGAGTATTCATTTGAGCACTAGTATCTCTTTGTTATTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATT:1 - chr3R 14136456 5' + 1360 3260 1 72.28 TGGAGCTGGAATTTGAGGCTGTTAAGTCGAGGGCGGGGGACAGCGCAGGGAGCAAGGCGAGGAGAGTGGGCAGCACACACACACACACACACACTGCATAA:1 + chr2L 11804508 5' + accord 7107 2 65.35 AAAGGTACTCGGAGTCTTACTTTTAGCTGAGATTTAGACGCTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATT:2 - chr3L 19439153 5' - jockey 4932 1 59.41 TGCTTTAATTAAAGCGCAAGAGTTTTGAGCTCCCAGGACCTCCAATCTGCACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATA:1 - chr4 810164 5' + Idefix 6912 2 56.00 AAATGCAAAAAAGTGCATGGGATGAGCTTAAGAAGTGCACTGAAAAAGAATGACATTGAAATTATCCTGTGGAAATAATAAAAAAAAAAGAATTTTAAAA:1 - chr3L 13185005 5' - FB 176 1 89.00 AAAGGGGGGTATTGAGCCATAGGGAAGGGGCACCCACAAGGGACTATGGGAAATTTACCCACTTTTTCTGGCTAAAAGCCATTTTCTGAAAGTCGGTCGAT:1 - chr2L 21330950 5' - Transib-N1_DM 455 1 61.39 GGCAATCAAGCTAATTAAGTTGAAGGTTTTCGCACACACACAAAAAATTCTCTAGTCATGGGTCGCGGAAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGAT:1 - chr2L 16977793 5' + Tc1 381 1 61.39 GCTCAAGGAAATCGAGGAGCTTAAATTGTCGGTGGCCAAGTTGAAGCTGCCCAAGGAACACTCGCCGCGCGGGAACAAACTACCTGCAACGCCAGCCGGAC:1 - chr2R 18660099 5' + HeT-A 5611 1 69.31 AATTGCAGATTGCAAAATTTCCGCTTTATTGTATTTATTTGTATGTGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCG:1 + chrX 16677046 5' - invader1 368 2 78.22 ACAACGCTTAATTATATCGAGGAGCCGAGTCCTTAGTGCCCCTGTTGCACCTGTTGTGGCTAGAGTTGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCG:1 + chr2L 15741701 5' - R1A1-element 5333 1 69.31 CGCTTTCCGGCCGCACGCCCCAATATCGTCTCAATATCTATAGGGAGCCCAGCTCGTCGGCGCCCTCGTAAACAAATAATGGTCCTTATTGAGAAAGACAG:1 + chr3R 24350786 5' + Fw2 264 1 68.32 TTGGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 2090307 5' - roo 388 2 59.41 TTTGTGAATTAAATGTTATATTGCAACATGTACGGTGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCG:1 + chr2R 21312434 5' - Quasimodo 328 2 61.29 GATAATTACATTTTTTGTTCGAGTTCGCTTTTTACATTCTAAATCACATTTTTTTACAAATTTACAAATAACAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGC:1 - chr2L 12242078 5' + invader3 5191 2 73.27 AAGAGTGGAAAACAGCGCCCACCTGCAACCCACAGGACAAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAG:1 + chr3R 19549390 5' + P-element 366 1 43.56 CTAATGTATCAACTTTAACAATTTCCTTGGGTTTATAACAATACATCATGATGATTTGGTTTCTGTTTTGTGTATGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATC:1 - chr3L 3991439 5' - invader4 270 2 78.22 CAACGACAGTTTCAACAACCCCAACGACAACCGAGTCAACGACAATTTCAACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAAC:1 + chr3L 5483293 5' + F-element 320 1 57.43 AGCAAAATAGTGCCAGCACTTCGGGTGACGAAAAAAATTGCTCTCAGTTCGCCCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAGTTTGCTTGCTT:1 - chrX 12821477 5' - 1360 3264 1 68.32 AAAACAAATTTTTTTAAGAGTGCTTTTGCTTAACTCAAAAAGTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chr2L 1912996 5' + pogo 31 1 62.38 ACATCAAATTAGTGTAACGGATGTTGATTGCTCGACGAGCTAAAAGTGCTTGCAGTGCCCAACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATA:1 - chr3L 13311992 5' - G2 2645 1 56.57 TACACGATCCGGGCGGCCATTTCGGTTGTTTCCCTCCCATTAGACTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTCTCTTTTCATTTCAATATCCGATTC:1 + chr3L 10911331 5' - Bica 4552 1 54.46 CCCCATTTGTCGCGTCGACATCGAAACACACATGCCCAACGACGCTCTTCCCCCCAGCTCCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGC:1 - chr3R 11745017 5' - 412 262 2 67.33 CGAGATGGCAAGGACTATGATGATCATTGTGAAATTCCTATTACTCAGTTTCAATTATACCGTCAACTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGT:1 - chr3R 13060979 5' + Copia1_DM 131 1 75.25 ATCTAGCGACAGTTTCAATAATAGCTTCGACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 9868645 5' + roo 15 2 63.37 GGGATATGCGACTCATAAATTAAATAAGGGTGATTAAAGTCCGTTTATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTGCTGCCTCTGTTAG:1 + chr3R 28564226 5' + G4 3772 1 63.37 AAGAGTCATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 2539312 5' - roo 9026 1 70.30 AAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1 + chrX 14317415 5' + 1360 51 1 67.33 TACAACTAACTACTAAATCGATCCCATACTCACTGGCCAACTGCCTTTGGCGCTTGCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACA:1 - chr3R 27066526 5' + Idefix 7043 2 63.37 TTCGAGGAAATGCAGAGGTTATATGTTTGGACTATTTGATTAGTTTGCTTTCTATCACAGAAAGAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCA:1 - chr3L 22745328 5' - FB 37 1 71.72 AGATTGCTACATTTTCGCAATTAAACACAGACACAGCACACACACACACACACACTCGCAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAAAAAA:1 - chr2L 13482223 5' + hopper 14 1 63.37 TCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAA:2 - chr2R 22774512 5' + BS 21 1 53.47 CCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 + chrX 23078689 5' + INE-1 556 1 80.61 AGGCGTTTCCGGGGAGGGTGGCGAACCGGAGGGTCGGATGCACATCATTTCGATTTCACAAAAGTGTTCTGCATTTTGCTTATTGCAGGGTCACCAATATG:1 - chr3L 21985048 5' - Chimpo 204 1 60.40 AGGGCTTTTAAGAAGCGACGATCCAGTGGAAGCTCGAACTCCTCGCGGGAATCGCGCGCCTCCCTTTCCCGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAG:1 + chr3L 16901565 5' - jockey 4697 1 61.39 AATCAGGAGGCAACAACACCGCCAACGCCGCCAAGGGGATCGAGATGAGCCGGGTAGGAGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATAT:1 - chrX 15266688 5' - G2 2843 1 68.13 TTCATATGAGCATTGTTAAAAGAACAGAGACAAACAAATTTTTCACTTCCGTGAAGAGAGGGAGAGAGCTTCTGCCGGTACGTGTGTATATGTGTGTGTGT:1 + chrX 11982678 5' - accord 191 2 60.40 GCAAANTCAACTTCCTGATTTGGTATATTTATGAATTACAAAAAAAGGGGGTTTCCTTCCTTCAAATCTATTGCAGTACTGGGTAGACCGTGAGAGGGGG:1 - chr3R 17528892 5' + accord2 193 1 60.00 CACCACCGCCGCCGCCGCCGTCCAAGGCGAACACTACTGCCGCCAATGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGTC:1 + chrX 1647818 5' - R1A1-element 324 1 53.47 ATTTGGCACAGTAGAAATAAAATAGTTCATACCAGCCACAACGAATCGGGCAAAAGATTACAATACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGATC:1 + chrX 22732192 5' + 412 374 2 70.30 CATAGCCCTCTTAACCCACTAAGACCCACCTCCAGTCAAGGCCATTAGTCTTGTAACTTTCTATAGACTTGACAAAAATCATCACGCCCACACTTTTAAAA:1 - chr2L 12754391 5' + INE-1 250 1 57.43 GGCAGCAGTACGGGTGCCAATGTGTTGTCTATTGTTATGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTATGGCTATTGTCT:1 + chr2R 12758445 5' - G6 1851 1 75.00 CTTGATCTTGCTAAATGCAGACAGGGTGCAGGAGTTTGACGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGG:1 - chr2R 6616859 5' - blood 7145 2 56.57 TCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 + chr2L 22689969 5' - Tabor 440 2 72.28 TGGGCTGCCTCCAGTGCTCCATCTTCAGCACCACCCTCTCTTCACCGTCACTTAAATGGCATTCCTTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTA:1 - chr2L 12955254 5' - gypsy4 6558 1 72.28 CTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGT:1 + chr3R 1047984 5' - Stalker2 360 2 61.39 GTGGGGGCTGTGAGGTGCATATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTG:1 - chr2L 11761324 5' + roo 8819 2 60.40 ACGCTAAACAACAGCAACAACAACTGCCGCAAACAGTCAAAAACTATAAAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGC:1 - chr3R 18102986 5' - R1A1-element 5163 1 51.49 GATGCCTGCCAAGCAAAATCCACACATTCATGGACAAGAGAAGGCCATATCAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGAAGCTGACGCTTGCGAAG:1 - chr2R 15364050 5' + Chimpo 4115 1 76.24 AAACCAACACCGAAACGTACTCAAATTAAAGGTAACAACAAGAACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAG:1 - chr3L 18138089 5' + Bari1 37 1 63.37 TGCCCTCCGGGGAACTCTTTCAGAGATCAAATAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAA:1 - chr3L 413929 5' + hobo 479 1 65.96 CCCGAATCCGTATCCGAATCCGGGACCAGACGCAGAACATTTTGCCAAGTGATTTATGAGCCTCATAGCGGGGCAACGAGAGGAGGACGGAGAAGGGTATG:1 - chrX 4174254 5' + gypsy8 4475 1 77.23 TTCGTCTGCACAATTCCATGTTCCGCGGCATCACCCGAGCTGCCATGTACTTCTTCAATACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCG:1 - chr2L 8357639 5' - Doc3-element 4573 1 58.42 GAACGACAGAAAAAATACAACAAGAAAATCGATTTTCCTGAACTTACAATTTTCTCCGCCTCACTGGGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGG:1 - chr2R 16098007 5' + R1A1-element 4919 1 75.25 TAGGAATAATTAACGCTTAAGAACTTATACGGGTACGGAGTTCAGTGGGTTGGGTCCTCTTGTCGCGCGGGGGGGCCTGCCAGTCCATCTTCTCCAAAGTT:1 + chr2L 22091705 5' - G6 309 1 57.43 ATAATAATATGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATAATAATCCAACTTTACAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chrX 23431558 5' + roo 8683 2 60.40 AACAAGAAGGTGCACAAGAAAAAGAAAACCGCGTTCATTTGGAAGACAAAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTAACT:1 - chr2R 3170151 5' + I-element 4960 1 59.41 TTTCTATTTTTTGGCCATTTCCTTTTCGAATTGTCTGTAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 - chr3R 10028384 5' - 1360 20 1 66.34 CGCTCGAAGCACAAAATTGATTGGCAAATAATGGATAATTTGATGCATCGGTGTTAATTTGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTT:1 - chrX 13065126 5' - I-element 390 1 70.30 CTCTAGCTGCCGCCCCGTTCCGCTGACAATTTTTCGCTGTTCGTGAAAAACTCAGGAGAGAACTCTATAGCCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTAC:1 - chr3R 11096151 5' - INE-1 551 1 61.39 CCCAACTCCATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 + chrX 17049526 5' + Stalker2 11 2 68.32 CCACCCACCGACCGGCTGCATCCCCCAAAAAAAAAAGCTAAACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAAT:1 - chr3R 27652259 5' - invader4 2638 1 59.41 GAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTG:1 - chr2R 4879041 5' + G-element 15 1 67.33 CTTGANTGCGAGCGCTTTCAATTATTGAAAGGAGCAGACAGCCGAAACACACACACATACACATGCACACAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr3R 14614800 5' + 1360 2 2 74.26 TCCTTGGGTGCCCTTAAACCCGCCATCGATGCTCTTGAATT:1 + chr2L 17498208 5' - mariner2 485 1 68.29 CAATCTCGAATTTCACGAATTATAATTGATATTTGCTGCTGCTCGGTCGGTGAAAAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACAATT:1 - chr2L 2058371 5' + 1360 35 1 56.44 TGAGTAGCAAGTAGATAAAGCAAATTTAAGCTAAAAAGTAACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 - chr2R 11449129 5' + blood 7095 2 64.36 TTGAGTTCACCGTTTATGATGGAGCATTGGTCAAGGAAGTCCACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCT:1 - chr2L 8778722 5' - copia 103 2 58.42 AAGTGGCTTTTATCGCATTTTCTTGAACCAAATTTCCTACTTTTTCCATCGCAGTTGATGTTGGCAATATAAAAGCTAGAAGGTTTAGATTCAGCAAACAG:1 + chr3L 10548296 5' + INE-1 174 1 70.30 GCTTATAGATTGCCGCCCCACTTACATATACATACGCTTCCTCACTGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTC:1 + chr3L 9413341 5' - Stalker4 189 4 67.33 ACCTAACAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAGGGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAAGTGTGGC:1 + chr3R 19446989 5' + Cr1a 4426 1 58.33 GATGGTATATAGGAAATCATGGTATTCGGTTTATGGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGATCAAGAAGATAAGATTATAAAGATCAATGTAACGGCGATAA:1 + chr2R 11295893 5' - Ivk 90 1 72.28 ACGGAGGCAAGACGGGCAGGAAAAACGCCGCAGGAGCAGCGAGATCGCCGGACGAGTTATCTATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 22407446 5' - roo 9059 1 64.36 TCTAAGCTAATGCATTAACCACCATATGATCCGCCACATCTGTGACCAACATGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCAC:2 + chr3L 6599493 5' - flea 123 1 54.46 TTCACCGATCCCTTGCCGCGAATTATGATCTTGGCGCCCGTATCCTTCTCCATAGCCTGTATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAACGAACGTACAT:1 - chr3R 17543863 5' + Ivk 4999 1 57.43 ACAATAAACACTTCATTGCGCACTTGAGTTAATTTGTCAAGAAGGCCAGACGCATATGCTGAAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACAG:1 + chr3L 4632836 5' + Tirant 218 2 66.34 AGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTT:1 - chr2R 22774487 5' + BS 46 1 71.29 CGTACAATTCGCGTCGAAAAATAACAAGAAGTAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATC:1 - chr3L 16844950 5' + jockey 4987 1 75.25 ACTTCATAAACAGCAGCAGACTGCCAAGAGCCGAGAATGAGAAGAGCAATAAGCTTAATAAAATATAGAAAAATGTATTGACTTTTATTTCATAATAATGG:1 - chr2R 23195265 5' + transib4 2302 1 57.43 CCAATAATAATAAAATTATGCAATAAAGCGAGGAGGAGTGAGTACTAAGCGGAAACTCTAGCTAAAATAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATC:1 - chrX 20764892 5' - S-element 365 1 55.45 GTCCTACAAGCGCTTGATCTTCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGAGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTG:1 + chr2L 21162895 5' - jockey 4707 1 77.23 TTTGATTGAGTAATCTTTTTTATATAATGGATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTA:1 - chr3L 21552047 5' - hopper 285 1 74.00 TATCTCGGGCATTTCATCTGCCAGCGCAAACAAAATAAACACTAAGCCGCCCGACCGGCAATCCAATATCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 16554779 5' - roo 400 1 82.18 AAAAACCGTTTGTGTCTTTTTTACAATGGTTGTTTAATTATTGAAATCCCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGAC:1 - chr3L 15342070 5' + invader1 41 2 53.47 GAGACCATCGAAACGCCCTTGAAGGAGATCAATTTCCAGGAGCTGAGAACCCTCGCCTTGGGACAGGCAACAATGAACCCCCGACCAATCTACAACTTTG:1 + chr3R 9758843 5' + G-element 4222 1 71.00 GTGTTATTCAGCTGGCGACAATTGAAACATTTTTTATGCTCTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1 - chr3L 1992450 5' - 412 7473 2 59.41 CCTTTAAAAAGTCAAAGCTTAATTTGGTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chrX 1399951 5' + P-element 8 2 71.29 TAAGTGGCTGCCGTTTGTCGCAGCTTGTTGCTGTACCATACAAATTGTTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAA:1 - chrX 4347627 5' + 1360 3164 1 53.47 TTATTCAATTGAATTCGTTTACATGCATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAGCGGG:1 - 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mdg1 341 2 72.94 TCCTTCCAGACTCGACTTTCAACCGGAGCGTGGCATTTACGACCTGCAAGTCAAGAATGTGTAAACCCTCCCCTTCTAAGAAGAAGGCTGTCCACAGACTT:1 + chr2L 4079495 5' - Burdock 6102 1 55.45 GTTGCGCAAGTCCAAGTGGCGAAGGCGGTGCAGCGGACGCAGTGCCTCGCTGGGAATAGTGAATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGCAGGC:1 + chr2R 8011481 5' - Quasimodo 6894 2 61.00 ACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACAATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr2L 15997882 5' + 412 36 2 72.16 TTAAAACTATTGTGATTAAATGAAATTTGTGGTTCGAAATGAAGAATACTGACTGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTA:1 + chrX 9260591 5' - 3S18 318 2 56.44 ATTACCCTTGTACTCTTGCTTGTTCTTTTGGGCCATTTTTCTTGGACGCCTTTTGTTTACTCTCCCTGTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGT:1 - chr2L 4238586 5' + Cr1a 240 1 63.37 TCATTGCGACTATCAGCGTATCATATGGAGAGAAGACACATATATACATGCATGAACATGTAGCGCACTTTCCTTAGTACATCTGCAACATTTTTATCAG:1 - chr2R 1928371 5' - Copia1_DM 4203 1 75.00 CTTTGCTCTTACATGTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr2R 20698381 5' - P-element 2827 1 19.80 TCTTTCTTGATTATAAAGATTTTCTTAAGAAAGCTGCAAACAGTTTAAGGTAAGCACATTATGTACATAGCGGCATTTGGTTA:1 + chr3L 24280235 5' - gypsy11 4173 2 67.47 TAATTATTTCTTTAAATAGAGGAAATACTCTTTATTTAACAAACGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3R 18170654 5' + pogo 30 1 58.42 GTAAAAGAAAAGCTGGCAAACAGAGGAGCGGAGGACCACTGACAGCCGAGCTGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGA:1 - chr3L 8252660 5' + Rt1a 4719 1 59.41 AAAAAAACTTTAATAACTGTCACTTCCTTAAATCTGATATGGCAGTACACTTATGCATACTCGTTTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACA:1 + chrX 11728124 5' + 1360 195 1 52.48 TGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1 - chr2L 3245006 5' + rover 28 2 63.00 GAAGAGTCGCAACGCTTAAGGATACTTGTGCAAGATTTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACA:1 - chr3R 25573191 5' + transib2 333 1 63.37 CTCGTTGACTTATTGCCCGACTGCATTGTGTCCAACAACCAGGTGGGCTTCACGACAGATCCGCGTTTCTCCCGCTCCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCG:1 - chr3L 1068488 5' - F-element 4467 1 62.38 GTAGTTGCAGTGCAGCTCGCTCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCTGTTT:1 - chr3R 8859548 5' - Juan 300 1 77.23 CACTTTTCTCGGATATTCCCATGGCTGCTAATTAATTTAGTTTTGTGAAATTTAGAAATGCTCGGCAAAAAATTGAGTTTCGAAGTAGTTCAACTTATTT:1 - chr2L 9445630 5' + S2 424 1 67.00 TCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCT:1 - chr3L 25232910 5' + GATE 8268 2 52.48 AAATTATACATAAAAAACTCACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTTTATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATA:1 + chr3R 12833727 5' + Cr1a 4359 1 82.18 TAATACATTTTACAAACGGATTATTTATTAGAATTAAATGTAATAAAATTTAAGTAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chr3L 25798437 5' - blood 355 2 57.43 AACCGACAAACAGCAACACAAACGCCGATCAATCAATCAATCATTTTCACTTCTTATGTCTTCGCGACACTTGCAAACGCAGACAACGAGCGGCCAATAAC:1 - chr3R 16107835 5' + F-element 304 1 50.50 AATCAACGACCCAGACGTTCCCAGCCACGCCAGACTAACTTACAAGCCATAAAAAAAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAA:1 - chr2L 22391352 5' + HMS-Beagle 273 1 57.43 TATGATAATTATATTAATTTCGCTTTCGTGTTATTAAAATAATGAATATTTTAAAATTTGAGAATTTTGCTTTAAATTTTATTTCCTTTATTTT:1 - chr2L 7253245 5' - TAHRE 38 1 77.66 GAGTTTAGACCTATAGACGGATTGAATGTAAAAGCTCTGAACGCTTTTCTAACAGAATCTTAAGAACACCTCAATGACCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACC:1 + chr2L 18077005 5' - R1A1-element 4948 1 70.30 TCTTTACTTAGTACTTGTTGAATCGCCTGTTTCTGTGTTGTTTTACTTCCAATTTATGTGTATTTTTACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTG:1 + chr2L 17475581 5' + transib2 387 1 74.26 TGGAAGAGCTCACATGGCTGGCCCAGGTACATAGTGGGGTGTGCGTTTGAATTCACACCAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAACTCGACTATA:1 - chrX 505581 5' + INE-1 565 1 56.44 TTCACATATCATGGGAATTAAGGCGGTCCGTTACAGTTAAACCGGAACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCC:1 - chr3R 8874348 5' - Doc 424 1 65.35 GACATTGCATCGGTTTGCGATAAGGCGCTCCTGACATGCATCTGGGCTACCCTGGTATGTGAGCAACCGAGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCAT:1 - chrX 13800749 5' + G5A 2557 1 69.31 TATACTCACTGATATTCTAATAATGCTGACTGCGTACCGTTAAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATC:1 - chr3L 15638146 5' + FB 302 1 58.42 AGCCCACAGACTGAAAAGTAGAATGATGCATTAGATACAAATCTATGTATGTATGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCG:1 - chr2L 16603812 5' - Copia1_DM 153 1 61.00 CAAGCGCTAAACATTTCCGACCAACAAAAACAGAAACTTGAGCATATTTCCGCTGGATTTCGTATCTAGAAGGAAGATCCAGCGATTCCAAAACATATGTT:1 - chr3L 12436290 5' + G2 2718 1 73.27 TTGAATGTTAAGTGTGCTCGCCATGCATGCGTATGAGTAACGATAGTGAGAGTGTGGGTGAGTGGGTGGTTTCAGTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTT:1 - chr3L 12223560 5' - jockey 4743 1 65.35 GTAATGCTTCCTATTTACCCGCCTTTGTATACATTAGCTTAAACGAGCACGTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTC:1 + chr2R 9677147 5' - gypsy4 304 1 53.47 CAATTAGCTGCAATACTTGTTTAATTGTTAGTCAACCAATATTCTCTCTCCAACTCTCATGCCATATTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAG:1 - chr2R 21392992 5' + Doc 306 1 69.31 GTAGTTATATATATTAGTACTCAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAAATA:1 + chrX 16483466 5' + flea 309 1 74.75 GAAGTTTACAGGACATAAAGGACATGCATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTT:1 + chr3R 30928207 5' - Burdock 113 2 73.27 GATATGAAAATGAAGTGGACGGCCATTGGTTGAATTTCAATGCATTTTCGGAATATATATTTCTAGAGACAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAAC:1 - chr3R 20495829 5' + Juan 4076 1 71.29 AACCGCAAATAAGCCAACCTGACATGGTTAAAGCATAGAAAGCCAACATTGCCGGCTACCTCTTATAATGGCTAAAGCGATGACCGTGCCTTATTCATTAC:1 - chr2L 15086861 5' - gypsy7 5116 1 56.44 AAACTGTATAACTGTATATATCGAATGCCTAGTTCTAAGCCAGGTGTAGCAAACTATCAAATAGATCGGGATGAAACCCTTATCAGCTGCACCCGGAAAGT:1 - chr2R 10323335 5' + Gypsy12A_LTR 145 1 69.31 TTGAGCGATGACATTTGCTATAATCTCGACCTCAGCTGTGCTTAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGG:1 - chr3L 10670584 5' - I-element 5077 1 55.81 GAGAAGAAGAAGAGTTAAAGAAAACGCCAACAAAATAGACAACAAGGCAAGTCCGCGCCTCCGGTCACAGAAGAAGAAACTGCTAAACTAATTGCTGCAAT:2 - chrX 18893622 5' + G7 169 1 62.38 AATGCTTTTGTTTGTTTGGCTTACTTTACGTTAGAATTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chrX 2306860 5' - opus 7464 2 63.37 AAGGGAAGACTGAAGGGCGGGAGGCGGAACCACGCACAATGGCCGAGCTTAAATGGCCTAATCACTTCGTGGAGTTTAGAGTTAATGGGGGACAGCTACAC:1 + chr2L 15518395 5' - Doc4-element 2370 1 56.44 TTCAACACTCCTGCTTCGCATACTAGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 22094490 5' - P-element 2838 1 31.00 TAAAAAACAGAGTCGCCGCGATTAAGAAGAACAAGCAGCGGCACAATGCATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACGCGGTC:1 + chrX 2275003 5' + Doc3-element 328 1 64.36 CAGATGTACAAGATTTGAAACAATCTTATATGTGCATACAAAAACAACACCAAACAACAAAGAGAACAACGCACGAAAGGGAGAGTAAACAAAACAGAAA:1 + chr2R 3931595 5' - Cr1a 205 1 72.00 CAACGCGGACCGCTTGCTGAGGTAAAAAGTTGCGGACAACAAACTTTCCTTCTTGACGGCTCGACTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAG:1 + chr2R 18982514 5' + hopper 349 1 67.33 GTGGGTTCCCAAACAAGTTCTGTCGAAATCGGTTAAAGTTTAAATTGCTCGAAAGCGTGAGAAATGGCACACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3L 13888598 5' - copia 248 1 71.29 CTAATTTTCGGTGTCGCACGGGCAAAGTTTTGCAATTTCCGTGTGGTAGGACGAGTGGGAGTAGTTTAAACAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGAT:1 - chrX 1416178 5' - INE-1 575 1 70.53 AAAAGATACCAACTTGATCAAGGCTTACTAGTAGCTTATAAATCCGGATAACCCAAGGCTGCAAATTACACTAAAACCAAGTCCCAGAATCACACCTTTGC:1 + chr2R 577460 5' + invader5 411 1 67.33 CTTAAGTAAACCATTATTCAACAACAGTCTATTAGAGCTAACTAAATTTATGTAAAAATATTTGAATGTGGCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATT:1 - chr3L 20857059 5' - flea 254 2 78.22 ACATTTCCCCTACTTTCGGGGAGAGAGAGAGAGCTCCGCTCTCCCAAGCGCGAATGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGATAGAAA:1 + chr2R 20111175 5' - diver 363 1 54.46 CATGACTAAGCCCAGTGACTTAATTCATATTTTTTAAAAGGCTTTCGTCGCAATTTTAATTGAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCA:1 + chr3R 25044381 5' + F-element 278 1 66.34 GAGGAAATACTCTTTATTTAACAAACGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 18170672 5' + pogo 48 1 76.24 GCTTGCCTGGGTTCTAATTTGTGGTTTTCTTGCTCCGATAATGCGAAGAAAATCGACAATTGCTTCCCTCGCTGTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAGAAT:1 + chr3L 1496938 5' - Doc2-element 4631 1 71.29 ATTAACCATATGCAAATCACATTTCGCAACAGCTGTCTGTCGTCTGCTTTGCTGTGGAAAACATACACACACACACACACACACACAAACACACAGCTCAT:1 - chr2L 16553367 5' + gypsy3 427 1 62.38 CACGGCGTAAAGCCCGCTAAGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 10635223 5' - roo 400 1 68.32 TCGCTTGGCTTTTACCTTTTGGGTCTTTTGCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAG:1 - chr3R 12578217 5' + jockey 4 1 75.25 TAAAACGTGAGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3R 14913161 5' + blood 7053 2 64.36 CAAAGTGTTGACCCATTTTAAGTCGTCACCTGTCTCAGGCAACACAAATTCAAGCAAAAATAATAATAAACTATTTATGACTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr3R 26294576 5' + roo 8663 1 80.20 CCTCTATACGCTGGCGGCCTTTCCGCTGATTTATCATAGTAGATTCGGACCGAATACTGACTTAGCATTACTCCTCCCTTAGATAAGTGAGGGCCGTCCT:1 - chr3L 8711607 5' - gypsy9 4986 1 46.00 CAATCNCACGAAATAGCACTCCCCTAATTGTACCACAAGTCAAGTGCACCGACTTCTCGGCTGTTTATTCCAGAAATCCATATTGCTGTTCTTGGGTACAG:1 + chr2R 10275333 5' - Stalker3T 261 1 76.24 CGAACGCACTCTTTAACTATTTACAATGCACTCTGAGCATACTTGTGCACACATACAGTTTTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGT:1 + chr2L 1716621 5' - 1360 131 1 78.22 GGCAAACGTCCACGTCCTTGGCCATTCTTTACGCTGTCAACGACCAGCTTAA:1 - chr2R 19258566 5' + HMS-Beagle2 6984 2 65.38 TGGCANGTTAAATATTTATAGCATAATTCTAGGAGCTGCTACATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 20140547 5' + jockey 22 1 66.34 CCCGAAGGATCCTTCTGCGCAGGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTA:1 + chr2L 13023439 5' + diver2 146 2 78.22 GGTAGNGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr3R 19535691 5' - hobo 2918 1 52.75 AGCCCGCCTGGGTCATTTGCATAATCTGATGCCGCAGTGCAGCAGGAGCAATCTGCCACCGACCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATA:1 + chr2R 10171378 5' + micropia 246 2 69.00 GTTCCGGTTCCAGTTCCACCACCGCTAGTTGCTTGTTTATGTGTTCACATCCATTTGCTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCA:1 - chr2R 18286476 5' - R2-element 489 1 79.21 CTCTACCCAAAGCATCAACGAGAACGCAGATAGCGTGGAGAAACGGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCAAAATTTTAGTCTCTTCCGACA:1 + chr3L 3356773 5' - diver2 230 2 56.44 TAAACAGACATGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATA:1 + chr3R 18860346 5' + R1A1-element 5006 1 55.00 TGGCTGCTCAACTATTAAAATCAATTTCAACTGTACTGAACTGATCGAAAATGTATCTGAAGGGCAAAGGGAATTTGGTTGTAAAAATAATTGTGATGCGA:1 + chr3L 18499173 5' - Bari1 235 1 60.40 CGATCGAGGTGTATAAGGGTCATTGCAACCGAGACTGGGGGCCTCTCAACTGCGCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACG:1 + chr3L 3080666 5' - Cr1a 4019 1 60.40 AACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAA:1 - chr2R 4879003 5' + G-element 51 1 73.74 GAAGAAGTTCGAGAAGTTCTTTATTGCCAAACACGAATCGGGTCAAAAGCAGAGCTCAAGGCGCAGACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCG:1 + chr2R 14807828 5' + accord2 205 1 72.28 TATTGCAAGCAAACAAAGACAATCGCACTAGCACAGCTGTAACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGG:1 - chr2R 20258135 5' + flea 4711 1 65.35 AGGAGTCCAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCT:1 - chr2L 3273896 5' - gypsy5 360 2 76.24 CCCCCCCCCTCCACCATTCTCTTCATTGGGGGATATTGCAAAGGGCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCAAAACAAACAGTATCGTAAAATAAACAAA:1 + chr2L 3213739 5' + diver2 4839 2 55.45 CTTCAACAGCTTGTTGACGAGATTCCCCCAAAAGCAGCCATCAGGTTCGCCCTCGGCCGTCTGTAGTTCAGCGATAATCTGCCTAACTTGGCCTGCGGATT:1 - chrX 6909958 5' - gypsy6 7346 1 53.47 TTTGGCAGCTACTGCCACCGGATTGGTATCATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGTTTGCACGCCTTTTTTTGTTGTATATATGACCAGAGGTTTTCT:1 - chrX 11376078 5' - Tc1-2 1189 1 70.00 GTCGGNGCAATTAAATGATTGGCAGTGATCATGAAATTTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chrX 2090195 5' + roo 8664 1 74.26 ACCACAGGCAACGTACCCGAAAGAAAGCGCAATGCCTCTGGAAGCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:2 + chr2R 5640339 5' + roo 8696 2 58.42 CAGCTTTAAATTCCTTGCAGCACTGTAACTCCATTTAGAGAGAAAATGACTACACATATTTACACTCAGTTCGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTCA:1 - chr3R 5015926 5' - accord 7028 2 56.44 GATTCNGTGTCGAATGTGCACGTTTGGCCCGTAATAAGTGGCTACACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chrX 16619680 5' + opus 27 4 56.00 TTGTACACGGCTCTGGCCGGAATCAAGCCCCATCAGTGCCTGCCCATTGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGT:1 + chr3R 27154903 5' + R1A1-element 5034 1 58.42 TTTGAAGCAGAAATACAATTCATTTTGGCTCTACGTTGTTCTTTTACAAATTGTTGTTCCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACA:1 - chr3R 5189134 5' + roo 8659 1 65.35 GATAGNGTTTCAATAGCAAGTGCATATATTATGGTTTATGGAACCCACCTGAATGCTCCGATGCCCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGG:1 - chr2L 10365707 5' - F-element 277 1 70.30 CCATTTAGGCATTTTAAGCATTGAAATGCAATGAGGATTTGTGCCATAAGCGAATAAAATCAAAATATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3L 19511889 5' - roo 9042 1 66.34 TCTCCACAACCCACACTCACTGATCGACAGACACATACCCATTAACCTTAATGATTAAACGCTGGGACATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAATCC:1 - chr2L 11794695 5' + G5A 2749 1 68.32 ACCAATCAAAAGCGAAAAAAGAGCAACAATGCCCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chrX 9653289 5' - roo 9028 1 65.35 GGCAGAATTCAAAACGGAACCGCCATAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACC:1 + chr2L 8140941 5' - 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aurora-element 388 1 69.31 CTGTTCAAAACGCAAACAGGCCCGAGGTCGAGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACG:1 - chr2R 3130432 5' - accord 7063 2 69.31 TAAAAATGACGTAAACGTTTAATACCCTTTGTTAGTAAGCCGATTTTATTTTACAGAAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAAC:1 + chr3R 7757763 5' + I-element 161 1 63.37 CGGATCGCTTGGGATCGGCATTCTGGCTGGCAGTCACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGT:1 + chr2R 13188023 5' - diver 82 2 65.35 AAAATGTGCGCGCCGCAAAACTTTGGTTTCCTTCGAAAAATGTAAAAAAAAAGGACGAAAAACTGTGGTCGTTTCGCTTTGTGGACGTTAGATTGGGCATT:1 + chrX 2834545 5' - INE-1 215 1 68.32 GCAAATATTTCACGTTTTTTAATTATTTACATTTAAAGTTATTTGCTTAAAGTGACTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGC:1 - chr2L 14939743 5' - Idefix 7089 2 67.33 GTAAGGCGGGAAATTGAATTACTTTGCTTGTGCACACGCCCACTTTCCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCT:1 + chr3L 3565338 5' - R1A1-element 5137 1 55.00 CTGGAGGCCAATCGGCGGCAGTCGTATGACGTGACCATCGACCTACACATCGAAGGCACGCTGATTTCGTCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAAC:1 - chr3R 9984240 5' + F-element 320 1 74.26 GATTCAGTCGGTTGAACGCAATCATTTTGGGCTGACATTTCCCGTTTGCATTTCAAATAGCCGAGTTACGGTTATCTGATAGTCGGGGAACTCGATTATAG:1 - chr3L 7648175 5' + INE-1 566 1 66.34 GTTAACATTACTTAGTTTAATTAGCTTGAAAACGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAGGTTCAGTTTGATTTTATATTTAATAAAGAGCGCATCGC:1 + chr3R 24181195 5' + gypsy6 174 4 66.34 CATTTGGAGGCCGCCTCGAACTTCTCGCTCTTCTTTTTCCGTCGCCATTTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:1 + chr3L 3769241 5' - hopper 1391 1 52.48 CTGCCCTTTGGATGCCATTCGAAACCGCCTTTTAAACTCAACCTGAAGATCTTGTGTTATGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGG:1 - chr2R 10733218 5' + Cr1a 234 1 65.35 GTTTCTGCGATGTCTCATTATTTTGTTGCCTTCGTTTGGGGCTTTTACTTCACTTAACTACCCTTTTAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTT:1 - chrX 7590408 5' - invader2 307 1 59.41 AGTCCGTAGTAAAGATTTTTGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2L 6605533 5' + blood 7 2 68.32 ACACATTCGTACTTGATTTAATTAAATTAAATTCCAGTCCGCCTCAAAAAACAACAACAACAAGAACTAGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGG:1 - 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chrX 15102191 5' + Doc2-element 368 1 64.36 GAGAAGCAGCTGATAGCAACCAAACCAGGTCAATGAAATAGCAGTGCGAGGGGAACTATGAAATACAGATATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGTATCGACTA:1 - chr3R 4449247 5' + HB 67 1 63.37 TAAAATGACAGTATATCGCATCGCAGTCGAGTTCTTCCCGCTGAAATCCGAAGACGGCTAAAACCAACGATAATTATTAGGGCCACACAAACTCATATCAG:1 - chr3L 11642335 5' + Fw2 3842 1 69.31 AGCTAGATAAAAGTATCTAATCTTGGTTTTTTAGCGATACACGACCACCAATGCAGCCGTATTTATAAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCT:1 - chr3R 16008457 5' - roo 8740 2 70.30 ACCGCCGCTTTTTCGGGGCAACACCTTGGGCCGCCCGTCGCCCCCTCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAAT:1 - chr2R 18258589 5' - R2-element 3147 1 55.45 AATCAAACAGGGTAAACAAAGGGGAGTAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTATACCTACTTTGAACAATGAAAATAGTTTG:1 - chrX 17475246 5' + invader1 450 1 73.27 TGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3L 11696459 5' + blood 20 2 57.29 GTTGTCTTAAAATATTTATGCCCACATCATACCAATGTATTGCAACATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGA:1 + chr3R 4579213 5' + Quasimodo 5 2 55.45 AGCACACATACACATGCACGCACACACAAGTAACACAGAGGTGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATA:1 + chr3R 12174533 5' + Rt1a 39 1 64.36 TAAGCNGCAAACACGAATCGGCCACAAAAAACGGCGGGGTAGGGGGCCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 13992344 5' + Doc2-element 234 3 72.84 AAGAGATTGGCGCTCAGTTAGGACACATATATTTTTATTTCTATCGGACGGACGGCGAGGGCCCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCTGTG:1 + chr4 1077756 5' + micropia 473 1 53.47 ATTCTAAATTTTATCCTGGAATCGATTTTAGTACATCAAAGTAGTCTCTTAAGGTTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:2 - chr2R 5616629 5' + 3S18 24 2 55.45 TAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAA:1 + chr3R 25796015 5' + BS 5024 1 53.47 TGTCCTTAAATTCGTGTCCTCTCACTTTCAGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 + chr3R 26729736 5' - 412 448 2 70.30 TGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATC:1 - chr2R 1234691 5' + Q-element 625 1 74.26 GGCATGGCCTACCGAGAGAGTAACTACAACTCCGCTCATTTTGATTTCGCCCACCCCCTCTCACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAA:1 + chr3R 7103481 5' - Dm88 395 1 65.35 ACCCAGTTCTGGGGCAGGAAGATGCAAACAGCCGTGCAAGTTGAAGTCAAGAAGCCGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGTCCCTGCGC:1 - 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chr3L 8987347 5' - gypsy4 6456 1 60.40 GCCGACTATGTGTCTCATTCGCTGTATCTCAGTTCTGAGCTCTTGGGCTTTATTTGGGATCAAAAACATGACTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGC:1 + chr3L 1676000 5' - R2-element 3380 1 70.30 CCGGTGGTGGATTGCTCCTAACCTGGCCGAGACAGCTGCAAAACCGCCAAGAGAGCCAGGCGCTAACAAACTCATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCA:1 - chr2R 10675623 5' + hopper 448 1 78.22 TTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTA:1 - chr3R 433128 5' - 1731 4587 1 61.39 AAATTGAATACATATAAAATTAAAAATCACGATGTAACGATTTACAGCTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAA:1 - chr3R 10784183 5' - Idefix 7026 2 57.00 GGGCATCGTCGCCTTTTCGCCAGCTTTATTCCCATCTTGCCATCTTACCAACTCGCACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTACGCTCTCAGCTCTCCC:1 + chrX 6503896 5' + Porto1 494 1 59.41 AGTAGCTGGAAATCAGCCATGCCTAGAGAAAATAAAAGAGTTGAAATATGCCACAAGGCTTCCGAGTGAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr2R 11540653 5' + Transpac 49 2 75.25 TTATTTCAAACCTTTCGCTCAACTGGAGGCCTCAAGTTTCCGCCGCCGACAACTTCCGGTTTTCCTTGCGTTTTCTTGGCTTCATTGTGCTTACGCCAAAT:1 + chr3R 26176761 5' - 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chr3R 23700984 5' - mdg1 7423 2 62.00 CTATTCATAGATACTACCAGATTACCAGTCGGCTGACAACTTGCCTCTAAGACACAGCTCAATAGGTTTAGAGAAATACAATCGCGAGCAGCACGAA:1 - chr3L 16631493 5' + G5A 2491 1 56.70 CTTCGCAGTTTTCGACGAGCAGTTTGTTTTTGAGGTAACAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCT:1 + chr2L 17602198 5' - Quasimodo 7071 2 62.38 CTCCTGCCACTGCTGCGTTAGACGTGTTCTGACCAAATCCGACAGATACTGCTGAAGAATTACCAACGGCTTGCGGTTCTCTCGAGACCCCAATGTGCTG:1 + chr4 655240 5' + X-element 376 1 77.00 ACTCTGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTATGTAGTCGGAGCGGTTCCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGAT:1 + chr3L 11819268 5' - Cr1a 4221 1 62.38 GAAATGCATCAAATTGAAATGTTCATTCATGCATTTGCCGGACTGGCAGTTTGTAGGGTAAAGCCATTGACCCTGAAGTTGGACCGGGAGGAGAAGTGGAC:1 + chrX 19978063 5' - G5A 127 1 57.43 AGGCCCGAAAAAGCCGAATAGAGCAAATGCAAATACAAAGCAGGTGATCTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGG:1 + chr2R 15817264 5' + flea 4547 1 71.29 TACGGCCAGTGGCGCCAGGTAGCCTAAACCTAAATTAGATGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTCACAAAATATGCCCTTCACCTTAA:1 - chr3R 11289015 5' + 1360 215 1 60.40 ATGGACTGTCATTAATAATGGCCACAGACGCTATAATTCACCAGAGGGGGGCGCAGTCGGAGGGGGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTT:1 + chr3L 14587954 5' - F-element 4434 1 69.31 ATCGCAGCAGTCGAAAAACATTATCAATTTCAATGGCCTAACGAGTTGTTGCTATTTCACGTCTAATCCTGTCTCCAATTTTTGGCACCTTCAGATCACGT:1 + chr3L 22704438 5' - jockey2 3029 1 53.47 TCGCTGCCCTTGTTGTTCTTGTTGCCATTGTTTGTGTATGTGTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTA:1 - chr3L 5847787 5' - R2-element 3356 1 61.39 TTTNCCCTCACCCCGCGCACAATGGTGACACTTGAGTGGGACACAGTGTGCCACAATTTCCAAGAACATAACAGAATACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chrX 9876363 5' - accord 7030 3 65.66 GCCCAAGGGTTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTA:1 + chr3R 26331629 5' + G-element 19 1 61.39 ATACAGTGTAGTCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGC:1 + chrX 22867335 5' - HMS-Beagle 7006 2 64.65 CACGGCTCTGTAGCCCCGTCCACTTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 - chrX 22874527 5' + HMS-Beagle 55 2 75.53 CTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 - chr2L 17862275 5' + F-element 25 1 60.40 GCATCGCATTCGTTCCATCATCAAATTACAAATTGGTTTCCATGCAGTTTTGCATAAAATTCCAAGGACTCCAACGGGCAAAGGGCGAAGAGGTCGAACGG:1 + chr2L 8559042 5' + gypsy8 125 2 71.29 TTGAGTGTAACTCGGTGATCTATCACACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACA:1 - chrX 16652023 5' - 412 7136 2 75.25 CCGCATTTCCGCAAGGGAAGCTGTTACATTTTCCGTTGTGGTGCATAAATTGAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 - chr2R 19232931 5' - Burdock 6372 2 63.37 GGGCAATTGAAATACGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chrX 10555400 5' + Tirant 20 2 61.39 ACGCACAACTTGGGCTATAAAAAACAACAAGTTTCAGCTGCATTGGCAGTGGTTGGCAGATGAAACTTGTTGTTTTTTTGTTTTCCTTTATTTTT:1 - chr2R 23729977 5' - Doc2-element 253 1 60.00 TTTGAGTTCAGTAAATTGAAAAAAAAAAAGAAAAA:1 - chr3L 7108251 5' + Doc 4700 5 74.29 GGCGGGGCGTCTGAACTGAGGCAATTTGGTGGCGCACGCTGCGTATACGCAATCTGTGATGTTTTATAATATAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGAT:1 - chr3R 26494871 5' - Doc2-element 36 1 74.00 TATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCA:1 - chr2R 6164606 5' + Tc1-2 8 1 43.56 GCATGCAATTGTTCTTTTTTCGCCTGACAACTTCTGGTCTATTTATCTGTGTTTTTGTGAGGATTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr2R 18941604 5' - mdg1 410 2 50.50 GGTAAGTGCCATCTGAAGTTGTGGGGGGTTGAGATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTGACCC:1 - chr2L 14392209 5' + X-element 105 1 67.33 TATTTTCGCATCTGCATGCAGCAGGCTCGTTCGAACAGACGCCTCTGTTCTCCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAAC:1 - chr3L 5711830 5' + I-element 409 1 56.44 TTCGAGCAAGAATAAAAAACAAAAAGCAATGGTAAGACGGAGCGAACAAAATCGAAGTAGTTCGGCACGAATAACAAGAGGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2L 19302516 5' + 1360 23 1 63.37 ATCTAAAGTTTTTTTTAATCAAGCCATGACTGAGTCATTGTGTAAATATCAATTTAAGCCGAGAAAGGAGGACAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCG:1 + chrX 462523 5' + Circe 275 1 71.29 ACGAAAGAAAAAATTGTCTGCACTGATGCACTTGTTTGTTTGATTATTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGTCTACAGTATT:1 - chr4 622751 5' + Circe 7308 1 55.45 CCCTCAGGGAAGGGACACACGACAACGACCTTTTGTCTATGCGATTGGCCTAGGGACTCAGATTGCTATGATCAAATATAACATTAACGACAGAATGCCGG:1 - chr3L 13391141 5' - gypsy3 6757 2 60.40 GGCACTGGTGGTGGTGCGGCTGCGGCGGTTGAGGTTGCATTTATTGTTGCTGTTGTTGTTGATGCTGACAGCAACGCTTCTAGTTCGACCTTGCATTCATT:1 + chr2R 10333794 5' - Chouto 5951 1 67.33 TGCTGACCAGTAACTGAATAGCGGGCAAAGCCATAAAGTGGCACGGAAAATCGGATTTCATTTTCTTCTCAGTTAGTACTTCGATTACTAATTTGGTTTTT:1 - chr3R 20922548 5' - Doc 4426 1 61.39 GATTGGCTGGAGTCCCGATTGTAAATAGAAGCCCCATTTCTACCAAATCCTTGAGTTTCTATTAGATGTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTG:1 + chrX 10631097 5' + HMS-Beagle 7002 2 72.28 GCAAAATTAACGACAGTCGCGGGTGGTTGAAGTAAATAGATACTGGATAGATGACAGATGCTATTGTTAGGCAGTTCATCACACAATTTGGCCCAAAGTTC:1 - chr3L 18432944 5' + G5A 387 1 50.50 AAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:2 + chrX 17049560 5' + Stalker2 45 2 66.34 CATGTGGATCTTCTGGTCACCGATGTCGAGCTCCTCTCGGTATAATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTCATTGTCACGGCTCCGCCTGACACTTG:1 + chrX 16589972 5' + gypsy2 283 2 70.30 ATTTATCCAATTTATAAATAAATATCGCCAAAATTAACTAGTTGGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 - chrX 22867423 5' + HMS-Beagle 6804 2 71.29 CATTACTGACTGTGACATAATTGCTTCCACTCCCGGAGACCTAACTGGCTCTTTTTCTAGACTCTGCCTAAATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATAT:1 + chr3R 27300991 5' + F-element 4232 1 73.27 AGTGTGTGTGAGCGGAAGTAGAGCACTTGACAGCCACCAATACCAACAAGTGGAAGACCAGAGCAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGG:1 + chr3R 7463917 5' + accord2 44 2 69.31 TCACATTATTTGTGCTGGACGATTCATCCTCAAAGACTATATATGCAAAGTAAACCAAATACAATAGAACGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGGTAC:1 + chr4 378975 5' - INE-1 558 1 59.41 CTCAAGTGCATGTCGTCATCGTCGTGTTAAGTGCTCCCAAACAAAGCGACATTGGGCTCTGCATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGA:1 + chrX 1525346 5' - 1360 3192 1 68.32 TGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 + chr2R 18891033 5' - opus 7484 2 54.46 GCCTGCACTTAGCCTAAGTATACAGTTCATACATACACGAATAATTCATGCACACACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr2R 19079163 5' + 297 6598 2 55.45 CAATCAATTCATGTATAAGTTTTCCATGAGCAATCATCTAAAGTGATGTTCATCTGCAGCCTTATATCTGCAGCCCCAAATTCAGTGGGTAATAAATAAAA:1 + chr3L 7201128 5' + Fw2 66 1 50.50 GGCTGAAAAAGATACAAAAGTGGCCAGAGATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATG:1 + chr3R 16533200 5' - hopper 288 1 71.29 GACCTCGTTTCTTAGACAGTAAATGGCGTAATTACTGTGTGAAGTTCTTGTGGGGATGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCA:1 - chr2L 6205690 5' + hopper 438 1 62.63 GGTCATATAGATCGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 13824344 5' + roo 8686 2 58.76 AATCCTGTCGCGCATCCTGCTACTCCTGCTGCTGAGCGTGTACGTAAAGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCGG:1 - chr2R 12440749 5' + Rt1a 4785 1 64.36 TTGTACTCGTTTGGTAAATCACAAATGTGGCATAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chr2L 9823687 5' - hobo 2896 1 75.25 ACGAATCCTGGGCACGAGGACGTCTAGTGGATATTACCTTACACAATCGTCTGACAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCA:1 + chr3L 18281865 5' + Tirant 169 2 57.43 AAAAAATTTAAAATAAAGGATACGTTTATAGTTAGTTATAGCGAGTTATAGTTGTTCATTGTATTTCTTCTCTGCTATTGTCTTAATGACAAGTTTTATTT:1 - chrX 573282 5' - Doc3-element 4460 1 53.47 TATCTGTTGTCTTATAGAACTTCCTTAAACAACCCTTAAACAACTTTTATGTATTCCCTTTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCA:1 - chr2R 8119703 5' + Tirant 169 2 59.41 GATGGACAATTTGTGTAATATGATATACCCGAATATTCAATACAATGTTTACTATTAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 31143343 5' + roo 18 2 58.42 CCAGCGCTTGCTGATGATTTCCGTTGTTATTGCCGTTCTGCTGTTTTGGGGCTGCCATTTTCCCTTGGAGGAGCTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 + chr2L 2936692 5' - gypsy3 424 4 62.38 GCCGTCATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAA:1 - chr2R 3760478 5' + accord 30 2 55.00 TATTCACCGCCGAGGATCCGGATCCCCCAAACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCG:1 + chr3L 15762600 5' - R1A1-element 4946 1 69.39 GAGAAATTGTAGCTACCTTCCGCTGACAACATGGCTCACCTGTACAGGTGAGTGGGTTCTGTGGGCTGCTGTTTAGCTGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAT:1 - chr3R 27481911 5' - gypsy2 482 1 80.20 TTAATTTAGTCAGAGATTCTTGATCTGGCAATGCATGGAATGGCTGAAGAGAGGGCGTGGCAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTA:1 + chr2R 4607703 5' - INE-1 299 1 75.25 TGCGAGGCGTAAGTTTAACCAAGTTTATACCACCCCCTAGACATTCCCACCCTCCCTTACCCCCTCCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCA:1 - chr3L 16694188 5' + F-element 4484 1 66.00 TTCATTAGGCGAGCGCGCGCCGCTGTTTCTCTCTCTCACTCTCTCTCGCCCAGCGGGCGTCTGTGTGCACTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCA:1 - chr2R 8649577 5' - Chimpo 15 1 76.24 CCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCT:1 - chr2L 21403545 5' + G5 4409 1 54.00 TGGAATATGTTCATACCCTCTCCGCAGAATTGGAAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 22544974 5' - roo 9030 1 64.36 CAAAATAACAAAAAAAGAGTAATCCTCTATACATACATGTCAACAATTATACAAGTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACT:1 - chr3R 26961747 5' + I-element 310 1 59.41 GATCAGCGGGTCGGAAGGAGAGGGCAAACGCATTGGGGCGCTCACTTACATAATCTGTGTGTTCGTGTGTGTTGTTGTGGGTTTCCTTAGTGGGGCGCCA:1 - chr3R 28444650 5' - gypsy3 398 1 64.00 ACTTTCACATGTGATTTTCCCTCGCGGCCTTATCAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATT:1 + chr3R 28589037 5' - Stalker 63 4 66.34 TAAATCGTCAATTTGAACCGAGTGGTGCACTATGAAGTTTCTATCACTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAGTCCGGTCAGCCGTAAACT:1 - chr2R 12244672 5' + Rt1a 63 1 54.46 AATGAATTTGGGGCAAGATCGTTACGCTTTTAATGCTAATCAAATTGATGAGGAACTGCAATTGCAGCAATTGTGCATCTAAATAAAAAAAAAAATAAAAA:1 + chr2L 17399435 5' + Rt1a 5080 19 54.46 CAAATTTGTTTCGAATGTTTGAGATTTTTATCTGCGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTA:1 - chrX 14505514 5' + hobo 8 1 70.30 CAGGCGCCACCCCCTTTGCCGAAAAACTTTCATCATCGATGCTGCGCAGCATCCCAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTA:1 - chrX 18674443 5' - BS 5011 1 74.00 CGCCAGGCTTGTGAAATTTCTTAGTTGTCTGCCGTTGTCTTGGTATTGTTATTGCCATCGTTGCTGATGTTTCTCCTGACGTAGGGCACTAAAGGGGCCGC:1 - chr2R 18927153 5' + gypsy12 9861 2 70.30 ATTTTTCATATTGGTGAGGTGTATTGCAGTTGGATAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCC:1 + chr3R 9400901 5' - Doc 424 1 71.29 CGGAAACACGCATACGCCCCGTCGCCCAGCCACCCACTTATCAAATTCACCTTCCATTGTTGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCG:1 + chr2L 6282526 5' - invader1 3581 1 60.40 AGCGACAAATTGAGGGGCTCGGGGGACCCGGATACAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATTCGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chrX 1627302 5' + 1360 38 1 67.03 CACCTTAGAATCAGAAGTACACAAGTTCCAAGATTCCATCGCCGCAACCTGGTCCTGATCCGCACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAG:1 - chr2R 25047702 5' + Chouto 447 1 54.46 TACGGATGTGGATGAAGCCGCTGGCTAGGGGATCCAGATGGGCGGACGGTGTACTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTC:1 + chr3R 7416656 5' - baggins 5391 1 59.41 TTGAACCTATTGAGGCGTTACTATTTCGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3L 5827956 5' - blood 355 2 55.56 GAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1 - chrX 22867379 5' + HMS-Beagle 50 2 78.79 AAAAGTGTCTTAAATGTAGCCCAACTTAAGTACCGATTAGATAAAGAACTCAATGGCCAGCAATTTATGAAAGTGATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACT:1 - chr3R 17789005 5' - roo 9069 1 77.23 CATGCACTTCATAATTTGCTAAGTGATTTTCAAACAGCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:2 - chr3L 10378969 5' - mdg1 7419 2 67.33 GCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1 - chr2L 14536291 5' - blood 7335 1 76.24 TACTTACATCATGCAATTAAAGTGGTTAAATATGTGAACACCCTTACTTAAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCAGGAG:1 + chr2L 7282255 5' + TAHRE 308 1 55.45 CAAATTGAACTAGATTATTTGCATATTTTTGTTATAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAATTGGGGTTTTTTCCATTC:1 - chrX 8173578 5' - Idefix 6961 2 68.00 TGTCAGTCCCCTTGTAAAAAAGTCTTCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCC:1 - chr3L 14757507 5' + F-element 458 1 70.45 AACATCCAGTGCAGTTTATATACGGTCCCTGGAGCAACAGATGAAAAACCTTCGGTATGCATAAACAAGCAGCAAAAACTATCCTAATATGTACCATGTAA:1 - chr2L 17597539 5' + 1360 3144 1 75.25 TCAAGTTCATCGAAATTTATGATCACTATACATATATATGTATGTATGCATGTGGGTGGATATGGATATGGATGTGAATGGAAATGGAGTTTCTTCTATTT:1 - chr3L 17047705 5' - 297 6505 1 81.19 AGCCAAGAAGATAGCCAATGAGTACAAGCTTAAGGAGCCTCTAGTTGGTAAACCTAAAAGAAAATCTTGGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTCTCAGAA:1 - chr3R 10044838 5' - baggins 5020 1 75.25 CGCTTNCGGTTAAGGGAAGGCGGGGAATTACTTTGCTCGGCGCCAATAGAGGAGTATAAGTTATTATATAAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGT:1 - chr3R 15000133 5' + Chouto 10 1 62.38 AAAGACGGAGGAACCCTACGTATACATATTAGTCAAGAGCGAACTATATGGCCGATTCCCCGAATATCAGACACCCGTTGCTCAGCTAGTGTGAATGCGAA:1 - chr2R 5987969 5' - INE-1 531 1 58.42 AAGTTGGTACACTTTGAGAAATATAAATCACTTCTTCAATAACAAAACAGAACCTTTCGATATTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGT:1 - chr3L 4652727 5' + R1A1-element 5073 1 67.33 TACTTTTTGGATCATGCTAAAATTGCAATATAGCAAAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATAT:1 - chr3L 15276388 5' - hopper 1120 1 66.34 ACTTGCAAGTAGAAGAGGGCACAACTAAATGCTAACAAACATTTCCAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCG:1 - chr2R 24093732 5' + Doc 461 1 53.06 GAAAATTACAAGAAAAGTGGCCGAGTGGTTGGAAAAGTGATGGGGGGTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAA:1 - chrX 7647669 5' - HMS-Beagle 6689 1 57.43 AAAGAATCAAACACTTCCTCAATCGATGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCC:1 + chr3R 8846858 5' + Doc 373 1 80.20 AACCTGTTGCCTGGTAAACAAAGCCGTTAGCGAAGCAGAAAACGTGGTCAAAGCATAGTAAATATTTGAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr3R 5208116 5' - hopper 1411 2 75.25 TTATCCCTGGACTTGCCGCCATCCTTCTCCTCTGTAATGTCAACGGTTGAGAAAGACATCTGGAATATGAAATCCGAGTCGCTATCATCGCTTCCCAAAAA:1 - chr2R 19364343 5' - transib3 2530 1 76.24 AAATGAAGTAATTATTTTACACTTCAACACTTTGAAAAGCCGGTGGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGT:1 - chr2R 16992681 5' - Transpac 5164 2 55.00 TATATAGGTATGTATCAAATTTGTTGTTGCCCTTCAAGTGATTGCCCCACATCTAGTGTTTCAGCATTGTTTCTGGGTATACACAAGTGCTCAAAATGCTG:1 - chr3R 10388408 5' + HMS-Beagle2 6942 2 72.28 TATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAAATGAGCAATTGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 13280126 5' + jockey 22 1 64.91 CTTCATCTGGGCCTTGGTGGGTGCTTTGAAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGGCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCC:1 + chrX 17628467 5' - Quasimodo 7099 2 70.30 GACAAACTCAAACTGCCTGCAGCTGGAAATCTTTTACTCTTCGGCTTCATCATATAAAAGCGAAAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTAAAAACCTT:1 - chr3L 21083995 5' + Porto1 122 1 53.47 GTGCCTGCCTGCCTCCTCGGATGCCTTTATATCAAATGCGGTTTTTATTTCACTGCAACAACAGCCGCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAG:1 + chr2R 11029456 5' + HMS-Beagle2 6837 1 73.27 TGTCTNAAACATGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr2R 4901592 5' - Transpac 5188 2 70.30 GCGAGACTCCCAAACCAACTGCTCTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAGCTTTAGTTGCATGACTTGCTGTTGAGAATGGTGGCCACCAGCTGTGTCATC:1 + chrX 2833891 5' - G6 1566 1 74.26 TTTTCAAACTCGACCAGTCAATGACATTGCCCACAACTCAAGAAAGAGCACGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACCCCCAATCTCCAGACACTTGCGA:1 - chr3R 24015827 5' + Doc2-element 490 1 73.27 GGTTCAAATTTCTAATAGAATTCCTCAAAGCAGCCACAATCAATCAGTCAAAAATGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTC:1 - chr2R 11396405 5' - micropia 410 2 58.42 GCTCTAACTACTTGCAGTTTATAACGCCTCACAAGTGCCATTAATGTGTACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chrX 3306589 5' + hobo 27 1 60.40 AGACAAGCTTTTGGGGCAAGGGGGGCTGGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGC:1 + chr3R 8419519 5' - Doc2-element 4564 1 78.22 GGGTGAAAAATCAAAGTCAAGCAACAAAACACGCGGTTGTGGATGGTCTTTCGTTTACCGCCGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAG:1 - chr2L 19736245 5' - Doc 442 1 64.36 TAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 22564807 5' + blood 20 2 59.41 ATACGAACGAAAGTACGAACAAGTATGTATACACAGAGTGACACAGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATG:1 - chrX 964584 5' - jockey 4591 1 55.45 CACAACATGGCAAATAATTTAAGCTACAAACTTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCT:1 - chr3L 980201 5' + Juan 316 1 77.23 CGCACCTTACAAATCAGGTAGATAAGCAGCGCGCCGGCGATCGAAAAAAGCGCAAGCAACTGGAAGCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATA:1 + chrX 259567 5' + F-element 309 1 70.30 TGCAGCAACAACATGCGTGAGTGACCCAGTTCCCTGCGCCGAGTCGGCTCATCTCATCTGGCTTGGCGGAGCTATTCAGCTGCTGTTGCTGCTGCTGATGG:1 + chr2L 1647110 5' - TART-B 151 2 73.27 CTGTTGAATAGAGCCACAGGAGGAAGGCGGCTGCAAGAGAGGTCCACCAAGAATGGTGGGTTGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAA:1 - chrX 5008627 5' - Doc 407 1 65.35 ATACATTTTTTTATTTAGCAGTTTATTTTGCAGCCCATGCTGTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCG:1 - chr3R 7629535 5' - 297 182 2 58.42 GGCCATTTGTTGTTACCAATATCTCTGCTCGTTTTGATGGATTGGGCGTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGGCTAACAATAAGATTTCA:1 - chr3R 18116170 5' - Doc3-element 4674 1 54.84 GGAGAGTGTGTGTGGAAATTTAGAAACTGCACAAATTGTGGCACTACGGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr3L 21982088 5' - hobo 2884 1 52.48 CATAATTGCAAATTCCGTTATCAGATCATCACGAATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTCGCTTAAACTCTGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGAT:1 + chr2L 17314626 5' + rover 7143 2 66.34 GGGTGCAAGTGCACCGGGCGGAAAGTGTGCTGCTTTTGCCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 - chr2L 2858074 5' - transib2 2790 1 59.41 CGTCAATTTTAAAGATTATTGTTAACTAGCTTAAAAACGACTGAAAGCGATGGACTGTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTG:1 + chr2L 7230816 5' - Bica 255 2 62.38 AAGTTCATAGGTTAAGCCGAAAAAGCAGGTATTTTTGGGCAAAACAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAG:1 - chr2L 16201895 5' + flea 4832 1 55.10 AATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr3L 27415301 5' - transib2 2804 1 54.95 GCAAACATTTGCGCACTTTATCATCTTTCCCATTTCCCATTTCCCGACCCCTGGCTTTGTGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATATTAGGATAAAGT:1 - chr2L 19370181 5' - Cr1a 4216 1 64.00 AAGGGGCGGGGATGAAGGGCCGGTTGAACTAAATGAAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTGGCTGAGCTT:1 - chrX 727950 5' - Quasimodo 497 2 65.00 CAGAGATGCAAATTACATTCGGAGATGGAAAAGATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTCGTTAGTACTCCTTCCATATATGAGGGAGCTGTGAAGATTC:1 + chr2R 15448136 5' - Q-element 25 2 76.29 TTAACTATTACTAGGCGCGTTTCGTTTGTTTTTGTTGTTGTTGTGGTTGTTGTTGTTCTTGTCGGTTATGCATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGG:1 - chr2L 2954077 5' - Quasimodo 27 2 66.67 AACGGTCTTGTATCGTACTATCGCCAGTGAAACAGCAGCAAAAGAAGCAGTCTTTTTAAGAAGACTCTAACAAGAGATGGGATGGTTCGACAAGGGGCCAT:1 - chr3L 23593346 5' - frogger 467 1 70.30 GGAAAGTAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATATGAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 + chrX 14625478 5' + invader4 34 2 61.39 AACAAAAGCGTGGAGTTAGGAAAGTCCACTGGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACGGGGTTCCAAGCAATTTA:1 + chrX 3003785 5' + Juan 221 1 67.33 CACATACATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATGCGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGGGG:1 - chr3L 776147 5' + 1360 47 1 68.32 GGGTGTGTCTGCGGGCAGTGGTGTGCTCATGATGTCAATGGATTTCTGTGGACAAAGCGAATACGGGTTAGCAAAATTCTCAAGCTTTTCCTCCTGTTCTA:1 + chr2L 18764598 5' + Gypsy12A_LTR 2018 1 73.27 CAGTCGCAACCAGTCAATAGGGCAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGTCGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCA:1 + chr2R 6229869 5' + Bica 4660 1 77.23 ATTTGGACTTAGTTCTTATTAGCGTTCGGTAAATATATTGCGTATACGTCGTGTTGGCAGGCCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCGACGCAACAACGCG:1 + chr2L 18207601 5' + F-element 248 1 63.37 ATGGCATTCCCGAATTGTGACAGATTTGGTTAAATTGGCCTAATCAAAATCGGAATTGCAATTCCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chr2L 10081035 5' - mdg1 408 2 63.37 ATTCATTGGGGTCTTCCTTCAATTAAAGTCTTAATTGGATTATTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTTCTTAATCTTA:1 - chr3L 25800408 5' + gypsy12 10073 2 71.29 TGCATAGTCATGGAATCTGGTCAATGAATCGCACCGTGGAGAGGTTATTCTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAG:1 - chr3R 10034399 5' - G5A 2674 1 70.30 ATCAATAGCAAGACAAAAAGAAAACACAACAACAACTTTTTAAAATCTTTCGACGTGGCAGTGGTGGGCAAACATGGGCAAACGATTCCAGCTTTTAAATT:1 + chr3L 23000454 5' - FB 40 1 60.40 TACGCCGACTGCTAAACAGCTCCTCTAAACTCGATTGCCAATTTTTTTCGTTCAGTATTTCTGTTTTTTTTGTTTTGCTTTTTTTTTT:1 + chr2R 15026812 5' - Doc2-element 252 3 63.64 TTTTATTGCAAGGTTAAAACAGTTTGGTCCGATCGGGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGACATTA:1 - chr3L 5132755 5' + invader4 185 2 75.25 ACTTTTTGCAGGGCATTGCCAACTGCAATAGCCTCAATTGTAGAGAGGCCAAAAATGTCAAATGGCGAGAAGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCG:1 - chr3R 28129131 5' - FB 201 1 74.26 TGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 18865898 5' - roo 9028 1 70.30 TATTGTGGAAAGCCGGTTTCTACGATTAGTTTAACTTACTTCTATTTGCTGCCGTTCTTTCCTTTTTTTTTGTTTCCTTTT:1 + chrX 20083218 5' - Doc2-element 224 1 69.14 GATGTCATTTGACTTCGCATGAAATCATAAAGCTCAACTGACAAAGAAATTGTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr2L 20230071 5' + pogo 21 1 58.42 TATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATG:1 - chr2L 21657038 5' + invader1 3645 2 73.96 AGTGCCATGGAGCAGCACGTTGTGCATGTAGCGGGCGCCAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 12728645 5' - opus 7460 2 67.33 CAGAAACAGGAAAAGAAAATGCAACAGCAAAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCAGAGATAATTCATCTA:1 - chr3L 22832827 5' - micropia 5150 2 70.30 GGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGC:1 + chr3R 26331662 5' + G-element 46 1 69.47 AAATTTCGTATAAACTCATAAATACGGTAGAAAATTTTAGCGAAATAGCAAAACATAGTATAAAAGATATAGACAGACTAAGAACACATGAAAATAGCTT:1 - chr3L 2362725 5' + G4 3625 1 59.00 AAGCAGGAGGGGATTCCCCATGGCCAGCTACACAAGTACTACTCACTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 + chrX 17187028 5' + HMS-Beagle 6804 2 47.00 CACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr2L 7654018 5' + jockey 56 1 73.27 AACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGT:1 + chr3R 19445152 5' + flea 4819 1 65.35 CCCGCCTGGCACCAAAGCTCTCGGAATGGATGATGCGCACCAGCGCAAAATCAATAGATACGACAGACCGGACATACGAACTGAATTG:1 - chr3L 6283748 5' + R2-element 3117 1 71.59 TTATACATAAAACCATCATGCACATCTGAGCAAGGCCAAACTATACAAAAATTGACGCGACTGCATTCACTAGTGAGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGAT:1 + chr3R 25776037 5' - diver2 4859 2 78.22 AAGGTNTGCTATGCAAATGCAAATGCAAAGCGAGCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCGCTCGCTTCCGTGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGC:1 - chrX 10345160 5' + blood 7180 2 82.18 GGACTGTGAATACAGAAAATTTATCCAATAGTATTGCCATTTAAAGTACTTATTAAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr3R 25876338 5' - flea 4997 2 63.37 CATCCCTGAACAAACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 28623900 5' + roo 36 2 65.35 TTTTGATTTGATTCATGAACAACCTATCAGGGAGTGAGCTTTGAGTTGTATGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTTTTCGCTCTCACTCTATCGCTCTTT:1 + chr3L 25337287 5' + Cr1a 290 1 57.43 ACTCCACTCTTGACTCCACCAAATTCAAACCAGACTCCACATAGAATGCCAAACCCCGAACTGCAACGTCTCCAGAGGCTTCCAGCGAATCGGTGCTTCCG:1 - chr3L 11354121 5' + HeT-A 5720 1 59.41 AGTAGAATGCTATATTTACTGTAATGGCTACTCAGATGCAGCTTTCTTTCGCACATTTTTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1 + chrX 3050645 5' - I-element 5341 1 65.35 ATTGAACAAGGAGCTGCCGGCGTAGCTGGCGAAGGAGAAGGTTCGTATGAGCATTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATG:1 + chr3L 8112675 5' - 412 7282 2 62.00 AGAAATAAAACTGCTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 - chr2L 17862288 5' + F-element 12 1 73.27 AATCGAAGATGCAACTCGGCGACATGGTAACGATGTGGGGAATTAGGCGACATGCAGCACTCGGAAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCT:1 - chr3R 23364166 5' - ZAM 7961 1 34.65 GTATGAATAGCGTTGCTGACCTGTTCATCTCATTGGTAAAAGTTAAAAATTGTCTGTTTTTCATATATGTATATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 - chr3L 23228573 5' - mdg3 5492 2 80.20 GTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr2R 13314154 5' + jockey 62 1 82.18 TTTGTAGATAAGCCAACTTTGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr2L 22319372 5' - Transpac 5218 2 68.32 TAGACNCGTTGTCAATTAGCAAGGATTTAGCAATCAGCCATGCCAGTCTCTGCACTTTTCTCTCTCACATCGAGTCCTTTTTCTGTGGGAGAGCGAGAGAG:1 + chr2L 6460006 5' - Cr1a 306 1 66.34 GGTGGGCGGCACAAATTGCGTCTGCTTGTCGTTGCAGTCGCCGCAGCCCAAAACCATGCCCACATCGGCTGCCCCTTGTCAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 28204578 5' + Doc2-element 218 2 56.44 AGAAACCAAACAAAATAAAATAAAGGCCACAAAAGGAGGCTACACTCGAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTGTG:1 + chr2L 5146654 5' - Quasimodo 38 2 67.33 AATGANTGTGTGCAAAGGTATCGGGTCAGAGCTTGGATTTTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTT:1 - chr2L 18315970 5' - 412 7233 2 60.40 TCGTTCTGTCATAAACACGTGTGAGATTCTTCTTGATGTCATTCCCGAGGGTGCTATTGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCT:1 - chr3R 3470135 5' - Doc 4564 1 68.32 CAACTCCTTGGCCAGCCGCTCATTGCTTCTGATTATATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGT:1 + chr3R 15913701 5' - 297 6824 2 65.00 TTTGCCAGCCCAAGATGCCAATTAAAAAGAAATTGCTCAAGTGCAAGGGCATACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1 - chr3R 21819421 5' - INE-1 82 1 54.46 ACCTCTTATAGTACATACATGCCTATGAATCTAGTATACCATTGCACTATGGGTAAAAAGCCGGGAATTTTGGTATTAATTACAATTATAAAGATAGCGAC:1 + chr2R 5143480 5' - transib4 2600 1 73.27 GACCAGGAGGCCATGCGTCTGCTGCTGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCAT:1 + chr2L 11179577 5' - G2 2845 1 75.25 CAGGTGAGTTAGCCCACGATATCTCTAGTAAGATCACTACTAACCGAATGTACTTCAATCCACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGG:1 - chr3L 436203 5' + F-element 420 1 64.36 TGTTTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr2R 19726845 5' + 1360 22 1 58.42 TCCCGATAAGAGGGTTGTAAAAGTACAAAAAGCGGGAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGC:1 + chr2L 7843787 5' + 412 298 2 62.50 CAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:2 + chr2R 10315297 5' + Doc 81 1 72.28 CTGCTCCTTTTCGAAAAACTTCAGTGCGCTTTTATTTCCCCGCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGAC:1 + chrX 15319598 5' + F-element 4248 1 58.42 TAGCTCTAAAGTTTTAAAGTGATTTTGATTTGATCAGTAAACTTAAATTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAC:1 + chr3L 10464629 5' + invader3 5204 2 55.68 CTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chrX 21668899 5' - mdg1 366 2 80.20 CACGTTTCCCTTCTAAGATAAAATTATTATATTCCTTACTAGTCTAGTTGTATTGCAAACAGATTCAATCACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGA:1 + chr2R 19701668 5' + accord 7211 2 71.29 CCCACATCAACTGCATGCAGTTCATCGAAGCGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTAATGTCTGTTGGATTGGGTTCCC:1 - chr3L 12531730 5' - Quasimodo 287 2 72.73 ATTCACAGGAGAAGGGAAGTTTTCCGTGTGTGGGATTTTCTCTGGAAGAACTTGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCCTTCT:1 + chr3R 7977219 5' + INE-1 572 1 57.43 ACTGGTCCGTTGTTACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr2L 1353783 5' + I-element 28 1 54.46 TGGCTCTGCTTCTTCTTCTTCTGGATATTCTCTAAACGAAATACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1 - chrX 15161769 5' + invader3 5251 2 59.41 AAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGTATTTATAAACACATACATACTATATATGTATGTATATATATTC:1 - chrX 11541537 5' + 1731 4411 1 55.26 AGGAATGTGGCCAGCTTTTCGTATGCCCACGAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chrX 16681204 5' + Bari2 907 1 63.27 ACATGTTATGAAATACGTCTCTAGTCTGTTCAATATAGATTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr3R 11685545 5' - mdg1 7450 2 67.33 ATGATTTAAGTGCCCATTTTTCTGTGTGTACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr3R 27619296 5' + hobo 6 1 71.29 TAAGTGCTCTTGGATAAACAGACATGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACG:1 + chr3R 18860332 5' + R1A1-element 5033 1 55.45 TGAGCGCTGTCCTTGAGAATGGGGCGGCCGAGAAGGCGGGCATCAAGAAATGCGATAGCCTCCATTAAACATCCATTTTCGTAACGAAAACATTTTCATTC:1 - chrX 5737147 5' + X-element 154 1 55.45 AGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr3L 2182727 5' + blood 39 2 62.38 CAAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCCC:1 - chr3L 947909 5' + hobo 53 1 73.27 TAGTTAGATTAATGAAAATAAATCATAATTTTATTTTAGTGCAGTGCCTTCAGCTGTTTGTATGTGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTC:1 - chr3R 13629874 5' - 1360 117 1 62.38 ATTGCTTACCAAGTCCTCCATTTGCGAGCGTAAATGATAAATTTTCCATCCATTGATTTTGTCCTACATCCTTCTGGTCTCAGCTTTGGCGTTAGCCATCT:1 - chr3L 12812438 5' - gypsy8 4520 1 60.40 CGTCCTTGTCATTGTTTGCTGATGCTGTAGTTGTAGTTGTAGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGTGTAGGCG:1 - chr2R 19081272 5' - ZAM 50 2 57.73 CACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chrX 21087571 5' + mdg3 5268 2 60.40 ATCGAATTTCGACAGGGGTTTCTATTAGCTACGAGCACTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 17072951 5' + roo 32 2 64.36 CCCAAATGGTGCCACTGTAGCAGCTCGAACTGATCGAAGGGGTCAGTACACCGCGGCAGGAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGT:1 + chr3R 4856421 5' - Tirant 472 1 62.38 TTTATGATATCACAAGATATAATTAAAATAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATT:1 + chr3R 5775651 5' + invader4 2771 2 67.33 GCAAAGGCTTAGGTATGCAAACATTTTTAACTTGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGT:1 - chrY 1447222 5' - G2 2827 1 66.67 CAGATTCATGATTCTTTTACATGCATTGCACTTCCGTTAGTGCTTCTACTTTGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGATTGCTGGACTCGTCAAAAGG:1 - chr2L 18628956 5' + R1A1-element 338 1 54.46 AGAGCACACAAACGTGTGCGTGAGAGAGCGAAATCGGAGAGAGGGCGATTTGTTAAATTTTGGCTGTATGCGGGTGCGGTTTGAGACGCTGGCAGTGCCC:1 - chr3R 21582051 5' - G-element 3934 1 67.00 GTGAAGTCAACGCGGGCCATTGATATATGGGCCTTAAGTGAGTTTTTTAAGTTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGA:1 - chrX 7973641 5' + invader2 114 2 56.44 AAACGACAAACGGCAACCACAGAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr3R 14832390 5' + blood 7027 2 59.38 ATAGGNTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAA:1 + chr3R 5775678 5' + invader4 39 2 65.35 AAGTAAATTATAATAGGCATAATAAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATG:1 - chr2L 19092229 5' - I-element 5045 1 76.00 ATGTACGAACAAATGAAGGAAAATCTCAAGCCTAATTCCGCATTAAGCTGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr2L 15020090 5' + jockey 4694 1 52.48 CAGGACTATGTAGAGCACACCCACCGATCTGCCCGATCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCT:1 + chrX 20754748 5' + I-element 5015 1 63.37 CACTGAGCAGCGACACGCAGAATGGAGCTGTAAGAACAAATGTATAGGGTCTCGGATAAACCAGTCGGCGATCCATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGG:1 + chr2L 20700233 5' - mdg1 7227 2 45.54 CTTGGGGTCTCTTTTTATAGTGGAATTTCGGACATAATAAGGGGAGTTTAGTATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATT:1 - chr3L 23725820 5' - mdg3 5306 2 54.46 TCGCAGCTTTCGGAGTTGACCTCCTTCAGACCTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGA:1 + chr3R 3854475 5' + Idefix 94 2 70.30 TTGAGGGTATTACTATGTGATAGATTCTGGGGTGCTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 3254940 5' + 1360 1 2 79.21 TCTGCGGCGTGTTTCCTGCAACGCCTTGCCCCCATAACATCCTAAACCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr2L 23189204 5' - 1360 3362 1 70.30 ACATTGGCACCCATTTTCTACTTCCTTGTCGTCAGGAATGCCCTATACCTTTTTTTCAGGGTGCATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCG:1 + chr3L 14553103 5' + blood 259 2 64.36 GGAGCCGAACGAAAATGATATTTCACAGGGGCAGTAATTTAGTTTATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGTTGTTTAACACTTCACCTTTAAAAGC:1 + chr3R 30923807 5' - transib2 154 1 55.45 CTCCAATAAATTGAGGAAAATCAAGTTCTCCTCGCCCTCGGAAAACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGA:1 + chr2R 11073647 5' - opus 129 2 56.44 TTTTCGATTCATCCATAATCTGATAGTACCGATGTATGAAATATATGCAGGAATGTCAGGATAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAG:1 + chr3L 10630233 5' + Bica 10 1 54.46 CAAAAAAGAGCATCGCAAGGCGGGAAAAAACTAACTCAGAGCGCAGAAGCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGCTGTCTTTGG:1 - chrX 5886358 5' - Stalker2 317 2 58.42 TCCATGGGACCTAACAACCAGCAGGCAGAGCGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCT:1 + chr3L 20227119 5' - Doc 326 1 79.21 CATTTCTCATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1 - chr3L 14005637 5' + F-element 36 1 48.51 CAATAAAAATAAAAGCAATTCAAACCAATTTCATATTAGTTGAAGTTTAAACAGAAAAATCCTTCGAAATATTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTT:1 + chr2L 7363435 5' + 1360 3151 1 71.29 AGGAAAATCTGAGGCATCAGCTCCCTATTAAATGGAGGGCGCGTCGCTAATGGATGGGGTTAATGGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAG:1 - chr3R 17343548 5' - baggins 5132 1 65.35 GCAGGGCATTGTTGAACGGTTAAATCTTAATTAATTATGCGTCGATTTTATGTTTGAAAACTCTGAGAAAGCAGACGCGTGAATATGTCGCAACCGAGGAA:1 + chrX 19223276 5' + invader6 4803 2 57.43 ATCATTTTCAAATAAAAGCAAATCCTTTGCCATCATTAAGTTACACACCCCAAAACGACTTTTGAGTTTCGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAG:1 - chr3L 2786511 5' + R1A1-element 5074 1 70.30 CGACTTGAGGCTCTGCGAGGATATGGGTTTGGCGCCCAGCTTCTTCAGCAGCGAGTCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACCTCGATTTCCGACAAT:1 + chr2R 14902929 5' - flea 4823 1 57.43 GCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACC:1 - chrX 22386763 5' + hobo 84 1 61.39 ACCAGAAGAGCCCAATGATGTGCAAATCGCAGTCAAGGAAAAGGTCAAATCCAAAACTGCAAGTTTAGAGACTGGTTGCATCATTGTCCTAGATAGGCCGT:1 - chr3L 2050048 5' - aurora-element 3961 1 56.44 GCGCATCACATGTGCAGTAATTAGGACTGGTAACATTATCATATTTTAGGGTATGTTTACAATTTACAATTGAAATGATTTTATAGAAAACATTGAAATTT:1 - chr2L 21806795 5' - TAHRE 10158 1 80.20 GCTTATTGTGGGCTTCAACGCTGTGAGTGGCAGTGCGGGAAAAGGGGCGTGGCTGGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCAC:1 + chr2L 1551638 5' + Idefix 160 2 51.49 CAATTGATTCATGGCTTTAATATTACTTTAACGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3R 9193643 5' + roo 8709 2 72.28 GGAGGATGTTTCTTTCTAAAATGTAATCAAAAGGAGCGCTGCTATTTGCTAGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTCGACCCTTAAA:1 - chr3R 4418541 5' - Quasimodo 366 2 58.42 GCAAGTTCAGCTTTTTATGGTCATTACCAACTAGGCTAGTAGGTGTACTGTTTGTAGGGGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATCACT:1 - chr2L 19157314 5' - baggins 5385 1 67.33 TTGCATAATTAAATTTACTGGCTGTACAATTTTCCATAAGAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTA:1 + chr3R 7770862 5' + X-element 41 1 50.50 CACCACCCACCCGACTGGCAAAACTAAAAGCAACAGCATCAAAAGGAATATGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 + chr2L 18286091 5' + 412 3 2 76.24 AATGGCCAGAGATACGCAAGTATCTTTCGTATTTCTATGAATGGCATGTAGTTTAAATTAAGATACTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGC:1 + chr2R 24326673 5' - Bica 480 1 68.32 CCCAGTATTTGTGGGCGTCGCTGACAGCTAATTTGTATTTTTAGGCAATCATTTTGCTATTCGTACTGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACT:1 - chrX 16831697 5' + Porto1 429 1 70.30 TAGACAACCGGCAGACAGTGCCATCGGCCAAGAAAATAGTTGGAGTGTGGAGTTACGTACATACCCCAATATCTATCGCTATCCCAGAAAAATTATGCAAT:1 - chr3L 13177152 5' + INE-1 509 1 60.40 AGGAAAGATTCTCAACTTTTCCACACCACAAGGAACTTGACATAAATCATACTTAATGCAAATCATCTAAATATTACTAAACATTCCATTTCATTAATACT:1 - chr2L 18346411 5' + jockey2 3260 1 69.31 TACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr3R 22675827 5' - 412 441 2 78.22 AAAAGATTGGCAATTGCGGGGGCCAACCCAAGCCAGCCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGA:1 + chrX 1583757 5' + G6 364 1 59.77 CTATGTGAAGCAGGCGCTGGCCGCCAACGAACTTCTAACGCAGCTGATCAGTGGACACGGTTGCTTTCGCAGCTATCTGAAGCGCTTTGGACATG:1 - chr3R 11677719 5' + Rt1c 5035 1 65.26 CTGCCCGTCTTGTTGCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3L 8763210 5' + jockey 24 1 60.40 TTTGANTTTGTCATTCGCATAAGTGGCTCCCAGAAGCTCCAATGCTGTGATCTGCTTTTATAAAAATTGGTGCCAGGTTATAAAACCTGGTCAGCCAAAAA:1 + chr2R 20664271 5' + Cr1a 483 1 54.46 TATAAAAGCTGCAAAAAAAAAAACATGAACTACCAAGCTAAATGTTTCAATAATATATAATAAAACCAATATGACCGTATGGACTAGAACTCTGGGGAAC:1 + chrX 3796828 5' + Porto1 4276 1 68.00 GTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr3L 22564832 5' + blood 45 2 74.26 ATGACGACTCCTAGCTCCACTGAGCCAGACTCAACTGAGCGGCACTGAGCCATTGTTTTCCTAACCGTAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAA:1 - chr3R 23560582 5' - accord2 7261 1 76.34 AACGCTCATCTGCTTAAGCGGAAAAGTGTTAAAATTGTTTCGCGGTAGGGTAGAATGCACAGAAGAACATAATTCCCTTGAAAAAATGATTTTGAAATTGA:1 - chr2R 22524435 5' - Stalker4 6863 1 39.60 CTTGGCAGCCACCTCTTGGCGCACCAGAGTCGCGGATCGAATATTGTTGTCGATAGGCTATAGTTAGTATTTTGAGAAGTCCGAATGTGGAAGGATTTGTA:1 + chrX 5319454 5' + aurora-element 4099 1 72.28 GAGGCTTGTCAATAGCGAAATACAGTGTAGTCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 + chrX 22867316 5' - HMS-Beagle 7023 2 58.42 GTTGCTTACATGACGCGTAAGGGGGTTTTAAAAAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGG:1 - chr2R 19463847 5' - Doc2-element 409 1 74.00 TAGCCAAGTTAAGCAGAAGTTAACCATAGTAAGTGTTCATTCAATGTTTGTGATACCCTAAGTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATGTGCTGCTGC:1 + chr2R 24490091 5' - Bica 4582 1 64.36 ATTCAACATTTCAGCTCGGCATACCGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTACTACATGCTCTATGCATA:1 - chr2L 19811881 5' - G4 3743 1 66.34 AAAGCATTATTCCGGTTAGACCACAGTGCCGCAAATGTTTGTCGGTTCTCGTTTTGAGTTTTATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - 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chr3R 32016145 5' - gypsy3 6836 2 74.26 CTTACNATGTGCCGTTCTGGTAGTAGTGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 697496 5' - roo 9022 2 75.25 CGTAANCACTGGGATCGTAAAATCCGTTTCGATTTATAGCCATTATAATGATATTTATAGCAAGCCACTAAAGTCACAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr2R 11728677 5' - mdg1 7409 2 78.22 CGGCCCATTCGATATTTCTGAATATTTCAGCGCCCGCCACGGAAGCCAGATAAGAAAAAGACTGTTATACGATCCTCGAGAATAGAAAAAACCCCAATTCT:1 - chr2L 19716678 5' + Idefix 145 2 55.45 CTCCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2R 21266509 5' - roo 389 2 61.39 CACCTATTCGGATCTCAATCAATTAATTTGCACTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr2R 16018846 5' + I-element 43 1 67.33 CGCATGTGGCCAAAAGATTTTTGCCCTCTTTTGCCAGTATTTGATTGAAGCTCTTGTTGGCGCTGCCGTAGTATGTGCGAGTGACTTTAAACGGTGCTAAC:1 - chr2R 15112240 5' + Stalker 467 1 73.27 ATGTGNGGGCTGGTGGGAGATAAAGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTAC:1 + chr2L 14823002 5' - 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Ivk 5236 1 62.38 TGAAAGGTAAAGCTAATAAAATCTTGGAAAAATATGTTTAACTAGTAGTATGCTAATATAAACATTTTATAGTTCCTGAGATCGAGACGTTCATACGGACA:1 + chrX 8453826 5' - INE-1 132 1 62.38 CGAATGCTTTAAATTTAACAGGTTTTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTTTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGAGAT:1 + chrX 4798972 5' - Cr1a 4160 1 73.27 GTTTCAACTACGTAGACTAAGTTGCACCGACACACAGTGATGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGT:1 - chr2L 9227630 5' - I-element 5140 1 60.40 TATATTATTTTACCATAAGGACAAGAAAAGGGACTCAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAA:1 + chr4 954403 5' - 1360 407 1 70.30 GAATTGCGCCGTTTTTTCGCTCTCAAATAATGCTCCAAGCTTCCCGTTCGTCGCTTCCCCACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGT:1 - chr3R 23723310 5' + Transpac 5050 2 62.38 ACTAAAAACTGAATGGCTGATTATATGGAATAATAGGTATTTTTAAAAACCATATAAATACACATAAAAATTGAAAACAAAATACAAAAAAAAAAGAAAAA:1 + chr3R 30753279 5' + F-element 4687 5 55.45 ACTAATAACCAATAAAAAGTCTTAAGGCTTCCTGAGCTCATAAATGTTATTTTCAAATAAACTACCTAGCCACCAAAACTAAAACTTGAGACAAATACCGA:1 - chr3L 13256746 5' + Porto1 4483 1 56.44 GCGGCTAGTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3L 22564793 5' + blood 6 2 71.29 GACTATGACTGGGAATGAATGAGCAGACAGGCCAACTTACAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGA:1 + chr3R 17781472 5' + Idefix 87 2 60.40 AGGCGCAATGTGAAGCTGCCTACAGGGAGCAAAATAAGTCCACATGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATT:1 - chr2R 16632127 5' - G4 3370 1 67.33 AATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2L 12843381 5' + roo 50 2 75.25 GCCGTGTGGCGCCTGTCTGATCAAAAACAAATCCGTCAACACAATGCCAGCCACGTTGACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAA:1 + chr2L 11927730 5' - 1731 4273 1 64.36 ATTTTACATTGGTCTTCTTTGCGCTGCTTAGCTCCATGGGATCGTGCTACCAATGGCAAAATAGATGTAATAAACCAATATAGGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr3R 9996473 5' - blood 363 2 64.36 GAAATTTTGAAGTTTCCTTCAACTTTGACACTTTGGGCATGACAACATTTGGAAACAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAA:1 + chr3R 4139204 5' + Cr1a 3978 1 60.40 GGGGGCGAAGGGGCGTGGCCGCGGTCAGTCAAGAGCGCAGTCTGTGTGTGTGTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTG:1 + chr2R 22622729 5' - 1360 3217 1 55.00 TTACTTAACTATTATTGTCTTGGCACACACACACCTAATCATCACACCACACTCTCGCACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGC:1 + chrX 5562572 5' + 1360 3283 1 48.51 GGAGGCGTGTTTCACATGCAAAGCAGGTGACACTGCCACATTGCCACGCCCACCGACTCATTACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGC:1 - chr3R 18939532 5' + X-element 4338 1 61.62 TTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - 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HMS-Beagle 205 2 68.32 AAATTTGTCGGATGGTTGTTGTAAGTCAAAATAAATCGCAAATAAAAGATTAATACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAA:1 + chr3L 21809467 5' + I-element 4916 1 61.39 GTGAGTGGGTGACAAATGAATGGGCAGCAAAAAGACGAGAAGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTC:1 - chr2R 11615635 5' + Quasimodo 261 2 59.41 TCTAAACAGAGGATTGCTTGTTTCTAATTCCAGCTATGGAGCCAGTTACGACCTGGCTGCTCGTCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAG:1 + chr3L 12594156 5' + flea 4567 1 68.32 CAGATGCACCTCATCCAACTGTTCAAGCAAACAGCTACTGATATCGCCTATACAAACTCGACTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 17624146 5' - roo 394 1 64.36 GCAAAGTATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2L 7654051 5' + jockey 22 1 65.35 ATAGTCGTTGAGTTCAAGTGATCATCTCCATTAGGGGCACTCGTGGGCGTCTGACACG:1 - chr3R 27036089 5' - Doc3-element 310 1 75.86 AGAAATGCTTAAACTGGAGCTGCGATTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCGTCTTGTTATTCT:1 - chr3R 10485705 5' - 1360 11 1 74.26 CCGAATAGTTTTGTTTGGAAACCGGTGACGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGAT:1 - 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chr3R 12092175 5' + rover 6922 1 63.37 CCGTATTCCATATTCCGTATTCCGTTCGCCGTGGAGCGTGCAGAGCGCTTTCAGTCGCTGATTTGACCGCCAAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACC:1 + chrX 18155319 5' + Doc 289 1 76.24 GCATAAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTAGACGAGAGCAGACGTGCCTGCGGATC:1 - chr3L 3924265 5' + G6 24 1 55.56 TCGATNACGATGCTGAAGCCAACGCTGTTGCTGTGACCCCTGTCATTGCTATAGCCGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAATCAAATAAATAAG:1 - chr3R 31939192 5' + Tc1-2 60 1 64.36 CGCAACAATAGAATAAGAACCTTTAATGATCAAAAACGATTTACTCTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATACATTTT:1 - chr2R 1076513 5' - FB 249 1 67.33 CAGTAGCAAACAGGCAACAAAATGTGGCACTGCAAGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCC:1 - chr3L 21363754 5' + G2 2739 1 78.22 TGAGTGCAAAACTCGTAGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGTAAAGCTTCCCGGTTCGATGTATCCTACTTGTG:1 - chr2L 19471781 5' - ZAM 8018 2 78.89 TTCTAATTGCTTTCTGACAAAATATCTCTGTTTGTGTGTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGA:1 - chr3R 26806002 5' + flea 4790 2 60.40 GCCATTGAACCGCTGGGACTGCTGGTGTGGGTGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGT:1 - chr3R 29693728 5' + flea 4819 1 68.32 TGCATGCCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 19510741 5' + roo 8698 2 59.41 CAACTTAAGTACCGATTAGATAAAGAACTCAATGGCCAGCAATTTATGAAAGTGATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:2 - chr3R 17788984 5' - roo 9048 2 56.44 TTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTT:2 + chr3L 24213800 5' - invader2 195 2 77.23 AAAAGTGGAGAGGCAGAATTTATCAGTGAAGAGCTTGCAGCACACAGTCGCACACACAAACACACGCACACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATT:1 - chr2R 15323088 5' - Cr1a 4151 1 74.26 CGATCCTGGATGGATTTACCATCTGTGGAACGCAGGCTATAAATAAGTTCCGGCAACACCTTATGACTGCGAAAGATCCCGCTTGAATATGACCTACAAAA:1 + chr3L 7915043 5' + S-element 1350 1 57.43 GAATAAAAACATTTATTATGCCAACAGCATGGGTCAACAAACTAGAGCTGCGTGTATGCGTGTCTCTAGAATCTGTATACTAAATCTTAACCTTCTAGCTT:1 - chr3L 4890719 5' - INE-1 167 1 66.34 AGGCAGATAGCACACACGTTCGCAGATACACACAGATAAGTGAAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGT:1 + chr2R 21378305 5' - P-element 72 1 50.00 GATTAGATAAAGAACTCAATGGCCAGCAATTTATGAAAGTGATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3R 17788971 5' - roo 9035 1 61.39 AATATNTAAATAAATATGGAAAGTAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATATGAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTC:1 + chrX 14625461 5' + invader4 2776 2 62.38 CTCGCCAGCACATGAAAATCAATAATTGAATCAGAAAATCAAAACACGGATTCGCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTAT:1 - chr3R 24161263 5' + copia 4808 1 62.38 TGTGATAGAACGTTGTCTACCGACATTTTTTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCC:1 - chr3L 15099975 5' + Tirant 8105 1 77.23 TTTCGGCTCGTTTCGGGTCTCCAATTGCTAATCATCCTCCGTTGGCCAGCTGATGAATCCCAAATATTCGACGTTCTCTTCAAAGAACTTAGATTTTTCTA:1 - chr3L 21780071 5' - TLD2_LTR 148 2 56.44 GTCGGNATGTTGATGTCTGGACCTAGGTCCCTAAAGCTTCATCATGATGAGCTTTGCAAAAGCCTAGCTGGGCTTTTCGACCTTTTTGCCACTTTTTTCTT:1 + chrX 15921480 5' - S2 1270 1 77.23 TTGGTTTCCGTTTTTGACTCAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATC:1 - chr2L 3270905 5' - 297 6742 2 57.43 AGAACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 + chr2L 306473 5' + Tirant 8134 2 54.46 CAGTGAGAGAGAAAATGGCTTGGCAAAAGGGAGACAGACATGGCCAGATCGAATCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 + chrX 20927808 5' - INE-1 87 1 57.14 AGCCATATGCCATTAAAGTCTAAGAGACTAGATTGAGCATTATTTATGGCTCAAAGTAGTGTTCGTTGTTGAAAGTGCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chr3R 23088918 5' + jockey 4676 1 67.33 TCAACGTCTTCCTCGCTTTCGCTTAGATAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGG:1 + chr3R 8451883 5' - R1A1-element 5298 1 80.20 TGGCTAATTGATTGGGGCGGATCCGTGGCTACGAAAATCCACTGCAAAATGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTG:1 + chrX 3052092 5' - transib2 455 1 54.46 CTCGAATAATTCTAAAGGATCGTTTAATTCAAGCGGCACTGCAGATAACACCAGCAACCGAAGGCGACGAAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATA:1 - chr3R 2819864 5' + G3 4466 1 58.42 TGAATTGGATCGGAACTCTGGGGTTGGGTTATCGATTGAATGGATGGAAGCAGATTGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATAT:1 - chr3L 13275139 5' - R1A1-element 5025 1 59.41 TATGCACCTCTTCTGCTGAAGAACCCAAAACACAAAGATTCGCTGAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTGGACGGCCAGGTGGTTG:1 - chr3L 12058929 5' - G2 2870 1 51.04 TTTTATTCGCAGAGCCTCGTGGGGATTAGTCATTCCACGGGGCGATAACAGACGTCAGATGTACGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAG:1 + chr3R 15695071 5' - jockey 225 1 71.29 CATTATCGTTCGCTGTGGTTTTCGTCCTTTTTCGCCCATCTGTGCGTTTGTCTTTGTTGGTCTGTGTTGTGGTACGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr3R 13357040 5' - Transpac 5211 2 78.22 GATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 + chrX 2253850 5' + Tirant 54 2 77.23 TGGCTTCGTAAAATGGCCAACGGGCATGCCAACAACAAATATAACAACAAGAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 - chrX 1088166 5' - INE-1 546 1 57.43 ACAATATTTGTCATTCACAGGCAATTTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 + chr3L 18957632 5' - copia 5075 2 76.24 ATTCCGCCGAGAATGTTCTGGCCTGGGAGCATGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGT:1 + chrX 3809562 5' - Quasimodo 6898 2 69.00 TAAACNTATTGTGCGTTTGCTGGGCTCCTCGGAATCTCTTCCAGATTTCCGCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTAGTAACTCCTC:1 - chrX 11897835 5' - Tirant 8106 1 57.43 AGGCAAAAGGCAGAAAGAAAATAAAGCAGACGAGTTCGCCGCGAGATGCCTTCAACGCGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGA:1 + chr3L 19081433 5' - Quasimodo 276 2 61.39 ACTGAATGGAATCATGTTAAGTCAGAGGATAATCCAGCAGATTTAGCATCCAGGGGAGTGGATTCTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAA:1 + chr3R 19446439 5' + gypsy12 12 2 66.67 ATGTCACACGAAAATTGTTTAGCAGCATAATTAGTTTATTCCATTTGCATAATAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAAC:1 - chr2R 20826289 5' - copia 461 1 59.41 GTCTTAAAGGCTTGACCTTTTGCTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAA:1 + chr3L 13875703 5' - FB 472 1 77.23 CGCTGTGTTTGTGCTCCTGGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTGGCCTCGGTTTTGGGTTTCGTTTCCGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr3R 14832492 5' - blood 7379 2 69.31 GAGCGCGTTCTCTCGTTCCACGATCCTCTTAATTTCATCACTCTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2R 1373111 5' - pogo 2071 1 57.43 CTCTACCATACAAAACATATAATCTAACATAACATATTGTCCTCAATCGAAGAAAACTATTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGC:1 - chr2L 20327354 5' - roo 8976 2 67.33 CAAAAAGACTTTGCGACGCTTTCGTTTATCTGTATCTGGTATCTTTCGGCTGTATCTGCATCTCTTATCGTGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCT:1 - chr2L 13266629 5' - Quasimodo 363 2 75.25 CACGGTTCGTGTGTTATTGTAGGCTTTTTATGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCT:1 - chrX 17122608 5' - flea 115 1 70.00 GAATTTCGATGGCATCGATTCCTCTCGCTTGGAAAATGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTT:1 - chr3L 14633343 5' - I-element 4910 1 60.44 CTGATATGTCACAAAGGTTTTGCGAAGGCATGGTCAATTGCCTTCTTGGACTTTGTCTACGAGATCTACTCCTCTCTTTGCTGCTGGTTGAATGTGTTA:1 - chrX 12108578 5' - gypsy7 4 2 71.72 TGGTGNGTTGTTGCTTTGACATAATTAATTAGCAAATATGGCCGTATAGCGACAACAACAATGAAGAAGAACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGA:1 + chrX 7692499 5' + accord 365 2 77.23 CAACTGATCTCCTCTGCCCTCTCTCTGATGCTCTTGCTCACACTTGTTCGCTCCGTCCACTTCCGCACCATGGGCAATCATCCGCCTCCTCATGTCCA:1 - chr3L 19792972 5' - Rt1c 5049 1 54.08 GCGGATGCCACAAAATTAGCCTGAGTTCGGGAAGAATTTGTATATACATAAGAATTCCCCCCAAATTCAGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chrX 19561910 5' - 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chrX 17076802 5' + rover 7012 2 67.33 ATGGCGCGGTGTTGGGAAATCACTTCACTGCACTAAAATCCTATTAAAACCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCC:1 + chr3R 15573133 5' + 1360 3227 1 54.46 AGCCACAGCCACTAAGAGTAAGCGACGTTTTCGTGACCTCAGGTGGCAAATATACGTTGGCGCACCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 7316398 5' + jockey 12 1 74.26 TCGCACAGGCATTCTTCAAAATGCCTAAAAGTAGGCAAGAGATTTTTTTGCTTTTTCAATCTTTTGCACACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr2L 2834747 5' + jockey 16 1 63.37 GTTTACTAAGGATTAACTTATTACCCTTAGTTAAACATTTAAAATAATTTGAAATAAATTGGTAACATTTTCACAATACACACACACACCCATACTCACAC:1 - chr3L 10811829 5' + accord 7035 2 56.44 AATAGCAGCACAAACTTTAAAGATTTTGCTGTAGTCGACTGTAGACTATAAATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATCATGTGAGGACTTACAACTATGTC:1 + chr3L 5695118 5' - BS 4985 1 50.50 CGTCGTCACCAGCTGCAAGGATATCTGTGTGTCAGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3R 24545625 5' - roo 9031 1 66.34 TCCAATTACACATGCCCACAGGCGGCCACTCAACCGACGAACCAAATGGGCAAGGAGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGG:1 - chr3L 9956200 5' - R1A1-element 5182 1 61.39 CCTTTACTGGGGTTTTCTTTCTGCTGGGGGACAGCTACGCCTATTAAATGTGACTGTTTGCATTTCTGCTCGTTGATTACAATACGCCAGTTAGCCAGCCA:1 + chrX 18580458 5' - Doc4-element 2302 1 76.24 TACTCGCTTCGATTTTATTTGGCATATATCATTGCCGATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGG:1 - chr3L 19410032 5' - blood 7147 2 63.37 AGTAAAATCCTTTGGCCCATTTATTGTTTTTCGCCCAGCTTTGTGCTTTGTGTGTTTTCCGCTTAGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATA:1 - chr3L 20879017 5' - accord 7048 2 68.32 TCATGGCGTGAAGCACTCCTACTGGCAGGATCGCGGCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACCCC:1 - chrX 10898862 5' + Rt1a 4772 1 64.36 ATTTCACCCACTCAACCCCCTTTAGCCAGCCACTGCCATCCCTTCGGCAAAGTGAGTTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGC:1 + chr3L 17781173 5' + G2 285 1 63.37 GGCGCTGCAAATTGAATTGCCACCCAAACCAACTTCGTCCATTAATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr2L 970328 5' + 297 26 2 60.40 TCTCGAAACTCGAAAAATTGTTTTCAAATTGCTTTTGTTGTAAGTTAAATGCGCGAATGCGAGTGTGTTTGTGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTG:1 + chr3R 9327647 5' - Quasimodo 7006 2 73.27 CTAGAATGGAATAGGTGGGGAAATCAATGAACCTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACAT:1 - chr2R 8038885 5' + hobo 227 1 67.33 GTTACGGCAAGTCTAAGATGCACCATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr2R 5529983 5' + 1360 62 1 62.38 CAATAAATGCGAAAACAATGAGCAAACGTTCGAACAAACAATTCTTACAGAACCCAATCCCCCCCTCGGCATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTTAAAATGCGC:1 + chrX 18175933 5' - baggins 5121 1 70.30 TAGAAGCTGTCCGGTGTGCGATTGATGTCCAAGCTGGACTTCGGCCTCGGAATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCTAGACTAAGGGGAGAGATGTAATTAA:1 - chr3R 13749565 5' - Doc2-element 4295 1 47.52 AGTGGATTTTCCCAGACCATCACCACCGACTCTCGATTGCGTGCCCATAGTGCAAACCACTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGT:1 + chr3R 16383743 5' + diver2 4663 2 63.37 GAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3R 7808942 5' + jockey 37 1 51.49 TTACACATTTAAAGGGTGTATAAATCTTAAACTAAATAACTGCAATTATTGGAGTGCATTTATTGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCA:1 + chrX 4744320 5' + 17.6 478 2 68.32 AATGGCTGTTATCCTGCAGGACCCCTTACGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAA:1 + chr3L 10190400 5' - 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Quasimodo 112 2 64.36 GGCAAGTTTTCCAGCTGGGCTTTATAGTTTTTCACGATTCCTCATGGACGAGATGAGTTGCTTTTATATGTTTTTTTTTTCCATCAGTTCGGTAATAATCG:1 + chr3L 1991528 5' + Circe 443 1 58.42 CGTATATAGAATCACAAGCTCTGTAAATGTACAAAAAATACTAGCTACTTTAACATTAACATTAACTATGCCCAACCCCCAAACTCACCACATGCAATGTT:1 + chr3R 20813157 5' + TAHRE 10308 2 77.23 GCATTCAATTAATGCGATGGCAAAGTGACTACAAATCCAGATTAGATCCAACTACAAATGCTAGAAAAGACGTATGTTTATATGTTTAAAAAAGAAAATTC:1 + chr3L 20939805 5' + TART-C 11037 1 71.29 AGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 11240903 5' - roo 9023 2 74.26 CGTTGGTGGTAAATTTTGACGTTGAGGCAGACTTGGATGTTAATGTATACATTAGGGTAGGCTGGGCTTGTTATTGTCACCAGAATTCGGGTTCTTATTGG:1 + chr3R 19324829 5' - Quasimodo 127 2 66.34 CAACGCTGCTGATGAGTTTCAGTTATCAAAAATAGTGGTAGCCCTCCAGGTAAGGTCTCAATTTCCTGACGGCCCATACTATTGCTAAACATTCCTTTTCC:1 - chrX 7463389 5' - Osvaldo 57 2 67.33 AAGACAGCGCGTTGCATGCCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 19510729 5' + roo 8686 2 61.39 GCAGAGAGGTAGTAGCTATGTGGCAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr2R 21937498 5' - 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BS3 1524 1 55.45 TATGTTACATATAGTTATGATTTCTTATTACAGAATCTGCAGTACTGTTTTTGTCTTATATGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCA:1 - chr2L 4142159 5' - Bica 82 1 53.47 AAATTAGCCAGCGGGAAACCGTAGTTTTCGGAGTCCAGATGAAAAGGGGGAGGGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGAGGTGGTCGCTAT:1 - chr2L 21034275 5' + R1A1-element 5176 1 55.45 GAATTTTGGGAAAATGCGGCAGACTGCAGACAATTTTCGTCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr2L 2689864 5' - roo 9035 1 64.36 AATCTTAGCCAGCTTTATCTGAATCCAGTTTGGCGTTAGAGTGGGTGTGGCAACGTGGATCAACAAACTTGAGCTGCGTCTCTATGCTGAATCTCAACCTT:1 + chrX 20677913 5' - INE-1 174 1 69.31 TGACTCTCAGATGTCTGTCAAATTAATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 + chr2R 19232864 5' + Burdock 6184 2 75.25 GGTCTAAAGGCAATGAATGGGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCA:1 - chr3R 5775768 5' - invader4 321 2 74.26 CCAAAAAGCAGCGCCTGCGACTACGAGTACGACGTATGGAGCATTTTAATGCGTAGTGTGCTTATAACAGCAGATCTATGGAAAGTCGTTTGTGGTCAATA:1 + chr2L 21050367 5' + Copia1_DM 423 1 73.27 TGCTGTTTGGATAAATCGAGGTGTCATAAATACTTGTAAACAATTCAGTCCTCTTTCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTG:1 + chr2L 6818829 5' - HMS-Beagle 62 2 55.45 CCCAAAGGCGCACTTAAGGCGGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGATCGAAAGGATG:1 + chr3L 22193699 5' + G2 183 1 77.23 TCCGTCTATTTAAGTTTATTATTATGGCCTTTTTGCACTAGCGGACATTTATTGGCTGTCTTGTTCGGCGCTATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTTA:1 + chr2R 14924443 5' - hopper 952 1 77.23 TTTTAACGCACGCTGTGGCTTAATTAACTCGTATTTAATAGTAACTAACTGCCGATCAATAAACTAAGCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGT:1 - chr3L 8634003 5' + 1360 3352 1 72.28 CAATGNAGGAGCGCCACCGGGAAGGGGCATAGGAGTCGTCAGTAGAATGCAGCTTAGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTG:1 + chr2L 3023411 5' - HeT-A 6039 1 45.54 GGTTGCTCTTGCATAAAACACGACATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAAT:1 - chr3R 19512364 5' + invader4 2806 2 80.20 GTGGACGTAATGCGTGATTTTCGTTGGAGTAGAGAGATGGTGGCAGCAGGACTCAGACTCCCCCAACTCCAAAGTATCCCCAATATTTTGCCATGTTTATG:1 - chr2R 16150537 5' - R2-element 3411 1 65.35 TTCGTTCGCTCCTTTTTTTTTTGTTATCCCTGCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTCTCTCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTT:1 + chr3L 10411268 5' - 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chr3L 12460857 5' - X-element 4436 1 58.42 GCTCTCAAGGAACTGGTCCGTTGTTACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr2L 1353794 5' + I-element 17 1 62.38 AGATACTTTGGTAACTCAATTAAGTACAGGTAAAGGTGCACGAAAATGAACAGATGGCGGGGGCGGAGGGGAAAAGTGATCTGTTAGTTGACGCGAAGGCT:1 - chr2L 12809447 5' + Gypsy12A_LTR 469 1 75.25 AATGCATCAAACAGACAGATGCAGCCAAGTAGATTCGAAAATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATG:1 + chr2L 13100256 5' - R1A1-element 5201 1 60.00 TCGCCCACTGCCGGCTCCTCCAAGGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCA:1 + chr3R 18984878 5' - R2-element 3456 1 76.24 AGAGGGAGCGCGGGAGAGTAGGAAACCAAACAATCGTGAGATTAAGTCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr2L 222088 5' + P-element 28 1 51.49 GACGCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 14364947 5' + blood 20 2 55.67 CAGGGAGACAATCAACAAGGAAGCGCAGATGGCACGTGCCTTTCGAAAGGGAATGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTAT:1 - 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chr3R 27800610 5' - springer 44 2 73.27 CGAAAAGCCTAATGGCACAGTGAACTTCACTTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGTGAGAGCAAGA:1 + chr3L 16802235 5' - Doc2-element 459 1 63.64 TACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 13824368 5' + roo 8714 2 72.28 AGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:4 - chrX 1399912 5' + P-element 47 1 32.67 TTGGAAAGTAAAATTGTTTAAGGTTTAAAAATAAATATGAAATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 + chrX 14625476 5' + invader4 31 2 59.00 ATATATATTAAACTTTTACTTATTTTCGAAAATATTTGCATACGCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTT:1 - chr2L 20556566 5' + Doc 366 1 57.43 GGAGGGTTCAACTGTACAGATTCAGTGCTAGGTCAATAGAGATCATTCCTGCTCCCAGCTGAGGGATTCGGGTCTATTAAGTGAGAAATCGAATAGAGAGA:1 - chr2L 16772971 5' + invader3 224 2 79.21 CGAACACAAAATTCAAGTAAAAATCACGTTCCGAGCAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr2L 18380836 5' - 1360 3345 1 68.32 CATGGACATGGACATATATTCGAAAGATGGTCTGGCGGAATTCTAAATTTAGTGCATATACCGAAAAAATGTGTGCTTTTTGTAAAATATTAAATATTTGA:1 + chr3R 27152665 5' - TLD2_LTR 104 1 78.22 TGTCTNTGTTGGACAACCCTTTCCCCAGGTCACAAAAACACTACCCGTTTTCGTCTATTGCTTTTACTCACACAAACAAGCAAATTCTACTTTTAGATTTC:1 - chr3L 10281618 5' + 1360 3270 1 59.41 GAGGAGCTTATACCGTTGTCCTGGGATATTTACTTCGGTCCACATTTCTCGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGA:2 - chr3L 25514068 5' + X-element 36 1 49.50 ATCATAGTAACTAAATTTATTAAAACCAAAATGCTTTATTTCACCCACTATTTTATACTTCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAA:1 + chr3L 18457952 5' - Ivk 43 1 65.35 TGGGTGACTTTGTGTACAGTGGCACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACA:1 - chrX 18314800 5' - Q-element 128 2 81.19 GAAATTAGTCAATTATCACATTCCAGTGTACTCGTTCGCGCGAGCTAAATTAATAGTTTAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAA:1 + chr2L 9730779 5' + Bari1 1489 1 67.33 ATTAAAATTCACACAAAAACTAATTTCCAGTCTCTGTTTTATAAAAAGAGAGAATGCTATAAGGAATTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chr3L 22760832 5' - INE-1 543 1 76.00 ACCAACAACAACAACGCTGACGCTGATGATGACGACGACTGCAGCGGCGAGTTTGAGGTTATGTATGTGGGTGTGTGTGTGAGTATATGTAGTCTTATACT:1 + chr3R 17716868 5' - Quasimodo 18 2 63.37 GAAAAGCGCGCGAACTGTGGCAGCGCTGCATTTGCATCCTTTGGTGGGCGGATGTCGGCGTCTGACCCGTTGTTGATGTTTATGCTGCAACTTTGTATCGC:1 - chrX 6331315 5' - ZAM 88 2 56.44 TTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAT:1 + chr3R 19449976 5' - roo 39 2 64.36 TTTGGGAAAATAGAGTCTGGAGTGTTATATCCGTTACTCGATTCCGACCATATAAAGTATGTATATTCGTGATGATATTCGTGATTAGGATCAATAGCCGA:1 - chrX 158248 5' + INE-1 89 1 75.25 TAGTTAGCTCATAAATTTGCATATTTCGCACTTGTTTAGCTGTTGCTGCTGAACGTGACCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAA:1 - chrX 18534896 5' + micropia 251 2 57.43 TTTCGNTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr3L 15099939 5' + Tirant 32 2 58.42 TATAAATAAATAACCTTCTGTATAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chrX 17947378 5' + hobo 29 1 51.49 ATTTCGTGCTGTGCCTGACAGCGGCTGTCGCTTATAAATTGCAGATTCCACAAAAACAGCAAGAACAACAAGGACCATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAA:1 + chrX 21232618 5' + copia 284 1 78.22 TTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 19726908 5' - 1360 3343 1 71.29 AGAGGGAACAAAAAATGTCACCCAACAACGACTAATACAGAATTATTTCATTTCTCTGTGCGCTGAGCTCAAAATGCATTAATTTTCATTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 14843407 5' - transib2 2646 1 75.25 ATATACAGCTGATTGACCGATCGAATACGAATACGGATACAAATACGATTGATGAGCGCTGTACGTTGTCCAATTAGTTTTTTTTTGTTTTTTAAGTAAAA:1 - chr3R 29134729 5' - transib2 2633 1 67.33 AAATGAAAGCACCTTAATTTAAATGTTTTAGTTTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3L 11610372 5' + 412 7097 2 69.31 ATGTTAAGGCACACGGACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 - chr2R 11129318 5' - hopper2 1552 1 81.19 CAAGATTGGGACAAATATTCTAGGACATATCAGTTGCTCTCCGGCAAGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTC:1 + chrX 9261408 5' + 3S18 5782 2 50.50 GTACACTTGAGTGGATTTTGTCTGGGGACTCCTGCTTTCTCCGCCTTCGACGCGCTGCATTTGTTTGATTGAAAATATGAATTTCTAAAAACTTAAATGCT:1 - chr2R 23189706 5' + gypsy12 9816 2 71.29 TTGTGGCGTTAGCGTTAGGAAGTGGTGCCCAAATTTTCGCGATTCAAATACAAGCGGTTTGAAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCG:1 + chr2R 13785436 5' + R1A1-element 155 1 77.23 AAGATGGAGATGGTGGTGCAGTCGTCCTCGGCTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTA:1 - chr2R 9851223 5' - gypsy4 6476 1 80.00 TTAATCATTGGGAAAACATTTAATTTTGCTGTTTTTTTTAAGTGAATTGATAGAATAGTGCATTACCTATACAAAAACTATTTAAAATGCATTTTAAAGTT:1 + chr2L 10061419 5' + Transib5 266 1 78.22 TAATCAAGCATTTTTGGTCAAGTTAATATTTTTTTAGCGGTTTACTCCATTGACAAACTTTCGACCCACTCGCTTCCTTCTGCCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chrX 20686428 5' + mdg3 5271 2 81.19 CTATATGAACATAATTTATTTAGGCGATGATCGTGCACACTATCACACACACACATACAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATA:1 - chr2L 10772196 5' - Stalker2 7639 2 55.45 CTCAAACGTACATAGGTGAATGTTAGATTGTGTCGCGTGTGGTGCTCACCAGGTCCTGGCATCATTTGGGAGGAAGTTTTGCCCATGCATCCTGCACAACT:1 - chr2L 16751277 5' - HB 1233 1 54.46 GGACCGAAGTCCAGACCCTTAGCCCATCTTTTCCTGTTTTGTTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATG:1 - chr2R 19966062 5' - I-element 5141 1 66.34 TAAACGGAGTTCTAGTTTAACATGCTAACCATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACAACCACT:1 + chr2R 6890052 5' + accord2 7343 1 66.34 TAATGCGCTTATACAAAGTATGAGGAAAGTTTGCGAAAGACTTCATAGCTTTGAAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAC:1 + chr3R 19448385 5' + 1360 3346 1 61.39 AATTGTACTTTCTTACATCTCAGTAGTAGTTCTTATCTGAAATAAATTTCTTCAATATATCTACTTAATAAGATTTTTTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAA:1 + chrX 2125011 5' + G2 3003 1 73.27 TAATANCAGCGCCTGTTAGCAGCGTCGCTGCACCACTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAA:1 + chr2R 12705114 5' + P-element 13 1 35.00 AAGGGAAAACGTGGAAAGCTGGGCGCAAAAGTTAAGAGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chrX 13560774 5' - roo 9031 1 61.39 CCACTCTCGCCTTATCAATGCCACAAAGTCAGCTCCTTATTCCAGTAGATTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAA:1 - chr3R 26858066 5' + Cr1a 4016 1 68.32 CTAAAATTAATATAATATTTTTTTTACTATATTGCTTATCAATATCTGATAACTTACAGTTGCAGAAGTATAAATATAAATATAAAAATATAT:1 - chr3L 19514571 5' + Stalker 6938 4 60.22 GATGGTCGAGGCGTTGGAGTTTATGCTACCTTTAAAATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3L 2978973 5' + hobo 40 1 64.36 GAATCTATAGATCATCTTGTCAATATTGGAAAGGAGCATCATACATATGCATATATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 + chrX 19885156 5' - HMS-Beagle 7027 2 64.36 ACCACCCATTGGCCAGCACCCATTCCGACCACTTCAAGCAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATA:1 - chr2R 16037434 5' + accord 73 2 65.35 ACTCGTTACTCGTAGTAGCTCGTTTTTTTTTTTGTTTTACAA:1 - chrX 13020298 5' + Tc1 1474 1 90.48 GTGTCNGTCCTTTATGCTGCGATAGATCTTTAACTTGTGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCATCGGTAGGGTACGTCAATCCGCGGACACGATTACACCG:1 - chr3R 23271732 5' + Gypsy12A_LTR 1974 1 62.38 CACAGTAGGCGTTAAGGTAACCGTTAGCTAACCGTAACCCTAAACGTAACGAAACGAGAGCCGTAAACGTAGTACGATCGTTAATACGCATCCAAAAATTA:1 + chr3R 11399742 5' + transib2 240 1 70.30 CACTCAAGCAGGACTCTGCAGGACCTACACATATGTATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chrX 14424091 5' + hobo 38 1 66.34 ATTGAACAGTTTAATCTCAGATACACTTTTTTCTCTAAACCCACCAGCAATATAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCCAATTATGTAAT:1 - chr3L 27177990 5' - Cr1a 4282 1 52.48 CCCCGACGTGACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAACAGTTTATCTAATTTCGGTGCACATAGTGCAAACCGCTGTTTTCGCACGCATTTATCTGTACGGC:1 + chr2L 22218035 5' + diver2 4650 2 58.42 GCGCAGCTCTGCCGGAAAAGTCAAACAGAGCCAGATCTGGCCAGGCTGTTTGGGTGCGCATTAAGTCGTTCCATATATTTTTCGGGGATGTTCTGGAGCTT:1 + chr2L 6401729 5' - jockey 4628 1 64.36 AGATTTACGCATGACTTGACAATTTCTGTGACAACAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr2L 3621081 5' + 297 33 2 65.35 CAATTGGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGAATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr2R 18891028 5' - opus 7489 2 55.45 GAACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCA:1 - chr2R 4879046 5' + G-element 9 1 73.00 AGAAAGGAGATCAAAAACCGGCCGGCAAAGTTATTAGTCGCAACGGTATCTGAGAGGAGAGAAGCGGATCCAGCTGCACACCAACACACACACACACACAT:1 - chrX 10479414 5' + accord 7027 2 74.26 AATGCCGAAAAGTGCTTAAAAACCATATCCGTGTCTGTGTGTGGGTGTTTTCCCTGCGCGTGTTAACTCCTCCCCGCGTTAGGTTAAAGTCGTCC:1 + chr2L 8084256 5' - gypsy4 6544 1 60.00 AATACCAAACCTTAACCCCTTCGTGACCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAAT:1 - chr2L 15389263 5' + HeT-A 5988 1 57.14 ATTGATTGGGATCTGATTGGATATTTAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCA:1 - chr2R 24545427 5' + F-element 4390 1 74.26 TGGGCAAGTTTGAATACTTTGTATGCCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAAGAAAAAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATG:1 + chr3L 17474660 5' - copia 4954 2 71.29 CCTGAAAACGGGCAGCGACCACGGCGGAGGAGTTGGTGGTTGGGGTGCGTGTAGAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAGA:1 + chr3R 30599101 5' - F-element 4415 1 64.36 GCCTCACTGGAAACCAACTGGACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr3L 3255018 5' + 1360 49 1 66.67 TAAGGAGCCCAGGTCCCCGTCTTCCCATTGATCTCTCTGGCCGGAGGAGAGACAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCA:1 + chr2R 24376894 5' + R1A1-element 4935 1 50.50 CTGCCATTTAGACAAGTGACATATGCGCCAGGCACAGGTGAAAGGGGCCGGAGAAAGGGGAGAAAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTT:1 + chr2L 17051215 5' + flea 157 1 64.36 TAATCCAACCATAAAATGATTCGCGACAATGGAACGACGGCTTTCATGCGCAAATTCGTCCCGTCTCTTACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGA:1 - chr3R 5044320 5' + G6 1696 1 76.24 TGTGGTCTCTCCCTATGCCGTCACAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATATTATGTAAATGA:1 + chrX 697463 5' + roo 50 2 74.26 CCTGAACGAGGTGCGTCTGATGAACAATCGAGTGCCCCTGGCCACGCTGCCTTCGCGTCTGTTTGCTAGGGGAGTGCCCTACACGAGATTTGTGGGG:1 + chr3R 26838618 5' - gypsy8 4669 2 70.10 GATATGCTTCTTATTAAATTAAATATGACTACTGTGGAAGTCAAGCTATGCAACTAATAAAATAGCAAAATACAAGGCGTTAATAAAACTAATATGGACGT:1 - chr3L 11434687 5' + Porto1 4254 1 55.45 AAATTCATTTAATTTGATTTTTTAAAATCTAGGTGTATTAATATGGGATCGGACGTTATTAACACTTTTAATTGCGCCGTCGATGCATTGATTATATCCAT:1 - chr2L 10968651 5' - invader2 309 1 72.28 CGCGTTTCTGGACGGCGAACCATGGACATCGTCACGTCCTGCCGCCGCAGTCGCTCGCCGCCCACCAAGTCCGTTTTCAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 9540176 5' - 412 7505 2 68.32 TTTGAAAAACCAGCGGAAGTTTTTAAATAATATCTTTTCTAATTCAATTTTTTTTGAGCACGAGTCTCGTCCACTCTAACGCACTAAAACCGCCAAAAACT:1 + chr3L 27421755 5' + INE-1 346 1 66.34 CGCTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCAC:1 - chr2L 20360647 5' - R1A1-element 4992 1 76.24 GTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCA:1 - chr2R 1000372 5' + HMS-Beagle2 6934 2 77.23 CTTTTAGAGTGTGTACACAAAAAACGAATGACAAACGAAATATATTAAGATTGCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2L 18568120 5' + I-element 25 1 54.46 CGAAAGCTCATCGAACGAATTGGAAATGCTCTGGGTTGGAAATTAGCAGGCAATTAAAATTGCTACATTCAACGACAAGACCGGACGCGGCCGCAGTA:1 - chr2L 17255822 5' + gypsy4 6610 2 77.55 TCACTGTACCTGGGACGCAGCACTATAGATAGCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 - chr2R 10697098 5' - 297 352 2 74.26 GTATTTGTATGCAATTAAAATTTGAATACTAGATTTTCTCCTGCAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - chr3R 17468425 5' - Transpac 5199 2 58.42 GTAAAATAAAGCACGTAAAATTCAAGGGCCGTCAAACAAGAAGTAACACACAATTTCATTAAATGTCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGA:1 - chrX 12151336 5' + F-element 127 1 68.32 TTCTTAAAAAAAAACACCAACATCGCCCAAAACACAACAAAAACATCGCATACATTGGTTTGGCACTATGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCA:1 + chrX 8925298 5' - 1360 3331 1 52.48 TCCAACCTCGGTACGTGCATTCGGCACCTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTG:1 + chr3L 2099991 5' - Idefix 7156 2 73.27 AGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr2R 18891055 5' - opus 459 2 71.29 TATATTGTATGTATATGTGTATGTGCATTGGATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACAT:1 - chr2R 8265575 5' - 412 7171 2 69.31 AGAGATACTAAGATATATATATGTATATATGGAGATCGGATAATAAACCTTATAAAAGGACTTACGGCTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTA:1 - chr2R 12608222 5' - Doc 66 1 72.28 TGTTGGATCATGGTTACAATGCGCGACCCTAGCCTTAAAGTGAGGGGAACAGACTCTAAGACTCGG:1 + chr2R 2950538 5' + G5A 2451 1 63.64 AAGCGTTTGCAGAATAAACTTTGTGTGGGCATTTTGGGTTCTCCTCTTTTGACGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGTCCATC:1 - chr2R 22486057 5' + gypsy12 10174 2 58.42 GACACTTTGACGGATGAGGAGCATAAGCAGCTGGACAAGCTGTCCAACGTGTTAGCCAACCAAACCATTTTCCGCTCCCATGTGTGTGTGTGTGTGTTAGT:1 - chr3R 24358558 5' - accord 7027 2 55.45 GCTGGCATAAATCAATCAAATGCAGGCACAACACGCAATGCACGCACACAAACAGCTGGAACAGTGAAATAATACAACAATCAAAAATCCTGCGAGCAATA:1 + chr2L 3926631 5' + Doc4-element 2667 1 74.26 AACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:2 + chrX 17049562 5' + Stalker2 47 2 68.32 CCGCACCTATAGCGGTGTATACAACCACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTGTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAG:1 - chr3L 231382 5' + G6 69 1 73.27 GGCAAGTTGTTTTTGCACTCTCATGATGCCACTGCTGCAGGAGTAGGTCGGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCGGATAGTCGGTGATCCTTGCT:1 + chr2R 20451234 5' - Chimpo 3836 1 72.28 ACGGGCAAATTCAGACGAAAGAAATCGAAAAGCAGCATTAAAATATCAGTCACAAAAAAAATTACATTTATACCAAAATTTGCGGCTTTTAACCCATAG:1 + chr3R 12208256 5' + transib4 2633 2 71.72 TGAGTTTAGTTTTATGAAATGAATAGAGGCACCTTAGAGGTGTTACCCACTAATCTTAGCCCGTTAGAGGAGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGAT:1 + chrX 21344409 5' - F-element 4333 1 70.30 GTCACCAACGATAACTTTATGCATATGGTCATGCTTTGTAAATTTGACAAAATATCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTG:1 + chr4 183952 5' + 1360 248 1 80.20 CTCACTGGTGGCGTCTCTATATTATCCGCATCCACGTCCTTGGAGGAGCCCTGCATCTCGTTTTGGTGTCCCTAATCTGTGCTCTTTCATAATATATAGTT:1 - chr3L 7121561 5' - transib3 69 1 65.35 GTGTCNTGTGTGCGCTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3R 19535669 5' - hobo 2930 1 69.31 GGTCTGTGTTCATTTTTTCGTGGCGTTTGAGGCGGTTTCAGCTCAAAGCGCCCATCCTGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCAT:1 + chr3L 18136084 5' + Transpac 493 1 63.37 GTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCAT:1 + chr2R 5284570 5' - Doc4-element 2606 1 60.40 GACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACAT:1 + chrY 680454 5' + invader2 4860 2 64.36 AGTGTTTAAATTTTAATTATTGCAACAGCCTGCGCTTTAATCAATTCGCACTGCACTCTCTCACACAGACACTTGCAGGCCTACACACACACAAACACACA:1 - chr2L 9558473 5' + accord 7101 2 72.28 ACGAAAGCCGGCTACTCCCTTGCCAAGCCAAAATCTCAAGACGTTCTGCGATTAAAAAATATTAACACGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr2R 8463654 5' + I-element 14 1 66.34 CTTTTTCCTTTAAAAAGTCAAAGCTTAATTTGGTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chrX 1399957 5' - P-element 2885 2 77.23 GTTTTTGTTATTTCTAGCGCATATCTCAGCCACGTTCTCATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr2R 11257857 5' - pogo 2067 1 62.38 GTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 - chr2R 8157245 5' - Transpac 5190 2 64.36 TCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 1399914 5' + P-element 45 1 34.65 CGATAATCTCGATGACGGCATATTGCTTCAGCTGCCTGCCATTGGCCACGTAGGATTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAAAGCAATGCTCTCCCAAAAACAC:1 + chr2L 3481352 5' + 17.6 268 2 58.42 GATGAGCTGCTTGGCTGGTTGGTGCACCAGAAGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGG:1 - chr2R 6733036 5' - F-element 4419 1 68.32 TTGGGCAAGTGGCCGGACTAGCTGGCCGTCAATTATGCTGTGATCCATTTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAAC:1 + chr3R 7989704 5' - hobo 2569 1 52.48 AATGTTAATTACAAGCGGCCGCCAAAATTAGAATTGTGCGCGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACA:1 - chr3R 10229685 5' - 1360 3161 1 65.35 GCTGCACTGCTCCTCATCGCGTCCATTCAAGAGTCGGAGGGCAGTATACTAAGGCAACATTAAAGTTTCCT:1 + chr3L 6599545 5' - G5A 312 1 69.01 ATACTAATCAAGGCAAATGACGCGTGTCGTTGGCTTTTGTCTCCACTCTTCAGAAAGAAAAAAATAAACAAAATCCGAAATTCTATTTAAATCTTAATTAT:1 + chrX 8496856 5' + transib4 2560 1 69.31 CCACAGGCATCGCATGCTGAGTCAGATGGGAGTGCATCTTGCGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTC:1 + chr2L 11177869 5' - G2 2790 1 58.42 TTCTCTTTGCCCCGCGGCTGTTTTTGTGTGTATTTTCTTAAACACTGTTTTGAGCGGACAAAGCGACGCCGTCGGCCATTTTTTGTATTTTCCTTTTTTTT:1 - chr3R 22667266 5' - Doc2-element 254 1 53.47 TTTGTTTCGACATATTTGCCTTTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAG:1 + chr3L 25413903 5' + Doc 443 1 78.22 GGAGACAAAACTGCGACACATTGGCATGTGATACTCTAGAAACTCTTATAAATTACAACATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3L 17861681 5' - 1360 3381 2 52.69 GATGTAAATGAGGGGCTTTAAGAGCGAGGTAACACGTCTGTGGCTGGCATACCTGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAG:1 + chr2L 19460973 5' + invader4 186 2 54.55 AAACAGAAGAAGCAGAGGGCGACAGTGTGCGGAGTACCGTTAATGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGCTCTAGCTCATGGCAATGGGTGTGGTGGTCTTG:1 - chr3R 5684904 5' - Gypsy12A_LTR 2174 1 63.37 ATAAATATGCGCGCGTTTTACTATGTAACATGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAATATATTAAGTACATATATATGTACATATATTCTTGATCAGGATCTATA:1 + chrX 21594320 5' + INE-1 84 1 79.00 AAGCAGCTGCATTTCGTAAACACCTCAATGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAA:1 - chrX 12359604 5' - R1A1-element 257 1 75.25 ACGATAAGTGTAAGGAAAAAACAAGACTCAGCAAACAATTAAATATTCATTTTGTTGTGGTCCACGAGGCGGCGGCGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGC:1 + chr3R 7822200 5' - HMS-Beagle2 126 2 77.23 AGTGTAGTCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTA:1 + chrX 22867339 5' - HMS-Beagle 204 2 69.31 TTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chrX 2090232 5' + roo 8688 2 57.95 ACACTCTTCCTCACGTACTGACCTACAGCAGCGACATGAGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAACACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCAC:1 - chr2L 2033656 5' + F-element 4335 1 59.41 ATACAGAGGAGTTCAAAATTTCAGCAATGGGCCGACGAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCGATTGGCGGG:1 - chrX 3823606 5' - diver2 206 2 72.28 TTGATAATTTAATTTCATAAATACATATATTTGATACAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2R 8157186 5' + Transpac 36 2 68.32 TTGCTTTGTAATCATTAGCTGATAAGGCGACAAAACCAGTGTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2R 24614440 5' - hobo 2905 1 56.44 AACGAAATGCGATTGAAGGTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGATCATAAGAAATCTAA:1 - chrX 5354060 5' - 1360 3283 1 79.21 GGGCAACTCTTTCGATCGATTGTTTTCAATTAAGGGTTCAGTGGACTTTGTTTCGCTTGGAAGTTTTGATTCCACTAGGTGAGTAACGGGTATCTGCTAGT:1 - chr3L 5584924 5' + INE-1 548 1 68.32 TTTCCAATTCGTCAGCAGGATTAAAGGGCTTACTTAATGAGCTTCAATTCCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 + chr3L 2182659 5' - blood 351 2 53.47 TTTGGGCAGCGGTTCAGAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACCGCCATACATTGGTTTGGCACACGATTTTTTTGCCATGGCTCTAGAGG:1 - chr3R 801660 5' + 1360 56 1 71.00 GGCTAATTGTGCATGAAGCGACTGTTAAAAATCGCATTTAAATGTGCGGCCCTTTCGTTTCGCTGCAACACACACACACACACACACACACATACATATAC:1 + chr2R 19055989 5' + Quasimodo 41 4 80.20 GGCGAAAATTGCCTGTCATGCGTTTTACTCCCTCCTCCCTGGATTGGGGTTCCGACTCCTCTTATAGGGGACCTCGATAGCCTACCACTCCTCCTGAACGG:1 - chr2L 13077455 5' - Rt1a 482 1 69.31 AAACCATAGTTATTTACAATCTATGCAAAGGAATGTAAATAAAATTTATATCTTCGGCTTAACAAAAAACGCCTTGGACCTGTCAGATCGCAAATCATACA:1 + chrX 19988666 5' + Copia1_DM 3863 1 78.22 CAACAGAATAGATTGTTGACCCACAATCGGTGGCACACCCTTATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTG:1 + chr3L 9752735 5' + mdg1 7310 2 48.51 CCGTCGGCTGCATTCCCGTAATGTTGCTGGCCAAGCCGCTGCTCATCATGCAGGCCCGCAAGCAGGCGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGC:1 + chr3R 29136629 5' - 1360 3266 1 75.25 CCTTTTAGTTGCTGCTGCCACCATTGTTGTTGTAAATTGTTGCTCCTGCTCCTTCTACTGTTGTTGTTGTAAGCACGTTCAATTTCTTGGTCTTATTCATT:1 + chr2L 18887889 5' + gypsy12 10079 2 69.31 TTAATACCCTCAGTGTGGCATCTCCATCTTGCAACTCGACAAAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATAT:1 - chr2L 17306277 5' - jockey 4653 1 58.42 ATATACGCCAGTTTCTTTCAGTGCATATCAAGATACACGAAAAAATCCATCCGTGGAGAACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 5726796 5' - roo 392 2 62.38 GTTTTATAAGGGAACGTGAATCTTTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2L 18040736 5' + pogo 49 1 77.23 TAGAACATAAGTTAATTTGTCTATTAGGAGCAGTTGGCTGCCAAATGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCG:1 + chr3L 15764994 5' - Doc 4477 1 55.45 CATTCATTTGCGCGGATATGTTTCCTTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3L 776141 5' + 1360 53 1 74.26 CGGATAATTTAGACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2L 23372627 5' + 1360 8 2 56.44 GGACAGGAAGGTGATTTTACAATTTATTTATAACATGCCAAATGAGAAGACTTTACACGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 17249985 5' - roo 356 2 61.39 TATAATAAATTTAAACCAGGCTTAAATCGCGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGAGCCCACCCGAACCCGTTGGCGAATGA:1 + chr2R 2948896 5' + G5A 2633 1 70.30 TAAACCAATTATGCAGGATGCAAGTGACACTCGTCGTCATTCAGGCCATGTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCA:1 - chrX 21247600 5' + blood 7178 2 71.29 CTTAGGAACAATGAATGGTTTTTTTTCTTCTAGTTGATACTATCTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:2 - chr2L 9463442 5' + roo 8696 2 57.43 CCAAGTATTCGTTTGCCTCCATTTCTTTTACAAATTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTA:2 - chrX 10718604 5' - invader2 5100 2 67.33 GACTTACCTGACATTTCCGCCCTGTTGTTGGTGGTGGTGCTGATGGTGTGCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTAT:1 - chr2L 3760134 5' + flea 4822 1 56.44 ACTCATTTCTTTTGCACAATGTAAATCGGTCAAACCAATCAAAAGCGAAAAAAGAGCAACAATGCCCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 9653256 5' - roo 9061 1 69.31 CACTGTCATATCCATAAAATTGCGAGCACATTAGCAAACAACTTGGGTTAAAGTACCCACAAGGACGAAAAATGCAAAATACTATGTATATTTGCTTAAA:1 + chr3L 18962657 5' - Cr1a 168 1 60.00 CAAAAGGTGCTAAGCGTCGCCTAACAATGGGGCTCCGTCAGGTGGAGAAATATTAAAATACAACCCGATCGGACCTCACTCAGCTGTAGAGGCTGTTCGTG:1 - chr3R 6237294 5' - invader4 105 2 62.38 CCGCGGCATTCGAAAGTGTTGAGGATAGGATCAAGAAGATAAGATTATAAAGATCAATGTAACGGCGATAAGCTGGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAA:1 + chrX 9653583 5' - Ivk 60 1 75.25 CTAATTAAAACTCCGTCAAAGATACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2L 6605609 5' - blood 7339 1 75.25 ACTGACACACATTTTCCGGCCGGAACTTCCGGCGAACAAAACGGATTTAAGTCCATTCGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTACGATTTGTTTAT:1 + chrX 6041814 5' - Idefix 7120 2 58.42 CTAAATGATTTATTGATGTCTATAGATGTCTTGTTATCAAAGTCTTAATAAAGTAGTATAGCGGGAGGGAAGTAGATGTCTATACGAAAACGAGAAGCATA:1 - chr4 909835 5' + invader1 159 2 61.39 TGGTGAAGGATGAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3R 25360948 5' + jockey 14 1 72.28 GTACACACAAAAATGATAATCAGTCAATTGTGGCTACAATGATTTTGGCTTCAAGCATATCTTTGATATCTTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr2R 8125051 5' + Doc 9 1 65.35 GGACGNGGAGACGAGACGGTACAAGACGATGGAGCCAGGAGCGAGACGAATAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 27448483 5' - roo 9045 1 51.49 CATAGCGTCGGTGCCCCATTTGAAATTATTATTAACATGGGCTAGTAGGTGTACTGTTTGTAGGGGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTC:1 - chr3R 14532383 5' - baggins 5391 1 76.24 ATTGANCATTATTTATGGCTCAAAGTAGTGTTCGTTGTTGAAAGTGCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr3R 23088887 5' + jockey 4707 1 53.47 ACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1 + chr2L 14536258 5' + blood 44 2 65.66 TGGTGGAACGGACATTGAACGGACACAGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCACGATTTGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGT:1 + chr3L 16152002 5' - P-element 13 1 30.69 CTCCGATGGCACACTCTCAACCGCTCCAGCGCATGAAATACGTCGACGAAGGCATTCTGCAATGTAAGCATTATGCCGGACGTCG:1 - chr2L 14040300 5' + gypsy2 6554 2 69.41 AAATGATTTAATATACAGCCAGGCGCAATTGCAAATCCACTTGACTTAAAATGGAAAAAGTATTTTGATGAAAGAGTGAAACAAACAAAAATGTTAGCAAG:1 - chrX 17581406 5' + Fw3 3064 1 36.63 CACATCATACCAATGTATTGCAACATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACAC:1 + chr3R 4579235 5' + Quasimodo 27 2 67.33 CACTGATGAGTGTGATTGATTGGTGGGGGCGGACAATGCGAGCGGCGAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGA:1 - chr2L 11802270 5' - I-element 105 1 53.47 CCGTTTTTGTGTTAGGCGTTCGCACAGTGGGCTCAAAAAGTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAAT:1 - chr3R 7076507 5' - F-element 252 1 57.45 TCACTGAAAAGAATTAAAATTTAGAAGAACGCGTAGAGTAACGATTATCCTTATTAGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAA:1 - chr3L 3252996 5' - 1360 444 1 57.43 AATTGCAAGAGGTTAGTAGTACAAGCGGCCCACTTGCCCCACATCTAGTGTTTCAGCATTGTTTCTGGGTAAACACAAGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGG:1 - chr3R 17471619 5' + HMS-Beagle2 6950 2 71.29 CTTGTGGCCCAGCAGCCGACTATTCCGACATCCACGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTCTTGGTAGAG:1 + chr2R 6640208 5' - R1A1-element 282 1 66.67 AGAAAGAGAAACATTTGTAAGTTTATCTAAAGCGACCTTGCACACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATT:1 - chr3L 16266096 5' - Burdock 6363 2 56.44 CGAGGCAAACATGTTATGAAATACGTCTCTAGTCTGTTCAATATAGATTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAAT:1 + chr3R 11685537 5' - mdg1 421 2 76.00 GGCACAACCTCCACAACAGTAACAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCACAAAACATATTGT:1 - chr3L 20610811 5' + copia 4947 2 67.33 AACGGGAATGCCAAACGCATCGCATCGCTTCGCCTCGCGAGGCGACGCATGTAAAAAGTAAAAACTCATAAAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAG:1 + chr2R 11057435 5' + micropia 5260 2 73.27 CTGGACAGGCACTATTTATCTGTGTTTTTGTGAGGATTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr3R 22831075 5' - mdg1 7421 2 63.37 TAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3L 5827874 5' + blood 7038 2 53.47 CTCGGGCATTTCATCTGCCAGCGCAAACAAAATAAACACTAAGCCGCCCGACCGGCAATCCAATATCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 16554782 5' - roo 402 1 83.33 AGTGCNTGTGATCTAGTGTACGAGAACAGCGAGAGAGGAGCATGGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCA:1 - chr3R 24348494 5' - Max-element 8286 2 64.36 GGCGCGTGTTCATTGTCGCTCCCTCCGCCCCATTGTTCCTCTCTCCCCCTCTTCACATCTACTTCCTCCAACGCGTATGCCTGCGTTGGCGACGAGCTC:1 - chr2L 18937159 5' - R1A1-element 477 1 57.58 CGCCTCCTGCTACGCTGCCAATTTTGCCCGCTAGATGTCGGTGCTGGCCATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATCACGTGAGCAG:1 - chrX 11682401 5' - Rt1a 4711 1 54.46 CGCGGAACAGCCCCGACCCTTTCAGGTAACAACGCCCGCCACCCAAGGTCGGGGACACAGTATGGGTCAAAAAGCCCCACCTGTCAAAGGCAGCCGAAGGT:1 - chr2R 19661933 5' + Osvaldo 1332 2 60.40 CATTCGCTAACCACTGACGTTCACTGGTATTCTGTCTTCCGTAGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGC:1 - chr2L 20661171 5' + Tabor 7109 2 57.43 GGCCGCAGCCTCGTGTTCGCTCCCCAAAATCCCCATCGGATCACCACATGCAATGTTAAAATCTAAAATTCGAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAAC:1 + chr3R 6951969 5' + TAHRE 10351 1 65.35 GGTCTTCTGCTCGTCTTCCGTCTTCCGCGACTGTGTGTGTGTGTGCGAGTGCGTTTGTACTCTGGGGAACTGTCAGTAAATCCCACTTACAGCT:1 - chr2R 9005324 5' + Porto1 4300 1 68.09 CGAAGGACTTAACAGTCGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGT:1 - chr2R 21421094 5' + springer 7162 2 54.46 GTTCGCTTTTTACATTCTAAATCACATTTTTTTACAAATTTACAAATAACAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCA:1 - chr2L 12242056 5' + invader3 5213 2 54.46 TGGGGTAATTTTAACACCTCGACACCATCGACAAATATCATCTGGAAAGCGGGGCCTTTTCGCTACAGATATAAATGAATATGATCAAGAATTGAGCGTGC:1 + chrX 405980 5' - Gypsy12A_LTR 2115 1 58.42 TAATAATATAACTCTAATTAGCTAAAATGACTCTCAGATGTCTGTCAAATTAATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr2R 19232837 5' + Burdock 21 2 56.44 TTTATAACCCATCCATATTGCACTGCAAATCGAACATTTGTCATTCATAATTACTGGCACTAAGCTCCGATTGTACTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCC:1 - chr2R 19883245 5' - baggins 5375 1 72.28 CTGACTGTCAATTTCATTTACGTTTTCAATCCATTTAGTGTAAGCCCAACCACACAACACGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1 - chr3R 31996773 5' - mdg1 404 2 62.38 GGCGACGGGCAAGCGAACTGCTGCTCGTCAAAGTCTGAACACCGCGCTCCGTTTGCTCACCGATGTGGAGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTAAGTGTAGGC:1 - chr3R 5674531 5' - Rt1b 4929 1 60.40 TAACATTTAAAGGTTGCCCACTTACCTCCGGCAGGCATAGACTGGGAAAAACCCATTAGGTATAACAATATAGTGAAAGTTAAA:1 - chr3L 13786477 5' + Doc 75 1 82.14 CCATTGCACAACCTCAAACCAAAGACTCAAACGACGAACCTGGCGACGTCAATTAGCAAATCGAGAGTTAACAGGTCAGAGTAACACTGTACTCTAGATCG:1 + chr2R 14456129 5' + Dm88 4511 2 69.31 CACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chrX 2090288 5' - roo 9032 1 61.39 AAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr4 868647 5' + roo 8691 2 56.44 TAAATCATGTAGCCCAAGGTTGGTGCAACATTAGATACATATATTCCTCTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr2R 6838481 5' + I-element 27 1 56.44 AGAAGATTTCGGTTGGTAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCC:1 - chr3L 23841635 5' - 1360 3194 1 77.00 GGAGGGCAAAGATCTACTCCCACCGCCCAACATACCAACTACTTTACCGCATATACCATGGCCCCAGGAAATGCCCAACATACCTGCTACTTTCCTCATTT:1 - chr3R 23816105 5' - jockey 400 1 78.22 GGCAACAATAGCAACAATATGATGAGTGATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGT:1 - chr3L 11350287 5' + R2-element 3489 1 72.28 TTAAGCAGCTGAAGGAGCAGTGGCAACAGTGGCACCAAAACGCTGCGAAAAGTCAACAATAACAAACCAGGGAACAAGAGGAAAATTGAGCAAAATTTTAG:1 + chr3R 25791054 5' - looper1 1788 1 75.25 TTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGAGCTAC:1 + chr2L 9823649 5' + hobo 49 1 68.32 GTGTTGTATGTTTTGTGTTTTCTTGTTTTTGTGTGAGGATGGGCATGAGTTTAATATGAGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAA:1 + chr3L 9929579 5' - I-element 5016 1 54.02 CTATCTGCTGCAATAGCGCCTATATCCCTATACTCCCTCTTTTAATATCATTCTTTCCTCTTTTTTCCCCTTTTTTTTTTTGTT:1 - chrX 7192131 5' - Bica 337 1 83.33 CAGATTTTGATTCTGGCTGAGGGTTCGTGGCTGGCTGGGCCTCTTCTCCTTATGTTGATAAGGAGCGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGT:1 + chr3L 277122 5' - G6 272 1 62.37 TCTGGTTTAATATACGATGGAATAAATGCCTCGACACGCACCGACTTGGTGCCCCACCATCAGATCGAATCCAAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr3L 4696194 5' - blood 365 2 79.21 CAGGTGGGTCAGTAAGGGAGTCCAGTACTCGCCAAAGGTTTTTCCAGTAGTTCCGCATTTTTAACTCAGGGGCAGGAGATCTACAGCGGAGCTGATGGAGT:1 - chr3L 528455 5' + aurora-element 3907 1 75.25 GCCCCCTCTCCGCCCGCCTCTCAGTCCACTGTCTCGCCGTCTACTTCCCAACTTCCCAGTTTTCCACCAAGCGAATGGGATCCGAAGTCTCCAGTG:1 + chrX 8541935 5' + hopper 358 1 68.75 CTTCGTGTTTGTGCAATACAAGGATCCACCACAGAATGTGAAGCCAGTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTC:1 + chr2L 8963114 5' + G2 2628 1 54.46 AAACTGGAGAAAATGAATACGAGTCTTATAAGGTAGTAGGTCGACTGCCCACAATTTCCGTGCCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTA:1 - chrX 4469256 5' - Doc 4278 1 70.00 ATAAANACGATTGAAAAGGCATAGTGGGCTTAGTGGCGTTTTGCTCTTTCGGATTGCGGATTTCAGATTTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTA:1 + chr3L 8164120 5' - 297 485 1 69.31 TACAAGGACGTTAAGATGTTTATGGCTTTTTAAGGATTATTGTTTATATACTATGTT:1 + chrX 21448180 5' - invader2 47 2 70.18 CTAATGATCTCTTACGCCCACTAAAATATGAGTTTTAACTTAGCAAATAGTGACCCCCCAAGTCACTAACAGTGAAATAATAGTGAAACGAAAACATTTTC:1 + chr3R 7965690 5' + X-element 150 1 60.40 GGGCAGGAAAAATATTTTGTAAATTACCCAATACCTTACGAGATGACTTACGATGTTTCAACTAGATTGGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGAAAGCG:1 - chr3L 22779310 5' + INE-1 30 1 65.35 CAAGGGAAAACAAATAAACAGCCAGCTCGAGGGCAAAAAAAAAAATACAAAATTTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTT:1 + chrX 15309405 5' + jockey 157 1 55.45 TCCGGCTCCGCTAACGTCCACCACTTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGCAGTGGCAGTGGCAGTTGTCGTTGCTGCTGCGGCTG:1 + chr3R 27258934 5' - Max-element 8505 2 66.67 GAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 - chr3L 27415308 5' - transib2 2801 1 56.44 ACTCTCCTCCTTTACAGGGAATTCTTGGGATTTAATACGAAAAACTTATCGAAGTGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGATGAG:1 - chrX 724041 5' + Dm88 337 1 74.26 ACCACATATTTACAAATATTCAGTTAATTATAACTATTTAGATTACTGCAGATTACTGAAGCGACAGATGTAAGCTTGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACT:1 + chr3R 28012480 5' - diver 224 1 74.26 GTTGGTGGCATTGATTGTGCTTGCGTGTGTGCTTTTCGTTCGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAA:1 - chr2R 16401973 5' + Stalker4 268 4 59.41 AGATGCAAAAGCGTTTACATCGCGCACACACTCTTGAGCTTGATTTTGAGCGTCGGATCCGCTCATATTTTTGTTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTT:1 - chrX 7977011 5' - Porto1 176 1 60.40 GGGCCATCGGGCGATGCAACGGTGGTGCGAAAATATCTTTAACGGAGTCATTATCGCCGCTTTTGGTATGCGCCTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGT:1 - chr3R 20182175 5' - HMS-Beagle 6839 2 78.22 AGTCGGGACAAGGCCAATACAAATTAACAGCAATTAAGGCAACAACAAAGGCCAACGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGA:1 - chr3L 601313 5' + F-element 292 1 54.46 TGTTTGTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2L 16252348 5' + pogo 29 1 56.44 ACCACTCGATGAGTCACAGTTGCCGACCTGATCCATATGTGCGGAAACTGAACTCCTTTTGCAGCAGCACTTGACTGCCAACTTTTTATTTATTTTTTTTT:1 + chr3L 18210438 5' - mariner2 791 2 71.29 TCACTGAAGCCTTCCAACTAACTCAAGCTGTTGTCCTACATCCTTCTGGTCTCAGCTTTGGCGTTAGCCATCTCGACGGGGCATCTTGACCCTTCACATAT:1 + chr2L 5394030 5' - gypsy8 4492 1 79.21 TGACANAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 2090279 5' - roo 9023 2 70.30 CAGTAACTACTGAATGTGCCCCAGTTTCAGTTGAACTTAGGCACTGACGAAATATCTTGAATTGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGC:1 + chr2L 20298662 5' + F-element 454 1 69.31 CAAAAGCACCAACGAAATGCCCTAAACAAAATGCTGTTTAGTGTACCAAATAATAGAGATCTAATTGTGTGCAATCGATTGCAGGCGTCGAGAATATGGTC:1 - chr2L 5745837 5' - Ivk 5141 1 60.40 CAAGCNCGATGGGCACTCGCACCTCCTCTCCCGCTAAGCCTAGATATATAAGATCTAC:1 + chrX 13711311 5' + 412 261 2 55.17 GAAACTTGGGCACGGATTCATTTGCTACGAGTGTGTGGGTGATGTTTGTATGTATGTATGTATGTATAATCATCTGTATGTGCATATGTATGTATGTATGT:1 - chr3L 13775172 5' - 1731 4390 2 81.19 TACCTTTTGGGTCTTTTGCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGATCAATCGAGTGGA:1 - chr3R 12578205 5' + jockey 16 1 63.37 ATGGCATCTGTTATTAGGTTAAAAGAATTATTGATATTGTTTGCAATACTTATATGTGAAAAAAAAAAATATAATGTTAATTTCACGAAATGATTACAA:1 - chr3L 15900308 5' - Idefix 7347 2 59.60 AGCGAGATGAATATACAAGTGGCTGGCCTGCTAATAAATCAAATAAACTCGCTGCTGGTGTTGCTGGTGCTGCTGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCTGG:1 - chr2L 8825464 5' - TART-B 151 2 56.70 AGTGGAATAAAGAGGCTGGAGTTCAATAAATATACCATCGCTCTTTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3L 21908958 5' - roo 9041 1 55.45 AAACCTTTTTGGCCCGCTGCTAATGAGCCGAACAGTCCTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCT:1 - chr2L 15418393 5' + Cr1a 4085 1 71.29 TTTTCCTTCCTGATTGCCGCCTGGGAGCAGTACTGTCCTCTACCCACTAAAATATAATTTTTTTTAAATTTATTGCCATTTTAAATACACGAATTAACTTA:1 + chr2L 6600752 5' - HB 290 1 76.24 ACACCCATTCCCGCAATTGGGAAGTGAACCACACGTTTGGTTTTATACTTAAAACACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACAATCAGATACCCG:1 - chrX 17167552 5' - INE-1 555 1 73.27 ACTTTAAACTTTTACCAGGTGCTCCGAAAGTCTTCCAAGCAGCAGTTCCTCTGCATGTTCACCCAGATGACACAGCTGGTGGCCACCATTCTCAACAGCAA:1 - chr2R 24778943 5' + G6 1580 1 64.36 TGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr3L 5827892 5' + blood 45 2 66.34 GTTCAAAGCTAAGGCGATCTAATTAAATATGAAATGTAAAACACTTGAGGATTACGACTATATTTCGTCTGTTTGGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCT:1 + chr2R 8297083 5' - Burdock 6126 1 63.37 ACATGATCCCGACACTCGATCCGTCCGTCTCCATTGCAATCCTCGCCACCATATCGCTGCACATAGCTACGCACATACATAACCACATAGGAACAGCCATA:1 - chr3L 7068100 5' + Quasimodo 58 2 74.26 AGCTAAGCGGCCTTTTTGATGTTCAAAAATCAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGA:1 + chr2L 5649198 5' + Idefix 6941 2 71.00 ATCCTAGTTAGCACGTCGCAAAAAACATTCGCAATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 + chr2L 19845918 5' + F-element 57 1 68.32 CAGCGCAGCACACACGTAACAGAGGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2L 14536295 5' - blood 7339 1 72.28 TCTAAAGCATACTTATGTGGTTAATTACTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chr3L 12646318 5' - jockey 4954 1 72.28 CGCACCACTAAATCCCTCTACTTTGGACTTGTAAATGTTGAAATACATAGCTTAGATAAATACCAAAATTGGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTA:1 + chrX 16286925 5' + 1360 3362 1 70.30 ATCCCATTGAATTTGTAAGTTATCGAAATCCGAAATCTCTAAGTCTATGCAATTTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAAG:1 + chr3L 17760962 5' + I-element 5061 1 60.40 TTAAANATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAA:1 + chr3L 20224130 5' - Chimpo 175 1 67.33 GCCAAAGAACTGAGAAGCATGTGCACATGAATGGTTGTTGTTGTCACAGTACGAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTG:1 - chrX 14124310 5' - Doc2-element 492 1 69.31 AGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1 + chr3R 9833059 5' + Tabor 6888 2 73.27 TAAGATAAATGTGGCGCAGAGAGTAATCAAATCCCCATATATCTATATCTACATGAGCTCTCTCTCTCTACATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGT:1 + chr2L 3244904 5' - rover 7295 2 77.23 TGTGGGCGAAACACGATATTTTTACGTTTAGTTTGCAAAATTGAATAACACGTAAATGTGTTTAGTACGGAGGGGGAAAATCAAAAATTTCACTTTTTTCA:1 - chr3R 30665225 5' + FB 160 1 81.19 AAACATATAGCTTGCCTAAATGTATTTTTTTATAATTATATATTTAAATTATCTTTAAACATTTAACAGTATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCA:1 - chr3L 25236935 5' + accord 6949 2 75.25 AAACATGTTATGAAATACGTCTCTAGTCTGTTCAATATAGATTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3R 11685543 5' - mdg1 7452 2 69.31 TCTAACCCCATGGTTGTTTAACACTAGCAAGCCAACGAACTAGAACAATTGGCTCAGTGTATGAAACATAATATCAAAGTGCTGACCCAGCATTGGGTCGG:1 - chr2R 3106162 5' + Gypsy6A_LTR 61 1 78.22 TGTTGAGCTCATCAATAATGCGTTGAGCACAATGCGTTCGAATTCACACTAGCTGAGTAACTGGTATCTGATAGCAGGGAAACTCGACGATAGCATTCGCT:1 - chrX 5477040 5' + INE-1 574 1 67.33 TTGATGTAATTTGAGCGCCTAATTGGCGCACGTGCTAAACTGACGATGGCAGGTTCTGTAGCCGAAGGGTTTTCCCCTTGTTT:1 - chr3L 17167290 5' - X-element 481 1 67.47 TGGCAACATACGGAGAGACGATACATTCCGCGAGGGAAGACTTACAGTTGGGATTTCCAATTTCCGAAAAACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAA:1 - chr3R 1849108 5' - Cr1a 389 1 77.00 TAAATTACTTTAATTGCACATTACCACGACGGCAGGATAGCGAAGTGTGAGTGTGTGACTGTGTAAGTGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTAA:1 - chr3L 10139672 5' + Stalker 456 1 86.67 ATTACGTGGTAATTATGTTGTTCAACTCTTTGTTCCACTTGTTGTTTGTGGTCTCTCCCTATGCCGTCACAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 697417 5' + roo 8668 2 75.25 AGGTTCAGCAAAACCCAGTCACTGGGGGTTTTATCTAAGACATATGCCTCGCTTCTGATCTCCCAGTTTATCACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGT:1 + chrX 6510153 5' - mdg1 437 1 69.31 TAACGGCAGAAATCTACAGGCTTGACTATCACATACCCATTAACTTTTTAATAATAAACACAATTAAAACCAGAGAAATTGCTTTAGTCGAGTTCCCCGAC:1 + chrX 15264489 5' - INE-1 568 1 72.28 GACACGGCAGACTCTGCGCTGGCCAATGAAGTGGACGACCACCGTGATCAGTTATGCCATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGC:1 - chr3R 5824172 5' + G5 4417 1 52.48 GAAACAAGCGTACTCAATAAAACTTTTAAAGGCTTTTCATATTAAATGCACAAGTTTCCGGATGGAAGAATACAGTTGAGTTCAATTAGCATCGACACATA:1 + chr2R 15792106 5' - diver 62 2 67.33 TCTCGAAAAGCTATTTAAAGTGAATGTTAAGGGCTTGTTATGCGCGAATGTATCTGTTGATACCGATAACACGCACGCACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGC:1 + chr2R 10539321 5' - G-element 158 1 56.44 AAACGTCCGCCTTCCTTGGCGATCACTGCCAGCCATCGGATGTTGTTCTCAAGATGATGCTGCAGCGGCGGCACCAACATACTTAATCATACTTAACCCCT:1 - chr3R 18213879 5' + G2 2954 1 76.24 TTTGTCAAGGCTTCACTGTGCTCCTTTTGTGGGCGGTATATTAAGCACACACAATGCCCATAAAAATCCTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTCTTGTC:1 + chrX 15532305 5' - 1360 5 2 66.34 TCTGCTAGCCATTTCGGACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTG:1 - chr3R 19446536 5' - gypsy12 10175 2 57.43 CCCGAGATCAGCTAAAGTTTTATCCTCCGCACCTTTCTCGTAATAAATTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTG:1 - chr3L 18216345 5' - invader4 26 2 53.00 TTGGGGTGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 11832967 5' + roo 45 2 71.29 AATAGCCGCATTTAACGAAACGAACTAGTTTCCGAGGCAACGACATAAAAAACCATACCAATTTCATCAGTCCATAAAACAACAAACCAGAACTCGATAGG:2 - chr3R 24572230 5' - Bari2 631 1 63.37 AAAAATCGCAACACCAACAATCGCAACGCAACTATCGTTGTCAGGCAACGAATGGGGAGTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTT:1 + chr3L 156588 5' - Max-element 22 2 69.31 GCGTGATATGCATATATTTTTGCAAATGAGTGAATGATTCTAAGCGAAACCTTTAGATTCTCGTAAAAATACATAAGGTATTGTTTAATTTATTTTATTCA:1 + chr3L 9023034 5' - HeT-A 5 1 69.31 TGGGCTGGGCTGGGCTGGACTGGTGGTTGGTGGTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCC:1 - chr3R 20792596 5' - 297 6594 2 65.35 AAGAGTTTAAGTGCTCAGATAAACAAAAAGCACCAAAGTCCTGCGAAGGTGTGAGGATAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAAT:1 - chr3L 12234012 5' + Stalker4 6967 4 65.00 CATGCAAAAGTGGGTCATGGCCGTCCGCCACGCGGCCTTCGAGGAGCCCAGCGTGTGCGACTTTACCGTTTGACCTCTTTGCCCTTGGCCC:1 - chr2R 6764631 5' - gypsy8 209 2 71.43 TGGCAGTCGCAGAGAGAGATGGCTATCGAAGTCTCCACAAAAGCTTTGCCCAAGGGTATTACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACAT:1 + chr3L 22642120 5' + G4 3581 1 66.34 ATGAAAATCGGGCAGTTACAAAACCTAGGATGCATAAAGTGCCTCTATGAAGCAGGGTAATTGAATCGTAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGA:1 + chrX 16163541 5' + mdg1 7127 2 68.32 CTTACCGCTTGTGCTGCTCCCTTATTTTTGTTTTACGTGGTCGGCCACTACGCGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAAT:1 + chr3R 17973404 5' - Tc1-2 474 1 72.28 CAAAAACGAAACACAACGAAAAAAAAATAAATAGCGAAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTTCT:1 - chr2R 17663139 5' + F-element 4214 1 59.41 CTAAGCAGTAGGCTACACTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTG:1 - chr2R 20698749 5' - P-element 356 1 23.76 AACAANTTGCAGCAACAACGTCACACGTCTGCGACACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAA:1 + chr2L 9167141 5' - rover 302 2 70.30 AACATTCGTCAGACGAGTCGACTTGACAACACGTTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCACGATTCTATGAAACGCAGATCAACAAC:1 + chrX 17477777 5' + Q-element 218 2 63.37 GGAGGCGCTGCAAATTGAATTGCCACCCAAACCAACTTCGTCCATTAATAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:3 - chr2L 970331 5' + 297 6604 2 57.43 TCATTATGCAACCAAATTGCATTTTGCAAACAGGATATAAAACTAATATTTTACAACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATA:1 - chr3R 31017489 5' - X-element 4558 1 57.14 CGAAAAGACAAAACGAGACGCATATGAATTTTTTTTCTCCATTTCTTATATTTGGTCGATGGCAACAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATAT:1 - chr3R 8969779 5' - Stalker2 7285 2 68.32 GGAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 19510797 5' - roo 9028 1 67.33 AGAGACGCACACATACACAACAAAAATTGGGTTAGTAGGGTAGCAAATAGTGCGGTTTCGAAAAGTCGTTTTTTTTTTAATTTTATACGGCAGGAAAATGA:1 + chr2R 19567685 5' - Rt1a 5056 1 71.29 TGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:2 + chr3R 19450172 5' + roo 8705 2 63.37 ATCCCTCGGGATTTCCGTTTGCCACCCAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCA:1 + chrX 13185718 5' - roo 8969 2 63.01 GTTTTTTGCCCGCATTTTCACATTTTCCCACTTGAGCTGGGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTT:1 + chr3R 11216100 5' + jockey 243 1 60.40 CAAATAGTAAATAAATGGAAACTAAAGTAGTAAATCAAAAACAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:2 + chr2L 773255 5' + I-element 36 1 56.44 CTATTTGAAAAGAGCCGTCCGCTTCTGCATGCAATCTTCATGTCTAATCTCAACTATCTAGCTAAGCTGTAGTTCCCGAGATCTCGACGTTCATACGGATT:1 - chrX 21312940 5' - INE-1 132 1 68.32 AGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAG:1 + chr2L 10635242 5' - roo 9047 1 53.06 GAAATTATTATTGAATTCTTTTTGTCTTGCCGTTGCCAGCATGCCGTTTGCATCCAACCGTAACTTGTAAGTTGGTAAGTTGTACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr2R 11262319 5' + Tc3 237 1 56.44 TGCTTTGCGTACGATTTTTGTGGGGTGGATGTGGTGTGTGTGGTTGTGGCTCTGAATGGGGTGCAGACGCACAGGTGTTTCTGGGTTTATATAGACCAAAA:1 + chr2L 15265883 5' + NOF 87 2 58.42 AAAGCAATAGTGTAATTGGACCCATTCTTCAGTGTTCTCCTGCCACTGTTGTTGCTTTTGCTGCTTTTAATTCAACGTAAATTTTATTTTATTTTAATTTC:1 - chrX 7378176 5' + transib1 1899 1 76.24 TCATACAAACTTGCAACTAAACAGGACTCTGCTACGGGACTACAGGATTCGTATCGTGAAGAGTAAAAGCTTTACGTTTCTCTTGGATTCAGGTGCATTTG:1 + chr3R 22339369 5' - Idefix 345 2 55.45 GCAACACTTCCTGCTGCCCTACCGTCCGGGGAGCAAAAGTGTGTTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAG:1 - chrX 12951538 5' - Gypsy6A_LTR 249 1 77.23 TATAATGCCATTCCGATATGTATGTAAATAAACAACAAAAAGATAGTGTCTTTGTGTGATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3R 20767957 5' - 412 7526 2 43.56 TAGGGGTAGTACCACGACAACGTTGACATATTGAAGGAAAACGACAGATTTAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTC:1 - chr3L 21854523 5' + invader2 4920 2 64.36 AACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGCCGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGT:1 - chr2R 4879003 5' + G-element 53 1 72.28 AAACAGGTCCCCCTAAATAGCCTGTTCAAAGTAGAGGGACTGGATGCAAGACAGGCGGCAGGAAAGCCAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCC:1 - chrX 16543616 5' - pogo 41 1 72.28 CTTTTTGCTGTCCATAAATCAATAGAAAATCCCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCC:1 - chr3R 6728415 5' + gypsy4 6650 2 68.32 AAAAAATCGGGGGAAGCGACGCCTGCTTCCGAGACAAGGCCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTT:1 + chr3L 4081299 5' - HMS-Beagle 6869 2 58.76 TCAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 + chr3R 9833034 5' + Tabor 6863 2 53.47 TATGAGTAAAGTCATTTTCTTGTTTACTACGTAATAAAATCATGGGAGCAGCACACGATGCTCTAACCAACCATGGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 908348 5' + 1360 1 2 76.24 TCTTGCATCGTGTATGTATCCGGTATTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTTGT:1 - chr3R 1705140 5' + Cr1a 211 1 75.25 ACACGTCTTGAACATATACGTCTTTACTCACCAACACAAAGAAAACTTTTGTAGGCATCGAAAGATATTTATTTATTTTTATAATGTAGGTACATGTCTAA:1 + chr2L 21314440 5' - mariner2 812 1 58.42 GGCGGCGGCGGTCGCTGGATGAGGGTAGGGGCCGTTGAAGTCTTTCGTATTCGGGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCAC:1 + chr3L 21728053 5' + invader4 434 1 63.37 TGATAAATCATATCTGCGCTGTGATGAAAAAATAACCCGTTATGTATGGAACGTCGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2R 2745762 5' - 1360 3368 1 74.26 GTTGCTGTTGATTTACTGGCAATAATTTGTGTAGTTTCCTCATAACGTGTTTGGTTTTTCGTTCGTATGATGTATCCAAATACCAGATAAGAATATGATTG:1 - chr2R 14512337 5' + Idefix 108 2 75.25 TCAAGGTTGTTTTGGCGTGACAAATATTTGAGGTGTGGACTAATTTGAATTGTATTTAAAGCCATGACACCGGAAAACAAGTTCGAAGGGATCCGAAAAGC:1 + chr3L 15234735 5' + R1A1-element 5329 1 71.29 TTTGTTAGGTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2L 16252346 5' + pogo 31 1 58.42 CAAGCCGGGCGTACCAATTAATTACGGTGAGTGCCGCTTTAATCCGACCATATGAAGTACATATATTCCTGATCAGAATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCC:1 + chrX 4919995 5' + INE-1 101 1 58.42 TATACATACATCTATATATACACCTGTGTAAGACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCTGCCACGGG:1 - chr3L 5221569 5' - accord2 15 2 59.52 ATTTTACGAGGCTCTTTGGCTAAAAGCGCGCTTTTATGGCTTTGTTGACGCTCCCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAAT:1 + chr3R 31293196 5' + hopper 20 1 60.40 ATGTGGGGACACATGTACTCCGATTCCGAATTCGATTCCCGCCGCAAGATGAATACTTAATGGCAAATTTTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAGTTTATTT:1 - chr3L 12570501 5' - 1360 372 1 60.40 GGAGGGGTCTTTATATAGTGAACGGGTTGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAAC:1 + chrX 12474411 5' + Cr1a 468 1 72.28 GAAGCNATCCACAGATACGGAACGCTCCTCGCTGATTATATGCTTGCGCCGGAAGATGGGGGACTCATCCACTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCG:1 + chr2R 8918734 5' - R1A1-element 329 1 75.25 TTTTTNTAATAAATTAAACAAATAGCGGAAAATGCGCGCGTTTGCTTTTCGATAATTTCAACTGTGCGCACGCTCACAGAAAAGGCAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 15655233 5' + Doc2-element 239 1 60.40 GATGTTGCTGTTGCTGTTGGATCGGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTGGCTGTTGTTGCTAAAGGGGCAGTTGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACTGGTAGG:1 - chr3L 3413349 5' - Doc3-element 485 1 56.44 ATTAATTAAATAATAAAGTGTTTGCTCTCAAGTGCGAAAATTAGGGCCGTCAAATAGGCATATCAAGAAGCACAACTTCCACGGAACACTAAATTACCTAT:1 - chr4 852675 5' - R1A1-element 72 1 72.28 AATGATGATCATATCTTTGACCAGTTAATCGAGCCAAGAATAATGAATGACGAAGGTGACATTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAG:1 - chr3L 25606654 5' + micropia 5122 2 66.34 ACTGGCCCTCGTTTAGCGCACAATACTCACAGCACTCACCTTGATTCGAAACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCAT:1 + chr3R 10105030 5' - 1360 387 1 56.44 TGCATGGAGATGCCTGCAAAAAGTTGTGGATTGATTAACTTCACTATGTCGGCAGTTAGAGCCAATTCCATATTGAAACTGAAAAAGCTAGACTGGCTTTT:1 - chr2R 20641987 5' + G5A 2342 1 67.33 AGGCCAATGTCAACTTACAGAGAAAAATATCTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCT:1 + chrX 6143250 5' - I-element 4920 1 69.31 AGCGACATTATCCCATAATTATAGGGCCACCGTATGCTGAACTGGGACTGGGACACGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCAT:1 + chr2L 6815225 5' - Tirant 97 2 60.40 TTTGCTCTTTCATTTAGTTTCCAGCCATCCAGTTTGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATAT:1 - chr2L 5151780 5' - I-element 5088 1 66.34 CGGAATGGCTTGAAAGTTTTGCAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAA:1 - chr2R 3648813 5' + Stalker 7175 4 78.22 CTGGTTTCGGTTTTTCTTTATGCTCTCGGCGGATTACTCGGTTGATATTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCAT:1 - chr2L 6704029 5' - hopper 951 1 54.46 TCGAAGGAACACCATGGAGTTGAGAATTTGTTCCAGCTATTCGCTCTACAAGATTCTCGCCTTGTGCTGCTTTTTAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGC:1 + chr2L 8967557 5' - Burdock 5985 1 76.24 AATATTATATTTAAGACGTCGTTGGGTCTCCGGTTTTCCCCCACACAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGT:1 - chr3L 13191012 5' + Circe 99 1 54.46 TTCGCTTTCTATTTTACTTAAACTTGGCCAGCAACTTAACACGGCTAAAATAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGG:1 + chrX 9944366 5' - Quasimodo 14 2 75.25 TTCTATTTTTCTGTTGATATTAGCGCTTGTTTATGGCTCAGTGTATATGTATTTTCTAACACTTTTTCATCATATTGCTGACTAAACTTAAATACTACAG:1 + chr2L 1839064 5' - Tc1 1555 1 53.00 TTAGACAATGAAAAACGTATCACAGTTTACAATCTTATTGCGCTAATTAAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGA:1 - chr3L 12595912 5' - flea 4939 1 56.44 AAGCCAGCTGAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:2 - chr3R 19535779 5' + hobo 11 1 68.32 CTCCCCCCTTAACAGTCATTATTCTCTACTACCATGTTGGTGAAGAACAGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAAC:1 - chr2R 10174019 5' + invader1 3856 2 52.48 CGGAAGTGGCCAACGATGGCGAACAGAGCAACGGCAGTAGCAACAAGGAGGCGGATGCTGATCCGGAAGGAGTTCGGAAGTGAGAACGCGCGG:1 - chr2R 11827466 5' + gypsy8 440 1 69.89 ACAGCTATCATCATAATAATACAGGTGTGCCAAGTTAAGATCAAAGAATTTGATTTAGATTGCTAGAACTTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr3R 13494935 5' + F-element 22 1 57.43 ACTTAAACGAAAACAACAAAAACTACTACACCTATCAACTGAAAAGTAGCAAGGGCCTTCAAGTAGATCTACATAGTTAGTTAGATCTACAATGATTTAAG:1 + chr3L 42326 5' - Cr1a 4147 1 59.41 TTTTGCCACACAGCAGTTGCACTCACACACATTCACCACCACCACCACCAACAACAACAACAACAGATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTAT:1 + chr3R 19069368 5' + McClintock 135 2 64.36 ACAGAAAAACAGACAGCAGTTTTGGTCTCGGCCACAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACATAGCCCACCAACACTAC:1 - chr2L 11024466 5' + I-element 4964 1 66.34 GTCTGTGATTGCGTCGGCGTCGCCTCCTTCGCTGTCGTTTACGATTGCGACTTTTACAAAGCACTCTACATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTTGT:1 + chr4 1082553 5' - mariner2 722 1 74.26 CGTGTTGCCAGGGGCAGGCTGCAATGGTGTTGGTGTTGGTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGG:1 + chr3R 20282701 5' - I-element 5013 1 61.39 AGCTTCCCTTGTGGAAAAGGCTTCTCACGAACCTGGTGCTCGCCTGCACCTTGGGAGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTGACTCAG:1 - chrX 645712 5' - G-element 3989 1 59.57 AACTCGGTAAGTGCATTTCATTGTCTAATAACTTAAATGTTTTTTATTCCTACGATATATAACCCCAAAAAGATAAGAATAATGTAATTTTAATTTTGATC:1 - chr2L 8770401 5' + Rt1b 129 1 60.40 TATTAAAGTCTCGGTCTGAATTCGTAAACATATGTACACATTTTTTTACGTACACATGTATGTACACATATTTAATATGCCAAAGGGTCAAAACCGCATAC:1 - chr2R 3021019 5' + Quasimodo 216 2 78.22 AATATAAACATTTATTTTAAATGTGGTGGGATAATGCATTACATTATAGCCAAAACTATGTACATATTATCACAAAAATAAACTTCAAAAATGACTTTATA:1 + chrX 22945150 5' + 1360 376 1 53.47 GTTGTTGATTACATTGTAGTGGCTGCCGTGGTTGTGCAGCTGGGTGCTGCGTTGTCTGCGGCATTATTACAGTTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTG:1 + chr3L 22256463 5' - Doc 468 1 77.23 ACAGCAATTTCAGCAACCCCTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chrX 13560739 5' + roo 8721 2 84.16 TATTGTTTTGAGCGTCGGTGACGATTATTTGAAAGGATGGCTTTATTTGCTCCTGTCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATG:1 + chr3L 6567079 5' - F-element 327 1 58.42 GGGTGAACGGCAAACCGAAATTGGCGTTATGAACTCTATGCGAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGG:1 - chrX 4869677 5' - Ivk 5136 1 62.38 CAGGATTATGGGCAATGCCCTGGCCATTTCGTTTCCTCGCCCACTTTTGCTATTCCGTGCCGTTCTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTA:1 + chr2R 12117037 5' - Bica 225 1 54.00 TATAATTCAACTAGTTTGTTTCCAAATTTAAAGTAAAGTAAAATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAA:1 - chr2L 15292204 5' - R2-element 3148 1 57.14 TAAGTGCTAAATTATTTATTTTCGAATCTCATTATTCGATATTCGCCATTCGTACGGTATTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCA:1 + chrX 17331268 5' - gypsy4 463 1 64.36 GCGAGGGGTGTATTATGACTCGTGCGAAGACGTCTAAATCTTCTCGCGAATTGTGCCGTACGATACACGGCAGTGCCCCTCAGTCGGTTGGGCGGG:1 + chr2L 478850 5' + Cr1a 4417 1 66.67 TCACGGACCGACCTGCACTCCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCACCCCG:1 + chr2R 5910881 5' - hobo 2891 1 76.60 AGTGCAGTTCGCAATAACACTACAAAATGTAATTTAAATTCTCTTTATATTTCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 11576374 5' + roo 8687 2 56.44 GTTTGAAAAGCAAAAATGATAAAAAGCCTTTGGGACATTTAATAGAAAAGAGCTGTTTGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCAAACAAAAATTAGA:1 - chr3R 5141064 5' - 1360 93 1 58.42 CTGATCCGCAAGGCGGGTGCGTCTCAGGACACGACCAACATTCTGCAAGAAAAGAAAGTCCGGATGAGATACGAATCCCTCACACACATGCGATTACCTCA:1 - chr3L 21980324 5' + I-element 4875 1 72.28 GGACAGGCACATCGCCAGGATTCTTGGGTTCCGTTCCCGGCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAATGTGAACATTTTCGTCCTTTCGAGAAATTCTGTTG:1 + chr3R 20466429 5' + rooA 392 1 60.40 GGAACCCCATTGGAAAACGTCATAATTATCGGGGATGGCTGAGTGGGCCGCCAGTGAACAAGTGAGCACAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAGCTTTCTAT:1 + chr3R 19808400 5' + X-element 248 1 67.33 AGTTCTTTTACCTATGTATTTGTATGCAATTAAAATTTGAATACTAGATTTTCTCCTGCAAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr3R 17468440 5' - Transpac 5214 2 65.35 AAAATNAACACTAAGCCGCCCGACCGGCAATCCAATATCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3R 16554810 5' - roo 9032 1 62.38 AGGCGAAACTTCAGCAACGGCCATTATAGCTGTGACATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAG:1 - chr3R 5808841 5' - R2-element 3381 1 65.00 TGTATTTGTGGCGCTGCCTAAAACTATGCAGCGCAATTTTGAAGCTGACATTTTGTTTGTTCGCTCCTACGAGTATTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chr3R 17505044 5' + jockey 6 1 77.23 GAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 + chr2L 306492 5' + Tirant 8152 2 70.00 AAGAAAACAATTTTAATTTTTGACTTCAATTTGTTTGTGTTTCCTCTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTC:1 + chr3L 9471048 5' - Bica 468 1 57.43 TGGCTAATTCAACATGCCAATACCTCTTTGCTATCTTTTGGGTTTAGTGTCTCGCGCATGGACAGCGACATGAGCAATCCACTCAAGAGAGCGCTTAATTA:1 - chr2L 2352243 5' + Quasimodo 426 2 64.36 CGAAACAATCCACAATGCCGGCTGAAAAGATCCCAATCCCTATGCAGTGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCA:1 + chr2L 3752098 5' + HeT-A 5990 1 57.43 GTTAATTTAAATTCTAAGTAATATTCCGTGACCGAAATGTAAACGGAGTCAGACTTTCGTCTTTGTTTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCA:1 + chr2L 9298538 5' + Cr1a 223 1 62.38 TGCCATGCCGTCAAGTACCTACACGATCGGGGTAAAACAAATTAGTTTTATTTGGGTTCGAATGTGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGC:1 + chr2L 20063141 5' - flea 27 2 71.29 CATCAGCTTAATCTCCACTTGCCACGGAGAATTGTGACGTAGGTATAAAACCCGATAGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATC:1 - chr3L 4537101 5' - Rt1a 4907 1 63.37 CGGCAGCGGCAACCGAACGAATTTATTTTATTCTCTAGTTTTACCAACCCGACCGCCACCCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTA:1 - chr3R 27382817 5' - Dm88 378 1 60.40 AAAGCTTCCAAACTGAGTTTGAAACTGTTTACGTAGCAGCGATGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCGAGTGTCTCG:1 - chr2R 6170222 5' + hobo 348 1 62.38 TAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCGTGTCCGTATGTCCGTATGAACGTCGAAATC:1 - chr3R 4947765 5' + INE-1 132 1 89.11 TTTATTATTTTCCAACGAAGATATACGAAAAAGAATAGAGTGTTTATAACTTGCTAACATAACATGTAATTTCGCGTGCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAC:1 - chr4 687972 5' + INE-1 534 1 74.26 AAATTTGACAGGCCTGATTGAAAATGAAAAGTTGGACACAAAAAGGTGCTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 - chr2R 11730940 5' - blood 350 2 52.48 CTGTGGTTGATTCAACTTCTAATCTATTAAAGAGAACAACAGAAGATGTTAACTCCAATTTTAGAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chr3R 19448684 5' + 1360 203 1 71.29 GGCTACGCGCCCGAGCAGAAGATAAGAGGTCGGTGAACCAGGAGTCAGTTGTGCCGTGCGCAAAAAGGGAAATATCGGGATCCCTGCGGCCTCTAAAGGG:1 - chr2R 4295420 5' + gypsy8 331 1 75.00 TTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2L 9823631 5' + hobo 31 1 52.48 TAAACTTTGTTTATTTACATAGAGCGTATTCAACATTTAGGCAAAAGGCGCTACTAACATCAACTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGTTATTACA:1 - chr3L 18655927 5' - transib3 445 1 66.34 CTGCGTGTGAAACAACTTAATTCCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCACTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCT:1 - chr3R 20094040 5' + HMS-Beagle2 7083 2 75.25 CGTTTATCACAGAAAGGTCCGTTCCCAGTAAATAACCTCGATTCGAGGCGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2L 6644350 5' + hobo 25 1 54.46 GGTCGGTCTGCCGGGTGTAATACATTTTGGTGGCTATTTTAAAATCCACTCGCTCAGTGACCTTGACGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAA:1 - chr2L 23023559 5' - Quasimodo 7095 2 65.35 AGCAGCAACCGCCGCCACCAACTTCACATCTGACGCACACCGACCGGATATCATACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGCT:1 + chr3L 21435605 5' + Chouto 5961 1 67.33 AAACTATTTTGTTCCTTGATAAATATGTATTTCGAAAACCGAAACAGATATGACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGA:1 + chr3R 24677846 5' + copia 4829 1 61.39 ATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCTTAAAC:1 + chr3L 15276647 5' + hopper 31 1 55.56 TGAAATATTAATTGGAACATTAACTTTACCGTATTTATAAATGGCCACACCAATTACTCAAATTAGAATGTTCTTTTTTTTTAACAATAATGTCCGATTAT:1 - chr2R 3785144 5' - Circe 458 1 51.49 CAGCCTGCCCGTCTTGTTGCGATACATCGACTGCCGCCCACTCTTTTAGTTTATTTATACAGATACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 8763206 5' + jockey 20 1 64.36 AGTCATTTCATTAACTTTCACTCGCACAATTCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCC:1 + chr2L 10106430 5' - invader2 278 1 69.00 GTGTCTTAAATGTAGCCCAACTTAAGTACCGATTAGATAAAGAACTCAATGGCCAGCAATTTATGAAAGTGATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 17789001 5' - roo 9065 1 73.27 TTTCTCATTAGCTCATTCGGACCTTGAACTCTATGCGAGCAGCCTAACTGCAAAACAAAAACCTCCGCGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGG:1 + chr2L 19847638 5' - Rt1b 4955 1 49.50 AGCCACCAAACCACCCACTCACTCACTACTCCGAGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGCGCCTAGAAAGAAGGCGC:1 - chr3R 25153471 5' + G-element 361 1 73.27 TTTAAATGAATTATCCTAAGACTATAACTTTCTTTGAACTTTCTAATGCCCGTCGTCCGTTCCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACA:1 - chr2R 20187050 5' - Tirant 475 1 66.34 CTTCACGTGGCCGAGCTTTCGCTCTCTCCCTAGTTCTGCTGCTGTTGGTTCTCTCTCGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCGCTCTG:1 + chr3R 22470240 5' + Cr1a 289 1 77.23 ACCTGAATTCCAGGGCCTTTAACGACGTCTCCCAGGAGCCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2R 20791813 5' - roo 9034 1 63.37 GACAGTGTTTGTTTCTCCGGCATTCTAATCACGTACTCCATGCCAGTTATAGTTCAAGAGCTGGAGATTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCTTACTT:1 - chr2L 1239801 5' - Stalker3T 77 1 55.45 GGTTTGGGTGTAAAAAGCCACAAAATGTCGGGGTATACATTGGGATATCAACTAGACTTAGGCACTAGAATAACAAGATGCATAACGGCCATACATTGGTA:1 - chr2R 21007237 5' - 1360 3365 1 69.31 GTGGTGTATGGCCACCCCTTTGGCCAACACCCACTTTAGCTTCAACTCCAGTGAAAGTTTGTTGTCGCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr2R 22454911 5' - hobo 2937 1 75.53 ATAAAGTACTCACTTAAACACAAAAGGTTCAAAAACAGAGACAGCAAAGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTC:1 - chrX 15185724 5' - Rt1b 4978 1 58.42 GCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTAAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCACT:1 - chr3R 2689400 5' - diver2 4465 1 44.44 ATCGTTCTACTATCTTAACTGGGGCGGCGTTTATCTAAGGCGATATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCCTT:1 - chr3R 15656411 5' + roo 153 2 70.30 TGGTATATTTTTTGTGCGCTGCCTTCGTTCACCAAAACGCATCTATATCTATCTATATTAAAGTGTATATATGAGTACAAACTTTGAGTTTATTTTTAATT:1 + chr2L 12495203 5' + transib4 248 1 68.32 TTGTTTGTGCTTTTGCTGGCGAGCATGCTTTACGAGCACAGCAGACAACTATAAAACGCAGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTAT:1 - chrX 18139946 5' - pogo 5 1 62.63 TATACTTGCACTTTTGTATGCAAACAATAATAAGTATTTAAAAAAAATTAAATTGTATTGTATTGTATTTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGA:1 - chr3R 3854608 5' - Idefix 321 2 70.30 GAAACACTAGAAGCAGATTACTCAGACATTACAAGTGTAAATTACTATTATCCGTTATTTATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAA:1 - chr2R 19459521 5' + F-element 4425 1 55.45 GCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 + chr3R 9833066 5' + Tabor 6895 2 78.22 GCATTGACGACAGCTGCTGCCTCTTGGAAACCAACAAGCAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 7097971 5' + G2 3077 5 95.24 TTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCC:1 + chrX 21087587 5' + mdg3 31 2 56.00 ATGAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:2 - chr3R 25360939 5' + jockey 23 1 63.37 TCTACCAGATCCCTTGGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chrX 2090320 5' - roo 407 1 74.74 AATTCTAATTAAAACTCCGTCAAAGATACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr2L 6605613 5' - blood 331 2 71.29 CATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3L 22324084 5' + hobo 39 1 62.11 AACGCAAGACGAACGAGCCGAGGAAAAGCTAAAATGTAATAACTCTTCTTGGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2L 12991390 5' + hobo 14 1 61.11 CCTTCTCTTACACGGCATTTTGCAGGTTTCACAATCACAGAACTTGTGCAAGGAAAGCGTGCTATGATATTTTTCCATAAGTTCTGTGATT:1 - chr2L 14924731 5' - F-element 4426 1 50.55 TACTTCCCTGATATTAAGATATAGGGCACACACATGGCATATGCCCAAAAGACATTGGCACATTAAAAAAGAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAAACAAAAAA:1 - chrX 19379431 5' + gypsy7 5013 6 57.43 ATTCTACCGCCGTCTCGCACTCTTTATCGCCCTCTCTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAAAGGCAGGAGTTGG:1 + chr3R 24771241 5' - invader2 211 2 64.65 CAGCACTTGGCACTGGCGACTGCAATGCCAAAGGTTAATGCACCATTCGACTGTCTCCTCTTGGCCGCCTTGCATCGTGGCTGTTGCTAGGCCACTCCCC:1 - chr2L 1305243 5' - gypsy8 36 2 68.00 CATTTATCTCAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 + chr3R 9833026 5' + Tabor 6855 2 61.39 AACCAATTATACTATTTTACAAAATAATACAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATA:1 + chr2R 15002373 5' - 3S18 294 2 69.31 AAAAGGATGATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 63013 5' + roo 8707 2 70.30 GAGAAAGAGAGCGGAAAATGGGAATTTATTGAACTACAAAATTGCACTAAAACACCACTAAAAAAAAGAGGCATTGGCTTTTGTGATTGTTCTGAGCATTT:1 - chrX 6718383 5' - Porto1 4342 1 63.37 GATCAGCGTGATCATCTGCGGTTATGTAACGCACCGCATGGGCGTCTGCATTTGGGCGGGACAGACAGCCGAAAT:1 - chrX 16827763 5' - diver2 4723 2 80.00 GCTTANCGCATAATAGGGGCGGATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 + chr3L 12246128 5' + HMS-Beagle 6845 2 75.25 CCTATAAATATGCAGCACTTGGCTGTGATTATTGCGCGGACTCCTGCTTTTCTCTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGA:1 - chrX 850152 5' + Doc 412 1 64.36 TGTGTAATTGCTATTTTTCCAGTGATTTGTTACTGTTAGTTGGCTTTGGATGCGGTTTGCTTGGTTGGTTGGCCATTGTAAATTACCGGGAAAATTTAGCT:1 + chr3R 13631434 5' + aurora-element 4160 1 70.30 GCAATGCTGGACGTGCGCATCCAGAAGTCATTCAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAGCCTGATAACAATT:1 + chrX 9051582 5' - hopper 257 1 71.01 CACCGAGATCCTGATGCGGAACGCCCAATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGGTCTGTTTAGAGCGTTAGCCCGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAACCTGTCA:1 - chr2L 4456130 5' - X-element 4421 1 73.00 CCTTTCTGTGGTCATTATTTGACATCTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACG:1 + chr2R 21565212 5' - accord 347 2 81.19 CCCGAAAAAGACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGT:1 - chr2R 22774525 5' + BS 8 1 66.34 CTAGCCAGTCACCGGTCACATGGAGCTACAACTTCGCCCGTGCCTATGCCAACCTTCCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAAT:1 + chr2L 7428061 5' + Doc 4422 1 62.38 CCTGCGCTGTAGGTTCGACTGCATGTGTATATATGTATATAGTCACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATAC:1 - chrX 4740576 5' + 17.6 40 2 69.31 CAGATCAAATATTTTTGCTAGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCAC:1 - chr3R 19445907 5' - Ivk 53 1 80.20 CGTTGAACTGACAGCACTGTTACTCTCGCAGAGTCGTCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCA:1 - chrX 3773419 5' - Tabor 6961 2 63.37 AAGTCNAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9955470 5' - accord 7036 2 50.00 CCAGACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGT:1 - chr2L 22227344 5' + F-element 55 1 71.00 CGTTGACACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGGGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGT:1 - chr2R 4878998 5' + G-element 44 1 73.56 CTAGTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3L 22564797 5' + blood 2 2 73.12 TATATGTTCAGGTTGGAGAAATGAATTCATTGTCAAGCTAGTAACTCCCATTGGTTATCGAGTATGATCTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTG:1 - chr2R 15208217 5' + mdg1 7282 2 57.43 TTGATGCGACTGTTGCTCCTGTTTTGGGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGA:1 - chr2R 15078440 5' - invader4 338 1 78.22 AAGCATTAAACGCTAAATCAGATAATGTTAGACAATTGAGCAGCGACGTCGCTGACATTAAAACAAAAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGG:1 - chrX 7459442 5' - accord 7377 2 68.32 TATAAACTCACAGTTCTTATGACAGAAGTATGGTAACAGATTTGTACATATTTCACATAATAGCATTCCATATATTCTATTGCTTTTTTTTAATAGTTCCG:1 - chr3R 14062102 5' - Porto1 4424 1 86.14 ACTACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTT:1 - chr3R 2533957 5' - gypsy8 4817 2 57.43 AGATGGTCTCTTCTGTGGATGGATGATCATGGCCCGAGCTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAAGGATTGTGTCTT:1 - chr3L 4271008 5' + R1A1-element 244 1 61.39 ATCCAACACCCAATCTCAGCAAGATTCCACGCTCTCCATTGGCGCAGCGTCGTCGCCGAAGCATCGATAATAGTACGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGAT:1 + chrX 6649494 5' - invader4 271 2 78.22 TCACCAGCATTTCATCGCCGGCAAATCCTGCCGTCAGGATATCAACAAAGTCGTTAATCTTGCCGGCATCGTGACTATAGCTGAAGTGACCAACTGGAATA:1 + chrX 13621127 5' - Chouto 222 1 71.29 AGAAACAAAAAAAGAAATGACTAACAAATGGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCAGCACATATTATATGTGC:1 - chrX 11726374 5' + baggins 5231 1 72.28 TTCATGGGGAGATGAGCAGCAATCACTATGATGAAGACAAATGGAGTCCGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAA:1 + chr3R 15308123 5' + invader4 2972 2 54.46 TCTGTGTGTACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3R 27619276 5' + hobo 26 1 53.47 GGGGAAATTTAGTGAAAGAGTCTGTGGCAAATGTGCGATAAATATGTGTGCTGAATACTTGTTAAACAAAGTAGTGCGCAAAGTTAAAAAAAAAACAAACA:1 + chrX 10572382 5' + TAHRE 10441 1 58.42 AAGGAATTCCCTTGAAAATTAAGAAACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGG:1 + chrX 5106680 5' + roo 208 2 75.25 CAAACTCTGGGACTGAGTGTATTTAAATCTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTA:1 - chrX 11007992 5' - roo 83 2 71.29 CCACAAAACAGGCCCAACATTTGACTTTGATTTTGGTTCTGGCCCCACAGAGTACGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTG:1 - chr2L 19321460 5' + baggins 5003 1 56.44 TTTCCACAATCAACGCAATGCCATAAATACTTCCAGTATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGGTTCAGGTTCCTAATAGATTTTGAGATTGAGGCCCTCCAAC:1 - chr2L 14577062 5' - Transib5 2866 1 77.23 AACCAGCCAACCAACTTACCACCTAGCCACCCCATTTGAAGGGCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCT:1 - chr3R 12580430 5' - blood 269 2 57.43 GCCATGATTTTATTACGTAGAATTGTTAAGGCGATAAAATATTGTTCACTTTCAGTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3L 25598146 5' - 1360 3370 1 55.79 ACCGGNATGCTCAGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACACACTCTGCTTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGAA:1 - chr3R 2988382 5' - Circe 7378 1 63.37 GAGCAAACCAGAAAATGCCAAATGGTGAGTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACG:1 + chrX 19116369 5' - rover 309 2 71.29 TTACCTTGTGCAGTTGCACAAGTTTTATGACTTCGACGGAAGCGCAGAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTT:1 - chr3L 3495539 5' + hobo 2551 1 53.47 TGGAAGTGGAACTGATTGGTTAGTGCGGATGCGAACGCGAAATTGTATGATGAATCTCGACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 - chr3R 25312442 5' - INE-1 137 1 77.23 GCAACCCCTATCAAGAGATTCGGCCTGGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCC:1 + chr3L 22952826 5' + F-element 379 1 72.16 TAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACA:1 - chr2R 3120302 5' + accord 245 2 72.28 CCGCAAAGTATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2L 7654053 5' + jockey 20 1 67.33 CTAACTTGTCGTAAAAAACAAGCGAGATATATATGTGTGTATCAGACAACTGTATGTGTGCACATGTATGCTCGTGCATTGTAAATTTGACTAAATATGTC:1 + chrX 2803003 5' + 1360 204 1 58.42 AAACCGTCAACAACAAGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACATAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chrX 6493501 5' + blood 7060 2 70.30 AATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1 - chr3L 27415301 5' + transib2 30 1 54.46 AGTGTCGAAACTATTGCCGAGAGTGGACCTTCTTTTACTCGAGATAAGAACGGGGATTGGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTC:1 - chrX 766293 5' - gypsy4 6642 2 65.98 GTGGCATGGGGCACTGGCACATTTGAACTTTAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGAT:1 + chr2L 14663044 5' + Bica 4539 1 75.00 CCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTC:1 - chr2R 4879010 5' + G-element 42 1 65.98 TGCTTGCAGCGACAAAAAAATAGCAACAATTTATAAAAAAAATCTGCTTGCTCAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1 + chr3R 23346524 5' + P-element 22 1 55.45 GGATTAGGATGTGCTGTAGATCCGACAGCACAGTCATGAACTCTGAACCCCATCGAATTTCGATACCAACAATATTTAAAACCAAAAATAAAAAAAAATAA:1 + chrX 2487230 5' - Tc1 1398 2 68.32 CCAACNTCCGTTCACATATTGGTGCCGGTTGACTTTACCATGTGGCACAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 - chr3L 13326753 5' - transib2 2799 1 56.12 TTCGTACAAGTAATTACTTTAAAAGCAAAACACAAACGATATATATTGTTAGAACCAAAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAGA:1 - chr3R 13667258 5' - BS 4951 1 66.34 GACTGGGTGTGGAACCTTTTCGGTATTGAACCTATTGAGGCGTTACTATTTCGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCC:1 - chr3L 5827981 5' - blood 378 1 79.21 AGCCCCCAAATTGAAGTTGAGCGTCGAACGTGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCA:1 - chr2L 796718 5' + jockey 290 1 69.31 TTGGATAACCTAAGTGGTTCTCCTTTTTCCTTGGCGTTAACTCAATTCAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr2R 21105169 5' + FB 26 1 56.12 TGAGANCCAAACAATAAGTGTCTCACCGTTTTTCACATGTGATAGCGATCGCGCGCGGTTGCTGGTGTCATCTTGTAGTCCTAGTGCTAGGACATTATCAT:1 + chr3L 1067637 5' - G3 4401 1 57.43 AATTACAATAATTGCCATATTTAAGAAAAGCTACGTCCTTGGCTTACATTTTGCATGGCGCTTTTCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATGTATGTAGT:1 - chrX 17620649 5' + baggins 5282 1 54.46 ATCAGTTAGCTAGACAATTAAATTGACACATTTTGTACACTTTCTTGTCTGGTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACA:1 - chr3L 6519706 5' + Circe 92 1 66.34 TTAATNTCGATTTGCGGGGCGTTGTGGGCGTGGCAAGGCGAAAGTCTCAGGGTGACTGGCGCATCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAA:1 + chr3R 9861542 5' - gypsy 25 2 63.37 CTGATTTCTATGGGGTCATAGCTGTCCTGACAAACAATTTCCTGCAAGCTCGTTAAATAACCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTT:1 + chr2R 5616537 5' - 3S18 6089 2 63.37 GTGTANGCAGCGCCCATAGGTGGGCTATAAAAATTTGTTTAACACGCACACGTACAACTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTT:1 + chr2L 18214012 5' + 1360 296 1 62.38 CGCTCTAAACTATCACTCTCCTTCCACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACA:1 - chrX 7591662 5' + Tirant 108 2 76.24 TAATGAGAAGTCATAAAGTCGGCACGATAGCTAAAAATACAAATATGCAGCAATCTAATGAGTGCTTGAAAATGTTACAAAATTAAAAAAAAAAATAAAG:1 - chr2L 13097768 5' + Doc 4698 1 68.00 GTGTGTAGAAGAATGTGAATTTGTCATGCGGTGGGCAGGAAGGAGGAACGGGACTGTGCCGCCAAGAAGGATCCGGATGTGTCTTCCCTGGGGGAGTGGCG:1 - chrX 4769091 5' - transib4 2356 1 71.29 AGCGATGTGAGCATGCCGGCAAGAATTCGGTTTTTAGCACGGAAAAAGGACTATATTTCGCGTTCGCATTTCCACTAGATAAGTAACAGGTATCTGATAGT:1 + chrX 21567190 5' + INE-1 548 1 55.45 GTGGGTTCTTTTTAAGGATTTAGGAAAAAATCAACGCGTGCGAACGCGTCGAATGCTCTACAGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGTCTCCCG:1 - chrX 12632878 5' + TART-A 13235 1 68.32 CAATCCAAGCACGTGCACACTAAACCCCAACCCGTATCCAACCCCCCCCAGAGTTAAATTTGTAAGGCCACACAGCACGATTCATTTCATAAAATGATATT:1 - chr2R 9021177 5' + Doc3-element 4631 1 58.42 AGGACGTTTGAAGAGAGAGAACAGGAAAGCTGATTATTTATTTGTGTTTTCATGTCGAATTTCACCGAAATTAAGCGAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr3R 16707320 5' - blood 7180 4 59.41 CCACGGAGCAGCAAACAATCGATGCTATGATGGCCACGCACACAACGTCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTG:1 - chr3R 27980712 5' - R1A1-element 366 1 53.47 TTATGGTCACTAGAAGACTTTGTGATCAATAAGCTTGCATCAGGAGCACCCACCGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAA:1 - chr2L 13764589 5' + accord2 7457 2 68.32 TAAGCTGGTTGGCAGAACCACCAACCAGTTACCAGTTACCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAAAAGGTTTCCTG:1 - chr2R 10235915 5' - F-element 334 1 60.40 TCTCTCTGCTCCTCGGGATCGCGCATCCTGCAGATCCTGTGGGCTCAATGGCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGA:1 - chr3R 6059936 5' - Juan 164 1 53.47 CATGGGAATGGCGGTAAGAGAGAGAGATGGGTTCAGCTAACCCGCATATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTT:1 - chr2L 23318361 5' - Stalker 268 4 65.38 ATCCGCCCTGCATGTTTGTGCGCTTTTTGTGCGACCAAAATTGCCCTCTGTCCGCTCGCTTACTATGAGAGCGTAAGAAATCTAGAAATAGAATTTGCTTG:1 + chr3L 3247338 5' - 1360 3267 1 73.27 GAGAAATTCTAATTAAAACTCCGTCAAAGATACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 6605617 5' - blood 7347 2 67.33 TGATGAGGATTTTTGACACTTGTTTTGGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTC:1 + chr3L 21637353 5' - Bari1 1659 1 73.27 ATTCTCAGTGCAATTATAATAGTGTAGTGACCTATTAGATACCTATACTCAAGTACCCCTGCGTATTTGGAATTTGCATGGCTAGATCGACTCGGCTAGTG:1 + chr3L 21567769 5' - INE-1 101 1 76.24 GCTACAATGGTTTCTTTTCCTTTGGATTTTTTACATCCAGAAACTATCCACCCGAAATCAGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGT:1 - chr3R 19444862 5' - I-element 4927 1 63.37 GCGTCGGAGAGACAGACTTTCAATGTTGTTTGCTCGGCTTTGTCTGCTGTCTGTGTGCGTCTGGCTGTTACTTGTGTGTTTTCTTTTTTTTTTTAAATTTT:1 - chrX 4422215 5' - TART-C 11096 1 78.22 TTTAGTAAATTCGATGACTGTCCCAACGTTGAGTATCATTTCAACAAAACGTGTCCTTTTCATTTGGTGTTCGGGCCGGAGTTATTTAATTAATTAACACA:1 - chr2L 20046228 5' - Stalker2 7194 1 54.46 AAACGCAGGCCAAGTGGGCGCCACATTGTGAGGGTTGGTGGGGTGTGTGGTGGGTAAAAGATTTTCGGACCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTT:1 - chr2L 2911248 5' - 1360 3164 1 59.41 TAAGCACACACACATTCACACTCGAGGAGGTAGGGAAATCTTCGAAAGATTCTTGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTC:1 + chrX 20890247 5' - R2-element 3504 1 69.31 AAAGTTCCCGAGACTCCAATCATTTTCGAATTTAATTCTTTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTG:1 + chr3R 10735830 5' + invader4 2697 1 61.39 AACAAACAGGAGATAATGCTTTTCTATGCTATGTTGTCTTAAACATGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr2R 4901626 5' - Transpac 5222 2 73.27 CGGCTTTAACCCTTTCATCCATTACGGTGAACGGTCCCCAAGGATGGGAAAAAAGAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr3L 776062 5' - Tc3 313 1 79.21 GTGTTGCAATCGACAACAAACTGGAAGAGCAACAAATGCTGCCTCGACTGGACAACCACCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCCTGGACAACAGTGAAACC:1 + chr2L 1272240 5' + G-element 4137 1 56.44 TCGACAGGTTTTGGAAAAGGTGTGCGATATGGTAGTGATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGAC:1 + chr3L 5809050 5' - Tirant 151 2 63.37 ATTTGGTTTCCGAAATTAGATAAAAAATATTGGTCACTCTCCCCTTAGCGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 + chrX 22689316 5' + HMS-Beagle 6822 2 51.49 GAACTGGTCCGTTGTTACGATAAGAGGATACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:2 - chr2L 1353785 5' + I-element 26 1 53.47 AAGCTACATCGTAAGTTGAGCAGTTCCCCTAGCAATAAATCAAATTGTGGCGCATACAAATACCATTCCTCGCGGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGT:1 - chr3R 25547284 5' - Doc3-element 4515 1 73.27 GCACTTTTTGATTTATGGAGAGCCAAGCGGGACTAGGTTAGACACAGTGGGCAAAAAAAAGTGGAGGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAA:1 + chrX 7773011 5' - Doc2-element 458 1 67.33 ATTTANGCACCCTCACGCCCAGCCTAAAGTCGCCATTGCCGCCGGTTTCGGTGTTTGGGCCAAAGCTCTTTGGTGTGTTGGTCACCGCAGAGTACGGGGCT:1 + chr3R 5424896 5' + baggins 4963 1 71.29 TGAGTTTTATATTTATGACAACGAAGCACGCGACTCGAATTTTATTACACCCAGGCGTGCTGCGTTTTGTTTTAACGGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTG:1 - chr3R 6421420 5' - roo 171 2 79.21 TGGAAAATATATAATTTCGTTTATTTGCCAATCTCATTTTTATGGTATGATCCAAGTTTATCATCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCT:1 - chr3R 8379592 5' + accord2 7248 1 68.32 GTATCAAGCTTAAGAGGTCTGTTTATCCACGTTTTCTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTC:1 + chr2R 24202071 5' - F-element 491 1 71.29 CAACAAATATTTAACAGTTAACAAGCGACTGCCGTCGCTGCTGGAGAAGAATGCCATGCGCGTTTATCTGGAGTTAGCGATTGTGGCCCTGCGCATGTTAA:1 + chr3R 5528447 5' - gypsy4 3 2 71.29 TGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGTTGTTGTCACAGTACGAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGG:1 + chr2R 16395904 5' - Doc2-element 489 1 72.28 GGCAAGACGGGCAGGAAAAACGCCGCAGGAGCAGCGAGATCGCCGGACGAGTTATCTATAAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 22407451 5' - roo 391 2 59.41 TGGCCAAATTAGCGGCCAACTAGCATGGCCATTTGGGACGCAGTCAGGAAACAAAGAAACCACAAATTGATAAATTAAACAAGAAATTCAAT:1 - chr3R 23457587 5' - S-element 1580 2 73.91 AACTCATGATTTTGCGTGCTTCGCATGGCAATGGCCTATATTGAGTTACTTATACGCAATACTTTACTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTG:1 - chr3L 22710842 5' - G2 153 1 75.25 ATTAGTCATGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAGTTGTGCAGGATGCATGGGCAAAAATTCGCCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCG:1 + chr2L 21383448 5' + HB 1280 1 72.00 GTATGGAGTATAGTCACACTTAGCGGTTGGGGCCGGGATTTGCATTTGCTCATTAGCTACCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCG:1 - chr3R 31520318 5' + BS 4955 1 67.74 TGCTTCTTAATTTTGTTTGTCTTGTGTATTGTGCGTGACTGTCTCGTCTCCGGTTTTTCATATATACACTAGTGGGCATAAGTACTTAGACACCATTAGCT:1 - chrX 702589 5' + Tc1-2 14 1 55.45 AATCATTAGTTTTGAAAGGCGAACATAAATTTGAGAAGGACTATATATTTTCGACTATATAAAGTATATATCTTCTTGAACAGGATCAATAGCCGAGTCCA:1 + chr2R 4014844 5' + INE-1 94 1 67.33 GACATATTTGCGAATATTTTTCATTTAAGGCCCCCTTTGCCAATTATGATAATTAAAATCTAACATTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTG:1 + chr2L 18110296 5' + transib2 2823 1 75.25 GAAAGGCCAGAGGGAGGTGCACTATTCATCGGATATAGATATAGTCAAAAATAGAATAGGCAAATGTAGATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAC:1 - chr3L 18321324 5' - HeT-A 6052 2 62.38 GCTGGAGCATGTGGCACCTTGAGATGGAGGAATCGAGGCTGACTTTGAGAGGCTTACTTTTTTTTCAAAAGTCGTGAGAATTATTTAAGAAAATAAATAAT:1 + chr3L 22167034 5' + Doc 147 1 48.51 ATTTCAAATGCGTTTCGCTCCGATTGATAACCAGTCAAGTGGCAGACGGAATTAATGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAG:1 - chrX 2253915 5' - Tirant 8489 2 62.38 TTTTCATGTGTGCATGTGCGGGGGACCTTTGTCTTCGTGTGCTGAAAATTATGTATATTTTTAGCACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGA:1 - chr3R 31368701 5' + accord2 180 1 71.29 CACCCCGGAAAATCAAATCAAGCCCGGGCAGAAGACAAAGCGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCCATTTCTGAATCGGAT:1 - chr3L 19217903 5' + Bica 4539 1 57.43 GTGATTGATTGCGCTTCCGTGCTTATTGCTGGGTTGGGAATTATCATTAATTTCGGAATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGC:1 + chr2R 8426947 5' - Doc2-element 4475 1 56.44 TGTTTGCGTATCTGTATCTTGAAGATATTAAAATTGGCAGGGAATCGTGCGGTTTTAACAGCTAGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTG:1 - chr3L 3155043 5' + Cr1a 395 1 56.44 ACGAATGAATTTTTAGCTAAAATACATCCATATGCAGTATGGGTCGACAGCAGTTGGCGGAAGTAAATATAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGA:1 - chr3L 2965487 5' - flea 389 1 76.24 ATCGTGCCCACAATGGCCAGGCATTCACTATTCAATAGTTGTTCTTGGTTTGTTTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCG:1 - chr3L 4198324 5' + X-element 457 1 54.46 GATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr3R 19535697 5' - hobo 2902 1 59.41 AAAATGTAGTAATTATAAATTGATTGGCGTAAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAATTTATTATAGTCAGAGCATAAAACTCTGTAAGGGTCAA:1 - chr3L 20768294 5' - Cr1a 4179 1 77.23 ACAACAACCAACTAAATTTTTAAAAATTTAATCTCAACGACTGCGCACACAACAACAAACAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACACTTAAAATACAACCAAT:1 - chrX 5073662 5' + FB 434 1 66.34 TTGCAATAGTTAAGATTAACGTAAATCAATCATTGTTTTCCTCTTGTGCTCTATTTTATCATTTACCTAAACAAACGTTTGTGGGCGATAGAGTGGGCATG:1 - chr2R 4612369 5' - INE-1 215 1 81.19 CAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr3R 14832416 5' + blood 7058 2 69.31 CTGAGGACAGAAGAAGAGCGGCTGCGATATACATCACATAGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATC:1 + chr2R 5079063 5' - I-element 93 1 60.40 TATCCAAACTTAAAGAAAACAGCCCTTATGTGCAGCGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCA:1 + chrX 19330544 5' - INE-1 563 1 50.50 AAATTGTGAGCGGTGAAGCTGCGAGGATGCGTAGATGGCCGTCTGCCCACATTAACCGCCATTTACGCGTCCCCACCACAGATACTCACACACACACACAC:1 + chr3L 22486905 5' + Quasimodo 31 2 66.34 TGTGGTTGTTATGTATATTACGTATTATCATGGCAAATGTTGCCTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCT:1 - chr2R 6846820 5' - 297 27 2 58.16 GAAAGGACCTCTCAATATTTCTATCCCAACACTTAGCCGAGTTTCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGT:1 + chrX 12389310 5' + HMS-Beagle 6677 1 62.38 CCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:1 - chr2L 3245008 5' + rover 27 2 61.39 CAAACCCGAAAAAGACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 - chr2R 22774529 5' + BS 4 1 70.30 AAAACGGTGTTAAGTTGCGGCTGACGGAGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGGTGACGGCCAGGTGATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGC:1 - chr3R 6502789 5' - G2 2836 1 68.32 ACCGTTTGTGGCATCTTTTGTTGGCCGAAAAGCTTGGGCTTTTAATGATTCTTCGCGGTGCCTCTTTCTTTTGTCGAACAGTGTAGTATGTGCATATATCG:1 + chr2R 11730833 5' + blood 7010 1 80.20 AGGAACTGTTCGGCACGAATGTGGTGGCCACCGCCAGCTGCCTGCGGGAGGCACTGAAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAA:1 + chr3R 22352770 5' - 412 474 2 57.43 CTGCAGCACCAATCTCCGCTGGAGTTGGAGTAGTAGGGGGAGGAGGTACCAGTGGAGGAGATCTACAGCGGAGCTGATGGAGTTGTCAGAAGCGCTAA:1 + chrX 20394950 5' + aurora-element 3922 1 50.00 GCAGAGGAGGAGAATTTAAAAATGTGCCACACAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGA:1 + chr4 914146 5' + invader4 2996 2 69.31 AACCAGGTGGACCTGGTAATGGTAACTTGCAGCACAGATTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCG:1 - chrX 656266 5' + 1360 115 1 60.40 TTTATGCCAAGACGGATCATTTATATGGGGTATGCTCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATA:1 - chrX 7670789 5' - R2-element 3267 1 64.36 AAAATAATTGGTAGAATTTAATAAACGATTGATATCGGCTATGATGGTTAGCAATTGTGGATCATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTAC:1 - chrX 10001068 5' - Tirant 468 1 63.37 GTGTTGGTTGGAAGCTATAATCTCCTTTCTTTTCCATTATTATGTTATTATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 - chr3L 16529086 5' - copia 230 1 52.48 ATACTCAATTAAGTGTTTACTTAAACTGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTA:1 + chr3R 31643849 5' + flea 4749 1 71.88 ACCGATGAAGACTGAAACAGAAACATGGCCCAAAGCCAAGACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATA:1 + chr3L 13899016 5' + I-element 5010 1 60.40 AATAATTAATTTAGGCGGGCAATTGAGCGATGGCCGCTGAAACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATT:1 + chr2L 9510425 5' + I-element 236 1 59.41 CTCGTCATGTGCCGACATGTGCTCACTCCCCAAGTTCAATTTTTTTTTTTGCATTCGTATTTTTTGGTGTTACCACCGAAGTAGGCAGCTCTCCGTCAAGG:1 - chr3R 22207278 5' - baggins 478 1 60.40 GAGTCACAAAAAGTTAGCACACATTTTCCGTCCAAGAAGAAGCCAGCACTTTAGCAACTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCA:1 - chr2R 17655891 5' - X-element 4656 1 71.11 AAACATATCAAAGTGCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCAA:1 - chrX 8846507 5' + gypsy7 5009 2 71.43 TGAGACCGTTCGGCGGTAGAAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAAC:1 + chr2R 1276195 5' + R1A1-element 5276 1 80.20 TAATTCGATGTAACTCTTATGCTAAACACTTGCGTTTGATTTGTGGCCGTGCGGACGTGCTGCATTTTATGAAATTGCTTGTTGTTATTATTATTGTTATT:1 + chr3R 19364643 5' - mdg1 7057 2 63.37 ATAAAATGAGATACATGTTGCTTTAAATCACCAAACTTAGCTAATGTAATTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr2R 8157261 5' - Transpac 5206 2 57.43 AGCATTTTATGCGCTCCGCACTTGACGTCGCTGCCTGTTGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCA:1 + chr2L 3431054 5' - Stalker2 75 2 61.39 TAATAACAGCGCCTGTTAGCAGCGTCGCTGCACCACTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:2 + chr2R 12705114 5' + P-element 14 1 35.64 TGCCTCTTCCTCGCCCACAATTGTAATCTGTGACGCAGCTGCGAACAACCCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAAGACTTG:1 - chr2R 23292716 5' - Cr1a 183 1 63.37 CATGCATTTATGATATCACAAGATATAATTAAAATAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCA:1 + chr3R 5775645 5' + invader4 6 2 73.27 GAGCACCAAATTTGTATTTGCATTTGTCGCACAATCAAATCTCAACAATAAAAACCAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCC:1 - chr3L 11677205 5' + HMS-Beagle 6614 1 58.42 ATAAAATATTTTAATTTTAAAGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCC:1 + chr3R 16719614 5' + jockey 4656 1 79.00 TATGCCGCTCTTTGATAACATGATCAAAAACGTCGACAAACTAGTGGGTTGAACTTTGATTTTGATATTGATCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chr2R 24661675 5' + FB 6 1 72.28 CGATTCTTTGTTCAAGCCATCGAACCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAG:1 - chr3R 21572874 5' + I-element 251 1 76.24 CAGAAGCCGAGGCAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAGTAAACCAGAAGAAATTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTATTTAAAAAAGACGACCTAAACT:1 - chr3R 13700127 5' + TAHRE 357 1 47.52 ATTATNGAAAAGGAGTAGTTGTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATT:1 - chr2R 19195957 5' - TAHRE 10376 1 76.24 TTTTTAAACGTTTTAATTTGTTAATACACAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:2 - chr2R 4784797 5' - 1360 3346 1 72.28 TTAATGTTAATGTTAATGTTAAAGTAGTTAGTATTTTTTCTAGTCTTAGCTTTTAGACAGTAACGTGGACTGGTAACATTAACATATTGCAAAGTTTGTTT:1 - chr2L 22243307 5' - HeT-A 5836 1 70.30 AAAGTTTGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2L 7654049 5' + jockey 24 1 54.46 CAGAGTACGAGAAGGATCTGGCTTTGCGTCAACACAACTACAAGGTGGCCATGCAGTCACATATAATATGTGGAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAG:1 - chrX 16629508 5' - baggins 5208 1 55.45 TCAGTNGTGAATAGCTCCAAGTGGGCCTGGCACGCGCTACTCTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGG:1 - chr3L 7759851 5' - Doc 4549 1 58.00 TCCCTTTCGTTTCGTGGGTTGATTGATGTGGTGTGCGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTATATTAAAAAA:1 - chr2L 18403467 5' - Circe 85 1 64.36 GGTGCAAAAATTGCGTTGCGTATACGCAGCGTTGCAATCGGAATTTGATTTTCGAAGCAGCACTCCGCCCAGTCGGCAGCGCCCCTCGGTTGGTTGGGCCG:1 - chr3R 28558784 5' + Cr1a 4416 1 80.20 AAATTTAAAAAAAAAATTAAAAACTTTCCTCAAAAATGTAGGTGTGACAGTTTTGGGCATTTCTTCTAGACAATGCTAGATCGACTGAGCTATTGATCCTG:1 - chrX 12671462 5' - INE-1 95 1 36.63 CTAGTGTTTCGTTCGTGTGCGTGTGCCCGTGTGTGTCTACACCATGATGAAATAACAAAGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAG:1 + chr3L 5691242 5' + P-element 194 1 42.00 ATTTATACAACAATTTCAACAACAGCTTGTAGATTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGAGT:1 - chr2L 16564330 5' + Doc3-element 4584 1 67.33 ATAATTGTTCATCCCTTTTTTTTATTGTATTGCTTCAATTCCAATGTTTCTTGTTAAATAATTCAAATTATCAAATGTAAACATAACATACAATGTGATAA:1 + chr3L 7498773 5' + TAHRE 10202 1 64.36 AGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr2L 20840492 5' + Transpac 37 2 61.39 TCTGGCAGATAATGGAGATAACAGGGTATTGCATGAGATAAGGGGTATATAGTTTTTAGTAAATCTACTTGAAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAACCAAGT:1 - chr2R 9951293 5' - Cr1a 4083 1 65.35 TTGGTCAGTCGGTCTTCGTCTTCAATCGAAACAATACCCTTATCATTTCCCCTCTCGCTCGCTCCCCAGCTCCAAAATGGCGGCGCCTCTGCGCGTCC:1 + chrX 8049412 5' - aurora-element 431 1 73.47 GTCGCTATCCAGAGAGTCGTCCTTTGCCTTGCGTCCACCTTTGCCCTTGCCTTTCACTTGTCGCTTGACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAA:1 + chr3L 6736469 5' + micropia 5315 2 74.26 TGATAACTTTTATAGTAGATTTAGGCTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGAGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTGGCTAT:1 + chr2R 16302411 5' + R1A1-element 5176 1 79.21 AAATGTATGTACATGTACATATACATATAGAGGTACATACATACATACATACATATATCCTTTCAATTATTCGATACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 22578453 5' - hobo 2935 1 68.32 ACGTTNCTCGTTTTGCTTTCTGGTATTTTATTGAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTC:1 - chr3L 10596338 5' - mdg1 286 2 76.24 GCGGTGAAGGTCATTGCTACCAAAATTGTGTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCG:1 - chr3L 18079303 5' + Cr1a 270 1 70.30 CCGCTGTTGATCGATATTTTAATTTTATTAAAATCTCGACGTTCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTGATCAAGAATTT:1 + chr2R 25240199 5' - INE-1 84 1 60.40 AAGTGTGGGCCAAGTGCCACTAGAATAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATA:1 - chr3R 19964385 5' - jockey 4854 1 74.26 GCTCATGTTGTTTCTGTTGTTGACCTGGTTCAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 16135939 5' + F-element 4680 1 65.12 CTCCTGGCAATTTCCATGATGTGAGCAGTCAAAAAAAGCAAATTCACTAGAAATTACATTATCTTATCTTGAATCTTTGTAGAACTAACTATGAGTTGCAT:1 + chr4 39721 5' + Cr1a 4159 1 65.35 AACAACAAAATCCGCACCACACACCCAAATCAGCAGCACAAAACACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGA:1 - chrX 6024656 5' + I-element 252 1 62.38 TGATTTTGGTAGTCACTCTAACCCAATGCCACGCCCACACTTTTGATAAATGTGTTGATATTTTATAACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 - chr2L 8754188 5' + INE-1 301 1 71.29 GAAGCAGCCAGTCTTCATTAGTGAGTCCATTGAAATTTAGCATGCCCGGGCAGCTCAAGTGGTCAAGCCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACAC:1 + chr3R 22346549 5' + Stalker2 236 2 56.44 TTTGCATCAGGTGTCATAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATATGTATATTTACATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCC:1 + chr3L 16736358 5' - Stalker4 7002 4 80.20 GAAATGCCTTTATAAACATCTGAGGAACCCGTGCGGCACGCCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTC:1 + chr2R 15392328 5' + F-element 298 1 59.41 TTTCTTAAACAAATCTAGTCGATATAAAATAAACAAAACTGGGGGTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAG:1 + chr2R 16775622 5' + X-element 4294 1 63.37 CCACTGTCTTCAAAAGAAGAGTGAAAAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 12958905 5' + roo 48 2 74.26 CACAAAGTATGCTACAAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 947923 5' + hobo 34 1 59.38 GACCACTGTTACACACCTACTCACCACCAGCTATTTATCGTCTATCGCCTTGAATGAAACATCAAAAAAACATACCCCAAACGTACAAGAGACGGCAACCT:1 - chr2R 17539210 5' + I-element 362 1 80.20 AATTGAATGAAGACATTTGCCAGCCAGACGAAAACATTGCCAGCAGCCGCACTCCTCACCCTGCTCACATCCAAATCCGCTTGCAAGAAAACTTATTCGAG:1 + chr3R 22887606 5' + Doc3-element 4537 1 71.29 TGTTCTTTTGCCAACTATTTTTCGCTTTCTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 + chr3R 8480420 5' - transib2 2782 1 68.00 TTTTGCAGCTCTTGAGCGCCGTTCTAGGAATTTGAACATGGGAAAACATGGCGAGGGGGGTAGAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTT:1 + chr3L 12122132 5' - hobo 2624 1 64.36 GAAGATGGCGCCCACACACATGCTTACACACTCTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chrX 11042531 5' + jockey 4718 1 65.00 TCGAGCTCACCTGTGTGATGAAAGACCCTTTGGCATGACAACGAAATAAAATACACAATCAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATGGGGTGAGTT:1 + chr3R 20535232 5' - HeT-A 5941 1 61.39 GTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGGCGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACA:1 - chr2R 17495110 5' + G6 42 1 73.49 GATAATTGTGGCTGACAATGGTGTTTGTTCGTTGCTCGTCGTTTATGTGCATGCAGCGCTGTTCCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 - chr3R 5773734 5' + invader4 31 2 69.31 CCTGGGACCAACTCGGCTGGCCACTGACTTCACTGACCCTTACGACACGCCAGATCCTACTCTCTTGTAGTGATCTTCCTTCCGTGCCCTTCGGGCTTC:1 + chr3L 26023452 5' - gypsy8 495 1 52.53 AGATACTTTTCTATCGCCAGACCAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAA:1 - chr3L 4413952 5' - diver2 4677 2 78.22 TCCCAAGAACGGATCGACAAAGTTTTGGGTGAGCGGAGTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr2R 10697020 5' + 297 6593 2 55.00 GACAATGACATTGTTGTTGAACAATCAAATGAAATGAGTAGGAAAAATTATTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGT:1 - chr2R 5527750 5' + hobo 253 1 57.43 GGCACGAGGCAATTGAAAAAACACAGAAAACATGAAATGAAAACGAAAACGAAGCGAAGAGCGAGCAAATCAAGGCAAAAATTCGAGAAAGCCTGGAGACA:1 + chr2L 10124212 5' - 1360 78 1 78.22 AAAAAAATTTCCTAGCGCTTTGGAGTTCCGTTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAG:1 - chr3L 5499001 5' - Porto1 4211 1 78.22 TATCTTAAAACGCTTTTTCCCTCGCCGTGCTCACAGCTCAAAGGTGTCCTGATTTTAAATCAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTAT:1 - chr2R 20292809 5' - INE-1 565 1 64.36 ACATCATCTTTAATAGCCGGCGCGGTTCGAAGTCCAAGCGACAAGAGCAGGCAGAAAATAAGAAATTTGATTAAAAATATGATCTCTGAAGGTAAAAAATA:1 - chrX 13644816 5' + Tc1 411 1 61.39 TCGACAACAGAGTGGGCGCGACCGTTTTACAAGACTAATCTTTTATTACCCTAGCACTGGCCAACAATTCCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGC:1 - chr3L 26657817 5' - INE-1 534 1 66.34 AGCGCGTTGCATGCCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 19510734 5' + roo 27 2 56.44 TTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 2539277 5' + roo 8716 2 81.19 CCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:2 - chr3L 25232909 5' + GATE 8269 2 51.49 AAAAGNTTGCCATTTTACATTTGCATAACTCAACATCCAAGCAAAGAGAAATGGAAGGAGAGTGGAACCTTAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 + chr3R 15703651 5' - copia 249 1 62.38 ATTCCCCTGGAGAAAAATTGTGGCAAAATGAGCGACAAAAAATCGGCAACGCCGATTGTAGAGCAAAACCCCCGCCAGCAAATCATAAAAAAAAAAGAAA:1 - chr3L 1274921 5' + Rt1b 5147 1 74.00 CCATCGCTGGTTAAACCTATGCGCAATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTT:1 - chr2R 11847555 5' - Bari1 1657 1 75.25 GCAAACGCATCGGCATAAGCAGCTGAACAAATATAAAGGTAAACGTTAAATACATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCC:1 + chr2L 4590363 5' + Idefix 18 2 76.24 ACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACG:1 - chr3R 19446519 5' - gypsy12 10159 2 64.00 AGTTGGAAAGCTGCAAAAAGAAAACAGCATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCC:1 - chrX 22867384 5' + HMS-Beagle 6843 2 74.26 TAATCTGTCCTCATTATCACCAAATACTGAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGG:2 + chr3L 15056289 5' + BS 5004 1 77.23 TAACGGCTGAATGATATTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr2R 12705160 5' + P-element 57 1 20.79 ATATTAGCTAGAAAACATTTCATGATAGTTAATAGCAAGGAACGAGAAGAAGTCATCAAATGTACGGTACCTTAAAAGATTTTTACTTTTATTATTTATTT:1 - chr2L 1750647 5' - BS 5094 1 64.36 CAAATATTCAGTTAATTATAACTATTTAGATTACTGCAGATTACTGAAGCGACAGATGTAAGCTTGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCA:1 + chr3R 28012492 5' - diver 212 1 64.36 TTTAGACATCATCTCCAGCGACCGACGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGC:1 - chr3R 4936272 5' - F-element 267 1 74.26 GATGGTCCAGTTCCAGTTCGTCCTCCTTTGGTGTTTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTA:1 + chr2R 9234784 5' - I-element 4895 1 65.35 GAACTAAACTTAAGAGAACTATGAGATGTTTTTTCGCTTTCGGATTTTTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCG:1 + chr3L 12776428 5' - F-element 63 1 65.56 CTTTTCTATTGAAGACCTTTCAACGGACTCCTAACAAAAGGCCAGACATATGATTTGGATTTTGGGGAATGAAGAAGGGAGTGCGACTTGGCCTCACATTC:1 - chr3R 10182805 5' + Rt1b 4948 1 78.22 AATAAAAATGTTTTAATCATATAACAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3L 18076310 5' + roo 8715 2 77.23 GCTCAAAGAAAATTCAAAAATTAAAAAACCATCCATTGAATTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chrX 9180983 5' + FB 37 1 68.32 CACGCACTTCCATATGCAGGATAGATAGATATACGGTTGGGAAAAGCGGGGAAAAGCGAGAATGAAAAGTGAACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTAT:1 + chr2R 19076145 5' - Circe 15 2 63.37 GAAAGCAGAGTCAATGCACTTCGTTGCAACTATTCAGCCTTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTC:1 + chr3L 17986551 5' + blood 169 2 79.27 AGTGATGAAGTGGAAGAGGTAAAAAAGCGCCCCCCCAAAGCCCAGACCTTAATATCATTGAAAACGTTTGGGCTTTTATTAAAAACCAACGAACTATTGAT:1 + chrX 9023309 5' + Bari1 1230 1 72.28 GGCGACTCCACTGGATCCTTGACTTTGGTTTTTGTTTCGGTTTTGGTTTCGGTATTGATTCCACAATTCGCTGGAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGG:1 + chr2R 22037543 5' - copia 4743 1 79.59 AAAGCTTAACAGCAACTATTGTATATGAGAACTACTACATTCTTTAAGTTTAATGTGTGATAATCAATTTATTTCGGCGTTGATCTTAGTTCAAATACGAA:1 + chrX 22636526 5' + Tom1 354 1 71.29 GACTTCACCCTAAAATTTACCGAGCAATTAGCAGAAGGGATAATTTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGC:1 - chrX 9527898 5' - jockey 4663 1 56.44 AAAATNCGGCAGACTGCAGACAATTTTCGTCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 2689854 5' - roo 9025 2 74.26 GGAAAATTCCGTCAAGCGTAACCAAGAGTTAAAATCAAATAGGCTGACCTCATTAACCGAAGGGTCCTACGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATA:1 + chr3L 21085497 5' + transib2 2601 1 41.58 AAGCTCTCAGTTATCAAAACTTAGTGCCATACAGGAAGTCAGATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:1 + chr3L 16266021 5' + Burdock 6167 2 58.42 GGTTGCCTTGGTTCTGGATCCTTGCGTCCCTGTCTGCTCCGTCTATCGTCCCTATCCAATGTTCAATATTTTGACTACTCCAGGCACCATGATATGGATTT:1 + chrX 12106289 5' - invader2 4670 1 58.42 ATTTATTGTTTAAATGTCTGACAGCATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr2L 14535878 5' + blood 7024 2 41.58 GCGAGAAGGAAAAAAAACTTTGGAAAACTTTCGTTGAAAGACCAGGATAGCGAATCAAAATTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGA:1 + chr2R 14756167 5' + I-element 276 1 61.39 TGCCAATTTATTTATCTATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACCACTTCGTCAACCTAATGACAACAAGTAATAATCATTAATTATTAAATTGACAATTCA:1 + chr2R 7762253 5' - invader4 2628 1 83.17 GAGTGGGTGAAATGTTACCACCATTGGAGCTACCATTGCACATGCTGCCGGCGCCACTGCAATGGTAGCTCCATTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTT:1 + chr2L 17487755 5' - Rt1a 4845 1 59.41 TTCAGTGGGTGTGAAAGGTAACCTTTGACCTTCTTTATCGAAAAGTAGTTCCTCTGTGGGCTCCTCCTTCCACCCTTCAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGG:1 - chr3R 17033398 5' - Rt1b 4880 1 59.41 AGCAACACCAGCTGGGCCTCTCCACCTCGCCGAGGGCGATGTGCTCGATGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGG:1 + chr2R 23520363 5' + F-element 426 1 53.47 AGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGC:1 - chr2R 4879040 5' + G-element 16 1 66.34 TTTAGTGGAAATTGTTTAATTGTGAATGCAGATGCAGTCGCTGGTGTTGGTTTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAG:1 - chr3R 10662262 5' - invader3 112 2 54.46 TGCGCCTAGAAATATGCTATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGAGCAGAGAACTGCAGCCTGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3R 22238747 5' - hobo 2915 1 56.44 AAAGTCCCCGCACTATTAATTAAAAGTCGAAACCAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 - chr2R 16928914 5' - blood 7346 2 67.33 AAAAACAACAATAAACAACCAGGCAACAAAACTCTTTTTTCAAAAAGGCAGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 + chrX 17692555 5' + 3S18 1 2 78.00 TGGATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chrX 2253848 5' + Tirant 52 2 77.23 CTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 + chr2R 25203782 5' - 1360 3345 1 66.34 TTAAGTATCTTCTCTTTAGTCAGGCCTAATCACATTCTAGCCATTGGGTTGTTGCTGTTCTGCTGCCTGTTGTTGGTCTGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 18919843 5' - accord 7031 5 55.45 GCTGGCGCTAACAAGATTATTTTGTATGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 + chrX 16103385 5' + I-element 4919 1 73.00 AACAGTTGCCAAGTAAAAAGGGAGGAAAAAAAGTTTTGCCACACTCACTCCAACGACCTCAAACCGCCCATAACTGCCACGCCCACATTTTTGAAAATTGT:1 - chr2R 17294949 5' + INE-1 255 1 52.48 GCAGATACACTTGTCAACTTCAACCTTAACCGCTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACGAAATCTGGCATTCAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTT:1 - chr3R 8636937 5' + diver 5775 1 67.68 GGTCTTATAAGGGTCTCCATCTCGACAATTTTGTCCTTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1 + chr2R 2903844 5' - 1360 204 1 58.62 CCAGAATGCTAAAACCCGCGAATACCCGCGATGTGACCCATTTTCACAAGCCACCCCTGAACAAGCCAATAGGGCGGAACGGGGTACCTGACAGCGTCTTT:1 - chr3L 6293953 5' - Rt1b 4676 1 67.33 AATTTTTTAATTTTCCTTTTTTTTTTGGATTTTATGACAAAGGATATTGGATATTTCTCCCTCGCTCTTCCGCAGCCATGAGCTGTTGTCGTGTTTTGGG:1 - chr4 219063 5' - S-element 1295 1 71.00 AACTCCATTGACAAAAAACGGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACT:1 + chrX 17049529 5' + Stalker2 6 2 70.97 ACCTAGCGAAGTAACTAGGCACTAGACGTGGGGTTGCCAGATCTGAGCTGAAGTGGCGACTGAAGTTGTAGAACAATACAGCTCTCGATAGACAAACTTTA:1 + chr3R 11613288 5' + Gypsy12A_LTR 32 1 55.45 GTAACTCTTGCCAACACTCCACACCAAACCCTCTTTTTACACCTTGCAAAAAAAAATTGAAAAACCCGGGGAGGGAACAGAAAAAATTGCAGTGGAAGCGT:1 - chrX 11525563 5' - S-element 321 1 55.45 ATAAGTTATACTTTTGTTTAAGGATTTTCATAGTGTATTGGTTTAAATTTAAATGCAGAATAAGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGT:1 - chr3R 25637607 5' - gypsy4 6477 1 65.35 GATGGCATTATATCCAAGTGGTTCGGCCGCTGCGGCTATGTTCCTAGAATCTGTATGCCTAATCTTAACCTCTTTAAGCTTTTATAGTTGCTAAGATCTCG:1 - chr3L 9591292 5' - INE-1 147 1 71.29 ATGACCACCAAGGAGTACGAGCGCGGCAAAGAAAAGTGCGCCCGCTACTGGCCAGACGAGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGAGCTGGT:1 + chrX 2110367 5' + R1A1-element 5052 1 63.37 AAAAGGTGGAGTAGGCCGCGACATGGCCTCACTTTTAATTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGG:1 + chrX 20915503 5' + invader1 116 2 69.31 ATCTCNACTTGCAGAGGCCAAAACGGAACTAAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTTATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCT:1 - chrX 15057994 5' + F-element 4214 1 77.23 TTTGAGCAAGTTCATGCTCAACAACGATTTTGTGAAGTGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr3R 26294479 5' - roo 9035 1 61.39 TCTGTCATCCCTGAACAAACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 28623895 5' + roo 31 2 60.40 TATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAAAACTGCCAACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTGACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATC:1 - chr2R 1751256 5' + INE-1 297 1 74.26 TACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 9823645 5' + hobo 45 1 66.34 CAGGGGGTGTGGAACCATGCCATTGGCTGCCAGCACATGGTGGGCGGCACGGTGTCTTCCGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGC:1 - chrX 7309075 5' - Bica 69 1 52.22 GGAAAATGTTGCTATGCGTGGAAAGTTGTTTTTCTTTCTTTTTTTTCACGTTATTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTG:1 - chrX 2678274 5' - Porto1 264 1 53.47 GATTCGACGATCGGTGTGCGTGGCGCTGTTTCTGTTTCGGTTTTTCTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGC:1 - chr2L 16766637 5' - I-element 4885 1 53.54 GATTCCGCCTGGTAACTTGTTGCTATTTCCTTATATGTGCGGTAATTGAACTCACGCGTGTGGGAATAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGT:1 + chr3L 20636386 5' - I-element 298 1 72.28 AAGTATGTGAAAGCATGCCATAAATCGCCCGCCTTGTTGTGGGGGAGTTTTTTGTGTTAGTGTGTGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTA:1 + chr3L 13223684 5' - F-element 4438 1 72.73 ATCCGGGGTTGAGTGGTACGTGGGGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAG:1 - chr3R 22598877 5' + R2-element 85 1 76.24 GGCGTCAAGGATGCTGCGAAAGAGGGAAAGGAATGGGAAGAGTGGGGAAGGGGATGGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTG:1 + chr2R 21592846 5' - BS 4845 1 44.55 TCCCGAATTGTGACAGATTTGGTTAAATTGGCCTAATCAAAATCGGAATTGCAATTCCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr2L 10081028 5' - mdg1 7439 2 56.44 CACTGAAAGGGTATCATTGAGTTAACCTACAGAAAATATCCTTTTTGGGCGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTT:1 + chrX 12870162 5' - I-element 97 1 58.42 ATCAAGTATACAAAAACATGGGCCAGCCAAAGTCGAAGTGCCGCATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chrX 20126454 5' + F-element 48 1 56.44 CCTGGTTTGATTTTTAAGAAGATGGGTCGGTAAATCGATAAAAGCTATATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGC:1 + chrX 358948 5' - FB 217 1 63.37 CGATACATTTTTAAATGCTTTTGGAAAAATAAAATAAAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTAACTATCAGATTCCCGTTACTAAGCTAGTGGGAATGCG:1 - chr3L 22983575 5' - INE-1 533 1 62.38 TGCGCGGTGCTATAATGGGCCTCCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTC:1 - chr3L 5923737 5' - R1A1-element 36 1 77.23 GATGTAAATTTGCGTAATAAAAAGCAATATATAATTAATTGCAAATTACTTCCAAACCGCTTGTTTTTAACACACGAAAATTTGCACACCACTTCCGCGGA:1 - chr3R 16307542 5' - R1A1-element 88 1 68.32 ATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3R 22238696 5' + hobo 40 1 75.58 CGCTCCGTCGGCTGGAAGGAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCA:1 + chr2L 3245554 5' + rover 6995 2 78.22 ATTCGATCTTACCCTAACTGGGCAATAGGTATATTATCAATTTTGAAATTTAAATATCTATTGTTACTATCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 1270757 5' - roo 9063 1 35.64 GCTCGAATTCCAGAAGCAATTTGCATAAGTCACGAGGGGCATTCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGA:1 + chr3R 13928233 5' - jockey 4605 1 57.43 CTGGCTAATATTACGAAAATTGCTTATACCAGGCTTTCTCGAATTTTTGTTCGAAAGCGAGAGAGCGGAGAGAGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCA:1 + chr3L 19041270 5' + 1360 134 1 72.28 ACCTTTATTATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 13280134 5' + jockey 58 1 76.00 ACAGTGCCCAAGGGTTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGT:1 + chr3R 26331624 5' + G-element 14 1 66.34 CTCGAAGAGGTCAAAATCGTTTTTCAGTCCAAAGGGGTATCCTCGATATTGTACGGTTCGAACGATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCAC:1 - chr4 1227230 5' - Quasimodo 7000 2 73.27 TAATCGGCTACCTTCGGCCTACAGTATTAAATATTATATGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATT:1 + chr3L 9067048 5' - jockey 4718 1 61.00 ACTCGCTTCCAGGAAAACACCCGCCGCCGGCTGTTCCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATG:1 - chr3L 16031008 5' - R1A1-element 4973 1 63.92 AACAANAACAGCAAATAGTTAAGTTTGATGAAAAACATTTTGAATTTTTTTTAAAAAACAAAAAAAA:1 + chrX 12391892 5' + transib2 2634 1 58.21 GGGAGGGATGGCTAGAAAAATATCTGCCACGACCCAAGCAAACAAACATTGTGGAACGATGATGAGATGGAAAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGG:1 - chrX 701897 5' + 1731 4219 1 77.23 TCTACTAGCTTAGAGCTAAAAAGCCAGTCCACTTTGGCTCGAAGTGGTTTTTTATGATCTGCATTAGGACAGGCACTTATGTTTGAAAACTCTGAGAAAGC:1 - chr2L 16899236 5' + invader6 4774 2 45.54 CGCCACAGCGGTTCAGACGACAGCCGCCGCCGTAAGTGCGGCACAGGCTCACGCGCATTCGCATTAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 - chrX 272566 5' + INE-1 559 1 62.38 ATACATATACATTTTTTTTTTCTTTCTAAGCAATGTGCTGAATATACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 10366709 5' + 412 29 2 54.00 TGGCAGGAGGGTGTCGGAGGATTTGTGTGGGACAAAGCCAAGTGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGC:1 + chr3R 19714775 5' + blood 94 2 57.43 AAAACTGCTACGACCACACTTTTGTACAAGTGAGCATATACATACATACAGAGGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTTGATAAAAAATTCATATGATTTAC:1 + chr2R 4200577 5' - HB 1580 1 67.33 TATTAATTGCTTAGCATAAAGAATCAAATACTCAAACGAAAACCACAAAAAGTACTACATCTATCAACTTTAAAGTAGGAAGGGCCTTCAAGTCGTTCTGA:1 + chrX 3710724 5' + Fw3 188 1 75.25 TGACAAGCTGGGCGAGCAGTCTGCGAGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCG:1 + chr2L 11170239 5' - Max-element 8242 2 80.20 ACGCGCAATTTGTGGATTGCGCAGAATATTCAGATATATTAAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 - chr3R 5946170 5' + HMS-Beagle 31 2 61.39 TAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 15072559 5' + pogo 16 1 60.40 GACTGCCTGACTGACGGCTTGATGGACCAAACAGGCAATAGTTGTGCCAAAATGGGGGTCCAAACTCTCTCGCTCTCCCACAGAAA:1 - chrX 17467086 5' + Cr1a 306 1 61.63 TATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGA:1 + chr3R 31996555 5' + mdg1 7351 2 66.34 AAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 2832927 5' - 1360 3341 1 76.24 AGGCTACCGCCGTTATGGGCTGATGGTTGACGGTCGATGTGGCCGCAGTGCTAATAACGCTGTTGTTATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAAT:1 - chr2L 5803397 5' - Stalker2 354 2 73.27 TGGCCNAAACAAACAAGCACGCATATTTATAAATATATATTTAAACGTATGCACGGCTGTGTGTATTTGTATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chrX 9950796 5' + hobo 4 1 74.26 ATATTGTTGAAACACTTCTCTGAAGTACAGTAGTATAAATCTACTTACCAAAGGCATCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCTTT:1 - chr3L 13330951 5' - hopper 1237 1 66.34 TTATAATGGTAGTACGTAGCCGGTGGAGTGGGAGATGGACCGTGGCAATGGGCTGCCAAATATGATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr3L 22052749 5' - mdg1 407 2 65.35 CGGCTGACAGTCACCTAAGGAGAACGGTAAAGGATAAAAGATCTTTTAATACGTATTATTTTCACAAAACTTGAAAAGCCTGAAAAGAACCCTAGGTCCTA:1 + chr2L 22676077 5' + BS3 414 1 73.27 CAATTTGGGGGCTCGAAAAACATTTTAGCCCGGAATTTAATTTGATTGCCCGGCTCATGAGCGTGCCAATGAATATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 + chr2L 796727 5' + jockey 8 1 76.24 CTCGAAGAAAAGGCGGCGAACAAGGACATGCCTGACTGCCACTAATTCCCCCCCATTTGCCCATTGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATA:1 + chrX 17392056 5' - blood 7122 2 68.32 GCAAANAACAGCGTTTATTTCGTAGATTTTACTATACAGATTATAAGATTATTGAACTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr3R 17468337 5' + Transpac 16 2 62.38 ACAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTC:1 + chr2R 22525779 5' + jockey 176 1 50.50 TCATTTTAAAGGCAGTTTAACTGGCTAGTTGATATACACATTTCGTTCAAAAACTATTGAAATTTTCCACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGT:1 - chr2L 9474861 5' + hobo 2524 1 79.21 AGGAAAGCAGAGCAAAAATCCTTAATTGCTTTATTCCTTAACCTTTTCAAGGAAAGCTTCCAAAAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGGTGTGAAATGAGA:1 - chr3L 14109732 5' + accord2 56 2 51.49 GGGCCGAAATGCACCAAGGTTATTTCGGCTTCGGTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGA:1 + chr3L 3917382 5' - F-element 4514 1 56.06 GACTGCTCTAGCTCTTTTTTCATCCTCCACAACTTTCCAAATCTGAGCCTTAAACAATATGTGTCGAATAACTCCCCGACGTCTAAGGCTCAGATTTGGAA:1 + chr3R 4296621 5' + HB 1211 1 53.47 GTATATTAGCGATAGCAATAGACACCATAATATTTTTTTTACTTACTTGTACATCATTAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAA:1 - chr3R 6580952 5' + I-element 412 1 59.41 TATCATCATACATCGTTGAATTCGTAATTTTTTGTTGTAATTTATTGATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 + chrX 10660933 5' - HMS-Beagle 7014 2 59.41 TTATTNGTTTTAATGTTTTCTTCTTTCCAGTGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTA:1 + chrX 305305 5' - 17.6 7093 2 69.31 CCACACAGACTGACGGACGTACAGTTGCACAAAAAGTCAAAATCATCCGGCAACCACAAATACACCCGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTTA:1 - chr3R 20287528 5' + 1360 3235 1 71.29 CTTAACGATGCCTCACAGCCTCACACCAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACA:1 - chrX 3646182 5' - R1A1-element 4900 1 56.45 GGACAACTCCGATATTGGCGAATTCAGGGACAGACGGACATGGCATGATCAAGAATATATATAATTTATAGTCGGAAACGCTTCCCTCTGCCTGTTACATA:1 + chr3L 25883605 5' - INE-1 29 1 73.27 TTTTGGAGTTGGAGAAGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chrX 22133471 5' - 1360 3342 1 82.61 TTGTGGAACAGAAATACTAGAAGGACATAATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAAC:1 - chr2L 6300230 5' + opus 7392 2 74.26 ACTAAATGTGTAGTTGGCTGCCTTCGCTTTTCCGCCCTGCTCCTTTTTCCTCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATA:1 + chr3L 11477451 5' + Quasimodo 14 2 63.64 CGAAAAAACAAGCAAAGCTTCGAAACTGGTCCAAAGCACTGGCCAACACTAAAAAAAAAACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTA:1 + chrX 21457472 5' + F-element 4633 1 56.44 TGTTGNTATATTGATTTTACTCAATTTTAAGTAAACGCAGTTGTTCATTTCAGCTCCGTTACGATACTAAATTAATGCATTTTATTTTATTTTTGAACTTA:1 + chr2L 8626255 5' - TAHRE 20 1 80.20 TAGACNAAATTAGCAAAGTTCTAGCAGATGATTGAATGGGCAAGGGGATGACGGCTTGTTTTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGGC:1 - chr3L 17949415 5' - diver 471 1 65.12 CAGTTGCGTTGGATATCGAGAAGAACACGCACTTGGCGAAATACAGCCATCGTCCCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 + chr3L 26852021 5' + diver 23 2 56.44 ATAACTTGAAATAATATGTTTGGGGTACTCCATACGAATTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2L 14252755 5' + jockey 33 1 56.44 GCTCCTGCACTAGATTCCGACCGCAGATATGGCCAGTTGTTGCTGCTGTTGCAGTAGATATCGTGATTACTGTACTGGTAGGTAATGAACTTGACACCGTT:1 + chr3L 20914764 5' - Doc3-element 466 1 60.40 AGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCTCGCTCTCTGACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGC:1 + chr3R 20683400 5' - 1360 47 1 75.25 TGGCAGCGCCTGCCTGACCACTTCGCTTATTTCTACATACATGACTCCAAAAAACGGGTTACCCCAAATAACAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGC:1 + chr2L 18521145 5' - Cr1a 4 1 68.32 AGATTTAAACAATACACTTGTCTACTCATGCCATACTATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTT:1 - chr3R 3750728 5' + 1360 81 1 69.31 AACAAAAGTGTCGGCGACACAAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATT:1 - chr3R 24526404 5' + P-element 203 1 28.71 ACTCCTTGCGCCGCAACTCGCTCTTCCTTAACTTTTTCTCAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGA:1 - chr2L 20507778 5' + Idefix 6932 2 61.00 GAGAGCGTATACTGCAGCCAGGACACAAGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAA:1 - chrX 11721593 5' + micropia 258 2 72.28 TCTCTCTTCGCTCTCCGCTCGTTTATTTGTATTTGTATTTGCTAGAAATGTCGTTACATTTGTATGATCTGCGACACGGCCATCCTGACCTATTACACGTC:1 - chr3L 10842913 5' - invader1 3585 1 76.24 TTTTTNTATGTTTATATCTTTTCTAAAATCTATTTTTAATGAAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTT:1 + chr3R 6238136 5' + hopper 241 1 70.30 TAGATAGATAAGTTCATTCATGTATTTTTTCCAGATTTTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 2539261 5' + roo 36 2 65.35 GAAAGTGAAAACAATTATGACCATCAAAATAGAAAAGAGAAGCACGCAACTGCAATCGGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAAT:1 - chr2L 17871306 5' + baggins 5429 1 59.41 ATTTTGAGATTTTTGAGCCTTGAGTGATTGAGCTTGACTTTCGTGGTATTTGCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATC:1 + chr2R 2118802 5' + accord2 7295 1 55.45 TCCTGTTATTACCCCACCACCGCCACGCACACAAGCACAGACACACACGTCCCCGTCAGTCACAAGTCATTGGATACCATTTTGGCAGAACATTCAAGGGT:1 + chrX 19811757 5' - HB 441 1 74.26 TATTAAGGTCCAAACAACTTAAAAATTAAAAATAAATATGGTTTTTTTTTTATCTTTAAATACTTCTAAAAAAAAATACAATAGCAAGCTTTACACGCACC:1 - chr3R 4484891 5' + F-element 4451 1 51.49 TAACANGTCTAATTGCTGGGCCAACAAGTGCAATCTCATTACCCTCAAATATATCCGAATATCACACAAAATAATTACACATTAAGTACTTAATAACTAGA:1 - chr3L 7741097 5' + G5 4696 1 75.25 TATGTATAATTACAACCTAATATGTAGAAATGCCCAGATGCATGGCTTGCAGCTCTCGACTGGACCACACGGAGCCTATTG:1 - chr4 114218 5' - G5 4431 1 61.73 TTGCGTCATCGGCGTTTGTTTGCTGCTACCTTTTAATGGTGGGTAGATTGGTGGGCTGGTGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGG:1 - chrX 5337457 5' - G-element 297 1 62.38 GTGCGAGAGAGAGTGTGTGGCCAAAGATTTTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGAATAAATCTGGAATAAATCTGGAA:1 - chr3R 11097137 5' + mdg1 320 2 47.52 TTTTTTTTTCGTAAAATTACAACTAATGAATGCGCAAATCCTATTGCTCTGATATATATATATCAACATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAG:1 - chrX 21348773 5' - 1360 3245 1 79.21 GCCAGTGTAAAGCTGCCCTCATCCGCCAAAGTGCCATCGCTGCTCTCGTGACCATTGCTGAAAGCGCTTGGAGTGTGTCCAGTCTGACAATATCAGAAGAT:1 + chr3R 8836782 5' - Chimpo 80 1 56.44 GAAAATGCTTCAGTCATATCAGGCGTCCGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCC:1 - chrX 2355685 5' + F-element 4490 1 71.43 TAAATAAATCAACTATTAGTTATCGCTAGTGCTGGTGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTG:1 + chr3L 2799646 5' - G2 2870 1 64.00 GTCCTCCGTTTCGAGCTGTCAACATTGATTTGTTGGCTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCC:1 - chr3R 4987687 5' - F-element 244 1 61.39 GCAGTGCCTAAGCTGCATCCTTCCCTTTCTGGACAAAGATCTTATCGATAATCTACCCTATCTTGTATGGCTCTCTCTATCTCGACGTTCATACGGACAGA:1 - chr3R 19245160 5' - INE-1 130 1 69.31 TACTCGTAAGCTTGTCACTTTGAAATGTCGTTTTGTCTATGATTAAAAGGGTTATCAATATGGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTA:1 - chr2R 21120823 5' - Chimpo 165 1 53.47 GCATCNTATTCTGCTGGACTGGTCCCGAGGAGCTTATACCGTTGTCCTGGGATATTTACTTCGGTCCACATTTCTCGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATA:1 - chr3L 25514094 5' + X-element 10 1 67.33 AATAATTTATGTGCCAAGGTTTTGCCTGTGACCAACACACACTGACTCCCTTCAAGGAAGTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 11005443 5' - roo 9057 1 58.16 ACTCCCGATTGCAGTGTCCCACTATTTTGTCTGTCTGCATGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAGGTCATTGACCGGGTGGATGAT:1 - chr3L 4861760 5' - Doc3-element 335 1 60.40 TTTAGAAGAACGCGTAGAGTAACGATTATCCTTATTAGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTCACACGTCACAAGC:1 - chr3L 3252977 5' - 1360 425 1 59.41 TGATGCTGGTCCTGGGTCCTCAGTTTTTAGTCCTCACTTAGCCGGGGCGCACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACGAAATCTGGCATTCAAAAGA:1 + chr2L 20956687 5' + diver 5758 1 51.49 AAGAGCATGTACTACTTTGTTCTAATCAAGCTAGGCAGGTCGAATTCAAATTGATTTTAGCACGTTTTCAATTTCAAGTCTTGATCTACAATTCTATTTTG:1 + chrX 9067231 5' + F-element 4234 1 76.24 TTGATAGCATAAATCATCATCATTGGTTCGTTCCAAATACAAGTTATTCAATCAATTCAATCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGT:1 + chrX 13746016 5' - accord 207 2 67.71 ACTTTAAATTGTGATATAGAATTATATGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCC:1 - chr2L 14541230 5' + F-element 389 1 69.31 AAAATGGGCAATGCGAATTTATTTATAGGAATTTAATGAGCGTTTTGAAAAAAAAGAAAATTTTGATTTTCGAAAATTTTTGAACTTTTTCGAAAATTCAT:1 - chrX 2395196 5' - FB 126 1 51.49 ACATCAGTCCACAAATAGTGCATTACCTAGAGACAATTTTTAAAGGGGGCGAAACTACAAAATTCAGATGAAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCG:1 + chrX 673680 5' + Doc2-element 4543 1 66.34 GTCGATGCTCCTCCTGTATTTCTTATCTACTCCCAATTAATCGTTGCAGAGGGGGAGGGGAGGGGAGGAATGCCAAGGGGAAAGATCGGAAGAGCG:1 + chr3L 21281882 5' - mariner2 569 1 48.96 GTTTATGTAAACACCAAGAACTTATCTACCCCTTGATTGATGGGACAACATACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGA:1 - chr2L 3278961 5' + gypsy5 6995 2 57.43 CCACCACCCACCCGACTGGCAAAACTAAAAGCAACAGCATCAAAAGGAATATGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 + chr2L 18286090 5' + 412 2 2 77.23 TTTAAGCTGTTGCTGCTTAAATTATAGGGGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2R 22740089 5' - Transpac 266 2 75.25 GGGTTGAAAGGCTGTTGTGGGTGGTTGCTTGAAGCACAGGGGTTGCAATGACGAACGTCCGATGACAATGACATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATG:1 - chr3L 10826854 5' - flea 4580 1 74.26 CACAGTTGTTGGAGTGCCTCGCCAAAGGACAACAAAGCCCAAGGACGAGAGTGCTTACGTAGCTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTT:1 + chr2L 6214637 5' - Stalker 6938 4 53.47 GCTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 - chr3L 15099935 5' + Tirant 36 2 62.38 TAATGCCCTTATCAGTGTCACCCACACGCTTTCGAACTCATCCTCCTCCTCATCCGCATCCACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTC:1 + chrX 13479085 5' - I-element 416 1 61.39 TGGTTCATGGATGAATAGCTGACATAATTTAAAGTTTAACTATAAAATAAATAGTCACTTAGCTGGAAAGAGAGAATCGGAGAGAAAGAGAGAGAGAGTGA:1 - chr2L 1341210 5' - Cr1a 295 1 79.21 CGTTAATTACGTTCACCATTCCCACGTTAAGTCCCGCTAGTTTTTGTTGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGACAGTTCCCCAGAGTTCTAT:1 + chr4 656488 5' - Porto1 4281 1 57.43 GGCCGTCTGCCGTCGCTTTCCGTGTTTTAAGGTATAGTTGAGCGATGACTTGGTATCCAGCGATGAGACTATAGCTGATGGCGGTCCATTAGTTGTTGTT:1 - chr3L 19660121 5' - TART-A 12927 2 47.00 GAAATCACCAAGTTATGGCATTCCTTCGGTGATTGGTTCCATGCCGCACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCG:1 - chr2R 12583062 5' + GATE 302 1 53.47 TACTGCAGATTACTGAAGCGACAGATGTAAGCTTGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATAT:1 + chr3R 28012523 5' - diver 6069 2 66.34 TATCTCCAAATGAATCAGTTGATTAATGGTCTTTATATATCGTTAAAGACACCCTCTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATATCTTCGTT:1 - chr3L 9741508 5' - Porto1 4383 1 57.43 CCATCGAGGAGCACCGACGGCAGCTGGCGAAGGATCCGTCGCCGGCGGAAAGCGATCTCATCTATGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAA:1 - chr3L 19811282 5' - R1A1-element 4950 1 73.27 AAATGGACTAACTAAAATTTGAAGTCCAGCGCGTACTTAAAAATATAGCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTG:1 - chr2L 15272565 5' + BS 4800 1 52.48 CCTCCTTGTCACCCCATAGTCCTTTTTTATCCGCCCCCATTTTCCATTTTCCACTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAA:1 - chrX 20905756 5' + Cr1a 155 1 58.42 ACTGTAATAATGTATTAAGTATGTAAGAATGCTACCAATGTTAATATGTAATAATAATTGTAATGACCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 13824442 5' - roo 400 1 70.30 CTTTTCCAATTTCAATCCTTCGTAGTTTTCATTTAGTTCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCA:1 + chr2L 16835890 5' + F-element 4454 1 63.37 CCGGCGTTTTGTCCCCAGAGGGTTAAATTCTTGCCACACACACACATACACATGCACACAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2L 4089833 5' + 1360 13 1 53.47 GATTTGTAGACATTTTATTGCTTTATTGATGCGTTCTTATCAAAAGCGCAGCGTTTTGTTTGATGGATTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGTAGGTTG:1 - chr3L 18323158 5' - I-element 378 1 70.30 GTTTGAAAACGCATTTGCCCCCTACTCATAATTAGCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2R 18372620 5' + jockey 4713 1 65.35 ATCAGACAATTTCGACGACCGATTCGTTTGCCTCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3L 1280201 5' - hopper 1373 2 65.35 CCATTCGACACACTTTTCCTCAGCCATAATCTCTGCCATGTCCGTATGAACTTCGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACA:1 + chrX 6058578 5' + INE-1 173 1 66.34 TCCCTGAGCTAAGGAAGAAGACCCTCATTACTCTCAAGACCCCTGCCGACATCGACATCCCAACCAGTTCTAAAGGCAGTATGAACCTACGCGATGCAACT:1 - chr3L 24862212 5' + G3 4194 1 71.29 AAACCAGAGGCTTGTGAAGTAGGCACCTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTT:1 + chrX 285978 5' - Juan 3890 1 58.46 TAATTTCTTTTTCTGTGTATAGCAATCACGACGAGGGGCTTTCGGGGTGGCTGGGATGGGCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCT:1 - chr3L 566074 5' - Doc 433 1 66.34 TACTTAAGCAACAAAAGTTTGTCCTCGCCCATTCAGATTTTTCCCATTCTCGTCGAATTTATGTATTCTTGAATGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAG:1 + chr2R 15709634 5' - Quasimodo 36 4 61.39 AAATTGCGGAGAAACCTATAAACAGGCCTCAGATTTTCTATAAAGCACTCGATATATTAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 17004717 5' - roo 392 2 63.37 TGTGGTAGGTACCATGCAGTAGCATAGTTAACGGTAGATAAAGGAAATATATTCCTGGGGGCATGTGTAACCCACTAAAAAAAAATCATCCAAATATCTCC:1 + chr3L 26661632 5' - hopper 57 1 52.48 GTGAGCGGGCGAGAAAAGGACTCAGCTTCGGCTGACAGGCGGGCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTT:1 - chr3L 11403276 5' + 297 321 2 57.43 GGCGCGTTGTTGCTTGTAAAATGAATCCATTGTATATGTAAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 27253576 5' - roo 9028 1 68.32 ATTTCTTACAAGAGAAATGGTAGGTCTTCGCCCAGCTAAAGTTACACTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATC:1 - chr3R 2474585 5' - invader2 4715 1 58.42 CTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 + chrX 10555427 5' + Tirant 47 2 69.31 TTACAAGTGGTCTTAAATTAGCAACGTTATAAGTTTTTGATCAGTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCAAAGCAATCACGATATCTACTGCAA:1 - chr2L 17025989 5' + Doc3-element 497 1 56.44 TTCATTAACAACAGACTGGTTGGGATTGAATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 + chr2L 22689926 5' - Tabor 7322 2 77.23 GCAGCAGAGAAAGCTCGTAGAGGCGGAAAGACAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTA:1 + chr3L 16900490 5' - Quasimodo 6914 2 69.31 CAACTGCCCATTTTCCAGGGTAGCAGAGTGCTGACCATGCACTTATGCAGTATGCTTTAAAGCGGGCAATCATATAACGCTTCCACTTGAACATTATTGTT:1 - chr2R 13558016 5' - gypsy11 114 2 73.27 AGCCTGAAGAACTGACTGTCAATTTCATTTACGTTTTCAATCCATTTAGTGTAAGCCCAACCACACAACACGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3R 31996784 5' - mdg1 7453 2 73.27 AGCCGTCTGCACTGTAAGTAGCAACCCAGTAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAGGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATT:1 + chr2R 15464674 5' - micropia 102 1 69.31 TAAAGAAAACAGCCCTTATGTGCAGCGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTT:1 + chrX 19330554 5' - INE-1 553 1 57.43 AATATGTCAATTACTTTCAACAAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - chr2L 14536334 5' - blood 7378 2 67.33 GACGCACACTTTTCGGTAATGCAAATCGTAAATTGAGCTTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTG:1 - chr3R 6769461 5' + micropia 202 2 61.39 GAAGTCAGGGGAGCAGGCATGCGGCATGGGATATTCCTCTTCCTCATCACCCGAATTAACATATTAAAAAGAAAAACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTTA:1 - chr2R 22731637 5' + HB 1382 1 54.46 GAAATAAACCTTATTTTTCATACCCAAATATTGAACACAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCTTATCAGC:1 - chr3R 17209834 5' + accord2 7186 1 66.34 TCTGATGGTTTCTTCTATTTTGACAGCTTATTTCGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 - chr2L 5390685 5' - Tirant 348 2 65.35 AGCTCACCTCTTTTAGAGGAGATTTTATTTGATATATCTTATGTCTTATTTTCTGAACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAAAGGGATTTAC:1 - chr2L 18954975 5' - Porto1 4303 1 50.50 ATCTGGACTCGGGACTCACCTGGAGGAACATATCACCATCCAACAGGCCGTGCTCGAAGGCGCCTAGTTCTCTTTCGCCCCCGTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 16383964 5' + hopper 140 1 69.31 GCGGCGGCAACAATTAGATAAGATCAACAGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGAT:1 + chr2R 15094543 5' - invader4 3030 2 71.29 GGACAACAGAGAACTGCAGCACGGCACTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCACCCACTTTTTTGGT:1 - chr2R 2498375 5' - 1360 3339 1 73.27 GTATCATCTATTCGTTTATTTGTATGAAATTTCATTTTCATAATTATAAGCAATCATGGAATATATGTACATGATAAAAAATTATTATATTATTTAAATTT:1 + chr3R 25184192 5' - HeT-A 337 1 64.36 CTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATGTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 + chr2L 21737998 5' - Burdock 6350 2 69.31 ACGATAGCGGTACGCAATAGTTAACCAACTAGCTATAAATTGCTCTAAAATAGATTACGATAGTATCCCTTAAGCCAATGTTCCCCCGCAAAACCA:1 - chr2L 16771588 5' + G6 1966 1 65.62 TTCAAAACTTTCATTGTTCGCTTAGCGCATAATAGGGGCGGATTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:1 + chr3L 12246109 5' + HMS-Beagle 6826 2 56.44 TCTGGTAAAACCGGCGGAAAAGCGACCTGTGCCTGCAACCTTTGGCTTGGTCGGACGACCGTGGCCAAGAAGACGGGCTACTTCATAATAAACTTAAGTTT:1 - chr3R 30452353 5' + gypsy4 6753 2 70.30 GATTTTGTCAACATATGTTCAACATAATCACAAACAAGCTAGGGTATTACTTTAACACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGT:1 + chr3R 19997651 5' + hobo 118 1 62.38 TTATAAAACGGAAGGCAGCGGCAACTTACTCAAGCGATAAAGTCAGAATGGCCGTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCT:1 + chr3R 11517490 5' + micropia 26 2 62.38 TGATTATATGGAACAACAGGCAAAACGATTAGTTGGGCGCATACGCATAATGCATGTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTA:1 - chr3R 27445423 5' - R1A1-element 316 1 60.40 CTATTTGGCACCATACTATACATTTTTTCCCCAGTGCACTAGAATAACAAGATGCATAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCATCCACTTGTTTGGT:1 - chr3R 12617999 5' - 1360 3339 1 65.35 CTTCATCTCGGGTCTCCTGGTTTCGAAACAATTCAACAGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAG:1 - chrX 6409440 5' - G6 1647 1 62.38 TCTTANCTGTGCTGGGCTTATCGCCACTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTA:1 + chr3L 22801478 5' - roo 8859 2 63.64 TGAGTGGAGCATCATCGATGCGGATTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCAATTCCACCGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAA:1 + chr2R 20619354 5' - R1A1-element 48 1 74.26 AAGAGTAATTTAATAAATGTGTCGTAGAATTTGTAATGGAATTGATATACCTTCGTTGTACACTAGAACAATATTATTTCCAATAAAAATATACTGGCTCT:1 + chr2L 21369932 5' + G3 4106 1 81.19 GGCGGATGACGGACTCATAAATTAATTAATTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGG:1 + chr2L 5479715 5' - rover 7135 2 55.38 TGTGGCGCATTTTCTGCGTTTTCGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGC:1 - chr3R 8695819 5' + 1360 91 1 77.55 TTAGCTAAGAAGTTATGTTGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chrX 11060479 5' + I-element 28 1 50.50 GGTCATGGATTAGGCCAGTTTATACTGTCTTTGCATGTGTGCAGCCTGATTTATGTACAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3R 22675893 5' + 412 7068 2 64.36 TGACCAAAATTTGTGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 - chr3L 11696472 5' + blood 12 2 67.33 AAAAAAATATTTCCACGATTTCGATTTCCACGATACCCGTTACTCAATTAGTTCGAGTGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCA:1 + chr3L 20659418 5' + X-element 4279 1 59.41 ATCCCGCTGTTTAGCCGCTTAGGATGATAAACAGCTGACGATGGGGTGAGGTTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAG:1 - chrX 17392757 5' - Idefix 181 1 65.00 GAAAATGAGAGGCAGTCATTATATATTCAAGCATTTAACGGGGCAATAATTTTTTTCTGATTAGCAGCAATTTGAATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAA:1 - chrX 22383084 5' + invader1 3611 2 37.62 CACACAGGTGCGAAAAGCAAGGCATCAGTCGTAATACTTGTGCAAATCGACAAGCTGCCGCCATAACAAAACGGAGACGAAGAGTCATAAAGAACAAAAGC:1 - chrX 9992283 5' + HeT-A 268 1 68.32 GAAATGGGCGTGTCTATGGGCTTGTAAGTAATTAAGCACTCCCCCTTGCTGAAGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCC:1 - chr3R 28270210 5' - R1A1-element 5086 1 65.35 AGTCAGGCAGCCAACAGCTGCACTCGGGCCACCGCCGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAG:1 + chr2R 23032794 5' - hobo 296 1 64.36 AGCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACA:1 - chr2L 3245014 5' + rover 21 2 59.41 TGTTGTGTTTGAGTTCGAGTTGCTGCGCTTGTGAGTTTCTCAGCTTGTTGTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chrX 19848503 5' + P-element 25 1 54.46 TTTGGCTTCGATAAGTTTTTAATCAGTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 - chr3L 3485016 5' + diver 52 2 77.23 CGCATAGGTTTAATTGAACATGGGGATTCCACCTTCATATTTAACGATATTCTTTAGCTCGTGCAATTCCTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACC:1 + chr3R 10098191 5' + R1A1-element 5162 1 79.21 GTACAACGTAAGTGCTGGCATTTTACATATGAATTTAGAACGTATTCTTACTTATATTTATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2L 10993428 5' + 297 13 2 48.51 TTTTCGTTGTTTTTTGCGGAACTCTTAGCCATAATGCCGCTTGGGAACTTTTAACCATGCTGTAGGAAAATAATAGAAAAAATAGAGAATGCTATATTCGA:1 - chr3R 19254234 5' - INE-1 578 1 69.31 CCCACACCTAATAGCGCCCACCAAAGTGCCCTTGAGTGCCTACAGTTAATGTGCAGTCGACCTTCACGCCAACTAAAGACCATAGGTTTTTATATCCGTTT:1 - chr3R 30147104 5' - Burdock 283 1 79.21 ACTATNCACCGACATCCGAACAAAGCAATCAATCAGGCAATCAAGCAACCAAGCGACCGAGGGGCGCTACCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGA:1 - chr3R 13638941 5' - Cr1a 4381 1 56.44 TACCACCTTGGTTCACCGACTTGCCCCACTGTGCCTTCACTGTTCAGCGAGCAATTGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCGAAAATTGCTCTCTTTCCGCTC:1 + chr2R 7104129 5' - 1360 3311 1 63.37 ATTTTTAATTAAGATTTGTTTTCGTTTTTCATATTACAGTGAATCCTTGCTTACTTCCTCGTCCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTTATGTGTAGCTTGAAA:1 + chr2R 15646015 5' - G5A 2779 1 61.39 CTGCTGTTTTTGCAAAAAAATATAAATGAACCAAGCTGGTCAACTAAAGAAAGTGTACAAAAATTTCAAGTTATCGGCGCCCCTCGATCGGTTGGGTGGGA:1 - chrX 11665591 5' + Cr1a 4418 1 79.21 ACCTTGAAGTATGCAACAATTTTTCGACCACTGCACTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTA:1 - chr3L 13830755 5' + 17.6 6945 1 64.36 GACATGAGCTGTGCCAATTTGTCGTTGTTAATCTGCGGTTGCGCCCCCAGAAAACCCAGATCCCCTTCATTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAGGAACTAT:1 + chr2R 19497346 5' + INE-1 143 1 76.24 CACTGGCCCTGAATTGCAATTAAGCCTGATATATGGGGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCA:1 + chr2L 1828864 5' + R1A1-element 5119 1 63.37 CAAATGGCATATTAACTTACTTAGGTAAGCATGAAGGCAGCAGGCGAAGGATTCCAGCCGCCCAGTGTTTGGTCAGTTATTATTATTATTGCAATTAT:1 + chr3R 11076946 5' - mdg1 29 3 56.12 GTCTGCCTGGAGGGTTTATTTTAAAGGCCGTTTTAAGTTTAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCA:1 + chr3L 14461437 5' - 412 409 2 73.27 AAATTTGTTTCGAATGTTTGAGATTTTTATCTGCGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 14505513 5' + hobo 9 1 69.31 GAGCCCAGTGATAGTGAGGCATATGCCAGCACCGCCTTAACTGCCAATGCAACAGCACCACCAGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTC:1 + chrX 15032375 5' - R1A1-element 4952 1 61.00 ATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCT:2 - chr3L 23112566 5' - R2-element 3239 1 62.38 GAGCCGAGGAAAAGCTAAAATGTAATAACTCTTCTTGGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2L 12991404 5' + hobo 39 1 64.36 GCCATGGGAGCAGAACGCTCTGATTGTGGATCAGCTGGGCTGCATGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGG:1 + chrX 2628567 5' - Doc 4323 1 56.44 ACCCGAGAACTTGTTCGGGGCTTATATTACCTTTTTTTTATTTCTCCTCTATACGGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCAATTCCACCGAACACTAA:1 + chrX 17109733 5' - R1A1-element 81 1 60.40 TCACTTGCATCTTCACCATTAAATCATTAGCATATTGTGAAAATAACATATCTATCGCTGATACCTAACTTCCAACTTTTATAGTACCTGAGATCTCGACG:1 - chr2R 18221236 5' - INE-1 144 1 47.52 GAAGCAGAAACAGCCAGGAGCACTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATAAAGATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCT:1 + chr2L 16646369 5' + Cr1a 438 1 67.33 TATTTNTTTACCCGGCATTGTTTCTTCATCCCGCTGACCGAATAACGGTATGGGAGCAGCCTTTGCTCGCACTGCTTTGCGCTTGACTTCCCCAGGCTCTG:1 - chr3L 349470 5' - G-element 443 1 76.24 GTGCTCAGTAGCCAAGAGAAGACACCTAACAATGCTGCTGGCCAGGATCAGGCCACCTCGCCAGCGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCT:1 - chr3R 24217850 5' + R1A1-element 5159 1 66.34 TTACTATTTCGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr3L 5827939 5' - blood 7348 2 64.36 AGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACGACACGCACACATATACGCGT:1 - chr2L 14588754 5' + 1360 3217 1 61.39 AGCGAGAACTAGCCTCTGGTCGCCGTAAGCCGGAAAAACCACAACACCCACCTGCTGTTCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCAC:1 - chr2R 16102451 5' + F-element 4410 1 65.35 TATAGTTTAGTAAATTAGTAAAAAGAAACTGCAAGTTGAAATATATATAAATTATCATTTTAGTGAATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 - chr2L 8967091 5' - Burdock 6360 2 56.44 AAATANCTTGAAATAATATGTTTGGGGTACTCCATACGAATTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2L 14252757 5' + jockey 31 1 57.43 TGCCACTCCTTGCAGGATTCCAGGACATCCAGGACCACCCACCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTA:1 - chr3R 14146706 5' + hopper 33 1 56.44 GATATATCACCATCTAATGGGGCAAGGTCAGCACAAGCAATTTAAGCAGAGTTTTCCATGCAGTTGGCTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1 + chrX 14898940 5' - blood 7322 1 60.40 AGCAAATGTCGCTGGCGGCACGTCCGCGAGCAAGGATGCCAGGACATATATTCACACATCCCCCATTCTCCATATATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTT:1 - chr3R 16159324 5' - mariner2 724 1 61.39 TGAGCTCCGCTCGATTCTGCCAAACAAAGGGACTGCAGCTGCATCAAGAGTTTGCTACAAATTGCCGAAGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAA:1 + chrX 22746427 5' + Doc 4556 1 72.28 TGTAACATTGTCACTCGAAAACTGAAGCTGTTCAACGCTGCGATGAAAGAATCCGTTGTGAGATCCTCGGTTACCTTCTATTGAGCTTCCTTGGTG:1 - chr2R 1658150 5' - X-element 4477 1 66.67 GCCCGATGCTGTTCCTTGCACCGCTGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTAT:1 - chr3R 15983196 5' - invader2 253 1 75.25 TGCGTGTATGAAATAATACAATAATTTCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGAAATCCGTCG:1 + chr3L 11162869 5' - G4 73 1 73.27 AAACAATGACTGCCATCGTTAGAGCACAAGAGTACGTCAAAAACAATACTTATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCA:1 - chr3L 21508450 5' + F-element 4280 1 53.47 TGGCGAAAGCTATTGAAAGGAGTGATCGAATCAATCTTGTAGAAAATAAAAAAACACAAATGAAGAAAATTTTATACAAGCAGACAACATTTATTGTTTCC:1 + chr3L 8377357 5' - Cr1a 437 1 58.42 CACGGCAAGATTCCCCATTCGTGCACCGTATGCGGCAACGAGAATGTAGTGTCGAGGAAGCTGTGTGTACCGACTGGGCAGAGGCAGCGCGTCATGGCCG:1 + chr2R 14178753 5' + Osvaldo 478 1 67.00 CTGATGGGAGGGGTGGGGGGATAGATCCTGCGGAGTCCTTAGACTTGATTAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 12344544 5' + roo 48 2 56.44 ACACAGGATGCACAGAATGCGGTGGATCAGATTCAAGTGCCTTGCAGGTCTTGAGGGCTCGAGGCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAA:1 + chr2L 17954417 5' + jockey 4629 1 70.30 AACACAACAGAGAGCAACGAGCTCAAAGAACAACAAATTGCGGACAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTT:1 + chrX 8202118 5' + copia 465 1 55.45 AGGCAGCCGTGGAAATGGATGGGAATCAACAGGTAGTGGTTCTTTGCTATCGCTAGGTTTCGTCCTTAACATTTCGATACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 19765956 5' + G2 3077 4 65.35 ATTACGTGCCGCCAAGTCTCTGTGTACATAATTCATATCACTTAAATATGACATCCCGCTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCACGCTCTTC:1 - chr4 618952 5' + GATE 53 3 60.40 AACGAGAGCGAAGTGCTGAACGACGTTAGCTAAGGAGTTGTGGAAGAAGTAAGTTGTGCGTTCTGCCTCCGTGGCTACGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGG:1 - chr3L 24208367 5' - Quasimodo 216 2 76.00 CCAATTAAACACCAATTAGTGGGATGAGGGGGGACTGCTGAAGTTTCGGCTTAGCAAAACTTTTAATTTATTAACTTGAAAGACGATTTCAATTAATTTT:1 - chr3R 20529939 5' - HeT-A 431 1 67.00 TCTTTCAAGTGCACATACTGTAGGTTCTCACTCACCCTTTACTGCGCGAAACCAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGAC:1 + chr3L 14843785 5' + I-element 4926 1 58.42 GGAAAAGCTAAAATGTAGTAACTCTTCTTGGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2L 12991411 5' + hobo 46 1 71.29 AGAGCGACTGATTGCGATTCCATTTGCTAGCCTGTGCAAGCCAAACAAGGCATTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGT:1 - chr2L 20534519 5' + Cr1a 4000 1 55.45 CAGCATGGAGTGCTTGGCGGAATAGAGCAATACACGGCAGCCGGGATCTCGAGTTATCTCGAAGTTCTTCACGGGGTCGGGGAGTCGCGGATCGAATATTG:1 + chr3L 16778576 5' + aurora-element 4043 1 69.31 ACATTGAGTAGACCAAATATAGCATTGTAAACAGACCCAGCGTTATTTGTAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTA:1 - chr3R 25224267 5' + Doc3-element 4637 1 65.35 GAAGGAGAAGCAGGGACTGAAGCCAGCTGAAACTGCAGTCAAACCCAAGAAGCACAAAGGGCCCAAGAACCCCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAG:1 - chr2L 1731595 5' - R1A1-element 208 1 75.25 CACATCCAACAACCAACAATCGCTCCTATTGCAAAAACTGCTTTTACAACTAAGCATGCCCATTATGAATATAAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCTG:1 - chr2L 6986194 5' + Chouto 7 1 71.29 TTCTATGGGGTCATAGCTGTCCTGACAAACAATTTCCTGCAAGCTCGTTAAATAACCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTT:1 + chr2R 5616542 5' - 3S18 319 2 58.42 CTAACCATGTTCTTTGAATAAATTCGTATATATGTATACGTTGGACTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAA:1 + chr3L 3484967 5' - diver 6082 2 54.00 AGCCGCGAAGCGCCGTCATTTCCGCTGCCTGTCAGAGCAGCAACAATTTAATTTTTATTGTTATGATGTCATCAGCAGCAGCCACGTGCTGAGGCTGGTAC:1 + chr3L 20166860 5' + G-element 244 1 76.24 GAAGAACTGTGGTGCAAAAGTCGATCTACGTGCTCCATTTCATTTGGGCCCAGCCATTCCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTA:1 - chr2R 20394915 5' + rover 141 2 65.35 AGTGCATATGATGATGATTACATGGGTCGCAGGATGCTCAGGGGTTTCCCCAAGCGCGGTGGGTTGGTGGTGGTAGCGATACCGTAAGGTTCGCCGGCTGA:1 + chr2L 2062939 5' - G-element 134 1 73.27 TGAATGATATGTTTTATTGAGTTTAGCGAACGAGAATTGATGTACAATGATACGAAAGCGAATCAGCAGCGCTCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACGAAAA:1 - chr2R 4374957 5' - diver2 155 2 68.32 TTAAGAGTCATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 2539314 5' - roo 9028 1 68.32 GATCAGGAAAAATATGTCGTCCTGATCATCGGAGCTTAGTGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGTCTTTTTTAGTGACGGCCAAAA:1 - chr2R 14376129 5' - 1360 3328 1 60.40 AGCCGGCAATCAGGCTCAATCGTTTGGGCCAGGACGACGGGCGAAAAACGAGGAGCGGAGCATGCAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACT:1 - chr3R 29005808 5' + Doc 327 1 67.00 ACATATATTTCATTCTAAAATATCATTTTATTTCCAACATACATAAATTTTGTATCCACACTTGTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chrX 23431784 5' + jockey 20 1 64.36 TGACAGTGGTCACAATTGAGTTTTCGGCCGCCGCCGAAGAATCAGCAAACACAGCGGTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 5322086 5' - 1360 3372 1 62.00 AATAACGTTGGTTTCAATTCACAAACAAGTATCCTCATTTTATTTGCTGAAAAGAAGATATGAAGTCCCTTTTCCTTAAAATAAAAATAAAATAAAAAAAA:1 + chr3R 18373473 5' + Rt1a 5078 5 73.27 TTTCGGCGTCTTTATCGGGAACACGCATCATTGACTTGAAGGCTTTTCCACACACACACACACATACAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTC:1 - chrX 17049645 5' - Stalker2 400 2 73.27 CAGCGTGACTTTAAATGATATGAAATAAGGTGATGAGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3R 26404484 5' + 412 37 2 63.27 GCTGATCTTGGCCCTCTTCTCCGGCTTTGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTAC:1 - chr2L 372103 5' - invader2 190 2 72.28 GGGGCTGAGGGTGCGAGGGAGAGGGGCTGAGGGACTGAGGCGGTCGTTCCACATACCGTGAACTAACGGCACATTAGTTGGACCATGTACCCGAGCGGGCC:1 + chr2R 21706088 5' + gypsy8 286 1 55.45 TAAGTGCCCTGATTAATCCACATCCACATCCTTATTCACATCCTGTTTGTTTTCCTGGTCGAAACTCACGTCGTTTGATGGGCATAAAGTGAAATAATAAA:1 - chr3R 30406717 5' - transib3 2836 1 79.21 CCGGTCTGGATCCCAGCTCCCTTGTGGATATAAAGCCACCGAACTACTTTGGCCTCTTAGTCGAACAAAATAACAAAAAAAAAATAAAAGAAAAA:1 + chrX 9755220 5' + R2-element 3585 5 70.53 AATTCATGAAATATACGGTATTTAAGTCTTCGTTCAACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTTTACGGTTAGCTAGGGA:1 - chr3R 4541570 5' - Cr1a 4007 1 67.33 GAAAANAGGCGGCTTAACAATTTTAAAGTAGTGGGTGAATGGTTCCTGAAATTGAAAGCAAAAGTGGACTTCCACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATGG:1 + chr2R 6216023 5' + INE-1 547 1 45.00 TCCCTNCTAGCGTCGAGTCAAATCGAGTTCGTTGCCTAAGTCTTTCGTTCGCCTGGCACAAAATCTAAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGTT:1 - chr2R 9012971 5' + Cr1a 344 1 59.41 AGGAGACAGTTAAACTCAGCGACACCTCAGCTGTGAAGCAATATCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 - chr2L 22319353 5' - Transpac 5199 2 55.45 CGGCGATCAACAGAATGATTAATCATTCCCTTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTCA:1 - chr2R 19035450 5' + invader4 230 2 69.31 TACTGAATGGAATCATGTTAAGTCAGAGGATAATCCAGCAGATTTAGCATCCAGGGGAGTGGATTCTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAAT:1 + chr3R 19446438 5' + gypsy12 13 2 66.34 AAGCGAGAGAAAGAGAGAGCTAATTGATATTCTTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTGATGAAGGGGTAGTACAATAGATCC:1 + chr3R 14596682 5' + baggins 5391 1 70.30 CCCAAAAATATTGTTGTGTTCCTGCACTCGACCCCAAAAATGTTTCCCTCTATTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTCGCACACTTAGTGATAGTTTTTTTTTT:1 - chrX 9180306 5' - Doc 4597 1 49.50 CACTTGTTGTTTGTGGTCTCTCCCTATGCCGTCACAGGCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 697452 5' + roo 39 2 65.35 ACGCGCCAACACCAGCAATTCAATTAAACGCCCACCAAAAAATAAATAAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAA:1 + chr3L 6477286 5' + I-element 101 1 55.45 TCCGTTGAGCTCTCGCTTATGACAAAATCCCGCTGTTTGTTTTCGGAGTTTCACGAACACACAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr2L 19090030 5' - opus 7491 2 67.33 AGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3R 19535694 5' - hobo 2905 1 56.44 GAACAATACAAATGCGGGTATTTACAGAGGCTGGCAAATCAGGCTGATTTTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACA:1 - chr2L 10548015 5' + Doc3-element 4505 1 51.49 AATTGTTGAATTGTTTCTCCATCGAACATATTCAATCCTTTCTTCTGCACTCATCATTTAGTTGTTCTCTAAAATAATAGGAGTGATTGCTTTGGGTTTTT:1 + chr3R 26255039 5' + Tc1 255 1 77.23 TATTTTCCAGATAGTCTAACCACCAGCAGCCAGAAGGTCTTGGAAATCATTCAGGCCCAGAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAA:1 - chr3R 30422021 5' + F-element 341 1 66.00 GATACATTCCGGCGAGCGGGCCTACAGGTACGTTGAGTCATACAGCTATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTT:1 - chr3R 8730372 5' - roo 8730 2 53.47 TCTCGTCCGTTGGTCATGTGTGCGGTTCAGTCTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAG:1 + chr2L 8088278 5' - Doc 4288 1 67.68 TATTACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chr3L 25798515 5' + blood 33 2 56.44 GGCATCCTGTCGTTGTTATTGCGAGTGGTGGTTCTGCGGTGGTTGCCGCAAGGGTATCGTGGAGGAGATCTACAGCGGAGCTGATGGAGTTGTCAGACGCG:1 + chr3R 28185308 5' + aurora-element 3918 1 57.43 GTTTGGGTTGTTTATATTAGGGAGTAGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATGGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTAT:1 + chr2R 4738696 5' - F-element 157 1 72.28 GGTTTGGCACTAGATTGGCACATGGTGTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:2 - chr3L 13888672 5' + copia 4920 2 74.26 TCCGCCTGCTGCCTCCCCTTTTCCGCCTCTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGGGCTGACACTAGCAAATTCTGC:1 - chr3R 30803528 5' - mdg1 250 2 69.47 CTGAACACCGGCACCGCAATCCGCTAAAAACAAACAAAATGAAATGAAAAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGA:1 + chr2L 16860764 5' + mdg3 5137 1 63.37 TGCAGGCAGCCCTTGGCTGGAAAGGACTTGCTACTACTATAAGTTGACATTTTTCTTGCATCTTTCGTTCTTTGTTCTCACTGAGAAAAAAACGAAGTATA:2 - chrX 22746193 5' + Doc 4454 1 79.21 TATTAGACTCAACGAAGCAACCTTAACGCCTGGCTCTCGTCAAGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCTGCCTCCTGTGCAGCCTTCTTGGTGGGC:1 + chr2L 16006744 5' - BS3 1545 1 65.26 GACTTGGCCATATTGGATAAGCTGCTCCATCTACTTCTTGCGATTGTTGCAGCGGATAAAACAGCTGATAGCGCTGCCAACTTGGCGGAGCGGGCGATCTG:1 - chr2R 8936782 5' + Rt1b 8 1 65.35 ATGTGTGTGCGACTGAGCATGCAATTTGAATTGAACTTTCTGTATGCAAATAAACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACAT:1 - chrX 21006808 5' - hopper 324 1 59.41 TGATTGTCTGCAGAGAGCCATGTTATATTAAGCAATTTATTGATGGAAAGAGACAGTGAATTATCTTATTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGT:1 + chr2R 18349116 5' + Idefix 7052 2 70.30 AATCAAAATAAATTTGCCAAATCACGAACTTAATTTAAATGTCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAA:1 + chr2R 18075227 5' + 1360 3252 1 62.38 TAGCGAGTCTTAAAACCTCATAGGAATCATTTAAAACACGCTGATTTACGAAGGAAAAATGAGTACAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTA:1 + chr3L 947840 5' - hobo 2929 1 68.32 GACTGTTTCAACCAAGTAGAAACTACGTTTACAAATATAAAAAACACATACAACGTTTTGTGCTTATAAAAATGAACTTAAATCAATTAAACACTAAATAA:1 + chr2L 9158819 5' - McClintock 350 2 62.38 ATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACAC:2 + chr2R 5617481 5' - invader1 4011 2 68.32 GAAAGAGGCGATCCGTACAAATTGTTTAAGGTTTGGTTGGCTAGTCTTAAGGGCAGACAACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAATCTA:1 + chr2L 19787648 5' + springer 269 2 67.35 GTAATCCCGGATAGCTGAGATTGCCCATTTAGCTCCAAGAGTTTGAAGCAGACTCCAAAGGACTTTAAATTGCAGCCGCTGTATGTGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chrX 18027050 5' - Quasimodo 36 2 79.21 TTTAAATGTTCTAGGATGAGTCATTAAATGGTATAAATTATATACAGGGTACGGCACCATAATTTCCTTTTTTCAGAACTATTGTAGGCATCGGAAAATAT:1 + chrX 8541615 5' - mariner2 845 1 66.34 AAACCGAAAGTGCCGCCCAAAACGACCCACTCACAATGTAAAACACCACATTCAAAAGGGCAAATTCCTCCGTTATGGCCGTCGCTCCAAACTGGGGGGGG:1 + chr3R 22040415 5' + ZAM 7938 1 67.33 GCTGTGCGAAAAAGGTCATCTGGTGCTGGTCAATATGTAAAGCCAGAAGATGGCTCTGAAGATTCCGAAAGATGGAATATGCTCGATCAAAAGGCCCTGGC:1 - chr2L 20051291 5' + Copia1_DM 489 1 74.26 GTAATGTCAATACGATTTGCGTTTCTTCAAAAATACAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 16252338 5' + pogo 39 1 66.34 TGCGAGGGCTGGGAGACCAATTGGCCAAAACCAATATTAATTAAAAACAAGAGAGAACGCTATAGTCGATACTTTCTCTACTATTAGATACCCGTTACTCA:1 + chr3R 31968674 5' - INE-1 548 1 59.41 TGGTGGTGCTGGTTCGCTGGCTGGTCGGGCTCCTCGTCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGG:1 - chr2R 19278022 5' - F-element 4480 1 67.47 CGAGCGTTTGCCGAGCAATTAGGAGGCCAGGCGTCAATATTTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACC:1 - chr3R 11719281 5' - F-element 4490 1 64.36 CAGCGCACGGACCTCACCGGCGTTCTATGTTAATTTTGGATTTCGAAATTTTTGGGTACTTTTACGCAATGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 14256569 5' - 1360 3375 1 72.28 TTATTGATGTTGCCATGGCTGCTGAAAATTCTGGACTCCCTATCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAC:1 - chr3L 25332054 5' + F-element 267 1 57.43 CTGCGAGATGTGTGACTCAATGCCAAACACGTAGGCCGAGTGCAGAAAGCCTAGAAAACGGGATTGCATGAGATTAGGGCTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGT:1 - chr2L 415540 5' - G2 6 1 78.22 CAATACCCATAAAGCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTT:2 - chr2L 3245026 5' + rover 6960 2 71.29 TTCAGGATTCTGACTGGGCTGCATCTGAATTGGTTTTGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAG:1 + chr4 956602 5' - 1360 3299 1 72.28 CAATAAAACATACTAAGCCTAACAAGCAACGACAAACAAATCGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCA:1 - chr2L 10300004 5' + F-element 340 1 64.36 GTAGTGATATTCCTCTTCCTCTTCCGTCTGAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATAG:1 - chr2L 3421194 5' + mdg3 5327 2 76.24 GTAATTGGAAATAATGGGCAATAACGGTAATGGAAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGG:1 - chr3R 4246358 5' - McClintock 6061 2 66.34 CAGCGCTTTGGGGTCAGTAATTAATCCCCACACCCCACACAATAGACGAGGTATTGTGCGTCTCTCCGCCCAGACCATTGAAATTGTTTATTGAAATCGAT:1 - chr3R 21679774 5' - Idefix 293 2 59.41 CACCCATGGCCAGTGTTCTTAACATCCTTGTGGCCACTAATTGCCCCCCTCCTGTCTGGCGGCTCCGATTCGGCATTCATTAATGTCTGTAGCGAAAAGG:1 - chr2L 9739568 5' + Gypsy12A_LTR 2140 1 81.00 TTTCCTTAACAACAGGATTGAAATTATGCAGAAAGTCGTTAGCCACCTACAAGACACCAAATCATGCTGGCCCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACA:1 + chr3R 26411534 5' + G6 411 1 72.28 TGTGCCTGCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3R 9996378 5' + blood 24 2 56.44 TTGAAGACGCAGTGAAAACAAAGCTAAACAAAGATCAGTAAACAAATAATTCATAATAATGGATTATATCATAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATT:1 + chr3L 12791523 5' - 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Chouto 498 1 57.00 CGTTAATAATTGTTATGATTGTAGTTCTACTACTAACTATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCCACATGTAGCTGTTTAAAAAAAATTGCAACTTTGAAGA:1 + chr3L 18870130 5' - hopper2 1231 1 71.29 TCTGGCCTCTGTTTTAGGTGGTTCGGGTTGCCGGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGG:1 - chrX 20503706 5' - Doc 4492 1 67.33 AATGGAACATGAGAATGCTGGCGGATATGTAAAAAAAAACGAAAAAAATAATAAAAATGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGC:1 - chr3L 4581832 5' - invader2 220 2 65.35 AATTCCCCCTATGCCAATGCCATGAACGCTGCCCATGCAGCGGCAGCAGCGGCGGCGGCAGCCATGATCAAGATGCCCCGTCGAGATGGCTAACGCCAAAG:1 - chr3L 10983374 5' + gypsy8 4516 1 79.21 TGGTGAAGGATGAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGAATGGGAGCTGAGCAATCGAGTG:1 - chr3R 25360948 5' + jockey 14 1 72.28 TATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 + chr3L 3254981 5' + 1360 42 1 67.33 AATGGTATGCACGTTATTTTCATACCCTACGCATTAATGAAACTGCGTCCGTCGAGCTGGATAGCTGGATAGGTCCAGGTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTA:1 - chr3L 254469 5' - Fw2 3524 1 61.39 TTAAGTTTTCCATTGCAAAGTGAATAATAGTTTTCCACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTT:1 + chr2L 5773968 5' - 1360 371 1 72.28 TAAAATGTAAAAGCGGAAGTTTAAGTTCTTCCTTTCCAGCGACGGATAAAAGTTGATCAACATCAGGGGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCTGAC:1 - chr3R 25574480 5' + ZAM 133 2 73.00 GATACTTTACAACAAGTACAAGTACAACAAGTACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCA:1 - chr3L 21637428 5' + Bari1 48 1 73.27 CCATTTGTGCAAAATGTTAAGACTACAATAAGTTAACGCACACACGCAGGCCAATATACCAGCCGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGAT:1 - chr2R 18482341 5' + Quasimodo 84 2 67.33 ACGCCCTCAAAAAGTTGCTACCCATCCCTTATTCATGCACTTTGTATTTTTAGCATTAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCTTTTGAGAG:1 + chr3L 18095359 5' + invader3 5335 2 50.00 TATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTTTTGACCGTTGAATTACAACGCCCACACTTTTGAAAA:1 - chr2R 1751256 5' + INE-1 251 1 81.19 CACAAGAGCTGAGCTCAGAACGAAGCGGACAACTTCAAGTTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGG:1 + chr3L 5064710 5' - 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chr2L 21657894 5' - invader2 4662 1 77.23 TCTATGCTTTCGTTAAGTATGCGATGGGCACGTTCCAAATCGTTTACGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGC:1 - chr3L 9900559 5' - Bica 473 1 63.37 TTAAGGTATTTTGTTTTGTTATTGTGGTAATTGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAG:1 - chr3L 3828824 5' - jockey 4751 1 69.31 ACTGCNCAGAAGGTGGACGTGTATGGCTTCGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCG:1 + chr3R 7182240 5' - Rt1b 4898 1 70.30 CCCGATTAAAATATGTATTTCGCTAAGTGTACTGTGTACTGCGTTGTGTGTGTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAAC:1 + chr3L 20260563 5' - 1360 3170 1 57.43 ACATCGAACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAG:2 - chr2R 4879051 5' + G-element 5 1 77.23 TCTCGTTGGTAATGTGGTCGACACCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCTAGAGGCGCTGCTGTGTATCGTAC:1 - chr2L 16784306 5' - Cr1a 4400 1 67.57 GGAAAAATATGTGTAGCAGATCGCAATCAATTGTTTATATATAAAAAATATTACTAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATAGAGTAGCCGC:1 - chr3L 6914243 5' - 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pogo 128 1 55.00 GTTTTTTTATTCTATTCGTTGATTCGATGAAAGTATGAAAGTTAAAAGTATATAACAGAAAGCATTCAAGACCCGTCACGCTTCCAGCCATACAAATTTTA:1 - chr2R 4709801 5' + hobo 2673 1 71.29 TTGTAAACCTGGTTACTCCAAAGTCGATCCTTATTCCCAAGGCTTTCACTCGCCAGCACATTTTTGAGACTGTCAAGACACTCTTTTCACAAAACAATAAA:1 - chr3R 16408755 5' - S-element 1493 1 63.37 CGCTAAAATCGGGGCAAAATAAACACACGTGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAACTTATTGGTGATAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGC:1 + chr2L 9677291 5' + R1A1-element 252 1 67.33 CTACTCAATCAGGGACACAAACAACACTCAAATTGTTGGCCAGTTTCAGATTCAAATGGCAAGCAGTAGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCG:1 + chr2L 17049535 5' + flea 137 2 61.39 CACAGCAAACGCGGATACTGAACGGCAGTCTCCACACTGCTCTCTCTCCCTCTTCGCTCTCTCTCTCTCT:1 - chr2R 12453329 5' - 1360 106 1 48.57 GGTGGGTGGTGATAGAGGGGACGGACCATCTCGTTGGCAGGCAATTTTAGGCATTATCTCTCATCAACCATTCGCCACTCTATCGCAAAATCATATCCAGC:1 + chrX 11005341 5' + G5A 262 1 64.36 ACCGATCATCTGGCCTATTGTTTTGGAGTGACTTTTTTTTATTATGCCATCAACAATAAAAACAAGCCACCGAGAACAAAAACAAGAAACGAAACAACAAA:1 + chr2L 3583961 5' + TART-C 184 2 62.38 GTAAACAAAATCCTAGTATCAAAATTTACTACAACGAAATTGAAAGTGGCTTAGTTCGAAAAGCCGAAGTGTGTAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAG:1 + chr2L 6339892 5' - roo 8643 1 74.26 TCTGATATATATTTTACTTTCATTAATTATTTAGTATACTTATTAAGTCATTTGACTTTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGATGTCGGAGG:1 - chr2L 1590363 5' - G5A 2673 1 46.53 AATATTAGTATAAAGCACATTTAAAAAGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTCAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr3R 26404529 5' - 412 7498 2 70.30 TTATAAATGCAATAAAATACTTTTCAAGCGAAACTCATAAATTTCCAAAAGCATTCGTACGTACAAACCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTC:1 + chr3R 30721004 5' + F-element 399 1 70.30 GGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTAC:1 - chr2R 4879036 5' + G-element 20 1 62.38 TAATATAAAGGGTATCTAATGATAAATCCTTAATTGAAATTTCGCGTTCGCATTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTAACTGATAGTCGGGGAACTCGACTGT:1 - chr4 1249318 5' + INE-1 564 1 66.34 TTTTGAGACCATTGATTCAATTAACGTAGATAACCAATATTTGTTCACCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAG:1 - chr3L 3120432 5' - Doc 4259 1 53.47 CGCATTTCTCCCTACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGACGCTGTCTTA:1 + chr3L 3773972 5' - blood 123 2 78.65 TTGCATCAAAGCCGATGAGCCGATTAGGAAAGGGAATGAATAGGAAAAACTGAATTGCATAGCACAGACGAAAAATGAAATTTCGCATTCACACTAGCTGA:1 - chr2R 1593256 5' + INE-1 529 1 78.22 TGCACCCAATTAATGAAAACGATAGAGAAAGGGGTCTTCTTAATGTCTTTGTCAGAATTTGGTAGATCGTCTAAATCGGCTAAAATGGCAAATCGGTTATC:1 - chr2L 7283782 5' - Fw2 134 1 71.29 TACAANTTTGGCATTTTATATTTTTTACGATTTCTTTTCGCCGCAGATATGTGCGCCATACTTACAAGTATTAATCTATGTTTTAAATTTGCGGGAGACAT:1 - chr2R 21794466 5' - TART-A 13247 1 65.35 GAGCCGTATTTGACTCCTCATTGTGTGATTCCCAAGTCGCCACTGGAAATGATGCGGGACTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGA:1 - chr3R 7510800 5' - ZAM 8099 2 60.40 CACAGTCCAAATTTGACCAGAGTGCGGTTGTTTACCAAAGTCGTCCCCTGGCGCAAAAGTCCGTATTTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 - chr3R 25814801 5' - 412 7543 2 75.25 TTTGCTCTCTAGGCAACTACGGCGCCCAATCGAAGCCCATTCAGATCTCTGTGAATCATCCGTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTT:1 + chr3R 10000166 5' - Transpac 315 1 66.34 CGCCGGGAGGAGTCGTCAACTTGGTTTCCCGACTAAGGTACTATATATACATATATATACATACATATATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCT:1 - chrX 12290723 5' + HMS-Beagle 6799 2 65.35 ACTCGTGAATAATGCGGTAATATCATCCACTTCAGTAAATATAAGAAACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGATGACGATTTTCGGGCCGAA:1 - 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chr2L 4831056 5' + Rt1a 5000 1 68.32 ACCATTAAGTGGTAGAGTAAAGGAATATACTAAACGTTGAGTACAGATCGCTGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTATAGTCCAAGTTCCGGGACATCATGCT:1 - chrX 392340 5' + GATE 8008 1 76.24 CGATATCGGGGTTGTTGAAAATCCGTTCGATGTCTCTTACTTGTGCAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTC:1 - chr4 1108211 5' - ZAM 7962 1 76.24 ATATATGTGTCGCCGACGTGCTTTGTTCTAATACGGGTTTTGTTTAAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTA:1 + chr3R 28015422 5' - R1A1-element 5209 1 57.43 AAGCTGACACAATCTAGTTAATCGCAAATTAGTAAATTTATGAATGCTGTTTTATTTGTCGAGTGCCTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3L 21840251 5' - 1360 3382 2 70.30 ATTAGAAATGTTAAAGTAACTACTTTGAATAAGTTTTGAAATCTGAACATAATCAATCTTATAATCAAAGGACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 11005553 5' + roo 8668 2 67.33 GGGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAG:1 + chrX 22726186 5' - Helena 1282 1 56.44 TTTTAATGTACAACACACGCAGTGGCATTCCCGCCTCCGTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAG:1 + chr3R 22935833 5' - Stalker4 6889 2 65.35 ATCGTCGTCATTGGCACAATTGTCTTTGCTTTGCCTTATCATCGCCGTTTGCTTTTAGAGATTGGATGGTCATTAGATGGACCATTAACTATATGTGGCGA:1 - chrX 20506074 5' + Copia1_DM 4053 1 62.38 GGACCGTTAGATAGATGTTGGATTTGCCCCCAAACCCAGACCGGCCACCCCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCT:1 + chr3L 13403807 5' + G2 46 1 75.25 CAGCTGCAAGGATATCTGTGTGTCAGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 24545616 5' - roo 358 2 75.25 AGGTTGCCCCAACCGGATACGTGGTCCGCTGCAACCTGTCGGACGACCTACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAA:1 + chr2R 7283175 5' + Doc 4444 1 52.48 AATGGGAAAAGGACACTCTGCGTCGGCATACAGCATTTTTATCATGCTCGCCTGCTACGAGACCGTTTCTGGTGGAGGTGGGTCATGGAGTACCTGCCTAC:1 - chrX 5143763 5' + aurora-element 3766 1 56.44 GAGGGTCTGTAAATGAAGTGTTATATTTTATGTGGCAATCCGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGGGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGG:1 - chrX 10574217 5' + R1A1-element 414 1 59.41 CCGCTTCCGCCCACCGGACACACACACACAAGCGCTATGCACCTGTCAGTTACTCTAAACACCAAACATTTTCTCACTTTGTTTATATTTGTTTATGGTTA:1 + chr2L 14841297 5' + Transib5 2642 1 70.30 ACGCCCTGGTCGTAAAACCTACACAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAG:1 + chr3L 6337526 5' + BS 4946 1 76.24 GGGAAGCACGAGGAACTGAGCTGGGCGAATCGAAGGTTTCTCCGTTGACACTTTTAATTTAGTAGTGGGGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAA:1 - chr2L 2306032 5' + transib2 421 1 72.28 GACCAATTGATTTTCATTCAAGAATATCCATTTATATGTCATCCGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTGAAGTCTATGAAC:1 + chr3R 30981588 5' - 1360 239 1 56.44 ATTTGAATATACACCATACACCATAACCATGTATATAGTCCTAGATAGTTTTTGACCATGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAA:1 - chr3L 15493030 5' + 1360 322 1 66.34 TTAAGCTTGTTCACGCCAGCGAAATACCCAGTTCAAGTCAAGCGGCCCGTTTTGTTCATCAAGTAAGAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCA:1 - chr3R 29859154 5' - accord 339 2 71.29 GAACACGCAATTTAAAACAGGCCTCACGCATCTCCCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGC:1 + chr3R 16955469 5' - R1A1-element 4954 1 66.00 CTTCGGTTGACAGTGGTGGACATTGAAATGCGACGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGC:1 - chrX 9741606 5' - diver2 4651 2 73.27 GATGGGAAGGTTGTACAACTGCTTTTGGATGGTTTCTCGAGACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATA:1 - chr4 814424 5' - hopper2 192 2 59.41 CCGTGCTGTGATGGGGCTCGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTA:1 + chrX 17138560 5' - I-element 4954 1 81.19 GCTGAGCTGGACCTCGCGCCTTGTGATTGTCATAAAAATGGAAAAATCGTAACATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTGG:1 - chr2L 16393756 5' + 17.6 493 1 58.42 AGTCTTAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 - chr2R 15002438 5' + 3S18 5786 2 51.49 CGCTGATAAACTATCTGCTGCGTTTTGGACTACCCGTTCTGCCCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATA:1 - chr3R 27060834 5' + accord 6921 2 58.42 AATTTCGCTGCGGGTTGCATTAGATTTTCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCAT:1 + chr2L 10197626 5' - 412 7147 2 71.72 CATGGGATCGTGCTACCAATGGCAAAATAGATGTAATAAACCAATATAGGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3R 9996439 5' - blood 7341 2 74.26 CATGCCCACCAAAAACAGCAGATGATTTTTCCATTTAATTTTTTTGTCAACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAA:1 + chr2L 7415252 5' + FB 138 1 64.36 AGGCAACCCAACCGCAAGATCTTTTAAACGAATGACTCCCTGTGTGTGTGTGGGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGC:1 - chrX 10555510 5' - 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chr2L 743722 5' + accord 37 2 71.29 GAATTCCCGAAGTTCCGGTCCGAGCTCCTGCCTTTCGGACCTGCTCCTCACCAGTCTCTAAAGCCGATGGTAGCTGGTGCAGAACCGAGAAGCAG:1 - chr2R 4929650 5' + G7 7 1 56.84 GGTGCTTAAGGAGTACACCGAACTTCAACGCAATCCCTACTCCTTGCAGGTTGGTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAG:1 + chrX 16315774 5' - accord 478 2 61.00 CTTTTCCCTGCTTCTCCTGAATCGAACTTCTTTTCCTGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTACTTAAAGAGCCACTAGAACCATGATCTTAAGGAAAGTG:1 - chr3L 25847061 5' + Gypsy12A_LTR 1932 1 63.37 GTTTATTTTACTATTATGCTGGAAGCATTCTCCAATGAATAAATATTTAATAGTACCCATATACGCGTTCTCGTCGCTTGTTTTTACTCTCACAAGCAAGC:1 - chr3R 23824519 5' + 1360 3250 1 57.43 GTTGGAAAAATGTCAAAATATAGCCCAACTTGTACTTACTTGATTTATTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGT:1 - chr3L 15872049 5' - F-element 301 1 60.40 CTTCTAATAGTGCGGTATTCGTATTTAGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGGCGTGATTACAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGATCT:1 - chrX 6866447 5' + 3S18 236 2 74.47 ATAGCACCCAGCTATACATACATACATATGTGTGTCACGGGTGGTTTGGTGTCTGAAGGGCGGGCTAAAGGGATATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAAC:1 - chr3R 18860422 5' - R1A1-element 5330 1 71.29 CTCGCCTATGAATATCCCATGAGCTCTCGCGCTTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCA:1 - chrX 1523778 5' + jockey 24 1 66.33 TGGTCTGATAGTTATTACTCATGTGAAGGATGCATAGTAATTAAACCAAAACCGTTGAATAGAATACACAATCCCCGACAACACACACACACACACACATA:1 + chr3R 19615621 5' + Quasimodo 38 4 68.32 ATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTG:1 + chr2L 22315576 5' + frogger 2310 2 64.36 GACCAGGAATCGCAGTGGGCAACCCAACGCCACTCGATGCCATTGCGCATGCCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAG:1 - chr3R 17604839 5' - Juan 165 1 56.44 CCAATTAGTGTCGTGAAGATTAAGGACAATATCTCAGGGGCAAAGATTGCCAAAAAAAAAGTGCTAAGAGAAGGTCGTTAATAAATAAGGTAAAAAGAAG:1 - chr3R 28814569 5' - Q-element 514 1 64.00 ATATGCCAATAGCACGACCACACTAAGCCAAATTTACAATGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 + chr3L 695576 5' + hopper 37 1 77.23 CCTTAAATCTCCTGCAGTGCACACCACAGCCATGGCAGTGGCACTCCAGCATCAGCTCAAATCCTTGGCTTATCCAGTATCCATGCGCGATCCACTCAAGA:1 + chr2R 22470614 5' + Quasimodo 413 2 58.42 CGCGGGTGGCTATAAATTCGAAATGAATTACAATGCACAGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACT:1 + chrX 8714582 5' + P-element 38 1 41.58 ATTGCCGCTAATAACCACTCGAAATTCGATAAACAAATATGATTTTGAATGTATATGTATACTGTTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAA:1 - chr2R 12352939 5' + transib2 186 1 72.28 GGTGGTAGGTGGCAGGTGCACCTGCAGTTTCAGGTGCGGCTTCCTGTTTTAGCGTTTCCCATTTGTTGCGGTGTCATTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGT:1 + chr2R 8829522 5' - Doc 346 1 74.26 CTTCATTTATAAAAAGACAACCACCAATTCTAGCATGTTGGTACGCCCAAGTTGGTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCC:1 + chr2L 22257096 5' - 1360 3350 1 75.25 TTGATTTGGGTTTCCATTTTGACTTGCAGGGGGTGGAAAAGTCAGTGCTCGCTTTTTAGACTTTACAAATTTAGGTGTACAAAAAATTACCTGCTGCCGAT:1 - chr2L 12689423 5' + hobo 2733 1 55.45 ATCAGCTTCTTGTCCCAATAATCGTTGGTGGTGTTGGCGCGCGCCTTCTTCATCACGTTGTCGATCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCC:1 - chr2R 20328402 5' - I-element 340 1 68.69 TCATAATCACCCCCTGCTCCTGTTTGCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCT:2 + chr2L 18930836 5' + micropia 113 1 78.22 GATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 22238672 5' + hobo 31 1 55.45 TCGGTCTGAATTCGTAAACATATGTACACATTTTTTTACGTACACATGTATGTACACATATTTAATATGCCAAAGGGTCAAAACCGCATACGCAGCTCAAG:1 - chr2R 3021009 5' + Quasimodo 6954 2 68.32 GAGCCCAGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3R 14832411 5' + blood 7052 2 62.00 GGGTTAAGTCCTGCTCCCGCTGTTTGAGCCCCAAATGGATCCCGGCTTTTGTGTTTTCAATTGAGGAACAGAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 25395693 5' + roo 8669 2 74.26 CATAGCAGCCTAGACCCATGTATGCCAACCAATTGCACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAG:1 - chr3L 13514767 5' - hobo 286 1 65.00 CAAGGATATCTGTGTGTCAGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 24545610 5' - roo 9016 2 81.19 CTTGATCTTTTGCTAATTTGAACTCTCTGGGTGTCGTCGCGTGTTTCGACACTCGAACATATACACAAAACACTTACACACACACAAACACAC:1 - chr3L 2926635 5' + accord 7100 4 59.14 GCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGACTCTAAAAAAATCATCGGAAAC:1 + chrX 10555415 5' + Tirant 34 2 51.00 CTTACNTGCATATAAAATTCTTGGATTAACCGATTGGAACATATTTTAACTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 - chr3L 16973472 5' - S-element 1708 2 69.31 GAACGAAACATAAAAACAATGCAATGATGAACGATAATGAGTCTTGAGTAAACCTTTCACGCCCACACTTTTAAACAATTTTTAATTTTTTTCTCATTTTA:1 - chr2R 7608131 5' + INE-1 472 1 56.44 TTTTAGTGGGTAGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGCAGGAGGACAAACATATAATGACATTTAAAAAACCCTTGAATGTTCTGCCAAAATGGTATCCAATG:1 + chr2L 21252402 5' + HB 453 1 61.39 CGCCCAGGGGGCGTGGCATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:2 - chr2R 21937549 5' + 412 29 2 51.49 TTAGCCTAAGTATACAGTTCATACATACACGAATAATTCATGCACACACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr2R 19079171 5' + 297 25 2 57.43 GACGCTTTTGATGCAGGAAAGCATGGAGGAGGACATCATTAGCCCTCTCAAAAACTTACAATTAAAGCCCAAAGTCATCGGACAAGTTCGAGAAGAAGAT:1 + chr3L 20802413 5' + jockey2 3153 1 72.00 TTCGCAATAACACTACAAAATGTAATTTAAATTCTCTTTATATTTCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2L 11576381 5' + roo 8693 2 59.00 AGAGCCAAGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGGTAGGGCAATCTGCGAACACAAT:1 - chr3L 17298608 5' + Gypsy12A_LTR 1967 1 78.22 CTTACATTTTATATTTATTTACTCTTTATTCTTCTGTATTTCGTGCGTATTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCA:1 - 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chrX 8081745 5' - G6 202 1 67.33 CATCCTTTAGTTTTATTCAGCTGCACCCTCGCATCCGCTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACAGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATAAGTACCCTT:1 - chr3L 912866 5' + Quasimodo 6976 2 65.00 TTTAAATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGA:1 - chr3L 87169 5' + jockey 15 1 53.12 GCGGGAAGCAAAGGGGCACGCACAATCCGGCAGGAAAGGCGCAAAGAAACCCTCTAATTGGGCCCGAGCCCTTCTGTAATGTTGGTTACCACAGAGTACGG:1 + chrX 1603056 5' + baggins 4959 1 68.32 ACATCTTTTTGACAAACTGCGAACCGAACCCCAATTCCCGCCCGTCGATCTCGTCTCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACCAAACATCCGTC:1 - chr2L 14298222 5' + Idefix 180 1 61.39 CGCACNTATTTGCTTTGTAATCATTAGCTGATAAGGCGACAAAACCAGTGTCGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2R 24614431 5' - hobo 2914 1 54.46 CGGGGCGACGGCGACGTTTGGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACTAGAGCCCCGGCGAAAAAATCGTGTG:1 + chr3L 19908886 5' - 1360 48 1 80.20 GAAAGCAGGACGAACAATTAATTTATTAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 - chrX 8547711 5' - hopper 153 1 55.56 CAAATGGAAATGTGGAAATGGGCCATTCTTTCTTCTTTCCATTCTTTTCATGTTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAAAACGCGTATAAGTGTGCG:1 - chr3L 8453052 5' - 1360 3222 1 47.52 ACTTATGTATTTGGAAGACAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGC:1 + chr3L 24764807 5' - 1360 3333 1 85.15 CCCCCCCACCGCAAACGCCCACTTTTTTGGGGTGCTGCAGCTAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2R 16928831 5' + blood 7018 2 71.29 AGATGCGGGCTCTAAAAACCATCAAATGCCAGACGGAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGA:1 + chr2L 2077706 5' - Circe 7231 2 64.36 ATATTNTCATATTTTTTTCCACGTGTAAAATCTAGAAGAAGATGGCAGAATCCAAGTTGAAAGAACTCTTAGGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 9653374 5' + roo 8668 2 74.26 TGATGATCCTGGTAAACAAATCAAATACAGTTGAGCTGCATTTTAATAGCAAAACATAGTAAAAAAATATATAGACGGACTGAGAACATATGAAAATAACT:1 + chrX 18513039 5' + G4 3624 1 60.40 TATAACTTGTGCCACTCTAACCCCAAGACACACGTTACAATAGCGTCGCTGAGTAACAGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATACCGATCGTTGTTGAAG:1 - chr2L 7629987 5' - Bica 4761 1 73.27 GTGGCTCTTCGTTGGGTTTATCCACCACATCTGCGTTGACTTCATTTCTTCGATCAGAAGTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACA:1 + chr3L 1944825 5' + 1360 3206 1 60.40 AAGACGACCTCCGAAATGAGACCAAAGGCCGAAGACGCACGAGCAGCAACCCCTTTATGGTCTTAAAACTGGACAACCACCCTAACCATCTGGCTATTAGA:1 - chrX 4567943 5' + G-element 4116 1 72.28 AATTATAACACAATATTTGTCATTCACAGGCAATTTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr3L 18957623 5' - copia 215 2 71.29 GTCATGGGGTTGGTTTGGATCTTAAAGGGCGTCGAAACAAACCTTGTGTAATAATTTAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACT:1 - chr2L 3273159 5' + gypsy5 388 2 69.31 TCAGCCAAAATGCCGAGCAGGACGAACAACAATGGCAACACAATCTGATGCCTGATGCCTTAAGTAAGAATACATTGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTT:1 + chr3R 31027615 5' + Stalker 286 4 71.29 TGGACGTAAGGTGAATGCTATGAAAATCCAACTGCAAGCTGCCATATTTGCATAGCATTCACCTTACGTCCATTAAGAGTTTATGAAAATGGATCGGAAT:1 + chr3R 29267617 5' + Circe 7060 1 79.00 TCTGTATATGTGTGCGTGTGTTTAGTGTTGTTACATTTAAATTAAATTTTAAACTAGGCAACAAATTGAATTTGTTGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGAC:1 + chr3R 21626892 5' + Rt1b 4910 1 74.26 TTAACTTTTCACATTCTTACTTCCACTATCAGATAGCCGGGAAACTCGACTATAGCACACTAGAACGCCCAGAACTGCCACGCCCACACTTTTGAACAATT:1 + chr2R 5246672 5' + INE-1 254 1 56.44 GGGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCG:1 - chr3R 5775750 5' - invader4 303 2 56.44 CCACGGCGAAGCAGTGGATGTGGCTGGGCTGGTTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGA:1 + chr2R 23997433 5' - jockey 4559 1 67.33 CAATGNTCTTGCGGCGAAAGAAATCGAATCGCTTATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 15384753 5' + 412 42 2 66.34 CAACCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACA:1 + chr2R 1751259 5' - R1A1-element 5306 1 78.00 ATATATGATGATGCATATGTTGACTGCTTCGCATTGATATTTTTGCTACCGCTGACGTACAAAATCGCGA:1 - chr3L 25978333 5' + invader4 284 2 75.71 GCATTATCCTTGGGTTTTACTATTCAAATATTGTTAGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATC:1 - chr3L 5257436 5' - HMS-Beagle 6815 2 64.36 ACAAGACAACCACCCCAGCTGGACCTTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGT:1 + chr2L 22209052 5' - hobo 80 1 75.25 CTCTCTGCCGGCGAATGATGAACGAGCGCTCCATTAGATTTAATTTACTCAACAAGAGAGAATGCGATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATATCCGTTAC:1 + chr3R 14856186 5' - INE-1 551 1 53.47 ACACCTGTCGGAGTCCTCGGCTTCACACTGCACCACTATTTTGGCCAACATCACTCTGGCCTGACACTTTTCGCCACAGACTCGACCAAATAAAAATAAT:1 - chr3R 15140918 5' + I-element 4921 1 80.00 AGCTTAGATATATCTAGAGGTCTTTTAGAATTTGTATTCCAAATTTCCTATAAAGTATATATATTCTTAATCAGACTCAATAGCCGAGTCGGTCTGGCCAT:1 - chr2R 8370085 5' + INE-1 103 1 57.43 CAGATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 - chrX 9260648 5' + 3S18 53 2 73.27 GCTCAGGGCCACCGAAGTGGAAGTTTCTACTTCATCGTTCCCGGCTAGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGTTGGAAGGAGGAGCCCTCATGGACTACACTGAT:1 - chr2R 19215245 5' + Rt1b 4919 1 76.24 TAAGGTGAAAGATCGAGCCCTCATCATGCAATCCCCGGTGGAGTTGCCAATGGATTGCAACACAAAGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTCTATAAATC:1 - chr2R 8055924 5' + Ivk 4961 1 68.32 AAAAGCCGACGATTAAGGGTGATCGCTACCTGAGGAGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGATCGCAATCAAAAATGCTCAGAAAA:1 + chr3L 27365807 5' + Porto1 4334 1 64.36 AAATTTGATGACAGCGTCGCCGGTGACAATGAAAAGTAAGCGAACTACAAAGCCAACAGGGCTCTTTTAATCAAAGCCATACTTTCTCCAACGTGGAATTA:1 - chr3L 7490273 5' + G5 4370 1 59.41 TCCAGGCAGATTATCGATGACAAAATATACAAAATAATTGTTTTTATCGCGAATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chrX 3485614 5' + P-element 6 2 73.27 TATATTAGGTATGTGTTAATTAGTGTTGGTGCGTCAGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGG:1 + chrX 820349 5' - 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roo 387 2 57.43 ACCCCTCGTACCGACTGAGTCCCCCTTACTTCCCACGTACATGGTGAACCCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATA:1 - chr3L 8513359 5' + Doc 482 1 50.50 TTTTTGGTAGGTAGTAAAAAATATAAACAATTGATTCTGAAAGCAAAAAACACATAAAAAACAAGATATTCATTTGCAGCACCTTTGTAGATCATTCATAT:1 + chr3L 14399776 5' + Q-element 178 2 67.33 TGAAGATTGAGTGGGAACTGCGGGGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2R 18865909 5' - roo 9039 1 59.41 AGAGGCAGTCATGAGAGTAAGAGTTCGAGCTATTTTGGCTTCTGATCGTGCGGAGAAAAAGCTTCTGATTTTAATTGTTTTACGTTTTTCTTGGATTCAAG:1 + chr2R 22115233 5' - Idefix 353 2 60.40 CCTTGTTCTAAACATATTGTAAAATGTTTTTAAGATAATTTTTATTTTTTAGTCCAGCGTTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:2 - chr3L 21840360 5' - 1360 3374 1 62.38 GCCCAAATTTTGAATCAAGGCACAACTATCAAAGGCTATTACCTTAAAATGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTTCTTGCTCT:1 - chr3R 16068265 5' + F-element 4220 1 47.52 TAACGCCACGAGTGCTCGCATGTGGTTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3L 22324116 5' + hobo 12 1 65.00 ACATGATTCAGCGGCTATTTATAAACGACGATCAGAATAATCTCCAAACTCAAACGAATGAGCAAAAAGCGATCTTGAAGTGAAGGGCATATTTTGTCAAA:1 + chr3L 1379811 5' - 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F-element 384 1 62.00 CGATAGATACACACCAGAGAATTTTGTACTATCAGTGTTGAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3L 19051907 5' - roo 9037 1 56.44 GTTCGGCGTGGCCCGTTCATCCGAGGCAACCATGGATATTTTCCTGTCCAAGTGGTAAGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGC:1 + chr3R 29168375 5' - Ivk 5031 1 60.40 GTAGATAAATGCGTGTAAGAGAGGAAGTGAGGCTTCATGCATATTGAAACAAAGTGAGTGCTCGCATTGCGTATACGCAGCGTAGTCGCTGTTTACTTCTT:1 + chrX 4865638 5' + micropia 4983 2 82.18 GGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 9823619 5' + hobo 19 1 62.38 CATCTTTAACCAAAATTGAGAAGACATCAAAATTCAGAAGTATTTAGCCAAACGGTTGGCTATGTACTCCCGGTTGCTGATGCTGTTGCTGCTGCTGGTG:1 - chr3L 12442767 5' - TART-B 152 2 54.00 GCCGANATAAACGCGCATTTTGCTATGTAACTACAAACTAATAAACTGAAATGCACTCTAGAATTATTGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGAT:1 + chrX 7968200 5' - 17.6 7188 2 70.30 AAAAACCTCGCTCCTTTGTGCCCAACTGAGCATGAAAAGGCCAACATCCGTTGCGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGGTCTTG:1 - chr3R 31001538 5' + F-element 4216 1 57.43 AGGGCGGCATCGATTACATCTAGATCCCGAAAATATTCTCATTTGAATTCATTACCTTAGCGAGGCTGGCAAATAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTTA:1 + chr2L 8818716 5' - 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Tirant 8465 2 68.37 TTCACACACAAGATAAAAATCGCAGCAACTACGTGAGCTTGACGTCGCCATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTT:1 + chr3R 9380015 5' - flea 481 1 58.42 ATGTATGCAAAATTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACA:1 + chr3L 3244199 5' + P-element 2738 1 26.73 GACGCAGGACGCTCCTTCTGTCTGCATTTAATTGAATTTAATTCACTGATTGTGTGTGAGAGTCCTGGATGCGCCATCATGTGTGTGTGTAGGTTTATGTG:1 + chrX 11649502 5' - accord 7093 4 56.44 TAATAATTAATGCAAATAAACACACAAAACGACAAAAAACGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTGCAACAGTGTAGGCGGAAACAGCGCAGCAAAA:1 + chr3L 1154042 5' + gypsy5 7108 2 60.40 GTGATATGTGGAAAGCTGTTTTGCTTGTTGAGCGCCCGGGCGTTCCTGTAGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGAT:1 - chr3R 18817360 5' - I-element 88 1 54.46 GTGATTGGAAGGTGTCAACAACTTTGTTCTCATCTCAATGAAAACTTTTCGAAAAATCTTTGCTGTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGT:1 + chr3L 7065064 5' - BS 4789 1 67.33 AAAGCAACTTAAGTGGGCGTAAGGGCTACGAGCAAAACCATGAATTACATAATAGAATGGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGA:1 + chr3R 26654261 5' + Porto1 4259 1 64.36 TCAGGACAATTTAAGTAGCGACAGGAATTCTCCTAAACAATTAGTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 14396251 5' - Doc2-element 232 1 43.55 CATAAAGGTATGTACATACATATATGCGGAAACAGTGGGGCGAGCAAAATAACAAAAAAAAAGGCAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 10677492 5' + G2 3067 1 59.49 ATTCCCTGCTCAATCAGTGACAAATATTAATGCCGTAAACAAATTCACGTCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAAC:1 - chr2L 14373625 5' - Quasimodo 7250 2 62.38 CGAATAAAGTTCCCTTCACTTTCATTGCCTCGGCATAAAAAGATGAAAGACACAACGCCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGCAAATGGGGGACGTCAC:1 + chr3R 9829062 5' + mariner2 751 1 58.42 GGTCCGGCAACTATTCATGTGTAAATTTCAACAAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGT:1 - chr2R 20455288 5' - Burdock 297 1 67.33 CATAAAGTATACATATTCTTGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCCCATAAACGCCTAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGA:1 + chr4 897244 5' + INE-1 153 1 74.42 GGGGGAATCGGGCGGGTCAACACTATCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCC:1 - chr2R 11611591 5' + Circe 7163 1 75.25 GGTTACGTTGCCTTATCGAAATACACACAGAAAACTGGGGGGAGTGGTAACAGCGTTTAAAGTAAATTTCTCGGCCAGAGTTTGGCAATTTTATTACTCTA:1 - chr3R 10620536 5' - frogger 2435 1 59.41 AAATTGGTCATATTTATATTGTTTTTTTTTTTGAGGGCATGCGTAGAAGGGTGAATGGGTCTTGGGAGGGCTTGAGCGTTTCCGCAGAAA:1 + chrX 23155490 5' - Doc4-element 86 1 70.00 TGATTCCTGATAATCCTGTACTTATCCGTGCATTTGAATTAAACAAAAAGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAAC:1 - chrX 6223247 5' - R1A1-element 5015 1 52.53 GTACATGGAGCCAATAGAAAGATAGACAGAAAGTGAAATCATTTTTTCTATTGTGTTTTTTGAAATCCCGTGTTTATGTGAACCGTCCAAGAACCCTAGAA:1 + chr3L 18024915 5' + mariner2 634 1 60.40 CGTGCATAAATTCATTTTGGGTACATTGAGATGTGCTTATTAGAGAACACACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAA:1 + chrX 19766727 5' + 412 265 2 59.41 GATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 + chr2L 22689963 5' - Tabor 7285 2 66.34 TGCGTGATGTGGTCAAACAAATGGAGAAATTCTAATTAAAACTCCGTCAAAGATACATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 - chr2L 6605640 5' - blood 358 2 59.41 AGAGCGAAACCAATTTGTGCTCATTGGGGAGCAAAATTCATGGCGCTTAGCATTTGAATTATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3L 5209724 5' + 412 7070 2 59.41 AGGGAGAGATGACAAACACAATGCAGAAGGGAGAATGGAGACGACCACAAAATGCACTGAAGGACAATTGAGTGCAAAAATGGGCAAAAGCTATTACTTTA:1 + chr2L 14718835 5' - 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X-element 403 1 68.32 GCCGTGACAAATATTTTTCTTCATGTTCTCTTCTTTTCGTCTTTTCTCAAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTTCCGAATGTATTAATTTGCAT:1 + chr3R 9121978 5' + Gypsy12A_LTR 2051 1 59.41 ACTTCAACCGCCTCATCAATACAAACACCAAAACCCACCCACCGAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTACCAA:1 - chr3L 21912979 5' - Bari1 1330 1 56.44 GTATTCTTTCTGTCTGCTGAGGAATTTTAATGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCT:1 + chr3L 21660875 5' - transib2 2467 1 70.30 CTCACTTAGTTAGTCGAGCATGGCCAAAAAGCCCGAGTTGCCAATTGCCAATTAGAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAC:1 + chrX 17580428 5' + I-element 88 1 65.35 CCCGAGAAAGACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGT:1 - chr2R 22774525 5' + BS 8 1 64.36 TACCGGGGTAGGAGTCCACATGCCAGCCGGCTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAA:1 - chr3L 21353599 5' + Idefix 304 2 69.00 GAATTCGGGAACTAAAATACTGCAAATTTTAAATTAGACCTGTGTTTGATCGAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCT:1 - 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chr3L 3947386 5' - roo 9028 1 71.29 CAGTCGGAACATTTAGACGGCAAAGTTAAGCGCTCGTAGCGGCAGAGGAGTCGCAGCCAGCGACAGTGGCGTCGCAGTCAGCGACATAGAGGGACGCAGCC:1 - chr3R 30888195 5' + aurora-element 281 1 69.31 TTTTGGAACTCACGTAATTTGTGGGCGGCGCCTACGTTTTTGGAATCTGCGTGCCTAATCTCAACATTCTAGCTTTTAAAGCTGAGATCTCGACGTTCATA:1 + chr3L 10224847 5' - INE-1 138 1 73.27 ACTGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCG:1 + chr2R 4577072 5' - Chouto 493 1 54.46 GAGTCCGTGCACATTCGCGATTGGAACAGGTGCCGTGGAGTGGTTCACTGTAGTGCAGTGCCCGAGTCCGAAGTGTTTTCAAAGAAAACCCGATTACGAGA:1 + chr3R 21404437 5' - gypsy10 431 1 58.42 TTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3R 9996396 5' + blood 42 2 63.37 CTTGGGCATGGGCATGGAATATTCACATCTATCTTCTTGATCAGGAATAGCTGAGTCGATCTGGCCATGGCCGCCTGTCCGTATAAACGTCGAGATCTCAG:1 - chr4 200411 5' + INE-1 136 1 67.33 ACATAAAGGAGACCCATTGATCACCGTAATGAAGAGGCCGACGATTCCCTAAAGGCAGTAGCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr2R 3171064 5' - 1360 3374 1 52.00 TATAGTTGGAATGAAACAGCAGCAGAATGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCAGTAGAATGTTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTG:1 + chrX 2852661 5' - gypsy4 6647 2 84.16 AATACAATAGAAGTTATATGTAATAGTTGCAACTTATAATGTAGCTGAATGGTGAACTTGTTTTTTTGAATTTGGGAACGGGGAGCTTGAGAGATACGCTC:1 + chr2R 8830284 5' - Doc3-element 436 1 61.39 CCTTCCCCTTTTGCAACATGCAATCATGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTAC:1 + chr2L 18344364 5' - R1A1-element 5034 1 57.14 TGTGTGGTAAGCGTTGGAACTGAAACACCAATACCTGGTAGTTCCTTAAGGAAATAATTCAATTAAAACCTTTTTAATGCAACTCCTTTTTTCAAAATTTG:1 - chr4 1165093 5' - Tc1 283 1 52.48 TGATCGTGGGCGTGCTGCTGTAAGGCGGATGGCTGGAGTTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAAA:1 + chr3R 5681359 5' + Stalker 7103 4 61.39 CCACAGTAACATTTTCCTTTTGTACCATTTAAAACTTACATAGCTTTAACAACAGTCTTAAGAACACTAACTGAGTTAAGGGTATCTGATAGTCGAGAAAC:1 + chr4 669451 5' + INE-1 556 1 69.31 ATCAGCGAGTGGGTGAACCCATAGCGGAAGTTTGGATCGTCTCTAGAATCTGTATGCAGAATCTCAACCTCCTAGCCTTTATAGTTCCTGAGATCCCGACG:1 + chr2L 120830 5' - INE-1 144 1 61.39 TAAGACACCCAGAGCCACAAGGAGTCGGGCAGCAACCACATCATTTGCTATAAATTTACTTCATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1 - chr2L 12237112 5' - jockey 4980 1 63.37 GGACTCTCTCGGGGTTGCCACCTCCTATCTAGCAGGGTTGCTGCACGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGAT:1 - chr3R 23240097 5' - G6 1780 1 54.46 TTCAAAAAGGGCTAAATTCCGAATTAAATTGCTCAATTATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2R 22781039 5' + roo 8701 2 65.35 GCTTAATTGCAATAAAATACTTGCTCCACTGTGCGGTGCGGCAAATGTCAATGGCTTTCAGCACAAGAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 20998320 5' + G2 3078 114 58.62 AGTGGTCGATTCGTGGGTGGAGGACGAGGAGCGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGTGCCGTGGAGGAGCTTTGAGACAAGCATTGGCCGCTTACA:1 - chr2R 7363070 5' - Max-element 38 2 74.26 CTTAGAACAATACTTTTCGTAAACAAGGGTGCAACTGTAGGTGTACTGTTTGTAGGGGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATCACTCA:1 - chr3R 6259639 5' - baggins 5383 1 64.36 TGGATTCCTGCTTTTTCGAAGAAGTTTCCTATAAGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAA:1 - chr3L 20530016 5' - invader4 2664 1 66.34 TGTTAATTATTTAATTGTGGCGCTTACATCGCAGAGCCAAAAAACCAATTATACTATTTTACAAAATAATACAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTT:1 + chr2R 15002331 5' - 3S18 6101 2 63.37 CTCTGAACTTTGTGTCCCGACGATTGCCCCGGCCAGTGGTGCAGAAAGGGACTACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAA:1 + chr2R 15636100 5' + Gypsy12A_LTR 1953 1 63.37 ATAAAACCAACAGCCGTTCGTTATGTTTCTTTATTATTTTCGTGTGTTGTGCATTGCACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGATACACGACAC:1 + chr3L 18788376 5' - Stalker2 7248 1 60.40 TTTGTGGCCAATACAAATGAGCATACGGCAGGCCATTTACCAAAAAGCAGCCGCTCCCCCAAGCACACCCACAAACTCTTGAAGTCGTATCTCTACAACA:1 + chr3R 11525858 5' + Fw3 2794 1 66.00 TTTTATAGAGAGCAATTTCCATTGGATTTTTATTCTTTTTAATTTGCGCGCCATTTTTTGCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTT:1 + chrX 12348940 5' - I-element 426 1 69.31 TGTCGCTCTTAATCTACTGTGGAGGTCGTTCTCGCTTGAGTAGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCGCTTTGGTCAGCTTGGTGG:1 + chr3R 23788669 5' - G-element 347 1 65.35 TTTGACTGTGTGTGGCATTTATGGCTTTTTTCTCTGTTGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAG:1 + chr3L 15186588 5' - Doc 4544 1 62.38 AAGGTGGGAAGGTGCGGCATTATAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGA:1 + chr2L 20898630 5' - FB 620 3 77.23 ACAGAAGAGGGAGACGGGCAGATTGATGGGTTAAGGATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGG:1 + chr3L 22323488 5' + hobo 2615 1 62.89 AATTGATTATTTTTGTATGCAAAGAACTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr3R 14913203 5' - blood 7340 1 73.27 TAACAATTGTTTAAACAGCAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 + chr3R 6216824 5' + pogo 52 1 84.16 TCGTGTTTGCCTAAAAGTATTAAGTTTACTGTTTTGTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATC:1 - chr3R 29411404 5' + pogo 208 1 70.00 ACGGTAAGCACTTCCACACACACATACACACACACACACATAT:1 - chr3L 18970127 5' + Quasimodo 35 2 74.42 TGTTGAAGCATTACTTGCCTCGTTCATCCATTTAATCCGCTCCCCGTCCGTCGGCGAAAAAGTGGCTGCATAGTGGCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCA:1 + chr2R 6546194 5' + 1360 3366 1 62.38 AAAGGGGCGTGTCTCTGCAGCTGGCATGAGCTTATGTAATTAATTTTCAATTTTCCACTGTCCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTA:1 - chrX 6961557 5' - Cr1a 371 1 57.43 GCCGCCAACGCAAAACTTTCGCCGCCTCCAATCTCCAAGAAAAAAGTTCCAGGGTCCTCGTAAGCAAAATAATGGACCTGATTGGGAAAGACAGTTTCCAC:1 + chr2L 8926763 5' + Fw2 271 1 63.37 TATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGTGTGCATATTGTGTATTTAGGTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chrX 21994026 5' + 297 6600 2 58.42 GCAGCTTAACCTAAAGGAGAGACTATTTTAGCAGGAAAAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATCGATAA:1 + chr2L 18646253 5' + 1731 435 1 65.35 GCAAGATCTTTTAAACGAATGACTCCCTGTGTGTGTGTGGGCGTCTGCTCAGTATCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 - chrX 10555497 5' - Tirant 380 2 60.40 CTTCTAGCTTTGTTTTGCTGTCTCATTTCGATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAA:1 + chr3R 9137232 5' - P-element 114 1 37.50 AGCATATGCCCACTCTTCTTACTCGGGATGCTTTCGCTGCGTAGATACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGAT:1 - chrX 18972745 5' - Doc2-element 4414 1 75.25 GAAATCTTTGTTATGTTGATATGATCTGCACGGAGGGGCAAAGTTAAATATTGCAGTGGCGTAATTTAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTT:1 + chr4 523941 5' - I-element 5125 1 66.34 GGAGTGCATTGAGTGTCATTTTATTTTGTGTTTTATTCCCAGATTTCTGTGGGATCTTTCTTTGGAGCCCCGTTCGTTCTGGCGCTCCACTAGTGGTTTAT:1 + chr3L 16757036 5' - Juan 195 1 71.29 GCTTTGGCAACATGTCGTATGATTGATTTGGGGCTACGTGTTTGTAAGTAGCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCAAGTTAACAACTAACAATGTA:1 - chr3L 4835824 5' + gypsy 6986 1 43.56 ATCTATAGATCATCTTGTCAATATTGGAAAGGAGCATCATACATATGCATATATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATC:1 + chrX 19885158 5' - HMS-Beagle 229 2 62.38 AAAGCGTTGCCTTTGTTTCAAACCAGAACCGGAAATCAAAAAAAGCAACAATCAGCCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAA:1 + chrX 15161537 5' - FB 92 1 59.41 TAGGCTTATGGTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAA:1 + chr3R 5775679 5' + invader4 40 2 66.34 AAATTTAGATAATTCCGAAATATATATTCCATGCGCCTTTCAATTTTGTTTTTTACTGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCAC:1 + chr2L 9346139 5' - Doc 319 1 62.38 CGCAAAATGTCAAGGCCTTCGGCTCGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTT:1 - chr3R 23550482 5' - Tirant 38 2 64.79 GATTATCGATGACAAAATATACAAAATAATTGTTTTTATCGCGAATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chrX 3485622 5' + P-element 14 1 65.35 AAATTGAGAAGAACGCGTAGAGTAACGATTATCCTTATTAGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTCACACGCCGCA:1 - chr3L 3252980 5' - 1360 428 1 60.40 GTTCGACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:2 + chr2R 18891022 5' - opus 7495 2 65.35 TTTAAAGTGTAAAACTATCATAACGAGCGCCAAGTTTTACGTTAAGTGAAAGGATTTTTTCCGACTAAATAAAGTATATATGTATATTCTTAAGCAGGATC:1 + chrX 3671880 5' + INE-1 80 1 61.39 AATTTGTTTAGGCAAAATTGCTTACGTCAGGGTTTAAGATTTGTTTTCAAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCG:1 - 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chr3L 25341887 5' + 297 44 2 74.26 AGGGAAATATATATGGGTCAATCGATATACACCGACAACAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAATGAAGTATAAC:1 + chr3L 14408862 5' + Doc 4456 1 56.67 ATGCTGCAGCAAACAATAGCTGGAGAAGATTTGCAGAGTATTTACTGCGGAACGCCGGCTTTGATCAAGGACAATGATGCGACCCGTCTCTAAACTTGCAG:1 + chr2R 14274229 5' + aurora-element 3984 1 67.33 TGAATATCCCATGAGCTCTCGCGCTTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 1523770 5' + jockey 35 1 56.44 TTCCAGCGGTCTGGGTAAGTCAGAGTTGGCGTTTCAATCTTCTTCTCGTTATTCTCCGATGGCTTTGGGCTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAGACTATTC:1 + chr2L 13488782 5' - jockey2 3110 1 74.26 TACGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chrX 10555412 5' + Tirant 8139 2 54.46 ATTCGAGATGTGTCCATGTCGTTTGGCTAATTAGGCACACAACACACACACACACACACACACATTG:1 - chr2R 10010321 5' + accord 7031 2 77.61 GGGTTTAGTTTTGGTCCGAAAAGGATGATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 63031 5' + roo 8689 2 54.46 TTAGTAAATTCAGCTGGGCACCTGTTGAGTGGGCGTGGTAATATTTCAACAAACTTGCGCTGGTTCTGTCTCTAGAATATGTATGCTTAATATAAACCTTC:1 - chrX 304992 5' - INE-1 173 1 74.26 TCTGATCTGAGCCTGATCTTGTAAGCCTGCTGATATAAATAAATTTTTTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 5875810 5' + jockey2 3406 1 70.00 AGCAGTCTCCTGGTAGCACCCGCTGCCAAAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGAC:1 - chr2R 5736449 5' + F-element 472 1 71.29 GGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTC:1 - chr2R 4879008 5' + G-element 48 1 69.31 AACCAGTTCTATTTGTGTCCTTATTGCTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3L 14365006 5' - blood 7339 1 74.26 TATTATCGTTAATTTTTGGTGGCAGGCAAATATTAGTTTATTACCTGCCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 23431473 5' - roo 9043 1 59.41 TTAGTGTGATGGGGTCAAAGTTCGATGCGATTCGGATAGGTTCGTGTAGTCATAAGGATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAG:1 - chrX 1645528 5' - Doc3-element 356 1 60.40 TTTTACTTTTTTTTTCCACTATGCATGCGCCAAGTGAAAAGTTTTCAACGAGCCGTAATTTAAGCTACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCC:1 - chr2R 21461066 5' + I-element 5113 1 72.28 AGCAGCTGTCGAAGCAAGGTGGAAATTATTTGTCCAATGTGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGT:1 - chr3R 11422678 5' - 17.6 60 1 64.36 CATTCCTCGGACACGAATTTCGGAATCGAGTGGGGAGCATGCCAGCGTTTCGGTATCTGTGTACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr2L 9100732 5' - hobo 2925 1 50.50 AAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCG:1 + chrX 15019098 5' + accord 157 2 79.21 CTTTTCATTGGCCCTGTCTATTTTTGGAGATTTTTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 27448547 5' + roo 42 2 70.30 TACCCTAGGTATCCGCTTTTTTCCACGCCACGAATTGTTGCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCGATTGGCGGG:1 - chr4 396997 5' - diver2 4738 2 56.99 CTAAACTACAATTAATTTCAGATGCGCTCAGCTCGTCGCAGGGCGAAGCGAATACACACACTCTCACTCACAGTCAGGCACACACACACACACACACTTTC:1 + chr2L 5000361 5' + accord 185 2 59.41 CAGATCGTAGTAGGCTTGCTTGACGCCCAGCAGCTCTGGCAGATCCATCACCAAACTGCCGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAG:1 - chr3R 17683339 5' + gypsy4 446 1 70.30 GAGCCAAATCTGCCAGAGATCGATGAGGAGCCCTTGTACAAAGGTAGGATTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCACCTGCGCAGTATGCATTC:1 - chr3L 6747880 5' + 17.6 144 2 59.41 GGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr3L 5827924 5' - blood 351 2 70.42 GGTATCGTGTTAATATCAGTTGGAATCATAGGCATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATCACTTTCTTACAAATTAGCAATGGCATAAGTATT:1 - chr3R 4190878 5' - Tc1-2 1441 1 68.32 GTTTTTCGCATTCGACTGACAGGATGAGCAGGAGCAGGAGCCGGAGCAGGAGCAGGAGCAGGAATGAGGATGGGTGGCGAAGGATATGTGGGTGTTAATAT:1 + chr2L 10045436 5' - transib4 2407 1 66.34 ATTAATGAGCCCCCAAACGAAAAACCTCAGTAAATACGGGCAAAATAAATTTATAAATAGGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAATTTCACCATTCATC:1 - chr2L 17005903 5' + I-element 291 1 66.34 GGATGTGGAGAACTGGGAAACTAGTTCGCAACTACTCGGTAGCATGGCCCATTGTATTAATCACTGGGCATTGCTGATTCAGAGGTGCTTTGAATTGCGAA:1 - chrX 17470836 5' + transib4 174 1 73.27 ACACGACCAAGCACAGGACGCCCAGCAATGTAACTCCGCAGTATAGGGATCCTCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATG:1 + chr3L 336604 5' - accord 450 2 63.37 GAAACTGCTCGGTGATTGCTATATGTTAGCAGTGAAATCCGCACCAAATAGGGAAAATTTGGTTTCTCCCACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 23343845 5' + roo 8670 2 67.33 TGGTTAACAACAATTCAAAATGACACACGTTTGTTTGCTTAAATACATTTAAATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAA:1 - chr3L 16045919 5' + Bari1 352 1 72.28 ATCAAGCGATCTTTGTTTATGTAATGTAATACTACTAGTTCCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTA:1 + chr2R 19471840 5' + invader4 2638 1 59.41 AAGGAGGAATGGGCCAGGGGTTTAAGAGTAGCAAACAGCCGGAGTGGCAGCTTCACTGCGAGTTTAACGGGGTTTGCTCTGTTCTACATAGTCTCGGT:1 - chr3R 24022688 5' + invader6 157 2 62.24 TAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3L 22564826 5' + blood 39 2 68.32 AAACTTGCATCCGAAATGTTGCAGTTATGCCAGTTGGCGTTTAAAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGAATCGAGACCGAGTC:1 - chr2L 1417147 5' - Stalker 418 1 73.00 GTTCAGGCGGCAGCAACAAGCATGGCAAATCAATAAGTTTATGCAACAGTAGGCGATGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATT:1 - chr3L 7554310 5' - 1360 3150 1 56.44 GCAATGACAATTGAATGGGCAAAGTTGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGC:1 + chr2R 18328725 5' - F-element 267 1 74.26 TTTTTTGGTTATATTTTGTGTTCAAATTAGTTGGTGCGTAAAGTTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chrX 8179100 5' - pogo 2071 1 58.42 CCATTAGTTGAATTCTTTTTTTTATTTAGTTTTAGCAAACTACTACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCGCTTTTGCAGCAAGTTCCCAAAA:1 - chr3L 21986494 5' - Tc1 171 1 64.36 TGATATTCAAGCGCAAAATCTCTGCGGCCCACATGGAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAATGTG:1 + chr2L 16629133 5' - INE-1 539 1 59.41 AATACACAAAACCCAGTGCGAGTCGAGTGTCGGTTTAATCAAGCAGCAGACCGCGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAATAAGCTGTGTCTGCTTCACC:1 + chrX 13509006 5' + diver2 4469 1 57.43 CAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACATTTAGTTGC:1 - chr3L 11696443 5' + blood 41 2 63.37 GTGCAAGAACCGTTTGAGAGGAAACAGAACAGAATCGAAAGGAGCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCGCGTCAT:1 - chr3L 18552431 5' + Stalker3T 229 1 56.44 AATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:2 + chr3R 19450157 5' + roo 26 2 78.22 CGTCAGGTGGCCGCGGTCTTGTGGTCATCATTCTTCGCCTTTGCTTCGCGAGGACGATCAGGATTTGCTTACTCGTAGACCCTCCTGGCTCTCTCGGCTCT:1 - chrX 18140478 5' - Rt1c 5275 1 60.40 GCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGG:1 - chr2L 21403529 5' + G5 4426 1 70.30 CTTTCCTGCTGTTTTCCCGCCTGTCAAAAAGTTGCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCT:1 + chrX 8915161 5' - hobo 412 1 66.34 CCAAAATCATTTTCGTACACAAACAAGCTATCGCCTCGAGCTGATGAGACAAATATACAAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGC:1 - chr2R 16758835 5' + Stalker4 124 4 63.83 CAGACTCGAGCCGCCGCAGCGGCTGCGCAGAAAACCACGCCCAAAAAAGGCGGCAAAAATCCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCC:1 - chr2L 4879980 5' + F-element 4490 1 67.33 ATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTC:1 - chrX 22689427 5' + mariner2 38 1 59.41 AATGCGAAAGGGTTTAATGTGTATCGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2R 4784757 5' + 1360 48 1 78.22 TAAAAAAGGCTTTAATTGCATAATTAAATTTACTGGCTGTACAATTTTCCATAAGAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTG:1 + chr3R 7770847 5' + X-element 26 1 55.45 TGGCCACTGGCATTGAAATTGGCCAACTGCCTGCTCCCTGCTGCCTGCTGCCGAGTGACTGGGTTTTGGTTACAGCTTGAGTGGATGCGCGATATCGAGAA:1 - chr3R 18505950 5' - Tom1 94 1 56.44 GTATGTGTATTTATGTGTATATGTACATGTATGCGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:2 + chr3L 17858137 5' + HMS-Beagle2 4 2 75.25 TCGCTTTATAGTCCGAGATATCGCTACATATATCGTCGAATATAGTTTGTCGGTTGGCCTCTACGTTCATACGTGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCG:1 + chrX 6781714 5' - INE-1 108 1 66.34 ATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCC:1 + chrX 21772492 5' - gypsy3 6549 1 66.00 TGACAAAATATACAAAATAATTGTTTTTATCGCGAATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chrX 3485631 5' + P-element 23 1 56.44 ATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTT:1 + chr3L 27356076 5' - Tc3 1686 1 62.38 CATAAATCAGTCTGTCTCCCTTTCTGGTTGAAAGAAACTCTGCCACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACA:1 - chr2L 18632246 5' + Tirant 8472 2 55.45 CATGATTTCCAGTTTCGAGATGAGTAGATGGCTTACAAAGTACCAAGGGGATAACATGCCAGCGGTTTATCTTACAAGCTGAGAAATTTGGAAAATCAAAA:1 - chrX 6409025 5' + Bari2 398 1 51.49 GGCGGTATATCATTTTGCTGCTCAGTGATGATTCGAAAGGATACGGTTGTTTCAGTTGGGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTCGAGAATATGG:1 - chr2L 16968588 5' - Ivk 5143 1 61.39 TCATGCTTTTTTCATCTCCTGGTGCTTGGAACTTGCTTTTCCATTTCCTTTTCATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATA:1 + chr3L 3476144 5' + Idefix 14 2 62.38 TTTATTTATATTGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAG:1 + chrX 23291011 5' - Stalker4 391 1 59.41 TGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr3R 15072549 5' + pogo 6 1 70.30 GGAACTTGAAAAAACAAGATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTA:1 + chr2L 6643995 5' + hobo 2529 1 82.18 CAAAGAAGTTTGGCACACTTTTTTTCTCTCTCTGCCTGAAACTAACTCACCACGCCCAAGCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAA:1 + chr2L 17000811 5' + HeT-A 5955 1 62.38 GATTGGCTCGGGCGTCCAATGAACCTGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 20084883 5' + 412 7094 2 71.91 GTGGGGCAGCCGGAAGGTTCTTCAAGATACAAATCGGACGACGGCTGCAGCGCCATTTATGTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAC:1 + chr3R 16665247 5' + BS 5047 1 69.31 TTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTTGTTTTTTTTTGCGCCCCGATTTTTTTGTTGTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGG:1 + chr3R 3922965 5' + Cr1a 52 1 81.19 GATAGACCAACAAATAAATGAGCGTTCCCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAA:1 + chr3R 25303909 5' + I-element 50 1 69.70 TTTCTTGGCTGGGAGATATAAATTGCGTATACGCCCTGTTTGTCCCGTGTTTTGCAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 9110965 5' - accord 184 2 71.79 GAGGGAGAGGTGGATCTGGAAAAAAGCTACATAACCTTCCTTCCAAACAGTTACTTCATAGATCCCCCTTAAGTCCAATGCACTGTATAATTGTCAGAATT:1 + chr2L 14332209 5' - baggins 5340 1 58.42 CCGGGCACCCAAGCCCAAACCCATTCCCCCCAGATCCACCAAACATTTACAAAATCACTTAAAAAAAATACCAATCCCAATTAGCCGAACCTAATTTTATA:1 - chr3R 29713493 5' + I-element 240 1 60.40 CCACCATATTTTCCTTTGCGTTTCTGTGTTATGCTTTTGTTGCAACACATAAGTTCTCATCATATTGCGAAGAATCCAGTACACCATAAACGCACTAAGCA:1 + chr3L 5385813 5' + Copia1_DM 4110 1 54.46 TTTGGACTCCTTAACGGCTGAACTCGGTTTTACCCTCGGAGATCCCCCTCCTGAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGGTCACGCAGCG:1 + chrX 17421273 5' - Bica 68 1 57.58 GATCTTTTAGTAAGCAATGTCTTGTTTATGCGCTAGATAAGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAA:1 - chr3R 31987580 5' + Circe 7198 1 62.38 CCTTCGTGCATTTAAATGCACCGAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 7808920 5' + jockey 15 1 71.29 TAATTCAGGAAGTTTATACCAAACTACGCATAGCTAGACCTTTAACTGGCAAAGGCACAGTTTAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAA:1 - chr2R 1338239 5' + 1360 3198 1 65.35 ATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr2R 18891046 5' - opus 468 2 62.38 TGTAGGTTCTCGGGTGGTTGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCA:1 - chr3R 30751918 5' - accord 6994 2 69.74 ATTAACGATTCGACTTTCTTACCGCAGTCACCGTACAAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTAGAT:1 + chrX 15470627 5' + I-element 4897 1 66.34 ACGCACGAGTTCAGTTCTCGTTTACTTTCCACATCACCACCACCACCCATTAACACTTTACATGATTTTTCACCCAGTTTAAAGCCTGGCTTCGCGTAAGC:1 + chr3R 6776663 5' + I-element 46 1 67.33 TTCATTTACCGACACAGCGAATGAAAATGACTCATCGGGGGCCTGCCAGTCCATCTTCTCCAAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGGCA:1 - chr3L 4232567 5' - G6 276 1 64.00 TTTGGCCAACTTTCAGTGGGGAATTTTTTCTCCTGTCCGCAACATCGGTCGCTATCATTCGTCACCTCCGCCTGTGCGGACAATTTACAACAATTATACGA:1 + chr2L 21956018 5' - accord2 7155 1 73.27 GGTTGGGATTGAATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr2L 22689943 5' - Tabor 466 2 60.40 GTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACAT:1 - chr3L 24208179 5' + Quasimodo 45 2 77.23 TCAGCTTACTCAAAGCTGTAAAGTGCAGTTCGCAATAACACTACAAAATGTAATTTAAATTCTCTTTATATTTCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2L 11576353 5' + roo 8666 2 77.23 AGTAAAGTTTTAAAAAAAGCTGTTTTATATAAGGAACATTTTTGCACAATCAATTGACCCATTTGCTTGGACTGGTACACATCCTGTAATTTCCCCACCAT:1 - chr2L 11199875 5' - G5A 441 1 75.25 ACATAGCACAACATCGCCAAAGGAAAAACGTCTTCTAGCACAACACGCACCCATATTCGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTC:1 - chr3L 10246473 5' + 1360 3256 1 76.24 GTGTGNCAGTGTGTGTTAGCCAGAGTCGGATGAAAAACAGCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATAC:1 - chr3L 14588575 5' + F-element 4429 1 65.35 TGGTTCCACTCCTATTGGGTACTAGTCAAACTTACTTATGTTGCAAGGAACAGTTAAGCCACAGTTATGTTCCTTGAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAAC:1 + chr3L 16661765 5' - Juan 462 1 61.39 TAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCA:1 + chr2R 5284577 5' - Doc4-element 2599 1 67.33 AGTTGAGTGTACATTTCTGTCATCCCTGAACAAACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:2 + chr3R 28623880 5' + roo 16 2 59.41 AGGCTTAATTAGGCAACTGATAAAGGCTAATAGATGGAAATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chrX 14521312 5' + jockey 4711 1 58.42 AATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2L 22719607 5' + 1360 53 1 80.20 GTAAANAACCTCGATTCGAGGCGCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr2L 6644323 5' + hobo 52 1 75.25 TTATGNGGCGGACGAGGAGACGAGACGGTACAAGACGATGGAGCCAGGAGCGAGACGAATAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 27448474 5' - roo 9054 2 60.40 CGACTTTCCCTGACAAGGGGTTACCTGCAGATGGAAACGATAGGGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGA:1 - chrX 13061551 5' - F-element 482 1 56.44 GTGGGNGATTCGAGACTAGGAGGATGAATATTCATTTCACGAGTGTGCATAAATACATACGTAGATACACATGCATGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 + chr3R 22675774 5' - 412 494 1 76.24 CACACATTATAGTTTCGTTGCGGCGGACCGCAAAATACACAATTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 - chrX 4326932 5' + FB 34 1 60.40 CACATCTCATTTGCCATATGCATTTCCATATCGTCAGCCATAAAAATCTCATCAGCCTAATTCCAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCT:1 + chr3L 7829054 5' + jockey 141 1 69.31 CCGGCTCATGAGCGTGCCAATGAATATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2L 796776 5' + jockey 57 1 76.00 AGATGGGAAGTGGGGAAAGGACTCTGGAATTATCGAAGAATGACCAGGAGTCCAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGT:1 - chr2L 3273941 5' - gypsy5 405 2 70.30 TAACAAAGAAAATTAGCTCAGCCGAAAAAGGTGAGAAATAGTAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACA:1 - chr3L 13879353 5' + hopper 991 2 58.42 GTGCTCGACATCAATTTGCCGCAGCGCAAAGTGTCCGTTGGCGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACT:1 + chr3L 9944837 5' - F-element 4414 1 69.31 TTAACGCCATCGGCGCAAGGAACTGCCCATTGTCAGACCCCATAAATTGCGTTAAAATGCTGTTGCTCGCATTGCACCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAA:1 - chr3R 25971899 5' - F-element 4264 1 65.35 AAGGTACAGTGGATATCCGATATGTGGGGCTACCACACTGCAAAACAACATCGAAAGATGCAACCCAGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGT:1 + chr3R 3843050 5' - Max-element 8525 2 69.31 CCGAGTTGTTAATGCTGGGATTTCACAGCGATTTCTTATGGGATTGCTGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCG:1 + chr2R 16972570 5' - accord 177 2 53.00 TAGAAAAATTAGGGTATCTTCTCACCAAGTCGACCAAGCTATCGCATTTCGGCTGCCTTCTATCTTTTTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGTCTTTTT:1 - chr2L 5447874 5' + HB 70 1 68.00 TCTAGCATGAAAGAACATCCACAACATATTTGTTGAAATAAATTCAGAGTTTATTGCTTCGTTATTATTTCTGTATTTTCCTTTTTTTTTTACCTT:1 - chr2R 20716805 5' - Doc2-element 247 1 70.83 CAAATNCGAACCCATTTCAAAAATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr2L 14536228 5' + blood 16 2 62.38 CAAACTAGTGACTTTACTGAGAAACGGTTAATGCACGCAAATATATATTGTTAAAATTCGCGTTCTCATTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 - chr3L 14593613 5' + INE-1 547 1 54.00 TATAACACTCAGTACCGAAAACCATTCAAGATCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGC:1 - chr2R 4478729 5' - Chouto 25 1 69.31 GAAACAAGAATAAGAACCAAGAAGTATATTCAAAGTGTCGAAGAACTACAACAGAATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGGAAGGGCCG:1 + chr4 134444 5' + Porto1 4583 1 64.36 TGTGATTTTGGATGGTAAGGAAAGTGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr3L 1490307 5' - 1360 3341 1 75.25 CGCAGTACCGAAATAGTTCAAAAATAGCACAAATATATGCGAGCATGACTGTTATAATAAAATAATTGTTATAATAAAATGGCTATGACGATGGTTTTAGT:1 + chr3L 5754502 5' + R2-element 3444 1 52.48 TTTGCAGATCGTTGACCAATTCAGCCGTAACACCTGAAACACTGTTGCACCTAGCCAAGTATGTTTCTTTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGC:1 - chr2R 1006879 5' - F-element 331 1 75.25 GGCTTTGATCTCCACATGACCCTGCACCATCTGCTCCAGCTGAATGATGTCAATATTACTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGA:1 + chr3L 1412518 5' - F-element 4263 1 64.36 ATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGATTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCG:1 + chr3R 934264 5' - Bica 68 1 55.45 AATGGCGTGCCATGGCTCATAACTTCCAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGC:1 - chr3R 8421107 5' + hobo 350 1 67.86 TCGAAAATTTGTATTTTGAACAGGCAGACGAAATGAACGACAGATCCAAGGAAAAAGATTTGCAATGTATGGAGAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTC:1 - chr4 1083275 5' + mariner2 763 1 61.39 GGACGTTCTAGTGATTTCTGAGGATACAAGTATCAATGTTTCTATGATCTTAAATTTGCAATATTAACTACGCAAAGAATTTTAATTATTTGAAGTGAAAA:1 - chrX 11696711 5' - TLD2_LTR 96 1 74.26 CCAAAATTTGCCCACCAGTTCCTCCAGACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2L 22227367 5' + F-element 33 1 55.45 GGAAGAAGCAGAGCGACAGGGGTCTTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCG:1 + chr2R 14525355 5' - ZAM 7961 1 64.38 CCTTCGAAAAATAAAAAAGGGAAAAACTTGCCAAATAGATCGTCTATTGCCTCATCCGATCAATTTTTTAAAATTTTTTTTTATTTGTACTTTATTAAGGC:1 + chr3L 8248465 5' - BS3 1764 1 81.19 GATGCCTCCTATCGCATCAATCAGGAGCAGGACGTGGAGGTGGAGCTGCTGCGTGAGGACAACGAGCAGCTGGTGACGCAATATGACAAAATAAAATAATT:1 - chr3L 7933099 5' - 1360 3100 1 83.17 GGCATTTTCCGCTACCGTGCCCCAGGGATTGTGCAACTCTTTATCGATTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGA:1 - chr2R 16885944 5' - Bica 453 1 53.47 GAGGGGCTAAGGTGCAGCAACGTATGGTGCTGGTAAAACAACCTTACTGGGAAAACACCTGTGCGTGAGCTACAGGGGTAACTTTCAGGTCTCTT:1 + chr2R 2306545 5' - G5 4512 1 63.16 ACGTGAACTGAAACTTTAAGCGCAAGTCGAAAATTATGCACAAAAAAAAAAGGAAAACCAAAAGGAAAATAAAAACAACAAA:1 + chr3L 7879834 5' + gypsy7 5013 1 90.24 AACAGTGCTTGCCCCTTCACCACTTTGCATTTTGAAGCCAGTGTGGCTGCGAAATCTGTTGGTCAGTCGGTAGATCCTCGT:1 + chr3L 5608738 5' - Chimpo 4143 1 61.73 GTCGGTCGAAACCCAAATGGCGACAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chrX 19848452 5' - P-element 2833 1 27.72 TCCACTAGCTGGGACACAAACCTAATGGCAGCGGCCTACTGCCGAA:1 - chrX 3046505 5' + rooA 114 2 71.74 TGCTCTACACACTCCCAACTTCCAAACACACTCACACTCAAGCAGGACTCTGCAGGACCTACACATATGTATATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chrX 14424125 5' + hobo 4 1 70.30 CACTCGCTTTATAAGATTGCTAGGCGATTTCAGGATAGACCGCTAAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAGCAACTCCTACCTCTCA:1 + chr2L 13474922 5' + Porto1 264 1 58.42 AGTATGTAATAAGAGAACTTTAAAACTAAAGCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCAT:1 - chr3L 3484901 5' - diver 5899 2 69.31 CTGGCTGCGAATGGGAATTGACAAGCCTTTTAAAACATGAAACACAACGTGGAGGAGTAGATATGTATACATAGATATGGGTATGTATGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 16064404 5' - Quasimodo 40 2 66.34 CAGTGACTGTTGTATTAGAGGAGAAGTTTAGCCGACTAACCAAGTTGGGACTATCAACTTCACTACGAATAAGCTTACAAATAAAGAATGTTCCAAGCATC:1 + chr2R 4886773 5' - Cr1a 4027 1 80.20 GATGCCGAATCTCGTTCGCTGAAACCAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAG:1 - chr2L 22319166 5' - Transpac 75 2 74.26 CAATAATTGCATTATCAATCGATAATCGTATCGTATCTTCGAGCGGTAGGTTTCGATAAAGGGTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chrX 22517548 5' + 1360 11 1 43.56 TTTCGCCAGCTGCTGCTAATTTCGCGAATACCACTGTGTCAGATTTTAAGCGTAAGTGTGTGTGTACTTGGGCTGAGGCCATGTTGCAGGCGCTGGATGCG:1 + chr3L 16709911 5' - HeT-A 5652 1 66.34 GTTTATCTTCGTGTTCGTTCGGCTGTCGATTTCGAGGAGACGGTGATGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAA:1 - chr3R 14282815 5' + P-element 30 1 55.45 TACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr2L 23068863 5' - 1360 3351 1 70.30 AAAAAAAACCCACAAAGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACAGTCTGGGCGCCACATCTACTCCCCCTCCAGTGACTTCGCCAGGTGGTGAAGG:1 - chrX 7684861 5' - Chimpo 4229 1 53.47 TTTGCATATTAAGAGAGTTCTATAATATCTCCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 7375337 5' + roo 8710 2 73.27 ATTTTACAGGGGAAGAATGGGACAACGACGGTAAAATCTTGAAATCCCTAAAAGCCATTAAAGAATGCGTAATTCTTTTCTCTAAATATATATGTACATAT:1 - chr3L 3484490 5' - gypsy11 7 2 76.24 GATTTTGTAGGCCTTGTGTATGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAA:1 + chr3L 4135149 5' - Doc 295 1 80.20 GGATGGTGCACCAGGGGGGTCCCAGGGGCCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGATAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCTGCTGC:1 + chr3R 23972126 5' + Quasimodo 6905 2 67.33 GCTGCGGCAGCAATTTTGCACAACTGGATGTGTGTGTATTCATTTCCTGAAGTCGTCAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAA:1 + chr3L 11454266 5' + F-element 4406 1 60.40 GGTATNTGCTTTCATGTCGTCGGCTAATAGAAATCTCTTCACACGTGTCAGAAATTACCCAGACACAACAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr2L 14906667 5' - 1360 3366 1 72.28 AGGAGCTATCGAACTGTTTCCTGCCATGCATGAAATCTATGTCCAATCCCCAAACTCACCCCACGTAATGTACACCTCAAAAATTCAAACAATTGTACCTA:1 + chrX 6976404 5' + HeT-A 5968 1 66.34 TTTTCGTTATGAAATTATCTGTTTTTCTTATATATAGGACACACTTTCGATAACCTTTGACCCAGTGTAGCAAAGATGCATGTCGTACCGCTCGCAATTG:1 + chrX 13765239 5' - G5A 2494 1 76.00 GCCAGTGAAAGAAAGAGAAAGTGCCTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGA:1 - chr3L 10206787 5' - Tirant 323 2 75.25 GCACTTATTTTCGGAGCAAAGTGCAAATGAACATTGTTATTGTAAATACGTAAATTGCCATAAATTACAAGAGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAAT:1 - chrX 8422298 5' - diver 77 2 71.29 AAGTCTTGCAATATTTTCTGTGACATTTATATCTCACCCGCCAGGACTCGCTGGCATTTTGAAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCG:1 + chr2L 17070700 5' + R1A1-element 155 1 58.42 AGGGGAGAAGAAATGTAAATTCCGATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chr2L 5151988 5' + I-element 51 1 75.25 AAAAAACTGATTTCGGGTGGATAGTTTCTGGATGTAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAAT:1 + chr3R 19444817 5' + F-element 4427 1 65.35 TACGGAAGCAGAGCCACAATTACACTTGTGCACAAAAATAACAGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGC:1 + chr2L 1338286 5' - jockey 385 1 57.43 GCTTCTATTACTGTTTAGTTCTACCTCACTGCTTCTATTAGGATGAGATTCTAGTCTGTCATTCTATTTTTTTTTGCTATTTCCTGAATCCTGTCTCCAAT:1 + chr2L 18862425 5' - jockey2 3051 1 64.36 CATTCAACAATGGCAATTTCTTTTTGGAGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAGTAAA:1 - chr2R 14808997 5' + F-element 79 1 68.32 GCGGGAAAAAGGCTGAAATGTACAACAGGCTAATGCGTCTGCAGGTGGAGGGCGGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTC:1 + chr2R 7897268 5' - Chimpo 3857 1 52.38 ATCGAGCAAGTACTTATACCGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCA:1 + chrX 20532638 5' + I-element 4909 1 80.20 AACCATGAGTGTTGAGTTTATGGATGGGCACAAGTAACGGGACTTACAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTT:1 - chr3R 4668252 5' - G6 13 1 74.26 AATTGTCCTTGGCAAAACTTTCTCTGCATATATACCAGGCAATCACGGCTACCAAACCTACACTTTCAAGCTTAGCTGCTGTAACCACCAGCACGGTTGCC:1 - chrX 10303932 5' + Doc4-element 270 1 60.40 TATTATTTTTCGCAAGAGTAGGAAGAAAGATATATTTAGATTTATACATATATGTATATGAAGCATAAGATTTAGTTAAGCGCAACCTTTCGTTTTGTTTT:1 + chr2L 8264253 5' + Transpac 5075 2 60.40 CCCCTTTAAGGACTCGAGGCACTTGTGAGGGAATGGTAGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTT:1 + chr2R 14450605 5' - Bica 4635 1 62.38 CCATATAGCTTAGCAAAAGCCCCCAAAGTATGATTCCCCTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATAC:1 - chr3R 17827450 5' - Doc 4471 1 62.38 TTCGATGAATTTGCGATAATGCTTTTTTTGGCAGGTGGTATATACATTTAACTTCAGCGCACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAAT:1 - chr2L 11483152 5' - Idefix 216 2 60.40 GGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCC:1 + chr4 1301735 5' + 1731 4340 2 49.50 GCCAGTACAGATTAGAGAGCGAAAAACGAGGGGTTTTCAATGAAATAGCAATGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAG:1 - chr3R 5364771 5' - HB 1379 1 67.33 CCCCACTGCATCCACCCGAGATTCCCCCCTCCGGCATTTCCCATTTTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGC:1 - chrX 4506868 5' - blood 379 1 60.40 CACGAGAGTCAGCACAAGGACATGGCCCCAATGTTTCATAAGAATGCCAGGCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCA:1 + chr2L 17811386 5' + 297 6521 1 58.42 CTTTGTACTGGCGGTTCTCCTGTTGTGCGTTGCGGACTCCGTTTACGTTTTACAAAAACGTAGCGATCCATACCAGTCTGCCTGACCGAATTTGGGCGGCC:1 - chr2R 25170190 5' - Doc4-element 448 1 74.26 AAAGCCGGTCTGAGCTCATAAAGCCAACGAACTAGAACAGCTGGCTCTGTGCATGAAACATAATATCAAACTGCTGACCCAGCATTGGGCCGGAAACCCGT:1 + chr2R 22529399 5' + Gypsy6A_LTR 69 1 80.20 AAAGCCGTTAGCGAAGCAGAAAACGTGGTCAAAGCATAGTAAATATTTGAACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr3R 5208135 5' - hopper 1392 1 56.44 AAAATGCGCCTCGCTGAATAACTCAAGCCAAAACTCGTGTCAAGTGCTCGGTGGCGGTGGGTGGGTGGTTGGTTAGTGAAGTGGACAGATCGGAAGAGCG:1 + chr2L 4296615 5' - mariner2 569 1 80.00 CACTGAATGGCCACCGACATGACGTTACAACAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr3R 14146651 5' - hopper 1370 1 72.28 CACTTGTTGATAGAGAATATAGAGAATACATCTACATCCAGCCTACTGCAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAAC:1 + chr3R 16394930 5' - invader2 4808 1 62.38 CCCTTCCTTCGCTTGTTTTGGTTGCGATTCCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCC:1 - chr2L 8340990 5' + Max-element 137 2 71.29 TGAGCATAATTTTCTTTTCTTCCTGCCTTTTGTCTCAGACAGGAAGAAAAGAAAATTATGCTCAAAGGAAAAGCGGTTGAGGCTAGAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 12269012 5' + G2 3071 1 78.22 TCCAGTTGGCGTCCATCCCAAGCGTCCAACTGGGGGCCATGTGATAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACT:1 - chr3R 23899633 5' + F-element 4416 1 55.00 AGCTATATATACCTATATTCAAAGTCTACGCGATGTGTAAGATAAGTTAAGCAGTGCCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr2L 5611466 5' - pogo 2083 1 62.38 AGTCATAAAAATTAAAGCGAAAATATAAAAAAAGGTAAGACATGAAAGCAAAGGAGAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAG:1 - chrX 17773614 5' + hobo 2890 1 63.54 TATTATTTACAAACAAAAGTTTAACACGTCATTTTCATTCGGGATTAAACAATCCACACGTTTTCACGACTTGAATCCACTACGATTTGATTAGAAAAGAA:1 - chr3R 21288765 5' - Gypsy12A_LTR 260 1 57.43 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGGGCAATCCAAAAGAGGAAAAACTAAAGCATACGCTTTTGTCTGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 5' - blood 7179 2 51.04 ATTAGATAAAAAATATTGGTCACTCTCCCCTTAGCGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 + chrX 22689330 5' + HMS-Beagle 40 2 65.35 GAAGTCGAGAAAGTAATGTGTGTGCATCTATTACCATTTTTTGTATATATCACACCAATAAAGTTTAAGTGAATTAAGTGCAACAAAACGAAGAACTAGAG:1 + chr2R 1775006 5' + mariner2 311 1 77.23 CTGTCAGCCGGAGGCGAAGGGGTCAGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTGAGTTGTTCGCAGTAACTTT:1 + chr3L 13670959 5' - G-element 218 1 77.23 TGGCACTGTCAACACCTCGAACTGTCGACATTGGGCAGAAATGTTTTCATTGGCCGTGTGGCAAAAAACCCAGTGCTCGAAGCAGCGGTATAATTGCAAAG:1 - chr3R 25704901 5' + G6 218 1 65.35 AAAAACGTATGTTATTACACATTCAAATATTTTGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGG:1 + chr2R 10749727 5' - F-element 477 1 70.00 ATTATGCACACCCTCTACCTCACAGACACCGCCACTGGTTTGTTGTTTATTTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACATCCTCCCCCCGTTGGAAGC:1 - chr2L 7077239 5' - diver2 4514 1 62.38 CTTTTCGTTCAACGTTCATGACGTTAGAAAGTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACGTCACTTTGCACT:1 - chrX 11775613 5' - gypsy4 454 1 67.33 TAGAGCTCTGCCGACTTTTTCGCACCGCAAATCCCATTCGATTAATGACCTAAACCTAACGAACTAACGACAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAAT:1 + chrX 6138364 5' + mariner2 739 1 72.28 CTGTGTTTGTACTCCTGGGAGTATGCAACAGTTTTGGCTTGGCCTCGGTTTTGGGTTTCGTTTCCGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr3R 14832490 5' - blood 365 2 65.35 ACAAAAATAAAAAATGGGCAAAGTATTATGTTCATTTTTTTTTATTATGTATTTAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAAC:1 + chr2L 15056335 5' + I-element 138 1 58.42 TCCCCCTGCAAACATATTGACCCGAAAATCACTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTC:1 + chr3R 23651370 5' - F-element 237 1 72.28 AGGTGAATCGTTATGTTGGAGGTGCGTGTTATTATTCACTTCTATAAGTGATTTAAAGTCCCTTTAGGTATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCAGTTTTT:1 - chr2L 16857017 5' - Doc4-element 2751 1 53.47 CACCACCGTGGCATCCAACTTGGCGGCCAGCGGAGCGGTGGGGGATGACACCAAAGATGATTACAAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGG:1 + chrX 2660576 5' - R1A1-element 4985 1 65.31 GTTAAAGACTTATACAAATTTATATAATTGTACTACCATCGTCGATGGTAAGCTTTGTTAAAACAGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGT:1 - chr3R 2557695 5' + Cr1a 4409 1 61.39 GAGTGCGGTAATTGTCGAGTCACTGCCTCATCTGGGGATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTAC:1 - chrX 17544304 5' + hobo 2680 1 66.34 GGAATAGGGTAAAAAACAAAACTGGCAAATAAGCCAGTAAGTAGTTAATAACAATTTGTTGACATTTTCGCGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGA:1 + chrX 1101118 5' + invader1 153 2 76.24 AAAAGGCTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGC:1 - chr2R 22774520 5' + BS 13 1 59.41 AATGGATATTATCGCAGCCAGCGATCCGGCCAAAGCAGCGATCCAACGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGG:1 - chr3R 8169449 5' - G-element 4271 1 56.44 GAGAGNTATTAACTAAACTGTAGACGCGACCAGATCAAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCGAAAAGAAGAAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACG:1 + chr3L 1651335 5' + 412 7493 2 60.40 CGTTTCCGGCTTGCGCTTGTTGGTGGCGCCAGTTCTTGAGCTCGTGTATGACCATCTCGTGCAGCAATCGTATGCTCACTGAC:1 + chr3R 20540844 5' - R1A1-element 324 1 78.31 CAGTANAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGA:1 - chrX 1018157 5' + 1360 196 1 73.27 TAATCGGCTACCTTCGGCCTACAGTATTAAATATTATATGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTG:2 + chr3L 9067048 5' - jockey 4717 1 61.39 TTACCAAAAATAGCAAATGTGAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGA:1 + chrX 9431181 5' + F-element 4319 1 79.21 CTTGCCGCGGGCGTGGCCCTGCTGTTCTTGGTTAACCAGACGACGGAGCTCTCGCACCGCCCAGTCAAGGTATGACTTCGATGAGCAGGATGTGAAGCCAG:1 - chrX 20401947 5' - Rt1b 4956 1 69.31 CTTGGATTCAGATCCGGAATTCGTATACGTATCTGTATCTGAATCTGAATCGGAATCAGAATCAGAATCTGCAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chrX 11006812 5' - roo 404 1 73.27 TGTTATGTAAAAATTTATTAATGCTTGGTTTATTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTATTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTG:1 - chr3R 12008087 5' - I-element 5129 1 65.35 TGGGTGGTGGGTGCTTTCGACACGTGCGACGGGCGCTGAGTGGGCGGCTGATGGTTTCACTGTTATCCAGGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAGGGTGGTTG:1 - chrX 20503634 5' - G-element 4110 1 56.44 TAGTTGAGCTCCTCCTGCAACTGGACGGAGATGTCGCGAAACAGTTCCGTCTTACAGCATGTGGCAGTCTCTCTGTTTCGCCACATCGGCTCTGTAGCAAC:1 - chr2R 8609648 5' + invader2 4963 2 63.37 AATGGTGGCTTCTTCGCGGAGAAATTCGTAGTGGCGATTTTTAACAAAAAGCACGCATCTTGTTATTCTGGGGTCTT:1 + chr3L 8449940 5' + 1360 3386 2 80.52 ATACGAAGACGATGGGGAATGGAGCTGGCAATAACGATGACTGGGAATGATGCAGCGGCAGTGGCAATTGGCGGTATAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAA:1 + chrX 20973572 5' - diver2 180 2 66.34 CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTC:1 + chr2R 2007458 5' + Cr1a 3987 1 55.45 AAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATA:2 - chr2R 1000407 5' + HMS-Beagle2 6899 2 67.33 TTTGACTTATTTTCCAAAGTGCTGCACATAGGGCAACGTTGAGGTTTAAACAAAAAAATTTGCCACGCCCACTCTACCGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGC:1 + chr3R 4277765 5' + INE-1 348 1 56.44 TTGTTATTTCTAGTGCATATCTCAGCCACGTTCTCATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr2R 11257861 5' - pogo 2063 1 66.34 AGGCGTCGACTTGCCGCCACTTCCGCATGCAGCCGATGCAGCCAATGCAGCCGATGCACCAATTGCAGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGC:1 - chr3R 27914851 5' - hopper 402 1 75.25 TTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689428 5' - diver2 4474 1 64.00 CGGATTTAAAATAGATTTTAGAAATTGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 8640830 5' + roo 49 2 76.24 ATTTTGCTTCGGTGTGATGTGTGGCATTATTATAAACCTGTTTATTTGTTTTGATAATCCAGTTATGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCC:1 + chr3R 17500440 5' + R1A1-element 5078 1 67.33 AATAGAAGAATAAATGTAAACAGGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 2689822 5' + roo 8713 2 80.21 CAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGGCAAGTAAACGAGCCACGACGTCATGAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGG:1 + chrX 12076675 5' - diver2 168 2 57.43 TAAGTTCTGTTTTCTTTCCACTTCTCTTTGCCACCAGTTTCGTGGCCTATTTGATAAATCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCG:1 + chr3R 21195121 5' + Doc 456 1 64.00 AATAGAAAGAATCGAAGGGGAGAAGAAATGTAAATTCCGATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr2L 5152003 5' + I-element 36 1 60.40 GGTGGCTGTCTAGTCACATGCAGGGTGATAGTCGCCGCCATTGAGTGAGTGTGCGATTTTGTATCACCTGGATACGTTTATAATTAGATTCGGCTGCAATT:1 + chrX 149395 5' - Helena 1095 1 53.47 GCACTTAATGGGGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTT:1 + chr2L 9823610 5' + hobo 7 1 71.43 CCTTAAAATCAAAAAGGAAATCAAGACAAATAATAAAATATTATCACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAA:1 + chr3R 19446837 5' - copia 4994 2 55.45 ACAATGCCACTTTAAGTTTGTTTCAATTTGCAGATGCATTTCGAGTACGTTTAACCGCAAATTAGTCTGCTCTACCCTCGCATACACACACACACACACAC:1 - chrX 6206304 5' + accord 7025 2 60.40 TCACTTGGTGGATGGCCAATTGGTTTGTGATGTCCAACAGCCAGCTGCACGACTCTTTTATAGCCACTTACACTTTTCGAGCTGAGTAACGGGTATCTGAT:1 - chr3L 8222152 5' + INE-1 545 1 80.20 GCTCANTTAGACGGACGGACAGCCGAACCGAAGTGGTTGGGGGACACACCATGTGTAGATATACCATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3L 7231101 5' + 297 6586 2 65.35 TATGGCTCTGTGTATGTGTGAGTGTGGGTGCGAACTATTAAAAGCAAACAGGCGCACACACACACACGTGGAGAACTAAAGCGGACAGATCGGAAGAGCGT:1 + chr3R 22098984 5' - mariner2 568 1 55.45 GGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATACAT:1 + chr2L 14536269 5' + blood 7067 2 75.00 TGCAGTGTGGTCCAATTATAATATTTCCTCCGATCGCTCCAATTAAGTAATAACCTTGCTCTTTTTACTTTGAAGCGCTGTTTTTTTCTTCTGTGTTTCTT:1 - chr2L 14236970 5' - rooA 432 1 57.43 CTGCAGCAAGGCCGCACTCTTTTCCTCCTGGGTGACCGTGTCCTTATCAGCGACTTTTCCCTTTAAGCACACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCC:1 + chr3L 8845185 5' - invader3 5371 2 58.42 CTCTGCGAGTCACCTCCACGCAAAAGTGCACCAAAAAGCGTTGTTAAAAAAACAAAACAAAGTGATTTTAAAAGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 - chr2L 20084963 5' - 412 493 2 79.21 AGTATTCGCCCACCGCCCTCAGCGTTATCTGCTCCACCTGAGTGTGCTGATGGAAGCGCATCCTCTGCTCCGCCGGCAAAGATCGACTTGGCTATTAATCC:1 + chrX 8973209 5' - INE-1 97 1 40.59 TAACTCTTTCTATAAATTCATCAAAATTCATCGATGGAATATTTGATTTCCCCTCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr2L 11113963 5' + transib2 20 1 53.47 GGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCC:1 - chrX 22386786 5' + hobo 54 1 59.57 CAACACAACTCACACTCGTTTGGCATTTATACATATATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTT:1 - chrX 5161684 5' - transib2 2427 1 65.35 GATATAAAAAAACCATTCGCTTTAAGGGGGAGCAGATAACGTGAGCATTTCCTTTAGATTGATGACTGAGCACCCACTATTATCAACAATATGTTTAAAAG:1 + chr3R 16220554 5' + transib2 2409 1 74.26 TTCCGAGTGCCTATTGAGCTGATATTGTCATTGCCATTAAATTTCACCTTCAGACACTTTACACTGCTTAATCTAAACATTTTATAGTTCCTGAGATCGAG:1 + chr2L 18632482 5' - INE-1 147 1 67.33 AGTTATAAACGTTTTATTCTCTCGTAAGAAAAGGAAGATCGGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGA:1 - chr2R 693911 5' + Bica 489 1 70.30 GTGCCACTGGCCGTCAGAGGAGCCGCCTCTGGACAGCCCAGTCCCTCGACCCTGCTACCGGCTTATTCCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTC:1 - chr2L 13897664 5' + Chouto 229 2 53.26 AGGGTGGTCGAAAGTTGCCCCCTGCCATGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:1 + chr2L 8050423 5' + 3S18 5789 2 44.55 GGCACCGAGCACCTGTCTGCGATTTCTGAGCGCCTGTTCGGAATGCCACCTCCTCCGCAGGGGGAAGTGGAGGTCGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chr2L 2260697 5' + 1360 84 1 76.24 CATCTAATGACTGAAACAGCTCATATAGGTCATAAGTTTTGCTTAACATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCA:1 - chr2L 247249 5' + Doc2-element 424 1 60.49 AGCTACACTGAAACAAAAGCAAGCTATGATTTACTTTAAGCATGTATCTTGAAGTTTTAGCGTATTATAACTTAATAATCAACACTTTTGCTTAAGATCAA:1 - chr2L 19024718 5' + frogger 201 1 55.45 GGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCA:1 + chr3R 26331662 5' + G-element 49 1 70.41 ATCACATTCTTGCATAGAATCCGAATACATTACCCTACATCCTCCCCCCGCTGGAAGCTTGGCTTCCAACAGAGTCCTCAAGGGGAAGCAGACACAGCTTG:1 - chr3R 29601072 5' - diver2 4471 1 65.35 CCGCCACCGCCACCACCTCCACCTCCACCACCACCACCACCACCAACACTTTCTCCGTCTTCTAGCACAACACGCACACAT:1 - chr3L 4459828 5' + 1360 3209 1 54.32 GTGCGAATTCCTTCGAATATTGGTTAAGATAAATGGACATACATTCTTATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAA:1 - chr3R 28273691 5' + 1731 4468 2 52.48 GGTTGGTATGTAGTGGGTAAGGACAGGCCAATAGTTCGGTGACTCGAGTTAAAAATGTATGTAAACTGTATAAAAAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAGT:1 - chr3R 27913729 5' - Q-element 317 2 71.29 GTGCTTGGTAAGCTATCACTTGATAATTTAATATGTATTCCTTATAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTTAACACAAAACCCACTCCCATTTTCCCTGAGCA:1 - chr3R 9071737 5' + Circe 7366 1 55.45 TCAATGTTCTTTTCAGGTACATGTCACTGTATGCGTGTTGCTGCTGCCGCTGACGACGATAATAATGATAATGATAATGATAATAATAATAATAATGATTA:1 - chr3L 5670449 5' + mdg1 44 2 54.46 GTACATAAATACATGCATATGTATCTGACTGCAGGAGGGGCTGGTGTGACGGTAGTGGTTTTGGGGATTATTTTATTTATTAGTGAGTGGTGAAATAAAAA:1 + chr2R 6120485 5' - 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chr3L 6899658 5' - Doc 283 1 53.47 AGCGTGCAATCTCGCAAAACTGGAAAAGTTGCGAAAAGCGGAAAAACTGGCTAGCGTGTATGGCTCCATTGTTATTGTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTA:1 - chr3R 28932258 5' + micropia 5091 4 78.22 AGCGACGGTGGGAGAAAAGAGAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chr3L 5620876 5' + Burdock 10 2 38.61 ATGCCCAGATGCTGAGAACTTACCCTCGAACATAACTGTCAACGGTTCTCGGGGACTTGGGCAACAAAGGAAGGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAACC:1 + chr2R 24594594 5' + INE-1 219 1 72.28 TGACTCATGGCAAATAAAAAACACAAAAACCCACAAATAAACAAAGTCAAAAAGCGAGCAATAACTGGTTCGCCTTGGACCTACGGATTCCAGTTGTAAAA:1 - chr2L 2413843 5' + Doc4-element 2733 1 60.40 AAGCGAGCTAAATGTCGTAAATTTTGGATTCATTCTAAAACAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGA:1 + chr2R 8247416 5' - Doc 348 1 59.41 ATGAAGAATATTTAAATAGTCTTAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTAT:1 - chr2R 15002455 5' + 3S18 5769 2 68.32 GACAAAGAGTAAATTTGTACGGTTACATTTACCCAGTTTGGCCCCAAGTCAAGTACAACAACTACTTACCTGTAACGTCGCCAGAGGCTCCCAGCGACTCG:1 + chr2L 1577658 5' + HeT-A 5711 1 58.42 CTCTGTGGTTGCCACTCCCCCCGCGTGCCACACATCCCCTTTATCCGCTATCGTGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCA:1 - chr3R 10591903 5' + R1A1-element 5079 1 57.43 CACCATATATATATGTACTATATGTGGTCGTCTATATATATGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTA:1 - chrX 4589468 5' - BS 4898 1 60.40 GTCCGTTCTTCGTGGCCTCCAGCGTGTAGTTGCTGTCACTAATGATATACGTGTTAGACTTAAATGGCTCCAAGTGTAAAGTTATGACCTTTTGTCGTGCC:1 - chr2L 8645150 5' + Q-element 679 2 56.44 TGTCGNAAATCGCATATATTCATAATCAATTCTTCTATGATAACTCCAGAAATAAATCATTTCGAATACAAGATATTTGCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3L 4987369 5' + I-element 1 1 75.25 TATCTCTTTTGCATTGCACTGCTGGACATCTTGAAAAACTAGCCATCATTTTTATATTTGCTTGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATT:1 - chr4 397710 5' + Idefix 7265 2 64.36 GAGAGCTCGAATGGAAGAGTTCTTTCGCTGCTCCACTTAAGCTCAGCTTAAGACTCTTGACACATTCTCCTGCACACACACACACACACACACACACATTT:1 - chr2R 15887775 5' + accord 7031 2 69.31 CAACGCAGCAGGTGATGTCCACGGCAGTGGAGAAGGGGAAGAGAGAGGGTGCCTTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGG:1 - chrX 9750210 5' - accord 139 2 56.44 TTTCTTTCTTTCAAAATCAAAGCCACACATTTCTTCCTAGCCTACAACTTTCTTACATAGAATTGAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGATC:1 - chrX 1246097 5' + Doc 4494 1 73.27 TTTTCGCTGTTAGACTTTGGCTTGCTCCATATTTTCTTTGTTTCTTTTTCTTGGAACACTCATTCAAATGCCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGG:1 + chr2R 16820848 5' - gypsy4 328 2 71.29 GTTTANTTAATCAGTCAGTCAAGTCAGTGGACAAATAACAACGATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTC:1 + chr3R 11638101 5' + invader1 3893 2 57.43 AATGCCCATAACGACGCGACCCCCTGAGTGGATCGATCGATCTTATTCGGAGCAGCCGTTTATACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCA:1 + chr2L 385063 5' + F-element 340 1 68.32 TCACACCGACTATAACGGCAACACCTGCTTTAAAAGCAGTAGGTAGATATACCGCATCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACAC:1 - chr4 169911 5' + accord 7100 2 60.40 CCAATCGCTTTATCGCCCTTCTACAGGCGCTGATGCGACAAAAGCAATTTCAGCCGCAGCCTGGCAACGACATTGGACTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 - chrX 8222780 5' - jockey 4927 1 80.20 AGTGCATCAGAGCAGTACCGGTGTGATCAACACTTGTGCAATGAGCCAGCTTCACCAGTTTCAAGGTTTCCAGATTGATAAAATAAAATAATTTTAAAAAG:1 + chr2R 3785253 5' - 1360 3092 1 81.19 ACTTCCTGCTCTCTTCCTCTTGCAAAAACTACGAAAAACAAAAGTATCGATTTTAATAAACACATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAA:1 - chr3R 16237610 5' + Idefix 7144 2 67.33 TTTATGTGTATTTTTTAATTTTTCCACTAAAAATGTGAGTTGTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTAATGAATT:1 - chr3R 4064355 5' - G4 32 1 58.42 GGCAGCCGCGGCGGCTGCCTTGCGTCCCGTGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAAT:1 + chrX 6325110 5' + opus 367 2 70.30 AGTGCACATAATGCGAGCAGCCCATAGCCACCACCAGCCTCACCAGTAGCACAAACACACTGAGATATCAATCATTGTGGATTTCGTGTTTGTCCCAGTGT:1 - chr2R 20709274 5' - Tc1 1611 1 76.24 AAAAATATTTCCACGATTTCGATTTCCACGATACCCGTTACTCAATTAGTTCGAGTGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAA:1 + chr3L 20659420 5' + X-element 4281 1 57.43 CCCTCTGCTCCTTGCCAGCATGTCCTTCCATGGCCATTGACAGGCTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTTCAGTCGCCATTATACG:1 - chr2L 1235657 5' + mariner2 117 1 55.45 GAATCATACGCTTTAGATGTGCTATCGATGTCATTACAATATGGGGGATGGAATTTCTAGTGAATCTGAAGAGAAGCTTAGCCGACTAACCGAGTCGGGAC:1 - chr2L 7455002 5' - Cr1a 4077 1 52.48 CGCAGGCTTGGGGGCGAGTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCG:1 - chr3R 7002419 5' - HMS-Beagle 116 2 64.44 CAAATAAGACTGCAAGTTAATTGTATTTATGTTTTGCAATATTTCTCAGTCGTCTAGCTCTTTTTCCCAAGTGTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTT:1 - 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chr2R 18213487 5' + invader1 3581 1 62.38 CCCATATCCCAGAACCACAACTATTTCTGTTTGAATTCTGGCCGCTTATCAGAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCT:1 - chr3R 17727607 5' + I-element 5015 1 54.46 GTAGTAAAGATTTTTGGTGTAAAAGTTTCAGTGCAACAAGTTTGGGAAAATATAAAAGATAAATATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2L 6605538 5' + blood 7023 2 63.37 CTATCTGCTGTCCCTTTATATATATTATTGCGGATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 - chr2L 17050211 5' + flea 39 2 73.27 AAACAAAACACAAATACGGACCACGAGAGCCACTTTCAGACTTGGCAAACAAAACAAAGTCACTCGGCAGGTAGGCACGTAGTACATAAGAAATCTTTTTC:1 - chr2L 18015859 5' + Tom1 161 1 62.38 GGATTATAACGATTGCCAAACATATGGCCATGGATATTCACAATATGTGAGTGAGTGCTCAAAAGATTTGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCACCGGC:1 + chr2L 9583520 5' - gypsy6 7780 2 77.23 AAAGACAATTGTCTTAAGTGTAAGCAAATCACGCGTGGATTCAAGACCAAAACCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATTCAACTGCA:1 + chr2R 12275691 5' + Doc4-element 2620 1 53.47 AATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAA:1 - chr2R 5395188 5' + Doc3-element 113 1 68.32 CCAATATGCTACCATTAATCCATGAATTACTTAAAACCACATTCCGTGCAGCGGCTACTCTATCTAGGGGTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAAC:1 - chr2L 11024327 5' + R2-element 372 1 54.46 CTCCGCTTTCACGCTTTTTTGTTGTTTTTTATTATT:1 + chr3R 8432799 5' - BS 5099 3 88.89 GCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr3L 3254988 5' + 1360 49 1 74.26 AGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr3R 27619263 5' + hobo 39 1 66.34 CTGAAAATGTACAAAAAGACATACGGCGATACGAATAACAATAATAATAATGCAAATACAAATACAAGACGCACAATAAAACCAATATGGACGTATGGAAT:1 + chrX 7651407 5' + Porto1 4261 1 74.26 ACATACATTATAGCTCATATTGATTGATACTCACATTTAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGC:1 - chr2L 1524040 5' - hopper 1317 1 62.38 ATTCTTGCTTGTCATAGGTGCCGATTCTCTTCTGGTACCTACAAAAATTCAACAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCAGTCACCAAAAAAGT:1 - chr2R 6742857 5' + 1360 3328 1 57.43 GTAACTAACCGGGTGAATGCGCAACACCCGTATCATTGCCTTGCTTCCGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGA:1 - 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F-element 405 1 60.67 AGAGATGCGCGAGGCATTCTTGAGTTTAGTTAAACCGTAAATTATACAACAATAAACAAAGAAAGAGAAAATTTTTTTAAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGT:1 - chr3L 1140509 5' - INE-1 254 1 71.29 ATTTCGTACGCCAGCCTAAAGACTTACAAGTAATAAAGAGTGTGTATTGTTATATAATAAATGTTTAACGTTTTATAAATACTTTTTTTTTTACATTAAT:1 - chrX 5845216 5' - Doc 4589 1 70.00 CGGTGNCCTTGAACGTGTCGCTGCCACGGGCGTGTCCTGTTCCTCCCTTTTATGCCCTACCCTACCTATGACCGCTTACCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGG:1 - chr3R 13567210 5' - gypsy12 9879 3 59.41 GTCCTGCAATTATTCAGCAATTAAAAACAAAACAGCCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCGC:1 - chr2L 1020157 5' - HMS-Beagle2 6781 1 64.36 CTGTTGCTCTTGCTCTTACTTATATTTATAAATATAACTTAAATCCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGG:1 - chr2R 18306645 5' - Quasimodo 167 2 58.42 CCTTATGCCTTTGAAGGCTTAAAGCGGTTTAATCGGTCCCTTCCACTCAGCAAACCCATTTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAA:1 + chr2L 16054468 5' - hobo 2495 1 66.34 CATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTAT:1 - 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chrX 3030975 5' - hopper 87 1 64.36 TTTGGGCTGTGGAATGAGAGCGTGCGCGGACTCCTCTTGTAGGGGACCTCGATAGGCTGTAGCTCCTCCTGAACGGGTCGTTGGGATCGG:1 - chr3L 18402564 5' - Rt1a 468 1 68.89 CAGGTCACCCGATGCGGCCACAAAGGCACCGCCGGTTTTAGGATTACGATGAGATGGTTTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGT:1 + chr3R 28593198 5' - gypsy4 6496 1 67.33 TCTGCGCCAAAAGCAGCAAATTTCATTTCACACCCAAAAGACCCCAGACATGCCAAACAAACAACAGAATTTTTTATAAATTTTTTTTTTCTTTTTAATAA:1 + chrX 2822954 5' + hopper 154 1 52.48 TTTTCGGCCACGAAGCAAACTTAATTCTCAGGCGAACTTTAATTCTTTAAGTTTTATACTTGGGTTTTTGATTATACAAACGCCCAATTGCCAAAATCGCT:1 - chr3R 10084732 5' + 3S18 5703 1 64.36 CGAGCCCATCATCAACTGCATTTACATCAACAAGGATCCAGTGACGACCACCACCACGCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCA:1 + chrX 4559759 5' - jockey 15 1 57.43 GACCGCCGACAGGTGCGCCACCTGCCGGAGCAGATCGGAAAAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTTAGTAATACAAATGTATCTTTCCA:1 - chr2L 6584561 5' + HB 45 1 59.41 CGTCTCAAACGGATCCGGTTGGTGATTGGAGTCCGAGGATGAGGGCGACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTT:1 + chrX 16596974 5' - R1A1-element 355 1 53.47 CCTAAGGTTATTTTCTTTCTTTTCTTCCCTCGCCCCCACTTGAGAAGTCCTTACCAAATCTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2L 14062954 5' + jockey 25 1 50.50 GGTGTTCAGCGCAGCGAGCACTCACACAGTCGCACGCTTTCATCTCATACACAATAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 16487074 5' + X-element 4717 9 76.00 GAACACAATTGTTGCTCATTACTGATGAGGCAAATACATTATTTGCTGGTTGAATCCTTACGTTAAATTTTAAGCACCATTAAAAAATTATCTACTTACTT:1 - chr3L 14866955 5' - looper1 350 1 72.28 CTTAAATACAGGCCGAGCCCGGGCGAGACCAATCGCCCTCATCATCTGATCACAAGCTTCCCTCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAAGATGT:1 - chr3L 22181788 5' + Tirant 417 1 65.35 AAATCGCCATTAACAATGACTTTTTGTGTGGCCAAAAAATAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGC:1 - chr3L 11762414 5' + mdg1 368 2 60.40 AGCAGAGAGGTAGTAGCTATGTGGCAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr2R 21937497 5' - 412 442 2 77.23 AGAGCGTCCCCCTTCCGCTTCTGGCTGGAGCGGGTGCAGCCGATGACG:1 + chrX 17655358 5' - F-element 463 1 64.58 GTACTTTCTTTTCTCGATTAACCAACTGAAGAATCACATATGTTTTTCGTACTTTTTTTACTTTTCATTACCTACACAAAAAAATTAAAATTGATTGCTT:1 + chr2R 21192672 5' - Cr1a 4259 1 78.00 AAGACACAATATGCTTGTGCATGTAAACTGAGGTGTTGTGTTATGTTAAAAGTTAAGTAAAATATATTTAAAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chrX 3050752 5' + I-element 12 1 72.28 TGCAGCCAACAGGCGGGCGGGGAATGTGAACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCT:1 + chr2L 9827162 5' - roo 8759 2 71.29 CAAGCAAGTTTATCTCTTCCCCCAAAACCCAACCTAATCACAATATCATCATCAAGTTCAACCAAAGATACTAAAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2L 16747435 5' + 1360 17 1 63.00 CCGGGAAAATGTAATGCTTCTGCTGGCGTCTGGCGGTCGCGGCGCCAAAGTTTCTTTATGACCTCTGCTCTGTATCGCGGCTGTTGCTAGGCCACTTCCCT:1 - chr2R 24634806 5' - gypsy8 35 2 76.24 GGAATCGGAAGCTTCAATCTGTGCACATCCCTTCTGGGACCATTACTAATCCGCAGGTTTCCGCGTCGACCTCTAATGACACACGGGAAAAACAGCGTCCG:1 + chr2R 8088647 5' + baggins 5102 1 78.22 ACATATATTAATCCAAGTATCATTGCAAGGGGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACA:1 - chr3R 3920664 5' + 1360 3243 1 43.56 ACAATTTTAATTTTATTAAAGAAACATTTCAAATTAACCGCACACACACACACACACACACCCATGCATCGCACATACACACACACACACACACATATGCA:1 + chrX 15370859 5' + accord 186 2 60.40 TCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGAT:1 - chrX 22824230 5' - Gypsy12A_LTR 2255 1 48.51 ATTGATTGTTCAGAAAACATACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCG:1 - chr2R 21857621 5' + I-element 4930 1 78.49 TTCCAACCAATCACTTATTATTACCCCTTCTTCCCATCTTAAAGGGGCCATTTAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCC:1 + chr3L 18343061 5' + Idefix 181 1 47.52 GGGTTGGCGGAAGAAGAGGATCTGCCTGAAATGCAACAACAAAATGCAGTTTAAAACTGCCGCAGCCGCAGAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACAC:1 + chrX 17399508 5' - accord2 65 2 73.27 TTTTGTAGATCTCCCAACTAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 - chr3R 25810162 5' + 412 7137 2 78.65 ATTACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3L 25798514 5' + blood 7045 2 59.41 AAAGAGCTTAGAAAGCTTGTCTCTGCAAATAGATGAATTAACGTTTAGCTGACAGTTTTGTAATACCAGTAATATTTAGATAGATGGCGCCACAACAAAGA:1 - chr2R 16605402 5' - Transib-N1_DM 367 1 66.34 ACAAAAGCGTAAATACCCGAAGGACTTAACAGTCGCATTACGTATTTCAGAGTCTCATCCAAAATACGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTC:1 - chr2R 21421111 5' + springer 7145 4 67.33 GCCATGGCACCGGCGACTCTAATTGGAAACAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 11833011 5' - roo 9028 1 68.32 GTGGANAGAGAAATAAAGCAATTTTGTGGAATTTTGTTACAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTG:1 + chr3R 3618921 5' + P-element 215 1 40.00 GGCAAAATGGATGACGAGGCTGGGGTTAAACAGCTGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 + chr3L 3802306 5' + jockey 4708 1 63.37 TGAGCACGTTCCTTGGGAAATGGATCTTAAGGCAGAATATTCAGGGGTTTTTTGAATGTCCTTGTATGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTGACA:1 + chr3L 1377029 5' - HB 388 1 66.34 CCGGGTGTTCTTGCCATTCATGTCGGTCCTCCAGATCCATCTTCAGATCCAGCTCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTG:1 + chr3R 8817747 5' + F-element 4245 1 60.40 TATGAGCGCCTCGATCCCCATTCACTGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCG:1 - chr4 826324 5' + pogo 182 1 74.26 ATGGTGCCGATAACATTGCCGGGTGGTGCCGAGACCTCGATACTCTGCAGACAGCAGGGAAACAGACAGGAGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACC:1 + chr3L 10221732 5' + Gypsy6A_LTR 339 1 83.00 TGTGGCCAATTCGAAATGTGGCTGTGCTGCAAATTGCATTACTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACAAAATCGATCCCGA:1 - chr3L 2366078 5' + 17.6 374 2 58.42 GTAACATTTCCACTAGAGTAAACAATCAACGGTGGCGCCGAAATCACAGAAAACAAAAAAAAAAGATCCAATGGGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAA:2 + chr3L 15734985 5' - Max-element 427 1 83.00 GTGCGGCACTTTTCATTATTTGCAAGAACAAAAATGGTGAAGAAAAAATAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGG:1 + chr3R 28987598 5' - I-element 5069 1 53.47 ACGCATACGATACAGGGCCTGGAACTTGTCATCTAGCCAGGTTCGCACTATGAGCATCTGCCTAAGAAAGAGGATTGTCCATTG:1 - chr3R 15194568 5' - G3 368 1 70.24 TTTGAATGCCCATTTAGAAGTTTAGAGTTGGATTAGCTTTTGTTTTTCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGTGGTTTTGCTTTCGCTGACTCAG:1 + chr4 334346 5' - F-element 493 1 63.37 GGCAGCCACCATTCAATTGTGGTTCTTTTCCTCTTTGTCTGCGGTTTATGGCTTTTAATTCGTTCTGAGCGTGCAGACTGCTTTCTTGCGGTTCTTTTAAC:1 + chr3R 25504716 5' + Cr1a 353 1 69.31 CAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCA:1 - chrX 21667926 5' + gypsy2 6523 2 56.44 GTGGGAGCCCAAGAATCGCACAGATGACGATGATGACGTTAAAAAAGCTGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGT:1 + chr3L 12594405 5' + flea 4663 1 66.34 AAGCCAGTTATGCTATGGTGGTGCAAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGATTTTCGGAACTTTTGGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTG:1 - chr3L 7181853 5' - FB 113 1 73.27 ACTGCAGATTACTGAAGCGACAGATGTAAGCTTGCTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 + chr3R 28012524 5' - diver 180 2 67.33 ATGCACCGAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 7808935 5' + jockey 30 1 56.44 ATCGTGCTAAGCTGTAGATTCCGCTCTTGCTCATCCTGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGT:1 - chr3R 8517358 5' - Bica 262 1 63.37 CATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAA:1 - chr2L 22227337 5' + F-element 63 1 78.22 AGGCGTCACAATGCAGTATGCAAAACATACAAAATATTCCCTATAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCATCGTTGCAGCAGGCGTCGGCAGCGG:1 + chrX 21224528 5' - HMS-Beagle2 7056 2 80.20 GATTTCAGAAATATTTTTCATATTTTATTGAGAACAATAGCATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATAAAACTCATAGCGGCCACT:1 + chr2L 18948574 5' - gypsy6 121 2 59.41 CAAACGAGTTGGAAAGTGCGAATTTTTGCACGTCTCGGTATTAGCATAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGG:1 - chr3R 9920965 5' + Bica 427 1 53.47 CGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTA:1 - chr3L 25482928 5' - Porto1 4411 1 67.33 ATTGTAAAGATGGAATTTAACTGAAAAAGGTGGTAGTAATTTTGAGAAACTGATCTTGTCAACCCTATTTCCCTCCGACGTCTGAAAAGAATACATCCACA:1 + chr2R 3175766 5' + G5A 2681 1 53.47 TTTTGNCATTATGGTTACAATGGGGTATTGATGTCTTTTTGTGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAAT:1 - chr2R 7967592 5' - I-element 499 1 70.30 CGGTATGCTTCCGCTGGCACACAACGACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCCGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCA:1 + chrX 2033979 5' + F-element 479 1 75.25 CCAAATGGGAAATGCACCCTTAAAATGCAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCCAACC:1 + chrX 14213248 5' - Burdock 6024 1 73.27 GATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTATTTTACGTGGCTTGTTCCACACTGA:1 - chr3R 2412144 5' - R1A1-element 5302 1 69.62 TAACTTAATGCTAAATAGTTGGTTTGACTTAAACGTACATTAGGTTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATAT:1 + chrX 2444295 5' - Porto1 4390 1 53.47 CGTGATTGAGGGGGAGGGGGTACCGGATTGGATTTATGGTCATTACGTTGGCAAGCGCATGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTAC:1 - chr2L 12979096 5' - Quasimodo 262 2 63.37 GAATANTTTATGTGCCAAGGTTTTGCCTGTGACCAACACACACTGACTCCCTTCAAGGAAGTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 11005442 5' - roo 9055 2 56.44 AATTGTTTTTATCGCGAATTGCCAACGCTCTGTACAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chrX 3485649 5' + P-element 41 1 38.61 TATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATTTATTTTTTGTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGAAGCTTTCGCTG:1 - chr3R 19446750 5' - Doc2-element 4476 1 62.38 TCAGCGTCGAAAATTGCAACAAAAAAGTAAAATAATTTAAATAAATTTTCCAAAAACACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTGTGCGATGC:1 + chrX 11164633 5' + Doc2-element 115 1 72.28 TTTTTTGCCTTTTTTGCCTTATGATTTATCCATCCAGACAACAAAGCAGCGGAATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTAAGAACACGTGTTTTC:1 - chr2R 15492221 5' - blood 7367 2 50.50 TATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGGTGCTGCCC:1 + chr2R 4577083 5' - Chouto 482 1 60.40 AACAGCACGGGCAGGTGAGGCAAATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCAACCGCATACAGCG:1 + chr3L 22427778 5' + G-element 3951 1 77.00 AGCGTGTGCCCTCCGTGAAAATGTAAACAGAAATCTGGCATTCAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTTTGTCCACTTCCGATTTCAACATAATTATGATCAAC:1 + chr3R 9088666 5' + diver 5810 1 71.29 CCGTTTGAGGGAGCTCACGCCGAAGATCATCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAAT:1 + chr2R 8397613 5' + jockey 4818 1 71.29 CTGATCCAGATAGTAGAGGCGCATCTTGTTGGGCGCCAGACCCACCAGCTTCTCCAGCTTCACCTTCAAATTCGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTCGGC:1 + chr2R 10156775 5' + 1360 3313 1 70.30 CGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 + chr3L 17858170 5' + HMS-Beagle2 6920 2 68.32 CATGTGAGGATGTCACAAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCATTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chrX 19561839 5' + 412 56 2 76.24 CTGACATGTATGGATCAAAAGGGATAACAGCACTGCTTTGCGGATCATTTTGCTTGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACCTTCAG:1 - chr2R 22214504 5' - Tc1 417 1 75.25 TGATGCAACTTTGTTGAGCGGGCATAGCTGGAGCGAATGTTGCGCCAACGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 - chr3L 14411545 5' - Tabor 7269 2 51.49 ACAGGCCTCAGATTTTCTATAAAGCACTCGATATATTAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr2L 17004738 5' - roo 9034 1 61.39 TTGTCGCACCATTCTAAACGAAGGATCGCCAATTGAGCCCAGATAGAGGCCCATTCCTCCTGAAACGCAGGTAGCTCCGTGTACTGGATACCACTCCTGAT:1 - chr3R 29126865 5' - G2 474 1 53.47 ATGCAGTTATTAAATTTCTATTTTCCACCCAATTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr3R 21010746 5' - hopper 1371 1 69.70 TAGACAAACACACATAAATGCTAATTACAGAGCCCCGAAAACTTAGAGACCAGCAAATCGACATATGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGT:1 + chr2R 14787841 5' - R2-element 3110 1 66.34 CGATANGTCCGGGTGTATCAGCAACTTTTGTTGGCAGCAACATGACGGTTGGCGGCAACATACTTTAAGAGCATCGATGGCTGTTTTGAGGGAACACTTTC:1 - chr2R 625775 5' + mariner2 503 1 62.38 AAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3L 22564809 5' + blood 22 2 57.43 GAGTGTAAGCTGGCAGCCCGCTGTTTTTGTCACTGACATTCGAAATAATTTTGTTGGCAATGTTGATGTCGTTGCTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGT:1 - chr2R 5910574 5' + hobo 2549 1 80.20 CACCGGTTCTACAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAAA:1 - chr3L 13559425 5' + Doc2-element 246 7 91.18 TGGGATCTCATAAATAACTATATATCTCAAGTTAAATTAAAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACCGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 11240863 5' - roo 400 1 66.34 ATTTCCTAATTCGGTTAAGTCGCTCCAGGCATTCTCGAATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGAGCGGAAAGAGCTCATGATGCAATGTAAATTTGACAAAATAG:1 - chr2R 19220401 5' + 1360 201 1 81.19 ATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 23456276 5' + 1360 4 2 69.47 TGAGCGGAGTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr2R 10697048 5' + 297 6623 2 69.31 CGCCCCGTAACTGGGAGTACCAGCACCTTGAACAGCACAGCTACGACCCCCCAGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGA:1 - chr2L 36620 5' + G2 2834 1 60.61 GGTGGCGATGTGACGCAGATTGATTATATCGGCTTCATCGGTTCCCCCATCATGACTACCAAGATGATCGACTCGGCTATTGATCCTGTTCAAGAATATAT:1 + chr3L 5766879 5' - INE-1 82 1 68.32 TAGAACTAAAGTACAGACAATATTCTTAGCTTAGTCTACCCTTCCCGAAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACGCGGGGAGGAGTTAACACGCGCAGGGC:1 - chr3L 25772985 5' + gypsy4 6567 1 61.39 GAAGAATGTGATTGGTTATAATTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 - chr3L 25341880 5' + 297 6632 2 81.19 AATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGT:1 + chr3R 2527719 5' - INE-1 581 1 52.48 ATTGAACAATTACTAGAAGTCTATAAAACTATTTTAAAATCAATAAAAATCTATAGTGGAGTTCGCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chr2R 1995060 5' - INE-1 537 1 56.44 ATTTCTTGTTTTTGTTGTTGTCTCTATAAATATAGTTTTTTTTGTTAATTTGTATGTTGTTTTATTTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGC:2 - chrX 3703387 5' - gypsy4 491 1 61.39 ATAATTCTGAGGAATTTTTTCTATCAAAAATTCTGCACCCAATTAATTGAAGACGTACAAATTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 25931297 5' - roo 395 1 65.35 TACTACAGGTTTACATAGCGCAGCGCTTAGTTTAGGTATATAGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCAC:1 - chr3R 14301730 5' + 412 7168 2 58.42 ATCTGAGCCTTTAAAGGCAGTAGCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2R 3172236 5' + 1360 54 1 78.22 AAAAAAAAGTATTACATTAAATTATGTTGAAAATTAGGGAAAAGTCTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 15814649 5' + roo 8696 2 59.41 ATGATGACAAAGTTGGAACACATGAATTCTATTCTTTTGATGCGCGGCCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAAAATAAAACTCAGCTGCGTTTACAAACGC:1 + chr2R 5329614 5' + rooA 7443 2 53.47 ATCTTCTGTTTTCTAATAAACTTCAAAAATACAAATTAACAAAACGCCGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAAC:1 + chr2L 17863143 5' + F-element 334 1 53.47 GACCTTGCTGACTAATCCAAACGAAAGCCAAATGCTTTTTATGTCCCCCTTGCTGCAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr2L 15019746 5' + jockey 4689 1 57.43 TCGGACAGTGAATACTCAAAGAGTTTTCACGCCAAAATAAAAGGAGGCATAAACACACTCGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1 - chr2L 13927797 5' - 297 6894 2 70.30 GGTCGGGAAAGTTCGACTCACCTGGCCACTAAACGGTTGAACTTTATGCAAATTAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCC:1 + chr3L 22923634 5' + gypsy4 456 1 59.41 TCTTGTGTCCCGTAGCAAATCTACTCTATGGCTATGGCTTTCGGGTGGCATAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAAT:1 - chr2L 22076074 5' + invader2 5006 2 64.00 TACAGTGGGCGATCATGTGGATAATTTGACAGATTCGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGG:1 - chrX 5373847 5' - HMS-Beagle2 7048 2 56.10 AGTTCCCTTGGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 2090314 5' - roo 395 1 66.34 TTGCTCAAGCTGGATGGGCTCGTTTCCACTGTCCTGCCGATCTAGTCATCCCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGT:1 + chr2R 4674826 5' + Quasimodo 368 2 52.48 GCTTGGCCTTTTATTAGCCGGGCGTATAGAAATGCTAGCTTCATTTATTGCCACGACGAGTACACCAATTTGTCATTAGTGTATTCAGCTTGCGACGTGTG:1 - chr2L 2052294 5' + 1360 417 1 70.30 GTGGGGGATATAGCTTTGCAATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACATTCTGCCAAAGGGCCA:1 - chr2L 12843420 5' - roo 8649 1 66.34 ATGGTNGTCAGAACATTATTTGTCTTGAATTGTTAGTTTTGGCACCGCCAATTAAGGGGTATACAGTTTCTCAACATCAACACGAATAAGCTTACAAATAA:1 - chr2R 5477567 5' - Cr1a 4044 1 56.44 GGCTGGCAGGCAAAGCTAATTTGACTGAACGGGCCAGGAAACGGAAGTGGAAAGCGTTGTGGTAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCG:1 + chr2L 9147587 5' - F-element 4467 1 69.00 AGTCCTCATTACGGTTGCCCGCCATACCGTACGTGGGAATGTCACCCAGAGTGCGGCAAAACTCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 + chr2L 11985335 5' + jockey 4723 1 71.29 AACCAAGAAAAACCACACAGATGAGTTAGGCATGCCGCCCACTTGGCCTTTTTGAGAGAGCCTTAGTTGTAATATGGAGTTTGCTTGAGTGGAAAAGCCAA:1 - chr3L 17061034 5' - G5A 2355 1 56.44 ATTAAAGTTACATTACATAAGCTAAGCTTGTGTCCAGTAGTGATAGAGATAGAAATAGGTAGACAGTGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1 - chrX 13143613 5' - roo 8968 2 70.30 GACGANATACGGACAAACGGACATGGCTATATCTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATG:1 + chrX 5245657 5' + 1731 75 2 69.31 ACGTCGCGATACTCCTTCTTCACCACCGTCTCATCGATGATAATGCCCGTCGCCACCACTCTGCTCAACTCATCATCCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTG:1 + chr3R 14322747 5' - TART-B 155 2 52.48 TTAGTTGCTGATTTTTATTGTTGTTTTTTCCATTGTTTATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCT:1 - chr3L 21098252 5' + TAHRE 10403 1 63.37 TAGAAAGTGACTAAAATTATCAGGAAATTCTATTTTTGGTATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:1 - chr3L 6062041 5' - Juan 4128 1 60.40 GCTCCNTGTTGTTGTGACCCTTTTTTTTGGTAACCCTTTAACTTTTTTTCGTTTTCGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 13921720 5' - Doc2-element 232 1 73.53 ATGTTTGCATAAGAAATTGGATTTTTGCATTAGTTATGGAAATGAGAAAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGC:1 + chr2L 12772561 5' - flea 4633 1 54.46 GATTTTTACGCTTTTAAAAGAACAGAGTACTTGTTCACCACGAACGAGCACTGCGTCGGATTCTGGATGACGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTA:1 + chrX 13168607 5' + 412 314 2 46.53 TTTTTTCACATATTTATTAGTCTTGTAAATATCTATCGATTTCCCATGCCCACTTTATGGTCGAGTTGCGTATATGTATACCAGGGACAGTTGTTTATTTG:1 + chr2L 22063437 5' - Helena 1153 1 72.28 CATGTAGGTGAGGCCATTCAGATCGATTTGGAGGCGGTATCTCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTA:1 - chrX 9256964 5' + 3S18 35 2 55.45 AACGTTCGCGTATGATCTGCAAGATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 14582914 5' + roo 17 2 61.39 ACGCGATGACCACATTTACATACCAGAAACCCACACAGAGACACAAGTTTCCGCAGCTCAACTCAACACTTTTATTATCTTAAAACTATGCTTAATTTAAT:1 + chr3R 26128546 5' - Transib5 435 1 59.41 ACCGCAGAGCTGAGGCGGCTTGACAGGCACTTGGACGTGGCAAAAATCGATAGAAATTTAAGCGACATATACAATTATGAAAAAATATCCAACAATTTTTT:1 + chr2R 21270260 5' - INE-1 385 1 65.35 GACGTGGTATATTGATGTCATTGGTGTGAATTTGTGTTTCATTTAATTCCACGTTTTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGC:1 + chr3L 1141591 5' - G5 4562 1 61.39 GATATTATGACCTCTGGATTGTCCATGCTGAAATCTGAAGAGTAATCCACGTTCAAAGCTCGGACCCTCAATCCCGAAAAACAAAAGTATTGATTTCAATA:1 + chr2R 294346 5' + Idefix 284 2 54.46 AGCTTCCACGGATAGTGGATTCGGAACATATCGGTCAAACATCCTGATTTTTCGGGAAAGCATTGTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAG:1 - chr3L 26294672 5' + 1360 3303 1 69.31 GTTTTCCTGTTTTCCGCCATCAGCTGTTAATAACTAAATAAAATAAATAAATAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAA:1 - chr3L 17707752 5' + F-element 135 1 65.35 CATGTGGTTGTGCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr3L 22324098 5' + hobo 31 1 50.50 TTGTAGTTTACTAAGTGGTTTTATAGACATCAATTATTTTGTGGTGGTAGCCTCTTCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAA:1 + chrX 9350518 5' + R1A1-element 41 1 56.44 CCACTTGAGCAGAGACAACTGACTTCCTTGAGCACGGAAAAGAGAACTGCCAAGTGGACTTTGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATG:1 + chr2L 2170969 5' - Chimpo 4016 1 67.33 ACGCACCCGGCCATTATGTGCATTGCCATCGCGTTTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGT:1 + chr3L 6660843 5' + 1731 4585 1 72.28 TTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATT:1 - chr2R 2875203 5' - TLD2_LTR 114 1 67.33 TTTTCCTTTAAAAAGTCAAAGCTTAATTTGGTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 1399955 5' + P-element 4 2 75.25 TAATGGAGCATACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2L 9823615 5' + hobo 15 1 66.34 CCAGTCCTGGTCTAAATATTAAAATTCATACGCCATGTCGTACAGCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGTCGACTGCACTG:1 - chr3R 22834603 5' + Doc3-element 4562 1 55.45 ATAGTCTTAAAGCACACACAATAATTGTAATCAACCCCCATGGTGTAATGGCAACTATTGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCAC:1 - chr2R 15002440 5' + 3S18 5784 2 53.47 CATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:1 - chrY 2720354 5' + opus 6 2 73.27 AGAATTGCTCCAGTTCACGCTTACAGGCGTTGGCCAGCTTGGGGTCCAGTTGAATGCTCTCGCGCTGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTT:1 + chr3L 21504580 5' - HMS-Beagle2 84 2 71.29 ATCATTTTGAGTATCGTTTTCTTTTGAACCCCTTCGTATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGC:1 - chr2L 13105500 5' - Quasimodo 420 2 67.00 AGTGTGAATGCGAATGTGCCCGTGTTTGCCAATAGTTTGGCCGCCGCCCTCTTTGTGTCCATGGTTTCAGGAGAGCCTGTAATCTTCCTCAGAGTTTTTGC:1 + chr2R 8702650 5' - jockey2 2970 1 76.24 AGTTGNAAATTAACAACTGCTTGGGCTGCGATGAAGTGGAGATAAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCTTTATCTTAAAT:1 - chr2R 23273646 5' + Cr1a 4132 1 55.10 AACTAATAGCACAGACCAGCTGGAAACCAATTTAATTCACTACAGTTATGTTGCCATTTTTCCTCTCCGCTTGTGTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGCATG:1 - chr3L 13834584 5' - accord 7026 2 61.39 ACGAAGTTAGTGTTTTTCTATCTATTTTATAGCACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATC:1 + chr3R 11160856 5' + accord2 7295 1 67.33 AGCGGGGGCGCCGCCACGAACGGTTACTCCCGCATATCGAGCAGCTAAAGTGCAATCATCTGCACTTCTCCGCCTCTAACGGCCACTGCTTCGCTGCCGAC:1 + chrX 22457925 5' + HMS-Beagle2 7045 2 43.56 GATAGTCGATAGACTGGCTCTGAACCACTGCTGGCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGAGCTGCTTTACAAGTGTCAAGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 20803412 5' - blood 7180 2 58.00 CTTTGGCCGTCTAGCTGCCAAACCAACGGAAAAAACGAAATCGTACACTGCGTAGGTTATGAAAAATGTTAATAAATGGTTGTATTTAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 16104219 5' + transib2 2633 1 70.30 TTCTTGGTGATGCCTCCCTTTGGACACTAATCTGAGGAATTTCACTAGACAAACTGCTACTAACATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATAT:1 + chr3R 15916575 5' - Bica 4559 1 43.56 CATGTAAAACAGACAAACAAATAACAAAATGCTACTAGAATTGAAAACCTAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAAT:1 + chr3L 4193699 5' + mdg3 5147 1 56.44 GCGTGGTGTTGCCATTTTTTTTGTTTTTCCTCCCCGTTGATATTGTTTAACTTTTATTAACTTTGCTTTTAACTTTGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 - chr3L 9215994 5' - HeT-A 6059 2 59.41 ACCCATAAGCCCATCTCACTAGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATG:1 - chr2L 7134507 5' - accord 210 2 79.21 AGATACACTCGACACTAGAGAACCACCTAAACAAAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAAC:1 - chr2R 19839759 5' + I-element 360 1 66.34 TCCGTTTAATTATGGAAAATGATCATGACAGAGAGCATTTCCTGTCCCTGTCTGCGTTTTCAGTTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAG:1 + chrX 4576015 5' - jockey 4573 1 64.00 ATTCTGAGCAATTAAAACATTATAAAAACAGACAGTGGCAAATGCATGTCATTCGAATTAATTGATCAGCAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCT:1 + chrX 4868057 5' + 1360 3227 1 71.29 TAGAGAAAATTGCTTTTGTGGGATTGGGAACTTTCCAGCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTT:1 + chr2L 1541701 5' + Doc 276 1 63.37 CTCTTGAGATTTGCATACCAGATGCGAACGAATGCCGTCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 + chr3R 10490333 5' - transib2 2798 1 53.47 ACTTTGGTGTTTGAAATCTGTGTGTTTGTTTTATTCCCCAATATCTATCTATATCCCAGAAAAATGATGACATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGT:1 - chr2R 5724987 5' + INE-1 531 1 72.28 GGGAAACACCGAAAAACAGCCATCGTAAACTTTACGAGATTGGATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATA:1 + chrX 17049548 5' + Stalker2 7272 2 51.09 TAAAAGTATAAAATATGTACAACTTTCTCTTCAGCTCGTGGGCTATAACTAAATCTACCGACTACTAAATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGAT:1 - chr2R 8225829 5' + hopper2 1337 1 74.26 ACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 19450160 5' + roo 29 2 75.25 CCATTTCGCAATTAGCATTGGCGTACACAACTAATTTGCGCTGCGGGATAAGGTTGACTACGCCGCCACCCCACACCACCAACGATGCGACTCAAAAACA:1 - chr3R 17602512 5' + HMS-Beagle 6724 1 79.00 TGTGACAACCTAAATCGGGGCCACGTACATTTTATCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCC:1 - chr3R 20353779 5' + Doc 435 1 66.34 ACTGCATTTATTGTGTCGCAAGTGAAGGGTATGTAAACTTCGACCCGCTGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTG:1 - chr3R 10833330 5' - F-element 421 1 56.44 ACTACAATGATAAAGATAAACCCATACGAACACACACATACACACATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAG:1 + chr2R 24557071 5' - Ivk 5038 1 55.56 TGCTGCCGCTTCGGCTGCCACTTGCCATTTCCTCACATTTCTGGCCCTTTTTTCGCAGGGGTCAGACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGC:1 + chr2L 4798577 5' - Cr1a 4415 1 52.48 CATCGTTTAGAATGATTTTCAATATTCGTTGCTGCCTGCTTCATTCATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCG:1 - chr3L 11210535 5' + Stalker4 7123 6 55.45 CAATTGCTAAGCATTTATCTTATAAATATTTGCCGCGTATGCATGTTTTATGTGCTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACGGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGC:1 - chr3L 15939924 5' - diver2 4796 2 63.37 ACATAATTAAGTGAATCGTTTTCCATTCTGAACACGCCATTCGTAAATTCCTTCTTTTGTATTTAAACCCACTTCTCTTCATCACTCCATCTTGCCTTTAT:1 - chrX 14519370 5' - R2-element 469 1 75.25 ATTCCCCAATGATGACCGAGCTTTCAATCATTTAAAATTCCCCAAATACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1 + chr2L 5658982 5' + Quasimodo 73 2 58.42 AGACTATCACTAATGTAGCTACCGAAGCATTGCACCCTACAAAATTAATAAGTGTAGAAGATTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCAT:1 - chr4 171120 5' + baggins 5369 1 64.36 TGCTGGCCAGTTTGTGGTACTGCCACACTGAATGGCCACCGACATGACGTTACAACAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:1 - chr3R 14146726 5' - hopper 1395 1 47.52 AGTGGGTGTAGAATGGACATGTTACTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCATACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chrX 22252779 5' + 297 46 2 79.21 TTGATTGAAGAAAAAGGCTTTGCACTTGACCGGTGTTAGCCAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAG:1 + chr2L 19317449 5' - Stalker2 374 2 52.48 CTCGAGTGCGTTAGAGGGGGGCACCGGCGTTGACATTTCGACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATAT:1 + chr3R 32014972 5' - jockey 4653 1 60.40 CACCAGTTAAAGAAACAGGGAAGATTCGAAACTGTAACAAAGTGTGAAACAGTTTGGGCTGCAAAGTGGAGCCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTA:1 - chr3L 26022557 5' + Circe 7190 1 68.32 TGCTGACCAATAATAGAAGCGATCAATACGTGCATCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chr4 623762 5' + jockey 4807 1 65.35 ACTTGCTGGAAGTGGGGGCAGATGAGGCTTGCCATGGTCAAATAGAGGATGATGAAATCGTGCG:1 + chr3L 17851265 5' + pogo 1632 1 67.19 GGTAGACTAAGCAAGAATATTGTCTGTAGTTCAGTTTTAGAGCGGCAGCTCATCAACTCCAACTAAGCGTCGTAAAATATATTCTTATTACTTATTCTGCC:1 + chr3L 25772968 5' + Gypsy6A_LTR 234 1 60.40 AAAAAGCTTACCATAACTAGTAAGCCAAAAACCATTTATAATGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGG:1 + chr3L 14251081 5' - F-element 4522 1 59.41 TTCACGACAACGACGCCAGGGTCTTCGGGGGTTCATTAAATTTCCAAGGGGCTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCA:1 + chrX 1426887 5' + HMS-Beagle 191 2 58.42 TTCTGTCTACCAAAATTTGCCCACCAGTTCCTCCAGACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr2L 22227376 5' + F-element 24 1 64.36 TTTAATCATGATTTTGCGCATTTTACAACACCACCCATATGAGAAGACAAGGACTTGGCAAATTTCACACCCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTG:1 + chr2R 20801692 5' + 412 7531 2 47.52 TTGCTCTTTTTCGTATAAGTATAAGTGGAGAACTGGATTTGAAAAATGAACTTTAGATCGTAGCCAAAATTATGTTCGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCG:1 - chr3R 18161704 5' + diver2 277 2 79.21 CTGAGAAAAAAACACAACAAGTGTGATCACATCACATTGTTTTTTAAAAAAATTTTACAAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15675311 5' - invader2 299 1 63.37 ATCAGCCATTCATATTTTTTACACCCAGATGCATTTGGACAAACGGCTGGGTGCACTAAACAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGC:1 + chr2R 14076571 5' - Max-element 8324 2 64.36 AATGCTTGCTGACTGGCAACGTAAAGTGAAAAGCATACAAAATGCCGGGCAATTGCGGTGGGCGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGA:1 + chr2L 9226619 5' + R1A1-element 374 1 64.36 TTAAGAGCTACCAACCCGTCCGTAATTACACAAAAAGTTCCATATCGCATATACATAAATCGCAATTAATCAAGTGCAAGCCTACCCTAATGTATACATTA:1 - chr2R 23580396 5' + Quasimodo 6894 2 78.22 AATGGCCAAGGAGAAAGATGACTAGAGGCGAAATGGACACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGAT:1 - chr2L 11330761 5' - 412 128 2 63.37 TCTCAATTTTCACAAAATGGGTTTCGAATTGAGTGCAGATCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTAT:1 - chrX 15679763 5' - X-element 418 1 60.40 TTTCTAATATTTTCCAAGAGGAAAATCGTCTACTTCTGATTTATACCTGCAGTTATGGTTCTCAGAATCTTTGTTTGTGCTCGCTGTTTGATGTCAATATT:1 - chr2L 21368451 5' - F-element 4307 1 54.46 AACGTTGTCTACCGACATTTTTTTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:2 - chr3L 15099967 5' + Tirant 8112 2 70.30 GAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 25814718 5' + 412 7100 2 74.26 ATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2R 21937532 5' + 412 46 2 68.32 GAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr3L 776116 5' - 1360 3337 1 77.23 GCCAACGTCCGGCGGTGGATCTCATATCTCAGATACGGACTCAGCCGGTAGTCGAACTGATTTACCAGTTAAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACA:1 + chrX 7623235 5' + F-element 272 1 75.25 ACTTTTCAACTTGAAGGAAAATAAAAAGTTCCTCCAAAACTGCACACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACATT:1 - chr3L 6625371 5' + Doc2-element 4389 1 55.00 ATATTCAAGGCTAAAAATCTAAAATATAATCGAGAGTTAAACACCAAAAGGACAAGCAGGACTGAGATATAATTCAGCTGTAAATGTGATTCCTTAATTAA:1 - chr3L 2359318 5' + TART-C 10947 1 55.45 GGCTTGTAAGGTGAAGTGTGTTTATAGTTAATGGGGGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGT:1 - chr3R 21999783 5' - mdg3 46 2 61.39 GCGCATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr3L 22324087 5' + hobo 42 1 61.39 AAAGGGTAATTTTCCAATTCGTCAGCAGGATTAAAGGGCTTACTTAATGAGCTTCAATTCCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGT:1 + chr3L 2182649 5' - blood 361 2 63.37 GCAGCCAATTCCGTGTCCACCAACAGTCAGGGAAAGAAGAACAAGAAGCAGGCGAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 + chr3R 24244256 5' - 1360 3209 1 62.38 AATGTATTTTTAAAGCCCACTACAAAAGCCGGAAGCAAAGCATTCGAACGGAAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:2 + chrX 5253202 5' + hobo 39 1 56.44 TGCATTTTGAGGTTTTATAGGAAATATTACAAAACAATATAACTATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:1 + chr3R 19512306 5' - invader4 3056 2 60.40 AAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678153 5' + Osvaldo 18 1 69.70 CATCGAAAGCACATGAACTTGTGAAATTGCAGGGCACAACAATATAACAGCGCTAAGTTGCTGATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGCCACTTAGCC:1 + chr3L 9812171 5' + 17.6 7105 2 67.33 TCAAGACGCTTACGTTTCGTCCCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTTACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCT:1 - chr3L 7039083 5' - F-element 48 1 77.23 CATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACT:1 - chrX 14321911 5' + jockey 156 1 63.37 TTTAAAAAAATTTGCTTCTAATTTCGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACAC:1 - chr2R 4025846 5' + accord 439 2 75.25 CCACTCGTTTGCCACTTCCCCACTCCACAACTAATTAAATGTGATGCCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCATTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCA:1 + chr2R 11738200 5' - Tc1-2 167 1 66.34 TCTGGTCAAGAACGGATGTGTTGAAATTCATTCGACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chrX 5104586 5' - roo 400 1 70.30 CATTGCCCGTATTCCCATTGGGTGTCGGCGGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGCTTTAG:1 - chr2R 18957272 5' + HMS-Beagle 172 2 66.32 ATCCTAAACTTTTTCCCTCGCCTGACTCGTCGTCACCAGCTGCAAGGATATCTGTGTGTCAGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 24545652 5' - roo 395 1 64.36 AATTTTACTGGCGCTTCTTTGCCATACAGCGAAATTAAATATATTAACATACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr2L 20465665 5' + blood 7037 2 54.46 ATTATTATCCGATCTTCATTTCGAATTGGCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTC:1 - chr3R 19449161 5' + roo 9056 1 71.29 ACAATATTATAATGTGTTTTTTAATTCCCAAAAGGACCATTTGATTCGCAAATATAATTGATTGATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACA:1 + chr2R 21264736 5' - Doc3-element 4612 1 77.78 TTTTGTTTGCTTTTAAGGTTAGATTCTCATTCATTTGAATAGGCGTATGGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAA:1 + chrX 2351044 5' + Juan 4183 1 51.49 AAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 7808968 5' + jockey 64 1 77.23 TCAAAGCCCACCTTGATCAGCGTGGTGCCACCGTTGCAGGTGGCTCCGGACTTAACAGCCTTGAATCCCGGCCAGGATTTACAGTACAGGTCCTTGAACTC:1 + chr3L 18921366 5' + gypsy8 95 2 75.25 CAATACGCACCTGTCACATAAATCACAGTCCAAATGTGATTTATTAGCTATTCATATTAGTTACTTTGGCTCCGACAGAAACCCCGCTACCTCCAACAACA:1 + chr2L 21024916 5' + F-element 407 1 72.28 TATGCGGAATGTGCTGGTGGGGTGATCGGTGAAAGGGGGGGAGCGGCAGGACGCAGTGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCA:1 + chr3R 8186457 5' + Doc 479 1 52.17 ATTAAACGTATACAGCAAAAACACACATATTAATGTTTCTCTCAGTGTAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAA:1 + chr3L 21928588 5' + I-element 5020 1 52.48 AACACAGTCATTAGCTCAACACCTTTCCAATACACTTCTTCTTAGATTTTTTTTTATTATATTTATTATTATAGATCCAACACTGACCTACGCCATCCAAG:1 - chrX 16929672 5' + G5A 2425 1 81.19 GCAGCAAATGAAAGGTGCGCAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACTTCGCGTCGCGTGATCTTGTCGCGCGTTTTGATTGGCCCAGCCAACGTACCTAAC:1 - chr2R 21629718 5' + G6 128 1 80.20 AATTCATAAATAAGCCGTTTGACTTGGCAGCTTTTGTGACGCAATATTTAGCCAAGGACGAAGAAATTAAAGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTAT:1 + chrX 5829974 5' + R2-element 3429 1 74.26 GGTAGCCAGAGGGGCGTGGCAGTTCGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGG:1 + chr2L 19332128 5' - I-element 4907 1 75.00 AGACGTTAGTTAGAGAGTGCGTGTAAATTGTTGAAGGGATATTGTGTTTCCCAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTA:1 + chr3L 546522 5' + BS 4991 1 64.36 TCACTTACAAACGCGCAATTTGTGGATTGCGCAGAATATTCAGATATATTAAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 - chr3R 5946180 5' + HMS-Beagle 6817 2 56.44 TCATGGCAAACAAAGGCGACAGGTTCACCTAGCCAGCTGATAAAGGACGTCAAAAGGATGCGCCGCAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGC:1 - chr3R 8191292 5' - Quasimodo 7259 2 72.28 CTGGCCACCGCCGCCTCCCTGAAGATTGAGTGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 18865928 5' - roo 395 1 63.37 GAGCTTTCTATTACGAAATCCAATTGCAAACAAAACTGAAATTGCACTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGCAACAGGGGGTTCCTCTGTCACTGG:1 + chr3R 22175032 5' - springer 323 2 55.45 CAGCACACTTTTATCCGATTTGGGAACGACGGCAAGCTGTATCGACACATACCGCATCGCGCGGGCAACGAGGAGGTGGCATCGTGGAAGATGTGTGTACC:1 - chr2L 6071286 5' + Osvaldo 449 2 72.28 GATTTTCTTTTAAGAAATCCGGATTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTAT:1 - chr2L 8680828 5' - Doc2-element 4323 1 77.23 CCCGTTAAAACGGGTTGCCAAGCGAATCGATCAGCGCGGAGCTGAAGTTCCAATGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGGTATCGTCCTCCAGGAAAGGTCT:1 - chr3R 8356033 5' - Chimpo 59 1 65.00 AAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chr3R 19535755 5' + hobo 35 1 58.42 ACTTTGCCTGGCTAGGTCATTACACCTGCGCCTTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACG:1 + chr2L 15087956 5' + R1A1-element 5033 1 65.26 TCGGAGTTTGAATGGAAAATTTTTTGTTGTGAGTTTGATTTTTTGATTTTTGTTTGGATAAAGTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTT:1 + chr2R 25117548 5' + Cr1a 246 1 66.34 ACTTTGCCTGCTTCCTGGGCGTGATGTCCGGCTGCCTGGCACTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGAGAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTAT:1 - chrX 6677478 5' + Max-element 8380 2 55.45 AAGAATTATTTAATAACAATACATAAAATACTGTTATTAGCAGTTCGTTTTAATATGCAAACAAATTTAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr3L 19260881 5' + pogo 3 1 70.30 TATATNGTGTTCCTTTTGTTTCAGTGGATCTGGAAGCTTTTACAGATGTGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGAAATAAA:1 + chr2R 11986437 5' - ZAM 244 2 54.95 GCAGAGATTTGGGCGATTTTTCCAGGGAAATGAATCAATGCTATGGGAAAATCGCTTTCCGGGGGAAGGGAAGCAGAGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGG:1 + chr2L 1957327 5' - INE-1 219 1 78.22 GTTTGTATTAGATGATAATAACAAAAGCCCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 22545017 5' + roo 8712 2 78.22 CAGCTGGTGGATAATTATGAATGCCACATGATGACTACCACGATGGACCCAGCCCCTTTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATAC:1 - chr3R 14828698 5' - R2-element 3553 1 72.00 ATTGCACGTTTATTATACGGTTTACATGGTTTAATTACAAGACTAGGAGCTACTTTTTGAGAGACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAA:1 - chr3R 14031454 5' + Stalker2 7629 2 70.30 CTGGCTTCTGGCTGTCGAAAAAAGATGGTATGCAAAAAAGTGAAATATTTTGGGCATAGAATTATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTGGAGCTG:1 + chr3L 22412582 5' - Stalker 7067 4 80.20 AGCTGATCGCCTCGATCCTCAGCGATACCGCCTGCCTGAGCAAGTGACGATCTGGACGATTACCTCTAGGTAATTACATAATTTTCAAACCTCACTTTATG:1 - chr3L 8631908 5' + NOF 160 2 69.31 CTGAGNGATACGCACTGACAAAAATGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr2L 15478807 5' + jockey 4721 1 77.23 CCGAAAATGTTGGGACTTGAAACGAGTTTAGTTTGGCCTGGAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCAAAGAAAAGCAAACTCTAGACTTTTCGTAATT:1 - chr3R 28302788 5' - GATE 8419 2 64.36 AATTATAAATTTTCGTGTACTCCTTGTGTAAATTGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATT:1 + chr3R 14147527 5' - hopper 1125 1 66.34 GCGGTGGTGGTTGGTAAGTGCGGCATGGACCCACGCTATGGTATTTTTCCTTTAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCT:1 - chr3R 24458046 5' + F-element 4440 1 47.52 ACGAGGACAACCGAGAAGATTATCATACGGGAAACGACTGCAAGCGGAGATTTGGCAGAGTCAAATGCTTTACTAAGGGCAGTCTAGATGACATCAGTTTG:1 + chr3R 25461956 5' - Q-element 295 2 59.41 CTGGCGGAGAGCGCCCAACAATACGAATCGAAGCTAAACACTGATCGCACAGTGGATTTGGCAACGCATCCCTCTCCAGATCGCCCACTGCGCCAAGTTGG:1 + chr3R 12013150 5' - Rt1b 5 1 65.35 AGTCGAGGTATTATTTTGCTCTCCTAACTGTGGTAAAGTGATCTATACGCCCCCTCAGAGTCCTGATCTGAACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAA:1 + chr3L 23580387 5' + S-element 1250 1 76.24 CAAGTCTTTAAATGCAGTGCAATAAATATTCAACAGGAATTGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 2804893 5' + hobo 34 1 56.44 ATCACGAAACATATCTTGGGCAGATTGGAATTCAAAGAATTCTGCTTCGACTTGCTATGACCGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTAT:1 + chr3L 10630770 5' + 1360 158 1 67.33 GAGCAGACTAATTGGGGTCGAAGGTTACTTTCCACTGGAAGGGGTTACGCATATCTATGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2L 9823620 5' + hobo 20 1 59.41 ATTGTGTCTATGTTGAGAGGGAACTCTGCCAGGATTTGCGAGCGATAATCCGCGTTTATTGAACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTC:1 - chr3L 11073658 5' - accord2 69 2 64.36 CGTTCGGGTGCTTTTTTATCTGGCCACTTTCAAAATCAAATCTTACAAATTCACAACTGACAAACAAAAAACAAAAAAAATCTAATCTTCTCAGCGTGCAG:1 + chr3R 11145578 5' + Cr1a 328 1 78.22 TGGGTTTCTGATAAGAAGCTCCATATCTTTTGCCATATGGGCCGGACTTGGTTGGGATTGCTTTCCCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGA:1 - chrX 4565501 5' - hobo 287 1 74.26 TAAATCTGGGCTGGTAGCAGTAGTTTCTGGCATTTGCAAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCCCGAAAAGCAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATA:1 - chr2L 11867449 5' + Idefix 295 2 65.35 GAGCGAATGGGTGGGGTGGGTTGGTGTGGTTTGTGTTGGACCCACACATTTGCAGCGATGACACTTGACCTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATG:1 - chr2L 8104116 5' - F-element 327 1 74.26 TTATAGGGCTGAACCTGAACCTGAGGCAGAAATGTCACAAACAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCC:1 + chr3L 17413466 5' + roo 173 2 61.39 AGGCAACGCGCGATAAATAAATAAATAAATGCCTCCTATTATGTGTTGCCATTGTGGGCTGGCGCGCATGGAAGG:1 - chr2L 15143190 5' + gypsy2 6387 1 61.33 AGCGACGGAACTTGGAGCCTCGGTCGGGGCATCTTCCCCAGCAAACTACAAATGTGCTTTAAGGCTCTTTTAATCAAAGCAAATATCCTAGCTAATCCCAT:1 - chr3R 28700975 5' + G5 4604 1 66.34 TGAAAGTACAAACATTTGAAATAAACTGTAGGAGACTACTTAGTGACACTGAGACCCTAGTTGAAGCAATTAAAAAAGCCTGGGCAACAATTTCACTAGAT:1 - chr2L 6264750 5' + Tc3 1342 1 59.41 GGCATAACTCTGAATTAGTTCTGCTCAGGCTGGGTGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAAT:1 - chr3R 14491400 5' + Tc1-2 53 1 65.35 AGACAAAAGGAATGGCACTGGAAGCATAGCTACTTCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACT:1 - chr2L 23488923 5' + F-element 4379 1 66.34 GCTTCCTCATGTTTTTTGCACGCTGATTAACATATTATTCCCACTAGAAGGGTGAAAGCTGCTTACACAGCTTCACGGATCAAAACTTTCCACGTATTTCA:1 + chr3R 21957272 5' + Quasimodo 7102 2 66.34 CAATCGGAAAACCTTTTTTTTAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 7795753 5' + transib2 2632 1 97.06 TCTCTCTCAGAGGCTCTATTTTACTCGCTCAGCTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr3R 4807826 5' + P-element 42 1 37.62 GAGGGATGGACTTTGGCCCAAACTCTGGGCGAAGGTGCCTACGGCGAGTGAGTGTCTCCGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2L 16691146 5' + pogo 15 1 66.34 TCAGGAGGCACTCCTCGGCAATGGTTACTTTTGGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTT:1 + chr2L 6638700 5' - Doc2-element 351 1 79.21 ACAGCGTGATGCATTGTTGTGCTACATTTGTCATACCGTGTAGTGTACCGTGGGTGTTATGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGA:1 - chr3R 25795232 5' - Doc2-element 443 1 55.45 GCGCTAACTGAAGCTCCTCAAATATCTGAAGCTCAGCTTGTACCGACAACTGCAACATAGCCCCAGCCCAAGTACAACAACTACTTACCTGCAACGTCTCC:1 - chr2R 5762621 5' + HeT-A 5692 1 56.44 AGCATCGATGTTTTGGAAAATGCTCCTGCCATTTCGCAAATGTATCGCATTTCCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCCG:1 + chr2R 19058914 5' - Bica 449 1 58.42 TTTTCGCTGCCGCATTTTTCCCTTCCCTGCAACAGCATCAACTTTACCCCTCCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chrX 5138504 5' + 1360 25 1 55.10 ATGTGGCTTGCACCGCGCGACTCCCAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATGTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGG:1 + chr2R 15109227 5' + blood 484 1 74.26 TTTTCTTCCACGGCGAATGACTATGGGGTATATATCGGGGCAGGTTGAGGAGTTCTACTTAACATCAGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAG:1 + chr2L 3718542 5' - R2-element 3378 1 73.27 AATCATACCTACTAGGAAACCTCTCCGATTACCCGAACCGGAACCCACACGGGTGTACCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAGACACAAA:1 + chr3R 10248475 5' - Cr1a 205 1 67.33 GCAGAAAGTGGTCTGGAAAGATGTCCAGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAA:1 + chr2R 6949708 5' + mdg1 345 2 73.27 ATTAACGTACAACTCCATAACGAGATACACCTTTGACTTATCCTCATACGTTTCTAAGAGTTGCACTATATTTGAAAGCTACCTAGATCGGATTGTAAGTC:1 - chr4 450305 5' - Q-element 631 1 73.27 ACTGCTCCATGAACTGGGCTACAAGAATCAGCCGGCAAAATGCAGCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCAC:1 + chr2R 20671623 5' - Stalker 462 1 71.29 AAGAAAATCTTAATGAAATTATTTTCGTCCACATATTTCTCGCTGGTATTTCCCCGATTGGCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGAT:1 - chrX 21201388 5' - jockey 4592 1 67.37 TAGGTTTTCGGCCATAACTCTAAGCTCGTACATTGTTCCTTCCAGCAGTCTGGGAACCACGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCAC:1 - chr4 762574 5' + roo 8798 2 64.36 TTTCGGTTAATAACACAAGCAATAGACCAGGAAAAACACGAAATGAGCGGCGTGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATT:1 - chr2R 11651908 5' - hopper2 1342 1 60.40 CCGACCGATGGTGTACGACTCAATGACTGCCCTCACCGTGGTGTTCCCTGGGTACCGATTATTACACATTTTACTCATAAATAATTATCAACATAAATATA:1 - chr3R 20618732 5' + 1360 2950 1 68.32 TTTGGGATTTTCTTCATTTCCTTCGCAAACATTTGTCAGATAATTTGGCATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chrX 2874798 5' - 1360 3363 1 55.45 GACATTAGAATATTCAAATACAGTGCCGTTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAACCTTCAATTCCTTACTTATTTTGTGCAAGAAAAAA:1 - chr3R 4577548 5' + Tc3 124 1 67.33 AGAAAACATTAAAACACTAAGTGCTCACTCCAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGC:1 + chr2L 14194293 5' + jockey 170 1 70.30 GATTCTGGGGTGCTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 3254962 5' + 1360 23 1 57.43 CGAAAGCAAGAAAATATTATTTCAGGTGTATATGATTAATTAACTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 8640881 5' - roo 9039 1 67.33 CCGATTGATAACCAGTCAAGTGGCAGACGGAATTAATGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 - chrX 2253896 5' - Tirant 8470 2 65.35 AATACNAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2R 1373186 5' + pogo 31 1 55.45 TGAGCTTGCAATTGATCTCCGTCTTCCATACAATCGACCAACTAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTAC:1 - chr3R 9883077 5' - micropia 5388 2 57.00 GTGGCAATTTGTGTAATTTATTTGGCAATTCACTGACCACAAAACCTGTCACTACGAGTGCCGCAACAAGTGCATTGAACCTTTTTTTTTTTGTTT:1 - chrX 18457684 5' + Tc1 1469 1 75.00 CCAGGCGTTGTACTTCCCAATCGTAATTTTTTTAGTTGAATCAAACGCACAAATCGTCGCGCTTCCTCACGTCACGTCACATAAATAAATAAATAGTCAAA:1 - chr3L 10092740 5' - copia 223 1 76.24 CAAGTACAAGTACAACAAGTACAGTCATGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTT:1 - chr3L 21637416 5' - Bari1 1648 1 73.27 GACTGGCAAAACTAAAAGCAACAGCATCAAAAGGAATATGAATTGAGGTCGATGTGTAAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chr2L 18286103 5' + 412 7068 2 64.36 AGAAAGTATGCTAGGAAAAATCCAGCACCTTTATTATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 13280160 5' + jockey 30 1 56.57 TTCGCTTTATTTGTCGAGGATAAATCAATTCCGCTATTAACTAGACTACGGGCCCAATTGAGGGCAGACCGTGGAAAAACCCTCTTAACTATCTTGACTAT:1 + chr3L 22274092 5' + opus 7404 2 50.50 ATCGAGGACAATCCGGCGCCTCACAAGATCGACATACTCTTTAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCCAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAA:1 + chr2L 19523489 5' - invader2 4837 1 58.42 GGGCAGCATTTTCGTGATTGAATTCATTGATGAACAACAGTCGAACAGTCGAATTTCGACACGTTTATGCGCACACATTTGCAGTCTAAGATTCTCCTCCG:1 + chr3L 19453651 5' + baggins 5045 1 83.17 AGGCTGTTGGGAAACTTATATGTTTTATAGATTTGCTGTGCTGGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTTA:1 + chr3R 834126 5' - Doc3-element 433 1 68.00 CAACATTTTGATTGGAATGGAACTTGCTGCACTGTATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chrX 2782812 5' - I-element 5315 1 67.33 GCAGCCTGATTTATGTACAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 - chr3R 22675853 5' + 412 55 2 77.23 ATTACTTATATACTTGGCATGCATTATTTAAGTAATATTGGGCTTAGAGACTGTAAAATCCCAAATAAGATGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 15814721 5' - roo 9043 1 52.48 GGCCACCAGACCAGCGAGGGATCCTCTCCTGTAACACTCCTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTATTCTCTTTTTTATATCTTCTCGCGAATCGAG:1 - chr2R 3880495 5' + Cr1a 4376 1 59.18 CCACAGTACATAGCACCCTTAGAAAATGACCAGCACACTGACCATCTAGCGCGAGGTTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACC:1 - chr2R 10568057 5' + F-element 4514 1 56.44 AAAATGGGCCACACAACACGCGCATACCGAGGGGAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 + chr3R 22864230 5' + jockey 4714 1 68.32 TGGTTNGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr3L 22744687 5' + FB 54 1 77.23 ATCACCTCCCAGGTGGCGAAGACGTCGTCAGGAATCCCCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTGCTGGCTGCTCCGGGGAGTCCGGGG:1 - chrX 20443029 5' - Gypsy6A_LTR 319 1 75.00 CAAATTGACATTATTTTTTCCCGATTTCCTCTATTTCTAGGTAAGTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTT:1 + chr2L 9139974 5' - invader3 5362 2 55.45 TTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chrX 21668886 5' - mdg1 387 2 64.52 AATGATGAGACTAAATGGGAAATCACAACCTCAGTAACCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAAGCTCTTGGATGCCAGACTTCCGCCACAAAAGCGGAACTAA:1 + chr2R 14559623 5' + invader3 399 1 80.00 ATAAAGCCACAAAACCGGCTTCGTACAAATCGGCTGCTTTGAAAACTAACTCAAACTCAATTTTAAATAGGTATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAA:1 - chr2L 62363 5' + Doc 4449 1 77.23 TTGTGTTCAAGTGGCGTCGATGCCGGAAATGCACTTCAGTCTGCTCGGTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGG:1 + chr3L 6524435 5' - R1A1-element 306 1 53.00 TTTTTTCGTGTCAGGTTGTTATAGTTAGTTTGGTTTTTATTAACAATAAATTTCAATTACGCTCACGATTTGGATTTGGATTTGGATTTGAATTCGAATTG:1 + chrX 314195 5' - Rt1a 309 1 74.26 AAGATGGTACAAGCTTTATTTAATGCGTCACTTTAGATCTGTGTGCGGTATGCTGTAATAAACCAATATATGCCAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr2R 9653344 5' + blood 7063 2 53.47 AAGTTAAATATTTACCCACCGCTGCCGGGCAGCCAGTTTAGGCCACGGCCGAGGGAGGAAAGCTCTCTTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGG:1 - chr3L 4383545 5' + accord2 193 1 54.08 GTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACAACACACACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTT:1 + chr2R 4745228 5' + 1360 3263 1 68.32 CAAAGCGAGAAGATGCCAAGCTTTTCGCTCAGTGTAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGC:1 - chrX 14091604 5' + Max-element 8307 2 65.52 GGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAA:1 + chr3L 24213772 5' - invader2 5081 2 52.48 CGCAATCCAGCAAGGTGACGCTACCGAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGT:1 - chr3L 17874032 5' + 1360 45 1 70.30 GGGATAGGTGGGCTGAATGTTTATGTTGCAAACACGTTTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCAC:1 - chr3L 14658542 5' - Stalker4 453 1 63.37 CAATGGTTATGTATAATAGAATTTTTTGTGTCTCTTCTATAAATGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGA:1 - chrX 14024786 5' + pogo 1686 1 57.43 TTGTANCGTCTGTACCCGCTTAAGGAAATCTTGAAATTCCAGAGCACGCATTTCTGTAATCGGTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr4 1219260 5' + 1360 11 1 67.33 CCCCAGCTCGAGTGGAAATAAATCGCACTGTAGCCCAGATCTACTACAACTACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGGAGACATCG:1 - chr3R 7930672 5' + ZAM 8014 2 56.44 AATAAACACCAGAGTGCATTAGGCAAAAAATAACGAAACGCACATCTTAGTAGATTGAGTTGATCTAACAAAGAGTGACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCG:1 - chr3L 16836417 5' - jockey 228 1 76.24 TTACGGGTCTAATGACGCAATTGCCCGTTCCCGTTCTCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAG:1 + chr2R 20959548 5' - Quasimodo 7084 2 62.38 AAATACGATAATAAAATAGATTCTGCAATACATTTCGCCAAAAAGGAGCTTATATGTATAGTATAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3R 4824613 5' + I-element 14 1 65.35 TCATCACTCCAGTCAACTTTCATCCCATCCTTATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTC:1 + chr3L 9761169 5' - HMS-Beagle 6734 1 68.32 CGTAGTGGGGGATATAGCTTTGCAATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 12843424 5' + roo 8671 2 69.31 TGGCTCAATCAGCACGGAATTTAATCCCAAATTTATGGTGCACTGTTAAAACAGTTCAAATGTGTTATTTTCTTCTTTCTATTTTTTTTTTAAGTTTTCAA:1 + chr2L 14920671 5' - TART-C 11093 1 50.50 GCAATAGTCAATTTGCGCGATTATCAGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTT:1 - chr2R 5660177 5' + Rt1b 4693 1 65.38 CGGATTTGTGCCCGCAAAATGTTTCGTGAGCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTC:1 - chr2L 16066280 5' + Cr1a 275 1 70.30 AAGGCGGGGTGAGGAAGTGGGGTACAAGCGCCATAAAAATGTGGTAATAGGTCCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAAC:1 - chr3L 21892389 5' - R1A1-element 14 1 58.00 GTTAAAGAGACTTCCGCCTGTGCAGAGCTCCATCACGATCACCTTACCACGCCCCTCTTGACCCCGGGACCACTAGAGCTCCGCTATGACATCAACTAACT:1 - chr2L 20676652 5' - mariner2 46 1 60.40 CTTATCCACTGCACGTGGCTGGCAAAGTTCACACATGTACTCCTCCGGGATGTTTTGACGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGA:1 - chr3L 14011068 5' - F-element 274 1 64.36 GTTACCTGTCTCGAGTGATCAATTAATTTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGC:1 - chr3R 18043465 5' - flea 4633 1 73.27 CCCTTTTTCACATACATATGTGTATAAATATGTATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCAC:1 + chrX 3632627 5' - 412 7210 2 68.32 TTCACACACTTTCAAACCGCCCCACTCCGCTTTTCACCAGGCAGTGCAAACTTTTTGGCAAACAGGAAGCTCGGAAAGAGATATTTTTAATTAAATTAAAT:1 - chrX 20355763 5' + G7 1140 1 70.30 GAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 - chr3R 5775748 5' - invader4 301 2 54.46 GGTTAAGTCGAAGGTTAAGGTGGAACTTGAATGGCTTGTAATTGTTTTTGTTGCCGGCCGCAGCGCCTGTTTAAAGAGTTTTTTTTTAATTCGTTTATTGA:1 - chrX 14138172 5' - Rt1c 5421 1 74.26 GCTGTTCAGTATTCAATTCGCATCGATCGGGCGAAAATTGAAGGAGAAGGAGAAAGAGGAGTATTTTGGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAAT:1 - chr3R 11601034 5' + 1360 3307 1 70.30 AGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3R 15072573 5' + pogo 30 1 59.41 GTAATCTGAAAATCCCCCCACCATTCCTACAGAGGACCTCCGGCTGTGACAGAGACAAAGTGTTGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCCACTTTT:1 + chr3L 13473061 5' + G2 363 1 70.30 AGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAACGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGG:1 - chr3L 23678152 5' + Osvaldo 21 1 71.29 GAAGTCCTCCCCTTTTTCGGCCGGAAGGAAGCAGGCAGCTCGTCCTTTATTTATTGGCCATCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATC:1 - chrX 10300930 5' - Bica 4896 1 74.26 ATTAANATAAATTATATATTGTTTTGTAATTATGATTGAGGGCTGCCACCTTGTGATGAATGCTTACCAATAGCAAATTTTTTTTTCTCACGGGTCCCACG:1 - chr3L 12503958 5' - Cr1a 4448 1 62.38 GCACTATTAATTAAAAGTCGAAACCAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 - chr2R 16928905 5' - blood 7337 1 76.24 TGTGTGTCGAGCCTAAACTGAATACAAACAGTGATGCGAACTTAATTGATAAATGAAAACGATATAGTTCAGTGTGTCGACTACCATATACCCGTTACTC:1 + chrX 22738096 5' - INE-1 549 1 61.00 TCTTATTTTCTACTCGCGCTTCGCTGCGTGTGAATTTCGTAATGCAATAATGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGG:1 + chr3L 8041463 5' + opus 7291 2 64.10 CTCCGTCTTGTAAATTATGTGTTTTAATATTTTACAAAGACTCAAAAACTGAGCACTTTGTTTATAAACTTCTGCCTGTCTTTTGGCTTCTACACCTTTTG:1 - chrX 22805596 5' - TAHRE 282 1 66.34 CGCTGGTGTTAATTTCACTGGTGTCGAGCGGCAAGTGGAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACA:1 - chr3L 19510833 5' + roo 9071 1 71.29 TAAAAAGAATTGGAAGAATGTGATTGGTTATAATTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr3L 25341892 5' + 297 6620 2 69.31 GGCGTACTAGGAATTCAAATAATAACTCAAGCCATGTATTTACTATTCGGATGCTTTCCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGATT:1 - chr3L 21142741 5' - gypsy6 7621 2 62.38 GTTTGCCCACGCTTTTGGCCTTGTTTGCGATCCATCGCTAGATCGGCAAATGATCGAATCCCACGTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGG:1 - chr3L 17469295 5' - gypsy2 340 1 76.14 TCAGCGTAATAAACACGCATGGCAAAAACATTTGAATGATGCCACTTTCAGACTCCTTAAAACCGCTGCAAGCAACATATCTAGGTATCACCGTCGATAAA:1 + chrX 10553729 5' + Helena 903 1 61.39 CGCTCGGTGACTAAACAAGATTTCCCCATATCTATTGGTATCCCAGAAAAATGATGAAATATCGAGTTCGAATGCATACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 - chrX 20678535 5' + INE-1 544 1 81.19 GCAGGGATAAGAAGGCCAATGAGACGCGCTTGACAAGATCGCTGTTTTCTTGCTTGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTT:1 + chr2L 12703080 5' - Doc 4460 1 53.47 GTAAATTTAATGAGAGAGTCGCAGCATTGCAACGGAAAAATATTTAGCAAACATTATTTACATCAAAATGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGAGA:1 + chr2L 17279084 5' - copia 147 2 68.32 AAAATGGGTAAATAATGTAAACCGAAATGACTGTACATGCCGCCCGCCAATGCGTCGTCCAGCATGAAGGCTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATC:1 - chrX 7140409 5' - diver 5825 1 68.32 GTGGTGGGCACCGCTTCTTCAAATTTCTGTGTGTATATATCTTGTGTGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chrX 8141893 5' - hobo 2938 1 67.12 AAAATGAAGAACATCAACAACCATAGTGAGAGCGAGAATTGTTAAATCAAACAAAAGCAAAATAAGCACACACGCACACGCTCATACATTGCTTATATCTA:1 - chrX 17659294 5' - Stalker4 7237 4 72.28 TGCTAGTTTCTCTCTGTGTAAAGTCCTCTGGTCGTCGCCACGCAGACATTGATTATTATTCAATAAACTTACAAGTTTAAATATAATCTAAATATAATTCT:1 - chr3R 30329983 5' + gypsy7 5421 2 71.29 CGTGGCGTATACTTGATGCTTTGCCGAAAGTTTCGCGATGGAAATTTGTCTTTCGACACTAAACTTCAGAAAGTAGAATATAAACAATGAAAATTAAAAAA:1 - chr2L 13262813 5' + Doc 4688 1 79.21 TCTGGGCATGAGTTGGCAGATCTGGTGATTAGGGGGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAG:1 - chr3R 21584471 5' + X-element 4477 1 65.35 GAATTAACAAAGACACAAGTGCTAAAGTGCTGCCAGCTTTAGGCAATCGAGAGTCTAGGGAAATTACAGGATGCGTACCAGAGGTAGGGTGCTGTATTCTG:1 + chrY 676915 5' + G5A 469 1 59.41 GTCACCGGAAGGACTCGGCTTTGCAAGTGAAATAAAATTCAAATGTTTCGTTTGCACTTTTTATTTTTTTTTAATTTTT:1 + chr3R 28420258 5' - Doc 4697 1 60.76 CGAAATGCTTTATATTATCTTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTACGTCGTCGCCTGGGAACACTGTTGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTGCTGT:1 + chr3L 2534676 5' - Doc3-element 494 1 77.23 TCCGTCTCCTTAGCTTTATAATATATTGAAATATCACCTTGGCAAAACCGGACAAGTTGGCAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGAGTTATGTTTG:1 + chr2R 13056034 5' - I-element 4963 1 77.23 GAATGGGAAGATGGCGAGCGGAACAGAAGTTGCTTGTCAACATGGACAAAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTG:1 + chrX 12703164 5' - accord 180 2 65.38 ACTATATACCAACACAAGCCATCTGTAGACTTTGAATGATCTCGACGTTCATACGGACAAGCGGATATGGCCAGATCGACTCTACTATTGATCCTGATCAA:1 + chr4 664616 5' - INE-1 90 1 63.37 TACGATCCCATCCCATCCCATCCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCA:1 + chrX 17263979 5' + Doc 4548 1 81.00 CATCTNGCGGTATATTCAAAAACTATGCTGTATGCATGGCCAGTGACAGGGGTTAAGGGTTATTTATAAACATAAAAATTGGTCCTTCGAGCCGGATAAC:1 + chrX 7422753 5' + 3S18 368 1 62.00 CACATCTACAAAATTCCGTTGAAGTAAATCGTAAAAGCAAAAACGCAATGGGTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAA:1 + chr2L 6291528 5' + pogo 1645 1 56.44 GTTTTCTGAAATCGCATATCCTGGGTATTTGTAGGCAAATTGCCCGCATTTTGTTGCCCCCTCGATATTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCA:1 + chr2R 21240763 5' + jockey 478 1 62.38 GTGTGTTTGTGTGAGTGGATGGTGGACTATTAAATTAAGCTACCATCGATTAGAGGGAACACACACACACACACACAT:1 - chrX 11215229 5' + accord 183 2 71.79 TGGTGAGATTTATGATTACTACTCGCACGCAATTTGTTTGTCACAGTTCACTTCGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATT:1 - chr2L 7513473 5' - gypsy4 412 2 70.30 AAGAACGCGTAGAGTAACGATTATCCTTATTAGCACGAAGTACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAAT:1 - chr3L 3252972 5' - 1360 420 1 69.31 CTTTCGCCTTGGCAGAGGTTATCTTCACGGAGATGTTGTTGGGCAGATTGGCCAACGGATTGGCCGCCTGACGCAGCAAAACTGAACAACAACAACAACAA:1 - chr3R 21226322 5' + I-element 128 1 73.27 TTTTGACCCTTTAAATAATCAAATTCATTCAACAAAACGCCATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTC:1 - chr3R 12791018 5' - flea 473 1 62.38 CATGGCCGCAACGGCAGCTGCCATTTTTGGCATTGTTGCTGTAATTGCTTTTGTCTCTGCACTGAAATCACTACTTGTGTACATTGTTTTTTTTGTTTTTT:1 + chr3R 24425471 5' - transib2 2641 1 58.42 AAGGTGGATAACAAAACAAAAAAAAAAATGAAAAAG:1 - chr3L 16769961 5' + Doc2-element 229 1 88.89 ATGAGCGGACTGGGGTGCATACTATATCGGATACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 + chrX 12290637 5' - HMS-Beagle 7001 2 67.33 CGTTGTCTACCGACATTTTTTTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3L 15099965 5' + Tirant 7 2 68.32 CCGCGTCACGTCATCCACAACATTCATGAGCAAAACAGCACTCCATGGTACCAATCTATTAATAGGAATACCTCACACACATACGATTACCTCAAACAATC:1 - chr2R 21980780 5' + I-element 4882 1 66.34 TAGGCCTGGCATACAAACATTCGGTTAAAGCTTAAGCAAGTAATCCAAAGTACAATCATTTATGTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGC:1 + chr2L 13474697 5' + opus 7344 2 70.00 TGGGCCATTTAAATGCCATTATGCAATTTGTTGTCCATCTGCTTGGGTGGCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGG:1 + chr2R 18891680 5' + opus 7288 2 53.47 GGTGGACGGTGGGAAATTGCAGTCAACATTTATTTCCGCAGTATGATGGAAAAATTCGAAAATAATTTGCGAGCCATATGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 + chr2L 7843047 5' - 412 7545 2 77.23 CTATGTGGAACGCATATAGTATGGTCGGCTGGAGAGGATGGAAGATTTGGTGCAGCCTCATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGG:1 - chr3L 21667736 5' - Doc 4549 1 64.36 TAATATTCGAAATATTTCGCTTACAAACAATTAAAACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 11576465 5' - roo 9053 2 60.40 CTGTCGTTCACTATTCCAGATAATCTACTGCATTCGCGAACTTGATCTCAGAATCTCGAGCGCCACGGCGAAAAAACCGTGTGCCAAAAAATCGTAAGACG:1 + chr3L 6616648 5' - 1360 30 1 68.32 CACGACCCCAAGACCCTGCGATGAGGATTTGTGGGAGCGCAGCCAGCGCTACGTACCGGCAGAGG:1 + chr3L 26800170 5' + aurora-element 249 1 70.77 CCACAACAAATGGCCACCGGAAATATGCACAACAAACACACCCAAGTATGCAGTGGAAAAACACACACACACCCATGCATCGCACATACACACACACACAC:1 - chr3R 7683794 5' - Stalker 446 1 65.35 TTTTGGAGCAAAGTGGCGAAGTCGTGACGAACTCTGAACTCCAGTGAAAAAAGGAAATTATTGCAATGTATGGATAATGGGGGACGTTACCTATCAGATTT:1 - chr3R 6632273 5' + mariner2 762 1 50.50 CTAATNGCCCGAGTTGTTTGAGAAGCCATCGATGTGGGGAAATGGAATTTGATTCCAACCTCCAATTTCGGGAGACATTTTTGAATTACATTGCGGCAGTT:1 + chr2L 2486202 5' - TART-A 13224 1 72.28 CTTCCTGCTTTCGTCGCTTTTCGAGTATTTTGAGCTTTCTGGCTTCATCCTTGGCAAATTCTCCTAGATCTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTA:1 + chr3R 11802601 5' - INE-1 299 1 74.26 TCCTGCTTGTCCTCAAGTAGGTTTCAGAAATATGGGATATTGTTGAATTCTGGCTGAATTGAGTTTGTGATGGTTTAGGCACCGCATTAATGGTTTGAATG:1 - chr3R 434353 5' - HMS-Beagle 6678 1 70.30 AATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 + chr3R 10736043 5' - invader4 295 2 64.36 CGAGCGTGGGCTAGAGTGGGATAGATAGCTGGATAGTCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chrX 1399866 5' - P-element 2850 1 42.57 AAATCAACATTTAAAATCATGTTTGGTTTAATTTCGAATCGAATTAACGTGGATAACGTGGCCAACAGAGTAGATGTCTAAGCCCAAACTGGCGTCCTGGG:1 - chr2L 5495790 5' + Rt1b 4825 1 64.36 AAAAGAGCCGACTGGTGTTTTGGTGTCTGTTTTGGTGTTATAAAACATTTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTA:1 + chr2R 18883284 5' + X-element 4543 1 58.42 ACGCCACTTTTCACATGGCAGCACACTTTGCAATGCAGAACCTCCAACATATTGGTAGTCTGAAATCTGACATCATTTCGAGACCCATTTTAAGCAGCGGC:1 - chrX 7405570 5' + gypsy4 6403 1 67.33 CCTCAGCTTCCGCTTCCTTAGTAGGAGACTTTTCCCGGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCCGGAAGCCCGTGCATAGCCGGGAAACACTACCCGTTG:1 - chr3R 14888240 5' + gypsy6 7517 2 61.39 CACCAATAACACCAACAATCTCGTGGCCGTTTCACCAACGGGTGGTGGTGCGCAGTTATCGCCGCAAAGCTCGCAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAA:1 + chrX 4428656 5' + Idefix 7086 2 72.16 TCTCTCCTTTCGATTCGGTCTTCTTTCGGGTCTTGGGTTTTTGCTAGCTAGCGTCGCTTTTCTTTACTTGGTGAGGCTGGCTCAAGACTCACTGAAAAACT:1 + chr2L 11408409 5' + G5 196 1 62.38 GACGCATTTGATTTACCGGTCAATGATGAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2L 22227341 5' + F-element 59 1 74.26 ATGCAATTGTTCCTCTGCGTTTCAATCAAGTTCCTTTTTTTTTTATTGTTTGCAATGCCTGCAAAGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chrX 5726688 5' + roo 10 2 69.31 GAAGCAAAGGAGCTGGGAGCTAGGAGTAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGAAAGACGAAGAAGTGGCGATTGGCGGG:1 - chr3R 10437747 5' - diver2 206 2 71.11 AGAGCCCGAGAAAAGCAGCTACAACAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCA:1 - chr2L 8100378 5' + I-element 4909 1 76.24 GAAAACAAATCAAGGATACCAACAACAAACATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 19510796 5' - roo 9027 1 68.32 CCAACAAGAACGGCGAGGAGATGGCAACTTTAGAGCCGGGCTTAGACGGCATTTCGCAGTTGCAGACCCACTTCTTTTTTTTCTTTTTCGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 1979066 5' - Doc2-element 232 1 80.20 TGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGTAACAATCACATTGTAGCACTTT:1 - chr2L 22690002 5' + Tabor 6891 2 73.47 AGCGGATACTGTTCGAGAATGGTTATGATAACTACAAGTTTGTGGTAAGAGCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAG:1 - chr3R 23379163 5' - Quasimodo 173 2 52.48 TTTGATGTTCTTGCGTTAAGGGAAAGATGAAAACTGATGTTTGCTTACATAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTT:1 + chr3R 7363730 5' + Cr1a 4051 1 53.47 GCCTGCCACCGACGGTAACACTGCGGCTATGATTGGATGATAAGCGATCCATAAAAGCCTGGACAGCATAAGTGGTAACTACAGATAAGTACGATTGCAGC:1 + chr3L 3047079 5' + rooA 7335 2 64.36 GACTGGCGAGGCGACAGCGTTGTCGCGCTGTCACCGTGGTCAAAACATGTTAATAATGTGTATGAGCGTGGTGGCTTAGGGGAGGGGTGGTGTATGGTACC:1 + chr3L 26294998 5' - ZAM 16 2 67.33 ATACCCGTTTCAAAAAGGGCTAAATTCCGAATTAAATTGCTCAATTATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCC:1 - chr2R 22781047 5' + roo 8693 2 55.45 CATCCGATGGGCTGTGCCGTGCATCGTTCGGCTCGCGGGTGGATAATCAATCATTAAAGTGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGTTT:1 - chr3L 27157570 5' - 1360 3202 1 67.33 TCCGCTTCCCGCACTTCCGATTTCCCATTTTCCTCGTACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATGTA:1 + chr2R 13054232 5' - F-element 158 1 63.37 GAAAAACTGTCTGAAATCATTGCTTCCCTGCTTACATCAGATATACCCACAAGCAGACTGTTAACGACTTCTACATTTGCCGACGACACAGCGATTTTAA:1 - chr2R 4236514 5' + Fw3 2950 1 68.00 AAAAATTATGCGGGCTGTTGTCGACATTGGCGAGGACTTGTTTTTGGTCCTCTCCTAGGTTATTTTTTTTTTAAATATTTTCAACGTCTAATGACGCTGGC:1 - chrX 20995409 5' - TART-A 13383 1 69.31 TGAAAGATTATTTATATATATTATACATCATACGTAAGCATTTTGCTAATTTTTGCCAAAAAACGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGG:1 + chr3L 20189943 5' + 1360 3381 2 64.89 CACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCA:1 - chr2L 21403544 5' + G5 4411 1 55.45 CCTAANGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTG:1 + chr3L 24213792 5' - invader2 203 2 69.31 TTTATAGCCAAATATAGATGCCAAGGTGCCTAATTGACGGCATGAAGCAAAGCGGAGGGTGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTG:1 - chr2R 12726859 5' + TART-A 12990 2 54.00 ATGTAAGATTACGCATTGTATCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATG:1 - chr3R 10211113 5' + Idefix 6944 2 79.00 TAGGGGGTGGCTTTTTGGCTTTGATGACAGATTATTTTCATTAGCAAAAGAAGCGAATTGTTGTCCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACA:1 + chr2L 2386624 5' - invader3 5461 2 69.31 CACACGTTCGGACCGAATATTGAAATTTGCAACTCGATTTGCTACTGTGCGCTCGTCGATTTCTGTGCCGCTCTAGTCTGTCCTGGTACCGGCTGGAG:1 - chr3R 16273220 5' - BS3 1477 1 66.33 CATCTNCGGATGGTCCCAGTGCGTGGTCTCGCGTTCGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTG:1 - chr3R 19590777 5' + blood 418 1 64.00 CCACTTCCGTTAAAACAGGATTTTATGTTTTGCATAAACTTTCGACGGTACAATGCTTTCCGTGACCCATGACTAGAGAATTTTTGGTCTTCGTTTGGAGC:1 + chr4 1022291 5' - Tc1 328 1 61.39 TGTAGATATTTTTTATTTTATTATTTGTCTTTGTATTTCTATCAATATAACAAAGGGATCTACACTGGCTTATAAACGTTCACTCTCCCCTAAGCTTGGA:1 - chr3R 757318 5' + Doc3-element 4259 1 54.00 TTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTG:1 - chr3L 10849151 5' + Cr1a 261 1 68.32 ATACCAATACTAACTTTTTAAGACTTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAAACTAACTCACCACGCC:1 + chr3L 14959801 5' + HeT-A 5910 1 66.67 CGACTTCAAGGCGACTGTCCTTCTTGACAGCGCTGTGGGGCTATTTTTTAATTATTCTGGACTTGTCCATAAGATTTTACCGCGAAAACTAATTTCACTTT:1 - chr2R 5885738 5' - X-element 51 1 55.45 AAATGTCAGGGCTGTGTGCCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTT:1 - chr3R 24673685 5' - invader2 300 1 54.46 AAAAACCCTCTCATGAAAAGTGGGGCGGTTCCCCATAAATTAAGGGGCCACGAGCTTGGAACCCTTTGCCACATATTCCAAACAAAAGGAAAATAAAAACA:1 - chr2L 1549552 5' + Doc2-element 254 1 63.37 ATATCTAGCCAAGACATCAACCGCTCCCAAAAGCTTACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATAAAAATTCTATATAATCTTGATCAGGATCAATAGCCA:1 - chr3R 26988850 5' + INE-1 88 1 66.34 CACATNAATTTTTCGTCAAGTTTGGAGCATTGATCTCTCTGGTCTTGAAAATATTTTTGTTGGGTAGAGGACAACACTGCTCCCAGGAAAAAAGAATGTTA:1 + chr2L 21147653 5' + HB 371 1 60.40 GAAAACAAATGCTTTCAGTTGGTAGTACAAAACGAATAAGTTGGCCGTCGTCTCCACCATGTAGAAGAGAAAGCGAACACTAGACTTTTC:1 - chr3R 18158856 5' - GATE 190 2 81.11 TACTCCTCTGCCCGACAACCGACACGAGCTAACTGTAAAGGATTCAGTAATCAGATGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 21266511 5' - roo 391 2 63.37 TTTTGAGTTTTAGCTTTGGCTTTTCACACAAATCGATTGGCGAAACCCATCCTTTTAAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTAT:1 + chr2L 7854811 5' - BS 4882 1 64.36 TTTATAATATTATCATCTGGATTATCGCCGGCATTCGCGTGGGAGTGTGTGTGTGTGCCGAAGCAGTCGGCGGATGGCTCCTTTTGCTATCCCTCACCGTT:1 + chr2L 18017430 5' - Bica 459 1 57.43 GATGGACAATTTGTGTAATATGATATACCCGAATATTCAATACAATGTTTACTATTAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 31143343 5' + roo 17 2 59.00 AAAACAAAGGGGATGAGATTGAGATGGGGATCGATACACAAAAAATTATCTGCCATGGCACATTCTTAGATGTCCTGTGTTAGTGGGTTGTTTACTTGATC:1 - chr3R 15039747 5' - Tom1 225 1 63.37 GCTTATCCTCAAATCAGTGACACTTGAATGTGCAGCCCAAGTGACTGACCAAGTGGGTGACTGACTGACTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGAC:1 - chr2L 17049902 5' - flea 139 1 74.00 AACCCTACCTGTTGGCCAGGGCTGGACTCCACCCTAATATAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACC:1 - chr3L 7136964 5' - Circe 7107 1 75.25 CCTGCGGATCTTGGGGTGGCAAAGTCCTCGAAAATGCAGAGGCAATGAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2L 19090129 5' + opus 7141 4 54.46 CTGTGAACGAAAGTCACAGCCAGGAGCAGGATCGATAGTTTCACTAGATTGTTAACCGAAGACATGGAACACATTTGTTTTATAATACTTCAAACAGAA:1 - chr2R 16672095 5' + looper1 248 1 65.66 GCAAAGACAATTCAATCAGTCAGGAATATGGAACTTTATGCGAAACCATGGGATGAGAGAGGGTTATGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chrX 2874892 5' - 1360 3378 1 72.28 TGTAGGTTAAACGCATATGATGACATAAGATCAGACAAGTTAATACGAGCGGTGGAAGTTCAATGTCAACATTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAGAAGACGG:1 + chr3L 22174258 5' + gypsy4 6728 2 63.37 ATGTATTGCAACATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAA:1 + chr3R 4579247 5' + Quasimodo 39 2 80.20 ATCAATGTACCCTTTGCAAGCGCATAGAAAGTAGTACTCAACAAATCATTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAGCAAATTTTATAAAAGCAGACAA:1 + chr3L 18345188 5' - Cr1a 451 1 62.38 ACCAGAACGTATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chrX 2766811 5' - mdg1 376 2 71.29 CCCGGTTGTCATAAACATGAAATTTGCACAAAACCGCCATTTTTATAAGGTGTCAACGGCACAAATTCAACTCATACCCATGAGTCGAGTGGTAAAAAAGT:1 - chr2L 9820835 5' - hobo 21 1 80.20 AGCCACTGATGGAGAAGAATCGTTTGAACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTAT:1 + chrX 12016307 5' - 297 6822 2 73.27 CCCGGTGCAAATTGAGTGCAATTTGGGTGCAAGTGCACCGGGCGGAAAGTGGGCGGCGCACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAG:1 - chr2L 2858098 5' + transib2 15 1 64.36 TTATGACAATGTTTCTTATGTGTTTCTGTTAATCTATCTTCTATAGTTGTGACTATTCTACTGTAATAGGTAATACGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATT:1 + chr3R 1047959 5' - Stalker2 385 2 60.40 CGCACCTACGCTCCTCGATGCCAGGAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAA:1 - chr2L 11240412 5' - roo 25 2 75.25 CACGCNGATCGAAAGCTTCCAACAGGCGGCAATATTTGCACTGTAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGAT:1 + chr2L 9647996 5' - accord2 130 2 61.39 GGTTGGAATACTGATCAAATATAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAATCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGA:1 - chr2R 21721381 5' - R2-element 3278 1 77.23 AGAGGCCATACAACGCCAGCGACACGGAGATGTTGTAGATAATCGTGATATAAATGTAACCGCCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCC:1 - chr3L 1573018 5' + I-element 216 1 62.38 GCTTGCTCTAGCCGTTCTCTGCGACTTTGAGCCACGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr2R 1320486 5' - Transpac 270 2 64.36 GCTGGTGTAAATATTTGGGCAATGATTTAATATCTAAGAATTTTAAAGACCATCTATGTTCTGATTTTACATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr2L 21292910 5' + roo 8670 2 73.27 AGTTCCCAGACGAAGTGGTAGCTTCGAATCGAGATATACATACATACATACATATTACGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAAC:1 - chrX 8511330 5' - FB 807 3 65.35 GTTTCGATGCATCGAGCTTGAATGCTTCTGTATTTATAAAGCGAGGCAGAAATTGTTTTTGTCAAACTCACCATAGTGTGTCTGTGTGGTGGTGTATGAA:1 + chr3R 19143807 5' + invader5 3871 2 74.00 TCGGTCGGTCGGGACGAGGACTAAAATAATAAAAGAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAA:1 + chrX 2804619 5' - hobo 481 1 65.35 CCATGGGGGCTCGCCTATGAATATCCCATGAGCTCTCGCGCTTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 1523787 5' + jockey 18 1 73.27 CAAACGAAATTATGTTTTTTTTTTAACACACACAGAACAGAAAATGATCATAAAATCAAATGCATGCAAAAAACAACTCCAAATAGCACTGCGAACAACGA:1 + chr3R 25464039 5' - Cr1a 233 1 51.49 CGTGTGGTCGGTTGGCTGCCAGCACAAAAGAGCTCACAATAAACGCGCTGTTAAATCAATCGAATTAACTAAACGAAACTCACTTTTTTGAAAATATTAAT:1 - chrX 6482581 5' - HB 261 1 65.35 GCTCTCTAACTCTCTTGTGCTCGCTTACTTTCTCCGGAGAGCGAAAGCTTTAGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCT:1 - chr3R 20080461 5' - 297 6628 2 55.45 ATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr3R 27619257 5' + hobo 45 1 72.28 TCCTCCGACCAATTCGTATGTTAAATATCAATTGTTAAAGGCCCTTGCCCTCATGCACATATATCCTTTTTTTGGTTATTTTTCCCTTGTTTTTTTTCTTT:2 - chrX 11762122 5' - Porto1 170 1 68.32 TAAGATTGATAAACCAAGTTTCATGGCATCTAGTGAGAAGATATTCTGCTGCCGTCATTAATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 + chr2R 5968760 5' - flea 240 2 65.35 AATAGCTAAACCTATCCAGAAGTGATATTTTTCTTTGATTTTGAACTGGATTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGT:1 - chr3L 21530175 5' + hopper2 1204 2 59.00 CATTGTTTGTGTTGTTATTGTTATTGGACGGACGGGCGGAATAGGTAAGTGCAGGTATGTATGAGTGTGTGAGTTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCAATTT:1 - chr3L 3179334 5' + FB 48 1 76.24 TCCCGCGAAGATTTCTGGCTTTTAATTACAGGTGTGCCTAAGACTATGTGTTTGTTTTATTATATACATATACATGTGTATGCAGAGGACATACATATGTT:1 - chr3L 1256250 5' - Stalker2 232 2 73.27 CAAAATGTTTTAATTTGATCGATTTGATTTCGCCCAGAAAACAAACTTCTCTAAATTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGGTGCG:1 - chr3R 21960213 5' - 3S18 113 2 64.36 TCAAANGCAGACAAAATACGCCGCGAAAGGGTGCAGGCGGGGCGGGGTCAGGTACACTTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 9133416 5' + Circe 7280 2 55.45 AATTACAATTACATGCCTCTGCCTTCGAGTGTGTTTGTATGTGTGCCCGTTTGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 - chr3R 14020576 5' + INE-1 561 1 52.48 CCAAGTGTTGAGGCAGAGTCACCGATCCGCCCCAGCAGCGTTCAATATCACCCTTGGATCGCAGCATCGAGATGACGATACCTTCCCGAAAAGCCGAGG:1 - chr2R 6635910 5' + gypsy4 6524 1 65.66 AATGTGTAGTTGGCTGCCTTCGCTTTTCCGCCCTGCTCCTTTTTCCTCCTTTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:1 + chr3L 11477455 5' + Quasimodo 20 2 58.42 GCAATNATTTAATATCTAAGAATTTTAAAGACCATCTATGTTCTGATTTTACATGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2L 21292928 5' + roo 8688 2 54.46 ATTTTTGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:2 + chr2L 5932099 5' + jockey 29 1 54.46 CGAGACTTTTGTAAAGGCCATTCAAACGTTACCAGGGCCTAGAGGACTCCATGCCGCGTAGGTGTAAGGCTGTGATAGCTAACAAAGGCAATCCAACCA:1 - chr3L 12848557 5' + HB 1321 1 75.76 TCAAAACAAAATTATGTCATTCGGACCGCATATTGCAAGAAAATGTCCAAAATGTAAATTCATTTCTTCGACCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCATAT:1 - chr3R 16291136 5' + 1360 3188 1 57.43 CGAAGGATCTGAATAGCTGAGGTTACTGAGGGAAACACTGTGTCCATTTGTGGTCAGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGC:1 + chr3L 21139104 5' + R1A1-element 5296 1 61.39 AAATCGCGACCGACCAAACGACACCCGAAACGACTAAGCGTTTTAAAGAAGGCAGCGGACAAACACGTATGCAGACAGACTTAGAGCCCACCCGAACCCGT:1 + chr2R 2948919 5' + G5A 2623 1 78.22 GCCTTGGTCTACTTTTCCTCTCTCTTTTCAGAGGTGGTCAAAAGTATTTACACAACGTGCTTTTTTTGTCGAGTGACAAAAAATGCCACCTTTGCAGTTCT:1 - chr3R 4571126 5' - hobo 4 1 64.36 CATTCCTCAATATGGACTTGCTTCACTGTGCTTGGCTTCATTGTAGTCCATGTGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGAAC:1 + chrX 17939355 5' - Rt1b 4876 1 61.39 CTTCCCCCGTTTTGCTTTGTTTTTTTTTGGAGTGGGTGGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTGAGTTAG:1 + chr3R 6561407 5' - G-element 231 1 66.34 AAATATACGTTTCAATTTGCAGCCCCATATACATGTACATTATACTATACATTATACATTATCCACCCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATT:1 - chr3L 2733158 5' + copia 4809 1 72.28 TATGGATGCAATGCATTACAGATGTCCAGACGAATGGCATTTAAGGCGCGCCAGGCAGGCATATTGATAAAAAACATGAAA:1 - chr2R 10653745 5' - S2 117 1 90.12 CGGATAATCCGGCAAACGTTCGCGTATGATCTGCAAGATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr2R 14582928 5' + roo 8666 2 76.00 GCGTTCATTGCAGGTCTCAGGTCTTGAGAGGGATACTACTACCGGCACTAGAACGCATTACCTATGCCCAGGAAAACACATGCACACACACACACACAC:1 + chr3L 26552765 5' + accord 7025 2 70.71 ATGGTGGTGGTGCTCGATGTGGGCTATGTTGCTGCTGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAA:1 + chr3R 8367975 5' + P-element 212 1 46.67 CCACTAAAAATCACTTAAGGCGAAATAAAAATATTTTTTACGGCCCTTTTATAGATGTTGCAACAATCTAATAACACACGTGCGATTACCTCAAACAATCC:1 - chr3R 16764557 5' + I-element 4883 1 73.27 TTTGCTTTCGCTTTAAGTTACTACATAAATACATACATATGTATTTAATCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr3L 15099944 5' + Tirant 8134 2 53.47 CTCGTCATAGAAGCGCATCATCTCGATCAGCGATGGGTGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAGAATGGATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGT:1 - chr2L 14339288 5' - GATE 450 1 63.54 GCTTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 + chr2L 20840423 5' - Transpac 282 2 55.45 CCAGCGACCGAGGCATGACTCCATTCCCTCTCCTTCGCCACAAGAGACCAGACCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGG:1 - chr3L 22435604 5' + invader4 410 1 69.31 GTCAGTGGAGATGCCTCCGGCTGAGTTCTTCAATGAATTATTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTC:1 - chr3L 22240502 5' - Doc 4478 1 60.00 TGTCTNTCTGCGTTTTCGTCTGTGTCTAATAAAAGTACGCGTTGTTACGTTGAATTGAGAGCCGGCATTCGTCTTGCTTGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTA:1 + chrX 17865592 5' - F-element 206 1 70.30 TTTTATGTGCGGCTCTGTATGCGTGTTGCTAGCCATCCTTCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACA:1 - chr3R 11524463 5' + hobo 2681 1 60.40 ACAACAAACGCATGGTTTTGTTGTGGATAAAGAAGTCATAAAAACAATACAAGTTTTATATTGACGGTGTTTAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chr3R 8185282 5' + Doc 14 1 70.00 GAATTTGACGTTCTATTTGTTTGTTTCCATTTCAAAGGTCATTGCTCTAGTGCTTCCAAATTACTTCCACTAGCTAAGTAACGAGTATCTGATAGTCGTGA:1 + chrX 12984536 5' + INE-1 553 1 66.34 ATCCAACTTAAGACCAGGAGGTATGCGACTTGCGAATACCCTCGAAAGAGCTGACTTTATAGACTTTGGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGT:1 + chrX 18613534 5' - Idefix 7186 2 67.33 TTTGGTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 - chrX 1399929 5' + P-element 30 1 49.50 CCGTTTCTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTACATTTGTTGAAACAGGCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATAATATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGA:1 + chr4 431233 5' + 1360 267 1 52.48 ACCTTAATGCGATTGCATATGAACGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chrX 1548509 5' + roo 54 2 79.21 ACAAAACTCTTTTTTCAAAAAGGCAGCCACACATAACTGGCAACTAACAGGCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 + chrX 17692580 5' + 3S18 27 2 52.48 GGGATGAATTCCTTGAGGCCCTTAAAAAAGAACGTGCCTCCCGGATACCTGCAACCTACGCCGGTGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACATAATTAGTT:1 - chr3R 4431301 5' + gypsy6 381 2 67.33 ATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr4 868670 5' + roo 50 2 79.21 CTACTCACGAATTTAATGAAAAGCTTTATAAGCCGCTTGTCCTGACGGTAGCGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAA:1 + chr2R 5973949 5' + flea 308 1 58.42 GCCACAGCCACTAAGAGTAAGCGACGTTTTCGTGACCTCAGGTGGCAAATATACGTTGGCGCACCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 7316397 5' + jockey 12 1 74.00 CGGAAGAGGCTCTGCAAAATAAATATACGTTAATTAGGCCCTAATTAACGTATTCAAAAGGAAAACTATGTTAGTTCTAGGTCAATTTAAATTTTGTTACG:1 + chr3L 9952923 5' + HB 1393 1 66.34 TTTCCGAAAGGAGTTGTGCTCCAGACGAGCTCTGGTGGCAAACTGAATATATTTCGAGTCGGGCTGGGATTGATGGATATAGTATGGGAAATGGAATTTCT:1 + chrX 12412148 5' - 297 6512 1 61.39 TGGCGGCCGTGGCGGCGGTGGTGGCTTCGGAGGACGTGGTGGCGGCGGACGCGGAGGCGGCGGCTTTGGAGGACGCGGGGGCCATGTAGTTAATTAGAATT:1 + chr3L 21835706 5' - mdg1 426 1 82.18 GCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAAACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3L 14364950 5' + blood 27 2 50.50 GGAGCTACTATTATTCTGAGTCAACCTCAACTCCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTC:1 - chr2L 3851360 5' + opus 7090 2 68.32 ATTATTTTTCTCTGTGTCCGATGGGCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTAG:1 - chr3L 8826827 5' - F-element 4487 1 76.24 ATGTTNCGTATATTATATACGATGATTCTTGATTATTGTGGAATGTTTCATGACAAATTTTGTGCGTTCTTGGGTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTT:1 - chrX 16686052 5' - I-element 393 1 79.21 ATGCGNGTTCGGGACCAGAAGATGGGACCGTACCAACTTTGATGTCATTAACACCATACATAACAGCCGCTTCTCTGCCGACTTCACCAGGCAGCGAAGGC:1 - chr4 553329 5' + gypsy11 298 2 62.38 CCCCATTACTGGTTGAGTCATTGAACATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGC:1 - chr3R 8357937 5' + invader4 84 2 74.26 CCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTT:1 + chr3R 14882087 5' - gypsy5 380 2 61.39 CACCCGGTGCGCCTCACTCCTCACTCCACACTTCAGACTACAGGCGCCCGAGGAGCCGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGGG:1 - chr2R 7417044 5' - F-element 410 1 59.41 AACCCAGGCTACACCTGGAACTCCAGAGATGGAGGCCTACGCAGAAGCCAACTAGCGGTCTGCTCAAGGACGTTCGGCGCCTTTTCGTCAACCTCAAGCGT:1 - chr3R 31494040 5' - R1-2 393 1 57.43 TCCCCTCCAAAAAAATGTTGCATTCGCCAACAGTTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTGTGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATT:1 - chr2R 12704056 5' + hopper 336 1 72.28 TGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCT:1 + chr3R 18860356 5' + R1A1-element 5049 1 77.42 GGGTGCTGCAGCTAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr2R 16928860 5' + blood 7047 2 59.41 GGACAAGCGCAAGGAGGATGCCGTCCAAAAGCACCAGCGCCGCGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGG:1 + chrX 19616572 5' - Idefix 197 1 58.42 GTACAATCGCGAATTGATGAAAACAAAGCCTCCGCCAATATACATCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGC:1 + chr3R 8369931 5' + F-element 454 1 56.44 CATGGATTTCCCGGAAACCGAGGACACCTTCATTCATTAGGCATTTATACGATTTGATTTGTAGTTATTTCGTAACAGACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCT:1 + chr2R 12130763 5' + gypsy10 298 2 54.46 GTAGGACTAACTTTTCTAAAATCGCACCCTGTTCAATATTTATTAACTCGAAATCGAACTTGAAAATTGTCAGCAAACTATTTTCATTGTTCAAAGTAGGT:1 + chr3L 4848251 5' - invader1 444 1 71.29 CACATTTTTAGCATTCATTCGATAGCGGGCTCTCACTCCGCTTTTGCGATCTGGCCATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAA:1 + chr2R 22247160 5' + INE-1 146 1 54.84 TAAAAACTCTCTCTATCTATATTACGAAAATTCTTGTTGGTTGGTAGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 - chr3R 10583925 5' - HMS-Beagle2 488 5 58.82 ACGCCCACTTTTTTGGGGTGCTGCAGCTAATTAACAACTCCAGTGGCTGTTAGACTTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr2R 16928845 5' + blood 7031 2 60.00 ACTTAAAGGATGCCACCACGGCAGACGAACAGATCTGACAACAACAACCCGATATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCT:1 - chr2L 13782707 5' + Stalker 201 4 57.43 ACGAGGACCCTGGTGCCCAAAGGTGTCCTCTGGGTTAACAAAAGGTTCAAGTGCTGTCTACCACACTCCCACCCACACACACACACACACACATACACTAC:1 - chr3R 26775971 5' + Quasimodo 40 2 50.50 GAGGAGGAGGGCAATGCAGAGGATGAGGATGCGGATGCCAATAATGAGGAGGAGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGC:1 + chr3L 3287331 5' - F-element 4486 1 56.04 AACGGAAGCAACTGCCCTGTAATTACGTACTTTTCGAGGAATGAATTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGG:1 - chr3R 16116859 5' - Bica 4855 1 55.45 CATTTTGCCGTTTGGGATTTTCTTCATTTCCTTCGCAAACATTTGTCAGATAATTTGGCATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chrX 2874788 5' + 1360 16 1 62.38 ACTAAGAGTAAGCGACGTTTTCGTGACCTCAGGTGGCAAATATACGTTGGCGCACCCAGTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3L 7316388 5' + jockey 22 1 64.36 AACGCCACATGTGGCAAAGGCAGCGCGAGCAAGACGAACGACGGCTCTCAATTCAACGAGACAACGAGCGGCCAATAACCAACAAATCAAAAAAGAGCGCA:1 + chr3L 16211433 5' + F-element 352 1 76.24 CCCTGCTGGTCCCTCCAGCAGCTGGCCAGCTTATCGTCGAGTCAGAACGACACTCGCGCT:1 - chrX 5502241 5' + F-element 194 1 60.00 GATCCTTGAATCCAGGGGGCCAAGCCGAGACAGAAGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAACAATAACATCGGCGACGCTG:1 + chr2L 8803610 5' + gypsy10 5709 2 68.32 AATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:2 + chrX 10555429 5' + Tirant 49 2 71.29 TTTCGTCTATTAAGAAGAGAGTTTTATTGTTTTTGAAAGCTTTTTGTGGGTGTTTCGGCTAAGGACTAAAAATCAAATGTAAATTGGATTGAGGAGAAGAC:1 + chrX 11220820 5' - 297 6829 2 63.37 AATCATTACATTCCGCCGGCCGAGTGGTGCGTGCTCGCCGTGATATCGAAGGAGGAGACTGATTGGCCAGTACGACCCAGGGTTCTTTTCAGGCTTTCCAG:1 - chr3L 12436713 5' - BS3 405 1 56.44 GAGTGTAAAACCACATAAATTTTGCATAGCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 3947383 5' - roo 361 2 74.26 CCGAGTGTTGACTGGCCGTCTAATTAGCCCCGAGACCATGCAGTGTCCCACAAGAAAGCCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCCTTATTTATTAACGACCTC:1 + chr3L 5849442 5' + Q-element 522 2 64.36 AACATTCACTGGATTTCTCCAACACCGTGGCAGCGCCCTCTATCTCACAGCGCGCCTCCTTGCAAGTGTCGCGAAGACATAAGAAAAGTACGCGTTGTTAC:1 + chr3L 506113 5' - Doc2-element 349 1 69.31 CTTGTACCTCTTCAAACACACGAACACACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3L 14882827 5' + jockey 57 1 77.23 ACCTGCTTTAAAAGAGAGAGCCAACAAAAAGATAGTGTCTTTGTGTGATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 22667122 5' - 412 7515 2 54.46 CTCAAGAACTTTGGGTAATTCCTATAATTATCTAGCTGTTCCAAGCATCGTTCTACGGTTAGCTAGGGAGGGTAACTGAATTAGAATTAGTCTACTGGAAT:1 - chr2R 23778476 5' - Cr1a 3975 1 65.35 CAACGCACCTATACATGAAAGAGCAGGGGTGGAAAAAAGCAGGAGAAGAATGGATGAACGGATGGCTGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGG:1 - chr3L 14291594 5' + jockey 4642 1 54.46 AAATATTTATTCAATTTGCGTTGTCATTTCAACATTTAACTTATGCACAATACTTTTTGTGGTCGGAAACGTCTTCTTTTGCCTGTTACATACTTTTCAAC:1 + chr2R 14986375 5' - INE-1 20 1 55.45 GGTGCCAGCTCCAGTGCCGAAGCCGTAACCTTTCGGCCCGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATG:1 + chr3R 7115517 5' - Quasimodo 189 2 61.39 AAGGTGCTTCTCTTGATTACACGAAAAGATACAAAAATCATATTTAACTTGAACACGTGAAGTATCAAATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGT:1 + chr3L 14819938 5' + invader2 5066 2 52.48 AGTATTATTGGGAAAGCTAACAAAGATTTTTATGTCTGGTTTAAATGATTTTCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTGGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 - chr3R 10490419 5' + transib2 21 2 58.42 TACATNTTTTGTTCGAGTTCGCTTTTTACATTCTAAATCACATTTTTTTACAAATTTACAAATAACAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGA:1 - chr2L 12242072 5' + invader3 11 2 67.33 ACATTTTGTACAAAATATAATGGTTTCTTAGTTTTCTGCTTCAGTTCAAGATTTAAGTTTATTTTTACTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr3R 13357627 5' - Doc2-element 253 1 50.00 CACGCATCTCTGGCGTATATAATTTGTTTAATTTGTGGCTAATTTATCTTTCCACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTC:1 + chr3L 2388966 5' + R1A1-element 5108 1 53.47 TATCCGCTGAAAAAATACCCCACAGACCGGAACAGAAAAGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATG:1 - chr3R 25372922 5' - Doc2-element 411 1 61.39 CAGAGCCATTTAAATATGCAAAAAGTTCGCACTGAATGCAGCAGAAATGATTCGTCCACCCCCGCACATAGGGCACCTAAGGGGCCATTGGAGCCATGCTC:1 - chr3R 6982150 5' + Gypsy12A_LTR 1920 1 65.35 TATTGTGGGGAATCCCAAGAAGAAGAAGGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATACCG:1 + chr2L 11914720 5' + Bica 4891 1 72.00 ATTCCCGCAAAGCTTTATTCTACACAGAGAGAAAGCAGTTGTAACAAACTGTAAAAATGTTAATTTCTATATATGTAATATTATTATTTGTAAATTGCAAA:1 + chr3R 25767652 5' - P-element 2490 1 76.24 CAAACTCAGATACATAATGGATTGATTAGAAATGAATTCTGGATTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr2R 18434552 5' - pogo 2074 1 56.00 AAAGTCAAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9955469 5' - accord 190 2 51.49 GAAGCACAGACAACACACAATATACACACAGCGCACAACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATC:1 - chr3L 2539721 5' + F-element 339 1 61.54 CAGCAGCAACAACAACGACATCAGCTAAGTCAAAACAAGAATTTTCTGTTTATCCAAACACACATACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCAT:1 - chr3R 8165794 5' + Bica 4661 1 70.30 TCTCAAAGAAACTCAAAAAAGGTATCTCATGGTCGAGGAGCTACAATGCAAAAACAGTAAATATGATCTCAAAAATCGTGTGCATAAAAATCGTATGGCGT:1 + chr3R 4588572 5' - 1360 29 1 75.25 CACGTTCTCCTTTCCCCTGAGAAGCGAATTAGAGCGGGAAAACAATAGATTAGTTATGCAGTTATAGTTTGAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTC:1 - chrX 6657601 5' + accord2 7312 1 77.23 ACTATTTGAACAAGGGAAAACGTGGAAAGCTGGGCGCAAAAGTTAAGAGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 13560785 5' - roo 9047 1 52.08 AGTTGCTATCGCTTTCGATTTTCAAGCTATAAAAAAGCAGTATTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 - chr3R 12789920 5' + flea 4787 2 57.43 GGGCCNCTTCAGTGGGGTGGCTTTAATTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGGGAGCAGAAGATTGTTATTTATGTTGAGAGGAACTTTCCTATTTTAACTG:1 - chrX 14590268 5' - Gypsy6A_LTR 271 1 74.26 TAAAGTAAATAACAAAGTCAAACTTGAACGAGCCAAAAACTATGGCAGTGCGGACCAAAAAGAAATACCATACCAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAG:1 - chr3L 14738517 5' + I-element 439 1 78.00 AGAATAACTACTACAACATATCCATAAATACCACTTACAAGTATCAACAGATACCTATTCATATATTCTTTATATATTATTTGGAATGCAAACGGCCTGCA:1 - chr2L 8846451 5' + G6 1630 2 76.24 GGAAAGTGTACAATTTTAGAGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCA:1 + chr3R 25360202 5' + Quasimodo 100 2 79.21 GTTAATTAGCATAACATTAAATATGGTAGCGCACTTTTTTGGGCAAGTTATGGAGAAAATCCCTTTTGAAAATATCAGATTTTTGGCAACATTTTGATTTT:1 + chr3L 22240964 5' - HMS-Beagle 329 1 65.35 TGATTAACAAAGGTGAACGCCAATACATTTTAAAATTTTAAACCATTTGTAGGGCAGTCTTACCAGCTTCCTCGTCTTCCATCCCTTTATTTCGTTACACG:1 + chr4 442801 5' + Gypsy12A_LTR 2254 3 75.25 ACATGCTCGTACACCTCGTACTCAAACTGTTTGTAACTTATATGGGTATTAATTTTGGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATG:1 - chrX 12304415 5' + 412 7159 2 59.41 GTGCTTTGGGCGATTGGAATGGGAGTGCCTCAAACTCGGCCATAAATTTCATTGCCTTGGCTCCCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATAC:1 + chrX 14504991 5' + hobo 2665 1 66.34 AACTTTTAACTCTGCATTTTTAGGAGACTGCTCAAGCGATAGCAGCTCCTCGGAGTCAGAGCCTGGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCTA:1 + chr3R 4405457 5' + G-element 466 1 73.27 CTCCTAGAAATCTTAAATTTTCTTGGAAACTGCGATAGTGGCATGTAATATACTTTTTACAATGTTGTTACAATATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATT:1 - chr3R 14570374 5' - I-element 5242 1 58.42 ATCGAAGATGTTACTTTTATAAAATCCAATTTCAAAGAATGCAGGGAAATATTCCAAGGTAGTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2R 5095445 5' - roo 392 2 60.40 AAATCTCTGCTGAATGCCATCATCTTCGTAGCAGTGCTGGCGACATAACAAGGACAACCCCAAGCGACAGGAAAAAGGACATCCACACACACACACACACA:1 + chrX 20280818 5' + accord 180 2 64.36 GGGTGNTAACTCTGCGGCAATCCAGGCGCAGATCGAAATTCAACAAAAACGGGGAAAATCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 17788893 5' + roo 8683 2 57.43 TTTGCACAATGTAAATCGGTCAAACCAATCAAAAGCGAAAAAAGAGCAACAATGCCCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 9653266 5' - roo 388 2 59.41 TGACACATTTCCCACACCTCCTTGGGGTCAGCTCCGGACCAGAATCAGGGAGCCCAGCTATTGTATTACTCTAAGCCTATCGAGCTGAGTCTTAGAGGCAG:1 - chr3L 22588800 5' - G5A 2456 1 53.47 GATATAAGTAGGAATTATCTAACACGCTCTCTTATGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCAC:1 - chr2L 21037695 5' - G-element 26 1 65.35 AGACGTTCTGCGATTAAAAAATATTAACACGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chr2R 8463616 5' + I-element 52 1 70.30 GCTCTGCATATTCTGGCCATTTTCACGGACCGACCTGCACTCCGTACCAGAGAACGGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 5910859 5' - hobo 2911 1 54.17 CAACATTATACCCATCATAGACCAGCAATTCGATTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTT:1 + chr3L 8105156 5' - Quasimodo 283 2 67.33 CAGAAAATTCGGATCATAAAGACAGAGTCAAGTTTACCAGTAGTAAAAGAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAA:1 - chr2R 3188497 5' + INE-1 139 1 53.47 CTCCACATTCAAATTGCGGAGAAACCTATAAACAGGCCTCAGATTTTCTATAAAGCACTCGATATATTAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 17004707 5' - roo 402 1 72.28 ACACACACACACACAAATACATTCGCAGAGATGCCAGCAGAGATATCTCCACTCATGCACACACACACACACACA:1 - chr2L 7049524 5' + accord 180 2 82.67 TTTTCNGTGTGTACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chr3R 27619279 5' + hobo 23 1 55.45 TGTTTTCACTTGCAATTTTTATTGCACCCGTATCACCTTTCGTGCGTTGTTCGCAATGCTATTTGGTGTTTCTTTTGTATGCACATAAGCTGCAC:1 + chr3R 1586478 5' + Cr1a 264 1 66.32 TTTTGCGCTCTCTACATTCTATTCAGCAGAAGTGCGTCTGCGTCTGACATTTATTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATT:1 - chr3R 18859897 5' - F-element 293 1 62.38 ACAACAATAACAACAATCAAAAACCAACACACCACAAATTCAACAACAAGTAGCTCAAACAACAGCTGCATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACT:1 - chr3L 2419264 5' - 1360 417 1 70.30 TATGCAATAAAAAATTTCACACACGAGCACGTTAATTACGCGCGGCATCCGAATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2L 7654045 5' + jockey 21 1 63.83 ACTAGACTTTGCAATTAAATTGCAACACGAGCGAGGCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAA:1 + chrX 10314848 5' + hobo 356 1 67.33 GTTTANGCGGTCCTGTCATCAGTCAGCGAACAAAAGCAATCGCAAAGGCCGTAAAAATGGAAAATACTTTATAAATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCAC:1 - chr3R 28748719 5' - Cr1a 152 1 48.51 GACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGG:1 - chr2R 2994306 5' + gypsy8 4768 2 46.00 TCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chr2L 17862241 5' + F-element 52 1 71.28 ATAATGGTCATGATGGTCCATGGTCATATCTCTTGTGATAATAATATTTGTAAAAGATATTTCTTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAG:1 - chrX 4604408 5' + roo 157 2 67.33 CTCTTGGATAAACAGACATGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAG:1 + chr3R 18860338 5' + R1A1-element 5039 1 61.39 GTTGAGGATCCAGTATCCCATGCTGCTTGGCCTCCTGGATACCGTGCAGCAATCTCTGATAGTCGCCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAAT:1 - chr2L 2421889 5' - X-element 4296 1 68.32 CAGCTCTTCTTCATCTTTTTTATCGGCGCTTGAACTTGCTTTGTGTGTGGGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAG:1 + chr3L 17962266 5' + baggins 5402 1 54.46 GATGGGAAAAAAGAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr3L 776104 5' - 1360 3349 1 67.33 ACTATGTGATAGATTCTGGGGTGCTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGGCTCAGTTCAGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr3L 3254951 5' + 1360 12 1 68.32 AGTGGCCGGCGTTATGTGCAGCAATCGCTCATCGCTTCCGGCTTCTGATGGCAGATCTGCGAATTGACTGACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAA:1 + chrX 13276492 5' - Burdock 6241 2 67.33 CTGCCGACATTTTTCTGTTCTTTTCTGTAGTTTTTGAACTAATGCTCACAGGGTTTTCATGCTGGACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAAA:1 - chr2L 19945353 5' - Porto1 4312 1 66.34 GTGCATAATCGTGATGCCGTTAGCTCTGGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTT:1 + chr3R 11921625 5' + X-element 4509 1 72.28 TAGACATTTACAAGACTAATAAAAATTTTAAAAAATATCAACACATGTTTTAAAAGTGTGGGCGTGACAGTTTTTACGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1 - chr3L 24324475 5' - INE-1 217 1 81.19 GCCACCCCAAGCAAACTATCCAAGCTATACTCATCCACATACTCACCATCACCGGCGCACCGTAGTACGTTCGAAGTGATAACTTACATAGGGATTTATTC:1 - chr4 545771 5' + Fw2 3667 1 56.44 CCGAAGGAGCTGTCAAGTGCGGGAAGGTAAGAAGCACGAAAACATGGGATGTGGAATAACTTTACTTGGACAGGAGGTGGATTTGTGTGAGCGCAGCCAGC:1 + chr2R 7391490 5' + aurora-element 231 1 80.20 ACGTTGCCTCTTTGAGTCGATTATTGCCGCACACGGTATTATTATTCTTGGGCCTCGAGTATCTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chr3R 20500199 5' + opus 159 4 69.31 TCAAAAGCTAAGAACGCAAACAAATTATTGAATAACAACGCACTAAAAACGATGGCAGGTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr2L 306463 5' + Tirant 8124 2 64.36 AGTCCATTTGCAAGTGTGTGGGCAGCGTTTTAATTAGGGCGTGGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAA:1 + chr3R 30205206 5' + 1360 499 1 59.00 TAAAGGCAATGAATGGGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATT:1 - chr3R 5775764 5' - invader4 3076 2 70.30 AAAACGCAAAAACACATTTCATTGCCAACGAGAAACTTTGGGGTGTGGTCAAGGATTCATGGAGCAAAATTCCTCAAAAACGGTGCGAGGGCTTGGTGGAC:1 + chr2L 13879420 5' + Tc1 1273 1 74.26 AACCAAGTGAGAGGTACAACAAACGAAGGACAAACTCTACTGAAACCGAAGATCTCCCAATGATTAAAGATACAACCGATTTTATACGGAGCTCGATGAAA:1 + chrX 13776879 5' - Doc3-element 26 2 73.27 CTCAATGGTCTTCTCGGCAAACGCTTTAATTCCCGTCCAGGACTCTTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGAGAT:1 + chr3L 7497537 5' + gypsy 443 2 51.49 TTTCTCCGCGATGTCCAGGATGCTGAGGATGTTGGGGATGTCGAGGATGTTTACTTAGGATTAGTTTTTGTTTTTTTTTTTAATTCGTTTATTGAACATTT:1 - chrX 20116494 5' - Rt1c 5415 1 56.44 GCGGCTGTTAACGAATTCGGACTGAATATTGAGCAAAGTAAACACTACGCAAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACCAACTTTCTTCGGCTATTTATTATT:1 + chrX 8081557 5' + diver2 4861 2 59.41 CGTCTGGATGTTGAACACTAGGGGTAACGCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTA:1 + chr2L 10642383 5' + Doc 4374 1 78.22 TTGAATTCGTAATTTTTTGTTGTAATTTATTGATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCTCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chrX 10660948 5' - HMS-Beagle 203 2 72.28 ATTATTGCTCTAATAACGTAAGTACCTACATCACAAGCCTCTGGTTTCCTAAACTCAGCTTTTAAAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAG:1 - chrX 286003 5' - 17.6 7190 2 71.29 GATTGTCCGACCAAGGAAAAGCAATGGGTTCTTATTATAGCCGTTTATTCTACTTTCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2L 22407547 5' + roo 8683 2 60.40 CGTACACTGACGAAAAAAATGGTCTATGTAATGCCTAATGCTATGATTTAATTAATATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAA:1 - chr2R 21092031 5' - 1731 294 1 58.42 CATTTTATTAACATTTTCATTTAGTTTTGCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGG:1 - chr3L 17223195 5' + blood 7218 2 65.35 AGTCCAAATTTGACCAGAGTGCGGTTGTTTACCAAAGTCGTCCCCTGGCGCAAAAGTCCGTATTTCGGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr3R 25814798 5' - 412 7540 2 72.28 ATTAAGTGAATTAATCGTCATCAACAATAACATAAGAATTTAATGCTCTTATGTGTGAAAAGCTTTTTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 + chr2R 8498356 5' + Tabor 10 2 67.33 AAGTTAAATATTTATAGCATAATTCTAGGAGCTGCTACATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 20140551 5' + jockey 23 1 65.31 CCTTGTTTGCAACCCCCAAACAACATGGCTTAAACGGAGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATCATCAGCATTCATGGACA:1 + chr3R 18511509 5' + Chimpo 4050 1 62.38 GTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3L 14364964 5' + blood 41 2 66.34 GCAGATATTATTCCGCAAAAGGATTTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAA:1 + chr2L 14246851 5' + F-element 70 1 79.21 CCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr2L 14536260 5' + blood 7058 2 68.00 TTTGGCACTGCTCTGTTACAAGGTTTATGGATTGTTACCACAACAGGTTATTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 + chrX 2253821 5' + Tirant 8132 2 56.44 TATATGTTTTTACTATCTACTAAAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 19260787 5' + pogo 13 1 43.56 AAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chrX 10555435 5' + Tirant 8162 2 77.23 AATTTTTTGCTGCTATTTTTTTGTTTATTGTTTGTGTTTGCTTCCCATGCTCTTTCTGTTTCTGTGCGGACATGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAG:1 + chr2R 19222520 5' + Bica 69 1 68.32 CCAAGNATTCAATAAGACTTGTGGGTACGAAATCTTCATCCCCATCACCAACACAAATATGTAAATATTCTACAATATCTATCGGTATCCCAGAAAAATTA:1 - chr3R 25720898 5' + INE-1 503 1 71.29 TTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGT:1 + chrX 21087590 5' + mdg3 5287 2 57.43 GGCGCAGTTGGATGTCGCTGTTAGCTAATTATTGTAAATTAGTCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTG:1 + chrX 14620564 5' + micropia 5352 2 57.43 GCTACNGAACAGAAAGGCAATAAAACAGCAAAAATGCTTCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGGCGTACAGATAAAT:1 - chr2R 1733654 5' - diver2 4657 2 67.33 CGGGCGGACATGACGAAATCGGTGCGGCTGGGTAGCTTAATCAATCAAATTTTTTAACAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAA:1 - chr4 151531 5' + G4 3389 1 59.00 CAACGCAATATGGCGTGTATAAAAAGTGTCTGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr3R 9833035 5' + Tabor 25 2 52.48 CAGTGCCCAAGGGTTCCATGTGAGGACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAG:1 + chr3R 26331625 5' + G-element 10 1 66.67 GTGCATTTAAATGCACCGAGTCGCCACACCGCACCGAAATGCCAAGTGACCGCATCACTCATACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3R 7808925 5' + jockey 20 1 66.34 GAACGATCAGGACCAGGGCTCGGCGGCAGTAGCAGTGGAGTTCCAATTGGTGGGTCGCGGGGGGGCTTGCCAGTCC:1 - chr3L 18841836 5' - G-element 324 1 65.79 AATAANAACTATGAAACATGCGTTAATTGCCAAGAGACTTGGGGAAACTTTTTATATGTCTGTTCGCACTATAAACTTGTGCGTACCCTTAACGAGTTCAA:1 - chr2L 15103612 5' - rooA 346 2 63.37 TATGANTGTCCATAAATGTATCAAGCCATTATGCAGCGTGTTTCAAGACAAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chrX 22517683 5' - 1360 3363 1 53.47 TGACAACAGAACACAGCGAAAAAAAAGAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr2L 9854117 5' + Transpac 4957 2 76.92 GTCCGCGAACCTTGACCGCAGCCATGTGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3R 22352835 5' + 412 7102 2 74.26 AAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr2R 25203779 5' - 1360 3359 1 58.89 GCTGTCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCCGCATAGTGCTAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCT:1 - chrX 3464218 5' + 1360 3378 1 76.24 TATGATTACCCTTAATCACTACCCATTTTTTTTATCAGTGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAATTA:1 + chr3L 1281393 5' - gypsy 7334 2 61.39 AGTTGATGTAGCGCACCATTATTTCAGGGGATTTTCCAAGTGGGTGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGT:1 - chr3R 17968504 5' - Doc 474 1 55.45 ATCGCAATCAGATGTCTAGAAAAAATGAAGTATTTCGTTATTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCA:1 + chrX 17715866 5' + F-element 4309 1 59.41 AGCGCATGTCGATGGACAGGATGCGATCGCAGTCGCCGCCACCAATACCGCACTACACGGATCACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATA:1 - chr3L 12848657 5' - accord 99 2 71.29 GCGGATGACTTCCTGTGGTTGGTATTATATATATAGCATTAGCTTCTTAAACGGAGGGTTAAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCA:1 + chr3R 20912329 5' - R1A1-element 5177 1 61.39 ACTAGGTTAATGAACGCCTCCATTTACTACTTCCCCATAGTACAGCGAACACAGTCTAGGATTCTTGGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAA:1 + chrX 15861520 5' + Doc3-element 4415 1 65.35 CCGCAGGCCTTGCAAAGCAAATAAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGAGGTT:1 + chr3L 1882172 5' + X-element 4318 1 76.83 TATCGCCAGCAGGTCCTTGCATTCGGTAGTTTCTGCTCCTGTTTGAAGCGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCAC:1 + chr2R 20708402 5' - Stalker 299 4 66.34 TGTTTTTTATAGCACTGGAGAAGTTTCAATTTATATCAAAACATCTCTAGAATCTGAATGGGAAATCTTAACCTCTAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATA:1 + chr2L 10701119 5' - INE-1 138 1 66.34 GGGAGNTTCTTCTGCTCGTGGAGGAGGCTGTGAGGAGAGAGGATAGCGTCATAGTTCGACAGGCCAAGGAGCTATTCAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCC:1 - chr3R 22763402 5' + Doc 419 1 78.22 AAATATATATTTAAACGTATGCACGGCTGTGTGTATTTGCATGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chrX 9950826 5' + hobo 13 1 55.00 GGGCAAAACCACTGGACTCGCAAAGGACCGATATGGATTCCAGTATAGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2R 20791746 5' + roo 29 2 56.44 AGCGAGATTGCAATCTTGTAATTTAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAA:1 + chr3L 21840478 5' - 1360 3254 1 76.24 AAGGGCGCACAATACCGTTTCCCACACACACACACACACACAGGACTTTGATTAGACCTTTGACCTGTGCTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCA:1 + chr2R 22020540 5' - accord 6966 2 37.62 CAACCTTAATGCGATTGCATATGAACGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:2 + chrX 1548507 5' + roo 8716 2 77.23 GGCGTGTTTCAGTAATTTAGTGCGCCATTTAAAATGTCGGTCCTTCGGGTGTGGTTTCCTATCCTTTGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAA:1 - chr2L 1516266 5' - I-element 5037 1 69.31 AAAGTCAAACTCAATTCTGTTTAAATCGAAATTAGTGCAGAGCCGGACAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGAC:1 - chr3L 14233546 5' - jockey 4739 1 53.47 AGTGTTATGTACAACACACTACCTCTAAATTATGGTTTTCTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACA:1 - chr2R 17828126 5' + copia 53 2 61.39 CTCTAGTTTTTTTCAAATTGTGTATTCTTACGGGGCATTGACGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGCCAGTGAACTCTGTCGCTTCTG:1 - chr2L 12197117 5' + baggins 5192 1 74.00 AGTTGAGTTGGATATCGAGAAGAACACGCACTTGGCGAAATACAGCCATCGTCCCGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 + chr3L 26852022 5' + diver 24 2 53.47 CTTGGACTGCTCACTGAGTAAACATGACATATTTTTGTTTACCGAAAACGTTTTCCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTA:1 - chr3L 7073363 5' + 1360 3264 1 62.38 GCAAAAGCTCCAAGAGGTCACACTCCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCA:1 - chr3R 24317912 5' + Tirant 66 2 76.24 TTAGTTGTCTTAAAATATTTATGCCCACATCATACCAATGTATTGCAACATCAAGAAACTACAAATTGTAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATA:1 + chr3R 4579210 5' + Quasimodo 2 2 58.42 GTAAATTAGACACGAAAAATGGGTAAAAAAAAAAACAAAAAAAGGGAAAAAAAAAA:1 + chr2R 23589606 5' + gypsy7 5005 1 91.07 AAATGGCAGGCACTTTGCAGTGGCAGCACATAAGCTCCATCCAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGC:1 - chr3R 17466535 5' + Transpac 5055 2 59.41 GAGAGCCAACAAAAAGATAGTGTCTTTGTGTGATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 + chr3R 22667137 5' - 412 7500 2 69.31 GATACTTTCCCGAAAGCACACACCATGCAGGCACATATGTTGACATACCCTCCCCTCACCGACATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTC:1 + chr2R 17356317 5' - 1360 3320 1 71.29 ACTAAGTGATTTATTTCACAGATTCTTTGTAAAACCAAATTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr3L 25798511 5' + blood 36 2 62.00 GGCTATAGCTCCCTTGCCGCTTACGTTGCTTTGCCTTGTTCACTCGTATGCTCATTCTCCTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTT:1 + chr2R 4675247 5' - Quasimodo 245 2 62.38 CAGCGGATGCGCCTTAATGTATGCAATGATTGATATTACTGCCAAATTAGGGCATGTCGTTGGGATTGTCGGTGAAACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGC:1 - chr3R 28665124 5' - F-element 259 1 63.37 AGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAATTTTTTTTTTGCGAAAGCATAGAAATCAACAAGACTAATAAAAATGTGACAACATATCAACTCATTTTTCAAAAGTG:1 - chr2L 2545705 5' - INE-1 261 1 73.27 TATGCATTTTATTTGAACAGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTACTTTCTCCTCTTCGTCTTTTGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGG:1 + chrX 11821304 5' - 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chrX 13700355 5' + hopper 1188 1 56.44 ATGATTGCCCGTCCTACTGGATTGCGCTACTCTTCCGCTTTCCTCTATTCTGCATCCTGCATCCTGAATCGCCCACCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAA:1 + chrX 726024 5' + accord 7381 2 74.26 AAAACGAGATTGTTTCTACGAGAGTCTGTATTTATTTTTCTGATTCGCATATTGAATATGTTTATTATGACAAAGTGTTACAATGTATTGACGCTAAGTTA:1 - chr3R 12549956 5' - Stalker 51 4 67.33 GCAATGTACGGCAATTTAAATTGTTTATTTTTTTATAAGTACATTTTAAGTTGATCCACAAATGTAACGGTTCTTTTTTTTGGTGGGCACTTGCTGCAAAA:1 + chr2R 25168138 5' + Tc1 170 1 65.35 GAGAGAGCGCCTATCTTGGGATGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAG:1 - chr2L 9194777 5' - F-element 4399 1 78.22 AAAAGNCCCGAAACCTAAGGTGCGGAATTTTGGGAAAATGCGGCAGACTGCAGACAATTTTCGTCCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 2689888 5' - roo 396 1 63.37 GCGAACGGTACGAACAAAATTGTAAGCTAAAACGTGAGTTGCATTTACTTAAGAATTAGGCATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr3R 14913134 5' + blood 15 2 65.35 TTTGTGGGAGGAGGCGGATGCCAAGGCCGAGTTCGAGGTGTTGGCTGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAA:1 - chrX 11700926 5' + opus 275 2 54.08 TAATTGAAATGGAAAAGTAGGTAAATTTAAGAAAGAAAAAAAATAGTGATTAATTATTCAAAATAACACTAAGAAATTTGTTTTTTTTTTCTTTTATAAAT:1 - chrX 8998922 5' - HMS-Beagle2 479 1 76.24 TCGTTGTAGCGACTTGAATGGTGATTAATCTGTTCTCTAACCAAAGACACTCGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCA:1 + chr2R 5636508 5' - 1360 3350 1 77.23 GCGGANCTCTCCGGGTCCTACATTTTCCTGCTCGCCTAGGCGCACGCTCAGTATACTTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGG:1 - chr2R 5764521 5' - 412 7364 2 63.83 GGGAAAAGTAGGCATAATAAATTGCAGGAATTCGAAAAGAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 17607855 5' + roo 35 2 60.40 ACACACGTACGTGTATGCCAGGATACACGGAAAATATTACATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAAC:1 - chr3L 14862959 5' + accord 418 2 61.39 AGAATGGCTGAGAAAATCCAAATCAAACCCCGGGCAGTAATTTTCATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAAC:1 + chr3R 20469761 5' + I-element 4946 1 55.45 AGTGAAGCGGCCCTCCAAGCGGCAGGAAGCGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 + chr3R 14832417 5' + blood 7059 2 70.30 CAACGTGGCCAGCGGTGGTCCCGGTACCAACCAGGGAGCAGGTGAGTCCAGTCCCGTCATCTACATATATATTTATATACAGGATGCGGCAGCATAACTTC:1 + chr3L 5673662 5' + mariner2 1 1 62.38 AAGGATAAAATGGTTTTACTCTTCAGTTGCCAATTAAGTTAAGCAATGCTTATATTACGAAAAAAAAAATTCAAAAATGACTTTATATTAAAATATTTGTC:1 + chr3L 17213940 5' + 1360 390 1 40.59 TTGCGATACGAGGAAAATTGGGTCGCATTTCAAAAATTTTTCGGCTCACCGGCTTACGGTGCCCAGCTTCCCCCCCCCTCCTCACTCCTTATCAACTTTGG:1 + chr3R 17453688 5' + G6 295 1 57.43 ACTATGGGTTCCCGTCTATTTTTTATTACTATACTGGCATTGGATACCATTGGCAAAACATTCAAGGGTTTTTTGAATGTCCTTATATGTTTTTCCTTCCT:1 + chr2R 5651330 5' - HB 409 1 66.34 TTTAACAAATTGGCAAGATTTCTACGACTAGCTATGCACTGCACCCGGAAAGTTTTTGGATAATTTGGTTATCGTAAATAGATTGACTTTCAGCTGATCG:1 + chr2L 19580009 5' + Gypsy12A_LTR 192 1 61.00 GGACCGGCGGTGCAATGGCAGTTAAAGTTTTCGGTGGCAAAGAGCGTATCTGTGTTGTTTTCCTTTTTCCTTTTCGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 10842782 5' - Doc2-element 233 1 51.16 CATTTCATTTCTGTATAAGTATGGGTCTTGTTGGATTCTGGGTAGCCCTTTTGGCTCTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTT:1 + chr4 328257 5' - jockey 390 1 66.34 AATGCTAATGAGCGGCGAACAAAAACGAGTCGAAACGAAAACTGGACGTCAGTCCATTGTTGAGGGACTAGTAATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACT:1 + chr3R 5027550 5' + Chouto 110 1 77.23 AGAAGNCGAGGAGGAGTTGGACTCCACAGTAATAGACATAGTAATTCAACCCGAACAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACT:1 - chrX 4682120 5' + transib2 2730 1 59.41 AACCAAATCTCAGATGAACGGTTCCGAAATACGGAAGGACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGATGCTGCATATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAG:1 - chr3R 4318883 5' - GATE 8442 2 67.33 CTCAAGAATGAGTTGCTCAGCCTGCGCGTGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGAGGG:1 + chrX 5673064 5' - diver2 4738 2 71.29 ATGGGGACACAACAAACAAAATTAGAAAATACTCTTCACGAGATTACTCACAATTGCCACGTCCACACTTTTGAAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAG:1 - chr2R 5028198 5' - INE-1 263 1 58.00 TATATTCCATGCGCCTTTCAATTTTGTTTTTTACTGGGCAAGTTATGTTAGTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 + chr2L 9346161 5' - Transpac 5206 2 48.51 ATGAAAAGTTGGACACAAAAAGGTGCTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr2R 11730917 5' - blood 7340 1 74.00 GTAACAAATACGAAATATTTTGTCTGATTTGAGCACGAATTACTACAGCCAGATAAGGATCAATCAATAAATAATGTTCAAAAAGAAAAAAGAAATAACGG:1 - chr2L 13437170 5' + invader2 499 1 75.25 ACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 - chr2R 2427628 5' + Doc 9 1 70.30 AAATAGTTGGAGAGTGTATGAGGGAGATGGATATGCGCAACATGGGTCAACAAACTTGCGTCTTTAGAATCTGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTA:1 - chr2R 5987890 5' - INE-1 165 1 64.36 AAAACAACTATTCGCAAGAAACAACACTAAAAGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1 + chr3R 13339052 5' + BS 5040 1 65.35 AAAACAATAAATCACATCCCAAGTAGTCGTAATAAAGTACTGCTTTCCATGCCATAAACCCTTTCTTTAATGGTTTGCGCACGACCCGCTCGGGT:1 - chrX 19287479 5' - gypsy8 295 1 77.89 ATACTGACGCAAGTTGTATTGGGTATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGTATGCT:1 - chr3L 25768165 5' - Circe 7384 1 75.25 TGTTCGGTTTGCAGATACACTTTTTGCGAGGGCGTGGCAGTTTTGAGAGTGTGCGTGGAAGCAATTTTAACCTTTCAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCG:1 - chr3L 15448756 5' - INE-1 147 1 69.31 CCATCCTTCCGACTGATTTATGCAATTCGCGCCGTCGATGCATTGTTTATATTCATTTTTTTTTTCTTTTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTT:1 + chrX 14592424 5' - invader2 274 1 79.35 CCCACNTGTCGTATACGCAATGACAAAAATGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 + chr3L 7021073 5' + jockey 4716 1 72.28 ACTCCAAAGGGAGTGAATAATCAAAGTGGTTAATTTAAAAAAAAGAAACAAAA:1 - chr3R 1585275 5' + TART-C 11098 1 73.58 AAATGGCATTACCTTGGTTTACAGCTGCTCGCTGCTGTCACTCAGCAAAATTATTTCTATGCATATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTT:1 + chr2R 12798572 5' - I-element 114 1 72.28 GCTCTTCCAACTCTTTGAACATCTCCAGATACGGTTCGATTTCCGCTCTCTCGCTCTTGAACAAAAATTCGAGAATGCCTGGAGCGACCTCTAGAGCCACG:1 + chr3L 19493006 5' - 1360 64 1 61.39 TGTGTTCGCTTTATATATATATTTGTATGTAATCAGCACTTGAAAATTTTTTAAAATTGTTGGTTTTTTTAAAATTATTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 - 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gypsy7 473 1 56.44 AGCCAGAGCATCTTGTGAATGTCAGCCGTCAGGCTATCGGTCAAGCTGTTGTCGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAA:1 - chrX 2228993 5' - S-element 1256 1 58.42 TACTGAATGAATAGAGGTGCCTTACAGAATGATTCATTGACAAACTGCCACCGCAGAAAACAAAAGATACATCCATTAGGCTTTGGCGATGCATTTCGGCT:1 + chr2L 12831728 5' + diver2 4710 2 40.59 TGAGCAAATTCCAGTAGAGGTGGCCTACGCAGGGGCCTACGTAAATAGGCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGC:1 - chr2R 13891661 5' - roo 238 2 75.51 CTGAGNTTTGGGAAGACAGCGCGTTGCATGCCCCCTTTGGATGTTTTTCCTCGTATCGTGTACATTACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 19510717 5' + roo 8674 2 72.28 CGATTTGTGTGTTAATTTTTCATGAGTCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr3L 2182758 5' + blood 7019 2 69.31 CGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGG:1 - chr2R 4879025 5' + G-element 30 1 52.00 CCGGGAACCCGATCCACTCGAAGCCGATACCTTGGTGCTACTGCCATTAGACTTGACCGACGTTGATGACCGTCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATA:1 - chr3R 24245491 5' - R2-element 353 1 76.24 CCTCTTCGGAATCTTCGATGGGAAGGGCGCTTCACTGGTGCTCCACTAGGGCGGCCTGACTCGGTTCTTTTCTATCATTCTACCCGCCTAAAAAGTTAGAA:1 + chrX 19597120 5' - Gypsy12A_LTR 489 1 64.36 TTCACACCTTTATGCGACACTTTTGACGAACATGTTAATGGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATT:1 - chr2R 21492484 5' - hobo 462 1 60.40 TCCACCATTGTTACGCCAGATTGCTAATGATGGCGATGGAGAGGGGGTGAAGGACAAGGACAGTGCCTTGGCTACGCGATTTCTGTGGCGCTCTAGCCTGT:1 + chr2L 9326508 5' - BS3 1494 1 59.41 TGCAAGCAATCCTGCCAGTGCACAGACTGTTTCCAGCAGCTCACAAACGGGCACAATCCGTCAGCGTACAATCAGATGCCACCTTCACCAACATCAATCCG:1 - chr2R 12585065 5' + Chouto 6183 1 72.28 GTCCATATATGCACATATAGTATATGCCTCTTTTCTGCACATAATTATTTATTTATTAGCTAAAATGTTTTTTGTTTTACCAATTATTTTTAAAATATCCA:1 - chr4 772825 5' + Tc1 1493 1 75.25 CAAAAATGTTTTGGACGCTATGTAATCCTCGCTGCGTAGGTACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAA:1 + chr3R 7785193 5' - Doc2-element 4409 1 72.28 AAGGAAAGCGGGTATTGCTTAAGCGGACTAGAGGGCCAGCGGGCTAGCGGGCAGTAGAGCGGGTGACAGCGGGTGACAGCGGGTGAGCGTAACTTGAACAG:1 - 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hopper 1039 1 74.26 CAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGTCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACG:1 + chrX 15408750 5' + INE-1 535 1 84.16 CCCGAAAAAGACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTG:1 - chr2R 22774525 5' + BS 7 1 67.00 CTGTGTCACGCTTATGATTTAATAAGCAAATGTGCTGCGAAATTGCTGAAATTGTTTGGCTGTCCGTCTGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 + chr3L 22948945 5' + INE-1 134 1 68.00 ACCTTCTTACATTATACATTTAATTGGTATTTATTCACCTCTTTTACGCATGTGCTGCTCTCGAACCAAGCCGTACGATTCGCGGCAGCGCCCCTCGGTCG:1 - chr2L 21589498 5' + Cr1a 4407 1 58.42 TAGAGATTGAGAAATATCGATGTCCGCCATCATCGATATTTCTCAATCTCTATTAACAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr4 1183001 5' + 1360 10 2 47.96 TGGTGACGCCGTTCTGCGATTTGCTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGT:1 - chr3L 3897263 5' - mdg1 239 2 77.23 TAAGTCATTCCTTCTTTAAATACGCATAAGTTAAGCATCCTACTTCGCCCACTTTCTGCTCAAGGCGATTTACCCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACA:1 - chr2R 17866585 5' + I-element 4879 1 71.29 TTCAATCCGATGTACAACCAACAGCAGTGGCCCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACT:1 - 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chr2L 10002638 5' - F-element 4400 1 66.34 ATTTCAATTTATGCAAATCTCTTTGGTACCCGCTAAGAATGCATGCATAACGCATTACATTGCGCATTGTCCCCGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGT:1 - chr3R 31159805 5' - hobo 457 1 79.21 TCTGANTTCGTAAACATATGTACACATTTTTTTACGTACACATGTATGTACACATATTTAATATGCCAAAGGGTCAAAACCGCATACGCAGCTCAAGTTCG:1 - chr2R 3021005 5' + Quasimodo 6958 2 63.37 CAGCAAAGAAAAGTGATTCTAAGAAGCGCAAGGCAAACGGAGAAACAAAGAAGAAAAAATAAGAACAGTTAGTTTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chrY 357969 5' + 1360 2 2 74.26 CCGTTATGATTGCAATGGGATTGAATGCAAATACATATCGAGATGCCATCGAGGTGTTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCA:1 + chr3L 13291333 5' - Doc 4456 1 62.38 CGAGGCCCGTTCACGTGTTTAGCACAAATTCCGCATGAAATTGTATGGATACATATATATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chr2R 22740011 5' + Transpac 10 2 67.33 GGCAAGCAGGATCGTCCCGAAGTCTGTCGTTGGTCCAACATATTGTCGGTGGGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCG:1 + chrX 20582118 5' - F-element 236 1 57.43 GGACTCGTGTTTAAATCTAAGCTAAAAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - 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opus 470 2 60.40 TGTTTTTGCATTTAATAAAGTATTAAGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGC:1 - chr3L 4862100 5' + gypsy2 202 2 74.26 CTTTTCTTCTTTATTTTCTCAATATAACATTTATCTGGGGGTGACTTTCGATCTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr3L 14324863 5' - 1360 3366 1 53.47 GGAATGAGTACCTAATCCATTCAGACATTACATAGACAACTTCCGATTTTATAAAGTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCC:1 - chr4 956494 5' + INE-1 102 1 60.40 TGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATT:1 + chr2R 2666337 5' + Rt1a 31 1 52.48 AGGAGAAGACTCGCTTGGCTTTGTCGATGGCAATTGCAATTGAATCCGAGCAGCGAAAGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTC:1 + chr2R 13690453 5' - F-element 73 1 61.39 GCTCTACTAACTATCGTATTGGCAACTTATTTCTTATCATTTTATTCCCCGATATCCCAGAAATTTCGCGTACGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGTTAT:1 + chr2L 9943671 5' + INE-1 540 1 64.36 GGGGGNCTGACGGAAAACGTAAAGCTGAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chr3L 24242073 5' + G-element 4325 1 60.00 GGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chrX 2090293 5' - roo 9037 1 56.44 GTGGTGAAGGATGAGAAAGTGGCAACCGGAAGGAGAATGCCACTTCCGCTGTTTGCCAAATCGACAGCGACATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3R 25360949 5' + jockey 11 1 74.75 CATAAATCTGACACTCGGACAGGGAAAGAGCATGGCCCAAACCGATCTATAAAATTCATCGACATGGCGGCTGCATGACCCAATATC:1 - chr3R 25560752 5' - diver2 4531 1 72.41 AGAACAACATCAGCATCCTTTATATAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTT:1 + chr3R 13252643 5' - F-element 103 1 79.21 ATTTTGGCAATGGGACACGCTAGAAAGTATGCTAGGAAAAATCCAGCACCTTTATTATCAGATTCACACACTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr2R 13280181 5' + jockey 11 1 76.24 AAAGAACCTGCAGACTTACCCTCTGAATTATACCTTTGCCTTAAATTATTATTATTATTATTAAGTGGGCTTGTATGTGTAATGCGACCCAGTCGGATCTA:2 - chr3L 25350813 5' - baggins 5406 1 52.48 AATTTAAGCTGTCTGTTTGGGCCCATTTAAGGATAATCAGGGCCTAAATCAGCAGCATTTGAGAGCGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAATGGCTGCATA:1 + chr2L 13321686 5' + 1360 3337 1 64.36 GTATTATTCAGCTTAAGATTTTCCCAAATTGAAGAAGAAACTTGAAGCTAGACGTGCGTACAAGTTCTCAGGTCCTTACAAATGAAAACAGGTGGTTTAGC:1 - chr2L 17423259 5' - Chimpo 3911 1 53.47 TGCTTGCAGGCTACGAACGATGGTATAACGAAATCCGAAAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAGGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATAT:1 + chr2L 220512 5' + Dm88 12 2 66.34 AAATGGAAAATGGAAAAATCCGAGGCGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTG:1 + chrX 3004957 5' + invader4 2677 1 78.22 CGCTGCTGGCGTTAATGACATTTCAACATAGTTCCCCCCCTCCCAGAACTAAGGATTAAAACGTTACGACAACATCAAATTAGTTTTAATTTCATCTAAAT:1 + chr3R 10273057 5' - G4 417 1 67.33 TGTTGCTTTAGTTTTTAAGTTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTCTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGATTTTTAATAATA:1 - chr3L 21083580 5' - invader2 445 1 78.00 CAAGTAGGCCAAACAAATATTCCCATTCCCCAGAAATAATGTATCTGCAGGCCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTG:1 + chr3L 5255213 5' + G6 363 1 54.46 TAGCACAAATCAAATCTCTTACAGCTATCATATGGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTCCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAG:1 + chrX 20385036 5' + Bari1 49 1 66.34 CCTATTAATGCGGCTTGAATTCAATCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAG:1 - chrX 21496677 5' - F-element 4502 1 71.43 GTTGCATGTAAAGTTGGTGCCATCCAACAGGAGATGTAATGTTTTGGTGAACACTTTCGGTATTCAGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGC:1 + chr4 952240 5' + gypsy6 176 4 72.28 GTTGGGGGATCTAAGCGATGGTGTAGAGGAGGAGCTTGATGAACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCA:1 - chrX 752685 5' - 17.6 7077 2 58.00 TTTCTGAGCGAAAGTTTAGCATTTGCATATGTACATAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr2L 9346223 5' + Transpac 37 2 65.35 TTCAGTTTTGGCCAGAAACCATGTCAAACTGGCCAGAGTTCCGCCGCATTACCAACACATTTTGGAAACCCACTCCAGTCCGCATACATCAATACTAATGC:1 - chr3L 18464614 5' - invader1 197 2 56.44 GCAGANGAACAGTATCGACATTCCAGTCATGCCGATGAATTTTTGCAGTGAGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCA:1 + chr2L 7457054 5' - jockey 4578 1 58.42 AAGTGAAACCCAAAGTGATGAAGCCTACGCCGAAGGTGCAAAATCAAAATCACTCCTTGTTGCAGCAACAGCAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr3R 14267571 5' - hobo 2926 1 81.19 TCGAAGTCTTGAGTTGGCCATTTTCGCATTTGCGGTAGTTTCAATTACCGCTTCACCTAATTGCCAGCGGGTGTACATTCCAGATTTATTCCTGATTTATA:1 - chr3R 12288310 5' - mdg1 318 2 70.30 CCGCGACACTGCCACGCGGCTCGGAGATCATCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGAGTCAATCGCTGACG:1 + chr3R 17539022 5' + G-element 3985 1 75.28 CCAAAATGGAGTCTGCATGTGAGCATCCAGGCCAACATACGCCTAAAGCAACTCCACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCAAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGAT:1 + chr2L 11177788 5' + G2 2608 1 76.24 TTGCATTATTTTTATATATAAAGCATATATATGTAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAA:1 + chr2L 12026118 5' - Idefix 7065 2 68.00 AGAAATACACATAAAGATAATAATAAAAGAATGCAATAACATATGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGT:1 - chr3R 1048042 5' + Stalker2 32 2 55.45 TGGTCCGAAAAGGATGATCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 63020 5' + roo 36 2 63.37 AAAGGACATCGAGGACCTTGAAAACGGGCGGCAGAGGACTTGTGCGCCATGTGGAAGCTGTGTGTACCGACCGGGCAGAGGAAGCGCGTCATGACCGA:1 + chrX 20018090 5' + Osvaldo 479 1 55.10 TTCCTCTATCTCCGGATCAGCCGTTTCTCGAACTGATATCTCCTCTTCAGGCGTTACATTCAGATCCTCATCATCATCATCTCCTGGTTCTCGTCAAGGGG:1 + chr3L 20598400 5' - BS3 1597 1 66.34 TCTGTTGTGTTATGTGCATTACATTTGGCTACTGTGGGAGTTGATCGGAATTATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGTACCACGGTGCTC:1 + chr3L 14384911 5' - Fw2 3642 1 55.45 AGATCTTATGAAATAAAGTGTGTAATAAAATCTCCTATTAAATTGTTCATACTCTTGGAAAATAGGAAAATGGCAAAGGGCTGGGAAATCAACTTGTAATT:1 + chrX 3567372 5' - Ivk 280 1 79.21 CTCTGGACGCTGGAGAAGTCCACGGATTATGGCAAGACCTGGACGCCTTGGCAGCACTTTTCCGACTTGATCATGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGACAT:1 - chr3L 6215644 5' + INE-1 103 1 64.36 AACTGTTAAATTTGAATTGAATGCCAGTGGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTGAGTTGTTCGCAGTAACTTTAGCCGAATGTAACTGTTGA:1 + chrX 22671091 5' - G-element 199 1 70.71 GATTTTTGACTGCTTGGATTGGCCAGTTTGGCATTTTCACGCATTGCAGTGAGCTTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGTATGATGTATGGTCATGTTG:1 + chrX 9238610 5' + Transib5 2776 1 61.39 TCTCACCTATGCACACCTCCAGATCCATGCGTTTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTG:1 - chr2L 10761635 5' + 1731 4587 1 72.28 CACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCT:1 + chrX 21772503 5' - gypsy3 6537 1 77.23 CGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTG:1 + chr3L 24213783 5' - invader2 212 2 60.40 TATATCAGATCGATATACATAGATGGATATATAGTAATACAAAAGCTAAAGAATGGTTGAAGATGTGGCGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTG:1 + chr3L 21773398 5' - accord2 7336 1 67.33 TTTTTTGGATTGCGCAGGCAGCTGCGCTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAT:1 - chr3R 7175913 5' - F-element 4319 1 73.27 GAAATGAGTATCGTTTTAGCTCTTGCAGTTTAGCAACCAAAGATTCTTTATATAAAAATTATTTACAATATACCCCTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCA:1 + chr3R 13855912 5' - R2-element 3391 1 81.19 GCCCAGGTATACCGATACAGATTTAGCTACAAGCTTCAGTAACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTC:1 - chr2R 22110530 5' + mdg1 7228 2 59.41 AAATTATTTTGGACCACGTGGCACGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCA:1 + chrX 21070286 5' - blood 60 2 76.24 GCAGGGCAGAGACTGCACTCCAACATGGGTGAATAAACTTGGGCTGTGTCTGTATCTTTAGAATCTGTATTCTTAATATCAACCTTCTAGCTTTTATTGTT:1 - chr3L 9337107 5' - INE-1 159 1 76.24 GCGCCACATCGTGGATGAACTTCTCCAGCTTCGTCTGCATGCCCCAGTAGACAGCCGAAGGACCTCATCATGCTCCCTTGACGAGAGCCATAAGATGATGA:1 - chrX 13769383 5' + BS3 1603 1 56.44 CTGCCNGCACGGGCAAACACAGCAGACTCTCTTCGCACACACGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCAT:1 - chr3L 8247027 5' - P-element 153 1 44.55 GTCTAAAGGCAATGAATGGGAAATAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCAT:2 - chr3R 5775767 5' - invader4 320 2 73.27 AGACTATGCATTTTTTCATTGTCGGAAAATTCAACGACGGCGTGTTCAGGATTTGTGGATCCCAACGATTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAA:1 - chr3R 4066497 5' + copia 4877 2 72.28 AATATAAATAATAATAGAAAATCATTGTTGCAGCATTGATGAAATATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATA:1 + chr2R 11939991 5' + 412 264 2 60.40 GTCGTTTCACTTTGTCTCTCGATTGGCTCGGGCGTCCAATGAACCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr2L 20084863 5' + 412 33 2 55.45 AACGAAGGATGTGGTGATGAAACAAGAGATGAGCGAACGAAGCCAACTTATGAAGACTCTAGTGTGTGCCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACA:1 - chrX 5122337 5' + 1360 195 1 72.28 ACAGACATGTATGTACAATATATCCCTTTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTA:1 + chr3R 18860349 5' + R1A1-element 5050 1 72.28 TGAGTAAGTTCGGTAGCTCCGGGGTCATGATGTTGACGATGTCTTCATGGTTAGATGTATTGAAGATGGCTTTTTGGTTTGTAGGAGGGATAGGCATGAGT:1 + chr3L 27383085 5' - I-element 5053 1 75.25 TGTCTAATATGCAGTTATTAAATTTCTATTTTCCACCCAATTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 + chr3R 21010738 5' - hopper 1377 1 62.38 CCTCTGCGTTTCAATCAAGTTCCTTTTTTTTTTATTGTTTGCAATGCCTGCAAAGTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chrX 5726699 5' + roo 8685 2 58.42 CTTGAGGGCTGCACAAAGTAGGTAATGGGTGTAAAAGTGATATGGTTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCA:1 + chr2L 19444420 5' + roo 133 2 55.45 GCATACGATCGCCGACCAAAAGGTGACAATCAGGTAGGTGTGCGCGCATTCATCTCCTGTCCACTAATCACGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTA:1 + chr2R 6200989 5' - invader4 2681 1 69.70 GTCTCATTCCATTCCGATTCGCTCCGTTCCGTTTCATACCTGTATGTATACCTACACATATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTG:1 - 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roo 185 2 67.37 ATCATCCGGGCTTGTGGTCTGGAAAGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTC:1 - chr2L 8283498 5' + R1A1-element 148 1 75.25 AATTTGCTTTAAATTTTTATTTAAACAACAATTTGTCGAGCGCAGATTGAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTG:1 + chr3R 30609995 5' - I-element 41 1 53.00 GGGACCCAGACCCTTGTGCTCCTTGTCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTATCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTG:1 + chrX 12975998 5' - R1A1-element 326 1 68.18 CAATTGCTCCTTGGAACTGCCGGTGAAGGCCACTCAAGATGAGGACAACATGCGTCTCTAGAATCTATATGCTGAACCCTTTAGCTTTTATATTTCCTGAG:1 + chr3R 29670284 5' - INE-1 153 1 55.45 CAAAAACGAACATTCTCTTCGGTCGATGTCTGTCCGTGGCACTCTGGGGAAATGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATG:1 - chr3L 17693888 5' + Porto1 4325 1 58.42 AATCATTCTATCGAGGCTTGTCAATAGCGAAATACAGTGTAGTCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGAT:1 + chrX 22867304 5' - HMS-Beagle 7035 2 70.30 ATTTATGTATGTTTTCATGTTTTGTGTTTGTGTGGTTTATTAATATGCAGATTAGGGCAAGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGTT:1 + chr3R 18960356 5' - gypsy4 194 2 60.40 GTGCGCTCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 19535678 5' - hobo 2921 1 61.39 CAGAAGTGTCTTTCGAAGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGCTGAGCTGTTTCCGCCTACACTGTTGCAACATGA:1 - chr3R 23678272 5' - gypsy5 152 2 81.19 CCTTGGGACTGTTCTTGCGCAGGTTGAATATCACCTTGGGATTGCTGGCCACTGACTCCACTGACCCTTCTCTACTCGCTTCTGTGTCCTTCGGGCTTCTT:1 - chrX 12016606 5' - gypsy8 493 1 59.41 CTTATCTTTTTTTTTTTCTTTGCCAGCAACTGCAATGTCCTTGACGTGAACTTCGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGA:1 - chr3R 16515880 5' + flea 4934 1 53.47 TGTTGGTTGCCAGCCACATAGATGTCGGAGCCGGGTCTCGGATTGGAATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTT:1 + chr2R 22091894 5' - flea 4600 1 55.45 AAAAGCCCGACTTTTGGGGATGTGGTGGTGGCCTTAAAGCCACCGAGTAGCGCCAGCAGGCCAGACGGACATGGCCAGATCGGCTATTGATCCTGATCATA:1 - chr3R 9940024 5' - INE-1 89 1 68.32 GTGTTACCTGCTTTAAAAGAGAGAGCCAACAAAAAGATAGTGTCTTTGTGTGATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 22667117 5' - 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INE-1 133 1 54.46 CAGTTGCCACCGGTGGATCAACAGCCGCCGCAACAGCAGCAACAAGTTTTATCGGAATCGTACCAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 + chrX 12605020 5' + Doc 292 1 71.29 CTAGAAGCAGCAAACCAATGACAAGTCGCCAGAGCATTTTGTAATCTAGAAACTTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGA:1 + chr2L 16833864 5' - Bari1 240 1 59.00 CGCATTTATTTATATTTACACACCGTTTAGCTACCATAAAAGGTATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 + chr2L 20465589 5' - blood 7358 2 61.39 TTTTCCTATTATTGTGTACCATCGGTGCTTTCCCTAAGGCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGC:1 - chr2L 11981440 5' - HMS-Beagle2 7079 2 56.52 AGCAGTCGGCCGGAGTCAGTTGCCAGCCAGCCGGAGTCGGTGCCCTCCCCTTCCCAGTCAGCAGCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAA:1 + chrX 1445715 5' + Doc 4582 1 68.32 GGGAAAGGGACGGCGTTCGTCGCATGGGTACGCAGGAAGCCGCTCAAAGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTT:1 - chr2L 17327545 5' - Quasimodo 84 2 56.99 AAAAAATATATTTAATATTGAGAACTCTCTGCAGTCGCTCAGCTGACTGATGGCGTGCATTATCGAATCGTTACTGTACTTCTCCACGAAAAACGAACGCA:1 + chr2L 5389708 5' + Bari2 902 1 65.35 GATTAACACTTGGCGACAAGCGTTGTCGATTCGAGGACCTTTCCCAAGTGAGCCACTCCAAAATCCTTCTTACATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGA:1 - 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G6 239 1 75.25 ACAATCAGTGAGCAGGCGGTGTTGGGACTTACGAAAGCCATCTGAGTGGGAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAAT:1 + chr3R 22118610 5' + F-element 137 1 53.00 GGCTGGGGTGGGTGATAGTGCGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCGGGATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTG:1 - chr2L 15919074 5' + R2-element 3522 1 77.55 ATTGAGAGGGTTTCATAAATATGCATTACAAATATTGTATATCTTAATTTTCATACATATGTTAAATTTTCTAATTACCTTTATTTTTTTTTAAATATTTT:1 - chr2R 16248569 5' - TART-B 10507 2 86.14 CCATTTTTAAACGTTGTAGATCACTGTCAAAATTGGATACGTACTACTCCGATTGTTTTATATTGTTGTATTACAATGTTGGAGTTCTTAGAAATAAAGTA:1 - chr3R 7517680 5' - ZAM 241 2 70.30 TTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chr2R 18891048 5' - opus 466 2 64.36 TGACCCATTTTAAGTCGTCACCTGTCTCAGGCAACACAAATTCAAGCAAAAATAATAATAAACTATTTATGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3R 26294568 5' + roo 8671 2 72.28 CGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 - chr2L 22690013 5' + Tabor 44 2 65.35 AGTACTTTTCTTAAATAGGCTTAGTTACTTTTAAACCTGCCCACTTTTAGCCAAGCCATATTATAAATTATTTATTTATCGATTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 11393407 5' - 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chr3L 9607769 5' - hopper2 274 1 72.28 GGCACAAATTACAGGCAAGTGTGACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGG:1 + chr2R 8339211 5' - accord 292 2 71.60 AACAATACAAGTTTTATATTGACGGTGTTTAGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr3R 8185240 5' + Doc 57 1 69.31 TGTTTGTCAGTGATGGGAATTGTGTTCAGTTACCGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGGTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTTTACTTGTT:1 - chr2L 15161848 5' - Porto1 180 1 66.34 CGTGACACATTTTATTTATAACGATACAAATTTGTTGCTCCTCTCTGTGTGTTATGGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTT:1 + chrX 10289929 5' - F-element 353 1 63.37 CAAACCAGTTCAGAGGTGCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCAATGCAATGTGCTTAACGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTT:1 + chrX 5055243 5' - blood 7081 2 59.41 TCCCACTGTAACGCGCATAAGTTGCAAATACAGTCGCAAGCCCAAAGCTGCCACTGCCTAAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCTACTATAGCA:1 + chr3R 4354911 5' + INE-1 568 1 61.39 AACTTNGCAACTGGAACATAAATTTAACCTAGAATCTTCATCCCTAATCATCATAATTTTCTAATGTCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTC:1 - chr3L 25420652 5' - 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Quasimodo 7222 2 58.42 TTTATTGTTATCACCATAAATCACAAACATTTTATTATATTATTAGTAATTGTATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATA:1 + chr2L 12241972 5' - invader3 5441 2 52.48 AATATTCCAATAATAATTAACAAGAAAGTAAGTAAGATTGTATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATA:1 - chr3L 11887848 5' + Burdock 9 2 58.42 ATGCCGCATGACAAAGAAGCTTTTTCCTGTCTGCCTGTCATTCTGTCGTTAATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGCCAAATGCATTAAG:1 - chr2L 9441150 5' + gypsy3 227 2 62.38 CAAATTTTACGATATCAATAAAAACGTCGACAATATAAACTTTACTTCTGGCTCGTGGGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr3R 22238662 5' + hobo 20 1 61.00 ACGGGAGATGCGGCGCAGGCAGTTTCTGAAAAACAGAACAATCGAAAGATGAGCTTGGGCCAGAGCACAATAAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACG:1 + chr2R 24961723 5' - accord2 7562 2 72.28 TTGCGTAAGATCGAAAACCTGGCGCGGATTGAGCAGATGCTGGAATTTTCCCAGCAGCTTGTGGCCCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCT:1 - chrX 9019745 5' + micropia 470 1 68.32 AAGTCTGAAGCCCGAGACGAAAAAGTTGGAAAGAACTCGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGCTGAGCTGTTTCCGCCTACACTGTTGC:1 - chr2R 5868103 5' - 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chr2R 13359346 5' - gtwin 7051 2 73.27 ATTCAATCCACTCCATTCCAGCCACCCACGCAATCCGGTGCACAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCCAGTCAACGAGTCCACTTGCG:1 - chr2R 15520748 5' - micropia 358 2 57.43 AATTATGTACTTTTAATCGGCTACCTTCGGCCTACAGTATTAAATATTATATGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCG:1 + chr3L 9067035 5' - jockey 4730 1 48.51 TGGGCTCATTCGTGTATGTCCTGGCATCCAAAACCAAACATAACCAGCAGAGGGAGCGGAGAGTATACCCTTCGCTTCCATAATCCTGACCATCCGGGCTG:1 + chr3R 22459701 5' - BS3 489 1 64.36 CATTTTCGTGTTTAAGGCAGCGATTTCTTTACATGAGTATTTGTTGATTTTTGGCAGGGGCCTGTTGCAGGCGCTGGGTGCGCGCCACTTGCAACATATAT:1 + chr2L 12040579 5' - HeT-A 5633 1 67.33 TCGTNAGACTAAATTGAAAATTACACAATAGAGGCGCAAACTGGATTTTATTCGACTTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTATGCGTAACGAT:1 - chr2L 3963270 5' - invader1 3927 2 60.00 GGCACGATACGCTCTCACTGCTCTTACCATCTCACTCTACCTCGAGCGGTCCATCCGGTCTCTCACAGCTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTAT:1 - chr3L 23184775 5' - hopper 1098 1 71.29 CCAACGGAAGCAATTAGTTTCATTTGGAGCTGCAGCAACTCGAAAGGGGAGAAAACACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATA:1 + chr3L 2541823 5' + roo 410 1 63.37 ATGTCTGAGCAGGTTCGTTGTCGTGCTCAGCTGTTTCGCTCCGTCCACTTCCGCACCATGGGCAATCATCCGCCTCCTCATGTCCAAAGCGCTTC:1 + chrX 13439341 5' - 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chr3R 28629257 5' + roo 8677 2 48.51 TGTGGGGTGTGGGAACTCTGTAGTGGCTGCGGTTTGCTGGGATAAATAATGGGTGCGGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGT:1 + chr3L 15679158 5' - F-element 429 1 54.46 GGTCAGTACGGCACGAGGTCCTGGAGTTCGAAGATCGGGTTATTAAGCGTCTACGGTGAGCAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCG:1 - chr3R 26403700 5' - 412 209 2 68.00 TTGGCAACCACCCTCCACTCTACGAATTTCCCATTCTGAAACTAAGATCTGGGAAAACAACAAAGCAATTGATTTTGGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGG:1 + chr2L 21781826 5' - P-element 2751 1 77.23 CCCCCTGTGCGTGTGTGTGCGTTTCGCTCGCTCTGAGTGTGAGTGTGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCAGATAAACAC:1 + chrX 14505430 5' - hobo 2911 1 52.53 CAATGTGAATCACGACGAAATTGCATTTGATTTTGGGAGGCTCGCATTTGCATTCGCACTAGCTGAGTAATAGGGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCGT:1 + chrX 5516432 5' + INE-1 569 1 57.43 TATTGTATATATTGTATATATAATATTGGCAGTCTGAATTTTATTAAGTTTCAATTAACATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATAT:1 - chr3R 13763124 5' - Bari1 1691 1 44.55 TTCAAACTCAATTGACTCCCCGCCAGCAATCAACCACAAACCCACTTCAATTGCAGCTCGTGCCAACTAACTCACCACGCCCAAGCCCCAAACTCACCCCA:1 + chr3R 26031902 5' + HeT-A 5930 1 70.30 CAGGAAGGAATCGGACTCAGAGCGTTGGACTTGCCCGGGATAATACGATCATGACCTCTGGTCAGCATTTTGAGCACTTGTGTTTACCCAGAAACA:1 + chr3L 22837279 5' - HMS-Beagle2 47 2 62.50 AGATGAAGCGCAGCGTTCCGAAGGCCACACTTTGAGGCCAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCT:1 + chr3R 8489246 5' + transib2 2482 1 61.39 CATCATCCCGCACAGCATCCAACCGAAAACCCGGTAAAAGTCGTTCGCATGCTGGAACCTCCAGCTGGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGC:1 + chr3L 16431352 5' + G2 450 1 71.28 TTTTCATTTTGTAATAAGCTCGTATAGTTTTTATTACAACATGTTCGAAATCATGCAAATAACAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chr3R 26048626 5' + flea 45 2 68.32 TAAAAACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:1 - chr3R 5775744 5' - invader4 3056 2 56.44 GGACAAACAAACGCTATAAGGATGGATATACGGACGGACATACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAA:1 - chrX 20541588 5' + opus 360 2 63.04 TTACAATTAGGCGTTTATAAGTATTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGCCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAAT:1 - chr2L 21728696 5' - INE-1 86 1 77.55 CCAGCAAATCAAGCTCACATTATGCTGAGGAATGCGCCCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTC:1 + chr2L 430506 5' - roo 115 2 62.00 TGGAGTTGCTATTATTTGTTTAATTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCG:1 + chr2R 4577074 5' - Chouto 493 1 53.54 TGACTAGTATGTTTGAAGTTATTTTCTGTTCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATATGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGC:1 - chr3L 5441810 5' - rooA 312 2 79.21 TGTAGGCAAGGAATATTAACCGTGTATGTACATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chrX 22867341 5' - HMS-Beagle 202 2 71.29 GATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCT:1 + chr2L 18112506 5' - transib2 2794 1 55.45 TTTGCCCACTATTCTTTCATTCTTTGGGCTCGTTTTTTCCTTTTCTTTTTTTCCCAGATTGCTCGGATTTATGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGG:1 + chr3R 21815017 5' - jockey2 3189 1 70.30 TTGTTTGATTTGTGCGATTGCCGATTGAGTAATTAGTTGCTTGTTTATGTGTTTACATCCATTTGCTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACT:1 + chrX 13659903 5' - R2-element 497 1 67.33 CCCGCTAAGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 10635235 5' - roo 9051 2 56.44 TTCAGAACTCGAGCTTTAACAGTGAGTACCCCCAAACGACCCCACCACCGAAAAATGTCCTTAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAAC:2 - chr2L 931631 5' + mdg1 473 1 67.33 GAAACCGAGTTAGGCAGTCCTTCAGTTAGTAATGACCCAAATGAAACTATTCACATACAAAACCACATAATGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCC:1 - chr2L 20876782 5' + 17.6 40 2 53.47 GTCTCGCTTGGGTTGAAGTCAGACAGCCAGACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr3L 16150760 5' + P-element 42 1 36.36 CCAGGNTACGGGCGCTGCTCCTTGCACGGCTGCAAGCTAGACATTAAAGTTTTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTC:1 - chr3L 9245316 5' - Stalker2 7624 2 51.49 TAAAATATTTGTAGCTTACCCAAGTTTCTTGGCATGGCTTATAATATAGTTTGCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2R 23343740 5' - roo 399 1 62.92 AAGCAAGAAATACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2L 11240902 5' - roo 9024 2 73.27 TAAATGCAGTGCAATAAATATTCAACAGGAATTGAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr3L 2804885 5' + hobo 40 1 63.64 AACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACATTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr3L 11696436 5' + blood 7059 2 70.30 GCCTAAACAATAATTTAAATTACAAGCAAATTTCACTTACACACACCCACGTCTGTGTATCTACTGGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATG:1 - chrX 12841053 5' - accord 180 2 76.24 CTGTCCTATCATTCGATATATCTAATCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAG:1 + chr2R 10527670 5' - GATE 8290 3 75.00 ACACTTCGCAGTTGCATCATTAATTTTCAGTTTTCGTTTCGCCTTTTCCATCCGCCCTCGCGTGGAGAGGGTAATTGCACTTCCAGTAG:1 - chr3R 18115105 5' - baggins 75 1 58.43 TGCTACACCCTTATATAATCACCCTGGACCCACAAATGTGTTCAATGAATTAATTGTAGAATTTTCCTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTC:1 + chr3R 18711988 5' - baggins 5366 1 63.37 CGTGAAGCCCGCTAAGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 10635228 5' - roo 402 1 65.96 GTCTTGAGAATCATTATTTATGATCTAACAGCATTGGAGGTTATTTTAACTATTCTTCTTATCTAAGTTGTTTTTTACAAAGATTATATGATTAAGAGTAT:1 + chr3R 15427953 5' - jockey2 3277 1 58.42 GGTGGAGTTCGCCTTTGACATTAAGCACCTCTTTCCGCAATCGATCATCCTGACATTTAAGATCACCTGACCTTGTCGAAATTTTCAACTTATAACTATTA:1 - chrX 20001943 5' - invader2 4796 1 56.44 GTGTGGGTGCTCTCCTGTTTGTTTGCTTCCTTGTGTGTGTGCGTGAGCCTTTTATTGTTAGTGTCGCTGTCGCAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTT:1 + chr2R 14552227 5' + Tirant 394 2 74.26 CTGCCAATTTGTTCTTATTTATTTTTATGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATATAACATTCGCGTGTACTTATGTACGC:1 - chr3R 17276439 5' + Q-element 560 2 71.29 ACTTAGACATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGA:1 - chr3L 26007757 5' - G5 4760 1 52.48 GAGCGTCGTCAGCGAACGACTGGTGTACTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGACCGTGTCAGTGAGCA:1 + chr2R 9826973 5' + R1A1-element 313 1 74.26 CTGCGNTGTGGAGTGCAAATTTGAAATGTGTTCGCCGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAGTGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATA:1 + chr2L 12572864 5' - jockey 4854 1 70.30 CAGCTGTTCCTGCAGCTGCAGCTCCAGCGCCTCCCATTCCGGTACAAAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCG:1 + chrX 17190538 5' - HMS-Beagle 6936 2 52.53 ACATCCAGAAGATTGGCAACAACTACAAGGCGTTTATGTAAGTGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAG:1 + chr3R 10215153 5' + roo 106 2 65.35 CCGGCACCTTCTGTAACACTTGACAAAAAGGAACCAGGGGGCACATGACGATTTCCCACGGAGCAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATCGATAA:1 + chrX 7918302 5' + 1731 435 1 52.48 TGCTTGTATATTATGAGTATGAGAATAAGGTCTCGGCGGTTGTTGGTGTTGTCTTTCGTCTTCAACTTTTCGTATTCGGTCAATCACCCATAACCCGACAA:1 + chrX 16840401 5' + Doc2-element 402 1 79.21 GGGCCACGTGGAGTTTGAACCCCACCAGTCCCAAAATGCCACGCCCCGACACGTAGATAACCGAACCGAAAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAATATT:1 - chr2L 11857123 5' - transib1 1897 1 58.16 ATCCTCCGCAGACATGCTTGCCGACCAACAAGTACAACAGCAACAATGACAACATCAACAGCAACTCCAACATTGAAATATTCCAGAGATACCAGTCTATG:1 - chr3L 9069407 5' + G3 4249 1 64.36 TGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCCAGT:1 + chr3R 10736061 5' - invader4 277 2 78.22 CGCTGATCCCGAAGACAGAAAAGCTTGATCTAGCAGCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTGCTCAAATTGCTACCTGGGTGGTCGCTAT:1 + chr3R 30851035 5' + R1A1-element 5176 1 64.36 AGATGGCATATGAACTCGAGCTGGAGGCATTATCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACATTCATGTT:1 - chr3L 8429536 5' - flea 4817 1 66.34 GCGAGTTGTCAAAGTGACATTTTTCAGGCACGCACACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3R 16403163 5' + Tirant 40 2 62.38 GCTATGAAAACTACTCCGCAAAAATATCAAATTCGAATGGGAACAGCAGCACATGGAAGGTGAAAGAAGACCGCTAGGACAGAGGAGCACGGAGAAGGATA:1 + chr2R 4877825 5' + gypsy8 4473 1 55.45 ACTCGTCGACAAAGGGCGAAAAAGAGTGGAACTGCGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - chr3L 18627633 5' + FB 43 1 64.36 TCCTTTGAATGCCAATTAGTTCACTTTGCGAACAATTACTGCTCGCTGGATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAG:1 - chr3L 2751315 5' - Doc 4293 1 61.39 CAAGTCTGATAGGCAAATCAACATGCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTA:1 - chr3R 24952080 5' + McClintock 163 2 78.00 TTTCGCAAATCAGATTTGAAAACTGTGACTGCCTGATAATCCGCTCCAGCATCCGCACTTGATTTCAACCACGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAA:1 + chr2L 15148705 5' + HeT-A 5935 1 72.00 CAGGTGTGATGTCGTCTTCAGTAAACTTATCGTCTCCAATGATAATTTCTCTGCTCGGACAGGATACCCTTCGCTTCCATAATCCTGACCATCCGAGCAG:1 + chr3L 27715819 5' - BS3 489 1 52.00 GCCCACGAAAATGGGTGGAAAGCGAGAGGGCTGCGTGAAAATTCCGCCGAAATGTTATGGTAAACAGGATGGCTGTGTACACTCGCTCAATAAAAACCAAA:1 + chr3R 8700635 5' + mdg1 7384 2 79.21 TGTGAAGAAAGAAAGAAAGAGAAACATTTGTAAGTTTATCTAAAGCGACCTTGCACACATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr3L 16266109 5' - Burdock 6376 2 60.40 ACACACGGAGTAAGAATCACCCCGAAGTCCAGCAAATCACAATCATGCACTGGAAAAACACCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAA:1 + chr2L 15847309 5' + Doc3-element 349 1 55.00 ACTTGTGGCTTTAATTGTTATGTGTAGGTTGTAGGAATCCCAACCAGAAACAGGGACGATGTTTGTTAGCATAGCAGGTGTTAAGTTGTCAATTTCTTCTT:1 + chr3R 7761980 5' - mariner2 675 1 61.39 AGGCATCGTCGAAGCTGTCGACGGGAAATATGCTTCGCACCTGTCCAAAGGGCACCCACTTAGAGTGTAAGTCGTACGTATTGGGTTGACACGACTAAA:1 + chr3L 12680536 5' - Q-element 689 2 59.60 CTTCTGTACGTGGCAATGGACTTTGTGATAATTGTGTAATCCTCTGATCTATAAAATCAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTA:1 + chr4 272113 5' - invader2 4761 1 63.37 TCCGCATATCGGTTCTCGAGTTCTTTTGGCTGATATTTTTTTTTCGCTTCCACGGGCAAGCACGAGCCTTTCGCTTTATTTTTTGAA:1 - chr2R 14559521 5' - X-element 410 1 50.57 CTAATGGTCACACCAATTGGTCTTAAGAGCTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTT:1 + chrX 5922271 5' - F-element 4588 1 70.30 ACACACACACACACCCACACACACTTCAAATGGCCTGCGCTGTAGGTTCGACTGCATGTGTATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACAT:1 - chrX 12258321 5' + 17.6 7 2 73.27 TTCTATGTACGCGCCTCTGGGTTCTGGTGATTTGTGTGTATTTACAGGGGGATTCGAAACGGCGGACCAACGCGGTCGGTCTTTTGTATAAGTGAATTATG:1 + chr2L 8246462 5' - Tom1 23 1 59.41 AAACGATTACAAATTAGGCGACATATATACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 28623911 5' + roo 8711 2 76.24 TGAACATGACAGTGCCCAAGGGTTCCATGTGAGTACCCATCCGAATGGATTAAGATATACGTACGGTCAAGTTTTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGT:1 + chr3R 26331616 5' + G-element 6 1 74.26 CTGACNCTTTAAGGCACGCCAGATCCTTCTCCTTCTCCTCTCCAGGATCACTCTTCACTTGTGGTGATCGTCCTTCGGTGTCCTTCGGGCCTCTTGCCGCC:1 + chr4 145871 5' - gypsy8 487 1 70.30 ACATAGGAATCAAAAGGGGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTA:1 + chr2L 11894336 5' - Stalker4 395 1 45.54 AATCTCTTAATTGTATTTTATTTAGATTTTAATTTGCCTATTTCATAAGCAGATTTGACTGCTCTCTTTGAATTTTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGC:1 + chr2L 1404416 5' + 297 6769 2 57.43 TATTTGACCCCCCAATTAAAAAATAAGCCGTCTTGGTATGCAAACAATAATGGCAAAAAATAGGCAAACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATT:1 + chrX 381112 5' - FB 26 1 57.43 ATGCGAAATGCTTTCGTATCAGGCGCAAGGATAAAGGATACAAGATGCCTTGGCTAGGCGATTTCTGTGGCGCTCTAGCCTGTCGTGGTACCGGCTGG:1 + chr2L 13062044 5' - BS3 1479 1 54.08 TTGTATGATTTAAGTGCCCATTTTTCTGTGTGTACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chr3R 27619300 5' + hobo 2 1 75.25 TAACACAGCGACGTTTGGTAATGGATAAAATTCACACCACACGCCACATTACAAAAGCAGGAATGGTTTTGCTCTTCGTTATATACATACATAGTACATAT:1 - chr3L 15673032 5' - Dm88 4373 2 68.32 TATTTTTGCCCTTTGGTCGTCTCTTTAAGGGTTCGGTGTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGG:1 - chr3L 19622541 5' - Tirant 17 2 59.15 TGGGCGGGGGTTAACTAAACAGTTGTAAAATAATATTTTATTATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTA:1 - chrX 14625545 5' - invader4 3052 2 68.32 TTAGTTCCCGGGACATCATCACCCCCTCTCGAAAAGCCCAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTGGGCTC:1 + chrX 9299725 5' + G5 4461 1 63.37 GTGTGGGGCTTACTGCATCTTTTGATTTTGCGCCAATTAATCTAATGATTGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAA:1 + chr3R 13167927 5' - Gypsy6A_LTR 355 1 71.29 ACACACAGATACACACACAAATGCGTCTGACTTTGTAAGCTGCTGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTC:1 - chr3R 26784639 5' + accord 213 2 56.44 CTTTTGGTCAATATGCAGTCTGTTGCAGAAACCGCTTGTACACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAAC:1 - chr2L 10815224 5' + roo 9036 1 56.52 CAGGACCTCATTCGGCATCCCAGCACCTGGTTGAGCCGGGCATGGGATGCGCCTGCGATCAGGTGAGCAGGTGGCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTA:1 + chr3R 17069161 5' + INE-1 118 1 76.24 AGTTAAAGCGACAATTTCTCCCGTACCTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGA:1 + chr2L 11661118 5' - F-element 465 1 73.86 GGATATTCTCCGGCATACCCCCCTTCGTACGAACCTAATCCAGCCGGTTGTCCCGCGGCATCTTTGCCCAGATGACACAGCTGGTGGCCACCATTCTCAAC:1 + chr3R 5371241 5' + G6 1575 1 71.29 TTTAAGTGCCCATTTTTCTGTGTGCACCCAGGGTCATCGCTCAAGACATGTGTGGAGGCATTGTGGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3R 27619292 5' + hobo 10 1 65.35 ACGGATTTTCTCAGTGTGGCATGTATGGCAGTTGCTCCTTGAACCTGCCGCCAGCTACAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 - chr3R 18796377 5' + 1360 18 1 52.48 CAGTACCCATGACTCGGCAACGATACACAAAAAGTCGCGGCTATTTGTCTGCTGACTTGTCTGCCTGCTCCTTAACTTATTTCCCTTTATTTATTTATTTT:1 + chr2L 8931167 5' - Doc3-element 84 1 74.26 GAACATTTGAATGGGGCTCCAAATGGTTAAGAGAACAGCGCAGCCGCTGCTGGCAGCGAGAGCGAGGGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATA:1 - chr3R 31713689 5' + Rt1a 4968 1 73.27 ATGGGCAGCAGATGGTTTGCCTCACGAAATTTTGGGGCAGGCGTAAAAAAGAGATTCAGCACGCCCGTCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCTCAGGAACTA:1 + chr3R 15465695 5' + INE-1 142 1 71.29 CGAAAGCGTGACCAATTGTGCGCTGATAACAAAATAATATAGCATCTAATTAAGTGCAATCGATTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTA:1 + chr3R 27377030 5' - Ivk 5126 1 67.33 GCTTCCAAGTTGTTCTTAAGTTTTCATGATAATAATGCAACCCTCGAGTAAAAAAGTGCCATTAGGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAA:1 - chr3L 10673142 5' + Tirant 494 1 69.31 CGTCGGCGACGCAATCGTTGTCGCTTGCGTGCACACAGTCTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACAC:1 - chr2L 14062014 5' - gypsy 394 2 60.40 GCAACTTGTCATAAGCGGCACCGCCGGCTTACAATTAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCT:1 + chr3R 22652267 5' - Tirant 157 2 65.00 CATTTGTTAAGCTTTTCATTGGCCCTGTCTATTTTTGGAGATTTTTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 27448558 5' + roo 8695 2 59.41 ATATGTAAGGTCTATGAAAAATGTAGTAGTAGTAGCCTCAAATATGTAAACATCCCTAATTTTTTGTACATTATTCCATTTTTTAAATAAAATATTTTTAA:1 + chr2L 18603553 5' + hopper 165 1 71.29 CAACAAAAGTTGCCTCTTCTTTCGAACACACCTACCCCCCCCTCAAGACGGAGGCCGACCTTAACTCCGCAATCGCCACGTTCAGTTGTCTTGCGG:1 - chr3R 29321621 5' - gypsy2 6418 1 66.67 CTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACC:1 - chr2R 4879031 5' + G-element 25 1 57.43 TCACTTACAGGGACATCAACAAAATGTGTAATAAATGATATACACATTTTATGTGCACTGAATTGTGAAAAGTTAAAAGATTTATTTATTTATTCTATGGT:1 + chr2L 16948340 5' - Doc3-element 79 1 57.43 CAAGAAAATGGGTTCGAACAAGCAAACGATCGGAGGTAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 1320429 5' + Transpac 37 2 61.39 AGATCAAGTAAGCGAACTAAAGGATGAAAAATTCCCAAAAATAAATGGAGCGCGGATTTATGCGCCCGAGTGCCTCGTGCATATGTGTGTGTGTGTGAG:1 - chr3L 4581507 5' - accord 186 2 54.55 AGCGGTATCAGGCTGTAATTTGTGCCTCAAGAGTAGGATCGCTTTAAAATGTCGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 9193580 5' - roo 9046 1 55.45 CAGTTTGTTTTTATGGTTTGTCGCCCAAAGACAATGGCCATGCCCACCACCCACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATT:1 - chr3R 25674795 5' + I-element 4893 1 58.42 TATGTGATAGATTCTGGGGTGCTAGCGATATCTTGGCCACCAGCCACTTGTCCGCCTCACTGGAAACCAACTGGACTGAACCAAAGACACTTGAATAACAA:1 + chr3L 3254953 5' + Tc3 241 1 56.44 CGCGGAAAGCTCCGAAAAAAGGCCATATATGTAGTATTAATAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAG:1 - chr2L 14821479 5' - Stalker4 6942 2 59.41 CAAAAGGCAAACAGGCAGCCAAGGCGGCACACGGGGCTACGACAGTTTTCCAGGGCATACAGTTGATCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 6891125 5' + 1360 7 2 62.50 ATCGACATCTTTCGAGTACCGACTCAGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACAC:1 - chr2L 12730073 5' - opus 169 4 72.63 AAGGCAACGGCGGAAGTAAGGAAATGTCGCAAGACAATTTGAGAACCGTCTCCTTGAAGGAGAGAGGCCTACTTCGATGGGAACACCAAAAA:1 + chr3L 17907145 5' + baggins 497 1 68.48 ACAAAGCAATTGCCTAATTTTATTGGCTGTCTTAACGACTTCATAAACTCAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAACATAAAAAAAATTAAAATAAAAA:1 + chr2R 16208769 5' + Doc 4692 1 54.26 TCTGACCCCCTGGAACCTCCCATGCCGCCACAAAAGTTAAATCGGGGATTTGAAATGGGCTGGGGGTCAGAGGCTACCGTTTCCAAATAAAATTAGTTTCT:1 + chr3R 18319356 5' + roo 9027 1 43.56 TATATATTTATAATTTTATATCCCAATAGGGTGCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTA:1 + chrX 15706505 5' - 412 7292 2 67.00 GGGTTTGAATTTCGCAGAACTAACGCAGACATTGAGTAAGTTTGATTAGTGAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGT:1 - chr3L 21495612 5' + P-element 486 1 42.00 TTTACTCAAGAACATCCGCCTTTTCTCTCTCTCTCTCTGCCATTTTTCAGTTCTCGGCGAGTGGACAGAGGGCAACTTGGGCCATCACCAAAAAAGTGGCT:1 + chr2R 15138052 5' + 1360 3332 1 61.39 TAAAATAAATGTAATTCTCACTTATACATACATATATACGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 8299681 5' + roo 37 2 64.36 CGTGCTAGCAATGACAGTTACAAAAACGCTCATAAAGAGCCATTAAATTTCCCATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTT:1 - chr3R 14187385 5' + Bari1 405 1 66.34 AGTTATGACATGAAAGTCGGTTAGTCACGTCTGCAGCCCGCTGCATGTTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCA:1 + chr3R 14492237 5' - Ivk 491 1 53.47 TCGGTTTTAAGCAAGCTTGTAATTCCATTTACACCGCCGGGAGACCCACAAAAAACCAACAATGTCAGGCCAACCAGTGGTATTTGACAGTACGTTAGTCA:1 + chr2R 15183294 5' + gypsy2 369 1 72.28 CGGGCAGATCCGTTTCCGATGGCTGCTGCTGCATGAACGAGGCGTTGACGTAGTTTAGCACACTATCTGACTACCTGACAGCAATTAGTCTCTCAAACACC:1 + chrX 5779458 5' - BS3 469 2 63.37 CCGCTAAGGGTACAGAGTCCATTTGATAATTGCAAGGAGGTGTATCTGGTTTTTGGACCATGCGCATCTTTCAAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCC:1 - chr3R 21346213 5' - flea 135 2 77.23 CGAAACAAAAATCGATAGATGCTAAAGTACGAAACAAATATTTTCGAAATTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAA:1 + chr3R 18016096 5' - aurora-element 4183 1 52.48 TAAATAACTCGGCATTAGCACACACGTCACACGGCTGGCTTTGCGCACGAAAATCGAAAAACGCCGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATT:1 - chr3R 5074081 5' + R1A1-element 5156 1 73.27 GCGGGCGTGTCGACCGTCACATAGTTATGCAGAGCAGGCATAATGTCGATAAAGTAGTCAATACCGCCCTTCATGACTAAAAGATCCCCCTGAAGTCCAAT:1 - chr3L 8119755 5' - baggins 5362 1 69.31 CAAAAAGGTGGCCAAATTGTTCTTGCTTTCCAATTGATGGGTTTTCAAGGGCAGGGGCATGCCCGGTTCATCCAATTAAAAACATAACTCTATTAACTGGC:1 - chr2L 1252076 5' + gypsy7 233 1 76.24 AATAAGAAATACATTTTCCATTTCGGCGAAAAAAAAAAGGCAGATGGGCAGAAGGAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAC:1 - chr3L 4182006 5' + 1360 3201 1 56.44 CGTTTAGTTTGTGTTATCCTTTATATTTTCATATTTATTCAATTCAATTCACCTGGCCCGAGTAGCGCAAGGCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTG:1 - chr3L 23455753 5' - gypsy4 6487 1 82.18 TCATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 2539307 5' - roo 357 2 75.25 ACAGAACGCTGCTCCGATTCGCAATGAGTGGCTTTAAACTCCACTCAATTGTGATCCTCTTATCTGCTCATTCTTTATTATAACGGTTCTTTGATGTGTCT:1 - chr2R 10149493 5' + looper1 98 1 42.57 GAATGCGATGGGTATAGAGCGGAAGCGAATAAGAGCGAGATAGCGCGATGGCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCT:1 - chrX 18495682 5' - flea 4745 1 54.46 AATGTTCTTTATTTTTAATCAAAGCTCCTGCCACTCCAACGGGAATATTTAATAATGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGCCTCTTCCG:1 - chr3L 14121787 5' - diver2 233 2 62.38 CATCCTTTCACGGACGACTGAGCTGGGAAACCTAAAAATCGAACTGGACGAGAGCGTGGCCAAAAACAACGTGCCCAGACACATATGGGCTTACAAACCCT:1 - chr2R 7942634 5' - aurora-element 4111 1 63.37 TTGCANATCCCCAAATTAGCATTAGCTAATCAAGGTAACAAATGGCAAGAAGAAGGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGA:1 - chr2R 16537956 5' + Rt1b 4828 1 60.00 ATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAAA:1 + chr2R 4673585 5' - Quasimodo 7330 2 71.29 GTACCGCAACAGCAATTATTGCGTTGGTCTTGATTTTGGGTTTATTAAAGATTGCCAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:2 + chr3L 21908878 5' + roo 22 2 57.43 GTCTGCACTTTCGATTGTTTGTTCTTGGCTCTGAAAACTGTAATTTAATGTGCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 27619195 5' - hobo 2916 1 56.44 GACTTTGGCGTTTGGCTTTTCGCCTTTCACAAATCAACGTCCAAATATGGAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTTCCC:1 + chr2L 12121387 5' - INE-1 571 1 77.33 TGCCTCAAAGTTCTGGACCACCACCTGCGACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAG:1 + chr2L 7015728 5' + Doc2-element 430 1 74.00 AAAATGCGTTCGCTGTCATTTTGGACGCCGTATTGCACTGGCTACGTGATTGTATTACTCTAAGCCTATTGAGCCGAGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACT:1 + chr3R 27405430 5' - G5A 2445 1 56.44 GAGAGCATTGAAAACCAACTTGAATATATTATCAAGAATTTAGACGAGAAGAAACTCAACTTGTTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 15653087 5' - roo 8997 2 60.40 TAAGTTTGCTGAATAATCTTACAAGCTCGACTTTTAAGGCGGAAGTTTGGCTGGAGTTGGAAACTCTTAAAATAAATTAACGCAGGCCTTGACTGCGGGAA:1 - chr2R 14974121 5' + baggins 428 1 57.43 CTCCATTTCTTTTCTCTCACCTATTTCTGCAAAAGCACACATACTTCGCTATGTTATATATATACGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 8299763 5' - roo 395 1 64.36 AGAAACAATTAACCAAAGAACTAATTTAGAATGTTAAAATAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2R 5267340 5' + pogo 34 1 66.34 GTACCTACACTGGGCGCAAAAAGGGGTAAATAACTATTTCTAAATGAGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chrX 13354253 5' - pogo 2074 1 60.40 AAAAATACGTTGACTGTTTATTGCAAAAATGATTTCTTGAGACACGAAGTGCGAACATAAGCACCCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2R 5126514 5' - P-element 2876 1 68.32 AAAAACGCCTAATAAGATTCAAATAAAATATTTTAAAATATTATTATTTCCAAACGAAGACCAAAAATTCTCTAGTCACGGGTCGCGGAAAGCATTGTACC:1 - chr2L 22541271 5' + Tc1 361 1 58.42 CTGACACATAATTCCACATTCGTGGTAGGGGAAACAGAACAGAAGTCTCAGAAAAGCAAGCGAGCTTAACTAAGGGAGGAGTTATCATAAGTAAGGTCAAT:1 - chr3L 21696268 5' + gypsy9 5014 2 68.32 TTTATTTTTGTGTAAAGTATGTATATAACATGTTTAAATTTTTATGTGTGTATTTATCTCTGTGTGTGGGTGTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCG:1 - chr2R 1000421 5' + HMS-Beagle2 2 2 81.19 ATAGCAACCCCCAAACAATGCACAACCCACCCTCTTTCTCGCACTCGTTTTGGTTTTGAAGGGTATTACTATCCCGCTCTCGCAACAATGCATACTTTTCT:1 + chr2R 15116029 5' + Doc 278 1 80.20 AACCAAAATACAAACTCCGCACATACAGTGCGAGCAACAATTATACCTCTCATTCACACACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCT:1 + chr2L 7305293 5' + Porto1 312 1 64.00 TGCCTAAAATACCTACTAAAATGCAGTGATCTACGCGTTCGGCAATCTGAAGCAATTATGACTTGCAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCAT:1 - chr3R 896334 5' - invader4 2627 1 71.29 CGCGTGGGCGTGGCAGGGAGGACAGTCTGCGGGCTGTCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAGTAGAGCGGG:1 + chrX 17192399 5' - F-element 384 1 72.00 CTACGCCTACTCTAACGTCAAGAAATGTCAAAACCTCATAGGGAAATACAAACTATTTCTTATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2R 9868538 5' - roo 398 1 64.36 TAATCAGGCGATCAGGGGTTAATAACGGCTAGCTCTTCTAAGTCCTAGCACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGA:1 - chrX 4621077 5' - micropia 5001 4 52.48 AAACCATGCAGCTGTTGGCTTGTGTTCGTTGTGGAAAAGTCTTTTCAATGACTTCCATAGTTTGTGTTGGGGCATGCAGCCGCCAAAACT:1 + chrX 8174326 5' + diver2 5 2 81.11 GATCATGAAATTTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chrX 2090221 5' + roo 25 2 52.00 ATGTTAATACATTTATAGATCTGGGTGGATTCGCTGTGTGTTCGTGTTTAGCGTAAAATGTTGCTTCGGTTGTCAGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCA:1 - chr2L 5985860 5' - F-element 233 1 78.22 GATTCGATTAGTTGCGGGAGCAGAGTAGATGTAGCTAGGACTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTAA:1 - chr3R 16284712 5' - G5 4547 1 67.33 AAAATNATTACTGATTTCTTTACAAACCAGTCCTGGCAAAAGTACATACATACATAAATATGTACGTATGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 - chr3R 23723201 5' - Transpac 5224 2 74.26 TATAAACACTGTTTACATGAGAACTTCCCTGGCTATTTGTCAGTTGCAAATTTAGACAAGTTGTCGGGCAGATTTCACTCGACCAAACAAAAATAATACGA:1 - chr2R 15492167 5' + I-element 4925 1 78.22 CGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3L 14005624 5' + F-element 49 1 61.39 CAAAGACAATTCAATCAGTCAGGAATATGGAACTTTATGCGAAACCATGGGATGAGAGAGGGTTATGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chrX 2874891 5' - 1360 3377 1 71.29 TCACGTTGGAACGCTCAAAATAAGAGAGCCGAAAGGGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATA:1 + chr2R 7352853 5' + Burdock 6228 2 64.36 TGGACCCGGTCAGGTGCAGTCGCCCAATGTGAGGTCATACCAGATGCAGTATGATGTAGCTAGGGTATACCAGACGGGATGCAACCCTTATAAGCTGCACC:1 + chrX 17250107 5' + gypsy12 129 2 75.25 CGGGGCCAACTTGTCAGCCATCTCCGGGTTTTCTGGCACACATTTACCGACCCCCTTCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAG:1 + chr2L 17918388 5' + I-element 5064 1 55.45 CATTCNCCGTCGCCCCCTTTTCGTGCGGTTTAACCCCAAGGATCTCCAAAGTCGAATCAAGCTATACCTCAAAGAAAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCT:1 + chr3R 13329370 5' + Ivk 4934 1 78.22 GGCCGACGGATCATCCAGATCGCGAGTTAAGTCCTCGTCATCATCGTCGTTGCGCGACTTTTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTGTACACATATACTGAT:1 + chr3R 15971483 5' + rover 154 2 61.39 TCCGACTGTCCAAATGCTCCAGCTGGAGCCACGGATGTTGAATCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACC:1 + chr2L 2240009 5' + copia 4779 1 58.42 GAGGGCGCAGGCAAGACGTTGTGCAGTAGACGATTTTCGGGCCGAAATTTATTCTGATCGAAGAAACGAACGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATAAGAT:1 + chr3R 19245602 5' - 1360 3114 1 78.22 ACTGCAAGCGGAAAAAACGCTGAGAACACTGAGAAAACGAGGCCCCAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr2R 21379467 5' - P-element 2856 1 38.61 TTCTATAAAATTAAGCACTTTTATTTGGAGATTTGTCGAATGTATATTGAGTTAGGCGTAGATCAGTGTTGGACCTAATATGGCTTTTATTAAGAGAGCCT:1 + chr3L 15160874 5' - G5A 2393 1 60.40 TCTATNTTCTTTATGTAGCTCGATGTATGAAATATGGCAAGTGTGTATTATGGTTGTTGCAGGGCTTCCTTTGGTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATG:1 + chr3L 13642590 5' - F-element 327 1 75.25 TCTTTAGAGGAGTCCAATGTCTCTTAAAGTGCCCTCAACGGCTTCGTCCTGGAGTACAGAAAATTTCGACAAGATCAAGTGATCTTAAATGTCAGGATGGC:1 - chr3R 23960924 5' + invader2 4832 1 59.41 TGAGGATGCTGTATATTTGTATATAATGTCTAATGTCCGTGTGTCAGTCTGACAGTCTGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTACAAAAGCT:1 + chr3R 23238204 5' + INE-1 150 1 66.34 GACTGGTTGGGATTGAATCTGAATGATGTTTCCGAGAAGCTATAATTGCCCAAGATAGTAGTTATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 + chr2L 22689939 5' - Tabor 470 2 64.36 CTTGTCATTATCTTGCTCGACGGCATTAATCAGAGCGACCTGCTCGCTGCAGCCAGCCATCCGTCGATTGCATTCGAGTGGGCGATCATGTTACATCCGCC:1 - chr2L 14702725 5' - 412 7166 2 78.22 AGTAATTTACATGCAGAAAAATGAATAATTGGATGGATGCCCTGTAATTATTCCGTGCCCGATCCCATGGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGT:1 + chr2R 9379005 5' - G2 3048 1 75.25 GTACTCGTTTGGTAAATCACAAATGTGGCATAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr2L 9823685 5' - hobo 2905 1 74.44 ATAAAATCGCTGATTATATAGGAAAGGGGCAGGGAACCCTCTAATTGGGCCCGAACCATTCTGTGGTGTTGGTCACAACAGAGTACG:1 + chr2L 16205114 5' + baggins 4958 1 75.86 GATGTGTATAAAGATCTTTAGCTGGGATTTAAAACGGATAATAAATAATAAAAATACATGGCGATAGGGAGGCTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTG:1 - chr3R 20367248 5' - Tirant 301 2 74.26 TAAGCATTCTAACAAATAATTGAGTTCAGGTATTTGGTAAGCGCTCTGAAGTTTACTTAAGTTTTGACTTGCACTTTTGTTTCATGAATGTTGCCCTTGGT:2 + chrX 3841551 5' - Fw2 305 1 58.42 AATTACCTCATCTCCCTGGAACTATTCATCACGGCATAAACCCATGGTCGGCAAGCCGACTCAGCATTTATGCAACATAGCTTGGTACCCCGGATAAGGGG:1 + chr3L 14306194 5' - gtwin 130 2 72.28 GGGTCTGTCTATTTTTTGGCATTTCTATTATTTTGGTAACTTCTCCTATTTTACTGCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGC:1 + chr2L 17187235 5' + roo 169 2 53.47 AAAAGTCCCTCTCGAAGGACTTGAGCGGATCCTGCGGCTGTGCATCTTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTG:1 + chrX 18408538 5' - F-element 4507 1 61.11 CTCAGCGCCCTGCATTCGGGTTCGGCTCAACACTTCGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:2 - chr3R 22899236 5' - P-element 2847 1 38.61 TAAATTAGGAAATTTCCGCATTCCCACGTTTACTTAGCGGCACATTGGGCGCCACGATTAATTATATGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 + chr2L 15997851 5' + 412 5 2 71.13 CAAACGGTGTACAAATGACCACTGATTTTCGAAATAAAATTCAACGATTTGGTATCAGCTGTGCTGCACTATCTCCGGTTACGTTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chr2R 5091617 5' + blood 165 2 58.42 CGACTTCTATTACTCATTTATCATCGTGCTAACGAACTACATATTTAGAAAAAGTAAAGCCACCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGC:1 + chr2L 17116608 5' - opus 7166 4 55.45 GTATGTAAAGTAATTATTATGACCAGTTAAATCTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCC:1 + chr3L 18682033 5' - roo 8949 2 67.33 TTTTAAAAGGCGCCGCCGCTCTGAAGCAGGTGATCTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCAT:1 - chr3R 28206941 5' + flea 4561 1 77.23 AGCGCATATTTCAAAGACTTTGGCTCTGTCCGTCTTTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTACAGGATGCGGCAGCATAATTACCTTTTTTCCGAAC:1 + chr3R 22759381 5' - mariner2 878 1 74.26 GAGGGCCTTGGTGCGGGGGTTGGGGTGGATGGTCGCAGACAGGGGCAAGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3R 11832948 5' + roo 8690 2 53.47 TCTTAATGCACATCGCCTGCACTTAGCCTAAGTATACAGTTCATACATACACGAATAATTCATGCACACACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr2R 19079149 5' + 297 6584 2 69.31 TGCCATCAAACATCGGACGACGGACATCAACATCGTCCACATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCGTCAC:1 - chr3R 13909308 5' + Tirant 8069 1 71.29 ATGTCGTCCTGAAACTGGCACAACTGAATCTCAAGGCGCTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCC:1 + chr2L 397998 5' - R1A1-element 345 1 69.31 GGTTTACTATGGTGAAGAACGGGTCGTGGCGCATGGATGGCATGAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGGA:1 + chr3L 15559311 5' - Transib5 2586 1 54.46 AAGGGTATTTAGCACAGTCTTTCATAAGACTTCCACCATAAAGTTGTGTGTTTCCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGA:1 + chr2L 13911710 5' + BS 4995 1 50.50 ACGGAAAAGACGGTGGTGGTGTTACGTGAAAATTTCGGAGATCGTCGAGGGCCAGAAAATCACATTTAGTGGCCGGCCAAAGTCACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 12804717 5' + 1360 3 2 77.23 TGAATAATTTATGTGCCAAGGTTTTGCCTGTGACCAACACACACTGACTCCCTTCAAGGAAGTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 11005441 5' - roo 9056 1 58.42 GGTCGCTAGGAGCAAAGTACTGATATTCGCAGTCCTAGGGCGACTGCAGGGGCAACTTGCGCTGGAATGACGGTTTAGACGGCCAGCTAGAGAGTTGCCGG:1 - chr3L 22913397 5' + aurora-element 175 1 77.23 CAAGCAAACAGCTACTGATATCGCCTATACAAACTCGACTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:2 + chr3L 17624169 5' - roo 9034 1 59.41 TACAGCATTCTCAAATACCAACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 11240912 5' - roo 399 1 71.70 AGGGCAAGTTGTACCACAAATATAAAGCAAATTATTTGCATGTTTTAATTATTATAGAACTTATGTCATATAGTTCCTGAGAACTCGACGTTCATACGGAC:1 - chr2R 4410801 5' - INE-1 133 1 72.28 GACAATTCAATCAGTCAGGAATATGGAACTTTATGCGAAACCATGGGATGAGAGAGGGTTATGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chrX 2874887 5' - 1360 3373 1 67.33 AAAACAAAATAAAGCCCAATACGATAAAGCCCTATAGATAACCAAGATTTCAAGTAAATATAAAGCATACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCT:1 - chr3R 9068123 5' + Doc 317 1 74.75 TTGGCTACCGTACAGCAAGCACGCCACCTTCCTAGTCCCCGGTCTGACCACGTCCGACAGTATTAATTGGCTT:1 + chr3L 20558084 5' + gypsy12 10004 2 75.34 TATTCCCCCCCTTCGATCGGAGTCCCATTTGGAGACCCAGTTTATGGTATATGGTATTCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAAAG:1 + chr2R 21045269 5' + 17.6 7175 2 63.37 TACTTTAAGTGCAACAATTCCAAGTGCATTCCCGTTCGTTCTGCCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAACGGCAGATG:1 + chr2R 8221764 5' - Juan 162 1 66.67 CCAAGGGGTTATATCTTGCTCGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATA:1 - chrX 14771282 5' - F-element 4619 1 78.22 GGCTTTGGCTTTTTCTCGGATGTTTTTTTTTCCCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATG:1 + chr2R 9025432 5' + 3S18 302 2 67.33 GTAGTCTTTCTTGCAATTAATGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chr2R 15856412 5' - mdg1 7405 2 79.21 ATGGATCTCAAAAAGAATCATTTCTATATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 19051859 5' + roo 50 2 79.21 GTCTAGCTGTTTTACGTCGATACGTTTGATTTAAAATACGTTTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGG:1 + chr2R 1346276 5' - I-element 5077 1 54.55 AATTAAATTAAATTAAATTGCCGTAGCAATTTAAGGCGCCTTGTGGCAACTTGCGCTGCGTCTGTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTA:1 + chr3R 7739991 5' - INE-1 171 1 55.45 CACGTTCTTCTCGTGCCAACTGATCCCATTGGGGCTGACCTCTATCAATTGGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAA:1 - chr3R 12323797 5' + opus 7364 2 58.42 TGTGGTATGCATTTCTCATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:2 - chr3L 14005646 5' + F-element 27 1 51.49 AACCAAATAAAAAACACAAAAGAAACAAACAAAGCGAAATAAAAACAAACCTCCCGCGTGGTCATATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTACAATCG:1 - chr3R 25760236 5' - rooA 112 2 52.48 CTTGGCGTGCTCGTCGTTACGGCTCGTGTTATAGTTGCGGCTTTTGCCTCGCCGATTATATTTGCACGCATGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2L 10635343 5' + roo 3 2 77.00 TAAGTNGTCAGTAAAGCGACCGAATTTTAATACCACCTCAACCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACT:1 - chr3L 1346525 5' - F-element 4281 1 58.42 CCAAAATTTGTGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr3L 11696469 5' + blood 7026 2 64.36 GGAAAATATAATTGTTAATAAATTTACGGCCCAAAAAAAGGAAAAATAAAAAAAGACGGAACGACACTCGCGTTC:1 - chr3L 8040215 5' + Doc2-element 285 1 58.67 ACTTCAATTTGCATATTTTATTGCCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACGTTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCAC:1 + chr2R 14442603 5' - Bica 173 1 76.24 AGATAATATTTGCATTGGATGTACTGCTAATAACATGTAAATTTGCTTAACCATCTTAATTGATTAGCACTCGAATTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGG:1 + chr3L 17573163 5' - 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diver 5669 1 59.18 AAAAATAAACATCGCAACAGCGAGAGGCGAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAAATTACAACTCCCTTAACAC:1 + chr3L 21392672 5' - Max-element 8413 1 71.29 TGAAAAGGATTTGGAATCGATGCCATCGACTGGTTTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTC:1 + chr3R 12952773 5' - R1A1-element 268 1 62.38 AAGCTCCCCTGTTCATTGCATCTACTTCAGGTCGTCTGTCCGCAGGCTTAACATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTAC:2 - chr2L 3245015 5' + rover 6971 2 60.40 TATTTACTTTCTAGATATACCAACATAATTGATTTACTGGTACTTGGACATCTGCTAAACAGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTG:1 - chr2L 15081340 5' - invader4 3005 2 68.32 AAATCNCTTCCACAATACCCAATAGCCAAACAGAATAGACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAAC:1 - chrX 20013361 5' + I-element 4878 1 65.35 AAAACCCTCTTTGCCGGCAAGTGCAGAAATCGAAAAGCAATGCCAACAAGTTCCAAACTGAAACAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAG:1 - chrX 21247126 5' + Porto1 216 1 61.39 GCCAAGTCAATGTCGCGTCCACCGATCTGGTCCCAGGTGCTGGCCAGCATCTTCAGTTTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCC:1 - 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INE-1 546 1 76.24 ATGGCTATAAGGCACATATGTACATATATACACAGCCAGTGCGCTGATAAGCCTATTAGCACATCATAGCTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 + chrX 11449030 5' + FB 7 1 63.37 ATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCC:2 + chrX 21772472 5' - gypsy3 6567 1 50.50 TCATGGTTCAAAATTACCAATTCTTGGAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAA:1 + chr2L 23033634 5' + G6 1907 1 73.27 AGAGTAATTGCTTGGCATTGTGGATTATTGAATATTGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 - chr2L 11114039 5' - transib2 2787 1 67.33 GGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2L 10635246 5' - roo 9040 1 59.41 AAGGCAAAGGCAGAGCAAGCCACCAAATCCAGACCGGCCACCTCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCCAGCTTCCAACAAATGTTTGCTCGCTTTGAAGGCA:1 + chr2R 5893689 5' + G2 169 1 63.37 AATGGCAATGGACAGAGCAAGACCAGAAAGGAAGGAAAAGCATATAAGGACATTCAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAA:1 + chr3R 31899304 5' + HB 460 1 76.24 AATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAA:1 - chrX 23182900 5' + Idefix 39 2 68.32 TTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACT:1 - chr3R 19447101 5' + 297 6880 2 61.39 TAATAGCCACTGTGAGACGGCGCTGATCTTCCAGGATCTCTGCCTCCCGTGAACGTTCCATGTCGGAGGGCATTAGATTTTAGATTTTTTTTTTTAATTTT:1 - chrX 10013789 5' - Transib5 23 1 59.41 CGACANACATCAGAAGCCGCACCACAAATATACAGCAATCGGATTGCTGGCAAGGAATTATTCTGTTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCG:1 - chr3L 13935867 5' + 1360 3294 1 44.55 AAACGAGGGAAATAAATCAGTCACAGCTTGTAAATCCTGTGTTTTAATAACCGAACTTCCTTTTTTAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCG:1 + chr3L 27863623 5' + mariner2 44 1 47.52 CCAGTGGATGATTCTCGAATTTCATTTCTTTTTCCCCCTTACATATTTCTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chrX 22747492 5' + Doc 31 1 51.49 CGATGCTTACCTGTAAATAAAAGAGAGTAAAAATTGAATTAGAACAATGTTTTTTTCAACAATAAGGCAAAATAAAGCAAAAAAAAGGCAAAAAAAAACA:1 + chr3L 7828703 5' + gypsy7 5008 1 74.00 GTTCTCTTTATTCTCAATAATAAGATGGACTACTTGGAAATACTTCATACTTCATTACGTGCTGCCTGGCTCACCGGCTTACGGTGCCCAGCTTCCCCCCC:1 + chr2L 11370061 5' + G6 271 1 48.51 CGGCTCCGTTCGCTATGTCCCACCCCTACACACACACACACACACACACACATATATA:1 - chr2R 19061436 5' + accord 7032 4 74.14 TCCTCTTGTTGTTGCTCAAGCAACCAGCAATCCTTTGTGACATTTGACTCGTCGCACGCACACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCT:1 - chrX 3580422 5' + 17.6 145 2 66.34 TTTTATTTCAGGCCAACAATACCTCGTATAAGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGAATTTTGTCCTGACTCTTGTTAGCATAGCAGG:1 - chr3R 3469468 5' - mariner2 698 1 69.31 TCCGTCTTTTGGCAGGAAGCCAAAAACTTTTCGGCATAGAAATCCAACCTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACG:1 - chrX 1000848 5' - INE-1 128 1 56.70 ATACAGTACTCATTCAATACAAGACAAACCCCTTCTTACTCTTTCACTTCGATAAGTTTTTCGTATTAAATCCCTGAATCACCATATTTAAAGATGCCGAA:1 - chr2L 11818560 5' - Dm88 257 1 57.43 GGCTCTATCCCTGCACCCAGATGAACCCTTAAGGACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATCATCAAAGTGTGTTGAAGTTGGGTTCAGCTAACC:1 + chr2L 1402691 5' - Stalker 304 4 62.38 GGCAGACCCAGTCCGTTGATCCGGCGCGTTGTGGTGGGCTTGATGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr3L 5750704 5' + opus 7055 4 54.17 ACAAACACACAGCCAAAGGACAGCAATAAGCATTGCTTTATTTATCTTCTGTCTGCTTTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACT:2 - chr3R 26805767 5' - flea 150 1 64.36 CCTAAATGTGAGTTTGAGTTAGCATGGTCGGTGGTGTTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAG:1 + chr2L 227547 5' + invader4 2959 2 63.37 TTGGAGTACGTCAAACTCGTTTTGTCAAGCACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACA:1 + chr2R 4577097 5' - Chouto 476 1 72.04 AAAGAAATCACAAGTTAATCACTGGAACATACATGTGAGGATGTCACAAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chrX 19561808 5' + 412 24 2 57.00 GCCCCNTGAAATTCAGCAATTCAGTAGCATACATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACTGGAATGAGCAACCTTCATCCGCCTACGCATCGGGCAC:1 - chr3L 12353157 5' + Ivk 5041 1 64.36 AACGAATTAAAGTGACACTTTTGAAAGAATATTCATTTTATTGTGTATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTA:1 - chr3R 5775740 5' - invader4 293 2 60.40 TCTAGCGCATATCTCAGCCACGTTCTCATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2R 11257869 5' + pogo 46 1 72.28 AAGAAGCGTTCATAAGCGGTTCTTGTGTGTGTGCGAGGACATGCCACTGTGTGGCACAACCACACACACATGCACACACACACACACACA:1 - chrX 16534670 5' + accord 180 2 85.56 AATCAACTGTTAATTTTCATAGACGAGAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 87165 5' + jockey 57 1 71.29 ATTCTGCATGCTTAAAATCATATTTCTAGTTATAGTATTATCTCGGCGCTTTTACGATCAGACGGAAGAACAGAGTTAGATGGACTCGGCTATAGATCCTG:1 + chr3L 27331675 5' - INE-1 95 1 63.37 TTTTCAGTGCTCCGTCTTCGGATTCTACTCGCGATCTGATGGCGAGAACATTTTCCTTTGTGTCTCCGTCTACTGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTT:1 + chr3L 19003206 5' + jockey 496 1 76.24 GATGCACCATAGACCAACTCTGCCATCGAAAGCAGCATGCCCACACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCC:1 + chr2R 6548300 5' + F-element 389 1 56.44 AACTGGGAATTCAATCGTATAGAGCGGGGTAGAAATGGAGCTGATTGAGTCTCAGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTGCATAATTAGA:1 + chr3L 20351561 5' + Cr1a 4274 1 59.41 GAGAACCAGTTGGCAAGCGCATCTGTGGAGAAGAGTCCGGTGCAAAGGAGTTGTCCCGTCGATAGCAGCTCCTCGGAGTCAGAGCCTGGGGAAGTCAAGCG:1 - chrX 7895436 5' + G-element 443 1 61.39 CTATGAATATCCCATGAGCTCTCGCGCTTCAGTATATGCGCGCACTTTGCATAAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAATGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chrX 1523773 5' + jockey 31 1 58.00 TAAGGAGGATTTATGACGTGGCTAAAGTGCTAACCACGCTGGAAACTCGAGGATAATTTGTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAG:1 + chr3R 13772276 5' - I-element 74 1 68.32 AAACTGCTGAAACTTTTGCACCAAATACTTAATGAGTGGCTCATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 - chr2L 17862281 5' + F-element 19 1 66.34 CTGGTTAACTTTGGCCTTAATTTGCAGTGAAGCAGCGTGGCAATCAGGAAGTTCTTAATTTATGTAAGTGGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTG:1 + chr2R 14793151 5' + flea 322 1 73.00 AGAAACTCGAGTGGCTGGCAAACTGACATGCTCCAAATATTTCGAGATCCCACGAACTATAAAAGCTAGA:1 + chr2L 10124028 5' + INE-1 153 1 62.86 CGAGATAATAAGTGCATATGCATATGTCGTAGCAGTTCTCGAATGCAATTTTGAACTTAGTTCGATTTAAAATAATATACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chrX 3697215 5' + jockey 4674 1 79.21 ACTCGACTCGACGCAAAATATGTACATGGGTGCGATTTTGGCGGACTGACTTGTCGTCTATAGGGATGTAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 2302943 5' + blood 7178 2 79.12 GCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGTCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 - chr3L 11696458 5' + blood 7021 2 61.18 ACGAGGAGACGAGACGGTACAAGACGATGGAGCCAGGAGCGAGACGAATAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 27448485 5' - roo 9043 1 51.49 TCAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTG:1 - chr3L 829959 5' + G6 36 1 56.44 CGAACGCGAAGGGAGAGCAGTTAAATAACATATAATCGCATCCGACTTTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 17624238 5' + roo 25 2 54.00 TATATTCTCCACAGCTTCTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGAT:1 - chr3R 10142391 5' - F-element 4388 1 82.18 CGCCCCCTCGGCTTTCCTGTTCGCTGACCAATCAGCACGTTGCTGTCCTCCAGTGCGCCGGTGTGCGTGAGGGCATCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCG:1 - chr2R 7418671 5' - accord 7028 2 76.77 TAATTACAATGCCCTCCGATAATACCAAATACATACCAATCAACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCC:1 - chr2R 23177017 5' + I-element 315 1 58.42 ATCTACTTACCTAACTTCTATGCACAATTCATACTAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:2 - chr3L 22324083 5' + hobo 46 1 65.35 TATCGCTTGCCTGCTCGTCGAGATGTTCGAGGGTGTCTTTGGTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAG:1 - chrX 2626589 5' + R1A1-element 4977 1 56.67 AGTATCCCAAAAAAGAAGAACAACCGAACCTACCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAG:1 - chr3R 21784488 5' + Idefix 7140 2 68.00 ACCATTTTCAAAAGTTATTAACCCAATTGGAGTCACAAGAATTCGGCGCGGAGAAAGGACATGCCTAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTTTATTCTAGT:1 + chrX 10488537 5' - 1360 8 2 71.29 TATGTACGTCCTGTTCCTCTAATACACAACTCATTTGTTCGTTCGCTTCCTCTCTGTCGAATATAAATCTTGAGATAACTGTAATGTGCACACATATCGAA:1 - chr2L 22690056 5' + Tabor 1 2 79.21 TAAACTTCAAAATTTGAAAAAAAAAATTAAATTTAAAATCTTTTCTCGAGATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTT:1 + chr3L 2830139 5' - Juan 3890 1 53.47 ATTGCCTTGGGGTATTTTTCAGTAGTTCCAGTTCAAGCGAAACTACTTCGACTTGTTCTATTTCTTCGCCAGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTGG:1 + chr2L 4065109 5' - F-element 4481 1 77.23 CCACATACTTGCTGAACTTCTGGGCCTTCAACGCAGCCACCACGATACACCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGACCAGTCTTGTATAGCTGCTCAACCCGT:1 + chr2R 12579254 5' - R1A1-element 4945 1 61.39 ATGTGCGGCTGGGACTGAAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACC:1 + chr3R 16418360 5' + opus 7331 2 78.57 ACGGGCTGCTCATCGCCAATGGAGGAGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTT:1 + chr2R 12225187 5' - F-element 4443 1 74.26 CCAATCGCGAGGGGGAAATCTGTGTGTGTCAAGTGGTCATGACAAATCTGAAGGGCAAATACTAATCCAGGTTTCTTTCTTCCAGATGTGAAAAGCCGGTG:1 - chr3R 22847804 5' - TART-B 379 2 54.46 TTGTATATACAGTGTACATAGAGATGAGCACACAAACATCTGTTGGCGAACTTAAAGCTTTTCTATCCCAGGGTTCAAGTCTTGGCTAGAACCCTGGTGAT:1 + chr2R 8069876 5' + X-element 283 1 70.30 AACAAAACAAAGTGATTTTAAAAGCCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr2L 20084913 5' - 412 7496 2 72.28 TATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACAT:1 - chrX 23182896 5' + Idefix 42 2 72.00 CCAAACCGAAAAAAAAACTAAAAACAGACTAGAAAAAAATACAAAAAAAAAATAAAATAATAATAATAAAAAAAAACAAAG:1 - chr3L 17964041 5' + Rt1a 5073 2 85.19 AAATCATTTCTATTTAATGGCATGACATGCTTGTATCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAACCCCGCT:1 - chr2R 20937874 5' + F-element 394 1 64.36 AAACATGGCCGCATTTCCGCAAGGGAAGCTGTTACATTTTCCGTTGTGGTGCATAAATTGAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTT:1 - chr2R 19232939 5' - Burdock 6380 2 71.29 ATACGGATGGAAGATACGCAGTGCCTCAGTTAACGCTTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2R 14582891 5' + roo 40 2 66.34 TCGGAGAACACGATTTTCAAGTGGCACTTGGGTGGGCAGGGGCAGAAAAAAAAAACTGAAAATCCAAAAAGAGAAAAAAAAAACCAA:1 - 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gypsy12 9920 3 61.39 TTGCTGGCAACCTTTTCTCGTCATCCCTGCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTT:1 + chr3R 11352033 5' - Bica 414 1 71.29 TGTTTAGTTTTCCAGCGGCAGCTGATGAGTGGGGTGGAAAATTGTGTGTGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATT:1 - chr3R 31169087 5' - HMS-Beagle 6608 1 51.49 GGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTT:1 - chr2R 4879015 5' + G-element 41 1 62.38 TGGAGAGGTGATTCGCCGCCGGATTGCATCCACTGGGTGAGAGTTGCTGTTGTTGTTGATGATGTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGA:1 + chr3L 12463640 5' - F-element 482 1 67.33 CGTCGCAAATTGCCATGCACACACAACACCAGCGTCGAACGCCGGTACGAAAGGGTCGCAGCCAGCGACAAGGAGACGCAAGAAGCGTCATTTGTGGAGAC:1 + chrX 8651484 5' + aurora-element 352 1 72.28 GTTGATGAGGTATTTTCGGTCATTGAGCTAGTCGTATGTAACACACACACACACACAGATACACTCGCAGATATACCAGCTTGCACACACACACACACAC:1 + chrX 20521860 5' + accord 179 2 54.00 TGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGC:1 + chr2L 14536251 5' - blood 11 2 65.35 AAGAAGGAAGGTGGAGGAGGATCAACATCAGCTAGCCCCCATCATATACAGCTAAAAAAGCAGTATTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 - chr2L 16348883 5' + flea 4761 1 67.35 ATATGTCAATTACTTTCAACAAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr2L 14536333 5' - blood 7377 2 66.34 CATAAAAGGCCCGCAGCGAATGCAAACATAATAAAAACCCGCACAGTATACTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr2L 15622702 5' - mdg1 7438 2 56.38 ATGTCAAGTTCCGAAGTAAATGGCTTAAACCGAGGTCAATATAAGCGTCAAGGTTGATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGAACTCGACGTTCA:1 - chr3R 19435115 5' - INE-1 140 1 58.42 GCGCCCAATACTCCACTCCAACAGCGCTACCGTTGGCCATTTGCCGGGCTCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAA:1 - chr2R 22101267 5' - X-element 4597 1 60.40 CCACAAACCTGACATACATAAATACGTAGCGGAAGCTATTACGTGCGGAGCACGAATAAAACCAGGCCTTACTCTACAACTCCGTCCTAAAACCAACCAG:1 + chr3R 7448262 5' + Fw2 3528 1 66.00 CAGCTTAAAATATAGTCAGTATCTAAATAATAGTGTCATTGTTCGGACACGCGGCTCGGGACTTTTTATTTCGCGTTTGCTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAA:1 + chr3L 15912244 5' + 1731 231 1 59.41 AAGTCCGTGTTTTTTAGTGTATTCCTACATTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGT:1 + chr2L 12776269 5' - Doc 4395 1 73.27 GGAAATGTCCGCAACAACGGCAGCTCCCGTTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTG:1 + chrX 17314887 5' - F-element 475 1 70.30 AGGTGTATTATGCACTCAACTTGAAACCTGCCTCTCTGTCAATTCCCACTGAAAAGGTGAGAATAGCGTTGCGTTGAGTGGGAGAGCGAGAGAGAGAGAGA:1 - chr2L 14483365 5' - Cr1a 299 1 57.43 TGACTTTAAATGATATGAAATAAGGTGATGAGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3R 26404489 5' + 412 45 2 69.31 GTGAACGGTCCCCAAGGATGGGAAAAAAGAAGAAAAACTGGGGGGTTAAAGGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:2 + chr3L 776088 5' - 1360 3365 1 53.47 CAAAGCACCAAAGACGGCAGCAATGGCAGCTGCAACCAGGACACAGAAAGCTGGGAAAAAAGGATAAGTCAGCGTCATTTGAGTCTGTATATGCCTTACTA:1 - chrX 10496943 5' + Transib5 2534 1 60.40 AGCGAAAGTTTAGCATTTGCATATGTACATAACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 - chr2L 9346217 5' + Transpac 4962 2 71.29 CATCAAGACAGTTCCAAGATCCGGCGTGTCAAGAAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCG:1 + chr2L 7194008 5' + R1A1-element 465 1 66.34 GCTTTGCTTTTGGCCAATTAGCGGCTGTCAAATGTTGTTGACTCTTGTCTCGTTCCAGTATTTGCATTCCTATCTTGATTATTTTTCCTTTATTTTATCGT:1 - chr3R 24958803 5' + Circe 6969 1 58.42 AATAAAGATAAACACGCAACACAAGACGCATTAGCTGCAACATCTGAAGCAGCGATCGATGACGATCCAAGTGCGATAAATACTAACAATAATAATAATAA:1 - chrX 4587290 5' + mdg1 29 2 64.36 CACTTGAATCAAAGTGACAGGAGAGCTCCGAGCCCACCAAACCACCGAAACTGATAAGAAGTGCGCGTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTG:1 + chr3L 648657 5' - R1A1-element 5313 1 70.30 CAAGCTTATCTCGTTGTTATTCGTAAAAAGATACATTGTAGATACATTTTCACACACACACTCACACACACATTCACAC:1 + chr3L 17227295 5' + accord 189 2 41.77 CTCTTTGCACTCATTGTACTCCGAAAACCCTTCAAAAAAAAAAGAAAAA:1 - chr3R 28113213 5' + Doc2-element 212 1 79.59 CACCCAGGGACATCCCCGCCTGACTCGTGGCCGCCTTGGTGGGTGAAATCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGT:1 + chr2R 11987283 5' - X-element 4417 1 67.33 GTCTCGTGGAGTAGCGAGGCAGCCTTGGATTGTCCATGATCCGGTGCACTTAAGGTTAAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGT:1 - chr2R 20722927 5' - Doc 4476 1 61.39 GAGGTGGCCAATTTCAGCAAGCTAATCGAGCGTCGTGCCCAGGAAATCCGCGAGCGACAGGAGCAAATAAAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACA:1 - chr3L 6567169 5' + invader4 2967 2 75.25 ATGATTGCGAGCATAATGGACAAGTGTCCCATTATTGACAAAATTTGTTTGTCGGTTTTAACTGGTTATATTCTGCAGCATTTCTTCGTTTGACTAGTGAA:1 - chr2L 9505302 5' - Chouto 6119 1 65.35 GATGANCCATAAAAGAAAAAGTTGTTCGAAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 63008 5' + roo 8712 2 75.25 GAAAGCAAAGGAGGTGCTCTCGCACTGCTGGCATAAATTATGTAACATTTCACGTATTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCT:1 + chr2R 10399555 5' - invader2 480 1 60.40 CGAGGGTGACGCCCGTTAAGTCCACAATATCGTCCTGATCGTCGTGCTCGATCTCGTCGGAGGTGTTTGTATTATTAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAAT:1 - chrX 17705252 5' + flea 4936 1 78.22 CTCTCTTTAGCCATGTTATCCAAATTAAAGCGCGGCCCAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAAGGCAGGCACCT:1 - chr3R 16611494 5' - mariner2 150 1 67.61 TGCAGCACCTGCTCCGCCACACTGAAGCTGCTCCTGTCCGCGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAAT:1 + chr2R 19314656 5' + flea 4587 1 59.41 TCTGTACAACTGGGGCGAGAAGCGATATTCAAACCTTCCGTCCATTACGTTAAAGCCGAAATGGGGCATACAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACA:1 - chr3L 277462 5' + 412 7087 2 59.41 GATCAATTGTGGCCCCAAGAAACCTGTAGCGCTGCGCAGTTTTAATCAGCGTAGAATCGGGAGAGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAA:1 + chr3L 15510855 5' + transib2 2715 1 72.28 TTTTATCAAAGTTTGTTTTTCGCAAATTTTTTGCATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - 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chr3R 776947 5' - Cr1a 42 1 68.24 AATTTGGAGAATCAGATGCTGAATATTTATGTCCGAGGTGTCGGCATTCATACGGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAA:1 - chr4 805912 5' + F-element 315 1 58.42 GCACATTTATCATATCGCCTCATTAGATAAATTGCGAATGCGAACAAAAAACAAAGCCCTGGCTCGACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr2R 24614526 5' + hobo 10 1 69.31 CTCTAGTTCGCTTGTCTTTAATGCACCCTTAGTTGGCGTTAACTTGGAGCCATTTAAGTCTAACACGTTATCACGGCACCATATTTGAAATCGATCTAGAT:1 - chr3R 5476989 5' - Q-element 644 1 60.40 TTCAGCATATGCGCGCACTTTGCATAAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACACAAACTTAATTGTG:1 - chrX 1523746 5' + jockey 59 1 73.00 AAGTCAATAAAAATGTTTTAATCATATAACAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 18076315 5' + roo 46 2 72.28 TTGGCTTATGTTCCACAAACCCCTAGAGTAACTCATTATGTACCACAGCAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCA:1 + chr2R 1333712 5' + I-element 166 1 53.47 CCCTCCCAAACAGGATGGAACGAAAAACCTGCTTGGACTGGAGGCTGCGGAGGCTGGTGCTCTGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACG:1 + chr3R 8134555 5' - 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chr3R 14064429 5' + Quasimodo 254 2 65.00 AGAATTCAGTGCGTGTCACCAGTGCGAGATAATTATGGTCAGTCGGTAGATCCTCGTGGTGGTCTTCGCAAGCGTCAGCTTCAGCTAAGAAGGCAGGCTTG:1 - chr2R 18785195 5' - Chimpo 4099 1 65.35 GACTCGTTCTGGCTTTTATTCCATCTCCCTGGCTGCTCGCAAGCAACTCCTCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACCTTCCTGC:1 - chrX 17034028 5' - Bica 4918 1 72.28 CACTAGCGCCTCACGCAAAAAAAAAGCTGACGTACTCGGGAAAAAGATTAGGATAATAGGATAAACTAATAACTCTGCAAGGGTCATGCAACTCATAGTTA:1 + chr3R 29749237 5' - Cr1a 4165 1 56.44 GTTTTCAATTGAGGAACAGAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 25395641 5' + roo 54 2 83.67 GTGAGTACTAGTGACATTCCACATATCCACATAAGTCCATGGTGCCCCACGTTGGGCGCCAACAACTTATGCATTTCTGATTCTCATTCTGATTCTGATA:1 + chrX 16412733 5' + transib2 2532 1 73.00 GCTCACTTTTTTGTAGCAGCTTTATAGCTGAAGTGACCAAGTGGTTGCTGAATGTGTGTTGCGGCACGTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGC:1 - chr3R 12578774 5' - Chouto 316 2 78.22 CCATCAGTTTCTGTGACAATATTCCTCACCTATGGGCAACGCGTTTTATTTGTATGTGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTC:1 + chrX 12838890 5' - invader1 3988 2 56.44 ATTGGGCATGAAAAGCACATCCGAGCACACAAAGGATCATGGCCAAAAGCGGAACACGCACTAAAGAGCCTGGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGA:1 + chr3R 24944256 5' + G-element 459 1 71.29 AGTCACGTGTGAAACATGTGAGTTTCGTCCTGTGTTTGAGTTGCCATTAAGTTTCTCAGCACGTGACCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTAAGG:1 + chr2L 3274813 5' - gypsy5 325 2 78.22 TGTACCAATACGGATTTAGAACAATCCACGGCTATTGAAACTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAACTAAAATGGCGACCACGGAC:1 - chr2R 14614247 5' - Max-element 406 1 59.41 GGGGTGGTACAGTGACTATCGGTTAAGAAGGCAGTTAGGAAAGGATTTTAGATAGAATAGAATAGATTTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGC:1 + chr3L 8589275 5' - Tc1 1634 1 71.29 GACAAATACGTCAACGAGTTGAGTTTGGTACAAATCATCCAGATGGTTAAGCCAAAGACACTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 - chrX 4804909 5' + 1360 24 1 75.26 TTTTGACGACAAACTTTTTTGGCCCATAGTTTTGGGGGCATTTTTTCGAACGAGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATT:1 + chr3R 22864862 5' + jockey 373 1 59.41 ATACAGGGTATTACGAAAAGAAATAGCAAAAAGAAATCGATTCTATGGCATGTTGGATTGTTATGCAAGATAAAAACCCTTCTACCTGTGACCTACTTCTG:1 - chrX 10166840 5' + Helena 458 1 55.45 CATCGGCGGCGCAACCCCTCTTTTCACCCTCCCCCCCTTGAATAAAGTGACGGCCATAACGAAGGAATAGA:1 - 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chr3L 25798546 5' + blood 7013 2 78.22 AAAAAGCTCAATTAACAGCTTGAAAATGTCGTAAATAAAAATAAAGTAACATTAATATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCAG:1 - chr2R 5850942 5' - BS 5013 1 60.40 TTTTTTTTGTGCAACCAATCCTAACAGAAAGGAATATCGTTGAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3R 31143426 5' - roo 9041 1 57.00 AAACTGGGAGCGCACCGCGATCCGAACCGAATAAACAGATTCAAACAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTT:1 + chr3R 29020299 5' + Stalker4 395 1 72.28 GGCCTATACACAGAACCAGTTCTATTTGTGTCCTTATTGCTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr3L 14365019 5' - blood 7352 2 61.39 GAGCAAAGTGAAATGCCGAAACGGAACTATACTTCCAACGAACGTACATTAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCA:1 - chr3L 2565104 5' + Ivk 5051 1 66.34 TAGGCAATCAATTGGCAATCACCACTTGAGCGTATCGACAAGCCATTAAACAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr2R 14582824 5' - roo 9046 1 53.47 TATGGTTTGGAAGAATACGCAGAAACAGGCGTGCCCATTGAGTCAATTGTTCGAGTTGAGGGTACAGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTGGCGG:1 + chr2L 16829426 5' - Doc2-element 376 1 72.00 AAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACA:2 + chr2R 2492933 5' - invader2 5085 2 56.44 TGAACGTAATCAATCTTATAATCAAAGGACTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 11005510 5' + roo 8693 2 72.29 AGAAGTGGAAGTGGGAGGCTCATGAAAAATTGAGCAAGTGCCGCACTTGCAATTTCAACAGCTCATCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATAT:1 + chr3L 1693183 5' - invader4 2826 2 75.25 GATTCGGAAATGAATCTTTATTGTTTTGTTTGCGCGCATTTCCAGTGTCAATATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACT:1 - chr2L 16241982 5' + G6 1983 1 54.46 GTGGAATTAGCTGACTCGGATCGAGTTTATATAACTCGCTTTGCTTCGAAGGCTGCACAATTGATGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGT:1 - chrX 18170917 5' + roo 8984 2 72.28 AACGACTGGTGTTCTTGATGAAGAGCTCCTGCCCCAGGACTCTGACGGTTCCCCGCTGCTGCAGGAGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTA:1 + chr3L 15003651 5' - flea 12 2 71.29 ACCAACACAAAGTTTTTATAAACAAAAATAGCACTGAAAACGTATTTGCTGAATAAAATTAATGGGAGTGATTGCTTTGGTTTTTTTTACGACAAATTTTG:1 + chr4 512459 5' + Tc1 270 1 80.20 ACAACGTGAACTAAAACCAACGTGCGCCTAGAAATATGCTATACAAATTTAATGCCCAAAGGAGGTAGTGCCCACGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr3R 22238769 5' - hobo 2937 1 78.22 TGTCTAGCATTGACTCTAATGGGCCAACGTTGCAATTAATTACACCGACTCGAACGAGCGTCCATTGAAATCGAAAGAAGGGAACGATTCTATACGATGT:1 + chr3L 5737839 5' - 3S18 462 1 75.00 AAGGAACAATATGTTTAAACTGTAGTGAAAATGAATGATAAACCTAATTAACCATCGAAATGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGA:1 + chr3R 13242268 5' - Doc 4228 1 55.45 GGAAGGCCATCGTAGAGTTGGAGCAGCAAAGGAAGGTAGGGAACGAGTAGAGAACCCTCTAATTCGGCCCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAG:1 - chr2L 18970316 5' + baggins 4954 1 52.48 TGATGCAAGTCTCGGGGCTGCTGAATTTGGATTCATCTAACCTAAGCACTAAACCGTAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 + chr2R 7596225 5' + F-element 82 1 62.38 GGAGGAGTACCCATCAGCATTAACGTGACTCCAGCAGCTCAGTTTGCCAATGACGGCGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTG:1 - chr2R 14237619 5' - G2 91 1 55.45 GAAAGCTGCATCTGATCCATACTTTGGCCAGCGGGTGGCGAGACCATTTTTTTCATGTTTTGCTTATTCCCTTATCTTCCCTTTTACTTAAGAGGCTAACA:1 + chr3R 32039084 5' - Doc3-element 4685 1 77.23 AATGTTATCTATTTGCATATTAAGAGAGTTCTATAATATCTCCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 7375326 5' + roo 35 2 62.38 TCTGGAATCGACAACGTCGCACGAGGCTCCTGTGCTAATGGCATTTGGCCTATTTATGCTTCCACGCAGCGAGCACATGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGC:1 + chr2R 6147315 5' - Bica 38 1 65.35 CGTCTGCTTTTTGTATCGCATAAACTTGGTTTATTTTATAGTTTATTTGAAATTTTTAACTTTTACTTTGCAGGTGGGTTTAACTTTTGTTCTTTATGTTT:1 - chr3R 19500575 5' - HeT-A 271 1 75.25 TGATCCAGAACGTCGCCACCTACTCGTACCCATTTTGTATCCATTTTGCGAATTGTTTACGGCAGCTAGGGCCGCCAAAGAGGTATATCGAATGCACAAGT:1 + chrX 1516639 5' - diver2 4778 2 58.42 CTTTCCCTCCGGCTGTCACTTAGTACATGTCCTTGTGGACTAAGTGACCGTTTCCCACAAACACTAGGCTTGCTGCACGACTATCAAATACCCGTTACTCG:1 - chr3R 14924679 5' - INE-1 548 1 58.42 AAGCCATCAAACTGGGGGTAGAATTGGGGAGTTCATCAATAATAATAATAATCAAGTTTGATGCCCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATA:1 - chr3L 15781207 5' - Tabor 402 2 74.26 GCTGCCTTGGAAAATGAAGTGGTGTAAATAATTTGAATTTAATACTATTTACTCTCGTTGTTGATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAAT:1 + chr2L 20494140 5' - R2-element 3376 1 68.32 CCAGGTAAATATTTCACAAGTGACCGATTTTTGAATACTATTTGAGATGAGGATTTTTGACACTTGTTTTGGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCAC:1 + chr3L 21637309 5' - Bari1 1703 1 71.29 CAGTTCAAATTACTTTTCATTTTAGCATATCCTTAATAATCCTTATTCCATCAGCTTGGTTAGGGTATAAATAACGCCACACACACACACATATACACCCA:1 + chr3L 13802020 5' + accord 7036 2 74.26 TCAAATAAGTACGGCTTAGATAAGTTATTGAGATTAACCTATTGATGGCCAATCAATATTAAAATGTAATGATGAACTTCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr3L 11610446 5' - 412 478 2 61.39 GAGAAGTCGAGGGAGGTTCTGAGCCTTAAGGCTCAGATGAATGGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCC:1 + chr2L 17408745 5' + R1A1-element 69 1 57.43 CTCCTAAGCAAAGAATAAATAAAACCCGCCAGTCCATCGGCAACTACTTAATATTAATAAGCTCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGT:1 + chr3R 11043838 5' - HMS-Beagle2 194 2 69.31 CGAGCCGGGCCATAAAAACTACATCGAAGAGCCGAAAAGGGGGCGAGGAGTACGGGACTTCGGAATGTGCCAATTGGATTTTGCTGTGAGATCATTTCCTG:1 - chr3L 1082899 5' - TART-A 155 2 51.49 TCTAGGTTCTCTTTGCTCTGGTTAGTTGTTTTGATCTTACATTAACACTAAGTTGCATTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCC:1 - chr2R 17465172 5' + 1731 264 2 64.36 TTGCTGCATGAGATGGCAACTGTTGCTGCCGCTTTTTGTTGATGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGGCATAGGTTCAGGTCGGTTTTAGG:1 - chr3R 19273979 5' - Fw2 3535 1 57.43 TTGAAAAGCGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAGCACTTAG:1 + chr3L 5827884 5' + blood 37 2 56.44 CATTCGAAAATCTGATAAATCTGGCGCACCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGC:1 - chr3R 14424556 5' - F-element 4361 1 72.28 ATCCTGGCACACCCTTATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTA:1 + chr3R 31996540 5' + mdg1 7336 2 52.48 CATAAAAATGGTTTAATCAAACCTAATAGCATAATCATCTATCGTCATGCTTAATCTTAACCTTCTACCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGGCGTTCATAC:1 - chr3L 22724105 5' - INE-1 137 1 54.46 AGTGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr2R 18865900 5' - roo 9030 1 68.32 TTTCACATATTTTACATTGGTCTTCTTTGCGCTGCTTAGCTCCATGGGATCGTGCTACCAATGGCAAAATAGATGTAATAAACCAATATAGGCCACCAATT:2 - chr3R 9996481 5' - blood 371 2 72.28 GGTATGCATTTCTCATTTCCGTTACATGTTTTGTTTCATATTTCTCAATATTTCTCAACTAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chr3L 14005643 5' + F-element 30 1 48.51 CTTTTGGTATAGAGAAAAATAGTTACTTGTACATTTACGGGCTTGTGGGTTTATAGGTTTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGAC:1 - chr3R 23984762 5' - baggins 5386 1 60.40 TTGTAGAATCGAAAAATGGCAAAGAGCTGACTCCTCCTTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATA:1 + chr2R 21355138 5' - G5 4581 1 62.38 TTTGCTCTACTCCAGCTGCCGTCGCTCTCCTTTTTTACTGAGTGATGGCTCTAGGTAATGCCAGGATACCAGATACTCGACCAAATAAAAATAATACGACT:1 - chr3L 6046371 5' + I-element 4927 1 83.17 TAATAGTTGCTTTAATCAAAACAAATTTTTTTAAGAGTGCTTTTGCTTAACTCAAAAAGTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr2L 1912979 5' + pogo 14 1 61.39 TTCATAAAAACTAAAACCTAACAAATGCATTCTAGTACTGTATAGCATATGTATATTAGTTTTAGTGAGCATTGCGCTCGTGTGTGTGTCCGTGTATGTGC:2 - chr3R 23229970 5' + Stalker 444 1 75.25 CATAATTACTTCCGATTTGAATGCATCTACGTGCCATGCAGCAAGGCCATAACTCACTTCCCAACGCGGAAGGGCGAAAATGCGCACGGCGTTTTTCCCGT:1 - chr2L 14487674 5' - baggins 5105 1 76.24 CAACCGAGGATACCGCAAAAAATGCTACAACGAATTTGGCCAGGTATGCCCACTAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCG:1 + chr2R 20527282 5' + FB 115 1 52.48 CTGTANTAATGTATTAAGTATGTAAGAATGCTACCAATGTTAATATGTAATAATAATTGTAATGACCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 13824441 5' - roo 399 1 68.32 CTTGGCACCCTGTATCCCATGTGCCTGCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr3R 9996359 5' + blood 7016 2 75.25 ACTGGCGGTATTCATATGTATACCAACAGGCACTGGATTGTACGGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr2R 5910923 5' + hobo 33 1 60.40 GACTAATTGGATTACCGCAGGCGGCGATTCGCGTCAAATGAAATTGCTGGAAAAGTAAACAAAATATCGCAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTAC:1 + chrX 16522298 5' + Bica 268 1 50.50 ACGGATGCCGCGACCCTTGAGATGCTCGGTGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACAC:1 + chr3L 5759518 5' + Bica 102 1 75.25 AGGCTGGCTTCATTTTTGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 5932088 5' + jockey 18 1 65.35 TATCAGGCACATTCGTCACGCACCTACATGGACACACACAACACAGAGACAGACTC:1 + chr3R 9452040 5' - Stalker 429 1 67.86 TTTGTACGCCATTATGAAGTTAATTACTTTATATTAAAGCGCATTCAATGCCCTTGAAACTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGA:1 + chrX 21264806 5' + Cr1a 408 1 54.46 TAGTACAAATAGAAATCGTAAATGTTTGTTCAAAAAATTTGTTTTTAAATATACTTTTTCTTCGTGAAATTCATTCAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 + chrX 21960817 5' + F-element 14 1 75.25 ATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGG:1 - chr3L 19339441 5' + Tc1 14 1 69.31 TTTTAGCGATCAAGTTCTACTCTAAAATGTGGGTATGGTTGTTTGGTTTTGTGTATGTAATGATCACTAACTAAATCGCTGCTGGGAGGGCTTCGCCTTTT:1 - chr2R 4736327 5' - rooA 296 2 65.35 GAATCTGAAGACTGTGATTCAGAGAAAAAAAATACAACAGATTTGGAAGCAAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAACGGCCGATTTCGTTAAAAATA:1 + chr4 232462 5' + hobo 472 1 59.41 TGATAAAAGATGATTTTACATTTCACAAATAATAATAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAA:1 - chr3R 4749587 5' - hopper 144 110 68.33 CAACGCAATATGTCAATTACTTTCAACAAGGCTGCCAACTGTGTCCAGCGCAGCACACACGTAACAGATGAATGTGTAATAAACCAATATATGCAACCAAT:1 - chr2L 14536340 5' - blood 372 2 73.27 TGTGTTTTATTCCCCTCTGCTTGGTCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGT:1 - chr3L 2885032 5' + roo 235 2 76.24 CAGCATCGACAAAGTTCGTGTGCCGGCGTCTCGCACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGAATATTTCAATAGA:1 - chr2R 10637982 5' + Tc1-2 1275 1 66.34 TGAAATGTACCTTGTATGTGACCTGTATTGTTATGCATTATGCCCATCTGGAACACTCTGGGTTGATATTGGCTTACTTTCTCCTCTACGTCTTTTGGCTT:1 - chr3R 26528218 5' - TAHRE 294 1 72.28 AATTGAGTCAAAAATGCAAAAATACAAAGTACACAATTACACACACACACACTCGAAAACTAACTTAAAGTCCTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAA:1 + chrX 17306062 5' - 17.6 7121 2 51.49 GGGATCGACCTGAACAACAAACCGACAAGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAAACTCGTTTAGCAGCTAATTTGAGCGGCAAAACTTTTCCGATGGGCTGGTT:1 - chr2L 15290260 5' + R2-element 192 1 72.28 AAAATATGCAACGCTTTTAAACTAACTAAATGAATCATAACCGTTTTGAATATTCAACTCAGCTGGCAACAAGAAAAAAAACGAACACACAATTAAACACT:1 + chrX 5477973 5' + invader3 5029 1 70.30 ACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2R 18865893 5' - roo 360 2 75.00 CATGTCGCCCAGGGGGCGTGGCATGTGGCTGCTACCGAGCGCAGATACATATCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr2R 21937554 5' + 412 7072 2 58.33 AAACACTGTAGCGTTCGTGGTGGCCAGGAGGGGCTCCACAGGCACAAATGAAATATGTGGGCTAACAAAATGTATGGGCAGTTTGTAATTCCACGCATGGC:1 - chr2L 14932182 5' - BS 4744 1 79.21 CTGGACGAGATCATGAGCAGGGGATCTGGTTGCAATTAAAAGGACCCAATTTGTAGCTGGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCA:1 - chr3R 25815604 5' + flea 4560 1 81.32 CGCCTTGACATCCTGGCACACCCTTATCTACATACACACACAATTTTTGAGGCGGTCAAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAA:1 + chr3R 31996531 5' + mdg1 7327 2 61.39 CCAATGGTAGATCAAAATGCCCGTGGGACGATTACCGGCTGCAAATGGTACGTAAGGAACACAACCCTGCATAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTTGA:1 - chr3R 18020892 5' + BS3 1440 1 75.25 TCAGCATGGTAGTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGCGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 19535684 5' - hobo 2915 1 53.47 ATACACAGATCCCACGATACACGGACACCGCACACGCACACCGATGCGCGCCAAACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAAAAATATTCTTATATAAAGT:1 + chrX 19774352 5' - 1360 390 1 65.00 ATTAANACCAGGCAAACACAACAACAGAGGGCGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGA:1 + chr2L 12994000 5' - hobo 2630 1 51.49 TCTAACTAATTTAAGTTACACAAATGGCTTCGGTAACTATATACAATACAATATATAAATAGCACATTCACAAAAAATAAATATGTATGTAATATGTATGA:1 + chr2L 9675303 5' + Dm88 8 2 82.18 GAGGAAACCAGACATTTTACATGTCCAAAGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr2L 1353762 5' + I-element 49 1 75.25 TCCACAAAGCGGCGTTCGAAACTTCAACATGAAAATAGAAAGAATCGAAGGGGAGAAGAAATGTAAATTCCGATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 - chr2L 5152036 5' + I-element 3 1 75.25 CGCAAAAAGGCGAATGCAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3R 25814694 5' + 412 19 2 58.76 TTCCCCCAGATACTCGCACACACACACACACACACAGCAGCGTTGGACGACTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chr2R 12970948 5' - 412 479 2 63.37 CCTACNATGTGGCCGATATGCTGAAACAGTATTTCCGCGAGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCAATGAG:1 - chr3R 14394188 5' - Doc2-element 338 1 59.18 AGCAGCCACAAAATTTAGCTGCCGGCGGCAAAAGCACACATGTTAATCATACGCCATGTTGTCCGCACGGATGTCCATTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chrX 8817077 5' + jockey 4674 1 77.23 TGTAATATATAAGCACCACCAGCAGTATCCAGCCACGCAGTTCATCCGTTTGATCGCGATTGAGCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 3934005 5' + roo 8694 2 66.34 GAGTCGTCGTGGTGGTGGTGGTTGAGGTGGTGGTGCTCGGCGTAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTAG:1 + chrX 2885748 5' - HMS-Beagle2 83 2 55.45 AACAGGAGATTATTAATCCGCAGAGTATACATAATTCGTTGAAAAATATATAACAGGTAAATGGATGCGTTCCCCACCTTATTCTTGATCAGGATCACCAG:1 + chr2L 22082183 5' + INE-1 85 1 59.41 CTCCGATTGCAGCGTGCAACTTGCAACTAATTTGTCTGGCGAATCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTG:1 + chrX 22747910 5' + Doc 489 1 57.00 CGCCGCAACAATTTAAGGGTCAGTTTGGGGCATGTGACAAGCTCCATCAGCATTACAAGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTT:1 + chr3R 31293254 5' - hopper 497 1 67.33 CTGCTGCTGGCTTTGTATTTTGTTTATACATATTTGGTTATCGTAAATAGATTGACTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCTGATGGCCTTAACCCCGGCTTG:1 - chrX 2279057 5' + Gypsy12A_LTR 224 1 69.31 CATTAACAACATTAACGAGTTAACCGGGACATCCGCCAGTCTTCTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATAATAC:1 + chr2R 6168316 5' + Tc1-2 77 1 57.43 ATTTGAGTTCTGAACTCGTTTGCCTCGCTTTGAGCCTCGCCTTCTTCTATTTCTGTTGGTCTTCCCCGGACTACTTCGTTCTCGTCCGATTTGCCTGAAAT:1 - chr2R 17214729 5' - Bari1 1630 1 84.16 TCACCTGCTGCAGACTGCGACTGATGTTGGCCAGGAGGCAGGCATTGAAGCTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACG:1 - chrX 19249306 5' - Rt1b 4886 1 53.47 GTGAGCCTGTCCAGTGGCAGTACCACGACCACAAGCACAGATGCCACCACCACAACGACCACCGCCTCGTCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCC:1 + chr3L 11564793 5' - R1A1-element 160 1 74.26 CCTGCGACTGCGAGACGTGGGACACCAGGCCAGCTCCAATAGCCGAGTCGATCTAACCAAAGACACTAGGATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTC:1 + chrX 17230762 5' + 1360 23 1 64.36 GACAAGCAGGATCTTCCGCCGCCCTCTTTCGAGGCAGCCATTGCCGTGAGATTTGTCTTTCTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCCCTTGT:1 - chr2R 24137422 5' - flea 4561 1 69.31 TATCACAGGATAATAAAGCAATTACTTTCATATCTAAAACCTTAAGTAAAATCGAACAACTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTGTTTTTCCTTTTT:1 + chrY 3572624 5' - invader2 499 1 58.42 GACTGGTTTTAACTTGTTACTGCAGGCCGTCAATTGATCCCACGTCCTCGTCGGCCGCAATCGACCACATCAACGCCAACACACACACACATTTTCACACA:1 + chrX 10049867 5' + accord 7036 2 76.24 ATGAACACACCTTGTCGTCCTTGATGCACTGACCTGCGGCGCGGTATTCATGTGAGTCCTTCTTAGTCCTGTTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGA:1 + chr3L 20058172 5' - flea 156 1 76.24 CATTTCACAACCAAAACAAACAAACACAATTATATATACTCCATATGGTCGGAAACGCTTTCTATATCAACAAAATTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTT:1 - chr2R 14554445 5' - INE-1 247 1 70.30 GCGGATGCGTTGCGAGGCAGCGTTTAGCGGATCAAGTGGACCAAGTGGATCACTCATGGGTGCTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGA:1 - chr3L 8351073 5' - Quasimodo 224 2 57.43 GGAGACTATTGTCAATAAGATACAAAACGTACATAACAAACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGA:1 - chr3L 14108474 5' - X-element 4524 1 78.22 CGTTTTGGATTGTAATTGGGCGTGCAAGTGGAAAAGATAATAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCT:1 + chr2L 306057 5' + Tirant 8187 2 59.41 TGGCCNCCAACCTGAACCTGAGCGCCGCAATAGCTGCACCATGTTCAGACATCCGTGTGCACCAAAAACTTTAGAAGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 + chrX 20352088 5' - INE-1 579 1 62.38 TTCTGATTCTCTGCGTTCTTTATTTTTCGTGTTGCTCTTTTTACTGCGTTAATATTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAA:1 + chr3L 2833077 5' - 297 6853 2 57.43 TGTGTGTGTGTGGTGGCAATGCCAGTGATAACTGGAGTGAAGTGATCGGAGATCAGATCTGATCAGTTCAGTCAGATGGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCG:1 + chrX 18244950 5' - accord 110 2 83.17 TTTCGCTTACAAACAATTAAAACAAAACTACTGCTCGCATCTGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr2L 11576451 5' - roo 9039 1 64.36 CCAGCCTCAGGATTCGCCATATATGGCCAGGAGCCGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGCT:1 + chr3L 21802414 5' - G2 26 1 64.65 GCTGTTTCTGCACTTTCCCAGCTTCGTTTTTTGTTCGGTTTTGTAGAAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAA:1 + chr3R 6063319 5' + invader2 4897 2 65.35 CTAACGGCCAACTTTGAGGATTCCCTGAACGAGCTGTGGGAAAGCCTGATGGCTCAGGAGCTGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAG:1 - chr2L 9923428 5' + 1731 256 2 67.33 GTCATTTTCATTTTTTCACACACAAAACATAAAAATTGTTAGTGCTCATTAGTAGATACTTAATATATTCGAAGAATCATATCTATATTTATGTATTAACG:1 + chr2R 18252348 5' - diver2 442 1 76.24 AGTGANACCTATCGATATGAACGTGACCAAATCAGACGCTCACCACTGCATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGCTTTCGTACAGACATCTACTT:1 + chr3L 20816092 5' - invader1 149 2 51.49 TGCACAAGGTAATGCTGGAGGCGTAAGAGCGGGAGGAGGTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGT:1 - chr3L 17953645 5' - F-element 4422 1 61.39 TGGTCAAGAACGGATGTGTTGAAATTCATTCGACTTGAGCCTTAAATGCATTGCATTTAACTGTGCTTGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 5104588 5' - roo 398 1 68.32 AAATAATGTGAGTGTGTGTGTGTACAAACATTTTCGCTGTCTCTGTGCACACTCGCACAGAGACAGCGGAACTCACTCACACACACACACACACATGCACA:1 + chr2R 5850335 5' + accord 188 2 52.48 TTTCTTGATTTCGCTTTCTCAGGATTCACGCATTGATTTTTGATCCGTTTTCTTTTTTTTTGGCCGTGGCTCAATAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 - chrX 17999899 5' + 1360 72 1 64.89 TGATANCTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAATAACATAACAGCG:1 - chr3R 25796065 5' - BS 5049 1 60.40 GATAGCTGCTATCGATTACCACCAACGGATCATATGGTCTTAAATATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTAGAAAACCTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAA:1 - chr2R 20065884 5' + Doc3-element 4682 1 56.44 TCACTTCCACTTGACTTACGAGTTGGCTGAGTTTTTCACAGGGATGCAAGCCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTC:1 + chrX 660134 5' + Cr1a 3987 1 60.40 GCAGGCCCTGCAATCAGCTCGCGATGACGCCGGCGTGCCCAAGTCTTGGGTGACCCTCACCGCCCCGATGACCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCG:1 - chr3R 15532434 5' + accord 6991 2 76.24 GGGGCCTGAGTCTGCGTCTGTTGGGGCTGTCGATGCTGGGCGTCTTGCTGCTGTGCATGTGGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGT:1 - chr3R 4438208 5' - 1360 3219 1 66.00 TAGTGGGCTACATATATATTTGGCAAGCGACCCCGGCATGTCCCGAAAAAGGAACCACTCTGGTAGAAACCGCTTGGACAACAGTGAAACCATCAGAC:1 - chr2L 18107196 5' + G-element 4144 1 73.47 AGTAGTTTATTGGGCCACTCGCGGAGGCGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCC:1 + chr3L 8263884 5' - Porto1 372 1 72.28 TAAAAGGTATCTGATAGTCGAGGATCTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTT:1 + chrX 19551965 5' + R1A1-element 5096 1 74.26 CGTCGCATCGTCGGCGGTTTTGCTAAGCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCTCTGGCTGCTCCGTGGAGTCCGGGG:1 - chr3L 14035440 5' - Gypsy6A_LTR 319 1 68.97 GAAAGCAAAACACAGCGAGTGGGGGTAATGAAATTGGAATATATAGCAACACATGAATGGTTATTAAAATAATACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGTG:1 + chr3R 30217414 5' + Doc3-element 93 2 57.43 TAAATTTGGTCAATGGTTTGGGCACATACATTCGGGAATACACTTTTGATGTTTTTCGGAAAAGACTAAATTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCC:1 - chr3L 13756461 5' + diver2 4788 2 57.43 GAAACNAAAATATGGGGAAAAATAAACCAACAATAAGGAAAACCAAATTAATCACAAATATTACTTGTGCTTGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 - chr3R 8480508 5' + transib2 2 1 76.24 ACATGTGCCGCAGCGTTGACCTGCAGGATTTGCGTGGCCGCTCTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTA:1 + chr3L 15099868 5' - Tirant 8477 2 56.44 CTGCAGCTGGTGGTGATGACTGTGGTGTGTCTCCACCCTGTGGCTCTCTCTGCTTTGGCCAGGCTGCATCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCT:1 - chr2L 12241391 5' - invader3 482 1 76.24 TTTTTTGTTACGACTTAGTGGTAATCATATGTATAATAAACTTGTCTACCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGT:1 - chr2L 8253651 5' - HMS-Beagle 6663 1 59.00 TAGAAACAGCAGCAGAATTGCGCGTGCCGCAGATAAGTTGCCACACCTACAAACTTACCAAACCTGTCACGCTCGTGCTTTTGAAAAATGTTTTGATCTTT:1 - chr3R 29321411 5' + INE-1 265 1 61.39 GAATTTGATTAGTTTTTGCCACATTTCCCGCAGTGTTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCGTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAACAGGTTGCCGT:1 - chr2R 22363813 5' - I-element 374 1 65.35 TGGGAGTTGGAAAATGAGAGTGAGCGATTCTAATGCGCTCACTCTCATTTTCCGACTCCCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 - chr2R 10555340 5' + blood 7177 2 71.95 TTTTATTTGCAGTGCGTTTTCATAGGCAGCGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGA:1 + chr3R 25920360 5' - I-element 311 1 73.27 TAGTCCTGATTTCTTAGCTCATGGATGTTGCTCTTGCTGCGTTGCTGCGGATTTTGCGGATTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTTAGTTGCAGTACTAGGT:1 + chrX 7714230 5' + accord2 7604 2 66.34 TAACTGCCGCTTTGGTTAACATTCTTATAATTTTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGAT:1 - chr3L 16476711 5' + HMS-Beagle2 109 2 74.26 TCACGTATTAGTTGTACACTACTTAACAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr3R 10207945 5' - hopper 150 16 75.56 GGCAATTAAATGATTGGCAGTGATCATGAAATTTGATAGCAACTATGCCAGCGCACTCGAAACAGACAAACCGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 2090200 5' + roo 5 2 70.30 TCTATGAGCTAAGTGTATCCGTATTCGTAGTCCTAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCGGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAAC:1 - chr2R 15962951 5' - Cr1a 4174 1 66.34 CGGGGCAAAACCACTGGACTCGCAAAGGACCGATATGGATTCCAGTATAGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2R 20791744 5' + roo 27 2 54.46 GCGCGGCTAGTGGTTCTTACGGTCATATTTAATGGCTTACCATTTGGGCAGAACATTCAAGGGTTTTATGAATGTCCTTATATGTTTTTCCTTCCTTTCTT:1 - chr4 51591 5' - HB 404 1 72.28 TTATGGATTTGGTTTTGGAAAAATATTTTAGATAAGCTAATAGATTTGGCTAGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTA:1 - chr3L 23611440 5' - flea 4590 1 56.44 CAAAGACACATGGACCGAGATACCGAGATAAGGATACAAAGTTTTCTTGCAGATCAAAAATGTGACTAACTTAAGCTTTGGCTGTACTCACGCCATACGAT:1 + chr2L 8560426 5' - 3S18 207 2 60.40 TGATCTGTGTACATAAGGGGCAGTGGGGTAAACATATATGTAAATGATTAAAAGGGTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTAGA:1 + chrX 6372184 5' + G2 3057 1 61.39 GCTTGGAATGCAGTTGTGGGTTTGCTGTAATGGTGGTAAGTCGTGTACTGTAAGATTGGAAGAGTAGTTGATGTTTCACTACAAAAAGACTAGGCAATCGC:1 + chr3L 17870464 5' - jockey2 23 1 68.32 GAAAGTTCAGTGACCAAAATTTGTGCAGCAGCCAAACGGCAAACGCAACCCCTGAAACTCAGACGGCGTCTAACGTCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr3L 11696482 5' + blood 7013 2 77.23 TCGGAATCCGCAGATCCACACTTTCCCACCCCATGGCAAAGTGTGGCAGTTGGAGAAATTGGGGAAAGGAGGTTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATC:1 - chr2R 15725290 5' - Idefix 136 2 74.75 CCTGGTCTAGGCAATTTGATTGAGTTGTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGG:1 + chr3R 9936190 5' - F-element 4516 1 73.27 ATTATTGGGAAAGCTAACAAAGATTTTTATGTCTGGTTTAAATGATTTTCCCATTGCACTATGGTCCAGAATTGGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 - chr3R 10490416 5' - transib2 2800 1 55.45 AAGACAGGAACCGTGCACAGCCAATAACTCTAGTCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTG:1 + chr3R 7426231 5' - BS 4845 1 66.34 AATTGCTAAATGCGAAATTATGCCTCAAAAGGAATGAGTAACAAAAATACTTATGGCTTTACCATTAAACACATGGATTTTGCAAAAATACTCGGGTGGTC:1 - chrX 21974921 5' + hobo 275 1 78.22 GCTATATTTAAAGTTACTTTTCTGATGCGTAAATCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chr3R 7879837 5' + 1360 45 1 70.30 ACAAATTCACTTTAAAAGAAAAAATGTGGTATATCAAGAGAAAAACTTTTTTTTTTATTAACGAAATTATTTTATTTAAT:1 - chrX 16727150 5' - jockey2 3383 1 86.25 GTCAAGTGGCAGACGGAATTAATGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGT:1 - chrX 2253882 5' - Tirant 349 2 79.21 TAAGCGGCTAGTTTAATATGCTGCGGCCCATAGATCTGAATAAACGAACTGAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chr2R 22287441 5' + flea 4777 2 49.50 TTTTATACGATTTGGAAAAAGGCGTGACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 + chr3R 15153047 5' - hopper2 1560 1 69.31 CCCTGCATTTGGAGCAGCGACTATATATGTACATACATATGTATATATGTATAATGCAAATATTTGTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTAGCCAATGTT:1 + chr3R 26104270 5' - invader2 4708 1 74.26 ACAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 + chr2R 18891027 5' - opus 487 2 60.40 GATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGTAATACGACAA:1 - chrX 21667934 5' + gypsy2 6515 2 59.41 TAGTACTATTGATGGGAACAGAATGCCCCGAAGAACAGTTAAAACGGGTAATAAAGCAAATAGAACGCTATAGTCGATTTTCTCGACTATCAGATACCCAT:1 - chrX 12247599 5' - INE-1 554 1 57.43 CATCGGCGGCGAGAACGACATTATGGATAGCATCTACAGCGGAGCTGATGGAGTCGTCAGACTCGTCAGTCGTGAACGACAACGGCCTATCTAGGACAATG:1 + chr3R 6249302 5' + aurora-element 3959 1 69.31 ACACTCAGGCGCCTGTCGTGCACTAGGCGGAACACGCGGGTCAGCATTTTGCTATTCACTTGGTTTCTATTGTGTTTATCTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTT:1 - chr3L 1351211 5' - Doc2-element 218 1 53.47 CGAATTTCAGTTTTAAATCCCCGTCATTAAACAAACCCACCTCATCCCATCTCAAAATCCTCTGGCAAGAAAAATTATTCGAGTATGCAACCAAAGCCGAC:1 - chr3R 14083373 5' + Doc3-element 4555 1 53.47 GGCGGCAGTAGTAGTTGCGATGGTTTCCCTAGCGAAGCCGGGAGAAGCCACCTTTGGCAAGCTTAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCG:1 + chrX 17203215 5' - Doc2-element 4597 1 69.31 CGTCTTGAAATTGTGGTTAACTGTTTGGGTAGCTCTCGCTTTTCGACTTTTGGAAATTTTTATTTTGAAGAGGTGGGCTAACGAAATTAGTTGTATTTCA:1 + chr2L 7007686 5' - FB 441 1 49.00 TAACATTTGAAATGACTTCATACGAAAATAATTGCACGAACGGAAAGAGATCAAGCGGCGTGTCTGCGGAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATG:1 - chrX 22518560 5' + 1360 3355 1 79.21 ACAACAAAATGGGATACCAAGATGGGATATAAACATAAAAACATAACACGCCGTCCGTGCAACCTACGAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCA:1 - chr2R 5064636 5' + Tirant 8472 2 71.29 TCACGCCCCACATTCCCCTCCAACTTTTTGGCAATAAACTTTATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTA:1 - chrX 10554998 5' + Tirant 312 2 67.33 TTTAGCAGTTTGTCGTCCCAATCCCAACTTCTTCGCTTGAACAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATG:1 + chrX 19569584 5' + 412 99 2 59.41 AAAGATATTTCGACTAAGATAAGGGCTTTTACGAAAGGGTTAGCTCCAAGAAGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGTTTGATAAAACCGTGCTGACACGGTGAT:1 + chr2R 15101483 5' - Q-element 198 2 69.31 AAGGTGAGACCCGGCTTCCAAGTGCATTAAGCGCATGTGAACGGGTGCCAAACAACAACGCCGACGTCGCCGAAATCGGTAACCATATCATTTTACCGTAA:1 - chr2R 23288869 5' + Helitron 69 1 54.46 TTCTGCGTAGGATTCCCTGTTCTTGCGCCCACTCCACGGACTCACTACAGCGGTCGAGAGATTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr3L 420986 5' + 1360 12 1 62.38 AACGGAGATGGGTACTGTCGACTTTGATGATGATGATGGTTAGGGGGCAGGAAGGAATACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAG:1 - chr3R 26502777 5' - R1A1-element 42 1 45.54 CGTAGCAAATCTACTCTATGGCTATGGCTTTCGGGTGGCATAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTAA:1 - chr2L 22076064 5' + invader2 5017 2 74.26 ATAGAACACATTGATGATGTCGATCGAAAATAGCATAAAAACGTGCTGAATATCAGTGTAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCT:1 - chr3L 8525986 5' - accord 7363 2 68.32 ATGGCCTTTTAAGCATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTA:1 - chr3L 12150457 5' - Transpac 4755 1 79.71 CATTTCGAAACATCCGAATTGAGACTTGTTTGCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCA:1 + chr3R 8923750 5' - hobo 379 1 68.32 GTGATGGTGTGCGGGTGTATGTGTGAGTGCGGTACATGTCAGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr3R 19535695 5' - hobo 2904 1 57.43 GACAGCTGGTCAGTTTTACACAGCAAAACGAAGTTTAAGCTTGGAGTAATCACTAAAAATTGAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chr2R 11540176 5' + Transpac 12 2 60.40 GCAAATGCGCTCTTAGCGGTTCTCTTGCGCTCTTTTGGGCCATCTCGCCCAGAGCACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2R 11115858 5' - hobo 2908 1 50.50 CTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 23068848 5' - 1360 3366 1 55.45 GAATAAAGAGGCTGGAGTTCAATAAATATACCATCGCTCTTTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr3L 21908954 5' - roo 9041 1 57.73 AATTGACGCTCTTTCACAGAATAATATTTGCCAAAGCAAAGGAAATTGCGGTGTGGGCAAAAATGTTGCTGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 + chr3R 25937974 5' - blood 306 2 77.23 CAAACAACATTTGAGGAGTCAAAAACCACGCATTAAATTTTTGTTATTAAATATTTAATAATGCGTGGGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGT:1 - chr2L 12855020 5' - GATE 75 2 71.00 CAGAAGCGAGAAAAGGAGCGTGAAAAGGAGGAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAAGACC:1 - chr2R 17524455 5' + X-element 4331 1 67.00 GATACGCGTCTACGACAACTTAAGCTTATTCGTAGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGTTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAA:1 - chr2R 24709481 5' + Cr1a 4109 1 78.00 CCTCATATAAAATAAACGTAACTGCTTACAAAATTTAAAAACTTATCATACTTTCAGAGAATTTGTGGGTTCACCGACTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2R 21266398 5' + roo 2 2 77.23 TCATTTGGTATAGGAATTGGAGAACAAGAGTTTATAACAGTGGAAGATAAACATGAGAAATATGTGAGAACAATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTT:1 - chr2L 12190768 5' - INE-1 246 1 80.20 CAGCTCCACCAACTCCCTGGACAGCCCCTCCCAGGGCGGAGCCAGCACACACCACCGCTACTACCCATCACTATCCTCCCTTTTTAAAGAAATTACGTAAT:1 + chr3R 25981102 5' - Stalker4 6930 2 64.36 AGCTGATTCTACCATCAGCTTCTACAGAAGCAATCGATATCTAACCAAGCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTG:1 + chr3R 15371881 5' - Bari1 225 1 56.44 ACTTCTCCCGCTCTCTCACGTGTTCGCCTATCACTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTT:1 - chr3L 20509773 5' + blood 226 2 72.45 AGCAAGTGACAAACAGACATACATCTCACCCGAATCACCTACAGGACGCACGAAACCCCAAATCGAAGATGCACAGCCTGCATAAATAAATAAATAAATAA:1 + chr3L 14942747 5' + Juan 4213 1 63.37 CATTTCTAAAAACACATGTAATGTAATAATATAAAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCT:1 - chrX 13943282 5' + I-element 267 1 66.34 ATAATNTCTGGTGTTGCTATCTTATTTTGGCCAGGCTATTGTGCTTAATTTGCCTTAAAAGGATAAAGGAGCTAGTATACAAAATCGAAGGAAGCAAATTA:1 - chr3R 26411861 5' - Gypsy12A_LTR 2063 1 67.33 CAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCT:1 + chr2R 22525780 5' + jockey 177 1 51.49 CTTCCCTCTCTTCTGACACACCGAGATCCACTTGAGCTGAGCAGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTT:1 - chr3R 10106436 5' - opus 100 2 63.37 CTTGACGCGTCCCTGCTTGACCAAATCTGCCAAGTGGGAATGGCAGATGAATAATGGAGATTGGATGCCTATGAAGCCTCTTTATGTACCGATCGCTGCAC:1 + chr2R 4932826 5' - G7 953 1 68.32 ATAGANTCCATCGTTATATAACGGAGGGTATGCACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3R 11685579 5' - mdg1 378 2 66.34 ACCTAGCCAATATGGCTGCAATAGCGCCCTAACCTTCTCCGCCATATTCCAACCCTTTTCTGGGGGGTTTGGGGGCTCCACCCCTCCCTCTAAACCACCAC:1 + chr3L 5126338 5' + ZAM 7991 2 79.21 TAGTTTCGATTATTCCATGATGCCTTCAGACCAAAGCCACTTCGCCTTCAATTTACACACTTTTTCTCTAATTGAAACATTAAGATTATTAGTATTATTGT:1 + chr3R 20305561 5' - mdg1 35 2 28.71 CACATTTCAAGCGTTTTATTCGTCCTGATTTCACTTTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGACGCGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCT:2 + chr2L 15021014 5' - Stalker3T 214 1 81.19 CCCGAGTCCTTTGTCCCCATTTTCTTTGCGCCCTGTAAGCGATATTGTAAATTTCTTTATATCCATTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCC:1 + chrX 9961495 5' - invader2 278 1 66.67 ATACAACATAAAACCATTCACTCAGCGCCAGTGGAGCTCCAAAGGAAACGTGTATTTCTTCCTGCGCACCGTGATTGGCTCAGCCGGCGAACCTTACGGTA:1 - chr3L 9461185 5' + G-element 134 1 44.55 CTTCTGCTGTACATACCATAATCGATGGATTAATTACTTCTAAGTGGTTGTTGGTGTTGTCTTCTTACTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCA:1 + chr2R 6759902 5' - R2-element 499 1 76.24 AGGGGTGGCTGCGAACAGCAGGCGGCAAAGTGTCATGCGCAGGGATATTTATGCGCTATAACGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAGAA:1 + chr3R 6864197 5' + R1A1-element 207 1 68.32 TTACTGTGCACGAAAAAGGCTTTCTTCGACTTGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGTGTACCTGAAAGTAAATCAATTAAACAATGTTAGTTTTAAATCTCA:1 - chr3L 20023375 5' + TAHRE 10144 1 73.27 TTGCGCCCGAACCACACACACACAAACACACACACAAATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTA:1 - chr3L 10299279 5' + 1360 3273 1 74.26 CAGTTCAGTTTTGAAGGGCTATGAGCTGTTATCATTGAATTGGTTGGCTAGCCTTAAGGGCAGTCAACAACGGAGAGAGGTTCTCCCACCATATCTCCCAA:1 + chr2R 19198593 5' + springer 7402 2 74.26 ATAATGAATTTCCCATTTCAACGCACTCTCTTTATGCTCGCTACGCTACAAAAGTCGAGCATTCGGCCCGGCCATGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCT:1 - chr3R 5777848 5' + INE-1 133 1 70.30 AATATTTCGGCTGACCTGTAAGTACCACTAAAATCTTAAAGATTGGAAAATAAATATTTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 15390401 5' + gypsy7 5006 13 76.25 ACGGACGTGGCGCACTCGAGCATTGTTCGTCTCGCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATC:1 - chr3L 4737231 5' + F-element 448 1 59.52 AGTACGGCTTAGATAAGTTATTGAGATTAACCTATTGATGGCCAATCAATATTAAAATGTAATGATGAACTTCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3L 11610439 5' - 412 471 2 54.46 CTCAGGGGACAGGTGGACAAGGTAACTAATCTATATATATGATTAATAATAGTCTCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGAT:1 + chr2L 952122 5' + 1360 250 1 57.43 CCCTTCTATGCTAAGGTGTAACGGATATGAATACCTATAATGGTGTCCATTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGT:1 + chrX 13550642 5' - BS 4816 1 56.44 AAAATGCAGCTAAGGATGCTTTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3L 947908 5' + hobo 34 1 70.37 GTTTCAATGTCACAAGATGAAGTGCAGCCACTCGAGGGATGAGATTTTCCATCATAAAAAACAAAAAA:1 + chr2R 11808771 5' - hobo 385 1 86.76 CGCCCATAAACAATGTTACATTTGGCAGCCTATGATTCAAAATATATGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGC:1 + chr2R 6726611 5' + mdg1 7287 2 55.45 TCTTATCAATCCTGAATACACAATATATGTACAGTGATATACCTCTGTATACCCAGCACCTATGTAATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACA:1 - chr2R 22803330 5' + S-element 3 2 71.29 AATTGAAATAATATGCAGGGGACAGCATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAAT:1 - chr3L 3476213 5' - Idefix 7346 2 74.00 GGCGGCCATTTTTGCGAAGGAGCTCTGCAAACTTTGCAGAAAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCAAGAGAATAGGTGAACAGTGCAGTTTATGTGTATGCAAA:1 - chr3R 17557844 5' - Cr1a 264 1 59.41 TTTCATTTGTCTCTGCTGTAGGATATTTTTGATTTGCTGCTGGTTTTGTGGTTGCTGCTGCAGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGC:1 + chr3L 14027305 5' - gypsy7 264 1 66.34 AAAGTCAACTATTTCGAACGAAATCGAGATCACAGATATATCCGAACTCTTGAGTTGTTGTCGTGTTTTGGGGCCCCTTTTTGCAACCTTATTCTTTAAGT:1 - chr3L 2551634 5' - S-element 1266 1 52.48 AAAGGCGCCAAGTTCGCCGATCGGAGGCCAAAACGAACATACAATGGGCAAAAGATATGACTTCACCGTCAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAGCTGACGT:1 + chr2L 7524494 5' - transib2 451 1 63.37 CGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2R 981623 5' + 1360 1 2 67.33 GTTTGGATCCAAACTCATTCGATCGTTTCGACATATTTTCTACATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGT:1 + chr2L 5496238 5' - Tirant 8253 2 57.43 TTGGGATTTTCTTCATTTCCTTCGCAAACATTTGTCAGATAATTTGGCATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 + chrX 2874799 5' + 1360 27 1 57.43 TATAGTTTTGAAAATGTTTTCAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAATAC:1 - chr2R 8092612 5' + Porto1 4242 1 78.79 GCAAATCGATGTGAAAAATCCGCAAAATTTCAATCATTTGGTTGAATACGATTTGCACGAGAGAGAATGCTATTGTCGAGTGCCCCGACTATCAGATACC:1 + chr3L 10484998 5' - INE-1 557 1 63.00 CATTTAATGACAAAAACCTTACACGTATGTTCTCTAGATGAGAAGAATTCTAACACCTGATCAACAGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGATATGCA:1 - chr3L 25264260 5' + Burdock 5966 1 68.32 CAATTATGCCAGCTGCCCCCTCTGCCCCACCATCCCCCCCCCATAATTCCGTATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCCCTGTA:1 - chrX 9389269 5' - Dm88 362 1 57.45 TGTTATAACCGAAATTGTGATGATTTTGAACAAGACAAGAGGCGGTCTTTTCGCTCCGCGAGAGCAAAAGCTTGTTTTTCGAGTTAGTTGAAGGTAAGGGT:1 - chr3L 25116125 5' - Doc 329 1 63.37 GCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTG:1 - chr2R 22774486 5' + BS 47 1 72.28 TTTGGCCCAAGTCTGTGGGATTGCCACTCGTTTCGTTCGTGATGGTGTCAATGTCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr2L 5932102 5' + jockey 32 1 51.49 TATATGACTCTATCCTATGGCTCGGGTACCGTTTTGGCCAACATGCAAGTGGCCTACTGAGTTACCCTGCAAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 13566786 5' + G2 3074 2 67.05 CCACCGCCGCCTCCCTGAAGATTGAGTGGGTACTGCGGTGGTGGAGTTGGCTTCATGGTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 18865924 5' - roo 9054 2 59.41 CTGCAGCCGCTGCTGAATGTATCGCTGCGCGGCTTTGTGGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGAAAGCAG:1 + chrX 1347655 5' + R1A1-element 404 1 59.41 GAGTGGCACGCTGTCGCGTTATCATAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2L 6177181 5' + pogo 46 1 76.24 GAAAAGCTTGGGCTTTTAATGATTCTTCGCGGTGCCTCTTTCTTTTGTCGAACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr2R 11730859 5' + blood 25 2 54.46 GGAAATGCGAAATGCGTTTGCCAAAAATGCCGACCGACTCATAAAATGCAATGCTGGAATAAAAACAAAAACAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATC:1 - chrX 12395487 5' + Porto1 278 1 68.32 TTTGGCGTCTCCTCCACCTTGCCAGCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCACGTCAATGGTTT:1 + chr2L 22129452 5' - HMS-Beagle2 6770 1 75.25 GATCTNCTCAAGAATGCTGTGGTGCCCGAGAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAATCATGGTTAGAGG:1 + chrX 21389484 5' - R1A1-element 4886 1 70.00 AATTAAATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGGGAGTACGTTGTAGTCGATTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTGGG:1 + chr2L 18177048 5' - INE-1 539 1 59.60 CTTAGCAATGGTAACACGTTGGCCATGATCAGGCAGATACGGGTTAACAATAACAACAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCA:1 + chr3R 13268674 5' + F-element 4436 1 63.37 CAGCCNAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chrX 1399913 5' + P-element 46 1 32.67 TTGGATCGCCGACAGATGATGTTAATCAGAGCGTCCTCATCTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACA:1 + chrX 16418922 5' - Cr1a 3980 1 59.41 CATTCATTTATTGTTTTCCTTAGCGATTGTATTCAGCAAAGGGTGTTTGTGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAG:1 - chr3R 11091987 5' - hopper 946 1 54.46 ATTCCATCCTTTAATAGAATGCTAGATAACAAAAATGACATTGATGCAATAACACGGTATAACCAAAGACACTAGAATAATTTGGCCGTCACCAAAAAAGT:1 + chr2L 17432009 5' + 1360 3328 1 64.36 GTGTGTGTGTGTTAGCCAACTGATTAATCTTGTGCATCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTAT:1 - chr3R 11477431 5' - I-element 313 1 63.37 GCTATGAGCAATCTAAAGGCGAGCCGAAAGTTAATAGCTGATGGGATGATGCAATCAGCAAACAATTCCGCCCACTCCACTTCATGGTCCTTCGAGCCGGA:1 - chr2R 7662961 5' + Max-element 317 1 62.38 TATTCATTCTCAGCCCCATCCACCAATCCACCCACTCACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAAT:1 + chr3R 17969763 5' - invader4 2631 1 63.37 AAAAGGGTTGTGCTGTAGTCGCAGCAGATCCCGTGACCTCGTAAAGCGACTGAGTAGATTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAA:1 - chr2R 9798050 5' + accord2 81 2 54.46 CCAAACCATGTTTTAGTATAAAATAATTTGCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCACAATAAACACACCCTCAACTCTCTCGCTCACAGC:1 - chr3L 10570221 5' + Porto1 473 1 71.29 CCTAATTTTGACACATCCATCAAATGCTTGAGCACAGTGAGCATTATAAAATAAGATTTTTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTT:1 - chrX 13819366 5' - gypsy4 453 1 65.35 CATTGNTGTATGAGACTCCCAAAAGTTGGATCAACATCTCGTTCGGCGATTCCAGTTTCGAGGCACTGACGCGACACGACCCCAATCAAGTCCAAGTCACA:1 - chr3R 6457410 5' - invader4 2697 1 49.50 TCCACATTTGGACCCCACTCTCCACTTGATTTGGCTTATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATT:1 - chr3R 20765439 5' + S-element 399 1 70.30 TATACAAGGGCCATTCGAAAACTAGTCGGCGCATCTTCATTCACATCGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATG:1 + chrX 11846126 5' - McClintock 116 2 54.46 TTTCAATTAAATCCCCCCTCTCTCACGCGTCTAATTGAATTGAACGAAAATTGAATTGAGTATGGGGACAGCTACGCCTATTAAGCGTAAATGTGACATGT:1 + chrX 14575206 5' - Doc4-element 2346 1 68.32 TGTATAGCTAGTTTCCACCGATCAAGTAGTCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chrX 17947360 5' + hobo 47 1 69.31 TGCAGGAAAGAATGCAAAGGTTGGTAGTTTATCGGCCAGGACAAGGACAAAGCAAACGAAATGGGAAAGGTATTTTTCCATTCCCCTTTTCGGAATCG:1 + chr2L 7179001 5' + HB 63 1 71.43 TTTTTGTTGCGTCAATTAGGTTCATAGATCTAATAAATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGC:1 + chr3R 11719065 5' - Tc1 1446 1 75.25 TGTACCATGTTTAAGGTAGAAGTACGAATATTGTCATATCTGTGTTACAAAGTAAGACCTTTATTAAATTACATTGATGGGACAAACACAAAATGTGCTTA:1 - chr3L 27353410 5' + Tc1 1617 1 58.42 GAAAGTTCGTATCGAACCCAAGCGCTGACCTTTTCGATTTTCCAGCAATTGCGAGTTGCTAGCAAGTGTAAAGTGTAAAGAAATAGATTGATGGAAGGCAA:1 - chrX 10319489 5' - Gypsy12A_LTR 2246 1 68.32 AGAGTCATAGATGTAACTAAAATACTGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 2539311 5' - roo 361 2 71.29 TTTGGGCCAACTTGAGCCGCATTTACATGGGATTTTCACGGCGGGCACAAGGGGGGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGGTATT:1 + chr3L 19252011 5' - F-element 320 1 65.43 ACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 17495765 5' + opus 7043 4 77.23 TCAACCATTTTCGGCCATGAGCGCCAAATGAAATATCCCACTGTGGACAGCCATCAAAAAACGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGA:1 + chr3L 11188130 5' + accord2 66 2 56.44 GATTTTCTTCCCTAGACGCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr3L 14364933 5' + blood 10 2 67.33 TAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 19450155 5' + roo 8688 2 80.20 ACGCAGCTAAGTTGGTTTTTAAAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTC:1 + chr3R 20536658 5' - 297 6827 2 83.17 ACTCCAACTCGCAGAGTGTTTAAAATAAAACCTGTATACCAGTTAGGTTGCCTGTCCTGAGATTGGCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 - chr3R 22237766 5' - transib2 2816 1 54.46 AAACAAAACAAAGCGGCGTACTAACAATTCATATAATTTATAATAATCATTCGAATTTCGTAGCATTAAATACGTATATAAATTATCATTTTAGTGGATTT:1 + chrX 12801416 5' - Burdock 255 1 72.28 GCTTTGCAATGCAGACGTAAATAATACAATAGACACCTTCAGTTCGCACAGCCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 12843408 5' + roo 8687 2 54.46 AACTTATGTGGCGGACGAGGAGACGAGACGGTACAAGACGATGGAGCCAGGAGCGAGACGAATAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 27448471 5' - roo 394 1 64.36 TCCGAATGTGACGACTGTCCCCACACATTATAGTTTCGTTGCGGCGGACCGCAAAATACACAATTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAA:1 - chrX 4326953 5' + FB 12 1 67.00 TGGATCTGCTGCCTCCACCGTCTGTCGATTCCATCTGCTCTGCAGCTATGGCTATGGCCATAGTCAAAGTCAAAGCTATGTTTGCGCGCAGAACGCCGTGG:1 + chr2R 24276512 5' - mariner2 395 1 76.24 ATCTTACACTGAGAAAAAAAATATTTGCATTTCCACTTCCCTGTTGAATCAATAAGACACTTTTATTAATCCTAAATTTCAATGTTTTTTGTAAATTA:1 - chrX 15128567 5' + HeT-A 5796 1 50.00 ATTCAGTTATATCAAGACGTGCACTTGGAATAAATAAGCACTAAATGAACGCATAAAACGTGGGTCGAGGGAAACAGATACACACACACACACACACATA:1 - chr3R 6939914 5' + Quasimodo 38 2 80.00 CATATGTGTTTATATTATATTAAGTCGATACTTGTAAGGTATAAATACCCTGGCTTTTAATTTGTAATTTATCCTCCAGTTTAGATCGTCTTTTTAATTAA:1 - chr2R 18199016 5' - TAHRE 355 1 66.34 ATATCNAGGTAAATATTTCACAAGTGACCGATTTTTGAATACTATTTGAGATGAGGATTTTTGACACTTGTTTTGGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTT:1 + chr3L 21637305 5' - Bari1 1707 1 74.26 GGGAGAAGGATAATCAACCATTCAAGTGTGGGGAACAGCCTCTAAGACTCAGCTCAATAGGCTCAATAGTAATACAATCGCACGACATGCATCTGGGATAC:1 + chr2R 10962768 5' + G5A 2506 1 82.18 GGCATACCCGGCGTATACGCAATGTTTAACCACATATGCATTACACACACGCCATGTTGAACAACCAATTTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chr2R 8198553 5' + F-element 17 1 71.29 AAAGGAGCGCGGTTGAGTGTTGGCCAGGAATCAGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACG:1 - chr2L 21779328 5' + jockey 485 1 77.23 CCATTCCCTTCCGCTTCCTTGCTGCTGGCTAACACCACTTCACCATACCACCCAGATTGACTTTCGCGTGCGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGCATCT:1 + chr3L 22937699 5' + INE-1 542 1 64.36 TGCCGCGGGCGAGAACCAAACATTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 + chr3R 9833065 5' + Tabor 55 2 77.23 AATTTATGCAAGTTTGCTTCGACGACAACAACTGTATTAAAGGATGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGC:1 + chr3R 1025085 5' - jockey 385 1 55.45 TGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGT:2 - chr2R 4879042 5' + G-element 14 1 68.32 GCACAATAAAGCAGCACTAAGGCAGCTCGGCAACAACTACAAATGCAAACAGAACAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTG:1 - chr3L 10550184 5' + 1360 161 1 61.39 AAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCCCCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chrX 10555435 5' + Tirant 21 2 62.69 TACCAGTTTTTAAATTTAACAATGATCTTACGAGCGCTACATCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTGCACACGTAT:1 + chr2R 3492802 5' + 1360 172 1 67.33 GTGTTTAACCTCATATCAAATGTATGTACATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATT:1 + chr3R 5775689 5' + invader4 50 2 76.24 GAAGAATACAGAGTGGCACGCTGTCGCGTTATCATAAGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr2L 6177171 5' + pogo 36 1 66.34 ACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGGGGTACCTGATAACCATACAAGAGAGAGAACGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACT:1 + chr4 836079 5' - INE-1 550 1 48.51 CGTCTTTTTCGCCAACCTTTTTTATGTCTTTGCTATTTTTCCTATTTTGGCAAAGTGTCACAATGTATTTACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTTT:1 + chr3L 6841253 5' - Stalker4 31 4 54.46 CCGGAGTCCAGCACCAAACTACGCCGATCGGTGGCCACCAGCACACCGGCTTTGGTAGTAAGGATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGT:1 - chr3L 15855963 5' + G2 218 1 57.43 CTCCGCAACTTTCCTAGAACCTACTTATCATAACTAGCGCAGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACT:1 - chr3L 27414389 5' + HMS-Beagle 451 1 59.41 TTAAATGTTTATTTAGTTGTTTATTTGTTTGCTATTTCCTGAATCTTGTCTCCAATTTGTGTCACATTCAGATCGCGTTCGATATCTCTGATCCCCATGT:1 - chr2R 22966128 5' - jockey2 3007 1 68.00 GTCGGTGAGATAGTCAGCTGTTCAGCCGAACCAGTTAGCTCTGCTGGCGTAGGAGATGATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACG:1 + chr4 853618 5' - 1360 3242 1 63.04 AGCTCCAGGTGATGAATAGAGGGACGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAA:1 - chr3R 31639008 5' - invader4 2694 1 76.24 CGTCATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCC:1 - chr2R 3760476 5' + accord 33 2 57.43 TTTATNTCCAATTTGCATTTTTGTTTGCATATTGCATTTCACATTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCC:1 - chr2R 6711318 5' + Doc 374 1 60.40 CCCGACTGAACTTCTTGTAGGTGGGTGTGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAA:1 + chr3L 18685318 5' - F-element 4400 1 79.21 AAGTAAAAGCTTCCATTGTTTTTACTGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 + chr2L 18578959 5' + jockey 87 1 74.26 GGATCTTGCAAAGTAACTTGGGCGCGTCGAGCAAGAGGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCTCGACACAGTTCAGTCGCCATCATGCGTTGAAATAGTGAGGT:1 + chr2R 5181331 5' + mariner2 132 1 69.31 AGCCGGGAGATAGGCAGATGGGGCCGAATGGGGGCCACCTTTGGAAACGCAGGTAGCTCCGTGTACTGGATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCC:1 - chrX 17123727 5' - G2 456 1 57.43 TCTAATTACTCAACTGAATCGGAAGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTT:1 + chr3R 24351361 5' - Quasimodo 283 2 73.33 GGTCTTTTCTTACCAAGCGTCAGACAAGTCAACTCAAACTTAACCCAACACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAA:1 - chr3L 10015053 5' + ZAM 75 2 55.00 TCTGCNGCAGTGGTCGGCCGCATTGGCAGTTTTTGGGTCTATGGTTCATGGATCCCACGAGTTGCAGAGAAATAAACGGTCCATCCTGGCAGAGATCCGCA:1 - chr3L 19231693 5' - baggins 346 1 70.30 ACGCGAAACTTGAAGCAGAGATTGCAGCCTGAAAGGGCTGAATTAATAGCAACCAAAGTGACAAAGGGGTTTTCGGCTACCCCGTACGCCTTAATAAAGTC:1 + chr2L 16163380 5' + BS3 1756 1 88.12 TCTACCAGTTCCCTTGGCTTTGGCATTGGGCCCACATTTGCTGACAGAAGAACTCGTTTGCCAGTCAGACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 2090320 5' - roo 401 1 72.28 ATGTTNAATAGATTGGAAATAATTAGATATTAAATTGAATCATCAACTGGATTTCCTACCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGT:1 + chr3R 21705464 5' - 412 7151 2 57.43 GCCGGCTGCAGGAAGGATCGATGTCAGCTCCTTGCTAGTGATCCTTGTCAATGCAGTGGCATCAGGAGTCGGAGACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTC:1 - chrX 8388259 5' - F-element 4488 1 59.00 CAGGCACGCAACGCGTTGTTAATGTATTTTGATTTCAGGCCCGGCAGTAGCTAACAATTTGGGCCTGCCTTTGTTAACTTAAAGCAAAATTGTTCAATAAT:1 + chr3R 20431217 5' - Tc1-2 1555 1 74.26 AAAAAAAACACAGATAAACCAAAAACAAACACTAAACAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCCAAAA:1 + chr3R 30564409 5' - Tc1 1422 1 67.00 CAAGTTTACACAGCCCATTGAAAGCACTCGAAATCTCTGTTTGCCAACTCACCTGAAAATAGCGAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAA:1 - chrX 3113198 5' - S-element 1518 1 69.31 TGATGGGAAACTGAGTCTGGAACGATTTGATTTATTTTATGTTATTAACTACAATATTTATCGTACTTCACTAAAATCGAGTGATTTTATAC:1 + chr2L 22344354 5' - Doc3-element 40 1 69.57 ACAAAAGAAGAGAGCCGGCGAGTTGCATGAATGCAAGACCCAAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAA:1 + chr3R 26824220 5' + Doc 321 1 58.00 TATGGCACACACACACACACACACACACACACAAATGC:1 + chr3R 12973639 5' + accord 7031 2 84.21 AAAGTATTCATTGAAGTGAGTTTGAGTGCTCCAACTGGGTTCGCAATTTTTGGCTGCCCAAACGTGGGACAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTT:1 - chr2R 21734409 5' + Circe 278 1 59.41 GGCAAGAAATTTGCATAAAAAAGTGGAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGTCAGAACTTAATACTCTGTAAGGG:1 - chr2R 12605812 5' - Cr1a 4183 1 77.32 ATCCTGGAATCGATTTTAGTACATCAAAGTAGTCTCTTAAGGTTTGTTTGGGAACGAGACACCCT:1 - chr2R 5616617 5' + 3S18 5765 1 67.69 GCACGCCGGACGCGAACGTGATCATCATCGCTCAGTAGACTCTGCGAACTCCGCTGGCCTTGCTGCATTGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTT:1 - chr3R 16372502 5' - roo 404 1 73.00 GAGAAAGAAAATGCGGCGGAGAGTGGGCGCTCGAGTTGCAGAAGTGAGGACCGCGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTGCTTCACC:1 - chrX 8609236 5' + diver2 4469 1 73.27 GACTANTCCTAAGTTTTCGCACTTTATGGGACATCGTTGTCGTTGCCGTTGTCTTTGTCCCTAGTATCTGTAATCTTTAATAGTTTCTTAGATCTCGACGT:1 - chr2L 18261739 5' - INE-1 143 1 56.44 GGGGCGGATGGAGAAAGGCAGACAGAAGTAAGTAAATCAAGTTGTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCT:1 - chr3R 22182033 5' - Doc 4370 1 56.44 TTTGTGGCTGCAGCTCAGTGTCGTTTGTTTTATTCGCCAATGTTTTCTTTTTTTATAATTCTTTTTTTTTCATTTTGTTATTTTTTTGTTTTTTCTTTTTT:1 - chr2L 20018400 5' + hopper 143 7 56.44 GTTATCCGACATTTGCACATAATCTCTATATATACGAATTGAATCAACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCC:1 - 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S-element 1622 2 70.30 CATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 12578187 5' + jockey 33 1 52.00 AAATAAACAGTGGCCACAAAGTTAACCAAACAATTGACTGATTTTTAACAGCCCGAATATAAACAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAACA:1 + chr2L 7199235 5' + mdg1 7057 2 50.50 CATTATAAATCTTTAGTAACTAGTCAAAAATAGTGCCGTAGTGCCTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chrX 13259304 5' + pogo 27 1 54.46 AAATCCAATTTTACTTGTACTTTCCATCACAACATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCA:1 + chr2L 10691041 5' + jockey 127 1 67.33 TGGTGGCTCTTTGGGGTCACCATTGGCATTGGCAGCGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTACCTGGGAGATTGG:1 + chrX 6754703 5' - transib4 2358 1 63.64 CGTCTGCACTTTCGATTGTTTGTTCTTGGCTCTGAAAACTGTAATTTAATGTGCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 27619194 5' - hobo 2917 1 57.43 GCCTCTCTATAATCCTTGATGAGTCCTGAAGAACTCGGACCGGGCATCTCAATAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGC:1 + chr3L 17710953 5' - Bari1 237 1 60.40 ACCTGAGCACCGTTTCCGGCAGGGCAATCAAAACCGAATCGAGCCTTGTCCTCTGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCG:1 - chr3L 13213791 5' - X-element 4457 1 59.41 TTTCGAGCCCACCCCAAATGAGAGACATAACTGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr3R 15343908 5' + roo 45 2 71.29 TGGTCGCGGACAACAAGCTTGTGGGCGTGGTTTCCTGGGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGG:1 - chr2L 20256263 5' - Quasimodo 172 2 75.76 GCATTTCTGTGTTGTGGGTTGGAATTTGACCAGTTTTGTTTGTTCGCAACCAACAACAAATTACACACAAACTCCGTTAACCATTGTAGGCAAGCCTACTC:1 - chr2L 926750 5' + Doc4-element 232 1 56.44 CACGACCAAAGAAGATGGCGCCCACACACATGCTTACACACTCTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chrX 11042521 5' + jockey 4709 1 55.45 CCAGGGCGTGACTATCCGCTGGCTGAAGGACACAATGCGGGCGGGCACCTTATTGTTCGCGATTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACATCAACTACTCTTC:1 - chr3L 8278386 5' + jockey2 44 1 54.46 CTGTTTACATTTGTTTGCTTTTGTATTTGCGCGCCTTGCGTTTGCATTTCTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGT:1 + chr2L 1401995 5' + Cr1a 230 1 58.42 GGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1 + chr3R 10736058 5' - invader4 3039 2 77.23 GCGTGTACAAACATAGATCAAATAAGTTTGCTCAAATTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGT:1 + chr3L 17858169 5' + HMS-Beagle2 36 2 67.33 AGTCAAGGAATATAAAACGTTACATATTATTAGCTAATCATTTATATCTTCTTCTATAATTTCAATGTGGTATAAGATTTTTTAAAGTTTTGTCATCGAAA:1 - chr2L 10795349 5' + transib1 255 1 51.49 TTAGGTAAGTTATTTGAGCTTATACATTTAATATATTTCCCATCTAATGCTGAGACTGTGCACTGGGCAAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 - chrX 17135198 5' - Tabor 479 2 73.27 CACTTNCATTCGAATTGTGACGAAGCTGTGAGCGGTGGTTTTGGGGGCCCATAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr3L 15276640 5' - hopper 1390 1 52.00 CCTGGTGGCGCACTGGCCAGTCCCATACCAACACCTATGAATATTCAAGCATCAAATAATACTTTTTCATATGTATGAACATAAGCATAAGCAAGAAGAGA:1 + chr2R 15845579 5' + Tom1 194 1 67.33 TATACATACATACATACAATACATACAGATGTACATATACACACACAGACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATA:1 + chrX 12601559 5' + rover 7066 2 50.50 ATTGGCTAGATAAAGATTAACTATCGTAAAACACACCGCTCCATTACAAGAACGAGAAGAAGATTTAAACGCCACCACCC:1 + chr3L 6676154 5' + jockey2 3169 1 57.50 TGTCAATCTTCAGTGAACAGCTGGTACGATTTTTATAGCAAACATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATAT:1 + chr2R 18008556 5' + blood 176 2 57.43 TTCTGNAATCCACAGTGCTTCTAAATTTAGTCTTTGCAGTTGAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chrX 21657161 5' - 412 7512 2 58.42 AAGCGTTGCACAAAGGAGGCAGGAACAAGGCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTGTATTCTCCAAATCACATCAGGTGTCGCACAAGGGAGCCATCTTGGTC:1 - chr3R 15386595 5' + Q-element 490 2 80.20 TAATTATAAAGTTGTACTAAATGGCAGTAGGTCTTGGGATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGAGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGG:1 + chr2R 5284560 5' - accord 7378 2 61.39 CGTTGTGCGAGGTCGTTTCACTTTGTCTCTCGATTGGCTCGGGCGTCCAATGAACCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 20084852 5' + 412 21 2 58.00 TACTANGATAGCATTTAAGCACGTGTAGTTCTGAGTCGATTTAATTTATATTATGTGCATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 21293018 5' - roo 390 2 63.37 CATCTTTGCATATCTGGGTTGTGCCAAGCAAAGGAAGGAACTGCTCTAGGAAACAACATTATTTTTCGAGCATACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAG:1 - chr2R 24832272 5' + invader3 5350 2 78.22 CCCAAAATAAACCTGATTTAATATTTATATACTTGGATGATACTAATTTCACCGCGTGCGTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGC:1 - chr2L 9844994 5' - accord 178 2 81.91 TTTTCATCCGATTATGAAAGGGCGCCGAGTTGACCGGGCATTGTCCTCTCTGCCCGGGAGTTTTTACTACGTATTTGCTGAATAAAACTAATAGGAGTGAT:1 - chr3R 23632462 5' + Tc1 241 1 70.30 GTGTATGGCCACCCCTTTGGCCAACACCCACTTTAGCTTCAACTCCAGTGAAAGTTTGTTGTCGCCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2R 22454914 5' - hobo 2927 1 67.33 TACCGTTGTCCTGGGATATTTACTTCGGTCCACATTTCTCGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTT:1 - chr3L 25514058 5' + X-element 46 1 59.41 CAACAAGGGCCACAAAATGATCGTAAAATTTAGACAGTTGTTAAATTTCGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATC:1 + chr3R 10625979 5' - Juan 287 1 56.44 CTAATGAAATTAAGTTGTCCAAGGGATTCACGGATACGCCGCTATCGCCAGATCCGGGCGCATTAAACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAAACATAAACAT:1 - chr3R 21258282 5' + Quasimodo 170 2 68.32 TATAGGGAGGGAATTGTAAACTAAATTGATATAGTGAGAATTTCTTACAACCATTTGGTTACAGAGATTATTAAAGATCCGTTGGCTTCGCGAGTGATTCT:1 - chr2L 8054139 5' + Cr1a 128 1 73.27 ATGTTGCCGCTCTTAATGTTTGTTGCCACTTCAGCAATGGGATGGGCCTTTGCGCTTGTGTGGTTCTTCTACGGTAATTCTACGATGCAGAAGAAACTGTA:1 - chr2L 17946710 5' - Fw3 392 1 58.42 GTTTTAATTTGTTAATACACAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr2R 4784788 5' - 1360 3337 1 81.19 ACCAGTTTATCGTATATCTAAAACGGTCACTTAGTGTCCCGAGATTTCTTCGCGCACCGTGATTGGCTCAGCCGGCGAACCTTACGGTATCGCTACCACTA:1 - chrX 2662312 5' + G-element 146 1 74.26 AAAACACGCTGATTTACGAAGGAAAAATGAGTACAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr3L 947872 5' - hobo 2897 1 66.34 GCTGGTTGGAGTTAGTGGAGTAACGTGGGGGAGATTAACTACACTTGGAAAATACGAGGTGTAGAACATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCA:1 + chr3L 4747504 5' - Doc3-element 4476 1 70.30 ATATTTATAGCATAATTCTAGGAGCTGCTACATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGTAGATGAGCAA:1 + chr3R 20140558 5' + jockey 7 1 76.00 GCATGCAGTCCCAATGGATTTTATTGGATTTACTACGCAGAATCGGTTGCAGCAGTATGGTTTAGAATGCAGCTTCATGCGGCTGCTTATTTACTAATATA:1 - chr3R 13254360 5' - 1731 4426 1 72.28 TCTCCCGTTCTTCGCATCGCATCGCCTCGCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAACCTTCAC:1 + chrX 2643615 5' - invader4 3007 2 67.68 TGTTGCTGCTGCTGCTGGTGGTGGGCGGCGACGGCGGCCGCGAACTGCGTGGGATGGGCGAAGCTCAGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGA:1 - chr2L 14414819 5' - F-element 4514 1 69.31 CCGATTCTTGTCCTAATTGGCAGATATGCTAACCTAAACAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGTCGCACTTTAACCGTTCGTTGGCGTTAATGGCAGCG:1 + chr3R 19506818 5' - HMS-Beagle 6849 2 62.38 GATTGCTCATATACAATCGTGTATTTTCGGGTACAGACCGAAAATATGTTTTTTTTTTCGGACGGGTCCAACGGCTATACCTCCCGACCAACCGACGGAGG:1 + chr2L 22729692 5' - Cr1a 4420 1 57.43 GTAAAGCCCGCTAAGTGGGTGGGGGAGGTTGGGTGGTGCTCGAAGGATAGGCAGCGAAAAGGGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 10635229 5' - roo 394 1 62.38 TTATGCGGCGCAATAATAGCGATTCTAGTGTTCCCTAATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGCTTAAATACATTTAAATTATTGAATAAAAAT:1 - chrX 15703485 5' + Bari1 319 1 63.37 GCTTGAATGAATCTCTATTGAATCCATTCATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGG:1 - chr2L 2885558 5' - I-element 5183 1 69.79 CATTTTGCACATCTTTTTGGTAACCGACAATCCAATCAAAGCCACATTAAATCTAAATAAATCCTAAATCGTCAGGATACAAGAACACACACACACACATA:1 - chr3L 9182044 5' + accord 180 2 68.32 AGCGGAGACAGAAGAGCATGAATAAAAAACACGGCAACACGGACGACGCCCATGTGTGTCTGAGTACGGGGCTTACTAAAGTCACTGGAGGAAGAAAAACG:1 - chr3R 15892550 5' + baggins 4991 1 72.28 TACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:2 + chr3L 22564833 5' + blood 7057 2 75.25 CACGACTTGGCCATTATCCGACTCGAAACACATAGAGGTCAAGACGACGCACCTCAGACTAAAAGCAAGGGATCTACACTGGCTTATAAACATTCACTCTC:1 - chr2R 5679341 5' + Doc3-element 4246 1 76.24 CAATTAGGGGAGTGAGTGAGTTGGCCGGGATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTATTCCGGATGTACCCAA:1 - chr2R 19329789 5' + Idefix 83 2 71.29 TGGCGCACGTGGCGTATGCGCAATGCTGGAACGAAAAATTGAACTGGCTGATAAAGCGGCAAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAA:1 + chr3L 9585759 5' - 1360 3191 1 72.28 ATTGTGTTTCGCATTTAAATGTGAATTCAATGGACGACATAAGTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTCCTGATA:1 - chr3L 4523030 5' - I-element 78 1 57.43 GGCGTGGCGGCCGGAAATAACGCTGGAGTCGGTCCTTATTGTGTCCCAGCTACTTTGCGTTTGGATCCCATCACAAAGCGATAGAAATTTACAAGACTAAT:1 - chr2L 1387189 5' - INE-1 297 1 78.22 CATATGTAAGCATTACATTTTATAGATTATTTTGAATAATATTGAAGTTGTACAGTGGCTTGAATTTTGCTTTTAAAATTCGATATTAACTGGAGCTCT:1 + chr3L 13313891 5' - Porto1 37 1 62.63 TTGAGTTTGAATTTGATTTGGCCCGTGTGTTTCTCTGTGTGTGTGTGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGA:1 - chr2L 16950292 5' - R1A1-element 5263 1 54.46 CTCCTTGCGCAGCTTAATACTTAGTGGCACCAGGCATAATCGGTCAGCTGAGGGTTAAGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGA:1 - chr2L 8516162 5' + Rt1a 5030 1 65.35 ATACTCATATTTTCATATTTTTTTCCACGTGTAAAATCTAGAAGAAGATGGCAGAATCCAAGTTGAAAGAACTCTTAGGGGGTGTTCACACATGAACACGA:1 - chrX 9653380 5' + roo 8662 1 81.19 CGGGAATCAGAGGCGAGCATAAAACTCTGCAGAAGCTGCGACGTGAGCAAATTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATC:1 + chr3R 16911832 5' - Burdock 303 1 59.41 ACATGTCAAGTACAGCCGACCAGCGGGCATCCCAGATACCCTACATACCTCGGTAGCTTTGGCACTTTAGAACAAAATGAAGAAGTAAATAAACTCAGCGA:1 + chrX 6778879 5' + Quasimodo 7214 2 66.34 CCCGCTGGCAATTTTCACAGTTTGTCAAGGGGCTGTGGAGAATGGTAAAAAGAAGAAAAACTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGA:1 - chr3L 14286525 5' - S-element 1329 1 62.38 GATTATCTTGGCCGTCAGCTCGTTCTCCAAAAGTTTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGA:1 + chr2L 21154707 5' + Idefix 276 2 65.35 AACAATCGAGATTGACTATCTGCTCAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTCTAATTATTAAAAGAAATGACAACAAC:1 + chr3L 19010241 5' + I-element 264 1 74.00 AACCAATCCCGCAGACCAGAAGATAGAAGCCAGGGACCGAGACCGATAAACCAGGCCGTTTCCACACGGACCAAGTCGAGTGGATGTCATGATTAATCATA:1 - chr2L 7189871 5' - G3 4303 1 84.16 AATGGGGGATTTAAAAGTTATACAAAATCATTACTAGTACTTACAATAGCTCTATTCACCTAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGA:1 + chr3R 14178467 5' + INE-1 99 1 67.33 TGAGATAGCTCATAAGTATATGTTCCAAGGAATCGAGGTATTTCAGAACTTACGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTT:1 - chr3L 3267579 5' - R2-element 252 1 56.70 AAATGATTTTAATTAGCTCAGCGCTCCTTGTTGCTAGCCGAACCCAACAGAAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGCCAGTCTCGG:1 - chrX 4883497 5' + R2-element 3281 1 53.47 CTATCTGCACAAGGTACTTCGCCAACTGATCAAGCGGAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCAACCGCATACAG:1 - chr3L 22259981 5' + G-element 3949 1 63.37 TTCTCTCCTTCTAAACAACCACCACCACAACAGGAGATAGCGGCGGCATTTGAACTTTCAACGAAAATATCAGTTATCATAAGTAAGGTCAATAATACTGA:1 + chr2R 18514301 5' + gypsy9 9 2 61.39 GCAACTGAGTAGGGTTTATGGTAGGCGTTACTGTCTGTGACTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCA:1 - chr3R 16343168 5' - Porto1 371 1 59.41 ATGTGGCAAGTTAAATATTTATAGCATAATTCTAGGAGCTGCTACATCACCAGCGCATTGTCTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 + chr3R 20140544 5' + jockey 19 1 70.30 GTAAGCAATGGTTTTTTATTTGTGTGCTCGCTAGCTAGAGGGTAGTGCGTGTGTGTGTGGCAGGACGATTAATCCCTACTACATACTCTATGCATAACATG:1 - chr3L 22642627 5' - G4 3738 1 62.38 CAAATACTTGAGATACTTTTTTAACCGCAGCGCGAAAATTTATGCGCTGCATGTGTGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCC:1 + chr3R 7336420 5' - opus 288 2 58.42 CATAAAAATTCTCATATATATGCAAGACAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 - chr2L 17862240 5' + F-element 60 1 74.26 TTTCGGGCCGCGGCCACTAAGAGAGGGCACTGAGGCTCTGATTTACAGATGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTT:1 + chr3R 4515192 5' + HB 40 1 66.34 AAATGTTTTTAAAACGATACAATGTGTGGATTGGGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTCATTCGTTGGTGGCTTGAATATG:1 + chrX 2811074 5' - Ivk 4993 1 74.26 GAGAAGGGGAGCGAAAACACAAATTTAACGCAGTATGCGAGTGTAAAATATTTAAATTAAACTGCAAACGCAAATACACACACAACCACACACACACACAC:1 + chr2L 937662 5' + gypsy3 418 1 49.50 CAGAGGACCACTATCGCCCACACTTACACACCCATAGACAGATACAGAAATACCCACAGATACACGCAAGCGTCAGCTTCAGCTAAGAAGGCAGGCTTGAG:1 + chr3R 20091273 5' - Chimpo 4097 1 70.30 TAAATGTTAAGGCCTTCCGCTCGCTCCTGAAGCTGCGTGGGTGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 + chr2L 17278051 5' + copia 35 2 57.43 AACCGATTTGGTGCAACTGATTTTTTTCACCTGACTTGTCAGGCTTCAAATGAAGTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGA:1 - chrX 8417974 5' - I-element 235 1 62.38 CAGAACTTTAACAATACCGCTATATCATAAAGACAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAATAAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCACCG:1 + chr2L 7504890 5' + Doc3-element 228 1 68.32 AGTATGTGTGTGTGTGGGTGTACAAGGGAGCAAGTCTGCGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 23702171 5' - accord 7032 2 79.31 AGTCATTAGCCTATCAGCAGTGTTTGTTACAAGCTAACAGTGATACAACGTGCCTGGAATCGCAACCAGAACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTC:1 - chr2R 6985539 5' - R1A1-element 5037 1 67.33 AAGTGCAGCTTAGTAATCCCAGACGAGACGAGACGATCCGAGCTGAGCGGCACCTGCCTAACGCGGCAACGGGGCGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTA:1 + chr3R 5081744 5' - 412 105 2 75.25 AAACTAATAGACAGACAGTCAGTAAACACAGTGTCTAGATATCAGTTAATATATATTATTAGCGTTGAATGAAATACCAAAATGCGTAACGGCCGTACATT:1 + chr3R 21113418 5' - 1360 3369 1 58.42 TATTATGAATACACCATCCAATAGCGATTAAACTCAGTAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGT:1 - chr2L 20021096 5' + P-element 197 1 47.52 TATGTATTTCGTATTTTACGAGGCTCTTTGGCTAAAAGCGCGCTTTTATGGCTTTGTTGACGCTCCCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 31293184 5' - hopper 1407 2 72.28 TGCAGCATGCACTTCATAATTTGCTAAGTGATTTTCAAACAGCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3L 10378974 5' - mdg1 7424 2 62.38 GATTACAGCTCAAAATCGGAGCAAAAGGCCAGGAACGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACT:1 - chr3R 14998822 5' - invader2 4910 2 60.24 CCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCG:1 + chr2R 2666333 5' + Rt1a 27 1 49.50 CCACGGATGTTTATTTATACCGCATAAATCCTTGTATATATGGTGCTGTTATTGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTGACGCTACTGCTTTGAGT:1 - chr2L 12823081 5' - BS 482 1 69.31 CCCCAATTCGGCACAGGTATCCATTTAGATAGAGAAGGGTACAAAGTTTCTGCTCAGCTGACCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGGCCGTATGAACGT:1 - chr2R 8359665 5' + INE-1 125 1 65.35 GGCATTTCTAGTGGCCGAAAACAAAGTTTTTTTTTAGGGGCGGACACATGCACTCAACAATCATTTCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATAC:1 + chr3R 31356937 5' - 1360 418 1 59.41 AGTCGGCTGGAAAATTGTTTTGGGTGTTAAGAACTCACACTCATAGAGCGCTGTCCACCTCAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGA:1 - chr2L 4309498 5' - Circe 7378 1 65.35 TTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 + chrX 21087577 5' + mdg3 5274 2 55.45 TGCACACCAGCGCTTTGTGTGTTGCTCGTACTGTTGCTGCTAATACTGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAACAACAAGTGTGAGAGGCAGGCCGCCC:1 + chr2R 18120070 5' + blood 494 1 66.34 GGAGAAAAAATGGTTTAAAAAAAGTACATTATGTCATTACTGTGTCTGCTACACACAATTTGAAATCGCAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAAT:1 + chr3L 24035887 5' + Tc1 1447 1 72.28 CATTCCCTTGACAACAAGATGAATAACCCCCCGGGTCCACCATTTGTGTGCTTGACCCATTCTCAAAATTCTTAAAATACAGCAGGCCTTGACTGCGGGAA:1 + chr2L 11819751 5' + baggins 428 1 37.62 AAGACAACAAAAGTCAAAAGCTAAAACACTCCGGATTCCCAAAAGTGTCCAGCAGTGGTCGTCAGCGGCCACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTT:1 + chr3L 22369991 5' - HMS-Beagle2 7005 2 55.45 GGAAGTGCGCACTGGCAAACGAGTTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAAAAGATTTCGCAGCCACCTAAACCGCCGAGCCCTGCACCTGC:1 - chr3L 16789707 5' + Chimpo 4185 1 75.25 CAAAAGAAATTGCATTGAAGCAAATGTCGAGTGAAAATCAAACGTTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTT:1 - chrX 14988435 5' - Bica 395 2 55.45 AGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTT:1 - chr2R 4879016 5' + G-element 40 1 61.39 ACCTCTTTGCGATGGGAAATGGCAAAGGTTTTTCTTCCACTGCTATTAATTGGATTGTATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTC:1 - chrX 14384962 5' - accord 178 2 46.53 ACTATGATGTCAACTACCTGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACAAGTGGGAGAACACAAACAGAGTAAGT:1 - chrX 3484710 5' + P-element 427 1 27.59 CTAGTTTTTGATGCCGTCGAACGCTGCTGCTGCGCTGTTGCCAAACTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 - chrX 6871853 5' + 1360 3379 2 55.45 TTGGCTGCCCGGTTCGTGGTGGTCACTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGAGA:1 - chr3R 5544932 5' - Ivk 4987 1 71.29 TTATGCTGTGGCACGTAAAGCTGGAACATTCGCTCGCATCGGATCGTAAAAGTTTGGTACAAAGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGG:1 - chr3R 30258983 5' - Idefix 70 2 74.75 AAACGTGGAAAGCTGGGCGCAAAAGTTAAGAGGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 13560768 5' - roo 9026 1 67.00 CCGAAATCTGCAATGGGAAAAGGTGTTTCGTATGTTTTACATTGAACCGGTTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTC:1 - chr2R 9161100 5' - accord 149 2 65.22 TGCAGCGAGAGCGAATTACCACTTTGATTCGGGATGGACAAGAGGAGGCCAACCAGGAGGCGGAGCATTGAAAGAAGGAGTTCGGGAGTGAAAACGCGCGG:1 - chr2L 15361404 5' + gypsy8 440 1 62.38 CAATTTGAACATTTATACATTTGAAGGAGCACAGCACTTAAAGTTTAGTGTGCATATGCTAACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:2 + chr2R 18891028 5' - opus 486 2 59.41 ATCTGTGCCGCTGCATCAAAAGCGCCGGGAGCTGGTAGCTTCTCTACTCCACAGCCTCAATAACCCTGGTCATCATCTTTCTTATCTACCGTCTGAAAGC:1 + chr3L 9559463 5' + gypsy10 5567 1 54.00 CAGGAGATCGAGCTCATGCTCTTCCTGTATCGCCGTTTAGAGCGAAGCATTCTCGCGACACTACGTAGCGGTTTTAGAGTAGCGGGACTTTGAGCACGAAA:1 - chrX 6958523 5' - G-element 60 1 55.45 CATACACGCACACAAAGGCGAACAATTGTCTAAAAAATGAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGATTTTTCC:1 + chr3L 14984966 5' - Max-element 368 1 61.39 TTAGCATCCTAACGCAATTACAAGACAATCAAAAAAAAGCAGCAACTGAGGAAGTCCAACCAGCAACACACACTTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATCC:1 - chr3L 10818750 5' + invader3 5356 2 69.31 TTAAACAAGATTTAAAAACAGTGTTAAAGGAATTTCACGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 - chr2R 2311293 5' + hopper 36 1 76.24 ATGAAATTTGTGGTTCGAAATGAAGAATACTGACTGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACT:1 + chrX 9260610 5' - 3S18 6064 2 62.38 TTTTATTTCCCGACTTTGGAGTGGAGCCTGCCTGCAAACGTGCACCAACAACAACTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCA:1 + chr3L 1181189 5' + Porto1 474 1 63.37 CATTTGTATTCGCCAGCTGTATATGGTGCGCATTTATTGAGTAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTA:1 + chr3R 28844409 5' - roo 8610 1 59.41 GAGAATTAAAACACCTAAATGTCGCTGTCTGTAACATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 + chr3L 62974 5' - roo 9067 1 50.91 CAATAGAAGTATTATCAAACTGGCAAAGTGACTTTTTTTTAATCAAATACAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAATCATAACTTATGGTCTAA:1 + chr2L 22042431 5' - Transib5 2746 1 65.35 TGGTTGGCGTAATAACGCACGGACGAACAAACAGACGATATGCTGATACTAAGTTAGCGTGAACTACATATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTA:1 + chr3R 4352128 5' + gypsy4 8 2 59.41 AGGGTTGGGGAATAGCCTTGAATGGTTTTTGGTCGCGTGGCCTTATTGGCTCATTAGTAAATGAACTGTAAATGAACGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGAT:1 + chr3R 19985461 5' - I-element 4990 1 81.19 TTTGCATGTGTGCAGCCTGATTTATGTACAATACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3R 22675864 5' + 412 7096 2 66.00 CCGAAAAAGACTTCACTGCCAGACATAGTTGAGTTGCAGCAAAACTTTTTCCATTTGCCAGCACAGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 - chr2R 22774524 5' + BS 9 1 65.35 GTCTTTATCGGGAACACGCATCATTGACTTGAAGGCTTTTCCACACACACACACACATACAGAACACATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAA:1 - chrX 17049638 5' - Stalker2 7641 2 66.34 ATAAAACCTTGACATTTAAGGTGTGCTGCTTTTGCCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 + chr2L 2858018 5' - transib2 2786 1 63.37 ACCACTCGGACCCGGACGCCGAGGAGGACAACGGTGGACCCGATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGG:1 - chr2R 24776142 5' + R1A1-element 414 1 57.58 ACCTTGATGCCACCGGATTGCAGGAGATGATCCGCCAGTTCGTCGACGTTTCGGAACCCACCCGCAGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCA:1 + chr2R 7243913 5' - invader4 2830 2 68.32 GATTTGCTTAGTAAGTTTGTGTACATTCAATTAAGTTAAGATAAGAACCTATGTAAAAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCTAGTCAGTAAGAT:1 + chr3L 18437044 5' + rooA 7546 2 64.36 CGCGCAGCCAGCAATCCGCTGCCCTGCAAAGGAGCCACTCCCAAGCTGCCCCGGTAAGATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAG:1 + chr2R 18544011 5' - R1A1-element 5134 1 57.43 TACATCCATTTATGGTTAAAACGCTTCGCTTCTCTACCAATTTCGTAGTCAAATGGCTTCGGCTTCACTGAATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTA:1 + chrX 14714224 5' + 17.6 7274 2 73.27 GGATATTCACTCTCACTCACGTCCTATCAGATTTTCATTGCTCTGCACTTCGATTTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCC:1 - chr2R 5138742 5' - invader2 5013 2 61.39 GAAAAGGGGAGGCAGCTCGGTGGGGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGG:1 - chr2R 17318668 5' + R1A1-element 5067 1 79.21 GGGCTCGAAAAACATTTTAGCCCGGAATTTAATTTGATTGCCCGGCTCATGAGCGTGCCAATGAATATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr2L 796735 5' + jockey 16 1 68.32 GTCCACTTACCATGGATAATCGAATCCCTTGCTGTAGCCGCACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGC:1 + chr2R 8574067 5' + jockey 195 1 59.41 GCCCATGGACACTCCCACATAGTGGGGCTGACATACAGGTAACTTTGCATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTT:1 - chr2L 14313619 5' + R1A1-element 5281 1 53.47 AAACAGTTTATATTGTAGTCTTTCTTGCAATTAATGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr2R 15856426 5' - mdg1 7424 2 63.54 AAAAAGGCGAATGCAAGTGACGAGGTCCATGAACAAGGCCGAGAGTGTGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3R 25814697 5' + 412 26 2 53.47 GAAACTCGCTAAAATCACAATTCAAAAAGAAACGAAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATA:1 - chrX 5575424 5' - invader6 4526 2 79.21 ATGTTAGCTAAGAAGTTATGTTGGTTCACTAACGTAGAATTATTTAAGTACGCATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chrX 11060476 5' + I-element 25 1 48.51 AATGGNCTTCCCGGTCGCCATGGACTGAAGGGACAGCGAGGAGAATACAAGATAAAGAATTTTTAAAGAGGACTTTCTGCGTCCTGCCATTCAGACAGCTT:1 - chr2L 5015290 5' - Q-element 411 1 55.45 CGACTGATTTTAATCCAATGCAAATCTAGTTGATTGCGTAAACGAAAAGAACGAAGTCAAACGGGAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAG:1 + chrX 16569984 5' - hopper 382 1 67.33 GTTATAGTTGCGGCTTTTGCCTCGCCGATTATATTTGCACGCATGTCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:2 - chr2L 10635316 5' + roo 31 2 55.45 AAATAATCTTTACTCTCATATTGAGCACGTCAATAGGTTGATTGGTTGGTTGGTTGGTTTGTTGGTTTGTCTGTAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAA:1 - chr3R 29107630 5' - Stalker3T 304 1 75.25 AAGCTGGGCAAGACGGAGGAACCGGTGGACGAACAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTAGCCACCACATCCTGCTCACCGATGAA:1 + chr2R 8881811 5' + Rt1a 4891 1 64.36 TACAANATATTGTATTTTCGATTTATATTTTAAGGCTAGTTGTTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAAAAGGAAA:1 + chrX 14021441 5' - copia 128 2 71.29 GTGTAGATTACATCGCCGGCGAGTCGGGGCGTTCTTGGTCAATGGACAGATTTTGCGTGCAAACTATTTGTGACTTAACAACAAAATGTACAAAGTTTATA:1 + chr2L 15635638 5' + transib2 2766 1 55.45 CTTGCATTAGGCTAACGAATTGTAAACCAACACCGACAATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTTAATAACGGTGCC:1 - chr3L 21917651 5' + Tc1 1259 1 63.37 TATTGATAAATGAAGAGCAGGGCCTATACACAGAACCAGTTCTATTTGTGTCCTTATTGCTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3L 14365039 5' - blood 360 2 61.39 AAAGTTAATCACGTTGTTATACAAATACACTGAGTTCCTCTCATCGGCTGAAAAGCAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGTATACTC:1 + chr2L 21862649 5' - 1360 416 1 60.40 CTTTACTCATTTGTATGCAGCGCGATTTTTGCAACATTTCTGTGTTCCAAGCAGATTCACTTGAAATTACATACCCCTAATCTTAAATCATTGTAGATCTA:1 - chr3L 9279095 5' + Cr1a 4145 1 69.31 GAAAATGTAATTACTGTGATTTAATTTTTTTCCACATTTACTTCTATTGCAGCAATGACAGCAGCAGGAGCAACAGACCCAAAAAAGTATGCTACGACTGG:1 + chr2L 5262896 5' - Rt1c 474 1 54.46 CGGCGAAAATAAATTTCTAGCCGCGCGCGCCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCATCTAAT:1 - chr3L 8672887 5' - Transib5 2917 1 71.29 GCTGATGGCTGAGAGCTGGGAACCGCACCCACAGCAAAGCAAACAAAAACCAGACCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCT:1 - chr3R 10916260 5' + G6 360 1 52.48 TTGTTGAACTATTTTTCATAGCATAGTTTTAGGGACTCGCCGTGCACTTAAGCGTATTAAAATGCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2R 13314195 5' + jockey 20 1 66.34 CGAAAGGGTTTAATGTGTATCGTCAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr2R 4784761 5' + 1360 52 1 82.18 TCCTCTTAGAACAAGAGACTAAAAAACAAAGACGAAAAATGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTT:1 + chr3L 18154110 5' - Cr1a 122 1 80.20 CGTGCAGCAAGGAGTTCTCTGTATTTCACCGATTTTATGCAACTGGCAACCTTTTGCTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAG:1 + chr3R 21868060 5' + 297 191 2 61.39 GCACTACTTTAGTACTCCCATTAGCGCTTATAAGACGCCTCTGCGTTAGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTGAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACAGCG:1 - chr2R 5779056 5' - rooA 171 2 78.22 CGAAGNCAATGAGTAAAAAATCCAAAGGCAAAGGCAAGCCAAATCCCCAACAATGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 4856665 5' - roo 9049 2 54.46 TGGATGGATGTGCAACGCCTACGCCAGCGGCTTACCTGTTGGACTTGTGCGCCGTATGGGGCGTATGGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAA:1 - chrX 12987335 5' + R1A1-element 46 1 66.34 AAATGCGAAACGACTGGCAGCTGGTCAAAATATCAAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chrX 12155530 5' + 297 35 2 69.31 AAAGAACCGAAATGAAATAAAAACTGAAACTGAGTTAAGAAATACCGAAAATCAGGAAAAAAAAAAGAATAAAGCAAAAAAAAAACAATAAA:1 + chr2R 19619960 5' + gypsy7 5013 2 61.96 TCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2L 22719568 5' + 1360 13 1 65.00 AATTGAAATACGCTTTAATTAAACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACACCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 + chrX 10555404 5' + Tirant 24 2 57.43 GTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr2R 10697056 5' + 297 50 2 77.23 TGGTACTTCCGAAGGATTGAGGCAGAGTGTAACGAACTGTCTGCTCGGCCACAGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGACTACGGACAAGGGATTAACAATGTC:1 + chr3R 2892912 5' - accord2 7400 1 55.45 GGAATCGATTTTCGGTGCCCAGCAAGCAAAAGTCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTAAAC:1 + chrX 16634673 5' - Circe 7060 1 77.23 CACTTGATATTCATCAACATCAGTGTCTGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATA:1 + chr3L 6884160 5' - invader4 2955 2 69.57 CAGGCGTAGTTTAAAGTCTACCAAAGCCGGCAAAAATGCAGCTACAGTTTTGGGATTTGTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTGTTAA:1 + chr3R 10207307 5' + hopper 151 5 83.72 ATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACGTTTATA:1 + chr2R 11575016 5' - INE-1 138 1 50.50 GGCGGTGTGACCCTCCTGCCACAGGAACTCGCGGGTACGTAGGAAAGGAGTTGGCTGCTTGAATTCCCAGCGCTACAACAATCATTGCCCTTTTAATTTTT:1 + chr3R 23953307 5' - 1360 439 1 79.21 CGGCGATACAAATGCGAACCCATTTCAAAAATGTTGACACCCAACATAGGGCAATTAAATTCATTTTTCATTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2L 14536220 5' + blood 8 2 71.29 TAGCTAAAAACTTTTCAGCACTGAAAAAGTTCTTTACCAATTTTAAAGTGGATTCTTGCATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 25931399 5' + roo 17 2 63.37 AGCCGAAGAACCAATTACCGCTTGATTTAACACACGCATAACTTAGTCCGCGCACCGGTTTGTGGCGAGGATAACTGACTTTAATAATATCTTTCAGCACT:1 + chrX 22820600 5' - Gypsy12A_LTR 349 1 72.28 TTCGGACCTTCGGTTGCACACAATTTTATGGCCGCAAACAATATTTCAAAAATCATTTCCACGCCCACTCCAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGC:1 + chr3L 10604029 5' + INE-1 348 1 64.95 CATGATTCCAAGTCCTTCTCCTCCACCTCCTACTACTTCAACAACAACAACAACATCGACGACGCTGAGCCAGCCCTTTAACGCATTTCGCTTTAGCGAAA:1 + chr2L 21130080 5' + gypsy10 101 2 56.44 CGAGCGGGTTCTACGTCAGTGTAAATTTGTGTAATAAACCAATATATGNCACCAATTGAGAACANGTGTTTTCCTTGCANTTGGGT:1 - chr3L 5827930 5' - blood 342 2 65.12 CGCAGAAATTTTGCATAATACGGAGGACGACACTCGCTGTTTGGTTCGTTTTGGTGTAATTTATGATTTTGTGTTGTGAGGAGTCTTAAAACTCTCCACAA:1 - chr3R 29415488 5' + gypsy8 4 2 70.30 GAAAATCATGCCACGGTATCAGGCTGGCGAGAGCATCAGACAAGTAAGCCAGATATATATATACACACACACATACATACATA:1 + chr2R 21021479 5' + Quasimodo 38 2 73.49 TAAAGATTTATTAGGCAAATAACGCTGAAATCGTATATTGTGAAATCCTTGTCTTTCTCTTTGCTAAAGCCAATAAGATGAAAATATGGAAAATAAATGTC:1 + chr3R 21153684 5' + transib2 265 1 84.16 CAAACATGGGAGCCAGTGCAGCATGAGTAGCAGTTTGCAAACACACTTGCAAACTCGGCCAAAGTGGTGCCAAATCAAAGATAATCTTAGCATCAACGACT:1 + chr2R 18029674 5' + diver 5629 1 59.41 CTTGATCATTTGAACAAATCTTTCCATTGTATCACTAGTGAGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTTGCGA:1 + chrX 21564320 5' - diver2 296 2 68.04 CTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAG:1 + chrX 22726201 5' - Helena 1267 1 48.51 ATAAAACCAGAATCCCCCTAACTTTTCCTTGCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCGGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 9654387 5' + opus 153 4 66.34 CAATGCAACTTACTTTAGTATATTTAATAGAAATTAAAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 10969616 5' - accord 188 2 58.89 TGTCTGTCTCGCTTGGGTTGAAGTCAGACAGCCAGACGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr3L 16150765 5' + P-element 36 1 41.84 GATCATATTCCAACGATTTATATACAAGCCTTGCTGATTATAATTAATATTGACTTTAAAGCTCATTAAAAACTATACAAAAATATGCAAAATAAAAAAAA:1 + chrX 12850042 5' + TART-A 13403 1 73.27 GTGGGATTGTGTCTTTGCCCGCGGCGGAGCTTCGGCCTTTAAACTGATTTCCAGGTGAGAGCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTA:1 - chr3L 14901436 5' - R1A1-element 456 1 62.38 AGTTCCCCGTTTAGAATTGGTCGTAGTTCCCATTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAGCCGTAGAAGTATGCTTGGAACAGT:1 - chr3R 6908416 5' + Cr1a 4020 1 72.28 CCCGGTTTTTCCATTCGGCGGAGCCTGCGAGCCCTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGC:1 - chr2R 11078278 5' - hobo 145 1 67.33 GGGGTGGTGGGAAGCAGGAGGAAAAGGTGGTGGAGGAGAGCAAAAGAGAGGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTC:1 - chrX 2270267 5' - Bica 354 1 55.45 AAAGACCGAGAAATTTTATTTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGGAAAATATTTATTTATTTTTATAAT:1 - chr2R 5185457 5' - mariner2 828 1 75.25 GGTTTCGCGCTATACAGATTTTAGGCAACTAACGCTGAAATACTTACTGTGTCCGTGCCATCAACACGATCAGGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTG:1 + chr4 549212 5' - flea 4650 1 76.24 GGGGAATTAAGGTACCACGCAGATACCCAGCTATACCCACAACCGACTTCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAA:1 + chr3L 2678141 5' + Doc 4577 1 55.45 GGCGAAAGAGATGGCCTTCGAGGGCCAGAAAGAGACGGCCATGGAGAGTTAGAATCAAGTATTATGTATGGCTCTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAG:1 + chr3L 15274188 5' - gypsy5 212 2 50.50 ACAATGTAAATATGGCCGACCCATTTACTTTTTTCCGCCCCTCGAGCGAAACGGATGGATCAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTATGAAAATTACTCTGA:1 + chr3R 16051835 5' - G5 4542 1 57.43 GTCGCTTGTACAACAACATGAAGAACGAGAGCGGCAACAACAATTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCC:1 + chrX 21213714 5' - F-element 470 1 54.65 ACTTGCCCAACCGCAAGCCCCGCCTCGCATACGTAAAGCAGTGGGTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGC:1 - chr3L 4612399 5' + Circe 7201 1 66.34 AAATAAAATATTTGTAGCTTACCCAAGTTTCTTGGCATGGCTTATAATATAGTTTGCTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 23343737 5' - roo 390 2 58.42 AAGATTCATTCCTCTTGGCCAACTAGTTCAAGCACTGCTTGTCGAAAAGCGTAGCCAAATGTCCCCGTCTCCGTCCACCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr3R 11861755 5' - blood 167 4 58.42 TTCGTTCTTCAGATGTCGCATTGACTCCAGGGGGCCATCGTAGACAACCTCTCCATCACGCAGCAAGCGGAACTTTTGGTCTTCGTTTGGAAAAAATTCAA:1 + chr3R 28542484 5' - Tc1 320 1 72.28 TAGCCTAAGTATACAGTTCATACATACACGAATAATTCATGCACACACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1 + chr2R 19079172 5' + 297 6607 2 58.42 CCCCGCTATACAGCCCCCAAAAGTTGTTTTTACCGACGAGATGAGCCGTCAAGTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAGGATAAGTACG:1 - chr3L 15484801 5' + GATE 324 1 56.44 TGGCCCGATGACAATTCATGCGATACGGTCGGCTTGAATCCACCCAGAAATCCAGGGATTTCGTTCTGCTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAG:1 + chr2R 9162081 5' - Transpac 490 1 71.29 GTCAAAATAAAAAAAAAAATTAAAAA:1 + chr3R 10316082 5' + F-element 4687 3 96.15 GCCAACAGCCATGCCAGTGGCGCTACTATCAAGGAGGTCGAAATCGTGGTGCCTGCTAACAACAGGCTGCTGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCAATTAT:1 + chr2R 24029933 5' + Ivk 5171 1 73.27 GTTTCGCTCGCTCTGAGTGTGAGTGTGAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 + chrX 14505450 5' - hobo 2889 1 75.25 TCTGTAGCTAAGATTTCTTCAATTTTTTAATGTTCTTTCACTCGGTTGCATTGCAAGCTAGGTTTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTT:1 - chr3R 17322468 5' - I-element 225 1 68.32 TGAATAAATTCGTATATATGTATACGTTGGACTGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATAT:1 + chr3L 3484981 5' - diver 179 2 68.32 TTACANATTTGCATTTGACGTGTTTCTATATCCGTACCGGTTTCCCCTTCTCCCTTTCAGCGGTGTGCAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACA:1 + chr3L 22321617 5' + hobo 2713 1 71.29 AGCCAGCTGAAGAGGGGCGTCGGAAAAGTGTGCTACGGAAAAACTAATAATGCCAATGACACACTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 19535778 5' + hobo 12 1 67.33 GACCAGCCGACAGCACAGCAACGACCCACATTGGTGTCAACCTCGGGATCGATTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGTGACTTTAAAC:1 + chr4 107758 5' + Stalker 458 1 52.48 TATATTCTTTCTCATAAATAAAAAACCGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2R 11257913 5' + pogo 43 1 74.49 AATCCACAGGCCGCATCATCCTCATGCCCCTGCCACTTTGTCGCCGAAGCTCTTGTGCACAGCTGGTGCAGTTTATCGTGAAAGCTTCAGTGCTTGCATTG:1 + chr2L 8168106 5' - gypsy7 5269 2 73.27 CGTACAGAGTATCCGTGGCTAGATTGACGGAGTTGTTCACGGCGGCCGTGATTTGTGCGAGATAGGGTAATCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGA:1 + chr3L 19804085 5' + Chouto 124 1 61.39 ACCTTTTGGGTCTTTTGCATACTTTTCGGGGCTGGGGGCGACTTGCCCTGTCTACGTGTCAAAATCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr3R 12578204 5' + jockey 17 1 62.38 GATTTTGACCACTGTACGTGTCTGTCACCTTATTAAAATAATTTAACGGGCTTTAAACTTCGGTTGGGATTTTTCTACTGACGAAGAAAGTGGTGATGAGA:1 - chr2R 2230394 5' + looper1 484 1 61.39 GCGTCGTGGATACGATATAAAGATTGTTCGTTTTGATGTAGGCAAATGTAGTCTCCGCCGTCTGAAGGATCGGAGCCAACAGGGCTAAATTAATGCGATTC:1 + chr3R 9559033 5' - mariner2 223 1 74.26 AGTGTCCGTGCGGTTAATGTGCTTGATTGTCGGCATCAAGGCGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTC:1 + chr3R 20041000 5' - Tirant 8109 2 58.42 GCACAGCCCACAATCGGGTGGCTTAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCT:2 + chr3R 30525542 5' - R1A1-element 391 1 76.24 GGCCTGGGCAACCGTTTTTCAATGGCTTTTGAGGCTTTTGTTATTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACA:1 - chrX 19435610 5' + jockey 246 1 60.40 TGGCGCTGCTGCAGCTCCTCCTCTTCTGAATCTGACTATTGTAAACTGTTGATGTTATCTTTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCATATT:1 + chr3R 14733338 5' + baggins 5221 1 64.36 CTACATGTCCAAGGACCACAAGCAGACCTCCTACAAAGAGGACGATCTCGACCGAGAGACCACCATAAGCAAATTCGACGGTACAATGCTTTCCGCGACCC:1 - chr3R 30036535 5' - Tc1 361 1 77.23 ATTCTCAATGCTCAACTCATCCCATCACAAACTTCAAAGGATCCAACACTGCAATCAGCCAAGATGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTA:1 - chr2R 4375920 5' + INE-1 563 1 65.35 GTGCGGGCGCACACTCACCCTTGTCCTTGCGACTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATATCTTTTCGTTACATACAATAATGAATAAGACCAAGAAATTGAGCG:1 + chr2R 9234427 5' - gypsy12 10075 2 67.33 TTCGTTGTGCGGTAGCAGTCAGCTTATGTATGTGTACCTCTACAATTCGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTTTCGAAA:1 - chr3R 15973713 5' - invader2 4816 1 78.22 GGTCTTTCTTCGCGCACTTGGTCTTCTTCTCCAGGTTGGGTTTCGTCACTCCGTACATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTT:1 - chr3R 7059876 5' - Transpac 470 1 79.21 GTTGACAGTTTCCCAAGAACGGATCGACAAAGTTTTGGGTGAGCGGAGTACCGGGCAGGAAGCTTAACCATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:2 + chr2R 10697010 5' + 297 3 2 64.36 GTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 19450163 5' + roo 8696 2 72.28 CTTTTGAGCGCACATAAAATGTGAAATGCGGGGCGAGCGGTGGCGAGTGTAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGTATATTCCTTTTTAATTTCAAATTATAACGT:1 - chr2L 3937857 5' + invader5 3701 2 54.46 TTTTCTTCGTGTAGAGCTGCTCTCTGTGTTTGTGGTCTATAAGTGTGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGG:1 + chr2L 2201368 5' + Bica 52 1 55.45 GGCATAAACAAACACAAACCGACGGCGACAAAGCCAAACAAAAAATGGGAAAAAAAAAACCTAAATTGAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGA:1 + chr3R 22265786 5' + G-element 11 1 56.44 CTCCTTAGCGGTTGCTGCTTCGCAGTCTCGAATGGCGCTGGGTCCGCCTGCAACTTATTTTTAGATATAAATATTGTTATTAATTATTAAGCATTGATTGA:1 - chr2R 20473136 5' + gypsy12 9781 2 62.38 GACAAAAGGGAAAACTGAGCCAAGGCGTAAGCGAAAAATGTGCAGAGCGCAAATAAATTACTCTCAGCACAGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAATTCATCTG:1 + chr2L 18252338 5' + Porto1 409 1 60.40 CATACATTTCCATGACCAAAGCTAACGATGTGTTGAAAAGTGGATAACCAAAACAAGCTTTTCAATTGAATCAAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr3L 5827852 5' + blood 7016 2 75.25 CATTTCATTGTTGGACTCAGCTGGACTCACTTCAAATTCCTTTTAAAAATTAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAAAAAAGTAGGAA:1 + chr2R 5426584 5' - S-element 243 1 52.48 TATGAGATTTTATATGGTGACTCCATAGCGCACACTCACTTACGCGCGGCGCTATACAGACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1 - chr2L 4878475 5' + Quasimodo 59 2 75.25 AACTAATCAGAAGATATATACACCATATATAGACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chrX 10555425 5' + Tirant 8145 2 64.89 TATCCATTGCAGTCTTCTGCTCTCTGCCCGATCATCTTGTGGGGACTCCAAATTGTTCATCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTC:1 - chr2R 21225369 5' - R2-element 483 1 54.46 CAAATAAACTGAACCAGAAGTATAATCGAAGTATAAAAATTCCCATTTTAGTAAAAAAAAAACAAGAAAGAACCCGATACTCAGCTAGTGTGAATGC:1 - chr4 995016 5' - INE-1 534 1 67.01 ACTGTCAAACGAAGAGGAGACCCCACCGAGTTCAGCACGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGA:1 - chrX 18611674 5' + Doc 352 1 63.37 CTATTTTAAACACTATGTTACTATGCTTAGCTATCGACTATGAGTAATCCTCCGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCT:1 - chr2L 9612592 5' - BS 4829 1 58.42 ACTGCATCCCCCAACTAGCTCCGTCTCCGATTCGTCCTAATTGCACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCGAGTCGGGACTCTCAACATCCCCA:1 + chr2R 8212903 5' - Cr1a 4063 1 55.56 TCTCCATTATGTAATCTGTGTGTGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTG:1 + chrX 13498693 5' - accord 7107 2 77.23 CGTGTTCGCTTGTACACTGTTAAATTCGTTTGAATTCTGCAAATCAATGCATAAAAGATCGGTTCGCTGTAGTGCTCTCTGCTCTCTCACTCTCTAACAAA:1 + chr2R 2204467 5' - 1360 100 1 51.49 GTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 + chrY 104334 5' + INE-1 153 1 78.22 CGGCAACGAAGGACGAAGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTC:1 - chr3L 22221312 5' + micropia 13 2 54.55 AGGACGATTCCTTTGGCGTTGCTGTGCTGGCTGGTAGTTCAGAACTAAATAATACAAAGAGAGAGAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACGGCC:1 - chr3L 21421718 5' - Chouto 78 1 65.35 CGCAATCTCAGCAGCTGAGCGCCGCGACTGCAGCAGGCGTGCTTGATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGAAGCTTTCGCTGCGTAG:1 - chr2R 18955250 5' - Doc2-element 4471 1 54.46 GGAACNCACTCATCCGCAATCCCAATCGCATTCGCTATAGGCCCACAACGGAGGAGCGCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAA:1 + chr2R 18792027 5' + HeT-A 5959 1 64.36 TATTAGCAAATATTAGCTGGATGCATAGGTATTCGATAGCTCAGCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTC:1 - chr2L 9408896 5' + R1A1-element 5171 1 56.44 AATTCNTAAACTTCTTGGCATCTTCATCGTTGTCGTTATCCTGCGAGTTGTCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCAGAGCATTTTT:1 + chr3L 11646565 5' - Porto1 4340 1 55.45 TACAAACGCACAAACACTTGTGTGCACAGAGTTTAAATTAACAAAGCAGCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTATATGACCCTCGAGAATGGAA:1 - chrX 8810990 5' + Idefix 131 2 55.45 TACGAACGTCACAGAAGAAACTGCCGTTCAAACAATAAATTTTGAAGCATTAAGTTCTATCAGATAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTAT:1 - chr2L 9259065 5' + 1360 301 1 68.32 GATGATTCTCGAATTTCATTTCTTTTTCCCCCTTACATATTTCTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTGTTTCAAGCTACGAAT:1 - chrX 22747486 5' + Doc 35 1 54.55 TAAAGCGACAAGGAGCGCACTGTATCTAATTTCCATTTGAAACTATGCTATTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGA:1 - chr3R 29024083 5' - Doc 304 1 56.44 CCTTCCTAATTCGTGCTTATATCGATCCCAATCAGTAATATCTGACAACCTAATATTGGAGATTTCCGTAATCTTCATGGCCATATCCGTCTGTCCGTATG:1 + chr3R 4637181 5' + INE-1 120 1 70.30 ATCGGGGGCAATGTCTATCTAAGGCGACCTTCTCCTAGATACGACTTTCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTA:1 - chr2L 8257907 5' + opus 403 2 53.47 CCATCGCGGGCGGGTCCAAATTGTCCGATGATCTGATGGGGTGGATTCCGATTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGA:1 - chr2R 16022226 5' - R1A1-element 5043 1 64.04 GGGGTGTATGGATCTGAAGGAGTTCTACATCGATCGCAATAGCCTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCC:1 + chr3R 29986558 5' - roo 8776 2 57.43 GGATGGGATTAGTCTGCATATCTTGACCTGTGTGTTGATGTTGAAGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAG:1 + chr3R 29765278 5' - gypsy7 268 1 71.29 TGCAACTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGTTGCTGTTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGATGTTGCTGCTGGTT:1 + chr3R 9931949 5' - TART-B 152 2 77.23 GTGCAATAATTCAGAGCCTTTAACGATCGTGAGAAGGTGAGGAAGCAGCTCAAGGCACATTTGACTGCCTCTTTCCCCAGAAGTCATTCAAATGTTAGCTT:1 + chr3R 11607654 5' - hopper2 113 1 63.37 TGGGGGAAATGCATGCCATGTGTCGGTGATTGTTGCTAATTTGCATTAATTATTGATGTAGTGCTTCCCTTACAGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATT:1 - chr2R 13912513 5' - Tirant 43 2 78.22 TGTCACTCGAAACTAACCGCATCTGAACTAACCATAAAATCAAGACAAAGACGGAGGCGATTAACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCC:1 - chr3L 14516142 5' - flea 407 1 71.29 ATGGGAAGTGGGGAAAGGACTCTGGAATTATCGAAGAATGACCAGGAGTCCAGATTCATTCAATCATCGCTGGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCT:1 - chr2L 3273939 5' - gypsy5 7342 2 68.32 AAAATTCCGATATGGCGTTTTGCGGTTACAGACCGTTTTTGTTCACAGCCCCTTACCCATTTTCCCATCTCCCGGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTT:1 + chr3L 5981046 5' + 1360 126 1 77.23 GCACAACTGCTCTCAAACCAATATTGATATAGGTAGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr3R 4806568 5' - P-element 2846 1 38.61 AGGCCTGCACGTTTCGAACATTATTTGCCTATGCGAGAGGGGCTCAGTTCGCGAGCCGCGACCTCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1 - chr3L 11659714 5' + jockey 4737 1 70.30 CAGCTTACTCAAAGCTGTAAAGTGCAGTTCGCAATAACACTACAAAATGTAATTTAAATTCTCTTTATATTTCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 11576354 5' + roo 8667 2 76.24 TTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGT:1 + chr3L 24213781 5' - invader2 5072 2 58.42 GTCCTTTGTGTTCTTCAAATATGAAATACTTATCGTTAATAATATATGTATGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 + chr3R 23723095 5' + Transpac 23 2 55.45 GACAGTATTTCAAAATAAAAATTCCAGAAGATTGCCAAAACCGCTACTCTGACGCCAACAAACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAC:1 - chr4 1244900 5' + gypsy4 6691 2 68.32 TTTGACCCTGAACTGCCATTGTTACAGAGACGGACTCCCGGGACTTTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCT:1 + chr2L 2794538 5' - Quasimodo 284 2 59.41 GTAGAGTGTCGTCCTTTTCCCCTGGTATCTTCTATACATATATATACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:1 + chrX 12817475 5' + HMS-Beagle2 6911 2 53.47 TATTTATTTTGTTTCAGTTCGCAACAATCTCATTCCAAACATTTCTCGATTTTGCCACGATTTTTTCCCACGCCGCCACCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCT:1 - chrX 4722450 5' - TART-B 156 3 67.33 TGTGGCCATGTTCTTGTACAGCATTAAGTACTCTGCACTGGGCCTTTACGCTTCTGTGGTTCTTCTACGGTAATTCTACGATGCAGAAGAAACTGTAGCTT:1 + chr2L 8057644 5' - Fw3 388 1 64.36 GGCGACCAAAGTCGAGTAGATCGGTCATATAGATCGGGCATATACATACATATGTACATACTGCTGGCTGGCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 13824322 5' + roo 4 2 74.26 TCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 9996392 5' + blood 38 2 59.41 CCCACACTCATTCTCGTTTCGTTCATTTCGACCGTCGAATAGTCCCATCGTCCCATCCGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTG:1 - chr3R 16235849 5' - flea 141 1 68.32 ACATTGGCAACTTTTTGCTTTCGTTGTTTGAGTGTCATTTGTTGCACTCGATATCGCATAAGCCAGGTAAAGAAGTCACTTTGATAAATTTGTCACTAATT:1 + chr2L 15907615 5' - Ivk 485 1 59.41 GCTTAATTTGGTTTCCTAAGCTCAGCCGAGGCACGAACCGCGCACACACTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:2 - chrX 1399935 5' + P-element 24 1 55.45 GATATGGGAAACGCCCTCTTCGGCACCTGGACTCCCGATGGGGCGATAGAGGAGTTTATACGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTA:1 + chr2R 18110147 5' + Max-element 37 2 68.32 CAAGTGGGAGACTCGGGCAAACAGCTCTGGTCTGTGCTAATGGCTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCATAAGGACG:1 - chr2L 20483620 5' + Rt1a 4737 1 57.43 TTACACGTGCTAAACATTTGCCACGTGTACATTTATATTTGACTAGCCAAAAAGGAAAAGTATATATTCGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCA:1 + chr3R 17121383 5' - R2-element 3391 1 41.58 CTTCAGCCTCTGGCTCCGATAAGCTTTTCGATACCCACTCCCTTTTGTTCGTTTTGGTTTCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAA:1 - chrX 7587833 5' + FB 618 3 64.36 TTTGAAACGATAAACCGTGCAGCAGGTCTGACGCCTGGAGAGAGATCCCACATGCACGATGCTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTT:1 - chr3R 16311698 5' - Idefix 367 2 64.36 AATTAAGCTACTTAATATCGTTCTGAACCAGAACGTATTAAGAAATATTTTTGGATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chrX 2766837 5' - mdg1 402 2 57.43 TGTGTCTCCGTATCCGATATATTGCTATTTCCATCAAGGCTATCACCCAAAGTTTCGTCGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:1 + chr2L 21615608 5' - Tirant 344 2 67.33 CGGGCGGAAAATCTTAACAATTTAAGCACATTTTTCACCAGGTAAGCCAACTAAAGCAGCTCGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGG:1 + chr3R 27273115 5' - TAHRE 10039 1 70.00 AGTCCTCGTTCATGCAATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2L 6177216 5' + pogo 51 1 81.44 TTTTGTTTAAATTAACATTTGAAGGTTGTTTTGAGACATACTGGCTTCATTTTAAGATTTTCTGTTATCGTGTTAAGTGAAGTTTTTTTGTTTCTTTTTTT:1 + chr3L 9738759 5' - HMS-Beagle2 490 2 85.15 CATGCGATTTGTGTGTTAATTTTTCATGAGTCAGCAGCTGAGCTTGATGTGAAACTAGGCTGTCCAGCTTAAGGGGTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chr3L 2182762 5' + blood 7011 1 76.29 AGTGGGCGATTGGTTAGCTAAGACCGATGTGGTTGAAGCGGCCGTGACTGATGTGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGT:1 + chr2L 12539496 5' - X-element 4373 1 56.44 CCAAACCGCCCAGTTGCCTGGATAAACAAAGTTTGGGATTAGAAATTCAAGTTAGGAGCTAAAATAGAAAACGAATCACATTGTTGCGGTTTCATATTCGT:1 + chr3R 16962082 5' - gypsy2 6615 2 60.40 TCACCGAGTGCTCGCGAGGAATACGAACTGAATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAAC:1 + chr3L 1351876 5' + R2-element 3171 1 77.53 ATCCCATGTGCCTGCTCAGATCCCTTTGATGCTTCAGCTCCTTCAGAACTGCAAGGATTCTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 9996372 5' + blood 7029 2 62.38 CCACGGGGACACCTCAATCAAGCTTAAAAACCCTGCACTGGCAATTAAATGGTAAAGTATCTAATCTTTGTAAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTA:1 + chr3R 17317630 5' + Chouto 194 1 76.24 TGGAACAAACTGATAAGCGTGTCCAGGGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTC:1 - chr3R 24901803 5' - R1A1-element 5245 1 73.27 TTTGCTAATTTGCCTTTTACATTGCTGGCTGCGACCCAAACCACTTGGTCTCATAACCTTTATACACATATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACG:1 - chr3R 21535761 5' + G5 4792 1 63.37 TATCTAGCCACTGCACCGCAAAGTGAGTGCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCG:1 + chr3L 5933117 5' + hobo 2647 1 75.25 AATAAACGGGCTATTTACACACAAGTACTCCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTATAAATTT:1 - chr3R 25708618 5' + 1360 191 1 70.30 AACGCGTACGTAATACGCATAATTGAATTAATTTGTATAAATGAATAGTTTAAGTGGCAAGTCGCGAAAATTGTATAGTTGTAGATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 6853788 5' - accord 186 2 52.48 GCACCAACAATTTTAACAACATCTAAATGCGTGTTTACAAGAGTTTTCATTTAGATGTTGTTAAAATTGTTGGTGGATAATAATGATAATGCTGTGTCCCC:1 + chr3L 21870374 5' - Rt1b 4753 1 68.32 GACACTTGGCATTTCTTTTTGGCCAGCACCGTTAGCGGAACATTTTCTTGACATCGTGACTTGTTGGCTGTCATCCGGATAGTTGGTAGTATGTAGGGTAA:1 - chr2L 5450788 5' - G5A 167 1 61.39 ACCTCATAAACCCCGAGTTGCGTTCTTTCCCCCCCACATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCC:1 + chr3L 13214546 5' + Rt1b 4808 1 64.00 TGGTCGCCGACGCGATTCTGACTCGCCCCGACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCT:1 - chr3L 23678191 5' - G2 408 1 66.34 TGAAAGCACAAACGCAAGACGAACGAGCCGAGGAAAAGCTAAAATGTAATAACTCTTCTTGGGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2L 12991380 5' + hobo 15 1 64.36 ATATTAGCACAAATCAAATCTCTTACAGCTATCATATGGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTCCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGT:1 + chrX 20385032 5' + Bari1 45 1 62.38 GATCAATGGCTCAATCAAGCCTTTTGTCTGCTGTGGATCGCAGCACTTGTAATTCAAATGCGTCAAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCAT:1 - chrX 9590384 5' + Ivk 5022 1 70.30 ACATNTTGAATTATCGTTTAGCAAATGGTCAATATTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAAT:1 + chr3L 13285559 5' + Quasimodo 424 2 71.00 TTTCATGTGACAATTCAGTTACTATCACTGCCCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 - chr2L 9267257 5' + mdg3 5308 2 69.31 CAATAACAACAAATATAAGCATTTTGAGCACTAGCTGAAACGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAA:1 + chrX 9693673 5' + HeT-A 237 1 60.40 AGAGCTGATAAGCAAACACTTTATGTCAGCTTGAGTCTGGGAGTCAGGCCATGTTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGGGAGGAGGGCACGGTAGGAACCGTT:1 + chr2L 20799757 5' - G-element 273 1 52.48 TGGGGAAAAGTGGGGAAAAGGAAAATGTTTGCAACTGTAGCCTAGGTAAACAAAAGAACTGGGAGGAAAAGCTTGAGAATTTGTTGCCTGTGAAACACCGG:1 - chr3R 17249699 5' - Gypsy12A_LTR 1993 1 69.31 TTTTAAAATTCAAACAAAAAAAATGTCTAGTGCGTAAAATTGAAAACTAAAAACAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGAC:1 - chr3L 5157585 5' - Rt1b 4999 1 61.39 GCTGATATTAAAAGTTAAACAAATAGTTAAAATGTAGCATTTATTCAAGAATTCAATGCCTAGCTATTTCAGATACACAAACACACACACACACACATGCT:1 - chr2R 11543511 5' + accord 7030 2 74.26 CGGAGCCAATGGCACTTTAAGTTAATGGCGTAAGCACAAACGACAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAG:1 - chrX 15204605 5' - R1A1-element 4958 1 63.64 TTTTTAATAAACATAAAAATAAGACAACTTCCACATAATACCTCAAAAAAAGGGCACCATCCACGAAACTAAGGTCCAAGTAAAAACCGAAGAGAGCTTTA:1 + chr3L 7814344 5' + Fw3 110 1 72.28 TAAACAATTTTTAATTGAGCCGGGAAAAAAGTTTAAGCAAATATCGAAAAAACGAAAAATCCATGAAACACAATGAGCACACCATTGTTGGGCACATGAGT:1 - chr2L 20955614 3' - McClintock 475 2 76.24 TTTTAAAGTCTTAAAAAAGTAAAGCAATGTTATAGAAAATGCAATTACCAAATACAAAATAATACACAATCAAAAATTTACCTACAGCTAACATTCTTGCA:1 - chr2L 2481012 3' - looper1 244 1 56.44 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACCAACAATGCAGCAAGGCCAGCGG:1 + chr3R 16372452 3' + roo 9030 1 71.26 ATACAGCGAACAGCTCTTTTCTGCTTATACAGTGACAGCCGACAACTGTATGTGTGCACACTGTACCGTATTTATATTAATAGCCAAGCCAGTGGTAGAAA:1 - chrX 14787040 3' + 1360 129 1 56.44 GCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGCCAGGCGTTATCGTGGCCGAAACGGGCGTTGTGGGGCTGGTGTTCTCCT:1 - chr2R 17600622 3' - 1360 2977 1 53.47 TAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGCACTCAACGCTTGCGGAAGGTGTTGTGCCCCACCAGTGTAGTGGTCCTCAAACGCAGCC:1 - chr3R 1922116 3' - diver2 155 2 65.00 GCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACACTCATTTTCTCTCAGTGCACGTGTCAAGATTGGAGGCAATCGAGCTGAATTAGATGCTGCTG:1 + chr3L 16393365 3' - 17.6 222 2 66.34 CTAAGTTTGCTATGAAGACAATGTTTGCGCTGCAATTTGTTTAACTTTTTCTGCCAATTTTCACAATTTAAAATGAGCGATAAATACAGCGAATGGGAAGT:1 + chrX 6930634 3' - transib4 233 1 65.35 CGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGAACCATATAAAAGTCACTGTAAATTTACATTAGGAATTAATGAAGTTGCATGCCCCCT:1 + chr2L 9087162 3' + X-element 4542 1 62.38 GTTGTTCTTTTCACATTCTGATTAGTCTTTTACATTTCTATCGATTTCATAGTTGCCGTCACGCCCAAAACCGCAACTGCCACGCCTACCTACCGCCCCTT:1 - chrX 12250164 3' + INE-1 277 1 57.43 TGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTATCATGACAGAATGATTTTGCATTGGGCATGACGTG:1 + chr2R 17684557 3' - I-element 5188 1 63.27 GAGATCTCAGGCACTATAAAAGCTTGAGGTTGGGATTTGCCTAGGTATGCTAATAAATTAGGTGGAATATATATGGGTGGCGCACATTTAGTTAAACTCTC:1 + chr2R 5186696 3' + INE-1 148 1 67.33 GGAGTAAGCGTCTGGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTTGAGAGTGCCTTCTCGTAGATACTGGTATGGCGGTCGT:1 + chr2R 24924490 3' - BS 4882 1 60.40 ATTCTTGATCAGGATCAATATCCGGGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTAGAGATCTCTTTCTTCGACATGAAAAAGGAT:1 - chrX 21450621 3' + INE-1 86 1 73.91 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGCATCGACTTCGGCTTCGCGAGAGTCCAATTCAAGGGAGGGCGCGGGCAGA:2 + chr2L 222277 3' + P-element 2877 2 67.33 AACGAATAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTGGCGTATATTGCAT:1 + chrX 5726801 3' + roo 397 1 67.33 GAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATGATTTTCTTTTTGTCCCCCATTGATTTCCCAGCTCCTAAGACTGCAAATTCAT:1 - chr2R 8199088 3' + F-element 312 1 56.44 TTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAAAAACAAGCGAAAACTCAATAAAATATGCTGGTGTTTGGTTTGGTT:1 + chr3L 9922191 3' + I-element 350 1 69.31 AGCGTCAATACATTGTGATACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAATCCGATACTCCAAAAACAGCAAAGTGGACAAATCACGAAG:1 - chr3R 8052939 3' + Stalker4 57 4 65.66 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTGAATAGAAACTTA:1 - chrX 17479561 3' - I-element 38 1 55.45 GGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCACTGGAATTCACTTTTCGCACAAAAA:1 + chr3L 11216605 3' + F-element 441 1 77.00 TGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCTACCCATCCGAAAAATTCTCCATTCCATATA:1 - chrX 7960270 3' + R1A1-element 33 1 69.31 CAAAGGGAGTTATTTATTGTAACGACCTTAGACATCGACGAGGCAAAACAAGAAGAAGACGAAACACAAACAAGCAACTTGAAAACTTGATGTAGGTC:1 - chr3L 4719976 3' + I-element 488 1 63.27 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGG:1 + chr3R 25814757 3' + 412 448 2 68.69 CATCATGGTGACGATGATCACGTGAGCCCCATCCCAAAACTCTCGGATTCCATTCCATTCGCTTATTTACGCTCAAACGAGCTCGTTACAAGACCC:1 + chr2L 5223102 3' - Rt1a 4718 1 62.50 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGTGTTGTGTGGTTGGGCTTAC:1 + chr3R 31996734 3' + mdg1 365 2 79.21 AACTGTGTTGTATAACAACACCTTGTAGTCCAATCGTGGAGGTGGAGAGCACACATAAAAACAGTGGTTCTAAAGGGGGAGAAGGTCTACGGAACTTGGCT:1 - chr3L 9782268 3' - Doc4-element 2565 1 71.29 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTAACCCAAC:1 + chr2L 13670336 3' - BS 5004 1 60.87 ACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCAAACAAATTTGACAAAATGAAGCCCCTTAGCAACGTAAACGACCT:1 + chr2R 3921584 3' + 1360 131 1 73.00 GACTTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGTCGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCCAATTAGAGGGTTCTCTGCCCTTCCGTATAAATGATAAAATTCTTT:1 - chr2R 7888876 3' - baggins 4973 1 77.23 TCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCGATCGTGGGAGGCGCCGACTCAGTTCGATGT:1 + chr2R 4879051 3' - G-element 4 1 78.00 CCATCNGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCTTTGGACTGGCATCCAAAGTAGTCTCAGTTGCAGACCCACTTTGGAGCACTTCCCCATGC:1 + chr2R 14225547 3' + transib2 2514 1 71.29 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTACACAGATACCGAAACGCGCGCAAACACACACACACACACACAAA:1 + chrX 7978951 3' + hobo 2909 1 57.00 GAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCACTGTAAGATCAAGCATGCGG:1 - chr3R 18426186 3' + P-element 227 1 23.76 CACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGAGTGTATAATCGATAATTTGTTGATACAGGTTCTCGTTCTTA:1 + chr3R 13373154 3' + 1360 479 1 64.36 TGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCTCGCAAGAAAACACATTAATCACATCGACAATTA:1 + chr2R 22524691 3' + Doc 4438 1 76.24 CATTAGCCACGAACACAAAAAAAGTGGAAAACAAACTAAAAATTTTGCCGCCCAACGGCCGAACCCACGGCAGTGCACAGCAGAAAAAAGCAGTGCAGAAA:1 - chr3L 25334933 3' + gypsy2 389 1 64.36 CTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTTCTCTCCCAGCTCTAGCTGCTGTTTTTCTCTCCACCTAAGTTTTTGCTTTGTTTCAAGCTATGAAATGTGTTTT:1 + chr3L 3632878 3' + Doc 337 1 78.22 AGGGANTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTTGCTGCATTGAGGAGGCGTTGGGCACATTGATGTTC:1 + chr2L 15269707 3' - BS 4884 1 63.37 CCTCCGTTTTTGTATTCTAGCTCCTCTACTCTTTTGTCGCAAGCCGCAAACTTTTCCCTTTTTTGTGCCCTTTGATGTTTCACAATAGTTGCGAAATGAAG:1 + chrX 15176717 3' + Gypsy12A_LTR 2073 1 59.41 CACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTCTAGTTCTATGAGTAAAAACATATGATATAGCAAAAACTTCAACAAAACTAATGACTTTG:1 - chr2L 12190668 3' + TAHRE 10317 1 66.34 ATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCCACGCGGATATATCTTGATATCTGGCATATATCTGAGGCGACAATTGGG:1 + chr2L 5021390 3' - Bica 4881 1 54.46 ATAACCAACTGTCCCTGGTATTTAAGTAACTCCACACTCCATAAGGACCTCAATTACGCCGCGTCCTCGACAAAAAGCAAATAAACATCGGCGTTACGCCA:1 + chr2L 4318336 3' + Helena 1156 1 57.43 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGTTATAGAAACTGATGTGCTTTGAATTCAATAGATAT:1 - chr2R 13645321 3' - jockey 4691 1 60.40 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTT:1 - chr2R 14121069 3' - I-element 34 1 65.35 CAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAACACCAACCAAGTGTAGAAAAACTGGCTCTCCAGCAACAGTTCTAGCCCAAATCAAGCCTCTGACAGCA:1 - chr2R 4704781 3' - baggins 5195 1 68.69 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGTACAAAA:1 + chr2L 9823689 3' + hobo 2917 1 67.07 GATGAGATGCGAAGAAAGGTGAAGCTGGAGTCGCACAAATTTCCGGACTATTTATTTGAAACCGGAAGTCAGTACCTCCACATCACCCACATCGGCGGTGG:1 - chr3R 23410802 3' + Osvaldo 337 1 57.43 TATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACAATGATGAAGAACGAACGCCACAAAGAAGAGCGCAGCACTGCGAGCA:1 - 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chr2L 15140868 3' - F-element 327 1 53.47 GACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCACCGGCTATTTGTCGGCAATATACCTAAGAATAGAGATCGCGACGAATTA:1 + chr3R 20795228 3' - Idefix 6970 2 61.39 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACCTAACTCCCGCGCTCTTTCTCTCTCTTCAAATGAACGGATCGTCTCCAAGCTTTGAGCTGCCGTAATCTC:1 + chr2L 306566 3' + Tirant 383 2 59.41 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTT:1 - chr2R 18372616 3' - jockey 4699 1 54.95 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAGGTGAGAGAAAAGAA:1 + chrX 8299757 3' + roo 389 2 58.42 GTCTCGACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTA:1 + chr2R 2427624 3' - Doc 13 1 66.34 CAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCGTATCCGTGTAACTCCCCACATCCACTAACCCAATTTTCCCAAAAGTATCCAAACTCAGGATACCTTTGTTATC:1 + chr2L 4641530 3' + I-element 5102 1 77.23 TATAGATATAACTTACTGATTTAGAACTATGTGTTCCATCCTGTAATTGTTGTTGTCTTTGTTTAGGTCTTAGATATACAAAATTTTCCCAAATCTTCCTT:1 + chr4 904769 3' + transib3 300 1 75.25 ATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCGGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAG:1 + chr2R 5424272 3' - 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chr4 1261257 3' - invader4 89 2 68.32 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCTAATGGT:1 - chrX 1399833 3' + P-element 2883 2 75.25 TAAACNAACTAAATATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCTTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGTCGCTGAGGAATAGGCGTCTCAGTTAAA:1 - chr3L 25146532 3' - Doc3-element 4642 1 71.29 TTAAATCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTATTTGAGAATGCTGT:1 - chr2L 11240913 3' + roo 349 2 82.18 GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATTGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAACTCACACACTCATACATACCTGCACTTACCTATTCCGCCCGTCCGTCCAATAA:1 + chr3L 3179314 3' - FB 68 1 56.44 CGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGGGGTGGAGCCCAGGGTGCCATTGAGTTTAGGACCCGCACACATGCTGACAGACCCCACTTACAGTCCG:1 + chr2L 17073602 3' + opus 287 2 74.00 TGTCAATATTGCTGTTGCTGGCGTTGCCCCATAGCTGTGCGCTAAGGTCCGGATGGGTTTCAATACATCTCTTCAGTCTGAGTTAACCTTTGCTAAGC:1 + chrX 844555 3' - F-element 4295 1 68.37 AGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTTGGTAATCACTGTAATCTAACGGCAACATGGACGTGTATGGCCTTTGCATTTTTTCATAAACCTCATA:1 + chr4 902490 3' + invader4 7 2 73.27 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGCTGC:1 + chrX 3485716 3' + P-element 2865 1 53.47 ATAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATGTTTTGTTGTCTCTCCGCGATACGATGCATATAATCCCGAAAGCGCTGGATTGGGCACGCCTGTGTAGAACGTC:1 + chr2L 22688361 3' + Cr1a 444 1 68.32 TTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACACTTCCCGATCGAATGTTACTTTGGCTTCTTTGTTGGCCTTTGT:1 - chr3R 30546347 3' - P-element 416 1 48.51 GGTGGGTTTAACTTTTGTTCTTTATGTTTCTTCGTTGTCTACGTGAACAGGACTAAAGCCTTGCCACAAGTCAATGGATGCGAAAGCAAATTAGCCACAAA:1 + chr3R 22648319 3' - HeT-A 278 1 73.27 CCCCCTCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTTGGCGAGTACTTCCTTAAGTTGGGCTGTGGTGACCACTATAGTTATTCGGCAAATTTGCAGA:1 - chr3R 20107255 3' - gypsy3 6550 1 68.32 CCACAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAAACAACATGAAAACAAAAACACCCGCACGCCTCATCTGCATCAACATCATTTGATTTTATCGAGTTCTTCAGGCT:1 + chrX 16487204 3' + G2 3074 2 51.49 ACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTACGATTCAATTACCCTGCTTCATAGAGGCACTTTATGCAT:1 - chrX 16163570 3' - mdg1 118 2 69.31 CTTTTTCTCCGATAACCGAATTATACCAAACTTATCGGGTGCAGCGGGCGGTGAAGTTGGCAGCGAAAAGTGGAAAAACAAAATGAATGTTGTTGCTGGTC:1 - chr2R 10216836 3' - gypsy12 166 2 65.35 CCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCACTACCACCGTGGGAACCACTCAATCGACCATAAC:1 + chr2L 16814610 3' + R1A1-element 4893 1 65.35 GTGCTGGTAGTTACTACAGCCAGGCTTAGGAGAGTAGGCTTGCCTACAATGGTTAACGGAGTTTGTTTTGTGAGCACTTTTTGGCAATTTTCCATTTGGGT:1 + chrX 3628002 3' - Doc4-element 263 1 65.35 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGAGAGGCGTGGCCGCCGTTGAATCAGTCGCATAACAAAGGGCTTCG:1 + chrX 7853685 3' - jockey 4768 1 52.48 CAGGTCGCACTCCCTTCCTTAAGTGTAGGCCATGTGGGCTCCTCCTTCCATCCCCTGACAACAATCGGCCATCGATTTAACTGTGGCCAAATTAGGG:1 + chr2R 22213582 3' - Rt1b 4937 1 61.86 TTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACGGATAGCGGAGAACTTGCAAAGCGTTTCATCCAATTAGAGAGTGTTGTTTCATTGTTAATTGCTCCAT:1 - chrX 1702395 3' + blood 7267 2 79.21 AACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAGTGGAAAAATCATGCAATGGCCACGGCTTTGGCTTTTGGCTTGGCTTGGCAGTT:1 - chr2L 14223921 3' - pogo 88 1 57.29 GTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAGATATAAGAGTAAGGCGATAAGCCCGGAACGTCACTG:1 - chr2R 8645220 3' - Cr1a 4186 1 64.36 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAATACAAATGAAAAAATGGAAACCGGCACACAAAGCAGCCGCACGGCATTTAAAAAGTAAAA:1 + chr3R 27406545 3' + jockey 4978 1 46.53 CTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTGCCACCAACACCAACCAATAAGGCGCTGCCACG:1 + chr3R 21031692 3' + F-element 348 1 74.26 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGAGTTTATCTTTGTGATTTTCTTTCTCATTTAAATTTCTTACAAATTTTTAACATGAGGTTGAAGCTAAAG:1 + chrX 5104705 3' - roo 8670 2 71.29 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTCTCGTCTATGAAAATTAACAGTTGATTTAAAATATAATTGTCATTATGGTTTTTGTT:1 + chr3L 87195 3' - jockey 26 1 59.41 GAAGCTGAGCAGGCTAGGACCGAGATGACGAAGGCCAAGTCCAAGGAGGACAGCTAACACGGTCCTGGCCACCAGCGGGATTCAGGACATGGGACACGGAA:1 - chr3R 19492809 3' - G3 275 1 65.35 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACTCATCACCTTATTTCATATCATTTAAA:1 - chr3R 26404493 3' - 412 49 2 73.27 CGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACTTTTGAAATCCACCCGGCACCATCATTCGAGCTATGTTTCGGATGGGTAA:1 - chr3L 15325114 3' + F-element 311 1 56.84 GTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTAAAAAGTGGCAAAGCAAAAT:1 - chr2L 11157457 3' - X-element 4458 1 80.20 ATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGTGCAGAGCTGTGTGAGTATGCTGACCTTAGATACACACTAA:1 + chr3L 10192043 3' + Bica 4907 1 55.42 GTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTCAACACAAGCCAACCAGTTCGGCGAGGCCACGGCGACT:1 + chrX 18825577 3' + Doc 477 1 62.38 CGATTTGGAATGGCCGGCACGATCTGTCCCCTTGTGATTTTTTTCTCAGTGCAACGGCTTTTGTTGTGGGCGTTGCAGAAGGTCGTAAAACTCGAGTATTG:1 - 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chr2R 8158728 3' - Juan 14 1 73.27 TAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAATGTCTACCCCGTAAAAATCTCGGAAAAAACAGATTCAA:1 - chr4 493091 3' + 1360 3284 1 62.38 CAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTGACAAAGCACCGACCTCAAAGGCCGATGATCGTCTCCAGAA:1 + chr3R 9505548 3' + R1A1-element 353 1 59.41 GCTCANTTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCT:1 - chr2L 18112505 3' + transib2 2795 1 53.47 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCAAAAGTAGCGGGTGAACCAAATGCAGTGGGGTGGTGAGAAGGT:1 + chrX 13747420 3' - P-element 29 1 50.50 GACGACCGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGAGTCTGGTCTAGATAAATAACTTTATTA:1 + chr2L 17862670 3' + F-element 234 1 71.29 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCT:1 - chrX 1399839 3' - P-element 10 2 69.31 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCAGATCAT:1 + chr2R 14582903 3' - roo 28 2 54.46 TCCGACCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAACTTGATCAAACTTGTTAAAGCAATACAATCAACGGCATCCGAAACAACAAA:1 + chrY 1687441 3' + gypsy4 475 1 60.40 TATTAATAAAATATTTTATTAAACACACGCGCCCCCTCTTACGACCCCGCTTACCATACGCCCCCGAACCCCGCCCATCGCGTTCTGCTCCCCTGGCTGTT:1 - chr2L 18888117 3' + transib1 1930 1 67.33 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGC:1 + chrX 3485713 3' + P-element 2862 1 51.49 TAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACAAACTGCTCGTCGAAAACTGCGAAGGGGCTTGGATATTAACGTAAAATCCCAATACAAATATTTT:1 - chr2L 17602158 3' + roo 8773 2 75.79 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACC:2 - chr3L 13326687 3' - transib2 39 1 65.35 CCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGAAACGTCACCTGTCATATTTCACCTTCAAAAAAATGCTGCACTGAAAAATAATTGCTGCGTTTATT:2 - chr2L 15509373 3' + mariner2 729 1 67.33 TGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCA:2 + chr2L 3244999 3' - rover 36 2 70.30 AAACAAGCAATGTAAACCATGATCAGGGGATCGGCTGGTCAGGACGACCGAGGTGATACTCCTCTAAAGGATGTGCCATTTCAGCAACATGAGCCCCCC:1 - chr2R 19084163 3' + invader3 5134 1 51.52 ACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCCGGTGAGTTGATGCACTTCTGGTCACAGCCGCCATTGTTCTTGCTGCACTCGTTGATGTCCACG:1 + chr2L 6982115 3' + hopper 298 1 67.33 GGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTTATTGATTGATTGCGATTGTGGGCGGATGGTGTTAGCAATTAAGTCAACAAGTCTACATGGTTAAGTGA:1 + chr2L 21120012 3' - G-element 4229 1 73.27 ACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTAATGATGTCGCACTTTTGCTTTCGGGGGAATATCAATTTTGTTCTTCTTGCTCT:1 - chr3R 9144237 3' + HMS-Beagle 6708 1 54.46 ATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCAAACCTAATTCATCAACCTAAAAATTCGATCAGCATGTTGGTTAAGGTATATCATGTGTTATTTACAA:1 + chr3R 6684518 3' - G4 3536 1 72.28 ATGTCNGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCTTATATCACACGCATGCAGTATAAGTTGTATAACTGACAAGCTGCAGTCCCGAAATTAATTAAACC:1 + chr2R 18060551 3' - hopper 1253 1 67.33 GTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGCTAATTTTATTAAAAATAGTTAAGAGTACCTTAAACAGCTACCTAGCAGTTCACCCCACCCCAA:1 - chr2R 16839405 3' - I-element 114 1 59.41 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCCACACGCATGTGAGCCGTTCCAAATGCACAGCTAGAAATAATATCAAGCAATA:1 + chr2L 1629658 3' + hopper 1395 1 55.45 TTTTCTTTTTTATTTAAATAAAAAGTGTTGTTTATAAATAAATAAACAACAAACTGCATCCTTTATAAACTAGAATTGTTCAAGTTTTAAGGGAAAAAAAT:1 + chr2R 5355892 3' - transib2 2634 1 70.30 CCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATTTAATGTATTTATATTTATTTATAA:1 - chr3L 20987236 3' + diver2 168 2 53.47 AACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAATGCGCGGCACCTTACGGCTAAAGTTCAATAA:1 - chr2R 8999188 3' + F-element 300 1 71.43 GTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCAGAGTTTGTCATTTCGCTTGTTTGACTCATCC:1 + chr2R 21785207 3' + diver2 101 2 68.32 TAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATCTGGCAACTCTGGCCTAAAAACAGTATTCGAACAGTATTTGAACACCATCAGGCA:1 + chr2L 17551850 3' + Transib-N1_DM 442 1 37.62 CGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAAAGTTACATGA:1 - chr2L 9796614 3' + invader4 2737 1 61.39 GAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTGGGAAATAACAAACAGTGGAAACGTCTGGCGGCGGCGGCTGTTGTGACGACAGCGTCAGCGGCAACGGAGGCTGTGGCG:1 + chr3R 3382152 3' + gypsy8 446 1 52.48 CCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAGTCCACGACGGGCGAACAATGCTGAT:1 - chr2L 10633051 3' + G5A 2699 1 79.21 TTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCACTTGCGCTGTCTTCATTTCGAGATCGTCGTTTTCCATCCAATGCGCTTACA:1 + chr3L 13005976 3' - G4 179 1 79.21 ACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTTT:1 + chr3R 5775741 3' + invader4 294 2 59.41 AGGCCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAACAATGACAGCGGCACAGAAATGCGAAGGCCA:1 + chr3L 20050844 3' + G6 332 1 68.32 CCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATATTCGTTAATTAATTGAACTAAAACAGAACTAAAACAGAGTTTCTCAG:1 - chrX 20751219 3' + HeT-A 6061 2 54.46 CAACGAAACTATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAATTACATCGTGTAGTTGCCATAATGATAGATTTCAAAAATAAATTGAGCAAATTAT:1 + chr3R 25970588 3' + Porto1 4421 1 67.33 CTGGTTCTCGTCAAGGGGGGCCGTATGATAAGGTCTTTCAGCTGTTTTGATGTGTCTCCTTCGATCGCAAATGAATTTCTGGTGGTCCTTAAGTATAAGTT:1 - chr3L 1470932 3' - BS3 1593 1 58.42 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACT:1 + chr3L 15853526 3' + jockey 4964 1 53.47 AGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTGGCTAATGTGTAATTTCTGAACAAAGGATAAAAGACTAAAGAAATCTAAATTGTTCGTTATATGTT:1 + chr2L 7642543 3' - Stalker 148 4 71.29 TGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACAACGTCCGGCGTGCTAACCACC:1 - chr3L 8287710 3' - 1360 493 1 79.21 AATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGGCAAGCTTTATTAGCGTCACAAAATC:1 + chr3R 14832365 3' - 1360 478 1 68.00 AGATTTGGCAAGTTGTGCGGGTTGCATGGGCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTGGCAAGGTAATAGGTTCGCAATTTGTACCAGTTGTTG:1 - chr2L 2738720 3' + HB 1223 1 65.35 ATCAGACAAAATATTGGATTCACATTCTGATTCCGATTCGAGTTCAGATTCGGAAATTTATAATGTAGAAAGAAGCATGAATCATATGGAAAGGAAAAGCA:1 + chr2R 19423124 3' + transib2 2516 1 72.28 TCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCTCCGGACTGTCCGGGTCTTATGTAAAGCAATACACAAACACACACACACACA:1 + chr3L 7344648 3' + I-element 4902 1 57.43 AGTAAAGTCATCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTAAGCCCAATATTACTTAAATAATGCATGCCAAGTATATAAGTAATTGATAGTTGTAGCACCTTACT:1 + chr3R 15814742 3' + roo 401 1 66.34 AGCAAGAGAAGGTTACCATCGCAAAGATTACAGATGGATGTTGTGTCTTTGCTGATATACTTATGGGCTCTATGGACTTGGGGAAGTTGCAGTTGGGCTGG:1 + chr3R 22532841 3' - Ivk 448 1 76.24 ACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATATAGTGTAACACCCACACTTTAAAATATTTTTTTCGACATTTAAATTTCTTTGTTTTTGCTCATCTTA:1 + chr3R 4690934 3' - invader2 4868 2 61.39 GGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACCGCTGGCGGGTCTTTTGGACTTGCACTTGGACTTGGAGTTGG:1 + chrX 21512232 3' - F-element 4452 1 58.42 CTTCGGCACTAATTTAACCAACGAATTTTTTTTTGCAACTAATGAAGACGATCGCGTCGCCGCTGCATATTTGATTGTTTGAAAGTCTCGAATGAAAGTGC:1 - chr3R 11646025 3' - HMS-Beagle2 421 1 70.30 CAGAANTGAAACTTTGTACATTTTGTTGGGAAGTCGTGACTGTACCGATTAAAGAAGGATGACTTTCCCACCCTAGCAAGCGCTCTTGGAATCAAGCTGGG:1 - chr3L 23768514 3' - transib2 2771 1 71.29 ACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGAGCAACAACGGGCCATCGGCAATCTGGCGACCAAGCGATAGCT:1 - chr2L 10029335 3' + HMS-Beagle2 6810 1 67.07 TTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGGCGGTTTATGGGCGTGGCAAAAAGGTTTTTGGCATATCGATACCTTTTTATTGAGCACAATTCCGGTGATAG:1 + chr3L 12859955 3' - INE-1 250 1 69.31 TTGATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATAAGCGATATCCCGCCCTCTTCACGGACGTCCACTACCATCGCGCCTTTATTG:1 + chrX 876422 3' + Bari1 1247 1 60.40 TTTAAAATAAAAAAATAAAAAAATTGTCCAAGACTCTGTCTAATTCAAATGCAATCCAGGCAATTCGTAACGACCCTACACACAAGGTCACCGCTAAGAAG:1 - chr2L 22534992 3' + TART-C 11100 1 45.54 CTGGCGTTGCCAGATCAGAGTTAAAAAACGAGACCTGTTTTCAGTATTAAAATACCAAATGGGCGCGACCACCAAGACGTTCATCTGCACTGCGGAGGAGC:1 - chr3R 7154773 3' + Rt1a 253 1 66.34 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGAAGTAAATTTATAGCAAATGATGTGGTTGCTGCCCGACTCCTTGTGGCTCTGGG:1 + chr2L 12237105 3' + jockey 4973 1 56.44 ATGCTGGTCCGAACTCACCACAGGACAAGCATTTGTCTCACTCTAACGCATCGTCGAGCCGAGGCTATGTAGAACAGGCAAAAGGGTGCAGCCCATTGGAA:1 + chr2R 20948511 3' - invader6 214 2 81.19 GACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCCCTCATCCATTCCTACACAGAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 4394287 3' + mdg1 90 2 67.33 TGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAAAATCAATAGAAGAAGAAGAAGGGTAAAAGAATTTGGAATGACTTACCGGAATTTATTTTTGCAAAG:1 - chr3L 23773284 3' + R2-element 462 1 73.00 CTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTTACATTAATCTTTATCATCATATTTTCTTGATCTTATCAAGCATGAAATTTAAAATATG:1 - chr3L 12671887 3' + Ivk 58 1 79.21 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCCGGGCTAAAATGTTTTTC:1 - chr2L 796741 3' - jockey 22 1 62.38 ACAATGCATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCCCGCGAGTGCCAAATCCAAATCCACATCCAAATCCATATCCATGAAGCGACTGAGGCAACCAAGCAGCC:1 + chrX 8009800 3' + Doc3-element 291 1 61.00 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATA:1 - chr3R 19535712 3' + hobo 2888 1 74.00 GAATATTTGTCTTTAGAGTATTCAGCTAGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCCTGTTTGGCGCATTGTATTGC:1 + chr2L 2514413 3' + 1360 401 1 63.37 AAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCTCACATGTGGATGCCGATGGGGCATTAGCATATAAGCCT:1 + chr2L 2464727 3' - R1A1-element 5312 1 66.34 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGA:1 + chrX 3485706 3' - P-element 32 1 45.54 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGC:1 - chr3R 14913159 3' - blood 40 2 62.38 CAGCATGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAATGTGTAGCTTAAAAGATATTATAGATTCTGGGATTTATACCCATTTTACAATGATGACACTAA:1 - chr3L 27159968 3' - G5A 2809 1 64.36 CAAATTTAACACAATCAATCAGCGAGCATATTTATTAAGCAGAAAAGTATTGAGAGAAGCCGATCAGGATAGTTGCTCCGCAACGGCGGAAAATGGAAGTG:1 + chr3R 11494457 3' - NOF 473 1 76.24 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATTTGTTTTCCACTTG:1 + chr3L 19510802 3' + roo 9033 1 62.38 GATAAGAAAGCTAGACAGACAATGATTTGGGCGGTGGCAAAAGTATTTAGGCATCACATTTAATTAGTTCGCATTGCGTTTGGTTTGATTTTCCTAAGTTA:1 + chrX 13880239 3' + Tc1-2 171 1 70.30 ATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTC:1 + chr3L 19339401 3' - Tc1 55 1 73.27 AGATTTCATCTTCAAAAAAATATAAATAAAATACACCATTTCTAAGCTCGTGTCAACAATCGTTATAATAATGTAGAATACCGCTGGCTTAACTCCAG:1 - chr4 1138605 3' + mariner2 778 1 78.57 GCGCACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGATAGCAGACTAATGAGGTGGATACCTGTGCAATAATTGCTGCCTGGTATTTTGCGGCCAAATAAAACGCACT:1 - chr3R 28534774 3' + 1360 134 1 65.35 TCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATGATTCTAGTGAATTCGACAATGGCGGTCCATTTTAGTTTATATGTACATATA:1 - chr2R 5956146 3' - Cr1a 4161 1 61.39 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTATCTGTATAAATAAACTAAAAGAGTGG:2 - chr3L 8763243 3' - jockey 58 1 78.22 ACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCCGAGTGCTCCGTCTTTCACCGAATATCCGCACTTTTTTCCCAGGCCCGATTTCTGGGCCGC:1 - chr3R 31622517 3' - Ivk 4946 1 68.32 ACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTATA:1 + chr2R 5206901 3' - G4 3721 1 74.26 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAG:1 + chr2R 14713642 3' - P-element 49 1 32.67 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTCTGGCTGTCTGACTTCAACCCAAGCGAGACAGACAACAAAAAGCA:1 + chr3L 16150775 3' - P-element 29 1 50.50 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCCCCCGCGTCCTCCAAAGCCGCCGCCTCCGCGTCCGCCGCCACCACGT:1 - chr3L 21835739 3' + mdg1 393 2 53.47 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCATTTTAATACGCTTAAGTGCACGGCGAGTCCCTAAAACTATGCTATGAAAAATAGTTCAACAACTTTAT:1 + chr2R 13314201 3' - jockey 9 1 76.04 ATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGCCGCTCTCGTGCAACTTCGTTTCCTCTTCGGCTCGTCATTCGGG:1 + chrX 3778171 3' + Doc 322 1 58.59 AATCTTAAATGTTCAATAAACGAATTAAAAAAAAACTCTTTAAAGTCGGATACATATTGTTAATAAAACTACGCATTTTACATTTACCACTCATTTGGTAA:1 + chr2L 20463555 3' + Rt1c 5409 1 55.45 CAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTGTTCTTCTGTCTTCTGCCGAATATATCAATTTGCTTCTCTTTCAGAAGTCAGTTCGTGTATGAGATTCTT:1 + chr3L 9969579 3' + Gypsy12A_LTR 2008 1 65.35 GCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCCAGCAGCAGCAGCAGAACC:1 - chr3L 22583291 3' + F-element 408 1 80.00 CCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGTCATTGGGCCTGAGGCTTTTGGACTTAAA:1 + chr2R 6739225 3' + F-element 4477 1 71.29 ATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGCGTGGTGGTGGTCGTCACTGGATCCTTGTTGATGTAAATGCAGTTGATGATGGGCT:1 - chrX 4559761 3' + jockey 14 1 56.00 TAAAGCGAAAACCGGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAAT:1 + chr2L 5710 3' + G6 446 1 71.91 TTATGCGTGTTCCTATTTATTCACACATATTAGACAAACAAACGACGGCAACAACAAATTGGCCAAAGGCAGCAATAATAGGAAGAGGCAATAACAAG:1 + chr3R 31066110 3' + micropia 155 2 79.59 CGCGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGGTTTACCAAACG:1 + chr2L 9823680 3' + hobo 2889 1 77.23 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATAATTTTGGCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTC:1 + chr3L 9908582 3' - roo 49 2 55.17 GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTTCCTTCAGCCATCTATGTAGTTATATG:1 + chr3L 13888710 3' - copia 4882 2 64.36 ATATATGTACATATGTATAAATAAACAAGCTGAGTTGCCTCGCCGAGCCACAGAGTCAGATAAAGAACGAACCAAAAGACGAGTTGTTAATGCTGGGATT:1 + chr2R 16972570 3' + invader3 5086 1 79.00 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAGCTATATACATACGTACATATTTATGTATGTATGTACTTTTGCCAGGACTGGTTTGTAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3R 23723195 3' + Transpac 299 2 69.31 TCTGTNGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGTCTGTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTTCGTTGAGCTACAGCGAAACGGAAAAGAGTAAAAGCGGG:1 + chrX 11679168 3' + invader4 2841 2 56.44 TCTAATTTGAGTAATTGGTTCTTAGGAATTATAGTTCTGATTTTATAAATATTATGCTTAATATTAGTAGTAAGTTTCCTTGCCGTTTTAGTAGTGCACTT:1 - chrX 13029152 3' + Circe 491 1 63.37 CCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAACGAAAACAAAGCGTTTAGATAACCGCAAAGAGCAACAATGATAGCAACAACAAAGACGGCGGTTG:1 - chr3L 18521502 3' - R1A1-element 234 1 65.35 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGACACTGACACGTACCGCACTCACACATAAACCCGCACACCATCCCTACCATGC:1 - chr3R 19535687 3' + hobo 2913 1 47.00 AACTGATTAAATATAAATAAATATAGAGTTTGATATAAACTCATTTAATCTTAATCAACTTTTTTCTCTAGTACATTCGTAAGTGTCGTTATTTACATTTA:1 + chr3L 15447133 3' + Burdock 306 1 77.23 GCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTGGG:1 - chr3R 26331630 3' - G-element 16 1 62.89 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTAC:1 - chr4 490246 3' - pogo 37 1 64.36 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAAAAAGGTTGGGAAAAATAATAAG:1 + chrX 697540 3' + roo 403 1 76.24 TGTCGNTGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGCCAGTCAGGTCTTGTTATTTGTTCCATTTCGTCA:1 + chr2R 16416992 3' - HMS-Beagle 6870 2 65.35 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTC:1 + chr2L 13670326 3' - BS 5023 1 53.47 CTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATTGCGTTGAGATAAATGCATCATTTTGA:1 - chr3R 9833015 3' - Tabor 5 2 72.28 AAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGAGATGGGAAATAATCTACTAATTTTTAAGCTTTTAATAATCACGAACATTGTGCCATTGTCTGTTTTT:1 - chr3R 12130316 3' - 1360 3233 1 70.30 ACTTTTATTTAAAACAAAAAAAAATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGTAGTCAATCCAAGGGAGCAGACCAGCTACATTCG:1 + chr2L 2128385 3' + transib2 2631 1 65.35 GGTTACGGTTTTGTGTTTCCAAAACAGCCATATACTGATCAGATCTGCGCTCTCTTTCTCTCGCTCCCACTTCTTTGGGCTTCTCGCTCTCGCTTGCTTAA:1 - chr3R 23887320 3' - invader4 404 1 54.46 TCTTCTTATGTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAAGCCAAGGGAACTGGTAGAG:1 + chrX 2090321 3' + roo 408 1 77.89 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTAATCATTACAGTTTCAGTGCCTACCGCAGGCAGCT:1 - chr3R 22352805 3' + 412 7501 2 71.74 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAATTTCTATTAGGAAAATTAAGCAGCGGCTACA:1 - chr3L 18957594 3' + copia 244 1 67.33 AAGGATGATAAAAGATGATTTAAATTATAGAATACAAAAGAATTTAACTCTTTACAACCACGTATTCAAACACTCACGATTAATCACACTCTCGCCGACAC:1 - chr3R 12303103 3' - Tc3 409 1 64.36 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAG:1 + chr3L 5691283 3' + P-element 2836 1 28.71 ACAGCTGACCGCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTTCTCACCCACTGCTTCAGTCGCCACTACAATTGACCCAGCAATTTGTATGAGTAATTGGCTTCT:1 + chr2L 9447357 3' - gypsy12 45 2 70.30 TCGATCTCGAAGGTGTTTGAGAGACTGATTGCCACTCGGATGGTCAGGGATTATTTCGGTAATAACGGGGATAATTCAATAAAAACCAAAAGTAATTTGGT:1 - chr3R 22477175 3' + BS3 458 1 59.41 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCATCTGATTACTGAATCCTTTACAGTTAGCTCGT:1 + chr2R 21266488 3' + roo 9031 1 69.31 GAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAACCCAAACTCAACTTATAAATAA:1 + chr3L 18359081 3' - R1A1-element 192 1 79.21 CAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGATCTGCACTCAATTCGAAACCCATTTTGTGAAAA:1 + chrX 15679757 3' + X-element 412 1 66.34 AAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATACCTTCCCGAAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACCGTGCCTCTGCCTTTTGCTTCTTTCTCTG:1 + chr2R 1654431 3' + gypsy4 6490 1 71.29 GTGAGGTGATTATGTGTAGTTGCGAGCCGGAGGCAAGCAAGGTGCGATAAGGAACCCAAGAACCTGGTTTCTTTTGAATGCAACATCTCATTAACTTCCGA:1 - chr3R 9709781 3' - G3 482 1 69.31 GCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTCTTCTCGTCCACGCACACTAATCATTAGCTTGCTGTCGCTCTCAC:1 - chr2R 17052773 3' - R1A1-element 252 1 55.45 CGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCCCACGCATTATTAAATATTTAATAACAAAAATTT:1 + chr2L 12854986 3' + GATE 8275 2 66.34 AGACTNTACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATAGCATTGCATTATTTTGTTTTGTGTATAAACATTAGTGCATTTTT:1 + chr2L 16947204 3' - flea 340 1 55.45 GCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAATTGCGAGATGATTTATGCCTCATTATATAACCAATTCCATTCTTATGTTTCCCTGTTCGTTAGA:1 + chr2R 11258768 3' + pogo 1751 1 70.30 GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGAGTTTTGCCGCACTCTGGGTGACATTCCCACGTACGGTAT:1 - chr2L 11985358 3' - jockey 4746 1 63.37 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAAGCATTTTTTTAGTAGATAGTAAAAACATATACGGTTATATGTGG:1 - chr3L 19260774 3' - pogo 25 1 58.00 AATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAG:1 + chr2L 18112568 3' - transib2 2586 1 59.41 AGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAACAAATTATCCTCGAGTTTCCAGCGTGGT:1 - chr3R 13772308 3' + I-element 42 1 70.30 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTTAGTTGCCTATTTTGAGATTATAAATATACTATCTGGTTGACCAGTT:1 - chrX 22748455 3' - Doc 316 1 57.00 AAACTAAGTAATACAAAGGTACTTTTACGTGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATATCACTTATAGCGTAATATGCCCTTAAATGGTAAACCCCTTTAAA:1 + chr2R 17207569 3' + HB 38 1 64.36 CACACACACACACATATTCACACATACTGCGTACGCCAACGCAAAATTACAGACGACATTACATAAAATGCCCGCAAAGCCCCCCCCCCCACACACACAC:1 - chr3R 18622919 3' + accord 188 2 69.00 GGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTTGTGCACATTCCATTCGCTCTTGGCCTTGTTTATTCAATCCGTAACCCGTTAC:1 + chr2L 18275556 3' - F-element 4460 1 65.35 GTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGAGGATAATAGCAGAACGGGTGCGGACTCAGGTGTGCTGGAAAATAGTGATACATACGC:1 + chr3L 21694506 3' + R1A1-element 4992 1 62.38 CCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 21 1 71.29 AGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGAATACAGATTGCGAACGGTTGCGCCGAGAATAGCGCGATCCCGACATAGAGCGGACGCGAGAGTGGG:1 - chrX 22875009 3' + INE-1 156 1 57.00 CCACANGAACTCCTTACACGTAAGATAGCACAGGATATCGCGTTGTGGCAACCACTTCATAATGTGCATGTTGGGTGGCTGGTTAGGCAGTGTTTCGTTC:1 - chr2L 18825585 3' + G5A 2698 1 68.00 TTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACCGCAATCAAACTGCTGCTAACCACGGCCTTGCCTCCCTTGGC:1 + chr3L 16529647 3' - copia 189 2 61.39 GCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAATTGAAATATGTGGATTGCACGAAGCAGCGAGAAGAG:1 + chr2L 15792435 3' - Doc 385 1 67.00 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGA:1 + chr2L 6177222 3' + pogo 2082 1 69.01 GTTTATAACGACAACCAGATTTCCCAGTGCTTGGTGAAAAATGAAACTTTCCATGCACATAGTAAGCATATAAATAGATAACATAGTCGTAAGCGCTGA:1 - chr2L 19517262 3' + Dm88 4061 1 68.69 TATCTTGAGGCATGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCTTCTTTAATTTTGTCTCCCCGCCTGAGCAACCGATGTCACAATAACATCATGGCA:1 - chr3R 25939647 3' - 1360 476 1 57.43 GTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTAGAGGGTTGGTATGTTTTCCGCCCAGATACTCCTCCTTGATCATGTCCGCCCCCTTCTCGGCGATC:1 + chrX 14902090 3' - I-element 5124 1 57.43 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAA:1 + chr2R 8157244 3' + Transpac 270 2 65.35 AACAGCCGCTTCTCTGCCGACTTCACCAGGCAGCGAAGGCGCAATTCATAGCCTAAGAATGTACTTGTACTTTATAATCAAATTAAACACTTCTTAATAGA:1 + chr3R 26984255 3' + gypsy11 4256 2 60.40 ATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCG:2 + chr2L 18112566 3' - transib2 2588 1 61.39 GGTATCTGATAGTCGGGGAACTTGATAAGAGCATTCTCTCTTGTTATTAATTTTTCCCACAGCTGTGCGGACGCATTTATCTGTCCCTGGAAAATCGCACT:1 - chr2L 4981246 3' + INE-1 557 1 55.45 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAA:1 + chrX 2090301 3' + roo 9046 1 54.00 ATAAAGTAAAGTAAAGTAAGGTTGTACGTCTGTCGTCTAAAATTCCATTAATCATCAATTCCCACAATCTTACCAAGATTAAACATTACTAAACATCTTTT:1 + chrX 17017699 3' + TART-A 13110 1 74.26 CGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCAACACTTTGTCTCTGTCACAGCCGGAGGTCCTCTGTA:1 - chr3L 13473088 3' - G2 390 1 64.36 AGGGGATTTGTATGGGTGGTCCGCTCCATGAATACTGAACAACCAACAAACTATAGCTAGCTGTTGATAGTACGAGTATTCAAAATAATTCACTTTCCTGA:1 - chr3L 7470580 3' - Doc 4485 1 42.57 AGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAA:1 - chrX 21087559 3' - mdg3 5256 1 71.29 TCTTTCATGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGTTATGGGTTATTGGCCGCTCGTTGTCTTTTGGGTGCCATAAACCAATGGCCCGAATCGCCATTA:1 + chrX 930650 3' - F-element 347 1 63.37 TCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTTAAAAATGCGTTAACATTTTTGGTGCGTTGTAAGCTTCTTAGACTTTTGCATGAGA:1 - chr3R 15572416 3' - 1360 3168 1 55.45 GACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATTTTCCGCGTCTCAAAAAATCGCGAAAATCTGTTGTCTCCTCCCCACACCAACGCACAGGTT:1 - chrX 19445075 3' + F-element 290 1 65.35 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTCTTTTAGATCAATATTTTACTAATCTTTTAGACATAATACGATCAAACT:2 + chrX 13854507 3' - pogo 24 1 55.45 CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCTGCAGGTCAACGC:1 - chr3L 15099880 3' + Tirant 359 2 68.00 TGAGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCTCACATCACGCAAATTAGCGTCGCCACTTATTGAAATCGGTTTAGGAGGCTTAGTTGGGAATCCTGCAGCGGGCG:1 + chr2R 22281741 3' - accord 7028 2 54.46 TTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAACAATGGCGCGCCATTAACCTTCTGTCAATTTCAATAAGTC:1 - chr3R 29374412 3' + TART-A 13150 1 71.29 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAAGCCAAGGGA:2 + chrX 2090311 3' + roo 9055 2 63.37 GTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGTGGGTGGCTGGTTTTTACGATTGTTCCTGGTATT:1 + chr3L 16401959 3' - F-element 4517 1 66.34 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCA:1 + chr3R 22675854 3' - 412 7107 2 76.24 TGAGACCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGTGTACTTTGCCTTCCTCTGTTATGGGGTGGAATATGCTTCCATTATT:1 - chr3L 25332423 3' - Doc2-element 320 1 51.49 GTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATCGAGAGATCATCCTTTACCTTA:2 - chr2R 4576422 3' - Chouto 482 1 79.21 CATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTACTAAAATTTCCACAAAAATTTCTAAATATATTACGTGTTCGACGAGTATGCGTTACACAAATG:1 + chr3R 18742548 3' - hobo 2520 1 72.28 AGTCTNCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGTTCAAATAGTTGTAAATGGGCGAAAATGCAAACAAAA:1 + chrX 13560812 3' + roo 9069 1 76.24 TCGTTTATATACACAACACCCATGTTTAACATTAAGATTGTTAAATTCCAATTGATGATGCCAGTGTCTAAATAAAAACGAAGACCTAATTTTCAACCAAA:1 - chr3L 9403106 3' - accord2 390 1 60.40 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCA:1 - chr2L 16691152 3' - pogo 20 1 61.00 TTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAAGAGGCTCTTGCCTGTTGCTTCAAAATGTTCGCCACATTTCTAGGCAGACGTCCCATGTACGTACTATGGT:1 - chr3R 31968326 3' - FB 6 1 73.27 GAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGATAGGTGGTATCTTTAGAAGAGAAAGAGCAAAGAACCAGTTAAGGCGGTGTCCAAGAAGCAAAAACTATCGCCGCC:1 - chr2R 12968976 3' + Rt1a 5009 1 62.38 GGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTAATCTGATCCCCAAGAGGGGTAACCCTTTAGAACGCATTCTTCAAATGATGA:1 - chr2R 17613665 3' - G5 4576 1 72.28 AAGTGTTTGGAGATGGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGACCAAAGATCGGGGGACGGGCGAAGGGCAGTTCCAATCGAAATCGGAAAAGAAAACGGA:1 + chr3L 9342521 3' - Doc2-element 486 1 60.40 ATAAAGGGTAGGCGCGAGCACGGATGCGGGGCAGTTGGTACTAAAAATTATTATTTGTTGTTTAATTAAAATTGCAAATGTCATTGAAAAATCCAGGACAT:1 + chr3R 28001673 3' + gypsy8 345 1 71.29 AAAAATCCTGCGAACAATAACGGATGCGCCTTGATACATCCGGAACGCGAACAAAAGGCCAAAAGGCAGGGGATCCCAGTTGTTGTTTTCATTTAAAGGGA:1 + chr3R 28144963 3' + Doc4-element 2670 1 52.48 ACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTC:1 - chr3R 26331646 3' - G-element 35 1 55.00 TTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGAAGGAAACAAGCAAGCTTGAATCGAGTTTTTGGCAAG:1 + chr3L 14516001 3' - jockey 259 1 63.37 TAAGGACAACGCTTAGAAATAAAAAATTGTTGCTGTTTTCTCACTGATTATTTCTTGTGTCGCTGCCGCTTGGCGTTGCTGCAACTAAATTGGCCTTAATT:1 - chr3L 21128716 3' - 297 342 2 70.30 GGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTTGATGTACATGGAATGGAAAAGCG:1 - chr2L 13084116 3' - jockey 254 1 76.24 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAAT:1 + chr2R 4611935 3' + mdg1 377 2 65.35 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATG:1 - chr2R 14121063 3' - I-element 28 1 57.43 TACAANAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATCACTTTCATAAATTGCTGGCCATTGAGTTCTTTATCTAATCGGTACTTAAGTTGG:1 + chr3R 17788985 3' + roo 386 2 57.43 TCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCGCACTTAGGAGCAGCAGCTGGCCTGCTGGGTACTCTGTAC:1 + chr3R 19006026 3' + roo 8795 2 60.40 CTACCTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTATACCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTTTCGGTAAAGACTAAGACCTTGAAGTATTCATTTTTCAT:1 - chr2R 5065221 3' + diver2 169 2 75.25 TTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCATCGGACTGGCATTCAGCGTGTGGCTCAAATTTCACTAATCACCAAACCTTCCT:1 - chr3R 16370744 3' - Circe 302 1 57.43 GCGTGNAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTATGCAGTTTTGACCCATAATGCACCTCTAATTGTGTTGTTTCTCATTCATTATGAATTCATTAAAATATT:1 + chr3R 11999096 3' - Quasimodo 368 2 62.38 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTAC:1 + chr2L 12843392 3' - roo 39 2 64.36 AACAAGGAATGAGCGCCTTACAGATAAACGCGTGCGAGAAAGCCAGAAGAAAGGCCTGAAAAAGCGCAGGGGTGATGTGTACGGCGAACCGATGAATGAAC:1 - chrX 17353310 3' - diver2 4664 2 65.35 ACAAAGAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACACACAATTTTGCATAAGTGTGAC:1 + chr2R 1373163 3' - pogo 54 1 76.24 TTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGTCCGCCATGGTCCACTTGTTTATGGCTTACGTAACCTGGGTGGCAAAGGA:1 - chr3R 29298129 3' + F-element 347 1 58.00 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGACGTTGC:1 + chr2L 3621146 3' + 297 358 2 63.37 CACACACACGCACATTCACACACACACGTAGACAGTATGCTGATATTAAATTTTATGTTAATGTAATTTGATTTCATTTGCTCCGCCCACTCCTTTCATGT:1 + chr3L 9961085 3' + accord 190 2 77.23 TTTGTGTTCTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGATGTTTTTCATTATGGCCAAATAATTGAGTTATTGCGACTCGACGAGCATC:1 - chr3R 27107873 3' + Cr1a 205 1 54.46 GTATTNCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTA:1 + chrX 21667939 3' - gypsy2 6510 2 62.38 CTAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTTATATGTACGCACATATTTATGTACGAACAAATGA:1 + chr2L 15020084 3' + jockey 4753 1 63.37 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAAT:2 - chr2L 5932099 3' - jockey 28 1 55.00 ACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGTTTGTTTCAGAGTCTCACGCCAACAATCCGAAGCGAACTGCTAAACTTTTGTTTCTAAAATGTTTAT:1 - chr2L 14747138 3' + Transpac 347 1 67.33 TATTACTTAATACTTATTACAATACCACGGAGATAGAAAACCTACGTGGGTTGCTCGAAGCAGCCTATATTGATGACTGTATAAATTCCCATAAACCAAC:1 + chr3R 25777973 3' + Stalker2 404 1 53.00 AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAAAGCGGCGTTGGCCAGTTTCCAAAAGGTGCTCGATCTGGAAAATGGCGAAAAAGGAGAGTGGGGCTTCAAG:1 - chr2L 8996967 3' + blood 7329 1 74.26 AATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCGATTGTACATAGCCTGAAACTAAATCCTAACTAGAAGAGGATCCA:1 + chrX 15006323 3' - Rt1b 5105 1 70.30 ACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTATCGAACTCCAATTAGAGCTTGTCTCGCCTTTCTCTCCACCTCTTCCACTTTGGACTTGATTTCCGTT:1 + chrX 3685771 3' - 1360 162 1 74.26 GACGACGACAGCATCGCAAAACGGTGCGATCAATCTTCAAATAATTTCCAATTGAAAAGCCAAGTCAACAGGGTTCCCCTTCACCTCACCTCTTTCGATCG:1 - chr2R 21249637 3' + Gypsy6A_LTR 375 1 57.43 TAGTGTCAGCACTTTGCTGTCACGAGCGATCGGCCTGCAGGCCACGCTAAGTTTCAGATATAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAA:1 - chrX 23280899 3' + mdg1 261 2 75.00 TTTAAACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGGTTCGTATTAGCTACCTTACCCATTAGAAACACTTGATTAGAGAAAGTC:1 + chr2L 7884918 3' - S-element 1520 1 51.49 GTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCAGCAGCAGCAGCAACAGAGAGTTCAGAATGCAGCGTTAACGTAATTTAACTAAAACGAAAAGCAAA:1 - chrX 11710949 3' + jockey 468 1 65.35 AGCTAGTGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGACATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGA:1 - chrX 15408743 3' - INE-1 527 1 84.00 ATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCGCCTTAGATACTAGAAAAAAGTCTGTGTAAGAAAAAACATCAAGTGTTAAGTA:1 + chr2R 10518694 3' - roo 8805 2 57.43 TAATATTCTAGTGTCTTTGGTCTAAAAAACAGTACACTTGTGTCATTAAAATAATGCATGGATCACTATGTGGTACGCGACTGTGACTGTTAACATATCTA:1 - chr3R 7541449 3' + Tc3 313 1 70.30 ATGCCNATAGTGCAAGCCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACAACTGTATCTGTAGCACGGCCCGAAACTGTGC:1 + chr2L 15625515 3' + diver2 4624 2 57.14 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTCACACTCACACTCAGAGCGAGCGAAACGCACACACA:1 - chrX 14505441 3' + hobo 2908 1 62.64 ATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCT:1 + chr2L 22684573 3' - transib3 53 1 64.36 GATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGGCCCACCGAAGACGAGATTGCCGCATCGCAG:1 + chr3L 21336472 3' + Fw2 3680 1 76.24 ACTCCNCACAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCCACGATGCAAGGTGGCCAGTTCGTCCGGGAGCAGAGCAGCATAACAAGTGGAGCGCGAC:1 + chrX 6303052 3' + gypsy8 15 2 59.41 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTCCTCTACGCACATGATATCCCCGATTAATAACATTTTCTTA:1 - chr2L 18818596 3' - jockey 4710 1 57.43 TGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGGACAGACGTGTTATCAGCTGCAT:1 - chr3R 6143819 3' - rover 6995 2 76.24 CTTCCNCTGTGGAGGAAAGTATTGCAGCCTCACCATGGCGGACATTCAGATGCAGAACCTGGACGCCGGCAAGTTGCTCAACGCCCAGACCACGCCCAGTC:1 + chr2L 6413472 3' - BS3 355 1 71.29 CAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGTTTTGACATACTACTACTACAACATATACTACTATTGTCACTACTATACCAGAACGA:1 - chr2L 16252112 3' + jockey 4741 1 39.60 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCTTTTAAAATCACTTTGTTTTGTTTTTTTAACAAC:1 + chr2L 20084924 3' + 412 7507 2 61.39 TAGTAAAAAAAATCATATAAAAACTTGGTACATTTAGGCATGGTGAACTTTTGCACCACAGCAATTTCACTGCTTCGGCTTTGTCGCTTATCTGCTTTCTT:1 - chr3R 11834794 3' - Circe 425 1 66.34 CGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACTCATCGCCTTGATTGGCTTTAATGTAGCTG:1 + chr3R 20121879 3' + Ivk 8 1 76.24 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCA:1 - chr2R 10697044 3' - 297 38 2 63.37 TAAATATGTATAAATATGTATTTTTTAAATATGTATTATATTTGCTTAATATTTGCTTCTCGTATTTAACTTTATAAATATTTCTTAGACCGCCAATGAC:1 - chr3R 20098408 3' + G3 4512 1 61.00 GTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGAGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACTGTTAGGTTTTCCTCTTCAGCACAGCCTGACCTTTTTT:1 + chrX 12502686 3' - springer 37 2 75.25 GGTTTNCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGCCTGAACCGTATAACGTTCAACATTCACACTAATGTCATAAAAACCAACCAAACAAATGATTCTGTTA:1 + chrX 14981376 3' - I-element 5107 1 73.27 CCAATTGCATTAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAACGTAATCATCGTAAATCTCCAAGTGGATTTATCACCCTCTTCAACACGTATATAAGCCTCTTGTACG:1 - chr3R 8197606 3' + gypsy3 235 2 75.25 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGGGACGATGGCTGTATTTCGCCAAGTGCGTGTTCTTCTCGATATCCAACGCAACTGTTTATGGTTGTAAGGTGT:1 - chr3L 26852003 3' - diver 5 2 74.26 TAGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAAC:1 + chr2L 9823679 3' + hobo 2892 1 80.41 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGCGCTGGACACAGTTGGCAGCCT:1 + chr2L 14536312 3' + blood 7356 2 55.45 GACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTTATGCAACAAATCGCTTATCGATTAACAATCATCGATGCTGCAGGTGCGTGAGCAGCTTG:1 + chrX 17477996 3' + Doc3-element 4574 1 58.42 GTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCCCGAAATACGAAAAAGCCGAGGATATGTCCAACTTGACATACCTTAACGATGCCTCTGTGCTCCAT:1 + chr2L 16769545 3' + Doc 4471 1 69.31 TTGAATGTTCTGCCAAAATGGAAGCCTGAAAACCGTGGTACCATTTGTAAAAGCACAGATAAAGAGGGGAAAGGATACCTGACAGTTGCAACACTAAGAGG:1 - chr2R 5506411 3' + HB 445 1 53.47 TGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTGTATTTGCGTTTGCAGTTTAATTTAAATATTTTACACTCGCATACTGCGTTAAATTTGTGTTTTCGCTCCCCTTCT:1 - chr2L 937663 3' - gypsy3 419 1 49.50 CTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTTATTATTTCATCCCACAAAAAATACACACCGAC:1 - chr2L 2926439 3' + hobo 2631 1 54.17 CTGCGTCCCTCTATGTCGCTGACTGCGACGCCACTGTCGCTGGCTGCGACTCCTCTGCCGCTACGTAGCTGGCTGCGCTTCAAAAACACCATCTGGTAACA:1 + chr3R 4101952 3' - aurora-element 279 1 78.22 AAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGAAGTGGGATAATTCCGAAGTTTGGCGCCTGTTTCTCCCAGTGCATGTGGGCCCGTGCAGTCAGTTGCCGGTTCC:1 - chrX 2782346 3' - I-element 5139 1 77.23 TAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAAATAAGAATAGGTTGGCATATATTCAAAAACTGTTCTTTTAAATTATAATCAACCGTCCTGTTTGC:1 + chr3L 7587348 3' + transib2 242 1 74.26 ACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGATGCTGGCCTGGAATTCAAATATGCCGAAAATGTGGAAAATGCTTCAATTGTCAGACGGAGCAGGCGGTGCGAGAT:1 + chr3R 7929194 3' - GATE 258 1 53.00 CGATTATCAGATACCCGTTACCCAGATATAGGGAGTGCGCGGAAGGTGGAGGCAAGTTAGTAGCAAAGCCCCAGTTCCAGTTGCCTTAACTTGCCACACTC:1 - chr3R 7260845 3' - INE-1 550 1 66.34 ACTCAGCTTGTGTGAACGCGAACGCGAAATAAATTTACTATCAATCAATGGGTTGCATCACTTTCAACACAAATAAACTATAAAATCGGAGAGGAAACTTC:1 - chr3R 13306479 3' - INE-1 531 1 75.25 AACCGCACGACAGAAGTCTGCACGCTGAGAAGATTAGATTTTTTTTGTTTTTTGTTTGTCAGTTGTGAATTTGTAAGATTTGATTTTGAAAGTGGCCAGAT:1 - chr3R 11145595 3' - Cr1a 345 1 61.39 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAACTGTGTATTAACAAATTAAACCCTTTCGCATTGTTTTTTAC:1 - chr2R 4784748 3' + 1360 3356 1 62.38 TGTTACATTATTATTATTGTTTATTTAAGCTATCTATTTTTTCAGCAGTACTGAAAAAACTATTCAACTCTAAGCTGGCAGACGTAATGCGGACATCAGGA:1 - chr2L 18042722 3' - invader3 5044 1 56.44 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGTATCGACTTCGGCTTCG:1 + chr2L 222244 3' + P-element 2847 1 35.71 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTT:1 - chrX 17692579 3' - 3S18 5789 2 54.55 GACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGCGGTTATGTATGTGTGTGTTTCATGCACCGGCTTTTTGTTCTCATATACGCA:1 + chrX 4931826 3' - Quasimodo 91 2 65.35 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAAC:1 + chr2L 7654015 3' - jockey 59 1 76.24 ACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTCTTAATTCTTACTTTAGGCCTTAGGCATATGGATACAAAGAATACCCTAGTGTATTTGAATCAGCAAAGGAAAGA:1 + chr2L 21301788 3' + diver2 4556 2 74.26 TCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTACATTGATGCATGGTGTATGTATGTATTGTATATAGGAGGAGTGTCGTATTCCCGATTCC:1 + chr3L 12634566 3' - Stalker3T 297 1 63.37 CGGAATCTCTGCCAACTCAAAAAAACAAGACGTCAAAGTAATAGGGCCGACGTTAGCAAATGTGTAGTTTGCGATTTTGGTTTGATTTCAGGTGTCCAAGG:1 + chrX 906715 3' + diver 473 1 63.37 AGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAAACACTCAATGAGCGCGTAACCGATATGACCGGATTCAGTATGGAGATGAGCGAT:1 + chr3R 8249698 3' - I-element 5143 1 60.40 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAGAGG:1 - chr3R 22899162 3' - P-element 16 1 61.39 GACGGCTGCCTTCAACTGAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCTTTTTAAATGTGCTTTATACTAATATTGTTTTAATTAAAT:1 + chr3R 26404542 3' + 412 458 2 57.43 AGCAGGACCACTAGCGCTCCGCTTGTCATCAAATAACCGCAAAAAAACACACAGGGATCAGAGGAGAAGTGGAGATAAGAATCGAAATTGTAAAATGGTAC:1 + chr2L 8841733 3' - mariner2 63 1 65.35 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAGGAGTGCAGGTCGGTCCGTGAAAATGGCCAGAATATGCAGA:1 - chr2R 5910861 3' + hobo 2923 1 51.22 ACTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCCAGCAACCGCCGCTGCGAAGGAGCAGGCAAAGCAGAGAGCGAGAACATTTAATTCGGCCATATTTGATT:1 + chr3R 16857915 3' + gypsy8 15 2 60.40 CACTTCCCTCCACAGTGGAAGCTCGGTATCATCTCCATGATTCATAAGCCTGGAAAGCCTGAAAAGAACCCTAATTGATAAATGTATCTTGAAATATATAG:1 + chr2L 2884122 3' + BS3 356 1 71.29 AAACCNATTCTGGACCATAGTGCAATGGGAAAATCATTTAAACCAGACATAAAAATCTTTGTTAGCTTTCCCAATAATACTCTTAATGAATTTTAAAAATA:1 + chr3R 10490439 3' - transib2 1 1 78.22 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTGGAGGAACTG:1 + chr2L 22227352 3' - F-element 41 1 60.64 GTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCTGCATTTTGCGCATGCCAAATGAAAAATAACAAACCGTAAATTCCAATGG:1 - chr3R 18513148 3' + Quasimodo 272 2 55.00 ATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACTTGTTGTACTTGTACTTGTTGTAAAGTATCAGGTAGAGGAAAGCGATTCCGACCCTATAAGTGG:1 + chr3L 21637462 3' - Bari1 14 1 66.34 GCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGCACATAGCCCAAAAACACACCAGAATACTAAGAAAACATAATGAAATCGAAGCGGTCGACCGTGCAAAAACACAA:1 - chrX 19646636 3' + flea 4667 1 69.31 GGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGGTGGTAGCGCCTCTATGTGCCGCTGTTTGCTGATTACTTTTGCTGCTGTTGCTTCGCAC:1 + chr3L 7062703 3' - I-element 4993 1 63.27 TTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTCAGTCAGTATTCTTCATTTCGAACCACAAATTT:1 - chrX 9260613 3' + 3S18 6061 2 65.35 CGGGANCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGCTGCACGCTGGGCGAATCG:1 + chrX 3485731 3' + P-element 2880 2 68.32 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTATTTCTCCCAGTGTCTGCA:1 + chr3R 6191679 3' - roo 8709 2 83.15 AAAAANTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAGCATACTTTGTGGCTGATACTCGGGAAGGATCTCTCGTTACCAAG:1 + chr3L 947956 3' - hobo 6 1 73.27 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATAGTTCAATAATCTTATAATCTGTATAGTAAAATCTACGA:1 - chr3R 17468356 3' - Transpac 35 2 62.38 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCCCTGTGCCAGGACATCTGTGGATGTCCACTGGGTGGGATG:1 - chr3R 6497630 3' - pogo 6 1 42.57 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTTGTACGTCTTCAATTAATTGGGTGCAGAATTTTTGATAGAAAAAATTCCTCAGAATTATAATTACGTTTT:1 - chr3R 25931286 3' + roo 406 1 76.24 CTTTTACCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTATTCTTGCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATAATCATATATAATAAAATATGTCATCAAAGTTAGGCTTT:1 - chr2R 5249847 3' + Tc3 236 1 66.34 AGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTTAAGAAGCGCTGTGCCCTGTTGACTTGTTTGTGATTTCTCTTCGGTCTAGATTTAGGATTAGGTCTA:1 - chr2L 8114533 3' - 297 6542 2 73.27 TCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTTTATCCAAGAGCACTTAACAAAACGTTCACGTT:1 - chr3R 18860316 3' - R1A1-element 5017 1 62.38 GTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACAGGTCTAGGATTCCACCGAAGGACCGAGAAAAACTAAAATGTATCCAAGAGAAAACAAGGAGAAGAG:1 - chr2R 19911331 3' + gypsy4 455 1 77.00 AATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTACATACAATATTAATCATAATATTTAATAATAGCGGCTTACCACTCAGCCGTTTTTGTTTGTGTTTGCTAGAA:1 + chr2R 10722941 3' - invader3 5100 1 73.27 GGTGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGCCCATCCCAGCCACCCCGAAAGCCCCTCGTCGTGATTGCTATACACAGAAA:1 + chr3L 566065 3' + Doc 424 1 57.43 CCGGTTTTCGCTTTATCTCGCTCGGCTCTGTATGCGAGGTGCTTCCCTCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTTATCGCCGGCGGCGATACTGTTCTCGTAGAA:1 + chr3R 23081437 3' - 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INE-1 252 1 54.46 CTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCACACCAAGCTCAAAATCGAAGTATGCAGCTATTCTACTTGAAAAC:1 - chr2R 4719921 3' + roo 322 2 56.44 TAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACACTGGCACGAACAATTCGCATATAGTTTTTTGTACGAAAACCCATCGATTTGGCAGCGATTC:1 + chr3R 21822478 3' + gtwin 6915 1 69.31 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCTCCTGGGAGACGTCGTTAAAGGCCCTGGAATTCAGGTTTACATACTGGATATTTGGCTGGCGGCCAAAC:1 + chr2R 20791845 3' + roo 403 1 72.28 GGTGAAAAATGAAACTTTCCATGCACGTAGTAAGCATATAGATATCAACTTGCGACCAGTTCAACTTGGTGGAAATGCTTTGTACCGCTAGGGAAATTGCT:1 + chr3R 4523037 3' + Dm88 4093 1 65.35 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTC:2 + chr3R 19535741 3' - hobo 49 1 72.28 TCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTTAAGCAATCGATTTTTAACGTCAGAGTGACCAACTGGTCTTTCCTAAAAATAATTACACTGACATG:1 - chr3L 27279291 3' + Cr1a 4223 1 50.50 TTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAACGATTTGGGCGATGGCAAATAGTCTTCGAAGTACTCCTCACGATAGG:1 - chr3R 4487066 3' + Tc1-2 139 1 73.27 ACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTCATTGCGTGACAAGCGCGTTAAATGTGTCTTTCTGCCGGGAAGCATGTAT:1 - 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gypsy5 28 2 53.47 TTAGTTATTTACAAAGATTATATGAATTAATGAAAAGAAAATGTTTGCACCAGCAGAAGTCCAGCTCAGGTGGCTGGAGGGGATTTCTAGAGGCTCGGGG:1 + chr2R 6525683 3' - jockey2 3290 1 80.00 CTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCG:1 + chr2R 5640416 3' + roo 409 1 72.37 CACAANGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAACAGCAACCACAGAGCCTGCCAATCTC:1 - chr2L 10203430 3' + I-element 110 1 73.27 ACAGTGCATTAGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATCTATCATAGAGCACTTAAGTTAATTACATCAAATGGGAAATATTTAGCA:1 + chr3L 10680277 3' + baggins 5355 1 53.47 CAGATCTTTGTGCGATCGCGTGGCAGCTGGGCAGGAAAAGCGTTAATTAAAAGGGAAGTCCGACGTAATGATCCGCATTGCGCTGCACTGTCATTTCATCT:1 - chr3L 17536525 3' - X-element 225 1 71.29 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGTGCTGCGTCTTCGAATACTTAAGTCTAGAACGGTACAAGTGCTGTCTGAAA:1 + chr3R 18514411 3' + 1360 3364 1 62.38 TTCTAGCTTTAATAGTTCCTGGGGTCTCTATCGACGTTCACACGGACAGACGGACATGGCTAGAACGACTCGGTTATTAATCCTGATCAAGAATATA:1 - chr3L 20756363 3' - INE-1 154 1 80.41 CGCGTTCCGGATGTACCAAGGTGCACCAGTTATTGTTCGCAGGAAATTGCTGGCCTGGCAAGGTGAAGAAGCTGAAAGGAGCACACATAAATACTTAAACT:1 - chr2R 8930229 3' - Doc4-element 2697 1 64.36 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCAC:1 - chrX 1399871 3' + P-element 2845 1 37.62 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAAGCACAGTTAAATGCAATGCATTTAAGGCTCAAGTCGAAT:1 - chrX 5104615 3' + roo 9034 1 66.34 CGTAAGCAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTTAGTGTTAATATATTGTGTTAAAAAATATAT:1 + chr2R 2745258 3' + 17.6 61 1 72.28 TACCTACATATAAAAGCAGGGGTACAAAAAAAAAACAAAAAAAATTAACTAAAAACGGGTGAGGATGTGTAATCGATGTGCTTGCAAGTCGCA:1 + chr2L 11406357 3' + Juan 3930 1 70.97 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATCACCGTCTCCTCGAAATCGACAGCCGAACGAACACGAAGATAAACA:1 + chr3R 14282816 3' - P-element 29 1 55.45 AACAACACCAAACAGCACTGCGAACGACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAAATCGATGAGATTCTAAAGTGGCTT:1 - chr3L 17298589 3' - Cr1a 241 1 72.53 GAGATCTTAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGAATACTTTTAAAGATTACTTATAAAAATGTCGGTTTAATGACACTATATATATAATTTATTGAGGT:1 - chr2R 4901689 3' + INE-1 148 1 62.38 AGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGTCAACTGTGGCGAATGTCGAATACTTCAATTAAACAA:1 + chr2R 12832207 3' + 1360 114 1 66.67 ACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCATTCATTATCTGACGCCCCAATCTCTGGAGCAGCAGCCAACACTTGAGC:1 - 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Transpac 30 2 54.46 TCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTAAACACCGTCAATATAAAACTTGTATTGTTTTTATGACTTCTTTATCCACAACAAAACCATGCGTTTGTTGTCAATT:1 + chr3R 8185287 3' - Doc 10 1 74.26 TGGAGCTCCATGGTATCTTCGAAACGAGAACTTCGACGTGCACGAAACGCACCGGATCGAGGATGGGG:1 + chr3L 9473523 3' + Doc3-element 4413 1 66.18 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGCATCGA:1 + chr2L 222233 3' + P-element 2833 1 25.74 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAACAGAAAGTATATCTTATACATATAAATG:1 - chr3R 25876266 3' - flea 43 2 76.00 TTTCGAAACTATTTAAAAAATAAAAGTGAAACATTTGTTGATTGTTTGAAATTAAATACATAACGATTATTTCGTATTTACTTATTTTTACTCACCAAAGC:1 - chr3R 19287022 3' + HB 1483 1 62.38 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACATGTATAAAATGTAATAATACTTAACACAATTAAATTGCACAGAAATTCCTGGTAATTTTCGGCTTTTCCT:1 + chrX 11205404 3' - I-element 11 1 52.48 GCACGTTGTCGGCGGCTACATTAGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTGGTTTCTTCTCCTTATTCCTTGTTACGCTTCTATGGGTCTTTTGAAGTCCTTGCTAGG:1 + chr3L 13618166 3' - G-element 487 1 70.30 TGCAATTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGTGTGCTTAGTTCCTCTTCTCAATTTCATTTTGTCAGTT:1 + chr3L 13374607 3' + Cr1a 192 1 62.38 GCTGAACGGAGGGGAAGTCACCCCTATAAAAACAGTGGCAGCTTTCCGGATGGTGGTAATGCAGCAGTACTCGACAGCAGCTATAGGATACTA:1 + chr3L 5147326 3' + aurora-element 499 1 62.37 GGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACACGCTCCAAGGTGCTTTGGTAGCGCAAGTGCAGGGCGGTCGGATCCCAGTCGATGGCAATGGTGAAGTCT:1 - 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flea 4781 2 55.45 TATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCATCTCTTTGCCGCTCGTTTTTTTGTTGTTGCTGTGCTGT:1 - chr2L 14426754 3' - F-element 4385 1 71.29 CTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATACCTTCTCGTTGGTAATGTGGTCGACACCGGCGCGCAGATCGTTCAACTGGCCGT:1 - chr2L 16784277 3' + hopper 251 1 60.40 TTATGAAATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTGGCTAATGGCTATCGACTACTTTATTTACGTAATTAAAGCGTCAAACTGTGCTACAGCAACAA:1 - chr2R 19074852 3' + accord2 475 1 75.25 CAAGAGAGAACGCTATAGTCGATTTCATCGCAATAAAGCATACATGGTGTTACCATGACAGACCATTGACTTCATCTTCTGCCTTACCGTAATGTTTATT:1 + chr2L 21954639 3' - INE-1 578 1 81.00 ACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGAGCTACATTGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTTCTTCGCTTACGAAACTTGGTGTACCCCA:1 - chr3L 25464094 3' - Cr1a 4173 1 71.00 GGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTTAGAGTGGGACAGCGTGACCAGGTAATGGACTGT:1 - chr2L 17278874 3' + copia 159 2 66.34 TCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATTGGCAGCATTTAATAGCGAAACTTTTCCCATCGATGTGGCGACAAATG:1 - chr3R 30664015 3' - R1A1-element 370 1 58.42 ATGCGAAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGCGATAACCGATAAACAAGTACGATAAATATTATGACAACAATAAGCTGGCAAGAAAGCAATCAGC:1 - chrX 20802281 3' + Rt1c 5219 1 66.34 CTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGAAACCTCTAAACCTAAACCCCTAAAAAGCGGGAAAGGCGGA:1 + chr2L 8749778 3' + jockey 4566 1 60.40 GCACGCTCAATTTCTTGGTCTTATTCATTATTGTATGTAACGAAAAGATATCTGCACAAGCAAGACCACCACACCAAACACCCCTTTTCGATCTGAGGTCC:1 + chr3R 16783974 3' + gypsy12 10072 2 76.24 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATAT:1 + chr3R 22238736 3' + hobo 2904 1 61.39 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATAAACTAATGTTGCATACTTTTGGAAACCTTTAAGGCTATTGCTCTTTCCTTTCCTTGCTGTGT:1 - chr3R 29653026 3' + jockey 4982 1 57.43 ATTTACTAAAATTATTGAACAATTTTGCTTTAAGTTAACAAAGGCAGGCCCAAATTGTTAGCTACTGCCGGGCCTGAAATCAAAATACATTAACAACGCGT:1 - chr3R 20431227 3' + Tc1-2 1545 1 64.36 TCAAAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAAAGAAATACGAACAAAATAATATACATTTATATGTAAAAGTGAAGA:1 - chrX 17486518 3' + accord 7295 2 53.47 GGCTTGATGGTGGCAACCGACTCGACGACAGGAATAACGGTGCCTGCGCTGTTTAAAATCAAAATCTCACTGCGCTCTCTGAATTGTGCCCTGCGAAAGG:1 + chr2R 24943213 3' - Chimpo 331 1 54.00 AGCGAGATGACGAAGGCCTTGAGCCAAAATGTAGCAATTTGTTGTGATGGTAATGGTAATGCCAACAAACGAACCGGGGTCCACATATGCACAGTGAGAAA:1 - chr2L 3853770 3' - G3 257 1 55.45 TCTATAAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCCGCTGGGCGACCTTAATTTGTATCTGGTATTATT:1 + chr3L 19044725 3' + micropia 5161 2 64.36 AGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTTTTCAATGACTGTCAGCAAGTGCATTTGGAGTTATGTCAGCTGGAGCAGCTCTGTATGTGTGTGTGTG:1 - chrX 14376915 3' - 1360 3271 1 73.27 TGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGGCACTATTAGTATATTCCCCGTTCAATCAAGTAATTTCAAGCGATTTACCGAA:1 - chr2R 16377575 3' - hobo 128 1 58.42 ACAACNACAGTGAACAGCAACACACAAACAAAAATATATAAACACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGGACATAAACAGTCCAGCCCAATTGCAAGTGTA:1 + chr2R 3157642 3' + gypsy10 478 1 68.32 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTA:1 - chr3R 10490348 3' + transib2 2783 1 68.32 ATGCGAACTAATTAAATGTGATGCCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCAATGAGGCATTCTCTGCAAATTGCGTCAGCAAGATGCATTGCCACCAACC:1 + chr2R 16484348 3' - Tc1-2 223 1 58.42 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAGTTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTCCTCCGACCTGCC:1 - chr2R 14121044 3' - I-element 9 1 67.33 GCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTGGGGAGTGGGGTTGGTTCTGGTTATGGAGGGGG:1 - chrX 18119341 3' - Transpac 440 1 64.13 AAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACCAGTGTTTTACCCCCATGACATGGGTTCCGAGCACTTC:1 + chr3L 8841350 3' + Quasimodo 218 2 62.38 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATAAACTGGCCTAATCCATGACC:1 + chr3R 22675893 3' - 412 7068 2 64.36 GGTCGTTGCGGTGCAGCCGACTTTGGCTTTTCTGGGATTTCGTTTTCTTGGTGTCTCTGGAGTGGAAATCGGAATCGAAGTCGGACTTTG:1 - chr3L 5942027 3' - Doc 4538 1 74.44 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATCTGCGCCTGGATTGCCGCAGAGTTA:1 - chr3R 17788899 3' - roo 8683 2 55.79 TAATATTCTAGAGTCTTTGCTTTTTACCTATACTACGGTTGTGTTTTCGATCGATTGACACGGCAAGTTCTGAACTCCACGGCAATAAAATATATATGCGA:1 + chr2R 6086907 3' + Tc3 313 1 75.25 TTCATGGACTTCAGCTAAGCAGAGCGTCGTCGCCATGAGCAGCACAGAAGCAGCGCACGTACATAAAGACCCACCTATAAAGTCGTGTAATCGTCTTCATA:2 - chr2R 5841476 3' + Copia1_DM 3919 1 53.47 GAAGAGCATGACAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGACCAAGGACCAGGACGGACACAAAAGCCAAGACCAAATAGCCTGGAGATGTGCCATTA:1 - chr3R 7611459 3' + Bica 10 1 62.63 TAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTATAATTACGGGCCATACCCCCCGCCATCATCATCATCACGATAT:1 - chr3L 20577543 3' + Quasimodo 6907 2 56.00 GGCAATGTTAAATTGCTATACTACAAAAAAATCGTAGATGGGAAAAATAAACCCGAAAACGACATTAGCACCAAAAATAATGGCGAAATTCGTTGAGCGAA:1 + chrX 9074671 3' + Doc3-element 123 1 56.44 GTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTCCCAGCTTTTCCGGGCAAATCTGTGCGGCAAAATTTACGCAGCTACTTAAAAACTATGCAGGCT:1 + chr2R 11025745 3' - G6 1833 1 66.34 AAATGTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGGCGCAGTGCCGAGATGCAACCGAAAGTGTAATGAAATTTGA:1 - chrX 16556928 3' - S-element 317 1 59.41 CAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAGAAAGCGAAAAATAGTTGGCAAAAGAACATGAAGCTACTGCTTTAAATAACAAATGCAAAAGTTT:1 - chr3R 8480384 3' + transib2 2817 1 74.26 AGGAANGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTATACATACAAACAACAAACAACACATACCCGCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAA:1 - chrY 2720387 3' - GATE 338 1 69.31 TCACTNTTCACTTGATACGGATGGACGGAACGATGAACTAAATTTACCCCGATCTCAGTTTTTGCCAGACTCCGAGCTTAGTATGTATGTTGCTTGGATG:1 - chr3L 22936479 3' - Max-element 457 1 78.00 TGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGTCGTTGTTGGGCTTTCATGTTGTTGTTGCTACTGTAGTTCTTAAAGCATTATCAATGAACAAATGA:1 + chr3R 6970294 3' - Porto1 332 1 71.29 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGTTTAATGGCTTGTCGATACGCTCAAGTGG:1 - chr2R 14582845 3' + roo 400 1 57.14 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAGACCAAC:1 - chr3L 21908900 3' - roo 8708 2 68.32 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGCCTGTTTATAGGTTTCTCCGCAATTTGAATGTGGAGTG:1 - chr2L 17004705 3' + roo 404 1 74.26 AGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGAACTGCCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAAGGTGGCATGAAAACATATAGTATA:1 - chr3R 16006571 3' + F-element 496 1 75.26 AAAATNAAATAAAATAAAATTATAAACTAAACTTAAATACGAATCGAGATCCTTAGTTGAAAATCTACAAACAACAAATTTCGGTGCCGAGCAAAACGAAA:1 + chr3L 3644169 3' - transib1 1898 1 64.36 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACGACCGCAGTAGTAGCACTTTCGCCCCGAACGAAAAAGCAACAAAA:1 - chr3L 4627250 3' - FB 51 1 55.45 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCCGGTTCCGCTTCGGTATTTCCGTTTCACTATTAGGTGTCGGCCTGATGTTCGAGTTTATGATTCATTATCTTCGTA:1 + chr3R 21319282 3' + invader4 315 2 82.18 TTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCACACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCCAGCC:1 - chr2L 5932089 3' - jockey 7 1 70.79 AGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTAAACCAGATCCCCCAAAACCAGCGCCAGCGGTAGCCAAGCCCACTCCGGTTCCAGTTCCTGCGAC:1 - chr3L 9062255 3' + hopper2 1355 2 69.39 CTCTCNGCACAGGAGCGCAGAATACTCGCCTAATTCATCAGCTCGTACACCAACAACAACTTCGGGCAGGGCTGCGAGGAGGTGAGATCAGTATTTAACAG:1 + chr2R 14496578 3' + Porto1 390 1 61.39 ACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACAAGCAGTGGGGAAGCGAACCTGTT:1 - chr3R 27151515 3' + opus 7262 2 77.23 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACATTTTACAATATGTT:1 + chr3L 21840350 3' + 1360 3364 1 53.47 GAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTACAACTTGATTTACTTACTTCTGTCTGCCTTTCTCCATCCGCCC:1 + chr3R 22182032 3' + Doc 4369 1 57.43 TGGTACGTGATGATCCTCGTGGATGTGGACGATGTGTTTCGTTCGTCGGCGGCAAAATCAGCAGCATTGTCGGCAGGGCAGTGAAAATT:1 + chrX 4139244 3' - Tirant 8032 1 55.06 TTTTTCCTTAAGTTGCGTGATTGCGTTGGTCATGTCTTCAGTGTGATACGGTAAATTTGATTTGTCTGCTGGATTCCAACACTCAGGACCTTAGTGGGAG:1 - chr3L 6608467 3' - F-element 4426 1 72.00 CGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGCTCGTTAATTATTATTTAATGACAGACCAAATTGAAAATAAATTTAAACCTAATAAGCGTTGAAATAAACG:1 - chr2R 20411559 3' - HMS-Beagle 96 2 68.32 TTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGAACTCGTTGGTGGACGTGCCATTGCTTCCACCTGAGGACGGCCCCACAGTAG:1 - chr3R 16344054 3' + invader4 2657 1 55.45 GTCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTACCCACCCTTAAAAAACCTTTAACAAAAAAAATGAAGCAAATAGGTTACAGATGCCAAAATCAGAGTTAG:1 + chr2R 4139113 3' + FB 358 1 59.41 CCAACATATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCTCTTGGCCTTAGTACACGCATAAAAGTCTTGGCTTGCAATAA:1 - chrX 9378572 3' + Idefix 101 2 58.42 CCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGGGCAGGCGAGCAAAAACAGAAAAAACAGAAAAAAAGGCTGCGTAGAC:1 - chr3R 26759086 3' + F-element 477 1 53.00 GGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCCTGCATTGTGGATCACTATTATACAGTAAGGTTCTATGCGATAAGTTGGCTGCGATATGA:1 + chrX 3829853 3' - G2 2914 1 62.38 ACCATATATAGTATATACATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATATGAAAGTAACAGTTCAGAAAACAGACGAAATTCTTACCGCAACT:1 - chr3L 18945894 3' + INE-1 58 1 47.52 AAATCACTATATATTTAAGCGAACTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCTTCTTTTTTTTACTCTTTCTTCTCTGCAAATGGACAGAGAGTCATG:1 - chr2L 9445212 3' - F-element 149 1 58.42 CGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCCTCACATACGCCACAATGCCAACCACACACCATCAGCACCACCACCAACAACA:1 + chrX 6910346 3' - flea 81 2 54.46 CTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCTGGATTCACGTGCGTTGCCTTTGTGGCCGGTGCTTTGGCCTGGGGGGGACCTTCCTT:1 + chr2R 16132560 3' - R1A1-element 395 1 62.37 GCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACAATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAGTTGTTTAAATTAGGCAACATGTATAGAAATAAATTAATTCGTA:1 + chrX 12571449 3' - Idefix 252 2 74.26 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTCTGATTAGTTTAATTAAAGCGTATTTCAATTGCCCAGTGCGCAGTT:1 - chrX 10555389 3' - Tirant 8116 2 72.28 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGAGTATAAACAAACCCGACTAAAGTGACAGCGATAGC:1 + chr3L 25305809 3' - 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TLD2_LTR 95 1 40.59 CATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTAGCGTCCAACTGCAGTTTCAGGGTTTAGTTTTCTGTAATATTTTCGTA:1 + chrX 5410749 3' + R1A1-element 4973 1 55.91 ATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTATCTGGCAAAGCACATAAACCCTCGGAAGACTTGTGTGGGACCCCCACTTAAATCTCAATTCCAAG:1 - chr2R 15362674 3' + Quasimodo 7140 2 74.26 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATCC:1 + chr2R 18434534 3' + pogo 2055 1 74.26 TCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAACCCCGCTACCTCCAACAACAACAACTGGAGTGCGTAAAACATAAACAGACAGGTAAGTGGAAG:1 + chrX 18936759 3' + F-element 375 1 63.92 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTATTGTTGGTTTATTTTTCCCCATATTTTCGTTT:1 + chr3R 8480507 3' - transib2 3 1 76.24 TGTTATCTGGATTGCGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGTAACCCGAGATGCATTGAAATGCT:1 - chr2R 8039084 3' - I-element 5121 1 76.00 TTATANTTCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGT:1 + chr3R 3586571 3' - 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G2 2651 1 67.00 TTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTTTCTGATTGATCGTAGGAGGTGGGAGCGGGCTTAAGAATCGGGGGATAT:1 + chrX 15352604 3' - 1360 130 1 67.33 CTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGACTGCAATTCGAGCACAAATGTAATTCCATACATGAGACTCTTGGCCTGCG:1 + chr2R 16767055 3' - McClintock 274 2 55.45 CGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATGACTTTTGGCATAAATTTGTTGTTGGCAGCTGGAATAAATTTACTTA:1 - chr3L 4542625 3' - BS 80 1 61.39 CTCCAAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGGGACAGGGGATGTCCATATACAAGGATATGCCATATGCGGCATTCCAATGAGAGCCGAAAGTTATTTGCAAT:1 + chr3R 17367165 3' - G6 297 1 55.45 AACGCCTGCTATGCTAACAAGAGTCGCGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACACAATGTATGGGGATTTGGGGCCCGGAGAACAGAGAGAACGCATGATTGT:1 - chr2L 1266194 3' + mariner2 694 1 61.39 GCACACGAGGACGTGTGATAGGTCAGGATGGCCGTGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGAAATTTCCGCTTCGGTTCGTCTTTTTATTTCCGCCTTTTATT:1 - chr3L 15734802 3' + invader1 3576 1 65.35 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCACATTAATGA:1 - chr3R 20140538 3' - jockey 13 1 76.24 ATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGACGCGCTCCGACATATATATTTCATATTTTTTTTTTCTTCTTTTTTCTATGCATGTAATGCTAAA:1 - chrX 4847916 3' - invader4 28 2 53.47 AGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTTGGAAAATGACATTGTATAACACCATCAATGATCAAAGATAGTTACT:1 + chr2L 2447958 3' + F-element 330 1 61.39 TCTCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTCTTGTTAACCCTTTA:1 + chr3R 27222724 3' - P-element 408 1 23.76 CTTATTCTTATCTAGTATCTGCTGGGTACATCCAGAGTATTGTAGGGTGTGTTTGGGTGTATTATTGTGTAGGCAAATTCTAGATGCATAAGGAGGAGGTG:1 + chr3L 16153897 3' - Idefix 6920 2 74.26 ATAGANGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATTCACGGCATTTCGATTTCAATTACGATACAAATTGTCATTAATGTTGGAAAGTTG:1 + chr2L 15462646 3' - Doc 4244 1 65.35 CGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCCCCACATACGCCACAATGCCAACCACACACCATCAGCACCACCACCAACAACAGGGCGGAAATGTCAGGTAAGTCC:1 + chr2L 3760135 3' - flea 4815 1 79.21 CGAAATTTCATCATTTTTTTTTGGATATCGATCAATATGGGGAAATATAATTTGGAATACATAAAAAATTGTACAATTTGCAAAGAAAATAAATATAACAG:1 + chr3R 905058 3' - transib2 2647 1 63.37 CTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTTGGGCTTGGGCGTGGCTGGGCTGGGGATTTGGAAAACGCATTAAA:1 - chr2L 7940328 3' - BS 4889 1 50.00 AAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCAGCGATGATTGAATGAATCTGGACTCCTGGTCATTCTTCGATA:1 + chr2L 3273911 3' + gypsy5 375 2 61.39 CGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCCGCTTTCTCAGAGTTTTCAAACATAAGTGCCTGTCCTAATGCAGATCATAAAAAACCACTTCGAGC:1 - chr2R 21043988 3' - invader6 4810 2 65.35 AAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACCCTCTATCTGCTCTGTCTGGTGCTAGCAAAATTCGC:1 - chr3L 13326652 3' - transib2 4 1 75.25 AGTATTTATATTTATTGATTAAATCATTACTTCAACAGGCTTTATAATTGTAATGTTTCATTGCAATTGTTTGCTATTTGACATTTTAGTTTTTTGTTAAT:2 - chr2L 9051117 3' - diver2 444 1 88.12 AGAAAATAACCAACAAATTCCACACGAAGCAGAGGAAGTGTCTGAGCAGAACTGAAATGAAGCTGGTTCTGCAGTTCTTTGTTGGCTTCGCTTAGTTTTTG:1 + chr3L 16350531 3' - S-element 1544 1 58.42 TCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTGTTAGGATGTTATGGTGCAGGGTGTATCGTCCACGGGCGAGGCAACGCTCGGCCTGGCCACTGACTCC:1 - chrX 23287524 3' - G2 352 1 66.34 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCACATTCGAC:1 + chrX 16619672 3' - opus 7152 4 64.36 CTTCTNGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAAATCAACTTATCCCTTCTTTCTCAATGCAT:1 + chr2L 6033675 3' + G2 2889 1 70.30 GATATNAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTAGGGAAACAAAATATCTTATCAAAATTACTATGGAGTTACGAGTGAAATGAAATTTAGTATGCAAT:1 + chr3R 27352675 3' + blood 93 2 64.36 GGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGCTGCGCTATAGCTCTGTCGGCGCTGACGCCTACTTACTGCGATATACCC:1 - chr3R 30203563 3' - Doc 314 1 53.47 AATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGATGCTGTTACTGTTGCCGCTGACGCCCGCAGGTGTTGCACGTAGTGGCCCCGCCCACTCGCAAC:1 + chr3R 23024126 3' + invader4 66 2 66.00 AATCGAAGCTCCTCACTGAAAGTATGATGCCTTTTAGGTTTACTTTTGGAAATTAGCTAGATTTTGAATTTGTATTTGATTTGCTAAGGCCTGGCGTGGGC:1 - chr3L 10451950 3' - Transib5 238 1 59.41 GTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGAACTATGCATCAAACAGTTCAAGCGCCAAATAAACCTCCTGGACCACATGAAGTAATTACA:1 + chr3R 9627897 3' + pogo 415 1 72.45 GAGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCATCGGTAGATTACGGAGTCGGCTAAAAATAAAAGTTGATTTGTATAACTAGGT:1 - chr2L 14358213 3' + diver2 4670 2 58.42 GCCTTCGACGGTCACCCAGCGCGAGTTACCATTCGGGCCGAATGATGGGAGGTAAATATAACAGCAGTAAAGATGTTGGGCGTTTTTGAGAACATAAATCT:1 + chr2L 16116422 3' - gypsy10 5806 2 77.23 ACCTANTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGAAACTTATATAATTGGCGCCGCAAAACAACAGGAAGGGTTGAGTAAATATTGGCAGAGTAATCCACA:1 + chr3R 31623329 3' + gypsy 435 2 53.47 ACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACTGCTGTGATGCGGCCAAGAATCCATTTAGAAGAAGCTGTTGACACTCTCACCCTTAATATCAAGGCTGCAGCCAG:1 + chr2R 5615743 3' - 3S18 5642 1 55.45 TGGCTTCCTCCAATTTTGTATACTATCTAATATATTCGGAAGACGAAAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCATGAGAATTGGCGCTGCTTAGCTATGGCTGT:1 + chr3R 3345522 3' + Gypsy12A_LTR 2067 1 73.27 ACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGCGCAGAAATCCACCTCGACTTCAACCCACCTGTGGTCAAGAGATTGCTGTAATGAAGATGGCGAGCCCCGAAGAATCGG:1 + chr2L 715101 3' - 1360 3217 1 75.25 GAAATCAATTTTGATCTCAGAAACGAAGGTACATACATACATATCCCTATAAAATACCACTAACCATAACGCAGAATCGCAATCGAAGCACCGATAACAGA:1 - chrX 18326192 3' - 1360 3172 1 68.32 GGACATTCAAAAAACCCTTGAATAATCTGCCAAAATGGTATGCAATGCCATTAAATATGAATGGAAACCCAATATCCCTACCATTCTGCTGCCTCCTTTTT:1 + chr3R 16378844 3' + HB 428 1 79.21 CGAAGGGAAGGCAGCTCTGCATATCTGGATGATCTGAGAAGTTCGTAAATGCTGTTGATTCTCCATGTCATGGGTTCGCTCTTCACCAGAATCGCCTCGAA:1 + chr2R 10893441 3' - Burdock 5983 1 78.22 TGGAGTGCTTTCGTTGTTTTTGCTACGATTTCGTTGCATTCGTGGCCTACGTAAGAAGTTTGGTGGGCAATCGCTCTGAACACCACATGGAAGAATATGGT:1 + chr2R 16768896 3' - Stalker 122 4 59.41 CCTGCTCATCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGACAGGGTAAGGGTTAAGGGTGCACAAGGAGTGAAAGGAGTGCCGAAGGAGCAGGAGGATCCGAGGG:1 - chr3R 28954249 3' + Rt1b 4968 1 71.43 AATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTCTGCCTTGGCTGGGTTTAAAAATGAGTTTTAGAAATAATCGATACCATTTTGTATGATTTACAATTGAGAGTCACA:1 + chr3L 5249095 3' + hopper 392 1 63.00 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATAAGCGATTCGATTTCTTTCGCCGCAAGAACATTGTTTATTTGATCGCATGCATTGTTT:1 - chrX 15384729 3' - 412 18 2 62.38 CGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACCACGCGTACTTCATTAGCGCCTATTGTGAATTGGCAAACTACCCATACTACCCCTAGCAAATCTTTCGTCTCA:1 + chr3R 18228583 3' + F-element 236 1 67.33 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTATCAC:1 - chr3L 3254956 3' - 1360 17 1 63.37 CGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGAGAAAAAGACAAATAATTGTTGAAATTAAAAGTGCTCTCCGGCGGG:1 - chrX 8883111 3' + roo 452 1 56.70 CAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGATTCGCTGGAAGCCTCTGGAGAACTTTGATAAGGAAATCATTGGCATACCCGAGCCGACGCCCACATTG:1 - chr2R 9142799 3' - HeT-A 5741 1 53.47 ATAAAAAAAAAAATAAAAAAAAACTGTAGAAAATACCAAAACAAGGGGATGGCAAACTTTGGAGCGCGACTTTTCTTTAATTTCTCTTTCGCAG:1 + chrX 4062249 3' + BS 5103 6 52.13 AGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAATAACGCTTTCTCTCTTGTTTGTTTTTTAGTTTTGTAAATTTCTTTGAAAAGAGTTTGTATCTATAAG:1 + chr2L 20719650 3' + INE-1 550 1 77.00 CTCAATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGACCAAAGTCAGCGTGAAAGTGGCCAATGCACGTCTCCTTGCGCTGATCCTCGTCCGCGTACTCGAATATC:1 - chr2L 19186312 3' - Doc2-element 20 1 59.41 CCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCGACGATAAGCTGGCCAGCTGCTGGAGGGACCAGC:1 + chrX 5502237 3' - F-element 224 1 60.47 TTCTGCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATAGAAGCCGAAAACGGTGACCAAAAATTAATTGGAATTCTCACATTGGGGAATTTCATTGTCTG:1 + chrX 12320635 3' + HB 452 1 56.44 AAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACAGCAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAGCAACAACAACAGCA:1 + chrX 10744579 3' + Bica 4609 1 59.41 AGCCACCAACGAACGTACATAAACTGGAATGAGCAACCTTCATCCGCCGTCTTCGATGTGCTTGTGTGTGTGTGTGCCCTTCGAGGCGACTTGGCGCTC:1 - chr2R 19058465 3' + Ivk 5001 1 57.58 AAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTAAAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTCTATAGGAACTATAGGCCTAGCCCAAG:1 - 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F-element 309 1 70.30 AGCCTGCCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCGCTATTCCCACCGACAGTGCGTTGCAAAACTATATACCCATCTCAATTGACAGACCTTTG:1 + chr2L 5224892 3' + Quasimodo 6893 2 52.48 GTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATAACTTGATTCGACTTTTTAGGTCCTTGGAGTTAAGCGGATGGAAAACACTGGCCAAATATGGCGAC:1 + chr2R 16975921 3' - Ivk 4931 1 71.29 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGGTTTCGAATGCATTCAATCAACGCAATTGATTGA:1 - chrX 4987737 3' + invader4 3080 2 70.30 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTCCTCCACCCAATGCATAAATTCTACAATTTTCTTCGGGCAAAGGGTTTACCTTGACTGCTCTG:1 - chr2L 14523618 3' - 1360 306 1 68.32 ATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGAAATTTTTGTTGCCACTGAATGGTTTTTTAGTAAATCATAAGTGCCAGCT:1 + chr2L 11357658 3' + transib2 244 1 51.49 TAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTGTTCTAGATAGAAGGAGATCAACGTTGGCAGGAGACATAGACGATCGCAGCCGC:1 - chr3L 9831505 3' + Stalker3T 30 1 58.42 GCACACACACACACACACACATTTTATGCGGGGGTGTGGGCTTAATGGAGTGTGTGTAGATGGGTCCAGGGCTAATAAATGGATAGAGCTCGGAATTCAT:1 - 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Quasimodo 371 2 61.39 AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGATGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAA:1 + chrX 21087676 3' + mdg3 5491 2 61.46 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCGGGATGCCGGGGCGTATTCGCAATATATTCGCCCATGACGGCAATCGTCACATTCTCT:1 + chr3R 31159715 3' - hobo 15 1 60.82 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACTTTTCCCTAATTTTCAACATAATTTAATGTAATACTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 15814646 3' - roo 29 2 56.44 CTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACACAAATGCCGCGAATAGTTTTGAAG:1 - chr2R 14925808 3' + 17.6 7351 2 72.15 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGT:1 - chr2R 11129275 3' - hopper 34 1 60.40 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATAGCCCTTTAGTCCTTTTAGTCTATTTTTCGTGTTCGTATTTTTGGCATATTTAAGCCAATTAAAAACAATAAAA:1 - chr3R 23004128 3' - accord 181 2 77.55 TATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATGTCTTTCATTTTTCTCTCTATAA:1 - chrX 13874699 3' + X-element 4579 1 78.22 AGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAGCCAAGGTGATCCTGCAGCGGCAGGAGAAGCAGGC:1 + chr3L 11882271 3' - 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R1A1-element 378 1 62.38 AAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAAACAAGAAATAACCTTACATTGGTGATATACGAGACGACCATATCGGCCATTTGGTAGCTGTGTTGTAATCT:1 - chr3R 3920882 3' - Circe 64 2 62.38 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTTCCCCATCCTTTAAATTTAGCCAGCCAGTCAGTCAGCCAGCCAATCAATGGAAATCGAATGGTGGGGGGGG:1 - chrX 20703623 3' - Quasimodo 9 2 57.43 AGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTGTCTCTCTAAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGTCAAACGAAATACAATCTA:1 - chrX 21022995 3' + Tc1 90 1 76.24 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATACCGTTCACAAAATGCAAACAGGGTCAACGTAACCCCCGAAATATT:1 + chr2R 6715054 3' - pogo 25 1 56.44 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAG:1 - chr3R 9996395 3' - blood 7052 2 62.38 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGAAAAAATGGAAAAGGATTTTTGCGCGGCCTTTTTACATATTTTTCCGTTCGGGTCAGGCACATAACTG:2 + chr3R 11097609 3' - mdg1 6 2 74.00 GCAATGGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGAGTATCCTTTGAATAAATACATAGGGAAGTGGACGACATGCAGAGCCAGTGAACATCGAAGCTGGCCC:1 + chrX 19408687 3' + jockey 25 1 69.31 CTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCGCTCGTAGATGGTCACATCCCGATAGCCCAGACGGGCCAAGAAGG:1 + chrX 9199496 3' + Doc2-element 4591 1 55.43 ATTGAAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACACAAAGTTCGATTTCGCATGTAACTCTTATTG:1 - 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chr3R 26331667 3' - G-element 57 1 76.24 CCAAATCCTCTTGCAAGAAAAATTATTCGAGTATGCAACCAAAGCCGACTGCACCGGAACTCCTCATCTTTCATGATGAAGAAAGCAGACGATCTCAGG:1 + chr2R 6880719 3' + Doc3-element 4528 1 60.61 TTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAAAAATAAATTGGAAATAAAAGCATTTCAAATGAGTTGCTTTAAGTTGGGCA:1 + chrX 8823693 3' - FB 109 1 59.41 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCT:1 - chr2R 5322025 3' - 1360 52 1 80.20 AGCGGCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGGTGCGGATTGCTGTTGCCTTTCACTTTCACTCA:1 + chr3L 21321602 3' - accord 210 2 52.05 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATAGATATTCACTGGGTGATGAGAATTTGAGCGTGTCCATATAAAAATACAGTTATCTG:1 - chr2L 12751680 3' - flea 4770 2 62.38 TTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCAGACTGTCAGGTAGCAAAGTTTCCGCCCGAACATATCCGCGTGTGTTTTTAAATTAATAGTGAAGTG:1 + chr3R 5783154 3' + invader4 3013 2 70.30 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCT:1 + chr2L 1353763 3' - I-element 48 1 74.26 TGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCCTTTCGTCAACGTTTATGACAATCTATCAGGGGAAGATCCATCTCCATCTCCATTTTC:1 + chr3R 13808642 3' - F-element 4445 1 57.43 AGCCGTACGATACAAGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGATGGGAGGTGTGGCCGTGGGACAAGTCAAAGGACATTACAATCACTGCCTACAGTCCCTTGG:1 - chr3L 11621542 3' + Cr1a 4396 1 65.00 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCATCCCTCGACGACCTCC:1 - chr2L 16691136 3' - pogo 5 1 74.26 TCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCCCGAAAAACAACGGCAAAACCC:1 - chr2L 945644 3' - invader4 2906 2 80.20 ACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAGGCATTTACCAGTTTTTAGATCATAAGAAATTACT:1 - chr2L 4249888 3' + F-element 235 1 65.35 TTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACAGCGTATTAGCACCTCGCAGAGGGGCGTG:1 - chr2R 21613929 3' + accord 204 2 75.25 GTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTCTTCGTTACATACAATAATGAATAAGACGAAGAAATTGAGCGTGCCCACAACAACAGTGACTGCTCCTACTACAACA:1 + chr2R 5926233 3' - 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chr3R 10287979 3' - pogo 206 1 54.46 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATTAAATACATATGTATGTATTTATGTAGTAACTTAAAGCGAAAGCAAAAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCT:1 + chr3L 15099969 3' - Tirant 8109 2 73.00 GCGAGGAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAACAAAAGAGCATAAAA:1 + chr3L 14923934 3' - Cr1a 271 1 73.27 ATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCAGCCACTGCCAGAATGGAAGTCAGCCGGTGGTG:1 - chr3R 17883971 3' - Stalker4 7200 6 68.32 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTA:2 + chr3L 776143 3' - 1360 51 1 72.28 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAA:1 - chr3L 27415228 3' + transib2 2795 1 56.00 GCTCATCTCCCATGCGAATGACGAATACTCGTAGGAGCGAACAAACAAAATGTCAGCTTCAAAATTGCGCTGCATAGTTTTAGGCAGCGCCACAAATACAC:1 + chr3R 17505045 3' - jockey 5 1 78.22 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTT:1 - chr3R 13375979 3' - 1360 43 1 70.30 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTCGACACTGGGTTTGTCGCCTTATCAGCTAATGATTACAAAGCAAA:1 - chr2R 24614439 3' + hobo 2917 1 51.11 TGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTTTTATTTGCAAAGCTTAACACTCGCAATTTGTCAGAGGCTGCAGCATCGCTACCCGCCGTTTAACCTGGTCGACAA:1 + chr3R 26571019 3' + accord2 7236 1 75.25 TAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATAGACCA:1 + chr2R 21092012 3' + 1731 4587 1 66.34 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTTGCCTGGTTG:1 - chrX 17692570 3' - 3S18 5782 2 62.38 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAG:1 - chrX 6283650 3' - P-element 32 1 31.17 CTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTGGACAAAAGCCAATCCCTAAGACGCATGCAGAGAACGCCGGAAATCAAATGAAAA:1 + chr3L 18397249 3' + G2 2848 1 79.21 TAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATAACGCAATGGAACAAGCCTAAGTTCTGGACAAATAATATGCCTAAGATTACCTTATCTTGGAT:1 + chrX 6705567 3' + jockey 4780 1 70.30 TCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCTCCATATGCTTTTTTAAAACATTGTCTACAGCGCCGATTCTAAGCTTGTAGAAGTCCTTTACAATT:1 - chr2R 2951262 3' + R1A1-element 5219 1 70.30 GGGATGAGTGCACTAATTAATGCATGCAAATTCCCGTCTCCAACAGCTGGGGCTCCTCCTTCTCATGCTCCTGTTTCTGAATTTCGTCAGTGCTCTTGTCT:1 + chr2R 1450859 3' - diver2 421 1 72.28 ATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCGCCATTCCGCAATGGATGATCCTGTGTCTGTTTGGAGATGATGCCCTCATATACACCATC:1 + chr2L 8752525 3' + roo 8613 1 69.31 CTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTCAAAGGCTTCCGTCTGCGGTAGCAGCATTAGGATGCCAAACAGGGCATGAGCCAAGTACTGAG:1 + chr3R 12462952 3' + Dm88 96 2 70.71 TCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAGTTGCTATTATCTTGGGATGGGAACGGGGCAGATGAATGATGCTTAGTA:1 - chrX 22768753 3' + Tc1 1336 1 55.45 ACTGATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAGTTATGGCCAGCAAATTGATTTGTTTAACAGTGATTATGACTGTCTG:1 + chr2L 14633578 3' + mdg3 137 2 55.45 CATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTCAAGTGGAAATTATACAATTAAGACAATGATAGTTTAAAAACTCTACTTT:1 - chrX 15627277 3' - F-element 122 1 57.43 GTAGAATTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTGGG:1 - chrX 17049526 3' - Stalker2 10 2 69.00 GCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCTCAGATTGAAGAACAGCAGAAGTTACTACAGGA:1 + chr2L 4188689 3' - HMS-Beagle 112 2 67.33 AGACTTAGGCTTTTGACAGTAATTAGGACTGGTCGACGGCCTATAACCGCAGTTGGTCACCAGATTCGCCGTACATTGTGGAGG:1 - chrX 4142310 3' - TAHRE 10239 1 70.24 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAAGGACCACCCTAATTGGTTACAGCGGCTCTCAGTCGGCGTCGCAGTCGTTGGTTGTAT:1 - chrX 6340586 3' + Juan 4199 1 61.39 GTGTATGTATGTGTGTGCTCATGCCCGTCTGTCTGTGTGCGTGTGAAGGACGAACGAAACGCCTCAAATACATATGCTTCAAATACTAAAGAAGCCATAAA:1 + chr3L 18742844 3' - 1731 72 2 83.17 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACCGAAATAAGCTGTCAAAATAGAAGAAACCATC:1 + chr2L 5390682 3' + Tirant 8452 2 68.32 TAGACNGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATCAGATAATATAATTATGTATATTGTATATAACGCAACTTTTCGTGAGAAGC:1 - chr3R 24839985 3' - I-element 26 1 53.47 TTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTAGTCGCACGCTTTTCCTGCCTTTCCTGCCTTTCCTGCCTTTACC:1 + chr3R 11856597 3' - Doc 4533 1 56.44 TATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAA:1 - chr3L 21637349 3' + Bari1 1663 1 69.31 TGACTCCGCTCATAATCCGTACAATGTGTGTTTATATTATTTTTGTGTGTTGTGCTTCGCCTTTTTCTGTTTACACACTCTCCTCTCGCTCTGTTTTAGCG:1 + chrX 20490977 3' - diver 2 2 62.38 ATATGTACATAGATTTGGCTATTTTTAATCTATTTTGAAATAATAATAACGTTAAGCCCAGCAGAACCACAGGACAGACGGCATTTAGAATATAAATTTAG:1 - chrX 7346376 3' - 1360 343 1 56.44 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAA:1 + chr2L 1353771 3' - I-element 24 1 60.00 TTCAGCTTTGGCTGTAATCACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGTTAGATGGTCGAATTAAATGTTCCAATATATGAGTAAGC:1 - chr2R 15003378 3' - 3S18 216 2 66.34 TGTGTTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTTCCTTTTCTTGGAATCGGAGATTGGAGG:1 - chr3R 23874992 3' - Bica 103 1 72.28 AAATTGGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTCCCGGCCGCAATCGACAAACTGCAAAAGTAAGCCCCAAGAAA:1 + chr3L 5679574 3' + FB 39 1 56.44 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCGACCATCGCATTCCCATTCTATAGTGCAA:1 + chr3L 2978995 3' - hobo 14 1 59.79 TTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGCGACTGTCACTTTCAACAAATGCACT:1 + chr2R 16018592 3' - I-element 205 1 74.26 GTCCCCTTGTGATTTTTTTCTATTGGGTTTTTTGAAGTCAGTCTAGAGCTCGGTGCTCTGGAAATGCATTGAAATTGAATCGATAGAGTTTCTGTATCCAA:1 - chr3L 23252273 3' + mariner2 583 1 64.36 GCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCATCTAGAGTCCACCGATTCAGGCCATCTGACCCAGTTGGTAGCCCGGTTCCA:1 + chrX 10958385 3' + R1A1-element 4907 1 55.45 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGATATGTGGTAGAATTTTCTTGTTGTATTCTTTTATTCCTTGGACCTCGTTTTCATCTCCAGTGACC:1 + chrX 5178480 3' - hobo 9 1 70.30 ACACACACACACACATATACACGAACGCAGCGCACGTAATCATATAGGCCCAGGTGGGAGGCCCACCTGAATGGCAATCGACAGCGAAACTTAATAAGCCC:1 - chr2R 15445496 3' + accord 7033 2 64.36 TAGGATTTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAAGTAGCTAGGACAGTCTAGGTGCCTCGGAATTTGGAGGAGTCAAGAAATCGGGAACACTAAGTATACAAC:1 - chr3R 15786345 3' - Cr1a 4279 1 62.38 CGACAATAGCATTCTGTCTTTTTTATTTTGTTATGCCAATTCTATAAATATGGCAAGCAAAAGTTGGCCTGTTTATTTTTTATCTCATTTTTAAAACTTCT:1 + chr2R 6646740 3' + INE-1 579 1 77.23 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAG:1 - chr3L 17624180 3' + roo 9024 2 70.00 TTTAAAATATCTATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTCAGAAAATAGAGAATCCCTATAACAACCCAGTCAAATTCGTAGTTCATGCCGAAAGGAATT:1 + chr3L 25675028 3' + Tc1 1502 1 56.44 ACATACATACATACATATGTACATATGTACATATACGCCATACGGGATGCCCTGTATTTGTCGATCCTTGCAGACGAAGTGACGGCACTTTGGATGCACCA:1 - chr3R 23713750 3' + 1731 78 2 71.29 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGACGGAGAAAGAGTCATAGAAATTGTTGACATATTTTAATTGGTT:1 - chr3L 16150704 3' + P-element 2857 1 49.50 CTAACTGAGTAACGGGTATCTGTTAGTAGGGAAACTCGACTTCTTCTTATTGGCACAGGATTTCGGCTT:1 - chr3R 18377768 3' + INE-1 543 1 85.51 AAGCACATGCCTACATACTAATACACATACAGCATGTACACACAAATACCTATTTTAAAATTCTAACTTATCATACAAAAATAGTAATCATTTTATTGACA:1 - chr3L 19226772 3' + Idefix 29 2 58.42 GGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGGTTCTGGTTTGAATTGGATTTTGATGTTTCACAAAAGATCTTTACAGTTGGGCGGGGATTGTAATG:1 + chr3L 590762 3' - Quasimodo 319 2 73.27 ACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCATAACATCAAAAGCGGCGCCGCGTCCTTGGGGCAGCCCAAGTATGCAAATCAGCGTGTT:1 - chr2R 8749588 3' + Doc 495 1 57.14 TACTGCGAACAACTCAGCAGCAGCCACGTGGAGTGCAGGGCTTGGGCTCGCAACATCATACACGATCGCAAGGAGAGAATCGGA:1 - chr2L 6790669 3' + G-element 223 1 70.24 GGGTTTTCATTGAAAACGCTTCGGACTCGCACGCTGCACAACAACAGCCAATATCAGCAGAATCTACGACGTCCACAAATCGATCAGATGCCCTACAATAA:1 + chr3L 16851897 3' + gypsy10 441 1 54.46 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATGGCAACTGATAAGAAACGGCACA:1 + chr2R 22113481 3' + mdg1 7407 2 76.24 CTCTCNCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCTGA:1 - chrX 14317408 3' - 1360 96 1 70.30 GGATACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTGATCGTGTGCTGACTTATGGTATAAGAGCCACGCCTAACGCTACGACTACGCCAA:1 - chr3R 9679264 3' - Idefix 81 2 60.40 GATGCGTAACACCATAAGATTTTTTAAGCATATCCTTTTTGCAAGAGCCTCGAGCTGCCATGGCCATAGTAACCCATTGAAATTAAAACGCTCTATTGAAG:1 - chr2R 13287941 3' + 1360 21 1 77.23 GGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTGTGAAGTTGAAGCCGCTGATGTCGTCGTTGGTGCCAGGGCTAGGTTGGGTTGCATGGCCACGCTTTGG:1 + chr3R 18655778 3' - F-element 268 1 74.26 GAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACCTCGGATTCGAGTGCCGCAATGACGCATACAAGGCCATCGGACTGCTCGGACCTGTGTGCTTTG:1 + chr2R 9083306 3' - Doc 4540 1 70.00 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAGCACCAC:1 - chr2L 10635261 3' + roo 361 2 72.28 TTGAGGAAACAGAGGAAGACTCTTGTAACGAGGAGTCTACAGAATTTGACAAAAACGCAACTCCTCTATCGTTTATGAGACGAACTGGGTGGCCAAACGTG:1 - chr2R 3287850 3' + invader5 297 2 58.42 ATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTTCATTCAGCATTCGATTTAAAGTATTACAATTTCCAGGACGGTTGGGTTTTGCGATATT:1 - chr2L 21373540 3' - copia 4682 1 58.42 GGCAGAGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACAGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGACCGAG:1 - chr3L 16047622 3' + Cr1a 4411 1 58.42 GCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACCCTATAGACATTGAATTAAAGTATTGTCAGCAAGAGTAATAA:1 + chr3L 20748205 3' - McClintock 5996 2 58.42 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTGCATACCCTCCGTTATATAACGATGGAATCTATATTGAACAGACTAG:2 - chr3R 11685565 3' + mdg1 392 2 52.48 ATAGCACTGCGAACAACGCATAAAAGGGAGAGTAAACAAAACAAATATTTTAATCGAAGATATAGCCCCAAAAAGCATGTTATTGTAAAATTTTATATTTT:1 - chr3R 5240071 3' - Cr1a 230 1 63.37 TAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTTTTTTTTTGGTTTCTTATTCAATCTGTCTGTGTTTTTGCATCTGTGTATAGGGCGACGGCACAAATTGTAATTAG:1 - chr2L 16874961 3' + INE-1 566 1 74.26 ACGGCGCATACTATTGCTAAACATTCCTTTTCCGTTGCCATTTTCCGTTGTTGTTGCCTCGTTTTCTTTGTGCAACTGCTGCAACTTACCAATCAAGCCA:1 - chrX 16518495 3' - Osvaldo 68 1 73.00 CAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGAGAGTGCGGGAGAGAGAGATGGCAAGTGCTAACCATGCCTACCTGCGCTTCCAGGTCA:1 - chr3L 1492226 3' + 1360 3263 1 58.42 AAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTGTCATATTGCGTCACCAGCTGCTCGTTGTCCTCACGCAGCAGCT:1 + chr3L 7933056 3' + 1360 3021 1 64.36 CTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCTCTCAGCAATTATATGTAGTCCGTTTTAATTTTAACATAGGCTAAGAACAATCACAGACCTTCAACACATTCAC:1 - chr2R 11983283 3' - 1360 473 1 68.32 ACCCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCCGCTCGGGGGCATTTTAATTTTTGATCTCGTAAATTTTCACAAGAGATA:1 - chr3L 13139717 3' + hopper 492 1 53.47 TGGTGGTGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCATCGGCATGGACACATTAATGGTAATTTCAATCTGCAGATCCTACAGTTGG:1 - chr3L 8725668 3' - G-element 4181 1 58.42 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGTGTGTGAATCTGATAATAAAGGTGCTGGATTTTTCCTAGCATACTTTCT:1 + chr2R 13280160 3' - jockey 29 1 57.14 TTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGCGTATATTTGACTTCCTGTTGACGTGTTGAAGATGGCCGGCGATG:1 + chr2L 19263811 3' - 1360 3252 1 56.44 GCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAGTAACTGTAAATGGTGATGGTGGCGGTGACGGTGGTGGGTGGATGACAGGCAGATTACGTTTCCGGTT:1 - chr3R 24475710 3' + invader2 481 1 72.28 CTAGTCAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAGCAAGAGCTGGAGTCGAAAATTAATATTGTAACAGAAGCTGAGGAGGGGCTGCTGACCAACGTGAAGA:1 - chrX 4033414 3' - gypsy6 7651 2 55.45 CCGGTGAGCGAGCAAGGACTGCACGTGGCCGGCTCGAGTGTATTGTTGCGTGTTCGTTAGGCACGTGGGCTGAGCCAGTGCGCGCG:1 - chrY 1425539 3' + Rt1b 5002 1 73.26 TATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTACATCGATCGTGAATCATTCGGGAATAAGGTAGTCGAGCTAGCTAGGGCCAATCGAGCGATCTGGGGCATTGTCAT:1 - chrX 16523789 3' + 1360 3276 1 79.21 TTGTTTTTTTATTTCCTTTTTTTTTCAGGGTCTGTCCCGAGCCACCCACTCACCCACACTCACCCAGCAAACCGCACAGCCAAGCCCAAAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 14213706 3' - gypsy7 5009 1 66.34 CGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCTTTCTTTATTTATTTGACGTTAAATTAGTCACTCATTTGTCCACTTAACACGACC:1 - chr3R 23429074 3' - F-element 190 1 50.50 CCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGATCGGTGGGCCAAGTTTATATAAGCGATGATGATACGT:1 - chr3R 20429315 3' - R1A1-element 4971 1 71.29 ATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGCTTGTATCCCAAGGTCACCGCCTGGTTGGATCGCCTCAATAAGCTGCCCTACTA:1 + chr2R 18399006 3' - Cr1a 3979 1 54.64 TTAAATGCTTTTTTTTACTATTTTATTAAATCTTTTTTTTTCATTCGCCAATACCACCTTAACATAAATCAAGAAGCTAACGTAGTCAACAGTTTGTTGTT:1 + chr2L 14711001 3' - P-element 452 1 78.22 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGATACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGCTACATGAT:1 - chr2R 6838484 3' - I-element 30 1 57.43 CGAGCGGAAAGAAGGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGACACGAAAGCCAACTAAAGTCAACCACAAAATCCGGAA:1 - chr2R 20768151 3' + 1360 3310 1 62.38 CTTTGCAGCTTGATAAATCATGATATTTAACATTACGTAGAATGCAAAGCGGATTGATGTTGGTGAAGGTGGCACATGCACGGCTATTCTCATAGCACGCA:1 - chr2L 8852017 3' - Chouto 6232 1 73.27 AGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCTGCCAAGTTTAGCGAATTGTTAAGCGTTCAGTGTTCTGATGATGGGGTCTGGAATAAAGTTGAGG:1 + chr2L 7907831 3' + rover 7158 2 67.00 TTTTGGTAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGTTATTATTTTAACCGCAGCTGTATGGGTAGGGATTAGAGCTCTGGAGGCTGGAGCACGGACACTACTG:1 - chrX 19698891 3' - Tc1 35 1 56.44 CGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACAAAAGCAAGCACCGCCATCCTGTTATCCTGCTTGCTGCCATTTT:1 + chr3R 24424418 3' + 1360 3205 1 65.35 TGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAGAAAATGGTTCAGGCTAAATAACCTGAAATTTTTCTCTACCTTTCTTCAAA:1 + chr2L 16572816 3' - hobo 2681 1 55.45 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGACGATACACATTAAACCCTTTCGCATTGTTTTTTACTTTAATTCCA:1 - chr2R 4784738 3' - 1360 29 1 67.33 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGC:1 - chr3L 3254973 3' - 1360 31 1 58.16 ACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTAGCCTTAACACCACTTTTTACTCTTTTTTGC:1 - chr3L 3682526 3' + R1A1-element 41 1 69.31 GGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACATTCACACACAGCGAGCCTGCG:1 - chr3R 18797998 3' + I-element 343 1 78.22 GGATGNGCACGTAGTTTGTTGCGATATTTTTTGGTTTTAGGTTACCGCGACATCCGTAAATGTCGTGGAATTATTTGGCCACCCCCGTGTACGTGGAAATT:1 + chr2L 20900968 3' - Fw2 3735 1 74.26 AGAATGGATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTGATAATGGCAGCAAAAAAAAAA:1 + chr3R 30338672 3' - GATE 464 1 62.07 TTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGTTTTTCACATTCTTTTTTCATTTGTCTTTTGCCGAGCATAGTTCTCAATA:1 - chr2L 14073272 3' + jockey 177 1 57.43 GCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAACTACTACGAAAACCCAAGCCATATCGAGTTTCT:1 + chr2L 21883118 3' + BS 4671 1 67.33 TTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGTTTGTCCCTGTTATCCAGTAACTTTCTTGTTAGATTCCTCTTAATTTCATCCCAGTCTA:1 + chr3L 27387130 3' + invader4 2709 1 66.34 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATATACAGATACCCCACAGTTGGAGGGGTATATACACG:1 + chr3L 8763276 3' + jockey 4958 1 63.37 AAGATCTAATTATGTATTAAAAAAGCTAAAATTGATTGCTGTAAGAGCGCCCCAGGTGATAATGATATTTTATTAACCATTTTTTTCGGTGGCCATAAATC:1 + chr2R 7599032 3' - Cr1a 4278 1 56.44 AAGCATTTAATTTGTAAAATGGCAAAAACAAAGTCTAAGCCGTTACCATTCGACTTCTGTGCCCTTGCCCGGCTCGACTCTACGGTTAAGCACAGTACAGT:1 + chr3L 25255304 3' + Bari2 237 1 72.28 TGACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCCAGTTTACTGGAACGTTGCTTG:1 - chr3R 22408487 3' - G2 402 1 78.22 CAGTGCGTTCGGGTTCATATCGTGCAGTCTTAAGCATCGCTTGCATTCTGCAGTTAATTAAGTCAGCCTGCTTATTGAAACTAATTGAAATATGTGGATTG:1 + chr2L 15792416 3' - Doc3-element 413 1 76.24 TGCACGAGATTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTTACATCTCCCCCTTCCTTCGGAATTTTGAAAAAGACTGATGCTCCAATCCGAGCGATTCGCGGTTTAT:1 + chrX 12457767 3' - gypsy8 14 2 73.27 CTCGTCGAGTGTTCGATCGCTACCAAAAAAATTACCAAAAAACGAAAACACTATTTATCGCAATTACTATTTGCGCTTATATTTCCGTACTTTACTTT:1 - chr3R 7090275 3' - G6 4 1 53.06 AAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATTAAATAATCAAAACAAAAACGTGACAATTGCACAAATCAAATCAGCCATAAGTTTGACATAACGTGA:1 - chr2R 25138482 3' + HeT-A 5968 1 64.36 GAGATCTCGATGTTCATACGGACAGAGAGACGAACCGACTCTATCCCTTCAATTCTTCTCGTCACTTCACCCAATTGTACATTTATTAATCGGTTATTTAA:1 - chr2R 3205164 3' - INE-1 134 1 61.39 CAGTAGAACGCTGAACGCAGCGGAAAGAAACTACTCTGCAACGGAAAAGGAATGTTTCTTATTTGCTCCTCGTGTTTCGTCTTCTAACCAAATATTTT:1 - chr3R 26343445 3' + Osvaldo 15 2 58.16 CGGAGAGCGGCCTACTTCGGTGGTAACACCAAAAAATCCTTTTTTTAGCACTACTGCACTCTTTTAAGGGAATATCCAAGTGGATGAAGCTGTCACTCT:1 - chr3R 28034256 3' + baggins 484 1 62.63 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGGGAGAAACCAAATTTTCCCTATTTAGTGCGGATTTCACTGCTAACATATAGCAATCACCGAGCAGT:1 + chr2R 23343842 3' - roo 9 2 66.34 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTA:1 - chr3R 19450192 3' - roo 61 2 57.43 CTCGTCGTTCATACGGACAGAAATATATTTAGATCGACTCGGCTATTGATCAGCATCAATAGCCAAGTCGAACTAGCATTGTCCGTCTGTCCGTATGAACG:1 - chr3L 23871826 3' - INE-1 129 1 55.45 GGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTTAATGCTCAATATTGGCCGTGGCTTAAACAGTTTTGACCATTTCATGAGCTGAACTTTGTTG:1 + chr2L 18217650 3' - Doc 4542 1 65.35 CTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAGCAAATGATCTAGCTGCTTGTATAAGAGCTATTTTTAAGACTAATGGCGCTACTGTAGGCGTGTAAGAGAAG:1 + chr4 553514 3' + 1360 426 1 77.23 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGGCAGAGCTCTTCCTCATGTTATGGGAA:1 + chr3L 13658384 3' - Tabor 87 2 73.27 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCAAATAACTTGATTATGATTTCTTGATAATTATTTGGAGCCACTTCCATTCACGGAACTCTTACT:1 - chr2R 22113412 3' - mdg1 12 2 67.33 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAAAGACCCA:2 + chr3R 12578198 3' - jockey 23 1 56.44 CGGATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTTAACAAAACAAAAAACAACTCCTACCTCTCACCCACAAACTCCATCAGCTCCTGGGTACAC:1 - chr3L 24917410 3' + Porto1 216 1 76.24 CACACTTTTGCAAAATGTTTTGATATTTTTTCATAATTTTATAACTCGTGATAATTTCTATTGACTTGACGAAAAAACTTTTTGCCACGACCACTCTAACG:1 - chr3L 26710195 3' + INE-1 259 1 69.31 AGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCATACCCATACTCAACCCTATTCGCTATGGAAAATCCCCATCCTTTTTGGA:1 - chrX 8396539 3' + G6 1882 1 56.44 TTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGGCGACAACAACAATAACAACAACAACAAGAACA:1 + chr3L 2580158 3' + 3S18 296 2 66.34 AATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACTTATGTTCCACAAACAACGAGGAGACCTTCCAT:1 + chr3L 20418818 3' + Tirant 8203 2 61.18 ATAGGCAAAAAATAGGCAAACGATTCCAGCTTTTCATTTTCAATCTGCTTTTTCCGCTACTTCTCGAATGTGGAATAGGCAACGAGTGCATGGTCGAGGC:1 + chr2L 3625271 3' - FB 57 1 69.00 AAAGTNCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGGTGAAAAGCAGCAGCTCAAGCTGATGTGTGTTCTCAGCATGATGAGAATGATGAAGCAGAGATCCGAG:1 + chr2R 13208896 3' + G-element 361 1 53.47 TTCATNATATAATTTTCCCTTTCTAACCAAGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTCCGTAGGTCAGGTGTGGTGG:1 - chr2R 13194017 3' - micropia 5236 2 48.98 TTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTGTGTGTGCCTCGCCTTGATAATTCTATTTTACGCGTATTTCTTTTCTAATAGA:1 + chr3R 11448519 3' - I-element 163 1 57.43 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATT:1 - chr3R 9833041 3' - Tabor 31 2 55.45 GACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCACATTCGTTACCAGT:1 - chr3R 1418271 3' - BS3 208 1 46.53 AAATGTCTTCGTCCGAGTTCGTATTGGCGACTTCTTAGCGCCTGCGGGTTGCTTCTTAAAGAAGTTGTCCATAGTGCCGGACGTCGATTTGCTGGGCGTGG:1 + chr2L 15255560 3' + accord2 7553 2 68.32 GTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACACACAGTATGTACATGCGGTATTTGATTAGCGTGGGAATGTTGACCATGGCATTTATCGTCCAGCTGTGGCTCTGGT:1 + chr2R 5887314 3' - diver2 4536 2 38.61 GTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAAAACCAAACACTTTGCATGCCAGTGAAAAATATTCAACGCATTAGGCTAAATCCGGCCTAAAAT:1 - chr3R 12745436 3' - Circe 7099 1 68.32 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGCCGTTCATGTGTTGACCAAGTTGGTAGTAAGCCG:1 - chrX 896824 3' - jockey 4691 1 66.34 AAAAATGTATTTTGATTTCGGCATTGCGCTTTTCCCATAGCCATAGCATCATTATCATTATCGTGATGGGGTGGGCGGTTTTGGTGTTTTGCAAATGGGTC:1 + chrX 11758670 3' + Dm88 4287 1 64.36 TTCAAAAATGTGGGCGTGGTAGTTTTGGGAGGCTTTAGGGCATTAGAGGAACTGGAACTGGAATGGGCCCACTTCGCACACAATGCGACAACGTCGGCGA:1 + chr3L 13087682 3' - INE-1 249 1 56.00 CCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTTGGACCGTGCACTGCGTGTTCTTGTTA:1 + chr2R 1687549 3' + 17.6 132 2 73.27 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGC:1 - chr3R 5208138 3' + hopper 1389 1 53.47 CATCCATGGATTTATCGGATCCTTTACTTTCAAGCCTAAATAAAAACATATCGTTAGAAATCGCTAAATAAACCTCGTCTTTTAATTGCAAAAAAAAACAG:1 + chr4 909234 3' + transib3 2390 1 62.38 GTTCGATTATTACCGAACTGATAGAAAAAAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTATGCCTTCGGACTGTCCAAGATATCTACGGAAGTCAAGAG:1 + chr3L 25709096 3' - Circe 446 1 63.00 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTT:1 - chrX 17692582 3' - 3S18 29 2 50.50 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTGAGTGTGAG:1 + chrX 14424095 3' - hobo 34 1 62.38 ACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTGTGATAATTACTAAACCACGTCGACCCACCAAGAGTGCTGAAATGGAGT:1 + chr3R 18860487 3' - R1A1-element 5101 1 54.46 ACTCGNCTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATAAGTAATGGTTCCGGATGGGGTGCTTTCATCATCCGGATCGCTGGCAA:1 + chr3L 17370102 3' - flea 140 1 53.47 TCGTCNGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTGAGCTGCTGCTGCCTTTGGTCAGCGGATTCAATTGCGAACCCTTCGCTGTTATTTGCCACGG:1 - chrX 11582746 3' + accord2 7561 2 67.68 GGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTA:1 - chr3R 26331666 3' - G-element 56 1 75.25 TCCTCCTGAACGGGTCGTTCCGATCAGGGGGACTGCCCCCCACTGGCCATCCTTCTAATAGGCCAACAAAAATCTCAGCTGGATAATGATGCACTGACAAC:1 - chr2L 1559856 3' - Rt1b 416 1 61.39 GGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATG:2 - chr3R 1875806 3' + Rt1b 4747 1 43.00 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAAC:1 + chrX 697512 3' + roo 9038 1 59.41 TTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACCGTGCACGGTTGCGTTTGGGCAGCAGCC:1 + chr2L 7803276 3' - Cr1a 465 1 78.22 ACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCTACCCACTTATCAGGTGGCTGCGTTTG:1 + chr3R 22348105 3' + accord2 98 1 71.29 TTCTTTTCTTATCTTTAATTATACATGTTTAGGTATGTTTAGGTATTAGCTTTCTAGCAACTCCTCCTGCAATCAATCAGCCACAATCGCATGAAGGGCAA:1 + chr2L 9633245 3' - invader2 4740 1 68.32 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAGCGATGACCCTGGGTACACACAGAAAAATGGGCACTTA:1 + chr3R 27619290 3' - hobo 12 1 65.35 GCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGATGAGCTAGGAGTATAACTCTTTTATTACTTATATATCATTGTATTTAAGATTACGCGAATGTATTTGTATTTCTT:1 + chr2L 20379128 3' - F-element 481 1 80.20 AGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTGCAAAATGAGTAAACAAACTTGCGCTGCATCATTTGCAAACTGCAAAAAGGAATTCTTAACAATCGCAATAAAACTTT:1 - chr3L 15911534 3' - INE-1 346 1 55.45 ACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTAAAGATTCATCTTTTATGTGACATGCATAATGGTGTGCAGGACCGAAAACTGCACATT:1 + chr3L 21951757 3' + roo 116 2 55.45 CAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTAGATCAAAGCCAAAGCAGCCACCCCGGCGTCTTCCGTTTGCCCCTGCCACCGATCTCCTTCTCCCAGGA:1 + chr2L 5158074 3' - flea 299 1 73.27 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCACATTCGACACCGAATCGGATTCAAA:1 + chrX 16619689 3' - opus 7022 2 60.40 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGC:1 - chr3R 22899176 3' - P-element 25 1 50.00 TTTAAATTTGATTTTATTTCATGAAAATTGAGTTTCGTTGCGGGGTTGTGTTTTTGTGCTCTCCACTGTCTGTCAGTGCCAATTGTCGCCGTTTTTGCGTT:1 - chr2L 13419276 3' - HeT-A 324 1 72.28 CGTAGAACGATGCTTGAAACAGTCTTTATTTGTAGTTATCCTTTGTGGATTTAACGGCTCATTTATCTGTGTAAATTAGTTGTGTTACTGATTCCAAGAAG:1 + chr3R 23170855 3' + Cr1a 4019 1 71.29 CGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACATCTACCTCTAGTGAATCTGGAGAGAAGCACCCACTGGCTGTCACCAAATCC:1 - chr3L 20639832 3' - Cr1a 4087 1 56.57 GGACTAGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGCAATTAGCAAAGGTTCACGATTGTTGCCA:1 + chr3L 4190095 3' + R2-element 403 1 69.31 GGTAGGAGTTGTTTTTATTTTGTTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCATGAATGAACGAAAATGTTTTCCTTTTTAGTTTATTTATTTTTTTA:1 + chr2L 1512281 3' - Porto1 259 1 54.46 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTT:1 + chr2R 8463630 3' - I-element 34 1 54.64 AAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGGGCTAAGCTCTAGCCGTATATTGTTTGTAAGTCTTTTATCGTGCAACGCATAACTCTGGCTTA:1 - chrX 886889 3' + HeT-A 5968 1 68.32 GAAATTAACCCGAACGCACTGAGAGCGTATCTCTCAAGCTCCCCGTTCCCAAATTCAAAAAAACAAGTTCACCATTCAGCTACATTATAAGTTGCAACTAT:1 - chr2R 8830306 3' + Doc3-element 414 1 45.54 ATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCAGGGTCACCAATGAGAGATTGGGATGGGGGCCTGATTTCAAATTTTCATATTACGAAA:1 - chr4 991800 3' - diver2 418 1 56.44 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATATGGCAGCGTCTCCCAGCTGAAAGATGAGGGGCAACGAATGGAGGATT:1 + chr2R 5968858 3' - flea 4777 2 59.41 CTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGTGAAGGAGGGCCAATACCGACCGAATCGTATTG:1 - chr2R 20719791 3' - G2 2893 1 67.00 TTGAAGACTCATTTTCCTGCCGTGTAGGATGGATGTTAATGAATGCACGGCGAGAAAACTACAGACATAAAACGCATGTCGCTGAAAGTTGTAAAAAATGA:1 + chr2L 3121487 3' + Rt1a 5048 1 69.31 TGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGTAAATTAAAGAAAATGCTCGCTTACATT:1 - chr3R 16117743 3' + Burdock 268 1 60.56 TTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAACCAAGTGCCTGGCAACCGACTGACGCACTGACACAC:1 - chr3L 11404104 3' + Doc 300 1 59.55 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTC:1 - chr3L 22052786 3' + mdg1 7408 2 76.24 TTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTGTCTGTTTACCTTAACTTTCGATTACCCGTGAAGCCAAATACCGAGAACCATAAAAATCGTTGTTAC:1 - chrX 15434855 3' - Bica 4589 1 66.34 TGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTTCTACAAAACCGAACAAAAAACGAAGCTGGGAAAGTGCAGAAAC:1 - chr3R 6063322 3' - invader2 4900 2 68.32 GCGTGGGGGTTTAGGGGGCGGGGCGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCTTTTGATGCGC:1 - chr2L 306458 3' - Tirant 12 2 69.31 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAGTGAAGGAGGGTCAGGGTGGAAAAATCAACATAAGCATTTTGATATTTCAAATATTTT:1 - chrX 19053768 3' - jockey 4810 1 63.37 TTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCCAAGGAAGCAACCCAGGCAGTAACATGGGAAACAATTGATCGAAACGATTATCTAGTCAAATATTGA:1 + chr2R 2457457 3' - 1360 3344 1 69.31 CAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCTAGGCATAGCGTAGCCGCAAGATAAAGTGGCATTTGAAACTTGTGCTCACTATTTCTGTGTTTTGGCCTT:1 - chr3R 28453545 3' + G2 153 1 76.24 TTTGGGCGGTTTTAAGGCTTTGCGAGTTTATTTACAAATAGGCGATAATTCCGTAAAAAAAAAAATAATATCAATACGGTTCATAAGCACAATTAGTTTCT:1 - chrX 3708247 3' - INE-1 343 1 72.28 TAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCTTGCCTCCGTGGTCCTG:1 - chr2L 22407439 3' + roo 9066 1 75.25 CACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAAGCCATAAAACATATTGTGAGAGAACGCCGATCGTTTTATTCCTATACTGTTATCATAGAAG:1 - chr2R 21282603 3' + copia 4913 2 70.00 ATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGAAAAATTGATTTCTATCTCGAATTCTTTTTGTTGCATTTTTTCGCGTTGGCCT:1 + chr2R 8558252 3' - hobo 2663 1 60.67 TTAATCTTAAATGTTCAATAAACGAATTAAAAAAAAAAACAAAAACTAATCCTAAGTAAACATCCTCGACATCCCCAACATCCTCAGCATCCTGGACATCG:1 + chrX 20116486 3' + Rt1c 5407 1 48.51 TACAGNTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACATTCTAACCAGTTGATCAACTGTGATTTTTGGTGGAAAGGTCCGAAATGGCTAGCA:1 + chr3R 19446534 3' + gypsy12 10173 2 55.45 CTAAGGACAACGCTAAGAAATAAGTTTTCACGTTTTTATTCATTTGATCTCAGCTTAAGACTTAAGACTCTGTAATTCTTAAGTCTTAAGCTGAGATCAAA:1 + chr2L 22076769 3' - 297 6924 2 79.21 ACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTGCATAATCCCAAAATCGAATACCCACAATTGGCAGATGACCCAAACTTTCCTCACTAGC:1 + chr3L 6444953 3' + 1360 170 1 63.37 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTGTAGCATACTTTCC:1 - chrX 3697107 3' + jockey 4973 1 61.39 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACCGCCAG:1 + chr2R 5910922 3' - hobo 34 1 61.39 CTCTGTCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACTTTAATATTATATCTTCCTATTGTGATAAATTGTGAAATTGTTAAGAAATCAGTATAAT:1 - chr2L 13689120 3' + Cr1a 4245 1 63.37 ACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCCGTATCTATAAACAGAGAGCGGATGGCAAGTTAATTCGCCTC:1 - chr2L 19035923 3' + I-element 5044 1 58.42 TATAAAATAAAATTATTTGAAATCCTAAGAAATAATATTACACTACAATATAACTAAGTTCATTTGAAAGTGATATTTAATGTAGCTAAAAATAAACGAAG:1 + chr2L 15124498 3' + HMS-Beagle 419 1 76.24 AGATCTCGACGTTCATACGAACAGACGGATAGATTCAGATCGACTCGGCTCGATCTTAGTTCCCTCCTCCACGAGAGCCGTCAACTTGGCAGTGG:1 - chr3R 21752519 3' - INE-1 133 1 52.63 GTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGATATGGGTGCGTGTTTGCGGTTTTTTCACTGAATGTTACTATACCTAATTCAAATGTTCTTGTTTCG:1 + chr3L 15604383 3' - 1360 3240 1 56.84 AACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTGGCGCTAGATGGTTGGATGGATGGATGGATGGATGGCTGGATGGAAGGATGGTCAATGGGCAAGGGTTGCGATGC:1 - chr3R 11316811 3' - F-element 4493 1 63.37 GAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGAGTACCCAGGTGTTGTCGATGATGGAACCACCGCACCACCAGCTGCCGCTGG:1 - chr3L 6050961 3' + flea 4836 1 58.42 AGCAGCTTTCCCGACTTTAACCTTTTGCACAGATTTTTCACCCAACGACCGCCGCATTGGGGTCAATTTTAAATTATACACTTCCGCTTCCGTGCTCCGAC:1 - chr3R 22867709 3' - flea 446 1 82.18 GTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGCAAGATAAATAAATAAATAAAT:1 + chr3L 14461787 3' - Porto1 369 1 78.22 GGAGCAGTGCTGTCCTTTACCCACTAATATATAATTTTTTTCATTTTTATTGCCTTTACTAATGGTTTTTGGCTTGTCACGGTGAATTATGGTCGGGCA:1 - chr2L 14444123 3' - HB 353 1 59.60 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTATCACATAG:2 - chr3L 3254952 3' - 1360 13 1 67.33 AAGCAGAGGCTCTGGTGTCCGAGTCGAGGCGGTACAAACCTCCATCCGTAAAAACCGAAGGGACATAACTTGTGAGAAACTTTGACAGGATTCTGTGGGTG:1 - chr2R 12067998 3' + Rt1b 245 1 55.45 TTTTCCACTCCGCACGTGTTGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGGCTTTAATTGGGCTCGGGCTTACGTTCACGTTTACGTTTATGTTGGGCCCATTCAAGTGG:1 + chrX 14949842 3' + R1A1-element 165 1 66.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCAC:1 - chr3R 11005453 3' + roo 9048 2 49.48 CCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTCTCGGGCCGTGCCTAGTTGTTATCTCTTCTTATTTAATTTTGGCTGCCATTGCCGA:1 + chr3R 5090611 3' - McClintock 6011 2 59.41 TATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAAGTCTGATTTCCCCCGTCAGCGTTCCAAATAGAGATCTTGTTCGACTTTCCGCGAATATT:1 + chrX 1158986 3' + invader1 236 2 59.41 AGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGATAAGGGTGTGCCAGGATGTCAAGGCGT:1 - chr3R 31996530 3' - mdg1 287 2 63.00 TTAATGACACATGGGAAAAACACCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCCGACAACTATATGTTGCACTGGTTTTTATGACATGATTACTATTATCATGCAGTT:1 + chrX 9898913 3' + baggins 5095 1 57.43 AAAACCAACGAACTATTGATAAAAATAGAAAACGAGAAGATCAACGAAATGGCAGCAGTGATGCAGCTAGCTGCAAGTGTAGATGACGGTGTCGTGCAGCG:1 - chr2L 6944521 3' + Bari1 1232 1 68.32 TCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCCAACGTTTTGCGTGAGTTTCGCGAGTTGTCGTAAAAATATTTTTA:1 - chr2R 13280297 3' - jockey 224 1 55.45 CATCACTGTATGCGTGGAAAAGAGCTGTTCTACTTTACCACTCTCTCCAGCACACAAACTTACGCAGTGTCCAATTCCATATCATCGGAGTCCTCAGCTCG:1 - chr3R 24657373 3' - 1360 144 1 77.23 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCA:1 - chr2L 9823655 3' - hobo 55 1 76.24 ACTGCCTTTGAGGCAATAAACACACACTCCAGCCGGTACCAGGACAGACTAGAGCGGCACAGAAATCGACGAGCGCACAGTAGCAAATCGAGTTGCAAATT:1 + chr3R 16273197 3' + BS3 1451 1 69.31 ACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACGTGACGACAAAGCTGCGGGTGCCCTTCTGCTCCTCGATGAAT:1 + chr3R 14139457 3' + hopper 1384 1 54.46 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - 412 7101 2 73.27 AATTGNTTTCGGCCCGAAAATAGTCTTCTAGCACAACTACGCACACATATACACGTTCTCGTCTACGGTTTTTACCTCTGTTTGCATGCGTATCTCTCTTT:1 + chr3R 16569320 3' + 1360 3184 1 74.26 GAGGCCCCTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAGTCCACTCGTAATGTCTTCAGCTCAATTCAATGGAAAATAATCGAATACACATTACTTTGACATACAG:1 - chr3R 23648300 3' + McClintock 240 2 66.34 CGAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAATATGAAGCCCCAAAGAGGCAAACAGTCGGTCCAAGGCCC:1 - chrX 9538905 3' + Porto1 4367 1 61.39 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACATTTTTCGCCAATTTCCCGTTTCACATTACAAATATTTTATTTTTT:1 + chrX 10661010 3' - HMS-Beagle 29 2 56.44 CCTGCCTTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTGTTCGGCTGTTCATTTTGAATACAGTGTAAAAGGATGGAGGGAGTTGGAGGGAAGAGAATACTTTTCAGGAAG:1 + chr2L 14185713 3' + mariner2 155 1 65.35 TCCCATTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTCGCCTAAATGCAGGCAATTCATTCGATTCATTTTATGGCGAGAAGACGACAAGAAGAGCCGA:1 - chrX 823433 3' + gypsy6 7531 2 68.00 AGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTATATAAGTTAAGAATAAATTCTATACA:1 + chr2L 22975141 3' + Tc1 1592 1 68.32 TTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATGAGTTGTGTA:1 + chr2L 22690034 3' - Tabor 23 2 57.43 ACTTTNAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTT:1 + chr2R 4879003 3' - G-element 53 1 73.27 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTGCTTACAATTCCTCGG:1 - chr3R 15072585 3' - pogo 33 1 68.48 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGGCGG:1 + chr2R 5322059 3' + 1360 3349 1 70.83 AATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACATATGCCCATTAGTAATAGGTGTAGGGCACAACTTGCTGCGGGGAAAGCACACACCAAACGGAAA:1 + chrX 6863552 3' - flea 373 1 71.29 GTATGTTTCATATAGATATAACTTACTGATTTAAAATTAAAATTATTGTCTTTGTTTACGTCTTATTTAGCAAAATCCAAGAGAAAGAATGAGAAATTCAA:1 - chrX 13079689 3' + transib3 290 1 76.24 GTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCAGCCCGTGCTCATCTTGGCTGGCTCTGACGTCACCCCA:1 + chr3L 12497572 3' - invader4 350 1 63.37 TGTTCCAAGCATAGTTCTGTGGTTAGCTAAGGAAAGGAAGTTAATTAAAAGTAGTCTACTTGAATGAGGAGGATAGTCACACCAC:1 + chr3R 18178089 3' - Cr1a 4018 1 67.06 TCACTTCTATTAATTTTATTCAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTGTCTTCAGCCCGCCTCGCATATCATTTGCATATAAATTGAATT:1 - chrX 4241763 3' - Tc1 240 1 53.47 GGACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACAATGGAGCTCGGCGATAGCGGATGGGCATCAATCACATTACGTGC:1 + chr3R 14378638 3' + R2-element 3347 1 55.10 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACGCTAAGGGGAGAGTGACCAATATTTTTTATCTAATTTCGGAAATCAAATA:1 - chrX 22689315 3' - HMS-Beagle 6821 2 54.46 TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCA:2 - chr2L 15478808 3' - jockey 4722 1 78.22 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCATACATCATTTATGAACGAACGCA:1 - chr3L 22324051 3' + hobo 2899 1 71.91 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAA:1 - chrX 19561822 3' - 412 39 2 64.36 AGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGACTTGTATAATTGTTGACATGTATGTATAGAGGATTACTCTTTTTTTGTT:1 + chr3R 26961741 3' - I-element 316 1 54.46 GTTTTTTCCATTCTCGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTGCCCTAGAGAGTTCTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGCTGTGTGTG:1 - chr3R 18778054 3' - Idefix 136 2 53.47 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATTTGTTTTCCACTTGCCGCTCGACACCAGTGAAATTAACACCAGCGA:1 + chr3L 19510834 3' + roo 402 1 72.28 CCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCAAAATATTTGAATGTGTAATAACATACGTTTTTA:1 - chr2R 10749726 3' + F-element 477 1 69.31 AAGACNCTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCAATCTTGAGCT:1 - chr3R 14882065 3' + gypsy5 402 2 61.39 ATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGATATAAAAAAGAGTTCAGCAGCGTGGTAAAAAATGTTAGAAAAAGCGTAATTGATTAATAAAATCAC:1 + chr3L 1845463 3' - Cr1a 4385 1 60.40 CAAAANAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAGTAATAACACAAAATAACCTGAGATTGCGATATGCTTGCAGGCATACGGTCATTTTGTATTGGG:1 + chr3R 12926723 3' - pogo 148 1 72.28 TAAAAAAGATCAAGAATTGAGCGTCAAATAAAGAAATTCAGAAATGGACACGAGAACGTGATGCGTGAGGGCAAATTCATTCTGGTGAAGATAAGCTATCG:1 + chr3L 12189313 3' - Gypsy12A_LTR 2119 1 59.41 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCT:2 - chr3R 9996407 3' - blood 53 2 74.26 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCAGCTTAATGCGGAATTAGGCTT:1 - chr2L 15020117 3' - jockey 4721 1 76.24 ACTTGGCCTCACATCCTGCTCACCAGAATAGTGTGTTGCTTGATATTTACAGCGATTGGTAAATAAAACATGTATGCTTTTGTAAAATTAGAAATTCAATT:1 - chrX 18883181 3' + Rt1b 4954 1 80.20 GAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAATCAAAACATTGGCTC:1 + chr2L 13270701 3' + X-element 381 1 77.59 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTTTGTTTACCAGGCAACAGGTTA:1 - chr3R 5208115 3' + hopper 1412 2 76.24 TGATAGTCGGGGAATTCGACTATAGCATTTTCTTATCAGTTTTGCTTTTGTTTATGTGTAGAGACATTATTTTATATATAAGGTACATATGTATATGCTTT:1 - chrX 6064552 3' + INE-1 563 1 75.25 CGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCATGCAGCCCAGCTGATCCACAATCA:1 - chrX 2628587 3' + Doc 4303 1 76.24 CTTATGTATGAGCGTTAGATCGTATTACTCGGACGATGGAATGCTTATGTAGTCATTGGTGGTCTTTTGGGTATTTGCCGTTTTAATAGCCTGTGGATGTC:1 + chr3L 18453830 3' - Stalker4 158 6 74.26 CCTTGGTGGGCGAGATCGGTTTAAAGCGCTGGCTACACCTCTATTCTGGGTGTGTGTGTGTGGGGCCGAGTGGGCGTGGGCTGTCCACCACCCCGTTGAAC:1 - chr2R 23763360 3' - X-element 4463 1 70.30 CGCTGCTGGGGCTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGTTTTGTTCCAAGCTTGTGGGCGCGCGAACTTTTTGAGGTCTGCTTTGGGTAAG:1 + chr3L 13724406 3' - G6 391 1 73.74 CAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTCCTTTTCGACCTCCCACAAC:1 - chr3R 27357849 3' - I-element 4999 1 80.20 ACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTTTCCTATAACTATAGAACATAACCCGGCTCAATAGATCAAGTTTGGGTGGACGCGTACAAACTGATCACTTGGG:1 - chr3R 30237412 3' - gypsy4 6751 2 71.29 ATCAGNATCAATGGCCGAGTCGATTTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGCTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGA:1 + chr3L 23747152 3' + INE-1 93 1 61.39 TCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCCAGCCTGGGGAAC:1 - chr2L 5932081 3' - jockey 11 1 72.28 CTTCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGATATAGTGAGGGTGGCGAACAATAATGT:1 + chr3L 3498664 3' + Circe 7093 1 73.27 CACAGAGCGTCTTTTTCGCTTTCGATTTATTTGTTTGTATTATATTAATCACTGATTCACTTCAAGGGCTAATACAAATGCAAAACGAGGCTAGGATGAAT:1 - chr3R 24683986 3' - Doc2-element 109 1 54.46 GGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGCAAGCGCCAAAGGCAGTTGGCCAG:1 + chr3R 27066494 3' - Idefix 7074 2 76.00 ATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGCTGGAGTGGGATGAATGTGGAGCAGGCCAGACA:1 - chr3R 20094733 3' + R2-element 418 1 67.33 ACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACCGGACCAGCTGGTCAACAAGAGCGTC:1 - chr2R 7961527 3' - hobo 2875 1 72.00 AAAGTNGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATCCCGTTGACTTTATTGTAAAAATTGACAACGTGGCTGCCTTTGTTG:1 - chr2L 7216589 3' - copia 4900 2 54.46 ATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTACCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACTCCAGCTCTCCGGCACTACGATTTAT:1 + chr2L 16347092 3' + HMS-Beagle2 37 2 76.24 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTATAAATGTTCAAATT:1 - chr2R 18891029 3' + opus 7488 2 58.42 TAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACG:1 - chr3L 5691251 3' - P-element 204 1 32.67 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGGAATTGAAGCTCATTAAGTAAGCCCTTTAATCCTG:1 - chr3L 2182674 3' + blood 336 2 67.33 TCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGTGTGTGTTGGCGTCGCTAAAAAAGTGCATGTGAAGATTAGGAAAATAATAAGGAAGG:1 - chr3L 540178 3' - Idefix 7077 2 59.41 AAGACAATCGGGAGCGGCACGACATTTACGATTACATTTTGAGCTCCATTATTTGCATTATACAATCAAACGGCGTCACAAGATAAGACAATACGCGGATC:1 + chr3L 15306421 3' + G5A 2490 1 74.26 TTGTGTCCTAACTTCGTGCCTCAATATATGACTTTTGCAATAAACATTTTTCATATTAGTGGAAATAAAACTACGGTCATGTTACCAGCAGATAAATTTAT:1 + chr2L 21151819 3' + 1360 470 1 54.46 TAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTC:1 + chr3R 24729638 3' - Juan 4121 1 67.33 GCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATTATTATTCACTCTATAACATGAGAGAGAGTGTGAGAGGCAATCTAAATATCTCTCTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 9023555 3' - G6 1959 1 33.66 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAATTTCTATTAGGAAAATTAAGCAGCGGCTA:1 - chr3L 18957596 3' + copia 242 1 65.35 GACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTTTGTGGGGCGGAAAAACTCGTCCTCCTCTTCTGCGTCCACGACCTCCGGCTC:1 - chrX 2726072 3' - R2-element 444 1 62.96 TAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTTGGTTAAAAATTGATAAAAGGAAGTGGGTGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCAGCTGT:1 + chr2L 15763113 3' + mdg1 30 2 39.60 GGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAGAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGATTACAAATCCACACACCCCAGCAAT:1 + chr2L 1605589 3' + F-element 4359 1 73.27 TGGAAACAATAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATGTTTTGTTGGCTATGTGAATGTTGCATATAATCCCGAAAGCGCTGGATTGGGCACGCCTGTGTAGA:1 + chr2L 22688356 3' + Cr1a 436 1 62.38 CTCGTGCGTATACATTAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCACCAGCGCCTCAGCCAGTGACTTGGTGTAGGCATACGTGT:1 + chr2R 9900115 3' + accord 345 2 45.54 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGCGCTGGCATAGTTGCTATCAAATTTCATGATCACTGCCA:1 - chrX 2090214 3' - roo 8683 2 56.44 CAGTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTGATGTGTAGCTTAAATTAGCAATCCGTTCGGTGAGCTGACAGCACTTAAAACATCCGACTGCGAA:1 + chr3L 12989579 3' - G5A 2809 1 56.44 TCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATCACACTCGCCGGAAAAAATACCATCCATCACTGGATATCATTATGTACAAGTATTTTATTC:1 + chrX 2173412 3' - R1A1-element 74 1 66.34 TAAACTCACCACAGTGTGTATGTGTAGTGGTGTATGAAAGAGAATAAGAAAGGGAAACGCTTGGTGTAGGTCATTGCGTTGGCGCACCAATTGATGTTTTC:1 - chr2R 7271226 3' + invader5 169 2 70.30 CTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGCTACTAAACTAAATCTTAAACAAGAACTTCGAGGCCATAATCGAAATAT:1 - chr3L 16218795 3' - Bica 4516 1 55.45 CCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGCCTGATCCAAATGTCACGGAGGCAGAAACTCCTCAGG:1 + chr2R 19427562 3' + micropia 5215 1 63.37 GACTTGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATGCATTTTATAGGGGGGAAAAGAAAAATAAAGACAGAGACGGAGATAGTGGTGAGCAAACACACACAACC:1 + chr3R 11471214 3' - INE-1 92 1 41.58 TGCCTGCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGGACGACTTTGGTAAACAAC:1 + chr3R 25814775 3' + 412 464 2 49.50 GAGGANATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAACAACAAGTGTGAGAGGCAGGCCGCAGCAGAAGAGCAATGCCCAAGAAGAAAG:1 - chr3L 21112736 3' + blood 439 1 71.00 CAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGGGTGGCATTGCTGGACGTACCATCAAGCTGAATACCACAGCTTTTCAACAGCC:1 - chr3L 4504794 3' + Doc 312 1 60.40 AGGCTTTAGACTGAAAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTG:1 - chr2R 14121067 3' - I-element 32 1 61.39 ATCATAACACCTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGCCAGAAATTCATCGCAATGTGGCGCAAAAACTTTCGATTTGTTTACCATAACTTGACATAG:1 + chr3L 9574701 3' + mariner2 689 1 59.41 CCTAGCCAAGGCACTAACCAGAGGTCGCCCACCCCTTGCGGATCCATCCCCTGCTGCTCGAGGTTCATTGACTTGGCATCGATTTTCCAAACACCCTTTTT:1 + chr2R 23609034 3' + BS3 1519 1 72.28 GCCTTTTTTTGATTATTTAAAAAAAATTTGTAGTGTTTCCTCAATAAACAAAAAATAGCCTTTTGTTTTGTGCACTTAGTTTAAAATTGTTATTTCAGTTT:1 + chrX 13975894 3' - G2 3053 2 83.17 TAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGAGCGGAATAGAGCAGAAACACAGAAAA:1 + chr2L 17651727 3' + blood 452 1 76.24 AGAATTGATTTCGGCCCGGAAATCGTCTTCTAGTACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCCTTGACTCGACACAGAGTTCGGATAACGGCAAGAGTG:1 - chr2R 5322202 3' + 1360 3182 1 65.35 GCAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGGAGCTTCGGGTGCTGGCGCAGGGATTTATTTATAGTGGAGTGGCGTGGAAGGAGGTTTCGTCACGT:1 + chr3L 22704966 3' + jockey 4712 1 54.46 TATTATAATTATTATTAATACAATGCAAAGGCTTTCAAACGGATATGATAGCACACTTTTTTTTTAAACAACAAAAGCCATAAAAGGTCCTTAAAGGACTA:1 + chr2L 1737194 3' - mdg1 7087 2 57.43 AGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAAAATGCTTATAGATCTGTCAGCAAAA:1 + chr2L 12487211 3' + Doc3-element 11 1 75.00 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATTGTTACATTTTCCTGCCT:1 + chr3R 1292528 3' + roo 9022 2 80.85 AACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGTAAGGCGAACCAGCGCGACTCGGCTGCAAAAACGTAAGGAGTTACACA:1 - chr2R 11209894 3' + Transpac 250 2 56.44 AAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATG:1 - chr3R 22899169 3' - P-element 23 1 54.46 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCC:1 - chr2R 14121077 3' - I-element 42 1 73.27 TTTTTTTTCCCTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGGTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGCACTGGGCGCGCTGCTGGGGCTGCCTTTTCACATTTTTCAATTTT:1 - chr2R 21470355 3' - gypsy7 5005 1 68.32 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCCAACCAGCTGGCAAATCGAAAACCGTAAGAACACCTTGCGTTCGACACGTGCACACGCTG:1 - chr3L 9908091 3' - BS 5043 1 63.37 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGTGTGTGAATCTGATAATAAAGGTGCTGGATTTTTCCTAGCATACTTTCTAGCGTGTCC:1 + chr2R 13280169 3' - jockey 23 1 64.36 GCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTGGTGGCCACGATCGGAGACTAGAAGCCACATCCTGCAGACCCATTTCCCTGAACCAATGCCTGG:1 + chr2R 4581428 3' - Chouto 429 1 55.45 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCG:1 - chr3L 11115123 3' - micropia 4987 2 53.47 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAGGTGAGAGAAAAG:1 + chrX 8299755 3' + roo 387 2 56.44 CCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCCTTTGTCTCTGTTCGCGGTGAGAATGATAAGATAATAAAATGCGACTCCGCAACGCGAGACATT:1 + chrX 11501522 3' + F-element 242 1 63.37 GCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCGAAGAGACCCGCCTGACTTTGAA:1 - chrX 9880002 3' - HMS-Beagle2 7154 2 77.23 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATT:1 - chr2R 545172 3' - flea 11 2 68.32 TAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATATCCCTTTAGCCCGCCCTTCAGACACCAAACCACCCGT:1 + chr3R 18860386 3' + R1A1-element 5294 1 66.34 CTTGGTTAGGACATCTGCTATCATGTTTTCTGTGGGACATAAAGTGAGTAAGCTGACGCTTTGACACAAATTGCCATTTAAAATAATTAGAAAAGTTGCAA:1 + chr3L 22226699 3' - Dm88 4210 1 68.32 AAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAACAAAGGTAAATATGATAAATCACCATTTCTC:1 - chr3R 10981185 3' - 1360 372 1 72.28 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTGGCCAGAAGTGTCTG:1 - chr2R 11129257 3' - hopper 16 1 63.37 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGTTTTGCTGCA:1 + chr2R 22774490 3' - BS 43 1 68.32 CAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAAAATTAAAGCTTTTTAAATTCGCGGCGAATTGGCAAGTGACACAGAAAGAGCGGAGAGCGAGGCAAAGGCA:1 + chr2R 8862531 3' - 1360 3101 1 66.34 ATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTAGATGGCCAAGCCGTATCTCTTGGCCATGGTTTAAAGCTGGCCCGA:1 - chr3R 10913118 3' - F-element 4574 1 54.46 TATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGCAGAGGGGGCCTGCGGATGGCTTTTTGGTTTTCAAATAGGACAGCAATTGTTAT:1 + chr2R 5939217 3' + R2-element 3434 1 58.42 AGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCG:1 - chr3R 10736041 3' + invader4 306 2 58.70 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTTAATTAGCCTACAATGCTAGAGGTCCACGTTACACTATTGGGGCAGTTACTTGTGACCAAAATGCTTT:1 + chr2R 8557924 3' + hobo 2937 1 75.53 ATTAANGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTACGATTTATGTGCTATGCAATGTCCGTCGTT:1 + chr2L 43459 3' - Doc 4573 1 68.32 TTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGGCAACAGCATCTGTATCAGCCGCCACTTTT:1 - chr3L 12986966 3' - I-element 4890 1 70.30 GTTGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGGATGGGCTATTCCTCCATTAAAACTAATGGGAAATTTGCTATAATTTGATTTCAGAGACCGAGAAGAAGA:1 + chrX 7484060 3' + GATE 8203 1 75.25 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTCTGTCCCTGTGGGGCTTCCCGGCAGTGCTGCTGATTTTATACATTCAAATTAGTTCGCTTTGCACGAG:1 - chr2L 17050122 3' + flea 5009 2 75.25 GATCCGTATTTGAACTAAGATCAACGTTGAAATAAATTTGCTATTTTTCCAAGAAATATGGTATCGTCCCATAATGTATTAGGGCCTAGCATGAAAACGTA:1 + chrX 17178158 3' - Tom1 356 1 68.32 TTCGTGTTTGGCCCACCGTTTCTGTATTTTCTAACACTTTTTCATCAATGTGCTCAAGAACTGCGACCAGAAGGGTCGTCGTGTGCTCATCGTGAACTGTG:1 - chr2L 7431387 3' - Tc1 1608 1 57.43 CGGCGTGTGAAAAAATAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTTAGTGCCCATCTCGGACTCGGATGCCAGCCGAGTACAGAGCCGTGGCCTGGGCCTCACC:1 - chr3R 27247100 3' + 1360 430 1 64.36 TGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAGTACATTTCGCATATTTCTAATTTTTCAGAACCATTC:1 + chrX 15384805 3' + 412 486 2 55.07 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGCAGGACTCCTGGCAACAGCA:1 - chr2R 3171117 3' + 1360 3332 1 73.27 TAAGATACCTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCAACGATCTCTTGGAGAGCAGACCAGTACCAGTTCCAAGGAAGTTGGCACACTTGG:1 + chrX 9993964 3' + Chouto 171 1 60.92 TACCGGGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCC:1 - chr3R 19535707 3' + hobo 2905 1 62.50 CACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAACCATATATTCTGCATATTTCACGCGTGTGTGCGTGAGCGCTGTAGGGTTAATAC:1 + chrX 19354376 3' - P-element 198 1 60.40 CCAGTTTAGATCGTCTTTTTAATTAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGCTTTTTCGTGTGTCACGCATTTCGAAGCTGCTGAAAGTTTGAT:1 + chr3L 399162 3' - TAHRE 359 1 52.48 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAATATGGCTGAACATCAAGTCGATGTGATGTTGTTTGTA:1 - chrX 18805769 3' + Burdock 233 2 63.37 GTGGGNATTTTAGTAGTGAGTGGTGAAATAAGAAATTAAATAAAAAGTTATTGAAACATAATGACGTGCAAGTGCAAACAGATGAGTCGAGGGACCTA:1 - chr3L 14169451 3' - accord2 7336 1 74.49 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGC:1 + chr3R 11833005 3' + roo 9022 2 74.26 CCAATATGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAGTATCATATCAGTAACATTTATATGCGTATGATATATTTTTTCAATATTGAAATAAGTGATTACC:1 - chr3R 19168388 3' - Doc3-element 4666 1 67.33 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGAGTAATGTCATTTTCTTGTTTACTTCGTTCTGTAATGGTCATGCGTCCCTGTCTAAG:1 + chr3R 908387 3' + copia 241 1 62.50 GTGTANTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCA:1 + chr2L 20840495 3' - Transpac 4953 2 57.43 TTAAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTTATTCCTGTCGAGCTGAGAACTATAGAGTGGAGAGCTGGGAAAGCTGGGAAAGCCGGGTGGAAAATGCTCGAG:1 - chr2R 17217864 3' + Chimpo 289 1 53.47 ATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTCAAAAAAAAAAATAAAAACAGAATTCAACAAATGGATTATATCATAGGATATGAGTATTATCACGTCTCA:1 - chr2L 7997884 3' - Tc1 1429 1 71.29 ATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGACAAACCAAAGTGCGAACCGAATGCTCGTATAGAATTCTCTCTGTAGGAACGAAACCAGTTTTGGCATGTGTA:1 + chrX 11886565 3' + Cr1a 448 1 79.21 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCATAACCCTCTCTCATCCCATGGTTTCGCATAAAGTTCCATATTCCTGACTGATTGAA:1 + chrX 2874882 3' + 1360 3368 1 62.38 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTACCCTGAAATGTAAATAGAGTACAAGCTGAATAAATAATCGAATTCCTTGTATTTTCACTATTCCTATA:1 - chr2L 20999298 3' - FB 8 1 68.32 CATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGTGCACGCATGTTTGCGTTGAGATCGTTTCGAATTGCAGGCCACTCGGTTGAAAGGGAGTTAGTAGCCCACAGCTGTTT:1 + chr3R 17909630 3' + 1731 487 1 67.33 AAGTTGTTTTTGGCTGCTCAGGTTTTGTAACCAGGCGCCAATTTTTTTGAAAGCAGGCAAAGTTGGCACAAGTCGGAAGTGGTAACATATATATGCGCAGT:1 + chr3R 10280286 3' - Cr1a 489 1 58.42 AGGATCAAAAGCCGAGTCGATCTAGGTATGTCCGTCTGTCCGATTGTCCGTATTCCGCAGAAATCGGCCCTGAATCCACCGGGCACATTGGCCTACATCAC:1 + chr3L 7046605 3' + INE-1 96 1 52.48 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAAT:1 - chr2R 8125092 3' - Doc 46 1 72.16 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGCACATTAAATTACAGTTTTCAGAGCCAAGAACAAACAATCGAAAGTGCAGACG:1 - chr3R 27619194 3' + hobo 2919 1 58.59 GACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAACAATTCGTCAACAGTTGACGCCATTCCCTAGTACATCGGCTTTTCCGGTTGGTTTG:1 - chr2R 5451163 3' + baggins 5413 1 60.40 CTAGAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCGTTACTGAGCTAGTGTGAAATGTTGCCTCGCCCACCCACCACCATTTCAAATTTTCCTGGCACTTTTCC:1 - chr2R 11058527 3' - INE-1 566 1 50.50 ATGATAAAACCAAACCTCTCACTAAACATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAG:1 - chr3R 13339059 3' - BS 5013 1 61.19 GAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTCGTGCAACTTCCTCTTGAAATCTGGATCACTCCGACGCTGTTTGTCGAAATATACGCAATAG:1 + chr3R 10735769 3' + invader4 250 2 68.32 GAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCGAAGATGCTCGGCTCGCACTTTTGCAGTACATTTGTTTGTCTTAAGCC:1 - chr3L 13744450 3' + F-element 194 1 54.46 CTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATTATGTGACAGGCGATTCAAAAGGAATTGAGCAGGGGAAAAATAGTGAAAGAGAAGCACTAG:1 - chr3L 13326221 3' + R1A1-element 4989 1 66.34 GGATTGGGTGCCTTCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATATCCATCTATGTATCTCAGCCTCGTTTTGCCTGTTTTGTGGCTT:1 + chrX 4478953 3' - Quasimodo 278 2 56.00 ATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGATGGTGGAAAGAGTCAACTCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGG:1 - chrX 21933826 3' + gypsy11 382 2 60.47 CGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATTTAAGTTTACTGATCAAATCAAAATCACTTTAAA:1 - chr3L 10464641 3' - invader3 5229 2 66.34 GTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGCATTTTGTTGATAGTTGGGATTATTTTGG:1 + chrX 9845391 3' + R1A1-element 5238 1 71.29 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGACCGTTCACCGTAATGGATGAAAGGGTTA:1 - chr3L 776068 3' - 1360 4 2 73.27 GATCGACTGAGCTATTGATCCTGATCAATGAAATACACGGTAACTTCTACCTGTTAAAAACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACCCTTAA:1 + chr2L 12157173 3' - INE-1 96 1 43.56 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCCGGGC:1 - chr2L 796754 3' - jockey 35 1 54.46 TTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGACTGTCTGTCCCGCTAATTACCACTTTGGGTGAATTGAATAAGGGTTTGGCCACTTTTCCGCATT:1 - chr2R 9348328 3' + diver2 4693 2 59.41 GATTCTCCTCCGTGAATGTAACCATAAAAGATTCAAGACCTTAATGACACATGGGAAAAAACTTGGGGGTGGTGGGAAAATCCAGCGGGTGAGGGAGGGG:1 + chr3R 19733463 3' + baggins 5055 1 62.00 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCGA:1 + chr3R 4215904 3' - 1360 66 1 73.27 TATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGTTTCAAATAGCTAGATAACTAGCTAAAAGTAAAAACACCTGTATGTAAT:1 - chr3L 3199211 3' + Ivk 4975 1 53.47 CTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGTGTGTGTGTGTGCCGAATGCTTTGTCCTGCAGGT:1 - chr3R 18862221 3' + R1A1-element 5206 1 69.00 ATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATTGGGGTGGTGGTGTCGAACGGATGGCAGAAAGTTGCAAAGTTGCCGAAGGCTGAAAAACGAAAGGCCATA:1 + chr3R 11495187 3' + baggins 5349 1 75.25 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACCCTCTATCT:1 - chr3L 13326679 3' - transib2 31 1 57.43 ACTTCCTCTGCCAGATCACAAGGCTGGCAGTTAAAATAGGAAAGTTCCTCTCAACATATATTCCACCGCAGCCGGAGCTCTATGATTCTGGTTCTGGTTTT:1 + chr2L 9508274 3' + Gypsy6A_LTR 244 1 57.43 GACGGNACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTGAGGATT:1 - chr2L 6656251 3' - P-element 9 2 68.32 AGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCA:2 - chr2R 4577098 3' + Chouto 467 1 75.25 AAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTAAAAACCTTATGTCTCTCTGTGAACATGATAACCAAATCGAGAAAACAAAGTAGAAACAACAACAAAGTAGT:1 - chrX 13860820 3' + Porto1 106 1 70.30 AATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGAGCGAGTTGACCAGAGATACCCGGGTGCAGTCATCTGAAATAGGTTTTTCATGTTAAAATGCCTCAATTTA:1 - chr3L 354463 3' + mariner2 734 1 71.29 CATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGAAAAATTGTAATTTTGTGGCCTAATGCTTGAGATAATTGAGCAATGCTTAATGTGCCTTAAGTTTTGATT:1 - chr2L 14289373 3' - transib2 2559 1 74.26 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATACGGGGGTAGAACGTGTCTAAAAGCCT:1 - chr3R 5946115 3' + HMS-Beagle 6994 2 74.26 CTTTTTACCTTATTTACTAACGACCTCCCCTTAGTAATAAAACATTCGCATGTACTGACGCACATGTGTGTGGTGGCCTCCCTGGAAGCTGTCCGTGATCG:1 - chr3L 22385141 3' + Q-element 517 2 55.45 TTTTCTTTGAGGTATAACTTGATTCGACTTTTTAGGTCCTTGGAGTTAAACGGAGATGAAGGAAGGATGGGAAAAAGTCGCTTTTGAATATTTAATATTTA:1 + chrX 16579722 3' - Ivk 4911 1 57.43 AGTGCAGAGCTTTGCCGGCTATGCTCGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTCAAGACAAATCCCATAAGCAAATTCGGTTC:1 + chrX 8724927 3' - gypsy3 61 2 72.28 TAAGCACATTTCGTGTTTGTTCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTAAGTGTGTTCCATAACCCACCTTCATATTCGTTTCTAATTACTAATAATT:1 - chr2L 19551009 3' - Tc1 1617 1 58.42 AGCAATATGATAAAATAAAAGAATATTTTTCCAAAATGATTTCTTTATTTTATCATTAAGGCTTACAGGCACTCTTCCATTTTCTTTAGTGCATCTCAAAG:1 + chr3L 5014883 3' - 1360 3103 1 80.20 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCATTGTAGCCACAATTGACTGATTATCATTTTTGT:2 - chr2R 8125057 3' - Doc 15 1 59.41 AAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGAATT:1 + chr3L 10464684 3' + invader3 230 2 76.24 CGTGTGCCAAAAAATCGCATAGCGTTACGCAATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACCATCTCGTCCCCGTACATCTCCACTTTTTCGCTGAGCTTC:1 + chr3R 2831919 3' - 1360 32 1 78.00 AAATGTCTATGTCGTGAAGCTCAATAAGAGCAAGGAACTCATTGGTCTTCAAGGACATAGGAGCAGGCAGTGACTGCAAAGGAATCGGACATTGTGGCAGC:1 - chr3R 8479844 3' - G5A 91 1 54.46 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTT:1 - chr2R 14121068 3' - I-element 33 1 64.36 TTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACGAGGTCCATCAAACGGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAAACACCTTTTGTAGATGAGCAGCAAAT:1 - chr2R 3073428 3' - Tc3 238 1 57.43 TGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTGCGGCACTACTACATGCA:1 + chr2L 7654067 3' - jockey 6 1 79.21 TTCGGNTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCTCCCTCTCTTCTGAGT:1 - chr2L 222079 3' - P-element 19 1 60.40 CCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCAACTGACTGACTTTGGGTTCTTGTTCTCACTGCGTTTCGCATTTTATAAGCTGCACATTTC:1 - chr3R 9118366 3' + Doc3-element 362 1 65.35 CTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCAAATAACAACCTCACCGAACCCGTTCAAATGTCAAGAACACAATTTTGATTGATTTTTCCAC:1 + chr2L 9366192 3' + Doc 293 1 67.33 CTTAAGAATCCAATAGCAATGCTCCAACAATAGCCAGTATTTTACTTTTTTATGATAGCCTTGGACCGGACCAGGCGTACGCGATTCGATTCGATTTATGG:1 - chrX 22901301 3' + 17.6 7181 2 75.25 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTGCTTAAAAATGCTTACTTTATTTAGAAAGCACCCTCCGTTTTACAGCTAAAAA:2 - chr3L 18076251 3' + roo 9049 2 55.45 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTA:1 - chrX 19561823 3' - 412 7093 2 62.38 TGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAACTCGAAATTTCATAATTTTTTTTTTCTGCCATTCGCAGTTGC:1 + chr3L 15398022 3' - INE-1 568 1 78.22 AAAGAAAATAAAATAAAATAAAACAAAATACACTTTCACGAATCCTTTAATTATTGCGTTATAACACCGTTATAGTTATAAGGAGGATCACCTACTTGGCG:1 - chr2R 5064508 3' - transib1 1902 1 81.19 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCAGTTATGTCTCTCATTTGGGGTGGGCTCG:1 + chr3R 15343905 3' - roo 8712 2 74.26 ATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTGTCGTCGTCACACTGGCTGATACCGATAGCAAACGCTTGGCTGGGGG:1 + chr2R 22461007 3' + McClintock 465 2 74.32 TTAAAACTGAATACAAAAGAATATGCAAAGTGTGGATCTACCCTGGCCTCCAGCGGAGTTGCCAAACAGCTGGCCACACCAGCACCCAAACGCAGCAAAGC:1 - chrX 12586705 3' - gtwin 236 2 59.41 CCGTGTTGACACGGTAATATGATTGTTCTAAATCGCTGTTAGTGACATTATTTATTTTTATGCGAGATAATGCGCCAGCTACGACATTAGTTGTCCCGGGT:1 + chr3L 23512567 3' - Q-element 194 2 75.25 AGGTTGAGATTCAACATACAGATTCTAGAGACAAATACGCAAACTCCCGCACAAAACTGCCACGTTAAAGCCGAGATGAAGCCACCCGGCATGGAGTACCA:1 + chr3L 1476845 3' + INE-1 175 1 42.57 AGTGCCGAGCATGCACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCACGTCATGTGCAGGCGCCAGATGGTGCACTT:1 + chrX 14832769 3' + Stalker3T 169 1 79.21 GACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCCGAATCAGAGCTACAGGAACCGCGATCGCCGA:1 - chr2R 8057130 3' + invader4 2735 1 38.61 CTGCCTCTGACCGATCGGTAAACACACCTTCCACGACGCCACACATGAGACTCCCATACAACCATCTCACTCTGCCGACATGTGGGTGGTGCTGGTTTCCT:1 - chrX 2969274 3' - Osvaldo 465 1 47.52 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGTTGCGTTTGCCGTTTGGCTGCTGCACAAATTTTG:1 + chr3L 11696468 3' - blood 7025 2 64.65 GACCCATTTTAAGCAGCGGCGTCACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGCCGAGCACACAGGAATGGAGACGGA:1 + chr3L 12062749 3' + gypsy4 6405 1 78.22 ACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCCGTTAAATGTTTAATTGTATATTATATG:1 - chr3L 7882196 3' + Ivk 31 1 72.28 TTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTGGCGTATATTGCATTTTTGCGCCGTTC:1 + chrX 5726814 3' + roo 410 1 80.20 TAAAAAATAAAAAAAAAAACAAGCCAAGCCAGAAATCTTTTTTATGAAAAGGTTTCAAACTAGAATTCCGGCAAAAAGTGCCAA:1 + chr2L 17894431 3' + BS 5104 14 52.38 CTCGANATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTGCGTTTGCATTTGCCACGCGGAATATTTCGGCACATCGAAAGCCA:1 - chr2R 21807359 3' + BS 4973 1 54.46 GAGCCTCTGGAGACATTGCAGGTAAGTAGTTGTTTTAATTAGGCTGGGTCAGCCACCCCGGGCGTATACTTTATTTATGTATTTGCCGACTACAATCAACT:1 - chr2L 8497614 3' - HeT-A 5700 1 54.46 GTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAATACACAAAGGCAGGAGTTGAACTGATTTACTGATTGATATTTGAGTATGAGATTTATGATATGTAA:1 - chrX 22838819 3' - invader2 5102 2 60.40 GACAGTTCTAGAACAGGAGGAAAAGCTTGAGTATTTTGTCGCCTGCGAAACACAGGTGGAATCGATATCGCGTATACGCTATTCGGCGCAGGCGCCATCTC:1 + chr3R 4281283 3' - Gypsy12A_LTR 2026 1 63.37 ATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGTCATCGGGGCGGTGAGGGTCACCCAAGACTTGGGCACGCCGGCGTCATCGCGAGCTGATTGCA:1 + chr3R 15532426 3' - accord 6996 2 70.41 CTTTCGCTCTCACTTTCTCGCTCTTTCACTCTACCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCCGACTGCTCTTTGCCGTTCCGCTGCCATTTTTGCGCACT:1 - chr3L 14863011 3' + Cr1a 286 1 71.29 CGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGGTCCGGAATGCGATCAGAAGTCGGGGAAATAGATG:1 - chrX 1836526 3' + R2-element 3473 1 61.11 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAAAAATTTGCTGAGAGAGCGTAAGAATGGCAAGTAGGGAGGA:1 - chrX 18366045 3' + jockey 4981 1 52.56 GGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGCTCGCTTTTGTTCTTTGGTGTATTGAGTCCATAAAAATTAATTTAATTATCTTCGAGCACCCA:1 + chr3R 31040952 3' - Porto1 344 1 60.40 TGAGTAACGGGTATCCAATAGTCGGGGAAGTCGAATATTGTATTCTCTATTATTTCGCTGTCTTTTCCATATGTCATTATAATTATATTTATGAGTAATGT:1 - chrY 1739937 3' + INE-1 548 1 52.48 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGAATTTATGCCAGAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTG:1 - chr3R 10490351 3' + transib2 2787 1 64.89 TCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCA:1 + chr3L 23678130 3' - Osvaldo 22 1 72.28 CTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACGCACATACACTGGAACTCGCGACACAAACACACATGAACGGATTGAGAACT:1 + chr3L 11119690 3' + accord 7060 2 57.43 TTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAACTCTACCACCATCTGCACCACCTGTCTCGCGCATTGCGAAAATTTGCATCGAGTCACGAAAAATAAATGTAAA:1 - chrX 18562388 3' + R1A1-element 274 1 68.69 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCG:1 - chr2L 6656283 3' - P-element 41 1 36.63 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGTGGCTGACGTGTCTGTAGATTTAAAGTAAGTTAGGTGTCATGAGTTTTGAATGAATAT:1 + chr3R 12353969 3' - 1360 17 1 68.32 ACTTTGTGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTATTGTTGGTTTATTTTTCCC:1 + chr3R 8480494 3' - transib2 16 1 63.37 ACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCAACAAACACACTGCAAAACAAAAAACAAAATGCCAAAACCAAAAAT:1 - chr3L 17940240 3' + F-element 484 1 70.30 CACACTTTTATAAAATGTGTTGATATTTTTTCACACTTTCGCTTCGTCTTTGTTTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTCTAGTTTC:1 + chr2R 1751261 3' + INE-1 259 1 66.34 CATGGAACTCCAGACGGCACGAGGGGACGACTAAGCGCTCTGCTGAGTCCGATGCCTCCAACCGAAGACGCAGCGGAGGCGTTCGATAAAATACCCACATT:1 - chr2R 10691272 3' + gypsy10 185 2 69.31 CCTCTNCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 21 1 70.30 ACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTGTTTTGTGTAAGCATTCTTCATTTTATTTCCGATGATTTTTCTCTG:1 - chrX 17338636 3' + I-element 4962 1 55.45 ATTATNCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCCAATATGGACTTTAGCATATTGCAAGACAAATGGGAACTTGGCTTACGGGCCGG:1 - chr2L 14350923 3' - Idefix 7264 2 60.00 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGTACATATATGCATATGTATGATGCTCCTTTCCAATATTGACAAGATGATCT:1 - chrX 19885164 3' + HMS-Beagle 223 2 56.44 TGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTTTTTCTTCTGTTGATTTGTTGCCATTGCTTTGGCCAAATGATTTTGTTTGATTTTCCATTTA:1 - chr3R 26442890 3' - I-element 162 1 66.34 GACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCCCTCATTACCCGCTTCCACGCTCACCGCCCGAATTCTTTAGAGGCGTAATATCGATTACT:1 - chr2R 4430581 3' + GATE 8265 2 60.40 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCCCAACTATGCACTCACTGTTGTCAAACGCTCAAGAGCACTGAAGCGCTCCTCTTGGGCGGCGGCAGAC:1 - chrX 17667446 3' + roo 9015 2 80.20 GCTTTTGTGATTTTTCTGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTAGGATTTACTGGCGGTGTTGCCCTCGTTATGTCATAATCGCATTTT:1 + chr2R 18213625 3' - Porto1 4345 1 65.35 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGTGCATTGTAATTCATTTCGAATTTATAGCCACCCGCGATCCG:1 - chrX 8714577 3' - P-element 33 1 46.53 GAAAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGCAATGAATTTAGAGAAGCCAGGTGCTGGAGCCGACCGACTTGCTCTATGCTGTT:1 + chr3L 1337799 3' - Cr1a 291 1 50.65 GATCTNAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACACGAACATACTGCACTGGCTTGACCATCAATGAAG:1 - chr3L 20902176 3' + invader2 4833 1 59.30 TCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCGTGGGCTTGGGCTGCTTCTACAGTGGCAATCCCATCCAGGTCTTTCAAACTG:1 - chr3L 1935245 3' - Quasimodo 7012 2 59.41 TTGTATTCTATAATTTAAATCATCTTTTATCATCCTTTTCTAAGATGGGCCGCTCTCCAAAGTGCATACATATATACGCTATAGAAGTGGATATAGAAGTT:1 - chr3R 28325970 3' + Tc3 394 1 52.48 TACCAGATACCCGTTACCCAGCTAGTGGGACGGTGATCGAGAAAGTGGCAAAATGGCTGCGGGACAGGAGCAATCAGGCGGTGAACCCGGCTAGTTAGGGT:1 + chr3R 28182100 3' - INE-1 546 1 59.41 CTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGCAGAAACACTCCAACTCCAACTCCAACATTGAATTATGAAATGTGAAAACTGTGTTA:1 - chr2L 10020026 3' + jockey 440 1 59.41 CAAAACTTTTCCGATGGGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTGAAACTACAAGCACAAATAAGCTCGACAATAAGTTTACTCAGCGCTACATCA:1 - chr4 163595 3' + R2-element 190 1 68.00 AGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCACTCCATAAAATGATATGTTATGTTTTTGTTACTCGATACAGTTCACCCAGACATCGTGCAG:1 - chr2R 5108504 3' + Doc3-element 4596 1 55.45 AAATCGTTTTATGAGCTTTTAAATTTGAAGTTTTAAACAGCATTTCCCCCAAACCTACTCCCCTTTAAGTCCTGATTAATGGCCGCCAAATGCA:1 + chr3R 16752773 3' + transib2 140 1 69.15 GGTTCCTCCAGGAGTATAAATGACTGCATCAGCAGGAGAGCAGCCCATAGGATGTCGGGCTTCGTGACCTGCTGCAATTCGTCTCCGCTTGACGCGTCCCT:1 + chr2R 4932818 3' - G7 103 1 61.39 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAGAAATATTGAGAAATATGAAACAAAACATGTAACGGAAATGAGAAATGCATACCACAGTCACTATCAA:1 + chr3L 14005657 3' - F-element 16 1 62.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTG:2 + chrX 2090276 3' + roo 9020 2 73.27 GTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAACCATATTGAAATTCCAATGATTTTCGCA:1 - chr3L 12526387 3' + opus 224 2 72.28 AAAAANTGGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTT:1 + chr3L 21840329 3' + 1360 3343 1 71.29 CTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGGAATGTTTCGGCCATAAAGGGCCTAGCTGCGCCGATTTAGCCAACTGTAG:1 - 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opus 488 2 57.43 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGAGTGTGCTGCTTAAGAAGTGTCAAAAAACTAAAGGCGTC:1 + chr3R 22667186 3' - 412 38 2 71.29 TGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCACCCAACTTGAAGCTCTCGTGACGACATTGATGCGGCAGTCGAGGAACTCACT:1 - chr2R 4954579 3' + G2 2736 1 54.46 ATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTCAATATCCAATAAATAATGCTCAAGAATACATTCGT:1 + chr3R 5863562 3' + Ivk 103 1 77.23 ATATGAACAATGTAAATTCGTTTCATCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATGCAGAGCCCAATGTCGCTTTG:1 - chrX 1525387 3' + 1360 3151 1 75.25 AAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGATTGCTTTCGGAAGTTGTCACAATACTTGTTGCACGTAATTTCACAATCTGGCGATTTGTGC:1 + chr3L 12412755 3' - 1360 246 1 67.71 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGTGGCTTCTTTTCGGTGCCAGCTGTCTGTAATTATGTGCG:1 - chr3R 22831019 3' + mdg1 7421 2 61.39 GCAACNGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGGACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACCATATGATAGCTGTAAGAGATTTGATTTGTGCTAATATAACT:1 - chrX 20385028 3' - Bari1 41 1 57.43 GAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCTCCGCGGGTCACGCAACACAAAATGTATCTCGAGCCTCG:1 - 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chr3L 5519970 3' + INE-1 560 1 55.45 ACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACAGGGACAATAACTAGCCTCCGATGAAGACACAAAG:1 - chr2L 11843800 3' + 412 164 2 66.34 TTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGTTTTTCTTTCCCCTTTCCTTTTTCTCTTTCTTTTTCAATTCCTCTT:1 + chr2L 19260427 3' - Doc 4517 1 58.42 ATGAGTTCCGGATTTATCTTTTACACCTAATATGAGAATCTTTTATGTTTATACAAATTAGTTTTTTTTAACTATTCAATAACTTTTTACCAATTAGACAT:1 + chr3R 23445753 3' - NOF 325 1 72.28 AATCGNATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATGCCAAATTATCTGACAAATGTTTGCGAAGGAAATGAAGAAAATCCCAAACGGCAA:1 - chrX 2874792 3' - 1360 20 1 58.42 TAAGCNATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAA:1 - chr3R 9996413 3' - blood 49 2 74.73 GCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATTTGATAAAAATATGGATAAATCTAAAGCTGCA:1 + chr3R 7177717 3' + G3 4422 1 79.00 CGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAATAAATCACAGTCTAAATACCCAAAGCTGAAGTTTAGGCCCCTTTCCGCTCG:1 + chr3L 15255865 3' + F-element 4523 1 53.47 TTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCACTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGTTTGTGCAGCCTGCATGACGG:1 + chr3R 28075066 3' + R1A1-element 4935 1 77.23 TGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAACATATTCAGTTGCTGGGCCGTAAAGATTTCTAATTCGGTGGCCTT:1 - chr2L 14926685 3' + hobo 436 1 65.75 TTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTAGAGACAGGCAAATTTTTGTCCTCTAACATCTTACTTAGAAAGTAAGATGTCCTGATAGCAAAGGGGAA:1 - chr2R 7936737 3' + invader2 4632 1 80.20 TGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGAGCT:2 + chr2L 3245014 3' - rover 6972 2 59.41 TAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCATGGGTCGTCCAAATGGGTTGACAGAGCACAGG:1 - chr2R 8019484 3' - 297 267 2 67.33 AAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGACACCACCACCAGGGCTGCCCCCACCGAAACAGTCCCGCCCACCCTGTCATGGGGGACA:1 + chr2R 12491003 3' - R1A1-element 5022 1 56.44 ATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCCTAAAAACGGATTAACACTATATTTTATTTGTA:1 + chr4 815592 3' - HMS-Beagle2 7134 2 67.33 AGTATAAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATGCCTCTTCCATAAAACGTCAAAA:1 - chr3L 15102350 3' - Tirant 258 2 70.30 CAATTTAAATAATTAATATTATGCTGCAGCCGCAGTGGGCGGAGCGGGGTGGCAATGAAAGAAATGGAAGCGTAAGGAAAATAAATTTTAAATTGATAAGT:1 - chr2L 13601528 3' + TLD2_LTR 100 1 52.48 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGCGCTGGCATAGTTGCTATCAAATTTCATGATCACTGCCAATCATT:1 - chrX 2090208 3' - roo 8677 2 62.38 TTTCTAAGAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTAAACTATCTAATGTTTATTAAAAGGTTGTTTCCTCTACTTTAATATGCAATTCAAC:1 - chr3L 15274534 3' - hopper 1077 1 56.44 TTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGCACAGTAAGATACCAAAAATTAGTTTAAAAATTTTTTACTAAACTTTAGGATAACACGCATTTCAGC:1 + chr3L 21342604 3' - HeT-A 5998 1 67.33 CATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGAATGGAAATGTGAGATGCAGCCGGATCTGATCCCCTTTAAACAGGG:1 + chr2L 640399 3' - Ivk 5091 1 57.45 TAGTACGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACGCGGAGGTTTTTGTTTTGCAGTTAGGCTGCTCGCATAGAGTTCAAGGTCCGAATGAGCTA:1 - chr2L 19847646 3' + Rt1b 4947 1 56.44 ATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCATGTTTATAATTAGTAGTAAAAACAATCTAGAGGAAAGCAACTTCAGAGTT:1 - chr2R 6107899 3' + flea 4736 1 54.46 GACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAAAAACGGAGTGAAGTGGAGAAAACTCTACTCAAACTCGACTCGATTGCATGTAATGGCACTTAAGCT:1 + chr2L 14830286 3' - Rt1b 4980 1 72.73 ACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATATGATATGCCGCCCAATGTGAAACTTCTGTGTCATC:1 - chrX 5151916 3' + Quasimodo 43 2 65.35 GTCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCGGCGTCACTCATAATGTTGTACGAGGTGTCCTATGCGGATAATGAAGGACTGGAGGAGGACCACGACCTGTACAAG:1 - chr3R 17804718 3' - micropia 429 2 60.00 CTAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCGACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCCCAACTGAAACAACCGTATCCTTTCGAAT:1 + chr2L 16968558 3' + Ivk 5113 1 69.31 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCC:1 + chr2L 20840494 3' - Transpac 4954 2 59.41 AAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTTACTATATACATATATAATATTTCAAGCTTACTTACCGAGC:1 + chr3R 19800381 3' - G2 153 1 59.41 ATAACAAAAAAAAACAAAAAACGGAAAAAAAGAACAATTTGTGGATGGCGCGCGCAGAAATGTTCAAACTATGTATTTTCTTTGAGTTATTACCTGGAAGC:1 + chr2R 14293086 3' + gypsy7 5002 1 60.40 CCATCCTCATAGCCATTTAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGCGTTTGCTTTCGGGGCGGCAGCCTTTCCTG:1 - chr2L 18746462 3' - R2-element 3437 1 52.63 CTTCTTCATATTCACCGTACATAGGATCTCATTTATGTTTAATTTAAGTTCTGATTGCTGATTTTCGTATGGATGGAATGCGCATTTTCCGCCCTGCCAAT:1 - chr3R 17382888 3' - Quasimodo 470 2 65.35 TAATAATAATTATTAATATTTTGTAGCTGTGTGGTGAACTATAGTAAGTGCCTGCCTCCTCCCATGATGAAGTTAAAATTAAAACCTGGTCCAAAACCAGA:1 - chrX 7683197 3' - BS 314 1 72.28 CTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAATCGGCTCCCTCGAGAGAGAACCCTGTAGACGGGTTTTG:1 + chrX 13245812 3' + G2 54 1 62.38 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGATGTGGAAATGGAAATGGGGTCTAGGGCACACACAGACGGAGGCCGATAAGTGAATATGCTACAA:1 - chr3R 18766911 3' - copia 4894 2 67.33 TGCGAAGCTACTAATGGTTTCTGCCTTGGCTGGGGTTAACAAAAGAGTTTTCTCATCCGCTTGCCTTCGATCGTCAAAAACTGTATCGAGACTGCTATTAA:1 - chr2R 8362513 3' + hopper 396 1 54.46 CGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACACCTCCCAAACTGACCAAACACCCCCAGAATCAGCATTGAATAACCATTCACGCCCGAAAAAA:1 + chr3L 15458208 3' - rover 166 2 68.32 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCTGCAGGTCAACGCTGCG:1 - chr3L 15099876 3' + Tirant 8469 2 64.36 ATTTGCGAACCCCATTACTATGATGCCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAATCATTGGTGGCCCATGGGGGGGTGGCCAACTGATAAATAGCAGCAGGTAG:1 - chr3L 22002626 3' + diver 6080 2 69.31 TTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTCTTCACCA:1 - chr2R 4673562 3' + Quasimodo 7353 2 64.36 CGATGCCTCCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTCAAAGTGGGCCAGAGTGGCTC:1 + chrX 17223975 3' - ZAM 52 2 56.60 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCAAAACTTTGTCGATCCGTTCTTGGGAAACTGTCA:1 - chr2R 10697012 3' - 297 6586 2 62.38 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAGATCGAAAGTCACCCCCAGATAAATGTTATATTGAGAAAATAA:1 - chr3L 14324873 3' + 1360 3356 1 63.37 CTTTGGTTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCGTGGGGTGAGTTTGTGGCTTGGGCCAATATTTTCTTTAC:1 + chr3L 17723020 3' - HeT-A 5993 1 81.00 TCATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATATGCTTACACATATTTTTATATATATTAGCACTTTGCGAATTTGATTAACCCATTTTATGTTTCTAAAATGCCAA:1 - chr3R 11455575 3' - rover 7049 2 74.26 GAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGTCCCAGTCCACAGTTATTGAGGTCGCAATGCCCCAAAGTAGAAATAGAATATCGGTTATAA:1 + chr3L 10630430 3' + opus 310 2 67.01 GCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCTAGCAATAAACGGGTGGCACCGGCAGATGGTCGTTGGCTTTGACCATTGACAATTACGGGAAAAACTCTTGACCT:1 + chr2R 20118201 3' + F-element 480 1 69.39 GACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACCAACATCAACGCCACACACACACGCATTCAACACCACAGAGACCAACAACCACTATCCCACAC:1 - chrX 2495215 3' + accord 226 2 73.27 TAACGGGTATCTTATAGCCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTCCATATTATTTACAAGCCCAGTTGCTTATTCAGTAGATTTTATT:1 - chr3R 12909937 3' + INE-1 552 1 67.33 TCGATNACGGACTTAACTCGCGCACACCCGGATGCATGCCTGCACATGTAGATTTTGACTGGGTGTTTGTAAGTACCCGCTTCAAGAAAATGCCTAGATGC:1 + chrX 6235172 3' + Tirant 402 1 61.39 TAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGACACACTCTCGGCCTTGTTCATGGACCTCGTCACTTGCATTCGCCTTTTTGCGTATTCAAGTGCCTGTGCGG:1 - chr3R 25814675 3' - 412 4 2 75.25 GCCTTTTTGGGGTTTGGTTTGGCGATGACGTCAACAATCTTGCTGGGGGTGTTATTGCAGAATACAATCAAGTTATTCGCATCATCGATGTTTATCTCTCG:1 + chr3L 4513846 3' - BS3 234 1 52.48 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCAATATTGGTTTGA:1 - chr3R 4806580 3' + P-element 2834 1 26.73 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGT:1 - chr3R 9193575 3' + roo 9051 2 60.40 TTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTTCGCTGAATTACATGGATTCTACAAGCGCAG:1 - chr2R 21559332 3' - Porto1 4407 1 66.34 TTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCGTGCCGCGCCCAGTCCGAAAACTATTTGAATGCGAAATCCGTTTGTGATGCGAATAATTC:1 + chr2R 21874743 3' + 17.6 410 2 65.35 AATGCGGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACGAACCTGGCGACGTCAATTAGCAAATCGAGAGTTAACTGTTAACTCTCGATTTGCTAA:1 - chr2R 14456181 3' + jockey 4718 1 53.47 TAGGTCTGTATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTGGAGTTTTATTAACTTAATGTCTGCTT:1 - chrX 10696173 3' - flea 4695 1 71.29 AAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTGATGCAATATCTAAATTAGCTACATCACAACCACTGCGCTGATAAGAGAAAAA:1 - chrX 13395218 3' + I-element 119 1 61.39 CCCGACTTGGTTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTTCAAGTAGATTTACTAAAAACTATATACCCCTTATCTCATGCAATACCCTGTTATCTCCATTATCTGC:1 + chr2R 9951289 3' + Cr1a 4079 1 69.31 GTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTCCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTTAACTAACAGCACTCAATATAACTGCGATAATAT:1 - chr4 96364 3' + Chouto 72 1 73.27 AAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGAGAATGAATGAAAATCACGAGCCAAGATGCGCTGCCAAATGG:1 + chr3R 28392316 3' + invader2 4985 2 58.42 AGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCTGGGTTGCATCTTTCGATGTTGTTTTGCAGTGTGGTAGCCCCACATAT:1 - chr3R 3843069 3' + Max-element 271 2 51.49 CATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCAGTGACCACCACGAACCGGGCAGCCAAAG:1 + chr3R 5544934 3' + Ivk 4990 1 72.00 ACATCTATACCTGTTACATTTTAAAACTATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGATTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGCCGGTTTGGCCCTATTCGAAAA:1 - chr3L 2748241 3' + Stalker4 396 1 76.24 TTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAAAATAAAATATAAATATAAGCTTACTAAGCGTAATTTTTCTGTTCAAAAGTGTCGTAGG:1 + chr3R 31988243 3' - micropia 5045 1 59.41 CTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTTCACACCGCACCGCTGCCCCTCGCATGTTCGGCTTCCAATTCTTTAT:2 - chr3L 12674538 3' + R2-element 3516 1 53.47 TTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGCGCGCCTGTATCTGTGTATCTATGAGAGAAGTGACCTGCCTGGCA:1 + chr3L 14758122 3' - 1360 3253 1 55.00 CAGCCNATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGTGTAGCATATCGTCCTGCAGTGTAAAGGAAATTTCACGAT:1 - chr3L 8343212 3' - F-element 453 1 59.41 CATCTACAATGATTTAAGATTAGGGATTACAGAAGTTTAGCCGAACAATTAAACGTTTTTTTTGAACCGATGCGGACACACATTTACGGAAGGTAAGCTTT:1 + chr2L 85164 3' - Cr1a 4143 1 70.30 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTATTTAAGTATTTTGTTAGATTTTAGATCACTTTACATACCAAACATTTAGATTA:1 - chr2L 3759792 3' - flea 14 2 66.00 AAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTTGTTGATGAAACTTATAAAACACCGAGAGAACATGTCTAAGTGGGACCATCAAGACGTAGTTGTGAAGAATTG:1 - chr3R 4299859 3' - Doc3-element 4530 1 75.25 AAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGGCATTATATAAGCATACTGGGGAAGGGAACCGAAGCCATCGGTGTGCTGCAGCT:1 + chr2L 3463567 3' + R2-element 477 1 57.43 TCCAAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGGGGGATCTGAGCACCGCAGAGTCCCACTGATGGCATTCGCATGGGGCGCATTGTGAAGTGCAAAAAAGGCGTA:1 - chrX 14683092 3' - G6 296 1 70.30 CTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAAGCTATCTGAAAACCAATTTTCGTTGCTAAATTGATGTTTATAGCTATGT:1 - chr3R 27504610 3' + R1A1-element 5262 1 57.00 CAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCTGACAACCGAAGCAACATTTTACGCTAAACACGAACACACAGCGAATCCACCCAGATCTATAAA:1 + chr2L 5985849 3' + F-element 222 1 67.33 ACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAACCAATTAGGCTGTCAGTTGATAGGCCTACAAAGTATGTTGTTCATATGTATATGGCCAACAAA:1 + chr3R 14019416 3' - Cr1a 4030 1 71.29 TTCAAATTCGCAAGCTAACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATCGCCTGCGCCTCGTCCTGACAGGATATGAGTATTTAAATTTATCG:1 - chr3L 5057808 3' + hopper 270 1 66.34 TCATGAACACACACACACACACACACACAGACAGGCGGGGGTAAA:1 - chrX 6147634 3' + accord 7025 2 66.67 ATTAGGGTAGGCTGGATTTGTAATTGGCAATTGTTGTGGGCTGCTGCGTGCTCGTAGATGTTGTCGTCGATGCGGCAGTTGTGTTGCTGTCT:1 - chr3L 1822567 3' - Quasimodo 156 2 81.52 TCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCTACACAATTTGTTAAACTGTTAAACCACAA:1 - chr2L 15966877 3' + Doc 4501 1 70.30 TAAACCATGATCAGGGGATCAGCTAGTCAGGATGGCCGAGTCGTGGCTCTGAATACAAGTGAGTACTCAGGGGCATGGCTCAAGCGGCATGTTTTTGTTGC:1 + chr2L 1258141 3' + invader3 5146 1 64.36 ATATGTGTGTGTGTGTTTGTACTTTTTGGCACGTGACAATAAATTGTTGTTTGTTGTCTCCCACCCTGATTAAAGTTTATTTTAATTTGTTGCTGTTGTTC:1 + chr3R 26779687 3' - accord 183 2 73.27 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAAATGATTCTTTTTGAGATCCATGCCGCTAAGGCAGTTGAGAGTAATAACGATTTG:1 - chr3L 19051826 3' - roo 8681 2 60.40 AAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCTGCCTTTGCACTTTGGTGCATCCTTGTCTGGCGTTTGAACTTTTTGTGCTGTGCTGTTTGGCGTGCAATCTT:1 - 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chr3R 12177994 3' - Doc4-element 225 1 62.38 TCTTAGTGGGTAGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTATTAAGCTAAGAAGAATACAATCAGTTACAACACCAATGCCCTGAAGAGCG:1 + chr2R 7723171 3' + HB 346 1 65.35 CAGTCTATGATGCTTAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATCCACGTTTAGTCCCTTCTGATCCCTCAGGGTTAGGTGACCAT:1 + chr3L 27365671 3' + G3 4262 1 62.38 TATTTTTATAATGAAGGTACATGTCTAAAGTTTCCTTTATTTTAATTTAGCTGCTCCAACTAATGGATTCGGGCTTACGTAACTCCAACACTTTGGCCGTA:1 + chr2R 12220219 3' - mariner2 818 1 68.32 AAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAATCAAGTTGAAGTTGAAGGGTAAGTGGGCTCCCTCTGTGC:1 - chr2R 8472944 3' + I-element 141 1 61.39 ATTTAGGATGATTACGTTGGGAAGATGATCTGACTATTTGCGTAAAGCACCTGCTGATGCTCCGCCAAGAAGCCATCAGTTAGTGAGCAGGCTCCAAGCCG:1 - chr2R 18811432 3' - gypsy3 6838 2 78.22 TAGAGCCACGCCAAAAAAATCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTAGAAGCGTGTTAGCTATTGTGTCCAATAATACGGACGGTTTCATAGGG:2 - chr3R 22733032 3' - 1360 52 1 92.08 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGCATAGGTAAAT:1 - 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chr2R 18257581 3' + F-element 337 1 61.39 GATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTCATCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAGCGAATTCGGCAAAAGTTGCTGGACATCGAC:1 - chrX 21031734 3' - Quasimodo 256 2 77.23 CAAAGCAGCGAGCAGAGACGCTAATGTAGCCGCCGACAACGTGCCCAGCACCACCGCACCCATGCGCAGATAGAAGCTGCCGTAGTGTGCATCCCGCCGTC:1 + chrX 5655287 3' + G-element 465 1 66.34 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACTGACACACAGATATCCTTGCAGCTGGTGAC:2 + chr3R 24545621 3' + roo 9027 1 70.30 TTGCGGGTTAGCTGAGCCCAACATCAGCACACATTGACCATTCAAATAAAGAACAGCAATGCAAACTGACGTCAATGGGTGCAAATCCCTTGGATTTGGAT:1 + chr2R 7250730 3' + Stalker 7148 4 63.37 ACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGACATTAAACTGCATGACCTGAGTT:1 + chr3L 2410116 3' + R2-element 441 1 77.23 TTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACTGCAATTGTTTACTTCATTGATTT:1 + chr3L 9344004 3' - 412 125 2 76.24 ACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGTTCATCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGAAGAGCCGCGAACTAGAGCAACTGAAGGCGGCCAAGATC:1 + chr3L 16347131 3' - Rt1b 4929 1 74.26 CAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCCATTTCAGAATCGGAACAAGACAAGACGGAAACCAGTTAAACATTCCCTTACACTAGCAACTTAAATG:1 - chr2R 18976762 3' + Bica 4512 1 65.35 ACAATNGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTACTTCCCATGCCGAAGAAATGGCAAGATTTTTAATTCGCGATTGGCTGC:1 - chr3R 10136738 3' + flea 4604 1 55.45 TTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACACACTCGAGCAAAATTAACCAAAAACGTCTGACTAAACGCAAATTCT:1 - chr2R 15522696 3' + 412 79 2 64.36 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTCCGTAGCACACTTTTCCGACGCCC:1 + chr3R 19535764 3' - hobo 26 1 53.47 TGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATCAAACAAATAGAAAATATAGTTATAAGTTTTGATGCTACCTAACAAAAAATAACTAAGAAGCACTTTAAGAGATTG:1 - chr3R 31934690 3' - Idefix 7379 2 49.50 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAAAACTGTTGCATACTCCCAGGAGCACAA:1 + chr3R 14832484 3' + blood 7380 2 67.39 TATTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCTCTGGCCATTCCAAATAAAATATTAATTAAACAAGAT:1 + chrX 10816305 3' + F-element 270 1 63.37 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGC:1 + chr3R 23618235 3' + hopper 1408 2 71.29 AGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATT:1 + chrX 1018147 3' - 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Juan 4026 1 75.25 CCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGT:2 - chr3L 25889014 3' - gypsy8 309 1 77.23 AAAGAGAGAGAGAGAGAGCTTGTTAATAAAAAGGATGTAAATTCAATTAAAATAGAAAGAGATAGAGAGGGCGAGCGAACGCAGTTCGTTTGCGTTTGTAT:1 - chr3L 10856619 3' - blood 165 2 61.39 TAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGCGACGACGATAAGCATTTGGGTCTGGCTATTTCTGTCGCCTTGGCTACG:1 - chr2L 5152631 3' - I-element 366 1 54.46 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCATA:1 - chr2L 18286139 3' - 412 51 2 76.24 GTTTGTGGACGTTAGAGTGGGCGCAACGTCTATGTCCAAGTAATAATTGCGTACAAAATTAATGAACGTGCTTTTGCGTGGAAAATTTGATTAAAGTGCTC:1 + chr3R 18861360 3' - INE-1 218 1 66.34 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGCAGC:2 + chr3R 11833014 3' + roo 9031 1 65.35 ACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATATACGGCTCATCGGGACGAAATATTTCCGCTCAATTTTACAATTTTTGTTTTTTT:1 + chrX 12685343 3' - 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INE-1 503 1 69.31 CCAAGNTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACATCGGATGACCAAAGGTCATTAATACGAATATGAATATTACGGA:1 + chrX 18122940 3' + I-element 5021 1 55.45 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGTTGTAACGTCATGTCGGTGGCCATTCAGTGTGG:1 - chr3R 14146648 3' + hopper2 1567 2 69.00 TTTATAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAAAATTTGCTTGCTTGTTCTTGCCTTATGCTTG:1 + chr3L 22791169 3' - 1360 3325 1 80.20 ATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATTCTCCGAGGGTACCACGCGAAAGAAATTGGGAAACGCATCCTTGGTGAAC:1 + chr3R 21774723 3' - hopper 123 1 53.47 CCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCAGCTCGAACGCTTGCCAGTTACTGAAA:1 - chr3R 19686900 3' + F-element 384 1 73.27 CAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTTCCTTCAGTTGGGCCGCAGATCTTTTGAGCTTGTGGCAACAGACAGACAGGTTTCAT:1 - chr3L 12728703 3' - gypsy3 6544 1 75.25 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGAC:1 + chrX 9256966 3' - 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chr3L 26852654 3' - 1360 51 1 71.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCACATA:1 - chr3R 11005450 3' + roo 9047 1 49.50 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTCATTGCCTCTGCATTTTCGAGGACTTTGCCACCCCAAGATCCGCAGGG:1 + chr2L 19090130 3' - opus 7024 2 57.14 AAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAGAAAGAAAGCCCTCAATGTCCAGGTTACGGAGATCAACGCGCTCCACCACTC:1 + chr3L 21442733 3' + Tc1 420 1 74.26 AAAAAAAAAATGGAAGAAGAAAAACCCGTAAGAAAAGTTCAGAGGCAAAAGCTAGTGCCACAGTCTAGTCGAGATGCCACCGAGTCGATCTCAATCCT:1 - chr2L 18891526 3' + Doc2-element 232 1 57.14 TACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCTTATGTCTTCCGGGGCGTATGAGAAACTTGATTTGCCA:1 + chr3R 12525063 3' + F-element 4448 1 62.38 CCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCAGCAAAACATATCGTTGGGCTCCTCGATGCTCAGACCCACTTGAT:1 + chr3L 17548958 3' + copia 4890 2 55.45 ACATTAATGAATAAGATCAAGAATTGAGCGTGCTTACAACAAAACAAATCGATCAAAATGTTCAAAAACCACTTGGAAATGATTGGGCGCAATGAGAGCCC:1 - chr3R 15179086 3' - Gypsy12A_LTR 2126 1 63.37 CCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCTCATAGCATACACCCAAAGAAAATCACC:1 - chr3R 11803317 3' + hobo 2596 1 72.00 GTGGGCTAAGTTTGTGTGTCCTAGTCAAAGTCGTATTATTTCCATTTTCAAATATTTGTAGAGTATTTTCCAAATCTGATTTTCTATTTCTTTTCCATTCA:1 + chr2R 16164057 3' - I-element 4955 1 70.30 AGTTCATCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAA:1 + chr3L 23678147 3' - Osvaldo 25 1 69.00 CAGCAGCGAGTTAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTTTAGGCTCTCGAAAAAATGGGCCTGGGCAAAATGCAGCGAGGTGAGTTAACAA:1 + chrX 4153843 3' + rooA 7548 2 55.45 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATA:1 + chr3L 9907351 3' - BS 5019 1 52.48 TCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAAATTCAAATTAGAACTAAGAACTAGGACATTTGTTCACAACAGCACTTGCTAGAACGCGTGGGTG:1 - chr2R 6619551 3' - Gypsy6A_LTR 195 1 61.39 ACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACGCGAAACATGATTATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAAACAAATTTAAAAATTGTTTAAAAAGGTG:1 + chr3L 24073179 3' + Doc 226 1 78.00 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCACAATGCACTGAGAACCAGCAGCCTGACCTGCATTT:1 - chr2L 13598193 3' - pogo 37 1 63.37 CAAGAGCTGGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTGAATATAAAATAAAACAGAATAGCGAAGAGCATATTTTCCAGATTTAGCTGTGTAACTGC:1 - chr3L 27369828 3' - gypsy6 198 2 54.46 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGAATTGCAATTCCGATTTTGATTAGGCCAATTTAACCAAATCTGTCACAATTCGGGAATGCCATTCCCTATTGC:1 + chr2L 10081045 3' + mdg1 418 2 73.27 TTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTTATGACTTTGAAACTGTGTATTATGTCATTGCATTTTATGTGCAGAGCCACTCAATTCCATCATAATATT:1 + chr3L 1685104 3' + 17.6 415 2 70.30 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACT:1 - chr3R 15072573 3' - pogo 30 1 59.41 TTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAAGAATTTCGCCATAGCAATAGGCGCCGAAGTCGCCACATTGCTACATGTG:1 - chrX 2512916 3' - Gypsy6A_LTR 210 1 54.46 TATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGAGAAGGCGTTGGGTATCCTCCGTTTGA:1 - chr3L 9086223 3' - R2-element 3473 1 73.00 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCGACTTCCGTAGAGGCGCCCCTAAGTAGGCAA:1 - chr3R 31159648 3' + hobo 2898 1 67.35 GTTAANTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGT:1 + chrX 6283694 3' + P-element 2857 1 50.50 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATATGTATGTATGATGCATAAAAGGGAAAGCAAACAAGCATTGGTGATAAGATTTGATATTT:1 - chrX 15018992 3' - mdg1 13 2 66.34 AGATCTCCAAGTTCATACGGACGGACGGACGGACATGTCTAGATCGAGGCTTCCTTCTGAACTTTTAACGGAACTTTCGCGATCGAGCGAACTGCAGCAAA:1 + chr3R 4547208 3' - INE-1 133 1 47.52 AGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCCGCGCGGACTGTTGCCGCTGCCATAGTTATTGTTGTTCTTCTGCTTTAATA:1 - chrX 15483269 3' - Quasimodo 7176 2 62.38 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATATTCAGCACATTGCTTAGAAAGAAAAAAAAAATGTATATGTATAATTCAGTTC:1 + chr2L 20129003 3' - 412 18 2 43.43 TCCAACCGAAGACTTGGTGGCCTGAATAAATTTGATTTGTGCGAACAGAGATTTCCGGGCCCCAACTCCCTCCCAGATAAACGTGGCTAAATTAAGAGG:1 + chr3L 13373827 3' + gypsy10 5883 2 67.68 CGGAGAGAAGCTCCAGAACATCCCCGAAAAATATATGGAACGACTTAATGCGCACCCAAACAGCCTGGCCAGTCAGTGCAATGAGTTATTATACTGAAGGT:1 - chr3L 16065876 3' + jockey 4621 1 79.21 TCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTGGTGGGTCTTTTGTTGAAGAGCTGGCGTGGCCGAGATTAAAGACTATATTTATGGGAGTTCAGTGAA:1 - chr2L 1307779 3' - Doc2-element 427 1 71.29 GTGTGAATGTGTGTGTATGTGTGCGAACGGAGGCAGTAAAACGAAATGAGAAAGCATGAAAAATTACATTTTCTGGACTTGCATTTTATTTTTAATTCATT:1 + chr3R 6420759 3' - accord 7035 2 61.39 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTTGTACGTCTTCAATTAATTGGGTGCAGAATTTTTGATAGAAAAAATTCC:1 - chr3R 25931307 3' + roo 9048 2 55.45 TTAAGCTAAGAAAGGAAGGAAAATCATATAAGGACATTAAAAAAACCCTTAAGTGTTCTGCCCGAGTATCCGATGCCACAGCCTGAAAACCACAAAGGAG:1 - chr2L 14347493 3' + HB 397 1 78.00 ATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCAACTAATGCCATTGATATTGCTAATTATCAGCTACA:1 - chr3L 5843477 3' - invader2 4979 2 66.34 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGCCACAAGTCCAAGTCCAATGCTAGACACGGAAAAGGAAAAGCGCACGCG:1 - chr2L 11385125 3' + transib2 2798 1 53.47 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAAAGCATCGGGCACCGGCTCCACCTCCTCAAGCTGGCGTGGCAGCCGCCACGGTATCAGTCATC:1 - chr2R 22107009 3' + Burdock 241 2 74.16 TATGTATGCAATATGTATGTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCTAGCTATATCCTGGCACAAATGCCACTGGTATGGCCGTTGCTCTTGTTACTTCTCT:1 + chr3R 12512644 3' + Dm88 10 2 60.40 TAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTCTGGTAGCTAAAAAGTAAAATAGCAAAAAGCAAAAATAGTTAAACCGAAAAAAAATAAAAACCAATGAAATTAATTT:1 + chrX 20801081 3' - Doc 4498 1 73.27 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTTGGGTGG:1 + chr2R 8157281 3' + Transpac 307 2 77.23 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGCATCGACTTCGGCTTCGCG:1 + chr2L 222246 3' + P-element 2846 1 38.61 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCAATATTGGTTTGAGAGC:1 - chr3R 4806576 3' + P-element 2838 1 30.69 CGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAAAACTCACCATTAACAACCAAAAGTCATTCCACAGTTCACTTCACTTCCGTCCCGACAGTTTATTA:1 + chrX 20603370 3' + X-element 433 1 73.27 TGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCACATTCGTTTATTTTGGCGTTTTCTTTTTGTAAAGTTCCAGTAGCGTATT:1 - chr2L 4908422 3' - 1360 252 1 57.43 CGTTGTGCTAGAATACGATTTTCGGGACGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGATTTTACATATTTGGGGAGTTTTGGCGGAAGTGTAAGTGTACCGTTA:1 - chr2R 20583130 3' - 1360 3200 1 78.00 CTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAATAATAGTTAACCTTCCTTTTTCCAGATTTCGGGTTAACTATTATTTAACGAGCACAACTTTTGTCAACACACAAACAG:1 - chr3R 7333217 3' + Cr1a 4238 1 57.43 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGTTGGGTGTCAACATTTTTGAAATGGGTTTGCATTTGTATCGCC:1 - chr2L 14536221 3' - blood 7020 2 68.32 CGGGTTAGCAGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGATTTATTTTATTTTCTCTAAATACATAATAAAAAAAAATGAACATAATACTTTGCCCATTTTTTATTTT:1 - chr2L 15056338 3' - I-element 141 1 55.45 TTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTCGGGATCTTGACAACGACGCCATCGAATTG:1 + chr3R 10391375 3' - flea 344 1 70.30 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATCCGCCCCTATTATGCGCTAAGCGAACAATGAAAGTTTTGAATCAATTCAAGTTGTCCAAA:1 - chr3L 12246090 3' - HMS-Beagle 11 2 68.32 AAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTCCATAAATCATCATGCCACGAGGAAAGTTCGTCAACCACAAAGGTCGCAGTCGCCATTTCACATCTC:2 - chrX 4553928 3' + mdg1 7322 2 73.27 ACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGCGTCGTCGTCTGTCCGTAAAGGGGAAAGC:1 - chr3R 16039798 3' + flea 273 1 71.00 CACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTC:1 - chr3R 14882105 3' + gypsy5 7332 2 70.00 GAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAAATAAAAACCCCAAACGAAAGCTCCCATACAACATAAAAA:1 - chrX 7475853 3' + Quasimodo 69 2 70.30 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCGCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTACAG:1 + chr3L 15853530 3' + jockey 4970 1 56.57 AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTCTGTTTGTACCAAAAAAGAGTTTGGCCTTATCTTTTTTTTTCATGCAGGCCGAGACAATAAAT:1 - chrX 21302901 3' + Quasimodo 7362 2 67.37 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATATTTCTAGGCGCACGTTGGTTTTAGTTCAC:1 + chr3R 22238764 3' + hobo 2936 1 76.29 TGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCACTCGAATCGGGAACGGGGTTGCTGCACAAATTCAGGGACAAACCAAACCAGCGGCG:1 + chr2L 11948888 3' + Stalker 7143 4 56.44 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCC:1 + chrX 1548531 3' + roo 351 2 81.19 TTTTACGCGTCAAAATTATTTACATACAGCTTTTTTAATTGTTTTTTGCATATTTATGCTTCGCCGTTTGCATGTGAATTATTATTTAATTTTATCTTCGT:1 - chrX 16902902 3' + Bari2 96 2 53.47 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAAACTAAAACATTTAAATTAAGGTGCTTTCATTTTATTGACAGAAAATAAATTTCAGATATGTACA:1 - chr3L 11610340 3' - 412 12 2 74.26 TACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACATGTCCGCACTCCCTGGCCCGAGGCCGCACTCAACCACAAGCACTTGGCTGGCTCACTCAAATGTTTT:1 + chr3R 28996909 3' - Bica 74 1 55.45 GCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCCCAACGTGGGGCATTTGACAGTGCGTTAGTCATTAGCCACAAACATAAAAAAGGACGTTTTAATCGAATTTATGTGT:1 + chr2R 20500622 3' + gypsy2 335 1 71.29 ACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGCCACCAGTAGCAGAGAAAATGCAACAATAAATCTCATTTTATGCAGAGCGCACAGCGAACGGCCCTTTTAT:1 + chr3R 23370456 3' + Doc3-element 4448 1 75.25 TCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACTGCTGGAATGTCGTTGCAAAGTCCTGGCAAGGTTAATCAACAGAAATACAACACTCATAA:1 + chr2L 17760035 3' + R2-element 51 1 66.34 TATCATAAATTCCAGGACGGAATATGAAATACCTAACTGAAACTAATAAATAGGTGTTCGCTAATGGTCCACCAGTTAATCTAGTGGTTTAACTAGTAAAC:1 - chr2R 19982785 3' - Circe 363 1 59.41 CGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGGGATCGGCGATCATGATGGGGTTCTGGTCGGACAGCATCTGCAAACCGGCTA:1 + chr3L 17662293 3' - invader1 4008 2 63.37 AAAGTNCTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATGTAACCAAACT:1 - chrX 13354238 3' + pogo 2089 1 68.32 CATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACACGCGCACACTCGCGTGTATATACGTGTATCCTATATCCT:1 - chrX 19719137 3' + 1360 3116 1 60.40 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCT:1 - chr2L 9823621 3' - hobo 21 1 60.40 GCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACCCGACAAAAGCTGCCAACCAAAAA:1 + chr3L 4421945 3' - opus 7116 2 76.24 CGAGCTTACCGACTATCAGATACTTATTACT:1 + chr3L 16236521 3' - INE-1 559 1 74.19 TAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGGCGACAACAACAATAACAACAACA:1 - chr2R 9320982 3' + 3S18 6052 2 75.25 TTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTGGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGCAAACATAATTTAATCAAATACAC:1 + chr3L 5341179 3' - R1A1-element 133 1 70.79 GCGATACCGAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAGCCAGCGAGGCCAATACAAAGCCACTAAAAGCTGGCAAATATGATGAGCCC:1 + chrX 20969110 3' - mariner2 208 1 54.46 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAGATTCTGATTCTGATTCCGATTCAGATTCAGATACAGATACGTATACGAATTCCGGATCTGAATCC:1 - chrX 11006815 3' + roo 401 1 70.30 CTTTTNGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAAT:1 - chr2L 22762327 3' - Dm88 4434 2 65.35 TAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTAATA:1 + chr3R 1048060 3' - Stalker2 14 2 65.35 GAACTCTCCAGATATCATAAATTCCAGGACGGAATATGAAATACCTAACTGAAACGGATTAGAGCTATTTGTTTTAAATTACCACAAAAATAGATAAGGGT:1 - chr2L 18918263 3' - Circe 375 1 54.46 TCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCATATCCTAAGATAGTGGTACTACCGTATTTG:1 - chrX 6225558 3' + blood 134 2 65.82 AAGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCACAATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAA:1 - chrX 22398536 3' + Gypsy6A_LTR 159 1 56.25 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGCGCTGGCATAGTTGCTATCAAATTTCATGATCACTGCCAATCATTTAATTGCC:1 - chrX 2090200 3' - roo 8669 2 70.30 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTT:2 - chr3R 14913164 3' - blood 45 2 67.33 ACCTAAGCACACACATACACACATCGACTGCTGGATAAATCTATATATACAATCTGGCTTTGGAACAGGATCAGAGCTGTGTGATGTTTTGGCTTGGG:1 - chr3L 16723920 3' + accord 254 2 75.51 ACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGCAAATTCCAAATACGCAGGGGTACTTGAGTATAGGTATCTAATAGGTCACTACACTATTATAATTGCACTGAGAATT:1 - chr3L 21567768 3' + INE-1 102 1 77.23 CCATCCAGCCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCCCATTTGGCCACTCTCAAATAAAAACTCGGCTGAAAGGAGTTTTGCTTGCTAAGTTTTTAGCA:1 + chrX 7809606 3' - baggins 5239 1 68.32 CTAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCACGGCCGGTTTATATGTAACATATAAAACGAAAACGCACAGCAACAGCAACAACAACAATACA:1 + chr2R 13630172 3' + gypsy9 494 1 35.64 ACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTGCGGAATACTGTTAGCCATTATATCATTAT:1 - chr2L 19438867 3' + hopper 1205 2 70.30 GGCGATCCTTGTTAGATCAAATGTCTCTCATCATTCTCCACTCTATCGAAAAATCATATCCAGTAACTATTGAGCTGATGGATTGGCTTCAGGGTGCGGGG:1 + chr3L 25285650 3' + G5A 216 1 75.25 AACCTGGATATAAATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCATCCGTAATAGAGACAAACTCATAAGGCAAGAAGGTCGGAGAGAAATG:1 - chr2L 17861012 3' + Bica 4876 1 53.47 TCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTACCTTTCAAATTGAATGTTCCAAATGAAATATTTTATTGCATACTT:1 + chr3R 21256642 3' + pogo 1929 1 58.00 TCATTACCTTCTAGTAAGGAAACTTGATCTTTTAGGTTTCTCTGTTAATCTTCTAAATTGGATTTTAAGCCTTCTGCATGTAGGCCTCGTCGATGCGGTTA:1 + chr3R 23755781 3' + Q-element 345 2 75.25 CCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTGATAAGAGGCTTAGACTAGATTTATCTAAGTGGTTATCTACAATCATAAACACATAGTTC:1 + chr2R 6724961 3' + Transpac 23 2 73.27 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGGACGACTTTGGTAAACAAC:1 + chr3R 25814775 3' + 412 7517 2 51.49 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATA:2 + chr3R 22675873 3' - 412 7088 2 57.43 TATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCATATTTTGTTAGTTTATTTTTGGTTGGGATTTTGTTTTAGTATTTGTTTTGGTTTT:1 + chrX 17952607 3' - F-element 138 1 60.00 CGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAATCCACCTCCACACATGTAACATCTTCCGACGTCCTGTCCATAT:1 - chr3L 411550 3' - R1A1-element 5109 1 57.43 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTTAGCGAATTATACTGTACCTGTATTTTTGCAGAAACGCAAATCGTATTGACATTAC:1 + chr2L 16252338 3' - pogo 35 1 62.89 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTAAAAACGTATTAAGATCTTTGGGATATTACAGCTGATGTTGGCGTTTGTGAACTGAA:1 - chrX 7413937 3' + pogo 2085 1 48.51 GTGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATGTTGCGCCTGTTTTCTAGGCTCCTTGGCTGAATTAATAAATTAAATTGGCGTGCAAACAGTTTTCTGGAT:1 - chr3R 24088849 3' - accord 7033 2 69.31 ACACGAAAACGATAATTAAAAATCTCACTTTTCATAACCGTCAAGTTGTCCTTATAATATTAAAATGTCAACTTTTGCCGCTTATTTGATTAACTGTAAAC:1 + chr3R 8611215 3' + transib3 101 1 55.45 GTAATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGACGACACCGAACTTGGAATAGGGAGAGCGTGAGAGAGATGCTCTCAGTGCGTTCGGGTGTTTTGTTCTGGGAATTA:1 + chr3L 23937145 3' - Doc3-element 483 1 79.21 CTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGCTCATTAATTTGATTCGAAACTCACCTCGCTTACTACACCACGATTTAACGACTTTAATTAAGGC:1 - chr3L 13336817 3' + G2 2848 1 73.27 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCAATTTTTAGTGATTACTCCAAGCTTAAACTTCGTTTTGCTGTGTAAAACTGAC:1 - chr2R 11540184 3' - Transpac 19 2 53.00 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACCAACAATGCAGCAAGGCCAGCGGAGTTCGCAGAGTCTACTGAGCGATGATGAT:1 + chr3R 16372482 3' + roo 9046 1 52.48 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGCACTATGCAGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGACTTTGGCCGACTATTCTGT:1 + chrX 184010 3' + 1360 3376 1 49.50 CTTTCNCTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGGGG:1 + chr2R 21379587 3' + P-element 2829 1 22.77 CTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCTGT:1 - chrX 22726183 3' + Helena 1285 1 59.41 ATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTCAATGTAAATTTTATTCACAGATATGTGAA:1 + chr2R 17205171 3' - I-element 5223 1 67.74 GTTTATATTTGTTTATGGTTATTTGTTTGTCCGCTCACTGGGAGTCGATTGTTTTTTTTTTGATGCACTCGTTCCTGGATAACCGCCGATTTATTTGGCCC:1 + chr3R 21252188 3' + Transib5 2643 1 80.20 GAGAGNCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTCC:1 - chr2R 14121055 3' - I-element 20 1 58.42 AACCAGGTTATGGAGGTCATGAGGGTGGGTTCTCACAATACAGATTGCACATTAATAAATTTAATTTTTTTGTAGCATTCTTTTGGGATGTTCACAAATGT:1 - chr3R 18390191 3' - jockey 4768 1 72.28 TCCAGCGGGCCAAGGGCAAAGAGGTCAAACGGTAACGGAGCGTTGAAGAAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGTGCGGACATACGGACATACCCATACCGACC:1 - chr3R 2893149 3' + gypsy8 4766 2 66.34 AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTATTTGAGAATGCTGTATTTCTTGCTTTAATTTAACTTGAGATATATAGTTATTTATGAGATCCCAT:1 - chr2L 11240862 3' + roo 401 1 67.33 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATCTGCGCCTGGATTGCCGCAGA:1 - chr3R 17788903 3' - roo 8693 2 55.45 ATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCTTATACCCTCGCCGTGTGCGTATTTCCAAAAAGTTCCCAGCATCTTGCCCAGAAACCCTCTGCCATCCAAC:1 - chr2R 10482464 3' + Porto1 295 1 64.36 ATACGAGCTTCACGAGAAAAATAAACGGAGCGGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTA:1 - chrX 21933832 3' + gypsy11 382 2 57.50 AAAAAAAAACAAGTGAAAAAACGGAAATATACATACAGCAAATTCAGGAATTTAATCCGTCTGCTGTGAACTAAAGGCTAAGAACTTGAACCACCAACACG:1 - chr3L 9181676 3' + Porto1 173 1 53.47 GGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCATGTCTCCCAGAATGACATCCCCAGCA:1 - chr3R 8031350 3' + Quasimodo 222 2 74.00 TGAAGGGATCTTCTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTTTATTTGCTCCTGTCGCTCGCGGATTTCCTGGGCACGACGC:1 + chr3L 6567140 3' - invader4 2985 2 54.44 GAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTATGGAATGCCATGTGATCCCATGTGCGGCTGCTCTTTCGCATTTTATGGCCGAATAAATATGCAATGAGAATTGCTAG:1 + chr2L 308654 3' - Tirant 8072 1 78.22 GCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCTTAAAAAGGGGAATGAGAATGAGAGGACAAGGCAGTTGCAGCACATTTTGGAGGTCCCCTGGGGCATGTCC:1 - chr3R 11836019 3' - flea 4541 1 79.21 AACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTATTATTACTGATTTGACTGATTGATTTAACGTTCTGATTCTGGCTGTAATATGGATGTTGAGTTAGA:1 + chr3R 30172944 3' - 412 7421 2 72.00 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTGC:1 + chrX 1548543 3' + roo 9027 1 69.31 CTGATGGTGTCTAAATACTTATGCACACGCGTACATAAGTATTTAGACACCATCAGCTTGCAACTGTCGCCCGAGCTTTTCATTAGCGTGATTTGGGAAGA:1 + chr3R 31942614 3' - Tc1-2 12 1 56.44 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTAATGTTAATGATTATGGTCGGG:1 - chr2L 1624478 3' + flea 240 2 78.22 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTAATGTACACGATACGAGGAAAAACATCCAAAGGGGGCATGCAACGCGCTGTCTTCCCAAAA:1 - chr3L 19510722 3' - roo 15 2 68.32 GAACATTACGGTATCGCTACCACTACCAACGCACTCGTACGTGCGTGTTATCGGTATCAACAGCTACATTCTACTATAGCGAACATAAAAAATATTACACA:1 + chr4 501092 3' + G-element 143 1 64.36 AGCTCAAGTGGTCAAGCTACACATAACATATGCATTGACATTGATGAATGCCGGGAAGATCTTCATGACTGCAAATCATCCCAATATTGCCATAATACGAA:1 - chr4 223640 3' + Stalker2 208 2 76.24 ATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTTCAATGGGAAATCACTTGGATTAGAGGCTGACCA:1 + chrX 19543365 3' - Quasimodo 98 2 64.36 CATATCAAATATGAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCATTTTAATGTTGCCATGCAAAAGTCAACATAAG:1 + chrX 10123292 3' - copia 4912 2 66.34 AATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCACAGTCTTATCAGCAACAAAGTGCCAGAAAAAAAAAACAAGGGGCGACACACCCAT:1 - chr2R 20387176 3' + hobo 315 1 58.42 CCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACACACTTGTGGATCCCAATGACAAGTACCTGCTGCCTCTCA:1 - chr3L 11818748 3' + F-element 417 1 60.40 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTTTTAGCTTAGATTTAAACACAAGTCCAATTAAAGCAAAACGCATTAATAACTAAG:1 + chr3R 7375404 3' + roo 389 2 59.00 CTATTNAAATATTCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGTGCGAGACGCCGGCACACGAACTTTGTCGATGCTGA:1 + chr2R 10637983 3' - Tc1-2 1274 1 64.36 TCCCCTCTGTTCAGCCGGGCACTCTTCCTGGGGGAATGCTGCATCTTCCTTTAGCCGCCATCAAAACAACTCTAACGATGACTGCTCTCCCATTAACACGC:1 + chr2L 186294 3' - aurora-element 492 1 61.39 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTGTCTGTGTTTAATTGCGAAAATGTAGCAATCTTTTAGG:1 + chr2L 13482229 3' - hopper 8 2 69.31 ATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTGGCAGCAGAACTTTGGCAACATTTCCGATTGCCTGCGCC:1 + chr3R 28931961 3' - accord 224 2 61.39 ACGCCTCCCTCTCCAGATCGCCCGCTGCGCCAAGTTGGCAGCCCCATGTGCCCCATCTGCCCCATTCTGGGGCATGGCATCCAGAGCCCCCTCCTCGATTC:1 - chr3L 1104857 3' - Rt1b 21 1 62.38 CCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGA:1 - chr3R 21276520 3' - BS 4999 1 74.26 AAGAAAAGAAAAAAAAATGAAAAACCAGCCAACAAGAAGCAGCAGCAACAACAGCTGAGAAAATCGTTGGTGGCAGCAAGAACCACCAGCAACTGCCCGCT:1 - chr3R 28424376 3' + invader2 4752 2 74.26 AGTTGNGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATTGCTTGTCTTCACTTAATAAACATTGCGT:1 - chr2R 9882466 3' - Stalker 300 4 70.30 AAAAAAAAAATAAAGGAAAAAATGCAGAGAAAATGTAAATCCATATATATTTTTATTTTATTTATAATTAGCTAAGTCATATTGCTCAAATATTAAGTTAA:1 + chr3R 13889150 3' + Doc2-element 229 3 54.46 GAGTGCTGGCTAATCGTAGTTGGGCTGGAGCTGGTAACTCTAAAAAATTTCCACATCTCCGTGCCGGACTAAGGTGATAGTTAAGGATGGAGTAAAAAGTA:1 - chr2R 9066638 3' + baggins 151 1 75.25 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTGTAGCATACTTTCCAGGCATTTAAG:1 - chrX 3697096 3' + jockey 4984 1 72.28 GGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAGCCAGGTCATCTTCAAAAGCCATTCAACTCTTGATAACCCTTGATT:1 - chr2R 17625252 3' - G4 3378 1 67.05 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTGAG:1 + chrX 14424089 3' - hobo 40 1 68.32 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCACATTAATGAG:1 - chr3R 20140537 3' - jockey 10 1 78.79 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTGTTATATGATTAAAACATTTTTATTGACTTATTTGTAAGCAGATAAATGTTAAATATATAGAGCACCTA:1 + chr3L 18076356 3' - roo 7 2 68.32 CGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGCTTAGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATACAAGAGGGCCAAATCTCAATTTACATCGCATCATAGCGGC:1 - chrX 19874506 3' - Tc3 1716 1 59.41 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCT:1 + chr2R 18865906 3' + roo 9038 1 61.62 GCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGTGGGATTCGAAGCTGAACTTGGACTTGGTCTTGGCTTGGACCTGGACCTGGACCTGGA:1 - chr2L 14551423 3' - transib2 9 1 69.15 CGTGGGTACATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGTCTGGTTGGCCATGTTAATGTGGGCTCAGACATGTCTAACACTCTTTTGCCTAGTCGCCCTCCTTTCTTT:1 - chrX 21197936 3' - G-element 4205 1 74.26 CATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTCCGGATCGGAGAAGTATCGCTGCTCCGAAGGCGCCAAGTCCCTTCGCTCGCTGCC:1 - chr2R 20317510 3' + R1A1-element 5024 1 62.77 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGATCTGAGCAGGCACATGGG:1 - chr3R 9996374 3' - blood 7031 2 60.40 GGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAACGAACACACTCATAGAGCCGCCTCAACAC:1 - chr3L 26022164 3' - Circe 7370 1 70.30 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTCGTACCGTTCGCTTTTTAG:1 - chr3R 14913127 3' - blood 7019 2 72.28 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACAGTGATAGCAGACAACTATATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATG:1 + chr3R 4571525 3' - 1360 204 1 68.32 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCG:1 - chr2L 22319256 3' - Transpac 4926 2 68.32 CTGAATCTCATCCTTCTAGCTTTTATAATTCCCAAGTTCTCGACGTTCATAGGGACAGACGGACATGGCTATATCAACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGA:1 - chr3L 20756368 3' - INE-1 167 1 79.21 TTATTATTGTTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCGGCACACGCGCACTTCATTTCCCAGTAATAATGGAATAACGTTCAATGATCTATGCCAAGATTGCGCA:1 + chr3R 22577497 3' + 1360 316 1 70.30 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTATCTGGTGGTTGCTGTTGGTGTTCTTAGTTCGTTATACTCT:1 + chr3L 16372237 3' - jockey 4737 1 60.40 ACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATATTCCTTAGATAAGTGCACGCCAAATTGGTCGAAAATTTACCGCAAATGGGCG:1 + chrX 13970288 3' + roo 8818 2 59.00 ATAAAAACTTTAGACATGTACCTACATTATAAAAATAAATAAATATCTTTCGATGCCTACAAAAGTTTTCTTTGTGTTGGTGAGTAAAGACGTATATGTTC:1 - chr2L 21314449 3' + mariner2 803 1 67.33 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGC:1 + chr3L 15276716 3' - hopper 31 1 63.00 GAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGAAGCTTGGCTGGCATCTCACACCTCTGGC:1 - chr2R 22277683 3' - TAHRE 10090 1 71.29 GCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGCTTCCGGACACCAAGTCTACATCGCCGTAAAGACGGACGTCTTAAATTAACGCTGCGCGAAATACTCGAAATTATA:1 - chr2L 22374081 3' + 1360 3385 2 74.26 CCATACATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGACAAAACGCAACGAACACGCCCCCGGGGGGGCGGTGGCGCAAGG:1 - chrX 19768109 3' + Stalker2 7472 2 59.00 CGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:2 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 4926 1 62.38 GATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGCTCTGGTGTATTTATGGTTAGTTGGCGGTCTTGACTTGATTTTTTTTTCTGCCTCGCAAC:1 + chr3L 10248863 3' - I-element 215 1 61.39 ATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGGCTAGCGAAATTGTTGTTTTGTTGGCTTTGCTTCGCCTATTGCTT:1 - chr3R 28686374 3' - I-element 194 1 75.25 AAGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTTGTTGGAGGCCATTCTGTAGCTGTATCTGTATCCGTATGTCGTCTATCGCGAAAGGTGCAAGCGAAGA:1 + chr3L 3300831 3' - TAHRE 10064 1 70.30 CCGTGNTCGCCATTCTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCCCATTGGATCTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGATTTCGGCGCCACCG:1 - chr3L 15735014 3' + Max-element 408 1 61.80 GCACCAACACACACACACACACACACACAGAGACACGCACACATACACGTACGCATACACACGTATGCATTTTAATAACTTGCCAAGGAATAGTACTT:1 - chr3L 9209100 3' + accord 179 2 65.31 GCAGGCAGCGCGAACATCACTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAACCGAATTGAATTGTGAGCATATTTTT:1 - chr2L 3404654 3' - Stalker 497 1 75.25 CGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGATCGCGAACGTTTGCATTCTGTACTTTTTGCGGGGGCGTTTCCTCAAGGATTAGGGCCTATTTGCATAGGTCT:1 + chr2R 12533318 3' - Doc3-element 393 1 52.48 AGTCAGTGAAATTCAAACACCCGAATTGAACTCAAAGTAAAAAGAAAAAGGTTATTCGAGTGATTCTGTACGCCTGCTTTTTTCATCCCACTACCCGCACA:1 + chr3R 17829187 3' + rooA 7556 2 68.32 CATTTTACTTACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAACAAAAGCAAAAACCGAAATCAATCGACTAAGAAGACGATGTTTGTAGCCAC:1 - chr2L 9683326 3' - Tc1 1563 1 54.00 GCTGCGGCCACGAATGCTTGGCGCTCCTTGCGCCTTCTGACCTTTTGGTTTTGGATCGCTGCATGAACATTGATGTTAATATTAGGCATTTTCAGCTTCTT:1 - chr2R 20626933 3' - aurora-element 378 1 41.58 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATGTGTGATACCGCACAAC:1 + chr2R 18891098 3' - opus 7055 4 81.19 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCATATTCCTTTTGATGCTGT:1 - chr2L 18286123 3' - 412 35 2 60.40 GAGTCATATTTCGCGACTTGGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGCGGCTTATTGTGTTATGCAGTGTGGCGAACTTGTATCTATTTAAATTTTGTGTGTGG:1 - chrX 3509338 3' - gypsy4 6649 2 62.38 TACATTATCAGAAGTGGGCTGATCACGAGCCAAAGAAGAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAAGGATATGTACAAATACAACAACA:1 - chrX 4447537 3' + invader2 263 1 76.24 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACCGCCAGTCGTTGCCCATCAATTC:1 + chr2R 5910939 3' - hobo 17 1 62.38 GCAGANCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATATACAGATACCCCACAGTTGGAGGG:1 + chr3L 8763265 3' + jockey 4947 1 73.27 ATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGACTCTTGATTTTCTTTTGTTTGCTTGTTTGCCGAGAGAGCCGCTAAAGTTGTGGTTGTT:1 - chr3L 21008401 3' + 1360 3203 1 63.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCTTGCCT:2 - chr2L 22407450 3' + roo 392 2 60.40 TTGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCACCTGCCACAGTAAAATGTTGCAACTCCGGGAA:1 + chr3R 25561243 3' + Doc 459 1 73.27 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGC:1 + chr3R 4807830 3' - P-element 38 1 41.58 ACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCACCAAGACGCATCCGTAGAACCATAGTCAAAATTAATCAATACCTTTTCCTCACTTTT:1 + chr3R 28033167 3' - R1A1-element 4960 1 43.56 ACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCCGTTAAATGTTTAATTGTATATCATATG:1 - chr3L 7882196 3' + Ivk 31 1 72.28 AAAAAGGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTGCTTTTCGAATCATGCCACAGTTTGTAAAACCTAGGAAAGCCAGTGGCCATCAAAGGGAAACCTCGAAGG:1 - chr3R 26252220 3' - transib2 3 1 71.29 AAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTTAATGCAGCTAAGTTTTATTCTTAAATCCGAAATAATAATCCCGCACGAAATTAAATCCCTCGCCCACACGGCCACCA:1 - chr2R 22269898 3' - rooA 7458 2 56.44 ACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAA:1 - chr2R 4577093 3' + Chouto 472 1 70.30 CAAGTNTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAAAGC:1 - chr3L 16973351 3' - S-element 1524 1 70.30 TGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGTGCCTAGAAGGAAGGCGTCTGGTCTGTCCATCTGTCCATTTCCGTCTAAAACCCATCAAAATGT:1 + chr3R 18600662 3' + G-element 328 1 56.44 ATTATTTAAACTATCCAGTGACTTGAAATTTTGATTTGACCTTTCTCAAAATCGGATAAAGGTTTTCCGCGGCCCATCTTAGAAAAGGATGATAAAAGATG:1 - chr3L 27357555 3' + Tc3 1468 1 69.31 GGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAATAACTCAATAGAGATATCTTCGATTATCGGTATAAATACATATTAACCCCTTAG:1 + chr3L 46471 3' - FB 212 1 61.39 ACCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAACTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTCTCCCATTGCCTCTTCAGATCTTCCCCAC:1 - chr3R 30426804 3' + Ivk 5226 1 71.29 ATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGGCCTCGCGGTGTGCTG:1 - chr2L 22319248 3' - Transpac 4918 1 76.24 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATT:1 + chr3L 25341885 3' - 297 46 2 72.28 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATTTTGATTGCAGCACACACATAAGCACACACA:1 - chrX 13629445 3' + I-element 5313 1 69.31 GTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTTCTCACATATATGTTTATAGCTCATTCTCGGAGCAGAGACACTTAATTTACTATTTTGCTCAAACTCCTCTG:1 - chr2L 17788062 3' - accord 254 2 74.26 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAAGCCAAGGGAACTGG:1 + chrX 2090316 3' + roo 398 1 69.00 TGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATACAAAACTACACACTTGTTTCGTTACACTCGGAATGCCCATGGCACTTGACAC:1 + chrX 16261086 3' - R1A1-element 5283 1 58.42 GCAAGNAAACTAATCTGAGTATGCAGTCAAAGCCAAGCCGATTCCAGTTGCTAGCCAACTTAGATCGAAGTGCCGGGCCAAGACACAGCAGCAACAATGTT:1 - chr2L 17548965 3' + Doc 4508 1 67.33 ACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAATCGAAAGCGATAGCAACACTCTTCCTTTCT:2 + chr3R 12789932 3' - flea 18 2 61.39 CAGTTNTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGCTGCAGTTCTCTGATTCATACATCATTTATGAACGAACGCACAC:1 - chr3L 22324048 3' - hobo 2700 1 55.45 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGAT:1 - chr2R 8158776 3' - Juan 42 1 53.47 CCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAATGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGCGAAGGGGATGATGAAAGTGCCAAATCGGAAAT:1 + chr3L 1416081 3' + R1A1-element 303 1 63.33 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAG:1 - chr3R 22899165 3' - P-element 19 1 58.42 CTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTATGGGCTATGGGAATGTGGCCAAAAAGTCTGCTAGTCGGCAAGGACAATGCTCAATGCAACAGACTG:1 - chr2L 13851278 3' - F-element 348 1 72.28 AATTAAAAGGAATGGAAATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGATGGACAAACTTGAAAATACAGATACGTGGGGTGACCGATCTTGGGGCCAATG:1 + chrX 6084879 3' - GATE 345 1 65.35 ATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTATAGTATTTGCGAGTCTTTGTTG:1 + chr3R 17746860 3' + Bica 4546 1 78.22 AGCTGGGGATATTGTTGCAGTGGGTGTTGCACATTTTTATGCAGCGATACGTAAAGCCCGAGGAGCGGGAGTAGGAACTGTGGCATGGCTTCTGGGCAACT:1 - chr2L 9033422 3' - Tirant 139 2 44.55 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGCCGTTTGTCGTTTACT:1 - chr3R 14832387 3' - blood 7029 2 59.41 TATACGGACAGACGGACATGGCCAGAACGCCTCGGGTATCGAGGGTCGAGGAGGGCCTACAGGTGTTTGGCTACCGGCTTTGTATATATTGGGTGGAAAAA:1 - chr3R 28717110 3' - INE-1 120 1 69.31 TGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAAGTTGGGTATACATTTGTACTTGTATTACTAGTATTATTAGTTATGGTAT:1 - chr3R 17464220 3' - HMS-Beagle 6718 1 51.00 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACTTATTCAAATCGTTGAGATTCCCTCCCTCTGACCCACTACCCACCCCCCAGCAGCACTTTCCCCGCTCTCCT:1 + chr3R 6917555 3' - copia 3 2 73.27 GCTTGGGAGCGGGGACACAGAATAATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGCCCGTGTCCTGGATGATTAGCTGCATCAGTGGC:1 + chr2R 6635495 3' + Rt1b 4743 1 65.62 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTGTTGTCACAGAAATTGTCAAGTC:1 - chr2L 3621093 3' - 297 6626 2 77.23 GGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGTACTGCGTACCTTCTTCAATTTTATTCATTACTTTTTATTG:1 + chr2R 24248269 3' - G2 2759 1 59.41 ACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGATGTTAAAGACCCCGCTGGCATCCGACGACGCGGAAGTGACACAATTTATGCCGCTGAAACGAGGCCA:1 - chr3L 21211485 3' - Doc 464 1 72.28 TATTATTGTTTATTTTTAATTTAATTATTAGTTTTATTCTAAATGTTGTACAGTGTGTGAGTTTGCACTTTGCTAATTTCAACCAATGAAAATAGCAAAGT:1 - chr3R 29422729 3' - flea 4998 2 40.59 GTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATAATTTCTGGATTCCTGGAGGATCTCGCACAACTTACACATGCAGC:1 + chr2L 2492246 3' + G-element 4 1 55.45 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCAATTTCTAAAATCTATTTTAAATCCGTTAAAAGTTTTGTAAAG:1 - chr2L 8640813 3' - roo 32 2 59.41 GATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTATGTACTATTAGAATCATATAATTTATAAACTCTTGATGAGGCGTAACCAATATTCTCTATTT:1 + chr2L 11056638 3' - opus 7396 2 69.31 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCAAGAACGGATCTAAGGTTCAATGACTA:1 - chr3R 15091194 3' + I-element 5306 1 75.25 CGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAACACACACACTGGCGCAATGCACATCCACATGCACGGGAGCACAGAACGCTGAGCATATTTGGCAAACAAAAGGATTT:1 - chr3R 7450036 3' + Stalker4 7258 4 75.25 CGTCGNGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTATAGATCAGTCATAGCCATATCGGCTT:1 + chr3L 19088653 3' - accord 7115 2 55.00 CCCAAAGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATTG:1 - chr3R 9833040 3' - Tabor 30 2 52.48 GTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGTCTGTGGCGATGAAGTTGAGAAGGTAGTTGACCATGTCCAACTTGGA:1 - chr2L 21261651 3' + hopper 370 1 53.47 CCCTACTTCCCTCCGACATCTGAAGAGAATACATCCCCAGCCATAAACCATTTGCATTTTTTATATGCAGACATATGTACGTACTTATGTACCTATGTGCA:1 - chr3R 11774679 3' + G5A 2664 1 66.34 CACCGCCCACTTCGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGTCAACAGCGCAGGCACCGTTATTCCTGTCGTCGAGTATTCGCATTTATGAGTAATCCATTGT:1 - chr3L 21563544 3' + Chimpo 259 1 72.28 AATATTATTGTTAGTAGTATCTAATTTTGTATTAAATAAGGTAAAATTGATAATACCCTAGCTGTTTCGAGTTTCGAGCAATAAGTCAACGGATTCGTATT:2 - chr2R 1330343 3' - Cr1a 4293 1 71.29 AGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAGTAATAGCATTAAAAGGGAGAGTCACGAATAGCAAATATGAATCATACGCCATGTGTGCCAAATGCGTTGAAAC:1 + chr3R 15703774 3' - copia 2 2 74.26 GTTTTGTTTGGCGATGACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCAT:1 - chr3R 1418287 3' - BS3 223 1 64.00 GTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCACCAAAACAAATGCAATTAATAATTAACCAAACGAATGAGCAGAGTAATCCAA:1 - chr3L 7224988 3' + F-element 497 1 56.44 ACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCAGCTATACCGGGCTTACGGCGACTTGGCAATG:1 + chrX 8528392 3' + R1A1-element 4942 1 68.32 TATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGGCTCGTAACGAATGTATGGGTTGAACGAGGATCACTGGACTATCTGTAGGTATAAGTGTTA:1 + chr2L 23372838 3' + 1360 3276 1 67.68 TATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGTGGTCTATTGGCCGAATCTTCTCCAGCACAGTGCGAATCTCGATCAGAC:1 - chr2L 5758963 3' - mdg3 5349 2 51.49 AAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCACTGAAGATAACCTGCGCTGCATTGTAGACGATCAAGACTTTGCGGAGCTCGAAAGGCTT:1 + chr3R 7984041 3' - opus 7111 2 64.36 TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGAAATCTGGAGACCATGCCCTCCTCTAAACCTCCCCCCCCCC:1 + chr3L 7137551 3' + Tirant 370 2 55.26 TTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTGGTGCGGGTAGGGCGACTCGATGACCCAGCAGCGAGTTCCCAGCGGG:1 + chr3R 13410034 3' - G-element 4238 1 55.45 GGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACAGGTGCTGGAGTGCCACATATGGGGCAGCATTGGATTGCACAAGTTCAAATGCCACGCATGACCGTCACAAATC:1 - chrX 16151993 3' - springer 7187 2 65.35 ATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGGCTGTCGGTCACACTCCACCACAATTTGCATCAAAAGTTCAAAAGTCGTGAAAAGGAAA:1 + chr2L 17208631 3' - F-element 308 1 49.50 CTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCAAAAAGACCGAACTCAGCATCAATCTGAACTAC:1 - chr3R 17779917 3' - invader4 186 2 67.33 GCTGCNGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTCTTCGTTTAACTGGCGACGTAACGCCTTTTTTGGCAGCTGTCTTCATTGCGCCCTGCCACTTCCC:1 + chrX 3562430 3' - F-element 4489 1 66.34 TTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAG:1 + chr3L 17307313 3' + Stalker 7087 6 60.40 TTTGGATGAATTTTTTTTTATACGTTACACATGCCTCCAGTAAATTTTACACACAGAATCTCGAGTTAAGCACCCAATATGAAAATATATACTATATTAAG:1 - chr2L 12171210 3' + hopper 64 1 42.57 ACGGACCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTATTATTACCCTTAGCTTAAATAATATTTATTGGTTCCAACTTCC:1 - chr2R 5095360 3' - roo 8695 2 55.45 TTAGTTGGGTCCCTTCAAAAGCCAATCTCTTTCCAGGCATTTCATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCTATCGTCAGAGCGAAGAAGATAATTGCGAAAA:1 + chr2R 11146396 3' - S-element 422 1 68.32 TTTTTTCTTTTTTTTTTGTAACTTCACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATACATATATGGATCCAGCATGTAAAGGTCTCGGCTAA:1 - chrX 13590508 3' - G2 3073 1 75.79 AAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGATCTAACAACAAGTTTTGATGATTTATGCCAACACGTCCGTCAAAATGTCAAATTCTTGGGCACA:1 + chrX 16129134 3' + accord 76 2 69.31 GCACACACATTGCTTATATCTATGTATTTTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCCCTTTCGGTTTACTTGGCTTGCACAGTACTTCC:1 - chr4 755446 3' - Stalker 7130 4 63.37 AATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGCAGTCGTTTCGCCTTTCCCTTTTCTTCGAAATTCCATTAAACAATCGTAATAGTTTACGAGTAACGTTA:1 + chrX 17938739 3' - hopper 1069 1 68.32 TTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGAATTTGGAATTCGGTTTTTGCGAGCATATGAAAAGCCAATTATGTGGGGAGGCGGCGGCAAAAG:1 - chrX 15368585 3' - Doc3-element 4550 1 70.30 AACAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAGGTCCTGCCGCTCGTTTTTACCCAAATGGGATGTTGTGCGGCCAAATGGGCTATACTTTTTGGG:1 - chr3L 6759085 3' + gypsy7 5004 2 90.22 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTGCCACTGAGTGCAAATCTGGGCCGC:2 + chrX 1548566 3' + roo 9050 2 57.43 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACG:1 + chrX 3485700 3' + P-element 2849 1 39.60 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTTGGGTCGTGCTACTCCGTGTTCTATGCAACATGCAGCTGGCTGCCCCAAAAC:1 + chr3R 22864327 3' - jockey 4791 1 55.45 GCCGTNGCTCTATAGGTGGCTCCAGGCCCCCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCCAAAGAGCCAGAGATACAGTGATAGCAGACAACTGTTGTTCTCTTCATTT:1 + chr2L 15984733 3' + 1360 62 1 62.38 TTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGCCTGGAGCCACCCCGTAAAAATTGTGTGCAAAAAAATCGTATTTAGCGCGTAGTTAGTCGCAATTGAAATGAATTACAC:1 + chr3L 144153 3' + 1360 55 1 45.54 GGACAAGCGTTTTTAATGTGAAGCATGGATTTGTTGTTTTCAGTGGGCGTACGAGTACCAGTGCGAGTGGGCGTGGCGCACATGCAGCTAATGGCTTAACT:1 - chr2L 4736603 3' - Helena 820 1 58.42 ATTCTGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCATCGGTTGTTGCGTCCATTGTAAGTGTAGATTGGGCA:1 + chr3L 11079015 3' - Porto1 4333 1 64.36 ACCGTATGAATTGAGCTCCAGTGAGCTCAATCCATATATATACATATAGCCATATTCTCCAAAGCCGCACATATCTTGCTCCGCTCCACGAGTCCAAAACT:1 + chr3R 13553011 3' - G3 4540 1 59.41 ATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGTAATCGCAGTGCCGCCATCAATCACGTAGTTCCCAGCATGTTTTGTCGCCGATCCCATCTGTATCTGTATCTTGACG:1 + chr3R 29021812 3' - Doc 4569 1 81.19 ATACTNGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACGTGACGACAAAGCTGCGGGTGCCCTTCTGCTCCTCGATGA:1 + chr3R 14139455 3' + hopper 1382 1 48.51 AGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGTTGTAACGGCGTGTCACTGCCAAATGGCCTGTCAAATAA:1 - chr2R 9628361 3' - 1360 175 1 66.34 TAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCAACGTCGCTCAGCATTAGCTTTGGAATCTTTGAATGATTTCTTTGGAATATTAGGTAAGTTAAACTT:1 + chrX 4799251 3' - G6 1685 1 72.28 GGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGTGGGTTGGTGTAATGTTGAACTGGGAAACACTATGAGAAAGCTTACATATTCTGT:1 - chr2L 19331102 3' - I-element 5133 1 59.41 TGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATTCCGTTGAAGCTAACCAAGTTGCCAGCA:1 - chrX 18578899 3' - jockey 4626 1 72.28 AAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAGTGTTATCGTTTTCTCACTCTATCAAGCTGCCAGTGATGGCTTTGAGAAATTTTATGCACACAAACAAA:1 + chr2L 7460904 3' + Bari1 1639 1 73.27 AGAGTGTTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCTAATAAGGATAATCGTTACTCTACGCG:1 + chr3L 3252967 3' + 1360 415 1 71.29 GCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGATGACAAAATGATCAACGCATTGCGGCTACGGGG:1 - chr2R 18270467 3' + invader2 457 1 37.62 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATGTATTCGATTTACCCATTCTTATGCGCAATAT:1 - 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F-element 88 1 74.26 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGGTTTCATGAATGCATTAGCAAGGTACAAATCTTCGGAGGAT:1 + chr2R 10029480 3' + roo 9037 1 61.39 CACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTATTTAACAGTATGAAGAAGTAACTTTTTCTCTCCGTGTAAGGCAACTGCAATTGCATTTATGCAGCGTACA:1 + chr2R 22622638 3' - Doc 4371 1 67.33 TCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCCAGATCTGCAGCCTCTTTACAAATTATTAGACGACGACGACTCGTTTGCTGGCTC:1 + chr2L 9183384 3' - jockey 4603 1 59.41 TGGGGACCGTATGGTGAGGTCCCTCGGCTGCTGCTGTTGGAGGACATCTGGAAGTCCGTCTCATCCCTGGATGTCACTTGGTACTGGCTGTGATGGCC:1 + chr2L 14605068 3' - BS3 1579 1 73.47 TTTTTTTTTTCTTCTTATTTTGCTGGTGCCCATACCGGCGAAGTTTCCCCTTCAAAATGCTGACAACGTTTTCCTCCTTTACGATTTGCAATTATTTTTGC:1 + chr2L 9092186 3' - Doc2-element 217 1 68.32 GACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGGGTGCAATATATAGGTGCAATTATTTGAACTACTCGTCGTTGAGTGG:1 - chr2L 10615100 3' - TAHRE 10402 1 75.25 GAAAAAAAATATGTTAATTAATTTTTTCCCCTTTGTTATTATTTTTTGCCCAATATTCCCGGCAGCTCATTTCGGCTTCAAAAGGACTCAATAAATTGCTT:1 - chr3R 20739895 3' + Stalker2 7185 1 73.27 AATATNCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGACACACTCTCGGCCTTGTTCATGGACCTCGTCACTTGCATTCGCCT:1 - 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chr2L 11406690 3' + gypsy3 421 3 73.27 AACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGTGAGCCACCTGCCCCTGCTCCCATACTCCCCACCCCTCCGCACACCAAACCGAATCCGCATGCAACGCG:1 - chr3L 13249088 3' - R1A1-element 4996 1 79.80 CTTGCTATGGTATTTTTCCTTAATTTCCGAATTGTAGGGTACCTTCTATCGACTACGCCCCTGAATGGAACGCACTTCGTGCATGTGTGTTCCCGGGTTGT:1 + chr3L 15006089 3' - F-element 4438 1 79.21 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAGAGGGCACTGCTCAGAG:1 - chr3R 22899149 3' - P-element 3 2 74.26 GATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCAAATGTGCGATTGCAAAGTGCCTTCGATTACTTAGGGCTACAA:1 - chr3R 14309602 3' + Circe 7127 1 60.40 TCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAATGCACTGGCGATTGGCATCAATGTCGCTTGGCCGCTTTTTTCCTTTTTTTCTC:1 - chr2L 8899568 3' + Bari1 1609 1 62.38 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTATATGTTTGCGGTGCGCAAGGC:1 + chr2R 23468974 3' - I-element 44 1 68.32 GAAGGAGCTAATCTGACGCTTGAGGTTGGCGAAAAGGCAAGCGCCAAGGTGGAGGAGGAAACAGCGAGGGTTTTGTACTGCAGATGCAAATGAGCAACAGC:1 - 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HB 1176 1 58.00 AGCGGGAGAGCAGGAGCGGGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGCTCGTCCGTTCGGTGCCGCCGCTCCCAAGTCGCCGGTG:1 - chr2R 15773913 3' - F-element 368 1 62.38 AAAAACAAAACAAAAAAAATGGCAAGAGAAAAAAGAGAGAGAGTCGGCACAAAATAACTCATTAGAGGTAAGCTAGCAAACGCAATCCCATGGATCGATAT:1 - chr2L 5764298 3' - hopper 141 1 53.47 AGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACGCAACTGTGTCGCAATCTGAGGTGCCCGACATCCAC:1 + chr2L 22630969 3' + 1360 3347 1 73.27 GTGGAAACTGTCTTTCCCAATCAGGTCCATTATTTTGCTTACGAGGACCCTGGAACTTTTTTCTTGTCGATGTACGATTTTACTGCTCTGTCAGCTTCACG:1 + chr3L 11408591 3' - Fw2 271 1 56.44 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAA:1 + chr3R 8480461 3' - transib2 49 1 73.27 GATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAATGTTAACAGGGTTTCCCGTAGCTTTGCATTTTTTGCTGACCTTGCTTGGTGACAATGTCAAGGTGTT:1 - chrX 14597399 3' + BS 5080 1 66.34 TCTCTAATCTTCGCGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGCCAACAACCGTCTAACCAAAATCGATCCCGACACCTTTGCGGCGGCCAAGGAACTAACGCTACTC:1 + chr3L 12794464 3' + Ivk 436 1 69.31 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAATACTCGTAGGAGCGAACAAACAAAATGTCAGCTTCAAAATTGCGCT:1 + chr3R 17505015 3' - jockey 35 1 50.50 CCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCCATCCCGAAAAACGAAAGTATGGATTTTCCGTAAGCCCAATGTCTGATATCACGAA:1 + chr2R 16532388 3' + Idefix 229 2 71.29 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATCGTTCTAGATGAGCGTGATTTATTTTCTTAACACTTCATCGTACATGTATGTAC:1 + chrX 17479633 3' + I-element 5335 1 57.43 CCGCGNCTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCCGG:1 - chr2L 796756 3' - jockey 36 1 55.00 TAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCCTCCCGAAACCAAATGATGATTCTGAGAGCCA:1 - chr3R 6453597 3' - F-element 4264 1 68.00 CCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAAGCCTCTGGAGACATTGCAGGTGGCGCTAAGTTATTCGACTTGTTATTCACGGTGGCATCGCGGGATTGGG:1 - chr3L 16705771 3' - HeT-A 5729 1 51.49 CAAGATCGCGTTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTTGATATGTGGTTCCCCTAAAATAGCAAGAAGTGTAGAT:1 - chr3R 9394203 3' - Porto1 338 1 72.28 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGA:1 - chr2L 19845901 3' - F-element 40 1 51.49 AGTCTTTTAAATTTCTATCGATTTACCTTTTTTTTTATTAGAGTTTATCATTTATTATTAGTTTCCCTGCACTGCACAGAGCCTGTGTGTTCGACAGAATC:1 + chr2L 20264410 3' + INE-1 300 1 60.40 TTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGCCACCCAAGCAGATGGACAACAAATTGCATAATGGCATTTAA:1 - chr2R 18891688 3' - opus 293 2 58.42 GTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTATCATTTATTTTATGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCCCTTTCATGCCCCTCCACTCAATG:1 + chrX 11282359 3' + Cr1a 70 1 76.24 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGCGTGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGG:1 + chr2R 18055068 3' - jockey 4759 1 73.47 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAAATCTCA:1 - chr3R 10490337 3' + transib2 2794 1 57.43 CCATGCATCCTGCACAACTTGGCAAATCTGAGCCTTAGACGTCGGGGACTTCTCGACACATAACTTTGCTGGTAGTTTGTGTTAGTGGGTGTGCCTGTGG:1 - chr3L 8573247 3' - HB 1230 1 62.00 GCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTTGAATGATGGTTAGTTGCAGCCCGGTTGCA:1 - chr2R 18661939 3' - ZAM 8082 2 62.26 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGCCGCATTTAATTTTTAAATGAGGGACTTTCTTTCAGCCGCACGAGAAACCGAAAGAG:1 + chr2L 2645283 3' + mdg1 407 2 60.82 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAAAATATAAATATATGCTTAATACATATATATATAGATTGTATTAATTTT:1 + chrX 19119845 3' - roo 25 2 59.41 ATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGTTTAACTCCTATGTCATTTCCCTTATGCCACCCAAAGCGACCCCGTGATCAGCGATGCACCAAA:1 + chr2R 6569287 3' + Doc3-element 4526 1 73.27 ATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCACCTAATATGGAAAACAAAGCATAGTTTCATTGGACAAAGAATTTATTTAAATTTTGTTACATTTT:1 - chr2R 19698471 3' + 1360 3109 1 66.34 TGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCACACGCCCTACGTGACCGGAGCATTGGCGC:1 - chr3R 28081377 3' - Tabor 7203 2 71.29 CCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAGCAGCAGGTGCTGTGGAGTTTTAAAGTTACCCCTTCGGATTTTACTAGCTACACCCACATGCGA:1 + chr3L 10914871 3' + I-element 5061 1 64.36 CATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCTATTAAGTATTTTTTGTTGCCGTAAAATGCGGCACAACCCAGTGGTATACAATCCTTTTGATATCGATATA:1 - chrX 21562256 3' - BS 4962 1 75.25 ACTCAAGCGACACCACCCTCATGACATTTTCACATGTTGCGAATAAGTTGGCAATACTTTCTTCATATATGAATGGAAAATGTTTTCAGCTGAAAAGCAAA:1 + chr3R 11117056 3' + jockey 4750 1 73.27 AGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCAAATGCATAATAAAATGCGAATCTA:1 - chr3L 6529117 3' + Quasimodo 6974 2 75.25 GACGAAGGCCTTGAGCCAAAATGTAGCAATTTGTTGTGCTTACTTCCACAAATACGACAGCGATCGGCAATATCAGTCAAGTAATAGCAAACAAAAAACAA:1 - chr3R 10511144 3' - G3 249 1 68.32 ACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCGGCTATTACTGTGCAAAAATATGAAACCAGTTTGTAAATGGACAATAACACAGAGATT:1 + chr3L 18952571 3' + Doc 4490 1 65.00 ACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTCTGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCATTTTGGCAATGTAAAATGA:1 + chr2L 13691694 3' - 1360 170 1 78.22 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCGA:1 + chr2R 20698409 3' - P-element 44 1 32.67 AGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCCTGGTCAATCGATGGAAGTGGGTTTTTGAACCTACTCTAATCAATACATCAAAATTT:1 - chr2L 14673083 3' + jockey 4635 1 60.40 TACTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAGCACTGATTAAATGGTATACGCTTTGTGTTTTCAGGTTAATCTCTTTCTTGCAATGCACTGTAGCTTTTATTA:1 - chrX 22796381 3' - Chimpo 470 1 64.36 CGATCTCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATGTAAGTCAAGCGGTATACGAGCGACA:1 + chrX 21589395 3' + Stalker4 181 4 70.30 AGTAAACAAAACACAAAGATGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAACAATATGCGCTGGCTCCTCCTCTGTCGGCCTGTCG:1 - chr2L 5300440 3' - Cr1a 200 1 65.35 CGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATTTACTGCAAAAGGGTAACAACATTGGAAAAACGAGGCGAAAAAAAAAGGAAAACACGCAGCGGAAATT:1 + chr2L 17849846 3' + accord 237 2 60.40 ACCTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAAACTAATACAACAGAGAAAATAAACAACACAAACACAAACCATAAATTGTGCTATGATTCGTTTA:1 - chrX 11059036 3' - aurora-element 4216 1 69.31 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTCCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCATAAATTAGTCAATTAGTTGATGAACGTTAAT:1 + chr2L 15997954 3' + 412 472 2 57.43 ACAAAAATGCAGCTCTCTAGCTTTATTATTTGACTTTACGCCAAAAAAAAATCTGGCTCAGTTCCTTTGTAGCGGAATTGCCAGCATTTGCCAACCTGTGG:1 + chr3L 291030 3' + transib3 2815 1 71.29 CAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGTTCGAGTATTCAAGCGGATTGGCATCTTCTAAGGTTGCTTGAGTTTCAAGAAC:1 - chr3R 4933180 3' + Bica 4874 1 57.43 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCACA:1 - chr3R 20140545 3' - jockey 20 1 69.31 CATGCNTTGGAATAGTGAGGAACGTGCCTTTGCCGCACTACTCCAGGTAGCTCAGGTAGGTTTGAGCCTCGTAGGTGTTGCATTCCCGCTGACCTCCAGTA:1 + chr3L 21843602 3' + mariner2 133 1 73.27 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGC:1 - chr2L 306478 3' - Tirant 32 2 56.44 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCGACCATCGCATTCCCATTCTATAGTGCAACCTCCTACAGT:1 + chr3L 2979006 3' - hobo 7 1 68.32 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAGATTCTGATTCTGATTCCGATTCAGATTCAGATACAGATACGTATACGAATTCCGGATCTGAATCCA:1 - chrX 11006814 3' + roo 402 1 71.29 CTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATAGACCATTTTTTTCGTCAGTGTACGCTGAGATCCGTTGGG:1 + chr2R 21092046 3' + 1731 4622 2 74.00 GCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCGATACTTTGCTACCGCAGGTGGCTGGAAGAACG:1 - chr2L 21782710 3' - jockey 471 1 67.33 TCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATTACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGACTGCCAGCGAAATATGCCAATGAATGTTT:1 - chr3L 8460329 3' - Porto1 357 1 70.30 AACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTAACCGACGACAGGTTATAAAAAAACAAGAAGGGAAGCTAG:1 - chr2L 21368794 3' + Dm88 4205 1 59.79 ATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAATTATTTCACCTTTGCGCTTTAAATCGAAACCCCT:1 + chr2R 3860924 3' - copia 235 1 72.28 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTG:1 - chrX 3697133 3' + jockey 4947 1 70.30 ATACATAGATATAAGCAATGTACATATGTGCGGGTAGCAGTTCCACAGTTTCCGCAGATTCAGGAGCAGAGTCGGGCAGCCATAATTCAAAAACAGCCCCA:1 + chrX 14518524 3' + Stalker4 276 4 65.35 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGAT:2 + chr3R 5208228 3' - hopper 17 1 62.38 CCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATCCATTTAGCTTAAGCCCTACTCCCTTTCCGAGATAAACAAAAACAACGAATCAAATGCACTTTCTTTGTAC:1 - chr2L 14670787 3' + F-element 4419 1 70.30 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGACTACTTGATCGGTGGAAACTAGCTATACAGAAGGTTAT:1 + chrX 17947369 3' - hobo 38 1 60.40 CAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCATACACCTGATTGTGGAGGGTACGTTTGCAGGTGCATAGACTTTTCTTTGAT:1 - chr3R 8391981 3' - invader2 4717 1 54.46 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTTTTGTCAGCCGGCCAAAATTGTTGGAAAACGTCAACTCTTGAAATTT:1 - chr2L 19344932 3' - 1360 28 1 55.45 ATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCTTCAGAATTTGTATTACAAATATATATAG:1 + chrX 17165316 3' - hobo 2642 1 71.29 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTCCTCTACGCACATGATATCCCCGATTAATA:1 - chr2L 18818607 3' - jockey 4721 1 68.32 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGTGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATATTAGACAGACAGAGACATAAGCAA:1 - chr3R 21010721 3' + hopper 1394 1 58.42 GAGGCNTGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGATTATTTAAATAATTTTTGTATTTATTTGGAAATACGTAGAATTGTTAATCAATTTGTAC:1 - chr3L 19960043 3' - I-element 18 1 61.39 CTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAA:1 - chr3R 1047970 3' + Stalker2 7622 2 49.50 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGTTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGAGGCCAATGGACAGCGCTTATCGCA:1 + chr3R 8712325 3' - I-element 86 1 74.26 GGCGCGTTGATCCCCTTGTGATACCTACTGGCGTGGCGGTGCACGAAAAAAGCCATAGAAAAATCGCTTGATGATTTGCGAAAGGTGGATAAGGC:1 - chr3L 6524897 3' - baggins 20 1 62.11 TGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTCTTGTACATTTATATTAGTCTTGTAAATATCTATCGATTTTAATGCGATTTCGCACACA:1 + chr2R 19975490 3' + INE-1 250 1 78.95 GGATGTTGGTTTTCAAATCTTGTAGGGCTCTAACTGGGTTTTCTTAGATTTCACGGCTTTAATTTGCTCGAAATAGAATGAAACGATTTCTTAAAGGTTTG:1 + chr2L 18868853 3' - mariner2 653 1 76.24 CTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGGAGAGTCATAAAACGGAAATTGTACACAAAATCCTTTCGGATGCTC:1 - chr3R 12806610 3' + blood 213 2 57.43 GGTAGGTCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTAGATTATGCAACCCGGCGACGGGCACGGGGCGTATGAGTAATGTCTGAGAAGCGAACCA:1 + chr3R 9947963 3' + R1A1-element 4979 1 64.36 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAACAAACAAACAATATCTATAATCGGTTTAATTCACAACTTCAACTCTAATCAACAAAAACACCTTCG:1 - chr2L 8230346 3' + jockey 4958 1 63.37 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTGTGGCAGCTGAAGCTTTATTGTTGTGA:1 + chr3R 21997432 3' - hopper 49 1 74.26 TATTTTAGTTTGTTTTGCACTTGTTTTTGTTGCTACAGCCCTGTTGACGTGGCTGCGTTTGACTAACCCAAAAGATCATAAGATAGAAACGCCTGCCAGAT:1 + chr3R 15314358 3' - gypsy2 456 2 64.36 CAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGT:1 + chr2R 21421072 3' - springer 47 2 76.24 CTACGAATATGAGATCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTCATATTCATGGTTATTTTGCTCTAGCCGGATA:1 - chr3L 18663795 3' + gypsy2 6613 2 74.26 ATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCA:1 - chr2R 981616 3' - Tc3 236 1 74.26 TACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTACAATTTTTATTTCTTTGAACAATAGAAACTTATTTGAAGAGTTTCTCCAGATATCAGCAACATTGACTTC:1 + chr2R 2498894 3' - S-element 1518 1 66.34 ATGCCGATAAGTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTCTTCAACAATTTCCTCAATTTCTTCAATAACTTCTTTCTGCGGCACTTCCTCTTCTGGA:1 + chr3L 2084465 3' - HMS-Beagle 460 1 63.37 AATCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATTCAACTCACGCGAGCATCTCCACTCCTTTAACAGTATATTTAGAACAAATGGACGGGCGATTTATTTTCG:1 - chr3R 26504320 3' - gypsy6 149 2 73.27 GCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAACTTGCTATGGTATTTTTCTTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAAGTGGGAAATTAGGAAAGGTAACGATTCCCTG:1 + chrX 21504976 3' - F-element 4464 1 69.31 AGTAGNACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGC:1 + chr3L 2978963 3' - hobo 50 1 73.27 TCATCAATTTGGATTTTGAAAGGGACACGGAACTATTGAACAGGTCCAGACTGGTGAAACACATATTACAGCCATTTTAATCGTCTAGCGAGCAGG:1 - chr3L 17155226 3' + Helena 285 1 73.96 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCATCCCTCGACGAACTCCC:1 - chr2L 16691135 3' - pogo 4 1 77.23 TATCTCGTCGGAGGATAGTAACTCATTATCGTCGCCGCCGTCAATTATAGCCTCATCGCTGGACTCCTTCAGCTGCAACACAGCAGTTGCAGAGGATTTGG:1 + chr3R 29658822 3' + TART-C 256 2 67.33 ATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTTTAACCCCCCAAAATTGCATTGTGCATTG:1 + chr3L 17950100 3' + rover 119 2 71.29 CTATGGAAAGTCGTTTGTGGTCAATATGTAAAGCCAGAAGATGGCTCTGAAGATTCCGAAAGAATGGAAAGTGAGTGGAAAGGTAGCGACGGCAACTGTAA:1 + chr2R 17893203 3' + Copia1_DM 419 1 66.34 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTG:1 - chr3L 17624173 3' + roo 9030 1 63.37 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAACGGACCAGTTCCTTGAGAGCCTTCCGGTAGACGT:1 + chr2L 1353808 3' - I-element 3 1 76.24 ATAATTTTTTGTGTAGTTTGATATGGAGATCGATTGTACTCGTCGGCAGGTTCCCAGCCAGATTGGCGCTCAAACGCCTCCTGCCGATTGGAGGCGAAATG:1 + chr3R 3853420 3' - Porto1 297 1 80.20 AAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAGTCAAGCCACGCCCTACCAACTTTTGGCTTACTACTGGCAATTTTCTCCAT:1 + chr3L 3582038 3' + 1360 3317 1 53.47 TGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGATAGCATTTTGGCTGTGGAGAAGTGGGCGGCTTCTGAGTTATACGCGTTGGGG:1 - chr3L 20419130 3' - F-element 410 1 56.44 GACGACGACAGCATCGCAAAACGGTGCGTTCAATCTTTAAATAATTGGCGCTCAACTAGTGGCACCAGGAAACATATGTAAAACGGACAATTTACTTAATT:1 - chr3R 15589554 3' + Gypsy6A_LTR 375 1 64.36 AAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTATCTAAAGACAAGTTTCTATAGACAAGTTGAATGGAACGTTGCAGTTTAAATAATACCAAAACAAGTGGAAAAA:1 - chrX 18805808 3' + INE-1 174 1 57.43 ATTTATATGATCATATTTCTATGGCTTTCACTGTCGCACATAAATACATATAATTTCTGGAGTGCGACACCCACAAACTGCCGGCCCATAAATTCATAAAA:1 + chr3L 12084551 3' - transib2 83 1 77.23 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTGTGGC:1 - chr2R 5322020 3' - 1360 47 1 75.25 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAACT:1 - chrX 19561820 3' - 412 37 2 59.41 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAACTTGTGATTTCTTTGTCCCCTGCTAGATTGA:1 - chrX 19561791 3' - 412 8 2 73.27 AAAAAAAAATGAAAAAAAAAATCTGAAAAAAAAAGAGTTGGAATTTTTGTAAGCTGGTATGGTTCACGTGGAAAACGTGAGGCGTGAGACGTGAGGAAAAA:1 + chr3R 7079653 3' - hopper 143 7 57.43 GAACTCAATGAAAATGATTGTATTCGTCGGTCAGAAGTTTACGGCCACGAATATATATCATTTAAAATTTCCAATTGGCTTGCCACTTGCAAAAACAAACA:1 - chr3R 18816713 3' - mariner2 860 1 55.45 TTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCACCTGTACGACCTTATGTATGCTC:1 - chr2L 17990798 3' + hopper 356 1 77.23 TTGTTGTGCATCTATACCGTTCTTTTTCCGTTATTTTTGTACACATATATATTTGACATAGTATACAGTTCGAACCATGTGTGTATATCTAAACGAAATA:1 + chr3L 21068463 3' + rover 7072 2 49.00 AGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTTCATTCTGCACCAAGTTTTCATTGT:1 + chr2R 6246767 3' + roo 76 2 75.25 AAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGTTGGTCTAAACAAAATCTTCAATGAAATTTTTTAAGCTGAATTTGATTGCTTTCGGAGCCAGC:1 - chr3R 13985723 3' + diver2 4776 2 66.34 CTGTGCTTGCTGGCTGCGCACGGGTTTCCCAATGCTGGTTCAGCACTTTGATATTATGTTTCAATACACGAATTTAATCGCGACTTATCTTGTTCGAGATG:1 - chr3L 23174476 3' - Gypsy6A_LTR 88 1 65.35 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGCCAAGCAATTACTCTAATGGC:1 + chr2L 11114045 3' + transib2 2793 1 61.39 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTAAAGTAATATTAAAGCCATGAATCAATTGGTTTTAATGACAATTTAA:1 + chr3R 9193661 3' - roo 8691 2 54.46 CTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTATTTTGCATTACTTTTTCGATTTCGGATTTTAATATAAATGCTTTGGTTGTAGTTGTTGTCGATTTACAATACAGAA:1 + chr3L 9156583 3' - Doc2-element 223 3 77.23 GCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATCTGTACTTGTTTTTCGACCATCCTTGCCGGAAGCT:1 + chr2R 20731551 3' - hobo 360 1 65.35 CATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTATATCCCCCACTACGGCTGTAATCCAGCCCAGCTAC:1 + chr2L 12843445 3' - roo 8645 1 72.28 AAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTC:1 - chrX 17479580 3' - I-element 57 1 74.26 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATTCATAAAT:1 - chr3L 21840286 3' - 1360 42 1 68.32 CCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAACCTCACCCCATCGTCATTCTCCCACGTTCAAAGCTGGGACCTCCATCCGCTCCGCCCAGGGAATCACTGAACAC:1 - chr3R 22695524 3' + Idefix 7020 2 61.39 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCAGCAGCAGCTCAGTTGGTCACGCACACAAATGTAG:1 + chrX 8714636 3' + P-element 2849 1 41.58 GAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTTCTCGAATTGCTACCGAGGGTTATCAGCTTTTTATGCTAAAACTGCATCCGGAAAAAGACAAAAGTAATGTGCTTCAG:1 - chr3L 22261485 3' + R1A1-element 5146 1 70.30 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAAC:1 + chr2L 1353772 3' - I-element 39 1 65.35 CAATAAGCCGCTGCAATCGTGCTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCAGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAATTGATGGCACAGAGAAGTGCCAAC:1 - chr3L 23454676 3' - rooA 7344 2 78.00 GCGCCGACACGGCCATCCTGACCATTACACGACCTCGTGCAATACTTCCAAAATATACTTTGCGATATACATAAAACATTTTTATTAACAAATTATAAAAA:1 + chr3R 15021690 3' - 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chr2R 22525774 3' - jockey 169 1 44.44 ATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATGCGTTCCATTCCAAAAGCTTCACTCGCCTTATCATCAGATATTATTTATGTCGC:1 + chr2R 5876317 3' - invader1 3662 2 58.42 TACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAAAGCAGCAAGGACAACAAAAGTGTGCCTTCCTGGTCCGCGC:1 - chr3R 32042011 3' + hopper 1383 1 58.42 TGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTTGATTCAATTCGTATATATAGAG:1 + chrX 4105673 3' + flea 49 2 77.23 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAAGGGTTTGCACAGGCAGGCAAAATGTCCTGATGAATGTCCTTTTCATTTTGTTTT:1 + chr2L 2585676 3' - hopper 14 1 40.59 AAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGCGTTCTGAATGTTTCAAGCTCCGTGGAGG:1 + chr3L 21044381 3' - 1360 40 1 67.33 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATT:1 - chr2R 8158775 3' - Juan 41 1 52.48 TGCTCGACGTTTGAGTTAAGGTGCTGGATGGCCAAAAGAAGCTGGCCAGTGCGTGAGCAGGCCCAAAGCATGGGCGTGCCGAAGAGGGGTATCGCGCTAGC:1 + chr3R 23453653 3' + R1A1-element 5046 1 74.26 TTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTACCGTTCTCGCATTCACATCCGCCTTGTAGGTGCCGGCA:1 + chr3L 12541303 3' - roo 8787 2 62.00 ATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGTCTTCAAAACGATAGGTAAGATAATTAGATAAC:1 - chr4 653852 3' + F-element 4496 1 67.33 TACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACATAACACCCACGGTACACTACACGGTATGACAAATGTAGCACAA:1 + chr3R 25795216 3' + Doc2-element 427 1 57.43 GGTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCCATGTAATTGTCGGCTCTGGCGAACCGGTA:1 + chr2L 5608846 3' - micropia 449 2 61.45 CTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGGTTAGATGGACTGGGAG:1 - chr2R 9004233 3' + jockey 4899 1 81.00 GAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATGAAAAGGAAAAATCCAGCTGCCATACTGCCAGCCATACAGCCAGCAA:1 + chr2R 17251740 3' + F-element 4395 1 54.46 TGCCAAAAGGCCAATAATCAAAATCAAATGCCCGAACGAAACGCACTGCCCGACGAGGACGAGGAGCTATAAGCCTATTTGTAGTTAACTTAGAGCGAAAT:1 - chrX 11145620 3' - 3S18 419 1 59.41 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:3 + chr3L 25232906 3' - GATE 8272 2 50.50 GGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTAAAGGAAAAATACCATAGCGTGGGTCCATGCCGCACTTAC:1 + chr3R 24458033 3' - F-element 4453 1 60.40 GTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGATCTCGGGATGTCGGGTCTTCGGGTTGAGGG:1 - chr3R 9989524 3' - Porto1 428 1 71.72 ACCCCGGATAAGGGGTGTCCAATTTCATTAATGTGCAGCTTGCACACAATTTAATATTTATAGTTGACTGACCTCGTTTCTAATTAAATGCAAATATTTCT:1 + chr3L 18416350 3' - gtwin 123 2 82.18 AATTTTTGATTTTCGAACATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGAAGTGGGCAAAAAATAATCATGGCAAGCGCTTAAGCGTAGCTT:1 - chr3L 22747739 3' - FB 148 1 69.31 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAGACCAACGCAATAATT:1 - chr3L 21908891 3' - roo 35 2 59.41 GTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAACGTAGGTGCTTCAGATGAAATCGAGCCATGAAACTTT:1 - chr3L 2693865 3' + invader4 2799 2 62.38 GGCCTGCCTCTCACACTTGTTGTTGTTTCGAATTCTTAAATCAAATCGGCAGTATTAGCAACAATTAATGAGGTTATAAAAAAAAATCCAGAGTTTTCCC:1 + chr2R 4608883 3' - 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pogo 20 1 59.41 ATACCTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGAGAACGTCGCCTGAGCTGGATTCGTGTAAATGTCGCGCCGGAAAATGTTGGGCGTCTGGGTTT:1 - chr3L 6117147 3' - Max-element 8355 1 73.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCG:1 + chr2R 5640387 3' + roo 9020 2 80.81 CAAAGATACTAAAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTCGGCGTGGCTCTATCCGTGCTGGTGACAATCGAAATGTTGAACGCAATGAACAGGTG:1 - chr2R 23929679 3' + 1360 1 2 54.00 AAATAGTGTGTAAGAGAAAGATGAGAATGTAGTGAACGCCAGCGTGTTTTCGGATTCGGCTTCTTTAATTAAACTCTAATTGCGTGATTAGTGAGAA:1 + chrX 7247260 3' + invader4 2909 2 56.70 GTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTACGGTTTTGATGCGTCCTGTGGCATC:1 + chr3L 6595642 3' - I-element 217 1 72.92 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTAGAATG:1 - chr2R 16018820 3' - I-element 17 1 61.39 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAAAGACCCAAAAG:1 + chr3R 12578202 3' - jockey 19 1 60.40 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGC:1 - chr3R 22899185 3' - P-element 39 1 38.61 AAGCTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATAGGCAAAAAACGGCAGCAAAACAAATGTGAACTATTTATTTGTGCCACTCGGCCCACAC:1 + chrX 15385302 3' - FB 97 1 60.40 CAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACAC:1 - chr3L 5691262 3' - P-element 215 1 21.78 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTATATGTTTGCGGTGCGCAAGCCAACTAATGACCCTGTATTTATATGACAGGGGAAAGTTTATAAA:1 - chr2R 19684259 3' - I-element 1 1 54.46 ATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACACTAGGATTCGGGTCGCGA:1 - chr3L 5691228 3' - P-element 181 1 55.45 GGACTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAACTTCCACTGCATCGAAAGAAGCTACATCCTCCAAAGAAACGGAGGGCGATGACAAAGGAGACGAC:1 + chr2L 15752530 3' + G5A 2559 1 55.45 GCACAACACGCACACATATACGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAACAGGCACACACACGCACAGAGTGAAAATCGAAAGATGCAG:1 - chr3L 3337529 3' + 1360 3214 1 60.40 GTACACATACCTTTTCGCTACAGACATTAATGAATAAGATCAATAATTGAGCGTGCTTGCCACAAAAGCATCTTTAGAATTTCATTGAAATTGGATTCTCA:1 - chr2L 2896524 3' - Gypsy12A_LTR 2149 1 65.35 TTTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTCAAATATCTAAATTCCGCAATATTTCTTTTCATTTGCCCTGTAATTAGTGTAAATCCCGATTTATGTTGGCCTCTATTA:1 - chr3L 13875419 3' - Doc2-element 217 4 56.44 TAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATAAGGCCGTGTTCTCCTGCGTTCCACGAGAATTGAGATTAGTATTATGTATGGTA:1 + chr2R 7745994 3' + F-element 97 1 70.00 TAAATNGTCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGAGTAGACGAACGAGATCCTCGCGGGAATCCATTTCCACATACGCA:1 - chr3L 11395145 3' + accord2 7169 1 57.30 ATAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGGTTTATGGTCTTATGGTCACACCACATAATGATGTTTTTAAACGCACTTTAATTTTTTTGATTGTATACAAA:1 - chr2L 16672946 3' - Tc3 315 1 55.45 GATCGTATTACTGGGGCGCTGGTGTGCTTTCGTAGTTTTCGGGTTCTTCTAATCAAAAAGACCTGGCACAAAAGGTTTCGGTAATACGATCCGCGGAGGGA:1 - chrX 12211137 3' - Stalker4 141 4 58.42 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGTGCGCCAACGTATATTTGCCA:1 + chr3L 7316355 3' - jockey 56 1 73.27 ACTCGAGTAGATACCATGACAGGTTGGAGCGCCACAGAAATCGGATGGCTAGCGCTCTAAGCAGACCTCGTCCACCAAGCTAGCTAATCCGCACTACAAGC:1 - 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mdg1 25 13 56.44 GAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTTGTCTGAAGTCCCAGCTACCCATTTCCATGCAGATCCCAACCAGTTTATCGAGCGATGTTTCC:1 + chr2R 2864150 3' + gypsy2 6525 2 62.38 ATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAATGCTGAAGTTATTTCCCAGGATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTGCAGTTTGATTGAA:1 - chr3R 4063912 3' - G4 85 1 67.33 CTTCTGCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCACTTTGCCCTTCGGCATTTGGAAGCAAATCACACAGATTCAGTTG:1 + chr3R 19755454 3' + F-element 272 1 54.46 CCTACATTATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAAAACAAAAACAAAACAATTATGTATATTAATTTAACAATGTAATACGCTATATG:1 - chr3R 21570893 3' + invader2 261 1 60.40 TTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGCTTTTCGCTTTTGCTTTGGAGCCGCCAAAAAAAAACACAGTTTTATGTGTGTATACTGCATTTTTAT:1 - chr2L 1648675 3' - I-element 121 1 71.00 GGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCTGGCGTAAATGTAATCTTCAGTCTTCAATTTTTGGTAATTATAAATTATTTATCCGCTTGAATG:1 - chr2L 3273834 3' - gypsy5 6950 2 54.64 ATTTTTCTGTATGCTTCTCGCTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCCGCTCCTTATGCATGCAATTTGGGGGGGATTTCGTACGGTGGAGAAAGAAGGGA:1 + chr3R 8131919 3' - invader1 3777 2 54.46 CCGACCATGGGTTTATGGCGTGATGCATTGGAGCCAGGGTAGATCCACGCTTTTCCTATTCCCTATTTTTTATAAGCTCAATATGGTGGGTAATGGCTAGG:1 - chr2R 4516703 3' + gtwin 7096 2 56.44 CATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCATTTCGATGCATATTGCATTTATATTCAGCCA:1 + chr2L 18428653 3' - Rt1a 4855 1 68.32 CAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTTTTAATAAAATTATGACACGTAAAATGACATTTGTAAAAATATTTCATCAGCATTTAAATTTAAACAATTACGATAA:1 - chr2L 17650029 3' - G4 487 1 67.33 AAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGTGATCTTCGTTGAACTTTCGCAAAGAAGAAGAGCCAACACGGTTCTTCCATCAGAGTTATGAGTTATTGGAACA:1 + chr3L 19040522 3' + accord2 7553 2 57.43 CGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTTTTTATTTCC:1 + chr3R 5775749 3' + invader4 303 2 56.00 TTTCCGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTCGCCTGCTTCTTGTTCTTCTTTCCCTGACTGTTGG:1 - chr3R 24244275 3' + 1360 3190 1 65.35 AATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGAAAATATAAATAATAAGCCCCATCGACGTCAGCAAACAAACTCAACCGACCCGGCCAATAAACAGCTTCA:1 + chr2L 9126108 3' + Stalker3T 294 1 75.25 ACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTATTACCCATGACCATTGATCCCTCCCCTCCCTTTATCAGAGACCGCTCCACACACTGCCGTTAATACGTTATTGT:1 - chr3R 29081933 3' + Porto1 478 1 77.23 TATTGAGCTAAGTCTTAGACGCTGTTCCCCACACTTGGATGGCGTAGGTCAGTGTTGGACAGGATGCTATTGAGCTCGCCCAGCTTGCCGCCCACATTGCC:1 - chrX 18860548 3' - G5A 2458 1 57.43 TTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTAAGGGTTTTTTGTGGATATATATTTTAATATTTCTAAATCCCCGGATTTTTACCATAATGCTGCCTCTGCCTTTCGTA:1 - chr3R 26573746 3' - S-element 1671 1 73.27 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAACAAATTCAAGCAGTAGCTCATCGCCCAGAATCTCATTTCTC:1 + chr3L 18957680 3' - copia 35 2 62.38 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACATGTATAAAATGTAATAATACTTAACACAATTAAATTG:1 + chrX 11205371 3' - I-element 44 1 65.35 AGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGCTTTACCCGCCCATAGAGTTGGCCTTCCTCAGCTTGTTCAAGTTCATTCCAAAGTATCTGCAATGGTTCTTT:1 - chrX 4916436 3' + Burdock 5987 1 76.24 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAAGCAAATTACCAG:1 + chr3L 12707846 3' - jockey 4768 1 67.33 TTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTTTTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAAT:1 + chr3L 19339417 3' - Tc1 38 1 55.45 GAGCCACCTCTAGAGCCACTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATACTCTCAAAATGAGCTTGGGACCTTCGGTTACCCAGTAGTCTAGTCACATTTGCTA:1 - chr3L 15218332 3' - 1360 62 1 62.38 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAGCATACTTTGTGGCTGATACTCGGGAA:1 + chr3L 947938 3' - hobo 24 1 55.45 GGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTTTGTCATAAATCGGTTGATTTTGCTAATGCTGTCCACCGAAGGTGTGGGAAAACGTT:1 - chr2L 17781506 3' - 297 6506 1 71.29 GCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCCATTGAGCCACCAAGCCATCGGGCCATC:1 + chr3R 13848693 3' - Max-element 78 2 56.79 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCG:1 + chr3R 12578166 3' - jockey 56 1 73.27 ACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGATTAGGGCACACATGTGTCCTTTGGTGTGAGTTGGAATGAGGTTGGTTTGGTTATCTTTTCCTTTGATT:1 + chr2R 17127805 3' + jockey 4761 1 72.28 TCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCACGCCCCACATCCTTCCTTCCTTCCGT:1 - chr3L 15730777 3' + F-element 254 1 74.26 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGCGCTGGCATAGTTGCTATCAAATTTCATGATCACTGCCAATCATTTAA:1 - chrX 2090205 3' - roo 8674 2 65.35 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACGTGTGCTGGTGAGGGAATGTGACCGAAACG:1 - chr2L 22586625 3' + 1360 3342 1 73.27 TTGAAGGTTTTCAATTAGCTCGAAATCCATATCTAGGATGACCGGACATCGACCATTTTTATACGTCGGTATCACTCCAGACGATTGGGACAGGCAGCGGA:1 + chr2R 2540798 3' + invader2 4648 1 71.29 GTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAA:1 - chr3R 26331638 3' - G-element 28 1 52.48 TTCCGTGGAAGTGGTGCGGAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTCAACGGAAGAACAAAAATCTACGTTTGGGCGACTACGTGTGCTAACAGCCCCAC:1 - chr4 477762 3' + R1A1-element 87 1 57.43 AGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTGGTTGCCTAGTGGAGCGGGCGGGGGTTTGCTGGCAACGTTGAGTTTTCTGCTGGCAAGGCAA:1 - chr2R 13348605 3' - I-element 410 1 65.35 ACTGACACACACACACACACACAAACGAACGCACACATACAGCGAGGGAACGTGGTGAATATGGAATATTGGGGAACTTGGGCCTGATCCCGAGACGAGGG:1 + chr3R 28410439 3' + Quasimodo 35 2 59.41 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTCCATGAAACCAATAGGATACATACTTGTGGTAAGATTA:1 - chr3R 16567722 3' - roo 12 2 62.38 AGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACCAACAATGCAGCAAGGCCAGCGGAGTTCGCAGAGTCTACTGAGCGATGATGA:1 + chr3R 16372481 3' + roo 401 1 63.41 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCC:1 - chr2L 11165354 3' - transib2 57 1 78.22 GCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAGCCACAAAACACTAGAATCAACGGCGGTGCAGCAGCAGGAAGAAGAG:1 - chr3L 17529642 3' + 1360 200 1 53.47 TGTGCGATGGTGTTAGTGCGAACTACCGTTAGGTACGTTGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACACGCAAAGTTCGTTTAAGTTAAATAAACGTTTAAACG:1 + chr3L 20688560 3' - G6 155 1 64.36 CCCCAGTCGAACCTTGGGGTCTGGGCGGTGATGCTGATGCGCGATGACTATGACGAGGATGAGAATGAGGATTGCGACTGCGATTCCGATGTGGCCGTGAA:1 + chr2L 8804256 3' - Gypsy12A_LTR 417 1 56.44 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAG:1 + chr3L 947912 3' - hobo 50 1 72.28 TGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAATATACCAAAATTATAAATATCTTTAAAAGAAATTTTCTTATCAAATAAATTCATTGAAATGATAA:1 + chr2L 15937628 3' + invader4 325 2 56.44 ACCAGAATTGGGGTTCTTATGGGATACTTGAATTTATGACTTATAGCCTAAGGCATTCTATGATTTGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGT:1 - chrY 418188 3' - Quasimodo 128 2 68.32 GCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGGCGGGAAAATATTTAATTAATATTTTCCTTGGGAT:1 + chrY 2720389 3' + Stalker4 201 4 65.35 ACACACACACACACACAAATACACATGCAGTGGCTAAGGGAAAAAAGACACAGACGCAGACACACAACG:1 + chrX 12840773 3' + accord 185 2 72.46 TTTTTNGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGCTCTCATTTTTGTCCCTTTTCCATGGGAGGAGTCGCTGAAATTATGTTATATGTGACTGGTGAG:1 - chr3R 7221399 3' - jockey 4630 1 65.35 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGTACAAAATATT:1 + chr2L 9823693 3' + hobo 2902 1 69.31 AGAGAGCCTGGAGACACCTCTAAAGCCAAGCCGAAAAAATCGTGGACCAAAAAACTTGGCAAGAAAGAGAGAGCAACATGAGTCACCCACGAAGATCAATG:1 + chrX 10546100 3' - 1360 72 1 53.47 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTGACAAATTTGTAGCAACTAGCA:1 - chr3R 16372425 3' - roo 8714 2 76.24 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACATTTTACAATATGTTTA:2 + chr3L 21840352 3' + 1360 3366 1 54.46 CATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCACACTA:1 - chrX 23291021 3' + rover 6957 2 54.46 AAAACTGTCACGCCCACTCTTTTGAAAAACTCTCGAGGCTCGACGTGCTAAAAAACGGCGCTTGCCCTCAAAATGGTCTGCATCTGCCCTTCTTTTCCCTG:1 - chr3R 5804921 3' + INE-1 245 1 78.22 CTACATTATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGAAAGCGCAAACAAAAGGCGTTTGCAAATACCAC:1 + chr2R 16328069 3' + invader2 262 1 78.00 TGGAGACGTTGCAGGTAAGTAGTTGTTGTACTTGGCCTTGAGCTAGTTGCGCCTGGGTGTGACGGGCGTCATTGTCGTCGCTCTCGGTCGGACACTCGCCT:1 - chr3R 25660390 3' - HeT-A 5693 1 69.31 ATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACGTGACGACAAAGCTGCGGGTGCCCTTCTGCTCCTCGATGA:1 + chr3R 14139455 3' + hopper 1382 1 56.44 GTTTAATTCGTTACACGTTACATTCTAACCAGTTGATCAACTGTGATTTTTGGTGGAAAGGTCCGAAATGGCTAGCAGACCCAAAAGAACTTTGGCCTCGG:1 + chr3R 19446558 3' + gypsy12 10197 2 79.21 CTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAAAAGAATTCCATGCCTTAGTTTT:1 - chr2R 11804724 3' - F-element 107 1 77.23 CATAAAATATATAAACAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGACAATGTTAATTTGCTACATAAAAATCCGAGGCCAACATGCATACCCTTAATCATATG:1 + chrX 13981333 3' + Doc3-element 81 1 63.37 CGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGC:1 - chr3R 14882098 3' + gypsy5 369 2 71.29 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAAAAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAAAGTATGCTA:1 - chr3R 13339030 3' - BS 5006 1 57.30 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATCGGTCGCCAAGGTCGATACGGG:2 - chr3R 6216776 3' - pogo 3 1 76.00 AATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAAACTTTTTTGGGCCATTTTGCTCAGAGTTTTTATTTTGTGCGGCTAAGTCGG:1 - chr3R 18780648 3' - 412 7469 2 57.43 TTTCTGTCTTTAGTTTCAAAACTCATCAGAACGCGCAAAGTCGCATAATAAATACAAATGCAAACAAAAATCGATATATATTATATACATATATGCATATA:1 - chr2L 1051590 3' + gypsy4 203 2 55.45 CTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGAGTGCGACTTGGCACTCCAAGTACTTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGAAACATCGCGTGGTCAAGCGAACTGAGT:1 - chr3R 12722297 3' + Rt1a 4855 1 36.63 ACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTAGATCACTACACGGAAAAAAATGGGAAAG:1 - chr3R 6198626 3' + R1A1-element 4945 1 71.29 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATTCATAAATTTACTAATTTGCGATTAACTAGATTGT:1 - chr3L 21840259 3' - 1360 15 1 64.36 GTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGACAATGTTTTATTAATGTTGTTTTCCTTTTAAAATGTCGAGCCTGTCAGCTGTGGATAACCTTGCTAAATAGA:1 + chr3R 31027043 3' - Chimpo 173 1 77.23 GGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGAGAAATGGGGGCTTATAGATTCGCAACCGATTTGGTGGCCACTCTCTCAATCTGAGA:1 + chr2L 16694466 3' - G-element 4229 1 57.43 GTGAAAGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAATACGCACGAAATACAGAAGAATAAAGAGTAAATAAATATAA:1 + chr2R 22859495 3' + Bica 74 1 65.35 GATCCTGGTCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCATTCTGCCTCTTACATACACACGAGTAAGGGGTAGAAAAATTGATAGAAAGGAAG:1 + chr2R 5514845 3' - INE-1 80 1 74.26 GATACACGGCAGCGCCCCTCAGTCGGTTGGATGGGTGGCCAAGTGGGTGGTGGATGGTGGGCAGCCTTTGGCTAGTGGGTGGCAGATCAGCAATTGCTGAC:1 - chr2R 14636569 3' + Cr1a 4404 1 72.28 ATATATATACATACACACATTTAATACGGGTGGCCAGCTAGCTACATTAGATACACATATCGGATGGCCCGAGCATCCGTATCTGTATCTGTGTATCTGAA:1 - chr3L 6256173 3' - 1731 97 1 72.28 ATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCTAAACCAAAGCAGTCAATGCCTGAAATATCACACTTCGTACAAAACACAAGCAGTAATT:1 + chr2L 5662877 3' + invader4 2627 1 63.37 CGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTTTATCCAAGAGCACTTA:1 - chr3R 18860332 3' - R1A1-element 5033 1 55.45 GAGGANGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTG:1 + chr3R 8480465 3' - transib2 45 1 68.32 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGAGGCAAACGAATCGGTCGTCGAAATTGTCTGATATGGAATTGCCTATTTCCGGCT:1 + chr3L 1280223 3' + hopper 1395 1 55.45 TTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATCCATTGTGTGCATGTACCGCTCACCTCTCCCCCTGCCTACTG:1 - chr3L 12326030 3' + Doc 233 1 58.42 TAGGGGAGGAGTTAACACGCGCAAGCTTCGGTTTGCTGACAACGCTGCTATGCCGGATGCCGTCGCGTCAAAGTTGAAGCCGAAACCAGAAACTCGTACGC:1 + chr3R 3194304 3' + gypsy4 6562 1 83.17 GCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATAAAAATACTTTA:1 - chr3L 19555067 3' - INE-1 149 1 79.21 CTAGGNCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTTAAACCGAAAACGGAATTGTTGAAGGCGGCCCTCGAAA:1 + chr3L 10035691 3' - jockey 4777 1 58.42 GAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCCAGGCAGACATTAACAGCAAAGGGAGATTAGAACGAGGGAAAAACATCAAAAACCATTTTATGTGCTAACGGAATA:1 + chrX 12925365 3' - Quasimodo 307 2 45.54 ATTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGATTTCGG:1 - chr2R 10158892 3' + hopper 143 8 82.35 TGAAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTCGGGCTCCAATTAACAGTGCTCTACAAGTTTTTCTGTTTTTCAGTTTCTGTTTTTTTCCC:1 + chr3L 272227 3' + aurora-element 4107 1 63.37 GTGGGTGTCCGATTTTTATGCATTTAGTTGTGAAATTTGCCAAAGTGAGGAACAATGCTCACGAAAGATAGTTTTGTGAAATTGTATTCTTTTCATTCGGT:1 - chr3L 13210022 3' + S2 322 1 82.18 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTTGGCAAGGGAGGAGCC:1 + chr2R 8463645 3' - I-element 12 1 58.89 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTCAACACCCACAACATAAATTAACGCGGTACTGCAGACTGAGGAAAAGGTAG:1 + chr2R 25207259 3' + jockey 4914 1 58.42 AGCGGAACTAATAGTGCGTCTGCAGGCCATTTCCCCAGAAATGCGTGGCGATTCACCGCCAAATAACGGATCAGCAACAGAGAGCGGGACCAGGAGCTCAA:1 + chr2R 14259470 3' + invader3 410 1 77.23 GACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTTCATATTGTTTCGGCGACTTTGGCATTCCGGGCTTCATTCCAATTCAAAGGGGAGCTTAGCTTTCAT:1 + chr2L 16116352 3' + invader2 4820 1 71.29 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTCAGTTCGTTTATTAGTGTCTCGCGGGGAAAGGTGAA:1 + chr2R 13504702 3' - flea 4792 2 66.34 GCATAAATTCAAAAAATTTTGTAAATTGTATTATGAAAGAGCAAACGAAATCCTATTTAAAAAAACCAAAGCGAATATCTTTATGCAACACTCATGAATCA:1 - chr3R 9442329 3' + transib3 29 1 65.35 ATTTTCCTTTTTTTTTTTACTTCGACTGCCATTCAAGGCCCATCGATAGCTAGGTGCCAACTGGCCCCGTAACGCGTAATTTACCCATGCCTTTGTCACCT:1 - chr2L 6780934 3' - Doc2-element 247 1 64.36 TAGAGATTCCTCGGTAATTGCTAGCATCCAGTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTCCATCGATTCGGGGATGGAGACGCGAAGGGGCGAACT:1 + chr2L 1936700 3' - Q-element 103 2 66.00 ATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCGGCGTTTTTCGATTTTCGTGCGCAAAGCCAGCC:1 + chr3R 5074049 3' - R1A1-element 5188 1 67.33 GCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGCTGGCTCTGGTGGATCTGTCGATGCTCATGATTTGTCGCTTCCAAGCTGGCCACCAAATGCAATGGACAGAAAAAACCT:1 - chr3L 3277960 3' + R1A1-element 4984 1 80.20 CTTGAACCCTGGGATAGAAAAGCTTTAAACTCGCAAACAGCTGTTTGTGCAGTCGCGTGGCAGCAGGGCGATGAGAGGTTGGGTCATTCTGGGCCACGAA:1 + chr2R 15703826 3' - X-element 261 1 66.00 GATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTCTACAGTTGGCCGTTGGGTTCGCATCGAAGGCATCACC:1 + chr3R 4815555 3' - mariner2 766 1 62.38 ATAGTACATATGTATGTATGTACGTATAAACGTTTGTGCCTGTAAGTGTGTGTGAGTGTGTTGGTGTTTTGAGAGGGACCATTGCGGTTTTGCAAGCATC:1 - chr3R 28257569 3' - 1731 4393 1 66.00 TATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGGTTTTCGGTGTTTCCCG:1 - chrX 17049547 3' - Stalker2 22 2 50.55 GACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAATCAACCGCTAGTAAATGGTAGCGTACTA:1 + chrX 4240923 3' + jockey 4589 1 72.28 TTCTCACCATCAAACGGCTTAATATTACGTTTAGCCTTGTCCATTTTTCACTTTTTCAAGAGTCGTCCTCCTAATCCTAACGCTTTTCCAGACCTTTCAAT:1 - chr3L 19303029 3' - copia 454 1 58.42 AACGAAGTCTGGTCGTGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAAGAACGGCAGACAGTTAGCCGGGCATGTTTGCCAAACAATCATTAGAGACG:1 - chr3L 2025606 3' + invader1 115 2 56.44 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTATGCATGGCTAAAGCTGGAAACTGAGAACTGAAAAGTCGGTAGAAAACAGCCTGCCCTAAGTTAAAG:1 + chr2R 21200779 3' - Quasimodo 55 2 75.25 GTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCAAAGTGCCTGTGCCCAAGAAGTGCAGTGGAATCGGATGTGTGGAC:1 - chr3R 10139545 3' + Cr1a 388 1 58.42 CAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCCAGACGCGCAACGAAACAGCCAGACCATCCA:1 + chr3R 21815375 3' + Doc 4355 1 69.31 ATTTTTTTTGTGACTGATATTTTAATGCTGCTTTAATTTTTGTTTGGCTTTTTGTGCTTTCGCCTTTCTGTTGCCCTTATTTACACCCAAGTTGCATGTTG:1 + chrX 20106510 3' + transib4 40 1 71.29 CTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCAACCTGCAACAACATCCAGCATCCAACTGACGAACAGCAGCCAGCCACATCCACAGATATCAATCATATTTGAGAT:1 - chr3L 10396511 3' + F-element 390 1 77.23 AGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGGAATGGCTGGGCCCAAATGAAATGGAGCACGTAGATCGACTTTTGCACC:1 + chr2R 20394905 3' - rover 151 2 55.45 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCG:1 - chr2L 22407458 3' + roo 9047 1 52.48 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGAACAGAATTGATAGCATTCTGCTACAATTTGTTTAGAACTGTGAGGTTCTT:1 - chr2R 9618049 3' + roo 386 2 53.47 ATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTTTTGTTAAATATGTCTTGTTCGGTTTATACGATACTTCTGACGCAAATCGCTAAAGTCCATCTTGGGG:1 + chr3R 10019195 3' - I-element 5111 1 61.39 TCATCCGCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTT:1 + chr2L 7945391 3' + Ivk 5040 1 62.38 GTCGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTCACTCAGCTGGAAAAGTGAAAGATTTCAACATTTTCTGTAATATCGGTGGAAAATGAAAAAAATATTAAAAT:1 + chr3L 24303737 3' - INE-1 561 1 73.27 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCGACCATCGCATTCCCATTCTATAGTGCAA:1 + chr3L 2978995 3' - hobo 18 1 57.43 TGGAATGCGAAGAGTCGCACTCCGACATATATGTATGTATAAGATGCGTGCACTTCCGTTTCCCGTTCCCCCGAATTTTTCCGGCTCAAACCACAGAGCTT:1 + chr2R 21035049 3' - invader4 2765 2 53.47 ACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAACCCGTATAATATTAGCTGCTGTTCGCGTGTTTAACTTTGTTTCGTTACGTTTATTGTATATTTATTAGCGT:1 + chr3R 5086377 3' - McClintock 6095 2 77.23 AAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCTGGCGTGCTCCAAATATGGCTGATATATTGGCCATGACCTCCTGGTCACCATGCGTTTGTAGCA:1 + chr2R 15370561 3' + Quasimodo 7014 2 78.22 AGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTTATCCACAATTTATATCGCAGTCATCTCATCTGTTACCCAAGTGCTACCCCCAATTGC:1 - chr2L 19713382 3' - 17.6 118 2 60.40 CAATATAGGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTCTTTTTCTTTGCTTTAGTCTTATTGGTCTGCTCA:1 + chr2R 18679775 3' - blood 7379 2 70.00 CGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACCGCTCGTGTACATGTTCACATTGAAGGGTTCGTGGTAGAGGCTGTTCTTGCCAATCGAGTCGTTGTCGTCCAC:1 - chr2L 6207543 3' - 1360 2981 1 74.26 AAAAAAAGGATAATAAAAAACGTTTGTTTTATGTAAGCAAAAAGCCAAACTTCTTCTCAGTCTTTAGCCTTAATTGTTAGAGATTTTACATATGCATGAAC:1 - chr3L 12468673 3' + Doc2-element 255 1 65.35 GTTTTCGTTGCGGTCGTGGACAAATTGCGATAGTCCTTCAGCAGGCGCTTCCGCTCCTTTTTCTCTTCGGGGGTCTCGTCCTTGGGTCTAATGGACAGAAC:1 + chr2R 10837279 3' + R1A1-element 8 1 74.26 GCGACCAGAATACGTTCGGCAGAAGAGAACCGTTACTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAAGGCTTTTGGCTTTTTTAGTTTCGATAGAGTTTGTAAGT:1 - chr3R 24703986 3' - invader1 3718 2 61.39 AGGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTTCGCCGGCTACTCTTCCTCGCTGCGGCTTATCACTTATCAGCTGTGAT:1 - chr3L 17238418 3' - Doc2-element 453 1 53.47 TGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGAACAGACGCTCGCGTCCAAAGTCTCCGCCGTACTTCTCAATCATTGTCAGGGC:1 + chr2L 1866824 3' + jockey 4578 1 56.44 AAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGGGAAAGCAATCCCAACCAAGTCCGGCCCATATGGCAAAAGATATGGAGCTTCTTATCA:1 + chrX 4565493 3' + hobo 279 1 66.34 CGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGACTATTAATGCTAGAATTTTGAGAATCAGCATACACAAACAGGGACAATAGATTACAATATCCTGCGGCG:1 - chr2L 3607393 3' + INE-1 128 1 70.30 GTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATAGACCATTTTTTTCGTCAGTGTACGCTGAGATC:1 + chr2R 21092039 3' + 1731 302 1 66.34 GCATCACATCCTGCTCACCGATGAATTACTTTGACTGGCAAGAAGGGCGGTGGCTTCGCTACCGTCTCGTCGGCCTACAAGGAGCAGTTGAACAGCTT:1 + chr2L 16777229 3' + Rt1a 4888 1 64.29 TGCACACACACACACACACACACACACGCACATACACTCACTTACCGACAACGACAGCTTGTTGTCACATTTACAATATCCTTCAGAGTTTATTCAAGCAC:1 - chr2L 6170487 3' + accord 182 2 79.21 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTTTCCTTGTACGCTAGCCCAAAATTTGACATATAAAATTCAACTTTTGGGTGGAATTTTTGAGTCC:2 - chr3R 11097490 3' + mdg1 7450 2 65.35 AACTCATAGCGGCCACTCCAACGGGTAGTGTTTGCCGGCTATGCACGGGCTTCCGGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTTCCACTCCCTCTTTGTTCTTGCG:1 + chrX 19041175 3' - gypsy6 116 2 77.23 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTTCCTTCAGCCATCTATGTAGTTATATGTTTGAG:1 + chr3L 13888716 3' - copia 4876 2 70.30 CATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTCGGAATCGTAATTGGCCACTTGGCCG:1 - chr3L 12287240 3' - HMS-Beagle 6673 1 74.26 CTATTGATCCTGATCAAGAATGGAATGGAATGGAAAAGAATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTGGGTTCCTTTCGCTGGCACAACGGCAACAGGCG:1 - chr2R 21190453 3' - INE-1 85 1 67.33 AATAAATAATAAATAATAATAATTTCTTTCCAATATAATGCGTCATTAGTGTTGCGTGATAACTAAACGGCTATTTATTGAAAAAACAAATGGTTACAAAA:1 + chr3L 17620155 3' + flea 4999 2 68.32 AATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATTGTAAACGTTGTTGGGTCGCAATGAGTCGCTGTTGTTACCTCAGGCGGAAGTGGCTTTGACAACA:1 - chrX 8885325 3' - accord 184 2 72.28 CTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACATTACGTGTACAATTCAAAACTTGAACAATAATTTTGACGCATTCGACTTTAGCGATTGG:1 + chr2L 11158081 3' + Transpac 310 1 67.01 GGTGTCCAATTGCTGTTGCTGACCGTTCGTAGCGCAGAGCGCTGAACTCCGTTGGGGCACGTCAGCATTGCTTATATGTGGCCAGCCCCCGAAAGACCCCG:1 - chr3L 14466474 3' - gtwin 7026 2 78.22 AGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATTTTGTTAAATTTGCTGAGATGCTTAAAATTCCGTTGACATGGTTACAAGTCCTATAAGACGAAGACCT:1 + chr3R 10735058 3' + invader4 121 2 71.29 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTCCGTAGCACACTTTTCCGACGCCCCTCTTCAGCTGGCTTACATCTGTGA:1 + chr3R 19535789 3' - hobo 1 1 78.22 TAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGGGGAAATCAAATATTCCATCGATGAATTTTGATGAATTTATAGAA:1 - chr2L 11113970 3' - transib2 27 1 53.47 CACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCACTAATGCTGACAGTTGAGTGCGACACAGTACATATAAATTTAAGAAAATTTAAATCCA:1 + chr3R 5435842 3' - invader4 229 2 65.35 CATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCCTGCTTAAGCCTCACCCCAAAATAAAAAAAAAACACTGATCGTTTTTGTTTATCAACTTTTACCACGCGCCAA:1 - chr2R 13542771 3' + Idefix 194 1 50.00 ACAGCCACCCGCACATGACGCGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCCTCCAGTTTGGATTTGCCATCAAGTTCATCGGCGTCACTCTCAGAT:1 - chr2R 17553608 3' - Stalker3T 243 1 54.46 CTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAACGATCCCAGAAAAGCTGTACAAAACCACCAACCAGTAACGACAGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 7607916 3' - R1A1-element 222 1 50.50 AAGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATTCTCGAGGATCATATAACAATCATATTCTTATCTGGTATTTGGATACATCATACGAACGAAAAA:1 + chr2R 14512283 3' - Idefix 184 1 82.18 CTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGAC:1 + chr3R 24729643 3' - Juan 4116 1 62.38 CGGCAAAAAGACCAAGACAAGCGCCGACTCTCTTCGCAGCGGAAAAACACCAAACTAATCATGGGCATGCCTCAGTACGACGAGGAGACCGGCACGCCCG:1 - chr2R 10326514 3' + Doc3-element 248 1 54.00 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCG:1 + chr3L 19051907 3' + roo 9038 1 56.00 TTGGGACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTGTTCTTTTGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGTTCGCGGGTAGGAGCGGGGGAAAGAAAGTTCGCGACA:1 - chr2L 8430147 3' + invader1 3652 2 72.28 CTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATTGCAAACAAAGTGAAAGTGTTTAAAAACAAAAAAAGGGTAACCACGACCTTGAAGTCTCTTTAA:1 - chr3R 17900357 3' + F-element 4638 1 61.39 ATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGTACTTAAGTTAGCCAATTTGGAGGCCATGCAGTCACCGCATTTTCCCCTAATTTTCCATTTTTCTCTGGTC:1 - chr3R 19519741 3' + F-element 4404 1 74.26 TCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTGACAAATTTGTAGCAACTAGCAGCTAGCAGACGAGTTCGCAGAGTCTACTGAGCGATGATGATCACGTTCGCGT:1 + chr3R 16372493 3' - roo 8662 1 42.57 TAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAGCCTTAGCAGTGACTACCACCAATAATCTGGTCTAAGGCGGGACAAATTGTGCGGGGAGCCACCTCCTCGG:1 - chr2R 23169713 3' - R1A1-element 265 1 53.47 ATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTA:1 + chr2R 5532329 3' - G4 3784 1 65.35 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGGTTTCATGAATGCATTAGCAAGGTACAAATCTTCGGAGGATAAC:1 + chr2R 10029483 3' + roo 9040 1 58.42 GTATGTAACAGGCAGAAGGAACCGAATAAGTATATATTCTTCAATCTGGAGAAGTATCTAGATCACGAACAACGAGATCCGTTTGCCTCACAGCGTGACGA:1 + chr3R 19898386 3' + INE-1 28 1 64.36 ATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGAAGGACGAGATGGTGCAGATGCGCACCAAG:1 + chr3R 24124426 3' - Tirant 8312 2 70.30 CCCGCAGGTTATAATTTTACAACAACACGAACCTTTCACGACTTTACTAGGCCATGAGCTCCGGACCCTACTACCTAATGCGACTAAACATCATCGTTGTG:1 - chr2L 6384058 3' - Gypsy12A_LTR 311 1 58.42 GACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACCCCACCGAAAGCACCACCACCCAACTGGCACCCTAC:1 - chr3L 8700498 3' + baggins 5366 1 63.92 AGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTACACAGGCCCACTCTTTTCTCGGCTCTGTCAAACTAT:1 - chr2R 9340318 3' - Quasimodo 333 2 64.36 GAAGANAAGATGATGAAGATCAATGTAACGACGATAAGCTGGGCGAACAGCAGAACGATAAACAAAGGTGTAAGTACGAGAGTACTAGAGCGAGCGAG:1 - chr2R 4559317 3' - Ivk 105 1 57.14 GAACCGAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAAAAACTCTTTCGAAAGAGTTTTTACTTTCTTTGGATTGGATTTATCTTTGAGTCAGCAGTCAAATCG:1 - chrX 6303595 3' + I-element 247 1 50.50 AGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTAACTCAACATGCCGTCCTGAAGGTGGTGCCCGAGAAGCATCTGGAGCACTTCGTAAGTGACGCATTACGTCTT:1 + chr3L 19537105 3' + Cr1a 4432 1 76.24 AACAAGATGCTTAACGCCATACGATTTTTATGCACACGATTTTTGATCGATTGACACCCCAACGAGGTGGCTGACCTGG:1 - chr3R 30243904 3' + 1360 16 1 73.42 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGGATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATG:1 + chrY 2720354 3' - opus 6 2 71.29 TCTCTACTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATACGTACATATTTATGTATGTATGTACTTTTGCCAGGACTGGTTTGTAAAGAAATC:1 + chr3R 23723189 3' + Transpac 293 2 63.37 TTATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGATCCAGTTAATCCTTGTTTGTTTCTTTTCTTTCTCAGTAT:1 - chrX 6525720 3' - Doc2-element 4681 1 60.40 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTAT:1 - chr3R 22675830 3' + 412 438 2 81.19 CTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCACATACGTTCCACACCAACTGGTACCGACTCATCTTCACCGTT:1 + chr3L 7533044 3' + F-element 457 1 60.40 TGCCGTATATAATAATAATAAAAAAAAAAAGCCAAACTAGAGTATGGTTTGTTTCTGTACGGCCATGCTCCCTCCCCATTTAAGTTTCGTGTGTCTTTACA:1 - chr2L 8422143 3' + Rt1a 5065 1 68.32 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTTTGTTATACGCGTCGGCGCATGTAAACTGGTTTTGGTATAACA:1 + chrX 9599950 3' + P-element 2834 1 45.54 GGTGCGGGAGCATAACTTCTTTTTTATTTACCTTTTGCTCCATTCTCATCTGGTTTCTTTCTTGATCGAAACCACTGACTATTTCTTCCTCCAGCAATGGT:1 - chr2R 3288099 3' + mariner2 4 1 63.37 CAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGCCGGAGCTACAGAAAGAGACGGGAAAGTTGAAAGGAAAGAGACAAAAATAGGTGAAGGAAAAGGGACAGTAGA:1 - chr3L 14287653 3' + invader2 498 1 69.31 TGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGAATTCTCTCTTGTTTTTGCTTTAATTTTATGATAAATGTTAAACCATTTGTAATAAGACAATATTTTTGACAAAGA:1 + chrX 15408937 3' + INE-1 563 1 92.08 CTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAGTACATCGTTCTGCCAATCTGCTAATCTTGCGCCAGCGGTCCGAGCACTATGACGACGGAATCGCGAATG:1 - chr3L 8398208 3' + Doc 440 1 75.25 AAAACATGTTCAGTGGCGTTTTGATCGCACGGCATTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGGCCTTTGTTTTATTTAGGATTCTTGTTATTATAATTT:1 - chr3L 16844524 3' - G4 497 1 69.31 CAGTAGCGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCAATTATTTGACAGGTTTCCTTAACGCCAATCCCAATCCACATGCCCATGCCAGAGTGGCCAACTACGGG:1 + chr3R 20212768 3' + gypsy4 6627 2 64.36 AAAAAGTAGAATGTAATGAAATAATTCTTGAATATGTACCCACTGATAAAAATGTTGCAGATGACATGACAAATTTCGCTGAGCTGCAGTCAAAGTTGAAG:1 + chrX 21275424 3' + Copia1_DM 4161 1 62.38 GGACTATTTACGTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGTATAATGAATTCGAGATATAAATTTTAATGGTTTTTGCTGCGTTGGCCAATACTTT:1 - chr2L 11442642 3' + roo 8949 2 67.33 CAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCA:1 - chr3R 15072563 3' + pogo 2088 1 60.64 TATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATAC:1 + chr4 716978 3' - INE-1 171 1 76.24 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCCTATATTGGTTTATTACATCTATTTTGCCATTGGTAGCACGATCCCATGGAGCTAAGCAGCGCAAAG:1 + chr3R 9996457 3' + blood 347 2 56.44 ACCACATTTCTGGGTAAACACAAGCGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCGGTTTCGTCCTTTCTTTATTGTCCTGCGATTTCTCACTG:1 - chr3R 2533712 3' + HMS-Beagle2 6926 2 61.39 TTTAACGTATGTAGTTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTCTGTGTTGTTTATACTTGCAAACGTTAACACCTGATTCTTGCATAATCCCGTCGAGCAATT:1 + chr2L 22322366 3' + transib2 300 1 54.46 AGTGAACACCAGAATTTCTGCCTATTAAGAAATTAAAAGAAAAAGAAATCTTTTTAAACAAATATTTTGTATATATTGCACACTAATGTACCTATGAATAC:1 + chrX 22676786 3' + HB 1439 1 76.24 AAAGAAAAAAAAACAAAAAGAAACAACGATGAGTAGGAAAAAACAAAAGAAAAGCAGAACGCAGTGGGATTCCAGCATGCACTTTGGACAACATATTAGA:1 - chrX 4963809 3' + Doc2-element 225 2 58.00 TGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGATTTATTTATGTACTTTTGACTTAAAAACAAAGCCAAACGATGTCCTTTCTAGCGCAAACTATGC:1 - chr3L 19254955 3' + pogo 241 1 66.34 ACATGGAGCTCCAGTAATGATTCCATGAATCTGTTAACTATGTCCGTATTTCTCGCAGTGCGAGTGCTGCTGCTGCTCCTTCGTCTGCGGCCAAATCATGT:1 - chr3R 13797343 3' - Doc3-element 4404 1 76.24 GGTGGAATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAATAGTAACGCCTCAATAGGTTCAATACCGAAAAGGTTCCACACCCA:1 + chr3L 5827978 3' + blood 375 2 76.24 GACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGATTTCAGCCAGTGATTGCATTATAAATTAAAATACGTCAACGCAGCGAATCAAC:1 + chr2L 2258316 3' + HMS-Beagle2 112 2 59.00 TCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTGCCTCTGATTGGAGACCCGACTT:1 + chr3R 13218663 3' + 412 170 2 77.23 GACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAAAACAAGTTGAAGTCGAGCAGCAGGAAATTAAGCCAGGCCAAGA:1 + chrX 2963777 3' - R1A1-element 5212 1 58.42 AAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAAGCGTGCTGAATGACTATATACATGGTTTCTCATTTATTTAGTCGCT:1 + chr2L 19912786 3' + roo 226 2 53.47 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGC:1 + chr2R 18865890 3' + roo 356 2 78.22 ATGTAAACAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTGTACAGGGTGTCCAAGCTGCAATGAGTACGAGTGTGTCTGGACCTTGTGAAATTGAAAGACCGAACA:1 - chr3L 10053822 3' - 3S18 5803 2 56.44 CCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACCCAACCAACCACCTAGCCACCCACTTTCACCCACATTTCTCACTTTTCTCCGCACGGAGCACAGATGTGT:1 + chr3L 11896689 3' + Tirant 8132 2 72.28 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCG:1 - chr3R 22899179 3' - P-element 24 1 48.91 GATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGTCGAACTACACGCCATGCCAGGCAGCCTGCTAAATAGTAGATGACATTTCTCTCTAGAACTGTTA:1 + chr2R 4581202 3' + Chouto 5928 1 64.36 TAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTCAGATCAGGACTCTGAGGGGGCGTATAGATCACTTTACCACAGTTAGGAGAGCAAAATAATACCTCGACTA:1 - chr3L 23580386 3' - S-element 1249 1 75.25 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTGTGTATCTGTGAGATACTGCCTTTCCCAGCGGCAAAACTTTCGTACGCACCGACACGCAGGTGCTTCGCCCCTCGC:1 + chr2R 17833721 3' - accord 7030 2 77.23 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTG:1 - chr3R 12780292 3' - BS 5021 1 49.50 TTATAGATTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTTTTGCAATTAGTTTTTGCCTCGGGCCAATGGCAAAA:1 + chr3R 28445596 3' - I-element 241 1 62.38 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTTTAATTAGCCTACAATGCTAGAGGGCCACGTTACACTATTGGGG:1 + chr2R 8557899 3' + hobo 2929 1 55.84 TTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGATCGGGAATATCTGGTACCGAGCACGGTATCTCTCGTCCCCATGTGGCCGTGTCAATCAGCCCGTCGC:1 - chr2L 376667 3' + Max-element 8114 1 69.31 GTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTCTGTATACGGATATATGATATGCCGCCCAATGTGA:1 - chrX 5151931 3' - Quasimodo 35 2 72.28 TTCGGAGCTCGATGAAAACACGTCTGTCCATCTTGCAGCTATCTTAATTTCCCCCATCCGACTGCCTCTGTGGATTGTTAATTATGACGGCCATTGGCAGG:1 + chr3L 10470127 3' - Doc2-element 27 2 60.40 CTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTATTATTTCGAACAGAGGGTCAGCATTTACATCGCAAGGCTTTGTGAAATATAAT:1 + chr3L 24156921 3' - BS3 196 1 61.39 TGTTTCTGCCGAACGTAGTCTCTCGAGAGCGAGAGAGAGATATTCCCGTTAAGAATGGGACTAGCAGGTGTACGGGGTTGGGGGTCTGGAAAAGCTGTTAT:1 - chr3L 22242944 3' + invader1 3713 2 65.35 CGTTCNCTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCTGTGGATGCTGATGTTGGACCAACGGACATGGCGAC:1 - chr2R 9378446 3' - F-element 65 1 63.37 AAGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGCAAAAATCTAAAACCCAACATCGCGACCACAACCGCAACAAGCCGTCAAGCGG:1 - chr2R 10915228 3' + Quasimodo 101 2 56.44 CGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATAATAAAATATTATTTTACAACTGTTTAGTTAACCCCCGCC:1 + chrX 14625543 3' + invader4 3050 2 69.31 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCATTTTAATACGCTTAAGTGCACGGCGAGTCCCTAAAACTATGC:1 + chr2R 13314175 3' - jockey 35 1 59.38 GGTGGGGGCTTAGCAGAATCACTTGCGCTGTCTTCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCATTTTTTTGTTTCGTTATCGCTGAATGCTGCT:1 - chr2L 5148349 3' - G4 150 1 67.33 GAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGCAGATCCCTTCAGTGAAGTTGGACTGTTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGTTTAATGAGGCTAATAAAGTG:1 - chrX 10295254 3' + invader4 207 2 79.21 ATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGCTTGCGATATGCGTCAGTGTCGTGGGGAGTTTTTAGCA:1 + chr3R 25319741 3' + invader1 3843 2 63.37 TCTGCNCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGTTGCAGAGAATCATCTGATTTAAATGTACATAGAAACCCAAATGAATTTTCGGAATTC:1 + chr2R 11540283 3' + Transpac 295 2 62.38 TGACGACGAACGACACACGAAGTTATACTTCGGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCAAGATTCGAGATTATTAAGCTTTGAATGTAACTTTTTTTTT:1 - chr2R 19242657 3' + Chouto 33 1 66.34 GAGTGGATTGCGCATGGACATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGGTCAGTTTTAGAAAGTCTTGTTC:1 - chr3R 24719105 3' - Quasimodo 409 2 76.24 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCA:1 - chr2L 6177184 3' - pogo 49 1 79.21 GGCATAAAAGAAAAAAAAAAACGAACCAAAAGAAAGCCAACCAACGCTAACAAAGAAACTCAAGCTATTGGACTCGTAAA:1 + chr2L 14519328 3' + Doc 4586 1 66.25 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGCGAAATGGGGCCAC:1 + chr3R 4807843 3' + P-element 2867 1 57.29 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGTGAAATGAATATTCATCCTCCTAGTCTCGAATC:1 - chr3R 22675780 3' + 412 7541 2 71.29 AAAACTTCAAAATTAAAAAATTGACAATTTTCTGGCCAAATTCAATATATAGCACTTACATTATCATTAAGCTTCAAAACACTTCCTGGGGTACTACCGCT:1 - chr4 259563 3' + 1360 3023 1 62.38 TACCGGCTTGCTCAGGGAAAATATACAACAAAAAATAGGCAAATGGCCCTTGCCATAATTATTTGTAAATATTTTATCCATAAGCAAAGTATACTCTCTTT:1 - chr3L 5242566 3' - Circe 7374 1 47.52 TGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACTCACACACACACACACACACACACAGAG:1 + chrX 7978952 3' + accord 48 2 69.23 TAGCGGTTCTGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCATTTTTGACCGCTGCCCGATGCCCATTGAGTGCATACAAATTTTT:1 + chr3R 14443959 3' - opus 7335 2 56.44 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACTTGCAAATCCTGTAAATAATTTGGGATGTTCAAA:1 + chr3R 28012567 3' - diver 45 2 68.32 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTGGAGGAACTGGTGGGCAAATTTTGGTAGACAGAAACCATTGCT:1 + chr2L 22227385 3' - F-element 15 1 73.27 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGTTGGATGAGGTGCATCTGC:1 - chr3L 17624145 3' + roo 395 1 65.35 CGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGCACGCGAAGGAAACGCAGATTAAAACTGCGAGTGGATATGACGAAACCCATTTCCCCAGTCATATTTGACAA:1 + chr2R 8797434 3' + hobo 2936 1 70.30 AGATCGGCGTTCGTCACGGCCATCTCCATCATGGCCATTTCTTGTCTTTGCGGTTCTCGTTGTTCACAGAGTATGATGTCAACTTGTGACAGCTGCTACCC:1 - chr3L 5297166 3' + gypsy12 428 2 79.21 CAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTACCCATATGCCCACTCGTCTGTTTTGTGTGTTGACTAACAATCGTTTTGTGCTCTCTTCCCCA:1 + chrX 12288849 3' + HMS-Beagle 6661 1 64.36 TTTTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTTTAAAGATACCATCTAACCTCGGATGGCATGCACGATTAAAAAATGCCAACGCAGGAGGTGCTGGAGTTGGG:1 + chr3R 28490904 3' - 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accord 6965 2 73.27 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTC:1 + chr2R 5640403 3' + roo 9034 1 65.35 AACAGGTACCCGTTACTCAGCTTGTGGGGATTGGTAAATTTAAATTTAAAAGGTTTTTGCACTAGACGATTAAGCGAAAAGAGAGCATTTTATACACGAAT:1 - chr3R 4699118 3' - INE-1 545 1 69.31 GTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACATATTGAAGATGAGGCCCAGATGGATTTGCCGCCGCCGCCGCAGTTCGCCGAGGATCCCATTGATTCCGGGCGGC:1 - chrX 11131669 3' - Circe 7256 2 48.51 TTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCCCGTCACCTAACCCACTGGCAACCACCCATCCAGCTGGATCCACCAGTTCCTCCC:1 + chr2R 7616922 3' + F-element 343 1 59.41 TGTGTGTGTCTGTTTATGTGCGTGTGTGTATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGGGGAGGGGGGGGAATGTTTCATTTTGGGGGGTTGTTGCACATATATTTACT:1 - chrX 18562607 3' + Stalker 445 1 73.27 CCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCTTCCCTTCGCTGCGAGTGTGTTTTTGGCCGTGCCAACTGTTTG:1 - chr2R 12493399 3' + Doc 336 1 60.40 AAGTCTTTAAATATATTCTTGTTCATGTGTGAACAGGGTCATGAGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATAACAC:1 + chr2L 10635318 3' - roo 14 2 55.81 TCATTAAATTTATTGATGATATTATGGGATTCGAAGGTCGTTGGGCGGGGGTCTGATGGGGTGGTCGTATTCAAATTATATCATTGGCAAAGTCAATTGTT:1 + chr3L 22050196 3' + hopper 335 1 73.27 CAGAATTTGGTAGATCGTCTAAATCGGCTGGGGTATGGGTATGGGTATGTATACAGCAAACATTTAGTTGCAGTTGAATTTGCGCGGCATCATTAGGAAAA:1 - 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gypsy4 48 2 65.35 GTTATTGTTATTATTATTATTATTACTTTTATTTGTATTATATTGCTGCTATTATAGATTAAGTGAATGAATTGACTACTCAATCGGAATGGGTGCAGGAA:1 - chrX 5585498 3' - mdg1 7059 2 59.41 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCTTGCCTC:1 - chr2L 22407449 3' + roo 9060 1 63.92 AAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAACTTGGTGGCACCGAGAACCTATGCTTGATGGTCGAGGAGATGGGCGGTCTAGACAAGCT:1 + chr2L 10059265 3' - diver2 4780 2 61.39 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAGCATACTTTGTGGCTGATACTCGGGAAGGATCTCTCGTTA:1 + chr3L 947951 3' - hobo 11 1 68.32 GGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGGGATTGCTAGCTTCATCTACGTTCGGAAATGGGAAAAGGATTAAAGGGAAAGCATTAGTA:1 + chr3R 28610542 3' + hopper 470 1 67.33 CTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCTTGAACTTATGTGTGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGTTTTTTATTCTGTAATTGATCT:1 + chr3L 25336972 3' - 1360 215 1 75.76 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGC:1 + chr2L 12843403 3' - roo 28 2 53.47 TCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCTAAGTCGGGAGCAGGCACAGCTGTCTCTATTTCGTTTTCCACTTTTTCGTCATCGTGATT:1 - 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X-element 4399 1 58.42 ATAGTCGAGAAACTCGATTATAGCCTTCTCTCTTGTTTATAAGTCCGTTTCTGCCATCATCAGTTTTTGCCTAGCAATTGGGCGGTAAGTTCAAAGCGCGC:1 + chr3R 4782512 3' + INE-1 565 1 66.34 GAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGCGGGTGAGCGTAACTTTCAGTCCCCGACTGGCTTTGGACTTGCCCAAAATTAAACCGGATT:1 + chr2R 14462826 3' - GATE 50 3 54.46 ATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGAAGAAGTGCTATGAGGAGATCAAATACCTTCCCGATGATAGCGACGATATCAGTGTGT:1 + chr2L 5267846 3' - Tirant 96 2 62.38 ACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGTGAAATGTGATTTATTTTAAAATTG:1 + chrX 22732353 3' + hobo 243 1 75.25 ACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAGTAAGTGACAAATTTTCTTGGCTAGCACCCTTTTTTGATTATTCGTAGCAATCATTGCCGTCTGTCTGG:1 + chr2L 7768963 3' + Ivk 457 1 57.14 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTTGCCTGGTTGT:1 - chrX 17692569 3' - 3S18 16 2 63.37 TTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGTCTACAGTATTGTAACTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCAAGCCCAAAACAGCATTGAAATCC:1 + chr3R 21993407 3' + Circe 7294 1 74.49 AAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGAATTCAGATTTTAGCGTTGCACCTAACGCAAGTCTGTTACCCCATTTAGATAACCTAAGCTCAACACCAACGTTAAC:1 + chr3R 31035030 3' + INE-1 165 1 68.32 TTTTATGAAATGAATCGTGCTGTGTGGCCTTACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAATGAAGATTTAAGCTGGCCGCAGAAAATTAAT:1 - 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F-element 4449 1 64.36 GGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGATTTATGTCACGGTGGTTTTGGTCTGTGTTTTGGATTTCCGATAAGGCAGA:1 - chr3R 30613081 3' - 17.6 40 2 56.44 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCT:2 - chr2L 9823641 3' - hobo 41 1 62.38 CTCACNACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCTTCCTTCCTGTCCTGTTGTTACCGGCTGCCCAACTCGCAAGCGCGAGCTTCTGCTTTTTTT:1 + chr3L 22221408 3' + Doc2-element 470 1 70.30 TTACAGATAATAGGATAAAGTCTATATCTGTAAGTATGTATAAGTATGTATGTTCTGAAACTGACCCATTTCAGGGTCGGAAATTGCACCGATAGTGAAGG:1 + chr2R 22128699 3' - Cr1a 4215 1 66.34 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTAAATATATTTTATGGTTATCGTAGTAGCACTATGGAAATTAATATAAAGAAAATCACAAATTGGTCG:1 - chr3L 12596549 3' + flea 4998 2 62.38 AAAAAAAAAACGAAAACGAAAACCAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCTGTATTAGTGTATCTATTTCATGCAAATGGATAAGTGTATATGTATC:1 + chrX 8048736 3' + Doc2-element 233 1 53.00 CCTAAAGTCTAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCGAGGCGGCCATCAATCAGATGCGTGAGGGGTTCCATTGGAGGTGGGGTAGTGGAAAACCTTTG:1 + chr2L 1465992 3' + Idefix 7217 2 58.42 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGAAAGTAGAATAAACGGCTATAA:1 + chr2L 22407513 3' - 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chr3L 2769692 3' + Tirant 8465 2 63.37 CGACTGAGCTATTGATCCTGATCAATGAAATACACGGTAACTTCTACCTGTTAAAAACTTTTCAAGGAATCTAGTATACCATTTTACTCTACCCTTAACAC:1 + chr2L 12157176 3' - INE-1 93 1 52.48 TCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCCAGCGAGCGCCACGAGTTGAGCCACCTCCTCTGACGTTCCAGCAGAGAGCGAAGTTCAAGTT:1 + chr3L 7962669 3' - Rt1a 4666 1 57.43 TATTTNTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACCACCCACGCAGCTTCAGGAGCGAGCGGAAGGCCTTAACATTTATGATTAATGAGCCTTAACTTTTGC:1 - chr2L 17278027 3' - copia 11 2 67.33 AAATAGAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTTATTTTCCTGCTTCTTTTTCTGGTTTTTCGTCGGCTCGCCATCC:1 - chr2R 7380492 3' + Bari1 1660 1 54.46 CTCACTAATACAATTCCCACAACCACTGCCGCCCCACTTCCTGCACTATTCGCACGGCGAGGCGGTGAAGCACACCGGCTGCCTGATCAACGGCCGTTCAT:1 + chr3R 25021101 3' + accord2 7338 1 75.25 GTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTGGTGTGGTGGTGGTAGTGGTTGACGGCTTACTAATTACAGACACTATAGCCGATTCAGCC:1 - chr3L 9089185 3' + R1A1-element 5003 1 64.36 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGTTGGGTGTCAACATTTTTGAAATGGGTTCGCATTTGTAT:1 - chr2L 14536225 3' - blood 13 2 66.34 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCTAATGG:1 - chrX 1399834 3' + P-element 2882 2 74.26 GGCTTCGCCGACGCAGACTGGGCAAACGACCTGTCAGATCGCTAATCATACAGTTTGGTAAACATTCATCTCCTCCTTGTCCAGCGAGATCTCGATCAGGC:1 - chr3R 7923099 3' + Copia1_DM 3833 1 53.47 ATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGGCATTTGAATGAGTGTTCCAAGAAAAAGAAACAAAGAAAATATGGAGCAAGCCAAAGT:1 - chr2R 16820861 3' + gypsy4 315 2 60.40 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGCCAAGCAATTACTCTAATGGCAAAGTC:1 + chr2L 11114051 3' + transib2 2799 1 55.45 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAA:1 - chr3R 20140561 3' - jockey 36 1 54.46 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGGCTGGCGGTCAATTTATCAACCCC:1 + chrX 23155230 3' - blood 7063 2 73.27 CGAAGTGATAACTTACAGAGGGATTTATTCATACTTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCATCCAATTAAGGGGTTTATATTTTCGTGCCTCAGCCCATGGGCC:1 + chr3R 4497105 3' + Fw2 3659 1 55.45 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACAGCTACACCTTT:1 - chr2L 22319265 3' - Transpac 16 2 57.43 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGAGCGTTCGAGCGGTGCGGCTAATCGAATTAGGCAGGTGCCAGAGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGCGC:1 + chr2L 12529800 3' + P-element 2879 2 69.31 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATATCATTCAGTCGTTAACGAAACTTCGCCGCGA:1 + chr2R 12705177 3' - P-element 40 1 38.61 GGAACTGAACGATTCCTAATAATAATAAATGATTTAAACTCAAAAAAAAGCATTGGCTGAATGTAGAACATTTTGCAATTGCCAACTGGGTC:1 + chr3R 23905428 3' + G5A 2810 1 71.74 CTTCACTTTGCACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACCGTTGTAGTTTTGCCGAGTTTAAACAACACTTTGTTGGATAGTTATTGTCACCTCTGCGTTGCTA:1 + chr3R 15060564 3' - Doc 94 1 59.41 CTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGGGCTTTTGTTATTATCATCTAATACAAACGGTGTCTTAAGTCGGTCAACAGACACCGCCATCTTCTT:1 + chr2L 22545055 3' - roo 10 2 69.31 CATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCAAAAATGACACTCCAAGTGCGGAACGTGGGCGGCAAAC:1 - chr3R 25814582 3' + 412 192 2 62.38 ACTGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCTCCACATTGTTGATGCTGCTAATTAAATTTTCCCTTATAAATG:1 + chr3L 6611962 3' - Cr1a 4213 1 58.42 TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTTTTTATTTCCCATTCATTGCCTTTAGA:1 + chr3R 5775766 3' + invader4 319 2 72.28 TTACAATCACGCGGTCAAACAAAAAGTGAAGTCAAAAGTCCCGACGATGCCAACGGATCGAAGCGACGCGGTCCGCGCACCACCATCAAGGCCAAACAGCT:1 - chrX 8768156 3' - Tc3 356 1 68.32 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTGATTCAATTGAAAAGCTTGTTTTGGTTATCCACTTTTCAAC:1 - chr3L 5827883 3' - blood 7047 2 57.43 AAGTCGAACAAATGATCCGTATTCCTAGTCATGCTTCGGTTGTTTTATAAGAATGAGAATTGTTAAAACGAAGATAGCGATATCCATGCGACCACAACAA:1 - chrX 12831429 3' - McClintock 6344 2 58.00 TCCCCGACTATTAGATACCCGTTAGTCAGGTAGTGGAAGTGAGACATTTACTTGTGGGCCAAAGTGAAAGCATCTCGTTTTCATTTCATTTAAAATGCTGT:1 - chr2L 14484305 3' - INE-1 554 1 64.36 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTA:1 + chr2L 12843410 3' - roo 8685 2 56.44 TGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCATCCACGACTTGCTGCTCTGCTCTGTACTTGCCCTCTCAC:1 + chr2L 685117 3' + blood 7088 2 61.39 CAGCACATTGGGGTCTCGAGAGAACCGCAAGCCGTTGGTAATTCTTCAGCAGTATCTGTCGGATTTGGTCAGAACACGTCTAACGCAGCAGTGGCAGGAG:1 - chr4 655240 3' - X-element 376 1 77.00 ATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAAGTTCAAAAACCGGTAAATCGGACGAAAATAAAATTAAATGTCATGGAAGCCACTAATTAAATTCATTT:1 + chr2R 5988520 3' - jockey 480 1 75.25 CTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCGAAACTATAACCTACCACAATATCCTTATCAGTCAATGCAATACAT:1 + chrX 6345617 3' + I-element 360 1 54.46 ATATTTAAGAAAATAAAAAAAACATGAACATGGTTATGTTTATATGAGCAACAGGCCGTGACTATCTATTGCCGCCGCCGTGGCTTGACTCATCGCCATCA:1 - chrX 15636516 3' + TART-B 10631 1 55.45 TTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTCGCCATTGTAAATTGCCGGCAAAATTTAGCTTTGACTTGTCGGGTGCAATTCTTATTGGCCCCCCA:1 + chr3L 18242001 3' + aurora-element 4116 1 70.30 AGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAAATGGTAGATCATTCGTTTCTACAGATTTATGGGTGACGCTTGATAGAACCTGTTCCTCCCCATCAATTTTGGAATC:1 + chrX 20345062 3' + INE-1 149 1 73.27 CTCCGTCAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCATATTACCCACCCATCGCTGATCGAGATGATGCGCTTCTATGACGAG:1 + chr2L 14339288 3' + GATE 445 1 63.37 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGTGCATTGTAATTCATTTCGAATTTATAGCCACCCGCGATCCGAATCAAAAT:1 - chrX 8714568 3' - P-element 24 1 55.45 ACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCAATCTTGAGCTGAAACTACAGAGTTTTGA:1 - chr3R 14882047 3' + gypsy5 420 1 79.21 AATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTATCTATTGATTTTATCCTTTCCTTTTTCTTTATTTTTTTCTCACCGAGTATGTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 8681923 3' - R2-element 3116 1 64.36 GATATGGGTACCAACCACATCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACTGCGGAATTCGCGTGGTTATGGGCTTGGCACAGGGACTAGTTTTTCCCTGT:1 + chr2R 22835413 3' - R1A1-element 5008 1 57.43 TGGTAAGTGAGCAGCCGAGTTATCGAAAGGGACTTAAAAGTTGTCCCACTGGGAGACCAAATAAACTTCCATTTTCCCAAAATCCGAAACTCCCACATCAT:1 - chrX 5198809 3' + G5A 2530 1 71.29 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGAATTTGATAGGACTGCTTTTTGTATACA:1 - chr2R 21239395 3' - jockey 56 1 70.30 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAA:1 + chrX 2090302 3' + roo 9046 1 54.46 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCT:2 - chr3L 3254961 3' - 1360 22 1 58.42 GCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGATCGGTGAATGCTTAGGAAGATCCGCTCTGAACTTCATCCAGAAATTAGATGAGAGCGATA:1 + chr3R 6264132 3' - Doc 4294 1 61.39 ATCCTGCACAACTTGTCAAAGCTGAGCCTTAGACGTCGGGGAGTTCTTCTCCTGTATTATATCCCTTCTATCTGGAGATCCGGCTAACATTTCGATGTGCC:1 + chr3L 27716712 3' - HB 1224 1 56.44 ATGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATG:1 - chr2L 9823623 3' - hobo 23 1 58.42 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAACAGAAAGTATATCTTATACATATAAATGATGTAAAGAAAACAAAAGTTGCACTTAAT:1 - chr3R 25876237 3' - flea 15 2 64.36 GACACACGGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCAGCACGCCCAACATCTCGATGAGCAGGTCTGAAAGAAGGTTATTGCGATCGAAATGGGAAATG:1 - chrX 5221206 3' + baggins 5100 1 66.34 TATGAAGGATAATGAGAAAGGGAAACGCTTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCTGCTGTGGTTTTGCCTCTAACTCTAG:1 + chr3L 5390098 3' + invader5 3887 2 74.26 ACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTATTAAGCTAAGAAGAAACGACAACCGGCAACAACAAGACAGTAGCATCAGCAGCAGCCGCCAACCGA:1 + chrX 7644050 3' + HB 362 1 53.47 CCAGCGCACCCACAAGCTTGGAACAAAACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACATCTACATCACCAACAGCCACTTCCATCTCACTCGCCAGATGTTTCTGAA:1 + chr2R 6138041 3' + G6 339 1 53.47 GTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGACTGATTAAAAACTTATCGAAGCCAAAGCTCTCAGGTATTATC:1 + chr3L 3485032 3' - diver 5924 2 61.39 AAAAGGGAGAGTGAACAAAACAAAAAGACGAAAAGGACCAGGAGCGCGCCCACTGGGTCACCTACAATCCATTCTACAATTAGTCTAGATTTCGTTTAAGT:1 + chr2L 10730199 3' - Cr1a 209 1 70.30 TAGCTGAACCCAACATCAGCGCACACATTGGGCATTCAAATAAAGAACTTGAATCAGCAATCGTATGAAATCAGGACGAATAAAACGCTTGAAATGTGATT:1 - chr2L 15021011 3' + Stalker 307 4 55.45 ATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAACGTGTGCAAGAAAACTAATTTGATGAGCAAATATCGCCTCGCCCGACTACGTAAAAACTTTACTTGTA:1 - chr3R 23651500 3' + copia 402 1 75.51 TCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCTATTTTATGGATTCGCTTGAACTTGGCTCGCTTTCCGGATTTTGGCGGCAGACTTT:1 - chr3R 24608377 3' - baggins 5201 1 56.70 GGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGT:1 + chr2R 2529357 3' + 1360 3376 1 36.63 TTAGATCTACAATGATTTAGGATATTAAGATCGTATGAATAAGTAATATGTGCCTTATACGGTCGAAGATGTTTACTTCCTCCAGCAGCATTAGCAAAATT:1 - chr2L 6241446 3' - Cr1a 4146 1 79.21 TAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTGAAGTTGAATTAGTTTTTTTTTCAAGAGGG:1 + chr2L 21576706 3' - Doc 4560 1 69.07 ATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCTGCTTCTGCTGCTATTGCTATTGAGATGTTGATCTAGCTGCGCCGCTCTATTTTCTTT:1 + chr3R 8818962 3' + transib2 2512 1 73.27 ATAATTAAAGATGATTATTAAAAACCACGGCTGATTTGACAAACACAAAATAAAAACCGGAGCAGCAAAAACACAAACATCCGGACGAGTTGGGATCGCAG:1 + chrX 15892919 3' - Cr1a 76 1 71.29 ATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTGAAATGGGCTACCTGCAATCAATCAACGCTGCCCAAGTGGCCCAGATATCCGAGTTTAGTGG:1 - chr2R 21468943 3' - I-element 220 1 70.30 ATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATAAAAAAAGATGTGTCTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTTTTAATGACTGTAGAACAATTCTATTGAAGA:1 - chr3R 4738138 3' - Stalker 240 6 76.24 GAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAAACTAAATACTAAAAGTTATAAGAAAGATGAAAAATTTAATATTGTGAAGAATTTAAATCTTTCATC:1 + chr2R 14817795 3' - 297 370 2 37.62 CGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTTATCTTCCAACTGGCATTTTCACAGCTGCGAAT:1 - chr3L 21998171 3' - Max-element 440 1 67.33 GCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTTGAGTTGCCACTAATAAAACGCACGACGAACTGACACCACTGGAATCGAACCACTGACCACT:1 - chr2L 16403281 3' - Stalker3T 289 1 70.30 ATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCTCCTCGCCCAGCGGGGCGTTACTAGTCCAGTTGGGCACTCTACATTCTGCT:1 + chrX 3175703 3' - Stalker3T 311 1 56.44 TGACTCGGTCTCGATTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGTATAATGTTGATTTAAATATATTTGGTTTAACTATCCAACGGCCCTGAAATT:1 + chr3R 14795243 3' + Stalker 417 1 60.00 CCATAGATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTATATATGTGCTTGTACACCCGGAGAAAAACATTGGTTCATTCGAATAATGACCTTACTATGACCTACGCA:1 - chr2R 16927042 3' + blood 7163 2 65.35 CAGCTGCCGATATGCCGACAGACAGCGCCCACCCAGAACACGTTCGTACACTGAAAGGAATCTCGATGAAGACGTCCTAGCTACAGAAAATACTCTTGCTG:1 - chr3L 23039024 3' + G5A 2601 1 71.29 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGG:1 - chrX 11042509 3' - jockey 4697 1 59.41 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTGAGCCTCCAGCTGCTGGCCGAACTGATTTAGAGCCACATTCTTTCGGAGAGTTT:1 + chr2L 15622786 3' - mdg1 21 2 56.44 CAAGGTGTTATAATTTGTTATAAACTATAAGTCTAAGATAGCTTAAGTACTTTGTGCAAAATCTACGGACAGAGCGAGTTAAAAGTTTTTCAGCGTCGCGA:1 - chr3L 11846968 3' + S2 1449 1 58.42 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATATTATTTTAAATCGAACTAAGTTCAAAATTGCATTCGAGAACTG:1 + chrX 3697183 3' - jockey 4702 1 50.52 CACTCACTACTAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCATCACCTCTTTAGAACCAATTGAGCAGAAAACCAGAAGGCGCCATCGAGGAGAGGA:1 + chr2L 16441853 3' + accord2 7336 1 58.59 TCTACNCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGATGGTCGGATACTGGGTTCCTAGATGGAAACTGCTGC:1 + chr2L 17889195 3' - G2 2794 1 63.37 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGTAAATATACAGATCCGTATGTGTTGCTTAAAGTTTCGCTTTTGATTTTCTTGTTATTCC:1 + chr2R 10028508 3' + roo 392 2 62.38 TTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCATATTAAATAAGGAAATACATTATGTATTTCCTTATTTAATATGGCCATTTAAATCATTTACGTTGGATAA:1 + chr2R 12836702 3' - F-element 4570 1 55.45 TGTCCAGTCTGACGATTTCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGCTGCATACCCTCTGTTTATTGACCAAAATGCGGTCGTTTCGAAACGTAT:1 - chrX 17636325 3' - Chimpo 84 1 53.47 AAAATACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCAATTGTTCAAGCAAAATGATCCGCAAAGTCTGTCTTCACATTGTAGCTGCAGCTAGAAAGTAACAAAACGGTG:1 + chr3R 8583958 3' + Tc1 427 1 55.45 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAGAAACGACGGCGAACGGCCAGCAGTGT:1 + chr3R 22899262 3' + P-element 2873 1 64.36 TAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGGCGTGATTACAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGATCTTGATACAACAGTAAGGCAGTGA:1 - chrX 17693879 3' + 3S18 179 2 78.22 CAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGAAATGCCGATTGAGATTGAGGCGAACCAAGCGATG:1 + chr2L 11595383 3' + R1A1-element 312 1 76.00 AACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCAGCCGTAGATCAAATCATCTGCTTAACCCCATT:1 + chr3R 14005934 3' + Doc 492 1 70.30 TCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTCTTGTTAACCCTTTA:1 + chr3R 27222724 3' - P-element 408 1 23.76 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAGATAGTATCAACTAGAAGAAAAAAAACCATTCATTGTTCCTAAGAAGAATTGGGA:1 + chr2L 9463453 3' - roo 8683 2 51.52 TACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGCTGCGACTGTATGTGTGTGGGCGCCCAGCCA:1 + chr3R 14385970 3' + Tirant 8113 2 64.77 GCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCATCGAATGTAGTGCCTTCAACCCGGATCGGGAACTAGTCCCCAGTTGTGGTGGCTCCC:1 + chr3R 19649783 3' + R1A1-element 492 1 64.63 TCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCTTCCAGCGAGTAAAAGATGAGAGAAAGAGTGAAAGAATGCGAGGGAAAGTGGAATAAAGTGAGTGA:1 + chr3R 14175394 3' + Ivk 4956 1 71.29 GGTCTGGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGCCTTTTATAAATACTTGTGTTTTTTGGAAACGAACGAAAGGTCGCAGTACAGGTGA:1 + chr3R 18858383 3' + hobo 293 1 54.46 AAATGNACTATAGGCCGAGTCGTCGAACTGCACCCTGGATCGGACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATATAAAGTGTATTTATAAATTAAATATAAGTTTTA:1 + chr4 90597 3' + diver 5686 1 69.31 TGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCAGTACGAATAGCAAAATGATTGCCTAAAAATACAAATTAGCTGTCA:1 + chrX 16831676 3' - Porto1 450 1 54.46 CGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAAACAACGTGACATGGGGATCGGGATGGGTTTGGGTTTTTCGTCTTCGTGGGGCCTGTGAATTCATTTTGTT:1 + chr2L 4366098 3' - HMS-Beagle 6958 2 73.27 ATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTTGCCTGGTTGTTTATTGTTGTTT:1 - chrX 17692557 3' - 3S18 5769 2 75.25 GATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGCTGCTGTTGGTTTTTCCATGGTTTTTTCCTTTATTTTGCCAATGCCTGTGG:1 + chr3R 9346039 3' - I-element 5112 1 66.30 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATGTATTCGATTTACCCATTCTTATGCGCAATATGAA:1 - chrX 13854432 3' + pogo 2064 1 67.33 CCTTAGGATATAAGTCATAAGTTCAAGTATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAGTAGAAATATGTATTTAGAGACCCGAAGTGCGCTGCAGGAGGTG:1 - chr2R 5344727 3' + Quasimodo 97 2 54.46 CATAAGTGGGCGATCATAAAACACTTCCACTTGAACATAAAGGAGAAGTTAGTGAAGCGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAAT:1 + chr3R 19449672 3' - gypsy11 137 2 60.40 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAACCTAACAAGAATCGAAAC:1 + chr3L 22564887 3' + blood 7356 2 57.43 CATCTGTCCGTATGAACGTCAAGATCTCAAATACTGATTTCTGTTTGCTGATTCCGATTTTGCAGGTCACACATCGTACAACCGGCCAGGTGATGGTGCTC:1 - chr3R 19060799 3' + INE-1 128 1 70.30 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTC:1 - chrX 14770554 3' + 1360 3344 1 70.30 CGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAAACTGAAGATAAAAAAACGAAATACACACAGAAAAAAAAAGAACAGAAAAATATAAAACT:1 - chrX 9506617 3' + X-element 406 1 59.41 GGATGTGATGCCAAGTCGCACTTTATCTTCTTTTCCGATGAACAGCAGCGGGACGCACCTTCCTTGTCTCATTAGTCGCTTAACACTCTTGATTGGCCAGA:1 - chr3R 13810288 3' - Rt1b 4948 1 78.22 AGGCATTCTATAATTTGGTGTATGACTGTTGCTAGGTAATAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGTGTTGTCTATAAGTTGATTAATGCTTGCCTCTGGGATA:1 - chr3R 28087298 3' - Quasimodo 78 2 63.37 AAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAAATGTCAACTCAAAACTTGCGGAAATATAGTGTAAGGATGCTGTTCACGGGCTTTGGATT:1 + chr3L 25514496 3' + X-element 421 1 64.36 TCCATATGGGTTTCAAAACGGAGTTATATAAGAGGACTTTTTACTCCAGTCTTAGGTGAGAGCCAAACGGAGTCGCCTGCTGACCACAGCTCGTCCTTATC:1 + chr3R 27544473 3' - Doc3-element 4303 1 62.38 GCCTANGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATTTAGTTGGATAGCCCCACAAACAGACTGCCACTCGAGTCAGGAAATCTAATCTAACCCCAAAG:1 + chr2R 9300117 3' - roo 8956 2 69.31 CGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGAAAGTTGGTAAGTTGGTAAGGTGGAGCGTGGTTGGAACTCCTGATACCAGCCGGTACCG:1 - chr2L 8253866 3' - F-element 4497 1 53.47 AGTATNGCAGCCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAA:1 + chr2L 21592739 3' - BS3 338 1 70.30 CATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATCAAAAATAAAGCCTAACTGCTTGGTATGTTCAAGCGGC:1 + chr3L 17475048 3' + I-element 204 1 67.33 AACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGA:1 - chr3R 21276543 3' - BS 5022 1 51.49 GACCTGCGGCCGATCGTTGACTGTGCGTTGCTACCTAATTTTTTGCCACTTGCCACCTAAACCAGCGACCTCACCTATCCACCTCTCTAGGTGAATGGCGA:1 - chr3R 18644345 3' + hobo 2741 1 81.19 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGCTTCCAGAGGCATTGCGCTTTCTTTCGGGTACGTTGCCTGTGGTTCTATCCAAACTGAGCAAGCAAGTCA:1 - chr2R 5640313 3' - roo 8670 2 73.27 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGCGAAATGGGGCCACGGCTG:1 + chr3R 4807848 3' - P-element 20 1 59.41 TTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTCTTTCAATGAATTGAGTGGGTCACTCACTACTTACACACTGCAACACCACCCCCCGCCTAACCATTTCCG:1 - chr3L 7837148 3' + hopper 146 111 70.21 GTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCAGAGAAGTTCACTATCCCACTCACATTCC:1 + chr3R 31129482 3' + F-element 4380 1 72.28 TGTATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCAACGGAGAAGTCAGGCCAAATTCACGAAAAATTCAAGCTTTAAAAGCAT:1 - chr3L 25768266 3' - Dm88 179 1 61.39 ATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAAAGAGAGGGCGAGAATCAAACGAGAGATTGAATTTCTGC:1 + chr3R 13622456 3' - blood 7235 2 66.34 CGGGACGAAATCAATTCTTATCGAAGAAACGAATTTACATAATTGGGGTCTTATTTGGCAGGGAGCATACCGATGCTGATGAAATTAAGCGAGGTCGGTAC:1 - chr4 313740 3' - 1360 3178 1 57.43 GCGGCGTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTATCTATTGATTTTGCGCTGGGGGCGAACAGTTGGACGAGCCGCTGACAGGCT:1 + chr3L 823506 3' - R2-element 3137 1 66.34 AATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACACAACCAAAACATACCAAACCACAAAAAGAGCAAGAAACTATTCAAATAAAA:1 + chr3R 26234708 3' + Doc 4363 1 58.42 AAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGTTGGATGAGGTGCATCTGCCTGGCGGTGG:1 - chr3L 17624135 3' + roo 405 1 75.25 CCACTGGTGGAGGAAAACAACAGAATTTCTCCTTAAGTGTACGCACAAGTTTATAATGTGAACATTTTCGTCCTTTCGAGAAATTCTGTTGTTTT:1 - chrY 36534 3' - rooA 409 1 66.32 TCTAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGTGCAGGAAAATTCTACCATTTTCATCCCCATTAAAAGATATCCCCTATTATCACTCAGTATCCCAGCTGTTTTC:1 - chr3L 6977977 3' + R1A1-element 4888 1 77.23 AATTGCGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCCAATCTGTGAGGTGGTCTCGGCCACGCCGCACGAGTTCACCAACCACATCC:1 + chrX 4620780 3' + R2-element 3134 1 52.48 GACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGAGAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGTCTAATGGGAGGGAAACAACCGAAATGGC:1 - chr3L 10911346 3' + Bica 4537 1 69.31 CTTAAAAGTTGTCCCATTGGGAGACCAAATAAATTCCACAGCAGCCAATATGCCGACAGACTTAGTCCCCACCCGACATTTCCAATGAAGTGCAACGTGTG:1 - chr3L 2773732 3' + G5A 2562 1 73.27 TGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCCTCATCACTATGGCTTTCAATAAAGGCTCAGAGCTTAAATTGCACCAGGCTTCGAG:1 - chr3L 15660916 3' - pogo 1732 1 60.40 TTAATCTACCGACTTTCATAAAATTGGATTTGGCCAGAAAAAGTACGTAGATTTCCCATAGTGCGGTGCTCAGGCGCAAATGTGTGTGGGCTGGTATCTGT:1 - chrX 22795177 3' + Transib-N1_DM 452 1 72.28 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGC:1 + chr2L 11114025 3' + transib2 2773 1 81.19 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGGAGGAGCACACTGCGAGAAAAGCAACAGCTATTTCATTTCTTTTTTTGAAATGTCACGTCTTTTTGACCAATT:1 + chr2R 8795676 3' - F-element 4526 1 72.28 TCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACTTGTAGCAAGCAGTACAAACAAGTGAACAATAAAACCAC:1 + chr3L 12952354 3' + Ivk 4953 1 61.39 CAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGCTACCCTGCCCCCTCAAAAGATATTTTTTCAACTACTTCTCACTGCCCCAAAGTCCTGATACATATAC:1 - chrX 17949711 3' - hobo 319 1 71.29 ACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTAACCAGCGGAAATCGAAGTTATATTCTTGTCTTTACAATGTT:1 + chr3R 27271840 3' - F-element 144 1 59.41 GCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCCTGGCTGTATCGTAAACATCATACAGAACTCCGGCAAGTTCTGTCATTTCGAGAGAACAGTCTATTTCCGTT:1 + chr3R 12790035 3' - flea 4679 1 76.24 GACGGCTGCCCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAAA:1 + chr3R 14832458 3' + blood 333 2 67.33 CCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:2 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 4894 1 58.42 CGATATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAAGATTGAGATTCAGAATACAGATTCTAGAGACAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1 - chr3R 4571528 3' + INE-1 147 1 54.46 TAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCAAAATACTCTCGGTGCGTTGTCTCT:1 - chr2L 20484114 3' - F-element 4620 1 74.26 CAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACATCTTTACCGCTTTTCCTTAACCACAAAACCCTGTGAGTACGGCCTGGGTTTTGCT:1 - chr2R 14404445 3' + Quasimodo 7046 2 52.48 CTTCCATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGTATGAGGAAATGGTGTTAAATGGCTTTGTGCCAGCGTTAAGGGGTGACGACCATTAGGAATATGGA:1 - chr3L 27413653 3' - invader4 214 2 70.30 AAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTCTTTAAGGGCGATGCGGTGGCTCCAGGTGTACAAGTATGTGTGTGTTGGTGGGGCTGCTCGATGACTGTGTC:1 + chr3R 23958906 3' - I-element 187 1 60.40 TTTTAACGTATTTAGTTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTCCTAAAATTGAACGACATATAAGCTAAATATCGAACCAGTTAAATAAACCAGTTCGAA:1 - chr3L 17621619 3' + transib2 299 1 61.39 ATATANGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAA:1 - chrX 17049536 3' - Stalker2 7269 2 58.42 AGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGCGTGCACACATACAAATTTAGGTACTAAATTTTTAATATTAGAATC:1 + chr3L 24291382 3' - 1360 222 1 68.32 GGGCGNGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGACAGAGAT:1 + chr2R 16802671 3' - Circe 141 2 47.52 TAATANTATTCTAGTGTCTTTGGTCTAAAAAACAGTACACTTGTGTCATTAAAATAATGCATGGATCACTATGTGGTACGCGACTGTGACTGTTAACATAT:1 - chr3R 7541452 3' + Tc3 310 1 65.35 AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGT:2 + chrX 21947729 3' - mdg1 31 2 55.45 GACCACTTGAGCTGCAAAGTGCAAAGTCAGCATTGATGGGGTTTTCCGTTCCAATGCACTTGAATGGATGCATATGATTTACCCACT:1 + chr3R 26573278 3' - Stalker 7059 4 64.37 TAGGGCTGAACAGGGTACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCCAAATCCGCCGCAAACCGAAGCCCGTGGAGAAACCTGCGCCAGAACCCGAGCCTGTGGCTA:1 - chr3L 3459398 3' - Rt1b 4686 1 57.43 GGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCATGGCATTTTAATCGATTTTGAGCTCTG:1 - chrX 20151078 3' - pogo 1676 1 78.22 TTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGATGAGCTGTCGCTTTTTAGTTACTTTGTTGTAGGTACCTTGCGTTTCGCTTTAAAGTGATTCCGAGTCCG:1 - chrX 19026107 3' - Gypsy6A_LTR 210 1 60.64 CAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCGCAAACACAGGTTTATTTCTGGTCTGGCTTACTGGCTTACTTAATAGC:1 + chr3R 11542369 3' + Doc2-element 444 1 57.43 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGTGCGCCAACGTATATTTGCCACCTGAGGTCACGAAAACGTCGCTTACTCTTAGTGG:1 + chr3L 7316390 3' - jockey 20 1 66.34 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGTTCGATTCATG:1 + chr2L 6177242 3' + pogo 2072 1 58.42 GCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGCTTCAGGTGGGGTTGTATATGGAATGGGATGGGATGTGGATAGGAGGACACTTGAGTTTTAGGCCGG:1 - chrX 7291853 3' - G2 155 1 55.45 GAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAAATACACTTCTGCTCCCAGGCACGTGGTCCGTTCGTTTCCGCTGCAGTCACCTCAGCAAGCGGTAAGTAATCCATTACA:1 - chr2R 9373161 3' + Gypsy6A_LTR 283 1 65.35 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTCCTCTACGCACATGATATCCCCGATTAATAACATTTT:1 - chr2L 18818600 3' - jockey 4714 1 61.39 CAAAAGGGAGAGTTAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATGCTTTGTATATTTGTTTAAACAAACCCGACTAAAGTGACAGCGATAGCATTCGATAA:1 + chr3L 25305818 3' - Cr1a 210 1 62.38 TAATTATATTGAATAAAAAAATTGCGTTTAATGAATCTGTCAATCGAAGCAGGTGAGGTTCTAGTTTATCCCCTGGGAGCTGACCCCTCGCCGCCGGCGGC:1 - chrX 5832198 3' + S-element 1622 2 73.27 TCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAGTGATTTCAACCAGAGTTGGGCGAGGGTGTGTGGAACTTTCCGGGTTGTTCTCATTTTGGGTGGTTTAGCCGA:1 - chr2L 13893324 3' - F-element 4327 1 75.25 GGATTTTTAGTCTACCACTGGGTGACTTATCTGCAGTTTGGGTTTTTCCACTCAACCTTGTCTTGAGAATTCCGGCAGCTCCGCCGGTCGCACGCCCACCA:1 + chr2R 10335126 3' - Idefix 6993 2 69.31 AGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCGGCAGGATCAGCCTGTTCGGTGGG:1 + chr3L 19579090 3' + flea 54 2 74.47 CAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTTACACAAGCAAGCACAGTTATATTTATTGGAATTTGGCCGTATATAAATGACCACG:1 - chr3L 15474644 3' + 1360 3217 1 62.24 ACTTGTGGAGGTATAGGGTGCCTTGGCTGTCCTCCGCGACTCTCCGCTCGTGATGTTGGGCAATCGCTTGAGTTGGTCTCTGGTCACGTTGGAAAGTCTCC:1 - chr3R 30178820 3' + R1A1-element 5265 1 78.22 TTTGCCATGCCACGCTTAAGGTTTTACGTATAAAAGCGATAATCTATTTTGCGCCTCAATGCTACATCTACAAAATGCAAATTTTATGAAGGAATATATTA:1 - chr3R 2724461 3' + Helena 23 1 58.42 CGCATGATGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCCAAAGGTGCACGCACACACACTAGTGGCCAAATTTACATTGCATGTGCT:1 - chr2L 12641043 3' - 1360 266 1 58.42 CAAGTCACACAACTTCGTCAACTTCAGCACCTAATTTCAGGTCCAGCCGCATCCTGTTTA:1 + chr3L 592041 3' - invader4 2684 1 70.00 GAGATCTCAACGTTCATATGGAGAGGGCCAGACCTCGATGAGCAAACGCTTGTCACGGTCCTGCGGCTGCAATTCACTAGGATTAAAGAAAATAAGGTAAA:1 - chr2R 16899807 3' - INE-1 134 1 65.35 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTAACCCAACTCACCAGCA:2 + chr2L 13670345 3' - BS 5004 1 64.36 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGATAAAAAAATCAACCCAATTCAAAAAATTTAATTTCATTAAAATAAAGAGCACGAAGGA:1 - chr2L 12728379 3' + opus 7487 2 62.00 GCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTCTGTACCTGGCTATTAATATCCTCATCGTAGTCTGTATTGTACGCTGGCTGGTTTTCGTAAGAGGGGGGCTTCG:1 + chr2L 34766 3' - hobo 2708 1 79.21 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCC:1 + chr2L 5151985 3' - I-element 54 1 78.22 TCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGTTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCGTATCGCGGGGGCGAATTGCTGAATTATTTGATTCTT:1 - chr3L 24122881 3' + R1A1-element 4961 1 69.31 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAA:1 - chr2L 5932096 3' - jockey 26 1 57.43 CCCTGGCCGGCTAGACAGCAGGATCGGCCTCTTCATTCCGTGCACGCTCCAGAAACGGTCCATCCGAACACCGCTCGTTCACTTCCGGTGCGACATGCACT:1 - chr3R 27977715 3' - Max-element 8184 1 72.28 GGTCCTTTCACCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTTGAGGTGCGCTTGAAGAGATCCATTAGGCGT:1 + chr2R 12941295 3' - F-element 4514 1 67.33 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATT:1 - chr2L 9823629 3' - hobo 29 1 52.48 TTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTTTGTTAGCTCTAACAGATTATGAAATTCTATGGCTTCCGTTAGC:1 + chr2R 6127712 3' + invader4 2639 1 56.44 CCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTAAAAATTCAAATTCAAATTATCTAAGACTGTTTTT:1 - chr4 412569 3' + Idefix 235 2 76.24 AGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAA:1 - chr3R 17495741 3' - opus 16 2 63.37 GATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTATTGTTTACAGCGGCAACATGTAAG:1 + chr3L 16893301 3' - I-element 195 1 79.21 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTG:1 + chr4 490323 3' + pogo 2079 1 57.43 TTAATNTTGCATAGGCACATACTACAGAAGATATGTATCTGCGCTCGGTAGCAGCCACATGCCACGCCCCCTGGGCGACATGCCGCTTTACAATGACATTA:1 + chr2R 21937573 3' - 412 5 2 72.28 TGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTAACTACCAGTTGGTGCTTATTTTTTCTGAGATATGTGCTCGCT:1 + chr2R 15789062 3' - ZAM 8138 2 57.43 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGCATTTAATGACCTTGTAAGTGGTAACAGTAATCTAGCAAT:1 + chr3R 18170727 3' + pogo 2068 1 64.36 ATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAGCAATTTTAACTGTTTATTTCGGGTGCCCCTAGACCCGAAAAAAACAGAA:1 - chr3L 17269406 3' - Tc1 214 1 58.42 GCGGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATATTATACTTGTTCCTCTAATTCTTCATCAAATTTACGTAATTA:1 - chr3L 23846183 3' + copia 5018 2 56.44 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAGAAAAACGATGAAATTTTTCTTTCGCATTATTAATAGCTGGTAATAGCTGGCTAACGGGTATCTGATA:1 + chr2L 12547703 3' + pogo 2098 1 73.74 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATCCAAAAATATTTCTTAATACGTTCTGGTTCAGA:1 + chrX 2766816 3' + mdg1 7421 2 66.67 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAGTTTTCAAAAT:1 - chr2R 25203751 3' + 1360 3376 1 66.34 CTCAAGACCTGACTGACCGGAACATGACATAAATCCCTTCAGATGGCAATGATTGTTCATATACCCTAGATAAATAGTTGTGCATTAATCAATCGTACAGT:1 + chr3R 9994298 3' + jockey2 3190 1 70.30 TACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCATGTAGGTGCGAGTGACTCAAACCTACCTCTCGCTATCTGGTGTCTCGT:1 + chrX 15949520 3' + Stalker 404 1 69.31 ATGCTGGAGAGCAAGATCGCGTTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTCCATGTATGGAGAGTGTTGAGTG:1 + chr3L 10668572 3' - Porto1 349 1 62.38 AAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAATGTCGGTGTTCTCCTCCAAGAGTGTCACTTGGCTCCCCAGCTATAAGCGTCGAGC:1 + chr2R 3089389 3' + Idefix 456 2 55.45 GTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAACAGAAACGAGGAGTGCTTGGTCGAGGAAGCGCGGAAGACGCTGTCC:1 - chr3L 23666445 3' + Quasimodo 148 2 54.46 ATATACATAATGATTTAAACATAGAAACAATCATCATCAAACTATTAGAAAAAGCAGCAAAAAACACGCAAATAAACTACCAGAGGATTTTGGTAAAGCAG:1 + chr3L 17824575 3' + Porto1 4390 1 79.21 CCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGATTGAATACTGGGGGAATATACGGAATTTTTAAATGGTTAAGTGGAATTCGGCAAA:1 - chr2R 18182092 3' + S-element 407 1 76.54 CCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTGCAACATACCAAAGTCAGAAAGAACAAAACATGTGATGT:1 - chr3R 10380227 3' + I-element 159 1 69.31 ATTGGGTTTGCTAAGAAGATCTAGAGGGCTAGTGTTTTGTGTAGTGTAAAGGTGTAAGGTGTAAAATGAAAAGCGAATCGTTTACCTGGTAATTTTTGTTT:1 - chr3L 537099 3' - I-element 5111 1 56.44 CTTGAGAAGTTATTTTTACAATAGGAATACAATCTAGATACCAAAGTGGTCCGATTCTTCGGACAAATGTTATTGATGTAAGCTATTTCCCGGTGTACTTC:1 + chr2R 11007481 3' + S2 1363 1 77.23 GAGTGGCATGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAAAGCCGCTTGTTCCTAGCAATGTTATATCAGTTCTGAAATGCATTACCTTGCACTCGCTGTGATTTTTG:1 + chr2L 15617011 3' - I-element 20 1 68.32 TTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGCTACGACTCACTCTTTCCCGCTTACTCGCTCTGTGGTCATATCCAGATCTCTCTGTGTGT:1 - chrX 6132931 3' + Cr1a 191 1 63.37 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGTGAAAT:1 - chr3R 22675807 3' + 412 7514 2 58.42 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAGCATATGTGTGGTTTAGTATAACTATTTATTTCTCCTTTAGATGTGGTTGCTTG:1 + chr3R 27565446 3' + 1360 3368 1 59.41 GATAGTCGGGGAACTCAACTATAGCATTCTATTTTTCTAGTTTTTTACCCCCGGTTCGGTTGAGTTTTGGTTTGCTATGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGT:1 - chrX 9549544 3' + INE-1 564 1 74.26 AAAAAGAAAATTGATTATAAACAATTTCCAGCAATTTTAAAGCGTTGTTTTTTTTCTTATTCTCCGCGAAAGCGTACATAAAGAGCGTATCTTTTTTAATA:1 - chr2L 14996472 3' + Tc1 388 1 81.19 TTGGCTCAGCGAGAATGTTCAAATAATAAAATGATATTTTACGGCTGCGAGCCGGAGTGAATAGCACTGCAGGCTCTGTCAAAAGGCTTAAGCTGGATATG:1 + chr2L 302809 3' - gtwin 7239 2 64.36 ATCTGTCGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATC:1 + chr2L 3964499 3' + INE-1 500 1 81.19 AACTAGATGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGCCCATAGCATTCTCTCTTCCGTTTCTCTACAGCACGGAAATTGAATATGAATTCGGACTAA:1 + chrX 21452618 3' + INE-1 541 1 92.08 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATATAATTCATCATGCCCACTACCC:1 - chrX 6308384 3' - 297 25 2 70.67 CAACACGTGCGGAGTGGAAAATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAATGCTTTCTTTCTATTATTTCCCATGCAGATCCGCGTGAATGGACGGAGG:1 - chr3R 23313070 3' - R1A1-element 164 1 50.50 ACCGGGATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCGAAGATCTTGTGAGAAACATGAGCACCACGCTCAGTAGA:1 - chr2R 8462414 3' - Circe 7373 1 59.41 CCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCAAGAAGAAACACCGTCGGAATCGGACCACCTTCACCACCTACCAGCTCCATGAGCTGGA:1 + chr2R 20923812 3' + roo 218 2 59.41 TGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGACCTTATAGCGACCCTTGACGCCAGCTGGACGACGTGCGCGTCGAGCTGC:1 - chrX 15999492 3' + HMS-Beagle2 7018 2 55.00 TCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCCCACCGCCCTTTACTCACCAGGGTGATATATAACACGCTCATAATTGGTCATAAATCTGACAA:1 - chr2L 11535066 3' + F-element 247 1 62.38 GTGTGGGCGTGGTAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTAAGAGTGGGTTAAGTGGGTGGTACTGTGGCGTAGGTGGGTTACGTTGCCCCCGTTTGGGGACAGC:1 + chrX 15218641 3' - INE-1 242 1 60.40 AGCTGTGTAACGGCTATCTGATGATCGGTGAACTCGACTATAGCGTTCTCTCTTGTTTTTAAAAAACATAAGCTATCGGCCGGACACAATGCACATATTTC:1 - chr2L 21950518 3' + INE-1 545 1 70.30 TGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATACATATTCTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGTCTGTC:1 - chrX 20964122 3' + INE-1 31 1 76.24 CGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAAAAACAAGAGTGCGAGACGCATTAATTGAAAGCATTTCCAACTCAACGAAGCGTGGCAAATTTCCCAG:1 + chr3L 14365959 3' - blood 197 2 71.29 CCCCCAGATCCCACTCATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGTGAGAGAGAGAGCGGGAAGATCGCCAAATTTTCCCTCTACC:1 + chr2R 8083423 3' + G6 1729 1 63.37 CAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCATGGACCCATCGAAGTGGGCCGTGATTAGTGTAGCAATC:1 - chr3L 11407610 3' + flea 4816 1 62.38 GGGACACAGCCTAATCATTAATATGATGAAGCGAGTCCGATCAGACGAAAGGACTGGCTAGAGTTTTTGTTTTTGTGTGGCGCCTTGCCTTGGCTTTCTGC:1 - chrX 19549136 3' + Rt1b 4754 1 55.45 GAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCTTACTTTCTTCACGCACTGTGCGCCTGGTGAATTTCC:1 - chr2R 13560793 3' + R1A1-element 39 1 63.37 AAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTGCTGTCTGAATTTTTGGCTTTTGCATTTTTGAAACTTGGGAAAACTTTGGTC:1 - chrX 13029099 3' + flea 153 1 56.44 TGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCTTTTAGCTCCTTGGCTTTATCGGGCACAGTTTCCTCCTTATCACGCATCTCGT:1 + chr2R 24510534 3' - transib2 2495 1 60.40 TCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCT:1 + chr3L 20224199 3' - Chimpo 54 1 77.23 TTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGTGTGTGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGCGGGCTTAGTTTAGGCGATATGTCGTATTT:1 + chr2R 15660012 3' - blood 284 2 63.37 CCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTAAATGGAAGTGTATAGCCA:1 + chr3R 21848306 3' + P-element 2751 1 24.75 TTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATAAATCAAAAAGTAATAAACATTTAGGTGTCAACAGCATTTTAACTGTGTTCTAAATGTTTGATATG:1 + chr3L 11716080 3' - X-element 23 1 65.35 CGAGTNGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCGACCATCGCATTCCCATTCTATAGTGCAACCT:1 + chr3L 2978998 3' - hobo 15 1 60.40 GGACATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCCGGGCTGAATGCGAGTAGCCTAAGCTTTTTAAGTACACTACATTTTAAATTTCTTGAGAATATA:1 - chr3R 9257740 3' + Tc1-2 8 1 65.35 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATAATTGATTTAACTCATTTTCTTGGCTTTGTCCGATGGCCCAATGATA:1 + chr3R 17727168 3' + I-element 5325 1 58.42 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGACTACTTGATCGGTGGAAACTAGCTATACAG:1 + chrX 17947361 3' - hobo 46 1 68.32 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGAATAATGGAAAATGAAGTGTTCATATATTCT:1 - chrX 23283821 3' + 297 350 2 72.28 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGGGGCTCGCACTTTGCTGCGATTTTTTAGCGATAAGGGGACTTTTCTGGCGTTGTTG:1 + chr2R 21379640 3' + P-element 2882 2 73.27 AAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACATATGTATAACGTATATGTGCAATGAATTTGCGTGATATGC:1 + chr3L 19259988 3' - pogo 145 1 62.38 AGCTTTTTAAATTTGTTTGTTCAAATCGCTGCTCGAATTAGCTTCCGTTGCGTTCGACCCTTTTTATCCCTCGCTCGTTTGATGAGTTTTAGTGTCTATTG:1 + chr3R 19680657 3' - 1360 3007 1 64.36 AGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTAAATAGTTGGTGTAATGCGTCGATTTCGATAAAG:1 + chr2R 24187137 3' - Cr1a 4183 1 74.26 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATATTATCAACTTGATAATCGTCTTGGGCTATTATTTCGGACGTCAACAACAGAACTGATT:1 + chr3L 10037671 3' + copia 238 1 59.41 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCAGGTAATAAACTAATATTTGCCTGCCACCAAAAATTAACGATAAT:1 - chrX 23431474 3' + roo 9042 1 60.40 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTATTTGAGAATGCTGTATTTCTTGCTTTAA:1 - chr2L 11240899 3' + roo 9027 1 67.33 GGAATACGCGATACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTTAAAGGGAAAAGTCGAATAAATGATATGTAAAAATTAAAACTTATAATAAACAATTCGTGTTTCA:1 + chrX 5075825 3' + invader3 185 2 54.46 TCTATCGACATCCCAGATAAATGATGAAATTTCGCGCTCGCATACATACAAGTTAACACAAGCAACCTAATCTTTCCACGATCCTTTCTAGAAGCTGTTGT:1 - chrX 1241716 3' + INE-1 501 1 62.38 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATTCATAGGC:1 + chrX 1523775 3' - jockey 30 1 61.39 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGGACATCCGTGCGGACAACATGGCGTATGATTAACATGTGTGCTTTTGCCGCCGGCAGCTAAATT:1 - chrX 8817088 3' - jockey 4685 1 66.34 GAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAAAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGTTCTTTTTTCCAAGTGTAAATTAGTGAATGGCAGCGCGAAGGGGTGAGTGTGTA:1 - chrX 15522887 3' + 1360 95 1 55.45 CGGACNAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCCTTTCAACCCCGCCTTGCCACCCGCATGGTTAAGTAACAAAAAGGAGATCC:1 - chrX 15260293 3' + jockey 4730 1 48.51 TTCATNGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAAGGGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGAGGAGGCTCGAAGAATTGTATAGA:1 - chrX 13304438 3' + blood 6961 1 74.26 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGG:1 - chr3R 14832406 3' - blood 7048 2 59.41 AAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCGGTGGCTCTAGAGGTGTCTCCAGAATCGGTTGACTAATGCTTCTACTTATTAAACG:1 - chr3L 19261481 3' + 1360 19 1 67.33 TTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTTCTGCTTCTCTTGGTTTAGTTTAGTTTATTGTGTGTTATGCTTTAAAAATAATA:1 + chr3L 13534669 3' - G6 1961 1 60.40 GATTGTAGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGAAAAAAAATTACAAAAAATGTCAAAGCAGCAGGAAAAAGTTAAAACTGAAA:1 - chr3R 9120701 3' + 1360 457 1 55.45 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTCGTGCGCACCACTGACGGTATAACCGTCAGCGCTGCTCTGCGCTTAGAATATCATTCAATAAAGAGAGCTA:1 - chr3L 25200627 3' + S-element 1712 2 73.27 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTGGCTTATTTTTGGCTGAGCAAGCGGATGTAGTCGAGTCT:1 + chr2R 14651217 3' - jockey 4742 1 61.39 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATATATAATAATATTATTGTGTTGTAAAATATTTAATCTTTATGTCATCGCCTAAAATTATGCCA:1 + chr3L 12893257 3' - Juan 4039 1 64.36 GGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTGCCGCAATAACGTCCCAGTGGTCCCTGCTCTATCCTCCCTTGCCTCCGTCGATTGCGAATCAAAGTC:1 - chrX 15778267 3' - HMS-Beagle2 6872 2 70.30 GAGAGCGAACGTTTATAAGCCTGTGTATATCCCTCTCAATGTCTTTCGCTCTCACTCTCTTCCTCCTTCGCTCTCTTTCTCGGTCTCAATTTCTTGACTTT:1 - chr3R 4281346 3' - Doc3-element 4246 1 73.27 ATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTACTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGTGGCTACAACAACGACCCGAACAACT:1 + chrX 14136236 3' + F-element 358 1 74.26 AATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATTGATTGATGAGTTCTTGCACTTGGCATTGACCAT:1 + chr2R 23791958 3' - 17.6 7361 2 71.29 ATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCCCTAAATACTCTGTTACCCTGCAATGTCCCATGAAATACAGAAATTGAAGAGTCAACCGCAGCTGGCAGTAAAAAG:1 + chr2L 11871299 3' + 1360 3119 1 70.30 CCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCACGCCCTTGTGGCAAGCGCCTGCCACACACCCTCCTCCCCCC:1 - 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BS 4825 1 77.23 ATAATCACCTCTCGTCTGGCACACTACAGGTCTGCCGCTACAGTTTTTGGAATTGGTGGTAATAAAAAAAAAATCCCAACTTGTCAAGTGCATCAACCGCA:1 + chr3R 8615120 3' + G3 491 1 74.26 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTCTATCAACCAGCTAAGGTATAAATGAACTTTATTTACTGAAGGATTTCGAATACAGCTTGTATTCT:1 - chr2R 15856343 3' - mdg1 10 2 69.31 AAAGAAAAAAAAAAACACCAAAAGAAAACCCCAAA:1 - chrX 20598848 3' + gypsy7 5013 1 82.86 GTAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACTAATTTATCTGTATCTGTATCTGTGCTTACCGGATAATACATTCCTTGCGGAGGAAGG:1 - chr3L 10518279 3' + diver2 80 2 55.45 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAATCAAAGGATCGCTGGCTCTTAAAATATACTTTGTGGA:1 - chr3R 19988035 3' - roo 45 2 68.32 CAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAAACATAACAAAATACTTGGAAAACTTGGACATGTGTGGG:1 - chrX 12871242 3' + F-element 499 1 70.30 GTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTGATAGATTGGTGGTGACTGATTCGTTTCCGGTTTTCCCTGCACCTGCTGCTGTCCATCAGCCAG:1 + chr2R 14675433 3' - I-element 4878 1 55.45 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGCCGCTAAGTAAACGTGGGAATG:2 - chr2L 15997869 3' - 412 7080 2 60.40 GTGTTTGCTGTTCACCTCGCGGAGCGATTCCAGCCTTTGAACCTCGCCATCCATATGGTTAAACTTAACATCTCTAATCGTATTTACAAGTGAGTGAGCTG:1 - chrX 19726896 3' + BS3 83 1 60.40 TTGGATAGACTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCTACGCGGCCTGGAACTTGCTGATCTTGCGGTAGAGCTGCTGGAATCGAAGCGGATCCTCAAA:1 + chr3R 27927934 3' - HB 1318 1 59.18 TATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTGCAGCTTGCAAATAACTGAAATTATGCCCACTCTGCCTCTGCC:1 - chr3L 5614692 3' - gypsy 427 2 52.48 GGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGATGTTTGGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGAGACGAGATCGACGGGCGGGAATTGGGGTTCGGTTCG:1 + chr2L 14298203 3' - Idefix 199 1 63.37 TACGCGTCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTATCACATAGTAATAC:1 - chr3L 3254946 3' + 1360 3382 2 73.27 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAAAATTTAATAACTTTTTGCGC:1 + chr3L 776173 3' - 1360 21 1 58.42 GCAACCAGTTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCGCATTTTCCCTATTTTGCCATTTGCGATTTGCCACTTAAAGTCACAGCTCCTTGACCCG:1 + chr2L 17037145 3' - R1A1-element 488 1 69.31 CGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGAGAGGGAGAAGGAGGAAGCGATGAAGGAGGCGCTACTGGCGGAAGGATAAACAGGACTTAGTTGACC:1 + chrX 2832425 3' - Cr1a 292 1 63.37 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGACCACCAA:1 + chr3L 26852077 3' + diver 174 2 74.75 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGTGGCACATATTTCTGCGCTTGGCATTGTGCTGCAAAATCAACTGATTTTTGTTTTGGTTCTC:1 - chr3L 14028523 3' - accord 7031 2 74.26 CTAAGGCATTCTATAATTTGGTGCATGGCTGTTGCTAAGTGGTATTGTGTGTGTGGGTGTTTGTGCGGCTATAAAACAAATGCCCCGATTTTTAAAGGTTT:1 - chr3R 17935994 3' - Quasimodo 81 2 62.38 CAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCTCACAAAGGCGGCTCTTCGAAAAAAAGGACAAAAATAAAATGTATTTTGTCGCAGCTTTTTAGAGGA:1 + chr2L 7197328 3' + 1360 1 2 62.00 CTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACAATAAATTAGCCTGTCAATTTTCTCCTTC:1 - chr2L 8281528 3' + Ivk 19 1 72.28 GAATCATCAGGACGCCCTTCTTTCTCTTCTACTCTCGTTAGAATCGGCGTAGTAGTCGACTGACCCAATTTGCTTGGAGATACCTGGGCAATTGGTTCAAT:1 - chr3R 16878365 3' - invader1 395 2 61.39 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTCTTTTAGATCAATATTTTACTAATCTTTTAGACATA:1 + chrX 13854494 3' - pogo 10 1 58.11 CCACTCTAACGCCCACAAACCGCACACATTCACAAAGAGGGTTAGTGTGTTAGACAGAGATAGGAGACAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' + INE-1 220 1 78.00 TAGGACGTTGGCTTGTGTTAACTTGCACACGTATACACATGCATTTAGCATTCAGATCTTGATATTTCCCAAATATTTCATAAATAGCCTTCCAATCCAGC:1 + chr2R 12686563 3' - Gypsy6A_LTR 2 1 72.28 AAAGAACAAAAAAAAAAATGGGGGGATTTGTGAACTAGCAACATTCTGCGTCTGTTGCTGCAGCTGCAGCGCATTAACCTCGTTCGTTGCGTCTCTCGTCT:1 - chr3L 10975921 3' - hopper 140 1 76.24 TTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGACTAATGGTCGGAACCTTTTGTT:1 + chr2R 5734338 3' - Ivk 5008 1 77.23 ATACTATATTACGCGTAAGGAGATAATGGGGATG:1 - chrX 5783703 3' - G5A 2707 1 58.82 GTGAGNCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTACACACTCTAAAAGGCTGT:1 + chr2L 18568125 3' - I-element 20 1 59.41 ATACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAATCAACGACGCTAAGACCCCGTCGTCGTTTATCTCTGGCGTGGCTATGTGATAAAGTCGCGGTCCG:1 - chr3R 28568487 3' + micropia 5301 1 73.96 CATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACTGCAAGATACTTTCGAAATAAGAGAAGAAAAGCAAAGCATACTTTTTGGGTC:1 + chr2L 6805810 3' + Idefix 238 2 52.48 AAATTATTTCCTTAATTATTGTACATCAAAAGCATACATAAATTTGAGTCGAGTGTAGTACGTACGTTTTGCTCACGTTTGCTGCACAAAATAAATCTTTG:1 + chrX 19368120 3' - looper1 345 1 69.31 CCAGCTCTTGCTGTCATTATTAAATTGGTTGATTGGTTGACTAGCCTTAAGGGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGT:1 - chr3L 23635040 3' + gypsy6 210 2 56.44 CAAGAAGCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCACCAAGGATGATACTCTCGTTTTGGTTTCTTGCCCGAGAGCCGCTGGTAGCATAATGGGTCTGCCAA:1 - chrX 14303883 3' - 1360 443 1 68.32 GGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTCTTGTTTCGGCCAAATATTAATTTGCTCTTTTTTTCTCTCTTCTCTTTGCAGATGAACCGTGCTTTACAGCTGAAG:1 - chr3L 13638542 3' + INE-1 571 1 80.20 GGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTATATGTTATTTCCTGTATTTTTTAGTTTAGTTTGTGCATTTTTTTCTTGAGATTTTTATGTATTGTAGTA:1 - chrX 21203379 3' - I-element 151 1 61.39 TCAACAGCTTCGCCGCAGCGTTAACCACCGAGCTCAGCAGAGCCGTCTCGCCTTTGGCCACTCGCGTGTCTTTGGGCTCCACGCGAAAATCGTCGCGCAAA:1 + chr2R 22699062 3' + Rt1c 5237 1 66.34 TCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGTATCAGACAACAAGATTTCAATCAAAATACTTGTTT:1 - chr2L 16592501 3' + Chouto 433 1 64.36 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATACCTTCTTTCA:1 - chr2L 23068827 3' + 1360 3387 2 76.24 AAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGGGTCTCGTTCCCAAACAAACATTAAGAGACTACTTTGATGGACTAAAATCGATTCCAGGATAAA:1 + chr2R 5616620 3' - 3S18 5795 2 54.08 TTTTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGTATTCT:1 - chr2L 6177173 3' + pogo 2058 1 50.50 GGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCACAGACTGCTACAGTATGTCGAGTGTCTTAAGTGGACTACACTGTGCACGTGGATATATT:1 + chr3L 25006751 3' + Cr1a 201 1 65.35 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAA:1 + chr3L 9762241 3' - jockey 4794 1 60.00 GCCGTCAAAAATATCCAAAAATTGTACTTGCCATCAAATGCTAATGTTAAACTCCTATTTATTCCCTCACCATCTCGGATCTAAAAGTACGTGTAGAAAA:1 - chr2L 6930881 3' + TART-B 10244 1 72.00 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAAATCTCAAGAGCTATTGGCAAAATTAAA:2 - chr3R 10490316 3' + transib2 2815 1 70.30 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGT:1 - chrX 3697122 3' + jockey 4958 1 59.41 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGCTGCGCTG:1 + chr3L 5691294 3' + P-element 2847 1 39.60 TTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAACTCCTTATAAGTATAGTTATACAATAGTTTTCGGTCTTACGCGTAAATTAAGTACATTTCAGAAGGCTTACGATA:1 - chr2R 1779319 3' + I-element 256 1 77.23 GACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCAGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGGAGATGAGAATAAGATCCAGG:1 - chr3L 8088787 3' - F-element 478 1 77.23 TTTGTGTTGTTTTTGGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCTCACTTATGCGAACATAATGCAATTTTAATGTAATTTATCTGTAAGATGATT:1 - chr3L 7034054 3' + Cr1a 252 1 56.44 ATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCAATTAGGTTGTTTCAAGCCTCTTGCCGGACTAAAGTAAAGCTTAGTTAAGCC:1 - chr2R 23054853 3' + invader2 322 1 53.47 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCACCTCTAGAGCAAAGAGTATTTTCTCGTTCAGTCTATCTTTCTGCCGGCTGCACACATAGAGGAAAAAGCCACCGTGGCA:1 + chr2L 12569317 3' - 1360 85 1 73.27 TATATAATTTTATGCAGCTGTGCCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACAGATGTGCCATATTAACTGCCTGTGCTTTT:1 - chr3R 14365745 3' - micropia 381 2 66.67 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAATTTCGAGA:1 + chrX 22747480 3' - Doc 39 1 61.86 CTATCAACCTTCCACATAACTATATACGTTGCAGAGAATCATCTGATTTAAATGTACATAGAAACCCAAATGAATTTTCGGAATTCCACAAATTGAATTCT:1 + chr2R 11540298 3' + Transpac 310 1 75.25 CCACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGAAATATGCATATGAATATCATCATATCGTGCTGAAATGAAACAGAGT:1 - chr3R 29018988 3' - Doc 9 1 76.24 GTTGGGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCTTTTGATGCGCACGCACAC:1 - chr2L 306450 3' - Tirant 8111 2 77.23 ACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACATCGTTCTCGAGAACGAAAATGATTTACGCAAATGGCTGGACAAACTACTAG:1 - chr2L 10245706 3' + R1A1-element 305 1 57.43 ACATAATCTGTGTGTTCGTGTGTGTTGTTGTGGGTTTCCTTAGTGAGGTTGCAGGGTTAGGGCGATTGCAATGCGATTTGAAGTGCACTCGTAACTGAAAA:1 - chrX 9591152 3' - gypsy3 429 1 57.43 AGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAACCGAGTCTACGGAAGCGGAGCTCATCGCGTAAACTTAAGGGCTCTTGGAGATTGCCGGAGGATAATTCTGGC:1 + chr2L 14871910 3' - Tirant 374 2 81.00 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGACACACTCTCGGCCTTGTTCATGGACCTCGTCACTTGCATTCGCCTTTTTGCGTATTCAAGTGCCTG:1 - chr3R 25814680 3' - 412 9 2 70.30 GATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGAAAGGTAAACCCAAAGAAATCGAATAAAGGCGCCTGTCCATCGGCAAATCGAATTTA:1 - chr3R 11116022 3' + jockey 4522 1 62.38 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCATAAATTAGTCAATTAGTTGATGAACGTTAATAAAGTTTATGGTGAACCG:1 + chr2L 15997972 3' + 412 490 2 75.25 CTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGAAGATTGTCCTTACCGCCATCGAGTTCTC:1 - chr2L 16331979 3' + 1360 232 1 80.20 AAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGACGTTGTCGTAAATTACGAATAAACCACAAATCACACATTATTACAGCATATTAAACCATTCCG:1 - chr2L 19846605 3' - R1A1-element 191 1 69.31 TCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAA:1 + chrX 21772498 3' - springer 53 2 60.40 TAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTAGTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAAGCGGGAAAACAACTTGGCAACTCAA:1 + chr3L 10288155 3' - Cr1a 3995 1 74.26 AGAATTGAGCGTGCTTGCAACAAAAAACTAGAGGAACTATTATACAATTCGGAGGAAGCAAATATTTTCGGAAAGAGTGCAATATTAACGGGTTAGATAAC:1 + chr2R 5172432 3' - Gypsy12A_LTR 2107 1 76.24 CGGTANGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGAC:1 - chr3R 22899173 3' - P-element 27 1 50.50 AAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAAACGAGCTAAAAACAAGTCCACGTTGATTAATTTAATATAAATTATCATGATATTAAACAATTTGCAT:1 + chr3R 15704016 3' + copia 489 1 70.30 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAACGCATTTTCAAAAGTGGAAACTAATTTTC:1 - chr2R 5267279 3' + pogo 2060 1 70.30 GACTTTGAGGTGGCTAATCCAATGTGTTTACGCAAACATCTTTCAGAAACTGCGTAATCATCTAAGTGAATAGAACGCACTTCAAATTAAAAAAGCTAAAA:1 + chr4 223031 3' - Tc1-2 1151 1 59.41 GACCTAAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCACATCCGAACGACAGATGCACTCAAGGAAGCGCTGCTGCTGCAGTATGCAGTCAA:1 + chr2R 22850790 3' + jockey 4601 1 64.36 TGAGGAGTTTTAAAACTCCCGACAAATCTGGATGCAGGGCAGCGGGCTGCATTCAGCTGAAAGTCAAAAAGAGAGAGGGAGAGCA:1 - chr3R 21808792 3' + gypsy8 1 2 57.65 GGTGTGCCCGATGCGTAGGCGGATGAAGGTTGCTCATTCCAGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGTATGCTACTGAATTGCTGAATTTCAAGG:1 + chr3L 12353154 3' - 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hopper 3 2 76.24 TAAGTNCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTTGGATTTCATTTTTTTGCTTCCCCTGCCACTTCGATTTTATGATTTTCCATC:1 + chr3R 29011030 3' + roo 147 2 56.44 CTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGGTTATGCCAAGTGACCAGAAGATGGCGCCAGCCAGGCAAATCCAGG:1 - chr3R 30294762 3' + F-element 455 1 53.54 CTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATGGCTGTGAAGCCAGCTGTTGCCTTTCCACAGCCCGAGTTTT:1 + chr3L 5978955 3' - baggins 5208 1 68.48 TATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCCATGAAGGTCTCACTCTATAAGTAGGAAGTTGTTAGTTGCTCGCAACATGAGAAACAGCAGCAAGTGC:1 - chr3R 25805424 3' + INE-1 138 1 75.25 CAGGCACACACACACACACACACACACATGCTCACACACGTGCACAAACACCCGCACAACCCGCACACACACACATATGTCGTTAAGGCCAAAGCTGTTTG:1 - chrX 9955485 3' + accord 7026 2 39.60 TTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTACTTGCTTGTCTGTTGTTTATGCATTAATT:1 + chr2R 6656298 3' - Bica 4633 1 78.22 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTATAA:1 - chr2R 18891040 3' + opus 474 2 56.44 AAAAGGCGAAGCCCTCCCAGCAGCGATTTAGTTAGTGATCATTACATACACAAAACCAAACAACCATACCCACATTTTAGAGTAGAACTTGATCGCTAAAA:1 + chr2R 4736327 3' + rooA 7531 2 65.35 GTGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAA:1 + chr2R 4878996 3' - G-element 60 1 79.21 CACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCGTGTTCTAGTTTCGCAGCAACAAGAC:1 + chr3L 20642476 3' - accord2 7430 1 74.26 AGATANCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGTATTCTTCGGACG:1 - chr2L 6177166 3' - pogo 31 1 60.40 AGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTACTGATTGTGTTTGCACGGGCTACTGGCCGATGGTGTTTTGGCGGTAAGTAGAACATGGTTTTTTTTTTC:1 + chr2L 18384898 3' - F-element 194 1 75.00 TGATAGCGACTCGGATTCGTATCACGATGATCCATTTTCTATGCATTTGAACGTAGAGTTTTTTAGAGGCTAGCCGGCAAAGTACTGAATCAAGGTCAATC:1 + chr3R 4960548 3' + transib3 2544 1 56.44 ACTAATCAAATCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTATGTAAGCAAACATCAGTTTTCATCTTTC:1 - chr3R 7363751 3' - Cr1a 4072 1 73.27 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCAATTTCTAAAATCTATTTTAAATCCGTTAAAAGTTTTGTAAAGTTAAAAATCTTCAATGCA:1 - chr2L 8640795 3' - roo 8678 2 64.36 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCAAACCTTTTTTATTACGGGATCTGATGGTACATTTTAG:1 - chr3L 22564825 3' - blood 38 2 67.33 ATTGGATTTCAAGCTGTCTGAATGGCAGGACTCGGGGGCACAATATAATTGAGATTGATGCAATTGCATATAAAATTCATATAAATTACTTGAAACTAACA:1 + chr2L 13570776 3' + Q-element 401 2 77.23 AATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTT:1 + chr3R 846259 3' + Stalker 6939 4 75.25 AGTATTCAGCTTGCGGCGTGTAAAAAATTAACAAGGCAATAATTGTATGCTTTAGGCGTATACATGCATGAGTGTGTGTGAGCAATTTTTATTTTTCTGAA:1 + chr2L 19575475 3' + 1360 417 1 57.43 TGCAGTGTTACAGTTACTCGGGCCGTTGAGCCACCGTTTGAACTTTGGCATTCAGAGCTGCGTGGCAAAATGAGTTTGGATAACGAGGAGCGGGCTAC:1 + chr3R 20919443 3' - Doc 479 1 79.59 CCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCTCCACGAGCATGTGCCGTGTCGTTGGCACGTGC:1 + chr4 702986 3' - R1A1-element 5123 1 67.33 TTATTATTATTGTTATTATGTTCCTATATACTACAGTAGGCAAATAGCATCAGCATCTGTATCTGTATCTGGATCAGCATCAGTCAGGCCGTCAGATTGGC:1 + chr2L 14451654 3' - mdg1 7052 2 60.40 AATTGNTGTCTGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGAGAAGGGGTGTGGTGGACAAATCAGATGTAGATGGAAGA:1 - chrX 14403847 3' + gypsy12 10097 2 60.40 AACGCCGACTTCCCATGCACCAACAACGGACATGTGCCGGATGCAAATGGCAGACTCCGAGATATGAACTGCCGATGAGGGCGGGGGTCCTGCAAGTGCAA:1 - chr3R 22313524 3' - R1-2 2776 1 73.27 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGCTGCTACGACGAGTCCGAAACGCCATT:1 + chr3R 21500406 3' + hobo 2879 1 73.27 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAGCATACTTTGTGGCTGATACTCGGGAAGGATCTCTCGTTACCAAGCAGCC:1 + chr3L 947961 3' - hobo 1 1 78.22 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCACGCCTTTTTCCAAATCGT:1 - chr3R 15153053 3' - hopper 54 1 79.21 TTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGGCCAACGAAATAAATCGAAAGCTTGCCTGGAAAGCAACGCT:1 + chrX 13658312 3' + Stalker 169 6 60.40 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGG:1 + chrX 22517674 3' + 1360 3362 1 59.14 TGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAAGCCGTACAATTTGACCATAAGTTCCTTCTCCACAATCCAACAACACGTAGGCATCAATTGCAGTCCTGAT:1 + chr2R 10308153 3' + invader4 2887 2 71.58 GATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCAACCGAGCACTTAAAAGATTAAAGAATACATTAACCAGTATTCTTTAATCTTTTAAGTGCTTTCCGTTTT:1 - chr3R 12745739 3' - Copia1_DM 163 1 44.55 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTAAGCATTCTCTCTTGTTTTACATTGCCAGCTGATTGAACTCGATCAGTGATTCCTTGATCAG:1 + chr3R 24199185 3' + INE-1 546 1 62.38 ATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAACACTGCGTTGCAGGGGCGTGGGCAGAGGGGATTTGCTCGATACAAATTT:1 - chr2L 10748284 3' + 412 49 2 57.00 TACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATTGACTGGATGCCTCTCGCCTTGAGTTCCGCTACAGTGCC:1 + chrX 2252755 3' - Tirant 445 1 59.41 TGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGAATTCGTTATTGGTTTATTGTTAGTTTTAATTTCTC:1 + chr3L 10464716 3' + invader3 262 2 64.36 TGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATAGAAATTATGTGGATCTGTTTTTTCAGTGAGCTTCTACTAGCAGTGTCAGTTTCAGTGGTCGC:1 - chr3R 4619448 3' - I-element 4957 1 54.46 CGTATNTCAAGAGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTTATTATGTTTTTAAACTTTTATTTAAAATATTTTATCAATCTTGCCGGCTGAGCT:1 - chr2L 847231 3' - Stalker3T 109 1 64.36 AAAAAAAAAAAGAAAATTAAAACGAGACGAAAGACGAAAAGGTTAAAGGCCAAAATACTACCGACTCCTCTAATGCCCTGTAATGTGTTAATGTTTGAAAA:1 - chrX 9758298 3' + Doc2-element 252 5 57.43 GAAATCGGCATGAACACACACACACACCTCAATCTCCGCCTGAACCCAGTGAATTGCTCTGGAACCTCAGTCAAGATAATTTCCTCAAACTTATCA:1 + chr2L 5184561 3' + accord 172 2 69.79 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTG:1 + chr2L 22227343 3' - F-element 57 1 72.28 AGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATCAAATTAAATAGCCACACACGCAGAACTTAAGGAACATGAACGCACGCGAAGAGCAATGTATATG:1 - chr3L 11114870 3' + 297 6778 2 79.00 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGACACTGGTTTTGTCGCCTTATCAGCTAATGATTACAAAGCAAATATGTGTTGTTTGTGGTTTTTTGTTGT:1 + chr3R 16334497 3' + hobo 2933 1 53.47 TGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAATCGAA:1 + chr3R 12789907 3' - flea 42 2 70.00 TACCATCTAACGTCCTTGGATGGCAATAACCCTCAGCTGAGGGATTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTATGCTCTCTCAGTGCACATAACAGCATCGC:1 + chr3R 29541649 3' - Rt1a 5022 1 80.20 AGGTCCGATCGGGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCGCACCACAGTGTTGACATTGTTCTTCTTTAGCTCCTACAAGA:1 + chr2L 16248755 3' + invader4 2889 2 67.33 TAATTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATATATCCTTTTCCCATTTAATTTTACCTACCTTTTAATAAATA:1 + chrX 21638098 3' - gtwin 6949 2 58.42 CGAATTTATGTTAGAGAGCGAGGGAAAGGAGAGGGCTACAGAGCACAGCTCATTTTGCCGCACACACCTGGTCCTGCCCCTCGAGCTCTTTATACCAC:1 + chrX 1427110 3' + 1360 94 1 50.00 TGTTTACTTGATCTGCTCGAGAGCGCTTCTACCTACTCATGGACTAAAATGGTATAGTAGATTCGCTGAAATGTATGTAACAAGTAGAAGAAAGCGTTTTC:1 - chr2L 14695478 3' - Tom1 216 1 69.31 ATAGTGCAAAACCAGTGTATGGCTGTTACGCATCTTGTTATTCAAGTGCTTTGTGTTTTGATGTTGTGAGCCTCCAGTGACTCCAATGACATGGACCTCCT:1 - chr2R 4122461 3' + 1360 3356 1 55.45 CAAACCTCGAACGCACGCAACATTAACTCCAGTGCACAATGTATCTTAATTTCGGGCATAATTAATGCCTGCAATTAAGTTTTGTTCCCCACCTTGGCAC:1 - chr3R 31012935 3' + HMS-Beagle 6644 1 81.00 GCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACCGTTAGAGCCAAGTTGGAGTCA:1 - chr2R 20576200 3' + Quasimodo 6922 2 74.24 ACAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAAGAAATATATGTAAAAAAAAAAATAAGAAAAAAAATGAAGAAAATAACCA:1 - chrX 11817074 3' + invader2 453 1 54.46 TTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGCGACAGCGACACTAACAATAAAAGGCTCACGCACACACACAAGGAAGCAAACAAACAGGAGAGCACCCAC:1 - chr2R 14552229 3' - Tirant 396 2 72.28 CTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATGTTATGATGTTGCGTTGTTGTAGGTCAGTTACTGGGGCAGGTTTTGCATTGTTTGCCGGTC:1 + chr2L 8824001 3' + 1360 232 1 68.32 GAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGCATAAGGATAAGGAGGATAACGGAGTCCTGCCCCACATACACGCACATGACGG:1 - chr3R 16384047 3' + Tirant 8283 2 57.43 ATCTGATTTGTGGTCAGTTAAGCAAGTTATTTTGTAAATATATTATAGTAGGTGTGTCCCGTAATGAAGAAAGACAGTCCTGTTGCAATGCACCTTGATTA:1 + chr3R 6400667 3' + BS 280 1 65.35 TGGAGCGCCACAAAAATCGGCTGGCTAGCGCTCTAAACATACCTCTCCCACATCCTGCCATGCCTGCTGCTCGCTGAAGTCCGTGGTCTGTGGTCCGCCCA:1 - chr2L 17626260 3' + X-element 4429 1 57.43 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGCAAACTATATTATAAGCCATGCCAAGAAACTTGGGTAAGCTACAAATATTTTATTTTACTA:1 - chr2R 23343732 3' + roo 395 1 63.37 CACCATCGGAGCAATTCCGATGGAGGGCGACAGCAGCGTGAGTGCGAACGCACGCAGTGCTGCATACTTTCAGAGGACACTGTACATGTAATTGCATTCGT:1 + chr2R 14280718 3' + R1A1-element 366 1 60.40 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTATTTGATGTTTAAAGAAGACAAATAGTGTTATTTTTTATTAAACTCGTTGGTCTTTCGGAATACACGA:1 + chr3R 3457070 3' - 1360 14 1 71.29 CCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACACCCACACAGCGAACATAATTACTTTGGTGGAGC:1 + chr3L 11416541 3' + hobo 30 1 72.28 AAACTAATAATTAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGGAAAAATTAAATGTTCTTACTTTGGTTTTTTCAACATACATTATCATAAACTTGTAGCTTAATA:1 + chr3L 20242233 3' + Transib5 311 1 71.00 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAAAGATGATATCGAGTCTGAAATCTGTGAAAATAAATT:1 + chr3R 19444955 3' + roo 9053 2 63.37 ACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTCGTTGCAGGCAGGATGTGTGTAGTGGTGCCGATTGCGATTGTGTTTGTGTTTGTCCAGGCC:1 + chr3R 7389119 3' - F-element 444 1 67.33 GTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCTGTGTTACTTGTGTGTGCGTGCATGTGTATGTGT:1 - chr2R 13223491 3' - Rt1a 42 1 67.33 GATGCGTATTAACGATCGTACTACGTGCAAAAATGGCCAACTGGTTTAGCGGTGTTCTCGGCCAAAACTGTGCCAAAGAGCTCGAAATTCGAACTCATTAC:1 + chr3R 32008551 3' - transib2 231 1 72.28 CCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGCGGCAGCTGGCATTTGAGATTCCGGCTGTGCTGTAATTGTCTCCTGTTGCAAGGGAACTTG:1 - chr3R 31675085 3' - F-element 421 1 69.57 ATTCATGCTGCAGAGTGAGGCGGAATGGCTGCCACGCCCCCAGCTTCACCTTCAACCTCTCACACTGACCCTCCTCCCATCAAAGGGTGTAATTAATGATG:1 - chr2L 18418590 3' + Rt1c 5202 1 74.26 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTTTTCACTCTTCTTTTGAAGACAGTGGCATTAAAAAAATGTCGTCATGCTTGTATTAATA:1 - chrX 12958873 3' - roo 15 2 51.49 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGACCGACACGCAGGTGGACGACGTAAAAAGA:1 - chr3R 25395612 3' + roo 9026 1 70.00 AAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGACCAGGTCGATTATGAAAGATTCATTTTGCATTAGTGATTGTGCTTTTTGGTGCGGTGTTTAGCTATTTGTTTGCAT:1 + chrX 1132912 3' - 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Doc3-element 4396 1 73.27 TAGAGGATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCTAATAAGGATAATCGTTACTCTACGC:1 + chr3L 3252966 3' + 1360 414 1 71.29 TCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATCTGTAACACTGAATCGCAGGGAAAAGAACGAAATTCATTTTTCTGCCGGAT:1 - chrX 16300355 3' + HMS-Beagle 6618 1 52.48 GCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGCGGTTTGTAGGGTATTATTTAGTGTAATAAT:1 + chr4 613883 3' - 17.6 64 1 73.27 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCAGCTTAATGCGGAATTAGGCTTGAGATTTTCCTTCATTTGTTCGTACATAAATATG:1 - chr2L 15020083 3' - jockey 4687 1 59.41 TTGTCATTAGAGTATTCATCTTGAAAAATTATTAAGGACAATACTGCTTATTATAATTTCAATTCACTTTAAATTGGCACATGCAGATCAGGGTACG:1 + chr4 611639 3' + 1360 407 1 72.16 TGTGTGTTTGTGTGTGTGGTTGGATGTGTGTGGCTTTGCTCTTGGGAATTGTGGCGTCACCATGGTGTATGCGTCATATTATATTTTCGTAGCTTACTAGC:1 + chr3R 15386105 3' - gypsy3 421 1 67.33 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAGTTCAGGCTTACTGCAAAAAACCAACGCAGCTCAGACATATAAAATGAACCTTCGAGCCACGGATATTTA:1 + chr3L 483340 3' + roo 405 1 72.28 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTCTTCGGTCTTCAACTTCTCGACTCGCTCTTCGGCTGCTTGGATTTCAGTTG:1 - chr3L 16936776 3' + roo 9047 1 54.46 ATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTATCGCGAGGAACTGGGCATAGTGAGCTCCGATTC:1 - chr2R 11261503 3' - Tc1-2 175 1 70.30 CTTATAACGATCCTCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTATATTGAGTTAAAAATGTTCATTTTCTGCATGTGCTTTAATTGC:1 + chr3R 31993378 3' - mdg1 450 1 54.46 AACCGGGAAGCTTTGCAATACAAGTTGCAACAAGTCAAAGTAGTTGGGCCCTCGGCCGTGGAGCTCTGTCACTCTACACATAAAAAAATGGGAGTGTTTTG:1 + chr3R 14855773 3' + ZAM 74 2 72.28 TTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTAGCGATCTCAGGGAAGAGCTTCAGGCGCTGGGTCACATGATCTATGATCTGGGGCTCG:1 - chr2R 21391104 3' + rover 146 2 65.35 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAA:1 + chr3R 5208218 3' - hopper 27 1 56.44 GTAAGATCTCGACGTTCATACGGACGGACAGTCAAACGGACAGACCAACGGACAGATGGACATGGTCAGATGGACTTGAGGCGACGAAACAGACGCTCATT:1 - chr3R 11554654 3' - INE-1 136 1 75.25 CATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTACACAGTCTAAGCTATTACTTAATTTGTTATTTGTTG:1 + chr2L 19566825 3' - diver2 73 2 68.32 GATTGCAAGCAGAGGAAACTTTAATGCTGCCTGAGTATACTGCCCTCCGACTTTTATATGCACCAGGGATTAGACGGGAGCACAGACGATGACAGTTTCTC:1 + chr2L 15623629 3' + G5A 300 1 55.45 CCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACCCTTTTAACAACCTGCGATGGGCGACGCAACTCTTCTCGAGCTTCATACTCTACGGTACCTTGTCGGT:1 + chrX 19584808 3' - Circe 7187 1 60.40 GGGCCACCAATGAATAGTTGTGATGGGGTTCGCAAACACAAATCATATATGCACGATTTATCTTCAGTTTATTTCTCCAGTTAAATTCACTTTTTTGCACA:1 - chr3R 10686140 3' - diver 234 1 74.26 GCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGGGACTTATTTCACTTTTCATTGCCTCTTTAATTGCAAATGGTGCGACCCACTTTTTGGCCAAGTCTCGG:1 - chr3R 17382717 3' - F-element 237 1 73.27 GGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTCAGGGTTCAGCCACCCCGATGACAAGT:1 - chrX 6152331 3' - F-element 4522 1 73.27 AGACGGGACATTAGTTCGACTCAGTAAAATACAAACATTTCAGTAGCTTACAGGCAGATATGAAGTAGGCGATTAAGCTGGATTTGTACATAGATGCTAAG:1 + chr2L 17753204 3' + 297 370 2 55.45 CATTCCCCCAGGAAGAGTGCCCGGCTGAACAGAGGGGAAGCCACCCCTATAACAACAGTGAGTACAGTCGCGGGAGTAGGGGATGCCGTATCCAAGTGGAG:1 + chr2L 6197019 3' + aurora-element 476 1 62.38 TTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAAGAGAGGTGAAAAAACAATTTTGCGATTATATTGTTCACGTGTTGCCAAATCCGCCC:1 + chr2L 1542165 3' + R2-element 3382 1 59.41 ATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCG:1 + chr2R 5532340 3' - G4 3773 1 56.44 ACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCTGGAGTAATGTATGTTGTATTGGGATGTATATGTTGGATTTGGTTTGCAGATTTGGCGCTGCAA:1 + chr2L 14963231 3' - Idefix 6925 2 72.28 AAGCACACACACACACACACATGCAAAGCACACACACACACACACGGATACAAAGACGACCTTTACGGTATTGCTCATTGTTGAATGATGTATAAAGCTTC:2 - chrX 6498701 3' + accord 181 3 53.47 AAATAAAAACAAAAAAAAAAACAGGTGGGAAAAATAAGTACTTGTTTGTTGATTTTATTCGAGCCTTTGACTGCTAAAAATAAATGGTGGAAA:1 + chrX 7349100 3' + HMS-Beagle2 488 9 83.87 GAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAGAGTAATGTACAATGCACGAGGATGGAAACTTGACGGCATTATACATACATATATACGCTAGTA:1 - chr3L 979113 3' + micropia 5300 1 70.30 CTATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGGCACTGATGAAAATAAAGTACAAAAAAAATCGCTTTTGAAACGCATATTCAGGAA:1 + chr3L 7132075 3' + F-element 4260 1 57.43 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCGTGGAAGG:1 + chr3R 20140609 3' + jockey 4965 1 64.00 GCAGAATGCAAACGATAGCAGTCTTGCTCACCAATGCTTATGGCTGCACGAAATGAACCCGAAAGCCCCCCCCCAAAAAAAACCAGATCTGTATCTGTAG:1 - chr3R 24991765 3' + Doc3-element 365 1 66.00 CCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGAACCCAATCCAACAGACATTAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCTTGATCTCAGCCCGGCAGTCTCAGCCTAGT:1 - chr3R 2451641 3' + Quasimodo 6994 4 70.30 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACC:1 + chr2R 18865896 3' + roo 9026 1 72.28 GCTGATTGAGAGAATGCAATTCCAAGGTATTATTTTCTTTCCTTTACTTACCCTGTGCGCTTTTTCTTTTAATGTCATCGCTTATTATGCAAAATTGTTGC:1 - chr3L 5255324 3' + transib2 179 1 78.22 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAGCGATGACCCTGGGTACACACAGAAAAATGGGCA:1 + chr3R 27619286 3' - hobo 16 1 61.39 TGATGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTCAGTCAGAATTTTCACTGCCTGTTTC:1 - chr2R 18061028 3' - F-element 407 1 74.26 AAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCTGGGTTGCATCTTTCGATGTTGTTTTGCAGTGTGGTAGCCCCACATATCGGATATCCACTGTACCTTTTA:1 - chr3R 3843047 3' + Max-element 8528 2 72.28 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTG:1 + chrX 14424087 3' - hobo 27 1 65.12 GAAAGATGATGATCTTTCTTATCTACCGTTTGAAAGCCAAACCAACTAAGACCACTGCGCATCGGTTTTGCTCGCAAGTTGAACGAGTTGCACTAATCTTC:1 - 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ZAM 94 2 81.19 ATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCCGTCCACGTTGACAAATTTTTTTTGGAGAGGGTTGCGCGGGACAGATTT:1 + chr3R 24482434 3' + F-element 4427 1 54.46 AGTATATTCTTGATCGGGATCAGTCTGTCTGTCTGAGCTTAAACTGTTCGATCGTCTGAGCAACTCGGGATTATTGGCGTTCTTCCCAAACTCTCTCTTCT:1 + chr3L 18087368 3' + INE-1 81 1 70.30 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCTTTTAAAATCACTTTGTTTTGTTTTTTTAACAACG:1 + chr2L 20084925 3' + 412 7508 2 60.40 CCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACATGCTGACAGATGCGCAGTGAACACAAATGCAATTTAAATTGAGTTTTTGACCAAACACAACATATGAACG:1 - chr3R 12193076 3' + HMS-Beagle 67 2 76.24 GTCCTGAATTCTGCAACTCGAATTGGTTTTACTCGGG:1 - chr3L 10791659 3' - diver2 4419 1 70.27 CGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCACCTTGAAATCGCAGGCACAGTCTCAACG:1 - chrX 9260051 3' - Max-element 440 1 71.29 TACACTTTGTGACACAGTTGTGTTCTCCCTTGTTGTTGATGTTATCATTTAGGTTGCCAATTGCTGGGTGTGTATGTGTTGTGTCCCTATGAATTGTGTTG:1 - chrX 18883373 3' - G5 82 1 63.37 TGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAGAAATATTGAGAAATATGAAACAAAACATGTAACGGAAATGAGAAAT:1 + chr3L 14005636 3' - F-element 37 1 49.50 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAAAATTAAGGAAGCATAACAACAA:1 - chrX 9531894 3' - F-element 61 1 74.26 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATAC:1 + chrX 3485689 3' + P-element 2838 1 28.71 AGCTTCACTAAATCGTTTTATGAGCTTTTAAAGTTGAAATTCTCTTAGCTGATTGAGAGCGACACAAACACATTACAAATGGAGTCAAGTTTTCCGGAATG:1 + chrX 700786 3' + transib2 131 1 67.33 CAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAACAACAACTACAACAACCACAACTAAACAATGTTAAGCGTAAAGATTAAAATATATTCCAACGA:1 - chr2R 22413085 3' + Porto1 229 1 64.36 TACATGGTGTTCTTACATATTGTATTGGTGTTCTTGTATTGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATCAGTTTTCTCTGCTCG:1 + chr3R 19949599 3' - Stalker2 7530 2 44.55 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTTAGGGTCTGGAACGGTGCTCGGGGATTGAGTGTGGTCAGTATATGCCTAACCATTATGATTGCTGCCGGGT:1 + chr3R 21709561 3' - 1360 24 1 79.21 GGACGGGAGCACCGAGTCGCTGGGAGCCTCTGGAGACATTGCAGGTAAGTAGTTGTTTTAATTAGGCTGGGTGGTGAATCGAAAAGAGACACCAGCTGCTT:1 + chr3L 22343978 3' - 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chr3L 16150714 3' + P-element 2847 1 39.60 TTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCTTTCGCTGCTCGGATTCAATTGCAATTGCCATCGACAAAGCCAAGCGAGTCTTC:1 - chr2R 13690457 3' + F-element 69 1 60.40 CCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAAAGGCACCCTCTCTCTTCCCCTTCTCCACTGCC:1 + chrX 9750188 3' + accord 6977 2 63.22 GAAGGTTTATATTAAGCATACATATTCTAGAGACAGAACCAGCGCAATTAATTTCGGCTAGTTTCGGTGGCCATGATTGGAATATCAGCGAGGAAGGACGA:1 - chr3R 17245703 3' + INE-1 173 1 61.39 CAAATAAATAATAAAAAAAATAAAATTAAACGAACTAAAACATTGACTTCCAAGAAAACAACCACACGGCATATGGTTGGTACTGGCTTGGGGG:1 + chrX 8169977 3' + BS 5093 1 73.40 GATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAATCCACCATTCGGCACACATCTTTAATCGAACACGAAGTAATGTCTTCCGTATCCATTGCAGCCTCACCG:1 + chr3L 12783374 3' + G-element 3922 1 73.27 TGTCAGGTACCCTGTTCAGCCCTAAGCTAGGCCCCATTTCTCTTCCAGCTCCCTCCGATCCCTGCCAGCCTTCGCCCTGCGGAGCCAATGCTCTGTGCAAC:1 - chr2L 4488335 3' + Rt1b 4684 1 77.23 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATA:1 + chr2R 5910905 3' - hobo 51 1 73.27 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCGCACAACCACATGCGAGCACTCG:1 + chr3L 22324108 3' - hobo 16 1 61.46 CGAATTATCATTGTTTTTTTTTTTATGCTATTAATGATTGACATTTGTATGTCCACACTCGCTGTGTAACTATTTTAGTCTGTCTGGCAAGTTCGAACTGC:1 + chr3L 14205232 3' - transib2 2647 1 69.31 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTAATGACCAAAAGGTAAACAACGAAGGCAGCCAACAGCGGTATCGATAACCAAACTAATCG:1 - chr3R 12408317 3' + P-element 2868 1 60.40 CCTCCACACACACACACACACTCACTCACACACACTCACTCACACACACGCAGCTCCCAAGTATCTGCATCTGTTTGCCTGGCGAAGCAACAAAAATGCGG:1 + chrX 2358653 3' + accord 255 2 41.58 GGCTACTGTAAAGTTTTGTTCCGACACGGTTCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCTTGCCTTTGCCTGAGACTACCGTTGATTACTATGTT:1 - chr4 646276 3' + mariner2 92 1 75.00 CTCTTAGATTTTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGCTTTTCGGGATTTGGGTGAAGGGAACGAAAGGAAAGAAGGCGGGCGGCAGGACTTGTA:1 + chr3L 12311875 3' - Idefix 307 2 63.37 AAATTAATCAAAAGTAGTCTACTGGTATATGGAGGTAATGTAAGGTTTGCTTTCCAATTTAGGCACTTCAAACCACGACATTTTTTTTATTTATCCTTGTC:1 + chr3L 23284145 3' - Cr1a 3981 1 66.34 CGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTGGGTGTTCCCGGGA:2 - chrX 17049515 3' - Stalker2 7248 1 79.21 AAGAGAGAATGCCATACTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAAACCTAGCCTATAAATATGCTATTAGACTATGTAAATAG:1 + chr4 512367 3' - INE-1 577 1 62.00 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGTTGGGTGTCAACATTTTTGAAATGTGTTCGCATTTGTATCGCCG:1 - chr2L 14536220 3' - blood 8 2 69.31 CTTCATGCCGCGTAAGTGTAAGGCTGTGCCAGCTACAGCACCCAGTTCGGCCTGCCCGCCTCTTAGACCACATCAGACTATAGCCTCGCCGCCTTAGTGGC:1 - chr2R 5511633 3' + HB 1290 1 76.24 ACCTCGTTGTCGCCTTTGTAGCTGCGGTGGGCAACATTCTTGCAAGTCGGTGTTTCGCAATCTCGCACAGTAGCTAAATAATTAGAAAAATATTATATTTG:1 - chr3L 15660073 3' - Chouto 449 1 74.26 ATAGTCAGAACATAATACTCTGTGTAAGGTCAGGTGTTGCTTATGCCAGTTCGCACAGAACAAAGGGCAGTGGATGAGCAAGGTTTCAATAGTGTGCTATA:1 - chr2L 5772780 3' - Cr1a 4189 1 71.29 CACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCTGCGCCTCATGGAGGAGGAGAAGGAGGCACGCGAGCGGCAGG:1 - chrX 19703504 3' + micropia 381 2 53.66 CAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCTGGGTTGCATCTTTCGATGTTGTTTTGCAGTGTGGTAGCCCCACATATCGGATATCCACTGTACCTTTT:1 - chr3R 3843048 3' + Max-element 292 2 71.29 ACTTGCACACACACACACACACACAGACCGCTGCACCTCGTGTTGAGTGCACATTCCACCCGTTTCGCTGTTGCCGGCTTCCAGCATTCAGATTCAGTTTG:1 + chr3R 16851277 3' + Quasimodo 35 2 54.46 TTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCCTTTTAATTGCAACCAGATCACCTGCTTTGACTTGATTGGCCGGCCTTTTGTTGTCGTTGCAGGGCAACCGCATGCA:1 - chr3R 12788329 3' - flea 4535 1 53.47 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTG:1 - chr3R 7808967 3' - jockey 63 1 76.24 GAACCGTGTCGGGAAAAAACTTAGCACTAGCCCCCTTGCTCACGAAGCACAATGTCGCGAATATCGTTATATCGTTTCTATTAGAACTGGAAAAGCATCG:1 + chr3L 16079049 3' - mariner2 102 1 71.00 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCCACACGCATGTGAGCCGTTCCAAATGCACAGCTAGAAATAATATCAAGCAATAGAAACTTATATATAA:1 + chr2L 1629673 3' - hopper 5 2 68.32 ATACCAAAGACCCTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGTTAATACCTTACGTTAGTTACGTTATTTTCTCTCTGTGTACATACATATTTATGCACTTCTGTC:1 - chr3R 28842006 3' - Tc3 314 1 58.42 GATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGCAACCGAAGGAAGCGTTCCCGACCCTATAAAGTATATATATTTTTG:1 + chr2L 17268905 3' - Juan 3758 1 57.43 CGGAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGCGATAACCACCGAGCTCAGAAGATGATAGATGCTGGAATGTCCGTCGAGTGTAATAAGGATGGCATTA:1 - chr3L 24309911 3' + Rt1c 5222 1 55.45 CCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATT:1 - chr3R 9193596 3' + roo 9030 1 66.34 AAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGTACGCAAAATACCAGATAAACCAGGGCTGGTGTATAAAAAAGTTCTTACAAATTTCTA:1 - chr2L 13367553 3' - hobo 2671 1 66.34 TTTTTTTTTTTCGTTTTATTTGGTTGAAACGGAAACGGCAGCAGCAGCAAAACTTTTTCCGACGCTTCATGCCGTCTCCCTTCGGAAAAAGGAAGTGCACG:1 + chrX 9433812 3' - gypsy7 5006 2 56.44 AAAACTTGATGATGAGAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGGTGGCGGTCGGGTTGGTAAAACTA:1 + chr3R 27382782 3' + Dm88 343 1 76.24 CAGTTCCAAAATCTTGGAGCGAAGAGTGCACTTCCCCAATGCCGCAACCAACAAGGATGGCAAGAAGAACAACAACAGGGCCAGGATAATACGAGCCAAA:1 + chr2L 8638348 3' + Doc4-element 155 1 56.00 GCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTTGCCAGCAATCAGATCATGCCAAGCTTAAATGCCCGCCCTAGCCAAAGCCAAAGCCCAAACCACAACG:1 - chr2R 9257688 3' + accord 113 2 74.00 TCATAGGCATCCCAACATAACGGCCATCTCCCTACTGGACAGTACTGAACAACGCCGCAGACTTTGGAGACGATTGGCAGCCAGGATGGGGCTGCTCTGAC:1 + chr2L 16811825 3' + G7 980 1 60.40 GAGTTAAAAGCATTCACATTCAACAAAAGGAAGCTCGTCTTTAATGCATTAAGCCCCAGACAAAAGGCAACAAGGAATTTTTGTTTCACTTAGCGCAACTT:1 - 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chr2L 5437507 3' + gypsy5 406 2 50.50 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGA:1 - chr2R 981622 3' - 1360 61 1 68.32 AGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGGCTCACTGAGGAAAATCCATTTTTTTTCGACGAAT:1 + chr3L 21223416 3' + F-element 217 1 69.31 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGACGTTGCATGCAAT:1 + chr2L 3621153 3' + 297 365 2 56.44 CAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAATCAAGTTGTTAACAATTTCGATGCTTTCGATCATAAAGTGTATACACATG:1 + chr4 716983 3' - INE-1 159 1 74.47 ATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGACATAAACTACAGACAAGAACTAAACATACAA:1 + chrX 9172649 3' + R2-element 3513 1 68.00 TTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGATCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGCCACACATGGTCGAACTTCAGCTTGAGTCCGTACTTCGGCACTGCCGCG:1 - chr2L 14334451 3' - F-element 318 1 51.49 ACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCG:1 + chr2R 4879021 3' - G-element 35 1 56.44 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAA:1 - chr3R 9996396 3' - blood 7053 2 63.37 GACTTNTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAA:1 - chr2L 5932102 3' - jockey 32 1 51.49 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTAGA:1 - chr2R 16018823 3' - I-element 20 1 58.42 CACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGAGGGGTGAGACGCGGTCGCATATGCAGGCAGCTGCACACAGA:1 + chr3L 13737467 3' - Doc 489 1 62.00 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAAAAAGAGAGAACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr2L 18177089 3' - pogo 46 1 76.24 TGGGAATGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGATAAAAGATGATTTTCTAGTAGGAATTACTCCATGATGTAAATGTAAGTGTAAAATGTATCAATAATATA:1 + chr3R 15611937 3' - Idefix 7000 1 72.28 GTGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAAGGCGTTAGAATGGGCTTGGCAACATTTAAAAAATGTTTATACATAAAATATCATAATGTATTTAAAATTAGAACAAA:1 - chrX 22784212 3' - 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pogo 21 1 60.40 TAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGGTAATATAGGCGCCGCAAGGCAAAAAAAAGCGGGGCCTAAATTTGATTATGA:1 - chr2R 17411628 3' - Cr1a 3991 1 64.58 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTCCTCCG:1 - chr2R 14121051 3' - I-element 16 1 62.38 GAACACACACACACACACAAGTCAAGTTAGAAGTTGAGGAATGGGATTCTCTAATTGATTTCGCTACGGTCACTGAAAACTGCTTGTTTGGGAAAGCCCAA:1 - chr3L 22546281 3' + accord 183 2 63.37 AATTTAAAATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGATCAAGTGAAAATGGGAAGGCGCAAAGAAAGAAAGTGCTAAGGTTGAAAATTTT:1 + chr3R 16666887 3' - G-element 4291 1 59.41 CGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTGCACCAACCACTACAAAACAATTCGTCAGTGAAGAAGCGCTGGTAGTGGTAGGTGCAATTGTTCCCGAGCAGG:1 - chr3L 14014636 3' + F-element 227 1 46.53 TTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGCCCCTGGAATGTTCCTTGGGTTTCAAACTGTGCCCACTTAATGCCCGGTTGTCCTCTGAAAAGAG:1 + chr2L 16337453 3' - F-element 4317 1 62.38 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCTGAAGGAAGCGATTCCGACGAAATAAAGTATATATCAGGATCAATAGCCGACTTAAAAAATAACTTCTAGTTCCAA:1 - chr2R 5075985 3' + INE-1 16 1 75.25 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTACCATGCTGAGCGCACACATGA:1 - 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INE-1 412 1 71.29 CTTAAGACTAAATGTACAGAGTTTTAATCCTAAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTATCAAATATGTATAACTCGTATATATAGCACGAG:1 + chr2L 8185110 3' - rover 7170 2 37.62 TGCTGCTGTTGCTGCTGCTGGATAGGCTGCTGTTGCTGTTGAGTTGTCAAGAGCGGAAGGGG:1 + chrX 317545 3' - TART-B 150 3 72.58 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGATGATGATGACGATGCATTCGAATTTCGAATTGGCCAGGCCAGTTTTACTTTGCCTCG:1 - chr3R 14282731 3' - P-element 16 1 64.36 AGCATTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTCAGGTAGAACTCATAGGGTATGTGTCCGCTAATTGGATCTATGGCCACTGGCCACATTTC:1 - chr2R 20146640 3' + R1A1-element 5038 1 64.95 AATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTCTGAGATTTCTTAACAGAAGAGATCGATAATATGTTATGCTCCTTATTTTGCTCAGTGCACCAAGCGGAAA:2 + chr2R 9249291 3' + flea 5013 2 70.30 TGATGTAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTATAAATGTTCAAATTGTCGAACT:1 - chr2R 18891021 3' + opus 7496 2 66.34 TCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTACCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGCTACACTTTACATCGATCTTTGATCTCATCATCAAG:1 + chr3L 20387976 3' - roo 232 2 64.36 AATGGNCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACCTGCTTTAAAATTCCACTCACATTGGCCGCCGGTGCCG:1 + chr2R 15826156 3' - roo 296 2 61.39 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCGTGGAAGGCGCGGAGAGC:1 + chr3R 20140619 3' + jockey 4976 1 53.54 ACCGCACAAAACTCCCACACCCACACTTCTTATAAATGTGATGATATTGCTTCATATTTTTTGGGTTGGCTCCCATGTAAATTTCCGCCGCAGACGACAAA:1 + chrX 22779862 3' + INE-1 355 1 62.38 TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAGCAATAAGGACACAAATAGAACTGGTTCTGTGTATAGGCCCTGCTCTTCATTTATCAATACTTGATCGG:1 + chr3L 14365048 3' + blood 369 2 70.30 TCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGCAAAGTGCACAAAAAGCTGCTAACTGAATTCGCAACAATTGAAAAAAATTGACAA:1 + chr2R 7187439 3' + gypsy3 309 2 64.36 CGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTGCCAATCCAAAAATCGAACCCAAACGAGCTCGAATTGAAATAATGAAGATAACAAAGAAATATGATAAACAAAACC:1 + chrX 2932611 3' + Idefix 7063 2 68.32 ATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGGGGATCAGCTGAAGAAATTGCAGACAGGTGGCAAATGGA:2 + chr3R 28420822 3' + accord 483 2 61.39 CAACGAGGATGTGGCGTCGTGGAAGATGTGTGTACCGATCGAGCATAGGCAGCGCGTCATGGCCAAAAACCCCAAAATCTTCGATCCTTTGCTACGTATTT:1 + chr3R 10580168 3' + Osvaldo 435 2 70.30 TCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGTTGCTCCTGATTGCTGCTTAAACTTTTCCCT:1 - chr3L 19445122 3' + Bari1 240 1 69.31 GGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTCGGTTAGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTATGAAAATTCTATCGGATTTGGGGGGCGCTGCACCC:1 + chr3L 21092621 3' - G5 4601 1 73.27 GTTGCCTATCCAATGCTTAATATTTTGGATGCTCCAGACACCTTTGACGTAGAGTTGCCGCTGAAGAGGCGCTGATGAGAGGGGATGGTCGTCAAG:1 - chr2L 15018070 3' - invader3 4997 1 62.50 TAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCTTCGGCGATGGCGACGTCTCTGGCGAGCAGCTGCACGAAATCCTGCGCGAGATCGATACCAACATGA:1 - chr2R 15858222 3' + Idefix 7121 2 78.49 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAATAGTA:1 + chr3L 5827938 3' + blood 335 2 65.35 CGACGCTACAGCTCCGCTTAGCTCGGTATAATAAAAAGTTGAAAGTAACTCCTTGTTCAGTTCGGGAGCAGTTTGGACAGGACAATTGATGGACAAACATA:1 + chr2L 1489347 3' + gypsy2 6706 2 70.30 TATAAGATATATATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGACGTATCCGGCAGCGCAGCTACGCAGCTTAGCCTAAGGCGCTTACTAATCGGCACAGCCAAGACTA:1 - chr2L 8700894 3' + 412 7324 2 71.29 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCCCCTATAATTTAAGCAGCAACAGCTTAAAATTAGAACAACGCTCGGCACGCAAA:1 + chr2R 22740114 3' + Transpac 291 2 59.41 GGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTGATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCGATCTGCGGGGGATGAGCGCGTT:1 + chr2R 15848895 3' + mdg1 7313 2 75.25 GACGATGGGCTGAGGCTTAAGCAATGTATTGTTTAAATTAGGAGCCGGCTTCACCAGCGGCTGGGGCGACTCATAAACACGGTAGTAAAACCGCATGGG:1 + chr2R 12969928 3' - Idefix 223 2 60.61 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGACG:1 + chr2L 3621142 3' + 297 6935 2 67.33 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACAATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCTTGATCAGGGTCGAGATCTCAGCAACTATAAAAGCTAGAAGGTT:1 - chr2R 1751260 3' - HMS-Beagle2 6910 2 59.41 CCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCTCTGTATCCGAAAAGGAGTTCGGTGTCGATAATTCTACT:1 + chr2L 18218293 3' - micropia 321 2 61.39 CCAGCNCTCGAGCAGATACCATGACAGGTTGGAGCGCCTCTGATGTGTTGTTTTGCAGTCGCAGAAAGCTGTGCAAGTAGATCTTTTTATCCATTTATCG:1 - chr2R 12095839 3' + X-element 4400 1 66.00 GGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATATCTTAGCGGTATTTATTGCGACTAATTGACAGAGTGTCAAT:1 - chr3L 9646334 3' + 412 112 2 58.42 AATTTCTTCTTTTCTTTTTAGACTTACCAAACAGAGCTTTTGTCCTAATGGAAAACGAAATTGCGCTGCTCACCCACGTATTCAATCGAATAGGGCACAAA:1 - chr3R 25965793 3' - 412 416 2 62.38 TTCAGNCAAACTGCAAGTGCGACAAAGAACTGGAGAATAATTTTTCATGATGATCTTCAATTTTGTTCGTATAAGAAATGCAAGGCCAGGTCCTGATGCGG:1 - chr4 633607 3' + mariner2 293 1 74.26 GGCCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGA:1 - 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G6 476 1 57.43 TCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTAGAAGTATGAAATGCGGCAAAATTGTGCTTTCAAATGG:1 + chrX 19393112 3' + R1A1-element 4888 1 62.38 TGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAGGAATCGGCGCCACTGAAAAGGCTAGTCCGATAGGCGTTATCCTGTGCCGTGCAGTGGTTAGTCAGTATCAGGATC:1 + chr2R 8946218 3' - Cr1a 49 1 72.28 CACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAATTTGAGCAAACTTATTTGATCTATG:1 - chr3L 17858180 3' - HMS-Beagle2 6930 2 78.22 TTTTCGAAAAAGTGGGAAAATGAAATGTCTTCGTCAAAGTGAGGGGAGAACTTTTAAAAGTATTAAGACTGAAAAGAAGGCTGGCCTAATCTGTCAAATCT:1 - chr3R 11085472 3' + FB 131 1 57.43 AATGANACAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGACTAAAAATAGTTATTTTGATATCCACACAGACGAAAGAAAGTTAAGTAAGATT:1 - chr2L 11094874 3' + G2 225 1 54.46 CTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTTTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCTCGCTTGGAAAATGTGTGTCACA:1 - chr3L 14633318 3' - 17.6 295 2 77.23 TCCAACGGGGGGAGGATGTTTGGTCCCAGCGAGCAATACATTGCTCTGTGCAGCAATAGATTTTGCATTCCCCTTTGTGCTATGTGAAACTTGCTCATTTG:3 - chr3L 25413127 3' + diver2 4517 1 67.33 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATTTTGTTATTCTAGTGTCGTGTGAAGATGATATGCTACGGTGATCGA:1 + chr4 957506 3' - 1360 6 2 69.31 TATTGTTATTATTATTTTTATTTTGTTTTATATTTGTGTATCTAGCATGTGGGTAGGGCTTTTTGGACAGGCGCTTCTTGCCTGCCATCTACAGCCGATGG:1 - chr2R 5686078 3' - mdg1 7057 2 72.28 TGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGAGATAGAATGATGGCATTTTAGTGGTGCTGCTGTGGTTTTCTTGAGGGTGTAAGGTTTGCTAATGGTTAGC:1 + chr3R 10914250 3' + Cr1a 491 1 61.39 CACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGG:1 - chr3R 26331656 3' - G-element 45 1 65.00 TAAACGAAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATAATTTTTTTTTAGAGTGAACAGAAGACAAACATATCCAGAA:1 - chr2L 18665105 3' + Tc1 1362 1 61.54 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTACCGTGCAGGATTATGTGGAACCCACGCAG:1 + chr3R 23700976 3' + mdg1 7414 2 70.30 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCATCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTAAGCCCAATATTACTTAAATAATGCATGCCAAGTATATAAGTA:1 + chr3R 15814719 3' + roo 9041 1 53.47 AAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAGTAAACGCAAATGCTGCCAAAATCCATCAATAAATACCCAGCAAACCAAAGTAGATAGCACCATTAAAACCACA:1 + chr2L 12127419 3' + F-element 495 1 36.63 CTGACTCGGCTGATGTTTCTCCTGACGTAGGGCACTAAAGGGGCCGCTAGAGCATGCCCAAGCCCTTGATTACCAATGGAGCAGCTCGGAAATGAGACACG:1 - chr3R 14324795 3' + gypsy12 9836 2 55.45 GAGGGTCATATAACAATCTTTTTCTTGAAAATTACAAAACGTGCTTGAATTCTTCTGCTACTTCGTCAACCACCCAAGTACAAAATCATCTGGCACTATCT:1 + chr2R 3091220 3' - Idefix 6937 2 79.21 ATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGGCAAAAGCAGCACACCTTAAATGTCAAGGTTTTATGTAAGCAATTGCCCGCCCCTATTTAGT:1 - chr2L 2857991 3' + transib2 2813 1 68.32 GACATGGAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGATCTGAAGTTCCTGGCCCACCACGCCTCCCTCCTCCGCTGGCAGCTCGCTGATCAATGGAAC:1 + chr2R 11584643 3' + invader4 2985 2 63.37 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGTTCGATTCAT:3 + chr2L 6177241 3' + pogo 2071 1 59.41 GCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACAACAAGTAGCCCATATCCCCAGTCTGTTTCGTTTTCTCGCGCCTGCTGTG:1 - chr3R 30111378 3' - Stalker 281 4 58.42 TCGTTTGTGGTCAATATGTAAAGCCAGAAGATGGCTCTGAAGATTCCGAAACCTGCCAGCCGACCATGTGTGATAAGTCGCTAGTACACGCAGATAGCCAT:1 - chr2R 20035693 3' + Copia1_DM 429 1 52.48 TGCTATATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACACACATAGTCACAGGCACACAGGTACGGGTACGCAAAAAAGGAAACCTAAGTAAAA:1 + chrX 12750646 3' + TAHRE 10326 1 59.41 GGGCAGTCTGTAATTGTACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATTGTTGACTCACCTGATAATTCTGATGCCGGAAATTACCAGGTGAGTCAACAATT:1 + chr3L 12945891 3' - BS 4748 1 46.53 TAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCAAATTCTAAAGTGGCGATGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGAATTGATTCGCTATTGTAGCTTTTGAAACA:1 + chr2R 10921379 3' - accord2 7388 1 73.27 GGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCACAAATCGTGCGCACTTTAATTTGATTGCCTTGGCTTGGCAGAAGCCCAAAGTCATTA:1 - chrX 8885197 3' + jockey 57 1 55.45 TCTCTGGTCTTGGGAGAGTTTGAGTGTTTCCTAGTAGGTATGATTAAATATTTTACTGTATTTTATGTGTTTCAATGAGCAGCACTTACCCTCATTAGACG:1 - chr3R 10248419 3' - Doc4-element 102 1 80.20 TTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTAGAGTGACGGACCGACCAATCAAC:1 + chr3L 774088 3' - 1360 2992 1 76.24 GTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGCACTCAACGCTTGCGGAA:1 - chrY 3655128 3' - diver2 4683 2 67.27 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGGGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATAT:1 - chr3R 21010744 3' + hopper 1384 1 63.64 CGTATGAACGTCCAGATCTCATACAGAGGCATACAGAATACAGAATACCTATGCCTTAAGATACATTGCTTTTACAAATGTTACGAGAAAATCATTCGTAA:1 - chrX 4507170 3' + INE-1 136 1 48.51 AAGGAACATAACTGTGAGTTCTACACGTACGATACTAGATCAAACAAGCCATACAAAGCCATTTTATCCGGGCTGGAGTTGGTTTTTGCGAGCCACGAAGT:1 + chr3R 4768847 3' + Juan 488 1 76.24 CCAAAGACAGCAACATAGGAATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGTCTCGGCTTATGCAAACGTATCTGCAACTTGTTCCTCGCTCTATC:1 - chr2R 23126416 3' + Stalker2 7565 2 55.45 AAATTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTGGGTTCTACATAGTTAGGTCTAGGTATTGGGGCAAAACAAGTTACGAGTTTACACATAACAGAAAACAGTGCATA:1 + chr2R 6089637 3' - Doc3-element 4590 1 81.19 AAAAAACACATAAAAAACCAGTGTGCAATGGTGGTCTCTTTGAGTACCACGTTGAATATCGTAAAGAAAGCACTCATGAGCAGGCGATAAAGTTATTGA:1 - chr2L 14190233 3' - transib1 4 1 71.72 GTAATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCCCAGTCCAATGACTTTCTTATCAAAGAGCCTGGTTGGCGACAAGTTTCTCACGTTT:1 + chr2L 7554500 3' + Quasimodo 6934 2 63.37 CTATGCCGATAAGTATTTTCCTTGTTACTGACATTTTCTGTCAGTGCCGACTGGTAGCTTTAGAAAACTCGAAAAAGTTCATGAATCAAGCAGATGCATTG:1 + chr3L 6153383 3' - HMS-Beagle 462 1 75.25 TAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAAACGACCCGCGGCTGCTGTACCGCTC:1 - chrX 18232607 3' + I-element 5051 1 75.25 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATGGGAAAAACACGTATAATGTTGAGGAGTTTTAAGAATCG:1 - chr3R 21311079 3' - Transpac 4926 2 61.39 CCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTGTTAGACTTGCAATGTAGAGTAAGAACAAGAAATCGACTTTAAAATACCGTACACAGGCGAACAG:1 + chr4 961968 3' + INE-1 127 1 70.30 AAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGACATCTATACGATGAAAGTCATTAAGTCTTACTAGATACTCCCAACTATTTCGATAAACCTAC:1 - chr2R 12763415 3' - R1A1-element 29 1 66.34 GCTATNTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGAGTTTGACCGTGTATCGATGTTGTACTTTCTCATGTTTTTGGCTTGTTTGATCCGTTGTTGTTTT:1 - chr2R 15529272 3' - Stalker4 38 4 69.31 CCTGTTACATACTTTTCAACGAGTCCAGTATACCCTTATACTCTACGAGTAACGGGTAGCACAGTGTCCAATTTTGGGATCTTTATCTGATCGTTGCAAA:1 - chr3L 25480842 3' - INE-1 18 1 70.00 AACCAAACTCACTTTTTAGAAAATAATGATCATTTCGGTGACGGAAGTGCGCGTGTCGGCGCGACGCCATTTAAGCCAAAAAATGAATATGGGCCTTATAA:1 - chr3L 2380860 3' - HB 269 1 70.30 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGT:1 + chrX 3485682 3' + P-element 2832 1 22.00 TGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGTCCGCCGGCCAGTCCCATGTTTCCATCGGAGGGAACCAGTGCCGC:1 - chr3R 19234775 3' - Rt1b 4990 1 55.45 AAAAATAACGTATAACCTTGAACCTATTACATAGTATTCTCGCCCGCTAACCACACGGCAAAGATGTCCAGCGGAAACCGAAACTCTCTCAACCATTAAAC:1 + chrX 10732839 3' + Stalker3T 342 1 42.57 TGAGCCAACTGTTCTAGTTCTTTGGCTTGTGTTAAATACTCCCCCTTCAAGATCATCCCGTTTAATTTAACGCTACGCCCAACTTCAATCTGTGCCACTC:1 - chr3R 19993049 3' - Gypsy6A_LTR 16 1 49.00 TCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGGGTGGTTGGGCGGTGTGTCGTTGTCGCCACCACAAACAAGCAAAGGCAAAGGCCGCA:1 + chr2L 1349863 3' - I-element 4931 1 63.37 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATCCCGTTGACTTTATTGTAAAAATT:1 - chr2L 7216611 3' - copia 4921 2 77.00 TTCCCGTTTATCGCGACTCACTTCTGAGTACTAACCCTCTTTTAGGCACTCATCCTTAAAGTGCACGTATCCCTTTCGGCACTGGCAGG:1 + chr3R 12968795 3' + rover 182 2 77.53 TGCAATATTTATAAGTGAAAAAATAAAATTTTTATTTCACTAAATGATTACAAAACATTTTACTGAGAGAGATTAAGCAAACGGAACATTTTCGGACTTAG:1 + chrX 16516000 3' - Idefix 7379 2 61.39 TTCTCTTGGATTCAAGTGCATTCGCTCTTGCTTTATGGCTTATAATTTGATACTTTTGTTTCCCAAAACTTAGCCAAAATTGACCTGCTGCTGCACCTGGT:1 + chr2R 18043123 3' - Idefix 7164 2 59.41 CATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAAATGTTTTATAACACCAAAA:1 - chr2R 18883313 3' - X-element 4572 1 80.20 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTGTGTGCATGAATTATTCGTGTATGTATGAACTGTATACTTAGGCTAAGTGCAGGCGATGTGCATTAAG:1 - chr2R 19079150 3' - 297 6585 2 68.32 ATAATAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTTGGTTAAAAATTGATTTAACATGGGATGTCGCGTAAGGAGGATTTAGCTTGTCTGTC:1 - chr3R 9039093 3' + mdg1 7064 2 46.53 AATAAACTAAACAAAATAAAAAAGTATCGATAAGGAAAAATCTTAACACTTTCCAAACGCGTGAGCGTGAAGGGCTTGCGCAGATTTCAATCTTCTGAAAT:2 - chr3R 6032299 3' + F-element 90 1 24.75 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTGGATCAAACAAGCCAAAAACATGAGAAAGTACAACATCGATACACGGTCAAACTCCTAAAAATACACGCG:1 + chr2R 15529331 3' - F-element 21 1 65.35 ACAAGAAGGAAAGAAAGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATATGAATGGGCATTGTTCCGGGCAGAGA:1 - chrX 7383945 3' - copia 4987 2 71.29 TCAGCATTTTGGGCGGATGTCGGCGTCTGACCCGTTGTTGATGTTTATGCTGCAACTTTGACATAATGTTCAAGGACAAATTTCTACACACATCCATTTTG:1 + chr2L 13097054 3' - ZAM 132 2 59.41 GTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCTTGTCTACAAATAGCAATTCAAGGGCCGTCAATGA:1 - chr3L 23821841 3' - 17.6 7160 2 69.31 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACTCGTGTGTGAGTGTGAGTGGCAAGTTTTGGCTCAGGGCTGAAGTGCCACCCACTTTTCCACCACCCACTTTCACTAC:1 + chr3R 28449118 3' - accord 7029 2 72.28 TTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCAAGCACACAAGCATGGTGAGCCGCCTCACACAGATACAGATTCGGATTCAGGAGCAGTGCGAAAACTAAACGG:1 - chr2L 17549044 3' + HMS-Beagle 452 1 75.25 TATTAATTTAGACCAGAAAAAGTGGGTCAATTTCCTATAGTCACGTGCCAGTTCCGGCTCTATGTGTGGTCGAAATGTAAAATTACTCAGTATGCACCTAT:1 + chrX 274635 3' - Transib-N1_DM 21 1 69.31 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGATCTGAGCAGGCACATGGGATACA:1 - chr3R 9996369 3' - blood 15 2 65.35 CTGTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATAAACTAACAAAGGCAACAAA:1 + chr2R 1880413 3' - 1360 55 1 74.26 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTCAATTCCTGTTGAATATTTATTGCACTGCATTTAAAGACTTGTTCCAGTTTTATTCA:1 + chr3L 2804908 3' - hobo 19 1 60.40 TATTTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACTTCAAGATCGCTTTTTGCTCATTCGTTTGATTTTGGAGATTATTCT:1 - chr3L 1379844 3' + 1360 177 1 56.44 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCCTACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGA:1 + chr2L 222226 3' + P-element 2828 1 21.21 TGATCCACCAATGGGCAATGCTATGCCGATAAGTATTTTCTCGATTTTCTGCGCGTACTGTGTGCTCGAGTTAGTTGCATTTTTCTATTTTTGGGTTCAA:1 - chr3L 13658116 3' - HMS-Beagle 482 1 67.00 GACAAATTTATCAAAGTGACTTCTTTACCTGCTTCTGGCGCGAGGTGAGCCTAGACTCACAGGCGTCGGCTAGGGCAGCGCGTATCTTCTTCTTGGAATCG:1 - chr3R 20589704 3' + Ivk 492 1 74.26 GATTTCACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGTACGCTTTTAAATACAAATGTACACTTCCC:1 + chr3R 6869516 3' + Circe 7190 1 59.68 CCACAAAGAGAAAATAAAAAACACAACAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGCCAACCCGTGACATTTGTGCCCGGTCCACCTACCATAGCCGTTCCG:1 + chr2L 16814479 3' + I-element 109 1 62.00 CATACCAGGGTAGCCCAAATGCATGTCGTGCCGCTCGCGATTTAAGCCTGGTTTAAATTTATTATACAAATATAATCTGTTTTGATCAAATTGCTGTTGTC:1 - chr2R 2948861 3' - G5A 2515 1 66.34 GCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCTCCACGATTCAAGAGAAAAGATACTGACTGCTTAA:1 + chr2R 3031745 3' + accord2 7287 1 66.34 TTAAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGTAGTCTTAAGCGCGTCATGTGCGGGATGCCGCTTCAAGGGTCCACGCCAGATGCTGGAGGCCCATCTGG:1 + chr2L 4379497 3' + Stalker3T 201 1 56.44 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATATTTCTAGGCGCACGTTG:2 + chr3R 22238752 3' + hobo 2920 1 61.39 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAATACTCGTAGGAGCGAACAAACAAAATGTCAGCTTCAAAATTGCGC:1 + chr3R 17505014 3' - jockey 36 1 51.49 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACCGCCAGTCGTTGCCCA:1 + chr2R 5910932 3' - hobo 23 1 56.00 CAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTAAGCGTGAGCGAGCGAAATGGTGCGAGATTGTCCTCTGCATAGGACCGCTTGCAAGAGATAGT:1 + chr2R 4830110 3' + 1360 3263 1 52.48 CGCACGTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTC:1 - chrX 1399879 3' + P-element 2837 1 29.70 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAATATCTAGTTAAGCTCCACACGATTTGTTAAATATTGTTTT:1 - chrX 10123235 3' + copia 257 1 54.46 TATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAGCCAAACAAGACATATTTGCTACAGTTTACCTCAGATATAAACTATTATTCAACCACAAAGCATGCTAACAT:1 - chr2R 5076128 3' + I-element 5047 1 64.36 CTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGACTTAAATAAGTAACTTCTCAAAAAAAGTTCACTTTTCTGGATTTAACAAGCTGATGAGGAACGGGATTC:1 - chr2R 3168840 3' - Tc1-2 349 1 76.24 TAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAAGCAATAGCCGCGTATGCCATCAAGCTTGAGGAGCTCATAGCCGGCGGCACATATACACCCATAC:1 - chr3L 7566201 3' + invader2 132 2 69.31 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGGTGACTATGCCGCA:1 - 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jockey 4708 1 64.36 TGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCATTACTTCGAGGCGAACGAGATTGGGGTTTATTTTTTATTCCCCATCGACAGGGGTACAAAG:1 - chr3R 16240647 3' - R1A1-element 411 1 69.31 AAGCTNTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTAAGAAGACTGACGCCATATTGCGGACCATCTAAAGATTTTCCCTTGTCGTTTGCCATTCGTTGCGATTGTT:1 - chr3L 6935307 3' + Chouto 109 1 66.34 CATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAAAACTGTTGCATACTCCCAGGAGCACAAACACAGC:1 + chr3R 14832491 3' + blood 380 1 79.31 GGATTCTAGCCTGTCATTGTATTTTTTCGCTATTTCCTGAATCCTGTCTCCAATTTTTGCGCCTGGTCCCTTGCCCGTTGAAGGGTCACGTGCATGGCCGG:1 + chrX 21175470 3' - jockey2 3083 1 52.48 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTATGGTTATCGTAGTAGCACTATGGAAATTAATATAAAGAAAATCACAAATTGGTCGTAGTTT:1 - chr3L 12596543 3' + flea 5004 2 66.34 ACCACNTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTGCCGACGAACACGTTTGCCATCACGGGTCATGGCGAGAACAAGACGAT:1 + chr2R 12870662 3' + I-element 5 1 55.45 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTAAGCCGAAGGTAGGCCATATGACTTCTGCAGCTCCTTGCATCCATACTTATAACACTGCCCTTTTCAGCGCTTCACCA:1 - chr2R 17605676 3' + roo 8991 2 76.24 ATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCGCACTCAAACTCACACTCACAGAGGCCGCCAGAGTGAGGATGATTTTGC:1 + chr3R 19729169 3' + Quasimodo 94 2 51.49 TACTTTATTTCTAAGAATTTTAACATTGTAACACACACAACACACACACTGTTAGCTTATTCAAGACCATAGAAGAGGCAAGGAAGACACGTACAGTGGTA:1 + chrX 13818826 3' + ZAM 241 2 71.29 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATGGTGCGAAACCAATGTAACGCCGTGACGCCTCTTGTTATTTTGGTGTCTTTGGTATGACTGTGCCATTTATTAAAACA:1 + chr3R 3696765 3' + 1360 3336 1 92.00 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGA:1 + chr2R 5640392 3' + roo 359 2 76.24 CAAATNCAACTGCATCACCAAGATTGCGGGCTTGGCGGGGTTTTGTGGGAAGGGTCCAGGATGGCAGGATGCACACGGCAATGGCTGCATTTAGTGTGCAA:1 - 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F-element 52 1 75.28 TAAACATAAAAAAAATCAAGTCGCTATCTTTATAATTGTAATTAATACCAAAATTCCCGGCTTTTTACCCATAGTGCAATGGTATACTAGATTCATAGGCA:1 - chr2R 5143499 3' + transib4 2581 1 77.23 CTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTGGCGCTGGCATATTAAAAAGTGTTGCCTCCTTAAGTGG:1 + chr3R 11388703 3' + HMS-Beagle2 6973 2 68.32 AAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGGATTACACAACACAAATGG:1 + chr3R 16890455 3' - roo 9061 1 79.21 AAAGACTGATAGCAATGGGTCTACCTGGAACACTGTGACGAGCGCAGATACAATTACAAAAATAACTCCAACCTCGACATCCAAGAAAATTGAAGAAAACA:1 + chr3R 10334436 3' + R2-element 3224 1 61.39 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCGACTTCCGTAGAGGCGCCCCTAAGTAGGCAACGCTTTTTGTGCCTGCTTTTATGGCTG:1 - chr3R 31159621 3' + hobo 2922 1 62.38 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGC:1 - chr2L 17004742 3' + roo 9030 1 65.35 CCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTCTTTACGTATATGACAGCACACACTCACACTTGCAGCCTG:1 + chr2R 24323127 3' - 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Tirant 8045 1 55.45 GCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAATTGATGGGTTATTTAAGTCCCTTTGGATTTTTTACATCCAGAAACTATCCACCCGAAATC:1 - chr3R 19444825 3' - F-element 4435 1 67.33 TCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACACGCACACACGCAGACCGGAAAATATTTGTTTTTAAAATTAATTATGCCT:1 + chr2L 6586409 3' + Idefix 196 1 55.45 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTATTTGAGAATGCTGTAT:1 - chr2L 11240911 3' + roo 9015 2 82.18 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGTTGCAGAGAATCATCTGATTTAAATGTACATAGAAACCCAAATGAAT:1 + chr2R 11540272 3' + Transpac 284 2 53.47 CCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGGAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAAAAAAAAGAAACATACATGTACATACATATACATACGTATACATAC:1 - chrX 18353093 3' + Rt1a 5025 1 63.37 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGTCTTCAAAGAGATCTCGACCGAGCAACAAGTGAACGGAAGAATCCGAG:1 - chr2R 8145928 3' - P-element 26 1 53.47 TATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCAGCAAATCGGACGCGCCGTGGGCGATCACTTCTTCACCTGCCCCAC:1 - chr3R 13237193 3' + Doc 4295 1 57.43 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGATCCCGATCCTGACCCCCTTCTTGATCCGGATTCTGATCCTCTGCTACTGCTTTCGTTGGCGATCG:1 - 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Quasimodo 401 2 61.39 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACACATGTACAAGTGCAGGAACACAACGGGAACAGGAGCCAGGACAAGCACGGCGAGAGCAGGAAGAAAAGG:1 - chrX 1526690 3' - jockey 61 1 74.26 TCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTTAAACATCTGGTTGAAGTATATGCTATACTTAAAATTCTGCTACAAAATCAACTGCTTT:1 - chr3L 5433549 3' + Doc2-element 4578 1 65.35 GTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGGTTATGGGCCCAGCCCCTCATCCGCCCATGAACCACCTCCTCTTCCGTCTTCCGCAATTTCTTCA:1 + chr3R 11658936 3' + 1731 302 1 56.44 TTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAGTTCAAATTTAGGCTATTTGCAAACATATCGGAAAAGTGTTCAACAATTGACAATGCATTTTCAAAAAAA:1 - chr2R 6034021 3' - Tc1 1487 1 59.41 AGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCACGCAAATAGGCTCAGTGCTGCTGAACGCGAACGTTGCGATACCAGTCCTTAAACACGTAATGCACAAAG:1 + chrX 15876452 3' - accord 9 2 56.44 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGACCGTTCACCGTAA:1 - chr3L 776083 3' + 1360 3370 1 58.42 GGCTGCTCCACCGCGTGCTCTGCCAGAAGGATGGTCTGGGCTGGGCTGGCTGGGTTGAGCTGGATTTCAGAGTCATTGGCAATATGTAGGGGCTGTCGCTT:1 - chr2L 6239747 3' - G2 446 1 70.30 AGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAATTGCCTACCTGTAATAGATGATTAATAAACTGATGCAGAACGTAGCCAACTGTGTGTTGCCG:1 - chr2L 8507088 3' - F-element 30 1 51.49 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCTAGAAATAACAAAAACTTACCCTGAAAAATATGGGCGGGGTGTCAGT:1 - chr2R 11257826 3' + pogo 2098 1 73.27 TTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAAACCACCCAAACATGTAGGCGAAAAGCATTTCCCCGTCACTTCATATTCATAGCTGATAAATCATACA:1 + chr2R 12097931 3' + G5A 2596 1 56.44 TGGGTATGCATTCTTCCTTGGAGGCAGTGCAGGAAAGGATTTTTGTTTGAACTGAGAACAGGAGCATTTACCACACGAAGGATTCATTTAGCAGCTAAAAG:1 - chr2L 2110461 3' + Copia1_DM 3886 1 74.26 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCTCCAT:1 - chr2L 9823617 3' - hobo 17 1 64.36 GCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCGGAAAGTGGTAAGTACCGGGTATATACGATAAATTGCCTATATATA:1 - chr3L 12060943 3' + Stalker4 167 6 59.41 ACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTAACCCAACTCACCAGCACCAT:1 + chr2L 13670349 3' - BS 5000 1 68.32 TTCTTCTGTATTTATAAAGCGAGGCAGAAATTGTTTTTGTCAAACTCACCATAGTGTGTCTGTGTGGTGGTGATTTAAAGACATCGCGTAAGTACGAAACA:1 - chrX 20672870 3' + invader5 3770 2 69.31 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAAGTCTAACAGCCACTGGAGTTGTTAATTAGCTGCAGCACCCCAAAAAAGT:1 - chr2R 16928851 3' - blood 7038 2 53.47 TCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATGTCTATTGCCTTGAGTTTGACATTCTGTTATACATTTTATGTATAATATGCCCGAGAATCCGA:1 + chr3R 19570129 3' + pogo 189 1 62.38 AAGAGGCAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGAGAGAGAGTAAATGCCAAGTTGAGTCAA:1 - chr3R 18408239 3' + micropia 5279 2 71.29 GTCAAGTACACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAACAAAAACTCCCAATGTGCC:1 + chrX 3489055 3' + Copia1_DM 113 1 79.21 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGAGCGTTCGAGCGGTGCGGCTAATCGAATTAG:1 + chr2R 8145988 3' + P-element 2843 1 35.64 GATAACTGTAATTATTAACTTATATATATTTTTGTATCCATGCAACCGGAATTGAAGGATGGGCCTGCTATTGACAGACTTTTCGGTCTCGGCCAAGTTGA:1 + chr3L 12246214 3' + HMS-Beagle 247 1 74.26 GTGTGTTACAATGTTAAAGTTCTTAGAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATAAGTATGTATATGGAATTGTATTCTTTGTTAAACA:1 - chr3R 13351262 3' - ZAM 255 2 84.69 TGAAAATAAAGTGAAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTTTGAAGGGAGATGGATGGTGGGCAAAGTCCGCAGAGTGATTAATATATTTGCCAAA:1 + chr3R 27929519 3' - transib4 2476 1 69.31 TTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACACGCAGAGCTGCCTTCCACAACAACTCCGCCCTAAGGGT:1 - chr3L 20363363 3' + Burdock 5957 1 66.15 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATGCTGAAAATTAGAGGGCGTCAAATTAGAGGCAGTGAAAGAGCACTTTTATTTCTGG:1 + chr2L 1913088 3' + pogo 2087 1 65.00 TTGAAGAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCGTGTATGTGCGTGTGTGTGTTGGTTGGTGGTCCACCGCTGACGTCATTCTAGTTTCGATTTTCCGCA:1 - chrX 13844130 3' + 1360 436 1 69.31 CTCGGAGTTCATCTAGACAGAAGATTAATTTGGCGTAAGCACAATGAAGCCAAGAAAACGCAAGGAAAACCGGAAGTTGTCGGCGGCGGAAACTTGAGGCC:1 - chr3R 26176788 3' + Doc4-element 2434 1 61.39 TCCCGAAAAACAAAAGTATCAAATTATAAGCCATAAAGCAAGAGCGAATGCACAGTGAGGAGGTCGCTACAGTGGAGCTTCGAAAAGCCCGAACAAGAGCG:1 + chr3L 3473607 3' + Idefix 7093 2 56.44 AGAATGTAAATAAAAAAAGGATAACATGAAAAACTTCCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATGTGCACCTAGGCAAAACGTAAAATGTACGCGTCGA:1 - chr2R 25089820 3' - HB 163 1 63.37 CACGTCGGCGATCGAATTGATTGTCTTGCATATATATGAGAATTTTTATGAGCCACTCATTAAGTATTTGGTGCAAAAGTTTCAGCAGTTTTATTTCTGCA:1 + chr2L 17862291 3' - F-element 9 1 76.24 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGTGCTTAAATGCTATCTTAGTATACCTCTATC:2 + chr2L 21293028 3' + roo 400 1 73.27 CATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGAAACTACGAATTTCCTTTTAATACTCGAACTGCGAACTAACATAAGCTGTGTGGCCAAATA:1 + chr3R 8005339 3' + I-element 4882 1 68.32 TTTTATAGTTCCTAAGATCTCGACGTTTTAACGGACATTGCTATCCGTGACGTTTATTGTTTGCTGCCTGGAGGAGAAGGAATCGTCGCCGCGTCAGAGGA:1 - chr3L 5732289 3' - INE-1 147 1 60.40 GCACGTACACCAACAACAACTTCCGATATACCAATAAAAACACCCTCAACTCTCCCGCTCTCATCTCTTCCGCTCCCTCTCTCTAATCAGCGGCTTGC:1 - chr3R 4823566 3' + Porto1 430 1 76.53 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGGCTTCTTTTCGGTGCCAGCTGTCTGTAATTATGTGCGCATAAGCAAGGTCCTTGTTGTAAGGGGA:1 - chr3R 22830991 3' - mdg1 11 2 68.32 TCAGAAACCTTTTTTTTCACGTCCGCCCAAAGGTGAGGTTATCCGCAAACAAAGGTCGAATTCCATAAAGCCAATTCTTTTGCAACGATGAGGTCGGATTC:1 + chrX 22900839 3' - Tc1 1182 1 72.28 TAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAAATGGGAGCGGGCGGTGCGCCAGGAAAAAGCAGTGGAGACCCAGTGCCCACAATGGCATTGC:1 + chrX 15881448 3' - McClintock 6225 2 64.36 GAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAACGACTCTGCTGCCGACTTGCACTTGTTGTTGCTGTTGCGTCACCC:1 - chrX 12736052 3' + 1360 3311 1 55.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCCGCCAAATGGCCAGCAGACAGACAGCGCCAGTTG:1 - chr2L 11240616 3' - roo 8707 2 78.22 ATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATTGTGTGCTCGCCCAAGAGTTTACGATTTATTTAATGTTGTAATTAAGTTT:1 + chr2L 3132553 3' - flea 335 1 54.46 GAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTATGTAATTAAGATGTTGGCACAGATGCCGATG:1 + chr3L 1478302 3' - 17.6 214 2 69.31 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAATAGTAACGCCTCAATAGGTTCAA:1 + chr3L 5827956 3' + blood 353 2 54.46 TTTTTTTTTTTGTTCTTTAAATCGAGGCATGTGGGTGTGCGGGTATATCGGAAAGCCGAAACATGCAAACTCCCCAAACGAGCCAAGTTTTCATTCATGAA:1 + chr3L 10976054 3' - TART-B 10633 2 78.22 CGACANGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCGTTGACTTTAAGCCGTAGACAATGCGGGGCATTAGGCATCCCGAGCC:1 + chr3L 7442550 3' + roo 8778 2 52.48 GGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGCGCTGCTGCTGCGCTGCGACTGCGCTGCTTGTGGGTGGTCAACGGGATCGTGGGGTCGGGAG:1 + chr3R 5517467 3' + R1A1-element 5120 1 68.32 CCCGGGGTTCCTAAAAATTGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACGATGAGATAGGTGATGTACTGCCAATTATGAGATAATGCACGTAAAGTTATTAAT:1 - chr2L 8507294 3' + Max-element 8086 1 60.40 AAAGTCGATTCCGAAAAGGGACACGGAAAAATACCTTTGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATATGCAAACACAATCAAAGCGCTTC:1 - chr3R 31902302 3' - HB 68 1 78.22 CCAATGGTGGCTCCTCCTTTTGTTGAATCCACTATCGCCACTGTTGCTATCCGCTGTTTTTCCTTTTTTTTGTTTCCTAAACGATTTTTGCCTGGACTTGC:1 + chrX 10851037 3' - R1A1-element 353 1 71.29 CAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCAAAATGAAATGAAATACTACAACCATA:1 - chr3L 18168402 3' + flea 141 1 74.26 TAGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCGATTCCACGGCGATCTCACAAGTCGAAGTACAATAGTATGGCGGG:1 + chr3L 9095423 3' - Stalker2 205 2 55.43 CGGGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTAGCTGTTATCAGCGAGGTATCCTCGTAGCTTCGAG:1 - chr3R 20859972 3' - G-element 4249 1 63.37 CTTTTATAGTTCCTTAGATCTGTCCGTGTGAACGCTGTGATCTTGGGAACTATAAAAGGTACAAGGCTTTAAGCGGATTCTCGTTTAGGTACGGCGG:1 - chr3R 6359143 3' - INE-1 148 1 51.55 ATTACNAACATTAAAGACTAGTATACAAACCCAAACCAGTCAGCAGGACAGGCTGGCCAAGGCGAGCACCACGGCATCTCAGCAGGATGTCGATGAGGTGG:1 - chr3R 14529353 3' - gypsy7 5092 1 77.23 TTCTAGCTTTTATAGTTCGTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACAGACCGACATGGCTAGATCGACTCGGCTAGTAATAGTTCTTATATGCTCG:1 + chr2L 22754488 3' - INE-1 154 1 79.21 TGTACGCCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAGATATATATATGTATCACAGATTGCT:1 + chrX 3003698 3' - Juan 52 1 70.30 TTTGTTATCTAAGGCGACATGGGGAAAGTGCATACATAGCTGGGAAATCGAAATCAAGAGGCAAGACCACCAGACAATGGCCAATAACTGGCAACTCCATT:1 + chr3L 3136257 3' + roo 8764 2 53.47 TTATTATTATTATTATCGTTATGATTTATTCAAAAACCTACCTGCTCCACAGTTAACGAATCGACGATCACCAAGAGGGGCTGCACCACCGCCAGGAG:1 + chr2L 8344096 3' - mdg1 20 4 88.78 AGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTCGTTTGCTTGTTACCCTCTTGAAAATGCCATACCAAACTCAATGCATTTAAAACCCCCATAGTTCTTAAAGGACTCACCT:1 - chr3R 19494317 3' - blood 165 2 70.30 CCAACGCAGGCGAAACTGGCTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTCAAGCGATAAGTGCACTCCG:1 - chr2L 13528443 3' + R1A1-element 487 1 79.17 AATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTGTATTATTTTGTAAAATAGTATAATTGGTTTTTTGGCTCTGCGATGTAAGCGCCACAATTAA:1 - chr2R 15002341 3' + 3S18 326 2 55.45 ATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGATGATTTTTGTCAAGTCTATAGAAAGTTACAAGACTAATGGCCTTGACTGGAGGTGGGTCTTAGTGGGTTAAGAGGGCT:1 + chr2L 12754388 3' - INE-1 253 1 60.40 TGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGGAATTTATGGAGGATTATATATAACACAGAGACAAGGTCATTGACCACA:1 - chr2R 4954713 3' - Q-element 70 2 66.34 TCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAAATCCCGCTCTCCTCCCGCTTCCACAGGCCAATTCCCAGGCCTGCCAGGGTATTTACGTGCCCG:1 - chr3R 26256271 3' + I-element 166 1 66.34 AGGGGGGCGGAATGTTCGAGTTACGGGGTATGTAGTAATTTAAAATTGTTCTAGAGAATGCTGGAAATTGATATTTTAATTGCTTCGGCGAACGGATTATG:1 + chr2L 9799023 3' + GATE 8224 1 75.25 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTAAAGCAGG:1 - 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chr3R 21674213 3' + Idefix 236 2 57.43 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCGCAACAATTTAAGGGTCAGTTTGGGGCATGTGA:1 + chr3R 31293269 3' + hopper 1375 1 69.31 CTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTATTACACGTCGCGTTGTAGGAACCTTTGATGAATTTCAATTTAGCTGCGGGCTC:1 - chr3L 15336823 3' - Doc 4433 1 56.44 AGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATTTCGGGATATTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGTTAAGATACCAGTAGATGCATCCGTTT:1 + chr3R 29746957 3' - G4 136 1 73.27 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAA:1 + chrX 3485710 3' + P-element 2859 1 49.50 TCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATATGTTTTGAGTGTAAGGCCCGTTTAACCC:1 - chr2R 7150062 3' - Tirant 94 2 75.25 TCTCGNTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCTGAC:1 - chrX 14317407 3' - 1360 95 1 69.31 AAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGAATTCGTTATTGGTTTATTGTTAGTTTTAATTTCT:1 + chr3L 10464715 3' + invader3 5447 2 63.37 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTCGGCTTCCGGTTCCGGTTCCGCTTGAT:1 - chr3R 14562592 3' - jockey 4794 1 76.00 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTGCGGCACTACTA:1 + chr2L 7654061 3' - jockey 12 1 73.27 ATATGTACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTGTTTTCAAATAATAATAACGAGCAGACAAAAGTCGGCCAATTGCCAAAATCCAATGCAGATGAGTTGATT:1 + chr2L 7337915 3' - 1360 343 1 54.46 TGCCTAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGCGTCTTTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGTATATCCGCGTAAGAATGCCCAGGCCGCG:1 + chr3L 22287903 3' + 1360 3360 1 67.00 TAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACACAGATATTTTATCGACGATACACTCATTATAATCTTCCACAATGATGA:1 + chr2R 16966656 3' + mdg1 357 2 58.42 GCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGA:1 + chr3L 23678158 3' - Osvaldo 14 2 67.00 GTGTGCTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGTTGGGTGTCAACATTTTTGAAAT:1 - chr2L 14536241 3' - blood 7036 2 52.58 AAAAATGACTTTACATTAGAATATTGGTCATTAGAGTATTCAGTTTGCGGCTTTGTTTTGACTTTTATACTTAGTTTGTGTTTACTGCTGTGTTCGTTATA:1 - chrX 22652458 3' + 1360 383 1 60.40 GATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTTGCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTGTGTCTTTCATCTTTTTATGCCGAGGCAATGAAAGTGA:1 - chr3R 9829077 3' - mariner2 766 1 65.35 AAGTAAATGTAACAGGCAGAAGAAGAAAGTATGAAGGTTGCAATCTCGTGAACTATATAAGCTAAAGTTAAGACT:1 - chr2R 12988880 3' + INE-1 24 1 73.33 ATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCAGTCCGCCTACAAATTGAACTTGAGGGTATTCGG:1 + chr3L 6154644 3' + mdg3 34 2 67.33 GCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAAACACCTTAAAAACAAAACGAAATC:1 - chr3R 13333835 3' + F-element 450 1 76.24 AGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCAGCATCGCCTCCCGGGCCTCCCGGAGCTCCTGGCGCGC:1 + chrX 15574435 3' - flea 4969 2 62.38 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAA:1 - chr3R 11005462 3' + roo 9035 1 57.43 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTG:1 + chrX 2090288 3' + roo 9032 1 61.39 CTATAATTTATGGATGCGTATTAACCATCGTACCAAAAGTAAGCAAATAATTTGGCGGGAATTGGATTCGGTGACAAGAACTAAACCTTAACCAGG:1 + chr2L 4827901 3' - transib2 243 1 71.88 AGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCGAGCAGGTTAGTGTGTGCCCTGTGGCATACATAGTTATTCTTTGAAACAAATTATACATTGCA:1 - chr2R 12804637 3' - Idefix 7198 2 74.44 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTA:1 + chrX 9256960 3' - 3S18 39 2 59.41 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTG:1 + chrX 14424087 3' - hobo 42 1 70.30 TTTTCCAACAAGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAACATTCGAGCTTTTCTCTCGAATGTATATAGGTGTGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTTCATCAG:1 - chr3L 25552481 3' - Fw3 31 1 84.16 AGCCGTGGGACCCGGGCGAAAAAAAGAGCCCTAGGACGGACAGCCACAAAATGAATGCCG:1 - chr3R 1135285 3' + Cr1a 4445 1 93.33 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTATCCGATATAGTATGCACCCCAGTCCGCTCATTTTCCTCCTTCTGG:1 - chrX 12290623 3' + HMS-Beagle 7015 2 53.47 CATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAATATTAACGCAGTAAAAAGAGCAACACGAAAAATAAAGAACGCAGAGAATCAG:1 - chr3L 2833079 3' + 297 270 2 55.45 GTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCC:1 - chrX 17049549 3' - Stalker2 34 2 55.45 TTTCGATTTCAATTTATTTGTTTATACAATATTTTATTGCCACTGCTGCTGGCGTTGTTGCTGTTTCTTTTTTTGGCACGCATGCCGAGAGTTCATTGACT:1 + chr3L 5633142 3' - Doc2-element 96 1 61.39 CTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAATTTTAACATTGTAACACACACAACACACACACACTTACAATGCAGCTAATTGCATTTTTGTAAAGCTTACT:1 + chrX 8694060 3' + ZAM 228 2 61.39 GTAGGGAAGTGGCCTAGCAACAGCCGCGATGCAGGGAGAATCTGGGCATGTACTACTTCGACAAAGCCCTTAAGCTTGGACCTGCAGATTTCACGACTCTG:1 + chr3L 21565714 3' + gypsy8 4684 2 70.30 CCTTTTTTTCACATCCGCCCAAAGGTTTTATTACGTAGAATTGTTAAGGCGATAAAATATTGTTCACTTTCGATTTTATATAGATTCATTGCGGTTTCTGC:1 + chr3R 1219855 3' - Tc1 1174 1 75.25 CACTGNATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGAATCAGTGCTTAAAATCGATTGTTAAG:1 - chr3L 9864597 3' - P-element 49 1 30.69 TCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGATAAGGGTGTGCCAGGATGTCAAGGCGTCAACACAT:1 - chr3R 31996522 3' - mdg1 280 2 70.30 AGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGGATACGCAGATACCCAGATACCTACAAATGAAGCCACCAAATCCAGGCGAGTTCAATGCGCGGCCAGGACGAAG:1 + chr3R 24663391 3' + jockey 431 1 80.20 AGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTCTTTTATTATTTTAGTCCTCGTACC:1 - chrX 2804629 3' + hobo 471 1 75.25 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAG:1 - chr2L 19845921 3' - F-element 56 1 70.10 TATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGATATTTTATGA:1 - chr3L 25613040 3' + Stalker4 401 1 71.29 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCGATT:1 + chr3L 19051910 3' + roo 9040 1 55.45 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAATACTCGTAGGAGCGAACAAACAAAATGTCAGCTTCAAAATTGCGCTG:1 + chr3R 17505016 3' - jockey 34 1 49.50 AACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGATACAGTTGGCACATTAAAAAATAAAAAAAGATCAGGCCAAACACACATGGAAAAGTCGTTGACTTGCAGCC:1 - chrX 9908955 3' + Bari1 489 1 67.33 TAGGTTCTGTAGCCGAAGGGTTTTCCCCTTGTTTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTCATTAAAAAATATTGATTTGAAGTGTACTAAGTTCTAGAAAAAA:1 + chr3R 16705890 3' - X-element 493 1 56.44 AAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCGCAGCGAGCTGACGCGACGGCCGTCGTACAATAAGATCTTCACCGAGATCAGCGGTCCGGACA:1 + chrX 18373428 3' + Quasimodo 6908 2 67.33 TCTCAAACCGCACCCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGTCTGAGTCAATCGCTGACGCTCACCCATACCATGAAAACTCCCAAGGTGCAGGCGAGCACC:1 + chrX 645678 3' + G-element 3948 1 77.23 GAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGCCGAGCGTCTTGTGGATTTTGCCGATCAGATAGA:1 + chr3L 7246061 3' - G-element 363 1 66.34 GAGTGGAAAATTTCCAATAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGGGGGTGAGTATCGAGTATGCCTGAGAAAAACGCA:1 - chr3L 17564575 3' - R1A1-element 153 1 48.00 GCTTANGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGAT:1 + chr2R 8463622 3' - I-element 46 1 63.37 CGATATAGCTCTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATGTGTAACGGAAACCACAGCTGAGTGCACGGCAGTGGATGAGGGATCGAAGGAT:1 - chr3L 6668650 3' + diver2 4789 2 63.37 CTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATAAATCAAAAAGTAATAAACATTTAGGTGTCAACAGCATTTTAACTGTGTTCTAAATGTTTGATAT:1 + chr3L 11716079 3' - X-element 24 1 64.36 TCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATTCTTCACTCGACTGATAAGCTTATTACGGGAGAGCGACGATTTGCTTCGACTGCTGAT:1 - chrX 756968 3' + S-element 1705 1 63.37 ATTTTCCCCGAAATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGCAAATACCGCTGAGTCGCCGATTCCGTGCCCTGAAG:1 + chr2R 10243441 3' - Max-element 243 2 67.33 TAGGTCTTCATTTCGAAATTCTGCCAAAATAAACAGGCGAAAAGCGAGTGGAAGTACTGAAACCTCTGACAGCCATATCTCTTAACCCAAAAACCGAAATC:1 + chrX 4711621 3' + transib1 2115 1 75.25 CGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCACGCCTCCTTTGTGTGCGAGTTTGTTTGGCGTGCCAGCGGCTTC:1 - chr2R 21260835 3' + Quasimodo 7001 2 62.00 CACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCCATCTCGAGCACCCGCATGGACGGCTTGGGGGTTGTCAGCTCCT:1 + chr2L 7649356 3' + hopper 970 2 56.44 CTGTGTCATCTGGGTGAACATGCGCTCCATCATCCTTTCCATCATTCCTTCCATGCGAGCTCACCCTGCAGTCCTCGGCCAAATGCAAGTGGGTGGAG:1 + chr3L 4137735 3' - G6 1554 1 61.22 GTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATTGTGAAGAACATTTATTCGAAAGTCCAATGGAGCATTTGTCTTGTTATTTCTCGCAGTGTACATTAGA:1 - chr3R 13892964 3' - Idefix 46 2 74.26 TCGGATTTAGGTAGTGTTGGTAGGTTATGTGTGTCGTATAATTTTTATTTGGTCTCTCTCTATCGTTTTTGTTGCTGTTTTCCATGGATTTTCCTGTTGCA:1 - chr3R 16702774 3' - I-element 4974 1 51.49 GCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACACAGTGATTTGCTTTCAAGTCAACCTTTCAACACTATCCACACTAAAGCTAAGCAAATGATAGAGATCTTG:1 + chr2L 4875684 3' + F-element 131 1 62.38 GTATATTATCTGGATTGGGTTTTCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAGTTGGTTTTCTCAGGTAATAACTTTTGTCCGGGGTACTTTTTCTATGAACTTGCG:1 + chr2R 18683089 3' - I-element 5124 1 54.46 TGTAANTGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCCGAGGAAACGATATCCATCGAGAGATTTAACTATTTGT:1 + chr2R 22847820 3' + roo 63 2 61.39 AACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCGACGTCAAGCTCACGTAGTTGCTGCGATTTTTATCTTGT:1 - chr3R 9380022 3' + flea 474 1 65.35 GATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGACTTGAAACAGAAAACTTTGCCAGATGGTCGGCGCTTTAATTAGATGGT:1 - chrX 5032668 3' + micropia 5172 1 52.48 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTT:1 + chr2L 23068912 3' - 1360 44 1 68.32 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCATCCGCGTTTATTTTCGGGTTTGTTTCGCAATAAACGATTATTTGTATTCGCATAAAC:1 - chr2L 19157842 3' - HMS-Beagle 6835 2 61.00 GTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAATCAACTTTTGGCTAACAACGCTTCGATGCGTTTCT:1 + chr3L 13129299 3' - roo 407 1 64.36 CGACTCGGCTATTGATCCTGGTCAAGAATATATATACTTTACCTGTCCGGAAACGCTTCCACCTGCCTCTTACATACTTTTTAACGAATCCAGTATACCC:1 - chr3R 14437796 3' - INE-1 93 1 82.00 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTATAAATGTTCAAATTGTCGA:1 - chr2R 18891024 3' + opus 490 2 63.37 AACAAGAGAGAATGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTTAGCAACTGTGAATTGAATTTACATACAATATTTCATTTTTGACCTTTA:1 - chr2R 10552705 3' - INE-1 580 1 84.16 TGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATAAACAATGGAAAAAACAACAATAAAAA:1 + chr3L 21098241 3' - TAHRE 10414 1 74.26 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTAA:1 - chr3R 22667129 3' + 412 455 2 61.39 TGAAGTGAACGCCAAATAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCTCCATCCCTCGGCTGCACACCAAGTGAGATAGCAAAAAATGTGTAATAGGTTCGG:1 - chr3L 22629478 3' + F-element 76 1 59.41 GATATAGACGCGATATTAAAAAGAGAACAGGAACGAGAATTGTTCATATCATTGACTTGGACCACGTACAACTGACCATGGGAAAACTAACAGACTACATC:1 + chr3L 26386190 3' - Cr1a 4361 1 69.31 TGGGTGTGGCAGTTTTGGGCGGTTAGAGTAGGCGTGTCAACGCGTGGTTGAAAATACGAAGGAAACATTTATTGTTCTCCCGTTAAGGCGAAAAACGAGGC:1 - chr3L 20658465 3' - INE-1 356 1 65.35 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGCTAACA:1 - chrX 11060477 3' - I-element 26 1 48.51 CGGCTGCGCCAGTTAGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCTTCTTTGCTCAGGAAAGCAATTTTTGTTGCACGTTTTTGAGATAGTTTTAGGCAGCGCAGG:1 - chr2R 17187381 3' - Tirant 408 1 64.29 CTCATCTCCTGCAGAGGTTGTCTTGAAAGTGCGTCGGCAACGATGTTCAGCTTGCCCTGACTTCACGAGGACGTTTGTGTTGCAGACGGATGCCAGCGACT:1 - chr3L 23678141 3' - Osvaldo 255 1 55.45 ATTGTCTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGTCCTGTTATTGACAAAATTTTAATAGTGTTTTACTATTCTAACAATAAAATGT:1 - chr3R 4521196 3' - Bica 4521 1 58.42 GCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAGTTCAACGCAACAAGTGCGAGAAATGCAAGTGAGTGGTGAAGCTGGGAATCTGTCATAAAAATTAAAGTATTTT:1 + chr3R 7249981 3' + Doc2-element 316 1 67.00 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTCACTTATTCGCGCTAATGTTTTTATCTCTGTCATAATTTTGTACAAATGCCTGTTCTGGC:1 - chr3L 18810669 3' - Transpac 15 2 63.37 GCGGCGTCTTACAAGCGCTGTATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTGAGAATGAATAAAAGGCTTCGGCGGCATCATAGTTTTGCACATTTTTCTG:1 - chr2L 18068427 3' + rooA 7470 2 63.37 TTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATACGATAGATAAGATTAACAAAAGAAGAGCTCATTATTGTTAATT:1 + chr3R 10976165 3' - HMS-Beagle2 65 2 61.39 TATATATTTGTACATTTCTTTATTTTATAACGTTTACTCCGTAAATTTACTTATATGTAAATTATATTTATACACTAAACTTTCTTTAAGACACTTTCCTA:1 - chr3R 26717661 3' - Juan 4180 1 55.45 GGTTAAAGTCGTCCTCGGCTTTTCGGAAAGGTATCGTCATCTGGATGCTGGTTTAAATTGAGCAAGTCTATGGGCGGAGATGGCTCTGGCATGGGCGAAGG:1 - chr3R 4225605 3' - gypsy4 6536 1 55.45 GAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTAGCAAAGTTTTCAAAGCGTTTACGACGGCTCCTTATAGCTTACCAAT:1 + chr2L 2360615 3' + F-element 116 1 57.43 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACGAGGGCCAGTAGCCGGAACGGAGCACA:1 - chr2L 9060466 3' + blood 342 2 63.16 TTTGGAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGAGCTTGAAGTGCCCCACAGCTGAATGTAATTCCCCAAAAGACTCGTAAATAGCTAAAACAGGACAGGA:1 - chr3L 6474246 3' - G2 2709 1 53.47 GCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGAAAACTTTTAAAAAACACTTGAGATTGCGCCGAGAACGAGCGCGGTGGGCG:1 - chr3L 12058996 3' - G2 2737 1 63.44 ACCTCNACCAGCAAAGTTAAAAATTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAA:1 - chr4 1294993 3' + HeT-A 6060 2 74.26 ATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGATAAGGGTGTGCCAGGATGTCAAG:1 - chr3R 31996534 3' - mdg1 292 2 58.42 ATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATGCAATGAACAAATTAATAAACAAC:1 + chrX 12701639 3' + hobo 2551 1 76.24 TTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTAGCTATCGTTGGCTGCTAAACAGTCATGATAACC:1 + chr3R 28636410 3' - I-element 5003 1 66.34 GCTCACTTACATGATTTGTGTGTGAATTGTGTGTCCTGGGTATTCTGGTATGGGGGTGACCCTAAAGGTGAATAGGTAGAATCCCTCGAAGCAGTCTGTGG:1 - chr2R 4203156 3' - gypsy3 437 1 53.47 CTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGTCGGCTCTAGCTCATGGCGTTGGGTATGGTGGTCTTGCTCTAGCGATTGTCTTGGCCCATCTATTAGATAGTCTATAA:1 + chr3R 18594843 3' - gypsy12 10151 2 61.39 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACAGCAGAAACGAAAAAGTGCAAACAGAAAAGTTTCAACGAGCTGAATTTGTACAACTCATCAAATATTCCTTA:1 + chr2L 17561926 3' + jockey 4974 1 74.26 TACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCGCGGAATTGGGGGATTGGCTTATTGGGTTGGTAGATGGGTCGATGGGTAGGTTGGTAGGAGCTGTCCCTC:1 - chr3R 24070287 3' - Quasimodo 159 2 71.29 TACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGCGTTAAGGACTATTGTTTTGCTCGTGATGACCGACTTGTGGGCGTGGCTGTAATTCCATTAA:1 - chr4 871737 3' + R1A1-element 5020 1 65.35 CTCTTAAGGTAAGCGGTCATAGGTAGGGTAGGGCAATCCTCCAATGACCTTAACTCCTTTTTTCCTATTTTTAGGGTGGCGGCAATGATGCGGAAAAGCAA:1 - chr3L 16231562 3' + Gypsy12A_LTR 1939 1 67.33 AAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGACCCCAAAATGTAAAGAAAAATCATAGGGAAATCAA:1 - chr3R 30114036 3' + FB 266 1 50.50 ATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTATTTCGGGACTGCATGTTAAAGGCGATTTCCTGATCGAAGACT:1 + chr3R 13339832 3' - BS 5025 1 51.49 AGGGAGAAGGGTATTTATCTTGCATAACAATCCAACATGCCATATATTGCAAAAGATTGTGGTTTTATATGGAGCAACTTTTGATTTTCAAATTGGCATTC:1 - chrX 6789236 3' - Helena 444 1 68.32 GATGTTGAAGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCAGTTGTGCTTTGGCTGGCGGTCGCGAATGTTCGAAGCTAACGCGATATTGCCATTTTGGCCACTTTGAGAA:1 - chr2R 21234810 3' - gypsy7 311 1 74.26 CCTAGNACGCATATCAAGGATCGGCCAACTACTCTTCGTCAACTTGCTCCAGACCCAGCCGCACCGCCGGGGCTCTTCGCTCCACTACCTCCCGACGCAC:1 + chr3R 19901549 3' + Chouto 6046 1 60.00 TTAAGACTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:1 + chr2R 10572710 3' - F-element 4382 1 58.42 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACCCGAATCAATACGGCGCGCTGCGTCGCGGGAGCCGACCACACTCCCCACTCATAACAGAGCACATAGAAG:1 + chr3L 23123909 3' - Tirant 5 2 76.24 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAATTTTTTCTTTTATGGATCATC:1 + chr3L 63008 3' - roo 38 2 71.43 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATATTGAACCGATGTTTTCAGAACATGTCAGAACATCTAGAACAATTTGTAATCTTTCTAACGA:1 - chr3L 23419727 3' - FB 13 1 39.60 GCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATAAATAAGGGAATGCAGAAAGTTTTACCTCGAGGCTCCTGACTCTGGAGTTTTGACTGGCTTTTAGCTTTTAATG:1 + chr3R 12043725 3' + micropia 5223 2 77.23 TATCAGAGAAGAAAGTAAAATAGAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCCGCGAGGAATGGTATTTGTATGCGCCACAATTTGATTTATTGC:1 + chr3R 25547253 3' + Doc3-element 4484 1 57.43 GCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGGATCAGTGTAGCTTACATCTAGTAGATCATGCACAACATGCTTTAACGATTTTACTATAGACTACAAAT:1 - chr2L 16774253 3' + pogo 268 1 71.29 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGAAAAAATGGAAAAGGATTTTTGCGCGGCCTTTTTACATATTTTTCCGTTCGGGT:1 + chr3R 11097595 3' - mdg1 7058 2 60.00 TCGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGCTAACAAACACTTGGCCATGCT:1 - chr3R 21998094 3' - hopper 1322 1 77.23 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGGACATCCGTGCGGACAACATGGCGTATGATTAACATGTGT:1 - chrX 8817112 3' - jockey 4709 1 56.44 ATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAAGTAATGGCTTCTGAGTAATAGCAGAATTCCAGTTTCTTGTTCTGGACTTTGAACACCGGAAATGC:1 - chrX 159231 3' - Cr1a 4135 1 67.33 AAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGGAACCACCCAAGCCAGCGCTGGCTCATCTTCATCTGCGTTATATGT:1 - chr3R 29993094 3' + Tc1 1580 1 54.46 GATGCCTAAAATAATTTTCATTGAGTTCTGAAAAAAAAAAAGAAAATTATGCCTCACCCTGTAGTTGCGCTCGCCGCCTTTCTTTGGAAAGCTTGTCCGCC:1 - chr2R 18945531 3' + mariner2 854 1 68.32 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCC:1 + chr2L 1353760 3' - I-element 50 1 77.00 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCAATTTTTAGTGATTACTCCAAGCTTAAACTTCGTTTTGCTGTGTAAAACTGACCAGCTGTCGAACGAA:1 - chr2R 11540169 3' - Transpac 5 2 67.33 ACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACGAGTTCAAGTACGCCCTACTGGCCAACAACTGCACCTGTCCCGGCGCCAGCACACTGGTCACCC:1 - chr2R 10336353 3' - G2 400 1 67.33 ACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTTTACTACAAAGCACTACTCAATCATCAAATCTCCAACGAAACGAAGTAAAATATAGCAATGACAAGGAAAATTGTT:1 - chrX 7957184 3' + Doc3-element 115 1 63.37 AGCTCCTCGGAGTCAGAGCCTAGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACAAGAAGTTTAGGCAGCGAGTTCCAAAAGACAAAAGGAATGGCACTGG:1 - chr2L 23488924 3' + G-element 430 1 51.49 GCTCAGGAACTAAAAAAGCTAGAAGGTTGACTGTTTGTTTACCGATGTTGCTACGCCCTTTCTAAACATTCAGGGATTCTGAAAGTGTCGGATGCAGAATT:1 - chr2R 4406891 3' + INE-1 152 1 64.36 GAGCAAAATTGAAAACAAAAGAATTCCTTGCAGTGCACCCAATGCACTGGATGCCTTCGAGCCGAATCCGAAACCAATTTGTCTTGGCGAATTTCCAAGTT:1 + chr3R 30436699 3' - S2 238 1 81.19 TCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCTTGGTTAGTAATTTTTTGTTAGCTGGTTATT:1 - chr2R 8746290 3' - micropia 407 2 69.31 TGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGACTTAGGCTTTTGACAGTGTTCGCGAAGCTTGGGCTTTTTATTTTCGCCACTTTTGATTGCTGATGGGATGTGGTA:1 + chr2L 10660894 3' - TAHRE 10262 1 67.33 CAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCTCAAGCGATTAGAAAAGAGTGATAGGAAGAACTGAAATGCGTAATCAAGGTATCGATTA:1 + chrX 11081781 3' + gypsy4 6647 2 65.35 TATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAAGGATGTAAAGGAACGCCAGGGGTAGAAGAAAGAAAAGCGCAAGGAAA:1 - chr2L 12868582 3' - R1A1-element 5332 1 55.45 GAGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCCGAGTTTGAGTAACAATTTAATTAATTTCGTAGTGCAGTGCGAAGTGCGAACCTGTTGTGCCACAGTTATG:1 + chr3R 14365441 3' - Quasimodo 409 2 66.00 CAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCA:1 - chr2R 4577080 3' + Chouto 485 1 57.43 AAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGTATGAATTTATTTGAATTTTCGTCTGCTGGTCAGTAGAAAATCTTTATTGAGCCGGTGTTCATTTGTTAAGACT:1 - chr3R 14964700 3' - pogo 1932 1 73.27 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGC:1 - chr2L 796774 3' - jockey 56 1 74.26 CTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTTAAAGGAGAGATTAACTTCATAGTGGAATTGGTAAAACATAACATAAAAATTAAAGTCA:1 + chr3L 24291188 3' + S-element 408 1 67.33 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGAAGAGTTATAGTGAGGGAAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTAT:1 + chr3R 1048020 3' - Stalker2 54 2 73.27 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCGATTTCCCTTATCAGTTG:1 + chr3L 19051924 3' + roo 9054 2 61.39 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCCCCTATAATTTAAGCAGCAACAGCTTAAAATTAGAACAACGCTCG:1 + chr2R 22740105 3' + Transpac 5201 2 59.41 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAA:1 + chrX 2090301 3' + roo 9045 1 53.47 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATCGGTCGCC:1 - chr3R 6216790 3' - pogo 18 1 61.39 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCTCGCCTGCGCCTGAGTCAGGACAGAAAA:1 - chr2R 11115808 3' - hobo 49 1 71.29 CAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGAAATCGTATAATATAAACTGATATTTAAATACACAAGTAATCCTACCTAGAATCAAG:1 - chr2L 4840094 3' + HMS-Beagle2 83 2 60.40 TACTGGCATTTCCCCAGAGTGCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCCATTCTATTAAGTTATTTGTCTTAAGTGCTGCCG:1 + chr3R 25628096 3' - Porto1 4284 1 70.30 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTACTTTTCGACGATAACTCACCCAAGTGCACGGCAAATGTCAGAGTTATCCAAAACTGCAT:1 - chr2R 15011791 3' - F-element 4462 1 65.35 CATACGAACAGACGGACATGGCTAGAACGAGTCGGCTTTTGATCCTGATGAAGAATATATGCCCCATCGAATATGATATTCCGAACAGACTCGCATGCCGC:1 + chr3L 16085845 3' - INE-1 120 1 60.40 ATTCGGTTTTGGTTTGTATTAAATTTATGAAAATGATTAATTTTTAAT:1 - chr3R 10914875 3' - McClintock 328 2 50.00 ACTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTAACGATGATCACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGCGACCACTTTTGGCCTGGTTGCCAATCCGACG:1 + chrX 7798769 3' - Rt1a 4740 1 68.00 CTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACCGTGTGAATGTAAAGTTCGTGCCTTCAGTCTTTTGTTCTGCTGCAGCATGCGGGTGAAATGCT:1 + chr3R 5404623 3' - flea 149 1 69.31 AGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAACAAAAAAAACACACAGGCTACGTGCTGTGCTGGACAAAACTGTCAACTGAAAAAATGATGACATATTAGC:1 - chr2L 22173364 3' + Cr1a 4435 1 66.34 GGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATAAGTTGTAAGTGGATTAGGAACGTATCAGAAAACCTTGGCAAGTTGGAAGAACAAAAATGTGAATTTTGCAA:1 + chr2L 19845478 3' - Idefix 71 2 69.31 CTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGATTATTACTGTTTATGACACTTCTGGTAGTTGAACAGGTGTCCATAAAATTAATTAAATTCAGTGA:1 + chrX 19045333 3' - Doc2-element 430 1 69.31 TGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGTACATACACGGTTAATATTCCTTGACTACACTGTATTTCGCTATTGACAAGCCT:1 - chrX 22867317 3' + HMS-Beagle 7022 2 57.43 AATCTGAATTGGAATCAGAATCGGAATAGACATCGTCATCAGCCGATTTGTTGGTTTTTCTGTTACCACTCCGAACGATTTGATCTACAATTAATGCTCC:1 - chr3L 5875281 3' - transib2 2544 1 57.00 GGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGATGTGCCACATGTCGCTGCAGTCTCACAGAGCCGT:1 - chr3R 18254982 3' - accord2 7302 1 66.34 TGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTAT:1 - chr2R 5284565 3' + Doc4-element 2611 1 55.45 CCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 4884 1 53.85 ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAGTCTAAAAATTGAGCTGCTGCTGTACCTTTTGCTGCTTTTTGGGGCTGGCCAACTTAATTGTAATTTCG:1 - chr3L 6673800 3' - transib2 55 1 60.40 CTGACTATAAAAGACTTTATTCTATTATCTGTTTTTTAATTATGTATTAAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAAAGCGGCAGAAACGTACGATTCCATT:1 - chr3L 6567581 3' + Cr1a 4203 1 48.51 ACCCGGGCTCAAGCCCTTTACCATAAATGCATGCAGTGCTCCTGGCTGTTTCTGCTTCTTCCTCTTGGCCACCCCCTC:1 - chr2L 16646349 3' + I-element 158 1 78.21 AAGAAATTTTATTAAAAACACGATCTGAAGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTCGCCTGGTACGCTTGACTTAAAGGAATCCCCGGATCAGCGACACGTTT:1 - chr3R 26852258 3' + Tc1 391 1 55.45 ACCCATAGCCCAAAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCACAGTTTATATGTTAAATTGTATATTTCTGCAATGCTTTTTAAATATTTT:1 - chr2R 19164375 3' + F-element 324 1 55.45 TATGGNCATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATT:1 - chr2R 5284579 3' + Doc4-element 2597 1 68.32 AAATCNTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTGTGGCCGGCGTGGAGT:1 - chr2R 5322009 3' - 1360 36 1 63.37 GAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATGAGAAAAATCAATTGAAATCGATGCGCCGGACGCGAGGGAAAA:1 + chr2R 16926178 3' - 1360 50 1 57.43 TCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGCACGCTAGGAAGTAGTCATTTTGGTAATTATAAAGTATTT:1 - chr4 1131453 3' + Quasimodo 203 2 63.00 ATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCCACCAGATGAGCCACTACGACGCACTGGGAATCAGGCGTCAGTGCACGCAGAACGAG:1 - chr3R 8032782 3' + accord 6946 2 59.41 ATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCAGTTCGAAATGCGCACTGAAAG:1 - chrX 10309081 3' + invader6 10 2 81.19 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTCCACAGAGCACGGTCACACTTCACTTTGTTCGCCATTGCTA:1 + chr3L 9864643 3' + P-element 2852 1 44.55 ATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGCCGTCAAGAAACCGCCTCCTTCCTTCTCCGGTGATCCACCTTTTTTTGGGGGCTGGCATTCCG:1 + chr3L 1043165 3' + gypsy4 6458 1 62.24 TGTTTATTGACATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGTGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGCCAGTATGTACAAGGGTAAAGTCTCATTCGTCATAAT:1 - chr2R 2796100 3' - Idefix 7105 2 63.37 ACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGATGCTGGTCGGCGGCCCGCGACCTTTGCACTTCCCAAAAG:1 + chr2R 9698889 3' + Chouto 6 1 78.00 ATTACAGATGAAAGGATAAAGTTATAGTCAGAATCGACAATGACATCTCGATTTCCTGATGCCGCGCCCACCAATCCGTATAGTCGGCAGAGTTCAGAG:1 - chr2L 9517612 3' - Cr1a 4216 1 58.59 TGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACAAACTGTCGACGGCACAATCGGCGTTAGATTTACGAGAATTATTGGGAATTTGCCGATGACAGGAC:1 - chrX 20641795 3' - INE-1 213 1 60.40 GCACACAAATTTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACACATTAATGGCACTTGTGAGGCGTTATAAACTGC:1 - chrX 3306602 3' - hobo 40 1 71.29 CTATGATCAAATATAAAATTAACGAATGACCGAATGACTGAGCAACTTGGCTGGCAAAAAGTTGACCAGTTGGCGACCCTTTTGCAATGGGTATTTTACAT:1 - chr3R 18770609 3' - gypsy3 196 2 70.30 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATC:1 - chr3R 6216797 3' - pogo 25 1 57.43 TGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAATGATTGCATACTTTAATGGGCGAAGCACTTAGGCAGCCTC:1 + chr3L 3756662 3' - Doc 394 1 60.40 AACTTTCCTCTTTTAACTACCTGCCTTGTAGAGGCGGGCAGCGTAGCCGTCGTGGTCACATGCTGGTTATTGGTACTCTGGATGATTGT:1 + chrX 272775 3' - Gypsy6A_LTR 268 1 71.91 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGT:1 - chrX 11042514 3' - jockey 4702 1 54.46 ACTTTGCCAGCTCTTTTTCATTTGCTCCCGTCTCTCGTACTCCTCACAGCTAACTAATTCACATACCCTATGCTATGTGAGGCAGTGGATTGTTTGGGCAA:1 + chr2L 21394410 3' - G5 497 1 69.31 CAAAANAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGG:1 + chr2R 5322056 3' + 1360 3341 1 74.26 AAAAAAAAAAATGATGAAATTTGCGTTCGAATTCACACTAGCTGATTAACGGCTATATGATAGTCGGCATTCTCTCTTGTTTTATAATT:1 + chr3L 24797363 3' + transib2 2645 1 73.03 GTTGCTGCGGGGGCTGCTGCAACGCGTTGATTTCAACTGGAAATGTTGACAACTGTTTTGCCACTTTTGCCGTAATTGAAAAAATGTATTCAAATTCACTG:1 - chr2R 9631979 3' - Max-element 264 2 64.36 TGCTATCGCTTGAGCAGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTTGGTCAGCTTGGTGGGTGAGTGGGGGAGTGGAAAGTGGAGC:1 + chrX 20904129 3' - G-element 409 1 76.24 TTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACGCACACACACACATGTAGACACGAACA:1 + chr2L 16778875 3' - R1A1-element 5325 1 76.24 CGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGGCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTCGTCACTAGTGACTTCCCTACCCACTTGTA:1 - chr3R 12942477 3' + 1360 3177 1 69.31 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACGCTAAGGGGAGAGTGACCAATATTTTTTATCTAATTTCGGAAATCAAATATTACAATGCAAT:1 - chrX 22689303 3' - HMS-Beagle 6809 2 66.34 AGTTTTTTTTGGCAAATCGATAGAAGTTTACAAGACATAAAATTAAGAATATGTGAGCGGGCGTTTGTCCCGTGGTGTCATGTTTTGTTTTGTGATTGTAA:1 + chr3L 25677646 3' - INE-1 315 1 57.43 CCATTTACTCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAATCAGCAACGACCTTTGCCTCAA:1 + chr3R 23800904 3' + roo 8977 2 82.18 CACTTNTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATGGGGTCAAAACATATGAAATATGACTATTAAGACAAG:1 - chr3L 12679175 3' + 1731 4188 1 71.29 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTAAAGCAGGTAACACCAACAAGGT:1 - chr3R 22667108 3' + 412 476 2 61.39 ACTCANCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCTCTGTTTGGGTCAGTTCTTAAATTTTTGAAAAACT:1 + chr2L 20098662 3' + McClintock 19 2 64.36 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGGAGCGTCAACAAAGCCATAAAAGCGCGCTTTTAGCCAAAGAGCCTCGTAAAAT:1 - chr3R 31293196 3' - hopper 20 1 60.40 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGTTAAAGTAATATTAAAGCCATGAATCAATTGGTTTTAATGACAATTTAAAATATAACAATCACAAC:1 + chr3R 9193678 3' - roo 10 2 69.31 TTCCATTTGCTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAATTATGAATAAATCCCTATGTAAACATAAATCTTAGCAGTTAGTGTTGATTAAGTAACTATTAAGGG:1 - chrX 5010246 3' - Fw2 3706 1 56.44 CGTGCCTCTGCCGCAGCGGTCAAACGAAAGCGCCTCGCACCACGCCCATGAATATGTGCAGACCAGCTCCAATCCGCTGCGTTCGGGAGCCGGGAAGCTGC:1 - chr3R 9563258 3' - invader4 87 2 58.42 CCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAAGAAATTTTTATGAAGCTATTAAAGCGAACTCACCTTTCGAACAAAACCAGGA:1 - chr3R 28816075 3' + accord 6983 2 48.51 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAG:1 - chr3L 21840297 3' - 1360 53 1 79.21 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGCTGCGCTGCTGGAAGC:1 + chr3L 5691302 3' + P-element 2856 1 48.00 GAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTTGGGCTCGTATTTGCGTAAACAAGGCCACACTTTGGTCAGGGCTGTTTGATATTGGGCTACGGGAGGGAT:1 + chr2L 598176 3' - I-element 5088 1 76.24 CCAACGCGAATTGCGCTCTCAACGGCAAAAAGACCAAGACAAGCGCCGACTCTCTTCGCAGCGGGGACGAAGATATCGCCCACGCATCCGACGTAGTGGAG:1 + chr3L 22950955 3' + Doc3-element 226 1 63.37 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTAATGTACACGATACGAGGAAAAACATCCAAAGGGGG:1 - chr3L 19510747 3' - roo 40 2 65.35 TGTAACGGCGATAAGCTGGGCGATGGTAATTACGCGATATGCAAAGCGCACACAATTGGAAAGACATAGACGTTCGCTACGAAGAAACGCCAAATGGTCA:1 + chr3L 7913490 3' - Ivk 82 1 73.00 AATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCGTCTAATTGTAGCAGAAAACTTGTCTAACATCG:1 + chr2R 11248868 3' - 1360 3260 1 67.33 CCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCCCTCTACCTTTTCTCGCGAATCGGTTGCCCAAGAGCGAGAGGGAAAACGTATACATGTATAAGTGTGTGTCG:1 - chr2R 20511280 3' + Cr1a 4345 1 53.47 ATTCGCGCCACCCAAACTAGGTATATACATAGATACATAAATCTGTATGTATTTGTGGCGGGACGAGGGGGTCGGCAAACAATTGGATGCTGTGGG:1 - chr3L 21869476 3' + McClintock 44 2 77.08 AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGG:1 + chr2L 3245009 3' - rover 6974 2 59.18 GTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCTGGCGTTCGTCAGCGATGGGAAGGTCGTTCAGTAAGCTCGGGAATGAATATG:1 + chrX 16221695 3' - F-element 271 1 60.00 ACTCANCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCAAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGCAGCACCTAGGGGCCGTATGATAATTGG:1 + chr3R 11833038 3' + roo 393 1 61.00 TCATGNTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACAACAGCGAAATAGAAATGAGTATTTCACATTCGCACGTAAACAACGCATTGAGTGG:1 - chr3L 10141466 3' - 412 7160 2 62.38 AATTGAATAGGGTTACTATCGCATCAACAATGTATTATCCTACCGACTGTGCCAGTTTTTGTTTTTAATTTTATTACCCTACTATTATTATTTTGTTTTCC:1 + chr2R 21638249 3' - rover 399 1 56.44 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTTTAGAAACTGG:1 + chr3L 25341900 3' - 297 31 2 61.39 GAATTATCCCAAAACTTTCCGTGTGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCATTGCGTAAAAGTACCCAA:1 + chr2R 14256518 3' - Gypsy12A_LTR 158 1 65.35 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATTTTAAACCTGATGATTATTCATGGTATTTCACAAAAATGCAT:1 - chrX 2781227 3' - FB 34 1 61.39 GCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACATTCTAACCAGTTGATCAACTGTGATTTTTGGTGGAAAGGTCCGA:1 + chr3R 19446523 3' + gypsy12 10162 2 60.40 ATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTGTATTTTTTTGTATCAGCTAAATCTTCTACAGACTGCTGCCGAGGCCAAAGTTCTTTTGGGTCTGCT:1 - chr3R 19446552 3' - F-element 137 1 59.41 ACCTTCTTCTTTAAGTAGACCCACAAATTTTTAATGGGGTTCAGATCACGACTCTGAGGAGGCGTATCGTGTGGAGAGTGCTGAGATTGGGAGGATCATGT:1 - chr2R 323917 3' - S-element 1260 1 68.32 TGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGGGATAGATTACGCTACACAGACATACATAGAAGAAACTTGGTTCATTTGGTTCACCCAGAATAATAC:1 - chr3R 18011718 3' - I-element 190 1 72.28 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGTTTATTATTGATAAATATCAAATTATCGATAGTACTTCCCCGATAAGATTCTGTTAACACACAT:1 - chr2R 17095080 3' - Juan 4040 1 61.39 AACCTTCATGCATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTTTCCTTCTACGTATTTGTGAGCTGGTCCTCTTCTTGGCCATAATT:1 + chr3L 17113784 3' + Tirant 356 2 48.91 GCCCACACTTTTGAAAAATTTTCAAATGTTTCCCGTTTAATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAAAAAAATGAATGAAACTGATGTCCGTCACATAGAGA:1 - chr4 374753 3' + INE-1 256 1 75.25 GTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATATGAGCCGCAACAATACTACGCGCCCATGGACTACCAGCA:1 + chrX 1195350 3' + F-element 196 1 65.31 TATTGTTGCCGCCGCTTTTCCTTGTCTCCTGGCGAGGCTGATAATAAAACTTGGTCGCTGGCAGGGAGCAGCTTAACCCGGGACACATAGGACAAGGTAAA:1 + chr3R 12945243 3' - HeT-A 158 1 69.31 AGCTCAAGGAAGCTGGGTTCGGATTTTTTAAATTTGACTGCTGGAATCGTTTAGAACTTTGATACGAAAAGCATTTTGGAATTGGTAATGCACCTGACTAA:1 - chrX 6769867 3' + FB 1 1 50.50 TCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCATTGTCATTTATTTGCTGCTCGTTTTTAGCTTTTCTACCTTTCATTGTATC:1 - chr2L 12944767 3' - G4 174 1 53.47 TCTCTTAATTTTGTTTTTTTTTTCATACATAGCTCTTTGCATAGCCGATTTGTTTAAAGCTGGCATTCGACCGATAAAAACACGTCCGCCAGCCAAGCCGT:1 - chrX 1012794 3' + frogger 2172 1 74.26 GTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTGGGCACTGTCATGTTCAGGCC:1 - chr3R 26331612 3' - G-element 2 1 78.22 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCA:2 - chr3R 15072563 3' - pogo 20 1 56.44 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCTGTTTACATTTATTCTTCTATTCAGCGTATGCAAATCGCATAA:1 - chr2L 2689801 3' - roo 8697 2 62.38 CAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGGAAAACAAAGAAAAACGAAGAAATGTCGGCGCAGCGTCTAAATGCAGCGGAACGGGATTT:1 + chr3R 8350150 3' - accord 7210 2 68.32 GGGGCAGTCAGTTGGACAGCAAGATCGCGAGTGGAAGGAGATAGTGCGTCGGAGCGGTACCAGAAGGAGTTCGGGAGTGGATCCATATTATTTATATTTTC:1 + chr2R 8999838 3' + gypsy8 372 1 78.22 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGCCGCATTTAATTTTTAAATGAGGGACTTTCTT:1 + chr2L 2645258 3' + mdg1 7416 2 67.33 ACATAAATAATTATCAACATAAATAATAATAATGATAATAATAACGGTAGCTGTAGTGGTAGTGGTATTAGGGGGGAGT:1 - chr2L 2123449 3' + 1360 2945 1 63.29 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTACAGAGCGTTGGCAATTCGCGATAAAAACAATTATTTTGTATATTTTGTCATCGATAATCTGCCTG:1 - chrX 3485616 3' + P-element 2879 2 71.29 GGCTTTCAAACGGTAGATAAGAAAGATGATGACCAGGGTTATTGGGGTTGGGGGATTGGGTGAAGTGAGCAGCTAGTGTGGGGCAATGGCA:1 + chr3L 822344 3' - gypsy10 5568 1 51.65 TGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTGCAGATATATTTTCATGTTGAGACCCAAATCGTTGCTGCTGTTGTCCGCCTCATCGTCATCCTCCAGATCCATCTCATC:1 + chrX 13883848 3' - Gypsy12A_LTR 2169 1 70.30 AGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAGATTGCTAGAAAGTAACAACAGATCAGTAACAAATCACA:1 + chr3R 13495009 3' + F-element 4647 1 65.35 TTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGACTGCGCCAGCTGAGGTCGTCCCTGTCGAAGATGGAGTTCTTCAACGAG:1 - chrX 1456215 3' - Tirant 458 1 59.41 ATTAAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAGTATTAAGACAAATTGTTAATCCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAATGGAAAATGCCTCAAGGGGTGCTG:1 - chr2L 1659967 3' + G4 3474 1 73.27 TCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTCGAACAGATTAATGAAGACCAGGACATTAATGCAAATCAGATTTTCGTTGAAAAAGAGAAAAAAGTACTCTAAGTGA:1 + chr4 732370 3' - INE-1 544 1 75.25 TGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACTGAATCCAACGAAGACTTCCCCAGCTGACCATATACTCGCCGAAGGTCATCTTGGTCA:1 - chr3L 24212701 3' - Quasimodo 169 2 57.43 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCCGGGCTAAAATGTTTTTCGAGCCCCCAAAT:1 - chr2L 796729 3' - jockey 10 1 74.26 TATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTAGTTCTCTCTCTACCATTTGCAATACCCTGTAACAGCGG:1 + chr3R 30286465 3' - Juan 3918 1 61.39 TTTGCTTGAGTGAAAAAGCCAGTCCAGCTTTTTCGGTTTCTATGAGGATTTGGCTCCAACTGCGCGCAATCTTATCGTAATGTTACTAGTGCTGGAAAGGC:1 - chr2R 9251964 3' - G5A 2355 1 60.40 TATTTNATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAACTTGTGATTTCTTTGT:1 - chrX 19561806 3' - 412 7076 2 58.42 TAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTCTCGACCGAAGTTTTTCCTCTGCGACCG:1 + chr2L 7398715 3' + roo 8941 2 77.23 CATATGGTGCATGTGTCTGGACACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTAAGTACATAGCTCCACCTCCGCCTTGAGTGGATTC:1 - chr2R 8824039 3' - R1A1-element 5240 1 73.12 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCG:1 + chr3R 25814750 3' + 412 439 2 76.24 TATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGT:1 + chr3L 22052865 3' - mdg1 1 2 77.78 AGTGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAGAATTAGTTAAATTATATTTAGTGAGCATGGCTGGTGGTTCATCTCTTG:1 - chr3R 25021350 3' + flea 274 1 57.43 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAATACTCGTAGGAGCGAACAAACAAAATGTCAGCTTCAAAATTACGCTCCATAGTTTTAGGCAGCGCCACAAAT:1 + chr3R 17505041 3' - jockey 9 1 70.30 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGC:1 + chrX 2090298 3' + roo 393 1 58.62 ACCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAATAATCCAATTATAGCAGACGATGACCCACGCTTAGTTGGCCTCAATAAATAACGAACGGAGTCGCGGGGAG:1 - chr3R 17426016 3' - Gypsy6A_LTR 250 1 69.39 TAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGCTCATACAATATGCAACTCCATTTGAAACACAACCCACCAGCTCGTTG:1 + chr2R 21828978 3' + Bari1 1622 1 52.48 ATAGGTATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTT:1 - chr3L 12072557 3' + HB 1587 1 64.36 TTCGTTCATAACTGGTAATGCTCTGCTTAAAAATAATCATTCGAGTTTCTTTTGCCATTTCCTACACATAACCCCACAGATGTTGCCTCAAATGGGAGCAT:1 + chr3R 11660020 3' - G7 326 1 61.39 ACTCGACTATTGATCCTGATTAAAAGGTGTAGGTGCTAGAGTTCTACAATAGAAACATAGAGTCGAACGGAAGGCCTAGGCTTCTGTGCTGCATGGCACAT:1 - chr3L 2532332 3' - INE-1 91 1 54.46 TTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTGGG:1 + chr3L 26852092 3' + diver 6075 2 60.40 TACTTGTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTGCCCTCCACATTCGTCCTGCGTAATT:1 + chr2L 12876727 3' + F-element 270 1 72.28 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCTTTT:1 - chr3L 15276630 3' + hopper 1400 1 63.00 TGTGTGTGTGTGTGTGTGCATTATCCTGTGGACGTACACATGCATGCTGGAATGTCCTTTTCTATCTTTGCAACCGATTAAATTAATGCGAAGAGTTACAC:1 + chr3R 16626478 3' - accord 180 2 61.39 TTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCCACAAATATGTACAAATATGTATATTGGTTTAGTTAATAACATTTCCCAAATCGAAATAAAAATCTT:1 - chr2L 22551673 3' + 1360 3110 1 58.42 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCTCCCGATGTCCATAAGTTATAAATATACATGTGTATACACTATACAATATTT:1 + chr3R 22066802 3' + hopper 1378 1 47.52 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCAGCTTAATGCGGAATTAGGCTTGA:1 - chr2L 15020115 3' - jockey 4719 1 74.26 GTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCCACCCCGCCGAGCGCCAAGGATGCACTACCTCCCGAAATCCATGGCATTTTTCTTTCGCATTCACTTCTTAACTTTG:1 + chr3R 21529348 3' + Doc 422 1 76.24 TTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGACGTTGGCAATATCGCTGGGGGTGATCGGTTGCATCGGCCATTTGGAGAGCTTGGGAGCTGGGGATTGCATGTTATTTT:1 - chr2L 2196123 3' - BS3 229 1 82.18 CTACGNGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTGTACATGTGAGTATGCAGGACATGTGGCATGTGTGGAAGGCAGGAGGAGCACAAGTGGCTTTCGGAAAAGT:1 - chr3L 22117407 3' - G6 1692 1 75.25 ACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACTAGCCAAATCTATTAGCTTATCTAAAATATTTTTCCAAAACCAAATCCATAAA:1 + chr3L 23611441 3' + flea 4591 1 56.44 TACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGCTTATCCGTACATTTCTAGCGAATTAGCGAACGTGTTT:1 - chr3R 29791084 3' - mdg1 7362 2 62.38 TATATTAACTACATACGTTAAAAACAACGTACCTTGTTCTTCCTTACATTAAAATAAGCTTTTTAAATTTTTTTCGAAATCATTTAAAAACAAGTGATTAT:1 - chr2L 18896922 3' - transib2 300 1 68.32 TATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTCGAGTGCGATAAGGACAAAGCGGCAGGACCCGCCTCACAGGATCCCCTGACCACATGCGTCCCTTGGTAGCT:1 + chr2L 13633669 3' - accord 7028 2 68.75 AAACAGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAATTTGCTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAATGATTTGTTGAGTACTACTTTCTATGCGCTTGCAAA:1 - chr3L 18345200 3' + Cr1a 439 1 74.26 TTCACGCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATC:1 - chrX 1399885 3' + P-element 2831 1 23.76 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTAAA:1 - chr3R 22667128 3' + 412 456 2 60.40 ACGTTATTATTATTATTTACCAAACTTAACGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTGTCTGTCTGTTGGCTGGCTTTTTTCTTCAATGAATATT:1 + chr3R 23450735 3' - G4 3658 1 58.42 AACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGAAAAGGAGCTGGCATTCAGTTTCCAAG:1 - chrX 18723266 3' + F-element 264 1 75.00 TTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCG:1 + chr2R 5173236 3' + Stalker4 409 1 76.24 TTCGTTGGCGTTGATGGCAGCACAGACATAGCGTGCCCCACAGACAAAGCTCCATACGCAAATCCGAAAAACACAAAACAATAAAATGCTTCAGATGATGA:1 + chrX 4508732 3' - HMS-Beagle 6849 2 47.52 TATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCGTTCGTTTCTTCGATCAGAATAAATTTCGGCCCGAAAATCGTCTACTGCACAACGTCTTGCCTGCGCCCTC:1 - chr3R 19245602 3' + 1360 3118 1 79.38 TCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTTGATTTTTAGTCCTAAGACCAATAAGAACAATAGCAAAGCAATAAAAGAAACTTTTGTTTTTTGGGGACACATTTC:1 - chr3L 20063011 3' + 297 6830 2 65.35 CGAACCGCTATTTTCTACGCATAGCAATGACAGCAGTGATGGAAGTCAAGTACTCGGAGGTTCGAGATCGCATTGTTAAGTTAACTGACAAACCACCTGCT:1 + chr2R 5427555 3' + 1360 135 1 78.22 TTGGTATTGAATTGGGAATTCGGTAGTGTTGGTGGGTTATATTTGTTTGGATCCTACTGCTGCGATTGCTGCTGCGTTTTACTGCTTCTGGTTGCTACTGC:1 - chrX 9694578 3' - I-element 4986 1 60.40 CCCAGCAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAATGAAGGAAAAACATATAGGGACATAAAAGCATGAGAGTACATGAAACAGAGAAGCTTAGATAAA:1 + chr3R 25705728 3' + HB 373 1 60.40 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGAAAATCATTTAAACCAGA:1 + chr3R 10490385 3' + transib2 2769 1 79.21 GACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGAACCGCAAGGCCAAGAGCCCT:1 + chr3L 12659912 3' - F-element 298 1 79.21 TACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTGCACCAGGGTATCATTATAAACGTTTATTACGCCCATAAATAGGTGAGAAATTACGGTGTTTG:1 - chr3R 11076047 3' + springer 346 4 60.40 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCTCCAAAGTTGGCTTATCTA:1 + chr2L 22319368 3' + Transpac 5214 2 64.36 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGT:2 - chr2R 16018836 3' - I-element 33 1 57.43 TGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAAAAATCGGTCACTTGTGAAATAT:2 - chr3L 21637317 3' + Bari1 1695 1 63.37 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAAGGAA:2 + chrX 1399953 3' + P-element 2881 2 73.27 CCTCTAGCCACTAAAATATAATTTTTTTATTTTTTTTTTAAATTCATTTCCGAACTGCGTCATAAAACTATCCAAGAGACGGAGCAATTTGTCTCCCTTT:1 + chr3L 16254552 3' - HB 340 1 59.00 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGCT:2 + chrX 3485714 3' + P-element 2863 1 51.49 TTGGACTTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCTGACAGCGCATTAAAAAAAGAATATGGTGTCAAAAAGTCG:1 - chr3R 19469275 3' + 1360 243 1 60.40 GTGGTTACATTAAAGACGAAATCTGGCATTCAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTGAACCACTAGAGGCGGAACCCTTGGTGGGTTGCGATCGGGAGGGCTGC:1 + chr2L 22022932 3' + diver 5743 1 54.46 AAAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTTTTAAGTTGAAAGATGAGAAGAATGTATGGAATACATACGTACGTCTTACATCATTTCTATTATTATTACA:1 - chr3L 10196489 3' + Tc1 498 1 43.56 CTCTAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCATCCTGATGGCACTTACACATACATACACATACA:1 + chrX 7465111 3' - hopper 39 1 61.39 GCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGCTGGGCAAATAAGTTGGGTGGCGTGAGTTCGCGACTACGACGACGCGAACATAACGAGCAAAATAAA:1 - chr3R 5774879 3' + invader4 2881 2 72.28 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCCAGCCAGCAGTATGTACATATGTATGTATATGCCCGATCTATATGACCGATCTACTCG:1 - chr3R 13824334 3' - roo 8679 2 63.00 TCGCANCATCGGCTCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGTAAAACGATCCATTGAGAACCGGAAAAGTTGGCGTAATTTGCCAAAATTTCCATATCTC:1 + chr3L 11056957 3' + invader2 4961 2 67.33 AGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGACGGCTCTCAATTCAACGAGACAACTAGGCGACGAAGTACTGTGCAGCACATTGTGGTATCCTCTATTTTCTTGAT:1 + chr2L 4422189 3' + F-element 217 1 50.50 AGAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCATTATCGCTTTCAAGAAATGTTAAAATCCATTTCGCCT:1 + chr2L 6653570 3' + hobo 260 1 60.40 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCAAGCC:1 - chr2L 5932089 3' - jockey 19 1 59.41 ACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACCAACTTTAATCGTCTTGTTAAATCTTCTCGCCACGATTCTTTGCAAGTTCATTTGCAGTTTCAAT:1 + chrX 6616197 3' + I-element 4898 1 67.33 TAAAACCGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTGGAGGAACTGGTGGGCAAATTTTGGTAGACAGAAA:1 + chr2L 22227377 3' - F-element 23 1 65.35 CTAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGAAAATTTGTGGCCTTCAAGGAAGAGTCTGCCCTCGCATCCGCATCCCCACTTGCA:1 + chr2L 11177043 3' - G2 2901 1 60.40 TCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCTAATAAGGATAATCGTTACTCTACGCGTTCTTCTAAA:1 + chr3L 3252977 3' + 1360 425 1 63.37 GGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCAAACACGATTCCACCTGTGCTTCGCAGGCGACAAAATTCTCTAGCTTTTCCTGTTCGGCGTCTTCGTTCAGGTT:1 + chr2L 11938391 3' + Gypsy12A_LTR 1953 1 78.22 TATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGCACCCAAACTGCATAGCTTCGAGCAGTTCCCAATTGAAGTGAGT:1 + chr3R 17722275 3' - I-element 4913 1 56.44 CAAGCAACTTAGTAAAATTCTGTTGCTTTTGCTTACACAATCCTTCCAAGAACATTTAATTTTGCTACTCGCTTATTCGTACATAAAACCACTTGAAGTTT:1 + chr3L 3114564 3' - Copia1_DM 4256 1 55.45 TACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAAGATGCGATGTGTGAAGGATAAGCCAAGGACTATCGCAG:1 + chr3R 25938525 3' + Burdock 6317 2 62.38 GCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACGACTTAAGCTATTAACAAGCTAAGAGACGGTTGGAAGTAAAATATTTGCTTA:1 + chr3R 25093525 3' + roo 306 2 59.41 TTTGGGATTGTCGTTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCCTTTGTGATTGCAGTGAAAATGCGCATTTAAATTTCGCTTTCATGGAAATTAATTAGC:1 + chr3R 24441062 3' - F-element 280 1 62.38 GCCGANGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGATTTAAACCATATCTCAAACTAACCATTCTTATCACCAACTATTTAGGTGG:1 - chr2R 18434466 3' - pogo 22 1 51.49 TTCCCTCGCTGCTGGAGCTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGTAATAATGTTACCGCGCAGCGAACGCCGCTAAATGAAATGAATTGTGAAAAATG:1 + chr3L 12310029 3' - G6 397 1 59.41 TAATAAATCGTAAAACTAAATTAAACTAAATATCCAACATCATATAAATACAACTCAAAACCGATTGCATGGAAATAATCAGCATGCAAAATAAATACAGC:1 + chrX 18138967 3' + Juan 3739 1 58.42 GGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCATGGAGAAGATGGCCACGGAAAGCAGCCGCCAATTGCCCGACCAACACAGAGCGCCAGCAACAGCAGTGCGAGC:1 + chr2L 19169843 3' + R1A1-element 5014 1 64.36 GTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCGATCGTGGGAGG:1 + chr2R 4879032 3' - G-element 20 1 60.82 TCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGATCACTACATATCTCACGCACGCAACCTACTACAAAAATTCAATACCAATTTTAAACTCCTTTGGAT:1 + chr4 195384 3' + F-element 283 1 70.30 AAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGTCATTACAATTATTATTACATATTAACATTGGTAGCATTC:1 + chr3R 13824416 3' + roo 9037 1 65.35 ATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATCGGTATTCGTTTGAGAGACGTGTGTGTT:1 + chr3R 9549708 3' + Stalker4 6928 2 75.25 GATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTAGAGTAGAGTGGAAGTAAGCATTGGGCTTTGGTTCTCA:1 + chr3R 24457418 3' + flea 4822 1 74.00 ACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCATCAATAGTGGGATGCGAAGAGGGATCCTCGTGCACGAAGATCAGGAAG:1 + chr2R 16656712 3' + F-element 235 1 56.44 AAATGTAGACTATATTAATAATGAACATTTTTTGGGAAGCGTTGATAGCGCACACACATATAGCCAGCCGTTTGGCCGTACTGCCGCACATTCCGCCGTAT:1 + chrX 18155303 3' + transib3 2502 1 60.40 ATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAATCCAAGTGTGTCTAAAGCACTTTGAGGAG:1 - 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chrX 12801429 3' + Burdock 6378 2 59.41 TGGTACGATCGGAGTGAAAACACATACTCTAAACACTCTACTATACCTAATTGAATTTTATTAGTTAAACTTTTTATTATGACTTTAAGAAAATCCCTCGT:1 + chr3R 14865226 3' + F-element 4367 1 76.24 TTTTTTCTTTCTTTTTCCGTTTCATATTGCAGCACGTCAAGAAAGCAGCGGGAATCGGGCGTTGAGCCGGAGCTAATTGGTAAAACTTCATCGAGCCATCG:1 - chr3R 8448117 3' - Doc2-element 239 1 65.35 CGATTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACATCAACTACTCTTCCAATCTTACAGTACACGAGCAGACACACAAAAGCCAGTCAGACAGACGTCTCCATCGCC:1 - chr3R 11697965 3' + jockey2 24 1 60.40 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCGTGGAAGGCGC:1 + chr3R 20140612 3' + jockey 4983 1 54.12 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATAA:1 + chr3R 22675874 3' - 412 34 2 56.44 AAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGACGGATCTGCTCTACTCGGGTGTTGAGCGGTGAGTTAA:1 - chr2L 6130031 3' + R1A1-element 5080 1 62.38 ATTTTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAACCGGCACGAGCTGGCTTTGACCATTTGGATTGCGGAATACCATGTAGTCGCGTCCGTTGATCAGGC:1 + chr3L 20108875 3' + INE-1 86 1 77.23 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACGATTTTCAATCGAGAGCTGAAAACTTAAGCCTTTA:1 + chr2L 11240947 3' - roo 40 2 68.32 TCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGCGAAATGGGGC:1 + chr3R 4807840 3' - P-element 28 1 51.49 ATAAAGACTTCGGAATCCCTTATGTTAACGGCTACGGTTTTTATAGACAGACTAAGAACCCATAAAACAAATTTCTCTTTTCTTCGCCCGGGTAATGGAAT:1 - chr3L 8456307 3' + G4 3556 1 56.44 GCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGGATTCAGCTTAGCTGCCACCAGGATTCCTCG:1 + chr3R 29975192 3' + G6 1649 1 66.67 TTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTACACAAAATAAAATAACATTTGAAATTATGATATCTATATTCGAAAAACAAAATTATAAAATTGCTAGAA:1 - chrX 21668513 3' + Bari1 1701 1 73.27 AGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTAAGATCTATGTAATTGCCTTAAATCGCCAATATCATCCGTAGATTAT:1 + chr2R 12618360 3' - accord 7331 2 54.46 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAAAAAG:1 + chrX 697522 3' + roo 9048 2 58.42 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGCTAACATAT:1 - chrX 11060474 3' - I-element 23 1 50.50 TAAGGGACTATTTTAGGAGGACGGGACGGGTCATTCGGGTCGGGTCGGGTCGGGACGGGACTGACTACAATCCAAGTTCGAAGGCACAATTTCAAAAGATT:1 + chrX 1074959 3' - roo 188 2 84.16 CACACGCCAGTGTGTATAGACATTAGCGCTGATTGCCTACAGCGAAGGAACTTTAATCGCTCTTCACTCTCTTCGCGTTTTCTCTTAGTTGGCGCCTGGGA:1 + chrX 4752051 3' + invader4 182 2 73.27 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAA:1 - chr3R 21799535 3' - jockey 4810 1 75.76 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAAGCATTTTTTTAGTAGATAGTAAAAACATATACGGT:1 - chr3L 19260783 3' - pogo 35 1 67.33 CATGGAATGGGGTACTATTAACCGTTTGCAGCCTGTTGGTCGGCTCATCTCATCGACCTAGCACGCATATCAAGGATGGAATCGAGCACTTCAGCACCGC:1 + chr2R 7365402 3' + Chouto 5990 1 77.00 CAGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACTATGTAAAGCGCGTAATGTCTGGATTCCTGGTTGTATCGAAGCCCAAGTCACGAGATGTCGAGGATAGACATC:1 + chr2L 6668693 3' + Doc2-element 288 1 75.25 AATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTAATTAAAATCAGGCCGTAGGTGTTTTTTATCTCATACAGTACATAGAGGCGGCCACAATTAATTTGCACAAC:1 + chr3R 14880168 3' + gypsy5 7256 2 38.61 CGCCTACCCTTTATAGGCCGCAGGAATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGTCCCGCATTCTTGCCGGCGACAAACAATAAAATACAAATTTGCTACTTT:1 - chr2L 2068722 3' - gypsy8 337 1 57.43 TCTCTGATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCATCCTGATGGCACTTACACATACATACACATAC:1 + chrX 7465110 3' - hopper 40 1 58.42 GAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGGTTGAGGGCACCGTTATTTGCACTTTACTTTACATTTTTACAACAGCCAAAACTTGTATCTTGGCCCTTG:1 + chr3R 17948854 3' + Doc 4362 1 57.58 GAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGGGGAATCATACTTTGGGGGCTTTTGCTAAGCTATA:1 + chr3R 17827447 3' + Doc 4468 1 65.35 TTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATTGCCGGACGGAGTCTGGGCCAGAACCGGAGTCAGAGCCAACTTAGCGAGCGGAACACGCTCCGCATTTAAGGA:1 + chr3L 22217953 3' + hobo 2657 1 76.24 GTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTTTGGTACCGATGGGTCGGTGGCTCTAATCCGGGCCAGAATCAGTTCCCCATATTTGAACCGGCTGACTGACAGC:1 - chr2L 19379026 3' - ZAM 7991 2 69.31 GCAATTTCAGTTTTTACAACTGGTCTTGGTGGGTGGTTACGGGCGGCTCGGAAGTTTGCAAGTTTTGCGCTTCCGTCGTTCGAGGATATTTGTCTGCTGAA:2 + chr3L 22086896 3' - Doc4-element 2744 1 73.27 GTATGACGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGGTACCTATGGAAGTTGACCCTTCATTGTCCAGGATGTGGCATGTGGCATGTATGTAGGTAT:1 - chrX 18267351 3' - 1360 16 1 73.27 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATAAACTAATGTTGCATACTTTTGGAAACCTTTAAGGCTATTGCTCTTTCCTTTC:1 - chr3R 29653036 3' + jockey 4973 1 50.00 GGGGAAAGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCCAGTCTAGGACGATAAGATTGGTATCCTTTCG:1 - chr2L 8373044 3' - roo 8831 2 67.33 CCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTCAGCAATAAGTGAAATACTCCAATGTGATAACTGATCAAAGTATAAAGTGCGAATTGAGTGTAAATGTCT:1 - chr3R 18271319 3' + Tirant 167 2 71.29 TATAGATCAGCCGAGTTTTAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTGAGCAGTTTCTTATAACAGATCCACAGGCTGGGTAATGAATGCAGTG:1 + chr3L 24360685 3' - Quasimodo 7119 2 62.38 AGCCGAAGAAGAGCCAACGACCCAAAGTCCAGGTGTTCGACGTCGACAGTGGAATACTGCAAAGGAGGGCAAAAGAATCAGGCAAAAAATGAAAAACGGA:1 - chr2L 3348868 3' + R1-2 214 1 68.00 CCAAGAGGGGTAACTTTCAGATCTCTTTCGATTACCTGTTCCAAGTTGAAGCGTACCAGAAAGCATACTCTCGTTTGTCGTATGTACAAATGCCATGGCAC:1 + chr2L 4303207 3' - G5 4517 1 66.34 CAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCAGCTGGGCAAAAGCAGGAAAATGAGAGTACACAGGGAAAAAAGTGTATAACAATTAATGTA:1 + chr3R 15031778 3' + invader1 3910 2 68.32 ATGTTTTTATTATTTGATCAACACACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGTAATTGATATATATAAATGTATCTCTTTGGATCTGGTGAGCAGAGGTTG:1 - chr2R 12431567 3' - jockey 4983 1 49.50 TTATCTGTACGGCGCTTATTCCTTGTTCTTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTTCTGTTTTATGTTGCTCGCCACTTTCG:1 + chr3R 19166141 3' + diver2 127 2 76.24 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCACATGTAAGAGCAAAGAGAACTAAAACTGCAGAGCCGCTCTCTTCAGTCGGCTTATTGGAGC:1 - chr2R 20698335 3' - P-element 14 1 65.35 TGAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACACACACACACACACACACCCACACACAC:1 + chr3R 28240376 3' + accord 7028 2 81.01 GTTTCCCGACAATCAGATACCCGTTATCCAGCTAGTGAACATGTGTTCGAAAGCAGGAAAAAGTTTCGCATGGGAAGTTTTTTTTAGGTAAAAATATGCAT:1 + chrX 22673984 3' - INE-1 556 1 70.30 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGA:1 + chr3L 63003 3' - roo 53 2 80.20 CGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCTGGGATGGGCGATGGAAAATCGGATTGATTGGTGAGTGGAGCCTCGAGCTTGGATCT:1 + chr2L 20958855 3' + R1A1-element 4946 1 63.00 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCAAGAACGGATCTAAGGTTCAATGACTAATTTCCA:1 - chr3R 15091187 3' + I-element 5313 1 68.32 GAAGATTAACTTGGCGTAAGCACATTGAAACGAAAAAAACGAATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGTGCCACCAGCCCCAACAACAACAGCAGCTCCTGCTCC:1 + chr3R 15687861 3' + Doc4-element 2453 1 61.39 TATCTGATAGTCGGGAAACTTGACTATAGTATTTTCTCTTGTTTTTAACTATATTAAGAGTGGGAACTGAAAGCTATTATTTTTATGGACAAATCGCTTGA:1 - chr2L 5151529 3' + INE-1 559 1 56.44 TTAAAACATTTAAAATATTTCTAGTAAAATCTGTAATGCATTGAAAGAACTAACGGAAAGGATGATTCACCTACTGGCACTTATGTTTCGCTTTT:1 - chr3R 7888481 3' + gypsy3 495 1 71.58 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGTCTTCAAAGAGATCTCGACCGAGCAACAAGTGAACGGAAGAATCCGA:1 - chr2R 8145929 3' - P-element 27 1 52.48 TTCGGNAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCTCCCTC:1 - chr2L 222089 3' - P-element 29 1 50.50 TTTATTGCCAATGACAGCTGCGGGTTTTTTATGCCTTCGCCGTCCGCCACCTCATCCGCATATTAAGGTGGCAATGCAAATGACTTGCAGAGAAATGGGTC:1 + chrX 14973912 3' - Tc1 1312 1 49.50 GCGCAACCAGCACCGTAACTCAAATGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCCATATGGGTACCAACCACATAACGCCCACACACGAAGAGGAAGCAGAATG:1 + chr3L 18177664 3' - R1A1-element 5057 1 64.65 TATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATATAACCCTCCTGCTTAACAATCTTCTTATGGGTCATTATGTATTTTTTGCATGTGG:1 + chr3L 23288036 3' - Circe 7192 1 55.00 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGAC:2 - chr3R 6216805 3' - pogo 33 1 65.35 GAGTTGCATCTCGTCTAGTAAATTACCAATGTATAAAACTGCATTTGTTTTTTGGGAGATCTACGCAGTCGTGGAAGAATCTTCTTAAGCTGCGAGTTTCT:1 + chr2R 13629460 3' - Gypsy12A_LTR 122 1 55.45 ATAACTTAGATATTAAGAATCGCTTAAATTGATACCGATTAAATTAAGTTGCCCAAGAAGGGTGTATGAATTTCCTTTACGATAAATATTATTTTAGGAAT:1 - chr3R 7441835 3' + jockey2 3304 1 62.38 TCCGTGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCAAAGTGGTGCAGGCGGTGCCAGTGGTTTTCATGTCATCGGAGGCGGGAATTGAAT:1 - chr3R 24976926 3' + R1A1-element 5219 1 57.43 AGGACAGATTCTGTCGTTGAACCAAACCAAACCGCTTTTGCCACTCAACCGAACACATCCAGCAAAGTGTAGGACCTGCTCCAGGCCGCCGAGGTCCTGAG:1 + chr3L 8886799 3' - Helitron 381 1 74.26 TGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCCACTACTCGCTCGTTTACGAAATCTCTTTTGCGGTT:1 + chr3R 10010086 3' + diver 354 1 64.36 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGTGCTTAAATGCTATCTTAGTATA:2 + chr2L 21293020 3' + roo 9055 2 66.34 GAAGAGGGTACACCCAACCGAACTCCCTACCCGAAGGATACGGAAGGACGATCACCACAATTAAAGAGCGATCCTGGGAGTGGAGGAGAAGGATATGGCGT:1 - chr2R 4708625 3' + G5 4641 1 65.35 TCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCAACTTTTTTTTCGCCCGGTCTTTGCGTTCTTCT:1 + chrX 20575208 3' - pogo 479 1 67.35 TGTACAGTCAGTCTTAAGCTGACAGTTTTAAAATAAAGACGATCACTGAAATTATTCGTGTTTCAATTGCCATTGTCCCCATTGTTATTGAACATCCTCAG:1 - chrX 7542288 3' + rover 7174 2 67.33 CACCAACAACAACTTCCGCAATAAACACACACTGGTCCACCCGTAATCGAACCCGTTTTGGAAGAAACCCCAGAAAGTAGCTCGGAATCGAGTGTTCCGCC:1 - chr2L 8138267 3' + Porto1 437 1 74.26 GGAAGTGGTGCGCAAATTTCCTCAACTCCCTCGTTTCGGTTTAGCTTCTCGTGCCGCCTGCTCTGGAAGTGGACGGACCTGCGCCAGGTGGAGGAGCTGGC:1 - chrX 4098250 3' + R1A1-element 93 1 72.28 GGTAANCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACG:1 - chr3R 22899172 3' - P-element 26 1 51.49 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGAACAGAATTGATAGCATTCTGCTACA:1 - chr2R 9618074 3' + roo 361 2 73.00 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTTGATG:2 - chr3L 22052738 3' + mdg1 7456 2 76.24 TAAAGAGTATGAGGTTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAACAATGTTGTTATATCCCAGAGTTGTCAACATACGTCGTGAACTATAATA:1 - chr2R 10805743 3' - diver2 4565 2 59.41 TTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTGCTTTCCAAGGCCCCTCGCCCTCCTCACCCCACCTCGCATATAATTAAGCCGTGGAAGCCTGGAATTGCGAGCATGA:1 + chr2R 11493768 3' + R2-element 88 1 80.20 GGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTTAAAGGGCATCAGTGGCTTCACGCGCAGGG:1 + chr2R 16016562 3' - I-element 5049 1 70.30 TTCAAAAAGTTTTTGGATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTATCTTTTTTATGATATCTTAGTCCATAACAGTAGA:1 - chr3R 20283582 3' - Q-element 132 2 74.26 GATTGNACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATATCCACCCCAACCCCAACCCAACATTCACCACCCCCACGATCATCTT:1 - chr3R 10927540 3' + R2-element 3343 1 53.47 CTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGCCTGAGTCTTTTGTTTTTGTGCTTGCATCTTAGACG:1 - chr2R 23787241 3' - P-element 2841 1 38.61 TTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGAAACAACAAAGCCCCGTAGTCGCCCAGC:1 - chr3R 9238727 3' - jockey 4654 1 71.29 TTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAGGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCCGAATGCGGACCCACCTCCCCCAATCCCACGGCAGCGGCCAC:1 - chr3R 6491649 3' - Tirant 429 1 56.44 CTTTTAGAGATTGGATGGTCATTAGATGGACCAATAACCATATTTGGGCGAGTCCTTAAAGTTCTTCAGGCGCAGCTCTTAAAGTGGCAGAGAACAGAGA:1 - chr3R 26776231 3' + Copia1_DM 4025 1 56.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGCAAACTATATTATAAGCCATGCCAAGAAACTTGGGTAAGCTACAAATATTTTATTTT:1 - chr2R 23343736 3' + roo 391 2 59.41 GCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGCGCATTCGACTGGCAGAGATAAAGATAA:1 - chr3R 31008770 3' - F-element 294 1 72.28 CTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTAGCTAAGTTATTGGTTTTTAATTGATCTTGGTTGCTTAGAAGAATCTCGACTATTGTAGAGAAGAGATTTTAA:1 + chrX 10821153 3' + R1A1-element 5069 1 75.26 ACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAGTCCAGAAAACACACAAATAACAACAAATGTATATAAGCTGACTAGATAATTGGTAATGGAAACTTTTGA:1 - chr3R 9826689 3' + I-element 5100 1 65.35 CTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCACTGAAAATCTTAAGAATCAACGCAAGAATTATAAACGCAAAACCGAACCGGATGATATACCCGT:1 + chr2L 15028281 3' + invader4 384 1 61.39 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCGA:1 - chrX 6283640 3' - P-element 42 1 35.05 AACAAAAGGTTTTTTTTTTTGTCAACTTAAATACCTAAACATGATTACTTATGGAAAAGAACTTCTCAATTTGAAAGAAACTGCCGCCGTGCTG:1 + chr3L 1024990 3' - HMS-Beagle2 495 1 81.91 CAGTACAGCTTGCCGTCCTCCTCCAAATAGTCCGGAAATTTCTGAGGCTGCCGCTTCACTTTTATTCGCTTCGTTTCAAATGGTGCAGGTGGTTGCGTGCC:1 + chrX 13167766 3' - Osvaldo 392 1 71.29 AACTTTTTTATTAAGTAGTAGACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAGCTATTTTGTCCGACATTGGGTAACTTTTTGTTTTGGCCTCCGTGGGAGT:1 + chr3L 11908317 3' - Bari1 494 1 59.41 GCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGTGTGTATTGTGTGTATTGAAACTAAGATGCGCATTAGGGCGATCAAAGTGTTAATATTAATTT:1 + chrX 1047307 3' - accord 7166 2 67.00 GTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCATAAGGAACTTTGGCCCTCAGCTTATTTTGGGTGATTGGGTTTTCTGGCTTCGCCTCGTTCGCTCGCTGATTATCTCA:1 - chrX 4841358 3' - G5A 415 1 70.30 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCAC:1 + chrX 9256957 3' - 3S18 42 2 62.38 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATTGCG:1 - chr3R 9833038 3' - Tabor 6867 2 52.48 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCG:2 - chr2L 796777 3' - jockey 59 1 77.23 TCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTGGCACAACACACCCACATACTATTACACAAGCACACATACATAGACGCGAAATTCGATATT:1 + chr3R 22485356 3' + 1360 3173 1 61.39 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTATGTACATATGCAAATGCTAAACTTTCGCTCAG:1 + chr2L 9346220 3' - Transpac 40 2 68.32 GCTGAGATGTACATTTGTATATTAGTTGCATTTATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGG:1 + chr3R 19450204 3' - roo 8622 1 67.33 GGGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCCCCAAGCTGACCAAAGTGCCTAGAAACAGAGTTGTACGAGTAGAATGAATCACGAGCTGCAG:1 - chrX 708822 3' + G-element 314 1 60.82 TAATTAATTTTCTTTTATTTTTACGGCTTCCCTCTTTCTTTTT:1 - chr3L 13877690 3' - NOF 3959 1 90.70 TCCAAAAGAGTCCTTAAGGGGAAGCAGACACAGTTTGTTCACTGCCCGCATTATAACTCCAGACGCAGGAGCAACTGCAGCTGCAGGAAGCCGTACAGCAG:1 - chrX 17460573 3' - diver2 4486 1 61.39 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTT:1 - chr3R 13375979 3' - 1360 42 1 68.00 AAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTGTGTTTTGGGTATTTTGAAGAATCATTAACGAGGTTGACGTGCCTTTAGAAGATCTCCTCGCTGCTCTTTCTC:1 - chr2L 5559998 3' - 1360 3262 1 79.21 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTT:1 + chr3L 23678153 3' - Osvaldo 20 1 70.30 ATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTCCAGGGTCAGGTAGAAATAATCCAATTTAGAAACCGCTAGTCCAGCG:1 - chrX 20092630 3' + R2-element 3395 1 53.47 TTGGAGGTAGTGGGGCTTCTGTCGGAGCTAAGAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGTAAAGTCCTGTTTGCCAAACTAGCCAAGGAGGAACTCCGGTTCGTCACG:1 + chr2R 18162127 3' - F-element 402 1 59.41 TTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCCTCTCGACACTTCCTTTTGCCACATTCCCTTCTTTCTCCAGC:1 - chr3L 9853220 3' - Bica 472 1 58.42 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCTCCATTAAGTGCATTA:1 - chr2L 9823606 3' - hobo 5 1 76.00 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCA:1 - chr2L 15478802 3' - jockey 4715 1 72.00 TTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCGTGTGAATGTGCTGGAATGAATCTCGCCCAGTGTGTGGG:1 - chr3R 22342083 3' - Doc 4461 1 61.39 CACGCTGGGTTTTAATAACCGATAAATAAGCTTGAAAAGTAGGCATCAAAAAGCCAATTGAAATAGTTCAAGGTTTTTAAAAAGGCGCGATGGTGGCCCAT:1 - chr2L 10099070 3' - mariner2 194 1 60.40 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGAAATTCTT:1 + chr2R 8157275 3' + Transpac 301 2 71.29 TGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAATCACCCTGCCGTTGGGTTCGAAGGTCCGCTCAAATAGATTTCC:1 + chr2R 11539912 3' - Transpac 5169 2 61.39 ATTGTTCGCAGGATGTTTTATTATGCTCGTTGTATTATTTAAATGTTGCTGATTTGTCCGATTACTGTACGTATGTACATATATTTTATAAGCGACAATTG:1 - chrX 9731398 3' - Doc4-element 2666 1 53.47 AAAAAAAAAAACAACTGAACACTATTCCAAAGG:1 - chrX 18692504 3' + Porto1 171 1 84.85 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGCTACATGATTT:1 - chr2R 6838482 3' - I-element 28 1 57.43 TGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTTATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTTCCCAGCGCGAGGACACGCGGCGTGTGCACAATTAATCAAAC:1 + chr2L 3268469 3' + hobo 339 1 56.44 CGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTCCGGTACAGTCGTCCTACCGCAATCAAATCGAAATTGCGCCGAAAACCAAAGGCCAGGCCAC:1 - chr3R 21923697 3' + Bari1 258 1 66.34 CGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAGAAGCGGGCGCAACAAAATAAAAACAAAACATATAAAAGGAACACTTTGTTGAT:1 + chr2L 16251134 3' + pogo 292 1 56.44 TACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGATCGGAGTGAAAACGAAATGGACGGACAGTAATGGACACCTGTGATG:1 + chrX 8202238 3' + F-element 4320 1 65.35 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGT:1 + chr3L 22052865 3' - mdg1 7041 2 76.24 CCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACGACATCCCTGCTTCCATTATCCCCATTCCCTACAGCATTCCTTGCCAAACATGTCCACAAACTATGCGTCGTCTGC:1 - chr2R 8322437 3' + mdg3 454 1 74.26 GATGATATTCTCATAATTGTTATAATGTTAATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCGGTGTTTGTAGTTGTTGTATTCCAAATTTTGTTGTGAATTTTGTT:1 + chr3L 22833381 3' + BS3 1620 1 79.21 ATTGGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATGGAAAAAAGGAAGCGGACTTAGGCGGTTGAGGGGGTGTTGGCACAAGTTTTTTATTTGCCAGGATG:1 - chr2R 14795477 3' + Juan 146 1 73.27 CACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTTGACATTCTCTTCTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGGTATATCAGGAAATTGACTTGGGG:1 + chr3R 18352221 3' + INE-1 539 1 59.41 AGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGTTCTGCAGTTTCACCATCTTTTCGCGTACGTTCTTTAGCAGATCCTTCATTTGTTCGTACTTTCCC:1 + chr2R 24533555 3' - gypsy7 291 1 70.30 TTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAATGTCGACGTCGAGAAATTGTCGCATTGACAAACTTAACCAAAGCCAAG:1 - chr2L 16567875 3' + pogo 362 1 52.48 AGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTCGATCATATCAACTTCACGACGCGTTT:1 + chr3L 778517 3' + Bica 172 1 73.27 TTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGGTGCCGTCTCTTCCTCTATGCATCGTGAAAGGGTCTCGGCGACAATGTTATCGCTTTCCTT:1 + chr3L 24939420 3' - I-element 399 1 51.49 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCTGTTTACATTTATTCTTCTATTCAGCGTATGCAAATCGCATAAAAACTCATTTCGAGCCAATTGAC:1 - chr2L 2689778 3' - roo 9 2 70.00 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAAAAATCTCCAAAAATAGACAGGGCCAATGAA:1 + chr3R 27448544 3' - roo 39 2 71.58 CAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGTTCGGGCATTTTAATCTGTGGGGAAGCAAGTGGAGAACACGAGGTTAGGTAAT:1 + chr2R 12760538 3' - R1A1-element 492 1 55.45 CTTTAACAGCTGTTATTATAATGATGCGCTGTTAAATTAACTTTTTCAATGTCAAACAATAAATTCAATTTCCAATCAATAGCCCCAAAAAAAATAAAGGC:1 + chr3R 32039682 3' + hopper 1272 1 57.43 AGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACACCATATCATATGACTTGAGCTCAGACAGAGGAAACCAGTTTTGATGTTGTTGTTTTTTTTAGTGCTTTCTG:1 - 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gypsy5 116 2 65.35 TTTTTTTGTGTTTTTGGAAAATTTATTTAAATTATTTTACTTTTTTGTTGCAATTTTCGACGCTGATTTGTTGTCTATCGAAAGGATCCAAGGACCGCGAG:1 + chrX 11165166 3' + Tc3 1553 1 77.23 AAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGACAGCCATCGAATTGACACAGCCTCAAAGCTTTTCG:1 + chr2L 9201892 3' + R1A1-element 5079 1 64.36 AATACTATAATCACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGACTCGGCAAGAAAAAATTAGGTTTATTCTGGTGGTCGG:1 - chr2R 24906458 3' - 1360 401 1 69.31 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTATAAATGTTCAAATTGTCGAA:2 - chr2R 18891023 3' + opus 491 2 64.36 AGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATAGACCATTTTTTTCGTCAGTGTACGCTGAG:1 + chr2R 21092036 3' + 1731 299 1 63.37 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACATTTTACAATATGT:1 + chr3L 21840349 3' + 1360 3363 1 54.46 AGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAACGAAGACGGCCAGGAGGTG:1 - chr2R 11259452 3' + F-element 4323 1 81.19 TGTGTGTTGCGGCACGTTGCTGCTCCCAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGCAGTGGCGTGGTGACCGTGGCCTGTTGCACATCTCCTCCATTGGCAT:1 - chr2L 8173783 3' - Chouto 343 1 63.37 ATATTGTTGATCAGGATCACTAGTCGAGTCGATCGGGGCTGGCTGAGTAAACCAAAGCTGATCTCGAGAGTCACTATCCTGTTTCATTCACAAAAAAGTCG:2 + chrX 16238072 3' + INE-1 84 1 64.36 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCGCAGGAAAGCGAGGATTTCTTTGAGAGTCTAGACAAAC:1 - chr3L 19913518 3' - jockey 59 1 62.38 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCAATTTTTAGTGATTACTCCAAGCTTAAACTTCGTTTTGCTGTGTAAAACTGACCAGCTGTCGAACGAAATG:1 - chr2R 11540166 3' - Transpac 2 2 70.30 AGGCCAGATGGCTTCTACGCCTGCCTCGTTTGTATTTCCTCTAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCATCCGCGCTGCAGTCGCTCTCAACCTCTTGTGTGCTA:1 - chr2R 19639834 3' - R1A1-element 451 1 78.22 TGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATGGGAAAAACGGATTCGTCAGCGGGTGTTAATGTTTAGTAAAGCCTAATATCGATCTATGTATTTGCCCT:1 - chr2R 13490202 3' - Quasimodo 6947 2 67.33 GAGTCAAATGCTTTACTAAAATCAGTGTAGATGATATCTGTTTTCAGTTTTTGCCAACAGGAAATTACAGCGAAAGCGTGTTGAAGCATAAGAGGAAGTTC:1 - chr3L 10563886 3' - Q-element 317 2 61.39 GGTTGGCATATCATTACGACGAAGTCGGTTTCGGCTGGATAGCCGTGTTAAGTCTCTCGCAAGCCTGCCTCTCTCTTTGGTCAAATTAAAACGTTTTATT:1 + chrX 3151511 3' - 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chrX 18268080 3' - Burdock 6276 2 77.23 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAACCTCCACGGTAACCATAACCACACCAAATCCAAGTCAAAGCA:1 - chrX 1554836 3' + roo 385 2 57.78 GTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCG:1 + chrX 1018159 3' - 1360 194 1 76.24 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAAC:1 + chr2R 2427611 3' - Doc 26 1 53.47 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGTATATTTTCAGTCCGGTTTCCGGTTTCTGCTACATTATTCG:1 - chrX 8179025 3' - pogo 31 1 60.40 AACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCTAATCGGAATGGATCAATGTCAACGGCCCC:1 + chrX 4336329 3' + Doc 486 1 70.30 AGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAATGTGAGGACCCACAATTTTGCGCAGTGCAACGCCCACGCC:1 + chr3R 9867533 3' - 3S18 152 2 59.21 ACACACACACACACGCATATCCAGTTAGACATACAACCAGACGTGCCACGCCCACTTCGAGCACATGTATTATTCATGAGGCAGCACACACGCAATATGCC:1 + chr3R 20419870 3' + accord 185 2 56.44 GTTAGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAATTACATCAATTACTGCATTACATTTAATTATTTGAAATCTATGTCCATACATTTCAATCCC:1 - 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Q-element 426 2 53.47 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTATATGTTTGCGGTGCG:2 + chr2R 23468968 3' - I-element 50 1 74.26 TACATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTTTAATTGAGTGGGTTTTTTTTT:1 - chrY 253839 3' - accord2 7525 1 79.38 ACAAACAAAATACCAATGAAATACCGAAAAATAAAACAAAGCCAAGGAGCAAGCAGAAGCAAATGCTGATTAGATGCTGATGCACCACGGCACCGAGAGCC:1 + chr2R 10330476 3' + gypsy9 413 1 76.24 GGAGCCAACGGGGCTAAATTAAAGTGATTCCGAACAGAGTGAACAGAGTTATTAGCTCGTTATCTTTTGCACTTTATATTTACACAGTTGGCTCCCAAAAG:1 - chr3L 22584125 3' - mariner2 231 1 71.29 ACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTTTGCTGAAGGGGTCCAGAGTATAGAGCAGCATA:1 - chr3R 24819436 3' - I-element 329 1 52.17 ATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATATACGACAACAACAACATAGATTACATACACATAGATTGGATTAAC:1 + chrX 13882371 3' + Stalker 7082 6 55.45 AAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTCACATGTGTTTGTTTGTACATTTTCATAAAAATGTTTCGTGTTGCACAGTGGTAGAGAATCGAAAATA:1 - chr2L 13422536 3' + frogger 2307 2 71.29 AGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAACTCAAAGGCTCCTCCTACTATTCCTAATCCTAATTTTAAATTGCCACACAACACCGCACAC:1 + chrX 1641929 3' - Circe 7112 1 64.36 TAAGGCGAGTACGTCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGGTGCCGCCGCTGCAGCATCATCTTGAGAACAACATCCGATGGCTG:1 + chr3R 18213850 3' - G2 2983 1 53.47 GAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAAAACTGCAATACGAATTAAGTTATTAATCTATTCCTG:1 + chr3R 6956107 3' + Doc 429 1 72.28 CTATAGTCGAGTTCCGCGACTATCAGATACCCTCGCCAATCAGACACTTGCCCGTCACATCGGGATTGAAGAAGTTCAGAATGTGATAGATAGCCTTCATT:1 - chr2L 11742459 3' - INE-1 566 1 72.28 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCCGAGCCCGACTCGAGCT:1 - chr2L 11165338 3' - transib2 41 1 62.38 TGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAAATTTGGGCCATGATATAGGAAACAGTTCCGGTTCGAATATTGCTCGAACTCCGCCGCTGGGATGCG:1 - chr2R 8042158 3' - Idefix 52 2 65.35 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGACCGACACGCAGGTGGACGACGTAAAAAGAGCCCGTGCCACGA:1 - chr3R 25395599 3' + roo 9038 1 57.43 TACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGAAATACAGTATAATAAAACGCATTTTCAAAAGTGGAAACTAATTTTCTGCCGCT:1 - chr2R 5267272 3' - INE-1 532 1 42.57 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGCTGCGCTGCTGGAAGCTCTCCA:1 + chr3L 5691308 3' + P-element 2861 1 53.47 AAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGTCCCAGGAATCTCAGCGATGCCAGCGAAGGTGAGTAGCCTCGGTCCTC:1 - chrX 18113239 3' - HMS-Beagle2 7111 2 53.47 TCGTTAAATAAACAAACATTTCTTGATATTGCGCATCCGCTCAAGCCGTAACCAAAACCTTTAAGATTTCAGTTGATAAATTTTCATTAGTGGAAGCTTTT:1 - chr2L 9261198 3' + Tom1 75 1 58.42 CAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAAGCGACTCAAATCAGCAACATTCGCGACGACAACGACGATAACAGTAACGACGTCATCGTTGCCACA:1 + chr3R 11669605 3' - R1A1-element 5054 1 71.29 GTACANTGTAAATTCATTTCATCGATCAGAATTGATTTCGGCCCATATAAGAGAGTGTCCTCGAGCGATGGGGGCTAAGAGGTGAGAGGTTCAGTGAGTGT:1 + chr2L 12328857 3' + 1360 3155 1 61.39 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTAT:1 + chr2L 7654039 3' - jockey 33 1 54.00 TGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCAGAGCTAGAAAGGCCAAACAATGCGGCAAATTTTGTTTGCCTAACGTGCACAATGAGAAAGA:1 + chr3L 2706915 3' + Porto1 4505 1 69.31 TAGCAGCTCCTCGTAGTCAGAGCCTGGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGACAAGGTCAAGGACTGCAAGTATTATGCCAAGAACGACAAGGATCAGCTGAA:1 - chr3L 21134239 3' + G-element 426 1 60.40 TTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATCTCGATAAGCTCGATGGAAAAAGAGTGAATTGGAGGACGCACCCTTGTAGAT:1 + chrX 20522493 3' - pogo 76 1 56.44 TTTACTTTAAGATGCGATTTTCATGTCACCTACAAATCTCTCACTTTTGATTTATTTTCCCGCTTGCATCACAAGCATCTTCTAATTTTCACACCATACAG:1 + chr3L 3532321 3' + roo 316 2 74.26 AATTANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGACCGACACGCAGGTGGACGACGTAAAAAGAGCCCGTGCCACGA:1 - chr3R 25395599 3' + roo 9038 1 56.44 AGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCC:1 + chrX 22386800 3' - hobo 47 1 69.31 AACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGATTGAATTGATTGAATAACTTGTATTTGGAACGAACCAATGAT:1 - chrX 13746034 3' + accord 7030 2 58.42 ATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATGCAAATGTCAGGCAACAATTTTCCATCGCGAAACTCCTAATGGCCATGCATTTG:1 - chr3R 16319765 3' - G4 3557 1 57.14 TGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTC:1 - chr2R 5532368 3' - Doc4-element 14 1 56.44 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTAAAAACGTATTAAGATCTTTGGGATATTACAGCTGATGTTGGCG:1 - chrX 7413950 3' + pogo 2072 1 61.39 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCA:1 + chrX 697509 3' + roo 9035 1 62.38 ATGTACATATGTACTCAAAATATGTACTGCAATGAAAATATAGGAAACCAAACCACTTAGGCCGCAACAAAAATAAAGCAGACAAAAAGTGAATACTGCA:1 - chr3R 25926925 3' - gypsy11 20 2 58.00 ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGCTTATGATATGTGTGTGTGTGTGTGTAGGGGGAGCATTTGAGCCAAGTTAAGTTATTGGCCAAGTTTGTGCTGCC:1 - chr2L 7094223 3' - Quasimodo 66 2 74.26 GCAGGAGCCTGCGACCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATCACACTCGAAGGCATTACACACATTGGATTCGAAAGGCAAATAATAACGCACAGAAG:1 + chrX 13443317 3' + blood 412 1 66.34 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGT:1 + chr2L 21292998 3' + roo 9033 1 64.36 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCTGTACACTATAAATCCAAAATTCAGCTTGGAT:1 + chr3R 16554860 3' - roo 44 2 72.28 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACACTAGGATTCGGGTCG:1 - chr3L 5691231 3' + P-element 2877 2 63.10 GTTGCGGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGATCTGAGC:1 - chr3R 9996385 3' - blood 7042 2 50.50 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTATGGATGCTCATAATCATATTGGGCTCCTCGAAGG:1 + chr2L 11165387 3' + transib2 2781 1 64.36 ATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACACCTGCGGATTGCGACACCGACAGAAGC:1 - chr3L 811360 3' + rover 119 2 73.27 GTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGGGGCAGCCTGCCAGCTTCATACATATTCAATTAGTGTGCGTGCA:1 - chr3L 14588598 3' - F-element 4335 1 56.44 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAAATTCGAGAATCATCAACTGG:1 + chrX 22747492 3' - Doc 31 1 51.49 CTATAGACACAGTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCAGGATGTTGTCGTCCGCAGCAGCAGCGATATTAAGGTAAGGCC:1 + chr2R 17922010 3' + G2 2825 1 57.43 GCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGATGTCCACCAGATCCGACTCCCGCGGCATGTGATGCGACCGGAAGACGG:1 - chr2L 20342230 3' - F-element 430 1 51.49 TCTTCAACTTTAACCCAAGAGACGTGACGAACACCGTCTAATACAGGCACTATAGGAATCGAAGGACGATTTTCAGAACCTCTTAGTGAAGCCGATACTGG:1 + chrX 23183662 3' + Bica 4481 1 63.37 CCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTACCGCTCGCAATTGTATTACTCTAAGACTATTGAGCTGAGTCTTAGATATGGCTTTTATTGGAGTGGAGTTTGCTT:1 - chr3R 28648777 3' - G5A 2511 1 71.29 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCGCACAACCACATGCGAGCACTCGTGGCTTT:1 + chr3L 22324115 3' - hobo 14 1 65.35 TGCGGACTCCATTTACGTTTTACATAAACGTAGCGTTCCATATACTCATTCTGCGGCATTGTTAATTGTTAATTCTGTAGACCAGATCTGAAATACATTCA:1 - chr2L 10408725 3' - Doc4-element 497 1 68.32 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGCGTGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:2 + chr3R 9418243 3' - jockey 4764 1 69.31 TGTATGAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATG:1 + chrY 2720331 3' - Stalker4 154 6 68.32 CTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGGGAGATGCCCCACGCGAAACACCAGTG:1 + chr2R 1923577 3' - pogo 8 1 69.79 GTTGTCTGCCGCGCATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCATGCCAAGCAGATACTGCCCACACAATACGGCAGACACGAGTCGAATTAC:1 - chr3R 5877998 3' - invader1 3685 2 61.22 TTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTCAGCGTATGTGGCTGGTCATGGAGTAAGCATTTAAACCGACCATTAAATAA:1 + chrX 9819907 3' + hobo 2644 1 59.00 GAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAATTTGTTGAGAGCCCTTCTGCGAGTTTTTGGCT:1 - chr2L 8360420 3' + invader4 2624 1 71.29 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGTGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATATTAGACAGACA:1 - chr3R 21010734 3' + hopper 1382 1 58.00 GGGGTTCAGGTCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTGTAAAGGAAAGGGTGGCATTTGGGCCAGTTGGACAAAGGCAAAGCCCTCGGCCAATTTGTGCC:1 - chr3R 16753478 3' - baggins 5313 1 70.10 GAGCATATGGCGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCACGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCAGCGACGAGACGTTCAACTACTGGG:1 + chr3R 25222048 3' - R1A1-element 5243 1 72.28 CCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAGATGAGCTCATGCCATAACCGGAAAAGAATCGTAGCAGCACTTTTTCAAAGTTTTCATCATTCACGATAG:1 + chr3R 10320113 3' + X-element 4367 1 73.27 AATTTTAGTCTCTTCCGACAGACGAAGACGGAGGCGAGCGAGACGGGTTATACTGAATGCTTATGTGCGTAAGCAAGGAAACCGAAAACGGAACGATAGCA:1 - chr2L 22218177 3' - diver2 4760 2 74.26 TAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGAATGTGTGTTTTTGTGAGTGAAGTGTGTGTGTAATTTAACCCAAAACCAACTTTCTTCC:1 - chr2L 2997188 3' - accord 7125 2 63.37 AAGGCAGCAGTAGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTACGCTCTCTCATTCGAGGGTCACTCGTGCAAAGCGAACTA:1 + chr2L 17050118 3' + flea 114 1 58.42 AGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTGGGTCTCTATAAATACTGACACCCTTTGCTGAATACAATCGCTAAGGAAAAC:1 + chr3R 11091975 3' - hobo 2935 1 72.73 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTT:1 + chr2R 2427620 3' - Doc 17 1 62.38 AAGGTGAAGCAGACACAGCTTATTCACTGCCCGCATTATTACTCCAGACGCGGTCTGCTGCTTGATTAAACCGACACTCGACTCGCACTGGGTTTTGTGTA:1 - chrX 13509008 3' - diver2 4471 1 55.45 CTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAAAGTGTATACACCTCCTTAAGTTCCGTACCTGACCGTTTTCCTGGAATTACTAGGT:1 - chr3R 19448996 3' - Tirant 8389 2 54.46 AGTCCACTACTGTTATAAATGCCACTAATATACCATGTGGATGTAATATTTAGAAAACAACAAAAATTATAACGGCTTAAGTTTCATTTCATATTTTATTT:1 + chr3L 26851951 3' + roo 8595 1 75.25 ACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCTATAAAAGCCACTCCAATAAGGTCTCCATCACGAAGTTGCCAAATGTAGATC:1 + chr2R 14499554 3' + Quasimodo 79 2 57.43 TGATANGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGAGTGGCACGACTTATCTCTTCGGTGTTCCTGCATGCTTGAAACTGGCAAATAATTTATT:1 + chr2L 9369149 3' - I-element 61 1 65.35 GCAGGTATCGTAGCTACACCGCACTTCGATTAACGCTTTTTGTTGTTGGCCAGCAGCGTTGGAAACTAAATGAGATTTGCTTTTGACGGCGTGGCGCTTGT:1 - chr3R 23251551 3' - BS 168 1 53.47 CGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGAAAAGCCTGGGAAATGCCAGGGAAATCTGGCGGGACGA:1 + chr3L 8244700 3' - flea 4705 1 62.38 TTATTCTCTGAGTAGACCGAGGTAAACTTATATGTCATATATTTTCGTTTGTACACACTTTTTCTGACAGTGCTTTTCGGACGTTTGATGTTTTTCGGTCG:1 - chrX 2638688 3' - FB 288 1 61.39 ATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACGTATTTAATGCTACGAAATTCGAATGATTATTATAAATTATATGAATTGTTAGTACGCCGCTTTGTTT:1 - chrX 12801421 3' + Burdock 6386 2 67.33 CCAACNGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAGCAATAAGGACACAAATAGAACTGGTTCTGTGTATAGGCCCTGC:1 + chr3L 14365023 3' + blood 344 2 56.44 TATGCGTTGTTCTGTCTGAGCGAAAAGGATGTGGTGTCAGCATTTTGGGCGGATGTCGGCGTCTGACTGTGACCTTTTGCTGGCCACTTAGAAGGAGCAGG:1 - chr2R 22973254 3' - ZAM 168 2 66.34 AGTTAAGCCGACTAATCAAGTCTGGACTCTTAACATCCTCACGAATAAGCTTACAAGTACAAGCTGTTCTCCAGGTCTTGGTCAACTGACCCGCCCTTGGG:1 + chr2R 21623757 3' - Cr1a 4082 1 53.47 TTTATCTCGTCAAATACCGTTGCTAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGGTCCCGTTATTTCCCTATTTTGCGCACATGGTTAAATGTCCACAAATTTCCCG:1 + chr2R 5172666 3' - X-element 4378 1 66.34 TCTTTAAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGTAACATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCACAC:1 - chrX 22252764 3' - 297 28 2 63.27 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAGGGGTTGCTGAAATTGCTGTGCAACGCAACGTTTGCACCTGTTTACAGTGGC:1 - chrX 13560707 3' - roo 21 2 57.73 GTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGAGTGCACAGCCAGGAGAGG:1 + chr3R 19723161 3' + 1360 3170 1 81.00 TAGGCACCAGCACGGTGAGAGGATGATATTTGGTCTGTCCGCGACCTTTGTGCCTAGGCGTTGTTCGCTAGTTGGTTTCTGGGCTATTCTGCGTCTGGGCA:1 + chr3L 18249818 3' - Rt1b 224 1 54.46 GGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTACGTGACCATGTCGGAGGTGTGGTTCCT:1 - chr3R 31303337 3' - Quasimodo 118 2 73.27 ATCCTACCGACTGCGCCAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCCAATTTTGAGGCATGCGAAACATCGAGAGTGCTTCTAAGA:1 + chr2L 17521776 3' - McClintock 495 1 57.45 TCTTGGAGCCCCTTTGTGTTCTCCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCACCGTTGCCCGATTCCTTTGGGCTGCGACGAGCGGCTCCGCCTCCTCC:1 + chrX 10468323 3' - X-element 4678 1 55.45 CCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCGCTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGGGGGGCTTGCCGAAGTCCAGGTCATCTTCCAGTTCTGTGGAGGAAGCGACTT:1 + chr2R 10725782 3' - G-element 367 1 62.38 GCAGCTCAAGTGGTCAATGCTGCGGTGGCCTACGCGTACTCCACCCCA:1 - chrX 17605075 3' + Stalker 217 4 66.67 CCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTCCCAGATCCAAACTCAGACCCTTGCCAGATCGATAAATTTTCCATTAAAGTTATTTTTAAAT:1 + chrX 18591555 3' + G6 1687 1 67.33 CGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCTTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTGAACGAGGAGAAGTTCTCAAGGATTGATCTTG:1 - chr3L 16860171 3' - F-element 4465 1 67.33 CAATAATAACAACAATAACAATAGCAACAGCAGCAGCCACGGCGGAGATGGAACCGGAAACGGATCCAGCCGAATGTCCGGCGGTCACATCACAGGAGGAA:1 + chr2L 16468663 3' + mdg1 24 2 61.39 AGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTCTGGGCCTGAATGATTTCCAAGACCTTCTGGCTGCTGGTGGTTAG:1 + chr3R 30422006 3' - F-element 357 1 55.45 TATTCNATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGT:1 - chr3R 1047964 3' + Stalker2 7628 2 55.45 TTTCTTATCTGGTAACTGTTGGGTACATCCGGGGTAGTTGTTGCTTATTTATTTAAAGTGAGAGCTTAGTTTACTTAACTTCGTGCTCTTATTGTATTTTG:1 + chrX 840494 3' - Idefix 6917 2 67.33 ATCAAGGTGCCTGGAGTAGTCAAAATAATAATACATACAATTGACGGGGTAACTCAGGGGCCAAAATCGCGCCGATAAGATTGAAAATTTGCGGTCAATCT:1 + chrX 4604613 3' + invader2 4678 1 77.23 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTA:1 + chr3L 22324080 3' - hobo 48 1 68.00 GCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCG:1 + chr2R 4879021 3' - G-element 31 1 54.64 ACTGCNTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTGATCTAATCTGATTTCTTCAGAAATTGGTTGATGGTTGGTTAGGAT:1 - chr3L 19914566 3' + mdg1 7423 2 53.47 TTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCTAACAATATTTGAATAGTAA:1 + chr3L 5257420 3' + HMS-Beagle 6799 2 80.20 AATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAAAAGTTATTGTGATCCGCTGATCAGCTGAGTGAATGC:1 - chr3R 7309131 3' - P-element 107 1 38.61 AGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACAGCAGCTGGTGCCAAGCGAACCAAAGCAAAGTCTGATGTACACGTTT:1 + chrX 6510884 3' - diver2 4851 2 62.38 GGTGAGACTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATTTTGGGTATTGCGATTTTTGGCAGCAGTTGGGTAATGAAATTTATCTTGAAGCTTGTTA:1 + chr3L 9169590 3' - Idefix 7032 2 62.38 TATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCACACACATGCAGTTGCGCTCTCTCGCGCTCGCACACCAACACACTCACCGTTTGGGAGT:1 - chr3L 18822832 3' + TART-A 12984 2 61.39 AACTAGTAAAAATGTTTTCAAATTATTTTTATGCTATCTTGTTAAGTTTTTCCATACATATATATGTTTATCTTTAAAATTAGCCTGATTATGTATTTCCA:1 - chrX 16010433 3' - transib4 114 1 76.24 CAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTCACTGCCTAACTGTAA:1 - chr2R 7904643 3' - roo 9061 1 76.12 ACACACACACACATATACATATAGACACAGTGGTGGCTGCCTCCAGGCATCATTACACCAAATACAACCTGCAGCAACTGGTCCCCATTGGGCAG:1 - chr2L 12180258 3' + Quasimodo 39 2 64.21 CGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCAAATACCCCATGATCCCCATATCACAAGTAATATAAATCATCTACTTTAGCGGTAATGTATAGGTATA:1 + chr2R 12765758 3' - R2-element 32 1 51.49 GCCAGAAAACGTGGTTAAATTTCCCATAGTGCAGCGGCTTTTTCATGAGCTCTGATTTAGATTTTTGATTTACATGTGTGGATATGCGGAGTCATTATCTT:1 - chrX 9141860 3' - Transib-N1_DM 10 1 77.23 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCATAAATAAAACTATAATAGAAAGGACAACGTTAAAACCAAGGAAAC:2 - chr3R 908305 3' - copia 4900 2 56.44 AAGCAATTACACAGGAACCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCTATATCTAGAATCGTCAG:1 - chrX 692426 3' + Q-element 102 2 78.26 AAATCAAATAAAGCAAATTAAATAAGTAACATCCAATCTAAGTATTGAACTATAAAAATATATTAGTTATATGCGAAGATTACTAAATACTTCCAGTGCAT:1 + chr3L 18322012 3' + TAHRE 34 1 41.58 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTG:1 + chrX 14424083 3' - hobo 46 1 74.26 CTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTCTGAGCAATGCACCCATGTCGCCAGATGGGTAATTAAAAAAATTTTGATTTCATTTACGGAAGTGACACA:1 - chr3L 5743238 3' - roo 8808 2 55.45 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCATTTTTGAAAAAAGAGTTT:1 - chrX 17692583 3' - 3S18 29 2 50.00 GCTATCAGATACCCGTTACTCAGTGATAATTTTCGGCAATCCTTTGTCCCGCAGTTAACCTCCAACTCTCTGACTCCAAAACGGGGTCCAGACAGCAGCC:1 + chr2L 7416091 3' - INE-1 548 1 80.00 GAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGGGATGCCGGGCACATGTGTTTACTTAGCACTTTTTATGGCCTGGCC:1 - chr3R 28154977 3' + Stalker4 7268 4 54.46 ACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCAAAAAGCTGACACCGCATTCCCTTCGCACAGACAACAGCACCCTTGACACCTACACACACACACACACACACACATA:1 + chrX 7978953 3' + ZAM 8081 2 59.41 TGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCCTTTTAATTGCAACCAGATCACCTGCTTTTGCTTTTGCGGCGTATTGGAACC:1 + chrX 7687887 3' - flea 4560 1 77.23 TAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTTAAAAAACCAAATTATACCACAAAATCTTAACACAAACTTGTATGCCTTGCTTCCATGGAACTTGCCAAACAAT:1 + chr3R 5526521 3' + I-element 5138 1 54.46 TTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTCACATTCTTGTGAAATAGCTTTTTGATCCTCTGATTAAGCTTTCTAATGCCAGTTTAAGCCA:1 - chr2R 12084725 3' + copia 321 1 62.38 AATGATAATGCTGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCCCTCCATGCTTTTGCTGTTTCCATCGCTTGATTTACATATATTTAATCGTGGCTGCAGCGGCAAAAGT:1 - chr2R 18324326 3' - Rt1b 4751 1 67.33 ATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAACTGTGGGCGTCGGCACCGGTAGATCCTGGATTAGCCGTGGCGTTAGCGTTGCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTAC:1 - chr3L 17385592 3' - HMS-Beagle2 218 2 62.38 TGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTGGGACCTCCCG:1 + chr3L 26852100 3' + diver 6083 2 52.48 AGAGCNGAGGTTCTGAGCTCGGAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCG:1 - chr2R 6438364 3' + Stalker 360 4 71.29 GATTCNTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTG:1 + chr3L 26852090 3' + diver 185 2 61.39 TCCACATAAATCTTGTCAATGAGAAAATTCGGAATAGGACAAAAAACCCAAAAGACACCAATCAGCAGGAAAA:1 + chr2L 15640296 3' + Doc2-element 4499 1 58.90 AATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACATGAAGCGCCACAAGATGACACACAC:1 - chr2R 14410980 3' + F-element 4403 1 74.26 ATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCAGAGCCCCCCACACACACACACACA:1 - chrX 11057075 3' + F-element 252 1 80.20 GTACANTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGGGGTTTTTGGGGTACGGTCCGTTCCCATAAATACTTAAATGCGAACGATGCCACGCTCAG:1 - chr3R 8400113 3' - jockey 4652 1 66.34 CGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGTGTGGATTATTAAACTTATATTTACCCATTCGACCTATTTTGTGTAAAGGTAATACTCACTTTGCACTTAATGT:1 + chr3L 18687216 3' - FB 786 3 80.20 ACGGAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTACGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATTAAAATACGTTGGAAGTCGTTAAAACAGAGGTTATTGATGCA:1 - chr4 161342 3' + G4 3544 1 63.37 TTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTATTTATTTGCACTCCGAAAATTCCCATTTGAATGGTTATTTTGGGCTATTTGGGAGGG:1 + chrX 19999534 3' - ZAM 125 2 65.35 TTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTTTTTGCCGCTCGCATCGTCGTCCTCCTCGCCGGTGCCCTCTCCACTTCCTATG:1 + chr3R 10521180 3' - F-element 4372 1 59.41 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTACCATGCTGAGCGCACACATGACACATAATCA:1 - chr3R 19535662 3' + hobo 2937 1 77.23 ATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTGTGGGAGTGTGTTAGCCGTCCGACGTTTTCGAGTTGGCCACATCAC:1 + chrX 1399424 3' - P-element 445 1 46.53 AGAGGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAGACTTGCACATCCTTCAGCTGATCGTCCTTTTTATATAGCTCCAGAAACGTGTCCAGGCAGTA:1 - chr2L 18154956 3' + INE-1 172 1 66.34 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAAAAATCTCCAAAAATAGACAGGGCCAATGAAAAGCTTAACAAATGCCATATAAATATGTATCCA:1 + chr3R 27448577 3' - roo 11 2 66.00 GTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCGAACGTAGTCCGCCGGCCTTGGATCGAGTACGCTACT:1 + chr2L 16813559 3' + invader1 3611 2 76.24 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAGATTCTGATTCTGATTCCGATTCAGATTCAGATACAGATACG:1 - chr3R 6482831 3' + roo 9040 1 63.37 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAA:1 + chrX 1399949 3' + P-element 2877 2 69.31 CAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAACAAGCAGCCACACAACTGCCACAGTT:1 + chrX 6878804 3' + G6 1865 1 74.26 GTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAGTCTTAGATACACGGTTACCAATGGCTT:1 - chr3R 6909221 3' - I-element 123 1 69.89 TGGGAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGGGAAATAAAAAAATTTTATTTCAATATATCCTTTACGTACGCCGATTTCCCGCCAGTTCGACGTCCACAAGGTGC:1 + chrX 6580902 3' + Cr1a 4435 1 60.40 TTGTTCAGCAGAGAGGCAGTACAGCGATTTTGGCAATGTTTGATTTGCCTGAAAGAGCCAAGCTAAGCAAAGACATCGTTTTGATTTTTGGCGACAAAGAT:1 + chrX 18823232 3' - 3S18 5725 1 69.31 AGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATATTTGGACATCAATTGATATTTGTAGCTAT:1 + chr3R 29734035 3' - 1360 3208 1 76.00 GTATTTATATTTATTGATTAAATCATTACTTCAACAGGCTTTATAATTGTAATGTTTCATTGCAATTGTTTGCTATTTGACATTTTAGTTTTTTGTTAATA:1 - chr2L 9051116 3' - diver2 443 1 88.12 AATTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCGATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTGTGCGACTTGTATTTGTATTTGCATTATTATTATTGTTATTCGTATCG:1 - chrX 7651433 3' - Porto1 4287 1 57.43 TCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGCAGGAATTTCCAGGTAAGCAAACTCAAACAG:1 - chr3L 13399367 3' - G2 193 1 69.31 GAAAATATAACAAAAATTTACAATAATTGTCCGCATTTCAGCTCGTCGACTGCCTCGCGAAGGTTGTCGCGCTCCTTGAGCAAACTGTCTTTGGCCCGCTG:1 + chr2L 19032012 3' + Ivk 5237 1 76.24 AGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGAAACGGGAGTTATCTTATCTTATCAACA:2 + chr3L 12773412 3' + invader2 4643 1 78.22 AACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTCAAACAAAATCAAAACTTTGAATGTTCGCATGT:1 - chr2L 17699091 3' + hopper 1128 1 67.33 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCT:1 - chr2L 222094 3' - P-element 34 1 45.54 ATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTACAGGTTTGACGGCGGGGCACGAAGGTGGAGGCTTCACTGTGCTGCCGTTGGTGGAAGTGTGTTCTCGAAGGACGCGCCC:1 - chr2R 13470548 3' - INE-1 253 1 67.33 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGT:2 - chr2L 16691155 3' - pogo 24 1 57.43 GCTCATCTCCCATGCGAATGTTGAATTTGATAGGACTGCTTTTTGTATACAAATACGTAATTTCAGATGTAAGGCAGTCTCTGTGAGTTTCCATTGTTGG:1 - chr2R 21239346 3' - jockey 5 1 72.00 CTCGCNTTTGATCCCAAGCCCAAAAGTTGGACTCTTATCGTGAAAGCTTCAGGTACTGCAACACTGCACTGATCCACTCGCTTTTCTCGGTTGAATGTTTT:1 - chr2R 4161876 3' - gypsy7 74 2 51.49 TTGGTNTGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTATGTTGAGAAGCAAATGAAAATTATTTTACTGCTGATCTGATGTGCATACATAACATATC:1 + chr2L 11162716 3' - I-element 213 1 71.29 AGGTGCCGTATCTAAATTCAAGGCACTTGACAGCAGCAATTAGTTTAGCAGTTTCTCTGAAAATGGGCAGCTCTTTAATTGCACTGAAATCTTGATAGATT:1 - chr3R 21249786 3' - G7 198 1 55.45 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAACGGACCAG:1 + chr2L 1353782 3' - I-element 29 1 55.45 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAGTGGTGTCCTCAGGTTTTTTTTAGCGGCACTGAAAGGAAGATGCAAAAGGCTAATCAGTTG:1 - chr3L 25201994 3' - 1360 14 1 62.38 GAACGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAATCATCCAACGAGCCCATGAAAAAACCATTGGACGTTGACTTATTTGGAGATGATGATTCTTAACAGGCGCTTACT:1 + chr2R 3094638 3' + Fw2 3574 1 64.36 ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGG:1 + chrX 9256951 3' - 3S18 48 2 68.32 AGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTACGTCGGTCATCGCCACGTACTTACAATTTGCCTACACGGATAGATAGTTGACCTTGCCGAAAAGCGTAATAAAGG:1 + chr3L 6786587 3' + Burdock 101 2 58.42 TTAATGGATAACTACTACCTCTGTTAATTTAAGATTAATTATAAAATTTGCTTATTTGGTTTGGACTTTATTCTATTTAGCTGCCGTTTGGCTGCTCTCTG:1 - chrX 777021 3' + G4 3767 1 53.47 TCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGCCGATGTTGTTGCACTGGTGTGTCTGGTGTGCTGCCAATGAGGGGAGTTGCCTTTGGGG:1 + chr3L 13216479 3' - Doc3-element 4383 1 63.44 CACAAAGAATCACTCGCGCAGCGAACGGACGGACGGAGTCTCAATTCTAAAAAATTGGGCAGCATATTAAATATTTAAGCGTCAAGCCGTAAAAATGCCA:1 + chrX 18735415 3' - Cr1a 133 1 78.00 ACCACCCAAAGCTGTGACAAAGAAACGAAAGTGCAAAGTGAAGCATTTTTTCCGACCAACATCACAACAATCTACAAGCGAAGTATAACACAAAATCCCAT:1 + chr2R 6620212 3' + gypsy4 323 2 79.21 CTGGTCAACTCGAGGGAAGTAAGTGACAAATTTATCAAAGTGACCGTGACCTGGTGTGAAATCGAAAAAGTAACCATTTATTTTTTAGCCTATTGCAAGAA:1 - chr3R 6171807 3' + Ivk 468 1 60.40 CGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCTTAATAATTGAAAAGAGTCGAGGCAGC:1 - chr2R 7115767 3' - Ivk 5036 1 74.26 CAATCGGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGACAGCAACAACAATTTCAGATGAGCAAGGAAATGCCGGAAG:1 + chrX 2305132 3' + diver2 474 1 57.89 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTAC:1 - chrX 13354253 3' + pogo 2074 1 60.40 GGATCGCACATCTCGGTAGGGCCTTTATACTGGAATTCACAGCCAACATGATTTGAGCCCGTTTTTTATCTGGTTTTGTACGGCGAACTGTGGTATTATGG:1 + chr3L 23941616 3' - BS3 293 1 70.30 AAACATATTGTGAGAGAATACCACTTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTTTATGTAGCGATTTCGAACGATAT:1 + chr3L 26001796 3' + copia 89 2 74.26 GCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCTGCTCTATTGGCTCCGCCTCCAAAAGCCGGCAGTTGGTGCGTTTCT:1 - chr3L 1185144 3' + F-element 331 1 68.32 GTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAATTCAATTCTTCGCAGAAAGAGAATATCTTATGGGGCAAACTTTCGAGTGCAGCAGCACTCA:1 + chr2R 19200604 3' - FB 856 2 68.89 ACATATTGTGCCGTTAATTCACGTCCTCTGCGTCCTCTTTGCGCACGCACCGTTACCGTTCGACCTATTTGCCCTTGATACTCAAGTTGTTTTGTTAATTG:1 - chrX 5161170 3' - gypsy8 4915 2 76.24 CTCTCCCTTTTATGCGTTGTTCGCAGGGCTGTATGGTGTTGTTTTTTGCATGTAGATAGTAAATTGATGTTACAATTGTGTGAGCCTGGAATATAAAGCCC:1 - chr2R 5581939 3' + Cr1a 220 1 55.45 GTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCC:1 - chr2L 19845897 3' - F-element 36 1 47.52 ATAAACATTAGCATCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCCACCAAAGGGTAAAAACCGCATCGTTCTCCCAGTCGCGCTCAGCTATGTGGGCGTACACTCCAGA:1 + chr3R 21006344 3' + Quasimodo 6906 2 55.45 GCTAAGAAGGTTTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGAAGGGGTGGCGTCGATGGTATTTATGGTGCTATTTGTGCCATGCCCT:1 - chrX 19526843 3' - I-element 5102 1 60.40 TTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGCGGCTGTAGAGATAGTTGATGGCTCAGACAGAGCGCAGTCGGCCATGTAAATCAATTAAAATCCTCT:1 - chrX 3516416 3' + HMS-Beagle2 33 2 76.24 GATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGTTTTATCGCCACAGTCCTCCAGAT:1 - chrX 16176368 3' - F-element 4387 1 65.35 AAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCACGATACGCTTGTCTAATCCCGGCTCATTT:1 + chr3L 9569003 3' + 297 6603 2 70.30 TATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACACTTTTAACAACCGCTGCTTTACTTACCCTTTGGTGCAGTAGTCCCTCACTGAGCCCTCC:1 - chr3R 31730242 3' - Circe 7192 1 74.49 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGCATAGGTAAATGGAGATGT:1 - chr3R 21799483 3' - jockey 4759 1 78.00 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAGCGATG:1 + chr3R 27619258 3' - hobo 44 1 71.29 ATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTAC:1 - chr3R 26331648 3' - G-element 38 1 57.43 CGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGCCGCTTAAATAATTTATCTGCATTGAGAGG:1 - chr2L 12968039 3' - F-element 4411 1 70.30 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGTCAATCAGAAACAGAATCAGCTC:1 - chr2L 18662335 3' + hopper 1364 1 74.26 GGCCAGATTGACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTC:1 + chrX 158236 3' - INE-1 101 1 75.25 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCACGGCCAGCTTTACAGCCAGACAAACAGCAACAAATG:1 + chr2R 19726914 3' + 1360 3349 1 65.35 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGCTGCACGCTGGGCG:1 + chrX 3485726 3' + P-element 2875 1 63.37 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTGCCACTGA:1 + chrX 1548549 3' + roo 9033 1 63.37 GGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACCTTACACCTAGGCGGCATGGATTATCAGCGACTGTCCGCTTAGTTGGCTCACATC:1 - chr2R 15256459 3' + 1731 4604 2 66.34 TAAGCGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTATATAGCTGCATCTCATTCGCCAAGTCCAAAAGGCGGCCATCGAATTCCTATCGGTTCGTCTGCTCAGA:1 - chr2L 18676504 3' - rover 6962 2 58.42 AATCTCAACCTTCTAGCTATTATAGTTCCTGAGATCTCAAAGCTCATATACGGGCGGACAGAGTCGAGTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATGC:1 - chr3L 20756358 3' - INE-1 164 1 73.27 GATCGTCTTTTTAAATAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTGGATCCTGCTCCTGATTTCGCTCCTGCTCCTGATTCCTGGCTCCTGTTGGACTGTTGTGGTTTT:1 - chr3L 17743435 3' - TAHRE 351 1 40.59 AGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACTGGGGGAAAAAAGAAGTTTTAAAATGAGATAATATTTA:1 - chr2L 13209872 3' + X-element 422 1 68.32 GGGGAGCAGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGATTTGAGTGTACGTGCAGATGAATGCGCGCGAACGTTTGGCTTGATCATTTGTAATTTTGTTTACTT:1 + chr3R 7190960 3' - Porto1 493 1 60.40 CTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGGAGTTCGTGTTCGTGGGGATGGGAATTGAATTGCTGT:1 - chrX 21584124 3' + R1A1-element 4971 1 71.29 ACAGAAGAATACTCCCCCCCTGCTCCTCCTTCCACTCCTCGAACTCCTTTTTGGCCAACTGCTCATAGTTGGCAATTACATCCGATACGTGTCTGTACTCC:1 - 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1360 3 2 50.50 ACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAAAAACCAGAACAATCCCACAAGAAAGGACGAAGGACCAAG:1 + chr2L 2120234 3' + Bica 250 2 60.40 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGTTAATCGTTAAAAACAATAGATAGGGCTATAGGTCGAGTTTCCTGACTATC:1 + chr4 435937 3' - 1360 306 1 61.39 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATACCGTTCACAAAATGCAAACAG:1 + chr2R 6715031 3' - pogo 49 1 77.23 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAAT:1 - chr3L 3254963 3' - 1360 24 1 56.44 CACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACCTGTCACCTGATTTAGACGATGGACAAGACATTCCACATC:1 - chr2R 12578900 3' + I-element 4907 1 60.40 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGCTTCCAGAGGCATTGCGCTTTCTTTCGGGTACGTTGCCTGTGGTTCTATCCAAACTGAGCAAGCAAGTCAGC:1 - chr2R 5640311 3' - roo 8668 2 75.25 GCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCGCTAAATGGAATGGGCTCAACGACACAAATCGTTGGATGAATTATCGCCCAAGTACTTATCCAAAAGCTGGA:1 + chr3L 26350114 3' - R1A1-element 109 1 75.25 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTTTGTGAGTAACCACAACCAC:1 - chr3R 24545587 3' - roo 8717 2 79.21 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAAGTCTAACAGCCACTGGAGTTGTTAATT:1 - chr2R 16928873 3' - blood 49 2 72.28 TTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAAATACATACATATATGTTGGGTGTGGGTGTGTGTTGGCCGTCGA:1 - chr3L 19212493 3' + roo 87 2 57.43 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGAGCTTTATG:1 + chr2L 3245019 3' - rover 6967 2 64.36 ATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCCAGCTCTGGGAAAGACGGATCCTTTGAAGACGCCATCG:1 - chr3R 2724380 3' + Ivk 4945 1 62.38 TCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCATTCTTACCTGTACGGATCCTCACCTGGCTGGCTGCAATCCAAGTGCTTTGCACTTT:1 + chr3L 11956617 3' + F-element 4389 1 76.83 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATT:1 + chrX 1523768 3' - jockey 37 1 55.45 GCTAGTGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGACATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAAT:1 - chrX 15408741 3' - INE-1 526 1 85.15 AGTTTGGGGTGTGGTCAAGGATTCATGGAGCAAAATTCCTCAAAAACGGTGCCAGGACTTGCTGGCAGACTTCTTGTTTGAACCCGACTCACGGGCCGTC:1 + chr2R 5979565 3' + Tc1 1228 1 61.00 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGGCATTTCGGTGCGGTGTGGCGACTCGGTGCATTTA:2 - chr3R 7808932 3' - jockey 27 1 59.41 ACAAANGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCAGCGATGATTGAATGAATCTGGACTCCTGGTCATTCTTCGATAATTCC:1 + chr2L 3273916 3' + gypsy5 7323 2 53.61 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTA:1 + chr2R 8157260 3' + Transpac 5205 2 56.44 CGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTATAGCCCGGAACAGATGTTGTTGTTGGATTGTAGCCCGGAATACT:1 + chr3R 17154918 3' - Quasimodo 7183 2 55.00 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCTTTTCGGACCAAAACT:1 + chr3L 63025 3' - roo 31 2 58.42 AGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAATCATAAAAGCGCAAAGCAACAGCCACATCGCACAGCAC:1 + chrX 2852822 3' + G6 1858 1 58.95 AAAATAGCATTTTAAGTTATGGCACGCGCAGACAACAAAACAAACAAACAACCAAACGACCAACCTCCGTCAGAAGAATTTTTGGCAATTGTCACCGCAAA:1 + chr3R 11395538 3' + 412 39 2 52.48 TTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCACCCCCCTATCAACTATCCCCCCACATCTGACTAACTGTCTTTTGTGTGTCCATTTCGGTTGCGGAAT:1 + chr3L 16205957 3' - I-element 370 1 67.33 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAGAAAGCGAAAAATAGTTGGCAAAAGAACATGAAG:1 - chr3R 8480415 3' - transib2 38 1 61.39 TGCAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCCAAGTTGCCCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAAAAACAGAGCATACATTTTCTCCATACTTATCTAGCTGTCTGTT:1 + chr3R 24631750 3' - 1360 3335 1 56.44 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAGAAAGCGAAAAATAGTTGGCAAAAGAACATGAAGCTACT:1 - chr3R 8480410 3' + transib2 2791 1 58.42 ACGCTGCGACATCAGAAGTGGGATCTGCTTTGCCTACAAAGTTTCCTCAGCTACCTGGAGAAAACCAAGTCGAAGACATCCCCCCACAAGTCATCGGAGGA:1 - chrX 21112501 3' + invader1 413 1 65.35 GCTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCTGTAGCGGTCCGGACAGCAGATGAGCACCTTGCCGTTCGTATAGCCGCACTGGCTGCGACTCAG:1 - chr3R 15329335 3' + GATE 31 2 71.29 CTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTGCACTGCTGCTCAATTATTTATGCAAACTACAAGGGAACCCAAACAACTGCCTGCATCCTTCGGCGA:1 + chr3L 10074565 3' - flea 139 1 64.36 ACCAGTCAAACTTCACTGAAGAGATTTTCTCACTTTTCCCTTCTTCCTCATATTCTATAATGTCTATACATCTGTACATCGCACTTTTCGGGCTCGATTAT:1 - chr2R 8919109 3' - invader4 242 2 69.31 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTGTTTGTGAGTAACCACAACCACAGGACCGGA:1 - chr3R 24545578 3' - roo 8708 2 70.30 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATATATGTATCCATACAATTTCATGCGGAATTTGTGCTAAACACGTGAACGGGCCTC:1 - chr2R 22740012 3' - Transpac 4926 2 69.07 TCGTGAAACTCGACTATAGCCTTATCTCTTGATTTTTCTACATTATCAAAATGTTCGTCATACTTACATACAGCACAATACAACATTGAATAAAATCATCG:1 - chr3R 3623672 3' + INE-1 569 1 63.37 CCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCATTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGTCCTTTCAACTTCTTACAGCTCGCCAACCAGCAGAACCCCGCTCCCAAT:1 - chr3L 22800755 3' + Idefix 178 2 52.48 AGTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGAAAATAAATATAATTTTTTACAAATGGGAATAATAAAAACACAACAAAGTAAATAAAGTGCAAAAGCCGAGGAA:1 + chr3R 8845212 3' + Chouto 228 1 78.22 TAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCCCCCCTCCGCAGACCCCTTCGATTTTGGGCACCTAGGAGCCGAAAAGTTCCCTTGGCCAACTGCGCCTTTCG:1 - chr3R 9480203 3' + Idefix 210 2 79.17 GGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACACAGAAAAATATCTCACAAATATCTTTGAAATAGTGGTTAAGATGAA:1 - chr2L 1891971 3' - X-element 104 1 53.47 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTG:1 + chrX 1548542 3' + roo 9029 1 69.39 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGA:1 - chr3R 22899171 3' - P-element 24 1 53.00 AAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATTTAATTATATATATATATGGGAAACCTTCTTTCGATATCATTTGGGCAGCGCCTGTGTATTGG:1 + chr3L 19246418 3' + Idefix 7368 2 57.43 TATTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTCCTAATGAGCGAATTAGTATTCATTATAAGGTGTCACTTCCTCGCAATTCTATTCCAGCGACCCACGTTTGAATAAT:1 - chr2R 7100732 3' + INE-1 29 1 81.19 TTCTCGTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAGGTGTCTAAAGGTTTGCCACACATCACATAAATACAAAAAGTGTACGCCGGAA:1 + chr3L 3415686 3' + F-element 273 1 49.50 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCCATTTGTTTGACCACATCACGCATACGCCCCGTGGTGCGC:1 + chr2L 6605657 3' + blood 7387 2 76.24 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTCCTCTACGCACATGATATCCCCGATTAATAACATTTTCTTAGCATACACTTAGGG:1 - chr2L 18818582 3' - 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G-element 3920 1 64.29 GTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAAACGTCAACGCTAAAAAGCAGCAAACAAAAAGCGACCCACACAAACAAGAATGGCGAGG:1 - chr2L 9854441 3' + F-element 220 1 66.34 CCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCATTAAGAAGAAATTATGAAGCGAATCTTCTAGAGACT:1 - chr2L 3355813 3' - opus 289 2 64.36 AGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATATTATTTTAAATCGAACTAAGTTCAAAATTGCATTCGAGAACT:1 + chrX 3697182 3' - jockey 4707 1 52.48 ACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAGTCCTTCGGGTATTTACGCTTTTGTT:1 + chr2R 21421112 3' - springer 7144 4 68.32 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAATTGTGTATTTTGCGGTCCGCCGCAACGAAACTATAATGT:1 + chrX 4326929 3' - FB 36 1 63.00 ATTTGCGGTCTGGGACGGGAGCCAACTCGTTTGCCGTCGTGCGGTGCCGTTTAATGAAAGGACGAAAACCAGGACACACTCGCGCTTGGCCAGCCTGCAAT:1 - chrX 20617508 3' - mariner2 248 1 74.26 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCTAAGAGTTCTTTCAACTTGGATTCTGC:1 + chrX 9653330 3' - roo 8705 2 72.34 CGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCAGCTATGTGAAACCGGGTTTTTGGGGTTGGTATTCAATATAAGGTTAGGAAG:1 + chr3R 3843146 3' - Max-element 8259 2 54.55 CAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTGCAAAAAGGCGACCAAGGAAAA:1 + chrX 8350160 3' - 1731 4550 1 78.22 AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCAATGAAACCGATGACGAGGAGGACGACGACGAGTCGGAGGAGAGCAGCAGCGTCCAGAC:1 - chr3L 15946964 3' - mdg3 84 2 63.00 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGT:1 + chr2L 18568104 3' - I-element 41 1 62.38 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGCAG:1 + chr3R 11833013 3' + roo 9030 1 66.34 TTTAAAGGGAGATGGATGGATGGCGAAGGAGTCGGGTATGGCGGGCAGGAGACAAAA:1 + chr2L 8584737 3' - transib4 2432 1 68.42 GCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCGTCGTTCTGCTGCAACTGCTGCTGCTCCGTTTGTCGTTCCCGTTCGA:1 + chr2R 14680018 3' + F-element 413 1 53.47 GCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATGTCAGCGGAACGGGCAGATATTCTTGTCGCAAACTCAATCCATTTATGTTCACCAA:1 + chr2R 13981537 3' - Ivk 132 1 55.45 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGAGGCTCGCACTTTGCTGCGATTTTTTAGCGATAAGG:1 + chr2R 21379620 3' + P-element 2862 1 53.47 AAATGTTTGGGTGGGCGGGGCATTAACTTAAGGGATTCCCTTCCCGTTGAAGGTTTGGTGCGACTCTGGGCCCATGAAGCTCTGCGCCTGTTCCAGGATCG:1 - chr3L 4814704 3' - G-element 4260 1 68.32 AGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTGTGCAGGGGTGGGGGAGGCGGTGCGTCTGCTTTTGTGTGGAATGTCATTAAGGA:1 - chr3R 29475513 3' - 297 6511 1 60.00 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGCTGCGC:1 + chr3L 5691292 3' + P-element 2849 1 39.18 CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATGTATGTTTTTCAGCGAATTCTGTTTTG:1 + chrX 12801502 3' - Burdock 6180 2 77.23 CTTAGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGGGGGTGCGGTGGTGGTGTTGGGCAACATAAAAGTAGGCATAAAGGCGTCCAAAAATATTAA:1 - chr3R 31357181 3' - G2 2893 1 57.00 AACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGAT:1 - chr3R 1047994 3' + Stalker2 7598 2 71.29 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTA:1 - chr3R 23618143 3' + hopper 1382 1 59.00 AACCCTTGAATGTTCTGCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGTAAGCCCTTTGGCACACTTTTTATGAATAAATAAAATAAATTGTAGAGCT:1 + chr3R 8633647 3' + HB 440 1 55.45 GAAAANTTATTCGATTATGCAGCCGAAGCCGACTGTAATTCAACACGAAACCCTTCACCTGCTGGGCCTTTTCCACGAGCAGAGTCGTCCCGATCGTGATG:1 - chr3R 15078790 3' + Doc3-element 4544 1 66.34 CCGAGNCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAATATGTATATTTTATAACTTATAAGTACTTCGATATG:1 + chr3R 17119360 3' + Idefix 7253 2 64.36 TTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:2 + chr2R 10572710 3' - F-element 4382 1 60.40 GTTCTTAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGGAATTGAAGCTCATTAAGTAAGCCCTTTAATCCTGCTGACGAATTGGAAAATTACCCTTTTCAT:1 - chr3L 2182645 3' + blood 7377 2 67.33 TAACAGACGAATCAGAATGTGAAAAGCCAAGTGCCAGAAGCCGTATTCAGATAAACTTCTCACCTATATGTTTTCTTTTTTTCCAAAGTTAAATGTATATT:1 + chr3L 69980 3' - INE-1 287 1 56.44 CGAGTGCCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAGTGTGAGCACTACCAGCGAGATAACACCAGAGGAGTCACAATATCAGGAGGCGCTG:1 - chr2R 8731291 3' + Doc3-element 325 1 66.34 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGATTGCCATTGCCATTGCGGCTGT:1 - chr3L 15426823 3' - P-element 39 1 26.73 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTCTTTTAGATCAATATTTTACTAATCTTTTAGACATAATACGATCAAACTGGTCTCG:1 + chrX 13854514 3' - pogo 17 1 62.38 TCTGACTCCGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTAATCTATTGGCTTTCCGGGTGGTCGAGGGGG:1 - chrX 7069861 3' - G-element 425 1 65.26 GGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTATGCCCACTTGGAAGACAATGGACTTGGGATCGATAACAG:1 - chr2R 9239560 3' - McClintock 224 2 59.60 GTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCGTCCATGGTTCGCGATGATTGCTGTCTCGTGTGCGCCGGC:1 + chrX 18006218 3' + hopper 305 1 60.40 CAACCTTCTAGCTTTTATTGTTCCTGACATCTCGACTCGGGTATTGATCCTGATCAAGAACATACATACGGTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTACATA:1 + chr2R 6219127 3' - INE-1 159 1 66.34 ATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAATGGAATGAAATGAATTGAATTGAAATGAAATGAAATGTGCTCGAACACGAAATGCAGAATGAAAATGAGTG:1 - chr3R 18375026 3' + Bica 108 1 78.22 GCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACTTCGTCATCAAATGTTTCACTGGAAAATGT:1 + chr2R 3901130 3' + Quasimodo 7045 2 70.30 CATTTGTATATAAATACATTTTTCACTTTATTTTCAAGGATTGTTTTTGTGGGCAAGGCCTAAACAAACTCAAGTGTTTAATGTTTTAACAACTGAATACT:1 + chr2L 2228957 3' + transib4 2462 1 53.47 TCACCACCCTCAAGACCTGACTGACCGGAACATGAAATTTGCAGGCCTAAGGCTTTGGTTGATTTATGGGTTTTCAGCCGAATTATTATTCCGACAGTAT:1 - chr3R 17342856 3' + jockey2 3182 1 67.00 TCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACAAACACAGCCGCACATGAGCATGCGAGGGAAAATTTTA:1 + chr2L 1260263 3' + accord 205 2 67.33 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATCTAAATTACCTGGCTTCTAATACAATGGTATTTAATTATTGAATCGTTTAAATGCATCTTAATTGCCATTGAT:1 + chr3L 1270916 3' - roo 8667 2 71.29 TTTTGGAGAGTACTTCCTTAAGTTGGGCTGTGGACTTCTTGACCCTAATGGCTCGATTTGCCAGGTGTTCACGTTATCGGTGCCGCTCTGCAT:1 - chrX 19492906 3' - gypsy3 6514 1 59.14 GGTCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGAGCCGCCGCTGCAACTCGCACATGCAGTCGGGAACGGAGAGAGTTGGTGGAAACTATATGATATATGGAT:1 - chr2R 21759432 3' - invader4 363 1 83.87 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGG:1 - chrX 11042509 3' - jockey 4693 1 61.86 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAGGTGAGAGAAAAGAAATGGAGAAA:1 + chrX 8299766 3' + roo 398 1 67.33 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGTCAC:1 - chr3R 9193572 3' + roo 391 2 63.37 TTCACNAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCATTAATTCCGTCTGCCACTTGACTGGTTATCAATCGGAGCGAAACGCATTTGAAATC:1 + chrX 2253916 3' + Tirant 8490 2 63.37 CCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGATGCTTTTTTGTCATTCACATGTCCAGACTGCTGCACATGACATAAATTTGTATCTGCAGCTGATTGTG:1 + chr3R 9870780 3' - Chimpo 16 1 77.23 TGTTGGCAATGACTGCCGCGCATCGCCTTGGGTTCCTTTCGTCCTATCTGTTGGCCATGGCAACCATCGTTTCCATTTTCCAGTTCGACCCCAAAATTACC:1 - chr2L 9038344 3' - Tc1 1310 1 53.47 CAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCAAATATGATTTCCCCGGAGATTGTTAG:1 + chr3R 19526015 3' + F-element 260 1 73.27 GGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGTTGATTTGTTTATTGCGAGTCAAATTCAATTTTACGCAAC:1 - chr3R 11813990 3' - Tirant 88 2 70.30 GAGGTGATGAACATGTGACGGCAGTGGTTGATACGTTCCGGTTTTCAGATAAGTACCATTGGCATCTACATGGCGTTGGGTTTCCTCCGAATCCTCTATCA:1 + chr2L 8318177 3' - accord2 7365 1 80.20 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGCGCAGCAA:1 + chrX 19848484 3' + P-element 2872 1 50.00 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATAATAACATAATAATGGAAAAGAAAGGAGATTATAGCTTCCAACCAACACCAAATAAAA:1 + chr3L 16529095 3' + copia 239 1 61.39 GAATATTCACGAATAATTTACAACTAGCTGCCATTAGTTCGGCGCATCCAATTTGTTAATGAAGTTATCAACGGTTGAAGTTTTGGTTTGGTATGGGGCTA:1 + chr2L 2454321 3' - transib4 292 1 80.20 CCTGCCGCAAGGAACTTCGTGCCAAATTGTAAGCTGAACTGGATACTAGGACCAGCAAGCAAGCTAAGCCTTACCAACGAAGTGTTACTCTTCA:1 + chr3L 23611050 3' - G5A 398 2 68.09 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAACAGGAAGGATATCTTATACATATAAATGATGTAAAGTAAACAAA:1 - chr3R 25876250 3' - flea 28 2 55.45 AAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACACGTCCACACACCACCCCCTCACACACACATATATACAACCCTTGCAACTGCCATTGCCGG:1 - chr3R 17711646 3' - Dm88 452 1 58.42 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGTTCAAAT:1 + chrX 13560782 3' + roo 9042 1 53.06 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAAATATTGAACCGATGTTTTCAGAACATGTCAGAACATCTAGAACAATTTGTAATCTTTCTAACG:1 - chr3L 23419728 3' - FB 14 1 40.59 AATTCTGAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTCCCGGATACCTGCAACCAATACCACGCCGCAAACCGATCGAGTTATAAATACAATACGCAAA:1 - chr2R 14798690 3' + gypsy6 7721 2 59.41 AACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACACAAGCAAAATAAAACGCCAGGG:1 - chrX 4168738 3' + Porto1 262 1 75.00 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATATAGTAACATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACC:1 - chrX 22252768 3' - 297 35 2 68.32 TTCTTGATCAGGATAAATAGCCTAGTCAATCCAGCCATAGAAGTTTTTCTGTCCGCGCCGTTTTCTTGGCTTTCTTCGGTTTAATGGTCTACTTAAAGCAG:1 - chr2L 13696808 3' + INE-1 87 1 67.33 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCTTTTCG:1 + chr3L 63015 3' - roo 8705 2 68.32 GGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGCACTGCTGCTTGTTGTTTCTGGTTTTGTTGTTTCGCTGTTGGCTGATGTTGTTGCTCTGGCTCTTTAAGTCGAACAA:1 + chr2L 18742509 3' + INE-1 548 1 67.33 CACGTNCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAAAGACCCAAAA:1 + chr3R 12578201 3' - jockey 20 1 55.45 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCATTTTAATACGCTTAAGTGCACGGCGAGTCCCTAAAACTATGCTATGAAAAATAGTT:1 + chr2R 13314189 3' - jockey 26 1 60.40 TCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCCTAGCGAGTATCTTTTTGAGCAACTTCAAACTGGCTTCTCGCAAGGATTGTAGTTTGC:1 - chrX 632708 3' - Ivk 4964 1 61.39 TTTAAAACTGACATTGTAATTGTAAAAAATATAAAAATACCTTATACCGAGAATATATGTGACTATATTCCTGCGCCTTATCACTAAGCTTTCCAAGAAAT:1 - chrX 9595517 3' - TAHRE 10139 1 75.25 AGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTGCCCGTGCACCCCCTCCCATTTGCGC:1 - chr2R 22525214 3' + jockey 397 1 74.26 AGTGTGTTCGTTACAGTTATAGACTCCAGCGGGCAAATGTTGGTGGTGGTGGGTGGTGCGGGCTGTTAGCTGCGGTCGATGGGTGGTGACATCAATTTGGG:1 - chr3R 22922825 3' + Circe 227 1 75.25 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGC:1 - chr3R 22352802 3' + 412 7495 2 73.27 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAA:1 - chr3R 10490343 3' - transib2 36 1 58.42 ACTAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAG:1 - chr3R 19718712 3' + INE-1 542 1 80.20 CACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTGGAATTAAAATATTTGGGGTAAACTTTAATTTGCGTGTGCAGGC:1 - 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chr2L 9087951 3' - HB 1417 1 63.37 AAAAAAAAAAACAAAAAAAACTTCATTGCAGTTTTC:1 - chr3L 14815268 3' + HMS-Beagle2 489 1 91.67 AACTCAGCAGCAGCCACGTGCTGAGGCTGGTACACCAACAAACGGTTCCTACCGTGCCCTCCACCCACTCCAAAAAAAAACAAAGCAAAAC:1 + chr3L 7090397 3' + G-element 233 1 73.63 AATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAA:1 - chr3R 14882101 3' + gypsy5 7305 2 75.25 TTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCGCACCTGCAATTTTTACGAAATATTGGCAAC:1 - chrX 21961837 3' - micropia 5162 2 69.31 CGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTCGGGAAACTAACACAACAAAATATCGGGCTAGCCATAATTTTTAAAGCTCACAATCGAGCGCGCTTAAT:1 - chr2L 2531162 3' - accord 7031 2 54.46 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGTCTTGCATATATATGAGAATTTTTGTAAATTATTAAGTATGCGTAATGAGATAGTAAATTTGTACC:1 - chr3L 16538696 3' - F-element 21 1 49.50 ACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGTTCGCGGGTAGGAGCGGGGAAAGTATGAGAAAATCGGGGTAAACTGAATTGTAAAGTGGCTTCAACATTTT:1 - chr3R 22156536 3' + invader1 96 2 56.44 TAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCCAGGTGTCGCACACCATCAACATGAGCAATGTGGTACCC:1 + chrX 7737955 3' + G6 1666 1 61.39 TAAAGNGGATAACACAATAGGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTTAACACCTAGGCACGTGAGTTTCCAATTTCGGCAA:1 + chr2L 11895238 3' - Dm88 4464 2 64.36 AATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATGCTTTTAAATATTTATAGGAATTGTTCATCCCCTACTGGAGCCCATGTGATGCCAGTTCG:1 - chr2L 21152034 3' - 1360 439 1 59.41 TACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTAAAAATATGCCTAAGCAAATAAAATGCATTCAATGTGTTTATATATATCGCTGTCC:1 - chr3L 17588231 3' + 1360 3232 1 62.38 GGATCAATAGCCGAGTCGAATTTTCATGTCCGTCTATCTGTATGAACTCCACGATCTGATCAATGGCAATCTTGTTTAGATTCTCCAGATATAGACGCGTC:1 - chrX 308687 3' + INE-1 97 1 56.44 AATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGTCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTTTGGTCCGCAACAAAGTTAAGTTAAT:1 - chr3R 12064946 3' - Ivk 5321 1 61.39 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAATCGAAAGCG:1 + chr3R 12789911 3' - flea 39 2 66.34 AAACANGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTTCTATTCGCCCCTTTGGCGCATTTAATAAAAGCGACAGTGAGCCAAAGTCAAGGTCGAACCCCAACGC:1 - chrX 22765744 3' + I-element 5201 1 73.27 GCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACCTCGCACGGGCATAGCTTGACCTTATAGACAGGCAGCTAAATCTAAATCTATGCAAACACCTAGCCATTAG:1 + chr2L 16760906 3' - R1A1-element 14 1 76.24 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGATTCAACTGTATACGAATAGTGGTGCTCTATGTTTCTCCCTGTTTTGTTTTGTTTTGCCTTTCTTGGCTG:1 - chr2R 5844804 3' - F-element 26 1 56.44 ATACACGGCATCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGG:1 - chr3L 16047628 3' + Cr1a 4405 1 56.44 CTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCCGTTGCTGCTGCTTCTAATCATGTTGCTGCCGCCCGTATTGCTGCTGGACTTCTCAGTGCTATCCGGAAGCA:1 - chrX 11896088 3' + R1A1-element 5048 1 79.21 AGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCACTAAAATCGTAGAGAAGACAACGAATACGAATTCGAATTTAAATAAAAAACCGTTCACA:1 + chr3R 10635858 3' - blood 407 1 68.32 ACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAAAGAGCAGGACATGCGCTCCTCCAGTTGTCCTGAGCGCATGTCCTGCTCTTTCTCAATAATGTGTGCCCGCTCGCCG:1 + chr2R 15938764 3' - F-element 249 1 63.37 TCCCATTGGGAGATCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATAAGCCAACAGACTTAGCGCCCACGGCCTCCACCCATCATATCGGCCGACTTCC:1 + chr3L 17240759 3' + G5A 2573 1 67.39 TAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATACATTGGCTTTCCCCACCAATCTGCCAAAAAAACGCGTGTAGTACTTGTAACCCGGCACACAAAACTCAC:1 + chr2R 11320342 3' + 1360 10 2 65.35 GAGAGAGAGAGAGAGAGCTAAGAGAGAGATTCCGCATACAGGGATAAATCCCATTTTATGTAGACAAAAGCTGACAGATTAATCATCGTTCTTTGTCATCC:1 + chr3R 25587996 3' - blood 164 2 79.21 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGATATTGGATTGCCGGTCGGGCGGCTTAGTGTTTATTTTGTTTGCGCTGGCAGATGAAATGCCCG:1 - chr3R 16554784 3' + roo 395 1 77.23 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAATAATTATATGAAAAATGACATAATTATTGGTCGAGAAATATTGTCATGGCGAATTGGTCAG:1 + chr3R 17216884 3' - blood 7027 2 42.57 TAATACAATCGCGAGCGGCACGACGTGCCATTTGGTCATTGTCACGTCTGCCGCAACTATGGAAGCGTGTGTGCCATGCCAACGAAAGGGTTGTCCG:1 + chr2R 8197692 3' + G5A 2489 1 73.20 AGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTCGGCTCGGTCAACGTGGCGGATGAGCGATTTTAATTGGTTTTTAACTAATTTGCTAGCATTGAGTG:1 + chr2L 11232198 3' + gypsy2 201 2 64.36 ACGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTGCAACAGTGTAGGCGGAAACAGCGCAGCAAAACGGAGGCATTGGGCAGGGACACTGCGGTGGATATT:1 - chrX 19901868 3' + gypsy5 125 2 75.25 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTATCTGTATAAATAAACTAAAAGAGTGGGCGGCAGTCGATGTATCGCAACAAGA:1 - chr3L 8763217 3' - jockey 23 1 58.06 CCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTCATGCCCACCATGATCTGACCGAAAAGTTGTGTAGCATAGACCGCCGTA:1 + chr3R 8635255 3' + R1A1-element 4930 1 52.48 AGAATGAGCGCGCTCTTGCTCTCCCGCAATTTTAGCTCCGACACAAGCCACGCTATCTAAAACAAATGACACTGGCTCAGAGCGTTAATCCTATGCATTAG:1 + chr3L 17772171 3' + F-element 362 2 65.35 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAATTCTAACGTAAAGTAAGCCAAACAAACAAAAGCATTAATGTAAACTTAAATACTATAAATAAGAAGCAGCG:1 - chrX 17318851 3' + opus 7499 2 59.41 GTACGTTCGAAGTGATAACTTACATAGGGATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGATGTGACCCAACAACACTTACAGCACT:1 + chr3L 19380930 3' + Fw2 3652 1 74.26 CTGAAACATAACAGTTTAGAGTATTTCCATGCAAATCTGCAAAATCTTTTTATTTCTTTCGCCGCAGTGCTCTCTTATTTATTTGATTGACTGTTTTTATC:1 - chr2L 18326576 3' + hopper2 1515 1 78.22 CAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCCCAAGTGCTCTCAGTGCCTCAATGCGACT:1 + chr2L 485750 3' + Stalker 150 4 81.19 ATTTTGCCTTTGATTACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTTTCTAATTAGATTTAAACAAAATGACAGGGAAAT:1 + chrX 4416936 3' - TAHRE 10369 2 66.34 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATCACCGTCTCCTCGAAATCGACAGCCGAACGAACACGAAGATAAACGAAAATACTAAACCAAAT:1 + chr3R 14282833 3' + P-element 2875 1 73.27 CACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTGAAAAAGCAGCGCGCCCTCGAGAGGATTTCGTTGCATAAGATTCGTAACTATTGTTACAAATTACGA:1 - chr2L 19437231 3' + flea 4590 1 64.36 TCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGATGGGTACCAACCACAGCCAAGGGAAAAAGAGTTGAAAAGGTTACCAAAATTGGTTGTTAGCAAGTCGCAAAATACC:1 + chr3R 6916752 3' - R1A1-element 5046 1 66.34 ACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTGTGTAATGCATATGTGGTTAAACATTGCGTATACGCCGGGTATGC:1 + chr2R 8198552 3' - F-element 18 1 70.30 TGTCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTTCGTTTGCTCCATATTCGTTGGCAACCGAGGACTGGGCTGGCTCACTATATTTAT:1 + chr3R 23868995 3' - F-element 428 1 56.44 ATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGGAACTTGATGCAGATACAGTAGCCTGCTTGCAGCACATAACTCATAAAG:1 + chr2L 386263 3' + invader2 4804 1 59.41 CAAAAGCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTGCCACTGAGTGCAAATCTGGGCCGCA:1 + chrX 1548567 3' + roo 9051 2 58.42 AGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCATCGGGCTGGGCAGCAATCA:1 + chr3L 8903806 3' - accord 465 2 61.62 ATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTGTAGAAATTATTTAATGCATCAAATCGTTTGACCAAACAACAAGCGGCAGCATCACAACAACGCTG:1 + chr3R 28049607 3' - S-element 369 1 74.26 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATGCCAAATTATCTGACAAATGTTTGCGAAGGAA:1 - chrX 2874815 3' - 1360 40 1 69.39 CACATACCAGCTTAAGGAAGACAGAGCATTTAGAGTTGTTAAAGCTATCGACACCACTAGCTTGGCGCCCCTTGGCAAATAGTCAAAACGAGTTCATTGAG:1 + chr3L 13854834 3' + G4 352 1 64.36 TAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGG:1 - chr3L 3254992 3' - 1360 52 1 78.00 TAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGTGGCGAAAAGTGTCAGGCCAGAGTGATGTTG:1 + chr3R 15140873 3' - I-element 4967 1 69.31 ACAACTGTATGTGTGCATACGTATGCTCATACATATGTATGTATATGCCAAGACATGCACCCCAAATTACTAAGCATTACATCATGCTGAAACAATTTCCG:1 - chr2R 19807619 3' + 1360 170 1 65.35 TATTAAGAGAGCCTTAGTTGCCATTTGTCAACAGTTTCGGCTTCCGTTTAGCAATCTAGCCTCCGATTCAGGGTCAGCCGCTGGCTTTTGGCAGCCAGCAG:1 - chr2L 18773725 3' - G5A 2385 1 79.21 TGTTACGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAATGTTAACAGGGTTTCCCGTAGCTTTGCATTTTTTGCTGA:1 - chrX 14597427 3' + BS 5052 1 57.43 AACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGTGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTCTGAACTTTCTTTGATATTTACTGATATTT:1 + chrX 20771117 3' - F-element 4493 1 68.32 CCAGANCTCGCCCACCAAGAAGGCTGCACAGGAGGCAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCTTGACGAGAGCCAGGCGTTAAGGTTGCTTCGTTGAGTCTA:1 - chr2L 16006747 3' + BS3 1536 1 67.33 TCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACCGAGGCGAAGCGACTCTTAATGGTAATTAAAGCATTTCCTAGCTTACGTTGTCTAACTCTA:1 + chr3L 16976789 3' + blood 222 2 68.32 TCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTTTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGATTTGTTTGTCGTTGCTTGTTAGGCTTAGTATGT:1 + chr2L 10299997 3' - F-element 347 1 71.29 GTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAAT:1 + chr3L 24208203 3' - Quasimodo 21 2 55.45 CAACCTACAACCTACAAACGACAACCGACAGCCGACAACGACGACATCAACAGACAGCTGGGATTGGCTAACGTGTTGCAGGTGGAAGCTGCACAGAGCCA:1 + chr2L 1213689 3' + Transpac 228 2 54.46 TTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGTTTCATGTCCCGCATAGACTACAATACCTTCGATATAGTCC:1 - chr2L 9515817 3' - P-element 249 1 46.53 TTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGGAACTGGATGCAGTGGTGGCCAAGGTTCATT:1 - chr2R 12005233 3' + FB 100 1 75.47 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTAAATTGGGTTTGCAAAGACCCACTCATTCGATATAGCATTTGCAATTACACATATGAAGTTGGACAATAT:1 - chrX 899095 3' - I-element 5144 1 51.49 TCCTCGAATTGTCTTGCGACATTTCCCGCAGTCAAGGCCTGCTGTATTTTAAATGATATCCATATCAAGTTATATTATTTTTTACGTGCTTGTGATATCCT:1 - chr2R 14511713 3' - baggins 450 1 58.42 ATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCCCACCCACGTTTTTGCTCAGTCCGCCCATCTCGGACAGCCCATAGCCC:1 + chr2R 20848606 3' + F-element 232 1 55.45 AATCGTTTTATATAAACATATAAACCAAAACAACAACAAGGAAAAACAAAAAATAAAAAACCCTAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCA:1 + chr2R 18524581 3' + gypsy9 432 1 76.24 TGGGTTGTTCACTTGATCTGCTCGAGAGCGCTTCTTTCATATGCTTATGTGCAAGTTATCCAACCCATAAACGTGAAGCACCCACTCCCACACACTGGTAA:1 - chr3R 22182235 3' - Tom1 221 1 77.23 TATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACCTATACTGCCCCACTACTGAGCCCACATACATACATGTGCAACAAAG:1 - chr2L 9802604 3' + Chouto 125 1 58.42 TAGGAGATCAATTTTCCACCTGCAGTAGTGCTCTACGTATATTTTTATATCATCATTGCTGAACCACAAAGCTCTCGACTACTTAAATATATGACACTTAT:1 + chr3R 14641382 3' - Tc1 32 1 57.43 GCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCCGGCGAACAAAAGCCGTCGCCAAAGGTTGACAAATT:1 - chr2R 13064373 3' + blood 215 2 64.36 GGCTTAAAACCTTGTTCTATTGCACCGCCACCGACAACAGAACAGCGAACTGTGGCAGAGATCGGCGGCAAATCGGCGGAGCGTGCC:1 - chr3R 16157432 3' - Fw2 492 1 64.37 CCTAGGTAACAAGATAGCATAAAAATAATTTGAAAACATTTTTACTAGTTATCGTTTATTTTTGGCCAACGAGTCCAATGGCCAGGTGGAGGATAGTCCAC:1 - chr3R 24255007 3' + transib4 86 1 66.34 AATAAGCAGCCCCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACGTCGGCTCCACGTGAATCCACCTCG:1 - chr3R 21718778 3' + 1731 4436 1 80.20 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATG:1 - chr2L 796782 3' - jockey 64 1 82.18 CTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAATGCCGGCTGCCTTTATCCCTGACTTGAATTTATTATAACGCTCCGGGGAAG:1 + chr2R 12269031 3' - hobo 2674 1 56.44 GCAGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTCTAAATCTCAATGTTAAGTTTGTATTCTCATAAAAGATTTCGAGGAATTTCCCCCAATGCTAGCTACACCGCAGATAG:1 - chr2L 14229051 3' + Gypsy6A_LTR 122 1 76.24 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAACTTGTGATTTCTTTGTCCCCTGCTA:1 - chrX 19561797 3' - 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Doc3-element 127 1 64.36 TATAGTCGAGTTTCCCGACTATCCAAAACCCGTTTCACATATCGCAGAAAAATGCAGAAAATATGAAAAACCCAAGTTAATTATAATCAATGTACATTTC:1 - chrX 12790133 3' - INE-1 565 1 65.00 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATAAACTG:2 + chr3R 22675878 3' - 412 30 2 52.48 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTTCCTTCAGCCATCTATGTAGTTAT:1 + chr3L 13888707 3' - copia 4885 2 61.39 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGCTGCGTTTGCCGATTGGCTGCTGCACAAATTTTGGTCACTG:1 + chr3L 11696475 3' - blood 7020 2 66.34 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCTTAAA:1 + chrX 6283683 3' + P-element 2857 1 44.44 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGAGGCGGGAAAATCAATGGGAGTATTAAAGTATCTCAAGGAACGCATCTGCGAGATGATCTTCAAGG:1 + chr3L 11882901 3' + Transpac 5220 2 71.00 CAATAGCAATGGTGTGTGTGTGTTTATGCACAAAGTCAATTCTTTTTGCACAGCCAAACACTCAAAGCCAACGCAAAGCCAAGCGAATGAAACAGAGATTC:1 - chrX 11981285 3' - G3 51 1 60.40 GAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGTAGATGGGTTTAGAAGTCTGGTGTTTATTTTGTTCTCGGTGTGTTTTATGGCTT:1 + chr3L 22390740 3' - G5 4644 1 59.34 AGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTGATGTGATTAAGCATGCGGCTTCCAGAGAGATAAGCGCAGCGCAAGTTCTTACGACAGCAGCTGTTATGCTGTCAACG:1 + chr3R 1839455 3' + INE-1 156 1 70.30 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTCTTTTGATTTATTAACACTGAACTACTTACCATTTTAAACCAATGGGGAAAGGAA:1 - chr3R 23701759 3' + mdg1 346 2 59.41 TCATGCATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGATACTGAGCAGACGCCCACAACACCAAGATGGAAAA:1 - chr3R 31763426 3' + Tirant 361 2 63.37 GCCGAGCCTCTTTTCGGTACCGCGGGTTGAGCAGCCTTTTTTATACACGTTATTGTTAATAAACAGACATTACAAAGCAGATAATGAACGACAAGTAGGAG:1 + chr2L 20962779 3' + R1A1-element 4924 1 72.28 GGATCGAATATTGTTATCCATAGGCTCTAGTTAGTATTTTTGAGAAGTCAGGGCAGTACTACCTTGTCGCAGTTCTTCTAAAAATGTAAATGTAAAGCTAA:1 - chrX 17494623 3' + aurora-element 4052 1 58.42 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAGCACCACCCAACCTCCCCCACCCACTTAGCGGGCTTTA:1 - chr2L 10635230 3' + roo 393 1 61.39 TTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACGGAGTAACCTTTCCGTTTGTTCGTG:1 + chr3L 22321581 3' - S-element 393 1 75.25 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCAGATGCGAGCAGTAGTTTTGTTTTAATTGTTTGTAAGCGAAATATTTCGAATATTATATTT:1 + chr2L 11576470 3' + roo 395 1 65.35 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCTGCAGGTCAACGCTGCGGCAC:1 - chr3L 15099872 3' + Tirant 366 2 60.40 ACACTAGAATAACAAATTGCGTAACGGCCATATATTGGTTTTGCACTATGCAGCCGCTTTTTTTGTGCGGCGATTTTTAATATTTCAAATAACTTAACCAT:1 + chrX 22718603 3' - 1360 3383 2 62.38 ATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGCATATTGTCTTTTCTAAAGTCTTTTGTAAGAATTTTATAAATTGATCTAATTTCGGAAAGGG:1 + chr3L 8942041 3' + 412 32 2 65.35 TGTGTATAAAGGTATACGAGACCAAGTGGTTGCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAATTTTATCTAGTTATCATGAAGAAGTTTTTGAAAAACT:1 + chr3L 12789386 3' - G5 4759 1 71.58 TAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGTCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTTTGGTCCGCAACAAAGTTAAGTTAA:1 - chr3R 12064947 3' - Ivk 5322 1 60.40 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAATCCTTCGATTGCAAAATACACAGTGCAGACAAATAGTTTAAACTGTCTTAGTGGTAATCAAAAT:1 + chr2L 15020371 3' + jockey 4986 1 62.38 AAATTCCTTTTTTCCGACCCCAGCTTCATTTGGCTGATTAAGACGACCTCATTAAAAACATTGAACGAAAAAGAGTTGAAGATACCCTACTTTGAATTAAA:1 - chr3R 30276762 3' - FB 14 1 60.40 AATGCCCCGTAAGAGGGTCAGTCGAAATGCGCACGTGTGTTTATTTAGGTTTAAATTGTCAACAATGTCACATTGTTTGGCACTAATTTGGCCGCA:1 - chr3R 9859964 3' - baggins 5131 1 68.75 CACCAGAAGTCATTTAAATGTGAGCGCAAATCGCTTGGCCAATCTCCTTGCAGTTCCACAGTATTTCGATCTCAATCTGTACACCACCAATCGTCAAGAGA:1 + chr2L 6952721 3' - hopper 286 1 64.36 TCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACAGGCAGGTTTATATATCCCGAGAATGCCACTTTACCTCCACGACATACATATCTATAAATATGTGCACGA:1 - chr2L 20419745 3' - R1A1-element 331 1 74.26 GAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAGTCCAACGTATACATATATACGAATTTATTCAAAGAACATGGTTAGAAAAT:1 - chr3L 3484962 3' + diver 6086 2 52.48 TTATTNTTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATA:1 + chr3L 22052854 3' - mdg1 14 2 65.35 AGTTGTACAGGATGCATGGGCAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAGGACCTGGTACCCCTTGTTCGCAGCGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAA:1 + chr3R 31887772 3' + HB 1233 1 53.47 AGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGCCTTCTCCAGCCGGAAGATCTCCTCCTGGAGCAGGTG:1 - chr3L 5706526 3' - hobo 2623 1 61.05 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCTAGAAATAACAAAAACTTACCCTGAAAAATATGG:1 - chr2R 11257839 3' + pogo 2085 1 60.40 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAA:1 - chr3L 18957625 3' + copia 5082 2 73.27 TTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTGCCGGCTTCTATTTCCTGCCCGACAACTCACATTTCATTCCATTGGACGAGGGA:1 - chr2R 16224602 3' + R2-element 230 1 57.00 AATACCCTGGCTTTTAATTTGTATCATTATCGAAGGTATTCAAGTTGTCGATCATGTCTAGTGTGATCTTTTTCACGTTTCTGCTCTGCTTTCGTTTCATG:1 - chr2L 3889012 3' - TAHRE 391 1 76.24 GGAAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGAATTCGGTAGTGTTGGTGATTCTGCGCGACGCTCGGTTTTGGACCCTTTACACTCTCATTATGTT:1 + chr3L 23854258 3' - I-element 5001 1 53.12 ACGTTTGCGATTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACATCAACTACTCTTCCAATCTTACAGTACACGAGTTACATGTTCAAGTATCTAAGTTTTATTCAAGC:1 - chr3L 15100775 3' + jockey2 17 1 70.30 CGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCG:1 + chrX 22386795 3' - hobo 52 1 64.36 CGCCCGCCAAGGAGGCTCAATAGAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAGAAAAATATTGCATACTTTTCAGCTT:1 - chrX 17262309 3' + X-element 4473 1 93.07 TGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCCCTCCAGCTTCACAGCCACTTGCAGCGCCTGCAAGGTGGGGATTAGTCAAGGTGTTA:1 + chr3R 13669704 3' + R2-element 3379 1 61.39 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGTAGCCACGGCCATAAATGATGTTGCGGTGCACTCGGGTGACACTCAAATCCAA:1 + chr2L 18662396 3' - hopper 21 1 58.42 TGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTCTGATCAATTTTCCCCGTTTTATATTTGCAGCGGACGCAAGCGTTTCGTTTCGGAGGGCGACGGCGGCC:1 - chrX 13746811 3' + P-element 251 1 72.28 CACACACACACATACATAACCACAATTCAACAATGATGCAACATTTCAACAATACTTCATACATTGGATATCCAACTGATAAATTGCAAACAAAACAAACA:1 + chrX 10004956 3' + Quasimodo 42 2 75.25 TGTTGTTTATTTTTTTCTATTTTTTATTGAATGAATTATTTATGAAGGGCGTTAGAGTGTTCGTTGTATCTACGTTTTTGTTTTTTTGTATCTTCACAGTC:1 - chr3R 9220377 3' - gypsy7 5011 1 58.42 GGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACTATCAGTACGGCTTAGGGTTCACAAATTTTCTATGAATTCGAT:1 - chr2L 13020160 3' + F-element 470 1 57.43 TTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTCCCGCTTTTTGTACTTTTA:1 - chr2L 7843804 3' - 412 320 2 81.19 CTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCATTTGCCGTTTGTTTTCTGCTTTCTGGCCCAGTTCAGTTCGGTTCGGTTC:1 - chr2L 4285391 3' + R2-element 3244 1 56.44 GATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGCCTCGCTCAAGAGTTGGTCTAGATTT:1 + chr2R 16754191 3' - R1A1-element 5106 1 74.26 TTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCGTGGGGTGCTGGGGGA:1 + chr3L 13619049 3' - accord 181 2 92.50 TTTGGATGTCCTTATATGGTTTTCCTTCCTTTCCTAGCTTAAGAATTAATATTCTTTCTCCTCGGAGCAGCGCAGTCCAAGGAAACCACGCAAATTCTCTG:1 + chrX 5902591 3' - HB 417 1 69.31 GCTGCGTGAGGTCCGATCGGGTTGTCAGCACAAGAAGTCAACTAGTTGGTACTCAGCTTAAAAGTCCTTCATCGCCTTGGCGACAACCGAAAGCCCGTTTT:1 - chr2L 15585654 3' + invader4 2881 2 74.26 TGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAACTTTGCTGGCAAAACTTTTGGCGT:1 - chr3R 27457534 3' - G2 98 1 75.25 AGTCTNCCAGTGGGTGACTTATTCTCGAGGATCATATAACAACCACCTACTCGGACAAATGGAACGAATTCAGCATTTAAGATCTAAATGTAATTTATGCC:1 - chr3L 6263304 3' - Idefix 169 2 61.39 AGTAGATTCAATAGTACAAGCACATTCTCAAGTTTCCGCAGCTGAACTCCACACTTATTATGATTATTTGCGGTGAAATTTTGCGGGGTTCTTATTGGATA:1 - chr3L 6839805 3' - Transib5 499 1 60.40 AACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACATCATGCGCTTAGAGGCCCAGCAAACTCCACAAACCCCACAACCTATAAACA:1 + chrX 14537194 3' + I-element 5006 1 54.46 AAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATGCCAGCAACACACACAGGCGCCATAGTATG:1 - chr3L 72981 3' + Quasimodo 227 2 70.30 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGATCAATACTGTACAGGTGAAACAACACCCAATAGAGGAAGAAACTATGAAGA:1 - chr2L 16334257 3' + pogo 2063 1 58.42 TTTCCTTAAAAACAAAAGTTAAGTTCGAACTTTAAGGCACTTAAAAACGACGGGTGCCCAATAATAATTTAGTATTCGATAAATAAGAGTTTATAATTTTT:1 - chr2L 5348955 3' + pogo 2026 1 88.12 CTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTAGACGTCAACAGCGATTTATTTCCCAGGCAACTTAA:1 + chrX 7383913 3' - Doc3-element 4523 1 65.35 AAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCACACGTATGCTCATGCATTGTGCATTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAC:1 + chr2R 4675996 3' - 1360 223 1 46.00 TGATGCATTGGAGCCAGGGTAGATCCACACTTTTCATATTCGTGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATATTG:1 + chr3R 15363962 3' + gtwin 200 2 75.25 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAAACTAAAACATTTAAATTAAGGTGCTTTCATTTTATTGAC:1 - chr3L 11610365 3' - 412 7090 2 62.38 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAAGCAAATTACCAGA:1 + chr3L 12707847 3' - jockey 4767 1 68.32 TGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGCTTGGGCTTCTGCTGGTTTAGATTGTACTCGGCATTGTTCGGGTTGATGGTATAGTT:1 - chr3R 19759793 3' + R1A1-element 4976 1 60.40 TCGAGCACCCTTACCTTCAACTAACTCGAAAAACAAGCTTTTTTCTCGCGCTCTCTCTAGTACTGTCGCACCAAAGACCCTCTAGTGTCTTTGGTCGCACC:1 + chr3L 25118793 3' + Doc 323 1 46.53 AAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGACTCGACTTAGTTTATGGCCGAGAGCTGAAATTAAACAGGAAGGCGGGAATCGTTTACGTTGGAAAATGCAAATG:1 + chrX 10342827 3' + micropia 392 2 77.23 AAGGAATTCCTAGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCAACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACAAGCCACGAATGAAGCTGGGCTTTCGGATGAAAGGATCGAGG:1 - chr2R 20065268 3' - invader4 2775 2 58.42 GTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTAGCGTCGTTCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGCTAAGGAAACTTTTCAACTTCCGGCCA:1 - chr2R 20902954 3' - Ivk 5107 1 55.45 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGC:1 + chrX 9256952 3' - 3S18 5812 2 67.33 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGGTTTCATGAATGCATTAGCAAGGTACAAATCTTCGGAGGATAACACCATCTCAT:1 + chr2R 10029493 3' + roo 387 2 58.42 GGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTGTGCTAGTACGGAATTTCAACATTTTGTTAGAATACCGATAA:1 - chr3L 23261989 3' - Cr1a 3989 1 53.49 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATT:1 - chr3R 23618148 3' + hopper 1381 1 62.50 GTACATATTAGGGTAGTTTTTAGCGCACTCCTAGCCCCACTGTGCACTGGCGACTTCTCGGTCGTCATGGTCG:1 - chr3R 13843688 3' - 1360 3137 1 76.71 GCGAGTGGAAGGAGATAGTGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCTTGCCTCCGTGGTCCTGATTGCTCCTTGACCCCGACGACGAGTC:1 - chr2L 22407412 3' + gypsy8 398 1 79.21 CTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAGTCCAACGTATACATATATACGAATTTATTCAAAGAACATGG:1 - chr3L 3484971 3' + diver 189 2 58.42 CATTAGAGTATTCAGCTTGCGTCGTGTGAAAAATTAAGTGTCAACATTATTTATTTTTTAAGTGTGCATTCAATAAGAAAATGTCATCGCGAAGGTAAATC:1 + chrX 2094404 3' + 1360 411 1 67.33 ATAAAGATTATTATTATTATTGCTATAATAATTTATAGTATTGGTTTATCTTGGCTCTTGCAGCGATTCATTTCGTGAGTTAAGCTTTTGGCCACATTTTT:1 - chr3R 19255389 3' - mdg1 7074 2 33.66 AAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTCGTCGTTTCCACAGATGGCTTGACAACCTCCTTTACATGAGAAAATCCAAAACGGA:1 - chrX 16604309 3' + hobo 260 1 58.42 CAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCTGTTGGTGTCATAAAATGTTTTGTGGCCCAGA:1 + chr2L 20496695 3' + hobo 104 1 68.32 TCCTAAGACCATGGATACGGTAGCAGGCCGATGGAACCCGTCATCCGCCACCCTGATGGCCGTTACCCAGCTGGTAATCGAGGGCACCCAGCCGCATGCGC:1 + chr2L 4308132 3' - GATE 8057 1 54.46 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATAGTTCAATAATCTTATAATCTGTAAAGCACCCAACCCATAATGGCAAATCCCCAAGAAACATTA:1 + chr3R 17448112 3' - Transpac 4929 2 45.54 TGGTGCATTTGACATTTAAAATACGTACGTGAAATTTCAAGTAAATATGCAAAACTTCACTGTTTTATGTCCTTGCAGCTGTCCAGTTTGCCGGCCAGGGG:1 + chr3L 14695797 3' - transib3 2788 1 59.41 ATTTCACTAAATGAAATTAAAAAATATTATGATCCCCACACCATTACACCACCTGCACAAGTGTGATGACGGCTTAAAAAACAATCTTCCTTTCTTATATC:1 - chr3R 4943910 3' + Tc3 1352 1 68.32 AAACATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTTGGGATGCGATCGGGTGTCGGTTGTCTTGAAGTAGGTTAGTGGCACAAATCGCGCTGTCTGTTGACTGCTGC:1 + chr3L 8006020 3' - Tc1 1433 1 56.44 ATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGTCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTTTGGTCCGCAACAAAGTTAAGT:1 - chr3R 12064950 3' - Ivk 5325 1 57.43 CTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCACAAACACCAGATGCCGCCGAGCTTTTATCACCTTTTTTGGCCGAA:1 + chr3L 13213920 3' + F-element 493 1 59.41 AGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAAGGGCAGGGGATTCCGCAGGCGCACAGTCACTTCACTAAGATCATTTTGCACCCACTGGAAAGC:1 + chr2L 20653478 3' + Stalker2 7427 2 73.00 AATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATCCATTGAATCCCACGGGAAGTCCCACCAACGAACCATCGGAGCCAACCGAAGA:1 + chr3L 11975299 3' + F-element 4403 1 57.58 TGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGGAAAATACCTTATCTGCTTAACTCTTTTCTTCTTCTTCTGGC:1 + chr3L 19941558 3' + 1360 276 1 61.46 CCCTGNTAGGCCTCTAAGGAGAGAAAAAGGGGCGACTGAGGGACAGGCGTAGGGCATAGAGACGCATTAGAGTGCAATAGTTCAGTGAATGGCGGG:1 + chrX 18194787 3' + BS 4902 1 81.25 ACAGCTGGGTTCAGAAATATAGAACTAGGGAATGCAGTAACCCACAGGTTAACACAATGATTGCAAGACTGGATTCTCTGGTAGCCGCCATGTGGAAAGG:1 + chr3L 18679548 3' + HB 5 1 72.00 TTCATCACCAAGAATGACCAAAACAAGCGTTTCCCTTTCTCATTCTCATTCATACACACACACACACGCACACTGTGAAAAGGGCGGGCAGGAAAAGAAAA:1 - chr2R 21254434 3' - invader5 234 2 64.36 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGCCGCATTTAATTTTTAAATGAGGGACTTTCTTTCAGCCGCACGAGAAA:1 + chr2L 2645274 3' + mdg1 394 2 51.49 CTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCACACCCCCTTTTCCACCCCGCCGTGT:1 - chr2R 15906725 3' + gypsy5 33 2 80.20 ACACACACACACACACATAGTCGTAGGGAAAAGAGAAAGCAGCACACACATACAGAGCACAAAGACATCGTATAAGGTATTAAGAGGCCAGTTGGATTTGT:1 - chr2L 12921801 3' + accord 7031 2 59.41 AAGCGTCGTAAAACATATTTTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGTTGACAGTTAAAAGAGAAGTGTTCCTCTCTGAATTTTCGGCCTCCAAGTACTC:1 - chr2L 15149051 3' + Gypsy6A_LTR 219 1 77.23 CGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGGAAGACTTCACAAAAAGATGTGGACAAACTGGTCTACAAAATGGTGTGTACAAGGTGTGTTTTGAA:1 + chr3L 4129271 3' - 3S18 189 2 73.27 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGCGCAGCAACTCGAACTCAAACACAACAGGCGCGAGCGAG:1 + chrX 19848515 3' - P-element 12 1 67.00 TTCCCNCCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCGAAGAGATTCTCGCGGGACTCCAACTCCGCACGTGAGCGACGCCCAAACATAATC:1 - 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chr3L 5511449 3' - F-element 71 1 56.44 CGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACTCTGTCGGATACCGAACCGGGAAGACGAACAACTGGCCCGGGATGCGGACAACTGCC:1 + chr3L 11983366 3' + Tirant 8108 2 76.29 ATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACGGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTTTCTGCTCAGCACAGAAAATGGATATACATTTAATTGC:1 - chr3L 16942495 3' - 1360 172 1 62.38 ACATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTCTGGCTGTACGTTCTGTTCTCCATGGTATCATTGACCCTTTCGCTGCTG:1 - chrX 2256437 3' + Tirant 8028 1 54.46 GCTGCACGTCACGCATCTGGGCTCCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCATAGCAGCCATCAACCTGAATGCCTACGAGGGCCACCGAAAGTGCGTAGTCTC:1 + chr3L 21913322 3' + G5 4459 1 54.46 AGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATGTGTGATACCGCACAACGAAGTTCTAGCTTTTTGTTGCAGTGCAGCTCTTCATCGACTATGTTCTGTTCGTT:1 + chr2R 18891153 3' - opus 110 2 74.26 ATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTTGAACACTTTGCAATTGCGATTGATTTAAGC:1 - chr2R 11759279 3' - I-element 301 1 69.31 CTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTCCAAAGAGTACGAAGTAAATGATTAAAGGTGATTAAAGATATTACTTGCCGCTTTTTT:1 - chr3R 21046014 3' - FB 218 1 59.41 CAGGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAGTGCGGCGTCAGCATGTTCGAATAGTAAGCCAGCTCAATAAAGCTTTCCACTGA:1 - chr3R 27931744 3' - Doc 380 1 65.00 AGGCTCTCTTAATAAAAGCCATATTAGGTCCAACACTGATCTACGCCTAACTCAATATACATTCGACAAATCTCCAAATAAAAGTGCTTAATTTTATAGAA:1 - chr3L 15160874 3' + G5A 2393 1 60.40 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCAATTTCTAAAATCTATTTTAAATCCGTTAAAAGTTTTGTAAAGTTAAAAATCTTCAATGCAGAACCAATTGA:1 - chr2L 8640784 3' - roo 3 2 73.27 TCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGTTGCGTTTGCCGTTTGGCTG:1 + chr3L 11696454 3' - blood 7011 1 70.42 GCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCAATTTTGGGCTCTGAGCCATTTGACAAATAAGACTTTTCATGTCGACATCATCGCGTTGTGGCAGG:1 + chr3R 26805604 3' + flea 4550 1 72.16 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGCCTCTTTATTCCACTGACTTATTCGCTG:1 + chr3L 21908971 3' + roo 391 2 61.39 ACGTTATTATTATTTGAAAATAGATATCGAAAATAATTGTTCCATTTTTCAAGTGCATCGGGCTACTTCTGGAAAAATCCGACAATAAGCTGGAGAAAGGG:1 - chrX 7772502 3' + 1360 313 1 78.22 GGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAGGCTTTAAAATTATAATAGTCAGAGCGCTTATCTCGCATGCCGCATCGCGAACTGCT:1 + chr3R 17339128 3' + 1360 2983 1 71.72 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTGGCCACCAC:1 - chr3R 22352790 3' + 412 454 2 61.39 AACGANTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATTTGTTTTCCACTTGCCGCTCGACACCAGTGAAATTAACACC:1 + chr3L 19510829 3' + roo 397 1 67.33 GATACCCGTTACTCTGCTTGTGCGATTGCGAACGCGAAATTTTATAATTATTCTGGGATATCGACAGATAGTGTGGAATGCATTAATGCACTGCTGCTGCT:1 - chr3L 22841748 3' - INE-1 541 1 76.24 AAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAGCAAAAAAAAATTGGAAGTAATAATGATGAGAGAAAACCACGAACATGATTATGAGTAAGAGTT:1 - chrX 10148655 3' + R2-element 3406 1 72.28 ATTATTTTGTATTTTATTTTTATAGACGCAGATCTCCATCGATGTGGCAAAAAACTTGCATCGCTGCACATCAGGCTAAAATAATTCAATAAAAGTTTGTT:1 + chr3R 7663627 3' - rover 6829 1 74.26 GTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTAAAGTTTTCAATCCATGTGCATCAGGCACTTGCACTTGATA:1 - chr2L 7281335 3' - F-element 4429 1 64.00 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTCCTCCGACCTGCCACTTTT:1 - chr2R 14121038 3' - I-element 3 1 75.25 ATCGAATCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATTTACGTTATATAGTCGAAATGAGGACCAGACGATTCTTCAGAACAATGGAAACACCTTTCTATCAA:1 + chr2R 20534698 3' - INE-1 95 1 51.49 CGTTAATTAAGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCTCATGTCGCTGTCCATGCGCGAGACACTAAACCCAAAAGATAGCAAAGAGGTATTGGCATGTTGAATTAG:1 + chr2L 2352240 3' - Quasimodo 429 2 56.44 TACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAATGTGTTTTGGCACCTTGCCCTCCTCCGGCAGATTCTTGGACTT:1 - chr3R 15412368 3' - INE-1 118 1 56.44 TGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGGTGTGTGTGCCTGTGTGTGTTTCGAGGGTTTTCGAGCTGCATTCGCTCCTGGAAGCACACTCGAAATGCTCGAGTGCCT:1 + chr3R 18960784 3' + Stalker 447 1 70.30 CTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGTTTCTTTTGTTTTCCTTCTTGTATTTCGTATATAAA:1 + chr3L 1344003 3' + 17.6 7202 2 64.36 TGAATATCAAATTTTTGACTTTTTTAGATCATTTGAACATTTGTTCTTGATAACGTGTTGCCTGTTGATTTTGATGTTGGGGGTTTGCTGCAGTAAAGCGA:1 + chr4 803172 3' + Tc1-2 260 1 58.42 AATAANCAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATTATTTTTTTTCCGAGTGTCCTTAAGCGGCGGCACCGATGTGCACCGACTGACA:1 - chr3L 3480823 3' + Idefix 302 2 56.44 GAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGATACTCCCACCACGGGCACGACTACGCCAACGAGAATGGCATTGAGAACAGCACCCCGAACCAGA:1 + chr3R 27766440 3' - R1A1-element 5112 1 53.47 AATAAATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCAGATCATACGCGAACGTTTGCCGGATTAT:1 + chr2R 14582925 3' - roo 8669 2 73.00 TAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTAGGTACCAGTCGTATTTGTGATTAGTTGCCTTCTCCTATGCCTAAGAGAAATCTTGAC:1 + chr3L 12598085 3' - Stalker2 9 2 67.78 ACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATTCACCATATCTCTCCGATCTCGTAGGACATGGTTCCGTTTAGATAAACCCCTCAGCCTAATATGCATA:1 + chrX 17356958 3' + I-element 5100 1 73.27 CGTTCGTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTTGCTATATATTTCTCTCAATTTTGTTCTAGTTTCATCGCAAAGTTCGACTGCCAATAATAATGA:1 - chr3L 5290620 3' - flea 4846 1 66.34 TGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGTATTGAATCATGTTGGAATATTATTCACGGTACTTGAAATTGGCGAAACAATTATTCGT:1 - chr3R 21339948 3' + jockey 4705 1 64.36 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTTATCTTTTATATTTTCCCAAACTTGTTGCACTGAA:1 - chr2L 6605564 3' - blood 38 2 69.31 CATTGGGCGGACGTGAAAAAAGAAGGTTTCTGAAGCCAAACCCAATAATAACGATGATATCCCTGGTCCGGAGCTCGGAAAAGGAACCGGAGCAGATGGAG:1 + chr2L 3313481 3' + Tc1 1172 1 57.43 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTGTTATATGATTAAAACATTTTTATTGACTT:1 + chr3L 18076315 3' - roo 46 2 72.28 CGACTATTGATCCTGATCAAGAATATATATATGAAGAGTAGAGTTGGACGTCGATGATTAGATCACCGGGGCGTGCAACATGTGCTTAGATAGTGCTAATC:1 - chr3L 12339746 3' - INE-1 88 1 54.46 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATTTCCATCTATTAGCCTTTATCAGTTGCCT:1 + chrX 14521302 3' - jockey 4721 1 68.32 GCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATATATTACATACAAATATTACTGGACAATTCATGTGCTTTCATTGTTTCTTA:1 - chr2L 8967006 3' - Burdock 6156 2 59.41 GAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGGGACTGCTACTTCTGCTTGGCAGTTTTATTTCCATTTGCGAATTT:1 + chr3L 16197142 3' - 1731 4541 1 55.45 AAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTTGGCTTGTACAACCACGGTAAATTTGAAATAAA:1 - chr3L 20895651 3' + invader3 181 2 67.00 TAAAACAAATGTTTTTTTTTTTCACATCTTTTTGCAGCTCGGTGACCTCTTCGCGACGATAGCGCATATTGGCCTCAACCAGATTGAAGTG:1 + chrX 8105526 3' - HMS-Beagle2 498 1 63.74 TCATGAACACACACACACACACACACACAGACAGGCGGGGG:1 - chrX 6147638 3' + accord 7025 2 73.17 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGC:1 - chr3R 14832402 3' - blood 7044 2 55.45 AAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCCGGATGCTCAGCCACTCCTCCTTCTGCCTCGC:1 + chr2R 8802773 3' + F-element 365 1 69.31 AATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACGAAATTTCTTTGGCACAAATTTCGAGACACAGTAAT:1 - chr3R 4691867 3' - roo 8771 2 64.36 CTTTANCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCAAGAGATTGGTACATAAGCTGGCGGACTGGAAACTGGGAACCGAGGATGGAGGAC:1 + chrX 7556802 3' - mdg1 468 1 59.41 TTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCCTGTACATCCTGTGAAAAATATTGCTTGACATTAA:1 + chr3L 14216691 3' - I-element 398 1 65.35 CGTTAGGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTGGACAAGGGGGATGCGTGCCACTTTCTTGCCGGGCATCTTG:1 - chrX 1563167 3' - 297 6643 2 57.43 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTATCACA:2 - chr3L 3254955 3' - 1360 16 1 64.36 CGCGGGTAGGAGCGGGAGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAATGCCAATGCAATGCCGAAATTCGAAAGTTATTACGCTTAATTTATGGGTCAAAT:1 + chr3R 9897701 3' + invader1 128 2 63.37 ATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACTC:1 + chr2L 20935283 3' - INE-1 545 1 49.50 ACTAGCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGACTATAGCAATCGGTGTTTTTGCTTTTATTGCAATGTTAATACCGTCGGGAGGGGATTCCATTTTATGCCACAT:1 - chr2R 21463930 3' + INE-1 542 1 65.35 GGTATATTTTGTCAAATCTACAATGAGACGTGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTATCGGCTGTCATCCTGCCGGGTCGGGTCGTCC:1 + chr3R 16552168 3' - 1360 204 1 69.66 GCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCCACACGGACAACTTTACGGATCAGGTGAGCCAGCAAGCAGG:1 - chr2R 22004691 3' + blood 160 2 58.42 TGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAAC:1 - chr3R 1047969 3' + Stalker2 7623 2 50.50 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTTA:1 + chr4 868749 3' + roo 405 1 75.25 TCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTGATTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATGTAATTC:1 - chr3R 23020831 3' + INE-1 561 1 47.52 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCG:1 + chrX 1523749 3' - jockey 57 1 74.26 GCTCAAAATCTCGGAGCAGACTTTGTGTTGTTGGCCAAAATAACCCAGTTTCTCTAACTCTTCGACCTAACGCAAAGAGTAGCGGTACTGTTCAATAAAGT:1 + chr3L 24870873 3' + G3 393 1 64.36 CCTTCATGCATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGACCATCCCTTGGACGTTTTCGTTGACAATTTTCTAATCCAATTGATTTGTGCT:1 - 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chr3L 2980501 3' + R1A1-element 5020 1 55.45 TGGCTCAACGAGAATGTTCAATTAAAACAATTGGTATTTTACGGCCAAGTGACGGCAGCTTGGGGGCGCATCAATAACGAGTGCTTGTCACCCGGTGAGCC:1 - chr2R 23285488 3' - gtwin 7238 2 57.43 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCTGTAGTGGTGCGGTATGACATGGCATATTTATGACACTGGTAATTAAATTTAATTGTTGCACTTCTCCGCC:1 - chr3R 27901137 3' - accord 185 3 81.19 ACTATTCGGATAAGATTCTAGTCTGTGCCGACGTTTCCACTCGCTGATATCATTAGAGCAAATTGATGAGCGCGCTGCCAAACAGCTGAGGCCACGCAAAA:1 + chr3L 5681412 3' - jockey2 3095 1 75.25 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAGACCAACGCA:1 - chr3L 21908897 3' - roo 41 2 65.35 TTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTAGTTCCTTGTTTCCTCGTTTTTATCACTCAATTATAT:1 + chr2L 7647820 3' - I-element 453 1 66.34 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATT:1 + chr3L 19510789 3' + roo 356 2 75.25 CGCTTNACTTCCCCAGGCTCTGACTACGAGGAGTTCCAATGTCCGTATTGCCGAACCCTAAGTAACGCTATAATACCGGTAACCGAAACGCTGCCCGCTTT:1 - 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X-element 38 1 48.51 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGCGCAGCAACTCGAACTCAAACA:1 + chrX 19848498 3' - P-element 30 1 49.50 GAATGTTCTTCCGCATATCAAGTCGCTACGTGATCGGCTGAAACCTGCTAGATTATGTTAATAGGATACTAGCGATAATATCAGATAATATTCCTAATGCA:1 - chr3R 14063197 3' + R1-2 2935 1 69.31 CCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATATATATAAATATTGTATGATCCCCACCTGCTGTGCCAGATCCGTGAAGCAGTGTTTCT:1 - chrX 21370843 3' + Stalker2 7263 2 52.48 GGGCAATCCGCAAACACAATTACACCGGTGTTTCGCCAGCAACAGTTCAAGTCGAATGGTAACTATGGACGGCCGCGTAAACCCTTTTATAGATGGCACCC:1 + chr3L 6131006 3' + Gypsy12A_LTR 1969 1 60.40 CAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGAATCACATTCGTAGTTTATGCTGATGGCGGTGCTACCGGAAGCTAT:1 - chr3L 278659 3' - Doc 338 1 63.41 GTAGAAGAAGGTTTTTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAAAATGTGTGACAAAAACGTGGAACATGTCGCAGA:1 + chr2R 14782567 3' - F-element 330 1 64.36 GGGATTCCGGGGCGCAGAAGATTGTTATTTATGTAGAGAGGAACTTATCCTCGGAAACTTTTCCA:1 - chr3R 31210045 3' - Gypsy6A_LTR 309 1 73.85 AATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACGTGGTGTAATTTTAAGTGTTACTTTTAATTTGTTTCACCCGGCGCTTGGGTTTGTGCT:1 - chr3R 26491178 3' - 1360 2998 1 60.40 CAACAGACATTAACATCCGCAGCCACGACGAGATCTCCTGGCAAAACGGAACGCACCACAAAATTGCTCAAATTCAGCCAGACATTAACGTGTTTTCAAAT:1 - chr3L 22411956 3' + Quasimodo 7027 2 81.19 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCATAAATTAGTCAATTAGTTGATGAACGTTA:1 + chr2L 15997952 3' + 412 470 2 55.45 TTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACAAAATCCCTATTCAAATCGCTCCCTCCATAAACCTAGTAC:1 + chr3R 16122404 3' - accord2 7298 1 69.31 AAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTG:1 + chr4 311376 3' + 1360 252 1 63.37 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTATTTTCTCTCCGCATCTTTAGTTTGGCGGATTTATTTATAT:1 + chr2R 18920877 3' - Tirant 48 2 59.41 GTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCGTTTCTGTTGGTGCAAGTGTGTTTTGGAATTTTGCCCGTGAC:1 - chr3L 17950607 3' + 1360 3359 1 73.27 TGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGTGTGTTCGAGTGTGTGTCTCTAAACTGGCGTCTAAATGAGGGGATGAGGGGATGCTTGGATGTCGGAATATGCTG:1 - 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chrX 17437618 3' - Porto1 264 1 63.37 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATACTGAGTGCAATTATCCGCAGGACCAAAGGCAAACTTAATGTGCCAATGATGTATTTACATCGCTTAATACG:1 + chr2R 13124499 3' + mdg1 7456 2 75.25 AACTACTGGCTTATACTATTTCAAACACAGACACGCACTCTCGCACAAACACACACACACACTCGAGTGGCGGCGTTTAAAAATAAATTTGAATATGACCA:1 - chr3R 8357724 3' - Doc2-element 186 1 76.24 TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTATGGATGCTCATAATCATATTGGGCTCCTCGAAGGGAGTACCTCTTTTGGCGATTTACAAAAG:1 + chr2L 11165415 3' + transib2 2810 1 63.00 CAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGAATTCATTCAATTGAATTCAAATGGCCGGGCAGACCTCGAAAAACC:1 - chr2L 14673740 3' + Stalker2 282 2 69.70 GCGAAATGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGAACAAGCTTGTAGTGGGCGTGGTCCTGCCACTATCCTGCCCACCTGTCCACCTGGAAAACT:1 - chrX 20021133 3' - G6 78 1 68.32 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGGGGAAAAGTCGGCGCCATTGGCCACGTCAATTGAATGGTAGGCGGAAAGCCGAAAGTGTTGGCCATAAGTCAGAAA:1 - chr3R 29323508 3' - jockey 4777 1 73.27 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGCCTGTTTATAGGTTTCTCCGCAATTTGAATGTGG:1 - chr2L 17004709 3' + roo 400 1 70.30 CGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGGGGAGTGCTTAATTACATTTACACATGAAGGCCGTATTTACAAGAGCGGCCAGTGAATGGATGCAGTGGAGGG:1 + chr3L 20858901 3' - F-element 4465 1 80.41 CAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAGAGTACAGAACAAAACAAAAGGGGAGAAAAATAAAAAATATATATTTATAA:1 - chr2R 13639953 3' + mdg3 158 2 52.81 CTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGTTTAATGGCTTTTCGATACGCTCAAGTGGGGTTCCCCAATGTTCTCATCCACTCCC:1 - chr3L 19807680 3' + roo 409 1 38.27 TCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTTTCGCAAGTGATTTCCATCCGAGAGCGATTGTGTGTTTGGATCCGTGCAGTGGAGCGCATTCCCCCGAAAAC:1 - chr3L 4721646 3' - 1360 87 1 79.17 GATCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAATCGTATTCGTGGTCGATTCTCACCCTTAGTTCAGAACCGACCCGAATACGATTTCAGATGTAA:1 - chr4 713159 3' + INE-1 530 1 54.46 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCAATTTTTAGTGATTACTCCAAG:1 - chr2R 11540215 3' - Transpac 4970 2 76.24 CCGCAGACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCGC:1 + chr3L 22324087 3' - hobo 42 1 59.41 ATACGATTATGCTTTCTTGAATGGTGAAGTCTGTCCGACTTGTAAATTTTATTCCTAGATTCTGCTGCCACATGTAGTCCACTACAAAGTTCCTGGAAATT:1 + chr4 964680 3' + hopper2 247 1 68.32 TTGCGGAAAAATCAAGATAAGTACGGCTTTAAATCGGCGAGTGGGCACGGCACTTGAAAAGGGCCTTGCCGATGGGTACGACGGACAAGGGGGATATCTTC:1 + chr3L 22750315 3' + Max-element 364 1 72.28 CAAAAGGAGGGAGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAATCATAATGTCGTAGCTAATGTTGATTTACATTTAATG:1 + chr3L 11907717 3' + mdg1 7025 2 62.38 TATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACT:1 + chr2L 20935282 3' - INE-1 546 1 50.50 TTTTTTTTTTGCTGTTTTTTTGCTTGTTTTTTGGTTCTTGGCAAAATCCCGGTCGATAAATTCGATTTGCTT:1 - chr3R 29842237 3' - gypsy7 5006 2 86.11 GAAATNGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCTAAGACTAAGTTATACC:1 - chrX 17949352 3' + mdg3 5051 1 81.19 TTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAATTAATTTAGTGCTCAGTTCAGTAGGTGACACCATT:1 - chr3R 18518006 3' + R1A1-element 9 1 76.24 AATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTAAGTTGGCTGGTTGTCGGTGGGCATGCAGGGCGAATT:1 + chr3L 20584471 3' - I-element 236 1 63.37 ACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTTATATGTATGTATGTACATATGTGTGTACTTAGCTTTTGTTG:1 - chr3L 5662986 3' - HMS-Beagle2 332 2 38.61 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGGAACTCACAAGCGCAGCAACTCGAACTCAAACACAACAGGCGCGAGCGA:1 + chrX 19848514 3' + P-element 2876 1 65.31 CCATGCCAATAGGTATCACAAGGGGATCAACCACCTGTCTCTGCTAAGAGTGCTGGCTAATCGCATTTGGCCTGCTTACCCTCTGTCACACTTTTTCACCC:1 - chr2R 16563162 3' + baggins 6 1 60.40 GAGCGTCGGATCCGCTCATATTTTTGTTTTTTTATATATTTTTTTTTTGTATCTGTTTGATTTTGCCTGTCTCTTGTTTATTTTGGTAAATTTCTCTCTTT:1 - chr3L 15185937 3' - Porto1 208 1 76.24 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAACAAGGTT:1 + chrX 697525 3' + roo 395 1 63.83 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGATATGTGGTAGAATTTTCTTGTTGTATTCT:1 + chrX 5178444 3' - hobo 45 1 68.32 AAGCGAACACCAGACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCTGTCTGAGTCGTCATTGAAGGGCTCATCCACTGACTGGGTGAAAT:1 + chrX 19019107 3' - GATE 8423 2 55.45 TTTGCGTGGCCGCTGTGAGTCTTTGTTATCTATAAGAATCATTTTAAGGTCGTTCAGTTAAATGCAGTGAAATTATTCTTTCACTGCGGTCGTCCATTGAA:1 + chr2R 19040133 3' + Gypsy6A_LTR 114 1 58.42 CCTGCNATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACGCATGTTACCTGCTTACCCGAGGACTTGAATTCGAATTTGAACTGGTACCTGTA:1 + chrX 14985507 3' + mariner2 698 1 58.42 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGAT:1 + chr2R 8463622 3' - I-element 34 1 59.55 TTTTATTTCGCGCTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTAGGTGAAGATGTCTCAACTTATTCATACTCTCGTTATGGTGCTCTGAATCA:1 - chr3L 7903473 3' + 1731 215 1 59.41 AACATTAAATGCATGCATTCATAATTAGAAGGCTTTGTTACTCGCTCAAAATCATTATCAAAAATTAGTTGAAAGTGATATCGTCTCAATTCAAATTCCTT:1 + chr2L 89632 3' - 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hobo 28 1 62.38 CGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTCTGGAGCGTGCACGGAATGAAGACGGCCTGCCTCAGTTCGCTGCGCTTCTCGTTGTATCGCTGGCTCAGT:1 - chrX 19858923 3' + Max-element 8124 1 56.00 CGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGCAATCCAAGAGGAAGACAGACATAACTCATTATAGTGCTGGCCAGGAACTCAAAACGGAAGTGTTCAAATAT:2 + chr2R 4582399 3' - Doc 401 1 78.22 TACTTCCACCAGCAAAGTTAAATCTCCTCCCACGACACGGCCATTCAGAAGCGTCTGAATAAATGGCGCTAACCACCGTGGCGGAAATAATGCAAATG:1 - chr3R 15240558 3' + HeT-A 6059 2 47.96 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTGTACATATTGCTGAATTTATTGTGTTTATGATATGTTCAGTT:1 - chrX 19337717 3' + blood 7354 2 63.37 GTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCTTTGTGCGCCGATCAAAGAAGGGCAGGGGCATCGTGAGATTGGGATTTGCCGACGATTTCTCTTTTTG:1 + chrX 1567348 3' + Cr1a 202 1 75.25 TCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCTGCTAAGCGGTTCTAAGGTTGATCGCTCGTACGCCATGTGATATTTGCTTATATAT:1 + chr2R 9304639 3' + F-element 4407 1 60.40 AAAATTCTGGCATTTATACAGAGCATTGGACATCAGGGGGATCTTTTAGTCATGAAGGGCGGTATTGACTACTTTATCGACATTATGCCTGCTCTGCATA:1 + chr3L 8119730 3' + baggins 5338 1 57.00 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGT:1 + chr2R 4536695 3' + mdg1 7444 2 64.36 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCAAACCTTTTTTATTACGGGATCTGATGGTACATTTTAGTTAAAATGAATATTTTTAACTGC:2 - chr3L 22564802 3' - blood 15 2 64.36 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATTGCGTTGAGATAAATGCATCATTT:1 - chr3R 9833018 3' - Tabor 6847 2 69.31 AATGCAAACAAAAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGAATCATCTTGAGCAACAGCATTTATTACACTGGTTGACAAGAAACCCGTTTTTAAACGTGTAACCA:1 - chr2L 5797415 3' - 1360 285 1 67.33 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACGTTTTTTTTTCTGCTGTCCTTGTTCCAATTATGTGAATTATGTCGTTAGTTTATTTGATTCCTTCTACTAAACTTGTTA:1 + chrX 16528393 3' + roo 407 1 70.30 AGGGTGTGGCACAGATCCCACTTCTGATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGCCACAAGCTGCTGGGAAAATTCCAGCATCTGCTCAATCCGCGCCAGGTTTTC:1 + chrX 9019733 3' - micropia 482 1 56.44 TGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTGGTAGCTTCTTGCGGCTTTTTGTTGGCTTTGTGTGCTTTATTGTTATCCCATGA:1 + chr2L 20131163 3' + 412 10 2 60.40 TACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATTCCTATCGTTTTCCACAAACATTTCTTGCAACAGAGACAAATACTGAA:1 - chr3R 14388728 3' + TAHRE 10428 2 50.50 TACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGTCCATATTTTTATTTCTTATAAAAACCTATTTTTGTA:1 - chr3L 13336182 3' - roo 8786 2 63.37 AGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGCGCAAGTTGCCACAAAACTGTCAGAAATTCAATGCGCGTTGCCGCGGCAAACATAATTT:1 + chr2L 9038421 3' + INE-1 175 1 52.48 TAGAGCCGAGTGTCCGCGTGCCGTGTGGAAAACAAAGGCGAAGCAAATTGCTTAAATGTTTAGTTCACTTTAGCCAGCCAGGCAGCATTTCGTAAATTTTT:1 + chr3L 13912266 3' - rooA 7122 1 71.29 AGCGGNTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCACTGGGCTTGAAATAGTTTTCCCACCGCAGTTTGTTACTGTAACTGGT:1 - chr3L 4410115 3' + hobo 84 1 58.42 TGATTATTCTGAACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAAAGGGATTTACTGGCAGTTGGGGCAGCAAAGGGTTAAGGTAGTGGCCACACACAG:1 - chr2R 14113203 3' - Porto1 4338 1 64.36 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTG:1 - chr2L 6177179 3' - pogo 40 1 73.20 ACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAACCAATTTAATCGAGAATGTAGAGTGTAGAGTGTTAATTCGAGGAAATTCTTTCGTGAGTTT:1 - chr2R 21094233 3' + G4 75 1 58.42 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAATATCTTGTATTCGAAATGATTTATT:1 - chr3L 4987419 3' - I-element 51 1 82.18 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCA:1 - chr2L 16691159 3' - pogo 28 1 55.45 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGCTGCACGCT:1 + chrX 3485721 3' + P-element 2870 1 58.42 AGCTGAGTAACGGGTATGTGATAGTTGCGAAGAGTTGATAAGAAGAGGCGAGAATTATTGCCACTCTAATCGTTCTCTCCCGCACATAGCCACCGATTTTC:1 + chr2L 22761603 3' + INE-1 545 1 57.43 ATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGGGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGCCCACTGGTTCTACGACAGACCCGTGCAACA:1 + chr3R 29145386 3' + HMS-Beagle2 94 2 74.26 GAGTCCGAAGTGTTTTCAAAGAAAACCCGATTACGAGACCTTGATTTCTAGATATTTTTTGTTTTAATTTTACTGCCGTTTTGGTGATATTAATAGAGTTG:1 + chr3L 10363698 3' - gypsy10 447 1 58.42 AACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACAATTGGGCCGCAAGAGAATTCGGAAATCGAGA:1 + chr3L 11731756 3' + X-element 25 1 68.32 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTATAAATGTTC:1 - chr2R 18891034 3' + opus 482 2 54.55 GTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTTCCTCCTCCCCTTGCCCTCCCACATT:1 + chr2R 19148346 3' - flea 4951 1 74.26 AAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAACAATTTAATGACCATAAATTGTGCAGCCCTCGTAAAACATGCGACTATTGCAGCAGGATGGCCGCCTGTTCGCG:1 - chr3L 8998533 3' + blood 166 2 73.27 TTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGACATATCTAACTTCAGTGCGCCA:1 - chr3R 28156356 3' - I-element 4914 1 78.22 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCTTGCCTCC:1 - chr2L 22407448 3' + roo 9063 1 66.32 CCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGATCACGAACTGCATCTCGTGCAGCACAAGTAAGATCAGAATTTGTG:1 + chr2L 16894940 3' + Quasimodo 293 2 59.60 GTGGCAATGCCATCAACAGCAATATTGAAATTATGCACAAATCCAATGAAGATGAACGACAAGAACAAATGCGCACTAAACAACTAAAGAAAAAAAACCAA:1 - chr2R 12090090 3' + F-element 4287 1 76.24 AGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTACCGAGGTATCGGAGGACAGGCGGACCAAAAG:1 - chr3R 18568686 3' - F-element 370 1 69.31 TTGGTCGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAAGTGCCCGTTAACCCAGACTCCCTTCCTGAGCCATGCGTCTATGTTCTGCCC:1 - chr3L 197915 3' + Rt1a 4835 1 59.41 TTAAAATAAGGAGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGTTGACTAATATGCCAATGTGATAGGGGAAATGGTTACGAACGAGAT:1 - chr3L 23324402 3' - Cr1a 4130 1 63.37 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTA:1 - chr2L 18112515 3' + transib2 2785 1 64.36 GATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACATCTTCAGTTGAGTTCCTTGCTTCAGCTTTTATGTTTCTTTTGCTTAGAGTTTGACTT:1 - chrX 9480606 3' - F-element 4387 1 55.45 ATCCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTAAACAAAACCGTGAGTGCAGGCAAACAGAATGAAGAAAACTCGCTCTCGC:1 + chr3R 27555026 3' + Bica 156 1 57.43 ATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACTCAATTAGCTAAACAAAATAATTCAAAATTGTCTTG:1 - chr2L 8626813 3' + I-element 5063 1 67.33 CATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACACCAACACTTTCTCCGAAGAAACCCAGTTGTGAAAAGAGGGCCATTATACCCAGCACATGAAAGAT:1 + chr3R 30124699 3' + Ivk 5041 1 66.34 CATTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATATAATGACTGAAGACCTTCGTCAACGCCCTTCAGAAGGACTACAATTTTAAGGTGGAGCACCTGGAGAGCGCCT:1 - chr3L 16786352 3' + Chimpo 450 1 67.33 AGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCTCAGCGAACGTAATGCAGATGGACAGGAAGGCTTTTACTATGTTTTTATCTTTTGTAATTGAGGAAAAATGA:1 + chrX 14987368 3' - baggins 5194 1 75.00 CGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTTGGATTGTATCTTGTGGATTGGATATTGTGGTAAGGTTGAGTTTCATTTGGTATCTCGGGTAGAAGTCAA:1 + chr3L 748874 3' - Ivk 4994 1 73.27 GCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATAAAAACCATTTCGGGTTCGGATGGACAATAAAAACACAGACTCAAATTGTTTGACAATTAAAAAGGGA:1 - chr2R 6585640 3' - BS 5050 1 66.34 CAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCTTCAGCAAATCGAATGTTTTATTTCCCTATACAAGTATATAAGTTT:1 + chr3R 7157110 3' - F-element 4581 1 55.45 TGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTAGGGTTGAGAAACGCTGCCTATGACGCCATGGTCCATGAATCAACTCAGATTTGTGCAAGTATTCATAGTATT:1 - chrX 16282733 3' - baggins 5341 1 74.26 AGCCCTGTTAATGCGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTCCTTTTTTTTGTTTTTGGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26093269 3' - gypsy2 497 1 79.45 GATTATCATATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAATGCGATCTGAATGAGTGTACATCCCTGCAAATTGCCGTGGAATGATTAGCGGACCTCGGGATGTAAT:1 + chr3L 20667056 3' - INE-1 549 1 60.40 TTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAGACCAATAATAATGCCCATTAGCT:1 - chr2R 8158730 3' - Juan 16 1 71.29 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATT:1 - chr3L 21840293 3' - 1360 49 1 75.25 GCAACAGCTGATTTCTTTGTTGTGGTCAATTATGAATGCATGGATTCTTCGTAATTGAAACGAGTTTGCCACAAGTGAACATGTTTTTTGTATTTTTTTTT:1 + chr3R 13857904 3' + Transib-N1_DM 354 1 60.40 CACTAAATCTTTTTATGATCTTTTAAAGGTGAAGTGTTAAACAGCTCCAGATGAAAGGTAAGCTCATGTTCTACATGTTCAATGTATGTCTTTGAAACGTA:1 - chrX 15929937 3' + transib2 136 1 64.36 TTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAATTAAACCGCACACAACTGCGAGCGGCAAAATGCACGTCGATGATGCCGATCGAGC:1 + chrX 13925898 3' + copia 386 1 55.45 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTGAGTGTGAGTGTGTTTGGAAGTTGGG:1 + chrX 14424112 3' - hobo 17 1 57.43 GAAGCCGTCACCGTTATGTAATTTTATTGAATCGTGTTTACCCTTATGTCGACTCGGGTTTTGTTTGTGTTTTCCTTTACTCATTTTTATTACCCGCCCCT:1 - chr2R 22525746 3' - jockey 143 1 50.50 TCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCAACTCTATATAGCTAATAAAACACGGCAAAGATACAAATACGGCAGTATTATCTATTCGAATCTTACTATTGGGA:1 + chrX 19891242 3' + R2-element 100 1 75.25 AACAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCTCATCAAAAGAACAGAAAGTAGATCCAGAGCAGGAACAGCAGTCCACACCACAGCGTCC:1 + chr3R 12681274 3' - invader1 106 2 59.41 CTGACGTGAATGGTTATTAATATAATACAAAACTATGTACGAAATCTCATAAAAGCGCGCAGCTCGAATTAAAAACGTTTTCTATTCCGTGGAAAGCGAA:1 - chr3L 14205752 3' + Doc2-element 67 1 74.00 AGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATTTCCCCTATTTTCGATCCGTTGGCCGCCCCTTTTGCCATGCCCCGCTGAG:1 - chrX 16501404 3' + R1A1-element 5210 1 51.49 ACTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGTACGCAGCCATCGATGTGAGTGTCTGCACCTGCGGCTGCAGTGGCTCCATGCGGTAGCCCACC:1 + chr3L 1770577 3' + R1A1-element 79 1 69.31 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTTTTCACTCTTCTTTTGAAGACAGTGGCATTAAAAAAATGTCGTCATGCTTGTATTAATACAATGCTTATTAAT:1 - chrX 12958859 3' - roo 8665 2 65.35 ATTCACACTAGCCGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGGGGAATTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTGTATATTGCAATCAATTTTTCAATAGTGAGTTAAG:1 - chrX 15574603 3' + INE-1 536 1 80.20 GGACTTGGTGGACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAATAACGAACTTGTTAAGAAGGAATATTCAACTTACTTAAAATCACAATAAT:1 - chr3R 11815778 3' + Tc1 1282 1 54.46 TATACGCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGTTTGAAATATTTCGGCATCTAACGGCGTTTTAAAGAGCCCAAACGAATATGC:1 + chrX 13021001 3' + hobo 2661 1 58.42 GTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCGAGATGATCCAAGTGCTGGAGCGTACCGAT:1 - chr3R 18389153 3' - diver 5782 1 77.23 ATTAAATTATTAAATTATTAATCTGATTAAAGAGCTATGAGTCATTTATTTTTTTCATTGAATCACTTCAGGAAAGTAGTTATTTGTGGTAATTATGCACT:1 - chr3R 15638160 3' + Porto1 4551 1 88.12 AAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGTCATTACAATTATTATTACATATTAACATTGGTAGCATT:1 + chr3R 13824415 3' + roo 9036 1 63.37 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGTTCATTGGACGCCCGAGCCAATCGAGAGACAAA:1 - chr2L 20084873 3' - 412 7096 2 65.35 CATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATCGTATCGGTATCGTTCGTTCTACTTGGAGTGGGAATGG:1 + chrX 14205283 3' + Stalker2 423 1 70.30 CGCTACCACTACCAACGCACTCGTGCGTGCGTGTTATCGGTATCAACAGTTACATTCGGCTAAAGTTTCGGCCATTTCGATCTAGAGTAAAGTATCTAG:1 - chr3R 9650143 3' + G-element 157 1 67.68 TTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAGTGTCGCGAGAATGCTTCGCTCTAAACGGCGATACAGGAAGAGCATGAGCTCGATCTCCTGA:1 + chrX 6958524 3' + G-element 61 1 55.45 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGC:1 - chr2L 796779 3' - jockey 61 1 79.21 GTTTTTTCCATAATTAAAAATAAACTCAAAGTTTGTACTCATATATACACTTTAATATAGATAGATATAGATGCGTTTTGGTGAACGAAGGCAGCGCACAA:1 - chr2L 12495214 3' - transib4 259 1 57.43 CTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACAATATCTTATTGTTTTATTCTTTATAAGATTGGGCTATTATTTTGCATCCATCATTCGGCACATAATATAAC:1 + chr3R 22457601 3' - Chimpo 178 1 66.34 AGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTAGTTAATACATAATAAGCTAACGTACAATCTG:1 + chr3R 22460625 3' - accord2 7600 2 75.25 AGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGTCACAAGAATTTC:1 - chr3R 9193563 3' + roo 406 1 76.84 GACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCGAGCTAGCATTACATATATACATACTCACGCAAGAAATGCCTTCATCCAGATCATATT:1 - chrX 16555932 3' + diver2 484 1 67.33 CTTTTGGGACACCGGATGTGACACTGAGAATAGAAGACAAAGAATTGTGAGAACATCGAGAAGAATTTCAGTTGAGGAAATCATAAGGGGAAACATACTAA:1 + chr2L 5076617 3' - Q-element 475 2 59.41 CAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATTGTAGTGAAACCGAGGCAAAACAGTCAAGGCAGCGCTGCAAAGCGAAGCAAACCGT:1 + chr3R 18090720 3' - R1A1-element 5210 1 61.63 TTACGGTGCGTCCTCTTTGTGCATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGCATTAATTACGGTTCATCCTGACCGCCCTTTAAGCGCCGATTTTCAGTTGCAC:1 + chrX 10020601 3' - gypsy8 4897 2 77.00 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCGACGGCCTGACGGACTATTGACGAGTTGATATTATTAATTGAATTTTTTTTTTTCAATATTCAAT:1 + chr2R 4727316 3' - Doc 44 1 35.64 CAAGGCAATGATTGTTGAGTGTTTGTGTCGTCCAGCATGTCGACAAGGGACACATAGTCATTGAGACAGATGGAGGAAAATTTCTCGACTGACAG:1 + chr3L 11809573 3' + 1360 448 1 80.00 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATTATGGTGATGATGATGATGATGATGCATTCGAATTTCGAATTGGCCAGGCCAGTTTTACTTTGCCTCGTTGT:1 - chr3R 14282727 3' + P-element 2875 1 66.34 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCGAATTTCCAGTCAGCTTGCCTATAAATAC:1 - chrX 6283613 3' - P-element 19 1 60.40 GAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAAATTGTTTTCGTGAAGCTCCTGCATGAACTCTTCTAGGCCTTTGTTTGGGTCGCCGG:1 - chr2L 13254588 3' + Circe 7409 2 77.23 AGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACGTACAAGAAGGAAAAAAAGAATAAAAAGAGTGGTATTCCCTCACAATATGTTTTATGGATTAAAAAATTACAT:1 - chr3L 10075353 3' - copia 5018 2 78.22 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGGCGGCCGAAAACTCAATTGTGACCACTGTCAGCGCCACG:1 + chr2R 5322094 3' + 1360 3379 2 69.31 CGTCCNCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCTCGACAGCCGTAGATGCATTCACCACGTTTGGCCACCCAGTTCGTCTCATAAACGATAGAGG:1 + chr2R 3287867 3' + Idefix 198 1 57.43 GCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCT:1 - chr3R 26331668 3' - G-element 58 1 77.23 TATTGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTCGCTTGGTAATAAAGCCGATTTCGCGCCATATATTGTTCATTGCTTAATAGGCTTAAAACTTGA:1 - chr3R 11088415 3' - R2-element 3253 1 63.37 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACCCTCTATCTGCTCTGTCTG:1 - chr3L 13326669 3' - transib2 17 1 60.82 ACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAATATTCTTCTCATAAAGACTGTATTGGGTGTCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTA:1 + chr3R 10736128 3' - invader4 2779 2 50.50 CGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCTCCCAGTGGATGTGGCTCTAATTAAACCGAGGGCAAAGAAGCACTCATAGCCCAAGTACTCATTTTCT:1 - chr2L 5655643 3' + F-element 210 1 70.30 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCACATAAATTAT:1 - chr3R 11005444 3' + roo 390 2 55.45 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACATACATATGTATGGGTGGGCACCCATACAGTGACAGTGAGAAATGTGCCGACGGTC:1 - chr3R 11731152 3' + hopper 1399 1 59.41 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCAT:1 - chr4 868643 3' - roo 8687 2 56.44 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCTGTTGC:1 - chr2R 12750079 3' - P-element 35 1 28.99 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTATTTGAGAATGCTGTATTTCTTGC:1 - chr2L 11240904 3' + roo 9022 2 75.25 GATCAGGATCAATGGCCGAGTCGATTTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGCTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCG:1 + chr3L 23747151 3' + INE-1 92 1 62.38 ATAATAATAATATTAATGAAAAAGCTATAGCTGATGGAACTGAATGAACTATTTGGTCCTTTGAGGCGGATTAATGAACTTGGGCTTAGCCAGTAGCTTTA:1 + chr3R 13671887 3' + mdg1 7079 2 82.18 TAAGCCTTACCATTTATTTTTGTTTTTCTCTGTGTGGTTAAGTTTTTCCGTGGGCTGGGAAATCCTGCCAGCGTTTCCTTCGTATTTATTTCGGCAGCTGC:1 - chr2L 10828076 3' - jockey 4646 1 57.43 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAACTAACATAACTTGCCCAGTAAAAAACAAAATTGAA:1 - chr2L 9346177 3' + Transpac 5191 2 64.00 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGATATGTGGTAGAATTTTCTTGTTGTATTCTTTTATTCCTTGGACCTC:1 + chrX 5178461 3' - hobo 28 1 51.49 TGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTGGGTGTTCCCGGGA:1 - chrX 17049515 3' - Stalker2 7248 1 79.21 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCC:1 - chr2L 16691153 3' - pogo 22 1 59.41 GAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTTTGTCGATCTAATGCGGCGCTGATGGCTGCCTCCATACCAGCGAATTGGTCCTGTT:1 + chr3L 25334387 3' - Quasimodo 7209 2 58.42 GAACCAAATCTATTACATCTATAACTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAA:1 - chr2R 6438344 3' + Stalker 382 4 54.00 TAGCCCAAAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTTATATAACCCGCAGGAATCAGCCCCCCAACCCTTGGGCCA:1 - chrX 13559574 3' + F-element 329 1 58.42 GATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGCTTTCACTGCCGAACGTCCTTACAACATTGTTTATTAGCCACTGTTCCATGAGCAGTCTTGTCAAAGAGGTGTA:1 - chr2R 18095288 3' - F-element 4392 1 62.38 ATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCAATGTTCTGAGAGGCAGATGGTGAACGCCAGCAACAATGAGTCCAACAAATGTTTCGCGATCC:1 - chr3R 1268784 3' - X-element 4503 1 69.31 TGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGTGATTCCATATGAAAGTACAATGTGTATATCATTATTTGATATTGTTACTGGGTTC:1 + chrX 2637949 3' - I-element 190 1 60.40 TTAGTATACGCTCTCCCCTAAGACTAGAATATAAGGTCTTACTCTACAACTCTCATCCAAAAACGTTCGAAGTCACAGAAGAAAAATGCTAGAAGACAAAA:1 - chr3R 24764333 3' + Fw2 3480 1 54.46 TTTCAAATTTTAAGTTAAATTTAAGTTAAGTTATAATGATGTATAATTTCATATAAATATGAACATATGAACATATATGACATAGTGCATTCCGCATGTAC:1 - chr2L 19625987 3' - 1360 3048 1 48.51 TTTTTTTTTTATTTTTTTTTGTTTGTTTGCGTCTGCCTGCCGTCTGGCCACAAAACATCATTTCATAATGATAAACACTTTGTGTGGGAGGACACCTTGCC:1 - chr2R 19212458 3' - G2 3076 2 50.50 AAATATCCATGGCTTCCCATGACAGCGACAGTCCACAGTTGTGCATTATGCCGCGAGGCAAGCGAAGTAAAGCAGGATAAGGGAGAGCAGGTCAAGCTGGA:1 - chr2L 16346704 3' - hopper2 390 1 65.35 CAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTTTTGTGCTGCATTTCGCAGGCGTTTGAAATGGCACACGAACTGAAAAATGGTGGGAAAAGTGAGG:1 + chr3R 10611186 3' + copia 275 1 72.28 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTATATATGTCGCCTAATTTGTAATCGTTTGTTCAGGGATGACAGAAATGTACAC:2 - chr3R 28623886 3' - roo 22 2 53.47 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGG:1 - chr2R 10697059 3' - 297 6634 2 80.20 TTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCTACACTGTGTGTGGGTAAATTCGGAATAACCGTATATCCGAATTTACCC:1 - chr3R 11378555 3' - R2-element 3572 1 63.00 CCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCTACCAAGGGCAACTGATTGACAA:1 + chr3R 6359451 3' + P-element 274 1 31.68 AATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTAT:1 - chr3R 10736028 3' + invader4 3069 2 64.36 TCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTAAATAAATATATATGAACTGGGCTCAAGCTGAGGCCGAGCAGACTATAATTAGTACGTAAGCTTGGTT:1 + chr2L 17998389 3' - jockey 4531 1 53.47 TGTTACATTATTATTATTGTTTATTTAAGCTATCTATTTTTTCAGCAGTACTGAAAAAACTATTCAACTCTAAGCTGGCAGACGTAATGCGGACATCA:1 - chr2L 18042725 3' - invader3 5044 1 55.10 GGACACAAGCACTTAACAAACATTGCTTTATTATTTTTTTACACGTCGCAAAGGAACCCTCTCCATACTCCACATTCGGATGGTGTCCCCCTTTTCCCGCC:1 - chrX 12118066 3' - 1360 456 1 62.38 AGATANCGACTTGATTTTTTTTATGTTTATAATTAAGATTTAAATAGAATTTCGGATTTTGTTTATTTTTTTCTTTCTGAAGAGTGGAGACAAAAGCCAAC:1 - chrX 8496884 3' - transib4 2588 1 69.31 AATAAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCCCCATTCAAAGCAAATGACTTGGTGGGCGGGTTCAGGATGGGCGTTGGAGTGGTGCGGCATGGCTCCTA:1 - chr2L 6885017 3' + micropia 105 1 71.29 GCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGATGTTTGCCCGGAGAGTTGGAGCTGAAGCTGGAGATGGAGATGGAGATGATGAGCACAAGGATGTGCGAGGATG:1 + chrX 18557441 3' - Doc 4510 1 79.21 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCA:1 + chr2L 15997923 3' + 412 441 2 79.21 CCGTATAAACTTCGAGATCTCAGGAACTACATAAGCTAGAAAGATTAGGCACGCAGATTTCAGAGACGTAGACGAAGTAAATTTCTATCGAACTTTTTTTT:1 - chr3R 24826087 3' + INE-1 135 1 86.14 CGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATA:1 - chr3R 10736037 3' + invader4 3060 2 58.42 TTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGTTTGTTTAGTTGACCGCAGTCAAAAATAGCTTTGAAAAACTTTGGCTGGC:1 - chr2L 19294877 3' - I-element 137 1 57.43 CTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGTCCGAAGCTCCGGCGAAGTTTCAAACAGTTGCTCCCGCAGTTTGTCA:1 + chr3R 8541275 3' + R1A1-element 5170 1 54.46 AGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTAAGATATATGGGCTAGATGACGTTCCCAACAGCCCCGAGAGGCGACAAGCCTCTACAGCCGATCGGAATA:1 + chr3R 6681585 3' - Stalker2 417 1 73.27 TGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGCGGCTCGTTGTGTGTGGGCAATGTGAAGTTCTCGATGTTGAGATGGTAAGTG:1 - chr3R 4878724 3' - F-element 314 1 54.00 CAAAATACAATTTACAAAACTTTTCGACTTTATTCCAAAAAAAAAGGGAATCTGGCCCTGAAAGTGTTTGGCCAAATGCATAACTTATTAGCTGTTGGCTT:1 - chr3R 29362061 3' - transib3 42 1 57.43 TATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGTGCAAAAAAAAACCGAATTCGTTAAAATAACTTGG:1 + chr3L 8768128 3' - Cr1a 80 1 74.26 AAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACAAATTGTAAAATGCTCCCTCTTGCAGCTCTGGACGATGGCCACGCCAAGGAGATGCTCTCCTACGAGCCCT:1 + chr3L 1803818 3' + jockey 4893 1 71.29 ACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTTGGCAAGCGGCTGCAGCTGTGGCATGCCAAAAAGGAAATCGAAAAAGCATACAAAATTAT:1 + chr2L 6985395 3' - flea 131 2 65.66 TACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGTCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTTTGGTCCGCAACAAAGTTAAGTTAATAAAATC:1 - chr3R 12064940 3' - Ivk 5315 1 67.33 CATTTTGCTGAGCTGTTTCCGCCCACAATGTTGCACTATGCTGCGACGAACTAACAGCTCAGCCGTGGAGTTATCGGGCCAACAGGCAGGTGTCCAACACA:1 + chrX 4574487 3' - gypsy5 171 2 69.31 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTCGTGCGCACCACTGACGGTATAACCGTCAGCGCTGCTCTGC:1 - chr3L 25200657 3' + S-element 1682 2 56.44 ATTTGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACAGAAACAATTTCTTCTGCCTCACATGCGGCATCGTAAAATGGCCTTTAAGCTGCTTTCGGTACG:1 - chr3L 16979658 3' + diver2 4880 2 62.38 GGCGTCGACCGACTCGTTCGATGATCCAATTTGCTCTGATTTTCCCTGAGTTTTCATGCCAATTGGCACGGGGCAATGCTTTAAGTTTGCATTTAAAAGCA:1 + chrX 19548417 3' - gypsy7 127 2 41.58 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGCTAAACGATTTTACTTGCATCATTAATTTCATCAGTGTAATTTTCTA:1 - chr3L 10378912 3' - mdg1 31 2 53.47 ACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTGGAGTTCAAGAAGTACTTCGAATAAGCCTGATATTCACGTTTTTATACCC:1 - chr3R 12367917 3' + Quasimodo 49 2 55.45 AGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAACAAGTCACTGTAGTACATTGCATTAGATGTGTGAAAGAGTCTTCCCGGGAAAAGGGAGAGGGGTTCTCG:1 + chr3L 21813142 3' + Doc3-element 4698 1 75.25 ATCTGTTGGAAATTTCGACAAGATCTGAGACAGGAGCAGA:1 - chr3L 16366645 3' + invader2 4804 1 60.00 ATATAGATGGCGCAACAACAAAGAAATCAGCTGTTGCAAGCAGCTGTTGCACGCACAAAAAAAAATTATAGTTAATCGGTTTGGCTGCACCACAGCCCTGA:1 - chrX 22920019 3' - Transib-N1_DM 369 1 54.46 CCCAGACACATATGGGCTTACAAATCCTTTCACATTCGGACTTCTCAAAAATACTAACTAGAACCTCGTCGTCTCGCCCGTCTCCATAGAGACCATCCTTA:1 + chr2R 6883715 3' - aurora-element 4117 1 59.41 AGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGCAAATAAGTGTCAGACGTGTGAAGGGGCCTCCTAATCCGGC:1 - chrX 1525757 3' - jockey 476 1 59.41 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAA:1 - chr3R 9996404 3' - blood 7061 2 71.29 ATCACAATAATAATAACAATAATAGTGGCAGCAAGTACAATTACATGGGTGCGAACGGTTCAGCGCCTGGATGAGATTCTGGCGCTGCTGTGGCT:1 + chrX 7687517 3' + mdg1 20 2 57.89 TATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTTTATCTTAAATAAGACCACTGTGCAGAACTGATTTGGGTTGTAGATAC:1 - chr3R 20844969 3' - Cr1a 464 1 77.23 GTCATCGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGGCACGCGAAGCTTTCGGCTTGATCGGGAGGTCGAAGGCAAAGTGTATGGCTCACGCAC:1 + chr2L 14396481 3' + F-element 80 1 61.39 TCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAAT:1 - chr3R 10736038 3' + invader4 3059 2 59.41 TCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATTCAGTGAAGCCGAAGCCATTTGACTACGAAATTGGTAGAGAAG:1 - chrX 14714252 3' - 17.6 374 2 61.00 CGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTGGCATCGCCATTTACTTGCACC:1 - chr3L 6191278 3' - Quasimodo 328 2 81.19 GGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAAACCAAAATAAATAGAATGGATACAAGTATAAATAAGTGTGAGTAATCACTGCAGTTCAGCG:1 + chr2L 16342530 3' + G5 4786 1 57.43 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCTTTAACTATACATGCATATGTGGGAC:1 + chr3R 17244144 3' - 412 49 2 79.21 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTCCACAGTCCCTGCATCCATTCGGTTTCGTTCACCTGATCCCAAGCTTGAT:1 - chrX 15388055 3' + 412 7507 2 52.48 AGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATAAATCGAAAGTCGAAGGGCGGAGGTCTACCTCCAAGCCCTTGTTTGCCCATCAAGGCGAAC:1 - chr2R 15352296 3' + roo 30 2 60.40 ATCATTTCGAGACCCATTTTAAGCAGCGGCGTCACCATCGCCGTTCCGTGATAAGTTCCATTTCCGCCAGACTATCCGCATCCTCGATGCTCACGCTGAGT:1 + chr3L 5344194 3' + gypsy4 6395 1 59.41 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTGGTCGCTTGGTTGCTTGATTGCCTGATTGATTGCTTTGTTCGGATGTCGGTGGATAGTAGATGGATATAGTGGCTCTA:1 + chr3R 13638961 3' - Burdock 27 2 78.22 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTT:1 + chr2L 5151989 3' - I-element 50 1 74.26 TTAATATATGTTTTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGTGTGTGTGTTTGTTAGGTGTGGTGGGTGTGTCTTGATGGCAACCTGGACCTACT:1 - chrX 8440756 3' + BS4 664 1 63.37 CACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCCAGCGATGATTGAATGAATCTGGACTCCTGGTCATTCTTCGATAATTCCAGAGTCCTTTCCCCACTTCCCATCTT:1 + chr2L 3273942 3' + gypsy5 7345 2 71.29 GATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGAGAGGAGACAAGGACTCCGGCAGGACGAAAAAATGTATTTTATTTCGTGT:1 + chr2L 17101916 3' + R1A1-element 384 1 56.44 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAG:1 - chr3R 25796004 3' - BS 5013 1 57.43 GCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGCGCAGCCGATGCTCGGCCCTTGTGTTTAC:1 + chr3R 13493884 3' - F-element 481 1 63.64 TACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGTCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTT:1 - chr3R 12064971 3' - Ivk 5346 1 61.39 CTGTGTGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTGCTCTTTACATGTGTGTTAACAGTTATGACTTGATTTCTCCGGCCCCAGACACACATGTCCAACGAGACCCACAA:1 - chr3R 8787793 3' + copia 5019 2 46.53 TTATAAAAATAAATAAATAATCCAAAAATCAAAAATGGCTCAAGAACCAGCAATTGTGCCTGGCCAGGATGATTACCCACCTTGATAGGAGTCCTGCTGCT:1 + chr3L 6564726 3' + mariner2 829 1 59.41 TTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAATAATTCGTCTAAATACTTTTCTATCTCGACCCTTTATAATTTTGTATCCCATTTATTTTT:1 + chr3L 17647730 3' - G4 3539 1 58.42 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGCTTTACAGAGCTGTGACTACAAAGTAGCGTTAACAGCCGTTAA:1 - chr3R 22547895 3' - transib2 31 1 62.38 ATTTANAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGATATATTTCTAATTAATAGCTGGCATTGCCTTAGGAATCGTTTATAAATCAACTTTCGGG:1 - chr3L 4388497 3' - 1360 234 1 66.34 GTAAAGAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATGTAATATTATATATAATAATTATG:1 - chr2L 8430375 3' + 17.6 62 1 76.24 CGTCTNCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGTGGAGGTTACACCAACGAGTGTTGCATTTACATGACTAGCTTGATCTT:1 + chr2R 21398862 3' - G6 1853 1 56.44 TCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTGTATTTTTGAAGAAACGCAAATCGTATTGACATTACTATACCAGAACGAATAAAATGCTTTAAAATTTAA:1 - chr2L 16252091 3' - pogo 5 1 36.63 TTAAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTTTAAACTGAATTCTACTAATTCTCAAAATGAAAT:1 - chr2R 6812213 3' + 1360 421 1 55.56 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTAATTTAATTAGGAACTTATCGGCAAGCAAATATTTTAAAAATATTTATCGAAGAAAATGATCTACGATT:1 - chr2L 20128944 3' + 412 487 2 49.50 GATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAACAACATTGTACGCAGGTATATATCTTATCGGGGCCTATGGACGGCTCTAAATTAAAACAGCGT:1 - chr3L 22672003 3' + roo 97 2 63.37 TAACGGCCATAGATTGGTTTTGCATTATGCAGCCACTTTTTTTGATGCCTGCTTGAGCGGAATAGGAGTATGCCATAACCTCCTTGTTGTAGGATCGCGTT:1 - chr3R 4909632 3' - 1360 3362 1 62.38 GAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCACGCCAAGGCAAAAGGATCTCAGATGAGGTGGTGAGATTGGTGG:1 + chr2R 14779301 3' - Doc 499 1 56.44 TATGCTCTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGCCGCTAAGTAAACGTGGGAAT:1 - chr2L 15997870 3' - 412 7081 2 59.41 TACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTCCATTGCACATTTTGGCATTCGACTCGCTTTTCGCCCCTCCTTCCTTTTTGCATCAGT:1 - chr3R 8479012 3' - transib2 2453 1 60.40 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGAATCAGTGCTTAAAATCGATTGTTAAGACTTGGCTA:1 - chr3L 9864588 3' - P-element 40 1 39.60 CAAGCTGAATACTCGAATGACTCTAATGAATTTGACCACTATAGTGCCCACAAACCGCCCAAAACGAGCTGAGCCAAACAAAGCAAACATACATAAGCACA:1 - chrX 11692537 3' - 1360 408 1 65.35 ACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGCCACCGGAGCCACCAGATACAAGGTTTACCGGGCGTGGCGGTCGCGAGTGGGTGGGC:1 + chr3L 21511430 3' - Ivk 319 1 61.39 GCCGTTATGCATCTTGTTATTCTAGTGTCACCGTTCAAGCTACTTACAAAATGCAGGCAAAGTTACACTCGACGCACTCAAATGGTTCTACGTGTGAAAAA:1 + chr2R 20153271 3' + 1360 3377 1 52.48 GGCGCAATTACCAGCCGAGACACTCGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATAGCCTCATAAAAATTCAAGCCACTATGCATTCCAATATTTTCCAAA:1 - chrX 6318190 3' - hobo 363 1 55.00 AAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAA:1 - chr3L 20224128 3' + Chimpo 177 1 70.30 GTTCCGAAGAGACCAAGGAGCTGTACTTCGAAAAGAGGAATCCGGGAATTGGGGAGCAGGAACATGGGACACGAGATTGGGAGTCATCTCCTTCTCGACAT:1 - chr2L 18645391 3' - Doc3-element 4416 1 67.33 AACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACGCGATCATGCCAGCGTTCCATCCCTAAGATTCTCGA:1 + chrX 22959959 3' - 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jockey 37 1 55.45 GAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGGTGCCATCAACACCACTTACTCCAACGGTTGTAAAAACTAACCAAGTCGAAGCTAAGAAAGTAGAATCAATGGAT:1 + chrX 12445345 3' - Cr1a 4364 1 77.23 CAGCCGGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTT:1 - chr3R 22667132 3' + 412 7505 2 62.38 GGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGCCTGTCCCAAGGCGAGGGTTCTCAGCTCCTGGAAATTGATCTC:1 - chr3R 9758867 3' - G-element 4247 1 57.43 TTTTTTTATTTTTTTTTGTTTGTTTGCGTCCACCTGTCACGGATGCTGGTATAAAAGGGGCCGGCACGCGATCACAAAACATCGCAATCTCTAACGATGAA:1 + chr2L 10681974 3' - G2 3077 5 70.30 TCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGC:1 + chrX 1018160 3' - 1360 193 1 76.24 CGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGGTCGTTTTGTACATAGAGAAGAGCAAAGAGGGTCATGTAACGCCAGTCGATGGCGTGCAGATCGTTGA:1 + chr2L 6052615 3' + ZAM 8082 2 76.53 ATATGAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCACACTGCACAGTAAAGCTCGGCTAAATGAA:1 + chr2R 22767447 3' + BS 4979 1 68.32 AATCTCAACTTTCTAGCTTTTAGTTAGATAGTTTCTGAAATCTCGACGTTCATACAGACGGATATGGCCAGAGAATCCGCCTTGGAACTGGAAACTAAATC:1 + chr2R 23967389 3' - INE-1 164 1 70.30 ATTTTTATATATATTATGACAAACTTAACAATGGCAATTGTTAATGGATTGCATAGCTAAGGTACTGCCAAATGCGTGCAGTTTCCTTTTGTTTGCCAAAA:1 + chrX 15599140 3' - Stalker 79 4 62.38 ATACGGGAGTACTCCTTATCTATAGTTCCGATTGGCCATCTCCTTGGCCAGCTCAAGGTCCTGCTGCTCCCGCTCGCGTCTCTCCTCGGCGCTCTCCCAA:1 - chr2L 19053509 3' - Rt1a 4777 1 65.00 CATTGAATTCTGAAAAAAGAAAATTATATACTTACCATTTTTAAGCATATGTAAAACGAACGAAACGAAAGACTTAGGACACGAACTTGGCAGGCAGGAGT:1 - chr3L 20614767 3' + mariner2 872 1 64.36 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAATTAATAACTACAGTTATGGATCGACACAGACTAAAATTTCATTAGCCCCCTTTCATTATCCATC:1 - chr3R 2474281 3' + Juan 4200 1 58.42 CCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACCATACGCCTATTCAAATGAATGAGAATCTAACCTTAAAAGCAAACA:1 - chrX 2351047 3' - Juan 4186 1 54.46 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAACGCATTTTCAAAAGTGGAAACTAATTTTCTGCCGCTTGCAGCT:1 - chr2R 5267265 3' + pogo 2074 1 56.44 GTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAGTTCCTGAGTGTATGTGCTAAGTTATGAA:1 + chr3L 6442162 3' + hobo 417 1 71.29 TCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATGTATGAAGCTGGCAGGCTGCCCGTCGTTGTCGTTGTCCCTTCTGCATTTTGTGCCATCCCGG:1 + chr3L 14588660 3' - F-element 4325 1 66.34 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTCTGAATAAAACTGAAAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATCAAGAC:1 + chrX 22689414 3' + HMS-Beagle 236 2 69.31 AAAAAGAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTGTCTGTGTTTAATTGCGAAAATGTAGCAATCTTTTAGGCGC:1 + chr2L 13482232 3' - hopper 5 2 72.28 TTGGTNAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGTTGTTGAAATATGAGATGTGGGACAATGACTTATAGTCCGCCTATAATCAGATTAGGATTAT:1 - chr4 1061094 3' - HMS-Beagle2 64 2 73.27 TTTTGTCATATTGCTACGAAATCGGACAAAACTCCTCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCAATAACACATTTGGGTAGCGTAACTATTTAAGTAGCAAAACT:1 - chr3R 18512558 3' + 1360 3110 1 61.39 TAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAA:1 - chr3L 5691248 3' - P-element 201 1 35.64 GTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATGTGTCACTATGATGCAAACGTTAAAAAA:1 + chr3R 5090026 3' + McClintock 443 2 72.28 TATTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTGACAAGCCATTTAAGCTGACATTATACTTGGTGCTT:1 - chr3R 9269557 3' - Stalker3T 327 1 64.36 AATAANTAAAATTAATAAAATAATCACGCTTCGCTTGCCAATTGAAGTGAAGTGGGGATGCAGATATCGGGCAAACAGCTCCAGGCAGTTTGGTTCCAGCT:1 + chr3R 16650170 3' + HeT-A 41 1 64.36 TGTGCGAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCTAGAAATAACAAAAACTTACCCTGAAAAATATG:1 - chr2R 11257840 3' + pogo 2084 1 59.41 AGTCGGTAACCCGACCCATGGTGACGGAATCTGGGTCCCGTCGGTAGCAAGGATTTATCTGCAGGCCCTGTAATTGGGCGACCAAGCAGCTGTGGAGCTCC:1 - chr2R 5313778 3' + Rt1b 469 1 57.43 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCTCCTGGGAGACGTCGTTAAAGGCCCTGGAATTCAGGTTTACATACTGGATATTTGGCTGGCGGC:1 + chr2R 20791840 3' + roo 398 1 67.33 TGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCCCTTCCCCCCTTTGAATTTCCCGAGATCTTGGCCA:1 - chrX 6644315 3' + roo 123 2 65.35 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGG:1 + chr2R 18865911 3' + roo 9041 1 57.43 CGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAAAATAACAAATGTCTGGGTATTAAACAAAGAGATTCAGAAAGAAGGAGAGAGCTGTTTTTGTCATTGTC:1 - chr3L 5549927 3' + F-element 17 1 81.19 AAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTCGTTCGTTTAGCGGATATCAATCGAGAAGCGAGTTAGAGAGATAGG:1 + chr3R 18303600 3' + Stalker3T 48 1 50.50 TGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTGGG:1 - chrX 17049526 3' - Stalker2 7248 1 76.67 AATATAAAGTATTTTTTGAAAATATTTCATTTTCCGTGCCAGGCAACTTCT:1 + chr3R 15982567 3' - 1360 378 1 84.31 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGTCGTACTAACTTAACTAATACACACACTCTCACACACA:1 - chrX 5796731 3' + hobo 2901 1 68.32 AAGAGGGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTATTACTCATCTAGTCGGAATACCGAACACGAAATTGCAAATATTTAGCCATATACTTA:1 - chrX 21406623 3' - INE-1 577 1 64.36 GCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACACTCCGGTTTCCTACATTTTTACTACCTCTACTACAGTCACACAAGTGCTCC:1 - chr2R 22468773 3' + Ivk 4989 1 56.44 AAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGC:1 - chr3L 23027558 3' + INE-1 549 1 51.49 CAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGGGGTGGTGGTG:1 + chr3L 15276712 3' - hopper 36 1 65.35 CAAATTCGTCGCATTCAGGCTGCCCAGTACAAAATCGCCAGGATGATTACCGAATGGTACCTGAGGAACACAACCTGCAGGCCATCGAAGAAGTTGTCGCC:1 + chr2R 14775704 3' + BS3 1346 1 77.23 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGGCAAAAGCAGCACACCTTAAATGTCAAGGTTTTATGTAAGCAATTGCCCGC:1 - chr2L 2858002 3' + transib2 2802 1 57.43 CTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACAATACGCTTTTTTTTGCCAGTGTGTTTGAGTGCGGAATTAAATGCTCTAAAATA:1 + chrX 17265921 3' + Copia1_DM 157 1 54.00 AGATTCAATAAATAAGCAAAACTTTGAAACGGAAAACAAAAGTCGTGAATAAATAAAATAATCCTGAAAAGCTTTTTTCCCCTCAGTCCTTTTATAGC:1 - chr2L 6835090 3' + Doc3-element 4709 1 74.49 TACTCTTTAATATTGTACGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCACAGCGTTTAATAAGCTAACTGCCAAAC:1 - chr3R 28603411 3' + diver2 46 2 72.28 GTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCACTAATAACCAGGATGCACGCACACAGTGAGTGAGGGAGACACCAAAAA:1 + chrX 8816674 3' + jockey 4715 1 51.49 AACAAAATGATACTTAATATCTATGTGCTTATATATGTACGTTTGATTTTGGGGGATTCATGGAGGAGTTGGTGGCGACGATGCCTGCTTAGAGCTGCACA:1 - chr2L 3735221 3' - Copia1_DM 4135 1 77.23 GTGTCCAATTGCTGTTGCTGACCGTTCGTAGCGCAGAGCGCTGAACTCCGTTGGGGCGCGTCAGCATTGCTTATATGTTAATACTACTAAGTTAACACACC:1 + chr2L 8984780 3' - gtwin 109 2 77.23 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAATTAAAATTCTATTGTCGATACTGGAAA:1 - chr2R 8557854 3' - hobo 51 1 82.18 TTTGAAAACACTTCGGACTCCCGCGCTGCACAATAATAGCTCCAGTCCCATCACAATTTTCTCCCTCAAGTCCGGCA:1 - chr3R 25203971 3' + gypsy10 449 1 59.74 CTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACCATCGCACTGGAGGACGGCAAAGTCTGAAAGTCTTAGAAGATAACAACAATCTTA:1 + chr3R 21194860 3' - FB 102 1 39.29 AGATTTATTACGCTCTCAGCGTAAGGACAGAGGGCAATTTTAGCCAGACCAAACAATTATTCAAACCCATTCAATTGAAAACGATAACCACTCGCGCTCCT:1 - chrX 14975794 3' + 1360 3285 1 59.41 TTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCAACTTCCGCCGGCAAATGTATAATTCTATGCCGGTGCACTGA:1 - chr2L 14143993 3' + accord2 7269 1 58.42 ATGTTCGTATGAACGTCGAGATCTTAGAAACGATATAACCGCAGAGACATCGCAGCCACGGCCACGGAGGTTGAGGTTGAATCCGAATCTCTGGATCTCTG:1 + chr3R 16032295 3' + INE-1 131 1 73.27 GTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGGTTGGAACTCCTGATACCAGCCGGTACCGGTCTGTTTTCCGATGTCTGCCCGCCTGTCGATGGGCAACA:1 - 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Quasimodo 7121 2 84.16 TCTTGACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCAATGTTAGGTTTAAGTTAGTCTTAATTTACAAGTGCACTGAATCAAGTGCCTCAAATTGCCAGGCTTT:1 - chr2L 2939325 3' + Max-element 139 2 66.00 AAAACAAAAACATAATTATTTTTGTTATCGTTATCCATTTTTTTATAATCGTTTAAAATTAAGATAAATGTTAATACAGAATCAAATTCACTTCTTAACGT:1 - chr2L 21806170 3' + gypsy11 3940 1 60.40 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTGTAGCAT:1 - chrX 3697114 3' + jockey 4966 1 54.46 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGATGGCCCAAAAGAGCGCAAGAGAACCGCTAAGAGCGCATTTGCGATTGGCAAGCCGGTAAAAA:1 + chr2R 11115878 3' + hobo 2928 1 62.38 TGGAGAAGATGGACTGGCAGGCCCCCCAGCGCAACCACAAGATCCTCCCCCAGTTTCCGCTGTACAACATTTCGTATT:1 - chr2R 9436579 3' + G6 314 1 58.97 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAGAAAGCGAAAAATAGTTGGCAAAAGAACATG:1 - chr3R 8480418 3' + transib2 2783 1 66.34 CATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCGTATGGATGTGGGGCAACATTTTGTTGTTGCT:1 + chr3R 17716570 3' + R1A1-element 4973 1 68.32 CTTAANCTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAG:1 - chr3L 12072542 3' + HB 1602 1 48.51 CGGGTGCTACCTGCCACGCACATCGCGAGTACTTACAAACACACACTATAAATCTGCACGTGCAGACAAGCACCCCGTTGTGCTCTCTTTGGGGTTCATTT:1 - chr2L 20293690 3' + hobo 61 1 81.19 TGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGCAAGCTTACATCTGTCGCTTCAGTAATCTGCAGTAATCTAAATAGTTATAATTAACTGAATATTTG:1 - chr3R 28012492 3' + diver 212 1 64.36 CATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTGGGACCTCCCGAACACCAAA:1 + chr3L 26852109 3' + diver 204 1 58.42 GAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATACTTTGCTCTCCAATAAACATACAAACGCACTTACCCAGTGTTTGTACATAGATGT:1 + chr2L 14412472 3' - Max-element 403 1 63.37 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACTTTTTCA:1 + chr3R 25931378 3' - roo 38 2 65.35 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCAACAAAAAACAAAAATACGCAAAAACGAAACGAAAAAGAACTAAATTTGATTGATGGCAAA:1 + chrX 18152548 3' + blood 329 2 71.29 AGTTAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAGTCCGGGCGCAGGAGAGCGGCCTAGCAACAGAGAAGAAGACTACCATGCGAGAGGAGTCAAGGGCGGCCAGGT:1 + chr2R 4997270 3' + gypsy8 4650 1 66.00 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACATGTATAAAATGTAATAATACTTAACACAATTAAATT:1 + chrX 11205370 3' - I-element 44 1 66.00 CACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATATAATGACTGAAGTATCTGATGTTCTGGCGCAACGTTCTTCGATGATGCGTCTACGTTCAG:1 + chrX 18113302 3' + Chimpo 437 1 73.27 AGAATTTTTATTAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTGAATGACCTCCAAAAGAGGAAAAACGCAAGAGAGTGCCGTAGATTTTCCTGCGCCCCCACG:1 - chr3L 18009667 3' + hopper 255 1 66.67 ATGTTGTTTATATATGTGTAGTTGTACTGTTGTTGTTATTCTCATGCGTGCGTGAGCACAATATGTTGCCATTTGTTTGGCTAGGCGGATTAATTGCCAGG:1 - chr3L 9939626 3' + transib2 308 1 71.29 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTTTATATATAGTGAGGTTTTAAGATTTTAAGGAATAT:2 + chr3L 12596629 3' - flea 4794 2 69.31 AGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTGCGCCACACACACGGAATTATAGAAAA:1 - chr2L 11709751 3' - Idefix 7060 2 73.27 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGACGGAGAAAGAGTCATAGAAATTGTTGACATATTTTAATTGGTTGGCTG:1 - chr3L 16150699 3' + P-element 2877 2 63.95 AATAATAATAATAATAAGTATAAATGTTTCCGTATATGAAATATATAAATTACTGAAATACAGACAGTAGATGGAAAGATACTGAAATATCCGTATAGGGT:1 + chr3R 20172113 3' + mdg1 46 2 21.78 GTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATAATTGTTGAGTGCAGTTTCTCGCCAGTTTCACTGCCTTGTCTCTCCCCCTTTC:1 + chrX 2458410 3' + 1360 409 1 59.41 TGATTTAGTAAATGTTTCGTGGGTCACAACCATATCTAGCCACACTGAGGTTTTGACAAACATCGTTTCCTCAACACTTTTGCCTAAAGCTAAATTAAAAT:1 - 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F-element 189 1 79.21 ACAAANTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTCACTAAAAATTACTTTCTACGGCTGACATTGGCAATGGCAATGGG:1 + chr2R 10834989 3' - Transpac 5050 2 61.62 AAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGG:1 - chr3R 26331651 3' - G-element 40 1 60.00 CTCTGTCATCGGTATTAGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTTGTCCTGGACCCCTTGTCGTTTGACATTTAATTTGTTGC:1 - chrX 7374331 3' - Porto1 4491 1 62.38 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCAATTTTTAGTGATTACTCCAAGCTTAAACTTCGTTTTGCTGTGTAAAACTGACCAGCTGTCGAAC:1 - chr2R 11540172 3' - Transpac 8 2 64.36 CGTATGAACGACGAGATCTCGGGCACTATTGTATTCTTACCAGCTGGATAACTAAAATTTAGCATTCATCGTTAATTGCAATGGGA:1 + chr3L 12067534 3' + INE-1 136 1 70.93 AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGAATAATATCTAGTTAAGCTCCACACGATTTGTTAAATATTGT:1 - chrX 10123238 3' + copia 254 1 57.43 ATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGATATAATGGGTTCGCATTAGCATAAGCGTTGTTAAAGACCGAAAATTG:1 + chr3L 7084962 3' - McClintock 6131 2 53.47 CAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGTAATTAATTGGTTATTTGTCTGCCATCATGGCATATCAAATAGAAAAC:1 - chr3R 7016900 3' + flea 4674 1 55.45 CAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGATCTGCACTCAATTCGAAACCCATTTTGTGA:1 + chrX 15679754 3' + X-element 412 1 68.37 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGCACAAAAGCAGAATACTGTAAAGGGTATTTAGCGCTAGGATAAACCATATGTGTTGATCAAATC:1 - chr3R 20321289 3' + jockey 4937 1 69.31 TAAAATGCGCGCCAATCAGTTGGTTGATGTCATAGAGGGGCTACTGAAAAGTTTTTTTGCAAGTGCCGTCGGGAGCGCGTTCAAGAAAAGGAGCAGCTTCG:1 - chr3L 20635648 3' + mariner2 29 1 56.44 GTCGCTTGTGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTTTTTTTCCAGTGCACATCAGCATACCATTTGTTGCCGCTTCATTAGACGCGACCCTTGAA:1 - chrX 14663115 3' + hopper 317 1 66.34 TCTTGACCAGGATCAATAGCCGAGTCGACCTGGCTGTGTCCGTCGGTCCGTATAAACGTCGCAATGGGCGCAATAATTAAAATGCCATCAATGCACCTGTA:1 + chrX 6022676 3' + INE-1 88 1 56.44 GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGA:1 + chr2R 4677353 3' - invader3 5204 2 62.38 CATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGATATACCAATAAAAACACCCTCAACTCTCCCGCTCTCATTTCTGCTGACTTTTTTGCTGCCTGAGTGAGTA:1 - chr3L 3845307 3' + Porto1 425 1 68.32 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGGGAGGCGGCGGTGGCCAGAGAGGCGATG:1 + chr2R 18865938 3' + roo 405 1 71.29 AAAAAAAAAGAAGAAAATAAACGAACTAACCCCTTTTGGTGATGCTCGAAACTTACCTCCGTGAAACTTA:1 - chr3R 24621100 3' + gypsy7 5007 3 88.57 AGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAGCTATTTTGGCAGACACACAGCCCCACCAGACAACGGAGGAGATGGATTCTCGGGCGGAGGGCCAATGGCTTG:1 - chr3R 16540638 3' - Bari1 471 1 56.44 TCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGTTTCTTCG:1 + chr3R 3586578 3' - INE-1 138 1 71.29 TCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCTGATTCTCTGAATGTTTCGAATAAAATATATATATTTTTTTTTTGCAAAACAACATTCGTGTGCATGAG:1 + chrX 11961679 3' + Idefix 249 2 73.00 GAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTA:1 - chr2L 18159046 3' - INE-1 165 1 38.61 CTATATATATACATATATACATAGTTTGTGCATCGCGTAAACTAATGATAAATTCTAGTCGCGTATCCAACAATAATGGGACTGATTGATGCACTAGTAAA:1 - chr3L 11285404 3' - G3 4509 1 90.10 ACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCAT:1 - chr3R 14882083 3' + gypsy5 7323 2 57.43 GTATCGACATCCGGCCAAATGCCGACACTAACATCAGCAGACCAGACGGCAAGAATGCCGATGCAGCATAAGAACCAAAGCCACCGAAACGACAGAGGAGA:1 - chr2L 21774388 3' - gypsy2 70 2 75.25 ATCATATTGCTAAGAAATTGGCCAAAACTCCCCAACTGCAATATCGATTTCTCCGCTGTAGGCCGTGCGCATCTACGCCGGAGTACATCGCTCCCGGTCCG:1 + chr3R 10693449 3' + 1360 3114 1 75.25 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAATTTAAGCGAACTTTTTGACCAAAGAAAAAGTGTTATTAAAAGCATTTAAGTATATTTAT:1 + chrX 17607937 3' + roo 393 1 64.36 GTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTTAGCCGCTTCCTTCCGGGCTTTACACGTTTGTTGGTATTGGGGTTGCTTTTCCTCTTAATAGCCT:1 + chr2R 13055884 3' - accord2 7362 1 69.31 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATATTATTTTAAATCGAACTAAGTTCAAAATTGCATTCGAGAACTGCTACGACATATGCATATGCA:2 + chrX 3697203 3' - jockey 4686 1 67.33 AATTGACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGAGCGGCGAGCTTGCGGTTTGACTGTCACAGCGACGGCGACTTGACGGCCTCGGCGGC:1 - chr3L 12224968 3' + R1A1-element 142 1 59.41 GATCANCGCCTTTAAAGAAGTTTCGGATTTGAAAGAATCAAAACGAGGGATTTTTACTTTAGATCTTTATTTAAATTGAGCATTGAGTGGCTGCGTGGCTT:1 - chr3L 14529504 3' - rover 295 2 66.34 GCCAGGTGGTGAAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGCTGCATTGTGTCGATGCTCCTTTGGATAGAGCGCAGCATATCATCCCAACGATTGTCCTTGTCAAC:1 - chr2R 4878514 3' - Chimpo 4222 1 65.35 TTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCTTATGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTAGATAAACTAACGTTACTTGGTAATTTGATATCTTTTA:1 - chr3L 13442402 3' + Cr1a 191 1 62.38 GCAAGGTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATCCATTATATAAAAAAGATTACTCAA:1 + chr3L 21552042 3' + hopper 279 1 77.23 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTT:1 + chr2R 8463624 3' - I-element 44 1 62.38 TTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAG:1 + chr3L 20224215 3' - Chimpo 38 1 61.39 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAAT:1 + chr3L 15276735 3' - hopper 13 1 66.34 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTCCGCGTTCGATTTTGAGATGTATCGGGTCAGGAAAGGACTGCGACCCCATAAACCGC:1 + chrX 21303005 3' - Quasimodo 13 2 61.39 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTATGACTCTTAATTCAAAGATCAACC:1 + chr3L 2539328 3' + roo 9042 1 54.46 AGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACAAGTGGCTGCCAAAACAATCTAATCAGTAGATATAACCGTGTACCAT:1 - chr2L 2854797 3' + invader2 480 1 62.79 ATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGCAATTATCCTTGTTAGTCGGCGCACAGGACAGGCCAATGCACAGTGGCTC:1 - chrX 20059734 3' - Tc1 1359 1 53.47 GAACTTCGGTTCATATACAGCAATGAAACAGCATTGAGACGTCATCCGATCACTCTCGAGTCTTGGAGACCTTATTGACTATATAAACTATGCGCGCACAT:1 - chr3L 10786993 3' + R2-element 3480 1 78.22 CATGGGTCGGGTTGCCGGCTCCTCTCGAGAGGCTTCATTAGATTCGCTCCTTGGCGG:1 - chr2R 22568346 3' - Rt1b 467 1 59.65 CGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACATACTAAACAAAATCCACCACTCCAACGCCATCCAATGTTTATTGCAACTTTCTATCAAGAATCCC:1 + chrX 6276904 3' - Rt1a 4993 1 55.45 GGCGTNTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGTAGAGAGGATGCTGCGGAAGGTGCGA:1 - chr3L 8790644 3' - invader4 2927 2 73.27 TTATACAATATTGAAATTAAAAATAAACCTTAAAAATATATTATTAAAAAAAACATAAAAACAATCATAAATTGTACAAAAAATTGAGTGCTGTGCGCTGT:1 - chr2L 4801640 3' - hopper 194 1 63.37 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCTCCTGGGAGACGTCGTTAAAGGCCCTGGAATT:1 + chr2R 20791808 3' + roo 9029 1 68.32 CTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATTTCCCATTTTTCGTTTAGTTTAGTGACTGACTCT:1 + chr2L 2485672 3' + hobo 266 1 66.34 TCGACTTGGCTATTGATCCTGATCAAGATTATAGAATACCCTTTTACTATATATAAAACTAAATAACATTTGGCGTTCAAGCTACCTAATGAGTGGCAACA:1 - chr3R 32007759 3' - INE-1 94 1 70.30 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAAATTTATAGTTCGAAAGGATATTAAGCAATTTGCCCTTGTATTGCTTAAATGGTTTGGAATTG:1 - chr4 188645 3' - 1360 31 1 62.38 ACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATAAGAGAGCCCGGATGGTGGGCGTGGCTGCTTTTTCATTTC:1 + chr2L 19854816 3' + Burdock 8 2 60.00 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCAC:1 - chr3R 11005470 3' + roo 9027 1 65.35 CGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCAGCTATGTGAAACCGGGTTTTTGGGGTTGGTATTCAATATAAGGTTAGGAAGTCGGACCTGGAA:1 + chr3R 3843158 3' - Max-element 12 2 64.65 GAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGAAACGGATGCCACTGGAAAACGCAGGAACGAGAACAGTGCACTGAAACTATAAAGATAATCC:1 + chr2L 15525913 3' - Quasimodo 7042 2 63.00 TGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTGTTATAGTTTGCTGGGGTGTTTATAAACAATTTTGGACTACGCATATGTAGAGGAAATGCCCTGACTATGCAA:1 - chrX 2975343 3' - HeT-A 6051 2 75.25 GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTAGAATTCGTTATTGGTTTAT:1 + chr3L 10464698 3' + invader3 5430 2 62.38 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTGAATAG:1 - chrX 17479568 3' - I-element 45 1 62.38 CGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATCACTCAACTCTTACGAATATTGGTAAAAA:1 + chr2R 16579519 3' + Stalker3T 292 1 71.29 CCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGACTGGAAACGCAAAACGGAAATCCCAGAAACGCTAAAAGTGTCCATTAAAAA:1 + chr2L 3115271 3' - Circe 332 1 56.00 TCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAAATTGCCCAACTTCCAGTTCAATCGCAGCATT:1 - chr2L 17064571 3' - McClintock 303 2 69.31 TTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCACTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTATCTGTAAGTGAGATTATCAAGGGCGAGGGATCTATGGCCAAGTACTACCA:1 - chr3R 10704436 3' - Porto1 4349 1 63.00 TAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGTTAATATTCTCTTAACATTTTTTTCATTTTAAAAAAGATTTTCACATTTATTTGCACTTTATTT:1 - chr3L 12369686 3' + 1360 164 1 64.36 TGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAATATCGGAGCGGCCAATGGCTTCATAGCCAATGCCAGCGA:1 + chr2L 14345030 3' + 412 304 2 67.33 TTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAATTGCCCAGAGAAACGGGGAGTCGCTGGCGAATGGAATTG:1 - chr2R 12983442 3' + Rt1b 4765 1 65.35 TTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCGGGACTTTTTATTTCGCGATGGCTTTGCCATTCTGTGGCCTTTGCATCGTGCCACGGT:1 - chr3R 28475430 3' + 1731 166 2 58.42 TGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAAGGACTTAATTCAGATTCTAGCCAAGATAAATAAAACATTTGAGTCTTTGCCATTGGTAAACAATTGATTATGGCT:1 + chr2L 21871302 3' + INE-1 132 1 77.23 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAGAAAGTGCAATAAACGAACGC:1 - chrX 6656020 3' - roo 55 2 86.14 TTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATGTGTTCTGTATGTGTGTGTGTGTGTGGAA:1 + chr2L 12374988 3' + Stalker2 355 2 71.29 TTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGTTGTCCTTATCAGTTTTGCGATCAGACGTGAATCCAATGGGCTCCGGCCAGGGAAGGAAATCGGAG:1 + chr2L 16340215 3' - I-element 192 1 74.26 TTTTATTTTTCACATCTAGTCCTCTCTATATCGCGTCTATAGTCTCGCGAATCGAGCCCTCTATCGGTTTTGCGAGTGCTATAGTCTCGACCTCAGCCAAA:1 - chr3R 14902929 3' + Porto1 4609 1 61.39 CCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGCCAAAAACCGATTGCCAAAAATAAAATAGAGCCCATTAAATAGCCCGCGTAAAGCGCACACAACAA:1 + chr2R 6246413 3' - roo 458 1 70.30 ATACTAAAGGAACCAAGTAAATATAAAAAAAATACGTTGAAATTCAATTCAAATCTTGAAAACAGTGCAGAGAGTCAAGGGAGAAGAGTAACTGCCAACAT:1 + chr2L 11751219 3' - gypsy12 9730 2 77.23 AATCCGTTATTCCCACCGAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAATTCTCGTCTTATCAGTATCCATGCGCGATCCTCTCTCCCACATTCGGCATTCTG:1 + chr3L 12481275 3' + Quasimodo 201 2 77.23 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATATTATTTTAAATCGAACTAAGTTCAAAATTGCATTCGAGAACTGCTACGACATTTCTAGTATGTTAATCCTTTTAT:1 - chrX 14103588 3' - jockey 4673 1 57.00 TCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTGAGGA:1 - chr2L 6656253 3' - P-element 11 1 66.34 TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTGGGGGCACGCAAACACACAAATACACACACAGAGC:1 + chr2R 16928949 3' + blood 7381 2 70.30 ATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTACAACAACAATTTTTGCCAGGCCCACTGTACACCCACTGCAGTACACGACTGTATCAAATGCCGCGGAGGAAA:1 - chr2L 7033456 3' + INE-1 297 1 54.00 TTTATNTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAA:1 - chr2L 21400732 3' - Doc3-element 65 1 65.35 AAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCACAGTCGGGGGTGTTTAAGTAGGAGCGTTTAGCTATCCAAGAAAGGCAGCTATTGGAGAAGTCAGTGCGCTAAA:1 - chr3R 29197384 3' - hopper 458 1 71.29 TACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAGGAATAAGATTCTTAAAAACCCCCAATTCTAAAATCACCCCACTGATACCATTACCCCCCCTGGA:1 + chr3L 1964913 3' + Idefix 82 2 73.27 GCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACATGATTAGCTGATAAATCTCGTCCAAATATATCTGAGACGAAATTTGTGCA:1 + chr3R 2691170 3' + accord 179 2 55.45 ATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATATACACACGGCCATATAGCGGAGTGCTCGGGGTATTGGTGGTATCAGGGGATATCGGGGGACCAAAGCTATAG:1 - chr3L 14464216 3' - R1A1-element 35 1 77.23 CGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCAAAGCCAAGAAGCCCTAATGGTGCCAACTATGTATGATAATGAGGGTCGGTCATCGGAACTGGAATTCCA:1 + chr3L 12544768 3' + F-element 453 1 70.30 GGTCAGGATCGATAGCCGAGTCGATCTAGCACCGAGTCGGGCAGCACCGCAGGACTACGCAAAGGTGCCGACACCTGGATGCCCTGTTGGCCCTGGCCGAC:1 - chr3L 26026738 3' + INE-1 92 1 61.39 CTTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTGATAATATTTTATTATTTGTCTTGATTTCCTTT:1 - chr3R 19446849 3' + copia 4982 2 65.35 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATATTATTTTAAATCGAACTA:1 + chrX 3697158 3' - jockey 4689 1 61.02 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGCACCTTTTTGTGTCCAACTTTTCATTT:1 + chr2R 11730919 3' + blood 7341 2 72.28 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGATTTTGTTAACTCCGGACTTCTCGTACAACGCATCAGCCAGCTCGGAGTTGGAGAAGTGATCCCACAGCACGTGAA:1 - chr3R 9248353 3' - Tirant 12 2 77.23 GATTTTTTTTCCTTAATTTTATTACACAAAAGAAAAGCTTGCCAGCAAGGTAAACACGTGAAGCAAACGGAGCGGCTAAAACAATATTGGCCAAAACAAAA:1 + chr3L 15770075 3' + Circe 6966 1 69.31 TGAAGCAAAAGACGTTCGTTGTGTTTCTGCGCCCTTACGAGTTCATCTGCTTGCTGTCTTCGGCCACTCAAACTTTTTATTTATCACACTTTCCGTGAATT:1 + chr2L 8482331 3' + hopper 490 1 78.22 TCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTTGACTTCTTTGCCGCCATTTTTGAGGTGATCATGAAGATGGTCACCTGCGTGATGTGGCTGACAC:1 - 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chr3L 3960620 3' + aurora-element 272 1 74.26 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATC:1 + chr3L 26852079 3' + diver 174 2 73.27 CTACACAAATCACATAGAATCACAGGAAACCCCCACTCCTCCGGACTGGGTGATAGGAGCACGACATCAAGAAGAATTTGTAGATTCTCAAGTCACAAGCA:1 + chrX 10040137 3' - Cr1a 143 1 73.27 TTTAAAACTGACATTGTAATTGTAAAAAATATAAAAATACCTTATACCGAGAATATATGTGACTATATTCCTGCGCCTTATCACTAAGCTTTCCAAGA:1 - chrX 9595520 3' - TAHRE 10139 1 74.49 AAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGG:1 - chrX 21791532 3' + gypsy11 4310 2 39.60 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCGCCTCGAATCGAGGTTATTTACT:1 + chr2L 6644324 3' - hobo 51 1 74.26 TGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTGATGCGTGGGCTGTGATCATGAGTAAAAAAATCAGGAGAAGAGAGCTGAAAAGAGGAAAGAATT:1 - chrX 15044480 3' - I-element 5209 1 63.00 TGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTATTAAGCTAAAACAAAAACAAAAAATCTCTATCCACAGAAAACCGAGCACGGGGGAAAAAAGTAGAAACACGCA:1 - 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chr2L 17731476 3' - G-element 303 1 66.34 GCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATAGAGTACCAACGTTTTGACTGCGTTTCAAGCAATTAGCCAGCGGAC:1 - chrX 5570760 3' - Stalker4 126 4 55.45 GGTTTNTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCCGTATGAATGCCGACACCTCGGACATAAATATTCAGCATCTGATTCTC:1 + chr4 805906 3' - F-element 321 1 57.43 CTTTTCGTTATGCTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCTAGCTCTTTAGAAATTGCCTATAATTACAATTTTTTTTTTAATTTCGATGCAGCTCGAAGAA:1 + chr3R 13236259 3' - Doc 4462 1 66.34 TTTTTCCTAAGTTTGGACCTTTTCCCGATGAGCCAGTGGAGTTGCTTTCGGGGCCCCACACCCTCTTGGGCACTTGAGTGATCCCCGGACTCTTGGAGTGG:1 - chr3L 21599773 3' - G-element 3849 1 58.42 AAACAATATACCCAAGAAATGAGGATTATATTTGTAGGTACATACATTTTATTTGCAAATATCTGGGCAAGGAGGTAGGAAGGAGGGGAAAGCCAGCAAAA:1 - chr3L 156722 3' - TLD2_LTR 180 1 58.42 TCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCATCCTCTCCACTCGGCATTGTTTGTACTGGCCGTTGTTTGGTTTATTGATATGTT:1 + chr3R 30221361 3' - Tirant 94 2 59.41 GAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTTGTTGACCATCACATTTTCCGCACA:1 + chrX 12392294 3' + gypsy12 10008 2 79.21 TTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGGCATGGTGGAGCTGACCCTGGTGAATCTGCCTACCGAGCAGGAG:1 + chr3L 17539662 3' - Bica 81 1 56.44 AGTGCACTTTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGGCATTTCTTAGGATACCCGATCCGTGCAGGAAGGACTGCATCTTCTTTAAGGTTGCCACCAAA:1 - chr3R 19779885 3' + R1A1-element 276 1 69.31 AACTTAAAATGATTCTTATAGATAACAAAGACTCACAGCGGCCACGCAAGTATGCTGTGCTTGCCGGCGCGAAGGACCAAACAATCCTATCGCCTATCGAT:1 - chrX 5636464 3' - Gypsy6A_LTR 142 1 67.33 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTAGATAGTATCAACTAGAAGAAAAAAAACCATTCATTGTTCCTAAGAAGAATTGGGAG:1 + chr2L 9463454 3' - roo 18 2 52.53 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCTCCATTAAGTGCATTAATCG:1 - chr2L 9823602 3' - hobo 2 1 79.21 ACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACACTCTGTTTATGCTGGTGAAAATTTTGCATGTGTCTCCTAATTAAAATTTTGCTCAAGCGAC:1 - chr3L 13717768 3' + R2-element 241 1 65.35 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCT:1 - chr2R 10697065 3' - 297 6594 2 74.55 CTTCTTCTTTAAGTAGGCCTGCAAATGTTCAATGGGGCAGCTCGCTGAGCACTCTAGAGCTACTGCTGGATCGCATTGGAGCCGGATGCGTCGAGGTGCTG:1 - chr3R 18661636 3' - S-element 1258 1 66.34 AGGGGGATCTTTGAGTCATGAGTCATAGGAGGGGCCTGTAGTTCCCCAACTATCGGATACTCCTAACTCAGCTACTCCTTTGCGAATTACAGGCCCCTCCT:1 + chr2R 3942344 3' + baggins 5372 1 61.39 GTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGACCGAAGCGTCCGGAGCGCAGCGGCCCAGTAGGTCCACAAGGGTGCAGTAGAA:1 - chr2R 8876976 3' - F-element 334 1 60.40 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCG:1 + chr4 490338 3' + pogo 2097 1 74.49 ATCGTNATTCGGCCGCGCGTTCGTTGGGCTTTAATGAAAGTCAAATTTGCAAACACGTAAAGTTGAAAACAACTAAGGAAAGAGAAATCGTAAGAAATTCT:1 + chrX 21398054 3' + Rt1a 277 1 77.23 TTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTCTTGCTGTCATTATTAAATTGGTTGATTGGAAAGCATCCGAATAGTAAATACATGG:1 + chr3L 21142710 3' + gypsy6 7590 2 74.26 AAAAGAGAGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCCCCCAAGGGCATCCTTTTTGGACTTTCCCCTGCACGCCGGCGAGTGAATTCCAGTTGCCGGACTTGA:1 + chr2L 1689222 3' - invader3 144 2 72.28 TTTGTGCTTTTTCCCTTATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAATATTTGGTACAAGTCACAAAAGAGTATAGTGGCAAAATTTA:1 - chr3R 13088412 3' - Juan 4198 1 47.52 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACACGGCCTTCCTGAC:1 + chr2R 1369812 3' - Tirant 8146 2 77.78 TAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGAT:1 - chrX 22398532 3' + Gypsy6A_LTR 158 1 61.39 TCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAAATGTGATTTATTTATACGAGGCAGGATATCGCATAGGATGGGCACACGGGGATGGATGGAATGGTCGGCAACGT:1 + chr3R 22176365 3' - 17.6 6942 1 78.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTGCTTAAAAATGCTTACTTTATTTAGAAAGCACCCTCCGTTTTACAGCTAAAAACGTAAGTACT:1 - chr3L 18076241 3' + roo 396 1 65.35 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAG:1 + chr3R 27619253 3' - hobo 49 1 76.24 TAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGTCAGCCCAACTCGACTGTCACAAAATCAATAAAACTTT:1 + chr2R 21458894 3' - blood 372 2 62.38 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTGGCCACCACATTCGT:1 - chr3R 22352784 3' + 412 461 2 55.00 TTTATTATATAAAGCATTTAAATGAATATATTAAATACACAAATAATAAGCTGAATTAATCCTTTTACGTAGGAGTCGAAATAGTTGGCGTACTCAAAGAA:1 + chr2L 17580282 3' + Ivk 5279 1 79.21 TTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGCTCTATGTGTGTGTTTAGGCCTAAGCGAAGGAATTAAATATCCATTTCCGTGGCCGGGTGAAGATGTGTACTTACCTGAC:1 - chr2R 15989692 3' + 1360 56 1 76.24 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGTTGGATGAGGTGCATC:2 - chr3L 17624148 3' + roo 9055 2 62.38 TTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTGTATTAGTGCGGTCATATGGATTCTATGCTTTTCATCATCGTCCTCCTTTTTCTTCCCATTCGTTTGGA:1 - chrX 8716071 3' - accord 7034 2 41.58 ACAACAATAATAATAACAATAACAACAGCTTGAGGGCCTGAAGCCGAATCAACTGACTTTCGGCCGCCAGCAACTTGAAGATGCTGCGCACGCCGTGCTTC:1 - chrX 5234107 3' + mdg1 7058 4 75.25 CAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCG:1 - chr2L 22719598 3' - 1360 41 1 70.41 CTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTGGCAGGCAGAGCCATAAAATAAACAAAAAGGAAAGGC:1 + chr3R 6433915 3' - HMS-Beagle2 7119 2 66.34 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTGTT:1 - chr3L 22052742 3' + mdg1 7452 2 72.28 TCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGGTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTTTACTTGTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTCTTAAACAACGATATAGTG:1 - chr3R 19449966 3' - Porto1 217 1 55.45 ATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGCAAGATGTGCTTAAAGTAGATGATGGAAAAGCGAAAGCTTAACAAAAC:1 - chr2R 17010903 3' + copia 466 1 76.24 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAGTATACTGTGCGGGTTTTTATTATGTTTGCATTCGCTGCGGGCCTTTTATGTGCTCTTTCT:1 - chr2L 15622692 3' + mdg1 7441 2 62.38 GAAAAGGGTCACAATAATGGCAGAAACGACTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACTTACTCAGATTACCCAAATGAGGAGTAAAGTATTTTAT:1 + chr3R 29924909 3' + hobo 447 1 63.37 CTTTCTGCCAAAAAAAAAAACACATAAAAACC:1 - chr2L 19915607 3' - transib1 16 1 87.50 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTTATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGAAGTAAATTTATAGCAAATGATGTGGTTGC:1 + chr2L 12237081 3' + jockey 4949 1 65.35 TAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACGGCTCACTTCGAGCACATCCGGCGGCATGGTGGCGGACAGCAGGATGACCTGCACA:1 - chr2L 5984390 3' + Doc 485 1 60.40 GTTCANGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCT:1 - chr2R 5532367 3' - Doc4-element 13 1 54.46 TATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACATAGTCATCGCCCGACTTTGCCCCTTCACCCATAGTTGTCATAAG:1 - chr2R 16090256 3' + Ivk 5146 1 61.39 ATGTGNTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACATGTCCGCACAGAAACAGAAAGAGCATGGGAAGCAAAC:1 - chr2R 19222555 3' - Bica 104 1 71.29 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAATCCTCACAAAAACACAGATAAATA:1 + chr3R 22831063 3' + mdg1 371 2 75.25 TGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCTTATTGCTAATAGGTATGCTTTAGTCGAATAAACGCAAACAGCTGGCAAATGTTTTTGGTTCGCTTCAAG:1 - chr3L 1469383 3' - Quasimodo 298 2 69.31 CGCATTCCCACTAGCTGAGTAACGGGTAGTCGGGGAACTCAACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAAATATTGTTAAACACCTGTATATTAAAGGCGTCAAT:1 - chr2R 4028655 3' + INE-1 533 1 62.38 TACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCTGTTTCCCCTGTTATCAGCTTAAAGTAACATTTTTATGGCCATAATATTCGGCTTAGTCACTCG:1 + chr2R 10163874 3' + 412 7273 2 71.29 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAAC:1 + chr2L 22690020 3' - Tabor 37 2 58.42 TCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGCAGGTAGTAATAGTCGCGGGCATAGAAGTTCAAGGGCTGAGCC:1 + chr3R 18422530 3' - Idefix 94 2 57.43 CCGCTCACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCGAGCATAGCCGGTGCCGCCAGAATCTTAACTTTTGTGAAGGAGAAGAATG:1 - chr4 215519 3' + springer 7166 2 61.39 AAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTTCCCGACAATCAGATACCCGTTATCCAGCTAGTGAACATGTGTTCGAAAGCAGGAAAAAGTTTCGCATGGGAAGTTTT:1 + chrX 22673964 3' - INE-1 576 1 56.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAGGTGAGAGAAAAGAAATGGAG:1 + chrX 8299763 3' + roo 400 1 67.71 ACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCTACTGCTACCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCATTTGAATCTGAAACTGGCCAACAATTTGAGTGT:1 - chr2L 17049558 3' - flea 131 2 62.38 CGGCACGGTATACCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAGCTCAGGAAGCTGAACTGGATACTAGGACCAGCAAGCAAGCTAAGCCTTACCAACGA:1 + chr3L 23611036 3' + Bica 399 1 62.00 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGTTCCGAACAGGTGTGCCACCTGTAAAACC:1 - chr2R 16018830 3' - I-element 22 1 50.00 ATATTAAACTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATACATATATATGTATATGGCAATGGCAACAGTATTGATATTTGCATATGTGCCATATG:1 + chr2L 13585799 3' + I-element 5046 1 62.38 GTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGC:1 - chr2L 19845898 3' - F-element 36 1 48.00 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATACAAA:1 - chr2R 18358417 3' - jockey 4669 1 58.42 AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATAAACTAATGTTGCATACTTT:1 - chr3R 29653069 3' + jockey 4940 1 83.00 GAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGCTGCATCTGCTGCATCATGGAGTGGTTGAGGGAGCTCA:1 + chr2L 16484390 3' + micropia 211 2 68.32 TAAGTCTAAGATAGCTTAAGTACTTTGTGCAAAGAATTTCTTGACAGTGTCAAATCTACGCAAACTAAGAAAATACAGTTTTAAAACTGATCGATGTCCCA:1 + chr4 128846 3' + S2 1476 1 65.35 TACTTTGGATGCTGGTCGGCGGCCCGGCGGCCGTGTTCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTGTTAAAGTAGGGCTTCAACACCAGTTTCACC:1 + chr3R 5580448 3' + Chouto 58 1 66.00 GGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTGAAGTGTTCATATAAAAAGTGTTAATTTTCCATGTGTTGCTTCTCATG:1 + chr2L 19699175 3' - X-element 364 1 69.31 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTCTTTAAGTATGCCTGTATGTGTGTGTGTGTTTGATTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9449646 3' - jockey 4700 1 51.49 ATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGACGAGCAGCCAGGTCGTAACTGGCTCCATAGCTGGAA:1 - chr3L 12594183 3' - flea 4594 1 63.37 TATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chr2L 12893452 3' + Stalker3T 54 1 64.36 GACACNCGGGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTACGGAGCATTGCCGGCTTCACAGCCGGATTAGTCTGCAATGGTTAGACAGACGCGTTT:1 + chr2R 9126217 3' + baggins 5100 1 66.34 GATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTTAGAATCTATCTAATCGGTGTATTGAAACAGAAATCAATGATTGAAAGTGTGTGAT:1 + chr2L 20832808 3' - F-element 4369 1 50.50 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGCGCAGCAACT:1 + chrX 19848486 3' - P-element 41 1 38.00 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGTGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATATTAGACA:1 - chr3R 21010738 3' + hopper 1377 1 62.38 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAATCGAAAGCGA:1 + chr3R 12789912 3' - flea 4794 2 65.00 AAGGAATGGAAATTTCGTACTTATCCTATAATTTGTTCGCTGATGAACAAACTTGAAAATCCACTCGACGGCTCATCTCCTCGGTAAAAACAACTTTTGGG:1 + chr3L 15484786 3' - GATE 339 1 61.39 GGGAAATGTAGGTGAATGTTGGGCGCCAGTTGCCAGTGATAAGTGCGGGTACCACAGAGGTGCTGGATAATCCTGGTGTCTTTAATTTCGCCGCATTAAAG:1 - chr2R 10698387 3' - gypsy7 257 1 75.25 GCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCCCATATGCTGTAACCGCACTTTCAAACTTTCCCAAAAC:1 - chr3L 15233914 3' + invader4 340 1 62.38 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAA:1 + chrX 3485697 3' + P-element 2847 1 37.00 GAACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGTACGGCTCGATTTGCGAGAAGATAGACGCGGGGGACGACGCACAGGCACAGGCTCAAATCAATCTG:1 + chr2R 16702709 3' - Cr1a 4440 1 64.36 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGTATAAGTAAATGATTGGAGTTTTACACTTTGTTGGCGATAGAGATGACAAACGAATTAAAACTAGAGATGAC:1 + chr3L 25611354 3' - roo 3 2 74.26 TCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCATCAGCAAACTATTATACCTTCTATTAGCA:1 + chr3R 31529612 3' + flea 4854 1 75.25 AAAAAAAAAAGGCAACAAAAAAAAAAATAGCGCCAGCAAAATAAAACCAGGAAGCCAGCAAGGTAGCGGGTTGAATGATTTGGATTGCATAATACTTTG:1 - chr2L 20073325 3' - Tc1-2 1390 1 57.58 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTTTCCTTGTACGCTAGCCCAAAATTTGACATATAAAATTCAACTTTTGGGTGGAATTTTTGAGTCCATCTG:1 - chr3R 11097485 3' + mdg1 417 2 70.30 TAAGTCAAATAATAAAAAAAAAACATGACACCTATGGAAGCTTGGTCGGGTAAGAAGATCATGTAGCAAAAACAAAATAATAATAAGACAGATACCAGGAA:1 + chrX 13644547 3' + Rt1b 5142 1 55.45 ACCAACACACACACACACACACACTCACTCTCCCGGCGAGTCGGAAAGTCAACAAAAACCATAATTCAGATAATTTTATTTATAACACCCTTGAGGAATTA:1 + chrX 17810191 3' + accord 7100 3 72.28 CAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGA:1 - chr2R 6438339 3' + Stalker4 386 1 58.42 GTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGAACACGTAATCGCATAAAAGCAGAGCCAGGACGTGCTCTGATTTTGT:1 - chr2L 1248865 3' + Tc3 236 2 59.41 TTTTTTTTATAAAATATAGAGATTAGATAAAGCCTCCAGCGAACGATTCGCATCGATGAGTTTATCCGGGAAGTAGTGGTTCCTCAGCTCCTGACTTATGT:1 + chr2L 9599514 3' - TART-B 10569 2 83.17 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAACGGACCAGTTCCTTGAGAGCCTTCCGGTAGA:1 + chr2L 1353805 3' - I-element 6 1 73.27 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGCACTGCTTAACTTATCTTACACATCGCGTAGACTTTGAATATAGGTA:2 + chr2L 5611457 3' + pogo 2074 1 53.47 CCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAAGTGTGGCCGTGGGACTCGCTGCCAAAATCGAAAAATCGCGGCCCAAGAGCTAAGTTCCGAGTGGCCGTCGCGGCCAAA:1 - chr3R 11315470 3' + Cr1a 4418 1 61.39 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTGAAAACGGACTTGGTGGGCGGCGAGCGACTGCGGCGGC:1 + chr3R 9540136 3' + 412 7466 2 73.00 GATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGTGGTTCCCAGACTGCTGGAAGGAACAATGTACG:1 + chr4 762548 3' - roo 160 2 67.33 AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTAATGATGCCCAGACAGCTAGCACAACTGAAAAACCCGAAGTTGGAAAAACCACTGAGAGTGTGGAAGAAAA:1 - chr3R 12030435 3' - 297 53 2 77.23 CATCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTAAGCCCAATATTACTTAAATAATGCATGCCAAGTATATAAGTAATTGATAGTTGTAGCACCTTACTTATATATA:1 + chr3R 15814750 3' + roo 409 1 74.26 TTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCATTCACCTGTACACCCATGGCGGTCTCTAATGAATTTGTATAAATAAATACTAATATTT:1 - chr2L 7606361 3' - Idefix 282 2 56.44 AGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTAACTACCGTGATTATAAGCAGTTCCCTGGCTATTCA:1 - chrX 21087895 3' + mdg3 5259 1 65.35 CTAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAGC:1 - chr3R 19718711 3' + INE-1 543 1 80.20 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGTGCATTGTAATTCATTTCGAAT:1 - chrX 8714597 3' - P-element 53 1 26.73 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACCGCCAGTCGTTGCCCAT:1 + chr2R 5910933 3' - hobo 23 1 56.44 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAAAGCAGCAAGGACAACAAAAGTGTGCCTTCCTGGTCCGCGCCAT:1 - chr3R 32042008 3' + hopper 1386 1 55.45 TGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAAAATAAAGGCAACAATGCCATAACAGCAATTTATAGTAGAATAATAAAGATTTAAACATTAAACTG:1 + chr2L 10049229 3' - Ivk 5247 1 65.35 ATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATAATAAAATATTATTTTACAACTGTTTAGTTAACCCCCGCCTATTTCCACATCAATAACAATTACGAAAAGGAC:1 + chr3L 5268777 3' + invader4 324 2 53.47 AGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGAGAAGTCTGACGGATGACAACATCTCAAGTGAGTGCCACCCATAATCGTTGGCTATATAGGAAAATAAGAAATCATTAA:1 - chrX 16841507 3' + Gypsy6A_LTR 346 1 51.49 ATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTGAAAATAGATGGAACGGATCGCAAAATGCGCCAGGCCAATAAAATATTTTGACATT:1 + chr3L 12616375 3' + diver 6012 2 66.34 TTTCATTTTTTTTTCTTTTCTTTGTTTTCCAAAGTTGGCAAAGTTTTTAGCTCGAGCATTTGCGCCTCGCAGCGTCGCACACGCATTTCCAATGCGATTGT:1 + chr3R 28420646 3' - Doc2-element 226 2 81.19 GCAGTNAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAATAATACAAAAAATATGCTGTTAAATAACACATTTTGTAGTTACAAAGTTG:1 + chr3R 22667810 3' + 412 100 2 48.48 TACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATACCCTCCTGTAGGTCACCATCGTAGCCATGCTGAACACAGACACAAACAGAATAGAACCTTGGAGTGGGATCCA:1 - chr3R 23699148 3' - mdg1 324 2 75.25 AAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGATAAGGGGAGGGAGTCTTCATTTGGGGGATCGAACGATGCGAAAGACTAGAAACA:1 - chrX 6812369 3' - I-element 5138 1 56.44 TCACTNGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGCCAAGGAATAAAAACCATCGTAGGGCGAA:1 + chrX 10153566 3' - I-element 446 1 70.30 ACATAGTTCTTAAGATATAATCCATTTTGCTATTATTATTACTGTTATTGGCTTTAATTAGGTATTACCGCCAGCATTCGCATATTAGCCATGGCTTTGTG:1 + chr2R 15059930 3' + Tc1 1365 1 79.21 ATCGAACGCGATCTGAATGTGACACAAATAGGATCCACAACAAACCAAGCAAACAAACCACATTGGATAGTTTTAAAATGCAAGTTATGTATGTACAGGAG:1 - chr3L 12140763 3' + jockey2 3024 1 77.23 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCATTAGCAATTTCGACGCCAACGCGAGAATACACAGATTATGAGTGCTGAAATATCCGGCT:1 + chr3R 12408412 3' - P-element 16 1 61.39 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAATTATGCTTGTAAATCAAAATTGGGGTAAATAATGGACAGACAGTCGGCGACTA:1 - chr3R 19691070 3' + Tabor 462 2 55.45 CCATACAAAAGTAATATCCCAAAGAACACTAGAACGTTTGTTAGTAAAAAAATGACAAAGTTAACGAAGTTTACAATTTGGAAAGGACAAACTTTTTCAGA:1 + chrX 12922999 3' - transib4 408 1 51.49 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGTGTGCTTGTGCGTTTGTGAGTGTGTGTTGAGGGAAAATGGCAACAGTGTTTGCAATGGTGTGGGTGTGCC:1 + chr3R 10967638 3' - roo 14 2 79.21 TGTGCTGGCTAACAAATGCTATCCAACCAAGTATTAGGCCCTAATTAACATATTAAAAAGAAAAACTAAGTTTGGCATTACGGCAGGTAATAGCAAAACGT:1 + chr2R 462992 3' + HB 1314 1 69.31 ACACACACAAACACACACATTGACACACACACAAACATCGAATCGATTTCGATTTCGAAAAACCCATCATCGCACACCTTGAGATTAATACGATGCCTACA:1 + chr3L 8108426 3' + gypsy3 426 1 62.38 AAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGTGCGTGTGTAAACATTAACTTTTCAAGAAGATTTAATCCCGATTATCCATTGACTGTGAAATTTT:1 + chr3L 21482167 3' + diver2 449 1 69.31 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATA:1 - chr2L 23068879 3' + 1360 3335 1 82.18 GTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGCATAGAAGACGGAATCGCAGCGAACGGGGCGTATGAGTGACGATGCTGGCGA:1 + chr2L 14242543 3' + hobo 2525 1 51.49 GGCCTTTTTTTTTTCTTTTTTGGAAGAATGCCTTTGTTTACCAATGAAATGGAATGTTCAACTAGCTTATGGTTTAATGTACGTACGTCTTTAAGGTATTA:1 + chr3L 10587738 3' + Transib5 367 1 56.44 TAATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGCACGATAAGGTCGTCGATTTTTTTACAGCATTTCGGGAATTTATTTAGTTCTTTACGCAAGA:1 + chr3L 14697974 3' + 1360 3115 1 66.34 CGAACAGCCTCTACAGTTGAGTGAGGTCCGATCGGGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATCTGGATGATAGAACGCTCAAGTTGCTGCAT:1 + chr2L 6413900 3' + invader4 107 2 68.32 ATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATACACCCCAAAACACGTGACCAGGCGA:1 - chrX 21089135 3' + mdg3 5286 2 67.33 AAAAANAAGGAAAATAAAGAAAAAACTTTAAGTATGAAGGCAAGAAGAAGGGTGTCCAGCATGGCAAAGCGCTTTTTACTGGTTAATCTAAAGTAATCGGT:1 - chr2R 9243508 3' + Doc2-element 254 1 58.42 GCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAGCCTA:2 - chr3R 19718708 3' + INE-1 546 1 80.20 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCTCGCCTGCGCCTGAGTCAGGACAGAAAAAAAAAAA:1 + chrX 10290189 3' - hobo 42 1 64.36 GGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACATCTGCCATCAGTAAGGCGGCAATCATAAAATAAAAATATGCCCTACTTGTCTCT:1 + chr2R 20942528 3' - Dm88 4244 1 56.44 ACTGTCACCCGCTCTCCGCTTCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTCTTATTCTTGGGAGTCTTGTGGAACGCATTTGAAATGCATTTGACAAATGGGCAAATGA:1 + chrX 5636792 3' + GATE 8266 2 70.30 CTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAGGCAATTTCGTTTTTGGACTTATCTGGATGTTGAGATGCATTC:1 + chr2R 17881087 3' + 297 6825 2 57.43 ACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGAGTACACGCACTCACACAGATATCACAGAAAACACGGTTACTATTTTCGAACGCTGATGTCTATG:1 + chr3L 16661439 3' + Transpac 5160 2 68.69 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCAAAACTTTGTCGATCCGTTCTTGGGAAAC:1 - chr2R 10697017 3' - 297 10 2 57.43 TGTGTGCTTAAACACACACGCACACACATGTAAGCACATATATGTATTGACAGGCAGTATATGCATGCACACGTATGTACACCCACACGAAAACACTGCT:1 + chrX 7154155 3' + G3 39 1 60.00 CTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGATCGACGATGTGCAGGCCTTCGTGGCCGCCGCTGAGATGCTGA:1 - chr3R 30593584 3' - Juan 4122 1 55.56 TCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAA:1 - chr2L 6656270 3' - P-element 28 1 49.50 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGCGACAACAAACTTTCACTGGAGTTGAAGCTAAAGTGGGTGTTGGCCAAAGGGGTGGCCATACAC:1 - chr2R 22454914 3' + hobo 2927 1 67.33 AATAAAATAAAATAAATACATAATGTAACATAAATCAACCTCATAACTATGAATCAAAACCAACTAAAGCACTAGTATGCACTTATAATCCTTAAGATTAG:1 + chr3L 8333812 3' - transib1 1896 2 67.33 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGGGAAAGTGGTGCTCAAAGGAAATATCAAGGAAATCAAGGCTAAGAATTGTTTTTGAAAGGAT:1 + chr3L 14455272 3' - jockey 4786 1 68.32 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATACAGATACAGATATCTATATAGTCATGTGGTTAAGGGGTTACGCATGGCGA:1 - chrX 17837961 3' + S-element 1699 1 57.45 TAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCATTGACTGCGCACAGCTGCATTAAATTATAAATAAAAAGAACAAGAAATTTTACGCTTAATATT:1 + chrX 8933116 3' + micropia 334 2 69.31 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATAACACGA:1 + chr2L 10635320 3' - roo 27 2 53.47 GAAAGCGAAACACATTGTTGCGGTTTCATATTCGTAGCGGCCACGCACGAATGCTGTGTCTCCCGGCTTCCGCTCGAGCAGCATAAAAATAAAGCCAG:1 - chr3R 22890500 3' - gypsy2 140 2 69.39 GTGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTGTGCTACTTTGTCGCTGTTAATTATAAAAATTTTCCATTTTCCCTCGTTTTAGCTGGCAAGTGGAGGA:1 - chr3L 2858718 3' - 1360 176 1 73.27 TTTCGGTACCACGGGTCTAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGTGCGGTTGGATGGTAGCTTCGCCTATGTGCTCCGTTTCCTA:1 + chr3L 8538492 3' + R1A1-element 4935 1 59.41 ATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGATCGGAAACGCCTCATTCTGCCTATTCCATAAAGCTGTGTGTTTTGGTTCACCA:1 - chr3L 12257471 3' - INE-1 95 1 73.27 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACC:1 - chr2L 18112497 3' + transib2 2803 2 56.44 CACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAATCAGCAACAACACTAACCAAAACGCAGA:1 + chr3L 28007032 3' + ZAM 7987 2 71.29 CCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCGCTTGAATTTGTGCTTTTTTTGGGCTTTTGGTCTGCGGCAAAATTTG:1 - chr2R 22771682 3' - BS 4658 1 60.40 GAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAAAACTGCCAACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTGACATTTTTA:1 + chr2L 23334738 3' + INE-1 141 1 51.49 AAGAGAGAATGCTATAGAAGAGTTTTCAATTCCGCATGCCAGAAGTCCGGAGTCCGTGAGTCCGTGAGTCCAGGAGCTCAGGCCAAGTTTGCAGCACGTAC:1 - chr2R 8851127 3' - INE-1 577 1 71.29 CGATCNGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAGTCCTTCGGGTATTTACGCTTTTGTTG:1 + chr2R 21421113 3' - gypsy3 6581 4 69.31 GGCCGCAAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACCGAGATGTGGGTGAGGGGAGGGGAAAATAAGGTTCATTTATCATCGCACAGATTGGG:1 - chr3R 8202705 3' + flea 4549 1 57.43 TACCTCCTTCCACGCGCGATCTGGTTGACTAACTCCAACTCCACCGTGTGCATTCTGCTTAGCACAACTCTGCCCGCCTCGTTGATCTGCAGGCCATAGTG:1 + chrX 17157644 3' - gypsy8 393 1 62.38 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGTACCGATTACAGAAATGCGTGCTCTGGAATTTCAAGATTTCCT:1 + chr4 1219238 3' - 1360 32 1 59.00 CTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCACCTCATTCGTTACGGACCTCACTCCGTGCTAGGGGGG:1 + chr2R 3877615 3' - Doc3-element 464 1 67.44 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATACT:1 + chr2L 1353761 3' - I-element 49 1 76.00 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCTTTTCTTTTGAATG:1 - chr3L 15276620 3' + hopper 1409 2 72.28 TACCACGAATACCCACGGTTGCTCACACACACGGGCGCGCGAGCGCAGCAATGGAAATATGGGAAAATACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCA:1 - chrX 20942187 3' - looper1 383 1 77.23 TATCTNTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTTTTTGATTTACTACTTTAGTTTCCATTTATTTACTATTTGCGCTCAGCGTCTTGATCTGTTTGCATATT:1 - chr2L 773226 3' - I-element 7 1 72.28 AAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAAATCTCAAGAGCTATTGGCAAAATTAAACTTTC:1 - chr3R 10490311 3' + transib2 2820 1 75.25 AGGAAATTTATTCATATTGGAACTACAAGCCAAACAACATCGACAGAGAGACACACACATACCAAATAAAACCCGATTCCAGTTGAATCCAAGGCAAAACG:1 + chr2L 14671237 3' + R2-element 220 1 74.26 GCCTCATTTCTCGCACTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAGGGAAGGAAAAAACCGCTGAAAATGCCCGGAGACCAGCGAATCGCTCTTTAG:1 + chr2L 18114638 3' - Tc1 186 1 60.20 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATGTTGATATAATGGTAAGAGATGTAATTTTTATTTTTCTACAGCCCTGATTTTTCGATA:1 - chrX 2766735 3' - mdg1 7050 2 67.33 ATAACAAGGTGCGTAACGGCCATAGATTGGTTTTGCATTATGCAGCCACTTTTTTGTCTTTCTCCACAACAGCTACAAATACTTTCACGGTTACTTCTCG:1 + chr3L 2298159 3' - 1360 3375 1 55.00 ATGTGTGCCGGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCCTTACAAACTTGAAATCACTGAATCAAATCACTGCTGAAGGCGCCCATCGCTGCGATG:1 - chr3L 2262669 3' - X-element 90 1 62.38 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAACGG:1 + chr2L 1353777 3' - I-element 33 1 60.00 TGTAACCACTCTGACTAGCGAGTCCTTCCAGACGTGCCGTTCGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGTTTGTGTGTGGTGCCTTGTCCTTTTCCCGAGCCAA:1 - chr3L 10986470 3' - diver 5730 1 78.79 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATACATATACATCTCCATATACATAAGCTGAAATCGAAAACGGGCCGCAGATAATCCCCTGCATTTCAATAATTT:1 + chr2L 1877103 3' + opus 498 1 45.54 GGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGT:1 + chr2R 490330 3' - hopper 116 1 75.25 GAAGATTGCGCTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTGCACACTCATTTTTCTCAACTTCGTAGAATCACCACATTTGGTGACCATCTCT:1 + chr2R 7880379 3' + Doc4-element 175 1 60.22 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCCGCTACTCGATTTTCTTGATTTTTTTCGATGGCCTTTGGTAGGTTGGGACTCATTACT:1 + chr4 167518 3' + P-element 2806 1 61.39 CCCCTTGCAAGAAAACTTATTCGATTATGCAGCCCAGTCTTAATCTTTAAATATATAGTTTTTTCTTGATAACCGAATAATAGGTGTTTTATCAGTATTTC:1 + chr3R 12364879 3' + Doc3-element 4534 1 71.29 GAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCAGCTTTGAAGCAGCTCGTTCGGACTAAGAAATTCCTCTTGCTAAAAA:1 + chr3R 10735112 3' + invader4 2968 2 53.47 CAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGACACATATATGTAGGTCGAAGCAAAAGAAATCCTGGCAGTTTATTTCGAAT:1 - chrX 18880066 3' + R2-element 434 1 64.36 AAAGTCGCAGAGCAAAATCAAAATTTTGGTAAAAAAAATCCGTTGGTTTAATGGGCCCGATAAATTCCACAGGCTGTCAGGGGGCCAAGGGTATATGGATG:1 + chrX 15237212 3' + HMS-Beagle 316 1 55.45 TATACAAATATACAAAAAAAACACCAAAAACTACGTAAGCACACAGAGAGAGTTATCCTGCGGAAAAGCTTGCGTTTGGGGGGAAAAGCTGCTGTTGC:1 + chr3R 25719753 3' + Stalker4 98 4 66.33 CCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTGCCCACATGGGCGAGTTTACAATCTGATCATGAGCTGTCCCATAAATCTAGGCATTGCCAA:1 - chr3R 5065552 3' + I-element 5077 1 72.28 TCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGGCGTTCTAGTGTGCTATAGTCGAGTTTCCCGGCTATCTGATAGTGGAAGTAAGAATGTGAAAAGTTAAAAAAAA:1 - chr2R 5246666 3' - INE-1 248 1 62.38 CCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGCTGGAGGCTGAGTGGCGATGCAAA:1 + chr2L 4297228 3' + Tirant 167 2 76.00 AGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTTTGTGTACACGCTTGAAAATTGTTGACGCGCGAGCCCCCCG:1 - chr2L 19519574 3' - F-element 394 1 57.43 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAAAGCAGCAAGGACAACAAAAGT:1 - chr3R 32042030 3' + hopper2 1557 1 77.23 CGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGA:2 + chr3L 23678158 3' - Osvaldo 15 2 67.33 AGCGGTTTGCCCTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGGGAATTTGGTCAAGTGCATTGAGAAGCATTTCGGCAGGTCACGCAATCTAATAACTGCAACTG:1 + chrX 9143240 3' - diver2 4623 2 68.32 ATTTTTGTAAACATGTTGGCATTGAGGAAGGCTCTTGAATATAAGCAATGCCCACATGTGCCTATGTAATTTTATGAATTATTTCTCATTTTTGTGGGCCT:1 - chr3R 15458776 3' + 1731 4281 1 70.30 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATATTTAATGTCTAATTAAATTGCAGACTCTCTGTAAATTCAAACGTAACATTAAAG:1 + chr3L 9552210 3' + roo 9052 2 54.46 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATATTTTGGTGTTTCAGCTTTTTTTCTGATTGCCAA:1 + chrX 12666037 3' + S-element 1681 2 70.30 GGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAACAATATTAGTTCTAAATTTCAATGTTTTTTGTAACTTTTAATATATTTTTTGAACGCTGGTTTTTAC:1 - chr3L 21434291 3' + HeT-A 5755 1 64.13 AAATGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGAGAAAGTTCAGGAGGAGGCGCGTAGGAAG:1 - chr2R 10739232 3' - F-element 4548 1 72.28 AATAATAATAATAATAACAATGCCAATGGAAAGCAAAGATATTCAGTTGCGATAGTGGCCTACCGTCAATCCATCTTCTTTTTTTCTTACCATCTAATGGG:1 + chrX 11362297 3' + mdg1 19 3 78.22 TCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCAGTAAGTGGACTCCCAGCTACACCAGCAGCGCAATCGTAGCTTACACGCTTTGGCATTTACTGTAGTTA:1 - chr2R 12323245 3' + flea 152 1 72.28 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGA:1 - chr2L 19845919 3' - F-element 58 1 69.31 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCAAATATCGGTCACCATCAATCTTTTCCGCCATCACAAATGGCCCCAAACTTTGGGTTTAGCTTTGT:1 + chr2R 3904810 3' + P-element 2870 1 71.29 GAGCAGTGCTGTCCTCTACCCACTAAAATAATTTTTTTTTTTAAGTTCACTGTCCCATTTTGCGATATATTTCCGTTTCTATTGACATCAGAGCATTTCCG:1 - chr2L 4130921 3' - HB 352 1 69.31 CCGTTNTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAATATTAATGTGTTTTTTGTGCTCTCATCC:1 - chr3L 7175603 3' + I-element 5013 1 73.27 ATTTANGATAAGGGGTATACAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCGGAATAATCCAAGGGATGAGTGTGGTGCCCTTGGTGGGGCTTT:1 - chr3R 29010951 3' - Cr1a 4132 1 65.35 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGGACATCCGTGCGGACAACATGGCGTATGATTAACATGTGTGCTTTTGCCGCCGGCAGCTAAATTTTGTGGCT:1 - chrX 8817080 3' - jockey 4677 1 74.26 ATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTGGACAGTTGGTTAAATTATATGTTTTAATTCCGAACACAAATCAGGTAACAAATAATTATGACTTCTTATTTTATTT:1 + chr3R 3921453 3' + Cr1a 195 1 77.23 ACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTT:1 + chr3L 25350809 3' + baggins 5402 1 56.44 AAAGTAATTTTCGTCAAATCAAACACCCAATCAGTGTGTGCGTTTGTATGCTACTGTATAATTCAAGCTACATTGATTGGGTGTTTGATTTGACGTAAATT:1 - chr2R 6218003 3' + Tc1-2 1469 1 73.27 GAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAGAAACGTTCCCTATATTGGCGGCGTTATGCCGTAGAAGCTAAAGACACCG:1 - chr3L 23666365 3' + I-element 365 1 52.48 GACGGAATCTCGGTCCCGTCGGTGGCAAGGGATGAGCACGCAGGCCCCCCGCAGCCGTTGACTAGCGCTATCAGCTGTTTTATCCGCTGCAACAATCGCAA:1 + chr2L 22373932 3' + Rt1b 491 1 64.36 ACTTCTTTATTTGACTGTACTATGAACAGCATAGCCCGGTAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGACCACATGTGAGCTATGGGAGAAGCCGGC:1 + chr3L 20558428 3' - Tc1-2 61 1 76.24 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGTCTTGCATATATATGAGAATTTTTATGAGCCACT:1 + chr2L 17862247 3' - F-element 53 1 67.33 CGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAATCGGAATCCACCCCATCAGATCATCGGACAATTTGGACCCGCCCGCG:1 + chr2R 16022222 3' + R1A1-element 5031 1 55.67 CTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGTCTTAGGAATATCGGAGGGGGAGGTCGGCTGGAGTGGCCATTCGTTTCGTCCTTTCG:1 + chr3R 6680133 3' + G4 3526 1 53.76 ATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATGCAGATGGAGATGCAGATACGGAT:1 + chr2L 2342023 3' - Quasimodo 461 2 76.24 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAACGAACAAATGAGTTGTGTATTAGAGGA:1 + chr2L 22690042 3' - Tabor 15 2 65.35 CAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCAAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTGCATAGCCCAGAAATCGAGCGGCAGCCAAGCAT:1 + chr2R 10547033 3' + R1A1-element 493 1 65.35 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAAAGGCAAAATCA:1 + chr3R 5208243 3' + hopper 1414 2 78.00 TGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATGTATGTTTTTCAGCGAATTCTGTTTTGGGGAAAAAAACCTTTCGGTCAACCCTCGTTCCCGCTGACATCGG:1 + chrX 12801545 3' - Burdock 6136 1 71.29 GGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATCTGGGCGCCGTGCTCGACTTTCGATGGACGCCCATAGTGGTGGGTCGAG:1 + chr3R 14881234 3' - X-element 4521 1 59.00 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACGATTTTCAATCGAGAGCTGAAAACTTAAGCCTTTAATCAGATCGATGTGATTAGTGCTGTC:1 + chr2L 11240973 3' - roo 8678 2 62.38 TGAACNCGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGC:1 - chr2L 5932094 3' - jockey 24 1 59.41 TGTCACAGCTACAATACTGTAGACAAAGATACGATAGATGCAAAACCTGGCTGAGCCACACGATGCTGAGTCATTGGCCTAAAAAGAAGTGAGTTTGATCT:1 - chr2L 19741149 3' - Circe 109 1 59.41 CGTTTTTCAAAAGAGTGGGCGTGACAGTTTTTTGCGATTTGTGGGCGATAGAGTCGTGGCAACATCAGCCAACGCTCAACTTTCTAGCTTCTATACTCGGC:1 + chr4 811360 3' - INE-1 254 1 64.36 CGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAATCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACAT:1 - chr3R 934264 3' + Bica 68 1 55.45 TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAGAAAGCGAAAAATAGTTGGCAAAAGAACATGAAGCTACTGCTTTAAATAA:1 - chr3R 8480399 3' + transib2 2802 1 59.41 CAGCAGGAGAAGGTTACCATCGCGAAGATTAGAGATGGATGTGATGTCTTTGCTTATATACTTAAAGGCTCTGTGTTGTGCGATAGCGGGGATAGCAGAGT:1 + chrX 2497529 3' - Ivk 449 1 74.26 GCGGCTCTCAAGCAAAATCTAGGGGATTCCGATTGTTTGGACATGTGTGAGGTTTTCTATTATCTGTAAAATGTTATGATTTATTATGTGCGGGCTCAAGA:1 + chr2L 14884106 3' - G7 1059 1 78.22 TGAAAGCCACTCTATTTGCGATAACCGAATTATCCCAAAACTTTCCGTGGGCTTGTGGTTGGCCATCTGTTTTTGCAGCTCGTACTTCTGCTCCTCCAAT:1 + chr3L 5791406 3' - Gypsy12A_LTR 184 1 55.00 GCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAGAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAGGGCGTGAAAATGCGACGAGGGTCGGGGAAAATTGCGAATGAGATG:1 - chr3R 13621672 3' + Doc 4483 1 52.48 AATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGA:1 - chr3L 16973358 3' - S-element 1529 1 64.65 TGTTTAATGTATTTTATTTATTTATTTAATGTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTTTTCAACTTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 3 1 74.47 GAGGGAGATATGGTATGCGTAAATACGCATTGGCAGTGCTAGCATTCAATAATGAGAAACTATTGGGTCATAAGCTATATGTGATCAGCTATGAAAAGATA:1 + chr3R 27379097 3' + gypsy11 3969 1 58.42 AGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTAAAAATACATTGAAAATGCATTAGACTTTGGCTCAATGGCATGAATT:1 + chr3R 21968894 3' + F-element 217 1 54.46 CTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGAAAATTTATCTAGTCTAGGGTAGTTAGTTGTCGG:1 - chr3R 27156483 3' + S-element 344 1 68.32 CGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGGCTGATTGTTGCTTTTTTTGA:1 - chrX 15161572 3' + FB 57 1 79.21 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGT:1 + chr2L 22319332 3' + Transpac 5178 2 76.24 ATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGAATGTAAGTACTTGGACATACCCACCACATCGTCGGAAAAA:1 - chr3R 25875907 3' + flea 275 1 60.40 CATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAGAGGACAGTTTAAATCATACAATTTCTTTGTAGGAAATCGATATGCCTTGATGCAGGTCAAGGG:1 - chr2R 7130512 3' - Doc3-element 4309 1 66.34 TTACAAATGCTTACAATCAAATGCCACCTTCACCAAAAACAAGTCCTCGCCAATGTCGACAACAGCCCGCATAATTTTTACCTGAAATGTCCTTTATTTCA:1 + chrX 20995431 3' + Chouto 6159 1 69.31 GGTCGGCGGCCGTGATCTGTGCGAGATAGGGATGTGGGCATTAGTATCCTCCGGGGATTCTGTGTCTCCTTACTTACATGCGTTTCTTGTTGTCGAATACA:1 + chr3L 5777206 3' + Chouto 71 1 72.28 ATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGCATTGAGTTGTTGCCGTTGCCGTATTTGTTGTTATTGCCACTGCCGACGACGAGT:1 - chr3R 21682690 3' - I-element 419 1 60.40 ACGTGGGCGCCAATTAACAGACAACAATTTTTATTTTTTTGGGTTTTT:1 + chrX 3161838 3' - gypsy4 272 1 68.75 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTGCGGCAACAAGGGTCGTCGGGCGATAATTGCAACAATAAA:1 - chr2R 22780975 3' + roo 9043 1 58.16 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTAAAATGCACAAACAAACCTTTTTCAATGCCCCCGTTTT:1 + chrX 2781282 3' - FB 40 1 64.36 AGATCTGAGGAACTATAAAAGCTAGAATATTGAGATTACTTGCCAGTTCAGAGGAGGCAGTCCTTCATACTCGGTGGTTCGACAGGTCAGCATCGGTTCCG:1 + chr2L 10013973 3' + INE-1 149 1 66.34 AAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAGGTGAAGCGCTCTATCCTTAGTCAACCTTTTTATTTGCTT:1 - chr2R 11847504 3' + Bari1 1672 1 59.41 AACTTTTAGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCACCTTTGTACATCATGTTGTTATGCCTCCCATTTCGCCGCCCGAAACCAACTTCGCCCCTTTAT:1 - chr2L 2925544 3' + Q-element 143 2 65.00 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCTGGAAGCAAAAGCAGAAAAATTGTTATGTGGATCTATATTATGGTACTTAATGAGCTT:1 - chr3R 18366526 3' - roo 8 2 60.40 GCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTAAAGTTTTGATTTTAAATTGTTATGCATTATACAGTAAACTGTAGATTGCTGG:1 - chr3R 8761828 3' + Quasimodo 7048 2 55.45 TAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGCTTTTTGCGGTTTTTTGAGAAATTTCATTTTTCTCCCCTTTTCTATTGCGTTGTAACGTCAACTTTCTGGTA:1 - chr3R 10071131 3' - hopper 937 1 60.40 CTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAAATCTCAAG:2 - chr3R 10490335 3' + transib2 2796 1 55.45 CCATAAATTCCAGGATGGAATATGAAATACCCATACAGTATTGGAGTTTTAAGACTTAAGTGCCGAGACGGTCGCGGTCGCGGGCTTAATTTGCAATGTCT:1 + chr3R 26004467 3' - Circe 361 1 74.26 TGGTTAGCCTGGGAATGCTAACCATGCACTTATGCAGTGTGCTTCATAAGAGTGTGCGACGCAGCATTTAGCTATAACACTTTCACATGTAGTATTAAGAC:1 - chrX 21939358 3' - gypsy11 181 2 54.46 TAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGA:1 + chr2L 3245011 3' - rover 24 2 58.42 TGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATATGTGTAGGTATACATACAGGT:1 + chrX 17936168 3' + jockey 4578 1 78.22 TTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTTAGTTTGCTCCAGTCATTTGTTTTGACACAACAAAACGGCT:1 + chr2L 12390519 3' - hobo 450 1 59.41 AGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGCAATCTACACAGGTTGACAAACTGCAAAAG:1 + chr3R 8999095 3' + TAHRE 10382 1 77.23 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGGGGTTTAAAAAAGCAATAGAATTATGTTGTATAGG:1 + chr3L 25751333 3' - Max-element 43 2 71.29 TAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACGTGTGGCGGTTTTATTTTTGGCTTCCTCCGTTTATTATTTATTGATAAA:1 - chr3R 21041617 3' - R1A1-element 5042 1 53.47 ATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATTGGGTTTATTTCGATTCTAACTGGGAAAATTTTCAATTTTTTTCAATACTTGCGGATGAT:1 - chr3R 15281847 3' - 297 6832 2 60.40 ATAAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATATTATAAAATTTCGTCTTGGTTAGGGTTGAAGACGTTCTTACGTGGAAAAAAGAAAAATTTCAACTAGC:1 - chrX 8810400 3' - accord2 7182 1 79.21 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGTGTGTGAATCTGATAATAAAGGTGCTGGATTTTTCCTAGCATACTTTCT:1 + chr2R 13280160 3' - jockey 32 1 55.45 CAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACAACTTGTAGTAGTACAACTTGTGAAAAAACTTCAGTAGATGTTTGTGGGATAGTCTTGTTCGATTT:1 + chrX 19258465 3' - Transpac 113 2 72.28 TATTATATTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCACTCTTGTTAGCTGCCTTTCTCAGCAGCAGTTCCGTATTTTCCT:1 - chr2R 16916192 3' - I-element 4922 1 56.44 TAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCGAGGCGAACAGACGGACAGAGATGGTCAGATCAACAAGAGGCAGACGGCAGCAACAGCTGCGGCCAACAGAAAGGAGA:1 - chr3R 14648486 3' - INE-1 151 1 57.43 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGGTA:1 + chr2R 5640419 3' + roo 9050 2 57.43 TTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACTGTCGATCAGACCATAAATGGCCGCCATGCTGTAGTCACTTTGCCCCAGTATCTTCTTGAAGAGCTCCACA:1 - chr3R 25492706 3' + 1360 3190 1 77.23 CATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAA:1 - chr3R 13339049 3' - BS 5037 1 62.38 CGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATTCTTTAAATTCTCCACTGCACTGCAGGCTGTATGCTAAGCAGAGCGACCATATCACTTTGGGGGC:1 - chr2R 18005074 3' - R2-element 3280 1 50.50 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATTCATAGGCGAGCC:1 + chrX 1523780 3' - jockey 25 1 66.34 CCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCACACTCGACCAAATAAAAACAACAACGACAGCTAGGAGCAGCGCAGCCAGCAGCGACGTCG:1 - chrX 5082006 3' + I-element 4880 1 56.44 CCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTGTGGCCGGCG:1 - chr2R 5322015 3' - 1360 41 1 70.00 GTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATCGGCAATTGTAACCGATTTATTGGAAGGTCGTCGTTCCAAACGTGCTGACTTGATAATGG:1 + chrX 12235359 3' + invader4 2684 1 70.41 TGAACATTCTCGTTGAGCCAAAAGGCCATCGAAAGACCACGGGGGCAAAGTCACGCCCTCCATATAGCGTATATGACTGCAATTAGACATCAAG:1 + chr2R 5966895 3' + gtwin 324 2 67.02 GCAGTACACATACAAACCCAATTAATAATAATGTAGAGCGTAAAAAGGATCTCTTATGTATTCATATGAATGAAATTCTTCTTGGCGTCGATTGTAAAGGG:1 + chrX 17507858 3' + baggins 5422 1 70.30 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATCTGCGCCTGGATTGCCGCAGAGTTATCACCCAAATCGATGTAACA:1 - chr3R 17788879 3' - roo 5 2 72.28 CCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACAGTAAATGGCCAGCGAGAGGTGGTTTTCACTGTGTGTGTG:1 + chrX 9805690 3' + accord 6986 2 61.39 CCCTCGATATATGCACATACTACAATGCTCCTGATTTTGCAACACATTTTCCTGAATGTAAAAGTCTCTGGGCAACCGCAGAAAAATGAGTGG:1 - chr2R 9653248 3' - blood 7014 2 74.19 GTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCTTTTCTTTATGTACCTACTGAAAAATCATGAGAAAACGGGC:1 - chr3R 29159307 3' - Bari1 297 1 62.38 CCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 4927 1 63.37 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATG:1 - chr2L 5932098 3' - jockey 28 1 55.45 CCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACGGAGCGGAAGTAGGAAGAAGACGGAAACTTTATCCTCGTGGCTGTGGTATTGAAGTGTTAATTAATAT:1 + chr3L 13607305 3' + Porto1 4476 1 70.30 AGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCC:1 + chr3L 13888667 3' - copia 56 2 79.21 AATAATTATATTTTTGAAATTACTTATTATTAATTTGTTCTTAATTAGAAAAATTCTTTCATTTAAACATGGTTTCCAGTTGTTTCAGTGTATGCATCAGG:1 - chr2L 12803816 3' + P-element 2503 1 50.50 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATAC:1 - chr3R 9193584 3' + roo 9042 1 56.44 ATTGTNATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAACTATGTAGAGGCAGCTCATAAATTGATATGTCCGAT:1 - chr2R 12734599 3' - mdg1 6 2 40.59 TACATCGTATAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACTACCATGCCGGCTGTAATTCAACACGAAACCCTTCACCTGCTGGGCCTTTTCCACGAGCAGAGTCGTCC:1 - chr3R 15078801 3' + 3S18 461 1 64.36 TTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACAATGTAATGGCATTTTTATGTTGCATCACGTACTGGTCAT:1 + chrX 9922720 3' + 1360 3167 1 62.00 GAGGAGGTGGCATCGTGGAAGATGTGTTTCAGCTTTCTCTCGTGAGTCCATTGGCAGGAGGAGGCCCGGAAAGAACACAGGACTACGGCTATTGAATC:1 - chr3L 18405895 3' + Osvaldo 439 1 63.27 GATCCGTTCAGCGGTCGTAGCAAACGTATTTGGGCGGCTGACGGGTATTCTTGGCAACACCACATGGAAAAGGACCCATCGAATTGCCCACCCATTGAAC:1 - chr2L 18654576 3' + Rt1c 464 1 70.00 TTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGAATGCGCCTTGAATACAATTT:1 - chr3L 11811001 3' + copia 4965 2 77.17 GTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGGGCTTAAGGGGAATCATTATTGTGCAATATCGCATCAGAAATGTTTTTCATCAGTA:1 - chr3R 4637054 3' - 297 180 2 62.63 ATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCTATCTACCGCATTCGAGACTTATTCCTAACATCTGTTGCAGCCAAAGATGACTTAAAGGC:1 - chr2R 14234324 3' - Stalker4 7169 4 64.00 TTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCCACGTGCCACAAAGCGTTTCGTTAAGGAAACAGAGAAAGACTAATTTCCGAGATCGTGCAGTTTAGCGAG:1 + chr3R 20854018 3' + invader5 245 2 72.28 CTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTTCACCTTGCCCACTTTTCCCGCCACGCTAATGATCCTCGCCACTGGCGCCCACGTAA:1 + chr2L 8572326 3' + HMS-Beagle2 134 2 62.38 TAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGCACACTACGACAGCAGCTTAGTCATTTCTTTGTTCGCCACCCAATAAAATCTCGATTTTG:1 + chr2R 9512062 3' + accord 7158 2 61.39 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACG:1 + chrX 16619660 3' - opus 161 4 76.24 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGCTAACATATTGAATTATAGAAAATA:1 - chrX 11060458 3' - I-element 6 1 65.00 GGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGAGGCGGCACAAAGAGAGTAGCTGGAAAAATGCTTCGATTCCTCATCAA:1 - chr3L 3577114 3' - INE-1 101 1 52.48 CTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTTGGTGCCGAGATCGCATGTGAACGGCATCGATGTGGACACCCTCGAAGGCGTAATCCTTCT:1 - chr3L 12130704 3' - R2-element 453 1 60.40 AGTTTNTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGTTG:1 - chr3L 17624161 3' + roo 9042 1 52.48 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCCGGGCTAAAATGTTTTT:1 - chr2L 796742 3' - jockey 23 1 61.39 AGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGCGGCTATTCATTTTCATTTTCTTTTCAGCATTTTCTTTGCGTTTTGTCTATAT:1 - chr2R 10225191 3' - blood 7174 2 51.49 TGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 457 1 58.42 GTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAACAACAACAAATAGCTGCTCAACGGTTTCGGAGCGTATTTCCAAAGAACGTAAATTAATGATGA:1 - chr3L 9147645 3' + 1731 300 1 70.30 TCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTCGATCTCCTCCTCCAGCTGGCGTGTGAGCT:1 + chrX 13827617 3' + invader2 4890 2 71.29 CTACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTACGCTTTAGTCTACTAGAGTCCCGGATTCCATCTCCGCTCCTCGGATCTTCGGATCTTAACTCAG:1 + chr3R 14725118 3' - accord2 7403 1 71.28 TATGACTCTTCGTCTCCGTTTTGTTATGGCGGCAGCTTGTGTGCCTGGCTTCAACTTTGGCGCAGTTATCGTGTCGACTTAGAAAGGTTATTCTT:1 + chr3R 19599224 3' - HeT-A 256 1 66.32 AGTCGGGGATCTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTAAACTACTCCCACTCGTCCTACCACACGGAAATTGCAAAACTTTGCCCGTGCGACACCGAAAATT:1 + chrX 1416176 3' + INE-1 567 1 64.36 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTT:1 + chr2R 8463630 3' - I-element 17 1 55.00 CGATGCGTTGCCCCATAGCTCGGAGCAATAGGTCCATATGGGGTTTAAAATAAAGTTATATAAGAGGTCTTTGGTGGAGAAACTTGAGTCTGAACCTTGGG:1 - chr2R 24160743 3' - Doc3-element 4335 1 70.30 GTTGAAACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCCACCGCATCCTCCAGCACCTTCACCTTC:1 + chr3R 28339346 3' + GATE 8203 1 70.30 TACGTNGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTAGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGAGTAATGAAACAGGAAATATAAATT:1 - chr2R 10530917 3' - Quasimodo 7097 2 73.27 GAAAAAGAAGTGGAAGTGGAAGACGAATTTACTCGCCTCTGGGCATGGGATAATAAAAGGCACATGAAAAATGTAGCAGCTTCCAGGTGGAAAATGGAAGG:1 - chr3R 26349106 3' + transib4 2201 1 75.25 AAAAAAAAAAGAAAAAACAAACAAACATAACCCACATTTCATGGGGAATTTATTGAGATGT:1 - chr3L 14307614 3' + HMS-Beagle2 488 5 68.85 AGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCCAACCAAACGAAACCGAACGAGCCATCATCAAGTGGGCGCTGAAAACAACCCCCGAA:1 - chrX 19535509 3' + G-element 3903 1 65.35 GTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTTAGTTTTGGTGGCTAGGTAGTTTATTTGAAAATAACATTTATGAGCTCAGGAAGCCTTAAGACTTT:1 + chr3L 13256731 3' - Porto1 4498 1 62.38 TTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCAGGAAATCTGGGCGAGATTCACTTCAAAGTCCAGTGGCGAATCGGGCGTTTGGATTTTGGTCAGAGTCG:1 - chr2L 3328121 3' - G6 1797 1 70.30 CCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACTGCTGTGATGCGGCCAAGAATCCATTTAGAGGGCGGTAGATTGGGCTACAATGTTTGAGCGAAAATGGGGAGTGCG:1 + chr3L 1937393 3' - 3S18 5641 1 71.29 AGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCCCCCGCCGCTATGCTCTTTGGCAAACTGTGCCAACTTGCAAATGGCGACAAGATGCTGGCTGGCAAAAG:1 - chr3R 17322091 3' + Doc 367 1 74.47 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGT:1 + chr3R 8480467 3' - transib2 43 1 68.32 CAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAGGACTTACGAATCCCTCATGTTAAAGAGTATCTCGTAATCAGCCCTTAAAATCT:1 + chr2R 7891496 3' + G4 3513 1 73.27 GCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCCAACTTTTGGGCTTGGGATCAAAGGCGAGCTTAAGAAAGAAGAGCAGCAGCAACTCGATGTCCACAGGCAG:1 + chrX 20461491 3' + gypsy7 5273 2 80.20 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTTTGAATCCAGCCGAACACAAT:1 - chr2L 22731662 3' + 1360 3340 1 72.28 GTGTTAGTAGGATTTAATTATGTACTAAAAAACTTAAAATTGATTGCTTTAAAAGCGGCAAAGAAAGGAGGACTGAGGTTTACATGCAAAAATTGATGCTT:1 + chr2R 1983471 3' - Cr1a 4286 1 61.39 TTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGACGTTGCATGCAATCCCTGCGACACTCCTCGAA:1 + chr2L 3621172 3' + 297 6965 2 75.25 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAGTTTCG:1 + chr2L 5152020 3' - I-element 19 1 59.41 CTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTATGCCATGTGCACGAGCGGCCCATCCTGTAGCAC:1 + chr3R 15415885 3' + Transpac 4836 1 66.34 TTGTTGCCCATGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCAGAACATCCGGATCCGAAAGCCAACAACGGCAA:1 + chr2L 21789452 3' - Tc3 1331 1 67.33 ACACGGAGCTACCTGCGTTTCAGGAGGAATGGGCCCAGTGTGCCCTGGCCAGAATCTCCAGCCTACATGGTGACATCTCTCTATCCCCGATTACCGACGCT:1 + chrX 4400618 3' + G2 493 1 74.26 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCTGCCTTGTGGCATTTTCGGGCCATTGTGTGCGTCGTGTGCGTGTCCTTAAGC:1 + chrX 7787867 3' + opus 498 1 53.47 CATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTTCCGGAAGAGGTAGTGTCGCACCAGGAACTCCTGGAACCAGCCGAG:1 + chrX 16962263 3' + F-element 231 1 54.46 TTTTTTATTTTTTATTATTTCAAGCTTAGAAACAGTTTACGACTATGTTGGACTATCTCGGATAAGTTTAATTACTTGGTAGAGTGCTCCATTTGAACATA:1 - chrX 4945216 3' - Rt1b 5146 1 56.44 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCAATATTGGTTTGAGAGCAGTTGTGCTCTCTTACACTCAAGTAGCTCTTTTA:1 - chr3R 4806542 3' - P-element 15 1 64.36 GTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCACTGCAAAAATCCGAGATATCTGCGGCGTTGTACCCCGAAAAGCACATCCTCTTTTCCCAAGTTCCCCCTTCC:1 - chr3R 28141778 3' + Ivk 288 1 53.47 ACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATTCGTCGCTAGCTGCTTTTCATTCATTTTGAACTTTCGACGATT:1 + chr3L 19515150 3' - roo 8646 1 57.43 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATATTTAATGTCTAATTAAATTGCAGACTCTCTGTAAATTCAAACGTAACATTAAAGAGAC:1 + chr3L 9552214 3' + roo 393 1 58.42 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAGATTCTGATTCTGATTCCGATTCAGATTCAGATACAGATACGTATACGAATTCCGGATCTGAATCCAAGCGC:1 - chrX 11006809 3' + roo 407 1 76.24 GCGTTACCAGAAGGAGTTCGGGACTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAACAACAAACGGTCATCACGGGCAT:1 + chr2L 7780767 3' + gypsy8 425 1 79.17 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTAT:1 + chr2R 14582891 3' - roo 8704 2 66.34 TATTACAATTATTATTATTATTAACTTCTAAGAAAGCTTATTGTGCAGTTGCCAACATTGTTGCATGGCCCCCAGCCCGGGGGGTAAAAAGCCACCCCCGC:1 - 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chr2L 769030 3' - I-element 234 1 65.35 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATGTTAATATATTTAATTTCGCTGTATG:1 + chr2L 20465643 3' - blood 48 2 76.24 AGCCCGCATAAGTTAATTTTGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCGGGCACAGGCGGCGGTCACCGCGTACGCCGCTCCGGCACTTGCTATCGCATAGGTGTAG:1 - chr2R 9501989 3' - hopper 1302 1 66.34 CTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACGTATTGCTGTGGAAACGAGATAAGGGCGGAAATTGAATTA:1 + chr2R 12754763 3' + invader4 2660 1 55.06 CATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAGACTTATTCTGCATTTGGAATAGAGTTGTATCCAGTAATACATAGGCCCCACTGTACTCTCTGCGTT:1 + chr2L 9069833 3' + Quasimodo 52 2 68.32 ACCAAATATCATCCTCTCACCGTTCTGGTGCTTAAGCAGAGGCTCAGGTGTCCGAGTCGATGCGAGGAGAGGCGAGGGATACGGAGGCTGGCCGGAAGTG:1 - chr3L 14139437 3' + Rt1b 212 1 60.00 TAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACACGTCTGGCTTCAGTCGACAAAATTTTTTAATGCGCGCGGTTGTGCGTCGCT:1 - chrX 1134853 3' - copia 4863 1 57.43 TCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCATCAACAGCAAACAATAATGAGAAATGAGCGGGGAAAGCAAAGGAAAGGGACGGAAACAGTC:1 - chrX 15234537 3' - Ivk 5106 1 65.35 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTACGTACATATATATGACAGGCCAAACATTCCCCAATCGCCATCGAAATTATGCGCCGATAGCAGA:1 + chrX 757089 3' + S-element 1708 2 59.41 AGCTGGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCGCACACAATTGGAAAGACGTCCGCACTCACAAGTCCCCGCCACTTGGAACCCCGGATCAAGAACTAG:1 - chr2L 14533405 3' - Ivk 69 1 61.39 ATTTAGTTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTGTGTGTGTGTTCGTCCTTGCGTGCGGGCATGTGTGAGTGTTTATATTAGAGGAATGGTAAGCCCTTT:1 - chr2R 23192978 3' + transib2 308 1 67.33 CAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCTAGCAAGCCACCATGCGCTTTGTGTCATCGATGAACAGCCCATTGGCTCCACGTATGAGCAGCCTTTCGCTG:1 + chr2R 19342615 3' + I-element 210 1 81.19 ACAATTTGCTGTCGATCCGCAGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCACCTGCTCCCAATCGTTGACGTGTTATGTCAATGTTTGTTTTCTACCTTCGCTC:1 - chr2L 9431608 3' - G6 37 1 58.00 TGCACATATTATATGTGATTGCGTGGCGCTTTCTATCATTGGAAATCTTGGTGCCCAGCCTATCCTTTACCGACCTGCTGCTGTTGTTACGCCTGGGTGAG:1 - chr2R 24091223 3' + baggins 5235 1 70.30 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATGAGAGTCGCCGGTGCCATGGCAGCACCTAGGGGCCGTATGATAATTG:1 + chr3R 11833037 3' + roo 9054 2 59.41 ATTAATTAAAAGAAGTCTACGGGAATAAGGAGGTAATATACGGTCATGCAGAACCAGCGGAATATGAAGGAACTGGAGGCGAACCTCCTGCTCCGACTGAG:1 - chr3R 9656345 3' - Cr1a 3979 1 61.39 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGGACGACTTTGGTAAACAACCGCACTCTGGTCAA:1 + chr3R 25814789 3' + 412 478 2 63.37 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGATAGTAACAATAGATATTTAAATTTCAAA:1 - chr3L 1270836 3' + roo 9022 2 75.25 ACTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCGGCTTATTCCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCTTCCATGTAGTGATACTCGTTGATCCGT:1 + chr2R 4500980 3' + Chouto 178 1 72.28 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCTAAAAGTATCACTGAGAGCAACCCCAAAATACCGACCCTGTTTGGATTGGATGTAATGGAT:1 + chr2L 3825350 3' - blood 17 2 51.49 TGACGGCTGCCCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAA:1 + chr3R 14832457 3' + blood 7344 2 68.32 GCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATGAGGCTGCACCAAATCTTCCATCCTCTCCAGCCGACCATA:1 + chr3L 21667717 3' + Doc 4530 1 60.40 TCTGGGTCTCAGTACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCTCCGTAACTCAAACGGCGGCGGCGGTGGTGCGGCTCCCTACA:1 - chrX 21206375 3' - R1A1-element 5081 1 64.94 ACCGTCCAAGAACCCTACAAGATTTAAAAACCAACATCCAAGAAGAAATTGACAACTTAACACCTGCTATGCTAACAAACATCGTCCCTGTTTCTGGTTGG:1 - chr3R 7762019 3' + mariner2 636 1 80.20 ATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCTCCATCGTGGACACGTCGGCCAGGTTGAGGCCCTTGCGCAGGCAGT:1 - chr2R 9817629 3' - roo 8982 2 54.46 AGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAAACACTTCGGTCCACCGTTTTCCGGTGCGCCACTGGCACTCTGTCCTTGACCCTGGC:1 - chr3L 25514005 3' + X-element 4697 1 53.00 TTTAACCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCACATCTTATAGATTCTAAAGTGAACGTATCC:1 + chr2R 8660543 3' - Dm88 421 1 69.31 CGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTAGCAACACCAACCTCTCTACTATAAACTCCAAGCAGATGCCAAACTTCCT:1 + chrX 16602899 3' + Doc 409 1 57.43 ACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCGTCGAGATGGCTAACGCCAAAGCTGAGACTGCCAGGCTTAAAACGAACGGCGCAGGGTCGACGAG:1 + chr3L 26526144 3' + gypsy8 4482 1 63.64 AAATACTTCACTTTGAACTTATCATGGCAGAACCAAACATGACCTTCCATGCTTGGACCGCTCTTGTATTACTTATTTGGTCCATTATTTGTGCGCTGCTT:1 + chr2R 15800645 3' - gypsy4 451 1 59.41 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGCACCTTTTTGTGTCCAACTTTTCATTTTCAAT:1 + chr2R 11730924 3' + blood 334 2 67.33 ATTTANATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCC:1 + chr2R 14582883 3' - roo 48 2 73.27 GTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGTTTTGTTTGGCTCAATTTTTATTAATCACCGACGATT:1 + chr3R 15870286 3' - micropia 5332 2 75.25 GTCAAATAATAAAAAAAAACATGACACCTATGGAAGCTTGGTCGGGTAAGAAACCTGGTATAAGTGCAACGTGCCCCGCGCAGGAAGCTTCCCCAATGAAC:1 + chr2R 16450079 3' + Rt1b 5145 1 63.37 ATCTTATTTGGGATTTTACAGTCTCTAAGCCCAATATTACTTAAATAATGCATGCCAAGTATATAAGTAATTGATAGTTGTAGCACCTTACTTATATATAA:1 + chr3R 15814751 3' + roo 410 1 75.25 GCCTTTTTACAACCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACGGGAGTACTCCTTATCTATCTCTACACTTCGGGCCACTTC:1 - chr3L 10250778 3' - Rt1a 4829 1 78.12 TAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTATACATAAGTAGCTGGACTGCCTGCTGCCTAGCTTTTCCCATCGAAAAAAGCAATCACCTGC:1 - chr3R 19804224 3' + Circe 7172 1 65.35 CCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTATGATCAGTTGCCGGCGTAGCGCTTACCAATAAATAAGTTCGATAAGATAG:1 - chr2R 18862706 3' + Dm88 4197 1 56.44 TCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGCAGGTGGGCGACCATAAGCAGCCAACTGTTTCAATCAACGTCAAATTAAACTTGTCCCGAGACTC:1 - chr3R 26587791 3' - F-element 4422 1 77.08 AATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGTTATACTGAACTTATGTATGTGTCATGAGTTCAAGCCGATTAAACAATACATA:1 + chr3R 23169271 3' - invader2 4930 2 70.30 AATTTCCGGACTATTTGGAGGAGGACGGCAAGGACGGACAAGCTGTTCCGACACATTCCGCAACGGGTGGGCAAAAAAGGAAACATCATCGTATCACTTAA:1 + chrX 13029411 3' + Osvaldo 374 2 50.50 TGTTATTATTATTATTATTATTGTGTATTTTTATTGTTTTTGTTGTGAGTACAGGGTACACCGCGTTTAGCTTTGTGACGGTGATTTCCTTTTGTGACCAA:1 - chr3R 9485263 3' - mdg1 7069 13 73.27 TTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTAACGGCGAGGAATCTTGGGCTTAATGCCAACACGCCCCTACTTTAAATGCTG:1 - chr3R 18720506 3' - micropia 5161 2 60.40 GGACACGATTACACCGGTGTTTCACAGGCAACAAATTCTCAAGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTCCATCCTCATAATCTGCATCCTACGCCTTCGA:1 + chrX 10969622 3' + Gypsy12A_LTR 1980 1 70.30 CGAAGATCGACAATACGAAGTCGGACGAAGATGTATTTGGGAGAAGCATGCATTTTTCTCGAAACCGGAGGACCTTTTTCATTTTTTGGCCGTAACCTCGT:1 + chr2R 22453543 3' - accord2 7567 2 54.46 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCA:1 - chr2L 16691181 3' - pogo 50 1 77.23 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGG:1 + chr3R 25814757 3' + 412 7500 2 69.00 TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTAATTTGACAGACATCTGAGAGTCATTT:1 - chr2R 19232861 3' - Burdock 6181 2 72.28 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATGCAAACTTAACCTCAATTTGGCACTATTTAATT:1 + chrY 1618884 3' - F-element 51 1 64.36 CCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCGCGAAATCAAACGACCGCGAACACGTCGCGAAAATATACGACTAAAATCGGTCATAAAA:1 - chr2L 20328862 3' + accord 7339 2 61.00 GGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGAATGAGAATGGGAACGGGAACGGGAACGGGAACTTTCATGCTGATTAAAAGTGGC:1 + chr3L 15664420 3' - F-element 4496 1 52.48 TACTTATGGATCGCTCTACATTGATCCAGATCCTATGATCGAATAAGACACCAAGATCTGGGACAGTGTTTGGATCAGAGCTGGTGCAGCCCACATTAATC:1 - chrX 21392937 3' - G3 4367 1 68.32 ATACATTTTTTTATATTTTACTGTGGCATTGAAACATATGTAAGTTTTCATCATAGAAAAGGAATAGCTTTCCATCTTTAGAAACATCTGAACGAAGTGCT:1 + chr2L 14262925 3' - transib4 2279 1 74.26 CTTAAAAGTTTTCCCATTGGGAGACCAAATAAACTCCCACAGCAGCCGATACGCCGACAGACTTAGCGCCCACCCTCTCCGGCATCCTTGGGTGTGAATTT:1 + chr3L 10709770 3' + G5A 2562 1 72.28 AATCCACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCGTCACTTCGAACTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAAC:1 - chrX 2253835 3' + Tirant 8053 1 44.55 AATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGTATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAAAGCGAAAGAGAAAGAAAGACGCACAACAAA:1 + chr3R 28788744 3' + 1360 3150 1 71.29 TATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTGACAGGCTTGTGACTTGTAGCTTTGCAGCTTGTCTGTGCGAGTGTAAAGTGTTAAAATGCACTTAAATATT:1 + chr3R 27804896 3' - Quasimodo 38 2 59.18 AGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGCCGGCATCTTAATGACGTCACGTCGTGCCGCAAAAAACCAACGATAACAACAGCTTCTGCAACAACGCGCG:1 + chr2R 17265990 3' + I-element 345 1 50.00 ATAAANGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGTACATACACGGTTAATATTCCTTGACTACACTGTATTTCGC:1 - chrX 22867330 3' + HMS-Beagle 213 2 59.41 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGAATTTGATAGGACTGCTTTTTGTATACAAATACGTAATTTCAGATGTAAG:1 - chr2R 21239373 3' - jockey 33 1 48.51 TATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCACGCAGCATTGCTTGGTGCTGAACTCGTCGAATTGTGGTGGGATCTTCCACCTA:1 + chr3R 3774703 3' + F-element 4251 1 58.42 ATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTTTCCTTGTACGCTAGCCCAAAATTTGACATATAAAATTCAACTTTTGGGTGGAATTTTTGAGTCCATCTGGGTG:1 - chr3R 11097481 3' + mdg1 7459 2 74.26 GGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTTCACCTACAAGCCCATCTTAAGGAAAATGTGTTAATAAAAGGTCAGGATCCGGAT:1 - chr2L 2086264 3' + baggins 5394 1 64.36 TAGTCATGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTTAGGTTAATTAATAAACCAGCACCAGCACATATAT:1 + chr3L 1459039 3' - copia 209 2 66.67 ACTTGTGCATTCGATATAGCTCGTTGTCGGCTGGCCAAACTGGCTTACAATCCGATCTGGTTTGGTTTTTTGCTCTTTTTTGGGCTACAGGGGTTTTGCAC:1 + chr3L 782156 3' + diver2 246 2 69.31 ATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCTACAACTTCGACTTTCGCATCAGATACAAGGTTTTGTCCAGGGACAGTTCGGTGACCCGCTACGGGGGC:1 - chr3L 20854950 3' + flea 4754 1 72.28 TGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATCGATTAGTGTCCATCGAAGTGGGAGTGCATTAGAAAGAAAGTGAATTTGTTAA:1 + chrX 8471025 3' - 1360 3305 1 64.36 AACGTTAATCAATAAACAACACAATCTGTTGGCTGCACTTGGTAAATGAGTGCAAGTGGGCGTGGCGTTGTTCTGATTGCCTGGCTTTCATTTCGTTTTAT:1 - chr2L 10550050 3' + 17.6 362 2 54.46 ATAAAATGGAGCATTAAGAATTTGTATTAATCTCAATATTTGAGTTGTATGTTTCCATTGTGGGCACTTCGCCTGCCACAGCGCAGATGACGGAGGCCAAG:1 - chr2L 18711514 3' - G4 3515 1 61.39 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAA:1 - chr3L 21908907 3' - roo 8715 2 75.25 AAATAAAGAGCCATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCTGTCGTTAATTTTATATTTGATCATAGCCCTCTGAGTCTGTCGACAGTCCTGTTTGTCC:1 + chr2R 12240427 3' + gypsy3 149 2 75.25 ATGTGCATGCAATAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACACACACCTTCGCACTTGGGCCACATGGGGCTGTTAGATCGTTAAAAGCAAGTTTAACTACCA:1 - chr2L 13593931 3' - Cr1a 255 1 67.33 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACTTCGGCGATCAGTGAGAATCTTTCCAAAGCCAGACTCTTGGCC:1 - chr3R 31318442 3' - F-element 64 1 65.35 CTATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAACAGCAAGAGAGGACACGGCTGCAAACTCAGGTGGATGTGACCGACGCGTCGGG:1 + chr2L 5644793 3' + R2-element 352 1 58.51 CGAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACTAGTCTATTAATCCGAATTGCATCGAGTGGGCCGAACGGCTCGAGCGGGAAGAAAGGG:1 - chr3L 16728984 3' + Ivk 4942 1 60.47 AGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACTTGCTTAAATGAAATCAAAGACGAAAGCGAAGACGGAACCTATTTATATAAT:1 + chr3L 1715465 3' + Tirant 425 1 55.45 AGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGGTGCATGAAATTTCGAGGCAGGCAAAGCAGCTGCAGATTGCAAAGCAGCTGCA:1 - chr3R 16315411 3' - roo 486 1 57.43 TGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACATGGAAGTCCCAGGAACCGCTGCGTCTGCGTGGTCATTCTCCAGTGGAAGAACACCCCTGCTCGCGAAAAGAATGCCC:1 - chr3L 10940077 3' + gypsy8 486 1 75.25 ATATTTTACAAAAAGCCAATATGAAAATCTCACGTGTTATTCTGCACATTTCATTTGTCTTGCAGCGTGAACATGTCGAGCCAATCCCGACGTGCTGG:1 + chr2L 5543336 3' + TLD2_LTR 115 1 74.49 TATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATGGGGTATAATTAAAATGATCGCAGCCCAGGGGCTTAGCAGGTACCGAGGCAAAA:1 + chr3R 18025731 3' - 1360 3210 1 65.98 TACACGGCAACGGAAAAGGAATGTTTAGCAATAGTATGGGCCGTCAGAAAGTAGAGGCCGTACCTGGAGGGGTACCACCGCCATAGCTGCAAAGATAATGT:1 - chrX 9021344 3' + Osvaldo 46 1 63.37 GGTGTTCTTGTTTTTGTTGTTATTTTATTATTCTTTTTTCTATTTGCATTCGAGTGTCATCGTGCCGATTCAATATGTTCATTCACCGATCACTATGTTGT:1 + chr3L 4110431 3' - I-element 132 1 69.31 AACACAACCCTGCACAAATACCTCAAGTTAGCCACTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGAC:1 - chrX 10319670 3' + BS3 1418 1 63.37 CTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGGCTCGCGTAAGCGACTTCGTGAGGGGATGTTGCTTGGCCACGAGATGTATGTACAATTTTATG:1 - chr3L 21723425 3' - Doc2-element 4609 1 70.65 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGATTTCCTTT:1 - chr2L 19845876 3' - F-element 15 1 66.34 ATTTCGGGAGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATGTATGTTTTTCAGCGAATTCTGTTTTGGGGAAAAAAACCTTTCGGTCAACCCTCGT:1 + chrX 12801530 3' - Burdock 8 2 60.64 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATAAACTAATGTTGCATACTTTTG:1 - chr3R 29653067 3' + jockey 4941 1 81.19 AATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTTGGAAATTAAAATTTGGAGTATTAAGTATTTCTTGTCAAGT:1 - chr3R 4063677 3' - copia 4836 1 59.41 TATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTCTTAGACTTTAAAGTAAATTCTTCTCATCCTGACGCCAGAAAAATAGTTT:1 + chr2R 5772326 3' + 1360 191 1 63.37 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCAAAATAAATAGAGTAAACTCACTGCAAATAATGCAAACAAAGTGATCAAAAT:1 - chrX 13569205 3' + Juan 4166 1 57.43 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACCTAACTCCCGCGCTCTTTCTCTCTCTTCAAATGAACGGATCGTCTCCAAGCTTTGAGATGCCGTAATCTCAGCTATT:1 + chr2L 306573 3' + Tirant 8497 2 68.32 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCAGATCATACGCGAACGTTTGCCGGATTAT:1 + chr2R 14582925 3' - roo 8670 2 72.28 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTTATCTTTTATATTTTCCCAAACTTGTTGCACTGA:1 - chr2L 6605565 3' - blood 7050 2 70.30 ATAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAAAATACTTGTCTGTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGACCAAAATGTTTATGACACTTCTCTAGGAATTGGC:1 + chr2R 9158078 3' + 1360 371 1 65.35 TTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATGGTTAAGATTCTGGGGACTCAGTGGGTTAAGGGGTAAAGACGGCTGGAGGGAAGACA:1 + chrX 7546341 3' + diver 6004 2 65.35 TTTATNTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCG:1 - chr3R 14832424 3' - blood 55 2 76.24 GATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACATTAGGCTATCTCCTTGAAAAGATTCTCCGTGGGTTCCACAAATAAACCGCAG:1 + chr2L 8410560 3' + 1360 269 1 50.00 TGTGTGATTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTCTGCGTGTTGTGTCATTATAGCCGACCAAAGTGTGAGTGCGAGCGAGATTGTTGTTGCCGTTG:1 - chr3R 18372900 3' - 1360 3243 1 59.41 TGTTCTTTTTTTTAACAATAATGTCCCATTATTACCGAACTGATAGAAAAAAAACATATAAAAGCATAACTGGATTAGACCGAGTAACTACTCCCTGTAGA:1 - chr4 618772 3' - Circe 468 1 67.33 TTTCTTGTTTTTTTTTTAATTTTATTAGTTTTATTCAAAAATCCAATATTGTTTAAACATATCCTAACTCCCTAATTAGGGTATTCCATATTCGCATTGAT:1 + chrX 17453297 3' - Doc 4699 1 77.23 TATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGAACTGAAAGGCCGACAATCTAT:1 + chrX 4588573 3' + F-element 191 1 78.22 TTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTTTGTTTTTATCTGGGGGTCCCTTTTTGTGG:1 + chr3L 2828760 3' - McClintock 6233 2 70.30 GTTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCAATTGCTCTTGCATACAAGTGCTATTAGATTCTTATCGACTTACGCAGCTACATCCCACGATCCACGAAGAGA:1 + chr2R 2796181 3' - Idefix 7173 2 63.37 GCTTGCTTGTGTGGGTAAAAACAAGAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTACTTGTGTAAGAAGACGGTTTTCCATTATGTTCAGCTCACGGGAGAGATC:1 - chr2L 10417601 3' - 1360 3250 1 71.29 GGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATTCGATTTACTTTGCCGTCGCCAG:1 - chr3R 22896733 3' + I-element 376 1 77.23 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATATTTTGGTGTTTCAGCTTTTTTTCTGATTGCC:1 + chrX 12666035 3' - S-element 36 2 72.00 TAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTTTCCTCGTTGCCGCACAAACAATTTCATTTTCCACTGCCTTGCTGATGCAATAATTTG:1 - 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chr2L 16691170 3' - pogo 39 1 66.34 ACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCAGTGGGTGCGGAAGTGGGTGGTTGTGGTGT:1 - chrX 12288905 3' - HMS-Beagle 6778 1 70.30 TGTGTGCTTAAACACACACGCACACACATGTAAGCACATATATGTATTGACAGGCAGTATATGCATGCACACGTATGTACACCCACACGAAAACACTGCTG:1 + chrX 7154156 3' + G3 39 1 60.40 AGACTNAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTTGGCAAGGG:1 + chr2R 8463638 3' - I-element 25 1 53.12 AAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTATAGCATATAAGTATATACCAGTTAAGTACATTTTTTGCAGTGTTGGCCAGTTCTTTTTTGGCCAAC:1 - chr3R 10967908 3' + P-element 344 1 69.31 GCACGGGTCCCACGACCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTAGATTCGCGAGAATTTAGTTTTAAGATCAGGTCAA:1 + chr3L 16814904 3' - Cr1a 4440 1 78.22 CTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTACAAGCTAAAAGGAATGCATTCCTGTTTCATTTGGGTGGCATTTGTCTGCT:1 - chr3R 25477648 3' + blood 208 2 56.44 GCTGCTCCTCCGCGCGCTCTGCTGCAGGATGATTTCGGGCTAATTGTAAAAGTGGATCAGACTTTACGATCGTGCAAGCGAATGAACGTCTTTTGATCTTC:1 - chr2R 17846076 3' - G2 445 1 80.20 ACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCCGTTGTCATTATGTAGTTGTCTGCATTATTTGCCGTTTGATTCTTACAATTTGAGAGCCATGTCGG:1 + chr2L 1439365 3' - F-element 4395 1 72.28 AGTCGTTTTATGAGCTTTTAAAGTTGAAGTTTTAAACAGCTTAAATCAGTGTATTTTAAAATAATTTTAACATGTTTTATTAGTTAAACTATTAAAGGTTT:1 - chr2L 11113221 3' + transib2 141 1 64.36 ATAAACTATTAGTCTAAGAAAGCATAAGTAGTTTGTGCAAACAATTTCTCGACAGTAAATTACAAATTTATGGTAAATTGCATATTGAGGGATTTTTCTCG:1 + chr3R 20147461 3' + S2 1468 1 55.45 AAACANATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCCACACGCATGTGAGCCGTTCCAAATGCACAGCTAGAAATAATATCAAGCAA:1 + chr2L 1629656 3' + hopper 1393 1 53.47 AAATAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATAATTACCGACAATTTGTGTGATTCCAGTCAGAAAATATC:1 - chr2R 16481881 3' - invader2 4940 2 60.40 TGAGTATCGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCTACAATGGCTTTATGATTGATGGAAAACTTGTTTTTAGTTATGTATTTTTACGTAAATCATAGAGGTGC:1 - chr3R 4599991 3' + INE-1 548 1 66.34 ACTGGGACCCTAGTTGAAGCAATTAAAAAAGCAACATTTCCAGGCACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCACTGTTTTAGCATTATTTAGTATTGTTTTT:1 - chr3R 4577208 3' + Tc3 1310 1 73.27 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTGGCGTATATTGCATTTT:1 + chrX 5726804 3' + roo 400 1 70.30 AGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGTTTTGCTGCAACTCA:1 + chr2R 22774495 3' - BS 38 1 63.37 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAA:1 + chr3L 12707834 3' - jockey 4780 1 57.43 AACGCGGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGACCTTCAAGCCAGGGTGGCTTTCTTCGGCTCCACGCTTGGGTGGTGACTTTGAGCAGAGTATTG:1 + chr3L 6718138 3' + R1A1-element 378 1 70.30 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGC:1 - chrX 2090252 3' - roo 8721 2 83.17 GTGCACTGTTAAATTAACGTATGCGGGCTATAACATAACAGTTTAACGTATTTCCATATGACCTGTTTTGCCTAGATTTTCACCCATTTTTCCTAGTTTTT:1 - chr3R 25437061 3' + hopper 1295 1 55.45 GAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGAACTGAAGAGCGTCACGGGTAATCCGTTGGGTATGGTTTTTAC:1 - chr3L 9458622 3' - blood 7175 2 58.42 GATAGAAATTTACAAGACTAATAAAACTGTATAATAATATTAAACTTGCGCTGCGTCTATGTCTCAAGAATCCTTTAAGGCTGCTATATGGGGTCGTGAT:1 + chr3R 12099548 3' - INE-1 297 1 70.00 CGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTCTCTTGATGTCCTTTGCCGGCTTCGACTCCTACCGCTGCAATGTTGTTGTTTTTGGCA:1 + chr2R 4429954 3' + R2-element 457 1 61.39 CTCGAGTATAGCCTTCTCTCTTGTTTATAAGTCCGTTTCTGCCATCATCAGTTTTTGGTCACGCACTGTCGCCAGGATGAATGAAATCCGCCGAGACTGGG:1 - chr2L 19687340 3' + INE-1 577 1 72.28 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAAAGGCAAAATCA:1 + chr3R 5208243 3' + hopper 1413 2 77.23 CAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTT:1 + chr2R 5424267 3' - 1360 3359 1 82.11 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGCACTGCTTAACTTATCTTACACATCGCGTAGACTTTGAATATAGGT:1 + chr2L 5611456 3' + pogo 2074 1 53.00 GTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGTGCCTGTGTATCTTTAATTTCATGAGATTGTAAATCAATC:1 - chr2R 20505040 3' + invader2 4843 1 60.40 TTTAGNAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTG:1 - chr2R 11129271 3' - hopper 30 1 55.45 TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACC:1 + chr2L 20840512 3' - Transpac 4936 2 64.36 GCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGA:1 - chr3R 13339040 3' - BS 5028 1 53.47 TACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGTGGCGATAAGCCCAGCACAGCTAA:1 - chr3L 22801480 3' + roo 8815 2 75.26 TCAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGCTTCGTAGAGACTAACGAACTTGTCCCGCTGGCCCTTGTACTGAGCGAAGAGCTCGTCGTCTTTGTGGCCCTT:1 - chrX 2243482 3' - F-element 475 1 76.24 ATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCACTGGAAAGAAGAAAACATTAAAACTA:1 - chrX 305309 3' + 17.6 7089 2 73.27 TCAGCAAGACGATTCGTTAATGGTCCAGCCCTCCTTCGCCAGCTCGAAATCTTCAGACAACTTTGATTAT:1 - chr2L 3979789 3' + BS4 592 1 54.29 GCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTCCTGCTCCTTCCTCCTGTCGAAACACAAAAGAGAGAACGGAAAAAAGAGA:1 - chr3R 11463991 3' + F-element 480 1 54.46 TACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCATTTTGAACTCGGCAGCTATTGTTGTTTGCCTTTTGCACTTCACTTCACTTCAAT:1 + chrX 7565447 3' - F-element 4350 1 58.42 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACACAATAACATAAATTGCAGAATGTG:1 - chr2R 16376830 3' + hobo 2890 1 78.22 ATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGCGTCAACGTCTCAAATGAAACTGAAAGCAGAAACACAAGCTGCGACC:1 - chr2L 8148925 3' + McClintock 117 2 53.47 TAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCAATACTCTATATCGTCCAGCTCCTTCATCATCAGAC:1 + chr3L 13998896 3' - 412 305 2 64.36 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATCACCGTCTCCTCGAAATCGACAGCCGA:1 + chr3R 14282797 3' + P-element 2840 1 38.00 AAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCTATTGGTTGAGCAACCTTCTCTGCCGAACATCTACTTAATTTTACT:1 + chr2R 24608660 3' - hobo 2625 1 54.46 TTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATGACATGTTTTTGAGCAATGCACCACTGTGCCGCCAACTGGAAATCCT:1 + chrX 13552890 3' - roo 176 2 74.26 CAGCCCGAGAGGCTTGGTTGCCGCTATGATGGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCGGGAGTAGGCTAGGCTGGCGTGGTGCTGCAG:1 - chr2R 18700384 3' + Rt1a 4659 1 68.37 TGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCGCCTGCCCTCCTGGGCTTCTATCA:1 - chr2L 7411016 3' + X-element 38 1 76.24 AATTGATTTCGTACCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCGGAGCGTTCAGTCGACCGGACGCATGGTCGCTGATACAAGATACAAGATACACGAT:1 - chr3L 9026064 3' + 1360 3184 1 63.92 AAAGAGTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGTGAAGCCCTCTCAATTTGTTGTGATTACCCGATGTTGCCATTCGGATACGGATGTTTGCCCTCCTGCG:1 + chr3R 10370939 3' + F-element 4336 1 76.24 GGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGA:1 + chr3R 3320509 3' - 1360 43 1 78.22 AGCACAGCCTTACACCTACGCGGCATGGAGTCCATCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGGTCATATTTTGAATGACCTTACCCATATCGTCTTCGGGTTGCGAA:1 - chr2R 8868284 3' - HB 1298 1 56.44 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACTGACACACAGATATCCTTGCAGCTGGTGACGACGAGTCAGGCGAGGGAAAAA:1 + chr3R 24545643 3' + roo 399 1 63.64 AAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAATAGAATCGTAGATAGCAGCAACTACAGTAAAATGACCAAAAATAGCTT:1 - chr3L 8160957 3' + F-element 4457 1 53.47 CTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCAGTAAAAAACAAAATTGAAAGGCGCATGGAATATATATTTCGG:1 - chr2L 9346153 3' + Doc 305 1 57.43 TTCATTTGTTTTCATCGAGGTGTGATATCCGGTCGGTGTGGACGTGGACGTCAACATCGACGAACTGCCGCTGGCGGCTGGCGACATGGACGAGAAACCGT:1 + chrX 10475409 3' - Chouto 5935 1 67.33 TAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTTTACTCCAGAGGGCATGGATACCTTATCAAATCCCTTGGGGAAGAGTTTGTGAGCCTCGGCATCGGTGACACTG:1 + chr2R 10427050 3' + mdg3 5232 1 76.24 ATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTGAGCACTGCATAAATCACTCCTCGGCCCCCGAAAGTATGCCAAAAAGGGGAGCTATAAATATTTTAGAA:1 - chr3L 4948040 3' - flea 4639 1 75.25 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCTCTTATGATGGCT:1 + chr2R 6838519 3' + I-element 5297 1 81.19 AATAATTTAGATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTGTAAACCCTTGTTTAAATGGCTACCGTCTTTAGCCTAGTTTAGTTTTCTTTCGACTG:1 - chr2R 20926185 3' - Bari1 309 1 54.46 CTAAAATAAATAATTATCCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAACCAAATCGACATACGTTCTCTGATTATTTCATAAAATG:1 + chr3L 19361196 3' + Doc 155 1 76.24 TCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTAATTAACTTTTCCACATCGCCCAAGAATTAGTAATCTACTCACGCTGCATTTGTT:1 - 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INE-1 133 1 72.28 CGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTAAAAGAAATTGAAACCAATATCTAACGCTTTCCAAACTTAACACCCAA:1 + chr3R 22075658 3' + F-element 227 1 54.46 TATATNAGAATATTTTTCATTAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGTCTCTTTAATTCGGTTTAATTTAGTTTATTTAACAGCTCTTGGCTC:1 + chr2R 24211508 3' + 1360 394 1 57.43 GCCTTTTTTTGATTATTTAAAAAAAATTTGTAGTGTTTCCTCAATAAACAAAAAATAGCCTTTTGTTTTGTGCACTTAGTTTAAATTTGTTATTTCAGTTT:1 + chrX 13975894 3' - G2 3053 2 85.15 AAAACCAAACCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTGTTTTCTGACAGTG:1 - chr3R 12780279 3' - BS 5008 1 47.52 CAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTATGGCCGTTACGCAAGGGGGCACTGCGAACTGAGAAGCAATTGCCATCAAATACGATTATTTTACAA:1 - chrX 10357552 3' + transib2 2817 1 55.45 ATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTGTTCAAAGTGGATATATGTAGAGAAGTACAAACAAATTTCATTCGCCCATCAGATATGAAATCATTCATCATTCTTC:1 + chrX 21037450 3' + Idefix 7215 2 71.29 ACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAATATTGTTGTCAGGTTATAAAACCTGAGGTTATAAAACCTGTATTATTTCAAAAGGCCCCTT:1 - chrY 3069807 3' + Cr1a 441 1 56.82 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACACATGGCTGCGGTCAAGGTTCGCGGACACATTGTGGTCATGAACAGG:1 + chr3R 22352855 3' - 412 7080 2 53.54 TTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTAGTGGGCATACCTGGCCAAATTCGTTGTAGCATTTTTTGCGGTATCCTCGGT:1 - chr2R 20527284 3' - FB 117 1 54.46 GGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAAGGCTATGAAAGCAAAAACTTTTTATTTCGCAGCTGAGCGAAGTCAAAACCAAAAGTGGAATAATAGCAGTTAT:1 - chr3L 21874254 3' + copia 159 2 80.20 ATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTGATTTTATAGATCAGAGGATTACACAATTATCACAAAG:1 - chr4 272133 3' + invader2 4740 1 62.38 TCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAATACATTAGGAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAG:1 - chrX 23291031 3' + Stalker4 371 2 62.38 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGCA:2 + chr3R 23618236 3' + hopper 1409 2 72.28 TGTTGGTTAAGTGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTGATTTTCCGTTAGGTTTGCTAAATGCTATTTCAATTTCTCT:1 - chrX 9028899 3' - I-element 162 1 64.36 AATTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTTGTGGACAAACATGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGACATAAATTCACTTCAGAACCAAAAGCGTAGAAA:1 + chr3L 6349771 3' - GATE 329 1 63.37 TTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCTGGATAGTGGAGAAGGCCATTTACCGCCGATACAGGAATGCCGACTGCGACGACGAGTTCCTAT:1 + chr3R 12410840 3' + roo 145 2 67.33 CGCCAGTTAGCCAGCCAATTCTCCACAACAGTAAGTAGTAGACTCCCAGTACAGCAGTACAGCAGTACACATCGATCAAATGCTAATCAAAAGTGTATCGT:1 - chr2L 20877482 3' - Doc4-element 2297 1 73.27 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGCTACATGATTTATGTATGCCGGTGGACCAAT:2 - chr2R 6838462 3' - I-element 8 1 71.29 GCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTTCGCATTGTAAATGAAATGGAATTAAATGAAATGTGAAATTTATTGTATTTAGGGG:1 + chr3R 9829936 3' + R2-element 3446 1 69.31 CCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGTTGTTTGAGGAC:1 + chr3R 3586561 3' - INE-1 137 1 63.86 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCT:1 - chr2L 22407455 3' + roo 387 2 55.45 CAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACATATACACCACATCCGGATATCCGACTGCCAACTACCGCT:1 - chr3R 17874549 3' + hopper 31 1 61.39 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCACACCAAAA:1 - chr2L 15478788 3' - jockey 4702 1 58.42 CAATTCTGATGACACCCAGCTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGTTTTGCTGCA:1 + chr2R 22774490 3' + BS 352 1 49.50 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGC:1 - chr3R 5208145 3' + hopper 1382 1 60.40 AAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAGTGTATGGCTGTTACGCATCTTGTTATTCAAGTGCTTTGTGTTTTGATGTTGAGAGCCTCCAGTGACTCCAATGACA:1 - chr2R 4122471 3' + 1360 3346 1 59.41 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTAAACTGACGTAGAACCCG:1 + chr3L 5827926 3' + blood 339 2 69.41 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGTTCATTGGACGCCCGAGCCAATCGAGAGACAAAGTGAAACGACCTCG:1 - chr2L 20084859 3' - 412 29 2 51.49 AATTTAATTTGCTTAAATTATTAACATAAAACTGGTTCCTATTTAAGAAAATGTCATGTTCCCACAAATAAAAGCAAGAAAATTGGTTTAATCTGAAATTG:1 + chr2L 17297151 3' - jockey 4937 1 78.22 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCG:1 - chrX 17049547 3' - Stalker2 32 2 53.47 ACTCGNTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTGTGAGTGCAAAACGCAGTGCGAAAGCAAGCCAGCCAGAATTCAATTTTAATTATGAACTTAAATC:1 + chr3R 28388569 3' + Stalker 419 1 78.00 GTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTTTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAATCCTACGTGGCCAATGGCAGGCAGCTGAAGC:1 - chr2L 3481376 3' - 17.6 291 2 69.00 ATTCCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACATCCTTCACATTTCCCACGCTGCCCACTTTCACCACTTGCCCCACCAACTGGGCC:1 + chrX 11265693 3' + FB 863 2 63.37 AGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATAGGAACCCTGCTCGAACCTTGAAAACATTTAAAGCTAAATACACACGACGCACCTCCTT:1 - chr2R 6248765 3' + roo 8742 2 63.37 CTATCAGATACCCGTTACTCACCAAATGTAAATGCTAACGAGAAATTTTTGCATTTTTCTGTGTTTTGGCGGAAAACGAAACCGTTATTGAGATATTTGTG:1 - chr2R 13942001 3' - INE-1 547 1 60.40 TTATAAAAATAAATAAATAATCCAAAAATCAAAAATCGCTCAAGAACCAGCAATTGTGCCATCACCATCAGCCAAGAAGACTGGGAAGAGTCGGTCGGTTC:1 - chr3L 15248784 3' + mariner2 829 1 58.42 GGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGAGTGCCAGGGAACCGCCCGAGCTCCAAGTGGCTCCCTCCGGACTTGCCGTCTTTGAGCCGAAAACTTCATG:1 - chr3R 10417063 3' - Tirant 92 2 77.23 AACGAATCAATACATTTCTTTACGCGTAGGGCCTGGGCCCATACCCAAATGTTTGCATAAGAGCGCCAGCCAGAGGAGCAGAAAGGAGGGTGCATAGTACC:1 - chr2R 12355871 3' + frogger 2232 1 62.38 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGTACAAAATATTTCTAATTTAGTTGT:1 + chr2L 9823707 3' + hobo 2916 1 56.44 TCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCACTGCGTGAAGAAACTGCGAAAATCCAA:2 + chr3R 25071895 3' + F-element 62 1 72.28 AAACAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTACGAAGGTACCATACGTATGCGCAATAGTCACCGTCCACCTGATCAGCAGGATCCTTTGCT:1 + chr2L 21363535 3' - 1360 306 1 65.35 TAATCACTATTATTATATTGTAAGTATAACGCTTATTTCGAATTGCGATTACATGATGACGATAAACTGGGCAACCAGCGGAATCATTGCCTGGAACAGTT:1 + chrX 12802708 3' + Burdock 457 1 71.29 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCGCACAACCACATGCGAGCACTCGTGG:1 + chr3L 22324111 3' - hobo 18 1 61.39 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAGAGGGC:1 - chr3R 22899160 3' + P-element 2873 1 63.37 GGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCGTCGGAAACATCGCCAAGATATCTTCGTTCG:1 - chr2L 11166836 3' + transib2 2449 1 69.31 CCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTCATATCTGTTTCGGTTTTCGAAATACA:1 - chr3R 24677871 3' - copia 4854 1 73.27 TCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGGTCACATGTTAACCAATCCCAGGGTTGAGTACGTGA:1 + chr3R 12828442 3' - I-element 5 1 43.56 GTTAACTTTCACTTGGTGATAGTGTTTGTTATTAATGCCCTCGTAAGTTTGTTTCATTTCGGCTAAATTGCATTTTATTTTGGCCTGCAAGCGGCGAAGCG:1 + chr3L 1366048 3' - Doc 4607 1 53.47 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTGCCACAAGTTGACGCACATCGCACGTGGGGCTACGTGTTGGCATTAGA:1 + chr3R 6989931 3' + mdg1 7421 2 56.44 ACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAG:1 + chr2R 8157263 3' + Transpac 5208 2 59.41 TTTTATTGATAATATTTCGTTTTAGCTGCAACGGTCTCTCGCATTTGCTTTTTTG:1 + chr3R 25986127 3' - FB 329 1 90.91 AAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGGGTCTTTGCTGCAAGGATTATAAACTCAATTGTTTTGGTTCCTTAGTTTCTTAGGGTATCATTTTGTTGA:1 - chr2L 13028617 3' - Tc3 313 1 54.74 ATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAAAGAATCAGCCCAACCATATGCAACGAAATGGGGGAAAAAATATATAATTCAAAATATTTGGCAGGTGGTC:1 + chrX 12804165 3' - hobo 440 1 72.28 TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATGTATATTTACGAATTCAGAATTAAAAA:1 + chr3L 25200713 3' - TART-B 10199 1 79.21 AACGACTGCTGATGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCTACTCTACTGCTGCCTTGCGATTCCTACATTTGGCCCTCCTAACTGGGTGTT:1 - chr4 591281 3' - flea 157 1 66.00 AAACGCTTCCTTCTGCCTGTTTACACGGAACGTATTGAAACGAGAGCGGTACACGGGAGCGGTATGGAAGCGGTACGAATCCGTTGAC:1 - chr3L 12482425 3' - INE-1 33 1 76.14 ACATGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGGAGCGTCAACAAAGCCATAAAAGCGCGCTTTTAGCCAAAGAGCCTCGTAAAATACGAAATACATACATATTT:1 - chr3R 31293177 3' + hopper 1414 2 79.21 TATAGATACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGATCTGAGCAGGCACATGGGAT:1 - chr3R 9996372 3' - blood 18 2 62.38 TAAAAAAAACAGGGCAAATTCCCCATAGAGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTGGCCAGAAGTGTCTGC:1 - chr2R 11129256 3' - hopper 9 2 68.42 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAGCAATAAGGACACAAATAGAACTGGTTCTGTGTATAGGCCCTGCTCTTCATTTATCAATACT:1 + chr3L 14365041 3' + blood 362 2 63.37 TAAGCGACGGATTTCCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAAAATAAGCCCCCCTTAAATGCGGTATGTGAAATTCGATTTGCGTTTTCAATATC:1 - chr3L 14451004 3' + G4 69 1 65.66 ATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCGAGTTGTTTTGAGTGCAGGG:1 - chr3L 2851089 3' + Stalker 40 4 80.00 TCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCACTTTTGAGGTATTTTTATGTATTC:1 + chr3L 20659383 3' - X-element 4512 1 75.25 AGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCGTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATTTTGTGTATGTGTTCGCCTGATGCCTAAATAAATAT:1 - chr3L 12163283 3' - hopper 1162 1 65.00 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAATTTCTATTAGGAAAATTAA:1 - chr3L 18957606 3' + copia 233 1 56.00 GAGGATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTTTTCAGCGTTTTTCTTAACTTTTTGGTGGAAGCTGAGTGCGCATGCGTGTTGT:1 + chr3L 6822352 3' - Rt1b 4851 1 61.39 CAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGAGCCATACACCAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAATTCGTTCGTAGACATGCCCTCAGCTGAAA:1 + chr3L 23698307 3' + G4 496 1 65.35 AATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTGTTTGTGATCCCGCTGCCGAATAAGCAGCTTTCCAGGCAAATTTGCCTGGGTATCAGCTGGACTGA:1 - chrX 13048169 3' - Doc 4608 1 75.00 GTTTGTTCCCGCGCCGCAGTCATTTTGTGAGTATCTCTTGTACCCCAATTGGAATGTGTGCAGATGAAGAGCATTTTTCGCCTAAGTCCTCCTCAATGAGA:1 + chr3L 19932458 3' - HeT-A 5590 1 55.45 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTATGGATGCTCATAATCATATTGGGCTCCTCGAAGGGAGTACCTCT:1 + chr2L 11165397 3' + transib2 2791 1 54.46 GCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATAGTGAGGATGTTGAGAAATGCTATGGAAGTTGCTATGGAAGTGGACAGGGGATTCAA:1 + chr2L 15134780 3' - jockey 126 1 70.30 AATGGGACAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCGGTTGCTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCAGGAGCGCCTTATCGCAAACCGATGCAATGT:1 + chrX 13800748 3' - G5A 2558 1 70.30 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAAC:1 + chr2L 1353775 3' - I-element 36 1 62.38 AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGA:1 + chr2L 3244995 3' - rover 40 2 74.26 AAATTAAAGTGATTCTGAAATGCACGTTGTGTCTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAAGGACAGGTGGTATGTCGAACTTAAA:1 + chr3R 11907690 3' - mariner2 216 1 77.23 GCAAGTGATCCTGATCAAGAATATATTGTACATATGAACATATGGTCCTTATAAAATCGAAAACGATTTAATGAAAATAGCACTTTATAATAATACCTTAA:1 - chr2R 6234303 3' - INE-1 86 1 73.27 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTTAATATATCTGAATATTCTGCGCAATCCACAAATTGCGCGTTTG:1 + chr3R 5946173 3' - HMS-Beagle 28 2 58.42 ACCCGTTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATGTTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAAATCGATCGGTTTGTCGTAACCCATTATCTTAACATAGTGCTCA:1 + chr3L 7640896 3' + gypsy6 7531 2 57.43 CGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAATCCTATACCCCATTTCCACAAATCTACTCAACTGTTGGCCGACTTAGA:1 + chr3R 22682642 3' + 412 7262 2 55.45 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATACACACATGCAGTCGAACCTACAGCGCAGGCC:1 + chrX 4740578 3' - 17.6 6965 2 69.31 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTTTTTGTCGCT:1 - chr3R 23346531 3' - P-element 29 1 50.50 AAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACAAATTTGAACAAAAACTCCGCTGAGCATTTCATATATAGTGGCTCCACCTTTAC:1 - chr3R 21520384 3' + S-element 156 2 56.44 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACC:1 + chr2R 5910917 3' - 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accord 96 2 70.30 TTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCGATTGTTGCCTGATATGAAAACGAGAAATTCATATTATTAACTTGTCAAATAAATAAAAAAATT:1 + chrX 16769984 3' - Dm88 73 2 67.33 GGTCTNCAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGGTAAGGGTGTGCCAGGATGTCAAGGCGTCAACAC:1 - chr3R 31996524 3' - mdg1 282 2 66.34 TCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATATTCTTAAACTACTATCTACAATAAGAAAACAAAATTAACAAAGCTGTTTGAG:1 - chr3L 14997510 3' + Porto1 249 1 58.42 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGG:1 - chr3R 15072580 3' - pogo 37 1 66.34 AATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTAAGTTTTGTCTTAGGTCGGATCATTTGGAAATAATTGCTCTACTTAAAAAGTGTTGTAAAATACTCCGTTGTA:1 + chr4 869515 3' - roo 403 1 75.25 TAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCAAGGCGTTCATACGTATGGACAGACAGACGGACATGGCCAGTTCGACACGGCTATACTAATCAAGAATATATATACT:1 - chr2R 8443980 3' - INE-1 151 1 73.00 AAAAGAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTG:1 + chr3R 23618234 3' + hopper 1408 2 71.00 AAAACTGAGAAGCGTCGCCAGTGCCTCCTATTGTATTCATGGTCCGTTGCAGTTGTTGCCTGCTTAGCGGGAAAAGTGCGGAGGCGTGGAGTACTCGGATC:1 + chr3R 30353672 3' - TART-A 367 2 45.54 GTGGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCTTTTGATGCGCACGCACACTC:1 - chr2L 306448 3' - Tirant 8109 2 79.21 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATTGGGCGCACACAGTCGCCGACAAAAGTTTGCCCTCAGCATTCGATTCGCCCCATTTCCTGCCAG:1 + chr3L 1406260 3' + micropia 426 2 71.29 CGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGTCGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGGCCTGCCAACACGACGTATACGCAATATATTTACCGAACGC:1 - chr2L 18207622 3' - F-element 269 1 57.43 ATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATCGGTTTTAGGGCTCATCTCTCGCCCGGAATTGTTTATGTTTATTGTGGGCATAAGTTTGTGCT:1 + chr3R 14450123 3' - G6 2003 1 66.34 ATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGAGTGGAAGTAGACGTAGAAGATGTAGCTCGAACTCAAACTGCTTTCATATTTG:1 + chr2L 3620039 3' - 297 324 2 52.48 CGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAG:1 + chrX 22386762 3' - hobo 85 1 62.38 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAGGCACTACGGCACTATTTTTGACTAGTTACTAAAG:1 + chrX 13259294 3' - pogo 37 1 64.36 CCTCCGCAAGACTCCCCGGAGGTAACTCGCGCGTCTCGCGAAAATACTCTCCTCGACTATCCTCGCATACGTACGGCGCCACGCGTGTTGAGACTGACTGC:2 - chr3R 1027407 3' + ZAM 8409 2 73.27 CGTGGGAACGTGACGAAGGGGTGAGGCCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAATGGACGGATGTTTAGTCCATTAAATGTAAAGCACTCGCAGCCGGAACA:1 - chr2R 11552370 3' - Idefix 234 2 67.33 CAAGTTCTCGGCTGATCAGCACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAAAGACGCGACGCGCTCAAACGCGAGGACCAACCA:1 - chr3R 24662521 3' + Quasimodo 6972 2 67.33 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCT:1 - chr3R 22667138 3' + 412 446 2 70.30 GAGACGATGAGATGTGATTAGGGTGAAATGGGCATAAATTATGAACTTAACACTTGAAAAGGTTATAGCTGTCCTAATTGCTTTTGTTTCGCCTAAAGAAT:1 - chr3R 10836593 3' + frogger 36 2 77.23 GCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAAGTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATTAT:1 + chr3L 19339452 3' - Tc1 3 1 78.22 ACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGCCGCCGTCGCGTTTATGATATGCTGTATATATAGACCATGGACACTGCGAGAAAAGAGGGTACACTAGT:1 + chrX 12814278 3' - HMS-Beagle2 7120 2 68.32 ACCAAGGGCAACATTCATGAAACAAAAGTGCAAGTCAAAACTTAAGTAAACTTCAGAGCGCTTACCAAATACCTGAACTCAATTATTTGTTAGAATGCTTA:1 - chrX 3841551 3' + Fw2 305 1 58.42 CTTCCATGTCCTTCGGGCTTCTTGCCGCCAGACGTTTCCACTGTTTGTTATTTCCCACTTGACCGCGGGTGGTTTACAACTTCCTTTTTAGCCCAGTTTAA:1 - chr3R 14582691 3' - gypsy8 494 1 64.36 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGCACAGTGCCTGTGACGGCATAGGGAG:1 - chrX 697471 3' - roo 8712 2 80.22 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAG:1 - chr3L 3254984 3' - 1360 45 1 70.30 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGTATATTTTCAGTCCGGTTTCCGGTTTCTGCTACATTATTCGTGGG:1 - chrX 8179021 3' - pogo 26 1 56.00 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAATGTGTGCGTGTTGTGTCCGTGTGTGCGTGTCGCTACACATGTTGCTATTTGGCAGCTAGTCGCCAACAG:1 - chr2L 13482107 3' - hopper 3 2 73.27 ATAATTAGGAACACGCATAACAGAAGAATGAACATGGAGATGAAGTAAATAGCGACCAAGCGCATACACATATTATTATACAGATTTGATAGTTAATTGAG:1 + chr3R 5235756 3' - micropia 5022 4 70.30 AGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTAGTTTAATAGTGTGACTAGGGCTACATGCAGGAGGATTAAATCTAAAGAATCGTTGCAG:1 + chrX 2371582 3' - 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chr4 419913 3' - INE-1 580 1 79.21 GTGCATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAATGCATTTGCCATTGCACTTGGCCAAATGGAATGGCGAATATTCGGTTGTCGTAGGTTAGTTAGGCAGTCGCC:1 + chr3R 21896460 3' - accord 187 2 60.40 TAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCAACCGATTCTGATTCTGTTTTTTTCGAGATGCGCGTGCTGCCTCGGTCGG:1 + chr2L 789390 3' - I-element 405 1 54.46 GATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCAATTGAAATATGGATCATAAAGTGCTGATATGCAGGTTTGGCATTCGGAAAGGCAGT:1 + chr2R 5910453 3' + hobo 478 1 68.32 GAGATTGGTCTCAAAGTTCAGCCGAAGAAGAGCCGAACGACCCACTCGCAACACCCCATGTTGTTGCGTAATCGATAGCTGAAAGCTTCGCCATT:1 + chrX 5268847 3' + R1-2 195 1 64.21 GTGAGCCAGGCAGCACGTGGCTGATGCTTTGCAAATAAGTCATATGGACAAACAGCTAAAGGTTTCCTACCCGACCCGACTCGATAGGAAATTGCTCCAA:1 - chr3L 20585920 3' - G6 244 1 70.00 AATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGGTAGTCCTGAAGAAAAATCATCTAAGCAGAAGGGGTACGAAATGATTGTGGCCACGAATAAGGAAATTTGG:1 + chr3L 14484563 3' + jockey 4667 1 77.23 CCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTCATGCATCAGTGGGCAACAACAACATTTGCAAATTCAATTGAATTGATACACGCACCACTTGTTAACCAATTCGG:1 - chr2R 22523901 3' + jockey 492 1 77.23 TTATCAAGCTGCAAAGTGGATCCTCGATGTCGACGACGCAAATCCTTGATAACATAGACATGGACGAGGACGCCCATTTTCCCCCATTTTCCTCCCATTT:1 + chrX 5828699 3' + Chouto 6238 1 77.00 TAAAAAACTAATTGGTAGGCAAACAGTTTCCCATTTCCATCTCGCTTCAATTTGTGTGCTAACTTTTACTCCGCTCCATTTTACGTTAACTAGTTTGTTTT:1 + chrX 15948026 3' - FB 81 1 77.23 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTATATGGTCAGAAACGCTTCCTACTGCCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 - chr3L 19471445 3' + 1360 3379 2 43.00 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAAATGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCCGATCATA:1 + chr2R 14582904 3' - roo 27 2 53.47 CTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGATGTGTGAACCAAGAACTGATAAGGGCTTAGTTTATAACAATTGCAAGATATATA:1 - chr3R 8318928 3' + 17.6 138 2 61.39 GGCTGNTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTATTAATGGACGAAGTTGGTTTGGGTGGCAATTCAATTTGCAGCGCCTCCTGATGCATCGCACG:1 + chr2L 970345 3' - 297 9 2 70.30 TACATTCATGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGTCATGTCCGTCCCAAACACATGTGTTTACGTCGATGGCTCAGATTCTGCGTTTCCCTGACCA:1 - chr2R 5992163 3' + INE-1 83 1 47.00 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACGATTTTCAATCGAGAGCTGAAAACTTAAGCCTTTAATCAGATCGATGTGATTAGTGCT:1 + chr2L 11240970 3' - roo 17 2 59.41 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCCCACCAAAAACCGAATTTAGAGCATCGGCAGAT:1 - chr2L 15478764 3' - jockey 4678 1 70.30 AACCACAGCCACCACGATACTCCCACCTACCCTCGAGGATTGGAACCCCAGCAGCCGGGTGGTGATCCAAATACCCTACAGCCTCGACCTGGCCAAAA:1 + chr2R 17137949 3' - R1A1-element 4996 1 78.57 TGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAAAGTGATGATATGATATGTACATATCTAGCCACGATTATACAATATCGATTACATCTTTG:1 - chr3R 21327157 3' + I-element 339 1 65.35 ACGTACGTATTTTAAATGTCAAATGCACCAATTCTACAAAAATACAAAATGTATTTATAAGTCACGGCTCTCGGATTTTCCTGGTCCAAGCGACCGCAATC:1 + chrX 20548435 3' + transib3 2780 1 56.44 GTCGATTCCTGCGTGCACTGCGGTGATGCGGCCAAGAATCCATTTAGAGGGCGGTAGATTGGATATGGTGGGCTTTCGATTTGGTAAAAGATTAATCAAAC:1 - chr3R 10955788 3' - 3S18 5634 1 61.39 CACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCC:1 - chr3R 14882077 3' + gypsy5 393 2 51.02 CAGCTATCCAAGACTGGTCATTGAGGTAGACCCCCTGGTCGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTTATAGGAGCAGAAAGCATC:1 + chr2R 5078394 3' + R1A1-element 4955 1 75.00 GTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATATTATAGATTTTCCACTTTATATATAATTCCATTTTTTTATATT:1 - chrX 23211102 3' + Bica 173 1 57.43 CAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGGTTAGCGTCAACGTAAATCCTATGCTCTTCCGCGACCTAATGCAGGAACTTTGCGAGCTGCGCAC:1 - chrX 19169029 3' - Ivk 4968 1 70.30 AAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTCCCACAATATTTGCAGTCTGTCGTAACTTTTGGTAGCTGGATTCTGGTAGCTTTACGG:1 - chr3L 15464660 3' + Tirant 8403 2 62.38 CAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAAACCTTCTTAGCAAACGCCTGGAGCGGGTCGAGGAGGTCATTGGGGGTTGGGTGAACCCAAGCGCAGCTG:1 - chr3R 29612398 3' + I-element 5082 1 56.00 CCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTTGGAGACTTCCATTTCTGCATGCTTTTCTTTAGTCTCATCCTTTGAATCCTC:1 - chr2L 6650647 3' + HMS-Beagle 109 2 51.49 ATTAGATTTGCGCGTGAGAGTCTTTGGCAAGCGAAGCGCGATTATATTATTAATTTTAGTCACCGTTGGAGCTTCGAAAGCGAAGTGCGGCTTTTGGGTTT:1 + chr2R 18771507 3' - HeT-A 81 1 57.43 CATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTAGTTCTAATTACA:1 - chr2L 22315557 3' - frogger 2291 2 51.49 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCATAACCCTCTCTCATCCCATGGTTTCGCATAAAGTTCCATATTCCTGACTGATTGAATTGTCTTTGCAGC:1 + chrX 2874895 3' + 1360 3385 2 78.35 TAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCGTGGCAGTTGCATGCGGCACAGAGAATGCAATTTGTAGACATGGACACTTCGAGCGCAGCCTTTT:1 + chrX 1500935 3' - 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chr3L 19051812 3' - roo 8667 2 74.26 TTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCATTCATCTTTCTCATTTTG:1 + chr2L 4300676 3' - P-element 249 1 22.77 GTATAGACATTAGAGAATATGATAAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGACTGGTAGCGTTGATTCGGATTTTGTCATTGCCGATGACTATGCC:1 - chr3L 3773502 3' + invader4 195 2 73.27 TGTTCAATAAAATTAATAGGAGTGATTGCTTTGGAATTTTTTAAGATTTACTCCTAAGAAGGGGCTCAGAAACGCTGAAACTGGCTTGATTAAAAATATT:1 + chr3R 20236829 3' + Tc1 237 1 62.00 TAAAAGACATATTAGGTCGAACACTGACCTACGCTATCCAAGTGTGACGTGTTCATCAAACGTTGCACTCGGTTCTCTACGCCTCGGGTAATGGCGCCCAG:1 + chr3R 7176393 3' + G5A 2405 1 64.36 AACGTTTTACTACCTACTTTTATTTCATTCATAAATTTGTTAAACATGGTGAATAACAAGGATTTCAAACGGTTAGTTGGCACAGTGGCTAAAAATACTCA:1 - chr2R 9969375 3' + Tc1-2 311 1 56.44 TGTGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCGTGCTGTGGCAACGTTTTAGCTGATTTTATGTTTGCTGGCAGACACACAAGGACCTCTTGAAAAGAATAT:1 - chr2R 6232784 3' - accord 7034 2 47.00 TAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTTAGAAGAAAGAAAGAAGCTAAAGTCCGATTCGCAATGAAGCG:1 + chr2L 685585 3' - opus 7335 2 58.42 GTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGAGTGGTGGGGGAGTGTTGAGTGTGAGTCGATTGGAAAAAAAAATTATCCACTTTAAAAGAATCGCTTTC:1 + chr4 406901 3' - hobo 81 1 68.82 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGTTCTTTGCATACAAAAATAATCAATTGAATAAAACAAACTTTCGTTCCTTAAGCTAAGAAAAATT:1 + chr3R 14913242 3' + blood 367 2 68.32 TTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTATCATCCTGGAAGCTTCAAAACGCATTAACTAGAAACACTGGGTTTGTTA:1 + chr3R 30171894 3' - Tirant 8166 2 56.44 TATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTCGGAGCAGCGGTAAGAGCTGTCTAGA:1 - chr2R 14520004 3' - Quasimodo 391 2 77.23 CCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACGTTATATGTTCGTTAACACAGTAAATGTTAAATGTTCAT:1 + chr2L 18643952 3' + 17.6 7004 2 61.39 GTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACGTGTAATTAATCAAATATTCTTCCTGTACAGATATCATATTAGCCATCTGTTCA:1 - chr2L 13014653 3' + hobo 56 1 61.39 GCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGAGAGGGCAATAAGGATAGATAGATGATGCGCTGAGAATGGAAAAGCTTATG:1 + chrX 5599514 3' - accord 7103 2 53.85 ATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTATTAGATTTTGTTGATTCAACTGGCAGTCCTGTCGGGAAATCAAGGCGTATTAGAAGGGAAAT:1 + chr3L 20713624 3' - I-element 239 1 65.35 GTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGAATACGAAAAGTTGAAGACGAAAGACAACACCAACAACCGCCGAGACCTTATTCTCATAC:1 - chrX 16840417 3' - Doc2-element 418 1 63.37 CTAAAATGAGCCAACTCGAATTGCGTGCTCAGCGGCAAAAATACCAAGACGAGCGCCGAATCTATCTCTTCGAAGCTGAAATATCGAACACGTAGTTAAT:1 + chrX 14120581 3' + Doc3-element 216 1 72.00 ATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAAAATGCATTGAAATTCAACCAATGGCCGT:1 + chr3R 20495811 3' - Juan 4094 1 55.45 TTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTAACGAGCAACCGAAACGTATTCACGCTCAGCTTCAGCTCAGCTTCGTCC:1 - chr2R 5808581 3' - Stalker 298 4 58.42 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGTCGTCGGGCATCGGATAAGCCAAAGTAG:1 - chr2R 18865855 3' - roo 8710 2 72.28 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGGAGCGTCAACAAAGCCATAAAAGCGCGCTTTTAGCCAAAGAGCCTCGTAAAATACGAAATACATACATA:1 - chr3R 31293180 3' - hopper 4 2 76.24 GAATATAACCATAAGAGGTTCAAGACTCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGACGACAGCCACAGTTAAATTGACAAATTACTTACTTGTAACAG:1 + chr3L 24253303 3' + baggins 5068 1 62.00 TCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGGGGCAAAAGCAGCACACCTTAAATGTCAAGGTTTT:1 - chr2L 2858020 3' + transib2 2784 1 65.35 TAGGTGGGTTTCTATGTGTACTGCGAACCAGTCGGATCTATTATTCTTACCCCACTGTTATTGCAGCCAATATGTGGCCCCAACCACCCAACTCCCACCCC:1 - chr2L 19636181 3' - baggins 5424 1 42.57 GGGCCGCCAATGAATAGTTGTGATGGGGTTCGCAAACACAAATCATATATGCACGATTTATCTTCAGTTTATTTCTCCAGTTAAATTCACTTTTTTGCACA:1 - chr3R 10686140 3' - diver 234 1 74.26 ATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGCTATTTGTATGCCGCTGACCATTTTTCAGCGCTGTGTGACTTTTGGATTGTGTGGTACTAAG:1 + chr3L 18770471 3' - F-element 4407 1 68.32 GTTATTTTTCATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGTCATCTTGTGTTTTTTTGTGACGGGCAGGGAG:1 - chr3L 15141926 3' + Cr1a 4322 1 68.32 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTGCTTAAAAATGCTTACTTTATTTAGAAAGCACCCTCCGTTTTACAGCTAAAAACGTAAGTA:1 - chr3L 18076243 3' + roo 394 1 63.37 AACCAGTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGGCGGCCGAAAACTCAATTGTGACCA:1 + chr2R 5322080 3' + 1360 3365 1 55.45 CGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATAAAACACCTCCGAAAATAAGTT:1 - chrX 17962852 3' - hobo 2746 1 78.22 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGACCGTTCACCGT:1 - chr3L 776085 3' + 1360 3383 2 66.28 TAACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTCAGTGGCCGCAGAGGGTCAACATCATCATCGAATGCTCCGATTGGGCTGTGTAAAATAAAATGTGTAGAAAAG:1 - chrX 2324215 3' - Chouto 146 1 80.20 AGACGCTCTCAGTGCGTTGGGGTTCATTTCGTGCAGCTATAAGCATAGGTGACGCGAGACTACGCCGCCAGGACGGCCAAGCTCAACCAGGAGCGCTACCT:1 - chr3R 29246656 3' - Doc3-element 422 1 51.49 AAGCAGAAACACAAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACACATACATACATATGTGATAAGTTTAACTTGATAACCTTGGGGCCCAGCCAAACCAAT:1 - chr2R 23359602 3' - invader1 3632 2 77.23 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTGC:1 + chr2L 7654051 3' - jockey 22 1 65.35 AAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGACGAGCTTGCGGGTGGAGCAAAAACGGTGAACGCCAGGTGTGTAATCAGCGCATCGTTAATTTGGCGC:1 - chr3L 3239391 3' + R1A1-element 162 1 63.54 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTCGTACCG:2 - chr3R 14913139 3' - blood 20 2 60.40 CGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATGTGTATAAAGTGTGTGCGTAATTTTTATTATGTGTTA:1 + chr2L 15119131 3' + Stalker4 7148 4 70.30 ATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTAGCCAGCGCTTTATATTATTTATATACTGGC:1 + chr2L 5111639 3' + X-element 4395 1 73.56 AAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCTGCGCTGAGCTGAGCTGCGTTGAGAACTCGAGAGCTGATCAAACCCAAGAAACAATTCACATTTCCGCATGC:1 + chr3R 14048431 3' + micropia 5377 2 75.25 GCTGTACAAAGCAGTCCTAAAGCCAGTATGGACCTACGCGATGCAACTGTGGTGAAAATAATTGGGCCACGCCAGGCTGTACTCTTTTCCTTGGACGAATC:1 + chr3R 8245087 3' + G3 4168 1 52.48 TTAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTATATACCTTCGCACAGAGGCACCGAAAGCACAAAGACCTACGGAAAACGACAGCCAAAA:1 + chr2L 9856318 3' - HMS-Beagle 14 2 63.37 ATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTATATACCTTCGCACAGAGGCACCGAAAGCACAAAGACCTACGGAAAACGACAGCCAAAACCCC:1 + chr2L 9856322 3' - HMS-Beagle 10 2 67.33 TCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGTACATAAGTGGAATATAATTACATTTTATGGTCTCACTCGAAAAACTCCCCA:1 - chr2R 24578246 3' - accord 152 2 58.00 TCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTGTTAGACAGAGAAATCCACGTCTCATGGAAGAGGGG:1 + chr3L 432787 3' - Stalker 6793 2 64.62 CTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTGTTTTCTGACAGTGTAGTCCTTAC:1 - chr3R 12780269 3' - BS 4998 1 57.43 ATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATCTAGTTCGCGAATCTCTGTGTGGAGCAGCTCACAGTAGTGACCTCCACTCGTTTGCTTGGCGTCCA:1 - chrX 11833194 3' - Cr1a 4142 1 67.02 GGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATATTCAGTATACGGTATACGTATTCCCTGGCCAGAGATGTAGT:1 - chr3L 602775 3' + opus 281 2 59.41 CGTCTAAACCGTCATTCCAGCGCAAGTTGCCCCTGCAGTCGCCCGAGGACTCGTGGTTGCCAGGAACAACGTTGCACAACAAATAACTGAACGGCGTATCC:1 + chr3L 15844008 3' - aurora-element 155 1 60.40 CAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAATATTCTTCTCATAAAGACTGTATTGGGTGTCGGATAGTTGAGTTGCTCAACT:1 + chr3R 10736127 3' - invader4 2778 2 50.51 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATTCATAGGCG:1 + chrX 1523776 3' - jockey 28 1 63.00 TGGCCTGACGGCTGCCCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGA:1 + chr3R 14832446 3' + blood 7339 1 77.89 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + Tabor 434 2 73.27 CGGCANTGTGAACAAGACGAGCGGCTTTTTTTTACAACGCAATGCATACTTTGCTTTCGTCTCGAGCACCCTCACCTTAGCGTTCTGCTGTTCGCTCATTA:1 - chr3R 3522751 3' + Doc 240 1 74.26 GGAACGGTAACGGTGCGTGCGCAAAGAGGGCGCAGAGGACGTAAATTAACGGCACAATATGTGGACCTTGACCCCGACGACGAGTCGGCCCGGCCAGGATT:1 - chr2L 22407397 3' + gypsy8 4879 2 71.29 CTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATAAAATTGCATGCCACAGACAAAAAAGGA:1 - chr3L 13172914 3' + R1A1-element 273 1 70.97 GATGGGAAGCAAGGGAACCTGTACTTCCGGGTGCACGCTTCAGAGTCCGGCTCTAGCTCATGGCGTTGGGTGTGGTGTGGTTGGATGGAACTCCAGTGCGA:1 + chr3R 13742909 3' - Gypsy12A_LTR 2236 1 75.25 TGCAAGATTGTATGTACAATGCTTGTGTAAGCGTAATATTTGAAGCATATTATGATACTATATACGTGAGAAAACCTAAGCGAAAAATAAATAAACTTAGC:1 - chrY 3649263 3' - rover 6995 2 76.24 CGCATNTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGTACTCTTAGTTTC:1 + chrX 22517704 3' + 1360 3384 2 60.40 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCCCACCAAAAACCGAATTTAG:1 - chr2L 15478777 3' - jockey 4691 1 57.43 CTCCGGAGACTGACAGGAAAAAATTTAAATCAAATATCGACCAACAGTCGTCGCACCACCAGAACACCGAGGATGTGGAGCAAGGAGCTGAGCCCCAAATC:1 + chrX 2660933 3' + X-element 440 1 65.35 CACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACACTA:1 - chr3L 5691243 3' - P-element 196 1 40.59 AATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGGTCGATGGCGTTGGCTGCTGGTGCTCATTGAAACG:1 + chrX 19111053 3' + hobo 2688 1 65.00 GCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTATGCCTTTGGGTTTCCTTTATTTGATTTGATGCATTTTTTACATTTAATTTCACTTCAACCACTTGCT:1 - chr3L 18641742 3' - I-element 144 1 76.00 CGATACATAAGTAAACTACACGACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGACTACAAGATGACACCAATAATAGTAGTTTACAGGAGAACTCCGTAGTCGCAGT:1 + chrX 1061039 3' + G3 4376 1 63.37 ATCAGATACCCGTTACTCCGCTAGTGGTTTAGACATATACGACATTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTGATTGACAAGGCTTTGAAGTAATTTGC:1 + chr2L 5408595 3' - INE-1 545 1 55.21 CCAAGGTCTGTAGACTCCTCGTTATAAAAGTCTTCCTCTGTTTCCATGGTTCATGTCCGCCGCAGACGTTGGCTATACCGCTACTCCTGCCACTCGTTCTC:1 - chrX 6811552 3' - invader5 324 2 58.42 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAAAATTTAATAACTTTTTGCGCTGTCGAACAGTAGCAC:1 + chr3L 776189 3' + 1360 3387 2 76.53 GAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAACTATAATAGTCAGGGCTGCGACATATGGCGACAATCAACTGGGCTCCACTGGGCCCAACTT:1 + chr2L 5740950 3' + 1360 2995 1 56.44 TGGACCTATGGCGCACAGCTATGGGGCAACGCCAGCAACAGCCGCCATAAAAGCCGCATTGCAAAATTTTTTAAAACCCGTAGTTACCCATGGAGTTAATA:1 + chr3R 2470943 3' + Fw2 3548 2 69.31 AACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTCTATAGAGGAAGAAAGCTGGAGAAAAGCAATTATTATAGGTATATTCTAGTA:1 + chr3L 14273455 3' + S-element 1697 1 58.42 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATCT:1 - chr3R 17788922 3' - roo 48 2 74.26 ATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCTCTAATACTTTATTCGCTGGGAAAGACAACGCACATGGCAATCAGCAAAAT:1 - chr2R 16452322 3' - F-element 4591 1 68.32 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAAGTCTAACAGCCACTGGAGTTGTTAATTAGCTGCAGCACCCCAAAAAAGTGGGCGTTTGCGGTGGGGGGG:1 - chr2R 16928831 3' - blood 7018 2 71.29 CCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGGTCTCCCGCTCTCTTAGCTCCGACAGAAGCCCCACTACCTCCAACAACGGCCAGTGAAATGAGATGGAGATT:1 + chr3L 6397838 3' + F-element 351 1 76.24 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCCCCTCGGTATGCGCGTGTTGTGTGGCCCATTTTGGGGGCTCATTTCTCATC:1 - chr3R 22864212 3' - jockey 4693 1 52.04 GTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTAAAGGCACTCCTCCAATACAAGCAGGCCAACCCATACATGCGAAGAAACGGCATAAACAAGCCGGCACACAGACA:1 + chr3R 17712483 3' - HMS-Beagle2 6794 1 77.23 TAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGATGGGAGCTCGGGCGAAAACGAAAGCAAACTTGCCAAAAGAGAGAAATTGCTTTGGCATA:1 - chr3R 28801077 3' + Bica 4908 1 64.36 AAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGAGCATGATGTCCAAGGGCGTTATTGTTATCACAGTGGGCCAGCTGCTGGGATGGGTGCGAGACTACGCCGA:1 + chr2R 16013349 3' - I-element 199 1 78.22 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACTGGTTCGGCGGCTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAGCGTCTGCTGTTTCTGCTTAATTTGCGAATAATTCG:1 - chr3R 29512070 3' - INE-1 255 1 64.36 ATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAATTATGCGGATCCTCTGACATTGAACTCGCTACTAACTACTGGGTGGATCCGGGAT:1 + chr2L 10022386 3' + F-element 321 1 60.40 ATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTACGACCTGGCCTCACATCCTGCCCATCATTAGCCTCATCATTTAGTCATCAGCTTCGGATTGGTCTCCATATTTTT:1 - chr3L 21404417 3' + Rt1b 4926 1 55.45 TCTTCATCAAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCATGTGGCATGCTATGTGGCATACATACATATGTGTGCTTCTATATCTATAACTGCTCACCTTTTCTCC:1 + chr3L 1070823 3' - R2-element 431 1 70.30 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCAACCCAGA:1 - chr3L 3254965 3' + 1360 3386 2 67.95 TCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACGGCGACGACTGCAATGAGATAGTGAACCTGAGCGAGGCATGA:1 - chr3L 16205993 3' - 1360 3287 1 58.42 ATGAAGGCTCCTTGTGATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTTTTATAGGCGTCGACAGTGGTTCGTAATTCTAATTTAGATAGACGAAATAGG:1 + chr3L 3484708 3' - diver 5841 1 53.47 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTATATCCCC:1 + chr2L 12843417 3' - roo 14 2 63.37 AAAAAAACAGCAAAAAACACACAAATAAACTACTAAGCCACCAAAACTCAAACGCATCTCGGATCTTCTCGCTCTTGGTCGCGTGGGCGTCTTCCCAAGCA:1 - chr2L 20956228 3' + Porto1 4436 1 63.37 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTACAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCC:1 + chrX 14424081 3' - hobo 48 1 74.26 TGTATNAAGATTCAGATCACGGTGAAGGAAATGCCGACGAGATTGAGAATTGAAATCTCAGTACTTGGCATGTGCTTGTGTTTGAACAGGATATGCTCGTG:1 + chr3R 20100230 3' - BS 4797 1 54.46 GCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGAT:1 + chrX 9260645 3' - 3S18 5773 2 54.72 CAGCGAGCAGAGACGCTAATGTAGCCGCCGACAACGTGCCCAGCACCAGCGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTGGAAAGCTCCTTCTGCCAGCTGGACGACAAA:1 + chr3L 3967669 3' + G-element 470 1 79.21 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAACTAACATAACTTGCCCAGTAAAAAACAAAATTGAAAGGCGCATGGAATATATATT:1 - chr2L 9346157 3' + Transpac 291 2 51.49 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCAGATGCGAGCAGTAGTTTTGTTTT:1 + chr2L 11576433 3' + roo 357 2 74.26 TTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGTTTCTTTAAAACCTTTTCAAGAACATCCGATTTTTACTTATTTAT:1 + chr2L 15894772 3' + jockey 4962 1 54.46 CGTTTGAGTTTAAGAGACTGTTGCGGTTGTCTGCCATCAGTGGTAGAAAATTTTGCAGAATCCAGCATGAGACACCTGAACAAGAAAAACGATCATTTCAA:1 + chr3R 1614396 3' - Doc4-element 333 1 74.26 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATAGATATTCACTGGGTGATGAGAATTTGAGCGTGTCCATATAAAAATACAGTTATCTGTTCTATTTGAGCA:1 - chr2L 12751667 3' - flea 4757 1 75.25 AATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTATCTATTGATTGGCTGGAAGAATCGAAGTTTT:1 - chrX 19821197 3' - R2-element 3157 1 79.21 TCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATCTGTGGTGGTAGTCCAGTTGATATTGTCCTG:1 - chr3R 6171387 3' - HMS-Beagle2 6849 1 79.00 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGTGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATATTAGACAGACAGAGACATAAGCAAAGGACAGATTTGCAGA:1 - chr3R 21010705 3' + hopper 1410 2 74.26 GTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGAAAGTTCAAATCGAGGGATGAAAAGGGATTGGGCGGGCATTGTGGTTTCATTTTCGTGGGGG:1 + chr3L 10191941 3' - Doc 236 1 69.89 ATATTNATATTTATTATGACAAAGTGTCGCAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCTTGCAGAAATCAGATATAATCAAGATTGAGGGAATTGAGATGCATA:1 - chr3R 4618171 3' - Stalker 6928 4 57.43 TGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTGGTCAGCATTGTGGTGGCACTGGCCATCGCCGCCG:1 + chr2L 19768826 3' - I-element 5188 1 65.35 GAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAACGAGAGAATATGTGCAGAATGCAGTGACTGTGACGCCATTTTCAGGCGAAGCGTATGCAAAAGAGAGAGAAGCCGA:1 + chr3R 10532497 3' - Cr1a 295 1 56.44 GCTCTCTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGAAACGCAGTCGAGAAATACGTCGAAGAACTCGACAAGAAGGGAGACAACTTGCGAAACCTCGGA:1 + chr3L 20802070 3' - Doc4-element 104 1 64.36 CGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTCACAGTATTATTTGGGTGCGATTTTTATTAAGGAATTCATATC:1 - chr2L 14776660 3' - F-element 392 1 57.43 ATATGGATGGAAGCCCGAAAACCGCGGTACCATACGTAAAACGCAAGTCAAATCGTGTTGCATAATTATAGTAATTTAGCGCCAAACATCAATCACAATTT:1 - chr3R 18815753 3' + HB 482 1 64.36 GAAAAATAAATAAACAAATAAAGTTTACTTTCCTTGGCGGGGCCAGTGGATGGGTGGCGTTTTTGTTGGAGGAAGGCCTTTGCCAGATTCAACACGGCAAA:1 + chr4 710967 3' + HeT-A 307 1 56.44 CGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTCGGCTGGGTCACAAGGGATCCCGTCGTGGAGCTTTCCAATTCAACTGACTGCCTCGCGTGCGGCA:1 + chrX 1735045 3' - Doc3-element 4583 1 63.37 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATC:1 + chr2L 1353767 3' - I-element 44 1 70.30 TCATCATATTCTCTAATGTCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCATAGCTCACACCCTATTTGTATCTTTCTCCTTTACTGGTGTTTTTAATGT:1 + chr3L 12038083 3' - invader4 198 2 50.50 TTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAAACACTTCGGTCCACCGTTTTCCGG:1 - chr3L 25514037 3' + X-element 4701 1 64.06 GAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATTAAAAAAAAACGTGAAAGCTGAAGGCAGCAGCTAGGAAAACAACGGAA:1 + chr2R 19151990 3' - Circe 123 2 64.36 TCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGAAAAATTCATTAAAAGTCATCACAGTCCGTTGCTGTTTTTATTTTGTTTTACTCTGTGCCCAAA:1 - chr2L 13081820 3' - gypsy4 22 2 70.30 GTCATTCCAAATCTCCTCTAATTGAGATAAATCGCTCTGGAAAGTGTTCCCTCAAAACAGCCATGACGCATAAGCTCCGATAAAAACTGTTGTTCGATAAG:1 - chr2L 2387444 3' - mariner2 542 1 63.37 AGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACAGCTTTGGGGTGTAGCTGGGCAACGTAAGAATGCTGACCATTCAGAAATAGGGGATCACATAACAC:1 - chr3R 1862047 3' + G4 3410 1 58.42 CAGTGTCTGGTTTTGTCCAACGTAAAGTCCCGAAAATATCAATATTTTCTAACGTGTGTTTTATCGTCCGATTTCGGTTTCATTCTCGATTGTAACTTCAA:1 + chr3R 8257419 3' + HB 224 1 60.40 ACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGACATTGTTGTTTTTGTTGCTGCCGG:1 - chr2L 17874489 3' - HMS-Beagle2 3 2 81.82 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTGCGGCACTACTA:1 + chr2L 7654061 3' - jockey 10 1 74.75 TGGCACAGATCCCACTTCTGATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCTCCTCATCCTCACCATCGTTATCCAGAAGGCCATCATCCAGCCCAA:1 + chr2L 9373125 3' - micropia 476 1 56.44 GTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGTGTTTTTCTTAACAAGATGAGTCCGATTTCAAAGCGAGCGTAAGTTTGCCTCAAAAGTGGGAATCCAGAAATG:1 + chr2R 23940596 3' - baggins 5123 1 68.32 TATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGTTGTTGTGCATCTAGGAGTAGTTGTGGTTGGGCGACTTGTGGAAGG:1 - chr2L 4940641 3' - I-element 5123 1 53.93 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAG:1 - chr3R 13375983 3' - 1360 47 1 74.26 ATCAGNTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTCCTTGATGCTAAGCTATACCCGTCTG:1 - chr3L 20759491 3' + roo 9039 1 56.44 TAACATAGTAATTATTATTTATTTAGGTCTTTTTTTTTTGGACGTTTCCTAAATTAGTTGCTTTTGTTATACAAGCTAGCCAAAATATTATTTTCCCCTAT:1 + chr3L 10540512 3' - jockey 4834 1 84.16 AAAGCACTGATTAAATGGTAGTAGCGCGTGTTATCTGAAGAAATGCGGTAAAGTCCTTTTTGATACATGCGATCAACCTCTTAAATTAGTATCTTGTATCT:1 + chr3L 2634581 3' - Chimpo 445 1 60.40 TAGCTNCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAA:1 - chr2R 18358426 3' - jockey 4678 1 58.42 CTATTGATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCTGCGATGAAGGAGGCATGGTGTTGCAATGTAAGCTGGGCCAGGCCCATGAACTAT:1 + chr3R 4623087 3' + Bari1 1244 1 57.43 ATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAGGTCCTACTTTTTAAACCTTTTTTTTTTCGCTTTGACGCTTTTTCAATTCCGCTTTATCTT:1 - chr3R 8926822 3' + hopper 363 1 66.67 ATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCAGACAAACTGACACACATAA:1 - chr3R 17714790 3' + hobo 401 1 79.17 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAGACCAACGCAATAATTGCTGTTGCGGTACTTTGATAAATATTGATT:1 - chr3L 21908861 3' - roo 8669 2 74.26 AAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACAGCCGCTTTGTTGTATCTATTCGATAACCAAATAGTTAAATGTATGTACGT:1 + chrX 18198489 3' - Doc 275 1 50.50 ACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGGGGGCTTGGTTGTGGGCTCTGACTTG:1 - chr2L 19065205 3' + R1A1-element 4945 1 68.97 ATCATTTTTCTGGGATATCGATGAATGTGAAAACATTTAAAAATTGTTCTAAAGTCTGGGCGTTAGAGTGGGCATGGCCAAAGACCTGCTCCGGTTCCCGG:1 + chr3L 17035948 3' - INE-1 504 1 77.23 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAG:1 - chr3R 15072562 3' - pogo 19 1 57.43 CTTTGTTTTAAGAGACTAACAATAAGTATTCAAATCTTAATCTAGCTTATTTAACATTAACTAAGTATTAGAAATTAGGATCGTATTCAAGGCCAAGGTCT:1 - chrX 20385392 3' - Doc 4656 1 65.35 ATGCAGACCTCTGGTCAGCATTTTGGTCACTTACGTTTACCCAGAACAATATAGGAACACAAGGTGTAGAGAGCTTGTTCTGGGTAATAAAACTAGATTAT:1 + chr3L 19954232 3' - HMS-Beagle2 6957 2 77.23 AAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCAACTACCCTCACATTTCAGTGTTTATGA:1 - chrX 2501031 3' + Doc3-element 4501 1 78.22 GAAAGCGAAAGTCTCGTGTTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCTAAATCAAGTATCGGCAAATGCCCACCATAGTGAACTGTACGAAGAGCTTAATGA:1 - chr2R 13517578 3' + X-element 419 1 84.16 AAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACTTGCAGTCCGCGATTGTTTTTGGTTTCCCTTATCAGTGGAT:1 - chr2L 3713766 3' + P-element 147 1 47.52 AATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTCAGCCAGACACTGTGTATATAGTTA:1 - chr3L 400695 3' - R1A1-element 328 1 75.25 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTACTTAAATTTTATTACATTTAATTCTAATAAAT:1 - chr3L 25798459 3' + blood 333 2 70.30 CTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACAGCTCACCCCGTCTGTAGTTAGCTTGCCCCTCGTCATGACCCAACAGTTTGCATGCGTGCTCTCGA:1 - chr2R 19616068 3' - R1A1-element 5121 1 47.52 AGAAATTTTTAATCTCTCATTGTAACGGTTCTTTTTTTCAAAAATCAAAAGTGCTTATATATTAT:1 - chr4 1044403 3' + Tc1 133 1 52.31 CGCGTGTTATCTGAAGAAATGCGGCTGAATCCGTTGGCAACACCCACGACCCAACATTTGTTTGATATATACTGAAAGAAAAAGCTGATTTATTGCGAAAT:1 - chr3L 3936064 3' - Chimpo 421 1 74.26 CAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTCTTGCTGCGCTCGCGGGATCGGGAACGTTTGCCGTTGCCACTGCC:1 - chr2L 9914242 3' + 1360 491 1 56.44 GGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTA:1 + chrX 22386797 3' - hobo 50 1 66.34 CCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGCTGGGCTTTCACTTTCCTTT:1 + chrX 1524508 3' - F-element 4565 1 75.00 AGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGGTCGAATAAACGAATTTTCCAGCTCATAGCTGTCGCCAATACTCCTTTCACGCAGCATGCAAATTGAGATTT:1 + chr3R 4911484 3' - 1360 3188 1 70.30 GCTCTTGAAATACGATCGAGCGGCATTATTTGTTGGTGAGCACGGCCATAAATAGGCCTCTCGATGAGC:1 - chr2L 8257994 3' + Stalker3T 117 1 79.71 AGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTCCGTGTTTGTGTGTTTGTGCTCTGTGTGTCTGTGTGCCAAAGTTTTAATTGAAGAAAACTTATCGCCGCATAA:1 + chr3L 1689449 3' - 1360 3225 1 79.21 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCAAAACTTTGTCGATCCGTTCTTGGGAAACTG:1 - chr2R 10697015 3' - 297 8 2 59.41 TATTCGAATGAATTCATATTGCATGTTCTTGGGCTCTTCCCATTCTCCATTCATCGGATGAAATCCGAGGG:1 + chrX 8772355 3' - Stalker3T 276 1 73.24 TCTTGGATACAAGCGCTCTTAGATTCCTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCTGCAGAGTTGAACGAATAGTGGTTAGTA:1 + chr2R 10510144 3' - Idefix 322 2 72.00 GCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTCATAGTATCTCCGGCTCG:1 + chr2R 11670886 3' + opus 89 2 73.91 TAGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGAAGGTAGTATGCGCTTTGCAGCCTGCATTTAAGGTCCTTTTCTCTCTATTC:1 + chr3L 1600510 3' - Cr1a 4000 1 57.43 AATCAAAATTTTGCAAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTGCCGAAGAAACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACTTTCTTTATCACTCTATCAT:1 + chr3R 11348460 3' + HMS-Beagle 331 1 78.22 GTCGATCTGGCCATATCCGTCCTTCCGTATGAACTTCAAGATCTCAGTTACTTTAAAACGTTTTTTGATTGTTATATAAGTCTTACAAATTTATGCCACCC:1 + chr4 823778 3' + INE-1 111 1 51.49 GACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCAGTAGGGGTGGTAATGAACGGCCAATCGATATTCAACGAGATGGCGAGGCACAAGTCGC:1 + chr2L 19197293 3' + baggins 5191 1 63.37 TAAACCACCACGCCTACACAAGTAGGAGACATCGACCGTGTCTGTCATCGATAATCGATACTCGATAAACACAGCAACGAGACAGGACTCTCATCACCCAT:1 + chrX 13775978 3' + ZAM 40 2 71.29 AATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAACCTTTACTCACCTAATGAGAATGCGAACGCAATATTTTATCATTTTTTTTGTTTTTCTTTTCTATT:1 - chr3R 31405632 3' - INE-1 570 1 77.00 TTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGACGTTTCTTTTCTTAGTCGGGTTAGAAAGTGTTGCTGTTTTATAGAAATAACTTTCACTCCTTTCATTT:1 - chr3L 13804562 3' - HMS-Beagle 6946 4 44.55 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGTCGCCATTTGGGTTTCGACCGACGCGCGCA:1 - chrX 19848445 3' + P-element 2877 2 54.69 GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTAAACACCGTCAATATAAAACTTGTATTGTT:1 + chr3R 8185240 3' - Doc 57 1 69.31 ACAAAAGTTTGGTTTTTTTTTTTGTTTCTCTTTGTTTTTT:1 - chrX 4484426 3' - HMS-Beagle2 494 1 67.50 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAGGCACTACGGCACTATTTTTGACTAGTTACT:1 + chrX 13259290 3' - pogo 41 1 68.32 TCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACCGAACTAAGCACAATTAATAGCCCAAGCAGTCATAACAAT:1 - chr3R 11489312 3' + roo 8771 2 57.45 TAGCANAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTTTAATTTATTTTCAAACTCCACCCTACCGCCTCGACCCGCAACTGTAAAAAGAAAATCTCGGAAAAAC:1 + chr3R 22938956 3' + 1360 3212 1 70.30 CGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAACAGATTTGGACATGGTCTGTGGCGAAACCGAAATGTACGAACTCGATATCAACTCATT:1 + chrX 15232554 3' - F-element 366 1 63.37 AACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATGTCAGGCCAAAAAAGGAAAAATATATAATATAAAACGAAGGCTGGGCTGCAGAGAGTGAAAGTTATTG:1 - chr2R 10394897 3' - gypsy12 10043 2 72.28 CTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCGTACTCCAATGAGGACTCCAGTGCAATGGCGCTGGGCACAGGCTCTGAGCTATCCACACTGCTGTCCCGAACCGAA:1 + chr3R 23063818 3' - blood 7296 2 80.20 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTCTGTCCCTGTGGGGCTTCCCGGCAGTGCTGCTGATTTTATACATTCAAATTAGTTCGCT:1 - chr2L 17050131 3' + flea 241 2 66.34 TTTCTATTCTCGAGGATCGTATAACAGTCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTCTATGTTGTAAAAATACATTTTAATTGAGACG:1 - chr2L 15222811 3' - Idefix 6948 2 78.22 AAATGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGGACTTTTCGCGTTTCTGTTTTGTATTTTGTGCGCCGCATTTGCAAGCCGGCAATGGGTGTTTTGTTAGG:1 + chr3R 31682813 3' + Q-element 82 2 65.35 GCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCCTTAACTCGAAGAAAACTAACTAAATCAAATAATCAAAAAATATTCGATATATGTACGTG:1 - chrX 16838399 3' + F-element 373 1 65.00 CCAAANAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATT:1 - chr3R 9193596 3' + roo 9030 1 65.35 GGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAGGGTGGTTGTCCAGTCGAGGCAGCATTTGTTGCTCTTCCAGTTTGTTGTCG:1 - chr2L 1272250 3' - G-element 4147 1 66.34 TGAACGTCGAGATCTCAGGAACGTCGTGGCAGATCACCGGAACCCACTTCTCATCAGTGAAAATGACAGGTGGACCACCACGCTCTTGGTGAGATCCACTT:1 - chr3L 12472023 3' + INE-1 140 1 44.55 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAG:1 - chr2L 9823627 3' - hobo 26 1 55.00 ACACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTTTGTGGCGTTGTGGTCAATATTCGTGGAAAGTCGAACAAGATCTCTATTTG:1 - chrX 1158973 3' + Stalker 118 4 65.98 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATAAGCGATTCGATTTCTTTCGCCGCAAGAACATTGTTTATTTGATCGCATGCAT:1 - chrX 15384734 3' - 412 23 2 57.43 CATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGAAAGTTTTTGCAGAGGTTAATGCGCATTTAAACTAATCAAATTAA:1 + chr3R 17542163 3' - 1360 173 1 55.45 CAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAG:1 + chr2R 21421087 3' - springer 32 2 61.39 TTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAACAACCGGAACAGGCCTCCGAGTTG:1 + chr3L 6125899 3' + Stalker 7170 4 69.23 ATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTCAAGATATGACTGGAATTATTGTTGCAATTGCTGCTCCCAATGCACGACACATTCAC:1 + chr3R 24065789 3' + 1360 447 1 60.40 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTAT:1 + chr2L 6177228 3' + pogo 2058 1 72.28 GATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTTATGGATGCGGTGCAATTCGTTTTTCTCAGTGTGCTTGGGCGAAACTTTTTGCAACTGCAGCAGATATGGCAG:1 - chrX 17424434 3' - Quasimodo 6899 2 77.23 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAAAGACCCAAAAGGTAAAAGCCAAG:1 + chr3R 12578214 3' - jockey 7 1 72.28 CGGATGGGCACGTAGTTTGTTGCGATATTTTTCCATTTGCTTGGCTATTTCATCACTGGCAGACTTAATGTCATTTTTATGTTGGCCTAAAGGATTTTTAA:1 - chr3L 12999927 3' - Fw2 3736 1 53.47 TTTTTGGTCAATCCAAAAACTAGTTTCACTACCTTCTCAGCTCAGGACTCACATACAACGTTTCATAAGGAATGTACGGCTTGGAACCAGTAAGATTCTGG:1 + chr3L 22767417 3' + jockey2 344 1 77.23 AATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGGTTATTTAACGAGCTTGCAGGAAATTGTT:1 - chr2R 5616569 3' + 3S18 292 2 70.30 TAATAACAATAATAATACCATTTGAATGCTATTATTATTGTTATTTGATGAATGTTTCAAGCCATTTCCATTCATCAAATAACAATAATAATAGCATTCAA:1 + chr3L 14731303 3' + mdg1 18 2 48.51 AGCGTCAATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCTTTGTACTTGCTGCAGGCGCG:1 - chr3L 14033235 3' + HMS-Beagle 6776 1 79.21 GTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGGAACTAACTCATATGGAACGCTGCTCCCACTATACAATATTTTAATGCCCCCATAGAAAAACGCAGCTAAC:1 + chr3L 10198588 3' - hopper2 1184 2 76.24 GCATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCTGCTGCTGTTGCTGGCCGCCGATGTGGCATAGTTGACCGCCTCG:1 + chrX 7688562 3' + HMS-Beagle2 6764 1 56.44 AGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGAGTTTTGCCGGGTCGTGAGTGTGTATGCGTTGGAAAATCTTAACCCTTAGTC:1 + chr2R 1892065 3' + Chouto 18 1 55.00 GGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTATGCCATGGCATCATGGGTGGTACATATGTATACATATTATAGGGGTCTTGGGGTTGCTGAAATGCC:1 - chr3R 20751392 3' + R1A1-element 4948 1 69.31 GCAGCAGCTCAAGCGATAGCAGCTCCTCGTAGTCAGAGCCTGGGGAATGAAATTGACTTGACGCATTTTATTGAAGGAGACAATGGGCGAAAATCCAAGAA:1 - chr2L 19161850 3' + G-element 410 1 59.41 ACTGCCCCGCATCCGTGCTCGCGCCTACCCTTTATAGGCCGCAGGAATCCCGTTATTTCCCTTTTTGGCCAGCTGCTCCTCTATAGCTTTTCTCAACTCTG:1 - chr3L 9826837 3' - gypsy8 358 1 66.34 GTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAACTATAGATTCTAGAGACATAGGCGCAGGGCAAGTTTGTTGACCCATATT:1 + chr2R 5296381 3' + INE-1 111 1 90.10 TCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTATAACTGCTTTGCCGTCCATAGAGCAGCAGGTACATGGACGGGATGGA:1 + chr3R 5381957 3' + Ivk 326 1 77.23 GTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTGAGGTGAACGATAAGTTGGAAAGTAAAATGATGTGTTTCAAACTATATA:1 - chrX 15562726 3' - Quasimodo 6890 2 52.48 TGCACATATTATATGTGACTGCATGGCATTTTCCAACGTTAACGTCCTCGACACTATCGCACACTTGAGTACATAGCGAACACAGCGTAAATGCAGCCACA:1 - chr2R 12959670 3' + baggins 5235 1 77.23 AGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGCGGCGGTGGGTACGTGAGGTGCCTGAGCAATGCAAATGTTTAATAAACTTTTTCAAATAA:1 + chr3L 22314161 3' - gypsy12 10003 2 64.36 ACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTAACTGAGTATTATGTATAGTTCTAGACAATTGT:1 + chr3L 11600283 3' - diver2 93 2 68.32 AGAGTNCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTACCATGCTGAGCGCACACA:1 - chr3R 19535675 3' + hobo 2930 1 68.42 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGTTATAGAAACTGATGTG:1 - chr2R 13645340 3' - jockey 4710 1 57.43 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTTAATATATCTGAATATTCTGCGCAATCCACAAATTGCGCGTTTGTAAGTGAAAAAGCT:1 + chr3R 5946187 3' - HMS-Beagle 6810 2 63.37 CTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCTTTGAATTCATAAATATATTGCTTTCCACTTTAAGTAAACGACCTCAACCATTACAATCAAGAAT:1 - chr3L 4634201 3' + Idefix 6979 2 71.29 ACGATCGTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATCTCATGTAATTTCACTGTAGTATATTATTGCATCATATCAATTCTTGCGGTGTATTCTTTAGAA:1 - chr3L 25278302 3' + transib2 234 1 68.32 TTCGCGCCCAACGAGCGCGCGGCCGAATGACGATATCACCACTGATCTGGCACGCTGTTCCACGAGGTTGAGCAGGTAGAAGGGATCCCCCAGGAACTGGT:1 - chr2R 7700423 3' - Rt1a 289 1 56.44 TCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACGCGGAGGTTTTTGTTGTATTGTAGTTCTGACCTTGTAGTTTCTACTTGAAAGGATTTTCCCGCCCTTCGGAGTTA:1 + chr3L 11466213 3' + Rt1b 4962 1 59.41 GCTACTGCAAAATTTTGTCTCGACACGGTTCAGTCGCCATAATGCGTTGGCTCCACTCAGATAGTGGTTCGCATGGTAGTTCGCGGTGGCTGTG:1 + chr3R 11308664 3' + mariner2 93 1 58.51 ATATTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTCGGTATAATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTGGTTGCACAACCAAGGTTAGGGGTTCGTTTTCGTTCG:1 + chr3R 17952520 3' + gypsy2 208 2 63.37 TGTGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGCTGTGGCTGTGGCTGTAGGTGCAATTAATACTGCATTTGCCAGCTTTTCCTCGACTTTGGCTGT:1 - chr3L 2442439 3' - Porto1 452 1 75.25 ACCACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACACAATAAAATAGCAATTTCAAAGGTTCATAAAAATAAATACAGAATTGATATCGCTA:1 - chrX 10309632 3' + Porto1 4184 1 59.41 ACTATCAGATACCCCTTACTCAGCAGGTGAGAATGCGAACGCGAACTTTAAAATTCTAAAAGATATTGAAATTGTCCAAAAATGCGGCCTGACACTGATTT:1 + chr3R 22165262 3' - INE-1 548 1 72.28 GGATAACGGAGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTAGCCTCAAGGACGTGTTCTGTGGCGATTCATTTTTCGCACAATTTAATGTTACTTAATTG:1 + chr2L 18088362 3' - G-element 4015 1 54.46 GGATCACGATGATCCATTTTCTATCCATTTGGACGTAGAAAATTTTGATTAATATATTGTAATAGAGAATATATATAGAAATACAAAGGAATTTCATCTGA:1 + chr2R 10562281 3' + transib3 2562 1 81.19 GTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTACAGTGTTGCAATGAGCTTATGTTGCTGGCCACTTCCAATGCGAATATCTTTTTAGAGTGCC:1 + chr2L 11730283 3' - hobo 2665 1 68.32 CTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATGTGTTCTGTATGTGTGTGTGAGTGTGTGATGGCTGGTTAAGGACACAA:1 - chrX 20368468 3' + Stalker2 374 2 52.48 TGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTGCAATTGCATTTCAGCAATATGGAAAATTCCCATTGTTAT:1 - chr3R 8558309 3' - I-element 4974 1 60.40 TTTGTCCCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTACGATGTCATCCCTGCCAACCATCGTTGGAGCTGTCACTGAAGAATTTA:1 + chr2R 5944567 3' + G2 382 1 69.51 GATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATGCCACCGATGAATAATACCACATCGTCCATGAACATATATTTGTTTACTCACGTAAAATAGGAATA:1 - chr3L 3300151 3' - Cr1a 4350 1 68.32 CACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACACATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGAGATTCGTCGAAATCTGAAATTGATC:1 - chr2R 12451657 3' + R1A1-element 245 1 39.60 ACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGCAGAAACTGAAACACACGCAACTCATTTACCAAGCTACTGCGCGCCTACTGTTGCATC:1 + chrX 15821952 3' + Stalker 6925 4 66.00 TGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATAGATATTCACTGGGTGATGAGAATTTGAGCGTGT:1 - chr2L 12751703 3' - flea 36 2 70.30 CCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTAAAAAGCAATCTTTGTGTTAGTTTACCGCACTCGTTTCCCGTTTAGCGTCTAAACGAGACTCCG:1 + chr2L 19106221 3' - G2 142 1 68.00 CGAGTCACATCCGGTGTCTCACAAGGGAGTCACCTTGGTCCCCTTCTTAAAGTTTGTTTAAGTAATTTGCCCAAAAATGTTGCACAAAATGCTCCACAGAA:1 + chr2R 10920492 3' + Q-element 472 2 61.39 CAAAANGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTTGGGAATTGGTTGGCCATGGCCATGGTCGTGGCTGAGAATGGGCCAAGAT:1 + chr2L 20370765 3' - I-element 4999 1 55.45 AGTACAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACACTGATAGAACATTCTTTGGGTCTGCAGCCCAACTAAATTAGTTGAA:1 - chr3L 728652 3' - 1360 3237 1 53.00 TGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATATCGTACCTGTTTATCCTTATTCAGTTCGGCATTACAGGTGGCTTTGAGGCGTCCGAGGACAT:1 + chr3R 21833973 3' + Cr1a 4176 1 67.33 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTATATACCTTCGCACAGAGGCACCGAAAGCACAAAGACCTACG:1 + chr2L 9856301 3' - HMS-Beagle 6827 2 60.40 AGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATGTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGTTCGGTTGGGTATATAACTCCGCTCATTAGTTGCCCTACACGCAATTAA:1 - chrX 7354249 3' - G5 4693 1 62.38 ATTTTGAAAAAGGTCAAATCGAAGGCTATAGGGAATCTGGCTTAAAATTGTGTTAAGCTCCACTCAGCGCGCTTCACTATAATTGCATTTCCGGCCGAAG:1 - chr2R 4716310 3' + Tc3 463 1 57.00 GTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAAGGCACTTCCGGCAGCCAAAGAGCGAGGACGGGCGCGGGAGAT:1 - chr3L 13320854 3' + micropia 5231 2 57.43 CACCACCCTCATGACCTCCATATAATATTTAATACTGTAGGCCGAAGGTAGCCGATTAAAAGTACATAATTCGTGATAATAAAAACTTTGTGTCAACAAAA:1 - chr3L 9067005 3' + jockey 4760 1 71.29 CAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGGGTCGCAGGGGTCGTCCGGAGTAAATCATCAAGCGGTTCTTGGTG:1 + chr3L 19347994 3' + jockey 4717 1 58.42 CTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGAGCATCGGCAGGGGAGGACCATTCTCTT:1 + chr3R 10533972 3' + micropia 5162 2 68.89 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGT:1 - chr2L 9823646 3' - hobo 46 1 67.33 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACATTTTTCGCCAATTTCCCGTTTCACATTACAAATATTTTATTTTTTCATTAGG:1 + chrX 10661017 3' - HMS-Beagle 16 2 58.95 GGTGGCCTATATTGGTTTATTACATCTATTTTGCCATTGGTAGCACGATCCCATGGAGCTAAGCAGCGCAAAGAAGACCAATGTAAAATATGTGAAAAAGT:1 + chr3R 9996485 3' + blood 7387 2 76.24 TTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACACTAGGA:1 - chr3L 5691240 3' - P-element 193 1 43.56 CCGTGGGCAGCCGGCAAGCACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGGAATGCGGCTGTCAAAACAGCAAAGTATCATTTTTACCGAGCTGTTGGTCCTGCCGTTT:1 + chr3L 25442229 3' + Gypsy6A_LTR 87 1 59.41 TTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCAAGATGACGCGACTGTGGTTGGACATGGACCGAGGTCAAAGGATGTTGCCTGGAACT:1 + chr3L 9748864 3' + copia 4990 2 60.40 ACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAGAGATTAAGCCACAGAATAGTAGTGCCTCTCTTTTACACCCATTGGTGGCATTTTCGACATACT:1 - chrX 693711 3' + INE-1 143 1 57.43 TTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTCAGTTTCAGTTTTAGTTCTATTTGGCGTCTGCAAAATGAGGCC:1 - 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gypsy2 6384 1 70.30 TTACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACTGATTAATTTGCATGTCGATGTGGCTAATACATACACACGGCGAAAAAAACAAAAAAAAAACTAGATC:1 - chrX 9719615 3' + TAHRE 10287 1 69.31 TGCGGACATGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACATATAAGACAAAAACAGTACTGCAGATTCTGTA:1 + chr2L 4142130 3' + Bica 54 1 71.29 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTGTGTGCATGAATTATTCGTGTATGTATGAACTGTATACTTAGGCTAAGTGCAGG:1 - chr2R 19079164 3' - 297 18 2 54.46 AGCTTCAAAACATTGTGACACTTTGTCATAATAAACAAAACATTCAATGATAATAAAACACTCACCTGAATACAATTGACTTTCAAATGGAAAAAATACCC:1 + chr2L 5686900 3' + Stalker4 57 4 58.42 AAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGGTATGGTATTTCTTTTTGGACCGCACTGCCATAGTTTTTGGCTCGTTCA:1 + chr3L 14738493 3' - I-element 464 1 55.45 TTTTTNTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAACAGGCTTCAAGAAATAAAAATCTCCAAGATTTACTCT:1 + chr2L 4071795 3' + rover 155 2 63.37 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCGAGATGGCCCAAAAGAGCGCAAGAGAACCGCTAAGAGCGCATTTGCGATTG:1 + chr2R 11115863 3' + hobo 2920 1 51.06 CACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATGTACATACATTTGATATGAGGTTAAACACCATAAGCCTATTTTAATTATATCTTGTGA:1 - chr3R 5775660 3' - invader4 21 2 58.42 ATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAACATGTATTTTTAAGGTACCCGGGAAAGGCTTTATTTATGCCAGCCGTGTGGT:1 + chr2L 17620005 3' + 297 260 2 54.46 TCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGTGTGCTTTTATTAATTTCAACGACGATAAAACAATGTTTTTGACGCTATTCG:1 - chr2L 7064030 3' - Doc 301 1 57.45 CCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCAAGAGAGGCGAGTGGTTCGTGAGGAATCGAAGTATGAGA:1 + chr2R 7322290 3' + accord 54 2 61.00 ATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTTGTCTCTGTCTGTTTCCGGTCGCCTGCC:1 - chr3R 8444408 3' - I-element 4981 1 72.28 GTTAANTTTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTAAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGAGCTAGTTGGGAGCAGGCAGGATC:1 + chr3L 15761873 3' + HB 389 1 71.29 GTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCATAGATGAGATCGCTTTCCGCCGGCGACGGATCCTTCGCCAGCTGCCGTCGGTGCTCCTCG:1 + chr3L 19811278 3' + R1A1-element 4949 1 71.43 AATATNATCCTCTCACCGTGCTGGTGCCGAGAAGGGGTATTTGCGATTGTTCTTCGGCGTGGGGATGCAGTT:1 - chrX 16603048 3' + Rt1b 216 1 65.28 GTTTGGATCAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGTTGATGTTGAGAAACTGTATACCCCTTAATTGGCGGTGCCAAAACTAACAATTCAAGACAAATAAT:1 + chr2R 5477553 3' + Cr1a 4030 1 62.38 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTG:1 - chr3R 15072569 3' - pogo 25 1 55.00 TACTAAATATCATTGATTTAAAAGCACTTAAAAATCAAATACTGATTTCAGGTCGAGATGCGTATTCTGAGCAGTTATTCCGGTGACGAGTCCGATTACAA:1 + chr2R 18299718 3' + Tc1-2 429 1 90.10 TTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCTGCAGCTTCTGCTTATCAACTGAGTTACAAGTGA:1 - chr2L 23311735 3' - 1360 3181 1 66.34 AGGCCNTATCAACCTTCCACACAACTGGCGACGAGGATCGATTTCGGTTTGTTCAGTACTGGTGGATAGCTGTGACTTCTGCTCCAGATCCTGGCCTGAAT:1 - chrX 15186782 3' + Transpac 305 2 64.36 TAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACACAACCGGCCAAAAATACCGTAAATCGATCA:1 - chr3R 12656967 3' + invader1 3865 2 69.31 ACTATCAGATAGCCGTTACTCAGCTTGTGAGACTGTGCGTTACAAATTTTCAAATGTCCAAGTATTGAACTGGAAGTCAACGGGGAGGACTGTGGTTGAAT:1 - chr3R 6185206 3' - INE-1 548 1 62.38 GAATTGTTTACACCAGCTAGGGATGGGTTCAAAGTGCCACAACGCAGGGCAGGGGTTAGCCGGTGTCATAATCGATGCGGGTTGTGT:1 + chr2R 19301353 3' - diver2 276 2 66.67 CTGTTAATCATTACCTTCTAGTAAGGAAACTTGATCGTTAAAGTTTTGGCAGTGCAAATATTTATGCATAGTTATGGTGATATTCAGAAGATGAATTTTAT:1 - chr3L 2195609 3' + Q-element 338 2 67.33 CAAATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGTCCCACGTATATGCCTTTTCTCAAAAATTGTGATTCTAATTACGCAAAGGCAACGAAATAAAAGCGAAG:1 + chr3L 12898569 3' + Ivk 163 1 73.27 TCTTATCTGATATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATACATGTATATCACCCCAACATCCCTTTCGCGCTTGTTTGCTC:1 + chr3L 20772463 3' - Idefix 99 2 63.37 ATTTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCATGCGGGTGGTCATATCCACGGCGAATCTGTACGAGGACGACTGGCACAATCGC:1 + chr2L 3160999 3' + 1360 38 1 60.40 CGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGTTAACAACTCAGATTTATTGCTCATCCGCGGACTC:1 + chr3R 11313829 3' + HMS-Beagle2 6780 1 65.35 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCG:1 - chr3R 15072586 3' - pogo 41 1 71.72 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGATACTGAGCAGACGCCCACACACACACAGGGAGTCATTCGTT:1 + chrX 10555484 3' + Tirant 367 2 59.41 TAGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACTTGGAGTCGTTCACACAAGGTGAACTGGGGGGGGCTGT:1 - chr3L 22333395 3' + aurora-element 4079 1 62.38 CTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGTTGCGTTTGCCGTTTGGCTGCTGCACAAATTTTGGTCACTGAACTTTCC:1 + chr3L 11696483 3' - blood 1 2 78.22 GCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACACTAGGATTCG:1 - chr3L 5691236 3' - P-element 189 1 47.52 AGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGATTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACATGGCCCGAGGAAAGGTTAAGAACGGGCTACGCGGAAGCTG:1 + chr3L 10343473 3' + R1A1-element 5038 1 57.43 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGGTGTACACAGATACCGAAACGCGCGCAAACACACACACACACACACAA:1 + chrX 7978950 3' + hobo 2908 1 56.00 CAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAATACAAATGAACGATACGAGTGCGCAATTAAGGAAGGAACTCGCAATTTGGCTGCTCATTTTGGA:1 - chr2R 11116564 3' + hobo 2701 1 71.00 CTTGTGTCTTTGGTCCAGTGCACGGCAGTGCAAGGGAAAAGTTTTGGGAGAACAGAGGAATTCGCCGAAGAGAGCTATTACATTAATTGCAGTTCTCTTTA:1 - chr2L 6234905 3' + hobo 345 1 82.18 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCATATTCCTTTT:1 - chr2L 18286131 3' - 412 43 2 68.32 CTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTGTCTGTTTTTTTTTCTATATCGCGTCTATCTTCTTGCGAATCGAGCCGTTCGTGTGTCGGCTGCTTTTGGTTT:1 - chr3R 26390214 3' + Cr1a 4207 1 76.24 TGGACTCCAGCGGGCCAAGGGCAAATAGGTGTGTGCAGGTGCTGGGTCCTGGGAGTGCCGGAGTCCTGCCCTGCGGAAGGTGGGCGCAAGGTGTCCTCGGG:1 + chr3R 9831873 3' + gypsy8 4761 2 77.23 AGAGTTTTATGTTCTGACTTTTTTCTATTATCTTAATGCCCCGCCATATCTGGGGCCTAATGCATATAATAGGCCATGCCTGCTATTTAAAGTCTAACAAC:1 + chr3L 14893099 3' + Cr1a 4190 1 73.27 TGTTGNCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATATGGCAGCGTCTCCCAGCTGAAGGATGAGGGGCAACGAATGGAGGATTCAAAAATCG:1 + chr2R 5968867 3' - flea 11 2 66.34 CTACGTGGGAGCCCCTTTCTAAGGCTGGTGGCGGGCCCTATGATTCCGCTCTAGATAAAACCGTTCCCTTTGGGTGTCCTGCTCTTCGA:1 + chr3L 23307843 3' + Rt1b 318 1 71.91 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGG:1 - chrX 11042509 3' - jockey 4696 1 60.00 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTATGTATGTTTTTCAGCGAATTCTGTTTTGGGGAAAAAAACCTTTCGGTCAACCCTCGTTCCCGCTGACA:1 + chrX 12801541 3' - Burdock 6140 2 67.33 TAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATAAATATTTGAAATATTTGAGTTGCCAGGTTTTCGTTGGCCGCTTTTGTTTACGCGATTTCGATT:1 + chr2L 4906090 3' + Chimpo 434 1 70.30 TTGCTCACTCGTGGACCCTCCTGGCTCTCTCGGCAAGTGAAGCAGCTCACTCTTTCGGTTTTCCTTAAACGCTACACAATTAATGGTCTTGTTATGAGTAT:1 + chr3R 10893397 3' - Rt1c 5290 1 69.31 AAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTGGACATTCAGTAGCATTCTATCTTTTTTCATATATGTATATGGGTATATATGGATATTCTAATACC:1 + chr4 499297 3' + INE-1 544 1 66.34 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGTTTTCAAAA:1 + chr2R 4536703 3' + mdg1 7452 2 72.28 GTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTGCTACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGTGAATAAAACTTTTTAAAAATTTTA:1 + chr3R 7641687 3' - INE-1 556 1 81.19 CCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAATTTCATTTTTCGTCTGTGCTATGCAATTCAGTTTTTCCTATTCATTCCCTTTCCTAATCGGCTCATCGGCTT:1 + chr2R 1593248 3' - INE-1 537 1 70.30 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCG:1 - chr3R 23618131 3' + hopper 1393 1 57.43 AAGTCGCGAAGAAACGATTTTAATTGCCAGCAGTGCACGGTGAAAACCTGGATACTCGTTGCATACCGAAATATTATAAATCTTACACTTCTTTTATTTTT:1 + chr2L 436241 3' + Tc1-2 1240 1 80.20 CAAAACCCACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCTCGAAATTGATGTCGCGGTAGGGAGAAGTGGTTTTGTTTT:1 - chr3R 20340275 3' + Doc3-element 4567 1 63.37 AACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGATTGTACGAGTATGAGTATAAATAATTTATT:1 + chr3R 24014317 3' + Stalker 313 4 70.30 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACA:1 + chrX 3485690 3' + P-element 2839 1 29.70 GGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCA:1 - chr3R 26331645 3' - G-element 25 1 50.55 AGAGTATTAATGAAATGGAATGTTTAGTAATATTTAGATGATTCGCATATCCAAAGTAAGGGTATTACAATAAGAAGGTGGCAAAGAAGAAAACAAACCC:1 + chr2L 14457748 3' - jockey2 3262 1 54.00 GTGTGTGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCATCAACCTTCTGGACAATGGCCACTCCCGCCTCACCACCCTCCCTCAAGAGCTT:1 + chr3R 10017692 3' + G2 2836 1 68.32 AAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACCGCTAGCAGCTTGCGAGCCTTCGACGATGACGAAATGCCAAAGACAGATACAAAGA:1 + chr2L 12636576 3' + Quasimodo 7037 2 55.45 CACCAGCAGCAGCAACAGCAGCACGCACAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCATGCCGCCCAGACAGGCACACACATGCAGCAACGTGTGAGAACATAATAGGA:1 + chrX 15019692 3' + TART-B 152 2 64.36 CAGCCAATATGCCGACAGACTTAGTGCCCACCCGAACACGTTGGGGAAGTATCAATAGATGAGGAGTCCATCAAGGATAGCACATCCGAAGATATGGTTAC:1 + chr3L 16982467 3' + G5A 2604 1 56.44 AGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACACGAATTGCTACCGGGGTGTGAGCTCCTTGTGCGAGTGCTTGTGGCATGTGTACAAAAACGCTTTG:1 + chr3L 7019119 3' + R1A1-element 5137 1 52.00 ACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGTTCGGGGCGATTGTCCACCACAATCCCCAATCACAACTCCCGCTTT:1 - chr3R 21327489 3' + mdg3 380 1 70.65 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTT:1 + chr2L 7654036 3' - jockey 37 1 55.45 CGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTCCAATTTGGTTAGCTTGGTCTTCTTGTATGCCTTGCGGCAGTAATCCGTCAGACGTTTC:1 - chr3R 23350467 3' + Max-element 206 2 64.36 TGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTTCATTATCTGCTTTGTAATGTCTGTTTATTAACAATAACGTGTATAAAAAAG:1 - chr2L 20962735 3' - micropia 5325 2 55.45 ACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACACGTAAAATTTGTCGTTGTCCTGTCAAGTAGGAA:1 + chr3R 12112337 3' + Bica 460 1 70.30 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGTCTTGCATATATATGAGAATTTTTATGAGCCACTCATTAAGTATTT:1 + chr2L 17862259 3' - F-element 41 1 55.45 GAAAAGAAAAAGTTTTTTTGAAATTTAAAGACTTATTTTAAAGCCGTACCAGTCACCCTAAGCGTAAACTGCACTCCACTGGCTGTCTAACTGTTTCTCAT:1 - chr3L 19871844 3' - Stalker4 6868 1 50.50 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCC:1 - chr3R 22899193 3' - P-element 47 1 30.69 TACAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTCATAGTTATTCTGACTTTGACTTGTAATTGTTTGCTTGTTTATGGGTTACTCATTCAACAGAATTTATTTAAATG:1 - 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Doc 4350 1 66.34 AACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAATGAGAAAATATTATATTATCTGCAAAATCATCTGTAACATCGAATGATATTCAACACT:1 - chr3R 27660628 3' + I-element 72 1 59.41 CCGTCTGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGG:1 - chr3R 26331640 3' - G-element 30 1 50.50 GTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAATAATTTTTTTGGCAAATCGATATGAATTGGCAAGACGAATAATGTAATGAAAAATTATTAAAACATTTTTGA:1 - chr3L 23568113 3' - INE-1 218 1 65.35 AGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGAACTGCATCTAAATGGCTACGGCGTGGGCATCACATCGATGGAGGAGGTGTTCATGAAGGTTGGCGCCGAAA:1 - chrX 21296540 3' + Gypsy6A_LTR 350 1 80.20 TCTCTCGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTACACATTCGCACACATGCGGTAACATGGGGTAAAGAAAACAAGTTTCAGG:1 - chr3L 12695512 3' - Quasimodo 7143 2 50.50 GTCTGNAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATGCTAACATGAGCTGTGGGACCCGAAGAGCGAACTGCTT:1 - chrX 1193059 3' + GATE 371 1 65.35 GGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACTTTCTCAAAACCCTAAGTGTATTTCCTATTAACCATTTTTAAGGCGTTCTATTTAAATGTAATGAAAAGTTTG:1 - 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TART-A 13175 1 66.34 GGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAATCGAAAACCGAATTGAGGAGAACAAGCGCAGTAGCCCGGGCATGTTCTCGTGGGAGATCAGGG:1 - chr2L 12084777 3' + 1360 76 1 74.42 TGTAACAGGCAGAAGAAAACGTTTCTGACTATAGTCAAAATTATATATATTCTTGATCAGTTCGAGATTTTGCTGTACAAGAAGAACAGTGAGTATACTTT:1 + chrX 14990424 3' + INE-1 31 1 64.36 CACGCAGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + blood 7148 2 78.05 TATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCCCAATGCCGACTCCCCTTTTCTGGG:1 + chr3L 6110638 3' + McClintock 172 2 75.25 GAACANGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGGCATTTCGGTGCGGTGTGGCGACTCGGTGCATTTAAATG:1 - chr3R 7808928 3' - jockey 23 1 63.37 CAGTCACCAAAGAAGTGGCTGCATAGTGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGCCATCTGGGACCATACCATCAACACGTACACCCTG:1 + chr2R 673634 3' + 1360 3334 1 46.53 ATTATGTTCGTATATACTACAGTATGAAAAAATGGAAAAGGATTTTTGCGCGGCCTTTTTACATATTTTTCCGTTCGGGTCAGGCACATAACTGTGCATGG:1 + chr3R 11097616 3' - mdg1 7038 1 80.20 CACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACAAGCTGGTTGAGCAGTCGAGTCCATTAGGCCAACACTCC:1 - chr2R 22740712 3' + accord 194 2 60.00 GGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCACTGCATACTTTCTAGTAGCATG:1 - chr2L 13842275 3' - jockey 4720 1 55.45 CTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGTAATTTTATTGAATCGTGTTTACCCTTATGTCGACTCGGGTTTTGTTTGTGTTTTCC:1 - chr2R 22525772 3' - jockey 169 1 43.56 CCAATTAGGCGAACCGAAATTTATAATTATTAAAAGGAAAGACAAGAGTATCTGATAGTACGTGCCCAGCACTTGACAATCTTCGAAGCTAAAGATAGATG:1 + chr3R 21706822 3' + I-element 237 1 65.35 GTGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGTGTGGGGTGGGGGCGTA:1 + chr3R 17602454 3' - HMS-Beagle 6728 1 58.70 AACACNGGGGACACGTTAGTATTCTCTGTTAAAATACACATAAATTGACTGTTACACAACAATGCCGCTATAAATAAAATCAACGTCGCAGAAAAGTCACG:1 + chrX 11478724 3' - transib2 382 1 59.41 TCAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAA:1 + chr2L 23069852 3' + Stalker4 6869 1 71.29 GAGAATGCTTTAGTCGAGTTCCGACTATCAGATACCCTTCACTTCGCTAGTGGGAATGCAAACGGAATCACTAATACACCCAAAAATTGACTACAACATCC:1 + chr2R 18066973 3' - INE-1 573 1 67.33 CCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGTTTGAACGTGCGTTATTAAATTGCATTTTGCGAACCAAACGGCAAATGACACAGCAGAAGCAGCAT:1 - chr2R 8557480 3' + hobo 322 1 69.31 CCTATGCTCTCTCTCCTGTCCTTTTCAAGCTCACAGACACACACTTATGAGCATTAGACGAAAAAAAATAAAGCGCGCCCGGCAAAATGCAATGCAAAATG:1 + chr3L 17606977 3' - Rt1a 4945 1 76.24 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATG:1 - chr2R 14121072 3' - I-element 37 1 68.32 TCTAGAATTGGGGTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTTTGGCTTTTCTTCCACTCGCAATCGTGGCGGCAGTACAAACAATTCGGTGTGGTTC:1 + chr3L 3474516 3' - Idefix 148 2 61.39 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGTACATATGTATGTATACATATACGTATAAATTTATACATATGGAGTTGCAATTGTGAATTAAGTG:1 - chr2L 970226 3' + 297 6969 2 74.26 ACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCATTTGCATCCTCACTGCTACGACGCTTGCGATGACGCTCGTCCGGTTGACAAAGTACATTAGATGCTG:1 - chr2L 21225398 3' - I-element 476 1 70.00 GAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAATGACAGACCGCGATCTTGCTCTCCATCTCCGGACCGTCCACAGACTCATACCCCA:1 - chr2R 9750607 3' + Doc 325 1 68.32 CGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTTCGGATAATTGTCTCTTGATTTGGTCGTGGAGCTGAGCTGAGGTGAAAATAGTC:1 + chr3R 5039887 3' - Tirant 89 2 60.00 GGAAAACCTAAAACTCCTCCTGTACATTGGCCCCTTAAGCCAAGTCGGAAATCGTGGAATCGGTGGCTAATTGCTCAGCCATTGTCCAAACAATGACGCAG:1 - chrX 8614005 3' + G-element 3865 1 77.23 CCAACGTTGCATTTGAGCAATTTAAATAAACTGTTTAATGAGGTCGGTGAGTTTTTCTGGTATTATATTAAACACCATGGACAGAGGAACTTGCTGACGTA:1 + chr3R 10803683 3' + looper1 16 1 75.25 TTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCCAGATCCACTCGGTTATCGATCCAGATCAATAATATATATATTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCT:1 - chr4 836649 3' + hobo 2628 1 74.26 AACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGTGGCTAGCTCTAGAGTCTGATTGGTCCCATGCTGCCCGTGTTTACAATTAGTTCTTATTGC:1 + chr3R 18848492 3' + TAHRE 10368 1 71.43 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACTCATCACCTTATTTCATATCATTTAAAGTCACGCTGACTATAACGTTTACCATTGCAATGAGGCTTTTA:1 - chr3R 26404451 3' - 412 7 2 63.37 TGAGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCAGGGCGAATAAGAAGTGTACCGCGTTGAGGGGTTGCGAAAAGT:1 + chr3R 31632747 3' + invader1 3692 2 55.45 AAGATGTTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATATTTAATGTCTAATTAAATTGCA:1 + chr3L 9552178 3' + roo 9021 2 75.25 AAAAAGTGGCTGTATAGTGCCAAACCAATGGCCACCATACCGCTTGCTGTTGCTTTTCCACAATGGCATGCCAGAACGCTAGACGACAGCGACATTGTTTC:1 + chr2R 17348047 3' + 1360 3343 1 76.24 TAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTTGAAAAATGCCTTTATGCGTATGAGATTGAAGCATCACAAGGAGGAGCACCGGGAG:1 - chr2R 22060137 3' + R1A1-element 251 1 65.35 ACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCATTCGGGCTTTAAATTGGGGTCAGGGTTACGCGCTTGACTCTT:1 + chrX 10726613 3' + baggins 5314 1 58.42 TGAAGAGGCGGATGATTGCCCAGCAGTGACCTTTGGCGCAGTCAACGCTTTCTAAAGTGCGCGTCCAAGTTCACGGAGAACGGCGGAAAACAAGA:1 + chr2R 20274408 3' + Rt1c 5055 1 77.89 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAA:1 - chr2R 18372602 3' - jockey 4695 1 51.49 AGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGGAGGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAACTGAATGCCGGAAGCCAAATCACAATTGTT:1 - chrX 17215280 3' + invader1 104 2 68.32 CCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCCAGCGCTCAACTCATATGTCCAGCAGCAGATAAAGCTG:1 - chr2R 6207342 3' + F-element 4419 1 66.34 ATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCACAACACATCCCGGCATATTTACATTTTTTCGATCTCATCCTTGATGGCATTGACCACGAACATCCTGAG:1 + chrX 17999995 3' + HMS-Beagle 6594 1 70.30 TATGGATGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATAGACCATTTTTTTCGTCAGT:1 + chr2R 21092026 3' + 1731 4601 1 53.47 TTCTCTAAGGCCCTAGCAATCAAGTGAAGTCGTCGGCAGCGGCTTACAAGTTGCAGTCGCAGAATGGG:1 + chr3L 12449328 3' - HMS-Beagle 6946 4 57.35 GTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCTGGTATTAATTAAAAGCGACTTCATTCCGTCGCTCGACTATTCTGTGGTTTTTC:1 - chr3L 10470550 3' + R1A1-element 5218 1 67.33 AAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACTCACATTCAGCTAATTGTTACGACTTTTGTGTTTAACCATTTAAAATAAAATGCTGGGTAGAGTTGA:1 - chr3L 18390954 3' - 1360 3262 1 70.30 CCTTTGGCAGAATGTTTACACATGAACACGAATATATTCAACGGCGATTCGCAGTGTGTCCACCTTGGATAACTTCTTGCTGCTACCACGTCCACCATTGG:1 - chrX 410151 3' + roo 8653 1 70.30 TTACATACATATTTTCAACATTATGCATACAGATACAAGAGATATAGACGCAGCGCAAGTTTCTTTACCTATGTTGTTATGCCCCTTTTGGACTTCTAATT:1 + chrX 699504 3' - Dm88 4359 1 81.19 CCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTTCATCTGATGGAACTGAAAATCAACATGAGATATTTCTAA:1 + chr3R 22113508 3' + jockey 449 1 60.00 AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTCCTGTAAAAGACGGCGGGAAATTAGGGGAAAACGGTCGAG:1 - chrX 2854047 3' - rover 7026 2 62.38 AAAAAGGAAGTTATGCTGCCACACCCTGTAGAGAATATTTCTCTCAATAGGGTATGTGTAGTTGGAGTGCCTCTTGCCTGTACTTCAGAAAGACGGTCATA:1 + chr2R 5180696 3' - mariner2 7 1 71.29 TAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCATCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTTGGTCGCGGCTGACAAACGACGGCAGCGAC:1 - chr2R 6547048 3' - G5 4648 1 74.26 CACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACATTACACTGATAATATTTGCCACGCCCCCCCACATTTACGCCCTGCCGCAGCAC:1 - chr2L 16146603 3' + Tirant 29 2 55.45 CCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACTGTAAGGGAAGCACTACATCAATAATTAATGCAAATTAGCAACAATCACCGACACATGG:1 + chr2R 13912498 3' + Tirant 8135 2 63.37 TATTTTTAAAATATCCATTACATCTGTTATTAATTTTTTTATTTCGCTGCATTTGAAAAGCGTGCCTGATTAGGCGCTTCATTTGGTATTTTCGATAATAA:1 - chr2L 17856289 3' + Tc1 1498 1 60.40 TTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTCTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGGCATGTCTGTTCTGCTCAACTCCGATGTCTACTCCAGTCAGTACTCCA:1 - chrX 10378241 3' - invader1 375 2 72.28 AAATATATATAAAAATTTCATTCAGCATTCGATTGGTCGTCTTGCAGCAAACCCACTTCTCCGGCGGTAATTACAAAATTTTTAATTAAATGTTAAGCGTG:1 - chr2R 20501487 3' - copia 4657 1 54.46 TTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAATCACAAATCAACAAATGCAACAATGAGAAGCGACGTCGCGAGGCGGAGAATGGCTATATCGAGCAGCTGT:1 + chr2L 9235156 3' + Stalker2 96 2 71.29 TGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAACAGGGAGAGTAAACAAAAGGCGTCCAAGAAAAATGGCCCAAAAGAACAAGCAAGAGTACA:1 + chr2L 4238578 3' - Cr1a 248 1 71.29 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCTCGCCTGCGCCTGAGTCAGGACAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 10290188 3' - hobo 40 1 64.29 GAACGATTCCAACTGACTAATGAATAATTATATATTTTTCTGTAACATTTTACTTTTATATTTCTACGTTTTGCTCCAATTTTCCACAGGGCACTCGTTGT:1 - chr3R 23027105 3' + G5A 2816 1 69.31 AACGTTGAGATCTCGGGAACTAAATAAAAGATGCGAATCCAGAGCCAGAGGAGGAGACTTAGCAACTTTGCATTTGCTTAGCCACCGTTTACTTGCACATT:1 + chr3L 17122617 3' + INE-1 142 1 72.28 GTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTATTTCACTGTATTTGTATGTGTGTGTTCGTGTGGGAGAGTTATGACAGCAGGAG:1 - chr3L 9309960 3' + S-element 1497 1 56.38 GCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTTCTAATTTCTTACTGTGTATCTCCGCAGGTCCTTCAATAAAAAGGGCCTGCTCCGCGCTTAGCTCTTT:1 - chr2L 19233351 3' + gypsy2 6803 2 64.00 GACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCTTTAGTGGCGTCTCTTTCGCTTGGAATACGGCCGTCTTTGTCTGCATTAATGCATATGCATGAGACTTAAGCGACG:1 + chrX 15267807 3' - flea 120 1 80.20 GGACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCCCGATTACCACATTGAGTGGTTTAA:1 + chrX 353664 3' + R2-element 3347 1 75.25 ACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGCAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTAGTGGACAGGAGATGAATGCGCGCACACCTACCTGATTGTCACCT:1 - chr2R 6201009 3' + invader4 2659 1 57.43 TTAATATCTAATTTGCTAAATAATTGCTGTGCTTGTAATTTTTTTCATGTTTTATTTTTCGTTTCCCTATTTCTGCTCTTTGATTTAGTTAATGCATTAAG:1 + chr2R 3169912 3' - I-element 5233 1 68.32 ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGTGGGTGTGGGTGTGGGTGTGGAAACTTTGAACAACTTTGACCAAACACCCAGACACGCGCCAA:1 - chr2R 22786389 3' - jockey 4782 1 63.00 GTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAATTGTGGTATACGTAACGGATGAAAATAAAGAGCAGAAGGAAAAGATGGAGGCCACGCCG:1 + chrX 495063 3' + Cr1a 4429 1 80.20 TCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGATCAAGAACTATCTGAATGCGGATGTGGAGGTGCGCCGTGGCGATGTG:1 - chr2R 15859258 3' - Doc 405 1 60.71 GTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGGGGTGTGTGTAGTGTGTGTGGGCTACGTGCCCTGCGTTTTGAGCTGCACCTGGAGGCA:1 - chr3R 24770495 3' - copia 91 2 62.38 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTT:1 + chr3L 10035654 3' - jockey 4814 1 82.18 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGAACCTCGCGCTAGATGGTCAGTGTGCTGGTCATTTTCTAAGGGTGC:1 + chr2R 10568045 3' - F-element 4526 1 68.32 CGCAANATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTTTTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACAAGACAACTTCCCGTTTTTTTACGTTTACT:1 - chr2L 22216132 3' + diver2 314 2 91.09 GCGGTTTTATTTATAAACATAAAAATTGGTCCTTCGATGTTCCTCTCACCTAAAACTCGTTTCGATGGTTTAGCGGGCTTTGTATTTGATATATGGCCAGC:1 + chr3L 20699233 3' + 3S18 343 1 70.30 GTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAATGTTATATAGAAATACCCCAAAGGATCAAATATTAATTCAAAAATTAGAAACGTTTTCCCAGTGCTGA:1 + chr2L 21342773 3' + roo 64 2 75.25 ATTAAATTAAGCATAGTTTTAAGATAATAAAAGTGTTGAGTTGGATGTCGATGCAGTTGTGTGGACAAGCCGTTAGCGTTCCAGAAGGCTATGTGCAGGCC:1 + chr3L 23963003 3' + Transib5 435 1 42.57 CATACACTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGTAGTGTCCACGTTGCGTATGAGTAATGCGAGTTTATATCCCACTCTCCCATTGACAAAACTTTAGATGAACATT:1 - chrX 20882812 3' + blood 7174 2 72.28 TCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACAGCAGCCTGTTGTTAGCAGGCACCACGATTTCGACCTCCTTGATAGTAGC:1 - chr2R 24029954 3' - Ivk 5192 1 53.47 AATAAAAGGCGAAGCCCTCCCAGCAGCGATTTAGTTAGTGATCATTACATACACAAAACCAAACAACCATACCCACATTTTAGAGTAGAACTTGATCGCTA:1 + chr2R 4736324 3' + rooA 293 2 62.38 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCT:1 - chr3R 14832410 3' - blood 7052 2 63.37 CTCATTTTAAAAAAGGAAGTTTTCACGCTCTCAATTTTACGCAAGCGGAGAGAGAGAGAGAGCAATTTTTGCTCAGTGTGCAAATCATCGAATTTTATATA:1 - chrX 20480793 3' - mariner2 16 1 68.32 TCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTTTCGGAAAAGACTTCGATGGCATAGCTCGATAGTGCCATTTGGTTTGACAAATTACTTTTTTTTTGAGAGG:1 + chr3R 5496577 3' + diver2 201 2 64.36 AGCATATACCATGTGGCTGCATTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAATTTATGCAATTAATGTGGTTTTGTTAGAATTTGCACAGTGCTGCTGTATC:1 + chr3R 12797834 3' - hopper2 1431 2 60.40 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTT:1 - chr3L 22052745 3' + mdg1 7449 2 69.31 GCGGGAACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCACAACTAAACGCTCCAAGTAATAACTTTTCCTTTAAATCGTAGA:1 - chrX 16500791 3' + roo 8945 2 55.45 AATAAAAAAAAAACAAAAAAATAATACAACGACCGAAAACGTGCCGATAACACGGTGTCGCACACTCCCCTCACTCACACTCCCCATCAGAGAGAGAGAGA:1 + chr3R 16819481 3' - hopper 143 12 80.20 TTTAANAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGGTGTGAATGATACTTTAATTACACCAAACTGCGATA:1 + chrX 5023256 3' + HMS-Beagle 6596 1 63.37 CAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCAACAGGACTAAGAAGGACTCACATGAATACCGCGCCGCAGGTCAGTGCATCAAGGACGACAAGGTG:1 - chr3L 20058179 3' + flea 149 1 69.31 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCTCCATT:1 - chr2L 9823616 3' - hobo 16 1 65.35 AGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAAACAACACCAAACAGAACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACAGCAACTCAGTATAACGTCGCAG:1 - chr3R 19990239 3' - Cr1a 265 1 78.22 GCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTTCAAAGAACTTTAACCAAGTTTAGGAAAACGGTACTTGTA:1 + chrX 10996528 3' + Quasimodo 323 2 63.37 ATATTGTACATATCGTATATAGGATGTACTTATAAATACAATAGCTGCACTGGTTCTACCCACTGGAACGCATTCAATTGTAAATTTAGTACTCGGCGCTA:1 - chr2R 10686471 3' - Stalker2 266 2 91.09 CTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAACCAACGTAAACATGAAAATTGCCTGGGAAACCCGAACTCACAACTTTCAA:1 + chr2R 22779129 3' - F-element 99 1 53.47 TATTAATCATACCTTGACCTTTATGTTTCATTTTATTTTGACAGATTGTTGACAAATGTCACCGGGGTTCGTATTGTGGGGTGCCATGCTAATTACCTTTG:1 - chr3R 19819481 3' - transib3 280 1 75.25 AGAAGGCCGTAAGGGGAAATGGCCGGATTGGAGAATCACCCTGGCAACGCTACAAATGTTTGCTGTGTTCTGATCATCGATTTGGGTGTTTTGTGCTGGAA:1 - chr2R 22995755 3' + accord2 255 1 55.45 CGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGTGTTGGGTACTGAGTCTGCTCCAAGGGCTCTATACTACTTCGTCGTGTCATCGGGACCGCCGAGGATG:1 + chr2R 12370415 3' + R1A1-element 4938 1 75.25 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAAT:1 - chr2L 22719572 3' - 1360 18 1 60.40 CCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGAACCCAATCCAACAGACATTAACATCCGCAGCCGCATTCGCGCAACTTAAGTAGGTACTAAGTGCTGCATATATCA:1 + chr2R 12535608 3' + Quasimodo 265 2 66.34 ATCTANTAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCTACACCTTTGG:1 - chr2L 22319263 3' - Transpac 14 2 61.39 AAAAAAAAAAACATCAAAGTAAAATAGAAGTAAAATGCGGAGATCAGCATTGGTGTAGGGATCCAATGGTGGAATTCCA:1 - chr2L 13847051 3' + gypsy11 3933 1 54.43 TTTACAACTGGAATCCGTAGGGCCAAGGCGAACCAGTTATTGCTCGCAGGATTTTTGATTGTTGTATTATTTCACTGTTCCAGCTGTTTGTGTGCGTGCAT:1 - chr2L 3926668 3' - Doc4-element 2732 1 74.26 ACAGCCAATTGCACAAGATTGTGACACACACAGTGTGTATTATATGTGACTGCATGGCCGCTTTATTCATCTCTACAACCACATACAAAAAATAATCAGAT:1 + chr2L 20889485 3' + baggins 5162 1 61.39 AGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAGGAACAAGGAATGGGATCCAGAAAGAAATCATCATATTATGATGGTATATAGTAATTAACGATCTTTGATATGAAC:1 + chr3R 18394329 3' - diver2 159 2 64.36 AAAACGCCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGCCTGAAGAACCAAAGTTTTCTCCTTCATTATGATTAAATTGTGGCCCATTATTTCTAGCTCCTG:1 + chr3R 16977153 3' + baggins 5111 1 70.30 CCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCGAGAAATGTGGACCGAAGTAAATATCCCAGGACAA:1 + chr3L 25514053 3' - X-element 51 1 64.36 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAA:1 + chrX 3485685 3' + P-element 2834 1 24.75 TCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTCGCGGATGTTCGAGTTGTCCTTCAAGGGAAGAGTGCCTCCTGCTAGAATCGCTGATG:1 + chrX 2131643 3' - F-element 426 1 65.35 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGCACTCGTGTGTGAGTGTGAGTGGCAAGTTTTGGCTCAGGGCTGAAGTGCCACCCACTTTTCCACCACCCACTTTCACTACAA:1 + chr3R 28449120 3' - accord 7027 2 74.26 ACAAAAGGTCATAACTTTACACTTGGAGCCATTTAAGTCTAACACGTTATACTTTGATCCATCGATTGAGAAAGGCCCAGAGTATCGTATATAGACAAACA:1 + chr3R 29734259 3' - Q-element 673 2 79.21 TTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGCATCTTCGATTTTTATTCTTTTATTTGTGCCAAATTGACACCTTAATCACCGGGACACGATGAGCACAAAATGTCAGA:1 + chr2R 9950656 3' - Idefix 7254 2 80.20 AGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTATGATATAATCCATTATTATGAATTATTTGTTTACTGATCTTTGTTTAGCTTTGTTTT:1 - chr3L 12791537 3' + Tc1 1333 1 74.26 CGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTCCCCCTTGCACAAAGACACACACTAGCTCACAGCACACACACACT:1 + chr3L 17156818 3' + Doc 476 1 55.00 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGAC:1 - chr3L 776095 3' + 1360 3358 1 58.42 AGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGG:1 - chrX 21933835 3' + gypsy11 4363 2 59.72 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAATGCTTTACTAAAATCAGTGTAGATGACATCTGTTTGAAG:1 + chr3R 2745085 3' + 1360 3354 1 62.38 AAATAAAAAAAAAACAAGTGAAAAATTATGCAAGGCAAATATCTAGCTTACTTTACACTTTAGATTCACATGTCTAGGGATCTCAGTTTCGAATGAGGGGG:1 - chrX 2844146 3' + Porto1 168 1 72.28 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAACAGAAAGTATATCTTATACATATAAATGATGTAAAGAAAACAAAAGTTGCACTTAATTGGAGT:1 - chr3R 25876231 3' - flea 9 2 70.30 GCTATAATCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTTTATTTTTATTTAATTAGAGTTGGAAAATTGTAGATTGTACGGCAACTTAGCCTCATCACTGGAT:1 - chr3R 17630943 3' - INE-1 567 1 65.35 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAA:1 + chrX 3485692 3' + P-element 2841 1 31.68 AAAAAATAATAATAATAAGTACGATAACATTTGGGTGGAACTATTTTCATCTTAGTTATTGTGGCTTCTGCACAAAA:1 - chr2L 16762605 3' + invader6 4387 1 74.03 AAAGACACTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAACCCCCTGCCATCGGCGAAAATTAACTTATCAAACATACAT:1 - chrX 2757799 3' + Ivk 265 1 65.79 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACA:1 + chr3R 5208201 3' - hopper 44 1 73.27 ATTTAGTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATG:1 - chr3R 14913175 3' - blood 7067 2 76.24 GCTGAAAGTGGTCGAATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCACAATGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGGAAGTGAAAGACAAACAAGCCAAATCATCAGC:1 + chr3R 17985534 3' + Tc1 434 1 70.30 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATG:1 - chr3R 21799533 3' - jockey 4810 1 74.26 TATTTGAAAAGATTATTATATTATCCATAAAAGCATGGCATTTTTCGTCCATTGCCTCAAGGCAGATGTTGATTTGATAGCTGATACGCAAAAACATTGGA:1 + chr3R 27467665 3' - TLD2_LTR 52 1 66.34 AATATGGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAACTTGTGATTTCTTTGTCCCCTGCTAGATTGAGACCC:1 - chrX 19561786 3' - 412 3 2 78.22 TAGCCAAATCTAGGGGATGAGTCCTCCTTTTTTTTCTTTTGGACCACCCTCGGGGTCTGCGAGTCCTGACTTCCGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 19367199 3' - G7 1050 1 79.07 TGGCAATGTTAAATTGCTATACTACAAATCGCGCCACTGCTTCATGGCCGATTTGTATTTCTCGAACTCGTTGCACCCTGCCAACTCTTTTCGGCCGCTGC:1 + chr2R 16429259 3' + Doc3-element 122 1 44.55 GGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACAACGGTTTGTGCATAATTAATTTAATTGGCTTTGGTCAT:1 + chr3R 22676581 3' + 412 7166 2 62.38 GACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCATTACTGCCGCCACATCGCGCTCCATTCAATCCATAGAGA:1 + chr2L 16353494 3' + G2 2814 1 61.39 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGT:1 + chr3L 5691284 3' + P-element 2837 1 29.70 TGCTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGAACGAACTCAATTTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTGCATTACTTTTTAAAAATGAGTGCATATTTATTTAGTTCTA:1 + chr3L 11833752 3' + S-element 247 1 72.28 GTTTGGGTGAGTGGGCGCACAGGCAACGATCGGGGTATAAGCTAAACAACGAAACACACATAACGACATACAGACGGAGAACGCAATCGTTTGTATATTTC:1 - chr2R 23872367 3' - hobo 2761 1 75.25 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCTAAGAGTTCTTTCAACTTGGATTCTGCCATCTTCTTCTAGATTTTACACGTGGAAAAAAATATGAAAATATGAG:1 + chrX 9653377 3' - roo 8665 2 78.22 GAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCTCATGACGTATTCGCGTTGAGTATACGTCATG:1 - chr3R 22799531 3' + Doc3-element 425 1 68.32 TTTTTAAAGTCTTAAAAAAGTAAAGCAATGTTATAGAAAATGCAATTACCAAATACAAAATAATACACAATCAAAAATTTACCTACAGCTAACATTC:1 - chr2L 2481017 3' - looper1 245 1 53.61 TTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTCAATTATCAATTTTGTAAGCTTTTGCTTTTCGCGTAAAAAATGCACA:1 + chr2L 12107331 3' - F-element 136 1 54.46 GCGATGACTTGGTATCCAGCGATGAGACTATAGCTGATGGCGGACTCGATGATCCTGGACAGGCATAATGGAGGAGGAGGAGGAGAAGGAGCAGGAGGAGC:1 - chr2L 10791676 3' - TART-A 13036 1 63.37 ACTAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTA:1 - chr3R 19718713 3' + INE-1 542 1 80.00 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTGTTTCTTTTTTCTCCATTTTAACTTTTGTTG:1 - chr4 1219181 3' + 1360 3348 1 70.30 ACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCGAGCGAGCGCCACGTTCTTGCCTTCCCTTCTGAAGGACTTTCTGCCGGCCGGAACGGGTTTGGGATGTTATGG:1 - chr2L 22407083 3' - Rt1a 4655 1 65.35 CCTATATTCAACACAAATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACATATAATCCCACAAAATCACCA:1 + chr3R 26654015 3' - 1731 4332 2 77.23 AACTAATATGGCTTTTATTAAAAGAGCCTTAGTTGCCATATGGAGTTTGATTGAGTGGAATATCCAATCCAGCTTTTTCAGTCGAGTTGGGTTGCTCCTGG:1 + chr2L 9269701 3' - G5A 2400 1 79.21 TTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTCCCGATGCCGGAATGCAGACGGATTTCGAGAGATTTATAGAGACAACGCACGTCATAAATTTATGGCT:1 + chr2L 7483814 3' + diver2 4693 2 71.29 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTATGGTGCCTTTAATTATTTATCACAATGACTGATCTCCACCGAATATGGCCCATTAG:1 + chr2R 23019972 3' + P-element 2789 1 64.36 ATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAATGACGGAGACCCGCGATGATGTTCCTGCTGCGGA:1 - chr3L 6239549 3' - INE-1 176 1 66.34 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGATATGTATCTGCGCTCGGTAGCAGCCACATGCCACGCCCCCTGGGCGACATGCCGCTTTACAATGACAT:1 + chr2R 21937571 3' - 412 7 2 72.28 TCGATGGCATCTGTTTTCAGCAGTTGCCGCCACAACACCCTGGAACAATAACAAAAGCAGTAACAACCGCAAAAGTCGCCAACATAACACATAAAATTTTC:1 - chr3R 27567810 3' - G2 334 1 68.32 CTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATCTTAGCATTTAGTTGTTCGT:1 + chrX 2917271 3' + Tirant 196 2 78.22 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATACATATATACAAGTGGGTGTGCTTACAATGCCACG:1 - chr2L 9856238 3' + HMS-Beagle 7002 2 67.33 GGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTATTCATTACCTGACTGGGCCGTCGGAGATT:1 - chr4 70547 3' - Doc 4547 1 70.30 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGACGAAAATTGTCTGCAGTCTGCCGCATTTTCCCAAAATTCCGCACCTTAGGTTTCGG:1 + chr2L 2689881 3' + roo 389 2 57.43 TTTCTATCGATTTACCAAAAAACTTTGTGCCACCGACAGGTCACACCACCGAAATAACCCAATGAATTTGAGTAGATTCCGTGCTCTAAGAGAGAAAATGA:1 + chr2R 19667459 3' + INE-1 311 1 64.36 AATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCTTGTGTTAGTGTGTGTGTGTGCATGAAGGTCCTGTGTGCTGAATGTTTTGAATACAATGCGTATAAGTATAAT:1 - chr2L 5997598 3' + Stalker4 7231 4 80.20 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGG:1 + chr2R 5322053 3' + 1360 3338 1 78.22 GGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGTTTATGTAATTCCTTTGGCAGTTTTGTTGGCTAAACT:1 + chr2R 14693205 3' + I-element 340 1 63.37 TCTCGCGGAGCACAAGCATAGGCAGGTACTCCATGACCCACCTCCACCAGAAACGGTCAACCATTTTCTTACGTTTGCTTCATGACGCGCTTGAACAGAAC:1 - chr2R 19641361 3' - aurora-element 3783 1 55.45 CCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTGCAGAGGTGCGGTCGATCATTTTGGTGGGCCAGCATATGGTTATTCAA:1 + chr3R 14574325 3' + Quasimodo 315 2 56.44 GAATAACGGTGCCTGCGCTGTTGCCACGTTGAATTTCACCAGAGTCAGGCGAAGTGGGCGGTGGAAGAGCAAGAGGAGACCGGATGTTTATGGACCGCCAT:1 - chr2L 13320371 3' - Chimpo 300 1 60.40 CCTCAGCGTCCCCGGCTCGTCGTAAAAGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGAGGAGAAGACACTGGAGACGTCAAG:1 - chr3R 1941275 3' + Rt1b 4869 1 77.23 GAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGCGACTGAGGGATGCAGTGTATCAGACGGAGGAGAACCTAAAAAA:1 + chr3R 25271466 3' - 1360 85 1 56.44 ATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTCAATTAAAATTGCGACGAAAGCCTTTTAAAAA:1 - chr3R 25044411 3' - F-element 308 1 72.28 CAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGGCCATCGTGGTAGGGCGTTACAACGAACGAGGGGTACGAGCGGAACTGGTGGTAGTCACTG:1 + chr3R 7308223 3' - micropia 17 2 66.34 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCCCCTATAATTTAAGCAGCAACAGCTTAAAATTAGAACAACG:1 + chr2R 22740101 3' + Transpac 278 2 63.37 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGGAATTGAAGCTCATTAAGTAAGCCCTTTAAT:1 - chr3L 2182678 3' + blood 7344 2 71.29 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCTA:1 - chrX 1399838 3' - P-element 9 2 70.30 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTTCCTTCAGCCATCTAT:1 + chr3L 13888699 3' - copia 4893 2 53.47 CAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGGGACCTGTCGCATTTTGTTGACAACTACATTGCAAATACGGCAAAG:1 - chr3R 12166622 3' + Bica 4 1 54.46 AAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGCACACTCACTCAATGGCGGCGACTATCACCCTGCATGTGACTAGACAGCCACCTGA:1 - chrX 149392 3' + McClintock 457 2 59.41 ATGGATCACAATCACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCAT:1 - chr2L 796783 3' - jockey 65 1 81.19 TGTGANCACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAA:1 - chr2L 5932096 3' - jockey 26 1 57.43 TGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGGGAGTGGGAGTGAGTGTGCACCTTTTGCATCCCATGACGCAACCACATGGCTAACAACAAAATTCTTATCCAATTTC:1 - chrX 15084285 3' - gypsy3 419 1 67.33 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCTCTTTTAGATCAATATTTTACTAATCTTTTAGACATAATACGATCAAACTGGTCTCGCCCC:1 + chrX 13854518 3' - pogo 13 1 66.34 AAAATATGCCCTTCACCTAAGAAGTTCTTAGCACACATCTCTGTCCATCTCGCTCTGGCTTAAATTCCGGTTCCCTCGCATTTTTTTCTGGGCATGTGGCT:1 + chr3R 7482022 3' + 1360 216 1 72.28 TATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATTCGTATATGTATGTAGTTTGAGGCATTTTCAAAGCTTGTTCCTGTTCCCAAAGACGTTTGGACATTTTGCAA:1 - chr3L 1626236 3' - I-element 5161 1 73.27 TGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCCAAAGAGAATATCAAACAAAATGCATTTTAGTCGTGCGC:1 - chr3L 979677 3' - R1A1-element 5079 1 61.39 CACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGGTAGACAAGTTTATTATACATATGATTAC:1 + chr2L 8253631 3' + HMS-Beagle 6642 1 71.29 GTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTGGGGCGGGATTCGCTTTCCTTTTCTGACATCCAAGGCCACTGGAGCAGCGAACATATA:1 + chr3R 12059599 3' - accord 207 2 73.27 TTTAAGAGCGACAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGAATAAAATTAAATATCACTGTTATGTTATAATACTGAAAAACTTGAACTTGAAATGAA:1 - chr4 867488 3' - Cr1a 4239 1 49.47 TCACCCATACCATGAAAACTCCGTTATCCACAAGGAGCTTGGAATGCCATGTCATGGCTAAAGCTTTAAAGCCATGTGTGTGCGGCTGAGTTTGGTGTTAA:1 - chr3R 23699352 3' + G-element 4008 1 57.43 AGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTAAGTACGCTGAAACGGTGTAAAATTATTATTTGGGTTGAATGTACTATGGCACACAAACATTC:1 + chr2R 4853938 3' + Quasimodo 432 2 57.43 ATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGTCTTCTCCTCGCCGATCCTCCTACTCCGTGGACTGTCGTGTTGTTGTTTTATACAGCTTTACG:1 + chr3L 16120142 3' - R1A1-element 4954 1 66.34 ACTAAAGAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAGGTAATTGATTTCGTATCGCAGCATAATATCGGAATATTTTGACTCCTTAATTAAGGTGCCCAATTTGTATAA:1 - chr3R 13481621 3' + 1360 3339 1 74.26 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTCTTAGATTTGGGTCCGCACCGCTGTTTTC:1 - chr2L 15407321 3' + roo 359 2 73.27 TTCAACGTAACAACGCGTACTTTTCTTATGTCTTCGCGACACTTGCAAGCTGCAGGCCAACGATGTAGGCGATTATTTCTGTCATGCGGATAATCCCTTCG:1 + chr3L 14879131 3' + Doc2-element 343 2 56.44 ATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCTTCGCAGGACCACGGAATTGCAGGACTCCAGCACTGTAGGACACCAGGACCAATGGCGTGGGGG:1 - chrX 19042781 3' - Rt1a 4664 1 67.33 GGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGCCCCACCCAACTGGAGTACACCACAAAATTCACGTCTCAGCCTCCCGCTATCCGACATCCAATCCAATGAG:1 + chr3R 24657687 3' + accord 223 2 74.26 ACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTCTCCTTTGCTTTCATGTCTTACCTTTTTTTATATTTTC:1 + chrX 17773596 3' - hobo 2913 1 62.38 TTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATTGCGTTGAGATAAATGCATCATTTTGAATTC:1 - chr3R 9833011 3' - Tabor 1 2 76.24 ATTCTTATCTGGTATATGTTGGGTACATCGCTAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTAATGGATGCTGTGATGCCTGGAGTATAGCTTGATGAGTCAACAA:1 - chr3L 21264680 3' - Idefix 6917 2 60.40 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATGCGAGAGAGTGTGTGGGTGCGTGAATGTGTGTGTGTGCG:1 - chrX 4789549 3' + P-element 2873 1 63.37 CGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGCGGGGGAGTTGCTTGTAGGTCTGGGCCTGAGTGTGTTTGCTCTG:1 - chr2L 14893414 3' + Bica 4914 1 67.37 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTAAACACCGTCAATATAAAACTTGTATTGTTTTTATGACTTCTTTAT:1 + chr3R 8185256 3' - Doc 39 1 52.53 TATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCGCCGGGACTGCCAGTCATTCAATCAACTTCAGAGGCCGATGCCCAG:1 + chr2R 20159039 3' - Rt1a 4968 1 71.29 GAAATGCGGCGCAAACCCCAGTGTGGATTTGCAGGTTTTTGTAGCAGTTTACGACTGACCGGACTCGTATATGTTGAAATCGCCATTTAGGTGCAGCCTTT:1 - chr3R 26295029 3' - Rt1a 107 1 69.31 AGAGAATGCTATAGTCTAGTTTCCCGACTAATTTATACTTTATACATACGAACTAAAATGTTTATGGCGTTTCATATATACACACACTTGTAAATACAAAG:1 + chr3R 24063500 3' - INE-1 574 1 73.27 TGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGCAGGACTCGTGTTTTTTCTCAGCTTGTCCGCCACAGCGAATACTTAATATATGACCAATGCATT:1 - chr2L 5699705 3' - roo 147 2 72.28 TGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTAAAACGTATTCAAAATGCAACTTTAAAGACGCCCCAAAGTATGCAAAGCACTGGTAAATAACATAAAATACGAAA:1 + chrX 9525020 3' - BS 4706 1 80.61 AAATCCAGCCACTAAGCAGGCACATAGCCACGTAGTACATAAGAATTCTTTTTCCATATTTCCATAAACAACCCAATAACCCAGAACTGATATTTTCCCTT:1 - chr3R 30133460 3' + Tom1 129 1 50.50 CCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACGATTTTGTTCGTACCGTTCGCTTTTTAGCGGTT:1 - chr3R 14913122 3' - blood 7014 2 73.27 AGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCCTATCCGTTCGCCTGCTGAAGCAACTGCGTCTGTTTTCCAGTCCTTGGCCCGGAAAGATCGACGAGATTCC:1 - chr2L 18672776 3' - G6 1660 1 74.26 CGTTAGGTCCTGTTCATAGTTTAATGAAAATAAGAGCTTAACCGAGAGGTTTGCCGGGCTCTAATTTGACGGAATCGTTAGTTGACCAGTGACGTTCCACC:1 + chr2R 20699030 3' + P-element 495 1 66.34 CGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGAGCCTGCAATTTGTGCAAACAGAGTCTCGTATCATCATTATACGCAGCGTCATGATCTGCGTTTC:1 - chr3L 18852243 3' - 1360 3222 1 85.15 TTCACGACTATCAGATACCCGTTAGTTCAGCTAGTTCAGGTGGGACAGATCGATGGAGTGCACCGGCACCGTTGACTGGAAGGTCTTCTCGGTCAGCCTCA:1 + chr2R 22300746 3' - INE-1 554 1 67.33 ACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGGTTCTTCGTCTGTGTCAGTTCGTAGTT:1 - chr3L 26386251 3' - accord 7233 2 73.27 CATATCACTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATTGGAGGAAATATATAAACTAGAAGGTTGATATGTTTGCGAACGGGTGACTTCCTCCTTCACACACTTTGT:1 + chr2R 4726717 3' + INE-1 122 1 60.40 ATTCTTGATGAGAATCAATAGCAGAGTCGATCTAGCCTTGCCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGCACAGTTTGAGGTTAGGTTTAATTTCTGAATATAAGCG:1 - chr3L 5157959 3' + INE-1 86 1 61.39 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATA:1 + chr3R 19449364 3' - roo 41 2 61.39 GTAGCNCCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTC:1 + chr3R 19535741 3' - hobo 49 1 71.29 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAACGTGTCAAAATGTGGCAATATTTTCTATTTG:1 - chr3R 12578141 3' + jockey 4954 1 64.36 AAATANATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTATATCCCCCACTACGG:1 + chr2L 12843425 3' - roo 6 2 69.31 TCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAGCGAAAGTTCAGCAAAGCCAGCGGGAATGATAAGGG:1 + chr2L 15620785 3' + Dm88 400 1 62.50 CACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCTAAACCAATGAATGGCATTACGAATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTTAACCCAACCATGCTTTGTCTTACTGGA:1 + chr3L 23317390 3' + 1360 3338 1 69.31 GTTGGNGTGGCCGCTATGAGTTTTATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATGCTATTGTTCTCAATAAAATATGAAAAATATTTCTG:1 - chr2L 18948579 3' + gypsy6 7535 2 63.37 ACATAGGTTCTTAAATGTAAACATAAACATAATTTTCGTTGGGACACCTGAGAACTGGTCTTCATTAGCTATTCGACATTCTAAGCTGAATTAAGCACACC:1 + chr3L 6846558 3' - Tirant 195 2 66.34 TTTCAAATTCAAATTCAAATTTCTTAGACAACAATTTTTATTATGTGAACAAATGGCACACTTGTATTATTCAAATTTACTGTAATTCATATATTTTGTTC:2 + chr3L 14920470 3' + Rt1a 311 1 79.21 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATATATAATAATATTATTGTGTTGTAAAATATTTAATCTTTATGTCATCGCCTAAAATTATGCCAAGAATTTT:1 + chr3L 12893265 3' - Juan 4031 1 72.28 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATCAGAAATCCATACAGGCGCGCATTTTAAAGCGCCTTAA:1 + chr3R 27796445 3' - jockey 4798 1 62.00 ACGTACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTCGGTGGCCGCCCGGCTATTGGAGCTGGCCTGGTGTCCCACGTCTCGCAGTCGCAGGGCAACACTAAGGTCCAC:1 - chrX 17230745 3' - I-element 4995 1 77.23 CATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTCTTCTACTCTTAGAGTAAGTAATTATCTACATGTTAGTTAGTTAGTTAAGCGCTAGTTAAA:1 - chr3R 4962482 3' + Stalker4 6925 2 66.34 CTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGTCTAAGCCACTTTTCCGAGTTGCACAGACAACGGCCAAATGC:1 - chr3R 7776998 3' + X-element 4368 1 58.42 GAGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGCGGGTGAGCGTAACTTGAACAGTTCTTTTATTTCATAATATGTTATGCGAGCGGGAAAATCGT:1 + chr3L 7056051 3' - GATE 8283 2 82.18 GGCAAGAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGCAGATGTTACATGGGGAATTACAAAAATAAACAAATGCATATTACTTTGATCAATAGGTTATTAAATCTGT:1 + chr3R 26061719 3' - Doc 340 1 72.28 TAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAAAATGCATTGAAATTCAACCAATGGCC:1 + chr3R 20495809 3' - Juan 4096 1 53.47 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCA:1 - chr2R 14121092 3' - I-element 27 1 83.10 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAGGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAG:1 + chrX 6106828 3' - opus 7040 4 83.17 GCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATTTAGATTCTAGAGACAATGACTCAGCTACAAGCCAGCAAACTAGCCCGGCAACTAACAACGGCAACAACAAATCGAAA:1 + chr2R 8317241 3' + INE-1 169 1 55.45 GAAAANTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACAACTAATACACTCAGACGATGTACCCAAAAGTTTGGTTGCGTCGCACAAAGAGCATAATTACC:1 + chr2R 19954802 3' - R1A1-element 92 1 67.33 AACTAGCAAACATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCACCGATCTCCCTACCGGAACAGACGACCAGCCACCTCCGAGC:1 - chr3L 25783576 3' + G5 4598 1 75.25 TGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCGTCGGTCGTATTGTTGTTGTGTTGATGAGATTGATTACGATTGCGGGTCGCCAAAGAACAACGGAGCCGG:1 + chr2L 14912438 3' - 1360 3348 1 75.25 AGCTGATTTCATTGCTGTGGCGCCATTTTTATTTATTTTGAAGAGAAAAAACGTGCGACTCGTTTAATTGAAAGGCTTTTGGGCATGCGACAAAACACGAA:1 + chr2L 1916880 3' + Transib-N1_DM 359 1 75.25 ATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTTAAATTGTTAATAGATATAGAGAAACTAACAACATCTGCGAAACGCTATTAACTATTCATAATTTATTGCACA:1 - chr2R 10216735 3' + I-element 452 1 73.27 ACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATAAATCAAAAAGTAATAAACATTTAGGTGTCAACAGGAAGGAATTCATTACGCTGCCAAGCTGCC:1 - chrX 16646877 3' - X-element 25 1 36.63 ACCCANATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCCGTATCCTTTGCATCCTTCGATTCCCTGCCATCCTTG:1 + chr3R 12552809 3' + Quasimodo 136 2 62.38 TCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCGTACAGGGCAGACGGACAGATGGACATGACTTTCGACCGGACTATCTAAAGCTGGGGGAGCTGCGTTCCAAATATTC:1 - chr3L 14631395 3' - INE-1 160 1 55.45 TTTCCTAAGTTTGGACCTTTTCCCGATGATCCAGTGTGAGTCGTTTTGTTCGTTGTGTAATATACATGGCTATACATAGATAATGCTAATTGCTGAACAGT:1 + chr2R 11642397 3' - G-element 3847 1 76.24 GCACAACACGCACAAATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACTCCGGCTAATTTATGGGTTTCTTGCACTCTTCGCAATGGTCGGGAAAGGCA:1 + chr3R 30302084 3' + 1360 3214 1 53.47 AGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAGAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTAT:1 - chr2R 4830334 3' - 1360 51 1 92.08 TCTTAGAAGTTCTTAGACTTTACTTTAATTCTATATTATTTTTGATCAATTGGCAACAACAGTTTACTTTGCTAAATTATTTGCTTAACACGAAATAAAAT:1 - chr3R 19066525 3' + 1360 231 1 54.46 ATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGAATGGCAAACAAGCGGCAAAGCGAACGGCAACTGCGACTGCAACTGCAGCAGCGGCAGCGGCAG:1 - chr3L 17225997 3' + micropia 5149 2 78.72 ACCAACATCCAAAAAGAAATTGCCAACATAACACCTGATTTCATTGAGCACTGAGAAAATTTATGTATTTCTTAATTTCTCTACGTTTTATGTATTGCCTA:1 + chr2R 13812704 3' + mariner2 665 1 69.31 GCGTATCCGGCAGCGCAGCTACGCAGCTTAGCCTAAGACGAAAGATATTTTAACACACACAGTAACAAACACGCACATGCACATTATATTTGCTTAGGATT:1 + chrX 3528035 3' + 412 7359 2 66.34 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTATTATTACCCTTAGCTTAAATAATATTTATTGGTT:2 - chr2R 5095369 3' - roo 8704 2 66.34 AGTTCAAAATCAGTCTGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTCATTTATACACTAATCACTTTCAGGAA:1 - chr2R 19977825 3' - Tirant 269 2 69.31 CGCTAAAAGACTGGACAACCACCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCCTGGATAACAGTGAAACCAAGAAACCGAGAAACCCATGTCCATGGGGGGCCATAT:1 - chr3L 15187605 3' + G-element 4095 1 64.36 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCATTAATTCCGTCTGCCACTTGACTGGTTATAAATCG:1 + chrX 2253895 3' + Tirant 8476 2 63.83 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCC:1 - chrX 1399883 3' + P-element 2833 1 25.74 CCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTAGTTCTAATTACATATTAAA:1 - chr2L 22315550 3' - frogger 2284 2 58.42 GCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACGCTAAGGGGAGAGTGACCAATATTTTTTATCTAATTTCGG:1 - chrX 22689325 3' - HMS-Beagle 34 2 60.00 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATAT:1 + chr3L 22052855 3' - mdg1 7051 2 66.34 TGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTG:1 + chrX 21667926 3' - gypsy2 6523 2 56.44 TTGTGGGTTATAGGTGGTGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCTTCTGTATTTGAATTCACTGCCTCTTCATTCGAAGTTTCTTGGGTGTTATTGT:1 + chr2R 16185297 3' - G-element 4192 1 59.41 AAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTATGCATTGCTTTGTATCACTCATGCGTAATGCATAGATAAACAATGGACCAGC:1 - chr3R 31441376 3' + Transpac 362 1 62.38 TGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGGGTTGTCAACGCGGCCGATGGCGATGTTATTGCTATTGTTGGTGTTTTT:1 - chr3L 457418 3' + accord 7014 2 54.00 TAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGGACAGACGTGTTATCAGCTGCATGCTGTACACGCTGAAATTGACTAACTTTTTGATCCGCAC:1 - chr3R 6143780 3' - rover 6956 2 73.27 CTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGAGGCTAATCGCTGACGCTTTTTATGTGGTTTTATCTTGGCATTTTCTGCACTTCATAT:1 + chr2L 3841739 3' + G-element 3949 1 60.40 TATTCGGGGAACTCGACTATAGTATTCTCTCTTGTTTATATTTAAATTTTGATGGCATTGTGAACACCAACAACGATCGGTCTTCAAAGCGGTGCCGAATG:1 - chr2L 12636700 3' + INE-1 566 1 64.36 GGCAACCAGTTTCGCCTGCGTTACCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTGCCTCGTCTTTCCTTTTGTTGGCCACCTGCCAAATCCGC:1 + chrX 4236241 3' - R1A1-element 489 1 62.64 AAATTTGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGGCTGGTCATCTGGTGGATCAGGAGGGGGCTG:1 - chrX 17223515 3' - G-element 4213 1 63.37 TATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAAATTAAAAAAAAAAATTGTAATTATAGGCAATTTCTAAAGAGCTAGAAGTAAGT:1 - chr3R 13236211 3' + Doc 4654 1 66.34 AGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCGAGAAATGTGGACCGAAGTAAATATCCCAGGACAACGGTATAAGCTCCTCGGGACCAGTCCAGCAGAAT:1 + chr3L 25514087 3' - X-element 17 1 61.39 TTTGCCTTTGATTACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGCGTTACACGCCATGGGGCAACTAGTTCAAATAAGCGAAAAGCGAA:1 + chr3R 29525151 3' - HeT-A 5998 1 64.36 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATACCTTTTATGGTAGCTAAACGGTGTGT:1 - chr2L 20465606 3' + blood 7341 2 78.22 CGTCACGCTTCAACCCATACAAATTTAATGCGTACAAAAAATAACCTGCGAGTATTTGTCCCTACTTTATTTTTCCACCATCAAGGTTGGAAGCATAGTTT:1 + chr3L 24762810 3' + hobo 2667 1 60.40 CGTCTCATTGACGGGGAGCGGCAACACCAAAAATGCTCTTAATCGGAATGTGAGCAGACCAAGGCGCCAGAACACCAAAGTATCCAGAG:1 - chr2L 11585739 3' + baggins 473 1 53.93 TACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTACTTACACTTTCAGCACACGCTTCAGATTGCAGTAATTTCTCTTTATTTTC:1 - chr2L 18892593 3' + rover 7001 2 56.44 ATATGGTTTTCGGAGTGTTTTTTGATAAGGAGAGAAGGGAACTGTAAGTTATAATGAAAGTGCAGCAGCTTCGAGAATTTGAACTGTTCTAAGTAAGAGG:1 + chr2L 5391419 3' - Ivk 351 1 68.00 CCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACCCACCCACTCGTCCTTTTTCCTTGCTCCTGTTGTTTGCCATTTTCATTTGCT:1 - chr3R 8426165 3' + F-element 4419 1 52.48 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAACCACTAAATTACACTTGTCCCCA:1 - chr3R 14468382 3' + blood 167 4 93.48 GATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAACAAAAGCCGAAAAGGCTAAAAACAAAAAAAATTTAAGGCAAGAACCGTGAAAATC:1 - chr2R 16712753 3' + F-element 4628 1 63.37 AAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCATAAAAGCTTACATTATTGATATCGTAGAGCTGTTTCAGATACTTAAGAAC:1 - chr3R 21915367 3' - baggins 5139 1 74.36 AATTCCACGGGCAACCGTGTATTACCAAATCAATAAATATAAAAAAACACACAACCAAAAACGTTGCGCGGCGAAGCCGACTGGATGCTGCCCGCGGTGGC:1 - chrX 15574326 3' + Tc1-2 454 1 65.35 CCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGGACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACCATATGATAGCTGTAAGAGATTTGA:1 - chrX 20385045 3' - Bari1 58 1 75.25 ATTCATGGAGCAAAATTCCTCAAAAACGGTGCGAGGGCTTGGTGGAGCCCGATGTTACCGATGAGGTGCCCAAGTGGGTGAAGAGTCTTGGATTCCCTTGA:1 - chr2R 9824961 3' + Tc1 1248 1 57.43 ATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTACTAAAAAGTTAAAATTAACTGCCAGATCGTTTAAGAGCCATAAAATATGCAAAAGGGAACTCGAAA:1 - chr3R 30773493 3' - Cr1a 4297 1 57.43 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAAT:1 + chr2R 18865904 3' + roo 9035 1 62.38 GAGTTNCAGAGAAATAAACGGTCCATCCTGGCAGAGATCCGCAGTAGATGCACTTGGTCATGTCGATATCGTAGCGTGTGGTACGTCTGCTGCCATCCGCG:1 + chr3R 15836406 3' - baggins 367 1 70.30 TCTATAATCATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTTTAGTGAATCTACTTGGAAGCGACTTGCAACGCATCCAAATCAATTGTCCAAATCACTTACAGAAGT:1 - chr2R 5284642 3' - Cr1a 4141 1 56.44 TGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGCTTTTAAAAATAGATCTGTCTTTCCTTCCTATTTCTATTCCCTCGTAGA:1 - chr4 818040 3' - mdg1 394 2 54.46 ATCCAGCCTGCCCTAATGTAACCATTAACATCTGCTGCCGAATCCGTTATCCAGGTAGCCCAGCACCCTCCTGTTGGTCGTGCCCGCCGGCGTTGTGTACT:1 + chr3L 7359188 3' + Quasimodo 6889 2 56.44 TTTTTTGGCCAAAACTTATTTTATGAAAGTCGATCGATGAGGAAGATAATATTAAATGCGAGTGAGTATTCAACACATGTTATTAATCAAATCAAATATAT:1 + chrX 3290310 3' - Transib-N1_DM 471 1 54.46 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTCAACTGCAAAGACTAAATTTAGAAGCACTGTGGATTCCAGAAAAAATATA:1 - chrX 21657153 3' + 412 467 2 52.48 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTGCCACATGGTAAAGTCAACCGGCACCAATA:1 + chr3L 13326737 3' + transib2 2780 1 73.27 ATGTCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' + Cr1a 4367 1 73.27 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCT:1 - 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chr2L 21750457 3' + Stalker4 6876 2 66.34 GTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGGGTGTGTGTGTGTTTGGGCCAACTGGGAGTTGCCATGGCAAATCCCTCGAATTCTGTGT:1 + chr2L 4352120 3' - accord 7053 2 64.44 TTTCCNGAGATTGGACTTAGCTAAAACGTTTCGTTCAAAAAATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAAGCGGGCAAATATGTTTCGCAAAGAGTTTAAT:1 + chr2R 13627714 3' + R2-element 3335 1 66.34 CAGCAGAAGCGACAGAGTTCATTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGATGTGAAGCTCTTAAACCTTAAACCTCTTAAAGAAGAA:1 + chr3L 25352078 3' - baggins 5195 1 60.40 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTATATCC:1 + chr2L 12843415 3' - roo 8680 2 61.39 CGGACGCGGCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAAAACTACACTTTTCTCACCATTCC:1 - chrX 7525235 3' + gypsy4 6615 2 77.23 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCTTTTCGGACCAAAACTAAACCCAAAAGAGACGCTGAAGAAG:1 + chr3L 63050 3' - roo 8670 2 73.27 TCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAAATTAAATTTAGCCGCCGGGCTTCGAATTCCTGTCCGCCCTAAATTTCCTCACCAATACCAATACCAATCA:1 - 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invader2 249 1 55.29 TGGCTNCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGGCAGCTTGTCAATTTTGCACAAATAGTTCACTGATTTATTGTTCGCTTTTTGTTGAGTTTTTTCGTCGATTTT:1 + chr3L 7527281 3' - TAHRE 278 1 68.00 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCCCATTGCCCGAAAATATCCTGTTGCCGCAGACACTCAGTTTCCGATTGGGAACTCCGTTTTTGCGGTGGCAT:1 - chr2L 10080921 3' - mdg1 6 2 69.31 CAAATAAAGACTGTTCCAAACATCGTTCTACTGTTAGCCAGGAACAATATCAAGCCCATCGGGTCAACTTCTGCAATCGCACAAGCTGCACATGCAACTGC:1 - chr3L 13777948 3' - Cr1a 4029 1 63.37 AGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGGTGCGGATTGCTGTTGCCTTTCACTTTCACTCACCGCAATCCGCACCACACACAGATACGA:1 + chr3L 21321630 3' - accord 210 2 53.47 TTATGCCAAAAAAAAGGAGTTCCGGGTGGCGAGCTGGAGA:1 + chr3R 16816259 3' - transib2 13 1 62.50 TTTAGCTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTCGTTTTCCGGGGAGGGGGTTGAGCTTTGGCCATGGCC:1 - chr2R 11542480 3' - Transib5 24 1 77.14 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAGAAATATTGAGAAATATGAAACAAAACATGTAACGGAAATGAGAAATGCAT:1 + chr3L 14005640 3' - F-element 33 1 46.53 AAAGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGATATTATTGTTGCGCAAACACAGACTAACTGACTGAAATGCGGAGAA:1 + chr3R 9602411 3' + Tc1 1590 1 67.33 TTGCTATCAGCTCATGGAATGGGGTACAATTAACCGCTTGCAGCCTGTTAGTCGGCGCTACTCGATTTGATTATTTTTAAATATTTTTTGCTAGTTACGCA:1 + chr2L 23013451 3' + Chouto 5978 1 55.45 GAACTCTCCAGATATCATAAATTCCAGGACGGAATATGAAATACCTAACTGAAACTAAGAGTGGATGGATTGTTTCTCCACACCGCGAACCTTTCGAGAGG:1 - chr2L 7061507 3' - Circe 375 1 74.26 TCCAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATTGCCAGCAACATCAACAGCTACAGGCAGCCTAAACTTAATTTCTTGAGTTTTTCCACTTGAAAA:1 + chr2L 8882017 3' + Ivk 157 1 58.42 GATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGGCGGTATGGAGAAAACGATGTCTCATTGAGATGTCAATTGCATTCTACAATGGCCTCCTTTTCGAGA:1 - chrX 3560844 3' - Ivk 5057 1 68.37 TTTCACAGTGTGTATGTGTGTGTAAGTGCTGCTTGAAAGTTCATGCACCATGTGCCCGTGTCTGTGTGAGCCATTTGAATTCCCATCCGCACTGGTGTTGG:1 + chr3R 28152752 3' - accord 7107 2 56.44 ATTTTTACATAGGTTCTTATCTTAGCGCAGGAATATCATTGTTATCTATGCAAATCGGCTGCGCGAGCATCTGCATATAAATTCCTCTCATTTTTGTTCGC:1 + chr3R 13513137 3' - rooA 270 2 72.28 GCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATTGACATTAGAATTTGCACAAACTTTGGTAAGGTATGTTAAGCAAACACTTGGGATAAATTAATTGCA:1 - chr3L 18522858 3' + Bari1 1273 1 66.34 ATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCAATGACTACTTATTATTTAAATAACAATGTTTTAACCAGTTCACACGTTTCTAATGAACTGAGGACCATGACAAG:1 - chr3L 21109423 3' + Stalker3T 295 1 78.22 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTATATGTTTGCGGTGCGC:1 + chr2R 23468969 3' - I-element 49 1 73.27 CACATTTAAAAAATATTTTTTTAGACCATAAGTTATTATTAATGACATAAAGCATTGTATGTCACAACTCGAGTGTCCGGTGATGAGTGTGCATCATGTTC:1 + chr3L 867363 3' + Transib5 2726 1 64.36 TGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGGAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTGGTGAGCATACTGCGGGGAGCCCTCAAGCTGCG:1 - chr2R 14234939 3' + R1A1-element 5007 1 65.00 GAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACTACGTGATTCTGATGGTGGACACACCTCCTCGCGTTTCTTGTAGCTCAAATCCTTGGGCGTCTCCTCGACTACG:1 - chr3L 9706678 3' - R1A1-element 329 1 71.29 GACACACGGGAAAAAAACCATGCGCATTTTAACTGGCTCATATCATGAACTCCATGCGCACTGCCATGTTAATTCTTGGCCAGGATAAGGACAACAAGTTG:1 + chr2L 11018113 3' + baggins 5100 1 65.35 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTCTGTCCCTGTGGGGCTTCCCGGCAGTGCTGCTGATTTTATACATTCAAAT:1 - chr2L 17050140 3' + flea 232 2 57.43 AAAGGGAAAAAAACAATGAATACAGTTGAAACTTTAAAGCAATAAGGGAGTGCAATAGGGGGAGGTGACCATTTTGGCCATTGCCCACGGCATCGGCGG:1 + chr3R 28727380 3' + invader2 294 1 60.61 CCATAACCAAATGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATACAGATGAAACGTCCTAGCAGATATACCGCACTACTTACGGTTGCAGTTGCTTATC:1 - chr2R 18759658 3' + frogger 2270 1 59.41 TCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAGGTCAAGTGTCATCGCTGCAAATGTGTGGGTCCAACAC:1 + chr2L 8104084 3' + F-element 295 1 65.35 GTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACCATCCCGCAATCCCCCATAGAAATGCCCACTT:1 + chr2L 16766533 3' + Bica 388 2 68.32 ATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTAGATGATGGAGGGTGGCTCATGGTGTTGATAAGAGTGGTTGGAG:1 - chr2L 2079237 3' - Idefix 117 2 58.00 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGGTCTGGGCGGAAAAAAAAACTGCTCAACTGGTAGGAGAAATAC:1 - chr3R 16531202 3' - hopper 27 1 56.25 TACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCCAGCTCCTTTTGTTCCCTGTTTACTCTCCCTGAACTGATTAA:1 + chr2L 3959551 3' + Doc 291 1 58.42 AGCCACTATCACCGAAATCACCACTCACTTGTCCAACCGATTGCGATTTAATGTATTTATATTTTTAATTAAAACAGATCAACTTGTATCGTGTTTCTCTC:1 + chr2L 9738086 3' - diver2 495 1 63.37 AAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCCGAATCCAAATCCACCCACGTGGGCCGGCCAATTGTTGCTGCCGTTAGCATAAACATTTA:1 - chrX 16811471 3' + Quasimodo 369 2 64.00 CGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAATGCGAATGCGCGTGAGCCTGTGCCGCACTTACGGCGGCG:1 + chrX 272542 3' - INE-1 559 1 62.34 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTAAGGCTCATTTACTTGGGATTCCCCCTGGCTGATGGATTTATTTGCCTTAAATGGAGGCGAA:1 - chr3R 23091186 3' + jockey 4971 1 62.38 GACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGTATCTCTAACATGTTCTACATCAATCTTTTCTTCTTCATTGGCATCATGCCCATTGGTCT:1 + chr2R 1370586 3' + Doc 225 1 63.37 ACTTTATTAACTACATCAGAAGCATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTACCGTGCAGGATTATGTGGAACCCACGCAGGAGACT:1 + chr3R 23700982 3' + mdg1 398 2 55.29 ACTTGTTTGCATTTCTGCTCGTTGATTGCAATACGCCAGTTAGCCAGCCAATTCTCCAACATCGCCGCTCGCATTTTGCGCGAGTCCTTGAAGACGGGACT:1 - chrX 15848957 3' - Doc4-element 2330 1 57.43 TGATAGTCGGGGAACTCGACTTTAGCATTTTCTCTTGATTTGCCTTTCTGTAAATCACGTTATGCAATCTCATTTGGCTTTATTACGGTTATCAACATCAA:1 - chr2R 9271245 3' + INE-1 563 1 66.34 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGTTTTCAAAAT:1 + chr2R 4536704 3' + mdg1 415 2 73.27 AAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATACCAAATGAGAAGACTTTACTCGGTGAGTAAACCCAATCGGAATTATCAAAATCGCGGGCAAACAACCTACAATT:1 + chr3R 8939803 3' - roo 426 1 53.47 AGTATTCAGCTTGCGACGTGTGTACAAATTTTAGGCGTACAGAAACTAGGTCAGTTGGTGAGAACAGTGCCAGTGAGCATCAGGA:1 + chr3L 25847254 3' + 1360 417 1 52.94 CAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGCGTACATTCCAGATCTATTTTATGTTTCCATTCGATTCAAGCGCGACATTCCA:1 + chr3L 24041216 3' - mdg1 7412 2 66.34 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAACATTCTAATCACTCGTGTGGAACTCGGGCGAACACGTTTTAGCCATTT:1 - chr3R 24546644 3' + roo 9017 2 55.45 GCTAGAAGACGATTTTCGTGACGAAATCAATTCTGATCGAAGACACGAATTTACATATTTGGGAAGTTTCGGCCAACTGCACTTATTTTTAATAAATGTAT:1 + chr3L 13888017 3' - 1360 3194 1 73.27 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATTTGTTTT:1 + chr3L 19510795 3' + roo 9038 1 65.17 ATGTTTTTTACAAATATATGTGGAATCAAATGGTATTAATGTTTTTTGCCCCTTTTTTAACGTGCATCGCAGTGCGCATGCACGTTAAAAAAG:1 + chr3L 12748904 3' + transib4 458 1 56.99 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAGAAAATATTAAAGCAAAATCGGAAAATATTGGAAAATAACAACAA:1 + chr3R 6216880 3' - pogo 28 1 59.41 GTGCCACTAGGGCTGAACGGGGAACCTGACAGCGACGGAAACTGCACCACATCCTATCCAGCAGCAGTTCCAGCAAGGCAATGATGTTCCGCTCCGTGATC:1 - 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chr3R 7808962 3' - jockey 58 1 71.29 GACGTTCATACGGACAGTCGGACAAACGGACAGGATCAAGAATATAATAAATAAATAAACATAATTTATAAGTAGCAGATTTTTTACGTCTGTGTTGGCAC:1 - chr2L 15540108 3' - INE-1 126 1 63.37 ATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCAATTACCATTTCGAGATCTTCGTTCGGTGGGCAGGAGTGTGGA:1 + chr2R 16710555 3' - G4 172 1 79.00 GGTATNAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCG:1 + chr3R 23618219 3' - hopper 23 1 55.45 CTCGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCTAGTCCACAATAGTAGGTCACCACGTTTCG:1 - chr2R 14763262 3' - 1360 2976 1 71.29 GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAAACGATTATGCTGGTTTTGAAA:1 - chr3R 10736015 3' + invader4 3082 2 75.25 TGGATGGTTGGCAGGGATAACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTCAAAAGCTGAGCTCGCTCAGCTGGCTAAGCTGACC:1 + chr2L 7676863 3' - G2 419 1 65.35 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTC:2 + chr2L 5151990 3' - I-element 49 1 73.27 TTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTAAGTATCCATATGTGCTTGTGGCGGTCGAAT:1 - chr2R 23591902 3' - Idefix 240 2 61.73 TAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGCCAAGCAATTACTCTAATGGCAAAGTCTC:1 + chr2L 11114053 3' + transib2 2805 1 56.70 CCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAATTTGCTCTGACTTTGATGCATCTATACTAAAATGCAGCTGGGTTACACCGGTCCATTTAGTACCGTTCGCCGAA:1 + chr2R 19869841 3' - mdg1 7235 2 76.24 ACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATACCCGAGGACGTGGAATATCGGTGTTATATAAATTATATGAATAAAAATGCTAAAATGCG:1 + chrX 15440222 3' + Q-element 313 2 54.17 GCGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACCGCCAGTCGTTGCC:1 + chr2R 5910930 3' - hobo 26 1 53.47 ACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTAGAACGTCCGAAGGAAGACAGTGGATTAGAGCGTGTGGAGAAGGAGCGAATTAGAACGTGCAG:1 + chr3R 2533651 3' - accord 6983 2 70.97 AAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGCACTCAACGCTTGCGGAAGGTGTTGTGCCCCACCAGTGTAGTGGTCCTCAAACGC:1 - chr3R 1922120 3' - diver2 160 2 60.40 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATTTCCATCTATTAGCCTTTATCAGTTGCCTAATTAAG:1 + chrX 14521309 3' - jockey 4714 1 61.39 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAAAAAGGTTGGGAAAAATAATAAGCC:1 + chrX 697542 3' + roo 405 1 78.22 AGAAACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATGAATATGCTATCCAGCGGTGGCATAAAACCTTTT:1 + chr2R 12815785 3' - 1360 3234 1 64.36 ATTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAATAAATCAAGAAAGAGCGCTCAAAAACCCTAAGCGGGTCAAG:1 + chrX 465245 3' - F-element 334 1 55.45 TTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGTCTCCGATCCTGGGTGAGGAACAGATT:1 - chr3L 9458969 3' + I-element 91 1 73.27 TGTGTGTGTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTAATAGAGTCCTTGCTGAGCCAGTAGGAGCGG:1 + chr3L 10764111 3' - Quasimodo 28 2 73.33 CACACACACACACACACATATACTTGTCCACTTGTACACAAGTCTTAACCCATTTGACCCCCTGACATTCTTTCATTGCCTGCTTCTTGCTGCAGTAAGAG:1 - chrX 3646396 3' + accord 184 2 48.51 ACTGANAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGACACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTT:1 - chr2R 14121058 3' - I-element 23 1 53.47 TCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCCCTATCGTTTCCATCTGCAGGTAACCCCTTGTCAGGGAAAGTCG:1 + chrX 13061551 3' + F-element 482 1 56.44 AAAAAATGGCTGCATAGTGCCAAACCATTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATACTTCACC:1 - chr2R 4830326 3' + 1360 3343 1 72.28 CCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTTCTTGCAAGTGGAGTGGAAGCGGCGATCAGGTGCATTATCCAATTGCGGCGGTGGAATGCCGGACGAACCACC:1 - chr3L 21596511 3' - Doc3-element 4563 1 63.37 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTA:1 + chr2R 2427624 3' - Doc 13 1 66.34 CGGGTGAACATGCGCTCCATCATCCTTTCCATCATTCCACATGACTTTTGTGGGTGGCTAGCTGTGGGGTGTGGAGTGGTGTAAATGGTGTTTGTGCTTGG:1 - chr3R 10070106 3' - G6 1544 1 68.32 GGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTAGACAGAGAGAGGTATAGATAG:1 - chr3L 4582806 3' + R1A1-element 4995 1 78.22 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACC:1 + chrX 9256958 3' - 3S18 41 2 61.39 CAGTAATGCACTTTAGTGATTTTCCATATTGTATCCCAGCTGCGCAGCATCCGTTTCTAATAAAAACTTTTTCAGCAGCCTCAACCCCAAAACCCAGCCCA:1 - chrX 8996127 3' + 297 6634 2 61.39 TGCCAGTTATGGACGAAGCTGGCCTGATTCCCGATCACCAGTTTGGCTTCAGGCGGCGTACAGCGCAGCATCTGCCTACGCGCTAGGAGACTCGCCTGAAA:1 - 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INE-1 557 1 42.00 TGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCAACAGCAACATCGGCCGCACAAGTGCTAATGACTTAATAA:1 - chrX 20618560 3' + jockey 4571 1 65.35 TGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATCTGACTTCCTGTATATTTGTAGCCGCCGATAAACTCAATTTGTTTGCT:1 + chr3L 9202262 3' - Burdock 24 2 52.00 GCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGACTTAGCATTAACAAATTCGGACTAATAATGAAGTATAGTAAAAACCATAAAAACAT:1 - chr3R 7570391 3' + micropia 5198 1 63.37 GAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATTAAAAAAAGTGGTACGGCATGATTCACGCCCGATACATCAAGGCAGAGCGTGGCGTGAT:1 - chrX 23352400 3' - Circe 112 1 57.43 AATACTCAGGCGTCCGGAACGGTGGATTTGTCCGCAGGATCATCGTCGTCGTACAGTCATATTTATGCCGCAAACTGTTTGAAATGCGTGTTCATTATTCA:1 + chr3R 15410575 3' - TART-B 294 2 48.51 AGTGACGAACTGGAATAAGCCGGTAGCACGGTCGTAGCTCCAACTTCTCATTTGTGGCTCATTGTTGGCGGCACTTCTCGCTGTGCCACGGAAAGGCCATA:1 + chr3R 18557696 3' - Chouto 217 1 62.38 CTTGANTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGGTATATCGAATGAAATTGTGCACAAATGA:1 - chr2R 14442051 3' - F-element 342 1 70.30 CGGATNCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 5323 1 51.49 GGAAAAGTATCAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAACCCTCTACAGTTAGCATTGTAAAATATTGTTTTTCTAGGGAAATGTGCCTTTG:1 + chr3L 6512520 3' - I-element 5142 1 61.39 CCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGATAGGTGATAGCTGAAGCTGGCGGAGAAGTGTTGGAAAAATGCTGGAAAATCAGCTTAGAGCTGGCTG:1 - chr3R 29969287 3' - F-element 4421 1 73.27 CCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGCCGCGGCTCTCCGCGCTCCATATGCATGGAAATCTCGGCTAACAAGCCAACTCCTCGACGAAGAAGCTGCC:1 + chr3R 22943457 3' + invader1 3706 2 70.30 AGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCAACTGTTGTTGAAATATCATTTGATTCAAGCAGCCATTTGGCCG:1 - chr3L 12016836 3' - copia 5072 2 57.43 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCCGAGCAGGTGGCCAACGAGTGGTTCGCCCGCATTCAGCAGCACCTGAGCTCC:1 + chr2R 24607868 3' + hobo 2851 1 56.44 GACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCATTCCCATCGACCGGACTTGACGCTTACCC:1 + chr3L 1255773 3' + R2-element 458 1 71.29 TTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGGGCTTTTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGTGAAAAAGTGTCAAGTGCAGAGCAACT:1 + chrX 15518363 3' + 1360 421 1 73.27 CAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATACTTACCATGGCGCGCCCAAAAAACAAA:1 + chr3L 9911880 3' + McClintock 6038 2 71.72 GAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGC:1 + chr3L 25232907 3' - GATE 8265 2 52.63 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAATAGTAACGCCTCAATAGGTTCAATACCGAA:1 + chr3L 5827963 3' + blood 361 2 62.00 ATTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCGCAATGTCAGCATTCTGCCGTGAGCGCTGGAGCGTGGCCACCTCTTCTATCCATATCCAACATGCACAGAGTGCG:1 - chr3L 20807556 3' + gypsy4 113 2 57.43 TGCAATACGCCAGTTAGCCAGCCGATTCTCCACAACAGTTAGGTGACCAGCCAGGTGCGCTGGGTGGCAGGCTGCAGGACTCAAGAGGGAGGACACTCG:1 + chr3L 13736228 3' - Doc4-element 2304 1 60.61 TCATCTATGCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTAT:1 - chr2R 4260434 3' - micropia 5135 2 80.20 ATGAGTAACGGATATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTATACCATTCCCTAGTGTTTATGCTGCTATCCTGCTGATCTGTTCCAGCGTTTGTTCTCCATTCC:1 - chr3L 7066149 3' + INE-1 547 1 76.24 CTGTTTGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGTATTAGTGTATTAGTGTATTTCATACGAAGCATTTTCAACTCGGGTCCGTGCAAAAGAAAAGAA:1 - chr2R 16790392 3' - Idefix 86 2 54.46 CACACACACACATACACACCCACACACAGCTGCTGATCCGCCTCGAAGCAGGTAACACAAACACCTGCTCA:1 - chr2R 13646793 3' + Quasimodo 42 2 80.28 TGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCCCATACGCATAAACAGTGCCAAGCAGCATGGTGCGGC:1 + chr3R 20310327 3' - hobo 80 1 54.55 ATGGAAAATTCACTAAAATGATAATTTATATATATTTCAACTTGCAGTTTCTTTTTACTAATTTACTAAACTATAAACTTTGAAGTATATTTGCGGAAGCT:1 + chr2L 8967117 3' + Burdock 6386 2 74.26 AGAGANAGAGGGCTTATGCGCATATGTGGCCATGAGCGAGGATGAGAGGAGGGAGCGCCAGGAGGATATCAAGGCACTGTTCGGAAAGGCCAAGG:1 - chr2L 13386913 3' - blood 159 2 71.58 CCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAATATAAATTACAGAGAAAAATATCTCGGTATTAAAAC:1 - chr3L 7069778 3' + I-element 335 1 75.25 GCGAGTACTTACAAACACAAAGTATAAATCTGCGCATGCAGACAAGCACCCGGTTGTCCGCAAGGCCATCGCTCGCGTCTACATTGTGATGCACCAGAAGC:1 + chrX 5673248 3' + hobo 85 1 56.44 CACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAAAAACGTAAACAAACCGAGCGACATTGCCAGCTGAAAGAAA:1 + chr3R 24134765 3' + hobo 42 1 59.41 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTCATTGCCTCTGCATTTTCGAGGACTTTGCCACCCC:1 + chr2L 19090117 3' - opus 7153 4 65.35 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCTAGAAA:1 - chr2R 11257867 3' + pogo 2057 1 72.28 GTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCCACAAGCAGTTTCCGCAGGTGCGAAGATCTTACAACATAAAGTTCAATGAAGATCCAGAATTCGAATGCGA:1 + chrX 13022394 3' + R1A1-element 203 1 58.59 CAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACCATTCATTAAAATCATAGGACCGAAGTCACGTGTTGACTTGTTGCACATATATAGCCATGTATTT:1 + chr3R 28531691 3' + P-element 2777 1 68.32 TTTTTGTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTCTTTTTTAATGTGCCAATGTCTTTTGGGCATATGCCATGTGTGTGCCCTATATCTTAATATCAGGGAAGTAG:1 + chrX 19379432 3' - gypsy7 5012 2 31.68 TAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATGCTGTCCCCTGCATATTATTTCAATTTGGCGGTGCAGCA:1 + chr3L 3476226 3' + Idefix 7358 2 61.39 GCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATGTGTATATTCCACAAAGGCGGCTGCCAGAA:1 - chrX 10445558 3' + INE-1 546 1 76.09 GGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGTGCGTGTGCGTGAAGCTGTGGGTTTTTCAAGGTTTTCCGGAAAATCGCTGGCCTTCAAAATTAACTGCGAAAA:1 - chr3L 12414275 3' + gypsy8 129 2 77.23 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGAT:1 - chr3R 9996391 3' - blood 37 2 58.42 CAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAAAAAGG:1 + chrX 697523 3' + roo 388 2 60.61 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTACGGAGACACGGCAAAGATGAAAGCCAAAAAGTAACCTGCAAAATAAGTATGGCAATGGGTATG:1 - chr2R 13646624 3' + jockey 4980 1 59.41 GCATGCATTTAATATTATCTTAATCGGCCGACTTTCATAAAATAGGTTTTCTCTAATCCCCAAATCCACATCTATTTATAGTCCCTTACTACCGCCATTTT:1 + chr3L 21766066 3' + Transib-N1_DM 433 1 56.44 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCCACACGCATGTGAGCCGTTCCAAATGCACAGCTAGAAATAATATCAAGCAATAGAAACTTATATATAAAAT:1 + chr2L 1629676 3' + hopper 1413 2 71.29 TCTATCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAATTATAAAAGAGAGAGCATACAGATTCTAGACCCAATTGCCTTCGGACATTGGTAGTTTGCTTAACCCTAT:1 + chr2L 4297566 3' + INE-1 130 1 63.37 CTCCGTTCTGGAGTTATTAATTTTGGCCAAAAAAGAGGGTAAATTTCCCATAGTGCGGCGGTTCGGTCAAAGAAGATCGGTAGGAAGAGGAACAGAAGATC:1 + chrX 15553651 3' - Transib-N1_DM 35 1 80.20 ACTTATGCCACTGCTGATTTGTAAACAAGTATTTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGTTTATTATAAACCTCATTCCAATTTGAAATTACCG:1 - chr3L 19100406 3' + Tc1-2 1444 1 70.30 CACGCACACATATACGCGTTCTCGACTCTTTTATTTCTATTGTTGTGGCTACAATGGTTTCTTTTCCTTTGGATTTTTTACATCCAGAAACTATCCACCCG:1 - chr3R 19444830 3' + 1360 3220 1 76.24 ACAGAACGGCACGGAATAGCAAAATGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATACAGCCAATCAGACGAACAGCAGCGAGATGCGCC:1 - chr3R 8071040 3' + Bica 393 2 63.37 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCAATGGGAAAATCATTTAAACCAGACATAAA:1 + chr3R 10490391 3' - transib2 49 1 73.27 ATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTTCAGCATCAGCAGCTGTTTCT:1 - chr2L 21841196 3' + Quasimodo 325 2 77.23 AAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCTCCGAATTTTCCTTATTATCGATAATATTCCGGA:1 - chr2R 5183009 3' - INE-1 579 1 66.34 AAAAATATAAACATTTAATATTCGTTCGCTCTAGAATAATTTTTGTGATGCGATGTGACTTTGGCATGAAGATAGGATGTTTGACATCTGAAGTGCCTGC:1 - chr2R 4716705 3' - Tc1 61 1 78.00 TAAACCTATTGAGCTGTGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACTTGGAGGGCTTCGGACATGGAACTTGGGACATGGGTGCTCCTAGTTCGAGAAGTTCGTTGG:1 - chr2R 7736935 3' - G5A 2464 1 53.47 GGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAGGGTGGTATGGTTGGTTAGTGGTTGGAGGTGCTCTTCCTAGCCAGAGGGTTGAAATAGTCGTTTGTATGCGAGAGG:1 - chr3R 11190188 3' - G-element 4120 1 76.77 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGGAGATATTATAGAACTCTCTTAATATGCAAATAGATAACATTTATAC:1 - chr3R 7375321 3' - roo 30 2 57.43 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGT:1 + chr3L 15853505 3' + jockey 4943 1 71.29 CTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGA:1 - chr3L 5691254 3' - P-element 206 1 30.00 AAGATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACATAAACCGAAAACCGCAAAATGTGGCAAAAAATAATAATACATACCATGTGGAAAACCAGCGGTAGCAGTAGC:1 - chr3R 16125157 3' - Cr1a 4361 1 75.25 CTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTTTCCAATTGATAGATTACGGGGTATGTACTTGCAAATAAATGGCGCTGGCGAATCA:1 + chr3L 15636332 3' - R1A1-element 340 1 63.37 ATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCTGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAGCGAAATAGTTGAGTGGCAAGACA:1 + chr3L 10518176 3' + 1360 3151 1 73.74 GCCTACGTACTAAAACAAAACCTCCGCGTGTCTTCATTCCTTTTTGTTGTCATCGCCTTCACACTTTACTTCCTCCTTCTTTTGTTGCTCCTTCTTTTTG:1 - chrX 7970342 3' - Rt1b 5037 1 61.00 GTGTGTGTGTGTGTGTTGCTGTTAGGGTAAGGTGGTTGGGGAAAACAGAAACGCACACACACACACACACCCACACACACACACACACACCCACACACACA:1 + chr3R 28240377 3' - gypsy3 420 1 53.47 GCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTTGATCTAGAAATTTCTCAATATTCG:1 - chr3L 22003234 3' + F-element 303 1 75.25 CCTAATGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGGGGACTGCTAACCACTGGCGTTTATTCGGGAGCACAGTTCGGAACGGCTGTCATCCTGGT:1 + chr2R 7928602 3' - diver2 157 2 66.00 CGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCTGGAACTTGGAACTTGGAACCTGGACTGGGGATTCTCGGCCAGCGGTTGTAACACGAGCCAGAAGCTC:1 + chrX 7560466 3' + F-element 302 1 73.27 GACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAGAGCCCATTGAGGGGGACAATCTGAAGATCAGC:1 + chr2L 11017336 3' + Bica 455 1 66.67 GCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCATTATATAGTATGTTCAAGCCCCAGGTCACAAGTTTACCTCCCCCATCCGCCCATACAGCTCCCAATTGGAC:1 - chrX 18993952 3' - gypsy4 128 2 74.26 CTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTTAGACCTGTGCACGGACAGACCGGGCTCGCACCGCAGCCGGGCCTCCTCGG:1 - chr3R 10773958 3' - roo 8954 2 57.43 TGGGTTAACACGACAAAAGGTCATAACACGACAAAAGGTCATACATAATCACAGGAACCATATAGTCCGTAGTATAAATACGTAGAGAAGTAACTGAAAAG:1 - chr3R 8156643 3' - Q-element 685 2 58.42 CATAGAATAAATAAATAAATCTTTTAACTTTTCACAATTCAGTGCACATAAAATGTGTATATCATTTATTACACATTTTGTTGATGTCCCTGTAAGTGAG:1 - chr2L 16948339 3' + Doc3-element 81 1 59.00 AAAGCGCAATACCATCGTTTGCCCACCTTTTTTTTTCTCTGCTTTTTCTCACTTTCCTCCTCCCCTTGCCCTCCCACATTTCTGGATTTTATTGTACCCTT:1 + chr2R 19148367 3' + FB 197 1 42.57 ATAATTATTCTGATTTTATTGACGTTCAAGCCTCGGTATTGACCTTTTCCAGCAATCTGTTTCCGGTTTCCTGGCGCAACTGCAGGAAGTACTGACGCATC:1 + chrX 17104774 3' - Idefix 7267 2 60.40 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAATGTTAACAGGGTTTCCCGTAGCTTTGCATTTTTTGCTGACCTTGCTTGGTGACAATGTCAAG:1 - chrX 14597404 3' + BS 5075 1 61.39 ATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAGACAGACATAGGGGCCAAAAGGCAAAAGGAGCGAAGGCTCTCCACGTCGCCGCCATCATCCACC:1 + chr2R 19971313 3' - R1A1-element 5276 1 75.53 GCGTCGAACGTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCAAAGCGTTTGCTTTTGGGTTAAGCCCTTTTATTGCATTCTGCAGATGGCGATGT:1 - chr2R 18061363 3' - Bica 4613 1 59.41 CAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAAGTTTATTTATATGGTTTATACGGTCGGGA:1 - chr2L 17084821 3' - Tirant 8429 2 76.24 AGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTATTTTAATGCAAAAGGCGTGATTTTCCAGTCATTTGAGAGCTTTTCTGAATACACAAAC:1 - chr3L 9389202 3' - Bari1 1494 1 62.38 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAATTGTCGTTTCTGCTTGCGATTAATTAAATATTAAAC:1 - chr3R 22676669 3' - 412 7093 2 68.32 CTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTGGGCACTGTCATGTTCAG:1 - chr3R 26331615 3' - G-element 5 1 75.25 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAAAACGTCACTATATACAATTATAAACAATCACATTCTTCCAATTCTTTTT:1 + chr3L 25341891 3' - 297 14 2 52.00 TTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATCTTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGAATCGCCAGCGAGAAGAGTCCATAGCTCTTTATG:1 - chrX 20486451 3' + 1360 3251 1 60.00 AAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGCACTTGCTGAGCCAGTTGCACATACAAATATGCATATGCTGCAGGCACTTG:1 + chr2R 9383804 3' - HMS-Beagle2 6834 1 59.41 TTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAGACCAATAATAATGCCCATTAGCTAAATGAGGA:1 - chr2R 8158721 3' - Juan 5 1 79.80 TTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGCAAGCTTACATCTGTCGCTTCAGTAATCTGCAGTAATCTAA:1 - chr3R 28012517 3' + diver 6075 2 60.40 TATGGACCTATGGCTCCGAGCGATGGGGCAACGAACTTGGCTACCTAGACCGCTTGAAATAAAGTCTAAAGTGCGGCCAAAGAAGTGCGAGCAGCACAGCA:1 - chr3R 23421193 3' + Doc3-element 4319 1 61.39 GGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAATGAATTGTTGGTCACATAGACCA:1 - chr2R 15692614 3' - rover 7115 2 77.23 CAGAAACACATAATACAAACCTGCTGCCTGCATCCAATCCAAATTA:1 + chr3L 18560464 3' + hopper2 1331 1 58.70 GATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTGAAGAGATATATGTATGTATGTTGGGGTATATGTATATAGAATGTATCTTTCGGATACCAATTGCCATTA:1 + chr3R 26797044 3' - R1A1-element 5321 1 76.24 GTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCGTTGCGTCTTTTGGATTGGCTTCCTTGCTTTTTGCACACACACAAAGTGCGTTG:1 - chrX 16148266 3' + R1A1-element 5187 1 61.39 CCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATCCATTGGTTTTTATGTTTTGTTTGCTGGCGTATAATACCGACGATTTCTG:1 + chr2R 18229691 3' - I-element 430 1 59.41 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTAT:1 + chr3R 12578186 3' - jockey 35 1 53.47 CAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACCAATACCACTTTAAAGTACCAGCCTCGAAATCAGGTGCGCTTTTAGAAGCCTCCTACATGG:1 - chr3L 21125930 3' + Stalker 291 4 69.31 TTCCTNGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCACCCAGAACTCGCCGCAGCAGGGCCAGGCGAAGGTGGTGCGGCGTGGC:1 + chr3L 19601012 3' - F-element 318 1 52.04 ATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTCTGTTGTAAGGGCAACTTCTGGGCTGGGCTCTTTATTGAAACCATTTGGGGTTGGGCTGCAGCTTTGCTGGGG:1 - chr3R 31724473 3' + mdg3 5494 2 71.29 AAATGATTAAATTTAATTTTGAAATATGCTTTATTATCACAGCTCATTTATTTTTCTAAACTAATTCAAACTGAATTCTATTGTCGGTGAAGCATGGTTAC:2 - chr2L 7570064 3' - Bari1 334 1 29.70 ATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTATCTTGACCATTTCAATTGCCTTAAAGTTTACGTACTGACGTTA:1 + chrX 16583644 3' - Idefix 294 2 56.44 ATTGCCTCAAAGACAGTGGCTATCTTGAGGTTGTGTTCCTTACGCGTCCTCATCCTTGAGGGTGATTCATCCCTTTTGTGGGTCAGACTCGAATCACTGTC:1 - chr3L 8463766 3' - BS3 1446 1 61.39 ATGAGCGCCTTACAGATAAACGCGTGCGAGAACAGCTGCATCGCAAGTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTCCACATCTTGGGCACAAGAAGAGAACGAGT:1 - chr2R 15893077 3' - diver2 124 2 70.30 GTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGAGGATCGCATTCGAATTGCACTGGACGGACCGCCGTTTGTTTTGGTTTTTGCGCGGC:1 - chr3L 8185471 3' - McClintock 100 2 66.34 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTCGAGCCAGGGCTTGGACATAGGCATCTCGCTCCAGG:1 - chr2L 13796751 3' - hobo 40 1 64.36 AAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGATTTGATGGCGGACTGCGATCGACGCGACTC:1 + chr3L 3952385 3' - accord 7199 2 70.30 ATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATG:1 - chr3R 19449694 3' - pogo 1978 1 66.34 TGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATATCGGGTTGTTGTTGTCAGATCTGTTCGTCTGCCGTGGTGGCA:2 + chr2L 13782697 3' - Stalker 7060 4 62.38 CACATATCCTTCTCCGTGCTCCTCTGTCCTAGCGGTCTTCTTTCACCTTCCAGTGCGTAAATGCTACACTCGTTTCGGGGTATATGTATATATTTATACAT:1 + chr2L 11168021 3' - gypsy8 4477 1 53.47 ATAGGGCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGGCATAGGAGCATTTCTTCGGTGACTGTTGTCTTTTAGCCAGCTTCCTTTAGTTTGGGCTTTGTTTCGTTT:1 - chr2L 14461885 3' - F-element 4252 1 75.25 CATGCACACACACACACACACATATACTTGTCCACTTGTACACAAGTCTTAACCCATTTGACCCCCTGACATTCTTTCATTGCCTGCTTCTTGCTGCAGTA:1 - chrX 3646400 3' + accord 7026 2 44.55 TATTCCTAACGGGGATATGATCATATGCTGCTCTCTGCCAACTGAGTGCGTGAGTGTGTGTGTGTGTGAGTCCGCGTTGCTGTATAAAATCTGTGGTCATC:1 - chr3L 17563957 3' - invader3 64 2 70.30 TAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACCAACAATGCAGCAAGGCCAGCGGAGTTCGCAGAGTCTACTGAGCGATGATGATCACGTTCGCGTCCG:1 + chr3R 16372496 3' + roo 403 1 70.53 ACGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTCTGTGTGTCCTAGTCCAAGTCGTATTATTTTTGTTTTGCGGTCCGGCTTGATGTTTTATCGGAAAAAGGGGTAAAAAG:1 - chr2L 7085570 3' - I-element 4967 1 56.44 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGGACATCCGTGCGGACAACATGGCGTATGATTAACATGT:1 - chrX 8817114 3' - jockey 4711 1 58.42 CGAAANGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATAATACATTGTTGTTGCTGCTGCCCGCCGGCTGCTTGTGCTTAATACTGCTGGATGTGGATGTG:1 - chr3L 11253821 3' + rover 347 1 59.41 TATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGGGCTTGGATCACCTGGTCCTGCACCAGGTC:1 + chr2L 6175101 3' + 1360 396 1 75.25 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGTATTCTTCGGACGAAGTTTGTAAAT:1 - chr2L 6177154 3' - pogo 19 1 61.39 AGCAGCCAAAAATTACTTGTTGGCTATGTGATAGAATAGTGCATACCATTATGGCTGAAAACTTTTCGCTCTGACGCAATAATAATAATAAACTAAAGCTT:1 - chr2R 19696510 3' + Cr1a 493 1 54.46 CAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACCAACAATGCAGCAAGGCCAGCGGAGTTCGCAGAGTCTACTGAGCGATGATGATCACGTTCGCGTCC:1 + chr3R 16372495 3' + roo 396 1 65.35 TAGATTATATTCACAGCTTGGTACTTGTACCGAAACTAAATTAAATTGAAATTTTAAATAAATGTTGCTGCAGCAGCTGCAAGAAAAAAGCACGTGAGAAA:1 + chr3R 15680313 3' + Tc1-2 1293 1 72.28 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACT:1 + chr2R 5640408 3' + roo 9039 1 60.40 GAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTGTTACCGCAAATGTACATCTAATATTACATGTACATACATATGATATCGAGAAGCCTTTCAGGGAA:1 - chr3L 24031865 3' - Tc1 29 1 68.32 AGCCCNTATGTGTCTGGGCACGTTGTTTTTGGCCATTGTAAATTACCGTTGTTTGACTTTAATGCAGCTCCGCATCTGCCG:1 - chr3L 20914165 3' + aurora-element 4121 1 58.02 GAGGCGTAACGCCATACGATTTTTTTTTTGGCCGTTTTGCGTTCAGCTTTTAATTGCGATTGCCCTTGTTT:1 + chr3L 22864548 3' + 1360 21 1 67.61 GGAACCAATTTTTGGTCTATATAAACCCAGAAACACCTTTCGTGCAGATTTTACAGCAAAAAAAAGGCCAATTGCCAGCATTGCAAATGACAACGCACA:1 - 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chrX 20112704 3' + opus 196 2 69.23 TCACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGATGCACAAGATTAATCAGTTGGCTA:1 + chr2L 14303841 3' + I-element 301 1 75.25 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCAGATGCGAGCAGTAGTTTTGTTTTAATTG:1 + chr2L 11576438 3' + roo 9026 1 77.23 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGATCTGAGCAGGCACATGGGAT:1 - chr3R 9996372 3' - blood 7029 2 62.38 ATTAAAAAAAAAACTTAAAAAATGAAAGATTAAAAAATATACTTCCTTAACTAAAATGCGGTAGTCAATCTTTGACCTTGGAAG:1 - chr2L 9646164 3' + P-element 2691 1 79.76 GTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAGATATATATATGTATCACAGATTGCTT:1 + chrX 3003699 3' - Juan 51 1 71.29 CATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGTACCAAAACGGAAACCTGATATAAGGGATGTATTTCGCGAATTTGATGTAAGTAGATATATTCTAGTA:1 + chr2R 4754670 3' + HB 476 1 65.35 ATAGTCTATTGTAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTAACATCAACAATTACTAATACATACCATCTGCTTTCCTTTGCAAAAA:1 - chr2R 2867701 3' - Cr1a 4199 1 63.37 GGAACACACACACACACACACACACACTCGGCAGACAAAACGCTGCATCGAAATACAGAGGAAAAGTATATTAATCATTTTGTGTGTACTTCAATATTTGA:1 + chr2L 21970316 3' + accord 7028 2 65.35 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGCATATT:1 + chr3R 23618240 3' - hopper 2 2 76.24 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATAGCAATAATAATAAAATGCTCTGCCTCAAAAGTAACCTTCAGTTTTGGTTTCCTTTTCGCAGCTGAACGCACTT:1 - chr3L 3544121 3' + roo 335 2 79.21 GTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCTCATCGCTCGCATTCCATTGTCCTTCGTT:1 + chrX 17047278 3' - Stalker2 7484 2 78.22 AAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTA:1 - chr3R 6216824 3' - pogo 52 1 78.22 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTC:1 - chr3L 22052774 3' + mdg1 7420 2 64.36 AATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAGTGACATTTTTCCGTTGGTTTTTCCGTTTTTCTCCCGGTTTTCCACC:1 + chrX 10242296 3' + FB 297 1 53.47 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCC:1 - chr3R 21799509 3' - jockey 4786 1 51.49 GCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTATGGCAACAGGCTGGCAGATTGTTATTTGTACGCTTTATACACAGTATACACATTTGTATATGGTT:1 + chr3L 9163728 3' - F-element 349 1 66.34 GGTGATGTGGTCTTCGTCTGCGATCCTGCCTTGGCCCGACGAGAGTGCCGCCCGAGAAAATTGTGAAGGTTTCCCTGCGGCGGGCAAATTAAAAGATTATA:1 - chrX 12637992 3' + aurora-element 3837 1 55.45 ATTGATACGAAATTGGCCAAAACTCCAAATATGTAAATTCCTTTCTTGGATCACGTACTAGACCGACTAGGTAGATTCCTTTATAAATGCATTACATTTTT:1 - chr2L 8471015 3' + 1360 3119 1 55.45 ATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTGCCATATATAGTGAATTATATTTCCACAATAATGCATGTTCAACT:1 + chr2R 4349942 3' - Q-element 87 2 65.35 TCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATGCCGGGGCAGCGGAATGTCCACCTGGAGGTGACTTTGACTGGTGGTTTTCT:1 - chr2R 19132891 3' - baggins 5207 1 50.50 TAAAACAAAGGTTTTTTTTTTTATATATGTTGCCCTTTTC:1 - chrX 677979 3' - HMS-Beagle2 498 1 85.00 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAGCTTTTAAGGAAATTAACAGGAAATTGTCTAGCCGAGCATACGGATATGGCTC:1 + chr2L 14936349 3' - jockey 4800 1 69.77 TATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAACAGAAAATTGATCATGTGAATTTCAACAGAGCGATTGATTCCTCCTCACGCACCTCAGGCTTC:1 + chr3R 7018226 3' + transib2 47 1 53.00 ATATTCTTGATCAGGATCAATGTCCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTGTTCCTAATCTCAACCTATTACGCCGTGTGTTATTATTTTAGCATGTTAATAA:1 + chr3L 22695631 3' + INE-1 84 1 78.79 TTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTTGTATGATATGTTTGATTGCTTGTATTGAGTTTGGCTTATTCGAATATGAAATTCTA:1 - chr3R 7287403 3' - I-element 4877 1 61.39 TTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGACAAAGAGTACGAAGTGTACGAACCACACCATAGCATTTCTTTAGCTTTCTTTTCC:1 + chrX 983377 3' - Juan 3827 1 55.45 TTATANCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAATAAATTTTCGTCTGTAATAGCAAA:1 + chr3L 95009 3' + hobo 2660 1 78.22 GAGAGGGATAACTTTCAGATCTCTTTCGATTACCTGGTTTGTCACTTCCCAGACGATAAACAGAGTCTTAAGTCTTCTGAAATATCGACACGTGCTCTCTG:1 + chr3R 1848235 3' - G5 4515 1 59.41 AGCAGCCACGTGCTGAGGCTGGTACACCAACAAACGGTTCCTACCGTGCCCTCCTCCCCTCCACACAGGCCGTCTCTTTCGCTCTGCAGTCGCCCGTCTCA:1 + chr2R 11478980 3' + G-element 241 1 61.39 ACATGTGAAAATACTATTGACAAGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGAGTTCATTGTTCTTGATTGG:1 + chrX 12855728 3' + Bari1 1501 1 68.32 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCT:1 - chr2R 11257872 3' + pogo 2052 1 77.23 TGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTTTGTATCAGTTTCTCTGTGTGTGTGTTACTGCAATCAATTTGCCAACACCTCGCGCCCCAACACACGCACA:1 + chr2L 9746345 3' - accord 7026 2 45.65 GGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAACAACAGAGAAAAAAGCCATAAATGCCACACACAGTCA:1 - chr3L 15186590 3' + Doc 4542 1 64.36 TTAAAATTAAAAAATTTTCATACATATATAACACAACAACCATTTTTACCCAACTATTACTTATGTATATATTACATTTTCTTGTAAAAACGCTTGAGTTT:1 - chr3R 23167284 3' + 1360 3029 1 43.56 ACAGAGCTAAGTCCCGTTGCCCTTCGATTCCTTAAATTTGCTCAATTATCGTCCATCGATGTGCCCTCATCTCCTCCGGCTCTTTGGATTAACTTGCCCCT:1 + chr3R 10443253 3' + diver 431 1 74.26 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGGGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGG:1 - chr3R 11005456 3' + roo 9041 1 51.49 CACTAGCCGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGGGGAATTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTGTATATTGCAATCAATTTTTCAATAGTGAGTTAAGCGATA:1 - chrX 15574598 3' + INE-1 541 1 60.40 TAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAG:1 + chr2R 5532342 3' - G4 3771 1 54.46 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCTAGAAATAACAAAAACT:1 - chr2R 11257856 3' + pogo 2069 1 61.00 CATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGGGGCAGGGCGCCAAGAGCAACGATTAATAGTGGAGCACGTTCGA:1 + chr3R 7808850 3' + jockey 355 1 56.44 CACCAAATAGCACTGCGAACAACGCATAAAAGCTGGAGCACGTGCAGGGTTAAATGTCCTGCGACGGCAAGCAAATTGGAATTTTGCCTGACAGCTGCACT:1 + chr3R 13648289 3' - Cr1a 236 1 75.25 CGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCATTGTAGCCACAATTGACTGATTATCATTTTTGTGTGTACATTCT:1 - chr2R 8125046 3' - Doc 4 1 70.30 AGAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAAACTAATCAACCCCATAACAACATTGCACCCAGCGATGAAGTTCGTTTGGAGTCAATAAA:1 - chr4 1081084 3' + mariner2 756 1 70.00 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCATTAATTACTTCTGCCACTTGACTGGTTATCAA:1 + chrX 2253892 3' + Tirant 364 2 68.75 CAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGATTCGACCACCAGGCCAACGGCGCCAATCACGGAAGAGGATAACCGTTCCATCGAGGACATAATTAAG:1 - chr2L 8513458 3' + I-element 4919 1 73.27 GTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGTTTCTTCTGCTGCCCACATTCATGCATAAATAATTCCACGATAACGATGCGAA:1 + chr2L 14068242 3' - accord 7312 2 57.43 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAAAATCTGGAAAAAATACATGAATGAACTTATCT:2 - chr3L 2539266 3' - roo 41 2 70.30 TCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATACGTACATATTTATGTATGTATGTACTTTTGCCAGGACTGGTTTGTAAAGAAATCAG:1 + chr3R 23723191 3' + Transpac 5214 2 65.35 TGGAGTTACATGCCTTCGATGGTCACCCAGCGCGCACACGCACACAGACACACAGCGAGACTCTTTGTTGTTGCCCCAGACATTGTTGTTCTCAGCCTGTG:1 + chr2R 16731583 3' - gypsy10 5817 2 53.47 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAA:1 - chr3R 20140562 3' - jockey 37 1 55.45 TCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGCCGAGGTGCCGACACAACAAATTACATGCAAATTAGTCTCTGGGGATTCTGCAGCAGATCATTATTTTTCGATAGGAAA:1 - chr2L 14252868 3' - jockey 224 1 78.22 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAATTTGGTTTTACAAAGAATCTGTGAAATAAATCACTTAGTAATAAAGTCTGGCCAATAGTTTATGTAG:1 + chr3L 25798539 3' - blood 7020 2 71.29 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCACCTTGTTGCTTTGTTTTTTGACCAGATCCATGGATACCAAACGTTGAAGCGAGAAAACAAGCAATAAATACGTCAG:1 - chr3L 9037305 3' + 1360 3363 1 78.22 CGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCGTGCCTCGCGGAATATATATATAAATATAAAAACTATATAAAAGGCAAATATTCATGCGGAAAATATAC:1 + chr3R 30997806 3' + Cr1a 132 1 75.25 AAATATTTAACAATTTTTTTTTTGTTCTCTGTAGTGTGGGTGGACAGGAAACCAGGAGGAGCTGGGAGAAAAACAGGATCTCTGACCGGAGCCAAGACCAG:1 - chr3R 24982781 3' - Tc1 53 1 65.35 TGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGAGTTTTGAGTTTTGAGTTTTGAGTTTGAGTGTGTGGCATGCAAGAGTTTTACTTA:1 - chrX 9181770 3' - 297 6507 1 59.41 ACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGCTCCTCGATGCGCTTCATGTAATCCGGATCCTTCCAGCCAAATTGGGGGGCCAAGGAAA:1 + chr2R 19026406 3' + R1A1-element 5052 1 64.36 ATGCGTGCTAGGTCGATGAGATGAGCCGACCAACAGGCTGCAAACGCTTAATGAAATCCGGCAAATATTTTTCCGTGCCATTTCCATTGCCAGCAATCAAT:1 - chr2R 19990656 3' - Chouto 6036 1 57.43 GTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTATGGAGGGAAACATTAACGATAACAGATGAACATTAAGGGTCTACTCTTAGGTATTGCTACATGAAAATATAAAT:1 - chr3R 18750068 3' - G6 1988 2 59.41 GCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCTCGCATCCTTAACGCGCGTCCTTCTAGGCGGGCATTTAAATAATGTTTTGTGTGAAAACCGAAAAAACCAAAAAAAT:1 - chr3L 10379626 3' - gypsy2 337 1 79.21 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTCGTACCGTTCGCTTT:3 - chr3R 14913131 3' - blood 7023 2 68.32 TATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTATTTGCTCATGTCACGGCCCTCAAACGCAATGCAATGAAATGGAAATGGTCCGCCCCTGCTGCCT:1 + chr3L 14592285 3' - Tc1-2 1265 1 69.31 AACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTCAAAAACCAACAACCCCCAAGATCAATGTATTACCCCATTGCTTCGGGGACGCACCCAG:1 - chr3R 6882389 3' + Doc2-element 4355 1 56.44 CAAATAATAAAAACATCATCTATTATTATACAACATTTTCCTATACTAATATTTTTACCACAATAATTAATTTCATTACGGCTTGGGGTGGTAAAACTAAT:1 - chrX 14523040 3' + jockey 4989 1 77.23 TGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATATCAACGCTAATCGGATCAATTCGTGAATAGATCGAGTGTGTATTTGAA:1 - chr3L 5057423 3' + R1A1-element 260 1 55.45 ACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTTCTATTGTCAGGACGAAGGTATCGCAGAACGCAGCCATC:1 - chr3R 25635667 3' + GATE 295 1 61.39 CGTGGCTGCATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTGAAATTAAAAAGAAGATCCCAAAAGAGCAGAAGAATAGCTAGTAGGAAGATATACTTTCCAACGGGTG:1 - chr2L 9077339 3' - hopper2 1420 1 56.44 TTTTCGTTTGACAACCGAGCTTCCCGTTAATAAACCATCCAACCCAAAATGCCCCACACTCCGCGGCCAACCATTCCAGAGTCATTTCAAACTCGATTTCA:1 - chr2R 16505891 3' + Circe 291 1 66.34 CAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGGAAGCTTCAGGAGACGTTGCAGGTGAGTATTTGGTAGAAGGGACGCATCGTTGATGGTTCTGCCGGCCAGTGTA:1 + chrX 3814434 3' - TAHRE 10092 2 59.41 AAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCATTATCGCTTTCAAGAAATGTTAAAATCCATTTCGCCT:1 + chr2L 6653570 3' + hobo 260 1 62.38 TGTTTTCTCTTTTTTTTTGTTATGCTTTGGTCTGAGTGCAGCAAAAGGAGAGCGCAAAATTAAAAAAAAAA:1 + chrX 3012986 3' - gypsy7 5003 1 54.93 AAAATGTGAAACTCATAGCGGCCACTCCAACGGGCAGTGTTTGTAGCCTGTCCAAATGTACATTTCTCATATCTCCTCGGCGTCCTCGTCTGCTGGTTCTT:1 - chr2R 23329092 3' - gypsy6 125 2 59.41 ATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATTTGAACATAAATTCCAATGAACGAAACAAAACCAAA:1 + chr3L 5319267 3' + Juan 4124 1 64.36 CGATTNATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGC:1 + chr2L 10635293 3' - roo 54 2 77.23 TATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATATATGTATCCATACAATTTCATGCGGAATTTGTGCTAAACACGTGAACGGGCCTCGAGGCGTGTGA:1 - chr2R 22740001 3' - Transpac 4919 1 77.23 AAACTTATCGACTGATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCATAGGCTACCTCCCCTTAGAAGGAGGCGATTCAC:1 - chrX 21088190 3' + mdg3 5379 2 66.34 TTAATGGCATTGGATACCATTTTGGCAGAATATTCAGGGGTTTTTTGAATGTCCTTGTATGTTTTTCACGTTTATTATTTTAAATAATCGATTTTCGGCCA:1 - chr3R 24473101 3' - HB 460 1 66.34 AATTTTTACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGAGGATGAGGACTTCAAGAAGGAGACCATCGACTACGACAGCTACGAGGATG:1 - chr2L 5041385 3' - transib2 23 1 57.43 TTGAGGAGTCATAAAACTCCCCAAAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCGATGCTGAGCGCGGCGAGGAAACGGACGGAACAGACGCCAGCGC:1 + chr3R 3525265 3' + gypsy8 4651 1 57.43 TGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGACTTTGCGGTTTTCAAAAATTTGTGTTTAAATTGTCACTCGTGTAATTC:1 + chrX 5151427 3' - Quasimodo 7048 2 51.49 GTCGGGAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTGGGAGGAGCAGCGAAGGCAACGAAGAGAAGCACCCGGC:1 - chr3L 20855783 3' + flea 4826 1 62.38 AAATTTTTCTTTAAATTTTAAACTTAAATTGCAGAACGTTGCCACTGCAATTAAATGCAACGATTTTATTGAGCTCGCATATGATGCTTAAACTTGCATTT:1 - chr2L 5085714 3' - 1360 3044 1 82.18 AACACACACACACAAACATTTTCGCTGCAAAGTACATTTTCATTTTCATTTTCGCTACCGTTTTTGTTGATTTGGGAACTGGTTTTCTTCTGTTTTGCCGG:1 - chrX 17879589 3' + accord 184 2 71.29 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAAACAACATATGCATATTTAAACTTTAAACTTTAAACTTTATAT:1 - chr3L 16542994 3' - copia 31 2 61.39 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCCTCCACTCTCTAATTGGAAGATGTCTTCACCAGACCTCGTCGCCTGTCGCC:1 - chr3R 14079034 3' + HMS-Beagle 223 2 56.44 GTATTGAATTGGGAATTCGGTAGTGTTGGTGGGGGTGAAAATAGAAATTGCTTTCAAATTTGCTTACATTTTTTATATTTTCGAGCTTTGTTGACTGTTGT:1 + chr3R 9974321 3' - I-element 4983 1 75.25 ACTGACTACTTCGGCGTACAATATTATAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATATGGCAGTTGGAGTGACAGAATCCAGGTGAAA:1 + chrX 11813005 3' - diver2 4589 2 66.34 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATGTAACCAAACT:1 - chrX 13354238 3' + pogo 2089 1 68.32 TCAGAGGCCAAAAACAAAAAAAGCCATACTAAATATATTTTAAAACTTCTTTTCTACACTGCAGCCCTGTTGCCGCACACCTACTCTTCCAATGCCCCCCT:1 - chr3L 3435030 3' + Transib5 14 1 68.32 AGTGTTTAATTGTGTGTTCGTTTTTTTTCTTGTTGCCAGCTGAGTTGAATATTCAAAACGGTTATGATTCATTTAGTTAGTTTAAAAGCGTTGCATATTTT:1 - chrX 5477973 3' - invader3 5029 1 70.30 TTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTGCGGAGGCTATCGATGGAGGAGGCTATGGTCACGCGTCATCGATAAGCAGCAGTGCTGGCGG:1 + chr3L 22071889 3' - R1A1-element 17 1 72.28 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGTCATTACAATTATTATTACATATTAACATTGGTAGCATTCTTACATACTTAATACATTATTACAGTAATTT:1 + chr3R 13824447 3' + roo 405 1 75.25 ATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGACTGATTAAAAACTTATCGAAGCCAAAGCTCTCAGGTATTA:1 + chr3L 3485030 3' - diver 5926 2 63.37 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTG:1 - chrX 17049528 3' - Stalker2 13 2 66.34 TATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATAGTTAACACCTCTGCGTAAGTGCATATTAAACGTAAACTAAAAGTAC:1 + chrX 4009325 3' + Stalker2 8 2 53.47 CGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAACAACAAAAGGCGAACGGGGGAAAGCCAAAGAAAAAC:1 - chrX 5082828 3' - jockey 255 1 68.00 TACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCGCATGGAGCGCCCTGCGAAAAAACAATGCCCCACTAGCGATACTACTAC:1 - chr3L 8451620 3' + F-element 4320 1 58.70 ATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACAT:1 - chr2R 4260437 3' - micropia 5138 2 79.21 ATAACCGATTTGCCATTTTAGCCGATTTAGACGATCTACCAAATTCTGACAAAGACATTAAGAAGACCCCGACCCGCCAAGATTCTCATAGAGAATCGCTC:1 + chrX 10136629 3' + Fw2 135 1 73.27 CTTTAAGATCGGCAGAGAGTCAAGATCACAGATAACAGGCTAAAAGCGGCATAGTCGACTCAAACCTGCTGGATCATGGCCATATTAAAATGTGATCGAAG:1 - chr3L 26803717 3' - Cr1a 4240 1 61.39 TAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCATAGCTCCATGGAGAGCGTGCCCATCAGGATGCCCTTGCAGTGGGCGTACGGCGTTGTGGC:1 - chr3R 20322295 3' + Doc3-element 357 1 58.42 CCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTACCTCCTGAGCTGGTCGTTCGCAGGAAAG:1 + chr3L 21557431 3' - F-element 466 1 64.86 TTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGACGCGCTTAAGACTTAATAAATTCCCACACAACCCGATTTTGAACCTACTATAAACATGTGTAAAATAC:1 - chr2L 18516011 3' - Stalker3T 258 1 61.39 AAACAATAATAATAATATAGTAATAATAATACCAGATTAATGTTGTATGTATATATGTATAAATA:1 - chr2R 17561628 3' + invader3 5044 1 87.69 ATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTT:1 - chr3R 178122 3' - BS 42 1 69.31 AGACGGGACTCTCAACATCACCACGGATAACCTTACAAATAACAAACTGTTTCCCTCCAATTTAGTTTACGCCTCAGCATATTCTGAAGATCAGTTTATTA:1 + chr3R 22489101 3' - Cr1a 4064 1 64.36 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGAACCACCTGGGCCAAAATTGAAAGCACAGTAAATGCCTGCCATCGACA:2 + chrX 8223274 3' - jockey 4707 1 52.48 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTAAATAGTATTTAGTGCGTATCTCTCAGATAAGAAAGATGTTAAAC:1 + chr3L 1452447 3' + 412 7530 2 44.55 ATAAAACAAGAGCAGCCAAAAATGATTTGATTGCGTTGTGATAGAATGATACATACTAAATGCGATGGTTTTAATGGTACTCGACGGTTTAGCTGCTCCTT:1 + chr3R 21913035 3' + Cr1a 483 1 57.43 AGACGAGATGCAACTCTTTATCAGCTGCACCCGGAAAGTTTTGGCATTCTCCGTCGAAGCCCAAACCAGCCAAGCCAGGCCCAAGAGCGAATCAAACAA:1 + chr3R 18920461 3' + Gypsy12A_LTR 128 1 58.59 AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAACAGTTCAGGTGAGTCAAGTTTCAAGCACAAATATAATGAAGACGAGAAAACAACAGCCAGCCATGTTTGTTATTAAAAG:1 - chr3L 15037139 3' + Doc2-element 233 3 59.41 AACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTTGGAAACCTAATTATTACATGGGTAATGCGATATCCCTCCTTTCCCATCGTCCCCGCCAGA:1 - chr3L 22449633 3' + gypsy5 36 2 65.35 GGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAAC:1 + chr2R 2248340 3' - invader3 5238 2 74.26 TAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGTCCTAGTCCTAGCCCACGTATGCTCCATTTCATTTGTGCTCGATCTAGTTACAAAATCCAATGGCAAAA:1 - chr2L 13446385 3' + G2 2893 1 68.32 ACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAC:1 - chr3R 25400123 3' + F-element 402 1 55.45 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCA:1 + chr3L 5691277 3' + P-element 2875 1 44.64 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCAAATAACTTGATTATGATTTCTTGATAATTATTTGGAGCCACTTCCATTCACGGAACTCTTACTGTGAATT:1 - chr2R 22113405 3' - mdg1 7043 2 74.26 CTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGGTACCTAGGGAGTTGGTTCCTGAAATACTTTCTCGTTCTCCTGATAGTTC:1 + chr2R 1717334 3' - Stalker4 170 6 53.47 TTCGTTGGTGGCTTGAATATGATGCAATTCGGACGTTGTATGCACCATTATTATCCGATCTTCATTTCGAATTGGCACCGGAATAAGCTTGAACAATTTGG:1 - chr3R 19449128 3' - Ivk 4992 1 74.26 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGTTCGATTC:1 + chr2L 6177239 3' + pogo 2069 1 61.39 TTAATNTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGA:1 + chr2L 20840480 3' - Transpac 4936 2 59.42 CCAAATGGTGATTATAAAAAATCAGTTGAACTACTTCAAAACTCTATCTTTTGCTAGAATTAACATAACAGAACGTAAATAGAACAACAGAATGGTGGTGA:1 - chr2L 13084059 3' - S2 442 1 56.44 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAATCCTTCGATTGGAAGTGCCTAGCTCTAAAATGTAATTTGATTTGCGTGAGATA:1 + chr3R 21340594 3' + jockey 4975 1 46.53 ACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATCGTTTTACTCTAAAAGTAACGGAAAATTGCAATGTTGGAATTTACTGCCTTTCTAGAATGTTTGCATCGGGGGT:1 + chr3L 24723748 3' - INE-1 12 1 66.34 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCAATTTTTAGTGATTACTCCAAGCTTAAA:1 - chr2R 11540209 3' - Transpac 45 2 70.30 GGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTGAGCGAATTGCATGCAATAAACTTTATAATTCAATTGTGGTTCTGCAAGTCGTGTGTCGTGTCGAAGGCAAAG:1 + chr2L 4725494 3' - Juan 180 1 76.24 TTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGTGAACATAAAATTCAGAATCAACTGAAG:1 - chrX 12298308 3' - G2 148 1 72.28 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCG:1 + chr2L 3621136 3' + 297 6929 2 73.27 GTTCCCTGGGTACCGACTATTACGCATATTACACATAAATAATTATCAACATATTAACACTAAATATTAAAACGTACGAGCGTGTTTATGCATACACCACA:1 - chr2R 23624607 3' + 1360 2913 1 58.42 TGAGCACCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACACTGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACAGCCTTGACTCGATATTAAAGTTCTGGAATTTTTAACAATGA:1 - chrX 19609238 3' - diver2 123 2 56.44 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCGCCTCGAATCGAGGTTATTTACTGGGAACGG:1 + chr2L 6644332 3' - hobo 42 1 66.00 GCAATATGTGCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTATTGTCGTCATCATCATCATCATCATCATCATTTTCATTTTCATCATCGCCGGCAGTCAAG:1 + chrX 17614806 3' - R1A1-element 14 1 65.35 CAGTTNGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTATGGG:1 - chrX 22398526 3' + Gypsy6A_LTR 165 1 68.00 CCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGACTTCATCATGAACAAAGCTGGCGCCTCGGGCGCAAATTTCAAT:1 - chr2L 11747936 3' + HMS-Beagle2 6796 1 56.44 CGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGAGCTTTATGGGTATTGTA:1 + chr2L 3245028 3' - rover 7 2 73.27 GGGAGCCATCTTGGTCCGCTGCCTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCACTTAGTACTCTTGCGTAATCATTTAAAAAAATCATAAAAAGTCGT:1 + chr2L 22718851 3' + Q-element 496 2 60.00 ACTGCTGCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGATGCTAGTAAGTGTGTCGCCGCCTAGTTCGATTGTGTTCTAAACGCTTTCCGAATTCCCACAATTTCGGCATC:1 - chr2R 21532795 3' - TART-A 131 4 51.49 CCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACAAGCCAAGTGAAAGGCGACGGAGCGCAGCG:1 - chr2R 16738578 3' + F-element 460 1 69.39 ATGTAGCCACGCCCACTCTAACGCCCGCAAACCGCCAGAAACTGATCGCCAAAGCAGCAGGCTCCACGCAAAAGATTCCACACATTCCCCACAAATGGGGC:1 + chrX 21518949 3' + INE-1 208 1 63.37 AGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATACTGATCGAAAAAAAGCACTCTGACTCAGAAATCCACTCCGTTTTTGAGTATTCTCAGTTGCTCTCCATTCGC:1 + chr2L 21331602 3' - 1360 3191 1 68.32 AAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAAAGAGAGATCTACCAGCTGACAAAGGCCAGCCATGTCAACATAGTTGAGCTCTACGGCACATCGAGG:1 - chr3R 22733537 3' + R2-element 491 1 70.30 TCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:3 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 4897 1 61.39 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAAATTGACTTAAATCGATGTTTACAAAAACTTAAAGTT:1 + chr3R 22167350 3' - P-element 85 1 39.60 GAAAGAGAGAAATTTTGGCCGTCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTCGCAACGTGGCATAATCCGCAAATTCATTCATGTGCGGAT:1 + chr3R 11894422 3' + 1360 3316 1 42.57 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGGCGCCGGTGCCATGGCAGCACCTAGGGGCCG:1 + chr3R 11833026 3' + roo 403 1 62.82 AAATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGTAACTAAGCCGAACTCGAGGATAGACCATATTACACAAGATAATTAAAGGCATAAATTAACTTA:1 - chr2L 6461209 3' + G5 4605 1 55.45 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGAAAAAATGGAAAAGGATTTTTGCGCGGCCTTTTTACATATTTTTCCGTTCGGGTCAG:1 + chr3R 11097598 3' - mdg1 7056 2 62.38 GTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTCATAAATTAGTTGGCAGCTTGGTTTCAAGTTGCATGCCGCAAATTGCCTTGCACCCCG:1 - chr3R 20239754 3' - I-element 5061 1 61.39 CCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAACTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTAACCATGAGTGATCCACTCAATGGGTAGATCAAAATTGGGT:1 + chr3R 4562860 3' + Quasimodo 6944 2 73.03 ATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCCGAAAATCGTCTTCATCAAAATTGTCATTGTCGTCATCGGCATCCAACAGTGTTT:1 + chrX 13206792 3' + 1360 3153 1 59.41 GCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTG:1 - chr3R 178128 3' - BS 48 1 75.25 AATCAATAAACTGTAATTATTTACTTGTACAAGGGCAAAACTATTAATATCCGTTCCTCGTATAACTGAAGGATTGGTGGTCACCGATGTGGTCGAGGTCG:1 - chr2L 19545012 3' + HMS-Beagle2 308 2 76.24 TCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAACTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAATTTATGACAATTTAAAGATTTTGCTAACAATCTGGATATTTCAATTTGAA:1 + chr3L 9420173 3' + Tabor 372 2 55.45 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAG:1 - chr3L 17624183 3' + roo 9020 2 73.27 AAAATGCAGCTAAGTTAAATTTGTTCAATCAGGCAGCAGGCAGCAGGCAGCGCGCTGCAACAACTTAAAGCCCGTGGGCGATTCACGCTCAACTGGTCCAA:1 - chr3R 31341796 3' - pogo 2040 1 66.34 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAAGGA:1 + chrX 1399952 3' + P-element 2880 2 72.28 AGGGTAGGCGCGAGCACGGATGCGGGGCAGTCAGTTGGACAGCAAGATCGCGAGTGGCAATGCAGAAGATTTCGTATTCAAAAACGTTATCAAGTGGCATA:1 + chr2R 8656961 3' + gypsy8 349 1 56.44 GCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCTGACATCTGATAACCATCTGTACAACCCAGGTCTAAAAAGAGTTTTCCTTCACTTTGTGG:1 - chr2L 14697266 3' - P-element 2537 1 38.61 TGGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTATGTATAGTTCTGGTACTGGCTGTGCTCCGATTACCATATTCAACTGGCCCTTCCTGTTGGCGATTTGTAGTTC:1 + chr2R 4525864 3' + INE-1 569 1 64.36 GAGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTGTTATTGTTATGACCTTTTGCGTTATTTTTTTGTGTTTTTTGCGTCGCTTAATAAAACCAGATTTGAT:1 + chr3L 17668286 3' - accord 7031 2 73.27 TGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGAAAAAATTAACAGAATTTATAAGAAAAGTTTGCCTGCTACCGAAAACTTTTTC:1 + chr3L 18557713 3' + P-element 491 1 56.44 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCTCTTTATGTATGCCTGTATGTGTGTGTGTGTTTGATTGTGTGTGTGTGAGTGCC:1 - chrX 11600812 3' - jockey 4692 1 45.45 CTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATTGACGCAGGAAATGGAGCGAAGAGGGCATAAACAGGCCAAGTCGATGCACCGATAGA:1 + chrX 9860138 3' + G3 4455 1 61.39 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCAATTTCTAAAATCTATTTTAAATCCGTTAAAAGTTTTGTAAAGTTAAAAATCTTC:1 - chr2L 8640801 3' - roo 20 2 58.42 CATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCCCGTCTTTCTCTGTCATTTATGTTTGCCAACCGCCCAGCGACCACCTCCGTTTTTTT:1 - chr2R 12071127 3' + F-element 327 1 58.42 AGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGCTGACACCTTTGTAATTGTCAACCATTTGGCA:1 - chr2L 21118720 3' - I-element 5143 1 68.32 TTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGCAAAAGTAAAGACGACACTTTCGTGACTGGCTGGCCAGGCAGGCAGGCGGCAATGTTTGTTTGTTT:1 + chr2L 3428560 3' - I-element 5169 1 69.15 AAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATTTAGATCTCACTCTCATCGAGTGTAGCTTAAGACTGCCTTATTACAAATCGTAACTCTTTTTTCTCTG:1 + chr3L 7173889 3' - gypsy5 324 2 78.22 TCATATCGTGCAGTCTTAAGCATCGCTTGCATTCTGCAGTTAATTAAGCCACGTTGCGAAATCGAGAGACAGGAAATCGATGACCAGGACACGCTCATTTG:1 + chr3L 23019566 3' - Doc3-element 399 1 57.43 CTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTCAACTACCTTGGAACACCTTTTGGTTGGCCACTCGTCCAATCCATGGACCCTCTTGAA:1 - chr3L 956068 3' + Max-element 8312 2 60.40 GTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCCTGAACATCGAAAGTATTCCACGTCGATATCTTCTGCAGATGAATGGGATCGTTGAAGTCGTCCAGC:1 + chr3R 20761614 3' - BS 4698 1 74.26 AAAAANAAAAACAAAAAAAAAAATAAATAAAAAGAGTTTAATTTTTTCAGGCCTGAAGCTTGAGAATCGGCGACAGGTCGAAGGGAAAAAGAAAAGCTCTG:1 + chr2L 4076525 3' - hopper 146 107 74.26 TTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTTAATAAGATGCATAATTAAATACAACCATGATCTCAGCGCCCCAATTTAAGA:1 + chrX 2125106 3' + G6 1988 2 54.00 ATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGGCCGGGACGGGTCTTTGCCTAATTATGCACTCAAAGCTTAGT:1 - chr2R 18039984 3' - G5 4689 1 54.88 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATTTATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGGGCTTTTGTTATTATCATCTAATACAAA:1 + chr2L 22545016 3' - roo 49 2 77.23 CGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATCGGTGAAAAATCGAGGAAAACTCCTGTCGGATGGCAGTGGCCATCGGCGGAAACGAA:1 - chr2R 18075438 3' + micropia 237 2 59.41 AGGTAACCTTAGGCCATCCTTCAGTTGAGGGAACAAAGCAGTTTGCATTTGTCTCCGCATGAAAGGATTAATGACAGGCAACAAACAAGCAAACCGAAAT:1 - 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chr2R 16583520 3' - 1360 154 1 65.35 GCCTTCAAAGCGAGCAAACATTTGTTGGAAGCTGGGTGGTGCAGGGCTTGCTGATAGAGGTGGCCGGTCTGGATTTGGTGGCTTGCTCTGCCTTTGCCTTT:1 - chr2R 5893688 3' - G2 168 1 64.36 TTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGAT:1 + chr2R 8157235 3' + Transpac 5180 2 74.26 TCGAATTAGCTATTGTTTACATATTTATATGTATGTTAATAATAATTTATATGTAATAATCGGTACCCTAAAACAACACGAGACGACGCTGGTCATGTTCT:1 - chr2R 11890681 3' - 1360 2975 1 67.33 TGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGCCTCTTTATTCCACTGACTTATTCGCTGCAGTCAAAGT:1 + chr3L 21908981 3' + roo 401 1 71.29 AGAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTCTTCCGAAGCAGCGCTCACGGCAGAATGCTTCTAATTCGCCATGTATTTTAGCCGATTTTCACTGTGGC:1 + chr3R 7478531 3' - gypsy4 6756 2 59.41 GCAACTGCTGCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGATGCTAGTAAGTGTGTCGCATGCTCTTTCTCTCTCGCTTACACTCGCCTACTGTCTGCCTGGATGATGGC:1 + chr3L 19895627 3' - TART-A 134 2 59.41 AGATTGACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTCTATT:1 + chrX 158240 3' - INE-1 97 1 75.25 AGAGCCACGCCAAAAAAATCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTAGAAGCGTGTTAGCTATTGTGTCCAATAATACGGACGGTTTCATAGGGC:1 - chr3R 22733031 3' - 1360 51 1 92.08 GGGGATGTATTCTCTTCAGATGTCCGAGTTGCAGTACCTTCAGTTTTATTGCCGTTTCTTTACCAAAGAGAGATTGTTTTCCATTTATAATTACGAAAAAC:1 - chr2R 3290562 3' - G5A 2680 1 79.21 AAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAAACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAA:1 - chr3L 24039756 3' + R2-element 131 1 66.34 GTTAGNGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGTGGGGGGGGAGCAGGGGGACAAAGGCATTTCGGTCGACCATGGTCCACATGGCAGAT:1 + chr3R 6501805 3' + invader1 3708 2 53.47 AGACTATTAGGATGGGATTCTAGCCTGTCGGAGGATACATCATACCCCGGAAGCATCTGTAAGTTCATCGATTCCCAGCCTCTCTCGAATTCTAATGAAGA:1 + chr2R 8037800 3' - jockey2 3097 1 42.57 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCAAAAGTAGCGGGTGAACCAAATGCAGTGGGGTGGTGAGAAGGTGGGGAGAGCGAGG:1 + chrX 13747433 3' - P-element 16 1 63.37 CGTCTCTGCTCGCTGCTTTGCGCTTGACTTCCCCAAGGCCATAGAGGCCGGCAACGGCGGCCATGCCACCAGGTGGGCCTCAGGCACACCTGCTCCGCCGA:1 + chrX 17976548 3' - G-element 463 1 71.29 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGC:1 - chr3L 13326691 3' - transib2 43 1 69.31 CGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGTACATACACGGTTAATATTCCTTGACTACACTGTATTTCGCTATTGACAAGCCTCGATAGAATGATTCCCTGGT:1 - chrX 22867297 3' + HMS-Beagle 246 1 77.23 AACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGACACCACGAAGTCCACCTCGTAGT:1 + chrX 2718724 3' + opus 213 2 77.23 GCCACTCCCCCAGGGAAGACACATCCGTTTCCCCACCCAACCTCTGGCTCCATCCGTCGTGTTGTTGTTGCGCCTGCGTAGCCAACAAGTTAGTCACATCG:1 - chr3R 19334572 3' + transib4 2357 1 75.25 TTAGANTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGGGGAAATCAAATATTCCATCGATGAATTTTGATGAATTTATAGAAAGAGTTA:1 - chr2L 11113963 3' - transib2 20 1 53.47 TGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTGGCGAGGAAACCGCAGCGGGGACGCTCATTCGGTTTAATTGTTATCATC:1 - chr3R 9182546 3' - Doc 4232 1 53.47 CCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACACTCTCAAAGGCCACAATACATGACCATATTATGTTAATTATTTGTGTA:1 + chr2L 18117434 3' + P-element 2751 1 56.44 CCCTCACCTTCAACTAACCCGCCCCTGACCCGCCCACTTTCCGCCAGCCCCCAAACCCCTCCATCTTCTTACCCAAAAAAAAAA:1 + chr3R 22002085 3' + Doc 330 1 71.43 CGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAACAAAATCCCGAACGTGTGACCAGAGAAACTGAA:1 - 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springer 7434 4 45.54 GGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATCAGCACTCCAAACATCCGACACAATCCGATG:1 + chr2L 21845058 3' - F-element 4452 1 69.31 TAAAGGGAGATGGATGGATGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTGTGGGTGCCCGGGCCTTGTGGGCAATTCACCTGACTAATTAATAACTAATAATGTGCAGTGC:1 + chrX 19037974 3' - transib4 2430 1 67.33 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAAGCACAGTTAAATGCAATGCATTTAAGG:1 - chrX 5104627 3' + roo 358 2 78.22 CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTATATACCTTCGCACAGAGGCACCGAAAGCACAAAGACCTACGGAAAACGACAGCCAAAA:1 + chr2L 9856318 3' - HMS-Beagle 6810 2 63.37 GTCCAAACTCCAAGAAGTGATTCAGCCATTCACCTCGGAGGTCATCTAGACAGAAGAATAGCTTGGCTGGCTGGCTGGCAAGGCAACTAATAAACTTTTTG:2 - chr3R 30331367 3' + Doc4-element 2401 1 66.34 TGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAG:1 - chr2L 20840424 3' + Transpac 5200 2 56.44 CGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGATGATCGCAAAATATAGCTCGAGAGCAAGGGGAGATTTGGTACACTGAGGAAATTAGGG:1 - chr3R 11369041 3' - opus 457 2 67.33 CTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAAAATGCATTGAAAT:2 + chr3R 20495796 3' - Juan 4109 1 63.37 CCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAGTCCTTCGGGTATTTACGCTTTTGTTGTTGGCAAA:1 + chr2R 21421121 3' - gypsy6 7417 3 77.23 CTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATATATGTACGTATTTACTTAGACTTTTATCTTTATGGGTAGTTCACAAACAACCCTTCGCTACCCG:1 + chr3R 30450106 3' - 1360 3245 1 64.36 AGCTTCCAACGGGGGGAGGATGTTGGGTATGGAACTCCACTAAGGAGGTTGGCAAAACGTCGAAAACAAGAAATCAGAAAATCAGAAGTAGCTGCGATTCT:1 - chr3R 20367286 3' + diver2 4513 1 72.28 GAAAGATGCAGCATTTCCCCAGGAGGAGTGCCCGGCTGAACGGAGGGGGAATAAGGATACGGATGTATCTGAGTGTGTTTGGTGTATGTGCCCAACTGGAT:1 - chr3R 5870067 3' + aurora-element 465 1 61.39 TACTANGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTCACCGACTCTCCACAATTCATATTTATAGTATACAAAACGTTTATGAACACT:1 - chr3R 24551090 3' - invader2 34 2 52.48 TCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTGGGCAGCAATTGCGAGTTGTAAACTGTAAATTAGCACGAAATGCATTATCGTCTATTTACAAAACATTTTGCA:1 - chr2L 14254229 3' - jockey 4603 1 76.24 TGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCTGCCCCAACGACACCCGAAAAAATTATCAAC:1 - chr3R 14494371 3' + X-element 396 1 69.31 ACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATTACACCTCCTTGGCAGAATCCCTCGCCCACATTGCCACATTCACTGACCAAGCAACACTTTTTGCAACCA:1 - chr2L 13038079 3' + mdg1 7246 2 75.25 AGCACNAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCG:1 - chr3R 26331657 3' - G-element 47 1 65.35 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCTCCTGGGAGACGTCGTTAAAGGCCCTGGAATTCAGGTTTACATACTGGATATTTGGCTGGCGG:1 + chr2R 20791839 3' + roo 397 1 66.34 CGCGAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCAATGCTGGATTGCTGGAACAGCCAGCTTGTTTGCTTGTTGATATTGTCAAAGTAAAC:1 - chrX 14717424 3' - Gypsy6A_LTR 98 1 54.46 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTGGAGGAACTGGTG:1 + chr2L 22227355 3' - F-element 45 1 60.40 TCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGGAGTAACTTGAACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAATACGAAAATAATGAAATTTCAA:1 - chr3L 13584026 3' + Dm88 120 2 80.20 CGCAAGGCAGCAGTGGAGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTCATTAACACAGTTCCGTACGTAGCCTAAGCCACACACACACATGTCCTAG:1 + chr3L 21921668 3' + flea 4870 1 56.44 CACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGATGGTGCGGACCTGAACATGTATCCAGATCTGCTGAACATTCCGAAGAGGATGCAGGACGTACAGGAAAG:1 + chr3R 31660897 3' + X-element 4404 1 77.55 GCTAANTAACGGGTATCTGATAGTAGGGGCACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTCTATGCTTTGTGCAATTTTTCTTTTAGTTTGTTGTCATT:1 + chr3L 1806762 3' + INE-1 546 1 79.21 CCTATAACCCACAACAATGAACCCCCGACCAATCTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCCCCACCCAAACATTTCTTTACAAAGCTAATAAAAT:1 + chr3L 14327929 3' + G-element 4200 1 79.21 CCAGGGGGCCTACCTCAACGAGCAGCCGGCAACGACAGAAATAACAACAACCATAGCCGAGTACAAATATCAAAGTGAGCAGCAGCCCCGGTAGAATATGT:1 + chr3R 9944671 3' - R1A1-element 4971 1 82.18 GTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGGCCGGTTTCGGTAGATCCATCCTAGATATGCAGA:1 - chr3R 29302391 3' - I-element 4923 1 66.34 TAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGTACTGCTTTTCGTCATTTCTCTTCCGATTGAAAGTTCGCCTGTTCTCTAACTGCAACGCTTCTATATAATTCCTATCG:1 + chr3L 25484457 3' + mariner2 544 1 78.22 GAAAAGTGCAGCTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAACGAGCAATCCACTACGATGCTGTACCAGCCTTTTGTTCTCCTGCTCCACAAGCTGGGCATTC:1 - chr2L 3500103 3' - Cr1a 269 1 64.36 GTTAGTGGTAGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGCTGACACGGTGATATGATTGTGATAACATTTTCAAAAAAGTTTTGGGTGGTCGGCCGAGATTCG:1 - chr3L 26743309 3' - Q-element 225 2 81.00 CAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGGCTTGTCAGCACTCAAAATATCTCATCATGCGGAATCCACAGCCACTTCAGCTGTGCCAA:1 - chr3R 13515445 3' + Ivk 251 1 66.34 ATATTATTGTTATTATTGTTAATTTTTATTTTTCACGCTACTAAACTTGAATAATTTTATTTTCAGACGACGCAAATCTTCACGGTTTTGCAAAGTTTGTT:1 - chr2L 7724267 3' - mdg1 32 2 80.20 ATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAATGATTTGGGCGGTGGCAAAAGTATTTAGGCATCACATTTAATTAGTTGTGGAGTGGGGAAGTG:1 - chr2R 11738212 3' + Tc1-2 157 1 77.78 TATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTACTTAGAAGCACTTTAACCTTGTATTTTTATATTTTGCCCCGCTAATATAATCATACG:1 + chr2R 11777321 3' - hopper 1079 1 64.36 TAGCCACCTCAAAGTCCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGGTCATATATACAACAAAAAAAAGCATTTCATCCGTAAATGAAGAGCAGCACTTGTAG:1 - chr2R 16683601 3' + Tc1-2 1157 1 64.36 CTTGATCAGGATTAATAGCCGAATCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTCAAGATCTGTAGCCTATTCTCTTGTTTTCCTCTTCAATTCCTC:1 - chrX 22492826 3' + INE-1 89 1 59.41 ATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACAAGAGACCAGACCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAATTTGGGTGCTGTCCGACAAGATGCCGACATA:1 + chr2L 15037613 3' + invader4 346 1 69.31 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGAGAGGGTTTCGAAAACACTCT:1 - chr3L 2804852 3' + hobo 2899 1 75.58 GTCTATTATATATTATATTATATACTTATGTAAATATTTAAGTTGCATATGAAATCTGAACGTTCTGCATGTCTCCGATAGAGGCAGTACCAAA:1 - chr3R 10920934 3' - gypsy11 4241 2 71.28 TCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTCCGTTTGCCCCCCCATAACCCGCTGATTCCACTTTCAGATATATTTATGT:1 - chrX 10266553 3' + FB 970 2 60.40 CATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCATTTTTTGGCGGCTTTTGGGCCGAATTTTGTTTGTTTGCTCGTAAAA:1 + chr3L 5185785 3' + 412 7254 2 54.46 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTGAATAGAAACTTACACTC:1 - chrX 17479556 3' - I-element 33 1 50.50 AACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTCCAAACCATTGATTAACATGATTATCAAACACAAGCACAAACTCCGATA:1 - chr3R 4656788 3' + I-element 157 1 54.46 GCGATGCGCTCTTTATTGAATATAAAATCAAACACAAAGCTCAGAATCGCCAAATTGGTCAAAACAAGTGGAAAATCACAAATTGTGGCCGAAACAACCGA:1 + chr3R 18874050 3' - gypsy6 7593 4 59.41 GTGGCGACAACATAAGTTCTCATCAACTACAACTACAAGTATTCTACCCTCTTTCTTCTTGCTAACCTCAAATTGCAGTAAGAATATTGGGCATGGAC:1 - chr3R 20393980 3' + Copia1_DM 4068 1 79.59 TGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTACCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCATTTTCTTTGGCCATCACCTTTCTTTCAT:1 + chr3L 26481188 3' + Cr1a 4180 1 71.29 GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGAATTCG:1 + chr3L 10464686 3' + invader3 5418 2 74.26 AGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGAATTACATGGAAAAATCGGCCATCAAAGCCAACAAAAATCTTCTGGCTTAAATA:1 + chr2R 15340662 3' + Stalker2 7539 2 54.08 CCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTACAGCTACAGCCACATAGAGCCGCACAAAGCCAGGACTCAGGACTCAC:1 + chrX 1591292 3' + R1A1-element 5155 1 56.44 CTGACGTGAATGGTTATTAATATAATACAAAACTATGTACGAAATCTCATAAAAGCGCGCAGCTCGAATTAAAAACGTTTTCTATTCCGTGGAAAGCGAAA:1 - chr3L 14205751 3' + Doc2-element 67 1 74.26 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTG:1 + chr2R 16928915 3' + blood 335 2 66.34 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTGCTTAAAAATGCTTACTTTATTTAGAAAGCACCCTCCGTTTTACAGCTAAAAACGTAAGTACTATCCCCAG:1 - 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R1A1-element 5091 1 63.37 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGAAAGGAAGGTTGTATGTAGCTTTGGGGCACCACCGATTAT:1 + chr2L 19144510 3' - jockey 4823 1 60.40 ACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCGTTGAGGTAGGCCTTCGGAGTTGGGGATACTGGGAAGCAGTGGGAGTTATGATAACATTCATTTGCCTGTAA:1 - chr3R 11264492 3' + R1A1-element 4945 1 62.38 TGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTACCTAAAAGTGATTTTTTTTCTATTATATTCGTTAACGTTGTACCAGTTGTACAAAAGGAAAT:1 - chr2L 21297368 3' - I-element 5184 1 76.24 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGTCATTACAATTATTATTACATATTAACATTGGTAGCATTCTTACATAC:1 + chr3R 13824424 3' + roo 9045 1 59.41 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGCCGTTTGTCGTTTACTGATTTTGTG:2 - chr3R 14832378 3' - blood 7020 2 68.32 CACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCGATCGTGGGAGG:1 + chr2R 4879032 3' - G-element 15 1 64.13 TTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATGTCAACTGACTTTTGGATTTAAGTGGTGTCAAAAAGTATGCTACCATAGATAGCGGTCATTTATTGCATACTTCTA:1 - chr3R 31270922 3' - jockey 7 1 39.60 CGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGCCGTTGGTCATATTGCAGCCAGAGTTGGAGT:1 + chr2R 19953080 3' - G-element 4194 1 68.32 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAGATTCTGATTCTGATTCCGATTCAGATTCAGATACAGATACGTATACGAATTCCGGATCTGA:1 - chrX 11006819 3' + roo 397 1 66.34 ATTCTAATGTCAATTTGGACCAAATCTCCGCTATTTCAATGATGGCTCCCTCTCGTTTTCTATTTTTATGTTTCATTGGCGTCTCAACTTTGTCACGTGTC:1 - chr2R 23255972 3' - Bari1 1297 1 68.32 AAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACGGCAACAGAAACAACAACAGTTCCCGGGGCGAGAACAATGCAG:1 - chrX 997078 3' + Doc 4460 1 57.43 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAG:1 + chr3R 22899236 3' + P-element 2857 1 42.86 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAAAATTTAATAACTTTTTGCGCTGTCGAACAG:1 + chr3L 776183 3' + 1360 3380 2 69.70 AACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTCTTTTTTATTCTAAGGAATAAGCACAATCATCGTTGGTCTTTCTCACTTTTCAATACCAGATCTAGCTGGTTTCA:1 + chrX 18569851 3' + INE-1 575 1 79.21 TAAGTTTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGCGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACTTTTTCAGTGCTGAAAAGTTTTTAGCTAAA:1 + chr3R 25931401 3' - roo 8679 2 65.35 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTGGCCACCACATTCGTGC:1 - chr3R 22352782 3' + 412 462 2 53.47 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGCTATCTATAGTGCTGCGTCCCAGGTACAGTGAACAATTGCGCCGGGGGGAAACCAATTT:1 + chr2R 10697125 3' + 297 379 2 64.36 AGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATACAAAATAATAATTTTTAAATACTTCCTTATACCTATGA:1 + chr3R 14007157 3' + Quasimodo 7231 2 61.39 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCTCCCTCTCTTCTGAGTCTCTCTTTCTGGCTG:1 - chr2L 222064 3' + P-element 2884 2 76.00 CCATGGCGCCTTAGATAACAAAATCTGCAGCAAAGTCAAGCCGAAATAACCATCTGTACCTCTTGCAGACACGCCCTCCTTCGCCATATCCCGCACACCTG:1 + chr2R 13718389 3' - roo 8764 2 78.22 GACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCATGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTGTACTCTATTGATTTTATCCTATATC:1 + chr3R 5027276 3' - Chouto 53 1 96.04 AATCGGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTTAAGCTTCTATCTCTGAGGAACTTTTAAATGTGTACAACATAAAACAAAGTATT:1 - chr3R 17569237 3' + diver2 475 1 56.44 CCATGGCAGGCTGGAGCGCCACAGAAACCGACGAAAAGTGGGCGACCAATGCAAAACCCCTGAAATGAACTCATCTAAACGAGAAATTCTATTTGGTGGA:1 - chr2R 20925899 3' + X-element 4418 1 78.00 CGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTTGCCTGGTTGTTTA:1 - chrX 17692566 3' - 3S18 5778 2 66.34 ATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCTCTCTTACAGGGGAAGAGGGTGATAAATCCACTTGACACAACTCGCGGCGAGCACAACAAAATAATTATTGATA:1 - chr3L 8700427 3' - gypsy3 328 2 61.39 GTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATGAAGAACAAATACCAGACCATAAGAATTATGCCGAGTCGCTTTTCCAGCTTCCCTCCGTTCAAGTGC:1 - chr3R 4365760 3' + INE-1 32 1 64.00 CCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGTAGCTTGCAAAATCTTGCCCATTATGTGATATGTGATCCTACGCCCATTACAGTGTTGTATTAATTA:1 + chr2L 2357025 3' - Tirant 409 1 65.35 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGACATTGATGAGCTCATTTTTAT:1 - chr2R 15368649 3' + roo 9033 1 68.32 ACTAAAAGTGGATGGATTGTTTATTAACCGGAAGCCCGGCTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGGGCTTTTGTAATAAGCTTATCGGCC:1 + chr3L 22059500 3' - Circe 322 1 70.33 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACA:1 - chr2L 22724109 3' - pogo 38 1 68.32 CCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATATTTGTTTGATTGGATGGAGTCTATAAAGCAATGGAGCTATGGAGCTA:1 + chrX 8128229 3' + F-element 277 1 53.47 AAATTCATCCAAATATCTCTAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCATCCTGATGGCACTTACA:1 + chr3R 21010778 3' - hopper 55 1 77.23 TTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATGAAAAGGAAATGGAAAAGCAAGTTCCAAGCACCAGGAGA:1 - chr3L 3476158 3' - Idefix 28 2 63.37 TGTACCATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGGAAATCGTCTTCTAGTACAACACCCCTAATTATTCACTTCGTCACATATTATCAC:1 + chr2L 13040341 3' + 1360 3154 1 64.36 GTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTAGAAGTACATAGGTGTACATATGTACATAGGAGA:1 - chr3R 17008740 3' - invader2 5102 2 67.33 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTGCCACATAGCTACTACCTCTCTGCTGTCG:1 - chr2R 21937493 3' + 412 7499 2 73.27 CACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATTGTTTTTTTCAGAATTTCCGGAGAAGCGACCGCAGCTTTTTACGGAACACTCGCGATACGAACCAGGAGATGTTTT:1 - chr3R 17238983 3' - Stalker2 7411 7 79.21 ATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATTCTTTTGATTTCAGCAGAAAGAATGGCAGTCGCCGCGGTGTCTGTTGCTCTTCCA:1 - chr2L 23176387 3' + invader1 28 2 54.46 CACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATGTCAACTGACTTTTGGATTTAAGTGGTGTCAAAAAGTATGCTACCATAGATAGCGGTCATTTATTGCAT:3 - chr3R 31270929 3' - jockey 14 1 39.60 TGTGCNCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGGAATATTTGCGTTCGCTTAATTTATTTAGTATGTGTGCGTTTGGGTTTTGGCTTCTTG:1 - chrX 7698244 3' - F-element 4311 1 62.00 GACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGTCCTCCACTACTGAAAACGGGCGCAGGCAGGGGAATAATGATTGATGTCGGCCTATACAC:1 + chr2R 20295267 3' - baggins 5367 1 65.35 CTACTATGATAAATCAGCGGAATTTGCAGTTACTGTAAATGGACACCCACGGTGGTTCCCGCAGGTGCAGCGTGCCGTGTGCATGTTGTCCAATAACAC:1 + chr3R 7532382 3' + gypsy9 62 2 57.58 AGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACATATTTGCATGTGGGTTATAATATCCGTTCTTTAAGGATATAATTTGTGGAAGAACAGAGCATTCCAAAATA:1 + chr2L 19087830 3' - opus 118 2 72.28 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAA:1 + chrX 2090295 3' + roo 9039 1 54.46 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTA:1 - chr3R 20140555 3' - jockey 30 1 59.41 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATT:1 - chr3R 10736030 3' + invader4 309 2 63.00 GGTGGNTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCCGGGCTAGCGAAATTGTTGTTTTTGTGGCCTAACTTGGAACCAACTACTCATGGGTGGGATAC:1 + chr3L 2797338 3' - I-element 179 1 58.42 TTTTTTTTCTTTTGCCTTTTCTGTGAGCGTGCGCACAGTTGAAATTATCGAAAAGCAAACGCGCGCATTTTCCGCTATTTGTTTAATTTATTAAAAAAAAA:1 + chrX 15655235 3' - Doc2-element 237 1 58.42 TCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTCCTACTTTGTCTGGTCCTTTAAAATTTCAATCCTGCTCACTTGCACATATCCCA:1 + chr2L 15138255 3' - accord 206 2 72.28 GTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGCACTTCAATGCTAATGTTGGCTTGGCAGCGACGTCTGTCGTCGACATT:1 - chr2L 19021463 3' + R1A1-element 5006 1 53.47 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACACTCATATGGAGTTGT:1 + chrX 22517692 3' + 1360 3387 2 56.98 AGGAAGACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAGCAATAAGGACACAAATAGAACTGGTTCTGTGTATAGGCCCTGCTCTTCATTT:1 + chr3L 14365032 3' + blood 7365 2 54.46 GTGTGGGCGTGACAGTTTTGTGCTGTTTGTGAACGTTAAAGTGGGCGTGGCGCAAACAAAATTACGCTGCGCGCCGAGAGCCGAAAAATGAAAACCAAAAG:1 + chrX 1080618 3' - INE-1 242 1 70.30 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGCAGCACCT:1 + chr3R 11833018 3' + roo 9045 1 61.54 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTC:1 - chrX 1399861 3' + P-element 2855 1 47.52 AATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAAAAAACACAACGACATTCTTGGATAAACACTTGGGTTGAAGATACCGCCCACGATATAATGTGATATG:1 + chr2L 9467959 3' + hobo 2706 1 74.26 ATTTTAAAAATGAATTTTAAAGATTTAGTAGTTCCCCTTTGAAAGAGTAGAATCTCTGGGTAAAAAAGTAGCATAGGTTGTGTTGAAAAACTGGATAAACA:1 - chr3L 17658983 3' - FB 664 2 62.38 GGGCAACGCCAGCAACAGCAATACCGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCAACGTGGGATTTCATAACAATAAGCA:1 + chr3R 2465785 3' + F-element 4288 1 79.21 GGCTGTACTCACGCCATACGATTAAACTAGCATAAGACGTAAACAAGTTAGTTAACGGGCGAACGATCTGAGTGTAGTCTCGAATGAATTTGCGGAAAA:1 - chr3R 3498376 3' - 3S18 207 2 56.57 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAACGGACCAGTTCCTTGAGAGCCTTCCGGTAGACGTGG:1 + chr2L 1353810 3' - I-element 1 1 78.22 CTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATAACGCACAAGATGCTGGCAGGGGAAATCTGGGAAATCTATCCGATCACGTTGCTT:1 + chr2L 10253491 3' + jockey 475 1 69.31 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCATGGTATCTGTATAAATAAACTAAAAGAGTGGGCGGCAGTCGATGTATCGCAACAAGACGGG:1 - chr3L 8763213 3' - jockey 27 1 57.43 GCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTTCTGGACAAATATGTTGCATATCTATTGAAAATGAATTTACATTTGTATACTCGTAAAAAATGGGGATGCGAAA:1 - chr3R 4804700 3' - P-element 2827 1 78.22 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGTGCTTAAATGCTATCTTAGTATACC:1 + chr2L 21293022 3' + roo 394 1 68.32 ATATTTGAAATCGATCTAGATCGGATTTAAGTCCAAATGGCACAAAGTGTCCTTGTGCTGTAGGCATAATTTAACATCTTCTCGTAATTTTATATGTTTCG:1 - chr3R 16539864 3' - Q-element 643 1 80.20 CAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGGCGTGCTAATAAACCCATTGAA:1 - chr3L 12956389 3' - blood 7331 1 78.22 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGTTCTTTGCATACAAAAATAATCAAT:1 + chr3R 14913202 3' + blood 7339 1 74.26 GGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTCTATGTTGTATTGGGTTAGTGTTTAGTGCATAATATAGTGCGCTCTAAGCCAATGTTATTACTTTAAGCGATT:1 - chr2R 7554152 3' - Idefix 91 2 64.36 GGATGAGCAGTTACCATCGTCCGATGAGATGGATAAAACCGATGCCCATCCTCCGCTTTGGTTCACGTGCAGGCAAAACCAAATCAACAAATGAAAACTAA:1 + chrX 7051974 3' - TART-A 12997 2 67.33 CTGAGCAGCCAAAAATGACTTCTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAACTGCGCAAGCAAACCACTTGGCCAGGGCTGAAAGGTGGCGAG:1 - chr3R 4283695 3' + Cr1a 490 1 59.57 GATGGATGGGTGGCGAAGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGTAGCAGCGATAGGGTGGGGGCGTTGGCATCCACGTGGGCGTGGCTGTCAACCGGGCA:1 + chr3R 22934223 3' - transib4 2422 1 60.40 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTCTGATTAGTTTAATTAAAGCGTATTTCAATAGCCCAGTGCGCAG:1 - chrX 10555391 3' - Tirant 11 2 68.32 TTATACTCACACACACACACACATATCCTTGGATACGTGTGTGTGTGTGTGAGTATAAATAAAATACCATATTCCCTGACATGAATATTTAACAATGCAAC:1 + chr3R 9101409 3' + Quasimodo 31 2 80.20 GGGTTNACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGGAACGCTCATTTATTTGTTGGTCTATCTATA:1 - chr3R 25303905 3' - I-element 48 1 65.35 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTA:1 - chr3R 6216824 3' - pogo 52 1 84.16 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCCGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATG:1 + chr4 490304 3' + pogo 2060 1 65.35 TAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTGTTGCCATCGACCAAATATAAGAAATGGAGAA:1 + chr3R 8969745 3' + Stalker2 3 2 72.28 ACCAANGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCACGCACACACACTTGCACTTCGATGGCTGTCTGCAAATGCTGCATAAA:1 + chr3R 14614906 3' + 1360 3366 1 56.44 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCATGGAGGGATTCGAAGCTGAACTTGGACTTGGTCTTGGCTTGGACCTGGACCTGGACC:1 - chr2L 14551421 3' - transib2 20 1 58.42 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTCAACTGCAAAGACTAAATTTAGAAGCACTGTGGATTCCAGAAAAAATATAAAAAAACCAA:1 - chrX 21657143 3' + 412 477 2 62.38 GTGTAATATATTATTCTATCCTCCGGGTAGGTCCGTTTACGTTTGCACATAAACAAGATTTTAAATAGTAGATTATATAACAAAATCTTGTAAGACTATA:1 + chr2L 14231007 3' - G5 4675 1 75.00 CCAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGAGCCACAAGGACCGCCCAAACTAACCAAGGCTCAGAAGAAGGCCGCCAAGAAAGAGGCCAGGCGACTGGCTATGAT:1 - chr3L 21209849 3' - Burdock 345 1 77.23 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTCATTGCATACTTTTTGGGGCGGCAA:1 - chr3L 16222782 3' - jockey 4988 1 75.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTAAAAACGTATTAAGATCTTTGGGATATTACAGCTGATGTTGGCGTT:2 - chrX 7413948 3' + pogo 2074 1 59.41 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTATTTTAACATTCTAAATTAGTTCTTTGGT:1 + chr2R 5267329 3' - pogo 45 1 77.23 TTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACATTTATCTTTTTGGATCCCCTGCTATCGTACTTTGTTCCCCACACTCACTTTTCAAT:1 - chr2L 8289722 3' + Tc1 181 1 60.40 TCAGATACCCCTTACACAGCTACCGAGTGTGGAATTTCGAAATGAAAACAAAATCAATTTTACATGTAGAATTTATACAGGGCAAAACCATTGGGATTCCA:1 + chr3L 19650763 3' - INE-1 544 1 63.37 ACACACACAAACACACACATTGCACACCAACAAACAGGGCCAAGCTCATGCGATGCACTCACGTAGAGAGAAAATGTTATTTTATAAATTTTTGGCGGTTG:1 + chr2R 13390487 3' + gypsy3 426 1 74.26 GACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTGTGGTGCTGAATGTGGCTAAGTAGCAATTGCGACGGCATTGAGGG:1 - chr3L 7948426 3' + accord 287 2 55.45 ACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAATCGCTGATAAGGCACCGGGATTAAACAGCGAACAACGTAACCGCATCAGCATGGCCGCTGCAAGTGGAGAACTG:1 - chrX 9608727 3' - accord2 7215 1 59.41 CTAGGTTGTCCGCATTCAGTCTGCTGCCAAGTACGGTTTCCAGAGAGCCACTGGATAATAGTAGCACTGGCTAACGGGAAAATCCTTTTTTGCGACTCATC:1 - chr3R 11495067 3' - Rt1c 5176 1 62.38 GATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTCAACGCGGGCCATTGATATATGGGCCTTAAG:1 - chrX 7973625 3' + invader1 3690 2 69.31 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCCCATTGCCCGAAAATATCCTGTTGCCGCAGACACTCAGTTTCCGATTGGGAACTCCGTTTTTGCGGTG:1 - chr2L 10080925 3' - mdg1 10 2 65.35 GGCAGCAATTCGAAACGATGACGTCCAAGAGCCGGGGCATATCAATCCAGTGCAACAGCTCCAGGGCGACAGTTGCTTCTCCTCCTCATCCATCCATCCAA:1 + chrX 16731132 3' - transib1 2118 1 64.36 TAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTCTAAAAAACAGTACACTTGTGTCATTAAAATAATGCATGGATCACTATGTGGTACGCGACTGTGACTGTTAACATAT:1 - chr3R 7541452 3' + Tc3 310 1 65.35 CAACTCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCTTATATGCAAAGGTCAGGTCGATAACTTAGAAACTCCTCTTC:1 - chr3L 19904275 3' + gypsy2 337 1 58.42 AAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTATGGCTCCGGAACTCTCCACCTACCTGCAATTCCCTCTCAAGTCGATGACATTCGGCTCTAACTTC:1 + chr3L 12512055 3' - Circe 416 1 52.04 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACAAATACACACAGCCGTGCATACGTTTAAATATATATTTATAAATATGCGTGCT:1 - chrX 9950811 3' - hobo 19 1 60.40 CTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCAGATCAACAAATTACAGTGGGAAACCACGATCCAAACAACAAGGACTTACACGATGCTCGATATACTACTGATA:1 - chr2L 23177311 3' - diver2 4889 2 76.24 ATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCTGACTCGCACACGCACACAGACAAAAGGCGCGAAAGAGATAGAAAGAG:1 + chrX 18050847 3' + F-element 4404 1 59.41 GTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCATTCATGGAAATCGGGAAAATGGTAGCAGAGTTTTGGAAGAGGCTCAAACGGATTTCAT:1 - 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chr2R 8145922 3' + P-element 2867 1 59.41 CTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAATCTACTGGAATGAGGAGGAAATATACAGAACCGCATCCGCTCCGCATAAATGTACCGAACCAAAACTATAAAA:1 - chr3R 1848445 3' - Cr1a 3992 1 52.48 CGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATCGTTAATAAATGCAATCGATTTCAGTTGATTAAGTTGAAAATGAAGCGCATAATTTGTTGTTTTAGCCAGCATG:1 - chrX 9721954 3' - Idefix 221 2 76.24 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGTGAAATGAAT:1 - chr3R 22675803 3' + 412 465 2 54.46 AGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGGTGTAATTAATATATTGTTTATAGTGTTCACCGATGATCGATAATCATCGTAC:1 + chr2L 20086974 3' - hopper 1159 2 70.30 TTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATT:1 - chr3R 1047989 3' + Stalker2 7603 2 66.34 TTTTTAAATCTTATTCTAAACTAACTAAAAATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCCTCACCACGTTGCGATCCTTACC:1 - chr2R 8223336 3' - Doc3-element 4658 1 77.23 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCATCTGATTACTGAATCCTTTACAGTTAGCTCG:1 + chr2R 21266487 3' + roo 396 1 61.11 CAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTATTCCATTAACAAATCCCACACAGACCCAAAACCACTAACG:1 - 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chr2R 11654763 3' - Tom1 75 1 71.29 CCCATTTTTTGCCCATGTTTTTTCGTCATAGTTAAACTTAGTTTTTTTCCAACTTTAGAATGCTGACCTTGGAATCTGCGATTTGACAATGACGTCATCCC:1 + chr2L 21209719 3' + FB 63 1 55.45 TAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGCTTGTTTTTCTTTTTTTGTCTCATTTTCATCTTGTTTTTCTCCTGGTTCTT:1 + chrX 5367522 3' + invader2 4909 2 63.37 CCGTTACTCATCTAGTGAGAATACGAATCATTTTTTTTTTTGGGATATCGGAATAGCTATTGTTATCCGGAGCGTCTGATGTGGAATCGCTGCCATAATCG:1 - chr3L 9608852 3' - INE-1 536 1 50.50 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTATTCGTCTCGCTCCTGGCTCCATCGTCTTGTACCGTCTC:1 - chr3R 27448495 3' + roo 9047 1 55.17 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATACTGAGTGCAATTATCCGCAGGACCAAAGGCA:1 + chr2R 13124459 3' + mdg1 378 2 69.31 GGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAATCTTTTTTAGAGACGGCCATTTATTGTTCCATTCTCGATGACATCACTGCGTATGC:1 + chr2L 17704209 3' - diver2 265 2 50.50 ACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCCCAATAAAACCAAAGATGATCCCATAAAATATGCCGTTAGC:1 - chr2R 17166836 3' + pogo 1996 1 59.41 ACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCACTTCACTTACTAGCTTAGATGTTATTTTTCCATTTGGCCACCTTAATTACATTCGTGGATG:1 - chr3R 8861480 3' - baggins 4972 1 37.62 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTGATGCCGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTTGTGTGCTGCGACAGGAAGGCGAGTAAGGGAATGACCTGC:1 - chr2L 12968511 3' - jockey 13 1 73.47 CTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAAC:1 - chrX 21087575 3' - mdg3 20 2 57.43 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTATCTGTATAAATAAACTAAAAGAGTGGGCGGCAGTCGATGTATCGCAACAAGACGGGCAGG:1 - chr3L 8763209 3' - jockey 23 1 61.39 CCGGTTTGGACCTCCCAAATACGTCACTTCCCCGACTATTCAGATATTCAAGCCAATCTACACTAGGCATCATGGCTGGATC:1 + chr2R 23913536 3' - 297 7 2 56.10 CCCCCAAACCTCCACGCCTCTAACGTTGTCGGACACCGAACCGGGAAGGCGAACAACTAGAGCACCGCTCGCAGCGAAGCGTGAAAAATGCTCGTATTTTA:1 + chr3L 17359368 3' + Tirant 8124 2 66.34 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGATATTGGATTGCCGGGCGGGCGGCTTAGTGTTTATTTT:1 - chr3R 16554810 3' + roo 405 1 76.92 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAGAAAATATTAAAGCAAAATCGGAAAATA:1 + chr3R 6216863 3' + pogo 2056 1 73.27 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTG:1 - chrX 17479573 3' - I-element 50 1 67.33 CTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGTAGGTATACTTTAGTATTAGTCCCTGTTGAGTCGATTCAAGTCAGTCAGTTCACTAGTTTAATTGAGCTTGGATAT:1 - chr4 419653 3' - Doc 4564 1 75.25 GGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGTGTGTATTCTCCTTAAAGTGCAAAATACATTTTTCGTGAAT:1 + chrX 3308416 3' - hobo 2622 1 59.41 TTTTGGTTTCGCTGACTCAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGGAAGAGAAGACGGCTAAAAAAAAAATTGGGGAAAAAAGTGGAATCTGCGAA:1 - chr2R 20455936 3' - F-element 491 1 47.52 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATGTAACCAAACTAGTTTG:1 - chrX 13354232 3' - pogo 6 1 74.26 AATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCATCGTGGGTTGATAGTTTTGCATCAGTGAC:1 - chr2L 22074573 3' + F-element 4292 1 75.25 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTT:1 + chr3L 23871315 3' - Doc 40 1 57.43 CAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGCAGTGACGAAATATGAAAA:1 + chrX 10343790 3' - F-element 358 1 79.21 CGTGGGCATAAACACACACACACACACACATACGCACACACAAACATTTATAGTTTGTGTGTCGCGCATATTATTAAGGACTCCATTTAAAGCTATTCTG:1 - chr2L 21965801 3' + G3 39 1 56.00 TCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTACATATATGAAGACTGGCACTTGAGCGGACAGAAGGAACGGCGGG:1 - chr2R 15892141 3' - gypsy 31 2 58.00 CTCGCTGTATGATGTCAATATTGTTCAATTGCTTTCTTGTACGGGCTTAAATGTTTCATATGCAACTT:1 - chr3L 25325876 3' - F-element 4307 1 66.18 GATGACTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGTCTGGCTGTCTGACTTCAACCCAAGCGAGACAGACAACAAAAAGCAA:1 + chr3L 16150776 3' + P-element 2865 1 54.74 CACTGGGAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCTTCTCTGCGCAACTCGAGTTAATAATCAAATTATTTTTTAT:1 - chr2R 15635016 3' + Idefix 179 2 60.40 GATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCCAGAACAACACGCAAAGTGGAAGACTAAGCAGAAGCGAGCGAAGAAGCCAAGTCGTCAAGTCTTCG:1 + chrX 10115064 3' + 1360 3178 1 66.00 ACGAAAACATTTTCATTCAAAAATACAAAGTTAAGTTTCTCGAACTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACAAATCGTCGAAATCTGAAAATGCTAGTGAAG:1 - chr2R 13910196 3' + X-element 158 1 69.31 GGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGCCTGGGTAAAATATTCAGTTACCCGGATTAAGTGGATTACCATTCAGCAAGTTGCATTGT:1 - 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F-element 4546 1 64.04 TCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCGCGAAAATGTCAACAAATTGT:1 - chrX 1101168 3' - invader1 203 2 79.21 GTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGATGAGGACGCTCTGATTAACATCATCTGTCGGCGATCCAAA:1 - chrX 16418921 3' + Cr1a 3981 1 59.41 AAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGATAATTTCAACTGAGGTGGAAACTTTTTGTTGGCCAATCCATCAAGTTGAGCGGAGCTAGGTGAAGAAG:1 - chr3L 5068523 3' + Tc1 1332 1 77.23 CCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACTGGAGAATCCAAAGGGCAGGAGCTGAGGTGTACAGGAACTCAAGTGAGTTCTCGGGTGAGTCGAGCG:1 - chr3R 6048648 3' + jockey 472 1 71.29 GTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCAGCAAACGATTTACACTGTCCAACAAGATGATTGACGGTCCAAGGGCACTGAG:1 + chr3L 17194252 3' - Doc 288 1 60.40 GAAAGGGGAAAAGGCGCAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCATCCCCCGGACCTGGTGTCCGAGTCGAGGCGAGGGAACGTAAAGGATGTGGAGCAGCTA:1 + chrX 18723649 3' + Rt1b 180 1 71.29 ACGATGATCCAGCACTCTTAGCAGAGACATGACCTAACTAAGAGCCTGTTTCGAGTCGCCCTCGCGTAGAGATTGCAGTTGGGCGTGATAGTGTGCAAGTT:1 - chr3L 1471674 3' - baggins 146 1 81.19 CATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGCTTACAATTTTGTTCGTACCGTTCGCTTTTTAGCGG:1 - chr3R 14913124 3' + blood 7202 2 62.11 CGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACATTTTTTCTTAAACCCAAATTTTTACCTTTGTGTTTTTC:1 + chr3L 6914326 3' - 1360 2974 1 72.28 GTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCG:1 - chrY 680453 3' - invader2 4858 1 63.00 GCTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGTTTTTGACTTATTCGTTATTCTTTGAGGATTTCCCTCACCTCACTCTACCGCACCTT:1 + chrX 1108081 3' - Porto1 4388 1 60.40 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGTCGGATGCGATTATATGTTATTTAA:1 + chr3L 17624218 3' - roo 8710 2 73.27 GAATAATAAGTTCCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATATAACGGTTCTTTACGCGTCTTTTACTCGAAATGGAGGTAGAGAGG:1 + chr2R 10523820 3' + Tc1 99 1 65.35 CTCCAGGAGTATAAATGACTGCATCAGCAGGAGAGCAGCGGTCCCAGGACAGAGCCTTGTGGGACTCCGTCCACATCCTCGAACTTTCTGAAGTAGCTTCT:1 + chr2R 4932244 3' - G7 98 1 69.31 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATAAAAATCTCCAAAAATAGACAGGGCCAATGAAAAG:1 + chr3R 27448547 3' - roo 42 2 70.30 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGGACATCCGTGCGGACAACATGGCGTATGATTAACATGTG:1 - chrX 8817113 3' - jockey 4709 1 57.00 AGAGCGTCTCTCTCAAGCTCGCCCCATTCCAAACGGATGGAAATTCAGATCTATTAGCAGACAGTCTAAAAACGACTTATCCGATAACAACGTCTCCCAGA:1 + chr3R 4542048 3' + Doc3-element 435 1 71.29 GGTCGNAAAAAATACTTCACTTTGCACTGGGATAAGCCGGTGTGGGGGCTCCTGAATAAATAAGCGGATGGATGAATGAATGGATCCCTGTGTTTTCTGGC:1 + chr3R 27968816 3' - gypsy4 460 1 73.27 CTACTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATACCTTTTATGGTAGCTAAACGGTGTGTAAATATAAATAAATGCGCTGCTTTCAAAAACTGCGA:1 - chr2L 20465570 3' + blood 365 2 64.36 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAAAATTTA:1 + chr3L 776159 3' - 1360 34 1 57.00 GTCTTCTTATTGGGGATTTTACAACAATGTTTTGCCACTGTTCGGCCTCCGAGTTTTACTTTATTTTATATGGTTTCGTTAGCCGGCCACATATTTCAAAG:1 + chr3R 28623995 3' + roo 407 1 77.23 TTTCCCTGGAGTTAACCAGCAAGAGAAGATTACCATCCCGAAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTAATCTTCGGGATGGATATAAGATGAGATTCGCCCAC:1 + chr2R 8037479 3' - Ivk 465 1 62.38 TTTTTGTATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTAATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGCTCGCTCGTATTTTTTGTACTTACATCTCAAATCATATCATATG:1 + chrX 12647183 3' + Cr1a 262 1 68.32 AGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCG:1 - chr3R 26331657 3' - G-element 47 1 66.34 GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTG:1 - chr2L 6656257 3' - P-element 15 1 62.38 GGAGTTGTTTTTGTTTTGTGGAAGAATACATTAAGCACAAAACAAAAACAACTCCCTGGAACCTGCAATATATTATATATATTTTTTTCGAGAGTTCAATG:1 + chr2R 17984782 3' - Porto1 255 1 50.50 ATACAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTTGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTACGTTCAGGGCTAACACGTTTAGG:1 - chr2R 3465970 3' + R1A1-element 4960 1 73.00 ATAGTTCCTCAGATATCGACGTTCATACGAACGGACAGACGGACATTTGTAAGTAGCCAAGTGCAAATGTATCGATTTACAGCGCAAACAACTCGCCCAGC:1 + chrX 18251979 3' - INE-1 143 1 71.29 AATTGNAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCTATACTGGAATCCATATCGGTCCTTTGCGAGTCCAGTGGTTTTGCCCCGCACACGA:1 - chr2R 20791737 3' - roo 8684 2 57.43 CCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTTTGTTTGTATAGTACTTAATAAATTTGTTTCTCCTTACG:1 - chr3L 8448026 3' - hobo 143 1 72.28 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTATATGCACATTTTGTGTGCGTGGCCAAAGCCAATCGGGTGCCTGCTGCAGTTTTGTGCTGCTTACTT:1 + chr3R 11303902 3' + hobo 2930 1 70.30 GAAAGTCGTTTGTGGTCAATATGTAAAGCCAGCAGCTCAGGCAACTTTGAGATTAGAATATGGTATCGTTGGAGAAGCAGAATGTAGTAGTTATCTGGACC:1 - chr3L 3305871 3' + Copia1_DM 424 1 76.24 CCAAAGAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAA:1 - chr2L 18112484 3' + transib2 2816 1 69.31 CGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCAGCAACCAAGCAGCCCAACAACCCACATTCATCACATCCGCATG:1 - chr3L 1691762 3' + I-element 5014 1 63.37 ACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAAATGAAATGCTAAAGTGAAAAATGCTAAAGCAAAAAAGTGAAGAGACAGAGGAAAAAACAGGCAGCGAAG:1 - chrX 7970831 3' + invader4 443 1 78.22 AAATATTCGTTGGTTAAATTGTGCCGAAGAAACTCCCGCGGTTATTTAAAAATTCTGAAGACAAGAGAAAATATTATAAGGCAATAATAAATAAAAAGGGA:1 - chr2L 21327789 3' + HMS-Beagle 349 1 66.34 CTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGATTGGGCACAAAAGTCATTTAAAGTTTGCCAAACAGTTCG:1 + chr2R 16545195 3' + 1360 3247 1 59.60 GGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGATTAGTGAAGGAGGGGTGGTTGGGGGGACCACGCACAAATCTACGCCAAAAAGTAAAGTCATAAGAAAATGC:1 - chr3R 10948204 3' - G-element 319 1 59.41 TCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTTTAAGCGCTCGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGTGGGTCAACTTGCTTGTAAGGAAAAAAG:1 - chr2R 7639554 3' - Stalker3T 146 3 72.28 CATTTTTTAAAAGTGTGGGCGCGGACGTTTAAGGCGGGAACCATAGCCTCGGACTCAGCTACAACAGTGTAGCGGGGTCGAGGG:1 + chr3R 9635886 3' - INE-1 254 1 60.71 TGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACACCCAGGAGGAGGAGCCCCCAGATCCGCAACTGATGCGCTTGGACAACATGCTGATTGCCGAGGGCGTGG:1 + chrX 15994030 3' + F-element 233 1 75.25 AGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACATGACAACTCCATGATACTGATAGCCCAGTCTGAT:1 + chr2R 12404722 3' + F-element 223 1 68.32 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACT:3 - chr2L 18112513 3' + transib2 2787 1 62.38 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTC:1 - chr3R 5208147 3' + hopper 1380 1 62.38 GAGTAACGGCTATCTGATAGTCTCTTGTCCGAAAAATATAAAATAGATTTCCAAACAGTTTCGTATTTTCTTAAAAATAAATGTAGATATTAGAATGTTTT:1 - chr2L 12156897 3' + INE-1 549 1 78.22 ATAGTGAAACGAAAACATTTTCATTCAAAAATACAAAGTTAAGTTTCTCGAACTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCATTCTCTCACCCACCGCCTCGCTGC:1 + chr2R 18554772 3' + X-element 150 1 76.24 CTGTTAAAGGACCGGCCACATAATATCTCCCGGTCTAATATCTCCCACTTCTCCTACAACACCAACTTCACCAACAACGCCAGATGCCTCTACTGCCACCA:1 + chr3L 18527176 3' - R2-element 374 1 58.42 AATAGAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTTCATCCCCACACAGCTGCCAGATGTAGATACATGCGTGTAAATCAACTATCGTGGCCGATCGTGT:1 - chr2R 18675756 3' + X-element 4491 1 70.30 AATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCAAAGAGTCGCGCTCCGTATTCAGGTCATTGCATTTGTT:1 + chr3R 4911860 3' - invader4 61 2 78.22 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGCTATCTATAGTGCTGCGTCCCAGGTACAGTGAACAATTGCG:1 + chr2R 10697107 3' + 297 6942 2 65.35 GTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTAGATGGAAATCAATATGTTTACGGTGAAGCATAGGAGCACTGCAAGTGATGCAGCCATGG:1 + chr3R 5851380 3' - F-element 320 1 63.37 AATGGGATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCTGCGTGCTCTTTAGTCCTCCCATCCCACCTGGACCCATTCCATTACCACCCATACCGTTTCCACC:1 - chr2L 17287046 3' - Rt1b 5048 1 53.47 GGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGCACGGGAATATTTGCAAATACGCCATTGAAACGAACAATGGTAAGGCAAATAGCCCCGAGGAG:1 - chr2R 23469714 3' + I-element 340 1 66.00 GGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTCATTGCCTCTGCATTTTCGAGGACTTTGCCACCCCAAGATCCGC:1 + chr2L 19090126 3' - opus 21 2 55.32 CCACCAGCAGCAACAACAACTGCACCCACGCCGAAAAAGCCATACAACAACAAGATGAGCCGAATCGAGACGAGCCAAGCCGAATGAGGCAATCGAATTTA:1 + chr3R 21990160 3' + TART-B 151 2 78.22 ACCGTGACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTTTAT:1 - chr3R 18860345 3' - R1A1-element 5046 1 66.34 TTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATAGGAGTGTTTTGATATCGACGCCGCATCTAACATCGGTGAGTGCTTACTTATTGTCCATATTTACATC:1 + chrX 3478214 3' + hopper 1089 1 71.29 GCTGGAGCTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGTGGGTGCGCGGGGGGGCCTGCAGATACATTATTTCTGGGGAAT:1 - chr3L 5255237 3' - G6 387 1 78.22 TATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATTAAAGTTAACTCCATACAATCCAAACAAGTGCT:1 - chr3L 22292486 3' - Ivk 378 1 67.33 TGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTCTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCCATTTGACCATACATGTGCCTTG:1 - chr2R 5653865 3' - 1360 3366 1 77.00 TGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGCTACTTACAAACACACCGTATAAATCTGCTACCGCCTAGACACAAACTTCAGGAATAGTTGGGTAATATCA:1 - chr2L 7910581 3' + hobo 59 1 56.44 TCTAACTCCTGGGTTTCACTACACGTTTCTCCTTTAGGCAGCTCCTAGGGCGCTGGGCCCATAACCGTTGTTTATTGCTTGGCTTTCCAGATGTATTTCTG:1 + chr2L 757658 3' - 1731 382 1 76.24 AGCCACTGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCTT:1 + chr3L 23090532 3' - 1360 49 1 96.04 CCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTGTTGATAATAATTCTTCACTTTCGGACTGAATGTTATGGTGGGCAACTAGAATTT:1 - chr3R 19449569 3' + roo 185 2 61.39 CTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCCCCACCAAATGGTTTAATATTTATCTTTCTCTTATCCAATTTTCTTATTAATCAATAC:1 + chr2R 4287715 3' - copia 492 1 59.41 TACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCATGCCATTCGGGATTGTATTACTCTAAGCCTATTTAGGGCGATTTCCTGCTGCCATCATCCGCTGCGGAGTTTTTC:1 - chr2L 3260965 3' - G5A 2513 1 56.44 ACGGTTTCCATGTTTATCTGAATTCAGACCACTGTGCACAAAAGGAAACGAGCTGCGAAAGCGAAAGGATGCTGCGAAGCCGTGCTAGAGAGGGATGGAAA:1 - chr2L 12263858 3' - Cr1a 424 1 65.35 GCTTGCTAGTGTGAGTAAAAACAATAAATGAGAACGTGCGAAAAACCGGTTTGGTTTGGGATCTGGCTCGGCCATGATTACCCTCCACTTGTCTTAACTTT:1 - chr2L 15928819 3' - 1360 3250 1 63.37 TGTATAGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAGTGTATGCTCAGCAATCTCACGCTCGGCGATCCCCAAGGTGAGTGTTTGTTGCCTCTGAAATCGATAATATGA:1 - chr2R 10532004 3' - Stalker2 7457 2 53.47 CTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGCAGGTCGCCAACACGAACAATGCATTTGAATCGTTGTTGCCGTTGTTGTTGCTGCTACTGCTGCTGCT:1 - chr2R 10614681 3' - accord2 7596 2 59.60 TTGACGTTGCTCACGAATTTCGTTTTGCATTTCACTAGCCATTTTGTACTTACTAGTTTTAGTTAAGAGTCATAGCAAACCGAAAATATTGGAAAATAACT:1 + chr3R 30506055 3' - Doc4-element 6 1 73.27 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTT:1 + chr2R 14582894 3' - roo 37 2 63.37 ACCAANGGCAACATTCATGAAACAAAAGTGCAAGTCAAAACTTAAGTAAACTTCAGAGCGCTTACCAAATACCTGAACTCAATTATTTGTTAGAATGCTTA:1 - chrX 3841551 3' + Fw2 305 1 57.43 AACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGTTTGTGTGAGTGCATACGTACGAGTGTGCGGTTTTGTGGGCCAAAGTTTTGTTAGCCAACAAGAACAGC:1 - chr3R 26421807 3' - 1360 3277 1 69.31 AAGCTACGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAGAACCCGCAGGTTGTGAAGGAAGGAGACGTCATTTGTGGGAAAATCACGTCAAGA:1 - chr3R 15227729 3' + G2 140 1 58.42 CTAAAAATATAATTTGCTTGCTTATATGCCTACCTAAACACGGTGAAAAAAGCCAAAGTGCCATCTCTGGGAGCATGCGGTGTCGCTCGCCCGATTTTCGT:1 - chr3L 19791085 3' - 1360 3265 1 73.27 TCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAAACTCGTTTAGCAGCTAATTTGAGCGGCAAAGTGCCTTCAATGTTCTGCATACAGAACTAGAGGAA:1 + chr3L 23408169 3' + R2-element 129 1 65.35 TTTTTCCAACTGTTCTATTATTAAACGGCCCTAATAATTATATTCACTAGACTAATGTGGTAATTCGAGATCAGGTCTATCTGATTGTTTGATTGTTTGA:1 + chrX 8494839 3' - F-element 4570 1 68.00 CATTTAATTATTGTCCACATGGACAGATTTTAAATTAATACATAGATCCCTTTGAAATCAAAACCGATGACGAAATCTGGAAAGCTCTAGAGCTGTCGCAT:1 + chr2L 12738981 3' + G-element 4277 1 56.44 TACTAAATCACATGTATTTGGTCCTACACTTTGCTGGATGTGTTCGGTTGAGTGGCAAAAGCGGTTTGGTTTGGTATATTTATGCTTTTTCTAATATGCT:1 + chr2R 5039456 3' + Helitron 308 1 73.00 AGCTATTAAATTTGGCCAGAAAAAGTGGTCAAATTTCCCATAGTGTGGTGGTTGCGTGTGCATAGACTTTTGGGGTGTCTTCATTTTTCTGGAAGTGCGTT:1 - chr3R 17831645 3' - Transib-N1_DM 24 1 74.26 ATGTGTGTATGTGTTAGAATGTGTGTGCTTACGTCGGTGTGTGTGTGCACTGCAATAAAATGCGTAGCCCACATATAATAATTATTTGAATGCAGAATTTT:1 - chr3L 10287089 3' - ZAM 263 2 80.20 TTAACATAATTTTTTTTTCAATTTTTTTAGTGATGCTTTTGATGCTGTGCTGCCTTTCTCATAACTGCATTAAAGTCATGCGTGCCGAATCTTCCGAAACA:1 - chr2L 14870898 3' + FB 409 1 73.27 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTT:1 + chr2R 8463630 3' - I-element 7 1 61.43 TGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCCGAGCCCG:1 - chr2L 11165347 3' - transib2 50 1 71.29 GATCCGCGACATCCCCGACCCCGTGAATAACCGATTCACTTAAATCCAAAACTGTGTGCAAGCAGTGGAGCCAACAAATAATTACAATTTAAGCGGAATC:1 - chr2L 11925587 3' - aurora-element 4035 1 55.00 GTTAAATATCATGATTTATCAAGCTGCAAAGTGGAGCCTCGATGTCGACAACGCAAATCCTTGATAACATAGACATTAAACTCGGCTATCATGGTGAAGAG:1 + chr3R 19090258 3' + Chouto 6223 1 75.25 TAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCGTTCATTTACAGTTCATTTACTAATGAGCCAATAAGGCCACGCGACCAAAAACCAT:1 - chr3R 19985482 3' + I-element 4969 1 60.40 ATTTAGCTTTTCATTGTCGTGTAAGAGTTGGAGGACACACTGCGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAATAGAGCCAAGATCGATTGTTGTTGCTGCTGCTAG:1 + chrX 13270749 3' + aurora-element 4174 1 65.00 TTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTAACTGGAAATAAAGCAAACGCATCGAGATTATATTGAAAATCTGGCCCTGAGAAAGGGGC:1 + chr3R 22211014 3' + hobo 396 1 51.49 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTATC:1 - chr3L 3254958 3' - 1360 19 1 61.39 CAGAATAAGAAAAAGAGGCGTCGTGTTTCCAGCGCACGAGTACATCTTCTTGCTCCATTCCAGGGAGACGGCGCCCAGGCGCTCCTGGAAGAACTTCTCGT:1 + chrX 15474760 3' - invader1 60 2 74.26 TTGCTGAATAACATTAATAGGAGTGATTTGTATTGTTGGCCAACCACTGCCTTCTGCGCCAACCGTCCAATGTACCACCCACACAATTGCGGGTGGAGATT:1 - chrX 2960316 3' + Tc1 236 1 79.21 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTTG:1 - chr3R 178120 3' - BS 40 1 67.33 TTGCCTGCGAAACACCGATGTAATCGTGTTCGCGGATTTCTCTACCCAACCTATTACTTGTTTTTTAGAGACACTGGATAGAGTGAATAGCTTGTCAAACT:1 - chr2R 1270926 3' - Gypsy12A_LTR 1989 1 56.44 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGC:1 - chr3L 3254995 3' - 1360 56 1 81.19 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCACATTCGACACCGAATCGGATTCAAATTCGAATTCAATTTGAT:1 + chrX 16619706 3' - opus 2 2 77.23 TACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCATCGTCCATAGCAAAGCGGTCAGTTGGGCCTATGTGGCCACGAGACATCCCATAAATCTACCGCCC:1 - chr2L 4787173 3' + Doc2-element 4603 1 67.33 TGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGGCCTAGGGGTCGTGCACAGTTTCAATTAGCCCGACACACAATTGGGGGCGG:1 + chr3R 23582883 3' - Idefix 7038 2 58.76 ACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTTGTTGTGGTGTTATTTGTATTGCACTAACTGGCTA:1 - chr2L 5922576 3' + R1A1-element 4942 1 70.30 GTGACTTCGCCAGGTGATAAAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGTCGGGCATTTGCGTTCTGTACGGCATAGTGTGGCTG:1 + chr3L 16784949 3' - Chimpo 4230 1 51.90 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGGGAGGCGGCGG:1 + chr2R 18865921 3' + roo 9051 2 56.44 GGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTTTCCAAGTCGCTCATTATTAAGGCGGTTTTGGAAATGTTTGTCGGTTCAGCTCTATTTAAAACTGAAATAGGC:1 + chr3R 25302818 3' - I-element 375 1 72.28 AGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACTGACGGCATAGCCAGAGGGTTTCCCATTCCATACCCTCCAGTCGAGTCGATTTCGGGCTTAT:1 + chr3R 8210146 3' + INE-1 175 1 63.00 CTATAATATACCCGTTACTCAGCTGGAGCGGAAGCGGGAGTGATAATAAAACAACACCGAAGGTCATTACTGGAAAAACGGGTTTTTCTAGCCAACCTCTG:1 - chr3R 19111350 3' - INE-1 547 1 80.20 TAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACGCATCGCATTATTGGAGGGCCGTTCTCTGCGCTTCTTAAACGGCCTTTGGAGTCACATTGC:1 - chrX 21976896 3' + baggins 5079 1 67.35 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGCTTCCAGAGGCATTGCGCTTTCTTTCGGGTACGTTGCCTGTGGTTCTATC:1 - chr2R 5640333 3' - roo 8689 2 56.00 AGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTCTTGTTTATTTTGTTGTATAATTAATATTTTTTTTATACACACACTTTTGATCAAACGCAA:1 - chr2L 4876501 3' + S-element 1512 1 74.26 GAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTGAAGGGTAAAAGGGCCATTTTCGAAAATTGTTATTGCGGCTGGGTTTTGAATGGCCCAACCCTTTGTTCAAAT:1 - chr3L 2976423 3' + hobo 2604 1 60.00 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGACCGTTCACCGTAATGGATGAAAG:1 - chr3L 776073 3' + 1360 3380 2 68.32 TTACCATTGCCAATAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAATCCCCAATCTCCACACTGCGAAGTTTGGACTGCTGCTGC:1 - chr2L 6376858 3' + Doc2-element 426 1 77.23 ACTGGAGTACAAAGTCCTCTTATATAACTCCGTTTTGAAACCCATATGAACCTATGGCAGCTATGGACCTGCTCATATCACAAACCTAAGAGTTATCCGAA:1 - chr3R 19865808 3' + Doc3-element 4275 1 65.35 TAAAGCTGTGTTAGCAGTTTCGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGCTTTCACCTAATTAACGCCGCTTCATGGCAGCA:1 + chrX 18559827 3' - Quasimodo 7076 2 64.84 GGCTGTGGTTGGTACCCATATACGGGATATTCCTATCCCATCGAACTAATGAGCTGGTGCCTGATGATGCCAGTGCCAGAGCAGGTACCTCACAGTCAGCT:1 + chr3R 23404208 3' + R1A1-element 5008 1 79.21 CAACCNGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 4931 1 66.34 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTGGGGGCACGCAAACACACAAATACACACACAGAGCGCT:1 + chr2R 16928952 3' + blood 372 2 73.27 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTGGAGTCTTTGGTTCAACCTTGATGGACTGGATGGTTATAATAACTACTTCCT:1 - chr2L 23170875 3' + 1360 3351 1 64.36 CTCGAGACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGTCTCGTTTTGTAAATAACAAATCAGGCATTTATAAATGATGTGAGCATAAAATTTT:1 + chrX 7638381 3' + 297 495 1 62.38 AAAGGTGAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTGCGTCGACTACTGCTGCTCATGTTCCTATCTATCGCTTATTTTGTGGGGACCTGCGGGTTTGATAACAGA:1 + chr3R 8000254 3' + Quasimodo 219 2 79.21 ATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTTTTTATTTCCCATTCATT:1 + chr3R 5775757 3' + invader4 3070 2 64.00 TCGGTAATAATCGGACATTATTGTTAAAAAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTGGTTCTTAGGAATTATAGTTCTGATTGGTTATCTCTTCTTCCATT:1 + chr2L 16682166 3' + Circe 452 1 79.21 TCTGTCCGTATGAACGTCGAGACCCATGTAGCCACTCCCACAAACCGCACAAAAGCTACCCTTACCCAAAATAACGTCAGCAATCCCCCAAATTTACATGA:1 - chr2R 5112103 3' + INE-1 130 1 53.47 AGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGGCGATTGGAACCATTAGCCGCAACGAGGACCTGCCCCCCACTCCCTGGAAGGCCATCC:1 + chr2L 12032754 3' + Transpac 338 1 61.39 AAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATTGTTCTCACATATTTCTCATGTTTATCTTCCGTGTACGCCGAACTGGTAGGCTGGGCATCGCTTAGCTTCGC:1 - chr2L 22131583 3' + INE-1 246 1 59.41 CCTATTTTTTTTTATTTTTTTTGTTTTGTCCTGCGTCAACGCTTGACATGTGTTCGTGTGTGTTTGTGTGTGTAGTGGATATTCCTGCGCTGGTGGTGGTT:1 + chr2R 18514530 3' + hopper 140 3 71.29 AAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGAGACGGATGTTTAGTCTATCAGTGGGGTACCAAGATCCGGAATAGTGACGGGGCGGCCAGCTCTGCTGTTGATGCTG:1 - chr4 714281 3' - Idefix 7022 2 55.45 AAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGACTTAAGGGTGCTAAGCGTTTCTGGTTTCGTTTTGTTTGCTATTTATTATATAAT:1 - chr3L 15047464 3' + R1A1-element 4964 1 61.39 ATTGAAGAATTGAATAGGGTTACTATCGCATCAACAATGTATGTTAACGCAACCACCGACTTAGTATCTAATATTTGCTGTGCTTTGGGCCAATCCTAAAC:1 - chr2L 21322552 3' - rover 406 1 67.33 AGCTANCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGTATATTTTCAGTCCGGTTTCCGGTTTCTGCTACATTATTCGTGGGATTTCGTGCAAGA:1 - chrX 8179008 3' - pogo 14 1 65.35 CACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGAGGACTTCTCGGATCAGGAGGCAGGGGACTTGGATGCGGACGCCGGCAAGGGTGCCG:1 + chr3L 21517675 3' + F-element 4463 1 64.36 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAGTATACTGTGCGGGTTTTTATTATGTTTGCATTCGCTGCGGGCCTTTT:1 - chr2L 15622705 3' + mdg1 390 2 55.45 CGTTAAGCTTGGGCGCTGCGTTTTTCGGCTGTCAAGCCAGCCATCCATCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTTGTTCGCTGCCCGCACAATTCTGTTTCCCAT:1 + chr2R 13380516 3' + diver2 172 2 64.36 ATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATATAAC:1 + chrX 21772507 3' - springer 7181 2 69.31 TTATTAACTCACGGGAATTTCTTGGGCACAATTTAACCAACGGATTTCTTGACTTAAATAAAGTTTCCATCTCTAAGTATAAAACGTACCCAAATAAAAAT:1 - chr3R 31738338 3' - HMS-Beagle2 441 1 55.45 TAGAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACCAGACAACATATTGAACAAAAAATTTCGGCTCAGTACAGGTCAGCACTCTAAAA:1 + chr2L 22674040 3' - GATE 8460 2 52.48 ATACAAAGTATTTTGCATCTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTACTCGTATGCAATTCCACTTTCCATTTTCATAACGCGTTTTTTTTTC:1 - chr2R 13926951 3' + Cr1a 179 1 53.47 CTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTAATAAATCAAAAAGTAATAAACATTTAGGTGTCAACAGCATTTTAACTGTGTTCTAAAT:1 + chr3L 11716070 3' - X-element 33 1 55.45 TTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTCCCAAACTTTAAGTTCTGATCTTTATTTTCATCAATCTGTGAAATGGAAAAGCTTAAA:1 + chr3L 16753247 3' - Idefix 7263 2 63.37 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTTTTAGCTTAGATTTAAACACAA:1 + chr3R 7375371 3' + roo 354 2 83.17 CGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAGGACTGGAAGTTTTCCTATCATAAGTAAATATATACTTACTTATAGGCAAGACTCTG:1 + chr4 826653 3' + flea 144 1 60.40 TAATAAGAGGTCTTTATATTTTTGCATTGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACATTTTCTTGGCAAAATGTATGCATTTATTTAACATA:1 + chr3L 7432768 3' + S2 1654 1 74.26 TTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCTAAAAATAATACCATGGATTAAATATGAGCTTTATGCCTGCATATAGCATATGTTAATTAACGAAC:1 + chr3R 17727859 3' - I-element 5110 1 72.28 TATATTAAATATTACTGTTATTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTGGACTTCTCTCATTAGGAGCTCATTTATTTC:1 - chrX 14613374 3' - Cr1a 4300 1 66.67 CAGGGGAAGAGGGTGATAAATCCACTTGGAGAATTACGATGATTACGTTGCGGAAGTTGTGGCTTAGTTTGCGGGCGAGTGGAGGGGCCAGCAGGGGCCAG:1 - chr3R 6552902 3' - gypsy3 294 2 56.44 AACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCATTTTATGCGGCTGAGAAGCCTGTTTCTTAGTTTTCTGATTTTTTTT:1 - chr3L 24710212 3' + Cr1a 172 1 59.41 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGTCATTACAATTATTATTACATATTAACATTGGTAGCATTCTTACATACTTAATACATTATTACAGT:1 + chr3R 13824442 3' + roo 400 1 70.30 CCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACGATTTTCCCTCACCTGCCCGTCCACAGATTTGCATTCGTATTTTGT:1 + chr2R 19073969 3' + Porto1 331 1 54.00 CACTCNACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGATGTGGGCTACTCTACACCGCGTCTGTCATTATCCGCGCCAGTGTGCGTGTCCTTGCGTCTGTGTGC:1 + chrX 20594354 3' + hobo 31 1 67.33 CAGGACCTGGTTGACTCCATGCCAAAGCGTTGCGCACCTATTATTGCTAATAAGGGTTTTAATTTAATTTAATATGCGTTTTTTTTTGAGGTAGTTATATT:1 - chr2R 8106975 3' + Tc1 1280 1 55.45 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTTCGTCACAATTCGAATGAAAGTGGACGGCT:1 - chr3L 15276633 3' - hopper 19 1 59.41 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGGCGGCCGAAAACTCAATTGTGACCACTG:1 + chr2R 5322083 3' + 1360 3368 1 58.42 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGTGACTTTAGTGGCTTGCTATAAATATCATTATAATGGCTATAAATCGAAACGGATTTTACGATCC:1 - chr2R 11728688 3' + mdg1 7408 2 75.82 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCTCCTGGGAGACGTCGTTAAAGGCCCTGGAATTCAGGTTTACATACTGGATATTTGGCTGGCGGCCAAACA:1 + chr2R 20791846 3' + roo 404 1 73.27 ATAGCTGACAACTATATGTGTGCACACGTATGCTTCTACACTGCTTTACCATTCCCCTACGCCGCCCCCACCATCATATCTCTTCCTGGTTTCCCGCAGCC:1 + chr2L 21324647 3' + 1360 163 1 67.33 CGCTGACGTTACTGCGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTTGCTATTTGTCTTGCTCATGCAAATTAGCACTGGGCACTTGGTATGCCGATAATACCAATGGCAG:1 + chr3R 21353571 3' - gypsy4 6619 2 68.32 TTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCTAAGTCGTATTATTTTTATTTGGAGTTTTGGGTGTGAATGCCTTAAATCTTCCACGAAACG:1 - chrX 9835518 3' - I-element 4969 1 69.31 AGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACTCACACACACATACGCAGAGTATTTTTTATTTTGGTGACAAACAAAATGGCG:1 - chr3L 9320652 3' - 1360 3332 1 63.37 TGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAACTCCCACGGAACCTACGCTCGGTACACTTTTAATTATTTTCGCTCTCGTCCCTAGCA:1 - chr2L 12198796 3' + 1731 4450 1 63.37 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGGCGGCCGAAAACTCAATTGTGACCACTGTCAGCGCCACGATCTCG:1 + chr2R 5322100 3' - 1360 4 2 75.25 TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACCCGGACGACAAAAAAAGGACGAAAAGCATTCGAATGAAAAATGTAATAAAGTATACAG:1 + chr2R 15281594 3' - F-element 89 1 63.37 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAGTTTCGAACGCCG:1 + chr2L 5152027 3' - I-element 12 1 66.34 TTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCCTGGTGAGGCGATTCTCTTCGTGTAAATAGGAAAAAAATTGACACGCATTTTTCA:1 + chr3L 9996067 3' + R1A1-element 257 1 60.40 TTTAAATAAGCAAACTAACCATACTTGAGAGAACTAATGAAAGGCAGTATGTGTGTGTGTGTTTGATTGTAGCTTTTCTAGCTTGCCACATTTGTCGCAAC:1 + chr2L 18252281 3' + BS 373 1 62.38 AACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCATTAATTCCGTCTGCCACTTGACTGGTTAT:1 + chrX 2253889 3' + Tirant 8463 2 72.28 TATACGGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTATCTTCTCTGTCACGAGTGATATCACCTGTGGCAGATTGACAGTTTTTGTTTTGTATCATTTGGCAT:1 - chr3R 24702980 3' - Doc 63 1 65.35 CTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGTGGGTGGTCCGACTTAGGGACTTGGTCCTGGATGCTCTCACTCCCACTGGGAGTG:1 - chrX 5263535 3' - G6 375 1 61.39 TCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACGATTTCGGTACTCGGTACTTGGTATTCTGCTAACCAAAATCGGAAGTCACGT:1 + chr2R 12523626 3' + 1360 3176 1 65.35 ATGTTGGGTTGTAGGGGGATGCAGTCCGAGGAAGTCACTGAAAAGCCCAGCCGAAAGACCTACGAACGCAAGAGCTACGACAGACGAACCTATTCACTGCC:1 - chrX 4242112 3' - GATE 252 2 78.22 GCATTCACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGAATTCTTAAGACCCAATACCAATTGTAATTTGTAATTTTAGTTAGAA:1 - chr4 515637 3' + INE-1 534 1 59.41 TTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAAAATGCATTGAAATTCAACCAATGGCCGTCCACTTCATTTTGATATCCTT:1 + chr3R 20495832 3' - Juan 4073 1 76.24 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACT:1 - chr2L 222104 3' - P-element 44 1 35.64 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGG:1 - chr3L 3254989 3' - 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F-element 313 1 77.23 TGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGGTTGTGGTTTGTGGCACTCTATTTGCATATTATGTCATCAGCAG:1 - chr2L 6814183 3' + 1360 408 1 58.42 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCTGCAGGTCAACGCTGCGG:1 - chr3L 15099875 3' + Tirant 363 2 63.37 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCGATTTCCCTTATCAG:1 + chr3L 19051921 3' + roo 9051 2 58.42 TCGGCTCTTCTGAGCTCGGTGGTTATCGCTGCGGCGAAGCTGTTGACCGCTTGCCATTTCGCATACAACGAGGACTACAGTTTTTGGGTCGTCGAATGCTG:1 - chrX 20237571 3' - Rt1c 5261 1 63.37 CTATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTAATACCCTTGGGCAAAGCTTTTGTGGAGACTTCGATAGCCATCTCTCTCTGCGACTGC:1 - chr3L 22642122 3' - G4 3583 1 64.36 CAAGCTAACATTTCATTGTCTTCCAGATATGCGGTAAGCTCAATAGATACAGATGGGCCAACAATGGAGGCCACCGCGAGCTCACAAAACACATTGCGGGT:1 + chr2R 20282004 3' + hopper 280 1 62.38 TACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTATCCACTTTGAATTATTTGCTGTTTGTTTTCCCCGCCCGCTCCGTCGGCCAAAACTGGAAAAAGGA:1 + chr2R 8252880 3' + Bica 389 2 71.29 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATACCTTTTATGGTAGCTAAACGGTGTGTAAA:1 - 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chr3R 25445167 3' - P-element 399 1 39.60 TGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTTTGATGCACTACAATGAAAACTCGAGCTACTGAAGAC:1 - chr2L 7330451 3' + 412 190 2 63.37 AGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGTAGTCGGTGCTGAGGCCATCGGAGTTGCTCCGTCGAAGGGCAGGAC:1 + chr3L 20028736 3' - Max-element 325 1 64.37 AGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGAGGCCTCAAGTGGGTGGTCGGGTGTGTGTAAGGACGAAGTGGGGTCCTAAGGAAAAACCA:1 + chr3L 971063 3' - accord 7124 2 70.30 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCG:1 - chr3R 22675813 3' + 412 7508 2 64.36 TGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGTTGGCTTATGATTATAATTATTATTGTTGTTTGCACAGGCACAAAAAAGAAGAACATAAAACCAT:1 - chr3R 16530934 3' - hopper 438 1 66.00 TGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGCTTTGTGTTGGCTTTTGTGGG:1 - chr3R 18967395 3' - Tirant 8287 2 72.37 ATTCANCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGTGAAACTTTAAGGTGGCTACC:1 - chr2R 4341781 3' - hopper 53 1 75.25 CTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTCAAAAGAAGACCGTCGTGC:1 + chr2L 14045883 3' + mdg1 7310 2 81.19 ACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCTCTGAGGATATCCTCGGGCAATTCGCCCAGATGCTGTTGGAGTAGAT:1 + chr2L 8136968 3' + R1A1-element 4945 1 67.11 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTCCTCTACGCACATGATATCCCCGATTAATAACATTTTCTTAGCATACACTTAGGGATTT:1 - chr2L 18818578 3' - jockey 4692 1 61.39 CTACAAATACGATTATGCTTCCTTGCATGGTGAAGTCTGTCTGACTTGTAAACTTTGTTTTATTGTATAATTATAGATTTTATGGTTTTGATTGTTGCTCA:1 - chr2L 2851125 3' + hopper2 241 1 55.45 GACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGCCGGAACACGATCGCCTGATGTTCATTC:1 - chr3R 29296880 3' + G2 2854 1 72.28 TCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTT:2 + chr3L 13888684 3' - copia 4908 2 62.38 TTAGAGTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTTCGCTCTTGTGGCTCTCGGATTTGCTGCTCTTGTGACT:1 - chr3R 23252774 3' + 1360 413 1 62.38 CTTTAGACATGAGGAGGCGGATGATTGCCCATGGTGCGGAAGATGTACTCCGCTAGCAGTTGCGCCTTGGTAGTGTCTCGTG:1 + chr2R 1806940 3' + Rt1c 5046 1 54.88 TTTGCACACTTCTCTTTTGTTTTCTATTTTGTTTCTATTCAGAGGAATTTCGATAATCAAACGGTAGATAATATGCCTTGGCGGATATCATTAAGCCAGGC:1 + chr3L 6838844 3' + S2 226 1 72.28 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGAC:1 - chr3R 5208162 3' + hopper 1365 1 75.25 TGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACA:1 + chr2R 21092005 3' + 1731 4580 2 73.27 ATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCTATCCATTCCGAGAGCCGCTGTCTGCCCTTTGATCGCCTTTTAATGATGATGACCATTGTTAGCTGATGT:1 - chr3R 21418206 3' + 297 6521 1 81.19 CCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATAT:1 - chr3R 778389 3' + F-element 23 1 52.48 CTGGTAGACTAAACATCCATCCCCTCACCCCATCAGTTCTTCGCTTGGCCGGTGACCGATGACATGGCGCCCGGTTACTCTTCTATAATCAGCAGACCCAT:1 + chr2L 7784231 3' + Idefix 181 1 71.29 CCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCAATTGAGATTGTCCAAAACCAGTGTGAGTTCCCCCATCTTATCGTG:1 + chr2R 22128415 3' + HMS-Beagle2 7068 2 72.46 ATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAATCGCGAGCAGGAAGTGAAACAGGACCTGCACCTAGTGACAGCCAGACAGGAAGCAGCCCTGTAT:1 + chr3R 25362542 3' + jockey 14 1 68.32 GCTTTATGAATACAGAAGAAATGCCCCATAAAATACCAAAACAATATGTCCAGCGTTCAGCAAATACCGTATTATACCCACCCAGTAATACTTAAGTTATC:1 - chr3L 15112784 3' - invader5 3768 2 66.34 CTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCTATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACTATCAGAAAATGTCACATAATTATGCACAGCCCAGGC:1 - chr2L 16336037 3' + F-element 489 1 63.37 CCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACGGCATCCATCAGAAATGCCAAAGAACGGACTATTAATAAACCCCAGAATGCATATCCTCCCATCCTCATCATCA:1 - chr3L 8871545 3' + G5 4531 1 76.24 TAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAACTGAATATTCATTCTAGTTGGGAGCTTTATGCAAATGTACCTG:1 - chr3R 9833609 3' + Tabor 7178 2 64.36 ACAGCTGTTCGAAAAGCTCACACGCAAGCTCGCCTCGCAACACTTTTACTCATTACGCTCTCGGGTTTAATGTCACGGATCT:1 - chr3L 13030990 3' - R1A1-element 202 1 53.66 GTGGCNGCATAGTGCAAAACCAATGTATGTCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGCCTAAGTGCGTTCGAGGAACTTATTTTCATTGAG:1 - chr4 1167733 3' + 1360 3348 1 66.34 AATAAAAATAACGTTAAGGCAACGCAAAACGAGTTCAATGAA:1 - chr3L 6962438 3' - 1360 305 1 71.43 CTGTCAAGTGCCTTGAATTTAGATCCGCCAACTATGGGAGTCGCCTCGCCACAGAGACGCTCCTCGTCCAATGCCAATCTCCGCAGGGACAGCAGCGTGTC:1 + chr3R 29732194 3' + G7 187 1 76.24 CGTTGGGTGTGTTGGTCTTGCTTGTATGGAAAACTTTTAGTTACAAACAAAAATAAATAAAAACAAAAAA:1 - chr3R 12630690 3' - Gypsy12A_LTR 2172 1 44.29 TTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCAGTGGTCGTCGTAATGAAAGATACATATGTACTATACATATTCATTCAAAGCTTAAAAAC:1 - chr3R 18922628 3' - Burdock 304 1 65.31 TGTCGACATCGAGGCTCCACTTAGCGTTTTTCGGTGCTATGCGATAACTAAATGCGACCAATTCGAGACATTGACGAGGCCTACTGCTCGATAAGAAGCCA:1 + chr3R 21082692 3' - Chouto 6251 1 76.24 GGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGAC:1 + chr4 909135 3' + 1360 3306 1 64.36 CTCAGACGCCTGCAGAGGAAACATCCCCTAGATCCCTCTGCCCCTGTTCCCGCCCCATCCATGACCCCCTGGCTCCGTCTCTGTTTCGTAGGTGATAACAA:1 - chr2R 13320838 3' + G-element 4159 1 69.31 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGTTTATTATTGATAAATATCAAATTATCGATAGTACTTCCCCGATAAGATTCTGTTAACACACATTGC:1 - chr2R 17095077 3' - Juan 4033 1 67.01 AGTCTNTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATAATTGAGCAATTTAATTCGGAATTTAGCCCTTTTTGAAACGGGTATAATGTGGCTTAATTTT:1 + chr2R 22781063 3' - roo 8677 2 67.33 TTACTTTGAATTATTCAAACCGAAAACTTAAGCTTGTTTGATTGACCCACTCACCTGTACGTAGTGTATGACCTTGCACAGCACCAGGGGCAGCGATCGCG:1 - chr2L 6057460 3' - Copia1_DM 236 1 74.26 TTTTCCGTGCCCAGCTTCTTTGAGATGAGCACTTCCGTAGCTAGCACATTTCGTACTAATTTTTCTTACAATGTATATATGTTTTTTGTGAAGTTTCTTAA:1 - chrX 8732972 3' - FB 5 1 62.38 AGACANTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCATGGATTGTCCAGGAAGAGTCATCATCCCA:1 - chrX 4581236 3' - blood 7071 2 70.30 CCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTATCCCCATATGCGAATACGCCCCAC:1 + chr2R 16927125 3' - blood 7218 2 73.27 AATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGAGATCTTTGAGTCATGAAGGTGATACGTGCCCTGAAGTACCAGGAGGTCTACGCCCAGGA:1 + chrX 21075456 3' + baggins 5335 1 61.39 TTTGATTACTTTAAATTATTCAAAAAATTAAAAACGAAATCCATAGTAATGTCACGAAAAAACCAATGATACTTAGCCACTGTGCGCCATTCTGAGCGGGC:1 + chr3R 13848554 3' - Copia1_DM 241 1 70.30 AGCCANGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCAGCGGTGTGCAAGAGTGTAAATGAAAAATCGCGTAAATAAGTTGCACCATTACG:1 - chrX 4859947 3' - 1360 49 1 58.42 GTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATACCTTCCCGAAAAACCATCTCATCGTAATCCTAAAACCGGCGGTGCCTTTGTGGC:1 - chr3R 28593214 3' + gypsy4 6480 1 58.42 TGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAGTCCTTCGGGTATTTACG:1 + chr2R 21421104 3' - springer 7151 2 61.00 AAAAAAAGAAAACAATAAACAAATAAATGAAGAAAACAAAAAGGGTCGAAGGTTTCGTGGAGAAAGTGTACTGTCTGCTCTCTTGCTTGATAATAAAGAAG:1 + chr3R 24603159 3' + gypsy7 5009 1 66.34 ACCAGAGATATCGAAAGCGATCTGAATGTGACAAAAATTGGAGACAGGATTCAGGAAATAGCGACGAAAAAAAAAAGACGTCAAATATTACAGCCATGGTG:1 + chr2L 23315341 3' + jockey2 3015 1 69.31 GCCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAACCCCAGCCCCAACCCACCGACTTGCCAACCCAACGCCCCCTCGACCGCCCCCCGCCCATTTCGATC:1 - chr3R 14714957 3' + Porto1 289 1 70.00 GTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCGAGTGTGTCCTGTATGTTTGCGGCACA:1 + chr2L 15945448 3' - G2 2747 1 73.27 ACAATTTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAGAGAATAGGTGCACATATTCAAGTAGGGTTTCTTCTTTTTTTTACACACG:1 - chr2R 496255 3' - Cr1a 318 1 65.35 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTGAGTGTGAGTGTGTTTGGAAGTTGGGA:1 + chrX 14424113 3' - hobo 16 1 58.42 TAGGAAGCAAATTAATATATTCGGAAGAAGACAGTTCTAGAAGCGAAGCAGCATTTGAATCGTTTGCGAGACTGTCTAAATCTTGAGCTCGTGCGTTTTTA:1 + chr2R 9469274 3' - Gypsy12A_LTR 2055 1 60.40 TCCGTATGAACGTCGAGATATCAGAAAATATAAAAGCTAGATTCAAAATCCAAATACGCTCCCCAAAATTTTGCCCTTTTCATAGGCACTTTCCACACCAC:1 + chrX 22857933 3' + INE-1 134 1 59.41 CCGTCNAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGCAAATGCAAAATGATTAAAATAATTGTATAGG:1 - chr2R 17690520 3' + P-element 26 1 35.64 TTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTATTTTTGGTCAGTGCCAACGTGTTTGCCCAGGATAATTACTGATTTTATTGCTAATTAAA:1 - chr2L 13471044 3' - I-element 380 1 64.36 TTTCACAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGACTAGCCTTGTTGAATCGATCTGAAAC:1 - chr4 1194255 3' + 1360 379 1 95.18 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTAGAATGCGTAAACT:1 - chr2R 16018812 3' - I-element 9 1 69.31 AAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACATACTCAAAACTTCCTCCCTGCACTGCCCACTTCTGTCGCCGTTCAAATATGCGA:1 + chr2R 7208625 3' + I-element 319 1 54.46 ATTGATCTGTTGTTCGAAGAATATCAAATTTTTGACTTTTTTTTCCATCCTCCCCATATCCCCAAGCCATTGTTTTCCCCCAACTCCTTGCCAAGTTCCTC:1 - chr2R 17952737 3' + Tc1-2 243 1 60.40 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTTAAACCGAAAACGGAATTGTTGAAGGCGGCCCTCGAAAGTATGCAACA:1 + chr3L 10035701 3' - jockey 4766 1 69.00 GGCAGNATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATCATAAAAACCTATTGAAACACTATTTGGCTTAGTGTGCCATTAGTAGCTGACTCTTAGAAAGT:1 - chr2L 6634210 3' + roo 8658 1 72.28 TTTCANAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAGAGTACGAAGTAAATGATTAAAGGTGATTAAAGATATTACTTG:1 - chr3R 21046024 3' - FB 228 1 56.44 ATTTTGCGACTCCAAAATTGTCAGCAAACTATTTTCATTGTTCAAAGTAGGTGCTATGGATCGATCTTGGAAGTATTCGGAAGAGACCCCAATGACCTTGG:1 + chr2L 9728092 3' - invader1 474 1 57.43 TACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTCCACGTGGCTCTAGCTGCCTTACTCCACACCCCCTCCTACCATCCCGCTCCTTCATAATTCATTGCCATTGTTGT:1 + chr3R 29475779 3' + Quasimodo 7086 2 69.31 AAATAAAATAAAATAAATACATAATGTAACATAAATCAACCTCATAACTATGAATCAAAACCAACTAAAGAACTAGTATGCACTTATAATCCTTAAGATTA:1 + chr3L 8333811 3' - transib1 1897 1 67.33 TTCGAAATCGTACTGTTGTAGCTCCAACGCGCACCGTGCTATCCTGCCGGAAGGACTTTCGGTGATATTCACCAATCATTAATCATATTTCCCCCGCTTT:1 - chr3R 19501689 3' - Osvaldo 184 2 47.00 ACACTGATCTCACCGTTGATCTGGCAGCCCCTCAAGATCACCCACTGCGGCAAGTTGGCAGCGCTATCGGTATACCGCAAGAGTTATAGATGGGCCGTAGC:2 + chr3L 27382319 3' - Rt1b 47 1 44.55 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTATCGAATAATTGAAAGGATATATGTATGTATGTA:1 - chr2R 16801151 3' + hobo 2894 1 66.34 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCTCCAAAGTTGGCTTATCTACAAAGTAT:1 + chr2L 22319376 3' + Transpac 303 2 72.28 AGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTCGGATTTAGGTAGTGTTGGTAGGTTATTAAGTGATTTGACCATAATGTACATAATGTACTTAAACCATGCATT:1 - chr3R 13658577 3' - I-element 5001 1 58.42 AGAATTATGTGTTCCATGTTGTAATTGTTGTTGTCTTTGCTTTCCTTTTTTTTTATATTCCATTTGGGCTTTTTTTTGCGTTCTTTTGGTTTTGTCCGCCC:1 - chr2L 4088857 3' + transib3 322 1 62.38 GCCTTAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATGACAGGTGGCCGTGGAATGGCAG:1 - chrX 10075314 3' + roo 257 2 75.00 AAATGCATTTAAATTATTGTATTCTTGTGCTATGCCCAAATGTTCATCTTCTAAATAAAGGGAACTTCCAACGTCGTTGTGCTTAACCAAATGTTATTCCC:1 + chr3L 18342207 3' + Bari1 313 1 64.36 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGAACAGAATTGATAGCATTCTGCTACAAT:1 - chr2R 9618072 3' + roo 9026 1 71.29 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTGTATTTTTGAAGAAACGCAAATCGTATTGACATTACTATACCAGAACGAATAAAATG:1 - chr2L 16252104 3' - pogo 18 1 45.54 TAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGGCCTGTGGTTGGGCCGGCCAAAATGCGAAAATGCCAAAATGCGAATAT:1 + chr3R 25184582 3' - F-element 4516 1 59.41 AACGTNATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGAAGATTGTCATTCTTTGTTATTGCAAATGTATGATTCCCGCGGAGAGAAAAAAGAATACACTCAAAAA:1 + chr3L 27382964 3' + Bica 4828 1 77.23 AACCAACTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAACTCTTGTGGTTTTGTATTCAGAAGATGATCTGT:1 - chr2L 4699635 3' - Copia1_DM 189 1 67.33 TTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTC:1 - 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Quasimodo 275 2 62.38 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAAT:1 + chrX 2090285 3' + roo 9045 1 60.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTCCGTGTGCCTTAACATGTCTTGATTGCCAAAAACTAAGCGTTATATACCAAATATTGCAGCTGCAGCA:1 + chr2R 11129370 3' + hopper 1411 2 75.25 ACTATCAGATACCCGTTACTCCGCTAGTGGTTTAGACATATACGACATATTTTTGTGGTTGCTAATCGTGGTTACAAATTCCACTACGCCTATTTATTGTA:1 + chr2L 6487444 3' - INE-1 548 1 53.47 ATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTTAATTGTTTATTAGGCATGCTCGATGTCTTTTATAATGTGCCCGTCTTAATATGATTTTTGT:1 + chr2L 11454626 3' - copia 328 1 57.00 TCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACACACACAAACAGAGATATTTTGTCAGAAAGCAATTAGAA:1 + chr3R 26806002 3' - flea 33 2 60.40 AGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTTGCGATTCAGCATACAGTTTCTGGAGATATAAACGAACTAATTGCTCCACATAATCATGGA:1 - chr3L 27858836 3' + INE-1 140 1 76.24 CTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGGTGCGTCTGGTTGCAGGCATTACATATGTAGCGCGGTATCGATGGCACATGCACC:1 - chr3R 28821188 3' - I-element 4900 1 56.44 TGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCCTGGTGCGGTAAAAAATATTTGCCTTCATCACTCACTTCAATCATGTGTC:1 - 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chr3R 28327047 3' - Doc 4467 1 59.41 GGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCCATTTGTTTGACCACATCACGCATACGCCCCGTGGTGCGCTAT:1 + chr2L 6605660 3' + blood 378 1 79.21 CCCCGCTACCTCCAACATCAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCTTGTGGCCAAGTCATCATCTCATCGGAACGCAGTTCGCGCTGAGTTCTCCAACGAA:1 + chr3L 2412091 3' + F-element 409 1 60.00 TGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTATGTAGTTTGCATTCGGAGGATGAGAGAGCTGCCTCTTCC:1 - chr2R 16978622 3' - 1360 3195 1 60.40 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGC:1 + chr3L 9762271 3' - jockey 4765 1 64.36 CGGCCACGGAATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCACTCCACCTTTGCTATGACTTCCATTAGAGCTGCTTAGTTCTCG:1 - chr2L 3113992 3' - accord2 7434 1 57.43 CAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCTATCTAGGGTCCACTTAGGGCTAGGTGTACGTGTGACTGTGTGTCGGATTTGCACCGGAAATGTGGATGACTA:1 - chr3L 9964287 3' + R2-element 325 1 70.30 TGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACAT:1 + chr3L 24208192 3' - Quasimodo 32 2 66.34 ATATATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACA:1 + chrX 13874136 3' - blood 170 4 78.57 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCGCA:1 + chr3L 22324088 3' - hobo 41 1 60.40 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTACCCTCGTCACGCCCCCAGCAAACCAGTAACCCAGAGCCACTTCCTCCTTTTACAAAAGACACGAC:1 + chr3R 23529659 3' - 1360 9 2 57.43 TGAGTGAGTTAAAAGAACCAACCACGGAAACACAGAAAGAATTAATTTTTGTCGCTCGGCTCTTTTGTTTTTGGGTTTTTATTCAAACGAAGTTCATTGAC:1 + chr2R 12407075 3' + invader2 352 1 63.37 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAAAGGCAAAA:1 + chr3R 5208240 3' + hopper 1410 2 74.26 TTTCTTTTGACCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAG:1 + chr3L 17307313 3' - Stalker4 486 1 70.30 TTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTTAATAAGATGCATAATTAAATACAACCATGATCTCAGCGCCCCAATTTAAGAA:1 + chrX 2125107 3' + G6 1988 2 54.46 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAACTCCAATAATTAGATTCTTTTCCGAAATTTATACACCTTAGCATATAAATGTGATACA:1 + chr2L 6292828 3' - roo 8732 2 63.37 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCAAAACTTTGTCGATCCGTTCTTGGG:1 - chr2R 10697021 3' - 297 14 2 53.47 GGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGAAGTCGACAGATTGGCATGTGCACCGAGAAAAACACTCGACTGTGTTCTGTTTC:1 + chrX 20775120 3' - hopper 119 1 60.82 GTATCTGTTAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCCCTCTTGTTTTATTTTATAAAAATTGTGCTGCAATGCCTTTTGTACTTTTTACTTCAAAGAACGCG:1 - chrX 22843978 3' + INE-1 558 1 54.46 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACTTCTCCTCCTTCCCGAATTTCTCACTAGTTGTGGAGAACCGAAGTCCCTGTTTGGAACTGG:1 - chr3R 23700903 3' - mdg1 7053 2 60.40 AATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCTCGCTCGCTCTTTTTGTGCCTGTTCCACTTTCTGCTCGATAAAAAGGGCTCAAATGCG:1 - chr3L 12931644 3' + G2 2744 1 72.28 GGCAGATAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATGTAACCAAACTAGTTTGAGCGG:1 - chrX 13354227 3' + pogo 2100 1 79.21 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATAACACGAGCCGTAACGACGAGCA:1 + chr2L 10635336 3' - roo 8675 2 69.31 CGATGGAGAGCGCCAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCCGAAACAGTTTGATAAGCACAATATTGCTTGCCACGGATCTGGTCGGACATATGGTAGTAATCACG:1 - chr3R 10138151 3' + R1A1-element 383 1 70.30 CTAAGTCCTGGCAGGTGTTCCCAGAAGTACAGACGTTTCTGCTTCTTCTGCTTCTGCTTCTGTTTCTGCCTTTTGTCCATTGTTCTTTACACCTTACTCCT:1 + chrX 1245715 3' - baggins 5024 1 63.37 CTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGCCCAGTATGCCGATCAATCCGTCGATTGATCTCGGCTAGCATCGAGCTTAGCACTAGCTTTCTTCTGAGC:1 + chrX 6233966 3' + G-element 3949 1 70.30 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGCTAAGATATGCAAAACTTACGAAAAGCACATTCCCCGC:1 - chr2L 23069244 3' - 1360 15 1 47.52 GTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTTAGAAATAAAAAATTGTTGGAGAAATAGTTTTCACGTCTTTCTACTTAAGATGTATTTGCTT:1 + chr2R 5468351 3' - 297 6949 2 73.27 ATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGTGGTCCCCGGTAATGCTAAACACCGCAACCAAAGACGGGG:1 - chr3R 17456486 3' + R2-element 85 1 81.19 TGGTCTTAGGGGAGAGCGTATACTAAGAAGCCAATTGGCTTTTAGTTTGAATGTGTGTCCACGCCATGAGACGTCGAGTCGATGCCTATCCTATCTGAAGG:1 - chrX 542920 3' - Fw2 3484 1 75.25 ACGGAGGAAGCAAATTAATATTTTCGGAATGAGACAGTTCTAGAATCGGGCAAAAGTGGGCGAGAAAAAAAGTAGGAGCGGTATGTCTGAGCGTGGCCTGG:1 - chr3R 11944059 3' - Gypsy12A_LTR 2058 1 59.41 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGCGACAACAAACTTTCACTGGAGTTGAAGCTAAAGTGGGTGTTGG:1 - chr2R 22454934 3' + hobo 2907 1 54.46 CGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGCGCAAAATTGTTATCAACAATTAATTCGTAAAAAGACAATTTAAGCTGCCCTACCCAAACAGCC:1 + chrX 11503729 3' - invader3 55 2 66.34 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGCTATCTATAGTGCTGCGTCCCAGGTACAGTGAACAATTGC:1 + chr2R 10697106 3' + 297 360 2 66.34 GTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGCTGGTGGAACTGAGGAAATCGTCGCTTCCGCTGCAGAACGGA:1 - chr2R 8470126 3' - F-element 4459 1 67.00 AGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGAAGCCGGATGGGCAACACGAGCAGCGGAGCGAGTTCGAATGGAAATG:1 + chr2R 7842610 3' + Rt1b 4905 1 53.47 TGCTTCGCAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACGATCACCCATGAAAAAGCAAATGGTAAAAAGTGGAAAGTGCGGGATGCAAACCGTTCACATTGTGT:1 + chr2L 8180882 3' - accord2 7221 1 71.29 TTAGACTTTAAATCTATATTATTTATGATCAATTGGCACCATGTAAAAAATTCTTGTAGAGTAACCAGGACCCCATTGAGCTCCTGGTCCCGCTCTCTGTT:1 - chr2R 14259466 3' + 1360 243 1 78.22 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATATTCAGCACATTGCTTAGAAAGAAAAAAAAAATGTATATGTATAATTCA:1 + chr2L 20128999 3' - 412 7077 2 48.51 TAACGGGGATATGATCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGTTATTTGTAAATTTGTAAAAAAATGTGATT:1 + chr2L 12242037 3' - invader3 5244 2 73.27 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAGAAAATATTAAAGCAAAATCGGAAAATATTGGAAAATAACAACAATACAAATA:1 + chr3R 6216888 3' + pogo 2081 1 57.43 GTTATTTTACATTATATTCAATTCCTCGTTCCTGTTCTCTAGGCCTGCTTTATGGTCCTGCTCGAGTTTACGATAATCTCATCATTTGATGTTGCAGCACG:1 - chr2L 2632522 3' + Cr1a 4322 1 71.29 CTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTAAGCCGCTTCAGATAATCTCCTCCCGAGAAAACGGACCGCGATTCGTCATATCTTTATATCTACGTCCAACTCCCG:1 - chrX 1248266 3' - gypsy 392 2 72.28 TACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTTGCAATAGCTGCAAGGATGCAAAAATTGAAAGGAGC:1 + chr3R 22896972 3' + P-element 135 1 36.63 GACCANCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGGGGCTCGCACTTTGCTGCGATTTTTTAGCGATAAGGGGACTTTTCTGGCGTTGT:1 + chr2R 21379638 3' + P-element 2883 2 73.47 CCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCA:1 - chr3R 14882075 3' + gypsy5 7331 2 51.49 AAGAANGGAAAAATAATCAAGAGTCGAATGCGGAAATTTATTGTGCGCGCTCTCGTTTTTTGGCGACCCCCTTAAATTGTTTATCGTCGCGATTAGCGGCC:1 + chr3R 6099604 3' - Circe 6962 1 61.39 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGTGCATTGTAATTCATTTCGAATTTATAGCCACCCGCGATCCGAATCAAAATCA:1 - chrX 8714566 3' - P-element 22 1 57.43 ACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTACCATGCGACAGACCGTTTTTCCCAGTGCAGCCATGTTGGATCGCCTCGATCGATGTCGAATG:1 - chrX 2050650 3' - 1360 465 1 66.34 ATTTTCTGAACACAGCTGTAGATATGTACGAAAGTATTGATTAGGCCTTCAGAGCTCTGATATACATATGTACGTAAAATCCGGCCCACTAACTCCCACGT:1 - chr3R 5365017 3' - HB 2 1 77.23 ATTAATAAGGCAATGATTGTGGAGTGCTTGTGTCCACACGAAGTGCCACTGTACCCCACTTCCTACCCATGGGCTTCCCCCCACCACCCCCTTGGAGGTGT:1 - chr2L 18717575 3' + 1360 443 1 68.32 GAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGATATACGAATGCGTGCATCTCGGCTGGATATCC:1 + chr3L 5781790 3' - Doc 378 1 67.33 CCGTATGAACGCCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGGTAGAAGGTTAAGATTAAGCATACAGATTTTATTCCAAGCTGAAATAGAGAAAAAGCTGTTAGGCC:1 - chr2R 9945323 3' + INE-1 135 1 66.34 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGGAGCGTCAACAAAGCCATAAAAGCGCGCTTTTAGCCAAAGAGCCTCGTAAAATACGAAATACATACATATT:1 - chr3R 31293178 3' - hopper 2 2 78.22 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTA:1 - chr3R 13375966 3' - 1360 30 1 57.43 CCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACATGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATACACCCAAGCTAAAACTATAACAAAAACAAGAC:1 + chr2L 5153648 3' + I-element 335 1 70.30 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGCCGCATTTAATTTTTAAATGAGGGACTTTCTTTCAGCCG:1 + chr2L 2645265 3' + mdg1 7425 2 59.60 TTAATAAAATCCATATTAGGTCCAACACTGACCTACGCCATCAAAGTGTGGGGAACTGGCACTCCAGACATTTGTCGCCTGGTACGCTTGACTTAAAGGAA:1 - chr3R 26852280 3' + G5A 2401 1 57.43 GAGTTTGGTTAAGTAAATTCGTATATTTGACATATATCTAAATGTAAAACATTTTATATGAATTTTGTACAAGTTCTTTTAGGTACGCAAAGATAACTAGA:1 + chr2R 25179146 3' + HB 281 1 73.27 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGCCTCTTTATTCCACTGAC:1 + chr3L 21908961 3' + roo 9044 1 54.46 TATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATGGCGCTCCACACTTTATCACATGCAAAATTTTGTGTAGCATACTTTTGGGGGCTGCTAAACC:1 - chrX 1518044 3' - jockey 4914 1 48.51 CTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCCGAGCGTGAGTATCGTGAGTACATGTAAGTCGCAACCAGAGCAGCGGATGCATA:1 + chrX 378153 3' + Stalker3T 112 1 56.44 TTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAAACGTACTTTGACTTACATTT:1 - chr3R 14807950 3' - roo 8778 2 85.15 GCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATTGTGCGCCACGTTTTATCTTTAATTGTGCGTTA:1 - chrX 6141103 3' + F-element 4484 1 71.29 GACTATGTCGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTTAATATATCTGAATATTCTGCGCAATCCACAAATTGCGCGTTT:1 + chr3R 5946172 3' - HMS-Beagle 6825 2 57.43 TGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAAAATATGCTTTCTAAAGAATATA:1 + chr2R 542924 3' - Stalker4 7011 4 62.38 GGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGATAAGGGTGTGCCAGGATGTCAAGGCGTCAACACATTTGGC:1 - chr3R 31996517 3' - mdg1 7313 2 75.25 AAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTGTTGTTATTGTTATTATTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGG:1 + chr3L 4832670 3' + R1A1-element 499 1 62.00 AATAACAGCAGAAATTCGAACTGCAGCTTCTAACGTCGCAAAATTAAAATATTTAAGTCATTGGCAGCATTTCGAATATCTAGGGTAATTTTTTTATCTGT:1 - chr3L 10004110 3' + Fw3 2649 1 67.33 ATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCATCCTCGGTCGTGGTGAGCAGCTCCTTTGTGCACTCCTCCAAATAGTTTA:1 - chr2L 4123074 3' + Juan 3807 1 57.43 TGGCGTTACGCTTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTCAGGACTTTGGGTCATTATTCCGGCTCCTTGGAGCCCATAAGCCAAGTGGGTATTGTGCGGGC:1 + chr2R 12666641 3' - 1360 13 1 60.40 CCAGTTCGATTCGGGTACCCTCAACGAAAAGCAACAAGTCGTCTGCAAGCGCGCGACCATTATTCGATAATGGGCTTATTAATGTCTTACACGGAAAACAT:1 + chr2R 19575536 3' - R1-2 2723 1 56.44 TATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCCCTGCCGCTGTCCCCGACCGCTTTTCCCAGTGGCTTGCCTAGTGGCTCTGCTGCACGGTACACACC:1 + chrX 2813754 3' - R1A1-element 289 1 71.43 AGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGACCCCTAGATAGAGTAGCCGCTTCGTTTGGTTGTTGAGGTTGTACCATATG:1 + chr4 204055 3' - R2-element 386 1 75.79 GTTTATTATTGAAACATGTACAAGTGTGTGTACATTGTGTATATGAAAAAATGCTCTAATTTGGCAGCCGTTTGAAATAATAAAATCTAATTAATTGTTTA:1 - chrX 9349972 3' + Chouto 5857 1 73.27 CTCTTNAGTGGATTGCGCATAGATACAGATCAGCAAAGTTTGAAATACGTGGAAAGTTTTGAAATGAGTTTCGAATAGAGGTCTTCAAAATCAGGAAGTTG:1 - chr3L 13794793 3' - Quasimodo 7142 2 60.40 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTATGACGAAAACAGCTGTCAGAAAAAGCTTTGGGCGAT:1 + chr2L 6656331 3' + P-element 2846 1 36.63 TTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAAGATGCCTCCGATGCACCACCAAAGCGTGGACTTTTGAACGCCATCAAGCTGCCAATCGCCAACATGATACC:1 + chr3L 16774508 3' - F-element 4328 1 75.25 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGGTAGGC:1 + chr2R 5640422 3' + roo 9053 2 60.40 TCGCATCAACAATGTATTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGTTCATTGTTGCTCGGTTTGA:1 - chrX 7527706 3' - rover 381 1 80.20 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTTTTCACTCTTCTTTTGAAGACAGTGGCATTAAAAAAATGTCGTCATGCTTGTATTAATACAATGCTTA:1 - chrX 12958864 3' - roo 8670 2 60.40 TATACACATTTAATAATGTTTTTGGATCAGTCAAAGAAAAACCAGTGATCTTATTGGGCACAGCCTTCAGGCTCTCCATAAAGATATCCGAATTGGTGTGC:1 - chrX 3462281 3' - Tc1 56 1 57.43 TGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGATAAAAAAATCAACGCAATTCAAAAAATTTAATTTCATTAAAATAAAGAGCACGAAGGAAGATTGTTAC:1 - chr2L 12728369 3' + opus 7496 2 71.29 AGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGGGGTTGTGGTGGTTCTCTGACATACTTATGGGATTTAAAGTACATATATATATAGGCATATAGTT:1 + chr2L 12025852 3' - G2 2890 1 56.44 GATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACTGATCCATAGACTTCCCCTCCTTTCGTTTCCCACCCAAGTCATGGCACATTTCCACATT:1 + chr2R 12603074 3' + 1360 3178 1 65.35 AGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGATTCATTTGCGGTGAGTTATGGGCAATTCCAGTATGAACGAACATCCCATCTATAAACAGGGTTTTGTC:1 - chr3L 5186104 3' - 17.6 183 2 77.89 TTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTACCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTGGAATTAGTATTTCAATGTTAAGATT:1 - chr3L 4244715 3' - hopper2 1309 2 70.30 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATTCTTCACTCGACTGATAAGCTTATTACGGGAGAGCGACGATTTGCTTCGACT:1 - chrX 756974 3' + S-element 1699 1 57.43 CACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTTTTTTTTCTTCTTGTTAGACTCCGCGGGTCCACAGTTTCTGCGCTTTCAG:1 + chr3R 15428589 3' + 17.6 7214 2 62.64 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGGGGAAAAAAACCAGGTTTGCAAGCGCAACACTTTTTGTAGGGTGGCCCGCATGAAAAGCGT:1 - chrX 12665945 3' + S-element 1707 1 70.30 GTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGTAAAGTGCATAGATTTAGTGAATCGCAGCAATTAGACCAACCAAAGCAATTGGAGCAGG:1 - chr2L 20675068 3' - Max-element 8386 2 61.39 TCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTAAACTATTAATTTAGCTCGCGCGAACGAGTACACTGGAATGTGATAATT:1 - chr2L 9730789 3' - Bari1 1499 1 58.42 CACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTAGTTGTGCGGGCTGCAAATCTTCAACAATTGCCCTGATTTATAATTTCTGCTTA:1 - chr3L 17138472 3' + HMS-Beagle2 6794 1 63.37 CAAGAGCAAACAGAGAAATCAAAAGCATGCCACAAGCACTGAACTCCCAATTTTCATGCAAATCAGCTGGGAAATCGCATTGAATTTTCACCTCAG:1 + chr3R 17784521 3' + Bica 425 1 78.12 CTGCTGGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCCACTTGCAATATGCATGTCCGGCCAGCGCTGCAAGCAGCCTATTATAGGTAAAGTTGCGACTTGCCA:1 - chrX 10330942 3' - TAHRE 10024 1 81.19 GATTTGCCCTCCTTACTGTTACTTATGTTACTTAATCTTAATCTTAAATGTTCAATAAACGAATTAAAAAAAAAAACAAAAACTAATCCTGTGTAATCA:1 + chrX 21033775 3' + Rt1c 5366 1 60.61 GTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGACGCATCATATGGAGAAACGGAATATTTGCAAGTGTAT:1 - chr2R 22060463 3' - HMS-Beagle2 7089 2 62.38 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGATATAAATTCAGTCGTTTCTGGGCTATTTCCA:1 + chrX 18258783 3' - jockey 4723 1 68.32 ACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGTGAAAAATGGGAACGGGTGGGTCATTTACCTGGTGCCATACTTATAAACGGCGGGGAACTCCTG:1 - chr3R 22529418 3' + accord 394 2 65.35 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGT:1 - chr2L 15997892 3' - 412 7103 2 83.17 ATATCNTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTTTGA:1 - chr2L 1912994 3' - pogo 29 1 59.41 AAACGNATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACCCTCTATCTGCTCTGTCTGGTGCTAGCAAAATTCGCTTT:1 - chr3L 13326649 3' - transib2 1 1 78.22 CAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGACAGGTGAGTTCCAATTAGCACATTACATGGAAGGAAAATCTAGCCAGCGAGGGCGAGGAGGG:1 + chr2L 13126484 3' + Tirant 41 2 68.32 AATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGAAGGAAACTAAAGTAAAAACACCAG:1 - chrX 21668216 3' - Bari1 226 1 75.25 CGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGTGCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGACGCCGAAGGGTGAATCAGCCTTGG:1 + chr2R 21146876 3' + G-element 341 1 67.95 GATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGCCGTTTGTCGTTTACTGATTTTGTGACGCTAATAAA:1 - chr3R 14832367 3' - blood 7009 1 79.21 AATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATATAGCAATCTATGCTGATTGCCTGGCTTTGCCAGCATTTG:1 + chr3L 5724331 3' + Stalker3T 294 1 61.39 CACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGAATGCATAAGCCGCCTATCTGTTTTACTGATTGATTTCGTTTATTTCGATTATATGGTTTTTCATCCTTT:1 + chrX 18113136 3' + Chimpo 437 1 72.28 GAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTAAGTAAAATGCTGAATATGCGACACCGCAATTATGTGTTGCTTACTTATGGGGATGGCCCGCAGGGCGTATGA:1 - chr3L 14923774 3' + Tc1 1547 1 66.34 AGTCTNCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCGATTTCCCTTATCAGTTGAAATGATACATTTTG:1 + chr3L 19051939 3' + roo 406 1 76.24 AGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTTATTACATACTAGAAATACAAACTATTTTTCATGTTTTAAT:1 + chr3L 3484931 3' + diver 47 2 59.41 ACGGTTTAGACGGCCAGTGAGGAGGATTTGTGTGAGCGAGGCGGTGGAAAAGGGATAGCCAGATGACGACCCACGCGGGCGGAGATCACGAGATGCCCC:1 - chrX 2664075 3' + aurora-element 207 1 63.64 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGGACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTG:1 + chr2R 8198508 3' - F-element 62 1 73.27 TATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTAAGGACATTTTTCGGTGGTGGGGTCGTTTGGGGGTACTCACTGTTAAAGCT:2 + chr2L 931620 3' - mdg1 484 1 56.44 ACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAACCGCAGATGGAGGCGTCAACGACTTCTTACACAAAACATTTTTGGTGTAT:1 - chr3L 3848329 3' + Doc 4476 1 60.40 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATTACGCTGTGTGTGAGCATGTGTGTGCGAGTGTGCGCTTGTGTGTGGCAAAATTGTATTATGTGCGGCATA:1 + chrX 9950920 3' + hobo 2937 1 77.23 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTACACACTCTAAAAGGC:1 + chr2L 18568122 3' - I-element 23 1 56.44 AACGGGGCTTTATTAAAGCGATTCCGAAATACACGCTGTGTTTTAATAACCGAGCATCCGCTTGAAAAGTATGAAAATCTAACAGGGAAAATGGCCAAAAA:1 + chr2L 5447809 3' - mariner2 225 1 72.28 ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTATTGTTGGTTTATTTTTCCC:3 + chr3R 8480494 3' - transib2 16 1 63.37 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGCG:1 + chr2L 14536292 3' + blood 7336 1 75.25 ATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAACAAACGTACAAGAAGGAAAGTGCTTGCATGCAAAAATGTGGCCCCACCGAACAACTA:1 - chr3L 14905334 3' - copia 166 2 60.20 CACCCGCTGTCACCCGCTGTCACCCGCTGTTGCAACGCTATGCCCTTGGGCAGAAAAATCAATTGCATTTCATGCACCAGCCCAGTCCACTCCAATGTCCG:1 - chr3R 18596504 3' + GATE 16 2 75.25 CACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACAATTAAAGTCAACAGGAAATGTGACACATT:1 + chr2L 17096868 3' - Bari1 255 1 70.30 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGGTAG:1 + chr2R 5640420 3' + roo 388 2 58.42 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTTT:1 + chr3L 25341891 3' - 297 40 2 70.30 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTACACACTCTAAAAGGCTGTA:1 + chr2L 18568126 3' - I-element 19 1 60.40 GGACCGAGAGTGGGGGTATGTTAACTCCTCCCCCCCCCTCCATACTTTTCCCCACCAAAGACAACAATTCCATTTGAATTATGACATTTCAATGTTAACAG:1 + chr2L 3150317 3' + accord2 199 1 71.29 AAAAGGCGAGTCAGATGGTGAAAGTTATGACTTACGATCGGTCTCGACAATACTCAGTCTGTTGAGATCTACAACTAGCTCTGGGCTTCCGATAGATGAGG:1 + chr3L 7764067 3' - gypsy9 4886 1 55.45 TATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATGATCTGTACCTGTCTTCGATTAGTTATGTCTATTGCTTATAACATTCTTTTTATGAA:1 - chr3L 21275558 3' + flea 385 1 74.71 AAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATTATGAGTACGAAGACAAGCAATTTTAATCTGATTCTATTGCAGTTGCTAAAAAAAAAAATATATGGCGCC:1 + chr3L 17858261 3' + HMS-Beagle2 307 2 72.28 TTTTCGTTTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCGTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTCCCCTTAACTTTTTCGCCCGG:1 + chr3R 23827363 3' + Cr1a 197 1 84.16 CGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACACGGCCATTCTGACTTTATCGCTTGAGTAAGTTGCCGCTGCCTTCCGTT:1 - chr3R 11517496 3' - micropia 32 2 67.33 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTGAGCCTCCAGCTGCTGGCCGAACTGATTTAGAGCCACATTCTTTCGGAGAGTTTTT:1 + chr2L 15622788 3' - mdg1 19 2 58.42 TGTGTGCTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTC:1 - chr3R 14913145 3' - blood 7037 2 54.46 GCAATGTTAAATTGCTTTACTACAAAGCACTACTCTGTGTGTGTCCAAGGTATGCGACAAACAAAGAAAGGCGAGGAAAACCAGGGGATGTTCTGAAAAAA:1 - chr2L 179476 3' + Doc3-element 124 1 63.37 TATTCGCACCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACAGATTCCTTCTGAGTTTCCTCCTTATCCTTATCCTTATCTTCCAATTCAATATGATTTTTTGCA:1 + chr2R 14615505 3' + McClintock 5995 2 64.00 GTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACTCTGTACTCTATAAACCGTATAAACCGTAAACCGTACCATCCTATCGCCGGTTCGTATTCCTC:1 - chr2R 24015889 3' + hobo 2854 1 45.54 TAGTTNCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAATAAGAGCCACGACTATGACTATCTGCAT:1 + chr3R 30897715 3' - jockey 168 1 74.26 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATGTATTCGATTTACCCATTCTTATGCGCAATATGAAATGACCCACAAACAAATTTCTAAATAGCTCGACTAA:1 - chrX 13854396 3' + pogo 2100 1 80.20 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGTGCGCCAACGTATATTTGCCACCTGAGGTCACGAAAACGTCGCTTACTCTTAGTGGCTGTGGC:1 + chr3L 7316397 3' - jockey 13 1 73.27 GCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACGCCAAACAGCACTGCGAACTACTGGATGCGACATCCTCACGTAAGCATGGCGATGTACGTAGAACGGCACGTAA:1 - chr2R 9456838 3' - Cr1a 262 1 57.43 CGGAAGCACCGATTCGCTGGAAGCCTCTGGAGACGTTGACAGGGGTTCCTTCTCTGTGGAGTGTATATTTACGCTGTTTGGTTTCAAGCTGTTGTATCCTA:1 + chr3R 9749534 3' - HeT-A 5720 1 67.33 GAGGCGTTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATCCATTATGTATCTGAGTTTGTATC:1 + chr2R 18434556 3' + pogo 2077 1 55.45 TGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTGCAATCGTGCTGTTCGGCATCTGAAAATTCAGGGCAAGATGTGGTTGAAAAATCTT:1 + chrX 5680789 3' + Bica 240 2 57.43 AAAAAAAAAAATAGAAAAAAATAGGTAAGGGAGAAAAACTTTGGCTTAACTTTCGTCATCATCAGGGGCCAAACAACATCATCGTGTGGCTCTGACAGCCG:1 - chr3R 8142874 3' - hopper 143 9 61.39 ACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAGTAAACATCAGCGGGACATCAACTGCGGAATCGCAAACGAAAACGGGCAGGACAGGGCAAA:1 - chrX 4028644 3' + Doc2-element 4502 1 62.00 TGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTACCGGTGCACAGTGAGGGGGTGGCGGGTGGCTTAGGAGGTTTTTGGGTGGTTAACGGTGGG:1 + chr3R 10464401 3' + R1A1-element 135 1 69.15 CCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAAATTCGAGAATCATCAACTGGCAAACACACACTCAAATACAAAGAA:1 + chrX 22747517 3' - Doc 6 1 73.27 TGTAGACAGAGATACGATAGATGCAAAACAACAACCCACGACGCATTTGCCGCCAAACCGACAGCATTCGCAGCCATTACTCATATATTTATGATCCACAC:1 + chrX 12284279 3' - Circe 92 1 75.25 CCTCTAACCCTGCTTCTCGGATCTGGGGGCAGTTGGTGGGAAAAGGGGAAGGCCGGGAGGGTGGGTGGTAGAGAGAGGGAGGAAGGAGCGAGAGAAACACA:1 + chrX 13070998 3' + R1A1-element 4886 1 76.24 CGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCACAAGCTTGCCGTGGCGCAGGTAATTGAGCACGGGTGCAAAGTATTTGGGGTCTCTGTCGATCAGG:1 - chrX 1514500 3' + F-element 281 1 73.27 GGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAACAGCCCAAGGCAAAAGCAAGGTTAAACATCCAATCATTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGC:1 + chr3R 19446978 3' + baggins 5417 1 66.34 GAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAATTTCTATTAGGAAAATTAAGCAGGGGCTACACATTGCGT:1 - chr3L 18957586 3' + copia 252 1 73.27 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGA:1 - chr3R 22899168 3' - P-element 22 1 55.45 CGTCTGTCGGTATGAACGACGAGATCGCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTAGAGATTAATCAAGTAGTTGTAGACGAATTTGATTTGTAGAATTTTCAAG:1 + chr3L 11497675 3' + INE-1 128 1 52.48 TAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTTGGTCTTTCTGCGTGTGGGCG:1 - chrX 3052874 3' - I-element 405 1 79.21 TAATAATAATAATAATAACAATACTAACAAAAACACAGCCAAAACTCAACAAAAAAGGAATAAAAGAGCCAAGCGCGCCATCT:1 + chr2L 14220852 3' + mdg1 7056 2 68.67 AAATAGTCGGATCAATACGATGAGCGATATTTTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGTCCCCACCTCCTGTACAAAAAGAAAACCCCCCGATCGCCTGCTTCA:1 - chrX 13122846 3' + transib2 2345 1 54.46 AACCCTCTTGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATATTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGGGGAAAATGGCACACAGCATACGAT:1 - chr2L 19878589 3' - Quasimodo 7055 2 75.25 CAGTCNAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTACCAAATAAACCAAAGAGGTCGGCTACTGGCAAAAGAGCCACATAAGCGCTGACGCCATGGTCCCACTCT:1 - chr2R 20143773 3' + invader2 161 2 53.47 TAAAACTTAAAATGATTCTTATAGCTAACAAAGACTCACCGCGGCCACGCGAATATGCTGTGGAAGGACGCCGATGCAGGTGAGCGCTGTTGTTGGGGAAA:1 + chr3R 20201005 3' - Gypsy6A_LTR 145 1 61.39 GCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGATGCATTTCTTAACTTCAACAATTTTGGCCGCCTTCAAGCTCATTTTAGTATATACATTTTG:1 - chrX 13445138 3' - hobo 2563 1 57.43 TATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCCTTAGTTTGTGTGTTTGTATCCGACATGCATACACTTGAATAGTTTACGTGG:1 + chr2R 19461667 3' - HeT-A 5981 1 62.38 AATAAAGTAAAACAAAAAAAAAATAATTGAAACACCATTCGACAAAACAACAAATTCAACAACTACAATAACCATCGAGAATTGCTGCGTTTCACGTTTAA:1 + chr2R 20606560 3' + BS3 1769 2 70.30 ATTTAAGCGAAATTTTTCTTATGTATCTATTTAATATACATATAATTATACTATTATATTAATCAAAATTTTCTACAACTATGCGCATTACCAGGAGGGCG:1 + chr3R 25012839 3' - transib3 2650 1 75.25 GAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGGGGAGATGGGCCAAAAGAGCGCAAGAGAACCGCTAAGAGCGCATTTGCGATTGGCAAGCCGGTAAAAA:1 + chr2R 11115878 3' + hobo 2937 1 56.52 TAGCAGACAACTGTATGTGTGCAGACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATCTGCTCCTTTTGGAACCCCCTATCCATTTGTTCTCGTTGAGGAT:1 + chr2L 12156459 3' + 1360 164 1 58.42 GAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGAATACAGATTGTAGAGACAAATGCGCAGCTCAAAACAACTCGTTGGAAAGTAGTAATTAA:1 - chr3R 15626721 3' + INE-1 148 1 68.32 AAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATAATTAAAACTTCTTAATAAACTTTATGGGACAATTATTTGATG:1 - chr3R 8217653 3' - transib2 318 1 57.43 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCGAAGTTAGCCGAAGTCGAGGCATTCGC:1 + chr2R 20698434 3' - P-element 19 1 55.45 TGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGCTAATCTTTCAGCTCAAAACAACAGTAAAATTATTCAGAACCTTTAATTAAATTAATTTCCATTCTTTTA:1 - chr3R 7168374 3' - hopper 415 1 71.29 CTCCTATTCTGAGGAATATCGATAATCAAAGTCATTTACGCTTTATGCGTTGTGTGGGTGGCCGATGACTGGATATCCAAATTCTCGGCAATTTGGGACTG:1 + chrX 8120557 3' + S2 257 1 65.35 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACACATTAATGGCACTTGTGAGGCGTTATAAACTGC:1 - chrX 3306602 3' - hobo 40 1 73.27 GCTACAGACATTAATGAATAAGATCAGGAATTGACCGTGCTTGCAACCGATGTGCCCGAGGCTATCAGCAGACCCGCTCCCACGTGGCACCCTGCATCAGT:1 - chrX 14692304 3' - Gypsy12A_LTR 2133 1 61.39 CATAAGCCGATCGCGGAGCGTAGGAATGATGAGCATCCACTTTGCTGCTGGCGGGCTTCTGCGATTGGGAAACATAATTCTTTCCAAGGGCTCC:1 - chrX 19586324 3' + Stalker4 7130 7 47.87 AGAAAACTTATTCGAGTATGTAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGAGTTAAATTTGTATTGAAGAAGTACATGGCAGCTCGGGTGA:1 + chr2L 8357609 3' + Doc3-element 4543 1 70.30 GAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTCAGAATCGCGATGATCACTTTCTGGTATCAACCCCAACGCAATATCAACATCTGAGTG:1 - chr3L 16905489 3' + Q-element 420 2 61.39 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCATTTTAATACGCTTAAGTGCACGGCGAGTCCCTAAAACTATGCTATGAAAAATAGTTCAACAACT:1 + chr2R 13314197 3' - jockey 18 1 68.32 GCGGGCACGGTTGCTTTCGCAGCTACCTGAAGCCCTTTAGACATGAGGAGGCTGGAGATTTGATGAGGAAGATGTACTCCGCTAGCAGTTGCGCCTTGGT:1 + chr2R 1806929 3' + Rt1c 5012 1 52.00 ATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTTCTTCTTCATTGTTGTTGTCGCTATACGGCCAAATTTGCTAATTAATTATGTCAAAGCAACAACGCAC:1 - chrX 7692501 3' - accord 7212 2 75.00 GTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCAGCGCGAGAGCATTCAACTGGACCCCAAGCTGGCCAAC:1 - chr3L 21504608 3' + HMS-Beagle2 6939 2 62.38 CGTATGGAATAGAACTCTAGGGAACTGCCAGTAAATCCCTTTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCGGACATATAGTGTGCTATAGCATGCCACAGCCTG:1 + chr3L 21225095 3' + Porto1 4273 1 66.34 GATGCNGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTTTGATTAAAGCAACTATTAATATCGATATA:1 - chr2L 1912968 3' - pogo 3 1 72.28 CTCTTTGCTGCTGGTTGAATGTGTTAACTTATACGCGAGTGTCGCTGGCAAACAGATGGCTGCATTAATTGGATCTGAAGATTTTTGCAATAATCCCAAGG:1 - chrX 18943820 3' - gypsy7 5243 2 76.24 AAAAAATAAAAAAATAAGTGAACGAAAACGGGCGAAAGTCCTGAAGGAGGGAAATCTTGTGGCGTTAATTGAAAATTACATGCACATTGTCTGTGGCCACG:1 + chr2L 3822833 3' - Tc1 1393 1 81.19 GCTGAGAGCTTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAAGCGGTCTTTGAAAAATGATCTGCTCGCACCTGAG:1 - chr2L 20668504 3' - 1360 3283 1 66.34 GTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGTTGGATGAGGTGCATCTGCCTGGCGGTGGAT:1 - chr3L 17624133 3' + roo 407 1 77.23 CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTGATCAAAAACCAATAAAGTGCCACGAACATCGTGCTGTGCGCAGGAAAAG:1 - chrX 17074675 3' - copia 77 2 56.44 AATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAAAAATCGGTCACTTGTGA:1 - chr3L 21637322 3' + Bari1 1690 1 58.42 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATTTTTGTTTTTCTTGTTTGCACCACATCCGGGACTCATTTTGGTTGTCTTTGGTTTGAGGCTAAAA:1 - chr3R 15713133 3' - 1360 36 1 68.32 AATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTATTTTCCTCGTTTCTGTTACAGGTATTTTTTTCCGAAGAGTTGGGTATTTTTGAATTTGCAGTGCTTTTT:1 + chrX 15049397 3' + Cr1a 4309 1 60.40 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTATCTGTATAAATAAACTAAAAGAGTGGGCGGCAGTCGATGTATCGCAACAAGACGGGCAGGCTGCCAAAACGCTT:1 - chr3L 8763195 3' - jockey 8 1 76.00 GATCAAAGGCGAGCTTTAGAAAGAACGGCAGAGCAAATTGGATCATCGAACGAGTCGGTCGACGCCTGCTTGAGCTGGTTGATGCGGTCGCCAATGGCCTC:1 - chr2L 5192947 3' + gypsy7 5318 2 65.35 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGAGCAGTGTGGGCCAACTCCACTAATTAACGTACAAACAGAACGGAGGCCTCAAAATGTCGCAGATACAAAGGCAA:1 + chr3R 5208238 3' + hopper 1408 2 72.28 CGTAGAAAAGAGCTGCTGGCTGTAGAGATATATGTATGGCCAAGGCCAAGGAAGAAGCCGATCTCGATGTCCAGCAGCCCCAGCAGACCAACTGTCAGCCA:1 - chrX 8861697 3' - 1360 132 1 77.23 GTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTCGGTGTGGTTCTTGTGGATGGTGTTGGTGTGGATGGTGTTG:1 - chrX 8510336 3' + Cr1a 231 1 61.90 AAAAAATCCTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTCTTGTCTTTGGTAAAACTAACCTGTCTCACGAGGATCAGGATCAGCAGTAAGAAGAAACCGTAGAG:1 - chr2L 8527979 3' - 1360 24 1 45.54 CTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTATATAAAAGCAGGTTTTCATGTTTATCTGAAATCAGACCACATGATGTTGTCACAAGTTTAAAACAATAA:1 + chrX 2991456 3' - Cr1a 476 1 71.29 ATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTTGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAAATGCAGCACACAAGCTTTTTCAGCAGTTGCACCCAA:1 + chr2R 13750744 3' - diver2 4766 2 75.00 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGTCCTATTTGTGGTAAATGTAGTGGTCTTTTTTCCTCCTTCTGTAGTGTTGCTACTGGATCAGTACATACGTT:1 + chr3L 9068118 3' - jockey 4747 1 51.00 TTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACACATGTAATATTTTTTTGTTAAGACCCCTCCCGGTAAAATACATAAAAAGGCCAGAAAATACATTAAAA:1 - chrX 11851376 3' - opus 7267 2 70.30 GCTAGNGAGTTGCCGTAGCTGGAGTGACGGTTTAGACGGCCAGCGAGGAGGAGGAGAAGGTTGGATGGTGGAAATTAGGAGCAGGCGGGAAAAGCGGGCG:1 + chr3L 9117750 3' + aurora-element 181 1 54.00 ACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCTGCACCAAGGAATCTCAGCGGCGCGGCTACTGTTCAC:1 + chr3R 20290495 3' - Stalker 7095 4 63.37 TCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTAAGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTAAGACCACGAGGACATATGAGCGATGGCAAGTTAAC:1 + chr3R 28644332 3' + R1A1-element 5028 1 66.34 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTTGTCTTGAAACACGCTGCATAATGGCTTGATACATTTATGGACAC:1 + chrX 22517678 3' + 1360 3365 1 55.32 GGGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCT:1 - chr3L 22054984 3' + mdg1 7031 1 54.46 TGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTTAAGTCAGAAGTAATGTGTTTCAATGCTAGACATAT:1 - chr3L 12602949 3' - flea 4675 1 64.36 ATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCCGTTTCGATACGCATTGTCGGTATTATCTCGTATATAATTGTATTTGAATCTTG:1 + chr2R 16668759 3' - F-element 172 1 72.28 GCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAACTTCAGCTGGACATGGGTGGCTTCAAGAAGGGCCAGGAAGTGGC:1 + chr3L 6066646 3' + R1A1-element 381 1 56.44 ATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTAAAGTGTCTTTGATAAACCCACTCCGCGATTCCATTCAAACATGCATAAATACATGGTGGTATTATTAAGTTA:1 - chrX 6949213 3' - 1360 19 1 68.32 CATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCGTCGTTCTCACCTTGAAAAGAAATGAGAAGATGCCCAGCGCCAATCCCAACTGCAAGGATC:1 - chr3R 8525488 3' + Idefix 194 1 55.56 ATTTCAACCACATTTCTGGGTAAACACAAGCGCCCAAAATGCTGACCAAACGTCCCGCAATCCTTTTTACTTTTTATTATTAACTACGAAACTGCCCACGC:1 - chr3R 8694917 3' + HMS-Beagle2 37 2 53.47 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGCGTCTATTTGAATATTGAACGAGTCTTTTAGT:1 - chr3L 9324640 3' - Quasimodo 37 2 60.29 TAAGTAATAATCTTCTGCTCCCCGGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTTACCTCTGGAGGATTCCTGACGACAACGATTGCAAATGCCGAACGGAATTTA:1 - chrX 5060560 3' + Gypsy6A_LTR 300 1 69.00 CCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGTGGCCGGTTTTGTTTTCATTTTGCACAGGAATTCCTTCCGTTCTTCAAGTCACCAAATGTTTAT:1 + chrX 8538188 3' + gypsy7 277 1 70.30 CGAACAGGGGGGCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTATCAGGCAGGAGTCGTTGGCCAAGTGCACGACACGGGCCAAAACCGGGAACAGGATGAGG:1 - chr2R 11050988 3' + Rt1b 4732 1 65.35 GGTGCAGCTAATAAGGGTTGCATCCAGTCTGGTATATTCTACTCTACTATTGTTATCATGGATCAAATAAATTAAGATAATATCACATTTCAATGTGACTC:1 + chr3L 10333446 3' - gypsy12 129 2 56.44 GAATTNAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCG:1 + chr2R 20698408 3' - P-element 45 1 31.68 TTATCACATTGTATGTTATGTTTACATTTGATAATTTGAATTATTTAACAAGAAACATTGGAATTTACTACACTTATTCGATATGCTACGAAACCACAAAT:1 - chr2R 12722010 3' - TAHRE 10202 1 66.34 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATCCATTATGTA:1 + chr2R 18434542 3' + pogo 2063 1 66.34 TATTANTATTATTATTATTATCGTTATGATTTATTCAAAAACCTACCTGCTCCACAGTTAACGAATCGACGATCACCAAGAGGGGCTGCACCACCGCCAGG:1 + chr2L 8344094 3' - mdg1 7075 2 84.16 AACTGATTAAATATAAATAAATATAGAGTTTGATATAAACTCATTTAATCTTAATCAACTTTTTTCTCTAGTACATTCGTAAGTGTAGTTATTTACATTTA:1 + chr3L 15447133 3' + Burdock 306 1 75.25 ACTTGAGCTGCGTATGCGGTTTTGACCCTTTGGCATATTAAATATGTGTACATACATGTGTACGTAAAAAAATGTGTACATATGTTTACGAATTCAGACCG:1 + chr2R 3021008 3' - Quasimodo 227 2 67.33 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTACACAGATACCGAAACGCGCGCAAACACACACACACACACACAAA:1 + chrX 7978951 3' + hobo 2928 1 55.56 TATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGGCTTAACCACTAGAAGCGAGTCTTAGATACACTAAACCATTAAATAATTCACAGAGAAAAGGTATC:1 - chr3R 10389734 3' - blood 7146 2 72.28 AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAAATCTCAAGAGCTATTGGCAAAATTAAACTTT:1 - chr3R 10490312 3' + transib2 2819 1 74.26 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGTATATATACACATGGTGTGTCCCCCAACCACTTCGGTTCGGCTG:1 - chr3L 7231120 3' - 297 12 2 57.30 CGATGCGTAGGCGGATGAAGGTTGCTCATTCCAGTTTATGTACGTTGCCTCTGTCGAACTTATACAAACTGTAAAAATTATGGTAAAATGTTGTGATTTGG:1 - chr3L 5748742 3' - Ivk 5036 1 64.36 ATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACACAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCGAATTTTTCTTTTGCTTAATTGCCGCCTATTAATCCCGAC:1 - chr2L 11958210 3' - invader2 417 1 58.00 GTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAGCTAGAAGAAAAAAACACCCCCGCAGAAGAGAGAGTCGTAAACAAAAACCATGGGCGTCGCTCTG:1 - chr2L 3303256 3' + Tc1 1593 1 72.28 AGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGTTATTGTTCCCGTTTTGGGACACTCTCTGCTACGTGAC:1 + chr2L 15640692 3' - F-element 4580 1 62.38 AAAAATTCAAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTGGAGCCGGCTAAAAAGTTCGTGAGCTTCTCTCTGTCTCTCGCTAAAAACCCAATTAAACGCGTCATT:1 + chrX 4813713 3' - 1360 81 1 62.89 CTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGCGTATGGAATAGAACTCTGGGATTACTTTGAAACGTATCCCGATCAG:1 + chr2R 18444071 3' + Porto1 4218 1 73.27 CCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTATTGCCTGTTGGTCCACTCAGAAAAAAT:1 - chr3R 26362698 3' - F-element 415 1 77.23 TGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACCTCTCTCCACCATCCTCTGCCAGCGGTGTGTCAGACAAACAGCTGCTTCTGTTGGCCGATAAGCATCG:1 + chr2R 23794235 3' - Bica 4515 1 75.25 TATTACTCCAGACGCGGTCCTCAATTCTGCAACTCGAGACGCCGTCTCTGCCAGGAATCAACTGCATGACTCTCGTGTTCGTGTACAGCATCTTAGATTTA:1 + chr2L 4131077 3' - diver2 4435 1 73.27 TTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGACATGGGTTAAACCGATAATTGACAACGACGCCGGCTCGAGAGGGCCG:1 + chr2L 6791991 3' - blood 433 1 58.42 TTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTGTGGGTGGCGGGGCTGCAGCGGGTGGTGGACCTGAAGACTGTGTCGGAGTTTGT:1 - chr2L 21230766 3' - McClintock 6036 2 54.46 ACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCTTCAACTGTCAATATGCAACCGAAATGGCCAA:1 - chr3R 12534929 3' + HMS-Beagle 6654 1 68.32 GCCCANTCTAACGACCACAAACCTCCCATTTCTTCTTGTCCAATATCTATCGATGGTCCTAAAAAATTAGAAATAGAATAGTCTGAAAGACAAATCAATAA:1 - chr3L 22950050 3' + INE-1 218 1 71.29 CTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGGGCGAAGAATGTTCTCGTTAAGTGCAGCAAACACCGCACATTACGCCGATTTGTTGCAGGCA:1 + chr2L 9275429 3' + 1731 4543 1 68.32 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTATTGTTGGTTTATTTTTCCCCATATTTTCGTTTC:1 + chr3R 8480508 3' - transib2 2 1 77.23 CAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCACAGCAGCGCCGAAAAATTAAC:1 - chr3R 28938850 3' + pogo 171 1 79.21 TATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTGTTTATGCAGTCCGCTCGGTACGCAACGGTTTTGCAATTTTAAAAGCAGTCTGACTGCAGTCTCCG:1 - chr3R 23615311 3' + 1360 177 1 65.35 AGCAAGCCGAAGTGTTTGCTGTTCATCTCGCGGAGCGATTCCAGCCTTTGAACCACGACCAGCTGTCCCACAGAAGCCAAATTGACAGCCACAAAGTCTTT:1 - chr2R 14696106 3' + BS3 72 1 69.31 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATGCAAACTTAACCTCAATTTGGCACTATTTAATTGTTGTT:1 + chrY 1618890 3' - F-element 45 1 58.42 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCATATT:1 - chr2L 18286137 3' - 412 7102 2 74.26 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGATAAAAAAATCAACGCAATTCAAAAAATTTAATTTCATTAAAATAAAGAGCACG:1 - chr2L 12728384 3' + opus 7481 2 58.42 CTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTATTATCTACTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTATAAATGTGTTTGTGGTCATAGATTAACTATCTTGGATGGG:1 + chr2L 11095609 3' - Doc3-element 4498 1 63.37 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCGATTTCCCTTATCAGTTGAAATG:1 + chr3L 19051929 3' + roo 396 1 66.34 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACT:1 + chr3R 25931372 3' - roo 44 2 69.31 CTTGTTTGCCGATATTTGATTTAGATTTTTTCCTAACTAAGACTCTTTTACTAAAAGCCATATTTGGTGTAGCAGTGTCGAGGCAATGTGCGCGCACTGGT:1 - chr3L 2594169 3' - X-element 466 1 69.31 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTTTGCAAGGG:1 + chr2R 8463638 3' - I-element 11 1 59.76 TGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAACTACACAAAAATAAGTAAACAAAAAAAA:1 - chr3L 19970729 3' + F-element 4643 1 77.59 TATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGACTCTGC:1 + chr2L 18112598 3' - transib2 2556 1 69.31 AAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCTCCATACCTGGCCCATAATTTTGTAATAAAATGGCAGAACGTTT:1 - chr3R 4977807 3' - flea 488 1 55.10 TACTGCGTCCTTTGGTACTCTTTGCGTTCGCTGCATAGCCTGAAGGGTTCCGCAAAGGTGTGATTCTGGGACTTGGTATATGGTAAAAGATGAAACTATTC:1 - chr3R 15804973 3' - invader5 463 1 74.26 TCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGCTTCCTGGCCGTCGTTCATCCCGTGACTAGCATGTCCCTGCGAACGG:1 + chrX 3655908 3' + Copia1_DM 132 1 56.44 ACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCACCAAAGGAAGCCCTGCAACAACCATAATACACACTTGCCATATTTCATACATCGAGCTACATAAAGAATAT:1 - chr3L 13642593 3' + F-element 324 1 73.27 ACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACTTCCACCGCGCTCTATTTCGGGGTGCATGCAAC:1 - chr2R 12069220 3' + F-element 235 1 67.33 GATGGGCTCCGTTCGTCGGCACCACTTCTCGCGGCGCACAAGCGTAGGCAGGTACTCCATGACCCACCACCTCCAGAATGGGACGTTTGCAGCCGTGACAG:1 + chrX 16716447 3' - aurora-element 3809 1 75.25 TTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCATCGTCTTGATTTCCTTGAGGCGTCTCCGCCGGCACACCCACGCTGCTTATCGGCAACGGACCCAGCTCGTCC:1 - chrX 19544330 3' - R1A1-element 455 1 55.45 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAAAATCCCTTTTCAGAGTAGCAGTAGA:1 - chr3R 19203521 3' + BS 5042 1 76.24 AAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCTTTCTCACCCGCGGCCTTACCAACCGAGCAACTTCCCAACTCTGCTCCCGATGGTCGTTTGCTGCTTTTGCATATTAA:1 + chr2L 720953 3' - blood 7177 2 63.00 ATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCACCGTGAGCAGCTCGGTGCCATTGTAGCTGGCCAC:1 - chr3L 16036035 3' + F-element 4452 1 62.65 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTAATGACGGCAGCAGAATATCTTCTCACTAGATGCCATGAAACTTGGTTTATCAATCTTAGGGAAACGA:1 - chr2R 5968751 3' + flea 5008 2 74.26 TGTACACACACACACACATACAAACACACGCATGTAACCCATTGGAGGCAGGTCCTTACTTCCCCCAGCCCCCGCTTTGGACACACCCCGTGACAAAGGCA:1 - chr3R 7815006 3' + Quasimodo 36 2 68.32 TATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAATCAGATGCAAATGAGATACGCATTTCGCGCACATGCCACTTTTAATTGGCAGAGCCCATCA:1 - chr3R 30495510 3' - Juan 4042 1 62.38 CGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGCCACGCTCTCGCCACTGTTAGTTAACATAGCTCTGC:1 - chr2R 11616128 3' - jockey 201 1 64.36 AATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTATGGTACAGTCCTCACGTGTTGCACGGACCGACAAAACAGGGCAAAACCCTTGGACGCGATA:1 + chr3L 18348306 3' + transib2 2445 1 64.36 CTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGTGGGTCTGGGCCACGCCCAGCGGCGTTGTCAG:1 + chr3R 28074271 3' - accord 58 2 68.32 CGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACATCCACATCCACATCCTCATCCCGATCTCTGCCAGAGACAACAGTTGGTGTCTGACAGCA:1 + chr3R 19337310 3' + copia 4754 1 62.38 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGA:1 + chr3L 25232910 3' - 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G-element 345 1 55.45 TAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGACCAATGAATTTGTGGCAAGAGAACAACTTCATCAATAAATTCTTTGTAAGCGTTACACGC:1 - chr3R 11169818 3' - F-element 4229 1 68.32 AACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGACAACCATCACTGTAACGCTGGAGGTTCTCTTCGGCAAAGCCTTTGATCTAGTATT:1 - chr2L 10460742 3' + F-element 4301 1 57.43 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGGAACAGGAATAGCACACTTGCCAAAGACGA:1 + chr3L 25842138 3' - 1360 1 2 94.03 GATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGAACATCGAGATATGGAAAACTATAAGAGCTAGAAAGTTGTGACAGGTGCTCTTGTTGCTGGTTGGCAGTCAGGATCT:1 - chr3L 20423175 3' + INE-1 114 1 62.38 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATTCA:1 + chrX 1523770 3' - jockey 35 1 56.44 TGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTACTGCTGCTACATCCGGATACCTGAGGCTGATGCGTGGCGTATATATTTCCCGACGCCTGGTGG:1 + chr3R 8839996 3' + roo 69 2 71.29 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTTATTAAACTAAATTTTAGCTTAGTGGTCAAACTTCTCTAAAAAGAGTATCAATAGTTTATAGTTATAAACG:1 + chr2L 8757187 3' + roo 405 1 68.32 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAAGTCTAACAGCCACTGGAGTTGTT:1 - 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pogo 8 1 68.32 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGGAGTGCAGGTCGGTCCGTGAAAAAGGGCAGAATATGCAGAGCTATGGCGGCCCCAATT:1 - chr2R 5910843 3' + hobo 2922 1 53.47 AATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATTTAAATGCCCACGAGAA:1 - chr2L 17080726 3' + Quasimodo 201 2 45.54 GTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATACCTTTTATGGTAGCTAAACGGTGTGTAAATATAAATAAATGCGCT:1 - chr2L 20465587 3' + blood 7360 2 58.42 CCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATCGCTGGCCTTGTCTCTCTAATTGCGTGAACCGAGATGGATTAACGGTTGAGCCGGCGCTGC:1 - chr3R 20291264 3' + R1A1-element 5317 1 66.34 AAACGCAAAAAAAAATGAAAAAAAAAAACAAAGGAGAGCTGTAATGACATTAGATGCTTGGCCGGGTGGACAATGCGATTCTTGACTCCCGATCCCTTGTT:1 - chr2L 3685453 3' + Bari2 917 1 67.33 AATGATGTCAGATTTCAGACTACTAATAAATGTTGATACTAAACGTGAACCGGTTTATATATTATATATATTCAATGAATCAGCAGCGTTGCTCATCGGAA:1 - chr3R 13709956 3' - gypsy4 6379 1 74.26 CACAGCAAAAATCTATCGACTATGAGTCGATGAAGCTAATTGCTGGCGCGTGCCCTGTATCAATTTTTCCATATCAATTTCGGCACATGACGTAATCTTC:1 + chrX 12474263 3' + G5 424 1 53.00 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTA:1 + chr2L 1353757 3' - 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I-element 5209 1 76.24 CAGGTAATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTATTTGTTTCAAATAGCAGAAATGAAACGTAAAGGATTTCCTCAAGCATCTGAG:1 - chr2R 4909109 3' + invader2 4828 1 51.49 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCC:1 + chrX 14424081 3' - hobo 32 1 71.76 CAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAACATCAGCAGCAGAAAGCTGGCAAATAAAT:1 - chrX 5936365 3' + Bica 444 1 71.29 GACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCACTTCACTTACTAGCTTAGATGTTATTTTAGCTTTGCCGGTCACCTTAACCGGTATGTTGT:1 - chr2L 15072611 3' - baggins 4973 1 38.61 GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGAATTCGTTATTGGTTTATTGTTAGTTTTAATTTCTCA:1 + chr3L 10464717 3' + invader3 5449 2 65.35 CAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAATATCCTAAAATATTTGTTATAG:1 - chr2L 2707152 3' + mdg3 5087 1 78.22 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCTAATGAATATCAGACATCTACATCCAATTCTAGTTGTTTGTGCCTTAATTATTCGACACCTTCCAAGCTGTAAAC:1 - chrX 20864402 3' - roo 8665 2 73.27 TTAACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGCCAAACTGTATGTATGTATCTAAATGATTACAAAATTGGTTACAAAAAGAGTACATTAATATTGAAATTTCCACTC:1 - chr3L 24719721 3' + S-element 1704 1 60.40 CAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGT:1 - chr3R 178127 3' - BS 47 1 74.26 ACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACTTGTGCACTCCCAATTCTTCGCTGTG:1 + chr2L 19630921 3' + F-element 235 1 74.00 TTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGGTGGCTAAGGTGAAGGCTCCGGTTCTGGTTATCCACGGCACCGATGATGAGGTCATTGACTTTTCCCA:1 + chr3R 25098831 3' + Tc1-2 1310 1 70.30 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGGTGCCCAATGTTACCGTTTATAGTATGTGTCGAAATGCCACG:1 + chr3R 24585158 3' + P-element 2868 1 42.57 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTGTGTTCGTGTGTTTGAAGAGGTACAAGCGCGCGTGGATGTAC:1 - chr3L 14882812 3' - jockey 33 1 59.14 CGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCACCGTCAACATCCAACCGTGTCCTGCACACATTTACACT:1 + chr2R 15449783 3' + Tirant 8093 1 62.00 GTATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTATTTTTCAGGTTGTTTAGCCCGTTTAAAGCTGCTGCTATTGTGGTTTTTCGAGACCCATCGCTTCCTA:1 - 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pogo 20 1 57.43 GCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGAACAAGCGAACGCGAACAAGTTGGCCGTTACGTTCCAACGTT:1 + chr3R 22178751 3' - micropia 5170 1 59.41 TACTTTTTAATATTGTAAGCCGAATTAGTTGATTGAAATAGAATTATTAACAAATGCCGACAGCGAACGTTGCAAAAGCAGCCAGAAAAAATTAATTAAAA:1 - chr2R 18486490 3' + diver2 46 2 78.22 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAAAGAC:1 + chr3R 12578195 3' - jockey 26 1 55.45 ACCATGAAGGCCCCACAGGAGACAGCCGAGGGACCTCACCATACGGTCCCCATTGACGAGAGCCAGGAGATGACGCCGTCTAATTGCTTTTGTTTGCTCCA:1 + chr3L 20711084 3' + BS3 1549 1 72.28 CGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTAACTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTTCGACAGGACGCACATTTGCCATTCTCG:1 + chr2R 18682566 3' + diver2 4654 2 75.25 TGAAGAAGATAAACAAAAAAACAAGTAAAAACAATAAACAAACGAAATATGAGAGCATGAGTAATGAAATGAACGCATTAAAGAAGAATTCTTTTAAAGA:1 + chr2L 18248262 3' + Porto1 155 1 62.00 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCG:1 - chrX 8364638 3' - jockey 4808 1 74.00 TGGCGTCGTGGAAGATGTGTGTACCGATCGAGCATAGGCAGCGGCAGCATCGCATTAACTGCACAGGTGTCCACTTAATTGACAGCTAACGAGGCACAGAG:1 + chr3L 21088041 3' + Osvaldo 446 2 64.36 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGCACATTAAATTACAGTTTTCAGAGCCAAGAACAAACAA:1 - chr3R 27619209 3' + hobo 2902 1 68.32 ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAAAGTATGCTACGCAATTA:1 - chr3R 13339022 3' - BS 5010 1 60.40 AAGCCCGTTAAATTTCTTCGTTAGACAAACCTTTCACTTTCGGTCTCATATCTAAATGCAAACAAAAGTCTCCGAAAATTCCTGAAAACTTTCTCGTTCCC:1 + chr2R 16397914 3' - looper1 436 1 66.34 ACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACTTGAGAAAAAGGACTACCAAATAAGAAAG:1 + chrX 17297211 3' + Bica 386 2 71.29 ATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCCTCATTCTCAGTACTACTTGTACCAGCTGTTTTCGCACAGGTGAAGGGTACAAAT:1 - chr3L 5200672 3' + Ivk 4945 1 57.43 CTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGATGTTGCCGTTTTTGTCATCGTTTGTAAT:1 - chr2L 10109898 3' - micropia 364 2 71.29 ACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTTTTAATGTTGGAAAAGAAGACTAACTTTCTACCAGACCATCGGCATTTGATCGAAATGTATCGAATTGATCGCACA:1 + chrX 21064173 3' - 1360 3230 1 79.21 GCTGGGGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTATTAGTATCGGCATTCGCATCGACACCGGATTGCAG:1 - chr3R 28665025 3' - I-element 5084 1 58.42 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGTCGTCGGGCATCGGATAAGCCAAAGTAGAAGCGAT:1 - chr2R 18865848 3' - roo 8700 2 64.29 ACCCAACTGCATTACCAAGATTAAATGCGACTGCGCCACTGTAATTCATCATCATCATTCTTAAGCTCCAACATCTCAGATTCATAGAAGTAAATAAATGA:1 + chr3L 9074434 3' + rover 6871 1 80.20 TCTTCCGAAGCAGCGCTCACGGCAGAATGCTGACATTGCGCTTCACACGCTCCGGGCAACAGAAATGGTTTTATTGTATTGCCTCAACTATCTGATACCGG:1 + chr2R 17650004 3' - gypsy4 155 2 55.45 CAACAAAACTATTAAAAAAAAAGCTGCAAAAACGCACATATTTATCACCTTAAAAGCGGCGTCTCAAACAAAACACAAATACGCAGCACTGCGAAAAGGAC:1 - chr3L 20540283 3' + Porto1 4421 1 64.36 TTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTTTGGTTTGCTCTTCTGCCCATCGAGGCCCCTTTTTTTCCCCTTC:1 - chr3R 20232950 3' - I-element 233 1 56.44 ACCTTCAACTAACTCGAAAATAAACTTTTGCGAGCCTACAATGAAAAATGAAAATTAAAAGTCTTTCCAAATTGTTAATATGGTAGTTACCATTGTTGCCT:1 + chr3R 9356058 3' + Doc 335 1 50.50 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCGTGACCTAAAGTGCATTGAACCAGATTCATTGCCAAGCTCAGAAAAATTCCCCGATAAGTAA:1 - chr3R 11160750 3' + hopper 1388 1 64.36 GTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCATAGAAACCCCAACTTCTCAAGTTCCCGCTCCCGTTTCGTCCAG:1 - chrX 5040541 3' + Idefix 184 1 62.89 AATAATAATAATATTAATGAAAAAGCTATAGCTGATGGAACTGAATGAACTATTTGGTCCTTTGAGGCGGATTAATGAACTTGGGCTTAGCCAGTAGCTTT:1 + chr3R 13671886 3' + mdg1 7078 2 82.18 GGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACA:1 + chr3L 21840336 3' + 1360 3350 1 65.35 TAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGCTGGCGAGGCAGGGAAATGAGCCAAGTGGCCGCAAACAACTCGGATTGGATGTGGAAT:1 - chrX 17765139 3' - Ivk 5021 1 68.13 TTCCAGTTGACTACTTTTAATTAATCTCACAATAATTTTTTCTGGCGTGCGTGCTGTCTATACTCATGTGTGTCGTGTGAGCTTCTGAACTGGCGACCAAA:1 + chrX 3291191 3' + Cr1a 3976 1 62.38 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAAACAACATATGCATATTTAAACTTTAAACTTTAAACTTTATATTAGTCGAAGCGAGCCGAACCACACCA:1 - 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G5A 2431 1 70.93 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACT:1 + chr2R 18865900 3' + roo 9030 1 68.32 TTTTTGTTTTTTTATTATTATTGTTTGTATTGTCGTCAATGTCCTCACTGCTGTTTCAATCTCATTTTCCTACACATTTTCACCCACAGATGACCTACTCT:1 + chr2L 13988681 3' - Rt1a 5072 4 60.40 TCCTACCGTGCCCTCCTCCCCTCCTTCCCTACTCCGGGACAACATGGACTGGCAAGCTCTGAGAGGGGAAATTGTACTAGGAAATTTGCCGGAAATTAAAA:1 - chrX 1766438 3' + G-element 279 1 56.44 ATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAACGGCTTAATTGTTCTTAACTGTTTTATTTGCTTTTTATGGAACTGAAAAGGAGACAGACGAGCAATTGGG:1 - chr2L 6815647 3' - copia 471 1 66.34 CCCGCATAGTTAGCATGTTGGTAGCGCCGTTCTCTTCAGTAAGTGTTAATGTGTTGTTGGTATTTTAAGTTCTCTGAGCTCTTATCGATGAAATGCTTGTG:1 + chr2R 6182039 3' - Ivk 5104 1 57.43 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTGATTCAATTGAAAAGCTTGTTTTGGTTATCCACTTTTCAACACATCGTTAGCTTTGGTCATGGAAATGT:1 - chr3L 5827855 3' - blood 8 2 72.28 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATTTGTCAACGGTAATGGAAATTTATGCTACCGTTGCTGCTGA:1 + chr2L 18286185 3' + 412 7511 2 58.00 TGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCAGGCACTAAAGCGTTTCCATTCGGTCTGGCCTTTCCTCGGAACTTAAGTTGACTCTGC:1 - chr2L 4098871 3' - R1A1-element 5244 1 59.41 AACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCCCGGATTTTAAGACGTTTTTT:1 - chr3R 24662707 3' - jockey 84 1 77.23 CAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAGCCCAGACTGACCGGACATCGCTGGCTGGCCGCGATGCAGGTCTTTAGCCATGGCCAATGTCTTAGGTGCCA:1 + chr3R 13436370 3' + 1360 453 1 43.00 CCGTGTGATCAGTGTTGTGTTGCGACAGTAGGGCGCGAAAAGTTCGGAGGGAAATGCGGTGATAGATGAGTTTTTCTTTTTGAGTGGTATATAATGCGGAA:1 + chr2L 11853950 3' + Rt1b 54 1 62.38 GCTACNACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTACTATTTCTCACCTTTTTCGGCTGAGCTAA:1 + chr3L 13879341 3' - hopper2 1207 2 69.31 GATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTACATCAAGCACCAGCAACAACAGGAACCAAAACTACCACCGCAGACTCAA:1 - chr4 331796 3' + Idefix 114 2 59.41 CTGTGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCTAATGTTCATGTCTTGTAGGTTGTCAGTGGCGAAAACAAAAACTC:1 - chr3R 17211113 3' - hopper 123 1 54.26 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATAATTGATTTAACTCATTT:1 + chr3R 17727139 3' + I-element 5296 1 79.21 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGCGCGTACATACATATGTATGGG:1 - chr3R 11731193 3' - hopper 52 1 74.26 GTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTTTTCCCATACTCATCCTGATTTGTGTTCCTGCCTCTCCGAGTCGCGAGTTTTGTTGTG:1 + chr3R 28026773 3' - Doc 4496 1 62.38 ATTAATGTGTTTTGTACGCTTGTGATTAATTGGATTCTTGGCAATACTCTATTCGCCAGCCCTAAGTCCACTTGTATTCGATAGCCTTGCATCGATAGCGC:1 - chrX 13387406 3' + frogger 387 1 60.40 CTGCGACGCTGCCGATGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTATTAGAAGCCTAGCATTGCTGAAATTGTCACAAATTGGCAATCAAACCAAAGTTATCTAC:1 - chr3L 7268742 3' + HMS-Beagle2 189 2 68.32 CACTAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTA:2 - chr3R 19718713 3' + INE-1 541 1 80.20 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCAC:1 - chrX 3697130 3' + jockey 4950 1 67.33 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTT:1 - chrX 13354270 3' + pogo 2058 1 77.00 CCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACGTTGTCGGACACCGAACCGGAGGCCGGCTACATCGCAATTTTCAATGGATGAAATGTCAAGCTACAGACGGGTTGCG:1 + chr2R 2048356 3' + Tirant 8124 2 64.36 TGCTCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATTCGTTGCCCCATCGCTCGGAGAACAGGAATGCGCAGAACACCATCTTTGGGGGCTATCTCATGCGCC:1 + chr3R 31594179 3' - Doc3-element 4365 1 54.46 TTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTAGCTGAGTCACCGGATGGCGCTAAATTATTTAAAACGCGAGTGTCACGAGGGCCAGAAAGGTGGGGAAA:1 + chr3R 31271136 3' - jockey 4925 1 79.21 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGAGCGTTCGAGCGGTGCGGCTAA:1 + chr2R 8145979 3' + P-element 2838 1 27.84 TAAATNTCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTTTATTTTGAATGGATTTGTTGTGTACACAATTCCATTTCAAAATCCAT:1 + chr3R 25431034 3' - Ivk 317 1 58.42 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAAAAACCAAGGAGACAGACAG:1 + chr2L 171774 3' - 1360 204 1 82.18 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACCCTCTATCTGCTCTGTCTGGTGCTAGCAAAATT:1 - chr3L 13326655 3' - transib2 6 1 73.00 CATATTTAACGCACGAGAAGAGAACGTGCTCAGCTGTTTCGCTCCGTCCACTTCCGCACCATGGGCAATCATCCGCTCCTTGTCCTGCATCCTTCTGGTCT:1 + chr2R 2994307 3' - Rt1c 5116 1 82.18 AGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCGGCAGTGAGAGTTCAATTCAAACAGAACATCTGATACAA:1 + chr2R 18889866 3' + opus 323 2 61.39 TTTTGAGGGAACATTTTTCAGAGCTTATACTATTTACCATTTTGTTGTGGCACCTCTATAGCC:1 - chr2L 3024061 3' + mariner2 507 1 71.43 GGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCATCAAAATTAGGGTTCTTATGGACTGGATGAAAGCAACTGGATTTAATTATGTTAATTTGTAATTTTAATATGTTAT:1 + chr3L 12645433 3' - Quasimodo 152 2 62.38 TGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGCAGCTCTGCGCAAGAAGCTCGCCAACAACGCCTTCGCGTTTCCTTGCTTTCCCAAGAGATTTGATGAAGATAGACGA:1 - chrX 15497251 3' + G6 485 1 60.40 CGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTTGTTGCTTTCGTTGTTGGTTGGCTGCATGTTGTTGCTTTGGTTGCTGCCATGGTTGTTGCTGCCG:1 - chr2R 12921405 3' - I-element 212 1 69.31 TCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTGGATCGGAAACGCTGCTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 - chr3L 19471445 3' - INE-1 138 1 65.35 TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGCGAAATGGGGCCACG:1 + chr3R 4807844 3' - P-element 24 1 55.45 GCAGAGCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCATATATTTTGAATCATAGGCTGC:1 - chr2R 6726635 3' - mdg1 273 2 76.24 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAACAGAAAGTATATCTTATACATATAAATGATGTAAAGAAAACAAAAGTTGCA:1 - chr3R 25876243 3' - flea 20 2 59.00 AGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACACACTCATTCTATGTTCACTATT:1 - chr3R 7512426 3' - copia 5077 2 78.22 TCAGCNAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCTCGGTTGTAGTCTTTTATCATGTCTTTAAGAGGTATGGTAAATTGTGGGC:1 - chr3R 4383998 3' + R2-element 3248 1 57.43 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAGTAATAGCATTAAAAGGGAGAGTCACGAATAGCAAATATGAATCATACGCCATGTGTGC:1 + chr3R 15703759 3' - copia 4886 2 59.41 AATGCACGGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGATTCGAAATAGCGGTGCTCCGCAACGTAATGGGTCACACGCACTCGACAC:1 - chr3L 97655 3' - baggins 5343 1 55.00 AGGGGGATCTATGAGTCATGAAGGGGCAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAATACACATAGAAAACCAATCTCATCTAGTTGCATTACGTTTAAATTT:1 - chr2L 18208569 3' + baggins 5372 1 69.00 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGTGTTGTGTGGTTGGGCTTACACTA:1 + chr3R 31996738 3' + mdg1 369 2 75.25 AATTAATAAAAATTGCAGCAATTTAACATTTCCTCACTTTGTTTATATTTGTTTCTGGCTGGAGTGGATTTTGGTGGGGGAGGGGAACGGTTTGGAGCACA:1 + chrX 21557127 3' + Transib5 2603 1 73.27 CATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTTATATTTTGGCTGTTGGGTAAAATTGGGTGAAACGTGTCGATCGTGTGGATCTCTC:1 - chrX 6738081 3' - I-element 168 1 63.37 TTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAGAGAAAATTTAAGAATTGTTCAAAGGTGTGGGCGTGACGAGCGCCTCAAAACCTTTGAACCCAGA:1 - chr2R 17235440 3' - INE-1 497 1 73.27 GTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAACTTTGGGCAGCAGCTTACCCAGTCCCGACTGCTCGAACTGCAGGATACGATCGGTAATGCGATTATGCC:1 - chrX 22483364 3' - Idefix 6989 2 80.20 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACTCTGTTAATAGAGATTGAGAAATATCGATGATGGC:1 + chr4 1183006 3' - 1360 38 1 70.30 ATTTGCTTGCTTGTGTGAATAAAAACAATAGATGAGAACGTGCGTATGTGTGTGTATTCTATGTCATCATTTGCTCTTTTTCATGGCTGTCTGAACGTCTG:1 + chr3R 21988008 3' - 1360 3254 1 50.50 ATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGGTTAATGAGATAAGTTTATATTTTGTACACAT:1 - chr4 806670 3' - BS 5052 1 68.32 CCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCCAATTGCAAAGGGTGATAACGATACACTGGCGATAACGCGTGTTGTCCTAAGCTTTTT:1 - chr3R 6446281 3' - baggins 4961 1 55.45 TTAAGGCTGACCGGACTCGTATATGAAAAAATTCGACAGGCGGTAAAGACTGGCTTAAATATATGGAACAAAAGTTTACAATGCAATGTTGAGTGCGACTG:1 - chr3L 15397002 3' - Rt1a 60 1 72.28 ACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGTGTGAGATTTAGTGTACTGGAGTGCTTAACTCAGTAAGTTGTAATGTGGGACGTAATTT:1 - chr3R 27045813 3' - accord 495 2 76.00 AAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTTGATATGTGGGCGAATGGGAGGTTGGAGTTGTTTTTGTTTTTATTCCAGCATTGCATTTTATGAGTCGGTC:1 + chrX 12395456 3' - Porto1 305 1 70.30 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGAGCTT:1 + chr2L 3245015 3' - rover 20 2 60.40 AACATACACACACACACATATGTGGCCAAATAAACATGTTAAGTTTTCAACAGCTGTAAATTATTTCTTGTGGCACTCCAGACTTTTTACTCTGCTGTCTA:1 - chr3L 11919717 3' + accord 7030 4 66.34 AATCACCGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTTGGGAGAGCGGAGCTCTCTCTCTCTCCCC:1 - chr2R 20111194 3' + diver 346 1 71.29 CACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTCGTCGATTTTTTACAGTTCGAGTAATTTTGCAATTAGGTTAATATAGTTACAC:1 - chr3R 31177391 3' - F-element 145 1 59.41 TCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAAAAATCCAAGTGACTAAGAAACACCAGCAGCAAACAACTCGTAATATGTTT:1 + chrX 4570536 3' - Cr1a 364 1 56.44 CAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCTCTATTAACTTTTCGTTTTAGCTACTTTTTCTTTGTCCCATCCGACGGACAGCCGGTC:2 - chr3L 10824040 3' - I-element 313 1 60.40 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGC:1 - chr2L 22407492 3' + roo 349 2 79.21 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGTGTCGCATGTGTTGTGTTCGGTTCTTCGGTTAGCGTTTGATAATGAAATGATCTCGGTGCGGAGCG:1 + chr3L 8733625 3' - Quasimodo 39 4 55.45 TGTTGTTGCTGCTGGTGGGGATTCTGGATATGGCAAATTGTCTGGGCGTCAACTGATTGATTTGTGGGGACTTCGAACCTGTTGATGCAAGTGCAAAATGC:1 - chr3L 10277584 3' - TART-B 147 2 72.28 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAGGGGTTTAAAAAAGCAATAGAATTATGTTGTATAGGTGCTCCTCGTTTACAACATCTTTGTCTATGGCTA:1 + chr3L 25751367 3' - Max-element 8243 2 71.00 AAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCG:1 + chr2R 5532337 3' - G4 3775 1 59.00 CATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGGCTTCTTTTCGGTGCCAGCTGTCTGTAATTATGTGCGCATAAGCAAGGTCCTTGTTGTAAGGGGAATTG:1 - chr3R 22830987 3' - mdg1 7045 2 72.28 TTTATAGTTCATTAGATCTCGACGTGCATACGGACATACGGACATGGATAGATCGACTGAGTGCTTCGATAAAGAATATTCCAGCATTTTTAGTCAAATAT:1 + chr2R 4330755 3' - INE-1 146 1 57.43 TATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCAC:1 - chr3R 9193601 3' + roo 361 2 71.29 GGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATGGCAATATGAAGCAATCCGGGGTAGGCTAACTAAATTTTGGGTCAAG:1 + chrX 14587025 3' - I-element 216 1 53.47 CTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATGTCAAAACGAAGCCAACCTGCCGCTCTGCC:1 - chr3L 6316134 3' + Idefix 26 2 48.51 CGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCGTCGCACAAAAACAAACAGCGCGGATTGTGGGTGGGGCAGGACACCTTTCGACCTT:1 - chr2R 15789860 3' + I-element 153 1 58.42 TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCA:1 - chr3R 12780295 3' - BS 5024 1 52.48 TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGAGGAAAAAGGAGCAGGGCGGAAAAGCGAAGGCAGCCAACTACACATTTAGTGT:1 - chr3L 11477449 3' - Quasimodo 14 2 64.36 AGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAAACGCAAGTAAACTCGTTGAGAAGCGCATAGAAAGGCGCGAACTTAACCTTAAGGTTATATTATGCTT:1 - chr2L 10569026 3' + micropia 323 2 57.43 GACGGNCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATAATACTCTACGTACGCTACTTTTGATAACTCAAACTCTCATTGCAGCACTCATAGCTG:1 + chr2R 7203327 3' - G2 2864 1 57.43 GTCCAGTACTGTACTGTAATTGACGGTCTTTCCGCTTCACCCTGCCACTGGTCTGTTTGTCCGTCTACTTGGAGGGTCGTTTTATCATGAAGAGCGCCCAA:1 - chr2R 12941682 3' - gypsy8 86 2 59.41 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCG:1 + chr3R 20140602 3' + jockey 4958 1 71.00 TACGTNACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTC:1 + chr3R 1048041 3' - Stalker2 7281 2 55.45 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAA:2 - chr3R 14913172 3' - blood 7064 2 75.25 AAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATCAGAGGCGTCAAGAGCAGCGCATTCAGGAGCAACTGCAGCGCCAAGAGCAACAGATTCGCCAAGAGCACCTGCAG:1 + chrX 6553009 3' + Bica 355 1 69.31 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATGTTAATATATTTAATTTCGCTGTATGGCAAAGAAGCGCCAGTAAAATTGCAAAATT:1 + chr2L 20465673 3' - blood 18 2 61.39 GGAGACAAGCTCCAGAACATCGCAATCAGGGGGCTCATGTGAAAAGCATTTCCTCATTTGGCTCGATGGCGCACAAAACGCACAGGTCGCCGCTTATTGGT:1 - chr2R 20970982 3' + jockey 4622 1 81.19 CGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCACACACCATCAGCACCACCACCAACAACAGGGCGGAAATGTCAGGTAAGTCCTTGGGA:1 + chr2L 3760141 3' - flea 4815 1 65.35 CACACACATATACACACATACATTTTGGCTTCATCACCGACACACAGACAGGGGCGGTGTGAGGGGGTTGGAGAGGGGAAAAATGCACGGGGGTTGCAGGG:1 + chr3L 16174201 3' + accord 7040 2 59.41 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATCATGTTATTCTAGGATCTTTGGTTCAGCGCTCTGTGCTGAGACCGT:1 + chr2R 1276182 3' - 1360 53 1 77.78 CATGATGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTTGAAGCAAAACAAGTGCACCGTTAGTTTCCA:1 + chr2R 20399499 3' - 1360 264 1 69.31 GCACTCAACAATCAATGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGATCGGCTCTTCAGCTGTTGCGATCTCGTAGAATTGCCCAATAACGCATTTACGTTCGTTAT:1 - chr3R 16840842 3' - 1360 448 1 64.36 AGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATAATTGGATCGAATGGGACTTCGCTTTGAGTTCTGGCCAAAACAACAGGATGCTGGGTGGTCCCGTA:1 - chrX 20021325 3' - jockey 4842 1 76.24 GCGACNATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTGGAGTTCGTTCTGGCGCTCTCCTCGTCTTGCAGAT:1 - chr2R 8123897 3' + Doc 239 1 64.36 ATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGAGCTGTGAGAAATTTAATGCCATAAACAGACTTTTTGGCACGGCATAATTTAG:1 + chrX 9942135 3' - 1731 267 2 60.40 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTG:1 - chr2R 5322024 3' - 1360 51 1 79.21 AAGTTTTTGGATAATTTGGTTATCGTAAATAGATTGACTTTCAGCTGATCGTGCTCTTCTGTGGCCTGGTCGATGAACTCGAACA:1 + chr3L 23768466 3' + Gypsy12A_LTR 163 1 62.35 CCTAGGAATCAAAAAATGAAAGGAGCATTAAAATATCAATCACAAAAAAAATTACATTAAAAACTTTAACTTGAAGGCGCCCAAGCTAGACTCGAGACATA:1 + chr2L 17234582 3' - transib4 70 1 59.41 CATATNTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATGTTGGCAGCTGAAAAATTTGGCTGTCCAAAAAGTTTGCTAGATTAACT:1 + chr3R 22826828 3' + Quasimodo 6 2 63.37 AGAGCCGGATTCTGAAGCGTGCATCCGCCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCAATTCTTTCTTTTTCGGGACCTAACAATACTCATACTTGCACTTAAG:1 + chr3L 3248085 3' + Gypsy12A_LTR 2204 1 61.39 TAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCCAAAATCAATTGCTTTGTT:1 - chr2L 21781884 3' + P-element 2693 1 20.79 TCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTCATCAGGAGGTGGGTCGAACTATACCAATTGATTTGCCACACTGATTGGCGTATTGT:1 - chr2L 4250624 3' + R1A1-element 5028 1 62.00 GCTACAGACTATAAACTTTGTACATTTTGTTGTTAAGTCACAAATAGTTTGCACGCAAAATCTGTCCATTGACCAAGAACGCCCCGACTCGCCGGCGATGT:1 - chr2L 15635647 3' - transib2 2775 1 64.36 CAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCAGTGTCCTCCTGTGGCAATGTGGTGCCATCTGC:1 - chr3R 4502516 3' + 412 101 2 68.32 TTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAAATGTACGTAAAAATAGATGTCCAAAAATGTATGAATTCTTTTTGTAATTGTAAATCTTGGAATATAATAT:1 - chr3L 16937944 3' + 1360 413 1 74.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAGAAACGACGGCGAACGGCCAGCAGTGTTTCAGTTG:1 + chr3R 22899270 3' + P-element 2881 2 72.28 AATTGAAACTGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACAGTAACACGGTACCACAGTTGCTCGAAGCGA:1 - chrX 19683358 3' - Copia1_DM 86 1 70.30 AACTACCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAATTAATACAAGTATGTTTTGCGACGAACAGTCGGAGTGATAATGCAGACGCTGACTGCTGGGGCCGTATTAA:1 + chr3R 12143942 3' - Gypsy6A_LTR 254 1 76.24 TAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGATTGTTAAAATCGCCGCTCCAGTTAGCAGACCGTTACACAAAAGCACTAACACAAAACACTTGGCAGAGCAGCTCTC:1 + chr3L 14536012 3' - 1360 3016 1 61.39 AACAAAAATTACTTGTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAACTATTTCGCTGCAGCGAGATAGAAGATAGTCGTGCTCTTCTC:1 - chr2R 19165325 3' - Tc1-2 1462 1 59.41 AAACACACACACACACACACATGCGAGCGGTGCATAAATAAGTATGAGTTTCCGAATGAAAATGAAATAAAATAAAATCCATACTCTGGGCGTGACCGAG:1 + chrX 20061247 3' + accord 183 2 51.00 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGG:1 - chr3R 7808966 3' - jockey 61 1 75.00 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAAATGATTCTTTTTGAGATCCATGCCGCTAAGGCA:1 - chr3L 19051847 3' - roo 8702 2 65.35 TATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATGTTGAGCTTTTAACGGTAAATTGTTGCTAGAACCAGAGACCAAAAGACAAAAC:1 + chr3R 25819984 3' - TLD2_LTR 114 1 60.40 TGGATGCCACTCTTGATGAGCATGGACGCTCTTCGACGTGCTCTGCCAGATGGGTGGTTGGCTTTGACCAGATCGTATCCGCCTCTCTCATCGGAAAATCC:1 + chrX 10080605 3' - G2 469 1 81.19 GGTTATTAATATAATACAAACAAATAAATAGAGAAAAATACATATAGAAGAAAAAATAAAACACGAAAAATTGCCTGCCTTTGTGCAACCGAATGGCT:1 - chrX 20871828 3' + Doc2-element 78 1 77.55 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCGTGGCTCAAAGTCGCAGAGAACGGCTAGAGCAAG:1 + chr2R 1320485 3' + Transpac 269 2 65.35 TTTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGGGGGGAGGGTGGCAAGGGGCGGCCTGAAGACGGAGGAAAAATCAAGGAAACT:1 + chrX 5213783 3' - blood 7180 2 41.11 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCAATATTGGTTTGAGAGCAGTTGTGCTCTCTT:1 - chr3R 4806562 3' + P-element 2852 1 44.55 GATGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGAGTTTGGCGTTGGCGTTGCGCTTTAAGATGTTGCTGTT:1 + chrX 8976769 3' + Dm88 353 1 62.38 GAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTTTGTTCTGACTTTAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTTGATCTCAGCAACCCCGCAACCAAGAAGCAAT:1 + chr3L 4418045 3' + Cr1a 4172 1 64.36 AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACACCCACACACAGAGATAAATACACACATAAAAATTTAAACA:1 + chr2R 1000391 3' - HMS-Beagle2 6915 2 58.42 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTA:1 - chr2R 16018825 3' - I-element 22 1 56.44 CAATCCAATTTACATTCGATTTTTAGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACTTGATCTTTTGTTGCCAAACAATAGATCAAGTTTGAAG:1 - chrX 14167453 3' + 297 258 2 61.39 AGTTTCCCGATTAACAGATACCTGTTACTCAGCTGGTTAAAATGCGAACGCGAAATTACATCATCAGGTATATATAGACAAACAGATTGTGGGCTGACTGC:1 - chr2L 17359415 3' - INE-1 557 1 65.35 GAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATTATTTTAAATTGAAGATGAATGCTTGTGGCAAGTTTAATTGGATATTTGATGTTTTTAAATTACGCAAAAATGA:1 - chr3R 12764157 3' - Stalker 407 1 77.23 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTA:1 - chrY 495740 3' - Doc 38 1 64.36 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTACACAGATACCGAAACGCGCGCAAACACACACACACACACACAAA:1 + chrX 7978951 3' + hobo 2932 1 58.44 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATGTAACCAAACTAGT:2 - chrX 13354235 3' + pogo 2092 1 71.29 ACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATTATGCGTTAAGTGCAGTGCTAAGGGTCTGCACCGAGGCCCCAGGG:1 - chr2R 16537800 3' - Rt1b 4801 1 58.42 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTGTTGTCACAGAAATTGTCAAGTCATGCGTA:1 - 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chrX 6331224 3' - F-element 11 1 47.52 TATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCAGCTGCATTCCCATTTCAATTTCAATTCCAATTCCGCTCGCATTTTTGTATTA:1 - chr3L 22039909 3' - diver 44 2 57.43 GTACATGAAAGCTTTTTCGTCGCCTTCGGTTGGCTGGTTATTTTAATGCCGCCCCTACTCCCGGATGCCCGGATGGCTGGATGGCTGGCACCTCGGGTGAG:1 - chr3L 17336655 3' - G3 4451 1 73.27 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATAAACAATATTTTCAAACTTATACCGATCGATATGTACCGCCGTGCTGACTGT:1 - chrX 18893713 3' + Juan 4190 1 55.45 GAGGGTGGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTTAATTTGAGTGCCTCCTTCCTGGACATTGTCGGTGCTCTGGTATCGCCGCTTTTCAGGGAGG:1 - chr2R 7234454 3' - mdg3 5257 1 68.32 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTC:1 + chrX 1399908 3' - P-element 51 1 28.71 CGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAATGTCTTTCCTGCGTAGGCTGGAACAGGGAGCGTTTGTATTTGTCTTCGATGCGCCTGTGCGATGGTGTCGTT:1 - chr3L 281346 3' + R1A1-element 393 1 76.24 TCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTACAATGTAAATCCAATCCAATGAACTTTCGATTGTAATGGAGTTTCGTGTGTATTTTAATGTGTA:1 + chr3R 15297277 3' - Idefix 74 2 70.30 ACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGATATTT:1 - chr3L 25613045 3' + Stalker4 396 1 67.33 CGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGAATGCCCCTCGTGACTTATGCAAATTGCTTCTGGAA:1 - chr3R 13928240 3' + jockey 4598 1 64.36 AGAAAGTTATGCTGCCGCATCCTGTATATTCTTTATCAGGATCAATAATCGATCTGTCTATCTCAGAAACTATGTTGCAAGCTAGCTGGGCTGGTCGTACT:1 - chr3R 26489909 3' - mariner2 3 1 76.24 GAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGTTGATAAGGGGGCGTGGAACATGAGC:1 - chr3R 21822334 3' - Doc2-element 346 1 76.24 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGTGCTTAAATGCTATCTTA:1 + chr2L 21293015 3' + roo 387 2 61.39 GACTGNCCTCTTTCAACGCTACCTAATCAGTGTTGTTAGGTGAGAATAACTCTTGCTGCTAAATCTGCGCCAATAATCCGTGTCTAATAATCATAAGAGAT:1 + chrX 17101426 3' + 297 6747 2 74.26 GAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGCTAACGACGCAAACGGAAACTTCTTGGCCAAATGGCGAAAGTTCGCAAACAATTGCGAATGTGTTGA:1 - chr3L 13985538 3' - 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blood 7062 2 76.53 TAAACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAAATAATAGAGGTTGAGCAGGATTTCGGACGAGGTCCTTCTGCTGCTTTAAG:1 + chr3R 25612896 3' + X-element 4614 1 58.42 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCACATAAATTATTCATT:1 - chr3R 11005439 3' + roo 9058 1 60.40 CAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTAAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCCCAATGCTGACGAGCTGAGCGGGA:1 + chrX 4117440 3' + R1A1-element 353 1 74.26 CAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACTCACCTCATCATCAAGCAGAAAATCACTGGTAATTG:1 + chr3R 26583968 3' + flea 121 1 64.36 AGTTGACGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTG:1 - chrX 3697120 3' + jockey 4960 1 55.45 GAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCACACCCACACCAAAACACACTCATACACACAATCGAACAGAAAGTCCTTAAGATGAAAAACTCAATTTAATCAA:1 + chr3R 16566381 3' - micropia 4986 2 73.27 GCTGATGTTGTTGGAGGTAGTGGGGCTTCTGTCGGTGAGGAAAAGGAAAGAAGCAGCAGCAGCA:1 + chrX 13887014 3' - F-element 412 1 51.56 CGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAGCTAAAAGCAACTCGAGATTGGCAAGA:1 - chrX 4855412 3' + roo 50 2 71.43 GATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGATAAAGGAGCAGATCAGAAACAACAATGAGGATCAGCAGTCGGGGGGGCAGAG:1 - chr3L 16366827 3' + R2-element 466 1 53.06 TTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTCCTCTGAGCTGAAACTGAAGCTATTGGCCCACTGTGCCGGCTCGGTTCATT:1 - chrX 16860838 3' - Doc2-element 239 2 61.64 TACTTNGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTCGCAATTGTAGAGAGTGTATACTTTGAAAGTAGGGACAACCCTTTCGACTCTGGGTATTG:1 + chr2R 10828070 3' + invader1 447 1 60.40 AACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGAATTCGGTAGTGTTGGTGGGTTATATTTGTGTGTCCTTGGCTAAGTCGTATCGATTTGACTTTTGATTGATATTT:1 + chr3L 12947184 3' - I-element 4996 1 66.34 ACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAACTTTTATGCCATAAAACAGATTGTGAGGAATTTTCTTGTTGTACAACACTCCTCCCTCAAGATTTTTATT:1 - chr3L 23529524 3' + copia 4914 2 56.44 CAAGACAAGCGCCGACTCTCTTCGCAGCGGAAAAACACCAAATCTGTGTCCAATTTCGGCCGTCAATACAATTTTCCCAAGTTTTTCGTCACAG:1 - chr3R 13999067 3' + Doc3-element 260 1 61.70 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAAAATCTGGAAAAAATACATGAATGAACTT:1 - chr3L 2539270 3' - roo 45 2 74.26 AGAGTTGCCGGAATCTCTGCCAACTCAAAAAAACAAGACGTCAAAGAAGAACACCGATAACATACGAGCATTTTCGGCTCGAACATGCGCCTTATGCTTCC:1 + chr2R 14709126 3' + diver 465 1 72.28 ATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGCACCCCAATAAAGTGCCAAATAATATAGGATATTAGCCAGTCGGTGGACGGAACCCAGCGAGGAGCGCA:1 - chr3L 19574747 3' + baggins 5297 1 64.36 GATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTTTTTCACACACTTATGACGTGGGCGA:1 - chrX 3100978 3' - invader2 4815 1 78.22 AATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTATCGTGGGACTACATAAAAGTTAACATGCGCAGGGCCACAATCGCTAACTCCAGATAAACGCGCATGGCATTCT:1 - chr3R 5528494 3' - baggins 5317 1 83.17 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCATCTGATTACTGAATCCTTTACAGTTAGCTCGTGTC:1 + chr2R 21266491 3' + roo 9034 1 66.34 CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGT:1 - chr3R 13339055 3' - BS 5043 1 68.32 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGACACACTCTCGGCCTTGTTCATGGACCTCGTCACTTGCATTCGCCTTT:1 - chr3R 25814699 3' - 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INE-1 135 1 66.34 GCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGGAACCTGAGACTGTCTTGGAGAAAATGGAGGTTGATGAAAAGGCAAATGATGACCAATCGGCTGTA:1 - chr2L 236752 3' + F-element 303 1 70.30 CCATAGAATAAATAAATAAATCTTTTAACTTTTCACAATTCAGTGCACATAAAATGTGTATATCATTTATTACACATTTTGTTGATGTCCCTGTAAGTGAG:1 - chr2L 16948339 3' + Doc3-element 80 1 58.42 ATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCCTTTTAATTGCGGTTAATTGGGATTAACAGCTGCGCCAAAATGTTTGCCGCTCTTGATGCA:1 + chr2R 21528145 3' - flea 4551 1 63.37 GGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAAATAAAAAAGAAAACCAATCCATTCCGAGG:1 + chr2L 22717836 3' + R2-element 3519 1 80.20 TAACTTAAAATTTTAAATTTATTTGTCTATGTAAGATCTCTAAATGGAGCACGAAGCTCTTCCCAATCTGATTGTATTTGCCGAGTTCAGTGACCTGGAAA:1 + chr2R 13647128 3' + 1360 3053 1 61.39 TTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCTTCTCATGGCCGCTGTGGCATCCGCATGCCAAAG:1 + chr2L 19699201 3' - Doc 325 1 66.34 CTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAAAACTGTTGCATACTCCCAGGAGCACAAACACAGCGAAAAGA:1 + chr3R 14832498 3' + blood 373 2 75.25 ACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCTCTCTGCTTTTGCCAGCCACAATT:1 + chr2L 8501410 3' + P-element 2757 1 25.74 GAAAAAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTTAATCCGTATTGCTATATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCT:1 + chrX 21668941 3' + Ivk 4929 1 51.49 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATAAACT:1 + chr3R 22675877 3' - 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chr3L 3087604 3' + INE-1 580 1 73.27 GAATCGAGTTAACGCTCCTGGAAAACCCGACTACTCACCATTGTGCATGGCCACACTCTTGTCCTCCACGCGACTCACGTAGCAGCACAGCTCGTCCTGCC:1 - chr3L 5722506 3' + Rt1c 25 1 67.33 CTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTCGTCTCGCATTCCGCCCACCATTCACCTTTTACCCCTCGGGGATGGGCACCTGTTTTTATGTGGCG:1 - chr3R 28094011 3' + baggins 4987 1 54.46 ATATCNTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCGTAAGAAATATACTACTAAAATACAAATTGCTCACAATTTCCTTTGCTCTAG:1 + chr3R 29194883 3' + Tirant 378 2 61.39 ACACCGAGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATATGTGCCAGCATTGCTGCCGTCGTGTTGCAGCAGTTTGCGAAAATTGCCAGCGAATTCCGAC:1 + chr2R 19910464 3' - R2-element 392 1 68.32 CGCCATACGATTATTTGGCAAACGATTTTTTCGTGTGAACGACCAACAGACATACCAACAATTCTGTGTCGCTCTCTCTTCTTCGCCATCTCCTCCTCCCC:1 - chrX 16750912 3' + 1360 30 1 72.28 TACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTCTCTGAATTTTACAATTGAAATTAAATTTCGTAAATGGACTTTATTAGATCGTTTAAAAAATGAAACAGATGT:1 + chr3R 27597789 3' - accord 260 2 78.22 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGTGCGCCAACGTATATTTGCCACCTGAGGTCACGAAAACG:1 + chr3L 7316373 3' - jockey 36 1 55.00 ACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACCGCACTCAAGACCAGCAAACGGTCAAAACTAACGATCTCGGCCAAGTGTCTT:1 + chr3R 21235858 3' + I-element 5156 1 57.43 GGTTGGTAGGTCCTTTCGCAGGAGCAGCAACAGACCGGCAGCCGATTCAGGTTTAGCAGCGTGGAGGAGCTAAAGGCCAA:1 + chr3R 18173613 3' - F-element 4522 1 78.75 AAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTGATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACCATCGCGTCTGTAGCGCACCTTCTTCCTTGAGTAG:1 - chr2R 9470053 3' + Dm88 4451 2 63.37 ACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACA:1 - chr3L 5691246 3' - P-element 187 1 42.70 TTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCTCGCCTTGCCACATGGGTTTTCCTTTAAAAAGAGAAACAAATTCTTCGTATCTTTCGTATCTTGGGCGTATCTT:1 + chrX 12811309 3' - F-element 4383 1 77.23 TAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTATTTCTCATAGCTAACTCAAGAACACTGT:1 - chr2R 10360193 3' + Transpac 445 1 72.28 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGAATTTGATAGGACTGCTTTTTGTATACAAATACGTAATTTCAGATGTAAGGCAGTCTCTGTGAGTTTCCATTGT:1 - chr2R 21239349 3' - jockey 9 1 68.32 ATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTTAGTTGTCGATGATAAATCAACGTGC:1 + chr2L 6606479 3' - 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roo 39 2 69.31 CGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAACCGTAAACAAAAGGATCAGGAGTACCCAGAAAATGGTGTTGAGTATTAGGG:1 - chr2R 8099658 3' + mdg1 206 2 56.44 ATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTGCGGCATTTGTTTTTGTTGTTCGGCTTTTTCTATTGCGAACGTGTTCAGCTTTTCTACGCTTTTCGTTTCGTTT:1 - chr3L 18926807 3' + Burdock 11 2 78.22 AACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAAATCAGATGCAAATGAGATACGCATTTCGCGCACATGCCACTTTTAATTGGCAGAGCCCATCAATTTTCCAGG:1 - chr3R 30495500 3' - Juan 4032 1 72.28 CAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACT:1 - chr2R 4577077 3' + Chouto 488 1 54.46 ACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTGCGCAGTAACCCGCCATCCCCTGCCGCTGCCTCGCCAACAACACACAAGCATGG:1 - chr3R 16080694 3' - Rt1b 4979 1 56.44 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGGTAGGCA:1 + chr2R 5640423 3' + roo 391 2 61.39 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATCCAAAAATATTTCTTAATACGTTCTGGTTC:1 + chrX 2766813 3' + mdg1 378 2 70.30 TGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGGGCGGGAAAATCGGAGAGAATTTCCCACAGTGGAAAACGACAACAAACGAACGAA:1 - chr3R 18849356 3' - blood 7180 2 76.47 AAAGTGCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGGTGAAAAGCAGCAGCTCAAGCTGATGTGTGTTCTCAGCATGATGAGAATGATGAAGCAGAGATCCGAG:1 + chr2R 13208896 3' + G-element 361 1 53.47 GGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTAGCTGCAGGGCGACATGAAAAT:1 - chrX 2459183 3' - F-element 4453 1 78.22 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCCGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATT:1 - chr3R 15072591 3' - pogo 48 1 75.25 AGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCGCTCTCCCTCTCTCCGCCACTCTTCGTTTTTTATTTTTTGATAAATAAGTGCAATA:1 - chrX 20508983 3' + blood 7136 2 54.46 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAATTTGGTTTTACAAAGAATCTGTGAAATAAATCACTTAGTAATAAAGTCTGGCCAATAGT:1 + chr3L 25798531 3' - blood 7028 2 63.37 CATCCAAAGCACTGATTAAATGGTAGTAGCGCAGTAAATCCCTTTTAAATTGCAAATTCTTTATGCTCGCATTTTGGGCTCAGCCGTAAACACCTCCCCAA:1 + chr3R 20470566 3' - Chimpo 450 1 68.32 TCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGCGGTTGCTGCGGCGTCTGTCTGTGTGGAATCAATTAAAAGTATTGCCAG:1 + chr3L 4306080 3' - Max-element 311 1 60.64 CCAGATGGCATCTACGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCCTACGACTGCGCAAATTGTATCTTTATGTTGATTTTATCTACGACCGAA:1 - chr3R 24028257 3' - R1A1-element 448 1 52.48 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTGCGGCACTACTAC:1 + chr2L 7654062 3' - jockey 11 1 74.26 GCAAAACAATTGACAGCTACAACAACAAGCGGAAAATAAGTGCAAGTGTGTGTGAAGACGTGGCACTTTTTTGTGCCATTGTTGTTGTTATTTAGCAACGA:1 + chr2R 18005751 3' + Doc4-element 391 1 57.43 CGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGATTGTGTGCTTTTATTTGAAAACT:1 - chr2L 5086697 3' - FB 54 1 77.23 AGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATATCTCTGTACACCACTGGTTTTCTGGAGCAACGCAAATGGTTC:1 - chr3R 5619095 3' - roo 9027 1 57.43 TTAATAATTAGAATTTAAATAGCAATTCTAACGTACAACCCCGACCAGAACCAATGCACGTATCCTGGACTCAGGGATGGGCATGGGCTTCTGGCCATGGG:1 + chr2R 24863495 3' - transib4 2563 1 61.39 TGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGAGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGATGCTTTGCGACAGACTCTCCGC:1 - 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jockey 28 1 59.41 GATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTGCTGACACACAAACACAGGAAGCTCAGGAAGTGGGCGCCGAGT:1 + chr2R 18373131 3' - jockey 4968 1 57.43 ACTAACAGTGAAATAATAGTGAAACGAAAACATTTTCATTCAAAAATACAATGTTAAGTTTCTCGAACTGGGGCTCACCGCTATCCCACCAACTGCGACTG:1 - chr2L 10803494 3' + X-element 135 1 75.25 GGTTCGTTCGGAGTGAAAACATTTTAAACAGCATTGATTGTCAATGATGTTTAAGATGTTTCAGCCGATTGGGAAACATTTCCACACGTTTCTGCAGCTGA:1 + chr3R 24582211 3' + F-element 4368 1 43.56 TAAATAACTCCCTTTGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTTCTTGCTTTTGTTTTGTAGTTTTTGATTTCATTGCTATTTTCGTGAGCCTGACTTTTGGTTCAT:1 + chr3R 20680901 3' - I-element 482 1 61.39 ACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGTAAATGGGGCAAGTTATCATTAACACCTCGCTGATCCAACCATCAGCAGCCCCCCTGAACCACGAAAA:1 + chr3R 7830442 3' + I-element 420 1 74.00 CTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGGAGACATCGAGCCAGTCAGGCCCAAAGCAGCAGCAAATCCAATACACACGGCCACTGGCTG:1 + chr2L 21958854 3' + F-element 272 1 58.06 GCATGGTGGGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTTTTGTAATCTTGGATTTTAGACAGTAACATGGACTGGTAATCGCAAATTCAGCGCTAAATCACAATCA:1 - chr2R 23826094 3' - HeT-A 5909 1 70.30 CGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGTCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTTTGGTCCGCAACAAAGTTAAGTTAATAAAATCATTTTAA:1 - chr3R 12064933 3' - Ivk 5306 1 75.76 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGTTGGGTGTCAACATTTTTGAAATGGGTTCGCATTTGTATC:1 - chr2L 14536224 3' - blood 12 2 67.33 GAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTTATGTGACAAAGGGAATTCTCCTGCTGGGCTTGCTTTGGCTCCTTCTGCCTACCGACCTA:1 + chr3L 22343679 3' - accord 7120 2 79.21 CCCGGTCCATAACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACAATCTGGCCACGATCAACCAACAGATCAGCAATCTTGGCAGCATCAATCAGCAGTTGACCTCGCTG:1 + chr3L 9592816 3' + Doc3-element 343 1 68.32 CAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGTTGAATCCACCTGACGTGATGGAACTCCACAGCCGATCAATCGAGTTGCTGG:1 - chr2R 24011762 3' - Ivk 4968 1 59.41 TAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAAAAGGTCACGCAACCAAATTGAAAACAGAACCGTGAACTT:1 - chr2L 15285375 3' + Tc1 1271 1 79.21 ATTTAGAGTTGTTATTAAGAATTTGCATTTTTCCACAAATTTAGATGTTTTAAAATATGTGATAGCAAATAATAATGTCGTCGCTTAAGAGGATCTATAAT:1 - chr3R 7102462 3' + G4 379 1 58.42 GATCAGGATGACTAGCCGAGTCGAGCTGACCATGTCCTTCTGTCTGTCCGTATGACGTTGAGATCTCGGGAACTATAAGACCATAGAGGTATTCTTCTAGT:1 - chr2L 22036435 3' + INE-1 92 1 73.27 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAGACCAACGCAATAATTGCT:1 - chr3L 21908888 3' - roo 8696 2 56.44 GCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGCTGAGGAATGTGCTGAATTGACTCAATTGGCCAAAGGCATGATTTATCGCACTTTCGG:1 + chrX 3525195 3' - Tirant 146 2 73.47 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTC:1 - chr3R 22667139 3' + 412 7498 2 71.29 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAGTAGCTGGA:1 + chrX 9260680 3' - 3S18 21 2 57.43 CGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGGAAGTTTTGATCTTGTGTTTCCATGACTAGAAATCGCTGCTCGTTAAGCTGACACAAATTATACACTAGAAAG:1 - chrX 15937483 3' + Cr1a 358 1 58.00 AAGAGGAAAGTTCCTCTCAACAACATATCTCACTTCACATTTCTTGTCGCCAACGGTTTCTCGAATTCAGTCCCATTCCATCCAATGTCATGGCATTCAGC:1 - chr3L 17832034 3' + Gypsy6A_LTR 278 1 79.21 CGACTATCAGATACCCATTACTTAGCTAGTGGGAATGCAAACGCGAAAACGCATGTAAAAAGTTAAGGCAAGGGAGCCGAATAAAATCATAAAAATTACAA:1 + chr3R 31955978 3' - INE-1 550 1 54.46 CACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCCCATTCGCGGGAGCGGGACGGCATGCAAACGTGGAAAAGTGAGCGGTTCGGCTATTG:1 - chr3L 6742438 3' + accord 7034 2 60.00 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCGGTTTGGTCCGAATGGCCAGCTGTTGCATA:1 + chr3R 23618238 3' + hopper 1411 2 74.26 CTGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTATAAGGT:1 - chrX 392288 3' + R1A1-element 5303 1 78.22 TTTCATTTTCCTTTTTTTTTTGTACTCCCATTTCCTGTCACCGTCACTTCCCCTATTGTCCGGACATTGTTTGTTTTCATCCGTTTAATAATTGCAATGTT:1 + chr3L 12683459 3' - Doc2-element 232 2 67.33 GATGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCACATCTGCAATTTTATTCGTCTCTTGTTCAGCAATCT:1 - chr3R 17664065 3' - I-element 492 1 77.23 CAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGCATTATTCACCTTGTTGCATGAACCACAAATAGTTAGGCCACGAAATA:1 + chr2R 7091390 3' - F-element 358 1 50.50 CGTTCGCTTCGAGAGTGATTCCTTTGGGATTCCGCGCAGGATTTAGGGTGGGGCTAGGTTTTTTATTGTTTCGACGACTTGTTGCGCAAAGCTTTTCATTT:1 - chr3R 5971072 3' + Cr1a 128 1 75.25 CTTGTNCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAGTAGCTGGACGACAA:1 + chrX 9260686 3' - 3S18 15 2 63.37 CACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACGAGCTGTTTGCGATGCGATGAAAGCATCTTGTAGGCTACGTCACTAGCTTAGGCCGATAAAC:1 + chr2L 21756819 3' + Quasimodo 44 2 77.23 TTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTTTCACACTCCTGTAAAGATCTGCAGTACTTATGTAGTTATTTACT:1 - chr2R 10669827 3' + 17.6 123 2 55.45 CTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTG:1 + chr3R 5775725 3' + invader4 278 2 75.25 TTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCATTCTACACTGTAAACAGTTATATCCGCCGGAAAAGCTTC:1 + chr2L 20057723 3' - opus 372 2 60.40 AAAAAGTGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCAGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAG:1 + chr2L 6177220 3' - pogo 51 1 74.26 CCTCGGTATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCAAAGGGATCTGAGCAGGCACATGGGATACAGGGTGCCAAGGAG:1 - chr3R 9996356 3' - blood 2 2 78.22 TTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTGTGTGTATTAAAATTGTTTACTAAGCCACTTGTACAATCATAAAACCATATCTTGATTTCTTCTGTTG:1 + chr3L 16824019 3' - I-element 234 1 64.36 AGTAANGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGGGAGGCGGCGGTGGCCAGAGAGGC:1 + chr2R 18865934 3' + roo 401 1 67.33 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTGCTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGT:1 - chr2L 14536263 3' - blood 51 2 71.29 GCTCGATGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGAACACTAGCTTAATGTAAAAATTGAATTGAAAAATTCTTGATATGTATATATACTTTCATGCAAGTATT:1 + chr4 340201 3' - Doc2-element 21 1 67.33 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGTTGTAACGTCATGTCGGTGGCCATTCAGTGTGGCAGTTT:1 - chr3R 14146642 3' + hopper 1380 1 63.00 GCTGCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATGAACATGGTCAGCGACTGGTGTAGTATATACACAGTCGACGATTAT:1 + chr2R 3289820 3' - Idefix 249 2 54.46 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTCTTTTCGAATATTTATTTTCTTCTACATAAAATTATTGGGCTTGCGGGCTACCGAATCACAATGGTTTTAA:1 - chr3L 9374883 3' + roo 406 1 72.00 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAAGCATTTTTTTAGTAGATAGTAAAAACATATACGGTTATATGT:1 - chr3L 19260776 3' - pogo 28 1 60.40 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCTTTGACTTTTTAAAG:1 + chrX 1399950 3' - P-element 9 2 70.30 CCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCACCGCGCCAGCCTTTGTTTATTGGCGTTTTCTGTTTGTTGAGCTACGCAAATTG:1 + chr3L 22235441 3' + accord 11 2 58.59 CTTCGCGCACCGTGATTGGCTCAGCCGTCAAAGAACTCCATTTCCTTATTAACGGCCGTTCATAATTTCCGTTCCTCTTGCAGAGCTGGCACGGCATCATT:1 - chr2L 10069655 3' + G-element 114 1 80.20 AAAACTGTCACGCCCACACTTTGAAAATGTTTGGAATTTTTTCATTTAATCATTTGCCTTGCCCATTTCAATCGAAAGCAAGAGAATCCTGGATTGCCAAC:1 - chrX 18611425 3' + INE-1 245 1 65.35 AAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTCCACGGTTTTCTGGATACTTACTAAATGTCAGAAATAGGATGCCACGCTGGAACGTTACGG:1 - chr2R 19139774 3' + Burdock 197 2 64.36 CAAACNGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAACTAACAACTGTCGCAAATAAATTGAGCTGCGACATATATACATGGCTAC:1 - chr2L 4302884 3' + invader2 5003 2 53.47 CTGAAAAAAGGAAATTATGCTGCAGCACCGTGTACATTATGCTCGAATCGGAATCTTTTACAGAGTTCTATTGCTTCTTCAGTTTTTATAACTTTACTTCA:1 - chr2R 22085388 3' + mariner2 881 1 60.40 GACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGTGGTGGGCTGTGGGGCGATGGGGCAGGAATGAATTTTAAATAAGAAAAATATCACAGAGCAGCCGGGTTAG:1 - chr2R 8811512 3' - G2 106 1 72.28 AAGCGCGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTAATTAAAATTTATTTGGCATTTATTCCTTGCATTGTTTTTTT:1 + chr2L 1094464 3' + Rt1b 4782 1 56.44 CACAAATACGACAGCGATCGGCATTACAATGTCGTAGGTGATGCGCACTTTCAATGCATTTTTGGTATATTACGTTCTTGGTTGTATTTTATTTTCTACCC:1 - chr3L 22070238 3' - G3 203 1 68.32 GAACGTGTGAACGTGACGATGGGGCGAGATTGAAGAAGTATAGTAGAGAAAAGTGGGGAAATATGGGGATTATTACAGAACCCAACCAAGGACAGACGCAT:1 - chr2R 19156389 3' - Idefix 237 2 73.27 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTCTTGTGGCCAGAGTTAGCAGTGCGGAAATTGAATTTTAGCGCTCTTATTTTTGCCCCTAATTTTACCGTTACTCGTAGAGT:1 - chr2R 5696820 3' - accord 7029 2 56.44 GTTTATATAAAAAAGCATTTTTGTTTGCAGACAGAATTCTAAATAAAACGGAGAAAAGTAATTTTGTAAAATACTAAATACGTCGCCTATACGTGCACAGT:1 - chr3R 22359055 3' - Quasimodo 7343 2 76.24 GTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACCTCTACTGCTTCTCACATTTTCAATCTCGCAACTCATAAGCAGCTT:1 - chr3L 9853529 3' + flea 484 1 61.39 ATATTTTTAAGCAAAAATCAGAGGACAATAAATGCCAGCGGCAAAGATATAGTTATCGCGGGTCGCGATAACTATATCTTTGCCGGTGGCGAAAATCCAGA:1 - chrX 22583983 3' + TART-A 13350 1 46.53 ATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAGTTTTTACAGCCCCTCAGGACATGTTCTTACCTTTCGATTGA:1 + chr3L 4963106 3' - baggins 5389 1 58.42 TTTAGACGATGATAATGATGATAAACCTATTGAAACGGCAACCATTGATAAATAAGTATGGTGATAATGATAATGATGAAGCCATTAGATAAATTGAATGG:1 + chr3L 5679865 3' + Juan 268 1 68.32 GAGAGAGTTGAGTTGTTGCTTGTAGAGGACATTTGGATCGACTTAAAATCGCTGTGTCTGAATGGCTGTTTGGTTGGCACGTGCGGCTTGAAAGGCAGTTT:1 - chr3R 17841150 3' - Fw3 2992 1 57.43 GCAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAGTCGGTCAACGAGATTTTCATCAGCCGCTGTCTGAACACTTCACCGTCTTTTA:1 - chr3L 11996524 3' - 1360 3230 1 58.42 TGTCGGCGGCTACATTAGCGTCTCTGCTCGCTGCTTTTCGCCGTGCTTAAACTAATTTTAGAGTTTGTTAGATTTTTCTTACTTTTCCGTGCATTGCCTGC:1 + chr3R 28731298 3' - G-element 481 1 71.29 AATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGATTAAAACGCATCCACTAATCGTCATAATAATGATGACAACATTATGCACTCGATAAGTTCGAAG:1 - chr3L 12326290 3' + Porto1 4459 1 66.00 TGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTGGTAACAGTTGTTGGCCAAAGGGGGCTAGG:1 - chr3R 8185798 3' - I-element 4885 1 70.30 GCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAATTTATAATAAACAGATTTCGATTTCAGGGCACTGCCTATCGATATATCGAAGACTGTGGT:1 + chr2L 13783488 3' + opus 7260 2 64.36 AGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGAATTAGAATTCATTACCCAGCAACGTTCGCGTCTCGGCGAGGGCATCAAAAAAATCGAGGA:1 + chr3R 28510487 3' + P-element 345 1 55.00 TAGTGGGTTGTTTACTTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTTATGCTTCTGTTTATCCATAGCTGAAAATAGAAAAGTCAATTAGGACTCGCGTGAAAAC:1 + chr2R 17717766 3' - Tom1 224 1 53.47 CCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCAC:1 - chr3L 12072527 3' + HB 1617 1 60.40 ACTTGAATCCAAGAGAAACGAAAAACAATTAAAGTCAGAAGCTTTTTCTCTTACCGCGTCAAAGCCTTAAAAATTCAAAATAACTATTATATGGATGTCTT:1 + chr2L 5480702 3' + Idefix 352 2 53.47 TTAAGCCGACTAAGCAAGTCGGGACTCTCAACATCGCCACAAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTGTGTATAAATTCAAATTCCTTTC:1 + chr3R 24586810 3' - Cr1a 4080 1 75.25 TCGAGGGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAATGGTGCTACGGTAACTTCTGTTTAGACACATTCACTCGCGGATCCTCGAACATTGAACCCCTC:1 - chr2R 16776447 3' + 1360 70 1 69.31 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAAAAATCGGTCACTTGTG:2 - chr3L 21637323 3' + Bari1 1689 1 57.43 GTCGGNCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTGGGTTAGGTTACACATCTGTATACATATATGGCATTTCGCGAATGCTGCGGGCACCGTCCGCAGTAGA:1 + chr2L 20082745 3' - 412 7492 2 75.25 AATATNAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGTACCAAACGTAAAACCACAGAGATAGAGGATCGACGCTGACTAGTTGATTTTTTCTTTTATTTCAATTGTTGG:1 - chrX 17591937 3' + HB 481 1 63.37 TATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGATATTTTCAGCCCGAGAAGTTTCGTGTCCCTTCTCGATGTCGATGTTTGTGCCCC:1 + chr3L 9381762 3' - Cr1a 4386 1 64.44 ATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCTCAGTGGGACAGCTTGTACTATTGTTTTACTAGGGGCACTCAGTGCGTCCAATAAATAAGCA:1 + chr3R 16553418 3' + transib2 2800 1 65.35 AGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGAGGTTCTGGAGGACTGGGCGACATCTTCAGCTCGAAAAACTTTGGCG:1 - chrX 21205790 3' - roo 219 2 55.45 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTTAATTAGCCTACAATGCTAGAGGTCCAC:1 + chr2R 8557884 3' + hobo 2893 1 71.43 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACGCTAAGGGGAGAGTGACCAATATTTTTTATCTAATTTCG:1 - chrX 22689326 3' - HMS-Beagle 6832 2 61.39 GATCAAAAAAAGAAAAAAAGAAAGCTGATGAAAGAAACATATTGGGTTTCCATATGCCATGTTGTGCCACTACTTTTGGCGAAGCACAAGCTGGCAATTGG:1 + chr3R 26344143 3' + R2-element 3582 1 58.42 TATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACAATCCCATATACCATATACCATATCCAAGTCCCATCCCCAC:1 - chr2L 19342703 3' - flea 4677 1 59.41 CCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCGGGAGATGAATGAGCTCTGCCAGGTTTTCCAGCAAAACTTGAGCCTGAGTCCGCCGGTCATCGCGG:1 + chr2R 22332374 3' - Bica 288 1 67.33 TCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTCTTTCTTTACGTTCGATCTTCGATGGCTGCCGAGGTCTCCATCTGAACTCAACTCGGCTTGACTTG:1 - chr3R 17954433 3' + hopper 381 1 65.35 ACCACTTGAGCGGCAAAGTGCATGCCCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGTATATGCTGACTAACAAAATGAGATCCTCTTTTTTATGAC:1 + chrX 14870197 3' - Stalker 7058 4 57.43 GAGAATACTATAGTCGAGTTCCAACGCCTACGTATTTCTTGCTTTAACGTCTTAGACACAGACAGTGCGATTT:1 - chr2R 5192619 3' - INE-1 573 1 69.86 TGATCCTGATCAAGTATATACAGCTGTGTTTGTTTGTGTGTGTGTGTAGGGTGTGTGCTTTCTATGGTATGTGTGTGTCCGTCGGTGTTAAACCTTTTCGC:1 + chr3L 17680579 3' - INE-1 81 1 76.24 GTTCANGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGGCTCAAGGAAGATTCGTCCAATGTTGTAGCCGTGCACTGTAAA:1 - chr2L 10259048 3' - accord 7080 2 56.44 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATATTCAGCACATTGCTTAGAAAGAAAAAAAAAATGTATATGTATAATTC:1 + chr2L 20128998 3' - 412 25 2 49.50 GGCCGAGGGACAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGTTATAGAA:1 - chr2R 13645349 3' - jockey 4713 1 58.95 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAAGTTCTAGCAATCTAAATCAAATTCTTTGATCTTA:2 - chr3R 13494970 3' - F-element 57 1 72.28 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATG:1 - chrX 13354248 3' + pogo 2079 1 58.42 GAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAATTTCTATTAGGAAAATTAAGCAGCGGCTACACATTGCGT:1 - chr3L 18957586 3' + copia 252 1 75.25 TGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCATATAATATTTAATACTGTAGGCCGAAGGTAGCCGATTAAAAGTA:1 - chr3L 9067042 3' + jockey 4723 1 55.45 GCTGGCAAACACTACCCGTTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTGAACAATTTGGATGGATGCCTGCTAAACAGAGGCACTTTTGCACT:1 - chr3R 19449094 3' + gypsy6 7518 2 55.45 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATATTCCATCCGTATC:1 + chr2R 14582892 3' - roo 8703 2 65.35 CGCGGNGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTAGTTCTAATTACATATTAAAC:1 - chr2L 22315549 3' - frogger 3 1 59.41 AGAGCATGCGAAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAACTCCAATAGGGCTGTCCATTATTTTCGCTTCATTGTTTTGGGGTGTTTAGTTTTAGAATGCA:1 + chr2R 18556951 3' + Rt1b 5024 1 77.23 GTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATAGATACAGCGATAGGGTGATGATTTTGAGTGTCCCCCTTTGGGAATCCTGTTGAGC:1 + chrX 22870775 3' - Idefix 31 2 66.34 GTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAATATAGCATTCTCTCTTGCTGTACATTGACAACTCGAACATTTCGTTAATAATTTGCAGTTTAATATCATCATTTGG:1 + chr3L 9357377 3' + INE-1 558 1 51.49 TAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAATAAGAACCCAGACCCGATTTGCATACCACATCAACGTGCAAAACTCACCTTCTTCTTGTTTTTCAA:1 + chr3L 5515445 3' + Q-element 324 2 59.41 TTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCGAGCCGAACCGAGTTCGCATTCCGCATTATT:1 + chr2R 6839659 3' - I-element 5003 1 69.00 TGTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCGAGCGAGGAGGAGCCCAAAAGATCCCAATTCGTATAGTTGTGGATATATTCAACAAGACCAGC:2 - chr2R 5539319 3' - rover 6937 1 50.50 AAGGANGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAGCAGGGCTGTGCTCCACCGATAGCCCTGCGTCCAGTTGCATCGCAGGTTGCGGGTAAAGG:1 + chrX 9246418 3' + Burdock 333 1 68.32 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTGCAAATGTGTCTGCGC:2 + chr3L 15276745 3' + hopper 1412 2 76.24 TCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGCGGCACTGTGGAGAATCCCGAAACGATTCGATGCTAAAAAGATTCGATCAATTTCGC:1 + chrX 17948653 3' - Idefix 7093 2 63.37 TATTCNTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCATTGTAGCCACAA:1 - chr2R 8125078 3' - Doc 36 1 58.42 TAATTTATTGAAATTTCCTTCCCCAACTATTTGGGGTGACTTTGATTACTAATTAGCTTTGAAATCGAAGCAGGGCACAAATAGGACGAAAGGACATTTTT:1 - chr2L 8852715 3' - Tc1-2 1278 1 60.40 GGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTA:1 + chr3L 24208217 3' - Quasimodo 7 2 69.31 AAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTGCGACAGAAGCCCCGCTACCTCGGCCTGACTATCTTGGGAACGATCCGTTTGACTTCCCTGGCCCGC:1 + chr2R 18681036 3' + F-element 365 1 53.47 AGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGACAAACGAGCTATACGCTACTACGCTGCTCCTCCGAG:1 - chr2L 13181637 3' + blood 167 2 56.25 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCACATTC:1 + chrX 16619669 3' - opus 7041 4 67.00 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACATGGCCTGAATGACGACGAGTGTCACTTGCATCCTGCATAAA:1 + chrX 21247593 3' - blood 7179 2 74.16 GTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGCTGTCTCTTTGCCTCTTGAGTTTGGCT:1 - chr3L 2145597 3' - R2-element 3171 1 77.23 AAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGC:1 + chr2R 2875214 3' + TLD2_LTR 125 1 75.25 TACGGCTCAATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAAAAGAACTGGAACGCAGGCGAAACTATAAGCGAAAGGGTCCCCAAACCAAATGCCACGC:1 - chr3R 14996842 3' - Cr1a 4381 1 64.36 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGCAGCACCTAGGGGCCGTATGA:1 + chr3R 11833031 3' + roo 385 2 55.45 CGCGACTTCTAGATAAGTTTGCACTCCTTTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGTGTAGATTTCTCTGCCTTGTCCTTGGACACAAAATCGAAGCGAGGCCAG:1 - chr2L 21958233 3' - Tc1-2 1226 1 52.48 AAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGAAGTGGCCTAGCAACAGCCGCGATACAGAGCAGAGGTCATAAAGAAACTTTGGCGCCGCGACCG:1 + chr2R 24634773 3' + gypsy8 2 2 60.40 CATCTTGTTGGAACCAAGTGTTCCCCAAACCCATCTCTTCAACCCGTGCAAAACCACAAGACAACATTGCAGGGAAACGTGGCAAACAACATTTGCCAAAC:1 - chr3R 13635825 3' - mariner2 449 1 64.36 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTGTAGCATAC:1 - chrX 3697112 3' + jockey 4968 1 56.44 GGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCCCGCGCCGTGTTCATTAATGCTGCACTAAATAAGCTGGCTCAGGAATGGGCCAATGTAGGATGA:1 + chr2L 2263743 3' - Tirant 8115 2 58.16 GTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAACACCCAATTGCCCCCGATATCAATCGCAAAGTATTTCAATGTCAGC:1 + chr3R 20790382 3' + transib2 61 1 54.46 AGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTACTATTGTCTCAATGGCAATTTCTTATTTATTCCGGTTATCTTATTTTCATTTTGTATTTTGTAATGTGTT:1 + chr2R 1372727 3' - Doc3-element 4496 1 55.45 GCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCAAGATCAGCAGGACGTCAGTTGGTTTGCAAGATGGCAAAGTAAACGAGTGCCATAGGACT:1 - chr3R 9425750 3' + R2-element 3511 1 68.00 CTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTCACTCAGCTTCAGGCTTTTACACCG:1 + chr2R 10000221 3' + Tirant 462 1 75.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAAGCACAGTTAAATGCAATGCATTTAAGGCTCAAGTCGAATGAATTTCAACACATCCGTTCTTGACCAGAT:1 - chrX 5104585 3' + roo 401 1 71.29 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGGGCATTGTTGCTCTTTTTTCGCTTTTGATTGGTTTGACCGATTTACATTGTGCAAAAGAAATGAGTT:1 - chrX 9653255 3' + roo 9062 1 70.30 ATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACTTTATTAACACCTCTTTGTTTTTTCGATTTATATTCGT:1 - chr3L 12710718 3' + Quasimodo 7053 2 62.38 GAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAAGTCAGTGACGGTGGCTAGCAGGGGGCTCCCATTGATGGC:1 - chrX 7360716 3' + jockey 350 1 60.40 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAGAAACGACGGCGAACGG:1 + chr3R 22899252 3' + P-element 2868 1 57.29 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAAATGATTCTTTTTGAGATC:2 - chr3L 19051862 3' - roo 8717 2 80.20 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTGCGCCGCCCACTTTCCGCCCGGTGCACTTG:1 + chr2L 2858069 3' - transib2 44 1 69.31 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTGTGGCCGGCG:1 - chr2R 5322015 3' - 1360 42 1 70.30 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGGAAGAGCGGGAGAGAGCGAGAGTGCAGAAAAATC:1 - chr3R 29088174 3' - 3S18 5807 2 65.00 GGTCCACAGTAAAAATCTATCGATTATGAGTCGATGACGCTAATTGGGCACCAAACATTTTGAATTTATGGAAATTTTATTACACTGGAAAACAGGGTAAA:1 + chr3L 15803445 3' + G5 420 1 64.36 CAGCANATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTTAGGTCAGTTGAATTAAAACATCCCG:1 - chr2L 9091414 3' + copia 4756 1 73.27 ACACACACACACACACACTGGGCCTTTGGCGCCTCCTGTTTGCTCCTCCTTTTGCCTCCACCGCTTCCTCTTCTTCTTC:1 + chrX 17077232 3' + accord 258 2 75.95 ATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATCCCAGCAGAGAAACTCTGCGTCTACCGTTCGATCCACCAATTACAAGATGTATAGCTTCATAAATCCTTAA:1 + chr3L 15737552 3' - Stalker 7012 6 53.47 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTCATACATCATTTATGAACGAACGCACACACACGAGCGTGTGAATATAGCTGCGTT:1 - chr3L 22324021 3' + hobo 2917 1 57.43 TAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCATCGGCCTATATAGACATCGGGATCCAGGCAT:1 + chrX 5628858 3' + Doc 491 1 73.27 GCTGCTTTTTAGCTGGTACGTATACAAGTTTTTCTTGGCATTTGCCAAAATGGCAAATCGGTTTGCCTTTTCTGTGCAATCTTAAATCTTCTAGAGGGAAA:1 - chrX 10679554 3' - Fw2 403 1 62.38 TCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTTTTACATCTATTTCCACATTGGCTTTGGCAGTGAATTTTCCATCAGTGGCTATTATGCTT:1 - chr3L 20018832 3' - Quasimodo 322 2 61.39 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTTAAACCGAAAACGGAATTGTTGAAGGCGGCCCTCGAAAGTATGCAACAACATTGCG:1 + chr3L 10035709 3' - jockey 4759 1 76.24 GATGAAGTCGTCCCCGGATTCAATGGTCTTAGATGGTTATTAGTTCGATTCGGATTCGGATTCGACAACAGCCTGAGCCCATTCAATTCAGATTGAGCCCA:1 - chr2R 8984262 3' - gypsy10 5607 1 67.33 TGCCTNCGATGGTCACCCAGCGCGCACATGCCCGCCTCGCTTTTGTGAGCCCAATCTCTGACCATTTGCCGGATGCACTACTTTTGCACAACGGTTACACG:1 + chrX 9010558 3' - gypsy10 5807 2 69.31 ATGCGGACGCTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAGAGGTCGACGCGGAAACCTGCGGATTAGTAATGGTCCCAGAAGGGATGTGCACAGATTGAAGCTTCCGAT:1 - chr2R 8088650 3' - baggins 5105 1 75.25 CGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACTAACGAAATATTTCTAATGTCTCACATTTCTACAACC:1 - chr3R 4159937 3' + G-element 33 1 63.37 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTA:1 + chr2L 18568107 3' - I-element 38 1 59.41 GCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCAGGGCGAGATAAAGCGAAAACCGGCAAAGAAAGCACAGGGAGAGCACTTAGAACCTTTACGG:1 + chrX 10335590 3' + G6 407 1 78.26 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAGCGATGACCCTGGGTACACACAGAAAAA:1 + chr3R 27619280 3' - hobo 22 1 56.44 CAAAACATATTTCAAAAGTGTGGACAGTTTTGGCCAGTTTGTTTGCGTCAAAATTGGCTTGGCAACAACAGCCCAAGTGGAATGGAAATATTCCGCAGAAC:1 + chrX 7806105 3' - INE-1 259 1 66.34 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGATCAATATCAAAATCAAAGTTCAACCCACTAGTTTGTCGACGTTTTTGATCATGTTATCAAAGAGCGGCATAGCC:1 - chr2R 24661672 3' - FB 3 1 74.26 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAGCGATGACCCTGGGTACACACAGAAAAATGG:1 + chr3R 27619283 3' - hobo 19 1 58.42 TGACAATAAATAGGAACACGCATAACAGCAAATCGAATAGTTTCGTGGGAGAAAGGACAGCGTAGCAGAGTTATTGGAAAA:1 - chrX 7967563 3' - micropia 158 2 69.14 AGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCCAGAGGACAGAGGGCAATTTTGGCTGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGTGGATGATGTTGCTGCGACATGTA:1 + chr2L 6768594 3' + 1360 3285 1 77.23 CTCCGACGTTCGCTTAAGTTTTTTTTATCATAAATTCTTAGAGCTAATAGATTAGTTGTTTATGTTAGATGTGTGCTTTACGTTTTGTATGTTAGTGAATA:1 - chr4 95075 3' + Quasimodo 7313 2 54.46 TTACTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCGAAATATCATAATTTTTGTGGGAATTAAAGTATTTATTTGCATAAACAAAAAAAAAAGAAACTATTCAATAGAT:1 + chr2R 8947773 3' - INE-1 533 1 54.46 ATATCAGAGTTACATCTCACAGCAAAGGCTCTGTTGTAGAGATACGACTTCAAGAGTTTATGGGTGTTTTGTTGTTTGCCTTGTTTTGGCTGTAGTTTTTA:1 + chr3L 18258575 3' - Fw3 2825 1 70.30 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCATTTTAATACGCTTAAGTGCACGGCGAGTCCCTAAAACTATGCTATGAAAAATAGTTCAA:1 + chr2R 13314192 3' - jockey 23 1 63.37 TAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTATCAAGCCCTCTCATTCTGCCACC:2 - chrX 12076646 3' + blood 7129 2 70.30 AACGGTTCCTACCGTGCCCTCCTCCCCTCCTTCCCTACTCCGGGACTATCCCAGCCTTGGCAAGAAGCCCACTAAAGCGAGTCCGGAGAAGAAGCGGGATG:1 + chrX 11831779 3' + G-element 273 1 58.42 CCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTTAGATTTGACAACGCTCTGGCCAGTAGGATGAGCCG:1 + chr2L 5910149 3' + GATE 352 1 69.31 TTGTTTAAAAGTGTGGGCGTGACCGTTTGGGCGTTTTGTAGTACAGCATAAACTTTATTTATTTCTGTGTGCCATTAAAGATGGAAATGTTGCCAAGTTCG:1 - chr3L 20254181 3' - INE-1 252 1 69.31 GGTGCGTTCTCTGCAGGCGTTTCGGTTGCTTGGACACCAGTTTCGATGGCAGTGGTGGTGCAACTACTGGTACTGGATTAGGAGTTCCAGATGTGGGCAGC:1 - chr2L 7781949 3' - G2 2913 1 80.20 TGAATAGTTTATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATCCATTATCCCCTCCAAGCCACCAGTTCCTACCAAA:1 + chr3L 8256037 3' - copia 4867 1 67.33 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAGCACCACCCAAC:2 - chr2L 10635256 3' + roo 9030 1 69.31 AACTTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGATTCAGATTGAGACCCGTCTTCTTCTAGGGGTCTTTTTGCAACGTTCTCACGGCCGTCGGCTTTGAGCCTTG:1 + chr2L 19570345 3' + Idefix 446 2 62.38 AAAAAAATAATAAAAAAAAATGGCAAATCGATTTGTTCAACCCAAAACAAAATTGAAACCCCAGCGCGTTAAGAGCTCTGACATAAAACCCTGAAAGCGGA:1 - chr3L 704827 3' - hopper 142 3 60.40 ACACCNTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCGGATCTTCCGTCCACGGACGACGGGCTACTTGGCGCT:1 - chr2L 4292494 3' - R1A1-element 418 1 62.38 AGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGAGACATGATGATTAAATATCGACAGGCGG:1 - chr3R 10828310 3' + mdg1 262 2 72.28 TTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATAATAAAATATTATTTTACAACTGTTTAG:1 + chrX 14625531 3' + invader4 3038 2 81.19 ATACATCACCAAGAATGACCAAAACCAGGCGTTCCTCTTTCTCATTCTCTTTCATACACGGAACAATATATTTAATCATTTTCTAATAAAAGAGAATTACA:1 - chr3R 12936152 3' - invader5 235 2 55.45 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCC:1 - chr2R 10697061 3' - 297 6618 2 75.90 CTTCTTGCTTATGCTTATGTTCATACATATGAAAAAGTATTATTTGATGCTTGAATATTCATAGGTGTTGGTATGGGACTGGCCAGTGCGCCACCAGGAGA:1 - chr2R 15845576 3' - Tom1 191 1 69.31 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTGGGGGCACGCAAACACACAAATACACACACAG:1 + chr2R 16928946 3' + blood 7378 2 67.33 ATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTATTATATTTTAATGTCAATTAACTATTTCGGCATTACAAAAAAGTGGCCTATTCACGATGTTGACTCCA:1 + chr3R 24843069 3' - F-element 137 1 63.37 TCTTCCTTTTTTTTTCTTGTTGGCATCGGACCATCTTCGTCGAATGTTTCGTTACCCTTCTCTGGCCAACGAAGTATCAGGGACAAC:1 - chr3R 23266063 3' - invader3 5015 1 79.31 AGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGAAAAGCCAGGCGAGAGAGAGCTCGGGCTGTCGACGTCGACTTCGA:1 + chrX 18534611 3' + micropia 5195 1 53.85 CGCCGNAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGT:1 - chr2R 4577072 3' + Chouto 493 1 54.46 AATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGTTTCATTGCCCAAGTTGGTGGGAGTTTGCCACTCGCCCT:1 - chrX 4156897 3' - Doc 4324 1 63.37 CTCTTTCTTGATTTGTTGGCAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGCCCATACCCTTGGGGGACAAGGTGACCTTCCGTTCCTGT:1 + chr3L 7234963 3' - F-element 348 1 61.39 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATAAGACTCAAATCAATTTAATATCGAAACTACGAGTACTTGAAATTACAAAGTAAATGTTTGAAGC:1 - chr3R 12789823 3' + flea 249 2 74.26 GCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGGGACGATGGCTGTATTTCGCCAAGTGCGTGTTCTTCTTGATATCCAACGCAACTGTTTATGG:1 - chr3L 26852014 3' - diver 5904 2 61.39 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGCGAAATGGGG:1 + chr3R 4807839 3' - P-element 29 1 50.50 AACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTACCAACACACCCACAATCACCATCGCCGCAAAGATCGCGTGCCGTTCAACCACAATTACGC:1 - chr2L 13915954 3' - diver2 94 2 61.39 TGTGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGATTGCGTTTTTAAAAATGTCTGCTGGGTATTAAAAAAAAGAGGAGCAAAGACTTTAGAATGGGAACTATGCACTTG:1 + chr3R 25372585 3' - I-element 112 1 84.16 TTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTGGGCAGGGGGTTTTCAAGCCCCAAACGTGATAATGGTGCAGAGCGAGAGCTCGGAAT:1 - chr2R 20321152 3' - G2 20 1 57.43 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAAGCAAATTACCAGATAGCATTGC:1 - chr3L 18413603 3' - jockey 4758 1 75.25 AAAAGAAAAAAATATTTCAACAATTTTATCTGATCTCGAAGAAATAAGTAAAGATAGTTGCATTGGATTGAATCGAAAAATGAAACCCACAAAATATGAAA:1 + chrX 18729995 3' - Tc1 1391 1 69.31 AAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAGGCGGGAGTAATTTTCCCCCTGTTAGCGGACAATTGGATGGGGAAACTCATTTCTGA:1 + chr3L 11092221 3' + F-element 4383 1 64.36 CTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGGGTGGCGAGGTCATTAGATCATG:2 - chrX 21933804 3' + gypsy11 389 2 73.27 TTAGATCCACAATGATTTAAGACAAAATCGTAGAACCGTGCTGTTGCATATGCATGTGTGTAGGGTTGCAAAAGTCATTCCTGTTTGACTTTTAATTAGCT:1 - chr3R 28431617 3' - Cr1a 4146 1 68.32 TAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGGCGCAAGCTGAATACTCTATTTTCTTAATTCTGCTTTAGGTTTAGTATCAAGATTCAAAGTTTTTATGGTAGAAA:1 + chrX 517101 3' - 1360 437 1 64.36 GTAAAAAGAAGGGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGGGTACCGGATGTGACTCGGAGAATACAAGATAAACAATTTAATTTTCCTTGTTTTTTTTTTCATGTT:1 + chrX 17526591 3' - Q-element 503 2 71.29 GCTATTGATCCTGATCAGGAATATATATACTTTATATAGTCCGAAACGCTTCTTTCTGCCTGTCAACGAATCTAGTATAATGAGCTCCGATTCTTACAGCC:1 + chr3L 18847990 3' - INE-1 86 1 64.36 CCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAACAGCAAGTTGGATGGGAGAAGCATTCAATTCCCTTTTTACGACTGTTACCCGATGCCAACTTTGTT:1 + chrX 8934945 3' + I-element 423 1 67.33 GAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCAATACGAGTGCCAAGGGAGGCAAGGCCGTGGTTAGCAGCAGTTTGATTGCGGTGAGTTCGAGGGG:1 - chr3L 16529613 3' + copia 4969 2 67.33 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAACAGAGCAGTGCCAAAGGTCAAGTGCATTAG:3 - chrX 2253806 3' - Tirant 10 2 71.29 AGCTGAGTAACGGGTTCCTGATAGTCGGGGAATTCGGCTATAGCATTCTATCTTTTTTCATATATGTATATTGGAAGTTATAGAAAATCCAGTTTTTTGTC:1 - chr4 498415 3' + INE-1 545 1 70.30 GAGCCCTTTAGTATATCAGCAGCAGAAGGTTACCATCGTGAAGATTGATGATGGATGATGGTCATCTTCCTGGTGGGTCTGGTGTCCATGATTCTGATGCG:1 - chr3L 5602878 3' + Ivk 400 1 46.53 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTAAAGCAGGTAACACCAACAAGGTGATCTCGCTCT:1 - chr3R 22667097 3' + 412 487 2 72.28 TAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTTG:1 - chrX 17692578 3' - 3S18 25 2 54.46 CAACTTAACTGGCTACTAGGAAAACACTCAAAAATAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACTTTCGCGAGTGTCGCGAGCGCC:1 - chr3R 30702832 3' + Porto1 4185 1 78.22 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATCCATTATGTATCTGAGTTTGTATC:1 + chr2R 18434556 3' + pogo 2077 1 55.45 GCGCGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAACAGAGCAGTGCCAAAGGTCAAGTGCATT:1 - chrX 2253808 3' - Tirant 8119 2 69.31 TTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATTCACGCCGACCCGCAAAATGTCAAAAATTACAAAAACAACGGCACACCAGAGA:1 + chr2R 2906670 3' - Gypsy6A_LTR 199 1 53.47 AGGCAATCGCGAACGTCCGTATGCAACGAAGGCTAGGCAGAGACTACTTGATGGGATGCCGTGGAAACAACTTGTTAACCGTTATATCATTCTGAAGTCGT:1 - chr3L 16198402 3' - jockey2 11 1 74.26 GCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACC:1 + chr2L 3244986 3' - rover 49 2 83.17 TCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAAAATGCATTGAAA:1 + chr3R 20495795 3' - Juan 4110 1 64.36 GCCTANGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCGGTTTCTATTTTTGGTTTGCATTTTTGCTTACGACAAATAAGGGAGGCGTCCGCACCATT:1 - chr2R 1278531 3' + accord 43 2 62.38 TTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATGTGTGTCGAAATATGTATGGCAGCAACAAAAA:1 + chr3L 641355 3' + transib2 2461 1 68.32 TATTTTATTTATATATAAATATCTCACTATTTACTTCTTCTAGTCCAAAAGCTTATTATACAGATGGCAACTGCCATATCATAACTCAGTCCTCCGCCATT:1 - chr2L 14570588 3' - G7 1141 1 90.10 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGTCAGAAAAATAGGAACAAATCCGAGCAGAAGCATGTTTTAATCTAGGCTTAATTA:1 + chrX 13021636 3' - roo 13 2 58.42 ACTATCAGTTACCCGTTACTCAACTAGTGTACATGCGAAAGCGAAATTTCAACATTTTTATGGCCCGTGGCTGTTTGGTTTTCGCTACGCCTTCGCCGC:1 - chr2R 15728999 3' - INE-1 548 1 60.61 CACACAGAGAAAATCAAAAACTAAATGTTCTGCGCAAAAGGTGAAAGTAATATTTTTAAATTTTATTATTTTGTTCTACGCTTAAATGCGTTGTTTTTTAT:1 + chrX 8013737 3' + I-element 110 1 86.14 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGCCTTGGGAATTATCCAGGATCTAAGACTGCCTATCCAGTAACCAGTATCCCACCCCTATA:1 - chr2R 22935015 3' + micropia 413 2 43.56 CTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTC:1 + chr2L 20935278 3' - INE-1 547 1 53.06 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAAGCCAAGGGAACTGG:1 + chrX 2090316 3' + roo 406 1 75.00 AGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGCCTGGAGTGCGACGGCTGGTTCTCG:1 - chr2L 7975399 3' - F-element 4515 1 70.24 GGACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCGTCGAGATGCCTAACGACAGGCTTGAGAATTTTTCCAAGGGATCCGCTTAATTAG:1 - chr2L 10557194 3' + gypsy8 4470 1 69.31 ATATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAAACCAAAATAAATAGAATGGATTTGAGCCTCAAGCTAGCTGTGCAATTAGCGTTTG:1 + chr2R 11523396 3' + G5 4780 1 63.37 ATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCTAGCACACACGCACACACAAGATACGCCGTAAACAGTCGGACCTCCTCGG:1 + chr2L 5449354 3' + Quasimodo 113 2 54.46 TGAACACACACACACACCCACACACACACACACAAGCACGTGGGCGCTTCACGCAATTTTGACAGCTGTCAAAACTTGACTGCACAATCGACTTCCCAGCA:1 - chrX 12820846 3' + accord 182 2 49.50 CGTCGTAATGATATGCCAACCCAACGATAATTATTAGGGCCACACAGAACGCTTTAAATGGGCGGAGGAGTGGTCGGTGTGCATGGGCATGGAGTGACATT:1 + chrX 22479271 3' + Fw2 3806 1 62.38 ATGATAAATCAGCGGAATTTGCAGTTACTGTAAATGGACACCCACGGTGGTTCCCACAGGTGCGTTGCTGGGGTCCAGGCTCAACGAAATTGGTTTTTAAA:1 + chr3L 10278439 3' + gypsy9 67 2 43.56 TTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAACTTGTACCAAATACAAATCTTAATTATTATAGTTAAACAAATATTTGTGTTCAAATTTGAATTTAATC:1 + chr3R 13088486 3' - Juan 4065 1 68.32 GGGCGAAAGATATTACTTTACGGCGAAAGAAAATAAATGCATTTTAAATACATTTGTAATGCAGCCTGGACAGATGTGGGAAAATGCATCTGCCGGTCGT:1 - chr2R 13569648 3' - transib2 485 1 71.00 AACCCCAATAAAATTCTGTCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGATCTTTGGGAGACAGTGACGCTTACAGCGTTTGGTAACAATAAAGGTATATAT:1 + chr2L 10223568 3' + baggins 5329 1 53.47 TAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCAGGGCTGTCGATGGCCGTCCGTTCGTGGAAA:1 + chr3R 28129994 3' + Doc 491 1 71.00 GCAATAACACACACACACACACACATAACACTGTTGTTTCACACACACACACACATAACACGTTTGTTGGTCAAATATTAAAAATATTGCAGAACCTAAA:1 - chr2R 21421689 3' + accord 7025 2 42.00 TATCCNAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGAGGGAGACAGAGGCTGCCGGGAAAGTCCGGGG:1 + chr3L 1840593 3' - Quasimodo 85 2 66.67 GCAATGCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGAACATAGAGGTCCTTTGGTCTGGTATGACTAAATTAGCATGTAAATGT:1 + chr3L 13824876 3' - R1A1-element 5158 1 54.46 GGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATTAAATACATATGTATGTATTTATGTAGTAACTTAAAGCGAAAGCAAAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCTATCAC:1 + chr3L 15099974 3' - Tirant 8106 1 76.24 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCGGCAGTTCTCTGCTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATA:1 + chr3R 22238735 3' + hobo 2908 1 58.33 CCAACAAACGGTTCCTACCGTGCCCTCCTCCCCTCCTTCCCTACTCCGGGACAACATGGACTGGCGCAGTCAGCTTGCAACTTGCAACGTCAGTCGCATGC:1 + chr3L 3394076 3' + G-element 267 1 64.36 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGTTTAAACAACATATGCATATTTAAACTTTAAACTTTAAACTTTATATTAGTCGAAGCGAGCCGAACCTCACC:1 - chrX 22868413 3' - copia 6 2 72.28 CCTAAGACTTAAGTATATGCCTACATACATACATACAGAAAGTAACGAGACTACAGTTAGAATGCAGCGTAGAAGCAGAGAACTGGGAAGTGCTGTGAGAG:1 - chr3L 27390771 3' + Idefix 19 2 70.30 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCTCCCTCTCTTCTGAGTCTCTCTTTCTGGC:1 - chr2L 222066 3' + P-element 2881 2 73.27 TAATTACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTTATTATTAAATTTACTTATTGTCATACTCTAAGTAGACTCGATTTCGTTACAGCTCCTTCAGAAGATTCAATT:1 + chr2R 5607811 3' + G4 3775 1 55.45 GCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAACTGCCAATTCTGACGAAATCGTCCTTCAA:1 - chr2L 21295337 3' - 1360 48 1 71.00 AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTTAAACCGAAAACGGAATTGTTGAAGGCGGCCCTCGAAAGTATGCAA:1 + chr3L 10035699 3' - jockey 4769 1 66.34 TACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCAAGCCCCACTCCCCGCACACTGCCAACCACATTTTC:1 + chr3R 16385051 3' - Stalker 7088 6 64.36 AAAAAAGAAACAAAAAAAAAAGAACGAAACCCCACCAGAAACAACCATTGGCAAAGAGGGAAAAACGATTTC:1 + chrX 2964287 3' + Doc2-element 222 2 69.44 TTCTCTGTGGCTACATAATTAATTAAACATTTTTCAAAGCTAAGGAAGCAAGTTTCCCTATGCATTACAACATTTATTAAGCATTAAGCTG:1 - chr3L 18346327 3' - Dm88 4185 1 61.54 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAG:1 - chr3R 20140582 3' - jockey 58 1 75.25 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGT:1 + chrX 2090277 3' + roo 357 2 72.28 AGAAAAAAAATGTATTTTGAGTTATCTACAAATTGTAAACTCAAGTGGACGTGTGTAGGTCAGGAAGTCGAAGATCTTCCAATGCCAAGTGCTGAAAAGGT:1 - chr3R 11626159 3' + invader5 3615 1 66.34 TACCTATGACCGCTTACCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGCCCCTTTGTGCCCTATGTCAGTTAACTATGAAGCCAGCAGTTTATCCTTTTCACTTCACTTA:1 - chr3L 14679709 3' - Gypsy12A_LTR 1942 1 57.43 CGACGTTAATACGGACAGACGGACGTCGGACTGACGGACAATACGACAGACTGAGAGACGGGCATGGCAAGGCAACCGTTTATTTATAAATC:1 + chr3L 6682576 3' - INE-1 127 1 76.09 TGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGAC:1 + chr2L 3244985 3' - rover 6995 2 83.16 TTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCGTGGTCAAGATCAATAGAAGTCCAAAGAGCCCAGAGAAAACCTCGT:1 + chr2R 5499203 3' - gypsy 7437 2 50.50 TAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGTGGCCCAAACGCACTTGCCAACTTGGCCAGGATGAGTGGAGCAGAGAGAAGGC:1 + chr3L 8285519 3' + G2 2812 1 52.48 CTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGTCGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCTGCTTTCTCAGAGTTTTCAATTCCCTGGGACCTTGCCGCTG:1 + chr2L 13690349 3' - invader6 4835 2 79.21 CACCTTAACCATCTGGCTATTAACCTCCTGTCCATCATCCTCCTGACACAGACCGCGCATATCGAGGCCTTTGGAAGCGGAGGCAGCTCTTCTGGCAATGG:1 + chr3R 18875888 3' + G-element 4114 1 76.24 CCCCATCACATTAAAAATGGGCGTCCTCGTCCATGTCTATGTTATCAAGGATTTTGGTGGGCTCGGAATTAAACATTGTTTTATTTCTCTTCTCTTAGATT:1 + chr2L 14743363 3' - Chouto 6309 1 54.46 GTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTATATAAGAATACATAGATATAACCGATGGAAAAGTATTCGTTGCTACAACTAATGAACACATGGGAAAAAACTG:1 - chr2L 23352248 3' - rover 6 2 57.43 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCGTTATCTAAGCTGCCCTTTCTCACGCTCTCTCTAGTTCTCTTACACCT:1 - chr2L 22319273 3' - Transpac 24 2 51.49 TGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTAATTGAAGGCGAAGTACGCGGCGGCGTGATGTGCAAATTTCGGTAT:1 - chr3L 3662686 3' - Stalker 7060 4 56.44 CCTAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACACTTCACAAAATCGTTGTTGAGCATGAACTTGG:1 - chr3R 26294484 3' + roo 9030 1 64.36 AGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGGAACTGGATGCTTTTACGAAATCCTAGGCGTGATTTGCCGTTTAATTGTGCAGCAAGTTGCCAAA:1 - chrX 6489641 3' + baggins 5194 1 75.25 AGTATTAGGCCCTAATTAACATATTAAAAAGAAAAACCAAGTTCGTTAGATGCTATTTTATGCGAGTGCCGCTTGCACAGCATCTTACTAAAAGTTTTTTT:1 - chr4 176910 3' + HB 1343 1 62.38 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGTGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATATTAGACAGACAGAGACA:1 - chr3R 21010728 3' + hopper 1387 1 52.48 CGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCGCGCCTATGACAGCTAGTAAATACACTAGCCAACAAAAACAAAAACTACATGCATAAAATTCAAATAATT:1 - chr2L 16365636 3' + 1360 3295 1 79.21 TTCGCGACTCCCACCAAAGGGTCAAACTGCTTACTGTGAAAGGTGCTATTTTAAAGGTTGCTATTACTGTTATCAAGAGTAATTTCGCTTTTTTATTTCCT:1 + chr3L 18392725 3' + Quasimodo 326 2 64.36 GAGCGNTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGAGCAACCAGAGCAAGTTTTTTAGGATCCTGAGCAAGTACCGCATCGGCTACAAGCTGCTGCTGA:1 + chr3L 19448536 3' - Max-element 341 1 71.29 GAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCCATGTTTGGGTTTTTAACACAGCCTATCGCCACG:1 - chr3R 18019157 3' + flea 469 1 66.34 TGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCATCAGCCACCCTCTATCTGCTCTGTCTGGTGCTAGCAAA:2 - chr3L 13326658 3' - transib2 10 1 69.31 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGACCCGTCGAAGTAAACAGGAAACGATGAAAAAAATAATAATTTACAGGAAATCAATATGGAAACG:1 - chr2L 17945832 3' - jockey 4688 1 64.65 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGGGGCGGAGGACCATAGAGGAGGTGAGC:1 - chr3L 14884660 3' - jockey 4786 1 70.30 TCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATCTTGGCAAAACCGAAAACCACCAGTAGCTGGGTTCACAAATTGAAATAAATATATAGAATTATATAAGCGGC:1 + chr3L 20317366 3' + 1360 3300 1 74.26 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGCGCAGCAACTCGAACTCAAACACAACAGG:1 + chrX 19848505 3' + P-element 2885 2 71.25 CCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTATTTAGTGTCAATAAGATCCAAGGAATTAAAACTAACCGAAGGTGTCGTGTTT:1 + chr2L 17249195 3' - Cr1a 4014 1 56.44 CGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAACAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGGCCAGGAGCTGCGGCAGCGG:1 + chr3R 29363277 3' + TART-A 13169 1 80.20 CGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGAAATGAGATCCTGTTTTTTTTCGGTGAGAGCTTGGCACAGTTGAGCACAGCGGTCAT:1 - chr2R 16471581 3' - G2 2896 1 63.37 TTGTTATTATTATTTACCAAATTTAAGGCTAAGTTATTTTCATGTCTTCTTGTTTTTCGGGG:1 - chr3R 17346363 3' - G4 3655 1 82.26 AGTGCTGAAAGATATTATTAAAGTCAGTTATCCTCGCCACAAACCGGTGCGCGGACTAAGTTATGCGTGTGTTTGTGGCTGAGGAATAGGCGTCTCAGTTA:1 - chr3L 25146534 3' + Gypsy12A_LTR 349 1 73.27 CCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTAAGAAGTTGGGTACAAAAGCAGGCACTTAGATTT:1 + chrX 1148036 3' - BS 4763 1 70.30 ACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCG:1 + chr2R 5532340 3' - G4 3769 1 54.64 GTTAAATATAATGATTTATCAGGCGGCAAAGTGAGTGTAGCAGTGCTGTAGATACAACCATTCAAAATGATCTTAATGTTCAAATTGGACACGCTGCA:1 - chr2R 23044475 3' + Chouto 6223 1 72.45 GTTTAATAATTTAAATAAAAAATGCTGAAAGCGAAAACACGTTCTGCTCACCGTCCATTCTCTGTAGTTGACATCCGGATCGATTTCATTGGAAGCTGTTC:1 + chr3L 309764 3' + jockey2 3401 1 44.55 ATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGTGTTTCCCCATAAAGGACGGCCACACCCCCCGCCCTTTTGCTTATAGCTGTGAGAGTGTGTGTGTAGGTGTGTCTC:1 + chr3R 9492484 3' - Doc2-element 4397 1 75.25 ATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTATAAACATTAAGATAGGGAACAACAACAAAAAATACCACTGATTGTCAATTAGAACGAATGCACTTCAGTTTTGGA:1 + chrX 13818602 3' - I-element 214 1 77.23 CGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGTCGGCGCTGCGATAAGTACGTTACAACTGCACGACAACCATGGCGGCAACGCCAACTGCCCCTTGGAAGCCGACGA:1 - chr2L 18141947 3' + blood 203 2 77.23 TCTATTTTATATTATTATTTGTTCCTTATGAAATAACAGTTTAGCGCTCGAACAGGCCCCAAGTTGCATGGCGTTGGCACTTTTTACTTTCGGCCAAAAAC:1 + chr3L 10132005 3' + accord2 450 1 63.37 TGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGATGTTGTGGATGCATGTTTGAAATTCACGCCAGAGCTGAATCTCATGGTGCTACAGAATTT:1 + chr3R 21621909 3' + 1360 78 1 70.30 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCATCTGATTACTGAATCCTTTACAGTTAGCTCGTGTCGGTTGTCGGG:1 + chr2R 21266501 3' + roo 9044 1 58.42 CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCAT:1 - chr3R 10490354 3' + transib2 2777 1 74.26 GAGATCCCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTCATCATACAGGTTCTAGAGACAGCGCAGGTTTGTTGCCACATGACGCCACTTATATACACATT:1 - chrY 1706806 3' + INE-1 148 1 76.24 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTAAAAACGTATTAAGATCTTTGGGATATTACAGCTGATGTTGGCGTTTGTGAACTGAAGAAGAA:1 - chrX 7413931 3' + pogo 2092 1 42.00 TAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAATGTCCAAACTTCTGTCTCTGCTTGCCGCCTCACCTGACTCTGTCCTTCTCTCGAGACTC:1 - chr2L 12869474 3' + G6 1827 1 69.31 GTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCATAGACCTCCAACATTAGTTAATATACCCCTCGCCAATTTCTAGCTTGTATAAACATCAGCAA:1 + chr2L 2475370 3' - hopper 473 1 64.36 GGTTCAAAGGCCAGCTTAAGAATTCAACTGAATGCTGAACACATCTTATATTTGCCTGAGAAGCATTGTCCATTGACTCACACGCTAACTACAGACCTCAA:1 + chr2L 2573388 3' + gypsy7 82 2 77.23 GAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGAAAAGTCACAAAAAAGGACACCAC:1 + chr2R 11608310 3' + roo 176 2 77.23 GCTGAGTCTTAGAGGCTGTTGTTCCCCACACTTGGATGGCGAAACCAATGCAAAGCAGACACATAAAAAAAAATCGCAAATCTCGCACTATATTCCATCAT:1 - chr2L 3489306 3' - G5A 2452 1 61.39 AAATCAATTCTGATCGAAAAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGATGTACGTCATTCACTCTCAAAGAAGCAGAGGTTGGCATATGCCCTATAGAAAAT:1 + chr4 51434 3' - 1360 3171 1 60.40 ATATAGTTAAATTCAAAAAACAATTTACAACATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAGGCCAACAAATCTGGGCCAGTGAGCATTGTAGAGAACACGTTTTG:1 + chr2R 5470699 3' - transib3 55 1 63.37 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTTTTAGCTTAGATTTAAACACAAGTCCAATTAAAGCAAAACGCATTAATAACTAAGTGAC:1 + chr3R 7375408 3' + roo 9055 2 62.38 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGC:1 - chrX 11060482 3' - I-element 31 1 53.47 CGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATGTATATACTTATTATGGTCAAAAACAGACAAAACATTAAAATTTAACGAAAATATTTTGTGTATAATTTAAAA:1 - chr2L 11757356 3' - INE-1 88 1 53.47 TCCCGAAAATCGTCTTCTAGGACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTGACCTGCAGTTGTGACCCTGTCTTATCAATTTTCTTTGTGG:1 + chr3L 13905420 3' + 1360 3195 1 59.41 TCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAAGGATTGCCTTGCATTATCCTTGTTCATTTC:1 - chr3R 19249249 3' - copia 4788 1 70.30 CCATGGTATCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCCATGGTCATAAGGGAATTTAATTGGTCAACGGCCGTCGTCTCCTCGC:1 - chr2R 23901557 3' + Doc2-element 4462 1 53.47 ATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTACTCAAACGTATCCTGGCTCAAACGCCGGCACATTCTGAATATACGTTATACAATGATA:1 - chr2R 21123421 3' + Transpac 432 1 39.36 CTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGTAAATGTAATGGTAATCAGCTGGAAA:1 - chr3R 31043982 3' + opus 208 2 74.26 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAAGCATTTTTTAGTAGATAGTAAAAACATATACGGTTATATGTGG:1 - chr3L 19260774 3' - pogo 27 1 60.40 GCCTANTTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGTCAGGCTAAGAAAATGCTTCGCATTAATAGAGGTAAAAATATCAAATAAAC:1 + chr3L 3641225 3' + Quasimodo 439 2 63.37 TATGAACACACACACACACACACACAGCTGGGGCGAAGATAATAGCACCCGCTGCCGCGGACCTACATAAACTTTTTGAAATGCTAAAATAGCTTGAGAAA:1 + chrX 2088200 3' + accord 180 2 75.25 TGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAACGAGCAGATTTATATAAACACCTCGAGTGGTGAACGCCCACTAAATGCGGCATTACACA:1 + chr3R 30869276 3' + Bica 4568 1 63.10 GACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACACTTTTATAGACTCATCAAAGTGTAAGCGTTGTCGTTGATTCGAAACTTTTTTT:1 + chr2L 22243113 3' + transib4 2374 1 56.44 CAATGCATGACCATACGTGTGCACACATACAGTTGTTATTTTAGTGTCTATTATAGGTTTGTCTTTCCGGTTTGCTCGGGGCATGTCTCCGTTGTGTCCAT:1 + chr2R 4396485 3' - 1360 184 1 71.29 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTCACACTCACACTCAGAGCGAGCGAAACGCACACACACGCACAGGGGGCTCAAG:1 - chrX 14505424 3' + hobo 2915 1 49.50 GGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTAATGGTTAATGCATTGTCATCACATTCGTTTTTTATTGAAAGCGTGTTCGCGTTTGGAGTGCGGTGA:1 - chr3L 18710462 3' - Porto1 270 1 72.28 TGCAGTTTTTTAAAGAAAAAAATAAGAAGTATATATTTTTATCTACGATTATATGGTATTAGCTTAAAACAAAGTGTACTAGTTCAACTAATGGCAAAACG:1 - chr3L 9761466 3' + flea 313 1 49.50 GGTTANCTAGGCGAAGCACCAGCCTTAGAAAGGGGTTCCCACGTAGGCCACGGATTTTCCCCTGGCTTTTACGCTCGATTCTCGTTCCAATTGAGGGCTTT:1 - chr3L 4868633 3' - Rt1b 342 1 71.29 GTGATGGTTCTCAGGATTTTCGATTGGGCCCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTTGTGCTGTCCCGAACAAAACATCTTCGAGTCTGGCCGGGCTAGACT:1 + chr3L 6830366 3' - Fw2 3618 1 56.44 TTACATACTTTTCAACGAATCTAGTTCCACTTTAGGCAAAGGAAATCCCAAAGTCAACTGTTAATTAGTGGAACGCGACTGTACCGTCAATGGTTGAGCAT:1 - chr2L 12957846 3' - INE-1 14 1 79.21 ATATTATTATTATTATTATTATCGTTATGATTTATTCAAAAACCTACCTGCTCCACAGTTAACGAATCGACGATCACCAAGAGGGGCTGCACCACCGCCAG:1 + chr2L 8344093 3' - mdg1 7070 3 84.16 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAG:1 + chr4 490299 3' + pogo 2055 1 72.28 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCATTAGCAATTTCGACGCCAACGCGAGAATACACA:1 + chr3R 12408386 3' - P-element 42 1 37.62 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTAC:1 - chr3R 15072595 3' - pogo 52 1 81.19 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCCAGGAACGAGAGGCGGAGGCTGAGGGCTGCAAAGACTGGAGGAGCCGAAAGGTCAATGCATTTAGTTAAT:1 - chr3R 29281281 3' - accord 7030 2 63.37 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGGCATTTCGG:1 - chr3R 7808958 3' - jockey 8 1 60.71 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGGACAAAATATT:1 + chr2L 9823693 3' + hobo 2904 1 68.69 CACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCTGCAGAAGAGTGAGTTCCAATCGCCCAAGTTCAATGACTGCGGTCAGACTTA:1 + chr2R 12705658 3' + P-element 319 1 55.45 GCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTTTTTCTTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGCATACAAAGTATTCAAACTTGCC:1 - chr3L 17474662 3' + copia 4952 2 73.27 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACTCGACGTATACGATTGTTTCACAGTTCGCAGATCCTAGATCAAAGCAAAACGAACAC:1 - chrX 5997756 3' + 1360 3182 1 62.00 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTTAATATATCTGAATATTCTGCGCAATCCACAAATTGCGCGTTTGTAAGTGAAA:1 + chr3R 5946182 3' - HMS-Beagle 19 2 58.42 AGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACACAATTCGGATTGCAGTCACGTCGGCTTTGGGGAT:1 - chr2R 21380622 3' + P-element 2737 1 38.61 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTGATGGCGCCGTGAAATATGCGAAGTGGGTGGTCCATTTAGGAGTCCAT:1 - chr3R 12132132 3' + blood 343 2 50.50 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAGAGGGCACTGCT:1 - chr3R 22899154 3' + P-element 2880 2 70.00 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCG:1 - chr3R 6216816 3' - pogo 44 1 76.24 ATAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAGTGAGCTAGTTTATGAAGTAATCCGAGTCAATAAAATTAAATTGATAAGGCTTAATGTTGTTGCTTTTAA:1 - chr2L 21672723 3' - HB 1445 1 77.23 TACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGATACTTTTTCATGCGGCCAAAACAAGTGGCCCG:1 + chr3L 15531020 3' + 1360 3255 1 70.30 GGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAGTTGTTTTGCAAAGGTTGCTGTCATCGTAGTATATTAGTTAATAGCAGATCTTGCC:1 + chrX 5760521 3' + flea 4726 1 67.33 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAATCGAAAGCGATAGCAACACTCTT:1 + chr3R 12789925 3' - flea 25 2 54.46 ACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAACAAGTGGCAGTTGCATGTGTGTGCGAGTGTACAAACGGGAGGGGGAAGGTGGGAGGATGTTGGCCATT:1 - chrX 6978554 3' + P-element 2748 1 75.00 CCAGCTAGAGAGTTGCCGGAGCTGGAGTGACGGTTTAGACGGCCAGCCAGGATTTGTGTGAGCGTGGGCACGACAGCGCACATTGAAAAATTATTAAGCAA:1 + chr2L 14503851 3' + aurora-element 178 1 63.37 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCA:1 + chr2R 14582884 3' - roo 44 2 72.45 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAAAATTTAATAACTTTTTGCGCT:1 + chr3L 776174 3' - 1360 20 1 59.41 CGAAAAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACATGCATTGTGTATAAATTTTTCAATATAATTTTATTCGCTTACTGGCCGCTACTTCTGAAA:1 - chr2R 18074471 3' + 1360 135 1 60.40 TTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGCAGCTGGAACAGGTTGTCCGTCGTCGTGTGTTG:1 - chr3L 11029850 3' - F-element 4590 1 67.33 GTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGTCTTGCCTCCGTGGTCC:1 - chr2L 22407441 3' + roo 9065 1 74.00 CGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACA:1 - chr2L 19845894 3' - F-element 33 1 48.51 TACTTAAACTATGGCGCGTAAAACGGCCGTCAAAGGGGCCAAAAATGGGAAAGCTAAAAAAAAGTAAAGCCAATTTCCTGACATATCGCTTGGGCTGTTGG:1 + chr2R 17338621 3' + TART-B 10219 1 69.31 CTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGCGTGTGTTGAATTATTATTTGTTTGATTTGGGTTGCATGTTCTGTGGCGTGTTGCACTTTTTTGGTTCTGTTTGTATTT:1 - chr3R 30547146 3' - I-element 5101 1 79.21 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGCA:1 + chr3R 11833012 3' + roo 9029 1 67.33 GCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGGGTGAGAAGAGCGGGGTGCAAGGGAAATGGGAAATGGGGAGTGTGTGTTATTTTTAGCCGATGTGTTGGTG:1 - chrX 17658345 3' + invader2 324 1 72.28 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAAGAGGCTCTTGCCTGTTGCTTCAAAATGTTCGCCACATTTCTAGGCAGACGTCCCATGTACGTACTATGGTGAGG:1 - chr3R 31968322 3' - FB 2 1 77.23 ATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCGCAACCAAAACGACCGACAAGGAGAACGATCCCGGTCCCAATACATCGATATCCACTACCGCCACGCCCCCTTCTGC:1 - chr3R 11348247 3' + Max-element 263 2 79.21 GAAGTATTGCAGCCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATA:1 + chr2L 21592737 3' - BS3 340 1 73.27 CGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAACAGTAGTGGCAATCAGAATCGAAAAGGTTTAAGAAGAACTCTAGTAGCAGGGAATTGCGTGCTCTTGATGCGAA:1 - chr3L 189816 3' - accord 7032 2 59.41 GTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACATTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAGTGTGACTATTAAATTGGCGGCGGTAATTTCAAGT:1 + chr3R 14458393 3' + R1A1-element 5015 1 63.37 GGTGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGCGCTGGACACAGTTGGCAGCCTTGTTGAAAGTAATTGACATATTGCGTTGCAA:1 + chr2L 14536343 3' + blood 375 2 76.24 TTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTAGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATACGGTTAGTGAGATCGGTG:1 - chr3R 21015376 3' + hopper 14 1 79.21 TGGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTAAGGGATTGGCTATTGTCCAGAAGGGTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGG:1 - chrY 1428635 3' - G2 2918 1 92.11 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATAATTTCTATTAGGAAAATTAAGCAGCGG:1 - chr3L 18957599 3' + copia 239 1 62.38 TTGACTCCGGCTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGGCACTCTTTTTGCCAAGCCAAGTCCTGTAGACTTCCCGTATTAGTTGAGCCAGTAATACT:1 + chr3L 25987564 3' + G3 468 1 59.41 TTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGGCTCTTGGACGGTTGCATCCCTCACTTCTCATACTTCCTTTTTGACAGGCAAAAACTCACTTAAACGGTCAGA:1 - chr2R 23469646 3' - I-element 380 1 57.00 TTATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGGCCACGCTCACTAACCTACCGCCCACCGTCTC:1 - chr3L 22349632 3' + invader2 4997 2 54.79 GCCGACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGTATTACGTTGTTGTTTAATTGCATTTTCAATTTTAAGTCGTCAAAATCGTCAGTCTTTTCATTTA:1 + chr3R 2444966 3' + G5A 2614 1 71.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAAAAAGTTGTGGCAAGAAAATTAAG:1 - chrX 698707 3' + roo 404 1 58.42 CGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCCTCACTATGAGCCGAAGACATGGGTAAACAAATAA:1 - chrX 10439043 3' + Bari1 1578 1 65.35 TATTGGTGTTGATGCCCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGGTTATTATTGTTATTATTATTATTGTTGTTGGCATTGTTG:1 - chr2R 11210995 3' - rover 6890 1 68.32 ATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTTCGTCGCCGAGTCGCTTCTGTCGCCAAACTTCAATAAATTCTAATAATTTATTTCATT:1 + chr2L 16615928 3' - HMS-Beagle 6983 2 60.40 ATTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACTTTCAGACGGACATGGGCAAATTGACTCGGCTATTAATAAACGGATGTTTTACTGACCGATGACCTGATATGATA:1 + chr4 192008 3' - INE-1 141 1 80.20 TGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTTGCCCCCGCTCCGTTGCCTTTTG:1 - chr3L 13590809 3' - I-element 180 1 77.23 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATC:1 + chr2L 1353759 3' - I-element 52 1 78.22 TAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCTCGTTGCCCGCCGGATCAAAGGCCTTGTACTTAATGGAGAAGTCCGACTTGACAT:1 + chr2R 15321767 3' + Bica 273 1 59.41 CGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAGATGGACTGAGAGACTGCAGCTGGAACTGGAGCAACGCCAGTTGGAGGAGAATGCCAAGAAACGGCTAGCAGCACGGA:1 - chr2L 20757332 3' - Chimpo 2 1 69.31 GAATTGAGGACCGCGTCTGGAGTAATAAGGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTGCTTCATTGGTTTTTGATTGTGTTTGGCTGCCTTATTTATTTATGGCC:1 + chrX 15223813 3' + diver2 4430 1 57.43 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGTACATATATGCATATGTATGATGCTCCTTTCCAATATTGACAAGATG:1 - chrX 19885168 3' + HMS-Beagle 7015 2 54.46 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGTATTCTTCGGACGAAGTTTGTAAATTTATCAGCCGCG:1 - chr2L 6177142 3' - pogo 7 1 73.27 GAAGGTGTTTGAGAGACTGATTGCTGTCCGGACTTATCCTGCCGACTCCTGGCCGTCCTTTGCACGTGTGCCCGGAGTTTAACTTTAATTGATTGCATTAG:1 - chr3R 28800526 3' + BS3 466 2 71.29 AACTAACATACAAAATATTTCCCTAAGTCCGTCGCAATCAAGTGGGCGAATAGATGAATTAACTAATTAATCAGCACTTAAATAGGAACAAATTGAACAC:1 - chr3L 14762321 3' - HMS-Beagle2 232 2 64.00 AGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTTGCATCCGCCCGTGTTGTGGCTTACAATTTCAATTGAAATTTAATTAATTAGATGACAGTTGGATTGACACTTGA:1 + chr2R 25049423 3' + R1A1-element 4912 1 78.22 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCGCCTCGAATCGAGGTTATTTACTGGGAACG:1 + chr2L 6644331 3' - hobo 44 1 67.33 CGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGATAGGTTGAGAAGCCCACAAACCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAATATTG:1 - chr2R 12521466 3' + INE-1 128 1 44.55 TCTGGCGACGTTACAGGTAAGTAGTTGTTGTACTTGACTTGGGGCTATGTTACAGGCGCGAAATTACGGTAAACGAGTGGCGTGAGTGGCGCACAGCCTAT:1 + chr3L 25209887 3' - HeT-A 5695 1 58.42 CATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATACATACATATTACATACATATTTTCAACACTCCTTCTCAATGCAATA:1 - chr3L 26544694 3' + invader1 3982 2 62.38 TGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACAAGTAACGCAATTTATATGCCTTCCTCACTGGCTTGTTTGTCTTGGCAG:1 - chr3L 9239489 3' + accord 7005 2 58.43 AGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTAAGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTGTGGCTGCAGGTGAGCAG:1 + chr3L 19879404 3' - F-element 362 1 76.24 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTAATTTAATTAGGAACTTATCGGCAAGCAAATATTTTAAAAATATTTATCGAAGAAAATGATCTACG:1 - chr2L 20128947 3' + 412 485 2 47.00 TTTTTCAAAAGTATGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCCACATGGTTAAATGTCTTTGTCCATGGGATTGGTTCTTTTTCGAAGTGACCGCAATACGAGTGCCG:1 + chr3R 9471446 3' - INE-1 252 1 56.44 AACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGGCAATCCGGCGACAATGGCCAGTAAACTCGAGGCGGCAGCAACTGGG:1 - chr3R 24142819 3' - R1A1-element 4996 1 53.26 CATATTTGCGTAGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTATAAGAATCATCAACAAAAAGGCCAAAAAATGAACTCGAAATCAAACGCGTTCTGTCTTTCAATCA:1 - chr3R 30113410 3' + Gypsy6A_LTR 110 1 56.44 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTCTGATTAGTTTAATTAAAGC:1 - chrX 10555415 3' - Tirant 35 2 57.43 CATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCGTTATTGTAAGAAAAGTTGCTTTCTTGCTTACTTACTTGCCTGCAACTGATAAAGAACGAGTAGCAAGGACA:1 - chr2L 10582409 3' - 1360 173 1 71.29 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTGA:1 - chr2L 6656256 3' - P-element 14 1 63.37 CCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCCAACATATCTTTCTAACCTGGATTCTTCCAAA:1 + chr3R 5537360 3' - opus 262 2 61.90 AAAACGAAGATCTCGAAATGAAGACAGCGCAAGTGATTCTGCTAAGCCCCCACTGGAAATTTGCATAATTTGACGACAAGTCGAGTTGAGGATTTATTATA:1 - chr2R 12729694 3' + G4 111 1 63.37 CATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTAATGCCTCTTTTAATTTAATGGTTTTGCATTAACTTAAAGAGGCATTAGTGCGTAAGTA:1 + chr3R 26487894 3' + G4 3738 1 60.40 ACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTACATATATGGTGCAGATCCATGCGATAAGTCGCCGTGGAATCACCGCTCAACGATCCGATGA:1 + chr3R 23172103 3' - gypsy6 417 1 46.53 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGCGCGTACATACATATGTATGGG:1 - chr3R 11731193 3' - hopper 39 1 71.59 CGGTTTCCTTCTATTAAGCCTCATTGGGCGAGGGCTGTACGGGTTTTGTTTGTGGTAGTTTGTTGAT:1 - chr2R 4431505 3' - X-element 4484 1 77.61 ATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAAGTTTTTTTTACTTCTTGCCCAGCCGTCTGACACGAGGACG:1 - chr2L 20045841 3' - I-element 242 1 62.24 AGACTAGTATAATTGGATATAATATAAATATATTAATGAACTATGCACAGCGCCAATTGGTTAAGTTTGTTGTTTTTTGGCCAGATACTTTCAAAAGGCAC:1 + chr2R 12777463 3' - gypsy7 5078 1 77.23 TGAAAATAATTTTGACCATGACTGTACTTGTTGTACTTGTACTTGTTGTAAAGTATCAGGTAGAGGAAAGCGATTCCGACCCTATAAGTGGATTTGCAATC:1 + chr3L 21637472 3' - Bari1 4 1 76.24 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATTTAAGTACGCATATTTCAGATTTTCCATAATTGATTATAATCTGTTTACATGGGCACTACGCAATGCC:1 + chrX 11060565 3' + I-element 5343 1 61.39 ATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAAAATGAAGTACTTGAGGAGAAACCAGAAAAGC:1 + chr3R 10245899 3' + Quasimodo 275 2 70.30 TCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTTTCCTTTGCTTCCGCCTTTGTTGCCGGGTAAC:1 + chr3R 31884596 3' + HB 1609 1 68.00 ACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCGCATAACAAACGCGACGAACTGACAGGCGACACCAAAAAATCAGGTTGACAAAAAG:1 + chrX 10046167 3' + G2 2875 1 57.43 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTC:1 - chr3R 21799510 3' - jockey 4787 1 50.50 AAAATATTTAAATGGACTAACAAAGTCTACAAAAACCCTATTAATTAATAATTGTGCTATATTCGCACCTACAATTAGAGGGGATGGGCATACAGTGTATA:1 + chr3L 19200842 3' + Copia1_DM 251 1 72.28 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTT:1 + chr2L 5152011 3' - I-element 24 1 52.58 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGAGTGTGTGCGCGGTTCGTGCCTCGGCTGAGCTTAGGAAACCAAATTAAGCT:1 + chrX 1399936 3' - P-element 23 1 56.44 ACCCTTACAGAGATTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTTCCGCCCAAAAGTCGTCCGAACCGCCTTCGTGGC:1 + chr2L 12278514 3' + Cr1a 4182 1 71.29 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATCGGTCGCCAAGGTCGATACG:1 - chr3R 6216778 3' - pogo 6 1 73.27 TAAGCTTACAAACAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTCTATCGATAGCTCGGGAAATGGAAAAATTAATTAACCTGGCCGTAAGAAGTGCAACTTCTTCGCC:1 + chrX 6156694 3' - Cr1a 4037 1 56.00 TCTTGATCAGGATCAATAGTAGAGTCGATCTGGCCATATCCGCTTGTCCGTATGAACGTCGAGATCATTCAAAGTCTACAGATGGCTTGTGTTGGTATATA:1 - chr4 664618 3' + INE-1 88 1 65.35 TCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGGGTTCCAGTTGCCATCCTCTCCACTCGGCATTGTTTGTACTGGCCGGTGTTTGGTTTATTGATATGT:1 + chr3R 30221360 3' - Tirant 94 2 57.00 TATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGGGACGATGGCTGTATTTCGCCAAGTGCGTGTT:1 - chr3L 26852044 3' - diver 46 2 67.33 CTACGTAGCTATGTGCCTGCCTAGTGACTGGGTTTCTATGAGTACTTAGTTTAATGTTACCCTAAACGATACTTGGCCCATGCGCAATTTTGTGTCTTCAT:1 + chr2L 8818629 3' - Tom1 142 1 70.30 TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTAAATTGCCTGTGAATGACAAATATTGTGTTATA:1 - chr3L 18957626 3' + copia 5081 2 74.26 AACGTTCATAAGGACAGACGGACACGCGGACCTGGCCAATGAATACTTTCATTTTGAGAACTACTAACGATCATGATTAGGCAAGTGCTTTTATACCTTCT:1 + chr2R 15024867 3' - INE-1 126 1 67.33 AGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGACCTCGCCCACCAAGGGATCTTGCAGCAGCATCTCGGTCACTCGGAAAAGTATGAGATACACTG:1 + chr3R 13949189 3' + X-element 4432 1 56.44 ACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTCCTAGAAGAAACGAAGCCGAAAAGAGTTGAAAAGTTAAAAGTCAAAAGAAATTAAAGCATTAATTTAACGCCAGCTTT:1 - chr3R 11608921 3' - 1360 3217 1 76.24 TCTCTCTCTCTTTCGCTTTCCCACACAAAATCTAAATTTTTCAATTGCAGACAGCTTGACGTATATATATGTAGCCGGGCCAGAGCACTATATCTCTCATT:1 + chr3L 21702440 3' + Cr1a 299 1 62.38 AGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAACTGGCAGACGTCTAGAAACGGCAG:1 - chr3R 6005962 3' + F-element 229 1 79.17 CTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACAGTAAGCTAAGTAACTGAATGTTTTCAAAAAGAAAACCGTCG:1 - chrX 8542940 3' - Max-element 8298 2 59.41 CCTCTGCTGGCAGTCAGCTGGATATGATTTTGCGATAGAGTGGCAAATAGTTGGATGGCTGGAGCAGTTTTGGTTTCGTTTATCTGGATCTGGGATAGCAA:1 + chr2L 20124221 3' - G5A 293 1 59.41 ATATAAAATCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTGTGATTCGGTTCTTTATTAATCTACTGCATATTCGACAATACCACATAGCCAACTCGATGGAGCT:1 + chr2L 18969665 3' - 1360 377 1 59.41 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGAAACACACAACTTTATGGTGGAAGTCTTATGAAAGACTGTGCTAAA:1 - chr2L 13911717 3' - BS 5002 1 54.46 AAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGCGGTTGGTGCGGTGCGGTAAATGCGACAT:1 - chr3R 24429610 3' + jockey 173 1 75.25 GTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCTAGCAAATAGCAGCGCTCCTTTTGATTACAT:1 + chr3R 4418521 3' + Quasimodo 7074 2 67.33 TATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCATTTTTTTCTCAGCGCCTGAACAAGAGCGTTGATTTTATCAAGCTTATTATAT:1 - chr3L 11382554 3' - Doc 4475 1 52.44 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCGGCGGCGGCCGAAAACTCAATT:1 + chr2R 5322073 3' + 1360 3358 1 58.42 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGTGAAATGAATATTCATCCTCCT:2 - chr3R 22675791 3' + 412 7530 2 60.40 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCATTGTAGCCACAATTGACTGATTATCATTTT:1 - chr2R 8125060 3' - Doc 16 1 57.58 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATCGACTATTGATGGTGTTTTCAGATGGTGTTTTCA:1 + chr2R 4536700 3' + mdg1 7449 2 69.31 GATGAAATCTTATAGGTGACGTCCCCCATTCATCATACATTGCGTCAGACGGACGTAACAATATTCCACATAGTCATGGCTAGAAATTGCGTTGCTTTTGT:1 - chr3R 19360018 3' - mariner2 766 1 58.42 CCACCCGAACCAACTAGCAAATCCTAGCTAAATAACTTACTCAAGCAACCTCCAAATGCTGTCTCGCAACTGACATCAACATTTTGTATAAAATATTTTCA:1 - chr2L 9723486 3' + G5 4587 1 78.22 AAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGAGCTTTATGGGTAT:1 + chr2L 3245024 3' - rover 10 2 70.00 CGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCCGGTGCGCCACGCCCCGCCCCATTCCCGAGAGCCATAAAATTTGGAAGCGTTGGTAATTT:1 + chrX 19419214 3' - Rt1b 4957 1 53.47 CTCCGGACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACTCGGATTATGACACCTGGTGCTTTGGATTTTCACTCGCCGGCCGGGCAGC:1 + chr2R 14970520 3' - R1A1-element 5316 1 55.45 TCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTGGAGCGCTGTACACTGAAAACCTGGATGA:1 - chr2L 20725534 3' + Doc2-element 4487 1 71.29 CCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAA:2 + chr3L 776153 3' - 1360 41 1 62.38 TGAGCTACAAAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAAACGAACCCTGCACTTGATAATGAAATATATGAACGTGGCTT:1 + chr2R 15800742 3' + G2 62 1 59.41 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTTCTTTAACTATACATGCATATGTGGGACTTTT:1 + chr3R 17244148 3' - 412 7097 2 75.00 TTTTCTGTGGGAGAGCGAGAGAGTTTGGACACCCATTTTGGCAACGAAATAAAAAGATTAAAGTACATGTTTAAATCAATCTGCATGGCATTACATTATAA:1 + chr3R 26776921 3' - Cr1a 307 1 83.17 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATCTGCGCCTGGATTGCCGCAGAGTTA:1 - chr3R 17788899 3' - roo 8689 2 52.48 AACATAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTCTTCCGAAAGTGCTGATTATGTGAATATGTAATATGCTCACTCTTTGTTCGCA:1 + chr3R 3744536 3' + Tc1 1364 1 58.42 CGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATTTGAAATGCGTTGCCAAGCAAAAACTAGGACACAAACTATGGAAATGCGGACAAGTTTAAGTCCACAAA:1 - chr2L 18664263 3' - hopper 104 1 73.27 CGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGAGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACTAACGCACACACTCGCAACGACAGCGCCGCCATTAAACAAACATTT:1 - chr3L 10035507 3' - R1A1-element 5323 1 52.48 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAAGCCA:1 + chrX 2090306 3' + roo 387 2 58.42 CGGCATCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACGGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGAC:1 - chr3L 16047626 3' + Cr1a 4410 1 59.18 GGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCGGCAAAGGTTGAAAGGGGGGTGGTGAAGGTGAAGGAGGAGGGGAAAGGATAGCAGCTGGCTTTTGCCA:1 - chr2L 7154792 3' - 1360 211 1 71.29 TTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTCCGCCGTACACGAAACAGGCTGCTCATGT:1 + chr2R 17901949 3' + 297 409 1 71.29 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCAT:1 - chr2R 8125089 3' - Doc 47 1 70.30 TGAATACCTTGCGGGAAGGAAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGATCCCGGCGCGGCGTCTCCGCCTCCAAGCGCTTCTCGCAGGCGGGGGAGTGTGTGGC:1 + chr2L 5332246 3' - Max-element 8358 1 58.42 GGTTGNATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTTCCTTCAGCCATCTATGTAGTTATATGTTTGAGAATGAA:1 + chr3L 13888722 3' - copia 4870 2 76.24 GGACGCAATGTGCAGTATGCTCTTGTATGGCCATATTTTTGACAGCTCTGTGATTTGCACGCAACATATGGACTGTATGCGCTGTATCTGTATCTTTGGAT:1 - chr3R 5914932 3' - Fw3 496 1 56.44 GGAAAACCCTTCGGCTACAGAACCTAGATATGGCGGCAATTCAAACCGATTTGGTTTACTTTTTGATACTCCCAAACTCGCTGTGTGCACCCGC:1 - chr2R 23699376 3' + X-element 489 1 64.89 GTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGTAAGAGGAAGATGGAGCCGAGGCATAAGGTCCGCCACTGCTGGAGCTCGAA:1 + chr3R 18688762 3' + R1A1-element 5072 1 76.00 TACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGCTTCCTTTTTCATTTCTCGTCCGT:1 + chr3R 13569436 3' - Tirant 196 2 76.24 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGCATTTAATGACCTTGTAAGTGGTAACAG:1 + chr3R 18170715 3' + pogo 2059 1 75.51 CTTCCGCAAATGCAGAATGCAGTTGCCATTGATTTTCGCAGTGCTTCCTAGGGTATAGCAAAATTCGATATCTTCAAGTCAGGCGTTATCAGTTTCGAAT:1 - chr2L 7387174 3' - G5A 481 1 54.00 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCAGATCATACGC:1 + chr2R 14582907 3' - roo 24 2 54.46 TCTAACATTGAAATATTGCAGAGATACCAGTCTAAAAGCTGTTCTGACAAACCAAAGTTCCTCAACCTAGTCATTGTTGGATTAGAGCTCGCTTCCAACAA:1 + chr3L 27361819 3' + G3 4235 1 71.29 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTGAGCCTCCAGCTGCTGGCCGAACTGATTTAGAGCCACATTCTTTAGGAGAGTT:1 + chr2L 15622785 3' - mdg1 8 2 62.07 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTGGCAACTTTCCTGTCAACAGCGCGCATGTAAGTTGTATCTCATGTCTGCGTTGCG:1 + chr3R 20140141 3' - jockey 85 1 64.36 AGAGGAAGAAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGGGTCCTATACCTTTAACGGTTATGGCGCATGCCAAGCAGAAACGCGCAATTA:1 + chr3R 3985681 3' + invader1 390 2 68.32 TAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACATATGTATTACCAGAAACCAGTGCCCTCAAAATAATAAAATAACAAAATAAG:1 - chr2R 25015712 3' + TLD2_LTR 172 1 56.44 TGCCACGCCCACTCTAACGTCCTATCTTATTACCCGTTCTCCCATCTTATTACCCAAATCCAAAACTCCGGCTGAACAATTTGTCAGCCAAATGTCAGCG:1 - chr3R 28741202 3' + INE-1 212 1 47.00 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATACTGAGTGCAATTATCCGCAGGACCAAAG:1 + chr2R 13124456 3' + mdg1 375 2 72.28 TTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGGTGACCGGCTCGGCCTGAATGGTTT:1 + chr3L 16924808 3' - I-element 5110 1 75.25 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCACATTAA:1 - chr3R 20140541 3' - jockey 12 1 76.29 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCGCAAACTAGGCCACACAAACATGAATTGGTCGCGAATAGGATACTTATT:1 - chr2L 6644274 3' + hobo 2910 1 57.43 CTGAATGTAGTGACCCATGTAACACTTGACTTGCGGTCTGGGACGAAGGCCAACGGGGCTTTACGTCCTGGGGAATGCCAAACAAAAACAAGCCACGACAG:1 + chr2R 17290731 3' - mariner2 276 1 62.38 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTGAATTTGATAGGACTGCTTTTTGTATA:1 - chr2R 21239397 3' - jockey 58 1 72.28 TTTAAAATTAAAAATTTTAAAATGTTTCTATGCAAATAGTTAGTTGTAATGTTTTACTTGCTTTCTTATGTGCTTTTAAAGATAATGAATTTTCCGCATAC:1 + chr2L 10865454 3' + 1360 3028 1 75.25 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCT:1 - chr3L 17624178 3' + roo 9025 2 68.32 AGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAATCTGATTAGTCTTGCATGCCGCCTGAATGTATTTGAAGTGCACTTCGGGATCCT:1 + chrX 15831312 3' + jockey 4736 1 61.39 CGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTAAATGCCCGTCATTACACTTTTCATTATAGCGATCCATTTATCAACGGCATTGTGAAAAGTTCTCATTC:1 + chr3R 7006445 3' - INE-1 550 1 69.31 GAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTG:1 - chr3R 14882088 3' + gypsy5 379 2 62.38 GTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATTACTATCTAAACAAAATATACGTACATCAGCTGCATATCAGGTGACAAGTATCGGAGTTCATAATGG:1 + chr2L 2612832 3' + I-element 325 1 70.30 TACAGGTTCCCTTGCCTTTCGTTACACGTTACAACTTAATGTTCCTTTATTTTTTTCTGGTTTTCCATTTTTCACTACATACACTATACATACACTACTTT:1 - chr3L 1502856 3' + Gypsy12A_LTR 2235 1 70.30 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCGAAGTTAGCCGAAG:1 + chr2R 20698421 3' - P-element 32 1 44.55 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTGTGGCAGCTGAAGCTTTATTGTTGTGAGCCTATGTACAAAAA:1 + chr3R 21997447 3' - hopper 34 1 59.41 CACACATATACGCGTTCTGGTCTCTGGTTTTGCTTTGTCAAACGAACTGCTGCCGTTTCATTCCAACCCCAAGCGAACGCACGGCATCCCTCTCGCACGCG:1 - chrX 2137090 3' + 1360 3224 1 76.24 GCTTTTTGATGTTTTTTTTTTCAGTGATATTCCTGTCAGCCTCGGCACATGCAATTTATAGCCGCACGTGGTTGTTGCATGTATCACGTGACACTTGA:1 + chr2L 15149369 3' + Circe 423 1 63.27 CTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTA:1 + chrX 22824220 3' + Gypsy12A_LTR 2245 1 48.51 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATACTGAGTGCAATTATCCGCAGGA:1 + chr2R 13124450 3' + mdg1 7407 2 78.22 CTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGGTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGGTTGTATTGTGTTGCTTGCTGCTTAATTT:1 + chr3R 13225800 3' - I-element 149 1 71.29 ACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATGATTGGCATGCTTTTAATTTTTTAATGCATGTATTATAGTCGGTGCGCTGCAGTAATGGTTTTC:1 + chr2L 5652280 3' - 1360 278 1 70.30 GTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGAAACTTCCCCTTTTTCAGGAGGGGTGCTGCATCCCAATC:1 - chr2R 6984258 3' + jockey 4670 1 61.39 CGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAACGATTAAATTTGTGTAAAAATAACAACAGGAACTCAGC:1 + chr3R 1252504 3' + Stalker4 450 1 62.38 CAAATGGACTTGCTTATGCAACCGATCACCCCCAGCGATATTGCTGACGTCATCGCCAAACAAAACCCAGTTGAATTCAAAAAAGGGGGAGAAACGAGCCA:1 + chr2L 4658062 3' + BS3 179 1 74.26 AGTCGAAATAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATTATCGGAGAAATAGCTTAGCTAAAATGGCCAGTCGAATGGCCCGGAT:1 + chr3L 9304311 3' - 297 6950 2 70.30 GTCCTTTTCGACAAACAGCAGTGCATTGTGGATCATTTTGTTTGAACAACCCACCATCACCCACTTTCGGCTCCCAATTACGACCATGGACCCATTCA:1 - chr2L 13626220 3' - Tc1 484 1 52.04 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTATGACTCTTAATTCAAAGATCAACCTTGGACTTCTACTTCACAAA:1 + chr3L 2539348 3' + roo 399 1 74.26 AGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACTGAAACTGGTATCGCAGCTCAGCCAGGAGACTTGCCAACTGTCCAAGAAGTCCATTCACCACGTGA:1 - chrX 446322 3' + R1A1-element 457 1 71.29 CATCAACAATGTATTATCCTACCGATTGCCCGGCAATGTATGTGTGCGATATTCTGTTACACAAAAAGGCAAAAACAAAAGGCACCGTTAGAAGGTGTGCG:1 - chr2R 9929797 3' - rover 378 1 79.21 TCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAACTTCAATTTAGTGTGTAAGCATCGATAAAA:1 + chrX 12948935 3' + Doc 4358 1 70.30 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGTGGGCACTACCTCCTTTGGGCATTAAATTTGTATAGCATATTTCTAGGCGCACGTTGGTTTTA:1 + chr3R 22238758 3' + hobo 2926 1 67.33 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCAT:2 + chr3L 22052861 3' - mdg1 7045 2 72.28 GCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTTTTTTTTTTAACTCACCGCGTAAACAGACTATCGATCTGTTCATCAAGACTCAGCTAATAAATGTTGCTAT:1 + chr2L 7535390 3' - Stalker4 7080 4 53.00 CAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCATTTGTCGTCTGGTGTGAATGATTGCCACTTGACGCGGTTCAAG:1 + chr3R 14463182 3' - BS 4670 1 58.59 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCT:1 + chr2R 18865906 3' + roo 9047 1 57.78 CATTTCTCTTTTTAGTTTTTCTACTAAATACTGAACTTGGGATACAGCTTCATCTTCCTCTTCTCATGGCTATACAGTCGATACGCCTTTGCCGTTTCGGA:1 - chr3L 26876794 3' + Tc3 41 1 58.42 AAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAACAATAAAGAGAAACATCTGCGGCCAACGCATCTCAAT:1 - chr3R 8253432 3' + invader2 243 2 63.37 GTTTTNGTAGGTCATATTCAAGCGGGATCTTTCGCAGTCATAAGGTGTTGTTGAATTTTTTTTTAATTTACAGCTCGAGGCAATTCTGGCACTCAAGTTTA:1 + chr3R 10730913 3' - S-element 1352 1 51.49 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCCATTTGTTTGACCACATCACGCATACGCCC:1 + chr2L 6605647 3' + blood 7377 2 66.34 CAAAAGCAGCAGAATTTTTCTAATTTGAAGCGTTAACCAACTGTCCTCCTCTTAATCACTGCATTTATCCCACTTCCTCTCTGCCACCACCATTTTGTGGT:1 - chr2L 18030164 3' + Copia1_DM 4247 1 83.17 GCACAAACACACACACACACACACACGCACATACACTCACTTACCGACAACGACAGCTTGTTGTCACATTTACAATATCCTTCAGAGTTTATTCAAGCACA:1 - chr2L 6170486 3' + accord 179 2 77.23 CGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTTCATATTTTATTTGGTATAAT:1 + chr3R 19448570 3' + roo 260 2 82.65 GATTGCGAGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGAGGGCTTAAGCAAGAGTTGGGAATACACGAGTTAAGGATGGAGGATCTCAAATTCAAAATACAGATCAA:1 - chr3L 27415001 3' - Idefix 256 2 59.41 TTTGTATATTCTTGATCAGGATCTTTAGGTGCGATTATAAACATTTTTTTTTTGTACTTTAGTATTTGTCTTCTATCATATAGAAGCAATTCTATCATATA:1 + chr2L 21761627 3' + INE-1 79 1 71.29 AGTCCNAATTCAATACCAACTTATCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTGAAATAGCCCGCTCGCAAACAAACAAGTTTCGTGATGTG:1 - chrX 14598688 3' + I-element 4989 1 60.40 CCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAGTCCTGTCGATGGAATCGAAAACAAAAGTTTAACTGCCTTCGGGGCGCTTAAGTTCTATGCTTGCTT:1 + chrX 7231791 3' + Tirant 8133 2 70.30 TTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGTCCTTTAGGGTTGGGGGCGTGGCATTCGCTCGGGGGTGGTTTCCGTCACTCGTG:1 + chr3R 6953272 3' - I-element 93 1 58.42 AGCTGTCACAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCGGTTCGAAAAGCTAACCAAAATTTAAATCACTAACGTTTGATATT:1 - chr3L 14460534 3' - R1A1-element 253 1 67.33 CTGTGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTTCAACTTTGCACCACCAACCAAGGAGCTGCCTCCTC:1 + chr3R 28475543 3' + F-element 190 1 65.35 AACGTCCTAAAACCACCCAAAACTGCCACGCCCACAGCCAGGTACTTCATGTCCGGACTAACGGCCAAACAGAGCACGGTCTACTCCAGCTTCAGTGTGTT:1 - chr3R 18285397 3' + INE-1 344 1 69.31 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTATTCGTCTCGCTCCTGGCTCC:1 - chr3R 27448513 3' + roo 9016 2 79.00 AATTGAACAACATTACACTGATTTAATTCAAATAATTAATAATTTCCATCTTTCACGCTGTTTTTGAGACAAAAAGCCAACTGAAGTGGGGTGGATCACGC:1 + chr3L 14142059 3' + TLD2_LTR 75 1 67.33 TATGGCCGTCGCTTCAAACTGGGGAGGGAGGAGGGGCCGGGATTCATGTCAATTAGAGCTGGAAAAGTTACCATCATCTGGCATCTTACGTATGCCA:1 - chr3L 4742932 3' + Tirant 8079 2 71.13 GCTAACAAAGACTCGCAGCGGCCACGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCTTGCACTCTTCGCAATGGTCGGGAAAGGCATTAAAGCCTCTATATTCCCC:1 + chr3R 30302104 3' - Gypsy6A_LTR 122 1 54.46 GAAGTGGGATCTCCCAAGCCTCACAACTGTGGAGACAATCTGCGAACACTCTTCGAGTCGCTAAATCACACCTAATACTTCATGTCAAACACGCTTGGCTT:1 - chrX 1127656 3' + invader5 356 1 73.27 GTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAACAATGTTTTGCCACTGTTCGGCCTCCGAGTTTTACTTTATTTTATATGGTTTCGTTAGCCGGCCACATATTC:1 + chr3R 28623990 3' + roo 402 1 71.29 TCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCACAGAGTCTCCGAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGAGAACCCAACGCATGAATTAATGTATCCTTTAACGAAATTTCG:1 + chr3R 2873401 3' + GATE 54 3 71.29 CAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCTGACCTTGGAAGTCCTTGCACCGAGTTCAACGACTGACCTCACTGCGTATAA:1 - chr3L 16292736 3' + Idefix 7031 2 56.44 AGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAACACTAAGGAAGCAAATATAGCTAGATATT:1 + chr3R 21339072 3' + jockey 4580 1 71.29 TAGTCGGTGCCTCGTGCCGTCTGGATCACGTTTGATTTATGCACAGCATTTCAGCTTCTCAGGGCATATATCTCAGATACATAACGATTTTATTGGATTAT:1 + chr3R 23522089 3' - gypsy10 196 2 75.25 AGCATNCGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGA:1 + chrX 3485701 3' + P-element 2850 1 40.59 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTCCGTAGCACACTTTTCCGACGCCCATCTTCA:1 + chr3R 19535771 3' - hobo 11 1 63.44 ATCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCTAGCGAGCGCAACGAGTTGCGCCCTCTCCTCTTGAGGGCCAGATAGCAGTGGCG:1 - chr2L 8320800 3' - Rt1a 4667 1 75.53 TTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCAAGGTGAAAGCCACTTAAAGCCAAGGGCAGGGCTCAACAATTTCCAGTTATCATGTGACA:1 - chrX 19055062 3' - jockey 4817 1 61.39 ATAAANTGATGTTATCGTAAGATACCTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCGATGATGCCACCGACGCGGCGGGGCCAAATGATAATTAAAAGAGTGTCGTTA:1 + chr3R 15471060 3' + Chouto 154 1 54.46 TTCGCTTGTTTTGTTTTTTTTGGCCTTTTGAGCGAAGAAAGCGTAGACAAGGGCGTTTCTGCGGTTTCTTGGCTCGTGCCTGGCCCAAAAA:1 - chrX 4562820 3' - Porto1 168 1 50.55 GCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATAATTCAATTTATTCTAGCGGGTTGTTCGCTCTACAGCCAAGTCGCTTATTCACT:1 - chr3L 23728715 3' - Tirant 72 2 59.41 TGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGTCCCTTCAGCTCCATTGTGTCTTTTTAGTCAGTCTGGCTGTCGTGCGATAAATTTCATA:1 - chr3L 1397068 3' - F-element 278 1 64.36 GAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCGTGAACAGGTCGTCGTTCTCGTGCC:1 - chr3L 19925924 3' + accord 111 2 78.95 CAAATAATAAAAACAAAAACAACGAAAACCAACAAAAACAAATAACCGACAAAAAAGCAGCTCCGTGGGTCATCACAGTGGTGGCTGCC:1 - chr3L 2439697 3' + Rt1b 5147 1 79.78 AAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGAACAACTGTTGGACCTTGAACCCGG:1 + chr3L 24566085 3' + gypsy8 126 4 70.41 AATCAATATAATGCAATAACAGTAACATAATGCTGCAATTAAATGTTATGCCGAAAATTGAACCAAGACGTTGATACTGAATCGCATTCTATG:1 + chrX 5266821 3' - BS 5062 1 72.04 CATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCAACTAACTATATCTATCGATCCAGACAAAGACA:1 + chr3L 8324226 3' - Quasimodo 7192 2 69.31 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCACATTAA:1 - chr3R 20140541 3' - jockey 14 1 74.75 GTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTGTTTGTGTGTGCTTTTTGTTTGGCTTGCCGTCTCAACTTCT:1 + chr2R 10275863 3' - I-element 161 1 54.32 ATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCATTCGTTAG:1 + chr3L 22052868 3' - mdg1 7038 1 79.21 AGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGCATGAGGATGTCTTTGAAGCCGGCTGTCGGGATCCTTGAATCCTTGGACCCCGAAGGCAGCGGAGAAC:1 - chr3R 28203522 3' - GATE 277 1 71.00 ACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTTAACATTAATAGACATTTCCGAATAACCCGGAACGTACTCAAAAACTCCCACTACCCAAAA:1 - chrX 7570637 3' + I-element 5098 1 59.41 ATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTGACGCAAAGAATATAAAGTTGAGTTTATTTCGTATTGAGAATTTCGTACTGA:1 - chr3L 23869089 3' - Doc 4508 1 55.45 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTTGGATTCGATCTGATGGTGGGGCACCAAGTCGGTGCGTGTCGAGG:1 - chr3L 4696222 3' + blood 7353 2 53.61 AATATNAAGTAATTGTATTAGTTAAGGCGGCAATAGGATTTCTTTGCTGGGCTTGGAAACTCGGCACAAACGAAATAAATTAGGCGACGGCAATGATTGCT:1 + chr2R 12813950 3' - Doc2-element 4670 1 52.48 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGC:1 + chr3L 21908944 3' + roo 9027 1 69.31 TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAATTGGGTGGAAAATAGAAATTTAATAACTGCATAT:1 - chr3R 21010744 3' + hopper 1371 1 68.32 GATATNGGTACCAACCACAGCAACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCATAAATTATGGGCTATGGC:1 - chr2L 14385556 3' - R1A1-element 5008 1 66.67 GAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGTTCATGGTTGTGCGGCTGTGGCTGCCACTGCGGGTGTGGGTGTGAGTCCTT:1 + chr3R 31630947 3' - Quasimodo 363 2 55.45 TAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTGGATGAGCAGGATGTCAGGAAGCTGGAGTTTTGAGGCATTAAAAGTTGCCCACTTTT:1 + chr2L 17811762 3' + TAHRE 10375 1 67.01 ATGCAGTTGGGGTTTGGAGATAGGCGCTCACTTACATAATCTGTGTGTCGTGTTTGGCTTTTTGGCACACACTGGAGTTGAGCGGTAAACATACAGGGCAC:1 + chrX 704019 3' - gypsy3 462 1 59.41 GACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAATTATTTACTTTACTTCTATACATTTTCCCCCATCTGTGTGCATATGGATAAGACAAGGCGT:1 - chr3L 15356976 3' - Stalker4 62 4 56.44 TGTAAAATAATTTCAATTGTTAAATGTAAACAAGCCTTTCTATATGTTTCTCTGTTCCCATAGGTGGAAAGATAAAAGCTCCCACAAAATCAGGTCCAAAA:2 - chr2R 22587770 3' + HeT-A 5809 1 63.37 CTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCATATACCAGTGAGTTTGGGCGTTTA:1 - chrX 7963191 3' + F-element 4436 1 75.25 TTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAGATATATATATGTATCACAGATTGCTTACCAAAACTAATGTCGCTGTTTGGCAGGGTAGA:1 + chrX 3003732 3' - Juan 18 1 54.46 TGTAGTATGTGCCTACGTAATATTAAAGAACATTTAAGTATAATAGTATACCAACATATAACAGAAAAACTTTGCAGGCATTGCAGTTGGGCTTACCATCT:1 + chrX 22777055 3' + 412 1 2 67.33 AAGATAGAGGAGTTATGCGGTCCAGAACGTAGCCACGGCCGTCTTGGGAGAATTTTGATGAGGAAGATGTACTCCGCTAGCAGTTGCGCCTTGGTAGTGTC:1 + chr2R 1806935 3' - ZAM 411 2 58.42 TAACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTACAAAGTGCACAAATGCCAAAGCATAGCCAAAGTTCGGTGGGTTTGGGTG:1 + chr3R 22859824 3' - Stalker 7097 4 61.39 GTGATAACTTACATAGGGATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAAATGCCAAATATCTTGTGTTCGTCCACACATTACGTATCCAA:1 - chr3R 8835773 3' + Fw2 3663 1 63.37 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATA:1 + chrX 5726771 3' + roo 9030 1 66.34 TATTTATTATAATTTTAAGGTTTCAAATGTGTAATATTTAAGAGTCGTTTAAAGAAAAGTTCAATGTAAATCCAGAAATATGCGCATCACATGGGTGTATA:1 - chr3R 13135824 3' + INE-1 427 1 50.50 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTTTAGTTAACTATTAATTAA:1 + chr2L 20385373 3' + roo 353 2 83.17 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGGGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCA:1 - chr3R 21799506 3' - jockey 4770 1 62.50 CGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCATCCGCTCTTCCGCATCGGCATACCC:1 + chrX 5418649 3' + Doc 371 1 83.17 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCAT:1 - chr3R 9996400 3' - blood 46 2 67.33 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCAGAACTCAGTGTAAGTGCGAATATG:1 + chr3R 23346580 3' + P-element 2835 1 29.70 TGTAGTAAAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCAATTTATTTGCGAGTGCGCCGTACGAAAATAAATTGATTTTCTAGTTGGGAAACT:1 - chrX 19402430 3' - Doc3-element 126 1 58.42 TCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCGATTAGTAACTGAGCAGGGAGAATACCAGTGGATGATAAATGAAGGCATATTTAT:1 - chr2R 21735515 3' - mdg1 352 2 59.41 TAAGCCTAGAGAAAAAATTACGGCTGTACAAAGCAGTCCAAAAGTGCTTTTAACCTACTTTTTTTGCGAGTAAACAGACTCGGAATCCATCCAACATATGC:1 + chr3L 15742335 3' + G3 4146 1 66.34 CCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAAGAGCGCAATCTACCGCACCGAAATTTCCGAGAGATTAACTTTGATCGC:1 + chr2L 19394303 3' - R1A1-element 5165 1 60.40 GGTAGGAGGGATGGGCATAAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGACATATTAAATACAAGTTATATTATTAGAACAAATGATATTTGGAGTG:1 + chr3L 20152763 3' - I-element 5053 1 51.49 GGCTTGTTATGTACAATTGCTTGTTTTGTTTTGAGATTTTTTTTTAGATGAGAATAGACTTTGGTATACGG:1 + chr3R 5509265 3' - I-element 5205 1 59.15 CAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCGTTATAGCGCATAAATATCCCTGCGCATGAC:1 - chr3R 6864228 3' - R1A1-element 238 1 70.30 AATTCGAGAGACTATGCGTACCAAATAAGTGAGACCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTAATAATTCACTTGTCGACCTGCCGCAGCAGCCAAAGA:1 - chr2R 10687261 3' - Ivk 5195 1 63.37 TTTATAGGTAAAACCTTTACCGTGGCATGGCAAATCCTGCCAATTCCTGCTGCATCCTCGAAGCCATTTGCCTCCCCAATAACTGGCTAAAACTTTATGGC:1 - chr3R 22797639 3' - Helena 35 1 62.38 TCTGTCTCCGTACCTCCGCCAGCAAAGTAAAATAATTCCATTTTCCAGAGAGGTGGTAGGAGGACCTATTGCTTTTTTTTTCCATGCTTGTTGTTAGCTGT:1 + chr3L 10240078 3' + HeT-A 6049 2 68.32 TAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCGGGGAAAGTCTGGAAAACCAACGAACCGACAGCGTTGAAAGCCAGCAAACGACTGAGCTCCAGAGCCCCAAAACGGA:1 - chr2L 18845162 3' + Rt1a 4781 1 76.24 TAGCGAAAAGGTATCTGTACAAGCATGACCACCATTACTCATACGCCGCATTAGCCGTTGCCCACATCATTGTCAAAATAAATTACAATAATTTGTTAAAT:1 + chr2L 12906789 3' + Gypsy12A_LTR 2151 1 68.32 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAG:2 + chr3L 22324081 3' - hobo 48 1 67.33 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACTGTTATATGATTAAAACATTTTTATTGA:1 + chr3L 18076312 3' - roo 49 2 75.25 CAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGACGCTTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACTTAATTTTAAAACAACCTTTTCATTT:1 - chr2R 17073254 3' + Chimpo 4086 1 73.27 CCTGATGGAGGAATTGTACGTCAACAATTTCAAGGAAGAGTTCTCCCCAACCTAATTAACTGCTGTTCTATCCCAGGCAAGGCTGTGCCGTTCGTGGAGCT:1 + chr3R 21259710 3' + R1-2 273 1 61.39 ACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTCCAGCTCCCGTTTTTAATTACCCACGCACAGCTTTTCACTTTCGCCCAACACATCGT:1 - chr2L 19369795 3' + Stalker 173 7 59.41 ATGGCCATCGCTTCGAACTGGGGAGGGAGGAGTTACTACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACTCTGTCGGCGGAAATCTGGAAGAGATTCCGAGG:1 + chrX 11897809 3' + Tirant 8080 1 73.27 GCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAACGTGAAGAACATGACTGTGCTGCTGAACAAACCGCTGCCGCCCACGGAACC:1 - chr3L 1716394 3' + Doc 4530 1 64.21 CCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAAGTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTAGTTTCTTTTGTGTAATCTTACTATATCAAAACCCGGTCGGG:1 + chr4 413909 3' + Cr1a 4139 1 57.43 GGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGATTAGCATTAGCTGGCGCGGCGATACGATGATATATCCGAGCA:1 - chr3L 13940739 3' - F-element 313 1 58.42 ACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTNGATACGCCAGAAAGCCAAATGCNNNNNCCAAGTTTTTAATGTGCGAAATTTCTAATTTAAG:1 + chr3R 28199768 3' - R1A1-element 5253 1 54.84 AGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGCCTTTTTTTTAATGGTGTATATAACATTATTATTTTATTGTT:1 + chr3L 9992839 3' - I-element 316 1 64.36 AAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAACTTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATACCACTGTTTCTCTACTAACAAAAAAAATAAAAAAATAAT:1 + chr3L 9962156 3' - Tc1 1482 1 67.02 CGTTCGAAGTGATAACTTACATAGGGATTTATTCATACTTCCGGTCAGAGATGAAATATCCAACCAATAAATATAGCACTCTGCCCCATTTGATAATCAAA:1 + chr2L 22778770 3' + Fw2 3655 1 60.40 TAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTGCTAGAGTCCTAACTCCTAACTATACCATGTTATCCATTCACCC:1 - chr3R 27381108 3' + 297 6887 2 56.44 AATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCATTGGAAACCATTTCATTGTCAAGGTGAAAGGTGCACG:1 - chr3R 25005630 3' + I-element 183 1 59.78 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTCCTCCGACCTGCCACTTT:1 - chr2R 14121039 3' - I-element 4 1 74.26 GAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGAAGGGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGTGCATATTGTTGCTATTATTGGATGCCCGGCGCTCGAGA:1 - chr3R 11724817 3' + Bica 21 1 54.74 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGTAGCCACGGCCATAAATGATGTTGCGGTGCACTCGGG:1 + chr2L 18662380 3' - hopper 37 1 67.33 CGGACATGGCTAGATCGACTCGCCTATTGATCCTGATCAAGAATATGTATTGTTTTTGGAAAATAATACTATGTACTTCTAAGACGGAATTAAATTAAATT:1 + chr2L 12265180 3' - INE-1 108 1 58.42 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAACCTAACAAGAATCGAAACCTAAAT:1 + chr3L 22564893 3' + blood 7362 2 51.49 ATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGGAGGTTTTGGAGGTTTTGGGGGCCC:1 + chr3R 13350175 3' - F-element 4225 1 75.25 ATCGAGATGACGATACCTTCCCGAAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACGCGGGGAGGAGAACAGGAAATGCATGAACGACTTCCTCAACAAGATAGACA:1 + chr3R 14300954 3' + gypsy4 6512 1 60.40 GTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTAATAGGTACTTCT:1 + chr3R 1048069 3' - Stalker2 7253 2 74.26 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGTCAATCAGAAACAGAATCAGCTCCCGTTTCGGTG:1 - chr2L 18662324 3' + hopper 1375 1 64.36 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTTAATAAGTACTTTAAATGGCAATACTATTGGATAAATTTTCTGTATTCACAG:1 + chr3R 25876335 3' + flea 235 2 60.40 ACGCAGACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCTCACGTTGCGCGTGCCACGCCGCTTAACTCAACTTATTTACAGTTGGCAAAGGGTTCGAGAG:1 + chr3R 27499475 3' + accord 187 2 64.36 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATAGACCATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTT:1 + chr3R 5775740 3' + invader4 3081 2 56.94 GGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACACCTACAAGCCCTCCTCGACATTGCTGGAAAAAAT:1 - chr2R 15009900 3' + baggins 5376 1 77.23 GCAGAGCGGGCTGCCAGTCCCTCTCCAGCTGTTGTCAGTAGGACTAACGGGAGTAGCAAGTTTCCTAACCTAAGTGCGAAAAATATAAAATATAGAGAG:1 + chr3L 23524189 3' - F-element 439 1 69.70 GGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTGATGCGTGGACAGGACATACTTGTACGCTTACACG:1 + chr3L 21324847 3' - Ivk 5123 1 73.27 TTTAACAGCGCATCATTATAATAACAGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGAAGATAGCCACCCCTATTTAATGGACTCTCTACAAAGTACTTGCTACATGTTG:1 - chr2L 15316903 3' - hopper2 1479 1 53.47 GTTTTAATTAGGGGACGGATGTTTTTTCTACCAGTGGGTGACTTTAATAAGATTTTAATAATTATCGCGGAAAAGTGTGAAATATTCAGCAGTAAACCAGG:1 - chr3R 12944423 3' - Idefix 193 1 57.43 AAGCTGCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGGAACGTAGGAGTGGTTACCCCACTCCAGTTAGTAGTAGGCCAAACGGA:1 - chr2L 10747572 3' + F-element 4457 1 50.50 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGA:1 + chrX 1523745 3' - jockey 61 1 78.22 TGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTTGTTATTGATATCGGTAAGCCAG:1 + chr3L 22790838 3' - I-element 4954 1 75.27 TTTGATCAATTGGCACTATGCGAAAAATTCTTTTTTGCATTGCCCTAATTTTATTATTACTTGAAAAACTAAGGAAAAACGTATAGACACAAAGTGCAACA:1 - chr3R 8660144 3' + 1360 266 1 57.43 CCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAATTAAAACTGCTTAAAATAAATTACTTCAAAAATATTTTCAGGCTCCCAGGCG:1 + chrX 17215725 3' + F-element 478 1 54.46 GCTCTTAAAGCAATCGATTTCAACTTTTTCATTACATTTTTAGTACCCACGTTCGTTGCATTCTTGCAGGACTTGGAAGCGCCATATGAGGTAAAGGACTA:1 - chr4 860324 3' + Cr1a 4252 1 71.29 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGGACACAGATACCGAAACGCGCGCAAACACACACACACACA:1 - chr2L 14444107 3' + hobo 2928 1 52.00 GGTTCTTATTATCTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGGTCTGGTCACCAGCTCTTGCCGGGAGCAGCGGAGTGCAC:1 - chr3R 10738395 3' - invader4 424 1 69.31 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATTATTCTCAAAATCAGTGCGATTTCCGTTTTGCCGCTGATCTTACTCCCACCCTACTATTACCAAAAAGTCCAAAACAAC:1 + chrX 855405 3' + blood 168 2 71.29 TTATGGTGCTATTATTGTTAACTGTACATCATAATATTGTATTAACATGTATCAAATCTTGAGTTTAATGCTAAACATCTCGAGGCTTTTTCAAACTGCAT:1 - chr3L 16085444 3' + Tc1 1636 1 77.23 TTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCGCATATAATACATTTTACTAATGATGCCGGCGAATTTCCATTAATAACTCATGCATTCCAT:1 - chrX 20118629 3' - copia 4937 2 72.83 AGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGCGATGGCCAAAATCAGCGCACTAATCACATAGATGTACTGCATTTTTTTCGAAATATGCTTGA:1 + chr2L 8325012 3' + F-element 4396 1 67.33 AATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCTGCTAGGAGTATTAACTTAATTGGGACAGCACTAAAGG:1 + chr2R 4341827 3' + hopper 1381 1 56.44 CCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATGGCTTTTTGTTTCAGCAATCCTC:1 + chrX 20779297 3' - R2-element 3499 1 77.23 AAAGCCAAGATTACAAAAAAAAATACCAATTTACAAACTAACTCACCACGCCCATACCCCAAACTAAAGAGCTTTTACAAAATGTGGTTTATAAATGTTG:1 - chr3R 10120490 3' + HeT-A 5884 1 65.00 TGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCCTTCGATCCTGCGGCAGGCTGCCCTTGCGAAAAATTCATTGAGCAAGGAACGCAGCAGCCGTCGCTCATTCTCATT:1 - chr3R 30852097 3' - F-element 4342 1 79.21 GACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAAGGGGGGAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTATGGCTG:1 - chrX 2082617 3' + Transib-N1_DM 458 1 88.17 CAAAAGTTCAAAAACATAATAAAAAAGAGTAGAAACGCTTTCCTAGTATTGGTACCATAATTTTCGCGCAGTGCACCCTTGTTGTTGCTGCTGTCGGAAAA:1 + chr3R 22003026 3' + TAHRE 18 1 86.14 AATAAATTAAACATTTAACAAAACGCAATATTTGCGCATATGAGCACTTTCACCGCTTGGGTAATCAAAACAGACTGACTCCATTTGTGGCAGACAAATT:1 - chr2R 8687637 3' + HeT-A 12 1 72.00 TTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCTTCGGCAATTTGTAGCAAACTCTTGATGCAGCTGCAGTCCCTTTGTTTG:1 - chrX 22746447 3' - Doc 4576 1 52.48 CTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTTTTGCATATTACACAGAAAACTAAGGGGAAAACTTAATCTAACGTACATGAGTAAAC:1 - chr2L 17819905 3' - I-element 439 1 60.40 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACACATTAATGGCACTTGTGAGGCGTTATAAACTG:1 - chrX 3306603 3' - hobo 41 1 74.26 CATAGTACAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCTAAGGGAGGCTTGTGCTAGCAATACTTTTCATT:1 + chr2L 3604684 3' + Tc1-2 59 1 67.33 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTAGACAATA:1 + chrX 6283713 3' + P-element 2876 1 68.32 ATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGATGAATGCAAATTATTATACTGGACAATGTGATATTGAGTGACTAAAATACGAGAGGCAGTGGCAAATGTTTTACG:1 - chr3L 16063340 3' + 1360 412 1 79.21 AAATCACCGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCAATGTTTGCGTGCTGTATAAT:1 + chr3L 3485103 3' + diver 345 1 80.20 ATAAACTTCGAGATCTCAGGAACTACATAAGCTAGAAAGATTAGGCACGCAGATTTCAGAGACGTAGACGAAGTAAATTTCTATCGAACTTTTTTTTCAAA:1 - chr3R 24826083 3' + INE-1 139 1 86.14 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAGCACCACCCAACCTCCCCCACCCACTTAGCGGGCTTTACGCCGTGT:1 - chr2L 10635222 3' + roo 401 1 69.31 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTGGCCAGAAGTG:1 - chr2R 11129261 3' - hopper 17 1 61.22 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATT:1 - chr3R 22675825 3' + 412 7496 2 76.24 AGGTATGATTTGCCGTTTACCGTGTCAACGATCTTTTTGCTGATAAGAAAACCACGCTGTAACATCTTTGTCATTAAATGGCACATAACGCCTTGATTCTG:1 - chr3R 4510644 3' + Tc1-2 130 1 51.49 TTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTATTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAATACACGGATTTTGTTGACGCAAAAAATTCAA:1 + chrX 3798990 3' + BS 5034 1 64.36 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTGTGTAATGCATAT:2 + chr2R 8198520 3' - F-element 50 1 63.37 ATGATATTTTATATCTATATGCTTACTACGTGAATGGAAAGTTTCTTATGGTTAATGCCTCCTTGTTGGAATTGGAACCTCATCCGTCCCTTGCTATCCCT:1 - chrX 9172469 3' - Dm88 4126 1 85.15 TAAGGAGGGCAAATCCAGGACTCCCCGCGGTGTGGCCGTGAAGCTTTCCTGCTCCACAGCTGCACATGTCAGAGACTCGAACTTTTAGCAAAAGACTGTTT:1 - chrX 7144630 3' - Rt1c 5359 1 58.42 TGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGAATGAGCGTGGCAAAGTTTTTGGGCGAACGAGGAGGAGTAGCTGAGGATACCGGAGCATGAGAAGCCGTTTTGCCGGCAG:1 + chr2L 17067086 3' - INE-1 341 1 60.40 ACTAAATGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGTTGCGTTTGCCG:1 + chr3L 11696446 3' - blood 38 2 60.40 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTATGACTCTTAATTCAAAGATCAACCT:1 + chr3L 2539329 3' + roo 9043 1 55.45 CCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTTGCAAATATAAAATTGTACAATTTAAAACGCAGACAAA:1 + chr3R 11290492 3' + rooA 183 2 62.12 TGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAG:1 + chr2L 3244991 3' - rover 44 2 78.22 TGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCAAACGTAGTCTGGTCGTGGGTAGGAGAGGGGGGAAGATTCTAGTATTGGGCCTGCCGCAGATGCCAATCG:1 - chr2R 18871155 3' + invader1 3692 2 63.37 TAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTTTTATTTATTCTATCGTCTTTGCGACGTTGTTGTTGTTGTTGGCCTCTCCT:1 + chrX 4107995 3' - 1360 3379 2 69.31 CTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACTGACTCAGACTCTGAAATATTCACAA:1 + chr3L 18039167 3' + flea 4714 1 74.26 ACTTCTCCGCTCGTTGTCCTACATCCTTCTGGTCTCAGCTTTGGCGTTAGCCATCTCGACGGGGCATCTTGATCATGGCTGCCGCCGCCGCTGCTGCCGC:1 + chr3L 10983335 3' - gypsy8 4554 1 72.00 TCTCTCTCTCTCTCTCTCATCCCCCTCTAGCCCACTCTTTTGTCCTGTCAGTCGGCTTGCAAGCGAACTTGGCTCGCTTTCGGTTTCGGTTAGTCCCCTTT:1 + chr2L 618708 3' + blood 7181 2 67.33 TATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAAGGACCACCCTAATTGGTTACAGCGGCTCTCAGTCGGCGTCGCAGTCGTTGGTTGTATT:1 - chrX 6340585 3' + Juan 4200 1 62.38 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCCCCCTCTAGCCCACTCTTTTGAGCCGCAAAACATGGACTCACATTCGATTTGTTTTTCGCTTTTCGTCACGCTTTTAAA:1 + chr3L 16271065 3' + blood 7180 2 54.46 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCT:1 - chr2R 5322029 3' - 1360 56 1 84.16 CATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGGAGGCACTTTTCTATTAACACTTCT:1 - chrX 369247 3' - Quasimodo 7034 2 74.26 CGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGAA:1 - chr3R 29019033 3' - Doc 45 1 69.57 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGG:1 + chr2R 5640417 3' + roo 9049 2 56.00 GATTTNGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCTAATTCAGAACTGAGACACGGCCGATGGCAAAGTTAAAATTTCAAATCCATTTGAATCGCA:1 + chr2R 21442610 3' + blood 467 1 67.33 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAGAAATATTGAGAAATATGAAACAAAACATGTAACGGAAATGAGAAATGCATACCACAG:1 + chr3L 14005647 3' - F-element 25 1 53.00 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCTGTTTACATTTATTCTTCTATTCAGCGTATGCAAATCGCATAAAAAC:1 - chr2L 2689797 3' - roo 8693 2 58.42 TGAAATCCCGTGTTTATGTGAACCGTCCAAGAGCCAGCACAGCCGGTGATCGGAATTGACCGCGATCGGTAATGACTCACACAGATTACGAATTCCAAAGC:1 - chr2R 11487058 3' + mariner2 615 1 75.25 GCGGCATTGGGTGGCGTGTGCTTAAAGGGAAAAGGATGCTAAAGAGCATCAGCAGGCAAATGCGGAAAATACATTTTTCCCTCTTCGAGAGTGCAGATGTA:1 - chr3R 4608944 3' + invader3 5385 2 73.27 AAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTAAGGCTTATCATAGCTTTTACATTTGCTTTTGGCTAACATACTTTGGAATTATAATTATTTCTCA:1 - chr3R 10670092 3' - Ivk 193 1 67.33 ATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGACCGAAAGGCAAACAAACACTCATGTCAACAAACATTCGTCTACAAATTCCAATCAATG:1 - chr3R 19523075 3' - F-element 41 1 59.41 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTGCTTAAAAATGCTTACTTTATTTAGAAAGCACCCTCCGTTTT:1 - chr3L 18076262 3' + roo 9038 1 63.37 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTTTCCTGCCCGT:1 - chr2L 22407457 3' + roo 9048 2 53.47 ATAAAACCAAACCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTGTTTTCTGACAG:1 - chr3R 12780281 3' - BS 5010 1 45.54 ACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACATGCTAGTGAGTTCATATTGGTAGTTCGTAATTGTGGATCCTATACTGAATTTGGTTTGCTTAA:1 - chr3L 2041081 3' - R1A1-element 274 1 68.32 TCTTGATCCTGATCAAGAATATATTTACTTTATATAGTCGGAATTCAACGCTCTTTTCACTCAACTCTTTCCCTTTCTTTTCGTTTTCTTGCGGTATAG:1 + chr2R 7295479 3' - INE-1 84 1 63.64 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACCCCTTTTTGCGCCCAGTGTAGGTACACATGTA:1 - chrX 13354246 3' + pogo 2081 1 60.40 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGCATAGGTAAATGGAGATGTC:1 - chr3R 21799482 3' - jockey 4759 1 78.22 TACCACGGGTTGAGGAGCTATCCAAGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTCGGAGTATCGTGGTGGCCGAGTTGTTGCCAATAACGATGGGTGTGGAA:1 - chr2L 12859749 3' + R1A1-element 4941 1 63.37 TTATGTATGTGTATGTATGTGTTTGTGTACATATGTATATATGTGGGCATTTGTTGATGATACAATGACGCTGCGCTTGGCAGCTGTTGTCTGTCGTCAGC:1 - chr3L 5847703 3' - Quasimodo 39 2 62.38 GCTGANAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCTACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGCCATTTGAATCTGAAACTGG:1 - 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chr3R 11097499 3' + mdg1 7441 2 56.44 CCAAAAGCGCAACGAAAACACGACGACCAATCTGTGCACGGGCGTCTATAATTATCACCCCGGCAAGTGAATGGGCGATAATGGCTTGATTTTTAGCTCGG:1 - chr3R 22920425 3' - R1A1-element 5 1 71.29 GACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCGTCTGATTCAACTCCGGGCTGGGATTCCGATTGTTCCAAAGTGTCTGAGCGCAATTGG:1 - chr2L 16593262 3' - McClintock 144 2 64.00 ATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGCGACGTTACTACAACCGGATGGAGTTGTGAATTCGAGATTGATGC:1 - chr3L 7946136 3' - 17.6 101 2 59.41 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCCCACGAGCCAGAAGTAAAGTTTATATTGTCGACGT:1 - chr3R 22238685 3' - hobo 44 1 68.32 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAACCTAACAAGAATCGAAACCTAAATAAATTGCTGTT:1 + chr3L 22564904 3' + blood 7373 2 62.38 ATACACTCACACACACACACACAGCGCCAAATCACCGCTCTTACACACACGAAAAATAATAATAATTTGGCATCGTTTAAAGCCAAAGCCGCCCAACCATC:1 + chrX 14712729 3' + Quasimodo 31 2 64.36 ATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' + R1A1-element 143 1 70.30 GTAACGCCTTTTGCCTAAACTCATAGGCAAGTTTAGTTTATATTTTGCCGTTTAAGACATTAAAGAACCATTTACAAAGTTTAAGCTTGTCGCTGCACATT:1 - chr2L 11823019 3' + transib3 492 1 58.42 AGCAATGTATGGCCGTTATGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTAAGTCTAGTTGATATCCCAATGTATACCCCGACATTTTGTGGCTTTTTACACCCAAACCA:1 + chr2R 21007238 3' + 1360 3366 1 69.31 CGCTCTCCCACACAAAATCAAAATCTTTGGGTGGTGATACATATGTAGAAAACGGTATGTCATAAATGGATATCACGTTTACAGTCCTCTTAATTCTGAAT:1 + chr3R 19408750 3' + Cr1a 312 1 81.19 TTTCTATCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCACCACGTGGAAGATGTGGAACAAAAACCGATTCGAAAAC:1 + chr3R 17284276 3' + diver 363 1 65.35 AATATTAATATTGAGAACTCAATGACTAGATATATTACGTAATTTCAATGTGAAGTGGTGGCAGGAGTTGCGAAGAGCAAAACCAAAAGAA:1 + chr2L 14519282 3' + Stalker 6790 2 56.04 TTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTCACTCGATCTCTCTGTAGGTACCCGGAAACGGGGTCACGAATCGGAGCCTCAACTTGGTCACATTCAGG:1 + chr2L 21833927 3' + roo 416 1 68.32 GACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGATGGAAGTAAACCAAAATGTAGTCGTTCTCCACAAAAGGTTCGATCTCCTTGATGATTTCCCTG:1 - 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roo 57 2 83.17 AGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGGGTGGCGAGGTCATTAGATCA:1 - chrX 21933806 3' + gypsy11 4363 2 71.29 CCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCACCGCAACTGGCCAAATCAGCCATGGACCGGGATGTCTGCGT:1 - chr3R 5530544 3' - opus 7346 2 60.40 GGGGCAAAAACAACGCAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGTAATTTTATTGAATCGTGTTTACCCTT:1 - chr2R 22529304 3' - jockey 198 1 71.00 TTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATATGAGCCGGCGGGCATTATTGTTCCGGCATCGTTATTTATGGATATATGTATTTAATAAACTCCGTGCAAGG:1 - chr3L 10840990 3' + Doc 4294 1 72.28 ATGGGNGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGGTTGTGGATGATTCGGGATGCAGGAGGATCGGATATCCTTGGATGTGCCAGGTGCTG:1 - chrX 8063874 3' + flea 275 1 64.00 TTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGAGAAATGGTGTGGCAATTTAAAAACACGGTAAAGTTAATGTTTCAATTTAAATTTTAGTTTTATT:1 - chr3L 26179314 3' + copia 4984 2 67.33 ATAAGTACCATATGTGGTCTCTCTGAGCAATAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCATCGCCAAAAGAGTTAAAAGTTAAGC:1 + chr3L 9201174 3' + Tc1 104 1 73.27 GCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGAGTGGGATCTGGGGGAGAAGTGGGCAACCGATAATTTACGGACAACCTGAGCAAC:1 - chr3L 19166862 3' - G6 1768 1 69.31 GGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCGCCTTAGTCTTAGCCTCGCTTTCAAAAGTGCGTGAGTGAGTGTCCCTT:1 + chr3L 1341169 3' - 1360 3347 1 53.47 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCGAAGTTAGCCGAAGTCGAGGCA:1 + chr2R 20698429 3' - P-element 24 1 51.49 ACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCCCCTTTGATCTCGCACGAACTGCGCTCAATTAAATTCTACAATAAAACACGATTTGCATTT:1 - chr3R 13905090 3' + Quasimodo 7019 2 61.39 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCAAACCTTTTTTATTACGGGATCTGATGGTACATTTT:1 - chr3L 22564827 3' - blood 40 2 69.31 AATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCGTCACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTCTGCAATCGAAGAAGATGAAACAAATGTGAGTGAACGAGA:1 + chrX 2135149 3' + Tirant 8053 1 60.40 ATGCGAGTTTCCCGACTATCAGATATCCGTTACTCAGCTAGTGGAAAGTCAAAGCGAAATTTAATCTAGAGGAACCAGCCGGCTATAGTCAGTACTAT:1 - chr3L 25806823 3' - INE-1 562 1 66.33 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGGGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTT:1 + chr2R 16928913 3' + blood 7345 2 66.34 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGGTTTTTCCGACCCCAGCTGCTTTGAGCTCGACAAACGGCCTTTGTTGATTCTGGGGCTCACAACTTT:1 + chr3R 31411379 3' - FB 41 1 59.41 CATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAAGGGCGTTCTAATTCCGACAAAGAACTCGGTGCATGTGTTCTT:1 - chr3L 21962092 3' + roo 8662 1 67.33 TTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGTGCATGTGAGGCAAAGCAAACAGACTAGGAAAAACATAGAACGTAAAC:1 + chr3L 9925852 3' + 1360 379 1 57.43 TATCAGATACGCGTTACTCAGCTAGTGGGAGAGGAGACGAGGCCCGTTCTGGGAGTCCCATACCATCCTGTATACCGTCTGTATTCCGTCTCCAGGTCTCC:1 - chr2L 14683758 3' - INE-1 546 1 73.27 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAATCCTTCGATTGCAAAATACACAGTGCAGACAAATAGTTTAAACTGTCTTAGTGGTAA:1 + chr2L 15020364 3' + jockey 4979 1 55.45 GCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATACCCGAAAAATAACCAAGCAAGCAGCACAAAAAACGCGC:1 - chrX 8367095 3' - blood 195 2 58.76 ATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCAAGACAAGGCAGGCCACAAAGGTTCCAACTCC:1 - chr3R 24849748 3' - flea 4594 1 67.35 TTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATCCACCTCACAGAACTTAGTCCAAATCGATGCTTCTGACGGAGCCAAGAGGCAGCTTCCCTTAAAGCCTA:1 - chr2L 18949473 3' - Ivk 344 1 77.23 GAGGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGAACTGAGCCGCCTAGCAGATTTGTTGAATATTCAAGGACCAAACGTGATTAATAATCCTGCGCCA:1 + chrX 6415291 3' + micropia 5289 1 68.32 GTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTCATAACTTTTCCACCTTTAAACCAAAATCAAGTGG:1 - chr3L 20535520 3' - accord2 7321 1 65.35 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCC:1 + chr3L 5827925 3' + blood 7334 1 78.22 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGACCGACACGCAGGTGGACGACGTAAAAAGAGCCCGTGCCACGAAAAGCTCAA:1 - chr3R 25395590 3' + roo 9047 1 52.48 CAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGC:1 + chr2R 5532345 3' - G4 3768 1 51.49 ACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTATCACCATAGCAACCAGCCACTGGCGATCAAAAGAAGGAGGAGTAGATGGCTTCAATCCAAGGAGCCG:1 - chr3L 2384309 3' + R1A1-element 269 1 55.45 TCTGTCTACTCTTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTGTGAAAAGTGGGCTAAAAGAGATTACATCATTAGTTGGTCCAAATACTGGAGG:1 + chr3L 7889170 3' - Circe 178 2 59.00 ACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTGCTCAGTCTTCAATTGGCAGCTGGCTCTCCG:1 + chr3L 11362605 3' - jockey 448 1 72.28 CATTGAAAACGTGCCGAGGTAGTAATGATACCTAAGCCTGGAAAACCTGAGACCAATCTCGCTTTTTATTTGGTACTCATAGCTTTTGGCCTGCTTCCTCA:1 + chr2R 4955048 3' + G7 217 1 68.32 CTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAATTGTCCCGGGGCATTATGTTTAGTTCGTCATCACTGCAACAATCGAAATCGAGTTA:1 - chr3L 14200716 3' - jockey 444 1 61.39 CGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAAAAAAACAAAAAAAAATCTTTTTTAACATTCAAAACAACTACAACAATAGGCACTCGTGTGTTGGAAG:1 - chr3L 11013715 3' + G2 77 1 60.40 AGAGGCCGCCTCTCCTACCCCGCAGTGACCTCCCTAGCAACTGTCAGTGCAGTCAGTTGTTGTTGCTGTAGTCTGCAGTAGAAAAAAGGACACACTCCATT:1 + chr2L 17155558 3' + Doc 431 1 52.48 CTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGTAAGGACTCCGAGGTCTAAAGCAAAACAATCGTGGCGGAAGAATGACA:1 - chrX 858505 3' + F-element 380 1 54.46 TGATTGTGCTCGCTGTAAGATGTCAAAATTGAGCAGGTCAGTTGCGAGCATGCCCCGGATTTTCCTTGGATCAACATCCCAATGCCATACACGAAAATTTG:1 - chr3L 24749999 3' - F-element 4315 1 79.21 CTAGTTCGTTGGCTTGTGTTAACTACTCCCCCTTCAAGATTATCAACAATAAGAAATATGTCGACCTATCGAAGTTGAAGTGACAAAGTGTGCGGCGCTGG:1 - chr2L 20130941 3' - Gypsy6A_LTR 3 1 65.35 GTGTGTGTGTGTATGTATGTGTTTTTCATCGCCCACATTTAATTCGTTTCCGCAGTTGACGATAAAGTATTGCCAAGCGTCCGCTTGCCGTCCGAAATC:1 + chr2R 6626627 3' - Quasimodo 29 2 54.55 CCCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATCTGCTGACTTCTAATTCAGCCGCAATAAATCAATGCAACGTGC:1 - chr2L 17269911 3' - Bica 2 1 60.40 TACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCG:1 + chrX 4740572 3' - 17.6 43 1 75.00 CTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGAAACACACCGATAAAGTACAAAATGAATGAATTAGCAGTCTAGGTAAGAA:1 - chr3R 17867571 3' - Dm88 4507 2 56.44 TATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGAAGTTGGGAGTCCCTCTTGATGGCAACTAAATGTAGTGGATCAAGCTTAAGTGCTTCAGA:1 + chr2L 15108456 3' + Cr1a 4027 1 56.44 TCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATCATGTCCAGTCTCCCCAATTT:1 + chr3R 7329067 3' - R1A1-element 5083 1 79.21 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATAACACGAGC:1 + chr2L 10635322 3' - roo 25 2 55.45 CCCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGCACTCGACAATAGCATTCTCTCTCGTGCAAATCGTATTCAACCAAATGATTGAAATTTTGCGGATTT:1 - chr3L 10485013 3' + INE-1 541 1 59.41 TTGGANAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCCCAGTGAGGCGGAGAAAATTGTAAGTTCAGGAAA:1 + chr2R 16097974 3' - R1A1-element 4944 1 62.37 GAGATCTCAGGAACTACAAAAGCAAGAAGGTTGAGACTTGGCATACAATGTGTGTGCGAAAAAAGTTGGATTTGAAAACGCCACCGATTTCTATACACATT:1 - chrX 21351019 3' + INE-1 148 1 60.40 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGTTTAATGGCTTGTCGATACGCTCAAGTGGTGATTGCCAAT:2 - chr2R 14582834 3' + roo 9036 1 60.40 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTGGCCACCACATTCGTGCC:1 - chr3R 22352781 3' + 412 463 2 52.48 AACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCTAAAAATTTGGGATAAGGCCATGAAGTGAATCTAGTTAAGCAGAACAAACGCGATCAGAAAA:1 - chr2R 15182117 3' - accord 138 2 70.30 ACAAACAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACTCTCACTTCTCATGTTCTCCCCATATTTTCATGTCCCTAAGAGAGTAAGAGAATCGGTTTTGCATGCAC:1 - chr3L 20508152 3' + Doc2-element 93 1 74.75 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTAAACACCGTCAATATAAAACTTGTATTGTTTTTATGACTTCTTTATCCACAACAAAACC:1 + chr3R 8185269 3' - Doc 26 1 57.58 CGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGAAATTTTACCAAATTGTTATCTATATATTTAAAGCCATTTGCTTAATGCTTCAGGCTATTCAATT:1 - chr2L 5651383 3' - 1360 3275 1 73.27 GTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTAATTTCGGGAAAAAGGGTAATAAAAATGCAAATAATTCTGGAGTGCCATGCAGTTTATCTTATTTAGTGGCGTATTA:1 + chr3R 13334376 3' + Max-element 8460 2 66.34 GCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCTAAGGTAATCGTGGAATCACTCCAAGCATAGATCTCCATTATATT:1 - chr3R 19446319 3' + Quasimodo 7092 2 55.45 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTACGTGTAAGTCTATAAAGTAAGTCTATAAATCCCAATTCGCACCACTTTCTTTCCGGTGCACT:1 - chrX 5905163 3' + S-element 1708 2 70.30 ACCTCTTAAAAGTTTTTTTTTTAGCAAACTTTTTACAGGGAATAAAATAATTGTTCGGCCCATCATTTAAATGCGGAAATGCAGAAATTTACATTTTGACA:1 - chr2L 12681725 3' + FB 876 1 55.45 AGCACAATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCG:1 - chr2L 19845891 3' - F-element 30 1 51.49 AAACGATTTTTTCGCCGTGGCTCCAGGCTCTCTCTTCAATCCATTTTAGTGGCGCAGCTGGAGCCGTAAATAAACCCAGCCCGGAAAACCCCCTTTTCATT:1 - chr3L 3502391 3' + 1360 49 1 68.32 GCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCGATTTGGCCAAATATCGATATGAAGGTAACTATCTGCCAGTTCAACGGG:1 - chr3L 8646092 3' - copia 498 1 51.49 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCAATATTGGTTTGAGAGCAGTTGTGCTCTCTTACACTCAAGTAGCTC:1 - chr3R 4806547 3' - P-element 20 1 59.41 TACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGAAGAAGGAGAGGGAAATCATTACAA:1 - chr3R 16521747 3' + hobo 397 1 75.25 TGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAAGCGGAGAACTACGAGGAACGCCTGGCTATTATGCAACGCGCAATCGAAGTGATG:1 + chr2L 13817095 3' + hobo 2865 1 59.41 TAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTTCCACCGCTGCCGC:1 - chr3L 19782216 3' + R1A1-element 145 1 70.30 GGCGTATTGCAATCAACGAACAGAAATGCAAACATTCGCAATCGAGCCGGAGTGCCATCCTACAGCGAGTACGTCTAATCAAAATCAACGTTTCAAACAAT:1 - chrX 1486412 3' + Doc4-element 2315 1 72.28 TACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGTTGATGCCCGCAATCTTGGTGCAATTGTACGAATTGACTTTTGAATTG:1 + chr2L 5586946 3' - rover 6934 1 73.00 AGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTATGTACATATGCAAATGCTAAACTTT:1 + chr2L 9346213 3' - Transpac 4966 2 75.25 AAACATCAACTACTCTTCCAATCTTACAGTACCCTCCATTGTATTCATCACCGACGTGATGCCTTGGTTGACCATGCCCGTCTGCATCATAATCATGCCCA:1 - chr3R 24698201 3' + jockey2 48 1 72.28 GCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATTACAGCGCATGGCGAATTCGTATACCCCCGATCTAGTCACTGGTCCGAAAACAATCTAACCTATCTTCCTGAG:1 + chr2L 22181373 3' - R1A1-element 5130 1 79.00 ATAAAACCAAACCTCTCAGTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGCAAGGTAACTAATTGGCCTGGTCAAG:1 - chr3R 16028572 3' - BS 5010 1 73.27 CTGGGATCTCGAGGTTCATACGGACAGACGGACATGGCCAGATCTCTGGCGTTTCTAATTCAGAATTCTAGGATGGTCCAGCAATGCAATTCCGTAAATGC:1 - chr2L 22210392 3' - INE-1 136 1 56.44 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATGTCAACTGACTTTTGGATTTAAGTGGTGTCAAAAAGTATGCT:1 - chr3R 31270985 3' - jockey 33 1 52.69 GAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGATTGAGGAGAGCCTTAAGAGTTAGGAAGTTAAAATTAGGCTGAAGAAATAATTTAATGTATATGTATATATATACA:1 + chr3R 12277008 3' - Doc4-element 63 1 65.35 ATTATGTTCGTATATACTACACAGGAACTAAATGCCAGAAGGTAGAGATTAAGCATACAGATATTACACAAAACTGCCACGTCCACACTTTTGAAAAATGT:1 + chr2R 5212075 3' - mdg1 7038 1 79.21 CCTTTTCCTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCATTGTTACGTAGGCGAATTAGTGCCCTCGTACTGGAATAGGACTTGGGCCGAGGGAGAG:1 - chr2R 5499748 3' + gypsy2 341 1 63.37 TACTTCACACGATCATTATTAAGTGTTTTGATTAATTTTCTGAATTCTTCAATACCTTTACCCCATCACGTTCGACTTTTTGCTTTTTATTCTCGACTTCG:1 - chr3L 4359304 3' - G4 327 1 73.27 CATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGCCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTCAAGTCTGCCTTTGCTTTGTTGGCCAAAGTTTTCAGCCAAG:1 - chr2R 18346199 3' + 17.6 7088 2 67.68 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACGATTTTCAATCGAGAGCTGAAAACTTAAGCCTTTAATCAGATCGATGTGATTAGTGC:1 + chr2L 11240969 3' - roo 8682 2 58.42 GCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCTGCAGCTGGTGTATCCTTTGAAATGCTCCTTTGAGCTGC:1 - chr3R 16399418 3' - F-element 4464 1 61.39 CCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCAGAAACAGCCACAGCCACAACAGCAAAATCCGCTGCAGAAACATTCCAGCACCAGCTC:1 - chrX 18404132 3' + F-element 460 1 59.41 GAGATCTCGACGTTCATACGGAGAGACGGACATGGCTAGATCCTTCTTCTGCCTGCTGTTCCAATTAAACGAATACTTGGCCTCATCACGGAATGCTTTGC:1 + chr3L 17566147 3' - INE-1 134 1 55.45 TTTATNTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTATATTCAGCACATTGCTTAGAAAGAAAAAAAAAATGTATATGTATAATTCAGTTC:1 + chr2L 20129003 3' - 412 7073 2 43.56 GTTTCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATGCCAAATTATCTGACAAATGTTTGCGAAGGAAATGAAGAAAATCCC:1 - chrX 2874801 3' - 1360 29 1 58.42 GACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGATCGTAGGGAAAATACATTAAAAATAGTTTTG:1 + chr3R 22049941 3' + I-element 277 1 69.00 ACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAAAAATCACTGGCATTGTACTATGTGGTGCCATATTGCTATCCTTCAAGCCAACAAA:1 + chr3R 9211774 3' + roo 393 1 59.41 TACACTATAAACTTGTGCGTACATTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTGGGGATAGTGTACGGTTCGTTATTTTGGCACG:1 - chr2R 21417019 3' - rooA 7596 2 80.23 CTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTAGGTCGTCCGACAGGTTGCAGCGGACCACGT:1 - chr2R 7283193 3' - Doc 4462 1 70.30 AAGCANATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAATCCTTCGATTGCAAAATACACAG:1 + chr2L 15020330 3' + jockey 4945 1 75.25 TCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGTGGTTTGTGTGAGTTTGGGATCTAT:1 - chr3R 4856741 3' - HMS-Beagle2 6860 1 73.00 ATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTTATTTAAATAAACCATAATTTTAATACATATAGTACTACTTCTTAAGCAGATCAGACTGCGG:1 + chr3L 5129613 3' + R1A1-element 370 1 69.31 CAAAAATAAATATATAAATAAATACTACGAAACGGTGGTAGGGTGTGTGTGCGTCGCTGTATGTATGTACATATATATCTGTGTGAGTATTTAGTGCACAC:1 - chr2R 14036865 3' + Juan 4214 1 56.44 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTG:1 + chr2L 7654041 3' - jockey 32 1 55.45 CTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCAAAAAGAACAAACACAGTCAAAACGATTTGAATCCCAATCGA:1 + chr3L 14632968 3' + R1A1-element 5179 1 58.42 GAGAGAGCAGCAGGGATGTAGGTGATTGGAGGAGATGCGAAGGAAGCAGCAGCCGCAAAAATTCCCGGACTATTTGGAGGAAGAAGCAGCAGCACGCACGC:1 + chr2L 21033552 3' + Osvaldo 309 2 76.24 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAA:1 + chr3R 12578191 3' - jockey 30 1 51.49 CACACNCACACACACATACATACAGTGGCATGCTGGGAACGAGAAAAGTTTGTGCAGGGAAATTAGTGGCGTAAATTTGAGCAAGGTCAAAGTCGAGACTT:1 + chr3L 10314030 3' + Quasimodo 38 2 53.47 AGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAAAAATAAAAAAAAA:1 - chr3R 21186302 3' + F-element 233 1 65.79 CATGGGCATGAATGGGACGGACAGAGTCCGGTAAAACTCACCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCACATGCGAATGCATGTGTGCAAGTGCGAGTTCTGC:1 + chr3R 28287825 3' + invader5 137 2 57.43 TGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTATGGTGCTGGTTGCGAAGTGGGCTATGTCCTGGCAGGATGTTGCAACAGCA:1 - chr2L 5671663 3' + R1A1-element 5013 1 62.38 AAAAATAATAATAATAATAAAGAGGAGGAAATCAATACATATCGAATCAAAAGGAGAACCATCCATCATAGGGCAATGTGTGTTTTTCAAAATACCGCCTA:1 - chr3R 26120491 3' + invader6 4388 1 56.44 TAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATAAACTGGCCTAATCCATGACCAAATCGGGTCG:1 + chr3R 22675904 3' - 412 4 2 75.25 GTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTACCGTATTGCCACCGTGGGGCTACTGAAAGTTACTGGATTGGTGGTTACCGTATTGCCACCGTGG:1 - chr2L 14125513 3' - F-element 334 1 46.53 ATTTCTCTGCAACTCGTGGGTACTATGAACAATAGACCAAAAAACATTAAAAATGTCGCAAGACAATTCGAGGACCGTCTCCTTG:1 - chrX 6342398 3' + baggins 374 1 56.47 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACTTTTTCAGTGCTGAAAAGTTTTTAGCTAAACGAGCAGCTCAC:1 + chr3R 25931413 3' - roo 3 2 77.23 CGTCGCCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTGTGTAATGCATATGAGGTTAAACATTGCGTATACGCCGGGTATGCCGCACAAAAGA:1 + chr2R 8198563 3' - F-element 7 1 79.21 ACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTATCTATATTGAGGATATGTAGCCCCTGGGAGTTCCCCATGGCAACAGATACTTTAA:1 + chr3L 15710539 3' + Stalker4 6924 2 65.35 AGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAGGCAACATTTGCCATGATAAT:1 + chr2R 6846797 3' + 297 1 2 79.21 CAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGTTTCGATGGACACGATTGAGTGCAGCTAGATTTTGATGACTATCACAT:1 + chr3R 16500435 3' - Quasimodo 6904 2 56.44 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTACGTACATATATATGACAGGCAAAACATTCCCCAATCGCCATCG:1 + chrX 757068 3' + S-element 1712 2 53.95 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGA:1 - chr2L 20840406 3' + Transpac 5218 2 68.32 TGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTAGTTTGGGAGATATGGTGGGAGAACGTCTCTGAAGTTGACGGGAAACGGATTCGATGTGCTGCGG:1 - chr3L 20132179 3' - springer 304 2 64.36 AGGGANCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8268 2 52.00 TAAAAATTTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGGGCCAAATTGAATGGGGGAAAAGGGAAGGATGAGTGGGT:1 + chr2R 20226570 3' - 1360 3264 1 61.39 ATTTTCCTACCGTAAGACGAATAATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 12187127 3' + Rt1b 5130 1 87.23 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTAC:1 - chr3R 19535692 3' + hobo 2907 1 54.46 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTTTAAATATATTTTACTTAACTTTTAACATAACACAACACCTCAGTTT:1 + chrX 3050728 3' - I-element 36 1 56.44 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCA:1 + chrX 2090279 3' + roo 9023 2 70.30 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATC:1 - chr3R 17788923 3' - roo 8713 2 75.25 AGCAATCAATGTAGACCATGATCAGGGGATCAGCTAGTCAGGACGGCCATGGAGTTGTAATTAAAAGGATATCCATATTCATTTCGTGTAAGCAGCCGCAG:1 - chr3L 19134952 3' + invader3 5135 1 56.44 GGACAAAAGCCCTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCCCACGCCCGAAATGAAAGTACATAACGCAGCACCTTAATTTTGAACTATGCGTGTCTTTCC:1 - chr3R 16414358 3' - 1360 456 1 61.39 TAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGCGTGTGCGTGTGTGGACTTATCTGGCG:1 - chr2L 5383958 3' - I-element 5217 1 73.27 AACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTATCACAAACACCGCGACAGAGAGAGAGCGGCAAGTGAAT:1 - chr3L 9401188 3' + HMS-Beagle 6646 1 62.38 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCACA:1 + chrX 16619666 3' - opus 42 4 70.30 AATACTATAGTCAAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTATCTAGTGTGAATGCAAAAAAAAACTGAAGTAAACGCATAAAACAGAACAAGAAAGT:1 - chr2R 17190027 3' - INE-1 570 1 61.39 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTT:2 - chr3R 5208148 3' + hopper 1379 1 63.37 ATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCTTGCCTCGTCGCACCACGCCCAACCAACCCGCAACTTTTGCCCACCTGCATGCAAAATAGACATGTGGCGCAG:1 - chr2R 24073806 3' + roo 8825 2 60.40 GTCCAAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTTAATTTTTTGCTCTGCTCTCGGTTTTTCGTTTGCTGGATCGGGTCTGGTGTCCAGGGAGCATGGTGTCCAGGG:1 + chr2R 16028979 3' + accord2 7563 2 69.31 AACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGAGTAAAATTCCATCCCTTCATGGCGTTTTGCCTCCAAATTTTTGTTGATTGCCATGTGTGGTTGCTGGCGTCCT:1 - chr3L 9657584 3' - Bari1 1658 1 80.20 TAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATTTTTCACATTACTTGGGATCAGTGTGGCTTTTTTTTTGAGTGCAACGAGCAAGCGGCTGA:1 + chr3L 18096750 3' + invader2 4640 1 49.00 CGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAGATAAACACCAATTTAATAAAGTGACCCAAAGTTATGCGCCTCCAGTCTAAGGGCGGTAGCATAAAA:1 - chr2L 17596509 3' + F-element 479 1 75.76 TTAAGCTACACAGTAGTTTAAGTTTAGAAGGAACTAAACGATTTTCGGAATACCGTGGCTAAGGGTCAGTATCCGCACTTGCGTCCAGCTTCCCGGATGGC:1 - chr2R 12848647 3' + G5A 2781 1 67.33 GCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTCCAATTTCTAGCGGTGTATTTGTATATAAAATGATAAATAAATAACAGTA:1 - chr3R 30396240 3' - Circe 7369 1 50.00 AAATAAATTAAACATTTAACAAAACGCAATATTTGCGCATATGAGCACTTTCACCGCTTGGGTAATCAAAACAGACTGACTCCATTTGTGGCAGACAAATT:1 - chr2R 8687637 3' + HeT-A 11 1 71.29 GCATGAGCATACGTGTGCACACATATAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGGCACTGGCGCCAGTTTCGCCACATTTACCTGCGTTTTTGGATATTCAGAGA:1 + chr3R 21321159 3' - 1360 180 1 57.43 GCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACATTCCCTTTCGAAAGGCACGTGCC:1 + chr3L 13727431 3' + Doc 260 1 76.24 TGATCCTCAAGAATGGAAAAAAACCCAATTCTAGACAAGTCACCATCTTAAACGCATATTCGCAATGATCTCCTTCCTCATCGTAGATTTTCTTGCAATCG:1 - chr2R 20504040 3' + Idefix 135 2 67.33 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCTCCATTAAGTGCA:1 - chr2L 9823609 3' - hobo 9 1 72.28 ATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGATGAGAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAGATGAAGTGGTTCTCTTATTCATAGCATTGTAATTC:1 - chr3L 2674936 3' + Dm88 317 1 69.31 TTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTCATTATTCGTCGCTTAATTCAACTTTTCCCTCCTCATGTTTCATCTTTATATTTTAATGTGC:1 - chr2L 20148271 3' - P-element 2666 1 66.34 AATCTAAAAACAAAACAGGCAAATGTACATAATAAGCACAGCAATTATTTAGCAAAATCGTTTCCTTTCGCGCTTTTTCCTTCGAACGAATATTGTTTTTT:1 + chrX 3111552 3' + I-element 5189 1 55.45 CAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCTCTTGGATTTTCGAGCGCTTCATAAATTAGATGTC:1 + chr3R 30559266 3' + Doc2-element 312 1 65.35 AAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACAACAAATGCTACGAGGACGCCACCTGTG:1 + chr2L 2353614 3' + F-element 187 1 76.00 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGAATCTGAATTAGAACTTTTCCGATATGCTATAGATGCGCTTAACGCTAACGCACTTGCGTCGCAG:1 - chrX 5176452 3' - hobo 10 1 73.27 AGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCTGGGGAGTGCGCCATTTGGGAGGACGAAGGACATTCGAGGGCTCCAA:1 - chr3R 13537057 3' + micropia 402 2 53.47 AGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCCCACCGACAATATGTTGGACCAACGACAGACTTCGGGACGATCCT:1 - chrX 20582125 3' + F-element 229 1 64.36 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTGCATACCCTCCGTTATATAACGATGGAATCTATATTGAA:2 - chr3R 11685573 3' + mdg1 7422 2 60.40 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGTAGCCACGGCCATAAATGATGTTGCGGTGCACTCGGGTGACACTCAAATCCAACAACTC:1 + chr2L 18662402 3' - hopper 15 1 64.36 GAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTAAGTAAAAGCCATCCATTCGATGAAAATTCCCTTCAGCATTCGTTTGTTGTGCGTTGCTTGTGTGTG:1 + chr2L 17803986 3' - 1360 3270 1 64.65 GGCCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCAGCTTTGGCAAAATTCCTTTTTAAATGTGGCATATGAATACGATTGCAGAATGTTTGAATTTCGAACTCCGGTC:1 - chrX 12809647 3' - GATE 161 2 77.00 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGATGAGATTCATTTATATTCCAAGTGTTTATCCTAGACTCTTTGCTATTTTATTCCAGTGCACTTATATTACTGCAAGT:1 - chr3L 19228883 3' + INE-1 155 1 64.36 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCTGCAGGTCAACGCTG:1 - chr3L 15099878 3' + Tirant 8468 2 66.00 GTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGGAAAGGTTGTGGTGTATTGATGTCTTATGCAACAGATT:1 + chr2R 17636037 3' - accord 314 2 62.38 CGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGCATAGGTAAATGGAGATGT:1 - chr3R 21799483 3' - jockey 4759 1 78.00 CCAAAGAGACTTAAATATTCCACAAGTCATCAATGCAGTCACAGAACTTTTGGAAAAATATCACAGCAAACGCATGCGAACGCCAATCGCGTGGGAAGCTA:1 + chrX 6872735 3' + F-element 4390 1 68.32 GAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAGGTTAAACAAGACCACAAGGATATGAGGAGACATCTGGAACGGAATGAGCTGGA:1 + chrX 6896777 3' - TAHRE 10090 1 59.00 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGTTATAGAAACTGATGTGCTTTGAATTCAATAGATATTG:1 - chr2R 13645319 3' - jockey 4685 1 62.89 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGACGCTCAACTTGGTAGCAGCACCAGGAATCCGAGTTCAGGAGGGGCA:1 - chr3L 19208073 3' - Max-element 8302 2 61.39 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAA:1 - chr2L 6656272 3' + P-element 2862 1 50.00 GAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGGTCTCGCTAAACTAAAATCCAAATGAAAATATTATTAAATTCAATTGGGCAAACATTAC:1 + chr3L 13548750 3' - Porto1 267 1 52.48 GTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATGAGAATTAAACAGAAATCCATTATTTGCTATTATGTTTTTTTATTAAAATTATATGTCAACTT:1 - chr2R 8286819 3' - 1360 3137 1 62.38 ATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGGTTCTCAAGAAAAAAAAAACAATCATATCGAATTGGAGCTTTAAGTGGAGTCTGCTGTCGTTGGCATTG:1 - chr3R 14686774 3' + opus 226 2 39.60 CGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATGTATGCCACATATATCCTATATATGTACGAGTATCTGGTATGCAGTTTGTTTTCGTTACGGCTA:1 + chrX 9737125 3' - Rt1a 4737 1 73.27 CGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGATCCTTTTGTCAGCCCAAATGCGCGAAAGTGTGGCGCAGGCGCA:1 + chr3R 29264789 3' + blood 229 2 57.43 TATTAATCATCAGTTTTAATTTATTTCAGGGATCGAGATCTTCCGTCTCCAGTGCAGGCGACAAAAAGGAGGAGGGCAGCATGCCGCAGTACCATGTGGAC:1 + chrX 21380924 3' - Juan 390 1 65.35 GGTTATGGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATTGTGTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGATACCTACTAAAGGGAAGTTGAAATTAAAAACACTCAA:1 + chr3L 10488600 3' - INE-1 87 1 69.31 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATCCAT:1 + chr2R 18434536 3' + pogo 2057 1 72.28 GAGCTGCAACAGTACGATTTCGAAATGTCGTCCTGATATGCGAAGGCGTGCGGCATCATTTCGGGCCCTATCACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTTTC:1 - chr3L 25232769 3' + Osvaldo 182 2 73.27 AGTAGTCGTCTCTCATTTATGCGTTGCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATAATCGTTATCATAAGCTGGGAGTCGCAAATCCATTTCTAGTT:1 + chr4 735105 3' - rooA 7196 1 65.35 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCGCA:1 + chrX 4740574 3' - 17.6 6953 1 69.41 TGTGTGTGTGTGTGTTCATGCGTGAGGTGCTAGAGTAAAACAACTAAACACAGAGCCATAAATATTGTATAAATCAAAGAAACACATTATATAGACTTCAA:1 - chr3L 19576979 3' - accord 178 2 74.26 ACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCCAGCACCAAGTAATACCCTTCTCTCTCCCCAAAAGAAACAACC:1 - chr3L 7161103 3' + gtwin 376 2 63.37 AATTGAAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTAATTTGAAAATCTTAGTTCGCTGAGCAGCGAAAGCGTCTACTTGTTCAGCAGAAACA:1 + chr3L 3056723 3' - Copia1_DM 86 1 64.36 CTACCCCTTCATGACTAAAAGATCCCTGTTGTTGCAGTCCATTTACCTTATGGTTGCTATTGCCTCCAGTAGCTTTCACTGTCACTTTGGCGGGAACATT:1 + chr3L 2721908 3' - baggins 5379 1 78.00 CCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTAAGGAAAATTCGTTTTTTGCTGGAACTAATTCTGATTAGTTA:1 - chr2L 13594400 3' - I-element 334 1 58.42 CTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTCTGACTTTAATTGTTTTTCGTTTGATGTTTCTCTAACCATCCCATTCCCACTTATTATATTGTTTGGTATTGTTCGTT:1 - chr3L 16625925 3' - Idefix 375 2 62.38 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTGGAGGAACTGGTGGGCAAATTTTGGT:1 + chr2L 22227368 3' - F-element 32 1 56.44 TTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGTCGAAATGTGAAAGTTGAATTTGCATAAGTTCAAACATTACAATGTTTTATAATAGCC:1 + chr2L 13480950 3' + hopper 1228 1 64.36 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCATCATTTCGAGGTTAATGGGGTAGTGGCATGTGAAGAGGGACTTGCAACGAGTGGAAAGG:1 + chr2L 7504041 3' - Tirant 8177 2 66.34 CTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTATTCTGTCAGCAAATG:1 + chrX 2090286 3' + roo 409 1 62.71 AAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTATCGGATATAGTATGCACCCCAGTCCGCTCATTTTCCTCCTTCTGGTGCTAAAAAGTTAAGCAA:1 - chrX 12290605 3' + HMS-Beagle 237 2 68.32 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTA:1 + chr2L 7654013 3' - jockey 61 1 78.22 CGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTTAATATATCTGAATATTCTGCGCAATCCACAAATTGC:1 + chr3R 5946166 3' - HMS-Beagle 35 2 64.36 TAGAGACGCGATATAACAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATTTATTAGCAAATTGCTTGAACAAACGTTAAAACTAGAGCAAGCGATCGCAGAAAAGG:1 + chr2L 17435358 3' - Cr1a 4359 1 54.46 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTC:1 - chr2L 16691176 3' - pogo 45 1 72.28 CGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATGGGGATCTGCATGCCACTGGCTAACCAGGGTGGCGAGGTCATTAGAT:1 - chrX 21933808 3' + gypsy11 4361 2 69.31 CAATAGTCTTAGAGTAATACAATTGCGAGCGGTACGACATGCATCTGGGCTACGTGGGCATTGTAGTTGGCGGCGGCGTGGTAGGCGGCCTGTGACCAGTT:1 + chr2R 25041084 3' + G5A 2475 1 56.44 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACGTTGCAGAGAATCATCTGATTTAAATGTACATAGAAACCCAAATGAATTTTCGGAATTCC:1 + chr2R 11540284 3' + Transpac 296 2 63.37 CTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTATGGATGCTCATAATCATATTGGGCTCCTCGAAGGGAGTACCTCTTTTGG:1 + chr2L 11165402 3' + transib2 2796 1 51.49 ATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGCATAAAATTCAACAAAAATGGTTTTAAAATGAATTGATTTATAACTATTAGAATAGAAATGACTTTAAATT:1 - chr2R 19184884 3' + Quasimodo 121 2 70.30 ATGATATGTACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTGTTTTCAAATAATAATAACGTTAGAGTAAATGTGTATTTTTTTGGGTGGTGAATACTATCAAATTTG:1 + chr2L 22718767 3' - 1360 346 1 56.44 TGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTCTGCGCTTCCGTCGAAGTCAT:1 + chr3L 3495513 3' - hobo 2577 1 79.21 TAGGACTGCGAATAAAAGGTTGTCGTCGTGCGTCCAGGGTCCGAAGAAAACCAAACAGACGCTAGCGGGGACGTAGTATCGCATCTGCAGGCGAACGCTCA:1 - chr2L 13307451 3' - aurora-element 111 1 67.33 TGAAACGCAAAACACAGATGGTGGGGAAATAGCAGGATGACTACGTGGTGGGCTAGTGTATTAGTGTATGTAAGATGTTAGCTGCGGCACGATGATTGCTG:1 + chr3R 4696815 3' + G5A 424 1 57.43 ATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGACATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAA:1 - chrX 15408731 3' - INE-1 516 1 86.14 GTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGGGTGGTGGAGCTCCAAGTAGGGTGTGTCCGCTGA:1 + chr3L 11145996 3' - I-element 354 1 66.34 GAGCCACAGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAA:1 + chr3L 776139 3' - 1360 50 1 72.92 TAGAATGCATACTGCGCAGATGGCAACTGGATGTGGCTATCTGCGTCCGCCTTCTTTCACCAGTACTTTCGCGTCTACAGTCCGGTGGCGTTTGGCAAGAA:1 - chr2L 20643976 3' - 17.6 146 2 76.24 GTGCCAAAAAATCGCATAGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCATTACTTTCGGGCGGTATATCTGCGCCAAGGTGGGCGTCTCGTTAGGCG:1 + chr2L 17535456 3' - 1360 29 1 54.46 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTG:1 - chr3R 22352798 3' + 412 446 2 69.31 AAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACAATCCCCCACTCTTATCACGAAAACCAATCACGCATGAACGCATTCGGAAGTAGGAGATG:1 + chr2L 5086756 3' - FB 16 1 58.42 TAACAGGCAGCAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAAAGTATATATATTCGCATTCGCACTAACTAAGTAACGGGTATCTGATAGTTCGGGTGTTTTTGTTT:1 - chr3R 21061645 3' + INE-1 33 1 67.33 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAAC:2 - chr2L 5932131 3' - jockey 62 1 74.26 AACAGCGACTACACGCATACTCATTAATTACAGCTCGATGACTGTGTTCGTTTTCGGTTTGGGGCTGTACAGATTTTGTTTGGCCATCAAATAAACAAGCG:1 - chr3R 26790623 3' - micropia 19 2 78.22 ATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAAGCGGTTTCTACCAGAGTGGTTCCTTTTTCGGGACATG:1 + chr2L 18107160 3' - G-element 4183 1 62.38 AAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTG:2 - chr3R 14882091 3' + gypsy5 7315 2 65.35 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATAAATAGTTTATTATTATTTTTGCTTGAATTTGTGTTGCCTGAGACAGGTGACGACTTA:1 + chr3R 26294558 3' - roo 8681 2 62.38 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTACAGTGGCAC:1 + chr3L 15853536 3' + jockey 4974 1 63.37 TACTTTTAATTAATTTACCTTAACCTTCCTCGAAACTAGTCGCATGCGGCTCATTTGGTGTTCCGTGAAGATCCGATTTCGGGCCTCTAAATACCGTCGTA:1 - chr2R 2644170 3' + Cr1a 3987 1 78.22 TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCTGCGTTGGTATAATGCGTTTCAACTGTTTCTCCGTGAACGAATTCACCCAAAAAACAAAAACAACGAAAAAAA:1 + chr2L 3810409 3' + jockey 4926 1 78.22 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGC:1 + chr3L 22324085 3' - hobo 44 1 63.37 AAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTGTCAGTTAGTTATGTGGAAAGTTTTTGCGGAATTAATACCAAATTAATTCCC:1 - chr3R 5165171 3' + Tc1 1588 1 66.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGTTGGATGA:1 - chr3L 17624156 3' + roo 9047 1 54.46 CCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACTCTGTCGGAGTCTCCAGTTTTGTGAATCATTGAGATCGGAGTTCATGTATGTAGATCATCTCAAGTGGAGCTACTCG:1 + chr3L 20594071 3' + Tirant 8124 2 72.28 TAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCTTGTTTGTCCCAGTGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATTTTTCGCTCACTGCTCTGCTCTCATG:1 + chr3L 14681742 3' - Tc1 1634 1 79.38 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCGCAGG:1 + chrX 4740576 3' - 17.6 6967 2 71.29 CATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGATCATCGCGTCGCCCACAAAATTGCTGCCCGAAATAAGATATCTGCACGTAGCTGTAATTTAAA:1 - chr3L 15700832 3' + S-element 1246 1 68.32 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACGATTTTCAATCGAGAGCTGAAAACTTA:1 + chr2L 11240939 3' - roo 8712 2 76.24 AATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTGATTTACAATGGCCAGGACAGCTGCAAATTGAGT:1 - chr3L 18138415 3' + micropia 105 1 66.34 ATTAAGTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGGGCGACCGGGCTCAGTGGCGGTTGTGTAAAAATTTCACTT:1 + chr3L 18420038 3' + 412 7102 2 59.41 GTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTATCATTTATTTTATGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGATTCGCATTGGTTATCTCCGAATAGATT:1 - chr3L 8890966 3' + Cr1a 73 1 72.28 GTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGTCAAAAAAACTTTTTGCCATCCCCACACTTACGCCCTAAAACCGCCCAAATTGTTTAAGTTCAAATTAACATAAATA:1 - chr3R 25295787 3' + INE-1 301 1 73.27 GATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTCTCGTAATCTTAAGTCAATAGGCTGTCGCATCATCTTTACCTAAGAATAGCCGGGTCTCTCAGGGGAA:1 - chrX 2442109 3' - Quasimodo 6899 2 74.26 CAGGAAATGATCTCACAGCAAAATCCAATTGGCACATTCCAGTCTAACAGCGTTCTGACCAACGGTGCCGGCAGTGGCTCCTCGATCTTTGGCTCCCAATC:1 - chr3L 8437581 3' + TART-A 155 2 65.35 AAAGTGGCTGCATATTGCCAAACCAATGTCTGGCTGGTAACCTTGTGGGTACAATAATGACTACCATAATTTTCAGG:1 - chr3R 4584975 3' + 1360 3345 1 57.14 CCAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGTGTCTGAAACAGGAACTTATATATGCATTAGAAGATCAATATTAAATCGAATGCTTAGATATCGTTGGCAGAAAAA:1 - chr2L 7663798 3' + Circe 7154 1 74.26 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCGACACTGGGTTTGTCGCCTTATCA:1 - chr2R 24614459 3' + hobo 2886 1 75.25 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCATCCCTC:1 - chr2L 16691146 3' - pogo 13 1 67.68 CCCTAATAAAATTCTGGCATTTATAAAGTGCATTGGACATACTTGGGGTTTTGGTTAGTCGGTTGTGTGATATGAGGGGTGGGAGGAGATTTAGCAATAAG:1 - chr2L 18307809 3' + baggins 5331 1 76.24 TCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTCAGGAGGGGGATCTCCGAGGGTAAAACCGAGTTCAGCCGTTAAGGAGTCCAAAA:1 - chrX 17421272 3' + Bica 67 1 57.43 TACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCACCGAACGGAAAAGGGGTTCAGATGACAGGCACATGCGGG:1 + chrX 910115 3' - 1360 3353 1 62.00 TTGTTTTTAAATCACGAAAATTTGTGCACCACTTTCAAACCGCAATATGTAAGCTTTATTGAATCCCAACGAAATTTCACTTTAATAGCTTCCCAAATGGC:1 + chrX 6184914 3' - R1A1-element 107 1 72.28 CCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGATGAACGACGAAATCTTGCCACGGACTCATTACTCGAAAGCTGGGGGTTACATGTTTTCCCCCTTGTTATTTTTT:1 - chr3R 7060345 3' - GATE 270 1 53.47 AGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCAGGAGGACCTCAACCGCAACGACTTCGCCGAGGACGTGCCGTTGGCCAGGCACGCCATCGATCACCACAACG:1 - chr3L 1029181 3' - Doc 468 1 75.25 TTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAGTAAACAGAACACTTGACAACCATCCCACCCT:1 - chr2L 17901308 3' + FB 409 1 71.29 AGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGTAATTTTATTGAATCGTGTTTACCCTTATGTCGACTCGGGTTTTGTTTGTGTTTTCCTT:1 - chr2R 22525770 3' - jockey 167 1 41.58 GATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAAC:1 + chrX 21667930 3' - gypsy2 31 2 55.45 CTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCGCAGGCCATTTGA:1 + chrX 4740584 3' - 17.6 6959 1 64.36 CCGCGATATGGGTTCCAACCACAGCCACCACGATACTCCCCTTTTTTTTTGTGCGCCGTTGTAATGCAATTTTATTTCATTTCATTGTAGGCAAAAGTTTT:1 - chrX 12118005 3' - R1A1-element 5012 1 59.41 CGGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGTCCCTGCGCGTGTTAACTTATACATATCCTCGACTACAACAACCCTCACACTTTCAATTCCGA:1 + chr3R 28055934 3' - gypsy4 6605 2 60.40 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGT:1 - chr2L 6177178 3' - pogo 43 1 73.27 GGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGTCGCCTTGCAGGTCTGTAGCATCTCGTCCTGGGTTATGCGCCCACCCAACGGT:1 - chr3L 25965901 3' - micropia 5435 2 58.42 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAGAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTTGCTAATCTTCCGCTGACACCGCG:1 + chr3L 27327704 3' - hopper 46 1 72.73 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCGCAGGCCATT:2 + chrX 4740581 3' - 17.6 35 2 67.33 GCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTGGGTCTCTATAAATACTCTACTTGATGAGGTTTTAATTTTTTTGCGTTTTGTGTTTTTTT:1 + chr3L 5574867 3' - hobo 2929 1 57.43 TGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATG:1 + chr2R 4677363 3' - invader3 8 2 72.28 CTGGGTCTCAGTACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCTCCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCTCGTCTGGCCAGTAGCGGGCGCACTTTTCTT:1 - chrX 2110395 3' - R1A1-element 5080 1 69.31 TTAAGGACAGTAGTCATAGGTAGATTACACCGGTGTTTCGCTCGAGGGGCGGAAAAAAGTAAATGGGTCGGCCATATTTAGATTGTCGTTTTCTAAGTGCA:1 - chr3R 16051820 3' + Gypsy12A_LTR 1942 1 66.34 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAAAATGAAATGTGAAAGGCAATGGCGAAT:1 + chr3L 20856103 3' - flea 51 2 78.22 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTTGTACGTCTTCAATTAATTG:1 - chr3R 25931336 3' + roo 9019 2 77.23 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACGTGACGACAAAGCTGCGGGTGCCCTTCTGCTCCTCGATGAATGTGTGCGAGTGTCCTGTG:1 + chr3R 14139475 3' + hopper 1402 1 66.34 GTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTGCGAGATTCAAACCGAAACGTTTTCCAAATACTGACCATTGAAAGTAGCCAAAGATTTATTTCTCTT:1 + chr2R 15296319 3' - Cr1a 4162 1 75.25 CGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCATAAGATAAGAACACTTAATAAGTAGATCTGGCAATTGTATTA:1 + chrX 6643503 3' + gypsy12 10112 2 58.42 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATACCTTTTATGGTAGCTAAACGG:1 - chr2L 20465611 3' + blood 7339 1 82.65 CCGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATCAGATAATATAATTATGTATATTGTATATAACGCAACTTTTCGTGAGAAGCGAAT:1 - chr3R 24839981 3' - I-element 22 1 57.43 ATTTCCATTTTTCGACAAATTTAAAGCCATTCCCTGGTCAGGTGATTCAGCTTAATAGATGGAACATCATCGAGGGTTTGAAAGTAACCAAGTGCATCGTA:1 - chr2L 4061614 3' + G4 399 1 59.41 GCTGCGGTCTCCACAAATGACGCTTCTTGCGTCTCCTTGTCGCTGGCTGATTAGTATGAACATGAACCCCAAGAGGGGTTCACAGCCGCCCCTCTTCCGCT:1 - chr2R 5915923 3' - aurora-element 358 1 57.43 TACCCACGAACACAAAAAAAAGTGCAAAACAAACTGAATAGGGCTTTTCATGCTAAGAAGGGCTGTGAATTAACGTGAGTGCAGTGCAAATAATAATAACC:1 - chr3L 22570593 3' + gypsy2 392 1 74.26 TTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGAACAGAAGGGCAAAAATCTGGG:1 - chr2R 13314483 3' - 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F-element 38 1 50.50 ATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCGGTCTAACCCTGTCCGTCTGTCCATCACCATTCTGTACCTTCACAAAGACGAACTGTTGCGCCTGAAGG:1 - chr2R 13988763 3' + INE-1 82 1 57.43 TAATGACACACGGGAAAAACGCCGTGCGCATTTTTACTGGCCTTCTTACGGGGAAGGGGAAGTGGGTGGAAAATGGCCAGTGGGTTGGGCGGGCCATGTGG:1 + chrX 17995926 3' + baggins 5096 1 50.50 CGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTAGTGCGTCTATATTGGTTTATATTTACCTGAGATTGGTCAAGAGTCAGCAAGGCCTT:1 - chr2L 14274911 3' + Doc 257 1 56.44 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTCCGTAGCACACTTTTCCGACGCCCCTCTTCAGCTG:1 + chr3R 19535775 3' - hobo 15 1 64.36 CGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGACACGGTCGCCATGTAATTGAAAGAGCAACTGAACAGAAATGCAATAAAACAAAATAAATGCTT:1 - chr2R 1733789 3' - Stalker 435 1 54.46 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACTGACACACAGATATCCTTGCAGCTGGTGACGACGAGTCAGGCGAGGGAAAAAGTTTAGGATTTGCGC:1 + chr3R 24545658 3' + roo 401 1 70.30 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTA:1 - chr3L 3254960 3' - 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chr3R 11509647 3' - gypsy10 5621 1 65.35 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTCGAATGTTATTTATTCCATAGCCATAGGCGTCCTTTTTGCGAATGTTATTAGCAGAATG:1 + chr3R 29376482 3' - P-element 38 1 56.44 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCAC:1 - chr3R 11005453 3' + roo 9044 1 51.49 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACATGTTCTCAATTGGAGGCATATATTGGTTTATTACATTACTTAAATTTTATTACA:1 - chr3L 25798475 3' + blood 7351 2 77.22 GCTTTTCCTTCTCTTCTAGAACTATCTTCTTTTGAATATGACCATTACTCCGTCTCCCACACCGGCTGCCTTCAGCGGCTGCTCCCGCACCACGATTATGG:1 - chr2L 3276893 3' + Gypsy12A_LTR 2022 1 64.36 AAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACGAAACCAAAAATCTGCTGAAGAGCAGAAGATTTCACGCAGACAAAGATGAAGTCGATGGATTGAATGAGCA:1 - chr3L 6816593 3' + micropia 5256 2 79.21 AAAAAAAGAAAAAAAAATGGGGAAAAAACACGAGCACATAAGCCTGTATCTGTGTGCAAACACACTCACAGAAACAGCTCACACACACACACACACACGCA:1 - chr3R 9418239 3' - hopper 139 1 48.51 TCCCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGGTTTGTACGTACGAATGCTTTTGGAAATTTATGAGTTTCGCTTGA:1 - chr3R 30721027 3' - F-element 422 1 55.45 AGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCACTACGAGCGGACGCTGTGTGTCGAGGGGGGGCAAAGACATCGGGAGCGGGTTGTGGGCA:1 + chr3L 6364151 3' - F-element 398 1 56.44 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGC:1 - chr2L 15997890 3' - 412 48 2 81.19 GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTACTCGCGCATACTAATAAAAAAATTAAGGTTAGTTTCAAATATTTTAGGTCT:1 + chr3L 25120081 3' - I-element 5141 1 59.41 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTTTGATTAAAGCAACTATT:1 - chr2L 1912980 3' - pogo 15 1 60.40 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATTCATAAATTTACTAATTTGCGATTAACTAGATTGTGTCAGCT:1 - chr3L 21840252 3' + 1360 3381 2 69.31 CAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTGCGCCAGTTAGTTTTTTATATTCCTGTGCTTATATTTCTTATGAAGAATGAAGT:1 + chr3L 18667233 3' - 412 7497 2 62.38 AATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGACATTTAAATTAAGTTCGTGATTTGG:1 - chr2R 18075243 3' - 1360 3268 1 76.24 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAA:1 - chr3R 29019037 3' - Doc 58 1 77.23 AGGCAGCCAAATCACACGCTAAAGAGGATAACACAATAAGAGACCATCGTGTATGGCGTGCGACCGCATGTACGATACTACGATATCGTTCCGTGCGTTCC:1 + chrX 16320369 3' - Dm88 123 2 65.35 ATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGCGTGACCCATGGAGCTGTCAAAGCTTTGACTGCAATTTTCTCCCAATTTTGTGTTTAAAG:1 + chr3R 4708362 3' + invader4 2656 1 61.39 CATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCTTTTCGCATAGGGTTTCATATCCCTACCCCTGAGAAAATTCACTTATTTGGTAAGAAAGACAAAATA:1 - chr3L 16765014 3' + Tirant 8230 2 70.30 AAGTGGGTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAGTGCCGTGCTGCAGTTCTCTGTTGTCCAGCACAG:1 + chr2R 2498382 3' + 1360 3346 1 72.28 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAG:1 - chr3R 22899165 3' - P-element 18 1 59.00 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAAC:1 - chrX 2253835 3' - Tirant 39 2 64.36 GCCGGTGACCGCGGCGAGGGATCTACACCAACAAATCTTTTGAGCACTCACTCACATATTGTGAATATCCATGGCCATATGTTTGGCAATCGTTATAATCC:1 - chr2L 9583520 3' + gypsy6 7780 2 77.23 TTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCCACTCTCTCACTCCTTTGGTTTCAATTAACTTTCCCTTTG:1 - chr3R 8685270 3' - I-element 454 1 60.00 TACGCATATTACACATAATTAATTATCAACATAAATATAAATTGCCACACCACTTCTCCAAGTCAATGAAATAGCTTATTGCCTCGATATTTGGTGACCCC:1 + chr2L 22218017 3' + 1360 2933 1 63.37 AGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGAACTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGTGAGCCGCCCCCAGCTAATTTTGTTTATGTTTTCATTT:1 - chr2R 13335395 3' - F-element 156 1 61.39 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAATACCGCCAGTCGTTGCCCATCAATTCGAT:1 + chr2R 5910942 3' - hobo 14 1 65.35 TAAGGTGAAGGGCATATTTTGTGAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACATCTAATTTAGGTTTAGGCTACCTGGCGCCACTGGCCGTAA:1 + chr3R 11289016 3' - 1360 214 1 60.40 TTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCAGATCATACGCGAACGTTTGCCGGATTATCCGGTGC:1 + chr2R 14582932 3' - roo 8663 1 79.21 GTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTATGGATTATATATCCTAAATGATTCAACTGACCGGATAATTTGATATCAAATATCT:1 - chrX 17489221 3' - opus 416 2 62.38 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCCCAGAACCAGTCAACACTTGGAAAATGCAATCATCAGCACTTTTTTGGGCCAACAAAGA:1 + chrX 5732586 3' - roo 32 2 65.35 CATCTCGACGTTCATACAGACAGACGGACAGGGCCAAATCGAATCGGCTATTTATCCTGATCGAAAATATATTATTATAATACCTACTTAACGAGCAGAGC:1 + chr2L 1094934 3' - INE-1 132 1 71.29 TATAGTTCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGTT:1 + chr3R 3586572 3' - INE-1 144 1 65.35 TTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTATATTATTCCGATTTTAAACCAACCAAACCACACGCACACTCGCACACTTGCAAAGGGGCTGACATATGGCAGAGAG:1 - chr2R 7861942 3' - gypsy4 6570 1 51.52 AGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGTTTGGGGAAGCGAAGTTGGCTCAATG:1 + chr2R 13751364 3' - 412 116 2 74.00 GCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGCTCTCCCCAAGAGCAGGGTGGGGCACATTAAAGCGCTCAATGTGTTGCCTTTTCTCGTTACCACCCG:1 + chr2R 6544241 3' - 17.6 140 2 72.28 GTTGCGGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTC:1 + chr3L 24834440 3' - Tirant 54 2 75.25 GAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGATTGCTCCCCCCTTGGCCAACGTCCATGTTCCGTTTGTGTGCTCGTGTGCGTGC:1 - chr3L 17194831 3' - R1A1-element 329 1 55.45 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGGGCATTGTTGCTCTTTTTTCGCTTTTGATTGGTTTGACCGATTTACATTGTGCAAAAGAAATGAG:1 - chrX 9653257 3' + roo 9060 1 68.32 CGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGTTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTACTGTTTATGCATATTAGTTGTTAATGAGCAACTCGCACTACAGGCAGTC:1 + chr3L 9584311 3' - R2-element 275 1 52.48 AAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCCAATCAAGGAGCAGCAATTGCAGCTGTGAATGCATCAG:1 - chr3L 4598878 3' + I-element 48 1 62.38 AACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTTCCACCGCCACCGTAACCACCGCCACCGAA:1 + chr2R 11241929 3' + F-element 4348 1 72.00 CCCTTTCTTCACTAGTCAAACGAAGAAATGCTGCAGAATATAACCAGTTAAAACCGACAAACAAATTTTGTCAATAATGGGACACTTGTCCATTATGCTCG:1 + chr2L 9505295 3' + Chouto 6112 1 58.42 CCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCACTCTGTGTTCTGCACCAGGAATTCCCTATCC:1 + chr2R 20151599 3' + Quasimodo 6900 2 69.00 TATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCTTCGACCTGCGGATCTGGAGATCCGCGTTCCCTAACAACTGCGCGTTCCGACTGCGCCTGTTCC:1 + chrX 1600400 3' + Doc 4527 1 74.44 TGCGTNTACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAGTAGCTGGACGACAAGCTGGA:1 + chrX 9260692 3' - 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Cr1a 4055 1 78.79 TGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGTTGGTGTGTGCATGTGTGTGTGT:1 + chrX 3312883 3' - gypsy3 417 1 69.23 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGG:1 - chr2L 17004743 3' + roo 9029 1 66.34 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTAT:1 + chrX 5726764 3' + roo 9023 2 73.27 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCACTGATGTTGAAGATTTTATACTCATCCCAGCTCGTTAAGAGAACTCTGTAAATATCATTGAATATTCAACTGGAA:1 - chr2R 18891850 3' - opus 7051 4 64.36 TGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATCAGCACGGCTTGGAATGCGAAAGCAGCAGTTAAATCAGCGAAGAACAGAGAGTTTGCGAAATTATAGCTAAGGATA:1 - chr3R 8819185 3' + invader4 2697 1 79.21 AATCTGAACTCGAATCCCAATCCGCAGAGAAGGTAGCTGAAACTTAAGCCCCAGCCCGAACTCCAACCGAATCCCAAATGGCGATTGCTGGCGGCCATGTC:1 + chr2L 1416374 3' - transib2 2544 1 66.34 AAAAAATAATTGTTAAAACAAAAAAAACCTTCAAAAATAAGCGAACAACAATGATCTACAGATGAGCGGGAAAAACGAAATAAACGTAACAGTTTCTAACA:1 + chr2R 11243013 3' - Tc1 1484 1 69.31 CGTCAACTACACCACTACGTACTTGTGTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACAAAACGTATTGTCTTTACGGAATATTTATTCTATCTGCTTTTCGGG:1 + chrX 18339724 3' + Copia1_DM 112 1 61.39 TCTGGGTAAACACAAGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGGTCTGTATAGTCTCCGCAGCATTCATGCCTTTAATTACAGCGTTAAGAGCCTCCCAAGATTTCT:1 + chr3L 27968694 3' + HMS-Beagle2 51 2 51.49 GTCATTAGAGTATTCAGCGTGCGACGTGTGAAATTAACTAGGCAATGATTGTTTAGGGGCTTTTTTAACAGGGTTCTGGTTTGTATCGCTATTTATTTCAC:1 - chr2R 11247889 3' + 1360 409 1 52.48 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACAT:1 - chrX 11060493 3' - I-element 42 1 64.36 CGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATTTATGAGGAATCTCTGCCGATGGTAAGCCCAAATTAACC:1 - chr2L 2025744 3' + 1360 3314 1 61.39 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAACTTGCTATAGTAGTTTCTTTAAGGACCTCACTGGTTATTTTTCGCCTCGTCTCACATTGCAGCCTCGTTGTTTTGGC:1 + chr2L 9025768 3' - F-element 4462 1 66.34 CGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAGTAGCTGGACGACAAGCTGGAC:1 + chrX 9260693 3' - 3S18 7 2 69.00 TAAGTAACCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAGCCAGCGTCGCTTGGTAAGTATTCGCCTCGCTTATGCAATTACCACAATGC:1 + chr3R 29751874 3' + Ivk 5220 1 57.43 TTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCCGAGCCCGACTCGAGCTCATCGATGTCTATTG:1 - chr2L 11165323 3' + transib2 2803 2 54.17 TAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAGATCAGAATAATTATCAGAATTAAGTTGTGGTTCTTACTAAAACAGGTTCTT:1 + chrX 19876820 3' + Idefix 409 2 73.00 TAGAATAAAAAGATCCGTAACGTCCATACAGCTATCGTACTTTGCCAATTCCTTAAATAATATTTACACAAAAGTACTCCCCTGTGTGTCTCTGGTCTAAT:1 + chrX 287788 3' + 1360 10 2 77.23 ACCGATCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACGCAAGCACTTGGAGGTCGTCATGCCAAGAGCGAATAA:1 + chr2R 22548155 3' + 1360 138 1 61.97 CGAATCGAGCCGTACGATACACGGAAGCGCCCCAAGGCAGGCAGCGGCAGAATTGCACGTGTGCACTTTCCAGGGGCGGTGGCAAATCATAAGGGATTTTG:1 - 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Tabor 17 2 63.37 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTACCATGCTGAGCGCACAC:1 - chr3R 19535676 3' + hobo 2923 1 63.37 CCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCACTCCCCTCATCATCTTCATCATCATCATTTTTAATGTGCAATTCTATTTTGGTCCCTGATATTTTCA:1 - chr2L 7659119 3' + roo 468 1 70.30 TTTTTTTTTTAGTTTTCTTTTGAATTTGCCATGGTGAACGA:1 - chr2L 254369 3' - Doc2-element 217 1 87.80 CTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGTCTAGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAAACGACGCTCCTGAATCGCACCTGA:1 - chr3L 1698643 3' - 1360 95 1 72.28 TTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGCTTTCGAGGGCAGAGAAAGCAGTGAAAGTCCCGACAATGGCGAGGAGAAAATGGC:1 + chr2L 9402599 3' - McClintock 6221 2 67.33 GAGTCGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCTGCTTTCTCAGAGTTTTCAAACATAAAATCGACGCATAATTAATTAAGATTTAACCGTTCAA:1 - chrX 19223287 3' - invader6 4814 2 64.36 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTGTAGC:1 - chrX 3697116 3' + jockey 4964 1 53.47 TGAAATCTGACATCATTTCGAGACCCATTTTAAGCAGCGGCGTCACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTAAGGGATTTATTATCCTTTTTATAGCGTTATA:1 + chr2R 19325322 3' + gypsy4 6384 1 73.27 AAAAGAATATGAAAATGTAAATCTACTGTGGCTCCAATGCATCACGCCATAAAGCCATGGTCGGCACCGTCTTGCGCTTTACCATCGAACCGCC:1 - chr3R 15413313 3' - gtwin 222 2 70.21 TCATAAAATAAAGAGCCATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCTGTCGTTAATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGATTAAGGACAGGGTTGTTAT:1 + chrX 4507432 3' + gypsy3 6719 2 81.19 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGCCGCAACAATTTAAGGGTCAGTTTGGGGCATGTGACAAGCTCCATCAGCATTACAAGAAGTGAAGTCGTCG:1 + chr3R 31293305 3' + hopper 1411 2 73.27 ATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGTTTTGCTGCAACTCAACTATG:1 + chr2R 22774501 3' - BS 32 1 57.43 AAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTTTTGGAAATGGCGAGCTGGATATATACGAAGTATTTTGTGTAGTTAGCA:1 - chr2L 10395174 3' - FB 645 3 60.40 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAA:1 - chrX 2253836 3' - Tirant 24 2 58.82 AAGTTCTTTGGCTTTAAATCTATATTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTTCGTTTAACTGCTATCACTTTCCGTTTTAATATTATTTTAGATTT:1 - chr2L 8110828 3' + 1360 237 1 54.46 CTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCAGCAGCAACATAGCCCACATCGAGCACCACCACCA:1 - chr3R 8367976 3' - P-element 224 1 40.59 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAACAGAAAGTATATCTTATACATATAAATGATGTAAAGAAAACAAAAGTTGCACTTAA:1 - chr3R 25876238 3' - flea 16 2 63.37 CCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGTACCTGACCTCCGCCCTCCACCCCGCTCCACTCATAGTTTTAAGCTTATGCATTAACCATCGCAATCCGA:1 + chr3R 5248093 3' - Rt1b 4701 1 68.00 AGGAAAGTTTCTCTCAACATAAATAACAATCTTCTGCTCCCCGGACTCCCCGGAGCAACCAACAAGGAAGCCCTTCACCCACATTTACAAAAGGAAAGAGA:1 - chr3R 10433435 3' + Gypsy6A_LTR 281 1 78.22 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTAAGTTGAAGAGCTCGCAATTTAATTTCATTGGATCCTGCGC:1 + chr2L 15997476 3' + 412 7507 2 63.64 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGATGATGATGATGACGATGCATTCGAATTTCGAATTGGCCAGGCCAGTTTTACTTT:1 - chr3R 14282737 3' - P-element 22 1 58.42 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTCTTTTCGAATATTTATTTTC:1 - chr3L 9374934 3' + roo 9017 2 81.19 AATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTACAAAAAATAAAAACAACAACAAAAAAGTTTATTATATGACTGCTTGTTGGTTTATGCTAATGCCCTGG:1 - chr3R 6396305 3' - I-element 186 1 57.43 TGTGTGCGTGTTGTTCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAAGGAATAATTTTCACTTTAAGCGGATTTGCCGCCCACGCCCCATGCTCCTTTTCTTGATTTG:1 + chr2R 16400252 3' - 1360 3208 1 68.32 CGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCTCTGAAGTGGATCGTTTTGTGGAGGCTGCCACCAGCATCAACCGTTTTCCAAAGAGGCGGAAACTCTC:1 + chr2L 13307001 3' - opus 7343 2 73.27 CCGATTTTATACGGAGCTCGAAGAAAACACGTCTTCACACGTCAGCGATGTTAATGTTAATTAGACTTAAAGCTTTTGTCTTGATCAACCTCAGACTTGCT:1 - chr3L 4960622 3' - Doc2-element 36 1 79.21 GGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTCCACGTTTGGTTGCCAGGACCCTCTTGCTTTGTGACTTGTATTTTTATTACATTTCCCCC:1 + chr2L 17847956 3' - F-element 4453 1 69.00 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTAAACACCGTCAATATAAAACTTGTATTGTTTTTATGACTTCTTT:1 + chr3R 8185254 3' - Doc 43 1 55.45 AAATGCAAGTATCCATAAAGGCTTAGGAACCCCTATTAAAAAAACGGTAAGCATTGAAGCAAATTTTTGTCATATTCAGAAACTTTGGGAAACCATTCCCC:1 + chr3R 8957025 3' + G4 3542 1 72.28 TTTAAAAATATATTTTTTAAGTGTTTTTGTACTTGGGTGTCATTATTAACTCAATTTGTCAAAAACAAATTTGAATTGAATTTGTAAAGGCATAC:1 + chr2L 15302927 3' + hopper 168 1 53.68 GGATCTTGCAACCATACTTAAAACTCTTTTGTTAAACCCAGCACTTGCAGAACTGACATATGATCCCCCACACCACAGATACATAAATACCAAATATTGCC:1 - 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chr3L 16528981 3' - copia 4871 2 69.31 ACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTGGATTCCGATGCACATTAAGCCTCGCAATGGAAATCAAAGGACAATTGTAA:1 - chr2L 5931706 3' + jockey 4703 1 58.42 TCCAACGTGGAGTTATGCCGTCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATGTGTGGTCCAGTCGAGAGGCGGGATCGATGGGAGCTAATGTCG:1 + chr3L 8740265 3' + G5 4377 1 74.26 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATGTTGATATAATGGTAAGAGATGTAATTTTTATTTTTCTACAGCCCTGATTTTTCGATAC:1 - chrX 2766734 3' - mdg1 11 2 68.32 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACAATCCCCCACTCTTATCACGAA:1 + chr2L 5086718 3' - FB 54 1 77.23 TGGTAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTACAGTGGACGTGGCAAGAATTTTTTTTTTGCAAATCGATGACTATTTACAAGACTAATAAAAATGTGTAAAAA:1 - chr2L 22063437 3' - INE-1 350 1 67.33 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCG:1 + chr2R 8198504 3' - F-element 59 1 77.66 CGAACAACGTACAAAAGGGAGAGTAAACAGAGATACAAAGGGCGAAAAAGCAGGTCCGCCACAGATAGCAGCGGGGGAAATGCATCCTCATGAATTTTTCA:1 - chr2R 5842006 3' - Cr1a 221 1 74.26 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATTCATAAATTTACTAATTTGCGATT:1 - chr3L 21840270 3' - 1360 26 1 54.46 GTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTGTGCTACAGAAGGAATTGCGAATGGCGAAAAAAAGTGAGTAAATAAATAACCGAGAAGGAAAC:1 + chrX 8320921 3' - hobo 111 1 71.29 CGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCGCCGTTGCTTCGTTGGCGATCGCCTTTACTT:1 + chr3L 12647800 3' - hopper 1298 1 69.31 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAATTTGAGCAAACTTATTTGATCTATGTTTGTACACGCATACATGTACATA:1 - chr3L 17858156 3' - HMS-Beagle2 6906 2 56.44 TTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATGCTAAATAATTCCAAACGGAAAATGCGATCCCTGACGATCAAGGGACCACCGCTATCGCCCTGGAAAGGT:1 + chr3L 14520015 3' + FB 742 3 58.42 TTCTTNCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGGCTCCTGGGAGACGTCGTTAAAGGCCCTGGAATTCAGGTTTACATACTGG:1 + chr2R 20791824 3' + roo 9045 1 53.47 GGTATATAGTTTCCAGTGAATCTATCAGGAATCGGGACTGTTAACTTCACCGCGGAGGAATGCGCCGCAGAACCACTATCGGTGCGCTTTAAATTCAAATT:1 - chr2R 7188499 3' - Cr1a 4119 1 53.47 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTATCTGTATAAATAAACTAAAAGAGTGGGCGGCAGTCGATGTATCGCAACAAGACGGGCAGGCTGC:1 - chr3L 8763205 3' - jockey 19 1 65.35 ATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCTGGGTTGCATCTTTCGATGTTGTTTTGCAGTGTGGTAGCCCCACATATCGGATATCCACTGTACCTTTTAACTTAT:1 - chr3R 3843041 3' + Max-element 8534 2 78.22 TTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGGCGGGAATGGGGCGACTATATTTAAGCGTTCTTGAATGTCTGTTA:1 - chr2L 4396642 3' - Doc 4581 1 55.45 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAGGGGTTGCTGAAATTGCTGTGCAACGCAACGTTTGCACCTGTTTAC:1 - chrX 13560713 3' - roo 31 2 58.42 TTGGCAGAGGCCGTTATGAAGCTCTTTCTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTATATTCCATCGGCTCCGTATGTATTGTAATTTGTTCCTTGTCGA:1 + chr3R 31672276 3' + gypsy3 83 2 61.39 TATTATTGTTATTATTATTGTGATAATCGCCGGGCTATAGCTTCGTCAATCAAGTGGCCAGCACGCCGCATGTGCTGTGAGTTCATTTAGAATCTATTCTA:1 - chrX 7688367 3' - mdg1 7060 2 71.29 GTCGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATCCAAGAAGAAGGTAAAGAAGCTTAAAAGGATGAGCCCGAG:1 - chrX 21396299 3' - INE-1 561 1 56.32 AAGGGNGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAGTAGCTG:1 + chrX 9260678 3' - 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Quasimodo 35 2 67.33 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATAGTTCAATAATCTTATAATCTGTATAGTAAAATCTACGAAATAAACGC:1 - chr3R 17468347 3' - Transpac 4945 2 53.47 GAATTGAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGTCTTCAAAGAGATCTCGACCGAGCAACAA:1 - chr2R 8145947 3' - P-element 45 1 34.65 AGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCTGGCCGTGGCAGGGCAGCAAAAAGTGTGACTC:1 - chr3R 10511981 3' + 412 7115 2 68.32 TCAGGCACTTGTTCTGGACGTGCGAGGCAACGCTCGGCCTGGGACCACCTATCCCGACCACTGACTCCACTATCCCTTTCGACCACGCCATGTCCTTGTCG:1 + chr2R 4584523 3' - G-element 3971 1 77.23 TTCACACGTCGGCGATCGAATAAGTTCTAGCAATCTAAATCAAATTCTTTGATCTTAACTTGGCACACCTGTATTATTATGATGATAGCTGTAG:1 - chr3R 13494933 3' - F-element 13 1 63.83 AAATATATGTGGAATCAAATGGTATTAATGTTTTTTTGCGAAACATTTTATGTTGTTTTTATATTTTTGGTTTTGTTCGCATTTCGACGCAGTCCTTATCA:1 - chr3L 12684343 3' + transib4 469 1 72.28 CGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATTCTTTGGCTTAGAGACCGCTGTGTAAC:1 + chr2R 24865881 3' + Doc 476 1 73.27 AGTAAAAACAGGAGACGAGAACGCGTATATATGTACTTAGTTGAAGGAAGGGTGGGGGCAACACTCCTCTTGGTTTTATTGTCTGCTTCTTATGGCCATTT:1 + chr2R 9513902 3' - 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chrX 8233692 3' + X-element 4681 1 62.38 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGTGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTG:1 - chr3L 17624169 3' + roo 388 2 53.57 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAACCTAACAAGAATCGAAACCTAAATAA:1 + chr3L 22564895 3' + blood 7364 2 53.47 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCGCCTCGAATCGAGGTTATTTACTGGGA:1 + chr2L 6644328 3' - hobo 42 1 68.75 ACAGGGCGTCTCGTTCCCAACCACAAGCATTTGAAATGCGAAAATATTTTTGCATCGCGCATATAAG:1 + chr3R 5809061 3' - 3S18 2 2 74.63 CGACTTAGCTCTTCGGAGGTTGAAGGGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAGTTTCGAACGCCG:1 + chr2L 5152027 3' - I-element 12 1 66.34 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACAAATACACACAGCCGTGCATACGTTTAAATATATA:1 - chrX 9950829 3' - hobo 37 1 65.35 TTTTTTTTTTGTAGTTGCACTCGAGCTGAAGAGTTCGCGAAAAATGGGAGGTTCAGCCTGCGTGTGTTAGAAGAAAACGTTCCGAATTGCAGCCTTATAT:1 - chr2R 17877795 3' - G3 4584 1 62.00 CTGACGTTTGTCGTGACTCTTTTTAGCATGGCAGGTGATTTGAGCCAGTAATTAGCCAGGACTCCAAACGGCGCCTTTCGCACCGGAACTACCAGGATACC:1 - chr2R 15805203 3' - mariner2 711 1 63.37 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAACAGAGCAGTGCC:1 - chrX 2253824 3' - Tirant 23 2 56.25 CTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAATGGTTTCGCTTAATTCGCGAATATGCTGCATGTTT:1 + chr3R 12954602 3' + F-element 461 1 65.35 AAAATCTGACCACCCATCCAAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGGATAAGCCGCTGCCGAATGCTAAACCCACGATTAAGACATCCATTT:1 - chr3R 19247589 3' + Doc 4479 1 60.40 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGTGGTAGAAATATGACATTAGTCATTTGGCAGCTTCTTCGATTAATTAACATCG:1 + chrX 18871388 3' + 1360 3369 1 56.00 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCCTATATTGGTTTATTACATCTATTTTGCCATTGGTAGCACGATCCCATGGAGCTAAGCAGCGCAAAGAAGA:1 + chr3R 9996461 3' + blood 7363 2 52.48 CATGCCAAGACGATGTCCAGCTGTCATTACCAGCATAGGTCACTGAGACAACTTTTAGATTCACTTTATCCCTCCCTCCCAAAAATATTCTATTTGTTTGG:1 - chrX 19695198 3' + Tc1 1297 1 62.38 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGGGCATTGTTGCTCTTTTTTCGCTTTTGATTGGTTTGACCGATTTACAT:1 - chrX 9653274 3' + roo 9043 1 52.48 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTA:1 + chr2R 6493192 3' + transib2 2808 1 69.31 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCGCAGTTCCACTCTTTTTCGCCCTTTGTCG:1 + chr3L 18627627 3' - FB 49 1 70.30 AAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGT:1 - chr3R 15095980 3' + Doc 4599 1 78.22 CGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGATTGGGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACACGGAATGTTTTAAATACTTCGAAGCACGCCATCCCTGATC:1 - chrX 6849533 3' - 1360 3275 1 57.43 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCTGTACACTATAAATCCAAAATTCAGCTTGGATCCTGACTGCTCT:1 + chr3R 16554872 3' - roo 8696 2 60.40 CGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGTACGTAATAATGCGTAAGGAGCCGTGCTGCAGTTGCCACCAATAAAATGCAATAATTGTGGCAAATGTTAT:1 + chr3R 7006965 3' - 412 213 2 74.26 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTGCATAGAAA:1 - chrX 17479565 3' - I-element 38 1 57.73 AACCGAAAGAAATCTTCGAGCTGGTGCGGAGGAATATGGAGAACGCTCCAGTCCGGCGGTCGCTCTAGTTTATGAGTTTGAAAATAATTAAGTGTGCAAAT:1 + chrX 17351378 3' + Osvaldo 1199 1 61.39 GCAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAACGCAAAATACTTTGTATTTTTGTTTAAACTACTGCCGAAAACAGTTTCGCTCGCTTGGCTAAAT:1 - chr2L 20838712 3' - Cr1a 211 1 70.30 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAA:1 + chr3L 22052848 3' - mdg1 20 2 59.41 ACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGTCCCCGCCCTTTCACCCTCGACTTTTCCACGCGAAACACCC:1 - chrX 2285673 3' + GATE 8209 1 59.00 TTGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGCAAACGCATGTTACATTCTTTTCAACGAATCTAGTATACCCCTTTAC:1 - chr2R 4618504 3' - INE-1 98 1 87.13 ACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCACGCAGACGGATTGGAAGAATGAGCTGATGGGGATTGAGTACGTTATGATCAAACAATTGGAT:1 + chr2L 4393217 3' + F-element 4466 1 66.00 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTCAACTGCAAAGACTAAATTTAGAAGCACTGTGGATTCCAGAAAAAATATAAAAAAACCAATGCAAA:1 - chrX 21657137 3' + 412 7536 2 68.32 ACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACACGCAGCAGCTCGAATAACAAGAAAAGCAGCCAGCCAACAGGCGAAGTTC:1 - chr2L 13286319 3' + F-element 245 1 60.40 TGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTCTGTCGCGGATCCTGTAGCTCGGTGG:1 + chr2L 2811466 3' - R1A1-element 403 1 76.84 AAAAGNAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATAACTACTATCTTGGGCAATTATAGCTTCTCGGAAACATCATTCAGATTCAATCCCAA:1 - chr2L 22689945 3' + Tabor 7303 2 58.42 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAA:1 + chr3R 12578162 3' - jockey 59 1 77.00 GCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATCCTGTTTTCTTAGAAAACCATCGATATTTGGCACTATCGATAGTTTTTCAGCTCTACAACCGACCGCTGCCG:1 + chr2R 6494382 3' - G4 28 1 69.31 TTTGTTTTTATAATTTAGGTACATGTCTAAAGATTTTATTTATATTTTTTTGAAGCTGCGGGAAAGATTGCGTCTTTGAAAAAGAACAGGACTTTCCCATT:1 + chr2R 7393814 3' - mariner2 820 1 54.46 TTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAATTCCAACATGGATTTCTACCGACAAAATGTTTTCGTGCCGCTTATTTAGATAAAGAGCGCGCTT:1 + chr2L 5874193 3' + Doc3-element 4687 1 72.28 CCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGGTAATTCATAGGGTGTAATTCATAATTGA:1 - chr3R 5183744 3' - R1A1-element 353 1 71.29 AAATTTGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGAACAGTTGGCAACCGAGTAGCGGG:1 + chr3L 14363402 3' + Bari1 337 1 74.26 CATGTTAATTTCAACGTCGAGATCGTTTGGTGCGGTTTGGTCGTCGGAAAACCACAGAAAGAGAAAGAAGAAAAGAACCCAAAGAAACTGTGCAGCATAGA:1 - chrX 6703794 3' - accord 231 2 80.20 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTACAGAGCGTTGGCAATTCGCGATAAAAACAATTATTTTGTATATTTT:1 - chrX 3485635 3' + P-element 2860 1 52.48 TATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAAAATAAAACAGACACACAAATACTGGTTGCTGCTGCTGCTGGCC:1 + chrX 9992454 3' + Stalker4 49 4 58.42 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGACGGCATAGGGAGAGACCACAAACAACAAGTGGAACAAAGAG:1 - chrX 697442 3' - roo 8693 2 55.45 GTATGACAATAAGTACATTTTATAATTAATCTTATATTAACAGAGGCAGTAGTAAGTAGTACGAGGTAGACAATCAATAATTACCTGTATAGTGAGTACTT:1 + chr2R 6627727 3' - G4 3808 1 52.48 TTCTCACTCCCGAACTCCTTCTGGTACCGCTCCGACGCACTATCTCCATTCCACTGAAATACCAGAGAGAAGCGTGGCACTTCTGCCTGGTTGCCATCA:1 - 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chr4 736761 3' + baggins 5325 1 66.34 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTTAATTAGCCTACAATGCTAGAGGTCCACGTTACACTATTGGGGCAGTTACTTGTGAC:1 + chr2R 8557913 3' + hobo 2919 1 59.41 CAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGGGAAGCTCGTGTATCTTCGAATCTGAAAACCCCATGAGGAATTCGTTCTCCACTCCTCTGGC:1 + chr3L 3678327 3' + G2 166 1 67.33 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGNNNNAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGT:1 + chr2L 6177232 3' + pogo 2062 1 64.36 ACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACCTAATTAAATATTTTCGTTT:1 - chr3L 22054966 3' + mdg1 11 2 72.28 GGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTCCAATGTGGATGGGTGCAGGAATATCTTGAATCGCCGTTAATGCTGCAAGATTACAAATTCA:1 - chrX 676776 3' - G6 1965 1 69.31 TAGATACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATGGGTGAGTAGTGTATTCGAAAACCGGAGTGATCCACCGATTCCTTTCCATCGGGATTATCGTAG:1 + chr3L 16089136 3' - Doc2-element 4452 1 71.00 GCCCATAACCTGTTGTAATTTTGGGCCTAGTAATAGTTTTATTTCAAGGATGTAGATGTAGATGTATCCCTTGGATTTCACTTAAGATTAGCCAAGACTGG:1 - 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chr3R 27514073 3' - R1A1-element 5057 1 74.26 TCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTGTGGCCGGCGTGGAGTTGCCTCTAGTCTCGAGCA:1 - chr2R 5321983 3' - 1360 18 1 57.43 TTACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTAAAGCACTGCCTCTAGTGGCTGGGGTCAATGTTTTCACACTCTTGCTATCAGCCTGA:1 - chrX 22796159 3' + INE-1 540 1 55.45 TGCATNTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAAGAGAAAGGATTCGCTGTCATCTGTCTATAAATTTAAAGTCATATCAAGGGGGCTGATACGAAAGTTCTCTACT:1 - chr2R 23569615 3' - accord 186 2 47.52 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGCGTTAAGATCGATTGTTTGGCCTTCAGCATACCGAAG:1 + chrX 3130934 3' - jockey 4797 1 66.00 CAAGCACACACACACACACACACACATAGACACACACGGGCACAAAGAACGTAACGAAAAACGTAAAATATTCCT:1 - chr2R 15582602 3' + accord 180 2 92.00 TTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCAACAGCCGGCGGCCAAAAAATTGACTCGATTATATT:1 - chrX 8635469 3' - 1360 117 1 76.24 CCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACAAAATAAAAACAAAAAATTAATGAAAACTTAAAAATTCAACTCCTTTCACTATAAAG:1 - chr2L 21559095 3' + FB 721 2 64.36 AGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTAT:1 + chr2R 5173187 3' + Stalker 7209 4 73.27 AACAGGAGGATGTCTATGTCGTGAAGCTCTAAAAGCGTATATTCGAGTGCTAACGTGAAAAGCGCCTCCTATGGTGATGGGGACAGTGGGCTATCGAACC:1 - chr3L 273190 3' - G5A 98 1 74.00 GTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGACCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACAAAAGACGAGTTTCGTTCGCGCGGGGATT:1 - chr3L 3857615 3' + 1360 3162 1 76.60 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTC:1 + chr3L 25804311 3' + 1360 3334 1 73.27 TGTAAGTTATCACTTCGAACGTACTACGGTGCGCCGGTGATGGTTCTCAGGATTTCCCTTCGTGTTCGCTGGATGTTTTGCTTCTTTTCCATTCGCTTCTG:1 - chrX 11243407 3' - Fw2 3654 1 54.46 GCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCACGTGTCCAGGGAAAGCGGAGAAT:1 - chr2R 9686533 3' + Stalker 220 4 75.25 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAACAAATCACAAAGTTTGAGGGCA:1 + chr2R 16895904 3' + I-element 5305 1 76.24 AGGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTTTAGGTAACGGGTATAAAAAGGCTATATGATTACCAAGGGAATT:1 - chr3R 4545021 3' - INE-1 31 1 68.32 GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAA:1 + chr2L 3244990 3' - rover 45 2 79.21 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAACTGCGGGCGCAAAACATGTGACGAAAGCAGTCGCCGGATTCGAG:1 - chr3L 18627580 3' - FB 33 1 57.43 AAAAANAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGCTCAAGTTGGATCTACCTGGAGTAGCTTCAATTAGTGGCAAAAGCAAGATATTTTTCAATTAGCCG:1 + chr3R 16531297 3' + hopper 1407 2 70.30 AGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATGTTTTCCAGGGGTGGCGAGGACTTTTCCAGAGGCGGAGAATAGCTGCTCGA:1 + chr3R 30626120 3' - X-element 4608 1 56.44 TCCACCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAAAGGGTCAAACTGCTTACTGTGAACTGTTAATTTTAATCGTGTGCTTTGTATGTGT:1 + chr3R 19757146 3' + Quasimodo 7025 2 73.27 AAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTGTTCGTCCTTCCTTCTGCGGTTTCGTCCTTTCTTTATTGTCCTGCGATTTCTCACTGCC:2 - chr3R 2533710 3' - roo 9053 2 67.33 ACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTAACCATTATGTGGCATGAATTTGCCATTTTCATTTAAATGCTGCTCTTG:1 + chr3R 6599741 3' + hopper2 1312 1 56.44 ATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATA:1 - chrY 680457 3' - invader2 2 2 66.33 GGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCTAGGTGTTGCCTCGGTTGGTGCCACTATGGTGGACGACTTTGGGGATTCCTCTAGCTTCACT:1 + chr3L 11959659 3' - I-element 180 1 67.33 AAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGATAATGTAGTAAAATACGAAA:1 - chr2L 6450237 3' - I-element 268 1 79.21 AGAAGTTTAGCCGACTGATCAAGTCGAGAATATCAATTTCACCACGAATAAGCTTATATATAAGATGAATGTTGTACAGGAAAAAAGAGGACTAAAACTAA:1 + chr3L 851049 3' - Cr1a 4085 1 61.39 AAGTGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGATGAGAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAGAATGCAGTTGAAGGACCCATAGACGCC:1 - chr2R 8006167 3' + Dm88 309 1 75.25 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTAATTTGACAGACATCTGAGAGT:1 - chr2R 19232866 3' - Burdock 50 2 77.23 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGTTTAATGGCTTGTCGATACGCTCAAGTGGTGATTGCCA:1 - chr2R 14582836 3' + roo 392 2 55.00 CGAGTTACCCGACTATCAGATACCGTTGCACCCAAGACCAGCAGCACCAAGGAGGTGCAGTGCCAGCACTCCGGCGCCCTGGATGAGCCCCATGTCGAGGA:1 + chr2R 19342163 3' - INE-1 559 1 77.23 CAATAACAAGTGCAGTGACCTCCCTAGAAACTGTCACTGCTACCACAACAACAACTTCGCTAAATGTGAAGCAACAATTTGGTCCCGCGGTTCCTTGCAGT:1 + chr2L 11006309 3' + Doc 499 1 58.42 ACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACATCAGCAGTAGTAAATCCCCGACAGCCACACCATCTCATCCGCCCTTTCAGAAATCCAAAGAGTA:1 + chr2L 11247071 3' + F-element 402 1 65.93 CATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAAAAGAAGTCGAGGGCTGCGGCACTTACCGAACAATAAACATTCATTTTACTATGCAGCTGACA:1 - chr3R 23444731 3' + I-element 305 1 51.49 TTGATGTGTGGATTGGGTGTGCGTAGACGGATGAAATAATAACGGCTAGGGATAAAGAGAAAGCAGCTATGCAGACGGATATGAGTCTGGATATACATATG:1 + chr2L 2926521 3' - Ivk 5059 1 69.31 CACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTTTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATATCGTTCCTTTGTGTGTATTGACTGGGCCC:1 + chrX 20072347 3' + rover 64 2 79.21 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGA:1 + chr2L 3621140 3' + 297 352 2 69.31 GAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTACGGATGTATGGCCTGTCGCATAATCAGCTCCTGATGCTGTGGACCCTGGATCAATACCGGTTGCTGCTGGACA:1 + chr3L 6750440 3' - gypsy7 287 1 78.22 ATTTCGAGACCCATTTTAAGCAGCGGCGTCACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATATAGCCAAGTTATCAGCGTGCAAGAGCGATGAGGAGCGC:1 + chr2R 11405793 3' + gypsy4 6398 1 61.39 CAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGAACACTGAGTGCCTTCATCCATGTATTAGTGTGTATCTATGTGCGCGTCTCTATTTGTTTGTTTGTCTGTGTCTCG:1 - chr3L 3437683 3' - Rt1b 4882 1 72.28 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTATGTCAACTGACTTTTGGATTTAAGTGGTGTCAAAAAGTATGCTACCATAGATAGCGGTCATTTATTGCAT:1 - chr3R 31270929 3' - jockey 13 1 40.00 CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAGCTAGATAATACAAATTCTTATAGGGATTTATATTAGTATAAACTACCTTGCA:1 + chrX 17608006 3' - roo 82 2 56.44 TGTCATTTGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTAATTGTCTTTCAGTCAGTCGCTTCATTCGCTTCATGCGGTTCAACCTTCATTAGGGCAGCAATTAATTGTA:1 + chr3L 22360619 3' + 1360 408 1 68.32 GTTTGGTTCAAAACACTTGCTTGCTGTCTTGGCCAAACAGCTATTCAGTTCTTTTCTGATCAGGGATTGTTCAAGCAAAGCTACAAAAAGTT:1 - chr2R 17196103 3' + R2-element 3362 1 69.57 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTGAGGATTAGGCTG:1 - chr2L 6656245 3' - P-element 3 2 74.26 CAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCTGGGTTGCATCTTTCGATGTTGTTTTGCAGTGTGGTAGCCCCACATATCGGATATC:1 - chr3R 3843061 3' + Max-element 8514 2 58.42 CTACAGAGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATCCTAGTGCGTAGTGCGTGTGAGCAAA:1 + chr4 710782 3' + 1360 129 1 74.26 AAAAAAAAAAAGAAAAAAATGGAAAAAATATTGCAATTTT:1 + chrX 12121459 3' - hopper 141 1 72.50 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTGAAT:1 - chrX 17479570 3' - I-element 47 1 64.36 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTCCGTGTGCCTTAACATGTCTTGATTGCCAAAAACTAAGCGTTATATACCAAATATT:1 + chr2R 11129358 3' - hopper 16 1 63.37 CATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGCGTTGGAGCGCACACAATCACTTCAGCCAGCTTCGTGTTAGCTTGAGCTTGTTTTGCTTTCAGACATTTCCTTCT:1 - chrX 1701835 3' - G2 336 1 76.24 TATCGGGATCCCTGCGGCCTCTAAAGGGTCAGCGCAAGCACGGATGAGGGTCATTCAGTCAGCCAGCCAGATCGCGGTGGTGTTGGTGGCGGTGACTGCG:1 + chr3R 3382113 3' + gypsy8 325 1 79.00 AAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAAGTGGGAGAAAACAATTTGCGTGGCGTAAATGTTCTTTTAGTAATTCTTCGTCGTCTTTTTCTCC:1 - chrX 8516419 3' + accord 7214 2 68.32 TATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATTATACTTATACCCCCAATACGATTATGATTAAT:1 - chr3R 9983171 3' + gypsy4 6452 1 67.33 ATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAATGTACAAATCATTAAGAGCTGCTTCGCTCGAAATGTGCCAACTTTCTTTCACTTTCACTTGCCAATT:1 + chr3L 9162355 3' + invader4 446 1 72.28 CACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCCAGCCTGGGG:1 - chr2L 5932084 3' - jockey 14 1 69.31 GCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTTGCTAAAAACTAAGCTGTGCAGCACGTTTCTCTGACGTCTTTGGCATCGATGTGTTATGTAAAAGCGGTGCACA:1 - chr2L 10093898 3' + F-element 408 1 68.32 CTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAACTGACGACGTTCAATCTGCATT:1 + chr2R 11488356 3' - Burdock 314 1 73.81 TTGTANGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCCCAAGAAGAGTTATTACATTTTAGCTTTTCCTCGGCTC:1 - chr2L 12991404 3' - hobo 30 1 59.78 TTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGCTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCTTTTG:1 - chr2L 306464 3' - Tirant 8109 2 72.94 ACAGGNCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACTAACAATGCACCACTATGTATCCATATATATGTACATATATAGTTTAATTATTTGCGAATAGCTCACTTTA:1 + chr3R 11731273 3' + hopper 1414 2 78.22 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCTTTCTGGCTTTTTGGCATCCTGTTACCGTTACCATTTCGTTTCAGCTG:1 - chr3L 14947747 3' + jockey 4914 1 52.48 AGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACAAGGGTCAGAAGAAGGAAACCCCTTAAAAACTGGTTTAACTGCAGCTACAGAATTGC:1 - chr2L 6088125 3' + jockey 4691 1 59.41 AAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACACACACACACGGCGGTGGAGCAAGTGGG:1 - chr3L 5800823 3' + Doc 4279 1 73.27 CCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACTATCTTGGGCGCAGGCTCTCCG:1 - chr2R 20642431 3' + flea 34 2 77.55 GGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCCCATCCGAACAGGTTTGCGGGAGCTTCGACTTTCCGGATTTGCCA:1 - chr3L 2960436 3' + Fw2 3697 1 73.74 AAGACCACATATACTTACACACACACACACATGCATAACCACATAAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTGATTCGAATGGGTAAGTGCTTAC:1 + chr3R 28376100 3' + Quasimodo 23 2 77.23 GAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAGACACAAAGACAAAAAAAACACAAAACTAACAGCCCTCGAAGTAACCACTTGATCACTGAGCTCATTTTCAG:1 + chr3R 5081605 3' - Cr1a 220 1 58.42 GTGCTGAACCAGCATTGGTCCGCGCTCCTTAGTCCTTGGACCCTGATTCTTGATACCCCCCGATTCGCTGCTCTCTGCCATAATTCCAGCTGCCCTCGCTG:1 + chr2R 13327744 3' + Gypsy6A_LTR 60 1 83.17 CTGCGCACGGGTTTCCAGCACACTGGAAGGCTGGAAGGTCGGCAGGGCTGGAAGGGTGTGCGCAGGAACA:1 - chr2R 22874691 3' - Gypsy6A_LTR 75 1 75.71 ATCTCTCTTCAAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATGGACTATAAGGGAAGCCCTAGCGCTGATCTGA:1 + chr2R 22698465 3' + Ivk 13 1 66.34 CCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTATCACATCTCCTTGCTGGTGGCGATTGTTCTCAT:1 + chr3L 22548822 3' + HMS-Beagle2 69 2 66.34 GTAAANTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTGGCGTATATTGCATTTTTG:1 + chrX 5726806 3' + roo 402 1 72.28 CACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCTTGATTGTTTTTTTTTTTGGTTTTGAATAGCGCTCTCTTTTCGA:1 + chrX 15367613 3' - Transpac 4810 1 56.44 AATCTACAAGTTACAGTTTCTTCTGCATCGTAGAATTACCGTAGAAGAACCACACACGCACACACAAACGGCCAGTTGGTCGATTCGCTTTTAGCTTTCAG:1 - chr3R 21660664 3' + Fw3 381 1 55.45 TAAAATTAAAAAACAAAAACAAAAACTGAGTAGGGAACGATTCTCAGGGGCAGAGCAAACAGCCACAAAAGATGAAGCAGAACGCGATAAGGCAGCACGTA:1 + chr3R 8927493 3' + P-element 2646 2 63.37 AGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTAATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATACGTATGCTCGTGCATTGTAAAATAAAGGTAAAAACGTTGCGCA:1 + chr2L 22579276 3' + 1360 133 1 73.74 CTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAGCTGTTCAAGCCGTATCTGCTCCTTCATATAACGTGCATCCCTACA:1 + chr2L 18685620 3' + Doc 298 1 54.46 GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGGAGGAGGAAAGGCTGTGGAACGCCGGAGTTACCCGAACGTGAACTTCAGC:1 - chrX 8597697 3' + invader4 3082 2 64.04 TCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGCCAGATGAACACGCCACGCCACAGTTGCGCAATGAGATCGAGGAGCATTGGCGAATGATCTTC:1 + chr3L 16851400 3' + INE-1 88 1 63.37 TTCGTATTCATGTGTGAACACTGTGGGAGAAACCAAATTTTCCCTATTTAGTGCGGATTTCACTGCTAACATATAGCAATCACCGAGCAGTTTCTCGTCGG:1 + chr2R 23343852 3' - roo 8663 1 76.24 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTG:1 - chr2R 25203769 3' + 1360 3358 1 53.47 CTTCTTATTGGGGATTTTACAAATGGTGTAAAAAGGAGCTGGGTGTGGGGCTGCTCGGCGGGCATGAAAAAGTGGGTGCTCCTTCGAGTTGAAACGCATTT:1 + chrX 5113582 3' + roo 409 1 79.21 CCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGTGAACTGTGACAAACAACAATTCCAAATTCGCCTGTCTCCAAAGACAATAAATAAGTGTTCT:1 - chr3R 12367832 3' + gypsy4 424 2 55.45 GTTCCATGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGCCACCAAGGCGATGCAGGACGAGGAGGGCT:1 - chr3R 12208755 3' - Cr1a 4017 1 70.30 CAAGATCCGTAACGCCATACGATTTTCTTGCACACGGTTTTTTTCGGGCTGGTCGTACTGTTTATGTATATATTTTATCTTTTGTCGATCTGTGCTGGTAA:1 - chr2L 4114380 3' + 1360 18 1 64.36 ATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAATATTGTTGTCAGGTTATAAAACCTGAGGTTATAAAACCTGTATTATTTCAAAAGGCCCCTTGAATTTT:1 - chr3L 28046553 3' + Cr1a 435 1 55.45 ATGACGAGGCAGAGCGGGCTGTCCCTCTCCAGTGGTTGTTGTTGTCACAGTACTAGTCACCGTAGGTAGCATAGTTGTCGGCGAACTTTTTTACATCCAA:1 - chr2R 2510269 3' - F-element 447 1 68.00 CATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCTCTTACTTACCCCTGATTTTC:1 + chr2L 4073226 3' - roo 8983 2 79.21 ATCTCCCTCCGTAGGCTGAAGAGGGTACACCCCACCGATCTCTACACCGGTGAGAGTTGCCAACCCGATTTACACGCCGGCTTATTCGATACTAATTGAGT:1 + chr2L 10247139 3' + G5 4624 1 64.36 GTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAACAGGCATAGACCGTGCAATAGTGTGTATGCAAATTTCTTGTGTTCGGACTAAATGCCG:1 - chr2R 5269235 3' - Gypsy6A_LTR 375 1 62.38 AACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAATAAAAAACTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAACAATTTCACGCCAAGAGATTTTTCG:1 + chr3R 24013884 3' - Tc1 1504 1 75.25 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTCAAAGTAATATAGAAAACCACTTTATTAAGGCACATTTCTCTCAAAAACTACATT:1 - chr2L 5611367 3' - pogo 19 1 56.44 GGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTTGCATTTTCTGGCGCTGCATTTTGGCCGAATGCAGCTGCCTTTTTGGCTCTTTGCCGTTTTTTGGCATCTCC:1 + chr3R 8698242 3' - invader2 349 1 78.22 GTGAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAACATAATAGGCAGCAATTCAACAAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACATTGAGGAGAAGGAAAATGGC:1 - chr3L 7849126 3' - HB 1477 1 57.00 ATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTTTCATAATAAATTAAATCCCTTAAAATCCCAATACATACACATATATGAAACCATTTCCCCAT:1 + chr4 734681 3' + Stalker 43 4 56.44 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATAACACGAGCCGTAACGACGAGCACGCCAA:1 + chr2L 10635342 3' - roo 5 2 75.25 TCCTTATATATTAAATTAAGCATAGTTTTAAGATAATAAAAGTGTTGAGTTGAGCTGCGGAAACTTGTGTCTCTGTGTGGGTTTCTGGTATGTAAATGTGG:1 - chr3R 26128555 3' + Transib5 426 1 68.32 CCAATNTCGTTCAATTTGCTGTCAGATCTTCAATGGCAGCCTGGTCATCACAATCCGCAACAAGGTGAACGA:1 - chr2L 19067227 3' + GATE 395 1 76.39 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCT:2 - chrX 1399878 3' + P-element 2838 1 30.69 TGGTGTGAGAAATGATTTGTGCCAACTTGTGCCAAAAACTATTGTAATAACTGATGTGTTTACTCAAAACAGTAAATAAGTATTTAAGTCATGGGAATAAA:1 + chr2L 7005335 3' + transib3 408 1 76.24 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCAAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGCAAAAGACCCAAAAGGTAAAAGC:1 + chr3R 12578210 3' - jockey 11 1 68.32 AAGTTTTTTATTTTATTTTTTTTTTAGTAATCGAAGCTAGTTTCGTTCTTGTTCGACGTGTGAAATGACCAACATCAAAGCCACACAAACTAAACAAAATT:1 + chr2L 7610826 3' - HMS-Beagle2 490 1 80.20 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAAT:1 - chrX 2253851 3' - Tirant 55 2 78.22 GCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTTAAATAAAGCTTGCTAGGAGGAGGGTAGGAGGAGTTGGATTCTCGTAAGTGCCA:1 + chr2R 8814929 3' - F-element 4439 1 46.53 CCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATACAGTCACATATTTGTCCTGCAAACTGCGGTCCGTGCTCAGAGGAATGATGGCCGAGGTGAAGGAATCCTGC:1 - chr3R 31589162 3' + Dm88 4502 2 71.29 TGCCTAACTTGGCCTGCGGATTTTCTTGCCTCAGTGAAACGCCTGGTTGCTTGTTTTTTTGGCCTGCAGTGGCTCCAATTCTGGCTGCTGTCCCTCCTCTT:1 - chr3L 15621188 3' - gypsy6 7346 1 59.41 TGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCACTCGAACTAATTGAGTAACGGGTATCGTGGAAATCGAAATCGTGGAAATATTTTTTTGGGGAGTCT:1 - chr3L 20659409 3' - X-element 4270 1 68.32 TGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTGGATAAAGGTTCTTATGCATTTTTGTAGTCTTTAAT:1 - chr2R 19211031 3' - Doc 4477 1 64.36 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCA:1 - chr2L 5932104 3' - jockey 34 1 49.50 AGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGATTTGACATCCCAAATACCATATAATACACACGAGTCAGATTCTCTTTTCGTTTTTGAA:1 + chr2L 18859997 3' + jockey 4691 1 64.36 AAATAGATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGCGCTGGCATAGTTGCTATCAAATTTCATGATCACTGCCAATCATTTAATTGC:1 - chrX 2090201 3' - roo 6 2 69.31 AAGTAACGGGACTTAAAATTGTCACAGACATGTGCCGCCAGCACCCGAAAAAAAAAAACACCATACCCCTATTTATTAATATCGATTGATGACCAAAGTCG:1 + chr2R 10338444 3' - G6 61 1 59.41 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAAAGCAGCAAGGACAACAAAAGTGTGCCTTCCTGGTCCGCGCCATTTCTAACACACCCATTAA:1 - chr3R 32041990 3' + hopper 1404 2 68.32 ACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACATCACAATAATTGGTTTTGAAATAT:1 - chr3R 26234339 3' + 1360 3145 1 77.23 ATATCACGTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAGTTTGATGGGCCGTTGATATTTCATAAGAAGTATTTACGCATTTTGCGTCTTAATAAGCGA:1 - chr2R 5343356 3' - I-element 5011 1 66.67 AAACACGCAATGTGCTTATGGTGCTATTAGTGCTTTTATTAGTCGTTAAGTACAGTCACATCTGAATCATTGTCTTTTAATGTCATAACTAACAAAGAATT:1 - chr2R 4719343 3' + Tc1 1621 1 79.21 GAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTCTTTTTTCTTCTTAGCCTTGCATATACACATACATAAATCAAAGTAGTTGCTGGTCCTATGT:1 - chr2R 8256731 3' + Doc 4304 1 66.34 CAAATCCTCCTCGCTGGCCGTCTAAACTAACAAGTATGCGCTCTCTCCACCTCCAATCTGCGCCATCCCAGCCCCTATGATTTGGCTGAAGCGGCTCC:1 - chr2R 12032958 3' - aurora-element 215 1 78.57 GACACCACATTCTTTTCGCTCAGACGGGGCAACGCATACAATTCCATGTGCATCCCGTTTGCAGTCTCAGTTGGACCAGGAATGGTCACAAGGTAGGCCCT:1 - chr3L 20347604 3' + ZAM 152 2 57.43 TCTTGATTAGGTTCAATAGCCGAGTCTATCTAGCCATGTCCGTCTTTTGTTCCCATGACAAACCCTTGCCCCGACGATACCAC:1 - chr3L 4169518 3' + INE-1 88 1 51.81 AGTTCTATAATTAGCTTTGCACTTATAATTTGTTTGTCACAGTTCGCTTCCTTCTTGATACATAGTTTTCAACATTCTTCATTGCGCTCATCTTCCCGCTT:1 + chr2R 1248176 3' - gypsy4 387 1 56.44 AACTTATAAGATAAGTACGAAATCTCCATACCCTTTAATTGCCGGCATATTCCGTTTCTATGGCCACTCGATCGCGTAAGAAGTTGGCAAACTTGTCC:1 + chr3L 4338111 3' + GATE 327 1 64.29 TCCTTAAAAACAAAAGTTAAGTTCGAACTTTAAGGCACTTAAAAACGACGGGTGCCCAATAATAATTT:1 - chr2L 5348986 3' + pogo 2028 1 88.24 CAATTNTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGCCACAAGTCCAAGTCCAATGCTAGACACGGAAAAGGAAAAGCGCACGCG:1 - chr2L 11385125 3' + transib2 2798 1 53.47 GCCATCTTGCGGCCAGCTACAAATTGGGTCCTTTTAATTGCAACCAGATCGACTGGCGTTGTCATTTGTGAGGGATCAGCATTAACCGCTACTAGCT:1 + chr4 550790 3' - flea 4541 1 51.55 GACTACTAATATGTTGGAGGTTCTGCAGCGACAGCTCGTGCAAGAACGGCAAGCTTAGTTGATCCTGAACTCCCATTTAATGGCTC:1 + chr3L 21470279 3' - gypsy4 6362 1 74.42 CAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGCGTAGCGTGAACTTTTCTAATTGTAAAATTGGGCCGAGTAAATTTCTCGGCTACAGTGCTC:1 + chrX 14522271 3' + jockey 4707 1 64.36 CAATGNATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACATTTTACAATATGTTTAGA:1 + chr3L 21840354 3' + 1360 3368 1 56.44 CTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCGGTACCACGACAGGATAGAGCGCCACAGAAGTGGAACTGCCACCGGATGAGATCGTGCAGGCTGGAAA:1 + chr2R 22392587 3' + BS3 1452 1 62.38 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGGCTTCTTTTCGGTGCCAGCTGTCTGTAATTATGTGCGCATAAGC:1 - chr3R 22831012 3' - mdg1 32 2 53.47 TGGAGACCGTAGATTGGGTTGGCGGTATGCCACCACTGCCGCCATCGCAGGTCTCCAGCTTCATGACGCCCAACAGTATGCCACCAATGCCGCCAGCTCGG:1 - chr2R 18046765 3' - jockey 492 1 67.33 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATAAGACTCAAATCAATTTAATATCGAAACTACGAGTACTTACATATACATGT:1 + chr3R 12787928 3' + flea 4994 2 50.50 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTGCCGCATTTAATTTTTAAATGAGGGACT:1 + chr2L 2645253 3' + mdg1 7411 2 72.28 CACTGTTGTCCAGGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAAGGTGGTTGTCCAGCGTACGGGGCTTTTCCTCCGGCAGTCCAAATATTTGTGCTTCAATTTAAATT:1 - chr2R 20203787 3' - G-element 4132 1 56.44 TACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACACACAGCGAGTGTCCCCACAGACGAGTTACCAACATAAAAAGTGGCGACACACATACACGG:1 - chr2R 23120234 3' + F-element 4241 1 65.35 GTCCANGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTCCAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 7 1 58.42 CTATCGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTGCCATCCCCACTCACACGCCCTACAACCACACAACTCATTTGCCAGGAGAAACAATTACCTGCAGTGCATACCT:1 - chr3R 25946761 3' + INE-1 314 1 51.49 TGAACGTCGAGATCTCAGGAACGTCGTGGCAGATCACCGGAACCCACTTCTCATCAGTGAAAATGACAGGTGGACCACCACGCTCTTGGTGAGATCCGCTT:1 - chr3L 12472023 3' + INE-1 140 1 44.55 ATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCTTCAAAGCTATGAAGTCTTTCGCAAACTTTCCTCATACTTTGTATAAGCGCATTACCCTTTGTTAA:1 - chr3R 19448374 3' + roo 98 2 80.20 GGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCAAAACTTTGTCGATCCGTTCTTGGGAAACTGTCAACGAT:1 - chr2R 10697007 3' - 297 6581 1 67.33 AAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGCCCAGTATTACAACAAAATCAAGCAGCCAGCAGCAACAAGTGGCTATCCTTGAGATACTAAGAAAGCCGACTAG:1 + chrX 7532200 3' + Doc 4460 1 76.24 CAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCATCATGAGGAATATGGTGCCCGGTCCCAACACGGTTGAAGGGCGGTGGAATGGTGCCGCCATCCTCG:1 + chr3R 29917039 3' - R1A1-element 4991 1 38.61 AGGTGACGTCCCCCATTTGCCATACATTGCGCACCTATCGAAAGGATTTCACTCACGAATTTGCGCTGCCGGAGGATTGGGGTGTCTTTAATCTATGAGCG:1 + chr2R 22717229 3' - mariner2 753 1 71.29 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTACAATTTGTAGTTTCTTGATGTTGCAATACATTGGTATGATGTGGGCATAAATATTTTAA:1 - chr3R 4579219 3' - Quasimodo 11 2 51.49 TTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCATCGGGCTGTCCTCCTTTCTCGGCTTAAATTGATATTTACACAATGACTCAGTCATGGCTTTATTAAAAAAAA:1 - chrX 462531 3' - Circe 283 1 61.39 GACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGTTGGCCGAGGGGCAAGGCAGAGAAAGCAGCGAAAGCAGGAGCGAAATCATCGAGAGCTGAGAAGCGCGAG:1 + chr3R 11372133 3' - Doc 458 1 78.22 CATATNTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACATGTTTGTCGTAGATATATAGTGTTTTCATATTC:1 - chr2R 12224496 3' + Quasimodo 6 2 66.34 AAGGCAATGCTTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATAACTTTTGATTAGTTTCTATATTTTTCTTTATCTTATTTTCAACGCCGAGA:1 - chr3L 14820274 3' + 1360 449 1 62.38 GGTTAGCTAGGGACGGTAAAATAATTAAAAGTAGTCTACTAGAATAAGGAGGTAAAACTCAGGTGAAACTAAAGCAATTTGCGAGAACTCAAAAGGGACAA:1 + chr2L 17414461 3' - Cr1a 3998 1 52.48 ATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAAGTGAAAACAATAAACAAATAGAAGCACCCGCAACATGATAATAAGAAAGACAAAAGTAATTT:1 + chr3L 17770848 3' + gypsy4 469 1 60.40 CGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCTACGCATACCGTATGGCTCATGCACGAAATAGTTTCTCACTTTGGCTCTTTCTTTTTCGGG:1 - chr3L 8329247 3' + 1360 112 1 58.59 AGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATCAAGTTCATCAGAACTCAAAAGTGCCACACTTCTTATTGTTAATTG:1 - chr3R 15085591 3' - hopper 1159 2 54.46 GGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTGTGCATTTGTATTGATGTGTGTGGACTGGAGTGGGTCTCCAAAATGTGTTCACCGTGCTGTGTCGTGAGCTGGGCGAG:1 + chr2R 5763442 3' + invader1 172 2 70.30 AATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCTTGACCCGTTCCTGGATTCAGGCGACATCTGCCAGTACCGAACTCACAATTTAATGTTA:1 + chr4 408477 3' + BS 4807 1 64.36 CAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGTCACGTTTCCGAACGAAGGCGGTGTCAACCTACCCATGCGAG:1 + chr2R 13216748 3' - 297 225 2 58.42 CGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGTTTTGCTGCAACTCAACTATGTCTGGCAGTGAAGTCTTTTTCGGGTTTGAGT:1 + chr2R 22774532 3' - BS 1 1 73.27 TGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATCATTGTCTTCCATTATGGCGGCGGGATAGCTGCACTTGTTCCACATCTACATCGGATTCGGGTTCG:1 + chr3R 8364871 3' - P-element 2819 1 70.30 TTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTGTGCTCTTTTCTTTTTTAGGTGATTCCCACACCCCCTTTTCCACCCCGCCGTG:1 - chr2R 15906726 3' - F-element 333 1 51.49 TTAGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCAAATGAACATCTATCTATACATATTCCGCTACTCTAAGCGAAGCTGGCAGCAGTCCCATACCGAATACCAA:1 - chr2L 16510980 3' - 17.6 401 2 44.00 GCAGTACCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGGTGACTATGCCG:1 - chrX 11042498 3' - jockey 4686 1 70.30 TGTATATGTGTCTGTGTGTGTGCATTGTCCTCGTTGCCATTGTTTAATGGTCACATTAAAAATGCCTCATTGTTGGCGTATACGTATGTCGAGTGTATTAT:1 - chr3L 5665386 3' - accord 186 2 76.24 GACGATTCCATTTCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGTCTAATGGGAGGGAAACAACCGAAATGGC:1 - chr3L 10911346 3' + Bica 4537 1 71.29 TAGCTCCTATATTCTTTTTTCGCAAGCACTCTCAATTTCGATGTTATTCATTAATGTCTGCACGCTCCTATCTCCTATCTAGAATGATTCACTTATATGGC:1 - chrX 13607582 3' + Gypsy12A_LTR 2090 1 59.41 GAACTCAACAATCATTATGTATGGCACCCCTTGTCCTTAAACAGGCATTCTGCCCTTTAGAGCCGGCATTTTAACACCTTTCGCAAAGGTGTTCCGTTGGC:1 - chr3L 3638062 3' - hobo 324 1 79.21 TAAGTNCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGCATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTTTTTCACTTGTTTGCTTTCATTTATTTCACTTGTAACATATATTT:1 - chr3L 7930867 3' - G4 3415 1 63.37 TCAGCCGCTTCTGCCATTTTTGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAA:1 + chr3R 25871994 3' - hobo 458 1 77.66 AAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATATTTCTCCCCTATTATCGTTACTTGAAAACAACCATTAAATAAACCGCAAGATTTAACAAAAAAGTTTAAC:1 + chrX 14525920 3' + jockey 4836 1 77.23 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGTGCGCCAACGTATAT:1 + chr3L 7316349 3' - jockey 62 1 79.21 AATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTGGGCGACGAGGCACGTACAAATTCAAATGCGGTTGAAATCTGCATTAACTATTGCAATTAGTGCGAAATTTCG:1 - chr2L 15206862 3' - I-element 4977 1 78.22 TCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACACTATACCCGCAGCCAAAACGCTGCCACTCAAATTGC:1 - chr3R 22874733 3' + 1360 3176 1 62.22 TTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATC:1 + chrX 21667934 3' - gypsy2 27 2 59.41 TTATTTTATTTTTATGATGTTTTGATAAATAATAATACTCTTCTACTAAGCGCACTGTCTGATAATCGCCCTCTTCCCCTTCATATTTTATCTAAATCAAT:1 - chr3L 14602940 3' - jockey 4999 1 70.30 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCCCTTAAGCTGGACAGCCTAGTTTCACATCAAGCTCAGCTGCTGACTCATG:1 + chr3L 2182738 3' - blood 21 2 53.19 AGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGTTTGGTGATTGGGCTGGGCAGGGGGTTCAACTTAGTTAGA:1 + chrX 15366008 3' - gypsy4 6508 1 67.33 TTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCTCCGGTTACTGAGTTGCATTGTTGCATTGATTTAAATTTA:1 - chrX 20907262 3' - Juan 338 1 60.40 GGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAATTTGATAAAAATAAATAGCGTTGACAAAATAG:1 + chr2L 3013610 3' + R2-element 3211 1 63.37 GACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCCGCACTCGCTAATTCTCGGCCGCAGCTCATTATTGTTGTTACTGCCGCCGGAGTTGGAACTTC:1 - chr2R 8850635 3' - 17.6 7130 2 69.31 TACCGAGGCTTGAACGTCAATAAAATTTAATATCCGTTTCGAGTGCAGCAGCAGCGACCAGAAATACTTTGCATAATCTGCCCCCAGGACGACGTACTGCG:1 + chr2L 1964559 3' + Idefix 7251 2 79.21 TTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1 - chr3L 25232774 3' + accord2 185 1 51.22 TGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTCTGATTCTTCTACTTTTTACTATTTTTTTTTTTACCTTTTACTCGGCCACGGGCGCCAACAACAAC:1 - chr3L 9764163 3' - 412 7436 2 61.39 ACTCCCCCCTCAGAATTAAGGCCGCCCTCGGCCGTCTGTAGTTCAGAGACGTGAACCCCTTTTGCAGATCCCGATCGTATGGTAGTTAGGAAAGTGTG:1 - chr2R 10855307 3' - gypsy6 7400 1 60.20 CCAACAAATCAAGAAAGAACGCTATTTTGCCGTTACCGAATGGAAGCGGAAATTCAAATGATGGCAACACAGCCAAAAGGCAAACAAATACAAATCCTATA:1 + chrX 20113026 3' + F-element 351 1 77.23 AAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCAAGTATCTTTCGAAGATTTCTATACCTGGTAAAAAAAAAAGAGAAGCAAAACTGTATTCGAAGAAAAAATT:1 + chr3L 14139830 3' + R2-element 3521 1 60.40 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATGATAAAAAAATCAACGCAATTCAAAAAATTTAATTTCATTAAAATAAAGAGCACGAAGGA:1 - chr2L 12728379 3' + opus 483 2 63.37 AGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTTGAGAAAATCGCCTATTGATTCCTGTTCTTGCTTGCTGACATAAAAATAGGTAAGGCAAATTATAATTTTTAGCCT:1 - chr3R 19718709 3' + INE-1 545 1 80.20 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCA:1 - 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chr3R 637479 3' - Doc 272 1 77.23 ATTTTTTTATTTTTTTATTTTAAAGGTTTTTTTTTTAACTCACCGCGTAAACAGACTATCGATCTGTTCATCAAGACTCAGCTAATAAATGTTG:1 + chr2L 7535386 3' - F-element 4685 1 52.13 AAATGAATGCAAGGTCGAACTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACAACTACCACATTCCCTTTAGAACAGACACATTGCTCTTAAACACTT:1 + chr2R 4581135 3' + Chouto 5950 1 52.48 TGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGCCGCCTCTGCAGCGGCGGTGTGGTGCAGAGTGCGGATCGGGATCAGGTGGTGTCCGAGTTGGGGATTAACCATTAA:1 + chr2R 15808042 3' - Chouto 323 1 77.23 TGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTT:1 - chr3L 27356081 3' + Tc3 1681 1 65.35 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTAC:1 - chrX 8364633 3' - jockey 4804 1 71.29 TTTAAAAAGATGTTATTAAAAATGTTATTAATTTCTTCTTTAATCCCCATAAGCTGAATATACCTAATTTGATCACAATAAGCAAATGTTTCTTTCCGTGC:1 + chrX 16580288 3' - hopper 166 1 66.34 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTTCTATTCATGAGAGTG:1 + chr2L 23068927 3' - 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F-element 4304 1 69.47 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTAATGACGGCAGCAGAATATCTTCTCACTAGATGCCATGAAACTTGGTTTATCAATCTTAGGGA:1 - chr2R 5968756 3' + flea 244 2 69.31 TGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTGGGGGTTCCCGGGA:1 - chrX 17049515 3' - Stalker2 7248 1 77.23 AAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGAAAACGTATTTGCTGAATAAAAATAACTAGGAGAATGCAGTACAGTGATTGCTCGTAAGAT:1 - chr3L 16749523 3' + Tc1 188 1 69.00 AGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATTAGGTGAAGCGCTCTATCCTTAGTCAAC:1 - chr2R 11847518 3' + Bari1 1658 1 73.27 AAAGTCGTCTTCTAGCACAACACGCATACATATACGCGTTCTCGTTTATGGTTTGTACTCATACCAAACAAGAATCTCAACGATTTCTTGGGCCGTCTGTC:1 - chr2R 4582301 3' + 1360 3200 1 63.37 TCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGGTCGAAAATCGGTAGGTGCGGAAGTTCTTCTCCTGGTCCA:1 - chr3L 20312740 3' - jockey 4534 1 60.40 AATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAAGCTGTTGTGCGTCGCACAGAGATGCTAAAGAAGGCCGATGAACTGGAGAAACAGTTTGTCG:1 + chrX 11613579 3' - X-element 4710 1 68.32 AAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGCATGCCGATTGGTTCGGCGGCAAAGGTGTGGGCCTGTGCC:1 + chr3L 3219723 3' + P-element 8 2 45.54 ACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCAATACATCACCAAAACTATCTACAATATATTA:1 - chr3R 27988543 3' + Stalker2 7278 2 73.27 GCACANGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCAGCTGAACGGAAGTCTAGGCAGCTGTATTTCGCCAAGTGAGAAACTGGGTGACAATTCCG:1 - chr2L 16344653 3' - Bica 45 1 67.33 GTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGAATACAAATGTACCGTGGAGAGATTAGCGGATCGCTCTTGCCAAAACCCCTTCACCCA:1 - chr3R 16020675 3' - G5A 2768 1 68.32 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGG:1 - chr3L 3254992 3' - 1360 21 1 68.12 TTTTTATATATATTATGACAAACTTAACAATGGCAATTGTTAATGGATTGCATAGCTAAGGTACTGCCAAATGCGTGCAGTTTCCTTTTGTTTGCCAAAAC:1 + chrX 15599141 3' - Stalker 78 4 63.37 CTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGC:1 - chr2L 15478811 3' - jockey 4725 1 81.19 TGTTTTGTTCTTTCTCTTAGAACGAACTCGATTTTGGTCCATTTTTTGGTCGCCACTTTCTGCAGGCTCCTCTTCACTTTTATACCCTTGCAGGATGTGGC:1 + chrX 20070937 3' + S-element 252 1 73.27 ACCAACAATCATGGCAGACCCACCAAACACTTACAAAATTACTTCAAACACACACACATACCCACATGTACGTTAATAAACTTATGGCACAAATTATTCCT:1 + chr3L 16821360 3' + I-element 177 1 61.39 TCACTCCAGCTCCGGCAACTCTCTAGCTGGCCGTCTAAACCGTCATTCCAGCGCAAGTTGCCCCTGCAGCCACCTGTGACAGGTCGAATGGCCACAAAAAG:1 - chr2L 19949323 3' - aurora-element 186 1 68.32 AGGCTCCACAGGAGACAGTCGATAATTAAATCCTCAATAATTGTTTTGTTGCTCGCTTTAATCGCAGTTATTCAGCGGTGGTCCTGGCCTGGCCTGGCCTG:1 + chr2R 16385420 3' + BS3 1556 1 79.21 GGGTGTATGTGTGTGTGTAAGTACATCAAGAGAAAAGGGGGGTGATGGGTGGACGGCGGTGAGCAGTGGTTCCTCCGGCGAACTAAAGAGCGGCTCACTGG:1 + chr2R 19328023 3' - accord 254 2 49.50 GCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAGACGAAGAAGTGACAATTGGCACGCCCACTTGATTAGCATGTACACGGTGAGCAGCTCTCAATTA:1 - chr3R 8552438 3' - diver2 4776 2 54.46 TATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATGATCTGTACCTGTCTTCGATTAGTTATGTCTATTGCTTATAACATTCTTTTTATGAAATTGCTGGTTTGTG:1 - chr3L 21275544 3' + flea 385 1 78.22 AAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTAACAAGCAAAATTAACAATTTCAATTCGCTTGGACCTCTTTTACGCTTGACCCACAAT:1 + chr3R 17256066 3' - S-element 376 1 59.41 GTTCGNGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGCCTGTTAGTTGCCAGTTATGTGTGGCTGCCTTTTTGAAAAAAGAGTTTTGTTGCCTGGTTGTTTAT:1 - chrX 17692565 3' - 3S18 12 2 67.33 CCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAACTCGCCTCGCAACTGTGTTTTTGTATATTGCGCGTACTTCCTGTCTAGTTTGTTGT:1 - 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chr2R 20151138 3' + R2-element 3238 1 67.33 GATTTTCCCCCAAATTGAGTGGTCCGGGAGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGGATTTGCACTTAAATCGACATTATCCCATACAGT:1 + chr4 703728 3' - Ivk 204 1 78.22 CGAACGCACTGAGAGCGTATCTCTCAAGCTCTCCCCATCCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTCCCCACTTGGCAACGATTCGAAGGTATACTGCATTTC:1 + chr2L 16346918 3' + Doc3-element 424 1 63.37 AAAACCAAAGACACCAGAATAAAAAGATGCGTAACGCCATACATTTTTTTGCAAACTCTACAACGTTTTTTTTAGTGGCCCTAATAATTGAGTAAAATATG:1 + chrX 7036183 3' - Tc3 315 1 58.42 TAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTC:1 + chr3L 9907379 3' - BS 4991 1 79.21 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGAGACGGGGAGTACTGA:1 - chrX 12756734 3' - jockey 61 1 78.22 GATTCCGAATTGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACACTGGCTTGAAAGGTAGGCCTCAACGGCAAAAGGCTTTTGTCCATATTAAGTCTATGAATA:1 + chr4 646315 3' - mariner2 206 1 69.07 CGAGATCTCATGAACTATATAAGCTAGCTAGTAAATTAAGCATACAGTTTTCAGAGTCATAGACGCAGCGACAAGCTTAAACTTTGTAAATGGTTCTTTAA:1 + chr2L 11823039 3' + INE-1 147 1 75.25 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATATATGTATCCATACAATTTCATGCGGAATTTGTGCTAAAC:1 - chr2R 22740027 3' - Transpac 4945 2 57.43 TCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTGAACCCACAAATTCTCTGAAAGTATGATAAGTTTTTAAATTTTGTAAGCAGTTACGTTTATTTTATATGAGGTGTC:1 - chr2R 21266394 3' - roo 8662 1 80.20 AGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTAAACCCATCCAACAGACAGCTTCTCCGAATTTTGTCACCTGACCTTCCTCAACTTT:1 - chr3R 20187863 3' + hobo 2617 1 58.42 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGTTTTTCTCGGAAAATGATGAGTGTGTTGTCTAACA:1 - chr3L 14467135 3' - Tirant 8147 2 56.34 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAAATTCGAGAATCATCAACTGGCA:1 + chrX 22747494 3' - Doc 29 1 52.48 ACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCCGTTAAAACAAAACGCAGCACGCCTGGGTGTAATAAAATTCGAGTCGCGTGCTTCGTTGT:1 + chr3R 6421403 3' + roo 154 2 62.38 GATAATTTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGTGCATTTATCAATTTCGGAATAGACATCTTGAAGGCATAAATCTTTGCCTTGTGGTCACAG:1 - chr3R 22281964 3' + roo 81 2 64.36 AGACCTCTTCTCCTAGTTTGGGAGATATGGTGGGTGCGCTGGGCGTGAAATGGCCAATGGATTTGCCCTACCCTCTCACAAATTATCGCTAATTTTTCCCT:1 + chr3L 7089419 3' - springer 282 2 78.22 GTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTGAGATTGTTTGAGGCACATACTTTTAACGGCACGCGAAGCTCCAACC:1 + chr2L 1012717 3' - I-element 4938 1 67.33 TAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGCTTAAATACCCTTTTTTAT:1 - chr2L 3165745 3' + roo 225 2 79.79 GAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCGACAGAAATATGCCCAGGAGCACTTCCAGGAGTGGTGTCGTCGCAAGGAGGAGCAGCAGCTGCAGCAGCGGCAG:1 - chrX 6124891 3' + R1A1-element 224 1 76.24 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGTATTCTTCGGACGAAGTTT:1 - chr2L 6177160 3' - pogo 25 1 55.45 GGCTCCGAGCTATGGGGCAACGCATCGAGAAGCAACATCACTTTTCCGAAAAGAGCCTTACATTCTCGCTTGTTTGTTTGTTTTTCTGCCAGTTTGTATA:1 - chr2L 9525654 3' + Doc3-element 4330 1 63.00 CAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTTCTAATAGAAATAATTAAAAGATTTCCTGGTATTCCCAACTATCAATTTATTTCGTCGCATTTGT:1 - chr3L 2822031 3' - R2-element 264 1 74.26 CCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACACACACACACGAACACTTTGGCTCTTGAGCTCTCGTTTTT:1 + chrX 8338019 3' - opus 7265 2 63.54 CATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTCTAAACAACCAATGCAAGCAACTATAACCACACATTTCAGCATTGGAAACTTCTTAAGCAGTTAAAAGAATTGG:1 + chrX 11958029 3' + ZAM 12 2 70.30 TGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGATTTGGCTGTGGGGCTGCTTGGAGAGCGCCTGATAAGAGATTCCGTTCATAAACA:1 - chr2L 7155317 3' - P-element 2774 1 57.43 AAAGTCAAATGCTGAGCGATACATAAGTAAACCAACGGAAACGTTAACAGGTTCAGACAATTCGAAAAATCCTCGGGACCAGCCCCAAACCCCCGCATCCA:1 - chrX 1893232 3' + G3 4360 1 76.24 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTGAGCCTCCAGCTGCTGGCCGAACTGATTTAGAGCCACATTCTTTCGGAGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 15622791 3' - mdg1 7053 2 62.00 TCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGAAGTAAATTTATAGCAAATGATGTGGTTGCCGC:1 + chr2L 12237084 3' + jockey 4952 1 64.36 TGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGGTGGCATATGTCCGCGTCTGGTAAGAGTTTCACGCGTTCTGCGGCGGAACTGAACTGATAGTAGTTGAAGAAG:1 + chr3L 4367349 3' - 17.6 7080 2 73.74 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATCGGTCG:1 - chr3R 6216792 3' - pogo 20 1 59.41 GGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGACCATCGCACGCATACCAAATCGTTTCGGACCTCAATAAACTTCAATAAATGTTAAAAGGTTA:1 + chr3L 5056294 3' - I-element 4888 1 70.71 TCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACTCATCCATGCTGATCTCATCGCGCATCTGCTTGATCAAACGTTGAGTGTC:1 + chr2L 6763396 3' - R1A1-element 5083 1 55.45 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTTGGTTAGAGCATTTCATATCCTTTACTC:1 - chr2R 10406045 3' - Transpac 52 2 72.28 TCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCGAGAGATGCAAACCCGGCAAAACTTCAACTTCAAAACTGATGACTGAGGCAAGCGCAGT:1 - chr3R 17269002 3' + 412 7349 2 61.39 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTGCATACCCTCCGTTATATAACGATGGAATCTATATTGAACAGACTAGAGACGT:1 - chr3R 11685559 3' + mdg1 398 2 53.47 GGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCAAATCCGAGGTAATACTTGGAGACACTAATAGATGATTTTAATCTTATGGATTGTAAACTCAGAGGTGGCACGG:1 + chr3R 15186636 3' + invader2 4830 1 78.79 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGGGGCTCGCACTTT:1 + chr2R 21379597 3' + P-element 2840 1 33.00 AGATTCCCGACTTGATCAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAAAGATGTCCTTTTTTAGTAATTACTGGGGAAAATTATTCTTCCA:1 - chrX 175147 3' + Cr1a 4074 1 51.69 CACACACACACACACACATATATATACTACATACAAGAGCAAACCTACTAACCGTACTAACGCCTGCCAACTCGCCACGCCCCCTTATCCTGCGCCTTCG:1 - chr3L 9184712 3' + accord 184 2 66.00 CTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCAGCTGCAGACAGTTTTGTCTAGTAATGCATGGCG:1 - chr2R 19969192 3' + Stalker2 390 2 66.34 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATT:2 + chr2R 8463623 3' - I-element 45 1 63.37 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAACAAATTCAAGCAGTAGCTCATCGCCCAGAATCT:1 + chr3L 18957672 3' - copia 43 2 70.30 GCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTTTTGGATTAGGGCCAAGCGCTGGCGAAGCCCCACAAGGCGTTGGCTGTTCCACTCAC:1 - chrX 1258280 3' - 17.6 7216 2 55.00 AACACTTTAAATGAAATCGCTGCTGCCGTGCATTCGCCGCTCCACTGCTGCTGTTTCCCTTGGTTTGG:1 + chr2R 12966617 3' + X-element 325 1 69.12 ACAAAAAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAA:1 - chr3L 24213802 3' + invader2 5051 2 77.23 CCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATAGATCAGCGACTGGTAGGGCAGAGGTCGAGCATCACAAAAGCCAACCACGACATATAAATCCTTT:1 + chr3L 5586408 3' + I-element 4907 1 67.33 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCC:2 + chr3L 22052859 3' - mdg1 9 2 70.30 CCAGAACGACACTTGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCTGCTCTCATTTCAATCGCGTGCACACCTGCAGATCCGTCCGAAATCGTTCGGCG:1 + chrX 15787308 3' + Doc2-element 287 1 56.44 CTCGTCCGGCTCTGTATGCGAGGTGCTTCCCTCGCTGCTGGGGCTGCTCTTGCGTGTTCTCAGACGCACTGGGACTTCTGCCAGGAGCTGTACGAGAGCAT:1 - chr3R 15238651 3' - G6 423 1 63.37 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAAATGATTCTTTTTGAGATCCATGCCGCTAAGGCAGTTGAGAGTA:1 - chr3L 19051837 3' - roo 8692 2 55.45 GCCGAAATTAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGCCCACTTGCAATTGCGTCGATGAAGACCTCTTCATCGAGTTGGGATGAT:1 + chr3R 6107205 3' - 1360 3175 1 55.45 CAGCTTGTTCACTGCCCGCATTATTACTCCTCAATTTACTTGGCATTACTTGGTCCTCAATTCTTAAACTCTTCTAAGTGTCCAGCTGAATCT:1 - chr2L 8031447 3' - diver2 4456 1 48.39 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGCCGTTTGTCGT:1 - chr3R 14832392 3' - blood 7034 2 54.46 GGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGTATTGTTTAAAAAAACCTCACTACCCTGCTG:1 + chr2R 21989961 3' - I-element 4952 1 77.23 GAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCCAGGTGGATGGGCGACAGAAGCTCTTCCTGGGCGAGTTGGGCGTAGTTAGTGTAAGTGTCTTGCC:1 - chr3L 1492862 3' - 1360 3280 1 70.30 TACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTGTCCTGGAATTCATAGTGCAGAGTATAAATCTATAGAATATCAGAAGA:1 - chrX 12883081 3' - roo 9046 1 52.48 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGC:1 + chr2L 14536291 3' + blood 7335 1 76.24 TTTCTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTGTTTTCTGTTTGTGTTGTGTCATCGACAGCGACAACAATGAAAAGAAGCTTCGCTTCCCCAGTTTCCCAGTTTCTGG:1 - chr2R 10917208 3' - G2 3076 3 72.28 TATATACATATATATGTATATGTACACGTACTCCTTGGCAGATTTCTGGCGGATAAGACCCACGACGATGTCTCCAACATATTGCAGCAGTGGAAGACGA:1 + chr3L 13965561 3' - Stalker2 251 2 73.00 TAATAGTAATAATAATAATATTTCTTAATGAGGAAGCTATAAAACAAATCAAGGACAAGTTTTTGTAAAATAGGAAGGCATGTGTAATTTATTCCTAAGGC:1 + chr3L 2376497 3' + mdg1 7071 2 76.24 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAGTAATTAACCACATAAGTATGCTTTAGAAAGT:1 - chr3L 12646314 3' + jockey 4959 1 68.00 TTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGCGATTTACCATTTTTTGTTTTTTTCGCTTGCCTCAGCTGCGGAAATGTTGCAGCGGAAGCGCGGATAAAGT:1 - chr3L 3455795 3' - invader4 2914 2 73.27 CGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTGAACTTTTCTCACTCCAAATGCCACTCGAAATATATAATTTAA:1 + chrX 17553164 3' - jockey 4622 1 57.43 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCG:2 + chr2L 22227339 3' - F-element 61 1 76.24 CCCTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAAGCGGATGTTCGGTTATTAAGACACTAGGATGTGCTTATTTGTTGTCAGTGCGCGTCAAACATTTGAAAACATTT:1 + chr3L 12311320 3' + mariner2 159 1 57.43 GAAAATCGTCTTCTAGCACGACACGCACACATATGTATGCAAAC:1 + chrX 20631136 3' + 1360 3199 1 77.27 AATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACATAGACGATTACCTCTTCGCGACTCAGCTGCTTGTCG:1 + chr2R 21488022 3' + Doc 4434 1 64.36 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTAAAAACGTATTAAGATCTTTGGGATATTACAGCTGATGTTGGCGT:1 - chrX 7413949 3' + pogo 2073 1 60.40 ATATTNCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTATGACTC:1 + chr3L 2539310 3' + roo 360 2 71.29 TGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATGCACTGCCAACCAACTGCGGACTTGTCCATTCAAATAAATCTGGAATCAAATTAGCGCTGCGGGAGCT:1 - chr2R 19214142 3' + Doc 4381 1 71.29 ACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCATATAATATTTAATACTGTAGGCCGAAGGTAGCCGATTAAAAGTACA:1 - chr3L 9067040 3' + jockey 4725 1 53.47 TCGACNTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAA:1 - chr2R 5206895 3' - Doc4-element 20 1 57.43 TACAATTTATAAACTTTTTTGATGCCATCGCCGGCAGCAGAACGGAATTTGACAGGAATAAACAACGCATAAAGAACACAGTTCAAGGACTTTGACTTGCC:1 - chr3L 5623376 3' - transib3 37 1 55.45 GACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTACCGATGAGCCACCCTCGTTGCAAAGACGCTTGTTTGTTGTGGTTGATGTATTGACTTTGTG:1 + chr2R 19542450 3' - G2 2615 1 53.47 CATATGGGTTTCAAAACAGAGTTATATAAGAGGACTTTGTATTCCAGTCTTAAGGGAGAGCGAACGTTTATAAGCCAGTTGCAACATTGGTGAGTGACAGA:1 - chr3R 2999642 3' - Doc3-element 4301 1 78.22 GTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTTCCAGTTTAAATCAAATAAAGTTTATTTAGATCGAATATCTTGCGATGTGAACTATGCAAC:1 + chr3R 5263109 3' + S-element 339 1 66.34 CCTTGACTGGCAGTCCCGATGAGCGAGCAAGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTCCCACTTCTTAATAAAAAATAAAAAAATTATGCAAAGCTAAGT:1 + chr3L 3736990 3' + Rt1b 4987 1 54.46 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGACGGCATAGGGAGAGACCACAAACAACA:1 - chrX 697456 3' - roo 8707 2 69.31 TTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTATAGATTTGTGCGGGCTATTTAAAGACGATGAAAAGTTGCAACA:1 + chr2R 14121876 3' - I-element 5233 1 61.39 CGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAAACTTCAATCGTCGAGTTCAAGGCAAACAATCGAAAGACACATATCAAACTAACATAATGCGTGGAG:1 + chr3L 15378292 3' - R2-element 3488 1 69.31 GCCCCGTCGAGATGCCTAACGACAGGCTGAGACCAGAAGCATGCAGGACAAGGAGCAGCGTCTTCAGGAAGGAGCAGTAGTCAACGATCTGGTCA:1 + chr3R 28839808 3' + gypsy8 4511 1 64.21 CGGGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTC:1 - chr2R 14121056 3' - I-element 21 1 57.43 AATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAGT:1 + chr2R 21421088 3' - springer 7168 2 60.40 AGCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGTCTGTATGTTCTTTTTAGAACTGCTATGTCATTTATTTACTAAGGTCACTATATTTTTCT:1 + chr3R 14456743 3' - BS 4989 1 57.43 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATTCAATACCAAGTCAAATAGTTTTTAATGTATTATTTCTT:1 - chr2L 8949529 3' - blood 7064 2 62.38 GTATGTGTGTGCGTGTGTGTTCGTGCGTGTGTGTGAGAAGACACTTTAAACTGTCATTTGTTTAGCCTACCTCTCGATCTTCCTATTGATAGCTATGCGTT:1 - chr3L 22246421 3' - accord 7029 2 58.42 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGACGGACGGAGAAAGAGTCATAGAAATTGTTGACATAT:1 - chr3L 16150715 3' + P-element 2846 1 38.61 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAG:1 - chr2L 10635267 3' + roo 9019 2 79.21 GTTCTGACTATAATAGACTTTTTGTTTTCATAATGTGTTTGATAGTCAGAACGAACATAATTATATTAAATTTTTATTAGTAGCCGACTGCGATTTCGGCC:1 + chr4 1117690 3' + Cr1a 4200 1 51.49 AACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGGCAGACCGCGTTCTGGCGCTCTCCTCGTCTTGCAGATCCTTTAGATGCTCATCATAGTTCTTAAACACTGGAG:1 - chr2R 8123861 3' + Doc 345 1 64.36 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGCGCTGGACACAGTTGGCAGCCTTGTTGAAAGTAAT:1 + chr2L 14536325 3' + blood 358 2 59.00 CCGAGNAACTACGTCAACATATCAGGGCAGCCCGACCTACTCCTGCAGCGATAGTAAAATGCAAATTGGTTGGGGTGGCTGGGCAGCAGCACTTCCAGGAC:1 - chr3L 3967348 3' + Chimpo 3855 1 59.41 GTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTATACCTACTTCTTGATCCTGTGATATCATATATAGGCGTATT:1 + chr2R 8695954 3' + invader1 383 2 68.32 GTTTGGGCGCCAATCATCCTTTTCTATATACCCAAGCTAAACAGGACTCGAGACCGATTTCGAGTTTCAGCTTCGGTTATGTTTAGCTTGGGTATATAGAA:1 + chr3R 11302774 3' - Burdock 265 1 56.44 ATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATC:1 + chr2L 3964499 3' + INE-1 500 1 84.16 CTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGCTTCAGCCAGTGGTGCACGAGGAGTGCGAGGTCATGTCAGAGTTGGGGC:1 - chr2R 6935749 3' - 412 7486 2 51.49 ACGAGGTAGAGCCGGATTCTAAGATTCTAAGGCGTGCACCCGCCAGTACAGCTGTCCCTGCTCTGCCCTGCCCTGCCCTCAATCTACCAATTCATCATCGT:1 + chr3R 25587984 3' + Gypsy12A_LTR 2197 1 50.50 GGGATTGGTAAGTTCTTGAAGTTCACACCATTACATTTCGGTGAAAGAATAAAGTATTCATAAATATAATGCAATGATAATGATCTGAAGGTGCCCAGTAC:1 + chr3L 868558 3' - I-element 217 1 79.21 AAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTGCTTATCAGCTGGCACAAATGGTGATGA:1 + chr3R 23223086 3' + McClintock 6055 2 72.28 CCGCGTCTCGCGGATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTGAAGTGTGTGTTGCTGGTTGGACTTCCTCAGTTGCTGCTTTTTTTTGATTGTCTTGTAATTGCGT:1 + chr3L 10818739 3' - invader3 5367 2 60.40 TATAATTTTAAAGCTTTTTTAATTTGTCCTGTTGTGCTGTGTACTTTATGACTTGTAGTCACTCGAGATCCCCATCGCCTCCGCCCACGTAGTCTAGCTTC:1 - chr3R 17838205 3' - 1360 3018 1 76.24 ATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCC:1 - chr3L 27356094 3' + Tc3 1668 1 69.31 TAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTACGGGTGGTCCGTCTGCAGGTGCTTGTTGGCCCCCACGTAGGAGAGTATCTTGGGCGTTACGTTCGTCCATCCGTCG:1 - chr2R 13968543 3' - Doc 4498 1 75.25 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTG:1 + chr3L 776147 3' - 1360 47 1 68.32 TATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTTGATTGTTGCGTATGCCCCGAACTGGTGGCACCCGTGGCTAGATGTTAACTCCGGAG:1 + chr3L 9049205 3' - accord 7181 2 59.41 GGTTGNCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTGTGTTCGTGAAACTCCGA:1 - chr2L 19090072 3' + opus 446 2 79.21 TTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGAAGTCGGTTGTGGGTATAGCTGGGTATCTGCGTGGTACCTTAATTCC:1 - chr3L 2678143 3' - Doc 4579 1 53.47 TGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAACCTTCTAACATTCCTAACATTCCGTAAGCATAACATTATCTGCTAACTTAAAAGAGCCAACAACAATT:1 + chr2L 13113709 3' - flea 395 1 60.40 CCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTTGCAGCAACAACAAAATGGGGGGAAAAAAACGACGCCAACGGC:1 - chr3R 5088008 3' + Doc 402 1 61.39 TTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGAGGAACACCATTCGATTTTTTTGCAAACGATTTTTTCGGCTTGGAGTAGAGGGAGCACAGAAGCCGAAAAT:1 + chr3L 15337061 3' - Tc3 316 1 69.31 ATTTGCACGTACGCGTTGATAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGACAAACAGCTGAAGAAAACCAGAAAAATAAAGCAAACAAG:1 + chr3L 9025086 3' - Ivk 136 1 61.39 TAATANGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAAACTAAAACATTTAAATTAAGGTGCTTTCATTTTATTGACAGAAAA:1 - chr3L 11610359 3' - 412 31 2 55.45 GGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACGCAGTGCCAAGTTCTGATCCTTTAGGCCAAA:1 - chr2R 16121221 3' + blood 7291 2 69.31 CAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAGGGTTCTTTACTTACCACCGGCAAAGTTTCGTTCACAAA:1 - chr3R 24140673 3' - HMS-Beagle2 312 1 59.41 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAGGGGTTGCTGAAATTGCTGTGCAACGCAACGTTTGCACCTGTTTACAGTGGCTT:1 - chrX 13560705 3' - roo 10 2 65.91 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTTCCAATTCTGCGGAGAGGGTATGAACATATTCCAAACAACCGAGTTTAATCGTG:1 - chr2L 22544954 3' + roo 9050 2 57.43 AGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTCTGTAGATTTTTAGTCGAGTCAAAAAATGGACCTCACCAGGAAA:1 + chr2R 5076318 3' + P-element 388 1 48.51 CCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCTAGACACCTTTCACCACAATTCTTGAAGCTCTCTTTTTCGCTTTA:1 - chr3R 26212636 3' - R1A1-element 5269 1 59.41 TAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGACGAGTTAGAGAAGTTAAATCTAGTCGCAAGCCGTTGCAGTTGCACAGCCGCTCGT:1 + chr3L 16681446 3' - Quasimodo 426 2 61.39 AAAAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTGAAATTAAAAATAAACCTTAAAAACTAATTATTAAAAAAAAGGGAGGTGAAATGAAGTTAAGAATTATT:1 + chr4 927327 3' - hopper 214 1 64.36 GTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGT:2 - chrX 17049553 3' - Stalker2 38 2 59.41 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGTTCATTGGACGCCCGAGCCAATCG:1 - 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chr2R 22068454 3' - Quasimodo 48 2 75.25 CGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTTACACCTAACCCAACAATCCAATTCCGAGGCAACAATATGCTCCGCAGCTTCGT:1 + chrX 7263581 3' - 1360 100 1 56.44 GTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTAGAGGACAATGTTTGCTTTTCTATGCTTTGGTCTGGATTCGAGG:1 + chr2L 743694 3' - accord 6911 2 59.41 ATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTGGTTGAAAAGGAAGTAAAATGCTTGGAAAACATGAGAAAAGCTGACTCAAGAAAAGCGAAGCTACTAT:1 + chr2L 18630182 3' - Bica 4921 1 76.24 GAGGAAATTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCTAGTGGATCGGTTTCCGTGCTCAG:1 + chrX 20524486 3' + R2-element 219 1 76.24 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGTAGGTTACTTTGTTT:1 + chrX 6283664 3' + P-element 2827 1 20.79 ATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAAGTTTCAGTTTCTGCTGTAAGTAATATATACACGTCTAGC:1 + chr2L 5721110 3' - S-element 398 1 65.35 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCGTGGAAGGCGCGGAGAGCG:1 + chr3R 20140620 3' + jockey 4975 1 53.47 AAACAAAAAAATAATACAACAATTTGGCAACAAAACAGAGAGAGCGGCAACATAAATAACCGGCAGAGAACACACCGTATGGAATGTTGTTCAGCTATATT:1 - 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rover 227 2 49.50 CCGGCTGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTACAAAAAAACGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGAAATGATGAGCAATTTATCTGCGCGG:1 + chr3R 6771443 3' + accord2 7426 1 76.24 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGATATGTATCTGCGCTCGGTAGC:1 + chr2R 21937524 3' - 412 7107 2 76.24 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGACTTTTCCCTAATTTTCAACATAATTTAATG:1 - chr3R 15814663 3' - roo 8710 2 73.27 ATCTTAGACTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCGCTCCTTCAAAAAGGGAACCACTGAAATATTGTATACCCACACGCTTCTTTGGGCATATAGTT:1 + chrX 21001301 3' + Transib5 2936 1 61.39 ATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGAGACGGAGCGAGGGCGCTAAGCTGTGTGCGAGCGAGCGGGAACGAGAACGAGAACGGACGTATC:1 + chrX 9094165 3' + Bica 17 1 66.34 GCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACGCTATTGTCCATTTTCATTGTGGGCGTGGCAGTGCGATACAAATGGGCAAGACA:1 + chr4 1133125 3' + hobo 2673 1 59.41 TGCTGCATAGTGCAAAACCAATGCATTGGTTGCAATGCAATGTATGGCCGTTACACTTCTTGTATATTTCTGATTAACTTTCTCACTTCTGCCGCTTCGCC:1 + chr3L 23773454 3' + 1360 3350 1 60.40 GGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCTTAAATGGAAAGACGGGCTAAAAGTCACGTGGGCGGATTGCAGAGGGCAAAGACGGGTCTTCA:1 + chr2R 6587463 3' + R1A1-element 4948 1 41.58 AAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGCGCTGCTGGTGACCTTTGGCTACCTGGAGAGGAGTATGATGCTTG:1 - 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accord 7269 2 61.39 CAATGNGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAGGACAAGCGTCGATTAAGAGGGGAGGAGAATGCATGAGAGGAAAGCCCCAAAAGGAAC:1 - chr3R 13462460 3' + HMS-Beagle2 6815 1 69.31 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCG:1 - chr3R 22899175 3' - P-element 29 1 48.51 GGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCTGGCTTCTATCTCTTTCGGCGCCTGGTGGTCGAGTAATATGCAA:1 - chr2R 17212156 3' + 1360 451 1 56.44 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAGAAACGACGGCGAACGGCCAGCAGAGTTTCAGTTGAA:1 + chr3R 22899272 3' + P-element 2885 2 73.74 ATAATAACGTTAGGGCAATGCAAAACACGAACTCCACGAAACTGGTTGGCCATGAGCAAAATATATTTAAGTATGTCAACAAGGATATAGTTGCAAAC:1 + chr3L 24764069 3' - 1360 301 1 77.55 TTGAAGATGAAATCTGATAGATGATGTCTCCCATTCTCCAATACACTGGCTGGCGTGTGGATAACCACTGGGAGCACTCCAGTATTGCGACG:1 - chr3R 9805859 3' - mariner2 771 1 61.96 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAATTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTTGGTATTTGAGCATGCTGTATTTCTTGCTTTAATTT:1 - chr2L 11240896 3' + roo 9032 1 61.62 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGG:1 - 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chr3L 7329682 3' - Quasimodo 7071 2 61.39 CGAAANTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAAAAACAATTTAAAGTTACATCGACAACTTTAATGGCCCAAAGGGCAAAAAGATGGCCATTACGAG:1 + chr2L 2937720 3' - FB 786 3 73.00 TTTTAAAATTCTTTTTTTTTTATTATTTCCACAGGATAATTTCAATGTCATTCTTTTTCAGTGCACTTCTTAAGCTCATCCCATGCACTTTTTTGCATTTT:1 + chr3L 13185006 3' + FB 176 1 89.11 AATAGTATAAGCAAGTAGTAGTAGTAGTAGTAAAAAAAAAGAGAAAATTGAAAAGAAAAATAAATGGCTAAAGTTCGAAAGCGTTTGCAGTGGGTAAGAAG:1 - chr3R 25499544 3' + Doc2-element 188 1 63.37 AACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGATCACAGCTGAATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAAT:1 - chr3L 12072561 3' + HB 1606 1 53.85 AATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACTTGGATACAAGTACAAATGCAGCAAACACA:1 + chr2R 22866881 3' - diver 186 2 70.30 ATGTAATTGTAGTAAAATTACTGTAAACTTGGAAAAGCGGGGGCGTGCGTTCCATGAGAAGAGACAGAATCGCAGACAGACGGACCCCTTATGG:1 + chr3L 525413 3' + X-element 4591 1 73.40 TTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTGCGAGGGGGGGAGTAGGAATAGATGTTGTTGTAGTAGCATTAGCATCTTAACTAATCTTT:1 - chrX 1684569 3' + Stalker4 7287 4 70.00 TAATGAATTTTAAAACTAAAACAAAACGGTTACATTGCACATACATACCTATGTATATTTTAAACATATTTGTATACTAAATACTAGACATTTCGAACGAT:2 + chr2L 14691619 3' - jockey 4802 1 57.43 GGCTTGAGTTTCCGTCCTATTTCTCTTTTCATCGAACCGTCGTGGAGTCAGTCGTGGAAAGTTCTCCTCCGAACGAACGAATCGAATGAGCAGCCGAATGA:1 - chr3R 16182696 3' + Gypsy12A_LTR 240 1 44.55 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTAATTAATCATATACACCTGAAATAATATTTTCTTGCTTTCG:1 + chr2L 8640881 3' + roo 9039 1 67.33 GGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTGTTTGTGTTGTTTATTTTCTCTGTTGTATTAGTTTGGAGCTTAATAA:1 + chrX 11059092 3' - I-element 175 1 73.27 GAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTATAAAATTGGCTGCATAGTGCCAATGACCAAGGAGGAAATAAAGCAAAGGAGCGAAACAATTGGC:1 - chr2L 20373821 3' + 1360 3307 1 61.00 CCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCAGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAAGGCACAAAATACGCCAGCAAATCGG:1 + chr2L 2709592 3' + 1360 3146 1 81.00 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCA:1 - chr3R 20140583 3' - jockey 58 1 76.00 CAACCAAACCCGTCCAACCCCACCTGAAGCTCCGCAACCCAGTAAACTAAAATATTTGTTTCTCGCTTCGTTTTTGGTTAGTTTTTCTTGGTTTTGCCATC:1 + chr3R 22943566 3' + G2 114 1 62.38 CAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGTATGCCTCGTAGTCCCCAGTTATTTCTGCTTATTGAATTTATCTTAGCCAAATTTCGATGGCGTTCAAGT:1 - chrX 18175310 3' + Circe 144 2 76.24 CCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAGTGCGAAGTGAACTGACAGACACAAGAGACTTAATCACCTGTTTATCAGCTAAGAGGGTTGGAG:1 + chr2L 15001548 3' + gypsy4 428 2 57.78 ACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTAAGGAGCAAAAGAGCGAGACACAAAGAG:1 + chr3L 4835344 3' + hobo 2487 1 73.27 ATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGGCAGATGCTCTCCTCATGACCAATGGCATTGACATGATTGCTATTTACAAAATTGGCACTGA:1 - chr2R 11209319 3' + Dm88 4175 1 58.42 TCTGAAGCCAAACCCAATAATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCATTTTTATTCCTCAAAAGTGTCAGGCCAGAGTGATGTTGGCCAAAATAGTGGTGC:1 + chr3R 15140889 3' + Tc1 1199 1 66.00 CCAAANGCAGCGGCTACTCTATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAACAGCAAGAGAGATGCCCAAATGCGAAAGTGCGTGCAAGCAA:1 - chr2L 14100292 3' + R2-element 334 1 69.00 ATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCGACGAAACTTTGGGTGATAGCCTTGATGGA:1 - chr2L 21615637 3' + Tirant 8422 2 70.30 AGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCG:1 - chrX 17479579 3' - I-element 56 1 73.27 CCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATGTTAAAAACTTAAACAACGCTGACATATTT:1 + chr3L 22178561 3' + I-element 53 1 78.22 CCTCCCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCAGTGGCGCACCGGAAAACGGTGGACCGGAGCAAATATCGCAGGACAACGGCATAAGCTCCTCGGGACCAGGCC:1 + chr3R 2996320 3' + Doc 394 1 75.25 TATTGNAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGCTGC:1 + chr3L 5691290 3' + P-element 2843 1 35.64 CCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGAAGCACAAAAACCAAAACAAAAATGTGTAAAAAATGATGAACGACGGGAGGAGTTCAGTTGGAAAATG:1 - chr2R 8383536 3' - 1360 41 1 71.29 GTACTTATCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGCCGACGAAGGCGAAGAAAGAGCAGCGGGTGGGAAGACGTGCGTGAAATACGCCCCAAATGCAC:1 - chrX 2361005 3' + F-element 269 1 66.34 TTTCAATTGTTTTTTTTTTATTTCTCTGCAACCCGATAATGCACACACAAAGCGGCTAAAAGCCCACAAGGTTCCTTACGAATTTCCGGCATTCCAAAGTT:1 - chr2L 20084177 3' - Porto1 169 1 61.39 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGACTTTCGGGGCTACGGCCATAAAAAATTTATGCCTG:1 - chr3R 8050543 3' - jockey 4716 1 64.36 AATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCATTAGACGCGAAGGAGATGCTTTCAAGTTGAGTCATAAGATGGCATTAGCTTGATTATGGC:1 + chr2R 18903604 3' - Quasimodo 306 2 64.36 ACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAGCGCCAAAAGAACAACGAGAAGCCCCAGGAAAACAACATTATGACAGACGTGAGGCATTCTGGATGCGA:1 - chr2L 6644441 3' - hobo 397 1 77.23 ACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACCTTTCCGCTGCCAAAGCAATCAAACATGGATTTTGGCTGCCCTTCGAGGAGCACCCTCAATCTAAAACAGGCAAA:1 - chr3L 7295480 3' + F-element 402 1 70.30 GAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGACTCTCTTAACTCTTAACTTGACTCTGGGGATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGATATATTCTTCTTTTGAATGAG:1 - chr2L 7669907 3' - R1A1-element 30 1 36.63 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCGTGTTGTGTGGTTGGGCTTACACTAAATGGATTGAAAACGTAAATGAA:1 + chr3R 31996761 3' + mdg1 392 2 52.48 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACAGAGAGGAAGCGAA:1 + chr2L 22690015 3' - Tabor 6881 2 63.37 AGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATC:1 - chr3L 12072530 3' + HB 1614 1 57.43 ATCAGATACCCGTTAATCACCTAGTGCAAACGCGAACGCGAAATTTCATCAGTTTTCGGGTGCATATAGGCACTTAGGCAAGGAGTACTTATCTTATCTCA:1 - chr2R 23586964 3' - INE-1 545 1 59.41 ATCTTGATCCTGATCAAGAATATATCAACTTCATATGGTCGGAAACGCTCTCTTCTGCTTGTTACACCCTTTTAAACTGTTTTCGCCCACATTAAATGTCG:1 + chr2L 20867272 3' - INE-1 85 1 70.30 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGCTTTATTTTGCGCCTAATAAATCTCATTATGTCATTATATGCTACTCCCCCAACCGCCAGCCCACCAACGAAAAAAAA:1 - chr2R 18358038 3' - jockey 4678 1 80.20 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCTATCACATA:1 - chr3L 3254953 3' - 1360 14 1 66.34 ATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACTATTAATATTTTATCCCATTTCACTTCGGCGTCCATAGCCGGTCCATTGTCATCGGCACTTGTTGGG:1 - chr3R 12796860 3' - I-element 5290 1 68.32 TGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACCCGATCGGACCTCACTCAGCGTGCTCCTGCTCGGCGTCCTCTCATCACCAGCG:1 - chr3L 21943979 3' - invader4 2923 2 65.98 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAAGTTCTAGCAATCTAAATCAAATTCTTTGATCTTAACTTGG:1 - chr3R 13494964 3' - F-element 51 1 66.34 ATGAANAGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAAAAATTGACAGTGCTTGAAAGGTCACAATTGGAT:1 - chr2R 1344519 3' + Dm88 4251 1 70.30 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATT:1 - chr2L 222119 3' - P-element 59 1 20.79 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTGCTTTTCGACGCTGAGGAGCCGCCCGTGCGAGTCACTG:1 + chr2R 20973974 3' - jockey 4789 1 66.34 ATATCTGGAAGGACGACAATTTAAAATCTTAGTGAGAACTAACTACTCCTCTATATACCCAATGAGAGCTGGACCTGAGCTCTAACCAGCTAAATGAGGTT:1 + chr2R 19828326 3' + Helena 492 1 72.28 CCGTGCCTTCGACGGTCACCCAGCGCGCACATGCCCACACACACACACAAATACACACACTCGAATTGGCAGTGGCCATTGGCAACTAATTGCC:1 - chr2L 5373579 3' - gypsy10 5810 2 62.77 CTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAACTATCTTCGATTAATCTTTTTAGAAATTGCACGCGTGCGCGCCTCACTGTTCCAGATCAATGG:1 + chr3R 22062743 3' - roo 9044 1 59.41 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAAAAAGGTTGGGAAAAATAATAAGCCA:1 + chrX 697543 3' + roo 406 1 79.21 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTT:1 - chr3R 178121 3' - BS 41 1 68.32 TCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACAATGGGCAGGCACTGATGGGGCTTGATTCCGGCCAGAGCCGTGT:1 - chr3R 27154907 3' - R1A1-element 5038 1 56.44 GTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATAAAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTTT:1 + chr3L 25341891 3' - 297 11 2 54.17 TGAGTCGCGATAAACGGGAATGTCTAATCAGTAAAATGTTGGTTAGCTACTAAAAAAGAAAAGGTATGATGTATAACCGATCTCACCTGACGACTG:1 - chr3L 573981 3' - rover 7131 2 64.58 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAAT:3 + chr3L 5827934 3' + blood 7343 2 69.31 CACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCCAATGTTAGGCTCAAAGATCAATCACCATTTACAACACCG:1 - chr3L 20852909 3' + F-element 55 1 61.39 TTAACNACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTGCATACCCTCCGTTATATAACGATGGAATCTATATTGAACAGACTAGAGACGTATTTCA:1 - chr3R 11685553 3' + mdg1 7442 2 59.41 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCT:1 - chr2L 306468 3' - Tirant 19 2 61.22 CGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAGTGGGAGTGAAAGGGTTGTGGGCGGGGCAGGCGGGCGG:1 + chr3L 4646987 3' + R1A1-element 5333 1 62.38 AATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACATTTGACCGAGGAAAGTTTGCTCGCCCTCTCGCTCTGAATCCGTGCCCCTCTC:1 + chrX 2658540 3' + S-element 157 2 59.41 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAATGTGTGCGTGTTGTGTCCGTGTGTGCGTGTCGCTACACATGTTGCTATTTGGCAGCT:1 - chr2L 13482119 3' + hopper 1401 1 62.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAGCACCACCCAACCTCCCCCACCCACTTAGCGGGCTTTACGC:1 - chr2L 10635227 3' + roo 396 1 64.36 AGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAGAGCGCCAAGAGCGTAGTAAGCGGCGTA:1 - chr2R 11115742 3' + hobo 468 1 72.28 AACACGTCTTCACACGTCAGCGAACACTCAGAATAGTATTGTAAGTCAATAGAATTATTAAGTAGGATCCATCTTAGGAGGAGGGAGTGCGATGCCCTGCA:1 + chr3R 20303792 3' - Doc2-element 11 1 61.39 TATTCNTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGAAATATGCATATGAATATC:1 - chr2R 16517963 3' - Doc 36 1 59.00 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGA:1 + chr2L 21292989 3' + roo 9024 2 73.27 GGCGTNGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTCTGATTAGTTTAATTAAAGCGTATTTCAATTGCCCAGTGCGC:1 - chrX 10555393 3' - Tirant 8120 2 68.32 AACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGCAAAAAATTTGCGAAAAACAAACTTTGATAAAAAAAAGTGCGCTAATCAAAAACGTTTATTTATGTTATG:1 + chr2L 3759905 3' + flea 251 2 74.26 GCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAGAGTTTTTAATAATTTCTAGTAGATATGGGTTAATGGACGACGCG:1 - 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chr2R 9872916 3' - F-element 4545 1 55.45 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGC:1 - chr3R 14913174 3' - blood 55 2 77.23 GACGANGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATGTGTGATACCGCACAACGAAGTTCTAGCTTTTTGTTGCAGTGCAGCTCT:1 + chr2R 18891130 3' - opus 10 2 59.34 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTAAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATG:1 - chr3R 10490346 3' + transib2 2790 1 64.58 GAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGGTGAACAGGATGAGGGCCTCCCACCAGAAGATGCGGTTATCCCGGAGGAAGTAGATCAGCACCACCAAAC:1 + chr2L 9733085 3' - gypsy5 7022 2 74.47 ACTAATAAAATTATGAAAAAATATCTAAAAGTATTTCAAAAATGTGAAAGCCGTGCCATTATCGAAACCAAGGTCGTCGGGTAAGCAGGGTGTGGCAAATA:1 + chr2R 3524083 3' - INE-1 401 1 57.43 CAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGCTCAAACCAATGCTAGCAGTCACATTTGCACGATGGGAGCCGACTGGCACACGAAG:1 - chr3L 17969229 3' + R1A1-element 399 1 63.37 AATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGCCGCTAAGTAAACGTGGGAATGCGGAAATTTCCTAATTTATGCATG:1 - chr2L 15997845 3' - 412 3 2 76.24 GCTCCAAGTGTAAAGTTATGACATTTTGTCGTGCCAACCCAATACGCACGACTTACACTCTAAGTGGGTTTTCTTCTTGGACGGGGCGGCATTGTTGCTAT:1 + chr3R 28833935 3' + Q-element 666 2 69.31 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTAT:1 + chr2L 1353766 3' - I-element 45 1 71.29 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCAAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTC:1 - chr2L 18112524 3' + transib2 2776 1 71.29 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTAGCAACCTTCCACATAACTATATTTGCAGGAGAAAATCTAGTATTCAAATTTTAATTGCA:1 + chr3R 17468416 3' + Transpac 271 2 65.35 CATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCCAGACAGGCAGTCAGGGGTCAAGTAGCCGTCAGGGGGTAAGTATTAAATCCATTAAACGTTCCAAGAACC:1 + chr2L 7362804 3' - Tirant 8272 2 72.63 CAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGAGCCCACTTAACACGCCCGCACCTCTTGCACTCGCTTTCGCAACGCGCTTTGATTTATTTGCCACTCC:1 + chr3R 15050304 3' + G6 51 1 71.29 CGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCAACCGAATCCAATGCGTTCTCCGCCTCATCGGAGATCAGCACTAGTTTCC:1 + chr3L 12509108 3' + G5 4633 1 67.12 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAAAATCTGGAAAAAATACATGAATGAACTTATCTA:1 - chr3L 2539265 3' - roo 8704 2 69.31 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGT:1 + chr3L 12707832 3' - jockey 4780 1 56.57 CTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTACCTAACCCAATTATTGTGCGTTTATGATAGAGAACTTTGAAAAAGTTAAAAACAAACTAAGAACCAGG:1 + chrX 5789130 3' + diver2 131 2 74.00 GTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCACAGAGGAGCTATACGAGTACGTGACCACCATGGTGTGCGTGTCACTCACACAACCATCCAGGGGCAGTTGGGCCATC:1 - chr3R 11294069 3' - G-element 4144 1 44.55 TTGTAGTGAAACATCAACTACTCTTCCAATCTTACAGTACACGACTTACCACATCAGCATTTTCCTTGTCTGCCCGCTCCACGTGCTCTTGCATTGATTTA:1 + chr3R 18266096 3' + jockey2 40 1 61.39 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATATTAATGTTGATATAATGGTAAGAGATGTAATTTTTATTTTTCTACAGCCCTGATTTTTCGATACTGCTG:1 - chrX 2766729 3' - mdg1 7044 2 73.27 ACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGAATTGAAATCGTAAAATTATAGCTATA:1 - chr3R 4692140 3' - Doc2-element 459 1 77.23 GGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGGCTTTCCCACGCGCCTAGAGGCGATTTTCGCCAAAGGGGAGGAATATCGGAGGGGCCATT:1 - chr3L 716870 3' - Stalker 6978 4 65.35 CCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACCAGAAGCATCAGCAATAAATGAAAACAAAGGAGG:1 + chr3R 9422550 3' - invader4 2870 2 62.20 ATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGACTATATCCTAGCAAATAGCAGCGCTCCTTTTGATTACATTTTAGAAAGAAACATCCTCCTACC:1 + chr3R 4418545 3' - rooA 198 2 74.26 CTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGTCGGGACGAAACGGGAAATATCGATCTAAATTTAGCTGGACCCCTGTGGCATAGGTGTTTAGTGGCGTTATG:1 - chrX 22386925 3' - accord 58 2 73.68 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTC:1 + chrX 22386755 3' - hobo 78 1 64.37 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTAATGACCAAAAGGTAAACAACGAAGGCAGCCAACAGCGGTATCGATAACCAAACTAATC:1 - chr3R 12408318 3' + P-element 2867 1 59.41 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACTAAAAACGTATTAAGATCTTTGGGATATTACAGCTGATGTTGGCGTTTGTGAACTGAAGAAGAAAGC:1 - chrX 7413928 3' + pogo 2094 1 44.55 CTCCCCACAAATCTCGAGTAGGAGAATGGCCTAGCAACAGCCTTGTACCCGAGCGGGCAAAAGGGTAAATAACGGTTGAGTTCATGGCAGATAGGAAAGAT:1 - chr2L 8540234 3' + gypsy8 16 2 74.26 GAATACTCTTATGTCAAATATTCTAATGAAAGGTAATTTTTGAAATTTATTTAGTTCTTTGTCATTGTGTCTTTGCGACTCCCACGTAAAATGTTTCAATT:1 + chr3R 8865864 3' - 1360 402 1 52.48 CAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAAGAAGGTCCTTAACCTGCAGCCGGGGGCGGATTGCACTTGCACTCACGTACATCACTCGCA:1 + chr2L 11658671 3' + Quasimodo 7068 2 66.00 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTACAGAGCGTTGGCAATT:1 - chrX 3485665 3' - P-element 57 1 22.77 CTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATAAGAATATGCTACCAACCTCGACGGGCAGCGCAGGCGCAACCGATTAGATATTAACTCG:1 + chr3R 2216700 3' - Gypsy6A_LTR 261 1 52.48 CACGCGACGCGAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACAGTACGCTAAGCGACCAAAGGTGCGTATACTTCTTAAAAAATGCATCCGTGGCGTATACTTGAT:1 + chr2L 325847 3' - G6 86 1 67.33 GAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAACGGTTACTTTTGAATATTTTGTGCAGAAGCCAAATTCGCTTTAGCTTCACC:1 - chr3R 10100817 3' - accord 7130 2 51.49 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCATATTTGCATTCGGACGAGAGATGGGCATATTTATGAACAGACA:1 - chr3L 11491933 3' - Quasimodo 42 2 61.39 ATTGGATACATGATTTTGTGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGTGGTTATGTATGTGTTCGTGTGTTACCGCCTCTGTCGACGTCGCTGCCGGCGGCGCT:1 - chrX 11384654 3' - Quasimodo 110 2 46.53 GTTAATATTCTAATTCAATTTCAAGTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTTTAGCTTGGTTCAATGTTTTCGGTGGCAGCACTAACCCGAAAACATTGAAA:1 - chr2R 23034799 3' - mdg3 226 2 61.39 TTATCGCGTAGTTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTACATTGATGTGTTAATTGCCGCAATTCCAAGGAGGCCAAGGAAACAGGCAATCACTAGACCAGGG:1 + chr3R 6475688 3' + Ivk 64 1 78.22 TGTGGGCGTGACAGTTTTGCGGCTTTAAGGCGTTAGAAGAGGTGGGTTGTGACCAAAAACCAAAAGGAAAAGGGAACCTCTTTGCCAGCTGTCTGCTGTGG:1 - chr2R 21253386 3' - INE-1 241 1 65.35 ACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGGCAATGAGAGGGGGGCGAACCAATCAACTGATTTAGTGCACGATGGGCTGGCCCCCTGTC:1 + chr2L 4293073 3' - opus 7237 2 72.28 GGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGAATGGGTTGATGGGTGCAAACACAAGTGTACAAACACTCTTGGCGAAAGATTG:1 + chr3R 13495403 3' - F-element 4388 1 55.45 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTCAAAGTAATATAGAAAACCACTTTATTAAGGCACAT:1 - chr2L 5611386 3' - pogo 38 1 64.36 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACAACGGACTAGTTCC:1 + chr2L 1353786 3' - I-element 25 1 52.48 GAAGCTGACGCTTGCGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATTTCGCAGCCTCATCGCTCCGCTTTGTTCCACATCAGGTGCTTACATGG:1 - chr2R 15732077 3' + Chimpo 4118 1 61.39 CTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTATATCCCCCA:1 + chr2L 12843419 3' + roo 8648 1 65.35 CTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGGTGCTCTACGTGGACAATACGGTTTTTAATGGCACCTTTGGCTTGTGGCGAGCCTGGAAGCTGG:1 - chr2L 11510370 3' - Quasimodo 7140 2 68.00 GCACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTC:1 + chr3R 2533949 3' + gypsy8 158 4 49.50 CAACAACACCCACAAACACACACACAACTAACAACCCCCACCCCCGACTTTTGTGGCCCCCAACTAGCAATAACTGTTGACAATCTTTGGCAACT:1 + chrX 6941580 3' + gypsy3 421 1 68.42 AACGGCGACTACGCGCATTCATTATTTCCGTAGTGTAGCGGTTATCACGTGTGCTTCACACGCACAAGGTCCCCGGTTCGAACCCGGGCGGGAACATGCG:1 + chr3R 7452115 3' - micropia 106 1 76.00 TAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTACAGGAATTTAGCCGGAGGATCCGTGCGAACTGGAATTCAATAAC:1 + chr2R 23711376 3' - 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I-element 5065 1 80.20 TATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCAGCTCCACGTGTACAGGGAACGGGCGCTTAAGGTGTGGTACAAAT:1 + chr2R 16685467 3' - Stalker4 7185 4 60.40 AAAAAAAAAAGAAAGGGAAAAGGAGAAAGAATAGAAAAAACGTCAGCAGGCCCACTGACAAACTGAGCCAGCTGATGGAGATTGACAAACTGACAAACTGA:1 + chrX 9989278 3' + Doc2-element 229 2 52.48 GCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACGTTTCCATTGGCCCGCCTCACGTTGACACGTCTGGAGTTGTTCCTG:1 + chr3R 14564396 3' + Doc 239 1 57.43 AAGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGGCTAGTCAAGGACTAACTATCAACATCATTGGTCATCATCAGGACGTCAGCATCAGCTGGGCCAC:1 + chr2R 15782952 3' + blood 494 1 66.34 GACTTGTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATT:1 - chr3R 20140557 3' - jockey 32 1 57.43 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGCATCAGTGTGTGAGTTATTAATATTTTGAAATTGGGTGAGCAATGACTTGCCGAT:1 + chr3R 16370889 3' - roo 8703 2 60.40 GAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAGCCAAGTGGTTCGGAGGCAACCACCCCGAATAGCAGCAGCACCACCAG:1 - chr3R 25355946 3' + HMS-Beagle 6652 1 55.45 TGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTAAAAGAGGATTTGGATGTGGGCGGGTGAGACAACCATGGCGGATACTGAA:1 + chr3R 20385005 3' - Doc3-element 4571 1 69.31 CATGGCGCACCAATTATTGTTCGCACGATTTTTGATTGTGCTCGTAATAATTGATTTTAACGTGTATTGATGGTTATGGTGATATTGATTTAATTGGCCAT:1 - chr2L 842325 3' - Doc4-element 2681 1 59.41 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGTGGGTGGAAAATGCAGCTGGCTGGTGTTAGCGAAAATATTTTCAAAGAAA:1 + chr2R 15436115 3' - jockey 4798 1 55.45 TGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTAGCCAACTTTGTTCTAATTGTTAAATTCTAGGGAAATGCACATCGTTAATCT:1 - chrX 11203527 3' - I-element 4879 1 49.50 ACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATTGTCAGACTGGACACACTCCAAGCGCTTTCAGCAATGGTCACGAGAGCAGCGATGGCACTTTGGCGGATG:1 - chr3R 8836801 3' + Chimpo 61 1 65.35 CTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCGTTCTCCGTGAATTTCCGCCGCTTTTCTTTCGCCTTTCCACTGTATCTCTGCC:1 + chr3L 2337672 3' - R1A1-element 4977 1 62.00 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCGACCATCGCATTCCCATTCTATAGTGCAACC:1 + chr3L 2978997 3' - hobo 16 1 59.41 CAATTTTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATTACTTTTAGGGAGTTTGTTGCATTAGTTTGGGGATTCTAGATGACAGGGATT:1 - chr3R 15648509 3' - Porto1 368 1 57.43 TTGGACTCCAGCGGGCCAAGGGCAAAGAGGTCAAACGGTAAAGTCGCACACGCTGGGCTCCTCGAAGGCCGCGTGGCGGACGGCCATGACCCACTTTTGCA:1 + chr2R 6764629 3' + gypsy8 109 2 62.38 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTGTATGTTTGCACTAGACGCACGGGAATATT:1 - chr2R 23469765 3' - I-element 36 1 60.40 AACCACAACTACTCTTCAAAGTTGAGCTGGAACCTGACACTAAAGCCATCCGGAAAAATGAAGTGCATCCAATATACGTTCTTCAAGTACTGTTGCGGTAA:1 + chr3R 20044598 3' + Fw3 311 1 76.24 GACTATAGCATTCTCTCTTGTTATTTTCATTATTCTAAGGGCTGCTCCACAAAGAGTACCGATTGCATCCAAAGCGATTTGAAAGGCGACTTTAAGCAGGG:1 + chr3L 16142486 3' + INE-1 580 1 64.36 ATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAGATATTTT:1 - chr3L 25613044 3' + Stalker4 398 1 68.00 TGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCATGTCATTTTCCTGACTTTTTTTT:1 - chr3R 6265612 3' - flea 4857 1 76.24 AGCAAAGTGACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGATAAATCACAAAAAAATGCTGCTCCTTTGCATTAAAATTTACAACC:2 + chr3L 10126938 3' + gypsy4 456 1 57.43 TTGGACATGAGGAGGCGAATGATTGCCCATGGTGCAGAAGTGGATGGGGCTGATCCTCGTTATCTGATCCACGTTAGTCAACCGATCGAGTGCGGCATGG:1 - 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copia 28 2 54.46 GGTAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATATACGGCGCATGTGATTCTAGGAAGACTGCACCAATTAAACACACATAAATCA:1 - chr2L 22745032 3' + diver2 79 2 56.44 TATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTTATTTTCAAAGTAAGGGGTTGGTTATCATATATAATGAAATTAGAAATGGGAGCTTAAGCAAAGATA:1 - chr3L 18225181 3' - hopper 966 2 55.45 CCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGTGAAGATTTTAAGTCGCTGGGATTAAAGAGACAAAAAATAAGGATGCTTTATTTGTATTTGGC:1 + chr2L 13465827 3' - Doc 4362 1 67.33 ACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATATATATATATACGAGTATACACAGTCCCTGGAATTACTGAGCGCAAAATAATTAACTGA:1 + chrX 12817567 3' + HMS-Beagle2 298 2 65.35 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGTAATATTGCGAACTCACTCAGCGCCGTTTTGAATGAGTGGAACCTTTTAAATAAGGTAG:1 + chr2R 6493193 3' + transib2 2809 1 70.30 CCATGGGTTTATGGCGTGATGCATTGGAGCCAGGGTAGATCCACACTTTTCATATTCTTTTGTATTCAGTTCGGTCTGGCTTGAGATTTGGCACTAATTAC:1 + chrX 9030928 3' + gtwin 7100 2 71.29 CCCTCGGTCGGTTGGTCGGGCGGTGTGGGTCTGAGAGTGGGTGGTTGGGCGGCGGGCACGCGTGTGAGTCGCGCCTATAAATACACGAAAGTAAATCAAGT:1 - chr3R 24137553 3' + Cr1a 4419 1 81.19 CTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGACAAGTTGGCGCTTATGTTATTGGGTGGCCAACACTCGCGCGTCTGTGTGTGTGAGAGCCCCCA:1 + chr2R 23043151 3' + micropia 36 2 66.34 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTGTGCCATTTCTCACGCTTTCGA:1 - chr3L 13888646 3' + copia 234 1 77.23 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCC:1 + chrX 2090293 3' + roo 9037 1 56.44 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTGCCACTGAGTGCAAATC:1 + chrX 1548558 3' + roo 9042 1 54.46 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTCCACAGAGCACGGTCACACTTCACTTTGTTCGCCATTGCTAGACAAAAAATTGTTTCGAG:1 + chr3L 9864662 3' + P-element 2871 1 63.37 TATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTATTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTGAAGTCAGCGTTTCTGGGGCGTCCATATCCATAGCAGCACTGGCGGG:1 + chr3R 11987061 3' + Circe 7102 1 53.47 TGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCAGCCGGATAGATGATCATCTCGCAGCCTGCGTTGCGATAGAGCCTCGCCATCTCCTCGAATCGA:1 - chr3R 9402110 3' + diver2 59 2 67.33 GATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATACAGTCAGAATCGCTTCCTTCAGCCTGTTACACACTGAAACGAATCCCGTGGGCGTTTAACGGCATCT:1 + chr3R 31482564 3' - INE-1 84 1 74.26 CTTTGTGCACGCACCGTTACCGTTCGACCCCTTCGCCTTTGGCCCGCTAGAGTCCAAGGCAGTCGTCACTGGGTCCAAATATTGTCATACAATATGCATGG:1 - chrX 16515057 3' - gypsy8 4795 2 58.42 TTTTATTTCTTTATTTTTTTGTTGCCCCAGCCACACACTTCCCATCCATCCAACTTCTTTTCCTCGTAGCTGTTCATGTATCACGTCCGAAAAGAAGTTGG:1 - chr3L 21653611 3' - Juan 4215 2 76.24 TGCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCC:1 + chr3L 23678117 3' - Osvaldo 33 1 71.72 TAAGTNAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTGCGTGTGTGCTGATTTTGCTTTTGTTTGTTTTAACAATTCTCGCTCGCACTATGGTTGTTG:1 + chrX 17659280 3' + Stalker 7116 4 64.36 ATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCATAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGCGAAAAAATTCAAGCAGGCATTATAAGCCTGTTGATTGA:1 + chr3R 19448885 3' - baggins 5058 1 61.39 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATTCAT:1 + chrX 1523771 3' - jockey 34 1 57.43 GAGGCGACAACGAAGTGACTGAACGGGCTAAATAAAACCCATTTGAAAAGACAAACTCGGTGTCCAGCGACGAGGGCTCCAGCATAATGACAGGTGAGCGA:1 - chr3L 20153461 3' + Chouto 455 2 59.41 AATGCAGTAACAATAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAAT:1 - chr3R 25796044 3' - BS 5053 1 77.23 GTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTC:1 - chr2R 5532368 3' - Doc4-element 13 1 56.00 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTG:1 - chr3L 3254990 3' - 1360 51 1 76.24 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTCTTTTTTTTCGCTGTGTTCTGTTGTCAGCTGCCAACTATTTGGGGGCAA:1 - chr2L 9854095 3' - Transpac 4945 2 57.43 TAATTGCTAGGGACTTAGGGGAACATATTGTATATTAGGTTTAGTTTTCAATGATCAATTACAATAAACGGGCCAACTGAATGCGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chr3L 17507099 3' + HMS-Beagle 150 4 70.30 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTACAGTGGC:1 + chr3L 15853534 3' + jockey 4972 1 61.39 CTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCAGTTTCGATATTTTATATACTTGAGCAGGA:1 - chr3L 10731368 3' + jockey 4697 1 70.30 ATTAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATAGTTGACAGGGTCAAGTACAGGATGAATTTATTTTTAAGAGATTTATAAATAAACATCAAACGAAATGC:1 + chr2R 22058939 3' + transib4 2595 1 75.25 GTCAGAGACGCCATTTCGGACGCGCAGAGGCGCCGCCATTTTGGAGCTGGGGAGCGAGCGAGAGGGGAAATGATAAGGGAATTGTTTCGATTGAAGACGA:1 - chrX 8049427 3' + aurora-element 414 1 55.00 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGAAATATGCA:1 - chr3R 29019026 3' - Doc 47 1 70.30 AGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACGCCGCACCACACTGCGTATACGTAATGCGAATTCGCATGCCATTTTGTTTTGACATTTTCAAGGGTTTT:1 + chrX 8110309 3' - Dm88 444 1 68.32 AACGAGAATATACACAGAGGCATACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAACAATTTCTGGCTTTTATAAATCAAAGCAAGTAAAAAACGGAAAA:1 - chr3L 1893206 3' + Doc3-element 4435 1 55.45 CCTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGTTGCGTTTGCCGTTTGGCTGCTGCACAAATTTTGGTCACT:1 + chr3L 11696474 3' - blood 7013 2 75.27 TGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGGCAGCTTGTCAATTTTGCACAAATAGTTCACTGATTTATTGTTCGCTTTTTGTTGAGTTTTTTCGTCGATTTT:1 + chr3L 7527281 3' - TAHRE 278 1 69.00 AATAAATTAAACATTTAACAAAACGCAATATTTGCGCATATGAGCACTTTCACCGCTTGGGTAATCAAAACAGACTGACTCCATTTGTGGCAGACAAATTC:1 - chr2R 8687636 3' + HeT-A 12 1 72.28 TAAACCAACAAACCGCGAAGTTATAATTATATATATGTAAAAACGATATGATTGTAAACTAAGCTAATATACCCTATACTACTACTAGCAAGAGGAATATG:1 - chr3R 21408677 3' + Quasimodo 7360 2 67.33 ATATTTAGATTTTGTGTGGAAGACTGGAAGACCGAGAGACTCAGTGGTTGAACGACTTCTGCGACAATGTGTTTGAGTTGGGTTTTAAGTTGGCTTGAAGG:1 - chrX 12001039 3' - Cr1a 316 1 81.19 CCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTGGGACCTCCCGAACACCA:1 + chr3L 26852107 3' + diver 202 2 56.44 TAACTGCTTTGCCGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATCTTATCCATCTCTAATCTTCGCCCGTTTGCCTATTTTAATAGACCACAATAAA:1 - chr3L 8221693 3' + Ivk 380 1 69.31 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATGTAT:1 - chr2R 18891042 3' + opus 472 2 58.42 TTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGACCTCCACCTCGCACATACTACCCATACCCTTAAGGCTCAATGAATCACTGA:1 - chr3L 15377300 3' + R1A1-element 5055 1 57.43 TGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGATTTTCGGTGGGGTGTATGACTATTAAT:1 - chr3L 16907187 3' - hopper2 1176 2 75.25 GTTACTCAGCTAGTGTGAATGTGAACGCGAAATTCTAAGAAAAATATCCAATGCAATTTGATACAATTATACAAACAAAAAAACATTCCAATGAAAGCTGT:1 - chr3R 12366999 3' - INE-1 534 1 71.29 AGTCCATGTTACTGTCTAAAAACAACAACAATACAAACATACATACATGGAAAACAACAAAAGCGTCAGAAAACACAAAAACATACATATTTTGAGCCCAC:1 - chrX 10795897 3' + HeT-A 5866 1 83.17 TTGTTCGTTGTCTATTTTTTTTTTACTTTTTTACTTTTATTTTGCTGGCGTATTCGTATTCTTTGGCTTAACGACTTCAGCCTTCGTCGGTATACTAA:1 - chr2R 6610900 3' - Doc3-element 184 1 69.39 ACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTTATCGACCGCACATCCTTGCCGGGACTCTCCACTCTTGGCCTGTAAATTT:1 + chr3L 2697323 3' + HMS-Beagle2 62 2 56.25 CCTGGNGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACTTTTTGTTTAATTCAAATGCACGG:1 + chrX 6223222 3' + R1A1-element 4988 1 75.25 AAACAGAAAAAAAAAAACACCAAAAAATAAGCAAGCGACAGTGAAAATTTACACATACCACTCGGCCGTGTTGCCCGGCTACTGAAATATCCTTGGGTC:1 - chr3L 9544920 3' + gypsy7 5011 1 71.72 ATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTATTTGGATTGAAAAATGTTTGTTGACTTTTCGCAGGCTCGATCATTAAATTGCAATTACGTAATGGCAAACTT:1 + chr3R 13864624 3' + Tc1 1510 1 65.35 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTTTTTATTTCCCATTCATTGCCTTT:1 + chr3R 5775763 3' + invader4 322 2 73.68 TATAAAGGCTAGAAGGTTGAGATTCGGCAAACGATGTGGATGAAAATTCTTCCGGTTTCTTGAGCCCAGAAGATAGCAAAGTGTTATTATTGCCGGGCAGA:1 - chr3L 22983962 3' + INE-1 162 1 69.31 AACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGCGGCGTAAGTGTAAAAGCCCTCAACTCGACAGCAAATCCATGGCCAAGCAAA:1 + chr2R 22448656 3' + Stalker4 7274 4 55.45 CTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCCCATTGAAGCCGAAGCCCAGCTTCCTTTGCT:1 + chr2R 12957373 3' + McClintock 60 2 65.93 ACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCAATCTTTATATAATTTATTTAAATTTATCATGTTGAGAATTAAGTGGAAAACACTTGGAGTCGAACG:1 - chr3R 15673699 3' + Gypsy6A_LTR 382 1 58.24 GAAGCNAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGC:1 - chr2R 6838492 3' - I-element 38 1 66.34 ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCTGCTAGGAGTATTAACTTAATTGGGA:1 + chr2R 4341815 3' + hopper 1369 1 69.31 CTCAAGATGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCTAAATGGAAATGCTTTTGATGCCATCATTTCTGCTCTTCGCGTAATCACAAAGCCCCAA:1 + chr2R 24325251 3' + Quasimodo 280 2 65.35 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATACCGTTCACAAAATGCAAACAGGGTCAACGTAACCCCCGAAATATTAAGCAAACTTT:1 + chr2R 6715065 3' - pogo 14 1 63.37 TGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 19622331 3' - accord 7034 2 86.36 TTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTAT:1 - chr3R 31996562 3' - mdg1 320 2 73.27 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCATTTTAATGTTGCCATGCAAAAGTCAACATAAGCTACAAATTTACCACCT:1 + chrX 10123309 3' - copia 26 2 53.47 CACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTCATTAGCTGTTTTTGTCGCCGTCAGTAAATTAGCAAACATAATGGACTTTATTGGCCTGCATTCCACA:1 + chr3R 20516034 3' - mdg1 481 1 71.29 GGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTGGGGGCACGCAAACACACAAATACACACACAGAGCGCTCGG:1 + chr2R 16928955 3' + blood 7387 2 76.24 CAGAATCCTAGACTGTGCTTGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTTGCTGTGGTAACCGCTTGCCTTGCTGTTTCGCTGACAACTGAAGTGA:1 - chr3R 15994602 3' - Doc3-element 4380 1 68.32 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTG:1 + chr3R 8480456 3' - transib2 54 1 78.22 TGTCACTATATATTTTTAAGCAAAAATCAGAGGACAATAAATGCCAGCGTCATTAGACGTTGAAAATATTTAAAAAAAAAATAACCTAGGAGAGGACCAAA:1 + chrX 20995367 3' + TART-A 13341 1 78.22 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCTAAACACCGTCAATATAAAACTTGTATTGTTTTTATGACTTCTTTATCCACAACAAAACCATGCG:1 + chr3R 8185274 3' - Doc 23 1 61.39 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTC:1 - chrX 1399859 3' + P-element 2857 1 49.50 CACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTTT:1 - chr3R 18860347 3' - R1A1-element 5047 1 70.00 AAAATGGAATTCTGGACCACAGTGCTATGGATGCTCATAATCATATTGGGCTCCTCGAAGGGAGTACCTCTTTTGGCGATTTACAAAAGTAAACACATTAC:1 + chr2L 11165427 3' + transib2 2821 1 74.26 GCGTGGGGTGAGTTTGGGGATTGGACATAGATTTGGTGTTAATGGATACGGGACGCAGCGCCGAGTGTTCGATCTGCACGTGCCAGGACCACTCCAAGGAC:1 + chr2L 1197559 3' - HeT-A 5933 1 60.40 CTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCTCGACCCCCACATCCCCCACCACTGTCCTCTGCCGCAGCGCAGCTCTT:1 - chr3R 16231464 3' + Transpac 62 2 56.44 GGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCAATTTTGAACATTGCTACGATTATATTTCCGTCTCTATATTTAATTTGTTTGG:1 + chr4 486261 3' - Doc 4471 1 55.45 ACATGTCTCGCTCACGCGCCAGAAAACGTTATGCAACTAATTGAATCAAAGACAAAGCTGCGACAATGAAATGCCAAGGGAATGCGCTGCGGAAATGCCAA:1 - chr2R 20491038 3' + invader1 335 2 63.37 ACACACACACACACACACATATATCCATTGTCGGGCGCAGTCAACAGGCCCCTAATTATGTGTAAAGGTGTTGCATGTGCTCCTCGCCCCAAGATCACGCC:1 + chr3L 1430072 3' + accord 183 4 78.22 AAAAATAAGACTAATAATGATGCTAGTCAAAAAAAAGAATGGCACCGATCGACTGTGTGTGGACTATCGCATGCTAAATGAATCTCTTTGAGGTCAGCAAT:1 + chrX 15173821 3' - invader6 6 2 65.35 CACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATGTGTGTGATACTTTCGCACTTTCCGCA:1 - chr2L 2588340 3' + HMS-Beagle2 166 2 70.30 TTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTACCCCAGAACATGAGCTATTCTTGTTTTTTT:1 - chr2L 13078266 3' - I-element 4911 1 70.30 TTGATNATATTTGGTTTTAAGAGGTGGGCAAAGGATTACCCTCTGATTCGATCGGGAATACTGAATCGGTAAGGTAATCAAAACGAAAAAAATGACGATCT:1 - chrX 15709225 3' - FB 324 1 54.46 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGATTTTCCCCGTTTTTGTTGAATTTCGATCTGCGCCTGGATTGCCGCAGAGTTATCACCCAAATCGATG:1 - chr3R 17788884 3' - roo 9 2 68.00 TCAATAAACTTACAAGCTCAAAATTAATTCGTAGGCCATAGCCACGACATCCATAAAAACCCACATATCGCTTACATTTGTTTTAATGATATACTGACATT:1 + chr2L 6078036 3' + gypsy7 166 2 59.41 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGAAAAAATGGAAAAGGATTTTTGCGCGGCCTTTTTACATATTTTTCCGTTCGGGTCAGGCACATAACTGTGC:1 + chr3R 11097612 3' - mdg1 4 2 76.24 TCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTCTCTCAAAAAGTAGCTCCTAGTCTTGTAATTAAACCATGTAAACCGTATAATAAACGTGCAATA:1 + chr3R 14031455 3' - Stalker2 380 2 70.30 GTAAAATCATGAATATGATTTGGCGTTAAATCCTCCTTTAGAGTATACATCCGGTGCCTTCGATTGCCTGCGCCCAAGGGCGTCGCCAGGGTAGAGCCTAA:1 - chr3R 3859243 3' - Transib5 2704 1 70.30 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTCAACACTGATAGTACAAAATTCTCTGGTGTGTATCTATCGATTTCCCTTATCAGTT:1 + chr3L 19051923 3' + roo 9053 2 60.40 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCAC:1 - chr3R 20140546 3' - jockey 21 1 68.32 AAAGACACTAGAATAACAAAATGCCCAATGGAGCCATGTACATGATGATTGGCGTGAGCATCGAACGCTTCCCGGAATTCAAGGACGACACCCACTTTGTC:1 + chrX 14264507 3' - 1360 3387 2 79.21 TGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAACGTCCAGTCGGTAATTAAATTATTT:1 - chr2R 24457282 3' - Quasimodo 410 2 74.26 ACATTGTGACACTTTGTCACATAAATTATAATAAACATAAATAAATAGCAAACGAAGTACACTCACACACACACACTTACAAGTTTTGACATGCCACACAG:1 - chrX 20902723 3' + Stalker4 66 4 73.27 ACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGAAAAAAAAGGGGGAATCACCAAGGAACCACGACTGCGAGATGATATATACAGCTGACTAGATCTTGGGTAGAATA:1 + chr2R 12219458 3' + accord 31 2 78.22 CTTGCGGTCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTATCCGATATAGTATGCACCCCAGTCCGCTCATTTTCCTCCTTCTGGTGCT:1 - 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Ivk 5112 1 72.00 AAAATAAAATATTAAAAAAAAATAAAATATATCTATTTCAAATTATTTCTTTTATTTTGGTAATCCCTGTGACCAGTGTGCCTCACATATATTTAATTGCA:1 + chr3R 18503713 3' + BS4 728 1 69.31 GATCCTGATCAAAAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCATCCTAACGTCCACTAACTACTTTTGAACAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTAT:1 - chr3L 24731967 3' - INE-1 80 1 43.56 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCGTCGTCAGGTGTCCATATCTTTTGTGCCACAGTACACC:1 - chr2R 1747116 3' - Transpac 4954 2 60.40 TCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATG:1 - chr3R 31996561 3' - mdg1 7351 2 70.53 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCA:1 + chr3L 9762256 3' - jockey 4780 1 49.50 TCTAAGGACAGCCTTCGTCTTAGAAAGGGAGGAGTTAACACATTCAACGAGCAGCAAGAAATTGACAAGTTCTGGATAGAAACGGATATGAAAAATAGCC:1 + chr3R 12559668 3' + Burdock 6105 1 57.00 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACGTATATATGTATGTATAAGTGAGAATTACATTTATTTTAAGTAATAATATTTACCAGT:1 - chrX 8299662 3' - 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Bica 201 1 78.22 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGC:1 + chr2L 12843408 3' - roo 8687 2 54.46 TTAGGAACAGAATCCATAATATCTGTTAAGCTACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTA:1 + chr2R 4339481 3' + G5A 2756 1 82.18 AAAATATTGAAGATAAAACAAAACATTTAAGAAATCTAAAAATCGGAATGAAGCAAGAAAATCAATTTCAGCACTTGAATAAAAGAGGCCAATGAACGAAT:1 + chr2L 14733699 3' + Tc1-2 83 1 69.31 CAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAGACCAATAATAATGCCCATTAGCTAAA:1 - chr2R 8158727 3' - Juan 13 1 74.26 CTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAATTTGTAATCATGCGGTCTTATACACAACTCTTATCGGATTCCCATCTCACATGCAACAACACAGTGGTG:1 - chr2R 13552014 3' - jockey 4568 1 74.26 TTATCAGCAAAACTGATCCGTATTTGATCCGCTTCTTAGTCAGTGATGCAGAGAAAGAAAATATACTTAGTATTCCAAAACAATTGGGTTTAAGTGCTTGA:1 + chr3L 8385147 3' + BS 254 1 72.28 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGGTAGGCAAGACAACCATTG:1 + chr2R 5640435 3' + roo 403 1 73.27 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGTGAGAGTTCAATTCAAACAGAACATCTGATACAATTATTTGGAAATTATCAA:1 + chr2R 18889884 3' + opus 7431 2 58.42 GGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCAAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGATCGTTCCTGGTCGATTGTTTTATTTGTTCACCATGCTCCTTTTGCATTTAAT:1 + chrX 22670555 3' + R1A1-element 495 1 56.44 CCGTTTATTGTAACTGATCATTTGAAACTGAAACTAACATACCAAATATATTCCAAAGTCCCTAGCAATCAATGCTGAAGCGTAGCCCAAAGACAAGTGAA:1 - chr2L 8917337 3' - HMS-Beagle2 7146 2 70.30 CTTAANCGCGTCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCACAACCTGAGAAGTGAAACTGAAAAAGTGTTTTCCTCCACTAAACTTAACTAAGAGCGGC:1 + chr3R 5416689 3' + Stalker3T 237 1 65.35 ATGCACTTGAATCCAACAGAAACGGAAAGCTTTTTCAATCTCATTAGCCTTAAACTGAGAAAAATGTTTTATGTGAAGAAATGTTCGGACTATAAATGTTC:1 + chr2L 17970015 3' + Idefix 7165 2 69.31 AAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAGTGTATGGCTGTTACGCATCTTGTTATTCAAGTGCTTTGTGTTTTGATGTTGAGGGCCTCCAGTGACT:1 - chr2R 4122480 3' + 1360 3344 1 65.96 CACCTAATTGCGATTGGTATGTTTTTAAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTTTTGTTGAAGAGCTGGCGTGGCCGAGATTAAAGACTATATTTATG:1 - chr2L 1307792 3' - I-element 226 1 55.45 GGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTTTTACTGTTTTGTTGCACTTCTATTGTTAGTTTTTGTTTGTTTGACTTTAAGTGTTTAAATTCCC:1 - chr2L 8327500 3' - 1360 3177 1 70.00 TCGAGACGTTCATACGGACAGACGGTCATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCATGTATGTATATTTTTTTTTATATTTCG:1 + chr3R 6500723 3' - INE-1 130 1 82.95 CAAAAATGCTTACACAGCTTTAAGGATCAAAACTTTCCACGTAGCCAACGACTTGCAGCGCACTAAACTGACCTACGAGAGTCGCGCCAATCTGGCTAAGA:1 - chr3R 21071768 3' + Quasimodo 7076 2 63.37 GTGAGGCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGT:1 + chrY 2720341 3' - 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chr3L 25200640 3' + S-element 1699 1 58.42 ACAAAAATTACTTGTTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATGTTATAAATTGAAAACTATAGTAGAGAACCAATACATACAT:1 + chr2L 7929491 3' - Tc1-2 1461 1 74.26 AAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGAAACATATACATAATAAAATTCACACACC:1 + chr3R 21651369 3' - I-element 4997 1 71.29 GAGAGGATTTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGAAGCAGATAAATAAAAGGCAAATCTGTCGTTGATAAACGGAGATTTGTTAATTGAGTAATTTTCC:1 - chrX 3021405 3' - Doc2-element 4560 1 69.39 GGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACAGGACTCCAGGAGTCGGAGGTACAAG:1 + chr2L 3242981 3' + roo 8708 2 75.00 GGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTGGCGAGCTTAGAGTTACTGGTAGTTTTGTGCGAGTGTATTTTTTGGGTTTCTTTTTTGAC:1 + chr3R 14064247 3' - I-element 4956 1 62.38 CTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTTCGAGAGTGATTCCTTTGGGATTTGTGCAGTATTTTAAACAAA:1 + chr3L 24293958 3' - F-element 346 1 56.12 CGGATATCAGCTTAAGACTAAAAATCAGAATGCCACCATTACCATTCTGATTTTCTAGGCATCAATGATATGGCAAACAAATCGCAGTCCATTTCTTTATG:1 - chr2L 22025789 3' - 297 279 2 73.27 AAAACTCATCATTATTGTTTCGAGATGTTTTTAATTTTTTTTTTCATCACCTAGTATGGTCGTTGTCGCTAAGCCTTTTGATTTCGGCTCTAAGCGTATCG:1 - chr2L 17000154 3' - pogo 1784 1 74.26 GTTTGGGAACGAGACACCCTGTACACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTGTTTACATTATCATTTGTCTTGCCAATTTTTATTGGTACGCCGAAAACATT:1 + chr2R 6250275 3' + 3S18 2 2 69.31 GTCGAGTTCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATCAAGCGTGCAAAAAGAGCTTGTTACAGTGTTGGTCACCGTATCTGGAAAGAACGTAAGTAA:1 - chr3L 26013535 3' + INE-1 145 1 63.37 CCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTGCAGGAGAAAATCTAGTATTCAAATTTTAATTGCATACAAATACATAGGTAAAAGAACTGAAACCCGTTTTT:1 + chr3R 17468453 3' + Transpac 5227 2 78.22 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACC:1 - chr2L 16691179 3' - pogo 48 1 75.25 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACATGTATCTCATTTTATAGGACGA:2 + chr2R 8157268 3' + Transpac 294 2 64.36 TCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGGGTGTCTAGCTACGGAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 17971843 3' - roo 158 2 39.06 CACGTGCAAAGCTCGCAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCTTTATTGGTCAGCGAACTCAAGG:1 + chr3R 26587073 3' + Idefix 7069 2 73.27 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGTCTTGCATATATATGAGAATTTTTATGAGC:1 + chr2L 17862243 3' - F-element 56 1 71.00 ATGTCGGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCGTTCGTAAACATACATATAT:1 - chrX 18200367 3' - F-element 289 1 76.24 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCGTAAGTCTTTTCGTCATGGTGAATGGGGTACGTCC:1 + chrX 2381280 3' - jockey 4775 1 63.16 GGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGAGTTGAGAGAGTTCGTATGTGTGTGTGTGTGGGTAGTGTGTGGCCGTGCTTTCTGCCTTTGTATCTGTT:1 + chr3R 5422500 3' + I-element 162 1 69.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGAACAGAATTGATAGCATTCTGCTACAATTTGTTTAGAACTGTGAGGTTCTTTAAGTTACAACGCC:1 - chr2R 9618035 3' + roo 400 1 67.33 AAGTTATGACATTTTGTCGTGTCAACCCAATACGCACGACGGGGTTGGGGCGGAAGGGAGAGGTCTGGAGGTCTTAGGATGGGTAGCCAGGGAACATTTTG:1 + chr3R 26497406 3' + Q-element 678 2 63.37 GAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATATGTTCAATATGCCACGGGGAGTGACAAAAAGTAAATCCAAGCGTGGGAAAATTAAGATGGAAAACGATATGGC:1 - chr3R 21580408 3' + invader2 297 1 78.22 CGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGGTGGCAAAATAAACATTTAATTAAATCGACTGCGTGTGCAGAAGG:1 - chr3R 20481287 3' + G2 2882 1 55.00 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTGAGGAT:1 - chr2L 6656252 3' + P-element 2877 2 67.33 ACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACGCCCATTTAAGGGAATTCAACAAACCCCAT:1 - chr3R 4532515 3' + Quasimodo 291 2 75.00 CCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGCGAACGAAGCCTTTGAAAATGCATTTTTATAAAACCGGCAAGGATGACTTGGTGCGT:1 - chr2L 6655064 3' + P-element 26 1 64.00 TGCATTGTAAATTTGACAAAATATACCCTTCCACTTGGTCCTCCGGTTTCATTGGCTATGCACCAAGAATATAATTTATTTTCCATATAATTTTACAAGCT:1 + chr3R 7664531 3' + 1360 199 1 73.27 GCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGCTCAGAGATGGCCGATTCCTCGCGGGACATCTTGATTTACGAATTGAGGAGACTTGTGCAGGCTCAGAGATGGCCG:1 + chrX 12900633 3' - X-element 4357 1 46.00 AAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGGGGCTTTAAACTGCGCTGCACTTGGTATCGGTTATGCGTGATTTTTACAGAATCCATTCACTCGACGGGGCGGAGC:1 - chr2R 9931488 3' - I-element 57 1 63.37 ACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAAACGAATGTTTAAACTTTAAAGTGGTATAGATA:1 - chr2L 20880414 3' + hopper2 1275 2 68.32 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAATTTGGTTTTACAAAGAATCTGTGAAATAAATCACTTAGTAATAAAGTCTGGCCAATAGTTTATGTAGT:1 + chr3L 25798540 3' - blood 8 2 72.28 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGAAGTAAATTTATAGCAAATGATGTGGTTGCTGCCCGACTCC:1 + chr2L 12237092 3' + jockey 4960 1 56.44 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGC:1 - chr3R 23618161 3' + hopper 1414 2 56.00 CACCGGTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTCCTTCCCATGCAGCGTCTTTCGTCTGAGGTAATTATAAAAAGCTGACTGGGGCCCCAGAC:1 - chrX 3009019 3' + Max-element 85 2 61.39 CAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGTTGACTGCATAAAATTATATAAAGCAAAAACACAAGTGCAAACACAAACGTAAAGAAAGGAAGCCAGTACATAG:1 - chr2L 16422977 3' + micropia 354 2 53.47 GTAATCAAAAATCCCTTAATTTTGCATTACATTTTAAAGAATCTAGTATACCATTATAACACAAGCAACATAACACCAACCAACATACAAACCAACCAACA:1 - chr3R 22711227 3' - S2 62 1 51.49 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACTTTTTCAGTGCTGAAAAGTTTTTAGCTAA:1 + chr3R 25931400 3' - roo 16 2 64.36 CTTCTGATGTAGTTTATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGGACATAACGCGATCGTATTCCCGCTCC:1 + chr3L 7124409 3' - mdg1 398 2 74.26 GACACAACTTATTCACTGCCCGCTTCGTCAATCCTGTCGGTGCCCTTAAGCTTGAAAATGCTGTTTATGATGCCATTTACTCCGACTCCAGTTCCCACAGC:1 - chr2R 18138588 3' - diver2 4460 1 61.39 ACCTTTTGTCGTGCCAACCCAATACGCACGACTTACACTCTAAGTGTGTGTCTGTGTGCTTGTGTTTTTGTTTGCGCTGGATTTTGGTCTGTTTGGTGGCC:1 - chr2R 9313766 3' + Q-element 686 2 57.43 TGAGCNTTTAAAGGTGAAGTGTTAAACAACTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATAAACTAAATTACTGCCCCTGTGAAATATCATTTTCGTTCGGC:1 - chr3R 30923810 3' + transib2 151 1 57.43 AATGATAATGGTTGGGGAAACGTTTTTTATTGTTAATATTTCGCTTTATTTCGGTACTGACAAAAGGCAACATCAGCGGCAAACACAATTTCGCAGCGCAC:1 - chr3R 28015357 3' - FB 353 1 71.29 GACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTATGCAAATTGGATGCAGCTTTGTGTCCCAATCAGTTTTCCAGATTGGAAGCAGTGGGTGTGTCCG:1 - chr3R 5778006 3' + invader4 2687 1 69.31 GGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGACCGGTGACGAAGCCGACGACTTGCTGGAGAAGA:1 + chr2R 8124907 3' - Doc 316 1 73.27 CCGAAGTCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTAGATATTTGGGAAGTTTTGGCCAATTTCGTAATTTCAAGGCGAGTTTTGCTCACCTAAAACCGCATATT:1 + chr3L 15511641 3' - 1360 3174 1 60.40 GCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATTTTTGATTATCTCATCTGAATATATCCATTATACAGATTCACACCCTATGAATGGC:1 - chr3R 20862100 3' + Ivk 5033 1 59.41 ATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCGCACCCCCCCACACATATGGCAATTAATTGTTGTT:1 + chrX 13705467 3' + mdg1 70 2 65.35 CGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTTGCGAGAAGACTTTGCTTTGCGTGAGAGTTCTTTTGCATGTGACGCTTAAATTAATTTGCACAAGCTTCGCTT:1 - chrX 9943426 3' - Cr1a 4396 1 72.00 CATCGGTACAATTCACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTGAAGACATGGCAACCGTGTGTCCCCTTAAATTGTTAATTGTTTTCCCTTA:1 - chr2R 12214373 3' + ZAM 7974 2 58.42 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATA:1 - chr2R 18358421 3' - jockey 4673 1 58.42 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTGGCGTATATTGCATT:1 + chrX 5726802 3' + roo 398 1 68.32 GCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGAATTCAACTGCGAGGCGAAAAGCATTAAGAGAAAA:1 - chrX 3691982 3' - accord 185 2 88.41 ACTCAGCAGCAGCCACGTGCCACGTGCCACGTGCTGGTACACCAACAAACGATACGTACACTGAATGAGGCGCCACCTTAATCCATTTCACACAGCAGAGA:1 + chr3R 24946392 3' + G-element 234 1 55.45 AGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATCTCGCGATC:1 + chr3L 20224246 3' - Chimpo 6 1 72.28 AATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAAAGAGTTGACATTTCTTCGTAAGTCAAAATAGTGTCGCCGATTAT:1 - chr3R 19447621 3' + roo 8621 1 56.44 GACTTCACTTGAATGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATGTATGTACATGTGTTGGACGTGGGGAATATGCGGTTTAAATGACAAACTAAATAAAATG:1 - chr3R 25428102 3' + HMS-Beagle 6937 2 68.32 ATTGGGATTTAGGTAGTGTAGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCAGCAAAAGCGAACATTGTCAGCCCAATTTC:1 - chr2R 20948311 3' - I-element 4976 1 67.33 AAAAANAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGATTCCATTGGCCAACT:1 - chr3R 23618114 3' + hopper 1410 2 74.26 ATCAGNCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTACTTACCGGCATCAGGACACCAGACATCAGGATATCAGGACATCGAGTGGAGCAGTC:1 - chrX 7404772 3' + invader1 3908 2 61.39 ACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAATCAGTGACGGCTTTTCCCGCCAGCTGGGAAATGAATATGGTGGCCATAT:1 - chr2L 4152439 3' + gypsy4 310 1 57.43 ATAAAGAAATTCACGTCACCAGTAATATGCGTCCTGGAACACAAAACAAGCAAGAAAGAAAAGACAGCACACAAGACGAACGGTCGGAAAAGAGATAGGG:1 - chr3L 18005791 3' + Osvaldo 1396 1 73.00 TAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCCTGGCCCTATTTTCCCAGCCCATCCCATCGCATTTTCCATTTTGCCTAGGCCAAACCAAACAAACCGGG:1 + chr2R 24228330 3' - Quasimodo 38 2 88.17 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCTTGCCAAGAGAA:1 + chrX 8491466 3' + P-element 2851 1 43.56 GTGACATAAGAAGACAGAAAACTAACATGCCCAACAATTAAGGAACAATCACAAAAAGCTGCCGAAATCTGGGGATGCGCAATGAAAAATAAGTTTGAGAT:1 + chr2L 7331679 3' + Fw2 96 1 67.33 TATTTGGGTGATCCAAACCGGCCATTTCAATTATTTCAAAGAAATAGAAACAGCAAACCAATCGATGTAGTAGTAAGTGTTATGGACAAAATGTAGCAAAT:1 + chr2R 16600530 3' + 297 6589 2 55.45 CTCACTTCGAGCCGATCAAAACCTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCACCGGGTCCTTGTAAATTTGCTGCTCGTTTCCCCGCTTCACGTGCTGTTTTTATGG:1 + chr2L 15161508 3' + rover 7149 2 52.48 TGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCCTTCTCGATATCCCGCTCGATGGTGCAGGGCGAGAGGCCCGTCTTGCAGCAGATCTCGTCAAAGCT:1 + chrX 16882926 3' - Quasimodo 317 2 69.31 CGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGAACATCAACGGCAACGTTGACCGCAACAAGCAAACACATGAGGGTCAAACTGTGAAAAAAGGAAAAC:1 + chr2L 4726803 3' - R2-element 3199 1 73.27 AGACGTTCTCCCACCGTATCTTCTAATTCTGAGGTCCTCGTCCACAATTACCATGAATATTAAGCCACAATAAGAGCCAAAAGCTGCAAGCTGAACTCGCA:1 - chr2L 16393280 3' + gypsy6 7697 2 73.27 AAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTAATGCGGAAATTCCCCGCTTTTCCTCCCGCT:1 - chr3R 28586543 3' + I-element 5083 1 76.24 ACTCGTCGAGTGTTCGATCCGGTCGTCGTGAGTACATCAGCGAAGCGTTGGTAGCCGGAAAATCGGCACCGCTCGCACCATATCCATCTACCATGCCCGG:1 + chr3L 9889747 3' - G6 5 1 50.00 TCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAAAAGTTCTCGTTCCAGTTGTAACTGCCGAGGAAGCAATCTGAAACATTTTAGTCTTTTCGAGGGAGCGGG:1 + chr4 1022774 3' - Idefix 322 2 74.26 TAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGAGTATTATGCTAACTGTAGGTGAGTTC:1 + chr3L 139166 3' + Stalker 133 4 73.27 CCATCAAACCGCTTAATAATACACTTCATATGCTGTTATCTGCTTCATCCGTAAATATCCTGCAAACTTTTCAGAGCATCCTCATACCAACCAACTTTAAA:1 - chr3L 18377656 3' - copia 448 1 63.37 ATTGGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTCAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAAGAGCTGGACGAAGAAGCAAGGAGAAGATTTCATCAAACACACACATA:1 + chr2R 12275466 3' - Max-element 152 2 56.44 GAGATAGTATACAAAATTGGAGGAAGCCAATTAATATATTCGGAAGACGAAAGTTCTGGAGGAGATCAAGCAGAGCAGACGGGTGATGAGAGCAAACCCTA:1 + chrX 13328743 3' - Gypsy12A_LTR 2074 1 58.42 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTATGACTCTTAATT:1 + chr3L 2539316 3' + roo 9030 1 66.34 GAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCATCTCTCGCTCTTTTCTGTGTCGCCATGTCAGTTGTCATGTCAATTGATCTGCCTTG:1 - chrX 17264253 3' + 1360 3199 1 63.37 CGGCTNCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGGTGACTA:1 - chrX 11042503 3' - jockey 4691 1 65.35 ATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCATGGCCATGGGCGTGGCATCAGGAAAATGAAAACAACATTTTACCAGCAACAGGCAGCGACGTCAAGTGCGGAGC:1 - chr2L 3431066 3' - FB 221 1 76.24 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTGCCACATAGCTACTACCTCTCTGCTGTCGGTG:1 - chr2R 21937490 3' + 412 449 2 70.30 GCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACTGAACGACGAGTCGATGGAAGAAATTTCCGACGAACTTACAGCTACCATTTCGGAAGA:1 + chr2R 5928686 3' + F-element 224 1 66.34 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAAAGGACTCCCTGCAAAGCCAACATATGCCCCACGTTTGCCAGAGACACAACTTATCA:1 - chr2R 22778330 3' - BS 6 1 61.39 ACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCTACTTTGTGTCCGTGAATTCGAGTGACTTTTCGTCTGTGAATTGGATCTTGATTGAATCTCGATAGTTGA:1 + chr2R 17854515 3' + Stalker4 7009 4 65.35 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCCGCAATAATATATATAAAGGGACAGCAGATAG:1 + chr2L 17050211 3' - flea 39 2 73.27 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAACACATGGCTGCGGTCAAGGTTCGCGGACACATTGTGGTCATGAAC:1 + chr3R 22352852 3' - 412 7085 2 57.43 TAGAAAGCTTTAAGCTCGCAAACAGCTGTTTGTGCGATCGCATGTGAAACGAGCCGCAGCGCAGATCCAAATACGATCAAAAGTTTATTGCTCG:1 - chr3L 11711987 3' - X-element 247 1 57.45 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGCACATTAAATTACAGTTTTCAGAGCCAAGAACAAACA:1 - chr3R 27619210 3' + hobo 2901 1 69.31 GAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTGCCTTAAGCCTCAGTGCTTTCACTTTTTGTGTATGTTTTTGGTCCGCAACAAAGTTAAGTTAATAAA:1 - chr3R 12064943 3' - Ivk 5318 1 62.38 GTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAACTAGAACTTGTGGCCAAAATAA:1 + chrX 17559112 3' - R1A1-element 4904 1 49.50 ATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCACAGTCAAAGGTTGAAAGTGCACCGCAATCTGGCCATATGAAAACCAT:1 + chr3R 17400617 3' + F-element 4245 1 54.46 CTAAGCGTGCAGACTGCTCTCTTTCCGTACATTTAACAGCTCAATTGCACGCTTGGTATCTCATCATTGCAAAGGTTTAAAGCTTCAATTATACCGCTGCT:1 + chr3L 24054581 3' + Cr1a 338 1 55.45 AACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACTATTTTCTTGGATACCTTGGCTGGTGGCGAACAATTGCCGCTCAAAGTTGAAGTTGAATTGGCG:1 - chr3L 3254428 3' + 1360 16 1 66.34 GTCCTCAGGTCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAATCAATCCATGCCATGTAAGTCCGAAGCTAAAAGGCTACATTTTAAGTTAAGTTAAC:1 + chr3R 19198249 3' - blood 413 1 66.34 GGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGAGATTTGGCCCGTTGGCAGGGCAACGATTATTATGAAAGCAGCAAA:1 + chrX 18441687 3' - hobo 2621 1 57.43 TATAGATTTAATGTCTATGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATACATATGTACATATATTGTCAAATTTACAATGCAGGTTCCGTGGGCTTCAAGCGATTCCTT:1 - chr3R 14668970 3' - 1360 239 1 73.27 ATTCCACTTACAGCTAATTCAGCGATCGCAATCAAAAATGCTCAGAAAAAGCACAAAAGTCTATAAGGGAGGAAATAGCCTTAGACCCTATCAACTTGAGG:1 - chr2L 236082 3' + Porto1 4307 1 60.40 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCAC:1 - chr3R 11005453 3' + roo 9045 1 51.00 TTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAG:1 - chrX 22398534 3' + Gypsy6A_LTR 156 1 59.41 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGTGTGTCATTGGCATTATTAGTTTTTCCGTAGCACACTTTTCCGACGCCCC:1 + chr3R 19535765 3' - hobo 25 1 54.46 GGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATCTCTGTACTTGGGTCCTTGTACTGCTTTCCTCCTCCGCCGGCACTGGCGATGCTGGCCCCACTGCCGCTC:1 - chrX 2668770 3' - Circe 47 2 74.26 TGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGTTGGCTAAGCACTCGCCTGTGGGGTACATCACATCGGATAAAGTTG:1 - chr2R 16294990 3' - 1360 259 1 55.45 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGGGGCTTTAAACTGGATGGCACAAAGAATCCAAGTGAACAGCATTGTGTAGTGGTTAAAATGTCAACCGGAATGGGTGTTA:1 - chr3R 26556673 3' - I-element 53 1 43.56 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGCGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAAT:1 - chrX 2253851 3' - Tirant 55 2 78.22 TACATATTAACACCCACATCTCCTTCGCCCACCATCCATCTCCCTTTAAAGCCGCTTTCATTTGTATATAAATATATTTTCCAGTTATTTTTGATTATTCC:1 + chr3R 4522710 3' + transib4 2404 1 71.29 AAAAACACGACCATTCGCTTTGAAAGCCAAATGAATATGATGTAAAAAATTGTGACCTGGCAGTGTAATAACCTGAAAAATCGCTATTATAGCCAAGATAT:1 - chr3R 11120019 3' - Cr1a 9 1 66.34 GTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTAAACATACATATTTTGGCTCACATCGTTCGTGGCTGATT:1 - chr2L 11826461 3' - Bica 137 1 71.29 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAACCTAACAAGAATCGAAACCTAAATAAATTG:1 + chr3L 22564899 3' + blood 357 2 58.00 CTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGCATTATCTGGCTGCTGTTGTTAGTCTCT:1 - chr2R 10019223 3' - F-element 348 1 72.28 AAATAAAAGAAAAATAAAAACATTAAATGGCTTCCCTCGAAGTTGCATGCGAAATTCGCAATTGTCCGGCTTTTCGCTGGCAGTCGATAATTGTCGACAGG:1 + chrX 14874333 3' + gypsy7 5008 1 72.28 CTTCTAGATTTTATAGTTCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGG:1 + chr3R 3586559 3' - INE-1 155 1 53.54 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGACTACTTGATCGGTGGAAACTAGCTATACAGAAGGTTATTTATTTATAGAGAATATTAT:1 + chrX 17947389 3' - hobo 18 1 61.39 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGTTCTTTGCATACAAAAATAATCAATTG:1 + chr3R 14913204 3' + blood 7341 2 72.28 CTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATATAAGGCAACCGAGGGAACTCCTCTCCGAAATCCCGTGAGTCACTGGACCATCGCTGGCGCATTTGAACGGAGCAGAA:1 + chr3R 7395604 3' + X-element 4471 1 61.39 TTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGATGCGGGTTAAATGTGTTTCGAGGCGACTGGAAATCA:1 + chr2L 16940994 3' - Ivk 291 1 63.37 AACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACAAATTTAGTTGTGAAATTAGCCAAGAGAAAAGGAACAAAACAAAATCGAAATGA:1 + chr3R 9285791 3' - 1360 3187 1 54.46 AATTATCCATTATTGTAATTAAATAAATTATTTTATTTGTGTCCAGTGCCATCCCCCCTTTCGATGTATACATGTATCCTGTTATCCTTGTCTGGCCATC:1 + chr3R 25930960 3' - hopper 196 1 58.00 CAACTCCAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTTCCCTAATTTAAACATTCCACCTCCCCCGGCGTTCGTGCCAGACCCATTTGCCATGATTA:1 + chr2R 22011291 3' + Idefix 6976 2 59.41 AGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAAGCTCTACGTACTGAGAAAAAAGTACGGTAAGAAGTACGTCGATTTACGCTAATGTGCCAGTGTGTGTAATTAG:1 - chr3R 20949704 3' - Tirant 11 2 69.31 TTCTTTATATACTGCTGACCTACCAAGACCCAATCTAACCGATTCAATAAGCGTTCGAATTGATGGTGCAGTAATAATAATGCTCTTAAAAGGGGTTGGTA:1 - chr3R 13185368 3' + BS4 111 1 71.29 ATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGGGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCCAGC:1 - chr2L 5932090 3' - jockey 8 1 69.66 TCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 5324 1 51.49 GTGTTCCATCCTGTAATTGTTGTTGTCTTTGTTTAGGTCTTAGTTATAACCATCTAACCAAAGTGTTCGTCTGAATATGGACTTGGGATGGGTGAGACTG:1 - chr2R 19811258 3' + transib3 330 1 70.00 GTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACTCAGAAGCCGCCCACTTCTCCACAGCCAAAATGCTATCCCGGCTCATCCGATCCAGAGTGCCTCAATTGC:1 + chr3L 20419194 3' + Doc 4448 1 77.00 AATAAACTTCCACAGCAGTCGATATGCCGACAGACTTACCGCGCACCCGAACACGTTGCCAATTGTTGCCATTTCCCGTATCCAATACATTGAAGCGTCC:1 + chr2R 8784891 3' + G5A 2589 1 58.00 TCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAATGCTATCCAACCAAGTATTAGGCCCTAATGAACATATTAAGGAAGGCAGCTGGAACGCACCT:1 - chrX 22877148 3' + HB 1291 1 78.22 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACTCATTTAGAAATAGTTATTTACC:1 - chrX 13354277 3' + pogo 2052 1 83.84 CCCACTTTTCACCCAGATCCCACTTTAGCATCAGCGGATATGACATCATACGGACATACCCATACCGACCGGCAG:1 - chr3R 2893144 3' + G6 1720 2 68.00 GCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAGAACCGCAGCAGAGCCCCCACAATGGCTCCACTTTGGGTTCGATTTGGTTTGGTTTGGCAAT:1 + chr3R 10821031 3' + F-element 471 1 62.38 AGGCGAAGCCCTCCCAGCAGCGATTTAGTTAGTGATCATTACATACACAAAACCAAACAACCATACCCACATTTTAGAGTAGAACTTGATCGCTAAAAAAA:1 + chr2R 4736330 3' + rooA 299 2 68.32 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTATTACGCTGTGTGTGAGCATGTGTGTGCGAGTGTGCGCTT:1 - chr3R 10949681 3' + hobo 2917 1 53.93 TCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAACAGGTCGGTGTTCTTCTCAACAGTTCCTAGGAAATATTTTCGTTTTATCTCAGCATTTCTTGGTATCATCTA:1 + chr3R 6195228 3' + Idefix 471 2 60.40 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGTACAGAGCGTTGGCAATTCGCGATAAAAACAATTATTTTGTATATTTT:1 - chrX 3485635 3' - P-element 26 1 53.00 GATCATCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAAAATGCATTGACTTGGATGAATGGTGATCTCACTCGTTAATTTTATGTGTTTTTTGTAAATAAATTACACG:1 - chr3R 31222502 3' + 412 7180 2 69.31 CTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGACTTGAGGAAAAATTAT:1 - chr3R 25795987 3' - BS 4996 1 72.28 TTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCGTCACATCTTCGGATTGCATAATAGGCAAATTTTTGTTATTTGACTTGATATCGTTTGTTTTGTATACG:1 + chr2L 21071089 3' - pogo 1653 1 74.26 ATCAGTAGAGATTTCAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGGCACGTGCTGCACAGTTACCGGGTTTTTAAAACTTTTGGTTCGCGTGCTCGCAT:1 - chr2L 10579273 3' + R1A1-element 5104 1 61.39 TTTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCACCCAAACAAAAAAAAAAATATTCAAGAAAAATAATATTTACATATATGTAT:1 + chr3R 23763360 3' + gypsy3 6687 2 57.43 TTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACAAGCGAAATAAAGTAAAGAAACGAAAGGAATGATGCTGAGCGGTGAGAAGGGGGGGAGGGGGGGAGGG:1 - chr3R 14965491 3' + gypsy7 5223 2 62.38 AGACAAAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCACACTGCAAAACGAATATTGCAGATTC:1 - chr3R 4581582 3' + Quasimodo 303 2 72.00 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAACTTCCTTGAAGGGAGTCAGTGTGTGTTGGTCACAGGCAAAACCTTGGCACAT:1 - chr3R 11005451 3' + roo 9046 1 49.50 CGCATAAAGAGATAGCAGACAAAGCGAAAGAGGCGCGACT:1 + chr3R 30903932 3' + 1360 152 1 70.00 TTGCCACATCTTCGTTTGTCGGAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCAAAATCAACAAGTTGACAATTTTAGAACTGG:1 + chr3L 24862149 3' + diver2 4746 2 78.22 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGTTGTAACGTCATGTCGGTGGCCATTCAGTGTGGC:1 - chr3R 14146647 3' + hopper 1375 1 68.00 CAAGCACACACACACACACACACTAAAAGGACGAGACAAAGAAAAACCAAAATACAGATGCCGCCCAAGGAGGAGGAAGGCAGGCTCTCCATATCGAATCG:1 - chr3L 15204409 3' + accord 7026 2 57.43 CACACACACACACAAATACACACAAATACAAATACACGAATTATTTAAAACCCACTCCAAAAGGAGC:1 - chr3L 19438945 3' + accord 188 2 61.19 CCTTAAAGGGCTGAATTATTAGCGCCCAAGGTGACAAAGCTACCCAGCACTTGTGATTCTAAGAAGACTGGATCAGTTCAACCAACATTTAGGTAGTTTTG:1 - chr3L 23271156 3' + BS3 1704 1 61.39 TAGCTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAAAAAACTTCGGGCTCCTCTGGAATAGCTACCTTTTGGTCTGGCCTGGTCTGGT:1 - chrX 13540119 3' + I-element 4890 1 48.51 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACTTTTTGAGTTAAGCAAAAGCACTCTTAAAAAAATTTGTTT:1 - chr2L 1912997 3' - pogo 31 1 63.00 ACATATAATATGTGGAGAGCTCTCCATCTCGGGATCCTTGGCATGTGGTGTTGATTGAGCAATTTGTGCGATCCTATATGGCATGCTATATGCTATATGCT:1 + chr3R 29305775 3' - baggins 5229 1 80.20 ACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCACGAACAACAACTATAACAACAAAAACAATTCCAACAACCAGGGAACAGCATCCAAGCTGAAGAGATAC:1 - chr2R 6507435 3' + gypsy4 366 1 71.28 TCAAGCTCTCCCCATTCAAGACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTGCTATCATTGCCAGCACTTTGCTGGGGTTTTCCACGGGTTTTTCTGGGGTACAGGAGCTC:1 + chr3L 14890177 3' + Doc3-element 447 1 61.39 TCTTTTCCCTTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGGTTGTTGTAATGAAAA:1 - chrX 7480761 3' - Bica 339 2 63.00 GCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTC:1 + chr3L 23678123 3' - Osvaldo 11 2 59.04 AGCAAAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATATTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGGATTAACAATTTGTCTTAATTCCTTTTGAATAATATCTACCACTT:1 - chr3L 11903417 3' - G4 3560 1 78.22 GGACCNATATGAACCAAACGCAGCGGCTACCTCAACTCGCTCCATGAAGGTCTCCAAACCTGGCCCAACAAGACCCAGGACTTCTTCCCCTATGGCAGTGA:1 - chr2L 8779755 3' + R2-element 321 1 75.25 TTTTCGTTTTTTTTTTTAATCTTGCAACGGGCAAAGTTTGTAACCCGGCACTTGACGCGTGGTGTGTGTGAGTATATATGTGTGTGTGTGCGTGTGCGATC:1 + chr2R 10955581 3' + Circe 7285 1 65.35 AGATCTCAGGATCTATAAAAGACAGAAGATGGAGATGATGGGGATGGCGATGATGATGATGATGATGGTGGATATTGGACGGCGTTGCTGTGAGAAGAAAA:1 - chr3L 5845860 3' + INE-1 149 1 50.50 ACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTA:1 - chr2R 5284560 3' + Doc4-element 2616 1 50.50 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTACACATTAAATGGACGAAAGAAGGCATATAAGCGACCGACCACAAAGGGGGGAACCGTGGAGC:1 - chr2R 5946531 3' - hobo 13 1 62.38 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAGTTTATTTTCCAATTTCGGGCATATATCATCCGTGCTTTGCAGCCGAATGG:1 + chr2R 20179837 3' - roo 52 2 60.00 GTGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTTTTTGGCTTACTTCCTTCGGTCCGTGAGACAGCT:1 + chr2R 8417327 3' - I-element 5086 1 55.93 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCC:1 + chrY 311346 3' + 1360 3380 2 61.39 ATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCATCCGCGGTCGGATGACGACGTAATCGCCAGTCAAAATTTTCCACTGGA:1 - chr3R 15366801 3' + invader4 2970 2 51.49 AGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCGAAGTTCACGTCAAGGACATTGCAGTTGCTGGCAAAGAAAAAAAA:1 + chr3R 16515871 3' - flea 4939 1 53.61 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATGAACAGAATTGATAGCATTCTGCTACAATTTGTTTAGAACTGTGAGGTTCTTTAAGTTAC:1 - chr2R 9618041 3' + roo 394 1 61.39 CGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGGTCAGGGGAACTTGCCAGGAGCGTGAACTGCGCAGGCAGATTTTGTCGCTGGATCTCGACTCATTGGAC:1 + chr2R 23691365 3' - accord 269 2 75.25 CAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTCCCCAGCCATTTTCCAGCTGACCGTACTTGCTTTCTAATTAAAA:1 + chr2R 12727916 3' + Quasimodo 302 2 56.00 CTTAGTCTGGAATACAAAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTTGGTATACATACATATATCTATTTAGTTTTATTTACTTTTTTGTTGTAATTTTTTTCATG:1 + chr2R 3169860 3' + Doc2-element 4312 1 70.30 CCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCTATTCTTTATTTCTGTAACCAATCCCTCGGCCACGCCCCCTTTTTGATCCACCCCTCTAAATGAAACTAACTCCC:1 - chr3R 11532002 3' + McClintock 190 2 60.40 TTGTGTGAGTAAAAACGAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGTGACGAAATCAATTTGACATGATTGCCATGGAT:1 - chr3L 19166248 3' - 1360 3244 1 79.21 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAG:1 + chrX 9260672 3' - 3S18 5793 2 50.00 GGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTGGTGGACTTGCGTTGGAGCGAATGATAAGTTTCATGCCTCCGGTGAGATGATTAACAGTCAGGCCGGG:1 - chr2R 2240911 3' - transib4 2379 1 54.46 AATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTATGAATAATCACTCGGCGGCAGAGTAAAAA:1 - chr3R 25522553 3' + jockey 4840 1 71.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTAATTAATCATATACACCTGAAA:1 + chr2L 8640862 3' + roo 356 2 79.21 CCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCCACGCCACTCCCCCAGGGAAGACACATCCGGATCCTTCTTGGCGGCACAGTCCCGTTCCTCCTTCCTGCCCACCGCATG:1 + chrX 4769067 3' + transib4 2332 1 56.44 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATACCGTTCACAAAATGCAAACAGGGTCAACGTAACCCCCGAAATATTAA:1 + chr2R 6715056 3' - pogo 23 1 54.46 GTGAAGTGAATGGTTATTAAAATAATACAAACAACTAAATACGAGTTGTGAGAACGCGCGCGACTTTGGTCCTGTGTCCAGGAAATAGATCCAGTTTGGTC:1 + chrX 21639700 3' + Doc2-element 67 1 68.32 CCGAAGATGTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCT:1 - chr2L 22407487 3' + roo 9018 2 72.28 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGATATGTGGTAGAATTTTCTTGTTGTATTCTTTTATTCCT:1 + chrX 5178453 3' - hobo 36 1 59.41 CAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACCCCCGATAACGAATGAACACTATATAGCTATATAGTACCCCTTGGCTCGCCAACTCCCCCGATATTT:1 + chrX 6603233 3' - McClintock 173 2 72.28 TTAAAGGTTAAGTGTTAAACAGCTGATTGAGAGAATCCAATTCCCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTGGTGTGTATGGTATGCATACCATAAAGTGGTTAT:1 + chr3L 22370255 3' + transib2 158 1 69.31 AGTAATACGACCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATAAGTCATTGTCCCACATCTCATATTTCAAAACATTGCATCTCTCAGTAACTTCGTAGAATTC:1 + chr3L 6802306 3' + Stalker 7000 4 68.32 TGTCCGCTTCCGAAAGTATTTTCCTCTGATTTTTGTTATCGTTATCCATTTTTTTATAATCGTTTAAAATTAAGATAAATGTTAATACAGAATCAAATTC:1 - chr2L 21806182 3' + gypsy12 9997 2 44.00 ATTTAGCAAAAAAAAAAACTGCAGCCACTCGCGTACCTAAACGGTTTCAAATCGTTGTATTTGGCAAAGGCCTTGCACAGAGCAAAGGCCAGGATAATGAG:1 - chr3L 8930887 3' + TART-B 10512 1 51.49 CGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGAGAGTTGATTCCGCACATCCTGCTGACTTTTCCCTTCTTTCCGTCTTGC:1 - chr2R 6559757 3' - Quasimodo 7095 2 54.46 CCTGCTCATCGAGGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGTTGAAATAGTAGGCCTGGCAATAACTACAGAAGACGAGGCAATCAGTGCTTCCAAGCTACTCCT:1 + chrX 19820778 3' + Rt1b 4968 1 69.31 AATTAAAACAAATTTTCCATTTGGGGGCTTATGTAAGGCAAGTTTGGGGACTTACTTGCTGAGTTTTCTTTACTTTTCCTTCCTTCAGCCAGAGAAATACA:1 - chr3R 18705012 3' - 1731 4262 1 81.19 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACAATAGTTGCCATTACACCATGGGGGTTGATTACAATTATTGTGTGTGCTTTAAG:1 + chr2R 15002435 3' - 3S18 5789 2 48.51 GCTTTAGACTGTGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGCTACATGAT:1 - chr2R 6838484 3' - I-element 30 1 57.43 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAATAGTAACGCCTCAATAGGTTCAATACCGAAAAGGTTC:1 + chr3L 5827970 3' + blood 7379 2 68.32 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATTCCACAGAGCACGGTCACACTTCACTTT:1 + chr3L 9864629 3' + P-element 2838 1 30.69 CTTTTATAGTTCCTGAGATGTCGACGTGTATACGGACAGACGTACATGGCATTCGATCTAACCGATTTCACTTTCGATCCGCAGCGAGCACCACACCATCC:1 + chr2R 8591560 3' - INE-1 148 1 59.41 CAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAATAAATCAAGTAAGTACAAGTTGGGCTATATTTTGACAT:1 + chr3L 15872040 3' + F-element 292 1 69.31 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACATTTGCGGCAACAAGGGTCGTCGGGCGATAATTGCAACAATAAAATGCA:1 - chr2R 22780970 3' + roo 9045 1 54.46 CCAAGTCCTGGCACCGTTATTAAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGTTATTGTCGGTGTTGGTTTACAATTCGTTAGCC:1 + chr3L 21917642 3' - Tc1 1268 1 72.28 TTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAATAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTCTGGTGTTCTCTGGGTCATTGC:1 - chr2R 19208045 3' + 1360 3275 1 78.22 AGACATCACATTTAATTAGTTCGCATGGATCTGTTGCCACCTGGTGGCTAAGCAGAAAGCACGGATAAACGGATACGGCTACGGATTGGAAATGGTACTGC:1 + chr3L 4143174 3' + Tc1-2 219 1 68.32 ATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTTTGCCTCACTGTCCTGCAACCGAAATCAGTGGCAGT:1 + chr3L 14483261 3' - F-element 4571 1 64.36 GAGCGNTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTCATTGCCTCTGCATTTTCGAGGACTTTGCCACCCCAAGATCCGCA:1 + chr2L 19090127 3' - opus 7030 4 54.46 CACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTATCCACGCCAGCTGGGCACCCAAGGTGGCACCGGG:1 - chrX 4021664 3' + Bica 121 1 65.35 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATATTTTGGTGTTTCAGCTTTTTTTCTGATTGCCAATCCACACAACGAAATCCACCGAAAAATC:1 + chrX 12666065 3' - S-element 7 2 72.28 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAACAGAGCAGTGCCAAAGGTCAAGTGCATTAGGCACCT:1 - chrX 2253800 3' - Tirant 4 2 77.23 TATTAAGACAAATTGTTAATCCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAATATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTTTGGCCTTCAAAAAAGAACACAAAACTCC:1 - chr3R 18891522 3' + G4 3505 1 72.28 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCAGCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAGCATACTTTGTGGCTGATACTCGGGAAGGATCTCTC:1 + chr3L 947947 3' - hobo 15 1 64.36 GGTGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCTTGACTCAAATGAGGCAAATAATTGGCAATGTATCAG:1 - chr3L 11526387 3' - 1360 43 1 66.34 AGTCTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATAACCTTGAACCTATTACACCTTACAACAACCTGATCTGTAACTAGGACCTATCCGGCTAACACCTGTTA:1 + chr4 1019093 3' + Stalker3T 323 1 69.31 TTAAANGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGTCGGTACTCACCATTTGGCATTTTCTGG:1 - chrX 19116376 3' + rover 7253 2 77.23 ATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTCGACTATTATATCACATCCCCAAACCTGTTGAAAGAACCCTCCCTTCTTGTTAGCAAGTTTATCCGAA:1 - chr3R 20797304 3' + accord 7222 2 64.36 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATAGTTCAATAATCTTATAATCTGTATAGT:1 - chr3R 17468367 3' - Transpac 4965 2 73.27 CGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTACAAAAACAGAAGCATGAACTAAGAAACAAGTCAAGTCGACTGCCATATACCCTATTC:1 + chr3R 13238581 3' + FB 991 3 63.37 CTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCCCGTCATAACGAAGGCCAAAGTTCTGCTGCAGCAAATCTGAAGAGAAAAACTTGAC:1 + chr2L 22227792 3' + F-element 418 1 62.00 CCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACACTGCCCCCTATCGAGCAGCCTAATTGAATATCCTTGGCATCCTGGCAAAACTTCG:1 + chr2R 9251017 3' + Tirant 108 2 60.42 ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCTATGCAATCATTCTGAGAATGGATTGCCCGCGAATTTTTAG:1 - chr3L 20656381 3' + roo 16 2 57.43 TATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATCTAACTCACATTCAGTCATCTTGAATTCCGTCACCAGCAGCTGTCAACAAACAAGCCAACCAGGAGTC:1 - chrX 10434810 3' + McClintock 6175 2 54.46 GAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAAACGAAAGAACGAACCCAGCTGAAGAAAAAAATTACAACAAGACCAAACCAAAAAAAAA:1 + chr2R 10961297 3' + F-element 312 1 61.39 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAATCAAAAGAGAAGAAAACCCAATAGGACAAAGGGGAAAGTCGACAAAAAGGATGTTCTCCTTAG:1 - chr2R 12813032 3' + Tabor 472 2 65.35 GGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGGTGGTGCGTTCGGGCCAGGAAGCAGAGCATTGACATGCCAAGTGCGAG:1 - chr3L 1978502 3' - G2 70 1 59.41 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTCATTGCCTCTGCATTTTCGAGGACTTTGCCACCCCAAGATCCGC:1 + chr2L 19090126 3' - opus 7030 4 56.00 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGAGTGTGCTGCTTAAGAAGTGTCAAAAAACTAAAGGCGTCGCTTTCGTTAAAAAAGAAACGTTAAAC:1 + chr3R 22667213 3' - 412 5 2 72.63 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCCGAGCCCGACT:1 - chr2L 11165344 3' - transib2 46 1 68.00 TTTAAAAAAATAAAAACAAAACATATGTTCTTTTTGTAGAGATCAAATAAAGAAATTATGGTTGCAACCTTTTTTTTTATGTGTACCCGGTTCTATGGCTC:1 - chr3R 9246973 3' + S2 137 2 69.31 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTA:1 - chr3R 9833054 3' - Tabor 44 2 68.32 CAATATTTCCGCAGAAATAATACTATCGATTACTTCAGGACATGGATTACCGCCAAACCACTGGATCTCACACAGGTGGGCATTAGCTCAGTCGATA:1 - chr3R 14800578 3' - Helitron 417 1 58.76 CATTAAAAAAAAAACTTTAAAAACGAAGCTTATTTAGCAACAATTATATTAAACAACAAAATTTTGTACTCAGAACGAGGACAACTTCTTGGAAACTTCCG:1 + chr2L 9648995 3' + P-element 2690 1 77.23 GGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATCCTCTAGTTGGGCCTTGTTGCCAGGGTGGTGCAGCTTCTCGTGGTCCTTATGCTTTTCCTCCTTC:1 + chr3L 17799166 3' + R1A1-element 5014 1 69.39 TACTATGATAAATCAGCGGAATTTGCAGTTACTGTAAATGGACACCCACGGTGGTTCCCACAGGTGCAGTCTGGACGTTGCGGCGCTGAGATACGGCACTC:1 + chr2R 14224076 3' + gypsy9 63 2 47.52 AGAGTNATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTGTGACGACAATGTCCC:1 - chrX 2320000 3' - gypsy 437 2 69.31 ACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTAAAAAAATGTAACAACCGCCTTTTAGCATAAGATTACTCTGAATATGAA:1 - chr3L 23277056 3' + invader2 4709 1 66.34 CGCTCCAGCCTGTCATGGTACCTGCTCGAGTGCAGTAAAATGCCGGAACGAAATTCGCAGTGTTCCCACCATCAGATACCCCTTACTCGGCTATTGCACAT:1 + chr3L 22970021 3' - X-element 4414 1 57.43 ATATGNCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATATGGCTCGCAAATTATTTTTGAATTTTT:1 - chr2L 7843096 3' + 412 446 2 68.37 TGAGTAATACCAGTTGTTAATATGGCCGTTACAACGAGGCTCGCTTCATCATCATTGGATTTGGTCAGACCCTTCGACACGGACTCATTCCGAATCTTTTG:1 + chr2R 21318199 3' + transib2 2677 1 78.22 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGTG:2 + chr2L 21292999 3' + roo 9034 1 63.37 ATTTATGTCAAGTTCCGGTCAGGCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTCAGTGTTCTCGTTCTCGTCCTTTGGCCTGCTTTCGCTTTTTGAATAATTCCAAC:1 - chr3L 7037053 3' - jockey2 3202 1 72.28 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTG:1 + chr2R 5640413 3' + roo 9044 1 55.45 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGAAGTAAATTTATAGCAAATGATGTGGTTGCT:1 + chr2L 12237082 3' + jockey 4950 1 66.34 AAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATTCCTACAGTCTGACGAAGCGCGGAAA:1 - chr3R 7441500 3' + HMS-Beagle 427 1 74.26 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGATTTAAACCATATCTCAAACTAACCATTCTTATCACCAACTATTTAGGTGGTCCGCTTTAG:1 - chr2R 18434456 3' - pogo 12 1 61.39 AGTGTNCCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTCGTACCGTTCGCTTTTTA:1 - chr3R 14913128 3' - blood 9 2 71.29 AATTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGGTATCCCGGCTGAGATACTGCTGATCCACCCTCATAAGCGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTC:1 + chr3L 1320907 3' - gypsy7 5093 1 70.30 TCTCANTTGGTGGCCTATATTGGTTTATTACATCTATTTTGCCATTGGCGATTTGCCTTATTTTCTATTGGTTTTTAAAGATAGACAGATCTGCAAACACT:1 - chr2R 19121626 3' + blood 367 2 61.39 TGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTACGGAGCATAGCGATAGTAGTTAGGCATGTAAGAAGCACTAGAAGAAGACCCATAGCCGTAGCCA:1 + chr3L 21189553 3' - G2 2929 1 70.30 ATTGTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTAGTGGGCGTGGAAAAATTTGAAAATGTGGGCGTGGCAATCATCTGAAACTATAAATTGTACGC:1 - chr4 1135983 3' - INE-1 253 1 74.26 CGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGGATGTGATGTGGTCCCCAAC:1 - chr3R 28746476 3' + I-element 375 1 76.00 ACAATAATAATAATGAAATAATATGAAAATGTCTGGGCTGGAGGTTTGTTTTTTTTTAATGGAACCCCAGTCGAATGGGCTGAGTGTAAATTGAAATGTAT:1 - chr3L 10772375 3' + invader3 5046 3 62.38 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTAATTAATCATATACACCTGAAATAATATTTTCTTGCTTTCGCTCTAGTTCATCTGCCGCTTTT:1 + chr2L 8640903 3' + roo 398 1 70.30 GCAGACTGCTCTCGTGCGCTTCGTACCTACGTGGAACTACATGGTGCTGCCAACTCGATTAATGATTCTATACCCTCAACGTTGTGAAAACATTTATTAAC:1 + chr2L 6318941 3' + Cr1a 346 1 78.22 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGATTTTGACACGTAGACAGGGCGAGTCGCCCCCAGCCCCGAAAAGTATGC:1 + chr3R 12578188 3' - jockey 33 1 51.49 TTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCATCCACCGTATTTTTCTCATTTTCATGTCAGT:1 + chr2R 18993898 3' + BS 4724 1 73.27 TCTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACATCCCTAACCATATCCGCAAACAAAAACCGACATTTCAATCTCTGACTCACTGCAGCG:1 + chr3L 19559861 3' + jockey 4733 1 50.00 ACACAGAAGAAAAAACCAGCGCTTCAAAGTAAAAAGAGCAGGGTGTAACAAACCCTGTTGCAAGGGCAAGCGCAAAAGGAAAACCAGCTGTGGATGTGCCA:1 + chr3R 24531427 3' + rooA 437 1 64.36 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATCCATTATGTATCTGAGTTTGTATCTAAATGATTGTTTTAAAGCCG:1 + chr2R 18434577 3' + pogo 2098 1 76.24 CTATTATATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTATAAACTGGCCTAA:1 + chr3R 22675884 3' - 412 24 2 55.45 TCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTAATCAATTTAATGTATCGTTACAAAATCACATCTGGCGTCGATCCATTTGGCGCCTCGTGTAGCTTCTGTCT:1 + chr2L 1103559 3' - S-element 408 1 70.30 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTGTATTTTTGAAGAAACGCAAATCGTATTGACATTACTATACCAGAACGAATAAAATGCT:1 - chr2L 16252102 3' - pogo 16 1 43.56 AGGTCCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGGGGAACAGCCTCTAGATACAATCGCGAGCAGTCTAAACATCAAAGCCGGCAACATAACCA:1 - chr3L 16812570 3' + G5A 2418 1 66.67 CGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 + chr3R 26435576 3' + R1A1-element 5031 1 76.24 AGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAACACCGATACAAACACAAGTCACACCAACAGCATCGCACCAGGTGAG:1 - chr3L 16520064 3' + I-element 370 1 54.46 TAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGTTCAGTGCGCAGAAGTCCAAGCTGCTGAAGGTCGTCATACTGGGCGACGGAGGC:1 + chr2L 19432916 3' - ZAM 7982 2 47.47 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAGAAACGACGGCGAACGGCCAGCAGTGTTT:1 + chr3R 22899264 3' + P-element 2875 1 66.34 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAACGTATTTCTGAGCTTCAT:1 - chr4 490217 3' - pogo 8 1 73.27 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAACAATGTTTTGCCACTGTTCGGCCTCCGAGTTTTACTTTATTTTATATGGTTTCGTTAGCCGGC:1 + chr3R 28623981 3' + roo 393 1 63.37 ATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCTTATTTGTTTCAGGTGAGGTTTGCTGATGATGAAGAAGGCTA:1 - chrX 20870646 3' + FB 369 1 58.42 TAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTCAGTCAGTATTCTTCATTTCGAACCACAAATTTCATTTAATCACAATAGTTTTAAAAATTCCTGTC:1 - chrX 9260580 3' + 3S18 6094 2 67.33 AAAAGAGAACAGAAACGACGAAATTAATGTAATGTAAAATCATTATAAATTTCAAATAACGTGACCCATATATAATATTATCATGCGTATCCTGCAACTAC:1 + chr2L 15527518 3' - Cr1a 4343 1 55.45 CAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATTATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGATTTCGGGCAGTGGACCTGACATGTTT:1 + chr3L 603407 3' - F-element 4596 1 71.29 AAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAATATTCTTCTCATAAAGACTGTATTGGGTGTCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATC:1 + chr3R 10736132 3' - invader4 2775 2 54.46 AACATGATTGTCGGAAATCGAGGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGACTCGCTGCTGAAGAAGCTGGGCGCCAAACCCATATCCTCGCAGAGCCTC:1 - chr2R 14902935 3' + flea 4817 1 52.48 TCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCACTTCCAGGTAAACAAGTGGGGAGAATTTTTGCCGGACTTCCTACCTGTT:1 - chr3R 7437226 3' - Quasimodo 7196 2 56.44 TTCACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGCGATTGACTCAATAAATTGGTAAGTTCTAACTAAAATTACAAATTACAATT:1 + chr4 515642 3' + INE-1 537 1 56.44 ATGTANAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGA:1 - chrX 17049532 3' - Stalker2 17 2 62.38 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCATCCCTCGACGAACTCCCT:1 - chr2L 16691134 3' - pogo 3 1 78.22 TTTTGACTCTAGTTCGAGGGGCAGCACTGATAGTTCTGCACTGACTGGCCAGCTCTGCTGTTGATGCTGCTGTAGTGCCTGATGGTTACCGTGCACCAGCT:1 - chr4 714249 3' - jockey 4724 1 56.44 GGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTAAACCAAAACTGAAGAATACTGAAAA:1 - chr3L 5979765 3' + flea 4862 1 74.26 ATTTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGAAGGGGCAGGGGCTAAGGCTAGGGATCA:1 - chr2L 20292765 3' + invader1 73 2 75.25 TCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAAATGACCTTGCTGATGAGGCACCTCAACTACACCGCCCCCTTGGAGGCCACCACTGCTCTTTTTGCT:1 + chrX 13541322 3' + 1360 475 1 74.26 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTATATATATTCCGATGTACATATATTGGCGCTCACTTGGCTGGGGCCAAAAG:1 + chr2L 12751779 3' + flea 4993 2 63.37 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGTTCGATTCATGGATACTATCACAGCGTAAAC:1 + chr2L 6177262 3' + pogo 2092 1 70.30 GAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGATCGTCCGAATGGCAAGTCATGAGATCATGAGATTCGTTATTTTATTTTCGATTACCTCAGGCA:1 + chrX 10421791 3' - ZAM 8109 2 67.33 GTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATCATATTTTAGCGCTATAAAGGATGTGTCCT:1 - chr3R 27043066 3' + 1360 3206 1 76.00 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCATCTGATTACTGAATCCTTTACAGTTAGCTCGTGTCGGTT:1 + chr2R 21266495 3' + roo 9038 1 62.38 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAACA:1 + chr2L 1353773 3' - I-element 38 1 64.36 AAAATGCACTTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTACACAAAATAAAATAACATTTGAAATTATGATATCTATATTCGAAAAACAAAATTATAAA:1 - chrX 21668523 3' - Bari1 17 1 63.37 ACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGGGCTGGCGAATTTTCAGCACAGGTTGAGTCCAAGATGGAACGCACTT:1 - chr3L 17197493 3' - F-element 4492 1 53.47 GATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGACTAAGGGCAGGTTAAAGTAGTAAAATAATTGCAAGCCTTTCATCTTTA:1 - chr3L 22009423 3' + Doc 321 1 53.47 GACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGGGGTGTTCGGAGATGATAACGACGACGGCCAAGCGGATACGATGATGATTGCCCCTATGGATCTCGATCCTG:1 - chr2L 15999393 3' - F-element 4472 1 72.28 AAACCAAACCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTGTTTTCTGACAGTGT:1 - chr3R 12780278 3' - BS 5007 1 48.51 ACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATATATATAACGCCGATCGCGGAACGTTTCGGGCTCGTGCGCGGTCTATTCGAAGAA:1 + chr3L 23666420 3' + Stalker 6976 4 70.30 AATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACCCCGTTTTCCCCTCCCCAATTTTCCGCCCTCTGTTTGGTGACGTGTGTTTATGCTGTTGA:1 - chr3L 14855493 3' + Circe 5 2 63.37 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGG:1 - chrX 17049567 3' - Stalker2 51 2 73.00 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCATCTGATTACTGAATCCTTTACAGTTAG:1 + chr2R 21266483 3' + roo 9026 1 74.26 TAACTGCTGTGAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAAGAGCCGAAAGGGCAGCCATCTGAAGATGAAATTTGTGCGCCGTGTGTCGC:1 + chr3R 22272182 3' - Porto1 478 1 53.47 ATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTTTTTCGCGTGCGGGCCTTTCCGTCCGGTCTGCAACTTGGCAGTTTCGCAATATCTTCGTTGAGCGTGTAA:1 - chr2L 21556985 3' + invader4 56 2 75.25 TGAAAGGAGCATTAAAATATCAATCACAAAAAAAATTGTAATTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCATAGTGCACGGTTTAAACAGGGATCTTTAGA:1 - chr2R 4547809 3' - transib4 54 1 71.29 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTGCTGTGGCAGCTGAAGCTTTATTGTTGTGAGCCTATGTACAAAAAATTG:1 + chr3R 21997451 3' - hopper 29 1 55.00 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATGTTAATATATTTAATTTCGCTGTATG:1 + chr2L 20465643 3' - blood 7058 2 76.00 TACTAGCTCCTTTATTCCTTTGTTGCAAGCACGTTCAATTCTCGAAGTACAAGCACGAGGAACAGCTACTTAAGCATGCCCAACAGAATCAGCACTTTTCT:1 + chr4 530663 3' + Gypsy12A_LTR 2087 1 52.48 GCCTACTTAAAGAATAAGGTTGCAAAAAGGGGCCCCAAAACACGACAACAACTCAAGAGTTCGGATATATCTGTGATCTCGATTTCGTTCGAAATAGTTGA:1 + chr3L 2551630 3' + S-element 1262 1 54.46 TTATTATTAGTATTATTATTAGCACGGGCATGCATTGCGGCGACCGCTTCCGGTTTTCCCAAGAGCATTACGAACGGCACGAGCGTGCGATGCATCGCCGG:1 + chrX 2166196 3' - mdg1 41 2 70.30 ATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTCTGTTACGAAATAACTACAAATCAAATCGTATAAATGCCTAATGAATGAAGGTGTCCTCGGTTTCCGGGAAAT:1 - chr2R 12130768 3' - gypsy10 5945 2 54.46 GTGTANCCTCGATATATGCACATACTACACCCCTTAAGCTGGACAGCCTAGTTTCACATCAAGCTCAGCTGCTGACTCATGAAAAATTAACACACAAATCG:1 + chr3L 2182758 3' - blood 8 2 69.31 TATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGCAGTGAAATTTTATGCGCTTAGTTTTTATTGCGGAATATTTTGCATGGCAGGGCAGTATAA:1 - chr3R 28241518 3' + Dm88 4174 1 68.32 ACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACAAATTGCATCTGAAAGTTCGATGATTCAAATTAAAAATACATTTTTATC:1 - chr3R 8766126 3' + FB 449 1 60.00 CTTGCGATCCAGCATTGGAGAGACCCAACCATTACTCTCAGCACAGGAGCGCAGAAAGGCTTTGGCATCTGGAGGGCTCAAAGCTCAGGTGTGTGTCATTA:1 - chrX 7209920 3' + Porto1 356 1 53.47 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATATACAGATACCCCACAGTTGGAGGGGTATATACACGGTTTGATCGGCGGCACATAATACAAC:1 + chr3L 8763302 3' + jockey 4984 1 58.42 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTTTTTGATTTACTACTTTAGTTTCCATTTATTTACTATTTGCGCTCAGCGTCTTGATCTGTTTGCATATTTACAAG:1 - chr2L 773220 3' - I-element 1 1 78.22 TATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTATCGAGCCTGCGACTTTTGGTTGG:1 - chr2L 4432278 3' + 1360 3278 1 76.24 ATAATTGCAATAATAATAATAACTGACCAAACACTGGGCGGCTGGAATCCTTCGCCTGCTGCCTTCATGCTTACCTAAGTAAGTTAATATGCCATTTGAAT:1 - chr3R 11076943 3' + mdg1 7067 3 57.43 TATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCAACCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCCAGCAGCAATAGCAATAACCGCTCTCG:1 - chr2R 12259338 3' - R2-element 3473 1 71.29 GCTTGGTGGTGCAGGGCTTGCTGATAGGGGTGGCCGGTCTGGGTCGTTGGGACTTGCATACCCTGTGCTTCTAAGGTCAAAGAGCATATTGGGTTGGTGGG:1 - chr3R 5122507 3' - G2 22 1 65.35 GCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACACCAATACTCCCCCCACCTACACAGCACCACACTCACACATTGACAGCCATTTTGCGGAAACGGAA:1 - chr3R 11150459 3' - R1A1-element 5019 1 68.32 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTT:1 + chr2L 5151998 3' - I-element 41 1 65.35 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCCCATTGCCCGAAAATATCCTGTTGCCGCAGACACTCAGTTTCCGATTGGGAACTCCGTTTTTG:1 - chr2L 10080930 3' - mdg1 15 2 62.38 GCCCGCGCAATTACGAAAAGTCTGGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGGGCATTTCAACGGATTTGATGTTGCAAGTGAATCAGTGGGCGTGCGACTGGTTAGG:1 - chr3R 11136807 3' + GATE 176 2 58.42 CTGTTGAGAATGGTGGCCACCAGCTGTCTCAGCTCGCACTCGACTCCGCTCCATCAATTGAATCAACTGCGATTTATTGTTATGGCATTCGGCACTCATCA:1 + chrX 6931615 3' - G6 1577 1 71.29 GGCGANGCTGTTAACCGCTTGCCATTCCGCCTCACCCGCCACAAACAGTCGCACAATCCGGAAAGACCCTACATCTGCACCGTGTGCCTGAAGGCCTTCAA:1 + chr3L 11604036 3' - Rt1c 5229 1 71.29 CACACACACATACACACACATACACAGGCACAATGACAAGAGTACTTAAGAGATTTTCACATCGTTACAAAGAGAACTGGGATAGAAATTAAAATTAATGC:1 - chrX 4032780 3' + accord 192 2 68.32 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAAGTTGAATACAGCATACTCATTTCCGTTTTCTGGTCTTAGCTATCGACTATGAGTAATCCT:1 - chr2L 9612563 3' - F-element 33 1 45.54 CGCCCNTTTTCCCTGAGCATGCGTTATTTGTATGGGCACGCCTTGAGCTTGAGTCGTTAAGAGGCGGAGGACTGAATGCATAAGTATTCGAATATCAATT:1 - chr3R 16904472 3' + Circe 7369 1 77.00 GCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCCATCTACATTTCCCCCGTATATTTTCTTTCAACGTGCGGAGAAAA:1 + chr3R 9151518 3' - Doc 4545 1 55.00 ATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTTCTTGGATGCCTCCACTTTTCGAC:1 - chr3R 6958850 3' - Tc3 315 1 76.24 AGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCGAGATCTATGTTCCTGTTCATCCTTGAACAACATTGCTAATTTATAGCTGGCGTA:1 - chr2L 20515873 3' - Stalker 7069 4 59.41 AAAAANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGT:1 - chr3R 9193575 3' + roo 389 2 61.00 ATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGACGTGTTTGTTGCCGGGTACAGTTCACTTCGCTGCAATCTCTTGCACATTTGCTTAAT:1 - chr3L 18998466 3' - accord2 7309 1 64.36 TTTGCTTGTTTTTCTTTAATTAACAACGCAAACATCTGATATGCTATCCCAAAGCTTTTCGCCTCGTACTTTTGCTTGGGCGCTTTTCAGCTGCGTCTATG:1 + chrX 20827006 3' - gypsy9 400 1 71.29 TTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGCTGCGGGGCAGCACATTGGGGGCTCACGTTAATGAGTTAAGCATATTTTACC:1 - chr3R 10187210 3' - X-element 433 1 73.27 AGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAAATTGTCGTTATTTGCATATGTAAATCGAATTTCATAAAAT:1 - chr3R 28507810 3' + Doc 4336 1 53.85 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGTATATTTTCAGTCCGGTTTCCGGTTTC:1 - chrX 8179039 3' - pogo 45 1 74.26 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTAGAATGCGT:1 - chr2R 16018817 3' - I-element 14 1 64.36 CTTTCACCATCTGACTCGCCTTTTTCGGCATTGTTTACATCGCCTGTCGCTGGTTCGATGGCAAAATGAAAGGCAACTTTTTGCCGGCATCGATGCTGAAA:1 + chr2L 17929178 3' + gypsy9 4884 1 49.50 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGATATGTATCTGCGCTCGGTAGCAGCCACATGCCACGCC:1 + chr2R 21937540 3' - 412 38 2 60.40 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACGTACTACCATTATAAGTTTG:1 - chr3L 22052744 3' + mdg1 412 2 70.30 CCATCTCTCGAATACCTATTCTGTGTAGTATATAAGTATACTAAGTATATAAATAGTATAAGCAAGTAATTTGTACAAAATGTTGGAATGCAAAATACAAC:1 - chr3L 20349968 3' + Doc2-element 138 1 65.35 TGGGCAACAAATAGGCAAACGATAAAGAAAGATGAGTACGCAAAGATAAAATGTCAAAGTTCAGACTGCGCCAAGGCCGAAATTCCCCAGTGATGATGATG:1 + chr3L 7785858 3' - FB 56 1 73.27 CTCTTTTTATTCTTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGCTGCTTGGCGTTTTCTTCCTCTTCCCTTCATTATTTAGCCGCCCCAAGTTGTTGATTTGA:1 + chr2L 2175427 3' + copia 112 2 68.32 AAAATTCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAGCATTGGTCTTGCTCCTTAACTTC:1 + chr3R 10099092 3' + accord2 7347 1 77.23 CCAACACTTAATTTGCTTATGTTATCGTTTATTATACTTTGTGCCACAGTTGTGGACTACAAGTTACAGTTAACAAAGTAATTGTAAAAGACCATTTCCCA:1 - chr2L 21400403 3' - G5 114 1 57.43 CGGCCTGCGGGATCTTGCAACCATACTTAAAAAACTTTCAAAAATTCATTTATTTTTCGATTGCATTGTCTCCAATTTCAATCAAAAGATTGACTAAAATC:1 + chr2R 13311006 3' - hopper 453 1 74.26 TGTTCGTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGCCGCTAAGTAAACGTGGGAATGCGGAAATTTCCTAATTT:1 - chr2L 15997852 3' - 412 10 2 69.31 GTTGTGGACGCCGAAAAATGAATTCACGTGCTCCTTCCTTCAACCCACCGCTCCTTATCTTC:1 + chr2R 24072848 3' - invader3 279 1 61.29 TAATTNTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGGGCGTGCTTTTCCGTGGGTTGCGGTGGGTGGTGGTGGTGGGGCAGTGGGGCATGTTG:1 + chr3L 15276730 3' - hopper 18 1 61.39 CAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCTATAATTTGTTTATATTTTAAATACGAATATTATACTTATATTTCTCTATCTGTTGCTTTGCTTTTGT:1 - chrX 17950934 3' + INE-1 95 1 70.30 CCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCACCCCATTCCCCCAGAGCCACTGCTTCTATGCCCACGTGCCAAGCGACGTGTTGC:1 - chr2L 12182284 3' + Idefix 7155 2 54.46 GACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGATATTTCCGCGTCCACTATTCTCCTCAAGATCCAGATAGGCGTCGATC:1 - chr2R 21061935 3' - G6 1979 1 52.00 TTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTCGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTCTTTGCCTCCCCCTTGTAAAAGTGTCTGCTGGGTGACCCTCCTC:1 - chr4 497261 3' + Cr1a 206 1 60.40 ACGTATGGAATCGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAATTCAGCGAACGCAATCGGCAATGCACATGACTAGCGGATCATCTGGATT:1 - chrX 12409546 3' + Porto1 4272 1 67.86 TTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATTTATTCAAAATCTTTAGTACAAGGCCCTCAAATGAAA:1 - chr2R 14610805 3' - flea 4623 1 63.37 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGACACACTCTCGGCCTTGTTCATGGACCTCGTCACTTGCAT:1 - chr3R 25814707 3' - 412 7089 2 63.37 GAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTGGTGGAAAGGTCCGAAATGGCTAGCAGACCCAAAAGAACTTTGGCCTCGGCAGCAGTCTGTAGAAGAAC:1 + chr3R 19446577 3' + roo 8925 2 70.30 CTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATCGTCGTCTACATGGAGTTTTAATCCAAACCAAAATTATCCGAGGTAATAT:1 - chr4 652639 3' + Ivk 5233 1 59.41 TTATTAATTATTAGTCACCAAAATTAATACAGAAATGAAACATTGCTAATTTGGCTTTTTATGTTCTCGTCGGTGCTGCTCATTTCCCCTAACTCGGTCCT:1 - chr2L 1828098 3' + Gypsy12A_LTR 1824 1 63.37 TGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAAGGGGCTGGGAAATAGGGGGCGGTAATCGGGAGTGGTGCTTA:1 + chr3L 18728356 3' - 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BS3 1351 1 65.35 CATCAGAAGTGGGATCGCCTATACCTACTTTGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTCAAGTTCGATTTCGAGTTAATAAATATTGAACAGGGTGCG:1 - chr3L 4848273 3' + invader1 422 1 60.40 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTTGGCAAGGG:1 + chr2R 8463638 3' - I-element 25 1 53.12 CCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTCGCCCTGCGTGTGAACTAAAATCCTGCAATT:1 + chr2R 14005023 3' - roo 400 1 69.31 GTACTNAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATGAATTTCCGTAAAAATGTTATTGCATAT:1 + chrX 7840847 3' - invader2 4908 2 79.21 TTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGTGCAGCGTTTAATTCGTATGATATAGACTGCTATCTG:1 + chr3R 7547535 3' + micropia 5176 1 63.37 AGCAAGTCCTCTTTAAAAATTCTTTTTCTTGTATTCTCCGAGTCACATCCGGTGCGCCTTGTCTGCTCTCCTTCTCCTGCATTTGACTTTATGCG:1 + chr3L 550081 3' + Q-element 434 2 57.89 AGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTTAAAGGGAAAAGCGCGAAGAAGCAGTTGCGGTGGCCAAAGAAAGTTCCGAAAACTGCAGCAAG:1 - chr3R 5604471 3' + invader3 184 2 59.00 GCTGCCTATAAAGAGCATTCCTTGCCAATTGGCTTTCTGTACGACGACGATGATCCTGCGGACAAATCCACCATTATCGGACGCTTCTTGAGCGGGCAGCG:1 + chr2L 15425388 3' + TART-B 224 2 34.65 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAG:1 + chr2L 21292988 3' + roo 359 2 74.26 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTGGCTTTAGGCATTTAGGCCTGCATACTTTCGGGCTGACATTTAAAGTCGGTGGCATTGTTACG:1 + chr3R 11118027 3' - 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chr3R 32041981 3' + hopper 1413 2 77.23 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCACATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGA:1 - chr2L 21737999 3' + Burdock 6349 2 72.28 AATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGCTTACCACAGAAACATTCATCTCCTCCCTGTCAGACACGCCCACCTC:1 + chr2L 11856728 3' - jockey 4851 1 53.47 ACCACCCAAAGCTGTGACAAAGAAACGAAAGAGAGCGCTGGGCGGCACTCAAGAATCGCGTGATCGAGATTTTGTTGGTAATTTATGGGCCGAACCTGGTG:1 + chr3L 1967629 3' + gypsy4 423 2 75.25 TTTAGTTCCTGAGATCTCGCCGTTGACTCATTCCTCCACGGTGTCCAATGTGAAAAATACTATTCAGCGTAACAAGCGTCAGGATCACATGGAGCGTCTTA:1 + chr3L 14073174 3' - INE-1 144 1 79.21 TTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTGCACAATCTGAACTTATCTAGGTCTACTAAAATTTATGAATGAATTTAAGCGGCTG:1 - chrX 9009763 3' + R2-element 236 1 58.33 GTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATTTGATTTTGGTATTTTCGGTTGTGTTTGTTGGTTTTGTACATTTTTTTTTTTGTTGTTTTT:1 - chr2L 6927433 3' - F-element 4415 1 64.37 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTCTCAGATTAGTTAGGTCAGGTTCTATCGACATTAATCCAGTTAGCCACGTTAAGAAC:1 + chrX 12958962 3' + roo 9055 2 53.47 TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCT:1 - chr2L 15478810 3' - jockey 4722 1 79.80 ATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGCACCAAAATGAGAAAAAACTTAAATAAATTTCCAATGTGTGTGCGGGCATAAATTGCATGAGTTGTGCT:1 - chr3R 28131865 3' - INE-1 504 1 77.23 ATAACGAGCCTCGGATACCTTCACACAGTCTGAGTTTAAGTTTGAGTTGGAGTCCCGGACTCAGTTTGATCAGAGAGTCAGGTTGCTGTCAGACACCAACT:1 - chr3R 19337314 3' + R2-element 254 1 79.21 TTTTTNTGAGGAAAAGTATGAGTTTTGTATTTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTATTTTAGAAATAGATTGCACGGA:1 + chr3L 2820277 3' - I-element 5151 1 76.24 CAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACAAGAGGAGCATGAATGCTGCCTGCCATCGC:1 + chr3R 19317572 3' - invader2 4937 2 70.30 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGGGCACATTAAATTACAGGTTTCAGAGCCAAGAACAAACAATCGAAAGTGCAGACGCGCCTTCAG:1 - chr3R 27619185 3' + hobo 2926 1 62.38 TGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAACTTTGTTCCCTACTAAGTACATACGCTTCCCTTGCAGAGCTGC:1 + chrX 16365189 3' + invader2 150 2 56.00 TTTTTCATTTTAATGTGTTAATTAGGGCCTAATACTTTGTTGTATAGCCTTTTGCCAGGTTTTTTTTTCGGGTATTTTGTATATCTCTTGCAGTTTTTCGT:1 - chrX 13977990 3' - HB 1357 1 56.44 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTAT:1 + chr2L 7654039 3' - jockey 27 1 57.45 TCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTAATGATGCGCGGCATTGGGGGCTTTTGAGTTTGGCGCTGCCAATGGAGTTTCATTGTTCGATCGCATTG:1 + chr3R 6718267 3' + gypsy12 10052 2 70.30 CATTATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAAACTAGTGGGTAGATAACATTTTCCGACTCCCGTTCGCAGCTGGCAAGCAATCGAAGA:1 + chr3R 16288099 3' + invader2 265 1 65.35 AGTGTGAGGAGTCTTAAAACTCTCCACAAATCTGAAAGTCGACGCTTTTCGGGCGGACAGTACAATAAAATGTCTCAAAATAAAGTCACAATCGCGAAATA:1 + chr3R 9482398 3' + gypsy8 4648 1 67.33 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGCGAGTTCTTGTGGGTGGTGTGTGCCAGCGGTGGGCGGCGTGTGGTTGAGAGCGTGCCGTTGCTG:1 + chr2R 8997438 3' - jockey 4794 1 64.36 TTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCACATGTGCTTCTAAATTTTGTGGCTGTCTCTAAAATCCCAACATTGTTATGAACATTTTGATG:1 - chr3R 5467833 3' + flea 83 2 65.35 GTTCTAAAAAGAGCCAACGCGAATTGCGCTCTCAACGGCAACTGTTGCCATCGCAAGGATTAAACGATACATTTACATGCCGGGGCTAAGACCAAATCCAC:1 - chr3R 16865471 3' + Doc3-element 213 1 66.34 CTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGCTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGAAGTAATACGTTATCAAGAACAAATGCTGTCTTGTCTTGGCCCAC:1 - chr3L 2982010 3' - Tc1-2 357 1 75.25 CTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCATGTCTCACCACAAATCAATCAAA:1 - chr2L 8257672 3' + Quasimodo 6896 2 77.23 CACCTTATGTTATTTCATCATGCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCGAATTTCCAGTCAGCTTGCCTATAAATACCAGAGCGGG:1 - chrX 6283604 3' - P-element 1 2 76.09 CTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTTCAATTTTACAAATCGTAGTTTATGGAGTGCTACAA:1 - chr2R 6975497 3' - 1360 445 1 65.35 TACCGTGCCCTCCACCCCTCCTTCCCTACTCCGAGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCTTGCATCTCACTCGCACACGACTGCAATCAAAAGGAATA:1 + chr2R 18305617 3' + G-element 282 1 61.39 CCGTCTCTTGTTCGCTTGCATCCCTCACCTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTTATTCTTTTCTGTGTAGTTGTGTTGTGGATGTCGTCAC:1 - chrX 379547 3' - I-element 356 1 59.41 AGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGACTTAAAACTGTGGAAATATAAGATCGATTGGTATTAAATTTCTTGCACTGCACGACAAAATATCGCGGAGGATGAG:1 + chr2R 18984252 3' - G6 74 1 75.00 ATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTATTGATTTACATGTACGCTGGCCATCAGT:1 - chr3R 26803852 3' + flea 275 1 71.29 TAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGGGTGAGAGCGGCAGCGGCAGCGTGCGAAATGCGAATGCTTTACGTTTCTGAGAGAAAGCGGATAAA:1 + chrX 16491223 3' - accord 185 5 87.88 CAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTTTAGCCTATCTTCGTACTGTTGCTGTTGTTTCTGT:1 - chr2L 5098438 3' + R1A1-element 148 1 46.53 GCGAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTATCTCAAGATTTATATTCGACA:1 + chr2L 22690002 3' - Tabor 55 2 74.26 CCTCGGTTTCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTGATCTAATCCGAAGGCAAGGTCGTTCGAGGTTCATTCAAGCGAAGCCCCAAATTGGTTATCT:1 + chr3R 10827587 3' - Idefix 7237 2 67.33 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTAAGAAAGCCAA:1 + chr2L 22719660 3' + 1360 3365 1 51.00 TGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGGGGCAACATTTACATTTTGTATAACTTCCGGTTATCAAGTGCATAAGCATAAATGA:1 + chrX 5150978 3' - Quasimodo 60 2 72.00 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTGAGTGTGAGTGTGTTTGGAAGTTGG:1 + chrX 14424111 3' - hobo 18 1 56.44 CTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTTGGCCAAGAAGAACCAGACTATGCAACTATGAATCCAAATGCGAATCCGAGAGGCCA:1 - chr3L 20562105 3' - INE-1 555 1 67.86 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATGTCTTGAGCGATGACCCTGGGTACACACAGAAAAATGGGCACTTAAATCATAC:1 + chr3R 27619298 3' - hobo 4 1 73.27 CGCATNTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCGTGACCGTGGCAACGAATATCGACAAGCTGTTGGGCGCTCTTCCCGTGTGGAAACATTTTTGGCTATTTTTTT:1 - chr2R 19726828 3' + 1360 3384 2 75.25 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAACATAATTATTCAGAAAATTTTTCAGTCAGG:1 + chr2R 1923551 3' + pogo 2065 1 66.33 TGTTAGTAGGATCTAATTATGCAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCTGAGACTCAATCAGCTCCATTTCTACCCCGCTCTATACGATTG:1 - chr3L 20351572 3' - Cr1a 4285 1 62.38 TATTGCAGTGTTACAGTTACCCTCAAGGTGGTTAAGCTGTTGGATCGCGAAAGAGTCGAACATATTAA:1 + chr3R 14638099 3' - Doc 482 1 70.59 GGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATTCTATATATACTCACCGATCCCTTCGCTCGCTGCGCCTGCCCCCGTACTCCATGG:1 + chr3L 13887188 3' + flea 4798 2 57.43 AATGCTATAGTCGAGTTCACCGACTTTTAGATACCCGTTACTCAGCGACTGCTCACCGACTCAGTGGCTCACTGGCTCAAAGTGGGTGGGAGGAAAAAGGT:1 + chrX 22632838 3' - INE-1 570 1 60.40 CCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCGAGCATCCCACTGCATCCTACCTAAGATACCCGAAACATGAGCATCCACAGTTCATTGATAGCGCGTGCTGGCGG:1 + chr3R 28586247 3' - R2-element 3523 1 73.27 TAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATCCTCTCTTGCTTTTCTGTGCTTGGGGTGTACACACCTAAAATGTTGCTAAGAATATTGACTAGAATAGTACTGTTT:1 - chr2R 5246364 3' + INE-1 566 1 55.45 CTAACGCCCTAAAATCGCCCAAACCATCCACTAACAAAATACCTCCCACTCACAGCCTCAAGTTTAAGCCTATTGGGCTAGGCCTTTTCTCTTGGCTTGTG:1 - chr3L 18031460 3' + INE-1 342 1 76.24 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGAGAGAGAGAGGTGGAAAGGG:1 + chr3R 9226947 3' - jockey 4766 1 76.74 AAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAAATGGCCAAGGCGGATGAAA:1 - chrX 11049761 3' + I-element 390 1 72.46 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGTTTCAGGGGTTGCGTTTGCCGTTTGGCTGCTGCA:1 + chr3L 11696459 3' - blood 25 2 54.46 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCAATATTGGTTTGAGAGCAGTTGTGCTCTCTT:1 - chr3R 4806562 3' - P-element 35 1 44.55 GAATTAAGTAGGATTTATGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGATACGAATGGAACAGTGGGTGGTGAACGATGTTTGGTTGCGGTCTCTGTC:1 - chr3L 21327086 3' - jockey2 3214 1 55.45 GCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAAGCAAAAATTCTCCAGAATGGCAGAGCGAAACCAGAGAAATTCCTTTTGTTCTTGTTTGTCAG:1 - chr3L 2314867 3' - 1360 121 1 58.42 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGCAAA:2 - chr3R 10490342 3' + transib2 2789 1 62.38 AATTAGAATAAGCGGCAGTGTAAAAACTAACCACGCTGAATAAACATATTTCCAAAGCAATTATGAATTGTAGTTTTTGGCATTCGTCGGCTGATTGACAG:1 + chr3L 19048323 3' + GATE 8355 2 59.41 GGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGTGGGCCGCGTGGAAGCTGGCTGAATGATTGCCTTGC:1 + chr3R 13570672 3' - Doc 4546 1 64.36 CGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGCAGCAACACCAGCAGACCCAAA:1 - chr2L 15269676 3' - R1A1-element 5030 1 81.19 CAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGGCAATGCCTTTAGATTTGTCAGCTTTCTCTGGGGGCTGCCAGATTACTTTATTTAAAGCACAGTAGAACAATAAGTA:1 + chr2L 14007465 3' + R1A1-element 353 1 59.41 ATGCCATAAAAGATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTATCAATTAAAATCTTTACGAGCACAGTGAAGGCTGCCTGCGTTG:1 + chr3L 16128066 3' + copia 81 2 54.46 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGT:1 - chrX 2253838 3' - Tirant 8149 2 67.33 AAAAAAAAAAAGAAAAGAAATGGCCCGTTTAAGCGGAAATT:1 - chr3R 11452321 3' - hopper 142 2 87.80 GTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTCTGTTTGTCCCGGCATTTTTGGGGTGTGCAAATTCACGCTTTCAAGGCTGTTTTTCCATCAGTTTCCGAGCGGCTA:1 + chr2R 15153372 3' + baggins 5358 1 77.23 AACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTG:1 - chr3R 178126 3' - BS 46 1 73.27 AAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTTATTAATCTTTGGTATAGAATTAAAGCAAGATAGAACGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 - chr3L 23747153 3' - FB 358 1 73.27 TCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACCTCCACCTGCGATCAACAACGTCGACGACCGGCAAATATATATGAACTCGACTATGATTTATGATCGCACC:1 + chrX 16742614 3' + HeT-A 6055 2 70.00 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATAACACGAGCCGTAACGA:1 + chr2L 10635330 3' - roo 8681 2 63.37 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGTACAAAATATTTCTAAT:1 + chr2L 9823699 3' + hobo 2908 1 63.37 AGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACACCACGGAGTCACTGTCCCTTCTGACCACGCCAGGGTTGTCGAGCTCGGTCACATTTTAC:1 + chr3L 17148261 3' + Cr1a 4091 1 73.68 AAAGANACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAAATTCGAGAATCATCAACTGGCAAACAC:1 + chrX 22747499 3' - Doc 23 1 58.00 TCATAGTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGTAGCTAATGAGCAAATGCAAATCCCGGCTCCAACCGCTAAGTGTGACTATACTCCATA:1 + chr3R 31520317 3' - BS 4963 1 64.00 ACAGCCTTATTATTAATATGATGAAGTGTGTCGGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGGTTAGAGAAGTGCCTCCGCGTATTGCCGCATCTCCAGGACA:1 - chrX 4112267 3' + Rt1b 4759 1 61.39 TCTTCGAACCAGAGATCAATGCGAAGTAATTAAATGAGAATGCCGGGCCAAACGGAAGCGGAAATGGAATTGAAAATGAAAATGAAGCGAGTGCTAAGGCG:1 + chr2L 4776513 3' - Tc1-2 241 1 73.27 GTCGTTCCGCTCGCGATTGTATTGCTCTAAGCCTATTGAGCTGATTTCGAAGTAACAATGATGTGAATGCGTTAACTTAAGTGTACTTAAGTACTCGGCTT:1 - chr2L 12213577 3' - G5A 2491 1 64.36 CGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTTTATCCAAGAGCACTTAACA:1 - chr3R 18860329 3' - R1A1-element 5030 1 52.48 CAACGTCAACGTGAGCAAGACGAGCGCCGACTCTCATCAATTTGCTTTGAACTCGAAACTCAATGAATGACTTGCCGCAACAACAACGAAAGTTGTTTGCA:1 - chrX 18954902 3' + Doc4-element 19 1 68.32 TTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTAAAAATATATATTTTGTGGTAATTTTATTTAAATACAATATATATTGAACAAAAT:1 + chr2L 11182488 3' + copia 4729 1 66.34 CTTGGAGGCAGTGCGTTTTCATGGACTTCAGCTAAGCAGAGCGTCGTCGCCATGAGCAGCACAGAAGCAGGTACTGAATGCATGGGCGGGCGGTCGCCATT:1 + chrX 3575665 3' + Copia1_DM 3902 1 72.28 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGTAGCCACGGCCATAAATGATGTTGCGGTGCACTCGGGTGACACTCAAATCCAACAACTCCTCCATCCAAC:1 + chr2L 18662413 3' + hopper 1413 2 76.77 TAGGAGAAGTACGCGTTGTTACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCACACGCACTTTTTGAGCCCAC:1 + chr3R 7076481 3' - F-element 259 1 64.36 CGGGACTGCCAGTCAAAGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGATGCCAAGTCGCACTTTATATTTTATGCTCTGGCTGTTAAAATTGAAAATTACTTTTGG:1 - chr2L 15329368 3' - Rt1a 4912 1 60.40 TCAAGAAAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTGTAAGGGTCACGCCCCCTAGATAGTTAAACGCCTTGGCTATAACAA:1 + chr3R 22220268 3' - Cr1a 4221 1 64.36 GCTCATCTCCCATGCGAATGAGTGTGTTCGTGTGTTTGAAGAGGTACAAGCGCGCGTGGATGTACTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTAGTCGCCATAA:1 + chr2L 5083344 3' - jockey 5 1 77.23 CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACCGTCCGAGTGATCGAGAGAGCAGGCGGCGAATTTCCAGTCAGCTTGCCT:1 - chrX 6283621 3' - P-element 27 1 52.48 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATC:1 - chr3L 3254962 3' - 1360 17 1 61.05 AATCCAAGAGCGATGCTCTCCCGAAATAGAAATATTGTTCAAATACTGAGACTTCTCCGTCATATAGCGTCATTTCTATTTTCATAAAGCCTTTGGGTTCG:1 - chr2R 13895756 3' + 17.6 7187 2 57.43 CCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAATGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCATGCTTAACTATCTGCCCGGAAATGTGG:1 - chr3R 10142562 3' + Doc 330 1 74.26 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAAGCATTTTTTTAGTAGATAGTAAAAACATATACGGTTATATGTGGATCCT:1 - 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I-element 25 1 73.68 TACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTACACACTTCGGCTTTTCGAACTAAGCCACTTTCAATTTCGTTGTAGTAAATTTTGATATTAGGA:1 - chr2L 6339902 3' + roo 8633 1 58.42 CACTCGCGATCAGTGACAACGCGAGCATGACGATCGCCGGCTCTCATTGACCTCAACAAACGCCGCATTGGCCGTATTTTGTTTATGGATAGCCAAACTC:1 + chr3L 15529699 3' + Doc2-element 296 1 57.00 ATATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATGAAATCTCGCATTCCCACTAGTTAAGTAACTGGTATCTGGATGTCTTGAAACTCGACTTTAGCATTCTCTCT:1 - chr2R 1649125 3' + INE-1 498 1 76.00 AAAAAGAAAAAAAACAACAACAAAATGAAAAGGAAAAACTGAAGGAGGTGGGCGGCTCTGGATGTGCGGTCCAAACGGCTATTGAACCGAGTAAAACCGAT:1 + chr3R 30310353 3' + gypsy7 5011 1 77.23 CAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGGCGAGATAAAGCGAAAACCGGCAAAGAAAGCACAGGAGCTGGACTACGTGAACCACCATGTGCGGACCA:1 - chr3L 17799501 3' + G6 408 1 73.27 TTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGGAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGCGTTATTCCCGCGGTAATAT:1 + chrX 6597181 3' - F-element 386 1 83.17 GTGTGNGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAATCTAGTTATATTAAGCATGATCCTAAGGTTCTGTTGAT:1 + chr2R 8022693 3' - Quasimodo 31 2 64.36 AGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCGATTTATCGCCCGCGCGAACCATCAACCAACTGTTAGTGTGTCCATGCGCATCCAATCCTGTACC:1 - chr2R 9256118 3' - 1360 462 1 70.00 TCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCAATACAGTTAAAAGTATAAAATTCTAACGAAACAAACTTAAA:1 - chr2L 12727207 3' - opus 7272 2 63.37 GTTGTGGCCGGTTTTAGGGCGTTAGAGGGGCGCAATAATAATGTCGCTAGCCAGGCAACGCAGTGTGCAAGCACAGACATACATTTGTAGCACCGATAGAG:1 - chrX 551205 3' - INE-1 345 1 73.27 CCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGATGGTGGCATTTTGACAGCTCTGCGGATTCCACGGCACTCACACAT:1 + chr2R 14439019 3' - ZAM 8020 2 58.42 ATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGATGTGCTACTACATGGAACAGATGAAGTGGATTGAGTAGATACAGATAGACCAGCTGCAATAGGTAGA:1 + chrX 15164382 3' - Doc2-element 411 1 74.49 TCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACATATACAGCAGCGGCAGCAACTTAAACTCAATATAGTGCATATATGTATATAACGATCGCAGCTCAGC:1 - chrX 1566226 3' - copia 163 2 70.30 TGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCTGACCATATAAGGTATATAGAAACTATAAAATCTAGAAGGTTGAACTTAAGAAAGACATATCATCTGCAGTGACAG:1 - chr3L 22956893 3' + INE-1 31 1 73.27 AGAATCTTAGACTGCCTACGTCCTGGTAGGTGTGGCCTGAAAGTTCATTTAATCACTGGTCGCTCATTAATTGCACCGCAAACATGGCGCATAACTGGCGC:1 - 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chr3L 662631 3' - Fw2 204 1 57.43 ACACTAGGATAACAAGATGCGTAACGGTCTTACATTGGTTTTGCACTATGCACCCACTTCTTTGGTGACGGCCACAAACGTGGGGTAGGTTAATGCTAATG:1 - chr2L 16520759 3' + 1360 6 2 76.24 CGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCTTTTTGCCCGTTAGCTGGTTATGTA:1 + chr3R 23066892 3' + accord 351 2 75.25 ATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGCAATGCGATTTAAAACTTTTAGGGCTGGTCGAACTTAGCGCGACTGTATCGTTCGATAACGCGCTATCG:1 + chr3R 7643722 3' + R2-element 3257 1 74.26 TTTGTNTTTTAGTTTTAAGTAAATACAAGCAATACAAGATGTGAGGCTTATGATTGATTTGTAGGTGATGAATTACAACAACCACAGCAACGAAATATCCA:1 - chr2R 23577044 3' - rover 6824 1 56.44 ATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAG:1 + chr3L 5691278 3' - P-element 213 1 23.76 CTTGCNGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTT:1 - chrX 1399854 3' + P-element 2872 1 60.44 GATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCTTGCAGCAGGCGTGGGCGCCATTGCGACCCACTGGGCGGGCGGTTGGTC:1 - chr2R 8955027 3' - baggins 5250 1 58.42 TTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGTCTATGTTCGTGTCTGTGTGTGCGCGTATGTAATTATTGGGTGGGTGGTGGTGGTTCAATCTCTGCTA:1 - chrX 9999995 3' - Doc2-element 492 1 69.31 TACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGAGATGAACCAGTTTCACAGTCGGCTGTAATAGCAATCTCCGCTTCACTTTTGCAG:1 + chr2L 14167757 3' + roo 158 2 59.00 TCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTCTATAAGCCATGTCCATTATCCTCATCCACACG:1 + chrX 5398873 3' + TLD2_LTR 144 1 67.33 AAGGCACTGTTTTAGCAATATTTAGGATTTGGTATGGCCACCCTTGTTCCCTCACATCCTTTGTCCTTCGACTGGAGCTATTCAAGAGATGCTGGAAGCTG:1 + chr2R 24219819 3' - Tc3 1444 1 55.45 CGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACGTATTACCTATTACAGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGA:1 - chr3R 1047983 3' + Stalker2 7609 2 60.40 ACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACACGGCAAACATTAATGAGCCAAAGCCACTTGAATTGCCTGTGAAATACAATAAAAA:1 - chr3R 28587090 3' + G2 2833 1 60.00 GGCAGCGTCGCAGCAGGCGGCGTCATCGAATGGGTAGACGAACTGGATTCCGTGGATTCTGAAGCCGTATCCGTGGCCG:1 - chr3R 28869149 3' - HMS-Beagle2 180 2 78.48 TTCGTGTTCATGTGTGAACACTTGAGTTTATCTTTGTGATTTTCTTTCTCATTTAAATTTCTTACAAATTTTTAACATGAGGTTGAAGCTAAAGGTAGTGT:1 + chrX 5104712 3' - roo 8663 1 76.24 GGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCCACTTTTGTCCCAGATCCCATTAGACCTCCAGCAGGCGGTTGAACATCA:1 - chr3R 27082189 3' + G2 326 1 73.27 ATCCCACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCCCCAAAAACACACACAAAACCCAGACACGGGAAGAGCAGCAAACGGTCAAA:1 - chr3L 5248336 3' + I-element 4901 1 53.47 CAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATATATATGTATAGAAGATACCAGGGGAAAAGGACGACAC:2 - chrX 12817480 3' - HMS-Beagle2 33 2 58.42 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCGCCTCGAATCGAGGTTATTTACTGGGAACGGACCTTTCTGTGATAAACGAACC:1 + chr2L 6644354 3' - hobo 20 1 59.00 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATATAATTGTTAATTTAATGCCATTTAATGACAAGAGTAATAA:1 - chr3L 23099731 3' - F-element 54 1 71.00 AATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCAGAGATGGGAAACAGTACACCGAAA:1 + chr3L 9064974 3' + roo 9033 1 72.28 TAAGTGTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCCAGCCAGCAGTATGTACATATGTATGTATATGCCCGATCTATATGACCGATCTACTCGA:1 - chr3R 13824333 3' - roo 15 2 63.37 TTGCGGAGATTCACGTGGGGTTTGACGGGTTTGGCAGTGCTTATGTTTGCATTCCTTTTTGGCATTTTTGCACTTGAATAACTTTGAAATATGGGATTA:1 - chrX 20358436 3' - G2 129 1 68.69 TGTTTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTTTCGTTTAGCTTTAAAGTTAATGTAATTGACGTTGACTGGTAATAGGGATGGGTGTG:1 + chrX 6132151 3' - gypsy4 476 1 60.40 TAGCTCTGTGGAAAATATCGCTCATCGTATTGATCCGACTATTTTTCCTTGCATGTGATAATCGGTCCCTCAGTTGCATCGCACAGACGTACGTACCATTG:1 + chr2R 6501067 3' - transib2 2367 1 69.31 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCC:1 - chr2L 15478796 3' - jockey 4710 1 66.34 TTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAATCATTAAATCACTATCATTAAATTTCGCGCCATGAACAGC:1 + chr3L 89308 3' + jockey 213 1 60.40 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGGATCTCGGTACGTATCAGAGAGGCTAGTTCGTCCATGATGTTCTCGCT:1 + chr3R 14122056 3' - 3S18 5810 2 50.52 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCTTCCTAATTTTTTTTTTGCTTTTTCGAC:1 - chrX 19054597 3' - jockey 4709 1 72.28 TATAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCGCCATGGGAGTGGAGACCACATGCTTAACGGCTTTGT:1 + chr3L 21556592 3' - Circe 7149 1 64.36 TCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCAACAGAAACTAAGAGCACTCCATTCTGCC:1 - chr2L 5931948 3' + jockey 471 1 73.27 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAGTTTCGAACGCCGC:1 + chr2L 5152028 3' - I-element 11 1 67.33 ATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGGTCAGGATGGTTGCCCACTATACTCCCATCC:1 + chr3L 13040440 3' - I-element 4918 1 60.76 GCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTCTGATTTTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGAGCTAAGATAATAAACAA:1 + chr2L 14501864 3' - 412 372 2 81.19 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAACGCATTTTCAAAAGTGGAAACTAATTTTCTGCCGCTTGCAGCTATCTC:1 - chr2R 5267260 3' + pogo 2079 1 57.43 CAAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACCACTTCAACACTCTGCGTGGGCGGCGGTGCCAGTTCTGCGGTGTAGGTGTGATGCACTTCCTCCACTGCAGCTG:1 - chr2R 13775559 3' + Tc1 187 1 76.24 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGCCAAGCAATTACTCTAATGGCAAAGTCTCGGGCCCA:1 + chr2L 11114060 3' + transib2 2808 1 61.39 AGTGCAGTTTATGTGCACGCAAAAAACACAAAATGGTCGAAAGCGGGCAAGTATATAACTTTTCGGAGCCACAAAGTCCGGATGCCAAGCCCCCGCTTCTT:1 + chr3R 24933680 3' - Cr1a 265 1 45.54 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGTTGTAACGTCATGTCGGTGGCCATT:1 - chr3R 14146656 3' + hopper 1365 1 77.23 CAAAAGGTCATAACTTTAAACTTGGAGCCATTTAAGTCTAACACTACAAACAATTTAACAACAAACAATTTAGCAACAATTAATTTGTAATCCAAATAATG:1 - chr3R 12035410 3' - Q-element 672 2 59.41 TGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTAGTTGGGTTTATGTTTCTGGTTTGGGCTTTTTTTT:1 + chr2L 18618228 3' - F-element 401 1 69.31 TTATTTTTTGTTTTTTTTTGTTGTTTCTAATCTCAGCCAAATCGAACCACTGTGCACTGAACCTGCGCACAGTGGTGCTCGCGCTCTTGTCCAGTTCGCAC:1 + chr3L 737786 3' - gypsy7 5004 3 73.27 TTGGGAATCTGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGTGCGAATATTCAATTAATTGAGCTGGCCATAAACTCGAGATGGCCCCTTTTCTCGTGCGCTGC:1 - chr3L 1442312 3' - McClintock 6019 2 66.34 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTCACACTCACACTCAGAGCGAGCGAAACGCACACACACGCACAGGGGGCTCA:1 - chrX 14505426 3' + hobo 2924 1 53.33 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTAACCCAACTCACCAG:1 + chr2L 13670343 3' - BS 5006 1 62.38 ACTCATAGTTAGATCTACAATGAATTAAGATAAGGGGTATATAGTCATTAGTGCTTAGGGACGGGGGAGCCTGGGCTACAGGAACTATCGCCACATGACGG:1 + chr3L 25479111 3' - Cr1a 4154 1 61.39 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGTACAAAATATTTCTAATTTAGTTGTTGGCTTAAAACA:2 + chr2L 9823719 3' + hobo 2928 1 67.33 AGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTTATACTTCTAAACGTCGTTTTG:1 - chr4 176050 3' + accord2 7391 1 78.22 TGAACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGACCTAAAACACGACAACGGCCCACATCTATGTGCCAGTATATGCGAG:1 + chr2L 3213576 3' + S-element 1239 1 70.30 TTGGCTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACATCCACGCGGCATGGTGTCCACCAGTTACCCGGCAACAAAGGCGGAAGCAAAGGAAACATGCTG:1 - chr3R 31884578 3' - HB 1322 1 59.41 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGG:1 - chr3L 22052768 3' + mdg1 388 2 58.42 GTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGGTTTAAATACAAAAGAAGGAATTTACGAATGGCGTGTTCAGAATGGAAAACGAT:1 + chrX 14519356 3' + R2-element 455 1 61.39 TTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCCTTCTCTCGAGACTCCCCACACGAAGTGGCTTTGTTAACGCCCCACAGTTTTGGTCCCGATGC:1 - chr2L 12869426 3' - I-element 205 1 68.32 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAAGTAGCTGGACGACAAGCTGGA:1 + chrX 9260692 3' - 3S18 9 2 68.32 GCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGTCTTCTGCACACATATCTCCTGACGCACTGCGTCATCTGTCATCGTCATGCATAAATGCGTGCGATAATCC:1 + chrX 13390434 3' + Stalker4 7162 4 61.39 CACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCTCCTGGATGCTGAATGAAATGGAGACCACGAGGCCTCAAAAACAGAACAAACACATACGGAATTT:1 - chr2L 18044141 3' + accord 190 2 66.34 CAAGTTGTGTAGTCTGCGAGCCCCTCACGGCATTTACAATTTCCAATAGATTACGATGCTGCATTTTAAATGCCTGTGCTGCAATCATTCAGCTGCATAAT:1 - chr3R 27904770 3' - invader6 499 1 68.32 CTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTGAAAAATAAAATCAAATGGAACAAAATCGTCCACCCA:1 - chr3R 15671538 3' + Tirant 289 2 67.00 CGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACGTTGGCGCGAGTTGGCTGGTTTTGGTGCAAAGTGGTTACCACTGCTGCCTTCCTC:1 - chr3L 14498955 3' - F-element 4506 1 59.78 GTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGATAAGTCGGAAAAGAATAAAAAGTGAAAGCGTCGGGCAGCAAGAGGCAACTTTTTCTCCTAATTGTTTCATTTCGTGAA:1 + chr3R 5944550 3' + gypsy8 440 1 68.32 TTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACATGTGCTCGCTGCGTGGAAGCATAAATAGGCCAAATGCCATTAGCACAGGAGCCTCGTGCGACGTTGTCGAT:1 - chr2R 6147321 3' + Bica 32 1 59.41 TGATAGTCGGGGAACCCGACTAGCATTTTCTCTTGTTCAATTTGGGGTAGCATATCCGTTCGTGGTGTCGTGCAGTTTACGCCATTTCGTTTTTTTGTAGC:1 + chr4 1019364 3' + INE-1 563 1 69.31 GCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACGTTTGGTCAGCATTTTGGGCGCTTGTGTTTACCCTCTAAATGGAGCTCTAGAGATGATCAATTCTC:1 + chrX 4418632 3' - HMS-Beagle2 97 2 67.01 CGCTAACGGAAAGTCCGGACAAGTGGCGTCCGCCTGGTCTGGTTAGCCTTACCCGGGTACTGCACAAAAAGGAGGTGTGCATTTACAACCTGGGAAGGAGA:1 + chr2L 17454114 3' + baggins 286 1 62.38 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCAAACCTTTTTTATTACGGGATCTGATGGTACATTTTAGTTAA:1 - chr3L 22564821 3' - blood 34 2 63.37 ATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTCCCCCATCATACGTCTCCCATCCGCAC:1 + chr3R 10486714 3' + Quasimodo 190 2 76.24 CTCGCACATACACACACACACACACTGTCACGCACCCATCGCCAGCGGCCACACACACACAAGATGGCAGGGAAATTATGAATGCGATTTCAGTTAATTAA:1 - chrX 685362 3' - Stalker 447 1 76.24 TTTATTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGATTTGCTGGAAGACTCTGGAGACGTTGCAGGTAAGTAGTTGTTGTACTAGGCGTATACTT:1 - chr3R 25410173 3' - HeT-A 5749 1 80.00 GTCGGGGGTTTATTGTTGTGGGTTATATGCAGGGTGGTTTTGGGCTGGCAATCGTAGGTCCCAGTAAGTGTTGTGTTGGTTTTCTTCACCTTAAAAGATTT:1 - chr3R 4616321 3' - G-element 4207 1 54.46 GTTACNTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAG:1 + chr3R 1048044 3' - Stalker2 7278 2 52.48 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCCC:1 - chr2L 15478795 3' - jockey 4709 1 65.35 GTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTGATCCGTGTAGTGCGGTATTGGTGTCGGCGACTGCGATC:1 + chr3L 12848633 3' + accord 6925 2 59.79 AATAAGGAGTTGTATTAAAGGTTTTGCGCTTTACTGAGGTAACAAACGAACGAACGAATGAACGATTTCCTTTCATTGGTTTCAATTGGTTTATTTAC:1 - chr2L 13282059 3' + Tc1 293 1 77.55 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACCCTGTTAACAATAAAAAAAACAT:1 + chrX 14597457 3' - BS 5047 1 77.23 ATCTGGGTGAACATGCGCTCCATCATCCTTTCCATACATGCAAAGCCTCCTTTTGCAGAGCGAGCAGCTCAATCGATTTCGATTCGGCGTATAACTACTTG:1 - chr3L 10261215 3' - G6 1547 1 72.28 TTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGATTTCCTTTGG:1 - chr2L 19845874 3' - F-element 13 1 68.32 AAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGTTAACTGATATGTCCACTTCATTAACTTGGCCACAAT:1 + chr2L 6241926 3' - Doc 279 1 63.37 TTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGATGAAATGGCTACCTTCGGCGAATACACATTCAAGTAGAGGCAATCCTCGTCCATGTCCAT:1 + chr2L 15759443 3' - Q-element 61 2 61.39 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGGGAGGCGGCGGTGGCCAGAGAGGCGAT:1 + chr2R 18865937 3' + roo 404 1 70.30 TGGATATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCCACTCGCACAATAAAAGTTTTCCAACAGCGAAATCGTTTTGTTAACTTGTTCACACAAGTGTCG:1 - chr3R 20419774 3' - accord 186 2 65.96 TACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTAAGTCACATGGCAAGTGCCATTCAATCACTCCACTAACTATTTCTTCCAGTGAAAACAGCTGAGTGGGA:1 - chrX 2087936 3' + Ivk 4967 1 77.23 TGGGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGTGCAAAGGGGGACCTGACTTCTTGGGCTTGT:1 - chr3R 10517443 3' - Doc2-element 455 1 67.33 GGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGAGCAAAACAAAAAGCAAAATGTCTATGACT:1 + chr3R 26952494 3' + flea 277 1 70.30 TAAATTTCAAAAAAATTTTTTCTTCCGTTCTGCACCTTTT:1 + chr2R 8380236 3' + Stalker4 6863 1 85.00 GCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTATTGTTATTCTTTAAATAGTTGTACTATTCTTGACT:1 - chr2L 71075 3' + Doc3-element 4618 1 79.21 TGTTGCGAAATAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTTCCTTTGTAAAAGATTAAATTTACAATCCGCCTTTGAATACGACTTCAGCCTCCTT:1 - chr3L 13693173 3' - invader2 4947 2 62.38 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTGGGGATTTTACAACAATGTTTTGCCACTGTTCGGCCTCCGAGTT:1 + chr3R 28623949 3' + roo 360 2 71.29 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATGTATGTGTGATACCGCACAACGAAGTTCTAGCTTTTTGTTGCAGTGCAGCTCTTCATCGACTATGTTCT:1 + chr2R 18891146 3' - opus 3 2 68.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGCCTGTTTATAGGTTTCTCCGCAATTTGAATG:1 - chr2L 17004712 3' + roo 397 1 67.33 AACTTGTCATTAAGAAAATAGCAGAGACGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTAGAACTATTTATTTATTGTTCGGTTCAAGT:1 - chr2L 2096501 3' + Doc3-element 4466 1 70.30 TCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACATGGATGCAGTGCACACAAATAGGCAAACACCCCAGCCATGTGGCGGCAGAAACGATATAATTTCGCA:1 - chr2L 17923008 3' - FB 126 1 74.26 TGTGTCATCTGGGTGAACATGCGCTCCATCATCCTTTCCATCATTCCTTCCAAGCAAAAAGGAACGTTTAAAACTGGAAGATCTGCCGGAGATCGCATTGG:1 - chr2L 17591973 3' - G6 1553 1 51.49 TGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCCTATCTCATGGATCTCTTTATCCATCCGATTTGCACATGTGTGGATTTGCCCAGCAAATTGTCTCA:1 - chr2R 15496634 3' - F-element 35 1 71.29 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTG:1 - chr2R 11129274 3' + hopper 1382 1 62.38 TAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATGATACGCAGGAACAGCAGCTGTTGCAACAACAGCCTGTTATGTGGGAG:1 - chr3L 2085716 3' - hobo 2480 1 55.45 GTTTCTTGGGCTATTGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGCTGAGGTAGAACCATCGTCGGCACCAGGTCTTGAAGCCCTTGGACTT:1 - chr3R 23121565 3' - F-element 320 1 55.00 AATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAGGGTCTTGAATCCTTAGCCTTTGGATGTCGTACCCTCACCGAATTGAGTTTACACAAATCTATCGAGTT:1 - 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HMS-Beagle2 6820 1 55.45 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAAT:1 + chrX 2090285 3' + roo 9029 1 64.36 CTTCGNGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCTTACAACACTCTCAATTTAGTCACTAATCCCATTTTCCTTCAACTACATTCAGAACTC:1 - chr3L 11477026 3' - 412 7174 2 57.43 CACCAACGGTGGTACGCGCCGTAATTGTGACACCCTACTGGAAGTGCAACTACACTCTCCACGCGAGGGCGCCGATGAACGAATGAATCCCGGGCAGCAAC:1 + chr2R 15952514 3' + baggins 41 1 70.30 CTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACGTACTAATTTGCTTTACAGCTGCCGGCGCAACACAAACACCAGCACATCAGCCAGCGATATGTATTATTCATG:1 + chrX 18197749 3' + BS 4689 1 75.25 TTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCTCATGTGTGTGACGGGCTCATAACAAATCATTGGACCATGTTAGCGTCG:1 - chr2R 15046479 3' - I-element 4917 1 65.35 CATCAGCATTCATGGACAAGAGAAGGCCATATCAGTCGATCTCCTCAAGCCTGCCTTCTTAGCTGTCGTTGGCTCTGTTGGCAGCTAGATCAGGG:1 - chr2R 6254218 3' + Chimpo 4054 1 68.42 ACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACAAACAGAAAATTGTGTGAACTTCGCATTTCAATTTACCTAAATGGCACATATTTCTGCACC:1 + chr3R 11096459 3' + roo 8780 2 66.34 TAAGAAAGCTAGACAGACAACGATTTGGGCTTTGGGTGCTGCGGAACACTTGGTTTTGCGCCGAATGCAGCTCGCCGCATTTTCACTCTCACTATTATTCG:1 - 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chr3L 14065864 3' + INE-1 95 1 72.28 AAATAAAAAACAAAAAAAACAAATATAAGCAAAAGAAGGGTAAGGGCAATGCCGCGTAACGGTCGTCACTTTCACACGACCTGGACTGCACTGCAA:1 - chrX 13484193 3' + F-element 4687 2 85.42 CATCTGGATGCTCCACGTTTCATAGGATCGAATATTGGAATGGCCTCTGCGGTGGTGAATGTGGTTAAGGATCGATTCACCCATTTGCCCCACTGGCTGCT:1 - chr2R 12299565 3' - 1731 475 1 70.30 ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCCGGGCTAAAATGTTTTTCGAGCCCCCAAATTG:1 - chr2L 796727 3' - jockey 8 1 76.24 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCGCACAACCACATGCGAGCACTCGTGGCTTTAATTGATGGC:1 + chr3L 22324125 3' - hobo 2 1 76.77 GTAGGGAAGTGGCCTAGCAACAGCCGCTGGCATTTCCGTCCAGCCGATTGGAGTCGTCGAATGAAGGAGGCGCCAGGACCAAGACATAAAACGGATTTAT:1 + chr2L 18168827 3' + gypsy8 4684 2 78.00 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTCAATTCCTGTTGAATATTTATTGCACTGCATT:1 + chr3L 2804883 3' - hobo 44 1 66.34 AAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACATACAGGATTTAAAGCTTAGCATCAAAAGCATAATCGATTTTTTTATGTA:1 - chr2L 16936009 3' - 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I-element 29 1 48.00 TGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGCTACTTACAAACACACCGTATAAATCTGCAAATGCAAGAAAGGATAAGCAGAAGAGCCAAG:1 - chrX 8977743 3' + hobo 59 1 71.43 ATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAAACTGTTTGTAGAAATGCTCCAGCTGCCCGATCAGTTGCTTC:1 - chr2R 7507155 3' - Burdock 6364 2 58.42 TCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAATGCGCTGCTAAGGTGTGTGTAAGTGCTGGCAATTCAGCGTGGAAAGGCGGAAATGGAGCTTAT:1 - chr3R 12172092 3' - Rt1b 5005 1 66.34 CTGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTAATTGTGTCTATTTGATATGTTTGGCTTGTCTGCCGCCCATTTCGATGATTGTCGC:1 - chrX 18237356 3' - accord 258 2 71.88 CAAAATAAACAGAAAAAAAAAAATGGAGTGTATGGAAGACTTCCTCCCGGGAATAATTGGGCACACAGCATTTTCTTGCTGACTTCCGTTTTGCATGGAAT:1 - chr3R 26310122 3' + Doc2-element 217 2 60.40 GACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGTCGGCATTCGTTGTACATTTGAATTGGCCGGCA:1 - chr4 746010 3' - baggins 4973 1 70.97 TTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGGCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATCAGCAACTTAGCGCTGTTATATTGTTGTGCCCTGCAATTTCACAAGTT:1 - chr3L 9812186 3' - 17.6 7120 2 52.48 ATTTTGTCCTACACTTTGCTGGATGTGTTCGGTTGAGTGGCAAAAGCTGATTTATTGTGGGAATTACTTGAAGTAATTAAAATTTAATTAATGGCCCGCC:1 + chr3R 20704739 3' + Helitron 323 1 61.00 TTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCCAAGAACTTCTTCTATCCGAAGTAGAAAAACTTTTAGGGCACTGAAAAATAC:1 - chrX 3050176 3' - I-element 5149 1 58.42 GGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTGCTGCTGGGGATGTGGATGCGTATGCTG:1 + chr3L 13872491 3' - G-element 270 1 67.07 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTATTCGTCTCGCTCCTGGCTCCATCGTCTTGTACCGT:1 - chr3R 27448498 3' + roo 9030 1 64.36 TTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCGGTATGTGTGAATATGTGCGTGTGTGTGTGTTGCTATTTTTGATTTCCATTATGATTTCGC:1 + chr2R 10545398 3' - accord 233 2 67.00 TGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGAATACAAAAATTAATGTCAGCTGACTTGCTTTGTTTCGCTTCTCATTTTCGTGGCGCTCCACACACACC:1 - chr2L 16270967 3' - gypsy12 10053 2 63.37 CAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACAGAGCCACAACACCCACCCAATTTTAGTTTACTCATCAAAGCGATTGTGATAATGGTTTTGTTTC:1 - chr3L 18397823 3' + Porto1 259 1 68.32 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTAATGACCAAAAGGTAAACAACGAAGGCAGCCAACAGCGGTATCGATAACCAAACTAATCGAAACAAAACTGTGT:2 - chr3R 12408303 3' - P-element 5 2 74.26 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACAACTAACAGAAAACTATGACTTCTTTGTACGAGATGAGATGTCGTCGCAGAAATTGCGACCTCAGTTG:1 + chr3L 11609036 3' - 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blood 49 2 69.31 TTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCACCGCCATTAGCATTCCATTAGCA:1 - chr2L 16502160 3' + P-element 134 1 27.72 GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATTTAAGTTTACTGATCAAATCAAAATC:1 - chr3L 10464649 3' - invader3 5237 2 74.26 GATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGTACGCGGTGTATCGATAAGCGATAGTAAACATGCATGGG:1 - chr3L 21824854 3' + hopper 362 1 61.39 GGGTTGGACGGGTTTGGTTGGGATTTGTTTGTCCCTCCAGCTCCGGTTGAAACCAAAAGAC:1 - chr3R 10797853 3' - G2 112 1 65.57 GAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGATCGACGGAGACAAGTGTTTAATGAATGGAAAAGTTGGGCATTTTATTT:1 - chrX 19804847 3' + R1A1-element 359 1 57.45 CATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTTCTTTGGACCTGCAACCTTTATTTTAATCTCCGCCTTTTCTTGGCACTCCTTTATCTTG:1 - chr3R 16053786 3' - Quasimodo 451 2 62.38 CCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATTTCTTTAAATACAATCAATCATATCTTCGTATAGACCAGAACCCATATTAATCTTGCCCGCTAATTAG:1 - chr3R 13990591 3' - flea 4707 1 71.29 GTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCTCGCTTTGGGTTTTGTTGGAATAACAAAAGGCCGTTGGCCAAACAAGCTGCCAGCG:1 - chr2R 17277666 3' - opus 7105 2 64.36 AAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTAATTTAGTTGTAAGTGCATTCCCAAGCTTGCCAATATATTTTTGTCATAGCATAGGTTCCGAAACTTTCGCCC:1 - chr2L 10105982 3' - R1A1-element 37 1 64.36 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGACTGAACTGAGCCGGACAAGTGGCTGGTGGCCAAGATATCGCTAGCACCCCAGAATCT:1 - chr3L 3254961 3' - 1360 21 1 59.00 TCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCCCCAAACCCACTTTTGAACCTGCTGCAGTGCACTGAAAACTGCAGGAAAATAAGAACT:1 + chrX 4825100 3' + gtwin 419 2 64.36 TGTACAAACAATTTCTTGACTGTCAAATTTGGCGGATCGCTGAAACAGAAACAGAACCCAGATAGTAAAATGGCAGAAGCGTTGAAACTACGCACTTCTTT:1 - chr3R 4803762 3' + S2 1501 2 51.49 AAAAAAAATTAAAAGAAAAAAAAAACAGAAAAATAAAATCAGTAGGTCTTATAAAATTTAAAGGAGTTACATTTGTTAGATCCACTTGAGATTTTAATAG:1 + chr3R 22175916 3' + Doc 4694 2 60.00 GGTTGGTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCTTTTTTTTTTCCACGCAAATTGTGGTTATTTATATAT:1 + chrX 6940912 3' - invader2 353 1 72.28 CACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGTCATGCGAACAATAACGTTGACATACATTCGGCCAGGTCCTTTGTTTTTGCCA:1 + chr3R 29519144 3' - Doc 494 1 56.44 TTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGACATATTTATGGATAAATCAAATAAATTCAAAAAAAAAACGTTCATTGCCCGATAATAACA:1 + chrX 8798033 3' + R2-element 3382 1 64.36 CGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACAGAAACCAAAGATGGGGGCCAGAAAAGAAGGGTCCTGGCG:1 + chr2L 3933039 3' - R1A1-element 93 1 67.33 GAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGCCCCATTGGAGCTGACACGCACCTTCTCCGCCGT:1 - chr3L 5254603 3' + I-element 466 1 66.34 CAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCCGAGCCCGACTCGAGCTCATCGATGTCTATTGTAATTGGACGCGTGTTTTA:1 - chr2L 11165304 3' - transib2 7 1 70.30 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCATCACCGTCTCCTCGAAATCGACAGCCGAACGAACACGAAGATAAACGAAAATACTAAA:1 + chr3R 14282827 3' + P-element 2869 1 67.33 ATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGGTTATTTAACGAGCTTGCAGGAA:1 - chr2R 5616575 3' + 3S18 286 2 76.24 TGCCCNGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCGGCCGGCAAAAAGAGTAATGGTCAAC:1 + chr2L 7418642 3' + accord 9 2 73.27 ATTATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAAGAAAAAAAGGAAAAACGAGGGGGAAAATGGGAATTCGGACTTAAGTCCATTGCCATGGACGAGCACC:1 - chr3L 18125144 3' + invader2 266 1 70.30 TGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCAACTTCAAACTCCAATTAGAGTGTCGGTTTAATGAACTGCTGTCTGAACAAGGCACACGG:1 + chr2L 20333870 3' - G4 3360 1 68.48 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGAAGTAAATTTATAGCAAATGATGTGGTTGCTGCCCGACTCCTTGTGGC:1 + chr2L 12237099 3' + jockey 4967 1 50.50 TGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGTGTGTGTGTGGGGAGTCCCTAAAGTTGTTGCTAGTTTGTA:1 - chr3L 5209327 3' - accord 7091 2 69.31 TTATATAACTTTTATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGGGCGGATGGAGAGGACTATAGCCAGCAGG:1 - chr3R 30431221 3' - Doc2-element 4692 1 79.21 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGACCGACACGCAGGTGGACGACGTAAAAAGAGCCCGTGCCACGAAAAGCTCAACTGTGGCGAT:1 - chr3R 25395580 3' + roo 394 1 62.38 TCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGTCACAGGACACATTATATATACTTTGTATTTATGATTTTTACACTCTTTTAAAAATTTGCGCCTTACTAA:1 - chr3R 19330833 3' - S-element 1526 1 69.31 CATCGAGCTCCGTATATAATCACTTATTTAGTATGTTAAGCCGGTTTTCTTGGCTAAACTAATCGGTTTTGAGCCACTTGCACTGCATTTTGGTTGTTCAA:1 - chr3L 343783 3' + Doc3-element 29 1 75.25 GAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAGCAGTGGTTGAAATGGGATGGTGGCAGGGTGGTGTTGAGCCACTCGGCCACTCGCTGTGAG:1 - chr3R 18490260 3' + Circe 7117 1 60.40 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCAGTAGCTGTTTGCTTGAACAGT:1 - chr3L 17624163 3' + roo 9041 1 54.00 AATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGTACATATATGCATATGTATGATGCTCCTTTCCAATATTGACAAGATGATCTATAGATTCGTGTAAA:1 - chrX 19885149 3' + HMS-Beagle 238 2 71.29 TTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCAATAAGAGATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGTAGTGGCAGGGAGAAGAAGCAGAGCGAAAA:1 - chrX 3685682 3' + invader3 98 2 69.07 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTAC:1 - chr3R 23618146 3' + hopper 1378 1 62.38 ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGACTGATTAAAAACTTATCGAAGCCAAAGCTCTCA:1 + chr3L 3485023 3' - diver 45 2 70.30 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCATTGTAGCCACAATTGACTGATTATCAT:1 - chr2R 8125063 3' - Doc 21 1 53.47 GGGAAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCCAGCGAGGCTCCCTTGCGAATTTCGTAACC:1 + chrX 14119231 3' + rover 6948 1 70.30 TTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAATTCATCACCAAACCAACAACAACAACTACAACCACCACGCTCGCTGATCTATCAAAAAATAAA:1 + chr3L 10576378 3' - HMS-Beagle 6722 1 62.38 AACGTCTTCACACGTCGGCGATATATAATTGTTTATTTTTTTTTATTTGGTGAATTTTACTTCTCCAGCGGCAGGGTGGGTGGTCGATCTACTTGGGCC:1 - chr3L 3761134 3' - F-element 19 1 59.60 CTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCTCATTAACCACTTTAAAAAATTAAAAATT:1 + chr4 806701 3' + BS 5051 1 73.27 AGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGTTTAGAATTTAATTCGCTTTGACTTTTGAGTGCTTGTTACCATTTGAAATCCATTGCTACCCCACCGTAGCAGATT:1 + chrX 7614923 3' - G5 4619 1 80.20 TTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAAAAAGTGTAGTCTGCTTCCAGGCGCAGGAAATGAGTGT:1 + chr2L 5307349 3' + hobo 343 1 63.37 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGCACCTTTTTGTGTCCAACTTTTCATTTTCAATCAGG:1 + chr2R 11730928 3' + blood 338 2 63.37 CTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCCCCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACATTAAGGTGTGCAAAGTTGCAAGAG:1 + chr2L 7594633 3' + G2 2825 1 74.26 CCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGGAGAACTGGAGACGCGGCTCGCTATGCCACCACCGCCGCCGCCGCC:1 + chr2L 6330462 3' - R1A1-element 440 1 62.34 CCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCATCAATCTTCTTAATTAAAAAGCTGACAACGCCGTCTACGGCCACCAT:1 - chrX 1398346 3' + Gypsy6A_LTR 353 1 61.39 ACACGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTAATTGGCACGCTCATGAGCCGGGCAATCAAATTAAATTCC:1 - chr2L 796758 3' - jockey 13 1 58.67 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGGTTTTTCCGACCCCAGCTGCTTTGAGCTCGACAAACGGCCTTTGTTGATT:1 + chr3R 31411362 3' - FB 58 1 76.24 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTTAATAGTGATCTGTCCGTCCGTATGAACG:1 + chr2L 21378455 3' + pogo 2056 1 73.27 ATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAACCCCCAGTTTTGTTTATTTTATATCGACTAGATTTGTTT:1 - chr2R 16775628 3' - X-element 4300 1 69.31 TGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCGGGCAATGGAAAGTCTTTGTTTTTCACAC:1 + chr2R 24133438 3' + 1360 408 1 71.29 ATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACA:1 + chr3L 829961 3' - G6 34 1 54.46 ACCTCAAATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCACCATTTTATATTTCAATTTTGATAGCAAATGGCTTCGA:1 + chr3L 7171584 3' + G4 3465 1 76.24 ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAATCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTCATCTACATAGGGTGGTGGGTAGAAGTGATTGCTGTGAGGGTG:1 - chrX 22851248 3' - INE-1 83 1 57.43 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACATGTATAAAATGTAATAATACTTAACACAATTAAATTGCACAGAAATTCCTGGTAATTTTCGGCTTTTCCTATT:1 + chrX 11205407 3' - I-element 8 1 55.45 TTAGACGTCGGGGAGTTCTTCGACACATTTTGTTTTATGTCCCCCCACAGGTTTTCAATCGGTTAAACGGTTAATTTCGAAATTGCTGCCAGCGATCGTTA:1 - chr2R 16579337 3' - HB 1196 1 65.35 ATTAACATTATAACAATTATGAGAATATCATCATCTCCTGGTTCTCCTCAAGGGGGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCCGCCGATGGGACTGCAACAATG:1 - chr2L 14652162 3' - BS3 1630 1 75.25 CCCTCNGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATTGTCCTCCAAATCCGCTCCGAAATAGTAGCGTCTGTCTGAGGACATCAAAACTGC:1 + chr3R 24654557 3' + jockey 4726 1 63.37 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATTTGTTTTCCACTTGCCGCTCGACACCAGTGAAATTAACACCAGC:1 + chr3L 19510832 3' + roo 400 1 70.30 GATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTCAAACTATAACTGCATAACTAATCTATTGTTTTCCCGCTCTAATTCGCTTCT:1 + chrX 6657582 3' - accord2 7331 1 58.42 GATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACATGCCAAGCGTGTCTCACTCGACTTTCATTCCCACCACACCCTCCTAACACACGCTT:1 - chr3L 939389 3' - accord 429 2 61.39 GGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGACCTCGGCGAGCACACATAGAAAACAGGAGAAAACTTT:1 - chr3R 19544303 3' - hobo 2646 1 59.14 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGCTATCTATAGTGCTGCGTCCCAGGTACAGTGAACAATTGCGCCGG:1 + chr2R 10697111 3' + 297 371 2 58.95 TATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATCTAACAAAGAATATATTAGACTTTTAAACACACTAAGAATGAAATATTTTG:1 - chr2R 12703535 3' + P-element 2549 1 53.47 AAAAAGTATGAATTTTTGTATGTTATCTGGCATCCACTACAGCGGTTTTCATTTCCAGGGCGGGATTTCGGTAGGTGTTCTGTTTTTGCTGGGACAGCCAA:1 - chr3L 12763336 3' - I-element 5141 1 74.26 GGGACCACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTGCCTGTGTGCCTGGTTCGCGCCTTGATGCATA:1 - chrX 1450650 3' - R2-element 131 1 68.32 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATCCAGAATTCATTTCTAATCAATC:1 + chr2R 18434533 3' + pogo 2054 1 75.25 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAATCGAAAGCGATAGCAACACTCT:1 + chr3R 12789924 3' - flea 26 2 53.47 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGAGCAGGCTGCATTCGCTTCAGTTCCAT:1 - chr3L 13326695 3' - transib2 47 1 73.27 GAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAAGGGCCTTCGGGGGCAGGGGGGCATTTAAAATAATAGA:1 - chr2R 8839489 3' - Doc 439 1 65.35 AATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAACTCCATGCACGGCTTAAGCTCCCATTTGCCCCGAGTATCTGTGCGCTTTCATCTGCACCTGTA:1 + chr3L 4977381 3' - Bari1 1562 1 73.27 TATATTCTTGATCAGGGACAATCTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTGTAGCCCACTGGCTCCGGCGGCGACCAGCCAATGAGCACGCTCTTGTTCAGC:1 - chr3R 15387214 3' + INE-1 83 1 56.44 CGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTACAGTG:1 + chr3L 15853532 3' + jockey 4970 1 59.41 GTTGTTGCAAGCACGCTCAATTCTTGATCATATTCATTTATATCTGTAGCGAAAAGGCCCCGCTTTCCAGATGATATTTGTCGATGGTGTCGAGGTGTTAA:1 - chrX 405990 3' + gypsy12 10062 2 57.43 CCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTGTGACATTGCTCCGCTGATGGAGCCCCATCCCATAAACCACCCAGGCAAATCCCCCCGCGCCCTCCAACTCCA:1 + chr3R 11510750 3' - blood 488 1 77.23 CAAACNAAACCCCAAAAAAGCTCCAGGGCATGATCTGCAACTCCACTATAAAGGCCAGGATCGCCCCCCATTTCGCCGTTGTTGTTGTTGTTGCCGCCATT:1 - chrX 19527168 3' + BS3 235 1 54.46 GTGGCATATATTGGTTTATTACATTACTTAAATTTTATTACATTTAATTCTAATATATAATCCGTTTGTAAACTGTATTATAGGTTTAATTTG:1 - chr3L 25798424 3' + blood 7388 2 72.04 TACATACACACACACACACATACATTTGTATATATACACGAAAAACAGATTAATGGAGAGGAACAGAACAACAATGGGCAGTAGAGTTAGCGTCCCACGCA:1 + chr2R 10549550 3' + Quasimodo 34 2 76.24 GGTCGGAAGTTGATTTCCTAAAAAAAATTATGAAATGTCGGCAAGGCAAGAAGGAGCCTTTTAAGCCGGTGACGGAACAGTATTTACCTTAGAAGCGCAAC:1 - chr4 704701 3' + Tc1 34 1 73.27 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCAC:1 - chr3R 14832418 3' - blood 7060 2 71.29 ATTTTCCTGCCGTATATAATAAAAAAAAGAAACATACATGTACATACATATACATACGTATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1 + chr2L 5069689 3' + Rt1a 5058 1 58.42 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTG:1 - chr3R 13375978 3' - 1360 42 1 69.31 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTTGTGACATCCTCACATGTATGTTCCAGTGATTAACTTGT:1 - chrX 19561817 3' - 412 7087 2 56.44 TTTTTAAAACAGTTTTTAATCCACTGTGCTGCGCTGCAGACAACGGTAACATGGCTTGGTGTTAATGTGCCATGCAGCTTGGATTTTCCCACATTGTGGT:1 + chr2L 15350232 3' + Juan 3784 1 57.00 TGGCTNGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTGTTGTCACAGAAATTGTCAAGTCATGCGTAAATCTTAGTAGACTACGATCTCTTTGGC:1 - chr2L 3621058 3' - 297 6591 2 69.31 GCATCGTTGGTGAGGTGATTCGTGATGGTTTAGGCACCGCATGACAACAAAAAACAATCAAAATAAATTTACGTTCCTATCAAGAGACCGTTTATAAAAA:1 + chr3R 26259940 3' - HMS-Beagle 6712 1 63.00 ATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTAACAGTAAATCCCATTAACTTGTGATCAATTGAGTGCAAATCGCTGTAAATAATTA:1 - chr3R 14655326 3' - I-element 245 1 58.42 TATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACGGGCTTTGATCGCGGCGGCCAGACCCGAG:1 + chr2L 12438404 3' + R1A1-element 5026 1 71.29 ATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCACTCGAACTAATTGAGTAACGGGTATCGTGGAAATCGAAATCGTGGAAATATTTTTTTGGG:1 - chr3L 20659415 3' - X-element 4276 1 62.38 TGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr2R 1751256 3' + INE-1 91 1 68.32 TGAACGGTTGTTCAGCAGAGAGGCAGTACAGCGATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCAAAAACCCAAATATAAAACTTAAAGAATTAAAGTTCGCCT:1 + chr3R 10084703 3' - 3S18 5732 1 60.40 TACACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAACCGAATCGATTGAAAATAAAACTTAAAACACATATAGAAAACGAAACGAAAGCAAATGTGTC:1 + chr2R 6686634 3' - Tc1 1551 1 69.00 TAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATAATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCA:1 - chr3L 24916686 3' + accord 318 2 76.24 AGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTGCCCTTCATGCGATTGTGGCTGATTGATTGCAGGAGGAGCAGAGATAACACAAGCGCGGCGCAGAG:1 - chr2L 9633199 3' - Doc 498 1 71.00 TATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCG:1 + chrX 21947732 3' - mdg1 28 2 58.42 GCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGATGGCGGTGGGTTGGTCCAGCCAGCGAATTCATAAGCAAAACCAAGAGGC:1 + chrX 14155479 3' - Doc 478 1 54.46 TATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAGTCCAACGTATACATATATACGAATTTATTCAAAG:1 - chr3L 3484978 3' + diver 182 2 65.35 GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTT:1 - chr3L 776121 3' + 1360 3332 1 82.18 ACAATTTGGCACAAAGTTCCTTGCGGCAGGTGACTGGAACGCAAAACACAGATGGTGGGGAAATTACAGGATGTGTACCAGTCCAAGCAAATGGGTCAATT:1 + chr2L 11199824 3' + G5A 390 1 80.20 TCTTGGTTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCGTCTGTCCGTCACGTGGTTTTTATTATAGTGCAATATAAAATAACATTGAGTATATACGC:1 + chr2L 21623545 3' + INE-1 88 1 52.48 GATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTCTGCTCCACCGCCCCTTCTTTTGCAATCCTGGCCTGGTCC:1 + chr3R 9076663 3' + invader1 3891 2 64.36 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCGGCAGGTCAACGCTGCGGCACATGTCGCACACAC:1 + chr2R 20452070 3' + Tirant 379 2 55.45 GAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTTTTAAGTTGAATTGCAATTGACAAATTATTTATTTGTAGCACATGGGAA:1 + chr2L 21924881 3' - INE-1 575 1 51.49 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCGCGCTCCGCTACACCGTTTTGTTGTGGGGTGTGCTTGTAGTGTAACTTGAAGATACAAGCTTTA:1 + chr3R 8815675 3' - Tirant 11 2 70.30 CGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCAATGACGATGTCCAGATGCTTGGGGCTATCGTCCCACAAGGTAGT:1 - chr2L 5524890 3' - R1A1-element 477 1 55.45 CCATTCACACAAAAATATGGAAAGTGCTCTCGGGCACTTGGCGGTGTGTTGAAAGGGAAAAATGCGCTATCACAAGTTTCAAAAAATACAACAAATAGAGA:1 + chr3R 20212353 3' - pogo 62 1 73.27 GGGGGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTCGGTCAATGATGGTGCTCGACAGGGATTTTTTGTGCGTCTGTCGCTGCAGGA:1 + chr2L 2990556 3' + flea 4889 2 49.50 AGAAAATTTAGTGGTGGCATTTATGTGTGAATTAATGCCCCACTGTATCTTGAATAACTGCTGGTCCCCAGGAGGTTGTTCCTTGATCTTATGTGATGCCA:1 + chrX 11724004 3' - Bica 4446 1 67.33 ACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTT:1 + chr2R 4879003 3' - G-element 53 1 74.26 CAAAGATAGAAAACCACAACCACTCTTCAAAGTTGAGCTGAAACCTTAGATGGCATAAAATGGGGGCGTGGCGCACTGTAGGGCGAGTGAAAGGGGCGGAA:1 - chrX 1497103 3' + Fw3 300 1 61.39 GGCCTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAAATGGTAAAACAGAAATAATGCAAAAAATATTAT:1 + chr2R 7427330 3' + I-element 327 1 67.33 TTCGGGGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGCTAACATATTGAATTATAGAAAATATAGGAT:1 - chrX 11060452 3' - I-element 1 1 70.30 ATTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTACATCTTACTAACCTCATCTGTTTTTTTTAGAAAATGGCGGATCGTGGCTATCTGGTCTTTTATCTGCTCCA:1 - chr2L 14665845 3' + Tc1-2 1617 1 66.34 ACCATCCGGGCAGCAATCGGTCTAATTGGCCGGTAGGACCGTAATGTCATCCGGTTTTCCACCCCATGCATCGATGTCGTGTTTCCGGGCATTCTGACTAA:1 + chrX 7402039 3' - BS3 480 1 67.33 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACA:1 + chr2L 21292995 3' + roo 9031 1 67.00 ATTACCCACGAACACAAAAAAAAGTGCAAAACAAACTGAAATAACAACTAACTAACAAGTAAAATCGAAACGACAACAGAACAGAATAATGCCAGGCCTTA:1 + chrX 7609296 3' + gypsy2 390 1 62.38 GATCCGGATTAATAGCCGAGTCCGATTTGGCCGAAAAGGCAAAGAGATTTCGTGTTTTGTGTGTTTGCAGCTTCAAACCAAATGACAACGCACGTGCGCAC:1 + chr2R 10955774 3' + INE-1 92 1 75.25 CTCAGAATTAAGGCCGCCCTCGGCCGTCTGTAGTTCAGCGATAATCTGCCTAACTTGGTTCCTAATTTTTTGCAGTGCATGGCTCAGGCTGGTGCGAACCA:1 + chr2L 9542639 3' - gypsy6 7392 1 57.43 CTGATAGTCGGTAAACTCGACTGTAGTATTCTCTCTTATTCTTATTCAATTGTGTAATAACTTTTCGCTGCACATAAGGGCTGTTTTCTTTAAGTTTGGAT:1 - chrX 19330545 3' + INE-1 562 1 49.50 GCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATAAGGCAGCTGAATTGTGTATCTTT:1 + chr3R 12065007 3' + Ivk 5330 1 77.23 GGATGCGCAATATCAAGAAATGTTTGTTTATTTAACTTTGGTTTCACATTCGCCGAGCGAGCAGAAGAGATGTGCTTAACTTTCTGGT:1 - chrX 16991744 3' - Tom1 91 1 70.45 ATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGGGGGCGTGGGTGGTGGCAATTTGAATACAAATTAAAGTA:1 - chr3L 22367269 3' - F-element 92 1 61.39 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGTTTCTTTAAAACCTTTTCAAGAACATCCGATTTTTA:1 + chr2L 15894763 3' + jockey 4954 1 63.00 GCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCTACACTGCGTACGAAAGAGATGGCGAGTGAGGGGGTGAGAGGGTGA:1 - chrX 5036222 3' - 17.6 177 2 57.43 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGTACCGATTACAGAAATGCGTGCTCTGGAATTTCAAGAT:1 + chr4 1219233 3' - 1360 38 1 64.36 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTTAAACCGAAAACGGAATTGTTGAAGGC:1 + chr3L 10035680 3' - jockey 4788 1 56.44 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACCAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCCAATCTCAGACGGCATTCGTTCGCATCTGGTATGC:1 - chr3R 10490345 3' - transib2 38 1 62.38 TAACTCAAACGTCGAGCTTGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATATATATGGGCCGCGTAATTGGTGGGCACGTTAATCAA:1 + chr2L 20515608 3' - R1A1-element 5042 1 62.38 GCTGTGTGCTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAATGAAAAATGAATTTAATTGCCCTATGTTGGGTGTCAACATTTTTGAAATG:1 - chr2L 14536240 3' - blood 28 2 51.49 TTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGC:1 - chr3L 12072553 3' + HB 1597 1 57.89 TTGAAAGTAAAGGATCCGATAAATCCATGGATGGTTTGCTTTTTGAATTATACGCTATTCCCCAACTATCGCATAATTCAAAAAGCATTTATTATATCTAC:1 + chr4 904930 3' - transib3 2401 1 51.49 CACAGCTTGCTCCGGCTCATTGCCGTAATTACACAATCAGCTCCGTCAAACCCATTTCCATTTTCCAGTCCCGGAGTGATTTGCATAGCCGAGTGAAGCAG:1 - chr3L 9953928 3' + gypsy 264 2 76.24 TCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATACACTGAACAATGCAAATAATTGTCAAACTTAGCTGGGCACAAAGA:1 - chr2L 15782730 3' - hopper 1018 1 55.45 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCGCTTAAAGTGATTTTGGTCAACAGCCTTTAGACAATTTCCAAT:1 + chrX 6283719 3' - P-element 5 2 75.25 TTAACATACCCCCTCTCTCAGTCTACCCAGTACTGCAACTGAAAGCCGAGCGAGTACGTCAAATGAGAAATGTGCAAACAAGTGTGGTTGGATAGTAGGG:1 + chr3L 14711551 3' - accord2 7628 2 61.00 CGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCCGAGCAGGTGGCCAACGAGTGGTTCGCCCGCATTCAGCAGCACC:1 + chr2R 24607860 3' + hobo 2851 1 52.69 CAAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACCGTTCCCTTTCAGAAGGTATTAATTTGCTTCTTTCGATTTTACATAACCCGCCAATCCTAATGCCATTTTGCCCAG:1 + chr2L 16655413 3' + Gypsy12A_LTR 2019 1 65.35 TGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTGATGACTAGGAAGCGGGTTCGACAGCTGGTCCGCGTA:1 - chr3R 8015280 3' - 297 238 2 63.37 AACTTTTAGGCTGTTCATAAGAATAGCAGTGTCTGCTTTTGGCACGTAATAATAATGGAGGCAACAAACAATGCAAAATTTGTCGAATTTTGATTATTTTA:1 + chrX 14313455 3' + HB 198 1 68.32 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATAAAGCATTTTTTTAGTAGATAGTAAAAACATATACGGTTATAT:1 - chr3L 19260778 3' - pogo 30 1 62.38 GAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCAATCGGAGCCGTTTCTTTGGAGCTTGCGGCAAAGTTTGCAA:1 - chrX 22747877 3' - Doc 499 1 59.41 TGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTATGAGAAATACGCGTTGTTGCGTCTTCAGTTTTCCTACAATTAAAGTCTGCCACATGATTTTGCTTTTGAATATG:1 + chr3L 13957126 3' - F-element 284 1 61.39 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCCCACC:1 - chr2L 15478792 3' - jockey 4706 1 62.38 TATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGGGCGGAAAAGGGTTAATTGAGTTGTTTGCCATTGTTTTATCTGCTTTTCCGGCA:1 + chr3R 17593973 3' + Quasimodo 7197 2 62.38 TAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGAGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTGGAGTGCTTGTGTCCGGCACTCGTACAGTGGCCAAC:1 + chr3R 22070224 3' + 1360 398 1 81.19 ATCAGNAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCGAGTGAGGAGCGTGAAAGTTATTGTTGGTAATATCAACACTAAAAGTGTTTATGATATGAAAAATGTT:1 - chr2L 14901691 3' - Ivk 5070 1 65.35 CTATCTTTTTTATGAAGAGGAATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGGAATTGTGAAGATTCCAGAAATAAGGAAGCGAAACCGATAATCATACGTA:1 + chr3L 7822986 3' - Q-element 68 2 74.00 ATTGGAGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGCGCTGGACACAGTTGGCAGCCTTGTTGAAAGTAATTGACATATTGCGTTG:1 + chr2L 14536340 3' + blood 372 2 73.27 GGCTAAGTTATTTTCATATGTTCTCAGTCCGTCTATATATTTTTTTACTATGTTTTGCTATTAAAATGCAGCTCAACTGTATTTGATTTGTTTACCAGGAT:1 - chrX 18513044 3' - G4 3629 1 65.35 TGAATAGGGTTACTATCGCATCAACAATGTATTATACTACCGACATAGAAAGCTATAAAAAAGACGAGTAACTAAAAAATAACTAGGAGAATGCAG:1 - chr3L 16749544 3' - rover 396 1 60.42 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATATATGTATCCATACAATTTCATGCGGAATTTGT:1 - chr2R 22740034 3' - Transpac 33 2 64.36 GATCGACGCGGCTAATGATCCTGACCAAGGATTTACTTAATATGGTCGGAAACGCCAATTGCCAGTTTCCCATTAGGTATCTGACTACCGGAAAATCTGTA:1 - chr3R 13730453 3' - INE-1 96 1 52.48 TTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTGGGGATAGTGTACGGCCAGTAGTCGTCTGAAGGCGTTACAAATCAAGTTTTAATTGGCAAAGTTGCACAAT:1 - chrX 15970447 3' - rooA 7572 2 57.43 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAAACTAAAACATTTAAATTAAGGTGCTTTCATTTTATTGACAGAAAATAAATTTCAGATATG:1 - chr3L 11610344 3' - 412 7069 2 70.30 AGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACATCATCTGCAACGGAGTCATGCCGTAGCTCTTGAAGAGCGATCCCTGCCAATTGGCAGTGAA:1 - chr3R 17607528 3' + Bica 4607 1 66.34 GTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGTTTCTGCTTGGTGGCGTTACTGCCTGCTGCTGATGG:1 + chr2R 17415089 3' + hopper 449 1 71.00 GGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGAGATGCTGCGCCAGTTGTTGGTTTTCTTCGTTGACTGACCACTTATTGACTGATT:1 + chrX 19578878 3' - HMS-Beagle 6743 1 53.47 GGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTTGGGTAATTATGATGAAATCAGTA:1 - chr3L 5426539 3' + R2-element 3240 1 70.73 AGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACACGAGGAAGTGAAATGTTTGAGCACTAAAAGAACGGAT:1 + chr3L 21925876 3' + X-element 422 1 63.37 TGCCAGGCTGGGGGCCCGTGAAACAACTAGCCCAGTCGCCCACTGGTGAGATGGAGGTGAAGAATCCGCTCTTCCT:1 + chr2R 24879439 3' + baggins 250 1 52.63 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGAT:1 - chr3R 15072583 3' - pogo 40 1 69.31 ATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGAAGAAAAGCATTTGCAAGAACAATAGTAAAAGTCCCAGACGGATCGACCACTTGGCCCCTACTATATTCATAA:1 - chr3L 20505261 3' - Cr1a 4100 1 78.22 CCCTCCCCTTCTAAGAAGAAGGCTGTCCACAGACTTCTTGAGAAGGTTCATGCGTGTGTTAGTTAATGGCACGGCGCCCTGATCTTCGTGATTCTCCACCG:1 - chr3L 11225900 3' - Burdock 6116 1 47.52 TAGATCGCAAGCGATCGTTTATAATAAATGATTATTTGAAACTGAAACTAACATACAAAAAGATTCCCCGATAAATACGAGAGGTACATCGTAACTCACTA:1 + chr3L 22381022 3' - HMS-Beagle2 7160 2 59.41 CCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTACAAAGCGCGCTTCTATGGCTGGCAATGTTGTCAACACAAATTAAGCTACCATGTAAAGCTGAATG:1 - chr2R 13741430 3' + hopper2 1541 1 73.47 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATAAAAAACAAATCACAAAGTTTGAGGGCAGTTTTTCCAGCTCATCCCCCTTTTGGCAAAC:1 + chr2R 16895935 3' + I-element 5336 1 55.45 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCTTTTGATGCGCAC:1 - chr2L 306456 3' - Tirant 8117 2 71.29 AGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCAT:1 + chr2L 4743174 3' - I-element 54 1 77.00 TTATAAACTTTATTTAAATGCAGTTGGGGTTTGGAGATAGGCGCTCACTTACATAATCTGTGTGTACATACCTGAAAAATAAGAAGAAAGAAGAAATAAAA:1 - chr3R 20274229 3' - gypsy3 479 1 64.36 TTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGAATGTTCGATTGTGGCTGTGTGGGGAGCGAGAGAGGAGTACACATAAATATTCATTGTGTTGGTTGGAAGCAACAT:1 + chr3R 22822716 3' - Doc 483 1 57.43 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTT:1 + chr2R 8157237 3' + Transpac 271 2 69.89 GACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACAGGTAGTTCAAAATCAGAGGTAAGGTATGCGACCGATCTGGAACCGGTTTCAACGGA:1 + chr2L 2163916 3' + invader4 2687 1 62.38 AACCTCCCGCTTGCGCTGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACACCTGCCTCGCACCTCGATTCGAAGGCCATGATATAAAGAGGGTTGTCAG:1 + chr3L 13216329 3' - jockey 228 1 65.93 TTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCCGCAATAATATATATAAAGGGACAGCAGATA:1 + chr2L 17050210 3' - flea 40 2 74.26 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTATATGTTTGCGGTGCGCAAGGCAAATGCTTCTCCTTTTTATTTGACGCCGAAAAAAGGCAAT:1 + chr2R 23469014 3' - I-element 4 1 66.34 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAATTTGAGCAAACTTATTTGATCTA:1 - chr3L 17858182 3' - HMS-Beagle2 6932 2 80.20 AAATATATTATTGAAATTATATTATAAATTTAAAAAAAATTCTTGGCTAAAAGCGGTACTCTTGGTAACTGTGTGCAAATTCAATTAAGACCCGCTT:1 + chr3L 4576882 3' - transib1 1924 1 81.44 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTT:1 - chr3R 21799514 3' - jockey 4791 1 55.45 TTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTAACCACGAAGTGATAATGGCCACTGTTTTATTTAACTACCATTG:1 + chr3R 11511978 3' + diver2 334 2 63.37 AAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAGTTGGCACTGTCTCTGTCCGGTTGACAATAAAA:1 - chrX 13168202 3' + 1360 3140 1 65.62 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATGTATATTTACGAATTCAGAATTAAAAAAAAGGGGTC:1 + chr3L 25200722 3' + S-element 1679 2 71.29 CCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGCAGTTCGAATTCTACCTGAACTGGCCAGAGTTCGCATCAAACAAATC:1 + chr2R 20951655 3' - R2-element 3523 1 53.47 ACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCATTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACAAGATCCAAGGACGCCGACAGAAG:1 + chr3R 15303899 3' - Circe 7185 1 75.25 CTGGTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTCTAATTGCCTTATCGCTTTCAGCGTTGACGGGCGCTCGAGCGCGAGGACTCAAAGT:1 + chr3R 28122407 3' - I-element 4958 1 61.39 TTCTGTGACCGTTGGTATGGGCTCAACGTGTTGAGGAGGCTGCCAGACCTTCGGTATACCTGGATTGATGTTGGTATTGACGGAGTGACTGGCATCTCCA:1 + chr2R 4933714 3' - G7 140 1 74.00 TCCAANTAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTTGGTCAAAGTACCATGCTTATGATTCAGTATCTAG:1 + chrX 5469863 3' + roo 9029 1 68.32 AGTAACGGGTATCTGATACTCGGGGAACTCGACTGCAGTATTCATTTGGTCTTATTTCTCTGCTCTTGACGTCATCTCTGTGTATTTCAATTTGGTATTTA:1 - chr2L 3107575 3' + INE-1 550 1 66.34 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGGCGACAACAAACTTTCACTGGAGTTGAAGCTAAAGTGGGAGTTGGCCAAAGGGGTGGCCATACACCACTTGAC:1 - chr2R 22454906 3' + hobo 2935 1 73.27 GCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCGACATGCAGACCGAGAATGAATACAAATGCGGCGTACGTGTTAA:2 + chr3L 19026611 3' + TAHRE 10384 1 56.44 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGCAAATAGTGCGGTTTCGAAAAGTCGTTTTCTCCCGCTTCTCTCATTGTTTAT:1 + chr2R 19567758 3' + 1360 3365 1 56.44 ACCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACACCCCC:1 - chr2L 14124017 3' + gypsy7 5004 2 83.33 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAGCATCA:1 - chr3R 9996398 3' - blood 7055 2 65.35 TTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTATCCGATATAGTATGCACCCCAGTCCGCTCATTTTCCTCCTTCTGGTGCTAAAAAGTTAA:1 - chrX 12290609 3' + HMS-Beagle 233 2 66.34 ACTCTATAAAGACCTCAATATTCACACAGTTGAGACACAAATTGGGAGACATACAAGTCTATCATTTTCTGAGATACATTATCTCCACGTGCAGCAGTTAT:1 + chrX 20135705 3' + Helena 1191 1 58.42 CCTGCCTTGGCCCGACGAGAGTGTCGCAAGAGCAACAAATTAAGGGAAGCCTGCGGAGCTTAGACTTCGGTGTGAATAAATGTAATTAAAATGTGGAGTCA:1 + chr3R 19955019 3' + aurora-element 3861 1 74.26 CACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATTTCCAACTATTCATTTGTTGTTTTAAAGCTCAATTATCTAGGTCATAAAGAGCTGTTTG:1 + chr2L 5786210 3' + roo 15 2 59.41 CAGCAAGAACCCAAAAACAAAAAGAAAAAGGAAAAGGAGCAAGCGAACGAAAGACAGATATGCGTAGAGGATCCAGAGGACTTTGCCGCACTCGCTGAGG:1 + chr3L 14850831 3' - Tc1 165 1 81.00 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGCATCGAC:1 + chr2L 222234 3' + P-element 2861 1 36.49 TGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTATAAACTGAAGCTTGATGACCCACTTGACGCCGGCCACGTTGATGCA:1 + chrX 1352744 3' + Chouto 83 1 60.40 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTTTTAGCTTAGATTTAAACACAAGTCCAA:1 + chr3R 7375377 3' + roo 9024 2 77.23 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGG:1 - chr2L 16691162 3' - pogo 31 1 58.42 GTGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATCAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAAGGGTGAAATAAGCACAAAAACATCCCATATA:1 + chrX 174128 3' + Cr1a 4062 1 69.31 CTGGTGGGAGGATCGTGGTGGTGTGGATG:1 - chr3L 8757797 3' + R1A1-element 4989 1 48.28 CAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATT:1 - chr3R 14882082 3' + gypsy5 385 2 56.44 TATCGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCGTCAGTCTGCATATCATACAAAAAATAAATAAAATACATTACACAAATAT:1 - chr2R 16764682 3' + INE-1 503 1 52.48 GCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCATACT:1 + chr3L 16047626 3' - Gypsy6A_LTR 13 1 64.95 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATAAGTCATCTTCATAAACACAAGTTGTTTTTATGTTCAGTTTGGTTTTCTAATAA:1 + chrX 5353844 3' + 1360 3326 1 58.42 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTT:2 + chr2L 18568101 3' - I-element 44 1 65.35 CTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGTTCTCGCATTCGGATCGTTCTGTTATGGGAAATGGTAACATCATTAGACCATTTGACATGGAACAT:1 + chr2L 15759871 3' - Tirant 157 2 75.82 TTGCGAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGATGTGGCTAGAGGGTCCATTCACCACAAGCAACCAATGAGCCTGACGCACCAGCAACAGAAGCAACAGCAACAGCC:1 - chrX 2045671 3' - X-element 4359 1 80.20 TCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAGCCAAGTATTAGGCCCTAATTAACATATCGGCAAAGAAATTACTAACAGTTCT:1 + chr2L 17971491 3' + HB 1291 1 81.19 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCC:1 + chr2L 6605618 3' + blood 337 2 66.00 CCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCTGTTTTAACAAAGCTTACCATCGACGATGGTAGTACAATTGTATAAATTTGTATAAGTCTTTAACACATC:1 + chr3R 2557700 3' - Cr1a 4404 1 68.32 ATACCGATGACAGAATTGGAACCAAGAAGATAAAAAAACAAAAAAAAAACAGATTGTAATTTGTTCCGTTGTTGTTACACATTTGCCAGCTAGCTTGT:1 - chrX 5401701 3' + Porto1 4498 1 51.02 TAGCTCATTGACCGGCTGGATGATTTGGCACTCGCGGGCGTCAGACACGACGGTGAAGTATGCATTTTACTTGCCGTAGGCAAAACGGGCTCACTTTAATT:1 - chrX 14635881 3' - Doc3-element 337 1 65.35 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGCGCCTACACTTTTCTTTTGACGTTTGCTTTCTTATCAGATTCCGACTTTCATGTGAGCA:1 - chr3R 12626678 3' + Tirant 363 2 64.36 TCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTTATGTACATATGCAAATGCTAAACTTTCGCTCAGAAAAATACAAGCTGCTACATATTTGCA:1 + chr2L 9346247 3' - Transpac 4932 2 63.37 TTAAGAATAAAACTTAGCTGCCAACGCAGACTGCGGCGTTTTACAATTGCTGCGCTTCAAGTGTAATATCACTTAAGCTCTTAAGCAGTCAACACCAAGCA:1 - chr3R 18891647 3' + rooA 197 2 61.39 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAATACTGCTTTTTTATAGCTTGAAAAT:1 + chr3R 12789903 3' - flea 47 2 74.26 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAACTACCTTGGAATATTTCCCTGCATTCTTTGAAATTGGATTTTATAAAAGTAACATCTTCGATTT:1 + chr2R 5095447 3' + roo 394 1 62.38 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGCTGG:1 - chrX 17049527 3' - Stalker2 7260 2 65.35 TATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGTAGCATTTGTCAAGTCACACAAATTTTTCAACT:1 - chr2R 14603621 3' + roo 8953 2 68.32 CCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCAGCCACCGCCACCGCCTTGGGGGATATGCGGCTGGAGATCAACTTTCAGCGGGTGAATGTT:1 + chr2R 10093679 3' + HMS-Beagle2 7030 2 64.36 AGCGCTGCCGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGCCCAGCGCCAAAGCGTGACTTTGGAT:1 - chr2R 16084285 3' + invader4 2848 2 72.28 TCTGACATCATTTCGAGACCCATTTTAAACCGTTTTCAGTAATCCGTAAACCGTACTCATCATTAACGTTGTCGTTTCGATGTCCATGTCCACAGATTGTG:1 - chrX 17948098 3' + gypsy4 6389 1 75.25 ACTTTCTCCTTGACGGAGAGCGGCCTACTTCGGGGGCAACACCAAAAAATGCTCCTAATCGGAGTGTGTCTGGCTTAAATAGTTACGTCAATTAATTTACA:1 - chr3L 12244692 3' + baggins 471 1 65.35 AAAGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTACAACTTTTACCGATTGAAGAATGGATATTCCCACCATCTACAAACCACCATCACACCTCAGGACTTCGATTTAAT:1 - chr2L 14285758 3' - HMS-Beagle2 491 1 91.09 CATTCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGGTTTTTTTGGCTTGTTATTCGTTCTGTGGAAAAAAAAATAATGACCATCGGATATCGGGTATCGGAT:1 + chr3R 24592082 3' - I-element 433 1 54.46 AAACGAAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTAGCAAGAGGACAAAAACCCCGAAGAGAGAGAGCCCACAAAAAGTGGCATACAAATCAAATGTGCTTAG:1 - chr3L 9179868 3' - invader6 84 2 70.30 ATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGACCGAAAACCAAATAGGAACTCAAAGTTGGCAAAAATTTGTGGGAATATGCATCCTCTCGATGTCGCTGAT:1 + chr3R 6895469 3' + hopper 462 1 75.26 CGAAGGTATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTAT:1 + chr3L 2539305 3' + roo 9019 2 75.25 GGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGTGGCCGAAAGATCGCATTAACACTGCCTCAAGCGCGGAGTTTCCCCCCAATTTCCACACACTTTTCCGTGACAGCCC:1 + chrX 20899752 3' - micropia 5081 4 78.22 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTTCAAATATTTACTATGCTTTGACCACGTTTTCTGCTTCGCTAACGGCTT:1 - chr3R 5208136 3' + hopper 1391 1 55.45 AGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGCAACATGCATCGTGCGTTTGGAACTCTTCTCAGCGCTTCGCCTTGCCGGGTTATTTGTGTTGTCCT:1 - chr3L 22439035 3' + R1A1-element 5110 1 72.28 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATTCCATATATACATGGAGCATTTATGGGTAAATGCAAAT:1 + chr2L 10749179 3' + 412 7511 2 59.41 TTTTCTTAAATAATATAAATAAAGTAATAACTAAACAACCATTTTTGCTCAAGCGCACATAACTTCCTTCTGTAAATCTAAACAAATGTCATCCGCGAATG:1 - chrX 15117860 3' + Ivk 5380 1 77.23 GTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCGGCTACTAAAATATGCAAATTCAAAAGTTTTCGAGCCAAATCAAGCGAAGCTACGAAC:1 - chr3R 15758843 3' + Doc 319 1 67.33 ATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACATACGTATGGCTTAGCATAGTGAAATCTCTTCTTACCG:1 - chrX 15769089 3' - Ivk 5056 1 62.38 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTT:2 - chrX 17049552 3' - Stalker2 37 2 58.42 ATATTCGGAAGAAGAGAGTTCTAGAAGAGGAGGAGCAAGCGGAGGCAACGATATCAGAGTGTGCGGCCACCCCAAAAGTGTCCAGTTCGGGATCTGTGGAT:1 - chr2R 17414813 3' - Gypsy12A_LTR 2039 1 75.25 TCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACCCTATTATGTTATGTAAGCATTTCATTGACTTTG:1 - chr3L 8696118 3' + Circe 7271 2 65.35 TAGCTGATCAACCCGTGGTAGCGAAATAAGATGCTCTGTCGTTCTCCTCCCTTTTTTGGTTTTTTCGTTAATAAGCGTTGCCACTGTGCGTTACTCTCTGG:1 - chr3L 23050021 3' - R1A1-element 4939 1 53.47 ACGGGCTTCCGGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCAGCAAAATTAAAAATCATGCAACCAACATGCTTCTTCTGCTTAAGATTTCAGTTGGATTTTAT:1 + chr3R 723192 3' - gypsy6 72 2 59.41 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGA:1 - chr2L 5932129 3' - jockey 60 1 72.28 TCCGTACTTCGTGACTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTCATACGACTTTTGCTCATTCACCTGGTGGGGCTTTGTTC:1 + chr3L 12083120 3' + 1360 475 1 75.25 CGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTCATTTTGTTTAGTTTGTTTAGGCTATGTAAATTCGGACTTGCTTTATTCGCTCTGGTCAACAGT:1 - chr3L 18067691 3' + 17.6 7291 2 73.27 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGT:1 + chrX 697507 3' + roo 9033 1 64.36 AAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATTTATTAAAATAATTGTATCGTGTTTCTTTTAACTTAAGGATAGCCTGTTTTTTTGAGT:1 + chr3R 14278142 3' + Ivk 179 1 58.42 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGACGGCATAGGGAGAGACCACAAACAACAAGTGGAACAAAGAGTTGAACA:1 - chrX 697435 3' - roo 8686 2 57.43 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCATCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATATGGCAGCGTCTCCCAGCTGAAAGATGAGGGGCAACGA:1 + chr2R 5968848 3' - flea 30 2 60.40 TGTACNCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTACAAACGCACCGACACCAAACGCACACTAACGCCGATTCTAAAGGTGAGCAAATCTAA:1 - chrX 16146850 3' + jockey 4669 1 67.33 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCAGCTTAATGCGGAATTAGGCTTGAGATTTTCCTTCATTTGTTCGTACATAAATATGTGC:1 - chr2L 15020080 3' - jockey 4684 1 62.38 ATGCTGATGAAATTGTAATATATGCGCCATACGATTTTTTTGCATACGCTTTTTTCGCCGTGTGTTCCACACCATTTAGGGTATAAATCACTCCAGTTGCT:1 + chrX 14917794 3' + invader4 2809 2 61.39 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTATTCGTCTCGCTCCTGGCTCCATCGTCTTGTACCGTCTCGTCTCC:1 - chr3R 27448489 3' + roo 9046 1 52.13 ATGTGTATGCAGAGGGCATACATATGATATGTATAGCTTGACCACTTGAGCTCCTAAGTGCATGTTCAAAGTATCTCATGAAATCGGTTATGTATAGTTTA:1 + chr2R 16478802 3' - Stalker2 238 2 63.37 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGCGCCTCGAATCGAGGTTATTTACTGGGAACGGACCTTTCTGTGAT:1 + chr2L 6644345 3' - hobo 30 1 53.47 ATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTCTGGCAATCAAAATGCATATTCATTGGGTGAACTGCCCCTTCCACATTCGTTTGGGGGCTCGGTAACCCCTCTTGCA:1 - chrX 15384588 3' + 412 57 2 76.24 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCCACACGCATGTGAGCCGTTCCAAATGCACAGCTAGAAATAATATCAAGCAATAGAAACTTATATATA:1 + chr2L 1629672 3' + hopper 1409 2 67.33 ACCGCCTTCAGCAAGGATAAACGACAAACCGAGCAACTACGTCAACATACCAGGGCAGCCCACGCTACTTAGCAATCGGTCGACAATTAAATGTTATG:1 + chr2R 10173287 3' + Chimpo 3827 1 54.08 AAAACTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGAAGTGGCCTAGCAACAGCCGCGATGCAGGGCGGCCAGGGCAAAGCAGAGAAACCCCATTTTGTGGGCCCCACCC:1 + chr3R 8210833 3' + gypsy8 12 2 76.24 TGAGACTAATACCGATGACAGAGTTAGAACCAAGAAGATTAAAAAGCGAACCCAACACGGTTATAAAAATTAATGAAAAAACAAAAAAATGAAAAAAATCA:1 + chr2L 1700895 3' + Porto1 4490 1 56.44 AACACAAATCTATTAACTGGCGCCCAATATACTATTTACGCACCTACATTTCCCGAAACAACAAAACTCCAGTTCTCGACCTATGACACCAAATGCCAATC:1 - chr2R 19432102 3' + gypsy7 234 1 70.30 CGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTATGATACTCTTGTTCATCTCAAAACAAAACAACAATTTGCTTGTGACAAGTTATTTACTTGAAACAATATGAAT:1 + chr3R 20749072 3' + Circe 98 1 55.45 GTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAAAACGTTATCCACAGCATCGAAACTAGCATCCTTAATAAGCAG:1 - chr2R 8168595 3' - Tc1-2 353 1 67.00 TGCAAACGAAGACCAAAAATTCTCTAGTCATGGGTCGGGGAAAGCATTGTACCGGCGAAAAAAGAAATTGTATTTGCACCATAATCGGCTTCA:1 + chr2L 3419851 3' + Tc1 330 1 79.57 ACAAAAAAAAAATAAAAAAAACACGACACAAGCGTAAGGACCACCACCATCCAGCGCGAC:1 + chr2L 3815588 3' + G2 3076 5 85.00 AACTTTAAAATGGTAATTAATATTCACCTTCGACTCCGTTGCTCGTCTCAGATGAATATTAATTACCATTTGAAAGCTTGTCATACACTTGTGTAAATTTA:1 + chr2R 13705727 3' + transib4 2606 1 76.24 GTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAAACCCCATGATCCACCCTTTTCCCCAGGGCTATGCCCACTCGATTCTGTGCGTTTTGCAGTCTTA:1 + chr2L 11254706 3' - R1A1-element 249 1 66.34 ACGGACGTTCGCGATTGCCTAGTATTTTTGTAGTGAAACTTCAACTACTCTTCCAAAATTACAGCAACAATATCAACA:1 + chr3R 31677346 3' + jockey2 13 1 71.79 AGGTAGTGTTGGTAGGTTATGTGTGTCGTATAATTTTTATTCTTCCAGCTGGTTTTCCGTTGTTTTGCTGTTGATTTCGGTTAATTTAGTGCGCAATTAG:1 - chr2L 6812699 3' - I-element 4966 1 65.00 GTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAAAAATCGGTCACTTGTGAAATATT:1 - chr3L 21637316 3' + Bari1 1696 1 64.36 CAAAAATTTCACTTTTTTCAATTAACTAACTGCTTAACTATCAGACACTCCAGCAACGGTAAACCACTCGAACAACAACAGCAACTACAGCCATACCATTG:1 + chr2R 15469674 3' + FB 162 1 57.43 TGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCATATTTATCAAAACATATTCGATATATGGAGAGGAAATGG:1 - chr3L 10112663 3' + 1360 428 1 63.37 CGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCGGCTGGCAGTAGAAACGCCCACGGACACGCCCCTGTCAACTGGCCG:1 - chr3R 16189004 3' - 1360 3247 1 53.47 CGTCTNAGACCATATATAGTATATACATACATGTATATTTTATATAGGACATGCCACATAGCCAGCATAAAGATTCCATATGAGTTGGATTGATTCAAGTC:1 - chr2R 14740915 3' + INE-1 50 1 78.22 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCTTTTTAAATGTGCTTTATACTAATATTGTTTTAATTAAATTAGTGCTAGATAATTTTATTTT:1 + chr3R 26404564 3' + 412 7533 2 62.38 CGAGTACTTGCCTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTCTTGCACCCCTGCTAAGATTGAGTTGTTGCAACA:1 - chr3R 31149123 3' - R1A1-element 5152 1 64.36 AGGCGNAACTGGTTGCCCTGGCCTCAGTTTCCGCAGTCTAGGAAGTGCGGACAGCGAGGATTCATCGGCGTACAGTGGCAGTAGTAGTGATGACAGCGCTT:1 - chrX 4537684 3' + R1A1-element 494 1 51.49 AGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACATTTTACAA:1 + chr3L 21840344 3' + 1360 3358 1 57.43 AACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCATCTGATCAACGATGGCAACGGCTTGGGCTTCATCCTC:1 - chr3R 18355450 3' - F-element 4625 1 63.00 CGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTATCCGATATAGTATGCACTCGATGCGGACGCAGTTGGTCGCGCCC:1 + chrX 13216105 3' + HMS-Beagle 7014 2 54.46 TTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATCATCAGGTGGCGCCATCTGTCGGCATTCCG:2 - chrX 3675027 3' - invader2 317 1 70.30 GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGTCACAAGAATTT:1 - chr3R 9193564 3' + roo 400 1 72.00 CAAGCCCTGCACCATCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACGGCTCCTGGCCATATATGGCGAATCCTGAGGCTG:1 - chr3L 21802415 3' + G2 24 1 66.00 GCTGGAATTTGAGGTGGCCAATCCAATGTTTTTATGCAAACATTTTTCAGAAACAGTAATCAGTTTAGTGTTATATTAAATGATGTAAAGAAATCTTTTTT:1 - chr3L 25120988 3' - Tc1-2 1155 1 65.35 GTTTATTATTATTGTTTATTATTAACAATAATATAACCTTCTTTTCTTTTCTTTGCCGGATGAGTGAGCACTGTGCTCAGGTCCACACAACTGGAGGTAGC:1 - chr3R 6493658 3' - flea 5004 2 48.51 ATATTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTTTTGTACGTTTTTTTTTCACGCCGCGTTGCCACGTCAAAAGGAGTTGGCCAAGCATATA:1 - chr3L 18511703 3' + copia 93 2 54.46 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGAC:1 + chr3R 22675867 3' - 412 7094 2 63.37 CGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCGAAGGGGTTGGTAAATGCACTTGTGGGCACTCCCTTGGCGTCAAAAGATTTGCTATAAATAAGG:1 - chr2L 7507692 3' + invader4 2866 2 70.65 TCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTACACTACTCGTATTATACTAAATAGGGATTGAAAT:1 - chr2R 7724510 3' - Idefix 7271 2 67.33 CCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATTCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTCCACGATGAGGGCTATCATATCCCA:1 + chr2L 20134651 3' - R2-element 298 1 73.27 ATGGCNGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTCTGGTACAAAAATCTGGGTAAAGTTTAATAATTGAACAATGATTCTCATATGCGAGGCCCCACTGTAT:1 - chr3L 12644435 3' + 1360 3374 1 66.34 AAAACAAAAACAACTCCAACCTCCCATTCGCCCACATATCAAACATACCACGCCAATGTTAATTAATTCCGAACTAAGAATAGATTTATATTTCGTGAAAA:1 - chr2R 16908816 3' + Porto1 260 1 61.39 GGGAGCAGAAGATTGTTATTTATGTAGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGCCCTGGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCGACGAGGGC:1 + chr3L 22320168 3' - Gypsy6A_LTR 300 1 70.30 GACAGTACGAGGACCGTCTCCTTGACGGTTAGCGGCACCAAAAAATGTGTCAACTTGAAGAATCGATCAGCCAGCAGCGAAAAGCGAAAAATAAGGCATTT:1 - chr2R 9030480 3' + baggins 459 1 70.30 AAGAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACACTCGAGCACATATACATATATAGAAGAAAAACTACAAAAAACATGCAGGGAGCGGAA:1 - chr2R 13318848 3' - FB 722 2 74.71 TGAATCTTGTACAATTAATTTTAGTTTGTATGGTAGATAATTTGAAAAGCGCGCACCTAGTTCGCCAGTCTATTCAAAAGTGATTATAGAAAAGC:1 + chrX 6056582 3' + Chouto 5866 1 57.89 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 33 2 53.47 CGCACNTGACGCGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGTATGCTCGGCCGCCAATCCAGCATCCTCCGAA:1 - chr3R 30917628 3' - Stalker3T 234 1 76.24 GTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCAATAGGAACCTTTCCATTATAGTTCCGATGTGATGGAGGTTTCTCAGGCTCAGCTCAT:1 - chr2R 4155857 3' - gypsy4 6476 1 63.37 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGATAGTAACAATAGATATTTAAATTTCAAAATTGA:1 - chr3L 1270831 3' + roo 9038 1 66.67 GGCGGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTGCTGATTAAAATAATAGGAGCGATTGTGGCTGGCTGTTTACCTTT:1 + chr2R 14429714 3' + Tc1 205 2 73.08 GAGAAATTTAAATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGACGGCAGCAGGGGGGCCACTCCAGTGGTCCTGGCCCAGGCGCATTAATCCATTTACGAGTAATAAC:1 + chrX 10293889 3' - Cr1a 319 1 72.28 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTGGCCAGAAGTGTCT:1 - chr2R 11129258 3' - hopper 17 1 62.38 ATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGCCGCTTTAACTCCTATTTAAATGTACTCGAAATCGCAAATATCTGCCGATC:1 - chr3L 6477585 3' - roo 141 2 58.76 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAA:1 + chr2L 10635301 3' - roo 8710 2 70.30 CAACAACAACAACAGCAGCGGCAACAACAGCAGCAGCGGCATAACATTCAAGAGGATGACGAAAATTTTCCACAGTCAGCCTCGAACAACCCACAGGATGT:1 + chr2R 2046019 3' + TART-B 155 2 65.35 ATGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGCTCCAGTGTGCGGGAGTTACTTCGTAACC:1 + chr3L 16381887 3' + Bica 171 1 69.31 AACGCAGGTAGCTCCGTGTACTGGATGCCACTCCTGCAGAAGCTCCTTCCCTTACCCTTGTCCACGCCAGAGATTGTCCATTCTAGATGCACTGAAAACAA:1 - chr2L 14584730 3' - G2 490 1 35.64 ATGCTATAGACGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTAACTCTGCGGGATAAGTGCAACTAATTTGAGATACAGTCGCAACTGTAGTTTATCTGCTGCCCT:1 - chr2R 21783002 3' - INE-1 569 1 60.40 GCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTGGCCGAACGTTACGTCAATATGTCATGTGAAAAAACAGCATAAATTTTAGTCCAACATGTG:1 - chr3R 25740169 3' + jockey 98 1 70.30 CTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGCCTGCCTGTCCTGGATCTCCTCCCACATGAAAATCGATATTGCTCAGTGTGGAGTTTATTTTGCCTTCGTGCTGGA:1 + chr2L 1281992 3' + INE-1 117 1 75.25 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCA:1 - chr2L 18286141 3' - 412 7106 2 78.22 TGTGTNAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTCCGCGTTCGATTTTGAGATGTATCGGGTCAGGAAAGGACTGCGACCCC:1 + chrX 21302996 3' - Quasimodo 22 2 52.48 TGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCTTCAGCTGCAGATGGGGTTGCGTTTGGGGTTGTGGCCCATTGTCCTTGGACTCCATTTC:1 + chr3L 2870981 3' - F-element 332 1 63.37 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTATATACCTTCGCACAGAGGCACCGAAAGCACAAA:1 + chr2L 9856293 3' - HMS-Beagle 6835 2 68.32 TTTAATTGAATTAATTTAAATTTGTGATTAGCCAGCATCTGTTGCGGAAGTACCGGTCCCAAAAGAGATGGAGCAGCCAGTGCAAACGGAAGAAGAGGATG:1 + chr2R 21483241 3' - HeT-A 382 1 67.33 TGCTGCGCTGCGCGATTTTCGACATATACGAGTCGAAACGAAACAGCGACATCAACAGTTTCCTAAAAGGTAAGCCTAATACACCTTTTTAATATTAATCC:1 - chr3R 15449305 3' + Rt1a 35 1 73.27 ATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTATGGTTTCTACTCCGTCGTAAATGTTCAAAAGGGTCAAGTAC:1 - chr2R 8464674 3' - I-element 290 1 62.38 GCAATAGTATGGGCCGTCAGAAAGTAGAGGCCGTACCTGGAGGGGTACCACTTCAAGGTCATCACGGACCATATGGATCAGAAAGACAGCAGCGTTCGATT:1 + chr2L 21810414 3' + Osvaldo 73 1 65.35 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGCCACAAGTCCAAGTCCAATGCTAGACACGGAAAAGGAAAAGCGCACGCGGCGAGAACAAT:1 - chr2L 11385114 3' + transib2 2809 1 64.36 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAAC:1 - chrX 11060495 3' - I-element 44 1 66.34 CTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTGGGCACTGTCATG:1 - chr3R 26331620 3' - G-element 10 1 70.30 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAAC:1 + chrX 3485699 3' + P-element 2853 1 40.62 TCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAGATTATGGG:1 - chrX 22398526 3' + Gypsy6A_LTR 164 1 67.33 TAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTCGCCGTCTCAGTTCCACACATCTTCTAATTTATTAAAAGCAGTGACAGTGTTTT:1 - chr2L 18571617 3' - I-element 405 1 53.47 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACTCATCTTGTTATTCTACTGTCTTTGGCCTGACTCACTGAAATGAAGTTTTCTTTCATTTCAGGCACAAA:1 - chr2R 4262562 3' + 1360 3353 1 59.41 AGTAATGGGTATATGATAGTCGAAACAAAATACAACTAAAGCTTTTGATTGATGTTACATTCTTTTAGAAGATCCCTTGGCCAAACAAATTCGTTTCAATA:1 + chrX 8681394 3' + INE-1 550 1 63.37 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGGTGGCGGCCACATCGATGGCACCACCAGCTCCGCCATTTAGTCCATCCGCCGCGCCCGGTTGCTCA:1 - chrX 7915397 3' - S-element 7 2 63.37 AAGAGAGAATGCTATAGTCGAGATCCAGACTAACAGATACTGGTTGTGGAAGTGAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAA:1 + chr3R 19449410 3' - INE-1 577 1 58.42 AAAAGGTCAGCAAACAACCGAGCAGCACTGAAAGCTTAAAATTACCTCAAGGTGGGGGTCAAGAAAATTTGAATTTTTCTCGTGTATTGAAGTTGAAGCGT:1 + chr3R 26358143 3' + S2 1285 1 55.45 GAGGGAGTCAGGCGAATGCTAAAGCTGAACACGTATAGATGAAGTGGCCCTTTAAGCTTCCGGGGTATGGAAGTCTATTAATAGAAAGGACAGGAACTTGA:1 + chr2R 20414042 3' + invader2 5011 2 71.29 TATTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGCAATTAAATGGTTTCTCCGCGAGTGGAGCAAG:1 - chr3L 19023329 3' - I-element 5152 1 68.32 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCTGTACACTATAAATCCAAAATTCAGCTTGGATCCTGACTGCTCTGGCTGGCTA:1 + chr3R 16554881 3' - roo 8687 2 56.44 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATAAGCGATTCGATTTCTTTCGCCGCAAGAACATTGTTTATTTGATCGCATGCA:1 - chrX 15384735 3' - 412 7077 2 56.44 TTTTGNGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCACGATGGGCAACTTATCAAAGCCAAAACGTGCCCAAAACCCACACAAG:1 - chr3L 9603357 3' - R1A1-element 5061 1 52.48 GGAGGTCATGAGGGTGGTGACCATTCCCCCGCTTGCAAGGCTAAAACGCTTGTTATCGTTCAATGTTGCCTACTTTCAGGCTTCCACTTTGGCTCGCAATT:1 + chr3L 9762279 3' - jockey 4757 1 72.28 CTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGAGTGTGACATTCTCCTGTTCCGTAGATGATCCCGGATTTCCAGAATCA:1 + chr3L 23014722 3' - Burdock 6217 2 52.48 GATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTCACCACCAACTTTGCCCACGAGCCATCGGCCCATTTGGGAAGAGCCCGACTTCTGGAACTACT:1 + chr2R 16115430 3' + HMS-Beagle 6815 2 64.36 AACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACTCGCGACATGATCTTCGAGCAGAACCAATCCTGCCAACTGGACACCGGTAGTCCCACCGG:1 - chr3L 21474882 3' - R1A1-element 5053 1 58.42 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAAGTCTAACAGCCACTGGAGTTGTTAATT:1 - chr2R 16928873 3' - blood 7059 2 72.00 AAAGGCGCTGCTGTGCATCGCAAAAGAAGATGGAGTGCGACTTGGCATCACATCCTGCTCACCGTGGCTTACAATTGTCATGTCCGTGTGCCAGTG:1 - chrX 986636 3' + Rt1a 4845 1 66.67 GGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTTGGATTTCTAAAACAAGCTGTAGTATTTATGTAAACTTTACACCACAATGTTATATAGTTAATCCTGAGG:1 + chr3R 16057067 3' + 1360 3083 1 78.22 GCAGAGCGCTGAACTCCGTTGGGGCGCGTCAGCATTGCTTATATGTGGTAACTTAGTGTTTATGTATTGTTGACATGAGTGGCAGGCCGATTGATAGGCAT:1 + chr3R 10714077 3' - gtwin 6993 2 77.23 TGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATGGCGATGAGGACATCGATGGCAAGTTAAACGAGGATGACGACGAGTACGATG:1 + chr3L 9869908 3' + Bica 4850 1 61.39 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGGAGTGCAGGTCGGTCCGTGAAAATGGCCAGAATATGCAGAGCTATGGCGG:1 - chr2R 5910851 3' + hobo 2914 1 54.46 CTCGAACATTCCGCCCTCCTTGCAATCACTGGGGTTGCAACATAGCCATCCTACGGCAAGCTGCGGCTTATGGTGTTCAAGTGCAAGCTGTTTGCCTCGAA:1 - chr2R 10824396 3' - GATE 8222 1 63.37 TGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGATTAAATATTAACGACGCTAATAAGAATGCATCTCCGACATGTATATAAGTGGCGTCAT:1 - chr2L 23390381 3' + invader4 3039 2 72.16 TTTGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACCTTCAGAGATCACGTTTTTAATCAAATTTCTTTTACTACAGAGCTTGTGAGATTGTAG:1 + chr2R 1779688 3' - Tc1 444 1 76.24 GAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGG:1 - chr3R 26331652 3' - G-element 42 1 61.39 AAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAAGTGAAAACAAGAATAAAAATGGCACAGATTGGCGCAGATACAGA:1 + chr2R 16786714 3' + gypsy4 451 1 76.24 GATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTGCCATAGCTGTGTGCCAGTGCCAGTCAGTGCCAGCAGTTTGAAATCGACGAC:1 - chr2R 9444918 3' + Idefix 432 2 68.89 GAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTATTTTAGAGAACAACTAAATGATGAGTGCAGAAGAAAGGATTGAATATGTTCGATGGAGAAACAATTCAACA:1 - chr3R 26255042 3' - Tc1 258 1 74.26 CTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACCCTTTTAACAACCGCTGCTTTACTTACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCATCGAGGTAAGTTGCAGGGTGAA:1 - chr2R 9920502 3' - Circe 7182 1 78.22 AGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACTTTTCATTGCCCAGACTAATTGA:1 - chr2R 14198053 3' + McClintock 1 2 77.23 AGTGTTTGCCGGCTATGCACGGGCTTCCGGACAGACGCTGTGTCGAAGCATTCGAGAACAAGAGGTGTTTATCTGAATAGTTTAATTTGCGAAACGTTTAA:1 - chr2L 9336357 3' - gypsy6 90 2 64.36 TTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTTGTTATGTTTAATTCTAATTTGTGTCTCATCTGCGAAAATAAAGCGAAATATTTGCAGAGCACACAATCTGCGATTT:1 + chrX 14617632 3' - 1360 3004 1 69.31 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCGGTGAGTACTGTTAGTCGGTAGTGAATCCGTTTGGAAAGCCAAAGTTTCTGTGTGCCATG:1 - chrX 1899985 3' + 1360 3378 1 62.38 GCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGGAAAAACTGCGGAAAATATCGTAAAAAATTATGCGTA:1 - chr3R 9321393 3' + jockey 4683 1 63.37 GATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATGTATACATATTGGTTTTGAAATGAATATCTCAACCTCGAGCGGCGGTTAGTGCGGATAAT:1 + chr3L 2670809 3' - 3S18 71 2 64.36 GTCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTTTTGTTTTTTTTTTTAGTAAAAAAGTGGTCGGTGTGAAATTGAGTGTCAGCCGAGGAAGGTGAACGGAAGAC:1 + chrX 8967903 3' + INE-1 251 1 76.53 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGATGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTA:1 + chr2L 5152001 3' - I-element 36 1 59.60 TTTTTTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTG:1 + chr3L 24916684 3' - Porto1 155 1 62.38 ACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATAGACCATTTTTTTCGTCAGTGTACGCTGAGATCCGTTGGG:2 + chr2R 21092046 3' + 1731 309 2 73.27 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTTTAGAAACTGGCTTAGTCGTGTTTGCAACAAAAGCCTG:1 + chr3L 25341927 3' - 297 6585 2 76.24 TGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCCACCCCTCCCCTCATTTCTATCACCCAGACAGATATTTAACGATAACACCCAAGGATAT:1 - chr2L 11290215 3' + Doc 404 1 58.42 CCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGACTGCAGTTCGACTTCTGTGTCATTATAACGTTCATTTGCCGGCGGCAT:1 - chr2L 21837770 3' + gypsy3 303 2 58.42 TAATAAACAGTGGAAGCGTCGGTCGGCAAGAGGCCCGAAGGACACGAAAGGCAAAAAAGGAAGAAAATAACAAAAAGAAAAAAATATATGAACGACAAAAA:1 + chrX 9530034 3' + gypsy8 467 1 47.52 AATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCCCGCCCATCCGAACAGGCATGCGAGAGACTTAACACGGCAATTCAATACCGATAAGGAATCCAGGAAAAGG:1 + chr2L 5797233 3' + Fw2 3721 1 68.32 TTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACACCATATGATATGACTGTACTGTATGTTTTTGTTGGTTTCATTAATTTTCGTCTACTTCTTTGGGAGTTGGGGT:1 - chrX 11796687 3' - R2-element 77 1 63.37 GAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATGTCGGCTGATCGCCTTATAATACACGAATCAGCGTTCTCTCTTGTATTAGACACTTGG:1 - chr3R 5167496 3' + Tc1 1627 1 70.30 AGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTAAGCGTCTGCGGCCAGGACATGCATCATAAAGTGCAGGAA:1 - chrX 4014598 3' - I-element 5137 1 60.40 TCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCAACGATAAAATAAAGGAAAAATAATCAAGATAGGAATGCAAATACCGCTCGCACCGTGGGAAAATTATTTATAAA:1 - chr2R 16110465 3' - Circe 6996 1 70.30 TTCTCGTCTCTTGTTTTTATTCACACAAGGTCCCCAAAAAGTGGAGTCACCAACTGATGTTACCCAGCCTGCTGCAGCTCCTCAATCCACTGAAGATACTC:1 - chrX 1159940 3' + 1360 3238 1 79.21 TTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGAACCTGTCGAGTGTTTATCAATTATTATTATGGG:1 + chrX 10103759 3' - I-element 4891 1 66.34 CCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCATGTGAGGCGAACTCCCAGCTGAACAAAGCGCACTTCCATCCATTGTCAAGTGG:1 - chr3R 28849420 3' + P-element 25 1 55.45 AAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGCAGCAGCAACAGCAAGACGCAGCAGAATTTGAAATTAGGTCAACAGGTTTGGC:1 + chr2R 8062685 3' + Doc 4498 1 57.14 TAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATACAGTATGTATATTCTTGATCAATAGCCAAACAGAGAAGAGGGCCAAAAAGGCAGGGGCCAGGGAGTTG:1 - chrX 6631875 3' + INE-1 33 1 55.45 AAGTGNCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATGGTTAAGCTTCCTGCCCGGTACTCCGCTCACCCAAAACTTTGTCGATCCGTTCTTGGGA:1 - chr2R 10697020 3' - 297 6594 2 54.46 GTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCATAGCCTTTAAATAGAATTTCCTTATCGTAACATTGGTGATAAAAAATGCGCCCAGCATCATCATTC:1 + chr3L 19630654 3' + Quasimodo 6934 2 72.28 CAATGTTAAAGTTCTTAGAATTAAAGTATCTGACACATCCGAAATTTGCATATCCCCACCACCGTGGGGTGGGGCAACAACGATAGGCGTCGCTGCTGGCG:1 - chr2L 9673506 3' - ZAM 8209 2 52.48 GGAGATAGGAGTGGCTGTCTCCATCACACAGTGTTGGCCCAAGTGGCTGACAGTAAATAAAGAGTGTCTTTTTATACTATATTTCGCTAGCACAAAAGCTT:1 - chr3L 6655032 3' + Rt1c 82 1 67.33 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCGTGGA:1 + chr3R 20140606 3' + jockey 4961 1 67.33 AACAAGTAACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGTGCATGTGTGGGGTAAAAAGGAAAGCACGCGAAAAAAGGCTTCCGAAAAGAGAAAGTTTTCGAAGAAACTA:1 - chr3R 24219431 3' + Chouto 5 1 78.22 AAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATGGAAAAACTAATGGTTTCGTTAGTAAATTTTAATTTTTTAAATAAACGATTAAAG:1 - chr2R 17195121 3' + I-element 140 1 61.39 CAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGTTTTTAAGTGTATCGATTTGTGATTTTATCAG:1 - chr3R 31735432 3' - HeT-A 5984 1 71.29 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAAC:1 + chr3L 22564870 3' + blood 7339 1 74.26 TGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGTGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATATCGGATTCGGCAGCTCCTGAAAGTAGCTCTCGATC:1 + chr2R 23811632 3' - Quasimodo 240 2 76.40 GAGGGNATGTAAGGGTATACATGACTATATTTGCCATGGAAATAAATTAGCTGATTGAGGATAACCGTAGTTAGTCGACCGGGAATGGTGGAATCGAATGG:1 - chr2L 11067677 3' - Transpac 4924 2 70.30 TAGTACTTCGATTACTAATTTGGTTTTTAGGTAATCAGCAGCGGCGAGCTTAATTTTTTTTTTTATATATTCTAGTGAGCTTCGTTTGTGCGGTTA:1 - chr2L 11697174 3' - Doc 4432 1 78.12 ATACAAAGTCTTTTGAATTTTTCATCCTTGTGTTTAGTTTACTCTCCCTTTTGTGCTTGTGCGTGGTGCAAACGAAATTAATTAATGAAATTATATTGCAA:1 - chr3R 6327870 3' + Cr1a 179 1 57.43 CTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATTATTCAGCTGCCTGACAGCCAAACGGCCAAACAGCCAAATGGCCAACTGGCCAACTGGCTAACTG:1 - chrX 7789751 3' + R2-element 3325 1 70.30 ATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTTTCAATTGCACATTTTTCAAATGCCTTGTGAATGTTTCTTTTTTCCTTGTTTTGTTTTTTT:1 - chr2R 18346842 3' - Bica 189 1 58.42 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCATAAAGTCAGCCTTGGCCTCCGTCCGCCAGCCACAATGTGCCGCCGCCCCCCCTCCATGG:1 - chr2R 20390219 3' - 1360 80 1 66.34 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCATTAGCAATTTCGACGCCAACGCGAGAATACACAGATTATGAGTGCTGAAATATCCGG:1 + chr3R 12408410 3' - P-element 18 1 59.41 GAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGCCCTACGTCTTCGTTCGTTCCAAGCAGGCCTTGGGGCGTGCGTGCGGAGTTTC:1 + chr2L 9700259 3' - Rt1a 4975 1 54.46 CAACAAATGTTTGCTCGCTTTGAAGGCATGTGCATGGCTGTGCATTCATAACAGTTCTGGCAAAAAGGGTCCTTCCTGTTTCGTCCTGCACTCGCTCACCT:1 + chr2R 15708532 3' + G2 163 1 79.21 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGTTGATGCGTAGATAGACGATGAAGCTGATCGCTGGATGAGCATGATTCAG:1 + chr3L 4129572 3' - Doc 32 1 53.47 GGAGGTACGGAGACAGAATAAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTTTTGTCATAAATATTTTCACTTTAGACATTTTTGTG:1 + chrX 15157387 3' - TAHRE 10413 1 67.33 GAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTGCTCAGTCATCAATCTAAAGGAAATGCTCACGTTATCT:1 - chr3R 16220587 3' - transib2 2442 1 62.38 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATAAGCGATTCGATTTCTTTCGCCGCAAGAACATTGTTTATTTGATCG:1 - chrX 15384741 3' - 412 7083 2 54.46 CCCGAAAATTTTCTTCTAGCACAACACAGACACATATGTACGTATGTACTTCAATGCAAACAAAGTTGAAAAACTTTTGGCTAGTAC:1 - chr2L 11873226 3' + 1360 3196 1 73.56 TAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATCTAGTCCAATCTACCCCGTTCATTTAATAGGTATCA:1 + chr3L 10745852 3' + Stalker4 6902 2 71.29 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAAC:2 - chr2L 6656286 3' - P-element 44 1 33.66 TGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCGGAACAATTAAGGAATTTTCCCCGGACCCGGACCCGAGCCCAGTACCAAA:1 - chrX 3999276 3' - P-element 2796 1 54.46 TCATAATAAATATAAATATACAAAGATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTCATAACTTGTGCAGCGGTATTAAG:1 - chr3R 24676434 3' + Stalker 82 4 57.43 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCGCAGCTGATTTGTAATTTAATCTT:1 + chr3L 7774493 3' - 17.6 6948 1 53.47 TGTGTCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGAGGTCCTTAAAAAAGAAAACCCTGGCATGGAGGTGTTAAATCATGCCTTTCCTCCCACAAGGCCAGTTCT:1 + chrX 19386708 3' - accord 7034 2 86.14 AAGCTNCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGAT:1 - chr3R 22899170 3' - P-element 23 1 54.00 TTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGTTGTTTGGTGTTGTTTTTTGGAACGCTACACTGTACTCCTTATCAAGTAACTTGCACGCTTCTCGTGCCCATATTGCATC:1 - chr3L 20516937 3' + Cr1a 227 1 65.35 ATTGTTAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAGAAATGATTCTTTTTGAGATCCATGCCGCTAAGGCAGTTGAGAGTAATAACGATT:1 - chr3L 19051828 3' - roo 8683 2 58.42 CGCGTAGTTCTTGACTTTACAGAATTTTAGGGAACTCATTAAGAGTTTTCTAATAGCCAGCTTCCACTGTACTGGGTTTTAATCCGTGACACAAACCTGTG:1 + chrX 20394294 3' - invader1 3862 2 54.46 GTGAGAAGCAACGTGTCGCAACACACATTCAGCAACCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGATCGGGAAGGTTGTGTGTGCGTGCGTTTTTCCCTCAG:1 - chrX 9553601 3' + Chouto 338 1 65.35 ATAAATTATAAATTACAACATGAATAATATCTAGTTAAGCTCCACACGATTTGTTAAATATTGTTTTAAAGTTTAAAAATAGGATATGCAGACTTACCAGT:1 - chrX 10123201 3' + copia 257 1 77.23 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGT:1 - chr3R 22675812 3' + 412 7509 2 63.37 GGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCAGGCTATGGTGTATATTTTTTGGAATTGGTACACTTGTCTGGGGACAACTGATTACCTCAGTA:1 - chr4 349024 3' + Tc1-2 8 1 61.39 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTAA:1 + chr2L 22719651 3' + 1360 3355 1 60.40 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATATAGTAACATGTCCATTCTACACCCCCAACTTCCCAACCACACACTATTGTA:1 - chrX 22252755 3' - 297 6603 2 55.45 ACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTGGGCACTGTCATGTTC:1 - chr3R 26331617 3' - G-element 6 1 74.00 GTGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGTATTTACCTTGCTGGCTGTCGATCCTGAGGATCCGG:1 - chr3L 7122248 3' - accord 179 2 61.02 AAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGGAAGGAGGTTGAGTCTGGTTCCGTGTGCACTTCGAGTTCGACGGCGG:1 - chr2L 13939529 3' + R2-element 472 1 59.09 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACA:1 + chr3R 22675868 3' - 412 7093 2 62.38 GTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGCAGGAACGACACCAGACGACCATCAACCTTCTCGCCGCGCTGTGCCGTCTTCA:1 - chrX 8439562 3' - F-element 304 1 56.44 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCATTTTTGTCAGTGCGTATCGCTCAGGTTCAACTCCCCACCAAAAACCGAATTTAGAGCATCG:1 - chr2L 15478770 3' - jockey 4684 1 64.36 GAGGCAGAAATTGTTTTTGTCAAACTCACCATAGTGTGTCTGTGTGAGGGTGTGTGCAGTGTGTTTGTAGGTGGCATTGGTGTGTTTTTGATGGACAATGT:1 - chr2L 20243730 3' + invader5 3790 2 65.35 AATTTCACAAGCAAAGTCAAAAAATTTCAATTGTAAAAAGCAATGCAAAGCAAAACATACAGAAAATAGAGAAAATTACAAATTTTTAATTACAATAGGCA:1 + chr3R 20300974 3' - S-element 338 1 53.47 CCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAAACAAAACGCTAAATTATTGCGGAAAAATTACACGAATGGAAATGTAACCCCATTTAAAGGTGAATGAAGTG:1 + chr3L 20059781 3' + roo 187 2 78.22 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCC:1 - chr2L 5932105 3' - jockey 35 1 48.51 CTCAGCTAGTGTGAATGCGTACGCAACATTTTAATAATTTTAAATAAAAACAGAAGGCACATTTCGGTTTTATAATTAAAACTGGCCGCAAATGATTAAAT:1 - chr3R 11075915 3' - INE-1 530 1 52.48 AAGATNAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAATATTAATTAAATCATAGCATTAGGCATTACATA:1 + chr2R 21092007 3' + 1731 4582 2 70.30 TTATTTTCTAATAGAAAAGTGATTAGTGATTTTTGTAACTACATTACAGGCAAACTAGGGAAGATCTTTTCGGAGAGTGCAAAATATGGATAGAAAGATTT:1 - chr3L 14232657 3' + transib2 73 1 73.27 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTACACACTCTA:1 + chr2L 18568116 3' - I-element 27 1 51.52 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAAAATCTGGAAAAAATACATGAATGAACTTATCTATCTAACATC:1 - chr3L 2539256 3' - roo 31 2 63.37 TTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCAGATGGATGTGTGCGTGAGTTTGTGTTGAACAAAGAGCAATACATTTGCATAGGGA:1 - chr2L 20615864 3' - F-element 280 1 60.40 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAGCTGAGCGAGTAAAATAGAGCCTCTGAGAGAGAACGCGAAAT:1 + chr3R 4807835 3' + P-element 2872 1 56.63 GAAAAATATCATAGCAAGCTTTTCTCTCACCCCAACCACCCATCGCGACCACCTACAACATGCCGCAGCTAATCGGTCACACGGCCACGCCCACCCAGCCA:1 + chr2L 12393800 3' + F-element 4442 1 64.36 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCATGTCGTCGGGCATCGGATA:1 - chr2R 18865866 3' - roo 57 2 81.19 ATGCTTGTGTGTCCTAGTCGATGTCGTATTATTTATATTTGATCGAGTCCGGTCGGAGAAAGACAAAGCACGGCACCTCAATTAGCCTCCTGGTGGATCCT:1 + chr2L 17600577 3' - I-element 4948 1 54.46 GATATNGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGTGGTAAACCAGACCAACTATTATTTCTACTGGCTT:1 + chr3L 20743520 3' + Bica 4882 1 60.00 AAACTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGTCAC:1 - chr3R 9193572 3' + roo 391 2 63.37 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAGACAATGCGCTGGTGATGTAGCAGCTCCTAGAATTATGCTATAAATATT:1 - chr3R 20140557 3' - jockey 32 1 57.43 AACTCTGATAACTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGTCTCGGTTTCGAGCTTTTCCAATATGGACTTTAGAGCTTTAACACCTGCACACACACTCACACA:1 - chr2L 14917540 3' - Idefix 7274 2 69.31 TTTCGCTTTATCTCGTCCGGCTCTGTATGCGAGGTGCTTCCCTTGCTGCTGGGGCTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTCTTTCAGCCAATGTCTTGCAGT:1 - chr3R 7251226 3' - G6 434 1 76.24 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAGCTGTGGCCGGCGTGGAGTTG:1 - chr2R 5322007 3' - 1360 34 1 62.38 ACACGAGCAAGTCAGAAGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGCCTGTAGATAACAATGAACTGGAATAAGATGTTCACGGACTGCCGGGCATG:1 - chr3R 9500719 3' + gypsy10 6 2 54.00 AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTACATATGACAGAGGACCTTCTGGACGAGCTTGTTCCTCGCCTGTTCTTTTGGCCAATCCCT:1 + chrX 8086378 3' - BS 5062 1 63.37 CAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTAAAGCGATCAGGGGGGTATATAGTATTTGATGAGGTGTTTCCAACAACCAAACCATAGAGAACATTTTGCAATG:1 - chr2L 8086585 3' - Cr1a 4156 1 77.23 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGCCGTTTGTCGTTTACTGATTTT:1 - chr3R 14832381 3' - 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roo 8699 2 61.39 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATAGATATTCACTGGGTGATGAGAATTTGAGCGTG:1 - chr2L 12751704 3' - flea 37 2 71.29 TATACATACATACATACTACATAGGTATCAACATAACCGAGCGATATGCATACATACAGATTTGTTTGTATGTGTAAGCTGTAGAAGCACAGCATGTGTCC:1 - chr4 59121 3' - Dm88 4375 2 50.50 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAGGGGTTGCTGAAATTGCTGTGCAACGCAACGTTTGCACC:1 - chrX 13560720 3' - roo 8702 2 65.35 CGGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTCATATTATAATTATAATATGAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCAGCTTGGTAAGATCCA:1 + chr2L 21774608 3' - mdg1 7135 2 56.57 TCTCAACAGCAAGTCATGCAATTAAAGCTCCACCTAGATAGTAAATCGATGCATCGCTTAGCATCGATAACGACCGAGAACATCGAAAGGTATCGACCCCA:1 - chrX 9658930 3' + G6 1590 1 77.23 TGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATGAATAATGGAAAATGAAGTGTTCATATATTCTCGTAATATATAAGAGAATAGCCCGTATGTTGGG:1 - chrX 23283788 3' - 297 10 2 68.00 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGACACACTCTCGGCCTTGTTCATGGACCTCG:1 - chr3R 25814717 3' - 412 46 2 73.27 CTTCGTCCTTTAAGCCAATAATAAATAAAAATGCCAGTTGCAATGCTAAGCGGATTTGCGTTTATGGCCATTAACCCGGCGCTGGTGCGTGTGTGGTGCT:1 + chrX 6003621 3' - G7 778 1 64.00 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACAACATGTACACAAAAC:1 - chr2R 11129293 3' - hopper 49 1 76.53 TATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCACTGCGTCTATCTGATTTAAAGACGGCAACATGTGTAGCTACCAGTGTGTTTCAGTGCCCCATCC:1 + chr3R 30700553 3' - 17.6 432 2 76.24 ATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACCACATGAGTTCTGCTGCTTTCTGCTCATTGACTCCTTGCCATCCATCA:1 - chr2R 5088111 3' + Ivk 4958 1 52.48 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTC:1 - chr2L 6656259 3' + P-element 2870 1 60.40 TTTGAGTGATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACCCCTACAAACAGTACACCTACAGTTGCACCCTTGTTTACGAAAAGTATTGTTCTA:1 + chr3R 6259637 3' + baggins 5381 1 66.34 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGATAAAAATCCAACTGTGTTCATATTTCTCTGAG:1 - chr2R 21762294 3' + 297 354 2 71.29 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGAGGAGCTCGGAATGCTTTTATAGTCCGCGATTTGTAGTTCTTAATTAATGTTTGCCAATTTA:1 + chr2R 7922628 3' + Transpac 5221 2 73.27 ATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCTCTTATTTTTGTTTGTAATGAAAATTGACATGTCCTTCGTCGGATTGTTGCA:1 - 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chrX 2253833 3' - Tirant 37 2 62.38 GGATTGATGTTGGTGAAGTTTGCTGATTTATATTCGTAGATTTTGGCAGTCGTGTTAATGAAGTTTGCTGATTTATGTGCTTATGAGCCTGTCGCCATCTG:1 + chr2R 22151561 3' - Chouto 6182 1 76.24 CAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCCTTGTGTTATTTTTAAATTTGTCCCTAGAATAGCCACGGTGCCAAAATAAAGGGCCCGGGTAATCTTTCATTGAA:1 - chr2R 4736963 3' + Cr1a 182 1 66.33 TCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTTCGAGTTCACATTTTTGTGCAGTTTTTGTG:1 + chr2L 17333704 3' + copia 113 2 70.00 AGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCAGACAGCGACCGCTAACTCTTGGCATTGAATGGGTAACTGG:1 - chr2R 24082465 3' - Stalker4 7336 2 60.40 GGGCTCTTGGACGGTTCACATAAACACGGGACTTCAAAAAAGAGTGGGAAAAATCAAAGAGAAAGATACGAAAATGTAATCAATTGAAATTCGCATTTAAG:1 - chr2R 18942920 3' - mariner2 629 1 66.34 CTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATTTATCTATATTTTATTACCATTACATTTAGTGTGGACGATA:1 - chr3R 31411101 3' + FB 911 3 59.41 AATATNCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGCCGCTAAGTAAACGTGGGA:1 - chr2L 15997872 3' - 412 30 2 62.38 ATATTTTTGATTCATTTGTCATTTAAATAGTCTACGCTGACTCATGGTGTAAAATCGCCTTTCATGGCTGTTTTAAAGTATAAATAAATAGCTTCTTAAAT:1 + chr2R 17172709 3' + Tc1-2 1365 1 84.16 CTTGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATTTTGGT:1 - chrX 10822930 3' + Quasimodo 36 4 72.28 GATTTAAATAGAATTTTGGATTTTGTTTATTTTTTGATCTGACAACGCCTTCTTCTCCGCCAAAGTCGAGGGAACGTTAAATAAGCCGGCCAGCCCATTAA:1 - chr2R 5748434 3' - transib4 2552 1 60.40 TTTAANTGGCGGAGTCGGTAGGATCCAATAAAATAAAAGAGTCCTTTTAGTACGGTACTAATCAACTGTGTATACCTACCGAATAATCGCACTGAAA:1 + chr2L 26762 3' + McClintock 493 1 69.07 GAAGTGCTACCTGCGGGATCTTGCATCCATAGCTTGGACATTTATCTTTCAGTACAGCTTTGGTTGAACCTACGTCAATGATTTCGAAGTACCTTTTGAA:1 - chrX 7842894 3' - hopper 459 1 76.00 GGCAATTAAATAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCAAGCCCCTTTGTGCAATAAAAAATATGAAGAGAAAACAACATCGACTTTAAGACCTGG:1 - chr2L 19907430 3' + GATE 456 1 63.37 AGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATAGATACAGATCAGTTTGGTTTTTCCCTGTACATAGCTCTGTTCGACAAAGTTAGTTCTTT:1 - chr2L 15048326 3' - Quasimodo 7149 2 62.07 TAAGTTAATAGATAAAACTAAGCATATAATTTGTAAAATGGCAAAAACGCGGAGGTTCATCGA:1 + chr2L 8482492 3' + Bari2 218 1 76.19 TTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCGAACTCCTTTTTGGCGCTGTCATTTTGTTTGCTTTGCCAAATGCTAAAAGC:1 + chrX 15227548 3' - Doc2-element 491 1 56.44 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGGCATAATTTTGCTACCCTGTTTTTCTCTCACGAAGTTGCCACAACTCGCGACGAACGAGCCACTC:1 + chr2R 23203752 3' - mdg1 11 2 57.43 CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACAAAAGACTTAAGCCACAAACTTGATCCTCACTGCACGGCAA:1 - chr2R 20565747 3' + blood 7313 2 60.40 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGTATATTTTCAGTCCGGTTTCCGGTTTCTGCTACATTATTC:1 - chrX 8179026 3' - pogo 32 1 61.39 ACTGTATGCGCAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTGCTCTCGAACAAAAATTCCAGAATGCCATAAACCACCCCTTATTATGTATGTT:1 + chr3L 9330067 3' - 1360 140 1 65.35 GCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTACCAGCTGCTCGAAGATGTGCTGGAATGTGGCGGCGGTATTGTTGG:1 - chr2R 20917187 3' - X-element 4438 1 65.17 TTATTATGCCACGTCCATTAGTTTGGGTGGTACCGAAAGTGGCCTGTGAGCAACGTTGGACAGTAGTCACATATGTTCATTATGTTTGCTAGCCGACAAG:1 - chr2L 16132915 3' - looper1 1770 1 67.00 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCCCACACGCATGTGAGCCGTTCCAAATGCACAGCTAGAAATAATATC:1 + chr2L 1629650 3' + hopper 1387 1 54.46 GTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGCCGCCGAATTGCTGTCCGGAGAGCATGCGTTGCGTCGACAATGGCACATGCAGTTACCAAGGCGTCCAGATCGAGA:1 + chr3R 7179285 3' + Idefix 242 2 79.21 CAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGGATAAACATACATATATACTCTACAAACATACATACATACTCATATACGTGGAGTCCCCACACACA:1 - chr2R 10011680 3' + I-element 5102 1 68.32 CAGTTATCGATTTGATTTTAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATCAATAAATTACAACAAAAAATCACG:1 - chrX 10660955 3' - HMS-Beagle 233 2 63.37 GCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAATAATTACAGACGACAGTGTCGGCCATAAGTTGTGCCACCAGTTTGGCGATACTC:1 - chr2R 14115110 3' + I-element 55 1 63.37 AATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAGATTTCCCTTTATCTAATTTAATGAGCAGATTTTAGATCACATTAATTGTTTTGCTTCGCGTCTCGG:1 - chr3R 6153959 3' - 17.6 467 2 66.34 CTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCCATCCATCTGGCGTCCCTTTCCCACCGCACTCGCACTCTTT:1 + chr2L 2127652 3' + I-element 5070 1 63.37 AGAAAAGCAAACTCTAGACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGAACGGCGATGTCGATGGCGATGGCGTTGGCGTTGGCGTTGTCATGTGAGCGTGGACCTGAAG:1 + chr2R 18109464 3' - 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Tirant 8325 2 64.65 CTGATCAGTACCCATGAGGGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCACAGCTTCTTCATATTCCTGCCATAGTTCGTTATTCCCA:1 - chr3R 25828883 3' + Quasimodo 255 2 69.31 TTTGCACTTGATTTTTAGTTTTTGTTTTGGTTTTTGTTTGGTGACTCACATGCGTCTAACGATTTGTTTGCTCGCTGCGCGTTTGTCTGTGAAAGTGTAAT:1 - chr2L 5442604 3' + 297 266 2 72.28 GCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCCCATCCAGAGTCCTGTGGGCAATCTCTGGAGTTATGCGACTGCAATAACACTAAATTGG:1 - chr3L 13340915 3' - 1360 3341 1 64.00 CTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGGCATGCGCAATGGCATCGAGTGGCGTTGGGTTGCCCACTGCGA:1 + chr3R 17604830 3' + Juan 156 1 57.43 ATTTTGGCCGTCACCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACA:1 - chr3L 21840298 3' + 1360 3327 1 67.33 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGA:1 - chr2R 14121084 3' - I-element 30 1 75.61 GGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCAGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTCGATTTTGTTTGCCTGCTCGATGCTGTCGATGCTAATAAGTTGT:1 + chr2L 19845413 3' - F-element 389 1 54.46 AAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGTTTTAATTCCCAAAATAAGGGGAACAAGAACCAAAATAAAGCCCATGAGTCAT:1 + chr3R 5215809 3' + 297 451 1 56.44 CGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCTAGCGCGGGTGACACCCTCTGAGTATATGACGAACT:1 - 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Cr1a 4210 1 70.33 CTCTTAGGTTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCAAGGAAATGAATATGCCACCGTTGGGCGTTGCTGATGC:1 - chrX 13512879 3' - Idefix 7124 2 65.35 CACTGGTGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTCTCCCAAGCGCAGCGGAGAGGGACGGAAACTGCTGAGCCAACGAAGCCTTTAAAGTTGGCAAAAAGCCTGCG:1 - chr3R 30284521 3' - GATE 118 2 63.37 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATAAACTAATGTTGCATACTTTTGGAAACCTTTAAGGCTATTGCTCTT:1 - chr3R 29653043 3' + jockey 4966 1 57.00 GCCATACATTGGTTTGGCCCTATGAAACCACTTTTTTAGTGACGGCCAAATATCTGGAAGTTCCGGACGAGAGCACCTACATGTTGCCCAGTGTGTCACCC:1 - chrX 15589671 3' - 1360 3357 1 55.45 CTATTGATCCTGTTCAAGAATATAAGTCAATAACAACAGCCGTCCGGCAAATCGGTGGCAAATTGCGACACACATGCCATATGGTAGTTAGGAG:1 - chr3R 16605856 3' - INE-1 85 1 68.09 ATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCAGATTGGGTTTCATATCGCAGTGGGGAGCGTTGGCCGGTCGCTATGCCGCCCTGTGTCCG:1 + chr3R 17565490 3' - accord 86 2 68.09 TGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTTTCTTTTTTGTGTCGGTCATGTTTTCCCTTTTGATACCGGTCATTGTTTTGTTTAATTTTTGTA:1 + chr2L 17089561 3' - hopper 448 1 71.29 TTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTCAATTTAGAGCCGCAATAAACAATAAACAATAAAAGCTCAATTCCTCAACACAACTGTGAACCAGTCTGTCGATATCA:1 - 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chr2R 8920821 3' + Porto1 4271 1 63.37 TCAGAATCGGATATTGAAATGAAAAGACAGCAAGCACGCACACCGGCGCACCGCCTTCCAAGAGGCCAAGAAGAAAAATGGCGACGACTTCGGGGTATCGA:1 - chr2L 5325484 3' + Bica 4549 1 70.30 TGAACGGAGCCCAAAATTGTGAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTGAAACTGAAACTGAATGTTGCTCTTCAAATTTCATGGCAG:1 + chrX 11006906 3' - roo 34 2 60.40 CGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATTTTATTAGCGCCTTGTCGCCGGGCCGTCTTAAGTGGCTGGGTTGCTATGCACGTTTTCAATATATCTCATATTG:1 - chr2L 11732038 3' - F-element 4345 1 75.25 CTTGAATTTTGCACCTAAACTTCGATATTAACTGGAGCTTTGTTAAAAACACGTCCGTCTGGGTTGATGGTGGGCGGTGGGCGTGTCTGTCTGGGGCTTGG:1 + chr3L 22321177 3' - Porto1 56 1 66.34 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCTCCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGAGACAAACTTCAAATGAC:1 - chr3L 15478497 3' - hobo 15 1 42.68 TTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTAATGTATCTAAGCCTTAGACAAGATGGCGATCTTTAAATTCGCACTCGAGTTGGTGGAGTAAATATAATAA:1 - chr3L 20779450 3' - I-element 4968 1 75.25 CGTTGGCGTTGGGTGTGGTGGTCTTACTTGTAACACGATACATTTCGCCGCCGCCGACCGGAGGAGTAAGGGTGTATGGTGTATATATAGGACCTACGATC:1 - chr3R 23148337 3' - Gypsy12A_LTR 2178 1 65.35 TAGGGTAAGTATGTAAACGTAATATGGGAAGCATATTATGTTACTATATATTCTCGATCAGAGAACAGAGAAATAT:1 + chr2R 4321139 3' - rover 24 2 92.11 CCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACGTCTTGCTGGCTACGCCACCTGTTGTTCTCTTGCTGCCTGCCCGTGCACCATTGGC:1 + chr3R 14571086 3' + HMS-Beagle 6848 2 60.61 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGATATTCATAG:1 + chrX 1523773 3' - jockey 32 1 59.41 AGTTCNAGCTCAACTTTGAAGAGTGGTTGTGGTGCAAGAAAAGTTATAAAAATCAGATTTATAAAATGTTAACTTTGATTTCATTTCTTATTTACGAGCCT:1 - chr3R 28949581 3' - Fw3 323 1 76.24 CCAAATATCTCCAATAGTTTAAGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTATGGGCCCCCAAAACCACCGCTCACAGCTT:1 - chr3L 15276662 3' - hopper 47 1 71.00 TCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTATGTGGCGACGGACGAGGTAAGTGGGCCAGGTCCTTA:1 + chr2R 10174793 3' + R1A1-element 4972 1 64.36 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGTTTAATGGCTTGTCGATACGCTCAAGTGGTGATTGCCAATTGATTGCCTAATGAGGAGG:1 - chr2R 14582815 3' + roo 9055 2 62.38 CGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCACAAAAATCGTCTTCTAGCAAAACCCTACAACTCCATTCGTTATCATCCACTCTGCGTATTAAATATCTGGCA:1 + chr4 430952 3' + 1360 3169 1 52.48 AAAATGTTCTCACAGATAATAGATAAATTTACTTAACTTACTATTATTGAACCAATTTGAAAAGAGGATATCTTAAGGATAAGGATATCCAGGATGAACAC:1 - chr3R 13937965 3' - Juan 44 1 44.55 TAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCCCTTTTTTCACAGTGCATCGTTGTTGTCTGCCCGCAAAAGATTGCTTTTAG:1 + chrX 7484755 3' - opus 332 2 57.43 ACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGCTCCTCCTATTGGTATAGTGGCTCAAAACAGTCCACCGGTCTGGCAG:1 + chrY 2468606 3' + baggins 5355 1 53.47 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTCGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCCACAATGCCTCCACACATG:1 + chr3R 27619246 3' - hobo 56 1 81.19 GCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATACATTACGATGAGCCGCGTACATGAAAGCATCCTATTCTG:1 - chr3R 13240358 3' + Rt1b 5009 1 61.39 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTT:1 - chr2R 25203791 3' + 1360 3353 1 70.24 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCA:1 + chr3L 27415285 3' + transib2 2778 1 64.36 ATTGGAATTCTAATTAACTACACACAATCCTCACAAAAACACAGATAAATAGTGCCTGTCCAGTGCCCCTGGCGTTGGGGATATGTGGACGACGTTGGGGC:1 + chr3R 22831113 3' + mdg1 421 2 76.24 CAGGGAGGGTATATTTTTTATTAATTTGTCATAATTTTGTAGTTGACTTTTTCGACCCAAAACTGAATTAAATCGCAAATTGCGTTTGCCTAGAAGGCAAT:1 - 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mdg1 6 2 73.27 GCTATCGCTTGAGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTCCTGAATTTTTGGCCCATTGGGTTGGTGCCGTTTTAGCCGTTTTATAAATTAGATAT:1 - chr3R 21495174 3' - G-element 408 1 52.48 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTAGAATGCGTAAACTG:1 - chr2R 16018811 3' - I-element 8 1 70.30 ATAAANGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTAACC:1 + chr2L 13670332 3' - BS 5017 1 51.49 ACCTCCGCAAGACTCCCCGGAGGTAACTCGCGCGTCTCGCGAAAATACTCTCCTCGACTATCCTCGCATACGTACGGCGCCACGCGTGTTGAGACTGACTG:1 - chr3R 1027408 3' + ZAM 446 2 72.28 CTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTCCCGTTTGACTTCGTTCTTTTCGTTTACGCAATCAACTAGATTTGCATTGGATTAAAATCAGT:1 - chrX 16569986 3' + hopper 380 1 65.35 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAATTTGGTTTTACAAAGAATCTGTGAAATAAA:1 + chr3L 25798502 3' - blood 7057 2 69.31 CCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAAAACTGTTGCA:2 + chr3R 14832467 3' + blood 342 2 59.41 ATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAATTCAAATCTGTCTCGTTTTTATTTTGCAAACACGTTTTTACTTTTAAACGGGTCTGAAACCAACATGAT:1 + chr3L 18930892 3' - 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roo 8651 1 75.25 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTGGCCACCACATTCGTGCCGAACAGTTCCTTGATGTCCTTGGTG:1 - chr3R 22352756 3' + 412 488 2 71.29 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGTAACTTTGCGAGGCAACCCAACCAGCTGGCAAATCGAAAACCGTAAGAACACCTTGCGTTCGACACGTGCACACG:1 - chr3L 9908094 3' - BS 5052 1 79.00 CCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATATGGCTCGCAAATTATTTTCGAATTTTTTCAT:1 - chr2L 7843092 3' + 412 7508 2 63.44 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAAAATCTGGAAAAAATACATGAATGAACTTATCTATCTAACATCATTACAAAAGTTATCGCAAAG:1 - chr3L 2539235 3' - roo 8674 2 70.30 CTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGCAGTTGTTGCAGTTGTTGCAGTTGTTGCAGTTGCACTCGCTGCCGTTGGTGTTCTTGCGCT:1 - chr3R 9937608 3' - Copia1_DM 139 1 53.47 CTTATATACATACATACATACATATATACTACATACATATATACATAACCCACTCTACGAAATTAGTTTATTTATTTTCCTTTCACACGTTCAAAGGAATT:1 + chrX 21226661 3' - 1731 100 1 64.36 CGTTAATCATCTTGTTATTCTAGTGGTCTTTGGTCCCACAGTATTATACTTAACATATTAGAAACCCCTACTAGCACTCGTACCCCTTTTACGCACCGCTA:1 - chrX 2461869 3' + 1360 3379 2 64.36 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGTGAAATGAATATTCATCCTCCTAGTCTCGAATCTCC:2 - chr3R 22675777 3' + 412 491 2 74.26 GCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCT:1 - chr3L 26852650 3' - 1360 48 1 67.33 AAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCCACCAGTGGATGCTGATCGCGGGCCGGGCTTAACAGGTGCATTGTAGTGGCCGATTGCCATACAGCTGGATTCTTGTTG:1 - chr3L 16878801 3' + Doc3-element 465 1 59.41 TCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACACACATTAAATCATCTTCATTTGTTTTAATTTATCAGAAGTTTGCATGATCATTAGCGGGTTAAGGTTTCTTAAATT:1 + chr3R 4051622 3' - 1360 474 1 78.22 ACGCCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTACAGTTAGAAGGGAGCTGGAGTTTGGAGTCGCAGCATTGGCAAACTTTGACAATTCCTAATG:1 + chrX 17691874 3' - 3S18 5962 2 59.41 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGCACCTTTTTGTGTCCAACTTTTCATTTTCAATCAGGCCTGTCAAATTTGTCAAGCTCGACGAGTTT:1 + chr2R 11730958 3' + blood 368 2 70.30 GCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAGGAACAAGGACTGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGATAAACGAAAAGTAGCTAGGGCGAAAAGTACAGCCACA:1 - chr2L 22218098 3' - diver2 158 2 66.00 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTCACACTCACACTCAGAGCGAGCGAAACGCACACACACG:1 - chrX 14505439 3' + hobo 2901 1 64.00 TAAACAAAACAAAAACAACTCGTACCTCTCATTCACCCGCGGCCCATCAAATTCTTATTAGCGCTCAATTTCAATTGATTCGCGCGCACACAAGAGGCCAA:1 + chrX 4813572 3' + Porto1 255 1 71.29 TATGGCGCGTACCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTATATTTAAATAATCAGGACATCCGACAAACAGAAAGTCACGCTTTAAATCCATTC:1 - chr3R 25078664 3' - invader1 3645 2 55.45 CATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTATGAACCGAGCCGAGTGGAAAAAGCGGAGTACAAATTGCTCCC:1 + chr3L 8217964 3' - Cr1a 4151 1 67.33 ATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCAAAGGCGGAAGCGTTTTTCTAAAGTTTAGTTTAGGTTTTGCCACTGGAACTTTC:1 - chr3L 10839826 3' - Doc 4508 1 56.44 TTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCATACTGGGCGGCAGATCGTGCGGCCGATGGAGACCCTGCAGATGCGCATGTGGATGAAGGT:1 - chr3L 8466230 3' + accord2 149 2 63.37 CTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTGGGCTTGGCCCGCGACAATTAAAGAAAATATACAAACATTTTC:1 - chr2L 21963876 3' - BS 4741 1 57.43 CAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACGGCGAGCTGGTCACCAGCGGTTGGATCGATGTGCTGGCCAAGCCGGAGATCTCTGGCCTGAACAACACCAAGTGTCT:1 - chr2R 24003290 3' + Rt1b 4997 1 77.23 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTAT:1 - chrX 1399886 3' + P-element 2830 1 22.77 GAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTAAGTACATATATGTACTTCAAATATAAGAAAC:1 + chr3R 14686606 3' - 1360 463 1 74.00 TCCTAGTCAAAGTCGTATTAATTTCGATTTTTGCGAACAGTTCGGCCATGGCTGTCCGAAACAATTTGCCAAATTGCCATTG:1 - chr3R 18778081 3' - I-element 4937 1 80.49 ACGCATATCAAGGATCGGCCAACTACTTTTCGTCAACTTGCACAAGCAGCTTTCTGACCGGATTCCTACTTCGGACTTTTGCGTGCAACACTTGCAACAAT:1 + chr2L 13727678 3' + Chouto 6052 1 54.46 CGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACATTGACTGGGAGAGCGAAAGGATCGCTCCCCCTTTTCACCACACTCTCTCTTAGGC:1 - chrX 8549275 3' + F-element 386 1 65.35 AATCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTGTGCAGTTTTGGAGGAACTTTTTATTTTCCTTCAAGTTGAAA:1 + chr3L 6625368 3' - Doc2-element 4393 1 56.44 GTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCGACATTATCGAGGACATGCCCTCCAGGAGAGGATCAAAGATGT:1 + chrX 21298416 3' - Quasimodo 428 2 52.75 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCCAGCCTGGGGAACC:1 - chr2L 5932080 3' - jockey 9 1 74.00 AACTCCGTTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCTCCGAGCTATGGGGCAACGCATCGAGAAGCTGCGATCCATCAGTGATCTGCCGCGCTACGAGCAATCG:1 - chrX 16680897 3' + Doc3-element 4300 1 62.38 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTGCACGCGTTAATTTCCTTGATTTCTGCGACAAT:1 - chr3L 14273380 3' + S-element 1674 1 69.31 CACACACACATACACACACATACCGCTTCGCTTTAGCACTCGAATACATATTTGTTTAGCTGCTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGTTGATGTTGCTGCCG:1 - chrX 13920392 3' + accord 192 2 42.57 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGCGCGTACATACATATGTATGGGTGGGCACCC:1 - chr3R 11731184 3' - hopper 43 1 66.34 TATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTACATCCAGAAACTATCCACCCGAAATCAG:1 - chr3R 19444823 3' - F-element 4433 1 71.29 GACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTACCATAAATATACTGTGGTCCTTTAACCCCAAATAGCCAGTTTATTTGCATCGGCATCT:1 + chrX 3055302 3' - Quasimodo 91 2 62.38 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCATATTCCTTTTGATGCTGT:1 - chr2L 18286123 3' - 412 34 2 60.00 TGGAGNGAGGGCATTAATCGTGGACGGATGGGTTTGTATCGGTATCGGGGTACTTTCGCCTCTAATGCGTCGTTGGGTTCGCACTT:1 - chr3L 6371037 3' + micropia 320 2 65.12 GCATGCTAACATTTCAATGACTTCTGAGAGAACCGTCGGGCAATGTCAACGTCTATATGTATGTCAAATTAATTGATGACCAATTTGCGTTTTCAATTAAA:1 + chrX 12352922 3' + hopper 279 1 80.20 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGT:1 + chr3R 25931364 3' - roo 8716 2 79.21 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACTGTCGACCAAAAATCCATCAGTAACGAAATTGAAATC:1 + chr2R 4611936 3' + mdg1 379 2 64.00 AAAACGAACTTTTCATGACTTGACTCCACGACTATTGTATTACAGAAATCAAATAATCCTGGAAGACTCAAGCCAGCTTTTGACACCAAAAACCGACCCAT:1 + chr3R 4717466 3' - Gypsy12A_LTR 288 1 63.37 AATTTACAACAATTATACGAACAAGTTGCTGTGTGTGATGACCCTATATGTGTACATCAATCGCTGATACATGAAGACGGGGCAAAAAAGCGCGTATCTAA:1 + chr3L 3437453 3' - accord2 7153 1 66.34 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATC:1 + chr2R 14582892 3' - roo 8703 2 65.35 TTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCCAAAGAAAAATCTGTGAATATTATGAAAA:1 - chr2L 8830906 3' - roo 349 2 74.26 TTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCACAAAGAAGGGTACCCACGGAGAAAAATTACAAGAAGTCATCAATACTGTGAAATGTAATATTGAAAATAGCG:1 + chrX 22571493 3' + rover 7053 2 61.39 TGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAGTCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCCTCGGTATTGGGTCAGCAATTAGTTATATCGCCCGG:1 - chr3R 26118780 3' - R2-element 3163 1 62.38 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATAATTGAGCAATTTAATTCGGAATTTAGCCCTTTTTGAAACGGGTATAATGTGGCTTAATTTTGTTTTC:1 + chr2R 22781069 3' - roo 8671 2 73.27 CCAGCGCAAGTTGCCCCTGCAGTCGCCCTAGGACTGAAACAGCCAGTAACTGCAGCTGGGCAACTGAAACTGCTCTCTACTGCACCTTTTTTAATCCCCAG:1 + chrX 9418156 3' - aurora-element 139 1 48.51 TTGGTTTTAAGAGATGGGCAAAAGATTTACATAAGTCCTGGTCATGGACAAATGAAAAGGAAAACGGGAAAACAATCGGGATTTAATGAATTGTAATGAT:1 + chr2R 6979273 3' - FB 314 1 78.00 ACGTGNAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACGTAGCTGCATACTTTTGGTCCACTTTTTGGGAGAGGTTGTG:1 + chrX 1056801 3' - accord2 7271 1 57.58 GATATAATAATAATAATAATAGTGGTACTTAGGCATGCTCTACTGTATCAGCAATAATAACGATTAAACAAAATCTGTTTACTATGCAATTTTGCATACAT:1 + chr2L 5276863 3' + invader3 5057 3 79.21 CCTTTCAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTGTTGAAGTAATTTTGTAAATGCTTTGTGTGTGAATGATTTATCAGCTGTTCG:1 + chr3R 24233765 3' - I-element 252 1 76.24 AATATNAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTCAGTCAGTATTCTTCATTTCGAACCACAA:1 - chrX 9260617 3' + 3S18 6057 2 68.32 AGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACGCTCTCTCAATCAATTGCACTGTCATCGTTGTCGCCGGCTTCGTTATCAGGAGGAAAGGAAAGACGAGGTTACCAG:1 - chr3L 7866098 3' + mariner2 545 1 68.32 GTGTGTGTGTGTGTACGTATGTGAGTGTGGAAAATCGTGTGAGAACGTACTTGATTTTGGGCTCACAAGGGCAGAGCCATGAAGTTGTATGCCCAAGTATC:1 - chr2L 20255288 3' - Quasimodo 31 2 69.31 GATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAAAAAGAGCATATAATAAGATTTAAAACCCAGACAATAAATAAGCCTA:1 + chrX 8279099 3' + Bica 80 1 58.42 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGC:1 + chr4 490309 3' + pogo 2065 1 62.38 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCATCCCTCGACGAA:1 - chr2L 16691140 3' + pogo 2092 1 72.28 AAGACTGCTCATTGAGGTAGGTCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGCTTGTTTCTGCTTCGCTGTTGTTGATTGCGCATCATCTTAATTAATTTGA:1 + chrX 697952 3' + R1A1-element 4964 1 53.47 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTTTCCTTGTACGCTAGC:1 - chr3R 11097541 3' + mdg1 371 2 80.65 AGGATTTTCGATTGGGCTTGTTGGATGATTTTTACGCTGCTGTTACTGGCAAGTCCCCATCTAAAATTGCGGCAGG:1 - chr3R 13770828 3' - Fw2 3606 1 65.79 GTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGCGCACGAATCGCTCTCTTCCCCGAAAGAATA:1 + chr2R 8770606 3' + accord 157 2 67.71 TCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATGACAAGAGCAACACGAACAACAGCACAC:1 - chr3R 14668459 3' + Idefix 7066 2 78.22 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGG:1 - chr3R 10736023 3' + invader4 315 2 69.31 ACATAGTATGTACATATGTATAGATATGTTCCATTATCTTTATAAACGGTTCACCGCCGCATAATCCGCTTTGGAAACTTCCCGGCTGCTCACATGTTTTG:1 + chrX 7335784 3' + invader3 5083 1 51.49 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTAGAACGATATATTTCTCAGTAATGTTCGTATTTGAATAGA:1 - chrX 17479567 3' - I-element 44 1 61.39 AGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAATATTCTTCTCATAAAGACTGTATTGGGTGTCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCG:1 + chr3R 10736133 3' - invader4 15 2 55.45 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCTTTTGAGTTGTTGTGTTAAATGGGTATGCGAGAAGTGTTCCAAAA:1 + chr2R 12317268 3' - roo 8694 2 62.00 AAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCAGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTAC:1 + chr3L 24566081 3' + gypsy8 4777 4 74.47 TTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAG:1 + chr2R 1076516 3' + FB 261 1 60.87 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTTTAGAAACTGGCTTAGTCGTGTTTGCAACAAAAGCCTGTG:1 + chr3L 25341929 3' - 297 6582 2 79.00 TGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCCTTCAAATG:1 - chr2R 18891045 3' + opus 469 2 61.39 GATACCCGTTACTAAGCTAATGGGAGTGCGAACTGGCAAACTCGCATGAGACAATTAAAATGCCATTAGACAAGCAACTGCATAAATGAGTGAATCAGTCG:1 - chrX 2915211 3' - INE-1 541 1 73.27 CTGGCGTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTTGAAGGTTAAGTGCAGTGTGATTTTTATAGGGCGCATAAAAGTAAAATGCATT:1 + chr3R 8883245 3' - I-element 395 1 55.45 CCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCTGGAGGAGAGTCTACTCTCGTGGGTTAA:1 + chr2L 17863250 3' - F-element 4339 1 72.28 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCATAAATTAGTCAATTAGTTGATGAACGTTAATAAAGTTTATGG:1 + chr2L 15997965 3' + 412 7536 2 68.32 ATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTCTCTCTCTGGCACCGAGACTAATTTTATAACCGAATCGCAGTGAACCGCGCGTA:1 + chrX 12640939 3' + invader2 55 2 62.38 TTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGTCGAACCCCCAGATTACTTGCCTTAGTTTCTTGCCTCCGCTGCAGTTTTTGATTATTTTACGTTTTATTT:1 - chr3L 9673586 3' - P-element 2797 1 72.28 CTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACAAACATTGGCAAAATTCGTCTCTTCAATACACTGGATAATAAAATGTGT:1 - chr3R 29734617 3' + accord 6989 2 54.46 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTGACAAATTTGTAGCAACTAGC:1 - chr3R 16372426 3' - roo 51 2 77.23 GGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAATTGTTCAAATTAACACAAAAGCCATTACGTTTTAACAACACTTTTAGAGCTTAT:1 + chr3L 9802744 3' - roo 9010 2 55.45 TGGCTCTGGGGACCTTTTCATAAGCACGTTTTTCTGGGCCTGGCAGCTTGTAACTATGTGTTTTGAGGTACTCCTCTATCTTTTCGTCCTGCTGCTCGTCG:1 - chr3R 24878173 3' - Penelope 171 1 66.34 GCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACACACAGAGGACACAAACACACTTAGTTTGACATTTAATTTTAAGCGCATGTTGG:1 + chr2L 1279853 3' + accord 229 2 69.31 GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATA:1 + chr3L 25232912 3' - GATE 8266 2 54.46 TATCCNAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGATTCAGTTGTGGTAGTTGGCGAATCTTCCGTTGATACCGAAGTT:1 - chr3R 12312174 3' + R1A1-element 4959 1 55.45 TCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAACACTCCTGCCGCTTCAGCTGCAAGGAAGCTAGGTGGAACGAGGACGACTCGGGACTGT:1 - chr2R 10281793 3' + gypsy 7371 2 55.00 AAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGATTAAATTTCCTTTAATTTGCGCTTCCTT:1 - chr3R 5452840 3' - jockey 115 1 71.29 CCGAAGAGATTAGTCGTGCCACCTTTTTTTGTTTCGCTTCGTGTAAACTGCAAAAAGGTGTGCTCGCTGCAGAAATTGTAAATTCACTCGCCACG:1 + chr2R 19337416 3' + I-element 18 1 71.58 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGAAATATG:1 - chr3R 29019028 3' - Doc 49 1 72.28 CGCTGAGGTGCGAAAGAGCTGTGTATGCGCACTGTATCGTACCGATGTGGTTATACGGGATCCCAGGTCTTTGGTTTTGCTCGTTGTGGTGTTATTCTAAA:1 + chr2L 15364515 3' + Helena 1022 1 62.38 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGTTATAGAAACTGATGTGCT:1 - chr2R 13645338 3' - jockey 4708 1 55.45 CCGTATTTGAACTAAGATCAACGCCGAAATAAATAAAAACTCCGAATGAATCCGCTTTGCGTTTTTATTGATTGAAAAGCGATAAGCTGCAATCTCAATG:1 - chrX 4069157 3' - Tom1 353 1 76.00 AGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAAGTTGCTTCTTTTTATTTTTTTTTTATTAATACCTAACCATGTTTCATTTTATCTTTAATCAT:1 + chrX 3544999 3' + 1360 417 1 62.38 CTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGTCCTGAGTCTGTAGTTCGCTGTAGGGAAATGCGCCATAGCTGAGAC:1 + chr2R 25128286 3' + blood 205 2 59.41 GTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATAACGGTAACAAACATTTCCAGGTGGCTGACAGTCGA:1 + chr3L 13706619 3' - accord 422 2 64.36 GTGTCCCCCACCTTGGGTTTCCACGGCCGTCTTCATAGATTATAGTGGCGCGCCAGCCTTATGCATGTTCATACGCCCGTATGAGTGCCGACACCTGGATG:1 - chr3L 26026758 3' - Osvaldo 1289 1 48.51 TATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGGCTTCTAGCACAACACCCGCGACACTCGACGACATAAATCAGGCTC:1 + chr2L 7581133 3' + 1360 3152 1 70.30 GGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAG:2 - chr2R 4577082 3' + Chouto 483 1 59.41 CAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTATTGTTGGTTTATTTTTCCCCATATTTTC:1 + chr3R 8480503 3' - transib2 7 1 72.28 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCC:1 - chr2L 9823656 3' - hobo 56 1 77.23 TTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTG:1 - chr2R 13645357 3' - jockey 4727 1 74.26 TCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAATGATTAATTATTTAAAACAACAACGAGCAGCGTTGTTTAAGGAAAAATTTG:1 + chrX 10549429 3' - I-element 351 1 63.83 GTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGAGTAGGGTAGGAGCAATGGGATGGCCCACTGTGTTGGCCAACAGCCCATAGAGCTTGACATTGAGTTGGGC:1 + chr2L 9534416 3' - G4 3361 1 80.20 ATGAGNATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTCGCTCTTTTGCCTTGTTCACAGCAGCATTTTTCAATTTTATGGTTTCCAGATGAAGTGCGTTCGACCGTAA:1 + chrX 9959015 3' - roo 318 2 77.23 ACTAGATTCGTTCAAATGTATGTAACAGAGACAAAGACGCAGCGTTACATTGGGCCCAACTGCTATAATCTGACACCTGAACCGCCACAGCAGAAGCTGAT:1 + chrX 12514983 3' + INE-1 11 1 62.38 TAGAATTGTAGAGCAAGAACTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTTTTGGCACACGCGTGCGACGAGTGTCTCTGGTTTCTCTTTGTGTAATTA:1 - chr2R 21418628 3' - F-element 4229 1 50.50 AGAGTGAACGGTTATAAGCCAGTGTAGATCCCTTGCTTTTAGTCTGAGGTGCGTCGTCTTGGCATCTTAGTGATTAGGTATAACAATTATATTTTTGGTTT:1 + chr3L 3273266 3' - Doc3-element 4245 1 66.34 ATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGAGGATCCCTATACTGCGGAGTTACATTGCTGGGC:1 - chr3L 336623 3' + accord 431 2 66.34 AGGGGNAGGGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGGAACGGCTGTGCCGACTAACAAGCGCATTCTGGCCAAGTGGCA:1 + chr3L 9596937 3' + R1A1-element 5141 1 56.44 GCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCCAGCTACCAACATGCACAGCAGCAGCAATTAGTTGCTGG:1 - chr3L 17966703 3' + F-element 4424 1 61.39 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGGACATCCGTGCGGACAACATGGCGTATGATTAACATGTGTGCTTTTGCCGCCGGCAGCTAAAT:1 - chrX 8817089 3' - jockey 4686 1 65.35 AGTGGGATTTACTGGCAATTCCGCAGAGTTCCGTTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATGGTAATTTTATTAAATAAATTCTGTTTTGG:1 + chr3R 13101700 3' - Porto1 4293 1 86.14 TTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAA:1 - chrX 22398535 3' + Gypsy6A_LTR 155 1 58.42 CTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAACAACAAGTACAAAGGAAAGAGGGCTGAAGAAATTAAGAAGGAACCAAAGA:1 - chr2R 10608775 3' + jockey 4848 1 57.43 ATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATTAATTGAATTTTTTCAAAGAACCACAAAATGCCTTTAAATCTTACCCGGGAATCCGTAC:1 - chrX 7013553 3' - TAHRE 10369 1 57.43 AAAAAAAAAGGAAAATAAAATCACCAAAGCTGAAAAACCAAAATCGAGAATAAAACAAAGGTCTTCCGATCTGAGTTGCGTTGTTAATGTGCGCAAAACA:1 + chrX 19168312 3' + Doc2-element 253 1 54.00 GAAAAACTTCTGTCCTTTTGGGAACACCTGCCAGGAATAGTAAAGCCCTGAGTTTTATACGCTGACGTTTGATTATCGACACGGTTCTGGGATTGTTGCTT:1 - chr2L 18427837 3' + baggins 5005 1 72.28 ATTTCGTGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCG:1 + chr3L 16047628 3' - Gypsy6A_LTR 27 1 56.44 CCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAACGGCTTAATATTACGTTTAGCCTTGTCCATTGTCCGCAATTTGTTGTTCTTTGAGCTC:1 - chrX 8202136 3' - copia 483 1 73.27 GTGATTGTTATGTTAATGTAGTAAAGTTACTTTAAACTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCCACAAAGTGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAA:1 - chr3L 19457486 3' + X-element 4582 1 56.44 TATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGTTGCCCGCGGGAAACCACGACGGAAACGGGTACAAGATTACCCAGCAGCACCACTA:1 + chr3L 8761564 3' - jockey 129 1 61.39 TTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGACCAAGTGTAAATAACGGTAAAGTTATATATGATGATGGCAGGAAAAGTTGAAAGCAGAATAACAACAT:1 + chrX 9944265 3' - F-element 160 1 70.30 TTCGANTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAATTGTGTATTTTGCGGTCCGCCGCAACGAAACTATAATGTGTGGGGACAGTCGTCACATTCGGAAG:1 + chrX 4326955 3' - FB 11 1 66.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGCAAACTATATTATAAGCCATGCCAAGAAACTTGGGTAAGCTACAAATATTTTATTTTACTATATGT:1 - chr2R 23343727 3' + roo 400 1 68.32 CCAGGTGTTCGACGTCGACAGTGGAATACTGCAAAGGAGGATCACTCCCTATCCGCTTTCAAGAAGGCAGTGACAGAAAAGTGCTCTCGTCTTGGTAAATG:1 - chr3R 4632623 3' + R1-2 242 1 71.29 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATATTCATTGGCACGCTCATGAGCCGGG:1 - chr2L 796775 3' - jockey 57 1 75.25 ACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCATTGTGTTTTTTGTCTCATTTTTATTTTGATTTTCTTATGTGTTTCTTC:1 - chrX 17946092 3' + G2 2928 1 52.48 TGCGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGGGTCAGTGAGCCCGAAAAAGTTTTATGCGAGCGCCAAAAGTGCAGTCAACGCACTTAGGGGCAAAGTCTAA:1 - chr2L 18214836 3' - Gypsy6A_LTR 74 1 76.24 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTATTGTACATAAATCAGGCTGCACACATGCAAAGACAGTA:1 + chr3R 22675871 3' - 412 37 2 59.41 GCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGCTCTCACCTGGAAATCAGTTTAAAGGCCGAAGCTCCGCCGCGGGCAAAGACACA:1 + chr3L 14901429 3' + R1A1-element 449 1 55.45 TATAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGGTTTATGGTCTTATGGTCACACCACATAATGATGTTTTTAAACGCACTTTAATTTTTTTGATTGTATACAA:1 - chr2L 16672947 3' - Tc3 316 1 54.46 AAGCANGACCACCACACCAAACGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCCTCTTTGACTGACAGCCCTAACAGCCTAAGTGCTTGTTCCT:1 + chr4 717872 3' + Gypsy12A_LTR 2171 1 58.42 CTGGTACGTATAAAAGTTTTTCTTGGCATCGTTGAGGTATTTGGTATTTGACTTCCGCTTTGTCTTGCAAAAAATAATGGTTTCGAATACATTGATTGAG:1 - chr2R 18226256 3' - Fw2 391 1 65.00 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACTCGAACAGCGCCCCAGCAGCACTAAGCTCTTAGTTGGGGTCAGGCTTTGCAATTATAATTGCATTCAACCCG:1 + chr2R 14581970 3' + roo 9034 1 79.21 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAAGCACAGTTAAATGCAATGCATTTAAGGCTCAAGTCGAATGA:1 - chrX 5104613 3' + roo 9036 1 64.36 CCCCTATTAATTTTATTCAACAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCACCCATTGTGCCTTATGGCAACTCTGGCAGATCTTTGGCAGACCCAAAG:1 + chrX 14118369 3' - Tc1 237 1 53.00 TCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGATTTGTAGATAGTCCACAGCTTTATCAATGGT:1 + chr2R 10026573 3' + roo 451 1 67.33 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCATACCCTGAAGGAAGTTGCGCCGAGGAAGTCGAGTCATTGAGTGACAATTTCGGCAACATTTCCGCTATAATTGG:1 - chr3R 11616849 3' + 1360 3387 2 56.44 GAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGTGTTCATTGAATGCATTTGGCATACTAACCGAAACCAACCAACCAACCAAGCAACTCCTGGCTCCTTTACGACCC:1 + chr2L 8613171 3' - Doc3-element 427 1 66.34 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTTAGTCAGTGTCCGGATCGGGCGGCTTCATCAATTACGTAGCTTCTGCTCCGGAT:1 - chr3R 23618128 3' + hopper 1396 1 60.40 TGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCTATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCGAAAAATATAAACAAATCC:1 + chr3R 19059908 3' + R2-element 305 1 81.19 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAGGTGAGAGAAAAGAAATGGAGAAAG:1 + chrX 8299767 3' + roo 399 1 68.32 GGTTTCGCGGCAAAATTGGCCCCGAGATTATGACGATCTTGGCCGTCTCCTTGGTTTTTGAAAAAGTAGTTGGTTCTGAACAGGCACTCATGATTTGAGGA:1 + chr3L 17746801 3' + Osvaldo 1351 1 75.25 CCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGTTAGGCGGCGGCCAGACAGAAAGAGACAGGCATACCGAGCGCGCGCAAACTGTGGA:1 + chr3R 21605805 3' - HMS-Beagle 6944 4 60.40 CATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCATTTTGGAACCAAAATAAATAGAATGAATTTAAAAAGAAGGGTTGGTCCTTGGGCAAACAGTGC:1 + chr2L 3708690 3' + G5 4781 1 80.20 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTT:1 + chr2R 16928913 3' + blood 333 2 68.32 CGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGCGGTTGGGAGTTGGTAACTTTTTCGCTTTAACTCAATTTTAGTTGGCATAGTTTTTCAATTT:1 + chr2R 21433619 3' - F-element 4497 1 63.37 GTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTGCATAATGACGGCGCAATGTCATTGCACTTCGGTTGGTTCAATGTGCGTGATGAGTT:1 - chr3R 31311956 3' - 1360 2993 1 61.39 CTGTAAAAGACATTTGCGAAGCTACTAATAGTACATAAATTGTTAAGTAACGACAGCTTGTACGTTTTCATAAAGACAGAATTTCTAAATGCAAAGCACTC:1 - chr3L 9264071 3' + hopper 382 1 67.33 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCTACCTATATCCTTGACGTCCGTGTGCCTGTGTACGTGTACACGATTCCACCATTTATC:1 - chr2R 19210636 3' + P-element 2869 1 56.44 GCCGCAGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCTGCGGTTGCTGTGATGATGATTCGATGTGGA:1 + chrX 272885 3' + gypsy4 53 2 69.31 CCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAAAAAAAACATAGCACAGGACTAGCCCAAAACTGCAGGCCAGAAAGAACGGCAAAACTGGCCAAAATGTCAGGG:1 - chr2R 12774666 3' - 412 7145 2 74.26 AAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGGCTATCGTTGTTAAAATAGGTAACATAAACATATGGATCGAAGAGCGAGAGAGCGGGAACGGTT:1 + chr2R 5992844 3' - Tc1-2 1554 1 74.26 TGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAGTGTTTTTTCTTTATTATTTCCCCGCGGCCCACGACACTCTTATCGGTATAGTGAGATTGAGA:1 - chrX 22680882 3' + Cr1a 4063 1 62.38 TCTTTTAGTATAGCAGCTTTCAGTGCTGCTTGGTTGTTTTGTGACCTTTTTGCCACTTTTTTCTTCAAATAAACCCACAAATTCAACGCCAACGATCGACT:1 + chr3R 21824673 3' - S2 1313 1 80.20 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGGGTGTGAAATTTTT:1 + chr2L 7654036 3' - jockey 33 1 53.61 CTCAAGGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGCCTGTTTATAGGTTTCTCCGCAATTTGA:1 - chr2L 17004715 3' + roo 394 1 64.36 CTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAAGAGTAGCGCGTGCCAGGCCCACTTGGAGCTATTCACTA:1 + chr3L 7759847 3' + Doc 4544 1 62.38 TAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCGCGGGTAGATAGGGCAAATGGTTTTTAAAAGGAGAAGCAGCAGCTGA:1 - chrX 14711280 3' - I-element 196 1 57.43 AATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCTGGAGTAATGTCTGTTAGGACGGCCGACAATGTCATCTGGGAGTCGTACCGCACTCTACGAACATG:1 + chr3L 25882704 3' - Idefix 107 2 58.42 CTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAATGACACCGCAACAAATGGGAAACGCTAAAACAGGAAGCCGCACCTGAAACTGCAGGTGCACCTGCC:1 - chr2R 8829532 3' + Doc 337 1 65.00 GTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTTATGTAACTGCGGCTTAACACAGAAACCAAAATAAAACTGCGATCGATTAAGCTCATTTTCATTGCTAATTA:1 + chr3R 17722931 3' - I-element 4902 1 72.00 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTGAGCCTCCAGCTGCTGGCCGAACTGATTTAGAGCCACATTCTTTC:1 + chr2L 15622777 3' - mdg1 30 2 53.47 CGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCTGCTCCCCCGCAGACAGAATACCTCATTTCCCACTCATT:1 + chr3R 28003876 3' + F-element 311 1 63.37 AGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTAGTCGAACTATTTGAACTCTCTGATACTTTCTGGAAAATTAGTTTACTTAACAGTTGGC:1 + chr3L 19512755 3' - roo 9037 1 70.83 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATATTGAAATTTCGCGTTCGCATTTTTTTCGCTGATCTACCAATTATTTTAGTTCAGACTTTGTCGAGATGCGCAACTTT:1 - chrX 21566299 3' + INE-1 500 1 59.41 CTCAACTTTGAAGAGTGGTTGTGGGTTTCTGTCTTTGCTCAGAATGTTGAAGACGGCTTTTGCCCTGTTGTTGCCGCCTGTCACATTGCAGCGAAAATTGA:1 + chr3R 11062514 3' - Fw3 315 1 63.37 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTT:1 - chr2L 16691165 3' - pogo 34 1 61.39 ATATACATACATATTACATATGTACATATGTAAATATGTATGCGCGGTTGAAGGTCAATTTCCGTTGCCAGCCAATTCGGACACTCATTTCTGGCATCGCC:1 + chr2R 7614542 3' - Dm88 12 2 77.23 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCG:1 + chr3L 2978967 3' - hobo 46 1 70.30 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCA:1 + chrX 16619664 3' - opus 44 4 72.28 CCGCGTCAATGTTTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCACCTTTTTTCCTCTCTGTGTGACAATTTCTCTGGCTGATTTGCGTGTTAAGACCTAA:1 - chrX 10175266 3' - HMS-Beagle2 6763 1 58.42 AGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCAGGTGCTACCCGCCACGTAGTCAAAACCATCACCCCAATCCACATCATAGTCAGTACCAGTACCAATACCAGT:1 - chr2L 21001607 3' - gypsy 4 2 63.37 TTAACTTAAAATTTTAAATTTATTTGTCTATGTAAGATCTCTAAATGGAGCACGAAGCTCTTCCCAATCTGATTGTATTTGCCGAGTTCAGTGACCTGGAA:1 + chr2R 13647127 3' + 1360 3052 1 60.40 TCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACGTTGGCGCAACATTCGCTCCAGCTATGCCCG:1 + chr3L 14411527 3' + Tabor 7251 2 69.31 TGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTTTATCTTCTGGATGCCCTTTGCCATATCTTTCTAAGTTTACGCGGGAATTTAATGT:1 - chr2L 23039375 3' - 412 7430 2 59.41 TGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATGGTTGGTGAACGGCAAGGGGGTCTTCTTCACCAGCAGCTGAT:1 - chr3R 22005963 3' + hopper 456 1 58.42 CAACCACACACACAAACACACACACACATGCACACGACCCAGGAACCACAACTTCCACTACGAGGAAAACTACAACAACGACTACTCCGAAGCCTACAACT:1 + chr3L 4275174 3' + gypsy3 421 1 58.42 CTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAGTGCG:1 + chrX 2496398 3' - accord 7104 2 72.73 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTA:1 + chr2L 13670329 3' - BS 5020 1 50.50 GTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGATCTTCGCTTAATGAAGCACAGCTCACACA:1 - chr3R 25480144 3' + Ivk 4966 1 68.48 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACCATTTAGTTCCTTGTACTTAATGGAAGCTGCATGCCATTGGGCCAGTTTCTTCAGCGAACTC:1 + chr3R 11685654 3' - mdg1 7053 2 64.36 TTTTATACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAGAAAGCGAAAAATAGTTGGCAAAAGAACATGAAGCTACTGCTTTAAATAA:1 - chr3R 8480399 3' + transib2 2802 1 59.41 ACAATGACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGC:1 + chrX 1523748 3' - jockey 58 1 73.27 TATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGACTTTTATTCTTAAATAATTTTATTTAAATCGCAACTGGCAGTGACACTT:1 - chr3L 3407848 3' - rooA 240 2 67.33 GTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAACTTCGGCAAATATCAACTTCAACTTTTTTCGCGAGATTCTTTCGGCGCTTTTCAGTTTT:1 - chr3R 18475878 3' - HMS-Beagle2 7144 2 67.33 TTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCCGACTTTTGTACTGTACATATA:1 - chr2R 16331514 3' - Tirant 8232 2 77.78 CTCTTATAGTTCTTGAGATCTCGACATTCGTGCTCCCATTCGGGATAAGAAAGTTTTCCGTTTGTGGGCTTCCTGTCCCAAGGAAATTAAAGCCAGCACAA:1 + chr2R 20844591 3' - INE-1 148 1 69.31 TCTTTNTATTTTTGCATTGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACATTTTCTTGGCAAAATGTATGTATCTAATTATTTAATAGAAATGAT:1 + chr3R 18917836 3' + S2 1664 1 79.21 TATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAATCGACGGCGAAAATCAAAGCAAACAACGTCGTTGTCGGCGATTAAACAATAAAATAACAATTATTG:1 - chrX 16860179 3' - FB 237 1 72.28 TCCTCCTTTTGTTATTTATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCAAATTAAAGATTTTCCCCTAGCTCTGACTACATTTTG:1 + chr3L 556978 3' - Burdock 319 1 74.26 CTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAAAAAATCTTATTAAGTAGATATATTGAAGAAATTTATTTCAGATAAGAACT:1 - chrX 2125038 3' - G2 3030 2 49.50 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAG:1 - chr3R 14913160 3' - blood 41 2 63.37 CACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTGATTTTGATTTTGCCTGCGATTC:1 + chrX 6071635 3' - R2-element 3519 1 77.23 AGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCTGATGCCATGACGATTAGATTTTATTAA:1 + chr2R 12911999 3' + Stalker4 7264 4 72.28 GCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCACCTAGAGTTTAGCATCAACTCAAATGTGGAGCAGGAGCTGCAGCAGAAGATCTTCCGAATAGATG:1 - chr2L 20652956 3' + Doc 4352 1 74.26 GCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAAATTTTGTATTTTTTTTTTTGCCCTCGAGCTGGCTGTTTATTTGTTTT:1 - chrX 15309411 3' - jockey 163 1 58.42 ATGTGGACATAAAGATCGAGCAGTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCGGGCGGCAACTTTTGGAAGGGGTAAATGCGACTGCAGCGA:1 - chr2L 22056216 3' - Tabor 196 2 60.40 TGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGAAGGAGTCATTAGCTGGTGTCTTGTGACAGGAACGGTCCTAATAGACG:1 + chr3L 25847401 3' - copia 4751 1 53.47 CGGCACAAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACACATACGAGTTGTCTGTGCAAGCAAATTGCATCGTGAACACAAAAACAAGCGAGTGAGTCAGTTT:1 - chr3R 18891065 3' + 1360 3193 1 60.40 CGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGCTAACATATTG:1 - chrX 11060472 3' - I-element 21 1 52.48 TATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAAACACTTCGGTCCACCGTTTTCCGGTGCGCCACTGGCACTCTGTCCTTGACCCTGGCCGTTCTTAAG:1 - chr3L 25513995 3' + X-element 4708 1 63.64 TATATTCTTGATGAGGATCAATACCCGACCCGAGTCGATCTAGCCATGTCATCTGTCCAAATGAACGTCGGGATTTCTGGAAGAGAGATTGGAAGTTAGAA:1 + chrX 22775686 3' + INE-1 83 1 62.38 GGCTTTTATAGTTCCTGAGATCGAGGCGTTCATAGGCTAAATTGCCAATATGGCCGCAACTCTGGCTTTAACGGAATTATGTCGCTAATTTAATGATGGCA:1 + chr2L 18015440 3' - INE-1 150 1 72.28 TACAAATTTTATGCGTACAAAAAATGACCTGTGCTCACTCTGCTGCGGCCGGCGAAGCTTTGCGGCGAACAGTCAAAGAGACTGCTGGTTGGAGCAGCCG:1 + chrX 1031381 3' + hobo 2684 1 70.00 GTGCCAAATTGTGTGATAACCTGCCTAACAATAGCATCTGTCCATCTAATAGTCGGAGGGCAGATGGTCAAGCAACGACTTCCGTTTGTCATCGAAAAAG:1 + chr2R 22765887 3' - G5A 380 1 63.00 TCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTATAAACGAAGCTCTCCGGAGGTCACTATGGCTACCTTCTGGATCAGCTCCTCTCTTTTCTGCATTTGAA:1 - chr3L 23436543 3' + Porto1 4348 1 64.36 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAATACTCGTAGGAGCGAACAAACAAAAT:2 + chr3R 17504995 3' - jockey 56 1 70.30 GCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCGAGATTTATGTGTCTGCTGCTCGCTCTTTTTTTCGTTGGTCTCTATATTTTAAT:1 - chr3R 18741890 3' + 17.6 7080 2 59.41 GACGCNTAGATTGGTACGTGATGATCCTCGTGGATGTGGACGATGTGTTTCGTTCGTCGGTGCTCTCTAAGTCCATTCACGTTGGACCCACTTCTTCTTTA:1 + chr2R 1070730 3' - Tirant 8043 1 61.39 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCTTTTAAAATCACTTTGTTTTGTTTTTTTAACAACGCTTT:1 + chr2L 20084929 3' + 412 459 2 56.44 CAATAGTGTCTCTTTCGCTTTCGATGGGAAATTTATCAAACGCATTTTCGCCCGAAGGCCAAAAGCCGAAAGTGGAAAATTGGAAATTGAAAATTGTTCAC:1 - chr3L 20886109 3' - Doc3-element 102 1 64.36 CCACTNGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTCAAGCGACAAGTGAAAGGCAAGGGCAAAGGTGGACGCAAGGCAAAGGACGAC:1 - chr3L 6736484 3' - micropia 345 2 59.41 TCTCAATAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTGAGGAAAAATTA:1 - chr3R 25795988 3' - BS 4997 1 73.27 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCAC:1 + chrX 16619665 3' - opus 7040 4 69.47 TAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCATCGAGTGTCAACCTCTTTGCGAGGGTGGGAATACGTTAGATGTCGAAAGTGGCCAACC:1 - chr3L 19531735 3' - 1360 3374 1 66.34 GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTGCGCCGCCCACTTTCCGCCCGGTGCACTTGCACCCAAATTGCACTCAATTTGCACCG:1 + chr2L 2858096 3' - transib2 17 1 62.38 CTACACCAACATAATTAGCATATGCATTTTCTATTGTGTCTTTTTCATTAATATTGAATGATTTATTATAGAAAGAAATTTATAATCGATTTTTTGATAGC:1 - chr3R 9374838 3' + gypsy6 7802 2 76.24 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTA:1 - chr3R 22667130 3' + 412 454 2 62.38 CCGATCGCGGAGCGTGAGAGTGCCGAGCATACACCTAGCAGCAAAGATGGACGCGCTATAGTTTTGGGAACTGTAGACGGGTGTATGTCGGTGCTGGCGAT:1 - chr3R 16060919 3' + Stalker3T 151 1 64.36 TTTAAGCTCGCAAACAGCTGTTTGTGCGATCGCGTGGCAGCTGGGCAGCGGAGCCCCAGTACTCGTTAAGCTTTCGTACTCCATTAGATAAGTTGCGTATT:1 + chr3L 18649481 3' - X-element 239 1 59.41 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGCCAACAACGACAGAGTACCAAGAGAAGAATAAT:1 + chr2R 1373088 3' + pogo 2067 1 63.27 CTCAGGAACTATAAACGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCGTAAGGATTCTAAAAAATACACCAAGCTCCAGCATCAGCAACAATAACAACAGTTTTAGCGAGG:1 + chr3R 12917725 3' + INE-1 153 1 53.47 AGTCAAGATTACAGATAATAGGACAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAATTTCTGTAAGGGTCATGGACATTCGGCTGCTGTTGCTCCAGTACGTAAAAG:1 + chr3L 1961694 3' - Cr1a 4223 1 68.32 TGAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTTGGTCATTTGAAATGGCGGATTATATTCGACATTACGTATACGCAGTATGGGACGAACCTACCGCAATGGCAGCCCC:1 + chr2L 487767 3' - G-element 364 1 76.24 ATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACCAGCACAACAATCACGATATATAGATATCCGGCTAGCTGCAACTGCAACTGCAACGTGCTGAGCTAACGAG:1 - chr3R 18040922 3' + Doc3-element 460 1 62.38 ATTTATTTATATGGTAATGCACCGTTGCCCGTCGAATTTTGTATAAATCAATGGTATTTTGTATCTCCCACTGGGAAGACTGCCGGTTCGGCCGGCAGGCG:1 + chr3R 16882840 3' - Tc1-2 470 1 55.45 TTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAACAAAAATCACAATATATAATCGGGCGAAGCGGTTA:1 - chr2L 1743263 3' - Transpac 324 1 65.35 ATCTTCGAGCTGGTGCGGAGAAACAGGCGCGCCACTATAATCTATGTAGAGGAATTTGACGGAAAACACAAACACTCGAAAT:1 - chr2R 21042466 3' + Osvaldo 1210 2 47.56 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTGTGCATTGTAATTCATTTCGAATTTATAGCCACCCGCGATCCGA:1 - chrX 8714576 3' - P-element 32 1 47.52 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTGTGTGTTCGTGAAACTCCGAAAACAAACAGCGGGATTTTGTCATAAGCGAGAGCTCAA:1 - chr2L 19090034 3' + opus 484 2 65.35 TAAACGAAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTTTAGTTTTTTATTTAGTTTTTGGAAATTTATTCGCACATAGCGCGCTGAATTGAC:1 - chrX 17211153 3' + Tc1 1362 1 65.35 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTTGATTCAATTGAAAAGCTTGTTTTGGTTATCCACTTTTCAACACATCGTTAGCTTTGGT:2 - chr3L 5827866 3' - blood 7030 2 61.39 GTGGANGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTAGATATTTTTTAGAAAACAAAACCGATACATTGACTGTTAATTGTAAAACAATTTCATTTTTTGAACCTCTA:1 + chr2L 6928433 3' + R1A1-element 91 1 75.25 GTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAAAAAAACACGCATGTGGAAAAGAAATCGAGACAGGGGATCCACAAG:1 - chr3R 20085349 3' - FB 88 1 52.27 TCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTAT:1 - chr2R 4260434 3' - micropia 180 2 82.18 ATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTGTATCTCTCTCACGTTTTGCTCTCTGAATCGAACGACATTGGCAACGAACTTG:1 - chrX 7069101 3' + blood 132 2 58.33 GGAAAGCATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGGAAGCCTGCGAGGGTGTCAATGCGCTACTGC:1 - chr3L 11457629 3' + Tc1 368 1 69.31 GCTCTNGCGCAGATCAAGTAAACAACCCACTAACACAGGACATCTAAGAATGTGCCATGGCAGATAATTTTTTGTGTATCGATCCCCATCTCA:1 + chr3R 15039728 3' + Tom1 214 1 53.76 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTATGGGTATCAATTCCGTATCGGCGAGCTCCTC:1 - chr3R 19965327 3' - jockey 4676 1 68.32 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGTGTGTGAATCTGATAATAAAGGGGCTGGATTTTTCCTAGCATACTTTCTAGCGTGTCCCATTGCCAA:1 + chr2R 13280178 3' - jockey 14 1 71.29 CTACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCCATTTGTTTG:1 + chr2L 6605627 3' + blood 345 2 55.45 GTACCGATGGGTCGGTAACTCGGGCGTTATTGCAGACACCCTTATTTTAGTGTTAGCCTCTTCCGGGCATTGGAATCACTGGGAAAGGTTGGTTGGAATC:1 - chr2L 7222896 3' - ZAM 7961 1 69.00 CATAGACATGGACGAGGACGCCCATTTTTAATGTGATGGGGAGTAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAGGAAAATTAAATGGAGCCCGAAACCGAAATAA:1 - chrX 18190561 3' + Chouto 6290 1 67.68 CCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCAAGCTCCCAAGTATCTCAAACAACAGTGGTTCCTCGTCGAACAGTGGATCATCTTCCAGTTCATCATCCTCCAACAG:1 - chr3R 17156708 3' + G2 16 1 65.35 GCCCGGTCTAGTTAGCCTTACCCGGGTACTGCGGATCTCTGCCCGGGTGGACCGTTTATTTCTCTCCATTTTCATGGGCGGTCGGGAACCATGGACCCTAA:1 + chr2R 9912949 3' + baggins 317 1 73.27 AAGCGTTAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGACAAATGGACACCGTACTTACTTGTTTCTGCTGACAAATAAGGTCA:1 - chr3L 23593644 3' + Porto1 4249 1 52.48 GGCAGTATGGGAACTTAGTGGCAATGAGTAAGCTGTAAGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATTGGTTGCCTACTCATTTGTGTTAAGCTCGTCGCTACCC:1 - chr2R 11178847 3' + Burdock 6028 1 62.38 ACAGTCGAGTGTCCCGACTATCATATACCCTAAAAGTGGTGGGATGAAATGTGCAAGCGACTGCTTTAGGGATTAACTATGAGCTTCACCGAGCGGCTGC:1 + chr2L 20139789 3' - INE-1 564 1 82.00 TGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCATAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGT:1 - chrX 17049553 3' - Stalker2 7248 1 63.49 GGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTAACCTAACAAGAATCGAAACCTAAATAAATTGCTGTTTACTCGAT:1 + chr3L 22564912 3' + blood 378 1 77.17 TCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCTTTCTTCATCACGATTTGGCCCAACATGCAGACATGTGTCGATACATGCTGGAA:1 - chrX 7179998 3' - invader4 3009 2 57.43 ACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTT:1 - chr3R 18860348 3' - R1A1-element 5046 1 70.41 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTT:1 - chr2R 6838496 3' - I-element 42 1 71.29 GAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCAAACAAATCGACAGGAAAGACACG:1 + chr2L 12487890 3' + roo 77 2 77.23 AATAATAATAATAATAACAAAAAGGAAAGGAGCAAATGTAACGACTTCTGTGTGTGTGTTGGTGCTTGCGAGTGTTTATAACACACTTTCAATTTTCAAT:1 - chr2L 14000799 3' + mdg1 7057 2 59.00 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAAGCAAATTACCAGAT:1 + chr3L 12707848 3' - jockey 4766 1 69.31 AACCGAAGACTTGGCGGCCTTAATAAATTCGATTTGTAGTTAGTTCGTAGCTTAGATAAGGTTTGTGTTTTTATTTTGGTTCGCGATTTGGATAGGGTTTG:1 + chr3R 3374377 3' + gypsy10 244 2 63.37 TTTCCCCTTTTGCGCACGGCTCGATCCGGTACAAGGTTCAACTATTGTACCGTTAGTTCACGATGCTCGGACACGGTTTGCAGTGGGTTTCTT:1 - chrX 1083138 3' - gypsy8 303 1 68.82 CTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAAACACACTTTTGGGGCCCTGACCTGCGACTCCTATTATCCGTACTCG:1 + chrX 873343 3' + Gypsy6A_LTR 251 1 65.35 CATTCAAAACATTGACGCGGTGCCCACCACCATCGACCCTAGACCACCCACTCCGCAGCTGCTCCACTCTTCTGTAGCCACAACGTCGTCGCAGCCATCGA:1 - chr3R 6613871 3' + HMS-Beagle2 6765 1 70.30 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTGGGGATTTTACAACTACCTTGGAATATTTCCCTGCATTCTTTGAAATTGGATTTTATAAAAGTAAC:1 + chr2R 5095436 3' + roo 9047 1 52.00 TTTTTGTTAATTTTGTCCCTTATAAAATGATATTTGACATTAATGTGTTTTGAGTTTCACCACGGCGGAAAATAATGTCGGACCTTTCTTACCTGGACACG:1 - chr3R 9590903 3' + frogger 349 1 57.43 TGTGTATTTGTGTGTGTGTGTGAATCACCTGATGGTGAAAACATGAACTAATTTCATATAATGCATCAAACTTCACAGACGTATCGCTCTACGTG:1 - chrX 400732 3' - accord 7034 2 53.68 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTTACACATCGACCTCAATTCATATTCCTTTTGATGCTGTTGCTTTTA:1 - chr2L 18286115 3' - 412 7080 2 52.48 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATTCAGCGCCTTCAAGGAATCTATCACAGAGACCCGAATGAATC:1 - chr3R 7143782 3' - jockey 4807 1 58.42 CCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATTGGGTTGTCAAGAATAGTGTGTTAGAGGGAGATGACAATGTAGTGAACGCCAAACCAGCTCTCGACGAACGAAAA:1 + chr2R 10806608 3' + invader4 2873 2 77.00 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACAAAAACGAAAATAAATAAACACACGCGAAACGACACAACAATTAGCGACATCTACCAGCTCGTCG:1 + chr2R 12609167 3' - BS 5039 1 74.26 CTATTAGATACCCCTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAATGGGCGGCGGTTTGTGGCTAAAATTGCTTACGAAGCGCCTGCTGACTTGAGTATTTT:1 + chrX 16988225 3' - INE-1 547 1 63.37 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACACAAGCACAGTTAAATGCAATGCATTTAAGGCTCAAGTC:1 - 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I-element 43 1 69.31 TTTTATTTCTTTTGACCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTA:1 - chrX 1840959 3' - Stalker4 491 1 75.25 TGGCTATGTTGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGTGGCAAATGCAGTTGGAGGCTATGTTGCTGGCGACACGAAAACGAATGTAAAACACACACAAAA:1 + chr3L 17223090 3' + GATE 8196 1 73.27 GAAAAGATAAAAGAAGGCAATCGGATCGTGAGGAACAATGCCAGGCGTGAGTCGGCTATCGATTATAGTGGATACCATAACTATACATTCTGCACACTCCG:1 + chr3L 19148555 3' + P-element 399 1 80.20 TTATGTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTCACTAATAAAATCCCCACAACACATCCGCATATCCGCATATCCGAGGCCATTCATA:1 - chr3R 27401861 3' + accord2 7295 1 65.35 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATTAATTTGACAGACATCTGAGAGTCATTTTAGCTAA:1 - chr2R 19232854 3' - Burdock 38 2 65.35 GCTGCAGAACCTCCAACATATTAGTAGTCTGAAATCTGACATAGAGTAACCTGAATGAACATAAAAACTGCATCACTTGTATTTGGTCAATCTCAGCTTGT:1 + chr2R 9004169 3' + gypsy4 6355 1 67.33 ATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTAATATCATCACTCATGTATGCCGCATACTAAAGAGAATTTATCAT:1 + chr2L 17126233 3' - G-element 4239 1 56.44 TACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTTTATCGTTATTTTTGTTGCTGTGCAGGCTGCCCCTTACGCACTT:1 - chr2L 1657005 3' + rover 7042 2 64.36 ATTAATAATAAACAATAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTCTGAGATTTCTTAACAGAAGAGATCGATAATATGTTATGCTCCTTATTTTGCTCA:1 + chr2R 9249275 3' + flea 241 2 54.46 TGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCTGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGCTAACCACACGGCAAAGATGTTGAGCAAAACTGCCTCGCGCTCCTCCTGTGATGT:1 + chrX 613369 3' - R1A1-element 4903 1 62.38 AACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCCGCTACTCCATCCCGTCCCTACCCCTACCCCTCTCTCTCTCATTCTCTGCCTACTTATCTCCTTCGCCTCCTT:1 - chr3L 3073955 3' + Quasimodo 6956 2 69.31 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTGGGAGAAACCAAATTTTCCCTATTTAGTGCGGATTTCACTGCTAACATATAGCAATCACC:1 + chr2R 23343835 3' - roo 8680 2 59.41 ATTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGGCCGCCTTTTGTGGCAGCCATTGCTTCACTGGAATAAATATTCAAATT:1 - chr3R 22343464 3' - X-element 370 1 53.33 ATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGATTGTGCCTCAGAAAGCTGAAACTATCGGGAATACCAACAGCATTTCATAGC:1 - chrX 20491764 3' - Idefix 7094 2 52.48 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCGACCCCAATTAGTATGCTCCATTAAGTGC:1 - chr2L 9823610 3' - hobo 10 1 71.29 GGTTGGATAGTATATTCCAACACTAATCGTTGGGATCCACAAATCCTGAACACGCCGTCGTTGAATTTTCCGACAATGAAAAAATGCATAGTCTAAAAAGA:1 + chr3R 4066504 3' - copia 1 2 79.21 GAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCCGACGTCTGAAGAGAATCAATTAAATTCTTCAATTCACTAGTAGGGGTCTTACAAAATAATGTGAAAACAGTC:1 + chr2R 18175944 3' + G5A 2649 1 50.50 CGACTAAGCGGCGTAAAACATATTTTTATACTCTCCTGACCTATGTGTGAACTTTGGAAAGGAGATGGCGCCAAAGAATATGATACACAAAAAACGATAGC:1 - chr2L 10542977 3' + Gypsy6A_LTR 214 1 77.23 AAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCTCTTACGAGTTCATCTTCTTGCTGTCTTCGATTCATTGAGGAATTTGACCCGGGCTGTTTCGAAACAAAATACTT:1 + chr2L 9814544 3' + hopper 496 1 52.48 ACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGGCACTCGCATGCACATAACGAACGGAAATGATAGTG:1 + chrX 16503052 3' + BS 4816 1 64.36 CCGTTCTGGAGTTTTTAATTTTGGCCAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTCGACTGGCGACAAGAAATATGAAGACACATGTAGGCCGAGCCAGCA:1 - chr2L 21108695 3' - 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chr2R 13488962 3' + G5A 2462 1 67.33 TGTGTGAGTTAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCTTGCAGCTCTAATTGTATCATTGACTAATCAAAAT:1 - chr3L 8332376 3' - 1360 3243 1 64.36 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTCAGCAAATGTGGGCCCAATGCCAAAGCCAAGGGAAC:1 + chrX 2090313 3' + roo 394 1 65.35 CAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTGCTTTGCGCTCTCTCCACCCTTTCTTCTCGCCTCCTTTTTGCACTCCGTTC:1 + chrX 4107447 3' + roo 460 1 61.39 TTCTGCGTTTGAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTTATGTATCGATTTCGAACGAATATCAGTTATTGATTTCAGCGAAC:1 - chr2R 1994881 3' - Porto1 4519 1 55.45 TTAATATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAAT:1 - chrX 2082626 3' + Transib-N1_DM 441 1 91.09 TGTAGTAGGCTTGAGGTACACATACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTCTTTATGTCTTTAGTGGGTACTACAATTCTTCTATAACTTCTATACC:1 - chr2L 22076192 3' + invader2 1 2 72.28 GTAGGAACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCGATCGTGGGAGGCGCC:1 + chr2R 4879036 3' - G-element 20 1 62.38 AGCTTCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAACTTCCAAAGAACCTACTTATCACAACTAGCGCAACC:1 - chr3L 27391703 3' + G2 41 1 62.38 CACCGATGAAATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCCAGTGAGTCAGTCAGTCATTTGGTTTTGGGTAAGACAAGGAT:1 + chrX 13496935 3' + Rt1a 4903 1 60.76 GTTGTNGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATATGGCAGCGTCTCCCAGCTGAAAGATGAGGGGCAACGAATGGAGGATTCAAAAAT:1 + chr2R 5968865 3' - flea 13 2 66.34 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGTTCATTGGACGCCCGAGCCAATCGAGAGACA:1 - chr2L 20084875 3' - 412 7098 2 67.33 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGCCTCACCTACATGACCAA:1 + chrX 9260671 3' - 3S18 5794 2 50.00 GATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTGGGACCTCCCGAACACCAAACGATTTTGT:1 + chr3L 26852118 3' + diver 213 1 67.33 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACGTGACGACAAAGCTGCGGGTGCCCTTCTGCTCCTCGATGAATGTGT:1 + chr3R 14139461 3' + hopper 1394 1 55.79 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTA:2 + chr3R 8480475 3' - transib2 35 1 60.40 CTTTTTTGGTGATGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGTTAGATGTTGTTTTATGAATTTC:1 + chr2R 6715311 3' - 1360 3327 1 77.23 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATCGGTCGCCAAGG:1 - chr3R 6216786 3' - pogo 14 1 65.35 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGCATCGACTTCGGCTTCGCGAGAGTCCAATTCAAGGGAGGGCGCGGGCA:1 + chr2L 222275 3' + P-element 2875 1 65.35 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTTTTTG:1 - chr3R 23346536 3' - P-element 34 1 45.54 CATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATATACGCATATGTAGTACCTATACATATGTATATGTATCGAATGCCCGCC:1 - chr3L 19246320 3' - Idefix 16 2 63.37 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGGTTCATTGGACGCCCGAGCCAATCGAGAGACAAAGTGAAACGACCTCGCACAACGCGCG:1 - chr2L 20084848 3' - 412 7071 2 61.39 ACACCTATGCTTGCCATAGGTGCCTTGGATTTGACCACAAAGTTTCCCAGTGCAGGGTCAAGGAAACCATTCGCTCTTGCCCAGGATGCACATAATCTGGC:1 + chr2R 24031008 3' + R1-2 487 1 70.30 TATTCATGCAATCTGATTTTAAAAATATAAACATTTAATATTCGTTCGCTCTAGAATAATTTTTGTGATGCGATGTGACTTTGGCATGAAGATAGGATGTT:1 - 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chr3R 10300139 3' - I-element 5113 1 69.00 GGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAAAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTACTGAAGAAGAGATCAAGTAAGAAGTTATACTAAAAAG:1 - chr2R 15299487 3' + I-element 324 1 63.37 TTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCCGTACACTATCCCCACATTGAACGTGAGTGACAGTAAACCATGGATGTCGATTGCGCTT:1 + chr2R 4054653 3' + rooA 7179 1 56.44 TACCTTGTCATCGGCTGCACCCGCTCACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACTTTGTCCAGGCGGGCGTGGAGCTGCCCATTCCCC:1 - chr2L 14167489 3' + F-element 458 1 42.57 AACTCAAAAACACAGTAAAGAAATGTGGTTACAGATCCCACAAATGAGTCATCCGTGCGCTTGGGGATACCGGAGTGGATACATAACTGCCTGAGATACGT:1 - chr2R 20835275 3' + Helena 944 1 68.32 CATTGNAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGAACGATCCCAGGATGGGAACTGAATAGTTACGAGACGTTGGTCCGGAGCTCTGGAG:1 + chr2L 590397 3' + jockey 4924 1 68.00 GATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCATTATTGCAGCTTGTAAACACATTAAAAAAACAATACCAAAGAAAGTCGGCTGGAAAAA:1 - chr3L 20587893 3' - F-element 4333 1 58.42 GGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGAACTTGTCCGATGACTTTACGCAGCGATTTTGGCCCTAAACTAAAAGATGGATGGAATGGCAATGCTATTCGTACAA:1 - chr3R 21916568 3' - jockey2 3165 1 63.37 GAGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGGCGAGATCTCCATCAGTAAGAAGTTGCTGCCGCCGAAGAAGGTACGCCCCCAA:1 + chr2R 15201822 3' + R1A1-element 5028 1 60.40 TTAGTTAGTTAATTAGTTAGTTAGTTGGCTTGGTTACGTTTGGGAATAGCGATTTGTGATAAGATCAACACGAAGATATAAGATAGACAAATGCAACGAGA:1 - chr2L 6640271 3' - HeT-A 28 1 69.31 AGACTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACACACACACACAAACACCTAGAGACAAGCCGATGTAATGCATTAAATAATCATTCCAA:1 + chrX 6719324 3' + I-element 4920 1 61.39 CACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCAACGTACCCAATGGTTGATGTCGACAGAATTTAAATT:1 + chrX 455181 3' + P-element 319 1 50.00 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCG:1 + chr2L 18568096 3' - I-element 49 1 70.30 CCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTATGGAGGACTAGACCATTGGCCGCCAGAGCTGCCGCCG:1 - chr2L 2963427 3' - I-element 224 1 62.38 AAAAANATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAATG:1 - 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BS 5025 1 54.46 AGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCTGGTAGGAGCGGGGGCCATGTGGGCATGTGGGGCACATGGGGCACGCGGCAGCTGGCTGAGAATGGGGGATT:1 + chr2R 13335027 3' + invader1 102 2 63.37 AGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACTCCTAGACGCCTTCTTGGGCCATGCCCCCAGCTGCCCACGGCCATGGGGTC:1 + chrX 4073731 3' - Rt1b 4936 1 54.46 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGCACCTTTTTGTGTCCAACTTTTCATTTTCAA:1 + chr2R 11730923 3' + blood 7345 2 68.32 AAAGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGATGCCAAGTCGCACTTTATCTTCTTTTCCGATGAACAGCAGCGGATACACTCCACCGATTAGCCCGGTATCGA:1 + chr3R 19173342 3' - Rt1a 4898 1 71.29 TGCCAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAATGAAAATAAGAAGAAAAACCCCGACTCATGTAATAGCCGGCGAAT:1 - chr3R 27074440 3' + Tc1 1324 1 62.63 CTCTTGAGTGGATCGCGCATGGATACTGGATAAGCCAAGGATAAGATTGTGTAAGATAGGGTTGTTATATAAATTTCTTCAAACCGAAAGTCTTTGTTAGT:1 + chrX 19542207 3' - Quasimodo 7142 2 68.32 TGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGGGGAAATGGGTGGCTCTGTTGTGAGGGCTCAGCGGGAGTTTGCGAAAATGATAATGGCGCATGGGGCGCA:1 + chr2L 4328638 3' + R1A1-element 5004 1 72.28 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCCCTATATATATAGTAACATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCAC:1 - 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G6 73 1 62.38 ACCCANACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCCGGCAACCCGAACCACCTAAAACAGA:1 + chrX 20503699 3' + Doc 4490 1 71.88 CTCGTTATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCAGCTGCAACGAAAGCAAAGGGG:1 - chr2R 13786853 3' + F-element 461 1 82.00 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGC:1 + chrX 19848477 3' - P-element 50 1 29.00 TGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGACGGTTTCGCTGTGACTTTTTGC:1 + chr2R 22102609 3' + pogo 287 1 77.23 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGACAACAAGCTGAGAAACTCACAAGCGCAGCAACTCGAACTCAAACACAACAGGCG:1 + chrX 19848507 3' - P-element 21 1 58.42 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACAAGTGATGTACAAAACGAGTTAAATACAAAACAAAACGAACGGATAAAAGCTGCACGCTGGGCGAATCG:1 + chrX 3485731 3' + P-element 2880 2 68.32 TTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAA:1 + chr3L 20224214 3' - Chimpo 38 1 62.00 TTGACTCTCTGCCGCTCTTTAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATGAGATTATAAACATGATGCTCAGTTTACTCCGAGGGGCTTACTTCGTTAAT:1 + chr3R 27628881 3' + Cr1a 4239 1 60.40 CATTTTCCCACTTTTTCGAAAATCAGCCACAATGATAATTTTCCCAATGAACTCTTCACTTTTGGAAATGTCGCTGTCGAAGATGAAATCAATACGAAATC:1 - chr2L 4800879 3' - FB 131 1 61.39 CCAATNCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACATAACAATTATTATGCCCTGATTTTGGACACTGAGGATGCCTTTATATCCATAAAA:1 - chr2R 8307914 3' + G2 2903 1 60.40 GGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAGATAACCAAGTGCTTCGGCAACTACGAAGAGAACGTC:1 + chrX 2081582 3' + Doc2-element 4466 1 67.33 AGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGCACTTGTTTATATGGGTAACCCAACGGGGGATAACAATGGTGGGTCAACGAG:1 - chr3R 8821740 3' + Doc 57 1 62.38 TGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTTTATCTTCCTCCGCATCAACCACTCCTCTCACTTCAACCACTCCTTCCTCAATAGTTACTCCACC:1 - chr3R 8295494 3' - invader4 2941 2 67.33 CTTTCTAAATTATCGGAGAGACTTATTGCCAATCGGATCAAGAACATTTTACGACAACGTCACAGTGCGTGTGTGTAATAATTTATAAGCAGAGATGTCAT:1 + chr3L 4981638 3' + Helena 211 1 59.41 TTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGAAGTGACAATACTCTACACAAGTGTCATACAACTTAAAAACGTATAACTTTTAAAAATAACTGTCTCT:1 + chrX 10242065 3' - FB 245 1 71.29 AAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAAGGCACAAAAGGTAGAAACTAAAAATTTATGAAATAAATAAAAATATG:1 + chr2L 21745539 3' - Cr1a 268 1 68.32 GGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCCCAATAAATATCAACAGCCACACAAATTTGCCTGTTGGCCAACTGGCAACTT:1 - chr2L 14550084 3' + Quasimodo 7099 2 57.43 ATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTGCAGAGCAAGGACGATACGGG:1 + chrX 3889994 3' - 297 6791 2 79.21 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTTAATATATCTGAATATTCTGCGCAATCCACAAATTG:1 + chr3R 5946165 3' - HMS-Beagle 36 2 66.34 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTGTGGCGCGCTATCATATAAAGCTGTCCGATCTTGTACTG:1 + chr2R 17698115 3' + P-element 2855 1 49.50 CATTCATAAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAAAAATGGGAGAAAAAGAAAAC:1 + chr2R 19116266 3' + HMS-Beagle2 478 2 90.20 GAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCGCTTGCAATGCTTGCCTGAACTTTCCTT:1 + chr2L 3759392 3' + flea 469 1 72.28 CGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACATTGTCCCCAGCTAGCCAGCCAGAGCAATCCCACAATGACGCAACTGCAGCAGCAACAGCAGCAGC:1 - chr2L 18137682 3' + Tirant 113 2 56.44 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGCCTGTTTATAGGTT:1 - chr2L 17004729 3' + roo 9043 1 54.46 AGAATTTTAACATTGTAACACACACAACACACACACTGAGATTCTAGATGGGCTCCGTGGGGCTGGTAAACCCTCAAAAAACTTACCGTGCGGGCAAA:1 + chr2R 22338791 3' + ZAM 254 2 81.63 CAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATAAAGAAAGCGCGTGCAACGGGCAAAAAAAAGCCAACCGACCGGAA:1 - chr2R 8634515 3' + F-element 304 1 61.39 GGTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTCGTATTTATTAATTCGTACCATGGACTGCAGTTCATTATGTTTTCTTTTCGTTTCCCGTCTTTCCTCATTTTCACA:1 - chr3L 22246211 3' - I-element 4872 1 70.30 GCTGTCTAACTGACTGCCCCGCTTCCGTGCTCGCGCCTTTTATAGGCCGCAGGGATCCTGCAACACAAAAAAAAAAATATCTGCAAAAAGTTTCTTCAAAA:1 + chr4 1251437 3' - gypsy8 370 1 61.39 GTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTCGCGGTTACACGTTTTAGAGGATAATCTGGATTTTCGCTATCG:1 - chr3R 3463946 3' - Idefix 7127 2 62.38 CATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTGGATTTAGGCTAATAACCCTTTATACTGTAGATCCTAAGATCACTTAAAAAATATACTTAG:1 - 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hobo 39 1 61.39 GAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCAAGCTCTTCCTTCGTAACACAGACAATGGGCTCGGC:1 - chr3L 25310214 3' + F-element 438 1 57.32 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGCATTTTAATACGCTTAAGTGCACGGCGAGTCCCTAAAACTATGCTATGAAAAATAGTTCAACAACTT:1 + chr2R 13314198 3' - jockey 17 1 69.31 TGGCTGCGTCCCTCTATGTCGCTGACTGCGACGCCACTGTCGCTGGCTGCGACTCCTCTGCCGCCTGCAGCTCCTTCTCCTTGGGCTGCTGATCCTTCATC:1 - chr3L 12043172 3' - aurora-element 282 1 62.38 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chrX 10664377 3' - 1360 21 1 57.43 GTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGCTTGCTGAAAGGGGTGGCCGGTCTGAGTTCGACGGCCTTCTTACGTAAAATCAACAACA:1 + chr2L 19575132 3' - G2 48 1 66.34 GAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTACCAGCCAGCCCTCTGCTCATCAATTGCGACGTGCTGGAAAATGCAGCTTCATTTATTTTACTCAGATTTT:1 - chrX 22895696 3' - INE-1 575 1 69.31 GGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCCTCATCTCTTTGACTTCTGCTTTCTGGTCTAG:1 + chr3R 10127296 3' - flea 4680 1 68.32 GGACCTCACTCAGCTGTAGAGGCTGTTCGGATGGCCAGCAGATTCCGGCAGACACAGTGGGGCAGGTCCATGCCAAATCATTTTGCATGGACCTAAAAGCT:1 + chr2L 4724388 3' - invader4 114 2 83.17 TCTTATACTTTATATGCATACCCTTAGTATTAATAACATATTGTAGGCGTTTTTCATTGAAAAAATATCTTTCCCACCTTCCTAGTTGTATTTTTG:1 + chr3L 21666163 3' - S2 1420 1 72.92 ATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGATATAGCCATGTCCGTTTGTCCGT:1 - chr2L 10186231 3' - 1731 83 1 77.23 TAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTCGCTATTAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGAGAGTGCTTTATTACCCC:1 + chr2R 21374665 3' - R2-element 3253 1 80.20 CGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTATTGCTATCTCAACTTTTGAATGTCCAGAAAAATTTCAAGGTCGGTGATTCACTACAAACTTAAGGGCGAT:1 - chr3R 1268493 3' - X-element 4324 1 69.31 GGATCNCGATGATCCATTTTCTTTGCATTTGGACATAGAAAATTTTGATTAATGGACGAGTAGAAAATTTTGGAATGATAAATGTACACGGGCTCTATGAT:1 + chr2L 21027794 3' + transib3 2562 1 56.44 ACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCCCCGTTCTCTTGGTGGCGCGGATCGGCATACATGGAAATAAGCCGAGGGGAAAACTTAG:1 + chr2R 12962992 3' + roo 8670 2 60.40 GTACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCAGGGGATTCCCGTAGTAACCCAACTGGCAACGCTCACAACT:1 - chr2L 14288148 3' + Transpac 453 1 58.42 ATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGGAGTTCGTCCATTCTTCCCACTCGCAAAACAGTTTTCCGGCTCGTTTTGATCGTCAACTTT:1 - chr3L 17361793 3' + hobo 324 1 64.00 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGTCGGATGCGATTATATGTTATTTAACTGCTCTCCCTT:1 + chr3L 17624230 3' - roo 8698 2 61.39 AACTAATATTGTTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCACCGTATACCGATTTTATCGCTGTCCCAGATTTATGCGCAGCAACAGCAAGACGAAGATGAGGA:1 + chr2R 5927906 3' - HeT-A 5769 1 67.33 CCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACGGTGAAGGGACTGCCTCCCATCCAGAAATCGTTGGATGGTCTGGCTGTTTCGTTGCGCGTCTGGGTTTC:1 - chr3R 21815360 3' - R1A1-element 5317 1 66.34 TGAGGGTGGTTTTAGTACGTAGGCGGTAGCGTCTGCAAAGTATTTCAATATCGGATGAGTCAGAAAAATGTATAAACAATTGAGATTCGCAAAATGCACTT:1 - chr3R 13959630 3' + R2-element 3450 1 74.26 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTCCGTGTGCCTTAACATGTCTTGATTGCCAAAAA:1 + chr2R 11129335 3' + hopper 1376 1 64.36 ATACATATATATATATTTTTATAGACCGGAATTTTGATTTTAAAACAATAACTTGGATGAGGCATTATGTTTTTATCCGTGCACGAACTTC:1 + chrX 20008739 3' - G3 4501 1 70.33 CGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCAATCCAATCCGATCCTTGATCTAATTTAAACCCAAAACTTCGCCATGCAAGTGCACAAGAG:1 - chrX 2482717 3' + Ivk 5032 1 67.33 ATGTCGGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCT:1 - chr3R 22667136 3' + 412 7501 2 66.34 CAAAACATATTTCAAAAGTGTGGACAGTTTTGGCCAGTTTGTTTGCGTCAAAATTGGCTTGGCAACAACAGCCCAAGTGGAATGGAAATATTCCGCAGAA:1 + chrX 7806104 3' - INE-1 259 1 67.00 TTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGTGAAATCTGGCCGAAGATTACCGCGGATCTGCGCGGATATGATGTT:1 + chrX 7044893 3' - F-element 319 1 54.46 GTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGCTTTTGTCACAAGAATTTCAATTA:1 - chr3R 9193558 3' + roo 407 1 78.79 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGTCTTCAAAGAGATCTCGACCGAGCAACAAGTGAACGGAAGAATCCGAGCAGTGAAGAA:1 - chr2R 8145918 3' - P-element 16 1 63.37 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCAATTGCGCAAAATATGCAAAGCGTTTTTAATTAAAATTTGAAGATC:1 + chr2L 777831 3' - 1360 86 1 55.45 TGGGTGAGCGTCAGCGATTAGCCTCAGTGCATTGTAGCCTGCCTTGAGGTCTGCGTCTGCGTTTGCCGCCGCGTTGCGGGGGAGCCGTTTCCAGTTGCCG:1 + chr3L 10940617 3' - G-element 3993 1 77.00 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTAAATTTGTTTGCATATTAAAACGAACTGCTAATA:1 + chr3L 19260847 3' + pogo 2064 1 75.25 GGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTTGCGCTAGGTGGTTGGGGACGCGTGCTTTGCTTTTCGGTCGATGCCTGTCCTCGCCACACAGTGGGATGTCTTTAATT:1 - chr2R 13192548 3' - F-element 4490 1 61.39 GGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGATTAAATACATATGTATGTATTTATGTAGTAACTTAAAGCGAAAGCAAAAAAAATGTCGGTAGACAACGTTCTATC:1 + chr3L 15099972 3' - Tirant 8107 1 75.25 CGAGTNGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTAACATTTGTCATTTGTTATTGGTATTGCCTATTTATGTGGGTG:1 - chrX 19729236 3' - G6 1689 1 56.00 CTCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAG:1 + chr2L 5152015 3' - I-element 24 1 54.46 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTA:1 - chr2R 16018828 3' - I-element 24 1 54.00 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGCACCTTTTTGTGTCCAACTTTTCATTTTCAATCAGGCCTGTCAAATTTGTCAAGCTCGACGAGTTTTCA:1 + chr2R 11730961 3' + blood 7383 2 73.27 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAGAAATATTGAGAAATATGAAACAAAACATGTAACGGAAATGAGAA:1 + chr3L 14005634 3' - F-element 39 1 51.49 CGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACACACACACCCTCCTCCCCCGCCGCCGCACAACTCATTAGAAGCGCATTCAGACCATTCAGCATTGAG:1 - chrX 9735059 3' + accord 234 2 76.24 CAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAGCGAAGCTGCAGGATATTCCCAGAAAGTTC:1 + chrX 1897226 3' + invader2 485 1 79.21 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCT:1 + chr2L 1353761 3' - I-element 50 1 76.24 TCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGTACGAAGAGAGATGGAGAAGAAAAA:1 + chr3L 15021251 3' + Doc 4345 1 75.00 TGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCGGCTGCTCCTCATTCTAGCTCGGAGTTTGATCGCTGC:1 + chr3R 12630875 3' + Circe 106 1 63.37 CGAGCTGTTCGCTGTAGAGCTCTCCGCTCTCTCGCTCATGAATAGGCATTACGTATGCGTTGAAATTTAAGTGGCTCACACACACACGT:1 + chr3R 26826258 3' - 1360 124 1 65.17 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAACTAACATAACTTGCCCAGTAAAAAACAAAATTGAAAGGCGCATGGAATATATATTTCGGAATTATCTAAAT:1 - chr2L 9346141 3' + Transpac 5226 2 67.33 TTTGGGGAATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGGAGCAAAAAGCGAGAAGAAACACATTCCCTAAGGGTTAT:1 + chr3R 10835771 3' + Ivk 212 1 69.07 AATATTTTAACACTGGTCTGAACTATGGAATATCATCAATACGCTGCAAACGCGATTTGGACGTCCAAAGCACATCCCCACTCAGTGCTGAGCAAAATCAA:1 - 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opus 7164 4 77.23 TGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCCGTTTACTCGCGCTCGCAGATAGTTGGGTTCGCGTTGGAGCAGTGGTAAGCTCCTC:1 + chr3L 193276 3' + INE-1 91 1 60.40 TGTTGAGGTCTGGACTTTGAGGTGGCCAATCATAACGATTTTCCTCCACCATCTGACATTTTCCTAATGCGCTTAAGATAGTGCACCGCCGTTTTTTTATA:1 + chr3L 19277749 3' - Tc1-2 1163 1 79.21 TGCACACACACACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGAGACAAATATGCCAAGGAGCAGGGTCAGCCATTTTGGTTT:1 - chrX 10822928 3' + accord 182 2 74.26 TAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTAAATCGAACAGGACAAAAAAGGTGGGAAATGTGGCAGAAGCCAACTCAAAAAGGACAAAGATATCCG:1 + chr2L 9883023 3' - X-element 4557 1 75.25 GATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTTGGTGCTACACATGTAATCCCCATATAGATTTGGTGCGAACCCAGCTATTTATAATAAG:1 - chr3R 30796986 3' + Quasimodo 7133 2 61.39 ATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATTTAGCATTGGATCTGTTTTTGGCCGAATGCTGGTAGCTCGTAATGT:1 - chr2L 10930559 3' - invader2 90 2 56.44 CCAGCTCGTCGACTGCGAAAGGTTCGCAACTCTATCAGCTGTATTGTCTGATGCAGCTGATCTGATAATAACGGCAAAGATAATGGAAAACCGCACAATAC:1 - chrX 17963746 3' - Rt1a 226 1 65.35 AATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGGAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGCTTACGTATACGGCATGTGGCCTTTGCTGCGG:1 - chrX 1368984 3' + R1A1-element 71 1 64.89 AGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAA:1 - chr3L 21637339 3' + Bari1 1673 1 59.41 TGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCGCCAGAATAAGCAACTTACGTGACGTCATCCTTTTGCTTCTTGGTGACA:1 + chr3R 27295079 3' - jockey 4619 1 51.49 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCAATTTCTAAAATCTATTTTAAATCCGTTAAAAGTTTTG:1 - chr2L 8640818 3' - roo 37 2 64.36 CAGACTGGAGAACCACCACAACCACCAGGCCATACCCAAGAAACAGTCCTACAAGCCCATCAATCGCGAGGGCTACTGCCAGTCCATCTACTGCAGACCAG:1 + chrX 11143151 3' + G2 2852 1 77.23 TTAATAGATACCAAGGTGACAAAGGAGTTTTCAGCTACCACGTATAAAGTATAAATAAAAAAATACAAAACTCCTGCAACATAATCTACATCAGCGGAGAG:1 - chr2L 8842945 3' + BS3 1719 1 80.20 ATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTATGAAAGTTTCAGTTTGTTTTAAATTGTTGCCACCGCTTTGTTCGACTTTGAACAATGT:1 + chrX 12999400 3' - jockey 4975 1 68.32 GGATCNGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGTGAAGGGGGCAGCGGGTAGAAGGTAGGTCCTGTGTGTGCGAC:1 + chr3L 13716752 3' - accord 7364 2 57.43 GTATAGTTTTTAGTGAATCTACTTGGAACCGTGAAGCCGGACCAGAGGAGTACGAGGTGGAGGTGTACGCCATCGCACTTGGCGGACAGCCACGTACATCC:1 - chr2L 4212426 3' - Cr1a 4116 1 71.29 CTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGGCTGACTTTTCATTTGTGCTGTCAACT:1 - chr3R 15584905 3' - Bica 118 1 73.27 GCCTAAGCCCTGGTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGAAGTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTTTGCTCACTTTGCATATGGAAAACAATTTGTACGGCTGTTTG:1 + chr2R 11518732 3' - baggins 5026 1 58.42 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCATTAATTGCAAGAAAGACTACAATATAAACTGTTTAGGTGGATATGGAGATAAGCTCAAGGTAT:1 + chr2R 15856455 3' + mdg1 410 2 67.33 GAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGCTACTGCCTTTAAAGGCTCAGATGCAG:1 + chr2R 3172240 3' - 1360 50 1 74.26 GGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCAATCTTGAGCTGAAACTACAGAG:1 - chr3R 14882053 3' + gypsy5 414 1 73.27 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTC:2 - chrX 11060487 3' - I-element 36 1 58.42 AAAGGAGTGCAAACTTATCTAGAAGCCGCGATATGGAAGCCGTGGCCAAGACCTCGGAAGGACAAGAATGAAAGAGCGTTGCCCATTTGGCCTGC:1 + chr3L 14332635 3' + Tc1-2 1218 1 75.79 AAACTACTATGCGACAATCTGAGCGCCTCGAGTATTGCCAAGAATCCAATTAATCACAAGCGTACAAAACAAATAATTACAAGTAAAAATCGCTGCGAGT:1 + chr3L 18449105 3' - frogger 443 1 71.00 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGT:1 + chr3L 22052857 3' - mdg1 7049 2 68.32 GTGGAAGAAGATAGTGCGTCGGAGCGTTCTTAATACACCGAGGACTCACTGTATTAAGAACGCGACGAAGGAGGCGCATAGTTTGCTGGTAACCTCGAGCG:1 + chrX 14610686 3' + gypsy8 402 1 49.50 TTTCCTTTCATAATATATAAATGTTTTCTTGATTTCTGTCTCATGACGAATTTCATGTGGCATATTTAAAACTTAATTTACATGGCTGTCCTTTGGCCGGT:1 - chr2R 14111661 3' - copia 234 1 66.34 ACACACACACACACATATACACACACACAAGCTCTCGTATGCTGAAAGAGACGG:1 - chr2R 18654196 3' + accord 7033 2 92.59 GGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAGAAAGCTACCATTAAAAATTGAAATATAATGCACATACACCCTCCTTAGAAGCACGA:1 + chr3R 6174407 3' - Idefix 7047 2 63.37 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGACCGCTGTGTTTGCTGATTCTTCG:1 + chr2R 5322052 3' + 1360 3337 1 79.21 GGCAANAAGTGCTGCAATGTCTGAGATGCCATATTTTTGGGCGTAGTTTGTAGTTTGCGCTTGAAGTTGAGTTGCCCGCCGAATATGGCCAAGATACTAGA:1 + chr2L 19718985 3' + jockey2 313 1 57.43 CACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAAATCTGGAATGTACACCCGCTGGCAATTAGGTGAAGCGGTAATTGAAACTACCGCAAATGCGAAAATGGCC:1 + chr3R 12288295 3' + mdg1 7341 2 57.43 TCTTCTTATTGGGGATTTTACAACTACCTTGGAATATTTCCCTGCATTCTTTGAAATTGGATTTTATAAAAGTAACATCTTCGATTTATTTAGATACTCAG:1 + chr2R 5095461 3' + roo 408 1 76.24 ACAGCTGCATAAAATTATAAAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTAAATCGTGTTTTCTCTAGTTATC:1 - chr3R 20039761 3' + micropia 5367 2 75.25 CAATAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGAATTAAGGAAACATTAATTTAGTATATAGGCTTTTAAAGAGTGTTCTTTATTTTTATCGTCGGTG:1 - chr3R 22351902 3' - 1360 440 1 65.35 CAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCGACAAACGGAAACGGAAACAACGCAAACAGCAAATTCTCACACACGGCCAGGTACAGTGGGTTAAATAGGCAAAAAACT:1 + chrX 8754836 3' + F-element 499 1 80.20 CCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCCAGTGCACCTGCCACCCGCACATGCCACACACTCAC:1 - chr2L 5332255 3' - accord 203 2 62.11 GCAGGAGTTGGACTCTTTTGTTTTTTTGGTTACTTCTGGGCACATCCTTCAGGTCCTTCAGGGTGGCCCAGAAGTAACCAAAAAAACTACCGATCGCACAA:1 + chr2L 7296855 3' - invader2 200 2 62.38 TAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTCTGTTTATATTTTTTTATTTAGTTTTAGCACACAAAGAGCGGCTGTCTCGTTCCCGCTCGCACTAGTC:1 - chr3R 11198145 3' + Tc1 1368 1 62.00 GTGGCNGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAGTAACATGTCCATTCTACACCCACAACTTCCCAACCACACACTATTGTAAACAAT:1 - chrX 22252749 3' - 297 11 2 62.50 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTT:1 - chrX 17049529 3' - Stalker2 10 2 68.04 TAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTCATGTTTATGCACGCAATCATCCACGGCTGCATGTAATATATCATATCGATGGGA:1 + chr3L 3469435 3' + 412 43 2 58.59 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATCCCGTTGACTTTATTGTAAAAATTGACAACGTGGCTGCCTTTGTTGTTGATCGTAAATATGCATATTTAACA:1 - chr2L 7216563 3' - copia 5 2 75.25 GCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATCAACAACGAGAGTAAATAGTATTAAATTCAAATTATTTACA:1 - chr2L 20494162 3' + R2-element 3354 1 62.38 AGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATATACGCATATGTAGTACCTATACATATGTATATGTATCGAATGCCC:1 - chr3L 19246323 3' - Idefix 19 2 60.40 TGATTCTTTGTGTTTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTCTTCATCTCTTCTTTTTTTTTTGTCTGTTTTCCATTTTTTAGC:1 + chrX 13858086 3' + Cr1a 143 1 69.00 AATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCAACAAAACCAGATCTGCCATGGCCAGT:1 - chr2L 13966529 3' + I-element 239 1 74.26 TCTAGAGGTGGCTCAAGACTCTCTCGATTTTTTTTTCAAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCTATACAGCGAATACGTTGTGAATGGATTTTAGTCCCGGATCGG:1 + chr2R 17716319 3' + 1360 70 1 60.40 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGGCATTTCGGTGCGGTGTGGCGACTCGGTGCATTTAAATGC:1 - chr3R 7808927 3' - jockey 22 1 64.36 TGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACACAGCACATATACCCTAGTGAAAGACACTCATCCACTCCTTGCACTTGTGAGCACATAAACAAACAGAAGACCGG:1 + chr2R 20464428 3' + X-element 4329 1 77.23 ATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACACACTCACATCCAGAGAAAGGCGAAAGCACGCCCATCGCCACCCGCTCTGCCCCT:1 + chr2R 14941440 3' + Stalker2 252 2 57.43 GCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCATCGGCGATTAGATTGGATTGACGCGGCGTGGTCGAGAATACGACTC:1 + chrX 4960143 3' - F-element 4464 1 53.47 CCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTGGCTAAGTGCTAGCTACTACACTTTATTGTGTTTACCGA:1 - chr2R 5273513 3' - Cr1a 4431 1 61.39 AGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTATCGTGATGACAGTTGGATTCGACGG:1 + chr2R 13643736 3' + Bari1 205 1 74.26 TTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGCTGGGTGCAGTCATGAGTATCCAAAAATAATCACCCCGGCCTTATCGAACTAAATAAATATTAAATTGTAATTAAG:1 - chr2R 23589121 3' - I-element 203 1 76.24 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTTGCAGGAGAAAATCTAGTATTCAAATTTTAATTGCATACAAATACATAGGTAAAAGAACTGAAACC:1 + chr3R 17468446 3' + Transpac 301 2 71.29 TAAGTAAGAGCGAGATAACAATAATATTCTTATTCCTAACGGGGATATGATCGGATGCGCCTCGGCGTCATCGGCTTCTTGGCAAAGAATCAATATCCCGC:1 - chr3L 25202785 3' - invader3 94 2 55.45 TTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGAACAGCAGGTGGGTGTTGTGGTTTTTCCGGCTTACG:1 + chr2R 16102428 3' - F-element 4426 1 62.77 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACTAGAACGCGTATATGTGTGCGATTTGTAGTTCTTAATTAATGTTTGCCAATTTAGTAGGCGTTCCTCT:1 + chr2R 7922642 3' - 1360 3254 1 53.47 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGCTGCGCTGCTGGAAGCTCTCCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 9023559 3' + P-element 2884 2 74.00 CCCCCTGCCAAAGGTAAGGGACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTACCGACATCCGTGCCATTAATATTTCATTTAACGCTGCAATTGTCCCAAGAGCAATAC:1 + chr3L 10238432 3' + roo 466 2 64.36 ATTAGGTCTTAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATAAGGTCGATTATCTTCGAGGGCGACTATTAGAAGGGCGTCGTAATACAATTGTTAGTCT:1 - chr2L 3369684 3' - Idefix 7290 2 60.40 AGAGAGCCTGGAGCAACCTCTATAGCGCCTGAGCCAGGTTGTTACCGCTGCGGCGAAGCTGTTGCCATAGGAGATGCGCTTGGCGGCCAAGTCGCGACG:1 - chrX 5313958 3' - 1360 72 1 68.69 AAATATCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGATTGTAAAGTATACGAATGACTTTCGTTTGGTGTTGGGCACAGACTAAAATTGAAAATTTTGGACG:1 - chr2L 15854248 3' - INE-1 265 1 77.23 CGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCCCTTCTACGAAAACTAAACCTCTCAATTTAAACCTATCTGCATGGAAGATTCATCTTTGC:1 + chr3R 4939827 3' - F-element 101 1 61.39 CCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGACCTTGCGAAGGGGGAGTCCTTCCTTTG:1 + chr2L 19758321 3' - flea 332 1 72.45 TGTATATATATATATTGATCACGAGCTCCCTTTTACGAACTCCCCCTTAATTTCGAAACGGCCTGCCATTCAATCGACTTCCCCTTTATCGCCAATTAGCC:1 + chr3L 13499107 3' + accord 6935 2 79.21 ATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAGAAATTAACTGCGTCCGCTCACAAGTATGCTACAATTTATTGCAACTACAGTGGCACGTACCGCCCA:1 + chr3L 15853546 3' + jockey 4987 1 73.47 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTG:4 + chr2L 7654050 3' - jockey 23 1 64.36 AAATANTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGGACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATATTTTTCAAGCGATCGAGCACATTCTAAAA:1 - chr3R 8578353 3' + HMS-Beagle2 7117 2 68.32 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTG:1 + chrX 5726788 3' + roo 9047 1 54.46 ATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATGCATAACTCAATAGCATTTTGATCGAGCTAAATTTGTAATTACTTATAAAGTA:1 - chrX 19536965 3' + Quasimodo 7 2 54.46 AGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGTCAGACGATTGTGTAAGGTAATATCCACTAGACGTCCTCGTGCCCAG:1 - chr3L 18281872 3' - Tirant 8283 2 53.47 TCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTTCCCCCTTGATTGACAGCCGAATTCTTATTATAGAAAAACGCTTTCTACATTGAATATGTGACATTTTTAGA:1 + chr2R 17598957 3' - I-element 336 1 74.26 GGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATATATTACATACAAATATTACTGGACAATTCATGTGCTTTCATTGTTTCTTAACTTTGATAGGCATATGC:1 - chr2L 8966988 3' - Burdock 2 2 77.23 GTTATNGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAAAAGTTAGAGAAATTTGTTTCGGTATCTAAAATATATGGAAATAAGTTCTACAGCTACAA:1 + chr2R 18062795 3' - F-element 304 1 63.37 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAGTCGAGTTTGTATAGGCGATATCA:1 - chr3L 17624184 3' + roo 357 2 73.74 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGGAATCAGTGCTTAAAATCGATTGTT:1 - chr3L 9864600 3' - P-element 50 1 28.28 GTGAAAATGTGTGTATGTGTGTGTTTGGGATACGCGGCGTATACGCAATGCGAACGGGGACACACAGTGCACAGTTGATGCCACACAATTTACACATACTA:1 + chr2L 15137381 3' - accord 187 2 59.41 ATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAAACACGGGGAAAGAGTGCTTATCATCGGCGAGCTGGGTTTCTGTATCAATTTGCATCG:1 + chr2L 146065 3' + roo 8636 1 61.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGTTTAAAAAGACAGGCAAAAGTGGCACATTTACACAAGCCATATAATATATATAAATCAC:1 - chr3L 8036366 3' + roo 9043 1 66.34 TTTATGAGACGCAGATCAACAACCACTCACGTTTTGGTCGCTCTGCTATTTGCATGTAACATATACCCACAGGTATATGTTATTCGAGGCAATCGTCTTTA:1 + chr2R 6506720 3' + Q-element 217 2 72.28 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTTAATTAGCCTACAATGCTAGAGGTCCACGTTACACTATT:1 + chr2R 8557895 3' + hobo 2922 1 52.50 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTAGATTTTAACC:1 - chr2R 8157168 3' - Transpac 18 2 59.41 CTTCTAGATTTTTTAGTTCCTGAGATCTAAAAGAAAACAAGTAAAATTGCAAGCATGTAACATTTACGCTAAATTTTAATCCATATTGGCCACTGAATATA:1 + chr3L 11231675 3' - INE-1 155 1 73.27 CGGCTTACGGTGCCCAGCTTCCCCCCCCTCCTCATAATCACAGGGCACACAGATGTTACAGGTGATTATGGGGAGGGGTATGGGGATGTGGCACATAGGGC:1 - chr3R 12332206 3' + G6 266 1 62.38 TTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATATGGCTAAATATGTTATTTGATGGCCAAAACAAAAAAA:1 + chr3R 25092251 3' + R2-element 3377 1 68.32 TTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTTAATAAGATGCATAATTAAATACAAC:1 + chrX 2125080 3' + G2 3001 1 73.27 GTCTTNTAAATTTCTATCGATTTACCGAAAAAACTTTTTGGGGCGGAAAGTAGCAAAGTCAGGCCAGCCGCAGCAGAATGCCAAACTACGCTGCGCTCTA:1 + chr2L 17469299 3' + INE-1 301 1 71.00 CGCCTGAAGAGAATACATTCCCATGAACTCCTTACACAACTAACGTACTTAAGATATTGTAATGGGATCAGACTTCCATGGACGTACTTACGAACAAATGC:1 + chr2R 25063169 3' + G5A 2680 1 67.33 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGATTTAAACCATATCTCAAACTAACCATTCTTATCACCAACTATTTAGGTGGTCCGCTTTAGTTTCTTAT:1 - chr2R 18434448 3' - pogo 4 1 69.31 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCGGTGAGTCCTGTCTCGGATTGCCGATTAATCAGCAGTGGA:1 + chr2L 13841003 3' - jockey 4788 1 60.40 ATTGTTGAGTGCTTCTGTCCGCACTTCGTGCCTGTAGATTAGAGAAGCAAAAAAGATGCACCTTTACCTTAACTGTTTGCGCAATGGGCAGAACAATGCAA:1 + chr3L 24761100 3' + 1360 458 1 67.33 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCAATGTGCCGCTAAGTAAACGTGGGAATGCGG:2 - chr2L 15997866 3' - 412 24 2 57.43 GACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGCGCACTTTGACAGCCTTGAACAGAGCCGGGTTGTTGTCCGCAAACTGAGCGAG:1 - chrX 16273406 3' - F-element 298 1 59.41 AAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCAATAATTTGTTTGCGTTCTTAGCTTTTGATG:1 - chr2L 306461 3' - Tirant 15 2 66.34 GCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATAGCACTCTGGGGAAATGCCCGAAAGATGATAAATCGATCCAATATATCTTCAAAATG:1 + chr3L 9731193 3' + Porto1 4239 1 58.42 ACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATTACTTTCTCAAAACCCTAAGTGTATTTCCTATTAACCATTTT:1 - chr3L 16529015 3' - hobo 371 1 58.42 AAAAGTTTTATTGTTAATAATTTTTGTCTAAGCAGGGGGGAAAGTTAACGAAAGCCAAAGAAATCAACCCCGAATGTCCGTTTAGAGTCTAGTCAGGGTTT:1 - chr3L 2866218 3' - P-element 2687 1 70.30 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATTCATAAATTTACTAATTTGCGATTAACTAGATTGTGTCAGC:1 - chr3L 21840253 3' + 1360 3380 2 68.32 TAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGACTTTGCTGCCGGCTGCAATTGATTAAAATTCTCGGCAATGAACTGCAAATAGAACGGATTCCTCAGAT:1 - chr3R 29391213 3' + R1A1-element 5035 1 73.27 AAGCTCGGCTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCATCGGGCTGGCCCCACGATGTGGCATTTTACTTAATGGTGCAGGCAAACGATGCGTAACTAAGT:1 + chr2L 20553305 3' - Circe 291 1 56.00 GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACT:1 + chr2R 2248341 3' - invader3 51 2 73.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACAACAATGTTTGTTGTTGGTATCCTTGATTTGTTTTCCAC:1 + chr3L 19510799 3' + roo 9050 2 58.02 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTTTATGTACATACACATACACATATACAGACACATTTCCCGCTCGCCGGCATGAAAAGTG:1 - chr3R 14139369 3' - hopper 14 1 65.35 AGAATGTTTTTTTTTTTGTTTTTTGAATGGATAAGCTTCCTGGCCCCGTCCAATGGGATCATTTAATTTGCCTCTAATGTGCAGCTGCCCTTT:1 - chr2R 18339229 3' + Tc1 1470 2 70.97 TCCTANTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCAGCCCAGCAACAAACTTACGAGGGCAAAAGCTGCCAGCCAACCTGGCCAACAAGCGGC:1 + chr3L 14340349 3' + Doc 4521 1 67.33 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGGTCAATCAGAAACAGAATCAGCTCC:1 - chr2L 18662334 3' + hopper 1365 1 73.27 GAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGCAACTCGGTTTAAAGTCAATGGAATCCATCAATAATTCCATCT:1 + chr2R 18541575 3' - 297 6798 2 57.00 CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGTATTGACCACACTTCGCTATGCTAGTCGTGCTAAGAATATCCAAAATCGCATGCACATCAATGAGG:1 - chr3L 5358174 3' - Stalker4 7205 4 59.41 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTTGCTTCCTAATGAGATTTGCTTAATTAAAATGAAATTCAATAACTGGAATTCCAATGAATTTA:1 + chr2L 15019641 3' - jockey 4716 1 69.70 CCATGTCAGCACGGTTTTATGAGACGCAGATCAACAACCACTCACGTTTTGGAGCCAGAGCAGCGTCGCAATAAGATGAACAATATATTGCGTGTAATTTC:1 + chr2R 16789497 3' + Q-element 202 2 54.46 ATGAAAGTTAGAGATTTTATTAAGTAAACAATTTTAAGGACAAAAATATATATATCACATTTTTTAACAATAAACATTTTAAAAATTATACATTCGTTTTC:1 + chr2L 18698610 3' - gypsy7 420 1 77.23 GCTCTGGAAAGTGTTCCGTCAAAATAAGTTACGTTCTGAAAGTTCCGCCGGCTTTCCGCCAAGTAATTAGCTCGTCAAGGGGCCTGACATTCAACTTGAAC:1 - chr3R 23517749 3' - mariner2 509 1 62.38 CCTACCCTACCTATGTCCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCCAATGGCCCCTTAGGTGCCCTATGTGCGGGGGTGGACGAATCATTTCTGCTGCATTCAGTG:1 + chr3R 6982121 3' - Gypsy12A_LTR 1949 1 68.32 GCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCG:1 - chr3R 13339042 3' - BS 5030 1 55.45 AGTGTGGGGAACAGCGTCTAAGACTTAGCTCAATACGCTAAGAGTAATACATTCGCCGCAGCACTGCTGTTCACCGATCGGGTCAGATCCACTGGGCAGAC:1 + chr3R 21554769 3' + G5A 2445 1 54.46 AGTCCAGTTTCCGACTGCGCCAGTTACAATATGATGGTAGCGATACCAGTTTTCTTGGCGTATAATACTTTGAGGACTTAAGCTTATTATATTCCTGAGGC:1 - chr3R 7105016 3' - gypsy5 430 1 53.47 AAGAGNATTCCTTGCCAATTGGCTTTCTGTACGACGACGATGATCCTGCGGACAAATCCACCGTTCCGGACGCCTGAGTATTATGTAGCGGCGTCGCAGGA:1 - chr3R 18674146 3' + TART-B 234 2 24.75 GCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGATCCATTTTGTACTTCTGGACAATGTCCTGCACCTTGAGTCGTCGTCGCACATGAGGCGGT:1 - chrX 10229589 3' + P-element 2761 1 65.35 TCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCTGATGCTGCTCCTCGTCGCTGTGGTTTCCGGCTGTGGCCGGGGACCCGTCA:1 + chr2L 20664098 3' + HMS-Beagle2 7013 2 55.45 TTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGGCAAAAATTCCCCCCAAACGTTGCCAGGACGTTACCTTGTGGACCCCGGTCCATGCGGGTTTTCTTGCAGGGCTTTC:1 + chr2L 21148071 3' + HB 1227 1 73.27 TAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGAAAGCCATAGAAATTGGCGGATGCGATTACATCACTAGAGCTC:1 + chr3R 9520312 3' + 412 7104 2 61.46 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTCGATATGTGGTAGAATTTTCTTGTTGTATTC:1 + chrX 5178443 3' - hobo 46 1 69.31 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAG:1 + chrX 8299743 3' + roo 9038 1 61.39 AAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTCTTTACGTTATGATGTCGGCGCGAGCATTAAAACTATGTGCATA:1 + chr2R 11027561 3' - 17.6 7030 2 70.30 CCTTTATATTTTTGCATCGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGACAAACTGTATATACATGCATTGCTTGTGTGCTCCGA:1 - chr3R 2474633 3' + S2 1664 1 75.25 TTATTTATTTATGCAATGCAACTAAATGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGACGTTAGACGCCGTCTGAGT:1 + chr3L 11696426 3' - blood 7069 2 78.22 CACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCATCCACCTGTCCTCTTTGAACGTGGAGGCCAATCCCAAGGATCTGTACGTCAAGGGCGGCAG:1 + chr3L 20496229 3' + G6 1689 1 61.39 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTATATGGCAGCGTCTCCCAGCTGAAAGA:1 + chr2R 5968835 3' - flea 43 2 75.25 CCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATATAAAGAGCGAGGGCGAGCCGGCTATATAGATTCGGAAATTTACGAGCCAGAACTA:1 - chr3L 14586733 3' + F-element 4409 1 59.41 AACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCAAGAAGCAGAAAACAGAGCACATAGTTGCAGAGGATGATGAGGAGCAGGACACGGAGTTGGAGG:1 + chr3R 24923119 3' - Stalker 424 1 70.30 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGCCAAAAGGATAATGGATTGCTGATG:1 + chr3L 17759400 3' - jockey 4847 1 79.00 ACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCACACCCAATCCCAAAGCACTTGACATGAAATAGGCGTTCTTGGTTTATATTTTGATTGTC:1 - chr3R 22317024 3' + Ivk 5013 1 57.43 CTTCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGAAATGCGGCAAATGCCGCCTGTTTGCCTTGCCACTGAGTGCAAATCTGGGC:1 + chrX 1548563 3' + roo 396 1 61.80 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACTGACACACAGATATCCTTGCAG:1 + chr3R 24545613 3' + roo 355 2 78.22 TAATTAATTAATCAATTAATTTCAATACATATACAAAATAAGTTTGTTTTTTTTTCACTGTATTTGCAAAGGACAGTTTCAATAACATATAAATTTAAGTA:1 + chr2L 3923013 3' + TAHRE 58 1 71.29 TGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATGTGCACCTAGGCAAAACGTAAAATGTACGCGTCGATTTTTTTTATTGACAAAGGCACTGTTTCTTTGAGTTGTGG:1 + chr3L 13074964 3' - HB 7 1 73.27 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTGTGTAATG:1 + chr2R 8198515 3' - F-element 55 1 68.32 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAA:1 + chr3L 24208196 3' - Quasimodo 28 2 62.38 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCA:1 - chr3L 22052777 3' + mdg1 379 2 67.33 TTATAAATATTGGTATTAATTATTAATCAACCTGAAAATATGAGTTTCTAAAGACTTAAATAATGACTCCACATTTATATATTCCAGTTCTTGGCGATTAT:1 + chr2L 8960562 3' + Gypsy12A_LTR 1812 1 68.32 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGTTCAAATAGTTGTAAAT:1 + chrX 13560792 3' + roo 386 2 56.44 GACCANAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTATATTATTTTAAATCGAACTAAGTTCAAAATTGCATTCGAGAACTGCTACGACATA:1 + chrX 3697193 3' - jockey 4696 1 57.43 CTATTGCCGAATTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGGCCTTAAACATGGTCAAAATTAATAACTCCACATATTTTTTATG:1 - chr3L 24351136 3' + rooA 125 2 67.33 ATTCAGCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTTCTTGTTGATTCAATCCCAAT:1 - chr2L 1629598 3' - hopper 53 1 77.23 TATTAATTTTATTTTTTCAAAAAAGTTTTCC:1 + chr2R 21982676 3' - Tc3 1564 1 61.29 CCTGAAATCTCGACTTTCATACGGACATAACCAGATCGACTTGGCTATTAGACTAACGAGGATTTCCTACTGCTCCTGCGCCGTCTCTCCTCACAAGTGGA:1 - chrX 480913 3' - INE-1 137 1 59.41 TCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATACATTATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACAGAAGAGAAACACATAACTTGTATATACTCATAAAAAAAAAA:1 + chr3R 2971876 3' - accord2 7547 2 68.32 ACAGTNACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGGTTATTTAACGAGCTTGCAGGAAATTGTTTGTCAGGACAGCTATGACCCCATAGAAATCAGATGACTT:1 - chr2R 5616530 3' + 3S18 6096 2 70.30 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATGAGAACGTGGCTGAGATATGCGCTAGAAATAACAAAAACTTACCCTGAAAAATATGGGCGGG:1 - chr2R 11257834 3' + pogo 2090 1 65.35 CGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCACTCACTCTCTCTATCTCTCTCTCACCAGCTCTGTCTGCCGCAATGTAGCTGTCTCTTTCTGATTTCTGGGAT:1 - chr2R 20919898 3' + blood 146 2 62.38 TGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTAGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGGTCATATTGGTTTTAAACTCTAGTTTTGGGATCTGAT:1 + chr2L 20614397 3' - Porto1 4315 1 78.22 TGTACATAATATGTATGTATATAAGGTTACGAAATCATCCTTTGGTTTTGTAGAGGTAATATTTGCATTTGATTTTCCCAAACTCTCTTATAATAAAAATG:1 + chr3R 19936635 3' + Dm88 4372 2 51.49 TTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTATACCACAATCCACAAAAGTGTAGTGCACAATTTAAATTAAAACGGAAAGGAAAACGGCGCCCAGGGGCATTCAT:1 - chr2R 18319600 3' + mdg1 273 2 40.59 CTCCCCCCGTTGGAAGAGTGGCTTTCAATAGAATCCTAAGAAGCAGGAGCAGGAGTGCAAACACAAAACGACAGCGGCGGCAAAAACTGCGCCATGTTTAC:1 - chr3L 7174649 3' - diver2 4509 1 63.37 TAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCACATCGACACCGA:1 - chr2L 19845884 3' - F-element 23 1 58.42 TTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTCAGTATATTCGTGGCGACGTTTGAGGCTTTTCTGCAGTTTCGTTATGGTTGTGGC:1 - chrX 5941417 3' + Cr1a 4006 1 62.38 GAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTAATTTCAATGAAATCATGTTGAGTAATTGGTGCTGCTGCTGTTGCTGAATT:1 - chr2L 5445800 3' - mdg1 7367 2 51.49 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCTATATCCCCCACT:1 + chr2L 12843421 3' - roo 8674 2 67.33 GAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAA:1 - chr2R 5617504 3' + invader1 3988 2 54.46 TATGCAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCCAAGTTGCCCTCTGTCCACTCGCCGAGAACTGAAAAATGGCAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr2R 15138076 3' - 1360 3337 1 58.54 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAAAAAGGGAATTCTTTTGATATAGAATTGAATGGCATCGGCTTTTGCTCCATTCATT:1 - chr3L 19247365 3' - pogo 17 1 63.37 GAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATACGCTAAGGGGAGAGTGACCAATATTTTTTATCTAATTTCGGAAATCAAATATTACA:2 - chrX 22689310 3' - HMS-Beagle 20 2 59.41 TTCCTTCTTTCCTTTTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAATTTTAACCTACACAAAAAAAGGAAAAAAACGAGTGA:1 + chr2L 19178202 3' + copia 121 2 62.38 TGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCGCTTCAGCAGCTCCAAGTGGGTGGGTATGGGAAAGTCTGGGG:1 + chr2L 19930833 3' + Tirant 342 2 58.42 CTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGCACTATGGGGCATTCGGCCTGTTTTCGAGGTTCCGAATTTTCTGTCGCAGTTGTAGCTTGCAATATCGA:1 - chr3R 3617243 3' - 1360 94 1 56.44 CATTCGACCCATGCCGAGAGTCTGCCAGGCTGGGGGACCGGTCTACGTGCCTCCCGAGGAGGTGAACGAGTCGAGCGAGCTGTACTTCCCGGACAACTTTG:1 - chr2L 1016869 3' + baggins 228 1 64.36 TCGAACAACGGATCAATGCGAACTAATTAAATGAGATGTGGCAACGGCCTGTCAGCGGCCCCATCCAC:1 - chr2R 9009113 3' - Tc1-2 238 1 54.41 CTAACAGTTACTATTGCAACTGATATGAGTTTGTGTGGCCCGGAAGTAGACAAACCGGATCTTCTTAAGGGTTCCATTGGCTCCCTTAAGAATCTAGGTTT:1 - chr3R 4497343 3' - Fw2 3861 1 75.25 ACGCATCTGGATGCTCCACGTTTCATAGGATCCATCCTCCAGCTTATCGATCTGATACAGGTTACTCATTCCGGCAATCTGCTCCGTGGGAAATCGTCATG:1 + chr2L 20296718 3' - 1731 478 1 79.21 AGGATATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGGGATGGGGGGTGCTGGCACCGGGGCGAATTTGTCCTGCAAATGGTCGCCTGTTTTTGGTCACGGCAC:1 + chr3R 13479109 3' - 3S18 370 2 57.43 GTCAGCAGACTTAAAAGATCTCGTACCGAGTTCAGAGACTTATCAAGAGCACATCATGATCACGATTGTAAA:1 - chr3R 16102530 3' + G4 3678 1 62.50 GTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCGGGCAGTTCGTGCTGGTGTGCGTGTGTGTTTCAATCAAAATCAACAAGAGCATAGCCGAAAAAACTTTCAACCAAAG:1 - chr2R 22354515 3' + invader4 2747 1 68.69 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGTGCGAACTGAAGGTGTCTATTGTATTATTTACGTCTGCATTGCAAAGCT:1 + chr2L 12843409 3' - roo 22 2 55.45 GCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGAAGTCAAGCTGGTCGAGGTGACCTCCAACATTTGGGGAACCAAGTTCAAGATC:1 + chr3R 27631324 3' + Bica 4893 1 54.46 TAACGCCATACGATTTTGTGGCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGAAGGAAGAACTATTACTTGCTTTGGGCCAAGAAAAGCAATCGATTTTAGG:1 - chr3R 4377023 3' + 1360 27 1 50.00 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCCGTACAATCCAGTGCCTGTTGGTATACATATGAAT:1 + chr2R 5910914 3' - hobo 41 1 65.00 TACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATACACAATAAAATGAATATTCTTTCAAAAGTGTCACTTTAATTCGTT:1 + chr3R 5775740 3' + invader4 3052 2 60.40 GTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGGGGAATACCTTTCGGCTTTGATTGTGTGCGTGCGCGACCGCCCTCCCGTCCACACAAGT:1 - chr3L 21014542 3' - Bica 4893 1 57.43 GAAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAACAATATTCGATCCGCGACAATGATAGATAGAATAGTTGGTGAGGAACCGGAGCCGCTGTCACTTGTGTCAA:1 - chr3R 14204719 3' - aurora-element 4073 1 66.34 GTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 4925 1 53.47 AGTAACAGGTATCTGATATTCGATGCTTTTGCCCAATGGCTTTCAATTAATCAGCTGGAAATTAAATAATTAAATGACCATATCATTTTGCGATTGCTTTT:1 - chr3R 7257697 3' + INE-1 550 1 73.27 GTACTTAGGCTATTTTAGACTTATAGTTTATAACAAATTATACAAAAACTCGTTTAAGGAATATTATAATAAGTAGCTTTAAAATTAGGCAAACAGCGAAC:1 + chr2L 4797039 3' - S2 1477 1 66.34 CTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTGAGGCGAGCTTTTTCGCTTTCGGCTCTTTAAAGCTTGGCCGGCTTCTTTCCTT:1 - chr3L 20731867 3' - Doc2-element 4592 1 59.41 TATAATATCATTAGGTATTTAATTTTAGCACAACGCATTGTTTGCCATTTTTACATTAGATACATTTTTAAAAAATGCTTTTGATTGAAATTATTATAACA:1 - chr2L 4413875 3' - HB 1535 1 78.22 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACGAAGTGTTGAGCCGAACCCGAATGCAGGGCGCTGAGAAACACCTGGCACACAGCACAGCCACTGAGAGCGA:1 + chr2L 8032227 3' - P-element 5 2 42.57 AACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACAT:1 - chr2R 6438367 3' + Stalker4 7313 4 75.25 CATAGAATGGCTTAGGATATAAGACATAAATTCAAGTATTCCATATGAACCCCAATTTCGGTTAAGTTATTCATTCCAGCTTGCGACACATAACAAATGCG:1 + chr3L 10452928 3' + Quasimodo 88 2 67.33 TGTGTACATTCCTGATCTATTCCTGATTCATAACTGAACAGATTCGGTTGAACTTAACCACGGCGAGGGCTTGTCTACAACACAGATACACAGCTACTACA:1 + chr3R 11894186 3' - mdg1 7366 2 65.35 TATTCAATTATTCAATTATTATCCATTAATGTTATAGTTGTATGGAAAAAATAACATACATTCTCCCTTACAACATTTTAGTAATTATTTTATAGGTAGCA:1 + chr3L 20667945 3' + rover 412 1 58.42 TCTGANAACCATCACTGGGGCACCGTTGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGACTTGAGGTACTTGGGACAAACACATTTGTTCTTCTTGAATTTGGGC:1 - chr2L 14333718 3' + F-element 4342 1 53.47 CGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCTGTAAGATTCATTTTTTATATTGCATCACTCTTTTCCAAAGGATCCAAAGAAGA:1 - chrX 4353798 3' + Gypsy6A_LTR 98 1 68.32 GTGTATATGTGTGTGTGTGTTTGCGTTTGGGCCATGCGTCAGGCACCTGAGTATTTCATTTTTTCCATGCTGAATGCTCCCGTTTTTATTGGTCTGACAGA:1 + chr2L 13063619 3' - accord 7033 2 89.11 AAGCTGAATACTCTAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTTTCGAATCAAGGTGAGTGCTGTGAGTATTGTGCGC:1 - chr3R 10105045 3' - 1360 407 1 51.49 TTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATACATACATATCTATTGTTTGT:1 + chr2R 21238249 3' - opus 7277 2 79.21 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGCACATTAAATTACAGTTTTCAGAGCCAAGAACAAACAATCGA:1 - chr3R 27619205 3' + hobo 2906 1 64.36 AAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAATTCCCGTGAGTTAATAAAAAACAAAAAAAAATGGAAACCATGTTGCCAGCGGCCACGTAGAAGGCATAACT:1 - chrX 6422793 3' + HMS-Beagle 351 1 61.39 TATCAGGCACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATGCAAACGCGAAATTTCATTATTTTTCCGGGATATCGAACTACGGTGTAATGCGAGTTAAATAAAGTTCA:1 + chr2R 5266950 3' - INE-1 546 1 59.41 GATATATTGACTTAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTC:1 + chr3R 8480471 3' - transib2 39 1 62.38 AGAAAATAAAATAAAATAACATAAAATAAAATAAGTAGAAAACGCCGTGGAGAGGATGGAGCAGCAGGAGTGTAATGGATATTTATGCGCCGCATTTAACA:1 + chr2R 12499248 3' - transib1 1900 1 52.48 ATTATGGCGCGTCAGCATTGTTTATGCGAGGCTACTTAGTTGCTAAGGGAATATGACGATCCGATCCGCATACAAAAGTTGCAAGTGGTGTGTGTATCGTG:1 + chr2L 4299008 3' - gypsy 7039 2 56.44 CGTGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTTAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAGTGTGGAGAAGAAAAAATCCCTCGT:1 - chr2L 8627478 3' + transib2 2586 1 68.32 ATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGTGTGCGTGAGCGAATTGTTACGCATACAAGCGGACCATTCCATTT:1 - chr3L 18963103 3' - copia 4835 1 55.45 CCGAAAATGTAATTTGCCACAAATTGTCACTATATATTTAATGCAAATAAACATAAATTCTAGCACTTAATTATAAACAGACCTCCGGGCCTGCGCTCATT:1 - chr3R 30770816 3' + TART-A 13317 1 67.33 GAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCTTGATGTTCACAGGGCTCGA:1 - chr3L 17186034 3' + P-element 267 1 53.33 GCTGGATGCGCGCCACTTGCAACAAATAGCCCTGGTGGAAGCCCGGATCTCCGGGCGGACGGTGCATCATATGCGCCTGGCTGTCCATCATGTAGCCCATG:1 + chr3R 10511473 3' - HeT-A 5640 1 75.25 CAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAAGAAAAACAAGGAAAAACGAAAAAGTTGGGCAGGAAAAACGAGGCGTTGCCA:1 + chr3L 12034809 3' - copia 150 2 68.13 AGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGATGCCTCCAAAGTTGGTCAATTGCTGCAGCAGGCGGATGTGGATATTGTGGCAGCCACAAAAGCAGAGATGC:1 + chr2L 16282225 3' - Idefix 184 1 72.00 GATTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTATAAATAATAAGTAATGGAAGTATGCTTCTAGATGTGAAAATAGATTAGGCATAGGAAACTCTTA:1 + chr2L 6645143 3' + hobo 304 1 69.31 GGAACCATAGGTCCAGGTTGGTTGTGGATGAAGTTCCAGAGGAAGTCGAGCCGGAGGAAGTCGAGCCCGAGGAAGTCGAGCCAGAGGAAGTCGAGCCG:1 + chr3L 20204788 3' - Fw2 3541 1 79.59 GCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTACACAAAATAAAATAACATTTGAAATTATGATATCTATATTCGAAAAACAAAATTA:1 - chrX 21668527 3' + Bari1 1687 1 59.41 AGCTACGTGGAAAGTTTCGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGCCTCGCAGTCATCTACATGCTACTTTGTTG:1 + chr3L 14497575 3' - Quasimodo 7100 2 61.90 CTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGTTTTGTCTAAGACATTAGTTTAACCTCTAGGTAAAATGCACTCAAG:1 + chr3R 5169657 3' - HMS-Beagle2 6837 1 54.46 TATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGTTTTTGGTCCGAAAGCAATAATATTTCAGCTTTTGTTATAGGTTTTCCTCGGCTCTCTCGCTTTCGGATCGTAGCT:1 - chr3L 13589714 3' - I-element 5118 1 81.19 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTGGCCAGAAGTG:1 - chr2R 11129261 3' - hopper 20 1 59.41 TTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATTCGTTATATATGGAAAATTGCCTAGCCTACCGTGACTCTATTGCCTGCCTGTTGATATTTCCCCCG:1 + chr2R 12439584 3' + Stalker4 7025 4 73.47 GAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGA:1 + chr3L 10464681 3' + invader3 227 2 79.21 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAATTTGGTTTTACAAAGAATCTGTGAAATAAATC:1 + chr3L 25798504 3' - blood 7055 2 67.33 TTTCGTGCGCGAATATGGACGACCATGTTTATTATCACTAAAAATACAAATTACTTGCTCTCAGATGTTTGTGTTTTATAGTTTACATTGTACAATTTGAA:1 - chr3R 9042262 3' + Helitron 144 1 70.30 TTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAAGACTGATGCTTCAATTCTGTCCCAAAAGTTTTTCAAAGCCCATTGAGTTTATTCACACAGTGGGCCACACAAAA:1 + chr2R 21710933 3' + Bari1 1485 1 77.23 TTCGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCGGCAATATTGGGCGGCCAGTTGACATAGT:1 - chrX 7851083 3' - 297 220 2 69.31 AGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCACCTGGAAGCTGGCTAAAAAGT:1 + chr2L 16092729 3' + Quasimodo 6974 2 79.21 ACACAGCTTGTTCACTGCCCGCATTATTACTCCTCAATTTACTTGGCATTACCTTGGGCTTGTCTTTGGCTTTGGGCGGCAACTTGATTGGAACTG:1 + chr3L 18968894 3' - diver2 4459 1 52.08 GTCCATCTTCTCCAAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGGTTATTGCAGACAGGAAAAGGTGACTTAAATAAGGCACACACAAAGTGAAAGGTTCAGCGCAA:1 - chr2L 13887956 3' - G6 306 1 74.26 TATCGTGAAAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCCTTTCTTGATGGTTTCAGAATCGAGCAGGACCAGTTGGACGAACCGATTGCGTTCGAGGACTCCGA:1 + chr2L 2671233 3' - gypsy7 5275 2 66.34 AACTAAATTTGATATGCTTAAAGAATTGCAGTTTTCATTATGGGTCGATGGAAATTGCGTTAGAACTTGGTGACTAAAATGGGCCAGACATCATGA:1 + chr2R 13066130 3' - jockey 4942 1 60.42 CACCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGAATAATATATTACACATTAAGTAAAATACTAAAATACTTCTAATATATAGATAGCTTATGCCAATATATGTTTGG:1 + chr3R 11903142 3' + G5 4656 1 61.39 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAGTGTACTAACAATGCACCACTATGTATCCATATATATGTACATA:1 + chr3R 11731240 3' + hopper 1381 1 60.40 CGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCGTTAGTGTGATGGCCCCGCTTGCCTTACCATGCCCTTCCGGATCGTCGGGGCGTTTTGGGCGTTGT:1 + chr2L 12814176 3' + Rt1b 5032 1 67.33 AAACTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAGGTGAGAGAAAAGAAAT:1 + chrX 8299759 3' + roo 391 2 60.40 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCCATTTGTTTGACCA:1 + chr2L 6605631 3' + blood 349 2 53.47 TACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATACAGATCAGCAAAGTACAGCTAAAGACTCGTAGCTTATTAAGAGCAGAATAGGGAGTTTA:1 - chr3L 25345634 3' - Quasimodo 7159 2 55.45 TCATATTTAAAATACGTACGTGAAATTTCAAGTAAATCGGACCACGCCTGTACCCCCCAATTAGGCTGGGCTATGCGATCCCAGGAGATTGAGTCCTTGAA:1 + chr3L 8430891 3' - transib3 2779 1 58.42 CCTTACCTTCAACTAACTCGAAAAACAAGCTTTTTTCTCGCGCTCTCTCTAGTACTGTCGCACCAAAGACCCTCTAGTGTCTTTGGTCGCACCTACACCTT:1 + chr3L 25118801 3' + Doc 331 1 38.61 TCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAATAGTTTTCTTCGATTGAGGACAATATGTTATGTTAGATTATATGTTTTGT:1 + chr2L 20327345 3' + roo 8967 2 58.42 TGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAA:1 + chr3L 25232904 3' - GATE 35 2 51.55 GAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGCCCGGCCACTCCATCGATTCGTGATTTTTACGAGCGCAATGTGGTCGAAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGGAG:1 + chrX 18897080 3' - F-element 327 1 66.34 CATAGTACATATGTACATACATATATCCCGAGAACAAACCAATGGAGTCACAACTAATGAGGCCATCTGAGTGGCTGAGAAAAGTGATACTCGGAGATGAT:1 + chrX 3191316 3' + 412 222 2 61.39 TGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAAAAATCGGTCACTTGTGAAATATTT:1 - chr3L 21637315 3' + Bari1 1697 1 65.35 CCCTTGTGATACCTACTGGCGTGGCGGCCAAGTCTCTATTTTAAGCGAGAGTAAATCGCAAAGAAAGGATTCAGTGCGGGTTGAGGTCGTAAA:1 + chr2L 17184485 3' - baggins 8 1 59.14 AAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCATGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATGTTGGCCGTCACTAAAAGGGTCAGACCCGCCAGAAATGGG:1 - chr3R 13461273 3' + 1360 3268 1 75.25 GATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGCCAGAAAAGATAAAAGCAGCGAGTGCAACACATTCGCATTGCAATTGATTGTGCTGTACGTACATGGG:1 + chr3L 17564066 3' + P-element 285 1 62.11 CGCCANACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCCACTAGCCGCCCATTCGCATCCCCGTTGGGATGCTG:1 - chr2R 8554978 3' + hobo 320 1 63.37 TGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATAAAGGAGGAAAAAGGAGCAGGGCGGAAAAGCGAAGG:1 - chr3L 11477471 3' - Quasimodo 36 2 65.35 GCGAGAAGATATAGAAGCGATATAAACAGCAGTAGGATCCCCGCCAGTTCGTGCCTGGCTACATTTACATAAGAGTGCGCTTATGGCCCCCCAAAAACCCC:1 + chr3R 28662755 3' - Cr1a 4368 1 79.21 ACTTATCCTTTTTCCCCAGCTTTCAATCCGGCTTCAGACAGCTCTCCTGATCGACCTCCAGTTGGCGAACGAACCTGCGAAAAAAAAGAATTAGTACGTTG:1 - chr3R 29104123 3' - Transib5 2502 1 76.24 TGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATAAAACAAAGTGCTGTCTACAAATAATTTGAGTTATTCGTGCAGAACAAATCGTACGTCATTTGT:1 - chr3L 18318331 3' + R1A1-element 4990 1 65.35 TTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTGGCGTATGAGTAATGTCCGTGTGTTTTCGGTTGACAGTTTGTCTCGCTGGTTAAACGTAAAGA:1 - chr2R 23030475 3' + INE-1 90 1 70.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTTATTTGGGATTTTACACCAACAATGCAGCAAGGCCAGCG:1 + chr3R 16372451 3' + roo 9015 2 76.24 CTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGGGAGGCGGCGGTGGCCAGAGAGGCGATGGTTT:1 + chr2R 18865942 3' + roo 409 1 75.25 GACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACGTAAGTCGATGGAGCAACTACTGCTCTTAGTC:1 - chr3R 30355902 3' + ZAM 8029 2 68.32 AAAGGGGCCCCAAAACACGACAACAACTCATGGCTGCGATAGTCGAAGAGTGGGCAGATCCCTCCATAACATGAAGAATATAAATAACGAAAGAGGATTGA:1 - chr3R 11899885 3' + S-element 1287 1 58.42 GTGTGTGTGTGTGTTGTTTTGTGGGTGTTTTTGCCTCGCCCCGCTTTCGGGCTTTCCCTGTGTGCGTGTGTCCGTTTGGGTGTGTCGCATTAATGTTAATT:1 + chr3R 26536911 3' - gypsy3 418 1 58.42 CGCCANACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTAACAAATACGCTCATGGAAAATCGGGGTTTTTTAAGACATTCAAGCACACATGTTTCCAAAGTCATTTCCT:1 - chrX 20892225 3' + hobo 320 1 33.66 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATGCCAAATTATCTGACAAATGTT:1 - chrX 2874825 3' - 1360 53 1 78.22 CAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTTGCTGTGGTTGGTACCCGAGTTAACCCACGTAAATGTGGCTGTACTCCAAAGTCTT:1 + chr3L 20928028 3' + R1A1-element 4963 1 59.41 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATTTTAAAGGTAGCATAAACTCCAACGCCTCGACCATCGCATTC:1 + chr3L 2978979 3' - hobo 33 1 58.00 TAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTATAAGAAAGCATTTCCAACCCTATAAATTATATATATTCAGGATTAATAGCCAAGTCTATCTGGCCATGTCCG:1 + chr3R 6032188 3' + INE-1 13 1 77.23 TAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATACGTATTTAATGCTACGAAATTCGAATGATTATTATAAATTATATGAATTGTTAGTACGC:1 - chrX 12801431 3' + Burdock 6376 2 57.43 GGTTAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTCAATCTTCTTCTCACTTTATCTCAGTTTATTTATTTTGGAGCCGCGAGTCCTGCACTCCACGTATGTGTG:1 - chr3L 17293377 3' - jockey2 3186 1 60.40 GTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACACGCAATCCCAAAAAACAAAAGTCTGGTTCCCCAAGCGGATGCTTGTGACTAGTAAGCATATTTCG:1 - chr2R 2363220 3' + Idefix 242 2 53.19 CTATCAACCTTCCACATAACTATATAAATCATCAAAATTATGTCTTTCATGTTTAAAAAAAAGACAATCCAAAATTTAGTTGATTGTCGGCGACAATTGTC:1 + chr2R 6085891 3' + Transpac 310 1 51.49 GGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAAT:1 + chr3L 25232905 3' - GATE 8273 2 50.50 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATCCTGGGCGAACTGCATGTTAACGTAGATTTTAACGAATGTTGACAATTAAGAAAAAT:1 + chr3R 24484863 3' - accord 7031 3 71.43 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAGTCTTCAAAGAGATCTCGACCGAGCAACAAGTGAACGGAAGAAT:1 - chr2R 8145933 3' - P-element 31 1 48.51 ACATTTCTATCGATTTGCCAAAATTCGGTTTGCCACACCCGCTCTAACGCCCAAGAACTTCCAAAAACCGATGGTTGATGCCAATGGCCGAGAAAGCGGAG:1 - chrX 13570531 3' + INE-1 308 1 67.33 CAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATAAAGGGATATATTGTACATACATGTCTGTTTATCCAAGAGCA:1 - chr3R 18860336 3' - R1A1-element 5037 1 59.41 TGGGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTATGGTGGGTGAACTGAACCCCCGTAAAACCCAAGTTTTATCTCTT:1 - chr3L 25515567 3' - G-element 4249 1 60.40 GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTACACACTCTAAAAGGCTGTAGGG:1 + chr2L 18568129 3' - I-element 16 1 63.37 CATCCTACCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCTCTGCTGTTGTGGCTTTCTAGTGCGGCAACTTAATTAAGAATA:1 - chr3L 5205775 3' - Tirant 416 4 57.14 AGACGCGATATAGAAAAGAGAACTGAACCAAACCGAACAGAAACAGAGAAACCCAAACAGAAGCCGAGCGACACAGTTAAAGGATTAAAATTTGCATTTTT:1 - chr3L 5735041 3' - Cr1a 4356 1 65.35 ATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACATTCAAACGTACACCGCCAAAGAACCAAAACACAAACACCCCCACTGCCGA:1 + chr2R 999952 3' + 1360 3185 1 55.45 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAAGCAAATTACCAGATAGCATTG:1 - chr3L 18413604 3' - jockey 4759 1 75.25 AAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGAACGATTGAAAGCAAGCGTGCGAAAATAAAAA:1 + chr3L 22525272 3' - Cr1a 68 1 70.30 CCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCCTGGTGACGTCGCTTTCCACAGGGGCGTTTGAATG:1 + chr3L 4139300 3' + Ivk 5006 1 65.35 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCTTTTCGGACCAAAACTAAACCCAAAAGAGACGCTGAAGAA:1 + chr3L 63049 3' - 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rover 6956 2 75.25 CCTCCTCCCCTCCTTCCCTACTCCGGGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAATCTGTCCGCTACCGAATTGGCCACATCCGCTTAATAG:1 - chr2R 22135853 3' + G-element 290 1 63.37 TTTGAGTGATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGACGTAATAATTAGTTGGTTGTTAGTCAAGGGATGAGTCGTACAATAAAGGAATAGAAA:1 + chr3L 1659619 3' + baggins 5381 1 65.35 CCAACGTAAAGTCCCGAAATGATTAATATTTTCTAAAAAGTGTGTTTAGAATCGCGATAGTCGATCCAAATGGGCAATAATACCTGATTGGGCTGCTATTG:1 - chr2R 10079210 3' + HB 240 1 61.39 AATTTTGATTTTGCTCTGCGACTTTTGTCTGTCGTTCGCGTTTATTTGCCACATAAAGAGAATCCCTCAATTTGCAATTACTTTTTGTTCTCCATTACATG:1 - chrX 9392042 3' - HMS-Beagle 319 1 55.45 TTTATTTTTATAATGTAGGTACATGTTTAAAGTTTTTATTTAGATTTCTTTTTCCATAAACCGATTTCTTTTAATAATGGCAATAAGCAAAATAATTATTG:1 - chr2R 5183049 3' - mariner2 820 1 77.23 TTGTAGGCCGAAGTAGTCAGTCGTAGCAGTTTGCTCTTCATGCTTATATGAACACCCACTTTCACCTGCTGCTTGACTGCCCCTTGCTGAAATTTAAAATG:1 + chr3R 14972774 3' + diver2 4590 2 73.27 TTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTGCGTTGGATGGACCTTGGGTTGCCAAAAAGTGTTGCTGCC:1 - chr2R 25248377 3' - 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chrX 5082827 3' - jockey 255 1 67.33 CACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACAC:1 - chr3L 5691245 3' - P-element 198 1 38.61 ATTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGGCCGCCTTTTGTGGCAGCCATTGCTTCACTGGAATAAATATTCAAATTGTATGTAA:1 - chr3R 22343456 3' - X-element 370 1 57.14 TTTTGAGTGTTGTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAACTCCGACGTCTGGTTTACGTTTTCAAATGACCCTTTCGGGTAGCTGCCAAAATTCTAGATGTA:1 - chr2R 3503883 3' - Porto1 4196 1 68.32 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTT:1 + chr3L 25341890 3' - 297 6622 2 71.29 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCAGCTATGTGAAACCGGGTTTTTGGGGTTGGTATTCAATATAAGGTTAGGAAGTCGGACCTGGGAACGTCT:1 + chr3R 3843164 3' - Max-element 8243 2 71.29 CGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATCGCACAATATATTGACAAGAAGAGAGGG:1 + chrX 8802167 3' - Doc 4424 1 72.28 TACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTATACAAAAAATACTGGTAGAGAAAAAAGTAGTGAG:1 - chr2L 14398736 3' + Doc2-element 360 1 69.31 AGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGAAAAACAAAACTCCAACGCCGCTCTACTCGTGCTGGGTACGTCGTCAGAC:1 - chr3R 8567513 3' + F-element 496 1 59.41 CAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAG:2 - chr3L 27415205 3' + transib2 2817 1 72.28 GGATCGATAGTCGAGTCGATCTAGCCACGTTCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCAGGAACTATATGACATAAGTTCTATAATAATTAAAACATGCA:1 + chr2R 4410765 3' + INE-1 97 1 64.36 AGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCCAATCGATGTCGTAAACGGTTAGACTTCCCGGTAATTGGATCTCAATGTCCTCGC:1 - chr3R 23847399 3' + flea 4771 2 53.47 ACATGACGTAAACCGATTTCTGGCGTTTGCCGTGACTTTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGCAATTTCATCTGTTTTTATTTTCGGGTTTTCGAATG:1 - chr2L 16121498 3' - mariner2 730 1 73.27 AATACNTTAATTTGCGAGACGCTATCAACAACAACGCCGACGTCGCCGAAATCGTGGAAGAGGCAGTATTACTGTTATTAGGGTTTGATAACCACCCTGCA:1 + chr4 460529 3' + Helitron 14 1 54.46 AAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCCCAATGCAAGTTCCCCAACGAATTCCCAATCCATTCGCATGGCCAGTACCCAAATAAAC:1 + chr2L 20339744 3' + I-element 140 1 65.59 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGCCTCTTTATTCCACTGACTTATTCGCT:3 + chr3L 21908970 3' + roo 390 2 60.40 TAACAGATACCTGTTACTCAGCTGGTTAAAATGCGAACGCGAAATTACATCATCATCGTCATTTTTAAAAAATAGTTGCCAGCCAACTTTCCATATTTTCA:1 - chr3L 13768419 3' - INE-1 546 1 75.25 GTTCCTTAATTATAGTGTATACAAATGTACCGAGGAGAGATTATGCTATATTACGTGTAAGGAGTTCATGGGATTTACCTCAATTGTTGAGTTTTTCAGAC:1 - chr2L 12588030 3' - G5A 2742 1 73.27 AACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACATACATATACGTAGGCGAGTATCTGTGTGTGATTTTTTTCCTTCATTGTTTGTGTTTTGAAATATTGT:1 - chrX 11818356 3' - Circe 7424 2 71.29 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCT:1 + chr3L 63010 3' - roo 46 2 73.27 TGTTAATAATAATTTCAATTGCTCTGCTAGCATTTGAAGTTCTCCGACGTTCAGGGGATGCCGCAGATAGCTTCGATGGCGAACAACTTGCACGGCTTTCG:1 - chr2R 16879356 3' - invader2 434 1 67.33 TTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACCATACACACATATATCGACATACCCCCACATACT:1 - chr2R 13803775 3' + hopper 1043 1 66.34 CAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAGGATCTGCTCCCTGCCGTTGATCAAGATTATTAGC:1 - chr2L 1130464 3' - I-element 485 1 65.35 TTCACACTAGCCGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGGGGAATTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTGTATATTGCAATCAATTTTTCAATAGTGAGTTAAGC:1 - 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chr3L 14920214 3' + Helena 400 1 72.28 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACCAAACACATCGTAAACTTTTTAACTATGACCTTATGGGGTCCTTAAGAAACTGTGG:1 - chr3L 11127926 3' + S-element 1699 1 65.35 CCAAAGTGCAGAGCTTTGCCGGCTATGCTCGAGCTTCCGGCCAATTGAGCCCCGCCTCGGGCACCAAACTCCGCCGAGGGTGGCCGTAAATCCACTAAAAA:1 + chr2L 12674519 3' - gypsy3 65 2 58.42 ATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCACAAATAGCAAGAGGATCCCTATC:1 + chrX 3030942 3' + hopper 54 1 76.24 AATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGCGACGGGAACTGCTGCTGAGCTGGTCGCGATCCGGCGGACTACTGGCCACCTGTTCGCGGGACAAG:1 - chr2R 14854585 3' - F-element 4535 1 58.42 CCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCAAGTTTCTCCATGACCATTAATCTTGCCAAGAAGGTAATTGCTTAGCAATTACCCTTTGC:1 + chr3R 11514029 3' + Max-element 8365 1 67.33 CTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCCTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCCGCTTCTTGTTCGGCTTGCCGTCGATTCCGCTATCGTT:1 + chr2L 1979124 3' - rooA 294 2 66.00 CTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACACCGACGCTTCTCAAAGAGAAAAAATACCCACCTCAGTGA:1 - chr4 1301728 3' - 1731 19 2 41.41 CTATTTAACTGGCGCAGTCGGAAGGATAACTCAAAGATTGCTTGATGCGAAAATATAAAATTAAATAGAAAATGAATTTAGGAATGGTGGTCATCGGAGGA:1 + chr3L 13848609 3' + McClintock 490 1 59.41 TATTTATATTTATGTACATAAATATAAATACTTTAATGTTAAAGGCAATAACATATTTGAGTTCTCAATTACGATTGTTAAACAACTTCATTACGACAAGA:1 - chr3R 6680443 3' - 1360 2954 1 87.13 AGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGT:1 + chr3L 20224205 3' - Chimpo 48 1 71.29 TATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTTGATTGTTGCGTATGCCCCGAACTGGTGGCACCCGTGGATAGATGTTAACTCCGGAG:1 + chr3L 9049205 3' - accord 7181 2 61.39 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATATTTTGGTGTTTCAGCTTTTTTTCTGATTGCCAAT:1 + chrX 12666038 3' + S-element 1682 2 69.31 AAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGTTACACGTAGATTGTCTTTCGAAC:1 - chr3L 1659036 3' + R1A1-element 37 1 76.24 CATGTTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGGGAGGAGGGCACGGGATCGAGGGGCTCACGTGGAGGCTCGCTACACCTGCTACCTGCAACTGAGTGTCCT:1 + chr2L 2718521 3' - G-element 303 1 71.13 AATCGAAATCACGTTCAAATTGAAACACACTTCTTAGCAATCCAGCTTGGAAAG:1 - chrX 19894269 3' - accord2 7241 1 92.59 AACCTCTGCAGCTGCGTGAGGTCCGATCGGGTTGTCTTAGATGTTGTTTTAGAGATTGCCAAAGGAGTGTTAGATAAATGATATAGGTCTGCAAATTTTAA:1 - chr2R 14460961 3' + invader4 2871 2 70.30 AACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAGGGGTATATTGTAAATAATTTTTATATAAAGAATCTTTGGTTGCTAAACTGCAAGAGC:1 - chr3R 13855930 3' + R2-element 3373 1 63.37 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACGGTTTGTCTGTTTCGAGTGCGCTGGCATAGTTGCTATCAAATTTCATGATCACTGCCAATCATTTAATTGCCC:1 - chrX 2090199 3' - roo 4 2 71.29 GGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAAGATCCCGATTTCTCTGCAGTGGTTTCAGTGCAGTAATTCGTCCTGTCCGGATTA:1 - chr3L 24011126 3' + F-element 4358 1 53.47 ACATANTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTACTTTGTGATGTGTAATGTGCTTATCTTAATGGCGAAAAATACTCTTACTTCGACCC:1 + chr3L 21738830 3' + copia 91 2 65.35 TTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATAGCTTCGAAAATCCTGATAACAAGTTCCGTAAACTGGCGTCGTTGGCTAGAGCCAATAATAGATTC:1 + chr3R 22699025 3' - F-element 4419 1 63.37 CTGAANACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGATCCCATTCATCTGGCTGAGCCCAGGACCTTATCTAGTTGTCGAG:1 + chr2L 2674143 3' + G6 1680 1 64.36 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTCAAAGTAATATAGAAAACCACTTTATAGTCGCATTTAACTATACTTCTATAACTGTAATCAAATTCCTGGGAT:1 + chr2L 5611566 3' - 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chr2R 18865831 3' - roo 22 2 57.43 TGTCCGTTTTTTTTTCTGCTTTGTGTGGGGTTGTCCTGCTCCCAGGGCTT:1 + chr3L 13694673 3' + pogo 271 1 94.00 AAGACCCTAGAATAACAAGATCCGTAATGCCATACTAACTCTTTGCTCCATCGCTTTGCTGGCTGGCTGTGGTGCTGCTGTAACCGCTTCCTCTTCTGCCA:1 + chrX 11711898 3' + 1360 3 2 50.50 GTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGATAGTTGAATTAAACAGTTATTGAAATCTACTTTTAAAGGTAAAC:1 + chrX 21387993 3' - 412 290 2 55.45 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTAATGACCAAAAGGTAAACAACGA:1 - chr3R 12408354 3' - P-element 78 1 23.76 AGGTTGAGATTTAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACATAGACCGCCTCTCATATATGGTTTATATGGTCAGTATATGGTCTGTAATATGTGTGTTAGAG:1 - chr2L 22959977 3' + INE-1 175 1 59.41 TCAACCGTTTGCGATTCGTTGCCTTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGCTCAAATCCCCAAGAACGAGCGACGAGTGAAAGCTGAG:1 + chr2R 9516337 3' - Bica 480 1 51.81 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACTATCCTTGTAGATATCGAAAGATCTTCA:1 - chr2R 10029429 3' - roo 47 2 72.28 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACATGTATAAAATGTAATAATACTTAACACAATTAAATTGCACAG:1 + chrX 11205376 3' - 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chr2R 8125092 3' - Doc 50 1 73.27 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACAAAGTCGGATGCGATTATATGTTATTTAACTGCTCTCC:1 + chr3L 17624227 3' - roo 37 2 64.36 CCAAATCCGCTGGTTCAGCTGAATGCGAGCTTCGCTCTGTCGACATGGCGTTTGTTTTCCCAACTTGCAATGCAGCGAATTAACGGATGTAATGCGACGCA:1 - chr3L 22071792 3' + gypsy5 203 2 59.41 ACACATTGTAAAATAAAATAATTTTAGAGTATCCGCTCCTCGCTTTTAAAGGCTAAGCAATCTTTTCTAGTTTTTGCTTGCGCTCTGTGACATGCGCCGCT:1 + chr2L 15474715 3' + jockey 4921 1 68.32 TTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGC:1 - chr2L 18112489 3' + transib2 2811 1 64.36 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCTATACTGGAATCCATATCGGTCCTTTGCGAGTCCAGTGGTTTTGCCCCGCACACGAGTTAAGACTGTAAGACAA:1 - chr2R 20791719 3' - roo 8666 2 75.25 ACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGCCTGAAAGTGGTATATATAAATGGAATATCAATAAGAACCGCAATGTCAGTGCTACATAAGTAAAACTTAGATT:1 + chr2R 8450253 3' + Tirant 483 1 74.26 CCCAGACTCGACCAAATAAAAATTATACGACACACAGTAACCCCAACCCTAATTACAGGCTGGTAAACCATTAATCTATTAATGCACAGCAACTT:1 - 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roo 12 2 65.00 ACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCGCTCGAAAGCTGTTATCCTTGCCCAGGGCAGAATAAAAAAAAACGGAGTGAAAAAAAGCGAAAGATC:1 + chrX 10018052 3' - G6 51 1 33.66 AATATGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTATGTGCTTATTTTGTCATTTGGATGACCCGGGCCAGACTGATGCCAGCCGCTCCTGGCTTCCCGTTGGCCGTCG:1 + chr2R 10990043 3' - accord 184 2 58.42 CGCGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATAGTGATTTGTGGTAATACTTAAATCATAAACTGGTGGAAAGTTTATTT:1 + chr2R 21876911 3' + TAHRE 123 1 34.65 TCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGGGGAAAAAAACCAGGTTTGCAAGCGCAACACTTTTTGTAGGGTGGCCCGCATGAAAAGC:1 - chrX 12665947 3' + S-element 1705 1 68.32 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGT:1 + chrX 13560776 3' + roo 9033 1 59.41 TAGCAGACAACTGTACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTGTATGCTGTGTGATGGTGGGTTGGAG:1 + chr2L 20876852 3' + 1360 164 1 61.39 TATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAGCGCGAAATTTGAACGATGGGTTATCTGAGGGCCAAAATCTGACCA:1 - chr2R 22996317 3' - INE-1 565 1 65.35 AATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCAATCCACTTTGTCCAACCAACCGAGTGCCACCAAGTGCTTTCCTTATGGCAG:1 - chr2R 8714591 3' + Stalker 35 4 60.40 AGTCTACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACATACGTAAAATTAATGACAATGCGCAGGACTGGCTGTCAGT:1 - chr3L 18374608 3' + roo 8595 1 55.41 GAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCCTTAGATGGACAATGGCACTGGCCTTGGGCTCCGTGGACACCTGACACT:1 + chr3R 12145272 3' + F-element 4378 1 53.47 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGCATAGGTAAATGGAGATGT:1 - chr3R 21799483 3' - jockey 4760 1 77.23 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCATTAATTGCAAGAAAGACTACAATATAAACTGTTTAGGTGGATATGGAGATAAGCTCAAGGTATCAATT:1 + chr2R 15856460 3' + mdg1 7453 2 72.28 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTGGGGCCTCGTTTTTGGGGGCTCGCACTTTGCTG:1 + chr2R 21379601 3' + P-element 2843 1 36.63 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAAAATCTGGAAAAAATACATGAATGAACTTATCTATCTAACATCATTACAAAAGTTATCGCAAAGGAAGTGTTT:1 - chr3L 2539226 3' - roo 8665 2 79.21 TCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACGCCAGCAGGAATCAACGGAAGACGCTTTCCGGAAGGCGTTGCCAATTTGGG:1 - chr2L 14896342 3' + jockey 4632 1 55.45 AATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACCAAATGTAAAGAAATAAATTAGCTTTTCTGTGCGAAACAGGAAAAAAATTCCGGTTAGTT:1 - chrX 6282030 3' + P-element 297 1 64.36 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCA:1 - chr2R 16018841 3' - I-element 38 1 62.38 AGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAGGATTAAATTAATATATTTTACATACAATTTTCAGTGTAAATTTGATTATTTTTTGTATGTGGTTGTAGAGA:1 - chr2L 20889475 3' - Cr1a 4064 1 70.30 TCCTCACTATTACAACGCATGATGGCGACTGAACCGTAACAAAACTTAGCTGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCAGTGCTCGTCGATATAAAGTTCGCGCGA:1 + chr2R 14864096 3' - mariner2 132 1 73.27 AATAANAATAATAATAATAATGCAGCGAAAAGAAAGAGAGATGTTCGCAGGCATTGAACTCTATTAAACTCAACGGATTTATTAATTTTGCTGCCGATTAA:1 - chr3R 16407865 3' + mdg1 31 2 57.43 GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTATGTATATACCTTCGCACAGAGGCACCGAAA:1 + chr2L 9856286 3' - HMS-Beagle 6842 2 75.25 GATTGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTATAAAACTGTCGACGATTGGGAGGAAAGTGGAAA:1 + chr3R 31657297 3' - jockey 4860 1 70.30 CTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCACAAGTAACAAAAGCCTCGCAAATTGTTGTC:1 + chr3L 18661784 3' + Quasimodo 6901 2 73.27 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGC:1 - chrX 21087579 3' - mdg3 24 2 53.47 CGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCATGTCTGCAGCAGAAGAAGAAGAGCGATTAAAGCAGCTGTGCGAAGTTCTCGTTTT:1 - chrX 17995194 3' - hobo 152 1 55.00 TATATGACTAATCATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCACTTGTTAAAGACGAAATAAAGTCAAATGCCACTCAGACAAATCCATTTCAATCCTGTCT:1 + chr3L 27361562 3' + G3 4301 1 70.30 AGAATNTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTTTGCCATGTTCTGCATCGATGAGTTTGCAGGGGATCGATTCCGA:1 - chr3R 23700779 3' + mdg1 252 2 55.45 TGCTAGTTGGATCTAATTATGTAATAAAAGAGTTAAAATCGATTGCCATAAGTTGACAGTGAGTGGGCCGCAATCGGTTATCAATAATGTAGGAATATGCA:1 - chrX 19402747 3' - Cr1a 4285 1 59.41 CATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCATATCTGTGCCCTCAACCGGACCTACTCCTTCCTGTGTCCCAATGGCACAGTCTTCAGCCAGGAGACATTAG:1 + chr3R 7243314 3' + micropia 139 4 78.22 ACACACACACATATTCGCACGTTTTTTTTTGTTTTTTATAGCTATGGAGGGAAGCTGGCAGGACGTTTCAGCTCCGCTCAGTTGCCACTGGTGGCCTCCAC:1 + chrX 9055049 3' + accord 191 2 65.35 GCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACTTTGCGGCACTACTACATGCAT:1 + chr2L 7654068 3' - jockey 5 1 80.20 AAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTACACATTTATTATTCCACCATTTCATTCAC:1 + chr2R 4916427 3' + S-element 156 2 78.00 CATATATGACTTGTTGGCTATGTGATCAAAGTAATCAGAGACGCCAGCGGAGGAAGCTGCATCGTCGGGCATAATACTGGCCACTGCCGCTGAAGTGGAAG:1 - chr2R 22376150 3' + Cr1a 499 1 80.20 ACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTTCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTTTACACATCCAGAGAAATATGTAAAT:1 - chrX 303535 3' + Circe 7339 2 72.00 TCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAAAAGTGTGAATTAGGCGCAAAAGTTGAAAGAAGCATAATAATTCAGTTCTGTGTGTATATTTTATTATTATAA:1 - chr3L 19018381 3' - INE-1 554 1 72.28 GAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAGATATATATATGTATCACAGATTGCTTACCAAAACTAATGTCGCTGTT:1 + chrX 3003720 3' - Juan 30 1 50.50 TCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTCACTCACACAAGCAAGCAAACTTTATTTACAGTGTATTCATGACATTGCT:1 + chr3L 21729699 3' + 1360 3204 1 74.26 AGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTCAATTTAGTGACGCATATGATATTGTTCCTGTTTGCGCCACGAGCGTGTTTGGAATGCCTT:1 - chr3R 28738835 3' - G-element 18 1 65.35 TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCAC:1 - chrX 21087568 3' - mdg3 5265 1 62.38 TACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCGCATGTAACCAAGTTATCTGAGTGCTCATTGAAAAGGT:1 + chr3R 15421428 3' + Stalker 100 4 62.38 TACTTTACTTTACTTTCATTTGAAGAACATTATTGACTGAATCAAAGTAAAGTATACTTGAAATTTTGTAGTTTAGTTAGTTTGAGCATACAACCAATTGA:1 - chrX 13083675 3' - TART-A 13146 1 71.29 GGCTCTGACTCCGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCTCTTTAGTCATTTGATGATTCTCGGA:1 - chr3L 21686978 3' - G-element 428 1 78.22 CAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTACGTTCGACGCAAAACACGCAGGTGAGAAAGCAAGCAATAGGGGGGCAAATTGAAT:1 + chr3L 22976045 3' + Bica 4583 1 63.92 AAGCANCAGCAAATATAACAAACGAGCAGAAGAAATGTTGTATATCGATGAGGAGACGCAGTCGCCAACGCCTACGCCAAGTAGCAGCAGCATGAAACGAA:1 + chr3R 27632342 3' + Bica 4580 1 69.31 CATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATAGAAAATACAAAAAAAAAAATGAATGAAAACAGAAGGCAAGAGCCAAAACGAAAAAT:1 + chrX 9097597 3' + pogo 54 1 59.78 CAGCCTCGGCACGTGGCTGCTGCTGAGTAGAGGGGTTTTAGGGGTTATGCCGGCGGCAGAAGCGGAAGTGCAGCATTTGCACATTTCCGGCGCTGCTCAC:1 - chrX 5861344 3' - G-element 240 1 75.00 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTTCAGTGTGGTTGTTGTTGTTGTAGTTGTTGCAATTGTTACGACAAACAGATGTTTTACACAAA:1 - chr3R 15296347 3' - Tirant 68 2 71.29 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAGCAAACTATATTATAAGCCATGCCAAGAAACTTGGGTAAGCTACAAATATTTTAT:1 - chr2R 23343739 3' + roo 9051 2 56.44 GGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGATGCGGGTTTATGCATGAGTTCTTTGTTCCGAGTCGAACACTAACTGGTTCCTATATACGTTAATCAGGG:1 - chr3R 2470789 3' - Cr1a 4121 1 68.32 TGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTGTAAGTTATTAAGTTATTGAAAGCACATTTTAAT:1 - chr3L 21559942 3' - accord 358 2 66.34 GAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTTTGCGCACAGACAAAACCAATCTAACTATAATTTCTGACATATTTGAGATTT:1 + chrX 19906244 3' + Ivk 309 1 60.40 AATAAATAAATAAATAAATCGAAAAGCGAAAGAGGTGGTATTGGCAAGGTTAAATAACAAAAATAAAAGTGAAGCAAAGGTGAAGAAGACCAGAATGAATT:1 + chrX 15024688 3' + Doc3-element 82 1 64.36 AAAAAGAAAATTGGGGCGGAGTGGGGCACGCCCACTTTCCCAAAACATTCGCTGGGTGCATTTTTTTCGCTCTAACACCATATTTTTTTATCAATTCCACC:1 - chr3L 17862712 3' - hopper 133 1 64.36 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTAATTCGATGGTAAAATTAAAAAAAAAA:1 + chr3R 10316172 3' - F-element 31 1 68.66 CGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTCTTGTAAGTAGCTGTTTTGTAGCTGTTCTGCTTGTATATATTTATCTATTGTTAGAT:1 - chr4 166106 3' + INE-1 555 1 54.46 TCCGGCCAAATTGCTGACCAAGCATGAGCTTCCGGCCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAA:1 + chrX 21772498 3' + gypsy6 7472 2 47.52 TAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATAGTACGTGTCGCGTTTGGTAAA:1 + chr3R 10408022 3' - R1A1-element 4939 1 78.00 TGTTCGGACGCTCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCATTCGGCAGCCTCTCTGCGTCCAGAAGTGAATTAAAGCTGACACAAAAGGATTCGGCT:1 + chr3R 19550237 3' + 1731 4503 1 57.43 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAG:1 - chr3L 21908906 3' - roo 50 2 74.26 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATTAATTACTTAATGTGTAAAAGTCACGCTGTGAGTGAAAAGTAAAA:1 - chr2L 8652709 3' - Doc 38 1 75.25 GAATTGAACTCATTAATTGTACGCACAAGTGCCACTTATTAAATTAAATTATGGAATTTGCTACATTGGTAACTGTCAAGTATATGCAGAAAACATAAATT:1 - chr2L 3941594 3' + rooA 7578 2 75.25 AACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTTTGATTTCTGGTGGCGTTTTTTGCGCTGTGGGAAAGGACATTTGGCTAAGCT:1 + chr3R 15567495 3' - X-element 4318 1 57.43 CACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGTGTTCTCTCTTGTTAAATATAAAATTGGCCATATCTAAGGCATGAACTTGTTGAGTTACTT:1 + chr3R 20361641 3' + INE-1 541 1 63.37 TACAACGCTTCTATTGAAATTTTGTTGACTTTGCTTGTGTGCTCCTGATGTGGGTCATAAATGTTACTCCATTTTTATGGCCAACTTGCACACGACGATGG:1 + chr2R 18719785 3' + S-element 317 1 72.28 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAGGCACTCGACAAATAAAACAGCATTCA:1 - chr3L 21840291 3' - 1360 47 1 73.27 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTTCCAATTCTGCGGAGAGGG:1 - chr2L 22544989 3' + roo 9016 2 79.00 ACTCAGCTAGTGTGAATGAGAACGCGAATTTTCATCATTTTTCTCAAAGGATTTGGGGGGATTTTGTAGGTTCATGCTATATAAAGTAAATATATATTCTT:1 + chr2L 22136620 3' - INE-1 531 1 65.35 ACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAAAGAGATCGAGTCTGGAGGTTTCTTTGCTCTGTTTACCACCCGACACTACAGTCAAAACAAGTGAATACACTGAG:1 + chr2R 9430724 3' + invader1 267 2 70.30 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTGGGGGCACGCAAACACACAAATACACACACAGAGCGC:1 + chr2R 16928951 3' + blood 7384 2 73.00 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTT:1 - chr3R 14913157 3' - blood 7049 2 60.40 ACGACCGACGCGTTCGATGATCCAATTCGCTCTTCCCTTATTTCTCAATTTCGATCAACTAAACAAAGTATAGCAATATTCTTATCTCTAAAGCTTACCCA:1 - chr2R 4896050 3' - gypsy7 5358 2 62.38 GTGTTATTATTATTGTTGTTATTGGTGGTGGTAGTGCTGGCGCCCTCTATGTGTGGCCGATAAAGGGGCGGTGTCGTTGATAAGGGGGCGTGGAACATGAG:1 - chr3R 21822335 3' - mdg1 17 4 67.33 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTTGTTTCCAATTAGAGTCGCCGGTGCCATGGC:1 + chr3R 11833011 3' + roo 9028 1 68.32 GTACACACACACACACACACATAGACACAGAGGCAAGGGAAATAACTGCTTCAAATCCTTTGGAA:1 + chr2L 12873134 3' + Quasimodo 37 4 80.00 GCGAGAGAAGTCACGAGGCGCAACGTTGACAGAAATAAATATCTAAATTGTACTTTATTTTTAAACAGTTTTAACTCGCCTTAATTGAAGCGCGAGAATT:1 + chr2L 7170667 3' + gypsy9 5169 2 41.00 TAACTTAATAATTGTTTAATTGGCGCCCAACTTAGCAGTAAAAGTGATCTAACTCTTTTATTTCTATTGTTGTGGCTACAATGGTTTCTTTTCCTTTGGAT:1 - chr3R 19444857 3' + gypsy9 316 1 55.45 TATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGTATTGGTATTCAGTTTTAACAAATTCAGGATGTAATTGGTGCAAACTGGCATTTTCTATGATCTTCAA:1 - chr2L 3702128 3' - I-element 5010 1 69.31 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATTACATAGGTGCTGGGTATACAGAGGTATATCACTGTACATATATTGTGTATTCAGGATTGAT:1 + chr2R 22803326 3' + S-element 1709 2 67.33 CGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGGCGGAAAGCAGTCGATTTGAATCCATGTTTAATGGAAGTGCCATCAATTCAGATC:1 + chr3L 20746929 3' - INE-1 93 1 53.47 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTG:1 - chr3R 15072572 3' - pogo 29 1 58.42 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACTCGTGTGTGAGTGTGAGTGGCAAGTTTTGGCTCAGGGCTGAAGTGCCACCCACTTTTCCACCACCCACTTTCACTACA:1 + chr3R 28449119 3' - accord 7028 2 73.27 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATTCATCATTGACCGGTAAATCAAATGCGTCTGGAGGAACTGGTGGGCAAATTTTGGTAGACAGA:2 + chr2L 22227375 3' - F-element 25 1 63.37 GCTTCAGCTACCATCTGATGCTCATTCCAAGTAATTGCGAGTAGTTGAACAGGAATCATAAATAAATAAATGTCATCCTAATAAGTTGTTTAAACTTAATT:1 + chr3R 11072536 3' + G3 292 1 72.28 AGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCCCGTGGAAATACGGGGAAAAGCTGGAGTGTCGAGCAGCCTGCATGGGTTC:1 + chr2L 5578419 3' - Burdock 6236 2 54.46 CTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTTATAATTTTTAATAGCTTGTAGCAGCGCTGCTTTATCGGTTGGGAAAC:1 - chr3L 16321763 3' + X-element 4525 1 55.45 AATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTATCGTTTGGCTCAACATACAAGAACAGTGGGAAAAACTGATAAATAATTATCTCACGTTGA:1 - chr3L 6628566 3' - INE-1 570 1 73.00 GTTAGATTTGCCGAAATCTCTTTCAACTCAAAAACAAGACGCAATCAAAGCTGCCCCAAATTAATTTAAAAGGAACCAAAAAGTTGTTCCTGCCCCGCTAT:1 - chr2L 4091959 3' + diver 462 1 69.31 TATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTCTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCTTATTCATCCATTTAAATGAACCAGTATTCACAAAACTTAGACTGTCTTG:1 + chr3L 23889301 3' - Porto1 4212 1 54.46 ACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACAAATAATTATGATGACTTGGCATGAGAACAAATTGCAATTCGGAAGCCAATGAGAGCGAGG:1 + chr2L 6932593 3' - R2-element 3313 1 71.28 GTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCTGGACTGTGGGAGTATTCTCGCCCGCTGCAACATCTCACGGAAAGCGCTCCAAGCCA:1 - chrX 1399620 3' - R1A1-element 4925 1 43.00 GGATGNACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAGTCGAAGCCACCTTAAATACAATTTAAAACCGTAGCCAGAAATGCACTGAAAGAAAACGCGATCAAAATAT:1 + chrX 9533384 3' - Max-element 439 1 81.19 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGTAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGA:1 - chr3R 29019034 3' - Doc 50 1 70.83 GGCCGAGTATAAAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGTATTATGTCCTAGGGCTATGGTATTATTATCCCGCTGCTC:1 + chr3R 27111756 3' + Transpac 459 1 60.40 TTAGTTGGGCGCCAATTATGAAGAGTAAGCGTAATTGGCCTTGGACAGCACGCGAAATACACAAAATGGGGCGATAGTAATTAG:1 - 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I-element 28 1 51.49 GTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCCCGCCGCGCATATAATTACAAAACAAAATATTACGCATACGCCATGGTGACGC:1 + chrX 17995040 3' - invader2 361 1 56.44 AATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAA:1 - chr2R 6438338 3' + Stalker4 388 1 60.00 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAATTGTGTATTTTGCGGTCCG:1 + chrX 4326909 3' - FB 57 1 83.17 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGATTTTATATCTATGCTTGTCAATATCCATGTTTTTTGCCGATTTTTTTATATGATTTGTA:1 - chr3R 15343837 3' + roo 9055 2 63.37 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAGAGGGCACTGC:1 - chr3R 22899155 3' - P-element 9 2 68.32 AAGCAGAGTGACCATAGCACAATGTTCTCAATGTTCTGGAAAATTACCCCACGACACACCGGCAGACATCCAGTCGATCAGAGCATGTCATCTAGCTCAAC:1 + chr3R 8066430 3' + BS 380 1 50.50 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATATACATATGTGTAGGTCCTGCAGAGTCCTGCTTGAGTGTGA:2 + chrX 14424094 3' - hobo 35 1 63.37 GGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTGCGTTCGTTATCCTTTTCACAAGTCCTTGCGAAAAGTTCACTCGTGTGTTGTTTGTTGATAATCCGAAAAGCGAG:1 - chr2R 23581373 3' + 1360 451 1 84.00 GGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTCATATTATTTGGAACTGAAG:1 - chr2L 21559175 3' - FB 55 1 79.21 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCGAAGTTAGCCGAAGTCGAGGCATTCGCCA:1 + chr2R 20698436 3' + P-element 2883 2 65.91 ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACAATAGTTGCCATTACACCATGGGGGTTGATTACAATTATTGTGTGTGCTTTAAGACTATTTAAATATTCTTCATTA:1 + chr2R 15002457 3' - 3S18 2 2 70.30 ATGGGCTGCAATAAACATGTCACCGGACAGCATAATATTTTTTGTTTAAATTTATTGTGATTTGTGCAAACACTTAATGAAGTCTAAAATTAAATTCTCAG:1 + chr2L 9764748 3' + rooA 57 2 68.32 TATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTAAAGCACTGTCTCTTGTTTTATTCTGTTTACAAATCATAAGTGGTTGGTGTGAGATTGCCGTGGATGTCTAAGTGC:1 - chr2R 25179390 3' + INE-1 559 1 59.41 GGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATCGGGTTTATTGTGTGTTTGTATAGAATTTCATCAATGAACCAAACAAAATGTTTATGTTTGACATGAGAC:1 + chr3R 21867942 3' - I-element 158 1 73.27 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGCAAGCTTACATCTGTCGCTTCAGTAATCTGCAGTAATC:1 - chr3R 28012520 3' + diver 184 2 63.37 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTATGGATGCTCATAATCATATTGGGCTCCTCGAAGGGAG:1 + chr2L 11165390 3' + transib2 2785 1 61.00 TGTATTATATTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTGTCGTCGTATTGTATTGGCAGCAAGAGCGCTGCCATACAGTCAATACGCACAACT:1 + chr2R 4023398 3' - Doc2-element 74 1 58.42 TTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTAGTTGGCGTGTGTCCACTATTCTCTCCTATCTAAAGTGCTACCACT:1 - chr2R 16580256 3' - jockey 4629 1 54.46 TCTATTATAGTCAGAACATAAATCTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGAATTAAGATAAGGGGTATATGCTTAACTTGGCAACTGT:1 - chr3R 11390778 3' - Cr1a 4195 1 80.20 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACCTAAATACACAATATGCACACAAGCTCGCGAACCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATA:1 - chrX 21994011 3' - 297 4 2 73.27 GACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCCACTTACATAAATTAAGAACTTCCTGATTGCCACGCTGCTTCACTGCAAATTAA:1 - chr2R 14793167 3' - flea 339 1 56.44 GTGGTTGGTACCCATATCGCAGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTCCTTGCCCCAAACTCATTTGTACAACGCCCCCGCCGCCCCTCTCCGCAGACCACCAC:1 + chrX 19792628 3' + R1A1-element 5012 1 65.35 CCCGCGAGTCGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCTGCTTTCTCAGAGTTTTCAAACCGTACTCCCTTCTAATCCCACAGATCCCCCAGGAC:1 + chr2R 8823659 3' - invader6 4819 2 65.35 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGATTAAAAGCACCCAACAGATGCAATTCCATTGTTGGAAAGCAAATGTTCTTTGTGC:1 + chrX 1598944 3' + roo 9051 2 59.41 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGGAGAGCGACAGAGAGAGCATCGACTTCGGCTTCGCGAGAGTCCAATTCAAGGGAGGGCGCGGGCAGAAGCAAC:1 + chr2L 222283 3' - P-element 4 2 73.27 TTGGTCTCCCAATGGGAAAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCTTCTTGCATTCCAGCCGTCTTCGCTGTTACTAGGCCGCTTCCCCGCAACCAGGTTTG:1 - chr3R 2446823 3' - G5A 2568 1 60.40 AAAAATTTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTCGTGCGATTTGAAATTTCTACTTAATTGGTGTAATTTCAACTAGTTA:1 - chr2L 21115154 3' + invader2 4764 1 54.46 GATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAATATAAAATCAAACTGAACCTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAGCGTTTTCAAGCTAATTAAACTAAG:1 - chr3R 24181205 3' - gypsy6 184 2 76.24 TTTTGTTTTTTTTTTTAATTTCAATTCAATCTAAATTCAAATTTACTCACAAAATTTTTGGAAGTGCGAGTGTTCGGGCATATAAATTTCTAGTTTCGACA:1 + chr3L 1252110 3' - Doc 4698 1 73.27 TAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGATTTGAATTTTTAACTTGTGCAAGGCGCAAATGAAAGCGAGCATTAGCGAAATGCCATCAT:1 + chr3R 13739940 3' - F-element 4474 1 64.36 CATTGTTCCGCTTCGAAGAGATAGATTCGGCGCTCGTCTTGGTATTTTTGCCGCTGAGCACGCAATTCGAGTTGGCTCATTTTCTCGATGTACAACTTAAT:1 - chr3R 9564044 3' - Doc3-element 275 1 78.22 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTAATTACATTAGCTAAGTTTGGTGATTTAAAGCAACA:1 + chr2R 8157246 3' + Transpac 5191 2 63.37 CATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCACCACATCAACTGCTCAACCAACTTTCAGCTCCATTCAACCAACTGCACTTTCTATGCCCG:1 - chrX 10996246 3' + accord 7289 2 55.45 CGACGGCTGCGTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTTCAGTGCCTCCCGCAGGCAGCTGGCGGTG:1 - chr3R 22352798 3' + 412 457 2 63.33 GGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATCAGATAGCCGGGAACACTTGGCCGGCCAG:1 + chr3R 18516136 3' + BS 4783 1 71.29 AGGTANTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGCTCAAGTTGGATCTACCTGGAGTAGCTTCAATTAGTGGCAAAAGCAAGAT:1 + chr3R 16531281 3' - hopper 24 1 54.46 GAGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTGTAGCCACTTATTACGGGCCAAACGTGCACATTCGAC:1 + chrX 16619672 3' - opus 7152 4 62.38 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAGTT:3 + chr2L 5152017 3' - I-element 22 1 56.44 GTACTGGCGTTCGACGCTGGCTGCGTCCCTCTATGTCGCTGACTGCGACGCCACTGTCGCTGGCTGCGATGCTGTCTGCCCCAAACTGCTGCCAATTTTTA:1 - chrX 7625119 3' - aurora-element 299 1 66.34 AAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAATGCAGGAGTTGTCCAAAAAAATTGTGCGTTAAGCCGG:1 - chr2R 19175366 3' - McClintock 6140 2 63.37 GCATACACACACACACACACACACACATACATAGTATATCTGTTAACAAAAATATTATATAAATTCTATATGCAGGCCAGCACACAGAGACATTTATCGA:1 + chrX 6417835 3' + accord 7025 2 70.00 TGGTGAAGTCTGTCCGACTTGTTAATTTTATTCCATGACCCTGCTCTCCTTCTTCCTGCCCATGATATTCGAGGCACTGGGTCTGTTCGAGAACTGGCATC:1 + chr3L 9607763 3' + hopper2 268 1 68.32 TTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTAAAATAATGATAAAGATAAATTTAATTAGTATTGCACAGTAAATTCTTTATAATCTGTG:1 - chr2L 10003382 3' + X-element 4562 1 61.39 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAA:1 + chrX 5726784 3' + roo 9043 1 53.47 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGATCTCGCTGCTCCTGCGGCGTTTT:1 + chr2L 22646069 3' + roo 9038 1 54.46 CACTCCTCCTGAACGGGTCGTTGGGGTCGGTGGCACTGCCACCCCCTGTTCTGTCTCACCTTCCAATAAAGACCCCCCACCCACC:1 - chr2R 18505075 3' - Rt1a 476 1 64.71 AAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTATAACTGTAGTTGAAACCCATTTTTCGTTTTG:1 + chr3R 2474338 3' - Juan 4018 1 68.32 AGTTTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTCGAATTTTAGATTTTGCAGAGCTGCGATGCCAGTGTGCATGCATGAGCTTTTACAAAGCCTGTGCGGCGCA:1 - chrX 4259534 3' - TAHRE 10352 1 63.37 TGCACTTGAATCCAAGAGAAATGCAAAGACAATTAAAGTCAGCAACTCAAAAGCTCTCTCTGCTCTTTTGCTCCACAGTTACTGATTTTTTGATTCAATTT:1 - chr2R 22619879 3' + Idefix 349 2 60.40 AATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCTAGCTGAATACTCTAAAAACAAATATTCTTATATAAGTTAACTAATGTTTTGATAAGAACATTTGGAGC:1 - chrX 22406693 3' - 1360 439 1 73.27 ATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTAGCATGAAGGTGATCGTTGATTTGAATGACAATTGATCTGTT:1 + chr3L 23854140 3' - I-element 5134 1 58.42 TTTTTCCTTTTTTTTCTTTTTTGGGTCATGAAACAAAAATGCACGACAAATCAACACTGGACGACCACGACTACGTGTGGCATTACTGGCTAGCACCGAAA:1 - chr2R 19222094 3' - Doc2-element 228 3 56.44 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCTTATGATAACGCGACAGCGTGCCACTCTGTATTC:1 - chr2L 6177174 3' - pogo 39 1 69.31 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAAATTCGAGAATCATCAACTGGCAAACACACACTCAA:1 + chrX 22747507 3' - Doc 16 1 65.35 AATCAAAAATCGTGCGAACAATAATTGGTGCGCCTTGGTATATCCGCTTAAAGACGCGCTCAGGCAACAGATTCGCCAATGATTTAGCTGCAGCCAGGCGT:1 + chr3L 22524456 3' + Doc4-element 2666 1 64.36 GGGAGNTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTGGGTGGATACCTACATATATGCGA:1 + chr3L 10007743 3' - Doc 4542 1 75.25 AAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATAAGGCAATTCTTTTGTTTTCTTTTGTTTTTCTACCGCCTTAGCGCAATTTGTA:1 + chr3L 13649384 3' + jockey 4607 1 57.43 AATTTTTTAATGAAATATAATTTATAATTTACTCTTTAATTACGTTAGCACGTCGGTAAAACACTATTGTATAAATCTTCCTTCGAGCATGGATAAGTATC:1 + chrX 16760877 3' - S-element 1623 2 47.52 CCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAAACACTTCGGTCCACCGTTTTCCGGTGCGCCACTGGCACTCTGTCCTTGACCCTGGCCGTTCTT:1 - chr3L 25513998 3' + X-element 4703 1 59.41 AATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGTTTCTGTTCATAGCAGTATTAATAATTAACGCATTGCCATTGGCAATAGTTTCGTTTTTGAAAATCCA:1 - chr3L 23019323 3' - roo 8789 2 74.26 TTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAG:1 + chr3L 19339436 3' - Tc1 19 1 64.36 ACAGGGCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAAGGGTTTGCACAGGCAGGCAAAATGTCCTGATGAATGTCCTGTCAGTTGGGGGCTCTCGAATATGGGT:1 + chr3R 15153119 3' - hopper 1 2 65.35 TTCGCATTCACACTAGCCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTAGACTTTAGCATATGTACGAGATCTCAGCTGCGAGATGATAAAATTATATATG:1 - chrX 17228725 3' + INE-1 531 1 59.41 TATAGTCGAATTCCCCGACTATACGACTAAATACCTGTATACCTCCTTAGTTATGAGTATCAAATTTTGTTATTAAGTGTTGTTACTGTATTTAAATTAAT:1 + chr4 986944 3' - INE-1 565 1 72.28 ATTCGCGACAACACATAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAATCTAGAGTGTAAATAACTCCACAGGCTACCGACTCTAG:1 - chr2L 3274431 3' + gypsy5 224 2 60.00 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGACATGCGTGCAAATATAATCGGCGAGGCAAAAGCCGCAACTATA:2 + chr2L 10635314 3' - roo 33 2 57.43 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACGTGTTAATATTTTTTAATCGCAGAACGTCTTGAGATTTTGGCTTGGCAAGGGAGTAGCCGGCTTTC:1 + chr2R 8463652 3' - I-element 11 1 67.71 CCCGCNCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTGCCTCGGGCGGGTGGCGGTGACAAAC:1 - chrX 14736912 3' + F-element 384 1 75.25 TACCGTGCCCTCCACCCCTCCTTCCCTACTCCGAGACAACATGGACTGGCAAGCCCCCTGCGATCCACCAGGCAGAGGATGTGCCGCAAAAGAATCGGATC:1 - chr3L 11311902 3' + G-element 282 1 69.31 AAGGTGCAGATTCAGCATACAGCCTCTAGAGACATAGACCATGTTGCCACGCCCAAGGCATCTACCCCGGAGTCGAGCAGCAGCAGCAGCAACTTTGTCTC:1 - chr2R 16085401 3' + INE-1 174 1 52.48 CGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGACGACCTGGCCGAGGCGGAC:1 - chr3L 17799304 3' + X-element 4446 1 76.25 ATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGCCTGTTCCTCAGTATCAGTTTATCAGT:1 + chrX 21384559 3' - 17.6 7360 2 73.27 TAAGACTCGAAACAAAAGATTGTTAATATAATATTTCTTCCATTGCGGAACACATTTCGAAATTAATAAAGATTAATCATTCTATTCTATTTTGTTAAAGT:1 - chrX 3002810 3' - Juan 3984 1 66.34 ACCCTNGATATATGCACATACTACAATATATTTATCTTTTATATTTTCCCAAACTTGTTGCACTGAAACTTTTACACCAAAAATCTTTACTACGGACTAAA:1 - chr2L 6605530 3' - blood 4 2 71.29 GGGCAAACGTTTCCATCTTTCAAATTTCAAAACTTTTTTTCGCTCTTTCACTCTTTTGGTTTTCCTGTTGTTTGCCTCTTGTTAGCGGGAAACGGGGTAAA:1 - chr2L 17120330 3' - FB 44 1 75.25 GCAAGAACGTGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTTGTTGTCTTCGGCTCGGGAAAAGTCGTTGGAAAAGGGGGACGGAAAAA:1 + chr3L 10186237 3' - Doc2-element 443 1 53.54 AACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACATATATCGAACATTCTGATAGTATGGGAAATGCTCA:1 - chr2L 17473421 3' + INE-1 142 1 67.33 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTACACGAAATGGGGCGAGCAGAGCAGTCGC:1 + chr3L 5691287 3' + P-element 2840 1 32.67 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCTACG:2 - chr3L 22052763 3' + mdg1 7431 2 53.47 ATATTGCATAGGCACATACTACACAGGTTCATTGGACGCCCGAGCCAATCGAGAGACAAAGTGAAACGACCTCGCACAACGCGCGCAAAAAGAGAGAAAGA:1 - chr2L 20084832 3' - 412 2 2 77.23 ACTACTTCAAAACTCAATCCATTGACAGGCATTTCCGGTTTGGCGGCTTTAGGGCGCAGAGCAAGGAAGCCATGGCAGTGGTAAAGGATGTGGACACAAAG:1 + chr2R 24494887 3' - S2 413 1 53.47 CCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAGTGTAGTTCCTAAGTTCGAGAAATAATCAATAAGTGCGATTAGGCACGATTCCCGG:1 + chr3R 23576836 3' - Tc1-2 27 1 72.28 TTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGGATTGCCCAGAAGGCCACCGTCGGTGTGGATGACATCCACGAACCTAGCGTCACTGGGACTCAAGCGGCGGT:1 - chr2R 16883698 3' + diver2 4693 2 80.20 AAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAATTGGGGTACACAGAAAATGCTCGGATAGAAAATTTGAAGTAAAACCTTGGAACGGTGGTC:1 + chr2R 17529975 3' + flea 4643 1 61.39 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCG:1 - chr2R 1373114 3' + pogo 2068 1 60.40 TTGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCTCCCCCTTTGACCATCCGGATTTGGCATTTCACAGCCTCTGCTAATG:1 - chr2L 19143859 3' + Q-element 332 2 54.46 CTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTGGACCGGGCAAATTAAGCGAGTTGGAAACCGGGAAAACGCCGATAA:1 - chr3L 14365432 3' + blood 210 2 54.46 GTTCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTGGTGAAAAGCGTCACAATTGCACAAAAGTCACGTTTTTAGCCTTTTATCCCTTTAGCCTGGATTGTGTCAATG:1 - chrX 18018242 3' + gypsy8 440 1 74.26 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCTTGAATCGGTCGC:1 - chr3R 6216791 3' - pogo 19 1 60.40 TGCGACAGCCAAATTTGCCGCATTCAGGCTGCCCAAAACAAAATAGCCGCCGTCCTTCTATCTTCGGCTGGTGATCCAATGCGACCCA:1 + chr3R 1829752 3' + BS3 1337 1 57.95 CTGCTTAAATTATTTTATTTAACTGTCCATTTCTGTCGCACTTCGACTAACGATTTTCTAGTCAAGTCTGCAAATTTATTTGCCTTGCCCGACATTCCAAC:1 + chr3R 16843994 3' - jockey 4929 1 55.45 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGACTACTTGATCGGTGGAAACTAGCTATACAGAAGGTTATTTATTTATAGAGAATATTATTACT:2 + chrX 17947393 3' - hobo 14 1 65.35 CTTATATTTAATTAATTAAGCTGATAAAAATAGATAAAAATATATACCAGAAGTTGGGTTTTAGTTCGGTTCAGTTTTTTAATTACTTATTTTATTGCACT:1 - chr2L 12574696 3' + springer 7525 1 61.39 AGTGCAGTTTATGTGCATAAAAAAACAACACAAAACAGCATTGCGAACAACGCAAGAAAGACAGAGTACACAGACAAACAAACAATGTGGGTGTGGGATGT:1 + chrX 7835367 3' - Cr1a 265 1 65.35 CCGGCNATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTGTCGGTCCGTCTTTTTTTATTTTTCCTTTTTTTGGGCCGTAAATTTATTAACAATTATATTT:1 + chr3L 8040212 3' - Doc2-element 314 1 67.33 CTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGATAAGGGTGT:1 - chr3R 31996548 3' - mdg1 7344 2 59.41 AGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCCACGAACCCCCATTTAAGCCTCCTCATACCCTCTCATCTCTATTTGTGTTTGTGTTTGCTTTGTGGTTTTG:1 - chr2L 11658256 3' + roo 243 2 73.27 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTATATATATGTATAGAAGATACCAGGGGAAAAGGACGACACTCT:1 - chrX 12817477 3' - HMS-Beagle2 6913 2 55.45 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTGAAGGCGGCCTCATACTCCACAATCTAGGAAAGAC:1 - chr2R 16782158 3' + 1360 7 2 74.26 GGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAACTAACATAACTTGCCCAGTAAAAAACAAAATT:1 - chr2L 9346180 3' + Transpac 268 2 67.33 GGCACCACTTCTCGCGGCGCACAAGCGTAGGCAGACGACGATGGGCGTGAGGTGGGCCGAAGGCCTTTTGTTCGGATACCGCTCCTGGTGCGTTTGTGTGT:1 - chr2L 17081454 3' - aurora-element 3792 1 72.28 CCATGNGCAATCCGCTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAAAACGAATCGTTCACCGGAATAAAACTCGATTGG:1 + chrX 21029818 3' + Quasimodo 7142 2 64.36 CTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTACCACAACGCTTTCCACTTCCGTTTCCTGGCCCGTTCAGTCAAATTAGCTTTGCCTG:1 - chr2L 9147593 3' + F-element 4460 1 62.38 TGCATTTTTTCCTTTATTTTTTTTTTACTCGTAAAGTTGCGATTAGCGGCCATTTTGCAAATCTGCAGCGTTATTAATTGCCACTGCGTGCTTTT:1 - chr3R 13888980 3' - Tc3 141 1 76.84 TTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCATGACTGTACTTGTTGTACTTGTACTTGTTGTAAAGTATCAGGTAGAGGAAAGCGATTCCGACCC:1 + chr3L 21637453 3' + Bari1 1685 1 57.43 CTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTTTTAATTTTACTATGCTGTTAGGTAGGACTTATGAACACCTGCTAAAGACCTCCTGCATTTTGTTCATG:1 + chr3R 19689932 3' + gypsy6 7548 2 75.25 TGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACTCAACGGGAAATGGACTCGATGTACACCGTGGTCATGGCCAACATGAACA:1 - chr3R 24255439 3' + Stalker2 7320 2 53.47 ACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCTTCCGTCCGTCTTCATTGCCGGCCTGCCATTGCGTTCACCTGTTTTGCAGATGGGTCCCCAGGTGAATGGTG:1 - chr3L 1981385 3' + Doc 4292 1 77.23 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTGAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAATTTGTACGTCTTCAATTAATTGGGT:1 - chr3R 25931333 3' + roo 358 2 72.28 TTATTCACACTAGCTGAGTAACGGTTATTTGATAGCCATGGAACTCGACTATAGTATTCTCTCTTTTATTATTATTATAAACGCGAGTGATGGCACTATAA:1 + chr2L 22130736 3' + INE-1 534 1 91.09 CTCTTTTAACTACCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAATTAATACAAGTATGTTTTACGACGGCGCTTTTTTAAACCAATCGAGCACTGCAAAGAATATATA:1 - chr3R 8462993 3' - Gypsy6A_LTR 261 1 60.40 ATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGTTGTTTGTGTTGTATTGTATGTATGTGGGTGGGTGGGTGAGGTCTCAACAGGAGAAAGCTACAGATATTATGCA:1 + chr3L 19312840 3' + Circe 7101 1 75.25 TATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGAGTTTGCATTCACACATTAGCTGCTAATAGGAGGCTTACGCTCGCGCATTCGAGCATCTCTTCAAACTATTATTG:1 - chr2R 7673412 3' + INE-1 509 1 59.41 GACTTNTCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATCAGATAATATAATTATGTATATTGTATATAACGCAACTTTTCGTGAGAAGCGAATAAACTTGACGG:1 - chr3R 24839970 3' - I-element 11 1 68.32 TCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGAGATATTGCAAAATGGGAAAAGTGTCTGAGAAATAAAGCCAAGCGAGTGTAGTTCAATTTCAGTTTAAAAACTGTG:1 + chrX 7053142 3' - 1360 3266 1 74.26 ATTATTTACATATGTATTACTTAAAGAAATAATTTCAACCACATACTTGAACTTACTTGAGCGACGTAATCGTTACCTAAATTATTTTTTAGCGCTGTT:1 + chr2R 4330659 3' + Transpac 4855 1 57.58 TCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGCGCACATGGTCTTCGCTTCGGATTCGCCTGCAGCCAATTGCAGTGTGGGCAACACAACA:1 + chr3L 17721813 3' - mdg1 7248 2 57.43 GACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTGATTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATGTAATTCAATTTGGAATACCTTCAG:1 - chr3R 23020813 3' + INE-1 580 1 57.00 CAACGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTGGACTTGCGCAACTTTGCTGGCTCCCAGCAGCAGCAGCC:1 - chrX 10017350 3' + F-element 286 1 59.41 GTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:1 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 24 1 74.26 AAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGGAGAGAGAGCGAGCTTAAAGAAAGGTTGATTCCGTTTTGTGGTGATTCCATTACATCG:1 + chr2R 21201349 3' - blood 7180 2 84.71 CACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCATTTTG:1 + chr3L 24766014 3' - 1360 46 1 78.22 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTGAGCAAGCAGATTTTTTTTATAAATTGTTGCTATTTTTTTGTCG:1 - chr3R 23346533 3' - P-element 31 1 48.51 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGAAAAAATGGAAAAGGATTTTTGCGCGGCCTTTTTACATATTTTTCCG:1 + chr3R 11097588 3' - mdg1 28 2 54.46 CTGCACAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCAGCCCCCCTTTACACAATCTACATTTTGTTTGCATTCTTTACCATATGTGCAGCATGTAT:1 - chr3R 1832042 3' - Cr1a 476 1 57.43 ACGCGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAAGATGAGCGCCGACTCTCTTTGCACCAGAACAATGTATACTTCAGCCTAAACTACTCACGATCCTTCT:1 + chr3R 29715231 3' + Doc3-element 229 1 77.23 CGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTGTCTGCCGCTCATCAGAAAAATAAAAAAAAACAAATGAAAGGAAGTCGTTTAAA:1 - chr3R 17634663 3' - invader1 3729 2 76.24 TCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGAAGAAGAG:1 - chr2R 6438335 3' + Stalker4 390 1 62.38 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCTCCC:1 - chr2L 222091 3' - P-element 30 1 49.00 ATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTGATGAACCCTTCAATTGGCCAGAGCCCGGTGCGGTGCAACAG:1 - chrX 10851917 3' - Tirant 454 1 58.42 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATCCGCCCCTATTATGCGCTAAGCGAACAATGAAAGTTTTGAATCAATTCAAGTT:1 - chr3L 12246097 3' - HMS-Beagle 18 2 61.39 GGGAAAGGGCACAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCATCCTCTCACCGTGCTGGTGGCTAAGCAGAGGCTCTGCTTTTGTGCTCCCATTCCGAGGGAGGA:1 + chr3L 4579701 3' + Rt1b 185 1 71.29 GATGTGTGAAGACGTTTTTAACAACCGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACATCGGCGATCGAAAAGGTATTTTTAAGCTAGTAAGGTTTTCTGTTAACT:1 + chr3L 25331067 3' + F-element 25 1 81.00 TCACATATCCTTCTCCGTTCTCCTCTGTCCTCGCGGTCTTCTTTCACCTTCTACTGCGGATGCAACTCTTCTGGTTCTTCGATTTGGCAGCAACTTTTACT:1 + chr2R 18943498 3' - gypsy8 4478 1 55.45 AAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCCGCACAGACCGCATCAACCGAAAAGCCCCAGTGAAAAACCCCAGGAAAATGCCACCCGTG:1 + chrX 8345305 3' + F-element 495 1 62.38 ATAAGTTGAAAATTTCGACAAGGTCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGCACACATACACACGCGCATCACAGTGGGCG:1 + chr2L 15578377 3' + invader2 4804 1 76.24 AACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATATTATCTCAAGAAGCCAGACTAT:1 - chr2R 13296962 3' - P-element 2838 1 33.66 CGAGTNGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCGGGATGCCGGGGCGTATTCGCAATATATTCGCCCATGACGGCAATCGTCACATTCTCTTCAA:1 + chr3R 31159719 3' - hobo 15 1 62.38 CGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGCGATGTCGTAGTTTTGCTTGTTTTTATAGTTGT:1 + chr3R 5042898 3' - F-element 494 1 67.33 GATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACACGATAGCGGATAAAGGGGATGTGTGGCACGCGGGGGGAGTGGCAACC:1 + chr3R 10591897 3' - R1A1-element 5085 1 52.48 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACATATAATTAATTGTGGCGCCCA:1 - chr2L 15997896 3' - 412 7107 2 87.13 ATGTTAGTCTAAAATCAGACCACTTTGCACGAAAACAAAACAAAGGAAAAGTTCTTAGACCATTTTCAAAAGTTATTAACCCAATTGGAGTCACAAGAATT:1 + chrX 10488558 3' - Cr1a 415 1 74.26 CTTCATAAGTGGGCGATCATATAACACTTCCACTTGAACTTTATTGTTTATTCTAGCACTGCCCTAAGAAACGAGTACGATTGGCTATCTGACTATCTGGC:1 + chrX 3870080 3' - gypsy11 140 2 62.38 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGCATAGGTAAATGGAG:1 - chr3R 21799487 3' - jockey 4764 1 73.27 CAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGAGCGAGATAAAGCGAAAACCGGCTGTGAAGACACCAGTTCAGGAGGGCGCAGGCTTCCAGCTAAGCT:1 + chr2R 14462649 3' + G6 405 1 56.44 AAAAAAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGAATGTGTGCGTGTTGTGTCCGTGTGTGCGTGTCGCTACACATGTTGCTATTTGGCAGCTAGTCGCCAACA:1 - chr2L 13482108 3' + hopper 1411 2 72.28 CATGTGGCTGGCTAGCTGCGGACGCTCCTTTGATGTCCCCCACGGGCAGCCACAATAGCTCGGTTTGCATCATCAATTAGCGCCTTGAAGGTGGCACCTC:1 + chrX 9929962 3' - Tirant 152 2 44.00 TTTATTCTTTTGATCTTAGCTTAAGACAAACAAATCGTATTTGTACTGCCCTTTTGTTTACATTATTTCGGGAACGAGATCTCCCGCTTGGGATATTGATT:1 - chr4 970228 3' - 297 288 2 49.50 TATACAACTCCGTCTTAAAACCAATCTGGACTTATGCTGACTTTATAAAAAGCAATATTAATGGCTTTACTCAACCACATTTGAAATAGTTAAGCTCGCAA:1 - chrX 1375333 3' + Doc 4263 1 76.24 TCCTAGGGCGACTGCAGGGGCAACTTGCGCTGGAATGGCCGCCCAATATGACTAAGCACACTCATCGCGCACTCCTGCGTACAACGTG:1 - chr2L 18747417 3' + aurora-element 128 1 60.23 AAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTATCCGTGGCTGTTTTGACGTTGTAATTAGTTTTTGCGGTTTTCCATTGGCC:1 + chr3R 4827776 3' + Max-element 382 1 64.00 CATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCAAGGACTCCGGACGCTATGAACTGAAGGTGAAGAACAAGTACGGCGAGCTGGTCACCAGCGGTTGGATCGAT:1 - chr2R 24003337 3' + 297 6851 2 79.21 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGGCATAATTTTGTCACTCATTTTTGACTTACTTATCCAATAATCGCAATGGAATCAGTGCCACTA:1 - chr2R 13124381 3' - mdg1 12 2 63.37 TTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACT:1 + chrX 1018156 3' - 1360 197 1 73.27 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGGTTTTTCCGACCCCAGCTGCTTTGAGCTCGACAAACGGCCTTTGTTGATTC:1 + chr3R 31411363 3' - FB 57 1 75.25 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCG:1 - chr3R 17495753 3' - opus 7144 4 65.35 CAACGGGGGGAGGATGTTTGGTCCCAGCGAGCAATACATTGCTCTGTGCAGCAATAGATTTTGCATTCCCCTTTGTGCTATGTGAAACTTGCTCATTTGC:1 - chr3L 25413126 3' + diver2 4519 1 66.00 GTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAAATTTAAGTTTACTGATCAAATCAAAATCACTTTAAA:1 - chr3L 10464641 3' - invader3 42 2 66.00 GAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCACACTATGCGCTCCCTGTCTCTCTCCCACCAG:1 - chrX 13934211 3' + G-element 24 1 62.79 CCAGANTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAAGAGTCCTGGACGGGAATTAAAGCGTTTGCCGAGAAGACCATTGAGAGAT:1 - chr3L 7497533 3' - gypsy 439 2 52.48 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCATAAATTAGT:1 + chr2L 15997932 3' + 412 7503 2 70.30 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCACTACTACCAGAACGGCACATTGTAAGTTGACAATTGTCAAACAGAGAA:1 + chrX 697518 3' + roo 9044 1 54.46 CATAATAAATATAAAAACACAATTAAATAAGTGCATAGAAAACAAACAGAACCATAAATAACACCCTGTAGAGCCACAATAGGCAAATAAATAAATAAATA:1 - chr2R 9501295 3' + Stalker 83 4 62.38 TTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGATTCGGTGATTTGGTGATTTGTGTTTT:1 + chr3R 18103140 3' + Cr1a 198 1 69.31 CAAAGTTTTGTCCCGACACGGTTCAGTCGCCATTATACGTTGGTATTTTATGTGGAGTTTTAGAGTTGGCACAGAAAGTATATTTATCGGATTGCTCCACG:1 - chr2R 14769426 3' + mariner2 100 1 65.35 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGG:1 + chr2L 3245009 3' - rover 6977 2 60.40 ATAAGATCAATAATTGAGCGTTCTTGAAACTAAAGAATAAAGGCGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAATAATCTTTTCGAACCTCCCAGTCCGAAGTG:1 + chrX 7797818 3' - Gypsy12A_LTR 2116 1 70.30 AAAAGGTTACCATCGCGAAGATTAGAGATGGATGTGATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGCGTCAAAGGAGTACAATACGACTGATGATGTC:1 - chr4 268037 3' - Ivk 442 1 68.32 CTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTTAACACCGTTTTTTTTATTGCATCATAAATTTAATATT:1 - chr2L 8555864 3' - rooA 7359 2 68.32 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATAATTGAGCAATTTAATTCGGAATTTAGCCCTTTTTG:1 + chr2R 22781037 3' - roo 8703 2 67.33 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAACAGAGCAGTGCCAAAGGTCAAGTGCAT:1 - chrX 2253809 3' - Tirant 8119 2 69.00 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTCTATCAACCAGCTAAGGTATAAATGAACTTTATTTACTGAAGGATTTCGAATACAGCTTGTATTCTGG:1 - chr2R 15856341 3' - mdg1 4 2 74.23 TAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTTACGCTCGACTATCAGATACCCCAATTTAAACAAAACCAAAAAAAAT:1 + chr2R 6107149 3' - Burdock 105 2 63.27 GTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCTCTCCACTCTGGCAACTTTCATTTCATAACTTTGT:1 - chr3R 5422426 3' - I-element 400 1 65.35 AATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGAGTTGCTTTAGGCGTATGTTGGCCTGGATGCTCACATGCAGACTCCATTTTG:1 - chr2L 11177789 3' - G2 2609 1 77.23 CACTGCTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGCAGGAGTTGATCTAAAAAGCAAAAAGTTAACACATGTGAAT:1 - chr2L 23015582 3' - gypsy4 6401 1 57.29 CACGCATTTATCTGTACGGTGCTCATTCCTTGTTCCTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCTCTGCTCTCTCATCGTCGTCCGCCAATTGCCAGAT:1 - chrX 18272142 3' + diver2 120 2 68.32 GGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCTTTGCGCTGGTGTTGTACAATGCGATATTATAATGTCCTAT:1 + chrX 840678 3' - accord 38 2 59.41 GCTATCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGATGGGAGCGTGATCGAAG:1 + chr2L 836556 3' + R1A1-element 4957 1 78.79 TGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAAACTGAGCAAAATTTATAGCACGATAT:1 - chr3R 19692109 3' + R2-element 3450 1 77.23 TTATTGTTTTTATATTTATTTACACTTTTTTTTTGTGTATGATTAAAATATTTTTTATATACTCGAACGACAGACCCCAGCCTGTTGCCGATGCCTTAAAT:1 - chr3L 9236902 3' - diver2 448 1 50.50 GACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTCCCAACCGCCAGCGGATGTGTTCAACTCGACTCGAAGCTTT:1 + chr3L 7755233 3' + F-element 290 1 57.43 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGTCCAGAAAATCGCAGTGCCAACGATGGACAGCTGTCCAGCTTGAGTTGAGTGGCCAGGACCAGGAA:1 + chr2R 17234623 3' - 1360 77 1 60.40 TGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGGGACGATGGCTGTATTTCGCCAAGTGCGTGTTCTTCTCGAT:1 - chr3L 26852035 3' - diver 37 2 58.42 GAAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTTGTACGATTTTCACATACCCTAATTATATAATTAGATAA:1 + chr3L 8941657 3' - Cr1a 4092 1 61.39 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATTAATGACGGCAGCAGAATATCTTCTCACTAGATGCCATGAAACTTGGTTTATCAATCTTA:1 - chr2R 5968760 3' + flea 4999 2 65.35 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAATAACCTGTTGTGGTAACAATCCATAAACCTTGTAACAGAGCA:1 - chrX 2253829 3' - Tirant 1 2 71.01 GCAAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCATTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTCCGTGGTCTTGCAGAGGAACTTTGTGAG:1 - chrX 18102633 3' + Cr1a 138 1 70.83 TGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATCAGGTGACCCAGATCCTGTTCGTCTTTCAGGCAATGCTTGTTTCAGCAAGTGAAA:1 - chr3L 23080357 3' - 17.6 351 2 59.41 TTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCACCTGCCATCGTTTTTAGTGCGTTGTTATTCA:1 - chr2L 306491 3' - Tirant 8152 2 69.31 AGTGTCTTTGGTCTGACACTTTCTTGCGTATCGCAATACAAACACACGTTGGAGACTTACTTCACTCCACACACACACTAATACCAACACACATTATGG:1 + chr2L 22497725 3' + Tc3 322 1 68.69 ACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCTATCGGCAGCAATTACTTTTGTACGATTCAGGCCCGCTG:1 - chr2L 15997381 3' + 412 7151 2 61.39 AAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAACTGTTCTGTCGTGTGTGTGTGCGTGAAAGAGCTTTTCTTTGAGAGGTTTTCGGGGC:1 + chr2L 7894055 3' + flea 482 1 60.40 CAGAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGACGGGAGCAGGTGAAGGGGAAGAAGGCACGCCATAAACATGAAGTGCTGTCTGAAG:1 + chr2L 18570816 3' + I-element 312 1 55.45 GAATGTGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGGTTTTCCTATGGGAAGAAGGGGGTGGTGGTTGGCTTCCTTATCGCCGCCCGTTCGCGACGGAAGCTTTCAATTT:1 + chrX 13057876 3' - accord 185 2 35.64 GCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGAC:1 + chr3R 3320510 3' - 1360 42 1 79.21 ATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTGGCACACACAGACCTTTCCCCGTTCAATCTTATATGCTCGTAATTTGTGATCTAATTATC:1 + chrX 14732477 3' + roo 126 2 59.41 CTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTTTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAA:1 + chr3R 20495783 3' - Juan 4122 1 74.26 ACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGCTTTTATGGCCTGATGAAAATTCTTCTTTTTGCGCGTTTAGTTTTTCTGCGTTGGGAGTTTCTG:1 + chr3R 14279253 3' - Chimpo 167 1 68.32 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATG:1 - chr3R 21799503 3' - jockey 4780 1 57.43 TGTTGCAGGCGCTGGATGCGCGCCACTTGCAACATGTATGTCCAGCTGCGTATTATTCGTTTAATCATATAGGTTACAATGACCGACTCGTGCGAGTGGGC:1 - chrX 8553063 3' - HeT-A 5650 1 58.42 CACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTAAAAATAGTGACAGAGTGTGTTGGAGACGACAACGACGTAGCGGGTTCGAGAAGCACAGTGGAGTCAGTGG:1 - chr2R 677435 3' + Circe 7367 1 59.60 GATCTGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCGTCCAGCACAACACGCCCCCGTTGCGTGACAGGGAAAACAGAATGCGAAAAGGGATCG:1 + chr2L 2448106 3' + 1360 3178 1 52.81 AATCTTGGAGCGAAGAGTGCGCTTCTCCAATGCCACAGCTAACAACAACAGCAACCACATACACCCCACTAGTAACCAAAACCACCAACCACCGAACCCAA:1 - chr3L 5887716 3' + Doc4-element 164 1 72.28 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATAGGATAACTGCATGCCATCCTTAAACCGAAAACGGAATTGTTGAAGGCGGCCCTCGAAAGTATGC:1 + chr3L 10035697 3' - jockey 4771 1 64.36 GGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGAAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGTGCCGAAGAAGAACTTCATCCACATC:1 + chr2L 4964747 3' + R1A1-element 5008 1 63.64 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGTTGTGTGTTTACTTTAAGTTTGTTGTTATTGCGAGGAATAAATAAATA:1 - chr2L 1359991 3' - Doc 33 1 79.00 GCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGAAATCGTTAGATAGGGACGTCTGATATCTGTGACTGATTTAAGAAGTATAATCCTTTTTTTTGGTTGCGA:1 - chr2L 20646913 3' - Tirant 8158 2 46.39 GTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTATGATTGATGTGACCGAGCATGGTCCAACCGAAAAAGCGATGCCACAACTATGGAGTGCTCATT:1 + chr2L 5456261 3' - 1360 3199 1 65.35 ATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGTCTTGAATTACAATTAGTTTTTAGCAAGGGCACGCCGAGAAATCCGCTC:1 + chrX 16762223 3' + roo 139 2 52.00 TGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTCGTGGGAGTTAACGATAGCTGGAATCTCTTGTGGGCCCACGACTATCCATTTCTTTCGTTCGC:1 + chr3R 10815803 3' - transib2 486 1 61.39 ATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGTTCGCTGAATGATGTCTGCACTTGACTGTTTGGCCATTGAATTGCATCGCACTGAGATGATGAAAGATGTTCTGGG:1 - chr2R 23480545 3' - F-element 4332 1 62.38 AAAAAAAAGGAAAAGAAAAACAAACTCTGTTGCAACTCTGTGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCAACAATGGGGATCAACAAATTAAAGTAATTTCCTACCGCA:1 - chr3L 10780350 3' + Doc2-element 254 2 62.38 ATCAGGATCTATAGCCGAGTCCATCTAACTCTGTTCTTCCGTCTGATCGTAAAAGCGCCGAGATAATACTATAACTAGAAATATGATTTTAAGCATGCAGA:1 - chr3L 27331677 3' + INE-1 93 1 61.39 TGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAATTGCTGTAAGCGGGAGAGTTGAGTGTGCGAGTTGGTAAGATGGCAAGATGGGAATAAAGCTGGCGAAAAGGCGACG:1 - chrX 6503902 3' - Porto1 499 1 54.00 AATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTATACGCTAGCCACTTAGCAAAGAGAGCAAATCGGCAGACTCTCTCT:1 - chr2R 8061415 3' - I-element 287 1 54.46 TGTTTGGTTTGTAGGAGGGATAGGCATGAAATTTGATGTGACATTGTTATCGCTGCAATACAACCGAACAACTGACAGTTTGTTTCCAGCTAATTGTGGGC:1 + chr2R 8417742 3' - I-element 5062 1 75.25 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCTCAATAGAAGGAGAGACGAGAGCCATAACCAGACCTGAGTGCTACCCCTCC:1 - chr3R 24749512 3' - Tirant 8111 2 61.39 TATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTGCGAATTGTCCGGATTCCGAC:1 - chrX 3229982 3' + Tirant 212 2 77.23 TCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGAGGGTCCAGATCGAAACGGTTTGTTTTCAGCTT:1 + chr2L 9851483 3' - Transpac 173 2 73.27 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTC:1 - chr3R 14913145 3' - blood 7037 2 54.46 CCGCTATGAAGCTCTTCTCTTTGTAAGCTTTAAGCCATTCGCAACTGAAAGTAATAAGATCAAGATGTTGTCCGACTCGCAAATAAAACTCTTCAGAGGGA:1 + chr3R 9152580 3' + gypsy3 93 2 73.27 GTTTGGAAGTAATTGACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGAGCGTGTTTTTCCCTAAGAGTTGTGCATTTCAATTTGCCTTGAATCG:1 + chr2L 15466823 3' + R1A1-element 132 1 57.43 CTCAGGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGGGGCTTGTTGTGGACTCCGCGCTTGAGTGAGCTCTCTTCCTTGCGCAGCTAGGGATATC:1 - chrX 2417074 3' - TAHRE 10060 1 58.42 TTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACAGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCAGTGCGGGAAGCGGAAAGTATCTGA:1 + chr3R 8460361 3' - R1A1-element 5325 1 74.26 CAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTCACCCACAAGGTGGCAAAGTAAGCAGAGATAAAGCCAGAAGCCCCCGACTTCATCATTAAAC:1 - chr3R 17829004 3' - blood 7286 2 68.32 ATTTATTAACGACCTCCCGTTAGTAATAAAAAATTCGCGTACTCATGTATGTGGACGATGTTCAAGATCCTAAATAGTTGGATAGATACTTTGCTTGTACT:1 - chr3L 2189201 3' + Q-element 528 2 60.40 AACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATCAATAAATTACAACAAAAAATTACGAATTCAACGATGTATGATGA:1 - chrX 10660935 3' + HMS-Beagle 7012 2 61.39 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCCTCTCCAACTCCAAAAATGTTTGTTATTGTATTTTGGTCTACGTCTTGGAAA:1 - chrX 22128764 3' + 1360 3369 1 55.45 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTTCTCCACGGATGGATTTTTTCGTGTATCTTGATATGCACTGAAAGAAACTGGCGTATATTGCAT:1 + chrX 5726801 3' + roo 397 1 67.33 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACGGGACGATGGCTGTATTTCGCCAAGTGCGTGTTCTTCTCGATATCCAACGCAACT:1 - chr3L 26852022 3' - diver 5912 2 55.45 TGCACACACACACACACACATACACATGTGATGAGGCCTCGAACTCCTTCGCACTTCGAAATCGAT:1 + chr3L 11035220 3' + accord 182 2 86.36 TTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTTTTGCTGTCATTATTAAATATTTAAAGGAAACGCTTCCCTTCAACTTGGCTTAAAA:1 - chr2R 10762766 3' + gypsy6 171 2 63.37 GGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATGCTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAA:1 + chrX 21772501 3' - springer 50 2 63.37 AACCGNAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTTATAGATAACTCGTCCGGCGAT:1 - chr2L 22407489 3' + roo 352 2 75.25 AACAAGATGCGTAACGCCGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACGAGGGCCCACGGACAACCTATTTTTTTTC:1 + chr3L 11667590 3' - 1360 3373 1 68.32 CGCACAAACACGCACACACACAGACAAGCTGGCAAAACGAAATTTTAAATAATATGTTCGCTGCGTGCTGCCGGCGTGTTTGGGGCATGGATGTTCTTG:1 + chr2R 13171955 3' - Stalker 445 1 67.68 AAACCAGGTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGTGATTGATATAGTTGAAATTTGTATTGCAATCGCCCTTGAAAGTAGGCAACATTTTTGTAAGCAAATTACCA:1 + chr3L 12707845 3' - jockey 4769 1 66.34 CCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCGCCCACTCCCTTCGCCCAATCTCTCTG:1 + chrX 12778765 3' + I-element 4904 1 73.27 AATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTTTTCTTGGAACAGTCTGAGTGTGTGCATCTGATGTTCTGTCAAAACTGTTTGCATCAATGAAAACGAAAAC:1 - chr3L 22047273 3' + Cr1a 3998 1 60.40 TAATCACGGTGGCTGGGCGCATGTACTTATATATTTTCACTTAATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACCAAGCTCAACTAACTTGGCTCAACGCGA:1 - chr2L 2917766 3' - Max-element 493 1 72.28 ATAGAGTCCGGTAAAACTCACCACAGTGTGTACGTGTAGTGGTGCATGAATAAAAAACAAGAAACATGTAACTTATA:1 - chr3L 3471586 3' + invader5 3843 2 63.64 AATCTNTCTAGATCGGATTGTAAGTTCAAATGGCGCGAATTGTCCTTGTGCTGGAGCTTACTTGCTAAATTGGTACCAGTTTCGAGTCTTACGAAAAGATT:1 - chr3L 12269629 3' - Q-element 635 2 54.46 CGATGTTTTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCCAGCCGACAGGCCCTCACCAATCTGGTGGCCTTTGC:1 + chr3R 26467287 3' - jockey 4622 1 62.38 TTCGTAGCAATATGATGAAATTGGGCGCTGTTTATAAATATCAAGTTGGAATATAAAAAAAAAAACTGAATAATAACAGTTGAAGGCTTCATGGAAACGCG:1 - chr3R 24545428 3' - 1360 3108 1 67.33 AGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACTCACATCGTCTTCCATAATGCTGCTATCCGCATGCTGAACTCCATCGGACTTGGGTCTCCGGCTCCGTTCCC:1 - chr2L 21719576 3' - accord2 153 2 78.22 GTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAACATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAACGATAAGGTTACCGCATCGATATTGAAATTTT:1 - chr3L 21899468 3' - hopper 371 1 64.95 GTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGGGAAAATTGTTCACAAGAGTAAT:1 + chr3R 433146 3' + 1731 293 2 57.43 GTATAAACTTCGAGATCTCAGGAACTACATAAGCTAGAAAGATTAGGCACGCAGATTTCAGAGACGTAGACGAAGTAAATTTCTATCGAACTTTTTTTTCA:1 - chr3R 24826085 3' + INE-1 137 1 86.14 TTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCG:1 + chrX 4740572 3' - 17.6 44 1 75.25 GAAGGNACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAACCAAATCAGTCTACTACAACATTATCATGACCA:1 + chr3R 9450100 3' + Quasimodo 285 2 67.33 CTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATAAAACCAGTAAGGCAGGGAAATCGAATACTGGGAAATTCGCTGGCGAGGCAGGGAAATGAGCCA:1 - chrX 17765173 3' + Ivk 5370 1 67.33 ACTGAAAAACTTCACGAGGCGATCAGCTGTGAGTGCTTTTAGCTCGTTCTTCCGCCGGCAGCCAGCTGTTATTAGTGTAGCGGCGCCACCCTATCTGGAGC:1 + chr3R 6387007 3' + G5 207 1 65.35 GAATATTTTTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAATTAGCAGATTAAAATTATTCGCCCTAAAGGGGACT:1 - chr3L 15676045 3' + 1360 401 1 64.36 CTGTCGTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATAAAACATTATAATGTAATATTTAACGGCCATGCTTAATATATTCATGTGCCATTGGAAACTAC:1 + chr2L 1341278 3' - 1360 3303 1 66.34 TTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTGTCTCTAGAAATATATATTCCGAAAATGCATTGAAATTCAACCAATGGCCGTCCACTTCATTTTGATATCC:1 + chr3R 20495830 3' - Juan 4075 1 74.26 AGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGCCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCATTGTCTGTCGCTTGGTTGCTTTCAACTTTTTTTGAATTATTAC:1 + chr3R 26072702 3' - Tc1-2 229 1 62.38 GCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGTTGCTTTTTTTTCCTCAAATT:1 + chr2R 13646376 3' - F-element 4481 1 77.94 AGTTGGTCGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCATCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGGCATCTTGGCAGGTTTTTCACGCTCCTTGAGTGACGAGCACGGAT:1 + chr3R 28440336 3' + Rt1a 4833 1 58.42 AGAACCTATGTAGGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTTAAGCACCCGAATTGAAGCCACAAATGAAATGAAAATACTTT:1 - chr2R 10693501 3' + rooA 275 2 75.25 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGGAATTGCAATTCCGATTTTGATTAGGCCAATTTAACCAAATCTGTCACAAT:1 + chr2L 10081022 3' + mdg1 7433 2 50.50 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCCGACTTCCGTAGAGGCGCCCCTAAGTAGGCAACGCTTTTTGTGCCTGCTTTTATGG:1 - chr3R 31159624 3' + hobo 2921 1 60.61 GTGGCCACGTTCAGCAACAACTTTATTGCTCCCATTAAATACTTAAACATTTCGCCGTGATAAATGCAGCTGAAATAATGCGCTGGTCTAGACTATCCTTC:1 + chr2L 17338729 3' - micropia 5197 1 70.30 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAAGTAACCTTCG:1 - chr2L 9823638 3' - hobo 38 1 59.41 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACTTCTCCTCCTTCCCGAATTTCTCACTAGTTGTGGAGAACCGAAGTCCCTGTTTGGAACTGGAGATTAGGAA:1 - chr3R 23700893 3' - mdg1 7043 2 68.32 TGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGATAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGCGTGTGTGT:1 + chrX 6802637 3' - blood 7182 2 55.70 GCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGTTGGAAGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTTGTATTCTGACTGAATGCCTTGCTGTTGGACTCGATGT:1 - chr3L 1331952 3' - HeT-A 5730 1 65.35 TTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACCCGAGCGACGATGAGAGAGGGCA:2 - chr3R 22899159 3' - P-element 13 1 64.36 AAATTAGTTATACAGTTCAAATTGGTTAGCTACACCTACATGCATTTGAAAAGTAGTAAGTCGACATGTGACTATATGTG:1 - chr2R 22148126 3' + Bari2 108 1 70.00 TTTGCTCTCAATTCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCATTTTGATTTAGATTCTTTCGAGCATGCTGAATTTCTAAAAACCTTTATGACATAA:1 - chr3R 21344076 3' + 1731 242 1 58.42 ACACATATAGTTGTCTGCTACCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGATGTAGCGCTCGTAAGATCATTGTTAAATTTAAAAACTGGTAAAAAAGGAAA:1 - chr2R 3492792 3' - 1360 162 1 57.43 GAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCAATCTT:2 - chr3R 14882070 3' + gypsy5 7336 2 56.44 TGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATATACGTAAGGATTGGATAATAAGCTTGATGATGGTCA:1 - chr4 1016261 3' - Ivk 5061 1 67.33 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCT:1 - chr2R 6838497 3' - I-element 43 1 72.28 TTTTTTGGCGTGGCTTTAGAGGTGGCTCCACGCAGCTAAACCGTGAATCGCCAAAATGATCTACTATATGCTACTCATACTGCCCGTGGTCCTGGCCCAGG:1 + chr3L 15337249 3' + 1360 56 1 78.22 CACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCG:1 - chr2L 22719600 3' - 1360 46 1 73.27 TTCGTCTTGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCTTTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTCAAGCGCGCTAATCGCGGAGTGGCCAGGATTTGTG:1 + chr2R 16286028 3' - F-element 218 1 41.58 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATCAGATAATATAATTATGTATATTGTATATAACG:1 - chr3R 24840003 3' - I-element 44 1 66.34 GGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGATAGTAAGAGCTCCTCATCCTTCGCCCGTTTTGCATTCGACA:1 - chr2R 11076230 3' - G6 1821 1 59.41 AATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCTTTGTTATTTCATCATGGTGTAGACACACACGGGCACACGCACACGAACGAAACACTAGGATTCGAGTCGCGAAA:1 - chr3L 5691226 3' - P-element 178 1 56.00 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGG:2 - chr3R 15072579 3' - pogo 36 1 65.35 GGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGCCGTTGAAGTCTGAGTAGTTGTTGTAGAAGCTTGGGT:1 + chrX 4245132 3' + R1A1-element 5008 1 63.37 CGTATATATATACATACATATATATATATGATTGTGTTGTTTTGTGGCTGCAAAGCCCACACTTGGCTGTTGTATTCAAGAGAAGACGCCACAGTAGAATT:1 - chr2L 19634308 3' - 1731 4412 2 70.30 AAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGATTTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTAGGTTGGCCATGAACTAACTTCGAATTTGACCAGT:1 + chr2R 9019981 3' - 1360 3009 1 66.34 ATGGTACATTAGAAACGAAGATATAGATGATGACTCAGCCAGAGTCAACAAGCGAACTTAGCAGCAATAAAACACGGCCTCAAAAGACACTTACAGCTCAA:1 + chr2L 21038727 3' + Porto1 4370 1 76.24 AGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTCTTGTAAATTTCTATAGATTTGCCAAAAAACTTTATTGTCCTTTTCACTAATCTCTAATAATGCTCATCACCAATCAA:1 - chr3L 13000010 3' + INE-1 156 1 56.44 TGAAAACCCCATTGTCACCTTGGTCACTATATTCATTCAACTTTGTCTTTGAGCTTTGTTTAAACTTGCTCGTCGCAGTCCTCGTTCGTTTCTCATTTATT:1 - chr2R 13770031 3' - BS3 1730 1 75.25 CACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAACGTGCTGCAGCCGGAGCCTTTGTCGCAATTACTCGGAATTCCAGCCA:1 - chr3R 27390539 3' + Tirant 8121 2 54.46 GACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGACTACCGCCATCGGACACAATCATTCATTAGATCACGGA:1 - chr3R 29275342 3' - Rt1b 4962 1 61.39 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTC:1 - chrX 10555434 3' - Tirant 54 2 76.24 ATTTTATCAGTCTTCTATGATGTATGGTCATGTTATATTTCGTCAGTGGCAACCCCAGCATCAGTATCGGCGGAGCGGAGACTTTT:1 + chr3R 13644371 3' + Transib5 2763 1 69.77 ATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGCCACCGGATTCCCTCGAACAGCCACCGGAACCCTCAATGGTGATTCTTCCCGTTCATTATCTGT:1 + chr2R 19175252 3' + Quasimodo 268 2 69.31 CCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGCTGTTTTTCATCCGACTCTGGCTAACACACACTGACACACATGCACGCACACTAATT:1 + chr3L 14588592 3' - F-element 4412 1 59.41 TATCCGTGGTGATGTTGAGAGTCCCGTCTTGACCAGTCTGCTTAACTTCAAGTGTGCTCGGCCTAAGAAATCAATTCGAAATGAGCCATTAAATGCTGCTA:1 - chr3L 3873068 3' + Cr1a 4057 1 58.42 GTCGAAATCTCAGGAACTTTAACGCACATTTATTTGGCCCAATTCCTAGGAGTTCCTTCTAAATGTGTTCACGCCAAGATCTCACTTTCCAAATAAGTAAT:1 + chr3L 21363702 3' + INE-1 145 1 73.27 AGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAGTTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCTTTGCTCTCTAACGGTTTAGCTCTCTG:1 + chrX 10309184 3' - R2-element 73 1 71.29 CCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAATGGCCACCTATAAACCCATCCCGCTGACACACTTTCGCTTTCATCGACTGCAATCGCCGATCTCTGAC:1 - chr2R 18607005 3' - Rt1b 4834 1 70.30 GTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCATTACAGACAACAATTAATCTTATATGGTAGTTGTACGGAATTCCCATAAAATGACTATTGTTGCATATT:1 + chr3R 14299179 3' - gypsy12 10122 3 56.44 TTAGGATCAATAGCCGAGTCGATGTGCCCATGTCTGCCTGTCCAGTGCATCGACTGCGAGATACCCATCAGATAATCAATTATATGACGCCCTGAGATAT:1 - chrX 158978 3' + INE-1 94 1 61.00 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTTTGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAC:1 + chr2R 4675996 3' - 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chrX 13712577 3' - INE-1 20 1 70.30 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCA:1 + chr3L 16973438 3' + S-element 1675 1 72.00 CAGCAGTAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATAAAACGAATTTGCGGTTTATGTTCCCAGCAAGTCG:1 + chr2R 23252154 3' + Doc 4568 1 61.46 GTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAATGTTAACAGGGTTTCCCGTAGCTTTGCATTTTTTGCTGACCTTGCTTGGTG:1 - chrX 14597415 3' + BS 5064 1 50.50 ATACGACAGACCGGACATACGAACTGAATTGCGTCGCATGATTGCCCTGGTTTATGACTTTACTCTGCGCATTGCTGCTGGCTCATGTTTGGTTTTTCTTA:1 + chr2L 18566347 3' + R2-element 3108 1 71.29 ATTCAGTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGACGGCATAGGGAGAGACCA:1 - chrX 697465 3' - roo 52 2 76.24 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCAATCAAAATTAATTAAGGCACAAAGAGAGGCGGCCAGATGCTTTGCATGGCTTTTCCTCCGACCT:1 - chr2R 14121047 3' - I-element 11 1 67.00 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGTTCAAAT:1 + chrX 13560782 3' + roo 9039 1 53.47 CTACAGCTCCGCTCGGCTCGGTGGCCGAGAAAGAATTTACAACATATGCAAGTTGGACGTACAACGGGGCGTATGATGAATCCA:1 + chr3R 8494809 3' + gypsy2 6711 2 77.38 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGATGCG:1 + chr3L 22324086 3' - 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HMS-Beagle 6670 1 54.46 TATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATGTTAAGCCTGCGGACAGACGACCTGAAGTAGATGCAATGAACAGGGGAGCTTTATGGGTATTGTAGGTAA:1 + chr2L 3245033 3' - rover 6953 2 78.22 TTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCAAAAGTAGCGGGTGAACCAAATGCAGTGGGGTGGTGAGAAGGTGGGGAGAGCGAGGTAAA:1 + chrX 13747437 3' - P-element 12 1 67.33 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGGTGTGGTGGAGCAAAGGATTCCGGATT:1 + chr2R 10688486 3' - jockey 4759 1 73.27 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGAATTTCTCCATTTGTTTGACCACATCACGCATAC:1 + chr2L 6605643 3' + blood 7373 2 62.38 CGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTATTTATTATATTCCAACACTTTCAACACCTCTCAACAAGTAAGCGAG:1 - chr3R 7017357 3' - I-element 180 1 55.45 ACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGTTAAAATGGCAAGATGATGAGGCAGAAGTCAGAAGGGAAAATTGTGCGGGAAAATCAAC:1 - chr3L 10579349 3' - McClintock 6162 2 61.39 AAGCANAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTGCCGCTTGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGG:1 - chr3R 178119 3' - BS 39 1 65.35 CGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAACAAGCTCACGTGGTATTGCCGCAGTCGCAGCAAACTTCCTTGCTGCAGCA:1 + chr3L 14012960 3' + gypsy4 448 1 58.42 CACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCG:1 + chr3R 2533950 3' + gypsy8 4898 4 50.50 ATTAGAATGATAACTTAATTTATAAAGTTTACATCCGGATTTTGAAGAATATCGATTACTTGAAGTTTCGAGAAACAAGAAAGGTTAACATGAAAACCCCC:1 + chr2R 15172897 3' - transib4 2173 1 60.40 AGGGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCCGGTGAGCTGTTGCGTTAATTGCTTTGTGAATGGGGTCCGCCTTGGCCGGAAAGTTAAAATTTAACTTT:1 - chr3R 28964643 3' - G6 275 1 62.24 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTGAACCCACAAATTCTCTGAAAGTATGATAAGTTTTTAAATTTTGTAAGCAGTTACGTTTATTTTATAT:1 - chr2R 21266402 3' - roo 6 2 73.27 AATAANAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTGTATCAAATATATGTATTTATGAAATTAAATTATCAAACGGAGTAGATTTTAACCACCTGCTG:1 - chr2R 8157160 3' - Transpac 10 2 67.33 CAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAAACCGAACACACCTAACCCAGGTAACACCACATAACAAAGTCATAACAACAAGTGCAAGAGCCAGT:1 - chr2R 11752200 3' + I-element 5096 1 71.29 AACTCATAGCGGCCACTCCAACGGGAACTAGTCCCCAGTTGTGGTGGCTCCCTGATTAACACTCGCTATGTCCTGACCGCAGCCCACTGTGTAACCGATAC:1 + chr3R 19649832 3' - gypsy6 7535 2 77.23 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAG:2 + chr2R 18865892 3' + roo 360 2 75.76 GTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACTTAGCTTCAAAAACGAAATATGAACGATTTAATTAACTTAATGTAAAATGGATTAACTGTG:1 - chrX 20692352 3' + Tc1 1573 1 65.35 TGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGTTCAGCTGTGCTTGTTGCTTGTACACATTTGA:1 - chrX 18195542 3' - BS 4816 1 68.32 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGACCGTTCACCG:1 - chr3L 776086 3' + 1360 3367 1 55.45 GTAAGGAAATAAATTGATGGAAGGGAAGGGATGGTTGTTGTGGATCAGTCATCATTTTGCAATGATGCTTGGAATATAATGGCATAATTTGTTTAAATATA:1 + chr3R 22062159 3' - Gypsy12A_LTR 2251 1 75.25 AATAGAAGCATTGAACTGATGCTTGTCTGTTGTCAGAAGTATTTGGAGACAATTTGGTTACTGTATGGCTCGAGAGAGGAGTTGCCAGCCC:1 - chrX 22564622 3' + Bari2 43 2 60.44 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGCTTGTTAAATAGGGATTTATAGGTGATTTCGTCATTCTCGATACTCAGGATGTTGATGTGCCCTTCCTCTG:1 + chr3L 16228148 3' + Transpac 253 2 73.27 TTCATAAGAAATTATAATAACTTGAGGTAATGGCTAATAATTGCAGGCCACGATTTCGCAAAATACAAAAAAGAAAGAGAGCCGCGCGAGGAGAGAGTGAT:1 + chr3R 19103715 3' - S2 1451 1 75.25 CTGTGTGTGTGTGTAACTATATAGCCAGCGATTCATTTGGATGAGGTGCCCCAAAGCGTTGCGGAAACGGAATTGAAAACCGCGAAAAAGATTGCATTGAC:1 - chr3L 18503160 3' - Quasimodo 31 2 71.29 CGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCCCGATATCGGGGGGCTAAGGTGGAGCCCCGTTTTGGGGTACAGCCGATGCAGGCCAACTAGGAGCATTTG:1 + chr2L 9758909 3' + Bica 461 1 72.28 TTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGTTTAGTTAAAATACCAAATGTCAAGCGCCTTGTCGCATCCTAATAGGATGCATTATATACAT:1 + chr3R 4152134 3' + invader4 44 2 75.27 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCT:1 - chrX 11060486 3' - I-element 35 1 57.43 TGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGCTATGTGCGCGAGATCTTCCGGTATTGCGGTGCACCCATCGATTTCGAGGTGATCG:1 + chr3R 25681386 3' - F-element 4431 1 65.35 AAACGAAAATTAATTTAATCCAAGCAACTTAGTAAAATTCTGTTGCTTTTGCTTACACAAGCCGAATTTAAGCGGCTCCTTTAAGGACGAAGACGATATGC:1 + chr3R 6387133 3' - Copia1_DM 4276 1 62.38 AAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGATTAAATTTCCTTTAATTTGCGCTTCCT:1 - chr3R 5452841 3' - jockey 115 1 72.00 CAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTCTCGTATGTGGAAATCGATGAAATGACTGGCCAGC:1 - chr2L 16266387 3' - Tc1 1450 1 63.64 ATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTAAAATAAAGAACAATGGACAAAAGGCAGAAACAGAAGCAGAAGCAG:1 - chr2R 23659445 3' + Stalker4 286 4 72.28 GGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGCATTTTTTGAAACTCGGTGTGGCTTAAAGGATTGACTTGCCTCCGTGTAAT:1 - chr2L 11772188 3' - F-element 4478 1 54.46 AAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCTGCCCAGGTTTTTCTAAACATCGCGATGCGAAAATGACAGACAATTTGATTGTGAGTGAAAGGTTTTTAAAGACAT:1 - chr2R 19472756 3' - Tc1-2 364 1 64.36 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTATTCGTCTCGCTCCTGGCTCCAT:2 - chr3R 27448511 3' + roo 353 2 77.23 AAACCAAAAATGAATTACCAGCATTTCACTCCAATGCCAAGGCGGCCAAGAAGGCCTACAAGAAGATGGAAAAGGAGCAGCGGTGAGTTCAAAAACGAAAT:1 + chr3R 21178397 3' + I-element 392 1 64.36 AAATTGTGCCGAAGAAACTCCCGCGACTATAAACACTTAAAATTCCATCAACTGAAAGCCCAGTAAACAGTATCTCTAATAGATCCAATTACAGTTTATGT:1 + chr3L 6812116 3' + HMS-Beagle 364 1 76.24 TTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACATTCAACTGGTAAAACATAATTCGATATCCTGCAACTTTGTAATATATTTTAGCATACTTTTGTGCTGACTATTTA:1 - 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INE-1 581 1 73.27 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCTTTAAAAAGGTGAAAAATATATATTTGTGGAAAATTGTGAGCTTGCGGAAATAGCTTCTTAAACTGTTTTGTGT:1 - chr3R 25982151 3' - hobo 24 1 76.24 CAGGTCCTTACAAATGAAAACAGGTGGTTTAGCATGACGCGCTTCATGATCAAAGTCCGATCGCCGGCCTGATCGTCGTCGTCGGGCGTGGGCGGCAGTGG:1 + chr3L 2563859 3' - Chimpo 3922 1 62.38 AAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAAGGCTTGTACTCACGGCTCACAAGCACCACACGCGTTGCTATCAGCCGAGAACAATACGTTTCGATCCG:1 + chr2L 19220209 3' + Max-element 8256 2 58.16 GCACCNGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTAGTATGAATTGTGCATAGAAGTTAGGTAAGTAGAT:1 + chr3L 22324083 3' - hobo 46 1 64.36 ATTTCCAAATAAAATCTGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCGTCAGACAGGCAGCTGCATTAATCAGCTTGCA:1 + chr2R 19964591 3' + roo 9026 1 65.35 AACGAAGATCGCCAATACGACAACAGACAACTTTTGTAGTTGTTTTTTTTTTTAAGCTTTTTTTTCCAGTTTTTGTGCCCAGGCAATTTTGTTGCACATT:1 + chrX 8576487 3' - accord2 7569 2 58.00 CACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATTCGCCACGCCAGACGAGATGATCAAAGAGATCGAGCACTATGCCCTCGTCGGCGACCAGCTGGACT:1 + chr3R 15305210 3' + HMS-Beagle 6717 1 70.30 CTTCANTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGG:1 - 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jockey 4789 1 52.48 CGCGGTCTGCACTTAATGAGACTTCTAAGCTATTCGACACGTATTTCGCTCCTCACTGCGTCATATGGAAAACATACGTCGAATTTAAGACACCTCCAGC:1 + chrX 3902306 3' - Burdock 6325 2 55.00 GTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTAGCCGATGGAAAATTGTTTTGCGGAGGCCGAGATAGTTATTAAAATACTTATGGACAGT:1 - chrX 21196952 3' + Bari1 206 1 65.35 CACTCCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTGACTGCCGCCCGCACTGGCCGCACTTGCAGGTGGGGGCAGG:1 + chr2R 11270193 3' + I-element 7 1 54.08 TTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAGGTTTTCTAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATATTTAAGACCATATGATCCGTTGGTGGTAATCGATAGCA:1 + chr2R 20065878 3' - Doc3-element 4688 1 62.38 AAAAACGACTGAGTAGTTTGAGTTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCATCGTTGACATATCTCGTTAATTTAATTTCTTATCGTAGGGATAGCATCGTC:1 - chr2L 671365 3' + accord2 7474 2 60.40 GGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCCGGTTAAAATACTACGTGTCCTTTTGTTCGACTACACTTCTTCCAT:1 + chr3L 13832457 3' - HB 1320 1 54.46 GATGGTGTCTCTCTTACAGGGGAAGAGGGTGATAAATCCACTCCCTACAAGTACCCTCAAAGCGTTGACCAAGAAGTCAACTACAAGAACAGCAAACGGGA:1 - chr3R 7429936 3' - gypsy3 6885 2 41.58 ATTGATCCTGATCAGGAATATATATAATTTATGTGGTCGGAAACGTTTCCATTTGCCTGTTACATACTGGAAGATTGATCGACTGGAAGAACGATAATCAT:1 - chr4 625635 3' - INE-1 83 1 66.34 GGACACAAACACTCAAGAATCATTGCCTTATTAATTTTTCCACCGATTTGTCTATATTTGGTCGGCAATGAACCATTTTCCCGATGACCGACTTCTCGCTA:1 - chr3R 27578832 3' - 1360 456 1 66.34 GTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTCCAGTGTTTTCCGACAGGACTTTTTCGGCGATGAGATCGCAAGTGTTCTGGAAAGTTAATTATGTAG:1 + chr3L 20383499 3' - 412 7429 2 70.30 GCAAGTGCGACAAAGCGAAGAGCTGGAATCTCTCTATCCTAAGCCTAGGAGACTCACTGCCCGACACTTTCGCAGTTTGCTCTTCAGTGACTCCTCCGCGC:1 - chr2R 2109998 3' + mariner2 305 1 76.24 TCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCAACCTTTGAGCCCTGAGAAAACTGCACCAGGATTT:1 - chr3L 13484985 3' + jockey 82 1 64.36 TTCCCCCTCTTCTAGAACTGCCTCTTTCCGAAAATATTTGCTTCCTTATTATCGATAATATTCCGGATTCATATAGACGTGAAGTATAATGATTATGACGT:1 - chr2R 5182975 3' + Gypsy12A_LTR 2026 1 59.41 GGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAGCTTTCTATCCTCATTCTTTGTAGTGCTCTCTTCAGTTCGTGTAT:1 - chr2L 11832474 3' + X-element 205 1 66.34 CAGGGCTTGCTGATAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTGGTAGCTGTCAAAGTGACCATAACAATATCCATAAAGCGTGCAATTAGCGCACCAGCAACATGTTG:1 + chr3R 10587590 3' - 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TART-A 13109 1 54.46 TATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGT:1 - chrX 17049539 3' - Stalker2 7272 2 55.45 AGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGCAATCTTAATATATTTCGTTTGTCATTCGTTTTTTGTGTACA:2 + chr2L 18568109 3' - I-element 36 1 57.43 CAAGTATTATGTATGGCTCTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCTAGTGGTACTCAACTCATGTGCAATCTGCACATACACTAATCGAGTGCAAAGTGCTC:1 + chrX 10163341 3' - gypsy5 236 2 60.40 GAGGCGACAGTTTTCTGAATTGTGGGCAATTCAAAATTATGTGGTCTACAGCATTGCAGACAGGCCAACTACCCGGCGTTTCTTCAACTTTGGCCCACAGC:1 - chrX 5433456 3' - G3 102 1 66.34 ACCCGAATTGAACTCATTAAATCTACGCACAAGTTTATAGTGCGAACATTTTCGTCACTTCCTGAGCTGCAATCAGTCGGAGTATAAGCACAACTCGCTCT:1 - chr3L 1532341 3' + rooA 7574 2 58.42 TTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCACAACAAATCCCCGAGCTCAAGAAATTAAACAAAGATATCGACGGAATTCGATAAATTTC:1 - chr3L 10631322 3' - Cr1a 4094 1 57.43 CTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGTTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:1 + chr3L 23678155 3' - Osvaldo 18 1 68.32 CACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTGGGCACTG:1 - chr3R 26331625 3' - G-element 15 1 65.35 GACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGTTGTAGGGGAAGCAAGAATGAAGTTCATCTCATTTCGTGCGGTACACGTGC:1 + chr3L 9242434 3' - GATE 294 1 59.41 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTTTTTGATTTACTACTTTAGTTTCCATTTATTTACTATTTGCGCTCAGCGTCTTGATCTGTTTGCATATTT:1 - chr2L 773225 3' - I-element 1 1 77.08 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAGATACGAACTCGTAACTGATGGCACAAGGCCTTA:1 - chr3R 17244103 3' + 412 7504 2 65.00 CGCGTCGTCGATGTTGTTCTTGTTGCCGTTGTTGTACTTGGATACAGTTAGGAAAAGCAGATGGAGACAAGAAAATGATTAACCCATTTGTTTGAGACATT:1 + chr3R 6410492 3' - gypsy10 5708 2 68.32 TGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGCACTGCGATTCTTCCCCCTACGCAAGTCTCGCCCTAATTGATTAAAAAAGAAAAAGGAACAAAAGG:1 - chr3L 6466193 3' + roo 254 2 68.69 GTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGTCTGTTAACGGATTTTGCGAGATTGCCACTGGC:1 + chrX 3305705 3' - hobo 2665 1 67.33 TAAAACTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGGGTTTAAATAATCAGCCTATAAACATTAGGTAACATTTG:1 - chr2L 9463379 3' + roo 9035 1 59.41 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTAATTTAATTAGGAACTTATCGGCAAGCAAATATTTTAAAA:1 - chr2L 20128973 3' + 412 7511 2 57.43 TGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAATCTACTATGATAAATCGGCGGAATTTGCGGATACTACTCAGACGGACACCCAACAAGAACTTAATATTAA:1 - chr3L 25878579 3' + gypsy9 37 2 68.09 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCCTAAGAGTTCTTTCAACTTGGATTCTGCCATCTTCTTCTAGATTTTACACGTGGAAAAAAATATGAAAATA:1 + chrX 9653373 3' - roo 5 2 74.26 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCTAGTTGAGAAATATTGAGAAATATGAAACAAAACATGTAACGGAAATGAGAAATGCATACCACAGT:1 + chr3L 14005648 3' - F-element 25 1 53.47 AATAAGGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGG:1 + chr3L 10464680 3' + invader3 5422 2 71.43 GTAGAATGCAAAGCGGATTGATGTTGGTGAAGGTGGCATCTGATTGTGGGCATTTTGTACTGGCTCTACTTCGATTTGCGCCAGCAACTCACCGACTATCG:1 - chr2R 24021393 3' - Chouto 6196 1 61.39 CCAATATATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTAGGTGCGAATAATAACTATGGCCATCAAGGAAATATTATTATTTCTTGGCGAAATT:1 + chrX 3309338 3' + 1360 3367 1 54.46 GGTGCCCTATGTCCAGAGAAACATCAGACGGGAGAGGTCGGCGACGCGCTCATCGTGGAGGCCACCTACCGCACCCGCCTGCAGTTGCTCACCAGGTATTT:1 - chrX 20268899 3' - Gypsy12A_LTR 1896 1 63.37 GCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGAGGCAGAGCGAACAATGCAAAGTGCGCAAAAAGTTTGCCAAAATTCGCATGCTGCTGCGGGG:1 + chr3L 16820600 3' + R1A1-element 409 1 59.00 CACTTTACCAATAGGTGGAGCACTACCACCATAGCAACTAGACCGTGTCAGTGAGCATACGATATGGCCTGCACATATAAATACGATTTTATGTGATGACC:1 + chr2L 7468317 3' + R1A1-element 280 1 56.44 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGATTTATAGGCAATGTCCATGTCAAAGCTAGCGAAAGTGCAAAATGTGACAGGGAAAATATATATGTCCA:1 + chr3L 22052860 3' - mdg1 7046 2 71.29 AGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTTCCTGGCATCTCGCAGATGGATCGGAATTTTAATCATTG:1 + chr2R 8121920 3' - Bica 92 1 74.26 CGTTTGACAACCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATAAACATCGAACAATGCTGGACAACCTAAACAACTCAATAAATCAACTGTCGACTGAGTGGCCT:1 - chr2L 15824896 3' + Circe 295 1 71.29 TATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGTTTCAGGGGTGTTGTCTAAAGTTATGGCTAAAAGGGAATG:1 + chr2R 19063821 3' - accord 184 2 51.39 GGTTGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTGCCTAGGCCTTTGATGAAGGAATTTGGTGCATGACA:1 + chr2L 9305851 3' - accord2 208 1 58.42 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCATTTTTTCTTTCAACATTTTCAATACTGTTTTATCTGCCAAGTACTGAAAATGGGGCTTTGATTTATGTATGTGG:1 - chr2R 15479863 3' - 1360 51 1 79.21 AGACCNACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTGGGTGAGGATTGGAGGCTGAAGGAAGCT:1 - chr3R 5429940 3' + I-element 192 1 71.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGCAGATTCTGATTCTGATTCCGATTCAGATTCAGATACAGATACGTATACGAATTCCGGATCTGAATCCAAG:1 - chrX 11006812 3' + roo 404 1 73.27 GTGCTGTTATACAACACAGTTCTAAAAGCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGCTAACAATAACTGGTGCGCCGTTGCCAACGGAGGCGCAG:1 + chrX 11682815 3' + Doc4-element 2566 1 54.74 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAATGCTGAAAATTAGAGGGCGTCAAATTAGAGGCAGTGAAAGAGCA:2 + chr2L 1913075 3' + pogo 2073 1 55.45 CTTTAAACGTGGGAACGTGACGATGGGGGGAGGGAGGGAGAAACGGTCATAGATATAGTTGCCTTTCCAACTTAAAGTCACCAGTTAGTTGCGCTCTTTTG:1 - chr3R 15504598 3' - Idefix 241 2 71.29 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGAGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTTTTTGCACCGAAAGTCTATTAATTTATTTCCACTGATTCAGTGGC:1 + chr3R 10054515 3' - mdg3 5285 2 54.46 AAAAAAAAACAGCAAACAACACAGCAGCTATATCCATACTATCCATACTACAAGACCAACACAAAAATATATAGGTCCTATTCA:1 + chrX 17065890 3' + Porto1 4434 1 65.48 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGAGCGTTCGAGCGGTGCGGCTAATCGAATTAGGCAGGTGCC:1 + chr2R 8145997 3' + P-element 2852 1 44.55 AAACATTTGTTAAATTGTTTGAAATTAAACTGTAAATCATAGGAATTTCTATCTTTCAATGACAATGACCGGCGACTTTCTCACTTTCTTCGTACGCTTCT:1 - chr2R 16348499 3' + HB 1511 1 55.45 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAATGTTTGGTTCTCGCCCGCGGCAGACACTTTTTATACACGCCATATTGCGTTGAGATAAATGCATCATT:1 - chr3R 9833019 3' - Tabor 9 2 68.32 AAAGTTACTGCGAACAACTCAGCAGCAGCCACGTGCAGTGGTTGGTAATACGACCAACTGTACCCAGCTCCCCCCCC:1 + chrY 1425624 3' + G-element 218 1 67.53 ATATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTGTTTGAGTGTATTATGTGTGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTCAGATCATTATCCCAATTGGGAG:1 - chrX 2221831 3' + 1360 2973 1 76.24 ACGGTATAAATTCTAGAGCTGCAGGTGCAGGGCTCGGCGGTTTAGGTGGCGATGATTGAGGCGGCTGCTGGAAAGGATTGAGGCATCTGTCAACGACAC:1 + chr3L 15080389 3' - Chimpo 4205 1 54.55 CCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCGATCG:1 + chr2R 4879025 3' - G-element 30 1 52.00 CGTTGAGATCTCAGGAGCTATAAAAACTAGAAGGCTGAGATGCCCACTCTTACACCTACAAACCTCAATAAGTTTTCAAGCCCACAATTCAAACCTTTTTT:1 - chr2L 21682703 3' + INE-1 144 1 58.42 ATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCCAAGATGGCCGAGGCGCTGTACATAGCCGATCGCAAGGCG:1 - chrX 9105213 3' - F-element 301 1 58.33 AAAGCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAAAAAAACGGCCAAAAAAGGGGAAGCCAGTGAGGATTTAAAGGAAGAGGATGATGACGACGATGAGGAG:1 + chrX 2940007 3' + invader2 454 1 72.28 AGCAGCCGATATGCCGACAGACTTATCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCGCTCTATTGGCGTATAAACAATTTTTGCG:1 + chr3R 19553792 3' + G5A 2602 1 71.29 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACATTCATCTGTTACGTGTGTGCTGCGCTGGACACAGT:1 + chr2L 14536303 3' + blood 336 2 64.00 AGACACACACACACAAATTCACACGCAGAAAGTTGCCAGGACATAGATAAGTGAAACATTTT:1 + chr3R 29269865 3' + accord 7033 2 64.52 GATGGACAGATTTTAAATTAATAAATAGTTCGTTAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAAACCATAATATTCAGTCGATAGCAGCAAAAAAGGG:1 - chr3R 18877708 3' + G-element 4294 1 78.57 ACGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTCGCTGTTTGTCTTTTGCCATGGCCTGGCATTTATATTTCCCTCCAGGAAGCAGCAACAAAAGTTGCGAAA:2 + chr2R 21237088 3' - accord 7105 2 86.14 TTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTATGCAGTAAAATAGACGGCGGTTAAGCTAACCTTCTTAAAATATGA:1 + chr3L 23099655 3' - S-element 1511 1 58.42 GGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCCAGCCACGCCCCTTTTCCCGCACTGCCACTCA:1 - chr2L 1551661 3' - Idefix 183 1 69.31 GATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCAATTGAAGTCTAAATATATTTCGAAG:1 - chr3R 18246537 3' + roo 97 2 78.22 TTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTCGTTTAATACTCATCTACTTGTATTGATTTGACAAAATACCAAATATGTATTAACGTGAAATGTAT:1 + chr3R 7769156 3' - X-element 4699 1 72.28 TTTCTTTCAATTTCTCCGCGTTCTCCACCGGTGTCTGGGTGCACTTCCCGGTCCCGGACGTCTTTTCGTTGACGCTGCCCAGTAAAACTTGTTTGGCGATG:1 + chr3L 20204328 3' - Osvaldo 1189 1 64.36 GAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAAATTCTCCGTCACCCCAAAATTGGCCGCACGTGTGTGTGTGTGCATGTTGCACATGCAGCATTTACCTGGGATCCT:1 - chr2L 18363932 3' - opus 7379 2 79.21 CTCAGGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAGATTCAGAATACAAATTCATTAAGACATACCAAACCCGAAAAACCAAAAGAGAGAATACAAA:1 - chr2R 16913791 3' + INE-1 153 1 73.63 CGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACATCTTGCTATTCTAGGGTCATTGGTTTGGGGCTGTATCACCAGCCGTGGAGTGGGAAAGGGAACGTGGTTATCG:1 - chr3L 21840107 3' - 1360 29 1 60.40 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTACCATGCT:1 - chr3R 19535686 3' + hobo 2913 1 53.47 CTTTACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTATTTTTTGTATTGTATTTTTTCCATTTTACAAATCACTTGAACTAAATATATACCCTTCGA:1 - chr3R 19076830 3' + S-element 1517 1 66.34 GACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTATTTCTCATACGTCTCCGACAAACCTTAGAACCGAGCAGTCGCCATGCAAGC:1 + chr2R 24891634 3' + F-element 234 1 65.17 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAATTTGATATGCAATTTGAATGCGATTAAAGATCTATTCCTGACATGAGACCAATACTAATGCCCATTAGCTAAATGAGG:1 - chr2R 8158722 3' - Juan 8 1 76.24 CACACTCGGGTGTGCGATGGTGTTAGTGCGAACTACTATCACTCTAATTTGTTTGTTTACAAATTTCAGCGCGAATTTCGCGACCAAAAACATAGTGCAAA:1 - chr3L 18872493 3' - G6 165 1 76.24 CTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCT:1 + chr2R 2994310 3' - gypsy8 114 2 47.52 GAAAACAAAGAAAAAAAAAATGCCACAATATGTAAGAAATCCGAAAAGGCGAAGAAACGATTCGAACGAATCGAGCCAATTTTACCCCACACACAAACACA:1 - chr2L 6920995 3' + invader5 3605 1 66.34 TTAAGGGTCATATTAAATGCATAGGGATTGAAGGCTACGGCGCACACAAACGTGTAACTTAATATGAAATTAGTCTTACATTTAAACCAGTTGATTATAAT:1 + chr2L 16252743 3' + Gypsy12A_LTR 84 1 72.28 TGTGTATTTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTATACTAATTAACAAACATTAAGGTGCCCATCGCTCAAAATGTTTTCTTATTTTTTATTTGGGGGAAACGGAG:1 - 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chr3L 17858141 3' - HMS-Beagle2 8 2 71.29 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGTT:1 + chr2L 6177233 3' + pogo 2063 1 67.33 CATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAATTCTGTAATCCCCCCCTGCAGAAAACAAGCGCAAGAGCGAC:1 - chr2R 23861124 3' + F-element 466 1 59.41 GCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCCGGACGCTTGTCCGGCGTGGTCGGTGGCTTGGCTCAATTCGAGCGGAGCGTGCAGCTCATCAAGAATCCTCC:1 - chrX 16959123 3' + R1A1-element 5193 1 67.33 GCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAATGTAACGATATTTACTATGAAATTCA:1 + chr3L 10030385 3' + F-element 432 1 74.26 GCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGTCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGCCTAAGTGCGTTCGAGGAA:1 - chr4 1167748 3' + 1360 3333 1 80.20 TTTTTCTTCTTTTTTTTCTTTTTTAATGTGCCAATGTCTTTTGGGCATATGCCATGTGTGTGCCCTATATCTTAATATCAGGGAAGTAGTACATACATATA:1 + chrX 19379444 3' - Doc2-element 246 4 59.41 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATCTTATTTAAGTATTTTGTTAGATTTTAGATCACTTTACATACCAAACATTTAGATTAGCGATTTGAT:1 - 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INE-1 542 1 77.23 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAACAATGTTTTGCCACTGTTCGGCCTCCGAGTTTTACTTTATTT:1 + chr3R 28623960 3' + roo 9035 1 62.38 ATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAAAACTGCCAACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTTTTGACATTTT:1 - chr2R 2245000 3' + INE-1 139 1 53.47 AACCCAACTGCATTACCAAGATTATATGCGTCAAGCCCAATACAAGCATAAGCTTCCTTTTAAGGGGAGGCAGCTTGTCAAAGTCAGTAAAATTTTAGTCG:2 - chr3R 29094006 3' + rover 6870 1 78.22 TATCAACCTTCCACATAACTATATTGATATTGCTTCACAGCTGAGGTGTCGCTGAGTTTAACTGTCTCCAAAGTTGGCTTATCTACAAAGTATAAATTTAG:1 + chr2L 22319384 3' + Transpac 311 1 80.20 GTAATGGGAAATGGCCGGATCAGCGGGTGTTGCTAGAGAATGAATAAGATAGTTGATTTAGTATTTCGCCGTTGCCAATAGCCAAGCTAAGTGTTTATTAC:1 - chr2R 11455064 3' + accord2 263 1 78.22 TGGGGNTTTGTTTCGCGATGACGTCAGCAAAGTGATTGGTTGCCGGTTGTTAATTGGGCTCTATGTTTTCTGTGGTTTTTTATTTCAAAAGATCCTAACTA:1 - chr3L 17980449 3' - BS3 227 1 58.42 AACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTC:1 - chr3R 26331646 3' - G-element 36 1 55.45 AGCTTCAAGTGGGGTTTGACGGGTTTGGCTGGGATCTGGACTGGATCTGTGTGGCTGT:1 - chr3R 10249169 3' - G2 123 1 56.90 CGCTTCCTTCTGCCTTTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTATTACTCTACGAGAAAAGGGTATAAATACACACATACAATTTCAATATTGTAA:1 + chr2R 5768910 3' - INE-1 30 1 75.25 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATTCGGATGCCGCGCGTAATTAACGTGCTCGTGTGTGAAATTTTTTATTGCATACT:3 + chr2L 7654047 3' - jockey 26 1 61.39 ATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTTTCTGTGGCAACTCAAAACCCGCACGGATATCACTTACATG:1 + chr3R 20483958 3' + roo 8782 2 68.29 TAAATAAGGCAAAAAGAAGCGGACCAAGAAGGCTTTCATGTGAGTTATGAAAAGTTACAAGATTTTCCATTCCTAATTTATTTGATTTCATTATTAGGGCA:1 + chrX 18027401 3' - Q-element 511 1 76.24 CTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAAATCAACCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTAGCAAATTAGCAATGAGTAAGTAGACTGAACTCAGTGGCTCA:1 + chrX 6771378 3' - Quasimodo 7144 2 58.42 ATTTTTGTTCGTTTTAGGTGTTTGGGAATGATTTTATGGCTGCATCTGAAATTGGGACTTCGATTTGATAATGATTATTACTTCACTAGCTCAAACGTAAT:1 - chrX 2290683 3' - I-element 419 1 72.28 CCTCGNACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTTCCTCGGGTCGTTTTCCCTGCCGGCAACCGCAATCCGAC:1 + chr2L 2525333 3' + jockey 4727 1 58.02 CGTCGGGGAGTTCTTCGACACATATTGTTTAATGTCCCCCTACAGGTTTTCATTCGGGCTTAAATCGGAAGATGGTGCTTGCCACTGTTTGTTTTGAACAT:1 + chr3L 15502048 3' - HB 1191 1 78.22 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTG:1 + chr2R 8198508 3' - F-element 62 1 75.25 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAAC:1 - chr4 490234 3' - pogo 25 1 56.44 GAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACTATTTCTCCAACAATAGTAACTCCCACAATAACAACAACAACAATCATGGCTCATCACTGCTGTTCTGGAACA:1 - chr3L 16375069 3' + 297 6874 2 64.36 GCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGAACGCTGGACTAAAAAATAAAAATTATCTTAAAAACAT:1 + chr3L 21840337 3' + 1360 3351 1 64.36 CGTTCGACGCTGGCTGCGTCCCTCTATGTCGCTGACTGCGACGCCACTGTCGCTGGCTGCGACTCCTCTGCCGACCGCCCCTAAAGCATTCGCATCCGTTG:1 - chrX 22749979 3' - aurora-element 292 1 72.28 GAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCACCTCCTTAATGGCGATTCGCACCTGCGTCTGCTTGTCCCTGGCGGCGTACACGGTGCCATAAGTACCTTTGC:1 - chr3R 19882886 3' + R1A1-element 458 1 76.24 ATGCACACACACACACACACACATCAATCAGCCATAATGATCTGATGTGAAAACTTTTGTGCGTGCTTGGCCATTATCAACTGTAAAATATCAAATAACCA:1 - chr3L 18410656 3' + accord 7027 2 56.44 GATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTGAATGGACTCACCTACATGACCAAGTA:1 + chrX 9260674 3' - 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hobo 454 1 66.34 ACTAAATTAAATTAAAAAATATTATGATTCCTTACCAAACCAATAAAAGAATCGTGTTCCGATATACGTACTCCGATGGAACATAAGCAGCATAATGTGAG:1 - chr3R 4578382 3' + Tc3 1357 1 64.36 CAAAGTTAGCTGTGCCATCTATGAATCATTTTTGCTTTCGGAAGTCCCAGTTACGGATTTTCCATGTACGGCTCACTCTTTTTCCCATTCCGGGCTAAATA:1 - chr2R 9774456 3' + pogo 190 1 72.28 TTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAAGTATGAAAAAATGTCATTATGTAAACTTAAAATGTTGTATAAAGGTATTAGGAAGGAAATAAGATTAGTCCTT:1 + chrX 22695082 3' + Tc1 1555 1 67.33 TGTTGCAACATTGTCGGCGGAAACAGCTCAGCAAGTCGGTTTCGATGTGAGCAAGCTTGGGCAGCAACAGTTTCTGCATATATTTAACCTTAAGTAGAACA:1 - chr2R 11036356 3' + gypsy5 7094 2 70.30 GTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTNNNGCCCAGAGAGTTTCGCAGAAAGTTTGTTTATTTTC:1 + chrX 14503293 3' + hobo 299 1 63.44 ACATTNTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTGATTGTTTTGTAAATGAAAATGCGCTTAAGGATTAAACACGGCGATTTTATAATCCCAAATAGATT:1 + chr3R 15886968 3' - Q-element 137 2 70.30 TGGGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCGGCAAATGGCCAACGGTAGCGCTGTTGG:1 + chr2R 22101250 3' + X-element 4581 1 75.00 AGCTGATCGTGGTTTCCGCCGATGGCCTACGCCTCGACTAATGTTTCCGGATTGTGGTTGTTGTACACCACATCGTACTTCTTTACGATCTCGATGAAATC:1 - 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Rt1b 4957 1 73.27 TGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAGGCCTGCGAAAAAAAGAGAGATTACAAAGTTGGCTAAGTGATAATTGACAGCATTTGAAAT:1 + chr3L 13907548 3' + copia 176 2 69.31 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGGCATATATTGGTTTATTACAGCATACCGCACACAGATCTAAAGTGACGCATTAAATAAAGCTTGT:1 + chr2R 9653336 3' - blood 7071 2 45.54 AGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTGCGCCGGATGCCTGACCGATCGTGGGAGGCGCCG:1 + chr2R 4879037 3' - G-element 18 1 64.00 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAAAGCCCCATAGTGCAGTGGGCTGATCACGGGGAATTTACTGGCACG:1 + chr3L 24148658 3' - hopper 39 1 65.96 GACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCTATTTTGAGAAGTGTGTTGATCTTTTGACTC:1 - chr3R 31529273 3' + I-element 4945 1 74.26 GACGGCTGCCCCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCGGAAACGAAACCCAAAACCGAGGCCAAGCCAA:1 + chr3R 14832457 3' + blood 333 2 68.00 CACGCTGCAGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCTGATGGTGTCTCCGCTTCGGGGCCTCGGGACATTTGGTGTTTCTGGTGTTTTTGGGCTTCGCGTTGCC:1 - chrX 14118847 3' - gypsy3 344 2 60.40 TCTTGGCATCGTTGAGGTATTTGGTATTTGACTTCCGTTTTGACTTGCACTTTTGTTTCATGAATGTTGCCCTTGGCCACGGTTTTTGGTTGTTTTTCGTA:1 + chrX 16082829 3' - Fw2 371 1 75.25 AAAAAAATTAAAATAAAAAAAGGTGAACGGTATAATTGGTGGCGTGTTAAATGAATATAATATTCATATGCTGTGCATAGCCTGCAATTGCTTGCTGACTT:1 - chrX 5139735 3' + Doc2-element 255 1 72.28 AGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTTTCTATTTCACCAGCAAACGCTGATCAGCCGAGTCGATTTTCATTTTGTATTCAGTAAAAA:1 + chrX 4738315 3' - Bari1 471 1 75.86 TGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAATCGAATCAGGATTAATCGCATCTGGCAATTATCCTGGCAATTCTAATTTGTACTGCAGTGGGAAAT:1 - chr3L 17294424 3' - roo 8620 1 77.23 AGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCTTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGTCGTCTAGTCAGCTTTTGTTCTTGATCCCCAA:1 + chr2L 19687644 3' + copia 103 2 66.34 TATTTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGTAGGCATCGGCAGCGAAGCCACGATGCCAGTGGTGCTGGGCCCAGCAATAGAGACCGAA:1 - chr3R 25053661 3' - HMS-Beagle2 7092 2 58.42 GGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCC:1 - chr3L 25889021 3' - gypsy8 315 1 74.00 GCCGCGTAGGTGTAAGGCAGTGCTGGCTAACGAAGGCAATCCAACCGACTTTCGCAGGTCCTGCGCACGACTATTAG:1 + chr3L 17243812 3' + HB 1296 1 54.55 GCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCCCGGGGCCAAACGGCAGCAACCCAAC:1 + chr3L 8459609 3' + blood 140 2 73.27 GCTATAGTCAAGTTCCCCGACTAACAGATACCAGTTACTCATCTACTGTATTGTACAGCTGTACGTGAAACAATCGGAAAATATCAGTCGAATTAATGGAA:1 + chr4 1092790 3' - INE-1 567 1 60.40 CATGAACAATATGATAATAATTATTACCGACTCCTCTTTCTCCTTTTGTAGAAAGGTCAACAGCCCTGCTGATAAGGTTTTGCGACAGTCGAAAATTCAA:1 - chr2L 3475413 3' - Transib5 2569 1 77.00 AATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGAACATGTCGCCCTCGATTTCGAGCACTTCTATCGCCCACCGCCTCCGGATTTCGAGAGCG:1 + chr3R 9363608 3' + Idefix 215 2 65.35 TATCGTGATTGCTTTGCTGGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGGAGGAGTTACCATAACAGCGACAACCTTGCCTTTCATCTCGAACCCATC:1 + chr2R 3877664 3' - Doc3-element 487 1 54.46 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTTTAAATATATTTTACTTAACTTTTAACATAACACAACACCTCAGTTTACATGCACAAGCATATTGTGTCTTTATT:1 + chrX 3050756 3' - I-element 8 1 76.24 ATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAAGTGGGCGAGTGGGCGTGGTAGGGAATGACGGTGGGTGGC:1 + chrX 16849385 3' - 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chrX 18114971 3' - Transib-N1_DM 397 1 54.46 GGATAGTCGGGGAACTCGACTATAATATTTTCTCTTGCTTTGAATTAAATTATTTATAACTGTTTTTTATGTATTTTGGTATTATGATTTTTTGAGAATAA:1 - chr3L 7708891 3' + INE-1 563 1 69.31 GCAGTTTGCACAACTAACAATTACTGACTATAAGCCTCCTGCAACCACCTGGCCCACTTCCACATCCGTCCTGCATCCGTTTCCGCTGCTTTGGAAGCAAA:1 - chrX 11019721 3' + Doc 112 1 66.34 CTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCACACATACACCATCGCAGTCGCCAGCACCACCACCACAAGATAACCCATACCAATGAA:1 - chr3R 11353611 3' + F-element 4234 1 60.40 GGTCGTCAACAGATTGTGTAAAGGTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGATGTCAACATGGCCTAGGCATATGAGC:1 + chrX 21262684 3' - R2-element 273 1 52.48 AGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAGGCAGCAAGGCGGTGGCATACGGCGTGGGGGTGGGTGAGCTCCGGAAACCTGTGGATTGGTCGAGGGAGTGCCAGG:1 + chr2R 13067283 3' - INE-1 141 1 78.22 GTGGATAAACGGCTCACCTTTGGTCCGCAACTCAAAAACACAGTAAAGAAATGGGAATTATAAACGTATGCTCAGTCCAGTGAAGTCTGAATAGAGTTAGG:1 + chrX 21639612 3' + Helena 916 1 54.46 ATTCATTATCATTCTCATTTCACAACTCAAACTACTCAGTCGTTTTCTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACTGCACTGCAATTCCTGGCCCGTCTTCCTG:1 - chr3R 26508478 3' - accord2 7499 2 67.33 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGCCTGTGACGGCATAGGGAGAGACCACAAACAACAAGTGGA:1 - chrX 697450 3' - roo 37 2 63.37 ACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACATACATACATATATCCTTGTAACTTTGTGTATCGCTGGCTGTTTTCATTTGCGCTTTGGCATAAAAACTTTGCAT:1 + chr2L 10560461 3' - Rt1b 5088 1 70.30 CATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTGTTCTGCTCACATTTGAATTGACAAGTGACAGCGTTCACTTATTCAATCAGTTCGAA:1 - chr2R 4321856 3' + 1360 201 1 56.44 TAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAG:1 - chr3L 24213793 3' + invader2 234 2 56.52 TTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATTTATCTATATTTTATTACCATTACA:1 - chr3R 31411117 3' + FB 895 3 75.25 GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATGGCCACAAGTCCAAGTCCAATGCTAGACACGGAAAAGGAAAAGCGCACGCGGCGAGAACA:1 - chr2L 11385116 3' + transib2 2807 1 62.38 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTCGGTGGAGAAGGCGGGCGAGGAGGTGGCAGTTACTGCCTTTTTTCGAAGCACTCATTCATTCATTCGTAAAGG:1 - chr2R 8787753 3' + hobo 2888 1 79.21 CGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGGTCTAGTCCGCCGTTCTTGTCTGCATGATATACTAATAATAAGCGAGTTTTTCACGCCCATTCAACCC:1 + chrX 22653108 3' - INE-1 108 1 72.16 CTCGGGGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAAGATGAGGATGGCCCCTCGCCGAACAAGCGACCCAAAACCGATGGAGATTCGGA:1 - chr2R 18636644 3' + R2-element 406 1 62.38 TGAGTAGTGGGTATCTGATAGTCTCGACTTATGCCTTTGTGAGCTTTTAGCCTATTGCAACACTTGCATATTTAATTGCAAGCCTTAAAAGCAAAACGTGC:1 - chr2L 3181989 3' + INE-1 548 1 84.16 CGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTAATATAGTCGGAAACGCTTCCTTATGTTTGGCTTGTGTTTAGCCCGTGGCATTAACAAAAGC:1 + chr3R 10287319 3' - INE-1 93 1 65.35 GGTTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTCTTTTTTTTTGTGTTTTCTTTGCCCTTCAGCTGTTGCGCTTTTTCCCCAGCGGCCAATTCCTTTTTTCCACTCA:1 + chr3R 18462822 3' - Porto1 4346 1 71.00 CTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCCAGCCCATCCAACCCATCCAATCCATGGAGCTCATGGTTGCCATGAACAGCAGT:1 + chr2R 6843468 3' - micropia 5177 1 57.43 TTGTGACACACTACTGGAAGTGCAACTACACTCTCCACGCGAGCTGTTGATATAGTAATGGGCCAGTGGCTGATCCATTTCCATGTAGAAATCCAGCCGGT:1 - chrX 4357642 3' + baggins 65 1 62.38 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAATTATAACCAATCACATTCTTCCAATTCTTTTTAGAAACTGGCTTAGTCGTGTTTGCAACAAAA:1 + chr3L 25341922 3' - 297 6590 2 71.29 TACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATGTAGATAAGGGTGTGCCAGGATGTCAAGGCGTCAACACATTT:1 - chr3R 31996520 3' - mdg1 7316 2 72.28 CCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTAATCCATTCGGATGGGTACTCACATGGAACCCTTG:1 - chr3R 26331632 3' - G-element 22 1 58.42 CAAGAAACCTTGTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCCCCTGCTCTCCCGCACTCGGCCACTCTTCCCCGCTCTCTCGCTCACGCGCAGCGTAAACA:1 + chr2R 6871867 3' + F-element 334 1 54.46 GCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGGGGCGCCGTCATCCACCCGTCTAAAAACACCACCCTTCTTGTAGGCATTTCCAGGATTCGCAGCT:1 + chr2L 21792587 3' + R1A1-element 5068 1 65.35 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGCCAAGCAATTACTCTAATGGCAAAGTCTCGGGCCCAA:1 + chr2L 11114061 3' + transib2 2809 1 62.38 ATGGTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTATCTGCTCCACAGATCACTTTCACTCATCCACTCATAACTTAATAGAATCGAGCCACCTTATTGGACAGAAA:1 - chr2R 19138480 3' - 1360 346 1 72.28 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGAGAGTGATGAAATTAAGAGGATCGTGGAACGAGAGAACGCGCTCTATTATTC:1 - chr2R 1373103 3' + pogo 2079 1 59.41 GCATTTGGCCGGATGTCGATACATTGTAGATACATTGTTGACCGTGTTGAATATATTTTAGGGTTGAGAAAATGTGTTTATAAACAATTTTCCCCTTTAAA:1 - chr2L 13533527 3' + gypsy2 6558 2 61.39 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTGAATTTGATTATATGTTTGCGGTGCGCAAGGCAAATGCTTCTCCTTTTTATTTG:1 + chr2R 23468996 3' - I-element 22 1 48.51 CCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCAGATCGTGGCGCACATAGACACCAAGAACCTAGTGTTGCCCACGACATACCAAGTACAGATGAAACT:1 + chr3R 16343664 3' + gypsy6 33 2 68.32 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGAATACAATGAAAGCGAGTGAGAAATGGCACACTTACAGAAACGTTTTTCCTCAATGGC:1 - chr3R 21799501 3' - jockey 4778 1 59.41 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 5411 2 54.46 ATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACG:1 + chr3L 27391399 3' - 1360 2 2 77.23 TAAGGTTACTCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGATGATGCGGCCCAGGGGATACCAGGCGCGGT:1 + chrX 21053073 3' - Chouto 88 1 56.72 CGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGCTTTTGGACTCTATCGTCGGCCGATTTCCAGCG:1 - chr2L 19108597 3' - F-element 465 1 64.52 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGCAAGCACAAGTAATATTTGTGATTAATTTGGTTTTCCTTATTGTTGG:1 + chr3R 8480482 3' - transib2 20 1 55.91 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATAGTACATTTCGCATATTTCTCATTTTTCAGAAC:1 + chrX 15384800 3' + 412 7503 2 65.35 ATAAAAACAATAAAATATTTAACACAAATTTTAACTTAATGCTCGAGTCGTAAAAATGTATGAGTGTAAAAATGCTTACACTTGCACACTGGCGGGAACTC:1 + chrX 15145636 3' + transib1 1926 1 78.22 ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAA:1 + chr3L 26852077 3' + diver 6060 2 75.25 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTCTGACTGGCAAACGAGTTCTTCTGTC:1 + chrX 2090278 3' + roo 9022 2 71.29 GTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATTAAAGATGACTTAGCAGTGGTTGGCCAAAAATTGCATAATTT:1 - chrX 16272320 3' + Stalker 7042 4 58.42 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGT:1 - chr3R 14832408 3' - blood 7037 2 55.68 TAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTCCATATACATATAATAAAT:1 + chr3L 4286928 3' + accord2 7343 1 55.45 GATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGACTGATCATTCACTGTATCTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGAATGATCAGTCATTTGTTAA:1 + chr3R 4357578 3' - Tc3 1649 1 56.44 AAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCTGAGATGAAGCCATTGTCTGTG:1 + chr2R 12536226 3' - 1731 262 2 78.22 TTGCTGTAAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATGGTTAAATCTAACAATCAGTTGGTTACCTTCTACAAATATTTAATGACGCGATTTTATTTTAATATT:1 - chr3R 15255846 3' - Porto1 475 1 68.32 AAAGGNAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACACGGCACAACTCGAATGACTTGTTTTAGCTAAGGTACTT:1 + chr2R 24390133 3' - micropia 5084 4 65.35 AAAAAGGTACCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTTTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTAAAATGTAATTTCGTTGGCCGGCAAATAA:1 - chr3R 30704724 3' + Q-element 80 2 77.00 TAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTGATTTCTCTCAGTGCATCGGCGCCGTACGGTTCGTTGCTCGATCTGGCCAACAGCGCACTCGGTTC:1 - chr2R 11094288 3' - FB 622 3 64.36 GGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTGTCTTGTAAATTAGTCCAAACACTCGCACACACGCACTCGAACCTCTCTTACAGACAGACCACGGC:1 - chr2L 15986687 3' + INE-1 571 1 57.00 GTGTTCATGTGTGAACACTGTGGGAGAAACCAAATTTTCCCTATTTAGTGCGGATTTCACTGCTAACATATAGCAATCACCGAGCAGTTT:1 + chr2R 23343844 3' - roo 8660 1 76.67 ATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAATCCTCACGCGACAACTGCTCGTCATCGTCATCCTCAATCTCACTTTTAAGATTGTACTTTACCCATTGAC:1 + chr3L 21439421 3' + Tc1 396 1 75.25 CCTGATGGAAAGCGCCACGCAATCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACCTGTGTCCACGTCCGCCGACAACATTTCAT:1 + chrX 7222830 3' - baggins 5253 1 70.30 CGCCGCAGTCTGCGTTTGTAAGTGCAGCTGAGTTTTACGGAGATGCGCAAAATTCTTAATTGGGGCATTGCGCAAAAATAAACAAAAACAGCCATTGAAAC:1 + chr2L 11924279 3' - rooA 219 2 76.24 TTTTATTTATTTTATTTATTATTTTTACAACTCTCATACCAAATAAATATGTTAAATGAAATGATATAAAATGGTTTACTTCCCCATTTTGTGCAGTGTGG:1 + chr3L 16258165 3' - X-element 4714 1 73.27 CTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTTGATTTTAATGTGGCTTAAATAGGATAATA:1 + chr2R 11552995 3' - GATE 8305 2 70.30 GAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTGGCTTATTTTTGGCTGAGCAATGAGGTGTTAAAATTCCACTGCATACTT:1 - chr2L 13842287 3' - jockey 4732 1 51.49 TTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCAGATACAGATACAGTGAATGTAGCACGGGGCTTTAGCCAAGTTCATTATGGCGCTTTGTTGA:1 + chr3R 12790990 3' + flea 428 1 62.38 TATATGCACATACTACACATACTTATATACTTATTTTGTTGTTGCAAATCAATTAATATACTATTAATTGAATTCCTATTCAAAAACTATTGGTTTAGTGT:1 - chr3R 20491403 3' - blood 7007 1 35.64 TGTAAAGTTGTGACCTTTTGTCGTGTCAACCCAATACGCACGACTTACACTTTAAGTGGGTGCCCTTTGTACAGAATAACAAGTTTTAAGGAAGACAAACC:1 - chr3R 18643393 3' + Q-element 674 2 80.20 TGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACCAAACGAAGCAAACCATTAACCCCA:1 + chr3R 6007320 3' + pogo 52 1 75.25 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGGTGTTACGCATCTTTCTTTGGTCCAACCGTAGTTGCAAATGGTGCATCTTAGACTTGCC:1 - chr2R 5529988 3' - 1360 68 1 55.45 AGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGGAAAAATACAAATTACGAGGAAAATCAATAACAGACTGTTGCCACAG:1 + chr3R 26318881 3' - G6 1856 1 53.47 AAAAAGCAAAGAAAAAAGGAAAAAAGGACATCCAGCCAGCCAGCAGAAGCGGGAATATTATCAATCAAATTCTCTATGAAAATCATTAACTTTATAATTAA:1 + chr3R 23133548 3' + Doc2-element 245 1 52.48 AGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGAATGGGGAAAACAACTCCATCACAGTCAAAAACAAA:1 - chr2L 3236544 3' + 1360 4 2 64.36 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGACTGGGTGCGCCAACGTATATTTGCCACCTGAGGTCACGAAAACG:1 + chr3L 7316373 3' - jockey 37 1 55.45 AAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGCTTCAAGTGGGGTTTGACGGGGGCGTGGGGATTATGGTTCT:1 + chr3L 3830393 3' - G2 161 1 75.31 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTTTCTTAATACGAAACCAAACCGAAGCAAAAACAACGTACAGAGAGCGCTTATTGTTATTG:1 - chr2R 19293585 3' - jockey 4683 1 62.00 TGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACAAAGGAGCCGCAAACTGAACTCGCAGCTCGAGCGGGCCATACAAGAAGCAATGACTGAGTTGGATAA:1 - chr3R 23895435 3' + copia 4766 1 71.29 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGAGATATAGCACCTCT:1 + chr2R 5640404 3' + roo 9035 1 64.36 GCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCAAAACTGAATTCTCTGCACCACCTTAGACTTAGTACAGGGCTTCGGCAACTGCTGCAATCGCAAAGGACA:1 + chr3R 22515323 3' - I-element 364 1 80.20 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACTTTGGACATGTAAAATGTCTGGTATCCTCTTATCGTAA:2 + chr2L 1353771 3' - I-element 40 1 66.34 ACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGTTGATTTCTAAAGCGCTCCAAGAGCCACAC:1 + chr2R 19465375 3' + Quasimodo 332 2 77.23 ATTATTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGCTCAAGTTGGATCTACCTGGAGTAGCTTCAATTAGTGGCAAAAGCAAGATATTTTTCA:1 + chr3R 16531289 3' + hopper 1399 1 62.38 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCGCGCGTACATACATATGTATGGGTGGGCACCCATACAGTGACAGTGAGAAATGTGCCGACGGTCGATGACA:1 - chr3R 11731145 3' - hopper 4 2 78.22 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCACTCCACCGGCT:1 - chr3L 22052766 3' + mdg1 390 2 56.44 ATCCTGCGCTTTGGTTCACGTTCTGGCCGTCCATTAGTTGTTGTTGTTGATGATCTTGGGCCAATTGTTCGGATGATTGTATCTATTTTGCAGGCTGAAAA:1 - chrX 10000110 3' - TART-A 12950 2 57.43 TTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGAGAAAGAAGCATGGGGAATGGGTGTGGTTGGGTGACCAAGTGCCTCCT:1 + chr3R 28012329 3' - 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I-element 4987 1 53.47 ATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCATAACAATAGACAACCACAGAAGAACCAAAACGACGTAGTTTTTACAGAACCAGCACCACAGCTGAACCAAGCA:1 + chrX 10035998 3' + G6 1879 1 66.00 ACGCAACAACGCGTACTTCTCCGCCGCTCCCTCCACCAACCCCCTCCCGTTGTTGTGCTGCTTTTTCGGGGCTTGGGCACAAAAAGG:1 + chr2L 11809014 3' + F-element 257 1 80.46 GAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATTATTGTAGCATTAATTGAGCATTGGAATTCGTTA:1 + chr3L 10464689 3' + invader3 235 2 71.29 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATCATATTTGGCAGCCCATTGCCACGGTCCATCTCCCAC:2 - chr3L 22052776 3' + mdg1 7418 2 66.34 GTTACCGCCTGAATTTGAAGGTTTTTTTTGTTTAACCATTTTTTGTTCGACGAATCGGCAACAGAGAAATTTATTAATTATTTATTGCTGCAATATCGGTG:1 + chr2R 18936089 3' + Tc1 1455 1 79.21 TGTTAAGTGCCCTTAAGGCTAGTCAACCAATCAACCAATTTGATAATAGATTTTAAACAGCTCGTCCCGCAAGTTGGAAAATTGATTTGTAGAAACGATAA:1 + chr2R 916837 3' - gypsy6 250 2 63.37 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGCGTGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTG:2 - chr2L 12814890 3' - jockey 4768 1 68.32 GTTTANGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCAAAGGGTTTGCACAGGCAGGCAAAATGTCCTG:1 + chr3R 15153093 3' - hopper 31 1 56.99 GCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAGCACCGACATCTAGCGGGCAAAATTGGCAGCGTAGCAGGAGGCGA:1 + chrX 11682402 3' + Rt1a 4713 1 55.00 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATGTATTCGATTTACCCATTCTTATG:2 - chrX 13854443 3' + pogo 2053 1 78.22 CATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTGGCTATGTGACTGCCTAGTGGCTGGGTTCTGATCACGGGAAAGAGAGCCGGGTCGGGGCAGCTTCTA:1 - chrX 18318895 3' - Tom1 170 1 71.29 ATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAGCTTGGCGCCCATCCCCCGGCCAACGTGGAGGTCCAGAACGGCAAGGTCACCGCCTGCTA:1 + chr2R 17276029 3' - Porto1 437 1 56.84 CACCCGAAGACTGTGAAATGCCAAATTTAAATGGCAATGAAATGCATTCAATGAAATATGCATATGAATATCATCATATCGTGCTGAAATGAAACAGAGTT:1 - chr3R 29018987 3' - Doc 8 1 77.23 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACCAAAACAAGTGTCAAAAATCCTCATCTCAAATAGTATTCAAAAATCGGTC:1 - chr3L 21637330 3' + Bari1 1683 1 51.00 CCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGC:1 - 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transib2 38 1 62.38 ACTATAAACTTGTGCGTACACTTAAGACGTTCTTAATTAACGGCTTTCAGCTCTAGGGCTTCGGCAATAAAATAGAGCTCCAATTGGGCCTTTAAACCTAA:1 + chr2R 10674419 3' - rooA 358 2 79.21 GGATCACCGACTAACGGAGCAACTACGTCAACATATCAGGGCAGCCCCTCGTTGTTGCATTTTTTAAACATTATCATCGCCTGCTACCCCCTGGACCGCTG:1 - chr2R 16684580 3' + Chimpo 3841 1 60.40 GGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGAGCCACCAAGCTGCTATTTTTGTACGCCTCAAGTAGAGCCAGCGGCTCGTCATCCTCCTCGCTGTGTCCTCCC:1 + chr3R 18387390 3' - accord 7036 2 54.64 TGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAATGCCATGATAGAAATCATCAACAGCAGGCAGTGAGCAAAA:1 - chr3L 14720450 3' - Cr1a 4093 1 66.20 TAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATCCAATCTCGTAAAGTTTACGATGGCTGTTTTTCGGTGTTTCCCGTTTTTTGTCAATGGAGTTGGG:1 - chrX 17049526 3' - Stalker2 7257 2 69.70 TTGCTTGCCGAGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGATACTCCCACCACGGGGACGTCGATCCGTCCA:1 + chr2L 22181438 3' - R1A1-element 5145 1 80.20 CTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCACTCGAACTAATTGAGTAACGGGTATCGTGGAAATCGAAATCGTGGAAATATTTTTTTGGGGAG:1 - chr3L 20659412 3' - X-element 4264 1 71.74 AACGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCGCTCTCAAATGCTGCTGATTTAGGCCCTGATTATCCTTAAATGGGCCCAAACA:1 - 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chr3R 32039086 3' + Doc3-element 4683 1 79.21 TGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACTCCACATGCTTTAATGTCACTTGGCAACCTATAGACATGTCCCGTGAAAACATTCGTGGCAAACT:1 + chr3R 4385959 3' - R1A1-element 197 1 74.26 GAAGAGAACACGTCTTCACACGTCAGCGATGTTAATGTTAATTAGACTTAAAGCTTTTGTTTAGTTCTTTATTTCACCCTTTGTTTAATCAAATTATAATT:1 - chr2R 6112452 3' - Doc2-element 17 1 55.45 ACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATACAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACCGTTTTTCTCGCTAGCCCTGCTTTGCAGTTAATAAAATATT:1 - chr2L 13487473 3' + R2-element 3466 1 57.43 AAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACTGAAATAAAAAACAAAAACAAGAGAGTGAATTTAACAA:1 - chrX 14839035 3' + F-element 495 1 72.28 TAGTTTGTATGGTAGATAATTTGAAAAGCGCACACACTCCTATTCCACAAAACAATAAATGGAAAATCCTTTAAAGAAATATAAAAACATAAAACATATTA:1 + chr2R 4581035 3' + Chouto 5887 1 73.27 CTCGANATATGCACATACTACAGTAATTTGGTTTTACAAAGAATCTGTGAAATAAATCACTTAGTAATAAAGTTGTCCACGGGCAGTTGGAACAATAGGTC:1 - chr3R 7601700 3' - blood 1 2 51.49 AATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTTAATTATGGCGAGCATTTTTCCATTTGATTTATTCACTCACATTTAAACGCAGAA:1 + chrX 19463248 3' + micropia 105 1 60.40 GGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCAGCAACCCCATTCTTGGGCGATTTTTAAAACGAGA:1 + chr3R 20139869 3' - jockey 203 1 65.35 GGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAACTGGTGACCTCTCTGGTGGCCAAGCCATCGCTGGGACTGCCCCTGCAGCCACTGGTTTGGGCT:1 - chr2L 4933489 3' + Rt1a 4705 1 63.37 ACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTATCGGCGTCTATGCAATCACTCATTCGTACAGAAATCCGAAAATGA:1 - chrX 13889973 3' + blood 138 2 63.92 AAGTGATTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTGTTGAGTGGGTCGAGAGTAGAGCCCAGACGGGCGCAAATGAACGGCCATTATGTTTATCCGAAGTGAAA:1 + chr3R 21396128 3' + diver2 487 1 74.26 TATTATGTTCGTATATACTACACAACACTTGGGAATTTGTAAGAAAATTGCTCATTAAAAGTTTTCACCTGAAGAGCCGCCCAAGGCGAATCTCGACACTA:1 - chr2L 2645169 3' - mdg1 1 2 78.22 GTTATGACAGCTGTAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACATACTATACTACTACGCCACAGTTTGCGCGATTTCTGCAAAACCCAGGCAATTT:1 - chr3L 13778113 3' - diver 25 2 63.37 GAAGGAAGTTGACATCAACTCCTATGAAAAACGTCTCTCATTTGCCTTGGAGTACATCAAGGACGAGCAGCGAAACCTAAAAAAGGAG:1 + chrX 11125621 3' + Bari2 567 1 61.36 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATGTATCTTTGACGGAGTTTTAATTAGA:1 + chr2L 6605610 3' + blood 7340 1 74.26 AGGAATCCCGTTATTTCCTTTTTTTGCGCCCCATCCAGACCCCTTTGTCAATGTCACCCTCTGCTATTTACACTCCGCCTTTGATATTTCGCTTCGCATTG:1 - chr3R 5122720 3' - gypsy8 316 1 74.26 TAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCAAATGGTCACTGCCCGGAGCGATTGGGCTGCATTCCATAGTCATAAGGCCGCCGGCGGCTGC:1 - chr2R 8026576 3' + gypsy4 81 2 59.41 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTGCTTTTCGAATCATGCCACAGTTTGTAAAACCTAGGAAAGCCAGTGGCCATCAAAGGGAAACCTCGAAGG:1 - chr3R 26252220 3' - transib2 3 1 73.27 ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGCATTTATATCCGATTTGTTCGGGTTGATATATCATGTATTG:1 - chrX 6363367 3' + hopper 1329 1 59.41 TCCCTCCATAAAATTTAATTATTGTCCACAAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACCATGGGATCGGGCACGGAATAATTACAGGGCATCCA:1 - chr2R 9379038 3' + G2 3015 1 64.36 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTTATGCAAAGTGCGCGCATATGCTGAAGCGCGAGAGCTCATGGGAT:1 + chrX 1523765 3' - jockey 37 1 57.14 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTGTTTTTGATTTACTACTTTAGTTTCCATTTATTTACTATTTGCGCTCAGC:1 - chr2L 773247 3' - I-element 28 1 51.49 CTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACCAGCTCCTCCTGCTCCTCCCAGCACCCA:1 + chr3R 11567437 3' - invader2 4977 2 72.28 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTGACGCCAAAGGAGGGCTACCGTGGGATATAGCACCTCTAACTATCTGCCGGTAGGCAAGACAAC:1 + chr2R 5640430 3' + roo 398 1 68.32 AAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGGGCGGGATTGGTGCTTGACGGGGGTGTTCCCTGTGGCGGTGGCTGCATACGAAAGGCTCCGTT:1 - chr3R 12989810 3' - Max-element 8518 2 69.31 TTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCGGGTGGTCCTTAATAGGCTTGTTGAGAAA:1 + chrX 6340641 3' - Juan 4074 1 70.30 ACGTCCTGCAAGAAGACTGCTATGGCTCAGTAATCTGCCACTGTATCGACTTGTATGTCTCCCAATTTGTTGTGAATTGTGAATGTTGCTGCAAATACTCG:1 - chr3L 12681433 3' - Helena 1275 1 73.27 CCGTGGTCGCCATTCTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCCCATTGGATCTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGATTTCGGCGCCACCGTTGATTGTTTA:1 - chr3L 15735003 3' + Max-element 408 1 66.00 AAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTGCTGGCCGCTTCGAAATATTACTCATA:1 + chr3R 30292406 3' - R1A1-element 191 1 78.22 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGGTCAAGGCTGTCGAAGCATTCCTAG:1 - chr2R 5322027 3' - 1360 54 1 82.18 CACGCACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCGTAAGGTTCGCCGGCTGAACCAATCACGGTGCGCGAAGAAATCATTTCGTTTTAATCATAACGAGAA:1 - chrX 179247 3' - G-element 164 1 76.24 AACAATTTCACTAAATTAAATTAAAAAATATTATGATTCCTTACCAAACCAAACCTTACTTACCAAACGTATGTTTGTAGTAATTAAAAACAATACTAAAT:1 + chr3R 4577202 3' + Tc3 1348 1 79.21 AATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCACCCTCTCCGGAAAACGAGTTGGACTACGTG:1 - chr2R 6685065 3' + G2 58 1 70.30 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTCCGTGTGCCTTAACATGTCTTGATTGCCAAAAACTAAGCGTTATATACCAAATATTGCAGCTGCAG:1 + chr2R 11129368 3' + hopper 1409 2 73.27 GTAGCTTCGCAAATGTCTTTTACAGAACAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAAACAAATCAGAAAGAAAACGCAGGCGGGGTTTTCCCGGC:1 - chrX 8921353 3' - hopper 385 1 61.22 CACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAATACCACTCTTTAAATGTAAAAAACTACCAATAAAACGTTTCAGTTTGCTTAGATGTTCATAAAAACCCACTAAA:1 - chr2L 14395525 3' - copia 5002 2 57.43 GCCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCAACCTAAAGAGCGAGCCCAAAAGAACCTATGAGCCACAAAAAGCACAGGCATTACGTAGAAGTCAACAATGGAG:1 + chr2R 18061142 3' - Q-element 258 2 63.37 TTTAATTTTCTTTTTTTTATTATTTCAAAGTGCAGCTGCTTTGAAGAGCCGCCAAACCCAGAGTCTAACCCTCCGTTCCCCGAACTTCTCCCCCTTCGAGC:1 + chr2L 1441811 3' - TAHRE 34 1 70.30 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGACATGACATTTATTTGACTTGCATAAATTAGTCAATTAGT:1 + chr2L 15997940 3' + 412 458 2 62.38 ATTGTNGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAAAATAGAAAAAAAGTCATCAGCAAAATAT:1 - chr3L 10836985 3' - I-element 129 1 71.00 GAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGTCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGTACAGGTAAGTAAGTATCAAGTTTTTCCATATCC:1 + chr3L 19545972 3' - Max-element 8325 2 65.31 GTAACGGCCATGCATTGGTTTTGAACTATGCAGCCACTGTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTCTCCAGAGATCGAGCGTCAGTAGGAGGCTTGCCTC:1 + chr2R 5735062 3' - 1360 3363 1 65.35 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTGGTTTCGACTTTTAATTAATAGTGCGGGGACTTTGGGGGCACGCAA:1 + chr2R 16928926 3' + blood 7358 2 55.45 TCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGCGCCTTAAAACCCTTGATTATCATCTCTTTGCCTTGTTTTCCACCTCCATAGCGTATTCTC:1 + chr2L 20325520 3' - flea 4598 1 56.44 AGACANGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATTGTAGTTAAATAGGAGTCAAAACATCAACCGGGCCATAACAAGTCTGAATTCGGCTTTGCGGCACTAT:1 + chr3L 14657015 3' - R1A1-element 5213 1 57.43 TAAACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGCAATATTCAATAATCCACAATGCCAAGCAATTACTCTAATGGCAAAGTCTCG:1 + chr2L 11114054 3' + transib2 2805 1 57.14 AGGTANAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGCCTAATTCTTAAGTAAATGCAACTCACGTTTTAGCTTACAATTTTGTTCGTACCGTTC:1 - chr3R 14913136 3' - blood 7026 2 64.65 CTGAATGATGTCAATATTACTGTTGCTGGCATTGCCCCAGCGATTTTCTAATTAAATGTTGCCACAAGCCAACTGCC:1 - chrX 15164806 3' - F-element 4303 1 61.04 TTTTAAGGATTCAAGTGTTCCAAGACAATGGAAAATGGCTGTTATTTTGATGATCCACAAGCGAAAGGAGGGATGCAGATGAAG:1 + chr2L 12853670 3' + Helena 92 1 70.24 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCATTAATTGCAAGAAAGACTACAATATAAACTGTTTAGGTGGATATGGAG:1 + chr2R 15856440 3' + mdg1 7433 2 52.48 CTGCTNTAAACAATTCGCAAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTC:1 + chr3R 2689391 3' + diver2 282 2 61.39 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACACAATCCCCCACTCTTATCACGAAAACCAATCACGCATGAACGCATTCGGAAGTAGGAGATGTGCCGGGGGCGGC:1 + chr2L 5086769 3' - FB 3 1 71.29 ATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGCGTGTGTATGGCGGTATAATTTAACGGTAGCGACACGGT:1 + chr2R 13506407 3' - accord 305 2 67.33 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTATGAGTGATGCGGTCACTTGGCATTTCGGTGCGGTGTGGCGACTCGGTGCATTTAAATGCACGAAGGCCACC:1 - chr3R 7808915 3' - jockey 7 1 77.55 AGAGGCTTGGTTGCCGCTATGATGGCAGACAAAATCGTTTGGGGTGGGGGAAGTACAAGACTGATACTAAGCATAAAAATGTAAAAAAAAAATACCAAATA:1 - chr3L 3262021 3' + Rt1a 4666 1 54.46 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATCAGATAATATAATTATGTATATTGTATATAACGCAACTTTTCGT:1 - chr3R 24839992 3' - I-element 33 1 55.45 ACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTACTCCCGCGAGATTTCCATGCCG:1 - chr3R 22301620 3' + Quasimodo 7033 2 77.23 ACTAGACGAGATGCAACTCTTTATCAGCTGCACCCGGAAAGTTTTGGTATAATTTCCAGGGTTCTCCAGGCTTATCTTCGACAACATAGGCACCACGATTT:1 + chr3L 25484655 3' + Gypsy12A_LTR 125 1 52.48 TTTTGGAGCTGGGAAAGATGCAGCATTTCCCCAGAAGGAGTGCCCGGCTGAACGGAGGGGAAGCCACCCCTATGACAAACGGAGTTTACAAATCGTATATG:1 + chr3R 27658402 3' + aurora-element 453 1 75.25 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCA:2 - chr3R 22675819 3' + 412 449 2 70.30 CATGTNCTGTATGATGTGGGCGGGTGGGGATTTCCCGACTGTGACTGCTGTGACTTTCCAGTGTGTTTGGTATCGGCTT:1 - chr3R 15323323 3' - gypsy6 436 1 58.23 GGATGGTTGGCAGGGATAACATCGTACAACGGTATAAAGATTAGGATGAGCAGAGGATTAAGCACATGCAACTGGTCGGGCTTGATGTCC:1 - chrX 3877266 3' - G2 418 1 75.56 TTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGCCCACGCAGGCAGATAGATCAAAGAT:1 - chr3L 1865956 3' + P-element 2716 1 31.68 TTAAGCTTCCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCTTTTTCGCCCTTCAGTTTCGTTCTCAGCCAACTGGCAT:1 + chr2R 6192218 3' + Chouto 107 1 62.38 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGG:1 + chr2L 6177221 3' + pogo 2051 1 79.21 GTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAA:1 - chr2R 4577088 3' + Chouto 477 1 65.35 AATAGCGTCGCTGAGTAACAGTGTGGAGGTGGACAGACGCACAGTTGAGTGATTTTTCGATTATCATTTGCACGCCTTGGGTGACAAATCAAATGTCCTGC:1 + chr3L 13159632 3' - Bica 4804 1 79.21 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACAGTCCAACGTATACATATATACGAATTTATTCAAAGAAC:1 - chr3L 3484975 3' + diver 185 2 62.38 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCATAATAAGCAACAATCTAACTTTATAGGCAACTCGTCGATCTGGAAAACCCTTCATTTCTGAGGATT:2 - chr2L 6656251 3' + P-element 2878 2 68.32 AGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCTGGCCAAAGGGAAGAGCCAAAGCCATGGCACAAGTT:1 - chr3L 12947527 3' - McClintock 6189 2 64.36 CCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCCAGTCATCACGAATTGGTCGAACCTGTAGGGACTAAAAAGTCATATTG:1 + chr2L 3523072 3' - F-element 4254 1 54.46 CTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGCAACAAGTTCAAGAATTTAATCAAGAGCAACCAAGATCGAAAATATCTAAGACAGGAA:1 - chr2L 16335980 3' + Porto1 360 1 64.36 CAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACGTATTTTGGATGAGACTCTGAAATACGTAATGCGACTGTTAAGTCCTTCGGGTATTTACGCTTTTGTTGTTGG:1 + chr2R 21421117 3' - springer 2 4 73.27 ATAATACCCCAAAAAAAGGACAGCATCCACGAAACTAAGGTCCAAGTAAAGAGAAGAGAGAGAAGTGCCGCGATTGACGTGGACTCGAATGGAATCTCATG:1 + chrX 6323165 3' + Fw3 65 1 64.36 AAATGAAAACAGGTGGTTTAGCAGATGCGCTGCGTAGCAAATTAAAAACGAAAACACACCTAAGTAGCTGATTTGCGGATTCCGAATCTGAAACTACA:1 + chr2R 15220485 3' - Chimpo 3911 1 73.47 GGTGCAGGGCTTGCTGATAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTGGGGTCTTTTGGGGGCGACATGGCATTCAATTTGAATTTGTTGGGCATTGCTTTTCAGCTTC:1 - chr2L 5424118 3' - G2 15 1 64.36 TACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCCGACAAGCGTCCCGGACTTTCACGGATGGAATCAGGGTT:1 - chr3R 12906462 3' - R1A1-element 5274 1 77.00 ATCAGGATCAATAGCCCGGTCGATCTGGTCATGTCCGTCTTTCCTTCCTTGTCTTCGTATTGCTTTCCTACTTCGTATACTTTCCGTGATCGCCAGCCCCA:1 + chr2L 22632498 3' + INE-1 93 1 57.43 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAATATCATTCAGTCGTTAACGAAACTTCGCCGCGAGCGGTT:1 + chr2R 12705183 3' - P-element 34 1 43.56 TATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTCGCGTTTGCATTCACAATAACAACAACGAAACGGTACCTTGAAGAGAATCTTGGAAATTTCACAAAT:1 + chr2L 14675236 3' + INE-1 499 1 54.46 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATAAACCCGCACACCATCACTACC:1 - chr3R 19535691 3' + hobo 2908 1 53.47 GGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTCGTGTTTTAGGTCCCTTTTGCCTTGGCTGATGCTGCTTCTTCTTACTCTTCTAGCTG:1 + chrX 10741358 3' - S-element 1328 1 72.28 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCGCTTCCTGCCGCTTGGAGGGCCGCTTCACTGGGCTCTGTGGTTGCCGTTTGTCGTTTACTGATTTTGT:1 - chr3R 14832379 3' - blood 7021 2 67.33 TTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGAATGATTGCCGACGCCTGCCGCTGACAAGTGTTGCGTGTTTTGAATATGGTTTCACATCTA:1 - chr2L 13053042 3' - Doc 294 1 60.40 TAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCATGGAATCAGCGATTCCATGCGGAGCCACGCGATAACAC:1 - chr2R 15829617 3' + mdg3 304 1 62.38 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACATATGTTATTGCATTCTTTTATTATTATCTTTATGTGTATTTCTAGAGTCTCTACTTTA:1 + chr3R 1048057 3' - Stalker2 17 2 62.38 CAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAAGACTTGATATATTTGTTTAAACTATTGCACAAAGCAAACTTAAAATTTGATGATTTCT:1 + chr2L 17329805 3' - Cr1a 210 1 79.21 AACAAGAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGCTAAACCATTGGGCAAAATTTGATATAAATCAAAAAAGAGTT:1 + chrX 15932394 3' - INE-1 580 1 58.42 GATTANCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACAATTGATTGCTTTGGGAGTGTTACAAAA:1 + chr2L 14696762 3' + I-element 4887 1 72.28 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGTGAACGATATATGCGAACTTGCCCGAGTGCCGAAGTTAGCC:1 + chr2R 20698417 3' - P-element 36 1 40.59 ATTATGCTTTCTTGAATGGTGAAGTCTGTCCGACTTGTAAATTTTATTCCTAGATTCTGCTGCTTCCACTCGGCGGTGAGATCCAGTCCTGTTCTCCGGAT:1 + chrX 11568800 3' + hopper2 252 1 62.38 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTTTTAGCTTAGATTTAAACACAAGTCCAATTAAAGCAAAAC:1 + chr3R 7375389 3' + roo 9036 1 65.35 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCATGTAAAATCAGAACATAGATGGTCTTTAAAATTCTTAGATATTAAATCATTGCCCAAATATT:1 - chr2L 21292919 3' - roo 14 2 65.00 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACAAAGCATCCTTAGCTGCATTTTGTAGCATACTTTG:1 + chr3L 947921 3' - hobo 40 1 63.00 AAACAAATAAAGCGAAAGCGATTAAAATCAGTGTGTGTGTGTGGTGTGTATATCCACGCACGCACGCACACAGATGTGCGTCACCAAGAGGCGTATCTCTT:1 - chr2R 8923144 3' + Doc2-element 95 1 63.37 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGA:1 - chr2L 19845914 3' - F-element 53 1 64.36 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCTT:1 + chr3L 63011 3' - roo 45 2 72.28 AATATTTGGACACGTGGTGAATTTTTAACAGAATCACAAAGTTGACTAAAAGATTCGCGTAATATTTTGAACGTTCTTCATCATAAGAATAATCATTCTT:1 + chr3R 23819409 3' - transib3 239 1 57.00 CTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTAATATATCGAGTGCTTTATAGAAAATCTGAGGCCTGTTTATAGGTTTCTCCGCAATTTGAATGTGGAGTGCGTGT:1 - chr2L 17004700 3' + roo 409 1 79.21 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAACATTCCTGCAAAAAAAATACAATGCATATAACAGAATTTTTCAGTTA:1 + chr2R 6247317 3' + roo 9043 1 52.48 CGGTTCACATGAACACGGGATTTCAAAAAACACCATAGAAAAAAATCAAAGGGATTTTCAATACCAATACATTCATGCGGCACTAGATCGAAGCCATATA:1 - chr3L 15483191 3' - mariner2 618 1 61.00 CAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAAATGTTATCTATAAAGTTAGTTT:1 + chr2L 8965374 3' + Burdock 15 2 79.21 ATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATCCTCGTGGATGTGGACGATGTGTTTTTGTGCATTGTGCTCCCCGTAGATGAGGAAGTGC:1 + chrX 11105142 3' - Tirant 8060 1 66.34 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATAGGTCCGACAGACGAATGCCGAGCCCGACT:1 - chr2L 11165344 3' - transib2 47 1 68.32 GTGCTGGCTAATCGTAGTTGGGCTGGAGCTGGTAACTCTAAAAAATTTCAGTGAACAGGCTATGGGGCCCTTTTGGCTGGTATTTCGAAAAAAATACATAT:1 - chr2L 18368977 3' + baggins 153 1 57.43 TCATACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACACGGCTATTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCAATTTGGCTCTGTGTGTCTGTCCGTATGATCGTCGAGG:1 - chrX 22905650 3' - INE-1 121 1 60.40 GAAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTTATCATTTCGCTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCAACAGACCAGCCCATCTGAAA:1 + chr2L 324375 3' - Tc1 260 1 40.59 GAAGANATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACTGACACACAGATATCCTTGCAGC:1 + chr3R 24545614 3' + roo 356 2 76.24 CATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACATATATTATACCATCTTATATCTATGGTATAATACTACTTGATTCTTTTTCATAGATGAGTTAG:1 + chr2R 12273033 3' + Quasimodo 6 2 65.35 CAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGACGAACAGGACATAAAACAATCGAATGAGGAA:1 + chrX 10819793 3' + F-element 4456 1 78.22 TCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGTGGCTTTACTTTTTCTAAATATGTAGTTCGTTAGCACGATGATAAATGAGTAATAGAAG:1 - chr2L 17116611 3' + opus 7050 4 54.46 AATGAAATTATTTTATTTATTTAATTGATGCGGATCTGTTTAATGTTTTCTTCTCATCTTGTTTATACTGCACTGGATCAACAAAAGTTGGGGCTAATAAA:1 + chr3R 20895978 3' - jockey2 3382 1 77.23 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTCTGATTAGTTTAATTAAAGCGTATTTCAATTGCCCAGTGCGCAGT:1 - chrX 10555390 3' - Tirant 10 2 71.29 GAGAGAGGTAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACACTTTATCCAAACAAAAATCAAAAAA:1 - chr2R 25117586 3' - Cr1a 283 1 73.27 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATATTTATCTTTTATATTTTCCCAAACTTGTTGCACTGAAACTT:1 - chr2L 6605560 3' - blood 7045 2 65.35 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATGTATTCGATTTACCCATTCTTATGCGCAATATGAAATGACCCACAAACAA:1 - chrX 13854417 3' + pogo 2080 1 60.00 TAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGGAAGAAAATGATTGCAGCTATAGTTGCATAGATTTTATACG:1 - chr2R 19343521 3' + hobo 419 1 59.41 TCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAAGTTGTTACCACCCAATGCTTATAGATAGGCTTCTGTAAAAGTTGCAATTTTT:1 + chr3L 10668121 3' - hobo 2596 1 64.00 GTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCACGCCTTTGTCGTCTCCGCTTCACTGTTTGCTTGATGCCAACTTCACGCAATCGGCTCACACACT:1 + chr2R 17293512 3' - Tirant 8117 2 63.37 TTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACATCTCGCCTCAAGATATGACTTTTGCTATTTTCATTTATTTATTTATTTAATACATCTCGATCACTTTCTCGGCCATG:1 - chr3L 7399694 3' + 1360 459 1 72.28 AAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGCAGATGGTAGCGTACAGGTAGAGCCATTCAGAGAATGAAACTTTCCATTGTT:1 - chr3L 10862705 3' - 1360 3272 1 61.39 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATCGGAATTTACATTTCTTCTCCCCTTCGATTCTTTCTATTTTCATGTTGAAGT:1 + chr2L 5152016 3' - I-element 23 1 55.45 AGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGGATGCCGGAGTGGACAACGTCACGAACTCC:1 - chr2L 654605 3' + invader1 172 2 70.30 GGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGACTTCGGCAGAACCATAACTCGTGAATATAAAGTTAA:1 - chrX 151696 3' - hopper 445 1 70.30 ATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGGTCCTTGGGCAACACGAGCTGCTATTTTTGGTTC:1 - chr3L 16246708 3' - flea 4686 1 66.34 CTCGAATATAGCATTCTCCCTTGTTTTTAAATTCTCCAATATCTATCGACATGCCAGAAAAATTATGAAATATCTCCGTTAGACTTCCACACAAAAGTAAT:1 + chrX 17277322 3' + INE-1 577 1 76.24 TGCCTGTCCCGCCAATTGCCACATCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCGTTGAGTCCTTTGCCTCTGGATATCTGCGGATAAATGTGAATCAAT:1 + chr2R 14743709 3' + diver2 199 2 50.50 TAATAATAATTATAATGTGTATATTACAATTTCATTTGTTTTTTTTCGAATTTAGATTGGTTTCTCAAAAACTGGAAATTAGCGTAGGAGTACCTCATCAG:1 + chrX 20133117 3' + mdg1 7092 2 57.43 AGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTATTGGGTGTTGTAGTGTTTTTGTGTTTCTACTTGCTGCTCTATAAAGTACAGTCCGCAAACAGGATAC:1 + chr3R 9982978 3' - accord 7129 2 74.26 TGAGANGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGCTACATGATTTATGTATG:1 - chr2R 6838475 3' - I-element 21 1 58.42 CTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTATAATCCTGGCTCCGCACACAAAATGACTGTTTGTTGCGTTTCATGCGTTGAC:1 + chrX 9706269 3' + 1360 3208 1 57.43 ATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTTATAAATACGGCTGCATTGGTGGTCGTGTATCGCTAAAAAACCAAGATTAGATACTTTT:1 + chr3R 16008449 3' + roo 8732 2 62.38 CGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAGAGAGGCGCTATTGTTGGCCTTGTTGCTTGGAGTCTTCGCCTCCTTCTTAACATCCTTTTTGGCGGAGGTGGCT:1 + chr3L 18805897 3' - I-element 180 1 78.22 GGTAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATCCTCTCTTGCTTTTCTGTGCTTGGGGTGTACACACCTAAAATGTTGCTAAGAATATTGACTAGAATAGTACTGT:1 - chr2R 5246366 3' + INE-1 564 1 56.44 CTCGGTCACCTCTCAGCCCGAGAGGCTTGGTTGCCGCTATGATGGCAGATTGACATTGACCCTTTGACATGGATAAATACCTCTGTGCATGCGTGTATGTG:1 - chr2R 23800386 3' + Rt1a 4646 1 57.43 AGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCTTTACATTGAGAGACCATAAATTTCTTGCTCAGAGAGCGAAACAAGGTGGCCAGATAAAGGGCTTTGTGTGAGA:1 + chr2L 18115343 3' - Tc1 164 1 64.36 TGTCGGAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTCTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTCGGTATGACCAGTAGTTGTCCCGAAGAA:1 + chr3R 23898616 3' - invader1 4011 2 70.30 AGCCGTAAACTGCTACAAAAACCTGCAAATCCACACTGGGGTTTGTGCCGCGGTTCTGAGCGTCACGGTGAGCGGTTACGCAAGAGTTCTACAAAATGG:1 + chr2L 11449350 3' + Rt1a 74 1 68.69 TGGTCCTTCGAGCCGGATAAACCGACACATCCTGATCCTGCCAGCACTCGAATAAAATCGAATAAGCATAAAAACGCATGCCATAAGGATACGTAT:1 - chrX 7630289 3' + 3S18 369 1 60.42 TTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGTTCTGCACGCAATCTTCTGTTTTCTAATAAACTTCAA:1 + chr2L 17863147 3' + F-element 273 1 68.32 AAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATTTAGTAGTCGGTAGATTTAGTTATAGCCCACGAGCTGAAG:1 + chr2R 8225801 3' - hopper2 1365 1 60.40 TTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAACACTCAAGAATCATTGCCTTATTAATTTTTCGATATCCCCCCTTTTTTCGATCAGTGTACGGTTC:1 - chrX 17318445 3' - 1360 483 1 66.34 ATACCCCTTATCTTAAATCAATGTGGATCTAACTATGAGTTGCATTTCGCTTTTGTATTTTTCGTTTTAGGTTTTTGTTGTCAATGTGCCATTGTTTGCAT:1 - chr3R 14781901 3' + Cr1a 4136 1 60.40 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGTTATAGAAACTGATGTGCTT:1 - chr2R 13645337 3' - jockey 4707 1 54.46 TTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAAAATGCGAGCAACTTGCGCATAAATCGCTATGTTTTAAACAATTAACAGTGGCCACCTACC:1 - chr2L 5894809 3' + 1360 3186 1 66.34 AGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCATACTGGGCGAGGAGGGAGCCCT:1 - chr2R 18637274 3' - accord 7208 2 77.23 CGACTNACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCTAAACAAAAAAAATATTTTCGAAGTTACTGCT:1 - chr3L 5249674 3' + rover 195 2 77.23 GTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGATAACATAGCTTTAGAAATATC:1 - chr2L 6775523 3' - I-element 229 1 78.22 ATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGAGTTAATTGGTTGCTTTAATTCACGTGGTTAACATACATAAATTTGTTGGGAAATAG:1 + chr2R 21309540 3' + Cr1a 4162 1 63.37 TACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACAGAACTAAACTAAACCACCAAACCAAATGTTTGATTCAGGAATGGAATTG:1 + chr3R 25870147 3' + G2 67 1 53.47 GTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTTTGATCATTAAAGGTTCTTATTCTATTGTTGCGCAGAAATGTTCGAATACCGAATCGTGTATTACAT:1 + chr2R 1076547 3' + FB 283 1 68.32 GGCTGGCTAGCTGGGGACAATGTAGACTGTCCTAGGAAGAAACAGGAAACTGACATTACAATTACAATATCGAACAGAACTTCAACGACGACAAGTCATAT:1 + chr3L 26386220 3' - Tirant 147 2 76.24 CTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCACAATAAACATGTAAAGCAAAAAAAAAA:1 + chr2R 7121911 3' + pogo 1855 1 73.27 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAGAAATATGTAAGGGGGAAAAAGAAATGAAATTCGAGAATCATCAAC:1 + chrX 22747489 3' - Doc 34 1 54.46 TATCACATGGCGACCGTGACAGGACCATTGCAGGAGCGGCACGACGATTTGCAGGTGATTGTCAGCGCCATTGGCAAGAACGCCCAGATGCCGAAGGTCAC:1 + chr3R 19488142 3' + gypsy11 446 1 74.26 AAAGTNTGAACCGCGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCGAACAATAAAAAAAAATTTAAAAAGATCCGTGGAAAAAAACACTAACGACTAC:1 - chrX 323630 3' + TAHRE 190 1 47.52 AGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGTTCAAATAGTTGTAAATGGGCGAAAATGCAAACAAAA:1 + chrX 13560812 3' + roo 9069 1 76.24 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTATATATATAACATAGCGAAGTATGTGTGCTTTTGCAGAAATAG:1 + chrX 8299743 3' + roo 393 1 55.42 CAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCATATAATATTTAATACTGTAGGCCGAAGGTAGCCGATTA:1 - chr3L 9067048 3' + jockey 4717 1 61.39 CACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACATGAAAATTGCTTTAGCACTACTTCAAATAAAACATTAAGTCAACGGAACT:1 - chr3L 23232603 3' + Juan 307 1 58.42 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAAGCGTTAACTGAGGCACTGCGTATCTTCCATCCGTATCTTGCAGATCATAC:1 + chr2R 14582905 3' - roo 26 2 52.48 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATCACACAAAGACACTATCTTTTTGTTGGCTCTCTCTTTTAAAGCAGGTAACACCAACAAGGTGA:1 - chr3R 22667106 3' + 412 478 2 63.37 TGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGATACCAGCTGTTCAGATACCCTACTAATG:1 - chr2L 9626815 3' + BS 4800 1 75.25 TTCAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCACCCGCATACAGCCAAAATTTAACAAATCGCCCTCTCTCCGATTTCGCTCTCTCACGCACACGT:1 + chr3R 21582040 3' + G-element 3924 1 56.57 TCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCATAAGCCCGCTTGGATTCCGTGGGAT:1 - chr3L 4946929 3' + G-element 5 1 74.26 TGGGCCACCAATGAATAGTTGTGATGGGGTTCGCAAACACAAATCATATATGCACGATTTATCTTCAGTTTATTTCTCCAGTTAAATTCACTTTTTTGCAC:1 - chr3R 10686141 3' - diver 235 1 73.27 AGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATACAATTACTAATAATATAATAAAATGTTTGTGATTTATGGTGATAACAATAAAAAACTATTATTAAA:1 - chr2L 12241958 3' + invader3 269 2 59.41 GTCAATCCTTTAAAAACATTCAATCCATGTTTCACACTTTAAAGGCTTGCTACACCAGCAATACAATTATCGGTGCATTCGGCTGCCTTGGCAAC:1 - chr3R 13434371 3' + BS4 301 1 71.58 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTGTCTGTGTTTAATTGCGAAAATGTAGCAATCT:1 + chr2L 13482223 3' - hopper 14 1 63.37 GGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAAAAATGAAGAAGAAAACCCATAAAA:1 + chr3R 19309186 3' + Ivk 202 1 68.35 ACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCTAAACCAATGTATGGCATTACGAATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTTAACCCAACCATGCTTTGTCTTACTGGAC:1 + chr3L 23317391 3' + 1360 3339 1 70.30 TGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGCCATTTGCCTCGCACTAAGCCTGCTGCCATCTCTTTCTATAC:1 + chr3L 17162916 3' + R1A1-element 5177 1 58.42 ACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAACATGTGTTTTAACGCCGATGGTACGAAAAATACTGATTTGGTGAGCGAACGTC:1 - chr2R 10124274 3' - Doc 4370 1 60.40 TCTTTATCCGTTCTGGAGTTACAAACCAGAAATTAATTTAGTTCGCAATGGGTGGTCGTGGATTCGCGTGGGTGGTGCGGTGGTGCTGTGGTGCTGGATGG:1 + chr3L 2716639 3' - Transib-N1_DM 40 1 64.36 TAGTTAGATCTAGAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTACAGCTAACAGTAGGAAATGGTGTCTAAATGTAATGTACTCCCTAGGATCTCTATGCAC:1 + chr3R 27242410 3' - Cr1a 4149 1 65.35 GCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGGTTTTTAACTAATATTCCCACAGTATT:1 - chr3L 23267977 3' + Cr1a 4249 1 79.21 GGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAGATACGCACCAGAGATACCCTCGAAGATAAAGTTTTTTTTT:1 - chrX 3433787 3' - mdg3 396 1 63.37 CATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCGACTGCCATTTAATTTCACTAATTA:1 + chrX 4806962 3' - I-element 427 1 75.25 CCTCCCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATTGCTTTATTACTAAAATTGGGAGTGCTAAATAACTTCTCAGCCCAGTGTTTTCTGACAGTGTA:1 - chr3R 12780277 3' - BS 4999 1 53.19 TACAACGCCCACACTTTTGAAAAACGTGTTGATATTCTTTTTCTTTTAATTGCTAAAATCGAGAATAGTCAAACTTCGTGTTTTCAACTACCCTAAACGCC:1 + chr3R 4947864 3' + INE-1 250 1 49.50 CTTGCAGCGAAAGCCAATGGGGGACACACTGCGTATGTATGTAGAAGAGTCCCATCCTTCCGACTGATTTATGCAATTCGCGCCGTCGGTTCTATATTTTG:1 + chrX 14592452 3' + S-element 1403 1 77.23 AAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACCCAAAACGGGCAAAGTTGTAACGCAGAAAGCGCAATTTACAAACAAAATGCCAAGTGATTCG:1 - 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chr2R 10810128 3' + Bari1 312 1 53.47 AAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCCGATGGTAGTTTTGTGTTAAATATCTTCTGATACAATTCAAAAT:1 - chr2L 7768112 3' + 17.6 7230 2 56.44 TGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATTGCGAATGTTTTTTGCGACGTGCTAACTAGGATAGGATGGCCCCGACAGACGCCA:1 - chr2L 19845896 3' - F-element 35 1 46.53 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGAGAGTGTGTAAGCATGTGTGTGGGCGCCATCTTCTTTGGTCGTGCACAAGTATTGGTG:1 - chrX 11042507 3' - jockey 4695 1 61.39 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGTAGCCACGGCCATAAATGATGTTGCGGTGCACTCGGGTGACACTCAAATCCAACAACTCCTCC:1 + chr2L 18662406 3' - hopper 11 2 68.32 CATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTC:1 - chr3R 21678311 3' + Idefix 7109 2 80.20 CCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGGATTTGGTGAATGTGTTTCCCAATGGCTGTGCGGAGGTCCTTGGGCGCTTTCTGGGACCCCGAATTGGGTAACCAAGAA:1 - chr2L 2723804 3' - F-element 4211 1 44.55 GTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGACTTTCTTATAGCATTACTTTGCAGTTGGACTTTCATTTGATTTCT:1 + chrX 20923549 3' + Dm88 4388 2 54.46 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGTTTCTTTAAAACCTTTTCAAGAACATCC:1 + chr2L 15894755 3' + jockey 4945 1 71.29 ACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACAAAGAACTCGCGAAAATGGAGAAACTATCTCTGCAGGAGCTGCTCAGTGAGGAC:1 - chrX 19124208 3' + accord 7055 2 56.44 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTACTATTTTGTTTCTGATCTTGCGTTTTGGGGCGCTGTTCTTTGTGGATGAAGCTCCTTGGCTTCCCGAACT:1 + chr2R 5321578 3' - 1360 37 1 76.24 CCGTCNCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTTGGCATAATTATTTCATTAACACTTAACAAGTGGCCAAGCCGAGTCTGGCGG:1 + chr3R 13604495 3' - I-element 356 1 59.41 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGCTGTTTGAAAATCACTTAGCAAATTATGAAGTGCATGCT:1 + chr3L 10378971 3' + mdg1 7421 2 65.35 CCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATATGGCTCGCAAATTATTTTTGAATTTTT:1 - chr2L 7843096 3' + 412 7509 2 65.91 GGTGCCAAAAATTGGAGACAGGATTAGACGTGAAATAGCGAAAAAATACACTACCAAAATAAAATGGCTAAGCTTGGATCTATTCAATTGTCGC:1 - chr3R 24458756 3' + jockey2 3041 1 55.32 GGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAACAATAACAAAGGCCATCCGCCAGCTGCTCCGTGCTTCATTATATTGTTGCTGTGCCGTTCACC:1 - chr3L 22054985 3' + mdg1 7030 1 53.47 TGCGGTAATTATATAAAGTATTCTGCGGTCGTACTTTCTAAATCTTTCTATAAGGTACGAGACAACAATATATGTACATATGAACGTAACTGAAAGTATTT:1 - chr2R 13574597 3' - flea 196 2 47.52 CCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATGTTCAGTAAAAAACGTTTGCCCATCCTTTATAACTCCCATGTTGCGTGCCATTAGGCATTGTCCCC:1 + chr3L 9565209 3' + FB 451 1 67.33 TTCTAGTTCGTTGGCTTATCTTAACTACTCCCCCTTCAAGATTACGGCCGTCCACGCCTGATGAGTGTAATGCGCGTTATTTCCACGTCCTCGTTACA:1 - chr2L 14563460 3' - Gypsy6A_LTR 5 1 54.08 AGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCAGCGGCATCGGGTGTTGATTGTGCTAAATAACTGCACAACAATGGCCTAAGTACGTTGATAGAA:1 + chr2L 16997882 3' + pogo 1894 1 71.29 GTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAATGTATGTGTAATGAAATTTGCAGCGTCAATT:1 + chr2L 6137592 3' - Quasimodo 428 2 68.32 AGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGATCTTTGGCTGTCGAGGGCCTGGCACTGGAGTGCAGCTGGGTGAAACTCGAGCTGGAACT:1 - chrX 22874252 3' - blood 280 2 62.38 TGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACTGCGCTCATTTTATCGTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGTTGTGG:1 + chr3R 17673837 3' + diver2 4644 2 71.29 TTTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTCGATTTTTAGATTTTAACATTGCATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGGACATACAATAGATTTGCAGGACTATCTC:1 - chr2L 17925198 3' - TAHRE 10350 1 77.23 TAAGAGGAATATTGTGTTAGCTTTGTTAACTGTGTGTTAACTGATACGAGCTTCACGATAAAAATAAACGGAGCTGGTGGAAAGAGTCAACGCGATCGATG:1 - chrX 21791533 3' + gypsy11 333 2 40.59 ACGACCTAAAACCGCCCAAAATTGCCACGCCCAGATTATTTCGCATCAATTTAATTACACACTCACACTTAGCGCTCAGCATTGGATTAGCTGAAAGTGC:1 - chr3R 31189145 3' + INE-1 345 1 67.00 CTTCGNAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGTGCAAATTAATTGATTGAGATCCGAACAGGTGTTCCACCTGTAAAACCTAGTAGAATGCGTAAACTGTGCCAC:1 - chr2R 16018805 3' - I-element 2 1 76.24 GGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCATGGCATTCTATTGAAATCTCTGAAGAAAATGCTGATTTTTTGATTA:1 - chr3L 777460 3' + 1360 3194 1 54.46 CATCTGGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACGGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAATGAGAAGTAGGCGTTG:1 - chr2L 22719557 3' + 1360 3386 2 73.27 AAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAATCGCTATCGCCACAAGGCAAGTGATAATAATTAAGGGGGCGTGGCAGTCGGCAGACAGTGAGGGCAATGAC:1 - chr2R 11052206 3' + gypsy 291 2 68.00 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCACATGTAAGAGCAAAGAGAACTAAAACTGCAGAGCCGCTCTCTTCAGT:1 - chr2R 20698349 3' + P-element 2859 1 51.49 AAAAGAAAAAATAAAACAAAAACAAAAACCAAGAAAACGAAGCCCGGCATCACGTCATACCGGTTTCTAATTTTAGGCCGTTCACACTTTGCGTTGGCACA:1 - chrX 2087418 3' + gypsy7 5012 3 61.39 TTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTATTATCAGGTTGCCGTCTCTTGTTTTCAAATGTTTCCATTTATTGTTTCCTTTTTTGTTGCCTCTCTAGTGGT:1 + chr2L 3404490 3' - I-element 397 1 52.48 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCATGAAGCCAACTCCACCACCGCAGTACCCACTCAATCTTCAGGGAGGCGGCGGTGGCCAGAGAGG:1 + chr2R 18865933 3' + roo 401 1 67.00 TTTGCATTCACACTAGCTGATTAATGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCAACTATTCCCTAACGTGTTTACGCATTAAAATCGATTGAAATTAGATCGGAA:1 - chr3L 10265200 3' + INE-1 531 1 46.53 CCAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTGAGGAAATCGACTACAACGTACTCCCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTAAACTAGTAATGTAATTGAG:1 - chr2L 18177045 3' + INE-1 540 1 64.36 ATAGAAAAAAACGCAATTGGACCAAAGAAAAACTATGAAAGATAAATTTATGGTTTTATACAAGTAAATGTTATGATTATTTCAATTCCAATTCATACATG:1 + chr2R 10571783 3' - Tc3 66 1 75.25 TACTGGCAATTCCGCAGAGTTCCGTTCCATACGTCCATATTGTTTTTATGTAATGCTGCGTTATTTTCGCCTTGGTTCCATTTTATTTATTACGTATACGC:1 - chr3L 2670131 3' - Porto1 4284 1 61.39 AAGTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCCGACCGAATTCAGCGCTCTGTGCTCGAGTGTAATATTTTTAATTGTTGTTAAAGGCTTAAGCGCTGCCAACTC:1 + chr3L 3724342 3' + gtwin 6966 2 53.47 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGACATTACATTTGGTCAACCTGCTGTCAGCGCGGGAAATGTGAAAAAC:1 + chr2R 18829302 3' + roo 9031 1 70.30 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGCGTGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 9418242 3' - jockey 4765 1 69.31 CCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACAACAAGGGCAGCATCGACAACGATTCCAGTTCGATTCACTCGGA:1 + chr2L 9993448 3' + Doc 479 1 60.40 TTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTGTATTTTTGAAGAAACGCAAATCGTATTGACATTACCTAA:1 + chr2L 16252342 3' + pogo 2061 1 47.52 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATGGCATACTTTAAGGTGCGCTCACACTTTGAGCGACAAATTAACGCCGCGTTAATGG:1 + chr2R 14582129 3' + roo 9042 1 57.43 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTCTATCAACCAGCTAAGGTATAAATGAACTTTA:1 - chr2R 15856377 3' - mdg1 7070 2 59.41 TCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCAAGACCTAGAAGACCCAACGGATCTCAGCGTACACTGACCTCCCCTTGACATCCTGGCCCTCCGCCTCTGGT:1 + chrX 9317615 3' - P-element 2845 1 42.57 GATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAATCCGAAAAGAAATCGCACTGACAACTAGAAAACAGCAAATGAGGCTGAAAAATTCGCATAAA:1 + chr3R 5405957 3' + I-element 356 1 67.33 CCGGGAGGAGAAGTGGACTTCTGACAACAGGAAGATGAAGGCAAGGCGTCTGCGCAGCAGACGGCGATCAGCAGTCAGCCGTGAAATACTACAATAAAGCG:1 + chr2L 23070692 3' - G5A 123 1 49.50 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAACGATTTTCAATCGAGAGCTGAAAACTTAAGCCTTTAATCAGATCGATGTGATTAGTGCTGTCAGCTGCATCGCT:1 + chr2L 11240985 3' - roo 8666 2 74.26 AAACTGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCAGCAGTCTGTTGCCATCTTCGTGATTTC:1 - chr3L 3530632 3' + invader2 5004 2 70.30 TGGGGTTTTTTTCATTCTTGAGAATCTTTTTCTTATCTGGTAACCTCCCCACCCATCTCCTGATTACCCGCACAATTAACGGGGTCAAATTTAATGCAACA:1 - chr2L 18375810 3' - Idefix 6956 2 57.43 CCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGAGAGCGGGACAGAGCGAGAGAGAGGGAGAGAGAGGAATGATAGTTATTCACAAATTCCAGAGAACG:1 - chrX 12007719 3' - blood 7240 2 67.00 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGAATCATGGAAAAAATTAATAAAAACTTCGTCTAAGGAAAATAGACAATTTTACATTTT:1 + chr3L 17882703 3' - 1360 18 1 54.46 GATATATGCACATACTACATTTGATTCAATTGAAAAGCTTGTTTTGGTTATCCACTTTTCAACACATCGTTAGCTTTGGTCATGGAAATGTATGAAAGAAG:1 - chr3L 5827845 3' - blood 7009 1 81.19 ATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACGGTGAAGCCGGAGAGAACCGAAACGCTACTGGCATCGGATAGAAATAATTGAACAAAAACACTTTTCA:1 - chrX 21399428 3' - invader2 111 2 72.28 ACTCAGGTAGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGATATTGGGGAATAATATAAGAACAAATTTTAAACTTGGTCAAAAGTGTGG:1 - chr2L 11186942 3' - INE-1 531 1 79.21 CCAATAATAACGAGGAATTTTGGGGTGTGGTCAAGGATTCAGGAAGCAAAATTCCTCAAAAACAGTGCCAGGACTTGGTGTACGGTAGAAGTTTTCAAAAG:1 - chr3R 6656995 3' + Tc1 1212 1 79.21 AGGAGGGTCCACGAGTGAGCAAATCCTTATCGCCCTCGCGAAGCAATGCTTCACGGCCCTACCGCGGTGGGTCAGGGGGAAAATGAAATAGAAA:1 - chr2R 6142866 3' + Rt1c 5290 1 73.40 GTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAACCGTATTATTTTGACACCAACATCATGAAGCACATTGAGGGTCAATCTTTA:1 - chr3L 13921202 3' + 1360 205 1 58.42 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGACTTAATCTCACGATTGTTTGGTTTCCTACTCTCCCGCGCTCCCTCTCTTCTGAGTCTCTCTTTCTGG:1 - chr2L 222067 3' + P-element 2880 2 72.28 CAGCAACAACAACAACAGCGGCAGCAGTTGCAGGAAATGATCTCACAGCGAACTCAGTCATAGACAAATACTGGGGCAGACAGTCGCATTCTGGTGG:1 + chr2L 6781494 3' + TART-A 125 8 55.67 TTACTCAGTTAGTGTGAATGCGAACGCGAAAGTGTTGACGACATGACAAGGGCAAACACAGTCGGAGAACAATAACAAATGCATGGGAAAACAAATTACA:1 - chr3L 6683466 3' - INE-1 533 1 56.00 GCCCAGCTTATCGCCGTTACATTGATCTTTATCATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGATCCTGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTTG:1 - chr3R 8005046 3' + Ivk 83 1 62.38 CATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACATTATGTGCGATGTTTGCTCTTGTTGCTCTCCGTTTTG:1 + chrX 5637889 3' - 17.6 63 1 70.30 TAGGGCCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTATCGATATTAGAGTACGTTACCGTGTATGTATAAACCTCTTTTATGTGGATTTTGTGTGCTTGCGTAT:1 - chr3R 16567447 3' - HB 1335 1 83.17 ACGTGTTTTCGTTTCGCTCGTGGACATATTGCTAATGACCTCAACACAATCAAATCTAAATCAAGTCGAGAAGTGGTCCGTTCGCAGGACAAGTGAAAGGA:1 + chr3L 5718633 3' + R1A1-element 4 1 71.29 GAGCTTTGCTTGATGTTTTCTTTTTTTCGCTTTTTATTTGTAGTGATCGTAGATCAAAGATGAAATTAGTCGGTGCTGATATCATCTTTGATCTACGATCA:1 + chr2R 24092517 3' - Doc2-element 4539 1 40.59 GGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTAGCAACCTCCTCAGTAGCC:1 + chr3L 21918984 3' - I-element 211 1 82.18 TTCTAGCCAAGACTTGAACCATGGGATAGTTTAAGCTTTAAGCTCAACAACAACTGTTTGTGTCACTTTTCCCTGAAAAATGAACAGGAAGCCAGTGAAAT:1 + chr2L 14390454 3' - X-element 273 1 61.39 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTCTATATATGGTGTATATATCTTCTGATTA:1 - 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mariner2 151 1 77.23 TTTTTGGTTAGCTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATATGAAGGTTTTTCTCTTTCATTAAGTGCAACAAACGCCGCAGA:1 + chr2L 8908195 3' + Tc1 1411 1 69.31 AAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACGGATGGGCGCTCGTGGGCGGACATGGGTTAAAGCGGCAAGGCAGCCCTTAAAGAGTGTTAACCAAGGAATCG:1 + chr3R 16248984 3' - Ivk 5242 1 75.25 TCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCCAACAAAAACGACACGAAAGCAGTGGCGG:1 + chr3L 14004978 3' + F-element 4342 1 73.47 CATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCG:1 + chrX 21947726 3' - invader6 4388 1 52.48 TGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACTGGCGGCACCCGAAATCCCAGCTTTGCTATC:1 - chr3L 2527852 3' + X-element 4429 1 67.71 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGCAAGAGATGGACGATGCGGTACCGCGGCGCCCGACAATTCTTCAGGATGTCACAC:1 - chrX 18886061 3' - F-element 45 1 62.38 AAGCTGTGGTTTATTTCGTCACAAGATTTGAACTCTCTTTTTGTTACTGTGCATATATTTTTGAAATCTCTGTGCTGCACACAGCGCAGGGGGAAAAGTGC:1 - chrX 19321738 3' - gypsy 7237 2 77.23 GGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGTTGGCCAAGGATCGGGTAAGCCGAGTGACCTCACTGTTGCCCAGTCCACC:1 - chr3L 968726 3' + Rt1a 4710 1 58.42 AGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGACGCACCACCAAAAAAAAGTGTCAGATAGATAGAGAGTGCGAGAGAAAGTGCTCTC:1 + chr2R 8862621 3' + Bica 230 2 50.52 ACGGTNTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTCCATCCGCTGGTAATGTGGCAAATGCCACCACAGCCCTAGCCGGTGGTAAAAGC:1 + chr3R 16289694 3' + F-element 484 1 57.43 AAAATTATCCCAAAACTTTCCGGGTGAAGCTGAGAGTTGCATCTCGTCTAGTAAATTACCCGTTTTGTGTTGGGTCTGTGTTTAGAACCTGC:1 - chr2L 15534154 3' - Gypsy12A_LTR 159 1 65.22 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGCACATTAAATTACAGTTTTCAGAGCCAAGAACAAACAATCGAAAGTGCAGACGCGCCTTCAGCAAA:1 - chr3R 27619181 3' + hobo 2930 1 70.30 AAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGGACTTTGTGAAAATAATTTTGACAATGACCATATGATAGCTGTAAGAGATTTGATTTGTGCTA:1 - chrX 20385036 3' - Bari1 43 1 62.11 TTTTAACAGAAAATTCTAACGTGCCCCCAGAAATCGAATTAAAGATATATAGCATTTGATTCTCCGGAAAGTTTAGCTAGAACTACCTCGTCCCAAGTTAG:1 - chr2L 11162099 3' + transib2 370 1 69.31 GTTGGCAGTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAGGAGCGGGCGTGGACCCATAGTGATCTGCTGTGCAGGTTGTTTC:1 + chrX 2053184 3' + Burdock 6025 1 56.44 AAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTGCCGAGGATAAATCAAATAAAACCATATACATTGCAACCGATTCAGTTAGCTAACAAAATTTCAAAATGCAACAA:1 + chrX 8354195 3' + HMS-Beagle 346 1 70.00 TAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGAATAGAATATGGCCAATAACATCTGGATTCTGGGTTCTAAGTTCTGGGAAGTCCTGCCTT:1 - chrX 14436591 3' + Circe 7169 1 72.28 TATCGCACGGGTCCCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGCGCTGCCTGTGTCGCATTGGCTGACAAATGTTTTAATTATGTTCGTTATTAAAGG:1 + chr2L 5844828 3' - Cr1a 4444 1 55.45 CTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGTTATGTTATGTTAGGTGACAACGCTGTTG:1 + chr2R 4879004 3' - G-element 52 1 73.27 GCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTCGATTTCTTGGGGGTATTAGCTGGGGAGGAATGATTTCGTTTC:1 + chr2R 14614884 3' + Doc2-element 463 1 57.43 CGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACGTAGTCTGTGTGTCCGCGGTACTCGCGCTGAATTCGTCCGTCCTCCAAACTCACTTGGTAGATCACTCCGTC:1 + chr3L 12193128 3' - 3S18 5645 1 77.23 TATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCCGCCGTGCTCACGTTACCCGACCCGCTGCGCTG:1 - chr3L 21219372 3' + invader4 2955 2 67.00 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAGCAAGAGACGAGAAAAGTGGCTGCTTTGTTTATGTGTGTGCGTTTGTGCGAATGTGGTAGACGCTGTTGACG:1 + chr2R 14683308 3' - 1360 3254 1 64.58 ATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTCGCTTTTATCAAATGCAATTTACG:1 - chr2R 13280537 3' - jockey 294 1 76.24 TAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACTGTGGAACGAGAAATGACATCTCGTTGCGCCTGGCAATTCGGTA:1 + chr3L 11869620 3' + mdg1 475 1 56.00 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACTGACATGTACCGCACTCACACATACACCCGCACACCATCACTACCATGCTGAGCGCACACATGACACA:1 - chr3R 19535668 3' + hobo 2931 1 71.29 AAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTACGCCGAGCACCACCACCTCAACCACCACCACCACGACGACTCAG:1 - chrX 2885746 3' + HMS-Beagle2 85 2 55.45 ATGGATAATAATTGAATAATTGAATAATTGAATAATTGATAACTATTTTATGTTTTTTAAAACTACTTGGCTAGTTTTGCCTCCGAGATTCCGCGACTACC:1 + chr3L 6368814 3' - rover 416 1 54.46 TCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCTG:1 - chrX 22726184 3' + Helena 1284 1 58.42 CGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGGGCGACAAAAAGGGAACGAACGAACGGCAGCAATGAAATCTTGTTTGTTAGCATAATTTGTTTGATTT:1 - chrX 7469000 3' + F-element 258 1 73.27 GGCTCTATGGACGGCCAAGCAGTTATAGTCGGATATGGTTTTCGGATAGTTTTGAGATGACTCCAATGATACTTCACGTATGCCGATATATTCTCGTTGAC:1 - chr2L 8489109 3' - Ivk 383 1 52.48 TTTTGAAAAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATTATTAAACGAGGTCTATGCTCCTATGATGGATTTGTTTTTAAACTATAATCACCAGTGCACAAG:1 - chr2R 8695350 3' - F-element 4588 1 67.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGCCTCTTTATTCCACTGACTTAT:1 + chr3L 21908965 3' + roo 9048 2 55.45 GAACTCGAATATAGCATTCTCTATTTTTTCTATTATTTTCCTACAGCATGGTTAAAAGTTCCCAAGCGGCATTATGGCTAAGAGTTCCGCAAAAAACAACG:1 + chr3R 19254230 3' + INE-1 574 1 73.27 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTG:1 - chr2L 16691164 3' - pogo 33 1 60.40 CACACTGAAGGGATTACAACCACGTCACCCTACACACCCACAAGTGAGCATATGGGGCATGTGTCCGTAACTCAATCAGATTTTGAAGACTCACAAAG:1 - chr2L 11518949 3' - R1A1-element 5288 1 68.37 GAAGTTAGCTCCAATAGGTTATTGGTTGTTTATGCTCAATGCCTCACCTCGATAGCATGGAAAAGCACCTCTTTAATTATCCCTAATCCCTAATCTTTTTA:1 - chr2L 19511084 3' - Q-element 242 2 50.50 AAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGTGACAAAGACGCAGCGTACGTTTGTTAACCCATGTTTCTCAAACATCTACAAAACCGCAAGTGCCGGTGGCA:1 - chr4 302466 3' + INE-1 174 1 62.38 AAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACTAATATGTTGGAGGTTATGCAACGAGTATCAGCAGGTGAATTATGGAAACAAAAGCATGGATGGA:1 - chr3R 30013861 3' - gypsy4 6392 1 54.46 GCTGAGGAACAGGTATCTGATAGTCGGTGAACTCGACTACTGGCATTCCCGCAGGTTTTTCCTTATTTTCTTCAGGGGCCTCTTCTTTATGTTACAATGG:1 - chrX 4563855 3' + INE-1 546 1 58.00 TTCTTNCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCAGTATTTTAGTTACATCTATGACTCTTAATTCAAAGATCAACCTTG:1 + chr3L 2539331 3' + roo 9045 1 57.43 ATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCAGAAATTGGACAACGGCTATAACCACCTGATC:1 + chr3R 24311257 3' + Bica 4870 1 68.32 CGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACTGAACATGCAGCTGACCGAGAACGTCGTGTCCACCCACACGATCAATGTGCT:1 + chr2R 8826251 3' + opus 7290 2 57.43 TAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGATCCACTGCTTCGCATCTGCAGAGTGCCGTTATTTAGGGATGAGCGAAGAGATGTAGAGATGGCAC:1 + chr3R 6759469 3' - Bica 4645 1 76.24 ACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTATAGTATAGCCTTCCCTTGCCTTCCTTGCTTAAAATAAAAAGTTCTAATATGAA:1 - chr2R 5885007 3' + R1A1-element 4967 1 58.42 ACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGAAAGATATCAAAGATATGCTTGAAGCCAAAATCATTGTAGCCACAATTGACTGATTATCATTTTTGTGTGTACAT:1 - chr2R 8125049 3' - Doc 7 1 67.33 TCTCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCAGTACAAAATAAAGGAAAAATAATTAAGATAGGAATGCAAATATTGCAATTTTTCGCACGTTTCATTGCTGAAA:1 + chr2L 9448288 3' - Circe 6996 1 72.28 TGCTTATAACAGCAGATCTATGGAAAGTCGTTTGTGGTCAATATGTAAAGCCAGAAGCGACGAGCCAGATAAATATCGCGACAACGACGAGCACTCGATAC:1 + chr3R 18347602 3' + Copia1_DM 402 1 56.44 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATTGCATCCTGATGGCACTTACACATACATACACATACATTTCGCAAGCTCATTGAAGTAACTGGTCTGAAACG:1 + chr3R 21010823 3' + hopper 1411 2 66.34 ACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGTATGGGCATTTCGAATTTGACTCAGATGTAAATTTGTTTTGCAATTTGGTGGGAATTCATCTCTGTTTAGCTGGCG:1 + chr2L 476918 3' - HeT-A 5938 1 68.00 TGGGGTGTACCCCCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGAATTGACGTGGGCGTGGCTTTTTGACATTGAAAAACCTCACGTGCGTTTGCGTTGCCAACAGAA:1 - chr3R 16283292 3' - G5 4636 1 67.33 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACCTCTTAACTTTTGCGCCCAGCTTTCCACGTTTTCCCTTGTTCAAATAGTTGTAA:1 + chrX 13560790 3' + roo 385 2 55.00 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCAAATATCTTGTATTCGAAATGATTTATTTCTGGAGTTATCATAGAAGAATTGATTATGAATATATGC:1 - chr3L 4987380 3' - I-element 12 1 65.35 TCCCACTAGCTGGGTAACGGGTATCTGGTAGTAGGGGAACTTGACTACAGCGTTCTCTCTTGTTTCACTTATTGTTTCGTGACTGCGATCTACATCTGCTG:1 + chr3R 4098787 3' + INE-1 538 1 64.36 AGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGCTAAGATGAGGAGCATCATGCTGGAGTAGCGTATG:1 + chr2R 16247380 3' + R1A1-element 451 1 64.29 TTTCCCTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGGTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGCACTGGGCGCGCTGCTGGGGCTGCCTTTTCACATTTTTCAATTTTCCAC:1 - chr2R 21470351 3' - Doc2-element 245 2 65.35 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTACCGTGCAGGATTATGTGGAACCCACGCAGGAGACTGCGAATGCGACAATCCTGTCTCGTTTGCTCGATAAG:1 + chr3R 23701018 3' + mdg1 418 2 76.24 AACACACTTCAGCTACCACGTGAGCAGCAACGTGCCACGTGCTTGACAAAACGAGTTTGACGTACTCCAATTAAACAAATAATAGCAACTCCAGTCATGTT:1 - chr2R 4577066 3' + Chouto 499 1 60.40 AATCATCCTGAACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTTAAGCCAGATGTTCGTGGGAGACCGAAATGGAGAGATAAAAATTG:1 - chr3R 9036066 3' + mdg3 307 1 58.59 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTGCAGCTTAATGCGGAATTAGGCTTGAGATTTTCCTTCATTTGTTCG:1 - chr2L 15020095 3' - jockey 4699 1 54.46 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCTTGGTTTTGGGAGCTGGCATGGTGTCCGCTCCACTCGTAGAGTGGCTTCATCGCGAAAAGGA:1 - chr2L 7793146 3' - jockey 4809 1 64.36 TAAGTNGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAACAAAAAAAGGAAAAAGAAATTGTCTCATTCATTGTTGTGGCGT:1 + chr3R 20140603 3' + jockey 4958 1 69.31 CTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGTTGTCATTAAAAAATTGCACTCAGCGAGCCAAAAAGCGTTGCTGCAACTCTGTTGCATGCA:1 - chrX 14319895 3' + F-element 4493 1 61.00 GTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTTTTCCGAGGGCGAGGAGAACTTGA:1 - chr2R 11073667 3' + opus 109 2 76.24 GCTGTGCACCGCAAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGGCACCACATCCTGCTCACCGATGCCAAGGATGCGGTGGAGAAGGCCCATCAGCTGGCCAAGAGTGC:1 + chr3L 9622007 3' + Rt1a 4854 1 57.43 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATAATATACAATTTTAACCGGGCTCAATTTTTGCACCCGTTTGTTGTAGCATACTTTCCAGGCAT:1 - chrX 3697101 3' + jockey 4979 1 67.33 TGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGATCCTTCAGTTGAGTTTCCATGGTGGTCCCAGTTGGGGCCGTTC:1 - chr3R 16657417 3' - Quasimodo 7138 2 60.40 TGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGAAAAAATAGATTTAAAAGAAAAAAATAAGAGGAAAAGCAAATAAGGAGAAGCGAAATAAC:1 + chr3L 3226453 3' - accord 7093 2 65.35 TCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAATGTGGGCATAACTGGTCAACGCTGT:1 - chr2R 13645356 3' - jockey 4726 1 73.27 TATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATT:1 - chr2R 5284579 3' + Doc4-element 2597 1 69.31 CCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTTGACCGCCTCAAAAATTGTGTGTGTATG:1 - chr3R 31996561 3' - mdg1 7356 2 72.00 ACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGAGAAAGAGGGATGGGGAGTGAGCGAAATAGAGACCTTGACCTTGTCTTTGACTTTGTCAGTCTGCTGCTTTG:1 + chr2R 10596477 3' + R2-element 459 1 76.24 ATAAACACTTACCGAACAAATAACTCTCCTTGCCACAG:1 - chrX 13198976 3' + hopper2 1189 2 89.47 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACTTTTTCAGTGCTGAAAAGTTTTTAGCTA:1 + chr3R 25931399 3' - roo 8681 2 63.37 AACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTATTGCTACCTTTTTTCGCCTTTAAAGTGTTGCCTACATTACAGCTAAAGGAAATATAGGTAGATGTCGGGTGTCATG:1 - chr2L 18299919 3' - X-element 4318 1 66.34 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCACCAACCTTGG:1 - chr2R 6838494 3' - I-element 40 1 69.31 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACCATTTAGTTCCTTGTACTTAATGGAAGCTGCATGCCATTGGGCCAGTTTC:1 + chr3R 11685642 3' - mdg1 7065 2 52.48 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATGTATATTTTCAGTCCGGTTTCCGGTTTCTGCTACATTATTCGTGGGATTTCGTG:1 - chrX 8179013 3' - pogo 19 1 60.40 GTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGGGGGCATTTTGTAGTCTTATCTCCACTTTCTGAGGCGATTAAGTTCAAGTCTTCAAGTGCGGATGGAGCATGGG:1 - chr2L 14237906 3' - accord2 7362 1 74.26 GTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATAATGCTGCTCTGCTGCTGGCGATGCCTGTGATGA:1 - chrX 15543091 3' + Idefix 255 2 67.33 TCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGCAGAGGCCGGCAAAGAATCGCATTGCAGCCGATGTTCAGCAATATGGTCGCTTGATC:1 + chrX 19159771 3' - 297 273 2 79.17 AATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATTTCTCCTAAAGAATATAAATTTTTACCTATGTAAAATGGTAAACCATTTATGGAAT:1 - chr2R 19820452 3' - HMS-Beagle 374 1 60.40 ACGCCGGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGTGCATCGTTTAGATTTAGTGCCGCTTGTTACGCTTTGATGTCATGTCATTTATA:1 - chr2L 17283929 3' + Max-element 8241 2 63.83 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACAGACTACATTTGATTCAATTGAAAAGCTTGTTTTGGTTATCCAC:1 - chr3L 5827891 3' - blood 44 2 63.37 CACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCAGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCTCTGTGCATTGGACCAAGTTGATGA:1 + chr3R 12174978 3' + Rt1a 4730 1 75.25 GCTAGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTCGAGTTCTTGTGCTCTTCCGATCTTTTTAAATAGACACCTGCTTGTGATACTTATATCAATAA:1 + chr2L 7677894 3' + 1360 425 1 50.50 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATATTTAATGTCTAATTAAATTGCAGACTCTCTGTAAATTCAAACGTAACATTAAAGAG:1 + chr3L 9552212 3' + roo 391 2 56.44 CTGAGTGACGGGTATCTGATAGTACCTCGACCCATAGCATTCTTGTTTTTAATAGGTTTCTCTTAAATTCCTATTCCTATAGCAATTTCCCGAAAGTCATT:2 - chr3R 11807331 3' + INE-1 547 1 84.16 AATATGACCTTGGCAAAACCGGACAAGTTGGCAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGAGTTATGTTTGTGTGTCGCTTTAACAAACCGGAAGTTACA:1 + chr2L 14801655 3' - 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accord2 7307 1 56.44 GTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCAGCGCCTTCGACGGCCCAAACTTCAAAAAGAGGAGAGGATAAAATGGAGTTTATATTTGGCATTATTT:1 + chr2L 192690 3' - R1A1-element 5062 1 76.24 AAGCGGACAAAAAAGTATACCTATTAAAGATTCGGATATGGTTGTCGATGTCGCATTTTCATAATGCCTCCGATGATCATCACTGGCTGCAGTGGCAGATG:1 + chr2L 8762860 3' - Circe 40 2 75.25 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGGACGACTTTG:1 + chr3R 25814766 3' + 412 455 2 60.40 TCCGACCCCAGCTGCTTTGAGCTCGACAAACGGCCTTTGTTGATTCTGGGGCTCACAACTTTTGCCTAGGTAATTTGCCAGCGACGCCCACGGATGGGG:1 + chr3R 31411416 3' - FB 2 1 76.77 CAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGTATTGAATCATGTTGGAATATTATTCACGGTACTTGAAATTGGCGAAACAATTATTCGTCG:1 - chr3R 21339946 3' + jockey 4707 1 66.34 ACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGATAAGAAAGAATGGCGAAAAAGAGAGACTAGAGGGCCGCTGCAGGTACAGTGCTCACCACTTCCC:1 - chr3L 24790468 3' - diver2 131 2 65.31 CAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACTAGTTTAGCGAACGAGAATTGATGTACAATGATACGAAAGCGAATCAGCAGGGCGATTAGCAGAAC:1 - chr2R 4374895 3' - diver2 263 2 64.36 TAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGATTAGTTGCGCCCGCGGGACATGC:1 + chr4 523426 3' - HMS-Beagle2 6867 1 76.24 AAAGGCAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTGCAATGCACAACACACGAAAATAATAAAGAAACATAACGAACGGCTGTT:1 - chr3L 18788384 3' + Stalker2 7240 1 52.48 TTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATATACTTTTCTTGCACTCAGCTAAAAATCTAAGAATCTAGAGTCATCATCATGTCGTAGA:1 - chrX 11833283 3' - I-element 204 1 56.44 TCTTACACAATTGAAGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAAAGAGTGATTGAAAATGGCATGGAAAATTGGAGGAAATCAGTACGCAACAC:1 - chrX 12178571 3' - Quasimodo 7280 2 55.45 ACACACACACACACACATACATCTGTGCGGGGCGCATTAAGCACTTGACAATCAATATATCCGCTGCATGTGCACATCCGTTTGCCAGGACACAACAGCAA:1 + chrX 5108064 3' + Quasimodo 37 2 57.43 GAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTTGGGCGCGAAGAGAGGTGTCTTCTTGGCTGGTCCTGGTAATGGATTCGGAT:1 + chrX 11375799 3' + opus 212 2 55.45 CCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATCGTTCGAACCGTACAATATCGAGGATACCCCTTTGGACTGAAAAACGATTTTGACC:1 + chr4 1227222 3' + Quasimodo 265 2 66.00 AAGATTAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGAAGCACATGGCCTGCGGTTCACTGTGGAAGCATCAGATTCGTATAAAG:1 + chr2R 13422042 3' - Ivk 425 1 55.56 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATGCCACATTTGTGATTTACCAAACGAGTACAAAA:1 + chr2L 9823689 3' + hobo 2899 1 73.00 AACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTATTCCTTCCTGCCCCCTAACCATCATCATCATCAAAGTCGACAGTACCCATCTCCG:1 + chr3R 26502775 3' + R1A1-element 40 1 47.52 CTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGATAGGGAGACAGACTTCGAATGTGTTGAGCTGAGGGACTGTCAACGTCTTTTATACTTGAACTTCACA:1 + chr3L 16303198 3' - pogo 1688 1 82.18 GTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGTTTCTATACT:1 + chr2R 5424286 3' - 1360 3346 1 64.36 TATTCAAGAATTATTTCATTACATTCTACTTTTTCACGAACAAAATGATACTTAATATCTATGTTTTAGTGAGTACTGTTAGATTTGCCTTAATTTCTGGT:1 - chr2R 15105971 3' - Copia1_DM 4173 1 67.33 TGAGCAAAATCGCAATTTTTAGGCTGTTCATAAGAATAGCAGTGTCTTGTGTGTGCTCTACCGGCTCACTTTCTATCGCGCTTATTTTTCATTTGCTCTTT:1 - chr3R 31968564 3' + HB 185 1 62.38 ATTTTCGTTTTTTTTTCTCTTTTTGCAGGAGGGGTTCTATGGACGGCAATAAGGGTGTCCAAGTGAAGAGATTACGGAGAAAGAGATTACGGAAAAATTAT:1 - chr3L 21916015 3' - Doc2-element 247 1 72.28 ACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCCGGACACAATGCATTATGTTAATTTGTGAGGATCTGGCCATGTAACTGGCTTGCGGTGCTGGTAACCC:1 + chr3R 12795725 3' + accord 7202 2 73.27 GATTCNTATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTATTGTTATTATTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCAT:1 + chrX 21668927 3' - mdg1 55 2 63.37 AACTAAAAGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCCGAGTGTATGTGCTGGCCAGTAAATCAGAGCGTATGGCGATGACAGCCT:1 + chrX 14647030 3' - Circe 323 1 63.53 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGCTTCCAGAGGCATTGCGCTTTCTTTCGGGTACGTTGCCTGTGGTTCTATCC:1 - chr2R 5640332 3' - roo 8689 2 56.44 GTTGTCCGCAGTCAGTCTGCTGCCAAGTACGGTTACGGTTTCCAGATAGCTGCGTTCCCTTGCATATTGAACGCTTTTGAACGTGTGCAGCAGATCAACG:1 + chr2R 12684086 3' - Rt1c 5172 1 72.00 ATTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTT:1 + chr2R 16880920 3' - 1360 9 2 78.22 GCCGANGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTGCAAAAGTAGCGGGTGAACCAAATGCAGTGGGGTGGTGAGAAGGTGGGG:1 + chrX 13747424 3' + P-element 2875 1 62.50 GCTTGGGAGCGGGGACACAGCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCATAGATCCTAAGAGTGGAAGAGATGCAATTGAAAG:1 - chr2L 14876504 3' + Rt1b 4743 1 72.28 AAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCCCGCCCATCCGAACAGGCATGCGAGAGACTTAACACGGCTATCTCAGTCATAGAATAAAATTAAGCCATA:1 + chr3L 21931293 3' + Fw2 3720 1 70.30 CAATCTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACGGTGACTCGTATAGTGAAAAAAACAAACCAGAATCTAATCGAACTGCCCGGCTTCCAGAC:1 + chr3L 15537221 3' + Doc2-element 492 1 52.48 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATAAATTGGTTGTTCAACATGGCGTGTGTGTAATGCATATGTGGTTAAACATTGCGTATACGCCG:1 + chr2R 8198545 3' - F-element 25 1 63.37 TATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTCCCAACTGCAGTAGACTTATTCT:1 + chr2R 4071172 3' + pogo 333 1 78.95 AGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCATC:1 - chr2L 19479163 3' + R1A1-element 128 1 59.41 GGCCATTCATATCAAATATGAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCATTTTAATGTTGCCATGCAAAAGTCA:1 + chrX 10123285 3' - copia 4919 2 73.27 GATTACAAATAATAGAATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTTAGCATGGCATTTATAACATACAATAATTAAGGCTATAATTAAATAAGAAGTAC:1 + chr2L 12129831 3' - Cr1a 4217 1 60.40 CAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTCGTTACGCGTGACTGTGGTGTGACCAA:1 + chrX 13640820 3' + jockey 4707 1 73.27 ACCGCCGCTGCACAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGAGCAGCAACGTGCCGGCCCCTATTTTCCACCCACCAGCCCCCTTCATCGGTGTGTTTGTGT:1 + chr2L 17687075 3' + Chouto 301 1 54.46 TGGGTTACACATGCCCCCAGGAATATTTTGGAAAATATGGATACGATTTAAAATGCAGCGTTTTTCATTCGAATATCTTTCAGCTCTGCCATATAAATGAT:1 - chr3L 5290954 3' + hopper 84 1 66.34 TGGTCCTTCGAGCCGGATATCTTACTCCTGCTTGCTCTTACCTTCCATCGTAGTTGAAGGTGCAGCAGAAATCAGTCCCAAACCACACCCACAGCAGCAGA:1 - chr2L 213752 3' + 3S18 369 1 65.35 GTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTGGAGTGCTTGTGTCAGCTTAACGTTCTTTGCTCTCGGACAATTTCGGAAAACTGGCTAAGTCCTTAGGGCTCAG:1 + chr3R 14000686 3' + 1360 436 1 64.36 CAGTGTGGGCGTGGTAGTTTTGGGCGGTTTGTAGATGTAAGGATGGGTAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATATGGGCGTTAGAGTGGGCGTG:1 - chr3L 22511715 3' - INE-1 244 1 66.34 GTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTGTGCAGCGGCGGTGTGGTGCTGTTGCTGCTGCTGATGTTGCTGTTGGCTGCTCGAAATGC:1 - chr3R 20294163 3' - Chouto 328 1 58.33 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATAAGCGATTCGATTTCTTTCGCCGCAAGAACATTGTTTATTTGATCGCATG:1 - chrX 15384737 3' - 412 7079 2 54.46 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATTCCGGCTTACTAACCTCATGCCCTATACAATCATCATTGCCCACGTTCCTAAC:1 + chr2L 13670331 3' - BS 5018 1 50.50 ATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTACATGTACCACACGACATGGAAGATCAGAATCCAGATGGCACACACCGAT:1 - chr2R 15536273 3' - McClintock 6156 2 61.39 TATGCAGACCTCTGGTCAGCATTTTGGTCACTTACGTTTACCCAGAACAATATAGGAACACAAGGTGTTGCGCACGCCGGCCTGAATCGAC:1 - chr2L 19169711 3' - HMS-Beagle2 75 2 74.73 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGGCAATCTTTAATAAACCCAAAATCAAGACCAACGCAATAATTGCTGTTGCGGTACTTTG:1 - chr3L 21908874 3' - roo 8682 2 61.39 TGTTATTATTATTATTATTATTATTATTAATACTATACTATACACTATTTATTGTTAGGTACAAATCACGTCGAGGCCACTAAATTTTGAGCTTATAAGCT:1 - chr3R 2559977 3' - mdg1 7069 13 58.42 ACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGAGGGGTAAAGTTGATGCTGTTGCAGGGAAGGGAA:1 - chrX 5138521 3' - 1360 45 1 73.27 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTCAAGCTATGCTACAAGAAAATCAACTATAATCTATGAATTCTAGGAACTTAGTCTGAGTAACACA:1 - chr2R 16502145 3' - I-element 42 1 56.44 CATCTGGCTATTAACCTCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCACCACGCTGCTTTGGTTTTTATATTTAA:1 - chr3L 22440302 3' + G-element 4123 1 77.23 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGAGCGGCCACGCAAATCCTGCAG:1 - chr3L 15099888 3' + Tirant 8457 2 76.24 CGCGGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATC:1 - chr3R 26331669 3' - G-element 59 1 77.23 CATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCATACTTGTAGGTGCCACTGTTGAAATGGGTTATGGGCATAATGCTCTGATTC:1 + chr2L 9684228 3' - 17.6 7180 2 53.47 GCAAACCGCTGTTTTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCAGTCCTTGTTCTTTGGTCGAATGACGGTGCGGCAAAAAGGAGCTGGCAAAGCTTTTAC:1 - chr2R 6000004 3' + diver2 4635 2 53.54 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATACGTACATATTTATGTATGTATGTACTTTTGCCAGGACTGGTTTGTAAAGAAATCAGTAATTATTT:1 + chr3R 23723200 3' + Transpac 304 2 74.26 GATAACACCAGCAACCGAAGGCGACGAAAAAGATTTCATGTACTGGACCGGCCAGTTTGACCTATGTAATCTCACTGATGTTCATCAACGGATGCGCATTT:1 - chr2L 13984760 3' + G3 4430 1 59.41 GCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGATAATGCCTCCAGCTCGAGTTCATATGC:1 + chr3L 8429531 3' + flea 4812 2 73.27 TTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTCGAAGTGTCAGTGGGTTGTGGGG:1 - chr2R 14680625 3' - F-element 4616 1 77.23 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGTATCCGTTTGGCAAAGCATCCGAAATTTCCAGCTGGCTCGCGGTTGTTTTG:1 + chr2L 14889137 3' + jockey 4970 1 53.47 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACTTCTCCTCCTTCCCGAATTTCTCACTAGTTGTGGAGAACCGAAGTCCCTGTTTGGAACTGGA:1 - chr3R 23700902 3' - mdg1 7052 2 61.39 GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAATCCGCCCCTATTATGCGCTAAGCGAACAATGAAAGTTTTGAATCAATTCAA:1 - chr3L 12246100 3' - HMS-Beagle 21 2 58.42 TCCTTATCAACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGGCCCCCCCCCGCACCACAGAAGCAATAACAATAA:1 + chr2L 7282645 3' + G6 301 1 68.66 AAGTGNATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATAATAAAATATTATTTTACAACTGTTTAGTTAACCCCCGCCTATTTCCATTTAAA:1 + chrX 14625557 3' + invader4 305 2 59.41 TATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAATGTCACCTTCGTCATTCATTATTCTTGGCTCGATTAACTGG:1 + chr3L 25606634 3' - micropia 175 2 53.93 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCCTTTAACCCCCCAGTTTTTCTTCTTTTTTCCCATCCTTGGGGACCGTTCACCGTA:1 - chr3L 776084 3' + 1360 3369 1 57.43 AACGAAAACATTTTCATTCAAAAATACAAAGTTAAGTTTCTCGAACTGAGTCGGCGCCTCCCACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCT:1 - chr2R 4879009 3' + X-element 157 1 60.40 TTTACGTTACTTTAGTTTACTTTAGATTAGCTTGTTTGTTTTATGTCTAATCTCTATCGTTTCGGTTATTCTCACTCATTATATACGATATGCATAATTAT:1 + chr3R 30084154 3' - TART-A 13153 1 70.30 GCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTCATTCGCTCTTCATCCCCACCTCTTTCTGCTGCCGCTGCCCTCTCTCT:1 + chrX 2083786 3' + HMS-Beagle2 7000 2 70.30 CCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGTGCCAGCAGGCAATGGAGCAAACTACTTGCCATG:1 - chr3R 28381711 3' + G6 335 1 71.29 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGACGGTAGCCACGGCCATAAATGATGTTGCGGTGCAC:1 + chr2L 18662375 3' - hopper 39 1 63.27 TATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATACTCATTTCCTCGTTCCCACAAAATTAGTTGCGCTTAAAGTTTGG:1 + chr2L 1554294 3' + Cr1a 4281 1 72.28 ATTATTCCCCAACGTGTTCGGGTGGGCACTGGGCTTTGATAAATTGCTGTGGTTTCGTAATCCGAGCAGGTATTCCATCATTTTTGACGACGTTTAGGTTG:1 + chr2R 25043653 3' - G5A 2634 1 77.23 AGCTGTTGCTGAACGGGGCCACTTGGGCTGCTTGGTAGAGTGAGAAAGCTTCCATAACTTGCAAGATACACACATATTGGTGTACATTTATG:1 - chr2R 24048479 3' + micropia 5197 1 53.26 ACACATTGGTTCCCGAAAGAAAGGGCAGACTAATCCGTGGTAGTAGAAATGAGGAGGATTATAAAATCCATACAATTGACCCAACTATAAAATTCGAA:1 - chr3L 26764382 3' - aurora-element 50 1 55.10 GCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAAACGAAAACGAAACTCCCACCTCA:1 - chr2L 4026360 3' + accord2 7401 1 79.21 GATGCGGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAATACCGTTCACAAAATGCAAAC:1 + chr2R 6715029 3' - pogo 19 1 66.67 AACAACAAAAAAGAAAAAAAAACACATTCACATTTTAAATTGCATGCACTTTTAGGCGCACGCACACATATACATACACATGTACATATGAATTCGTAAG:1 + chrX 3080949 3' + gypsy7 5004 1 66.00 ACCACCAATAAGCTTACAAATAAAGACTTATCCAAGCATAGTTCAGAATTAGTAACATCCAAAAATACAATTAGAATAGCAATGCATACCCAACGTCAGCG:1 + chrX 17287246 3' - Cr1a 4045 1 59.41 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCCCTTTTCGCTGCCTATCCTTCGAGCACCACCCAACCTCCCCCACCCACTTAGCGGGCTTTACGCCG:1 - chr2L 10635225 3' + roo 398 1 66.34 ACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACACAAAACACAACGTACACACTTTTTGATACGCTAAAGTCAAGTTAATGAATATGATATCTACACACATTTAT:1 - 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chr2L 17188861 3' + 1360 3286 1 63.37 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATTAATGCAGATTTGCGACCTGTGCTGGCAAATGGAAAAAGTTTTG:1 + chr2R 22774485 3' - BS 17 1 58.57 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTTAGCATATGCACACTAAACTTTAAGTGCTGTGCTCC:1 - chr2R 18891053 3' + opus 461 2 69.31 TCCCGTATGTTGGCGGGGCAAGAACTCTACGACTGTACGCTCAGTTGGTCGTAAAAAGGCGCTGCTGTACCGAGCCAAAAAAAATCTCTAATCAAATTATC:1 - chr3L 3424505 3' + Rt1a 4791 1 67.33 ATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCGTTTGTTTTACACTCCACCCCGCACCAAAAGTGCCCACCCACTGAGAAAAA:1 + chr2L 19266055 3' - I-element 293 1 60.64 TTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACATTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTTACTTGAATGTTGGTTTAATTTTAAACATTATTTGGTTTTGGGTTGGC:1 + chrX 8277075 3' - TAHRE 10428 2 54.46 CAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTATTGTAATCTTTTGCCCGATTCGTTGTGGCTGGGATGAACTATTTTATTTTTACTGTGCCAAAT:1 - chrX 22732192 3' - 412 369 2 73.96 GGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAACAGCCAGGAAACGCTATAATTATGTGGTGATTGCGCTGAAGGGGA:1 - chr3L 13771962 3' - accord2 7302 1 60.00 AAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCAGCTCCTGAGCCATCAGGCTTTCCCACAGCTCGTTCAGGGAATCCTCAAAGTTGGC:1 + chr2L 9923422 3' - 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I-element 442 1 72.28 CGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACTGCACCGACGAAGCAAAATAACGCCGAGGAAAGGAAATCTTCTTTAATAGACGTAACCATAC:1 - chr3L 21614077 3' - Cr1a 4087 1 59.41 CTGGGGGAGAAGTGGGTTTCGGATTCGGTTTCAGATTTTTTTTTTCCCTTATTTCTTTGCGTGCCGTGCATAAGCTAGTTGTAAACAGACATATTCGGGGT:1 - chrX 14807550 3' - G6 1714 1 80.20 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATTCTCTGGATGTGTCGAGATTTGTATTATTAAACGACGACTGGATCGCAAAAGTTCAGTGCGCTCGCAGCTATTATG:1 + chr2L 16488184 3' - I-element 5144 1 76.00 ATTTTAAAAATAAATGTAAAAAACATAAACGTTTTACTATCTTCAAAATGGCATGTTTAGCTTATTTTTATCATTTGACATAGAGTTGCATTTTTCGTTCA:1 - chr2R 16690701 3' + looper1 1806 1 77.23 TACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATACACATGCAGTCGAACCTACAGCGC:1 + chrX 4740573 3' - 17.6 43 1 74.26 CGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAATGAAATTAAGAAAGTTAGATACTCGT:1 + chr3R 24839900 3' - I-element 271 1 73.27 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGTAGGTGCAGCCATGCGAGTCACCCAGGTCCAGGTG:1 - chr3R 4234836 3' + Transpac 5204 2 65.35 ACAGATCCCACTTCTGATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGACATTCTCGATAAGCTTCGACATTCATTCGT:1 - 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F-element 372 1 79.21 TACAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGGAATTACAAACTGCCCATACATTTTGTTAGCCCACATATTTCATTTGTGCCTGTGGAGCCCCTCCTGGCCA:1 + chr2L 14932162 3' + BS 4724 1 59.41 GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAATTTGAGCAAACTTATTTGATCTATGTTTGTAC:1 - chr3L 17858173 3' - HMS-Beagle2 6923 2 71.29 AGTCGGGTTCAGCTAGATAGCCGTGTTAAAAATCTCTCAAGCCAGTTCAGATGGGCCGCAATAATCGTTCTGACATTTGTTTTCCCTGGCGTGCGTAAC:1 - chr2R 19705200 3' - Fw2 3783 1 56.57 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTGCTGTTTAAACAATTGTTACTCACCCGTTTTCTGTGACCT:1 - chr3R 6216803 3' - pogo 31 1 63.37 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGATATGCGTAACCCCTTCCAGTGGAAA:1 - chr2L 9823648 3' - hobo 48 1 69.31 AGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACGATTTACACATGTTTTGCCTAACAGGCCATTTGCATGAGGTTTATTTCAGTTTATTGCAAATAG:1 + chr2L 18966077 3' - R2-element 3330 1 67.33 AATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTATTTTAAACCCATTCCTTGGATACACATATTCGTGACTATTCAGCGGATTTGGTTTTGGCCAACATGTTTTCG:1 + chr2L 9570530 3' - Dm88 4290 1 53.47 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACACACCATGTGCCAATCTAGTGCCAAACCTAAGCCTTCGTTCCTTCAGCCATCTA:1 + chr3L 13888698 3' - copia 4894 2 52.48 AAAAGCAAATTTCAAAGGCATCTTCCAGACATTCGCCAGACATTGATGGTTATTGGATCCGAGTACTCCACGCCGTTGTAAAGCAATTTCTTGTATCGGCC:1 - chr3R 11851815 3' + Transib5 213 1 71.29 CCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCTTATTCTGCATTTAAATTTAAACCAATA:1 + chr3R 25637572 3' + gypsy4 6442 1 72.28 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAGTTCTTTGCATACAAAAATAATCAATTGAATAAAACAA:1 + chr3R 14913214 3' + blood 7351 2 62.38 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAATATTTAATGTCTAATTAAA:1 + chr3L 9552173 3' + roo 352 2 82.18 AAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCAATCTTGAGCT:2 - chr3R 14882065 3' + gypsy5 7341 2 61.39 GTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAACAGGAAAAAAACACTTTCGAACGCATTAACCGTCAATCAATCAATCAAATACTGGTTATAAGAATATTGTCAACAT:1 - chr2R 11449683 3' + transib2 2422 1 63.37 CTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCCAGGCAAGCTTATGCAGAAACGCCAACAATGCTGGTGGGTGCCACTGACCTTCGCAACAGCCGG:1 - 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chrX 5256142 3' + G-element 4185 1 58.42 GGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGGGGAACATTCAAAATTGCACGGCGTGAAGGATTGATCGATGTGAAAGGTGTGTTTTGCTTGAAATTTTGTTAAC:1 + chr3L 10753633 3' + S-element 1395 1 75.25 TGTTGTGTCCTGCCATTCAGACAGCTTGAAATCCAATTTAGAAGATCATGTCCAATGTCCAACCAACTTAAACGTTGATCCTAAGCTAATGTCATCGTTGC:1 - chr3R 19169855 3' - Q-element 416 1 47.52 GTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTCGTAACAATTGGGACAGTTTTAGTGCTTCGCCGGAACAAAAAGGAGCGAGGTTTTTGGTGTTTTGCTGTTT:1 + chr3L 19027445 3' - I-element 5183 1 79.21 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCAAGCAGCCTGCTCACGTTTTTTTTCCAATTGCTATTTTCTTTTTTTCTATTTTTGTT:1 - chrX 8714175 3' + P-element 2871 1 60.40 CAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACGGTGACTAGTACTGTGACAACAACAACCACTGCAACTGCAATCACACTGCCGGCGGCAGCAGTGGCA:1 + chrX 15722359 3' + Doc2-element 499 1 79.21 ATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTGGTGGAGGTGCTTCTGCATCGATTTCATTTGCACTAGTATCTGTTATTAC:1 - chr2L 21114814 3' - jockey 4631 1 52.48 TAGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGGAGGGCAGGTCGGTCCGTGAAAATGGCCAGAATATGCAGAGCTATGGCGGCCCA:1 - chr2R 5910847 3' + hobo 2918 1 56.44 CGGCTATGGATCCTGATCATGAATATATGAATGAATATTATACATGAATATTATTTTTTGGTTTTATGGTTAAAGCTGTCTATGTAAGCAGATTTCTGTGT:1 - chrX 3391179 3' - INE-1 88 1 59.41 GTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGAGCCCCCAAACCCCCCAGAAAAGGGTTGGAATATGGCGGAGAAGGTTAGGGCGCTATTGCAGCCATATTGGCTAGG:1 - chr3L 5126339 3' - ZAM 7991 2 79.00 TAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGTTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCGAACCGATCCGCAACGTCATCGTCCTCATCTTCATC:1 - chr3L 11343677 3' - invader1 3790 2 64.36 TCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGTGCTGCTTCGGTGCACTTCGGCTACGCCCACGAGGCCACC:1 - chr3R 22899181 3' - P-element 28 1 45.74 ACACCTATCAACTGAAAAGTAGCAAGGGCCTTCAAGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGATTTGCAACTATAATAAGTAGACTGCTGAT:1 + chr3L 1143269 3' + Fw3 165 1 46.53 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGTACTTAAATAATTCTACGTTAGTGAACCAACATAACTTCTTAGCTAACATATT:1 - chrX 11060473 3' - I-element 22 1 51.49 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCCATC:2 - chr2L 16691150 3' - pogo 19 1 62.38 TAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTTGCAAACAAGTAATTTTTGTTAAATCAAAAGAAGTTCCCTGTAACTCGGCCTTTTGT:1 - chr3L 15819810 3' + Tc1-2 1419 1 76.24 TGGCAGGACGCAAGAAGTCCTCTTTAAAAGTTCTCTTTCTTGTATTCTCCGAGTCATAACTGGTGTCCCAAAAGGGAGACAATAACAATGGAATTAATTAA:1 - chrX 22935031 3' + Q-element 423 2 66.34 ATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGCATTTCATCATCTAGCCTTCTGGCTCACCC:1 - chr2R 16870509 3' + transib2 2658 1 70.30 TGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAGTGGCAATCCCACAGACTTGGGCCAAAAATGAAGCCAGCCTGGGGAACCACAG:1 - chr2L 5932076 3' - jockey 6 1 77.23 GGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCCCCGAAGTCCCTGAAAATGTCAGATGTCAGGCCGTTGTGAACATGCAACAGTTTGCAATCGAAAGCTCTC:1 - chrX 6071320 3' - hopper 316 1 73.27 AATTTNTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCCAACCACATGTACACAAAACGCCCAGTTGTCTCTGTGTGCTGGC:1 - chr2R 11129269 3' - hopper 17 1 57.78 CAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCACCAAATGCTGACCTGTGACCTCTGACCAACAC:1 + chrX 12288887 3' + Quasimodo 6892 2 67.33 AGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATGTGGAAAGTGAGTTCCTAAAGCTCTAGTGCTGGCCATTAGCCCCAATCTTGAGCTGAAACTACAGA:2 - chr3R 14882054 3' + gypsy5 413 1 72.28 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAGAATCCTTGCAGTTCTGAAGGAGCTGAAG:1 - chr3R 9996403 3' - blood 7060 2 70.30 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' + blood 330 2 73.27 CACACACACACACACATACGCACACACACACCACCACCACACACACACACACACACAAACACACACACCCCCCACTCGACACCTGCTCTTTAGCACCCCTT:1 - chrX 3748099 3' + accord 186 2 72.28 CGGGGCGGGGATGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTAGCAGAGTCTGGAGTTGAAGGCACTCTTGGACTCCGTAGGGCTGCCA:1 - chr2L 2670408 3' + diver2 4522 1 51.49 TCATGGTGCGGAAGTGGACGGTCAGATGGACCCAGGCCGAGCGTTGCCTCGCCCGTGGACGATACACCTTGTCCCATAACATCATAATCCCAGCCGGGCCG:1 - chr2L 22646146 3' + Rt1c 5074 1 70.30 ACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATCATACTCGTGTTCCTCGTCGTCTTTGGTATAATCTTCTTCTGTGTGCGGAGATTCCTGAAGAAGCGA:1 - chr2L 2793406 3' + I-element 281 1 72.28 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACACCATTTAGTTCCTTGTACTTAATGGAAGCTGCATGCCATTGGGCCAGTTTCTTCAGCGAACTCTTTGTGTGC:1 + chr3R 11685663 3' - mdg1 6 2 73.27 AAGGTATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCGCCTTCATTTTCTTGTTCTTAGAAACTGAAATTTTCAGAGTGTGCCCTCGCTGGCAGACGGAA:1 + chr2R 5152480 3' + Gypsy12A_LTR 2056 3 54.46 CCGACGCGTTTGATGATCCAATTCGCTCTGCCCTTCTTTCTTAAGCTCGCCTTTGATCCCAAGCCAAAAGCTGATGGAAAATGCCCTTTAAATCGAAAGCG:1 - chr3L 11912829 3' - gypsy7 5354 2 71.29 CAACTAAGCAATCAATGTAAACCATGATCAGGGGATCAGCTAGTCAGGATGGCCGAGTTGTGGTAGGATGAAGTGGAGTCCATAGAGGCAACTGCTCCGGT:1 + chr3R 31319848 3' + invader3 5129 1 71.29 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGGCCGAAATACGGACTTTTGCGCCAGGGGACGACTTTGGTAAACAACCGCACTCTGGTCAAATTTG:1 + chr3R 25814794 3' + 412 7536 2 68.32 GCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCTTACCCTTTGAACTCGCGTAGTACAA:1 + chr2R 11115707 3' - hobo 393 1 74.26 GCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAGTCCCGCATAATTGCCAGGCCCACCAATCACTGCTGCGTGGGACCTCCC:1 + chr3L 26852099 3' + diver 196 2 52.53 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGAGGACCAACATTAAAACACTGACCTA:1 + chr3L 22564868 3' + blood 7337 1 76.24 TTCTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACAACAACAGCATCGCTGACAAATTAGTCAAGATCAAGGTTTGTTTATGTATGTATATTCAACCGCT:1 + chr3R 30874513 3' - 1360 196 1 68.32 TCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATATAATTATGAAGTATTATGGTATTATAAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCAAAGTTTTCTAGGCC:1 + chr2R 2879968 3' + TLD2_LTR 185 1 92.08 GTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCCTGTCCGTCCGTCATTCAGTCCGTTTGAACGTCGATCTCTGTGCAGCAGTTCAACGGTCAGAACCAGAATCCACAG:1 - chr3L 3767351 3' + INE-1 32 1 57.43 TGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCTGACGCAACAACAAGCAATTCCGCCCAC:1 - chr2R 2338600 3' + HMS-Beagle2 135 2 76.60 CTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGCAGTTGCAGTTGCATTGTTAGCTACCTTTTGTGTGGTAGTT:1 - chr3R 18502552 3' - G2 2621 1 64.36 TAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTATAGATTGATTTTCTCATATACATACATAGCTAAAGACCCTAACGCTACTGATATGCATTCTTATATTCAAGGC:1 + chr3L 15105259 3' - Tirant 325 2 76.24 CAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCCTATCGATATTCGCGTAATAGAAGCGCAAAACTGCATGAA:1 + chr3L 22057931 3' - micropia 5209 1 60.40 GTGCCAAACCAATGTAAGGCCGTTGCGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGGTCGAAGGAAGTTGGGCAGGTGGAAAGGAAGCTGGGCGAGTGTTTCTGCT:1 + chrX 18132032 3' + 1360 3359 1 78.22 AATACTCTAATGACAAATATTCTTGTATAAAGTCATTTTTGAAGTTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATAATGTAATGCATTATCCCAC:1 - chrX 22945175 3' - 1360 401 1 76.24 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGAC:1 + chr2L 3621141 3' + 297 353 2 68.32 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACATGCATGTGTATCTACGTATGTATTTATGCACACTCGTGAAATGAATATTCATCCTCCTAGT:1 - chr3R 22675788 3' + 412 480 2 63.37 TTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGAATACAGATTACAGTGTTTTATATTAAATCTACAATGATTTACGATTAGGGCTTTCTTGTTATTGTAGTTGTTTGTGTG:1 + chr2L 9727624 3' - Cr1a 4238 1 78.22 CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCC:1 - chr2L 20840447 3' + Transpac 258 2 79.21 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACATACGTACATATTTATGTATGTATGTACTTTTGCCAGGACTGGTTTGTA:1 + chr3R 23723181 3' + Transpac 5204 2 62.38 GGACCGCCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGACTATCCAGCTATCTATCCCACTCTAGCCCACGCTCGCTCTCTCTTTTTCTGCATCTCTCTGCTAATGG:1 - chrX 1399834 3' + P-element 2882 2 74.26 GGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAA:1 - chr2L 16952347 3' + Rt1b 4741 1 36.36 AAAGGTATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCAGTTTTTACAACGGGAATCCGTAGATGCGGCTATGTGGCGGCGATGCTCGTAGCTGGAAGTGAATTTT:1 + chrX 12899449 3' - Doc4-element 2767 1 55.56 TATTGAACATTTAAGATTAAGATTAAGTAACATAAGTAACAGTAAGGAGGGCAAACAACCAGCCGCAAAACCCGGCGCGTCCCTTGGCCAAATGGAGGGT:1 + chr3R 17910228 3' - Rt1c 5405 1 53.00 AACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCGAGATAGTAGTAGAACTGCGGGTTGGGACTCTGGTACTTCTGCAGCA:1 - chr2R 19216980 3' + F-element 4301 1 53.47 AGACCACTTGCTAAATGTACAAATGGTTAGAAATAGGCGCACACCCAAGTCAGCCAAGAGATAAATAAGAATCTGAGACATATAAATCGAAAGAGATTAGG:1 + chr3L 20933386 3' + hopper2 1270 2 64.36 GTTCAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCATTGCCGTTAAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAACCGCCAAAGTAAATTACGAT:1 - chr3R 30909800 3' + gypsy 239 2 76.24 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGCCAGCCAGCAGTATGTACATATGTATGTATATGCCCGATCTATATGACCGATCTACTCGACTTTGGTCG:1 - chr3R 13824324 3' - roo 8670 2 72.28 TTTTCTTCTTTTATAGTGATATCTAATATTACAAGCATTATTCAAATTTTTTAAACACCTATATTTATGCCAATTTATTCATTATATTCATATTGTGCTGT:1 + chrX 979964 3' + Juan 88 1 63.37 AAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAATCATTTTTCTTCGACTCTAGTAATGGCGACGTTCCACGTCCGTTTAATTAATGAGACGACAGTTAGCGACAAAA:1 + chr2R 9264941 3' + I-element 391 1 79.21 TGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGAGCTGCTGGAATTCGCCAAGCTGGGCTGCTA:1 + chr3R 9364347 3' + mdg1 452 1 69.31 CGTGCGACCAAAACGCCACTGCACATGTTCTCTTTTTCTCTCTTCTTCCAGACCCCTCGCACATAAACCTTTATTCATCATTCGCTTTCGTGACCTAAGCA:1 - chr3L 23688871 3' + G4 488 1 67.33 AAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGCGACTCCTGCACCGAGAGTTGGTATT:1 - chr3L 19878813 3' + copia 428 1 74.26 ACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTATGCCTGTGTTGGGCAGCGTGATAGTGTTGGTATCTGTTTTCGGC:1 + chr3L 13223782 3' - F-element 4492 1 62.38 AATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATTTTTGTATCCATGCAACCGGAATTGAAGGATGGGCCTGCTATTGACAGACTTTTCGGTCTCGG:1 + chr3L 12246205 3' + HMS-Beagle 238 2 65.35 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAGTTAATTAATCATATACACCTGAAATAAT:1 + chr2L 8640866 3' + roo 9024 2 81.19 ACATACGAGAGTACTCCTTATCTATATTGCACACTCCTCGACTGACGCTTGCTGCATAAAATTAAAAATGTGTAAAAAATATATATAAAGATGGCAAGAGA:1 - chr2L 13683199 3' - Rt1a 4779 1 79.21 ATGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAAGGATAACAAGGTTCAGAAAAGGATGTAAGGAGTTGAGCTA:1 + chr2R 25204880 3' + 1360 3264 1 58.42 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGACATTGACACCATCACGAACGAAACGAG:1 - chr2L 5932128 3' - jockey 58 1 71.00 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTTTCCTTGTACGCTAGCCCAAAATTTGACATATAAAATTCAACTTTTGGGTGGAATTTTTGAGT:1 - chr3R 11097492 3' + mdg1 410 2 63.37 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTGGGTGGTCCTGGATGTCCTGGAATCCTGCAAGG:1 + chr3R 14146699 3' - hopper 40 1 63.37 TGGATTGCTCATGGGTACTGATCATGTATTTAAATTTTGTTATGCCCCGACAAACACTTGAGTACCCGCTTTTTCGCCTCTTGTGGAAATGCAGCTTGCAA:1 - chr2L 7140053 3' - Quasimodo 258 2 72.28 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGCTAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATTA:1 - chr2R 18372606 3' - jockey 4699 1 51.49 TAATTTTTCTGGGATATCTATATATGTATATAGCTGTGTTCATAAGTATATTGGAAAATTAAATTAAGTGTGTAAAGCATAATATATTAAAAGTAAGTTTC:1 - chr4 983590 3' - INE-1 503 1 54.46 TAGGCTCTCCTAATTGGGATTGGTATTATTTAAATGCTAATTTGCCGATGCGGGAACTTCGTTTTGTTTTGGGTATGTTGTGATAATTACCTCAAGTTATT:1 - chr3R 18142102 3' - I-element 232 1 73.27 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAACTGAAACTGAAACTGAATGTTGCTCTTCAAATTTCATGGCAGCAGAATG:1 + chrX 11006913 3' - roo 4 2 65.38 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCAACAACAACATAGGAACAAATAAAACAAGAAGCAGGCAACAAAAGAGAGCCAGGCTGAGAGGAAAACAACA:1 + chrX 11624053 3' + 1360 3384 2 69.31 CATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAAAAAAAAAAGAGACCAACAACGGAAACCGGAAAAATAA:1 - chr3R 10906787 3' + Rt1b 5087 1 71.29 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAACGCATTTTCAAAAGTGGAAACTAATTTTCTGCCGCTTGCAGCTATCTCAGAATACACGTTCGTTTAA:1 - chr2R 5267241 3' + pogo 2098 1 76.24 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCGGAGACACTCACTCGCCGTAGGCACCTTCGCCCAGAGTTTGGGCCAAAGTCC:1 - chr2L 16691153 3' - pogo 21 1 60.00 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCACGCACACACACTTGCACTTCGATGGCTGTCTGCAAATGCTGCATAAATAACCGAAAAAT:1 + chr3R 14614918 3' + 1360 3378 1 68.32 ACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTTACCGCTCATGCTCGTAGTGCTTGGCCACAAACATGTCAAAGTAGGAAGTCACTACCAGCGCCAGATCGTT:1 + chr2R 18709913 3' + 1360 247 1 74.26 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAAGAGGAATATATGTATCTAATGTTGCAC:1 - chr2R 6838503 3' - I-element 49 1 78.22 GGTTGTTATATGATCCTCGATAATGGAAAAACCCCAACTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCATTAGGCAATCTGTTTAATCTATTACCC:1 - chr2L 13952075 3' + Idefix 6941 2 75.25 GGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTTGTAATCATCTTTGGTGTCATCCACCACCGCTCCGCTGGCCGCCAAGT:1 - chrX 2660593 3' + R1A1-element 4965 1 49.50 CCTGATCTTGTCGAAATTTCAAACTTAGTTATAAGTTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAATATTGC:1 + chr2R 4774800 3' - invader2 4810 1 60.40 ATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCAGTCGTCGTGGTTTCTCAGTTTCCAACTTATGCGGTTGATTTTTAGTCCCGGCTTCGCTGATCCTTTCCATTGGAT:1 + chr2R 16158223 3' - Quasimodo 440 2 79.21 TTTAATATTATCTTAATCGGCCGACTTTCATAAAATAGGTTTTGTCCAAAAAAGGGGTAAATTTCCACATAGTCCCTTACTACCGCCATTTTGTGTCCCAG:1 + chr3L 21766075 3' + Transib-N1_DM 440 1 77.23 CGATGAAAACACGTCTTCACTCGTCAGCGACCAAGCTTAATTCAGCTTCAGCACTCATCTCGTTTCTCGCCCCCAAACTTTTTTTCCTTTGGTTTATTAG:1 - chr2L 12228997 3' - Doc2-element 18 1 61.00 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAAAGAGCGATGGTATATTTATTGAACTCCAGCCTCTTTATTCCACTGACTTATTCGCTGCAGTCAAAGTAGTC:1 + chr3L 21908985 3' + roo 405 1 75.25 GCAATNAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGACAATACTGGATATATATAAAATCTCAATAGCTCATTCAGTA:1 - chr3L 15056313 3' - BS 5028 1 76.24 GACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGTTATGGGTGCATAATCTCCACACATCTGTATTTAGCTTCAAATTCGAGC:1 + chr2R 6501382 3' - Quasimodo 7055 2 59.00 GCTTGTTCACGGCTATGCTGGCGAACAGCGGGGCAAGCGAACTGAAGACCTTGACTCAATTAAAACCACCCAAATTTCTCCAACCATCAAAAAGGTTT:1 - chr2L 6337514 3' + Rt1b 4711 1 66.33 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTGGTTTCATGAATGCATTAGCAAGGTACAAATCT:1 + chr2R 10029471 3' + roo 9028 1 70.30 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGATATGTATCTGCGCTCGGTAGCAGCCACAT:1 + chr2R 21937532 3' - 412 46 2 68.32 CTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTATGCACGCTGAGAAATTATATAGACTTAAAGATACACCCGAGATACATATGCACATACGCATCAGGGTAATCAT:1 + chrX 11961759 3' - Cr1a 355 1 62.38 GAGAGAATGCTATAGTCGACTTTCCCGACCGTAAGATAACCCTTACTCAGCTAGTGGAAATAGGAACGCGAAATTGCCAAATTACGGCATCAAATGAATTA:1 + chr2L 16388153 3' - INE-1 575 1 72.28 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACGACATTTTAAAGCGATCCTACTCTTGAGGCACAAATTACAGCCTGATACCGC:2 - chr3R 9193581 3' + roo 9045 1 54.46 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACATACAAATACACACAGCCGTGCATACGTTTAAATATATATTTATAAATATGCGTGC:1 - chrX 9950812 3' - hobo 20 1 59.41 GGGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCTCCGTATTTGTGTGCACGCGGATTTGGCTAAAAACCAAAATGTTTGCCACCACTGT:1 + chrX 2262798 3' - R1A1-element 5110 1 61.39 GGGCANTCTGTAATTGTACGCATGGCACACATTTTCTTTTGAAAATGTGTGCCAATTGAACGATTTAAAATTCGTATATGCATATACGCTATGTATATAAA:1 - chr2L 18558362 3' - BS 4748 1 60.40 TTTGTGAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGTGTCTGTGTTTAATTGCGAAAATGTAGCAATCTT:1 + chr2L 13482224 3' - hopper 13 1 64.36 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGAGATACCGCCTCCAAATCGATCTG:1 + chrX 9260648 3' - 3S18 5818 2 73.27 GATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCATTGGGTGACTTATCTACGGCCTTTTATCGTTATCTCGGTCC:1 + chrX 1190272 3' - Idefix 220 2 75.25 GGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTACGGAGAAGTGGCGATGCCAGGAGGGACATGGTTACAAAACCTGAAAAAATTCACGCAATGTGGGT:1 - chr2R 19847558 3' - F-element 305 1 68.00 CTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGACTGAGATTAATCAGATTTTGCGTGCTGCCAAAGTTCCGCG:1 - chr3R 29732017 3' - G2 292 1 58.16 CACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTTAATAAGATGCATAATTAAATACAACCATGATCTCAGCGCCCCAATTTAAGAATCAATTGGATTAC:1 + chrX 2125120 3' + G6 2001 2 67.33 CTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGGAT:1 + chr2L 21403548 3' - G5 4407 1 51.49 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGGCTGCACGTAAAGAAGCTGGGTAACATTACGGCTGCC:1 - chr2R 10509985 3' - roo 38 2 66.34 TGTCCGCTCGCTTACGCTGAGAGCAAAAAAATATAAAAATAGAATTTGCGTGTATATGTGCGTAGTTTTGTTAGAAGTGCACGACCTCTACATGTAGCATA:1 - chr3R 1439331 3' - 1360 3298 1 75.25 AAGATAAGAAAAGTAAAAAAATGTAACAAAGTGCGGATCGCAACACAACTTTATAAATATATGTACATATATGTGTAGTTAGAGCGAGACGGGGCGAAATA:1 - chrX 6803353 3' + invader2 4747 1 75.25 AAATGGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTATAGCAAAACACACCTCATCCGCGGGCCAGCAAAATGTCCAAGAAACAGCTGAAGTTGGCCCAGGCCCAGCTG:1 + chr3R 22677408 3' + 1360 3183 1 66.34 TTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATAACTTTTTTTTTCATTCCAGTTCTCTGAAACTGCCATATATTACTTTGCACA:1 - chr3R 7603954 3' - Stalker 70 4 56.44 AAACAAAACACAAAGACGATATATATATAATTAAATTCTTGGCAATATTTCAATCAAACTTTTTTTTTGCCACTCTACGGGGCGGCTGTGTAGCCGTCCAA:1 - chr3L 13644835 3' - Cr1a 197 1 63.37 GGATTTCAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTATCTCAGAGTTCGCTTTTTTTTCGCTCAGCAAAGAGGGAACCCAAAGCAGACATAAC:1 + chr2R 13336012 3' - G-element 4228 1 65.35 TAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAGTGTATCGACTAACAGGAACCCATTACTCAGAAATCGATTTTGTAATGCTTATGAAATATCGATGGATATTGGAAA:1 + chr2R 5730602 3' + invader2 361 1 80.20 CTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAAGGCGACAACAACAGCGAGGATGAGACCATGAGATGGCTGTGTGGCACGGGG:1 + chr3L 6516387 3' + F-element 382 1 61.62 AAACTCCCCACAAATCTCGTGCAGGGGAGTGGCCTAATAACAGCCGCGAGCCGGTCCAGAAATCCCCAACCGCCGAGCCAGCCGATCTAAGCAAACGAAAG:1 - chr3L 7337122 3' + gypsy8 4664 2 54.46 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTGTCTTGCATATATATGAGAATTTT:1 + chr2L 17862236 3' - F-element 64 1 78.22 ATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAAAGTATGCTACGCAA:1 - chr3R 13339025 3' - BS 5013 1 57.43 TTTCACACCTCAAGCTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGCCGCCTGTTTTTTTTTTATTATGACCTTTCACCCCTATTACAGCC:1 + chr3R 30414589 3' - accord2 51 2 53.68 AACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCGTAATATGTATGTATGTATGTATATCTCGATTCGAAGCTACCAC:1 + chrX 8511316 3' + FB 947 3 56.44 GGGTGGTGTTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTTGTCTCAGTGTGTGAACCGAATTGAACCTTGGCCA:1 + chr3L 14361506 3' - X-element 4335 1 65.35 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATGGTATATCTACACATGGTGTGTCCCCCAACCACTTCGGTTCGGCTGTCCGTCCGTCTAACTGA:1 - chr3L 7231103 3' - 297 6588 2 64.36 AAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGAGAGACTGTCTTGGCCCGACTAAACATGGCCAAGAAACTGCCGCTGACTG:1 - chrX 3521025 3' + HMS-Beagle 399 1 59.41 TATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATTGAAATTGGCAAATCTAGAATGTACTGGTATATACTAGGTGCATTCCGAGAA:1 - chr2L 16251177 3' - pogo 206 1 61.39 ATCTTCAAAAAAATATAAATAAGAACTGTGTGTGGAATAATAACGTAAAACTAAAAAAAAAAATACTT:1 - chr3L 19092350 3' + mariner2 785 1 79.41 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATGCAAGAATCCACTTTAAAATTGGTAAAGAACTTTTTCAGTGCTGAAAAGTTTTTAGCTA:1 + chr3R 25931399 3' - roo 7 2 70.33 CTAGCTGCTGTAAACAATTCGCAAAACAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACCTACTCGAGTGGGGAGGTGCTAGGAGTTCCAAATTGGGGATTACATATG:1 - chr3L 19678986 3' + diver2 278 2 54.46 CTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTAAGCTTGCCAAAGGTGGCTTCTCC:1 - chrX 17203255 3' + Doc2-element 4558 1 76.00 CAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTGCAGAGTCAGCATAATTAGCATGCGCGAATCTCCAAGTAAGATTTATACATACATGTTTC:1 - chrX 17631829 3' + Tabor 6965 2 68.32 TTGCGATGCACAGCAGCGCCTTTTTACGGCCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCGCCGCCCTCTTTCGAGGCAGCCATTGCCGTGAGATTTGTCT:1 - chr2R 24137386 3' - Rt1a 4846 1 65.35 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTA:1 - chr3R 19450187 3' - roo 8720 2 52.48 GGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCGGCGGTGGCCCGAGTGCAGCTGTTGGCTGCCTG:1 - chr2R 23032797 3' + hobo 293 1 67.33 CGCCATCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCCAGCGAGCGCCACGAGTTGCCCCATATGATGATGATCTTCATCATCGCGGTGGTTGG:1 + chr3R 9347866 3' - Rt1a 4671 1 63.37 GGAATGTGCCAATTGGATTTTGCTGTGAGATCATTTCCTGCAACTGCTGCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGA:1 - chr3R 21502400 3' - TART-A 173 2 87.32 CGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGATTGGTGGTAAGCACAAGTCCTGGCTAAGTGTGGACAGAAACTCTGGTGTG:1 - chr2L 4203517 3' + jockey 419 1 56.44 TAGAACTCTGGGGAACTGCCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGACAACTCGCAGGATAAC:1 - chr3L 11646599 3' + Porto1 4282 1 76.00 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCCACTGTCCGCAGAGTGGCCATATGTTTCTGCGAGTCTGCG:1 + chr3R 23618209 3' - hopper 33 1 58.42 TGATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAAAAGTTTGCTGTTTTAAAAGTCTGCATTTCAAGAGAACTTTTGCATTCTCATTGCTCTTCCCAG:1 - chr3L 8570541 3' + 1360 410 1 69.31 AGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGATGGAGCGATGTCTGCGACTCGCGTTCTTTCAGGCCGTGTCCGATATCACTGTCG:1 + chr2L 18203928 3' - gypsy4 6485 1 65.59 CGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACCCTGGCCCCACTTATTTTGGAGTATTTCGAAATGCCTCCCACTTGTATTTGCTGCCCCATTGAGAGTTACTCG:1 - chr3L 12264498 3' - R1A1-element 330 1 77.23 TCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTAATTATAGAGCAGCTGCACGCCCGAGTCCGAGTGCATAACAAAA:1 + chr2L 19037538 3' + R1A1-element 5132 1 56.44 TTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTGGATTTGCGTGTGTCTGTGGGACAACGGCGCCATTTTAATTTGATTTTACCAGT:1 + chr3R 28220126 3' - 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Transpac 39 2 63.37 ATTTTTCGAACAACAGATCAAAGTAAACTATTTAAATTTGATGTCTCAATACTTTTGCCATGCTTTGTTGCTGATTTTCGTTCAGCGAGATTGCATGCCAC:1 - chrX 9266489 3' - Tc1-2 243 1 57.43 TCTTCNCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCTTACCCATCCCCCTTGCCCTTGATTAATTCAGTTTTGTTTCAGCTGCATTGCTGCAATGGCAA:1 - chr2R 18890836 3' - opus 295 2 65.35 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACATGGCCTGAATGACGACGAGTGACACTTGCATCCTGCATAATTGGTTTA:1 + chrX 21247600 3' - blood 7179 2 71.00 CGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACTCGCCCGGAGAACCGAAAACCGAAGCGAAACAAAACGAAACGAAAAGCGTATCAAACCGAATAAAAAGAG:1 + chrX 15562231 3' - opus 451 2 74.00 TCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACTAATTTTGTATCGTAAATCAACTTAACAACT:1 + chr2L 20772578 3' + R1A1-element 5028 1 69.31 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAGGCTAAATGAATTGTGTTGAAAATGTTGCTGGTTTATTGATT:1 + chr3L 1359413 3' + jockey 4953 1 60.40 GTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACACTGCTTGGAAATGGAAATACGAAAAAAAATAAGAAAACAGA:1 - chr3R 1363679 3' - 1360 3199 1 59.41 TATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATTGCAAGACCAAAGGTCAGCCGGACATCTGAAAAATGTCTGCCAGTCTCGCTGA:1 - chr3L 13824507 3' + hobo 2661 1 59.41 TTCTACATATGTACATACATTACTTAACCAACCTTTAAGGATATTCCACAAGGAGAAAACCAGGAGATGGTTCGGTAAGCATTTGAATTCTTTTCATTTGA:1 + chr2L 12401480 3' - invader3 5084 1 66.34 TCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATTGGCTGGTGCAAAAAGCCGGGTCTGATGCTCGGAAAATTTCATAAATCAAA:1 - chr3R 7776397 3' - 17.6 7090 2 69.23 GGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATGGCGAAGGACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATACGGAAAACAAACGTTTCTCGGCGATCCAC:1 + chr3L 8526767 3' + R1A1-element 2 1 69.31 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACA:1 - chr3R 15072557 3' - pogo 14 1 62.38 TATTANTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGGCATAATTTTGTCACTCATTTTTGACTTACTTATCCAATAATCGCAATGGAATCAGTGCCACTAAC:1 - chr2R 13124379 3' - mdg1 7048 2 65.35 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGAAGGAAACATATCCGCGCAAATGAATGTATGTGCATAAAAATTTAATAACTTTTTG:1 + chr3L 776170 3' - 1360 24 1 56.44 GATCAGGACCAGGTGGTGGCCACGATTGGTGACTATAGGGTTTAATGAGGAGCGGGAGTTCGGTAGGTTGTTATTTGAAGTGTGTATGTGTGTGCGTGTGT:1 + chr2L 11901973 3' - Chouto 406 1 35.64 ATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTGTTTGATGGTGATTTTTTTCTATTTTTGCTGGTGCAGCGGTTCTACTTCCATTT:1 - chr3R 23447387 3' + Circe 7123 1 61.39 AGATTGTTAATGCTACATTTTAAATATCTTTTTCGTAGATGGTAATTTATAATATATAACTTATTTTCCCCCTGTGCACTGAGCTCCCTGTACTCCAGTGT:1 - chr2R 16381773 3' + G4 3514 1 68.32 CGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGT:1 + chrX 21667938 3' - gypsy2 6511 2 62.38 CTTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTTATATTTAAGTATACCTTTCAAATTGTTTTAGAACTTAAAGTGAGTTCTTTTGATCATG:1 - chr2R 21752204 3' - Porto1 4422 1 60.40 AGGTGAAGAGCGAGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAATATTAGGGAGCACGCGAAGGAAGTACGTTGA:1 - chr3L 3239233 3' - GATE 8292 2 72.28 TGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCATTGTGTTCTTTGTCATGCTGTTGATTTTTTGCTACAGGTGTTTTCTGTTGTTCAATTGGAT:1 + chr2R 14615011 3' + Porto1 212 1 68.32 ATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCTTATAGTTCATCCCAGCTTTTTTTCCACTTCATCGGTCAATTCGATTCAATAACTCGAAG:1 + chr3R 18497718 3' + Idefix 320 2 61.39 GGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTCTGCCCTAAGGTTATTTACTCGCCCGTA:1 + chr3R 8614634 3' - F-element 4453 1 72.28 TAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTAATTAACTCGGAATTCTACCTTTAACGGAGGGCCAGAGTTATAGCCAGATTGTGCATTC:1 + chr3R 17727441 3' - I-element 5100 1 62.38 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAGTAATTAACCACATAAGTATGCTTTAGAAAG:1 - chr3L 12646315 3' + jockey 4958 1 69.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGCACATAATATAAATTAAATCGACTCAGAACTACACGTGCTTAAATGCTATCTTAGTATACCTCTATCAATA:2 + chr2L 21293032 3' + roo 404 1 76.24 AGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCTTTGTGTTGTCGGGCTGCCTGGTGCGATTGGGGATTTGTCG:1 - chr3R 5870146 3' + I-element 4955 1 60.40 ATTACCAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACACAGTGCAAGAATCCAACATTTTTAGTAGTCTCATCCACCAAAGTGGGCGTGGCCAATTGGAACGGGC:1 - chr2L 3963957 3' + Ivk 281 1 68.32 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCATGTAAAATCAGAACATAGATGG:1 - chr2L 21292959 3' - roo 8717 2 82.83 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTACCGTGCAGGATTATGTGGAACCCACGCAGGAGACTGCGAATGCGACAATCCTGTCTCG:1 + chr3R 23701005 3' + mdg1 405 2 63.37 TGCATGAGCATACGTGTGCACACATACACACAGAGAAAACACGAAACAATCGCGGGGGAAAAGAGAAAGCGTTGATAAAAGAAATGCAAATTGAGACCGCC:1 - 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baggins 5135 1 73.27 GTCACTCTATTTACGATAACCAAATTATACATTTCCGGTGAAGTTCACTCAAAAGGCTGTCTCGCCGTCATGTTTTGGTTTTCACACGACCAAAAATATA:1 + chr2L 7394464 3' - Gypsy12A_LTR 179 1 78.00 CAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTATGCTTTATATTTACTTGAA:1 + chr3R 9068075 3' - Doc 367 1 80.20 CTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGCATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACTTACCTTGCTTCGGCAACAGAATCAAAGGAACGAAAGAACA:1 - chr2L 10408350 3' + 17.6 7155 2 57.43 ATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGGCATAACCAATTCCGATGCACATCAAGGATACCAATATCACGAATTTCATTTTCACGATTTGTACACTATCTTCT:1 + chr2L 3669713 3' - Porto1 443 1 81.19 TATATACATACATACATTACATACATACATACATACATTTGGGTAATTTAATTATTTTTTGACATATATTAGGGTATTTAAAACTGGCCATCTGTTTGCAA:1 + chr3L 14284657 3' - 1731 94 1 69.31